Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score TGCGACGTTGGAAAGGTAGAACGGTGGCATATAGAAGCTATAGCCTCGGGTTAAAGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGT:1 - chr3L 6929490 5' - F-element 4435 1 61.39 TAGAGCCGGTCTTAAGTGANTGTAAATATCAAGACTTCATTAAACATCGCAAAAGAAGAGTCCACACCCTTAGAACCTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCTAG:1 + chr3R 27320126 5' - Cr1a 310 1 53.47 TTTTCTAATCCTAACGATGACACGGATTACTTCTCAACTATCGATTCAGCACAGGTTAAAATACATGCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr2R 15794788 5' - pogo 2094 1 70.30 CAACTGTTTCTCTGAAGTTGGTTTGGTATGGAGGACAGCGGGAAGTGGTTCAAAGGCTGGAATCGCTCCGCGAGATGAACAGCAAACACTTCGGCTTGCT:1 - chr3R 10242205 5' - BS3 72 1 62.00 ACTCACATTCTCTATATAGCTTTATTACTAATAAAGTTAATATGAACTTATATATACCAATAATAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGT:1 + chr2L 6615132 5' + R1A1-element 5310 1 70.30 TAATTGTTAACAAATTTACTGTATGTATCTATCTGCATATAATTGAACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chr2L 7328321 5' + I-element 31 1 54.46 GACGAAGGACCGTTAAAAATGTGTCGCCCGGCCACGCCCCCTCCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATGCCACTTATTTTTGTTAAATTGAATGTGTAGATA:1 + chrX 2397141 5' + HB 106 1 55.45 ACCCTTGAAAGGGGGTAGCGGGGTCGGGCGACGAAAGGGCGGGGGCGGAGCAGAAACAGTTATTTATTAAATCCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCT:1 - 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chr2L 16164140 5' - pogo 2095 1 71.29 GAGACGTTGATAAGGCAAGCGAAAAAAGCATAGCATACTTCTGAGCGCAATGCAATTTTCCGTTTTCATGTTCTTGGCAGGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 + chr3L 17254696 5' + jockey 4669 1 77.23 CGCCCTGTTGGATTCGGATCTGGGTTTTGTCGGCAAAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAG:1 - chr3L 10014082 5' + jockey 180 1 74.26 AGGTGTCGCTTTAAAATAAAAGGACTTTAGTTTCATTCGGTAGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr2L 2016753 5' + Doc 48 1 64.36 AGGCTTGGGATGGCTTCCATGATGACCCGGGCATGTCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 14132136 5' + roo 8703 2 62.38 ATGATGCTGGAAAATATGCNTTTAAGTTTGCGCTGGCAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGA:1 + chrX 6884886 5' - Tirant 88 2 68.00 CATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1 - chrX 23406393 5' + diver 5941 2 78.22 AGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGACAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGG:1 - 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chr3L 17668869 5' + micropia 75 2 76.24 ACAGCACTTTAGTATTCATTTATTTGAGATCTATTTGTCTGAACTTTAAAACATTCCCTTCATATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chr2R 5413407 5' - Juan 4202 1 64.36 ACACGAAATTGTTTTAAAGTGATTATGGCCGTGGAAAATTATGCTCCTAATAGAGGATTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 + chr3L 14887819 5' - jockey 4975 1 56.44 ATATCGCTGCCCCGTTCGGCACGTGATAAGTCGGTTCGGTCTTAGGAAGCAAAATGTGCGGTTATGGTTTGTGCAGATCGAAGAGCAATTTCAATGCAGCC:1 - chr3L 12606162 5' + Chimpo 399 1 54.46 TTTTTTACGTACGTATGTTATACGAGTATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr2L 10942363 5' + 297 6624 2 76.24 TTTGCTTTGTTCACAGAAATTCTCATCAAAATATCAAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCTTATCAGCGT:1 + chr2R 10977961 5' + accord2 7188 1 64.36 ACAAGCGCAAGTAATGAACGCCATTAAAAACATAGATTAATACTTGTAAGTATGGCGCGCATATCTGCGGCCAAGAAATCCGAAAATGTAATTTGCCACAA:1 + chr3R 26198231 5' + TART-A 13317 1 74.26 ATAACAATAAAATATCGCCAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 13439089 5' + G-element 4324 2 75.68 TATATATTTATTTATACCTAAGTGCCTTCTTTTGTGTCTTAGTAAGCGTGTAGCGCATTTTACCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 17098340 5' + roo 8677 2 67.33 AAATCCCCGTTTTTCGACTNCCAGTGCCGCCCCAATTTTCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 30639577 5' + hopper 138 1 96.00 ACATCATAAGTCTAAAGAGTTTTCAAATATAAAGTTTTTTTTGGAAGCTAGGAAATGTATGTAACGTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 + chr2R 19651157 5' + flea 4777 2 62.38 AGCAAAGGATTCTCTAGCCATTGCCTCGGGATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACA:1 - 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chr3R 2628929 5' + 1360 299 1 63.37 CGCTTTCAAATGCATCAGCAGGGGAGTTGTCCTGGGATATACGATTTTAAAAGATTTCCGACTAATGTTATTGATTTTTTTTTTGTACA:1 - chr3R 17698229 5' - HMS-Beagle2 7178 2 71.91 TTATATATAATTGTGTGTCTTTCGCTCTTTCGCCGATTCGTATTTGTGTGTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2R 19616210 5' - hobo 2915 1 55.00 CGAAAGAAGGACGCGAGTCATCATCATAATCAACTGCCATGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGTA:1 + chr2L 12602083 5' - ZAM 87 2 55.81 TAAAAGCACGTAAAAGTTTGTGGGCAATATGTAAAGCCAGAAGATGGCTCTGAAGATTCCGAACGATGGAATATGCTCGATCAAACGGCCCTGGCATGTT:1 + chr3R 17718689 5' + Copia1_DM 494 1 77.00 AATATCGAAAAACTATTTTTAAACATATATAAGTTAACGAAAGTTCCAATTGCATCAGGGTTCTCGGCAATCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr2R 16639707 5' - opus 7457 2 73.96 TTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTG:1 - chr2R 2868546 5' - Rt1b 4736 1 42.22 TTTGTAAATTAAACAATTATAAAGTTAGGACAAATAATAATTATTATTCTTTTTTAAGTGCATCAGAATACGACTGACCACTTTTGAGTTCTGTTTAAAAC:1 + chr2L 16978765 5' - gypsy9 5253 2 80.20 CAACAACCAAGCCAAAAATTAAAAACAAACAAATAATAATAAAAGAGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCTTTGAACG:1 + chr2L 11359508 5' - Idefix 7071 2 53.19 CGCCAAAAAACTTGGACAACTCTAAAGACCCGCTCGAAATATGAGAAATATGAAATATGAGACCCGCTCGAAATATATGAGTTGTAAGTCCTCACATGATT:1 - chr2R 18786750 5' + BS 4990 1 67.33 AAGTTATTCTTCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr2L 16866480 5' + Transpac 4959 2 66.00 GACAGTTTCGCAGGACATAGGACAAGATATCCCAGAGGCAAGCATTAATCAACTTATAGACAACACGACACACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTA:1 + chr3R 28087271 5' + 297 6536 2 75.25 ATAAATTAACCGTGCTAGGGGATCCCAATCATGGCGCTGCCATCGAGAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 16025690 5' + 412 28 2 52.48 AGTACTCAAAGACCAAGCANTGTCTCTTTGTGGTTGCTTAAAGAATATGTTAATGATTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATT:1 + chr2R 19353341 5' - 17.6 260 2 60.98 ACCGCTTATTTCTTTTTGGTCCGTTTAATTGGCCGTGCCTACTCACTTGTATGTGTGCTCATGAATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCGCCTTAG:1 - chr3L 24505286 5' + 1360 215 1 52.53 TCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr3R 30284227 5' + blood 7058 2 73.27 ACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 - chr2L 19907978 5' + Tirant 8131 2 57.43 TATAAAGCATTTACAATCCAATTTTTTGATTTGCTTGGCGGCGGTTATGTTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTATGTTAGAATTTGTTTATG:1 + chr3R 20708815 5' - TART-B 10275 1 68.32 GTGAAAAATATCCGTTAAAAGCTTTAGTTGTTACTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr3R 15523361 5' - 412 455 2 63.37 ATTTCCATCTTCTTGTTTAAGTGTACGAGCAATGGTTAGTTTGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGG:1 - chr3L 7341742 5' - I-element 5004 1 59.41 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATACATTGGTTTGGCACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGTAAGAAATTTAAAAATAGAATTTGCTTG:1 - chr2R 1982173 5' - 1360 3267 1 48.00 ATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTG:1 + chr3L 20756360 5' + INE-1 159 1 80.20 ATCGGTATCATATTCGAAATACGAAAAGTTTTATACATTTTTATTTTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr2R 20145065 5' + opus 7143 4 59.41 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGC:1 - chr2L 16999510 5' - 1360 3324 1 91.09 TTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr2L 23295874 5' + micropia 20 2 55.45 AAACGACAAAAGTTTGCGGCCGCATCCGGAGCAGAGACCTCATCTTCCTGCATCGCGGTCATCTTTGCTCTTGCTAGGCCACTCCCCTGCACGAGATTTGT:1 - chr2R 15627857 5' - gypsy8 22 2 58.42 TCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTA:1 + chr3R 1440187 5' + G-element 60 1 79.21 AAATATATAATAAGCATGGACTAATGTAGTTCAATGTGGCCTACTCTTGTCCCACTGTAACTTGTTACCATATTGGTGACCCCGCAATAAGCAAAATGCAG:1 - chr2L 8534826 5' + Chimpo 215 1 65.35 CTGATATTCGTTTCACAACCGGTTTATATATGTATGCAGATGCTGATGTTTTCGCCGCTCAGTTGAATGCCCCACACACACACACACACACACACATATGC:1 + chrX 2141788 5' + accord 7031 2 53.47 TACAACATTTATTTAGCTATAAAGTGTCTTGACGATGTATTTTCAATAACACTTCAATACCACTTCAATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr2L 7552493 5' + I-element 15 1 46.53 TACGTCGAGGGGCCAGCCGCACAATTTACATCTATGCACACACACATTCATAGACTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAA:1 - chr3L 17136041 5' + BS 21 1 51.49 TCAGCGGCTGGATGGGTCGGAAATTGTTCTTCAGATGATCATCGTTGGCTGTCAGCAGACGGAAGGGCATCCATTCATATCCACACACACACACATATATA:1 - chr3L 12182550 5' + Quasimodo 38 2 70.30 CATCTTCGTTGTTTTAGTCGTTAGAGTATAGTAAAGTCGAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chrX 21469025 5' + pogo 35 1 63.37 TGCCACGCCCAAACTTTTCAAAAATGTGTTGATATTTTTCACATTCTTGTAAATTTCCATCGATTTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 + chr3L 23118140 5' + INE-1 561 1 55.45 TAACTACGTTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACACAC:1 + chr3R 8856944 5' + rover 35 2 62.38 TGTCAAGTGTCCTTCTGGTGCAAAATGTAAAATACTGCAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGT:2 + chr3L 14878624 5' + Juan 14 1 66.34 AAGTTCGTAGCGAATGATTCCGTCCATAAGACTGTCGGCAGACGAGAGCCAGAAAGAGAGAGAGCGAGAGAAAGATAGAGA:1 + chr2L 7117690 5' + Penelope 610 1 62.96 GCATAAGAGATTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2L 19698502 5' - hobo 2908 1 62.24 GTAAAAAATGTGCCAGGCATTTCATTTAAGATCGAACCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATC:1 - chr3L 21102606 5' + Ivk 5023 1 63.64 TACTAGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAATGAAGCGTTTCCGACTATATATGAAGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr2L 22211546 5' - HMS-Beagle 7029 2 64.36 CAATTATGTTAATGATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3L 13639861 5' + hobo 39 1 62.38 CTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 + chr2L 1201973 5' + Stalker2 7274 2 53.06 GCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGA:1 + chr2R 5284583 5' - Doc4-element 2593 1 73.27 CTCGCAATTGTACAATTTAAATTTGAAAATTTTTTTTGAAATACCTTATTTCTGTGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2R 22369549 5' + roo 20 2 56.44 TATATAAAAATATATATAAACACTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCTTAGCTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTTGCGGTTTTTTGAGAA:1 + chr2R 5943529 5' - hopper2 1116 1 77.23 CTAATCGGCAAGATCCCCATACCCCGTACCCCCCGTAGAGAATCATAACCCCCTCCTTCACTACTCCGACACAACATGGACTGGCAAGCCCCCC:1 - chr3R 8814471 5' + G-element 319 1 59.57 CCAGAACTAGCGCTACAAGTAATTTCAAATTGATGGCGCGAAAATTACGACAAGCGCTGTGAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGATCTGCGAGAA:1 + chr2R 19775730 5' + 3S18 243 2 68.32 ATGTTAATGATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13639866 5' + hobo 42 1 66.67 CTTTAAATGTTTCATTAGCCGGCTTTCAAAATAATGCGAATTGTATGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAG:1 - chr2L 6410625 5' + P-element 208 1 48.51 CAAGGGGTTTTTCACACTTACTTCCAAAGCATTGCCCAATATTATTTTTATGCCAGCCAAGGTCTCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3L 7463365 5' + hobo 11 1 67.33 CAACGATCTCCACGCAGAGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGGCGA:1 + chr3R 2474440 5' + invader2 146 2 80.20 TATTTGGCTACCATATACAAAATAAGTTGATGTAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACT:1 - chrX 350386 5' + I-element 463 1 67.33 GGACGCAGGGGGGATGGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chr3R 18006525 5' + accord 7031 2 63.37 CATTTCCGCTTTCGTCTCANTTGATGAGTGCATCAAATTAAATAGACCTACAAATAAGAATTTACAAATTATATTATTATTTTATTTTATTTTATTTTATT:1 - chr4 1128514 5' + transib1 1896 3 67.33 TTTTGCCACTTCTGTTTACTCGCACATTATTTCACACACTTCTCCATTGACTTTCGACGTGCAGATAACGAAATAGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAA:1 + chr3R 13686525 5' - 412 7546 2 74.26 AAATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 9439171 5' + roo 42 2 73.00 AGTTAAATTCAATTGTAGCAGATATATGACCAGGATACTTGTTAGTAAAGTCGGTTATCCAATGTTGAAGCCCCACCCCTTTTGAAGAAAAAAGTGGCAAA:1 + chr2L 5155920 5' + S2 1265 1 80.20 TTTATATAAAAAGAAACCAAAGAAAAGGGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 + chr2L 7161316 5' - pogo 2056 1 82.18 AACAGGTTCAGCAGACACAGCAGCAACATGCCCTAATACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGA:1 + chr2L 195241 5' + Doc 486 1 63.27 ATATATGTAAAAATATTAATGATAAGGTGCGATAAAAGATAATAAAACTGACACGGTGCCCCAGTTCTCAGAACCTTTGATTGTGCTCGTTGTATGATGTC:1 - chr3L 21953299 5' - F-element 4313 2 50.50 AGTTGGTACCGAGGGGCGTCTGCAGGGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGAC:1 - chr2L 18243824 5' + R1A1-element 5047 1 74.26 TTGTGGTTTTATAACCATGAAATGGTCAATTTATTTCTTACAATGAAATTGATTTAAAAGGCTATACGGAGTCCTGGCCAACATACTTAATCATACTTAAC:1 + chrX 4349839 5' + G2 2950 1 79.21 ATGGAAATGACTCCCGCTGGTGTACTCGGGGCATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr2R 8528290 5' - Transpac 303 2 70.30 ATGTCGGCCGCGTTTTGGCAGCGGAATCAGCAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATG:1 - chr2R 21373967 5' - 1360 2937 1 69.31 AGAAGCCGAAGCAAAGAAAAGAGCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAAT:1 + chr2R 17794376 5' + F-element 4534 1 77.23 ATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr2L 16071153 5' + 412 54 2 75.25 GGACCGCCACTGCCGCAAAACTTTTGACATATTTCACTTGGCTAATTTATGGGCCTACCCCCAACTTAAGCCGCATTTTTTGTTGCTTGTAGTGGACATCT:1 + chr3L 5417217 5' - Fw3 2980 1 44.55 TTGTATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTG:1 - chr3R 17897187 5' - hopper 1373 2 62.38 TATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAG:1 - chr3R 17897184 5' - hopper 1370 1 65.35 GCTTTTCAAACAAAACAGTGATTATAGGCATTTTGAAGTTCAATTCTTATAACGATTTTATGGAATTACTTGTCTACGAAATAATATAATAATAATATTAA:1 + chrX 7374067 5' + invader3 5054 1 64.36 ACCGGTTTTAAGTGTGTTACTTCGTACCATCAAAATGCAAGTGACAATGCCTCGCAAAAAAACAACACCATACAGCACTGCGAAAAACGCACAAAAGGGAG:1 - chr2R 973981 5' - Cr1a 222 1 56.44 ACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCCGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 28447399 5' + blood 53 2 78.22 GAATTTAGTAGTTATATATCCAGCGATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2R 7186629 5' + jockey 63 1 75.25 AAAAGGCACCGAATTATCAGTTGATATATGTACATATGTAAGTAAGTGCCCAGTGTATATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 20555929 5' + 297 8 2 70.30 TCCCAAAGTAATTCAAATAAAATGCAATTGATCAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 - 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chr3L 5027508 5' + Porto1 301 1 72.73 GAGGCGAAATGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 20268969 5' - hobo 2921 1 61.39 CGGGGTCGGGCGACGAAAGGGCGGGGGCGGAGCAGAAACAGTTATTTATTAAATCCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCG:1 - chr2L 21786774 5' - Max-element 8512 2 55.45 AGCATAATTCAGTGGCCGACTGGACCCAAAGTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr3R 27448249 5' - hobo 2897 1 67.33 CCTATGCCAAAGTCGATTCCTGGCCGCAAGCTAAGTGAGTGTGCTGGCCTGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAA:1 - chr2R 15033627 5' - Max-element 8238 2 58.42 CACAGGGTTATGCTAATAGACCTGCACTTTCCACCAAGAGGAGGGTATACTTTACAGATTCGGGTCTGCGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 - chr3R 5722227 5' - Tirant 399 1 78.35 TGTGCTTAAATCAATGACAGCAACACAAAGAAGAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGGTAGTAAAGTGAAGTAAAAGAACCAAC:1 + chr3L 20157805 5' + invader2 352 1 75.25 ATTTTATTAAGATATATTTCAAAGCGGACTCTGTCACCGAACGCCGGAAATCAAATAAAAATCTTTTTCAAAGCAAAAAAAAAACTAAAAAGAAAAA:1 + chr3L 18397210 5' - Tc3 43 3 79.38 AAATGTGGCACTATCCAAAACATTTCATTCGTTTATTTTGTGACCCAAACCCCTTACCCATTGAGTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAA:1 - chr2L 3495044 5' - 1731 303 1 60.40 GTGAGGCGACGCAAATTGCAGAGCTTAGGAAATGCTTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 - chr2R 15160365 5' - Tirant 362 2 63.37 TTGCCAGCACTTGTTTGTGGCTGAACTTTTCATTTTACGGCCTGTAAGATATTAGACATATTTAAACTACATTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTT:1 - chr3L 20032341 5' - Tabor 479 2 71.00 AAATGGACAATGGCGATGCNACTCTATCTAGGCAAGCTAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2R 8254846 5' + roo 8703 2 64.36 CATATACATACATACTTGTTAACATACTTTCCGCTGCGTCAGATACTTTATTTCCAAGAACTCCAACACACAAATCATCTACTTAGCCACCAAAACTCAA:1 - chrX 10913595 5' + Porto1 4465 1 68.00 TTACCAATCTAGATGGTAGGCGGAACTCAGCCGAGATGAAATCATACCCGCCGAGTCGAGTGCTCATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGA:1 - chr3L 22899088 5' + Idefix 467 2 70.30 AGGAAGTTGAACTTACCTGAAAGAAAAGATGAGGATACATTGGTTAGATATAATTTTAACGAATAAATATAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3R 9121410 5' + roo 8669 2 69.31 TGCACCTTTCTACCCGTACTAACCGTAGTAACTATTAGAATATACAAATTAAACTGATTATGTTGTTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTG:1 + chr2L 23402926 5' - springer 7489 4 62.38 AGATCCTACTTTCAATCGTGTGAAATTAAAGTTAATCAACATTCATGACGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2R 24242883 5' + hobo 25 1 55.45 TCACGTCACAACATTAACATCCATAAATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 6399579 5' - roo 392 2 66.34 TTTTTTTCTGGGCCACCTTTTCACTATTTTTACTATCCCCAACGAAAGAGTCAAGCAAATGCAGTTTAACACTTGGCAGCCTCCAACCCCATTTTTCCGCC:1 + chr3L 18279994 5' - Transib5 2852 1 64.36 GCGTTGACGGCGTTCTTCAACAGGTTTCTCGATTCAAAAGGACCTCCATAAGTTATACCCACTCTCCTGTTTTTTTTCTTCTTTTTCTTT:1 + chrX 10134571 5' - Doc2-element 219 4 68.89 GTCTTCGGGACAAGCTTGCTTTACATTTGATAAAAAAAATATAACAACAATTTTACTGCATACATACACTAGTGGACATAAGTATTTAGACACCATTAGCT:1 + chrX 22924619 5' + Tc1-2 14 1 66.34 TCGCACATTTACGTCACTTTAGCACTCAAAAATTATTGTATAGCCACCCAAAATTATTATTATCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGCAT:1 + chrX 15033203 5' + Gypsy6A_LTR 91 1 61.39 AGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr2R 6074449 5' - 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pogo 2066 1 63.37 ACTTGGGGCTTTTTTTCGCTCAATTGCTTTCACTGAAATGGGAGCCCTTTGTCTGCGATTTTTCTCATGCATCCTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACC:2 - chrX 4279588 5' - blood 375 2 76.24 AATAAAAGTTGAGACAAGATCTTTCCAAATATTTTAAGCTCAATAGAACAATAACTATTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACA:1 - chr2L 16958140 5' - 1731 295 1 58.42 TGGGTATAGTGGACATGAANGTGGTGCAGTCAGCGCCTGATTATTGGAGATGGCCGATATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 11415657 5' + roo 8677 2 64.65 GGGCTTTATTCATTTATTAATGTGTTAATTAGCTCAATTATTGCGCGGCAACACCAGCGACAGCAATATTAACATCATACAGCGGGCACAATCAAAGATTC:1 + chr2L 2669132 5' + F-element 4322 1 52.48 AACAGTGGCGTATATAAGCACTTCAGCTTCGATGCCTGGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAATCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr3L 13059690 5' + transib2 35 1 59.41 TTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTG:1 + chr3R 11118053 5' + BS 47 1 73.27 CTTCAAGGGGTTTTTCACACTTACTTCCAAAGCATTGCCCAATATTATTTTTATGCCAGCCAAGGTCTCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr3L 7463368 5' + hobo 8 1 70.30 TATTAAATATCCATTACTGNCATTTCCAGTTAACAGTACCATTTGACTTCAAGTCAAGCGGAAGTCGTAGCTTTTAATTTGGTTTTTTTTTATTTTTTGAT:1 + chrX 6640182 5' - transib4 2536 1 87.13 AAAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAG:2 - chr4 156605 5' + INE-1 148 1 83.17 TCTTCTCTGTGGATGGGATGTCGCTGGCCTTGCTGGGCTTGTGGTTGCAGCTAATTCTGTTTGTAGTGGACGAAAATAATTTGTAAATTGCTTGGAGCCCC:1 + chr3L 14870295 5' - Juan 225 1 54.46 CCCGGCGGATGCCGCCAGACGCATTTCTCGGCATGCCGCTTGATGCCCGTCTCTGATTCCTGGCAGAGACGGCGTCGCTCGAGTTGCAGAAGTGAGGACCG:1 - chr2L 7414441 5' + diver2 4421 1 57.43 GTCTCCACATTTTAAACATTTTCGAAATGTTATAAAAACGTGTAAAGGGATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 + chr2L 21786693 5' + Max-element 8263 2 51.49 TGTTAATTTGACTTGTACACAGTTTTCTATTTTTTAAAAGGTACTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTTGTTTATCAAGATTTTGC:1 - chr3R 26233388 5' - I-element 83 1 74.26 AGCTACAATTATATCACATGAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 + chr2R 11524500 5' + I-element 57 1 78.22 GAAATGCTTTTCAAAAGCNATTTGGTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr2L 12800941 5' + hobo 12 1 65.31 ACTGCGTGTGAATTTGTGGCCCAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr3R 6761073 5' - blood 7363 2 56.44 AGCGGATACATTTTGTATCGTTTGACAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACAGATAAAGATGCCAGAACACAAAAAAAAAAAGGAAACAAAAAA:1 + chr3L 20935731 5' + Doc2-element 252 5 88.17 AGGTGGTTGGTTATTTTGAAAAGGGTTGGAGGTCTTGTTGTTTTTGTTGTTGTGTTTTGTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTAGA:1 - chr2L 8795230 5' - I-element 83 1 73.27 GTGGCATTGTTTTCCAGTTCGGCCGCTGATTTTTCCAACCGGCTTTCGGCTGGCTAATTGCCTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:2 + chrX 7970934 5' + P-element 13 1 66.34 ATGGCTCCAGATATAATCATACTTACGGCAATATCCGCCGCAACTTGGTGGTATAATCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTA:1 - chr2L 15152073 5' - jockey 4671 1 56.44 ACGAGAAGAGAAGAGGAGTCTCAAGTGCAAGTGTACTCAAAGTCTACCTTATGTTTGCTCCCCGGAGCAGCCAGCAAGGAAGCCCTTCACCTCTAGAGGAT:1 + chrX 3026769 5' + Gypsy6A_LTR 349 1 59.41 GCTTCTTCTTAGGCACTGAGAAAAAATTGTACTGATTTATATAAAAAGAAACCAAAGAAAAGGGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr2L 7161281 5' - pogo 2091 1 61.39 AGGCCCGCCGGCCAAATGAGTTAAGCCAACAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCG:1 - chr3R 21457197 5' + Stalker4 7128 6 71.29 GACGAGGATTCGGTTTCCTCCAGCGATTTCCATTCGAAGTCGAACGTGGGCAGCGACGAGCCCTTCTGGCAGAATTAGAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 16213116 5' - hopper 146 110 76.24 GATATATGAATATTGTGCACACACGCACGTAGCTGCGATGTGATGTGTTGCTAAAGGTGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTGCTGTGCTGGTAGCTGAAG:1 + chr3L 10986574 5' - Doc3-element 480 1 55.45 TTTGCTCTCTTTGTGTCTGTGATTTTCCCCTTAGGCTAAGGCGTGTCATTAATTTATGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2L 1858398 5' + pogo 19 1 60.40 GCTTATGCATCAATAATAACCCTGAAACGGTAGAGAAAATCTCTTAATGAACCATTATTAATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2R 13248811 5' + 297 6587 2 74.26 AACCATCTATTTAATGAAANCAAATTTTGTTAGAAACAAGAATTGTATAAATTATCATTTTAGTAAATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 + chr3R 12101033 5' - Burdock 6360 2 59.41 CAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGA:1 + chr2R 6482668 5' - gtwin 443 2 57.43 CTGGGCGAGAGCTTCTATATCGGCAGTGCAAATAACAACTTAACTTGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAG:1 + chr2R 22859378 5' + Porto1 4229 1 66.34 AGTCCCATCGCGAACGTTAGTTAGACGTACTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr2L 9724273 5' + 1360 25 1 53.54 TACACAGCCATTTCAACTGGAAGGCTACTGCTACTGGGATTGCGGTCTATACATGGCGAGTGCCCATGGGCTATGCAAATTATATAAATTCCAATAGGTCC:1 - chr2R 1922526 5' - gypsy 459 2 76.24 TACGCAGCGTTGGCCAAGCTCAAGAGCAAGCAGGGCAAAAGCGGCGATGCGCTCTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:2 + chr3R 7310690 5' + jockey 69 1 63.37 GAATATCGTGATCGAATTTTGGCACACATCGATTGTTTCGAGCGAACAGCGACTTGTGTTCCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr2L 5981046 5' + P-element 15 1 64.36 TTATCACCCCATAAATAGANGAAGCCCTTCTAGTAACATCCTCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 + chr3R 3005961 5' + Ivk 35 1 56.44 GGAGTACCTTAGGATAGATACCCTTCAACATAAACCGACATGATAAATGCTCGAATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTATACGATCCT:1 + chr2R 9853583 5' + Idefix 6936 2 55.45 TGAATCACTATTATTAAAGTTATTCTTCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 - chr2L 16866496 5' + Transpac 4944 2 55.45 TATACTTTACCAGTCTTTAGTCTTTTGATTTTGCGCTTGTACTTACATTTCGTTAGGTATTCTAAATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr2R 9369803 5' - pogo 2096 1 74.26 TTTTGTATTTCAAGCGAATAGTTATGGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 3985159 5' - roo 9050 2 65.35 GTGGTGGATTGTCCGACCATGCGTCGATATTAAATTTAAATTGGCGCTCGGATATTTTAGAGCGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTT:1 - chrX 19790586 5' - I-element 145 1 68.32 ACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 + chr3R 178123 5' + BS 11 1 56.52 GGCAGGTGTTTTAACCCCTCTATAACCCCGTGATGAAAACTTTGCCAACGGCAAATAGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 26498506 5' - roo 9054 2 58.42 TTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATTTGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAA:1 - chr2R 12185404 5' + accord 30 2 56.44 GAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGACGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGT:1 + chrY 425015 5' - McClintock 426 2 79.21 TAATGAGCAAACAAAACAANCAGCAGACAGAAAGTCTTTTCAGCAAGCTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2R 7635422 5' + jockey 35 1 52.48 CCATCGTGGCTGGGAGATCCGGAAAGGCTTGCGGTAAAGTTAAAATCCCCAAGGATCTGTTCTTCCCTTTCTGAAAACCATCAGTGGGGCACCGTGGTACG:1 + chr3L 24750094 5' + F-element 4352 1 74.26 GAATATTTACTGAACCGCAAAATGTACTATACCCAAACAAGTGAAGCCCCACCGCCCGTTGCATATATATACGCTGCTCTTCT:1 - chr2L 5626010 5' + blood 193 2 74.70 GATTGAGTGCATTCTTTTGCCATGCGTTGGTCGTCGCTCTAAAGTAGGTAACACATCTCGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAAATCAAGAAAGAGCGC:1 - chrX 15182156 5' + F-element 351 1 61.39 GAAGGTGGTTCCAGTGGGTGGTTGGGTGGCTGGGGTGTTTTGTGGGTGGTTCGTTGGGGTCGCGATTTATTGATGACCAGATCGACTCGGCTATTAATCCT:1 - chr3L 10856534 5' - INE-1 96 1 76.24 ATTTCATATTCAAAACTAATTAGTTAATTTGAAATCCTACCTTTGTTACTGTTTATGCTATACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTATAC:1 + chr2L 17871398 5' + Tc3 317 1 63.37 TAAACATATAACTCAACAGAATCTATATATAGCCCAACTTAACTTTAATAAATAAAGTTGGGGGAGGGCTTGAGCTTTTCCGTAGAAACGTACGAGAAATA:1 - chr3R 3187416 5' - Doc4-element 73 1 59.41 GGGTGGTGTTGGGTAGGATNTCACCTGGATGGCTTACAAACACACACAGATACACATACCCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAC:1 - chr3L 18738295 5' + Quasimodo 9 2 70.30 GCAGCCCAAAAGGTGTTGAGTGAACTGCTGGTGGGTGGATGGAGGAGCCCTCATGGACTACAATGAAGGAAGGGAGTGCGACTTGGCCTCACATTCTGCTC:1 + chr2R 20064141 5' + Rt1b 4953 1 68.32 CTAACATAAAGCCCGCTTACTTACAAATCACGTTCACTACGTCACGCACAAACACAAACCATGTCTGCCAATAAGTTTGCAAAAAAAAAAACAAGGAAAAA:1 + chr3R 20378653 5' + Doc2-element 228 1 71.29 ACGGAGTCAGGACGACTGACCCCACTCACTGGGATATATGCCATATACGAGTATGCCCAGCGCCAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAG:1 - 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P-element 177 1 52.48 ATGGGAAATTAACCGGAAANGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGG:1 - chrX 983391 5' + Juan 3813 1 68.32 ATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 19450158 5' + roo 8691 2 77.23 AATCAGTATGCCCCTGGAAAATCTCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGA:1 + chr3R 27447089 5' + hobo 2694 1 73.03 GTAATTAAAACCATTTACATATATATGTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr3R 19955237 5' - hobo 2891 1 75.25 CACCTGGATTTTTTGCTCTGTCTCCTCCACAGCCTCGATAACCGTCTACCGTCTGAAAGCCAAAGGTCAACAACCGTCTAAGACCATTGAATCCGGGGACG:1 + chr2R 3925276 5' + gypsy10 5599 1 53.47 GGAAACTTTCTGAACTTTTGATAAAAGCTTTATGCTGAAATTATTCCACTGCATTGTGAAATTCAATTATGCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACA:1 + chr3L 23514860 5' - 1360 3154 1 75.25 ATGTATATAGTGACATATCCAAAGGCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATTGATTTCAATAAACAAATTATTGTATAAGAATCTAAGAGCACTTGT:1 + chr3L 24421612 5' + Idefix 7131 2 70.30 AAGGCCAACACTAGTTATGACTTATTCATGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - 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roo 9039 1 56.44 ATGTAAAATACTGCAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 + chr3L 14878648 5' + Juan 38 1 63.37 CATGATAATGCATTTGACAGTTGCAGTAGTTCCTCCATTTTTTCCACCATTTTTTCACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr2L 16566264 5' + 297 6591 2 68.32 ACGGCTTTTTGCCACCTCAGAAAATGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGG:1 + chr3R 27088454 5' + X-element 4287 1 76.00 GATGAGAAGTGTGACAGTTTTTGAGAGCATAAAGAGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1 + chr2R 20520169 5' + Max-element 1 2 76.24 TTTTGGCTTACTGTCAATGGAATGGGGCCAACTTCCTTAGGGAGAGAATCATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 1930433 5' - roo 9044 1 52.48 CGAAATTGAAAACATAATCAACCCCAATTACTGGAACAAAGTCTGCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGC:1 + chrX 9746995 5' + Doc 432 1 55.00 GCACCTGGCCAGGTAGGTGTAGGTATCCATCCAGTTTCTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chrX 18322571 5' + jockey 4713 1 61.39 TACAAAATGGATTCATATTTTTATATAAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGAGCGCAAATTGTTCAC:1 + chrX 23431556 5' + G6 41 1 64.77 CTATCAGTACGCCTAAACTCACTACTTTGGCAACCTGCGGTTGGCGAAGTATACATGTATATCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 20192397 5' + roo 8678 2 43.56 TATCGGGCTGTCGGGGGCCGAGGCCTACCCAGTTCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAATTCCCCAGAGTTCCATTCCATACGTCCATATTGGT:1 + chr3L 630895 5' - Porto1 4262 1 62.38 AATAAGGAATTACACATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAATTTAATAGTTTAGTTCT:1 - chr2R 1422512 5' - Porto1 4548 1 55.45 TACAATATATATAAACAAGGTTCTGAACCATATTTTAGTTTTTCTAGTTCAAGTTTATTTAACCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chrX 14564632 5' + Doc 24 1 54.46 CAGAATTCCGAAATGGGTTTCATTATTTTTTGTAAATTGCTTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr3L 15776980 5' + I-element 7 1 69.31 CATATATATATTTTTATAAACCTTTCTCAAACAGTGGCGTATATAAGCACTTCAGCTTCGATGCCTGGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 + chr3L 13059661 5' + transib2 6 1 73.27 TCGAAGACTACTTAATGCCACGCCCACACCGCTTTTAACCGCCCACAGCTCCGTCAACTGGCGATGGCATGTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTG:1 + chr3R 27785771 5' + gypsy12 2 2 73.40 TTATAATTATATTCGTTACTCGTAGAGTATGGCCCATCGGCTCATTAGCGGATTCAGGATCCTATCTGTATGTCCGTATCGAGTTCTCAGGAACTATAAAA:1 + chr3R 1859828 5' + INE-1 147 1 72.28 AAGTTTTCATTAAATCTAGTTTATGATATTAGATGTATATAATTATAACTTAGCAATATTCAAGTACTCAAGATCCTATAAATTTCAACAATTACTTTAT:1 + chr2L 6122432 5' + 1360 375 1 76.00 ATAATAATCGAGCGACTCTGGCAGGAAAATATGAGGACCGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr2R 21454315 5' + hobo 35 1 57.43 ACGGAGACGGCGAGCAGCGTCACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 16580382 5' + pogo 51 1 77.23 ATATGTTTTTAAATTCCATATATTCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3R 30284204 5' + blood 7035 2 54.46 ACGAGGAAACGTGGCCAGAATTGTGTGTGGCTCGAAGGGATGTGGATGAGGATGTGCATATGGAGTGGGTAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 - 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chr3L 20032311 5' - Tabor 448 2 58.42 GCCTGCAGGCCGCGTTCTCAGGGCCGCCTGCGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:1 + chr2R 5813587 5' + HMS-Beagle 6838 2 67.33 GTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCT:1 - chr3R 934249 5' - Rt1b 4750 1 46.53 CTTTCTGCTATTTGTATTCACACGAGAGCGTTTCTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 4555437 5' - roo 9030 1 69.31 TGACAGTTTTTGAGAGCATAAAGAGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 + chr2R 20520180 5' + Max-element 12 2 65.35 TTTGGGTAACGTGACATTTNTCGTGGCTCACTTAAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 24612234 5' + roo 40 2 67.33 TGAATGTGTATCTTTTTTAAACCATTTTCCAACGTAGAAGATTTATTTTCTGCACTTTTTCATTTTATTTCCCAATATCTATCGATATCTCAGAAAAATG:1 - chr2R 1438272 5' + INE-1 502 1 64.00 CCCACGTTGCTTTACACTTNGGCACTTGTTCGTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTT:1 + chr2L 16071097 5' - 412 7524 2 55.00 ATCATCTATCTATCGTCTATTAGCTTTCTTTGGCCACGAATTTGAATTTTGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTT:1 + chr3L 28093918 5' - Stalker4 477 1 76.24 AAAATAAATGCTTATTACCCACAAGACGGCAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTCACAAAATCAC:1 + chr2L 3240499 5' + I-element 197 1 69.31 ATCCGGGAATATACATACTACCAAACTTTGAAAATGTATCTCCTACGCTTGCTAAGAAAAGAAGATCTTCAGGAGGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTC:1 + chrX 18584943 5' + Juan 2 1 75.76 CGAAATTTCACAAACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACA:1 + chrX 22426154 5' - 1731 301 1 67.33 TAATTTACGCACTCATGCTGGCTCTGCTCGGCCATTTTGTCTATTATTAGGGAGTGTGCTAGGCAGAGATTGAATTTTTTTATTTTTTCTTTTTTTTTTAA:1 - chr2L 16084944 5' + hopper 151 7 67.33 CCAATCACTTAGCCTCTTGNAGCTTCCTTCTTAAAGACAGCTTTTTAAGTAAAATGCAAATTTGCCTGGCACACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAA:1 - chr2L 18240476 5' + hopper 1391 1 73.27 AATTTAATGACTTGTTGACCCAATAAAAAGATTTATTACATTTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 + chr2R 19430471 5' + 3S18 5801 2 67.33 AGCATTTCACAATTTCTACCGACACACACAATTAATTAATAAAACTTCAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chrX 13029491 5' + I-element 35 1 52.48 GCCAATGTACAAACTTATTTCCATTTGCTAGATGGCCCCAAGAGGCGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAG:1 + chr3L 22051164 5' + Stalker3T 296 1 54.46 GAAACTCCCCAAGCTGAAAAGCCGCCCGAGGAGCTGCTGTGTATGGATGCGTTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGA:1 + chr2R 22695253 5' + opus 7266 2 57.43 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATACACCAACCCTCCCTCTAAACCACCATGCTTACACAAGTAGGAGAAATCGAACCGGGAAGCTT:1 + chr2R 1982172 5' + ZAM 8027 2 57.45 TTTTGCACATCCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 + chr3R 29374955 5' + mdg3 39 2 63.37 AGTATAAAATTTGTAGCATACTTTATGGGGCAACATATTATCCCCGTCTCGTGTGCGTGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr3R 24442519 5' + jockey 4686 1 61.39 AAATTGGAGAAAAGACCATTTGCATCTTTCTCTCCGGTTTGCAAGTGTGTAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3L 21118643 5' + 412 18 2 61.39 CATTCCATTTAATTTATTTGTGTTGCAGCCAGCCAAACTATTTTTATAAGTTTAGAATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr3R 17036521 5' - Transpac 296 2 60.40 CGAAGCAAGACAAAGATCAAAGCGAACACGAATAATTTCAGTGAGCGTCTTTATTTTAAAACTGTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATG:1 - chr3R 9629080 5' - 17.6 326 2 76.24 AATTAAAATCGCATGTATTAGTCTACCTCGACGATTTGCTGGTTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATAGGTGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTAT:1 + chrX 18697499 5' - 1360 163 1 58.42 ACTCTAATCAAAGCGAACTTGAGCAAATACTTTCAAGGTGTAAACGTGGAAAAAAAGGTGGTTCTTCAAATCGACAAACCTGGCATTCAAACCATTAATG:1 + chr2R 10153746 5' + HMS-Beagle 6673 1 55.00 GTTGCATGTGACGGGTTTCTAATTGCAAATAATTACATAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr2R 20690573 5' + mdg3 5292 2 60.40 ACACCCAAACAAACAAACAGCGAAAGTGTTCACCCGACAGATAAGATAGTAGGTGTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr2L 15331831 5' - 1360 3368 1 59.41 GTAACGCAGTAGTTGACCCACATTCGCCATCTCGTTCTGCCACTTTATCCCTCTCGCTTTTCCGCAGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr3R 9094834 5' - hopper 1408 2 72.28 GGCGAATGGAATGGAAAGAGGAAGTGTGGATGTGAAACGAGGATAACAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACCAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTA:1 + chrX 12735914 5' + flea 200 2 52.48 AAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 - chr3L 19274870 5' - transib2 2788 1 62.38 GAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAA:1 - chr2R 6482731 5' + gtwin 6955 2 65.35 GGGTTTTTTTTTTCAAAAGGGGCTCCTCGCAGGCAAAGTGGGGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 - chr2R 14563606 5' + Stalker2 7284 2 61.39 CATGACGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACCGGGGCAGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3R 4191163 5' - 1360 3357 1 58.95 CCCGAAATAACCACAATTTTAAGCGGAATGTCAACCGAATTTAACATTTAACAAGGTTCGATTTGATTTCACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATC:1 + chr2L 11332783 5' + Doc 4423 1 74.26 TAGGTGTGCTTTGTAGCTCTGGCCTTTGTGGGTAAGTTTATTATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGA:1 + chr2R 356100 5' - HeT-A 6025 1 60.40 TGATTGTTTTTTGTACTTAAAGCCCTTTATGGTAACTACAATTTTGAGATACATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGCT:1 - chr2R 13467053 5' - hobo 2917 1 51.49 GGACACACACCATCCTGATTGTTGTCCTCTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chrX 6388315 5' + hobo 49 1 70.30 ACTCGTTAAGCCTAATTGTGGCCAGAAACTGAGTCGCGAGTCGTTAAACAAACAGTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGCTCTAGACGTTCATACG:1 - chr3L 16841564 5' - INE-1 136 1 56.44 CCAAAAGCCGCTTTAATCAATATAATAAAAGACATTTGTTCACTTACCAAGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATT:1 + chr2R 15032427 5' - F-element 4315 2 61.39 AAATAGGGTGACATTTTTGTCAGCGGTAAAGTTTCCGAAATTTTCAGCAGCCATGGCAACAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGTGT:1 + chr3L 24349303 5' - pogo 250 1 59.41 GTCAGCGACATCAGTTCCATCGGCAACATCTTCCATCCAAGGTCTCAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTC:1 + chrX 12959255 5' - micropia 5300 1 54.46 ATCCGAAATGTGCCGGAATCAGTCAGACGTAGCTTAAGAGCTTCATTCCCCCCAATACACACACACACACACACACACACACAACCACACACACACACAC:1 - chr2L 12765731 5' + gypsy3 418 1 63.00 AAATCAATCAGCAACATAANGGGCTTAAGTAAATATTTATGCTTTTTGACCATGACATGATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chrX 915522 5' + flea 4768 2 70.30 TGTGTGCTGTGGAAAATCCAAAGCATTTGCCATAATTATCTCGCTCTTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCT:1 - chrX 18729246 5' - blood 494 1 53.47 GTGTGACAGTTTTTGAGAGCATAAAGAGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 + chr2R 20520177 5' + Max-element 9 2 68.32 GGGGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTAAAAAAAA:1 - chrX 10637542 5' - transib2 2633 1 74.19 AGAGTTTTGAGTTTCATTTCAAAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCAT:1 - chr2R 17402811 5' - invader4 320 2 74.26 CCAAATGAGCCAGACTCCAAAACCGGTGTCCATGAAAACAAATGGGAATTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACT:1 - chr3L 10472385 5' + R1A1-element 227 1 57.43 TAGATGGGATTCGTGTCGTGGGTGTGCGTCACTCCCGGTATGGGGTAGCCCTCCCAGTCCAAGTAGCACGCCTCGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAG:1 - chrX 18873178 5' - G5 4600 1 78.22 AAACAATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTC:2 - chr3R 1960326 5' - gypsy9 5233 2 89.11 ATTGGCAATTTCCGCGACTATCAGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACTTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCGGCT:1 - chr3L 21223985 5' + Chouto 200 1 75.25 ATTAGCTAAGCTAGGTCCTTTGTACATAGTTGCAACAAGCTGAATAGTAAGCTTTCACATTTTAATTTTATTTGTTTAAAAAATAATATATAAGTCATTTT:1 + chr2L 15132430 5' + blood 6918 1 54.46 TCATAAATTACGCATACGCAGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCA:1 + chr3R 26763937 5' - micropia 280 2 80.20 GTGTGTGTGTCTGTCGGTGTGTAGGCGTGCTTGTTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAG:1 - chr2L 1350911 5' - Porto1 247 1 67.33 TTACTTCGCCATTTTGGGTATTGATGTTATATTAGCACACAGTTTGCTGCACTTACTGTTACTTTTGGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2L 7714607 5' + roo 8 2 71.29 AAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr2L 19907949 5' + Tirant 6 2 57.41 GCCTAAGTTTGATGTAAGTTTTTTCTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACAAACACTACCGAATTCCCAATTC:1 - chr3R 3522344 5' + I-element 4978 1 69.31 ATAACCTACTACTACTGGACACTATGTAAACAAAGCTAAGGCCTAAGCAGAATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3L 20361769 5' + pogo 26 1 50.00 GTACCATGCGTTCCTTATTTTCGAGTGGCACTGTATCCACCAACCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAA:1 + chr3L 10161506 5' + Doc 4576 1 57.43 GTGAAGGAATCAAAGAGCGNAAACTGCAACTCAAGCGAATCCTATGACCAATTTGCAAGCCAGAAAGATGTAGGGAAGAAAAAGGACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6681168 5' + Doc2-element 221 1 77.55 GGAGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGACAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAG:1 - chr2R 2994309 5' + gypsy8 114 2 46.00 GCCATAGAGTTTTGTATTCAGATAAAAATGAGAAAGACAAGCAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr3L 26567352 5' + opus 7144 4 57.43 GAAAAGTTTTATACATTTTTATTTTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2R 20145087 5' + opus 162 4 81.19 GCTCTCATTTAGACATCGGGCTATTTGGATTGAGTCACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3R 28447349 5' + blood 3 2 75.25 TGAAAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 11832544 5' - roo 9026 1 67.33 AAGTAGCAAGTTACATTTTTTGGAAACTTTTGAGGTTGAACCATAAAGTCAAACTTAATTATATTTCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chrX 6496731 5' + I-element 9 1 61.62 CGACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGT:1 - chr2R 3341943 5' - Copia1_DM 4131 1 62.38 CCAAGCGGGCGATCTCGGTGGTATATTCACATAATCAACGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCA:1 - chr3L 23267881 5' + invader2 4976 2 65.35 CTCAGCGAAAATTCCGCAACTAAACTGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTA:1 - chr3R 22523964 5' + opus 387 2 74.26 ATTCATGCATCTCACACTCCACTTGAGATTGCGTGTGTGTCTCTGGGTAAGGATTCTGTTTGTTTTATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr3R 26350919 5' + hobo 4 1 75.25 TGAGACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2R 5651923 5' + Tirant 8117 2 71.29 ATAGAGCCGCCTCAACACACCCTGTCTACTCTTTTGACCGGCATGCTCAGG:1 - chr3L 26022160 5' - Circe 7380 1 92.16 CGAGTACCAGTTCCTCCTGGGCGCCCTCCGCGACTTCTGCAGACCGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTC:1 - chr3L 11121247 5' + Doc2-element 423 1 73.96 TAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr2L 13622018 5' - opus 7461 2 75.25 TTAATAGAAAGAAAATTTTTGAAAAAAGCACATCGACATTCGATATCATTTCATTAGAAAAGTCATGAAAGAGGGTCACGTTGTGTTAGAGTACACTTCTA:1 + chr3L 25299227 5' + 1731 4174 1 75.25 AATGACTTGTTGACCCAATAAAAAGATTTATTACATTTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 + chr2R 19430476 5' + 3S18 5806 2 72.28 ATTAAATGAAACGCAATAAATATGAATAATAATCGAGCGACTCTGGCAGGAAAATATGAGGACCGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr2R 21454290 5' + hobo 10 1 68.32 CTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGCCTAAAGCCTCGCT:1 - chr2L 20992960 5' + I-element 36 1 54.46 AACAAAATTTAAAAGTTGTGATATCTTTGAATATCTATATCATATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chrX 15290234 5' - pogo 2073 1 60.40 CGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 12485450 5' - roo 360 2 82.18 CCAAAAGCAATATAAGAGCACCCTCACAAGTATAAATAAGATTAAAACCGCAGCAACCACAATATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACC:1 - chr2R 9320470 5' + I-element 4984 1 65.35 TGTACATTTGTTGATTTCAAGATTGCGGTGGGGCTGCCTCTCTTCTACTCTCTTTCTGGCTCTCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAG:1 - chrX 8091069 5' - invader1 3954 2 72.09 AGAATTATATAAATTATTTTCTTTTCCCAATCCCATTGTTTAGATTGCATAATATTAATTGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chrX 10823938 5' + jockey 4776 1 59.41 GTCGTACATTAAATAAATTGGTAATTGTATGCAGATTTAGACGAGTTCAATAGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr2L 5304698 5' - 412 469 2 54.46 AATTTGAATAAATCAAGGGAGGGGAGCGTGAAAAATTAATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCT:1 + chr3L 12088208 5' - F-element 4327 1 62.38 GGAAAAAAAAAACAACAAGGAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGT:1 - chr3L 16667868 5' + Doc 124 1 78.22 CAAAAATTAAAAAAAAAATGAGAGAAGAAATCGGGGGAAAAGAACACGATGATGACGATGTGGGGACATGTAATGTATTTTTTTAATTTTTTTAATTAAAT:1 + chr3L 18191058 5' - HB 317 1 65.35 ATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:2 - chr3R 2689421 5' - diver2 4466 1 56.44 GAAACTTTCCATGGAGTTTGTCAGTTCTTTCTGACGCAACCACACATACAACTCCGTCTTTAAACCTATCTGGACCTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACG:1 - chr2L 15576942 5' + Doc 4298 1 55.45 TTTTGGGGTAGGCAATAAATTGGAACAGTGATAATAAGCCCATTGATATGTTTACAAAACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chrX 17175260 5' + I-element 18 1 60.40 TCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGG:1 - chr2R 14849005 5' + flea 4726 1 60.40 TTCTTTCATTATCAATATANTTTCAGATTGACACACCGAAACAGACAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 4203491 5' - hopper 149 109 83.10 ATATGATTGTTTTTTGTACTTAAAGCCCTTTATGGTAACTACAATTTTGAGATACATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2R 13467056 5' - hobo 2920 1 54.46 CTCGGAATCCAGCCCTAGGAACTCCCTGCCCCCCTTTCACCCAATCGTTTACGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCT:1 + chr2L 15991627 5' - Bica 478 1 60.40 GTTTCATAAAAAATAATTATATGCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chr3L 2016857 5' + Tabor 6857 2 60.40 CATTATTTGCACAGCACTTGTACAAAACTAGAGACGAACGCTTTGGCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAA:1 - chr3L 13589630 5' - hopper 1386 1 52.48 GTCTTTCGCTCTTTCGCCGATTCGTATTTGTGTGTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2R 19616194 5' - hobo 2902 1 67.01 CAGGGTATTACAAATTCGANAGGAATTTTGCTTATGTTTTGCTTTGTTAACCGTTTGGGGTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAG:1 - chr3R 11861556 5' - F-element 481 1 59.41 AAAAAAAAAATGGTTAAATAAAAAATTTAAAATAAATAAAAACCAAAAA:1 - chr3R 27221432 5' + transib2 95 1 67.35 CAATGGCAATGCCGCCGACGATGGTAAGCTATACGTAGACCAAGCAAAAAACTCGACCAGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTC:1 + chr3R 6444288 5' - R1A1-element 5058 1 62.38 TATAGGAACTTATCGCCTTCTCCACCTTAAACCCAGAGATAAGGTATACCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAA:1 + chr3R 8261298 5' - S-element 359 1 52.48 TAGGAGACCATAATATAGAAACCCCAATCGTGTCCGATTTGAGCACTGATCAATGCCCACATGGGTATGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAA:1 + chr2L 13596117 5' - pogo 1804 1 74.00 ATTACAATGCTGTGTTTGCATGTCTGAAATGTCACCTGGCACACGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTC:1 - chr3R 29410833 5' - hobo 5 1 60.40 CACTACGAACATCCTGCACNCTGCATGCAATCGAGATACAAAAAAAAAAGATTAAAAAAAAGTTGGGGAAAAATAAAGCAGAAAACAGAAAA:1 + chr3L 12593076 5' - Juan 81 1 82.61 GCAGACAGAAAGTCTTTTCAGCAAGCTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 7635400 5' + jockey 58 1 74.26 TTATCTGATGGGTATCTCGCAGTCGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCCAGCTAACCGTAGAAC:1 + chrX 159003 5' + Cr1a 4005 1 74.26 CAGTGGAAATGGGGTCTTGGCTACGTGATGAAGATTTATTGCACTTATGTGATTGGTCAAGGATTCATGGAGTAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACT:1 - chr2L 10555473 5' + Tc1 1265 1 56.44 ACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCT:1 - chrX 983380 5' + Juan 3824 1 58.42 CTGCCGCTGCATTTCCTAACGGTCATAAGGTAGAAAATAAGTTCATTCGGACGTACAGAGGGACAAACAAATGGACCTAGCCAGATCGACTCGGCTAGTGA:1 - chr2R 558662 5' - INE-1 100 1 60.40 ATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 9439173 5' + roo 45 2 75.25 TGGCTAGAACTAAAAAATGAAAGGGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAACAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTA:1 + chr3R 20450531 5' + 297 463 1 71.43 AATTGCGTATTTGTAGCATNTGCTGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAGCTTGGCGCGCATTCTGCGC:1 - chrX 11434436 5' - Porto1 404 1 76.00 TTCTTGTTTTATTTTCATTATTTTCTTGCAGTGTTGTTTTTGGCCCGCGCTGGTTGTGTATTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCT:1 + chr2L 10747872 5' + hopper 207 1 73.27 CAATTGAAGCGCTGCGTGATATCTGAATGACTCAGCACGGAATAAACGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGT:1 + chrX 19607230 5' - Tirant 8478 2 54.46 TTGGACTCCAGTATCAGCACGGAATGCTTCGCATTTTTGGTCTTAAATAAGCTAACAGTGTGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATA:1 + chrX 19412662 5' - ZAM 246 2 64.36 ATTAAATTACTCTTTCTCCTGAAAAGATTGTTTGCATTGGCATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAG:1 - chr2L 21369924 5' - rover 316 2 59.41 TCAAATCTATTTTTAATCTCTTCGCAGAGTGCACTCCAAGTCGTTGTTTGTATTGTATTATTTGTGCGGGTATGCGCGCCACTTGCAACATGTATGTCCGG:1 + chrX 13347524 5' - TAHRE 9990 1 73.27 CACCCCATAAATAGAAGAAGCCCTTCTAGTAACATCCTCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:1 + chr3R 3005965 5' + Ivk 39 1 59.41 AGAATGGCTCCATGTGGCCCTTTAACATCAAGATGCTAGCGTTGAAAGGAGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chrX 14132047 5' - roo 404 1 69.31 CCCATGTGGTTGGAGAAGGCGGCCAATTGGAGGCAACCGACCCAGCATTATTCATAATTTTGATTGACAGCCGACGAGTATCCTGTGGTCTCCGCTACACT:1 - chr3R 13700488 5' - Osvaldo 1063 1 73.27 TCACAGAACTAATTGATTACTAAAAATAGAGGTGGGAAACTACAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3R 29238605 5' - 412 7512 2 59.41 CCCAGACCCATTAAGTGCATGTGAAATTCACACGAAATATAGAAAAAAAAATCAATACAATGCAGTAACAGCAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATG:1 + chr3R 24521577 5' - BS 5032 1 50.50 CACCATTTCATTACACAACACACACAATTAATTAATAAAACTTCAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chrX 354922 5' + I-element 39 1 56.44 CTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - 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HMS-Beagle 218 2 61.39 CCTTTTTCTCCACACTCAATTGCAGCCTTGAGCCAAAATGTAGCAATTTGTTGTGCTTACTTCCACAAATACGACAGCGATCGGCATTACAATGTCGTAGG:1 + chr2L 18618804 5' - G3 187 1 76.24 ACTGGAAGATACTGTTCAACCGGCAGAAGAGCCAGCGCCAAAACGCGGCTTTAGGGCAGACCAATGCCAATAAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTA:1 - chr3R 19247561 5' + gypsy3 296 2 75.25 ACTCAGAGCAAGCCAAACCCAAGCCCAAGCATAAACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATGTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGC:1 + chr3L 3979179 5' + accord 317 2 67.33 TTTACCTATTTGGTGTGTGATGTTAAAAATTTATTAAATGTACTATTATAGTCTAAGATAAAACTTTTAGCTTTTATAGGTCCTGAGATCTCGACGTTCAT:1 + chr2R 1342902 5' - INE-1 139 1 69.31 AGGTGCTCTCTGTCCACTTNTCCCCATTTTGCTGACCAACAGCCGCCGAGTCAATTGCGAAAACTCACAGATTTTACTTACTGTTTGCATAAGAGTGCCGC:1 - chr2R 19533720 5' + frogger 2279 1 64.36 TTAGTTATTAAAATGTAGGTATGCAAAGATAATAACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chrX 15286487 5' - hobo 2899 1 63.37 AGCTTCTGCTTTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGATGTAGTGTATCTACCCTTAATATGCAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAG:1 - chr3L 23398239 5' + Stalker3T 29 2 48.00 TAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - 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chr3R 28449132 5' + accord 183 2 42.00 CCTCCCCCCCCCCAGTTCGAAGGGACGGCCATAGCGAAGG:1 - chrX 4882217 5' - Tirant 8072 1 87.50 AATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr3L 27357552 5' - mdg1 7427 2 52.48 AATCGCAGGATTCCACTGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3L 25345157 5' + Doc 40 1 57.43 ATTTATTTCGAATTTCTAAGATATTTGTAAACAAGGATACTTCATAATTGTGGAAATTTTCTCGGGATCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAATATAAC:1 + chr3L 6098811 5' - TLD2_LTR 190 1 66.34 ATTACCAAAAGCAGAATACATTACAAGTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 - chr3L 25059175 5' - mdg1 420 2 79.21 AGTTAAACGTTAGGCATAATCTATAGTCTACAGGTACATACATATCTATAGTCAGATTCAATTAAAACCTTTATTGCAACTCCTTTTTTCAAAAGTTGTCG:1 + chrX 19689505 5' - Tc1 280 1 66.34 GGGAGGCGTACTTCACATACCCACCGCCCTGCATCTGCTTCACAGAAATCACAGTCAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAA:1 - chrX 17085900 5' + F-element 4678 1 57.89 ACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGAT:1 + chr2L 23286583 5' + Tirant 415 1 58.42 TGCAGCGTACCGATGATGAAAGGGCATACGGACCTTGTGTTTGGCTAAGCGTTGGGCCGCTGAGCTTACGAGCTTACGATTTTTTTTTTTAATCAAATTAT:1 - chr2R 5065389 5' - jockey2 3406 1 72.28 AATCGAGCGACTCTGGCAGGAAAATATGAGGACCGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2R 21454320 5' + hobo 40 1 62.38 TCGACGCGCCTTCAAACTGATTAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3L 1227341 5' + 412 7106 2 75.25 TAAGAAATGTGCAAATATCAGCAAATTCCCATGATCGGAGCACACAAGCAATGCATAAAAATCGGTCACCCACGCAACGCATAAAGCGTAAATGACGATTA:1 + chr3R 2474599 5' - S2 294 1 55.45 AGGAGTAATGGCCGTAATAATAACAGTATTTGGGTTGGTATACGGGGCTGTTCTCCTGAAGATCTTTAATTTAATTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATC:1 - chrX 18585048 5' - Juan 4207 1 61.39 GCCTGTAAGATATTAGACATATTTAAACTACAATGGAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1 - chr3L 20032302 5' - Tabor 7278 2 62.38 TTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chr3L 25059127 5' - mdg1 373 2 74.00 TCTAATCCAATTTCTAATGCCTCAACAATTGAAACCGGAGTCCTTACACGCCCATTCATATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAAT:1 + chr3L 7461839 5' + hobo 443 1 66.34 TTGAAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 11814487 5' + blood 7046 2 58.42 TCACCTACTCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - 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Quasimodo 7357 2 70.30 GATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACA:1 + chr2R 19352214 5' + 17.6 47 1 75.25 TTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAGGAG:2 + chrX 21939638 5' - gypsy5 6900 1 69.31 GAGGAGTTTCATGATCCGCACAGGTAGTTGGTCCTTCAGTAAACAACATACCGACCCACACACGCACACACCGCAACAAACACACACACACACACACACT:1 - chrX 10432470 5' + accord 7030 2 72.00 GAATGGGGGAATATTGTGCAGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTCTTTACCACTCGGCTCACACCCTACA:1 + chr2R 20973045 5' + hobo 29 1 68.49 CTATTACAAGGCCAAAGAAATTGGTTAATAGATTTTCTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr2L 12764968 5' + Doc 34 1 69.31 TTTGTTATTTGCATTGGCTTATCCGTTGAATTGGCCACTAAAATTATGTACTGAAATTATATCCAAATTGTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGT:1 - chrX 22472640 5' + invader1 3609 1 64.36 TATCGGTTAATGAGCAAACAAAACAAACAGCAGACAGAAAGTCTTTTCAGCAAGCTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr2R 7635429 5' + jockey 28 1 59.41 GGGAGAGAGAGTGAGAGAGAAAAGTGCAGCTTATGTGCAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCT:1 + chr3R 11335704 5' - 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blood 7374 2 63.37 TATCCGTGTGGATGCGTTGCGGCATCGCCTGGGCATCCATGGATTGTCAGTCTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr2R 22269203 5' + jockey 4694 1 53.47 AGACTGAGCGAGGAAAATGCCTTTAATGCTTTAAATAAGAAATTATTTCCCTGACTACTGACACCATTCTTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAA:1 + chr3L 5385264 5' - Bica 244 2 68.32 AACTGATATAAACTGATATTTTGGAGGTTATATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 5025664 5' + roo 45 2 73.27 GATTCTTCTGTTCCTCTCAAGATCCCCGAACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr3L 13059743 5' - transib2 2779 1 70.30 GGACCGTGCATTTTTGCGGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGGGGGG:1 + chrX 18414216 5' - G-element 335 1 80.43 AACGGTGTATCTGTGTTGCTGTGCATCTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2L 20269035 5' + hobo 46 1 72.28 GGGGTGGCCAGGTAAACCCTTTTATCGTTAAGATTTGCCTAAGACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCT:1 - chr2L 21199194 5' - 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chrX 20015307 5' - INE-1 157 1 70.10 AACTGAGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 + chr2R 9061925 5' + jockey 4702 1 60.40 CAACTGTTTCTGACGATGTCGCTAACTCCCATCGCACCAATTTGGTTTTCGGGCAAAACATGGAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACTGAGTTATA:1 - chr2R 5108160 5' - Doc3-element 4297 1 69.00 CTTTGATTAATATTTAATGTTTAGAATACTTAAAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - chr2L 4020760 5' - 412 7506 2 63.37 TGCTCGCACAGGCATCGACACACCGGAAAATCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATACCTTGCTT:1 + chr2L 19911721 5' + Idefix 7022 2 72.28 TGGTGGCCATGGAGGAGGTGGTGGCTACGGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCA:1 + chrX 19081999 5' - HMS-Beagle2 79 2 76.24 TTTGCAATGATTCCAAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3L 8749943 5' + Doc 14 1 68.00 CACACATGTGCGGTGCTTGGAGGAGACAGCACTTGAATGTGATTTAACAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTTGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCA:1 - chr3R 7025057 5' + transib2 2797 1 63.37 AGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATTCTTGTATTCAGGATCAATTGCCGAGTTGATTTGGCCCTGTCCGTCTGTCCATATGAACGTCGAGATCTC:1 + chr4 836649 5' + INE-1 134 1 82.18 CGATAGCAACAATAATACAGAACGAGCGCACAAGAAATCACCAGAGATTGCACAATATGAATCCGATCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTGAATATAAAAT:1 - chr2R 9191464 5' - gypsy6 168 2 70.30 AACTGAAAAATTTTATTTTTCAAACAGATTTTCAGTATTTGAAAATGTTTATATTATAACACTATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGA:1 + chrX 309532 5' + HB 1476 1 70.00 ATATTAAAAAGGCAAAATGTGGCTTTTATGACCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr3R 7599096 5' - mdg1 7415 2 69.31 TCACGCAAAGTAGGTGAAAGACTTAGCCGGTGGGGATGAGGCATTGCTTGATTTCTTAAAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAA:1 - chr3R 19290717 5' - 17.6 7104 2 67.33 GACATCATCGACATTTGAGCAGCGATTAAAGACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGAATGTATGAGTTTTTTTAGGTCATTTTCAAGCGGGATCTTTTCCC:1 + chr3R 18949139 5' - S-element 1338 1 67.33 ACAGAGAACGGGGTCAACAGTTCAGAACAGGGACTCAGAGAACCTGTAATCCGCGCGATTACGCCGGCCTAGAATACTTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTA:1 - chr3R 19756263 5' + gypsy2 350 1 63.37 ATGCGGTTTCCCCTTCCTTTTCTTCTAACGATTTTTCACTTTGCTTTGAAGTTGGTTTAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 - chr2L 9045699 5' + jockey 4714 1 58.59 AGCATTGCTCTTGGTGGCGTGGTAGTTTTCCACTCTGTAATCTGCAGCAGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTGATA:1 - chr3R 27081884 5' - Bica 4532 1 51.49 CGGCAAAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCG:1 - chr3L 10014052 5' + jockey 210 1 51.49 TCTTTCAGTGCACAAGATGATCATGTGGTCTGCATGTGGCAGAAGTGAAGGTGTGCTCCTGATTGCTCCCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr2L 10020750 5' + hobo 6 1 73.27 CGGCTTGGCTGTGGCTGTGGCGTGTCGTCAATTGAAGCGCTGCGTGATATCTGAATGACTCAGCACGGAATAAACGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chrX 19607202 5' - Tirant 399 1 77.23 GGGAAATGAAACACAGCGACAGCGCCGCTTTTCGGGGGTTGCTATTGGTGACGAGCGAGTGCGAACGAGATGAGGGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCT:1 + chr3L 10289464 5' + gypsy5 306 2 69.31 TTAAAATAAAAGGACTTTAGTTTCATTCGGTAGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr2L 2016763 5' + Doc 58 1 74.26 ATACAAGAACTAATAAAAATGTTATAACGAATTTAATTAAATGTTTTGTCATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - 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chr3R 3389446 5' + Rt1a 4785 1 57.30 AGTTGAAAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2L 11832541 5' - roo 9029 1 64.36 ATGACAATAACAAAAGCGATTGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2R 13585703 5' - blood 7335 1 78.22 AACGGAGACGGCGAGCAGCGTCACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2R 16580381 5' + pogo 50 1 76.24 TCCGTCACTCCATGTGCTGGCCTGCAGTTTCCCCAAGTCATTAGACCGCCATTAAAAAAGGTCGTCTGGATAAGCAAGATGTAATAAGTAATAAGTAATAG:1 - chr2L 16994903 5' - Stalker2 403 2 78.22 GTGAAAGAGTGAAATTCCGTAGCTCGAGGCATAAATCAATTTATTTGCTAAACACAATGGTGTATCCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGA:1 - chr3L 17064127 5' + Porto1 4490 1 66.34 GCGATTGGGCAGAAAAAAAAACAAGTAAAGAAGTAAAATAAAATGAAACGAAAAAAACAGATTTATTGTTGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAA:1 - chr3L 5945887 5' - 412 485 2 51.49 TTCAAAGGGTTTTGCATCGACATTGCTCTGTTTATATCCATACGTGGACTTATGTAAATATGTTCAATGAAAAGTTTTTTTGTAAAATGTAATGTGTAGAT:1 + chrX 22509749 5' + HB 105 1 78.22 GTTTTCAACATCTCCACTTGACGTTGCCTAACACTGCCTGCTCTCTCTCGGCTTCTTTGCCACTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 - chr2R 19424169 5' + P-element 13 1 64.36 AACGAGCCACACTCCACATGACACGGCAATAAAAGAAAGAGACGGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTT:1 + chrX 12824285 5' + blood 7383 2 56.44 CGACCCACCCGTCTGACTTATTTATTTTTCTATTGAATAACACAAACGCAGACATCGAGCGATCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAAAA:1 - chrX 7322125 5' + F-element 335 1 54.46 CTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGAT:1 - chr2R 14849008 5' + flea 4722 1 57.00 AGTCTCAACCCACAATTTCTTCGCACTGTACACCTGCAGCTTTTGCTTGACCTCTTCGCGTTCTTTATATTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 - chr3L 21570326 5' - mdg3 5412 2 72.28 AAAATTCAATAAAAAATCACTTAACATTCCATAAGAAGCTTTCAACGTTACACACACAGCCGTACAACCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr3L 22327261 5' + hopper 7 2 72.28 TTATCGCCTGGAAAAATTATCTCCCTGTGTGTTTGTGTATTTGGTAAGTGGGCGGTTGGCAGTTAATTTGTTGCCACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTA:1 - chr3L 3928572 5' + G2 2891 1 74.26 TGAAAGTTCCAAAACCAAATAAGTTTTTATTTCTTTGTCTCTAGAATTTGCATGCCGAATTTAAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCGTGTGATCTC:1 + chr2R 19548379 5' - INE-1 148 1 65.26 GTGCTAGGGGATCCCAATCATGGCGCTGCCATCGAGAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2L 16025701 5' + 412 39 2 63.37 ATACTTTATGGGGCAACATATTATCCCCGTCTCGTGTGCGTGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:2 - chr3R 24442502 5' + jockey 4703 1 66.34 CAGCATCCGCTGCCAATGGNTGTGTGTGGGTGCGAGCGAGATAGTCGTTAGCCCAGTTACGCCAGTGGGTTTAATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chrX 8896133 5' + 1360 4 2 74.26 GTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAAT:1 - chr3R 11547799 5' + G2 272 1 80.20 TGGGCGGTTTTAAAATTGTNTGCAAATCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr3L 23947898 5' - pogo 2055 1 75.25 TTGATAACATTAACACACAATTAGATCGATATACACATAGTGAGAGAACGAGAGGAAGATAGCAAAAAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCC:1 + chr2R 16087822 5' + Doc3-element 4500 1 77.23 ATGAGAAGTGTGACAGTTTTTGAGAGCATAAAGAGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAA:1 + chr2R 20520170 5' + Max-element 2 2 75.25 GGCTGGAATTATGCTTACTTTGGAATTCAATTAACTTGAATTTGTTGCAGTGACACGACGGTGAATTATGCATTATTCCGCTGCGAAGAGAGTCGCCGCTC:1 + chr2R 19867665 5' - Doc3-element 266 1 51.49 TTTGTGTATATAAAATTGTATTTTGATTTGTTATTTATTTATATGTATTGTGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAA:1 + chr3L 28057059 5' + Stalker3T 57 1 58.42 TTCAAATGACCTAAAGAATGAAAGCCCATTGGATAGAGCTAGTAAATTTTGGAATATCAATAACAATTTCCAAAAATTAAACAAGAGAGATTGCTATAGTC:1 + chr2R 5793202 5' - INE-1 580 1 68.32 CACTCAACACGTTGAACTTGTGCTGTCACCTGTGAAAGCAATGATGAACAGCAATCCACCCCCCCAACCCTAGCCCCGGTTTTTTTTTTTGTCATTTTCTT:1 - chr2R 19549335 5' - Doc2-element 220 1 61.39 ATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACA:1 - chrX 9816315 5' - BS 5052 1 61.39 AGACCGCCATTAAAAAAGGTCGTCTGGATAAGCAAGATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTA:2 - chr2L 16994861 5' - Stalker2 7642 2 41.58 AGTGACCACTTATCGAATAGATTTATCGATAAGCATATAATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chrX 10326398 5' + P-element 33 1 37.62 ACGAGGATTAGACAAAGTTNAATGCGAGTTCGTTACCGAGCTTCCTTATTTGGCCAGCCCAAACGTTGGACAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTT:1 - chr2R 18510063 5' + Circe 277 1 58.42 CTTTTTTTCGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATT:1 - chr3R 9121504 5' - roo 9038 1 61.39 GTTCTGATATTCCATTCCACCTGCGGCGCTTCAAAATCTTTACTTCCTGCACGTGTCAAATAAATTATTGAGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr2R 18111419 5' + hobo 1 1 76.24 ACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 9871062 5' + roo 24 2 77.23 TGCAGATACAGATAAAATATATGCTAAACATCCGTAGATATTTCCATAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGAC:1 + chr3R 13756096 5' + I-element 4932 1 55.45 GTTTCTTTGCCTCTTTGGCATCCGAACTGATCTTTTTTTGTTCGTTCTCTTTTTTCTTCACCTCCAGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAAT:1 + chr2R 14849430 5' - jockey 392 1 71.29 TTTTAACCCCCTGCAGTCGAGCGGCGACGTCAACGCCTCCTGCTTTGCATTGTGCATGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACC:1 - chr3R 27785874 5' - gypsy12 10177 2 58.00 TGGCCGAAACTCAACTTCCACTTCGAGTTGCCACCACCGACCGCCCCCCCTTTTTTGCCCAGACACATATGGGCTTACAAATCCTTCCACACTCGGACTTC:1 - chr3R 13525714 5' - aurora-element 4095 1 57.43 AATTTTCACGCGACTTGCAACAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGC:1 + chrX 20507093 5' + Doc 4519 1 79.21 GAAGCAATCAAATCAACTGAGTCAATCGCGCTTTTATCAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr2R 13585663 5' + blood 7050 2 65.35 TCGGGGCAATTTCTTTCTTGTGGCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAAC:1 - chr2R 17348664 5' + jockey 62 1 81.19 CACGGCAACACTGGTCGGTCGCTCCGTCTCTTTGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAG:1 + chr3L 18234256 5' - ZAM 8015 2 62.79 ACAAGAGAGAATGCTTAAGNCTTACAAGTCCTTCTAGCTGTTATAAACCACATTCATAGACATGACCAGATCGACTTGGCTAGTGATCCTGATCAAGAATA:1 + chr2R 13565206 5' - INE-1 85 1 81.19 TCCTTGACCAGGGATGGTCATTCTTTTTTTAAATATTTTTTTTTTT:1 + chrX 6544227 5' + FB 175 3 80.43 GCCATGGCTAACATGCAGATGCCGCGTGTGTCAGCGAGAGTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 14194355 5' + pogo 32 1 57.43 ATGTGTTTTTTTTTTCTTTNTTGTTGTTGTGATCATTTCTCAAATATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACT:1 - chrX 3075623 5' - G2 3005 1 56.44 ATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTC:1 + chrX 21087586 5' + mdg3 5282 2 55.00 TCTCTCTCGGCTTCTTTGCCACTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr2R 19424124 5' + P-element 3 2 54.00 CGATGTCTGATATCTTGTACTAAACATCCAATTATTACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2R 22369621 5' - roo 9030 1 74.26 TGTGTGCACAGGTCGCATGGTAGATGATAGATCTGCACAATTGGAATTTAGAAACCAAAAGCATTATTTACAAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACG:1 + chr3L 23354608 5' + gypsy2 8 2 62.38 CAGCACATGGCAATCCATTAAGGATATCCCATAATTGCTGGCTTTGAAGTCAAAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAG:1 + chr3L 18546851 5' + Bica 2 1 69.66 AGGCCAGAAATAAGGCATATTCTGCCCAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr2L 13621969 5' + opus 45 4 72.28 TGCACAGGTCGCATGGTAGATGATAGATCTGCACAATTGGAATTTAGAAACCAAAAGCATTATTTACAAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCAAGGGCG:1 + chr3L 23354612 5' + gypsy2 6500 2 58.42 AAAACCACTATTTTTGTTTAACAAATCAATCAAATTAAATCAAATCAAATCAATCAGCCATCTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTCCGCTGCCTTTTACCT:1 - chr3L 25479491 5' + Q-element 505 2 75.25 GAACGAAGCCGCAAAACGGAGACGGCGAGCAGCGTCACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr2R 16580367 5' + pogo 36 1 62.38 GAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTT:2 + chr3R 1440168 5' + G-element 41 1 60.40 ATTATTAAAGTTATTCTTCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 - chr2L 16866487 5' + Transpac 4953 2 59.41 CAAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATC:1 - chr2R 2308851 5' + McClintock 4 2 62.00 ACCATATTTCAATTTCAACACCCACCCATAATTTGGCTTATTTGTGGCCATTACACTGCTTTTTATTTTTTATTTAGCCTGTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr3L 16873769 5' + roo 8663 1 78.22 ATAGAGATAAAATAGATATCATAACTGCCATGCCCAAATGCCAAATTTTTGAAAAATTTTTGGACTTTTTTCATAATTTTATTAGTCTTTTAAATTTCTAT:1 - chr3R 8013631 5' + INE-1 296 1 81.19 GATCAACAATGTTATAGCATAATTGCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - 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chr3R 14318228 5' + diver2 247 2 61.39 ACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3R 7582616 5' + 297 6604 2 56.44 AAGGATTGCTTACAAAATTTAAGCAAACATTAAGGTCAGATGTACAGTATGGAAACGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 + chr3L 20032237 5' + Tabor 6861 2 52.48 CCAGTACTGTTTCAACAGGCGGGCTCCACGGGTCGCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:1 + chr2L 6762727 5' - 412 434 2 65.35 TCTTTGTTACTGCTGCTCGGGCAAATAACGGTAAATGTGGATAACTTGAAATCTTTGTGCAGGGTTGTGTTTCTTACGTACCATTCGCAGCCGGTAACCGT:1 + chr3R 29158318 5' - BS3 1388 1 60.40 GCACTTTTACTACTGTTTTGAAAGGGTTCCATTATGTTATTGAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chr2L 7552430 5' - I-element 5324 1 59.41 TGTTGCTTTTGGCACCCGTCAGTCCGCCATAAAACAAGACTCTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 + chr3R 13441872 5' + 1360 34 1 60.40 ATGCCGCTATCAGCAGTTCTTGTTAAATAAGAGGTAGTCATTAAAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 8702778 5' - roo 9044 1 57.43 TGACTTAAATTGACTACATTTTTACAAAATTCATCTGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCA:1 - chr3R 9905485 5' - BS 5007 1 63.37 TGAGGTTCTGTGGGATTTGAGAAGTCACACGAAAACAATTCTCATATTTCAACCACATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTG:1 - chrX 9043027 5' + HMS-Beagle2 71 2 61.39 TCAGCTTATAAACAGTAAAAATAAAATGCCGGACTAAACAAAGGACGAAGGACAAAGAGTCACAACACACACACACACACATACACTCACACACACACACA:1 + chr2R 13695289 5' + Quasimodo 30 2 56.44 GTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGT:1 - chr3L 10056108 5' + transib2 311 1 72.28 CCGGAGATAAAGAACGAGCGTGAATCGAGACAAAGAGATCCATATACAAAATTCTTTCGAATCAATAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTT:1 - chr3R 22455146 5' + G6 1995 2 75.25 AATATTTTATGACAAGTGCTGGCTGGGGCTGGCAAAAGTGGGTTGGAAAGGGGCTGATCGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGT:1 + chr2L 16922129 5' - jockey 4725 1 65.35 AAGTTATTGTGAATTTATGACAACTGAGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chr2R 9061904 5' + jockey 4681 1 63.37 TAATAAAGTCAACACTAAANGCCTCGTTCAATATTCAATTAGACGCACAACACACACACACACACACACACACACACACATACAT:1 + chr3L 9324627 5' + Quasimodo 37 2 69.41 CTGCGCACTTGAATACCCCNGGAAATTGACTATGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTA:1 + chr2R 20397917 5' - Quasimodo 38 2 90.00 CTGGATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 + chr2L 1201965 5' + Stalker2 7269 2 58.42 AAACACGCAATAAAAGTTCAAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTTCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGG:1 - chrX 8409880 5' + copia 145 2 76.24 ATTTAGTTAAGGGTATACTTGCCAGTTTAGTTATTGAAAACGAAATTATACACTAATCATAAATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr2L 9053503 5' + flea 10 2 56.44 GACATCATAAGTCTAAAGANTTTTCAAATATAAAGTTTTTTTTGGAAGCTAGGAAATGTATGTAACGTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chr2R 19651156 5' + flea 19 2 62.38 CCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr2R 9061932 5' + jockey 4709 1 67.33 ATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTC:1 + chrX 21772488 5' - gypsy3 6550 1 65.35 AATTATAACGATTATAACGATTTGGGGATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAG:1 - chrX 15003300 5' + R2-element 59 1 80.20 TCATCGTCCGGTACTCCCCCCTGTAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCGGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2L 19567502 5' + pogo 46 1 71.29 TGCAACAGGGCGCGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2L 6647644 5' - 1360 3359 1 57.43 AAGATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:2 + chrX 8308703 5' - opus 489 2 70.30 AAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 27357551 5' - mdg1 7429 2 51.00 AGTGATATTCCGACCTGAACAACCTGCGATAGTTCCAGTTCCATTTCTGTTGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAA:1 - chr2R 20888472 5' - I-element 5018 1 58.42 TATCATAAGTTCTATTCTTTATTTAAAATGCCAGCATATAGCATTATATCTATCGTTATGTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 16759693 5' - Transpac 5215 2 45.54 AACTGTGGACCTATCATAATTCTTCTAATATTTGGTCGGGTCGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chrX 2911263 5' - hopper 1384 1 57.43 AATCCTCGCTGAAGCTTCGAGATTCGAAATCTATTTACTTTGCCGTGTCTCCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTG:1 + chrX 22766341 5' - HMS-Beagle 62 2 54.46 TTGATTCTGCCAAGCCATTGAAATCATAATTAGAAGACAAATGATTCTTCTGTTCCTCTCAAGATCCCCGAACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 - chr3L 13059785 5' - transib2 2821 1 76.24 AATGTAGCCACGAACCATTGCACAACCTCAAACCAAAGACTCAAACGACGAACCTGCAATGTTTCCTGAGGCTTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCT:1 + chr2R 14456115 5' + HeT-A 5727 2 53.47 GGTTTCGATTTTCTTTTTTATCTTTCGTTGAAAGCCAATATATATCTGAGTTAACTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCA:1 + chr2L 3494947 5' + 1731 4335 2 56.44 CAATCACACACATTTAATTGGAGCTTTAAATTAACGGATTTATAATACCTATTTAGCTGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2L 2506383 5' + jockey 12 1 59.41 ATAAATTCCCAGAAAATCTAATTCGAGTAGAGTAAACAGTAAACAGTGCTAGCTAACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr2L 5304785 5' + 412 7075 2 57.43 AAAATATAAAAAGCTTTGCACGCCACAGATACTCCGATATATATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2R 7775449 5' + pogo 29 1 63.37 AGTCACCTACCCAAAAGCCCGTCAGCTTGAGGATTGGATCGTCATGTCGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 17803046 5' + Doc 36 1 51.49 ATGGCTGGATTATTTGAAATGAATACTTTAGGGCTTAAATTCGTAATTAATCTGTGTCCTTCAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACC:1 - chr3R 31458472 5' + jockey 352 1 56.44 GTGTGGGGGATGTTTGGTGTGATCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chrX 20844332 5' - copia 237 1 74.26 ACAGCTTTTCACCTTTTGAAAAATGGTTGTTACGATGACATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr2R 18553870 5' - jockey 4948 1 67.33 CGAGTGTAGTGGTGCGTGTCCGTTAGGCACGCGGGCTGAGCCAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chrY 1431464 5' + Tirant 32 2 60.40 GACTAATAAAAATCAAGAGAGTTTCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCACACTTGCTGAATAGCGGGTATCTGATAGTCG:1 - chr2L 21383433 5' + INE-1 550 1 77.23 CTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 9287207 5' + jockey 36 1 54.74 TGAATTGAATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2L 2157854 5' + Doc 36 1 27.72 AATGCGATACGGCATATTAGTTATTAAAATGTAGGTATGCAAAGATAATAACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 15286471 5' - hobo 2915 1 55.45 GGGAGAAGAACTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGCGTCGGTCATCGC:1 - chrX 22576489 5' + Burdock 151 2 74.26 TTAAGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCG:1 - chr3R 1844864 5' + Cr1a 112 1 73.27 GATTGAAATGGACAATGGCGATGCCACTCTATCTAGGCAAGCTAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2R 8254851 5' + roo 8698 2 59.41 TCCTGTTTCCCAGTGGTTATTGGCTTAGCCCCAAATTAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 + chr2L 12884317 5' + HMS-Beagle 35 2 60.40 CGGGACCTTGGCTTTGCTTGCCCTCGGAAAAACGATTGGAGTATATACAATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chrX 8308812 5' + opus 20 2 59.41 AAGAATCCTTCAAAAACAATACTACTCACACGATTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGG:1 - chrX 16125644 5' - 17.6 280 2 68.32 ATTCCAGAGGAGCCCAAAGTTTTTGTTTTTTTTTTTG:1 + chrX 13540148 5' - HMS-Beagle2 491 1 67.57 AGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCC:1 - chr3R 11547756 5' + G2 315 1 63.37 TCCCGATGTCGCTCTAGTTCGTCTTTTTGGCTCTTGGTCAGCCTCATTTTTGTCAACAGACTTTATTCCTTCCAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGAC:1 - chr3R 19448154 5' - aurora-element 4132 1 75.76 TTCGTTTCGAGGGATTCAANTACATTTTAATGAGTTTATGCACGCGTGTGGGAGAGAACAGTGCATACAAAAAGAATACCAAACAGCACTGCGAACAACGC:1 - chr3R 16322504 5' - Cr1a 233 1 62.38 TAAAATAAAAAAACACGCAAAGTAGTTCAAATTCGACAAGCAGTGGAGTTGAATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTA:1 + chrX 5340993 5' - invader2 488 1 62.38 CTTTGCTCTCTTTGTGTCTGTGATTTTCCCCTTAGGCTAAGGCGTGTCATTAATTTATGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 1858399 5' + pogo 18 1 61.39 CAACGTTGTTATTTCAAAACTGGTACATTTTCATTATAAGAGCCGTATTGTAATAAACCAATATATGTCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr3R 7134339 5' - blood 7359 2 66.00 TAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr3R 24228958 5' + 297 26 2 57.43 CTGACCATGGAGGCGTATTGTAGGATTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAG:1 - chr3L 24034559 5' - 1360 3340 1 73.27 TCTAAAATTCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 27071849 5' + jockey 9 1 76.24 GACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCCCA:1 - chr2R 25051856 5' + G5A 2681 1 62.63 AGGTGAGTGGTATGCCTCTCAAACTGTATGCCATTTGTGCACGCATCCCAATGGTTCGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chrX 8228097 5' + jockey 31 1 55.45 TATCCCTATCTATTTGGTACTGCAAGCCAAGATGGAACAATAAAAATCAAGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACA:1 + chrX 1211658 5' + Transpac 458 1 55.45 GCAACTTATATTTATTCAACTTGGTTAAAGGCTAGGCTAAAGTAGCTTATAAAAACTTTTCCTATTTGTCGCAATTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGAC:1 - chr3L 9596644 5' - 1360 3243 1 76.24 CAGCGACAATAGGAGGCAAGATGTGAGTTTGTTAGTAAAGCACTGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTAT:1 + chr2L 285099 5' - Quasimodo 89 2 64.36 AATACACCATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chrX 11088304 5' + blood 9 2 69.70 TATGCAAATGAGCCACCAGCAGAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr2L 14970116 5' - hopper 1372 1 74.47 GCTTCTTACATAGATATGTGTGTAACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 + chr3R 17036450 5' + Transpac 4965 2 75.25 TCATAGTATCCCGCTTACANATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGC:1 - chrX 22824223 5' - Gypsy12A_LTR 2248 1 45.54 CATGGCATGTAGTGAACGTGTTGCAAACAAAAACAGAAACCGAAATGCACATGCAAACACACAAAACCCTGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACG:1 - chr2L 1068854 5' - R1A1-element 5320 1 77.23 CCATAATTTTATTTCTTAAAGGATAGTCCTTTAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATT:1 + chr2R 9370564 5' - pogo 1920 1 69.31 CATGTTGTCCCTGACTACCTGGCGCCCATGTGCGTCATGCATTCCTCTAGGACTCCGGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chrX 20015864 5' - transib2 2808 1 41.58 AAATTGAATAAAAATAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 4760671 5' + BS 5102 6 89.29 GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAA:1 + chr2L 21580876 5' + INE-1 500 1 67.33 CAAACATATTTGCGTTCAGAATAAATTCCCAGAAAATCTAATTCGAGTAGAGTAAACAGTAAACAGTGCTAGCTAACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 - chr2L 5304805 5' + 412 2 2 77.23 ATATTTTAGGCAGCATTTTACGATATTTAGATGTTTTCTGTTGTATAATTACGCAACTTACTATCAAGGCTCATTTTTTTAAATTTAAATTGAAATT:1 + chr2R 16993196 5' + 1360 3043 1 84.54 TCGATATTTCTGTTTACTATTTAAAACTATCTTATCATTTCACGTCTGCATTTTGTTCCCTGGGTACCGATTATTACACATATTACACATAAATAATTAT:1 + chr3L 7535755 5' + 1360 2937 1 55.00 AATCGCTCTCTTGGCAGCCTAATTTTACATTTTCCCTATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2R 8674137 5' - roo 9037 1 62.38 ACAGATATGTTTCTTTTCGTATTCAAGTAAAGTAAAAAGGCGAAAAAATTAAAAATGGAACAGTAGCTCCACGACCTACTCACAGCAAAAAAA:1 + chrX 15696601 5' - copia 5011 2 76.34 TCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr2R 1373121 5' - pogo 2061 1 67.33 TGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTA:1 + chrX 21772475 5' - gypsy3 6579 4 55.81 AGCTCCAGAAGGGCGTTCTTCTCGTAGGCCTGATCCAGCATCTTCTCGAAATTCTCTATGTTTACGTTGAGTAGAGCTTGGGAATCCGTTCACAAGAGCGG:1 - chr3L 9900613 5' - McClintock 65 2 59.41 CTCCTGTTGCAGTTGCAAGTGGCAAGACGTCTGAGCCTGTAAGTGGAGCAAGGCATTGAGGCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 + chr2L 13310229 5' - mdg3 231 2 55.45 AAGTCTCTGTATTGGGGTGGCCAGGTAAACCCTTTTATCGTTAAGATTTGCCTAAGACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 21199207 5' - roo 391 2 61.39 CGGACATAGCATATTGGAAAGTAATCTTGCTTTATAAAGCACTATATAGTAAGCACTATATAGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTA:1 + chr3R 30137500 5' - flea 5005 2 42.57 CGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr2L 12800981 5' + hobo 55 1 78.22 CTAAAACAAATGCAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 14311500 5' - roo 9043 1 57.43 CAATAACTTGCCAATGGGACACTGTTTCTCGCAGCCGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCT:1 + chr3L 19498571 5' - F-element 4454 1 67.00 TTTTGTTTTGTTTTGGTAGCGATTTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCC:1 + chrX 18929344 5' - Doc 424 1 77.23 GTCCCGCTTAGCGTCCTGGAGCATCCTTATCTGACGCAGAACTAGACAAATGAAAGGGAATGGCAATATGGTATTTTTATTTTCATTTAATACAATA:1 - chr3R 17518912 5' - TART-C 406 2 57.73 GTTGATATATGTACATATGTAAGTAAGTGCCCAGTGTATATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3L 17590072 5' + 297 6608 2 65.35 TTCCATTCTGTTTGTCCTGTTTGTTGTTGCCGGCATTGTCCTTCATCAAAAATGCATTACAATTATTACACTATACACGGCAGCGCCCCTCAGTCGGTTGG:1 + chr2R 12097123 5' + Cr1a 4412 1 53.47 AGGATCTATACTAAAAAAAACACTACTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACG:1 + chr2L 9723709 5' + 1360 3202 1 78.22 TTCCTAAACAGTAATACATTTTGTCTTTAAATATTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGATAATCTTAGACTG:1 - chr2L 21272564 5' - baggins 5047 1 67.33 CCCCATACAATTGTGCAACACACGCACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGAATATAAACACATACTGAACAA:1 - chrX 16586794 5' + hopper2 1186 2 73.00 ATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chrX 9828502 5' + Tirant 44 2 69.00 AAAAAAAATGAATGAATTGAAAAACAAAAACAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTTATCTATTCATAC:1 + chr3L 2401765 5' + Tc3 1625 1 72.28 ATCGAGCTGGCCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTCAAGACAACCACTGCAGGAAATGAG:1 + chr2L 22601732 5' + Osvaldo 255 1 55.41 CAGGTGATGTGGAAAATCGGTTCAAGACTAAGCTTATTATCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTT:1 - chr2R 12909576 5' - Porto1 4433 1 61.39 AACTCCATAAATTCAAAACACATTCGATTCGAATGCAACCTATGTAAATACAGAACATACATGGTGCTTAAAATCTCCACAACCACTGCCGTCACATGTTC:1 - chr3R 19583478 5' + accord2 7357 1 54.46 GGTGCTGCTAAGGACACGTCCATAAATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGCAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 + chr2R 9640356 5' + Max-element 39 2 66.30 GTAACGGTGTATCTGTGTTGCTGTGCATCTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - 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chr3L 27412294 5' + hopper 297 1 73.27 ATAGATAAAAAATAGGAAAGAAATGAACATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATTTTTTAGCAAAATTTTGATTTTGCTCCGC:1 + chrX 17106150 5' - HMS-Beagle 322 1 72.28 TATGTCACTTTCCTCATAAGTTATCCCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTT:1 + chr2R 10733392 5' + R1A1-element 23 1 76.24 TCCAAAGTCAGGAAAAAAAAAACAACAAGGAAAAAAACTACAACAGAATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTAT:1 - chrX 12854354 5' + Doc 114 1 66.34 TGTGTGTGCAATTCATTTTGGTAGTGAAAATGTTAAGCGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTCATCTT:1 - chr2L 18362527 5' - Max-element 377 1 61.39 CAGTTAATGTTGAATTAACTTGTCCGTTCGAGGTACTGTGTCTGCGGTTATTAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTA:1 + chr3R 1320156 5' + Cr1a 493 1 55.45 TCAAAATACCGAACAATAATCGCTCACCCACACGGTATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCATCATTTGGGAGGAAGTTTTGCCCATGCATCCTGCACACCTTG:1 + chrX 22883899 5' - HB 1231 1 67.33 ATAGCCCTCGAATTTAGAAAGTTATTTGAGCACATTTAGAGGTTATTGTTGTTTATCATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 11624439 5' - roo 391 2 58.42 GGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCAATCTGG:1 - chrX 158230 5' + INE-1 99 1 73.12 CCATACCTACGGCTTTTTGCCACCTCAGAAAATGGAAGTATGGGTGCCAAATCTAGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAA:1 + chr3R 27088446 5' + X-element 4280 1 66.34 GAACACAAATAGAGCGAACCTGTAAGTCTGCACAATATGAGTTCATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 5043285 5' + roo 8695 2 58.42 GGATTCCACTGGAAGGATGAGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr3L 25345150 5' + Doc 47 1 64.36 CTTTTGCCACTTCTGTTTACTCGCACATTATTTCACACACTTCTCCATTGATTTTCGACGTGCAGATAACGAAATAGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTA:1 + chr3R 13686524 5' - 412 494 1 77.23 AAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTG:1 + chr2R 5284542 5' - Doc4-element 2634 1 62.38 GTTTTGAAGCAATGGGGCTTACACAAAACAAATATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAAT:1 + chr3L 2589252 5' - 17.6 453 2 79.21 TTCACATTATGCGGCTACTCTTTTCCGCTTCTCATTTCGCCTTTTCGTTTACTATTCCTCTTTTTCCTTTTTTTTTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTT:1 + chr3L 3239846 5' - Bica 312 1 56.44 GCATTCTTACAAATATTACAAAAAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr3R 6761020 5' + blood 7065 2 80.20 TCCATTGGTCCAGTAACAGGGCACTAATACGTCGACGTAACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAGCCCT:1 + chr3R 2157416 5' - Quasimodo 7236 2 61.39 TCTCGCAATTTTCTTATTGTTGCTCGGGGTTACGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTT:1 + chr2L 13555461 5' - G6 1809 1 67.33 AACTATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTTACTCAGCT:1 - chr2L 22575946 5' - INE-1 545 1 73.74 AGAAAAAGTCAGTAACAGAGTTAGAAAGAAGTTGAAAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 11832512 5' - roo 395 1 67.33 AGACCGAAACAATATAGCAAATTTCGTTGTAGTTGTTTTTTTTTGCGCCAAAGGCAACTGTAAACTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 14301663 5' - roo 9053 2 58.16 TTTGTTTATAAGCTGTGGAAGAGTTTTTACTGTTGCCCAATTGTCTTTGCGAAACCTTGCCGTTTGAGTCGTCTGAGAGGTCAAGCGGGGATAAGACGTCT:1 + chr3L 25600921 5' - Helena 1291 1 79.21 ATGAAAGTGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 6171203 5' + 297 6619 2 68.32 GTGTTAGTATTCTTCTTAGTTTGCTGGCAAGACCTTTACATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 3985091 5' + roo 35 2 64.36 GATACGTTAAATGCCGCTATCAGCAGTTCATGTTAAATAAGAGGTAGTCATTAAAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 8702768 5' - roo 9054 2 54.46 TAAACACAGAACTAACCACNAGATGTATACAACACATTATGAATACGCTATGCCATGTGCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr3R 20381082 5' + jockey 26 1 59.41 TGAGAATCTGGACCACCATGTCATCCGAGATGAGATGTTCATCCTCTGGATTATTCTCTGCTGGCTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCTC:1 + chr3R 24111281 5' - Quasimodo 270 2 74.26 TATTCTAGTATGCAGTGAAATAACAAATAAAAGAGCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2L 15773369 5' + hobo 39 1 62.38 AAAAGCAGAATACATTACAAGTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 - chr3L 25059169 5' - mdg1 7452 2 73.27 GAAGGAAGCGTTTCCGACTATATACAGTATATATATTCTTGATCAATAGCCAAGTTGAGATCTCAGAAACTATAAAGGGTAGAAGGTTGAGATTCAGCATA:1 - chr3R 4947766 5' + INE-1 171 1 90.10 ACGTGCCAAAATGTATTGCATACTTTGTGGCGCAGACAACAGCATGTTGCCACGCCCCCACGCCATAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2L 4057110 5' + jockey 18 1 64.65 TTATAGACGCCAAGCGCTAGGAATTTTTCATAAGACCATCGACCAGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCAT:1 + chr2R 18569547 5' + R1A1-element 5025 1 56.44 ATAATCATGAAAGATTTTATTCAGTAAGCAACTTGATAGTACTTGTTCGTTGAAAGAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTG:1 - chr2R 9761243 5' + X-element 35 1 48.51 TTGCTTTAGGCAGATGGTGTTTGTTGTTTCAGAAGGCAAAAGACAAATGTTAGGGGAATAAGTAAAAATGCGAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTGCT:1 - chr2R 14537255 5' - INE-1 550 1 68.32 TTCTTGTCCCGCTTGACTAGCTTACGCTGTTCGTGCTCCTCGCGTCGCCTCTGATCCCGCTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAA:1 + chr2R 23893854 5' + INE-1 145 1 62.38 GTTTGCCGCGCGGTCCTTTCTCGCCGGGAGGTCCTGCAGGTCCAATGGGTCCCGGTTCTCCTCGAGCTCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAA:1 - chr3R 16556292 5' + X-element 397 1 70.30 TGAAATCGCCAGCTGCAATGCCATATACACATATACAGAGCATCGATGGCTGTTTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGATTTATCTCAATTAGAGGAGATTT:1 + chrX 1651543 5' + mariner2 534 1 64.36 CTGTTCACGAAGTTTTAATAGTTTTTTCTATTGCCGGGAAAATTTAGCTTTTCATTGTAGTGTAAGAGTTGGAGGACACACTGCGGTGAGCTA:1 - chr3L 26800115 5' + aurora-element 4204 1 94.62 CCCAGAGCAAACAACTCAATGTGTTGAAAGGCGGCAGACAATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 + chr2L 19629920 5' - copia 5088 2 62.38 TGTTGTTGCCTAAATCATATGAAGGGAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1 - chr2R 5413466 5' + Juan 4075 1 71.29 TTTAAGGAGAACTTTTGATAGAGTCATCGTCATCCAACTTGAAGGGGGCATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCG:1 + chrX 17228462 5' + Doc 4503 1 51.49 ACATTTCTGCTGACTGACGCCATTTTGTCATTGGGGTTCCGACTCCTCTTATAGGGGACCTCGATAGCCTACCACTCCTCCTGAACGGGTCGTTGGGGTCG:1 + chr3L 12292751 5' - Rt1a 469 1 71.29 GTAATAGTAATTTATAGATAATCTACTCGATCTAATACAACTAAAAATTAAATTCATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr2R 19430814 5' + 412 22 2 57.43 CTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chr2L 19907958 5' + Tirant 44 2 69.31 AGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCA:1 - chr3R 10741141 5' + 1360 3366 1 42.57 CACTGCTCAACAACGTGCGTTTTCTGCTCAACACGGCGGGCAGAAGTGGTGATATTGTGAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr3R 5360013 5' - 412 476 2 61.39 CTTCTCCAGCTGCAGCTGTCACGAAATTTCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 - chr3L 7156398 5' - Tirant 8463 2 70.30 GTCTGTTTTTCTTTCACTCGAGCTGAGCTTGTTTCACTTTCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGCTTTTT:1 - chr3L 12880240 5' - I-element 317 1 60.40 AAAGTATATTTGTGAGAGCATCTGTACTCCGTTGGCAAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:3 + chr2R 18043931 5' - pogo 2069 1 64.36 AAGAGTTAAATTCTTTTGTATTCTATAATTTAAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAAT:1 + chr3L 27357520 5' - mdg1 421 2 76.24 CATTTAAATACACAAAGCAGCAATTTGGAATATAAAAAAATTAAAAAGCTATAAAATTATAATAGTCAGGCCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTAT:1 - chr2L 13806815 5' + 1360 3094 1 62.38 AGCTGGCAGCTCCCATGATNATTGGTCATTTACTTGGGCCGTTTAGCGCATTAAGTCCGAGTTCCCCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGG:1 - chr2L 3582061 5' + transib2 8 1 70.30 TTTTGCTTTAGTTCTTTGTGGTTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTAT:1 - chrX 3675278 5' - TAHRE 10389 1 57.43 TATAAATATTAGTTATATGAGAGCACTCACGCAACAGCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr2R 23111314 5' - hopper 1379 1 59.41 CGTCCACGTCTCCAGATTTTAAACATTTTCGAAATGTTATAAAAACGTGTAAAGGGATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 + chr2L 21786686 5' + Max-element 21 2 55.45 CCTGATTAAGTCAAAGTATCGTACCTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chrX 15183764 5' - hobo 2887 1 77.23 GTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 - chrX 21668086 5' + Tabor 17 2 60.82 AGCTAGGCGAAATGCTTTTNAAAAGCAATTTGGTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr2L 12800933 5' + hobo 7 1 71.29 GCCTGCGCAACTCTTGTTCCTGGTCATTGACGGAGGCTAGCATATTCTCCACGTCCCAGAACTCCTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 - chr2L 5129242 5' + transib2 34 1 76.24 AGTGTGTTTGTGAGATAGCTCAACCGTACGGCTCGATTTGCGAGAAGATAGACGCAATATAAAACAGAGAACAGAAACAAGGAAATGAATATAATGTAAAA:1 - chr2R 15143729 5' - Cr1a 4326 1 78.22 AAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 6074386 5' + 412 48 2 71.29 GCAGAAAACACTTAAAAATTTGATTTTCTTAGCTCAAGAAAGAAAAATGTGAAAAAACTAAAGGTTTAATATGGAATATGTACGTATGTAATATGTATATG:1 + chr2R 18511666 5' - 412 216 2 80.20 GCAATGATTCCAAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3L 8749946 5' + Doc 18 1 64.36 AAGCCACGTGATCTGTCGATTTGTTCGTCGTACATTAAATAAATTGGTAATTGTATGCAGATTTAGACGAGTTCAATAGTTTGTAATGATGAACTCCAATT:1 + chr2L 5304672 5' - 412 495 1 80.20 GATGTGCCTTTATTAAGTGAGTTCACCAGGTAAGCTAAAAGGCAATAAATTAGCTGTGGCAAATTATTTATATGCCATAAGTTGAAAAGAAAAAGTCAACT:1 + chrX 12983727 5' - Tc1-2 1395 1 54.46 ATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCG:1 + chr2L 23299978 5' + invader4 322 2 55.13 TGGACCCCAGGTCTAGGTCTAGGACTAGGACTAGAGCTCGACTGAAGGATAAAGGATTCGGGCTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chrX 4279469 5' + blood 12 2 67.33 TTTCCATTTTAATGGTTTTTTCTTTGTGTGTATGTGTGTGTGAAGCAATCAAATCAACTGAGTCAATCGCGCTTTTATCAGCTGTAGTATGTGCATATATC:1 + chr2R 13585622 5' + blood 7009 1 79.21 GGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGC:1 - chr2R 17402772 5' - invader4 3040 2 72.28 TATATATTCCAGACTACCCAGATCACATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTCATTCTGTCTCCGTACCTCC:1 + chr2R 4971204 5' + TAHRE 10413 1 76.24 AAATTCAGTCAAGAGTTTCGAAAGGAAAAAAAATTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3L 16548897 5' - HMS-Beagle2 492 2 60.00 CATTTGTTTTCTGTTTGCCGGTTTTCCCATGAGCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2R 11699345 5' - roo 393 1 61.39 ACCGGCATTCACATAAATTTGTAATTACGTATACGACACGTAGGTGCCCAACTTCCTTATAAAGTCTTTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCATGGAG:1 - chr3L 8866006 5' - Doc3-element 4418 1 68.32 TTACATTTCGTTTGTTTTTCATATTTCTTCGCATGCCGGGCTACACGTGTTGGTAACATATTTTTGGACATTATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr3L 4923786 5' + jockey 10 1 75.25 AGTTTTTCTAGTTCAAGTTTATTTAACCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:3 + chrX 14564668 5' + Doc 60 1 78.22 AAAAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCATTATT:1 - chr3L 9220162 5' + BS 43 1 68.32 GACAGGCATTGTGCGGTGTTGCCACAGGAAGGGAAAAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCG:1 - chr3L 9220195 5' + BS 10 1 60.40 AACAACTCAATGTGTTGAAAGGCGGCAGACAATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 + chr2L 19629929 5' - copia 5079 2 73.27 AGTTTACGGCCACCGTTACCACCACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 - chr2R 13745751 5' - hopper2 1558 1 77.23 GCGCACGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 2917027 5' + hobo 40 1 73.40 TCAAGAAATACCAGGTGAGTGGTATGCCTCTCAAACTGTATGCCATTTGTGCACGCATCCCAATGGTTCGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 8228085 5' + jockey 18 1 68.00 GCTAAGCCAAAGACCCCAGCTAAAAAGAAGACTACGGAGAAAACTCCGGCGAAGACGCCCACAGACACATACATATATACAAACACACACACACATATACA:1 - chr2L 15835242 5' + accord 186 2 65.35 CTCCAGGTAGGCAATAGTATCGTCGTGTCTGTGATTGTGTTGCGGCTGCATAGATGTATGGGTCATTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 7605098 5' + jockey 18 1 59.00 GAAACGGTGCGAGTCCCTAGTAGAACCTACCATACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 4646325 5' + 297 6612 2 70.30 GTTTTCTTTGCATTTTTCCACGTTGGCTTGTTGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTT:1 + chr3R 25631564 5' - accord 419 2 69.31 ATATATAATTGTGTGTCTTTCGCTCTTTCGCCGATTCGTATTTGTGTGTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr2R 19616208 5' - hobo 2912 1 54.46 TCCCTATTTTTATCTATTCATTCCCAATTTTCATACTATCCCGTCCTTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr3L 24757085 5' + INE-1 162 1 72.28 TTTGTGGCATTGTTTTCCAGTTCGGCCGCTGATTTTTCCAACCGGCTTTCGGCTGGCTAATTGCCTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 7970931 5' + P-element 10 2 69.31 AAAAAGAGGACCTAAATTGAGCTGCAAAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCC:1 + chr2R 21893021 5' + P-element 228 1 33.00 AGGCAAAGTCCTGGCCACANCATAATTTCGAGTGCACAGATCCGAGGAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 - chr3R 28447450 5' - blood 348 2 52.48 GAAAGCTGAAAATAAACAACAAAATTTAAAAGTTGTGATATCTTTGAATATCTATATCATATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chrX 15290217 5' - pogo 2098 1 70.97 AGTCCAACGCGCACAGACAGCCTAAAACCAAAGACACTAGAATAACTAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCGA:1 + chr3R 4051904 5' + 1360 52 1 74.26 TTGCACCAGCATGTTCCCACCACCAAATCGCATACATCGCTCATACGCCGTGGGGTACGAGACACTAGGGCTGAACGGGGAACCTGACAGCGTCTTTAGCT:1 + chr3R 5801457 5' - Rt1b 4672 1 65.35 AAACTATAAATCACAATATAAATGTCTTAAAACACACCCGAATTGATGATGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGCTGAAGGC:1 + chr2R 19430731 5' - 412 465 2 50.50 ATCATTATCAACCGTCCGAACACGCCCAAGACACTGCTGGAGAACACAGGTAATTCGTTTGAGCTGATAGAAATACTTTTAGTTCAGTTTGATTTTATATT:1 + chr3L 6196663 5' + gypsy6 7575 2 74.26 AGATATCTCAGTTCATATGGAAGGTCAGACCAAAGACACTAGAATAACTAACCAATGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGAACCTGATAAAGAATAT:1 - chr3L 22016784 5' - INE-1 84 1 61.39 TTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr3L 27357560 5' - mdg1 7419 2 60.40 CAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTT:1 + chr3R 4973110 5' + 1360 3386 2 50.50 GAAAGCTTGTGCTTCGGCCTATCTGTGGGTCTGGAATAATAATTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCACATAGTGCAAACCG:1 + chrX 906173 5' + diver2 4621 2 72.28 ACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACG:1 - chr3R 11547792 5' + G2 279 1 73.27 GGTGTCCATTGTCAAGTGTAATTTATCATTCAGTCAACGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTTGTTATCTACCTACGT:1 + chr2L 1254704 5' + diver2 4685 2 60.40 GCTAAGACGTGTAGGTTAAGTGGAAATTTTCTTATCAATCTAAAGCTGCAGTTGACCTCCAGCGTCTTAGTATCGACTTGTTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 - chr3R 10078513 5' + Doc 4 1 80.20 TATGGTAATACTTATTTAGCGGCTTACTTCAGCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chrX 11454370 5' - P-element 2845 1 33.66 GCTGGCTGCAGGTGAATAAGGGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr3R 9074074 5' + hopper 7 2 59.26 AAAGTTTCGATGAGGTGTGATTATTTTTAGCAGTGCCTCGCAGATGCAAAGCATTCAACTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chrX 16763314 5' - opus 492 2 73.27 TGATGGAGCAGAGGGAATTNATGTGTTTCAGATTTTAATTTACAAGCTCAAATATAATCTACAATAAATATATGTAATTCGTAGGCCATAGCCACGACATC:1 + chr2R 657937 5' + gypsy7 5441 2 61.39 TTTGCCTTTGCCTTAATTTGTCTACAAATTTTCTTTTACTCGAAAGTTTTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAA:1 - chr3L 6480983 5' - Doc3-element 482 1 55.45 CGGTGGTGAGGCGACGCAAATTGCAGAGCTTAGGAAATGCTTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGGAA:1 - chr2R 15160370 5' - Tirant 369 2 55.56 TTGCGATTGGGCTTGTTTGTAATTCAATTATGTTAATGATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 13639837 5' + hobo 15 1 64.36 TGTGAATATTATTAATTTAATTAAGCTGCAGTTGTGGTTTTTTTTTTTAAGTTTTTTTAATTTTTGAATAAAAATT:1 + chr2L 17547986 5' + Bari1 320 1 86.84 GCTTAACACCTCTTTGTTTTTGTTTTCACCAAATCGTTAATAATACTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTT:1 - chr2R 19775188 5' + 3S18 5795 2 53.47 GCGTGTCAGAAAAATATGTTACTTATCGTTTTGGCTTACTGTCAATGGAATGGGCCCAACTTCCTTAGGGAGAGAATCATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 1930405 5' - roo 409 1 74.26 GAAAGATTTTTAAATTTTGTTAAAAATTTGCAGTTTGTAGGTTTAAGAGTGGGCGTGCCAAAATTTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAAT:1 - chr2L 21580245 5' - INE-1 297 1 57.43 GTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTAAAAGCATTTAATTATATACATATAGTAGCATATGTGCCATACACATAATCATAGAATGCCTT:1 - chr3L 19590776 5' + Quasimodo 79 2 70.30 CCATCTAACGTCAACATCACTGTTATGGATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAC:1 + chr3L 21275742 5' + HMS-Beagle2 8 2 71.29 TGGTGCAAAATGTAAAATANTGCAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCT:1 + chr3L 14878639 5' + Juan 29 1 54.46 GCCTTTGGCTGTTGCGCATTTTGTGTTTTGCCCTCCAATCCAAGTTTTATAGATGAAATCCTTTAGATGTTTTTTTGGAGCATAGCTCCGTTTATTTTTAT:1 + chr3R 12214586 5' - gypsy11 396 2 76.24 TTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACACACAATCTTGC:1 + chr3R 8856952 5' + rover 43 2 70.30 TATCAGTCCTTCATTGTCTGCACCAATTCAAAATTCATATGCATACAATCGCCAATCACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 19167887 5' - roo 392 2 63.37 AACTATGCAAATGTTCTCCAGCGCGTTAATAATGTTGGTGCTTTAATCAAGACTGAAATTCTTGTTACCTGGCATCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:2 + chrX 18050551 5' + 412 1 2 76.24 CTGACAATAAGCCGCAGAGAATGGGGGAATATTGTGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2R 20973027 5' + hobo 39 1 65.35 ACTGGTATATTTTGTTTGTTTGCTTAATGACTCGAAATGTTTATTCGTTTTCGTTTGGTAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3L 5512408 5' - pogo 2089 1 65.35 GGAGGGCGTAGGTTGGCTCCCGTTTTGGTTGTTATTGTGAAACAACTAGCCCAGTCGCTAACGGGGAGTCCGGGTAAGTGGCGTCCGCCCGGTCTAGTTAG:1 + chr3R 5460145 5' + baggins 310 1 62.38 GATTTCGTGATGCCTTTCCCTCCCCAAAAGTGTATATATATATATTTTTTTTTTGTAGCCTTTTTTTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAAGA:1 + chr2R 10574155 5' - G6 1991 2 52.48 AATATTTTAAGCTCAATAGAACAATAACTATTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTC:1 - chr2L 16958113 5' - 1731 4581 2 69.00 TTTCGATTGGTCCTGCTTTNGTTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGTACCACTCCAACCTCCGAAGAAACGAATTTACATGGTACAT:1 + chr2R 2009395 5' - 1360 3153 1 55.45 CGTCCTTTTAAAATATCACTCTACTCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTAT:1 + chr3R 3921269 5' - Cr1a 80 1 74.26 ACCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr3R 24228963 5' + 297 21 2 57.43 TAAGATTCCCAGATTCTGATATGTCGCCTTCAGGGAAACAAAGTCATCATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3L 9697950 5' - 412 7519 2 51.49 TAGCTGTGCATTTTTAATCGATGTTTGCCGTGCGACTTTAAGCCCGATTGGTGGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGAA:1 + chr2L 13292602 5' - 297 6683 2 53.47 CCTTTGCGATTCTTTTTCTAAATTTTCATTCTGCTGCCGCTTGTTGTTTGTTTTGAAACAGAGAAATCAGACAGAAAATCTAAAGACCCAAAAATATTAAA:1 + chr2L 16331058 5' + baggins 403 1 62.38 GCGATCTTCTCAAGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAA:1 - chrX 13932953 5' + Doc 4580 1 82.19 CTTCTGGTGGAAGGAAAACAAAAGTTAAATGACAACAACAAGTGGTCAAGTTGAACGATACGCCCCCTCAGAGTCCTGATCTGAACCCCATTGAAAATTTG:1 + chr2R 19415906 5' + S-element 1237 1 57.43 ATCTTTACTTCCTGCACGTGTCAAATAAATTATTGAGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2R 18111454 5' + hobo 36 1 62.38 AAAAAATTTCAAAATGTAAAAAAAATCTCAAGTTTACACAAGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr3R 14228090 5' - Transpac 5198 2 56.44 ATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCT:1 + chr3R 3922964 5' + Cr1a 65 1 69.31 AAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCG:1 - chr3L 10014047 5' + jockey 215 1 56.44 AATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - chrX 21668055 5' + Tabor 6891 2 75.25 TCACAAACTTTTTATTTAAAACTTTACAACTTTTTGCACTTTACAAATGGGTCATCTTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAA:1 + chrX 22426161 5' - 1731 294 1 60.40 TAGGCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAG:1 + chr2R 21776301 5' + I-element 223 1 54.46 TGTATACATCCATATTGTATGTCTATGTATGCAAGAAAAATATGTGAATATAAAATAATACAAAACAAAAGGGGAATTTTATAGTCAAGTTTCCCGACTGT:1 - chrX 20576567 5' - INE-1 565 1 83.17 GGGACTTAACTTGGGGTTTTGGAGTTGAAAAGGAAAAAAAAATTTTTTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGGTAGGGA:1 - chr2L 14312569 5' - G5 4664 1 77.23 TAATTTCATATTTTATTTTNATACGAAATGCAAGACAGCGCCAACTAACATTATAATAACCTCTCTAAAACCGACCAGAACTGTCACGCCCACACATTTGA:1 - chr3R 4159606 5' + INE-1 248 1 70.30 TCAGCATTTTAGAATAAGCNTAAATATACCAAACCAAAACTATAAAAATGAGGAGAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGCAC:1 - chr2R 4943249 5' - pogo 2085 1 62.38 AGTGATGTGAAGTGCCTGCAGGCCGCGTTCTCAGGGCCGCCTGCGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 + chr2R 5813574 5' + HMS-Beagle 29 2 54.46 GATCCTACTTTCAATCGTGTGAAATTAAAGTTAATCAACATTCATGACGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr2R 24242884 5' + hobo 26 1 54.46 CGGAGTTGCTGCTCCTCTTCACTTTGTTTATGTCTCAAGAATTCAATATTTTTTCAAACTATTCCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGGCGCTGGTG:1 + chr3R 28773578 5' - TART-B 152 2 74.23 TTGTCATAATTTCATTATTTGCTGCGTTCAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 29413078 5' + hobo 47 1 68.32 TCATTACAGCAATATTTGCTTTGCTCTTTTGTGCATATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 - chr3R 4164699 5' + HMS-Beagle 39 2 71.29 CCCGCGTTGCATGTGACGGGTTTCTAATTGCAAATAATTACATAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr2R 20690578 5' + mdg3 35 2 55.45 CCAAGAAAATGGAGCATCATCATGTGCACTGCACCACACTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCTAGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGAT:1 + chr3L 3782050 5' - gypsy11 73 2 70.30 TGCTCCTGTTGCAGTTGCANGTGGCAAGACGTCTGAGCCTGTAAGTGGAGCAAGGCATTGAGGCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr2L 13310227 5' - mdg3 5485 2 56.44 TTATGACAACTGAGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 + chr2R 9061918 5' + jockey 4695 1 53.47 TTGCATATGAATGAAAATGGTTGGAAACTTGAGGTGTCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr3L 16571792 5' - hobo 2900 1 72.28 ATGTAGGAACGATTATTTGTGCTGGTAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAT:1 - chr3R 20166371 5' - jockey 104 1 79.21 AGCTCTGTGTGAAGGCTTGGGATGGCTTCCATGATGACCCGGGCATGTCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 14132148 5' + roo 8689 2 54.55 CGTTCGATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAA:1 + chr2R 19352203 5' + 17.6 6957 1 62.11 TATTTTTTCACATATTTATTAGTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTTTATGGTCGAGTTGCGTATATGTATACCAGGGACAGTTGTTTATT:1 + chr2L 22063435 5' - Helena 1155 1 74.26 GAATAAAGTTAGGCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAAT:1 + chr2R 21776292 5' + I-element 214 1 54.46 TTTTCCACACTCCTCGCTCTACACTTGCAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr2L 3733127 5' - hobo 2890 1 74.26 TGTACGCATGTACGTTGATNAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chr2R 5651902 5' + Tirant 8138 2 54.46 ACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAAAGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 - chr2R 5651911 5' + Tirant 8129 2 57.43 AACAATTTTTCAGAGACTGGTTCAAGTACAAAGTCAGTTCAGCTGCAGTCTGGCTTCTTCGCTAGCCCAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGG:1 - 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chr3R 5837472 5' - Tc3 79 5 63.37 CGTTACGGGCCTCACTCCGTGCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 + chr3R 557205 5' - blood 7335 1 79.21 AACATTGACCTTAAAGAGTAGTTATTAGACATGAAGCACAAACTACGCTTTGTGCTGACCCTATTGATTGCCGGCTTGCTGGATGTTTTCACTCCGAACGT:1 - chr3L 8606334 5' - F-element 4371 1 77.23 AGGGATAAGATACTTATACTATAAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2R 6074352 5' + 412 7079 2 49.50 CACACAACAAACAGCTGAAACGGCTTTGCACACATGAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 26498582 5' + roo 39 2 64.36 AATCAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 27071864 5' + jockey 23 1 62.00 CTATTGTCCGCCAGAGACANCCGTGCTGCTCGCCTCGTACGCCGGTGGGTTTAATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chrX 8875687 5' - 1360 3365 1 51.49 GAATTTTTGCTTGGGCCGAAGAGATAACCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 20425442 5' - 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chr3R 5503402 5' + blood 42 2 66.34 ATGCGTTTAATAAAGCGTCAGTATATTCAATATGGAGGTCTTTACACAATAAATTTGTTTTTCTCTGACTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTTGGGG:1 + chr2R 4917969 5' - invader2 259 1 56.44 TAAAGTTCGAGGAAAAGCTTTAGAATGTTTGGACAATGATGCCTAAAACGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 10063282 5' - roo 9046 1 53.47 TTTGAAGTGTTTTGCATTTAAGTTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr2R 6824682 5' + Doc 61 1 77.23 CATATATCATAGTAACGCTNACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAA:1 + chr2L 19817832 5' - G4 3814 1 61.39 AGCCAGCACATACTGTATATCTGTTTACGTACATTCATACATATGTGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTTTATTATTA:1 - chr2L 20290299 5' - flea 243 2 53.47 ATAATGTCCAGGCCATTCACTATAAATAAGTCGCAATTGAATGCAATTTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTATAACCGTTTT:1 + chr3L 14226556 5' - Bica 277 1 52.48 TTGGCACGTAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACACATATA:1 + chr3L 9183575 5' + accord 7030 2 74.60 CGCCTCTTCCCTGCTTAAATATATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGC:1 - chr3R 15530101 5' - mdg3 5444 2 74.26 CAACACCACTTGTCAAATANGTGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 14949069 5' + roo 52 2 77.23 ATTCAGCAGGGCGCTAGCTGAAATTAATTCATCCCCAAATTCGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3R 8481967 5' + jockey 73 1 67.33 AATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 6399554 5' - roo 9030 1 64.36 TTATTGGCTTAGCCCCAAATTAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACG:1 + chr2L 12884333 5' + HMS-Beagle 51 2 76.24 ATGATTGGAATGTTTCATAAAAAATAATTATATGCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3L 2016846 5' + Tabor 6846 2 71.29 GCACGCTTGATTGGCGAGGNGAAATTTGTGGAAAAATTAAGTTCATTTAGAGACAGACGCCGGCATTGGAGAGTGTAACGTGTAACGAAATAAAGAGATGG:1 + chr2R 12636870 5' - Gypsy12A_LTR 2253 1 66.34 AAGCAAAAAGTTGCCACGGCGCACACTTTGCCGTGTCATTGAACGTCGTAATGGCTTCGGTATCCATATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTT:1 + chr2R 11041915 5' - jockey 4893 1 72.28 TCTAATCATAAAATGTCTTTTTCAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCT:1 + chr4 612338 5' + 1360 49 1 76.24 AACCCTGAGCTAGCGGCACTGCCACTAAGGAATTATAGAACTTTAAACACCGTAAACACATGTGAAGGAGCTAGACTTCAGCCCTGAATCCCAATAAAATT:1 - chr3R 3713695 5' + baggins 5322 1 74.26 TCGGGCTATTTGGATTGAGTCACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 28447364 5' + blood 7029 2 62.38 GACAATTAACACATGCACCAGTCAATTAAGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATA:1 + chr2R 18641367 5' - diver 6035 2 71.29 TGAGTACTCATCTATGGTTTGGGAAATTTATTAAAAAATGCCATAAGCCCGAGTTAAATCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTA:1 + chr2L 19907894 5' - Tirant 8477 2 52.48 ATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGAGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 - chr2R 8528258 5' - Transpac 5190 2 64.36 AACTTATTGATTTAGAATGCAACAAACGATGTCTGATATCTTGTACTAAACATCCAATTATTACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2R 22369647 5' - roo 9056 1 63.37 TTATTCTCACTTAATATCTATTAAAAAAATAATCAATTATAGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 17098426 5' - roo 9041 1 69.39 TGCTTAAATGGTGACCCCGACGCTTGAATTTCGATAATGGTACGCATAACAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACCATGCTTAAGCCTCACCCCATCGTC:1 - chr2R 5022191 5' + Idefix 223 2 53.47 GCAGCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2R 4606192 5' + 1360 8 2 69.31 TGTTTTTCCATTCTGACGGCTTTGTTCTGGCTTGTTTATGCCCTCATTGAGTGCGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 11829239 5' + jockey 28 1 57.43 GGTGAGACGGCTACATTTTNCATCATAAATTTCCTAGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 5421295 5' - transib2 2645 1 91.67 TACAATAGAATAAAATAATGAGAAGTATATCTGGTCTGCACGCGAAAAACAAAAATATTATTGAAATTTACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCG:1 - chrX 21453304 5' - HB 77 1 74.26 CATTAAAGCAAAATCATCATCATTCCATATCATATATGTGATATGCCATAAATTACTTATGCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr2L 4020682 5' + 412 7068 2 63.37 TACAGAATTGTGAAGCTCAAATTTTCAATTCAAGTATGACAGTAAGAGGAGTTGTTATGTACATAAAATAAGCCTTTAAAAAAAATAATAATAATAATTAA:1 + chr2L 11833482 5' + invader6 4387 1 90.10 TTACCAACGCTTTTCATTATTATCCTTTCCGCTTAATGAAATTACAATTCAACGGCGAGACCAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 19290646 5' - roo 394 1 60.40 TGTTTCCGGATTTTGTCACTCCACGAAGTGCGTGGGATATAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCC:1 - chr3R 18851060 5' + invader4 5 2 65.75 CGTGGGTTTTGGCCAGGTTTCAATAGGTATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chr3R 7582683 5' - 297 350 2 72.28 TATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3R 24228942 5' + 297 6623 2 73.27 TTAAGCTTAATAGTTTCAAATTTTACACCGATCACATTGAATTTTAAAACTGCAAACAAATATTGTGCATTCTGATAGGCTGTAATAATTGTAATGCATTT:1 - chr3L 2016973 5' - Tabor 486 1 70.30 ATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2R 25203785 5' - 1360 3342 1 69.31 ATACGACGATATTTTTTGTNACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTA:1 + chr3R 1440146 5' + G-element 19 1 60.40 CTCTGTCACTACTAACAAAAAATGTGGATACACCTTTAATATTTAGCTTTTTATTGGCTTTTTTTAATTAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr2L 1526374 5' + transib2 2634 1 60.71 TAGGTTTTGCAATGATTCCAAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr3L 8749938 5' + Doc 10 1 72.28 CCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATGTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 - chrX 21668084 5' + Tabor 6862 2 54.46 CTCGTTGGCCACACATGTACACGCATTCGTGTCCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATTAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAG:1 + chr3R 17256145 5' + I-element 333 1 65.35 TTTAGATTGAGGTTGTCCGTTCAAAAGAGTGTCCGTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 - chr3L 7215549 5' + copia 41 2 67.33 CATATGGTTTTAAGTATCAGAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 + chr3L 2016892 5' + Tabor 6892 2 74.26 CATAGTCGAGTTTTCGGAAATGGGTGGGAGCGGACGGAAGTAGATGTCTGCACGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTAGTATTGA:1 + chr2R 3143661 5' + invader1 3797 2 78.57 TTTCAGTTCTCAGCTCCCCCACTTATAATTTTAGCTTCTTAAAATTGGCAAATAATTGTACAAAAATAATGCATTGTGTAATATATTTTTAACGTTTATGT:1 + chr3R 6700695 5' + hopper 174 1 66.34 TTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGACGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3R 19094209 5' - P-element 2841 1 33.66 CTTTTCGATATAAAACAAAGGCTGCGTTAATTAAATCAAGCTAAAATAAAGGAGCTAGAATACAAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGG:1 - chr3R 17166131 5' - gypsy12 10000 2 56.44 GAAAGTCACGATTAGAGCAAAGTCACACTCCCCGAATCGAATGAAGAGGCCGATCCTGCTGTCTAGCCGGCCAGGGATACCTTTGGCTACG:1 + chr2R 23028683 5' + Max-element 8199 1 58.24 TCATATTCCCATTGATGTGGCTAAGCTTTTGCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTG:1 - chr2R 20744948 5' + McClintock 173 2 64.10 TGTAGCATACTTTATGGGGNAACATATTATCCCCGTCTCGTGTGCGTGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 - chr3R 24442508 5' + jockey 4697 1 60.40 TGGCCGGACCAAGTAGGCACTTTGGCTTGGTTTCCCACTTGAACGGCTTCATTAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCTAGTAGCTAAAGAACTT:1 + chr3R 22780708 5' - Doc3-element 475 1 57.58 ATTTATATATAATTGTGTGTCTTTCGCTCTTTCGCCGATTCGTATTTGTGTGTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr2R 19616212 5' - hobo 2916 1 56.44 GGCGACAACGCGACAACGCCGTCGCCTCACTCGTAACGGTACTAATTCTAAGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 - chr3L 25658499 5' - Max-element 8508 2 51.49 TTTTATGCCACCCGGCAAATATTTAAAGAACTTCACACTCGTGATATGTGAACTCAACAGGGTGAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3R 13441957 5' - 1360 3377 1 67.33 TGGACCCCAGGTCTAGGTCNAGGACTAGGACTAGAGCTCGACTGAAGGATAAAGGATTCGGGCTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chrX 4279469 5' + blood 7021 2 67.68 TCGCATTGGCATTTCTTACTTCCACCCCAAACTGTGACGACTACTGTGTCCTTTGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAGTGTCCCGAGATTTCTTCGC:1 + chr3R 19352235 5' + G-element 98 1 61.39 AAAATCAATTTGTCTTCTTTATTTGGAAATGCAGTTCTCGTTAAGGTAGTCGTTCGGACTGCCATAACTTACATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGC:1 + chr2R 4248047 5' + gypsy 6990 2 76.24 TTCTAATGATGCCGCGAATGAAATTAACATTTTGTTGCCTACTTTGCGGCTGCCTGCAATCACCTAGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:2 - chrX 15183833 5' + hobo 9 1 66.34 CTCTGTTCCGCTTGGCTGGGGCGGCGGCGGTGGTGGCATAGCGAGCCGCGTCTCCAGTTGATGAGCCTAGACCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATT:1 - chr3R 14813422 5' + F-element 4233 1 39.60 TCTCTGCTTGCGATTGGGCTTGTTTGTAATTCAATTATGTTAATGATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr3L 13639830 5' + hobo 8 1 71.29 ATACATTACCAACGTTTAGGCGCCAACAGGCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTA:1 + chr2L 14954837 5' + hopper 1318 1 75.25 ACCCCAAATATGCGCAACACTTTCGCGCCACTTGCGCACGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 2916994 5' + hobo 14 1 65.35 GGCAAAGGCCAACACTAGTTATGACTTATTCATGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2R 16580424 5' - pogo 2058 1 67.33 CGCTGCTTGGTTCCTAGCTGCCTTCCTGATAAATTGCCATAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTA:1 + chr3L 19661067 5' + 297 6512 1 60.40 TTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAATTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTA:1 - chr3R 545851 5' - HeT-A 6046 1 50.50 CCCTTTAACATCAAGATGCNAGCGTTGAAAGGAGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 14132064 5' - roo 387 2 56.44 AAATTTGCGAATATTTTAATGCATCGCATGGTCCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 6830725 5' + hobo 34 1 68.82 AATTATGTACTGAAATTATATCCAAATTGTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCG:1 - chrX 22472599 5' + invader1 3640 2 69.31 AAACCATTTAACAATTACCACCCTTGTATTCTTAAGCAGCTCGTTCAGGTGTCAATTCGAACTGATTAATTTTACTTTATATATTCTTGATTAGGATCAAT:1 - chr3L 22257739 5' + INE-1 83 1 75.25 ACATTTTATTTAATATCCTACAAATACTGTGGAACATAACTTATGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 21931494 5' + 412 7085 2 58.42 AAAAGATGCCATGATAATGCATTTGACAGTTGCAGTAGTTCCTCCATTTTTTCCACCATTTTTTCACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr2L 16566255 5' + 297 6582 2 77.23 GGAAATCTATGAATATGTGTAGGTGGTCTTGTTTATTTATTTATTTTATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTA:1 + chrX 5163995 5' - I-element 5138 1 64.36 CATCCTAAATAACTACGTTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 + chr3R 8856935 5' + rover 6977 2 55.45 TGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 - chr3L 25345141 5' + Doc 54 1 72.73 TGACGTTGGGTTATATATGGTTTTTGCATTTGAAATGTAAATGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGG:1 + chr2L 11891024 5' - accord 146 2 58.42 ATACATTGCCACTTAGGGAGAAAGCGGAGATGTACGGGGACGAGATGGTCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACCCCCGTATGTTGGCGGGGCAAGAACT:1 - chr3L 23608488 5' + Rt1a 4795 1 61.39 GCCAGCTTTAGGTTGCTAAACATTTATTCAGAAATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 - chr3L 7260532 5' + Burdock 36 2 65.35 ATGCTATTTGGCAAATATTCGGCTATATCTGTGGGTATTGTTGGTATAGTTTCTAGTGAATCTAATTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGG:1 - chr3L 8281963 5' - Cr1a 4080 1 56.44 ATTTTGTTGATATTTGCCCAACTTGATTATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chrX 9828532 5' + Tirant 15 2 66.34 GAGGAAATTTTGTAACTAANTTCATACTTGGCTTGCACTTTTCATTATATAATTTTCCCTTTCTAACCAAGCGGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCT:1 + chr3R 9544889 5' - micropia 5197 1 59.41 CCGTCACTCCATGTGCTGGCCTGCAGTTTCCCCAAGTCATTAGACCGCCATTAAAAAAGGTCGTCTGGATAAGCAAGATGTAATAAGTAATAAGTAATAGC:1 - chr2L 16994902 5' - Stalker2 402 2 77.23 CATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTT:1 - chr2L 23373500 5' - Tc1-2 1580 1 67.33 AATTGCATTTAAAACTAATTAAAATTGTAGACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 22219597 5' - roo 9028 1 73.27 TAAATAGAAGCAAATTAGGAGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 2029718 5' - roo 9014 2 79.21 AATTAAGAAAAATATAAAAAGCTTTGCACGCCACAGATACTCCGATATATATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2R 7775441 5' + pogo 16 1 63.54 GCTTTCCCACTCTCAGCGATCTCGCTCTCCCTCGGCATCGGTGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chrX 9584733 5' - pogo 2070 1 57.43 TATTTCTTCGCATGCCGGGCTACACGTGTTGGTAACATATTTTTGGACATTATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3L 4923765 5' + jockey 31 1 54.46 TTAATGAAATCACTAAGCATGATGAGCGTTTTATATACATTTAAGACGAATCTTGCCCGAACTCATTATGTAAATTTTACAAAATATGCCCTTCACCTTAG:1 + chrX 8330959 5' + 1360 215 1 78.22 GCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 7582614 5' + 297 21 2 58.42 TTTCGGTGTACAATGGGGGGCGTGGGCATGAACGCGTGCCAATTTTTTTGTTTTTTGTTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAA:1 - chr3R 28745296 5' - Rt1b 5116 1 65.22 GTACTCATCTATGGTTTGGGAAATTTATTAAAAAATGCCATAAGCCCGAGTTAAATCCGTGATCGAGGGTGGAGCCGTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 + chr2L 19907897 5' - Tirant 8475 2 53.00 CACACACATACCGCAGCAATTGCAATCACTCAGTTTGTGTTTCTTCTTTTTTTTTGTGTCCGTTTATTCTTTAAAGACTCCTGGCGCGCCGGCGCCCG:1 - chr2L 4625746 5' - Osvaldo 1493 2 38.78 CAAACGTAGCCACAATATTNTATATAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACATCAACATCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCTGACAC:1 + chr2L 23332219 5' + ZAM 8097 2 66.34 TTTTGCAAGGTTGCATTTTTTTGTTGCTAGATATTTTATGACATTCCAAGCAATTCAAAATTTGATTTAATTAAGTCATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCG:1 + chr2R 7940737 5' + Juan 3 1 76.24 GTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGC:1 + chr3R 11118043 5' + BS 37 1 65.35 TAATGTCTGCGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 + chr2R 15160301 5' + Tirant 35 2 58.42 AAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCT:1 - chr3R 11547758 5' + G2 313 1 61.39 AAAAGTGATCACTTATTGGTATCTATGTTATATAAATTGCATCACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr3R 17255996 5' + I-element 32 1 54.46 TGTGTGTGGTGTGTTAAAAGGAATGTGACACTTAGAAAAATTACGCTGGTGTGAACATTCATTTTTAAACGTATGTCTTAAGCACGTCATATGCGGGTGGC:1 + chr3R 25864895 5' + Stalker3T 240 1 81.19 CTTAAACGGCCTTTGGAGTCACATTGCTATACTGTCTGATTTTGATTTTCGGAACTTTTGTAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGAGTTGGG:1 - chrX 21976901 5' - FB 105 1 61.39 ATTTTTATGCCAGCCAAGGTCTCGAGCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3L 7463322 5' + hobo 46 1 72.04 TGTGCATTAAGCCACAATGAATTCTCTTTTGTTTTTTTTTTATTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTTGTAGTATGCGCATATATCGAGTGTACACTG:1 + chr2L 2622684 5' + blood 7021 2 60.00 TAATATTTCATCCTTTGGCATGGTCATGGTTCGCTCGTTCTCTTCTTCGTTTGTACGTTCGCCTCTTGATTTGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2L 16690521 5' + P-element 1 2 75.25 TTATCAAGCAGGCATCACACACAGCGCACACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGC:1 - chrX 18586787 5' + accord 320 2 77.23 CAAACATTAAGGTCAGATGTACAGTATGGAAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 + chr3L 20032260 5' + Tabor 6884 2 67.33 TCGAGTCCCAGCTCCAATCCAATCCCACCAACTGCTCGTTCTATTTTTCGCCCATTTTGTGTGTGTGTTTATTTGGGATTTTTAAAATTATTTTGTTTTTT:1 + chr3L 15234166 5' + 1360 3094 1 66.34 GCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chr3L 2016879 5' + Tabor 6879 2 61.39 AGTTGTGCACGCATCCCAATGGTTCGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chrX 8228129 5' + jockey 64 1 75.25 GTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 9871577 5' - roo 9045 1 53.47 TGGCAATGCCAGGATGCACTTAAGGTGGGCAACGATAAAAATCGTTTTACTGCCTCCGTTCGCACACATACACACACATACACACACATACACACACATAC:1 - chrX 19895728 5' + accord 7039 2 55.45 CTTATAGTGTCAAGTGTCCTTCTGGTGCAAAATGTAAAATACTGCAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACG:1 + chr3L 14878617 5' + Juan 7 1 73.27 CGATTCCGATTCGCTGGCAAACGAGCGAGTTGCCCACCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chr3L 5360164 5' + P-element 40 1 41.58 TTGATAAACTTATCTCTAANGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chr2R 25203774 5' - 1360 3353 1 58.42 TATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAAAAAAATCAAAACAATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chr2L 20117921 5' + flea 4766 2 66.34 CGGTAGCCGCTCTGCTCCTCGTCGGTGGATCCTCCTTTGCGGCCATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCG:1 + chr2L 15580289 5' - 1360 3222 1 55.10 CTGCGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr2R 15160307 5' + Tirant 41 2 64.36 CCAGGTGATTTTATTCACGATTCCGCTTTCGAATGCATGGAACCAGGCTCTACTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 11699252 5' + roo 8688 2 55.45 ATATACTTATATTTATCAGCAGATATATATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3L 15390348 5' - pogo 2058 1 74.26 CTATCCAAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCG:1 + chrX 18146940 5' - INE-1 555 1 67.33 GGGGGAGGGGGAAAGAGAGNAGCCGCAGCAGACGGAAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTC:1 + chrX 11375174 5' - gypsy 7406 2 64.36 TGAAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAATATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3R 11814488 5' + blood 7047 2 57.43 TTTTCACATATTTATTAGTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTTTATGGTCGAGTTGCGTATATGTATACCAGGGACAGTTGTTTATTTGTC:1 + chr2L 22063439 5' - Helena 1151 1 70.30 ATGTCAAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTTGGCAGTTTTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACG:1 + chr2R 2245003 5' - INE-1 136 1 56.44 ATTTATATTTTAATTTCTATGTTTGCTTACTTTTTGATTATTATACTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTC:1 - chr2R 3822063 5' + Max-element 148 2 55.45 TAGGTTATAGACTACATTGAGTAACACTGGATAGGGCTAATAGAATACGCTAGGGATAGATACTTCTACATATTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAA:1 + chrX 7022276 5' - Idefix 7073 2 78.22 CATTGCTTTTAAAAGAAAATTACGCAATCTCGAAATAAGAGTTTTTGCATCACCCTCGCCCTCTCACTAACTGAGTTAAGGGTATCTGATAGTCGAGAAAC:1 - chr3R 4508450 5' + INE-1 556 1 77.23 AAGGAAACAGAAAACCATTCCATTTAATTTATTTGTGTTGCAGCCAGCCAAACTATTTTTATAAGTTTAGAATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATA:1 - chr3R 17036536 5' - Transpac 311 1 75.25 AAGTCGTCAGCATTCGTCACCTCACTTCCCTGGCAACTGGGAATTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGT:1 - chrX 21273590 5' - X-element 4681 1 56.44 AAAAGCCTGTGTTTGCCTGACGACAACGCATAAAAAACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGAC:1 - chr3R 7893125 5' - jockey 4739 1 67.33 ATTTTTTTCCACTTTTTAACTTTTTTCAGCGCAGACTAATTCATTTTTATAAATATTTTTCACGTCTTTATTTTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATC:1 + chr2L 8290807 5' - 297 275 2 56.44 TAAGAACGTTTAAAATAAATTAGTGGAAATGCGGGTATATATATATAACATAACAAAAATGTTATAGTTTTGGGAAGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGCCAT:1 - chr2R 4751792 5' - INE-1 216 1 77.00 GTAATCACACGCAATCTTAAGCGCCCGAAAGCATGCTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAA:1 - chr2L 9287242 5' + jockey 7 1 77.23 AGGTGGCTTTAACCGCATTTGCATGGCTTGTCTGGACGGTAAATCGATTATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chr2R 13540966 5' - 297 375 2 60.40 GGAAAACTATATACTTCTTTTGTATTCTATCTAACCCGAATCCTATTATCTTATACACAACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3R 15882673 5' + jockey 22 1 59.41 TGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 14132096 5' - roo 9018 2 78.22 CGGGACGAGATCGAGAACATTTTCAAATCAAAGATAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr3L 25333348 5' - pogo 2065 1 67.33 TTTTTTATGTAGCCCGCTTTTGGGGCTACACACACACACAAACATAGAGTCGCCCAAACGCAGGCACACATACACACATGTAAGTCCTCACATGATTAGT:1 + chr3R 17362856 5' + BS 4993 1 78.00 GTATGCAGTGAAATAACAANTAAAAGAGTCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2L 15773362 5' + hobo 43 1 68.37 AATCCTCCCACTTCCCTTTCTCCCCAGCTGCGTCTTAAGTATTTTGTAAAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr2R 20441301 5' + I-element 26 1 51.49 TCACCATTTGTTGTGTTTCAAGGTTTTATATTATAATAATTAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 18406616 5' + Doc 40 1 58.00 GATGAAATGTTGAAACTATGGATCAGGAAGGCGTGAGCGGGCTTATGTTTTAAGCTTGGCTTAGTCGGATGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTC:1 + chr3L 14173749 5' + flea 144 1 70.30 TTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chrX 11088294 5' + blood 21 2 58.42 AAATGATTAACCTCTGGGTAGGCAATATACCCCTGATACCCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chrX 8896227 5' + 1360 32 1 58.42 TGATTTGTGAACATAACTATCATATTGGTTTGTAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATG:1 - chr2L 12801582 5' + hobo 2557 1 67.33 TTTGTACAAAATATTACTGGCTTTGGTGTTTCAAAAGATCCGAAATGTGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 - chr3R 5993347 5' - Tabor 456 2 51.49 CAACTGGCTGGCATTGCTGAAGAAATAACTTGATCAACAATGTTATAGCATAATTGCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3L 2424935 5' + jockey 30 1 54.46 AAGATGCTAGCGTTGAAAGGAGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chrX 14132076 5' - roo 9038 1 56.44 AAAAGCAATTTGGTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2L 12800953 5' + hobo 27 1 52.48 TGATTATGCCATGAGGATCAATTAGTGAGGCGGAGAGACAACAGCAATGTCTAATCAGTATATGTGTATAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGC:1 + chrX 7561585 5' - rover 128 2 53.47 CTAGTAATACACTGCCCGTTCCTTCTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1 - chr3R 4769539 5' - copia 239 1 60.40 TAAACTACATGCGACTGTGTCCTTAATTTTTATACCCGTTATTCGTAGAGTAAAAGGGTATATAGACTCGTTTAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCG:1 - chr2R 4828786 5' + INE-1 30 1 74.26 CTTGTGTGTGTACACTTGCNGGCTGGCCAGTAACCTTATTTCCCTCGCTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGAC:1 + chr3R 9019808 5' - hobo 2837 1 57.43 GAAAAGGTTCTTTGCACCACGAAAGATACTTTTCAATAAAAGCGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2L 7161370 5' + pogo 31 1 58.42 CCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 + chrX 21668013 5' - Tabor 446 2 61.39 ACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3R 28447385 5' + blood 7050 2 60.40 ATGCCCTATCTGATGAGCCCACAATCTGTAAAATAAAGCAGCAGCCACTCCACCACCTGCCTCCCGATGTCCATACGTTATACATATACATGTGTATAC:1 + chr3R 22066724 5' - Stalker2 7498 2 68.69 AAATAAATTAATGCACTTANTTTTATTGGTTTCTATAATTCATGCTCGTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 9887400 5' - hobo 2911 1 51.49 CAGACACGCCATAAACAAAGCGTCCAATTGTCAGTTTAGGCGCCTTTTGTTTACTTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGT:1 - chr3L 22344766 5' - I-element 329 1 65.35 AATCAAATCCCATCTAGGCACACATTCCGTCACATAGGGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2L 10020835 5' - hobo 2901 1 60.00 GAGCAATTGCAGTCGACTGGCACTCACAAACAGTGGTAAAGTTCCCTCGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGA:1 + chr2R 6051260 5' - 1360 381 1 56.44 TTTGTAAAGCTTAAAAGCCCATTAATCTTTGATTAATATTTAATGTTTAGAATACTTAAAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGT:1 - chr2L 4020786 5' - 412 7532 2 62.38 TGTGAAGAAAAAGGTGGAGAGAGTAATACAATCACGAGCGGCACGACATGCATTTGGGCTACCCTGGTATGTGAGGAACCGAGTTATTGAAAGGGACTTAA:1 + chr2R 2950863 5' + G5A 2545 1 81.19 CTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr3R 4769515 5' - copia 5084 2 67.33 AATTTTATTCCTCCGTTTATTTTCATTTTCCTTTTTTTTTTTG:1 - chr3R 21939178 5' - Doc2-element 231 2 79.07 ATAGAGTTTTGTATTCAGATAAAAATGAGAAAGACAAGCAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 - chr3L 26567349 5' + opus 7034 4 60.40 AGTTGACTAGTTAATGCCGCTCCAAGTGTCCGCGAATGTCCTTTTTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTT:1 - chr3R 30728273 5' - 1360 3264 1 53.47 CTCCTTCTCCACGTTCAAGCCAGCACATACTGTATATCTGTTTACGTACATTCATACATATGTGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr2L 20290316 5' - flea 247 2 70.30 AATAGTTTAGAAGGCAACATTTTTCCTTCGACATCAGCGATAACCCGCAATTAAAGCCGGGCCAAATGATGATGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 - chr2R 18111549 5' + hobo 2710 1 80.20 CCAGGGAACCTTGCTCGTTTCCGCATCCTTTCGCTTTGAATACCCTTGGGAAGTTGGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3L 1904242 5' - hobo 2919 1 59.41 GTAAGAAAGAAACTCAACAGTCGGCCAGACCAAAAGGTAGCTATTCCAGAGGAGCCCAAAGTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 10805384 5' - HMS-Beagle2 492 1 64.10 CGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGC:1 - chr3L 10014042 5' + jockey 220 1 61.39 CTCTCATAAAACGGGGCATATAACAAATGATAGTCGAGGCCACGCCCACCGCTACTGGCTCCCAAAAAAAAGAGGAAAAAAAAGAGAAAAAAAAGAACAA:1 + chrX 4890967 5' + gypsy7 5009 1 77.00 AAGCCACCATTAAGTAGACCTCCAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGT:1 + chr2L 13253409 5' + Rt1a 58 1 75.25 AAAACCTTTTTTCTGATCAAAAAAATATTTATATGAAAAGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAAAAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAA:1 + chr3R 24358008 5' + Dm88 4298 1 68.32 AACAGCCACAACAGCATCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCA:1 + chr3R 23465064 5' + Max-element 295 2 76.12 GAAAAGGGTTTGGGCAATTCATCTTGGTTGGTAAATAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 9439226 5' - roo 9037 1 68.32 TGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCAC:1 + chr3L 23907450 5' - 1360 3305 1 70.30 ACTGTGGTGAGTTTAACGGGAGTGTATCCGTCCCATTCATGCCCGTTGACAGAAGTGGGATCTCCCAAACCTCACAACTGTGGAGACAACCTGCAAACACT:1 - chr2R 17394452 5' + invader5 384 1 53.47 AAGTTTAATTTCACTTTCCTTTTGGCCCAGCACCCTACCTCTGGTACACATCCTGTTATATCCCCACCATAATGAGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCA:1 - chr3R 23619832 5' - G5A 411 2 73.27 GGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGCGAGAGAGAGGCGACGAAGGCCTATTGGCCATAAATTATTAATGATTACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 + chrX 17699872 5' - 412 7541 2 73.27 TTGAAATGAGCGCGCCATTTTTCACCAGCTTGGCCCAAAGGAGAATGGAAAGAAGGTGACTCTGTCCATGGCCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr2L 18239514 5' + hopper 11 2 70.30 ATTGAGAAAAACATCTTAAGATTAAAACAAGGGCGGTTTAAGGTCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAAAATTGATTATGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACT:1 - chr2L 23026411 5' - INE-1 300 1 70.30 GTCGTTCTTAAAGCTTACCCGCTTCGCTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGA:1 - 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chr3R 6171229 5' + 297 6583 2 73.63 GCGTTTTCTGCTCAACACGGCGGGCAGAAGTGGTGATATTGTGAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3R 5359997 5' - 412 460 2 60.40 CCGTCCATACCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGG:1 - chr2R 14849024 5' + flea 4707 1 64.36 TAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTTAGAATACAAAAGAATTAACTCTTTACAATCACGCGGTCAAACAAAA:1 - chr3R 4577076 5' - Tc3 354 1 71.00 AAAAATCCCGAGTTATATTTTCGCTACCGGTGAAAGCAGCTTATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr3R 29432826 5' - Transpac 5201 2 60.40 AAAAATCTAGAATTTTTAACTTCAGCTTACTTTAAAAAGCTTGTTACTTTGTTTTTTAAGTTTTTAAGTTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAG:1 - chr4 574482 5' + Stalker 6857 4 48.51 ATAGATTTTCTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr2L 12764995 5' + Doc 61 1 62.38 GTATTACTTATGCTTAACAGAAACGAACGTTTTCGTTAAAATGTATTAAAATATATGTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3R 6104354 5' - pogo 2087 1 65.00 GCACTCTCGATATAGCTACCTGTGGATCGGAGAAGAGGGAGAGAGAAAACGTTTAATAAACCCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chrX 16272522 5' + pogo 7 1 70.53 CGCCACTTGCGCACGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:2 + chr3L 2917019 5' + hobo 39 1 67.33 ACTTGTGGAGGGATAATATAGAATAAAGTTAGGCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAAT:1 + chr2R 21776272 5' + I-element 194 1 74.26 GCCCTGAATTTTTTCGTGTGCATCCACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 22237026 5' + 297 42 2 73.00 AAGCGGTTTTAAAAGTTGCTAAAAAGTTGTATTTACAAGTGTCATAAAACTTTATTATTTATGTAATTTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:2 - chr2L 18585952 5' + Doc 47 1 37.62 TAGATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTGTGCTTTCTGTGCCAATACATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 29608759 5' - roo 396 1 68.32 GCAAGAGCAACAGAAATAAATTAATGCACTTAATTTTATTGGTTTCTATAATTCATGCTCGTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr2L 9887413 5' - hobo 2924 1 65.35 TTTTTATGTCTAACCAATCGCAGAACGGCAAAGGCCAACACTAGTTATGACTTATTCATGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr2R 16580450 5' - pogo 2084 1 59.41 TTATAAGCGTACTTGATAAGTAGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 + chr3R 5503364 5' - blood 7336 1 78.22 AAATATTTCGAGAGGAATGAGGCCAAAAGGCAAAGTCCTGGCCACAGCATAATTTCGAGTGCACAGATCCGAGGAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACC:1 - chr3R 28447477 5' - blood 7387 2 74.26 CACGTAAAAACTTTATTACAATTAGACACAAAATGTGTATAATTACGCCGCAGTTAAACATTATGATCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2L 7991912 5' + P-element 7 2 68.32 AATCTGTATAGAATTTTTTCAACGAAGCGAGCACTCTCTTCAAATTTGTTCAACTTTGGGAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATC:1 + chrX 19814474 5' - INE-1 564 1 58.42 TCGCACTTCAAACGAAATATCCCGTCGAGTACTCCGGACTGTCTCAAGTGTCCGTGCATGTTGGACCACAACAACAACAATAATAACAATAACAATAACAA:1 - chr3R 19983748 5' + mdg1 17 2 65.35 AGAGTAAGAAAGGTTTAAGTAACTTTTTATAAATGGAGCAAACAAAATTAGGGCATTAAAATATAAATAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACAT:1 + chr3L 13204339 5' + I-element 5122 1 62.38 TTCGGCATAGACGTGCGAACTGGGTTAATTTTCTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr2L 20330088 5' + 297 36 2 72.28 CCTCGGTAGTAAGGCCAGAAATAAGGCATATTCTGCCCAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr2L 13621958 5' + opus 34 4 61.39 TTCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3R 30284226 5' + blood 46 2 72.28 ACCGGCTCTCCGAGGCTCTTTGTACTGCAAATTAATGGGCAATGCGCAAGAAATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACT:1 - chr2L 13156268 5' + copia 4796 1 54.46 CTTAGAAGACCTAGACTAAACTAAGCCTGTAATATGTGTTTCACCAGTCTGTGGACCTGTTCAATAGTTCCGTGTCCCTTTCGAAATCCAAATTGATGATC:1 - chr2R 9041878 5' - Helena 283 1 78.22 CTGTTCCTCTCAAGATCCCCGAACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 - chr3L 13059736 5' - transib2 2772 1 77.23 GCTCTCCGGAAACAAAACCGGCACCAAGGGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATT:1 - chr2L 7225749 5' + I-element 243 1 71.29 AGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 20425398 5' - roo 360 2 76.24 GATGTTAATTATTCGTTTTTAGTTTTACTCCATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTT:1 + chr2L 12800801 5' - hobo 260 1 69.31 GATTATATCCGTTCGATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATT:1 + chr2R 19352194 5' + 17.6 6953 1 55.00 TTTCTAGTTCAAGTTTATTTAACCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chrX 14564672 5' + Doc 64 1 82.18 AGGGAGGATCCACGGCGGGAAGCGGCGGTCTGGCAAAGTGAGTAACTAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATCATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAA:1 + chr2R 21681095 5' + invader2 4745 1 52.08 GAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 6399540 5' - roo 9016 2 78.22 GTCGGACAGGATGTTGAGAGCAAGTAAGCTCAGTGTGGGCGTGACAGTTTCGGGTGGTTTGGTATGTCTTAATGAATTTGTATTCTGAATCTCAACCTTCT:1 + chr4 988666 5' - INE-1 172 1 69.31 ATTTTTTGTAATTTTTTTTCTTTGTTTCATTGGTGTGTTGCCTATGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCGAGCGGGAGGTTGTTACAA:1 + chr3R 9120733 5' + jockey 235 1 53.47 CGGTCAGTCGAAAGATCTGTAGCGAAAAGAAGCACTGTTTGAAATCAGAGATTCAAGTAAGAGAAACCCCATTAATTTGTTGTTTTTTTTTAATTTACTTT:1 - chr2L 10294508 5' - F-element 4681 1 63.37 AGTACTGCTACATTTACTGCAAAAATGGCCTAAAAATCGCCTTTCAAGTTGCACTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr2L 5244405 5' + transib2 17 1 62.00 ATTAATCTCAATTTAAGCATTTTTATACGATTGAAGAATATGAGTACCAATTCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr2R 4896817 5' + Tabor 25 2 54.46 GGGCGTCGCTGGCAAATTACCTAGGCAAAAGTTGTGAGCCCCAGAATCAACAAAGGCCGTTTGTCGAGCTCAAAGCAGCTGGGGTCGGAAAAACCGAATTT:1 - chr3R 31411406 5' + FB 14 1 65.35 ACGGGGGCGTGCAATATTCGAGGGCGTACAAATGGTTTTCATGTGATATTTTTTTATTTTTTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chr2R 11524537 5' - I-element 5328 1 54.46 TGAGCCAGAAACTGTACGCCAACTCAAACAGAACTCAGGCCATGCCCCACAACCCCAAACTCCATCCCGAAATGGTAAATGAAGACAGCGCAACTGATTCT:1 + chr3R 21839399 5' + G4 136 1 67.33 AATGCAGTGGCACTCAGCCAGTACCGTTAGCCAGCGCCATTAGCCAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCA:1 - chr2R 18203984 5' + G2 294 1 55.45 TATTCAGTATACGCAATTTGCATCTAGCAGATGCACTTCACTATAATATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2R 16639644 5' + opus 7025 2 57.43 CCACCAGTGGGAATGGATTTTACGGAAGAGCGTATCTGTGTTGCCACTTTCGGACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTC:1 + chrX 15470910 5' + R1A1-element 242 1 51.49 CGATCCGCTGAGCGAGCGATCGCCGGTCGCTATTTCCACCGGCGCACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chrX 15499016 5' - P-element 2855 1 31.68 AGCTAAACACAGAACTAACCACTAGATGTATACAACACATTATGAATACGCTATGCCATGTGCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 20381079 5' + jockey 22 1 64.00 GTTATTAAATAAAAACTTCAATCGCTGATATCTATATATATATTCAAAGATGGCTATATAAATATGTGTATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 + chrX 5271289 5' + mdg3 5260 1 70.30 CTACACATACATAAAGTGCGTATTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chrX 1716659 5' + hobo 53 1 76.24 CTGTGTGTAAGTCGACTGGNCAGCGAGCTCCAGGCGGGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTG:1 + chr3R 10662558 5' - blood 7063 2 63.37 CCCCGATGCTTTTTGCCATCTTTTGGCCAGGCTTTATCAGTCTGGAGTCTGCCTGTTTTGGGGCTTTTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGT:2 - chr2R 18939594 5' - Doc3-element 187 1 67.33 GGCCGTCTGTCTGTCTTTCTGTTGCTGTTGCTGATGTTGCTGCTGCTGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAG:1 + chr2R 11076951 5' - Max-element 226 2 56.84 TCGGACATATCTTATCCGATAATATTTACGTCATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCAGACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTC:1 + chr2R 2944563 5' + 1360 3278 1 68.32 GTATTTGTTAGTTTAAGACTATACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGAACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAAAGCAGACATCGAGCGGTCAAT:1 - chr2L 17002280 5' + F-element 301 1 74.00 GTTTAGTTGTTTTCAACATCTCCACTTGACGTTGCCTAACACTGCCTGCTCTCTCTCGGCTTCTTTGCCACTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2R 19424177 5' - P-element 2882 2 72.28 CTCTCCTATTATCTCGCTTTTGTTGACTGCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3L 14143326 5' + pogo 42 1 72.45 GAAAGTAAAGCTTTGTATGCAGGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chrX 17284900 5' + jockey 4723 1 76.24 ATACTTGCTTGAGCAGAATTAACACCTAAAATAACTAACTAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAAATTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAA:1 + chr3L 4435501 5' + G5 4726 1 60.40 TTTGCCAACTCGGAGTGGCCAGCAAACGCTTCTAGCTGTTGCGAATTTCGCTACGATCGGTGCACTATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 - chr2L 12064788 5' + opus 5 2 74.26 AAAAATATCCGTTAAAAGCTTTAGTTGTTACTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 15523358 5' - 412 7505 2 66.34 CCACACATCCCCTTCATTATCCTTCGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTC:1 - chrX 16246804 5' - I-element 346 1 73.27 CGTTGGCCAAGCTCAAGAGCAAGCAGGGCAAAAGCGGCGATGCGCTCTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAATT:1 + chr3R 7310697 5' + jockey 76 1 56.44 GAGTCTGCCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGC:1 - chr2R 6482758 5' + gtwin 6928 2 67.33 GAGCAAATAAGTGAGTTAACTGTAATTTCGGGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:2 + chr3R 24464801 5' + 412 7097 2 68.32 TAAGAGTATCGCTCTGTCAGTCTCCACCTGAATCCTATTTTAGCTCTCCTATTATCTCGCTTTTGTTGACTGCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr3L 14143283 5' + pogo 2 1 75.25 TATTGCTTCAAGTGGCAACTTCGGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chrX 19607334 5' + Tirant 4 2 77.23 TCTGCCTTATGGTGTTGAANTGCGCTTGTTGATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 - chr2R 3032022 5' - F-element 4384 1 69.31 TACTATTAAAAAACTAAAACTTCAAAATAGGGACTTAAATACAACAAAATCTCTTCAAAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 5025594 5' - roo 9054 2 59.41 TAAACACATATCGAATTCCCTACGCAACACGCAGACACCCTTTTAAAGTTACGTTATAACAAACTTATTGGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTA:1 - chr3L 8749227 5' + Doc 4594 1 72.28 AAGCGTAATCACGTAATTAAAACCATTTACATATATATGTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chr3R 19955225 5' - hobo 2903 1 63.37 TGCGTAGTAGATAAAGCTANCAGATTCGTTCGTCCGCCTGACTTACTAAAGTCAAACCAAAGTGATTGTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 20148335 5' + pogo 4 1 74.26 AAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATCTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:1 - chr3R 19446736 5' - HMS-Beagle 7020 2 61.39 TCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAAC:1 + chrX 15408749 5' + INE-1 534 1 84.16 CTATAAACTTTCAGCTGGGAGAGCAACAACAAAATATTGTTGAAAATAATGTTGCTTTTCCCTGCTCATCTCGTTGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCG:1 + chrX 18118461 5' - F-element 4325 1 77.23 AGTCGGTGGCATTGTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAG:2 + chr3R 11118030 5' + BS 24 1 52.48 TAGCCCTTTGCAGCCATAAACTAGCCCCCTCACCTTTCACCTGACTCACACAACTGAATAAATAAATAAA:1 + chrX 18163791 5' + Juan 4214 1 87.14 AGTGAAAGTATTTACAAATTCAATTACATACATATATGTATGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - 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roo 386 2 56.44 CAAGTGGCATCGCTGCGGCGCCTGGGATTATGCAAAATTCAATTTGCAACTTAAATGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 897663 5' + roo 21 2 59.41 TATATGATACTTTCATATTTCCTGTAGTTTTTATAATCATTCTAATCTAATCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAAT:1 + chr3R 5886346 5' + I-element 4881 1 49.50 AGCGGATCGCTTTGATTTGTGTGCTCACACATAGATTTGTTTATATTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACGC:1 + chr3R 17713475 5' - G2 2809 1 52.48 AAATAATAAATTTCTTAAAATAATTTCATCGCTGGATTCCTGCGCCACCACAAATTACTTTTAGAATACACTTAAAAACTGTACCCACTAATGCTAAAAAA:1 - chr3L 18377029 5' + TART-B 10165 1 81.19 TGGATTGCTCTTTGACTCACGTAAATCGGTAATTGTAGCTGTTAATTGTTTTGCGTGTAATGCAAAAGTCAGTGAGGTCGTTGACTGAATCGTTTGAGTTG:1 + chr3L 21604603 5' - Doc4-element 344 1 77.23 AACATTAAATACAGGCAAGGAGGAGGATAAGGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTNCNCCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAAC:1 + chrX 13030947 5' + F-element 492 1 65.26 TGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGC:1 - chr3L 24761255 5' + 1360 43 1 66.67 TGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 12800967 5' + hobo 41 1 64.36 AATATTTTAAGGTGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATACAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTTCACTTATTT:1 + chr2L 21795758 5' + HB 83 1 49.50 TAATCGCAATTGCAAGGGGATCGGAGGTGGCTCTTCAGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATC:1 - chrX 21237606 5' - invader2 140 2 66.34 AAATTACTGAGTTATGCCAGCTGTCGCAAAAATCCCGAGTTATATTTTCGCTACCGGTGAAAGCAGCTTATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 - chr3R 29432853 5' - Transpac 309 2 79.21 AAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTG:1 - chr2L 23295877 5' + micropia 4973 2 58.42 CGATATAGTGCAGACAGGAGGGAGTCGCATAAAAATGCCAACTGTCCGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCG:1 - chrX 22766466 5' + HMS-Beagle 108 2 58.42 TTTACTCATAGAACGATCTAGTTAAAGCTTCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:2 - chr3L 17687848 5' + BS 42 1 69.31 ACTTAGAAGAGTATAGCATTGTCGAAAATCTGCTCATATTTCAGTCAACCAAGCGGAAATCCTTTATGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAAT:1 + chr3R 20000185 5' + FB 71 1 70.41 GATATATATAAGATTCAAATAGTTAAACCTACAAACTAGAACAGTTGGCTCAGTACGTGAAACATAATATCAAAGTGCTGACCCAGCATTGGGCCGGAAAC:1 + chr3R 32034506 5' + Gypsy6A_LTR 65 1 72.28 TTGATCTCAAGGCTTAGCAATATATTTAATCAGTGTAAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAAT:1 - chrX 17792592 5' + pogo 163 1 63.37 TTGGGTGGTATAGTATATAAAATAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAA:1 - chr3L 15776938 5' + I-element 192 1 79.21 ACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTTAAAATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGAT:1 + chr2L 23286583 5' + Tirant 415 1 58.42 AGGCATATATCACCGCCTCGCCCAACCCCTCTCGTCACCTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 20432463 5' + roo 8701 2 65.35 ATAAAGAAAACAAAACAAGCCCCGAGTCTTCGTTTTCGTCTTCAGGGGAGTAAATGTAGATCCTACTTGCCGAAAACGCACTCTTATAGAACTCACAATAT:1 + chr3R 23297500 5' + gypsy4 295 1 80.20 TAGAGAATCAGCCACCTGGAGCTCCGATCCGTAGAGTGACTTGCAGCTCTTTTGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chrX 19034099 5' + hopper 18 1 59.41 ATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATG:1 - chrX 983384 5' + Juan 3820 1 62.38 CGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 6399541 5' - roo 353 2 77.23 TAAAGTAAATTTACTCATAGAACGATCTAGTTAAAGCTTCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATT:2 - chr3L 17687857 5' + BS 33 1 60.40 AAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 5531190 5' + 1360 70 1 57.00 TGTTTGTTGCTGTAATTTTGAGCGTTTTGCGCTTAGCGGCCGCCTGAATCTGAACATACACGGAGAGAAAAAATGACACAAATCTATTTTCAATTATTTAA:1 + chr3R 29651534 5' - Transib5 259 1 72.28 TTGGTTTTAATACAGACCTNGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr2L 9724210 5' - 1360 3348 1 68.32 CATTACTCATACGACGCATTGTCAACCCCCCCACCCCTGGCCAAACCATGAAATCCCTACACGTAAGATAGCATACATTTGTGTACACTATAATTAAGGAA:1 + chr2L 12534169 5' + G5A 2741 1 53.47 TACTGTGCGGGAGAGCTTATAGTAGACGAGCTTACGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 9887340 5' + hobo 42 1 68.32 TCCAGACTAGAAGGCAGATGAGGCTACACCAATCACCGCACAGATACGATCCGCACTCTGCACCACACCGCCGCTGCAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTG:1 + chr3R 5027398 5' + Chouto 314 2 54.46 CCTGTATATGAAATATGTTTGATGTTAATATTTCTCCTAGTTTAGTTAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACAC:1 + chrX 6363019 5' + opus 7320 2 53.47 AGACAACAGCATGTTGCCACGCCCCCACGCCATAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - 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chrX 23269927 5' - Max-element 8299 2 67.33 AATATTCTAAAACAACCGAATTCAAATCGACCCATTCTTCAAATGCTGACCAGAGGTCTGCATAGTGTATGCTGCCATCTACGCAAACGAACG:1 - chr3R 11824997 5' + HMS-Beagle 55 2 78.49 GCAGTTAGTGCAGTTTTCAGCTTCGAAGAGCAACAAATATTTTGACACTTTGCTCTCGTGCTGCTTCCCGCGTCGGTTTCCATTTTTTGTTTTCTTTTTTT:1 + chrX 6918819 5' + hopper 141 1 53.47 GGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2L 2505665 5' + jockey 8 1 69.74 ATAACGTCACTCCACCCCGCCCCGCTCATATGTGCAAAATAAGCTAACAAAGGGAAAAACATCATAGCGGCCTCTGCCAATGCGCAGAGCTTCTGCCGGCT:1 + chr3R 15503700 5' - springer 7223 2 62.38 TACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTT:1 + chr3R 11118045 5' + BS 39 1 67.33 GTGCTGGACGACAACAAAACGCTGACCCTGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCA:1 - chr3R 9661917 5' - accord 7269 2 71.29 ATTTTTATAAACCTTTCTCAAACAGTGGCGTATATAAGCACTTCAGCTTCGATGCCTGGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3L 13059670 5' + transib2 15 1 64.36 CGCCCAACCCCTCTCGTCACCTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - 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chr2L 11336056 5' + Quasimodo 6997 2 56.00 TTGCGTAATTTGCACAATGTTGCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGACACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2R 20973066 5' - hobo 2922 1 63.64 TTTGCATAACATCACAAAANCAAAGAAAAATGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAA:1 - chr3R 8155810 5' + baggins 5060 1 77.23 TGCGAAAAAAAAGACCCACCCAATTAATTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTCCCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATAT:1 + chr3R 2944490 5' - 1360 258 1 73.27 ATCCGGCTGGCTGGGGGGAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTAT:1 + chr2R 1922424 5' + gypsy 29 2 53.47 ACACACATACTCACATAACTACACCGATATCTACACATACATAAAGTGCGTATTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chrX 1716629 5' + hobo 23 1 57.43 GGAAAATTATGACAATAAGNAAAAAAACGATTTGTGTTTAATTGTGGAAAAAATGATCTTCCTGGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 25839303 5' - roo 9052 2 60.40 TTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCA:1 + chr3L 24996099 5' - 1360 463 1 65.35 TAGATATTTAATATGGATACACCTAGTTCATGTAAACCTCAAAGTCAAAGTCAAATGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAG:1 - chr2L 17593507 5' + Tc3 316 2 64.36 TTGTTTCTGCGTTGTTTCTGCCCAAATGAAATCCAATTAGCCGACTACAAGGCCTACCATCAGTTGATGGACAGCGCAGTGGGGGGCAGTCCCCCTGATCG:1 + chr3R 21498022 5' + Rt1b 396 1 58.42 TGTGTGTATAGTGAATGCCGGCGAAAAAGAGAAGAACAGAGGAAATGAACATCAGCTGCAAACGGAGAGCGGGATTTATACAAAAACAAAGGAAAAAAAAA:1 + chr2L 19236923 5' + gypsy7 5005 1 61.39 TTATTATGTATGAGCTTCCTGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACAT:1 - chrX 21772477 5' + springer 7201 2 47.25 ATGGGAATCATAACAATTCCATACCTACGGCTTTTTGCCACCTCAGAACATGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGAC:1 + chr3R 27088428 5' + X-element 4250 1 57.30 CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGA:1 - chr3R 25400123 5' + Doc 301 1 72.28 CGTAAGCATTCCACCAAGATTATGGCCTATAAATATATATACTTATATATATACAGCCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr2R 16068705 5' - Burdock 6377 2 56.00 TTTCCAGTCAGAAGCAATAGAACAGCTGAATCTTTGATAAGGATTCGGGGTTCAAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATA:1 + chr2L 5647347 5' - invader3 255 2 56.44 ACACCGGAAAAGCAGATGGAAACTATGCCATTAGCAGGCCACGGGACTTGCCACCAACTCCACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr3L 20079688 5' + mdg1 17 2 61.39 AATTCCTGCGTAGCTGCCAAAAGCTGTTCAGGCCATTTGCACATTTTAAATAAAACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTTATTGTCAGAAAGTG:1 + chrX 19607437 5' - Tirant 254 2 64.36 GGCAAATCGAGTTAAATTGTTTGTTGCTTTGGTTGCTGTTCAGATGGTGGCGTTGTTGATGCTGTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATT:1 + chr3L 22071241 5' - mdg1 7069 13 60.40 TCTTGACGATGTATTTTCAATAACACTTCAATACCACTTCAATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCCTCGCG:1 - chr2L 7552467 5' + I-element 41 1 59.41 GAAATTAACATTTTGTTGCCTACTTTGCGGCTGCCTGCAATCACCTAGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chrX 15183814 5' + hobo 28 1 52.48 GTGGCCCTTTAACATCAAGATGCTAGCGTTGAAAGGAGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 14132060 5' - roo 9054 2 61.39 TGTACATTCACAAGATATANACAATTACATGTTTTGTTTCCCAATTTTCAATTGTGCTGATCTGTTTAAACATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr2R 5043386 5' - roo 408 1 77.23 CACCTTTTGTGCGTACTGTNCTGTTAGTTTTAGTCCTTTTCGATTTTAAAGCGCTTACACTTCGATATTAACTGGAGCTCTGTTAAAAACACGTCCGTCGG:1 + chrX 17408154 5' - Porto1 17 1 55.45 ACAAGGTTAAGTGAAATAAAAATCAGTGAAGTGCATAACAGAGAACTGCAGACCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr2L 9969557 5' - hobo 2900 1 67.35 AGTGAGGAGGAAAAGTTTTGCTGGCTGTCTTTGGATGTTTGCAACTTTCGGTGGCACGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTAACTAT:1 - chr3R 7266742 5' - R1A1-element 72 1 57.43 TTCATATTTCTTCGCATGCCGGGCTACACGTGTTGGTAACATATTTTTGGACATTATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3L 4923769 5' + jockey 27 1 58.42 TATTAATCGACACATGATCAACCTTTTCATTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGT:1 - chr2R 1450429 5' + diver2 380 1 71.29 CATGATTATTTGCCTAGGCATTCACATACTAAAAAATTCAATTAGTGCTGCAAAGCCAGATAGTGAAAGTTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chrX 1716733 5' - hobo 2936 1 76.24 CGACCGACATCGTTGGATAATTCGTAGAACCGATATGGAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3L 7099781 5' - 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INE-1 574 1 70.30 GATCATTTTGAGTGCCCTGNTCATCTGCTTTAGTGGTTACCGCTTGCAACATATGGGAATTCGCGATAATCCCGGCCAATTTATATCCATGTTGCAGTTTG:1 + chr3R 22988131 5' - hopper2 1172 2 91.09 ACCCACTCAGCCATCGTGTATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr2L 16548188 5' + P-element 57 1 23.76 CTTGTTTATGCCCTCATTGNGTGCGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3R 11829269 5' + jockey 59 1 73.27 GTTACGCCGACGCGGTAGAGAGTGATGCCGAGTATAAAAGTAATTCAGATCCAACATATACCATATATTTTTTCGGGGGCCAGTTATTAATTACAGTTATT:1 - chr2L 22490466 5' - HMS-Beagle 247 1 67.33 AATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACA:1 - chr3R 3854454 5' - INE-1 31 1 43.56 GAGAATTTACTAACTTCGGCGTTCTGCCTCTCTCCCACACACACACATACACGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 + chr3L 7156328 5' + Tirant 8130 2 52.48 TTGCATTGGCTTATCCGTTGAATTGGCCACTAAAATTATGTACTGAAATTATATCCAAATTGTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACAT:2 - chrX 22472632 5' + invader1 3617 2 56.44 TTCCGCTACAAAAAGAACTTGAAATGCATCAGAAACTGATCGAGATACTGTAGACGAATAGTTTTTAAATAAGATAAATATGTGTATACATTATAATTAAG:1 + chr3L 10365911 5' + G5A 2738 1 54.46 TACAGAATTGTGAAGCTCAAATTTTCAATTCAAGTATGACAGTAAGAGGAGTTGTTATGTACATAAAATAAGCCTTTAAAAAAAATAATAATAATAATTA:1 + chr2L 11833482 5' + invader6 4386 1 91.00 TGGCCAAAACTGAAATCGATCTTTTGGTGAATTCGAAAAGGGTTTGGGCAATTCATCTTGGTTGGTAAATAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - 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Dm88 4071 1 63.37 ATTAAGCCCACGCGCAGTTCTGAATTGTTTTCTATAACATTCACTTTTATTTTATTTTATTAGGTTGTAGGTTTGTAGGTATACTGCGACCCAGT:1 + chr3L 14121985 5' - baggins 5414 1 64.21 CAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTACATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr2L 13598203 5' + pogo 47 1 71.29 CCATTTGCATCTTTATCTCCGGTTTGCAAGTGTGCAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3L 21118628 5' + 412 7085 2 56.00 TTTAATTGATGCGGCTTCACGTTCCGTCTCGCTCGCACTCATTAAATTCGCACTTATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTT:1 + chr3L 23869754 5' - HMS-Beagle2 7183 2 64.52 ATTGGCCCTCCACTTTTTTCCACCATCCCACAACGGTCACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 19094283 5' + P-element 10 2 67.33 TAAGCAACTTGATAGTACTTGTTCGTTGAAAGAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAAC:1 - chr2R 9761219 5' + X-element 59 1 71.29 GGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2L 2505636 5' + jockey 63 1 78.22 CAGCATTCACCCATATTTTGTACAAAATATTACTGGCTTTGGTGTTTCAAAAGATCCGAAATGTGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 - 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Doc 4309 1 80.20 TTATTCGTTTTCGTTTGGTAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr3L 5512448 5' - pogo 2049 1 81.19 ACAAAAAATAGTAGCACCACCAGTACCGCCTGCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr3L 13639949 5' - hobo 2936 1 76.24 CCCATCGCGAACGTTAGTTAGACGTGCTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr2L 9724270 5' + 1360 30 1 57.43 GCTGGCCACTTGGTCTTAGAATGGATGGGGATTGGCATCGGCATCCACTTGGAGTCCACTTTGGCAACCGAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3R 31649979 5' + roo 6 2 73.27 GGACTGTAGATATACCATAGGTAGTCTGTTTTCCTGTCTCTTTCTGAACGCTTTGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATA:1 - chr2R 9554893 5' - Doc 4472 1 59.00 CATTTTTTTATTTTACTTTCTGCTATTTGTATTCACACGAGAGCGTTTCTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 4555452 5' - roo 9045 1 54.46 CTAATTTGTGTTATTTTCCCCTAATAATTACTGACCGTTTATCCACTGTTCCAATTTCGCCCAGTTTGCTTGCGATTTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTT:1 - chr2R 16211440 5' + Cr1a 149 1 82.18 TTCACTCTCCCCATCTGCTACATGCTTTGATTCAAAATAGAAAATTCAGTGCAAAACCAATATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTGTCTTTG:1 - 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chr2L 3964500 5' - INE-1 252 1 68.37 TTGCTTAGCAATATTTGATTCAAGTTGAGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2L 22241811 5' + pogo 17 1 62.38 GTATTTATATCGCCTTTGCATCCTATTTATATACATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTT:1 - chrX 18314270 5' + Doc 335 1 67.33 AATAAATATGTAAAGTCTCTGTATTGGGGTGGCCAGGTAAACCCTTTTATCGTTAAGATTTGCCTAAGACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2L 21199219 5' - roo 403 1 73.27 AATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACC:1 + chrX 292408 5' - G3 4559 1 66.34 CTCCTAGTCATTTTTGATANTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAA:1 + chr2R 1571530 5' - 1731 311 1 74.26 CAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 + chr3L 14878661 5' + Juan 51 1 76.24 TTGTTGCACGCAAGATATCGTATCGACAAGGGCTTTTAGCTAATCAAACTCGAGTTCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTG:1 - chrX 20950233 5' - Quasimodo 7103 2 69.31 ATAGATGGACCGTGTTTACTTCGCACCCACACACACACACACACACACACACACATATTT:1 - chr3R 18114591 5' + accord 7031 2 75.00 TGTAAATGCAGTTAAGAACATTCGTATCGCCAACCATAAATGTGAGCAGCTGATATTGTGTTCTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 + chr2L 16994785 5' + Stalker2 15 2 64.36 AATCAATATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAA:1 + chr4 970228 5' + 297 288 2 49.50 AAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATG:1 + chr2R 5284533 5' - Doc4-element 2643 1 71.29 ACTTGTTCGTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr2L 16071120 5' - 412 7500 2 64.36 TTTGAGTTTCATTTCAAAANCAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTAT:1 - chr2R 17402806 5' - invader4 315 2 68.32 CCTCTAGTAGGGATAAGATACTTATACTATAAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr2R 6074344 5' + 412 18 2 41.58 AGAGTGTCTGTCTCTTCTATGGCCAGTGCACAGTAGTGCACAGTGCATCGAGCAAGCACATAACCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTC:1 + chrX 18317234 5' + 1360 3226 1 78.22 CAGCACGCACACCCGAAAATCCCCTTTAGAAGACTTCCTCTTCGGCGGGAATCATCTCCGACTATCTCTGTTAGTGGGTTGTTTCCTTGATCTGCGCGA:1 - chr3L 18348585 5' - Tom1 218 1 76.77 TGACAATCTCTAATTGCCTAGGGTATCATTACAGGCGATAGCCGGCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAA:1 - chrX 3352891 5' + Doc2-element 464 1 55.45 CCAAACCATTCCCGCATCCACATTCACGTTACTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 + chrX 15599646 5' + jockey 4745 1 69.31 GTGCGGAGAGAGAGCTTTAACCGAAAGCGCGCTCTCCTCGCTTTTTAGCCTTATCTCAGCTAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 + chr3R 10093672 5' + P-element 15 1 64.36 GAAGTCCTGCTAAACGTTTTGCCACTTTGTTAAGACCCGACCTCTCAATATGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 1930512 5' + roo 8690 2 51.49 CGTGGGCAACAAGTGCAGATGGCTGGATGGATGTACATGGACGGGGATGTGGCTATGGATGCGGAAGGCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGT:1 - chr2R 20185884 5' - 1360 214 1 69.31 CTTCCTCTCGCTTTTTCTCACTCCCACTGTTGACAGCTGCCATCGAACAAGTGTCTTTAAGCAAATTATAAGAATATGAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAA:1 - chr3L 17533090 5' + Idefix 326 2 62.38 TCTGGAAATGACCTGGACTACGATCACACCGGATATGCATCGCAAAAGAACTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCT:1 - chrX 14473326 5' - opus 285 2 55.45 TTCAAAAACTTTTATAAGAGTGTTTTAAGTTTTAGTTAGGTAATCCAGAATAGTTTCTCTCAGTGCGGAATGATCTTGTCAACCCTATTTCCCTCCGACGT:1 + chr2R 3172712 5' + G5A 2661 1 73.27 GGAGTAAAAGTAGCAAGTTACATTTTTTGGAAACTTTTGAGGTTGAACCATAAAGTCAAACTTAATTATATTTCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 - chrX 6496738 5' + I-element 4 1 67.33 TCCGTTGCCGATGACGCCGCCACCGCCGACGCAGTCACCGCCACCGACACCACCATGGATGACGCCGGCGCAGGTGCTTCCCGGCTTCAGATCGCTTATG:1 - chr3R 3382142 5' - Osvaldo 1467 1 75.00 ATGAACATAACAACTGTAATAAGGTCCCCAATCGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chrX 17106172 5' + HMS-Beagle 38 2 65.35 TACAGCAATATTTGCTTTGCTCTTTTGTGCATATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAA:1 - chr3R 4164695 5' + HMS-Beagle 43 2 75.25 TGGCGTGGCAGTTTTGGGCGTAACAGTTGGCGTGGCAACAGGGGGGTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGC:1 - chr3L 25674158 5' - INE-1 169 1 67.82 CATTTCCAATTCCGAATGCAACTGGAGTAGAAAGACAATAACCCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAGAACCCACCAACACTACC:1 - chr2R 9637813 5' + I-element 4965 1 58.42 GATCTTTCTGTTGCTGTTTCTGATTTTAATTTTTTCTACTTTTTTTTTTGTGTCCGTTTATTCTTTAAAGACTCCTGGCGCGCCGGCGCCCGCGCTTCCTG:1 - chr3L 16825959 5' - Osvaldo 1484 1 46.53 AATGATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3L 13639871 5' + hobo 49 1 72.28 AAGTGGCAAGACGTCTGAGCCTGTAAGTGGAGCAAGGCATTGAGGCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 + chr2L 13310245 5' - mdg3 215 2 55.45 GAAATTAAAATTGAGTTATTCCCTGCTTTTATCTGAAGGTGAGCTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGACGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3R 7645087 5' - mdg1 386 2 57.43 ACACTGCGGGGTGCAGGGGNGGTATCGAATTGGGGGAGCAAGAACTAGAGGCGGCGAAAAGACCAAGATGAGCGCAAACCCTCTTCGCAGCGGAACAAAG:1 - chr3L 21223283 5' + Doc3-element 275 1 56.00 ATATATATATATATAATTAAAAATTCGCGGTTTGTT:1 + chr3R 6660262 5' - Quasimodo 7366 2 88.89 ACCACCGCTGTTGATCGATATTTTAATTTTATTAAAATCTCGACGTTCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTGATCAAGA:1 + chr2R 25240195 5' - INE-1 88 1 59.41 AAACTTTCAACTCGGTCCAAACCAGCAACAAAGTGGCTGTTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCC:1 - chrX 14979207 5' + hobo 2709 1 42.57 TACAGGTCAGCCTGGCTAAGTGCAATTAGTGAACTCACCTCGTTCGTCCATGGAGGGTCCTGTGTAGGTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCT:1 + chr3R 20398489 5' - Doc 431 1 71.29 GCGCTATAACATTTCTGATACGACGATATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAAC:1 + chr3R 1440129 5' + G-element 2 1 78.22 TTTCACCATAATTTTGATGAAAGAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAGTAACGTT:1 + chr3R 4474155 5' + copia 4885 2 63.37 TGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTG:1 - chr3R 11547765 5' + G2 305 1 54.00 GTCGATGGGTGTTGTTACCGAATTTAATGACTTGTTGACCCAATAAAAAGATTTATTACATTTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAG:1 + chr2R 19430451 5' + 3S18 5780 2 64.00 GTTCTCTTTGTTGATATCTCCTAGGGTATCTATTTTATTTGTTTGTTTGTTTGCTGGTGGTGGTTAACTTGCTCCTCGTTGTTGTTGTTATTATTGTTATT:1 - chr3L 575438 5' - mdg1 7057 3 54.46 GCCAACTCGACATTCTCACGTTTTCATACATGCATACCTGTGGCTACAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAA:1 - chr2L 19677363 5' + hopper 29 1 51.49 TGGGGGCTCTCTGCTTGCGATTGGGCTTGTTTGTAATTCAATTATGTTAATGATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3L 13639823 5' + hobo 1 1 78.22 TTGTACATGCCTAGTGACTAAGGGAAATCCTAAAAGGCTGTTGTATTTTTTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2R 18044006 5' + pogo 22 1 57.43 AAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 - chrX 20999569 5' + BS 34 1 65.35 ATTCTGAACCACATCTACATCATTGTGATGCGTTTAATTAAATTCCCCTCTCGATTTAGTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 - chr2R 24435601 5' - Juan 4192 1 63.37 ACAAATACTTACGGAGTTTCCCAGGATTTTGATGTATTTTCGCCTCTCGCCTTTGTTGTTTTCACTTTTTCTTTTTTTT:1 + chr2R 16914933 5' - Porto1 171 1 50.63 GTAGATCGCGGACTCATGGGCGTGACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATT:1 + chrX 304872 5' - 1360 386 1 78.22 GGATTGAGTCACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 28447375 5' + blood 7037 2 53.06 AATCGTTAGTCAGATAACTACTTTAGATATGGCAATTATAGCATTGTCTCTTGTTTTTATTCCTAGCGTTTTCAAATTCCATCTTTCAAATTTTAAAAATT:1 - chrX 18809990 5' - FB 31 1 66.34 TTTCGAATGCATGGAACCAGGCTCTACTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2R 11699278 5' + roo 8714 2 75.25 AAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAAAGTGGGCA:1 + chr3R 20001638 5' - FB 61 1 54.00 TATCAAAGGAATATATATTTTTTAATAAAAATCCACGTATGCCATACATGGTACAAAATTGCCAATTAAAAATATTACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAA:1 + chr3R 6646687 5' + Juan 5 1 77.23 TCTAATAAGTGTTCTAGGTCAATGGGTGTGAGTGTTTTGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTG:1 - chr2R 11444046 5' - accord 194 2 62.38 TAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAA:2 - chrX 20999581 5' + BS 22 1 53.47 TGGGGGAAAAGCAACAGGAACCGAGAAAAAGGGGTTCGCACAGTGGGAAAATGAGGAAAATCTGGGAAAAAACATAAGAAAAAAAACAACAAAAC:1 + chrX 14981646 5' + gypsy11 3931 1 83.16 CTCATACATAATAAAGAGAACCTACAACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATAAGTCCGGTTAACTCAGTTA:1 + chrX 21772485 5' - gypsy3 4 4 47.37 TGAACTTACCTGAAAGAAAAGATGAGGATACATTGGTTAGATATAATTTTAACGAATAAATATATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3R 9121417 5' + roo 8676 2 64.36 GACCTTAGAATTCTCGACCAAAAATGTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr2L 6112854 5' + blood 7060 2 72.28 TTTCTGTTAGCTTCAGGGCTGGGCTACCCGTCCAATTGGGTTGCTATTTTGACATGCTCTTCGGTACTTCTGGATTCATTATTATAGTTTTATTTTTAAT:1 + chr3R 22753113 5' - P-element 2691 1 80.00 TGATTAAAGTAAAGTCTGCTTTCCTTATCATTGCTACAACTGTGCAAATACTACTAGAACACAGCTGTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3R 22520976 5' - opus 491 2 70.30 GGGTGAGTCTTTGCTAAATGCTCAACACAGAAAGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGAAGTTTCAGTGTGTCCAGTCTGATGATATCA:1 - chr3R 6009020 5' - Chimpo 86 1 65.35 TTGAAAAACAGAATAAAAGTGGAACTTATACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr3R 21931547 5' - 412 445 2 70.30 CTAAAAACCAGACCATGCGCTTGATAAAGAAATTCCATGGAAAAATTCGAAGCGTTAGCCGAAAAAGGGGAAATAAGCGGATCCCTGCGGCCTATAAAGGG:1 + chr3L 21534565 5' + gypsy8 331 1 72.28 TTAAAAAGTGTTGCATTCAGCAGGGCGCTAGCTGAAATTAATTCATCCCCAAATTCGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3R 8481981 5' + jockey 59 1 54.46 TGATTATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chrX 9828509 5' + Tirant 8145 2 62.38 ATAAAGCCAGAGCTCCTGAATTCATAATATGTTAAACACCCTCCCCCTAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTA:1 - chr2R 6073976 5' - 412 7087 2 52.48 TAATAGTTAATCTTCTCGTAACACATTGCGTATAAGTTTTTTTTATATATTTAATTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAAC:1 + chr3R 24092421 5' - BS 5053 1 69.31 GGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGCGTCGGTCATCGC:2 - chrX 22576489 5' + Burdock 6287 2 76.24 CGCCATCCCAAATAATAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 3003957 5' + Rt1b 5146 1 86.21 TCTTAGAATGGATGGGGATTGGCATCGGCATCCACTTGGAGTCCACTTTGGCAACCGAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 31649966 5' + roo 8683 2 60.40 TCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3R 10741096 5' - 1360 3356 1 62.38 CCCTCTTATCACCCCATAANTAGAAGAAGCCCTTCTAGTAACATCCTCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:1 + chr3R 3005956 5' + Ivk 30 1 52.48 GTTGGGGAATGGGTTCAAAATTGGTAGTTACATTGTATTGATTGGGGATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCT:1 + chr3L 6982498 5' + Burdock 6158 2 53.47 TGAGATTAAGCGCGGAGCGAACACAAATAGAGCAAACCTGTAAGTCTGCACAATATGAGTTCATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2R 5043267 5' + roo 13 2 67.33 ATGAAATTTATAGCACGTCAATTGCTTTTCGTACGCTTTTTGTCACGCTCACTCTAACGCCCTAAAGCAGTCAAACCGGTCACGCCCACACTTTTTAACAA:1 + chrX 962032 5' + INE-1 252 1 63.37 AAGGGTTCCATTATGTTATTGAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr2L 7552451 5' - I-element 5303 1 80.20 AAATTTATCAAAACAACAAAAAAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGTCAATTCCATTCAAGGAGGATTGGAGTGTATCTACCCTCAATAT:1 + chr3R 19444972 5' + Stalker3T 2 1 91.58 AGGGGTTAGTTAAATAAGCTTTTTGGTTTTGGTTGGTTTTAATATTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTAACAGCTTTGGCT:1 - chr2L 5754914 5' - gypsy4 426 2 55.45 AATAAAACTCCCGTCCGAAGAGTTTCGTAACAAGGATTTATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 - chr2L 10658516 5' - I-element 5317 1 62.38 TAAAAAACTGATATAAACTNATATTTTGGAGGTTATATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 5025669 5' + roo 8704 2 68.32 AATTGGGGATCTGCAGATGTTGCCTGAAAGAACGGCATATCACTTTCTTAATGGTATAAATATAAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 13710636 5' - roo 9058 1 47.52 CGGGAAAACTTTTTCCACCGAAATGCATTGTTGCGAACCCATGACATGGAGAATCAGCAGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACACGCAGAGCTGC:1 + chrX 956840 5' + Burdock 5973 1 73.27 AAGTGAGAAAGGTATGCAAAGTACTAAAGGTACAGGATTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGC:1 + chr3L 19676271 5' + R1A1-element 298 1 67.00 TTGACCCACAGACACACAATGCAGCTCTGCAGCTCGACCATTTCCCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGAC:1 + chr2R 20158762 5' + Doc 4318 1 56.44 GCCGATTGCACACAAGACAAAAATAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCAAATGTGTGTATAAAGGAATATGAGACCAAGTGGTTTCTAAATTAG:1 - chr3L 18387307 5' - G5 4740 1 73.27 AAGGTTTGACAGCCAAAAGTAGCAATGGAGCGCCACAAAAGGCCAAAGGCTAAGCGACTCAAGCAGCGCAAGGGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCT:1 + chr2L 13637488 5' - micropia 5189 1 66.34 CATGGGGCGCAATCCACTGCTTCACTTCCTCCTCGTTCAAATAACCATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTTAG:1 - chr3L 1299648 5' + accord2 163 2 52.48 CTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTT:1 + chr3R 25796004 5' + BS 5013 1 57.43 AAGTGGCTCAGGTAAACGGAATAGGTTTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGA:1 + chr3R 10704505 5' - Quasimodo 7152 2 71.28 CAATTAAAAGATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chrX 8308696 5' - opus 496 2 77.23 GCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 + chr3L 2016883 5' + Tabor 44 2 65.35 CCTGCGGTTTTTAATTAAAATTAACTTTGTTTATTTTGCGCTTTTACCCACCTCTCCGCCGTCTCTCTCGCACTTCTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTTG:1 + chrX 20266807 5' + Cr1a 292 1 73.27 CATAGACGTGCGAACTGGGTTAATTTTCTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr2L 20330083 5' + 297 40 2 77.00 ATAATGTTATTTTTATTTAATGTACTGAAAAACATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chrX 17385169 5' - pogo 2061 1 68.32 CGAAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chr2L 19364077 5' + jockey 4684 1 39.60 GTTCTGTTTGCTCCCTTATTAGAGTCAATCATTCTGGAAAACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCCACTCAT:1 - chr3R 14090924 5' + G6 1725 1 60.40 CAGCAACAATAGGAAAATTGTTTTTGAGAACCAAATTTATTCAATAATCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTA:1 - chr2R 6671451 5' - 297 411 1 60.20 TAAGCTGTAATGAAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chr2L 15146444 5' - hopper 152 14 74.19 GCGCATATTCGAGAATTTANAGCTTACAACATGGAAAGTTTTGGGATAATTCGGTTATCGCAAATAGAGTGGGTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATG:1 - chr2R 4907346 5' + Gypsy12A_LTR 207 3 68.32 CTAACAAATTTCGCTTCACCAAAGTTGGATTTCGTAAACTTTTGATTACAACTTTTAATCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2R 19355868 5' + jockey 23 1 59.60 CTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chrX 1157621 5' + 297 49 2 78.22 TGTTTGTCAATTAACTTCTTTCACTTTTTCGCCATCTGACTCACTCATCTGATTGTCTCCCGGTTTTTGCCCAATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGA:1 - 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chr3L 25751095 5' + 297 6502 1 73.27 TGGCCGGCGAAAGTGGGTAACTGTGGACCTATCATAATTCTTCTAATATTTGGTCGGGTCGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chrX 2911245 5' + hopper 13 1 64.36 AATTCGAGTAGAGTAAACAGTAAACAGTGCTAGCTAACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2L 5304766 5' + 412 7094 2 62.38 AGCCCTTCGATTTCGCTCAATATGTGCCATCCACTGGCGCTCACCTACCGGCAAAACAATTTCAAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACCAACTTTCTTCG:1 - chr2L 6758723 5' + diver2 316 2 65.35 CGACCTTAGAATTCTCGACCAAAAATGTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:2 - chr2L 6112855 5' + blood 48 2 71.29 AATGGAACAAGCTATAGGGAATAATCGACAGAGTCAATTAAAGTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chrX 13498198 5' + Tirant 8113 2 51.04 AAGGATTAAGGGGGACATGCATGTATATGGCAAATACAGGACTGTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGTGGTGGTAACTCCTCCCTCCC:1 + chrX 7219368 5' - Tirant 8100 1 58.42 ATATTGCCATGGATGAAACCATTTTAATTAGTTCCCATTTACGTATCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 8254759 5' - roo 9065 1 72.28 ATTTAGCGTTAGATTTATTTCGGGCATTAAACGCAGATCGCATTCGAATACCTTAATACCCCAAAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr3R 23709603 5' + F-element 22 1 43.56 CAATTATTAAACGCCTGAGTGATTGCGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCG:1 - chr2L 1202026 5' - Stalker2 7600 2 73.27 CTGACCACGCCCACCACAAACGCCACACCCCCACCCCCCTTTAGGTGGGCAAAAAGAGGAAGAAAGACACCAAAAAAACAAAAAAAAAAACAAC:1 + chrX 3234098 5' + gypsy7 5010 1 52.13 CTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCG:1 - chrX 22386762 5' + hobo 85 1 62.38 CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCC:1 + chr3L 25232764 5' - accord2 176 2 50.50 ACCGAATTGAAATCAAACAAAACTGGTGTCTGCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chr2L 16566349 5' - 297 6937 2 67.00 AAATTAACAAAAGGGAGCGNGCTACTATAACTTTGTTTATTTCGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTT:1 - chr2L 7774735 5' - jockey 4860 1 57.43 AAGCCAAAACAATTTAGATTAACTGTAAATTGTGTTATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAAT:1 + chr2L 17308298 5' - hobo 433 1 67.33 CGGGAAAATTTGCATATGTCTAGTAAACTGGGAGAGCTAGCCGCTTGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 + chrX 9828439 5' - Tirant 381 2 54.95 TTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGTTGCACATAGTGCAAAC:1 - chr2L 22216554 5' + diver2 4619 2 53.47 AAAACTTCTCTGAATGTTGTGGCATGGTCGAATTTAATGTGCTATGTACTTGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGGGCTCCTTCCTTTAA:1 + chrX 17681353 5' - invader3 5444 2 56.38 CTATTACAAGGCCAAAGAANTTGGTTAATAGATTTTCTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr2L 12764968 5' + Doc 34 1 68.32 CAGAACTAACCACTAGATGTATACAACACATTATGAATACGCTATGCCATGTGCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 20381088 5' + jockey 32 1 54.46 TATATGTGATATGCCATAAATTACTTATGCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2L 4020714 5' + 412 47 2 76.24 AAAGAGCTCTTGAAATGGGCTGTAACTATGGTTGAAATGAGTGGGTGGAGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCG:1 - chr2R 10749805 5' - G2 2819 1 57.14 CATCAACTAGGGAAACCCAAGTGCCAAGCAGCTGGGACGCCCTTTTGCTATATATCTACACCAATGCAGCTAGCAACCAATTCTCAAGCTTTTCCTCTTCT:1 - chr3L 13484002 5' + Gypsy12A_LTR 2014 1 74.26 CATAAGGTCATATAAATATGTATAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 18883812 5' - roo 9023 2 74.26 GAAGTCCTTTGTCACACACTGCGTGTGAATTTGTGGCCCAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 - chr3R 6761090 5' - blood 368 2 73.27 ACCCCTCTATAACCCCGTGATGAAAACTTTGCCAACGGCAAATAGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTC:1 + chr3R 26498519 5' - roo 9041 1 59.41 TATTTGCTTTATTATTTTGTGGGGGATGTTTGGTGTGATCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 - chrX 20844348 5' - copia 253 1 58.42 GGCATATCGATAGATATTGGGGAATTACATTTTTTAACTTTGCTTTTATTTATTAAATCTTCTTGAATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTA:1 - chrX 23078696 5' - F-element 4621 1 67.33 CATTGTAAATTAGTTATATCGCCGCTGGCATAATCTATATATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACC:1 - chr2R 19352271 5' - 17.6 7389 2 64.36 TCAGCGATCTCGCTCTCCCNCGGCATCGGTGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chrX 9584721 5' - pogo 2058 1 69.31 TAGGGTCCTGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:2 - chr3R 9116533 5' + jockey 24 1 60.40 AACGCATAAAAGTCAAATGAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCTAGTCTCAGCGCTAGCCCCAAAGCTAAGA:1 + chrX 6520310 5' + Ivk 240 1 79.21 TTTACTGCTGTCTTGTTTTACTGGATATATACCAATCCCGCCCCACCCTTTTACCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTA:1 - chr3R 16719511 5' + I-element 5154 1 60.40 GTACCCAATTGTATATATTTATATATCTAAACGAAACCTACCGATCCTGGGAAGAAATCGCACACACACTCCACCCAATACAACAACACACACGCACACAC:1 - chr3R 14509943 5' + gypsy3 420 1 58.42 AACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCG:1 - chr3L 13142039 5' + F-element 443 1 79.21 ATGGTTGATGTTTGTGTGCGACGGGTCTAATGTCTGCGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCAACCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 15160274 5' + Tirant 8 2 72.28 AGCTGTTTACCCACAGATAGACTTTATAATAATGCACTCACTCAGCTCCAAAAAACATTATCAATAAAGCAAAACAAGCGAGAATGCTATAGTCGAGTTCC:1 + chr2R 22822314 5' - INE-1 573 1 66.34 GGTAGGATTTCACCTGGATGGCTTACAAACACACACAGATACACATACCCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:1 - chr3L 18738284 5' + Quasimodo 20 2 60.40 GAAGGCAGTGGGCCGAAAAAGAGAAAGACATTTCCGACTGACAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 + chr3R 30220192 5' + mdg1 7074 2 62.38 GTTTTGTATTCAGATAAAAATGAGAAAGACAAGCAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr3L 26567344 5' + opus 7152 4 65.35 TATATATGTATGTATGCATAGACATATACGCTTTTCGGCAGAGAACTACAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTAGG:1 + chrX 5419959 5' - hobo 2898 1 59.00 GTTATTGTTCGCCGTGGCCNTCGCATGCGGAGCATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATG:1 - chr3R 31654277 5' - F-element 231 1 66.33 AGAGAGAGAGAGCGCAACGTGTAAGAGAGGGAAGAGCAAAACGAGTTGTGGGCGGTGCGATGTGGGTTTGAAAAACGGCAGCACTCACCAGTCCATTCGTG:1 + chr2L 11804589 5' + BS 91 1 56.44 CTTATAGTAAGAGAGCTAAAACAAATGCAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 14311515 5' - roo 9058 1 63.37 TCTTGGCAAAAGGTTCCATATAAGAAAAGAAGCTCACCTGACTCTCAAAAATTCCTAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCT:1 - chr2L 22672850 5' + invader3 199 2 65.35 TATATAGTATAGAAGAGCTTAAGGATTACAGTAGTATAAAATAAACTATACATATCCCAAAAGTAGCTAAGTACCTACATTTAAATCTTATAAATTGAAAT:1 - chr3L 9955273 5' - Tc1-2 1408 1 57.43 TGGCAACTTCGGTAGGGCAGAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chrX 19607322 5' + Tirant 8122 2 64.00 TAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chr2L 16071152 5' + 412 7108 2 76.24 AGCCAGGCCAGAAACACTTGGATAATAGTGTGGCCCAGTACACTTTCAAAAACACAAAGACCTCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCTACAATAATGACA:1 - chr3R 11031593 5' + I-element 171 1 52.48 TGATCAAAAACGTTTTTGCGATTTAGCAAACGTGGTCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAATTTGAAAAAAACGAAATTTTTGATTTTCGAACAT:1 - chr2L 3959323 5' - FB 150 1 75.25 AGCGAATAGTTATGGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTGACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2L 3985147 5' - roo 9038 1 57.43 CTATGTTGCGTATTAAAGTAATCAAGAAAACGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 20555758 5' - roo 9027 1 70.30 TTTTAAGTAAATACACCATTTCATTACACAACACACACAATTAATTAATAAAACTTCAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chrX 354909 5' + I-element 26 1 52.48 AGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chrX 19607302 5' + Tirant 8143 2 59.41 GAGAGCATAAAGAGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAG:1 + chr2R 20520191 5' + Max-element 8257 2 55.00 GCAAAAGCATGAAGCAACAAACAAACAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAAAATTGCAGAT:1 - chr3L 8244999 5' + I-element 426 1 75.25 CATATGTTACATATAAATANAATGCACATTTTCATAACCTTTGTTCGGAGAGTAAAGGGTATACAACATTCGCTGGGTAACGGGTATCTGATTGTCGGGGA:1 + chrX 22672189 5' + INE-1 554 1 66.34 CAAAAGGTATAAGTCGCCCCAACAACAAATAATAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAA:1 - chr3R 18192713 5' - Cr1a 198 1 67.33 AAAAAAAGGGCAGAAAGCTTATATTGAGATGTTATATGTTATAATGAGCCTCTTAACATTTAAAATTAAGAACATTGGTTGACTATTGATCCTGATCAAGA:1 - chrX 12248279 5' - INE-1 88 1 43.56 ACTTCAAGCCCTATTACTGAGTATAATACGAATTCTAGATGCAATGCCCGAAGCAGGTTGATGTAAATCCTTGTTACCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:2 + chr2L 10658435 5' + I-element 3 1 76.24 TGTGTTTTAATGTCACTGGTATTACATTTTTGCTTGTGAATAACAATCAGAAATACAAAAATTTTTTGAATCACACAAACAACAAAGAAAACAAACAAGCA:1 + chrX 22906386 5' + mdg3 5084 1 73.27 CACCTTGCGCTACTTTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTG:1 - chr2L 22216573 5' + diver2 68 2 70.30 AGACAATATCCCTTTTTTATGCCTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chr3R 29413109 5' - hobo 2887 1 76.24 CAGCGACTCGTTTGCCTCGNAAACTTTTGTTTGTTTCGGCATAGACGTGCGAACTGGGTTAATTTTCTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chr2L 20330122 5' + 297 6583 2 77.23 GCTTTAGTTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGTACCACTCCATCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGA:1 + chr2R 2009409 5' - I-element 301 1 44.55 GGGGTAAACAAAGCCCATTTTTCGGTGCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACAAATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCC:1 + chrX 14334604 5' + I-element 5108 1 73.27 CGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3L 2917032 5' + hobo 52 1 80.20 TGAATTTATGACAACTGAGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr2R 9061913 5' + jockey 4689 1 55.00 GGAAAAGTGATCACTTATTGGTATCTATGTTATATAAATTGCATCACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3R 17255998 5' + I-element 30 1 52.48 AAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCG:1 - chr3L 13142057 5' + F-element 425 1 61.39 AGTCTCGCATGCACATGCCTTGCCTAGAGGGAATCTATCAACGACTGACAAGACTACAAAATCTAACTTCACCACGAATAAGATTACAAATAAACACTGTT:1 - chr2R 22922154 5' - Cr1a 4036 1 69.31 GTATACCTTTATTTATAGGATGCATTGCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGT:1 - chrX 7208693 5' + Quasimodo 452 2 73.27 ACTAAGTAATCCTATTTTCCTACCTCAACTGTGAGTGTCTATGAATGTGTGTTAGGTGCTAGTTGGGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGA:1 - chrX 17737762 5' + flea 4825 1 65.35 GTCCATACCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGG:1 - chr2R 14849022 5' + flea 4707 1 63.64 TTAGACATTCCGGCGCCTCCACGGAATTGGTCGCGCAGGGCCACAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTTACGTCAGCCCGACTGCA:1 + chr2R 22109783 5' + gypsy4 6627 2 69.31 TTACAAATTCAATTACATACATATATGTATGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3R 19955275 5' + hobo 43 1 74.00 TCCGTTAAGACTTATCATANTCGAATGTATTCCCCATTTTTAACAAACAATTATACAAATCGTAGAAGTTACAAGAAAATGCTTTTATTTTTACCGCAACT:1 + chr2R 15313141 5' + Tc1 1642 1 48.51 TAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCGATTATCAGAT:1 + chr3L 27596 5' - INE-1 560 1 55.45 ATAGGCATCCCAGGTGATTTTATTCACGATTCCGCTTTCGAATGCATGGAACCAGGCTCTACTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2R 11699243 5' + roo 15 2 64.36 CAGTGGCGCCTCCAAGAAGGGTCAGCCCATGGGCGGGGCGGGAGAAGAGGCGCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAA:1 + chr3R 11047366 5' + opus 349 2 66.34 TCAAAATCTGGGATGGCATGGGGTGCGAATGCTGGGGGGGGAGGGTATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTC:1 - chr2R 13095664 5' + P-element 2816 1 50.00 TGTTTAAACTAACCTTTTATGAGGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 - chr2L 16456661 5' - hopper2 1557 1 75.25 TGATTGACTTTCAAATGGCNTGCATACTTTCAGGCACTCGAAACAATTTTAGCCGCCATGCAAGCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 - chr3R 20154822 5' + jockey 18 1 66.34 TTGCGAGGAACGAAAATATCTGAAAGCGAAAGGG:1 + chr3L 7298871 5' + F-element 107 1 88.24 AACTGGTACATTTTCATTATAAGAGCCGTATTGTAATAAACCAATATATGTCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr3R 7134356 5' - blood 329 2 83.17 ACAAGCGCTGTTCACAAAGTAAGGTGTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - chr2R 24242939 5' - hobo 2890 1 76.24 GCGAAAATCAAATCAATATTATCGATCCCTGCACTCAAGACGTGCACAAAACATATGCATATATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 - chr2R 10167910 5' - opus 497 2 76.24 TTAATCCTCCACAAATGTGACCCGGCCATGCCAGTCTACTATAATTGTGTTTCTTGCTTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCT:1 + chr2R 21900442 5' - Bica 472 1 53.47 GTGGTTCGTACACTTCGTANTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCA:1 - chrX 983348 5' + Juan 3856 1 74.26 CCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1 - chrX 21668070 5' + Tabor 6876 2 60.40 TTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCAT:1 - chr3R 3268037 5' + mariner2 111 1 69.31 ATAATTTACATTTGTTTAAAACAGTAATCAGTAATTACTGTATATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGC:1 - chr3L 11903232 5' + opus 7459 2 56.70 TTAAGATTCCCAGATTCTGATATGTCGCCTTCAGGGAAACAAAGTCATCATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3L 9697949 5' - 412 467 2 52.48 TACGTTAGGAGATAGCTGGCGCAGTCGGCGGCTTAGCGTAGGAATGGCTGGGAGTAAGATGCACAGTACTACTTGTTGAATCACATGGCGACCGTGACAGG:1 - chr2R 1452034 5' + Stalker4 425 3 71.29 TTTGGTTTCCATTTCGTGGGTTTTGGCCAGGTTTCAATAGGTATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 - chr3R 7582697 5' - 297 6945 2 58.42 GAATAACTTTTAAATGAATCTTATTTGAGACAAAAACATACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 - chr2R 11509675 5' - pogo 2067 1 64.36 TATTGTTATGAATCTTTTGGCATATTTCCAAAGTCAGGAAAAAAAAAACAACAAGGAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chrX 12854380 5' + Doc 88 1 55.45 TCCCAAATGTGCTCTTTGCTCCAACTAGAACTAAGAGAAACTGAGGTTGTTCACTGCTTATGTCTTTCGTGTAATTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 + chr3L 16494688 5' + jockey 4670 1 71.29 AAGTATCTGTGAAGGAGCGGTTATTAAAGTGCCAGCAATGAAAAAGATTAGCAAAGCTCTATAAGAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3R 27199866 5' + roo 8673 2 70.30 CCTCCAATTATGTCCACTGGATGACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3L 9698003 5' + 412 7106 2 75.25 CTTTATTCTCGCACTTGTAAATTAAGACTAACTTAAACCTAACATTGTGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGG:1 - chr3L 25186297 5' - Max-element 8322 2 53.19 TCTTAATGTTTTTCTATTGTTTTTTTAAAGCTAACTTTACAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACAAACA:1 + chrX 8069741 5' + 1360 2994 1 61.39 CAATAAATAAGAATTGTCAATAATTGTTTCAGCACTCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2R 11941004 5' - 297 355 2 65.35 AAAAGGAACAGGGATAAGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGATTCGTGTTAGTTG:1 + chr2R 9660010 5' - Doc 340 1 64.41 TGGACAATTAAAATATGCAAATGAGCCACCAGCAGAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr2L 14970129 5' - hopper 1378 1 64.36 AATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTCAAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTTGGCAGTTTTGTATGCTCAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - chrX 4797163 5' - INE-1 166 1 78.22 GAGACGAGACGAAGTTTTCAGTGCGATTTGCGTCTGGCTTAAGCTGAATTTTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 + chrX 19356231 5' + FB 26 1 53.47 GCCGGCAAAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCG:1 - chr3L 10014054 5' + jockey 208 1 49.50 AAGAAGAAAAAGGGTTGGGAAATATGCGGAAGAATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCC:1 - chr2L 17888181 5' - 297 6573 1 69.31 GATTCGTGACGTAATTTGCGAGGGACGTGGATGGCGGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr2R 13956847 5' + P-element 39 1 38.61 GTAGCACACACATACATATATTTACCCCTAATAGTTGTCCTTGGACCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 18073239 5' - hobo 2907 1 54.00 ATCTTAATTATCTGCCCATAAAGGATTTTAATGAATCCTTTTGTGAAAATTATATTACATAAAAATTTTAACATTATTTCTTATTTTACTTTGTTTTTATT:1 + chr3R 19294778 5' - F-element 4672 1 26.73 GTATTCAAAATATGTCACAATGCATAAAAAGACTTTAATAAGTGTTGTTTTTATGCACCTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 8702870 5' + roo 13 2 57.43 ATTAAGCTTAATAGTTTCANATTTTACACCGATCACATTGAATTTTAAAACTGCAAACAAATATTGTGCATTCTGATAGGCTGTAATAATTGTAATGCATT:1 - chr3L 2016974 5' - Tabor 487 1 70.30 TGGCCATTTATTTAAAAACTAAATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2L 16071175 5' + 412 7085 2 53.47 CCTTTTGCATGGAATATCTCCGTTCCACAGTGGTTCCGCTGGTATAGAGCAGCGTCTATAAATAAATAAATAAATTTCAGTATAGCTAGAAGCCTAAGATT:1 - chr2R 5017070 5' - Transib5 2935 1 75.25 GGGGGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTAATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr2R 6074464 5' - 412 486 2 67.33 TAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 6104441 5' + pogo 34 1 57.43 AACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr2R 5214989 5' + F-element 61 1 75.25 ACAAACATAACTCATATTCACAGTGTGTATGAATTGCACACCATAAATCCAGTGAATTTCTAAAGAGAAATATTTTCTTAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 8041858 5' - hopper 160 1 56.67 GACCTCGGGCACCAACAAAAGCGTTGCATATATGGGAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr3L 22334954 5' + jockey 4703 1 71.29 TAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 - chr2L 14979228 5' + Ivk 32 1 62.38 GAAAGGAGAACCTGCCGCTGCTGCAGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 10924215 5' + hobo 29 1 53.47 GTATAGCTTTGTGTATCTACAGTATATTCGTATTTTTATGGGCTTTGAATAATAATATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 15523283 5' + 412 20 2 59.41 TTTGTATGCTTAAATTAAATTGTATAATTTAAAAAAATGGGCGGTGATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTC:1 - chr3L 23579392 5' + McClintock 5978 2 66.34 GCAGCTAAAAACTTTTGCGTCTGCCAAAGTTTTATGACAAATTTTTGTGATTATGCAGCCTTCCTCCACACTTCCAATAGCTGAGTAACGGGTATCTAATA:1 + chr3R 22096568 5' + INE-1 546 1 68.32 AACCCACAATAACCACTATTATTCACCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2L 11832581 5' + roo 50 2 78.22 CTGTGTTGAATGCTAATAAAATCAGTAAGACAACAACAATTGCAACATGGAACACAAATTGTAATTTTAAATCAGTAAGTTATATCTATATTAATCATACC:1 + chr3L 22014316 5' - transib3 289 1 74.26 TGAAATCAATTAACCACAAATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCAT:1 + chr3R 4674800 5' + FB 57 1 79.21 TCTGTTTCATATCTCTGGGTCATTTCCTTAAGTTTTAATCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chrX 983296 5' - Juan 4202 1 60.40 CTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1 - chrX 21668065 5' + Tabor 42 2 65.35 CTTTTTTTCCACTTTCTTTGACATCTCTGCTGGGGAGGCAACATGCGCGCGCCACAATGACAATTGCTTATTTGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTG:1 + chr3L 12310553 5' + R1A1-element 5072 1 81.19 AATACCATATCCCATCGCCGCTTCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTT:1 + chrX 12423544 5' + opus 428 2 78.22 GGGCGTAGTAGAAGTTCGTGCACGGATAAAAACATAATGCCTCATCCAAGTTATTGTTTTAAAATCAAAATTCCGGTCTATAAAAATATATATATATGTAT:1 - chrX 20008749 5' + G3 4501 1 73.27 GAAAACGATACAACGTTGTTATTTCAAAACTGGTACATTTTCATTATAAGAGCCGTATTGTAATAAACCAATATATGTCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chr3R 7134329 5' - blood 7368 2 58.42 AATTGTGAGTTGCTGCATCCTCCCACTAAGTGTGCATTTGTGTCCGTGAGAAGGCGTGGCACCACTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr2R 13316110 5' + hopper 13 1 66.34 TGACTATCTTTGGTTTTAATACAGACCTAGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr2L 9724201 5' - 1360 3357 1 59.41 TACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGA:1 + chr2L 3813588 5' - Ivk 5265 1 57.43 GTGTGTGAAGGCGCGTTGGCGTTTTGTTGTTGTTTTTTTTCTTTCTT:1 - chr3L 12266094 5' - gypsy7 5010 1 63.83 ATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chrX 8308736 5' - opus 7460 2 71.00 GGTTTTTCTACGGATCCAAAAACATACATTCTACGTTTATGCGAAGTGTTTTTATGGTTAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 - chr2R 7542247 5' + mdg1 19 2 58.42 TCTTCGTTGTTTTAGTCGTTAGAGTATAGTAAAGTCGAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chrX 21469023 5' + pogo 37 1 65.35 AAGTATTAAACTGTGCTAAAACAGATGTTATGATGTTTAAATTCGATTTATTGCATGTAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:1 + chr3R 14228000 5' + Transpac 4932 2 65.35 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGG:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 4884 1 66.34 ATCCAATAACCCACAATAACCACTATTATTCACCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2L 11832588 5' + roo 8707 2 71.29 GCATTCTGTATATTCAGAAGCTGAATGCAGTGAAAGGGTGAAGCTATTATCACGATAATAACTGAGTCGGCACGGCTTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTG:1 + chrX 20453448 5' - F-element 424 1 75.25 TGTGCCCATTGCAGGTCGAGTGTGTTGTTTCGAATTCTTAAATCAAATCGGCAGTATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATA:1 - chr2L 7162629 5' - gypsy11 446 5 78.22 AAACAAAATGAGGCTAATTTTTATAACCGCACACACAGACACAACAATGGCGACGCAGATAGCAAGTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr2L 17308040 5' - hobo 2932 1 72.00 GCTTACGCAAGACTACTCAGCATAATGGCCGAAAGACAAATTGCCAAAATGTCGAGCCAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 8817051 5' + G-element 4325 6 71.43 TTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGG:1 + chr3R 19094249 5' + P-element 290 1 30.69 TGGCTGCCAAGCTGTTGACCAGTTGACCAGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAA:1 - chr3R 15873101 5' + copia 85 2 71.29 GGGGGCCAGTGACCACGGTGAAAAAGAAAATAAACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCAATTAATACCTCATACACATGCGATTACCTCAAACAA:1 - chr2L 14671687 5' + I-element 4880 1 80.20 TATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3L 27357562 5' - mdg1 379 2 62.38 GGCTTCTTGGTGTTGGTGACTTGAGCCGGTTGCCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGT:1 + chrX 4425284 5' - Bica 4507 1 67.33 GTTGCAGATAATCAAAGTANCATTTACTTCCAAAGAGCATCTAAATTTAGCCCATTTCATTTAATTCGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chr2L 15159460 5' + jockey 4681 1 67.33 CCTTGCGGAAAGGAAAAGAGCGAAGAAAAGGTGGGAAGTGCCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGT:1 - chr2L 12543959 5' + R1A1-element 5101 1 59.00 ATGGTGGAGGGCTTGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAG:1 - chr3L 24761268 5' + 1360 53 1 64.36 TGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1 - chr3R 16611516 5' - Stalker2 7605 2 70.30 CAGCCACCCTCCTGGGTTTTCCCCATTTTCCGTTTTGCCGGCTGGGGCGGCATCATTAACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 - chr3L 3475667 5' - mdg1 404 2 62.38 TGACTCCCGCTGGTGTACTCGGGGCATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr2R 8528283 5' - Transpac 5215 2 63.37 GTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTT:1 + chr3R 1440163 5' + G-element 36 1 55.45 CAAATCCCTCTTGATAAAANCTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 - chr3L 25059123 5' - mdg1 368 2 77.23 GAAATTTGAAACTTTGACTCCTTTTCCAAAGTGGAACTTCAATGAAATATATCAAATCATTTTTTTAAAGTGTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGGCAACA:1 + chr2L 22725602 5' - INE-1 209 1 59.41 ACACATTTCATTATTTTAANGTATTAACGCTTAGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 - chr4 1043586 5' + Doc 54 1 67.33 GTTCAGCTGCAGTCTGGCTTCTTCGCTAGCCCAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCG:1 - chr2R 9640396 5' - Max-element 255 2 67.33 AGGTGGTCTTGATTTCTCACAGTATTTTTCCGATCGAGCTGATCACACTCAAGTTTCAAGCGTTTTCCTGCTTACGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chrX 17520292 5' - HMS-Beagle2 490 2 56.84 AAAGATAGTTCTTAATCTGATAACGATAATAAAGCTTAAATTTGAAAGCAGTTGTCTTGATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATAT:1 - chr2L 22108279 5' - Bari1 1691 1 63.37 ACAAGCGAATCTCTTTCGTTTTTCTTTCGGCTTCTCCGCTTTTCCTTGCTCCTTTTATTTTTTGCAACTTTTGCTGCTGTTGCTTCTTTTTTTCTTTTT:1 - chrX 14490294 5' - gypsy7 5011 1 73.74 GAATGGAGATCAAACAAGAATTCTATTATATCAAAAATTTTGACTTTAAGTCAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGC:1 + chr3L 15956451 5' + I-element 4991 1 59.41 TGATTATTTGCCTAGGCATTCACATACTAAAAAATTCAATTAGTGCTGCAAAGCCAGATAGTGAAAGTTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 1716731 5' - hobo 2935 1 75.00 AACCATTTCCCAAAGTAATTCAAATAAAATGCAATTGATCAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 - chr3L 18635354 5' - copia 220 1 64.65 CTAAAGAATATTGACTGGAGAAATTTAATTGCCAGCTTTAGGTTGCTAAAAATTTATTCAGAAATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGA:1 - chr3L 7260562 5' + Burdock 5 2 68.00 TTTTTGGGGTAGGCAATAAATTGGAACAGTGATAATAAGCCCATTGATATGTTTACAAAACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chrX 17175261 5' + I-element 16 1 62.00 CGAGCGGGTGGAGGCGGTGNTGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTACTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATA:1 + chr3R 16507822 5' + baggins 5317 1 80.20 CTTCAGAAAAACAGCCTTATATATATCCTTTTTGAAGGATCTCAAAGATTTAGATCAAGTACGTGGGTAGCTGATATAAATGTACATATGTACATATTTTT:1 + chrX 6729672 5' - G3 4503 1 78.22 TGCTAGGGGATCCCAATCATGGCGCTGCCATCGAGAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 16025702 5' + 412 40 2 64.36 GACTTTTTGGCAATTGTTCNGGGTGAAGTGGGCGGCTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chrX 1157586 5' + 297 6595 2 65.35 GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr2R 981624 5' + 1360 2 2 62.38 TGCACTTAATTTTATTGGTTTCTATAATTCATGCTCGTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2L 9887389 5' - hobo 2901 1 62.00 GCTAGCAGCCCTAAGAATCTTAATATTTTATATAGCTTAATCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr2L 16866419 5' - Transpac 5198 2 59.00 GGGCAAACATCTTAGTTTCTTAGTGTTTTTCCCTATAATTAAAGCGATTAAGAGTGTGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTG:1 - chr3R 8844879 5' - Porto1 431 1 60.82 TGAGTGATATTTAAATGAGNCATTAAAATATACAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2L 13586221 5' + BS 5103 9 72.55 TCATACTATTCATTCTTGATGGATTGTACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 + chr2L 22108207 5' + Bari1 49 1 75.25 TTGTGTGTTTTTCCTCTCGCCTTTCAAGTTGCACTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chr2L 5244518 5' + transib2 38 1 63.37 TTTGTCTGGTCGATTTTTGTAAAGCTTAAAAGCCCATTAATCTTTGATTAATATTTAATGTTTAGAATACTTAAAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTC:1 - chr2L 4020801 5' - 412 494 1 75.25 TTAAAAATATGGAAATCATAATAATGGTTTTGAGTCAAATGTATGAACTCGCCCCTTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAA:1 - chr3L 4707193 5' - X-element 4562 1 58.42 GAGTCGGCCTCTCGATGATTTTCTTCTACTCCTTCACTCAATTATTTCATCTCAACCTTCTAGCTTGTATACATAGTTCCTGAGATCTTAACGTTCATACG:1 - chr2R 4428891 5' - INE-1 136 1 52.48 AGAGCCTCGCCTCCATCGGTTTCGATTTTCTTTTTTATCTTTCGTTGAAAGCCAATATATATCTGAGTTAACTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGT:1 + chr2L 3494930 5' + 1731 6 2 73.27 TTGGCTAATTTGAAAATGCAATTACCAAAAATTAGTTCAATAATAGATAACGGGTGTATTTGGTTTCCATTTTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr2R 15794660 5' + pogo 1 1 71.29 AAACGGTAGAGAAAATCTCTTAATGAACCATTATTAATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2R 13248787 5' + 297 6611 2 65.35 GATGAGTGCCCGCTGCCTGTCGCTTGTTGTTTCCGGATTTTGTCACTCCACGAAGTGCGTGGGATATAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCA:2 - chr3R 18851087 5' + invader4 2765 2 74.26 TAAAAACTATCGCTTATCCATTGACATTTTTAAATAGCCCAAGACTTCATTCCATTATCATGAACTAGATTTTCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 + chrX 1203162 5' - Transpac 5228 2 55.45 TTTACACAATTTTGCTTAATAATTGTTGTTACATAACTGTGGAGAGCTCAGCTCGTTCAGGTGCCTCCAGGAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAA:1 + chr3R 30063655 5' + FB 6 1 55.45 AATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:1 + chrX 21667991 5' - Tabor 468 2 57.43 GAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTA:1 + chr2L 7133586 5' - R1A1-element 151 1 76.24 TCGCCATAATAAGCACTAAATATGCAGAAACACTCGCCCAGCTTCCTTTCCACCTGCCCAACTTCCTTCGACCAAAGACAATAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3R 12729109 5' - 1360 3381 2 77.23 TCGCTCTACATAGCCACCAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chr2L 9521675 5' - P-element 2828 1 20.79 AAATGCTTTTCAAAAGCAATTTGGTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr2L 12800942 5' + hobo 16 1 63.37 TCTTAATGGGTGGCAAAAGTGGCACCGCGTTGGGCTCGTAATAACAGCCAACCGCAAAGGAGCACACACGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr2L 9488805 5' + hobo 7 1 66.34 GCTGCCCACACTTCCGTTCGTCGTCCCATAACCCCCCTCCAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCAACCGCTGCAAGCAACATATCTAGGTATCACC:1 - chr3R 6792984 5' + Helena 894 1 67.33 TTTGTTATCTGTATACAATAATAATAATAATAATTTCAACACATTCTTTAAAAGTGTGGGCGTAGCAGTTTTGTGGTTTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGT:1 + chr2R 5678732 5' - INE-1 216 1 55.45 AATTGTTGCTGTTGCATTTTGTACGCATCATTGGGGCCCAATGGAGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 28271505 5' + hobo 23 1 54.64 AAATACATTTTTAAAATGCGAGCCATTCAATATTGACGATCTCTTGAACGGAACCACTAGTGCTCCGCTATTTCATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTT:1 + chrX 1980519 5' - mariner2 30 1 73.27 AAGCAAAAGTTTTCGCGTTCCACAATTCATTCGGTTTTTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTAT:1 + chr3R 10971006 5' - Porto1 4392 1 59.00 AAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 11832547 5' - roo 359 2 70.30 TTTAAAGGGTACTCTTAAAAGTATCGCTATGACTATCTTTGGTTTTAATACAGACCTAGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2L 9724172 5' + 1360 3 2 74.26 GCAGGATTCCACTGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3L 25345153 5' + Doc 44 1 61.39 GCCCGTTTTTCAACATGGTATGATCAATTTTAATTTTACTAGATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAAATTAAGTGAAAATATATAAGTACATGCGCCCAGCC:1 - chr2L 21808991 5' + Max-element 483 1 58.42 AATAGTTCACAATATTATTTCCATTTCTTAGAATGGCACCTTCTTGAATGATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGG:1 + chr2R 1905115 5' + Max-element 25 2 55.45 AAATAACATATCTAACGTCTATCGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAG:1 + chr3L 1387106 5' - invader2 215 2 68.32 CTTCTCAGTCAATATTGTTCCGTTATTGCTAACCACCTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATT:1 + chr2L 21369825 5' + rover 6955 2 76.24 TTATTTATAACCCAGTCCAAACTAATCTATTAACATGAACCTACACACACACATGCACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAA:1 - chrX 10437767 5' + accord 7141 2 70.30 GTTGCCAACTAAAATCGGATTCGGACATAAGGATGGGATAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 15606645 5' + Osvaldo 1521 2 89.29 AAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3L 8749962 5' + Doc 34 1 55.45 TTTTGAATCGCTGTTCGAGTTAGGCTTAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAA:1 - chr2R 15384740 5' - I-element 215 1 73.27 GTTACTTGGGTATGATTTTGATTTTGGTGGAGAGTGTGGATTTGATTGAGGGATTATAAACTTGGGCAACGGATGTTTAGTCTACCAGTCGGTGACTTATC:1 + chr2R 10491180 5' - Idefix 6984 2 64.36 AATTGTTGCCCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAA:1 - chr3R 4577126 5' - Tc3 429 1 77.23 CATCACTGTTATGGATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAA:2 + chr3L 21275756 5' + HMS-Beagle2 22 2 57.43 TGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chrX 8308734 5' - opus 7461 2 69.31 AAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCAC:1 - chr2R 2308850 5' + McClintock 5958 2 61.39 TAGCAGCTAGAAAATGCATTTCCATTTGCTCTTTATTGTCACGGAAAGTTAAATGAGGTTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chrX 15227121 5' + copia 19 2 58.42 TTAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 + chr3R 19446652 5' + HMS-Beagle 6824 2 56.44 AGCAACATCTGCAACAACAACAACAACAGCAACAGCGGACANAGCAGCANNATGAAAATGTTGACAACTTTNTNGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCT:1 - chrX 2453155 5' + 1360 49 1 76.77 ATCCAGACCCATAACTTGACATGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACC:1 - chr3R 10717713 5' + Doc 382 1 76.24 CGGATGGAGCGAGCGGGGANATCTAATGTGCTGGGCGTGGCTTTGCATTTATTCGTGTGTAAAATTTTAATTGAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAC:1 + chr3R 15530022 5' + mdg3 5253 1 77.23 AACCGGCTTTCGGCTGGCTAATTGCCTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAACGAAGTATACACTTAA:1 + chrX 7970970 5' + P-element 41 1 33.33 AGCACCACCAGTACCGCCTGCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr3L 13639937 5' - hobo 2924 1 64.36 GCTATCCGTGTGGATGCGTTGCGGCATCGCCTGGGCATCCATGGATTGTCAGTCTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGG:1 - chr2R 22269205 5' + jockey 4692 1 52.48 TGTAGTTTTTGTGTCTGCACTTTGATTAAATATACTTGATTATAATAATACAGAAATATACATACATATCTATTTATAAACACAAACACACACACAAACAC:1 + chr3L 17464964 5' + gypsy3 418 2 52.48 TACTGCACTGCAGAATAAGATCAGATAATCTTTAAAGATTTATTTAACATAATATAATAACAATTCAATTATCAATCAGTTTATTAATTTTAAAGTTTTTT:1 + chr3L 15708599 5' - 1360 3021 1 90.10 CGAGATGCAGTTGTAACTTATTGATTTAGAATGCAACAAACGATGTCTGATATCTTGTACTAAACATCCAATTATTACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGAC:1 - chr2R 22369661 5' - roo 9070 1 77.23 GGATTCGATTGTATTGCGGCAAGGAAAAGCGCTCAATCTTCTGCTCAATCCGAACATGACCTGCCTTTCTTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGT:1 - chr2L 20313549 5' - Doc 4354 1 75.25 AAGAAGTTGAAAGTTGAAANTAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2L 11832537 5' - roo 9033 1 60.40 CATTCACAAGATATATACAATTACATGTTTTGTTTCCCAATTTTCAATTGTGCTGATCTGTTTAAACATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 5043382 5' - roo 404 1 74.26 ATATGTGAACTCAACAGGGTGAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGG:1 - chr3R 13441914 5' - 1360 3334 1 79.21 GTGGAGGGATAATATAGAATAAAGTTAGGCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACT:1 + chr2R 21776276 5' + I-element 198 1 70.30 AAAAAAAAACAAGTAAAGAAGTAAAATAAAATGAAACGAAAAAAACAGATTTATTGTTGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chr3R 9198315 5' - 412 7527 2 52.00 AACCGCACACACAGACACAACAATGGCGACGCAGATAGCAAGTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAACCGATAAACACTCGG:1 - chr2L 17308016 5' - hobo 2907 1 54.46 ACTAATAAATAAATCACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCAGCTCTCTTCACTCAAA:1 - chr3L 25951921 5' + Doc4-element 42 1 80.20 GTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 19450173 5' + roo 42 2 62.38 AATGCATGGAAAATGGAAAAGCGTCTGGTGAGGGGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGACATAACGGC:1 + chrX 14008232 5' - G5 4562 1 68.32 CAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAAAA:1 - chr3L 24916684 5' + Porto1 155 1 62.38 AGCGTACTATTAAAAAACTAAAACTTCAAAATAGGGACTTAAATACAACAAAATCTCTTCAAAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 5025590 5' - roo 395 1 63.37 AATCCGCTTTGTGGCCCCCAGCTCCAGCCATACCCGATGAACGTCTGACTCCCTGCCAACCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCT:1 - chr2L 4521755 5' - R1A1-element 4880 1 68.32 AGAGGAAGCAACTGGCTGGCATTGCTGAAGAAATAACTTGATCAACAATGTTATAGCATAATTGCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3L 2424943 5' + jockey 22 1 62.38 TTCAGCATTCCATTTGTTTCGCTCTATGCAGTGGCTCCCAAACTGTTCATTAATCGAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 + chrX 14961021 5' - jockey 4972 1 43.56 ATTGAATCACTATTATTAAAGTTATCCTTCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 - chr2L 16866498 5' + Transpac 4942 2 55.45 CCCGTCACGTGTTTGGGATTCATAAATATCCTGGAAGCTCCCGCGCCGCAATTTTAAATCGAAGTGTTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAA:1 + chr3R 5963160 5' + R1A1-element 334 1 69.00 CAAATAAAATTGATTTAGAGCATAAGTTTAAACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr3R 5733185 5' + jockey 4716 1 73.27 ATGTTTATGGTACTGGCCACGGATGCGGGTCTTCAGAGAAAGGGAACGCTTGGTTTTGGTCATGCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATCCCACG:1 + chr3R 24752875 5' + invader5 3944 2 64.00 GAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAGCAG:1 - chrX 19820779 5' - Rt1b 4969 1 70.30 GTATGTGTGATGAGTTCAACAACCCAAATAGTTTCTCTACTCCAAGGCTTCACTAAAAATGGCAGACAATATTTCTCTTTTGTGGTAGGATGAACACTCA:1 - chr2L 5647458 5' + invader3 5185 1 78.00 ACTGTCAATTATTTCCTTATTCTTTATGCAAAGCCCCCAGACGCGAGTATCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 + chr2L 3581960 5' - transib2 2800 1 53.47 CCATTCTTTTCTTCAAACACAGAGCGCTTAGTCAAATAGAAGCCACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACGTT:1 - chr2R 25177195 5' - Bica 228 2 56.44 CCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGG:1 - chr2R 14849015 5' + flea 4711 1 58.33 ATCGCCTGGAAAAATTATCTCCCTGTGTGTTTGTGTATTTGGTAAGTGGGCGGTTGGCAGTTAATTTGTTGCCACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAG:1 - chr3L 3928570 5' + G2 2893 1 72.28 TTATTTGCCAAATCAATTGAATTATCCTTTTCATTGATGAATAACTCTTCTTCCTTTAACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCGGATTTTAATGT:1 + chr3L 7832479 5' - Quasimodo 182 2 48.51 CGAAACCGATTTTGTGATTCAAGCATCTATGCAATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATAC:1 + chr3R 3528055 5' + F-element 187 1 71.29 ACAAGTGCGGATAAATATCGGAAGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTT:1 - chr3L 2907165 5' + Burdock 125 2 77.23 AATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 - chr2L 14979234 5' + Ivk 26 1 56.44 ATAGCCAGCTTTTTTTCGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAA:1 - chr3R 9121512 5' - roo 383 1 52.48 TCGGTGAAAATTATGCATGGATTTTTTGTTCGTTAAACAATTGAAATCTTTTTTTTTTGTGCGAGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATG:1 + chr3L 17501656 5' + hobo 2595 1 67.33 CATATCTCTGGGTCATTTCCTTAAGTTTTAATCTATTCGTACAAAGAGTACGAATTAATTTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 + chrX 983303 5' - Juan 4195 1 53.47 CAACCACAAGTGCCGCCACAGAATCCCCGCCCCGCCCTCACCCCACATCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACAC:1 - chr3L 22136875 5' + G2 2966 1 52.48 GCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCGCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr2R 5651897 5' + Tirant 35 2 57.00 CTTTCAACCCTCGTCAGCCGCTTTTGTATTGGTAAATGTTGCACACTTACAGTATGAATTATTTAAGTGAAACTGCTGCGGCTGATGAATCATTGGCTACT:1 + chr3R 29692478 5' + X-element 348 1 64.36 AAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGG:1 - chr3L 25350818 5' - baggins 5411 1 47.52 CGCTGGTTGATTTTTGTTACAATTTCGGTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAG:1 + chr2L 4060447 5' + jockey 219 1 76.24 TGTATAACTAAAGGCGAGAAATTTGTTGAGTTGGATTTTTATTTGCGCAGCTAGCTCACTTGTGTTTTCAGTTTTCATTTATTTTTTTATTTTTTTTG:1 - chr2L 7486960 5' + Tc1 1396 2 72.45 TGATGTTGATGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATTTCTCCTACTTGTGTAAGCATGGTGGTTTAGAGGGAGGGTTGG:1 + chrX 12052777 5' - ZAM 7989 2 80.20 AAGTTGCACAAAAGCCGAATCACAGGGCTCGCAAAATTCGCGCACTGGAGAATGGGAAAATTAGCTAGGATATTTGCTAGTCGGTTCGGGTGGACCAGAT:1 + chr2R 16895095 5' - G5 4580 1 60.00 CAGCTGCACGAGAACACAAAGTTCAATACTGCCAGCCAGCCAGACATTACGTTTTTTACATAACTCGTTTGCTATATAAAGTATTGTTAGTTTGTGACCGA:1 - chr3R 19307965 5' - flea 4939 1 77.23 GTCACAGAATATGCGAGGCAACTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chrX 22382264 5' - opus 7454 2 79.21 TTAAAAAAAGTGAAATGTTTGATTTTCGGAAATTTTCGTACTGGAGGTGGGCAAAATGAAAAATTAATTGGTGGGCAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTT:1 - chr2L 8371769 5' - FB 47 1 52.48 ATCAATTGACAAACAGAAATAGCGATGAATAAATTGCAAATAAATAGAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTTAATAAA:1 + chr3L 14657461 5' + McClintock 6266 2 54.46 TTTTCGATTAACCTAAAGGTCCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr2R 18073281 5' + hobo 55 1 77.23 TAACTTTTGAAGGAACTAAGACAAAGACACATACATATATAGCGCACACAAAATAAAAGAAACAAAAAACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGT:1 - chrX 12810682 5' + hobo 2743 1 75.25 ATTTAAGTGGCCCTGAAGGNGATGCGAAGCCAGGGGAGGTGGAAGCGGAAGCAGTGTCCTGCCCCTCTCATCTGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAA:1 - chr3R 7880698 5' - HMS-Beagle2 6841 1 74.26 CAACTTTATTTCCCAATAAAAGTTGAGACAAGATCTTTCCAAATATTTTAAGCTCAATAGAACAATAACTATTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGT:1 - chr2L 16962889 5' - 1731 309 2 48.51 GCCCACTACTCCAGCAGAAAGAACGACCAATAAAAAAAAGTGGGCGGGGTCAGAGGTCGCACATGCAAGCTCTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTG:1 + chrX 5736475 5' + R1A1-element 218 1 75.25 AAAAGGTTGGGGCATCATTTGTTTTGGGAGGGCTTGAGAGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGAGTGAAGAGAGCTGACGCTCGTC:1 + chrX 1384797 5' - Doc4-element 37 1 66.34 AGTTAATGTAAAGATACGCTATAGCTGTTGGGGTTCTGCCGCCAGCCGATAGATGGTGCTTTACATAGAATCTTCGTGCTAATAAAAATTAATTAAAAAAA:1 - chr3L 18848331 5' + Doc 4693 1 62.38 CAATTTATCATTTCCGGTGGTGAGGCGACGCAAATTGCAGAGCTTAGGAAATGCTTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 - chr2R 15160384 5' - Tirant 8488 2 61.39 AACTAACAAGAAGGCGTTGGACTGACTGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTG:1 - chr3L 2507847 5' - Quasimodo 48 2 74.00 TTTTAGTGAGTTTCCGGCCTTTAAGGGGTGTATTTTTACGATAATAAAAGTTTGTTAGATCGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr2L 20824169 5' + Transpac 12 2 67.00 CGTTATTGCTAACCACCTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 + chr2L 21369845 5' + rover 24 2 56.44 GAAGAATGGATAGAGCAGTTCGGTGTTCTGGGCTTGAGGAGATTGAGTGAACCTCATCGTCAGAAAATAGGTGGTCGGACGTGGACATATTTGTTTATA:1 - chr3L 8969359 5' - TAHRE 442 1 54.55 CACGTAAACGGTCATGGCCTCATCCAAACACACACACACACACACACAAACGTAGGAACAGGACCAAAAAACTCACACACTACCTAAATCCCAATTCAAT:1 + chr2R 20453765 5' + I-element 4981 1 69.00 TTTTTGAAATACCTTATTTCTGTGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 22369582 5' + roo 8716 2 80.20 GTCCTTGGCAAAAGGAAGTCGAAAAAGCCGCAGGATTCATCGGCGTCATCGTTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTA:1 + chr3R 6976575 5' - Idefix 226 2 55.45 TTCGTCAGATGCTCATCGAGTGTTGCTGCGGGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 13549308 5' - P-element 2844 1 36.63 TAATGGATATGACTACGGTTATGGTAAATACAACAAACAACAAAGTAGTGCTCAAAACAATTATTACAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCA:1 - chr3R 13642300 5' + F-element 332 1 72.28 TTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAC:1 + chr3R 13582244 5' + BS 5047 1 75.25 AAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGT:1 + chr2R 5260084 5' - 1360 3225 1 63.37 GAAATCACGCACACTCGCTGTAAATCACACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACC:1 - chr3L 3964879 5' + Ivk 5123 1 77.23 AGCTTACCCCCTCGCCGCTCGATGAGTGGCTTTTCTTCTTTCATTTGGCCCCGTTGCTACTGGCTGCGGGGTGCATAACCAAACATCCTCCCGCCGTTG:1 + chr2L 19241617 5' - diver2 4519 1 64.65 AATATAATTAAATATTTTATTTCTTTACTCCTTGGCATCTTAATTTCTTAAATGATATATAGCACAAGTCTAAAAAAACATAAATAAAAACCTAATAAATT:1 - chrX 15380264 5' - INE-1 412 1 77.23 TACATAAATAAAGGAAATGAGTGGAACATGGTGATTTGTATTGTATTATGTTTTAAGAGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 18883745 5' + roo 17 2 53.47 TGTAAAGCTATTAATATTGTAATTCGGGTAAATTCCAAGGAAAATAAGAAAAACAAAAGAGTATGATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTA:1 - chr3R 4127532 5' - INE-1 552 1 58.42 ATTTCGAATCGGAAACGGAAACGGGAACTGTGGATAAAGTGTGTGTGTGGTTGACAGCGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGG:1 + chr3R 12873134 5' + opus 7263 2 64.36 CATTTGTGCTGAGGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2L 2505677 5' + jockey 21 1 64.36 TGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAG:1 + chr2L 23506307 5' - Max-element 99 2 58.42 ACGCTCATTCACAAGGAGAACCGCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGAATACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGC:1 + chr3R 30044457 5' - R1A1-element 191 1 75.25 AATATAAATGTCTTAAAACACACCCGAATTGATGATGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGCTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chr2R 19430745 5' - 412 451 2 64.36 ATTTGGTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 12800960 5' + hobo 34 1 57.43 CAGACAATATCCCTTTTTTATGCCTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr3R 29413110 5' - hobo 2895 1 73.40 CTATGCTTTCAGACGCCGAAGATAATTGAGCCCAAAAAGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACGGGGCAACGCATACAATTCCATATACATACTCATA:1 + chr2R 21769954 5' + ZAM 190 2 70.30 GGATACCCCCGTCCACGTCTCCACATTTTAAACATTTTCGAAATGTTATAAAAACGTGTAAAGGGATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 + chr2L 21786677 5' + Max-element 12 2 66.34 CTAGTATTTCCGCAGCCCCAAAAGTAGGCATTAATTTGCTTACAAATCTATTCATCTAATTAATCTTCATCCCCAGCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr3L 4901123 5' + jockey 4671 1 78.22 AGCCAAAGGCACACGGACACACACCATCCTGATTGTTGTCCTCTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chrX 6388329 5' + hobo 34 1 56.00 GAATTCGAGGAATACGGGAGTACGACCAAAGACAGACAGACGGCATACGGCGCACTCAATGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGA:1 + chr2L 16691715 5' + P-element 379 1 61.39 TGCCACGCCCACACCGCTTNTAACCGCCCACAGCTCCGTCAACTGGCGATGGCATGTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATA:1 + chr3R 27785786 5' + gypsy12 24 2 54.46 TGAAATGTGCTTACCACTGCCTGCGATACGAATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACGA:1 - chr3L 22647206 5' + Cr1a 4007 1 68.37 GTGGCACATTTGTCGGGTGATACGCTTTTAATTAGTGGCGATGGCTACGGCAATGCTGATGGCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr2R 13745681 5' + hopper 13 1 66.34 AATTGTTTGACTATTATTTCGCTACATTAAAATCAACAAATTACACACATACTCCGTTAACCATTGTAGGCAAGCCTACAATCCAAGTGGCCGCCCGAATT:1 + chrX 7308356 5' + Doc4-element 439 1 67.33 AAAATAAATTTTTTTTTAGAAATTTTAAGACCAAAGACAAAATTGAAAAACGAACAAGCGCTCAGCGGCAAAAATACCAAGACGAGCGCCGACTCCCTTCG:1 + chr2L 8705646 5' + Doc3-element 262 1 59.41 CATTTCGAAGTCCTGCTAAACGTTTTGCCACTTTGTTAAGACCCGACCTCTCAATATGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 1930518 5' + roo 17 2 57.14 GGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGA:1 + chr2R 1922432 5' + gypsy 31 2 58.95 AAATATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 - chr3R 4474239 5' - copia 223 1 60.40 AGTAGACCCGAAGTTTTGTTTTTTTTGTTTTAACGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATCTGGACAATAATCACATGTTTGG:1 + chr3L 25512948 5' - G-element 4272 1 74.71 CACAAGCTACAACATTTATNTAGCTATAAAGTGTCTTGACGATGTATTTTCAATAACACTTCAATACCACTTCAATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 - chr2L 7552500 5' + I-element 8 1 52.48 AACAGTGGCGTATATAAGCNCTTCAGCTTCGATGCCTGGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr3L 13059690 5' + transib2 35 1 61.39 TGACACAAGCCAAACGAATACACACACAGAAATGAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr2L 1858316 5' - pogo 2066 1 64.36 CTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTTAGAATACAAAAGAATTAACTCTTTACAATCACGCGGTCAAACAAAA:1 - chr3R 4577077 5' - Tc3 354 1 70.30 CTAGCTACCCCCCTCGTGATCACCTCCTGATAACTCGCGCACTCTGCCGTCAGCCTACGATCATCAACTCGTGCAAGCCGCTGTTCTCGCACGCATTTATC:1 - chr3R 2658228 5' + diver2 110 2 72.28 ATTATCAACTTATTATTTGAATTACTGTAATGATGAACTCTCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr2R 24293798 5' - 412 7492 2 70.30 ATTTCACACTGCAGCCAAAACAGATGCTGAAACTGTACACTATGGGGCACTTGGCCTGATTTTTTTTTACAAAAATTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTC:1 - chr3R 1273083 5' + 17.6 429 2 79.21 GACTGACTCGTGGCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 7582602 5' + 297 8 2 71.00 ATTGAGTTCCTAGTGCTGCTAAGGACACGTCCATAAATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGCAAGCGGCCAATGCTTGT:1 + chr2R 9640345 5' + Max-element 36 2 58.00 GAGACACACTTCATTATCGTACAAGATTCCCTATCAATTTCTAGCACTCAAAACTGATAAAGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 19167989 5' + roo 8678 2 65.35 GGGTATAGTGGACATGAAAGTGGTGCAGTCAGCGCCTGATTATTGGAGATGGCCGATATGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 11415658 5' + roo 8680 2 63.37 GAATATATTGGTACTAACACCATACAACTATAGCCAACCCCAACCCCAACCCCAACCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAA:1 - chrX 16117086 5' + I-element 5156 1 53.47 GTGGCGGCTTCTGGGCGATGCGAAAAGTTTTGTTTTGCCCCCGGCTGTCTGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2L 10924289 5' - hobo 2914 1 51.00 GGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGG:1 + chr3L 26852646 5' + 1360 42 1 63.64 GTGCAAGTATGATATTATATTATCAAGCAGGCGAAGTTATGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 13518274 5' + 1360 11 1 52.70 CAACCAAGCATGATACCTATCTGAAATGGTTGAAGCCGGACCCATGTTGCCACGCCCACTGTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTACCACGCCCACACTT:2 - chr2R 25203926 5' + INE-1 244 1 62.38 GGCCAGGTAGGTGTAGGTATCCATCCAGTTTCTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chrX 18322577 5' + jockey 4718 1 67.00 TTGGTCTAATGCTGAAGCGCAACTGTCAGCTGCTCGGGCCGTTCAAAAAAGCTAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - 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chr3R 15021691 5' + invader4 2746 1 44.55 TATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 + chr3R 19446672 5' + HMS-Beagle 6844 2 74.26 AAATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 9439171 5' + roo 8707 2 73.27 CCCCAAAACTAACAAAAATTAAAAATAGTCGAGCCAACGGGAAAAGTGGAGAAACCAAAAACTGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr2L 17131517 5' - mdg1 409 2 62.38 CAAAGAAACGGGGTTCCGCCGCGTGACGTCCACCTCCTTATCGGTTTCGGATTGGTGCCCATATGAATATCTGCTCCAAGCTTCCTTCTGCCTGTTAAAT:1 - chr2R 12674924 5' - INE-1 30 1 72.00 AAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2R 1373179 5' + pogo 38 1 62.38 TACATTTCGTTTGTTTTTCATATTTCTTCGCATGCCGGGCTACACGTGTTGGTAACATATTTTTGGACATTATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3L 4923785 5' + jockey 11 1 74.26 GTGTGGGGTTCACTTTTAATAAATTCATAAATATTTATGGATGCAAAATTCGGGCAAGGCGACATGGGTGCATTGCGCAAAAACATGTAATTTAAGTGCAC:1 + chr2R 16453819 5' + roo 134 2 50.50 CTCGTCAAGCTGCGCGTCTGCCTTCGCCACATGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATNTGCCTGGGAACTGAA:1 - chrX 4118642 5' - Tabor 6937 2 66.32 CCTCCTTTTCTTTGGACATGTCTTAGCTTTTCAGTCAACGTCGCTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGCTGAGTAACATTGTGGTCTGGCAG:1 + chr2R 18151289 5' - Bica 4792 1 58.06 AATTTTCCCATGAACATTTTTCATCTGCTCTAGCGTGCAGCAAATCTGATTCATAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATT:1 + chr3R 23555486 5' - TLD2_LTR 169 1 54.46 GAGAAGTATAGCTTTAAGGTTTATTTTTTATATCAATATTGTATCATTCATAACCGTCTTCCTTTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGT:1 - chr3R 21849230 5' + hopper 249 1 78.22 AAATTGTTCATATTAATGTATTAATAATGGTTCGCAATTTTTACATTCACGATTTCTTTTTAAAGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTA:1 + chrX 6499381 5' - I-element 407 1 67.33 GAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:1 + chr3R 14049329 5' + transib2 14 1 65.35 CACCACTCCTCCTGACCCCAAGCACTTTGATTAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAA:1 - chr3L 14653082 5' + jockey 4978 1 68.32 ATGGTTATGACCTTCTGGCTGGATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATA:1 + chr2L 1201947 5' + Stalker2 7251 2 76.24 CTTGACTCCTCAGGCCGCAGATTCCTTCGCTTTCGAGTCGTTTGTTAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTTATTCAGTATATACGTGGTCAGTGCTA:1 - chr2R 21699382 5' - Tc1 219 1 52.48 ATTTACATCTATGCACACACACATTCATAGACTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTA:1 - chr3L 17136018 5' + BS 44 1 68.32 GTGTAGTAACAAAGATTGTNGCTTTTGGCACCCGTCAGTCCGCCATAAAACAAGACTCTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3R 13441856 5' + 1360 14 1 63.92 ATATGTTTCATGCAGAGCTCCTTAGGAACTGAGAGACTGAGAAACAAGAGAAACGGATGGACATATATCTATTCTGCTGTTAATACTGATCAAGAATATAC:1 - chrX 21187603 5' - INE-1 82 1 43.56 TTTGTTTATGTCTGAAATATGCCGGCGTCAAAATGTGGTCTGTTTATATAATTGACATTTCTCGTCTGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGT:1 - chrX 10925695 5' - gtwin 7383 2 69.31 TTAAAGACGGAAGCGCCGGGCGGCAGAAATAAATGAAAATTCATATTTCTCGGCAGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chr2L 19994763 5' - pogo 2043 1 61.39 GTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATGCTGCATACTTCTACGGGGGGAAGAATATATT:1 - chrX 22577181 5' + Transib5 2826 1 43.56 CTTGAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAG:1 + chrX 22726201 5' - Helena 1267 1 48.51 AGAAGCTAAAAAACAAAAAAAAAAAGAA:1 + chrX 2974318 5' - hopper 150 11 89.29 CACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chrX 21087571 5' + mdg3 5268 2 60.40 AACACCTGGATTTTTTGCTCTGTCTCCTCCACAGCCTCGATAACCGTCTACCGTCTGAAAGCCAAAGGTCAACAACCGTCTAAGACCATTGAATCCGGGGA:1 + chr2R 3925274 5' + gypsy10 5597 1 51.49 CGACGCAAATTGCAGAGCTTAGGAAATGCTTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 - chr2R 15160359 5' - Tirant 8463 2 69.31 AGAAACTGAGGTTGTTCACTGCTTATGTCTTTCGTGTAATTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr3L 16494723 5' + jockey 4705 1 61.39 CATCGTGTGTATGTACAAAAAAAATTATTAAAAAAAAA:1 - chr3L 11630634 5' - hopper 162 3 71.05 TGCAACTAATATACTAATGGACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 19450181 5' + roo 50 2 52.48 TCTGAACTTTAAAACATTCCCTTCATATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1 + chr2R 5413444 5' - Juan 4165 1 76.24 CAAGATACACACCGAGATGTGTTTCCCTTTTAGTTTGACTAACACTAGGTGCGTTTAAAGCGATTTCCACTCTTACGTACGCTCGTATTTTTGTTTTATTT:1 + chr3L 20164308 5' - Porto1 196 1 66.34 AGGAAGGGAAAAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTT:1 - chr3L 9220170 5' + BS 35 1 62.38 GTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2L 2505642 5' + jockey 57 1 72.28 CGCGTTGCATGTGACGGGTTTCTAATTGCAAATAATTACCTAATGTAGTAGGCTGTTCCTTCTACCCTATTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 - chr2R 20690576 5' + mdg3 5281 2 49.46 AGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 + chr2R 5214954 5' + F-element 26 1 58.42 CTTTATAAACGATGTCGCAAAAGAAAACTGGATTCACAGGCAACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3R 8812624 5' - P-element 2885 2 47.52 AAAACTAATTAAACATTTTGCGCATACACGCTCCAAATGAGGAGAAGGAGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTT:1 + chr3R 4879620 5' - gypsy4 6631 2 63.37 CCTGGTCACCGGCAGCTCGTGTCGATTTCTGTGCCGCTCTAGTCTGTCCTGGTACCGGCTGGGGTGTGTGTTTATTGCCTCAAAGGCAG:1 - chr3R 19087498 5' - BS3 1452 1 75.28 GATGTGTGTTTGTGTTGTGGTTGCAACGCCTAGTTCGCTTCTCGCATCTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTG:1 - chrX 19699627 5' + Tc1 154 1 54.46 GGGTGTGCGGAGTGCTGCAATGCACCAGTTACAGTGGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 - chr3R 30284273 5' - blood 7349 2 63.37 CGCGATGCCAAATAGAAAATCATCATAATTTTCCTTTATTACCAGACTTCTTACCCATTTGCCATACTTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCA:1 + chr2L 20963438 5' - Bari1 1697 1 69.31 TCCATATGTTACATATAAATACAATGCACATTTTCATAACCTTTGTTCGGAGAGTAAAGGGTATACAACATTCGCTGGGTAACGGGTATCTGATTGTCGGG:1 + chrX 22672187 5' + INE-1 552 1 69.31 ATCAATGACTGAAAAAGAATTAATTCATTATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 - chr3R 22103694 5' - jockey 4943 1 75.25 GATGTCCACTGAGTTGCCGGTGCTTTGGTGGGGGACCGTCGAAGGTGAATGCTGAGGCGGTAACTCCTCCCCCCTCAG:1 - chr3L 20453226 5' - Tirant 8097 2 73.08 AGTGCACACAACAAACAGCNGAAACGGCTTTGCACACATGAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 26498586 5' + roo 8699 2 60.40 AGCCGAGACCTTTACATGCTTGATACATATATGTATATGCATATGATGTACGTGTATTAATGCTTCGTGAAGTTACAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAT:1 + chrX 13590510 5' + gypsy7 5010 1 81.19 CTGAGGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2L 2505669 5' + jockey 29 1 56.44 TATTTCACATTTCCGCGAATTTGTTTTTCCTCGGCGCCGTGCCTTGCTGCGCCAAGTTTTCCTTTCAATTGGCCAATAGTCGTATCTCTTTTATGCGTTGC:1 - chrX 16966957 5' - rooA 7191 1 74.26 CACGTATATTCCACCGCCGCATGCCGTTTGCATGTGTGCTTGCTTCAACGCCACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCC:1 + chr3R 25151638 5' + G2 2978 1 62.38 TTATTACTAAGGGTATGCCTTTTTTCTCATGCCACACGAATGGTTACAAATTTATAAATATTTTAAGTTTTTTTAAATAGTAAAAACAAAGACACTAGAAT:1 - chr3L 11314528 5' - Tc3 317 1 40.59 ATATATATATATATAAGCATAATATACTTCACATATTTCGCTTACACAAACATTGTATATACAATATTGCACATGCATAAACACA:1 + chrY 429468 5' + rover 7009 2 84.71 GCATGTCTTTTCTTCTTGGNGTGTTCTAGGAATTGGAGTTGTCTCCTCTAATGTGTGTGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAG:1 - chr3L 16031801 5' + opus 7252 2 59.41 TATAGTTTTTCTAATTTAAAAACCCATTTTCCAAACAGCTCGTTGTTTCAACAAATTGTATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 24612159 5' - roo 391 2 62.38 AGAGCCAAAGGCACACGGACACACACCATCCTGATTGTTGTCCTCTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chrX 6388331 5' + hobo 33 1 54.46 AGCATAAGAGATTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 19698503 5' - hobo 2911 1 62.50 CCACCTGGCTGGCTCCTCGGCTCCGGCCTGCTCCATCTTGATTTTGTTGCCTCTTGTGAGCATACCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr2L 19677270 5' + hopper 11 2 66.34 AATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTACATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTAT:1 + chr3L 6620557 5' - accord 7033 2 63.37 GAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2R 9871066 5' + roo 8692 2 77.23 ACATCAAGATGCTAGCGTTGAAAGGAGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 14132071 5' - roo 9043 1 53.47 ACTTTGAAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 11814484 5' + blood 7042 2 55.00 CACGACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTAT:1 - chr2R 3341945 5' - Dm88 4130 1 60.40 CAGACAGACAATTGACCCAAACTGCCAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACC:1 - chr2L 13997552 5' + I-element 4984 1 76.24 ATAATCAAATGGAGTTCTTTCTATTCCCCAATATCTATTCGCATTTCCCCTAACTGAGTAACTGGTATCTGATAGTCGGGTAACTCGACCATAGCATTCTC:1 + chrX 20092921 5' + INE-1 573 1 78.22 TTGTCGTGTCCTGAATTTTCAAAAATTAAGAACATTGCTACCGAATTGAAATCAAACAAAACTGGTGTCTGCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTT:1 - chr2L 16566388 5' - 297 394 1 74.26 TAAAAGTTTGCCATATGCGACAATATACTTATATTTATCAGCAGATATATATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr3L 15390326 5' - pogo 2092 1 66.29 AAATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAG:1 - chrX 983386 5' + Juan 3817 1 65.00 ATCAAGCCGTGAATGCTCTCGATGTCGCTGCGGAATTGCTCCAATGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTA:1 + chr3R 15361188 5' - G2 2849 1 56.44 TTACCTATTTTTGGCACACAACCCGAGGTCAATTAAAGAAATTGTACCTTGGTCTGGTCATCACTGCAGTTGGCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCC:1 + chr2L 8623595 5' - pogo 378 1 72.28 AAAAATAATGCCGTGTAATGTGCGAACGATGGAGTGGCGATGAGTGAGTGCTGGAGCTGATGGAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTAT:1 - chr3L 8461799 5' + P-element 2877 2 70.30 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTA:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 36 2 50.50 CGTACATTAAATAAATTGGTAATTGTATGCAGATTTAGACGAGTTCAATAGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr2L 5304700 5' - 412 7520 2 52.48 TAAATTACTCTTTCTCCTGAAAAGATTGTTTGCATTGGCATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGAT:1 - chr2L 21369922 5' - rover 314 2 61.39 ACATTACAAACCATATGATTCTAGGATGCCATGCCAGTAGGTATCACAAGGGTATCAACCACCTGGTGGTACGCTGCTGGAAGTGCAACTACATTCTCCAG:1 - chr2R 1069297 5' + baggins 81 1 71.29 GAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 6399510 5' + roo 8711 2 73.27 AAACAACCCACCCACCCCGATTCGATTGGGATTCGACCGCAGATGCAGTCAATTATTAAACGCCTGAGTGATTGCGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCT:1 - chr2L 1202075 5' - Stalker2 401 2 77.23 AATAATTGTAGCACCAGCATAGCTATATCTTGTACATAGATTTATTATATATATACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr2L 20330004 5' - 297 6962 2 66.00 CGACGGCGTGACAGCTTTTCCATCTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr2R 18850605 5' + P-element 51 1 31.68 GCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCG:1 + chr2R 21776304 5' + I-element 226 1 57.43 ACACCAGGAGAATTGAAAGGAGAACCTGCCGCTGCTGCAGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2L 10924201 5' + hobo 15 1 62.38 TGGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAAT:1 + chr2R 1922431 5' + gypsy 7023 2 60.40 ATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGTATGCTTAGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTTATACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGT:1 + chr3L 17307313 5' - Stalker4 7076 4 59.41 ATGTATTATCCATTATGGCTTAAATTTTATAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATATAACTGTTCCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAA:1 - chr3L 10715504 5' - Tc1 1413 1 70.30 ATTCTATTCCGGTGCACTTCTAAATCTTCTGGATTTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3R 28333521 5' - pogo 2066 1 62.38 TTCTAATAATAATATGACANGATACCATGTGCAGCATAAGGTCATATAAATATGTATAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 18883846 5' - roo 394 1 65.35 TCTATTGATATTCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCATTCGCATTTACTCGAGCTGAGTAACGGGCATCTGATAGTCGAGAAACTCGAATATAGCATTCTCT:1 - chr4 972662 5' + INE-1 574 1 77.23 CATACGACATGTTGTCCATATCACACACACACACACACATGAACACACACACGTACATGTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGC:1 + chr2L 5023753 5' + 1360 114 1 67.78 ACGCGGCCAACTCGCGCGACACTTACAAATTGCATTAAAAGCGCTCGCATTGCAAACGCACAGCCACTCCCCTTTTGGTGCCTGTTCACACATGAACACGA:1 + chr3R 11831382 5' + roo 8662 1 75.25 TCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr3R 27605330 5' - opus 451 2 76.24 CAGAAACGAGCAGCGGAAGTCAGCAACCTACACTGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATA:1 + chr3R 7683170 5' - accord 97 2 66.34 CACCTTCGCTGCACACAGGGCAACACCGTGCCACTGACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chr2R 16406053 5' - 412 7492 2 53.47 AGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr2R 4606200 5' - 1360 3373 1 63.37 AACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 - chrX 21939116 5' + HMS-Beagle2 30 2 60.00 AATAGATTTCCAAATCAATNGACCATCCCTGGGGAGTTTTTCTTTATTTCAATGCGAGAGTTTTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 7185303 5' - 1360 3375 1 67.33 CCGCAGCGCCCAACCACCATTGACGGCATTCAAACAGACAAGGAGTTGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCG:1 + chrX 4514671 5' - diver2 90 2 59.41 CATGCACATTTATTTATATTTCATTTTGGCGCTGCTGTCCCTTTCGGTTTTCTTTTGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGA:1 + chr3R 29340460 5' - F-element 462 1 65.98 TTATGTTGACAAGACAATTTGCCACATACATAACATAAGACGTCAGTAGCACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr2L 10171663 5' + 297 6599 2 51.49 TCTCTCACACCTACGCTCTATATACCCCTCCTGCTTCAACGGCAATTGTATGCTGTCAGTGAGGTAAGTGTTTTATTAAATTTAAATTGTGGATGCGGAA:1 - chrX 11426403 5' + TAHRE 10386 1 47.00 TCCTTCCACCTTATCAGCACCTTCCCTACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3R 8090557 5' - P-element 2838 1 30.69 TTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:1 - chr3R 15021689 5' + invader4 2748 1 45.54 ACCGCAGATGCAGTCAATTATTAAACGCCTGAGGGATTGCGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTG:1 - chr2L 1202040 5' - Stalker2 366 2 59.41 GGATGCTCTAGGATTTTCAAATCTACATCTTTTGAAAGTATTTTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chr3R 27184378 5' + Tirant 8137 2 54.46 TGCGTGCACCAGATAGTCCTCCTCCGCGGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chr2R 8528207 5' + Transpac 44 2 68.32 CTATGACTATCTTTGGTTTTAATACAGACCTAGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2L 9724198 5' - 1360 3368 1 54.84 CATAGGTAAGTTCTCGAAAGCAAGTCTGTGCAAAATACGGAATATGTTTTTTCTCATTTTCTTCCCCAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 + chrX 22765021 5' + HMS-Beagle 6801 2 70.30 ATGATGGGGCTAAAAAAATGTTGGCACCAGAAGCGTGCGCAAGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTT:1 + chr2L 14664127 5' - opus 7124 2 57.14 AACTTTCATCGGTCCTTTTGCGCAAGATATCACACAGGATGTGCTATCATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3R 6002935 5' + opus 24 4 55.45 GATAATAAGAACATAAAAAGCGATTAAAGATATTATCAACAGAGAATGGGGTGAATACCTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr2R 8674214 5' + roo 8663 1 73.42 TATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTAATTCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATT:1 - chr2L 22224562 5' - Rt1c 5399 1 58.42 AAATAATCTTGAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGT:2 + chrX 22726194 5' - Helena 1274 1 46.53 CCTCCTATGGTGGCTATCCGTACAGTCCCTATCCCAACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATA:1 + chr2R 20751750 5' + I-element 4922 1 64.36 TTTTTTATAGAGAGGAAAGTTATCAAATTGATAATCCCGCTTATGTTTTGTTTTTTACCGTTTTACCAAGACGCCCAGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 15887128 5' - accord 185 2 54.46 CAGTGATTGATATACAGAACGAATGGTTCATCGTGGCGAATATGAAACAAAAAATTCATTTTGCGCGCAATGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCT:1 - chr3L 27412598 5' + hopper2 1441 1 65.35 AAAATCAGAAATATGGGAATTGGTACGTAAAGTTTATATTGTTTGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3R 23788502 5' - pogo 2072 1 61.39 TTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 + chr3R 4164651 5' - HMS-Beagle 199 2 80.20 CTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTCAGG:1 + chr2L 17268903 5' + INE-1 137 1 76.24 ATAACAACACGTCGAGTAATTACCATCAAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCG:1 - chr3R 13642232 5' + Doc 401 1 72.00 AAAAAACACACAAATCAATTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTAAAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAA:1 + chrX 12668473 5' + rover 304 2 59.41 GTTTGCTTCCCTTTGATTTATGTCCTGCCATTGGACATCGGTCGGTAGGAGGGGGCCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2L 15331740 5' + 1360 19 1 61.39 CGATCGGGCAGAGCGGGACCAATATACTGCATACAGTTGCGGTAACAATAATAGCTCCATAAGCAGATTTCGTGTTTCTGTATTTTCTGACACTTTTTCAT:1 - chrX 19696953 5' - Tc1 1585 1 65.35 TGGGGGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr2R 6074465 5' - 412 7540 2 70.30 CACCTCTTTGTTTTTGTTTTCACCAAATCGTTAATAATACTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 - chr2R 19775182 5' + 3S18 5801 2 59.41 GCTTAAGTGGCGAACTTTTGAGCATAATTCAGTGGCCGACTGGACCCAAAGTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 27448229 5' - hobo 2917 1 55.45 TAGAAACACTAAATTAGCCAAAGGAGTCGAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 6399482 5' + roo 19 2 60.40 TTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAAC:1 - chr3R 11547749 5' + G2 322 1 70.30 CGAGTGTTTTAATGCACCACTCTCACTCACTATCCGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr2L 6411508 5' - P-element 2846 1 32.67 AACATGACTATTCTCTCTTCTTTATTTATTTTTTTTATAAAAAAATTAAAAAAATTTTTTTT:1 - chr4 333254 5' + HB 327 1 62.90 TTAATGAGCAAACAAAACAAACAGCAGACAGAAAGTCTTTTCAGCAAGCTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 7635423 5' + jockey 30 1 55.67 CAGACCGCTGAGAACGAGAAGCGCATCCTCACCGAGCGCCTAGATAGCGCTCAGACCAATCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCACCCGGTAGGC:1 + chr3R 24126450 5' + accord 45 2 66.00 AGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chrX 21668091 5' + Tabor 6855 2 63.37 ATATTGCCATGGATGAAACGATTTTAATTAGTTCCCATTTACGTATCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 8254759 5' - roo 9065 1 70.30 TGGCAGGAAAATATGAGGACCGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2R 21454333 5' + hobo 53 1 75.25 GTTTAGCGATCTGAAGAGGTACCTTAGTCAGGTGCATTACCAATTCCAAAATGCTTTTCGTATCAAAGTTCTAAACGATTCCAGCAGTCAAATTTCAAAAA:1 + chrX 6769844 5' - FB 33 1 53.47 GCTTTGCATTTATTCGTGTGTAAAATTTTAATTGAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chr3R 15530061 5' + mdg3 5292 2 61.39 CGTTTGCCTAAATTATTTAGTTTTCTTTTCGCTTTTTTTTGGACTAACCAATTGTTTTTTTTTTAAACTAAAATAAAAGTAAATTAAATAAAAAAAAATAA:1 - chr3R 15177205 5' + jockey2 3407 2 60.40 ATTGATTTCGCAAACAGGATAAATGTAGAAATGCAACGTTGCAGTGTTGTCCCAGTACTAGGCACCGTAGGTATACGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTCGG:1 + chr2R 10529274 5' - Doc2-element 498 1 62.38 AGTACCAAGAGAAGAATAATAGAGCGCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr2R 1373090 5' - pogo 2092 1 72.28 AGCGCTCTGTGGCCATGTCTGGATGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATA:1 + chr3R 28970597 5' + Bica 109 1 76.24 ATTAGAATATATCGACAGAATTTCGCTAACTATAGGATCACAAGCTACAGACGGAGTCGACAAATCATTTTGGGCTGCTCAGGTTATATAACCTGGCAGCA:1 - chr3R 1848819 5' - Cr1a 471 1 66.34 CTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 19907963 5' + Tirant 39 2 64.36 ATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATA:1 - chr3R 1960321 5' - gypsy9 5228 2 89.11 CCACAAACACACACATGCTGTGTTGCCATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTT:1 - chr3R 5039249 5' + hobo 2609 1 76.24 AAAACTGCAAACAAATATTGTGCATTCTGATAGGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGA:1 - chr3L 2016928 5' - Tabor 441 2 69.31 TATCCAAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCGT:1 + chrX 18146941 5' - INE-1 554 1 66.34 GCATATATGTTCAAATAGAAATAAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:2 - chr2L 2622751 5' - blood 7336 1 74.26 GTAAAATCAAGACCCTAATAACGACTCTCTCTACCAACGGATACTTTGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2R 10528306 5' + pogo 26 1 53.47 GGCGGAAAAGTCGGGGGTGCCAGCAAATGTTGCCTGTTGTCGTGAGGAAGAAACCAAAACAGAAAATCCCTCCTTTTTTTCTTGAAGGGAGGGGGGGGAGG:1 + chr3L 18191751 5' + gypsy2 6466 1 79.21 TCTTCCGTTTGCTGGCCAGCAGCTCGATGGCCGTCTGCTCGTAGTTGGCCGCCTCTAGAAATGCCGTTGCCATCAAAACAAGAGAGAATTCCATAGTCGAG:2 - chr2R 15142309 5' - INE-1 577 1 74.26 ATTATGCACTCGCATTTGAAATGCAGCCGACTCAACTCAATGCTGTAGGAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 - chr2L 13310302 5' + mdg3 5265 1 53.25 ATACCGAAAACAAAAACCATTAAAAAGGACAAACCTACTTTGTAGAACGTTGCCAAATCGCCAGCACCCCAGACAAAAAAAAATAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16758594 5' + Doc2-element 218 4 68.32 ATTTGTCATTTGGAATCTTTTTCGAGCATCTACTGAAGATCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTC:1 + chr3L 18091501 5' + accord 7117 2 61.39 TAATACAGACCTAGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2L 9724217 5' - 1360 3341 1 75.25 AAATAACCGAATATTACACNAAAGTATATTTGTGAGAGCATCTGTACTCCGTTGGCAAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2R 18043911 5' - pogo 2089 1 67.33 ATCGGCGAGCGGCTGCGCAAAACGAAGGACTCGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2L 16690437 5' - P-element 2842 1 34.65 AAACCGAACCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCTAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAATC:1 + chrX 18146946 5' - INE-1 549 1 61.39 TCCCACTACCTATTCGTCAAGCTACTATCAAGCCATTTGTGCTGCCCCGCAGCGCTCTCAAAAAATAAAGCTAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAGA:1 - chr2R 5877060 5' + X-element 433 1 63.37 GCGAGAGAAAATGAGCTGGCGAAATAGGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGAAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGT:1 - chr2R 11663560 5' + invader2 4840 1 78.22 CGATATCCCCGGGCCAAAGAGGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAATCTATCTATCTAATCTAATAACAAGGTACAGTTTCTTATAAGTAAAGCTCGAT:1 - chr3R 25574574 5' - Burdock 66 2 68.32 TATGGTTCTATCTGTAATCNGCGTTCCCTTCCCCTTTTTTTTTTTCACAGATGTACGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAAA:1 + chrX 5068846 5' - Doc2-element 4525 1 59.41 GTCTTGGAAAATTAAGAAAAGACCACACGTTTAGCAACTAAAAAAAATGTTGTCTTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 12774020 5' + pogo 18 1 53.47 TTTTGGGCACTACTTCCCCATTCGCCTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGC:1 + chr3L 9220139 5' - BS 5070 1 64.00 CGGCCAATTGGTATATTTCCCATTATTTGGCTAACTTTAATCGCATCAATAAGACGGTCGTTAGGGGAAGACTGAAAAAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 + chrX 9190722 5' - blood 168 2 60.40 GGGGGTGGCCGGCAATTATTGCGCAGTTTTGATTCAAAGGCGCAAGCACAAGGTTTGAACCCTGCAAAAGCCAAAGAGTAAAATAAAACAAAAAAAAAACA:1 - chr2L 846011 5' + F-element 4686 3 53.47 CTATACAGTTGGCAGGAAGCCATAAACACACACACACACACACACACACTTAA:1 - chr2L 18783936 5' + Quasimodo 39 2 79.25 AGGGGAATGGGTTCAAAATTGGTAGTTACATTGTATTGATTGGGGATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 + chr3L 6982500 5' + Burdock 6160 2 55.45 GAGCTGAGATCTATTTTCTGGCCTTTTTGCCCGACCCCAAGTTGACTTGAGTTATAGCCGACCCACGACACGCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3R 5953959 5' + roo 8667 2 75.25 CCTTTGTCACACACTGCGTGTGAATTTGTGGCCCAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3R 6761085 5' - blood 363 2 68.32 TTAATTGATGCGGCTTCACGTTCCGTCTCGCTCGCACTCATTAAATTCGCACTTATGCAAGTAAATAGTTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGC:1 + chr3L 23869755 5' - HMS-Beagle2 7174 2 58.42 TCTCATTCAAGATTAGCCAACTATCTCCTCGTGATATTATAAAATATTTACGACTCACTCATATCTACTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAG:1 - chrX 19888630 5' + P-element 2745 1 76.84 TTGCCCAACTTGATTATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chrX 9828519 5' + Tirant 8135 2 53.47 CGTCCATTTGTGCTGAGGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2L 2505681 5' + jockey 17 1 68.32 TTATGCAAATCGAGTTGAAAGTAAAAGCAGCCCCATATATATATGTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chrX 4235884 5' + Quasimodo 21 2 59.18 GATTGCGGTCTATACATGGNGAGTGCCCATGGGCTATGCAAATTATATAAATTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCC:1 - chr2R 1922489 5' - gypsy 422 2 63.37 GGAATGGGCCCAACTTCCTTAGGGAGAGAATCATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 1930451 5' - roo 9026 1 69.31 CGCAACAATAGAATAAGAACCTTTAATGATCAAAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTT:1 - chr2R 1076513 5' - FB 249 1 67.33 TAGCCATGTTAATTAGTGCAAAAAGCTCGGCATTGATCACCGGCCACTCCGGCCAATCGTTAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr3L 20079791 5' - mdg1 408 2 65.35 TTCAGTGCACAGCCAGGACATTCGCACACACACACACACACACACACATACACAT:1 + chr3L 2842647 5' + Quasimodo 39 2 72.73 TACGTAATATCATTTATAAATACGCCTAACAACACCCAGGCCCCATACGTATTGATGTGCATCTAATGCGACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTT:1 - chr3R 27764461 5' + GATE 8218 1 76.24 CCGGCATATAACGGAATGGNCGAATTAATTTATCAAATAGCGTTTCGACAAAACTTTCGTTGTAAACGAACTTAATATTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCG:1 - chr2R 5537426 5' - G4 3366 1 67.33 CCAAGCCAATGCGAAGAATCAGACGCTGATGATGACTACTTCCAGCGCAAAAGAAAGAAACCCGAAAATAATATCTATTTCCATTGTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 12296762 5' - transib2 2641 1 73.27 AAATGCAATGAAATTATGGTTCCCAAAATAATGTTTTATGCGTACAAAAAATGACCTGTGGTCGATCGTTGCTTGTGCGTCCACTCACCCAAACGG:1 - chr2R 4707545 5' + hobo 2763 1 63.54 GGGTTGGTTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATT:1 + chr3R 4164644 5' - HMS-Beagle 7002 2 73.27 GTCCAAACCAGCAACAAAGTGGCTGTTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGATCTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chrX 14979193 5' - hobo 2927 1 42.57 AAAAATCCAAACTGGCCAAAAGGATTTATGCAAATAAACATATTCTATATTCGATGGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCC:1 + chr3R 9834352 5' - invader4 409 1 60.40 AAATCCAAACCTATTTTCCATTCTAAAATTTTCAAATAATTTCAATTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 + chr2R 2262971 5' - Juan 4180 1 59.41 TAAAAGCAACCCAAATCACAAGTCCCATCGCGAACGTTAGTTAGACGTGCTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2L 9724293 5' - 1360 3382 2 72.28 TCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTTCTTTTCCCTCTCTACCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGC:1 + chr3L 25345155 5' + Doc 441 1 68.32 ACAGATCTTGTCCACATCCATTTCGCGACGCAATCGGTCAAATGCAGAAACAAAATACAGTATAGTTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3R 15213565 5' + pogo 23 1 56.44 TATATGATAAAAATACTTTAATAAACAAATTGCAACAAATTGTTAAGTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2R 16453505 5' + roo 27 2 53.47 TACGATCCTCGTATAACAGTTAATCATGAATATTTCCCGCAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr3L 16666648 5' + I-element 35 1 61.39 TGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr3L 24761255 5' + 1360 39 1 70.27 TTATGTGTAACTCGACTTGAAACTGTTCGCACACCACTGGCTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTG:1 - chr2R 11146326 5' - diver2 4545 2 66.34 TCGGGGCAATTTCTTTCTTNTGGCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAAC:1 - chr2R 17348664 5' + jockey 62 1 80.20 TAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTT:1 + chr2L 21369862 5' + rover 6992 2 70.30 TTCGCTAACTATCATGTGTGGCTTTCGTAGCCTTAAATATAATTCTTAATAATAGTGTGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGT:1 - chr2L 23403007 5' + gypsy6 7438 2 60.40 AAAGACGTTATTTACATGTGTAAATTTTCACTTCCAACTGACACAGTATTATTTATATTTGTATGTATGTACATATGAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 + chrX 23035717 5' + opus 3 2 76.24 AAACGAAGCAGACTCAAAACGAAGCGAGATCGGGACAGGAAATGGAAATGAGCTTGCATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAA:1 - chr2L 12595009 5' - 1360 3107 1 60.40 AGAGGCCTCGACGCGCCTTCAAACTGATTAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr3L 1227348 5' + 412 7099 2 68.32 CCCTGTTCGGCGCCGGGCCCCACCACCCGCTTTCCCACTCTCAGCGATCTCGCTCTCCCTCGGCATCGGTGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chrX 9584761 5' - pogo 2098 1 76.24 ACCTAAGAAAATAACAACGAAATGTTTGTGCTAAAGCAAGTTCATAAAAAGAAAATTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTA:1 - chr2R 11524081 5' + I-element 155 1 62.38 AAAGAAAAGCATTTATATTNTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 8254807 5' - roo 9017 2 82.18 TGGCCAGCGCCGACTTCCAGGCCAAGTCTCTGGAGGCAGCCAAATCCCCCGTAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCA:1 - chr2R 16793399 5' + Max-element 295 2 55.45 TTTCGGCCGCTTTGTTTGTTTTTTATGCCGGCGTATCGTATATGTTCTGCTTTGTGTGCTTTAATAATTTTTTGGCCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACT:1 - chrX 3031239 5' - gypsy4 454 1 77.23 CATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTG:1 + chr2R 17402726 5' + invader4 2802 2 66.34 ATTTTACTTTATTACACGAGTCAAATTACGTGCATATATATAGACCTCCTTCGACCATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr3R 6171119 5' - 297 387 2 71.88 TGTTCTCAGCTTCTTTCGCTGCTGCTGCTTTCTTATGTTAAAAAACTTTTGCAATTGTGTGCGACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:2 + chr2L 17307932 5' + hobo 14 1 65.35 TAAATGGTAATTCAGTGTGTTAGAAAGAATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 + chr3R 4512293 5' - flea 4970 2 70.30 ATTGAAATATTTTTGTTTGCTGTTGCTAGATAAAAAATGCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTC:1 + chrX 19872649 5' - INE-1 544 1 90.36 CTGCTCGTGTCCTCCGAACTGGTGTGCAGGCTGCGCTTGAAAGCGCGTCCGCGACGATGTTTAACTGGCCCTTTCTGTACGAGATTTCGAAATCGTAGTGT:1 - chrX 20440288 5' - Osvaldo 190 2 63.37 CATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTAC:1 - chr3L 25232906 5' + GATE 8272 2 50.50 TACAATCGTATGTAATCATTGCACGTCCGCATATGCTTCCCAGCAAAGCCTCCCACGCAGATATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAAT:1 - chr3R 20892097 5' + invader4 2770 2 67.33 AGAGAGGGGCCTACGCGGGATTCTGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3L 23219304 5' - 1360 3359 1 60.40 AATAAAGCTTAACACCTCTTTGTTTTTGTTTTCACCAAATCGTTAATAATACTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 - chr2R 19775194 5' + 3S18 22 2 56.57 GTCGACTTGAGGATTCGCGGCTGGCTGGGACCGGTCACAGGGACCGCTCCGCTACTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAG:1 - chr3L 21286522 5' - F-element 4460 1 57.43 TGTCTCTTTCTACCCCGAGCTGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGGATTTGCACGTACGCGTTGGTAAGGTCAAGAAGATAAGATGATAAAG:1 + chr2L 12310050 5' - Ivk 109 1 80.20 ATGACCTTCTGGCTGGATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTA:1 + chr2L 1201953 5' + Stalker2 9 2 70.30 CGGCTTGATTGACTTTCAANTGGCTTGCATACTTTCAGGCACTCGAAACAATTTTAGCCGCCATGCAAGCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3R 20154827 5' + jockey 12 1 72.00 AGTCGTATCTGTATCTGCAAGTGAATCGAAACCGGCTGGCGGGCCTGGGACTTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCCAAA:1 + chr2R 11664281 5' + Tirant 8110 2 76.00 GACAAAGTTTTTGTATTTCAAGCGAATAGTTATGGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 3985167 5' - roo 395 1 73.27 TAAGAGGAGAATTATTAAAGAATGTATTAAAAACCGTCGCTGGTTTTGACAAACGCAAAGAATCACTATTTAATAATTATGTTTACAATATAAGATAATT:1 + chr2R 4350343 5' - Cr1a 92 1 56.00 CCCAGCCGAAATGTATGAAATTAATAATAAAACAACATGAAAAACTCACTTTTCGGCCAATTCCCCGCGGTGACATTGCAGACGCTTTAATAAACAAACCA:1 + chr3R 11998543 5' + Fw2 3929 1 67.33 CGGCTCTTATAGGAAAGGTGTTCTTTTGGATGTGAAAGTTGAATAGTTGTAATAGTTAGTACTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 5359913 5' + 412 7069 2 61.39 CGCAGGCGAGCTTACCTGCTCACTTTTAGTGGAGACAAGAAAAACACACTAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCC:1 - chr2R 18552628 5' + jockey 203 1 53.47 CCGGGAGTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACA:1 + chr2R 17402689 5' + invader4 2765 2 72.28 GAAAAGCTGCGGGCTTAAAATTGATCACAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chrX 15290308 5' + pogo 42 1 70.30 ATACTTTGTTCGGAATAAAATGTTACTCGTATATTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 + chr2L 22104392 5' + Quasimodo 36 2 69.31 TACTTAGACATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAG:1 - chr3L 26007758 5' - G5 4761 1 53.47 TACCACATCGAGCCATAGGTTATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGG:1 + chr3L 9400416 5' + 17.6 106 2 79.21 GCAGGAGCATTTTCGAAAACATCGATGCTTCTCTACGCACACAGCACTACTCACCTACTCCATGTAACTTTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAA:1 - chr2R 19058921 5' - Cr1a 4121 1 39.60 TCAACAACCCAAATAGTTTCTCTACTCCAAGGCTTCACTAAAAATGGCAGACAATATTTCTCTTTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCA:1 - chr2L 5647443 5' + invader3 15 2 62.38 TATATATATTCGTCCAGCACATGCATTGTATACTTTTGGGCACTACTTCCCCATTCGCCTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 + chr3L 9220106 5' - BS 5077 1 55.45 TAAAAAAGGTCGTCTGGATAAGCAAGATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTG:1 - chr2L 16994851 5' - Stalker2 7632 2 45.54 TTCATGTTAAAGAAAAATGGCTTTTGAAAGTGTAAATGATAGTTGCAAGTATAATAATTTGTTTTGAGCTGCTTATGAAATTTTTAAATCAATAAATTAAA:1 + chr2L 13673070 5' + G7 1143 1 72.28 AACCCGTGCGAAAAAAAGTGGACCTAATAGACTTAGGCTATGGAATTCCCTGGACTTGTTGAAAAACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAG:1 + chr3R 2912491 5' - Cr1a 3986 1 64.36 CCTTCACACCCACTATAGCTACACCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACTAGTTTAGTCTCTTCCGACAGACGAAGAAGTGGCAATTGGCG:1 - chr2L 23177219 5' - diver2 4740 2 81.19 GAAATAGAGCCTCCGTAGGGCGCGTATGCCACAGGCATATATCACCGCCTCGCCCAACCCCTCTCGTCACCTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 20432495 5' + roo 5 2 72.28 GTCCTGAATAATGCAGAGACTCCCGATTCTATATCTTCTAAATGTGTGCTTTCGTATTTAGTCGTATAGTCGGGGAATTCGACTATAGCATTCTCTCTGTT:1 - chr3L 9263983 5' + INE-1 579 1 54.46 TTTTTTTCTTTCCATTTGTGTCCTACTTTGATTGACGACTTGGTAACATAAAAGCTTTCTATACTAATTTTTTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGT:1 - chr2R 4235603 5' - I-element 4872 1 76.24 CAAATCATAGCCCATGTCGGTAGCAAATAGATTATTAAACTTGTTATAATTGGTAGAACCAGATTCCGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 10283509 5' + Doc 40 1 65.35 TTGTGGCTGAACTTTTCATTTTACGGCCTGTAAGATATTAGACATATTTAAACTACATTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 - chr3L 20032327 5' - Tabor 464 2 56.44 AACAACAACTGGCCCGCCAGAGAGAGCGCCGCTCACACACACCACTACCGGGCACCAGCCCCAATACACCTAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACACA:1 - chr3R 17065339 5' + F-element 307 1 75.25 GAAGGAAACTTTTGCACATCCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAT:1 + chr3R 29374946 5' + mdg3 5282 2 53.47 ATGGTGAACGCTACCTTAATTTTGCCCGTAGTAGTCTTGTCCGCTTCCGCTTTCATGAGTCGATTTACTTCACTAAAATCAAGTGATTTTATACGGAGCTC:1 + chr3L 1943659 5' - Doc3-element 33 1 66.34 GCCCATTTAACATATTCCCAACTAACTACCCAAATTGCATGCTTGCAAAAACACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGT:1 - chr3L 20723522 5' - hobo 2848 1 59.41 CATGGAGCCACACACGTTTCTTCATTAAATTCCACGTGTTTATTTGTTTAAACTAACCTTTTATGAGGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr2L 16456705 5' + hopper 2 2 76.04 AAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCGATTTACGATTTACGATTTACTCTCTAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAAC:1 - chrX 362000 5' + FB 311 1 72.28 TTTCCCAAGGGACTCTTTCCAGTGTACATGATAGCCTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACAT:1 + chr2R 9866475 5' - roo 62 2 73.27 CGCATTTAAAAAAAAAAATAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13137190 5' + BS 5094 2 81.82 TATGCAACTAAATTTTATTTGCAGAAATAAGAGCTCGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3L 7463285 5' - hobo 2900 1 61.39 CACGAGGCGAAATGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr2L 20268966 5' - hobo 2924 1 64.36 AAGAAGAAGGAAATCGCAGTTGGCTCACAGTTTAGACTTTAAGCTGAATGTTTATGCAATCACAGGGTGGGAATCAAACTTATGTTTAGTGTTTTTTGTAA:1 + chr2R 6837139 5' + S-element 1488 1 57.43 ATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 + chr3L 21275770 5' + HMS-Beagle2 6919 2 63.37 TCGAGCCAACCATCGAGACCCAACCCCAAACTGCCTACGTCTACGCTCCTTTTTAAAAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAAT:1 + chr3L 17162543 5' + 297 221 2 59.41 AAAAATAAAGAAAATGGAAAACAAGTTCAAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAG:1 + chr2R 12620896 5' - copia 4981 2 71.00 AAGTCAGCAGCAGCGATAAGAGCTACAAACATACTCAAATTCACAGACATGCATACATACATCAGGAACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGAT:1 + chr2L 14901550 5' + Chouto 46 1 60.00 TGTGTGTGTGTGTTAATCAGAGGGATGGATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCC:1 - chr3L 10525107 5' + HMS-Beagle 470 1 72.00 AGTGGGTGTTATTTTAGTTTGTAGCGAGTGCAGGGGGTTAAACGTTATGCGCTTTTTGCATCGCTCGGTATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATA:1 + chrX 17101025 5' - mdg3 5493 2 63.37 GTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:2 + chr2R 20520216 5' + Max-element 8283 2 71.29 TTTTCATTTTACGGCCTGTAAGATATTAGACATATTTAAACTACATTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 - chr3L 20032315 5' - Tabor 452 2 54.46 TTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACTGAGGGGCGCTGCCGTGTATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 + chr3R 1135323 5' - Tabor 470 2 64.36 TTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCG:1 + chr4 1294994 5' - TAHRE 10403 1 75.25 CATGTTTCGGCCTGTTGGGGATTTGTGGCACGTCTAAAAATACGACAATAACGGATGAAGAAGAGCCAAAATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAA:1 - chr3L 2003701 5' + Tabor 7285 2 72.45 TAAAGAAAACGTAAAACCATGGCGTTCTTTTCAGTTTCACATTGGCGGTCGTTGAGCGCGGACGTGAGCATGTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTG:1 - chr3R 10170496 5' - FB 452 1 76.24 GCCGAGCAAATGATGCGTGCACCAGATAGTCCTCCTCCGCGGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 + chr2R 8528194 5' + Transpac 31 2 55.45 AAGGAAAAATGCAGTGAAATAAACACGTTCGTGCCTGTATTTTATTATTTATTATGACCACACCACACACGAGCATCATGCACACACACACACACACACA:1 + chr3L 6574677 5' + accord 182 2 68.00 CCGGAGCTGAACCAGTCAGTCACTCAGAGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 - chr3L 10281710 5' + Doc 292 1 76.24 ATACAGCTACAGTACACACACATTCGCATATGGCATAAGGACTGCTCCACACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAAG:1 + chr3L 963813 5' + G6 1715 1 53.47 GCGAGATGGTATAGGTTGCTATAGGCTGCATCGTCCGTATTGCATAGACTATCTGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTT:1 + chr3R 27603692 5' - opus 294 2 60.20 CAAAAGATTCATACATTTCTCAGCCAAGAGTCACCCATAAAGTCATTTGACTTAATGTAAATGTAAAAAGGGAGTAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGG:1 - chr2R 15369717 5' + 1360 3330 1 57.43 CAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr2R 11699312 5' - roo 9023 2 75.25 GAGGTACTTAAAATGGGGCAGTATTTTATAGCCAGCTTTTTTTCGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3R 9121539 5' - roo 410 1 76.24 TGCATAAATTAATTAGATGCCCACTTTTTATGCTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTTCCCG:1 - chr2R 20520255 5' - Max-element 255 2 65.35 GGCTTGGGGACTTGGGATGCAGGAATGGGGGAATGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGG:1 + chr2L 21845408 5' - F-element 4408 1 67.33 AGTAGCTGTAAATTACTGTACAATGACTCGCTGCTGTTCTCAATCATTGTTAGTGCAAAATATTAACTTCGACTTTGATATTCCTCGCCGTTTGTCGATCT:1 + chr2L 22209373 5' - Bica 450 1 72.28 CAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3L 14311488 5' - roo 9031 1 67.33 TCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 8749983 5' + Doc 55 1 76.24 AGAAAATACGGGGTATGGANTTCTTTAATAAGTTAACATCGGCTCACGTTACAAATGCAAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTC:1 - chr2R 19430550 5' - 3S18 323 2 60.40 GCCACCGTCGCTAGTCAAGCGGTCCCGAAGGCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTCTAATCATAGAAC:1 + chrX 7575161 5' + F-element 4559 1 67.37 GTATATAATTTTTAAACCTTTTGGCTTTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCATGTCGA:1 - chr2L 3334470 5' - R1A1-element 5171 1 67.33 CGCCCCCAACTCACACATCCTCATGTCGATGTACATGTGTATGTAAATGTTGTGTTATTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr2R 20389409 5' - pogo 2086 1 60.40 TGTCTTGAATGGCATCTAAATATCTGGCCAAATATATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCA:1 + chr3L 19785622 5' + Doc 261 1 65.35 GACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTG:2 - chr2R 3341942 5' - Copia1_DM 4130 2 63.37 GATAACACCACCGACGGCGTGACAGCTTTTCCATCTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:2 - chr2R 18850616 5' + P-element 40 1 40.59 TGTATATTCTTGTTTCGGCTTCGCTTTCATTTTCGGGTTTCTTTACCAAAGTATACATCATATGCTTACTTATTTTTTTTTTGTTTTTCTT:1 - chr2R 24756148 5' - Porto1 160 3 69.23 AAGCTCGGCATTGATCACCGGCCACTCCGGCCAATCGTTAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3L 20079769 5' - mdg1 386 2 59.41 TCTGGGATAAACATCACGTNCGTGGCCATCGGCGGTAAGTCCTTCCCAGTTTTCATACCATATACGTATGTACGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 + chr2R 20463940 5' - accord 182 2 84.16 TGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3R 9116525 5' + jockey 32 1 52.48 ATCAGCTATCTGCGCTTCAGAGAATTTTAGTATATGGTAATACTTATTTAGCGGCTTACTTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chrX 11454402 5' + P-element 14 1 65.35 GTGGAAAATATTAATAACAGCAATATTAACGTGGATCAAAGCAATTTAACCGAGACGAACGGCGGTGTCCCTTCAGTTGAAGGTTTTTTTTTTGTTTTACC:1 + chr4 535386 5' + Tc1 1473 1 78.22 ATTTCCATTGAGTCTGCCCNTGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACA:1 - chr2R 6482767 5' + gtwin 1 2 76.77 GAACGTATAGCTTTGTGTATCTACAGTATATTCGTATTTTTATGGGCTTTGAATAATAATATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 15523279 5' + 412 7069 2 63.37 TGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATATA:1 - chrX 21247589 5' + blood 7180 2 64.58 GTTCAAAGCAATTTTAAAAATATTTCAGCGAAGGTTTTATACAAAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATC:1 + chr2L 7554061 5' + I-element 246 1 55.45 AGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2L 10924239 5' + hobo 53 1 77.23 TAAGACAATTTTATCTGATTCATATCTTGTATTTCATTTCGTTAACCTATATAGATTTCAAATATCCGTTTCCTATACATACAGCTGCGGTTAAAATAATA:1 + chr4 125413 5' + Tc1 1 1 73.27 CGGGAGCTACACAAGTGTCTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTA:1 - chrX 20015543 5' + transib2 54 1 80.20 TGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGCTATTTTTGGCTTTAACTATTGCACACACACACACACACACA:1 + chr2R 8345518 5' + accord 182 2 63.37 CAATAAAACTAAAGAAAAGTATAATAATAAAATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTA:1 + chr3L 3685388 5' - Bica 96 1 72.28 TTTCATTATTTTTTGTAAATTGCTTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr3L 15776997 5' + I-element 24 1 52.48 AAAGGGTTCAAAAGTTTAAAGGCGTTTGAAAAGGTGTGGCCAAAGTGTTATTGGTACATAGTATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAAT:1 - chr3L 23568246 5' - roo 8954 2 63.37 AACGGCTCATCCAAACGTAGACACAGTATTTTATATAGCTTTGTGAGGAGTTTTAAGACTCTCCACAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCCG:1 + chr2L 23332208 5' + gypsy8 4688 2 89.11 TTATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 - chrX 9816337 5' - BS 5074 1 62.38 ATAAACAAAACTTTACGTCTTTCGAGCGAGCTCACCAAGAAGACTCCACAGAAGACATCCGAAGGACCTCATCAAACGTCCCCCTTGACGAGAACCAGGAG:1 + chr3L 13230997 5' + BS3 1596 1 69.31 ACATGAGCAAAGCGTCGCGCTTTTTTTATTGTCAAAACATTAATTTTACAAAAAAAGGTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACAAGGAAAAATACC:1 - chr4 1077447 5' - HB 55 1 66.34 GATTGCTTTCGGTGGTCCCTCGACTGTCGGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTTCTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCA:1 - chr3R 17362956 5' - BS 5079 1 55.45 CTATACTGTTTTTTTTTTTCTTTTT:1 - chrX 4459397 5' - gypsy7 5011 1 88.00 ATCATCCATAGATCAAAGAGCATTCAGAAGTCTGAATCGGGACACATACATAGCTGTAGAGATCGGGAGTAATGTACAAATATATAAAATAAAATATTTAA:1 - chr3R 21355951 5' + G7 1151 1 60.40 ACCCAGAAACCAATTATTGGATATAATCTTATTGGGATCGGTTAACATTAATTTGTTTATTGTATATATGTCATGTAAAATATATACAATAAACGAAAAAT:1 + chr3R 25879570 5' + Transpac 4760 1 47.52 CTATTATAATTTAATGTATAAGTTAACTACTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 2029746 5' + roo 8711 2 77.23 AAAAGCTTTGCACGCCACAGATACTCCGATATATATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr2R 7775457 5' + pogo 37 1 71.29 ATAAAATTTAACCCGCCGCATTAGCTGACGGAACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr2L 6411550 5' - P-element 2845 1 37.62 AAAAAACAAGTGTTTTATTTGCGGAATAAAACAAAAAAAAAACA:1 + chrX 19174735 5' + Osvaldo 1521 1 54.55 TATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCC:1 - chr3R 3268043 5' + mariner2 92 1 57.95 TGAAATATCGATTAATGAATATTCCACGGAGCCCTTTGATCTCTGTATTATTTCAATGTTACAGTTGCATCGCGTAGGTTCATACTGCCTTTAGGACTGCT:1 - chrX 17958939 5' - G3 4177 1 64.36 AATGGAAAATCGGAGGCTATTGCCCAGGATGTGGCATGTGGAATGTATGTAGTCCCACAGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAAATCTGGCATT:1 - chrX 18267385 5' + baggins 5330 1 58.42 ATATTTTTTAATAAAAATCCACGTATGCCATACATGGTACAAAATTGCCAATTAAAAATATTACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAA:1 + chr3R 6646701 5' + Juan 19 1 63.37 AAGGGCACTGAACGACGTTNGACCCCAAAACAAAGGTAAGAATGAAAAATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2L 13598269 5' - pogo 2078 1 53.47 TGATTATTTAACAGAACAGTAAGTGAAATAATATACTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCC:1 + chr2L 7605359 5' + HMS-Beagle2 6787 1 64.65 AGCAAGGGAACTCCAAAAAAGCCTGGCACAATTTGCGCCTTTCCAAGTATGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAA:1 - chr3L 10721567 5' - hobo 53 1 58.00 GAAGTGGGCGGCTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chrX 1157610 5' + 297 6619 2 67.33 TTTGTTCGTCGTACATTAAATAAATTGGTAATTGTATGCAGATTTAGACGAGTTCAATAGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr2L 5304691 5' - 412 7529 2 61.39 GTGATGTTCGTCCATCAAAGGAAAAGTAACAACTGCTTGAGAAATTTAAAAGTTCAGATTTCAAAATTCTGTGCTCGTTTGTATGTATGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 19892859 5' - Quasimodo 40 2 72.28 GCCGCTGGAGTGCCCGCAGACGTTGAGACGCTGGCCACTGGCCGTGATAGTATTAGCGATGAAATATAGCCCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGA:1 - chr2L 11179725 5' - F-element 283 1 75.25 TTTGTACTTATGTTCAAAANAAATTATCAATATATTCTTGAACAGGATCAACAGCCATATTTCTGTCCGTCCATATGAACGTCGAGATCTCAGGAAGTGTA:1 - chr3L 27157975 5' + INE-1 144 1 71.29 TTCAATTCAATTTTTAGTGCACACAACAAACAGCTGAAACGGCTTTGCACACATGAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 26498601 5' + roo 8684 2 60.40 CCATAGTAGTAAACAATGGCCAAGAGTTCCCTCTCATTTGTTGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATAT:1 - chr2L 17657535 5' + Stalker3T 313 1 58.42 ATTCTAATGCAAATTTTGANTTTTATTTGTTTGGGTGTTTGATATTTCCACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGA:1 - chr2R 11727801 5' - copia 4999 2 56.44 CGATATGATATAATTTGATATGATTGAAGTTACTCGTATTAAAACTTTACAAAATAAAAGCAAATAAAAATATTTGGCATTTAATGTATTATGTTTTTTAA:1 - chrX 20991299 5' - HeT-A 341 1 72.28 CAAAATAACTGCCAGTGTGCCCAATACAAGGAAAGGAAAGATAAATCATCTACCTGTGTGACCGTTCGTCCAGGCTGCTTGAGTATGTCACCGCCTAGTGT:1 - chr3R 18984016 5' - TART-A 96 2 52.48 TATGACAACTGAGCCAGCGNAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 + chr2R 9061919 5' + jockey 4696 1 54.46 ACTAAATGCCGTCGCAGCAGAACAGCAAAATCACAGCAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3R 26346657 5' + R2-element 3585 5 66.13 TAACAGAAACGAACGTTTTNGTTAAAATGTATTAAAATATATGTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 6104368 5' - pogo 2072 1 65.35 ACACGAACAATGGGGTTTCTTTGAGCTGCCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTA:1 + chr3R 20351800 5' - mdg3 5346 2 71.00 CGGTCGACAAACTGGCGTCTACAGTTTGGGTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chrX 14961065 5' - hobo 2933 1 44.55 TCTAGTAGATATCCGCCGGAAATCAGAAAAATTCTTTTGTTAAACCCAACCAAGGCAAAAACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCATTTAAAGAGCAATGGA:1 + chr3L 26834844 5' - hopper 373 1 73.27 GTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTGCTTA:1 - chr2R 3341938 5' - Dm88 4123 2 67.33 TTTTCATTTTTTTTCCAGCNAGGTATGTTGGCCCACGGACCTTGCGGTTAATAACAGGCTTCGCAGCTCATCTGTTTTTAGGAGGTGCTTCACCTCGGCTC:1 + chr3R 23949546 5' - G2 316 1 74.26 TTATTTTGAAGTTTATTCCTTTTTTGTTAAAAATTTAATTGTTTAACTATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGT:1 - chr3R 3629165 5' + GATE 8275 2 58.42 CATACATTACTGAGAGCAAAAACACGCTTGACTCACCATTTAGCGAAACAAGCCAAATAGGCAAACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTT:1 - chrX 12864106 5' - FB 23 1 44.55 ATTGGGCAGAAAAAAAAACAAGTAAAGAAGTAAAATAAAATGAAACGAAAAAAACAGATTTATTGTTGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTC:1 - chr3L 5945884 5' - 412 7535 2 51.49 TTTTGGGCGGAAAGGTGTTTGGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAAT:1 - chr2L 21683599 5' - F-element 4340 1 79.21 AACCATCTATTTAATGAAAGCAAATTTTGTTAGAAACAAGAATTGTATAAATTATCATTTTAGTAAATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 + chr3R 12101033 5' - Burdock 6361 2 59.00 TAAGCTGAGATCTTTTTGAATGAGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr2L 21251454 5' - mdg1 7405 2 77.23 GCATCTTGATGATAAATTTAAAATTTATCTCTTTTCATATATCTCTCTGGTAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chrX 23283335 5' + 297 12 2 63.74 CCAAGTTAATAATTTTCCAGCTGCTTGCAATTGAAACCCACTTAACCCTTTGGTCCGCCTTCTTCTCCGCCCACAAAAACAATCCTTGAAAATAAAGTAGA:1 - chr2L 2324907 5' - transib4 2483 1 58.42 TAAAAATGGCAGACAATATTTCTCTTTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCC:1 - chr2L 5647405 5' + invader3 53 2 76.24 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTG:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 126 1 59.41 CTCTGCAGCTCTGAGTTAACCATTAATCATTCGAACGGTAAGTGTTTAACATTTGGGGACTTTTGTCCAGGAGAGTGTACGAAGGAGGAAGACAATTTAGT:1 + chr3R 13232159 5' + Tc3 1285 1 53.47 TAAAGTCTAGTATAAATCCACGGAAAAAGGGTAAACTGTACCTTTTTTTTTATTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 - chr3R 7452004 5' - Juan 4185 1 48.51 TCAAAATTCTAATTTTATGGCACAAAACGCTCGTCGCAGGTACAACGGACAGATGAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTG:1 - chr3L 6955187 5' + Quasimodo 334 2 57.43 TATGAGTACGAGTAGGGGGTAAATTTAAAAAACAGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTG:1 - chrX 2360901 5' - Circe 7223 2 72.28 AAAGGATTGCTTACAAAATTTAAGCAAACATTAAGGTCAGATGTACAGTATGGAAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 + chr3L 20032236 5' + Tabor 21 2 56.44 TGTTGGTATGAATGTAAACAAAACAAATCAATTGGCAGTCAACAGATTGTTGATGCTTCTATTTAAATATTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chrX 3967835 5' - pogo 2097 1 75.25 AGCGAGCATTGTTCAATGTCCTTAAATTATTCAACAAAATCATGTTGCCACGCCCACAAACCGCACAAAAGTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAACCTGTT:1 + chr3R 6207604 5' + INE-1 258 1 60.40 CTCATAAGCATACAAATGTNCAATTCAACATTGTAAATATAAGTACATGTCATTACTGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr4 333615 5' + Doc 22 1 53.47 TATATTCGTTACTAAAACATTTTTAGTTCAGCTTAGAATTTTGAGTTTTCTGCAAATGTAAAGAATACAAGTTAATTTCTTTTTTTTTCCTTTAAAAA:1 + chr3R 14041772 5' + pogo 2017 1 46.94 AGTCAAGTCGACGACTGAGAATTACGGTCAAAGCCTTCAGTTATGAGTAATGAGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr3R 27131894 5' - copia 232 1 55.45 TGAGCGTGCAATTCACGTCNCAACATTAACATCCATAAATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 6399591 5' - roo 405 1 78.00 CGGCGGGGGCGGAGCAGAAACAGTTATTTATTAAATCCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCT:1 - chr2L 21786756 5' - Max-element 280 2 53.75 ACCGATATCTACACATACATAAAGTGCGTATTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 1716651 5' + hobo 42 1 67.35 TTAAGCAAAACATAAATAGAGATATTTGAGTAGAGTCAAAAGGCCATGTTGTTAGAAACATAAGTAATATTAAATGCCGTGCGATCAAAACGCCACTGAAC:1 + chr3R 3695997 5' + G4 490 1 71.29 ACATGAATTACCAATTACTNTTAGGCTGAGCATACTTTGTTCGGAATAAAATGTTACTCGTATATTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 + chr2L 22104361 5' + Quasimodo 5 2 74.26 TTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCC:1 + chr2R 17402716 5' + invader4 33 2 57.43 AAGACTTCATTCCATTATCATGAACTAGATTTTCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chrX 1203202 5' - Transpac 5188 2 69.31 AAGATAAACAATTGTGTTANACAATAAATATCCTACATTTGGGGGCTCAACCGATAAAACAATAAAAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTG:1 - chrX 22426263 5' + 1731 4321 2 67.33 TAAACTGTGCTAAAACAGATGTTATGATGTTTAAATTCGATTTATTGCATGTAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 + chr3R 14228006 5' + Transpac 19 2 59.41 CAAATGGTAAAAAACTGATATAAACTGATATTTTGGAGGTTATATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 5025676 5' + roo 8697 2 61.39 GGGTAAGCTTCAGCTTTGACTAACATCAAAAGAATAGAAAAGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGC:1 - chrX 22471122 5' - invader1 3614 2 75.25 CTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:2 - chr2L 16866469 5' + Transpac 4971 2 77.23 ATCTCAGCGAAAGGGGTTAGGCCTCCTGCAGGGGTTTCTGTGTGCTACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTAC:1 + chr2L 5242145 5' - transib2 314 1 60.40 TAAATACAAAAATGTAAAANGCAAACCGAATACGCGGACAAAAGTGCGCTCCTGTGCTGGAATAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 4959929 5' + Osvaldo 1522 1 88.89 ACTATATATTTAAAAATAAATTCCGTAGCAGTTAGTGTAAACGATTATAGTATGCACTAAAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTC:1 + chr3R 8851258 5' - G2 2711 1 71.29 TTGCAGCTGGTTGGGGCTCTGTTGATAGTGTTGCTGCCCGTAGCTTTCATGCTGTTGCTGTTGGCTTAATCCATAATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCG:1 - chrX 1204392 5' - Transpac 462 1 77.23 TTTACCATTTTTGTTTTGTGGCGGCTTCTGGGCGATGCGAAAAGTTTTGTTTTGCCCCCGGCTGTCTGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 10924306 5' - hobo 2931 1 65.00 AAAAGTATATATATTCGTCCAGCACATGCATTGTATACTTTTGGGCACTACTTCCCCATTCGCCTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAA:1 + chr3L 9220101 5' - BS 5082 1 55.45 AAAATAAAAGCCAGAGCAAAAACAAACAACCAGCGAGGCTGTGAAAATAAAATAAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTG:1 + chr2R 22271904 5' + jockey 4965 1 55.45 CTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 - chr3R 27605331 5' - opus 452 2 75.25 AGTGAAGTAATTTCCGCAAGTTCTTTGAATAAATTGCCCCGCCCAGTTGTTTTGTTGTTTTTATGACGCCTTATAATCTCGATTCCACCCTCATGACCTCC:1 - chr2R 24550749 5' + jockey 4757 1 77.23 ACTTATTCATTTAAACAAANATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACAC:1 - chr3R 3268046 5' + mariner2 97 1 58.33 TTTCATTTGAGAAATATAATTTGGGTAACGTGACATTTGTCGTGGCTCACTTAAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 24612253 5' + roo 21 2 58.42 AAGCATTTATAAATAATGAACATTGATTGCTTATTTGAACAAAATGAAGGCGGACATGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGG:1 + chrX 12861183 5' - Doc 4488 1 55.45 TGATGGAAACAAATTTTAAATAATTTCTTTTATTTTTTCAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAAT:1 - chr2L 17653026 5' + accord 224 2 61.39 TACATTACAAACCATATGATTCTAGGATGCCATGCCAGTAGGTATCACAAGGGTATCAACCACCTGGTGGTACGCTGCTGGAAGTGCAACTACATTCTCCA:1 - chr2R 1069298 5' + baggins 80 1 72.28 AAAAGTGGGTATATTTCTGTGCTTATCAGCAGATATATATGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2R 7775523 5' - pogo 2069 1 61.00 TCGACATTTGTTTTCTGTTTGCCGGTTTTCCCATGAGCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2R 11699349 5' - roo 397 1 65.35 CAAAATAGAAATCAATAGTATAATTTAAAGTGAAAATCTGTTAAAACCAGAAATAGATTTGACCCTACTATACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATT:1 + chr2R 1860285 5' + gtwin 6922 2 73.27 ATGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGAAAAGAC:1 + chr3L 25552484 5' + Fw3 34 1 86.14 CTGATAACGATAATAAAGCTTAAATTTGAAAGCAGTTGTCTTGATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 - chr2L 22108263 5' - Bari1 1676 1 54.00 ACGACATTCAGTGAGAGTTNGGTCCAGGCAATTTCAACTGAATTCTACAGGAAAACTTTTAGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATATAA:1 - chr2R 17734565 5' - Stalker4 409 1 65.35 TAAAGATAATCTTTAATTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAA:1 - chr3L 19274893 5' - transib2 2811 1 63.37 CCTAAGAGGGAAGAAAACTAAGGGATTAAAATTACTTCCAATCAATTGTAACGCGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTACTTCCCCTTGAGGACTATGTTGGAA:1 - chr2L 22744234 5' + diver2 4487 1 56.44 ATCATCATATGATAGCGTTTCCAGAAAAAAATTTGACAGGTATACATATCTATACAGCAGTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCAAAGTGTGGAACACT:1 - chr3R 12379362 5' - 1731 299 1 61.00 ACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCC:1 - chr2R 2529357 5' - 1360 3376 1 36.63 GAATGCATGGAACCAGGCTCTACTAATGTTCCCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 11699282 5' + roo 8688 2 67.61 AGAAATTTAAACTACACAGAAACTATATTTATACGAAAAGAAAATAGCAAGAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCA:1 - chrX 11221788 5' + Porto1 230 1 60.40 CACGTTGCTTTACACTTGGGCACTTGTTCGTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAA:1 + chr2L 16071099 5' - 412 468 2 53.47 AACTGCTGCGCGTAAGTATTCCACCAAGATTATGGCCTATAAATATATATACTTATATATATACAGCCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCAT:1 - chr2R 16068715 5' - Burdock 6386 2 67.33 GCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chrX 8308726 5' - opus 466 2 61.39 CTCATTGACTGAAAGATACAAGCAACTTTGAAGAAGGAGGAAAAGCAGGTGATCTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCA:1 - chr2R 6224941 5' + flea 4542 1 59.41 TTTAAATGATTTTGCATAATTCAAATGGTGGCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGAGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATTCC:1 + chr3L 11318240 5' - accord 7168 2 69.31 TTTGCAGCGATTAATTGTCATTGTGCGCATTAATGTGCTTCACAAGGATTTGCGTAATTTGCACAATGTTGCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr2R 20973115 5' - hobo 2936 1 76.24 CCGATTTGTGATACCTTTTATATTTGACCAAGACAGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATTTCC:1 + chr2L 16099261 5' + Doc2-element 478 1 65.35 GTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr2R 6074451 5' - 412 473 2 56.44 CTGCTCCCCCATAAATTCCAGCATTATTCCCACCCTTTTTACGGCAAAGAAGTCCAACAGCCCGCCTTCGCTCCGAACACAAATCGACAAGTCAGTAGCTT:1 + chrX 10732774 5' + TART-C 117 2 55.45 TATGTGCTTATGTGTGTGTGTGTGAGTGTTTGGTGCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 15163789 5' + hobo 40 1 68.32 GAGCCCGGTTTTAATTGGCTTCCTATGGTTTTTTGTTAATTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTG:1 - chrX 5028289 5' - I-element 69 1 69.31 AGATTATTAAACTTGTTATAATTGGTAGAACCAGATTCCGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 + chr3L 10283537 5' + Doc 65 1 59.18 ATGACAAGATACCATGTGCAGCATAAGGTCATATAAATATGTATAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 18883833 5' - roo 9044 1 55.45 GTTATGTCCGCACCCACGGCCACGCCTCCGCCTACGTAGTGAAAAGAAGCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCTTTTTGCCAA:1 + chr3L 4966468 5' + I-element 5003 1 51.49 AGGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAA:1 + chrX 22726185 5' - Helena 1283 1 55.45 GATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCACTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAATAACATAACAGCG:1 - chr3R 25796064 5' - BS 5049 1 61.39 CATCGTTATCCCATTTGAACCTGCACTTCGTCCGTTGTCACGCACACACAGTACAAAGAACCCAAGGCGTCACGGGAGACAGCCGAAGGACCTCATCATAC:1 - chr2R 5097085 5' + BS3 1571 1 75.25 CTCCGTTTTGATGTTATTAATTTTGGCCAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr2R 4561103 5' + jockey 56 1 71.00 TGACTTGGCTGGGAGCTTTGGGATGGGGCTCAGTTTCGTTTTCGGCATTTTTGCTTTCTCTGACAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGG:1 - chr2R 990601 5' - F-element 460 1 51.52 TAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 - chr3L 27415325 5' + transib2 3 1 75.51 CTTGTTTATTAAGTAGTCATTTGTATCTATCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATCGTCATCAGGTTCGAAAGCTAACATTTGAATGCCTTCTGGGG:1 + chr3L 17857085 5' + hopper2 118 1 64.36 ACTTACTTCCTCAACCAAATACCGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGAT:1 - chr2L 10657273 5' + I-element 432 1 78.22 ATTCCCAGCTCTAGCTCTAAGTATTCCTCCAACTCTCCATCTCGTTGGCATGTGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 6619757 5' - 412 473 2 58.42 AATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:3 - chr3R 2689430 5' - diver2 4475 1 65.35 AAGCCAGCACATACTGTATATCTGTTTACGTACATTCATACATATGTGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTTTATTATT:2 - chr2L 20290300 5' - flea 5003 2 54.46 GCACATATGCAACGGTATCCCCATTTGCGGCTCTTCCTCTTTGATTGGTTTTTGCTCTGCTTCGGTCGCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACG:1 - chr2L 249496 5' - Doc 4389 1 74.75 TAATATTTCTGATTTAGAAGTCAGAGGAAAATCCCCAATTAGATGTCGCACCAAAGGGACATTTGGTTCATGGAAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAG:1 + chrX 15369309 5' - F-element 248 1 77.23 CAAAAATATTTCGCTGACCATCCAATAAACTTTAATTGAAAGAAGGACTTTTGTGTTATGACAATTATAATTGTGCTTTTGCATATGTGTGTGTGTCTGTG:1 + chr2L 17652203 5' - accord 7032 2 57.43 GGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACT:1 + chrX 21772476 5' - gypsy3 6573 1 51.65 AATTAGCCCATCGTTCAGCNGTCTAAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTC:1 - chr2R 17087300 5' - F-element 442 1 76.24 AACAACAGCGCCCACAACTGGCACACTCACACAAAGGCGGCGATAACAACGATAACATTTTAGCACATAAATTACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 17245669 5' - 1360 3366 1 72.28 GCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACC:1 + chrX 21772502 5' - gypsy3 6539 1 75.25 TCAAGTACAAAGTCAGTTCAGCTGCAGTCTGGCTTCTTCGCTAGCCCAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCT:1 - chr2R 9640411 5' - Max-element 8506 2 52.00 TAGAGAGATTCCCAATGTCTGAGGACGGTATAAAAATTGGAGAGGGACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTAGTGACCCATG:1 + chr2R 2110063 5' - mariner2 279 1 59.41 CGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAAAAGCATCTCATCATTATGAGCCTGGGAAAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTA:1 - chr2R 9520874 5' - 412 105 2 70.30 TAGACGTGCTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 - chr2L 9724252 5' + 1360 48 1 71.29 TGGGTTATGCTTATGCTGACTTTCAGAATGCAGAAGGCAAAGATATCCCGACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAA:1 - chr3R 14450408 5' + Doc 4583 1 50.50 ATTGAGGTTGTCCGTTCAAAAGAGTGTCCGTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 - chr3L 7215544 5' + copia 46 2 72.28 CATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chrX 8308732 5' - opus 460 2 67.33 CATTTCATCGCAACTATATACAGAAAGAAGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr2R 24293830 5' + 412 7100 2 73.27 CCCGAAATGCTCACACTTCAATACTTCAAACTCACGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGA:1 - chr3R 8842356 5' + hopper 288 1 65.35 GCGGGGGCGGAGCAGAAACAGTTATTTATTAAATCCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGG:1 - chr2L 21786754 5' - Max-element 276 2 57.32 CTGTTGCTCTCTTTCTCTTTTTACATGTGTGCACGCTCACTGTGCTTTCCTCTCTTAAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAA:1 + chrX 7092010 5' + flea 311 1 63.37 ACCCACTTCGTCCTGCGTCCTTAGTCCTTTGCCCCTCATTGCTGCTCATTGTCCCACATCTCATATTTCAACCACATTTCTGGGTAAACACAAGCGCCCAA:1 + chr2L 4260257 5' + HMS-Beagle2 52 2 55.45 GCAACAAAATGGCAAACGCACTCAAAGTCAAAGTTCGATGTCTAGGGGCGTATGTATATGTGGGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTAAG:1 - chr3L 10528628 5' - ZAM 7983 2 66.34 CCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:2 - chrX 21668084 5' + Tabor 6862 2 56.44 TGGAATAACACTCGATTTTGTGTAAATATGGTGTCAATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCG:1 - chr3L 3835410 5' - 1360 135 1 64.36 ATATTTATCTCAAACTAATATGCAAGTTAAACATTTTAAATGATAATAATCCCAACGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCAG:2 + chr2L 16179697 5' - Doc2-element 385 1 60.40 ATTGCAGAATCAACCTATACTATGTATTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr2L 4916520 5' - hobo 2894 1 72.16 CAAATATGGGTTGCCTTGATGGTTGCTCTGGGGTATGAGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAA:1 + chr3R 9425558 5' - Transpac 68 2 61.39 AAAAATACCAAAATATCGCCCCCGCCGATTCCGATTCGCTGGCAAACGAGCGAGTTGCCCACCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chr3L 5360139 5' + P-element 15 1 66.34 CCCATTGCATTTCTAAGAGCATGTTTTCATTATAATTAGCTGTATCTTGCATGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTT:1 + chr2R 16993761 5' + Doc 4274 1 54.46 TTAAGGGTTTTACGAATAATCTTGCACAGGGAAGTCGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGA:1 + chr2R 4598060 5' - INE-1 154 1 74.16 ATTTTGATAAAAGTCTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATT:1 + chr3R 26173696 5' + P-element 178 1 22.77 GTGCGGCTCACAACTATAAAATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 - chr2L 14979253 5' + Ivk 7 1 70.30 TAAACTTTCAACTCGGTCCAAACCAGCAACAAAGTGGCTGTTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chrX 14979208 5' + hobo 2708 1 42.57 TTGATATTTGCCCAACTTGATTATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chrX 9828526 5' + Tirant 18 2 62.24 AACCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 - chr3R 20425417 5' - roo 9043 1 58.42 TTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTA:1 - chr4 651045 5' + micropia 10 2 69.31 TTTTTTTTCTCAGATTTTACTATCTATCATACAATTGATGCGGCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chr3R 13670514 5' - 297 6939 2 63.37 GTACATTAAATAAATTGGTAATTGTATGCAGATTTAGACGAGTTCAATAGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:2 + chr2L 5304701 5' - 412 466 2 51.49 GGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr3R 7582643 5' + 297 50 2 80.20 CGATTCGTTTGCCTTGCTACAATGTACACTTTTTCATTGCCGGCCAAAAAATCCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAAT:1 + chr3L 10463065 5' + 1360 3140 1 53.47 AAGGATAAAGGATTCGGGCTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 + chrX 4279513 5' + blood 56 2 83.17 AAAAGCCTGTTAAGTGGTTCAATGAACGGGTGGAGGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAG:1 - chr3L 2572463 5' - I-element 5008 1 64.29 CCTGACTCACGAGAGTTTGGTTTGAAGTGTGTCAGCCAATCAGTTACGAAAAGTGGTCGCAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCG:1 + chr3R 13211739 5' + G6 82 1 64.36 TTCAGCAGGGCGCTAGCTGAAATTAATTCATCCCCAAATTCGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 8481966 5' + jockey 36 1 62.50 AAGCGTGAGAATGCCATAACGCCCCCAAGCCTGGCTATTATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:1 - chr2R 5813646 5' - HMS-Beagle 7032 2 58.44 TAATTCTGCTGCAAAGTGCTCAAGTGCATAATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCG:1 + chr2R 6041530 5' + opus 1 2 78.22 CAAAATTAACTACAAGGGAAACGTTGCTGATGTTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAACTAAG:1 + chr4 1075302 5' + HB 1323 1 60.00 ATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAAC:1 - chrX 9816327 5' - BS 5064 1 52.48 CACACACATATGTACATACATACATACGTACACGTGGATTGGCAAGTGGATCAGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAA:1 + chr2L 12468869 5' + hobo 2604 1 56.44 TTTTATTTGGTTCACACCCACCTCATAAAAGTAGAACGAATTTAAATTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTG:1 + chr3R 25941236 5' - Rt1a 4892 1 54.46 GACAATAGAAGTACACATCAATTTTATAGAAGCCAATTGTTGTTAAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAG:1 + chr2L 5862993 5' - jockey 4757 1 55.45 AGAAAATACGGGGTATGGAATTCTTTAATAAGTTAACATCGGCTCACGTTACAAATGCAAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTC:1 - chr2R 19430550 5' - 3S18 323 2 61.39 CGGCTGGGGCGGCATCATTAACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr3L 3475629 5' - mdg1 366 2 78.22 AAATACTTATACTCCTAGATCTCAGTTTGCTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCT:1 + chr2R 5213807 5' - F-element 125 1 71.29 AACTTGGGCTCCTGGATAGTCTGCATGATTGGGTGTGAGTGTTAAAAGGTTTCTGAAGCCAAACCCAATAAAAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGA:1 - chrX 17067408 5' + Tc1 1227 1 57.43 TTTATTGCTCTATGGTTCTAAGACTAGGATATATCGGATATAACGGATATATCGGTATACACCCACAATGCCATTTTGTTTGTTCACTTGCTGTTACATCC:1 - chrX 9179492 5' - I-element 450 1 58.42 ACAGCTCGTTGTTTCAACAAATTGTATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 24612193 5' - roo 9020 2 77.23 GATACTTGACTATTGCGTTCCATCTTGTTGTGAAACTGGGGCAGCACGAGTTAAGTCCATGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 + chr2R 5651829 5' - Tirant 368 2 59.00 CCGCGACAGGCACCGCCAGGCTGCCTCCATCACCCACCAAACCCTCAGCATTTTCCACCAACCTCAGCCACTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCG:1 - chr2R 17323282 5' + Cr1a 292 1 65.00 GTTTCATTATTTTTTGTAAATTGCTTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 + chr3L 15776996 5' + I-element 23 1 53.47 GAGTAAGCAAAGAAACCGAAAACGAAACGAGCGCACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCGAGCACAGTTCCAAAATCTTGGAGCGAAGAGTGCACTTCCCCAAT:1 + chr3L 25952846 5' + Doc4-element 173 1 72.28 CACATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAATTTAATAGTTTAGTTCTGTTGGAGCTCTG:1 - chr2R 1422500 5' - Porto1 4536 1 67.33 GCGTAATAAAGCACAACCCCAAGAAAGTCGTCAGCATTCGTCACCTCACTTCCCTGGCAACTGGGAATTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGG:1 - chrX 21273614 5' - X-element 4705 1 66.34 CAAATTATTTTCGCCCAGCCAACGAAATTGTTAGATTCAATTGTGTATATTTTTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTT:1 + chr3L 16674069 5' - I-element 5097 1 57.43 TTGACGTCGCACTGGGGAGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTTCCCTCCCTTTAGAAGGGAAGCTT:1 + chr3R 16340690 5' - rover 6928 1 80.20 CCAAAAAGAACTATGATAATCTGCAACCTGAATCTTCCGCTAGATGTTAAAGCACTCCGCACTAGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTC:1 + chr2L 10489811 5' - 1360 3320 1 72.28 TTTGCCCAGAAGCCAGCAGCCTTCGCTAATCTCCGCTTGGAACGTGCGCGAAATGAAGAGGACGATCCTGATATCTAGCCGGCCAGGGATACCTTTGCCT:1 + chrX 734073 5' + Max-element 8196 1 63.00 TTTAACTTTGCTGGTGGAGNTACGGAGACAGATTTTTTATCTTTGCTGGTGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCC:1 + chr4 1294993 5' - HeT-A 6035 1 78.22 TCTAAATAAAGGAACACATGTACATTAAATAAAAAAACATAGAGCGTAAAATCTAACCAGAGAGAATGCTCGACCTCCGACTATCAGATTACCGTTACTCA:1 + chr2R 4379190 5' - INE-1 548 1 67.33 TATTGTCGTGATTGAGCAAAATGATGTGCCAAATGTGGGTCCGAAACCATAGAGTGTGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3R 27448318 5' + hobo 19 1 60.40 TTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 - chr2L 9342659 5' - HeT-A 6059 2 55.45 TTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTC:1 + chrX 21852453 5' - gtwin 7372 2 55.56 TTCACTCGGAATAAACAGGGTTTCTTTGTTTCAAATTGTAAATAAATATTTTTATAACCCAATATTGCTAGAACAACATTTTGAAGCAAACTATTTAGCTA:1 - chr2R 16548856 5' - R2-element 3352 1 72.28 AAATTCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 27071853 5' + jockey 12 1 73.00 TCAGAAATGATAAAGCCACAACAATGATATCCTCCTTTATGCAGCTCAACAATAATATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTTG:1 - chrX 5801701 5' - mariner2 756 1 49.50 TTTTTTTCGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTT:2 - chr3R 9121503 5' - roo 9037 1 62.38 AACAGTCTAGTCCTAGAAAGCACACATCTGAATTATTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAA:1 - chr3R 10361960 5' + G4 3564 1 71.29 CTGATCCTTGATGGGTTGTTATAAAAACAAACCTGCATCAACTACTTAAAAAGTACTATTCATATAATATGGAATTCTAAATTTAAAAAAATAAAAAAAAT:1 + chr3L 18038302 5' + TART-C 11098 2 69.31 CTACGCAGAGTTACATACCAACAGCAACTTTTTAGAGCAGGAACACTTTCCAGAGCGCTTCATCTTAACTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACGCTCTC:1 - chr3L 1557701 5' + mariner2 554 1 78.22 CATGGTCATGGTTCGCTCGTTCTCTTCTTCGTTTGTACGTTCGCCTCTTGATTTGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 - chr2L 16690503 5' + P-element 19 1 57.43 CGGTTAGCATTTACATATATTCGAACGATCTCTTGAACTCACCTTAATAAACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 10457150 5' + jockey 33 1 52.48 ATCACTGTTATGGATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 + chr3L 21275757 5' + HMS-Beagle2 6906 2 56.44 AAAGGAGTCGAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 6399501 5' + roo 38 2 64.36 ATTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAGG:2 + chrX 21939637 5' - gypsy5 6902 2 68.00 ATTCCAATTTATTTATTGTATTTCGGTATTTTGAGCCATTTGCAGTTGATTTTCTATATGCTATTGCCGGTATTTCAGCTTTTTTTATTATTTCTTTATAA:1 + chr3L 18339179 5' - BS 5090 1 61.39 GGCCACAACGTGATGCTGCTTCAGTAGAATTCTTCTTCCTAGATTTTTAATAATAATTT:1 - chr3L 21811881 5' - invader2 441 1 67.80 CCACACACAGACAACATCCAATTATGGGAAAGCTGACCAGATAGCGAAACGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTA:1 - chr2L 15088374 5' - accord 355 2 52.48 CAATTTTGTAACATGCACACGTATACAGTGAAGCTTGCATTATGTATTTCCTTTTTGGGCTTTTTGTATTCGCTGTTGGTTTCCCCTCTTTTTTTTTTATT:1 + chr2L 3868222 5' - Bica 337 1 66.34 ACCCGAATTTTTAAAAATGGCAACTTCTACACATTCATCGATATACCAGAAAAATGATGAAATTTCTAGTTCGAATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 - chrX 22601816 5' + INE-1 541 1 64.36 GTCCATCGTTTAAGAAGTCCTCCGACTAAGAAGAAACATTAACCGGATTGAAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATA:1 + chr2R 2944249 5' + 1360 3210 1 50.50 AACACCTTATATAGGAGAAGTTAGTGAAGCGCCGAAGATATTTGGGAGATACATACATTATACGTATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCA:1 + chr3R 19449621 5' - accord2 68 2 68.32 GGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGT:1 - chr2R 14848993 5' + flea 4738 1 72.28 CTGCACTCGGAAACCCTTGCCCATTCTTAATTCCTTACCCACCTCTTATTTCTTGTGTTTTATTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 14301553 5' + roo 8674 2 69.31 GTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTC:1 + chr2L 22092968 5' + INE-1 549 1 51.49 GCAGGCAAAGATGGGAAATGGAAAAGCTCTTCCGGCAGTTGGAAAAGCGCCCACGCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAG:1 + chr2L 18207958 5' + G2 3025 1 54.46 CAGTACCGCCTGCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3L 13639929 5' - hobo 2916 1 56.44 TTTCGTTCGTTAATATCCCCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGGAAAG:1 - chr2R 13956880 5' - P-element 2829 1 24.75 ATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr3R 19446655 5' + HMS-Beagle 31 2 57.43 TAAAGCGAGTGGCTTAAAGCAGATGTGGAAAAGTGTGGGAAACTCAAATTATAAACAAGAGGGAACACTAAAATACACAGATACCCGTTACTCGGCTGGT:1 + chrX 9928092 5' - INE-1 542 1 74.00 AAAATAGCAACTTAAATATTTGAATGCCCCGTCTTTTTGCCTCACCCTCCCTCTGGCTCTTCTTCGGCCAAAGTGGCATTTGCATAAATTCATTTTTTTTT:1 - chr3R 28076078 5' - invader2 301 1 52.48 AAATACTTTAATAAACAAATTGCAACAAATTGTTAAGTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr2R 16453515 5' + roo 37 2 63.37 CGTAGAGGTGCGACACCGACGTAGTCCTCACATGCTTAGTGCGAGGTTTGGTCTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTATTACTGCATTG:1 - chr2R 4009148 5' + BS 5054 1 78.22 TATCTCAGATATTTCTGGANGTATTGTCTCAATGCGTTACTGTTTTATTTTTTTGTATATTTTTTTTTCAACTACAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1 - chr2L 5661015 5' - jockey 4918 1 64.36 TTACTAAATCTGGTTATGTTTCTTCGTTTATTTTACAATCTACAAAGGGTCAATCACAAGTACTTAACAATCACATATAACAGGTAGGATTTAAGATAAGC:1 + chr3R 17610841 5' - X-element 4555 1 65.35 ATTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTTGTAGTATGCGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2L 2622723 5' + blood 52 2 72.28 ATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2L 13622019 5' - opus 7462 2 74.26 CCGACATTATTTTCACTTTGAGAATATCGTGGATGTGTCGACGTAAATCATAATAATTTTTTTTTCTCCTTATCTTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTGTGA:1 - chrX 20385826 5' - G4 3824 1 48.51 GCCAATTTGGATTTTAGACAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chrX 14984197 5' - hobo 2900 1 66.34 AATGTAAGGGAACTAATTATTGGTATATGTTACTTGAATTAGGTCACAACGCTACTTTTTACAGCTATATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGAAAA:1 + chr2L 22551394 5' - 1360 299 1 61.39 TATGCAAATGTTCTCCAGCGCGTTAATAATGTTGGTGCTTTAATCAAGACTGAAATTCTTGTTACCTGGCATCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1 + chrX 18050554 5' + 412 4 2 73.27 GTGTAAATAAAATATAAAGNTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2R 9871595 5' - roo 400 1 69.31 TTAACACATTCGTTCATTGCTTTCATCGTTGGCCTGCGTTTTTTTTTTTGCCCACTATTCTTTCATTCTTTGGGCTCGTTTTTCCCTTTTCTTTTTTTTC:1 + chr3R 21814952 5' - Doc2-element 228 1 58.00 AGTTTTTTGTTGCTGCCTTAAATGGCCTGGCCAAAAGTCGGCTTAAAGCCTAAACTTGAGCACACAGCATCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAAC:1 + chr3R 27892620 5' + Gypsy6A_LTR 84 1 68.32 CTGTACGTCCAGCCACTTATCATGCACATATTGTCCACACTCATAACCATAAAAGATTCAATATCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCGCATTTTG:1 + chrX 1645354 5' + baggins 5109 1 54.46 CCACGTCATCGTCTTTCCACTTGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGG:1 - chr3R 9117915 5' - jockey 4684 1 78.22 AAACAAACCTCCTCGTCCTGCCTTCCACATAGGAGCCATCCTCCAGCTTATCGATTTGATACAGGTTACTCATTCCGGCAATCTTGAGTAGACTCCAAAAT:1 - chr3R 27665167 5' - 1731 403 1 71.29 GCAATTTGCATTCGTGATAATGAGAACCACTTCGGCTTTTGGCGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACT:1 - chr2L 5692577 5' - gypsy4 200 2 66.00 TATCTGTTTAAAAATACCAAAATATCGCCCCCGCCGATTCCGATTCGCTGGCAAACGAGCGAGTTGCCCACCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:2 + chr3L 5360130 5' - P-element 2881 2 75.25 CTTACACTGAAATCATAAATACATGTTAAAAATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 9439142 5' + roo 8678 2 63.37 ACTGTAGCACACACATACATATATTTACCCCTAATAGTTGTCCTTGGACCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 18073236 5' - hobo 2911 1 50.51 ATAATTTGGGTAACGTGACATTTGTCGTGGCTCACTTAAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 24612238 5' + roo 36 2 63.37 CGGGGGACCGGAAAATAGCAAAACATGGTGAAAGGTAAAAAGTTATGGCCGAAATCGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTC:1 - chr2L 9847217 5' + micropia 28 2 59.41 ATAAATATCCTACATTTGGGGGCTCAACCGATAAAACAATAAAAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACAT:1 - chrX 22426240 5' + 1731 32 2 53.47 ATGCGGGCACTGATAAAAATGGTTACCACTTCCAAATAAATGTATTTGTTAAGCTATATGTATACACATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr3R 29607415 5' + 297 6582 2 81.19 AGGACAGGCACACAAGGAATTTCAACCCCCAGCGAGAAGAAATATTTAACAAAAATGAACAGAATACAACACCATGCCACACCACAACACACACACACACA:1 - chrX 10621701 5' + gypsy3 419 1 59.41 CTTCTACAACCGAAACCCTNTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTC:1 - chr3L 13142046 5' + F-element 436 1 72.28 CCAAAATACTATGTTTGCCGTTATAATGAGCAAAATGTATTATGCATGTTAGTATTTGTGCGTTTAATGAATTTTATTGATTGCAAATACAAAATAAGAA:1 - chr3R 13599805 5' + G3 4584 1 61.00 ACCACCGTTTTGATCCCATCCGAATCTCGGTGCGGCCCGGCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGCGGACTAGAGTCAAAAGAAGA:1 - chrX 683650 5' + jockey 4729 1 79.21 GGAGGGGGTTGAGAATCCGATTACGCAATCGCTCTCTTGGCCGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 8674111 5' - roo 402 1 45.54 ATATTCGTCCAGCACATGCATTGTATACTTTTGGGCACTACTTCCCCATTCGCCTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAT:1 + chr3L 9220111 5' - BS 5072 1 50.50 AAAATACAAAATATCAGCATGACGCAATGATTTCCGGGACGGGAGTGAAAATGAAACCTGTTGGAGCGGCGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTG:1 - chr3R 10433840 5' + micropia 5205 1 78.22 GATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAA:1 + chr2R 19352218 5' + 17.6 51 1 79.21 CAGCAATCTTCATCGAATATCAATTATACATAGCTCGATAATAATAACAAATTATATATATATACATGTATATTCGAATTAAGATATGACCAAAACAAAAA:1 + chrX 9182832 5' + 1360 491 1 72.28 GAGGGCGCCTATTCACCTACTCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3R 27605356 5' - opus 483 2 62.11 ATTGTTTTTGCCATTCTGCACATTCACAAAATTGATTTCATTCACAACATGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTATACTCACACAAGGAAGCAA:1 + chr3L 6924727 5' + 1360 3252 1 56.44 AGAATCCCAGCAGAATCAGCAGCTGCTCAAACGCGAAACCAGCGACATATCCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACAC:1 + chr2L 19909614 5' + accord 7021 2 52.48 GAGCCACACACGTTTCTTCATTAAATTCCACGTGTTTATTTGTTTAAACTAACCTTTTATGAGGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr2L 16456701 5' + hopper 11 2 68.32 AAAGCGACAGGCTGAGATACATATACTTGGCAACACGCACGGGATATGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr3R 26350820 5' - hobo 2912 1 55.45 TGATTTTAAGAAGGAGTTCGGGACGAACACCCAGTTAGGAGGGCCAAATGTAGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGC:1 + chr4 591256 5' + R1A1-element 372 1 54.46 GTTGAATAGTTGTAATAGTTAGTACTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3R 5359950 5' + 412 53 2 74.26 TCCGCCCTCTTGAGCAACGCAAACTCTGTTAATATATATCAAAACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGT:1 + chr3R 10718053 5' + Juan 4057 1 53.47 GATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr2L 9287186 5' + jockey 62 1 77.78 GAAAATAACTATAATCGATNGGCTTTTACTTAAATTTCATGACGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 4191200 5' + 1360 1 2 36.63 ACGAGAGAATAAGACTTTTATAATTTTAATCTCTTAAAATTCGCTCCTAAGCTATCCAAATCTGCCTATAAGGGGTCGGCGCGAGCACGGATGCGAGGCAG:1 + chr2R 675871 5' + gypsy8 357 1 69.31 TGCATATATGTTCAAATAGAAATAAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 - chr2L 2622752 5' - blood 7337 1 73.27 TGGTTGCTACGTAGCTTCAATCCCCACTGTATTCGTGTGCGCCTGCATTGGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTAGTGGCCACGATCGGTG:1 + chr3R 20286698 5' - Chouto 397 1 50.50 CTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 + chrX 21087580 5' + mdg3 25 2 52.48 ACTTGAATGTAGCAACAGCNGCACAGTTCATAAGCCAGGTGTAAGGCAATGCAAAAAAAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGTGG:1 + chr2R 16582075 5' - Transib-N1_DM 18 1 46.00 CATAATTTTGAACAATTTTTATTCTCCAATATCCATTTTTCTGGGATAAATTATGAAATTTCGCGATTGCATTCACACTAGCTGTGTAAAGGGTATCTGAT:1 + chr3R 5083660 5' + INE-1 545 1 56.44 TGGCAAAAAGTGGCCGAAANTGCTGCTAGCATATGCGTACCAACGGCAGTTGTTTTACGATAACGTAACTTTATTTCGGCTGTCAGTTCAGAACTAAATAA:1 - 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chr3R 11547747 5' + G2 324 1 72.28 AATATTTTGTTGATATTTGCCCAACTTGATTATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chrX 9828535 5' + Tirant 8119 2 69.31 TTGGAACAGTGATAATAAGCCCATTGATATGTTTACAAAACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 - chrX 17175241 5' + I-element 37 1 61.39 CATATCTAGGGTCCTGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 - chr3R 9116539 5' + jockey 18 1 66.34 CTCGCAATAATAAGAAATTTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 6104464 5' + pogo 11 1 66.34 AATTCGCAGATAGGCAATCTGAAATAATATTTTAAAGTGCAGTTATAGCCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTT:1 + chr3R 18540964 5' - jockey 4607 1 54.46 CATGCGAAAACCAGCAGAGGGCAACTGGAACTGAACTGAACAGAAACTGGGGCCCAGAAAAGTGCGCTGCGCTTGTGTTTTTTTATTTTTTTTTTTATTTA:1 + chr2R 8310891 5' + hopper 150 19 80.20 CCGCAAACATTCTAGCCACTATAAATACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAAGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGGTTCACTT:1 + chr3L 21397805 5' - HB 1506 1 75.25 TCCCATTGCGGGCATAACGTTTCCAGGTCAAGTACATACAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chrX 18053796 5' + 297 6612 2 64.36 GTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCAT:1 + chr2R 5284570 5' - Doc4-element 2606 1 60.40 ACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCACCCGGTAGGC:1 - chr2R 12185389 5' + accord 45 2 69.31 CGAATGGAACGCAGCTTCGCATCCAAAGACTCTCCATTCGCGGGCGCGAACGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGCTTGTG:1 - chr3L 12893514 5' + R1A1-element 240 1 54.55 GGGCTGACATTTAAAGTCGGTGGCATTGTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 + chr3R 11118016 5' + BS 9 1 59.00 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3370 1 56.44 AGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 - chr2R 5531183 5' + 1360 72 1 52.63 GGGCCGAAGAGATAACCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - 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G2 2773 1 59.18 GTATGAGTCAGATTTTTCATAAATATAATGTTATTTTTATTTAATGTACTGAAAAACATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chrX 17385145 5' - pogo 2085 1 59.41 GTGTGGTAGACAAGACAACCCTGTATGATGTATGATTACCGCCACAGTTGACTTTATTTCGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCAT:1 - chr3L 27362059 5' - G3 4314 1 53.47 CCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGT:1 + chr2R 6482663 5' - gtwin 7364 2 52.48 AGCAGTGATTAAAGTAAAGTCTGCTTTCCTTATCATTGCTACAACTGTGCAAATACTACTAGAACACAGCTGTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chr3R 22520981 5' - opus 7499 2 75.25 AAGTCGGCTGAAAGGGTAAAAATTGATGGCACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATAT:1 + chr3L 14260574 5' - transib2 317 1 66.25 GAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATT:1 + chr3L 17869903 5' + 1360 20 1 45.54 AAGTACGAAACGGTAATGTGCAGTTGCCATGCAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr2L 11537586 5' - hopper2 1567 2 64.36 CACAGCACTTGTACAAAACTAGAGACGAACGCTTTGGCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 - 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hopper2 1555 1 74.26 GATTCCAGGTAAGTGATCAGAAATTGGCGTGGTTTGCTTCCCTTTGATTTATGTCCTGCCATACAAATTTTATGCGTACAAAAAATGACCTGTGGTCGATC:1 + chr2L 15331709 5' + hobo 2734 1 61.39 AATAGTCACCTACCCAAAAGCCCGTCAGCTTGAGGATTGGATCGTCATGTCGTCGTGGATTGAATGTCATCGGCACCTTACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3R 17803043 5' + Doc 31 1 43.43 AAGCAATATAATTGGACTGGCAGATATTAATAAAAGATCTTACCAAAACGATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAG:1 - chr3R 3821388 5' + Idefix 343 2 54.46 CAAGATCTTTCCAAATATTTTAAGCTCAATAGAACAATAACTATTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAG:1 - chr2L 16958126 5' - 1731 4593 1 56.44 CTTTCTAGCCGCTTTGGGACGTCTGCACTCCGCTAGCATTGTGCTCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATTGAAGAATTGAATAGGGTTACTATCGCATCA:1 - chrX 19076848 5' - rover 395 1 55.45 GTACTTGTACTCCTCCAGGTCGAAGGTATGCAGGTTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGA:1 + chr3R 20651318 5' - X-element 4288 1 70.30 GTATTTAAGTCACACGGGGTGCTGTTAGATGTTAATTTCCACTGCCACTATCGTTACCCTCCCAACCGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTT:1 + chr3R 1515397 5' + Cr1a 243 1 69.31 AAAACCATCAAATTGTTTCCCTTTTTTTTGGGTTATGAGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 - chr2R 23111378 5' - hopper 1381 1 59.41 ACCGAGTCCTTGAGCGATCATTCATGCTCTTCTTCTTCTCCAGCTGCAGCTGTCACGAAATTTCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTT:1 - chr3L 7156432 5' - Tirant 390 2 70.30 ATTCTGCCTTCGCAAATATAACAATGGGCGACCGAGCTATTGAAAGGGACTTAAGAGTCCGTTGGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCG:1 - chr2L 21659034 5' + G5A 2596 1 70.30 GATTTTCTTTTTATTTGGCGATATGTTGTTGCTGTTATAAGTATTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTA:1 + chr2L 14707749 5' - I-element 63 1 63.37 ATCTTTCGTTGAAAGCCAATATATATCTGAGTTAACTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGT:1 + chr2L 3494966 5' + 1731 4354 2 63.37 AAGGACTCTTCGTAAAACTGTAAAGTATGAACTAATATTGAAAATTTTAACAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 22881115 5' + Doc 4702 5 70.59 TCCCTTTGATTTATGTCCTGCCATTGGACATCGGTCGGTAGGAGGGGGCCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr2L 15331747 5' + 1360 24 1 55.56 ACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr3L 15777024 5' + I-element 51 1 70.30 GAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACC:1 - chrX 23108343 5' + BS3 1405 1 68.32 AATTCCAGAGTAGGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAG:1 + chrX 21939636 5' - gypsy5 6903 1 64.00 CGTAGGGCGCGTATGCCACAGGCATATATCACCGCCTCGCCCAACCCCTCTCGTCACCTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 20432482 5' + roo 18 2 59.41 TACATGTTTTGTTTCCCAATTTTCAATTGTGCTGATCTGTTTAAACATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 5043361 5' - roo 9046 1 55.45 GTGGCAAAAGTGGCACCGCGTTGGGCTCGTAATAACAGCCAACCGCAAAGGAGCACACACGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr2L 9488796 5' + hobo 16 1 57.43 GCATAAGAGATTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr2L 19698502 5' - hobo 2905 1 65.35 GCATTGCAAACGCACAGCCACTCCCCTTTTGGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 11831428 5' + roo 8708 2 71.29 ATTTAATTTTAATTACAATAAATTTCACCAGTGAAATATATGCCTAGTTAGCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chrX 19199024 5' + pogo 20 1 51.49 TAAGTAAATCCCTCATTTTCAGTGGAAATAAAAATTGCCCCAGCAGCGTAACGCAAAATAAACACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 897564 5' - roo 396 1 66.34 AGAATCGAGTGGAATGGCGCGAGGTATTTAAACTACTATTAAATAGTTATGTGAAATTAAGAGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2R 13647805 5' + blood 14 2 65.35 CGGTATTCCATATGTTACATATAAATACAATGCACATTTTCATAACCTTTGTTCGGAGAGTAAAGGGTATACAACATTCGCTGGGTAACGGGTATCTGATT:1 + chrX 22672181 5' + INE-1 546 1 75.25 CTCAATATCCCGCTGGAAGCGTTTTTGGCCATAGATCCACAACACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2L 7714514 5' - roo 9040 1 59.41 TCCGACGCCGCCTGACGAANAATTCTGAAGAGTTGCGGGCTAGTTTCTTCAGCCCGTTAGAAAATCGATAAATGAGAACGTGCTAGAAGACGGTTTTGGGG:1 - chr3L 22774238 5' - 1360 3196 1 69.31 CTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr2L 12765004 5' + Doc 70 1 71.29 AAACTCGAGACACAAAAACTAATTTCTGCTGCGCGAATTTAAAAGTTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTCAGTGGAGATACTT:1 + chr3R 15530455 5' - mdg3 5142 1 54.46 TAGCTTTAAACCGCCCCGAGTACAGATCGTTGTGCTTCAATTTTAAGGTCTTGAATCTTTTATGGTTACATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCAAAG:1 - chr3L 15820712 5' - baggins 5041 1 58.00 ATGGCGACGCAGATAGCAAGTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 - chr2L 17307994 5' - hobo 2885 1 78.22 AGAAAATAATAAAACCAAATTTAAATGCAGATTAAAAAAAGAACGATTTGCCCGAGGGGGGGCCACCAAAAAAAAAGGGAAATGAAAAAAAA:1 + chrX 18013524 5' + Doc2-element 237 1 78.26 ATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTG:1 + chr2L 1201999 5' + Stalker2 55 2 80.20 TTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTTCAGTGCCGTCATCAGAAGTGGGTTCGCCTTAGCCAAAGGAGCGCAGATCTGATCAGTATATGG:1 + chr3L 23603170 5' + invader4 377 1 55.45 AACTTTCTTTAATCATATTTTCTCATTAAATCATAAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTC:1 - chr3L 1349163 5' - Bica 51 1 65.35 CAGTCGCCATCCCCATCCCCACGGTCTTATGGCTGCCGCAGAGTCTCCCCACGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATA:1 + chr2L 14531308 5' + HeT-A 5981 1 54.46 AGCTAAACACAGAACTAACCACTAGATGTATACAACACATTATGAATACGCTATGCCATGTGCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 20381079 5' + jockey 23 1 63.37 CTCATAAAGCTATGACAAATTTACGTTTATTAGTTTTTTTTCCTTTGAGCGCCAAATTGAGTTACGATTCGCTATTAACATTGAAATGGAGTGGGCGGAAA:1 + chr2R 22641643 5' - Max-element 302 1 80.20 GAACCTGAAATTTCAGAAGTAACCATACCACATGGAATTGCATATGGTATTTCTTGCACTGTAGATTCCTATCGGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCA:1 + chr2L 20845715 5' - Doc2-element 4410 1 75.25 TTAAATCGTAATCATTTTANGCGCTTAACTAAACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCA:1 - chr3R 22010449 5' - FB 226 1 68.32 AAAACAACAACAGCACACAGGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGT:1 - chrX 16216445 5' - BS 4877 1 80.20 TATTAAACGAGCACTGAGACTAAGCGAAATACCGATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGAATTTAGGTAGTGTTGGTG:1 + chr2L 8608535 5' - I-element 4974 1 63.64 CGAACGGTCCCAGCATAGAGCGCTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr2R 1276185 5' + blood 54 2 75.25 AGTTGCATGCCATTTCTAATTAGAAAAGAGTAGACGGGCCATTGATTTCCAACTGGATGGTGAGATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAAT:1 + chr2R 12343863 5' + Burdock 8 2 71.00 AACAACTTTCAATTCATTTAATACCTTAATGAAGAACACAGTTACGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr2L 16523795 5' - 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chr2L 12884370 5' - HMS-Beagle 6996 2 73.27 GTGATTTCAGATTCTAATANTTCTTATATAAATATGGCTTAAACAATTATGTATGATTAACAGAAGGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAG:1 - chr3L 22465549 5' + flea 290 1 70.30 CGTCCGACTGCAGCAGATTGTGTTTTAATGTTATCTTGATCAAATTCTCATCAAGTTGTAAACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 20354092 5' + 412 7068 2 65.35 TTAAGTGGAAATTTTCTTATCAATCTAAAGCTGCAGTTGACCTCCAGCGTCTTAGTATCGACTTGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr3R 10078498 5' + Doc 19 1 65.35 GAAGCTCGAAATAATAATTTACGAAAATAGTACAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAA:1 + chr2L 9798440 5' + F-element 4224 1 68.32 CATGTGTGGCTTTCGTAGCCTTAAATATAATTCTTAATAATAGTGTGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGC:1 - chr2L 23402995 5' + gypsy6 31 2 61.39 ATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2L 23372624 5' - 1360 3383 2 59.72 GTTGGATTCGGATCTGGGTTTTGCCGGCAAAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGT:1 - chr3L 10014076 5' + jockey 186 1 70.30 TTTTTTTTGGCAACTTGAGTTGCAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTC:1 + chrX 15284606 5' + jockey 121 1 78.00 ACATCCGTCACTCCATGTGCTGGCCTGCAGTTTCCCCAAGTCATTAGACCGCCATTAAAAAAGGTCGTCTGGATAAGCAAGATGTAATAAGTAATAAGTAA:1 - chr2L 16994906 5' - Stalker2 406 1 81.19 TATCATAGTAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTT:1 + chr2L 19817836 5' - G4 3810 1 61.39 ACAATGGGGAGGTCCCTCGNCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 19907978 5' + Tirant 7 2 67.86 TTTTGTAGAAATGTGTGTGCATTTTTCGTCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr3R 7085736 5' + P-element 45 1 36.63 AGTCAGCACAACTTGAAGTCAACTTTTGCCGCTCGTCGTTCGTTGTTCGCTGTTCGCTGTTCGTTGTTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGG:1 + chrX 18926023 5' - Tirant 8123 2 59.41 ATGTATGTGAATGAAAATCACTTAAGCGCACAATCTGTCAGCCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCA:1 + chr3R 31948805 5' - pogo 265 1 60.40 CCAACCAGACTTGCCTGCTCCCAAAATGACGCAAAACTTTCCCATGACTGGGGCATCATACCCAGCCATCATATACACCACCCATACAAATCCCCTCGCAA:1 + chr2R 23311887 5' + Doc 4490 1 69.31 AGAGCATTTAATTGAAGCCAGTTATGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAC:1 - chr3R 19957825 5' + 1360 53 1 79.21 CATTTTATTGTTGCTGGCATTTAAAGTCGCCTCCCAGGCCGTAGAAGAAGCTGACCTTTGACACTCGACTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTATTATT:1 + chr3R 13991011 5' - Rt1a 5075 3 71.88 AAATATAAATTATAAATTTAATTAAAAACAAGAGAGAATGCTATATAGTTCCCCGACTATAAGACACCCGATACTCAGCATAATTTTTCTGGGATATCAA:1 - chr3L 23742564 5' - INE-1 505 1 77.00 TCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 12800971 5' + hobo 45 1 68.32 GAAAAGCCGAACGAACGAAAATTTTAATTGCACCAAATATGCAACGGACTTGGGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGG:1 - chr2R 8292010 5' - R1A1-element 382 1 52.48 AATTTGGGTAACGTGACATTTGTCGTGGCTCACTTAAAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 24612236 5' + roo 38 2 65.35 CAAAAGTGACTGCAACAGTTTCGTTAGCTTCCAAGCCAAAAGTCGATGTTTTCTTGGCCAAGGGAAAAGCAGAAAAGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAA:1 + chr2L 10093641 5' + hobo 468 1 76.24 TGATTTGGTAAAAGTTTTTCGATTAACCTAAAGGTCCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2R 18073296 5' + hobo 40 1 62.38 TTGTTTTTCATATTTCTTCGCATGCCGGGCTACACGTGTTGGTAACATATTTTTGGACATTATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3L 4923775 5' + jockey 21 1 64.36 TATATTAATTATAATTATAATTATATTGATTTGGGAACAAAGAAAAATAAAGTTGACCAAAACAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCAT:1 - chr3L 16131776 5' + Max-element 8531 2 63.37 GTTTGCTGCACTTACTGTTACTTTTGGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 7714566 5' + roo 49 2 77.23 TCATCGTCCGGTACTCCCCCCTGTAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr2L 19567502 5' + pogo 42 1 72.16 GTCGATTTTTGTAAAGCTTAAAAGCCCATTAATCTTTGATTAATATTTAATGTTTAGAATACTTAAAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACA:1 - chr2L 4020793 5' - 412 7539 2 67.33 CAGAGATCATCATATATACNATACATAAGTTGAATGATTCTAACATCGAAATCATGGAAATAGCCAAAGACTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTA:1 - chr2L 6076589 5' + Quasimodo 154 2 67.33 TGTTTCTATTTTTTGCAGAGTTTTTCCGTGGCCTACAAGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCTTTGAAAAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCAT:1 + chrX 10211886 5' + invader4 2 2 60.40 TTATAGTTACTTAAACAAATGGTAACTTGACTTTGATAGTAGTTCCGTAACTTGAAAGTATTAATGTCTTAATGTTACCAACCTAATTATAAACATAAAAA:1 - chr3L 2605449 5' + transib4 2571 1 19.80 TGAGTAAATGATATTAGTGATGATCACACCTTTAAATTTGTTTGTATATACATACCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCT:1 - chr2L 201095 5' - flea 4666 1 60.40 CAAACTATACATAGTGAAAGATCTAATCCAAGACAAAAGCAAACCAAAACAAAACAAACAATACAAAACAACTTGACCAGGAATATTTTGGAAAAGTGG:1 + chr2R 14586347 5' + hopper 101 1 87.88 ATTTTTGTAAAGCTTAAAAGCCCATTAATCTTTGATTAATATTTAATGTTTAGAATACTTAAAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTC:1 - chr2L 4020789 5' - 412 482 2 65.35 CACAACTATAAAATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCT:2 - chr2L 14979245 5' + Ivk 15 1 62.38 GTTTGCCGGTTTTCCCATGNGCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 11699333 5' - roo 9044 1 54.46 TTATTTGTTTATATAGTTGCATTAATTTTTTGTTTTTCAGGTAATAGCTAATCTGGGGTTTTTTTTTTTAACTTTGCTG:1 + chrX 19787402 5' - TAHRE 10437 1 73.42 ACACTTGTGGTCAAAATGANAGCAGGAAAATCGAAATATTTGGTACGAACAGTACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr3R 23788375 5' + pogo 21 1 48.51 ATCCACTTGGAGTCCACTTNGGCAACCGAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 31649937 5' + roo 48 2 71.29 GTAAAACTGGCGGGCAGGAAGGACGGAACTAAATCGATACATAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAA:1 - chr2L 11846956 5' - diver 6078 2 59.00 CATGAGGGCTCATGTTGCTNCATAAAATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr2L 13622045 5' - opus 7488 2 65.35 GAAATTTGTTTATTCCCGGTAAACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 - chr2L 19908000 5' + Tirant 2 2 79.21 CCATTCATTAGCCTAGTACTCCACGCCTTTTTTGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATAC:1 - chr3R 26703425 5' + pogo 2098 1 67.33 GCAACTGTAAGAAAAGTGCTCAAAACCATTCGTATTAAAGCCATCTTCAAGGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAG:1 - chrX 5566459 5' - X-element 4512 1 56.44 CTAAAGCGAGTGGCTTAAAGCAGATGTGGAAAAGTGTGGGAAACTCAAATTATAAACAAGAGGGAACACTAAAATACACAGATACCCGTTACTCGGCTGGT:1 + chrX 9928091 5' - INE-1 542 1 74.26 ATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr2R 5237883 5' + Doc 50 1 40.59 CTGGTGCAAAATGTAAAATNCTGCAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTC:1 + chr3L 14878638 5' + Juan 28 1 53.47 CATTCTATCAATCAGCTTTCGTACGGTTAGCATTTACATATATTCGAACGATCTCTTGAACTCACCTTAATAAACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr2L 10457127 5' + jockey 10 1 75.25 TTAGTCCCAGCCTTGAGCANCATATGTTTTAAGATTAAGTCGAGGCAAACGCCGTGCTTAGTATTCTCGGTTTTGGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTAT:1 - chr3R 13212253 5' - Stalker2 7304 2 79.21 GTGTTCTTTTGGATGTGAAAGTTGAATAGTTGTAATAGTTAGTACTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 5359930 5' + 412 33 2 54.46 TATTTATATTCTTTAATATCAAACTTTGATGATCGTACCTTCGGCACACAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 4712769 5' - pogo 2080 1 58.42 TGCGCAAAATAAACGTTTTGTATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 - chr3R 17897204 5' - hopper 1390 1 54.46 AAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATT:1 - chr3L 9220159 5' + BS 46 1 72.28 CTCGCGGCAATTGGCCGATTCGAAGACACTTTCACTGCGATCATCGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCCAGATC:1 - chr3R 9377754 5' - BS 4686 1 56.44 TCCGCTTTCGAATGCATGGAACCAGGCTCTACTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 11699273 5' + roo 8709 2 70.30 GGATTTTTGGCAGTACCTCCCCACTCCGCATCATCACCCTGACAACTATTTTCACTATTCCATTTTTCACTGTTGGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTAGTTT:1 - chr2L 10108121 5' - accord 253 2 74.26 ATAAATACATGTTAAAAATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 9439156 5' + roo 8692 2 58.42 CGATGACAATAACAAAAGCGATTGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 - chr2R 13585705 5' - blood 7338 1 76.00 TAGTAATTTTTTTCTACACAAATTAAGCAATTAAGATAATCACACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 + chr3R 5993278 5' + Tabor 35 2 56.44 CACAATGATATAGGATAAANTCAATAGAGTACAAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGATG:1 - chr3R 5027282 5' + Chouto 47 1 97.03 CCTGCTGAATCTCTCCATTTATATATATTGTATGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCA:1 - chr3R 16940398 5' + P-element 144 1 39.60 TCCCATTTACGTATCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2R 8254791 5' - roo 9033 1 67.33 CTTCACAGGCAACTTGATAGCCCCCCAATCCGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 17049925 5' + hobo 40 1 67.71 CGTTATGTATTCATTAAAAATATGTCATATTTTTTGTTAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr2L 16025759 5' - 412 457 2 57.43 ATATATACAACTAGCGGATGTGAATTGTGTACATTGCGTAGGATTCAGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTC:1 - chr3L 25483068 5' - Porto1 4271 1 54.46 GTCTCGCAGATCCCGAAACCAACTCCCCACACGCTAATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTAC:1 + chrX 13911644 5' + F-element 4351 1 63.64 TTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 - chr3R 14049441 5' - transib2 2818 1 71.00 AGATGTGGTTTAACCAAAGACCCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTCTACATTTCGCAGACCCCAGACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTG:1 - chr3R 4148528 5' + Ivk 4968 1 79.21 CAATTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAG:2 + chrX 21939635 5' - gypsy5 6903 1 67.33 CGTTCGATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCC:1 + chr2R 19352203 5' + 17.6 34 2 63.64 TTTGCACAAAAATCTGTCAGTTCATCATTTTGAGTGCAGTAACAACGAACAAACAGCACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAACG:1 + chr2R 19051380 5' - Cr1a 203 1 58.42 TTTACAGTGTTTCCACTTCTTCGGAACATTTTTTGATTTGCTTGGCGGCGGTTATGTTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTATGTTAGAATTT:1 - chrX 390048 5' - TART-B 10282 1 66.34 ACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr2R 5651919 5' + Tirant 14 2 67.33 TTTTTGAAATACCTTATTTNTGTGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 22369582 5' + roo 8716 2 79.21 CGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACA:1 - chr2R 6482721 5' + gtwin 6958 2 73.40 AGAATCAACAGATTCATATTTTTTACCATTGGGAAATCTGACTCTACATTATCTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3R 3258953 5' - mdg1 7438 2 58.42 GCTGGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACA:1 + chr2R 1922429 5' + gypsy 34 2 58.42 ACATATAGCGTTGGCGCTTTATCAAGTGAAAATGTTGACTGTTCTGATCCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTATCGGG:1 + chr4 994794 5' + INE-1 537 1 65.35 ATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:1 + chr2L 1201969 5' + Stalker2 17 2 59.14 GGAGGAGAGAATGGACTCATTTAAAAATGAAAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTT:1 - chr3L 16242394 5' - rover 7034 2 67.33 GATATTTGATAATGAAAATCTCCGAAACTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr2L 20992987 5' + I-element 9 1 68.32 CATGAGCTGGCGAACCAACTTGGCCACAAAAACCATCAAATTGTTTCCCTTTTTTTTGGGTTATGAGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr2R 23111406 5' + hopper 6 2 72.28 CAATTATGAGCTTAAAGGAAAATGTTTAAAAAGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 - chr3R 12101097 5' + Burdock 39 2 67.33 AATTTAAATGCAATAATTATGTTAATCATTTACGTAACGTTTTATTAATTAGTTAGTTTCGCAGATTATAAACAGCTAGAAATTGTAACGAACATTTTATA:1 + chr2L 11591741 5' + invader5 25 2 87.13 GAAAAAGAGAAAGACATTTCCGACTGACAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAT:1 + chr3R 30220206 5' + mdg1 50 2 76.24 ATTCTACTTACAATATTTGTTGGATATCACCAAAAGATCTCGGCAACAGCAGCCGCAGCCGAAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAA:1 + chr3R 26075786 5' - micropia 47 4 67.33 AGACCCAGCATGACCCACGTACGAAATTATCAATGAATATCAAAAACAACGCGTATTTCTCGCTCGTTTCTACGGAAACGCTAAAGCCCTCCCAAGACCAG:1 - chrX 2032368 5' + Doc4-element 99 1 60.40 CGTCAACGCCTCCTGCTTTGCATTGTGCATGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGC:1 - chr3R 27785847 5' - gypsy12 10149 2 70.30 TTATTGATAGGTTAATTTATAATTGAATGTTACCAAACCCTTTTATTGTTTGCCCACGATTGCCCACACTTTAGAATTTTGTAAAAAATTTATACTTTAGA:1 - chr3L 24763980 5' + FB 244 1 56.44 GCCGAATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTG:1 - chr2R 5532339 5' + G4 3762 1 45.54 AAGCAACTTGATAGTACTTGTTCGTTGAAAGAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACT:1 - chr2R 9761218 5' + X-element 60 1 72.28 AGTTGGGTGTGCGATTTCAAGAGAGAGCGGCGATATTAACAAACAAATTTAAACAGCTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTT:1 + chr2R 14799625 5' + 1360 3086 1 74.26 GCCTATTGCCACGCTGATCCCTGCAGACATCTACCTTCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGAGCAT:1 + chr3L 23665711 5' - invader1 3691 2 79.21 GTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGTTAAACATCCAATCATTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAAC:1 + chr3R 19446910 5' + jockey 4895 1 76.53 TCATAGCTGAGACTTTTCAACTGTCAATTATTTCCTTATTCTTTATGCAAAGCCCCCAGACGCGAGTATCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTT:1 + chr2L 3581941 5' - transib2 2819 1 72.28 TGTTTTCTACTCGTGATTTGCCTTGCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTACAATGAGAGCCGGCGATCGT:1 + chr3R 9767693 5' - Doc2-element 325 1 75.25 CCCGAAAACAGCGAACAATCCAACGATCCGCCGCCGAGTGTTTTAATGCACCACTCTCACTCACTATCCGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr2L 6411473 5' - P-element 2880 2 61.39 GACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACAT:2 + chrY 680454 5' + invader2 2 2 64.36 CAGTGATCCTCGTTCAACCCATACATTCGTTACGGGCCTCACTCCGTGCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 - chr2L 23372814 5' - blood 350 2 52.48 AGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTGTTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAA:1 - chr3R 19450185 5' - Q-element 250 2 56.44 CCATTCAAATATATGATACTTTCATATTTCCTGTAGTTTTTATAATCATTCTAATCTAATCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACC:1 + chr3R 5886337 5' + I-element 4872 1 54.46 GTCAGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr2L 13598167 5' + pogo 11 1 68.32 CACTTTTCCCCATTCGAAAAATTGAGTGAGTTTTACCCCTAAAATATCGAAAAACTATTTTTAAACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr2R 16639749 5' - opus 491 2 70.30 ATGAAATATGCACATAAGATCATTTGGATGTTTGGTTCAGACATGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGAAAGGCAAGGAAACCTGTACTGCCGGGTGCA:1 + chrX 19813672 5' - Gypsy12A_LTR 2223 1 75.25 AATATTTGTCATTAAAAAACAGAAAGGCTAATTAATGTAATTATTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3L 5512503 5' + pogo 29 1 58.42 CTGGGCCAGCTAATCGGGGGGCGGAAGTGCCAAACCATCGTCTCTCTCCCAATATCCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr3L 7099870 5' + 297 6594 2 62.38 ACCAGCGCCTTGTCCTGGCCAGAAATATTGGATGGCAATTTGTCTTAATATTTTTTATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTAC:1 - chr3R 6623891 5' - G4 3454 1 65.35 TTGTTCCCCAAATTTTCTCCTCTTTTTTTTCGTAAAGTTGACCTGCCTTGACATCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTT:2 + chr3L 2325391 5' - hopper 1394 1 55.45 GGGAAAATTTGCATATGTCNAGTAAACTGGGAGTGCTAGCCGCTTGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTA:1 + chrX 9828440 5' - Tirant 370 2 55.45 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTT:1 - chr3L 14971177 5' + 1360 3272 1 67.11 ATTTAATGATGCAATTTACNTTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCG:1 + chr3L 27356101 5' - Tc3 1661 1 73.27 CAGGGACATTAAGTTACCATCTGTCAGCTTTAGTTTGCATTACCTCAAACAATCCCACCCAAATTTTACCGGAGTCGAGCAAATAAAAATAATACGACTTC:1 - chr2L 2066252 5' + I-element 4929 1 60.40 GAGCCGTCAATCGGTGGCGTGCTCTCGAATAGCAGAGTTTAAATAAAAAGAAAAATAATAAAGCAAGACCAAGACACCCAACGCCATCGAGCTAGAGCCG:1 - chr3L 23486018 5' + Gypsy12A_LTR 2189 1 69.00 GAAGTAGGCGTCGTTCAGGTGCTCGGGCACCTTGAAGTCACCGAGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGC:1 + chr3R 31595152 5' + Quasimodo 309 2 56.44 AATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGT:1 + chr3R 18717467 5' + Cr1a 182 1 84.16 ATATCCTACAAATACTGTGGAACATAACTTATGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:2 + chr3R 21931506 5' + 412 44 2 70.30 TGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3R 7582619 5' + 297 6607 2 56.44 GCCACTTGCCACCGCCTTAACTCAACTGCAAGCCGAAGATGCCGTTTGGCTTTCCCAAATAAAAAAAAAACCCCAATTCCAGATAAGTCACCCACTGGTAG:1 - chr3R 21704824 5' + Idefix 6982 2 68.32 TGCTAACCACCTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTA:1 + chr2L 21369851 5' + rover 30 2 59.41 ATGGACTGCGGCCGATTAACGGGGGTGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAAAAGTGCAGCTTATGTGCAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGT:1 - chr3R 29773086 5' - gypsy 7436 2 46.53 TTGTATTTCAAGCGAATAGTTATGGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2L 3985157 5' - roo 9048 2 63.37 CTACTATTAAATAGTTATGTGAAATTAAGAGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:2 + chr2R 13647837 5' + blood 7057 2 69.31 CGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAG:1 - chr3L 13142064 5' + F-element 417 1 54.00 AAATAGCCCTGAAGCTTTACATTGAGGAGTCGAAGGGTATGCGGTCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:2 + chr2L 9075553 5' + 297 6592 2 47.52 TTTCTGCCTTGCTAATGGCAGCGGTCTTTTTGTTGCTGCTCTTCTTAAGCACGGCCAGCTCCTTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTGCCCACCC:1 - chr3L 9369711 5' + gypsy5 7030 2 68.32 AAATCGACAACTTTCCAGCGAAACTTAGCTTGAACCAACTTTGGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATC:1 - chr3R 12599355 5' + BS 29 1 57.43 AGATGCTGCATACTTACAAGCGCTGTTCACAAAGTAAGGTGTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr2R 24242954 5' - hobo 2906 1 61.00 CGAATAATCTTTTTTCAGTTTTAGAGCTAATATTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGAC:1 - chr3L 13142100 5' + F-element 382 1 82.18 AATCATAGCTGAGACTTTTCAACTGTCAATTATTTCCTTATTCTTTATGCAAAGCCCCCAGACGCGAGTATCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 + chr2L 3581939 5' - transib2 2821 1 74.26 AAACCTTAACAACTTTTCAAATTTATAAGCGTACTTGATAAGTAGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 + chr3R 5503342 5' - blood 346 2 56.44 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCCCACGTGTGCGCACATAGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAA:1 - chr3R 4571525 5' - 1360 41 1 53.47 AGAAATAATTATTATAGCCGCAAAAGCATTCATTCTACAACAAATCAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCAGCCACATATCAAACTACACAAAAAATTAT:1 + chr2R 976540 5' + Porto1 297 1 60.00 AACAGAAAGAGAGACAGCGATTCCTTCCAGTGCACACTGGGCCAGATTCCCTGTTTTTTGGCATAATGTCAAAAACTTTTGTAAATTGTATTTTGAATTTA:1 + chr3R 447126 5' + transib3 48 1 62.38 AATGTGGGTCCGAAACCATAGAGTGTGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3R 27448287 5' + hobo 50 1 76.24 TATCCAATCTTGACCACGACTAGACTGGCCCTATGGAAAGTGTTTCCTCAAAACAGTCATCGATGCTCTTAAAGTGTGTGCTGTTGCACCGTCTTGTTGAA:1 + chr2L 23028382 5' - mariner2 459 1 74.26 CTTGAGCAGCTGTTTCCTCGCCAAATTGCAGAATCAACCTATACTATGTATTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2L 4916544 5' - hobo 2914 1 52.48 GATTGGGTTTTTTTTTCTTGTTTATTACATATATAAATATACATATGTATG:1 - chrX 7279271 5' - Stalker2 7499 2 56.86 CCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr3R 29374965 5' + mdg3 5301 2 73.27 CTTCCCTTTGATTTATGTCCTGCCATTGGACATCGGTCGGTAGGAGGGGGCCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr2L 15331745 5' + 1360 24 1 56.44 GTGTTATAGGGGACATTTGGCAGCTTTATTAGCAGGTTCGCGGTGCGTGTGTTCAGGCCATTCGCAAATGGTTGTTGTCTAAATATGTGTTTAGACATGAT:1 + chrX 13118979 5' + rooA 7240 2 66.34 GTCCATTTGTGCTGAGGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2L 2505680 5' + jockey 18 1 67.33 TAGCACCCATTAGTTGTAATTTTATTTTTCCTTTTTTTTTT:1 + chrX 13961761 5' - Doc2-element 233 1 65.85 TCATTAAATACTGTTGAATATATAATGAACATATATGGATAATGAACAACGATGTATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1 - chrX 22382050 5' + opus 11 2 70.41 ACAGGCATTGTGCGGTGTTGCCACAGGAAGGGAAAAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 - chr3L 9220194 5' + BS 11 1 59.41 GCAGCAACTTAAACTCAATATAGTGCATATATGTATATAACGATCGCAGCTCAGCGACCTAGCGAGGGCAACACAGCACCCTACCTCTGGTACACATCCTG:1 - chrX 1566259 5' - G5A 456 1 76.24 TCAACGCCTCCTGCTTTGCATTGTGCATGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCG:1 - chr3R 27785845 5' - gypsy12 10147 2 72.28 TGTCGTTTCGATAGCCCTCGAATTTAGAAAGTTATTTGAGCACATTTAGAGGTTATTGTTGTTTATCATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 11624449 5' - roo 401 1 68.32 AGAACTCCAGTGAAAGTATTTACAAATTCAATTACATACATATATGTATGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 19955294 5' + hobo 25 1 52.48 AGATGATGGGAAATTAACCGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGT:1 - chrX 983396 5' + Juan 3808 1 74.26 AAGGGCCATCGCATTTCGCATTGCACTGCTCGTTCGATTTTGCAAAGCGCAGCTCCAAAAAAAAACGTGTTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr2R 19616108 5' + hobo 4 1 74.26 ATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 9828504 5' + Tirant 43 2 67.33 AAAAAGCTTAGTGCAAGCAAAAGCTTGGTCAAATTTATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 + chr3L 16058689 5' + FB 41 1 67.33 ATCGACAGCAGCGAAAGTTTGAGGGCAAAATTTAGCTTAAATTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGAAGACTATAATTTGAAATGGATAATC:1 + chrX 5281713 5' - hopper2 1360 2 76.24 CAATCTGTTTGTAGTTTCANGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chr3L 27415220 5' - transib2 2802 1 56.44 CCGATTTAAGTTGATTGCATTTCGATTCGCAAACGATTCCTCTCACGCTCACGCCCCAATGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTT:1 + chrX 20134931 5' - Tirant 8149 2 66.00 ATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTA:1 - chr3L 19339395 5' + Tc1 32 1 71.23 CGAGTAACGGGGAAAAAATAAGGAATTACACATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAAT:1 - chr2R 1422528 5' - Porto1 4564 1 60.40 TATATGTGTGCCTCGGGCTTGAGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTTCAACTTATAACTATTACATTGTTCCTAGTCGCTATT:1 + chr3L 19975428 5' - invader2 4776 1 78.22 AACACACCAAAAAGTGTAATCATTATTATAAAAAGATCATCATCATTGGGTTATTTGATGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr2L 14981431 5' + hopper 7 2 67.39 GTGTTTCCGACCATTAAAAGTATATATGTATATTCTTGATCAGGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTGTTCTGTATAAATGTCTAGAAGGTTTAGATTCAGC:1 - chr3R 20500830 5' + INE-1 168 1 49.50 CTATCGAATAGTGGCGTTGAATTATGAGATTTCTTCACTAGTTGGGTTTGGTGAAAAGACAAATGCTAGTATCTTATTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTAAT:1 - chr2R 18796879 5' - Doc 4701 2 61.39 ATAATGTAACTTGATAAAATTGTATATGTTTTCCTCGTAATTTAAGTCCAGTCTTTTAATTACCTCAACAAAAAGCCTTTAAATAAATTCCAAAAACAAAA:1 - chr2L 11788238 5' + transib2 100 1 82.18 AATAAACATGAACATGCATACGTTTGAAGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3L 15390395 5' + pogo 46 1 72.28 CACACACATCGAAAAGCCAAGACAATGTATACATGCCTATGTACATAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chrX 19384063 5' + pogo 26 1 55.45 TTGTATATATAGGATTATAATATAACTATATAGTAGCATATGGGCCATAGTATAACACTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTT:1 + chr3L 24361716 5' - Quasimodo 7037 2 58.00 AGTCCTTTGTCGTCCTTTGTCGTACCAGTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATTCGAAGTATTT:1 + chr3L 13366378 5' - hopper 1365 1 70.30 ATTGGCATCGGCATCCACTTGGAGTCCACTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 31649949 5' + roo 8704 2 72.00 GGAGAAGGCGCAAATGCATCTGGCCAAGCAGCAGGAGAACACACAGGACCGGATTCATCCTTCTCCTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAA:1 + chr2R 9534938 5' - TAHRE 10413 1 41.58 GGGGCGGAAGTGCCAAACCATCGTCTCTCTCCCAATATCCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:2 - chr3L 7099853 5' + 297 30 2 61.39 GGGGGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr2R 6074464 5' - 412 7539 2 69.31 TGTTTAGAATTCTGAAGGTATGTACAGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATATTTGTGAAA:1 - chr3L 27412419 5' + hopper2 1565 1 66.34 ATATATTTAAAAAGTGGGTATATTTCTGTGCTTATCAGCAGATATATATGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr2R 7775532 5' - pogo 2077 1 55.45 CTGCACCGTATAGAAAAAGTTATCCATAGTAGACATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chr2L 20495120 5' + Tabor 6883 2 66.34 AAGGAAATATTTATTTACGAACATTTTTTTATTTTACTTTCTGCTATTTGTATTCACACGAGAGCGTTTCTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 4555473 5' - roo 403 1 73.27 TAGTAATACACTGCCCGTTCCTTCTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3R 4769538 5' - copia 238 1 59.41 TCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 + chr3R 1440180 5' + G-element 51 1 71.72 ATATAAATCTTTTCGCGAGACATACAGTCTATCACCCATAACTCGACAAGTTTACCATTGCCAATAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACT:1 - chr3L 10672390 5' + Doc2-element 454 1 74.26 TTGGGAAATCTGACTCTACATTATCTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 - chr3R 3258925 5' - mdg1 7410 2 73.27 AAAGCAAAATCATCATCATTCCATATCATATATGTGATATGCCATAAATTACTTATGCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 4020686 5' + 412 7072 2 59.41 TTTTTATTCGGTTTTATTTTATTTGCCTTTCCGATTTTAAGCGATATTTCAGAAAAATGTTTAAATGTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCTG:1 - chr2R 19128033 5' + INE-1 551 1 71.29 TTGCAGAGTTTCCCCAGCGAAGATGTTCAAAGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTG:1 + chr3L 16301462 5' + Cr1a 194 1 68.32 CATTATGTACTTATTTTTGGCTACTATAATTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAAC:1 - chr3L 22951435 5' + mdg3 5340 2 71.29 GTAACATACGAGCAGGGTACAGACCGACCACTGAGCCAAGAACCCACTGGTAGAAAAAACATCCGTCCCCTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCAC:1 + chr3L 3234291 5' + Idefix 214 2 59.41 AAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr3L 21275782 5' + HMS-Beagle2 48 2 75.25 ATTGACTTTCAAATGGCTTGCATACTTTCAGGCACTCGAAACAATTTTAGCCGCCATGCAAGCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 20154820 5' + jockey 20 1 65.35 ATCTGGTTTCCTCTCCCCTTTCTATCCGTTCTACCTTTGTGGCTAATTTTCGAGGCACCCACAATTCGCTTTAGGTATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTC:1 - chr3L 10999150 5' - Doc4-element 2758 1 69.31 TCCTCCCACTTCCCTTTCTCCCCAGCTGCGTCTTAAGTATTTTGTAAAATTTCAGTACCACTTAAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr2R 20441299 5' + I-element 28 1 49.50 ATTTTTAAAACACTCAAGTGTATCAAAAGTAATTTGAAGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr2R 18939171 5' + I-element 36 1 61.39 ATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAA:1 + chr3L 27356088 5' - Tc3 1674 1 63.37 TCTGTGATTTTCCCCTTAGGCTAAGGCGTGTCATTAATTTATGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2L 1858383 5' + pogo 34 1 62.38 GCCGCACCTGGAACAGCTAGCTAGTTTCCATTTGTTTGCCTCAGTTTCAGCTTGAACTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3L 20148221 5' - pogo 2083 1 61.39 GCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 - chr3R 6761048 5' - blood 7338 1 75.25 CGAACACCTTGGGTGGTATAGTATATAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAA:1 - chr3L 15776946 5' + I-element 193 1 74.26 AATCCATCACGTTCACCTAAATAAGCCATGTAGCTCGTTTGTCGCAAAGCTCTCACTCTGCCAACTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTG:1 + chr3R 3753052 5' - ZAM 453 1 79.00 CAAAGAGCCAAGGAACGACGGGTAACTTAGTTATTAGCGGATGCCAGGGCCTTTTGATCGAGCATATTCCATCTTTCGGAATCTCCAGAGCCATCTTCTGG:1 + chr3R 12148659 5' - Copia1_DM 452 1 57.43 TATTTGTTAAAAAAATTTGTGTTCATTTAAATTTTTAAGTGAAAACGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTG:1 + chr2L 14104264 5' + springer 7139 4 81.19 AATGATTGGAATGTTTCATAAAAAATAATTATATGCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAA:1 + chr3L 2016845 5' + Tabor 4 2 73.74 CAAAGCCTTTCGCTATCGCCGCACTTCAAAAGCTTCGACCTTCAGACGTTTATTCCTACACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATAC:1 - chr2R 11524319 5' + I-element 131 1 61.39 CCAACCAGCTGCAATTGGCCTTCATTTGCGAATGAGCAAATAAGTGAGTTAACTGTAATTTCGGGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr3R 24464768 5' + 412 11 2 69.31 GTCGGTTCGGGTCTAAGGCTTTGCCTATTTTTTGCCTATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGCTTTAGAGATATGAATTTTCGAAAA:1 + chr3R 18057228 5' + FB 119 1 73.27 GTGTGAAGCAATCAAATCAACTGAGTCAATCGCGCTTTTATCAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr2R 13585659 5' + blood 7046 2 61.39 GTGCGTCATGCATTCCTCTAGGACTCCGGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGCGCTACAGACTTGAAACTT:1 + chrX 20015509 5' - transib2 2779 1 68.32 TCCTGTTTCCCAGTGGTTATTGGCTTAGCCCCAAATTAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 + chr2L 12884317 5' + HMS-Beagle 26 2 56.52 AGATTTTTGCGCAAACACTCTGTTAACGCTTTCCTAAAAAGATTTATACCCGTTACTCATAGAGTGAAAGGATATACAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:1 - chr4 449816 5' + INE-1 15 1 68.32 AGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr2R 5214984 5' + F-element 56 1 70.30 TTATATCCGTTCGATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAA:2 + chr2R 19352196 5' + 17.6 6956 1 57.43 TCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:2 - chr3R 27605336 5' - opus 7460 2 70.30 TGACACCCATTTGAGCTGCGCTTTAGAATATCCGCACATCATAGGTACAAGGGAGAGATGTCATCCAGGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGA:1 + chr3R 5985603 5' + invader4 189 2 77.23 GGTGATTGTATCGCTGCTTGTACTTCTGTTGAATGTCGTAGATGCTGTCCTCGTTGCAATTGGTGCCAAAAAAAAAACACAAAAAAAAACAA:1 - chr2L 4353556 5' + gypsy7 5009 1 61.96 GTCGTTATCCAGGGAACCTTGCTCGTTTCCGCATCCTTTCGCTTTGAATACCCTTGGGAAGTTGGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3L 1904250 5' - hobo 2927 1 67.33 AAACGGATTTCAGCATTGANTTGCTGATTGCTCGAAAGGAACGGAGAGTAAACTTATTCAAATACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chrX 3334734 5' + 297 7 2 72.28 TTTCGCCTCGCATCAGCTGTAATTAAAGCCATGGCGAAAAGTTTACGGCCACCGTTACCACCACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr2R 13745790 5' + hopper 11 2 67.33 GGATCAAAATGATTTGTGCTTCTCCGTGGGCGTTTTTAATATCAATAAAAAAAAACAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTTCCCGACTATC:1 + chrX 21486911 5' - INE-1 564 1 59.41 GCTGGCAGCGATCCAAGTGGCTGAAAAGGGAGACTTAGTTGGAGGACACTGCGTGTGCCATTTTCACTTCCACTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGG:1 + chr2L 20292542 5' - F-element 4408 1 77.23 TTTATAGTTTTTCTAATTTAAAAACCCATTTTCCAAACAGCTCGTTGTTTCAACAAATTGTATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 24612157 5' - roo 9056 1 64.36 TAGGTTAAGTGGAAATTTTCTTATCAATCTAAAGCTGCAGTTGACCTCCAGCGTCTTAGTATCGACTTGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr3R 10078502 5' + Doc 15 1 69.31 TTGCTTCCAGTCATTTAACCATAGCCCCATATCACGGAGCGGTCCGTCGCGCCATTCACACATTTTCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATA:1 - chr2L 21612421 5' + Ivk 5126 1 78.22 ATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCA:1 - chr2L 21657045 5' + invader1 34 2 77.23 GCTTTAACTTTACTCTCGATTGAGATTCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 - chr2L 12801008 5' - hobo 2891 1 69.31 CATTGTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATT:1 + chr3R 11118039 5' + BS 33 1 61.39 AGGATACTGAAAAACATCACCACAGCCAGATTCCTTTGAAGTGTTCGTGAAAAAAACAGGGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 4555361 5' + roo 14 2 65.00 TTTATCCCTGATCCCAGCCGAGAAGGAAACTTTTGCACATCCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 + chr3R 29374925 5' + mdg3 5261 1 71.29 TTGACTTCTTTTGTGGAGTCAATTTCAGCAACGGATGGCATAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2R 20389499 5' + pogo 31 1 60.40 CTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATG:1 + chr2R 5284546 5' - Doc4-element 2630 1 58.42 TTCATTAGTCTTAAAGTCACTTAAAGTCAGTTCCTTCTGAACTTATTAGGTTAAGTAGCTTAAGTAGCTTAAAAGATCATATTATGGATACTGTTCCTTA:1 - chr3L 27113948 5' - G5A 2756 1 80.00 TGTGTGTTCGGCTTTTGTTTTCCTTATTGAAATCGGTTTAAGACTTATTGAATTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGA:1 + chr2R 22281692 5' - McClintock 256 2 84.16 TGTACTTTAGTCAACAGATGATGATGAGACCTAATAAACTGGGATAACAAGTGGAGGCTATGAACACTCCCCAAGATCGTTTTCACTTCATTTTCAACGAT:1 + chr3R 30393291 5' + transib4 2481 1 85.15 AAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTC:1 + chr2R 12185318 5' - accord 7366 2 59.41 TCATATTCCAACGATTTATATACAAGCCTTGCTGATTATAATTAATATTGACTTTAAAGCTCATTAAAAACTATACAAAAATATGCAAAATAAAAAAAA:1 + chrX 12850044 5' + TART-A 13403 1 72.73 TACTAATTAATGTGTTAGTATTCTTCTTAGTTTGCTGGCAAGACCTTTACATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2L 3985080 5' + roo 8688 2 53.47 TTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2L 13598182 5' + pogo 26 1 53.47 ACATTGGGAATTTGACCTTAAAACATATTTATGCATCCATATATGGTATTCAAAAACAACAATACCGCTAACCCGCGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCAT:1 + chrX 638259 5' + I-element 167 1 52.48 AAAGAAATTCGAAATATTTATTTCTTCTGAACTTCAAGCAATTATATTGCATAATATTGTATTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr2R 20821429 5' + 297 6588 2 71.29 TATCGCCTTAAGCGGCTGCTTCTCCTTCGATTATTTAGCTGCTTCCCAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 5264460 5' + P-element 30 1 50.50 AATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCC:1 - chr3R 934254 5' - Rt1b 4755 1 51.49 TGCTGGCAATGTCATAATATTGATTCAGGCCGCTGTCCTTGGCAAGGTATTTTATGAGCAGTATTATAAGTATTATATGGTGAGCAGGATGTGATGCCAAG:1 - chrX 466839 5' - Rt1a 4884 1 52.48 GAATCACACGCCATGTGAGTACTCATCTATGGTTTGGGAAATTTATTAAAAAATGCCATAAGCCCGAGTTAAATCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr2L 19907879 5' - Tirant 8492 2 62.38 GACGACGAGACGTTAACGAGAACGAGAAAAAATGTGTGAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTC:1 - chr3L 14877277 5' + Juan 405 1 62.38 AATTACGAGATTTTACTTTCGCAGTTTTGCGGCGAGCAACAAAAAAAAAACAACACGCGCCGGCAATCAGCCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCA:1 + chrX 1460587 5' + Circe 314 1 70.30 AGAAACGGGGACAGGCAAAGATGGGAAATGGAAAAGCTCTTCCGGCAGTTGGAAAAGCGCCCACGCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTAT:1 + chr2L 18207948 5' + G2 3015 1 65.35 CTGGGAACAGGATCTAAAAGTTGTTCATAGCCCTGACCATATTATTTCATAATTTCACAAAAATGTTGTTTTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAG:1 + chr2R 25248668 5' - HeT-A 6054 2 67.33 GGAAAACCCACTTGAAATGCATTTCCCTGGAGAAGTCTTTACTCCCCTCCCTTGTGATGTGCTTGTACATTTCAAAGTATTTTTTTTATTTTTCCTATCTT:1 + chr3R 10211722 5' - invader2 4747 1 81.19 GCAAAACAATATTTGTTCTGAAGATACAAACATATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:2 - chr3R 17952988 5' - copia 245 1 67.33 TGTGAATGTGCGCTGCTATCCGTGTGGATGCGTTGCGGCATCGCCTGGGCATCCATGGATTGTCAGTCTTTGTACACCCCAACATCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chr2R 22269219 5' + jockey 4678 1 66.34 CCAGAATTGCGTTGTCAGGATTTAATGATGACACGAGCCCACAACTCGCAGAAGATACAGAAAATGTGTGCAGATTTTATTCTTTTATTTATTTAAAAAT:1 + chrX 5105860 5' - G7 1143 1 76.00 TGTGTGTCTGCTTGCATACGCGCGCGTGTGTGTGTGTGGGGGCTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGG:1 + chrX 15259464 5' - accord 7026 2 77.14 GGCTTAAGCAAGGAGTTTAAGATGAAGTTTAACAAATTAGTTGAAAACCAGCATCAAGTATACGCCGCGTTGGCTTGGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAC:1 - chrX 8312128 5' + blood 7179 2 74.26 TGCCATGGATGCAACCAGAGTCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAG:1 + chr2L 11894647 5' + I-element 5115 1 78.57 TGTTGCGATGGACACATGTCCACAGGCGAGGATAGCTAAATAGAAGCAAATTAGGAGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 2029682 5' - roo 9050 2 55.45 TACGAATTAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 + chr3R 19446646 5' + HMS-Beagle 22 2 62.38 TAGCTGATATCATTGTCCAACCGAATTTGTATTTCTTTTCACCTTTTGATGTGGGGAAAGGGTTTTTCTCTCAGTGCAGGCAGCGGATGTTAATGTTTACA:1 - chr2L 20527199 5' - Quasimodo 6905 2 76.24 TCCTAATACTTTTGAATTACCTCTTTCATTTTTATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 + chr2L 20992919 5' - I-element 5309 1 70.30 ATGCAAAGCATTCAACTGGCGTGTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chrX 16763271 5' - opus 449 2 77.23 CCCTCTCGGTTGCATTTGCCCACTAAAAAAGGAAAACGCCGCCGTCTTCTTTGTGCATGCACCGTTACCCTTCGACCTTTTCGCCCTTGGCCAGCTGGAGT:1 + chr2R 22690035 5' - gypsy8 4764 2 58.42 TGAAGTAACTTTGAAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 11814477 5' + blood 25 2 52.48 TGAGACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGGGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2R 5651923 5' + Tirant 10 2 67.33 ACACATTTGAATTTAATCANGTATTTGTGATTGCAGAAAATATTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTT:1 + chr3R 17147919 5' - F-element 4336 1 58.42 TGCTGAGCTTGAAATGAGCGCGCCATTTTTCACCAGCTTGGCCCAAAGGAGAATGGAAAGAAGGTGACTCTGTCCATGGCCATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr2L 18239522 5' + hopper 3 2 78.22 ATTTGCATTGGCTTATCCGTTGAATTGGCCACTAAAATTATGTACTGAAATTATATCCAAATTGTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGA:1 - chrX 22472634 5' + invader1 3614 2 59.00 TTTTAAATTTATGTTTTATTGCTGACGTTATTTGTTTACACGCACATTTGGCGTTTAGCGATCGGTGTTTCAGTGTTCAAATAATAAAATGATATTTTACG:1 - chr3L 15592444 5' - gtwin 7218 2 76.24 CTGAAGAAATAACTTGATCAACAATGTTATAGCATAATTGCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3L 2424919 5' + jockey 30 1 49.41 GTAACAAACTTCAGCCATACTGCATTTATTTAATTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr3R 15213639 5' - pogo 2062 1 72.28 AGCAACCAGAAGAAAAGAACCACGGATTTTTACCCTTCATTTTATAATTGCATAATTACGAAGAGCAATTGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAAT:1 + chrX 6332646 5' - invader4 2638 1 74.26 AGGAAACTCAGCGCAGATCCAGCCAGATGTCGAAAGATGTCGTAAATGAAGATCCACCTACACTAACTAAATCCAAACTCAATACCAACTTGTCCGTTTTG:1 + chr2R 12258481 5' + I-element 4999 1 57.43 AGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAA:1 - chr3R 11547800 5' + G2 271 1 81.19 TTGGCCGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2L 12485455 5' - roo 9029 1 77.23 AACTATAAAATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 - chr2L 14979242 5' + Ivk 18 1 59.41 TACCTCGATATGTGAGCATTATCGCCAGCCAATGTTATGGGGACATCAAATAAAAACCCTAAGCCAAACGAAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACA:2 + chr3R 14543541 5' + F-element 4553 1 74.26 AGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCC:1 - chr3L 16047626 5' + Cr1a 456 1 59.41 CAATCTAAAGCTGCAGTTGACCTCCAGCGTCTTAGTATCGACTTGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr3R 10078478 5' + Doc 39 1 56.44 GTAATAACAGCCAACCGCAAAGGAGCACACACGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 9488768 5' + hobo 40 1 68.04 GTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 9439176 5' + roo 48 2 78.22 GTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1 + chr2R 1922440 5' + gypsy 45 2 69.31 CTGTAACGCCGAGTTCATTTAATGTTTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3L 27423376 5' + blood 49 2 71.29 TTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 + chr3R 14049353 5' + transib2 38 1 63.37 TAATTGTATTGTATTTTAGCACAATTATTAACTGTAGTCCCAAGCACATCAATATTATTATTTATTTTTGTATATTTTTATTAAGGCAAACGGGGTAGCTT:1 + chrX 22729105 5' - BS3 1750 1 61.39 TTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 13598174 5' + pogo 18 1 61.39 GTCTGCGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2R 15160305 5' + Tirant 39 2 62.38 TTTGTTTATTCCCGGTAAACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr2L 19907996 5' + Tirant 6 2 75.25 CTTAGCACTTGATCTCTTCCCCATATTTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr3L 13704502 5' + opus 156 4 75.25 CCGGTAAACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr2L 19907985 5' + Tirant 8124 2 64.36 TCAAAGCAGATCGACCTTAGCTCGAAAACAATCTGTCTTCGCGCCGAAACTTTCGCTGGACAGGCGGACATTTCCAGATCGACTCGGATCTTGATCCTGAT:1 + chr2L 17955615 5' - INE-1 93 1 63.37 ACAAATGCAAGAAAAGGCGNCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 14311495 5' - roo 9038 1 60.40 AAATAACTACGTTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACA:1 + chr3R 8856941 5' + rover 32 2 61.39 CAAAATGTATTGCATACTTTGTGGCGCAGACAACAGCATGTTGCCACGCCCCCACGCCATAATTCGCATGGGAGATGAGC:1 - chr2L 4057104 5' + jockey 5 1 72.50 GAAAAGCTCTTCCGGCAGTTGGAAAAGCGCCCACGCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAA:1 + chr2L 18207978 5' + G2 3045 1 65.35 CATAAAAAATGGCTGGCCCATCTCGACTTCATTACTCATTTTCCGCTGATATCCGTTGATATGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAA:1 - 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gypsy3 6544 1 71.29 TAAAGGAAATGAGTGGAACATGGTGATTTGTATTGTATTATGTTTTAAGAGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 18883753 5' + roo 25 2 55.45 ACCTTGTCAGCGTGCAGACACAAATTGTTGTCCAACAACGTACTCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAA:1 - chr3R 1838746 5' - P-element 262 1 47.52 AAAGCCACTTTACTTCAGCATCCCTTCCGCATTGAAACATAAAGATATTTGCTTAAGTAACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chrX 15227025 5' - copia 238 1 60.40 GCAATAAATTGGAACAGTGATAATAAGCCCATTGATATGTTTACAAAACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chrX 17175249 5' + I-element 28 1 53.00 TAATCACACGCAATCTTAANCGCCCGAAAGCATGCTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2L 9287241 5' + jockey 8 1 75.25 GAATAATATTTGGAACTATTTTTAGTGAATATTTCGAATACTCGATGTTTTTGTGCAGGGTATGGGCGATGTGCACGGGACCCCAGCCTGGCAGGCTCTCG:1 - chr2R 15988450 5' - baggins 242 1 76.24 GGTTCGGTTCTTAACCCATGCTTACCCTCATTAACATGTCCTGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGG:1 + chr2L 18483869 5' - accord 7326 2 58.42 TACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2L 12485444 5' - roo 9018 2 87.13 AAGCGCAGATCGAACCTTTTGTGGCACTCTGGCATGCGGTAGTTTCCACGTCAATTAGATTAGACTTAAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 + chr2L 17003942 5' + F-element 23 1 57.43 ATTCCAATTGCAGGAGTCCGAAATGGTTTTAAATTTAAATATTATGTTACTTTACGTTACTTTACTTTACTTTAATTTACTTTACTTTACTTTACTTTACT:1 + chr3R 23335031 5' - TART-A 13124 7 73.27 CTGCTAAGGACACGTCCATAAATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGCAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1 + chr2R 9640360 5' + Max-element 8287 2 71.29 AGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTC:1 + chr3R 1440169 5' + G-element 42 1 61.39 AGTACCGACTGGTTCATTTGTTTGGTTCTTGAGAAACGGAAGCGAATGCAAGGTTACGTCCACATCAGTTCCGGTTTGCCAAAAGGCCAATAATCAAAATC:1 - chrX 15196447 5' - 3S18 416 1 78.22 AGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTT:1 + chr2L 23295813 5' - micropia 404 2 73.27 GATTAACCTAAAGGTCCAAGCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGGGCGGGTGCTACT:1 - chr2R 18073276 5' + hobo 50 1 75.82 TATAAGAAATTTTAGTCGTGTTTAGATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACGCACACATACAT:1 + chr2L 23016845 5' + Quasimodo 37 2 67.71 ATTATAGTCAGCTGTTTTATTTGGGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTG:1 + chr4 353412 5' - BS3 1750 1 74.26 GCTTTAATCAAGACTGAAATTCTTGTTACCTGGCATCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chrX 18050590 5' + 412 38 2 62.63 ATTACAAAATAACTAAACTGTGGTCTGGCTTGTACAAATACCTTTTCGCTACAGACATTAAAGTATAAGATCAAGAATTGAGCGCGCTTGCGACAAAAGAA:1 - chr3R 31726994 5' - Gypsy12A_LTR 2101 1 78.22 CATTATTAAAGGATTGCTTACAAAATTTAAGCAAACATTAAGGTCAGATGTACAGCATGGAAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 + chr3L 20032229 5' + Tabor 6853 2 61.39 CAAAAAGACAAAAAGCACTTGCACTTATAGGGGATCATTAATCTGTAAAGCGCGAATGAATATTTAAAAAAAAATATAAGGGAAAAGAGGAATAGTAAACG:1 + chr2L 22211628 5' + Bica 352 1 77.23 TCCAAGCAGCATTTGCAGTTCAATTCAATTTTTAGTGCACACAACAAACAGCTGAAACGGCTTTGCACACATGAGTACTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr3R 26498619 5' + roo 8666 2 78.22 CGTTTTCACATATGGACACATAAAAAAAACCACTCAACTAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAA:1 + chrX 6497138 5' + I-element 241 1 61.39 AATAAATAAACAATTTCGATAGTGAAGAGGAATATCTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGC:1 - chrX 9816570 5' + Tirant 8225 2 65.00 TAAGGAGGAGTCTTCTTCTTAACATTGGTCCTCCAATTATGTCCACTGGATGACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3L 9698032 5' + 412 24 2 55.45 GTCCGTTCAAAAGAGTGTCCGTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 - chr3R 30255621 5' + copia 55 2 81.19 AGCAGGTTGATCGCTGCTTCCTAGCAATTACGAATCTCGCACACCTATGACACACTTGGTAGCGCCGTTCTCATAAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGT:1 - chr3L 18145552 5' - Ivk 5063 1 62.38 GTTGTTTTCCCATTAGTGACAAATCCTCCTCGGCGGATCCCATCGAAGCCCAAAGATCTTTGCGTCCTGGAACACAAAACAAGCAAGAAAGAAAAGACAGC:1 + chr3L 17495313 5' + Osvaldo 1442 1 72.28 TGGTTTTAGCGGACATCCCNTGGCTTGGGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCAC:1 - chr3L 12043868 5' - S-element 1338 1 76.24 AGGCAAGAACTCGGCGTGTTAGTAAGGGTCAAAATCAGTGCTCGGGTACAAGGTCCACATATGGTCCCGTTAATTCACGGTGCGCCCTCTTTGCGCATGCA:1 - chr2L 22646250 5' - gypsy8 241 2 62.38 TTTCCTTCGACATCAGCGATAACCCGCAATTAAAGCCGGGCCAAATGATGATGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2R 18111528 5' - hobo 2919 1 59.41 TATTGCTAACCACCTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:1 + chr2L 21369848 5' + rover 6978 2 56.44 CGAAAGCCTTATCATCATATGATAGCGTTTCCAGAAAAAAATTTGACAGGTATACATATCTATACAGCAGTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1 - chr3R 12379372 5' - 1731 4620 2 68.32 TAATGTGTCTATATACTTAGCATAAGTTTATGTGCATGCAAAAATCAACACCAAACAGCACCGCGAACAAGCACAAAAGGGAGAGTAAACTAAACACAAGG:1 + chr2R 20125398 5' - Cr1a 204 1 77.23 GAGCATTTCGAGTGTGCTTCCAGGAGCGAATGCAGCTCGAAAACCCTCGAAACACACACAGGCACACACACCTCGCACATACACACACACACAC:1 - chr3R 18960776 5' - Stalker 446 1 71.28 GTAGACCCGATGTATTTGCCAAGCGGCGAGTTATGAGATCTCGTAAAAAGAAGGAAGACGTATTTAAATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 - chr3R 11814579 5' - blood 371 2 71.29 ACATTAAAAGATATTTTCATGCAATTCTTGTAATTTTTAAAACACTCAAGTGTATCAAAAGTAATTTGAAGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 - chr2R 18939203 5' + I-element 4 1 69.31 AGTGGTTATTGGCTTAGCCCCAAATTAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 + chr2L 12884328 5' + HMS-Beagle 6842 2 71.29 CAACATCCGTGGCCAAAAACGGATAGTGGTGCTGTGTTTGTGGCGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTATAGATCTCGTCGTCTACCC:1 + chrX 17689542 5' - G2 2809 1 61.39 TGGCGGTGGTGCAGCCCCTCTTGGTGATCGTCGATTCGTTAACTGTGGAGCAGGTGGGGATTTGAATAAATCATAACGATAATAATAATACTAATAATATT:1 - chr2L 8344092 5' + mdg1 42 4 82.18 CGGGCATAACGTTTCCAGGTCAAGTACATACAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chrX 18053804 5' + 297 6620 2 72.28 AGTTGAGCAGAAAAAATAGAAGCGAGAAGGACGCAGGGAAAAAGGACCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAAC:1 + chr3R 9116705 5' + jockey 475 1 54.46 ATAATCAAAACTAAGACAAAAATGCGGTATTTTATGTAATCTAGGTTTCATTGTAGTAACCTTTAGACATAGATCAACTGTGTAAAGAAAGATCACCTTGG:1 + chr3L 14282517 5' - I-element 5021 1 53.47 CAAGCTGATAAGCCCGATGGCTACGAATCTTATATTCCTTTCATCTTTATTTTATTTTTTTGCTTTATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chr3R 6238988 5' - jockey 4973 1 55.45 GCTCGTGCGCTTGCAGCAACTTCTAGCCCAAAATGAATGAATAAAGTTAGTCAGACAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAA:1 - chrX 22581842 5' + jockey 4639 1 60.40 TTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689420 5' - diver2 4466 1 56.00 TCACTTTTTTATGTTTGCTGGTCTTTACACTGCTCGTTCAACCATCCGTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTAT:1 - chr3L 13178273 5' - mdg3 5362 2 55.00 GCAATTGTTCTGGGTGAAGTGGGCGGCTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chrX 1157595 5' + 297 6604 2 57.43 TCCAAGTTCCAAGTTCCCACTTCACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAG:1 + chr3R 22196701 5' - G6 1772 1 77.23 AATTTTTTCGTGTGCATCCACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3R 22237032 5' + 297 49 2 79.21 GATATTTGGTATTCATAGCTGACAAAGGCGAAACGTGTGCCAAGCTCCAGCGAGAAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 12485385 5' + roo 8684 2 60.40 ACTACAAGTCATCTTTTAGCAATAACTATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGA:1 + chr2L 11846909 5' + diver 50 2 72.28 TCCACACAAATCAATTCAAAGTTCGTAGAATTTTACACTTCATTTAAAATTCTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCTTATCAGGTA:1 + chr2R 15648336 5' - hopper 943 1 54.46 CCCATTTCGCCGGCCAAACCCGCTTTTATTTTCCATATTTTTATTCCATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCACCAGCGAA:1 - chr3L 10882339 5' + GATE 304 1 54.46 AATCATTATTATTTATTTTTAGTTAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr3R 7134390 5' + blood 51 2 75.25 ATATGGACATTGAGGATACTGAAAAACATCACCACAGCCAGATTCCTTTGAAGTGTTCGTGAAAAAAACAGGGATAGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr3R 4555349 5' + roo 2 2 77.00 TTCTCAGTCAATATTGTTCCGTTATTGCTAACCACCTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTA:1 + chr2L 21369826 5' + rover 5 2 75.25 ACCAAGCGAAAAGTCTCCACGAACCGCAGCCCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr3R 31724797 5' - P-element 2840 1 32.67 GAGGCGCCCCTGTTGAGTGATGTGAAGTGCCTGCAGGCCGCGTTCTCAGGGCCGCCTGCGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:1 + chr2R 5813559 5' + HMS-Beagle 14 2 65.35 GTCTATAATTTTTTCTACATTTATAAGCTAGTACATATATTTATATTTTTATATTTAGTAAAACGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATT:1 + chrX 3431863 5' + Ivk 5326 1 37.00 CGTTACGAATTTATCTATATCAAACGCTCTAGTGCAAGGACGAAACACAGCTACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACAAAACACGATAC:1 - chr3L 24282605 5' - transib1 347 1 61.39 TCACAACATTAACATCCATAAATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 6399574 5' - roo 9050 2 61.39 TTGAAACTATGTTGCGTATTAAAGTAATCAAGAAAACGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chrX 20555764 5' - roo 9033 1 64.36 GAAAAACTAGTTCCCAGACTAGTTATGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGC:1 + chr3L 3713012 5' + Doc 4510 1 75.25 AAAATATATACCATGGGAATATAATGTGTTCAACTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAG:1 - chr3R 26240234 5' - Ivk 5331 1 66.34 TTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAACGGAGCTATGCTTCA:1 + chr3R 19045995 5' + gypsy11 4376 2 62.77 CCTATTCACCTACTCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3R 27605349 5' - opus 470 2 57.43 AGAAAAAAAAAATAATTTTAAAAAA:1 - chrX 20806231 5' - 1360 3092 1 88.00 GCGTTGGGCTCGTAATAACAGCCAACCGCAAAGGAGCACACACGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - 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chr3R 11547779 5' + G2 292 1 60.40 TTGAATATACCTCTCCTAGTAATACACTGCCCGTTCCTTCTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATT:1 - chr3R 4769554 5' - copia 254 1 75.25 ATTTATAACTTTTCCCATGCATTATTCGCCCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAA:1 + chr3R 24511439 5' + Idefix 7102 2 71.29 TTCACAGGCAACTTGATAGCCCCCCAATCCGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 17049926 5' + hobo 43 1 69.39 CGACGAGGCCGGCAATCAAAATAGACGATTAGTCATAGACTTTCGTAAGCTAAACGAAAGAACTATCCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTC:1 + chr2R 2928361 5' - Doc 4350 1 70.30 GAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGGATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGCAAATATCTTCG:1 - chr3L 6399540 5' - roo 355 2 71.43 TTCTTGGCGGCTGGTTCAAACAAGGTTAACAGATAACGTTGCTATTGCAATGCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAC:1 + chr3L 24296996 5' - 1360 409 1 51.49 ACTTTGGCCAGCCAGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAAC:1 - chr3R 5773256 5' - Stalker4 408 1 78.22 TTCCGTTCTCCATCCCCAGATGCTGTGCCATTGCCGCCGGCGGTGGTTTCGCTAGATAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTA:1 - chrX 7668729 5' - R1A1-element 5327 1 57.43 CGATTGTGTTTCATTGTTACATTATGTGTAGTTTTAGTCGATTTTTGTTGATCGCGGAGGTATAGAAATCTTCGAAAGATACTTGGTCTGCCAACACTGTG:1 + chr3R 18330958 5' - R2-element 3534 1 53.47 CGATAATCGCGCATTGATGGAAACATTTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAG:1 - chr3R 26294116 5' - jockey 440 1 73.27 TGCTGATTTAGTTAAAAAAAAATATAATGGTGCATCCAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chrX 23035836 5' - opus 7498 2 73.91 CTTTTGCACTGGCTATGTCCATTTCGGACGTCAGCTATTCCCAAATTTTGTAATAATCCACAACATTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAACAAACGC:1 + chrX 1173320 5' - Max-element 438 1 67.33 GCCTTCAATGGCCCGAATAAAGAGGATACAATCTTTGGTGAAAAATATCCGTTAAAAGCTTTAGTTGTTACTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 - chr3R 15523398 5' - 412 7545 2 76.24 TACCAGACTTCTTACCCATTTGCCATACTTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCT:1 + chr2L 20963477 5' - Bari1 1658 1 72.28 CTTTTAGCCTCATAGTCCCTATGAATAATCCCAGAAAATGTATAAAATTGTAAACCAGTTACATATGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCCT:1 - chr2L 5676172 5' - 1360 399 1 62.38 TGCTGCTTATCGCCTTAAGCGGCTGCTTCTCCTTCGATTATTTAGCTGCTTCCCAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chr3R 5264453 5' + P-element 23 1 57.43 GCACGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3L 2917029 5' + hobo 49 1 77.23 ATGTTGCATAAAGTACTTGGAAAACGCTCAGCTCATACCCCGGGGAGCACATCCATATCCATAACTGCCGTCCATAGAGCCCTTAACTATATCAGCAAAGA:1 + chr2R 21862179 5' + Ivk 403 1 68.32 CAAAAATCAAATGCTTCGTGTGTGTGCGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAG:1 - chr2L 17003264 5' + F-element 342 1 64.86 TAAAAGATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chrX 8308700 5' - opus 492 2 73.27 GGCTGACATTTAAAGTCGGTGGCATTGTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 + chr3R 11118017 5' + BS 11 1 57.43 TCGACCGAGGGTAGAGGCGGCGGAGGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTGGGGTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATT:1 - chr2L 6329608 5' - F-element 4426 1 69.31 CATCCCCATGGAGTCGCAGTCCCTTTTCTTGGAGTACGTATGGATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTA:1 + chrX 4235721 5' - Quasimodo 7342 2 57.43 TTTCGATCGACTGAAGCTCNTAAATTAACGTAAATTTTATAAGAGTCCGCAACTGCAGCCGAGATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATT:1 - chr3L 7100781 5' + micropia 5109 2 66.67 TGTTATTATTATTTTTTTTTTTCGCACGGGCCCCACCCCCGCACTTCTCCCCCAACCGACCGAGGGG:1 - chr2R 18877108 5' - Cr1a 4418 1 77.61 AACACACAACATAGTTTTCCGTGACTGATTGGGATTTCGGCCCAGTTTGGCAATCACCAGGTGTTCAAAACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATT:1 - chr3L 21275851 5' - HMS-Beagle2 308 2 54.46 TCTTTTGTATTCTATCTAACCCGAATCCTATTATCTTATACACAACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3R 15882658 5' + jockey 37 1 57.43 ATTCGGATCTGGGTTTTGCCGGCAAAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTT:1 - chr3L 10014071 5' + jockey 191 1 65.35 CATATATGTTCAAATAGAAATAAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2L 2622750 5' - blood 7335 1 75.25 AACTTCAAAAGCGGCACTGCCAACGTCCTCATTTGGAGCGTGTGTTGCCTTTTGTCGTTGTCGCCTCGAACCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAA:1 - chr3R 22864743 5' + G4 33 1 75.25 GAATAACATTTAAACGATACAAACATAAGTGAATAAATATTTGAAATAAAAACTATGATAAGTGAAACAAGTTTAAATAAACAAACTTTTTTCGGCTATTT:1 + chr2R 2602990 5' + diver2 4855 2 76.24 CATTATCTTAAGTAAAAATNATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3R 2425644 5' - 1360 3364 1 56.44 ATGATGTTTGGCTTCTTAATTATGGGTTTTACGTCCTGGTTGTCTTCACTTTCCATTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGG:1 + chr2L 3527596 5' - ZAM 138 2 51.49 TAGTCCACGATTGGTATCTNTGGCGTCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCA:1 + chr3L 8901464 5' - roo 8826 2 74.00 AACAGCAAATTGCCATTAACTATTGGAAAAATGTTCGCATTAAATCATTGTTGTTATGTTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACATGATTTTTTGGCC:1 + chr3L 22015566 5' + 1360 43 1 58.42 TGGGATCTTAATGGGTGGCAAAAGTGGCACCGCGTTGGGCTCGTAATAACAGCCAACCGCAAAGGAGCACACACGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:2 - chr2L 9488810 5' + hobo 2 1 71.29 ACGAACGTCGCATTGTTTATTCTCACTTAATATCTATTAAAAAAATAATCAATTATAGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 17098442 5' - roo 391 2 66.34 CATAAATAAAATCGGTTGAACATTCCGTTTAGTTCTCGCAAACATTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chrX 6451077 5' + pogo 27 1 56.44 AATTAAAAGATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 + chrX 8308697 5' - opus 7498 2 76.24 ACAAACCGATCAGATAAAAAACCCGGTTAGCCAGCGGTCAGACTTTCATCGTCCGGTACTCCCCCCTGTAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr2L 19567762 5' + pogo 1 1 57.43 TTTGACATTAGAATTTGTTAAGACACGGCTACTCGATCATGAAATAAAGTTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTGATCATAAA:1 + chrY 676859 5' + I-element 296 1 61.39 CAGATGAATTGACATATTCAGCTAACCATTTCGTGTGTGTTAACAACAATTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATATA:1 - chr3R 8845301 5' - hopper 1119 1 52.48 TATTAACTTCGTACATTAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACACGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAGA:1 + chr2L 17383314 5' + mdg3 5121 1 79.21 TGTGGGATGCCGACCGACATCGTTGGATAATTCGTAGAACCGATATGGAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 + chr3L 7099771 5' - 297 371 2 55.00 ATCTGCAAGTGAATCGAAACCGGCTGGCGCGCCTGGGACTTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2R 11664293 5' + Tirant 8120 2 63.27 CCAAACGATAGGCCAGTGATCCTCGTTCAACCCATACATTCGTTACGGGCCTCACTCCGTGCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 + chr3R 557165 5' - blood 363 2 61.39 GATCTGAAATATGGAGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr2R 6041648 5' - opus 7486 2 64.36 GTATAACTATATTTAGTTCTTTACAGGCCAACTTATTCTAGTATGCAGTGAAATAACAAATAAAAGAGCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 15773402 5' + hobo 6 1 71.29 GTGCTATATTATATTAAATTAAAATCGACAACTTTCCAGCGAAACTTAGCTTGAACCAACTTTGGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGT:1 - chr3R 12599376 5' + BS 8 1 65.35 GGGGGTAGGCAATAAATTGGAACAGTGATAATAAGCCCATTGATATGTTTACAAAACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chrX 17175257 5' + I-element 21 1 56.44 GCAAAAAAAATAGCAAAACTAAAATATATCCCAAAAATTTTCCTTAATCTCAACATTCTAGCTTTTCTAATATCTGAGTTCTCGACGTTCATACGGAC:1 - chr3L 20853211 5' - INE-1 133 1 59.18 GTTGCAGTAGTTCCTCCATTTTTTCCACCATTTTTTCACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr2L 16566283 5' + 297 29 2 63.37 GTCGTTAGAGTATAGTAAAGTCGAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chrX 21469009 5' + pogo 51 1 79.21 ATGTGCGTGTTATAACTGCCAAGCACACAGATACACGAATACTCGGGTACACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr2L 20268977 5' - hobo 2913 1 53.47 TTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGA:1 + chr2R 5617478 5' - invader1 405 1 71.29 ATGCCACGCCCCGAATGTGTGGTGTCCTGTAAAATTGTGAACTTTATTGAATTGCAAGCATTTTATTGTGTGTGTAGCTTAAGACTGACTTATTACAAAGG:1 - chr2L 9861019 5' - gypsy5 263 2 75.25 AACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTC:1 + chr2L 22699413 5' - INE-1 573 1 79.21 GCCTCGTGTTCATAAATAGTGAATTGCGTAATCTACCTTCCCATGGATGTAAGAATTTAGTAGTTATATATCCAGCGATTCGCATGTGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 7186681 5' + jockey 10 1 75.25 GCTCCAGCTTTCGCTTCTCATTCGCTTGGGTTTCGCTCACGGGAGATTTAGCCACTCCACGGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCATGC:1 - chr2R 8525537 5' - Q-element 210 2 66.34 CTAACTAGAGCACGTATGAAACCTAGTTTTGTAAACATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chrX 17175197 5' - I-element 5311 1 65.35 AGTGTCAGAGGAGTTGATCTTTTCTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2L 16164095 5' + pogo 51 1 84.16 GCCACGTGCCAAAATGTATTGCATACTTTGTGGCGCAGACAACAGCATGTTGCCACGCCCCCACGCCATAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2L 4057113 5' + jockey 16 1 67.00 TACTATAGAAGGCATTAATATATATGATAACCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr2L 16016244 5' + I-element 46 1 72.28 ACAACAAACAATTACAAGATAAACGAGATAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGC:1 + chr2L 8430458 5' + invader2 4952 2 56.44 TAGTAAGGCCAGAAATAAGGCATATTCTGCCCAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2L 13621964 5' + opus 7156 4 67.33 ATCTATCTACATATATACTACATTCAAGATAGTTTTTTGTTTGGCTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2L 15773312 5' - hobo 2905 1 55.45 CAGTTCACAATATTACACTAAGTGCAATAGAGCGATGTTCCATCTAAAGAGAAAATATGTGGCCAATATGGCATTTTAGTTGTTATTTTTTTTTTAATAAT:1 - chrX 16369749 5' + hopper 155 1 56.44 TAAATGTCCAACAGAAACGCTGAGCTCCAGCTTATTTTGTAACACAAATACAAACTGAGTGTCTAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTAC:1 + chr3R 22519552 5' - opus 390 2 68.32 TCGGAGTGATTCGAACGTGTAACGGCTGGCGGGGAAGAAAGCGTTCCGCCCAAAAAGGGGGACAAACATAAAAAAAAAAATAATACAAAAA:1 + chrX 15173705 5' - Tc3 79 5 89.01 CGGAGCTCCTGCCGCCGGTTGGCCCACTGCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCAGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGT:1 + chr3R 23292211 5' + R1A1-element 220 1 69.31 CCTGGGATTATGCAAAATTCAATTTGCAACTTAGATGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2L 897643 5' + roo 8705 2 70.30 GTGTATTCAAATACATTCGAACTATTTTCCGAACTTAAGATTTGGCACATCTACAGCTAAACGAACCGATTATTGCGTTCGCATTCTCACTAGGTGAGTAA:1 - chrX 713441 5' + INE-1 533 1 75.25 AAAAAAAAACTGAAGTAACTTTGAAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr3R 11814467 5' + blood 15 2 62.38 GGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chrX 19607312 5' + Tirant 26 2 55.45 CTATAAATATTTACCAAGCGATGTGCAGATGTGACAGTATTGAGCGGATGGACTGGTGGCCGGAGAGGACGTGGCCAGATCGGCTATTGATCCTGATCATG:1 - chr2R 10846451 5' - INE-1 89 1 66.34 CAGTAAGCAACTTGATAGTACTTGTTCGTTGAAAGAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATA:1 - chr2R 9761222 5' + X-element 56 1 68.32 CGATTCTGGCAGTGCAATAAGCTTAATAAAGATGTCACACTTTAAAAACAATGTATTGTATATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 - chr2R 5238012 5' + Doc 22 1 47.52 AATCCATACAATATTTCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGATA:2 + chrX 7794417 5' - Circe 6985 1 49.50 TAGATCACATAGGGAATGGCTGAATAGGTTTATTAGTTGCAGTTGCGCTGACGTTACTGAGGCCGCGTACGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCC:1 - chr3L 26306385 5' - gypsy4 6585 2 67.33 AAAAAATATATATTGTAGATAGTTTCGCTGACGAGCAGGATCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCC:1 - chrX 18127781 5' - jockey 4564 1 60.40 AAATTGCCTAGGTCTTGGCNTCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCC:1 + chr2R 5284578 5' - Doc4-element 2600 1 67.68 ACAGAAAATATACCCATCCTAAATAACTACGTTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTAC:1 + chr3R 8856921 5' + rover 6963 2 61.39 TGTTTCTTATAATCGAAATCAAATGCTTATTTTGAATTCAAATGTACCCACTTATAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTT:1 - chr2L 16456843 5' + BS 5015 1 53.47 TAAATTTCATGACGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3R 4191170 5' + 1360 31 1 66.34 CCTTATTTTTATTTTGAAGTTTATTCCTTTTTTGTTAAAAATTTAATTGTTTAACTATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:3 - chr3R 3629173 5' + GATE 8267 2 56.44 AGTGCGAGTCGGTATGGGATCACGTTTCAACAGATTCTACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATG:1 - chr3L 14960782 5' - flea 4855 1 60.00 CCCACTGCCAACTTTCTCGCACACAAATCAACATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGACTCTCCGGAGCAGCCAACAAGGAAGCCCTGCACCTCTGGAGG:1 + chr3L 9182554 5' + Gypsy6A_LTR 347 1 73.27 GAAATATAACGGATCTTTATTGTATTGTTGTTGCCTAAATCATATGAAGGGAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 - chr2R 5413491 5' + Juan 4050 1 55.45 GGGGGAGGAGTCGTGGGAATTGCAAGGTATGGACATGCGATCTGCCGCGTTAAAGACGATGTTATTGCCACCTGGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGT:1 - chr2L 22329032 5' + invader2 4775 1 72.28 GTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr2R 7889470 5' + jockey 56 1 72.16 GCTTACGCACAGCTTTGGAGATGGTAGATGGAACCACATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr3R 27605277 5' + opus 7149 4 64.00 GGCTTTCGGCTGGCTAATTGCCTTTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chrX 7970974 5' + P-element 43 1 26.37 TCACTTAACATTCCATAAGAAGCTTTCAACGTTACACACACAGCCGTACAACCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr3L 22327277 5' - hopper 1392 1 56.44 GAGGAGGATCAGGGCAAAGGCAGCAAGGATGAAAAAGATGCGCACAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAA:1 - chr2R 11870821 5' + jockey 479 1 56.44 CGCATTGCACTGCTCGTTCGATTTTGCAAAGCGCAGCTCCAAAAAAAAAACGTGTTTACACCAGAGAAATGCAAGGGGGGCACTTTTTTA:1 + chr2R 19616124 5' + hobo 8 1 67.78 CGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 + chr3R 24228864 5' - 297 6961 2 66.34 GAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 11832552 5' - roo 9018 2 75.25 CATAATTTCATTATTTGCTGCGTTCAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 29413082 5' + hobo 51 1 72.28 TCCGCTGCCCGCCCACCTCTCGGCGGCAGCCGTGGTTGTCGCCCAGCAGCAACACCACCACCATCAAGCTACCGCCATTTTGGAAGCAAAATGTGCGGTTA:1 - chr3L 17077323 5' + Chimpo 362 1 62.38 AAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chr2L 19907948 5' + Tirant 54 2 79.21 GCCTGTTCTGCGATTTTCTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 17587532 5' - Doc2-element 252 1 91.18 CCCACCTCTTATTTCTTGTGTTTTATTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 14301590 5' + roo 47 2 74.26 GTTGTTATTTCAAAACTGGTACATTTTCATTATAAGAGCCGTATTGTAATAAACCAATATATGTCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chr3R 7134343 5' - blood 342 2 70.30 AGCGGACCGGCAGCCGGAACCAGCAGCCAAGCGTCGTCGACCCAACAAAGAGAAGTAGGTAAAAACTGCAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTC:1 - chr2R 10532757 5' - jockey 4749 1 47.52 TATAAAATAATATTTTTTTAAATTTTTTTTAATATATTGCCCTTTTAAATATACGAATTTACTTAACCAAACTCCCGATCATTTCGGGACTTTACGTTGGT:1 + chr3L 4505361 5' - HB 239 1 59.41 TATTTCAAACCTTAACAACTTTTCAAATTTATAAGCGTACTTGATAAGTAGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr3R 5503336 5' - blood 7364 2 53.47 TTGCATACTTTCAGGCACTCGAAACAATTTTAGCCGCCATGCAAGCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3R 20154803 5' + jockey 37 1 52.48 TAAATAAACAATCATTGACCCACAATTCATGGCAGTTCTCATTTCCCAACTCTACACACAAAGGTCATCAAATAATGTGCCCAGACACATATGGGCTTACA:1 + chr2R 17439845 5' - aurora-element 4117 1 71.29 ACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACA:1 + chr2L 1201983 5' + Stalker2 39 2 64.36 GTTTGTGTGCGACGGGTCTAATGTCTGCGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr2R 15160283 5' + Tirant 17 2 63.37 TCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr2L 19907957 5' + Tirant 8152 2 70.30 GATGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr3R 29432752 5' + Transpac 4951 2 61.39 ACATTTACTACTTTTATGTGTATCTATTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 - chr3L 13204410 5' - I-element 5304 1 73.27 ATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCTACTGGAACAGGG:1 - chr2L 21272319 5' - Cr1a 3971 1 53.47 TACTTACATTTCGTTAGGTATTCTAAATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2R 9369842 5' - pogo 2057 1 74.26 TTATGCCACCCGGCAAATATTTAAAGAACTTCACACTCGTGATATGTGAACTCAACAGGGGGAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr3R 13441955 5' + 1360 2 2 71.91 GCTGACGGAGCACGATAGTCTCGTGGTGTGCCAATTGGTTAACTGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAAA:1 + chr2L 12095015 5' + Bari1 438 1 61.39 GACGCGCAGCTAGACGTCCNACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3R 19094221 5' - P-element 2829 1 20.79 GCCAATAACAAGTAACGCGCTAATGTTTAATTAATCGTTAAGTCCAGAACCCAAACAAACAAACAAACGGAAGACAAATATTTATTGTGACTGATCTAGAG:1 - chr3L 2872533 5' - Dm88 4523 2 78.22 AGTTGCAAACTAACAAATTTCGCTTCACCAAAGTTGGATTTCGTAAACTTTTGATTACAACTTTTAATCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2R 19355859 5' + jockey 12 1 70.10 TGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chr2R 5651902 5' + Tirant 8138 2 54.46 ATTCAACATGAGTTGACGGGGATGTATTTGGGTCCTAACACTTTAATGATAGTTAAATATTTTTTAATTTTATCCACCAATATCTATCGATATCCAAGAAA:1 + chr4 166163 5' + INE-1 498 1 65.35 TCCTGTTAGTGCTACGCACAGACTTACTGGCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACACGAGAC:1 + chr3R 18541221 5' + jockey 4570 1 62.00 ACTTTATCAATGTGCCCCTCGTTTCTGCTTTCCAAATGTTAACTGCCAAGGACGAAACGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCT:1 - chr3R 5190085 5' - I-element 243 1 68.32 ACAGCAGGGGGTGTATAAGTCCTCCTTAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 - chr3R 22237075 5' - 297 352 2 78.22 TCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGC:1 + chr2R 5284537 5' - Doc4-element 2639 1 67.33 GATAGACGGACGGACTGGCGATAAGGCCGTCGGGCGAAAACAAACTGGCACAAGAGGGCACAAATCATTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGATTA:1 - chr3L 8705132 5' - transib3 386 1 55.45 CTGGCGACCCCAAAACTAACAAAAATTAAAAATAGTCGAGCCAACGGGAAAAGTGGAGAAACCAAAAACTGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:2 + chr2L 17131510 5' - mdg1 7454 2 69.31 AAAGTTTAAAAGAAAAATTATTAAAGCATAGCCAACAAACAAACCGAGTAATGTGGAGGTCTCTATGGAAGCTTTCGCTGCGTAGATACCATGGTGCCCC:1 - chrX 23507995 5' - Doc2-element 4456 1 55.00 GGGCGTTTATGGCTTGAATTAAGGACTTTTATCTGGGCGAGTTGTTTTTGTTTTGTGTGCCTGTGCATGTGTTTTTTATTCAAAAAATAAAAATAAAAAAA:1 + chr3R 25773184 5' + R2-element 3584 2 51.49 ATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAATTTAATAGTTTAGTTCTGTTGGAGCTCTGCGT:1 - chr2R 1422497 5' - Porto1 4533 1 70.30 GCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGG:1 - chr3R 11547781 5' + G2 290 1 62.38 GAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 6399510 5' + roo 8708 2 72.45 GAGTATGAACAACAGGGAAAATTATTATGCACCTGCAGTGAGAGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTAGAGTTCTCAGCAGCAGTCGT:1 + chr2R 13715355 5' + flea 156 1 60.00 TTCTCATTCTTAAGAGCTTTCGTTAGGGCGCGTGTTGCTGTCTTCAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGCT:1 - chr3R 3190473 5' - Bica 4646 1 53.47 AGTTATTAAAATGTAGGTATGCAAAGATAATAACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chrX 15286489 5' - hobo 2897 1 65.35 AAAACCCTCGCCTCGTTGACACTTCCGCCTCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTAT:1 + chr2L 22011233 5' + R1A1-element 213 1 66.29 GGAGAACCTGCCGCTGCTGCAGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 10924219 5' + hobo 33 1 57.43 CACAAAATCAGTCCCTGTCGATGGCCAATATGATGGGATTTGTGAGATGCTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACC:1 + chr3R 24989435 5' - R2-element 3366 1 55.45 ACTTCTTCCATGGCTCATTTTCACCATCTGGAATGGGATTTGATCTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAA:1 + chr2R 23583922 5' - McClintock 221 2 56.44 TGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 - chr2R 5237868 5' + Doc 65 1 55.45 GCATAAAGAGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCC:1 + chr2R 20520195 5' + Max-element 8262 2 52.48 CTCCTCGCCCAAAGCGAGTGCAATGGTGGACAGTTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCC:1 - chr2L 8367131 5' - Quasimodo 221 2 66.34 CATACTTCCGTGGGCCTCGTATACGCAATATTGCGTAGCCGCCGTGTAGACAAGTGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTA:1 + chrX 9816229 5' + BS 4991 1 75.25 GCAACAAGCTGGAAATGACCAGGCAGCTCTAGATAGTGGAAATAAGTGGGGGGAAAACACAGGGTGTGGGGTGGTAACTCCTCCCTCCCCAGTTCGAAGCG:1 + chrX 8877376 5' - Tirant 8088 1 72.28 TATAACATGTCGGATAACATAGCATGTAACACGAGTACACAACAACTCTAAACAAAAACACTAAAAATATAAAAAACACTATATAAAAAACAAAAAAAACA:1 + chr2R 13249723 5' + transib2 2636 1 63.37 TAGTCTGGAAAACCTCAAAACTAAGCAATTTAGTAATTTTTTTCTACACAAATTAAGCAATTAAGATAATCACACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAG:1 + chr3R 5993248 5' + Tabor 5 2 74.26 AATGCATTTAAAATGCAATAATAAAAATGATAATGGCATTATAATACTAAACACAGACATGCCCAGCCCACATTCGCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 - chr3L 13632014 5' + INE-1 544 1 67.33 TTAACGAATTTTCGGTGACGCCACTAACTGTAAGTCGCACAAACGTTCAAATCTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 20425336 5' + roo 23 2 56.44 TTAGGTTTTGCAATGATTCCAAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr3L 8749937 5' + Doc 9 1 73.27 ATATTTTAATGGAGTTTATTGTGTGTCTTAAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 - chr2R 17248147 5' - I-element 5309 1 69.31 GCACATTATTTCACACACTTCTCCATTGATTTTCGACGTGCAGATAACGAAATAGTGGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3R 13686546 5' - 412 7525 2 55.45 TGGTTTTTTTTTTTCACTTTTTTTTTTTCATT:1 + chr3R 26213468 5' - Bica 337 1 78.12 CAACAGGTAATGGCCGGAATTCCAAGGAATTTTCTAAGGGTTTTTGAAATTTGTTAGTTTGCATATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAAC:1 - chr3R 8857035 5' - rover 339 2 72.28 AACGCTTCTAGCTGTTGCGAATTTCGCTACGATCGGTGCACTATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 - chr2L 12064764 5' + opus 7032 4 59.41 CAATTATAATTTCGGTATTTTCCTAAAATTTTTCTACAAAAAAAAATGGGTTTGAGATGAAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTT:1 + chr2R 11599761 5' - opus 121 2 40.00 TTGAAACGGATTTCAGCATTGAATTGCTGATTGCTCGAAAGGAACGGAGAGTAAACTTATTCAAATACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chrX 3334737 5' + 297 4 2 76.24 TCTTTGGCCAGGTTTCAATAGGTATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 - chr3R 7582678 5' - 297 345 2 77.23 AACTGTGGGGCAGGTGTTTTAACCCCTCTATAACCCCGTGATGAAAACTTTGCCAACGGCAAATAGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 + chr3R 26498498 5' - roo 9068 1 71.58 ACAAATGGAAATGACTCCCGCTGGTGTACTCGGGGCATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr2R 8528294 5' - Transpac 307 2 74.26 TCAGCTCGCGGAAGGATTCCATGAGTTAGTTTCTGAAGTTGCTGAGAGCAGAAGAGTTTAGAGTGGGGGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGAT:1 - chr3R 22380872 5' - Porto1 479 1 76.24 ACAGTTCCACTTAACAGCTACAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGAACATAAA:1 + chr3L 22220410 5' + Ivk 5002 1 77.23 CCAGTGCAGCTAACATTCCGCGTGTATCCAATCTTTTATACAGCGGGATGGGTCGTGTGTGCTTGCATGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTA:1 + chr3R 17291423 5' + micropia 5005 4 70.30 GCAACGTTTCGGTCACATTCCCTCACCAGCACACGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr2L 22586621 5' - 1360 3346 1 69.31 ACAGCAGCAACACCAACACGGCAACAACAATTGCACTCATTTATCATGCTTAAAGTTTTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 - chr3L 15777074 5' - I-element 5339 1 58.42 GGTAAAACTGAAGCTAGAAACTAGAATCATCCTAATTCTGGCCTGTATATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 18549988 5' + pogo 23 1 56.44 GTTTTTGATTGAGAAATATAAAGTTTGTTGTTTAATAACTTGTATGTTATCTTGAAGCTATTTTTAACAAAAAATTTTTTTTTTTATGGAAAA:1 + chr3L 11488997 5' - pogo 2025 1 83.87 TAGCCACTCGATTGGCTGAGCACGTTTTCTGGTTTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTC:1 - chr3R 28328737 5' + rover 7135 2 64.36 CAGCCATCTAACGTCAACATCACTGTTATGGATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCC:1 + chr3L 21275739 5' + HMS-Beagle2 6888 2 74.26 TTGCTGAAGAAATAACTTGATCAACAATTTTATAGCATAATTGCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 2424922 5' + jockey 36 1 51.06 TTTCCCGCTTCAATAGGATNGATTATATCCGTTCGATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCAC:1 + chr2R 19352174 5' + 17.6 5 2 71.72 GGAATTTATAATCTTGCATGACTTGAGGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr2R 10528369 5' - pogo 2055 1 74.00 TCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 8254804 5' - roo 356 2 76.24 TACTTAGCTACTAGGGTATTTCTTAAGCCTTTATCCCATGCAAGTAAGATTTATTTGCTCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGA:1 + chr3L 10552748 5' - G4 7 1 52.48 AAAAGTTATTGTGAATTTATGACAACTGAGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr2R 9061902 5' + jockey 4679 1 65.35 CGGCCGATTCTAACTTCCATGCTGACATTGTAATTCATTTGCTTGTGGCAGTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr2L 20394465 5' - pogo 2079 1 57.43 AAAAGGACTAAATCGGTGGAGAATTGAAAAGGCTAGGGACCACCTATTCGTGACCTCCACTTTCGCAAGCCTTCTATCAAAATCAATAGCCGAGTCGATC:1 - chrX 22638578 5' + INE-1 96 1 57.00 AGGTTATTTAGGCGCAGGCACTAAGTTCCCTGGCTGCTCTCATATTTTTTTACGATTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGC:1 + chr2L 9865956 5' - R1A1-element 17 1 57.43 ATAAGTAATAAACTTAAGCCCAAAAGTAGGCAAATACATTTTAATATGTGAAAGTAAAGCTTTGTATGCAGGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chrX 17284949 5' + jockey 4674 1 70.30 TCGTGGATCGCCTCTTGTTGACTCTGGTCAAAGATCTATTGCCTGCACTCACAGAAAATTATTGCCTAAGTTTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 + chr3R 23445542 5' - copia 251 1 73.27 TGGCGGGCCTGGTACTTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2R 11664317 5' + Tirant 40 2 65.35 GACGAAAAGGGAGAGGGAGACGGTGGATGGCGGCAGAAAGAGACGGCTACAGACCGAATATCATCCTCTCACCGTCCTGGTGCCTAAGCAGGGGCTCTGG:1 + chr2R 6775061 5' + Rt1b 238 1 52.00 TAGGCGACATCCTCCCCGGAAGTTGACAGCACATTGTTGGCAAAGTGGCCTTGCGCCCGCACTCCGATTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTTCCCT:1 + chr3L 12618988 5' + Gypsy12A_LTR 2225 1 72.28 AAAACTTTACATAACTTTATGAAATCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAAAAAAATAACAATTAAAAATTCACGCCCTGATTATTATAATTTTAAAGTTTT:1 - chr2L 22217426 5' - 1360 3059 1 72.28 AACAAGTTACCTTTACATTTGGCTTACACTTTTGTGTATTCGTTGAATTGTGTGTTAGAGTTAAGTGTACCGCATATATGTTCTTGATCAGGATCACTAGC:1 - chr2L 20436290 5' + INE-1 86 1 63.37 ATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCT:1 + chrX 21772492 5' - gypsy3 6548 1 67.00 TCGGGAGTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACA:1 + chr2R 17402689 5' + invader4 2765 2 73.27 GCACAGCGGTTCTAAGTCGGTCTAAAAATCTTTTTTTTTTACTATATTTTTTT:1 + chrX 17221473 5' - BS4 728 2 90.57 GTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTA:2 - chr3R 1844825 5' + Cr1a 150 1 67.33 TAACTGTGGACCTATCATAATTCTTCTAATATTTGGTCGGGTCGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chrX 2911262 5' - hopper 1385 1 56.44 TCCCCAAAAAACCCAAAAAAAAAACGTCCGCCGGAAGCTCCAACCCTTTCCCCCAAAACAAGAAAAAATAAACATCAGACACATTTATCAAATGTGTGGGC:1 + chrX 7677006 5' - INE-1 256 1 80.20 TACAAAGTTAAAACACTCANAAGCATACAAATGTACAATTCAACATTGTAAATATAAGTACATGTCATTACAGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr4 333600 5' + Doc 6 1 69.00 CTAACGGTAAGTTAACTCCAAATTGTATTTACATATTTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 - chrX 7405129 5' - S-element 1679 2 71.29 AACTTGATCAACAATGTTATAGCATAATTGCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAAGTAATTG:1 - chr3L 2424909 5' + jockey 57 1 65.35 TATGCCCTATCTGATGAGCCCACAATCTGTAAAATAAAGCAGCAGCCACTCCACCACCTGCCTCCCGATGTCCATACGTTATACATATACATGTGTATACA:1 + chr3R 22066723 5' - Stalker2 249 2 68.32 GATGTAGGGAATTGATATGGTGTCAATTTTGCAAAAACGCAATTCGCGTTGGCTCATTTTAGAACGATCGATTTGCTCGTTGTCTATTTGTTTTTCAGTTT:1 + chr3R 851483 5' - Doc3-element 177 1 63.37 GATGTGTAACGGGGTTGGTTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr3R 4164633 5' - HMS-Beagle 7013 2 62.38 AACTTTTCTTTGGCTTGCTCTCATTTTCCCACTATACTTTGCGCGGTTCTTTTCTAAACGAAGTTAACCAGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 9045845 5' + jockey 10 1 76.24 CGGTCGGCTGCACTGCCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGT:1 + chr2R 6482642 5' - gtwin 7385 2 73.27 CATCGCCGAAGCTTCGGTGGCTCAATTTTCGTGGCTTTCGCTACTGCTGCCGTCGGGGTGCCTAAAAATTGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGG:1 + chr3L 11759894 5' + Max-element 8114 1 67.33 CAATATCTCCGCTTTTCCGACCCCTTTGTTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 - chrX 2745953 5' + FB 48 1 73.27 GAGTTCATGAGGGCTCATGNTGCTGCATAAAATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 - chr2L 13622050 5' - opus 490 2 70.30 ACTTGAACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTA:1 - chrX 8027510 5' + Juan 15 1 64.36 GTCGCAATGATTCTCCAGAAGATCAAAACAAGAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTACTTGTGTAAGAAGACGGTTTTCTGGCCGAAATCAATTCTGAT:1 - chr3R 14274791 5' - 1360 3179 1 76.24 GATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 24766008 5' + 1360 4 2 75.25 CCAGTAGAGCGTGTTCAGTGGCCAATTGGCAAAAAAATCGTTGCCATTGATGCAGAACATATCGGGTACTTGACATAATTGTTAAATTTGATTGAATTTTT:1 - chr3R 8507902 5' + 1731 4265 1 67.33 ATTTACCCACGCTCCTGACCTTGGAATACTTGTTTTCTTTGTTTTCCTCGACTGTCTCAACCTTCTAGCTTTTGTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 + chr4 1089195 5' - INE-1 137 1 53.47 CTGCAGATGTTGCCTGAAAGAACGGCATATCACTTTCTTAATGGTATAAATATAAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 13710646 5' - roo 9048 2 50.50 ATACGGGGCTGTTCTCCTGAAGATCTTTAATTTAATTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTA:1 - chrX 18585009 5' - Juan 4168 1 72.28 AACCTGCAGTACGAGCCACACCGGAAAAGCAGATGGAAACTATGCCATTAGCAGGCCACGGGACTTGCCACCAACTCCACTGTAGTATATACGAACATAAT:1 + chr3L 20079671 5' + mdg1 7038 1 78.22 ATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATA:1 + chr2L 1201981 5' + Stalker2 7285 2 62.38 CGTACTTGAACATTTCCCACGTTGCTTTACACTTGGGCACTTGTTCGTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAA:2 + chr2L 16071082 5' - 412 485 2 70.30 TTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAAC:1 - chrX 983344 5' + Juan 3860 1 78.22 AATAACAAAATGAAGAGTCGGAGCCGCGTTCGCATTTGCGTTTGTGTGAATTTTCCCCGAAATTAAAA:1 + chr2R 20520962 5' - Max-element 8481 2 80.88 CAAAACTAGAGACGAACGCTTTGGCGCGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3L 13589608 5' - hopper 1372 1 69.89 AGGCTGGAGAAAGTTGGGCGGGTGAAAGAATGGGCAGAGAACCCTCTAATTGGGCCCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACT:1 + chr3R 9109262 5' + baggins 4967 1 69.31 ACGCAATCTTAAGCGCCCGAAAGCATGCTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 9287234 5' + jockey 15 1 69.31 CCTTTTACTCTACGAGTACCTGGTATAAATAGTACTTCTTAGGGTGCAAATCCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCTCCCGGACCA:1 + chr3L 25245600 5' + Ivk 185 1 57.00 CACTTGCGCACGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 2917022 5' + hobo 42 1 70.30 GTGATCGGGTATATATAATATAACGAAAACATACAAACAAAAGCACATATCACAAAAGTAGAGAAGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGG:1 - chr3R 2845198 5' - Doc3-element 395 1 71.29 AAATTCGAAAAGAAAACATAGGAATACAATCAAATGGAAATTTTATTGTTGTCTTAATATGTAGGAAATAATTACAATTATTTCTTTATTTTCTGTTATTA:1 - chr3L 12311000 5' - Doc3-element 75 1 36.63 TCATTTTTTGGCAACTGCAACGCATTTCTACACCCGATCGCACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAA:1 - chrX 1577432 5' - Stalker4 415 1 60.40 TGTAATCATTGCACGTCCGCATATGCTTCCCAGCAAAGCCTCCCACGCAGATATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTG:2 - chr3R 20892087 5' + invader4 2780 2 57.43 AAATCGAGTTGAAAGTAAAAGCAGCCCCATATATATATGTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 - chrX 4235878 5' + Quasimodo 30 2 66.34 TAATTCGAGTAGAGTAAACAGTAAACAGTGCTAGCTAACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr2L 5304767 5' + 412 7092 2 61.00 TTTGAGCTTTGCCTTAGGTCAGGCAGTGACCATTTGCCTTGGCCTTCCATGCGCGCCAGCCCACAATGGCAACACATAACAGGAGGCAACATAATGCTGCT:1 - chr3L 439039 5' - gypsy2 6350 1 63.37 TTTCCCCTTCCTTTTCTTCTAACGATTTTTCACTTTGCTTTGAAGTTGGTTTAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 - chr2L 9045693 5' + jockey 4705 1 61.90 TGATAATGAAAATCTCCGAAACTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr2L 20992981 5' + I-element 15 1 62.38 TAATTTTTTTTCTTTCTGGGTGGTTGACTTAGCCAGTTGCTTCCCTTTTTAATGGGGTTTGCGGTTCAGTTTTTTGTGCAGGGTTGTGTTCCTCAGGTACC:1 - chr2R 3206178 5' - BS3 1407 1 78.22 CCCCATCCGTGGGCGTCGCNGGCAAATTACCTAGGCAAAAGTTGTGAGCCCCAGAATCAACAAAGGCCGTTTGTCGAGCTCAAAGCAGCTGGGGTCGGAAA:1 - chr3R 31411416 5' + FB 4 1 74.26 AAGGGTATACTAGATTCGTCGAAAAGAATGTAACAAGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTAGATAAAGAACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr4 1541 5' + 297 3 2 71.29 AAACAGAAAACCATTCCATNTAATTTATTTGTGTTGCAGCCAGCCAAACTATTTTTATAAGTTTAGAATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr3R 17036532 5' - Transpac 307 2 70.30 GTTGGTATACGGGGCTGTTCTCCTGAAGATCTTTAATTTAATTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 - chrX 18585015 5' - Juan 4174 1 66.34 CCATACTGAAAGGGGTAATATAGGCAAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGA:1 + chr3L 17792424 5' + Bica 4688 1 74.26 AAAAAACACCAGGAGAATTGAAAGGAGAACCTGCCGCTGCTGCAGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr2L 10924196 5' + hobo 10 1 67.33 GCCTTCATTTGCGAATGAGCAAATAAGTGAGTTAACTGTAATTTCGGGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACAGGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3R 24464785 5' - 412 7523 2 52.48 TTCGGCGGTAAGCACGAGCAGCGACTCGAGAGCTCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGA:1 - chr2L 8249853 5' + Quasimodo 322 2 67.33 CCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:2 + chr3R 27071876 5' + jockey 36 1 50.50 TAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAA:1 + chr2R 20520210 5' + Max-element 29 2 62.50 TTACATTGAGGAGTCGAAGNGTATGCGGTCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr2L 9075569 5' + 297 26 2 63.00 CTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAAC:1 - chr3R 11547762 5' + G2 309 1 57.43 TTTTATTGGTAAGTAATTATTTATTGTTTAGTGACATATGTAATGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 25078818 5' + 1360 29 1 72.28 ACACATTGTGGCATTTTTGCCAATTCCTTGCTAGTCCCATTCTTAACGGGAATATCTCTATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAA:1 + chr2L 22497736 5' + R1A1-element 5145 1 65.35 CATGGAAATGGGTAAACGACCAGGAAACCCCATTCCTCCTTTTCCACACATCCCGCCCAACCGACCGAGGAGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCACGATTC:1 - chr3L 25191306 5' - Cr1a 4390 1 57.00 ATGTACATACTTTCTAACACGCCACATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTG:1 + chr3R 1944547 5' + Rt1b 4815 1 74.74 CAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:2 - chr3R 17897175 5' - hopper 1361 1 74.26 ATATTAGCACACAGTTTGCTGCACTTACTGTTACTTTTGGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2L 7714579 5' + roo 8700 2 64.36 GTGTTCTCTACATAATACGTGTGATATTGGATAAAAATCCAACATTTATAACATGGTAAGTCCTGTGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACG:1 - chr2R 10339599 5' - G5A 2642 1 71.29 AATGATTCCAAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr3L 8749948 5' + Doc 20 1 62.38 TTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 6104446 5' + pogo 29 1 52.48 CAGCGATGAGGATCTGATGGCGGAGACGACCGATGGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATT:1 + chr3R 6793755 5' + opus 7405 2 64.29 CTGAAAACGATACAACGTTGTTATTTCAAAACTGGTACATTTTCATTATAAGAGCCGTATTGTAATAAACCAATATATGTCACCAATTGAGAACACGTGTT:2 + chr3R 7134327 5' - blood 358 2 60.40 CCTTTTAAGTGGGTGGAATGCACAAATGTTTTTTCGTATAATAAGCCCTCATCGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGG:1 - chr2L 9073557 5' + 297 192 2 59.41 GTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTT:1 + chr2L 20360642 5' + micropia 4983 2 56.84 AATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTT:1 - chrX 983359 5' + Juan 3845 1 63.37 AGGCCCAAACTGCAGGCGGTACTGGTGGTGCTACTATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAG:1 + chr3L 13639927 5' - hobo 2643 1 65.35 CTTAAACATACTAGTAGATNTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 30284229 5' + blood 7060 2 75.25 CGTGAAGCAATCAAATCAACTGAGTCAATCGCGCTTTTATCAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr2R 13585660 5' + blood 36 2 62.38 ACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr2R 6074391 5' + 412 53 2 76.24 CTGCGAAATGTGCGTGCTGTCGCTATCGGTGACCATAACTCCTGGACGCCACCGGCAGCGCATCATGCTAAACCACCTGTTTTCATTTGTAAGGACCTGAG:1 - chr3L 7317439 5' + Chimpo 3924 1 63.37 TTTGTGGTGAAGTACTAAGAGAAAAAGTTTAATAGTATTTAATAAAGTATACATTTATTTGTATAAACCAAAATTCCAAGGCACTGGATAGTTTAAATAAT:1 + chr3R 4946502 5' - Tc3 1468 1 77.23 AATAGAATTATATAAATTATTTTCTTTTCCCAATCCCATTGTTTAGATTGCATAATATTAATTGTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 + chrX 10823935 5' + jockey 4773 1 62.38 AACGAGAACGGGAACGGGAACTGAGAACTGCACTGGGAGAAAAGTATAGTAAAATTAAATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 16171987 5' + pogo 13 1 65.35 AAGTAGATGCCATTGCTTGGCGTCACCCGTATGTACTGCATCTCGTCCAGTTGCTCAATTTTCATAATTCAAAGCACCTCTGAATCAGCTGAATTTGAAGG:1 - chr3R 15707246 5' - transib4 155 1 61.39 TAATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr2R 6041558 5' + opus 141 4 59.00 ATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chrX 19607304 5' + Tirant 34 2 57.43 ATATTAAGTAAATTACCAAAAGCAGGACACAACAAGTCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTGTATTCTCCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCAT:1 - chr3L 25059186 5' + Q-element 483 2 79.21 GAGATAACCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 20425422 5' - roo 9049 2 56.00 GACGATATTTTTTGTCACGNGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 + chr3R 1440150 5' + G-element 23 1 56.44 TGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGG:1 - chr3R 433138 5' - 1731 4597 1 51.49 AAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 - chr3L 9220160 5' + BS 45 1 71.29 TGGGTATTGGCGGTAACTGTTTGACTGCTGTGGTGAACTCGAATGCGGGTGGTGCGGTGGTGGTGGGTTGTTGTTGGGTGGCAACCGGGCGTTTGTTTATT:1 + chr3R 9542702 5' - GATE 158 2 54.46 AGGGTTTGGGCAATTCATCTTGGTTGGTAAATAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chrX 9439222 5' - roo 9033 1 72.28 TATCTCCTACGCTTGCTAANAAAAGAAGATCTTCAGGAGGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTT:1 + chrX 18584979 5' + Juan 12 1 52.05 ACTGTCGAAAAGGCACCATTGATCTATAAGATCATAGACGACGCTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAA:1 + chr3L 20501333 5' + HMS-Beagle2 478 1 46.53 ACTGGCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAA:1 + chr3R 18541246 5' + jockey 4596 1 59.41 ATACTGGTATATTTTGTTTGTTTGCTTAATGACTCGAAATGTTTATTCGTTTTCGTTTGGTAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3L 5512406 5' - pogo 2091 1 67.33 TGACACAAGCCAAACGAATNCACACACAGAGATGAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2L 1858316 5' - pogo 2069 1 63.27 GGAGGCGGTTTTGCCTTTTTTTTTTTATTTTT:1 + chr2L 3938673 5' - Doc2-element 245 1 84.38 ACACGAGGTAACGGTAACGGACAGAAAAAGCGAGCACGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chr2L 13549256 5' + P-element 35 1 42.57 CAACTTTTTGTTTCTTGTTGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTG:1 + chr2R 12209500 5' - F-element 4391 1 81.19 CCGATCCTGGTGTATATCCGAAGGATTTGAGGGCGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTT:1 + chr2R 10757322 5' - Doc 469 1 66.34 CATCAAAAACAGATTTTAGACTTTATTGCACGGTGAAACGCCGGAGGATGAGCTATGTACCCGTTATACCCACCTATGAACTCTTCACAATCAGTAGAGTC:1 - chr2L 21326818 5' + hopper 230 1 58.42 TCCATATATTCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 30284218 5' + blood 38 2 64.36 CGGATGGAGCGAGCGGGGAAATCTAATGTGCTGGGCGTGGCTTTGCATTTATTCGTGTGTAAAATTTTAATTGAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAC:1 + chr3R 15530022 5' + mdg3 5253 1 76.24 AAAAAATAGTAGCACCACCAGTACCGCCTGCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3L 13639947 5' - hobo 2934 1 74.26 CAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3R 27071867 5' + jockey 27 1 58.42 AAGTTATAAATATATAACAAAGTTCAGGAAAATTTTAATGACAGTGGCTAACATGAATTGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTAAGAGTCCA:1 - chr3L 18272549 5' + Cr1a 4060 1 64.36 TTAAACTTATAAGTGGCTGNGTTTTCCTCCCTGTGTGCGAAAAACACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAAC:1 + chr3L 19234485 5' + Doc 108 1 60.40 CAGGCCGACATTTTCTTATTTTTCGCCCCGTGACCCACATGACTGACACTTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGG:1 + chr3L 3969702 5' - Bica 4873 1 56.44 TACCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATG:1 - chr2R 14849017 5' + flea 4714 1 57.43 TTTTGTTTGTTTCTCCTTAAACATCTGACTTATTTTGTTTGTCAAAATTAAACAAGAGAGAGTTCTATATATTAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTT:1 + chr2L 22045353 5' - INE-1 553 1 59.41 AAAGTTATTTTTTTTTAAAATCCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCGTGTATTGT:1 + chr3R 8112590 5' + Stalker2 478 1 76.67 TACATCCGTATACATTGCATATATTACATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAA:1 + chrX 12210054 5' + accord 7073 2 73.27 GGTCAATATTTGTGCACTTTGGAAGCTGGGAATGATGAGACTGGGATGAGAAAGAGCTTTCTTACAACAGGAGGATGTCTATGTCGTGAAGCTCAATAAAA:1 + chr2R 9674590 5' - G5A 84 1 58.42 TTAACATCAAGATGCTAGCGTTGAAAGGAGCTGAGAATCTGTCAAATGAGGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 14132068 5' - roo 9046 1 53.47 GACGCATAAGTGGCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr2L 7991852 5' + P-element 63 1 19.80 TTACACTTGTGAGAAAACAACATTCAGGATAATGGCGAATGCATATTAATAACAAGCAGTAATATTTATTAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAG:1 + chr3R 8442672 5' - Doc 267 1 79.21 AGAAATTTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 6104452 5' + pogo 23 1 54.46 TCCCATGAGCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr2R 11699321 5' - roo 9032 1 66.34 ATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGATAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chrX 8308706 5' - opus 486 2 67.33 GAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:2 + chrX 21087563 5' + mdg3 5260 1 67.33 GATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATA:1 + chr2L 1201968 5' + Stalker2 7272 2 55.45 TTTAACACATGTGGGCTTTATAGTGGGGCTTTGTGTCTAGAATCTGTATTCTGAATATTAACCTTCTCTTTCCTGATATATCGACGTTCATACGGACA:1 - 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chr3R 9116520 5' + jockey 35 1 50.51 TTAATGGGCATTTTATGGCCAGAACTTGTGAATTCTTTTCCAACTGTCTGGTGTTCTTTTTTTTGCGCTCCGATTCCTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCC:1 - chr2L 4752561 5' + Cr1a 48 1 59.41 AGTACAACTAAGCAGCAGTCGTAGCAGGCAGCCGCTTTCTCGGTGGTTCGTGACGTGGAATGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 - chr3L 16129658 5' + P-element 15 1 64.36 ACAAACCATATGATTCTAGGATGCCATGCCAGTAGGTATCACAAGGGTATCAACCACCTGGTGGTACGCTGCTGGAAGTGCAACTACATTCTCCAGGCGAG:1 - chr2R 1069292 5' + baggins 86 1 66.34 TATAATTGGTAGAACCAGATTCCGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr3L 10283553 5' + Doc 84 1 76.24 CTTACAGCTCTATTATAATTTAATGTATAAGTTAACTACTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 2029755 5' + roo 38 2 68.32 GGAAAAGTTTTAGAATGTTTGGACAATGATGCCTAAAACGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 10063292 5' - roo 9036 1 63.37 ATTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACTGAGGGGCGCTGCCGTGTATAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 + chr2L 23244249 5' - Tabor 7318 2 73.00 GGCCTTAATTTTTAAAACAGGTTGATGCCAGGTATCACAAAGCGCAGAGTTGCTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAA:1 - chr2R 990870 5' + I-element 4950 1 60.40 CAGATCCCACCTCTGACAGCTGCGTGTGTGTGTGGGGATGTGGGGATGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATG:1 + chrX 2498177 5' - accord 210 2 54.46 GCAGTTGAGACTTTGGTATAGCTTTTAAATTGCATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGA:1 - chrX 17776635 5' - roo 73 2 74.26 CCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATA:1 - chr2R 6482751 5' + gtwin 19 2 60.40 CATTTTCTTTGTTATCCTGCTACGCTCTCTTCTCTCTCACTCACATTTGTAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACC:1 - chr3R 9460817 5' + McClintock 301 2 67.33 TAACCAAACATTAAAATCTATATTTCTATTGAGAAATCGTTTAGCCGCCGTTTACAGTAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 - chr2R 15166045 5' - mdg3 206 2 63.37 AAGAAAACTAAGGCAACTATTACTAAGAGATTAGACCCTAGGAGTAAATACATATCCAAGATATATGTTGGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATA:2 - chr2L 19725700 5' + Doc 4454 1 75.25 GGCGAAACGTGTGCCAAGCTCCAGCGAGAAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2L 12485411 5' + roo 8710 2 72.28 TACCTACAGTGCTAAATTTGTGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - 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chrX 4479342 5' - Rt1a 4665 1 58.42 AGCTAGGTGCTCGATGGTTAGGCGGAAACACTGTCGGATGTTAATGTTTACATTA:1 - chr2L 5346754 5' - Quasimodo 174 2 80.00 AAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGG:1 - chr3L 13142056 5' + F-element 426 1 62.38 TTTTCCACGTGGTTGCAATATACCAGCCGAATGTCATTCACTCGGTCAGCCAACCAGCCAGCCAGTCAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:2 - chrX 726380 5' + Max-element 8244 2 68.32 TAGGGACTTAAATACAACAAAATCTCTTCAAAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 5025621 5' - roo 9027 1 69.31 TAACTGCGCCTCCAGGTAGGCAATAGTATCGTCGTGTCTGTGATTGTGTTGCGGCTGCATAGATGTATGGGTCATTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 7605107 5' + jockey 10 1 67.33 GCTGCCAGGATCGAGATTAATTTGCGCCTCGAAAGGATCTGACGTGTGCCTGTTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr3R 30220263 5' - mdg1 395 2 52.48 GCATAATACTATAAAATGTTTTCTACTAAATTTGCGAATATTTTAATGCATCGCATGGTCCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr2R 6830752 5' + hobo 15 1 64.36 TAGCAGCAATGGATCTGGCAATAACGCCAACAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACAC:1 + chr3R 17388917 5' - invader4 2950 2 70.30 CTGCACTTACCACTAAGTTAAGATGTTTTTGTCTCCGCAGTCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCAT:1 + chr3R 29535162 5' - I-element 401 1 59.41 TTTTTTAGTTAAAATGGTTTGTTTTGTTGCTAAAGCTAAATAAATTTCACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGATTATA:1 + chrX 13865982 5' + INE-1 565 1 57.43 ACAGACCTAGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr2L 9724221 5' + 1360 52 1 77.23 TTTATGACAACTGAGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr2R 9061917 5' + jockey 4694 1 52.48 TTCTTTTGTGTCTTAGTAAGCGTGTAGCGCATTTTACCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 17098366 5' + roo 39 2 67.33 GCCCACTGACAAAACAAAAAAAGCACTGAACCAAATACATTTCCAATATCCTCCAATACAATTTCGAATAAACTATATTAAAATATTTTTTTTTTTATAT:1 + chrX 7494211 5' - Stalker2 7179 1 88.00 TATTGCGTTCCATCTTGTTGTGAAACTGGGGCAGCACGAGTTAAGTCCATGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr2R 5651839 5' - Tirant 357 2 69.31 ATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTG:1 + chr2R 5284536 5' - Doc4-element 2640 1 68.32 ATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGT:1 - chrX 21534510 5' + 1731 4448 1 69.31 GTAAACGGCGCACACACTCTCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACAT:1 - chrX 22386785 5' + hobo 62 1 52.48 AAAAAACCAAAAAAAAAGGAAAAAAATGGG:1 + chr2L 7875705 5' - hopper 140 1 86.67 GGCTTATCCTCTGCGGCAAATGAAATTAAATTGTCCTTTTTCATTTTGATGCATATCAGTGCGGTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGTTTTGAATGC:1 + chr3L 411385 5' - HMS-Beagle2 6764 1 66.34 TTACATAAAGCCGAAAAAAGTGTGAGAAAAAGAGAACTTGGCACATGTGCCAAGTGCAAAATGCAAATATCTGCATGTACATACACATGTATATGTGGATA:1 - chr3R 27571948 5' + Stalker2 251 2 74.26 ATTGTTTTACTTCCTCGTATTAAATGTCGGTGCCGGGGTTCCAGTGTGGTTGTAGGGCGTTATAGTGAGTGTGTGAAATAGTTTTTTTTTTCAAA:1 - chr3L 25843212 5' + copia 370 1 55.79 CAGAGAGAAAACACATTGTTATCTCCTGCATTGTAAGTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 - chr2R 20145137 5' - opus 464 2 65.35 TGGCACTCGCTCACATAGACTGTACGGTATCGCGGTTCATACTATAAACTTGTGCATACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTTTTTGAATCTAACTGACTCG:1 - chr3L 23452262 5' - rooA 7554 2 68.32 GATGTCATCGAACTATGGACAAGTTTCTTTATGGTACCTGGCCGTCAACCTTCTGGACAATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTG:1 + chr3R 16690844 5' + G2 2919 1 65.35 GTCCGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAG:1 - chr2R 14849006 5' + flea 4725 1 59.41 TTACCTGCTGCCAGGATCCTGCTTCCTGTGTGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGTGGACTGGCGTGGGAGCGA:1 + chr3L 11357072 5' - transib4 2347 1 68.32 TTTAGAATAAGCATAAATATACCAAACCAAAACTATAAAAATGAGGAGAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2R 4943242 5' - pogo 2078 1 56.44 AATCGGAAGATGCTCGAGAAGAAGTTTTGCTAGACGAGGACGAGAAAAATCTGGAGGAAAATGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACT:1 + chrX 11457135 5' + P-element 273 1 66.34 CCGCCCATCCAGTTGGCACATCCTTCACACGAAAAACGGAAAGTTCGGTAAAGATTTCACAAATTGGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCA:1 - chrX 10134822 5' - copia 4927 2 70.30 CATTTTTTCCAAAACAATATTAGCACCGTCTATGTTTCTCATCGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATG:1 - chr4 580583 5' + accord2 7516 1 57.43 ATTTCAACTGGAAGGCTACTGCTACTGGGATTGCGGTCTATACATGGCGAGTGCCCATGGGCTATGCAAATTATATAAATTCCAATAGGTCCAGAGTTATG:1 - chr2R 1922517 5' - gypsy 450 2 67.33 ATATATATTTTTTAATAAAAATCCACGTATGCCATACATGGTACAAAATTGCCAATTAAAAATATTACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTA:1 + chr3R 6646697 5' + Juan 15 1 67.33 CATGAGCTATGAACTCGGANTACACTCTATTCTATGCCTCTTTATTCCTCTCGTTTGGTGAAAGGCTCTTGACCACAAAAAACTACTTAGGCACTCCAGCG:1 + chr3R 17958757 5' + Stalker 6974 4 73.27 CCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGNTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 20425415 5' - roo 9042 1 59.00 AAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr2R 1373167 5' + pogo 50 1 74.26 GTCGGTTAAGATTCCCAGANTCTGATATGTCGCCTTCAGGGAAACAAAGTCATCATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3L 9697944 5' - 412 7525 2 56.44 ACCGCATTTGCTTAGAGACCAGCAAAGAGCGTCCAAAAAATAAAAAAAGGTGAAAAACAAACTATCGAAAAAAAATCTGACAAAAACAAAAAAAAATAAAA:1 + chr3L 14132059 5' + G2 3076 3 72.28 GATAAATTCGCAAAAGACAAAAAAGAAAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATAACAACCACGGC:1 + chr3L 10012120 5' - R1A1-element 5284 1 73.27 GGCAGATAAGAAGGGGCTGAAAAGTCTAGAAGATGGAAACTAAATGGATTTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTG:1 + chr3R 19264247 5' - I-element 4878 1 50.00 GTGTATTGTTATGAATCTTTTGGCATATTTCCAAAGTCAGGAAAAAAAAAACAACAAGGAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chrX 12854383 5' + Doc 82 1 60.20 TCCTGCTAGTTTGGCAGCTAAATGGTAATTATCAATAAGCAATATGTGATTATGTTTCGCGATTCCATTTAAATTTTTAAAATTAATATATTCCTATATAT:1 + chr3L 4734178 5' - Tc3 291 1 56.44 ACTTGTGAAAATAACTTTTGCACTTGAACGAGATTTCAAATGTGTGTTGCTGAATGGGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 + chrX 6627232 5' - Quasimodo 235 2 64.36 CCCAGTCAACTGCACTCGCACACAAAGTCAAAATTATATATATTCTTATGTGCTACGTAGCTATGTGCCTGCCTAGTGACTGGGTTTTGATTACGGCTT:1 + chr3L 9220072 5' - Tom1 117 1 58.59 AATAATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGC:1 + chrX 15189246 5' + Doc3-element 276 1 56.44 ATATATATTTTGCCACACAAACAAAGGCGGCAGTGGGTGAAGATTACAAATAATAAGATAAAGTCTATTGTAGACGGATCCTAATACTCTGTAAGGGTCAT:1 - chr3L 23481845 5' - Cr1a 4179 1 68.32 TTAACTTTTCACATTCTTACTTCCACTATCAGATAGCCGGGAAACTCGACTATAGCACACTAGAACGCCCAGAACTGCCACGCCCACACTTTTGAACAATT:1 + chr2R 5246672 5' + INE-1 254 1 56.44 TTTGAGAATATCGTGGATGNGTCGACGTAAATCATAATAATTTTTTTTTCTCCTTATCTTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTGTGACAATAAGTAAATCTTA:1 - chrX 20385810 5' - G4 3808 1 53.47 TAACGGGGAAAAAATAAGGAATTACACATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAATTTAA:1 - chr2R 1422524 5' - Porto1 4560 1 56.44 CTAACATTTTATTTAATATCCTACAAATACTGTGGAACATAACTTATGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 21931491 5' + 412 7082 2 55.45 GAAAAGTAAATAAAATTCATATGTTTTTAAATTCCATATATTCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:2 + chr3R 30284186 5' + blood 6 2 72.28 AAACAGCGTGTTTTCGGGTTCTCAGTGGACGTCTTCATTTTCAAAAAATTTCACTTGGTGCGGCGGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAG:1 + chr2L 3828062 5' + R1A1-element 5224 1 71.00 ATTTAGCGATTTCTAACGATATGTTTTTATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGT:1 - chr4 909202 5' + 1360 3217 1 78.22 GTTTCATGCTAGCGCTGGATAACGAATCACTTGGCTTGTAGTTAGGTTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTTTTAAT:1 + chr2R 22131138 5' - G4 479 1 61.00 TTCTCAATTTCAAAGTGTTCCAACAATATCCGAGTATGAACAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chr3R 5036597 5' + diver 36 2 58.42 ATAAAAAGATCATCATCATTGGGTTATTTGATGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chr2L 14981458 5' - hopper 1372 1 70.30 GAAACCGGCTGGCGGGCCTGGTACTTGGGAATTGTGTCGTCTCCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr2R 11664308 5' + Tirant 8138 2 57.43 AAGAAAATTCATCCATTACAATCACAGCAACAACGGCCAAAACAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGA:1 - chr2L 7160162 5' - pogo 1918 1 57.43 GCAGCAAAGTCCAAGCATCGCGATAGTCGGCCCGTTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCC:1 - chr2L 21356434 5' + diver2 4722 2 68.32 ACAAAAGCGAATTTCATTCNACATGTGCAGCAGTGTGTGTATGTGTGTTTTGTGTTTAGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chr2R 18879212 5' + P-element 14 1 64.36 GGCCGTAAGCAGGGCGCTGATAAAAATAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chrX 2912022 5' - pogo 2057 1 76.00 GTCAATATCACCGGCTTTGCTGTTAAAATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGA:1 - chr2R 4673381 5' - Quasimodo 7322 2 78.22 GGCCACTCGCTAAGGGATATTCGGCTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGC:1 + chr2L 13091148 5' - 1360 3087 1 75.25 CATTCAATGGAACCAACCAAACGAGACAAGCAGATGAGCAAATGGGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3L 5533551 5' - pogo 2073 1 58.42 CTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAA:1 - chrX 983355 5' + Juan 3849 1 67.33 ACGCATATGTATCTAACAAAGTCCGGTCTAACTAGCCACTCTAGCTAATTACTGATTAAACTACCTAATTGCAGCCCTGAACCCAATAAAATTTTGGCATT:1 - chrX 2692874 5' + baggins 5330 1 74.26 TGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGAC:1 + chr2R 4860117 5' - micropia 32 2 66.34 TTTGCGTTTTTTTCCGTTTTATTATTTTCCTTTTCTCCATTATTTTCATCAATATGTAAAAAATAATAACAAAACTATTAACAATGAACGAGAAAAACTAC:1 + chr2R 2959947 5' + S2 163 2 58.42 GCTGAAACCATTTTAATTAGTTCCCATTTACGTATCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 8254770 5' - roo 9054 2 59.41 GGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 + chr3L 2016885 5' + Tabor 46 2 67.33 TTGTTGCTGTAAAGTAGACTTCAAAAAGTCTTTCACTCCATTCATGAACGTATAGTATTTATATAATAAAATAAAAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAG:1 - chr3R 6239086 5' + jockey 4641 1 74.26 CAATGGCCCGAATAAAGAGGATACAATCTTTGGTGAAAAATATCCGTTAAAAGCTTTAGTTGTTACTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr3R 15523393 5' - 412 7540 2 71.29 TGTGTGTCTCTGGGTAAGGATTCTGTTTGTTTTATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 26350886 5' + hobo 37 1 68.32 GGTCACACCCTCCCACCTCGAAGGTCGTGAACTGCTGAAGCAGGCAGCGCGAACATCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATACA:1 + chr3L 4792270 5' - Stalker 457 1 62.38 ATCTATCGCTCCATCAAAATGTTTTATTGTAGTTAATTAGCATTCCTATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3R 13913025 5' - mdg1 369 2 74.26 CTGGAAAGAACATCTCCAGTTCAATATCTATATCCCTACATCCAGTGACGACCCAGAACGAACAAGGCACAAAAGGTAGAGTAAACAAAACACAAAGACGA:1 - chr2L 1012577 5' - Cr1a 200 1 70.30 GACAGAAAGGGACAGGTTCAAAGAAAAAAAACAACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAGCAAACACAAAGACGAAAAATGCAAA:1 - chrX 3125981 5' - Cr1a 190 1 75.25 ATATCTGTTTAAAAATACCAAAATATCGCCCCCGCCGATTCCGATTCGCTGGCAAACGAGCGAGTTGCCCACCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3L 5360129 5' + P-element 5 2 76.24 TACTTTTTTCATCGTTGTGGCGGCTATTCACAACGCCCACTATCTAATTGCAGCTCAAAGAAGCGGGGGGCGGAAAAATAGAATTTTTGAAATTTGGAAGC:1 - chrX 22488728 5' + FB 29 1 46.53 TTATTCACAAATATTAAGCTAATCTATATAAAAATACAAATACCCAAAAGACCAGCAAGAACTACGTATGCATTCCAGTGCCCAAGTAATACGACCTAACG:1 + chr3L 5738595 5' + Stalker4 146 4 71.29 AGCATTCTATCAATCAGCTTTCGTACGGTTAGCATTTACATATATTCGAACGATCTCTTGAACTCACCTTAATAAACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 + chr2L 10457125 5' + jockey 8 1 77.23 CCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 + chr3L 27415204 5' - transib2 2818 1 73.27 TCCCCATCTTCCTCCGTCCCTTTTCGACCAGACTCGTCTCGTCTCGCTCTACATAGCCACCAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 + chr2L 9521632 5' + P-element 16 1 63.37 GAGTAGCAAAAAATATTTCATTACAGCAATATTTGCTTTGCTCTTTTGTGCATATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - chr3R 4164716 5' + HMS-Beagle 6818 2 57.43 AAATTAATTAGTATAATGGTTTGCATGTAAAATATGTTCCGATGTTGCATACAAATAATACGTTATAGATCTACTCAATCTCCGACACGGCCTTCCTGACA:1 - chr2R 1369289 5' - invader4 2746 1 55.45 TATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTATTGTTACTGC:1 + chr3R 25796041 5' + BS 5050 1 74.26 TGTAAATGGCTGTAACCCGCATTATGCTCAAGGAAAATTTCAATATTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 14164172 5' - roo 9042 1 56.44 GTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3R 9116498 5' + jockey 60 1 73.27 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 19450188 5' + roo 8721 2 53.47 CTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:2 - chr2R 5651910 5' + Tirant 23 2 58.42 TGGATAAGATCAAATAAATATAATCAAACTTATAATATATATGTATAAGTTATTGCTCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr3L 21275767 5' + HMS-Beagle2 6916 2 58.42 GAAGCATAAGAGATTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2L 19698505 5' - hobo 2908 1 62.38 CAACCTAACCAACTGCTCGGGAAAAAGGGGTAATGTTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAAT:1 + chrX 4486800 5' - gypsy7 272 1 65.35 GGAAAATTTGCATATGTCTAGTAAACTGGGAGTGCTAGCCGCTTGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chrX 9828441 5' - Tirant 8479 2 55.10 GGATAGCATCCATTAAGATTTTGCGCTGTTTTAGCTTCCACTTGCGACCCGATTCCTATTTTGTGTTTGCCGAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTC:1 + chr3L 10011553 5' + Cr1a 69 1 59.41 GACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAAAAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCA:2 - chrX 22386792 5' + hobo 55 1 61.39 AGAAGTAGATCCGGATACAGGACCAACCACCGAAAAGGATGCGATAATAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATCTGAC:1 - chr3L 22490278 5' - GATE 427 1 58.42 AAGAGTTTTAGCTATTTAGNTGTAACGCCGAGTTCATTTAATGTTTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3L 27423357 5' + blood 7041 2 52.48 TTAAAAAGGCAAAATGTGGCTTTTATGACCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3R 7599093 5' - mdg1 374 2 72.28 GGGCAAATATTTAGCTGTGCGCTTAATGAGCATAAAATAATTAAGGCCGCATTTAATTTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 1904147 5' + hobo 15 1 64.36 TACCGCCTGCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr3L 13639926 5' - hobo 2913 1 53.47 TGCATCAATAATAACCCTGAAACGGTAGAGAAAATCTCTTAATGAACCATTATTAATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2R 13248806 5' + 297 11 2 69.31 CACACAGAATCCTCCCACTTCCCTTTCTCCCCAGCTGCGTCTTAAGTATTTTGTAAAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr2R 20441308 5' + I-element 19 1 58.42 ACCCAATGTGCAAAAAAGGAAGCTGAGGGGAGCAAAACATTCAACCGAGAAAAGCAAGCCGAGCAGATGCACTTGAATCCAACAGAAACGGAAAGCTTTTT:1 + chr2R 4161843 5' + Idefix 7178 2 68.32 GATAGATGCAAAACGTTAANCAAACGGTAAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCACAGTTGGCATGTCGTGGTTTTCGGTCATGACGCGCTGCCTCTGCCCG:1 - chr3L 26022039 5' - Osvaldo 474 1 51.49 CTAAATTTTATTTGCAGAAATAAGAGCTCGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 7463292 5' - hobo 2893 1 68.32 AAGGTCATATAAATATGTATAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 18883809 5' - roo 356 2 77.23 CCGGTCGCAACCTTCGCTTTTCCACCTTTTCCGTACATATATGTACATATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chr2R 12343961 5' - Burdock 228 2 58.42 GTGAGACCTTAATCTACTTCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 + chr3R 26349633 5' + hobo 77 1 80.20 AGAGGGGAAATTTGTTTTCTTCAGGATTACTGCCACGCCCACACATTTGACATTTTATAGTTTTTCATATTTTTATTAGTCTTGTACATTTCTATCGATTG:1 - chr3R 31690058 5' + INE-1 302 1 78.22 AATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACTAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTTATAC:1 + chr2R 545172 5' + Stalker4 7109 4 71.29 TCACGGTGCCGATGCCCCANCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr3R 27605330 5' - opus 451 2 76.24 CTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAA:1 - chrX 20999582 5' + BS 21 1 52.48 AATTTGTGTATTTCCTTTTAAACATAATTAACTTATAAATAGTGTAGTTCCTCAAATTTTGTTGTCTACCTCATCAAAATGGAACTTAAAGGTCAAGGTAT:1 + chr3R 1146426 5' + transib3 272 1 75.25 TTAGCCTGATTCCGAATAACTGGATCCACTTGAACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chrX 10702392 5' - roo 8999 2 67.33 CTTCAAGCAATTATATTGCATAATATTGTATTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr2R 20821398 5' + 297 32 2 70.53 TCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr3R 24228950 5' + 297 6615 2 65.35 GTCACTGCACCTCTGACGCATAGTCCGTTGTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 + chr2L 19410938 5' + I-element 5141 1 70.30 CATACTCCGTTTTTATGTCTAACCAATCGCAGAACGGCAAAGGCCAACACTAGTTATGACTTATTCATGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr2R 16580459 5' - pogo 2094 1 69.00 GTAACGGTAACGGACAGAAAAAGCGAGCACGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr2L 13549263 5' + P-element 42 1 35.64 AATTGTAACATGATGTGAATAATTCATGGGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2R 10167819 5' + opus 151 4 70.30 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTGTGCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr2R 1982172 5' + jockey 4688 1 60.40 ACAATTATGAGCTTAAAGGAAAATGTTTAAAAAGTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chr3R 12101098 5' + Burdock 38 2 66.34 GGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3L 14311477 5' - roo 356 2 76.24 TGTACCACCTCCCCCCGCCCCCCTCCCTGACCATTTATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGGGCTGGATTAGAC:1 + chrX 2511577 5' - F-element 4491 1 63.37 AACAACAACTGATATTTTTGGGGGGCAGGAGTGCTCCGACTGCATCACCATCATCAACCGACGGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAA:1 - chr2R 12701871 5' + I-element 205 1 67.33 AGTAATTATTTATTGCTTTTAAAAAAATTTCAAAATGTAAAAAAAATCTCAAGTTTACACAAGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 - chr3R 14228111 5' - Transpac 5219 2 70.30 GCTCAACGAATCCGGCAGATCTGCATGAGAAAGCCGCATCTAAGGTGACTGTCATTAATAACTTTATGCCACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 + chr2L 9820307 5' + G2 3076 2 65.22 TAAAGTAAAGAATATAAAGGATCACTGGCTGAAAAATGTAATAAAGAGAGCTGTTCCGATCTGATCTACTATATGTACATGAATAGTTGTGATGCCTCACT:1 - chrX 6854476 5' - diver 224 1 76.24 ATGATGTTTTGCATTCATANGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chrX 8308733 5' - opus 7462 2 68.32 TGAGTCGTCTTTGGTATAAAATCGGCTGAGTGTACCGCTTCCTACTAATTAAGCGGCGTAAATAAGTTCTCGTCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATG:1 + chr2R 8310609 5' + Doc 4509 1 72.28 TTTGTTTTCTGTTTGCCGGTTTTCCCATGACCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 11699343 5' - roo 9054 2 57.43 TGCGGCTGCATAGATGTATNGGTCATTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2R 7605061 5' + jockey 60 1 75.25 TGTAAAGTCTCTGTATTGGGGTGGCCAGGTAAACCCTTTTATCGTTAAGATTTGCCTAAGACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 21199211 5' - roo 395 1 65.35 AAATCAGAGATTCGATAAAAACGAAAATACGATGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 + chr3R 29432722 5' + Transpac 2 2 78.22 CTGTGGCGATGGCGTTCTCAACATCACGGGTCCCTGCGGTGTCATCAAGCTTGTGCGCGGCTATGTTGGCGAACAGCGAGGCATGGGAGCTGGGACACAGC:1 + chr3R 23897764 5' + Rt1b 4742 1 52.48 TGTTCGTCGGTGGAAAGCTGGGAAAATCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAA:1 + chrX 4073318 5' - Ivk 5139 1 74.26 ACTCCATTTTATCCTCTCCTCTTTTTGAAGTTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAGCTT:1 - chr2L 192672 5' + diver2 228 2 71.29 TCTAATGCTGAAGCGCAACTGTCAGCTGCTCGGGCCGTTCAAAAAAGCTAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr3R 10093760 5' - P-element 2860 1 52.48 AAGTCAGGCAAATGTCAAATTCGGGTGTCAAAGCTTGAGTACCAGTGGTTGATTCGGACCAATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 - chr2L 14981532 5' + hopper 16 1 61.39 GCTTCAAGTGGCAACTTCGGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 19607330 5' + Tirant 8 2 73.27 TCCTTTGATCGCTTTTGGTCTTTGCTCTTCCGCCCGCGCTTGTTTTCCACAGCATCAGGTGACTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAAT:1 + chr3L 6735678 5' - 1360 405 1 67.33 ATTAAAACCAAGCTGATGTTTACCTTACATTTATTTTTCCAGTGCCTCGGCTAAAAACTCCAACTTCAATAGCCAACAAATCATTTTTGGCTGCTCAAGTT:1 + chr3L 11369017 5' - Cr1a 487 1 70.30 TTCGATGCAGCTAAAAGTTTGCCATATGCGACAATATACTTATATTTATCAGCAGATATATATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3L 15390315 5' - 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chr2R 20389497 5' + pogo 33 1 62.38 TTGTAGTAATTGTTTTATGGCAGAAATTACTCAATCATCAAGCATAATTCCCTCGTTTTCGCCGTTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTC:1 + chr2R 9976950 5' - F-element 491 1 67.33 CCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr3L 25232909 5' + GATE 34 2 51.49 GCAGTCAACAGATTGTTGATGCTTCTATTTAAATATTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chrX 3967801 5' - pogo 2063 1 65.35 CGTTTGGCCGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr2L 12485458 5' - roo 9032 1 74.26 CCAGTAATCAACCGCCTCAGCAAGCCCCATTCCTCCAATCGTAAGCTTCCCCCCCCCCTGTCCAAAATGTAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAAACGACAAA:1 - chrX 12676812 5' + gypsy7 5013 1 90.10 TGTGCATTTGTCGTGGTGTTTATTTAAGCAATTATTGTTATTCAGCCATGCCATCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3L 10161726 5' + Doc 27 1 55.45 GAAATCCGTAGCGAGCAAAAATAGAAAATCAGTTCGTTGCATCTGGCGCCCAAGCCTAATTGTCCGGGCAAATGGAAAAATATCGCAACAAGCTACGTGCC:1 - chr2R 1028480 5' + Fw2 3730 1 76.24 TGCAAACTAACAAATTTCGCTTCACCAAAGTTGGATTTCGTAAACTTTTGATTACAACTTTTAATCACATCCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 19355862 5' + jockey 18 1 65.00 AAGTCATCGCGCAGCGTGCACTTCGGGTACGACGAGAACTGGAAGCGATAGGTGTCGCCCCTTCTCACACTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chrX 925695 5' - flea 231 2 78.35 AACGTTACCCCGCCAATTGACGGATTCTCTACACTTAGTAAATGTGTCAATTTTTTATGTTTTTTTTTTTATGTCGTTTTTCCTTATTTTTTTTTTT:1 + chrX 4364326 5' - Doc2-element 229 1 67.01 ATGTTTGCCCGCCGCAGCCGCGAAAAAATACGCGAATGTCCGAGGGTCAGCATTGATCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTA:1 - chr3R 11334695 5' - jockey 4671 1 61.39 AGAACAAAATATATGAATTACAGTAAATTTGAATAATACAAGTGTGCCATTTGTTCACATAATAAAAATTGTTGTCTAAGAAATTTGAATTTGAATTTGAA:1 - chr3L 14920471 5' - Rt1a 312 1 80.20 TAATAACGATAAACTGACACAAGCCAAACGAATACACACACAGAAATGAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr2L 1858302 5' - pogo 2080 1 58.42 AAATATGTGAAACAAAATCAATTCCATATATATCCAGGTGAAGAAAACGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGGACAGGATCAATAGCCGAGTC:1 + chr2R 2959565 5' + INE-1 92 1 53.47 AATTAGTTCCCATTTACGTATCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr2R 8254784 5' - roo 9040 1 60.40 GAAACTAGAAATCTCTGAATGAAACGAGGTTTTGTGCATTCTTACAAATATTACAAAAAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3R 6760985 5' + blood 7030 2 54.46 ACACACTCCTCTGGTGCGTTCGTCACTATGTCAACTGCCGGGCTATGCTTTCCATAGTACAGTCAAATAAATAAGAAAACTATGGATAATAAAACAAAGAG:1 + chrX 17504269 5' + Tc1-2 86 1 69.31 GCGGGGAAAATGGTGGCGTGAGAAAAAGTATTGCATACCAGCGGGCGCCTTGTTCCTGCGATGATCTCATGCCCACATACATCTACGGTCTCCAGCTTAAT:1 + chr3R 7886171 5' + jockey 499 1 78.22 CAAAGAAGTACCTATTAAAGTATAAAGATAATAATAAAAGAATACAATAACATATGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAA:1 - chr3R 1048072 5' + hopper2 1322 1 79.21 GACGTGTTTTGGCCACATCAGCCGCATGCCATCATCATCAAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAAC:1 + chr2L 9489522 5' - hobo 166 1 60.40 ATTAAATCATGACGATTTGACAGGAAGCCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGC:1 + chr3L 10281509 5' - Doc 411 1 74.26 CCGACAGGCCAATGCCGCCNCACCACCGCCCACATCGCCCACGGAGATGGCCTACAGCTACAAGAAATCCCAGCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGA:1 + chr3L 5647108 5' - invader6 4550 2 76.24 AATCCAACTCAAAGTCAGCCGAAAGGCTGATGAAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACC:1 - chr3R 28213338 5' + 297 6762 2 67.33 AGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCACTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAAT:1 - chr3R 25796076 5' - BS 5061 1 49.50 TATAGATAAAAAATAGGAAAGAAATGAACATAACAACTGTAATAAGGTCCCCAATCGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGT:1 + chrX 17106149 5' + HMS-Beagle 15 2 64.36 AAACACTAAATTAGCCAAAGGAGTCGAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 6399485 5' + roo 8686 2 57.43 GAAAAAAGTAACTATCGATGGCTTCATAGATATTGCCATATACATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 + chr2R 16068620 5' + Burdock 6164 2 61.39 CAATTTCTAGCACTCAAAACTGATAAAGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 19167955 5' + roo 48 2 74.26 ATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGT:1 + chr2L 21999743 5' - TAHRE 10407 1 61.39 GGGCGTGAAGGACAGACAAGGAGAGGAAGAGAAATGCCAATGTCAAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chrX 7971020 5' - P-element 2856 1 48.51 ATGGTATTGGCAATAAACCGAAACGGAAAATCTGTAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chrX 1157670 5' - 297 358 2 67.33 CGATCCCAAAGCATCATCGAAAAACAGATCAAAATCTTGAATATTTAATCAGCTCCTAGTGCAAAACACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGT:1 - chr2L 9723870 5' - 1360 173 1 68.32 AATTTAGTAATAATATTTAATAATGGTTATAGCTTGACTTGTTATTTATTTAATAGTGTTATCAGCTAGAATATTATTATAAAGGTATATTCTTGATCAGG:1 - chr2R 11141648 5' + INE-1 77 1 90.10 CATCGGTATTTTAATATATATTTTCGTCCTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCAT:1 + chr2L 13591820 5' - pogo 1823 1 72.28 GAAATGAATGCATGAAAAAGTACGAAACGGTAATGTGCAGTTGCCATGCAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 - chr2L 11537603 5' - hopper 1391 1 55.45 ACATATCATACCCATATTTTCATTTATACACAGTTAACAATCAGTCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3R 13686627 5' + 412 7084 2 53.47 TTTTCAGTTTTAGAGCTAATATTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGC:2 - chr3L 13142089 5' + F-element 393 1 71.29 AGCTATTACTTATTACTTATTACAACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGCTAG:1 + chr3R 16611514 5' - G5 4600 1 67.57 TCGATACACTGACACAAAGAAATGCAACATCAGAAATCTTACAAATGTTCAAATATGCTAAAAGATTATTTTTTGAAATTTATTTTGTGATGATATGTACA:1 + chr3R 2449118 5' - 1360 356 1 66.34 ATTATTATTTTTATTATTAATCTATTGATTTGTTTGTAACTTTCGCCTAGTCCTGACCTCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 3262646 5' - 1360 3372 1 42.57 TACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 + chr2L 1201971 5' + Stalker2 26 2 52.00 TTGATTTCCAAATTAAGTGGATCTTTTAATATGTTTGGCCTTTAGGGATTTCAATCTTAAATTGGACATATAATAATCCTTTAAAATTAAAAAATAGTAAA:1 + chr2R 10668372 5' + 1360 3028 1 59.41 CAGTATTTTATAGCCAGCTTTTTTTCGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 9121521 5' - roo 392 2 58.42 CAACTTAACATCCTTGGCCATTTATTTAAAAACTAAATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2L 16071189 5' + 412 7071 2 61.39 GGGCATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chr2R 8528262 5' - Transpac 5194 2 60.40 CATTTATTTAATTTTAATTACAATAAATTTCACCAGTGAAATATATGCCTAGTTAGCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chrX 19199029 5' + pogo 2 1 64.77 ACATTTGGATAGACAGATAGATACACGGCCAAAGCGACAGGCTGAGATACATATACTTGGCAACACGCACGGGATATGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chr3R 26350790 5' + hobo 2708 1 78.22 CATTAGAAAATTTTTAAACAGTTTTAAACTCGCCTTAATTGAAGCGCGAGAATTATTTGCCTTCGGTTGCTGGTGTCATCTTGTAGTCCTAGTGCTAGGAC:1 + chr2L 7170635 5' - G3 4409 1 56.44 GTTGTCTGTTGTGTATTGTTATGAATCTTTTGGCATATTTCCAAAGTCAGGAAAAAAAAAACAACAAGGAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chrX 12854393 5' + Doc 75 1 68.32 AACAATAACTGCAGCTGCTCATCACGCCCAACTTCTGTCCCAGACTCCTCCCGGATTTTTGTTCGAGAGCGTGAGAGCGAAGAGCGCTACAGTGAACAGCT:1 + chr2L 6263170 5' + 1360 122 1 60.40 CCTAAACTATATGGATATGCATATATTTGGATTGAACAAATTAAACTAGCTATTATAATTTTGTCGCACTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACACATGTA:1 + chr2R 13192390 5' - mariner2 277 1 62.38 ACGAGTAACAAAAAATTTCCCAAAAGTGTAGGGTTTGGCCAAAGACACTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 + chr2R 3919531 5' + 1360 40 1 69.00 AGTCGTCAGCATTCGTCACCTCACTTCCCTGGCAACTGGGAATTTATTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGT:1 - chrX 21273589 5' - X-element 4683 1 54.08 AACAATATGGTAATTTGCTGCCCATTATATGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCT:1 + chr3L 6983769 5' - Burdock 6134 1 70.30 CCCGCCCTTTAGCTGTTAGTCTTTGTTGCCGGGAAAAATAATTTATTAAAGTTTTCGTTTTATTTCTTTTCTAATCAAATCGACGTGAAGTCAAGTCGTGA:1 + chrX 12810542 5' + Gypsy12A_LTR 276 1 59.41 GATTTGCAGTGTGATTTCAGTGCCAGCAATATATATACATAAATATAAACATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 - chrX 5271392 5' - mdg3 224 2 55.45 GTCGAGCCATCAGATTCTATCCCATACCGCAATCAATCAAATCCCATCTAGGCACACATTCCGTCACATAGGGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr2L 10020869 5' - hobo 2936 1 75.76 ATCCTTCATCGGGAACTGCCTGCGCTTGTCAGGTGGGTAATGTTGCTTTGCATAATGTTATTAATTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 - chr2L 17003465 5' + F-element 86 1 71.29 AATACGTACCATCCGGCGGTATCGATCCTTTCTATTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTCGGCA:1 + chr2L 14882298 5' - micropia 280 2 66.34 AACTCACAGATAACCATCGCTAGTGTACGTATGTGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 + chrX 21939061 5' - HMS-Beagle2 7152 2 70.30 CCTCCTAAATGCTTTTCCACCCACGGCTATTGTTGTTGCCCCATACATAATATGTTCTTTGTTTATAACAACAGAGAGACGGAGAGACTCTGTAGACGTTG:1 - chr2L 4010129 5' + 412 369 2 75.25 ATGTTATAAAAACGTGTAAAGGGATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 + chr2L 21786719 5' + Max-element 8288 2 77.00 GAAAATTAATATTTAAACGTTTTAAATATTTAAAATAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 18719563 5' + TART-B 10632 1 87.50 ATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGT:1 + chr2R 19352209 5' + 17.6 42 2 70.30 GTGCAATATTCGAGGGCGTACAAATGGTTTTCATGTGATATTTTTTTATTTTTTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 - chr2R 11524529 5' - I-element 5320 1 59.41 CATCCACCTTGGCATCCTCGAGAGCCGTTAGCATAAATCATGAGCAAGCCTAGACCACAAGTTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCT:1 - chr2R 24591832 5' + F-element 4250 1 52.48 TATGTATATATATAGATATAGATATTAATAGTGATATCCCAGAAAAATTATGAAATATCGCGTTCACATGAACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGT:1 - chr2R 12595175 5' + INE-1 548 1 92.08 AAATCTAGAATTTTTAACTTCAGCTTACTTTAAAAAGCTTGTTACTTTGTTTTTTAAGTTTTTAAGTTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAA:1 - chr4 574480 5' + Stalker4 10 4 46.53 AATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAGTCACCGTTTAAATCACCAAATGTACCGAACATACAAGTCAACATTACTTTACTTTACATATTACTTACTT:1 + chr3R 16041116 5' - Stalker3T 44 1 82.18 CATAATATCTGACTTATTCTATATATTTTTCATTTAACAGAAACGATCAACATCGTCTGATGTATTGGCTTATATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATC:1 - chr3L 12683085 5' + gypsy4 6574 2 55.45 TATATCTTAAGAAAATATACATAAATTTCGAATGTTCTAAAATGGGAAATTCAATTTCGAATCAATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 + chr3R 17952911 5' + copia 11 2 65.35 CTGATGGACTCGATAGGAACACGACTGGATCCTCCAGCGGCAAGGAAGATAAGCAGTAAGTTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGC:1 - chr2L 15650206 5' + invader1 32 2 67.33 GGTTGGTTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 + chr3R 4164645 5' - HMS-Beagle 7001 2 74.26 TGACTGTGACTTTGGGCCATTGCCATTTGATTGCACGTGTAACTCAGTGCACTAATTCCGACGAATTTCATTGGGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 21425739 5' - transib2 2643 1 75.58 TTTTAGAAATGTATTCAAAATATGTCACAATGCATAAAAAGACTTTAATAAGTGTTGTTTTTATGCACCTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2L 8702880 5' + roo 3 2 71.29 CGCAATAAATATGAATAATAATCGAGCGACTCTGGCAGGAAAATATGAGGACCGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr2R 21454301 5' + hobo 21 1 57.43 CCGGCGCTCCCCAAATCCAAAAGTGTGCAAAATTACACAAAGCCAAATAAGAACAAAGAATGCGAAAAGCGGCCAACAAAGAAAAGCAAAGCAAAATAAA:1 - chr3R 7423417 5' + F-element 4672 1 75.00 CCAACCAGTCCACCAACTACCGGCGTTCTGGGTAGACCCGCCGCCAGCGACATACGCGACAACCCGCCCCCACCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTC:1 - chr2L 23369863 5' - invader1 3723 2 71.29 CCCCTTATCCCCGATTTCCNATCCCAATATATTATATATATATGAATACCCCTTCCTGAAATACAAAAAAAAAAGGGAAA:1 + chr3L 746957 5' + Bica 336 1 70.00 AGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chr2L 19907969 5' + Tirant 8140 2 58.42 ACAGACAATGAAAATGTGACGGTCAGTGAAAACGCTCAGCACCGGAGAGCAGAATGCGTGCCAAATTCATCTGCGCGTACACCAACAACAACTTCCGCT:1 + chr2R 979827 5' + Porto1 435 1 65.66 GAAAGTATATTAGAACGTCNAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAG:1 - chrX 21668102 5' + Tabor 5 2 73.27 AGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAAC:1 - chr3R 11547782 5' + G2 278 1 71.11 ACAGTCCACTATATCGTTGTTTAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCGAAATGTTTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr3R 19449960 5' + copia 17 2 62.38 TCGCAAATCTTGCGTAAACTATCTGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:1 + chr3L 25007952 5' - Transpac 223 2 76.24 TGATAATTAAGAAAAATATAAAAAGCTTTGCACGCCACAGATACTCCGATATATATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2R 7775437 5' + pogo 17 1 64.36 GCCTAGGTTCAATAAGTCACAGGGTTTCAATTTAAAAACACTGACTTTAGTAAATATTCGTTTCAAATATTTATTGTAACTGATCTAGAGTACAATATTAC:1 + chr2R 5581299 5' - Dm88 4512 2 63.37 AAAGCATGCTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr2L 9287215 5' + jockey 34 1 50.50 ATCATGAATACTATAGAAGGCATTAATATATATGATAACCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr2L 16016252 5' + I-element 29 1 60.87 GACGATTCGATTTGCGTCGCTTTAACTTTACTCTCGATTGAGATTCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:2 - chr2L 12801026 5' - hobo 2909 1 51.49 CAACGAAAAACGAGTGCAACAACCACAGCAGCTGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 - chr2L 12897021 5' - accord 7029 4 64.79 TTATGCAGCATAGATCCTACTTTCAATCGTGTGAAATTAAAGTTAATCAACATTCATGACGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2R 24242872 5' + hobo 14 1 66.34 ACGTCACAACATTAACATCCATAAATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 6399577 5' - roo 390 2 64.36 GAGCTCACACAGAATCCTCCCACTTCCCTTTCTCCCCAGCTGCGTCTTAAGTATTTTGTAAAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr2R 20441313 5' + I-element 14 1 63.37 AACAATGGCGACGCAGATAGCAAGTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 17307998 5' - hobo 2889 1 74.26 CTTACAAAATAGTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chrX 9020661 5' - hopper 151 16 81.82 AGAGGAAATGAGAAAAAAAAAAACTACAAAAT:1 + chrX 10124202 5' + gypsy11 3931 2 90.62 GCGAGAAAATTTTTCACACATATTGACTTTGGTTTCCATTTCGTGGGTTTTGGCCAGGTTTCAATAGGTATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr3R 7582724 5' - 297 6972 2 75.25 AAAAACTTTATTACAATTAGACACAAAATGTGTATAATTACGCCGCAGTTAAACATTATGATCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2L 7991907 5' - P-element 2876 1 66.00 TAAACTTGAACAACAAATTTTGAAAATTTAATTTATCCAATGCTTTAATCAGCTTTTAAGGAAAAAGAAATGGGTTACTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCT:1 + chrX 6185496 5' - ZAM 126 2 80.20 TACAATATTTGTCATTAAAAAACAGAAAGGCTAATTAATGTAATTATTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3L 5512506 5' + pogo 26 1 55.45 TTTTGGTTTGCCAATTGGAAATCTTGACTCTCTGCCGCTCCTAAAGCAATCAATTTTAAGTTTTATATTACATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTA:1 - chr3R 24699584 5' - Cr1a 4284 1 56.44 GATAGATGTTTTAATTTAANCTTTAAATTGCTTATTGCCAATGGAATTTGTGAGTTTTTCGCAGTGTAGGACCTGTAATTGCCCCAGTCGAAACTTGGGG:1 + chrX 2786791 5' - Gypsy12A_LTR 420 1 71.00 TGCACCACGAAAGATACTTNTCAATAAAAGCGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2L 7161358 5' + pogo 43 1 70.30 CCACTTGCGCACGTATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3L 2917021 5' + hobo 41 1 69.31 ACTGAGTTTTCCCAACGCGTCTAGAAACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAG:1 + chr2R 10778560 5' - 17.6 7076 2 74.26 AAAGTATGCTACATTTAATTTGAACTGCTCCGTTTATGTGCATGTGTGACTGCGCTCATAATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 26292622 5' + jockey 25 1 55.56 TTATCCCTGATCCCAGCCGAGAAGGAAACTTTTGCACATCCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 + chr3R 29374926 5' + mdg3 5262 1 70.30 CTGAGAGGAGGAGACAGACAGCGCAAGAGAATAAGGCAAGGAGTTGAACATGCAGTGAAAATAAATTAAAAACAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTAT:1 - chrX 22736235 5' + invader2 426 1 60.40 AGTTCATGAGGGCTCATGTTGCTGCATAAAATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2L 13622049 5' - opus 7492 2 70.30 GTCGCATACCCATCGACATTTGTTTTCTGTTTGCCGGTTTTCCCATGAGCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr2R 11699361 5' - roo 409 1 77.23 AATTATTATCCCATTAAGGTCATTGCTTAATTTGAGACCATCTTAAAATTGCAGCTGCAACGCTTTTCAAAAATGTTGTGATAGTCGGGGAAGTCGACTAT:1 + chrX 12190831 5' + INE-1 564 1 62.38 GAACGATCTAGTTAAAGCTTCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATT:1 - chr3L 17687838 5' + BS 52 1 79.21 TACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chrX 19607293 5' + Tirant 8152 2 68.32 CGCAGTGGCGTGTGGTCATTGTTGTTGCCCCTATTGCTACTCCACTTTTTGTTGTTGCTGCTGGTGGAGACTGCGTCGCTGATGTTGTTGCAGCTGGTCA:1 + chr2L 3483080 5' - TART-B 118 2 60.00 GGTGTGGATGTGCATGCGGCTGAGGTGCTGGTGGACGGTGCGAAACCCCAGAG:1 - chr3R 11950639 5' + Rt1c 5088 1 67.92 CGGGAGTTCCTGAAAATCCTCGACGTGCTCTTTGCCACCGGTCAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAAT:1 + chr3R 13634700 5' + Doc 4500 1 57.43 TTCCCCGATGACTTGTAGTGTTCTGGGCTCTTCCTTCATGACTTGGGGCATTTCGGATGCTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTC:1 + chr3R 17802517 5' - Doc 429 1 63.37 AGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGC:2 + chr3R 1440173 5' + G-element 46 1 65.35 ACCGTCCATTTGTGCTGAGGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 2505683 5' + jockey 15 1 70.30 ACAAGGTTAAGTGAAATAAAAATCAGTGAAGTGCATAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr2L 9969557 5' - hobo 2897 1 70.30 GAACAAAAAATAGTAGCACCACCAGTACCGCCTGCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - chr3L 13639951 5' - hobo 2938 1 78.22 CCACACTGACAATAAGCCGCAGAGAATGGGGGAATATTGTGCTGCACAGAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGA:1 + chr2R 20973022 5' - hobo 295 1 54.46 TTCGTTCTTTTTAAAATAGATTATGAAAAGGATATTTTCGACAGTCTCATGGCATTTTCTGGGGTTTATTTGTTTTTTTTTTTAGTTTTACTTTATTATTC:2 + chr4 993697 5' - Doc3-element 164 1 76.24 CTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTA:1 - chr3L 19339423 5' + Tc1 32 1 51.49 TACAACAATTTAACAGTCAAAATTTCGGGAAATGTAATCTATATGGCAGGGCCAGTACATGAAATCTTTT:1 + chr2R 16804156 5' - G3 4457 1 55.71 ACCAACTCCAGGGATTTCAGGCCACAATTGATTTATGAACGAGCCTCCCGATAAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGAC:1 + chr2L 20290747 5' - flea 4728 1 55.45 ACAACAAAAAACAGCTTTTCACCTTTTGAAAAATGGTTGTTACGATGACATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 - chr2R 18553880 5' - jockey 4958 1 57.43 GTTGCAACTTTTATGGGCGCCACAAAGTATGACTTACATCTCATCGGGTTGGGTATATATTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTCTGAAAGGG:1 - chr2R 13835561 5' - Ivk 270 1 68.32 AGGAAGAAGAAGCATTGAGTTGCTTTGTGTGTTTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGAT:1 - chrX 4293309 5' - I-element 214 1 67.33 TTTATTTTGTTTATTTTAACTTTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTT:1 - chr2L 6134739 5' - TAHRE 10381 1 86.14 AGGTATATTACGTATACGCAATGTTTGCTTAACGGCAGCGGACGGCGACAAAGAGATTAGAAATCGCACAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAA:1 - chrX 6389942 5' + Doc 4490 1 73.27 AATTGATGAATAGGCTTTATTTCTTGTTTTCATCTACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 19446732 5' + roo 50 2 62.37 GAACTCGACCAAAGGGTACGGCCAAAGGCACCAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATTCGATGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCATGCTCTCTCGAATTTTAG:1 + chr2R 5309092 5' + 1360 82 1 66.34 TCAAACTTGCAATACAATGTTTGACTGTAGTAAACGCCTTACACAAGCCGGAGGAAGAAGAGGACAAATGGCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCG:1 + chr3R 5284209 5' + Doc 4530 1 75.25 CGATGATCGAGATGCATTCGGTTTGTGGGGCGACTGCGGCAGAACCATTCCCTGCTGCTGCTGTCGCAAGCGCCGCTGTTGTTGTTGCTGCTGG:1 - chrX 16423544 5' - TART-B 154 2 48.94 GACTAATAAAAATGTCAAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTTGGCAGTTTTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCG:1 - chr2L 22063437 5' - INE-1 147 1 48.51 ACCTACCCAAAAGCCCGTCAGCTTGAGGATTGGATCGTCATGTCGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3R 17803050 5' + Doc 40 1 55.45 CCGCAGAGAATGGGGGAATATTGTGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2R 20973038 5' + hobo 33 1 71.43 TCAGAGATTATTGATTTTCNCGATGTTTTCCCTATTTTTTTTTTATT:1 - chrX 716390 5' - Bica 337 1 95.74 ATTTCTAGTTGTGTGTCAACTATTCTAATAGTTCGCGCTTGAGTGGGTCGGTTTTGGGTCTATGGTTCATGGATCCCACGAGTTGCAGAGAAATAAACGGT:1 - chr3L 21871587 5' - baggins 367 1 52.48 ATGATCCCTCGCTGCATTTGTTGTCTTCCTTAATGCAATTGGCCTAGGGACTCAGATTGTTATGATCAAATATAAAATTAACGACAGAATGCCGGAGTTGT:1 + chr2R 5542944 5' - gypsy3 176 2 77.23 ACTCGAAGCGACTGAAGAGGTTGTAATTTGGTAGGGGGCTGCTTAAATTTCATTAAATGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTG:1 - chr2L 7550809 5' - I-element 5123 1 62.38 CGAATGCATGGAACCAGGCTCTACTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2R 11699281 5' + roo 53 2 78.22 TTCAATTTCCCGAGGGCTTNAATGAGGGGTCTACTACATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr2R 13540880 5' + 297 6610 2 62.38 AGCAACCACAGGCGACTTCCACCACCGGGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCAGTTAGGTATTTCATATTCCATCCTGGAATTTATG:1 - chr3R 10448866 5' + Circe 360 1 72.28 TGCCTACTTTGCGGCTGCCTGCAATCACCTAGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chrX 15183798 5' + hobo 43 1 68.00 AACAATCCGAAGAATAACANACAAAAACAATAACAACAGTCTTCAGAAGACAACAAACAAGAAGAAGAAGAAGAATCTGAAGATTGATTATCCATTTCAAA:1 + chr3R 21583774 5' + hopper2 1354 2 77.23 GCTGAGGTCCTTGAAAATACCTATTGACCTGATAGCTTTCGATCTAGTTATCATATATAGATGATTAAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATT:1 + chrX 16891547 5' - accord 243 2 69.31 AACCACATTTCTAATTCGTTGCGTATTGTGTTTTATTTCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr2R 9369899 5' + pogo 35 1 63.37 CAGACAAGAACAATCAAATTAAATGAAAACGTGTCCAAAAAGAGTAGAACGAGGACCCTGACTTGGAATGCATTTGTTATTGTTCTACGGTTAGCTAGGGA:1 + chr3L 7473309 5' - Cr1a 4007 1 65.35 CACATGTCACATGTCGGTGCCACGCCTTTGTCTCAGCATCTTTCTGAATGCCTCTGCTTCTTGTACTTTGGGATACTTTGACCAAAGACACTAGAATATTC:1 + chrX 19022346 5' - Tc3 313 1 76.24 GTGGTGTGGCCAGAACGCCGGCAAGACGACGCTGAAAATGTTGCAGCTTACATTGATAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGA:1 + chrX 7794785 5' + Bica 4640 1 61.00 GCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr2L 19907960 5' + Tirant 42 2 67.33 CGGAAAAGAAAGCTAAAGAAATGCTATGGTGTGGTTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCA:1 - chrX 983378 5' + Juan 3826 1 56.44 GGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr2L 19907973 5' + Tirant 29 2 54.46 TTTGTTTGTTTGCTTAATGACTCGAAATGTTTATTCGTTTTCGTTTGGTAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3L 5512418 5' - pogo 2079 1 55.45 TTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAC:1 - chrX 21668074 5' + Tabor 33 2 56.44 AACATCATATAACATTAAAGTGTGAACTTCTTTATTGTGTACGGCCCGTCAAATCTCGGGGCCAATTTTGCCGCGAAACCTTCGGCTGCCTTTGACAGGTG:1 + chr2R 4886829 5' - Osvaldo 1330 2 78.22 TTCCGGATTTTGTCACTCCACGAAGTGCGTGGGATATAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGAT:1 - chr3R 18851057 5' + invader4 36 2 65.35 TCTAACAAATACCTACGTTGAATGTCCTTTCCCTGTGCTCTCTCTAATTTTCCCACCTCTTATCCTTACTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATA:1 - chr3L 10288600 5' + Doc 145 1 70.00 TTGGATGCACTCATGTCGCTCGCCAATCTCTCTTTACAACGCAACCATGCATACATTGCTTTCGTTTCGGGGCAATTCGATGATCGAGCACCCTTACCTTC:1 + chr3R 9793729 5' + Doc 319 1 74.26 TGTGCATTTGTCGTGGTGTTTATTTAAGCAATTATTGTTATTCAGCCATGCCATCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chr3L 10161726 5' + Doc 26 1 56.00 AAACTAAATCACAAAAACAAACACATTTCATTATTTTAACGTATTAACGCTTAGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr4 1043606 5' + Doc 34 1 47.52 GCGATGACGTCAAAACGAACGTCGCATTGTTTATTCTCACTTAATATCTATTAAAAAAATAATCAATTATAGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chrX 17098456 5' - roo 405 1 80.20 TTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGC:1 + chr3R 1440160 5' + G-element 31 1 51.52 AAAAAAGTGTTGCATGCAANTGCATCGACGACAACGAAAAACGAGGGCAACAACCACAGCAGCTGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 12897052 5' - accord 7033 2 75.51 TCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr3L 13639902 5' - hobo 2889 1 76.24 TCTTATGTTGACAAGACAATTTGCCACATACATAACATAAGACGTCAGTAGCACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr2L 10171661 5' + 297 16 2 49.50 CAATTACCAAAAATTAGTTCAATAATAGATAACGGGTGTATTTGGTTTCCATTTTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2R 15794678 5' + pogo 19 1 55.45 CTCGGTCCAAACCAGCAACAAAGTGGCTGTTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 14979197 5' - hobo 2931 1 42.57 AGTAGCACTGAGAGGGAAATACTTGGAAAAAAGTGTAGACAGGTGTCAGTTTTTTTGGAAGCTATAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3L 13704586 5' - opus 7494 2 72.28 CATGGTTGATGGCCCGGCCTGGTTGGTGGGCGTTCTCCATGTGTGTGTTGGTTGCCAGATCAGCGGTGCGATCGTCATTCGGCCGCGCGTTCGTTGGGCGC:1 + chr2R 23032460 5' + Rt1a 286 1 53.47 TTTTGCAAGGGCATAGGCCNAGTCTGCTACACAGAGAGAAAACACATTGTTATCTCCTGCATTGTAAGTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chr2R 20145168 5' - opus 495 2 53.47 CCAAGAATACAAGTTACCCGTACAATTTCAATATTTTGGATATAAGAAGAAAGGTGTCGGTGTCGCGTGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGG:1 - chr2R 24054438 5' - G-element 312 1 74.49 GAATCCCGACATAGCTGGGCTGGCGAGGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAA:1 - 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diver2 170 2 70.30 GATGATCGTACCTTCGGCACACAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3R 4712742 5' - pogo 2054 1 76.00 TTTCACAAAATGATTACAAAATTTTTATTTGAGAAACTGAACTCTGATAATTATTCTAATTTGATTGACGTTCAAGCCTAGGTATCGAGCTTTTCTGATAT:1 + chr2L 16630575 5' - Idefix 417 2 63.37 ATAGATTATTAAACTTGTTATAATTGGTAGAACCAGATTCCGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3L 10283535 5' + Doc 66 1 58.42 TTTTGTTTCCCAATTTTCAATTGTGCTGATCTGTTTAAACATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCA:1 - chr2R 5043355 5' - roo 9040 1 59.41 AGTAGATACAGACACTCAGATACTCGAGGAACACATGTTTTGAATGTCCTTATATGCTTTTCCTTCCTTTCTAAGCTTAAGAATTAACATTTTTTTCTCCT:1 - chr3R 31887138 5' - HB 376 1 63.37 GATATTTTTTGTCACGAGTNAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:2 + chr3R 1440153 5' + G-element 26 1 53.47 CTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 19450171 5' + roo 8704 2 64.36 GATTGCAGAGTTCACACACATCATATCACCACCAAATCGAAATATATATTTTGTATAAATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr2L 20495040 5' - Tabor 466 2 57.43 CCTGGCCCTGCCACGCCCATTCGCTCGACCCGCCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCACTCTCTCACTCTACTCACTTAAGTACAATTGTGATGAAAAGGAGCT:1 + chr3L 10034807 5' - gypsy5 458 1 63.37 TAAGAAGCTGGACCAGTGTTTGTTTATTTATTTACCTTCGGCTGTTAATAATTTATGTAAGAGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGT:1 - chr2L 2438245 5' - G6 1942 1 59.41 TAATTTTTATAACCGCACACACAGACACAACAATGGCGACGCAGATAGCAAGTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 17308026 5' - hobo 2917 1 57.43 AATTCCGCAGAAAGGGCATTGATTTTTTTGATTTGCTTTCAGTTCGGTTCGCCATTCCCCCCTTTTCGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACT:1 + chr3R 29194484 5' - invader2 4887 2 75.25 CAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 19450161 5' + roo 8694 2 74.26 TTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chrX 14979152 5' - hobo 2902 1 65.35 CAACCACCTTAACTGCCCAACTTCCCAGCAGACCAACCGCCACCTCCCATTTTCCCTTGGAGGAGCTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTCG:1 - chr3R 11270510 5' - gypsy3 421 2 51.02 TGCAGCATAAGGTCATATAAATATGTATAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18883817 5' - roo 9028 1 69.31 CCTAGTAATACACTGCCCGTTCCTTCTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chr3R 4769540 5' - copia 240 1 61.39 AATTTGGCTTATTTGTGGCCATTACACTGCTTTTTATTTTTTATTTAGCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3L 16873798 5' + roo 8692 2 56.44 AAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCG:1 - chr3L 10014047 5' + jockey 208 1 53.19 GGATTGAGTCACAGCATCTNGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 28447375 5' + blood 7040 2 50.50 TGTTTGTTTCGGCATAGACNTGCGAACTGGGTTAATTTTCTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr2L 20330095 5' + 297 6610 2 65.35 AAAACCCTGCTAGCGAATGGGTTGCGTTGGAGTAATTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGT:1 - chr2L 21772682 5' - 1360 3221 1 64.36 ACAACTTACTCCAATTTCTTAGCCAATCTTATCAAAAACACACATGCATAAAAGCAAAGATTAAAACAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr3R 5998906 5' - INE-1 551 1 66.34 AAGTAAATTTACTCATAGAACGATCTAGTTAAAGCTTCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTT:1 - chr3L 17687855 5' + BS 35 1 62.38 GATGAAGATGAATTAGTAATACTATTGTATTAAATATAACATTAAATATATTTACAAATTTACAAGGATGTATCTTTTACATATTTCAATATTTATTAGAT:1 - chr2R 14434642 5' - Penelope 153 1 79.21 AGATTTTTACGCTTTTTATTGGGAAATAAAGGAGAGAAACTTACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAA:1 + chr3R 5722517 5' + Tirant 8380 2 58.42 AAAAAAAAAGGGAAGCAAGTACAAAGCAATCTCGGCATTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCC:1 + chrX 10415113 5' - Circe 7105 1 58.89 TTCTTCTTCTTCATTCTGCCCGACTGTCGGCTTGTGTCGGTATTGTTGTTGTTGTTCTTGTTTCGCTTTTTTCTTTTTTTTGTTGCCTTT:1 - chrX 5607999 5' - G2 3069 1 82.22 TTAGCGAAACTAAACGGAAACTAAGTAAATCAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAAC:1 - chr3L 16138496 5' + hopper 947 1 69.00 CGATACGGCATATTAGTTATTAAAATGTAGGTATGCAAAGATAATAACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chrX 15286475 5' - hobo 2911 1 51.49 CCACGTGCCAAAATGTATTGCATACTTTGTGGCGCAGACAACAGCATGTTGCCACGCCCCCACGCCATAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2L 4057112 5' + jockey 18 1 65.35 CGGATGCACTTGGCAGTCTTTGTCGCGGGTAGAGCCTTCAAGCTCGACGTTTGAGTTACGGACCCGAGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGC:1 + chr3R 29122041 5' + R1A1-element 5264 1 68.32 GAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGGATCTATTG:1 - chr3L 25350810 5' - baggins 5403 1 55.45 GACTAGAGCCTCGCCTCCATCGGTTTCGATTTTCTTTTTTATCTTTCGTTGAAAGCCAATATATATCTGAGTTAACTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCAC:1 + chr2L 3494926 5' + 1731 2 2 77.23 TGCACACAATTACGCACAAAAACACACACGGACGCCCGCGTAAGCCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACT:1 + chr2L 14689058 5' - R1A1-element 5217 1 57.43 TCTCTCGGCTTCTTTGCCACTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr2R 19424122 5' + P-element 56 1 24.75 AGGCAGTGATCACCCGCCGGAGACGCGTGTTAAGGTCCTGCATAGATGGCCACATAGTAGTGGCGTCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCT:1 + chr2L 227422 5' - F-element 407 1 69.31 AAAAATAAATCATTTCGCTGACAGCCCGAGCACGACCGCCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGAGCC:1 + chr2R 22436980 5' + F-element 4544 1 62.38 CGAATGGCCACATGACGAGGGCGCCTATTCACCTACTCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTACATCA:1 - chr3R 27605372 5' - opus 493 2 74.26 GGGCAGGTTCATTAAACTCGGGAGACGCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGA:1 - chr3L 7587754 5' + accord 7189 2 76.00 GATTGGACAGCATTTACCGTATTTACATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3L 13639874 5' + hobo 52 1 73.27 AGAATATTCTTAGGCAATAAGTTAAAAAACTTATTGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGT:1 - chr3L 4922273 5' + jockey 391 1 66.34 GTCATAATTTCATTATTTGCTGCGTTCAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 29413080 5' + hobo 49 1 70.30 GCGCATTAATGTGCTTCACAAGGATTTGCGTAATTTGCACAATGTTGCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr2R 20973091 5' - hobo 2912 1 53.47 CTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chrX 8308727 5' - opus 465 2 62.38 ATTGCGAGCTTTCGCTTTTTGCGTTTCCATCCAGTGATTTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCA:1 + chrX 9977910 5' - blood 446 1 61.39 AACTATCGCTTATCCATTGACATTTTTAAATAGCCCAAGACTTCATTCCATTATCATGAACTAGATTTTCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:2 + chrX 1203166 5' - Transpac 5224 2 51.49 ACTGATTCAATTGAATCACTATTATTAAAGTTATTCTTCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 - chr2L 16866507 5' + Transpac 14 2 66.34 CGGCTTTCAAGTCAAGGCGTGGTTTTGTTTTTTTTTTGGTTTTTTT:1 - chr2R 12886821 5' - gypsy7 5009 1 67.39 ACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 - chrX 21668067 5' + Tabor 40 2 63.37 ATACTTTTTAGGGCGCTCTGTGGTTGTGTGTGTGGGTGTGTTTTCTTTTGGGATGACGTGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr2L 261692 5' - hopper 1396 1 58.42 CCGGGCCAAATGATGATGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2R 18111493 5' - hobo 2915 1 74.29 CGATTTCCCCCTCGCCACATCGGCATGTACGTATGTGGCTCCTGCTCACCTGTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCTGTACGG:1 + chr2R 9755967 5' + Cr1a 4384 1 58.42 GCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGG:1 - chr3L 13142054 5' + F-element 421 1 61.70 AACTACTGACAGCTATTTGGCAGGAGTTTAAAAGGATAAAATTTTACTGTGCCACCAATGGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr2L 3246987 5' - blood 7342 2 53.47 TTACAACAACTTTCAATTCATTTAATACCTTAATGAAGAACACAGTTACGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2L 16523791 5' - 1360 3360 1 56.44 AGTGAGTTAACTGTAATTTCGGGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3R 24464810 5' + 412 7106 2 77.23 GAATATTGTATTAGAACGGATATTGTATCTAACTGAAGATAAAGTAGTTATGCTTGTGATGCAATTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGT:1 + chr3R 17255918 5' - I-element 5344 1 64.36 CCTCGACGCGCCTTCAAACTGATTAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:2 - chr3L 1227343 5' + 412 51 2 73.27 CCGAACGAAAAACGTGCAAAATATGATTTCTTTTGCGGAGATTTTGACTTTATTCTCCCACTCTTGCACTTTTCAAGTATATTTATGTATATCAGTTTCAG:1 - chr2L 12459480 5' + 1731 149 2 74.26 GGCACTTGTTCGTGGGATTNTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr2L 16071117 5' - 412 7503 2 61.39 ATTGGAATGTTTCATAAAAAATAATTATATGCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:2 + chr3L 2016849 5' + Tabor 6849 2 68.32 TTAAGCGACTTTCGAAAGGNACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr3L 639565 5' + P-element 59 1 21.78 CAAATGACAACGGCAGCGACAGCCGGGATCCAGACTCACAGTTCCAGACCCAGACCCAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAAC:1 - chr3L 4729270 5' - diver2 160 2 60.40 ATTGCTTTTAAAAAAATTTCAAAATGTAAAAAAAATCTCAAGTTTACACAAGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - chr3R 14228100 5' - Transpac 5208 2 59.41 CATTGGACCGGCTCCCATCGATGTTGGGTTGTAGGGGATGCTGTCCTGAAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTT:1 - 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chr2L 19618674 5' - Transib5 2760 1 66.34 AAAATAAACCTCTATGCACCTATGAATGCCAAAATCTTGATAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACA:1 + chrX 8470320 5' + Cr1a 4311 1 60.40 TTCATTAAATACTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGATGTATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chrX 22382051 5' + opus 13 2 71.29 CATTTTACTTAAATTTTCCTGTTAGTGCTACGCACAGACTTACTGGCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTA:1 + chr3R 18541205 5' + jockey 4554 1 76.00 GCTCCTGTTGCAGTTGCAAGTGGCAAGACGTCTGAGCCTGTAAGTGGAGCAAGGCATTGAGGCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 + chr2L 13310228 5' - mdg3 232 2 56.44 TCTTTTCTTTCCCTTTGCCATTGTTTATTGGCTTATGCTTGGGGTTAACAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:1 + chrX 1048738 5' - Stalker2 375 2 56.44 GGAATGGGTTCAAAATTGGTAGTTACATTGTATTGATTGGGGATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTC:1 + chr3L 6982503 5' + Burdock 6159 2 56.70 CTGCGTTAACTTTTACAACTACAAGTACTTCGTGTTGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTG:1 - chr2R 10031679 5' + micropia 5031 2 55.13 AGGAGATTATCTATCCTTTTTCGAGCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - 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Quasimodo 7327 2 76.00 AGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr3R 19094235 5' + P-element 56 1 22.22 AGTCACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 28447381 5' + blood 7046 2 56.44 ATATGGAGTACTGATAGGAAATATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 20229389 5' + pogo 51 1 80.20 ATCTAATTGTTCAATTCTACCGCTTTGCCTTCCGAGATCTTGAGCTTGTATATATTTTTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTT:1 + chr3L 25255827 5' - Burdock 328 1 64.00 CATAAATTATTAATGATTACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAGGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTAGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3R 24464834 5' - 412 437 2 82.18 TTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTCTTGGAACAACCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACT:1 - chr4 456267 5' + Cr1a 4064 1 59.00 AACGGGGAAAAAATAAGGAATTACACATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAATTTAAT:2 - chr2R 1422523 5' - Porto1 4559 1 55.45 ATGATTGTTTTTTGTACTTAAAGCCCTTTATGGTAACTACAATTTTGAGATACATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGC:1 - chr2R 13467054 5' - hobo 2918 1 52.48 AGCAGCAAAATGGCTGCTTTAGCGCTTCCGGTTCTCAAAGAAGTTTCGTTAGTGTTTGTGTGCGTGAGCGTGTGTGTACTTTTTGTTTTTTTTTTACTTTT:1 - chrX 14451838 5' - Doc 4698 4 70.30 CTGGGTAAGGATTCTGTTTGTTTTATGTGTGCATCAGAGAACTGAAAGGGTGGCACTTTTTTATCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3R 26350877 5' + hobo 38 1 70.97 TATTTGCATACCAAAAGTTGTTGCCAACAAGAGCAAAATCATTTTGCACTCGAAAAAACACTCGAAGACTTGTAGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chrX 6129749 5' + jockey 9 1 52.48 AAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr3L 25059139 5' - mdg1 384 2 62.38 TTGATACACCTGTCGCGGTTGTGCAGCTGTTCCCGGGTCCATGGCATTCGGCAAGGATGGCCTCTTCTTAATAAAAGCGATATTAGGTCCAACACTGAGCT:1 - chrX 6580831 5' + G5A 2413 1 68.32 CCGTGACTGGGCATGGGCGGCGTCTGTCAGGTGCTTCAAGGCCTGCGGTATTTTAACGGTTTTGGGTCTATGGTTCATGGATCCCACGAGTTGCAGAGAAA:1 + chr2R 25072996 5' - baggins 375 1 65.35 AATATAACTAATTCGTAACTCACTTAAAAGCACAAAACAAGTTAGCGCCGAAATGAAGTCCCATCGGTTTTCATCCATTTATGTATGTATGTATATATATG:1 - chr2R 21198919 5' + G3 4508 1 34.65 CTGTCTGTCTGTCTGTCTGAATGTCTGACTGTCTGCGCCGTTGTTCCTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATC:1 + chr2L 15041068 5' - Bica 177 1 54.46 TTGTTTAGGGACCGCAGACTTATACCTTCGCCAACCAACTTAACCAAGAAGGGTTTTTTGTAAAGTTAAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGGCCAACA:1 - chr2R 3393390 5' - G3 421 1 49.00 CGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGACCGCGGAGTGGTGAAGAGCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAG:1 + chr2L 23506316 5' - Max-element 90 2 65.35 GCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAAC:1 + chr2R 21776307 5' + I-element 229 1 60.40 CATATCATACCCATATTTTNATTTATACACAGTTAACAATCAGTCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3R 13686626 5' + 412 7085 2 54.46 CGCCCAATCGGCGGGGGATGCCCTGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATAACTTCTTATGA:1 + chr2R 13597553 5' - gtwin 395 2 73.00 GAGGATAGAAAAAGTCAGTAACAGAGTTAGAAAGAAGTTGAAAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 11832506 5' - roo 401 1 73.27 AGTAAGAGAGCTAAAACAAATGCAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGAAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3L 14311510 5' - roo 9062 1 64.13 CGACTGCCTTTTTCAGATAAGCGTTTGTTTCGTAAGCTAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGCGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTG:1 - chr2R 19345470 5' - gtwin 7349 2 60.40 CAGCCAGCAGATACATCGATATGTTGACGCAGCCCTGGCACCACTGACGCACGAAGTTTGACAGCGAATCCATTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3L 16129548 5' + P-element 5 2 76.24 TTAGAGTGGGCGTGGCAATTTTTTTTTTGCGAAAGCATAGAAATCAACAAGACTAATAAAAATGTGACAACATATCAACTCATTTTTCAAAAGTGCGGGCG:2 + chr2L 18111232 5' - INE-1 255 1 69.31 TCTTTAATAAGTTAACATCGGCTCACGTTACAAATGCAAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGAC:1 - chr2R 19430529 5' - 3S18 6067 2 61.39 ATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCAATCTG:1 - chrX 158239 5' + INE-1 98 1 75.25 CCATGAGCAAGAAGTGGTTCCTCAAGGATCATCTTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2R 11699319 5' - roo 9030 1 68.32 ACATGAAGGCAGCGAACTTTGCGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGA:1 + chr3R 22863731 5' + mdg3 183 2 78.22 TTATTGCATAAAGTTATGTGTATATATATCATAAATCCATAACGTGCCATACACCCTCATTTTTGAAGGAAAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGC:1 + chr2L 11488683 5' + Quasimodo 6962 2 76.24 ACAGAGGGCTACAAAAATTGGGGGTCGGATCTGGATATTCTCACAATGAAAATCCAAACGGTGGTGGGAAAAACGTTTGCCCAACCATTATAATTAGTTTT:1 + chr2L 21190244 5' + FB 359 1 72.28 AAATGGGAAATTCAATTTCGAATCAATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 + chr3R 17952950 5' + copia 4918 2 75.00 ATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCA:1 + chr3R 4357545 5' - Tc3 1675 1 62.38 TTTATGCTCCGTGTGTACATTATAAGTAGGACCGAGATGATAATGTTTATTTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr2R 3163292 5' + opus 23 2 54.46 GTTGCAGTCTTTCTTTGAATGTGTTTTCGTTCACATAGTACTCCACCCGAACTCTGCAAAGAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATT:1 + chr2R 10340150 5' + hopper 943 1 66.67 CGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr2R 5237902 5' + Doc 31 1 55.45 ATTCAAAATATGTCACAATGCATAAAAAGACTTTAATAAGTGTTGTTTTTATGCACCTTGCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 8702868 5' + roo 15 2 59.41 GGAAGTGGTGCAGGAGAAACCAAGCTCTATTCAGCTGCTGGACGCCGGAGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGC:1 + chr2R 11235373 5' + 1731 405 1 54.46 AAGGATTTCGGCCAGAGATGAGGTGCGAATATCTGGTAGCTGATCCTGATCCTCTGGTACGTATGCAGGCTGTTCATAAGAATAGCAGTGTCTGGTTTTGA:1 + chr3R 18594341 5' + HB 218 1 67.33 CACGTTAATATATGTATATGCAGTTCGGGAACAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr3R 24976745 5' - opus 459 2 75.25 ATGTGAGCCTACCTGGTGTGGTGGCGAAATTATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGG:1 - chr3R 28547086 5' + invader1 3731 2 66.67 AACAAAATAAAAATTTTATAAAAATAATACGTAGTAGAAAATCAAAATTTTGGTAAAAAAAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAATTCCCGTGAGTT:1 - chr3R 26023164 5' + HMS-Beagle2 436 1 63.37 GAGCTGTTCCGATCTGATCTACTATATGTACATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATAC:1 - chrX 6854428 5' - diver 177 2 69.31 AGAGCACCTACCACCTCATNAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCG:1 + chrX 21772499 5' - gypsy3 6542 1 73.00 GCAGAGGAGATGATGAGGGGTGTGTGTACTGTAGCACACACATACATATATTTACCCCTAATAGTTGTCCTTGGACCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2R 18073209 5' - hobo 2936 1 74.26 TTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chrX 8308714 5' - opus 478 2 59.41 CATATGTGGCCAGCTGTATGTGTGCGTTGTGTTGAGTGGCAAGTTGTGTACACAGTGTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 9884346 5' - hobo 2921 1 53.47 GAGTAAAAGTAGCAAGTTACATTTTTTGGAAACTTTTGAGGTTGAACCATAAAGTCAAACTTAATTATATTTCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - 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chr2L 3733163 5' + hobo 43 1 69.70 TTTTTTGGAAGCTAGGAAATGTATGTAACGTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAA:1 + chr2R 19651193 5' + flea 4812 2 81.00 TTTATTCCCGGTAAACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGATACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2L 19907992 5' + Tirant 8117 2 71.29 GTGGTCCAGTCGCGCTTTTNACTGACTGCCAGTGCGTACATGTGTGGGTGAGTGTGTTCGTCGGACTAAATCACACACTGCTATTCTAATGAACAGCCTAA:1 - chr3L 6084862 5' - HB 203 1 56.44 AGGTAATTAGTTCGCTACAACTTCTAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCGGC:1 + chrX 22738551 5' + 297 6589 2 75.51 GATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chrX 8038596 5' + 297 8 2 72.00 ATATATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGG:1 + chr2L 22092957 5' + INE-1 537 1 60.00 GAAAGTATTTACAAATTCAATTACATACATATATGTATGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr3R 19955283 5' + hobo 36 1 63.37 AAAAAATATTTCATTACAGCAATATTTGCTTTGCTCTTTTGTGCATATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 - 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chr3L 7007977 5' - transib4 2626 2 58.42 ATTGGGTCAAAAGCCAAGTAAAAAAAACAAATAGAAGGAAGGGAGAACGTTATACGGCCGGACAGACGGACAGTGCCAGATCGACTGGGCTATTGATACTG:1 - chrX 305995 5' - INE-1 95 1 54.46 TAGATTGAGGTTGTCCGTTNAAAAGAGTGTCCGTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1 - chr3L 7215547 5' + copia 43 2 69.31 GGGAACCTTGCTCGTTTCCGCATCCTTTCGCTTTGAATACCCTTGGGAAGTTGGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3L 1904239 5' - hobo 2916 1 56.44 AATCGATATTCTGATCCGAGAAGAAAAATCGCCGACGGAGCAAAACAGTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAA:1 - chr3L 8562228 5' + Doc 325 1 53.00 GTCTTACGCTCTGGCTTTTTCCGCTTTCCGCTGTCTGTGCGACTCCATCATCTTGTTGGAAAAACTTTAAATAACTTCACAATTTCTTTATTCGACTTCTC:1 + chrX 3767175 5' - invader3 5413 2 70.30 CACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTT:1 - chr2R 2875213 5' - TLD2_LTR 124 1 74.26 ACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chrX 19607298 5' + Tirant 40 2 63.37 CCTGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3R 9116527 5' + jockey 30 1 54.46 TGTAGCGAAATCAATTAAGGCACAAAAGCACTGCCCGCCCTCGTAAACAAATAATGGTCCTTATTGAGAAAGACAGTTTCCACATAATTCCCCTGACCAAG:1 - chrX 5145625 5' + Fw2 289 1 65.35 ATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACATTAGCTGATTAATGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCAACTATAGCATTCTC:1 - chr2L 9778708 5' + INE-1 573 1 78.22 TCTATTGATTTGTTTGTAACTTTCGCCTAGTCCTGACCTCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr2R 3218028 5' - 1360 3352 1 62.38 ATGGCCAAGAAAATCTGTTTCTATATGCACATGCAAACAACGCACACGAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAAACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTT:1 + chrX 9208289 5' - Cr1a 175 1 70.30 CTAACACATTGAAGACATGTAGTATCGACAGATTTTGACGTATAGTAAACGAATAATAATATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAA:1 + chr3L 22984126 5' + S-element 1671 1 67.33 GGAAATCAGAGGGAACAAATGCAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTA:1 + chr4 289815 5' + P-element 2720 1 33.66 ACAGGAACCACACATTCTATACTGCACACTCCACACGAAAGATACAAAGATACAGCGACCAGCGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGAAG:1 - chr2L 1012471 5' + Dm88 466 1 64.65 TGTGCCCATATTGATACGCAAATTGCTGTCAGCACACGCACACTGTCGCCGCCATAGACACAGCGCCTTCACACTAACTGAGTAACGGGTATCTGTTAGTC:1 - chrX 12365561 5' + INE-1 549 1 61.39 ACCGCGGCCTAGTTAAACAGCTGTAATCAAAATTAAGTATTGTGTTAAGCCTATATACATCTTTGCATTAACACTTCCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1 - chr3L 23257856 5' + INE-1 549 1 59.41 ACTGGTACCCAATAGCATGGTAGAAATCTTGTAATAGTTGCACCGAACTGATTTTCTTATTTCGCTCGCTACGGATTGCAAGTAGTTGCACAGGAATCATC:1 + chr3L 26029848 5' + G3 330 1 69.31 CATATAAAATAAATAAGTAATCGATAACACCACCGACGGCGTGACAGCTTTTCCATCTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr2R 18850638 5' + P-element 18 1 62.38 AGAACAATAATTAAAAAAAAATTGTTAATCATTATTATTTATTTTTAGTTAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr3R 7134416 5' + blood 25 2 54.46 CCAGTGGTGGGTCTGTGTTCCTTCTTTCGATGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTA:1 + chr3R 31815350 5' + R1A1-element 5102 1 72.28 GGTCGCTATTTCCACCGGCGCACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chrX 15498973 5' - P-element 2831 1 23.76 TCACCCACACCGTCCATTTGTGCTGAGGTTATATGCAAACTAAGTGCTTGTAAATGGTTTTATGCTTAGCCTCAGCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2L 2505691 5' + jockey 7 1 78.22 AAACACATTTCATTATTTTAACGTATTAACGCTTAGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 - chr4 1043588 5' + Doc 52 1 65.35 GGCATAGACGTGCGAACTGGGTTAATTTTCTATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr2L 20330085 5' + 297 39 2 75.25 AAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAG:1 + chrX 21772482 5' - springer 7158 2 67.74 TTCCCCAAATTTTCTCCTCTTTTTTTTCGTAAAGTTGACCTGCCTTGACATCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCT:1 + chr3L 2325394 5' + hopper 24 1 52.48 ATCTCATCTTCCTTGCCCCCGGTACCATCTCTTTTTGGCCTTAACTTTAGCCGGACTTTTGCCTTGTTGTCGCCACATATGGTTATTGGTCCATCTAATGA:1 + chr2L 14750356 5' - Copia1_DM 4043 1 70.30 GGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCC:1 + chrX 21772480 5' - gypsy3 6568 1 53.26 CGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 + chr2R 15160310 5' + Tirant 8151 2 67.33 ACACACATACATATATTTACCCCTAATAGTTGTCCTTGGACCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr2R 18073244 5' - hobo 2901 1 59.41 TTTCAAGGTTTTCGAAATATTATGAGGGGGAAAAAGTGGAAACGAAAAAATGAAAGCCAAAACGATCAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 4067376 5' + R2-element 3581 1 57.14 TTCTGATACGACGATATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACG:1 + chr3R 1440141 5' + G-element 13 1 67.00 ACGCGGTCTTGGCGCCAAAGATGCTGCATACTTACAAGCGCTGTTCACAAAGTAAGGTGTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr2R 24242972 5' - hobo 2923 1 65.35 CGAGATGATAATTTGGTGCCCGGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGG:1 + chr2L 8842913 5' - hobo 2649 1 78.22 GTTAGTGCTACGCACAGACTTACTGGCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 + chr3R 18541225 5' + jockey 4575 1 57.43 AAAGGAAAAACGTTGATCTAATTCCTTCAAATGTATGAGTACTTGTTAGGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 + chr2L 284465 5' + Quasimodo 22 2 58.42 CTATCATTTTTCGCCCATATTGCTCGAATCCTTTTGAATACATCTCACGAACATAAGTATTGCTTTTCTTGGCAAATATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCA:1 + chr2L 18589629 5' + Cr1a 252 1 76.24 ATAGCCCTGAAGCTTTACATTGAGGAGTCGAAGGGTATGCGGTCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2L 9075555 5' + 297 6594 2 49.50 AATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAAT:1 + chr2R 6947352 5' - 1360 3274 1 57.95 TGGTCTACAAAAAATATGAAATTTTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr3L 7215509 5' - copia 204 2 73.27 AGCTACAACATTTATTTAGNTATAAAGTGTCTTGACGATGTATTTTCAATAACACTTCAATACCACTTCAATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr2L 7552496 5' + I-element 12 1 48.51 TAAGAAAAAATTTAATTTTATAAGGAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3L 27395491 5' + opus 40 4 77.08 GTCATTTACTTGGGCCGTTTAGCGCATTAAGTCCGAGTTCCCCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr2L 3582037 5' + transib2 32 1 57.43 CCGTTTCCGGTTTTTGGGGAAAATTTAATAAAATTTAATTCGGCATTTGTTTTTAAATAAACAGTGTGAGTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGC:1 - chr2L 6599310 5' - accord 7025 2 64.36 TATCTCTTCTTCTTCCGACTCGAGCTGCTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATCTAACAGGTATAGATGTAAT:1 + chr2R 6438332 5' - Stalker4 393 1 65.35 ATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 + chr3R 4973103 5' + 1360 3379 2 43.56 GCACGCATAAGGATTCCATGAATATATTACGCCCGCGACAGCCGATTTAATCGTCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 5958648 5' + roo 23 2 51.49 TATGTCTAGTAAACTGGGAGTGCTAGCCGCTTGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chrX 9828453 5' - Tirant 8464 2 68.32 TGCCACTTGCCGCACCTGGCCAGGTAGGTGTAGGTATCCATCCAGTTTCTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chrX 18322560 5' + jockey 4701 1 50.00 ATTATTCATACATATGTACATCAATACAAGAGAAATATGCAAAATTAGATAGGAGTTCAAAAGATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 30276685 5' + roo 8677 2 55.45 TACCTGTGCTGCTTACGTGGCTGATTAGGGTCGCAGATTACGCTGTGGTGTGGTGCAGAGTGCGGATCGGGATCAGGTGGTGTCCACGATCGGTGACTATA:1 + chrX 19037211 5' - Chouto 244 1 59.41 ATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATA:1 - chr2L 21570254 5' + Dm88 28 2 55.45 CAGCATTTGCAGTTCAATTNAATTTTTAGTGCACACAACAAACAGCTGAAACGGCTTTGCACACATGAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3R 26498613 5' + roo 8 2 71.29 GCCTCGAAAGGATCTGACGTGTGCCTGTTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr3R 30220238 5' - mdg1 370 2 73.27 ACCGGCATCGCCGTAGTCACCGCGTTGTCCGGTTTCTCCGCGCTCACCTTTGCTACCATCGGATCCATAGTAGACATTGTAATGTGCACACATATCGAATA:1 + chr2L 5016655 5' + Tabor 3 2 67.33 GTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr2L 16071128 5' - 412 439 2 75.25 GCCAAAAGTGTTGCATACGTCGAGGGGCCAGCCGCACAATTTACATCTATGCACACACACATTCATAGACTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGT:1 - chr3L 17136056 5' + BS 6 1 66.34 CGAGATGCAGTTGTAACTTATTGATTTAGAATGAAACAAACGATGTCTGATATCTTGTACTAAACATCCAATTATTACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGAC:1 - chr2R 22369661 5' - roo 9070 1 75.25 TTCTCCTTGGCCCGAGTGTTTACCTCCACGAATTCGTAGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr2R 18407055 5' + mdg3 40 2 61.39 ACTGATTCAATTGAATCACTATTATTAAAGTTATTCTTCTACGTTCATTATAAATCTAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 - chr2L 16866507 5' + Transpac 14 2 64.36 CACAAGTTTTCACTCAATGGTCATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAAC:1 - chr2L 12511373 5' - P-element 447 1 26.73 GTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGG:1 + chrX 21852439 5' - gtwin 7376 2 68.00 GACGAAGCAACCAGTGATATTGTACTGTATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 25021689 5' - roo 9028 1 71.29 CATTGCCCAATATTATTTTNATGCCAGCCAAGGTCTCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3L 7463336 5' + hobo 40 1 62.38 TTATTTCTGCACTTGGCTGCTTGTCTGGCGCCCATCGAACGCTCAGCCTGAGCCTGTCTATCTGTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATGGCGG:1 + chr3R 20374847 5' - HeT-A 246 1 75.56 CGTAAAATATTTTACTTAAAAGCCTTAAAATATTGAATTCACGAAAAACAACCGATTTGATACGGAGCTCGATGAACGTCTTCACACGTCAGCGACCAAGC:1 + chr3L 547551 5' - Doc2-element 4 1 63.37 AGCGAACCAAGCCAACTGACAACAAAGCGAACTATGGATATCTGTGCCATGAAGCTATACATGTATGTGTGTATAGGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 19039627 5' - accord 189 2 52.27 CGGGCTTTGTTGTTTTGTTATTATATGGCATTTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 6619827 5' + 412 7096 2 66.34 TCCTATCTTACGCTCAGTTACATGACGATCCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTT:1 - chr2R 2753589 5' + invader2 82 2 70.30 CAAGTGGCAACTTCGGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chrX 19607326 5' + Tirant 12 2 69.31 CTAAACAAGTAAACAAATCGAATTGGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGC:1 - chr3R 24396139 5' + HMS-Beagle 6657 1 75.25 GACAGAAAGTCTTTTCAGCAAGCTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2R 7635397 5' + jockey 60 1 77.00 GTCCTCAACTTTCACCTTAATTATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr2R 21109163 5' + jockey 4725 1 79.21 TTTCCAGCGAAACTTAGCTTGAACCAACTTTGGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTT:1 - chr3R 12599344 5' + BS 40 1 68.32 AAATGTACAATTCAACATTGTAAATATAAGTACATGTCATTACAGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chr4 333628 5' + Doc 35 1 63.37 TGTGGGTCGACAAGCAAAACTCAGTCACAACACCTGAGGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGAAAGTTCTAAAA:1 - chr3L 19459378 5' + Doc 49 1 60.40 AAATTATTTAGGATGTGTTTTTAGAAAGCTCTGCTTTCAAATGGAACGTTGAATAACATTCTGCTTTGTCACACACACACACACACACACACACTTTCA:1 + chrX 3297319 5' + accord 186 2 77.78 TTTTGTGACCGCCAAGGGGAGGCCTACGCTCTGGGTGGATTTGGGGGTTCCGGGTGGGGGTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATA:1 + chrX 965347 5' + diver 380 1 63.27 TCTTAGTAAGCGTGTAGCGCATTTTACCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 17098376 5' + roo 8712 2 77.00 CCAAAGGCCAACACTAGTTATGACTTATTCATGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - 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Tc1 1468 1 78.22 CTTGACGACACTCCAGCTTCCCATATCGAATCATACCTGTTTCTCAGCACCAGAGGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTA:1 - chr3R 27059923 5' + Quasimodo 7097 2 53.47 TATTAGTTGCAGATAATCAAAGTAACATTTACTTCCAAAGAGCATCTAAATTTAGCCCATTTCATTTAATTCGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 + chr2L 15159455 5' + jockey 4676 1 73.27 ATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3R 27071903 5' + jockey 63 1 77.00 GTGCAATTCACGTCACAACATTAACATCCATAAATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3L 6399586 5' - roo 399 1 73.27 GAACTAGGCGTAGTCAAGCAAAATGATTGATGAAAAATCTGCGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 9884271 5' + hobo 29 1 54.00 CCACTAAGTGTGCATTTGTGTACGTGAAAAGGCGTGGCACAACTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chr2R 13316132 5' - hopper 1380 1 57.43 GACAGAAAAAGCGAGCACGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr2L 13549275 5' + P-element 54 1 23.76 CTTGTCTTTTCTAGGATCCCCTGAAATACCAAAACCCGCACCACACCCAACCATGAGCTAGAGACGGCCTTATAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACT:1 - 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chr2L 18585962 5' + Doc 37 1 47.52 AGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chrX 21087582 5' + mdg3 5279 2 53.47 ATAATAATGTATTTATGATAATGTAATGATTAAACTAGTGTATGTATGCAGTAAAATTGTTGTTATATTTTTGAGTCGAACTAATATCCCGTCAGTTGGCT:1 - chrX 4515971 5' - 297 363 2 67.33 TTTAGTTTAAATATTTACAACAACTTTCAATTCATTTAATACCTTAATGAAGAACACAGTTACGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr2L 16523777 5' - 1360 3374 1 57.43 CGAACAAAGACTGACTCGTGGCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr3R 7582594 5' + 297 1 2 78.22 CCTGTATTTATGACCGGGGCTTCATATTATCGCACACGATGTGTATATTTTTAAATTTAGCACTGACAGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTG:1 + chr2L 21910842 5' + Rt1a 18 1 73.27 CGGACAGACACACGGATACGCGAACGCAGACACGAGGTAACGGTAACGGACAGAAAAAGCGAGCACGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 13549227 5' + P-element 6 2 69.31 CCCAGAAAACCAACATGAGCATAAATCCTCGCACCCGAATGCCAATCGCAGTGGCCATAATCAATATTTCGACTCCTCCCCCGCCCCCCCCC:1 - chr3L 10833145 5' + accord2 221 1 52.17 TATCATTGCATGAATTTAAAAATATGCTGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAA:1 - 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hobo 333 1 72.28 TAATCAGTTTGAATAAATGATTAACCTCTGGGTAGGCAATATACCCCTGATACCCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chrX 8896241 5' + 1360 18 1 60.40 TGCGTAGTCAAGTAAACGAATAACAGAGTTGTACATAAGCAAGTTTGAGAGCGGAAGTGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGG:1 - chrX 17821818 5' - Porto1 483 1 59.00 TCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 + chr2R 5214946 5' + F-element 18 1 66.34 CTAGGACTAGGACTAGAGCTCGACTGAAGGATAAAGGATTCGGGCTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chrX 4279487 5' + blood 7041 2 57.43 ATATAAAATGGAATATAAAGGCTTATAGGCATATAAGGCATATTAGGCATATGCCTAAGGCATATTATATTAAGCTTAGGTATGCTTAATATAGATATAAC:1 + chr3L 14537050 5' + transib3 290 1 42.57 GAAAAACAAAATAAAAATTGTGCGTATACGAGGCCTTAACATCGCAAAAATTGCAAAACTTCGGTTCAGATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAATAC:1 - chr3L 23198564 5' + R2-element 3504 1 63.37 GCAGTTTGGGCCTGGCTCCTCTCATTCATTATGCATTAATGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr3L 13639918 5' - 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chrX 9816316 5' - BS 5053 1 60.40 GATGGCAGGCGGGCAGTAAATGGCTGCAACTTGGTGTCTCTGTGGCAAAAACAAACATAGGGAATGCGGCGGCGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCG:1 + chr2R 19572630 5' - Doc 379 1 77.55 ACTGACGGATTATTTTTTCTCCCCCGGCTGCATATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCT:1 + chr3L 22126744 5' - accord 63 2 65.35 CCCGAGGGCTTTAATGAGGGGTCTACTACATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2R 13540888 5' + 297 6618 2 70.30 TTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGG:1 - chr3L 13142062 5' + F-element 420 1 56.44 TGGTACATATATGATAGAATTGCTTCTATATGATAGAAGACAAATACTAAAGTACAAAAAAAAATGTTTATAATCGCACCTAAAGATCCTGATCAAGAATA:1 - chr2L 21761634 5' - INE-1 85 1 78.22 ATACCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGAT:1 - chr2R 14849018 5' + flea 4713 1 58.42 CATGCAACCAAATTATATTACTTCTTAAAAAAAAAGTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAA:1 - chr3R 4833048 5' - Tc1 1409 1 74.26 ATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGA:2 - chr3R 11547746 5' + G2 325 1 73.27 GGATCGAAACGGATCAAAATGGATTGGGCAATATATGTATGGACATACATACATATTGTATACATAGGTATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATA:1 + chrX 4477312 5' + accord 6954 2 74.26 CTCGAACACCCATACCCGACATACTTTCCCACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTC:1 + chr3R 16197112 5' - BS 4868 1 70.30 TGCAAACAGATGGCCAGTTNTAAATACCCTAATATATGTCAAAAAATAATTAAATTACCCAAATGTATGTATGTATGTATGTAATGTATGTATGTATATAT:1 - chr3L 14284656 5' + 1731 95 1 67.33 CACACGAGTCCAATTCCCAGCTCTAGCTCTAAGTATTCCTCCAACTCTCCATCTCGTTGGCATGTGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 + chr3L 6619745 5' - 412 7538 2 68.32 CACAATGGAGAACGAAAACGAGAGAGACTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAA:1 - chr3L 702155 5' - 1360 57 1 64.91 AAGTAGCACCTGGAAAATATTGCTGAATTTACGAAAAATATAAATATAAATTTCACTCTCTTCCCTTGCACCTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 - chr2R 13058293 5' - 297 370 2 67.33 GAATATATATCTTAAGAAAATATACATAAATTTCGAATGTTCTAAAATGGGAAATTCAATTTCGAATCAATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 + chr3R 17952906 5' + copia 6 2 70.30 CGGATACGCGAACGCAGACACGAGGTAACGGTAACGGACAGAAAAAGCGAGCACGTCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 + chr2L 13549239 5' + P-element 18 1 57.43 TTTTCAGTTCCCCCTTTTGTGTTTGTTTTTTTATGGGGCGGTCTTATGACACTTTTTTTTTAAGTAGTAGACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAG:1 + chrX 1105691 5' - 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chr3R 7599159 5' - mdg1 416 2 54.44 CCAATTCATGCTAATCACTNAGTAAAAAGATGTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAA:1 + chr2R 5277145 5' + invader4 40 2 70.30 AATTGCCAATTAAAAATATTACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACAT:2 + chr3R 6646743 5' + Juan 41 1 61.39 CGGGGTTGGTTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1 + chr3R 4164642 5' - HMS-Beagle 7004 2 71.29 AAGTACAACTTTGACATGATCTATCAGATTGGTGGGCCGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACC:1 - chr3R 27260453 5' + Max-element 8360 1 62.38 AAGAGAAGCGAAGCGGGAATAAAGAGCTCATCCGGATCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCCCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATT:1 + chrX 2500689 5' + Max-element 8356 1 64.36 TTTGGTTTGGTACGTCTAAGAACCTGAGAAGCAATAGCTTCTGAAACTATTCTACAACCCAACACTGACTATAATAGACTTTATCCCATTATCTGTAATCT:1 + chrX 21960532 5' + Cr1a 4218 1 51.49 AACAGGTAATGGCCGGAATTCCAAGGAATTTTCTAAGGGTTTTTGAAATTTGTTAGTTTGCATATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACA:1 - 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chr3L 14253157 5' - Circe 93 1 68.00 GAATTTCAAAAAAGGCACAAAGCTTTCCGCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGGGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGA:1 + chrX 15924863 5' + Porto1 382 1 82.18 TAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCG:1 + chr2R 5617505 5' - invader1 378 2 55.45 GATAAATTTAATTAAATTTTAATTCTCATCACTGAAGATATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATT:1 - chr2R 5260034 5' - 1360 273 1 63.37 ATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chr2R 5651885 5' + Tirant 48 2 71.29 CGCCAACGCGGATGAAAACCAACTGGAACTCAATTGAGCTGCCGCAGTCATTTAAATTGAACTTGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCA:1 - chr2L 5210468 5' + accord 9 2 69.70 TCTACATTTTTCTCAGTGCCGCAGCGGCATCGCCAGCTCCCTTGAGCTTTGTTTTCGCTTCCTTCTTTTTTTCGGTAGCTAAAATGGCAAAAACAAAAAAG:1 - chr2L 4255030 5' + Bari2 251 2 70.30 CGTTGGCAGAATTAAGTGGAGGAGTAGTGGCTGGAGTTGGGGATAATACACGCCCATACATTTTCCTAAACCTAATCTTTAAACTAAAAA:1 + chr3L 470855 5' - Circe 7041 1 70.00 CTGTATCTGCAAGTGAATCGAAACCGGCTGGCGGGCCTGGTACTTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 11664289 5' + Tirant 8 2 72.16 GGATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAT:1 + chr2L 1201967 5' + Stalker2 23 2 56.44 TTTGATGCTTTGTGACGCGAGTCTACGAAATACTGTGAGTGTGCCTTTTCAAACTGCATATTGCGGTGTTACGCGAAATTTTTCTGGGATATTGATAGATA:1 - chr2R 5644606 5' - INE-1 499 1 64.36 TGCCAGACGCCTTTTACGGGTTTTCCCTCCCAGAGGCTGAGCAGTTTTTGAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCA:1 + chr2L 4021032 5' - 412 7357 2 59.41 CATTAAGCCACAATGAATTCTCTTTTGTTTTTTTTTTATTTTTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTTGTAGTATGCGCATATATCGAG:1 + chr2L 2622688 5' + blood 1 2 65.52 GCCATCGCCCAAAAACAGTATAATGTTCTTGGCCTTCTTGGTGTTCCTCACGAACTCCAACTTTTCGCGGATGAGTTTTTAAAACTAAAGACAGAAAACTT:1 - chr3L 5595819 5' - gypsy4 6769 2 79.21 TTTTATTACCTACAGTGCTAAATTTGTGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chrX 6451140 5' - pogo 2055 1 76.24 AAATTTAATATGACCGAGAAGTTGCTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr2R 7185235 5' + 1360 43 1 73.68 TTTCTTTGGCTTGCTCTCATTTTCCCACTATACTTTGCGCGGTTCTTTTCTAAACGAAGTTAACCAGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2L 9045841 5' + jockey 11 1 74.49 TGTTTGTCGTTACGATCGTTATTTTTTATTTTTTCCCATTTACAATCGTTTCTTTTTTTGTTTTACTAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATCTGTTACT:1 - chr2L 7364095 5' + Tc1 1507 1 52.48 TTGTTGCTTCGTCAGGTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr2L 13598157 5' + pogo 1 1 76.24 TCCAGGCTAGCAAATCCATTAGCGCCATCTGACGCATTTGCCAGCAGGTGATTCAGGTCATCTCCATGGCAAACAATGCACACACACACACTCATATTTAC:1 - chrX 4075288 5' + accord 187 2 59.41 AAACCTTTCATTTTTGGCAGCATCATGAATACTATAGAAGGCATTAATATATATGATAACCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr2L 16016273 5' + I-element 17 1 60.40 GGGCATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 - chr2R 8528262 5' - Transpac 298 2 55.13 TAGTAAACTGGGAGTGCTAGCCGCTTGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAA:1 + chrX 9828459 5' - Tirant 8458 2 74.26 TCTTCTACAACCGAAACCCNTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCCGGAGAGGGACCGGCAGCCCGC:1 - chr3L 13142047 5' + F-element 434 1 69.00 AAAGGAGAACCTGCCGCTGCTGCAGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 10924216 5' + hobo 29 1 54.00 AATTTTGAGTTTTCCAGTTTCGTTTCGATTTTCCAAGTAACTTGATAGTGATTGTAGTCCTTAGGCCTTAGATCCTGATCCTGTCACGGTCGCCATGCTAT:1 - chr3R 19808964 5' - gypsy11 447 1 49.50 TGTAATCATTATTATAAAAAGATCATCATCATTGGGTTATTTGATGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chr2L 14981445 5' - hopper 1385 1 57.43 ATTTAGTTAGCATACGTACCATACTACTTACATATGTAATTTGTGAAATATACTCTGAATGTGCTTGTAATGTACATTTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTT:1 + chr2R 19480323 5' - I-element 5187 1 60.40 TATCATTTCCGGTGGTGAGGCGACGCAAATTGCAGAGCTTAGGAAATGCTTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 - chr2R 15160379 5' - Tirant 376 2 56.44 ATAGCATCAGCCCTTGCCCCCCAAACACGACTGATAAGCTGTTAAATACCCAGCACTAGAATACCAATACAAGAATAAGAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr2R 18235869 5' - 1360 3370 1 62.38 TGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATT:1 + chr4 1301732 5' + 1731 25 2 46.53 CATTGGTTAGATATAATTTTAACGAATAAATATATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 9121447 5' + roo 8705 2 70.00 GTCATCCAAATCACCTAAGGCCGCATCTAAGGAAATTTCCAACTTATAACTCTCGCGCACAAATTCTATTTTTTAGCCACTGCTCAGCGGTGGTGACAGAC:1 + chr2R 4309701 5' + jockey2 106 1 41.58 GGCATATTAGTTATTAAAATGTAGGTATGCAAAGATAATAACGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 15286481 5' - hobo 2907 1 56.57 GAATATAAAGCATCACTGGCTGAAAAATGTAATAAAGAGAGCTGTTCCGATCTGATCTACTATATGTACATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACA:1 - chrX 6854467 5' - diver 215 1 69.31 GTAAAATACATTATCTTAAAAACATATCTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 7542182 5' - mdg1 373 2 73.27 TAGGGGATCCCAATCATGGCGCTGCCATCGAGAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr2L 16025705 5' + 412 43 2 67.33 CTGCAAGTAAATACTCACATTTAAATTGCTGTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTG:1 + chr3L 14878658 5' + Juan 48 1 73.27 CAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGTGACGCTCTGTGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGC:1 + chrX 7469280 5' - Doc 4256 1 65.35 GAAGAACTGTGGTCAAGGCTCGTCCTCAACTTTCACCTTAATTATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chr2R 21109142 5' + jockey 4686 1 51.81 AATGGATATTTGATAATGAAAATCTCCGAAACTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - chr2L 20992991 5' + I-element 5 1 72.28 TCGAATAATTGATGTTATATTTCAATATAACTAAACATCAGCCCAGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr2R 2314933 5' - blood 7357 2 54.46 GGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACG:1 - chr3R 10741139 5' + 1360 3364 1 44.33 TGTAAAATACATTATCTTAAAAACATATCTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr2R 7542181 5' - mdg1 374 2 72.28 AAACAAAAGGACTAAATCGGTGGAGAATTGAAAAGTCTAGGGACCACCTATTCGTGACCTCCACTTTCGCAAGCCTTCTATCAAAATCAATAGCCGAGTCG:1 - chrX 22638582 5' + INE-1 93 1 53.47 GGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:2 - chr3R 20425404 5' - roo 9030 1 70.30 AGTTTTGTTTTCCCCGGCCAAAAGAAATCTCGTCGGTGCGTCTAAACCTTTCTGCGTGCGCCAAGTTTTTTGACTCTAGTCCGAGGATCAGCATTGACCAC:1 - chr2L 2506628 5' - jockey 4712 1 67.33 GCTCTTAAAGTCGTTACACAAACCTGGCAATAAAAAACAAAAAAAAAACAAA:1 + chr3R 9278734 5' + Rt1a 5080 13 80.77 AAACTGAAATCATTCAGATTGCTCATAGGCAAGGCCATTTTTCGGCGAAAAAGTCACAACCCATCATTTTTTGGTCCTTCGAGTCGGATCACCTGGATTTT:1 - chr3R 1445125 5' + GATE 284 1 45.54 TTCGTTTTGGGGGGTTCCGTAAAACCCGCATCCTGAACGGCACTTGAGGTCCGCTTTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTA:1 - chr3L 1296100 5' - 1360 72 1 51.49 ACACCATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chrX 11088301 5' + blood 12 2 66.67 GTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3R 10741073 5' + 1360 10 2 68.32 GGCTCACAACTATAAAATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:1 - chr2L 14979249 5' + Ivk 11 1 66.34 TATCGGTATCATATTCGAAATACGAAAAGTTTTATACATTTTTATTTTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chr2R 20145064 5' + opus 7142 4 58.42 TTGTTTGAAATATACTGCTTTCGATCGAGTGTGGTTGGTGTAAGTATGTGTGCCTAGAAAAACAACAACAACATTTAATAAAAAAAAAAATAAACAAAGA:1 - chr3L 10582792 5' + transib2 2640 1 58.00 ATCGGCTGAGGACTCGATGCTCTTTTATATTATTTTATAAATAGTATCCAAATCAAAATCTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:1 + chrX 23317671 5' - copia 240 1 68.32 CAGATCAGCATTTAAGGAAACAAATATGTAACAAACAGAGTTGAGAATAACTAGAGAGTAGAAATAAAAATCATTTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTT:1 - chr3L 27414514 5' + Porto1 9 1 76.24 CTGACTCGTGGCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3R 7582604 5' + 297 11 2 68.32 GGACAGTAAAAAGGTTTTCCCGTCCATAAGGGGAAGTTTACATTTTATTTGATTTTTTACGGCTTACGCGAAGGCGTTGAACTGAGTGGCACGACTTATCT:1 + chr3R 25935948 5' - I-element 24 1 70.30 ATTTGTCATTAAAAAACAGNAAGGCTAATTAATGTAATTATTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3L 5512500 5' + pogo 32 1 61.39 CACACTTACTTCCAAAGCATTGCCCAATATTATTTTTATGCCAGCCAAGGTCTCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 7463353 5' + hobo 23 1 55.45 TTACGAACCCTTTACCCTANCTTCTGGAGGAGCAGGGCGGGTGGGTGTTGCCTGGCGGTTGCTGGGTGCCATCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATC:1 - chr3R 11873537 5' - Quasimodo 257 2 62.38 GATAATTAAGAAAAATATAAAAAGCTTTGCACGCCACAGATACTCCGATATATATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2R 7775438 5' + pogo 18 1 63.37 CAGCCGCACAATTTACATCTATGCACACACACATTCATAGACTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 - chr3L 17136028 5' + BS 34 1 58.42 CATGGTATGTATTATTATTTTTTGCCACATTTTGCGGTTTTCGGTTTATGTTTTCAACATTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTT:1 + chr3R 16125181 5' + Ivk 479 1 68.32 TTCTCTTCTTCGTTTGTACGTTCGCCTCTTGATTTGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chr2L 16690484 5' + P-element 38 1 38.61 GCCTTATTGGTTCTTGAACCACTGTACCATGTTGTACAGTGTGACGTAGCTGGTAATAATACATGTTCGCACAAACTGGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTT:1 - chr2L 23049070 5' + baggins 5000 1 78.22 AGTTGAAAGTAAAAGCAGCCCCATATATATATGTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chrX 4235872 5' + Quasimodo 36 2 72.28 TGCATCTTTCTCTCCGGTTTGCAAGTGTGTAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3L 21118623 5' + 412 7091 2 61.39 ACTTCACGCGAATTTTCCACACTCCTCGCTCTACACTTGCAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2L 3733115 5' - hobo 2902 1 62.38 ATGAAGTGTTAGCATAGAGGGGCCTACGCGGGATTCTGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3L 23219317 5' - 1360 3372 1 60.40 ATTTAATCAGTTTCCTTTGAACTTTACTCTTTACAATCAGGTTATGCACGAATTTATTTTGGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr2L 11174907 5' - Transpac 5218 2 63.37 TTTATATTTTCTATTTTTGTATATCTCTAAATTATATGGAGTACTGATAGGAAATATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2R 20229356 5' + pogo 18 1 60.40 AGAGCATGTAAACCTGTCGACACGAACTTCTTCGTCGATTCGTGACGTAATTTGCGAGGGACGTGGATGGCGGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr2R 13956811 5' - P-element 2885 2 75.00 TATAACATTCTATTTAGCTTGGTGGAAAAACGTTTTTGCCAAAATATGCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAA:1 + chr2L 11892750 5' + I-element 5003 1 52.48 TTAGTTGGGGAAAATATATTTTGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 21898285 5' - hopper 160 1 73.53 GGGCATCTATTCCCCGGATGATATACTAGCTATTGATCGTTATGACTTTGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATT:1 - chrX 12448408 5' - Bica 407 1 70.93 TCTTTTTTCAGTTTTAGAGCTAATATTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCC:1 - chr3L 13142093 5' + F-element 389 1 75.25 AATGTGGTAGTGCGTGTATCTATTAATACACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTC:1 + chr2R 22267328 5' - 1360 3322 1 74.26 GCTAATGAATAATCTATGANCTTCTGAATGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGC:1 - chr3L 8394319 5' - jockey 4709 1 70.30 AGAAACACTTGCCTAGTCGCTTTTGCGATATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCC:1 + chr3L 27084227 5' + I-element 5113 1 71.29 CTCTCATTTTCCCACTATACTTTGCGCGGTTCTTTTCTAAACGAAGTTAACCAGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr2L 9045828 5' + jockey 27 1 59.41 ATCAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 27071865 5' + jockey 25 1 60.40 CATGCGATCATGACATCATAAGTCTAAAGAGTTTTCAAATATAAAGTTTTTTTTGGAAGCTAGGAAATGTATGTAACGTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 + chr2R 19651145 5' + flea 4765 1 74.26 ACTTAAGTGAAAATCGAAATCGCGGCGAAAACGTTGTTTAAAGTCAAGTTGGGTCAGATTTTAAATTTCTTCAATTATATGCACACACACACACACACAGA:1 - chr2R 9459371 5' + accord 182 2 74.26 AGGCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGG:1 + chr2R 21776302 5' + I-element 224 1 55.45 AAATCATCGCCAGAAAATGATGTTGTACCCCACCAGGCGGATGTCGGCGGCTTACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCG:1 - chr2L 3813020 5' - ZAM 8039 2 63.37 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGCCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 18 1 69.00 GCACTTGAACAAAAAGTAAGTCACTGGTGGGAATCTCTCGATTCTTGATTTCTGATCACCGATTTGTATTTCCAACTCTTTAGCTTAA:1 + chrX 9210337 5' + frogger 195 1 71.59 GCTGCCGCTCTGTAGCTTTAACCCATTCAATTTGATTCATTTGAATTTATTTAGTTTTCATAATTTCTGTATGCTACGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATG:1 + chr3L 10340589 5' - Porto1 218 1 81.19 ACTTACAAGCGCTGTTCACAAAGCAAGGTGTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr2R 24242943 5' - hobo 2894 1 72.28 TAGTTTTTATAATCATTCTAATCTAATCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCG:1 + chr3R 5886370 5' + I-element 4905 1 73.27 GGTTCTAGAATACATTTTGAATGTGCCAAAGTTAAGTCCCCTGTCCCATTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTG:1 + chr3R 9949449 5' - F-element 4335 1 55.45 TTCTGTCCGAGCCATAAAGCAGACAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr2L 16069945 5' - 412 445 2 66.34 CGGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGGTAAGACGTCTTGCAAGA:1 + chrX 22726185 5' - Helena 1284 1 55.00 CCGACCCGCACCTTGAACCTTGTTTATGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr2L 9969518 5' + hobo 49 1 72.28 TGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTT:1 - chr2L 23295870 5' + micropia 24 2 51.49 CACCAGCTACCGAGGAAGGGTGAGTATAGAATAGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCAAAGGAAGCCGCCGACAACGTGCCCAACACCAG:1 - chr3R 1439587 5' + G-element 497 1 65.00 ATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 + chr3R 19446673 5' + HMS-Beagle 6845 2 75.25 TGGTTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chr3R 4164648 5' - HMS-Beagle 6999 2 77.00 CCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:2 - chr2L 22241781 5' + pogo 47 1 72.28 TGATCATCGTGGGCGGCGGCGTTATCAAGCATCACATTTGTAATGCCAATCTGATGCGCAATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCGCACACAATTGGAAA:1 + chr3L 8199167 5' - Ivk 42 1 64.00 AAATTCTATTTTTAAATTCTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCGCTTACGATGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGC:1 - chr3L 13993640 5' - 1360 3266 1 82.18 GAGTTGCAAAACCGGAAGAATTTCCACGGCGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAGGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAG:1 + chr3L 19706450 5' - Idefix 181 1 70.00 ACTTTGACGTCATTATAGCTGGCCATCTTTCGCGGACACTTTAAATAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr2L 9075651 5' - 297 381 2 60.23 ACTGGCCAAACGACAAAGTCAAGTCCCTCGCTCAAGCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 10866789 5' - roo 9031 1 67.33 AAGGAAACTATTTTAAAAAGGCAAAACTACTTTGGCTTTAATTGCAACAAGCCCCGAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCA:1 - chr3L 15776154 5' + I-element 441 1 63.00 ATTTCTTAAAATAACTAGAAGTAGTCTGCGGTTGGGTGTCCAAAACGGTGGTTGTTCCCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2L 791526 5' + 412 18 2 59.41 TTAAATTCATGCAATGATAATTAATTCAATTAGGATAATTTCACATTTTGCATACAAATTACGTATACGCACCTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAA:1 + chrX 9816339 5' + 1360 489 1 70.30 CCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGGC:1 - chr3L 24566085 5' - gypsy8 4862 2 76.24 AACACGTCCATCGTCAACCAATTCATGCTAATCACTGAGTAAAAAGATGTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGAT:2 + chr2R 5277128 5' + invader4 2782 2 57.43 CAGGCATTGTGCGGTGTTGCCACAGGAAGGGAAAAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCG:1 - chr3L 9220193 5' + BS 12 1 58.42 ACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chrX 8308717 5' - opus 7478 2 56.44 CCTGATGCCACAACCGCGTCAAAATCCCCCTCTATTTATACCCCTGTCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGA:1 - chr2L 14823082 5' - G2 44 1 54.00 GTGGCAAGGCTGAATGAGTGGCGCGCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTC:1 - chr2R 18128369 5' + I-element 270 1 75.25 TCAATTAAAGTAAATTTACTCATAGAACGATCTAGTTAAAGCTTCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGAT:1 - chr3L 17687862 5' + BS 28 1 55.45 CACGCATTTTCACTCCTGTNTCTCTGCTCGCACATACATTAGCAGCAAACTGTATGTGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCC:1 - chr3R 22272093 5' + 1360 204 1 61.39 TCCTTTCCGCTTAATGAAATTACAATTCAACGGCGAGACCAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2L 19290624 5' - roo 9035 1 60.40 CTCAGCTGGTGACCCATATTTAAAATAATCTATTAATTTTTATTACCTACAGTGCTAAATTTGTGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chrX 6451177 5' - pogo 2092 1 72.28 AATTCGCTTTGTGTGCTTGNGTTTATTGTTTTTCGGTAGATTTTTTTGTAATTTTTTGGCGCTCCTCCGTCGCTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGG:1 + chr2L 12958768 5' - Idefix 235 2 74.75 GGTGACTCGCTTAAATGCTCTTTCTCTTGAAGATTCTCATTATGCTGACATAAAGGTGTCATTAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCAC:1 - chr2L 22744177 5' + diver2 4633 2 71.29 TAAGCATAGTCGGATTTCCGACCTTAGAATTCTCGACCAAAAATGTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2L 6112873 5' + blood 7036 2 52.08 TTTCTGCTCAACACGGCGGGCAGAAGTGGTGATATTGTGAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3R 5359993 5' - 412 456 2 64.36 TTCAAATATACCCACATTCACAGGGAATCCCACTAAAACTCCCCATAAAATGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGAT:1 + chr3L 18996470 5' + R1A1-element 5094 1 60.40 ATAAGAACATAAAAAGCGATTAAAGATATTATCAACAGAGAATGGGGTGTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2R 8674210 5' + roo 25 2 55.45 GTCGAAGAGCGGGCCTGGAAAATTTCAAATGCAAATGAAGAGGCAGATGGGAATGATTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATACC:1 - chr3R 10730313 5' + INE-1 86 1 59.41 GTCGGATGTGTTGAGTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATCTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGC:1 + chr2R 6438362 5' - Stalker4 363 4 70.30 GACTTATAAATGCGGTTTANCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr3R 19963470 5' + 1360 13 1 50.50 ATTTATTTATACCTAAGTGCCTTCTTTTGAGTCTTAGTAAGCGTGTAGCGCATTTTACCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 17098345 5' + roo 8682 2 60.40 ATGGCCACATGACGAGGGCGCCTATTCACCTACTCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 - chr3R 27605369 5' - opus 490 2 71.29 CATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 + chr3R 14049343 5' + transib2 28 1 53.47 TCTAACTGAAGATAAAGTANTTATGCTTGTGATGCAATTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr3R 17255945 5' - I-element 5318 1 63.00 TTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chrX 8308746 5' - opus 446 2 81.19 GGCCTTCGTTTTCCGTGCGCTTGGCTCATTTTTTCGGGCTGCGAGATTTCGGTTATGTTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTATGTTAGAAAT:1 + chrX 20564349 5' - TART-B 10283 1 55.45 ATATAGTTCCCTACAAAGGGCGGGGACAAAAGATTCCCAATTTTGGGCATGACCCGCTTTAAATGTCACTCTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAGCAAGAGA:1 - chr2L 20318282 5' - 1360 3244 1 74.26 CAGCATATCTCCGAAGTGAAAAATAGCCTCAAGACGTAGAATTTTTACAATTTTACTATTACAAGACACTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 25333444 5' + pogo 4 1 75.25 GATCCATCTTCGTTGTTTTAGTCGTTAGAGTATAGTAAAGTCGAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chrX 21469029 5' + pogo 31 1 59.41 GCTTGCTCGACGATTCGATTTGCGTCGCTTTAACTTTACTCTCGATTGAGATTCCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr2L 12801034 5' - hobo 2927 1 63.74 ATATTTAACAAAATAGTTGCAAAAAGTCAACAGAAAAGTGCAAAAAGAAAAAAACACTATGAGCCAGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAG:1 + chr3R 25519355 5' + Doc2-element 303 1 57.43 CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGTATGCTTAGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTTATACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTA:1 - chrX 12657099 5' - Stalker 129 4 50.50 AAAATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 - chr2L 13622022 5' - opus 7467 2 70.71 TTAAAACTAATTAAAATTGTAGACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 22219589 5' - roo 9020 2 81.19 AAAACAAACCTTTCATTTTTGGCAGCATCATGAATACTATAGAAGGCATTAATATATATGATAACCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr2L 16016278 5' + I-element 12 1 65.35 TAAAAAGAAGGAAGACGTATTTAAATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr3R 11814536 5' - blood 7340 1 74.26 TTGGGGAAAATAACGTACGNAATAGCGCTACAATAAGTAAAATTAATGAGCTAAAACTAAAACGAAACACATTGTTGCGGTTTCATATTCGTAGCGGCCAC:1 + chr3R 11284628 5' - gypsy2 118 2 59.41 ATTTAGAAGATCTTTTGGAATCGGGACGAGATCGAGAACATTTTCAAATCAAAGATAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3L 25333327 5' - pogo 2086 1 64.36 GCTGTTGCCGTTTTTACCCNATTCGTCGAGCAACATACATAGCAGCTGTAAAATAGTTGAAAGAAAGAAAAAAAAAACAAA:1 + chrX 11716048 5' + gypsy7 5013 1 58.02 TAGTTTCAAATTTTACACCGATCACATTGAATTTTAAAACTGCAAACAAATATTGTGCATTCTGATAGGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 - chr3L 2016963 5' - Tabor 476 2 60.40 ATGACAGCTTGTATGAAATAAATTCAAACCTTTTTTTTTATATTCAAATTTGATATTTTTAAACAGCGCGCAATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCCA:1 - chr2R 4192303 5' + 1360 3116 1 71.29 AAAAAAATTTCAAAATGTAAAAAAAATCTCAAGTTTACACAAGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - chr3R 14228091 5' - Transpac 280 2 55.45 ATTGATTGACAGCATGCGGCTATTTTGTCGTTGCCACGCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr3L 15745408 5' - hopper 1380 1 61.39 GGCATTGTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTA:1 + chr3R 11118037 5' + BS 31 1 59.41 AATATATTCGTTATGTATTCATTAAAAATATGTCATATTTTTTGTTAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr2L 16025767 5' - 412 7519 2 52.00 ACCTGTGGGTCGACAAGCAAAACTCAGTCACAACACCTGAGGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr3L 19459381 5' + Doc 46 1 59.41 AATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAG:1 + chr3R 1440178 5' + G-element 34 1 64.29 GGCATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - chr2R 8528261 5' - Transpac 5193 2 61.39 AATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr3R 24228866 5' - 297 378 2 64.36 AAGACCCGAAATCCACTGGATGTGTTTCGCTCCTCCCCTTCCGCCGACTGTCTCGGTTATTTACGCCAGCGGCATAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCC:1 - chr3R 31377777 5' + Doc 373 1 79.21 ACTAAGCAATTTAGTAATTTTTTTCTACACAAATTAAGCAATTAAGATAATCACACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 + chr3R 5993267 5' + Tabor 6863 2 55.45 GTTGTTGCTGTTGCTGTGCGTTTTCGTTTTATATGTTACATATAAACCGGCCGTGGTTTTTGTTTTTCACTCGCCTAGTGCAGTTGCACTAGGGTTTTT:1 - chr3L 2881719 5' - gypsy9 487 1 33.33 TGTAGGCGTGGCACCAATGGGTCGATAATACCCCCACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 + chrX 21667976 5' - Tabor 483 2 70.30 TATATGCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:2 + chr3L 2016874 5' + Tabor 35 2 56.44 TTTTAGTTCTAGAGATACGTTAAATGCCGCTATCAGCAGTTCTTGTTAAATAAGAGGTAGTCATTAAAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 8702755 5' - roo 404 1 67.33 CAAGCCAAGGAAGTGAAACAGAAAAAGGCAACGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAA:1 - chr2L 2558811 5' + I-element 371 1 69.31 AAAAATCCATTGTAGAATCGCCTATTGAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTA:1 + chr2L 5184451 5' + F-element 374 1 71.00 CCAGTGCAGTTGTGTGCAGGTCCTCGTTTTCCGACTGCATTTCGGTGTGTGCCATACTTCCACCGCCCGCCCGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGT:1 + chr2L 5729981 5' + Idefix 235 2 73.27 TATGCATGATTATTTGCCTNGGCATTCACATACTAAAAAATTCAATTAGTGCTGCAAAGCCAGATAGTGAAAGTTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 - chrX 1716737 5' + hobo 2710 1 79.21 TTCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATACGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3R 30284226 5' + blood 7048 2 67.39 TTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCCTATCAGCG:1 - chr3R 1977619 5' - micropia 423 2 53.47 GATATTAGACATATTTAAACTACATTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 - chr3L 20032294 5' - 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chrX 8896245 5' + 1360 14 1 64.36 TTTGGTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr2L 12800961 5' + hobo 35 1 58.42 GTAATAGGGTATACTAGATTCGTTGAGAAGTATGTAGCAGGCAGGAGGAAGCGGTTCCGACTATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATCCATAGCCG:1 + chr2R 4618504 5' + INE-1 88 1 82.18 TTGAGGTTGTCCGTTCAAAAGAGTGTCCGTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 - chr3L 7215543 5' + copia 47 2 73.27 GGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATG:1 + chr2R 1922432 5' + gypsy 37 2 61.39 TCTCAGCTCTCCCAGACTCTCTCCCAGCTCTCATTGGGTATATAGAGGAGTAGCTATTTCTCACCGTGATTTTAAATTGTCGTCCTTCCAGATATGACTTT:1 - chr3R 30450471 5' - Helena 486 1 77.23 GGAGCAGAGCGGGGCGTGAAGGACAGACAAGGAGAGGAAGAGAAATGCCAATGTCAAGGCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 7971031 5' - P-element 2874 1 63.83 TGTAATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAA:2 - chrX 9816309 5' - BS 5046 1 67.33 TATGTTGCGTATTAAAGTAATCAAGAAAACGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 20555757 5' - roo 9026 1 71.29 CAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr2R 9061933 5' + jockey 4710 1 68.32 AACAGCTGAATCTTTGATAAGGATTCGGGGTTCAAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTC:1 + chr2L 5647367 5' - invader3 5421 2 66.34 AAGCCTAATAATGAAGTAGTAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCG:1 + chr3L 16691540 5' + G2 2778 1 80.20 TGGGCATTGATCACCGGCCACTCCGGCCAATCGTTAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 - chr3L 20079765 5' - mdg1 7420 2 63.37 GCTAATTGATATATGATTTGAAACAATTTAAAATCTAAAGTCGTTATGCTCAAAAACAAAAAAAAAAACGAAAAAAAA:1 - chr3R 17734779 5' + R2-element 3585 7 47.44 CCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr2R 15160319 5' + Tirant 8160 2 76.24 ACGGCTGCTTATCAGAAATTGTTTTCATTCCGTTTTATTTATACTGTGTCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAAT:1 + chr2R 18351148 5' + pogo 468 1 54.46 CAGCACAACAATCAGAGGTGAGCGCAAAATGTGGCAACTGCCCCCAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTAT:1 - chr3R 18896366 5' + I-element 245 1 56.44 ATATCCACTTAAAAACAACGATTTTAAGCAATATTATAGACAATTGCTTGTAGGGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAA:1 - chr3R 14224463 5' + Transpac 484 1 61.39 CCACTGAACCACCGAAAATGCTACAACCACGAAGTTTAGCTCATTTAACTATATGTGAAAGAAAAAATGATTTAATTGAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAG:1 - chr3L 3567078 5' + Doc2-element 253 4 73.00 GGCGCAACCTTAAGCTTGGCAATGGCGGCTCTTCCCTTCCCCCTCCGCCCCCATAAAGTATAAATATTCTTAATCAGACTCAATAGCCGAGTCGATCTGGC:1 - chr2R 8378944 5' + INE-1 100 1 45.54 CATTGCACTTGCCAGAAATCACAGCGTCACCCGTTGGGTCAACGACCTCACTTGCATTTGCATTGCAAGCAAAATTAGCAGCTACAATTACCGACTTTCGT:1 - chr2L 12656912 5' + Doc4-element 405 1 77.23 TAATGTAAAGAGCTGCTGCATTAAACGTTTTGCCAACGTCATCGCCAAACAAAACCCCAAAAAAGCTCAATTGCATGATACTATCTGCAACTCCACACTAA:1 - chr2L 22168771 5' + BS3 269 1 69.31 TAATTCTATACCATTATTTCGCTTTGTTCTCCGCATCACAACAGAGAATTCGCAATATTTTGGCATATTACTCGTGTAGCCATTCTTGTAAACAACTCTTA:1 - chr3L 13284616 5' + 17.6 198 2 74.26 TCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCG:1 - chr2L 23295880 5' + micropia 14 2 61.39 ATTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCG:1 - chr3R 15021691 5' + invader4 2743 1 42.86 CAACAAGAAGTGGAAAAAGCCGAAAGGCATGGCGGCATTTGGAAAGCGCACTCTTCGCTCCAAGATTTTGGAACTGTGCTTGGCAACGATGGAGAGCAAGA:1 - chr2R 21900368 5' - Doc4-element 130 1 69.31 CAAATACGCGCGGTGTTAANCTGAACTTGGCACCGTTGGGAAGGGGGGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCTGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAG:1 - chr2L 15955055 5' - Doc3-element 401 1 68.32 TCAAACAATTTTTCAGAGACTGGTTCAAGTACAAAGTCAGTTCAGCTGCAGTCTGGCTTCTTCGCTAGCCCAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTT:1 - chr2R 9640435 5' - Max-element 294 2 67.33 TTTGCTCGTACATATTTAACATCTGTTATATTAGCAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCA:1 + chr2L 22643495 5' - Doc2-element 4363 1 65.35 ATAGCAGATTTTATAGTTCATCTTTGACTCTAGGCTTCAAGTCATCGACTTGGCGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGA:1 + chr3R 1203160 5' - Rt1a 5024 1 53.00 AATGCGACTCCAAAGGCCGTTTGAGAAGCGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGAAGAAGCGACAGAGTTCACCGTCTGCAATGCCAATTTTGTGCAAATGG:1 + chrX 21976898 5' - baggins 5166 1 65.35 ATTGCAAGAATTTATAAATAATTTAAGTATTCTCCCCCTTAAGCGGAAATATGCTTTATTTAATTTCACTGTTTCTGTTCTGCTTGTCGGAGCAAAAGAGG:1 - chrX 3040259 5' + R1A1-element 4895 1 80.20 TTCTGACTAGACCGCTCCGGGATGTTTAATAATTTTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAG:1 - chr2R 5800287 5' - roo 157 2 65.35 TAGGACTAGAGCTCGACTGNAGGATAAAGGATTCGGGCTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chrX 4279494 5' + blood 7048 2 64.36 AGATAATCTACTCGATCTAATACAACTAAAAATTAAATTCATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr2R 19430799 5' + 412 36 2 63.00 ATAAGTTAACATCGGCTCACGTTACAAATGCAAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTA:1 - chr2R 19430523 5' - 3S18 297 2 67.00 TTTTGTTTGTTATTTTTTTATGTTGACAAGACAATTTGCCACATACATAACATAAGACGTCAGAAGCACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr2L 10171646 5' + 297 1 2 46.53 CGACTGATGTTCCTGGGGTNCAGAGGCTAAAGTTTAATTGGCTAGTTTAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTAC:1 - chr2R 9626920 5' - mdg3 5257 1 61.39 TTTTTTCACAGACTGCACANTCGAGTTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACTCGG:1 - chrX 18983329 5' + Stalker 403 1 74.26 AAGCAATTTAGTAATTTTTTTCTACACAAATTAAGCAATTAAGATAATCACACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 + chr3R 5993270 5' + Tabor 27 2 52.48 ATTTATTCGTGTGTAAAATTTTAATTGAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 + chr3R 15530068 5' + mdg3 5299 2 68.32 ATTCATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATAATAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAA:1 + chr3R 20001628 5' - FB 70 1 61.39 TCCTACGCGAAGAGTGCAACAAATGTTTGGTGGACAACTTCGGGCCAACAAGGTAAATGTTAAGGCATACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr2L 16548253 5' + P-element 8 2 71.29 TGGTTGGGATTTTGGCAATNAGGATTGTGAGGACGAGGGGCTGGCATGCAGTGGCACCCCTCTAGGCATTCACCTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATG:1 - chr2L 17166638 5' - flea 4855 1 76.24 GTGAAAGGATTTTCTCATTACCGGGAAATCAGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 4064653 5' - roo 9026 1 67.33 AAATATTTGATGGAAAAACAAAAGACCAATATGCCTTTTCTATCCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGG:1 - chr2L 17515733 5' + invader1 111 2 68.32 CACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTAT:2 + chrX 21772503 5' - gypsy3 6535 1 80.20 CCGCCTTCTCCAACTGCGTTATCTACAACATCAAGGAAAATTTCTACCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACG:1 + chr3R 16615922 5' + Doc 4535 1 54.46 TGATTCAAAGTGCCTACACCAAGTGGACCGAAACGGTGCGAGGCCCTAGTAGAACCTACCATACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3R 4646296 5' + 297 2 2 74.26 CTGGAACAGGTGGCACTTGGAGCTTACCACAGTCTGTTCTGCGACAAGAAAGGCCACCTGTATGCTGTGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCA:1 - chr2R 16319965 5' - Doc2-element 386 1 74.26 GTTGCGATGGACACATGTCCACAGGCGAGGATAGCTAAATAGAAGCAAATTAGGAGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 2029683 5' - roo 386 2 54.46 ATAGAGGTGCATTATCAGCTATTGATTATTATCAGAATTGATCAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chr2L 22256816 5' + F-element 44 1 58.42 GGCAACTTCGGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chrX 19607321 5' + Tirant 17 2 64.36 TTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAG:1 - chr2R 17402769 5' - invader4 278 2 75.25 GAGTAAAAAGGGTGCCCTCTTTTCTTTCCCTTTGCCATTGTTTATTGGCTTATGCTTGGGGTTAACAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 + chrX 1048721 5' - Stalker2 392 2 67.33 TCTGAAATGTTTATAGCACGTAAAGCGAAAAAGGTTGAATATAAACAGCGAAAAACGAGGTGTGTTAGCAGAGTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCT:1 - chr3L 7997779 5' + I-element 365 1 74.26 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 19450188 5' + roo 55 2 52.53 CTATGCAATAGAAACTTAGCAGGAGATTATCTATCCTTTTTCGAGCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 11415746 5' - roo 9043 1 55.45 AAAGCCTCCCACGCAGATANGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGC:1 - chr3R 20892053 5' + invader4 52 2 69.39 ATTTATTTATAATACAAACGTCATTGCACATTTTGCACATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 - chr2R 19651237 5' - flea 4981 2 62.38 TGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr3R 24228979 5' + 297 5 2 74.26 AATTCTGTTCCGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTT:1 + chrX 12131139 5' - HeT-A 6022 1 84.16 ACTTTACAACCATATTTCCTATGCAATAGAAACTTAGCAGGAGATTATCTATCCTTTTTCGAGCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 - chrX 11415764 5' - roo 398 1 64.36 GTTTAACAGCGTACGCCGANAAGTATGCTGCGACATTTGGGCGGTCGACAAACTGGCGTCTACAGTTTGGGTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAA:1 - chrX 14961106 5' + jockey 4640 1 69.31 ATATGATAAAAATACTTTAATAAACAAATTGCAACAAATTGTTAAGTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2R 16453506 5' + roo 28 2 54.46 CCAGCGAAACTTAGCTTGAACCAACTTTGGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCGAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chr3R 12599341 5' + BS 43 1 69.31 TAAAATGATCGTAAAAATGCAGTGAAAAATAATTGTAAAACAATGGTTTTCCAGAGCTACCGCTTTTTGGCCTTGGAGTATAAAGAGAAGCCTATCGAGTT:1 - chr3L 11352455 5' + Bari2 620 1 76.24 TTCACATGTCATGGGGAAAAGTTGAAAAAAGTAACTATCGATGGCTTCATAGATATTGCCATATACATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGA:1 + chr2R 16068597 5' + Burdock 6141 2 72.28 ATTTACAGTTCAATTTTTCTCGGTTATGACGCTAGTGCTTAGGGTTCTCTATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2R 22659095 5' + 297 20 2 60.40 ATCCTAACGATGACACGGATTACTTCTCAACTATCGATTCAGCACAGGTTAAAATACATGCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr2R 15794781 5' - pogo 2087 1 63.37 AGCCAATCCCCCAGACAATCCCCAAGCCAAGCCAAACCGAACTCAACTAAACTGAACTAAACAGATCCGATCCACACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chrX 19394849 5' + I-element 2 1 76.24 CGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGCCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678155 5' + Osvaldo 18 1 68.32 AAGCTCGCTTTAATTTATTTTAATTCATTCTTCAGCCCCGCCCTTCTCAGCGTTTGATGTACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTT:1 + chr2L 3983495 5' + accord2 7244 1 54.46 TTGGGGTACTCAAGTAAATCCAACGTAGTTGCCAATAAATGATATACGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAAATGAGGATGTAACAGCAAG:1 + chr3L 21642469 5' + I-element 443 1 51.00 GCGCTATATATACATACGTATTTGAAATTTCTATTCAAATTGGATGGATCACACTTCTAAAAAGAAAATATATCTCGTTTTTTTTTTGTTTTGAATTTTT:1 - chrX 11214304 5' - Doc 4697 1 89.00 GGAGGAATTGAGAAGTGGATTTGAGCAGGAAGTGTGTATAAATATGCGTATGCTGTGTGTGTGTGTGTTAGTGGCAAAAAATGCCACCTTTGCAGTTCTCT:1 + chrX 10434526 5' - hobo 2 1 53.47 TAGTATTTCCGCAGCCCCAAAAGTAGGCATTAATTTGCTTACAAATCTATTCATCTAATTAATCTTCATCCCCAGCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGA:1 - chr3L 4901122 5' + jockey 4672 1 77.23 CATTTAGACATCGGGCTATTTGGATTGAGTCACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr3R 28447354 5' + blood 8 2 70.30 TTAACGGCGAGCTTTTATCTCCATTTTAGATGTTATTATGTTCTCTTACTCAAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTC:1 - chr2L 17967288 5' + Doc 378 1 51.49 TGGTGGAAAAAAGACTAAGACAAAAATAACGGAAA:1 - chr3L 21363915 5' - S-element 285 1 54.29 TATGCATCAATAATAACCCNGAAACGGTAGAGAAAATCTCTTAATGAACCATTATTAATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr2R 13248808 5' + 297 6590 2 70.30 GGGCAGGGCAGACGGGCTAAAAAATTTAAAAAAAATAAAATA:1 + chr2L 12287580 5' + TART-C 11096 1 54.76 AAGTGTGGCAATTATTTTTAACAACGTGTTTGCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTCTGTGCGGGT:1 - chr2L 3733164 5' + hobo 44 1 67.33 ATACACTGCCCGTTCCTTCTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 4769533 5' - copia 233 1 54.46 ATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATT:1 - chr2R 5532320 5' + G4 3781 1 62.38 TTTGCTGGCAATCACATAATTTATGCGACAAGTTCTACATTTTATTTACGTGATTGTGATTAAACAAATAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATG:1 - chr3L 6806525 5' + R2-element 3430 1 67.01 TTTTATATTGATATTAGAAGTTTGTTATGGGTCCGAGTATCTATTAACGTATTTTCGTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCTAT:1 - chr3R 16823255 5' - baggins 5179 1 62.38 GAAAAGGAAAATTTTGTTGCTATTATTATTTTGCCCGCACTCGTGCATTCGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCA:1 - chr3L 17588466 5' - F-element 193 1 58.00 ATGGAAATGAGAGAGAAACGTTAAGAAGCGTTAAGAATAACCCCGAAAAGTAACGCGTAAAATCCGTAGTAAAAAGATCTAGAAATCAAGGTCTCGTAATC:1 - chr3L 10678145 5' + gypsy10 419 1 61.39 GTCGGCGAAAAACGGAGATAGAGCGAGTTCTTTGCGCTGCTAGCCTGGCATCCTTGGATCATTAATCATCCTTTTTTGATTTTTTTTTTTATAATGTTTCT:1 + chr3R 22817283 5' - jockey 4997 1 62.38 ACCGACAATCTTTCAACATACAGCGACACACCGCCGAGCAATAATACACAACTAAAGAGGCAAAATATAAAGAGCATATGCAAATTTAGGCAAAAGGCGTT:1 - 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chrX 19192432 5' + INE-1 15 1 73.27 ATGTGTAACCAGATGAAAGGGTATAAGCTGGCAATATGAGGCGATGCAACAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGT:1 - chr3R 8049990 5' - Doc 308 1 56.44 CATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3L 23871322 5' + Doc 33 1 50.50 GACAATCGCTTCTTTGTGTTTTTCAAGAATGGCATCCATGCAAAGAGTTATGAGCCATTCTACGCCAATATACATAGTTGTACCAAAGACACTAGAATAAT:1 - chr2R 7093804 5' + Tc3 239 1 61.39 AAGAGGCGACAAGTGTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chrX 19887102 5' + P-element 59 1 22.77 GTTTTTTGAATTTTTCAGAGTTAAATATTCGAAAAATCATGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGT:1 + chr2L 6108929 5' - Idefix 45 2 62.38 ACAGTGGGCCGGAGCCCTCAAGCTGCAGCTAGATCATACTTTAGTTTATATATTCTTGATCATGTCCGTCTGCTCGTATGAACGTCGAGATCTCAAGAACT:1 + chr2R 4343332 5' + INE-1 141 1 58.42 CAAAAACCGGCGGCCTTACTGGTATACTACTCCCACCGATCTCAAGTGCCACCCAATATGAATTACATTATAGGGTGGGAGTTACAAACCTGTGGCCGAGG:1 + chr2R 18290237 5' + accord2 7437 2 59.41 AAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - 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Tirant 348 2 77.23 CAAGTGAGGAAATAAGTGANGTGACATAAGGTAGTGCGCAGGGGTATATAGAAAAATTATTTAAATGTCATAAACTAAAAACAGAAAAGTCAACTAAAAAA:1 - chr2L 339172 5' - Tc1-2 1389 1 58.42 AAGGGTTTGGTATGCTAAAATGTATCTTATTTTAGGATTTATAAATGAAGACACTGCAGGGAATAAACAACGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 - chr3L 16759795 5' + Transpac 4 2 34.65 AATAGCTGGGAAATTAGGANGCCAGGGTATGGGTTAAGCACTTGCACTTCGTCGACTTGGAGGAGCAAATAGTTAATAACATAAAATAAATAAATAAATG:1 + chr3R 17822814 5' + Doc3-element 80 1 66.00 CTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCC:1 + chr3R 1440183 5' + G-element 56 1 75.25 TAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCA:1 + chr3R 10741098 5' - 1360 3354 1 62.38 GAAGAACCGCAACTAGTGANGCATTGGGGTCAGGAAAGCTCGCGAAGAGATAGAAAATCTTTATTTGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2L 1776052 5' + roo 8 2 70.30 ACTTGGTTACTAGTGATAAATGCTGGCGATGGCAGACCAACTGTCAGTCTGGCAACACAAGCCTTAATCATAACAGAACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chr3L 22016424 5' - INE-1 537 1 59.00 TACACCTTATAATGACCAAGCCCATGCCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGTTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTC:1 - chr3L 11892909 5' - R1A1-element 4927 1 70.10 TAAGTCGGTCACTTATCATTTCGAAATTTTTTCTTTTTTTAAATTTT:1 + chr3L 22624764 5' - TART-C 11096 2 87.23 AACCGGCTGGCGGGCCTGGTACTTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr2R 11664310 5' + Tirant 8135 2 56.25 CAAATGTTTGGTGGACAACTTCGGGCCAACAAGGTAAATGTTAAGGCATACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2L 16548234 5' + P-element 27 1 52.48 GAGCCATCAGATTCTATCCCATACCGCAATCAATCAAATCCCATCTAGGCACACATTCCGTCACATAGGGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr2L 10020866 5' - hobo 2932 1 72.00 AAGAAGAAAACACACGTTAGTCATATCATGCTGTGGATTCTTGACTTACATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAG:1 + chr3R 19218920 5' - HMS-Beagle 6918 2 52.48 CAGTGCCTCGGGCATTGGCGGCGGCACGGCCTCGACGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTC:1 + chr3L 6122160 5' - INE-1 157 1 63.37 TTGCAGCTTCCTCTTTTATGCGGTTTCCCCTTCCTTTTCTTCTAACGATTTTTCACTTTGCTTTGAAGTTGGTTTAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - 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chrX 20844351 5' - copia 256 1 55.45 TATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGC:1 + chr3R 1440185 5' + G-element 58 1 77.23 CCATTGGGTGCGTGGGATGAGCGGGTTGTCATAAATGGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGGGGCGCACGCCAGTGTGCATAGACATTTGAGAATATGATG:1 - chr3L 24058998 5' + invader4 197 2 77.23 CTGTGCGCACGTTGCTGTTTTCGCACTTTTGTTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGG:1 - chrX 14696173 5' - F-element 477 1 77.23 TGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCT:1 + chr2R 21776309 5' + I-element 231 1 62.38 ATCAATATAGTAACAATTATAGAGATCCTACGGCTATCATAGTACACACATTTACTTTCATCTGCTTCATCGTCATCATATAAATAAAAATAAATACATTA:1 + chrX 12474032 5' + diver2 447 1 51.49 CTGAAGCTTTACATTGAGGAGTCGAAGGGTATGCGGTCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:2 + chr2L 9075561 5' + 297 19 2 55.45 AATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCGCTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr3R 10741093 5' - 1360 3359 1 59.41 AAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCGCACTCGCACTAACTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGTGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTT:1 - chr2R 1461346 5' + INE-1 580 1 85.15 CTAACTGTAAGTCGCACAAACGTTCAAATCTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 20425359 5' + roo 46 2 70.30 AATTTGTGGCCCAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr3R 6761063 5' - blood 7353 2 60.40 CACTGCTTTTTATTTTTTANTTAGCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 16873822 5' + roo 8716 2 80.20 CTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAG:1 - chr3L 13142053 5' + F-element 429 1 65.35 GATACGTTAAATGCCGCTATCAGCAGTTCTTGTTAAATAAGAGGTAGTCATTAAAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 8702768 5' - roo 391 2 56.44 CATTTCTTTCTACAGATTTCCCCTGTCCCCTTTCCAGCTTATCTATCTTTTGCTATTCTTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTG:1 - chr3L 14389722 5' - Bica 425 1 57.43 ATCTCTACACATAGAAAAGNCACGACTTAGCCCATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAAT:1 - chrX 16519545 5' - Cr1a 469 1 73.27 AACTTGCCTGGAAAAGCGGTTTTAAAAGTTGCTAAAAAGTTGTATTTACAAGTGTCATAAAACTTTATTATTTATGTAATTTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 18585965 5' + Doc 34 1 50.50 ATGACGCTGCAGGAGTTGTNGGTACTGAGTACTCAGCTCGTTTATGGCCAAGACTTTGATTTGATGGGTGACATCTTGTAGTCCTAGTGCTAGGACATTAT:1 + chrX 2761962 5' - G3 4404 1 72.28 CAAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 6761053 5' - blood 331 2 70.30 GATATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:2 + chr3R 1440153 5' + G-element 26 1 54.46 TCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGA:1 + chr2L 23299999 5' + invader4 366 1 78.22 ACCGGATTGTGCTCGAAATTGTCTGTTCACTACTATTATTATGTTTTGTTGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTGTTATTATTTG:1 + chr3L 18972759 5' - Rt1b 5147 1 62.96 GCGAATTTCGCTACGATCGGTGCACTATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr2L 12064748 5' + opus 157 4 75.00 GGGGGTGTATAAGTCCTCCTTAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGA:1 - chr3R 22237069 5' - 17.6 7249 2 61.39 GTTTTGCATGCAACAGGGCGCGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2L 6647652 5' - 1360 3367 1 57.43 AACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 6399539 5' - roo 351 2 79.21 AAAACACACACAACGAAATATCTACATCTGCGTTTGTTTTTATGTTGCAACGGTCTCTCGCTTTGCTCTCCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3R 7109871 5' + P-element 7 2 72.28 CACAAAAACCATCAAATTGTTTCCCTTTTTTTTGGGTTATGAGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr2R 23111382 5' - hopper 1385 1 55.45 CCATTTCTAATTAGAAAAGAGTAGACGGGCCATTGATTTCCAACTGGATGGAGAGATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 + chr2R 12343872 5' + Burdock 17 2 60.00 TGGTTAATAGATTTTCTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACCACA:1 + chr2L 12764989 5' + Doc 55 1 54.46 GGATTACGACATCAAGGTTGGAGGTTCGGGTTGTTTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTA:1 - chr2L 5360672 5' - F-element 4401 1 65.35 CGTTCTGAAGCAGAACGAANTGGATCTGTCATCATGCCATATTATTGAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr3L 23219233 5' + 1360 30 1 55.45 GAAGTCGTTATCCAGGAAACCTTGCTCGTTTCCGCATCCTTTCGCTTTGAATACCCTTGGGAAGTTGGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3L 1904253 5' - hobo 2930 1 68.32 CCAAATCCGAGCTGTAAGAAATCAATTACTTTGCTATGCGTAGCCGTGCCATACTCATTGTTCACGCATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 2832810 5' + roo 8686 2 59.41 CGTGGAGCAGGGTAAAGTGACCTGTATCAATAAATTGCGTTTAGGGCGTTAGAGTTTTTTTTTTGCAAATCGATAGAAATT:1 + chr4 400332 5' - INE-1 309 1 59.26 CCCGCTTCCTGCTTGAGATNAGAACGGCTTCAGCTGCTTCAGGGTCGGTAGACTTCTTCTGATGACGCCGCCTGAAGCCAAACTGGTGATCGGGAATCAGG:1 + chr2R 4932060 5' - G7 353 1 51.49 TATTTCTGGTCTGCCATAATGCATTGTTTTGTAGTATGCGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr2L 2622722 5' + blood 7062 2 71.29 CTGCGGGTCAGCTTTTGTGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTC:1 + chr3L 7463132 5' - Ivk 4943 1 78.05 CACGAAAGGACATTTATTAGAGTTGGTTAAACAAACCATTTGCAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACG:1 + chr3R 16508493 5' - I-element 5014 1 60.40 GACACGAGATGAGCTATGAACCCGATTCATAATAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 4916480 5' + hobo 41 1 66.34 AGAAGCACTTTTCTTTATTCAGTAGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr2R 4850780 5' - roo 9020 2 80.20 TCGGTCCAAACCAGCAACAAAGTGGCTGTTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:2 - chrX 14979196 5' - hobo 2930 1 42.57 GCTGAAACCTCGGTAGTAAGGCCAGAAATAAGGCATATTCTGCCCAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr2L 13621951 5' + opus 7143 4 54.46 AATGCCCGACAAAAATAATTATAATACCCGGTTTGGTTTGGTTGGTTTAAAATCGGAATAATATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCAC:1 + chrX 9416793 5' + gypsy4 6585 2 74.26 TCAGCATTTTAGAATAAGCATAAATATACCAAACCAAAACTATAAAAATGAGGAGAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr2R 4943249 5' - pogo 2085 1 63.37 TTTCATAAATATTTCAAACCTTAACAACTTTTCAAATTTATAAGCGTACTTGATAAGTAGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGT:1 + chr3R 5503327 5' - blood 7373 2 62.38 CAAAGCCAACTTAACATCCTTGGCCATTTATTTAAAAACTAAATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr2L 16071195 5' + 412 12 2 67.33 TATAGCCAGCTTTTTTTCGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAA:1 - chr3R 9121513 5' - roo 384 1 52.48 ATCGGGCTATTTGGATTGAGTCACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr3R 28447363 5' + blood 7028 2 63.37 GACCGACATCGTTGGATAATTCGTAGAACCGATATGGAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 + chr3L 7099782 5' - 297 361 2 65.66 TTTCCTTTTGGCGCCGATGCGAAAGTAGACACATGTTTCTATTTCTCTTACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTAT:1 - chr2L 8582929 5' + accord2 196 1 53.47 TAGACAAGTAATTATTTATTGCTTTTAAAAAAATTTCAAAATGTAAAAAAAATCTCAAGTTTACACAAGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 - chr3R 14228117 5' - Transpac 5225 2 76.24 GAAAAAAATTTGACAGGTATACATATCTATACAGCAGTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTA:1 - chr3R 12379339 5' - 1731 4587 1 65.35 AGTGAACTGCTGCGCGTAAGTATTCCACCAAGATTATGGCCTATAAATATATATACTTATATATATACAGCCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTT:1 - chr2R 16068719 5' - Burdock 6390 2 71.29 GTGAGTCACTCTGTGCACTCGAGCACAGCTTAGCTTACGCACAGCTTTGGAGATGGTAGATGGAACCACATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGC:1 + chr3R 27605245 5' + opus 2 2 77.23 CGAACTTTAAGAACGTATAGCTTTGTGTATCTACAGTATATTCGTATTTTTATGGGCTTTGAATAATAATATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr3R 15523269 5' + 412 6 2 73.27 CATTTTTGGCTGTATACTTACGTGTGCGTGTTAGTATCTGTGTAACGGTGTATCTGTGTTGCTGTGCATCTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr2L 20269078 5' + hobo 3 1 77.23 AGTCGGAACTGCCTGCAGCTTGCCCCGTGCATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTA:1 - chr2L 12884374 5' - HMS-Beagle 204 2 69.31 TGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCAAGA:1 - chr3L 24761224 5' + 1360 89 1 77.42 TATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATAT:1 + chr2R 5284572 5' - Doc4-element 2604 1 62.38 TATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGA:1 + chrX 7480759 5' + Bica 339 1 64.36 CGTCAACCAATTCATGCTAATCACTGAGTAAAAAGATGTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 + chr2R 5277139 5' + invader4 34 2 64.36 TTTTCCAACTGTTCTATAATTAAACATATATATAATCTATCTAATATAATCTATAATCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGAC:1 - chr2R 14088082 5' - F-element 4518 1 65.35 TTACCAGAACTGCGCCAAAAATGGTGTGTGTTTCTCTTGCTATATGGTTTTATATATATTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTAT:1 - chr2L 11932153 5' - Porto1 4498 1 66.34 TTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAATTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACA:1 - chr2L 13268395 5' - TAHRE 10420 2 47.52 CAGCTTTGGTTCCAAAAGTTACAGTTGCACAAAGCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTAAAAACATCCAAAGAGACTT:1 + chr2R 11246085 5' + F-element 4380 1 70.30 AACGGGGGGTGGCGAGCGGGGGAGAGCGGCCTACCGCCGCTGGTATAGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTT:1 - chr2R 11364460 5' + R1A1-element 5041 1 53.47 TGAAAACAATATTCACATGTAACGTATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 + chrX 9816283 5' + BS 5045 1 82.18 GAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr3R 9116500 5' + jockey 58 1 71.29 CCCGAAATCCAAGTAACTCTGTACTGCTTCAACACTACCCCTCCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chrX 7360604 5' + 1360 37 1 79.21 GGAAATCCAACCCTAGTTAGTAAAGTAGAGCTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACTTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCT:1 + chr3R 5025795 5' + Chouto 190 1 74.00 TGCTTTGGGTATTTTATTTATGTTCGTTATGTATTTTTGTAAATTTGTGGGTCTGTCATGATTGTTGATTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTT:1 - chrX 7794333 5' - I-element 145 1 65.35 AACACTTTTATTTTTTGACAAACTTAACAGCCAGCAGCTGCAATCGTTCTGGTCATCAGCATTGTTTATTTATTACGGCCTCCAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 10556425 5' + G2 3074 1 77.23 CTAACCCTTGTAAATCGGAAACTAAGTCTACATCGCTACAACAACTACTAACCCTTGTAAATCGGACACCTGAGCCTCTGCTTAAGCACCAGAACG:1 - chr2R 1021454 5' - Rt1b 232 1 70.83 ATCCTTGGCCATTTATTTAAAAACTAAATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2L 16071180 5' + 412 27 2 52.48 TTTTTCATATTTCTTCGCATGCCGGGCTACACGTGTTGGTAACATATTTTTGGACATTATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3L 4923772 5' + jockey 20 1 63.92 GAGTCCAATTCCCAGCTCTAGCTCTAAGTATTCCTCCAACTCTCCATCTCGTTGGCATGTGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3L 6619750 5' - 412 480 2 65.35 TCCAGTTGAGATCGTAATTAATTTCTGGACTCTCCCCTGTTTTTATTTTCATTTCTGAATGCAAATGAATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTAAGAGT:1 + chr2L 18927169 5' + Cr1a 4057 1 74.26 ACCCACTGTGCCTAATTAGTCAAGTGCATAAATGAATGAATCTGAATTACAATATATATAGTTTTGTATTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 + chr2L 7180583 5' - pogo 2099 1 68.32 AACTTTGAAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 11814483 5' + blood 7042 2 54.46 TGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chr2R 15160321 5' + Tirant 8162 2 78.22 CAAATAGCTTTAAAAACATTCTTCCATTTATACTAAAATTTTGACCTTTGTCTCTGTCACTTTCAAGCTTAGCTGCTGTAACCACCAGCACGGTTGCCTCT:1 - chr3L 26305988 5' + Doc4-element 273 1 64.36 TAACATCCATAAATATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3L 6399565 5' - roo 9041 1 53.47 GCTTTTTATTTTTTGTTTAGCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 16873826 5' + roo 8720 2 83.17 GGCCAACAAGGTAAATGTTAAGGCATACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr2L 16548211 5' + P-element 47 1 30.61 AACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 - chrX 21939116 5' + HMS-Beagle2 36 2 60.40 ATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACT:1 + chr3L 24996097 5' - 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Doc 496 1 53.06 AGAGATGCATTTTTGCTACAGACAATGGATTCGCCGGTGCAGAATATTATTATTTACGTTGAGAGGAACTTTCCCTTTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCT:1 - chr3L 8809713 5' - Gypsy6A_LTR 256 1 62.38 AATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCG:1 + chr2R 4673592 5' - Quasimodo 7323 2 76.24 CCTTTGATGCCAAAAGATCAATGGAATTGGCTGAGGGTATTTGGCAATTTGTCGCTGAAATACGGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTG:1 - chr2R 14924831 5' + Tc1 1270 1 68.69 ACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2L 12485443 5' - roo 353 2 81.19 TCAAAATTTGATTTAATTAAGTCATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGA:1 + chr2R 7940791 5' + Juan 37 1 52.48 ACGGCCAAAGCGACAGGCTGAGATACATATACTTGGCAACACGCACGGGATATGCACACCAGAGAACTGAAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr3R 26350814 5' - hobo 2929 1 61.11 GGTGAAGTGGGCCTCGAAGTGCAGCAGATCGCATCACAGAAAGCTAAGAACATCTTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTTCTTGCT:1 + chr2R 5471052 5' + F-element 4218 1 70.30 ATTCGTGGCAACATTGTGTGCCCCAGTTGTCGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - 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Tc1-2 11 1 72.28 TTTTATTTTTTCATTAGGCAAGAAGTTTACGGAGCTTGTAGACATTATAGAAATGTTAAAATATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 10661021 5' + roo 13 2 66.34 ACTTAATATCTATTAAAAAAATAATCAATTATAGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 17098418 5' - roo 9030 1 78.22 CCAAGGCAACTCAATCCCTCATCAAATAAAATAGGCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3R 5122265 5' + Doc 40 1 66.33 GCTGGCATGTTAAGTCTGCTAATCGGCCAGTTCGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAA:1 + chrX 22876352 5' - F-element 4416 1 66.67 GCGAAAATTACTCAAATAAAAGTGGAAGAACCAACCTGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGT:1 - chr3L 18403291 5' + Doc 283 1 63.37 ACAGTAGTTTGTGTGTTTTTTACTTGTTTATTGTTTTCACTAGTTTCTTTTGTTTATCTTGTTCACAGGTTTTTAACACATATAAATATGTGTTAGCGTCT:1 + chr3R 8817425 5' - Porto1 108 1 77.23 AAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCT:1 + chr2R 17402701 5' + invader4 18 2 61.39 CAAACCCTTGGCTTTAATTTTCCTCTCAGGCGGGTGCGCAATTCTGCATATATGTTCAAATAGAAATAAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGGA:1 - chr2L 2622796 5' - blood 369 2 70.30 AGATGCCATGATAATGCATTTGACAGTTGCAGTAGTTCCTCCATTTTTTCCACCATTTTTTCACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr2L 16566258 5' + 297 6585 2 74.26 CCCCATCGTCACCACGTAACCAATGGAACAACAATTGGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACT:1 + chr3L 15055024 5' + Idefix 7150 2 73.27 TATTGTAAGCTCCAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr3R 18549933 5' + pogo 53 1 53.47 CCCCAAAAAGGCGGACAACACCCCCCATCCCGCCCCCTGGCTTCATGTCGTCATCAGTTTCGGTTTTGTTTCTTTTTTACATTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 4861986 5' + hopper 141 5 82.00 TTACATGTTTTGTTTCCCAATTTTCAATTGTGCTGATCTGTTTAAACATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 5043362 5' - roo 9047 1 54.46 TCAATTGTGCTGACTTCCAAATTCTAGTTTTCCCAACTTCTCCAGCTTCCTTTGCGATATGTGTTTGTACATAAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTACATG:1 + chrX 18533942 5' - accord 7026 2 70.30 CTAATTCGTTGCGTATTGTGTTTTATTTCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2R 9369889 5' + pogo 44 1 73.00 GAGTTGCGTGAGCAGGGACCCACCGCGGAATGGCCAAGACCATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAA:1 - chr3L 1219216 5' + 412 126 2 59.41 AATTCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 27071854 5' + jockey 14 1 71.29 GTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGG:1 + chrX 21852449 5' - gtwin 449 2 57.43 AAATGTACCTAATTCTATTCCGGTGCACTTCTAAATCTTCTGGATTTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 28333510 5' - pogo 2077 1 55.45 TAAACGTTTTGCCACTTTGTTAAGACCCGACCTCTCAATATGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 1930502 5' + roo 8700 2 61.39 TTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGCCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGC:3 - chr3L 23678159 5' + Osvaldo 14 2 66.34 GTGGCCTATCTATCGACTTNTTTGCATGTTTTCTGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTA:1 - chr3L 6900479 5' - mdg1 10 2 67.33 ATATTTTACGAAACGGAGGCAAATAAATTGATTACATTATTTATCAGAATATTATCCGTAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATG:1 + chr3R 11284179 5' + Dm88 4352 1 53.47 AAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 + chr2R 5214988 5' + F-element 60 1 74.26 CAGAAGTGAAGGTGTGCTCCTGATTGCTCCCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 10020789 5' + hobo 45 1 68.32 TAAGGGCCATCGCATTTCGCATTGCACTGCTCGTTCGATTTTGCAAAGCGCAGCTCCAAAAAAAAAACGTGTTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2R 19616107 5' + hobo 2 1 77.23 CATATATATAGTGGGTATAATATAGCCGACGACTATATAGTAAAATGCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGA:1 + chrX 10370993 5' - X-element 4279 1 55.45 GAGAATGCCATAACGCCCCNAAAGCCTGGCTATTATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGC:1 - chr2R 5813640 5' - HMS-Beagle 7006 2 66.33 TTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 - chr2R 5651909 5' + Tirant 24 2 57.43 TACGCACAGACTTACTGGCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACC:1 + chr3R 18541233 5' + jockey 4583 1 49.50 TCCAATATGGGGAGACAGAATCGCCGCAGGGAAAATCTAGGGGCAAGGTGGTGGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGG:1 + chr3L 10428528 5' - HMS-Beagle 67 2 56.70 CCATTTATATATATTTATTTATACCTAAGTGCCTTCTTTTGTGTCTTAGTAAGCGTGTAGCGCATTTTACCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chrX 17098333 5' + roo 8670 2 74.26 CAAGAAAAGGTTCTTTGCACCACGAAAGATACTTTTCAATAAAAGCGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2L 7161373 5' + pogo 28 1 55.45 AGGGGGTTGAGAATCCGATTACGCAATCGCTCTCTTGGCAGCCTAATTTTACATTTTCCCTATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 8674113 5' - roo 398 1 68.32 ATTTCACTGCCCATGGGGTCAGTTTTATGGAAACACAAAGACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAAC:1 - chr2L 7357259 5' + G2 145 1 60.40 TTAACCTCTGGGTAGGCAATATACCCCTGATACCCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:2 - chrX 8896221 5' + 1360 38 1 64.36 AAAATCGCACACTCAAACTCCCACACAGCTGCGTTCAAAATAATAGCAGCAGTTACGAGGATATTTCCAAATAAAATGAAATCTTCTCATTTGGGATTTTA:1 + chr3R 13565696 5' + roo 9069 1 67.33 GATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATCAACGTCGAGATCTCAGGAACTA:1 - chrX 21587707 5' + INE-1 142 1 60.40 TTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGT:1 + chrX 21087590 5' + mdg3 5287 2 57.43 AGGAGCCCACCCAGCAGGAAGATCCAGAAATAGGCACAGTGGGACGAGAGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTC:1 - chr3L 1124671 5' + P-element 335 1 55.45 CTATGCACACACACATTCATAGACTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATT:1 - chr3L 17136010 5' + BS 52 1 76.24 GGAAGAGGACGGACCCTAACCAAGCATAAATTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTATGTA:1 - chr2R 5898272 5' - Porto1 4225 1 70.30 TACAACTTTATTTCCCAATAAAAGTTGAGACAAGATCTTTCCAAATATTTTAAGCTCAATAGAACAATAACTATTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAA:1 - chr2L 16962891 5' - 1731 311 2 48.51 GCATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGACTCGACTCTGTCCGCCCGTATATGAGCTATGAGATCTTAAGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAGATT:1 + chr3L 20756358 5' + INE-1 164 1 69.31 ACACCATTTCATTACACAACACACACAATTAATTAATAAAACTTCAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 + chrX 354921 5' + I-element 38 1 55.45 AAATCAATTAAATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 27071863 5' + jockey 23 1 62.38 GTGTCGCTTTAAAATAAAAGGACTTTAGTTTCATTCGGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAC:1 + chr2L 2016755 5' + Doc 50 1 65.35 ATGATGGCAACCACATTTCTAATTCGTTGCGTATTGTGTTTTATTTCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2R 9369907 5' + pogo 27 1 55.45 GGTGCCGAATCGACCAAATCTCTGGGTCCACTGATAGCCAACAACCATCCGAATCACAGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCCGACT:1 - chr3R 5177823 5' - Circe 7180 1 63.37 AGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGCCTGGAAACACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAA:1 + chr3R 20683400 5' - 1360 43 1 54.46 CACCCACTCGGCTGCCTGGCAGCAGTTTAGTTTAAGGTTGACAAATGGCCTCGGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTC:1 + chr2R 10752585 5' + G2 2928 1 56.44 AATTTGATTTCAGTTTATTTGTAAGTGAGAAGCCTATTTTCTGATATGGACTTTAGACTTTAGGGTTCTGATCGTGTAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCT:1 + chr2L 16481069 5' - Idefix 363 2 60.40 AGAAATGTAACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTG:1 + chr2R 20520203 5' + Max-element 8270 2 60.40 GCGCCGTTCGATAGACAGGCGCCCATAGAAGGTGTGGGTGTGCGGAGTGCTGCAATGCACCAGTTACAGTGGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 - chr3R 30284308 5' - blood 7384 2 69.31 TAATATATTATTCGGTTATCCGAATACAACTTATTCGGGTTATTCGGGAGACAACTTTTGAAAGAATTTTCTATTAGTTTATAAATGCAAGTAAGTATACA:1 + chrX 21049546 5' + Stalker4 259 4 69.31 AAGAGATTCACCACACAGCTACAAAATATTAATTTAATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 + chr3R 22198512 5' - Juan 4175 1 67.33 GGCGAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACG:1 + chr3L 17869900 5' + 1360 17 1 42.57 ATAAGAAATTTTAGTAAACGGCTAAGTACTAAAAATAAAGTACGGGTATTTACTTAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 6104455 5' + pogo 20 1 57.43 TTTCAGTTGGACAAAAGGAATTTTCTTTTTTTCCTGAAACTAAACCATTTTGCTTTAGGACCGAAAAAGAAATCAAACATTTTAACAAAAATTAATTTTTT:1 - chr3R 30978516 5' - Tc1-2 1466 1 76.24 CGGTGCCCAAACTTACATTGCAGGCGCATCCGGAGCGAAAATGTTTTCATTTTATTTAATTTCATTGCCCAGGCTTTTTGAATTGCTTCAACTACGGTCTC:1 - chrX 9900969 5' - Tc3 1313 1 66.34 ATGCACATTGGGAGGCGTCTGGATGTAATAGGACACTGCGTCGGCGACATCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 - chr3R 5849390 5' + jockey 4795 1 54.46 AATTTCAACGCACACATTAGATTCAATATCTATAAATTGTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chrX 10296169 5' - I-element 5322 1 59.60 GGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTT:1 + chr2R 12185347 5' - 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chr2R 4009185 5' + BS 5048 1 67.33 ATCGAAGTCACATACAAGGTATCTTACAAGATTACAAACCAGAGCTTTTTCGCAAATGCTTTAAATGCAGGACACGTTAGAATTTTCTGTAAAAATACACA:1 - chr2L 22322729 5' - transib2 364 1 71.29 CCGGGCATCTTGTCGCTTTCGTTGAGGATGGTACTTAGGGTTTTCGATTGGGCTCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTG:1 - chr3R 12407889 5' - Fw2 3563 1 74.26 ATTTAATATCCTACAAATACTGTGGAACATAACTTATGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3R 21931501 5' + 412 39 2 65.35 CTTGGAGTGAATTCTTGGTTTAGGAAAAGAGCTAAGGAGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 + chr3L 18314577 5' + copia 4908 2 65.35 TCATCAGCTGGCAGTCATCNAATTCGTGTGGTATGAATGGTTTTGCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAG:1 + chr3R 22059107 5' - copia 4882 2 55.45 GCTGCATACTTACAAGCGCNGTTCACAAAGTAAGGTGTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2R 24242950 5' - hobo 2901 1 65.35 CAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAG:1 + chrX 21852445 5' - gtwin 7369 2 61.39 CATATGTTACATATAAATACAATGCACATTTTCATAACCTTTGTTCGGAGAGTAAAGGGTATACAACATTCGCTGGGTAACGGGTATCTGATTGTCGGGGA:1 + chrX 22672189 5' + INE-1 554 1 67.33 TGGTGTGACAATAAAGCTATTCCACTCTGAAATTCTGTCTTCTCATGGTCGTGTAGCTTACTTATGTATCGCTCTGCATTTGACTTTATTTCGATTTTAAC:1 + chr3R 892967 5' - G3 4346 1 58.42 CATAACATCAATCGCACTTATATCCATCCATTCACACTCACAAATTACCCGCTGAGCTATAATTCTTTGCCCGCCATCACCCAGGACGCCAGTTTGGGCTT:1 + chrX 741579 5' - Rt1b 4825 1 53.47 AAAATACTGGTATATTTTGNTTGTTTGCTTAATGACTCGAAATGTTTATTCGTTTTCGTTTGGTAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 5512403 5' - pogo 2095 1 70.00 TGATCCGATTTACGAATTAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 + chr3R 19446636 5' + HMS-Beagle 6808 2 70.30 TGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 19450172 5' + roo 41 2 63.37 AATGCATGTACCTTCTCCGCCAAGCTTTCAAGAGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCG:1 - chr3R 31834627 5' - ZAM 89 2 67.33 GTCACTTGATGCATAATTTTTCAAGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGC:1 + chr3R 26293340 5' + jockey 494 1 76.24 TTCCGCCGTATTTGGTTGTCATTGTCGCCAGTTTTTCAAGAGTTGTTCTTTTCAGGTGCTGTAGTTGCTGATGCTGTTGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTT:1 - chrX 1099974 5' + hopper 149 109 74.26 TGCTGCTGCTTTCTTATGTTAAAAAACTTTTGCAATTGTGTGCGACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 17307951 5' + hobo 33 1 59.41 GTTGGAGAAAAGACCATTTGCATCTTTCTCTCCGGTTTGCAAGTGTGTAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 21118641 5' + 412 20 2 58.42 GAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGATAA:1 + chr3R 24228889 5' - 297 355 2 64.36 GAGTTAGAAAGAAGTTGAAAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr2L 11832529 5' - roo 9041 1 54.46 GCCACATGACCAGGTTTTGAGTCCTTTGAAGTTGCGCTAACTGAGCATTCGGATTACCTCGATTGTCCTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATTTTTGATTG:1 - chr3R 12323311 5' - F-element 4331 1 73.27 ATAACAAGCCAAAAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGT:1 + chr3R 3269634 5' + Gypsy6A_LTR 99 1 73.27 GCTCGTTCTCTTCTTCGTTTGTACGTTCGCCTCTTGATTTGCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr2L 16690489 5' + P-element 33 1 43.56 TGAGGATAGAAAAAGTCAGTAACAGAGTTAGAAAGAAGTTGAAAGTTGAAAATAGAAAGAGGTGAGATATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 11832505 5' - roo 402 1 74.26 AGGTGAAGAATCCTCACCGCCAGTGAAACGTGTTCACAATCCTCGATGAACTCGCACAGATGCGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCT:1 - chr3R 31573921 5' + F-element 322 1 66.34 GGGTAGGATTTCACCTGGATGGCTTACAAACACACACAGATACACATACCCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr3L 18738285 5' + Quasimodo 19 2 61.39 CCTGAATGGTTTAAAACATAGTTTCACACTCTATAAAGACCTCAATATTCACACAGTTGAGACACAAATTGGGAGACATACAAGTCGATACAGTGGCAGAT:1 + chr3L 21434612 5' + Helena 1243 1 76.24 TTGTGTGGAGTGCGCGTGCTGGAGGCGAGCGACAAAATGCAACTGAAGCTGAAAAGCCGAGCGGCTAGAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGG:1 - chr2L 5060839 5' + 1360 3330 1 64.36 TCGGTTTCGATTTTCTTTTTTATCTTTCGTTGAAAGCCAATATATATCTGAGTTAACTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGC:1 + chr2L 3494945 5' + 1731 21 2 58.42 TTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACAT:2 - chr2R 14848988 5' + flea 4743 1 77.23 TGAGAGGGATTTATTTTTGAATGCGGCCGTAAGCAGGGCGCTGATAAAAATAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:2 - chrX 2912046 5' - pogo 2080 1 58.42 TCCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 + chr3R 29374964 5' + mdg3 5300 2 72.28 CACATTTGAATTCATTAAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAAC:1 - chr3L 13710876 5' + opus 7377 2 83.17 GCTTGGAGATGGGGAAAGGGCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGATCTTGCTCTACAATTCTATATTAAA:1 + chr3L 488453 5' + F-element 4236 1 77.23 ATTTAAAAAAAAAATATTTTTGCCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAG:1 + chr2L 16013884 5' + I-element 5091 1 82.18 CATACCCTGTATACGAAAACCTCGACTATTAGATACCTGCTTATTACGCTTTGAAGAGTGCCATTAGTGTAAAGATATATAATTTTTATTTTATATTGTTA:1 + chrX 8706133 5' + blood 6933 1 70.30 TGCCAGGCGTCGCTGGACGATCAGCGGTGGAAGGAAGTGCCGGTGGAAGACTGGCCGTTCCGAGTGGCCGCGGAAGACGGGTACACGCGAATGTTTTATT:1 - chr3L 23300755 5' - Q-element 552 2 59.00 ACTTGACGTTGCCTAACACTGCCTGCTCTCTCTCGGCTTCTTTGCCACTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr2R 19424154 5' + P-element 28 1 49.50 CGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGT:1 + chr2R 12185346 5' - accord 7338 2 71.29 CCAGCCACTCCCTCCCCGACTTCCTTCACTCGCTGCATATCTTTCGGATCGTTGGTTTTCAACGTCTGTAATCCTTCTGATTTCGTTGAAGGAAATAGGAA:1 + chr3R 30818484 5' + looper1 1462 1 68.32 AAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCGAG:1 + chr3R 3269646 5' + Gypsy6A_LTR 111 1 61.39 ATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAA:1 - chr3L 11257412 5' - 1360 3370 1 60.40 GGGTGCCGCTTGGCACCGCCGCCGTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTAGTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTC:1 + chr3R 14649749 5' - Dm88 4237 1 76.24 AATTGGGGATCTGCAGATGTTGCCTGAAAGAACGGTATATCACTTTCTTAATGGTATAAATATAAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 13710636 5' - roo 9058 1 47.52 GCATTCGCTTCGAGCTTCGGCTCCTCGCTCGGAGGTCCTGCGAGCCTGCTTACGTCACAGAGCTGCGTAGGCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGC:1 - chr2R 12121751 5' + HMS-Beagle2 164 2 72.28 TTCTTAAGCACCCATCTCATTTCGAAGTCCTGCTAAACGTTTTGCCACTTTGTTAAGACCCGACCTCTCAATATGATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 1930535 5' + roo 8667 2 72.28 CCTTGTTGCATTCTCGATCGACGGCAATTGCCGCCGGCCACTTTCGCAGAACCTCGTTGACGACCTGATCCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCC:1 + chr3R 12403855 5' + Doc 340 1 71.29 CTGTTTATAAAGTCTATAAAGTCTGTGCCCCTTCAGCAAGTTAGTAAAAATACCCAATAAATTTCTTATCTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2R 19578358 5' + hopper 145 103 76.09 AAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3L 8749957 5' + Doc 29 1 53.47 TGGCTTGAGTCAGCCACTTCTTGGATTGCTACTGAAAGGAAAAGAACATGTCTGTCTGCCACGTGCTAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTT:1 - chr3L 6250076 5' - 1360 28 1 71.72 TAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTC:1 - chr3R 1977616 5' - micropia 5406 2 58.00 TGTTTATTTTTGGGGTAGGCAATAAATTGGAACAGTGATAATAAGCTCATTGATATGTTTACAAAACTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chrX 17175267 5' + I-element 9 1 66.67 TTGACTCAATCCGGTGACTTGCTTAGTACCGAATGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGG:1 + chr3L 24362799 5' - Quasimodo 7043 2 66.00 TCAATCGATTTGTTCGATGTCGGCGGACCATCCTCCTCGAAGTGATTTGCATAAGTTTCCAGATTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr3R 5722105 5' + Tirant 8117 2 71.29 CCCATATTTTCATTTATACACAGTTAACAATCAGTCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 13686617 5' + 412 41 2 63.37 CTGATTTAGATTTAGATTTNGCGAAGGTGTACTGTGCTTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTA:1 + chrX 5204870 5' - I-element 5143 1 62.38 CAGTTGAAGACAGCGGTGCACGAGTGGATGGGGTGTTGCTGCTTCTGGTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAA:1 + chr3R 8976225 5' - Quasimodo 6976 2 55.45 ATTTAATTTGGTCTACAAANAATATGAAATTTTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 + chr3L 7215501 5' - copia 5081 2 65.35 TCTGGGACATGGCCAAACCNCCCACAACCACCCAAAAGCAGCCGAGCACCTGGGCACCTGAGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACGTA:1 - chrX 8351025 5' + G2 2948 1 64.36 AGATGGCTGGATTATTTGAAATGAATACTTTAGGGCTTAAATTCGTAATTAATCTGTGTCCTTCAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCG:1 - chr3R 31458474 5' + jockey 349 1 59.00 TTGCATCTTTCTCTCCGGTTTGCAAGTGTGTAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:2 - chr3L 21118624 5' + 412 7090 2 60.40 GGTGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 + chr2R 17402739 5' + invader4 56 2 79.21 AATGCCTAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTA:1 - chr2R 5532335 5' + G4 3759 1 45.74 ATTTTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCG:1 + chr3L 3766789 5' - 1360 152 1 60.40 TTTTAATTGTTTTTCTTGTTGAGTCTGATTTTCCTTCTGTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTC:1 - chr3R 904369 5' + G5 4774 1 73.27 CGTTGTCGCCCCATGGTGCGAGTGTAGATGGGTCTGGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGG:1 - chrX 4483586 5' - gypsy5 6969 2 64.36 CTAACAGCAGAATGCTAACNCAAAGATGTTTGTTGAGTTAAGAAGCTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCG:1 + chr3L 26001911 5' - Porto1 4385 1 54.46 ATTCAAGGCGCTTATCATTGGCAAGTTGTTTGTCGACTGAAAGATGCGCAAGTTGCCGCCATATCTAGGTTCTGAAGACGACGGGTTTTCCCCTTGTTTGC:1 - chr3R 4389066 5' - X-element 479 1 80.20 CCCGCCGGAACCACCCCGTTCGTTGCAATGGCCTGTAAGGGGTAGGCGCGAGCACGGATGGGGGGCAGTTAGTGAGACAGCAAAATCGC:1 - chr2R 23912421 5' + gypsy8 378 1 67.42 ATGAATACTATAGAAGGCATTAATATATATGATAACCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr2L 16016249 5' + I-element 21 1 59.26 AAGTCCCATCGCGAACGTTAGTTAGACGTGCTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr2L 9724274 5' + 1360 26 1 55.45 GCCAACTGTCCTGGCCACCCAGCCCAGACCGCAAATCAATTGTTAAATGGGTGACTACATTCAGGCAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGGACTAGAGT:1 - chr3R 7604505 5' + mariner2 312 1 78.00 GCGGTTGGGTGTCCAAAACGTTGGTTGTTCCCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2L 791499 5' + 412 7098 2 68.32 ATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr2L 16071153 5' + 412 7097 2 70.33 AGTTACTGGACTGCCAGTCCATAAAGCTCACAGAGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGT:1 + chr3R 17529535 5' - Doc 4237 1 66.34 AGATTACGATAAGAGCCGAGGTGAGTTTTGAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1 + chr3R 24092607 5' + BS 5039 1 76.24 CTAGGGTCCTGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 9116534 5' + jockey 23 1 61.39 TGTGTTCGACGGATAGATTTTCCCCTCTTAATGGACAAGGAGTTGGAGTGGTTCTGGATAACAGTTGGTTGCGGCATTGGGAAAGCGCACTCTTCGCTCCA:1 + chrX 23155606 5' - Doc4-element 169 1 74.26 TTTGGCCAAAGGTCGTCGACAGATTTAATTTGATTAGTTCGACAAGTTAAGTTATGAGCATTGTCGAATACCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTA:1 - chr2L 20374482 5' - INE-1 544 1 56.44 CCACCTCTTTAATGATTCCTATCCGGGACTCATTCTGTATATTCCGGTATTTTTTTACGTTTTTATTTGTCTTGTGAATTTTTATCGATTTGCAAAAAAAA:1 - chr2R 19947687 5' + INE-1 312 1 52.48 GTTGGGTGGCAGTGGTTAAAAAGTAAGAAATCTGGGAGTAAATGATTTCTCTTTTTTTTTTAATTTTTTTATTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAG:1 - chr2R 8308108 5' - I-element 5067 1 70.30 TTTAGCTTTTTTCGACAGTGGTCCCGGGGTCAAGAGGGGCTACTGCAAAATTTTGTCTCGACACGG:1 + chr2L 19246266 5' + mariner2 99 1 75.76 CGTACTAACCGTAGTAACTATTAGAATATACAAATTAAACTGATTATGTTGTTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGG:1 + chr2L 23402940 5' - springer 7485 4 73.63 ACTGCCTTTCAACCCATTCACACGAGTCAAAAGAAGACACAAGCGACACCTCCCTCATG:1 - chr2L 20271700 5' + jockey 4751 1 54.24 CGCACACACAGACACAACAATGGCGACGCAGATAGCAAGTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAAACTCG:1 - chr2L 17308013 5' - hobo 2908 1 55.67 TATGGACATTGAGGATACTGAAAAACATCACCACAGCCAGATTCCTTTGAAGTGTTCGTGAAAAAAACAGGGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 4555350 5' + roo 4 2 75.25 GTAAAACTGGCGGGCAGGAAGGACGGAACTAAATCGATACATAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAG:1 - chr2L 11846956 5' - diver 6077 2 59.41 TTATCAATCTAAAGCTGCAGTTGACCTCCAGCGTCTTAGTATCGACTTGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr3R 10078482 5' + Doc 35 1 52.48 AAACGATAAAAACCATTTTTTAAGTGTGGGCAAACTTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGACCTAAAAACTGAACGTGGGCAAAAGAAACTA:1 - chr2R 5180266 5' - FB 93 1 75.25 GATGTTTAACAATGGTATTGGCAATAAACCGAAACGGAAAATCTGTAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - chrX 1157681 5' - 297 369 2 56.44 CCTTATCCAGGGACGGAGCTCCCCCGTTGCTTTTAAGCATCATTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGAGTGCGTG:1 + chr3R 12179285 5' - 1360 3220 1 57.43 AAACATTTGCTGGTGGCCTGTCTGCTAAGGGAATACGAGGAAAGACGCACTGGAAAAATAACTTAAGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAATATT:1 + chr2R 20877274 5' - Tc3 311 2 75.53 CACCGACATACACTACCGCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGG:1 + chr2L 5190185 5' - F-element 399 1 67.27 TTTAACAATGGTATTGGCAATAAACCGAAACGGAAAATCTGTAACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGA:1 - chrX 1157677 5' - 297 365 2 60.40 GCACTACAAAATTTTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAG:1 + chrY 424992 5' - McClintock 449 2 58.42 TCATTATGACGGGAATTTATAATCTTGCATGACTTGAGGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr2R 10528380 5' - pogo 2065 1 63.37 GCAACTCTGTGGCAATTTCCAGTCAGAAGCAATAGAACAGCTGAATCTTTGATAAGGATTCGGGGTTCAAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGC:1 + chr2L 5647332 5' - invader3 270 2 71.29 TGACTTGTCCACTAACTGGCGTCAGACGGCTGTCATTGCCAACAAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATCC:1 + chr3L 19338548 5' + Tc1 1366 1 74.26 TGGGGATGTGGAGCCCCATGGAATGGTGCCCCAAGTGGCCCGAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTAC:1 - chr3R 29521764 5' - R1A1-element 5034 1 58.42 AAATAAACAAGGATACAAACTTCCGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chrX 8942146 5' + pogo 51 1 76.24 CATACACACTCACGACCCGGCAAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGAC:1 - chr2R 1892040 5' + accord 7053 2 78.22 CATTAAAAAACATTTCTAAACTAATTTAATAAATTACCGCATTAGATCCATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTGCCATCGCCCAAATTG:1 - chr3L 8167226 5' - Tc1-2 193 1 57.43 TGACAATAAGCCGCAGAGAATGGGGGAATATTGTGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2R 20973028 5' + hobo 40 1 66.34 TATTGGTCGATTGAGCTATGTAAACATATCCTTAAATTGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTACAACGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGA:1 - chr2L 20468499 5' - INE-1 542 1 61.00 TAAATTGCTTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr3L 15777012 5' + I-element 39 1 55.45 TGTTTTGTGGCGGCTTCTGNGCGATGCGAAAAGTTTTGTTTTGCCCCCGGCTGTCTGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2L 10924295 5' - hobo 2919 1 52.48 TTAAGGAGGAGTCTTCTTCTTAACATTGGTCCTCCAATTATGTCCACTGGATGACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 9698033 5' + 412 23 2 56.44 GGTTTTATTTATAAATTCGCACTCTTGCCGGCGGCACTCTTGCTTTTCTATTCTACCTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTTCGGATACTTTTGTA:1 - chr2R 13260609 5' - 297 431 1 75.26 TGATGACAAGGACTTTAGTTTAAATATTTACAACAACTTTCAATTCATTTAATACCTTAATGAAGAACACAGTTACGTCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr2L 16523764 5' + 1360 2 2 70.30 TTCAGTTTTAGAGCTAATANTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGC:1 - chr3L 13142087 5' + F-element 393 1 69.70 ATCATGTGGTCTGCATGTGGCAGAAGTGAAGGTGTGCTCCTGATTGCTCCCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2L 10020769 5' + hobo 25 1 54.46 GTATATGGGGTTTTGTATTTGTATGTTATTATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTAGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATAAAGATTTAA:1 + chrX 18129421 5' - 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chr3R 18883807 5' - roo 354 2 79.21 AAACAAACAGAGACAAACAGGAGCAAACATCATAAAAAAGTTGCGCGCGCGCGAAGTCGGGTGCATCGAGTTGGCACTCCTGGAAAATCCCAAAATTTTCC:1 + chrX 8623533 5' + Rt1c 42 1 74.26 TCCGGCATGGTCAGGCAATTTGCACGATCCGCGTGCCATCCGATCCTCCCCTCGGATCCCCAAAGCAGCAGCAAAAAACAACAAGACACACAAAAAAAAAA:1 + chrX 6638446 5' + Porto1 157 1 61.39 TGGGCTTTGAATAATAATATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 + chr3R 15523321 5' + 412 58 2 82.18 CTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCT:1 + chr2L 21369861 5' + rover 40 2 69.31 CTACAACTGTGCAAATACTACTAGAACACAGCTGTATACAAGTTAACCCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr3R 22520943 5' - opus 7461 2 64.36 CTACCGAGCGGCTGGAGGCGGAAACCGCCGAACGCTTGAAGCTGGAGAAGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGAGCT:1 - chr3R 16073329 5' - gypsy2 6655 2 56.44 TTACTCTTTACAATCAGGTTATGCACGAATTTATTTTGGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 + chr2L 11174930 5' - Transpac 5195 2 64.36 AACATTTACTTCCAAAGAGCATCTAAATTTAGCCCATTTCATTTAATTCGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 + chr2L 15159478 5' + jockey 4699 1 54.46 ATGTCAGTGATTGAAATGGACAATGGCGATGCCACTCTATCTAGGCAAGCTAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2R 8254859 5' + roo 8689 2 54.00 GCAAAGTGAAAGAATTTGAGTAGAAACACTAAATTAGCCAAAGGAGTCGAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr3L 6399462 5' + roo 8663 1 80.20 AACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr2L 19907979 5' + Tirant 8123 2 62.77 TAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 20425400 5' - roo 9026 1 74.26 AACCAAAACGCAAACCCTTTTCAAAATCGCAAACTAGCCTGGCATTTAATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAA:1 - chr2R 21878633 5' + I-element 296 1 54.46 GGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATA:1 - chr3R 1977623 5' - 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pogo 2095 1 73.27 GGGGCGGTCAATGGGGTTCAAGGGGGCGCCTGAAAAGTGGGAGTGGCATCGATTGAATCGCCATTTGCATGCGTGTGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGG:1 + chrX 10296355 5' - I-element 5021 1 76.24 ATACTTTCGGGCTGACATTNAAAGTCGGTGGCATTGTTACGCATTTTTTGTGGCACTCGGTTGCTGTGTGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGG:1 + chr3R 11118008 5' + BS 2 1 65.35 GGTGCATTGTGCTGTCGTCCGGCCAAAAGAAATCCCAGGGAGCGGGCTTCATTTGCAATAACTTTGGACTTAGCCAGGCTTTTTTTTTTGTTTTGCCAATT:1 + chr2R 13023039 5' + Tc1 1477 1 77.23 CAAATGTGAAGATAAGCCAATTCAAATGCCCTTAATTTTGGTTTTATTACTTTTCTCCCCCGCATTCTGGCAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGAG:1 + chr3R 20343299 5' + INE-1 552 1 92.08 GGCTTAGCACTTGATCTCTTCCCCATATTTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chr3L 13704500 5' + opus 154 4 73.27 TTAGAAAGTTATTTGAGCACATTTAGAGGTTATTGTTGTTTATCATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 11624426 5' - roo 9043 1 63.64 CATTGGCCCTCCACTTTTTTCCACCATCCCACAACGGTCACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3R 19094284 5' + P-element 9 2 68.32 TATAAATAAAGATGACCGCTGTCATAGTAACAAAATATCTTTTGAAACCTTCAAAACAAAAAGAAAAAA:1 + chr2L 8601525 5' + Doc2-element 213 1 79.71 CGTCCTAATACTTTTGAATTACCTCTATCATTTTTATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chr2L 20992917 5' - I-element 5311 1 70.30 TCAATGGTCCAATCGATTTAAGAAGGCAAAAATGGCAACATGATAACAGAAACGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATT:1 + chr3L 9503233 5' - pogo 1936 1 57.43 AGCCACCTGGAGCTCCGATCCGTAGAGTGACTTGCAGCTCTTTTGGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 + chrX 19034108 5' + hopper 27 1 54.46 GAATAAAACATTAGGGGCGAAACGGGGCGATGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATA:1 + chrX 10284881 5' - 1360 3103 1 70.30 AGTGAAATAACAAATAAAAGAGCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr2L 15773356 5' + hobo 52 1 75.25 TTATGTTAAAAAACTTTTGCAATTGTGTGCGACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2L 17307964 5' + hobo 46 1 72.28 AATATGCGTATAGATTTTCGTTTACAATTTGTTCAATCAACGGTGACTGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAA:1 - chrX 21272872 5' + X-element 4423 1 60.40 TCATGAATACTATAGAAGGCATTAATATATATGATAACCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 - chr2L 16016251 5' + I-element 34 1 63.54 CGTACGTGCATACATGTGTGTGTATTTTTGGGAAAACATAAACACGAACAGGATCTTAAATAGATGCATGGGTTTATAAATAAGAATCTAACTAAAGATAA:1 - chr2L 4086614 5' - 3S18 44 2 61.39 AACAATATAGCAAATTTCGTTGTAGTTGTTTTTTTTTGCGCCAAAGGCAACTGTAAACTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 14301656 5' - roo 9043 1 55.45 CAAATTCGTTCCCAAAAACTGATTAATGTAGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3L 16571746 5' + hobo 45 1 72.28 TAAACTTTTGATTACAACTTTTAATCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr2R 19355902 5' + jockey 60 1 76.24 TGGCTGTGTAAATTGTGGTGACAACAATTCAATTTAACGCCCCACTGAACTCAGTACTCGGTGGATTCTGGCCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCC:1 - chr3R 17840818 5' - micropia 5261 2 77.23 TTTCCTATGCAATAGAAACTTAGCAGGAGATTATCTATCCTTTTTCGAGCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 11415750 5' - roo 395 1 58.89 TTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTCAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCAC:1 + chr4 1294993 5' - TAHRE 10396 1 80.20 TCCCTCGATTTTCCGCTCTACTCCCTCGCCGTTGCGAGTTGCTCTTTCGAGTGTCATAGTTTGCCTAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGCTAATCGGGAAA:1 + chr2L 5584343 5' + INE-1 555 1 66.34 GACAATAGGAGGCAAGATGTGAGTTTGTTAGTAAAGCACTGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATT:1 + chr2L 285103 5' - Quasimodo 85 2 68.32 GACTTTCGCGTAATCCGGCTGGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAA:1 + chr2R 1922412 5' + gypsy 17 2 62.38 AGAGGTTTTCCGCTTTGATTCTGAATACAGAAAGATCATTTGGATTATAATCGGAACACAATTGCTGTAGTCGAAAACCCGACTATCACATACCCGTTACT:1 + chr4 709505 5' - INE-1 550 1 58.42 TGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGGGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chrX 8038591 5' + 297 6585 2 74.26 ATAGGGTAAATTAAAATGGGCCACACTGCGTATGAGCGATGTGTATACCAGCTAGTGCGAACAAATGAACATCGAATAGATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 13057767 5' + roo 24 2 72.28 AAATTAAGTTAATTCAATAAGAGTTGTTGCTCACTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTACCGGCAAATTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTAAT:1 + chrX 3389621 5' + hopper 152 2 67.37 TAAAGCTGCAGTTGACCTCCAGCGTCTTAGTATCGACTTGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3R 10078473 5' + Doc 44 1 61.39 GAACTCGTGCCCCTCTCTAATCCCGGCGTCGGAAGCGAATCGGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGT:1 + chr2R 9131284 5' - HMS-Beagle2 6993 2 72.28 GCCACGCCCACCTTTTCGCCTACTATTTGTACATATATAGCCGCTGCTGCTTCACTTTTCTTCGCATC:1 + chr3R 27355507 5' - Osvaldo 342 1 52.94 CAAAAAGAGCGTTGACAGCCAGTACGAGCGACCGGGATCCAACTTTCCTCTTCTTGACGACCGGCGAAGCTGCCCTGCAATTTAATAAATTTATTAAACAA:1 - chr3R 14002547 5' + Tc1-2 1545 1 68.32 AGCTATGAATACCATTATTTAAGCGTAAACATAACAAAGACAATGCTTATGTTCGAAAATATAGTAACTGAAGACAATCACTGGGGTTGCAAAACAGCCAT:1 + chrX 15391665 5' - GATE 8195 1 68.32 AACTTTTCAAATTTATAAGCGTACTTGATAAGTAGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3R 5503352 5' - blood 7348 2 66.34 CTCGGGATCCTGTGATGCGTACCGGTTGGGGGTTAGACTATGGCGCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 + chr2L 22747250 5' + transib2 6 1 69.31 ATCTAGGGTCCTGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3R 9116536 5' + jockey 21 1 63.37 AATCAATGAGACATTTTTACTTACATATGTACGCATGTACGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chr2R 5651929 5' + Tirant 4 2 77.23 GTTCGTTGATATGCACAGAGTAGAGATGAGTTCGTGATGACAGACAAGGTTGTCGCTGTTATGGTAACTTCTCCCCCGTAGTGTAGTATGTGCATATATCG:1 + chrY 311462 5' + blood 7010 1 64.36 ATATAAAATAATATTTTTTTAAATTTTTTTTAATATATTGCCCTTTTAAAAATACGAATTTACTTAACCAAACTCCCGATCATTTCGGGACTTTACGTT:1 + chr3L 4505360 5' - HB 242 1 59.60 CATATCTGGCTCAGTTTAATATAAAGGCTTGCATACATTTGTTTATTAATTGATATTTCGATGTTTCGTACTGTATATATATTTTTTTACATTTTAATAAA:1 - chrX 3045612 5' + S2 1586 2 70.30 TGGCATATGCATATTTTCCAACTTGGGGTTTTTATTGTTGCGTTAAGTTTTGCTTTCTTTGACGTTTTCTTTTTAAACCTGACGCGGCCACAGCTTCATGA:1 - chr3L 13878252 5' - pogo 495 1 65.35 GGTCGACTTTGGGCATACCCTGCCTTAACATATCCATTTATATCATGCTAAGTATTGTTGCTACAAAAACTACCGAAAAACATAAAATCAATAAAATATTT:1 - chr3L 5704691 5' + transib1 1924 1 76.24 ATATATAGTGACGTATTAATATAATTAGCACTGTTCAAAGAAAAGAATATGCAGAGTCGGAAAACCACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGG:1 - chr3R 2472935 5' + accord 7046 2 70.30 TTTTTCAAGATCATCCGATAGATCTAAGCTTTTAACATTGTTTTTAAATTTCACAAAACTAACTGGAACAATGCTCAAATTTCACAACCAAATGCATAAAA:1 - chr2L 7633435 5' - S2 335 1 60.40 TAATTTTGTGCTCCTGTAAGTAGGCAACATTTATTTGGCCCTTCGCCCAGGACCTTCTTCATTTCGTTAATGATCTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 - chr3L 17708331 5' + jockey 4760 1 75.25 AAAATAAATCAGTTACTTAAACGCGTCAGCGAAATTCGAAAAGCAAAACAGTGTATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAA:1 + chr3R 5701662 5' - Quasimodo 7353 2 66.34 CTTTTACTTAAATTTCATGACGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 4191178 5' + 1360 23 1 58.42 CTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:1 + chrX 21668027 5' - Tabor 7271 2 75.25 CGAATGGATTGACACAAGTCAAGAGTATCGATTAAAATGCTTTTATTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGCGG:1 + chr2R 15920100 5' - Gypsy12A_LTR 2228 1 52.17 TTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chrX 21668093 5' + Tabor 6853 2 65.35 ATGTCGGCGTTTCACAGGGACCTCAACGGCTATCTGCTGACCAACAGATTTCGCAGCCACCTAAACCGCCGAGCCCTGCACCTGCAGCTCCATAATTTATA:1 + chrX 5704193 5' + Chimpo 4201 1 64.36 ACCATTTAATATAATATAATTTTATGTTACGTTAAGCAACCAATTGAATTGCTTTACAACGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chrX 11088299 5' + blood 7027 2 63.37 TTGGTCTTTATGCCAAATGAAGCGTGAGAATGCCATAACGCCCCCAAAGCCTGGCTATTATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 - chr2R 5813665 5' - HMS-Beagle 7028 2 65.35 CCTGATCCCGGGATATATTATTAGTAACATCATTGGCAATTGTTTCACCTATAAATTTGTTGCGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGC:1 - chr2L 13278804 5' - copia 4755 1 62.38 TGTGCGCATTAATGTGCTTCACAAGGATTTGCGTAATTTGCACAATGTTGCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2R 20973094 5' - hobo 2915 1 55.45 GAAAATCGCAGCTAAACACAGAACTAACCACTAGATGTATACAACACATTATGAATACGCTATGCCATGTGCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 20381070 5' + jockey 9 1 76.04 GAATTGAAATATTTTTGTTTGCTGTTGCTAGATAAAAAATGCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATC:1 + chrX 19872647 5' - INE-1 564 1 87.69 TTCTCAACTATCGATTCAGCACAGGTTAAAATACATGCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr2R 15794758 5' - pogo 2064 1 65.35 ATGGAAGGCAAAAGGCACCGAATTATCAGTTGATATATGTACATATGTAAGTAAGTGCCCAGTGTATATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr3R 20555920 5' + 297 6580 1 79.21 CCAGCAAAATTGCTTCAAATTGCTGCAGCAATGCTGGCACGTTTAGTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr3R 21775568 5' + pogo 28 1 57.43 TTTGAGTTTTGCATGCAACAGGGCGCGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2L 6647657 5' - 1360 3372 1 62.38 GCGGAAGCGAGGTGGCCCAGGCCAGGATGATGATAGACACAGAAGGGGGCTAGCTCATGGCGTTTGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTTTTCGC:1 - chrX 13574799 5' - Gypsy12A_LTR 2153 1 52.48 AGTGAAAGAATTTGAGTAGAAACACTAAATTAGCCAAAGGAGTCGAGGAGAGGGGCTGGGGATGACTATTTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3L 6399466 5' + roo 3 2 76.24 TGGTAAAAGTTTTTCGATTAACCTAAAGGTCCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2R 18073291 5' + hobo 43 1 66.67 TTCACACATATTGACTTTGGTTTCCATTTCGTGGGTTTTGGCCAGGTTTCAATAGGTATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr3R 7582712 5' - 297 379 2 63.37 CTATGTTAATATGGTTGTATATATTAACTTTAACTTGGCTCTTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAAC:1 + chr3R 31104782 5' - Bica 419 2 60.40 TTATCAATACGAACTAAATTCCGCCCTCTTGAGCAACGCAAACTCTGTTAATATATATCAAAACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTT:1 + chr3R 10718034 5' + Juan 4038 1 65.35 GTCTCCCCATCTTCCTCCGTCCCTTTTCGACCAGACTCGTCTCGTCTCGCTCTACATAGACACCAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 + chr2L 9521629 5' + P-element 13 1 64.36 TAGTTGTAAATATCGGCATGCCTTTACCGTCGACAGAAGATTTCGGTTGGTAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 23840618 5' + 1360 23 1 68.32 AGTGCGGCTCACAACTATAAAATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 - chr2L 14979254 5' + Ivk 6 1 71.29 AAATATTATCGGAAGGAAAAATTTCGAATATGGCCCACTAAAAGCATCCCCTAGTATTGTTTGAGTGGCTTGAAATTATTTTTTTTTATATTTATTTATTT:1 + chrX 16528222 5' - Tc1-2 480 3 89.11 AAATGGGATGAAACGTAGGTTGGTGCCAACTGAAGCAGCTGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCA:1 + chr2L 19703436 5' - R1A1-element 4993 1 47.52 CGCATACAGTTGTGTTCAATAATATAGGTATGGTCAAAAGAAGTATTGAATTGGCTTGCCTCCAAAATAACGATGTTCGGTGTTTTTTTTTCATTTTTTTT:1 - chrX 3425223 5' - gypsy7 5007 3 60.40 GTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 - chr2L 23295875 5' + micropia 4975 2 56.44 CAAAATGTAAAAAAAATCTCAAGTTTACACAAGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr3R 14228081 5' - Transpac 5189 2 65.35 AAGCAATTTGAAAACAACAGAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACT:1 - chr2R 6824509 5' - Doc 61 1 61.39 CGGTAGTTTCCACGTCAATNAGATTAGACTTAAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 17003978 5' + F-element 59 1 68.32 TTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 + chr3L 15777020 5' + I-element 47 1 66.34 AGTAAAGTTAGGCAGCTGAATAGCTGAAACTACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATC:1 + chr2R 21776293 5' + I-element 215 1 51.49 CGGGCAGGAAGGACGGAACTAAATCGATACATAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:2 - chr2L 11846946 5' - diver 6067 2 69.31 CACCTGGGAGATACTCCTTCGCGTTAACGAGCATAATAAATAATGCACGAATTCTTTAGATCATTAAATTGCTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr3R 21775674 5' - pogo 2099 1 71.29 TTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCAT:1 - chr2R 2868546 5' - Rt1b 4725 1 48.51 GCACTGTGTGCCAGCGACAATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAC:1 + chr2R 20732837 5' + Doc 4533 1 80.20 CATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCAAGATTGAGGCCGT:1 + chrX 21772487 5' - gypsy3 6551 1 64.36 TTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1 + chrX 7480761 5' + Bica 340 2 63.00 TGGGATGCGTCTATGTGGGATTGGTGTGCTATGCCACCTATTATGATTGCGATCCCATGTCTACAGGAGTAAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGA:1 + chr3R 25919812 5' - rooA 323 2 76.24 GGGTGTGTTTTCTTTTGGGATGACGTGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 - chr2L 261659 5' - hopper 1363 1 78.22 ATCTGGTTGTGACAAACATTCGTCGAGTAAAAGTTAACTTACAGCCCACTTGCACATCGCAATACGCAGTTTTTACAACTGGAATCCGTAGGTTCTGGTTG:1 - chr2R 9479126 5' - Doc4-element 2724 1 71.29 GTTTTGCATGCAACAGGGCACGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr2L 6647652 5' - 1360 3369 1 56.57 CTACCTAATTTCGCTTTCAGTCCAAAAAAAAACTTAATGATCGGCACCCAGTTCTTCAGTTTGTTTGTCAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCC:1 + chr2R 22098001 5' + Porto1 271 1 73.27 TGGCCACTTTGGGAGCCACATTCGCACCTCAAAACAGCGGAAATGCGACGGGGCAGACATGTCTGCTATTTTGTATGCAAAAAAAAAAAGAACAAAATAG:1 - chr2R 10269090 5' + gypsy11 3933 2 80.00 CATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTC:1 + chrX 21772491 5' - gypsy3 6547 1 68.32 TTTTAAATGAATCTTATTTGAGACAAAAACATACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr2R 11509668 5' - pogo 2060 1 71.29 GAAACTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGCCTAAA:1 - chr2L 20992964 5' + I-element 28 1 47.42 TTTGGTGAAAAATATCCGTTAAAAGCTTTAGTTGTTACTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3R 15523365 5' - 412 459 2 59.41 AGAGCAAATTTCGATCTAAAACAAATTGTTAACAGAATTATTATTCAGGCAAAATAGGTGTAGGTCCTTCTGCCTCAATATCTCAAGAACTATAAATGCTA:1 + chrX 20359420 5' + INE-1 151 1 69.31 CTCGATAATCATTCAAATTTACAAGAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACATAAGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTT:1 + chr2R 18962302 5' - Cr1a 184 1 75.25 AGTTTTGTGGCTGCCATTTGGCGCCGCAAAATATGCAACTAAATTTTATTTGCAGAAATAAGAGCTCGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr3L 7463254 5' - hobo 2931 1 68.32 GTGAGTCTTACACTGAAATCATAAATACATGTTAAAAATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 9439136 5' + roo 8 2 69.31 TATGGGGCAACATATTATCCCCGTCTCGTGTGCGTGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 - chr3R 24442496 5' + jockey 4701 1 69.89 CATGCATAAAATATATAAATATTTGGTGTAATGGATTCTTCGCAATATGATGAGAACTTATGTTGTCGCCACATATGGATATTGGTCTATCTAATGACCA:1 - chr3L 982525 5' - Copia1_DM 4040 1 71.00 CTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATC:1 + chr2L 23299996 5' + invader4 363 1 75.25 AATTGTATGCAGATTTAGACGAGTTCAATAGTTTGTAATGATGAGCTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACTTA:1 + chr2L 5304720 5' - 412 7500 2 64.36 CAGCTCTAGCTCTAAGTATTCCTCCAACTCTCCATCTCGTTGGCATGTGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 + chr3L 6619762 5' - 412 7521 2 53.47 GTGCATACATGAAAGTCAATTAAGCGTATTAATTTCCCTACTTGTTTTTGAATTTCGTCAATATGGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 + chr2R 17224296 5' + Max-element 13 2 41.58 ATGTCCACAGGCGAGGATAGCTAAATAGAAGCAAATTAGGAGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr3L 2029697 5' - roo 9035 1 58.42 TCACATAATGAAAAAAGCAGAGTCCTCGTGTTGAGGCAAGCCTATCCATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr2L 20290214 5' + flea 4780 2 53.47 AGAAACTGCGGTCGTCTGAAGTTGTGGTTTTTTGGGTTTTTTGGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTAGCTTTCGATTTATTTATTTATT:1 + chrX 17064876 5' - Doc3-element 86 1 64.36 CTCCACCTCACCTTTGCCGTGCAAGTTGCGCATCAGAAAACTCGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 8671734 5' - roo 355 2 57.00 GACTTATTACCTTCATTTGTATGACGTTGGTTGAGGGTAATGAGATCCTTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCT:1 - chr3L 15765182 5' - X-element 4455 1 66.34 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAA:1 - chr3L 14971177 5' + 1360 3297 1 72.28 CAGGCGCCCATAGAAGGTGTGGGTGTGCGGAGTGCTGCAATGCACCAGTTACAGTGGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 - chr3R 30284293 5' - blood 357 2 54.46 GGCAGCCGAAACTTTGACAACAAATAATGAAATAATGTAGACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAAC:1 + chr3L 19169119 5' + accord 7074 2 60.40 AAAGATAAAGAGACGTGATCGGTTTGACCAACTGCTTTCGTGAGAAGAAGTTCAGAAAGCGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAATATAGCATTCTCTC:1 - chr3L 38348 5' + INE-1 575 1 61.39 TGCAAAGTTCTTTTAACCACTGCACGCAGAGGCGGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATAAAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACATGGGAAAA:1 - chr4 84141 5' + baggins 5092 1 70.71 TTTTTCAATGAAAGGTTTTAAGGCTTTTGAAGTAAAAAAAAACAGGTTGAAATGTTTTAATAAAAATACTGACAATTGTTTTTTATGAATGGGTTTTTTAT:1 + chr3L 10805050 5' - NOF 4107 2 92.08 TCAAACTGGTTTTGAGATTTGGATTTTTCATAGCCCATGCTGGGGATTTTTTTATTACAATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chr3L 4901030 5' - jockey 4967 1 62.00 TTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGG:1 - chr3L 13142045 5' + F-element 420 1 67.86 GTCATTTTTCAATTGCCCACCGACTCCTGTCGCTTTCCCAGCGCTTTCCCAGCCACGCCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTG:1 + chr3L 3519554 5' - Stalker4 7058 4 65.35 CCGCGACTACTAACCGATAATGTTGCACTTGCAGATACTTTCCGCCAACCTAAATGCATAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 + chrX 20810233 5' + INE-1 559 1 60.42 ACATCCTTGGCCATTTATTTAAAAACTAAATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr2L 16071182 5' + 412 7078 2 54.46 TCTGCCAAGCCATTGAAATCATAATTAGAAGACAAATGATTCTTCTGTTCCTCTCAAGATCCCCGAACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 - chr3L 13059780 5' - transib2 2816 1 71.29 ACCGCATCGATCCCCCCTTGAATTCCTGGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGTCGAGATCTCACGAACTATGAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAG:1 + chrX 5552579 5' + INE-1 167 1 72.28 CATGTAAATGGCTGTAACCCGCATTATGCTCAAGGAAAATTTCAATATTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 14164170 5' - roo 9044 1 54.46 TGGTGATGTGTTTTGTTTTTATTTTTTATATCTGTTGTTGAATATTTTTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATC:1 + chr3R 8932048 5' - TAHRE 10399 1 60.40 TATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1 + chr3R 1440155 5' + G-element 26 1 53.54 ATCCTCTTCTGTGTCGGGAACAGCTCTGGGAAATAGAAAATTTCATAATATATAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACAT:1 - chr3L 7401197 5' + Idefix 6991 2 54.46 TTTGAGTTTTGCATGCAACNGGGCGCGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2L 6647657 5' - 1360 3372 1 61.39 TCTCGGGCGAGGTGTGAATGGGTATGGGTAGTAGGGGGGTGCTGTCCTGGAGTTTTCCAAATATGCTGAAAAGGAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAG:1 + chr3R 29992544 5' - GATE 8432 2 75.00 ATGCAAAGAAGATGAGGAGGAAAAAGAAAATTCTATCGCATTGCACACATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCC:1 - chrX 14730838 5' - R1A1-element 4994 1 53.47 TACCTTGAAAACGATCGCCAAGGCAACTCAATCCCTCATCAAATAAAATAGGCATTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chr3R 5122248 5' + Doc 26 1 53.47 ATGCTCGCACGTACTGCAAAAAAAAGTTATTTGTAATGCAAAACAAAACAAAATAATAATAATAATAATAATAA:1 - chr2R 19590684 5' + mdg1 7067 8 71.62 CGGGGTTGGTTCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chr3R 4164642 5' - HMS-Beagle 7005 2 71.00 ATTGAAAACTCATTCGTCCGCACATAAAACTGCAAACTCATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTAT:1 + chr3R 28465511 5' + I-element 245 1 62.38 AATATATTAGAAATGTTAGTACTTAAATCTTGTTATAAGCAATTGTATCCCACGCTGTTCTTGGTAAATTAGCATAGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGA:1 - chr3R 21943756 5' - X-element 4298 1 71.29 CACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCT:1 + chrX 21772503 5' - gypsy3 6537 1 77.23 ATTAGACACGTTCATTTAATCTGATTAGTAAGATTAGTATATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chrX 8579172 5' + roo 32 2 59.41 GATGGCAGCATCTGGCAGGTAAGCTGTGTCACATTTCTAGTGGTCCACTGGCGCCCGATGAGCAACTTCCATGCTAAGAGTCCCTGTTCGGGCGCCATGTA:1 - chrX 6124753 5' - HMS-Beagle 262 2 80.20 ACGATAAACTGACACAAGCCAAACGAATACACACACAGAAATGAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2L 1858307 5' - pogo 2077 1 54.55 GTACCCAGAGCAAACAACTCAATGTGTTGAAAGGCGGCAGACAATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chr2L 19629917 5' - copia 222 1 59.41 ATATGGTTATGACCTTCTGGCTGGATAACTAGTGTAATACATGCGATTTTCGCAATAGACCCACCCCGTTTGTGACCGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTA:1 + chr2L 1201945 5' + Stalker2 1 2 78.22 AAGCATTGCAATTGTGAGTNGCTGCATCCTCCCACTAAGTGTGCATTTGTGTCCGTGAGAAGGCGTGGCACCACTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr2R 13316101 5' + hopper 4 2 74.26 TTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCC:1 + chrX 21087559 5' + mdg3 5255 1 72.00 GAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCA:1 - chr2L 23295862 5' + micropia 32 2 58.42 CTCTCCGCTTGCGTAAAATTGAGAGCGTGAAAATCTACAGGGTGCGGCAGAATAACTTCCTTTTTTAAATTGAGCGCCATTCCAGTTAGTTGATGTCATAG:1 - chr3L 28011652 5' + mariner2 42 1 75.25 CTCCCAGCTGAAACCACCCAGTATTAGCGTGAGTTCCCAGAAGCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr2L 19909185 5' + Tirant 8169 2 57.43 TTTTTTCGTACTTGAACATTTCCCACGTTGCTTTACACTTGGGCACTTGTTCGTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGA:1 + chr2L 16071076 5' - 412 7544 2 76.24 AATTAAAAGATTTCCCATTNACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 + chrX 8308697 5' - opus 7498 2 75.25 TGAAAGTTAACTCCCAGAATAAATTCAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTA:1 - chr2L 14328382 5' - Bari1 1482 1 75.25 AGCCAGCGCAGATTGTGTGTGAAAGGAAATCGATAAGTATCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr2R 9061930 5' + jockey 4707 1 65.35 CTGGCGCATAGCTTGCCAGAAACGATGCGATGGATTTGAAGACTGGGTCCGCCAATAACACATGAAGAACGAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTT:1 - chr2R 4676699 5' - 1360 28 1 74.26 GAAATCAGCGCACATTCCGTTCGCAGCCAGCAAAATGTGTAACGCAATCAAAGCCATCGCTTCCGGTTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCA:1 + chr2L 18728845 5' + F-element 4449 1 72.28 AGACTCACAAGGCGTTCATCCATATTGTAAGGTTACAGGAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACT:1 - chr3L 27396593 5' - S-element 1512 1 61.39 GGAGAGATCGGGAGAAATAGAAAAATGCGGCCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAG:1 - chrX 2983752 5' - Max-element 343 1 76.24 AGTGCCTCGCAGATGCAAAGCATTCAACTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chrX 16763283 5' - opus 7464 2 65.35 TCTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 + chr2L 12765003 5' + Doc 69 1 70.30 AATCCATTGAGATAGAAGAGTGGTTAGTCCTCTAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCA:1 + chr3R 4557635 5' - aurora-element 4135 1 72.28 AAACAAATAGAACATCAGTGGTGATGTGTCGCTGACGTGTGAAAACGAGTTTTCATCGAGCTCCGTAT:1 - chr3R 889711 5' + Doc2-element 28 2 94.12 TTCAGGCATTGATTGGTATTCTTTGGATATTCCTAATTGGAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 28333593 5' + pogo 29 1 57.43 CGCACATGGCCATGATGGTCAACTCTCCCTCGTTCACCACCTCCGACTTGTCGAGCTTGAGGTACTACCTTTTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGACGTTGGC:1 + chr3R 19782260 5' - BS3 221 1 73.27 AAAAATTCAACAATTCCAAAACACAAACAATCCCTTACAAACTGGTCCCTTTCGATCCCATTATCACTTGTTTGAAATTATTAATTTTGGCCACAAAAAGG:1 - chr2L 21734343 5' - Transib-N1_DM 20 1 72.28 TGCGTTGTGCGAGGTGCGGTAGAGCGGTGGTGCGGTGGTGGAGGAGTGGAGGAGTGGGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCATACCTTGA:1 + chr3L 21694580 5' + Rt1b 4971 1 49.50 TGCCATTATAGCTGAAATAACCGTCATGCACGCCAGGGTCGAGTTGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACATGAACG:1 - chr2L 10487298 5' - Cr1a 4348 1 57.43 CGATTTAGTTTTCAGTTTTACGACAGCCTCAGCTTCAGTCTCGGACTTTTGCAACCGTAAATCACAACAAGAGAGGATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTA:1 - chrX 22618072 5' - INE-1 566 1 54.46 TTGAGGACGTCGAAGATGCGCTTCGAGGCAGGTGTTGTGCTGCAATATAGAACATACAAGTTAAAGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATCTCGGCA:1 + chr2L 12064681 5' - opus 7484 2 60.42 CATTGGACACTTGCAGCTAACCCTGGATAGTACAAATATAAAGAAATAAGTAATTACACTCAATACGGAAACTACTTGATTAATAATAAGGACAATA:1 - chr3R 14217596 5' + Transpac 4750 1 61.86 TTTAACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTG:1 + chrX 8403650 5' - McClintock 6132 2 67.33 TTTAGGCGCAGATTCATACCTTGAATTTCAATTTTCTCTACGGTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 - chr3R 16197868 5' - BS 5063 1 58.42 AAATACTGGTATATTTTGTNTGTTTGCTTAATGACTCGAAATGTTTATTCGTTTTCGTTTGGTAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr3L 5512404 5' - pogo 2093 1 68.32 AACATTGTAAATATAAGTACATGTCATTACAGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr4 333641 5' + Doc 48 1 76.24 TATGATGTGTACTCTGCTGACTGTGGCTGTTCCGAAAAATATATGTAGCTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 + chr3R 7645018 5' + mdg1 7067 2 53.47 AATTACACATTTACTACTTTTATGTGTATCTATTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr3L 13204416 5' - I-element 5310 1 67.33 TTAGTCTGAATGAGACACACTTCATTATCGTACAAGATTCCCTATCAATTTCTAGCACTCAAAACTGATAAAGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chrX 19168000 5' + roo 8667 2 76.24 CAAATTGAGCGAAACGAATGCAAACATGGTGTCCTCGTAGACGGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTG:1 - chr3R 4858382 5' + gypsy2 6674 2 57.00 TTTTTTCAGTTTTAGAGCTAATATTTTCGTTTAAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAATCCC:1 - chr3L 13142091 5' + F-element 390 1 72.28 AGTTTTTTTTTAATTTAGGAAATAAGTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 7422494 5' + roo 48 2 78.00 TCTCTACGGATCTTTTGCTTTGTGCTGTTGCTACCCAGGTGGTAATGCACTTCGATTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAA:1 - chr3R 8512403 5' - accord 413 2 60.40 CATATGGAGCATAGCCAGCGGGATACTGGGCGGCAGATGGCAGAGGGTAAGGGAGCTGTAATATTAAGGTTTCAGTTAATTTTTTTTTAATATATTTTGTT:1 - chr3R 29721676 5' - BS4 728 1 73.27 CCGCACACATTTCTGGGGCCCTTTTTTTTATGGCCACTTTCCTCAAACCACGCCCCCATTCCCTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGATATTATGCGTGT:1 + chrX 8334580 5' + micropia 56 4 66.34 TTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr2L 19698492 5' - hobo 2895 1 75.25 AAGCCAAACACACACACACACACACGAGCGGCACTAAGTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr3R 11028963 5' - P-element 2852 1 38.61 GCCGGCTACAAACAAAAAACCACAACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTT:1 + chr3R 6907210 5' + 297 6549 2 76.24 AAAACTGTTCGGTGTGTCAAAGTTCGTCACACCCGCAGCTGAATGGTATATGGTGTATGTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATC:1 + chr2R 15166402 5' + mdg3 102 2 64.00 TTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chrX 8308741 5' - opus 451 2 74.26 CAGGAATAAAAGTTTGCAAAAATGAGTGCTCCAAAAGGGGACGGAAACTTAGTTCCCACAGTCAGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGC:1 - chr3L 4541168 5' - F-element 241 1 70.30 CTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAACCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAG:1 - chr3L 13142046 5' + F-element 417 1 65.85 TGATCAGCATTTTTGATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCGTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr3R 22520909 5' + opus 23 2 82.35 CGATTTGGATGCGTTGCAAGTCGGTTTAGGTATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCAGTTATTGTTATTGTCCAGTTATTGTTCGCAGGATTTTTGATTGT:1 + chr2R 5284666 5' - Doc4-element 2664 1 55.45 TAGAAGTAGTCTGCGGTTGGGTGTCCAAAACGTTGGTTGTTCCCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 791511 5' + 412 33 2 56.44 CAACTATAAATTGGTGTTAAAATAATCTGGGATAACTACATATAAAATATGTAGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATT:1 + chr3R 20764860 5' - I-element 4995 1 53.47 TTGAACAACCTGGACCTGAGCTCAAACACCTTAACGCACATATCGCTTTCTTAATGGTATAAATATAAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 13698153 5' - roo 9061 1 45.54 AGTCGTTTATTTTCTGTTATCACTCATCCAAAACAAAACAAAGAAAACCACAAACCGAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAA:1 + chr3L 2953716 5' + Bica 4635 1 65.35 CTTTCAAATGGCTTGCATACTTTCAGGCACTCGAAACAATTTTAGCCGCCATGCAAGCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 20154815 5' + jockey 25 1 60.40 GTTGCAAGTGGCAAGACGTCTGAGCCTGTAAGTGGAGCAAGGCATTGAGGCATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGT:1 + chr2L 13310240 5' - mdg3 220 2 50.50 CCTTTTGCGTGAGTCGCCGGTTTCAGGACTTGGACATGTCTCCATGGTAGCGTTTTCGACCTTATAAAGTATTTTCCTTCAGGATCACTAGCCAAGTCGAT:1 - chr3R 9432763 5' + INE-1 95 1 55.45 TCCAAGCAAAATTGTCAGTGCTTGCCAAATCGAATCAAAATCCACTTCAAATGGAGCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chr3L 8749954 5' + Doc 26 1 56.44 TCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCT:1 - chr3L 13142047 5' + F-element 435 1 71.29 GCCGGAAGCGGGTGCTAAACAAATATTTTTAATTGAAATTTATATTGGAAAGCCAGTTTAAAGTACCGTTGGACGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGG:1 + chr2R 13622070 5' + opus 7265 2 68.32 AGTAGACGGGCCATTGATTTCCAACTGGATGGTGAGATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCA:1 + chr2R 12343891 5' + Burdock 6173 2 64.36 AATTTGGTCTACAAAAAATATGAAATTTTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 + chr3L 7215505 5' - copia 208 2 69.31 GAACATTTTTTTATTTTACTTTCTGCTATTTGTATTCACACGAGAGCGTTTCTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 4555455 5' - roo 9048 2 55.45 CGCAGTTCGCTGGGGACACAGTTGTCAACCGGCTGACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAA:1 - chr2R 11528307 5' + I-element 4914 1 65.35 ATGGATACCCCCGTCCACGTCTCCACATTTTAAACATTTTCGAAATGTTATAAAAACGTGTAAAGGGATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 + chr2L 21786675 5' + Max-element 8245 2 68.32 AGTACGGACGCAGGGCATCNTCTAGGGCTTTTGGCAATATCGGCGGCCGAGACGCAGAGTACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGG:1 - chr3L 18623466 5' - hobo 135 1 56.04 GTTAGTAGTGAATACGGCTNCTCCTGCATTCGATAAGGCCTGTGTAGCACCATGTATCCCCAATTACCTGATGTGTTTACTCAAAACTGTAATTAAATTGA:1 + chr4 904808 5' + transib3 465 1 71.29 TTAATAAATAAAACACAACNCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAAAGTG:1 + chr3R 20001633 5' - FB 65 1 57.43 AACCATATTTCCTATGCAATAGAAACTTAGCAGGAGATTATCTATCCTTTTTCGAGCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chrX 11415757 5' - roo 400 1 65.22 AGCCAATTTGCTTAAAAACAATGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 16453553 5' - roo 9019 2 80.20 CTTATAGTAAACTTAGAAATTACTCCAAACATTGGTGAAAAGCGTAAATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 + chr2R 20821325 5' - 297 371 2 55.45 AGTGAAATCTGTGGCAATAAATAAAAAGAGCATGCACTTTGCGGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAAT:1 + chr3R 20397121 5' + Stalker4 7212 4 71.29 AGGCAACTTGATAGCCCCCCAATCCGGACCAGAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAG:1 + chr2L 17049931 5' - hobo 286 1 73.00 GTGTTAGGAATTAGAATAAGAATCTCGCTAATATCTTAACATCTTAAAACCAGAATATGAAAATTCGCACTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTAAA:1 - chr3R 21888651 5' + INE-1 541 1 54.46 CATTAATTTGACACTTTGAAATGACGGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTA:1 - chr2L 18872476 5' - Doc 187 1 74.26 AATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAAAGTGGGCAAA:1 + chr3R 20001639 5' - FB 59 1 52.48 AAATCACAAGTCCCATCGCGAACGTTAGTTAGACGTGCTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr2L 9724281 5' + 1360 19 1 62.38 GTTCGACATAAGCAGTCGATTAAAACTATTTAAGGGTCATGCATAGTTAGATCAACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTG:1 - chr3R 1425374 5' - Cr1a 4113 1 73.27 AGAATGAATGAAACCAAATGAATTTTAAATGGTAATTCAGTGTGTTAGAAAGAATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 + chr3R 4512268 5' - flea 236 2 63.37 CGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 9116501 5' + jockey 57 1 70.30 TGGAAATGGAGACCGAAAAAAAACTAAGAAACAAGCAAAAGCAAATTCGTTCCCAAAAACTGATTAATGTAGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3L 16571705 5' + hobo 4 1 76.24 TGTTGATGGAATCAGCGATGGCACTCTGATTATATAAACTGCCGCTCTTAAGCAATCGATTTTAACTTTTTATTGCATAATTAGATCTTACTAACACTAAT:1 + chr3L 11245064 5' + Cr1a 4290 1 62.38 TTGTAGGGCGATTGATTTTGTGGACGTATTTTACGGCCAAGTGCCGGAGTAGCTGATCTTTATTGTTAAAGTGCAAGCTTAGAACTGAATACAAAAGAATA:1 - chr2R 12562911 5' - gtwin 7151 2 75.25 CCTGATAAGCAAACTAACCGAAAAAGCAAAAAAAACGAGTGGCAATTACCTCAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTC:1 - chr2L 11954675 5' - pogo 95 1 51.52 TGCCACGCCCACACCGCTTTTAACCGCCCACAGCTCCGTCAACTGGCGATGGCATGTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATA:1 + chr3R 27785786 5' + gypsy12 24 2 55.45 GTAAATGTAATTAAAACTGCATTAAATCGTCCTAATACTTTTGAATTACCTCTATCATTTTTATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 + chr2L 20992890 5' - I-element 5338 1 56.44 GTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCG:2 + chr3R 1440170 5' + G-element 43 1 62.38 GGTTAAGTGCCAGGACACTTCACGCGAATTTTCCACACTCCTCGCTCTACACTTGCAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr2L 3733099 5' - hobo 2918 1 60.40 AACCGGCTCTGCTAAATAAAAACAATAACAATGCGCCGCTGCTGCGTCTTTGTCTCTTGAATATGTATGCTAAATTTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTG:1 - chr3R 27655008 5' - INE-1 158 1 58.00 AACGATTTTTCACTTTGCTTTGAAGTTGGTTTAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 - chr2L 9045673 5' + jockey 4742 1 68.32 TTATTATAAGAAAAAATTTAATTTTATAAGGAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chr3L 27395497 5' + opus 13 2 62.67 AACATTTCTTTATCGTGAACTCAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTC:1 + chr3R 3590975 5' - Gypsy6A_LTR 378 1 82.18 CTAAAAGTTTGCCATATGCGACAATATACTTATATTTATCAGCAGATATATATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr3L 15390325 5' - pogo 2081 1 59.41 ATCCCCGGATCCACAGCTCGGGAGCTACACAAGTGTCTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 - chrX 20015561 5' + transib2 36 1 62.38 GAGTTTTTCCATTCATACCATCTGCGATTTTTAATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 5533617 5' + pogo 42 1 71.29 CAATGTAAAACTGCAAGCAGGACAGAGTGAGAAGGAGAGAGCGGTAAAAAAGAGACGAATCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCT:1 + chr3R 25472242 5' - X-element 4506 1 63.37 GCAAGACGGGAGAGGGGCTCAAAACGGAGGAGAACCAACTGAAGCAGACGGCACTGAAGACGACATCAAACATCAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr2L 17476043 5' + F-element 14 1 73.27 ACTCTGGTACGTGAACGAAAATTTTCCATACGCTAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAAT:1 - chr2R 11662713 5' + Tirant 246 2 64.36 GTTGCAGCCAGCCAAACTATTTTTATAAGTTTAGAATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chr3R 17036500 5' - Transpac 275 2 65.35 CATTTCATTTGTATGCTTAAATTAAATTGTATAATTTAAAAAAATGGGCGGTGATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATT:1 - chr3L 23579399 5' + McClintock 5970 2 62.00 TGAGCCCACCACTTGCATTGCCATCCGATTATCAATTCATGACTGCGACGTTATTACTCGCATCTGGAAAAATGAAAACAAGAGAAAATGCTATGGTCGAG:1 - chrX 16159186 5' - INE-1 577 1 83.17 TTCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 - chr2L 16866471 5' + Transpac 50 2 75.25 TATTTGATAATGAAAATCTCCGAAACTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr2L 20992985 5' + I-element 11 1 66.34 TTCGGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 - chrX 19607315 5' + Tirant 8130 2 58.42 AATTCCATTAAGCGAATGGATTGCCATTCATAACTGTCCTCGGGAATGTGTGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGT:1 + chrX 9895547 5' - I-element 146 1 57.43 TATTCGTTCCCAGTTCAGATCGTAAATCACTCGCAAAGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 5990631 5' - roo 9014 2 66.34 GCCGCAAAATATGCAACTAAATTTTATTTGCAGAAATAAGAGCTCGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3L 7463276 5' - hobo 2909 1 52.48 AGTATGTGTCAACGACCAAAAAGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTT:1 + chr3L 23181966 5' + Tc3 309 1 67.33 CCAAGCGCAAGTACAGTGAACACCCGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATACCTTTTGAAGGGGACAGTTCTAGAACAGGAGGAAAAGCTAGA:1 - chrX 18136414 5' - Gypsy12A_LTR 2018 1 76.24 CGACCCACTAGGAAAACCCTTAGCACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGT:1 + chr3R 21962001 5' - Cr1a 4402 1 38.61 ACCTTTGCATATGACACTGGACGGAACTCCACCCTCGCACGAAATACGAATGCTTTCATTCTGTTTGCTCTCGTTGACGCGAAGGCTCTAACTTTTTAGGC:1 + chr2L 9835950 5' + Gypsy12A_LTR 483 1 74.26 ACTTCCAAAGCATTGCCCAATATTATTTTTATGCCAGCCAAGGTCTCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr3L 7463346 5' + hobo 30 1 52.48 GGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 3985134 5' - roo 361 2 72.28 AGCGAAATAGTATAGTATTAAATTGTTACCATTCGACGTTTTGCATATGAATGAAAATGGTTGGAAACTTGAGGTGTCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCC:1 - chr3L 16571832 5' + hobo 2709 1 79.00 TACGACGATATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTAC:1 + chr3R 1440147 5' + G-element 20 1 60.40 AAATACGATCCTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTATCTTA:1 + chr3L 2818429 5' + Chouto 151 1 47.52 CAACAACGTGGCTGCCTGCCTGGATGGTGATTTTGTGAACGCACTGAAGGCGTTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAAAAGACGGGCTACTTTATATTAAGCTT:1 - chr2L 10486821 5' + gypsy4 177 2 52.48 GCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTA:1 + chr3R 18541250 5' + jockey 4600 1 63.37 CTAAAACAGATGTTATGATGTTTAAATTCGATTTATTGCATGTAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3R 14228015 5' + Transpac 28 2 57.43 CGGGCTAATAGATTTCCAAATCAATAGACCATCCCTGGGGAGTTTTTCTTTATTTCAATGCGAGAGTTTTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2R 7185309 5' + 1360 8 2 74.26 TAAATGAAGACACAGCCGTAGACGAGCGGCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCA:1 - chrX 20549054 5' + R1A1-element 403 1 71.29 TGCATCCTCCCACTAAGTGNGCATTTGTGTCCGTGAGAAGGCGTGGCACCACTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 + chr2R 13316123 5' - hopper 1389 1 52.48 CATAAATAGAGTGCAGTGTATATGCCATAAGAGCATAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTT:1 + chr2L 20725835 5' + P-element 2685 1 51.49 ATGTACTTCTACATAGAAAAAGCGAAATGTTTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 + chr3R 19449990 5' + copia 4916 2 72.28 GTAGACAACATAGCAGACGACAGCAAGAATAGAAGAATAGAGGTGCATTATCAGCTATTGATTATTATCAGAATTGATCAATCAATTCGATCGCCGACGTG:1 + chr2L 22256780 5' + F-element 9 1 57.43 AGGTGATTCCCGACTTTGGCTTGCTGTAATGGGCACACAAAGATTTCAATTCTGACTCACAGAGTCACAAAAGAAAGAAAAGAAAAACAAAAAAAAAAACA:1 + chrX 19586736 5' + Doc2-element 220 4 63.37 GGTAGCTTTTACTTCGCCATTTTGGGTATTGATGTTATATTAGCACACAGTTTGCTGCACTTACTGTTACTTTTGGTTGTTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2L 7714615 5' + roo 8664 1 79.21 TGGAAAACAAGTGAAAAAGGCACAAGCAGCGGACAGCAAACAAAATCCAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chr2R 21902161 5' + P-element 16 1 54.46 CATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAAATAAGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGA:1 + chr3R 4581857 5' - R1A1-element 5263 1 68.32 AAAATCATATTAGCATTTTAAATGAAGCATAAGAGATTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCAGCCACTCGCACT:1 - chr2L 19698528 5' - hobo 2932 1 70.00 GCCTTCAGGGAAACAAAGTCATCATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCTGGCTGACATATATTTA:1 + chr3L 9697975 5' - 412 441 2 74.26 ACAAGTAAGCGTAATCACGNAATTAAAACCATTTACATATATATGTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 19955219 5' - hobo 2909 1 57.43 GCAAAGTGGGAATCGGATTNCGATTTGGGATCGGGTAATTTTTTGGGTGGCAATGCAGAGAATCGAGCTGGGTGGTTTGATTTTTTTTAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 9099250 5' + hopper 143 7 40.59 TAGCATCTGGATTGGCTATGCAGCATTCGTATGTTATATACTTAGAAACCCGAAAACCACAGATACACACAACCACACACACACACACACACATACCCAC:1 + chrX 9029099 5' + accord 7033 4 75.00 TTTGCTCGGTCAGGTGAAAAGGGGGTAGTCGGAACTGCCTGCAGCTTGCCCCGTGCATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGAT:1 - chr2L 12884400 5' - HMS-Beagle 7026 2 63.37 TGAGACTTTTCAACTGTCAATTATTTCCTTATTCTTTATGCAAAGCCCCCAGACGCGAGTATCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATA:1 + chr2L 3581948 5' - transib2 2812 1 65.35 GTGGGAGTGGGTGCGTGATGTAGGTGTCATATGAAGTATTTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAA:1 - chr3L 18253246 5' + INE-1 122 1 71.29 TTGTTAATATAGAGCAAAATCTTTGATTCTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr3R 5503396 5' + blood 48 2 72.28 GTTCAATATGAAAATCGAATGAGACTTGGAGTGAATTCTTGGTTTAGGAAAAGAGCTAAGGAGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr3L 18314553 5' + copia 15 2 53.47 AATGAAAGGAAAAACGTTGATCTAATTCCTTCAAATGTATGAGTACTTGTTAGGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1 + chr2L 284461 5' + Quasimodo 18 2 62.38 GCAATCGGGAATGGCCGGCGAAAGTGGGTAACTGTGGACCTATCATAATTCTTCTAATATTTGGTCGGGTCGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chrX 2911234 5' - hopper 1413 2 75.25 CTCGGAAAAACGATTGGAGNATATACAATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chrX 8308790 5' + opus 42 4 75.25 TTCATGAGGGCTCATGTTGCTGCATAAAATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr2L 13622047 5' - opus 7490 2 68.32 GTTGATACCCTGGCGAGCCAGCTCCCTGGCTGGTCACCTAACTGTTGTGGAGAATTGGCTGGCTAACTGGCGTATTGCAATCAACGAGCAGAATTGCAAA:1 + chr2L 16844734 5' + Doc4-element 2325 1 76.00 GACGGCGGGCCATGAGTGACGCGACCGACCAAAAGGTAATCGTCCTGGCGATTTTGATTTGGGCAGCGTGAATGCGGCAAATTTGGCTGTCGCAAGCCCAG:1 - chr3L 23300971 5' - BS3 1330 1 64.36 TGTCGAGGCCTCGGAGATGGAGCCACAATCAGAGCCAAAGGCACACGGACACACACCATCCTGATTGTTGTCCTCTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chrX 6388361 5' + hobo 3 1 75.25 TTTTGCCGGCAAAACGCGAACGCACAAAGACAAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCACTTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTC:1 - chr3L 10014058 5' + jockey 200 1 54.64 ACAAAGGCGAAATTCTCCTCTTGCAAATCGCATTTCATGCCATCTGATTACGCCTTTCGAATCGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTC:1 + chrX 17521867 5' + gypsy12 10028 2 67.33 GTTTCAATCTCGCCACAGACGTAATTTATAAACTTTAAAATTAAAAAAT:1 - chr2L 7228246 5' + 1360 3022 1 63.27 ATAATAATAATAAAAAATAAATTCTATTTGTCATTACACACAAATGGGTGTAGCATATCGGACTAATCTACCCTACCAATACAATAAATGACTGGGTATAA:1 - chr2L 6235925 5' + Stalker4 32 4 50.50 TTTGCACCACGAAAGATACTTTTCAATAAAAGCGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr2L 7161360 5' + pogo 41 1 68.32 TTCCATATGTTACATATAANTACAATGCACATTTTCATAACCTTTGTTCGGAGAGTAAAGGGTATACAACATTCGCTGGGTAACGGGTATCTGATTGTCGG:1 + chrX 22672186 5' + INE-1 551 1 69.31 GAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTA:1 - chr3R 10741142 5' + 1360 3362 1 43.88 AACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr3R 28447398 5' + blood 52 2 73.27 GTTTGCTCGGTCAGGTGAAAAGGGGGTAGTCGGAACTGCCTGCAGCTTGCCCCGTGCATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr2L 12884401 5' - HMS-Beagle 231 2 64.36 GTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGT:1 - chrX 20999558 5' + BS 45 1 76.24 ATTAGAATAATTATTCTAGNGTCTTTGCCATAACTGTCTTTTATTGAAACTAACACGCACATAGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 4164264 5' + 1360 10 2 71.29 ACTCGGAGCTGAGGCGACCGTCGATCTCGCTATACTCCGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 - chr2L 5544331 5' - Quasimodo 244 2 60.40 GAAGTGGGCGGCTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chrX 1157610 5' + 297 6606 2 62.50 AACTAGTAGCAAATTAAAGCATTAAATTTAACAGCATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:1 + chr2R 20520211 5' + Max-element 8278 2 66.34 GTCGCCTGGCATGTCTTATCAATAAAACTGTTTGCCGGCCACTCCCGCACACACGCACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTA:1 + chr3R 23505888 5' + accord 7134 2 56.00 CAATCAGCTTTCGTACGGTTAGCATTTACATATATTCGAACGATCTCTTGAACTCACCTTAATAAACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 10457135 5' + jockey 18 1 67.33 AAATTGAGTGAGTTTTACCGCTAAAATATCGAAAAACTATTTTTAAACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr2R 16639731 5' - opus 7476 2 57.43 TATAGCGCTTTATGTGCGCGGTTGTGTGTGTGTTTTTGTGTGTACATGCTGTATGTGTATTAGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGAT:1 - chr2L 2511496 5' - Idefix 8 2 74.26 TGATCATGTGGTCTGCATGTGGCAGAAGTGAAGGTGTGCTCCTGATTGCTCCCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 10020767 5' + hobo 23 1 56.44 AGGATACATTGGTTAGATANAATTTTAACGCATAAATATATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAGA:1 + chr3R 9121441 5' + roo 36 2 62.38 CGCGTCGTGGGGACAACATGTTTAATTAACGAACACAATGAAGGAGAGTCGCAACAACAGGAGTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTA:1 - chr2R 22988647 5' - micropia 266 2 68.32 CATATAATTGTTAACAGTCATAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 - chr2L 10533982 5' - blood 7333 1 78.22 ATATGAGCTAGGTCTTTTGGCGCACATAAAACTGAACTAAGTATCCTTCTTATATGGACCGCAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTAT:1 - chr3R 28936016 5' + opus 7395 2 67.33 CCTTGGCTTTGCTTGCCCTNGGAAAAACGATTGGAGTATATACAATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chrX 8308807 5' + opus 25 4 58.42 CTATTCGGGTAAAACTCTGAATCAAAATCATTCTGCTGTTAAATTAGATTGGTGGGTTCAGATTGTTGGTTGGGCGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTC:1 - 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chr2L 16023572 5' + jockey2 3003 1 43.88 CTGTATGGTGAATGATGCGGTCATTATGGCCATGTATATACATATGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGT:1 + chr3R 20892006 5' - invader4 3053 2 61.39 AACAACAAACAGCAAACAGCAAACGGCAAACAGCCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTACACGAAAACACAAGATCAAAACT:1 - chr2R 22271015 5' - Cr1a 387 1 69.31 AAATGGCAAGAGCAAACCCAAGTAGGAGTAGCCCAGGGGTCCACAGAAATATACCCATTATCTTATATTATCTTATCTATGAGTTGCAAGACCCTTACAGA:1 + chr3R 13059320 5' + Cr1a 4171 1 52.48 CGTTGGTCACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3R 9121496 5' - roo 9030 1 69.31 CAGCGGAAATGGGGTCTTGGCTACGTGATGAAGATTTATTGCACTTATGTGATTGGTCAAGGATTCATGGAGTAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACT:1 - chr2L 10555473 5' + Tc1 1265 1 54.46 CTAGCCTATTTAGCCCGCAGTCTAAAATGTAATTAATCGATCCATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGG:2 - chr3L 19518397 5' - BS 4719 1 56.44 TCCAAAGTCAGGAAAAAAAAAACAACAAGGAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTAT:1 - 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chr2R 4561104 5' + jockey 56 1 70.30 GATGGCTTCCATGATGACCCGGCGCATGTCAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 14132128 5' + roo 8710 2 69.31 CACTGTTTTTTTTTTCCCCCCCGATTTT:1 + chrX 8960734 5' + Cr1a 24 1 96.43 AAATGAGCGCGCCATTTTTCACCAGCTTGGCCCAAAGGAGAATGGAAAGAAGGTGACTCTGTCCATGGCCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 - chr2L 18239511 5' - hopper 1401 1 67.33 AATGATAGTATGGGTAATATATGTGGCTTATTGAAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCC:1 - chr3R 9447561 5' + I-element 5045 1 66.34 TATATATACACACACACACGCACACACTCACTTCTGTGTTTGTGTATCTTCTATGCGCACACACACACACACAT:1 + chr3L 6945418 5' + accord 7027 2 71.62 CAAGAAGCCAAAGTGTAGANTGACTGACTGAGGGTAGGATTTTTTTTTGTTGCTAGCTGTATGATGTCGGTATTGCTGTTGCTGGCGTTGCCCCATAGCTG:1 + chr2L 12504812 5' - Fw2 3563 2 56.44 AATTTCAACACCCACCCATAATTTGGCTTATTTGTGGCCATTACACTGCTTTTTATTTTTTATTTAGCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3L 16873779 5' + roo 8673 2 68.32 AACACCTAACAACCAAAAAACAAGAACAATTCCTAGCCCACACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACGCATAAAATTCCATATACATACTTATAAACATA:1 - 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Cr1a 4231 1 76.24 GTCACAAAGGAAACGAAACTTCTGCTAACGCGTCTACATCCCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATT:1 + chr3R 6266298 5' - roo 374 1 57.43 GTTCAAGGCGAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGC:1 + chr3L 17869894 5' + 1360 11 1 43.56 TAAGGTTTCCCTCACAGCGGGTGGCATTCTTGCAACTCTGTTTTTGTTTCTTTGGATGTTTTCACTCAGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCA:1 + chr3R 30290974 5' - F-element 4344 1 58.42 TCGTGATATGTGAACTCAACAGGGTGAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGT:1 - chr3R 13441919 5' - 1360 3339 1 76.24 AAAGACTGACTCGTGGCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 7582599 5' + 297 6587 2 73.27 GATTTTGTGAGGATGGAGGGATGGATGGTTGCTCGCAGGTGGTGTGTATTCAAATTAATAATGCCAAATGACACAATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCGT:1 + chrX 20145940 5' + Cr1a 3 1 68.32 ATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGT:1 - chr3L 17667614 5' - P-element 205 1 29.70 TCATTAGGGAAAACCCGGTTAGCCAGCGGTCAGACTTTCATCGTCCGGTACTCCCCCCTGTAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr2L 19567465 5' + pogo 9 1 66.34 GTTGCCTCAGCTTTGGCGTGGCTAAAAATAAAAGGCGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2L 12800965 5' + hobo 39 1 62.38 TATGGTGTGGTTCGTACTCTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAAT:1 - chrX 983354 5' + Juan 3850 1 68.32 AGCAGCAACACCAACACGGCAACAACAATTGCACTCATTTATCATGCTTAAAGTTTTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chr3L 15777072 5' - I-element 5338 1 57.00 TGTGGCAAAATTGAATGGAGTCTTATGTGCTATAATATACATACAATATGTACACACATATACATACATATGTACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCC:1 + chrX 6854348 5' + diver 5 2 73.27 CCACAAATTTGCCGGAAAAGTTTTCTCCGACGCCTTGGAGAAAAGAAAAAACTTTTATTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAAT:1 + chr2L 7540160 5' - I-element 4888 1 64.36 AAAACCCATTTGTATAGTTGCAAACAATGAATATGAACACCCAATACCACCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:1 + chr3R 11951663 5' + Burdock 6221 2 59.41 AAGTTTTAATCTATTCGTACACTTCGTACTCTTTGTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCA:1 + chrX 983325 5' + Juan 3847 1 65.35 CTGGGTGGCTAACGCCCTTTCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 10345046 5' + hobo 34 1 70.89 CATAAATTTGAATATCATAAATTCAAATTCGGTTAATTATGCTCGTTACTCCTAGAGTAAAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chrX 152813 5' + roo 8676 2 68.32 GGTATGGAATTCTTTAATAAGTTAACATCGGCTCACGTTACAAATGCAAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTT:1 - chr2R 19430539 5' - 3S18 312 2 51.49 CCTTACATTTGTCACTAGGAAATACGTTTGGTGCGCTCGTCAAGGCGGAACCCTTTACCAAAATCAACGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCT:1 + chr2L 19417602 5' + mdg3 5387 2 69.31 GGTTTTATTAGGTGTCTTAAAACGAACTAAACATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAAT:1 + chr3L 1933679 5' + roo 418 1 68.32 GTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTC:1 - chr3L 27415314 5' + transib2 17 1 62.38 AGCATAAAATAATTAAGGCCGCATTTAATTTGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3L 1904175 5' + hobo 43 1 71.29 ATAAATGACTTGAGTTTCTTCTTTTTTTACGTACGTATGTTATACGAGTATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:2 - chr2L 10942383 5' + 297 21 2 56.44 ACATGGCGAGTGCCCATGGNCTATGCAAATTATATAAATTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAG:1 - chr2R 1922476 5' - gypsy 409 2 77.23 TTGGATTCGCTAATCTCGTTTGCGTTGGCGACAACAAAATTGTTAATATAGAGCAAAATCTTTGATTCTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr3R 5503435 5' + blood 9 2 67.33 CATACTCAGATGCATCTGAGTTCTGAGTACAGCTCTTCTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTA:1 + chr2L 12728850 5' - blood 480 1 62.38 AGGATACAAAGTCAGATGAGCAGCTGGGACCGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAG:1 + chr3L 18417489 5' + micropia 5218 2 70.30 CATCAACAAGCGGCGAGAGATCTAATTCTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTA:1 + chr2R 7776765 5' - pogo 1892 1 75.25 CTGTGGGTCGACAAGCAAAACTCAGTCACAACACCTGAGGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3L 19459379 5' + Doc 48 1 61.39 CATGACGAGGGCGCCTATTCACCTACTCCAGCTCACGGTGCCGATGCCCCAGCTATTGCTATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3R 27605362 5' - opus 483 2 64.36 GGGGTTATCCTTTTCATCGTCCTTTTTTGCTACTTTGGCGTCACTTTGAAGTTCTCGTTAACACAGTTCCATTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGT:1 - chr3R 4976672 5' + micropia 5111 2 73.27 TTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGAAAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - chr3L 23118140 5' - INE-1 166 1 53.47 ATCCGTATGCTGGATCTTCCATCTTTTATATTTTTTATTGATCCATATCAAGGATATATCTACTATATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACAT:1 - chr2R 18487322 5' - INE-1 30 1 55.45 AGCTTTTGAGTGCAAAGATCTCGATCTTCAGAGTAAAGTTTATTTTAGTTAAGCTATAAGCTATATAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTAC:1 - chr2L 19436753 5' + Gypsy6A_LTR 163 1 52.48 TCATTCTATTTGATGTATTATTATTCTGTCTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATT:1 - chrY 1801352 5' - Porto1 4241 1 70.30 ATCTGATGTCTCCTCCTGGCTCTTTACAATTGTGTAATATTCTGTCGGCATGTTCAAGCCGCAGCCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGT:1 - chr2L 20299919 5' - jockey 4674 1 72.28 CACAGCATCTGGCGAACTTGTTTGTCATGGTTTTTGTTGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3R 28447384 5' + blood 19 2 52.44 GAAAATTACTGAAACGTGGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGA:1 + chr3L 19274690 5' - transib2 2789 1 61.39 CATGAAGACGAAATGTATTATTATAAGAAAAAATTTAATTTTATAAGGAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr3L 27395514 5' + opus 22 2 57.43 ATACAACATAATTATAAGGCCAGACCGAGAGCAACTGAAGCCAAACCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr2L 12834220 5' + Tirant 8159 2 55.45 AAATTCATATGTTTTTAAATTCCATATATTCCTTAAACATACTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 30284198 5' + blood 18 2 60.40 TATTATATTTATTATTATAGATTCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGGGGAATGTGGCCAACGGAGTTATTGAAAGGGAGTTAAAAGTTGTCCCATT:1 - chr3L 5369128 5' + G5A 2558 1 52.48 GAATTTACTAACTTCGGCGTTCTGCCTCTCTCCCACACACACACATACACGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTATACAAAT:1 + chr3L 7156330 5' + Tirant 8131 2 51.00 CATCAATTCTCTAAGCAACAAACAAACACACGCACAAAAATATAAAGAGGGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGT:1 + chr3L 17153158 5' + opus 78 2 54.46 TTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTA:1 - chr2L 23295848 5' + micropia 133 4 72.28 TTCGTTGTAGTTGTTTTTTTTTGCGCCAAAGGCAACTGTAAACTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 14301641 5' - roo 9028 1 69.31 CGGCCAGTCTAAATCAAGGAATGTTTTAGCCAAGAGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAAATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGAACATGATTTTT:1 + chrX 1396421 5' + 1360 38 1 65.35 ATTTCATCGCAACTATATACAGAAAGAAGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr2R 24293829 5' + 412 48 2 74.26 GGTTTATATTTGCACTGACACTGGCAGAAAAATTATAAACTTTTCAATTGTAACAACAATAACAGCAACAACAACAATAATAATAATAATAGTAATAACAA:1 - chr3R 29717779 5' + mdg1 41 4 54.46 ATAACAAGCCAAAAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCG:1 + chr3R 3269634 5' + Gypsy6A_LTR 98 1 74.00 ATCTGTATCTGCAAGTGAATCGAAACCGGCTGGCGGGCCTGGTACTTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr2R 11664287 5' + Tirant 8117 2 71.29 CATTATGAGCTACTTAGCAACCGATTTGTGCAGCACTTGCCGCACCTCACGCACACATAAGCACTCCGCCGATGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCA:1 - chr2L 2126442 5' + 412 181 2 76.24 CATCCAAACAAAAAATCAAAATCACAAATTGCTATTGCCGACCACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr4 904081 5' + F-element 62 1 66.34 TACATGTTAAAAATGGTCATCGAATGTAATGAACAGTAAAACATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chrX 9439161 5' + roo 33 2 63.37 AAGCTGCCGTCCGCCGAAAAAAGCCTTTTCGAGTATAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 11814490 5' + blood 38 2 61.39 CGAAGGTTGGTTCCATCCATCTTATGCAAACTGCAGTTTTCAACTTGTTACCTGCCACTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCGGTGGTTGTATTAGG:1 - chrX 2548439 5' + Circe 7154 1 66.34 GGGTCTGTATGGTGAATGATGCGGTCATTATGGCCATGTATATACATATGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1 + chr3R 20892002 5' - invader4 298 2 57.43 GTCGCCAATTTGTTAGGCAGACCGTTGGATCGATTGTGAAGTCCAACTGAATGATGGCCTAAGGTTACCTAGGCGAAGCACCAGCCTTAGAAAGGGGTTCC:1 - chrX 12377108 5' - Rt1b 325 1 60.40 TTCGCATTGTTTGGCATTTNGCTTTGTCCATTGTCCTGATCGTGTTGTTGTAATGCATTAATTAATGCACTTATCCCGTTTATAAATAAATATAAATACAT:1 - chr2R 19125885 5' + diver2 445 1 56.44 GCCATATGCGACAATATACTTATATTTATCAGCAGATATATATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr3L 15390335 5' - pogo 2071 1 61.39 AGCCCATGTCGGTAGCAAATAGATTATTAAACTTGTTATAATTGGTAGAACCAGATTCCGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr3L 10283517 5' + Doc 48 1 57.43 GTCCACGTCTCCACATTTTAAACATTTTCGAAATGTTATAAAAACGTGTAAAGGGATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAG:2 + chr2L 21786687 5' + Max-element 22 2 56.44 ATGAATGAAAATGGTTGGAAACTTGAGGTGTCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 16571786 5' - hobo 2894 1 78.22 ATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAG:1 + chr3R 1440179 5' + G-element 52 1 71.29 TTTGCATCTTATAGGCTTCCACTTCATTTCTGTAGCACCGGTTACAGTCCTTTAATATTCCTTCATATATTCGACTTGAGGTAGGAAAATTAAAATCTTCT:1 - chr2L 22889120 5' - Rt1b 5119 1 71.29 CCTTGGTTTCGGGTAGAAGGCAATAACCTTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTTTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTC:1 - chr2L 2908955 5' - Doc3-element 4453 1 71.29 AATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAATAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chr2L 18177039 5' - INE-1 546 1 66.34 CAGGTCAACGGTTAATTCTGACAGCAGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCT:1 - chr2L 6170147 5' - invader3 228 2 74.26 AGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTC:1 + chr3R 18346609 5' - INE-1 580 1 71.29 ATAGTAATATTTATATTCTTTAATATCAAACTTTGATGATCGTACCTTCGGCACACAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3R 4712776 5' - pogo 2087 1 65.35 TGAAGTGCACTTTTGCGGATTTGCCTGATGATTTGTCGCTGTGTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGAAG:1 + chr2L 2509692 5' - Doc3-element 408 1 57.43 TAAACAAATGCGTCAGCCACATGTCAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAA:1 - chr2L 9287009 5' - jockey 4883 1 75.25 TTATCCCTCTCGCTTTTCCNCAGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 - chr3R 9094790 5' - hopper2 1557 1 73.27 TTAACAGAACATAATCAGGGTCAATTCCCTAGAAACTCGTTTATGTTAACAATCATAAAACGTATGTTTAATCATATAAAATGGTTATTTTAAAAAGAATT:1 - chr3R 13353423 5' - Tc1 1495 1 62.38 ACGAACTCGAGATGGCGCANCTGAAGCTGCGACAGCTCTCAGACGAGTGAAAAAGAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 22126582 5' + Doc2-element 218 1 62.50 TTCACACTCGTGATATGTGAACTCAACAGGGTGAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATT:2 - chr3R 13441926 5' - 1360 3346 1 71.29 ACGCGTTTCATTGCTCCACGACTCTCAGTGGCTGATGATATTTATGGCGGCGCTAGAGCTATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTAAGGTAGGG:1 + chr3R 12778116 5' + gypsy12 9899 2 61.54 TCCTATTTCATGGGGAATGAAAAACGATTGGGTTTGTGAATGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTT:1 - chr2L 16070206 5' - 412 478 2 42.57 CCAGACGGCAAGGAGAGATTCACTCGCACGAAATGCCATTTAATCATAAGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGAAGATCGGTCGTAGCCGTCACC:1 + chr3R 8468682 5' - gypsy6 7438 2 56.44 TCTGCCTTATGGTGTTGAAGTGCGCTTGTTGATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 - chr2R 3032022 5' - F-element 4384 1 69.31 ATGATAAAGCGGAGTTCAGAAGTTGTAACGACCAACTAGCATAAGACGTAAACAAATTACAGTTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAG:1 + chr2L 3370070 5' - 3S18 137 2 67.33 TATTTAGCTGTAACGCCGAGTTCATTTAATGTTTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3L 27423369 5' + blood 42 2 64.36 AACTCTTACAGCGCCGAGGACATGGAGGACGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chr2L 12808215 5' + Tirant 48 2 71.00 TGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTG:2 + chr2R 5284582 5' - Doc4-element 2594 1 72.28 ACTCCAGATACTTGACTATTGCGTTCCATCTTGTTGTGAAACTGGGGCAGCACGAGTTAAGTCCATGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGT:1 + chr2R 5651823 5' - Tirant 373 2 53.47 TGGGCACACAAAGATTTCAATTCTGACTCACAGAGTCACAAAAGAAAGAAAAGAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 19586765 5' + Doc2-element 218 1 50.00 AATAAATTTAGCGTACTATTAAAAAACTAAAACTTCAAAATAGGGACTTAAATACAACAAAATCTCTTCAAAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3L 5025581 5' - roo 404 1 72.28 AATGCAATCTAATAATTTGTACGTTACATGTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 - chrX 9816306 5' - BS 5043 1 70.30 AATTAGAGTTTCAGCTAAGTGACTGCAAATTCAAAAAAAAAA:1 - chr2L 9946954 5' + G3 4584 1 85.71 GGGCAGGGGCATTCCTATGCACAGTAGATCGAGGTATTGGAAATAACACAAATTGACCACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACTACGC:1 - chr3R 11370328 5' - Copia1_DM 394 1 61.39 GCAGTGTTTGTTGGGCAACACATGGGAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAAC:1 + chr3R 24938916 5' + I-element 400 1 74.00 TACTAACTTACTGGTCACATGGTTATTTCTCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGATAGCCTAACTA:1 + chr3L 25255148 5' + GATE 8334 2 71.29 ATTGAACGAAGACCCCAATAATTAATAATTAAGACGACCCAATTGAAGGAAGACTCCAAAAAAATATAAGACATTCAAGTTTATCTCGGTCTATTCAGAGA:1 + chr3L 25722577 5' + FB 284 1 66.34 AAAGTGTGACATCTTTATTAAGCTTATTGCACTGCCAGAATCGATTAGGCATTCTAAAAGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAA:1 + chr2R 5237991 5' + Doc 294 1 65.26 TGGGCAATTCATTTTTCACAGCAAAAGAAGCGAAAAGAAAAGAAGAAAAACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chrX 11182747 5' + jockey 30 1 58.76 GCGGCAAGCGAAGAGTTCTGGAAGTCGTTGGCAGTCGCAGCAGCATAAGCATATTTACATATTAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGG:1 - chr4 612077 5' + Juan 10 1 69.57 CAGACAGCACACACTGGGAATTGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTC:1 + chrX 20606523 5' - hobo 2604 1 79.21 TCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTG:1 - chr3L 13142044 5' + F-element 438 1 74.26 TGTCTCTGGGTAAGGATTCTGTTTGTTTTATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 26350882 5' + hobo 14 1 62.16 GTATTCACACGAGAGCGTTTCTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 4555424 5' - roo 353 2 82.18 CGTTTCGAAGCGGTCATCATTGGGTTTCCATTGCGCTCCTCGATTGATTGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCG:1 - chrX 4860918 5' + 1360 44 1 58.00 TTTTCGCATTGTTGCGCTTGGCTGTTTGCTTTTGCACTTCGCTTCGTGTTTTTGTGCTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACAT:1 + chr3L 3077774 5' + P-element 106 1 63.37 ACTAGATTCGTCGAAAAGTATGTAACAAGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTAGATAAAGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2L 22211545 5' + 297 6587 2 70.83 AAATGTGTCATGTCGCATTTGGATCGTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTAT:1 + chr3R 9364234 5' - roo 224 2 74.26 TTTTCACATGTCATGGGGAAAAGTTGAAAAAAGTAACTATCGATGGCTTCATAGATATTGCCATATACATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCC:1 + chr2R 16068595 5' + Burdock 3 2 74.26 GATTGACTTTCAAATGGCTTGCATACTTTCAGGCACTCGAAACAATTTTAGCCGCCATGCAAGCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 20154821 5' + jockey 18 1 67.00 AAAATAGAAAGAGGAGCTTAATGTACAACTTGTTAGAGAATTAAAAAAAAACATCGCACGGACTGATTTTTGATCTAACCCTTTTTAGGCCGCAGGGATCC:1 + chrX 7302510 5' - gypsy8 330 1 61.39 TTGTCCAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTG:1 - chr2R 2879480 5' - Stalker 137 4 65.35 AAAGGTGCGAGTGCTTCGGTGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAA:1 - chr3L 2322140 5' - FB 285 1 81.19 AAATCTGGTTATCTCCCTACGTATTTATTATTAAATGTTTCCAATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chr3L 11523275 5' - hopper 1385 1 55.45 GTTCATGTAAATGGCTGTAACCCGCATTATGCTCAAGGAAAATTTCAATATTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 14164167 5' - roo 9047 1 55.45 TGAATTGTGAAGCTCAAATTTTCAATTCAAGTATGACAGTAAGAGGAGTTGTTATGTACATAAAATAAGCCTTTAAAAAAAATAATAATAATAATTAAC:1 + chr2L 11833485 5' + invader6 4388 1 90.91 ACAAAGTCAGTTCAGCTGCAGTCTGGCTTCTTCGCTAGCCCAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 - chr2R 9640405 5' - Max-element 273 2 54.35 CAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr3R 6761052 5' - blood 7342 2 71.29 CTCCGGTTTGCAAGTGTGTAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3L 21118612 5' + 412 7102 2 72.28 GCTAAAGGTATTTTTTAAANGCTCCCTTGCACTGGAAATAATTTTGAGGTGTATTCCATATCAGGAATCCAATTTTGACAAAATAAAATCATATTAAAATC:1 - chr3R 22176006 5' - transib1 1888 1 87.13 ATGAGGGCTCATGTTGCTGCATAAAATAAATGCTAGACAGGCAGGATTAAACTATTTATTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr2L 13622044 5' - opus 484 2 65.35 TAAAAAATAAACAGAAAATNGAATGTCGAAGCCCCCTCCCCCCACCCCCCCCCCC:1 + chr2R 12801067 5' + accord2 224 1 69.09 CAGGAATTGTTAAGCAGTCCTCCTCCACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACAC:1 + chr3R 5429597 5' + Juan 355 1 74.26 CAACATCAGCTAACTCAGTGCAACAACATTCCCTACATTCCCAATATGCAAGCTCAGCGTCTGCATCTTTACTAGGTGTTAATTTATTTTTAATTTTTATT:1 - chr3L 25345848 5' + Rt1b 129 1 63.37 AAGCTTATTAATGAATTTAAGTGTTAAAAAATTACTGAATTTATAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chrX 23316604 5' + copia 33 2 60.40 ATCATACTCGTCAGGGTTGCATTGGAACCCTCCGGCAAAAAACAACAGCACAAGGGTGAGTACTAAGAAAATCAAAGACACAAGCACTCAACAATCATTGC:1 - chr4 855289 5' - 1360 452 1 69.31 GGGCCGAAAAGAGGGAAATGAGAAATAAAACCATGCAATGCCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCA:1 - chrX 1130942 5' + I-element 4957 1 60.40 CAATTCTATATAAATGTAGCAAATTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:2 + chrX 21468973 5' - pogo 2052 1 77.23 AAAACAGGCGAAAACAGCATACTGTTGAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAACAGCACTGCGAACAACG:1 - chr3R 1850235 5' - Cr1a 234 1 75.25 TTAAGCTTATGTCGCCAGGCAAAAGTATACATGCATACATACACTAGTGGACATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTTCAACTGCCGGGCTATGCTT:1 + chrX 22924733 5' + Tc1-2 35 1 68.04 AAGCACTTCACAGGCAACTTGATAGCCCCCCAATCCGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 17049920 5' + hobo 40 1 64.36 AGATTTCCAAATCAATAGACCATCCCTGGGGAGTTTTTCTTTATTTCAATGCGAGAGTTTTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 7185300 5' - 1360 3372 1 65.35 TATACCCGCCATATTAAAGTGTATGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr3L 2917034 5' + hobo 54 1 82.18 TCAAAAGAAAAGCATTTATNTTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 8254804 5' - roo 356 2 80.20 GTTTCCGACTGCGCGAGAGTGTGTTTGACTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTACGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTG:1 - chr3R 6419106 5' - accord 253 2 55.45 ATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAA:1 + chrX 15903168 5' + INE-1 82 1 65.35 CACGCAATCGAATCTTCCAGGCACGAGCAGATTTATCAAGCTAATTGAAACGACAATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTC:1 + chr3L 12466359 5' + Tirant 399 1 54.46 GTGTCTCTGGGTAAGGATTCTGTTTGTTTTATGTGTGCATCAGAGAACTGCAGGGTGGGACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3R 26350883 5' + hobo 41 1 68.32 CTGTTAAGTTGAAAAAAAAAATTTTTTCCTCTCAGTCTCCGGAGAAGCAGTTTGAGAGCGCCGCGGGGCAGCACATTGGAGG:1 - chr3L 27684021 5' - X-element 384 1 59.76 GGTTAAGGCTCTCTCTGGCATTCTGCTCCTTCTTGTCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTC:1 - chr2R 24970024 5' - R2-element 439 1 59.72 TTTTTTACCTCGCCGCTTTGGGATTTCTTTATAAACGATGTCGCAAAAGAAAACTGGATTCACAGGCAACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 8812650 5' + P-element 6 2 73.27 AAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCG:1 + chrX 21772497 5' - gypsy3 6542 1 74.00 ACTTAATTTAATTGGGGACAATAAATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 9121488 5' - roo 9022 2 78.22 CTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCT:1 + chr2R 1922434 5' + gypsy 7026 2 63.37 AAAAATGATTTCATAAGATGAAAAGCGCTTTTTCCCACAATATTTTCGGTGTGTCTGTGTGCGGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATAC:1 + chr3L 13612436 5' - Tirant 223 2 70.30 AACTGTAATAAGGTCCCCAATCGAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:2 + chrX 17106183 5' + HMS-Beagle 49 2 76.24 AGCAGAAGACAAAAAAATCTGCCAAGAAAATTATTAAAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGA:1 + chr3L 4314491 5' + F-element 347 1 63.37 AGTCATAATTATGCAGCATAGATCCTACTTTCAATCGTGTGAAATTAAAGTTAATCAACATTCATGACGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:2 + chr2R 24242864 5' + hobo 6 1 72.28 TGCCATCGAGTCACACGGAATTCCCCCGTCACTTTGCTTATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCG:1 + chr3R 31246773 5' - invader2 282 1 61.86 TTGACTCAAAGATGGTTCGAAAAGTGCTAATGATTTGTTTGGGTAATAAAGCACACAATTATCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 13710743 5' + roo 13 2 63.37 TATATGGTAATACTTATTTAGCGGCTTACTTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chrX 11454372 5' + P-element 44 1 35.64 AAACCGGAAAAGCAGATGGAAACTATGCCATTAGCAGGCCACGGGACTTGCCACCAACTCCACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr3L 20079688 5' + mdg1 7055 2 59.41 AAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGC:1 + chr3R 19449425 5' - roo 129 2 64.36 TTTTTATTTGCTCGGCTGAGCACATCTGCAGCATCAGCGGTCGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTT:1 + chr2R 13637344 5' - invader2 4764 1 58.42 TAGATGGCTGGATTATTTGAAATGAATACTTTAGGGCTTAAATTCGTAATTAATCTGTGTCCTTCAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCG:1 - chr3R 31458475 5' + jockey 349 1 59.41 AACTTAATATTTTGTTGATNTTTGCCCAACTTGATTATATCTATCACTATCATAATATATGTGCAACACCGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chrX 9828540 5' + Tirant 7 2 73.27 TGCCTGCGGTTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr3L 2016878 5' + Tabor 6878 2 60.40 AACAACCCACCCACCCCGATTCGATTGGGATTCGACCGCAGATGCAGTCAATTATTAAACGCCTGAGTGATTGCGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTC:1 - chr2L 1202074 5' - Stalker2 400 2 76.24 CCGGGGGTAAGGGGTCGCCAAAATCATAACCTCATGAACTTTAGCGCCCACAAACAGCACTAAAGTGTCACGCCCAAACTTTTGAAAAATGTGTTGATATT:1 - chr3L 4000282 5' + INE-1 264 1 60.40 GGCAGATAGGATCTGGGTGNCCAACGCGAGGGGATTAGAGTTCAAGGGAAGAGCGTTGTCGAGGGAGGCTGGTACGTAAACAAAAAAAAAAACCTAAAA:1 - chrX 20507471 5' - Tc1 1469 4 69.70 AATTCATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAA:1 + chr3R 20001627 5' - FB 71 1 64.36 AATCAATTTTCGCTATGTGCTACGAATTGATAAACATGCTTCCCTCTATGCTTGCTTCTGCTTCTCTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTC:1 + chr3R 29349802 5' - X-element 4363 1 69.31 TGCGCAACAAAAGCAACATGACGTTTCTGAACATATGACAGTTTAATTTACTTTTATTTTGCTGTGTGTGGATTGCATTCCATGCACACACACACACACAC:1 - chr2R 17309715 5' + accord 179 2 68.32 CATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCA:1 - chrX 22824222 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 46.53 GTTCGATTTAATTGGAACTATATCTTTCAATTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGAATTTTTATTGATCAAAAACTTAAG:1 - chr2L 284535 5' - Quasimodo 7325 2 71.29 AATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 + chr3R 1440178 5' + G-element 51 1 70.30 CCGGTGGGTAGGTTGTATATGAAAAGTGAATTTTGATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 20432408 5' - roo 9030 1 69.31 ACATATTTGCGTTCAGAATAAATTCCCAGAAAATCTAATTCGAGTAGAGTAAACAGTAAACAGTGCTAGCTAACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr2L 5304802 5' + 412 5 2 74.26 TTCCATTCAAATTAACGCTGGCTAATCAGACGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGG:1 + chr2L 4435989 5' - mdg3 364 1 70.30 CCTTAAGGGTATTATGCGAAATATTGAGGAAACGTAGCAGTCGAAGTCCTTGCAATCAATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTATTAACACAAA:1 - chrX 22879432 5' + Cr1a 4289 1 56.44 TCACCATACAACAAGCTGGAATTCGTACTGTACCAGCCCAATTGTAATATAAAAAACAAAGTTTGTAACTTTGTTGAGGAGCGTGCCTTTGCCGTTGAGGC:1 - chr3L 23649355 5' + mariner2 153 1 70.30 TGGAATGGCTTATAGTAAGAGAGCTAAAACAAATGCAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 - chr3L 14311523 5' - roo 9066 1 71.29 ACAATTGTAACATGATGTGAATAATTCATGGGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr2R 10167817 5' + opus 149 4 68.32 ACCTAGCCAAACTGAAAACNGAAATGGGGAAAACAATGCCAAGTCAGCTGCAACATCTTTCTGCGAACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr3R 20148971 5' - hobo 2889 1 70.30 GTACGGAAAGCTAACAAAGCCCCGCACCCACATATCTTATGGGTACGTTCTACCCACCAACTTATAAGGCCAGCAAGAACATTCAATAAATAAAAGCAAAG:1 - chr3R 13844529 5' + F-element 4663 1 71.29 CAAAAACAACAAAGCACGATGACAATAACAAAAGCGATTGCTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr2R 13585721 5' - blood 7353 2 60.40 AAGCCATTCGGACAGTCTTTGAGAAAGCCCTTGTGCCTTCGATGTGTCAGAGGTCAGAGATCGGGATAGCGGATAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAG:1 - chrX 18199788 5' - BS 4864 1 77.23 TAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGG:1 + chr3R 4973106 5' - 1360 7 2 46.53 AATTGCAGGAGACAATCAGAGCTTTAACTATGCAAATTGTAATAACTTGAAGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACG:1 - chr3L 4582206 5' + gypsy4 6502 1 64.36 AGAACCTAAGAACTCGGGGAAATTATTAGGGTCACATGTGTAAAAGGATATTTCCTTATTAACTCACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGT:1 + chr3L 14917788 5' + accord 276 2 71.29 AGCAGAAAACACTTAAAAATTTGATTTTCTTAGCTCAAGAAAGAAAAATGTGAAAAAACTAAAGGTTTAATATGGAATATGTACGTATGTAATATGTATAT:1 + chr2R 18511665 5' - 412 217 2 80.20 AACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCAGCACAAAATAGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr2R 5214989 5' + F-element 61 1 69.31 GCATTCAGTCGCCCAGATGTAAGTTATTAACTCCTTATCTATCCTTTTCCATGTAACTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATA:1 + chr2L 3869459 5' - 412 7296 2 52.48 TTTTATGCCCCTTTGTTGCCCGTTTCATACTCTTTCCCTCGTTCTTCGCTCCGGCAGGATTCGGAATCCATCAATGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAG:1 + chr3L 11754479 5' - Rt1a 4657 1 76.24 TCGCTGTTGAGAAGTAGACATCGAGGCTGTTCCACAAATCGCACAGGAAGGGGCTGAAGTTGGGTTCAGCTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATG:1 + chr3R 12554710 5' - Stalker4 7235 4 61.62 GCAATTTGGCTCCTTTTGTACGATTATTGTTGCAGTTGTTGTTGTAGTTGTTTTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACTGGTAG:1 - chrX 22697474 5' - Doc3-element 486 1 73.27 ATTTGTGGCCCAGTTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr3R 6761062 5' - blood 340 2 61.39 CTGTGACGCAATGCAAGACGGCACTGCATTGTAGAATAAACAAAGTAGCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGC:1 - chrX 7213627 5' + invader2 313 1 52.48 ACATATTTGCGTTCAGAATAAATTCCCGGAAAATCTAATTCGAGTAGAGTAAACAGTAAACAGTGCTAGCTAACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr2L 5304802 5' + 412 5 2 72.28 CCCTACCTGTATATCCTGATATACCCATTATTCCATTTGTCAACAACATAAATCTACGCCTTTGCCGTCGACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGG:1 + chr2R 5862382 5' - copia 4992 2 73.27 GCAGCCAGACAATATCCCTTTTTTATGCCTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 29413115 5' - hobo 2893 1 70.30 GGCGATGTAGGGGGGGAATAACATTTCGGTGGGGGAATCGGGGAACTGTTAATATGTTTTGGTTTTATTTTTATACGGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTTT:1 + chr3R 8837666 5' - gypsy3 414 1 75.25 TCTACGTTCATTATAAATCCAAGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr2L 16866470 5' + Transpac 51 2 76.24 CACAACTGCAAGCTCAAATACGCGCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTTACAGACACACAATTATCAAACCTTATACCCTCAAAGTGATAGAAGA:1 + chr3L 17606875 5' + Porto1 327 1 68.32 AGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGG:1 + chrX 15408751 5' + INE-1 536 1 84.16 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGCCGGCCAAAAT:1 - chrX 14317415 5' - 1360 3327 1 62.38 TGAGTTTTGCATGCAACAGGGCGCGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2L 6647655 5' - 1360 3370 1 60.40 GTCGCCGCGGTGTCTGTTGCTCTTCCAGGCCATCCCATACCTTCCATAAAAAAAAGAAAGACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTAGTATTG:1 - chr2L 23176392 5' + invader1 187 2 72.73 TGACTCGTGGCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 7582605 5' + 297 12 2 67.33 TGTGTGTTTTTGATTAACATTATAGGAGCATTTTTCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAA:1 - chr2L 11257808 5' - mdg3 357 1 76.24 GAAGGAGTAACTGAGCCGAGCCTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTGAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCA:1 - chr2L 16699197 5' + Chimpo 124 1 78.22 ATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAACTGCCGATTCGAACTAGACGTGTCTGCCTATCCGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAAA:1 + chr2R 8443974 5' + INE-1 146 1 67.33 CTTACGAAAATGTGGCAGATATTTGCAAATCCGAATGACACCTGCTACCTAAACCTACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAAT:1 - chrX 916497 5' + flea 56 2 58.42 CAGTGAAAGTATTTACAAATTCAATTACATACATATATGTATGTACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3R 19955287 5' + hobo 32 1 54.46 CATTCAAATATATGATACTTTCATATTTCCTGTAGTTTTTATAATCATTCTAATCTAATCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCT:2 + chr3R 5886338 5' + I-element 4873 1 53.47 AAGAGTTGCGGGGAGTTGACCCATTAATTTTAAATATTTTGTTATTTTTTTTTTTCTTTT:1 - chr2L 15792914 5' - gypsy7 5012 1 76.67 AATCAACTCCATCGTGCAGAGGTTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTTCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCT:1 + chr3L 3299063 5' - G6 1851 1 78.22 TGGCCGCTTAGCCGCAGATGCCATGAAATTGAATAGGCGGAATTTGATAAACAGCAGTGATAGATAGACAGACATCAGGAAAAAAAGAAAGGAAAAAAAAA:1 - chr2L 991093 5' + Doc2-element 232 4 54.46 ATTCTATAAATATTTTTGTATGTCCCACACAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAA:1 - chr2R 10081979 5' + baggins 5384 1 71.29 AAAAAGCATGCCACAACACACCAAAAAGTGTAATCATTATTATAAAAAGATCATCATCATTGGGTTATTTGATGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chr2L 14981417 5' + hopper 2 2 75.25 CAGCAGGGCGCTAGCTGAANTTAATTCATCCCCAAATTCGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chr3R 8481964 5' + jockey 76 1 72.28 ATCTACAGTATATTCGTATTTTTATGGGCTTTGAATAATAATATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3R 15523297 5' + 412 34 2 58.42 ATGTAATAAAGAGAGCTGTTCCGATCTGATCTACTATATGTACATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAG:1 - chrX 6854440 5' - diver 6077 2 58.42 AGAAATTGGCGTGGTTTGCTTCCCTTTGATTTATGTCCTGCCATTGGACATCGGTCGGTAGGAGGGGGCCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2L 15331727 5' + 1360 5 2 75.00 GCACAGCGTTTTCAGCTAATATATAATTACAAATACATTTAATCCTGACGGTTTTTTAATTGTCCTCGGTTTCGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAAC:1 - 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chrX 21469011 5' + pogo 49 1 77.23 TCGACAAAGTTTTTGTATTTCAAGCGAATAGTTATGGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2L 3985169 5' - roo 397 1 75.25 TAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr2R 6074393 5' + 412 7108 2 78.22 ACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATATTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chrX 8038612 5' + 297 6606 2 56.44 AAGGAGGAGTCTTCTTCTTAACATTGGTCCTCCAATTATGTCCACTGGATGACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3L 9698031 5' + 412 25 2 54.46 CCAGCGTTTCGCTGCTGCTCGGACTCGGTTTAGGCCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGACCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chrX 19887133 5' - P-element 2847 1 38.61 TTCAGGCAACTGATGTTTATTAATGTGCATTTGTCGTGGTGTTTATTTAAGCAATTATTGTTATTCAGCCATGCCATCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 + chr3L 10161703 5' + Doc 4 1 78.22 AGGGAAATACTTGGAAAAAAGTGTAGACAGGTGTCAGTTTTTTTGGAAGCTATAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:2 - chr3L 13704574 5' - opus 479 2 60.40 GAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAG:1 + chr3R 14049363 5' + transib2 48 1 73.27 GAACGAAGCTTTCTCACCTTGGTCATTCGTTTTAAGAGCAGCTGAAAATGTGGAACAAGTGAAGTTAGTTTTCGCAGTAAAAACTTATGGACAAGTCCAGA:1 - chr2R 5609485 5' + X-element 76 1 63.37 TACTTATTTAGCGGCTTACTTCAGCTCATGATGAAATAACGTAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chrX 11454362 5' - P-element 2833 1 25.74 TATGAACCGTTTAAATGAGAATAGTTCACAATATTATTTCCATTTCTTAGAATGGCACCTTCTTGAATGATATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGT:1 + chr2R 1905096 5' + Max-element 6 2 74.26 AAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 - chr2L 19907950 5' + Tirant 46 2 75.79 GCCGGGGGCGGAGCAGAAACAGTTATTTATTAAATCCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCC:1 - chr2L 21786755 5' - Max-element 8493 2 64.36 TGAAAAATGTGTGTGTTCGNCCAGCGGAGGAGGAGTGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGC:1 + chr2L 1397798 5' - Max-element 52 2 69.31 ACACTATTTAATTTGCAGTCCTTCGCTTGCCACAATAGTTGTATTAACTCTTACTTTCACCGGGCGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGA:1 - chr2R 13794971 5' - Idefix 202 2 68.32 TTCCGCACAGTGGTATCTAGCAGATACTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3R 6761049 5' - blood 7339 1 74.26 TCGGCTTGCTATCAGTACGCCTAAACTCACTACTTTGGCAACCTGCGGTTGGCGAAGTATACATGTATATCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3L 20192389 5' + roo 6 2 51.49 AATTCCAGAGTAAGCCGGGGTGGCTTCGCTGGAGGGTCTGTGTGCCGGTTAGAACCGGTAACTCCTCCCCTCCCGGATTGAAGTGACGGCCACAACGAAGG:2 + chrX 21939636 5' - Tirant 8072 2 67.33 TTAAGGGCCACGTTTGAGGGTTGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCATTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTAC:1 + chr3L 21477258 5' - Doc 4439 1 78.22 TGTGTCACAGACGGACGTGAAGTAGCCAAGGCAATAGGGAAAATAAAAAACACAAAAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCA:1 - chr2L 3433097 5' + I-element 159 1 62.38 CAAGAGTGCAGGAATAGGAACATCCTCAACCGAGTTATGATTTATGCACATTGCTCTGTGAAATCTATTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTG:1 - chr2L 3936234 5' - G2 69 1 71.29 CGCCTGATGTTTGCCCAGGNGAAGTGCAATGGTGTCTCTCTTACAGGGGAAGAGGGTGATAAATCCACTTGGAGATTTACGATGATTACGTTGGGAAGATG:1 + chr3R 11606715 5' - gypsy3 258 2 72.28 TATCGACTACTGCTCTTAGTTCCTGAAGAATGTCCATTCCGATTTGTCCATCGAAATAAAAGAGACAATTGTAATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAA:1 + chr3L 23560841 5' + mdg3 235 2 55.45 GCTTCTCTGCCAGGCAATAATTATACAATTGTAACATGATGTGAATAATTCATGGGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 + chr2R 10167793 5' + opus 12 2 65.35 TAATGTGCATTTGTCGTGGNGTTTATTTAAGCAATTATTGTTATTCAGCCATGCCATCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr3L 10161723 5' + Doc 24 1 57.43 TACCTGATCCATTCTCGTAGACAATGTAACGCCAAGACAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGG:1 + chr3R 8739929 5' - flea 4713 1 63.37 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAG:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5410 2 55.45 ACAAAGCGCAGAAAATCTGAGAACGTGGTTGTTGTGGTAGCAGTGACAGTTTCTAGGGAGGTCACTGCACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCG:1 - chr3R 31264906 5' - Doc 481 1 72.16 ATGCGATTTGCAGTGTGATTTCAGTGCCAGCAATATATATACATAAATATAAACATATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chrX 5271396 5' - mdg3 228 2 58.42 CTGCCAACAGCAGCAATGANGACGGTCAAGCAGCTCCTCCCCCGCAGCTACAACACCAGCAGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAACAGTCCAACTTCACTG:1 + chr2L 198400 5' - invader4 246 2 66.34 TATCTACAGTATATTCGTATTTTTATGGGCTTTGAATAATAATATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 15523296 5' + 412 7086 2 57.43 TTTTAAAAATCAAAAAAGATGTGAGATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTTACAAA:1 - chr2L 20967857 5' + Bari1 8 1 55.36 CGCTATGAAAAGCTGCGGGCTTAAAATTGATCACAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chrX 15290314 5' + pogo 36 1 64.36 CATATCAAGTATATTTTGTNTTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGAT:1 - chrX 20999575 5' + BS 28 1 59.41 TAAAGTTAATCAACATTCATGACGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2R 24242909 5' + hobo 50 1 76.00 CGAAAAGCCAAGACAATGTATACATGCCTATGTACATAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chrX 19384054 5' + pogo 35 1 62.38 CTTATTGACAATTTTGTTGCACTTCGTTTCAAGCTGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCT:1 - chr3L 7214437 5' - copia 5027 2 65.35 TTTAGACAACAACAAAGTAGAACGTAACAACAAAATAATAACGCAATAGTAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTTGCGTGTAACTGTAATTGCACTCT:1 - chr4 334852 5' - Tc1-2 104 1 53.47 TGGGAGAAAAGTATAGTAAAATTAAATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2R 11509618 5' + pogo 46 1 76.24 AGTGTGTTTGTTGTTACCTCTTCTTGCTCCTCTTCTCCTTTATTCCTTATCCCTTGCCCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAG:1 - chr2L 7203910 5' - pogo 385 1 67.33 GCATGCTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr2L 9287212 5' + jockey 37 1 52.48 CAGATTCCTTTGAAGTGTTCGTGAAAAAAACAGGGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 4555387 5' + roo 8705 2 68.32 ATATTTGATAATGAAAATCNCCGAAACTTGACCTTTTGCCTTCAGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr2L 20992986 5' + I-element 10 1 66.34 GATTTTCTGGTGCCATTAAACTAAGCTTATTTTGTTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2L 12764998 5' + Doc 64 1 65.35 ATACATTTTAATATGTGAAAGTAAAGCTTTGTATGCAGGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chrX 17284916 5' + jockey 4707 1 60.40 TACTACTACATATGTACAATACGTACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTAT:1 + chr2R 21776323 5' + I-element 245 1 76.24 TAAACACAAGTGTAGTAACNAAGATTGTTGCTTTTGGCACCCGTCAGTCCGCCATAAAACAAGACTCTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 13441847 5' + 1360 1 2 76.34 TCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCTTTT:1 + chr3R 4164652 5' - HMS-Beagle 198 2 79.21 CAAAGAACAGCATTGATTATAGGAAGTGCCGCCATATCTCAGGACAGTCAGCATTATAAACATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCA:1 + chr2L 6170078 5' + invader3 15 2 66.34 AATATACTAATGTACATCTNAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 19450188 5' + roo 8721 2 53.47 AATCCGGCTGGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTA:1 + chr2R 1922423 5' + gypsy 7015 2 52.48 AAAGGCACCGAATTATCAGTTGATATATGTACATATGTAAGTAAGTGCCCAGTGTATATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr3R 20555930 5' + 297 6590 2 69.31 TGGCTTCCTTTATCTGCTTAGTTGGCTCCGGCTCCTTTTCCGTTTTGCTTGGTGGCGTTTCAGGCTGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGTCTGACCCGTTGT:1 - chr3L 9479666 5' - ZAM 8078 2 72.28 CGGTCAAGCGAAACTTCTGCATTGACCTAAGAATAGCTCCACCCGTCCAACCGACTGAGGGGCGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAAGGC:1 - chr3L 9598362 5' - 1360 3377 1 59.41 AAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 7582636 5' + 297 6624 2 73.27 AGAAAGGACTTTTTGGCAATTGTTCTGGGTGAAGTGGGCGGCTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chrX 1157580 5' + 297 8 2 72.28 GTGATGTGTACTCTGCTGACTGTGGCTGTTCCGAAAAATATATGTAGCTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 + chr3R 7645019 5' + mdg1 30 2 54.46 ACAGCAACAAAACATGTTTCACTATATATTTAATTACCAATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 - chr3L 6982576 5' - Burdock 221 2 61.39 TTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1 - chr2R 17402769 5' - invader4 3039 2 74.75 TTTACTTAAATTTTCCTGTTAGTGCTACGCACAGACTTACTGGCACAAAAGCATTAGAAACATGCCAGAGTTACTCAACTTCGGGGGCTCCTTGGTATATG:1 + chr3R 18541208 5' + jockey 4558 1 72.28 CAGTTGCATGCCATTTCTAATTAGAAAAGAGTAGACGGGCCATTGATTTCCAACTGGATGGTGAGATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAAT:1 + chr2R 12343862 5' + Burdock 6144 2 71.29 TTGCCCATATGGTTTTAAGTATCAAAATGCCTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 + chr3L 2016887 5' + Tabor 6887 2 69.31 AGGACTCACAGGATTGGGTTCAGATGGCAGTCGCTGGCATGCAAACGGTTGTCATGGCAAGTGTCGGATTCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAG:1 + chr2R 7605304 5' + jockey 180 1 68.32 AAATCATAGCCCATGTCGGTAGCAAATAGATTATTAAACTTGTTATAATTGGTAGAACCAGATTCCGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr3L 10283510 5' + Doc 41 1 64.36 ATCCACTCCATCAGCTCCAGCACTCACTCATCGCCACGCCCACATTTTTGAACTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 + chr3L 8461751 5' + INE-1 547 1 56.76 AACATTTGACGGCATTTTGGACAAGTGGACTCGGAATCTGGACTCTGCCTTTCTTTCTTTTACATTTAACTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTT:1 - chrX 10630509 5' - F-element 338 1 79.21 AGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAA:1 + chr2R 5532367 5' + Doc4-element 12 1 55.00 CCGTCAAACAAGGGGTAGCTAATAGAATATGTACACCAGCTACCAAGGAAGGGTTGGTATAGAATAGGGAGGACGGAGAAGGGTATGTGAAGGGTCAAGAT:1 + chr2R 1008672 5' + gypsy8 4489 1 70.30 ATAATCTTTTTTCAGTTTTAGAGCTAATATTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGA:1 - chr3L 13142097 5' + F-element 385 1 79.21 CAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 - chr2L 23295846 5' + micropia 48 4 74.26 ATAAACAAGATTCTGAACCATATTTTAGTTTTTCTAGTTCAAGTTTATTTAACCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chrX 14564642 5' + Doc 34 1 52.48 GATGCCAAACATCTTCTATGATGGTGGTCACGTTGTTTTACCTTCGTCTTTAACAAGGGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATCATTAGTCATATACC:1 - chr2R 5301673 5' - G3 4299 1 58.42 GCATACTTTGTGGCGCAGACAACAGCATGTTGCCACGCCCCCACGCCATAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - 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chr2R 20145159 5' - opus 7489 2 45.54 AGGCAGGTGTTGTGCTGCAATATAGAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr2L 12064706 5' - opus 7454 2 78.22 AAGGAATATATATTTTTTAATAAAAATCCACGTATGCCATACATGGTACAAAATTGCCAATTAAAAATATTACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGG:1 + chr3R 6646692 5' + Juan 10 1 72.28 CTGCTTTTTCGGCCTGGGCTGCTGCACTTGTGCACTTGTGTGTGTCGGATGCGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTC:1 + chrX 450177 5' - F-element 312 1 56.44 TTTTGCCACTCAATTGGTGATCGTTATCATCAGTAGGAGTAGCAACCAGGATTAATGGGCAGCTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTG:1 - chrX 6778396 5' - R2-element 3585 6 68.97 TTAAATTCGATTTATTGCATGTAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chr3R 14228036 5' + Transpac 49 2 78.22 TATACTAGATTCGTTGAAAAAAGCACAAAGACACAAAGACGCAGCGTCAGTTTGTTGACCCATGTTGTCAAGCCCACTATAACGCCCTAAAACCGCCCAAA:1 - chr2L 21794173 5' + INE-1 343 1 62.38 AAAACACAAACGAGAGAATAAATACGTCATGCCTTATGAATGAGAAGGGGGGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 11831500 5' - roo 389 2 52.00 GTTGGCAATGCCGGTTGACACAGGTGACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGAATTAAGATAAGGGGTATATAGTTTTTAGTGAATCTACTTGGAACC:1 + chr3L 25481784 5' - Cr1a 4108 1 71.29 TTGACACTCGGATTGAGATTGCGCAAATATTGCATGATGGTAGCCGTCTTTGATGTGCCAGCCTCTCCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGT:1 - chr3R 28506840 5' + mdg3 162 2 70.30 GGAGCACGAGCGCACAAAGGGCGTCATTTAGGTGGCACTGATGGTACCACGGGGCATTGCCGGCTTCACAGCCATTTGCACCAAATTGGCATTGCAGACAG:1 - chr3R 18708680 5' + baggins 5174 1 54.46 AAGATATCATTCAGTCGCATAACAACAAAACAGAGAGGAAAATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATG:1 + chr2R 15167458 5' - mdg3 5295 2 59.41 GGTGGGCGTGGCTTGCGTGCGTGTGTGGGAGCTTTGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATT:1 + chr2R 7553955 5' - Stalker 63 4 70.30 AATACTACAAGTCATCTTTTAGCAATAACTATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATAT:1 + chr2L 11846906 5' + diver 5935 2 69.31 GATTTTAATTAGTTTTCCGCCTAAGAGTCTTTGGCAAGCAAGCGCGATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTT:1 + chr3R 28139189 5' - HeT-A 10 1 83.17 GCATATTTAACTGCATTCGGTTAACCATTTCCCAAAGTAATTCAAATAAAATGCAATTGATCAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chr3L 18635376 5' - copia 240 1 63.37 GGAGTCGCAGTCCCTTTTCTTGGAGTACGTATGGATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAA:1 + chrX 4235730 5' - Quasimodo 7331 2 69.31 TAAATCGGGCTACAGCGAAAATCATTTATGTTTATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTTGA:1 - chr3L 1300180 5' + Stalker 7171 4 67.33 TTTTCCGTTGCATATGGCACAGAAGCATACAAAAAGAAGTCGGAAAAGCAAAAAATATATTTTCATAAATATGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 + chrX 18990232 5' + copia 3 2 75.25 AATATACCCATCCTAAATAACTACGTTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTT:1 + chr3R 8856927 5' + rover 18 2 55.45 AGTGGCAACTTCGGTAGGGNATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chrX 19607324 5' + Tirant 14 2 66.34 CCAAAGAGTTTGCCGACTGCAAAGGAGTAAAGAAAAGGTGCAGACCAAAGGACATAAAAGAGAATAGTTCTAAACGAATTTGAATATTCGGAATCTTTAAA:1 + chr3L 13053801 5' + Dm88 250 1 47.52 TTTAACAGTAAGGTTTTCAGAAGGCAGAAACCCGTCAGCTCCATTAGCAACCTTTTGTGAGGAAGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGT:1 - chr3L 7891067 5' - Stalker4 66 4 66.34 AAAATTCCTGTCAAGATAAATGACTTGAGTTTCTTCTTTTTTTACGTACGTATGTTATACGAGTATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2L 10942398 5' + 297 6587 2 71.29 AGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAG:1 - chr2L 23295883 5' + micropia 4967 2 64.36 TGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3R 7582642 5' + 297 49 2 79.21 CTTAATTATACATAAAATAAGCCCTTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCAC:1 - chr2R 24318507 5' + 1360 3240 1 76.00 CGCTACTTTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGT:1 - chr2L 22216566 5' + diver2 4603 2 65.98 ATTTATGTGACGAACTGGAGTCCTACCATTCCAGGTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 6399551 5' - roo 9027 1 67.33 AAGTTAAAACACTCATAAGCATACAAATGTACAATTCAACATTGTAAATATAAGTACATGTCATTACAGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr4 333604 5' + Doc 11 1 65.35 TCGTTACAAATGTTACGGCAAGTCTAAGATGCACCATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr2R 5529972 5' - 1360 3364 1 69.31 CAGTTTTAGAGCTAATATTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACC:1 - chr3L 13142085 5' + F-element 397 1 67.33 AAGTGATGTGATGTGATGCATGGGGTGCGGTCCGCCGGGAGCTTGGGACCGGAGTTACGCTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGA:1 + chr3L 12302327 5' - I-element 5108 1 63.37 AAATTAAAATTGAGTTATTCCCTGCTTTTATCTGCAGGTGAGCTGTAGTTAATTAAAATTCCAATACTTCTGACGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:2 - chr3R 7645086 5' - mdg1 7423 2 58.42 AAAAAATGTACAGCGCACTTTGTCTCGACTTTGAAATAGTTGCGTAACTTTATTGATAAAAATAGAAATTGCTCACAAGCAACGTTGGGTGCGAAAGGGTT:1 - chr3L 6814401 5' - looper1 3 1 67.33 GCATTCAAAATTCAATAATTTTAAGATCCACAATTGGTGACCCAGACAATATGAAAATTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAAC:1 + chrX 1641137 5' + F-element 4402 1 59.41 TACCCGTTACGCGGTCTTGGCGCCAAAGATGCTGCATACTTACAAGCGCTGTTCACAAAGTAAGGTGTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2R 24242980 5' - hobo 2931 1 73.27 TGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGG:1 + chr2R 4330780 5' + baggins 5231 1 71.29 TGAGGAGTCGAAGGGTATGCGGTCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr2L 9075575 5' + 297 33 2 69.31 CGGCTTGCTATCAGTACGCCTAAACTCACTACTTTGGCAACCTGCGGTTGGCGAAGTATACATGTATATCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 20192390 5' + roo 8671 2 50.50 GACATCACTTCAGCTCTTTACTAAGCAAGCGAAAACTCTTGTATTTGGGAGATACATACATTATACGTATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATT:1 - chr2R 5154814 5' - accord2 71 2 59.41 ATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACA:1 - chr2R 14848989 5' + flea 4742 1 76.24 GAATGAAGTCGTTATCCAGGGAACCTTGCTCGTTTCCGCATCCTTTCGCTTTGAATACCCTTGGGAAGTTGGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3L 1904257 5' - hobo 2935 1 75.00 TAAGACATATCCCGAAAAGTATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 5595028 5' - 1360 3368 1 58.42 ATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr2R 5237888 5' + Doc 45 1 41.58 TTATTGCGCCGCGAACGCGTCCGTTATGTTGATTCTGCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGA:1 + chr3R 18298830 5' - gypsy 397 2 63.37 GTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 - chr3L 25059149 5' - mdg1 7432 2 53.47 AAGAGAAGAATAATAGAGCNCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr2R 1373096 5' - pogo 2086 1 65.35 CTTGATGTTGGCCTTAATCACTTCGTATCCATATGAGATCGGCTTGCAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGG:1 - chrX 11939530 5' + R1A1-element 169 1 59.00 CGTTGATGAAATCAGCGGATAACGGCTAAATAGCGCGTGTGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr2R 5651890 5' + Tirant 8150 2 64.36 GGAATTACACATATGATAGAAAACAAAGATTCTGAACTAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCTAATATATTCATAATTTAATAGTTTAGTTCTGTTGG:1 - chr2R 1422507 5' - Porto1 4543 1 60.40 TTCTGTTTGCTTAGTTTTATAAGAGCTTATTCAAGTGCATGTCTTACCCAACAATAAAAAAAAACTACATTACAATCATAATAATAATAATATAATGAAAA:1 + chr3R 11108719 5' + invader3 5048 4 57.43 ACATTGAGGAGTCGAAGGGTATGCGGGCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr2L 9075571 5' + 297 6610 2 65.35 ACTTAATACATATATGGGTATAAATATAAATGGGTTGTATACTGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGC:1 + chr3R 12379283 5' + 1731 4348 2 56.44 TGCACTTTATTCTCGCACTTGTAAATTAAGACTAACTTAAACCTAACATTGTGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGC:1 - chr3L 25186301 5' - Max-element 8319 2 52.48 GAGAACCTGCCGCTGCTGCAGCGGGCAAAAAAGTAATCTTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 10924220 5' + hobo 34 1 56.44 ATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chrX 21668078 5' + Tabor 6868 2 52.48 TTACTGGAAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACC:1 - chr3L 25350825 5' - baggins 5418 1 39.60 CGTTCTGTATGTGCGCGATTTGTGTTTTGCTTGTTTGTTTTGTGTTTTGCACTTCGCCTTCTCGTTTGTTTGTTAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTG:1 + chrX 13586826 5' - gypsy7 5006 1 69.31 CGAGGGCGTACAAATGGTTTTCATGTGATATTTTTTTATTTTTTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr2R 11524519 5' - I-element 5310 1 68.32 TCCAGTATATTTTATCACANGTTTGGCCGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 12485477 5' - roo 9051 2 56.44 AGGTAGCTTTTGGTTTTGGCTTAGGGGTGTTGGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCC:1 + chr2R 20961198 5' - Quasimodo 7016 2 72.28 TTAAAAACTAAATAAGACAAGCATCGCTAAATCGCCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2L 16071164 5' + 412 43 2 64.36 TGAAGGAGTTGGAAGATCTGGAAGAGATATTAGATAAAGAATTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACA:1 - chr2L 16347277 5' - Cr1a 4232 1 59.00 AAATCGCTCAGACTTCCCAGCCGAATGTCTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr2R 12812226 5' - blood 7341 2 78.00 GATTTCCTTAGTGGAAAATAATTAAGTTGTCTTCTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTT:1 - chr3R 30711980 5' - F-element 4348 1 67.33 CCGAGACAAATATTTGTAGAACCCATGCTGAGTGTCCAATGAGCTGGCCGCCATGTCGATGAGCAGGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCA:1 + chr3R 4503035 5' - F-element 81 1 71.29 AATATTTTCGTTTAAAAAGCTCTAGTCTTCTACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACA:1 - chr3L 13142072 5' + F-element 410 1 54.46 TGTGGTATTTACCGCAATANGTTAATAGATTTTGTTTGTGAGATGAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATC:1 + chr2R 7637902 5' - jockey 58 1 75.25 TCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGTCAGATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1 + chrX 21668026 5' - Tabor 7276 2 73.20 ATGTTTGCTGGCACTGTAANAACGTGGCTCAGTTCTACAAGAACTGCAACTTGGAGCAGAGCCTGCTTACGAGAAAAGGAGGCGGATGTTTATGTCTGTTG:1 + chr2L 15970679 5' - Quasimodo 299 2 80.20 ATGGATGAAACCATTTTAATTAGTTCCCATTTACGTATCAAAAGAAAAGCATTTATATTTTCTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 8254767 5' - roo 9057 1 64.36 TATTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:2 - chrX 21668095 5' + Tabor 6851 2 67.33 ATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTTTTG:1 + chrX 21634158 5' + Cr1a 245 1 76.00 TCTCTCCTCATAACTAGTTGATGATGCATTGGAGGCCGGACGATAAACGGCAGCGCCCCT:1 + chr2R 12098219 5' + Cr1a 4401 1 63.33 TTCGGGGCTTAACCCCGAAAAATGGGTTGTGGTCAATATGTAAAGCCAGAAGATGGCTCTGAAGATTCCGAAAGATGGAATAAGCTCGATCAAAAGGCCC:1 - chr2L 7159341 5' + Copia1_DM 485 1 74.00 TACAACCGAAACCCTTTCATGCAACCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCC:1 - chr3L 13142042 5' + F-element 440 1 76.24 CCAGCGAGGCCTTGGTTACCAGCTTCTCGCGCTTGGGTACCACAAGTGGGGCCTCTGCCTCATTCTCGCTCTCACCCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACGC:1 - chrX 17638313 5' + Cr1a 303 1 66.34 TAAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2R 9871592 5' - roo 397 1 67.33 TTAAATAGCTAGTTAACATACAAGCTAATAGAAATTTATATATAAATTTAATTACACGTTATAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr3L 20490748 5' + FB 12 1 63.37 AATAAGACATATCCCGAAAAGTATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3R 5595030 5' - 1360 3370 1 60.40 TGACCGCGCGACTCGCGCCGAGATTCTCCTCGACTATCCTCGCGTACGTACGGCTCCTCGCGTGTTATATCGTTATATCCCCTTTTGCGCACGGCCC:1 - chr2L 23332600 5' - gypsy8 303 1 65.98 AGTTGGTAATCATTAAAATGATAGAGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGCCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr2L 20992943 5' + I-element 53 1 71.29 AATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACA:1 + chr2R 5617480 5' - invader1 403 1 69.31 AATGAAGCATAAGAGATTCGTTAACAGCGTGTGAATTTCTAAGCGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2L 19698508 5' - hobo 2911 1 59.41 TTGTTTGAGCTACTTGTTGTTGAATTTGTGGTGTGTTGGTTGTTGTTATTGTTATTGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGAC:1 + chr3R 17879743 5' - F-element 282 1 55.00 ACACATTGTGCGGTTTAAGGCTAAAAGAAATCAATTCTGGTCGAAGAAATGAATTTACATAGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATAT:1 + chr3R 7477387 5' - 1360 3117 1 72.28 TTGATGATCGTACCTTCGGCACACAAAAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr3R 4712744 5' - pogo 2055 1 74.26 TCAATTAGGCAGGAAAATGTAACAATGTATATATAGGTAAAGTGATAAACCGATATGTATGCATACTACACTTCCCTCCTTTTGAAAGATAACGTAATAAT:1 - chr3R 1292534 5' - mdg1 7008 1 67.33 CTCGTCCAATGCCAACAAGATCATTAACCTGCTGGTGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTCTTCATTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTC:1 + chr2R 17114025 5' - invader4 275 2 64.36 TACAACAAAAAACAGCTTTTCACCTTTTGAAAAATGGTTGTTACGATGACATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - chr2R 18553881 5' - jockey 4959 1 56.44 CAAATAAATCCGTTCGTACATTTCAAAAGTAAAAATTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTT:1 + chr2L 13556139 5' - FB 139 1 43.56 AGGTATGCGTGACTTATGTTTACAGTTTATTTATCAAAAAACACTCCGAAAACCATATCCGACTATAACTGCTTTGCCGTCCACAGAGCCTTTAAGTATAT:1 + chrX 3282950 5' + Ivk 394 1 70.30 TCAGTACTTGAACCGAAATCAAAACTTGTTAGTAAGTTAAAGACAAACCCAATAATAACGAGGATCTTTGGGGTGTTGTCAAGGATTCATGGACCAAAATT:1 + chr2R 17523308 5' + Tc1 1243 1 57.43 GAAGGGAAAAAAGGGAAAAGGGTTAGGCGAATGGGGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTG:1 - chr3L 9220168 5' + BS 36 1 64.00 ATCGCCTGGGCATCCATGGATTGTCAGTCTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:1 - chr2R 22269180 5' + jockey 4717 1 76.24 TCACTTTCCAACAGCTTCGACTATGCCACGACTACGTCCCTTTCTCCTATATTCTTTGTCGCAAGCACGCTGTACAAGCAAGACCAAGACACCCAACGCCA:1 - chrX 22757353 5' + Gypsy12A_LTR 2175 1 57.43 AAAAAGAAGACTCTACTCATATCCTTTTGTTTATGAAGCAAAATAACCGCGGTGAGCTAAAATTTATTGCATGCAAAAATAAAATAGCAATACACAAGGCG:1 + chr2R 101019 5' + Porto1 4232 1 48.51 AGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGC:1 - chrX 20999590 5' + BS 13 1 57.43 ACGTCCATCGTCAACCAATTCATGCTAATCACTGAGTAAAAAGATGTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTC:1 + chr2R 5277131 5' + invader4 2785 2 56.44 CCAAAATATCGCCCCCGCCGATTCCGATTCGCTGGCAAACGAGCGAGTTGCCCACCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr3L 5360146 5' + P-element 22 1 59.41 TTGTGGCCTGGCCAACCCACCCCTTAGAAAATATACACAAAACCCGAACTCAACACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTT:1 - chr3R 10224721 5' - Dm88 381 1 58.42 TCCGACAAGAAACGGCTAAAAGGCTACTATGGCTACGGATGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCC:1 + chr3R 23196435 5' + Rt1b 4981 1 69.31 GGATGCCGAACTTTCCGTCGGGTCCCTGTTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATA:1 + chrX 19520274 5' + 412 204 2 71.29 AACTCAGCTCAAGTATAAACCTTCTCGCTGTGAACGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGG:1 - chr3R 31129914 5' + accord 40 2 71.29 ATAGCTGAGACTTTTCAACTGTCAATTATTTCCTTATTCTTTATGCAAAGCCCCCAGACGCGAGTATCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 + chr2L 3581943 5' - transib2 2817 1 70.30 CCGAGAGGCTTCTACATCTCTGGTGTGTTTTCTTTCTTGTCCCCCCCAGTTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19026812 5' + hopper 145 105 56.38 AGCCATCAGATTCTATCCCATACCGCAATCAATCAAATCCCATCTAGGCACACATTCCGTCACATAGGGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr2L 10020865 5' - hobo 2930 1 70.30 AGTAAAAACAATAAAAATTCTGAACTTTAATCGTCTATATTTCGAGTAAGCCGACACCACACACAACACACCATATACCACACACACACACACACATTCCC:1 - chr2R 24383166 5' + accord 7033 3 55.45 ATAACCGATCGCAGTTTGGTCACAGAATTCTTCAGCTCGGCAAACAGGCAAATCAAAAGTAATACTAGAATAATTTTAAGCTTCAGTTTGAATTTGCATTT:1 - chr3L 10921749 5' + Gypsy6A_LTR 161 1 57.43 GCGATTCACTCACTCTGATTTCGGTATAAAATGAAAGAAAGTCAATAACGATAAGCTTGTTCTGGTATATCACCCATAACTCGACAAGTTTACCATTGCCA:1 + chr3L 19112014 5' + Doc2-element 416 1 75.25 AAATTAATTAGATGCCCACTTTTTATGCTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATT:1 - chr2R 20520250 5' - Max-element 250 2 72.28 GATGTACATATTTTTGTAGAAATGTGTGTGCATTTTTCGTCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr3R 7085725 5' + P-element 34 1 47.52 CTGCACAGTTAAATTTGGTTCTGAGGAAAAAAAAACACAAACAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAA:1 + chr2R 3817464 5' + gypsy7 5006 1 49.21 TGGCCAAAACTGAAATCGATCTTTTGGTGAATTCGAAAAGGGTTTGGGCAATTCATCTTGGTTGGTAAATAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chrX 9439260 5' - roo 410 1 75.76 GCAGATGTTCAACTCGCCGTGGGTGAGCTTGCAGGTGGGTTCCATGTGTTAATGTGGTTCAACCATGTAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGAC:1 + chrX 21343618 5' + Dm88 460 1 69.31 ATTAAAGCCATGGCGAAAAGTTTACGGCCACCGTTACCACCACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 - chr2R 13745769 5' + hopper 32 1 58.42 TTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCACTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATA:1 - chr3R 25796085 5' - BS 5076 1 57.89 GAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:3 - chrX 21668090 5' + Tabor 17 2 62.38 CACTGTAAAGCATTTTACTAAGAATTTCGGACGCTGATTACTGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2R 8675505 5' - roo 394 1 58.42 GGTTTGGGCAATTCATCTTGGTTGGTAAATAAATGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 9439220 5' - roo 9031 1 74.26 TGGCCATAGAGTTTTGTATTCAGATAAAAATGAGAAAGACAAGCAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:2 - chr3L 26567354 5' + opus 7029 4 55.45 CCGTCCATACCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCG:1 - chr2R 14849024 5' + flea 4705 1 65.66 CCCCAACTCGCGCCCACATGAATCCAATAACCCACAATAACCACTATTATTCACCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 11832609 5' + roo 8686 2 55.45 TACGAGGGAAACTGTTTTTCCATTCTGACGGCTTTGTTCTGGCTTGTTTATGCCCTCATTGAGTGCGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3R 11829227 5' + jockey 16 1 69.31 GACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCA:2 - chr3L 24916691 5' + Porto1 148 1 55.45 TTAGAGCTGCAAAGCCAGATAGAGAAAGTTTAATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chrX 1716692 5' - hobo 2912 1 70.24 GATGTGTGGAATTAAGCCCTGAATTTTTTCGTGTGCATCCACACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 22237011 5' + 297 6609 2 58.42 GTTTTATCCATTCTAGTCCAGAAATGCAGGTCAGGCTGCTGGTTCTCAGTGCATTGTGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 13598172 5' + pogo 16 1 63.37 GTTGGTTGAATACTTAATAATATGATGGAACTGGGTTTTCGAATTTAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGA:1 - chr3L 4669275 5' + mdg1 7090 2 56.44 ATCAATTGGCAGTCAACAGATTGTTGATGCTTCTATTTAAATATTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chrX 3967809 5' - pogo 2071 1 57.43 CCTGCTGACCCTGACACTAAACGCCAGATAAGCAGTGTCTGCCACCGTTTCAGTCGCCTGGCTGGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAAT:1 + chr2L 10114497 5' + Doc 481 1 66.34 AAGTTTACGATCCTCGTATNACAGTTAATCATGAATATTTCCCGCAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3L 16666643 5' + I-element 30 1 56.44 GGTTGCTAACCATATCATAATAATGTTTTTTGGCAAATAGAAATTTAGAAGACTAATAAAAATGTGAAAAATATAAACACATTTTTCAAGAGCGTGGGCGT:1 + chr2R 4565707 5' - INE-1 254 1 76.24 ATTTTTGCTTGGGCCGAAGAGATAACCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 20425440 5' - roo 403 1 73.27 GGCCTAACTGCGCCTCCAGGTAGGCAATAGTATCGTCGTGTCTGTGATTGTGTTGCGGCTGCATAGATGTATGGGTCATTCATTCGCTTGGGAGATGAGCA:1 - chr2R 7605111 5' + jockey 6 1 71.29 AAAAGCTTTAGAATGTTTGGACAATGATGCCTAAAACGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 10063294 5' - roo 9034 1 65.35 GAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGC:1 - chr3R 10741142 5' + 1360 3365 1 42.57 AGAGATAATTATCCCACCTNCAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chrX 21668082 5' + Tabor 25 2 53.47 TGATAGGTGGGGTAGATATNCTACAGAAGCAAGACTAGTTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTAC:1 - chr2R 1224610 5' - Doc 490 1 64.36 TATCAACGGCTATCCGGTAAGAAACTTATTAGTACTTCAAGAAATCAACATTCTTATATATTTATATTTCCATCTCCTATTCCAGTAGACTACTTTTAATT:1 - chr3L 5593261 5' + Cr1a 3976 1 80.20 CAGCATAGATCCTACTTTCAATCGTGTGAAATTAAAGTTAATCAACATTCATGACGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2R 24242877 5' + hobo 19 1 61.39 CGCGTTGTCAATTCTAATTGGCGGAAGTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTT:1 - chr3R 22062938 5' + jockey 157 1 73.27 CGCTCCGCTCTCCATCCCTCGACCCTTTTCACACACACACGCACATGAGTTCTGCCTTGTTTTTCCCTTCTTTTTTTT:1 - chr2L 7929202 5' - gypsy2 409 1 62.82 GGAGGTTCCAGTATATTTTATCACACGTTTGGCCGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 12485483 5' - roo 394 1 63.37 CCGATTGCCACTTACCGTGGGCACATTGCGAGTCCGGAATCTCAAGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGACCAG:1 - chr3L 13424738 5' + invader4 360 1 55.45 CCCTCTTTTCCGGCTGCATTTGTTTGTTGGCCATGGCCAAGGCAATGGAAATTTTACTCGCGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTC:1 + chr3R 14330373 5' + opus 106 2 64.36 CTACAAGTGCACATAGTGGTGTTCGCTTGGGTGGAGCGTAATAATATTGCGGTAAAAATCAGTCGAGCGCAGCGGCAGAGGCACGGACAGCCTCTGCAGCT:1 - chr3R 11465753 5' + invader4 2862 2 68.32 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCG:1 + chr2R 1982172 5' - 1360 3295 1 88.12 TACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGT:1 + chr2R 5284574 5' - Doc4-element 2602 1 64.36 GGCTTTGCATTTATTCGTGTGTAAAATTTTAATTGAAATATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 + chr3R 15530060 5' + mdg3 39 2 60.40 ACACCCTCGTCGCCCAGATAAACACGGAGCATACAGAGAGCAGCGAGGCATCAACGCTTGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGA:1 + chr3R 28451008 5' - roo 273 2 61.39 AGTTATGGAATTTTAAAAGCTGAATCTCTATATGATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr2L 3985140 5' - roo 9031 1 66.34 AGCCTTGAAGCTTTACATTGAGGAGTCGAAGGGTATGCGGTCTCCCATTAATACAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr2L 9075557 5' + 297 6596 2 51.49 CTTTTAATGACTTTCAGAACGATGTGTGCATCAGTGGTGTGCATAATGAAAAATCAGAATTAAATATTTCGTCCATATTAAGTGTTGGAATATACTATTCA:1 - chr3R 10719794 5' + copia 4867 1 75.25 TACTGTCAATGGAATGGGCNCAACTTCCTTAGGGAGAGAATCATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 1930441 5' - roo 9039 1 58.16 GCTTTGCTCTCTTTGTGTCTGTGATTTTCCCCTTAGGCTAAGGCGTGTCATTAATTTATGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2L 1858400 5' + pogo 17 1 62.38 AAAACCCATTTTCCAAACAGCTCGTTGTTTCAACAAATTGTATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 24612177 5' - roo 9036 1 61.39 CTGGGAATTAGTACCGACTAGAATATACCTTTTATTTAAGATATATCTTAAATAATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAAC:1 - chr3R 19132428 5' - Bari1 301 1 62.50 TATATAAATATCTTCCAATTAACAATGGCAGTTACCGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCG:1 - chr3R 25561051 5' + F-element 4467 1 77.23 GGGCGGGGGGTGTGGCATCGCTCGAGCCATAGGCAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chrX 18990325 5' - copia 5083 2 66.34 GAAATTTATTAAAAAATGCCATAAGCCCGAGTTAAATCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 + chr2L 19907917 5' - Tirant 348 2 74.26 CAAACCTGTAAGTCTGCACAATATGAGTTCATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 5043299 5' + roo 8709 2 72.28 GTTTTCCCCATTTTCCGTTTTGCCGGCTGGGGCGGCATCATTAACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr3L 3475652 5' - mdg1 390 2 55.00 AGTGAGCCTATGGCTTATGATTCACATATTGGGAGTCGATTTGTTGTGGCTTCGATTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAA:1 - chr3L 16336097 5' - accord 7205 2 63.37 TAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1 - chrX 21668077 5' + Tabor 6869 2 53.47 AATATGATATTGACCGAGGTTCTACTGCTGTTTTTATCTGCAGTGCCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAG:1 + chr3R 2819805 5' - jockey 4704 1 54.46 TGAATAAATGATTAACCTCTGGGTAGGCAATATACCCCTGATACCCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chrX 8896232 5' + 1360 27 1 54.46 AACGAAATATAACGGATCTTTATTGTATTGTTGTTGCCTAAATCATATGAAGGGAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAA:1 - chr2R 5413494 5' + Juan 4047 1 58.42 GAGATGGACGACCCGGACGATCCGGACCAGGAACACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATT:1 - chr2L 4444511 5' - jockey 4650 1 66.34 ATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr2R 5531202 5' + 1360 59 1 68.32 GAGCACATGTTCGTGGTAAGTTGATACCGCTCGGTATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:1 - chr3R 29375010 5' - mdg3 207 2 63.37 AAAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCG:1 + chr3R 3269645 5' + Gypsy6A_LTR 109 1 63.00 AAGAATCGGTTTAAAAAGTCTGAAAACGCCTCTGTCCTATCTGCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTA:1 + chr3L 4432014 5' + blood 169 4 76.24 CATCCCCATCTATGCGCTACATGTAGATAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 + chr3R 29374962 5' + mdg3 5277 2 62.50 TGGTCCTACGAGCCGGATACCCTCAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAC:1 - chrX 9493261 5' + 1360 3205 1 81.19 GTGTGTGGACCTCGGGCAANAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 7582618 5' + 297 25 2 55.45 TAATAATCGAGCGACTCTGGCAGGAAAATATGAGGACCGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2R 21454316 5' + hobo 36 1 58.42 ACGTTTGGCCGGCGTTACATTTGGAATTCATTTTTATGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 12485459 5' - roo 9033 1 73.27 CAAAATTACATATTTTATTTTCCCCCCTAGATAAATAGTTACCGCATCAAGGAACTTTAACACTGATCACATCGACTGCGCCAATTGCAAATAAATGGTTG:1 + chr3L 8361433 5' - 17.6 494 1 63.37 AAATGTGTTCGACGGATAGATTTTCCCCTCTTAATGGACAGAATCGTTTGAGTTGAAGAGACTGTTGCGGTTGTTGTTGTTGTCGATGCGAATGCAGTTGT:1 + chrX 23155603 5' - Doc4-element 298 1 64.36 ATTGTGTGTTTTTCCTCTCNCCAGCCAAGTTTTCTTATCTCAGGCAACAATGTTGGTCGCGTTTTTCTTTGGGCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATT:1 - chr2L 5244519 5' - transib2 2823 1 75.25 CTTTACAGATACAAATGCGCGAGAGCCAGATACGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTG:1 + chr2R 5815587 5' - HMS-Beagle 6642 1 67.33 CAACTGAGCTCTGAGGTGGGGAAAAACTTTCTGCACTGTGTTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCAC:1 + chr3L 9929542 5' - accord 218 2 57.29 AAGTAGTTATGCGGCCAGAGCGGAATATGTGCTGGTGGATTATGTGGAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAG:1 - chr3L 15002407 5' - Doc3-element 356 1 57.43 CCGTTTCTCGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGCATGTAAGTATGTAACAGACAGTATGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGA:1 + chr4 431233 5' + INE-1 94 1 53.47 GCCATTATGAACTCCAACTCATTAACCGGTTTTAAAGGTCCAACTTTATGCACACACGCACACATATATGCTTTCTCGTCTCTTGTTTTTAATCACATAAG:1 + chr3R 11132966 5' + 1360 3245 1 62.38 GTTTTTGGTATTAATGGTTTTAATATTTTTTTCATTTTTGTTAAGCTGAACCCTTTGCGCCCATCGTTGCTTGTGAGCAATTTCTATGTTTTCAGAGCTAA:1 - chr3L 24303753 5' + looper1 35 1 60.40 TGTACCGTAAACTCCGTAAACAAAGACGAATTTACACGAGGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGAT:2 + chr3L 27145289 5' - 1360 3114 1 77.23 TGGCGATGGCAACTAATTAAGCAACGTCACACATGCAACGTCCATTAATGAAAGCGAATCAAACAGGACTGACTGAGTAGTTTGAGTTGTGAAATGAGAAT:1 - chr2L 12287469 5' + accord2 7489 2 75.25 CTAATATACTAATGTACATNTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 19450186 5' + roo 55 2 51.49 TAAAATACATTATCTTAAAAACATATCTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 + chr2R 7542183 5' - mdg1 372 2 74.26 ACTGACAGCCGTCGAAACTGACGCTATATAGCCAAGGCTTATAGCCATTGGCCCTCTTCAGCAATCTGGCCTTAGCAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAA:1 - chr3R 29025294 5' + S-element 1712 2 72.28 TTTACTGTATGTATCTATCTGCATATAATTGAACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr2L 7328307 5' + I-element 45 1 68.32 GTTCCGTTATTGCTAACCACCTAGGAATCCACCTTTTTGGATTACCTGCCTCATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTAC:1 + chr2L 21369841 5' + rover 20 2 60.40 GAAAAAGCGTCCACAAATTAACAGTTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGACGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr3R 19094185 5' - P-element 2865 1 57.43 AATGCATTAAATTGCATTTAAAACTAATTAAAATTGTAGACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 22219606 5' - roo 9037 1 61.39 AAGACGAATTTTTGCTTGGGCCGAAGAGATAACCGACGTATAAGGAATAAGTTTTTTGGCCCGCAGTTTGGCTTTTACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chr3R 20425447 5' - roo 410 1 78.22 ATCCATTTCCAAACCATTCCCGCATCCACATTCACGTTACTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 + chrX 15599638 5' + jockey 4733 1 59.79 GGAAAAGTGGTCTTAACTGAAGAATAATTAACTAAATTTCTTATAGTTACTATGGACTTTTCTTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCTAA:1 + chr3R 26636782 5' + I-element 342 1 76.24 GCACATTGAAATTGCTTTATGTTTTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACATA:1 - chr2R 13625876 5' + I-element 4949 1 76.24 TTCTAAGCGGCGTTTATCACCTAACCCAACCACTTCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAGAA:1 + chr3R 22266593 5' + F-element 4588 1 72.28 GTATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCGGTATTTGACGAAATAAA:1 - chr3R 16533702 5' + X-element 4378 1 31.68 ATCCTCAACTGAACAAACCATTTCAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3R 27071874 5' + jockey 34 1 51.49 ATTCGGCGTGTAGAATCGAAGCGGTTATGTATCGTTCGCAAAGAGGAAGAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGGCAAACCA:1 - chr3L 23486081 5' + 1360 3348 1 54.46 GTAAGTCGGGTAGCGTAATTCTAATAGGACATTTTTAAGGTAGTCCATGCTATTTTTATAAGCTAGGTATAATTTGAGGCTTGCCTACAATGGTTAACGG:1 + chr2L 17079410 5' - Doc4-element 226 1 82.00 TTAAACCATTAAATATGTATATGCATAATATATCATATTTAATTTGGTCTACAAAAAATATGAAATTTTAACTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 + chr3L 7215465 5' - copia 255 1 76.60 GAAGGTCTAGAAAGTATTGAGTACCTTATTACCTTGGGTATTTTGGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr2L 20836559 5' - 1360 3361 1 53.47 TTTAGAAATTGAAAAACTTGTTTAAAAGTTATGGCGTGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGA:1 - chr2R 1230430 5' + Bica 4902 1 64.36 GTTCTATTATCCAAATAACCCAACAAAGATTATGGGCCTAGACTTTTGCCCCCTGCGATCCACCAAGCTGACCAAAGTGCCTAGAAAGAAGACGCTCAAGG:1 - chrX 22398540 5' + G-element 367 1 53.47 CCATATGCAGATGAAGTCGGCTAAAACAGCAGCACAAACAGGATTTGGCCATGGCCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATAATGCTGTGTCC:1 + chrX 17465271 5' - Rt1b 4755 1 58.42 TCCCACTTCCCTTTCTCCCCAGCTGCGTCTTAAGTATTTTGTAAAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chr2R 20441296 5' + I-element 31 1 53.47 TTACACTTCGCTATAATTCCTCATCTTTTTGTGACTCTTTCAGAACCGCGCTCTGCCCGATCGGTACACACATCTTCCACGATGCCACCTCCTCGTTGCCC:1 - chr3R 22622928 5' - Osvaldo 432 2 56.44 GAGATTATGCTCTTTTCCCAAATGAGCCTACACGATCAGCGTAAGGACAGAGGGCAATTTTAGCCGTCGCCAAAGAAAGTGCCAAACCCATATATGGCCGT:1 + chrX 15839118 5' + 1360 3360 1 65.35 GGCGTGGTTTGCTTCCCTTTGATTTATGTCCTGCCATTGGACATCGGTCGGTAGGAGGGGGCCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:2 + chr2L 15331734 5' + 1360 13 1 67.33 CAGGTGAAAAGGGGGTAGTCGGAACTGCCTGCAGCTTGCCCCGTGCATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 - chr2L 12884390 5' - HMS-Beagle 226 2 56.84 CATATATTCCTTAAACATANTAGTAGATGTTTTAATATCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr3R 30284220 5' + blood 7051 2 66.34 ATTTCTGATACGACGATATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACGTATTTTCAGCATTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGAC:1 + chr3R 1440139 5' + G-element 12 1 68.32 ATATAATGATGTTGATGTTGTGTTGCTTTTACATATTTACACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAATTGAAGACAGCGCAAGTGATTCTGCTAAGCCCCC:1 + chr3R 3696425 5' + G4 147 1 60.40 AATTCAGTGGCCGACTGGACCCAAAGTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGGCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3R 27448254 5' - hobo 2892 1 70.30 TTTAAAGACCCGGGCACACAAACACACACATCTATAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTA:1 + chr3L 2927175 5' - I-element 4969 1 65.35 GCGAAATTGCAAACGAACAAAAAACCTCTTCCCCTCGACAAACATTTTTTGGGATTGTGCAGTGTATTTGTGTTTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTC:1 - chr2L 17102046 5' - accord 183 2 79.21 GGAAGGTCAGTAGCACTGAGAGGGAAATACTTGGAAAAAAGTGTAGACAGGTGTCAGTTTTTTTGGAAGCTATAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chr3L 13704594 5' - opus 499 1 80.20 ATTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATT:1 - chr3R 4583049 5' - Cr1a 4391 1 74.26 ACCTGCACCCACTGGCCTCTTTGTGCAAACGCGGGCCACTCAATTTGGGGAATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGAGAT:1 + chr2L 13691940 5' + Ivk 224 1 55.84 AAGCTAACTATGACTTGCCACTAATTGAAATCCGAAATCAAAGTAAACTCCTAATCTTTCATTGTCACGGCTCCGCCTGACACCTGATTAGTAAAAG:1 - chr2R 9638271 5' + gypsy2 294 2 59.79 AGTTAAGAACATTCGTATCGCCAACCATAAATGTGAGCAGCTGATATTGTGTTCTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:1 + chr2L 16994794 5' + Stalker2 7266 2 58.95 AATCCCGTCCATACCAATGGATGTCTGAACGGTTTGGAGATTAAAGACGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCA:1 - chr2R 14849028 5' + flea 4701 1 63.64 GTGATTTTTGTGCCTCAAAAAGTTGCAATTTGTCTTTTTACCTTTGCTCTATCGCCGGCAGTTTTATTTGCACAGTTTTTTTTTCTATTTGGCT:1 - chr2L 1562242 5' - invader2 290 1 60.64 TGTACAGACTTTTTCGCATTGTATTCGGGGGATGAGACGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGG:1 - chr2L 15016422 5' - Stalker2 132 2 55.42 GAACTCAATATGATTAATTTCGCACACACACACACACACACACACAGTAACAGTCGGCTTTGGAGTTTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr2L 19698420 5' + hobo 8 1 64.36 GAACTGCCTGCAGCTTGCCCCGTGCATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr2L 12884369 5' - HMS-Beagle 199 2 74.26 TAATTCCTTCAAATGTATGAGTACTTGTTAGGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACA:2 + chr2L 284483 5' + Quasimodo 44 2 68.32 TGCAATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGAC:1 - chr2R 19798132 5' + HMS-Beagle2 6759 1 68.32 GTAGCCGAGGTTTTTTGAGATCACATCCTTATAGTAGGTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATG:1 - chr2R 18295370 5' - hopper 992 2 65.35 ATTCCCGGTAAACAATGGGGAGGTCCCTCGCCTCCCTTAAAAAAAACGCATCAGGGATGGTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 19907989 5' + Tirant 8120 2 68.32 TCTCTGATATTTGATTTTATTGTCGTGATTGAGCAAAATGATGTGCCAAATGTGGGTCCGAAACCATAGAGTGTGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr3R 27448335 5' + hobo 2 1 77.23 ACACACTCAGTCCGCGAGATTCTCAGTTCGCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGATCTGATTTCAG:1 + chr2L 5461670 5' + Cr1a 407 1 70.30 CTCACCCCACACTGACAATAAGCCGCAGAGAATGGGGGAATATTGTGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2R 20973016 5' + hobo 28 1 54.46 ATATGTATTTATTTGTTTATATAGTTGCCTTGTTTTTGGTTTCCAGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 - chrX 13962009 5' - TAHRE 10433 1 64.71 TCCGATTACATAACTATTTNGTCTTTCCCAAAGGCCAAGAGTAAGAAATAAAAATGTGACATTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTA:1 - chr2L 18689620 5' - Gypsy6A_LTR 182 1 62.38 ACGTTGCTTTACACTTGGGNACTTGTTCGTGGGATTTTATGAGCTTAGTTGGCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAG:1 + chr2L 16071100 5' - 412 7520 2 51.49 GCTCCCTGGATCCCCGGATCCCCGGATCCGCGTATCCACAGCTCGGGAGCTACACAAGTGTCTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCAT:1 - chrX 20015578 5' + transib2 11 1 59.41 AAAGTAAATTTACTCATAGAACGATCTAGTTAAAGCTTCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 - chr3L 17687856 5' + BS 34 1 61.39 TCCGCATCGGAATATTTCTATTTGACATATGGGGCAAGACAGCGCGCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGA:1 + chr2L 19478615 5' + pogo 1689 1 57.43 GCCACTTCCTTGTGCCCTCTTCATGGGATTCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 11846666 5' - roo 9027 1 72.28 TGCCCGCTACCGAGGGCGTCGAGGAGGTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAG:1 - chr3L 4418290 5' - opus 7207 2 73.00 ATAAAAATGAGAAAGACAAGCAATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr3L 26567331 5' + opus 7046 4 76.84 GCATATTAAAGCATGTAATATGACACTTGGAGTCATAATTCAATGTTGCTGTCGTTATATTTGCAATCATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTT:1 + chr3R 24799875 5' - Stalker4 62 4 59.41 CTTTTCTTTGGCTTGCTCTCATTTTCCCACTATACTTTGCGCGGTTCTTTTCTAAACGAAGTTAACCAGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:2 - chr2L 9045843 5' + jockey 12 1 74.26 AAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTT:1 + chr3R 3269647 5' + Gypsy6A_LTR 94 1 73.49 TTATAAAGCGGTTCTGTTCCAGTGACAAGCCAACAAAAACAATAACATTACCGCCAACCCGGGCTCAAGCTCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAA:1 + chr3L 18633223 5' + I-element 181 1 60.40 CATATTCTCTGACGGATGCAATTCAAACATTTCTCTAGAGTCTAAACTTTTTATATATAAAAGTCGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTA:1 - chr2R 5721890 5' - INE-1 544 1 54.46 ACTATCTTTGGTTTTAATACAGACCTAGAGAAGAACATGCTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr2L 9724203 5' - 1360 3355 1 61.39 TACTCGCCGCATAAATATTCATTCACTATTCACTCTCTCATTCGAGGGCTGTCCGCTTCCGAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGC:1 - chr3L 10104231 5' + gypsy12 10026 2 58.00 ATTGAGTGAGTTTTACCCCNAAAATATCGAAAAACTATTTTTAAACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2R 16639729 5' - opus 7474 2 59.41 TAACTCTGTCCGGATTGCTGCGAGCTTCATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAACAGCAGAGAA:1 - chr2L 23299223 5' + Doc3-element 4472 1 77.00 TCAAGTGGCAACTTCGGTAGGGCATAGATACACCTACCTGTATGGATTTATTGCCCTGTATATGGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACT:1 - chrX 19607327 5' + Tirant 8118 2 70.30 CCAAAAGCAGAATACATTANAAGTCTTGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr3L 25059171 5' - mdg1 416 2 74.26 ATTTTACAGACTCAACATTTATTCGCCGGTGATTCACTGCACTCTCTCGATTTTCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAG:1 + chr3L 6263929 5' + Max-element 8392 2 59.41 TAATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 + chr3R 19446653 5' + HMS-Beagle 6825 2 55.45 GCTTTAATTTTCCTCTCAGGCGGGTGCGCAATTCTGCATATATGTTCAAATAGAAATAAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGGAGAACACGTGT:1 - chr2L 2622786 5' - blood 7371 2 60.40 CACGGATGGCTCGGGGACATCAAAGCCGAAACTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGCTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGC:1 + chr3R 17563243 5' - R2-element 3384 1 67.33 ACCAAGACCTCATCAAATTAAATGAAATAACTATCACATACAATGAGCAGATTTAAAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 + chrX 22589736 5' + I-element 4919 1 60.40 AAGAAGGAACACCATTGATNCAAAAACATAATGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 12664090 5' + jockey 4997 1 95.35 CATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2R 4606221 5' - 1360 3352 1 65.35 CTCTTCTCTTTCAGCTGACACACACTCCCCAGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCT:1 + chr2R 3209747 5' + Doc 4264 1 69.31 GAAATTTTGATATTTTCCCTTATCCTGGAAGTTTGGTGTTGGTTTCGTATACACCTTCTTGCTGTGCTAGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTCTTGAATGG:1 - chr3R 3005183 5' - Doc3-element 458 1 66.34 GACAAGCAAAACTCAGTCACAACACCTGAGGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr3L 19459370 5' + Doc 57 1 70.30 GAAAGCATTTAGATATTTTCACACTTTTTTTTAATTTCATTTTTTTTT:1 + chrX 4188437 5' - Doc2-element 253 1 83.33 ACTCTGCCAATAAAAATTTAATCCAGAAAAAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACCATGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTC:1 + chr2L 525762 5' + Idefix 7054 2 70.30 CAGCAGCAGAACATTTCCAAAAAATTAGAGATGTTTTGGAGAGAGATGTTTTAGAGATGTTTGTGGGTTTTTTGTTCAGTTTCTTCTTTTTTTTTTTATTC:1 - chr2L 17906393 5' - Osvaldo 1522 1 38.61 GCCTATTGGCCATAAATTATTAATGATTACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAGGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chr3R 24464844 5' - 412 447 2 74.26 TTCATTTGTATGCTTAAATTAAATTGTATAATTTAAAAAAATGGGCGGTGATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAAT:1 - chr3L 23579396 5' + McClintock 5974 2 62.38 CTGTTGGCGCTAGTCAAGCTGGAAGTTTATAAGAGCAGCAGAGTGTCCTGATCGACTTGGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAAT:2 - chrY 2971733 5' - TAHRE 10412 1 59.41 CATTTTCCCACTATACTTTGCGCGGTTCTTTTCTAAACGAAGTTAACCAGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2L 9045824 5' + jockey 31 1 55.45 GCCGAAAATACAAATACCCCACAAACAGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 - chr2R 11038638 5' + jockey 4763 1 69.31 CCATCAGATTCTATCCCATACCGCAATCAATCAAATCCCATCTAGGCACACATTCCGTCACATAGGGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 10020863 5' - hobo 2928 1 68.32 TAATTAGTGGGATATGGTCAAAGCGCTGACAGAGCAGCTTAACTCACGATATTGCAATTAAGTATCGAATATATCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAA:1 + chr3R 10026207 5' + FB 4 1 75.25 GGGGGGTTCGGTTTGGATTAATTATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTG:1 + chr3R 17895027 5' - hopper 31 1 78.00 ACATGAAATATATGTTTTGTTGCGTAGAAACTTAATTAAGGAAATTAAATAAGGAAATTAAGGAAATCACTTAGCCTATTAAAATAAAATCTTATTAAAAT:1 + chr3R 23405102 5' - transib1 1889 1 60.40 GTGCAAATGTGAAACGTGGCCGGAGCTCCGTCCACAGAAAATGGAATAACGTGACTGGCTCAAGAAGTAGGGAGCCAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAC:1 - chr3R 25569410 5' + gypsy7 5012 6 59.41 AAAGATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chrX 8308702 5' - opus 7493 2 71.29 TTTCGAAGCAAATATATTTCACCATATCTCGAAATATTCTACTTAAAGTTATGCAAGAAAGGAATCGAAAAACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 27199746 5' - 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hobo 2918 1 58.42 CTCAACTCTTTAACTCTGTTACTGTATATTTATTAACATCCATATTCAGGAACTCCACGCTGACCGAACGACTGCTGCTGAGA:1 + chr2R 19652189 5' - flea 162 1 43.37 TTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 + chrX 21087577 5' + mdg3 5274 2 55.45 ATATTCACCTGCTCACCGAGCGGACTCGTTTCCTAGCCTGTCCATTTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTA:1 + chr2L 19696645 5' - hobo 47 1 54.46 AAGCATGCTACAAAAATCATTATTTATCGATGGCAGCCGCAGTAGCAGAAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 9287214 5' + jockey 35 1 50.50 TATGTGAAAGTAAAGCTTTGTATGCAGGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - chrX 17284905 5' + jockey 4718 1 71.29 TCCAAAGTATTTTAATCAAATGTTATTCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGT:1 + chrX 12647209 5' - F-element 4386 1 73.27 AAGGCCAGAAATAAGGCATATTCTGCCCAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGGGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chr2L 13621968 5' + opus 7157 4 68.37 GGGTGGCAAAATTGAATGGAGTCTTATGTGCTATAATATACATACAATATGTACACACATATACATACATATGTACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 + chrX 6854347 5' + diver 5892 2 75.25 TTTTTATCGATAAGTGAGCTGGATTTATTAAAAAACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 - chr3L 11436345 5' - 1360 6 2 66.00 TTTTTGTTTACGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGG:1 + chr3L 1307195 5' - F-element 447 1 62.00 TATGTGTCAACGACCAAAANGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTTGT:1 + chr3L 23181968 5' + Tc3 311 1 64.36 TAAGTGCCAGGACACTTCACGCGAATTTTCCACACTCCTCGCTCTACACTTGCAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 3733102 5' - hobo 2915 1 57.43 TGTTTTTATTAAAAGTTGCAAAATAAAGCTTAACACCTCTTTGTTTTTGTTTTCACCAAATCGTTAATAATACTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTA:1 - chr2R 19775215 5' + 3S18 5768 2 76.24 AGAAAATATACCCATCCTAAATAACTACGTTGCGTGCATATTTTTTTGAACCCCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACAT:2 + chr3R 8856923 5' + rover 6965 2 59.41 GTTGAACATTCCGTTTAGTTCTCGCAAACATTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chrX 6451091 5' + pogo 41 1 70.30 TATACGTATATATATATTTTTAGAGATATATACAAAAACATATGTACGCTACAATTATATCACATGAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chrX 11289279 5' + I-element 11 1 67.33 AAGGCAAGGCGTTGTAGACGAAACACATAGCGCGGCTGAGCAAGAATCAAATACCTTCGTCGAGCAATCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAGTGTGAAC:1 + chr3L 23645913 5' + rooA 7599 2 75.25 AAAGCCTTCCACACACACACACTATCAACAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAA:1 + chr2L 18205503 5' + jockey 235 1 76.24 TCACAGCCGAACTTTTACACAAATCATATTCCCCAATATTGTCGGGTACAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 + chr2R 23583064 5' + HMS-Beagle 28 2 55.95 TGTCACGGTAAAAGGTGCTATTTTAAAGGGTGCTATTTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGGTT:1 - chr2R 82497 5' - Stalker3T 297 1 67.33 AAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 - chr3R 14049407 5' - transib2 2783 1 66.34 AATATTTAATGTTTAGAATACTTAAAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr2L 4020752 5' - 412 7498 2 71.29 CCTGCGCAATTCGCGCCCCGTAATTATGCGACAAATGCGTGAGGCAGCCGCAGCACTGGCGTTCTGACTTATAGTTTTATTATATAAGATAACAAATCACT:1 - chr2R 20160265 5' - F-element 163 1 63.37 ATTGTGCGTTAAAAAAACGTCAAGAAGAGTGAATTACATGGAAAAAACGAATCATAAGAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTTTTTT:1 + chr2R 11756950 5' - FB 700 2 69.31 ATTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr3L 19274878 5' - transib2 2796 1 54.46 AAAATAAACATGAACATGCATACGTTTGAAGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3L 15390397 5' + pogo 44 1 70.30 AGGCAAAAGGCACCGAATTATCAGTTGATATATGTACATATGTAAGTAAGTGCCCAGTGTATATGTACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 20555925 5' + 297 4 2 74.26 TCTCTGAAAAATAACAGCAGTTCGACCCAAAAATTCTGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTC:1 + chr3R 20431647 5' + roo 8828 2 63.37 TAACTAGTATTAATCATTAAAAGATTTATTTAAAGAAGTGTTTTTGCGGCGACCTTCGCCCGACACAATGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGAC:1 + chr3L 3058808 5' + Doc 4467 1 54.46 ATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chrX 8308736 5' - opus 456 2 71.29 CACGAACGCAAATTTACACTGGCATACATGAAATGCAATTATTATTATTATTATTTATTGCATTTTGCCAAACAAATGCTAAATACAAATAAACACACACA:1 - chrX 15805053 5' + Tc1-2 487 1 55.45 TTTCCCACTATACTTTGCGCGGTTCTTTTCTAAACGAAGTTAACCAGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:2 - chr2L 9045821 5' + jockey 34 1 52.48 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 19450170 5' + roo 8703 2 65.35 CGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTATGTATTCGTGGGGAAGGGAATGCCTCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACA:1 + chr2R 12444354 5' + hobo 481 1 33.66 GAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACAT:1 - chr3L 24834440 5' - invader4 2935 2 63.37 CGTACATACTCCGTTTTTATGTCTAACCAATCGCAGAACGGCAAAGGCCAACACTAGTTATGACTTATTCATGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr2R 16580463 5' - pogo 2097 1 72.28 TCCTCATCAACTTATTGCGGTTATGTCTCTTTCGCTCGCACTCAGGCCATCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATT:1 + chr3R 30313565 5' - F-element 320 1 56.00 AAATACGAAAAAAGCGGTTCTGCCGGTTTGCCCGTGGTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCT:1 + chr3L 1319060 5' - opus 7303 2 63.37 CAAGAGGAATTTCAAGAAACAACACTGAAACACTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 - chrX 21668062 5' + Tabor 45 2 68.32 TGCTGATTTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2R 25203746 5' + 1360 8 2 71.29 TTTGAAATGAATACTTTAGGGCTTAAATTCGTAATTAATCTGTGTCCTTCAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGT:1 - chr3R 31458460 5' + jockey 363 1 51.00 ATATCTAGGGTCCTGTGTGATATGGTAATAGCAGCTGCGAGTGTATGCGTTTTTGTGCCTTCTCCTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr3R 9116538 5' + jockey 19 1 65.35 GATTTCCCATTCACATTATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chrX 8308705 5' - opus 493 2 72.63 TTTCAAGGTTTTATATTATAATAATTAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3L 18406631 5' + Doc 56 1 73.27 CGTTAAAACTGCCGCTCCCAAACATTCGCTGCGATGGCCACCTCATCGATACTCGCCAAAAGCACAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCT:1 + chr3L 1550761 5' + Quasimodo 457 2 70.30 CCCTTGCCCATTCTTAATTCCTTACCCACCTCTTATTTCTTGTGTTTTATTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 14301566 5' + roo 23 2 56.44 TCTTCTGTTCCTCTCAAGATCCCCGAACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:1 - chr3L 13059740 5' - transib2 2777 1 73.00 ATCTTAATGGGTGGCAAAAGTGGCACCGCGTTGGGCTCGTAATAACAGCCAACCGCAAAGGAGCACACACGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 9488806 5' + hobo 6 1 67.33 CGGAGATGTGCGTAGCTTTGCTGCCTTCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACT:1 - chr2R 14500214 5' + F-element 473 1 73.27 TTTTTGTTTACGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTC:1 + chr3L 1307195 5' - F-element 446 1 61.39 ACACATCCTCATGTCGATGTACATGTGTATGTAAATGTTGTGTTATTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr2R 20389421 5' - pogo 2074 1 52.48 ACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAA:1 - chr3L 24916690 5' + Porto1 149 1 55.45 ACAACTCAATGTGTTGAAAGGCGGCAGACAATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr2L 19629930 5' - copia 5078 2 72.28 CTGCTTGCTTTGCTGACTGTCATTTATCATGCTTCACTGTACCAAGTCGATCTGTCTGTTTGTTTTATTTCTTGCTTGTTTT:1 - chr2R 11593632 5' - Osvaldo 1438 1 82.93 CTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr3L 23027556 5' - INE-1 551 1 51.49 TTGGAAATTGTGTCGTCTCATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chr2R 11664332 5' + Tirant 8162 2 80.20 CCATAAATTGTGGTATCATNTTTTATACGCTCCTTAGACCGGCCATCTAAATGACCCAAGAAAAGGGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 18204531 5' + roo 8674 2 66.34 CTAGAAATCTCTGAATGAAACGAGGTTTTGTGCATTCTTACAAATATTACAAAAAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3R 6760989 5' + blood 23 2 50.50 CTGTCAGGTTTGGCGACTTTCGCGTAATCCGGCTGGCTGGGGGTAGGTTTTTCTGGGCATGTCTTTTGTAGCATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGC:1 + chr2R 1922398 5' + gypsy 3 2 76.24 GCCGGAAAGCGGTGAATTTACCGAGTACTCGATACGCTATCGCACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGAC:1 + chrX 11669539 5' + I-element 4902 1 58.42 TCTTCCAGAAGCACTTTTCTTTATTCAGTAGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 4850774 5' - roo 9026 1 74.26 ACCCCCCCTCTCCCCTCACCCCACACTGACAATAAGCCGCAGAGAATGGGGGAATATTGTGCTGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2R 20973002 5' + hobo 14 1 65.35 AATGAGTAGAAAGTTTGCAAAAAAACGCCCCGAAAAAAGACACCACGCCAAGCCTCTTCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAA:1 + chr3R 5416603 5' + G4 20 1 68.00 TGTTCTTTTGGATGTGAAAGTTGAATAGTTGTAATAGTTAGTACTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:2 + chr3R 5359931 5' + 412 7087 2 55.45 ACCACACTCCATCGCTCCTTTGGCTTTAAGGACGTAGCAGGAGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGAC:1 + chr3R 7682258 5' - opus 7074 4 58.42 GTGACGGCATTTGCTGCGTGTGTTCCCGATATGTCCGCTTCTTGGTTGGCGTTGCTGCTGTTGTTACTGTTGTGGTTGCTGCTGCTGCTGC:1 - chrX 10345612 5' - Max-element 8504 3 75.82 ATAGCCAAGTACAAGCCCGATCTACGATATTAACCCTCACCGCATTCTTAAACGTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGT:1 + chr3R 9041909 5' - copia 140 2 55.00 TGTTTGCCAAACACACGACCATAAAAAACTTTTTAATATAGCCAGCTAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr3L 14874062 5' + Doc2-element 216 3 66.67 TGCCGAGCGCGCTATATACGTATGAATGTGTGTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCA:1 + chr3L 17135991 5' - BS 5047 1 68.32 TGTTTCCCAATTTTCAATTGTGCTGATCTGTTTAAACATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTT:1 - chr2R 5043352 5' - roo 9037 1 58.42 AGTAGTTTTAAGATTTTTGTTATTATTTTGTATGATGTTAAACAGTATTTTAGACCGATTTACACAAGTAACGGGTAACTGATAGTCGGGGGACTCGACTA:1 + chr2R 6255157 5' + INE-1 563 1 68.32 TATCCGAAATACTTTTTCAATTTCTAGATTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGAAAAAAGAAGGTTTCTGAAGCCAAACCCAATAATAACGATGAT:1 + chr3L 23620622 5' + Tc1 1207 1 57.43 GGGTGAGTTTTGTTCGTGTGTGAGCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCC:1 + chr3L 22838554 5' - I-element 340 1 82.18 CGAAATGGGTTTCATTATTTTTTGTAAATTGCTTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCAAGCAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chr3L 15776988 5' + I-element 15 1 61.39 ATTGATTATATCCGTTCGATTTTGATTGATGTGTGCTTCCGTGCGCTAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:2 + chr2R 19352191 5' + 17.6 6951 1 54.46 GGAGAAAACAAAAAAAAATTTTATAAAAAAAAAAATAAAA:1 + chr3L 7254064 5' + HMS-Beagle2 479 1 77.50 TATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGC:1 - chr3R 11547786 5' + G2 285 1 67.33 GTTATTTCGAATTTAAATTACGTGCTGCTGCGGTCGTACTACGCAAATGTTCGTTGTGCCATCGACAACAAAAACATGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAAC:1 + chr3R 28709071 5' + Tc1 489 1 73.27 ATAATGGGCTTAAGTAAATATTTATGCTTTTTGACCATGACATGATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chrX 915537 5' + flea 26 2 57.43 AAATTACTAGGAACTTTACTTGTTTGAGCACAATATGTAAAATATATATGTAAAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr2L 14979235 5' + Ivk 25 1 55.45 CTATAATTAACTATTTTTCGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTCACAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCTGGTTC:1 + chr3L 19021218 5' - ZAM 8035 2 81.19 GGATCCGGTTCACAATGAGACGACGACTCATTGGACCGGCAGTGAGTTATATCTTCATGAAAGATTTGACAGTTGCACCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTA:1 + chrX 15273709 5' + jockey 456 1 44.55 TAATTTTAGAAAGCTATTTCATTGAACTCCGCAAAATCACACACACAATCCAAATACAATACAGGAATGCCAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chrX 20885955 5' + gypsy7 5004 3 67.33 CACCCACACACTGGCATAGTCAGTAGACACAACAACCACCACAATGCCACGCCCTTTGAGCCACACAATGAATACAAATTGCTCGGTAAATAAACAAACAT:1 + chr2L 14944541 5' + Tom1 72 1 54.46 TATTTAACTGTTGCCCTGAAAATTAATCCATCTCAAAACAATACGCATTTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGA:1 - chr3L 2963685 5' - invader4 3027 2 53.47 CTAATGATGCCGCGAATGAAATTAACATTTTGTTGCCTACTTTGCGGCTGCCTGCAATCACCTAGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 15183831 5' + hobo 11 1 64.36 TATAATAAAAGAGGATGTTTAGAATTCTGAAGGTATGTACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATAT:1 - chr3L 27412434 5' + hopper 1333 1 60.40 ACTCGTGGCACGTGTGTGGACCTCGGGCAAAAAATTGGGTGGGGGATATCCACATCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:2 + chr3R 7582607 5' + 297 14 2 65.35 CCTCGCGTCCGAACGGCTCCTCGCGTGTTGAGACTGACTGCCTTGAGCTTTATAGGCGGGGATCCCGTTATTTCCACTTTT:1 - chr2R 5208838 5' - gypsy8 314 1 59.26 TTGCATTCATACGTACTGTNCTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chrX 8308741 5' - opus 7454 2 76.24 CGAACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 - chrX 21939118 5' + HMS-Beagle2 27 2 57.45 GACGGTCGTGCATATCATACCACGAAATGTATTTCCAGTTAGGAGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 2028044 5' - roo 9038 1 57.43 AGAATAAAGCTTAACACCTCTTTGTTTTTGTTTTCACCAAATCGTTAATAATACTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 - chr2R 19775196 5' + 3S18 5787 2 55.45 ATATCCGTTAAAAGCTTTAGTTGTTACTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3R 15523354 5' - 412 448 2 70.30 TTTAGAGGTTATTGTTGTTTATCATATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 11624405 5' - roo 356 2 83.17 TCCTGATAATAGACTTTTAACTTATTTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chr3R 4164652 5' - HMS-Beagle 198 2 81.19 AAACGTCATTGCACATTTTGCACATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTA:1 - chr2R 19651222 5' - flea 207 2 77.23 GGTGAAGTGGGCGGCTTGGTTTCGGCTCCTGTTCAGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chrX 1157607 5' + 297 35 2 64.36 ATCCAGTCCACTCTCGGCAATCCCATTTCGATCAAATAGATGTCGCAACAATCACCGCAGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATT:1 - chr3R 13440596 5' - mdg1 7197 2 62.38 AGTAGTTCTTCCCAGCTTTTATCCCATGCTAGCCTGGGAACCTTACTGGCGATTTTGTTTTGGGCAGCTTGAATGCGGCGAATTTGGCTGCCGCAATCCAA:1 + chr3L 10781341 5' - BS3 1331 1 60.40 CGAAAGGATCTGACGTGTGCCTGTTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr3R 30220234 5' - mdg1 7404 2 77.23 TCTGCTCGCTGACTATGTTTTTTTTTTGTTTGTTTCTGCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGAC:1 - chr3R 17082139 5' - Quasimodo 223 2 62.38 GTGGATAGGCTAAACTTTATATAATTTTTGACACTTTGTCTTTAAGCGGTTATATCTTATAATAGCTGTCCAAGAGTTTAATAATATAATAATAATGAAAA:1 - chrX 264848 5' + invader3 5054 1 60.40 AGCCCCATTTAAACGAGCAAAGTGAGAATAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2L 22241784 5' + pogo 44 1 69.31 AAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAAT:1 + chrX 292417 5' - G3 4551 1 58.00 TAACCCACAATAACCACTATTATTCACCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 11832582 5' + roo 8713 2 77.23 TTAAGGCTCCATTTCACAATGTGAAAATGGCAGTGGAGGAAAATTGGCAGAAGGGTGTGTGTGTTTGTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGGATGTG:1 - chr2R 13766394 5' - Quasimodo 30 2 54.46 TTGAATCTTGTTTTTCAGATTTAAAAAAAAAATCGTTATGTCTAAAAATCAATTTAAAAAAACCCTACATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATG:1 - chr3L 21067234 5' + Doc 178 1 68.32 AAAATGTGTATAATTACGCCGCAGTTAAACATTATGATCGCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2L 7991883 5' - P-element 2851 1 41.58 TTCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTATTTTTATTATATACGGCAGGGAAATGAAATCCTCTAAAGATACCATCT:1 - chrX 7994538 5' - Rt1b 5106 2 71.83 GTTGTTTTGTTATTATATGGCATTTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 6619819 5' + 412 7104 2 74.26 ATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3R 4474220 5' - copia 5073 2 79.21 CCCTTAAAGTGGATGTATAAATTTAATTAAAAACAAGAGTGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAACCGT:1 - chrX 705610 5' - INE-1 554 1 74.68 AAAATCTATATTACTAAATATGTTTATATCATTACTAATCTAATACCGTGATTGGCTTACTCTTTTAATTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chrX 8579268 5' - roo 410 1 66.67 ACAACTTCGGGCCAACAAGGTAAATGTTAAGGCATACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr2L 16548220 5' + P-element 41 1 38.61 TGTGGGCCAGCATTCCGGCAGCAGGGAGAGTGCTCCAACGCAGTGTAAATTGAGGCAGGAAATGCCGTTGGGCGCCAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGAT:1 - chr3L 22410334 5' - gtwin 7387 2 70.30 CAAGCGAAAAAAAGAAAGCCAAGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAAT:1 - chr3L 4779591 5' + Doc 481 1 78.22 TAGCCCAAGAAGTCTATCCCCGTGTTTGGCGTAACTAGCAGATTTAGGCACATTTTAGTCAATTGTAACCTTTGCTTGACTCCGGCTCGCAACTACACATA:1 + chrX 13607480 5' + G3 472 1 73.27 CTTGTTGCAACACTGCGGCGATTATACGACGCCAAAGCAATTTTTGGCCAGAAGGAGAGGAGGAAGAAGGAGACGAAAGAAAGAGAGGGAGAGTGAGAGCG:1 + chrX 9443380 5' - Cr1a 290 1 73.27 GTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGT:1 + chr3L 24796711 5' + Cr1a 397 1 69.31 TAATTTCGCGAGCAGAACAACAACAAAAAGACCGGAAATTCTTCGACTTAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGG:1 + chr3R 21115892 5' - HMS-Beagle2 6773 1 51.49 CCTTCATTGTCTGCACCAATTCAAAATTCATATGCATACAATCGCCAATCACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 19167894 5' - roo 387 2 57.58 ATCCGCTCTGCATGATGTTTTGCATTCATACGTACTGTACTGTATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chrX 8308722 5' - opus 470 2 57.43 ATTGCCCCAGCAGCGTAACGCAAAATAAACACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 897597 5' - roo 9026 1 76.24 TGCCAATGCTAGATGGCTGGATTATTTGAAATGAATACTTTAGGGCTTAAATTCGTAATTAATCTGTGTCCTTCAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGC:1 - chr3R 31458484 5' + jockey 340 1 68.32 AAATTCCTGTCAAGATAAATGACTTGAGTTTCTTCTTTTTTTACGTACGTATGTTATACGAGTATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr2L 10942397 5' + 297 6588 2 70.30 AATAATAAAAACATAGTAGATTGTAAATGGCTTTTTAGTATTAAACAAGATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTAC:1 + chr3R 3286388 5' + gypsy12 10160 2 56.25 CCCCGCGCCACTTAAGAGCNAATGACAACAAACAGCAAACAAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAA:1 - chr3L 6106950 5' + I-element 470 1 62.38 CACTCGGAAACCCTTGCCCATTCTTAATTCCTTACCCACCTCTTATTTCTTGTGTTTTATTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 14301556 5' + roo 13 2 66.34 ACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 + chr3R 14049339 5' + transib2 24 1 55.45 GTAAGAGAGCTAAAACAAATGCAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 14311509 5' - roo 9052 2 57.43 TCGCGCCCCCCTAAACGAAAGAATAGACATCGCGGGGGGCTCGTCTCTCTATTTCATAACGTGGCATAAACATTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGG:1 - chr2R 11664412 5' - Tirant 8505 2 76.24 TATATTAAATTAAAATCGACAACTTTCCAGCGAAACTTAGCTTGAACCAACTTTGGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:1 - chr3R 12599367 5' + BS 17 1 56.44 GATTATTATCTGCGAGGAGGGAGACGAGGAGATCTACAGCGGAGCTGATGGAGTCGTCAGACTCGTCAGTCGTGAACGACAACGGCCTATCTAGGACAATG:1 + chr3R 4137496 5' + aurora-element 3959 1 75.25 GCCCAGTTACGCCAGTGGGTTTAATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chrX 8896183 5' + 1360 54 1 81.19 TCAAGACTGAAATTCTTGTTACCTGGCATCAACTGTAGTATGTGCCTATGCGATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chrX 18050597 5' + 412 47 2 68.32 ATTGGGGTGGCCAGGTAAACCCTTTTATCGTTAAGATTTGCCTAAGACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2L 21199197 5' - roo 9044 1 51.49 TTACATTGAATAAGACATATCCCGAAAAGTATGCAGCACTATTTTGGTTCGGAAGATACAATGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 5595038 5' - 1360 3378 1 68.32 ATACAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr3R 19446655 5' + HMS-Beagle 31 2 57.43 TTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGATTTTTTATCTTTGCTGGTGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTC:1 + chr4 1294992 5' - HeT-A 6036 1 79.21 CGAACGTTAGTTAGACGTGCTTTTGCTCAGTTATCAGTATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 - chr2L 9724263 5' + 1360 37 1 59.41 GATCCTCGTATAACAGTTAATCATGAATATTTCCCGCAATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 + chr3L 16666651 5' + I-element 38 1 64.36 GATAACCCGCAATTAAAGCCGGGCCAAATGATGATGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2R 18111511 5' - hobo 2902 1 64.36 TACAACTGTGACTTCGATCNCATCAAATATTAAAAATTTAAAAAAA:1 + chr2R 13836112 5' + Doc 4690 1 80.43 ATCTTCCTCCGTCCCTTTTCGACCAGACTCGTCTCGTCTCGCTCTACATAGCCACCAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2L 9521637 5' + P-element 21 1 58.42 CCGCAGGCTGTGACTGGTTTTTTTTTTGGCAAACGATTTTTTG:1 + chr3R 21741430 5' + 1360 40 1 62.79 TTCCGCTGCACCTTATAGAAAAAGTTATCCATAGTAGACATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:2 - chr2L 20495125 5' + Tabor 6878 2 61.39 CCCCGACTATATGCCATGTTGTGGACGGGTTATATTCGGTTTTTAGATTATGCTTAGGTTGAGGTTGAGATCTTCCTTTATAGTTCCTGAGATATCAACGT:1 - chr3R 31045896 5' - INE-1 143 1 79.21 TCAATCTTTCAATAATGTTTGAGGGGTTCCAACATGCTTCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTC:1 + chr2L 10942492 5' + 297 338 2 61.00 AGACAGCCTGAAGAAAATAGTTTTTTTTTAATTTAGGAAATAAGTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 7064544 5' + roo 31 2 60.40 TATGTAAAGATTTAAATATGTGACTAATTTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTTGAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAAT:1 + chr3R 14154052 5' - 1360 202 1 76.24 TGTTGACCCAATAAAAAGATTTATTACATTTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 + chr2R 19430483 5' + 3S18 48 2 75.25 TGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 19450181 5' + roo 50 2 54.46 GTTCCAGGTAATCCAGCCAGGAAATTTCAATTTCTTCGCTGTCATTTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACAAATTGTTGATAATAGTGGTTCCGAGGAATC:1 - chr3L 14949928 5' - transib2 2391 1 55.45 GACGGGTCTAATGTCTGCGTGTTTGCCCTGTTAAAATGCCTTTTAAACAGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:2 + chr2R 15160293 5' + Tirant 27 2 53.47 GGTGCATCCAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chrX 23035808 5' - opus 7461 2 70.30 TCAGCCTCTTTTAACTCTGGCATATCTTCTACTACTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCT:1 - chrX 11457099 5' - P-element 348 1 37.62 GGGCCGTCTCCTGGCAAACAAGCTGAGACCGACTACCTACCTATATATGTATATATATTTATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTT:1 + chr3R 18850988 5' - invader4 313 2 56.44 GCTCAGACTGTCGAGCAAANATGTAGTTCACATGCACTTGCGGTCAAAATAGTAATACTTCCTCCTAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCT:1 - chr3R 29617487 5' + 297 485 1 64.36 GCTATTCAGACGAAATGGTTTACAAAAAGAGCCTAGGTCGCTTAAAAGCAAACAAACAATGTACAGTTTGTCAAAAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAG:1 + chr3L 25608361 5' - S-element 1699 1 57.43 TATAATGGTGCATCCAGTAGTTTAAATTTTTTTTTGAATATACATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 - chrX 23035814 5' - opus 7467 2 64.36 CACACGCAACGCACACACTCAGCAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCG:1 - chr2L 12881680 5' - HMS-Beagle 6978 2 77.23 AATACTTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGG:1 - chr3R 3268049 5' + mariner2 99 1 57.43 TTTAAAAACCCATTTTCCANACAGCTCGTTGTTTCAACAAATTGTATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3R 24612173 5' - roo 9040 1 57.43 TTTGCATGCAACAGGGCGCGTGTTATTCCCACAAAAATACACACTCACACTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2L 6647650 5' - 1360 3365 1 55.45 ATTATTATTGTCCGTTTTCAGAAAAACAAAGAATTTTAATAACACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr3L 18302680 5' - hopper 1385 1 56.44 TAATCTAGTAGAGAGCAGACAACATATCCGCTGGCAACAACCAACACCGAAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATC:1 + chr2L 14061553 5' + micropia 5302 1 60.00 ATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr2R 4606222 5' - 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flea 433 1 64.36 AATTTAAATTACTAGTTTTATTAATACTAACATTTTATTTAATATCCTACAAATACTGTGGAACATAACTTATGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 + chr3R 21931465 5' + 412 3 2 68.32 AAAAGTATGCTGCGACATTTGGGCGGTCGACAAACTGGCGTCTACAGTTTGGGTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCAGA:1 - chrX 14961088 5' + jockey 4658 1 52.48 CAAGTTCATTTGATGTACGTAAGAAGTAGTTGGATTCTAGAATCCAACTACTTCTTACGTACATCAAATGAACTTGTTAATAAATTACAATCTGTTTTTTT:1 + chr3L 19223472 5' - Porto1 4654 1 61.39 TTTGCATCTTTCTCTCCGGTTTGCAAGTGTGTAGATCTTTGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 21118625 5' + 412 7089 2 59.41 CTGGAATGGCTTATAGTAAGAGAGCTAAAACAAATGCAAGAAAAGGCGGCGAAACCTTAATCACTTTAATATGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 - chr3L 14311524 5' - roo 9067 1 72.28 GTACATTTTCTGTCTCAACTTTCTAAGGCATATGTATAAATACATACATAATATATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 + chr3R 11957583 5' - Burdock 6372 2 56.44 CACATTTCGTACATGACACCATTTCGTTTTCGACTGCCCACGTCCAGCTTTAGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAATTT:1 + chr2L 15940787 5' + FB 148 1 60.40 CTCTCTTGGCAGCCTAATTTTACATTTTCCCTATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 8674142 5' - roo 9032 1 67.33 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCGGTGTTGCACATATATTATGATAGTGATAGATATAATCAA:1 + chrX 9828510 3' - Tirant 8144 2 61.39 CATAGTTCAAAACCAATGTATGGCATTTTCGTTAACAGCACATCGGGCTGAAGGCCGTTCCACCACCCACAATCCACCAACGTCCCTCGCCCCCC:1 - chr2L 9263612 3' + 1360 3355 1 77.89 AAATAGCACTGACCACGTTTTTGCTGAATAAAAAAGAATTGCTAGCCATAGTTTGGGCTCTTAAAAATCTCAGAAGTTATTTATATGGAGTAATCGGTATA:1 + chrY 3572778 3' + Tc1 216 1 75.25 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCTTTATCAGTTTTGAGTGCTAGAAATTGATAGGGAATCTTGTACGATAATGAAGTGTGTCTCATTCA:1 + chrX 19167994 3' - roo 9 2 70.30 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGGCTCGAGCTCTTATTTCTGCAAATAAAATTTAGTTGCATATTTT:1 - chr3L 7463281 3' + hobo 2923 1 48.78 CAGTGCTGGCTAACAAAGGCAATCCAACCCGAGCACTGCTATTTTTATGAACACAGTTGTATAATCGCCACACATGAACTAATAACTATTAAATAAGAAAC:1 - chr3L 17245004 3' + HB 1313 1 69.31 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATATTATAGTGAAGTGCATCTGCTAGATGCAAATTGC:1 - chr2R 16639656 3' - opus 147 4 68.32 TAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCACAAAAAAATGGTTTCGGGCCGAA:1 - chr2L 13488552 3' - Doc 4258 1 76.24 CCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATTAGTTTGATATTACTTATTATAATGTCATGTTTCGGTCTCGTTACAGACATGTTTTTCAGCCACAA:1 + chr3L 4963264 3' + Tirant 11 2 73.27 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACTCATAACCCAAAAAAAAGGGAAACAATTTGATGGTTTTT:1 + chr2R 23111379 3' + hopper 1384 1 57.58 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACGTGCTCGCTTTTTCTGTCCGTTACCGTTACCTCGTGTCTGCGTTCGCGTATC:1 - chr2L 13549241 3' - P-element 20 1 55.45 TTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAATCCCAGGCCCCCAACTTTCTGATTTACTCGTAGTTTC:1 + chr3R 5264518 3' + P-element 2600 1 37.00 CGAGTGTTTATCGGGTGGANGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAGGTACGATACTTTGACTTAATCAGGAGAAAAAACAAGGACTTAGGG:1 - chrX 15183743 3' + hobo 2908 1 55.45 ATGATTTGTTTAGAGGCGTNGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCC:1 + chr2L 19907971 3' - Tirant 8134 2 53.61 AAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTTACAAGTGGTCACAAGGGGGTAGAAAAAGGGGGGAAGGGGCTAGGGGGC:1 - chr3R 8481688 3' + invader3 176 2 51.06 CTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAAATAATATTA:1 + chr3R 556480 3' - Juan 4109 1 60.40 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTCTTAGGCAAATCTTAACGATAAAAGGGTTTACCTGGCCACCCCAATA:1 + chr2L 21199198 3' + roo 9045 1 52.48 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTACAGATTTTCCGTTTCGGTTTATTG:1 + chrX 1157660 3' + 297 6929 2 77.23 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATCCCCAATCAATACAATGTAACTACCAATTTTGAACCCATTCCCCAACTCCATTCC:1 - chr3L 6982490 3' - Burdock 14 2 61.39 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGTGAC:1 - chr3R 28447382 3' - blood 36 2 57.43 TTATTTAGAAGCAATGAATCCATAAAATGCAGTAATAGTAACATAACAGCGTGTATTCAATGCTCAGATTTTCCTTTAACTTTGTGGGTGCGGCAAGGTAA:1 + chr3L 12258538 3' - BS 5078 1 55.45 CAAGGTGAGGTATGCGGCANCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTA:1 + chr3R 22520942 3' + opus 7460 2 66.34 AAAAAGAACAAAAAAAAGAAGGAAAACAAACGCAGCTCAAGTATAGGACGGTGCGTGCTGCCAGACTGTCGGAACGAAGTCCA:1 + chr2R 5421578 3' + Doc2-element 223 1 68.67 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGC:1 - chr2R 11664315 3' - Tirant 38 2 63.37 AAACAAGAGACGAGAACGCGTAGTCATATGCCCGATTCAGCCTGGCATCTAGTTCGTGGTCCAGCTCATTAAAGTGGCGCAGGTAGAGGCGTCCGTAATTG:1 - chr2R 16295654 3' - 1360 3232 1 80.20 TCGGTGAGCAGGATGTGATGCCAAGTCGCACTCCATCTTCTTTTGCGATGCACAGCAGCGCCTTTTTACGGCCGGCAGAGGGACGTTCCGAAGGGAAGGCA:1 - chr2R 4297380 3' - Rt1b 4958 2 72.28 AATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATGTGCAAAATGTGCAATGACGTTTGTATTATAAATAAATGTATATATTTTTTTAGCTTCATGTTTTCGAAA:1 + chr2R 19651269 3' + flea 5013 2 79.21 TGTTAATTGCGCTGTTATGNTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAACACACATTCATACGTATATAGCGCG:1 - chr3L 17135998 3' + BS 5040 1 74.26 CTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGGCGTCCACCGGCAGGCAACGCTGATCCACACACATCTTATCCACGCCGCATTTGGCTCCATTGGGCGTAAGGCCGGGA:1 + chr3R 14669280 3' - INE-1 148 1 77.23 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATCAAGACAACTGCTTTCAAATTTAAGCTTTATTATCGTTATCAGATTAAGAACTATCTTTGC:1 + chr2L 22108281 3' + Bari1 1693 1 65.35 AGTGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGATAAAGGA:1 - chr3R 29374922 3' - mdg3 5258 1 74.26 AAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGC:1 + chr2L 21400814 3' + Doc3-element 4718 1 39.60 CACATTGATAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAGTGAAACAAGTGAAACGCCAAAACGAACACAGTTCCTGAGCAAAATAGTTAAATAACAGTGTTGC:1 + chr2R 22868415 3' - micropia 5118 2 65.35 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTC:1 + chrX 7970995 3' + P-element 2831 1 23.76 CTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAACGGGCGCAAGTTACGCAGCCAGGAAGTTGGCTTGGTCAGGCAGTCAGTGAGTAATGAGA:1 - chr3L 25255046 3' - GATE 62 2 59.41 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGAC:1 - chr3L 25059052 3' - mdg1 9 2 70.30 TTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAAAAAAAAAATAAAAAAAAAATCGAGCACAACAAAATATAATTATATTAAATTTCTAAAATAATTCGAGTCTA:1 - chr2L 16479645 3' + G4 3832 1 64.36 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGGGGAACTCGGACTTAATGCGCTAAACGGCC:1 + chr2L 3582025 3' - transib2 44 1 69.31 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATTGATTCGAAATTGAATTTCCCA:1 - chr3R 17952953 3' - copia 4922 2 78.22 AAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAACGTAAGAAATAGAGAAAAAAGAAACGAAATGGCACTGCCATTCG:1 + chr3R 14070731 3' + Doc2-element 218 1 77.27 GAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTAGATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCC:1 + chr2R 1922472 3' + gypsy 7392 2 78.22 GAAGATATTTCCAAATAAANTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTAATA:1 + chrX 17098408 3' + roo 9020 2 88.12 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTGCAACTGCAACAGGAGCAAAA:1 - chr2L 13310224 3' + mdg3 236 2 60.40 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATTGTTTACCGGGAATAAAC:1 + chr2L 19907993 3' - Tirant 9 2 72.28 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAATTAAATTAAAGATCTTCAGGAGAACAGCCCCGTATACCAACCCAAATACTGTTATTATTACGGCCATTAC:1 + chrX 18585044 3' + Juan 4203 1 57.43 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACACCCACGCACAATGCGAATTTTCGAGCGACCAAAAATAATGCTGCATAC:1 - chr3R 13395395 3' - jockey 4787 1 50.50 TTCATATTAAGCTTAAGTTTTCAGTGTAATTCTCAACCGATTCTCTGCCGCGTCGCGAATAAAACGGTAGTTTTAAATTAAAATTTTAACAAATTTATACT:1 - chr2L 7674977 3' + gypsy4 185 2 76.24 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACCTTATTAGTTAATTAAGATATCTAACAACATGATGATTTTGGTT:1 - chr2R 8197459 3' + roo 9041 1 60.40 CATGGCCACTCTAACGCCCACAAGCTTCCCAAAACTATAACATTTTTGTTATGTTATATATATATACCCGCATTTCCACTAATTTATTTTAAACGTTCTTA:1 + chr2R 4751792 3' + INE-1 215 1 77.23 CCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACCGATTATTCAAACGCAGTTAACACCAACAACAGCGAGAAGAGAGCGAAAGTAGTTGA:1 - chrX 14986426 3' + Copia1_DM 123 1 62.38 TGTACCCTCGATATATGCANATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGGAATTTAAAAACATATGAATTTTATTTACTTTT:1 - chr3R 30284187 3' - blood 7018 2 71.29 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACAGTGGCAAAGAAGCCGAGAGAGAG:1 + chr2R 19424125 3' - P-element 52 1 28.00 GTATTCGAGCGATGATGCATCGCACAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGAAATATTTAATAACCGATAGAATATCGGCACCCATCAACCAGCTGAT:1 + chr2R 4552021 3' - Doc2-element 131 1 54.84 TAAACAATAATAATAAACANTCTTACATGTATGTATGTGCAAAATGTGCAATGACGTTTGTATTATAAATAAATGTATATATTTTTTTAGCTTCATGTTTT:1 + chr2R 19651264 3' + flea 249 2 74.26 TTACAGCTAATTCAGCGAACGCAACCAAAAATGCTCAGAATAATCGCAAAATCAAAGAAATGGAAAAATATAATTAGAACATCAGAAACA:1 - chrX 19297405 3' + Porto1 4314 1 56.67 TTTTTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTCTTTTTTAATGTGCCAATGTCTTTTGGGCATATGCCATGTGTGTGCCCTATATCTTAATATCAGGGAAGTAGT:1 + chrX 19379433 3' - mdg3 5102 1 61.39 GTTTATTATCATTGTTTATAATCATCGATTGCTTCCGCCTGATGTGATTGCATTGATTGGAAGATCAGGCAGCTTGGCGATATCCTATCGATCGTGAAATT:1 + chr2R 5029584 3' - flea 5004 2 69.31 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGAGACCTTGGCTGGCATAAAAATAATATTGGGCAATGCTTTGGAAGT:1 + chr3L 7463346 3' - hobo 30 1 52.48 CATGGCATTTAAACCATTAATGCGGTGCCCAAACCATACAACAACAAATCTGCCGAGCGAGCGTCTCTTTAATTTCCCCCACGCTCGCCCGAAATTCCCAA:1 + chr2L 22975231 3' + HMS-Beagle 6673 1 70.30 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAAACAATATAATCTTTACGTACCAATTCCCATA:1 + chr3R 23788491 3' + pogo 2061 1 72.28 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTGCAAGTGTAGAGCGAGGAGTGTGGAAAATTCGCGTGAAGTGTCCTGG:1 - chr2L 3733108 3' + hobo 2909 1 55.45 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCAT:1 + chr2R 11699317 3' + roo 9028 1 70.30 GTGTACATTAAGCCTTTCCNTATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTGTGTTGTGAGGGGGATTGTAAGCAGATAAAGTCATTTGCTTTGATATCT:1 - chr2L 15603807 3' - jockey 4654 1 55.56 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAGTGG:1 + chr2L 20290319 3' + flea 5009 2 73.27 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGGTGGTTTTAGCGGG:1 - chr2L 16548160 3' + P-element 2859 1 52.00 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTCAATTAAAATTTTACACACGAATAAATGCAAAGCCACGCCCAGCACATTAGATTTCCCCGCTCGCTCCATCCG:1 - chr3R 15530022 3' - mdg3 5253 1 76.24 TTCACGACTTGAATCCACTACGATTTGATTAGAAAAGAAATAGAACGAAAACAAAACAGCTTCTAATAATTTTTAATGAAATTCCAAATAAACACGTAAAA:1 + chr3R 13502247 3' - Gypsy12A_LTR 277 1 57.43 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAG:1 + chr2R 13316179 3' - hopper 52 1 74.26 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGGAAGAATCCACGTCCAAACAA:1 + chr2R 21040895 3' - P-element 55 1 25.74 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGTGACTCAATCCAAATAGCCCGATGTCTAAATGAG:1 - chr3R 28447352 3' - blood 6 2 72.28 AGTAAAGTAAAGTAAAGTGAAGAAAAACCGACACAACCACCGACAAACCACTTTTAATGGATAACATGGATCCACAAAACAAGGGATCTCCCTATTTTTTT:1 - chr2L 20317177 3' + TART-A 13119 7 72.28 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGTGACTCAATCCAAATAGCCCG:1 - chr3R 28447365 3' - blood 19 2 61.39 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTTAAGTGAGCCACGACAAATGTCACGTTACCCAAATTATATTTCTCAAATGAAAATT:1 + chr3R 24612256 3' - roo 8682 2 61.39 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTTTATTTTGCGTTACGCTGCTGGGGCAATTTTTATTTCCACTGAAAATGA:1 - chr2L 897576 3' + roo 9047 1 55.45 GGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTA:1 + chr3L 25350824 3' + baggins 5417 1 40.59 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCTTCAAACGTATGCATGTTCATGTTTATTTTTCGGTATGGAGC:1 + chr3L 15390409 3' - pogo 32 1 58.42 TGCTATTCGTAGCTTGAAANAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTT:1 + chr3L 25345158 3' - Doc 39 1 55.45 AGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCATGTATCTCAAAATTGTAGTTACCATAAAGGGCTTTAAGTACAAAAAACAATCA:1 + chr2R 13467053 3' + hobo 2917 1 51.49 AAAGATTAACTTCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCCACCAAAGGGTGCCTACTTGTGGACAGCTATAAAAATGTAAAATATATAAATGTAAAATGTTGCGTC:1 - chr2R 4628114 3' + Quasimodo 6908 2 59.41 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCC:1 + chr3L 17136032 3' - BS 28 1 53.54 TATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATCC:1 + chrX 15946746 3' - INE-1 565 1 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTCNTTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTTGTTTTAGCTCTCTTACTATAAGC:1 + chr3L 14311516 3' + roo 9059 1 64.36 TTATTTTTTTTTATTTTTTTGATACATGCACATAAATTTCTTGGCCCTTTTGCGGCACGAGCCTTCAGTTTGCAACGATGAGAAGGATGAGGAGGAGGAAG:1 - chrX 9289666 3' - R2-element 3584 1 66.34 AGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAA:1 + chr3R 2689428 3' + diver2 4473 1 63.37 ACTATTAGATACCCGTTACTCAGATTGCGGGAGTCGTTCGGCATATCAACAGAAATTCAAGAAAAAAATAAAATTTATAATTAAAAACAATACAATTAAAG:1 + chr2L 22082802 3' - INE-1 548 1 96.04 AAGAGTTGGAGAACAAACTGCGGAGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGAATTCTTCAGAATAAAACGTGCGCAGGACATCAG:1 + chr3L 24887050 3' + aurora-element 4196 1 83.51 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACC:1 - chr2L 12765006 3' - Doc 72 1 73.27 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATATGCACAAAAGAGCAAAGCAAATATTGCTGTAATGAAATATTTTTTGCTAC:1 + chr3R 4164714 3' - HMS-Beagle 6820 2 56.44 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAAAAAAATCCCCAGCATGGGCTATGAAAAATCCAAATCTCAAAACCAGTTTGATTTAAT:1 - chr3L 4901024 3' + jockey 4972 1 56.44 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATGAATTTAATTTTTAGTTGTATTAGATCG:1 + chr2R 19430787 3' - 412 49 2 75.25 CTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTTTTTGCAGTCTGTGTTACTTGGGTGATAGAACTTTAACTGTGTATCTGAAATTG:1 - chrX 23041444 3' - opus 7458 2 52.48 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATATAACCTCCAAAATATCAGTTTATATC:1 + chr3L 5025660 3' - roo 8713 2 77.23 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTCTACAATTTTAATTAGTTTCGACTTGTTTTCTTTTGTGTAATTTTATTTTCGTATGTGC:1 + chrX 6708950 3' + roo 394 1 50.50 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTTTTGTAAACATATCAATGGGCTTATTATCACTGTTCCAATTTATTGCCT:1 + chrX 17175251 3' - I-element 27 1 51.49 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATGCCTGTGGCATA:1 + chr3R 20432471 3' - roo 8692 2 57.00 TGAGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACTTGCTCTCCGGGATGCTGGATGATAGCACAGAGGCGAACTGCGGGGAGACCACCTGAAAGAACTGCTGGCCACTG:1 - chr3R 28907841 3' - G5A 2450 1 79.21 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGGATCACGGCTCCATAAAATA:1 + chr3R 7085766 3' + P-element 2832 1 24.75 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATGCCTTAACATTTACCTTGTTGGCCCGAAGTTGTCCACCAAACATTTGTTGCA:1 + chr2L 16548239 3' - P-element 22 1 57.43 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAATAAAAGGAGTATTTTAATCAGTTATGGACAGACAGAAAATAGCGTTTCCGCCCATGAAAAGTAT:1 - chrX 19918828 3' + copia 243 1 66.34 GTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAAAACTGCCAACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTGACATTTTTATTAG:1 + chr2L 22063435 3' + INE-1 145 1 47.52 CAAGCTATAGCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATACACAGCCACCAGCCCCATCCCCGTGCCCCTGAAACCCCCAGCATGGTCATTA:1 + chr3R 19821361 3' + Ivk 4912 1 53.47 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCT:1 - chrX 19034131 3' - hopper 32 1 72.29 GTTTTCGCTTTGTTTGCTGNGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTCTTAAAAGATATAATAAAAGTGGACTTAATGCCTAACATAAGTA:1 + chr3R 773436 3' - gypsy4 486 1 55.45 ATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTTCGATATTAAACACCAAGCAAAATGAA:1 + chr2R 12240392 3' + blood 7199 2 70.33 CGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGTACGGGAAATGTTTGACCTCACTCAGAATCGTCTTCACTTCCTCATGGTCCAGGAGCTTTGAATTAACAGTT:1 + chr3L 24368422 3' - Doc3-element 4535 1 76.24 GTTCGAAACACCACCCTGCACAGAGTTTTATGCAATAAATTCGGGAGACAGCAATTTCTTCGAGCTGAAATCACTACAAATAAATTTGATTTATTTTTAG:1 + chr3L 15766997 3' + X-element 4341 1 77.00 ACATCCGGAGTGGTGTATGTTGTATCGGCATCTGCTCGGCAGCTGGAACAAGTAGGAGTAATTAGTTTATTATATTAATGTATCGTATTATATTTAATTTG:1 + chr3L 1871602 3' - Idefix 77 2 40.59 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCGAATTTGGGGATGAATTAATTTCAGCTAGCGCCCTGCTGAATGCAACACTTT:1 + chr3R 8481977 3' - jockey 63 1 57.43 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGACTTGCTATCTGCGTCGCCATTGTTGTGTCTGTGTGTGCGGTTATAAAAATTAGCCTCATTT:1 + chr2L 17308035 3' + hobo 2926 1 66.34 TAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAG:1 - chr3L 5025613 3' + roo 9035 1 61.39 TAAAAAAAAATAAAAAAAAAACCAAGAAAAAACATTGCCCATAAAATGAGTTTCATAAAATGTTGATGTTGGTTTTTTCTAACCAAATTGGCCTCATTAGT:1 - chr3L 8285713 3' + HMS-Beagle2 488 15 61.39 ATCTATCGATATAACAGAAAAATTATGGAATTTCGCGTTCGCATGCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAGAAACTAGAAAAGAACGGACGGATGGAAA:1 + chr4 333048 3' + INE-1 500 1 76.24 TATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGAACACAATATCAGCTGCTCACATTTATGGTTGGCGATACGAATGTTCTTAACTGCATTTACACAGGCATCGACT:2 - chr2L 16994773 3' - Stalker2 3 2 76.24 GCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCACTTTTCCAAATAGGGGCGTTCTCAACTGCTTTCCGGACATC:1 - chr3L 9710992 3' - mdg3 5055 1 55.79 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGC:1 + chr2L 16016257 3' - I-element 33 1 59.41 TCGCGGGTAGGAGCGGGGGGCAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGTTGAGCTAGCAAGTAACATTTGCGAAAATTGATTTGATTTGATTTTAGATTTG:1 - chr3L 13760602 3' + invader1 127 2 53.47 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGGATTCGCTGTCAAACTTCGTGCGTCAG:1 - chr3L 16129591 3' + P-element 2839 1 33.66 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCTATGGGCGCCTGTCTATC:2 + chr3R 30284299 3' + blood 363 2 60.40 TAAAAATACTAATTTTTATAAAATGTATAAAATCTAATGTCGTGTACCTTCGGAATCTGTCCAAAAACGACATCAAGTGCACTCCCATCGCTGCCTATAGA:1 + chr2L 19558112 3' + Quasimodo 7342 2 48.51 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGATGTCAAGGCAGGTCAACTTTACGAAAAAAAAGAGGAGAAAA:1 - chr3L 2325403 3' + hopper 1395 1 50.00 GTGAAAAACACATTTTTGTGAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTTCGCCATGGCTTTAATTGCAG:1 + chr2R 13745774 3' + hopper 1388 1 50.50 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACTTGCTTGTTTGTAGAATGCTTTTTGTGTATCCACTT:1 + chr3R 12772998 3' - Doc 31 1 58.57 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTTTATTTTGCGTTACGCTGCTGGGGCAATTTTTATTTCCACTGAAAATGAGGGATTTACTTACTTA:1 - chr2L 897560 3' + roo 400 1 70.30 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAACAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCC:1 - chr3L 13366170 3' - hopper 18 1 41.58 ATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATGTTTATAATGCTGACTGTCCTGAGATATGGCGGCACTTCCTATAATCAATGCTGTTCTTT:1 - chr2L 6170079 3' - invader3 5202 2 65.35 ATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTCGTGCTGGCCTATCGCCTTCTCTGTTGCACCTTATC:1 + chrX 1199267 3' + 17.6 7048 2 63.27 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGACTTTGGGTCCAGTCGGCCACTGAATTATGCTCAAAAGTTC:1 - chr3R 27448240 3' + hobo 2906 1 58.42 GTCATCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAATCGAAAAAAAAACTTGCAAAACTATTTCAAAAAGGTTCGAAA:1 - chr3L 6698986 3' + F-element 464 1 56.70 TGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGAATAATTAAGTAATGGCGGAATTAATTTCGTGACATTCAGGGGAAAAATATAACATTAAATGTATTGCAGT:1 - chr3L 21186874 3' - Idefix 60 2 74.26 AGTGAGGGTAGATACACTACAAAGAACACAATATCAGCTGCTCACATTTATGGTTGGCGATACGAATGTTCTTAACTGCATTTACACAGGCATCGACTGAG:1 - chr2L 16994770 3' - Stalker2 7248 1 79.21 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTACATATACACTGGGCACTTACTTACATATGTACATATATCAACTGATAATTCGGTGCCTTTTGC:1 - chr3R 20555927 3' - 297 6 2 72.28 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTATGCATAAATTGGCGTTAGTTAGT:1 - chr2R 22659025 3' + 297 6931 2 77.23 GTTTCCAGCTCCAGCCCAACTCAACGATTAGCCAGCACTCTTAGCAGACCAGACCCACCCGCCAAGCCACCCACGATGCGTATGAGTGACGCGCCTTTATT:1 - chr3R 6297204 3' - baggins 167 1 70.30 CGATTCATTTACATAAGATNTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGA:1 + chr3R 20432446 3' - roo 8718 2 81.19 ATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCTGTTTGCAGATATGCTCTATAGTTATTATCACTATGCCATACTAAAATGTTATTTAAATATACTGATGAACTTCTAA:1 - chrX 21097391 3' + Tc3 317 1 70.30 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCGCCTTTTATTTTTAGCCACGCCAAAGCTGAGGCAACCAAATTGCTTT:1 - chr2L 12800954 3' - hobo 28 1 51.49 TATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCCGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGATAGAAATTGAGGTATGCAGCGACCGG:1 - chr3L 21813241 3' + 1360 3278 1 73.27 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCAACTAAAACTCGCTCTTGCACTTCCAAACTGGGGA:1 + chrX 14979150 3' + hobo 2900 1 67.33 AAATTAAAACGAAAAAAAAAAATACATTTATAATTTAACCTTCCAGTTACCTCGTACTTCTTTTGCTCTCTCACGCTGGCCCTCGGATGCA:1 + chr2L 12729208 3' + Doc 4699 1 75.82 GTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACTATTTCGTTATCTGCACGTCGAAAATCAATGGAGAAGTGTGTGAAATAATGTGCGAGTAAACAGAAGTGGC:1 - chr3R 13686529 3' + 412 7542 2 72.28 AACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGTAGACGCCGTGTCGTCGAACCAGGATCGCACTGCAGCCCGGATACTCCATCATGGCGGCG:1 - chrX 13738815 3' + F-element 264 1 68.00 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGCTAAATAAAAAATAAAAAGCAGTGTAATGGCCACAAATAAGCCAAATTATGGGTGGGTGTTGAAATTGA:1 - chr3L 16873777 3' - roo 7 2 70.30 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAATCCCTTTACACGTTTTTATAACATTTCGAAAATGTTTAAAATGTGGAGACG:1 - chr2L 21786692 3' - Max-element 26 2 52.00 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAACAGGCACACGTCAGATCCTTTCGAGGCGCAAATTAATCTCGATCCTG:1 + chr3R 30220258 3' + mdg1 7428 2 53.47 TTTTTCCGCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAATGAAGGCGACCGACGACGACGACGGCGACGACTACGTGGTGTTGCATATAGCAAAAGCC:1 - chrX 19499426 3' + FB 99 1 56.44 CTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGTGACCACCATTTGGGATAAAAAAACAGTGCTATCCCGTTTCACATACAGCTTTCTCTTTCGCCGACAGTATCGT:1 - chr2L 16017675 3' + I-element 90 1 76.24 CTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTACAATCCATCAAGAATGAATAGTATGATCGTGATCGTAG:1 - chr2L 22108195 3' - Bari1 37 1 63.37 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCATAACCAATGTACGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGAACATGTCGACACTGTGGGAC:1 + chr3L 23243043 3' - 1360 53 1 74.26 TATAATTTTGAATTTTTAATTTTGAGTTTTCACTTACATAGTAGTCCACATGTTCATCATGTCCGTGAGACTCGTGGGTCTCGTAGTGGGGCTCAGCGTGT:1 - chr3L 8337765 3' - 1360 3054 1 63.37 ACTTATATATATGTAGAGTNGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGGTCACAAACGGGGTGGGTCTATTGCGAAAATCGCATGTATTACACTAGTT:1 - chr2L 1201971 3' - Stalker2 7275 2 52.48 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGGTTGGAAAAATCAGCGGCCGAACTGGAAAACAATGC:1 - chrX 7970937 3' - P-element 16 1 63.37 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTTTTTTGAACGGCCCGAGCAGCTGACAGTTGCGCTT:1 + chr3R 10093750 3' + P-element 2850 1 42.57 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACAATTAAATAAATGCAGTATGGCTGAAGTTTGT:1 + chr3R 15213636 3' + pogo 2059 1 75.25 ATCACAATTACGTTTTTGTGTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATAATGTCCAAAAATATGTTAC:1 + chr3L 4923734 3' - jockey 61 1 79.80 AGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAGAGACGAAAAATAAAGCAATGATGACGATACGGGGGCGGGAAAATGTTGAAGAAGTCTGCGAGTAGCTCT:1 - chr2L 18277675 3' + TAHRE 273 1 65.35 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAA:1 - chr3R 14049335 3' - transib2 20 1 59.41 GTATTAATCTATGTTTTAAATTTGCGGGAGACATGTTTATTATTATGGTTTTTGCGATTTTTTTTATATTTAAGTATGTTCCGAAAACTTCTTTATGAATT:1 + chr3L 15390947 3' - TART-A 13259 1 77.23 ATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAATAGTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATATTTGGAA:1 + chr2L 16958118 3' + 1731 4585 1 64.36 CTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTCCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCT:1 - chr3R 19589900 3' - BS 4998 1 69.31 TAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACATGCACAATGCAAAGCAGGAGG:1 + chr3R 27785839 3' + Gypsy12A_LTR 2203 1 78.22 CACTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTTAACACAGCTGTCCATATACACAAGTCCCGCACTCGGAGATACTTACTCGCAAATGCGAAGCCTTCGCTAC:1 + chr3R 23326837 3' + HB 1608 1 60.40 AAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGTTGATAGTGTGTGTGTGTGGAAGGCTTTGTCTTTGTGCGTTCGCGTTTTGCCGGCAAAACCCAGATCCGAA:1 + chr3L 10014070 3' - jockey 191 1 65.00 ATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTG:1 - chr4 829446 3' + INE-1 80 1 80.20 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATAGGGAAAATGTAAAATTAGGCTGCCAAGAGAGCGATTGCGTAATCGGATTC:1 - chr2R 8674123 3' + roo 9051 2 58.42 GTGAAAAACACATTATTGTNAAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTCACGATACAAAACGTTTATTTTGCG:1 + chr3R 17897202 3' + hopper 1388 1 52.48 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGCTAACTAGGCATATATTTCACTGGTGAAATTTATTGTAA:1 + chrX 19199012 3' - pogo 32 1 60.40 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTCGCAGCTGCTATTACCATAT:1 + chr3R 9116519 3' - jockey 36 1 51.52 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTACAATGCAGGAGATAACAATGTGTTTTCTCTCTGTGTAGCAGACTGGGCCTA:1 + chr2R 20145155 3' + opus 7485 2 47.52 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATGCCTGTGGCATACGCGCCCTACGGAGGCTCTATTTCAAAAT:1 + chr3R 20432500 3' - roo 8664 1 77.23 ATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGGGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATCTAGTTAGTTGGTGAGACTTGTCTTAG:1 + chr3R 27597992 3' - HeT-A 6004 2 71.29 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGACCTCGGATCGTGAGGCATTCTGGTTTAATTAGATTTACT:1 - chr3L 2809735 3' + pogo 2090 1 58.42 TCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGTAGTTTTCATGAGACGGAATTTTAAAGCATTTAGTGCA:1 - chr2L 12256822 3' - P-element 2845 1 40.59 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAAAAGCGTATATGTCCATGCATACATACATATATACATATGTACATAATTGTAC:1 - chr2L 10584233 3' + hobo 2916 1 50.50 CATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACCTATAAACCTACACGTGTGATGTTACTCAACGTACGACGAAAACCAAAACCAAAAATCAGGCACCACC:1 + chr2R 4517894 3' + Stalker4 247 4 68.32 AGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGTGCAACTTGAAAGGCGATTTT:1 - chr2L 5244437 3' - transib2 50 1 74.26 ATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAATTACTTCTGCACCGGCTTCCCTCCCACGGACTCCTCCTGGTCTCCCTTACGCAGAAG:1 - chr3L 15981411 3' + hobo 159 1 64.36 GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTTACAG:1 + chr3L 17708318 3' - jockey 4773 1 58.42 AATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCTGCACGCATAGGCGCAGTATCAATGCCGAACCCCCAATGGCGATGGAAAAGCG:1 - chr3R 4835433 3' - Cr1a 375 1 57.43 TTCGACAAGAGCTAGTCGANGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAGTATTTTACATTTTGCACCAGAAGGACACTTGACACTATAAGGC:1 - chr3L 14878615 3' - Juan 5 1 75.25 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGTCCTTCACGCCCCGCTCT:1 + chrX 7971026 3' + P-element 2862 1 54.46 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATTTACGCTTTTCACCAATGTTTGGAGTAATTTCTAAGTTTACTA:2 - chr2R 20821329 3' + 297 6948 2 59.41 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGACATATATTGGTTTATTACAATACGGCTCTTATAATGAAAATGTACCAGTTTTGAAA:1 - chr3R 7134350 3' + blood 7347 2 77.23 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATAGTGCACCGATCGTAGCGAAATTCGCAACAGCTA:1 + chr2L 12064756 3' - opus 7040 4 67.33 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTACATGAGGGGGAACTGGTACGATTCACTTTGTGAC:1 + chr3L 2809816 3' - pogo 38 1 65.35 ATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACTGCACAAGAGCTTAAAGCTTGTTGTTTTCAGTAAAAGTATG:1 + chr4 193510 3' - flea 216 2 59.41 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTTGTTTTAGCTCTCTTAC:1 + chr3L 14311509 3' + roo 9052 2 57.43 ACGTATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTCGAAGAGGTCCAACTCTAATCTAAAGATCCACAAGAGCAACAGCAAGAGCAGTGTGGGAGCGAAG:1 + chr3R 31360443 3' + Ivk 5050 1 67.33 CACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGTATGCTCACAAGAGGCAACAAAATCAAGATGGAGCAGGCCGGAGCCGAGGAGCCA:1 - chr2L 19677279 3' + hopper 1396 1 58.00 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTTCCATACTGTACATCTGACCTTAATGTTTGCTTAAATTTTGTAA:1 - chr3L 20032246 3' - Tabor 31 2 53.47 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTTCCTGGAGGCACCTGAACGAGCTGAGCTCCTAGAAAATTGGCCGTGT:1 + chr3R 30063800 3' - FB 31 1 53.47 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTGTTATTTTTGGGGG:1 - chr3L 10811568 3' + Juan 4178 1 71.29 GATACCCGTTACTCAGCTAGTGTTCATGTGAACGGGTATCTGATAGTCGGGGATCTCGACTATAACAATCTCTATTGTTTCGTACTTACGCGATGTCTTTA:1 + chrX 20672874 3' - INE-1 541 1 70.30 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGTAGCCACAGGTATGCATGTATGAAAACGTGAGAATGTCGAGTTGGCTG:1 + chr2L 19677365 3' - hopper 27 1 52.48 GCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTAAGTTAAAGAAAAGTTAAAGAAAGTAAATCTTTAGATAAAGGACTTTTCAAATCTGTTAGTAAATTAAAATTTTT:1 - chr3R 4738597 3' + INE-1 154 1 62.38 GTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGTAGGGTGGGCACAGGTTAAGCGGATGCAGA:1 + chr2L 11900745 3' + Circe 7130 1 75.25 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGATATTGGGAGAGAGACGATGGTTTGGCACTTCCGCCCCCC:1 + chr3L 7099855 3' - 297 6601 2 55.91 ATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTTAAATTGCTTCACAGGCGATTCTTAACAAGCACAAGTATGTGCACACGGA:1 - chr2L 15766976 3' - accord2 7277 1 75.25 AGTAATATATATGTATATATAACTCCTCCATTCCTGCAGGAGATCTACCTGACCATGACCAGCATGAAGGGAGTCATCAAGAACGAGGAGGAGCTCTGTCT:1 + chr2L 5194790 3' + Dm88 4376 2 67.33 ATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCATGAAAAGCGAGTAAATAGCAGCCACTAAATATGAACATACCAATTAGAGCC:2 - chr3L 7159660 3' + Tirant 8223 2 55.45 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACTAACCATAAAAACACTTCGCATAAACGTAGAATGTATGTTTTTGGATCCGTAGAAAAACCAACATTGAAATGGGC:1 + chr2R 7542262 3' - mdg1 4 2 73.27 GAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATGTGGTTCCATCTACCATCTCCAAAGCTGTGCGTAAGCTAAGCTGTGCTCGAGTGCACAGAGTGACTC:1 - chr3R 27605247 3' - opus 4 2 75.25 GCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTAGCTGTAGAGAGTGATGCCGAGTATAAAGTGATTCAGATCCGACAT:1 - chr2R 6460812 3' - Quasimodo 174 2 54.46 GGATTCAATGGTCTTAGACGGTTGTTGACCTTTGGCTTTCAGACGGTAGACGGTTATCGAGGCTGTGGAGGAGACAGAGCAAAAA:1 - chr2R 3925285 3' - gypsy10 5592 1 55.29 TAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCTGCGGTGATTGTTGCGACATCTATTTGATCGAAATGGGATTGCCGAGAGTGGACTGGA:1 + chr3R 13440595 3' + mdg1 158 2 61.39 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTTACACACATATCTATGTAAGAAGCGATCTTCAGTTAT:1 - chr3R 17036437 3' - Transpac 33 2 62.38 ATCTTCTAAATATTATTGCCTAAACATTCAATTTTTTAATACTCATACAATCATATGAATTTTATTTTTTGGAAAAACTTCCGCTGACAGCGGCAGCAGCA:1 - chr3L 5821334 3' + jockey2 3238 1 55.45 TGCCAAAAAATGGTATGGCGTTACGTATCTTGTTGTCCTTTGCTGTTTTGCTTTTCTTCGAGGGACTGCCACAAAAATTTCGTATGCGCCCTGTGCTCTTC:1 - chr3L 15032912 3' - 1360 28 1 74.26 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATGAGTTCGGCGCGAGTGT:1 + chr2R 13316207 3' - hopper 23 1 56.44 CACACCTCGATGAAAACAANTGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTACAATGATCTGGAGAAGTTCGAGGAGTCGGTGGCGGACTATGAGACGGCGC:1 + chr2L 16506519 3' + Chouto 5933 1 54.46 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTATACTCGAAAAGGCTTTTTTCGGCGGACGGCAGCTTCA:1 - chr3R 11814488 3' - blood 7047 2 59.41 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAATTAAGGTGAAAGTTGAGGACGAGCCTTGACCAACTCTACGCCAAATTGCCACAA:1 + chr2R 21108827 3' - jockey 4691 1 47.52 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCAAAGCGTTCGTCTCTAGTTTTGTACAAGTGCTG:1 + chr3L 13589619 3' + hopper 1376 1 63.00 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCGCTTTTATTGAAAAGTATCTTTCGTGGTGCAAAGAACCT:1 + chr2L 7161366 3' - pogo 35 1 62.38 CCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCTTACAATAACATCATTAAGAAGCGATCCATTCCGGTTCG:1 + chrX 21939118 3' - HMS-Beagle2 34 2 58.42 GTGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTATCAGTGAACAGCTTGAAATTCCAAGAGGACAAAGTTGAGGGCTGACGCTAGCAAAGACCCTCG:1 + chr3L 21415858 3' - Porto1 451 1 67.33 TCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAATTGATTTCTGACGGCAGAGTGCGCGCGAGAAGCAAAGCGAAGCCAGAAGCTATGAGCAAAGCAAGAA:1 + chr4 317836 3' + 1360 3115 1 69.31 GTAAAGTCTTCTTATTCGGGATTTTACAATGTGTTTATTTTGCGTTACGCTGCTGGGGCAATTTTTATTTCCACTGAAAATGAGGGATTTACTTACTTACC:1 - chr2L 897558 3' + roo 402 1 72.28 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGGGAACAACCAACGTTTTGGGCACCCAACCGCAGA:1 + chr2L 791502 3' - 412 42 2 65.35 CGTCACCCGGTTAACTTAGTTAACTTATAGCCTGACAGTTTTGTTGTCAGTTTTTCCAAGCAGCGGTTTCCCGCCTCAGCTTGGGTTTAGTTTAAATCTAT:1 + chr2R 17373248 3' - gypsy6 7423 2 73.27 TCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGATCACGGAATACAATTGGGGACTGTGTAATACACTGTAGGGACCTGCTCCAATTTATTTTAGTAATGT:1 + chr3R 1273158 3' - 17.6 163 2 72.28 TAGGTACACTTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTAATATACCGTATCTGCGTATTTGGGTTAAAAGCCATTTTATATGGACGCCC:1 + chr3R 22051416 3' + Circe 39 2 63.37 CACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGGCGTGGCTGGGAAAGCGCTGGGAAAGCGACA:1 - chr3L 3519581 3' + Stalker4 7031 4 69.31 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCACTTACGCTAACATTATTTATTATTGTTGTTGCTGCTGTTGCTATTGTGGTGTGTTAAAAAGGTTTGTCGTAA:2 - chr3R 22219510 3' - roo 2 2 76.24 AATAACATAACTCTGGACCNATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCCATGTATAGACCGCAATCCCAGTAGCAGTAGCCTTCCAGTT:1 + chr2R 1922512 3' + gypsy 7432 2 62.38 ATTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGGCATGAGAAAAAAGGCATACCCTTAGTAATA:1 + chr3L 11314527 3' + Tc3 317 1 41.00 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCAAATCAAGAGGCGAACGTAC:1 + chr2L 16690469 3' - P-element 53 1 25.74 AAAATGAGAAAAAAATTAAAAATTGTTGAACAGTGTGGGCCTGACCGGTATGGCGGTTTGTGGGTGCGGCAGTACTCTACGAGTAACGGGTATACGACAA:1 + chr3L 24159191 3' - INE-1 471 1 57.00 TCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCAGTACATGTCTTCGTCCCTGTCCGTCCGTTTGTCCTTGC:1 - chr3R 30313745 3' - Doc 412 1 61.39 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAAGTATCCGTTGGTAGAGAGAGTCGTTATTAGGGTCTTGATTTTACTTGATTCAATGCTGAATCACAA:1 - chr2R 10528284 3' - pogo 4 1 73.27 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTACATGCAATAAATCGAATTTAAACATCATAACATCTGT:1 - chr3R 14228020 3' - Transpac 4952 2 62.38 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTGCTATTTATTAAGTGGTCTAATTAGGTATTTTAGTAAACATTTGACACACGAAGC:1 - chrX 3967719 3' - pogo 16 1 61.39 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTG:1 + chr3L 17136028 3' - BS 34 1 58.42 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACCTTGTAAGAGCGAGGGCTTAACTTTTTCATCGTCAGTTTTTGTAGTTGGTTTGCCATTACTTTAA:1 + chr2L 17131627 3' - mdg1 11 2 62.38 GGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCACTGACCTCCCTGGCAACTTGGCAAAAAGAACAGAACTCTTACAACTGCGAAAAGAAACGAAAAGAAGGCTA:1 + chr3R 30290696 3' + Doc 483 1 64.36 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATG:1 - chrX 8308718 3' + opus 474 2 55.45 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATGCCTGTGGCATACGCGCCCTACGG:1 + chr3R 20432483 3' - roo 17 2 60.40 CTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCATTTCAGATAGACTTTCAATAAAACGAATTGAGAACACTAATTTGTATTTTAAACTTAGGCTGCGTTT:1 + chr3R 10127182 3' - Bica 446 1 76.24 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCCAAAGTTGGTTCAAGCTAAGTTTCGCTGGAAAGTTGTCGA:1 + chr3R 12599352 3' - BS 32 1 60.40 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGGAGTGGGAAACTTCTTTGCACTTTCATGAA:1 + chr3R 25514174 3' + hopper 1410 2 55.22 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGGCGATTTAGCGATGCTTGTCTTATTTAGTTTTTAAATAAATGGCCAA:1 + chr2L 16071176 3' - 412 31 2 52.48 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTTATTTGCTCATTCGCAAATGAAG:1 - chr3R 24464787 3' - 412 30 2 54.46 AAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATGTATTTAAAACTAATTTTTCAAGCGAAACTCCTGAGCCGAAATCCATAGTTCATTCCCCTGTTC:1 + chrX 9977802 3' + BS 4704 1 71.29 AAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTGATGAAGTAGCTCCTGCCAATGGGTTTCGCCCGATAGTTGCAGTACAGCTCGGCGGTGGCGCCCTTCTCGGT:1 - chr2R 22391873 3' + 1360 216 1 72.28 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACCTTGTAAGAGCGAGGGCTTAACTTTTTCATCGTCAGTTTTTGTAGTTGGTTTG:1 + chr2L 17131615 3' - mdg1 23 2 52.48 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATAACACAGCTACCAAATGGCCGATATGGGCGTCTTGTATATCACC:1 + chr3L 27390348 3' + 1360 3364 1 95.74 ATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATT:1 + chrX 19820785 3' + Rt1b 4975 1 76.24 GAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGA:1 + chr3L 21773109 3' + 1360 109 1 76.24 ATTGATCATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTTTAAATGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTTTGCCTTGTAAGCAATAGAGTATCGATGTGT:1 - chr3R 24582641 3' + hopper 346 2 77.23 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATATTTGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAAT:1 + chr3R 19449685 3' + roo 9042 1 55.45 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCAAGCGGCTAGCACTCCCAGTTTACTAGACATATG:1 - chrX 9828451 3' + Tirant 359 2 66.34 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTATTTGAATAAGTTTACTCTCCGTTCCTTT:1 + chrX 3334700 3' - 297 41 2 74.26 TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTAATATACGAGTAACATTTTATTCCGAACAAAGTATGCTCAGCCT:1 - chr2L 22104383 3' - Quasimodo 22 2 58.33 CTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATT:1 + chrX 22913195 3' - gypsy7 5256 2 67.33 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTT:1 - chr4 333641 3' - Doc 48 1 76.24 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTCGCACACAATTGCAAAAGTTTTTTAACATAAGAAAGCAGCAGCAGCGAAAG:1 - chr2L 17307944 3' - hobo 26 1 53.47 AATGTACCATTAGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTCGTTCGCTTGGCTGTGTTGTGGCCAGGACAATTTCTTAAGCGGCATCAATGCAATTTCTTG:1 - chr3L 4640539 3' - Porto1 4358 1 58.42 GGAAAAATAATGCAGATATNTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTATGTACATAGGCATGTATACATTGTCTT:1 + chrX 19384045 3' - pogo 44 1 70.30 ATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACACACCCAACTGGAGACCAAGGACAACTGCTTGGCATCGCTTAATCTGCAGCTTGAGACAGCAAGAAGAGAATCCA:1 - chr3L 15082674 3' + baggins 5409 1 77.23 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCAATATTTAAATAGAAGCATCAACAATCTGT:1 + chrX 3967794 3' + pogo 2056 1 72.28 ATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTC:1 + chr2R 5531184 3' - 1360 77 1 52.48 GACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAACGGCAAATGGCAGAGGTTCGTTGAACTAAACAGACTAATTAATGGCTGATT:1 + chr3L 8004616 3' - hobo 2575 1 57.43 GAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGCCAATGCAAACAATCTTTTCAGGAGAAAGAGTAATTTAATAAATGTGTCGTTGAATTTGTAATGGAATTGAT:1 + chr2L 21369956 3' + rover 348 1 79.21 TAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCGATGCCGTAAGTGACCAGCGGGTATCTCGCGGGCTACT:1 - 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chr3R 5359943 3' - 412 7099 2 67.33 ATTTTTCAAGACTGTGGGCGTGGCGATTCGTGGTGTAGAAAGGCGTCTCAACCTAGCAGTGATTTGTCACACGTCACTAGACTGAGACACAAGTCACTAGA:1 + chr2L 22325197 3' - INE-1 253 1 81.19 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATTGTCTGCCGCCTTTCAACACATTGAGTTGTTTGCTCTGGGTACGCGCTCCATGGTCTCAGGACCTCCCATT:1 - chr2L 19629889 3' + copia 250 1 73.27 ACTCAACGAGTAAAGTCTTNTTATTTGGGATTTTACATATCAAAATTCACTTTTCATATACAACCTACCCACCGGGAGCTTGGTCTATATGTCTGAATGTC:1 - chr3R 20432382 3' + roo 393 1 63.37 GTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGTAAGTTATGGCAGTCCGAACGACTACCTTAA:1 - chr2R 4248087 3' - gypsy 42 2 68.00 AGCCCAGATGCGTGGCGTGCAGCTCTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTCGCGGCAGTTCCCCCAGAAGACGCTGAAATACCCCTTTG:1 - chrX 14481318 3' - G5 4460 1 71.29 TAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATTCGATTGTGTGATTGAAGGGATTTCAGTGTTGCCAGCAAACTATTTTATGTACCTAATAGACAAGAC:1 - chr2R 10526423 3' + R2-element 470 1 74.26 CTTAACCGGCAAGACTACCCTTCGATCACTTTGAACAACAACGTACTCCCGAAAGCAAATGAAGATACTTCTAGTTTTGTAAGAATTCTTGTCGAAGGAAG:1 - 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Cr1a 456 1 59.41 TTTATTATTTAAGAAAACAAATCACTATATATATAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGTATTTGATGGCATTTTGGGGAGATTT:1 + chr2R 705882 3' - F-element 167 1 75.25 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGCCATGGACAGAGTCACCTTCTTTCCATTCTCCTTTGGGCCAAGCTGGTGAAAAATGGCGCGCTCATTTCA:1 + chr2L 18239513 3' - hopper 12 2 69.31 GTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCAGGGATATTCAGTTGGAGATGCTCGCAGGCAGTGCCTGG:1 + chr2L 4778902 3' - Quasimodo 332 2 58.90 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTG:1 - chr3R 13582230 3' - BS 5033 1 61.39 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTA:1 - chr3L 27415231 3' + transib2 2791 1 59.41 TAGCCACAAAAACTTAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAGTGATTTGTGTGGTCCTTTGGCCACCTGCAAGCCAGGGGTTAGAGCCTGGCTA:1 + chr3R 13411531 3' + Porto1 4470 1 43.56 CACATACATACACACACACACACAGAAATTAAAGCAGAAAGACAACTCGGATCATCCCCCGCTGGAGTCCAAATCCAAACCAAAACCAAGTGGAGAAGTCA:1 - chrX 986537 3' + Quasimodo 30 2 63.37 CCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTCCGCAGCTATGTGTATGGCTTTGTTGTGTGCACACA:1 - chr2R 11793280 3' + Quasimodo 171 2 70.30 GCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCGTTTCGCTATCTGGTCAGCTTTCCCATAATTGGATGTTG:1 + chr2L 15088363 3' + accord 344 2 61.39 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCTACGAATTCGTGGAGGTAAACACTCGGGCCAAGGAGAACTTCTCTGAGGAGTTTCT:1 + chr2R 18407073 3' - mdg3 5255 1 68.29 TGAATTGCTATACTACAAAATTTTTTATGTATGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAACAAAAAATGAAACGTAAATACGGGCAAGGCGAGGACAATATTTT:1 - chr3L 10170150 3' + Doc3-element 131 1 60.40 TTATTTTGTTATTGTTTTTTTTTCCTCGGTTTTTTTCTTACCCCAATTGCTTGGCCCATCGAAAATTTTCGGTTGGCAGGGCCGTTGTGGCATGTAATTTG:1 + chr3R 8208399 3' - gypsy11 3933 1 73.27 ATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAA:1 - chr3R 11118051 3' - BS 45 1 71.29 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGCAATTATGCTATAACATTGTTGATCAAGTTATTTCTTCAGCAATGCCAGCCAGTTGC:1 + chr3L 2424936 3' - jockey 29 1 55.45 GCCCACTCTAACGTCCACAAACCGACTGAAACTGCCACGCACACAACTGAAGAAGGGAAACAAAAAACACACTAGCGAATAGGAACAAGTAAACTAAAATG:1 + chr2L 12188312 3' + INE-1 218 1 62.38 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTATGGCGTGGGGGCGTGGCAACATGCTGGTGTCTGCGCCACAAAGTATGCAATACATT:1 + chr2L 4057101 3' - jockey 29 1 52.48 GGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCTATGGGCGCCTGTCTATCGAACGGCGCATGACT:1 + chr3R 30284314 3' + blood 378 1 75.25 CTGTCCATATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTAAAGGTTGAGATTCAGCATACATGTGTAAAAGATCCAATCAAACGACCAAAGCCCGAAA:1 + chrX 22519604 3' + INE-1 131 1 58.42 ATCCCAGAAAAATTGTGAAATTTCTCGTTCTCGTATTTGGCATTGCGTTGCGTACTTGGCGTATAAAATTGTGAAATTGAATTGTTGCCTCGGGAAAATGG:1 - chr2R 13640682 3' + INE-1 510 1 63.37 TGTCAAGGTATGACTTCGATGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACCCACTCCTCCACTCCTCCACCACCGCACCACCGCTCTACCGCACCTCGCACAACG:1 - chr3L 21694582 3' - Rt1b 4973 1 50.50 GGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGCAAGGGACAAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGA:1 - chr3R 19448036 3' + roo 8650 1 67.33 GAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTACGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGGAATAAGGACAAAGGATAAGAAGGA:1 + chr3R 20348613 3' - Doc 439 1 71.29 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGTGAATAATAGTGGTTATTGTGGGTTATTGGATTCATGTGGGCGCGAGTTGGGGTATGGTTTTACTCTAGA:1 + chr2L 11832626 3' - 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jockey 66 1 55.45 TATTTCAACTGCAACACCAGCGAAGCCTGAGGCCTGAAGACTTCAAACTTATCCTAAAAGCTTCTTCATTAGTCAGACTTATCCAGTTTCAACTTAATTTC:1 - chrX 18997561 3' - copia 5036 2 78.22 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCGGTGTTGCACATATATTATGATAGTGATAGATATAATCAAGTTGGGCAAATATCAACAAAATATTAA:1 + chrX 9828537 3' - Tirant 10 2 71.29 AGTGCCACCCTTGCAGTTCNCTGCTCGAGACCTTGGCTGGCATAAAAATAATATTGGGCAATGCTTTGGAAGTAAGTGTGAAAAACCCCTTGAAGGCATTC:1 + chr3L 7463374 3' - hobo 2 1 74.26 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTCCTCGGATCTGTGCACTCGAAATTATGCTGTGGCCAGGACTTTGCCTTTTGGCCTCATTCCT:1 + chr3R 28447465 3' + blood 363 2 62.38 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCATGGG:1 + chr2R 11699320 3' + roo 9031 1 67.33 GGGTGGTGTCGCTTGAGCCTTCTTTTGACTCTAGTCCGCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAAT:1 + chrX 683601 3' - jockey 4746 1 52.17 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACTTATTGATTGCATTTTCACAACCACGGGA:1 + chr3L 10008577 3' - jockey 4784 1 68.32 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCGGGTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTTGGTGAG:1 - chrX 7290561 3' - hopper 33 1 59.60 TTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGT:1 - chr2R 5277144 3' - invader4 39 2 69.31 TGAGGCTTAAGCAAGGTATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGATTTTCCGGTGTGTCGATGCCTG:1 - chr2L 19911729 3' - Idefix 213 2 78.22 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTA:1 - chr2L 18239432 3' - hopper 42 1 68.32 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTC:1 + chr3R 9116500 3' - jockey 58 1 71.29 GGGCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATTTCGGGATGGAGTTTGGGGTTGTGGGGCATGGCCTGAGTTCTGTTTGAGTTGGCGTACAGTT:1 - chr3R 21839408 3' - G4 145 1 58.42 ATCAGTACCCATGAGTGATNCACTCAAGATCAATCCAACAACAACAACCATAGCAATAATAATAACCAAGCGAAGTGCGGGAGCACAACCAGCTCCTTGT:1 + chr3L 1714301 3' + Quasimodo 258 2 69.00 AGCGGATGGAGGTTTGTACCGCCTCGACTCGGACACCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGCGAGAAGGGTGAACAAGGTCTGCAGGGCGTTTGGGGCCAGCC:1 + chr2L 5034436 3' - 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opus 7160 4 73.27 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACCTGGAATGGTAGGACTCCAGTTCGTCACATAAATATTTATGGATGTTAATGTT:1 + chr3L 6399570 3' + roo 9046 1 57.43 CCCTAAGCCGCCTCCAATCTACATCAGAGAAAAAAGTTCCAGCGCCCTCGTAAACAAATAAAGTACCTTTGTAATCGAAAGGGTGTCAAATACTTCCTTAA:1 + chr2L 13096939 3' + Fw2 202 1 60.40 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAACTTAGGCAATAATTTTCTGTGAGTGCAGGCAA:1 - chr3R 23445580 3' + copia 5082 2 72.28 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGCAGTGTCAGTGAAAGTGTGGGAGTGAGCGAGTGTG:1 + chr3R 23803891 3' + P-element 2848 1 40.00 ATTTCCAAATAAAATTAGGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTCTTAGGCAAATCTTAACGATAAAAGGG:1 + chr2L 21199178 3' + roo 362 1 68.32 CTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAATGTCGTCATCGAAGGACCCTACCAGGCTATCAGTCGCATAGTTCTGCACATAGA:1 + chrX 19588465 3' + HeT-A 6062 2 59.41 GAATGTAGTTGCACTTCCAGCAGCGTACCACCAGGGGGTTGATACCCTTGTGATACCTACTGGCATGGCATCCTAGAATCATATGGTTTGTAATGTAATTT:1 + chr2R 1069302 3' - baggins 76 1 74.26 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCACCCTTTTGATTGATTTGATAAGGTCTGAAAAAGTAATGA:1 + chr2L 19567564 3' + pogo 2068 1 59.41 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATAAGCTGCTTTCACCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGCGACAGCTGGCATAACTC:1 + chr3R 29432845 3' + Transpac 5220 2 71.29 ATTTTGGATCAATTGGCACCATGTAGGAATTTCTTCTTTTGCATTATTCTAGTGTCTTTGCTTCTACTATCATCATCACCATTCATTCCATACCTGAGCGA:1 + chr3R 22733394 3' + 1360 263 1 66.34 CTCGTCAAATACCTTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGAGTTGTGATGAGTATGGCGTAGATGTTTTTCTGGTTAGTGTGTCGACGTTTTTCCATTTCCGGCA:1 - chr2R 20426875 3' - X-element 4373 1 50.50 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTC:1 + chr3L 13435601 3' - Doc 54 1 45.54 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATGTATGTACATATACACTGGGCACTTACTTACATATGTACATATATC:1 - chr2R 13338925 3' - 297 30 2 64.36 CCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTAAAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGGCCAACCCGAAATTAAAACACCCGGACTTCTTT:1 + chr2R 12876873 3' - R1A1-element 5067 1 67.33 ACAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATTCTGCATAAAATTAAGCGGCTCCATCTCCCCTCG:1 - chr3R 24439925 3' - hopper 304 1 66.20 TGGGGTTGCAACATAGCCATCCTACGGCAAGCTGCAGGCACCGGACAGATCCACGCCCACCTCCACGACATTGGTGCCGTTCAGCTCGTCGATGTGCCGCA:1 + chrX 8301866 3' - GATE 8193 1 59.41 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCATTTTTAACATGTATTTATGATTTCAGTGTAAGACTCACTGACC:1 - chrX 9439131 3' - roo 8667 2 74.26 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTAATTATTATAATATAAAACCTTGAAACACAACA:1 - chr3L 18406624 3' - Doc 49 1 66.34 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTAACAGGACACACACG:1 - chr2L 12884298 3' - HMS-Beagle 15 2 64.00 GTGAGGTCCCTCGGCTGTCTCCTGTGGGGCCTTCATGGTGGGCGAGCTCTGTACAGATAGTATGCTTACTTCTAACTAATTATATGGCTATTATTAATAAC:1 - chr3L 20713160 3' - BS3 1566 1 54.46 GACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTT:1 + chr3L 19339432 3' - Tc1 23 1 60.40 TGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAATCCCTTTACACGTTTTTATAACATTTCGAAAATGTTTAAA:1 - chr2L 21786703 3' - Max-element 15 2 52.56 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCAAAAATGCTGATCAAAGAGGCAAAATAATACATATTTGAGCAGG:1 - chr3R 22520879 3' - opus 7142 4 60.40 GTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGAATATACATGGCCATAATGACCGCATCATTCACCATAC:1 - chr3R 20892008 3' + invader4 292 2 59.41 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTCCCATCACCAAAATAATAGTTTCTCGTGGGCATCGT:1 - chr2R 18850564 3' + P-element 2849 1 41.58 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGGTGGTTTT:1 - chr2L 16548166 3' + P-element 2881 2 63.89 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTATATTAGCTATTCAGAAAGGTTTTTTTCGAAAAGCCAGCGACTTTTCACCAGC:1 - chr2L 6112789 3' + blood 353 2 50.50 AGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGAGGATGTTACTAGAAGGGCTTCTTCTATTTATGGGGTGA:1 - chr3R 3005964 3' - Ivk 38 1 58.42 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTAAATGCACCAAATTCCAGGCATTTAAATCCAGAAAGCGTTTTAAGCC:1 - chr2L 13155783 3' - copia 4897 2 54.46 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAAGCGACA:1 - chr2L 2016756 3' - Doc 51 1 67.33 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATTGGGCAAAAACCGGGAGACAATCAGATGAGTGAGTCAGATGGCGAAAAAGTGAAAGAAGTTAATTGACAAA:1 + chrX 3319438 3' - flea 4758 1 67.33 GCGTTAATTTGCATGCATTAATTAGTGCACTCATCCCGTTTATAAATAAATAATTCATTCAGTCGACGACAAGCCGTGTAAATTCCCAAAGTCTGGAG:1 + chr3R 7446410 3' + diver2 406 1 56.12 GTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATTACTTAACTATGACAAATTAGAAAACGTTGACAGTA:1 - chr2L 18901096 3' - Cr1a 90 1 64.36 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGCAATTATGCTATAACATTGTTGATCA:1 + chr3L 2424905 3' - jockey 60 1 71.00 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCCAAAGAAAAACGCGACCAACATTGTTGCCTGAGA:1 + chr2L 5244482 3' + transib2 2787 1 63.00 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTAACTCTGTTACTGACT:1 - chr2L 11832518 3' + roo 389 2 61.39 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAGGCATAAAAAAGGGATAT:1 + chr3R 29413104 3' + hobo 2917 1 71.21 CAGCAGCGTAGAAATCATCCAACGGGCCCAATCGAAACGGAGGACGTACAGCATCACGGCGACTTTACAGATCAGGTTGGTACTTATGATCCAATCGGTG:1 - chrX 17684090 3' + Fw2 3586 1 66.00 TTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTAAACCAACTTCAAAGCAAAGTGAAAAATCGTTAGAAGAAA:1 + chr2L 9045681 3' - jockey 4734 1 60.40 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATGGCAATTTCTGTAATTTGCATTTCACATATAGTATTTCATATACATATATTATAAATGC:1 - chr3R 9978587 3' + jockey 4975 1 56.44 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGTCACTGTGATGATGTCGCCGTTTCCGCTTCCTGTCCG:1 - chr2L 5866963 3' - jockey 4798 1 62.00 CGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGA:1 + chrX 20999602 3' - BS 1 1 69.31 CTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTGGCTAATGGCGCTGGCTAACGGTACTGGCTGAGTGCCACTGC:1 + chr2R 18203981 3' - G2 297 1 58.42 ACAAAAATTAATAAAAAAAAAAAGCATAGGAGGAGGATGAAAAGCGGGGAAAAAATATATTTTGTCACAGGGCGGGGGAGAAATTTGTTT:1 + chr3L 10572307 3' + Doc 4695 2 83.33 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGTATGTATGGTAGGTTCTACTAGGGACTCGCACCGTTTCGGTCCACTTG:1 - chr3R 4646315 3' - 297 21 2 60.40 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCAGTAGCCTCTGGCCTCGAAGTGCGCAGCAAAGTGTGCTGT:1 - chr2R 20452517 3' - HMS-Beagle2 10 2 42.57 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCAAATCAAGAGGCGAACGTACAAACGAAGAAGAGAACGAGCGAACCATGACCATGCCAAAG:1 + chr2L 16690509 3' + P-element 2874 1 63.37 GAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGTATATACATGGCCATAATGACCGCATCATTCACCATACAGACCCCGAAAC:3 - chr3R 20891996 3' + invader4 3063 2 55.45 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTAAGGTTTAGACTGAGAGTCTGACTCTGGCAGGACAATTGTTCGCCCAGGAGTG:1 + chr2R 10308585 3' - Doc 4486 1 65.35 TTGTTTTTTTTTTCGTTTTTTTTTTTCGCCCAGCACTTT:1 - chrX 12254294 3' - gypsy7 5009 1 74.36 AATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAAGTTTCATATTTTTTGTAGACCAAATTAAATATGATATATTATGCATATACATATTTAATGGTTTAATTAGTA:1 - chr3L 7215459 3' + copia 254 1 75.25 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAATATGGACGAAATATTTAATTCTGATTTTTCATTATGCACACCACTGATGCACACAT:1 + chr3R 10719773 3' - copia 19 2 54.46 CTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCGCACCATTTCATTTCATGCTCGGCTGACGTCGTCTTTTGTTTATTTATCAACGCCGAGCGAAAAGT:1 - chr3R 30283259 3' - invader4 2712 1 74.00 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCAAAGCGTTCGTCTCTAGTTTTGTACAAGTG:1 + chr3L 13589616 3' + hopper2 1566 2 66.00 TTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGATAACGCCAAGAAATAAAAAATTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAA:1 - chr2L 22076769 3' - 297 6959 2 63.37 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAGCCA:1 + chr3L 27357644 3' - mdg1 7047 2 70.30 ATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACCGCCTGTTCAACAACCTAATTACATGGCTAGCAATAACAACCGAAGGAATCAGACACAAC:1 + chr3L 8015209 3' + S2 1693 2 63.37 TCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAA:1 - chr2R 5617478 3' + invader1 405 1 71.29 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGGTTGGAAAAATCAGCGGCCGAACTGGAAAACAATGCCA:1 - chrX 7970935 3' - P-element 13 1 66.00 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTTTTTGTAATATTTGTAAGAATGCACAAAACCTCGTTTCATTCAGAGATTTCTAGTTTCTAGTCAGATGACT:1 - chr3R 6760972 3' - blood 7017 2 67.33 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTCCCGCAATTTCGGTGGCAAT:1 + chr3L 16666681 3' + I-element 5301 1 77.23 CGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTATCTATTGATTTTTCGCCCATATTACGCATACGCAGGGTGGGCGG:1 - chr3L 19460710 3' - R2-element 3136 1 65.59 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTTCCATACTGTACATCTGACCTTAATGTTTGCT:1 - chr3L 20032258 3' - Tabor 43 2 65.35 TCATAATTGACCAATGCTTAGTTCTGTACTCATGAGGTATTTGCTAAATAATCGATTTGCGGCTCACCTGCACACTGAAAACATAAACTAGGTGAATTATA:1 - chr2L 17549648 3' - Transib-N1_DM 409 1 80.20 GCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAGTTTACCACATTGGGAAACATCATTCTGAGTGCTTTCACTTTCCTCAGTGATTTCCGCCATCT:1 + chr2R 20622028 3' + Cr1a 4434 1 37.62 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGTCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGCTTTTTCGC:1 - chr3R 19094183 3' + P-element 2867 1 59.41 TAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACTTCCTCACAAAAGGTTGCTAATGGAGCTGACGGGTTTCTGCCTTCTGAA:1 + chr3L 7891052 3' + Stalker 51 4 51.49 CAACACACACACACACACACATTCACATACACACACACAGCTGCTGTGGTTGTTGCACTCGTTTTTCGTTGTCGTCGATGCATTTGCATGCAACACTTTTT:1 + chr2L 12897051 3' + gypsy3 424 4 75.25 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACC:1 + chr3R 28333579 3' + pogo 2053 1 48.51 GAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATAGAAAAGACTCCTCATAAACACCACAGCATATTGAACTCACCTGGAAGAGACGT:1 + chr3L 18620250 3' + Bica 4569 1 56.44 CGAAGTCGTATTATTTTTANTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTTGGGATAGGGACTGTACGGATAGCCACC:1 - chr2R 20751758 3' - I-element 4930 1 71.29 AGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGG:1 - chrX 21791531 3' + gypsy11 4311 2 36.63 CCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCCCCACCAAAAACCGAATTTAGAGCATCGGCAGATGTAC:1 - chr2L 15478760 3' + 1360 3197 1 63.37 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGCCAACTAAGCTCATAAAATCCC:1 - chr2L 16071130 3' + 412 442 2 76.04 CATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCTGTGGTGTGATCCAGCGGCGTTAGCGGCTGTGGTGTGGTCCAGCGAGGTCAGCGGCTGTCCGTGATCTCT:1 + chr3R 829506 3' + 1360 423 1 70.30 TGGTGGAAGATCTGCCAGACCACTGTTACTCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGGCCCGTGAGCACAACAACTACCACACCAGT:1 + chrX 10037595 3' + Bica 4781 1 73.27 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATACACCCCATTCTCTGTTGATAATATCTTTAATCGCTTTTTATGTTCTTATTATCAGCGTTTCGA:1 + chr2R 8674224 3' - roo 8675 2 69.31 CACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAAATGGGACAGGGGACTTAACTTTGGCACATTCAAAATGTATTCT:1 - chr3R 9949455 3' + F-element 4329 1 57.43 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGATGTGGATATCCCCCCCCCCATTTTTTGCCCGAGGTCCACACACGTGCCACGAGTCAG:1 - chr3R 7582604 3' - 297 6592 2 64.36 TACAAAATCGCGAAGTGAANAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCT:1 + chr2R 17402784 3' + invader4 293 2 59.41 CTATTAGATACCAGTTACTCAGGTAGTGGGAGTGCACGGGAGGTGTCTATATTTCCTATTATTGATTATATTCATATATAAGTTGTTGTCGTTTCCCGTTG:1 + chr3R 3624114 3' - INE-1 547 1 56.44 CAGTGTACCCTCGATATATGCGCATACTACAAAACAATGCATTATGGCAGACCAGAAATAAAAAAAAAACAAAAGAGAATTCATTGTGGCTTAATGCACAG:1 - chr2L 2622683 3' - blood 10 2 60.40 GTAAAGACCTTCTACTTTAATATTGCTTGCGCAATTTTGCCCGTAATCTTTTTTGTCTCGGGAATTAGGAAGAGAATGAAGACAAAGGCGGCCACCGCAAA:1 + chr2R 10085709 3' - Transib5 278 1 57.43 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTTATTTTTATCAGCGCCCTGCTTACGGCCGCATTCAAAAATAAATCCCTCTCATAAAGTGCTGATGATTTTC:1 + chrX 2912065 3' + pogo 2099 1 77.23 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGGGGTGGCAAAAGCTGGATGACAGGCCCCA:1 - chrX 13880920 3' - BS 5025 1 71.29 ATATAACAAAACCGAAGATCTCGAAATGGTAAATGATGACAGCGAGGAAACAAACGATTTGTGTTTAATTGGGGAAGAAAAATGCTCTTCTATTAAAGGAA:1 + chr2R 4915435 3' + G4 103 1 65.35 AGCCTTAAGGGCACTCAATAACGGAGAGACGTTCTCCCATCGTATCTTCTAATTCTGAGGAGAAGAGGTATGCGGTGGCAATTGGTGAGCCAGGGAGGCGG:1 + chr2R 22497938 3' + gypsy6 7671 2 72.28 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGT:1 + chr3L 13739659 3' - BS 5009 1 62.38 CCAGAATGCACGCCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGTGCCCGTGCGAGCTAGCTGGG:1 + chr3R 25007137 3' + copia 4784 1 77.23 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGAAAATAGTCATCCCCAGCCCCTC:1 - chr3L 6399515 3' - roo 8716 2 78.22 GATATTTTTGTTATTTGATTCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGATCCTTGAAACTCCGCTCGCACTGCTTCAGAT:1 - chr3L 22605818 3' - 17.6 91 2 66.34 TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATTTACTAAAATGATAATTTATACAATTCTTGTTTCTAACAAAATTTGCTTTCATTAAATAGAT:1 - chr3R 12101037 3' + Burdock 6356 2 63.37 TTATATTCATTTCCTTGTTTCTGTTCTGTTTTCTATCTATCTTTTTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTTCAAGGCTTAAGTTTTTGGTTGTAAGTT:1 - chr3L 15074117 3' + Cr1a 4333 1 74.26 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCGCAGCAACACTCGATGAGCATCTGACGAAGTGTTGCCAGGTGATACA:1 + chr2L 13549326 3' + P-element 2862 1 52.48 GTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCCCAAAGTTGAACAAATTTGAAGAGAGTGCTCGCTTCGTTGAAAAAATTCTATACAGATTAACG:1 - chrX 19814470 3' + INE-1 568 1 68.32 CACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAAAAACGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAA:1 - chr3R 3922958 3' - Cr1a 51 1 63.44 TCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGTGAACATGCTAGGAATGCCAACGATTAGATACGGGAAATTCATACGACAGTCAAATAAACGCGGACTGCAG:1 + chr2R 19651366 3' - flea 4934 1 73.27 GTGCATATGTATGTATGTATGTACGATCCTAGCGCACAAATAGTTTAAAGTTTAAAATCCTAAACAAATAGTTTAAACTGTGCGCACACACAATGAGTCTA:1 - chrX 19607804 3' - 1731 78 2 65.35 GACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCCACCGTATCCACTGGTCCTCGATAGTACAAGATAATGCTGGATATCTCATAGGTGGCAATAATAGTATTGC:1 - chr3L 8348519 3' + opus 7037 4 76.24 TTGCTCATCTCCCATGCGANTGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCGCAAAGTATAGTGGGAAAATGAGAGCAAGCCAAAGAAAAGTTCGC:1 + chr2L 9045848 3' - jockey 7 1 78.22 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGATGCCAGGTAACAAGAATTTCAGTCTTGATTAAAGCACCAACATTATTAACG:1 - chrX 18050574 3' - 412 24 2 55.45 CAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGAAAAATCTGAAAAGAGTGCTGGTGGTGGCTGAACAGAACAGGTTGAAATTGAAATTTGAATATAGAG:1 + chr4 590365 3' - G4 3498 1 69.31 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATGCCTTAACATTTACCTTGTTGGCCCGAAGTTGTCCACCAAACATT:1 + chr2L 16548232 3' - P-element 29 1 50.50 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACTTAACAATTTGTTGCAATTTGTTTATTAAAGTATTTTTATCATATATTTTGCATAGTAATAT:1 - chr2R 16453489 3' - roo 11 2 56.44 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCGGATTGGGGGGCTATCAAGTTGCCTGTGAAGTGCTTATCCTCAAATCAGTGACACTTGAATGT:1 - chr2L 17049893 3' - hobo 13 1 67.33 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTGACAAGTATCGCACAAAACATTAACTCAAAATGCAACCACCAAGATTCTATC:1 + chrX 10326476 3' + P-element 2868 1 56.44 CCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGACTGCTTGTGGTTGAGTTCTGGTAACTGGTCTGCGAGGACTGTGTTGACGTTTGG:1 + chr3R 17159245 3' - Q-element 257 2 59.41 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAACACACATTCATACGTATATAGCGCGCTCGGCAGCAGGTTTAGCTGGTTGTGTGAGTATGTGTGCAG:1 - chr3L 17135957 3' + BS 5081 1 64.36 TCAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAGGAAGAAAATATGGAAAAAATACAAAAAGGTTGTTGGCAACATGTGTTTTTGGATATGTTTTTATCAGATTTCCC:1 + chrX 9760776 3' + R2-element 3584 2 70.30 TGTGTTCTTAGTCTGTCTANATATTTTTTAATATGTTTTTCTATTTCTTCTTTGAAATAAGGGATTCCTAAGACTTTATCTGCTGCTCCTACTATCTTACT:1 + chr3R 1850451 3' - G4 3613 1 75.25 CTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTACATATATATATGGGGCTGCTTTTACTTTCAACTCGATTTGCATAATTTTATTTGTTTTCATTTGC:1 + chrX 4235904 3' - Quasimodo 4 2 74.26 AAACTATTAAATTATGAATATATTAGCGTATCCTTGCACTGGGCCGCTTCTTAGTTCAGAATCTTTGTTTTCTATCATATGTGTAATTCCTTATTTTTTCC:1 + chr2R 1422518 3' + Porto1 4554 1 50.50 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGCCTATTTTATTTGATGAGGGATTGAGTTGCCTTGGCGATCGTTTTCAAGGTATCCAATTTATTCTGTCAAAATA:1 - chr3R 5122226 3' - Doc 4 1 75.25 TTGTGCAAAGTACTCGAGGNAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCATATATATCTGCTGATAAGCACAGAAATATACCCACTTTTTAAATATATTCACCC:1 + chr2R 7775538 3' + pogo 2083 1 55.45 TGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATCAAGACAACTGCTTTCAAATTTAAGCTTTATTATCGTTATCAGATTA:1 + chr2L 22108267 3' + Bari1 1679 1 51.49 TTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGAAGGACACAGATTAATTACGAATTTAAGCCCTAAAGTATTCATTTCAAATAATCCAGCCATCTAGCATT:1 + chr3R 31458480 3' - jockey 344 1 64.36 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCAGCATTAATAAATTTGTGTACTTTTTGTGTA:1 - chr3L 18635305 3' - copia 4915 2 72.28 ACTAAAATACTTCAAATTTNCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTGAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGCCATGGACAGAGTCACCTTCTTTCCATT:1 + chr2L 18239471 3' + hopper 1361 1 67.33 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAGTTTTGATATATATTAACAGAGTTTGCGTTGCTCAAGAGGGCGGAATTTAGTTCGTATTGATAA:1 - chr3R 10718034 3' - Juan 4038 1 65.35 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCCGGAGTCCTAGAGGAATGCATGACGCACATGGGGGGTCAGAGGGAGATAGACTGCTGTT:1 + chr2R 16129153 3' + transib2 2810 1 39.60 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTTTACATATATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTCCTAGTAATTTT:2 + chr2L 14979236 3' - Ivk 24 1 54.46 GAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGT:1 - chr3R 20001645 3' + FB 53 1 47.52 GGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATCAATTTCATTGTAAGAAATAAATTGACCATTTCATGGTTATAAAACCACA:1 - chrX 4349840 3' - G2 2951 1 78.22 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCATTTTTAACATGT:1 - chrX 9439162 3' - roo 8698 2 64.36 GGAATATCTCCCAAGGTTGNGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAGATCCAACAAAAGCACATTAAACAAAGAAACACATGCTGCT:1 - chr2L 19140283 3' - McClintock 6136 2 58.42 CACTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTCGTTCGACTTTCAGTCCGTTTATCGTCTGCTGTGGTGCAGCCCTGGTTTGCCACGTAAATGAA:1 + chr3L 7220022 3' + Cr1a 354 1 67.33 CTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCTTGAATTGTGATTGGATTCAAAAACACAAATTCGTAATAAAAATGCCTGCAA:1 - chr2L 1697221 3' - accord 7371 2 55.45 TATTTTGGATCAATTGGCANCATGTAGGAATTTCTTCTTTTGCATTATTCTAGTGTCTTTGCTTCTACTATCATCATCACCATTCATTCCATACCTGAGCG:1 + chr3R 22733393 3' + 1360 262 1 66.34 TAAAAACAAAAAAAAAGAAATTAGTACGAATGCGAGAGCTGGCCTTTTATTAACCTTCTCGCAATGGGTTCGCACTATCCACAAATATGAGCTCTTTCACT:1 - chr2L 5598754 3' - Tc3 88 1 64.36 AACAAACGAAATCTAATTCAAAACCAGTACAAATACTCCAAACCATGGCTGCCTCGTACGGCGGTGGAGCTGGTGCTGCCTATGGAGGTGGTGCTGGAGCT:1 - chrX 17230646 3' - accord2 7244 1 53.47 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAGCTTGCTGAAAAGACTTTCTGTCTGCTGTTTGTTTTGTTTGCTCATTAAC:1 + chr2R 7635424 3' - jockey 33 1 54.46 ATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATACGCTTATCCAATATTTTTCAACTGGTATGTCTGTGAATCATGCAAATTTTAGACCAGCCT:1 + chr3R 23162289 3' - Stalker2 372 2 63.37 TAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATAAATCCGGAGATTAAGTTTTGGTTTTTTAT:1 - chr2R 20072977 3' + 1731 4181 1 70.30 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACTCATAACCCAAAAAAAAGGGAAACAATTTGATGGTTTTTGTGGCCAAGTTGGTTCGCCAGCTCATG:1 + chr2R 23111406 3' + hopper 1409 2 72.28 GAAAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCAACCGGCAGACCCGACGCCACAAAAGGCAGAC:1 + chr2R 21126608 3' - Cr1a 291 1 66.33 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGNTTCTTAACTTATATGTATATATTATAGTGAAGTGCATCTGCTAGATGCAAATTGCGTATACTGAATATTTTATGTGCCAAT:1 - chr2R 16639630 3' - opus 8 2 71.29 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGGG:1 + chrX 19887152 3' + P-element 2866 1 59.41 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAATCTGGAAACTTATGCAAATCACTTCGAGGAGGATG:1 - chr3R 5722133 3' - Tirant 38 2 63.37 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACG:1 - chr3R 6171147 3' + 297 354 2 82.18 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTTATTTGCTCATTCGCAAATGAAGGC:1 - chr3R 24464785 3' - 412 28 2 52.48 GAGAGAGAGAGAGAGAGCGGATGAAAGAGACCGACCATATTCTATGGGATACACCATATGGGAGGGGGGCGGTGTCTTGAATAAGGCGTTGGGTTCAAAGG:1 + chrX 12090658 3' - blood 7175 2 68.32 CAGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATGATGACTTTGTTTCCCTGAAGGCGACATATCAGAATCT:1 - chr3L 9697960 3' + 412 7509 2 59.41 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTTTACATATATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTCCTAGTAATTTTA:1 + chr2L 14979237 3' - Ivk 23 1 54.46 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTGTCCTACTATAAGCGTTTTTCTTGGTG:1 + chr3L 11763238 3' + pogo 2057 1 74.26 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGATAAAATATACTGGAACCTCCTTGTTA:1 + chr2L 12485489 3' + roo 400 1 69.31 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTAT:2 - chr3L 2029713 3' + roo 9019 2 74.26 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAG:1 - chr3L 2016881 3' - Tabor 42 2 63.37 TAAAAACCACGGCTGGTTTTGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAAT:1 - chr3R 3922957 3' - Cr1a 58 1 60.40 AGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGCACGTTCGTTGGTACTGAGCGATAAAGAG:1 + chr3R 16078685 3' - Ivk 5063 1 81.25 TATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACGCTCAAAACATGGGTTTTTTTTTTGCCGTTTGGCGTTGTCCAAACTATGGCT:1 - chr3R 18451415 3' - copia 179 2 54.46 ATTTGACTAAATATGTCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATATATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCCATTATATTATATTATTATTTAA:1 + chr2L 13979642 3' + 1360 209 1 78.22 ACCTGGGCAGCAACTAACTNAGAGTAGAGAAAGGAGGACCACCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAAC:1 - chr2R 12185353 3' + accord 7338 2 73.40 GACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACGCGCATAGTCGCACACACACGTACATAATTACAAATCGCTG:1 - chr3R 29628562 3' + gypsy4 6745 2 72.28 AAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACTCCGGCATGACACCGGCACCGTCGCTGGCCTCTCTTGAGCTCACGATATTCACTGGAACTTGTATT:1 - chr2R 5432116 3' - Cr1a 86 1 60.40 GGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGC:1 + chrX 22386763 3' - hobo 84 1 61.39 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCAGTTTTTAATTTTTCTTGACTTTTTCGCTGCTCTTGATTTGCGGCGCATTTTTCT:1 - chr3R 9094724 3' - hopper 15 1 60.00 TTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGCTGGTCTGCAGGTCGATGCCAGTTACACGTACGATGCCATGTCCGTGTCCGTATTGTTGTCCGTA:1 + chrX 14985369 3' - micropia 159 2 75.25 ATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGTAAGGGTTGAGTTCAGTTGAGTTCCCTGTCGGCCGTCAAATTAAATGAAAATTTGTGGTCG:1 - chr2L 9210761 3' + Dm88 4291 1 57.43 GCTGTTATGTTACTGTTACNGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAACACACATTCATACGTATATAGCGCGCTCGGCAGCA:1 - chr3L 17135988 3' + BS 5050 1 64.36 GACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAAGGGGCGAGTTCATACATTTGACTCA:1 + chr3L 4707163 3' + X-element 4532 1 75.25 TAGCTACAGGGCTTAGAGCTATATTTCTTTACGGCTCCTTTTCTGCTGCGCTTTTTGTCGTCCTGCTGCTGCTTTTAATTCGAGTGCATTTTCCCGTTGGA:1 - chr2R 5944398 3' - I-element 5288 1 76.24 TAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTTCTATCCAAAAATATATTCCTTTGCCGCCATAATCCTGCGGTAATCCCCAATGAAGATTCGAGTTTCAGT:1 + chr2R 18881356 3' + P-element 144 1 82.18 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTACAAAAAATAATGAAACCCATTTCGGAATTCTGG:1 - chr3L 15776979 3' - I-element 6 1 70.30 CGAGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTACCTGTTATATGTGATTGTTAAGTACTTGTGATTGACCCTTTGTAGATTGTAAAATAAACGAAG:1 - chr3R 17610862 3' + X-element 4534 1 51.49 CTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACGTGCGGACATTTTGTTTAGTTAGTCGATATCTAGCTGCGTGTATGTGCGC:1 - chrX 4339459 3' + hopper 44 1 58.00 TTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATGCACGGGGCAAGCTGCAGGCAGTTCCGACTACCC:1 + chr2L 12884378 3' + HMS-Beagle 208 2 65.35 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGCACGGAGTGAGGCCCGTAACGAATGTATGGGTTGAACGAGGATCACTGGCCTATCGTTTGGAACATCTGTAG:1 - chrY 669576 3' + blood 374 2 70.30 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTATGTAATTATTTGCAATTAGAAACCCGTCACATGCAACGCGGGTAGAAGCTTGTTGGAG:1 + chr2R 20690594 3' - mdg3 5271 2 59.41 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAACATAACGATAGATATAATGCTATATGCTGGCATTTTAAATAAAGAATAGAACTTATGATATAAGAACCC:2 - chr3L 16759684 3' + Transpac 5224 2 54.46 ATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCATCCTTTATTGTTTTCCGTGTTCAGTAGCTGTC:1 + chr3R 15512502 3' - F-element 4391 1 66.34 GTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATGTCATCGTAACAACCATTTTTCAAAAGGTGAAAAGCTGTTTTTTGTTGTAAACAAAATGGTACATCAAAGTAAA:1 + chr2R 18553905 3' + jockey 4983 1 63.37 CGCTACAGCAAATAGCTCTTTTCTACGCTAGCAGACAACTGTACGTGTGCACACGTATGCTCATTTTGTGTACTTTAAACTAGGTTGGCCACCTCTGATCC:1 - chr2R 23503653 3' + 1360 127 1 63.37 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCA:1 + chr2L 19907974 3' - Tirant 25 2 55.10 AACGTTTGGGGGGAATTTTTGCCAATGCATCCTGCACAACTTGCCAAATCTGAGCCTTTTTCTCATCTCGACTTGGAGCAGCAGCTGGAATTACTTTTGTT:1 - chr3R 15809437 3' - HB 1252 1 57.43 CTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTGTCAGTCTGTCCAAATGTCTGCTGTGCCAATGGTCTTTTAGTTATGGTGTCGTTAAA:1 + chr3L 27720114 3' - G2 2621 1 67.33 AAAATTCAAATTCAAATTCAAATTCAAAGAATCGCTTGCCTACTTTTAGGCCAATTAACATTTATATACTTATTGATGATTGATTTCATTCGTTTTTTTAA:1 + chr3R 21917769 3' + Rt1a 308 3 78.22 AATAATAATCAAACCACCTCCATTTCTGTAAGTGCACTAGCTTAGCACCGAAGGACATCGCGCTATGCATTTTGAGCAGCTATTCGCTCAAGTAGTTGCTG:1 + chr3L 14874651 3' + Juan 319 1 79.21 TGTGTGTAAGAGAGAGAGAGAGTGGGGCATGTGTGAGATGGTGCAAGTCAATAAAGCATAATGTGAGCACGTTTTTAATTGGCGCCCGCTGAAAGC:1 - chr3R 10423863 3' - blood 173 2 72.92 TCTTTTTTTTTTTCTCTTTCCTTTGGAATCATGCCCTTTGCCTCAACTGGCGACCATTTCGCGAAGATTTTTTTTTGACACTCGCGCAAGTTTGTCAAGTG:1 - chr2L 10114366 3' - Doc2-element 242 1 75.25 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGTTCAAGCTGAAACTGAGGCAAACAAGTGGAAACT:1 - chr3L 20148243 3' + pogo 2061 1 68.32 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGTATTAAACTTTCACTATCTGGCTTTGCAGCACTAATTGAATTTTTT:1 + chrX 1716703 3' + hobo 2919 1 53.41 CGATTCCAGCTTTCAAATTNCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTCTCAATGCCACAGGTTGCCTTTGTTACTATCACCTACATAAA:1 - chrX 9351926 3' - FB 37 1 63.37 ACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTCCAACGGGGGAGGATGTTGATGCGACTGCTGCTGCGAGTCCATTGGCCCTCATGCTGTTTACTTGCACCACTTTTTGTTG:1 - chr2R 22156789 3' + diver2 4497 1 67.33 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTG:1 - chr3L 25059076 3' - mdg1 33 2 59.41 CGCGCATCCAGCGCCTGCAACATAGACCCAGACAATTAACCCATGACAGACTGCAGCACATCGCATCACACCGACGTCGATTAACATCTTAAAGGCATATG:1 - chrX 2655632 3' + HeT-A 5650 1 73.27 AAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCCAAGAGGTGGAAAAATTGGCAAAGGCCACAAAGTACAGCACAACACTTTCCG:1 + chr2R 2738128 3' + gtwin 402 2 55.45 TAGAACTTGCTATTCGTAGNTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCTGACCCATTCATTACCATAAAAAGCGGAGGGGGCTAAT:1 + chr3R 11941233 3' - Doc 46 1 59.41 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCATGGGAAAACCGGCAAACAGAAA:1 + chr2R 11699338 3' + roo 386 2 54.46 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTGGCAACGACAAAATAGCCGCATGCTGTCAATC:1 + chr3L 15745405 3' + hopper 1377 1 64.36 ACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGCATATTATGCATATCAGTCCCTCCGCCCTTTAAACTAAAAG:1 + chr2R 6527786 3' + baggins 5192 1 77.23 ATAAGCGGACTTTATTTTCCAGAGTATTTGCAGTTGATGCTGGCGTTGTTGACGTTGTTGCTCTGCCAGTTGGTCTTTTTGCTTTTGTTGCTCCAGAATAA:1 - chr3L 8636507 3' - G4 3384 1 80.20 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTTATTTTTATCAGCGCCCTGCTTACGGCCGCATTCAAAAATAA:1 + chrX 2912036 3' + pogo 2071 1 62.00 GTATGTTATATGTTTTTGTNTAGTTGTATCGTGTTTAAAGTATTGAATACACTAAAGAACTTTGCTCAGTGTAGCCACTCACACATGCACCACCGCATCGC:1 + chr3L 16480663 3' + transib1 322 1 75.25 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCGCCTTTTATTTTTAGCCACGCCAAAGCTGAGGCAACCAAATTGCTTTTGAAAAGCAT:1 - chr2L 12800944 3' - hobo 18 1 61.39 AAACGTTTTATATTGGAATTATTGGAAAAATTAAAGTACTAAAGTCTAAAATGACGCCTCGCCCGCACACAAAGAAAGCCTTATCATTAAAA:1 - chr2L 8220486 3' - FB 482 1 52.17 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCGTCTTTTCCCCCAGTGTACGCGTAGTCATTGTTCTCGTTGTTGTTCTTTTTGGCTCGAAGTGTTGTT:1 - chr3R 29174609 3' + 1360 3182 1 72.28 TTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTGATTATCTTAATTGCTTAATTTGTGTAGAAAAAAATTACTAAATTGCTTAGTT:1 - chr3R 5993266 3' - Tabor 23 2 56.44 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAAC:1 - chr2R 15160313 3' - Tirant 34 2 65.91 TCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAACCTGTCCAAAAGTGTTTTTGAAGAACCGCTTAAGCATAAGCAAAAAAAGAAA:1 + chr2L 16780357 3' + Ivk 4953 1 57.43 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCGCTTTTATTGAAAAGTATCTTTCGTGGTGCAAAGA:1 + chr2L 7161362 3' - pogo 39 1 66.34 AAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTA:1 - chr3L 27415201 3' + transib2 2821 1 76.24 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAG:1 + chrX 19607294 3' - Tirant 8151 2 67.33 AAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTACAAATCTTGTATGCCTGGGATCTTATCTTGAATGACTCGATTAAG:1 + chr2R 5031788 3' - Doc3-element 4641 1 60.40 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCACGTGTATGTGTGTGTGTGGGAGAGAGGCAGAACGCCGAAGTTAGTAAATTCTCTCCACTTCTCTGTGTTTGTGCAT:1 - chr3L 7156305 3' - Tirant 8107 1 73.27 AAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGCACCGTGAAGTCCACCACAGAACGTCGC:1 - chr2L 5557347 3' + invader2 274 1 77.23 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATAAATTTGACCAAGCTTTTGCTTGCACTAAGCTTTTTAA:1 - chr3L 16058687 3' - FB 39 1 65.35 GGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGAGTTGCCTCGCATATTCTGTGACGTGTATGG:1 - chrX 22382256 3' + opus 459 2 70.30 AATTAAATTGTAAATAAATATAAAATATTGAAAATATGTTTTCCCATTTCATTTCTCTCAGTGTTTCTTCTGACCAGGTTAATTGTGGAATTAGAAGTTAC:1 + chr2L 9554680 3' + I-element 5269 1 89.11 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTTCGCCATGGCTTTAATTGCAGCTGATGC:1 + chr2R 13745781 3' - hopper 14 1 64.21 CTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAGCAGTCAACTCAATTAGCTAAACAAAATAATTCAAAATTGTCT:1 - chr2L 8626815 3' + Doc 488 1 63.37 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCCCTTTTCTTGGGTCATTTAGATGGCCGGTCTAAGGAGCGTA:1 + chr2R 18204506 3' - roo 8699 2 62.38 AATAGCTGTTGCGAATAAAAAATAGAACTCGATTTAGTTATCTTTTTAACAGTACACTTATTGGCTAATTGCACGTCAGCTAGTGCCTCTTGGAAAGATCG:1 - chr2L 22215761 3' - diver2 342 2 77.23 GCAGTTTTGGGCGGTTTTATGGCGATAGAGTGGGAGTGGCAAAAAATTGTTTGGCAAATCGATAGAAATTTGTAAATTTCCAAATGGCCTTTAAATTCATT:1 + chr3R 22793524 3' - INE-1 348 1 70.30 TTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATCTATTCGATGTTCATTTGTTCGCACTAGCTGGTATACACAT:1 + chr2R 13057729 3' - roo 9022 2 72.28 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTTAAGTCTAATCTAATTGACGTGGAAACTACCGCATGCCAGAGTGCCACAAAAGGTTCGATCTGCGCTT:1 - chr2L 17003942 3' - F-element 23 1 57.43 AGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTT:1 - chr3L 23797690 3' - Helena 1150 1 43.56 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCT:1 - chr2L 11832534 3' + roo 9036 1 57.43 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTTTTGAACTCCTATCTAATTTTGCATATTT:1 - chrX 11624369 3' - roo 45 2 71.29 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAAAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTT:1 + chr3L 13739644 3' - BS 5024 1 52.48 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGTAAAGGTCTTGCCAGCAAACTAAGAAGAATACTAACACATTAATTAGTATA:1 - chr2L 3985078 3' - roo 22 2 51.49 TTGTGAAAAAAACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTATGGGTACAACTGCCCTGCCCAGCTCTGCGGACTGCAACTGCTAT:1 - chr2L 6175650 3' + hopper 1386 1 51.49 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTC:1 + chr3L 25345139 3' - Doc 58 1 75.25 TCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGACTTCCCAGGTCTGTCCACCTTTTCCGATTTCTCCTCCGTGGGACTGTCCAGCTCCTTTTCTATCACAGCTA:1 + chr3R 8295338 3' - Doc 4439 1 74.26 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCGCTTTTATTGAAAAGTATCTTTCGTGGTGCAAAGAACCTTTTC:1 + chr2L 7161370 3' - pogo 31 1 58.42 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAG:1 + chr2R 20441286 3' - I-element 41 1 63.37 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCATTGAGTTGAGTCGGCTGCATTTCAAATGCGAGTGCATAATGCACTAATTAGGCGGGCGTTAAGTATACG:1 + chr2L 13310331 3' - mdg3 5260 1 67.33 GGGACCACCTTATGTTATTNCATCATGCTGCACACTGTCACTAAGCACTTCCGTTTCCGTTTTGTTTTGGCGCTGGTTTCATTTCTGTTGACTACTTTTTG:1 - chr3R 23803807 3' + P-element 2881 2 73.27 GAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCCCTCTCTAATTCACACTTTTCTCATTAGCCACACAATCGTTTAAATGCTATT:1 - chrX 19161446 3' - P-element 274 1 55.45 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAACTTAGGCAATAATTTTCTGTGAGTGCAGGCAATAGATCTTTG:1 - chr3R 23445570 3' + copia 223 1 62.38 TAGGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATGTATGTTAGGGTCAGGTTCAT:1 + chr2L 6170179 3' + invader3 5446 2 61.39 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTCGAGTGCCTGAAAGTATGCAAGCCAT:1 + chr3R 20154808 3' - jockey 32 1 53.47 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCAAAGCCGTTTCAGCTGTTTGTTGTGTGCACTAAAAATTG:1 + chr3R 26498594 3' - roo 27 2 53.47 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGCACATGGCATAGCGTATTCATAATGTGTTGTATACATCTAGTGGTTAGTTCTGTGTTTAGCTGCGATTTT:1 - chr3R 20381071 3' - jockey 13 1 72.73 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAAACCAAGCCGCCCAGCTGGACACCAGTTATAACCTCAGAATACATAATTATAA:1 + chrX 18041174 3' - 297 6584 2 45.54 GAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATC:1 - chrX 21087585 3' - mdg3 5282 2 54.46 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAATACGCACTTTATGTATGTGTAGATATCGGTGTAGTTATGTGAGTATGTGTGTATGAGTGTCGAGCTATGC:1 - chrX 1716611 3' - hobo 5 1 75.25 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGGTTATCTCTTC:1 + chr3R 20425425 3' + roo 9051 2 58.42 ATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTAAAACAAAACTCGGCCCTCTGGCATCTGAGCACTA:1 + chr3R 27407119 3' + Bica 188 1 73.27 TCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGAG:1 - chr3R 4976299 3' - blood 7180 2 87.50 AGTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAA:1 + chr3R 2689420 3' + diver2 4465 1 55.45 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGATGGCATGGCTGAATAACAATAATTGCTTAAATAAACACCACGACAAATGCAC:1 - chr3L 10161727 3' - Doc 27 1 55.00 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACAAGCTACTTATTTTGTATATTAAGTTACTGAAGTGTATTGC:1 - chr3R 29238528 3' - 412 7090 2 60.40 TGGCTGCTTTGCGCGCAAANTTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGTGTTTTGGAGAGCGTTGCTGAAGGGGACAAGGTGC:1 + chr3L 24150302 3' - hopper 1225 1 64.36 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTTTATTCCGTGCTGAGTCATTCAGATATCACGCAGCGCTTCAATTGA:1 - chrX 19607229 3' + Tirant 8490 2 58.89 ATTTGTGGCAAATTACATTTTCGGATTTCTTGGCCGCAGATATGCGCGCCATACTTACAAGTATTAATCTATGTTTTTAATGGCGTTCATTACTTGCGCTT:1 - chr3R 26198233 3' - TART-A 13319 1 76.24 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCACTGCCTCATCGGGTATAT:1 - chr2L 9053394 3' + flea 5000 2 60.40 ACAAATGTTTTTTTTTTATTTTGTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 3049945 3' - HMS-Beagle2 494 1 78.38 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATTATGAGCGCAGTCACACATGCACATA:1 + chr3R 26292588 3' - jockey 62 1 72.28 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTAAATATTTAAATAGCCGCGCGGTGGGAATCGGAGGTTTCTCTTTTTTCCTTTATTTTTGTTTT:1 - chrX 4533836 3' - roo 11 2 63.37 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAA:1 - chr2R 15160315 3' - Tirant 8156 2 72.28 TAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTCTTTGTCGCTTCTGGTGGCATTGTTAAGAGCGCGTTTGGAAATCTA:1 - chr3R 8206908 3' - I-element 244 1 57.43 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAAT:2 + chr3L 27357639 3' - mdg1 7052 2 65.35 TAAGTTTGTTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTGTTGCATAGAAACATTGGACATTGGATATTTTATGAACTAGAGAGCTTCCAATTGAGTATAGTTCTGAG:1 - chr3R 24343356 3' - gypsy7 5017 1 73.27 AGCTTGCTATGGTATTTTCCTTAAGTTCCGTTTGTTGCTTATTTTTTTTTGCCTTTTATTAGTTTTCCTCGTATTTTTTTGTGAAAACGCGGAAACACCTT:1 + chr3R 12079784 3' - F-element 4440 1 73.27 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTGATTCGATTTGGCAAGCACTG:1 - chr3L 8749969 3' - Doc 40 1 62.00 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCTAGGTGATTGCAGGCAGCCGCAAAG:1 + chrX 15183792 3' - hobo 50 1 74.26 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCG:1 + chr3L 27415297 3' - transib2 34 1 58.42 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCAAATTTTGTGACGAAATATGACAACACATTCTATTAAAA:1 - chr3R 4712688 3' - pogo 34 1 64.36 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAAATGAA:1 + chr2L 16016267 3' - I-element 23 1 54.46 AATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAATATGGAGCCACAGCCATTGACATTCACAGCACACTCCACTGTCCGCTGT:1 + chr3L 1589779 3' + Doc3-element 4507 1 63.37 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTGGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCGAATTTGGGGATGAATTAATTTCAGCTAGCGCCCTGCTGA:1 + chr3R 8481965 3' - jockey 75 1 67.33 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCAAAGCCGTTTCAGCTGTTTGTTGTGTGCACTAAAAATTGAATTGAACTGCAAATGC:1 + chr3R 26498611 3' - roo 8674 2 70.30 AGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAGTATTTTACATTTTGC:1 - chr3L 14878643 3' - Juan 33 1 58.42 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGTCTACACTTTTTTCCAAGT:1 + chr3L 13704566 3' + opus 7474 2 58.42 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGTGGTTGAAGTGGTTGAAGTTTTATTAATTAATTGTGTGTGTTG:1 - chrX 354937 3' - I-element 54 1 69.31 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGCATGTATTTTAACCTGTGCTGAA:1 + chr2R 15794744 3' + pogo 2050 1 79.21 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAAAATATGGGGAAGAGATCAAGTGCTAAGC:1 - chr3L 13704501 3' - opus 155 4 74.26 ATTTTTGGGCGATGTTCTGGACCCAAACTGTAGACGCCAGTTTGTCGACCGCCCAAATGTCGCAGCATACTTTTCGGCGTACGCTGTTAAACTATTACAGT:2 + chrX 14961115 3' - jockey 4631 1 79.21 CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCTGTTGCGTGAGTGCTCTCA:1 - chr2R 23111331 3' + hopper2 1555 1 75.25 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGG:1 + chr3R 20432442 3' - roo 8718 2 81.44 GTTAGTAAACAACTGAAAATACTCACAAGCAATACATTTGACAATTCAACAACAACCATTGGATTAAAAATAAACAAAGACCTATTCTATTTTCCTATCTT:1 + chr2R 3122926 3' - transib4 369 1 55.45 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATGCAGAATGCACGCATGGACTGTCAACACTTTGAACTGTTGCACCCGAGCTCCCATTTC:1 - chr3L 18738180 3' + Quasimodo 7357 2 70.30 TGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGTTTCGGTTGTAGAAGACTAGAGCTTTTTAAACGAAAATATTAGC:1 + chr3L 13142075 3' - F-element 407 1 57.43 TGTTGCCCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAATTT:1 - chr3R 4576771 3' - Tc3 1330 1 74.26 ATGGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATTTCAGGAACTAAATAAGTAAATATGGTCGAGAATTGTATAGTTCATGAATGATATTGTTAATCGC:1 - chr3R 4638044 3' + INE-1 117 1 53.47 AAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCCAGGCATCGAAGCTGAAGTGCTTATATACGCCACTGTTTGAGAAAGGTT:1 - chr3L 13059679 3' - transib2 24 1 55.45 ACTCAACGAGTAAAGTCTTGTTATTTGGGATTTTACAGTGTTTTTCGATTCCTTTCTTGCATAACTTTAAGTAGAATATTTCGAGATATGGTGAAATATAT:1 - chr3R 27199757 3' + roo 393 1 56.44 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTATGTACATAGGCATGTATACATTGTCTTGGCTT:1 + chrX 19384050 3' - pogo 37 1 65.66 CTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTCATATTCTTATAATTTGCTTAAAGACACTTGTTCGATGGCAGCTGTCAACAGTGGGAGT:1 + chr3L 17533071 3' - Idefix 345 2 58.42 TAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGCCTTTAAACGATTTGCGTTCAATCTTTCACACGCTGACAATTTATTTTTTTGCTTACATCTCTGCCTCTC:1 + chr2R 17660200 3' - G2 2925 1 75.25 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGGTGCCACGCCTTCTCACGGACACAAATGCACACTTAGTGGGAGG:1 - chr2R 13316128 3' + hopper 1386 1 53.54 CTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGACGTTGATAATGAGCAAAATGAAGGACAAGAAGCTGCTG:1 - chr3L 75141 3' - micropia 5131 2 62.38 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCCGTGTTGAGCAGAAAACGCACGTTGTTGAGCAGTGAGGTCTTTTT:1 + chr3R 5360023 3' + 412 486 2 71.29 TTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAAATAGTCATTAATAGTTAAATGTCTCCCATACTTTCTGTGCGAAATTATGGCCATCTAG:1 + chr3L 25624731 3' - invader2 459 1 74.26 CGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGTTTTGGATGATCCCAATCAACTTTTGATGACGACATTGGTCCGTTC:1 + chr2R 1246548 3' - gypsy4 6502 1 69.31 CAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAAAAAAAAACAAAACAAAACACGGCGAAAAAGGTAAATAAACGCACGAAACGCCGACGAAGGG:1 - chrX 17107645 3' + HMS-Beagle 6624 1 66.34 GCGGAGCTGATGGAGTTGTCAGACGCGCTAAGGTGCGAGTGAACGAAAACGGCCTATCTAGGACAATGATGCGACCCCATTGCTCAGTCCCCTGGAGATAA:1 + chr3L 3646132 3' + aurora-element 3913 1 75.25 TGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTA:1 + chr3L 17136041 3' - BS 20 1 52.00 TACTACGTGGCTGTGTGCCTGCCGCCTAGTGGCTGGGTTTGGTTACTAAGTGGATGCGCAATATCTAGAGTGGGCAAAACAAAAAAAGAACACTTCAGATG:1 - chr2R 14810102 3' - Tom1 144 1 68.32 AAACAATAATAATAAACAANCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAGTGG:1 + chr2L 20290319 3' + flea 250 2 73.27 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATTTACTAAAATGATAATTTATACAATTCTTGTTTCTAACAAAATTTGCTTTCATTAAATA:1 - chr3R 12101040 3' + Burdock 6353 2 66.34 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATG:1 + chr2R 5237870 3' - Doc 62 1 53.00 AATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCCACGGAAGTATGC:1 - chrX 9816228 3' - BS 4990 1 76.24 TACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCTGTCATTAAAATAATGCACATACATCTGAAGTATGTGGGCAGAAAC:1 + chr3L 10282839 3' - Doc 471 1 54.46 TGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTTCGATGAGGCCGAACAGGCCTGGGTTTGGGAATATCCGCTCGAGGATGGCGCCAAAC:1 + chr3L 11649291 3' - F-element 335 1 60.40 ACATTCTAGCTTTTATAGTTCCTGATATCGAGGCGTTCACACGGACAGGACAGACAAAAATAAAAAAAATCACTTGGCAATGTCAATTTCAATGTCA:1 - chr3R 9879368 3' - INE-1 157 1 56.70 ATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTA:1 - chr2L 21369854 3' - rover 6984 2 62.38 CTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAACGCATCCATACACAGCAGCTCCTCGGGCGGCTTTTCA:1 - chr2R 22695267 3' - opus 277 2 71.29 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATAAGCTGCTTTCACCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGC:1 + chr3R 29432828 3' + Transpac 5203 2 58.42 GGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAAAGGCTGCGTGGCAAAGTCTTGGCAAGGAAGTTGAAGAAAAAAATTGGCATTGGGCAGGTATACATATA:1 - chr2R 10608363 3' + Bica 282 1 77.23 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTTTATTTTGCGTTACGCTGCTGGGGCAATTTTTATTTCCACT:1 - chr2L 897584 3' + roo 9039 1 63.37 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTT:1 - chr2R 20520211 3' - Max-element 43 2 66.34 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACGCAGATTTTTCATCAATCATTTTGCTTGACTACGCCTAGTTCACATTTTAGGGCAT:1 - chr2L 9884257 3' - hobo 14 1 64.65 ATTAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAATTTGCCGGTAAAACAACAACAACAACAACAACAGTGAGCAACAACTCTTATTGAATTAACTTAATTTGTCTGG:1 - chrX 3389615 3' + Doc 4701 2 70.30 TCATCTATTCATCCTCACANATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTAT:1 - chr2R 4260434 3' - micropia 5135 2 81.19 TAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGTGTATCTTCATGTTTCGCGAAAACAAAAAAGGGTTTTCGAAACTCCCGACG:1 - chr2R 17402687 3' - invader4 4 2 75.25 AGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGATCTTACTTTTTCTGCCGCAGCAGAGAAAAACCTTACCATGGGCCTGTGGAGCGTGCCGATCACTACTCTAAAG:1 - chr2L 22719404 3' + Gypsy12A_LTR 464 1 66.67 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTATGACAAGCGTCGGGGGTCGGGAAAAATTCTGGAATA:1 - chr3R 29413048 3' - hobo 17 1 62.38 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTGCCAGTTTTTAATTTTTCTTGACTTTTTCGCTGCTCTTGATTTGCGGCGAATTTTTCTGCGCTCGATTTC:1 - chr3R 9094712 3' + hopper 1411 2 75.25 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACTAAGCGTTAATACGTTAAAATAATGAAATGTGTT:1 + chr4 1043587 3' - Doc 53 1 66.34 GACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTAAGTCGATCCGATTGCTGCTCTTGGTGCATAGTAAAGTTTTACTAGAGCGAAGAG:1 - chr2R 11930489 3' + accord 301 2 63.83 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGACCTCGGATCGTGAGGCATTCTGGTTTAATTA:1 - chr3L 2809743 3' + pogo 2082 1 50.50 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATCAAAAATGCTGATCAAAGAGGCAAAATAATACATATTTGAGCAG:1 - chr3R 22520880 3' - opus 140 4 61.39 GACTGACTGCCGCGCTCTGTACAGAGTGGCGAGGGGATCAGGCGATAAGTTTCTCGATAATATCTGTGTGCAGGAAGGTAAGAGTGTGCGTTATAATATAA:1 + chr3L 6440486 3' - mdg3 5409 2 58.42 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGCTGACCGAGTGTGGGCGTGGCTCC:1 - chr3L 15745340 3' - hopper 30 1 62.38 CAAGTTGGTATTGAATTGGNATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGGTAACGAGGCAAGAACATATTTTTAATGTTTTTAAGAATATATATATGATAT:1 + chr3L 18559216 3' - I-element 4990 1 58.42 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTTATTTGCTCATTCGCAAATGAAGGCC:1 - chr3R 24464784 3' - 412 7080 2 53.47 TTTTTTTTTCTTTTTTTGAATTTCTGTTCTAGGGGGCGAGGTCTGGTTTGTTTGGGGCTCGAGCAACCCAGCAATCAGAGAAGAACACCCA:1 + chr2L 16509186 3' - Doc 4700 3 92.31 GAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCACCCTTGGCCCGCTACTTTTTACCGCCAAAGGGCATTCAACCTGCGACTTTTCACTCGATTGCACTGCTATG:1 + chr2L 11757528 3' + Q-element 473 2 57.43 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATTGATTCGAAATTGAATTTCCCATTTTAGAACATTCGAAATTT:1 - chr3R 17952933 3' - copia 4902 2 58.42 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTTAATGATGCCGCCCCAGCCGGCAAAACGGAAAATGGGGAAAACCC:1 + chr3L 3475654 3' + mdg1 7429 2 53.47 GTTCCCCGACTATCAGATANCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTAGCATTC:1 - chr2R 10552681 3' - INE-1 556 1 89.11 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCGTTTTA:1 - chr3R 19589924 3' - BS 5022 1 49.50 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTGCCAGTTTTTAATTTTTCTTGACTTTTTCGCTGC:1 - chr3R 9094748 3' - hopper 40 1 65.35 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAAAGCATTTCCTAAGCTCTGCAATTTGCGTCGCCTCACCA:1 + chr2R 15160367 3' + Tirant 8471 2 61.39 GGAAACTCGACTATAGCAATCTCTGTTGTTTTCTGTAGTATTTGGGCTAGAACTGTTGCTGGAGAGCCAGTTTTTCTACACTTGGTTGGTGTTGCGATTGA:1 + chr2R 4704837 3' + INE-1 572 1 61.39 AGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGTTCTTTTCTACGCATACAGTTATAGCAGACAACTGTATGTATGCACACTAGATTAACAATTTGAATTTAAATAATCG:1 + chr3L 24934528 3' + 1360 118 1 69.31 AACCGTGTAGGGACAAAACTTTGCAGTAGCCCCTCTTGAACGCGCCACAGTATTTTCATTCGCCGCCGCCCTCTGCAGTATTTGCATTTTCTATTTTATTT:1 + chrX 7781068 3' - mariner2 101 1 65.35 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACA:1 - chr2R 15160312 3' - Tirant 46 2 69.31 AGTCGGCTTTGGCTGCAAACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATCACCACATCCCTAGCTGTCATAAATTTCTTT:1 + chr3R 779313 3' - Doc3-element 4556 1 69.31 AAACTAAGACTTTCTAGGTNAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAA:1 + chr3L 17708301 3' - jockey 4790 1 51.49 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACACGCACACGAGACGGGGATAATATGTTGCCCCATAAAGTATGCTACAAATTTTAT:1 + chr3R 24442516 3' - jockey 4689 1 58.42 CTTCAAAACAAAAAGAAAAAATCGTCATGCAACTGTGGGACTTCAGGCCGGAGCTTTCTGAGCTTTCGGAGCTGAAAAACTATAAACTAACTATAATTTAT:1 + chr2L 8601634 3' + Doc2-element 214 1 64.36 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGCGGAAAAGCGAGAGGGATAAAGTGGCAGAACGAGAGGGCGAATGTGGGTCAACTAC:1 + chr3R 9094826 3' + hopper 1406 2 66.32 GATTATTATATCATCCATATAAATATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCACAATATGTAGGCTGGAGAGAAGAGGCAGAAACCGCAATGAGCCTATATAA:1 - chr3R 908563 3' - TLD2_LTR 42 1 56.44 CTGCAGTTCCTAGCTTTCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGCTGGGGATGAAGATTAATTAGATGAATAGATTTGTAAGCAAATTAATGCCTACTTTTGG:1 + chr3L 4901106 3' - jockey 4688 1 61.39 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACGACATGACGATCCAATCCTCAAGCTGACGGGCTTTTGGGTAG:1 - chr3R 17803052 3' - Doc 42 1 57.43 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTTCTTATGGAATGTTAAGTGATTTTTTATTGAATTTTTA:1 - chr3L 22327259 3' + hopper 1410 2 74.26 GACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAAGCTTGCGAAAGTGGAGG:1 + chrX 22638512 3' - INE-1 110 1 93.44 TTTAAAAAAATGAATTTCTAAAAACCTAAGTGCTGACTCGGCTGATGTTTCTCCTGATGCTCCTGTCTCTTGCAGCTATTTGGCTAAAGGCTTTTAGGAA:1 + chr3R 11550443 3' + gypsy12 9804 2 57.00 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATAGAGAACCCTAAGCACTAGCGTCATAACCGAGAAAAATTGAACTGTAAATACACATGTACGAACGCAA:2 + chr2R 22659113 3' - 297 6583 2 76.24 AGATTATTATTATTATTGCTATAATAATTTATAGTATTGGTTCTTGGCTCTTGCAGCGATTCATTTCGTTAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTTTCACAGT:1 - chr3R 19255382 3' - mdg1 32 2 38.61 AGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTA:1 - chr2R 10552687 3' - INE-1 562 1 90.10 TCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGTTTCGGTTGTAGAAGACTAGAGCTTTTTA:1 + chr3L 13142060 3' - F-element 422 1 58.42 TAAGTTTCAGTTTGAATTTNCATTTTCCAGCACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAG:1 - chrX 22398534 3' + Gypsy6A_LTR 158 1 60.61 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAACGTGACCATTTCCAATCCGAGCAGTGCTAATTTTGGCCAGCGG:1 - chr2R 290907 3' - flea 32 2 57.43 TTTTTTCCTTTTTGTTTTTTTTATTTGGCATCCCTTCACAAACTATAATCACACAAGTACAACTCTTGTATACTGCTAGCGGAAAGGGTTGTGCGATCGTC:1 - chrX 7235860 3' - Doc2-element 229 3 65.35 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTCAATTAAAATTTTACACACGAATAAATGCAAAGCCACGCCCAGCACATTAGATTTCCCCGCTCGCTCCATC:1 - chr3R 15530024 3' - mdg3 5255 1 74.26 TGAATATGTGTGTGTGTGTGTTTTCAATTGAATTGCCTTCATCACGCGGCTCTTATCGGCTCACATTCAAGTTTTCGTAGCCGTGTGATTTTTCCAA:1 + chr2R 15407023 3' - accord 7032 2 79.38 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTGAAAGGAAGCAGGGGCAAGAGAAAGTATCAGACAGACGCGCAGCTGCGCCTGTGTGCGAGTTCAT:1 - chr3R 5803481 3' - Quasimodo 38 2 49.50 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAGGCATATAATTA:1 - chr3L 2016870 3' - Tabor 31 2 52.48 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGAAACTGGATGGATACCTACACCTACCTGGCCAGG:1 - chrX 18322574 3' - jockey 4709 1 61.70 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCACATGCCAACGAGATGGAG:1 - chr3L 6619791 3' + 412 440 2 78.00 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGTATTAATGGGAGACCGCATACCCTTCGACTCCTCAATGTAAAGC:1 - chr2L 9075566 3' - 297 24 2 60.40 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGCCACAAGAAAGAAATTGCCCCGAGAAATGGGAAAGTGGATGTGGAGGTGAGGCTGGG:1 - chrX 7762894 3' - jockey 26 1 59.00 CTGATGGACAAACTTGAAAATCAAGGTGATCCGGCTCGAAGCACCAAACTGTTGAATTCACTTTGCCGCCAAACTTGCGAAACTATATTACTCCTGAAGGA:1 + chr3R 24428016 3' - GATE 300 1 57.43 GGTATGAATAATATAGATATAACTTACTGATTTAGAACTATGTGTTCCATCCTGTAATTGTTTTTTGCATCTGTTTTAAGGTTTGATATACAAAATTTTCC:1 + chr4 904757 3' + transib3 289 1 61.39 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGCCAATCGGTGGCAATAGCCAATGGCCATGTGGAAAATTCCGAATTT:1 - chr2L 19290557 3' - roo 8693 2 57.43 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTC:1 + chrX 7970992 3' + P-element 2828 1 20.79 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACACCCACGCACAATGCGAATTTTC:1 - chr3R 13395421 3' - jockey 4811 1 75.76 GGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGGGCTCTGTTCTTTGCCATACGAGACCAACGGGAAATCCATCAAAAAATATCAAGTATGTATTT:1 + chrX 853618 3' + Doc2-element 4385 1 67.33 ATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTAT:1 + chr2R 14849018 3' - flea 4713 1 58.42 TTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAAACGTACGACTCCTCGCATGTTGTGACTGACTGCCTCGAGC:1 - chr3L 24300100 3' + G2 3028 2 61.39 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGCCATCTCGCTCTCGTCCTTTGTCCTCTGGAGTATTGC:1 + chr3R 29449808 3' + hobo 2869 1 63.00 GCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTATGCGACAATAAGACATGCG:1 + chr3R 18869839 3' + Doc2-element 398 1 80.20 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGG:2 - chrX 7970972 3' - P-element 51 1 28.71 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATGATGACTTTGTTTCCCTGAAGGCGACATATCAGAATCTGGGAA:1 - chr3L 9697955 3' + 412 7514 2 56.44 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATAC:1 + chr3R 20425410 3' + roo 9036 1 64.36 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAATCTGGAAACTTATGCAAATCACTTCGAGGAGG:1 - chr3R 5722136 3' - Tirant 8148 2 66.34 CTCTTTCTTGATTTTTTGGCAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGATCGCTCGATGTCTGCGTTTGTGTTATTCAATAGAAAAATAAATAAGTCA:1 + chrX 7322112 3' - F-element 348 1 67.33 GATTGCTCATCTCCCATGCNAATCCTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGAGATATTTATTTCTGTTTTTTGTATTGGGTTACACTAGGCTATAT:1 - chr2L 15332598 3' - jockey 9 1 75.25 GGCCGTTACGCATCTTGTTNTTCTAGTGTCTTTGCTAAAACTCTCGCATTGAAATAAAGAAAAACTCCCCAGGGATGGTCTATTGATTTGGAAATCTATTA:1 + chr2R 7185304 3' + 1360 3376 1 69.31 CGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCTTTGTATGACCAAAGCAAAGACACTTGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGAGCATCATATCGTTTTGATGC:1 - chr3R 3626139 3' + 1360 460 1 78.22 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAGGGGTTAAAACACCTGCCCCACAGT:1 - chr3R 26498499 3' + roo 9061 1 65.35 TTTTTTTTCTTTTTCTTTGTTTTTTTTTTCACCCAAATTACTCTTTGCCTGGCCCCAAAATTACGTATATGCTCGTTTGCCAATTTCTGAAAAAAATTGAA:1 - chrX 13598017 3' - gypsy7 5003 3 77.23 ACATATCCATAAGTCCCTAACACTTAAGCACATGCCTACACAATAATACACCCAACTCCTCCTCCATGACGACATCTGCATTAGTGGCCATCATCATCGCC:1 - chr2L 3917388 3' + Idefix 4 2 54.46 ACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAA:1 - chr2R 6438341 3' + Stalker4 384 1 56.44 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATGATGACTTTGTTTCCCTGAAGGCGACATATCAGAATCTGGGAATCTTAACCGACACATTTTC:1 - chr3L 9697936 3' + 412 480 2 65.35 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAACACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAA:1 - chrX 19887074 3' - P-element 31 1 50.50 TTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTT:1 - chr3R 28240017 3' + Cr1a 149 1 72.28 TCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGG:2 - chr2R 6482690 3' + gtwin 421 2 78.22 CTCTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCGATTGGCGGGAAACAAAACAAAGATTAATCGGAACAATCTAAGTCAGCGAATTGAGATCCAAGAATGTACCAATAG:1 + chr3R 2399699 3' - diver2 219 2 71.29 ATAACTAAAATTGTTGTCTGTTAATTGGCACACACACACACTCATAGAAAGCCACACAGTTGCCCAGACACAGACAAATGGAAGGGAGTCGGGGAGGTCCT:1 + chr3L 15354273 3' + gypsy4 257 2 71.29 TACTAAAGTCACTAGAGGAAGAAAAACATTCAGTTACTTAGCTTACTGTTGTGCGCGCAGTTGAGCATACCCTATCATGTATATGATACCCTCTAGAAAAC:1 + chrX 8543014 3' + baggins 4985 1 74.26 CCGTAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGTGGCTGCTAGATAAGCTCAA:1 + chr3L 8747659 3' - Doc 4278 1 77.01 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGAATTAAATGAAATGGGCTAAATTTAGATGCTCTTTGGAAGTAAATGTTACTTTGATTATCTGCAACTAA:1 - chr2L 15159457 3' - jockey 4678 1 71.29 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGA:1 + chr2R 22269179 3' - jockey 4718 1 77.23 ACTATCTATCTTTGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATTGCGCATCAGATTGGCATTACAAATGTGA:1 - chr3L 8199198 3' + Ivk 10 1 71.29 CACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGGTGGTTTAAAACGCATTGGA:1 - 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chr3L 8720277 3' - copia 4656 1 57.43 AATAATACAGATTTAAAGTCAAAGAACTTGTATTTAATTTATATTTATTTTAACAATTCCAATTAGGTTCAACAATTATGACACTCTTTGTTTTGGTTCG:1 - chr2L 5948112 3' - 1360 244 1 81.00 ATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACTCAATGGGTAAGGGGTTTGGGTCACAAAATAAA:1 + chr2L 3495013 3' + 1731 4585 1 65.00 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACATATATATGTAAATGGGTTTAATTACGTGATTACGCTTACTTGTGTCTC:1 - chr3R 19955214 3' + hobo 2914 1 52.48 TTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGTATAAACGAATATGAACTACAATAAATATGTTGAAAAGTTATTAAATATTATGAAATGTATTGTAACCA:1 + chr2R 19689126 3' + TART-C 11100 1 72.34 CTTGTTCTGGAAGCGCTGTATGCGGTTGCGGTTTGAGTGCGTAATAATCTGGAAGATTAATAATTTAAGTGGACTTTTTATGGTCTTCAATATGCTTAATT:1 - chrX 6633610 3' - G-element 3964 1 67.33 ACTAAGAGCCTGTTATCAGCCGCCCTCGCGTGGAGAGTGCAGTAGTGTGTCACTCTCGATGCCCAACCGAGTCTATTGTGCAATCGGCCTTTAGGCTCTTG:1 - chr3L 5468065 3' - baggins 110 1 56.44 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGT:1 - chr2R 5214942 3' - F-element 14 1 70.30 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAAAGCATTTCCTAAGCTCTGCAATTTGCGTCGCCTCACCACCGGAAATG:1 + chr2R 15160376 3' + Tirant 373 2 53.47 CCTCACGAGATTAGAAACGAGTGCCGATCAGCAATTCAACGCTTTACAAGCAGCATAACGGCAGCAGCTAAGTAAGTCCATCTATCTATCCACAGCAACGG:1 - chr3R 6413826 3' + BS 425 1 56.44 GAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATATATTTAAGCAGGGA:1 + chr3R 15530094 3' + mdg3 5437 2 79.21 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGGGGAACTCGGACTTAATGCGCTAAACGG:1 + chr2L 3582023 3' - transib2 47 1 71.29 ATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTCGATTTCCCCCGCTCTTTCCATCTGTGACGCGTGTCCTTTGCCGACAACAAGTGTATCTCCCAG:1 - chr2L 18809573 3' - hobo 459 1 74.26 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGTAACAAGGATTTACATCAACCTGCTTCGGGCATTGCATCTAGAA:1 - chr2L 10658467 3' - I-element 35 1 58.42 TAGATTATCCGCATTCAGTCTGCTGCCAAGTACGGTATCCAGAGAGCTCCGTTCCCTTGCATATTTTTCAGCATCGAAATCGCAAGCGATAGCCGCGCTCG:1 - chr2L 5338423 3' - Rt1c 5175 1 64.36 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATTAGCGCACGGAAGCACACATCAATCAAAATCGAACGGATATAAT:1 - chr2R 19352195 3' - 17.6 6954 1 56.00 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACCAGAAAATCTATTAACC:1 - chr2L 12764990 3' - Doc 56 1 57.43 ATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCTAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATTATTAGTGAGGTTTCAAA:1 + chr2R 3466481 3' - flea 56 2 80.20 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTTTTGTAAACATATCAATGGGCTTATTATCACTGTTC:1 + chrX 17175238 3' - I-element 40 1 64.36 GGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGTTGGCTCTGGAGTCTCAGTACATCTCTCTTTTGGCCTTCTCTGTCTTATGGGTGCTTCCTTG:1 - chr3R 32017697 3' + R1A1-element 201 1 63.37 TGTCCTTAGCCAACTGACGGGATATTAGTTCGACTCAAAAATATAACAACAATTTTACTGCATACATACACTAGTTTAATCATTACATTATCATAAATACA:1 + chrX 4515964 3' + 297 356 2 74.26 CGCTTAAAACTGAATACAAAAGAATATGCAAAGTGTGGATCTACCCTGGCTTCAATGCATCACGCCATAAAATATTTGCCGCAGAGCGGCCAACAAAGGG:1 + chr3L 22482809 3' - gtwin 7155 2 71.00 CCTGTTGCAAAGATTCCTATTTCCTTCAACGAAATCAGAAGGATTACAGACGTTGAAAACCAACGATCCGAAAGATATGCAGCGAGTGAAGGAAGTCGGGG:1 - chr3R 30818497 3' - looper1 1475 1 58.42 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTGGTCTCGCCGTTGAATTGTAATTTCATTAAGCGGAAAGGATAATAATGAAAA:1 + chr2L 19290636 3' + roo 396 1 57.30 GGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGTTTCGGTTGTAGAAGACTAGAGCTTTTTAAACGAAAATATTAGCTCTAAAACTGAAAAAA:1 + chr3L 13142091 3' - F-element 391 1 73.27 TACAAAAACTCAACGAGTANAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACGTTTTCTTGATTACTTTAATACGCAACATAGTTTCAACGACATTTAAGGCAAA:1 + chrX 20555780 3' + roo 386 2 58.42 TGCATATTAAGGGTAGATACACTACATCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAAAGCAGAAGCTAAGCTCTTCTTTCATTAAACATTAA:1 + chr3R 210309 3' - Stalker3T 5 1 72.28 ACACATATATATATATATACAACGTAGTATAATCGCATTATTGCCACACGCCCTCCGTTTGCCAAAGTCGAATGATGCCCCAAGGTTTCCAAATGGCTTTC:1 + chr3R 15470758 3' + Stalker2 7502 3 73.27 TGCTTTAGAATCCGGCTCTAGCTCGATGGCATTTTCGTTTAGTTTTTATCCTGAGTTTTGTTGATCAGGTATACTTGGCACTTTGATAATCGCTTGGCGAT:1 + chr3R 24345485 3' - Gypsy12A_LTR 2201 1 72.28 CGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTAGGTGTAACATAATTTTTTCTAGGTTCTATCCTAAAGGTACAGCGAATACGAAT:1 + chr2R 9914065 3' - F-element 4491 1 57.43 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAG:1 - chr2R 981626 3' - 1360 65 1 72.28 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGC:1 + chr2R 8528251 3' + Transpac 5190 2 69.15 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGG:1 + chr2L 19907959 3' - Tirant 8149 2 68.00 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCGAGCTGTGGATCCGGGGATCCGGGGATCCGGGGATCCAGGGAGCCCGGAACC:1 + chrX 20015586 3' - transib2 3 1 67.33 TTTTTGTATGTTATCTGGATTGCGATTGCAAAATCATCCTTTATTTTAAAAGTTAATATCAGAACTTTAGATTGTTAAATCATCAATTGTCTTTTATTTCG:1 + chr4 148167 3' - I-element 5129 1 79.21 TGCATTTATCAAAATAAAGAGCGGCAGCTCGTCAACTCCGACTAAGCGTCTGACACTTTGAAATGTAAAATAGACTTTGACTCTGAGCCCGAGGTGGTTG:1 + chrX 13508597 3' + Gypsy6A_LTR 176 1 55.00 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACCAAAAGTAACAGTAAGTGCAGCAAACTGTGTGCTAATATAACATCAATACCCAA:2 + chr2L 7714594 3' - roo 8685 2 58.42 ATCACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTGGGCGTCAAAGTCGAGAGACGGGTAGGTGTTCCCTTCAGGGAAGAA:1 + chrX 6268975 3' - R2-element 468 1 57.43 CCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTATTCATGTGCCAGATTTGTCTCATTGCAAATTTCAAACAAAT:1 - chr3R 14634067 3' + S-element 245 1 59.41 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTTAAGTCTAATCTAATTGACGTGGAAACT:1 - chr2L 17003982 3' - F-element 62 1 72.00 TCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAAATGACTGGAACTGCATCTCCTCAACCGCAACTCTCCTCCTCGTCTCCTCGCCCAA:1 - chr3R 23302554 3' + 1360 3180 1 45.54 GCAGATGAGGATGTAACAGNAAGTGAACATAAAACACTTTTAGCCGTAAACGTAGCCTCGGCGATCTGGCCATAAAGTTCGGTATCTATGAGCGGATAAAT:1 + chr2R 13748900 3' + I-element 442 1 64.36 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTGACAAGTATCGCACAAAACATTAACTCAAAA:1 + chrX 10326455 3' + P-element 2847 1 35.64 ATTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGAATCAGAATGTTAATCCAATATTTTGTTTTACTTTCTTGCTGAGTAATTTAATTTAGTGCAGTTATGCAAAAGTGA:1 - chr3L 9320756 3' - transib2 2551 1 54.46 CGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTGGGGTTCAAAAAAATATGCACGCAACGTAGTTATTTAGGATGGGTATATTTTCTGTGAAAT:1 - chr3R 8856916 3' - rover 7 2 66.34 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGATGGCATGGCTGAATAACAATAATTGCTTAAATAAACACC:1 - chr3L 10161740 3' - Doc 38 1 65.31 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTG:1 + chrX 19034165 3' + hopper 1366 1 72.28 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAAAATTCAGCTTAAGCCAGACGCAAATCGCACTGAAAACTTCGTCTCGT:1 - chrX 19356234 3' - FB 29 1 53.47 TTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCCTTCTGTTAATCATACATAATTGTTTAAGCCATATTTATATAAGA:1 + chr3L 22465528 3' - flea 310 1 55.00 CGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAGATATTATATTTAAAACTGTAGAGATGA:1 + chr3L 6256832 3' - Quasimodo 418 2 72.28 AAAAAATAAAATAAAATATTTTAAAAGTAAAATAGAAAAATTCTGATAAGAAAATTGGGTAGAAATCACGTCAAATGTAGATTTTGCGCAATAGACTGACA:1 - chr3L 1343901 3' + G7 1150 1 59.41 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGCACATGGCATAGCGTATTCATAATGTGTTGTATACATCTAGTGGTTAGTTCTGTGTT:1 - chr3R 20381084 3' - jockey 28 1 58.42 AATCTATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAG:1 - chr2R 6438337 3' + Stalker4 388 1 60.40 ATTTTGAAAATTAAATTAAAATAAACAAAGCATGAAGCAGCGCACCTGTTGATTGGCAGATAGCTTACACGCTTAAATGTGATATTTAAACAATAACTGAT:1 + chr2L 8012429 3' + 1360 3042 1 64.36 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACATATTTATGAAAATATATTTTTTGCTTTTCCGACTTCTTTTTGTATGCTTCTGTGCC:1 - chrX 18990247 3' - copia 4887 2 60.40 AATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGTGTTTTGTTGCGCGTCAAGTAAATAAATAAAAGCAAAAG:1 + chr2L 4091619 3' - micropia 5379 2 61.39 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTG:1 - chr2L 13598203 3' - pogo 47 1 73.27 ATTCGGCCCTCCTGATCATNATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAA:1 + chr2R 14848995 3' - flea 4736 1 69.31 CTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAGGGGTTAAAACACCTGCCCCACAGTTGCCAGAAATC:1 - 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hobo 34 1 58.42 GAGAGCCGAGCGCTGGTGANTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATAAATAAACATTATCATCTCGGTCCTACTTATAATGTACACA:1 + chr2R 3163281 3' - opus 7037 4 63.37 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGCGGAAAAGCGAGAGGGATAAAGTGGCAGAACGAGATGGCGAA:1 + chr3R 9094812 3' + hopper 1386 1 52.48 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCC:1 - chr3L 19274793 3' - transib2 20 1 59.41 GTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCATTTTTAAGTACTAATGAGTCTCTCTTATTTGCTCTGTCCTGGCGAAGTCATAAGGAGTGAAGTGATCCTCT:1 + chrX 22727597 3' - Ivk 5066 1 70.30 CAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACACCTAGACCGCCAATTAACACACTTGCAGGAAAAGCGGAAGGCAGAGGAAAAACGGGCGAAAGA:1 - chr2R 23196988 3' + Porto1 407 1 68.04 ATGTGCAAGATTGTATGTANAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGA:1 - chr2L 21369868 3' - rover 47 2 75.25 TCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGGCATGTGTAAGCGATGCTTCGGTATTTATTTGCCGGGTATTCCGAGTGCCATTGCGACTACGCCCA:1 - chr2L 16018529 3' - 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I-element 29 1 50.50 TGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTCCCTTCATATGATTTAGGCAACAA:1 + chr2R 5413464 3' - Juan 4077 1 73.27 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCGCATACTACAAAACAATGCATTATGGCAGACCAGAAA:1 - chr2L 2622724 3' - blood 7064 2 73.27 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAAAAAATAAAAAAATATCACATGAAAACCATTTGTACGCCCT:1 + chr2R 11524517 3' + I-element 5308 1 70.30 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 33 2 53.47 CTTCGCATTCACAATAGCTGAGTAACGGGTATCAGATAGTCGGTTAACTCGACTATAGCATTTTCTCTTTTTTTTGGTTGTGTTAATATATTCCTTTCTTG:1 + chr3L 18743188 3' + INE-1 530 1 81.19 AGTAAAAACAAAGACACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTAAAGCAAATTTAGCAATTAAAA:1 - chr3L 11314400 3' - Tc3 318 1 44.55 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAATTAAAAGAGTAAGC:1 + chrX 8579214 3' + roo 9018 2 83.17 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTG:1 - chr2L 12884327 3' - HMS-Beagle 45 2 70.30 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTA:1 + chrX 13134919 3' - BS 5033 1 48.51 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTNCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCA:1 - chr2R 11664326 3' - Tirant 8156 2 73.27 AACCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAGCACCAGCAGCAGCATCAGCGCGTCAAACTTTTTGCCAGCAACCAGCAACCAAA:1 - chr3L 10871147 3' + TART-B 152 4 60.24 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTTGA:1 - chr4 333639 3' - Doc 46 1 74.26 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATTGCTTGTCTTTCTCATTTTTATCTGAATACAAAACTCT:1 + chr3L 26567347 3' - opus 7026 2 58.24 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGATGCCAGGTAACAAGAATTTCAGTCTTGATTAAAGCACCAACA:1 - chrX 18050583 3' - 412 33 2 56.44 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCAGAGA:1 - chrX 983307 3' + Juan 4191 1 50.50 AAGTTAATTATGTACCCACAGAATACAGCCGGCAGCAGAAAATTTCGATAATAAATAATTCGAAGGAAAAAAAAAAGGTAAAAGGGCTTTT:1 + chr2R 4141960 3' + Dm88 4182 1 76.92 TCTATTTGTTTTTTAGTTTTACTTTATTGTTCCACACACAACAAATTTCTTGTATTGCGACAACCCTCTTGCCATTTTTTGGTACATTTGCTTGTTGATGT:1 + chr3L 23937220 3' - Doc3-element 174 1 57.43 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACAAGTCGATACTAAGACGCTGGAGGTCAACTGCAGCTT:1 + chr3R 10078471 3' - Doc 46 1 63.37 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACC:1 + chr2R 1373191 3' - pogo 26 1 53.47 GATGTCTCTTGCCGACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGTCCTTCACGCCCCGCTCTGCT:1 + chrX 7971029 3' + P-element 2865 1 57.43 GATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACACTGGAAATGGAAAAGATGGGGGGAGGAGATACTATTTTAATATGAAATGCTTTTTG:1 + chr3R 27804473 3' + hopper 349 1 61.39 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACATAAATTAATGACACGCCTTAGCCTAAGGGGAAAATCACAGACACAAAGAG:1 + chr2L 1858392 3' - pogo 25 1 54.46 TAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATGTGCTCGGGGG:1 + chr3R 29375015 3' + mdg3 212 2 58.42 AAAATTCCAGAGAGCCTGGNGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAG:1 + chr2R 5531181 3' - 1360 80 1 54.46 GTCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - chr3L 25232764 3' + accord2 176 2 48.51 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGTTTGTCGTCGCACAGAACAAATGTTGTGCCCCTGTGTTTGCAGCAAATGTCAACGTCGCAACAAAAGGCACCCAGC:1 - chr3R 31411293 3' - FB 2 1 77.23 ATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTTTGAACACCTGGTGATTGCCAAACTGGGCC:1 + chr3L 21275813 3' + HMS-Beagle2 271 2 67.00 TTATGCAATGCAACTAAGTNTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATA:1 - chr2R 13647841 3' - blood 7061 2 72.28 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTTATATTTATACCATTAAGAAAGTGATATGCCGTTCTTTCAGGCAACATCTGCAGATCCC:1 - chr3R 13710641 3' + roo 9053 2 45.54 TTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGATTAGATTAGAATGATTATAAAAACTACAGGAAATATGAAAGTATCATATATTTGA:1 - chr3R 5886341 3' - I-element 4876 1 50.50 GAGCTTGAACCAAAAGACGTTCATGGTGATTCTGCGCCCTTACGAGTGTCGCGGCTCTGCAAGTTCTTCCGCTAGTTCAGTTGGCCAAAACAGTTTAAACG:1 + chr3R 25961995 3' + hopper 485 1 62.38 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCACTGCCTCATCGGGTATATACTC:1 - chr2L 9053390 3' + flea 5004 2 64.36 GTGCCGAGAACCCTGATGCNAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAGTTGAATGCTTTGCATCTGCGAGGCACTGCTAAAAATAATCACACCT:1 + chrX 16763302 3' + opus 480 2 61.39 CAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTTTTAGGGGAAGTGGGCGGAAATTTTCGGAAACTGTTGAGCGGAAGAATGAATTTGATTTGATACGG:1 - chr2L 17753600 3' - Porto1 460 1 69.31 AATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGGTGAATTGAGGACCTTTTTATGGGGCAAGGATAATGTGGGTTGCCTATCAAAGTGATGGGAGATAAGCAA:1 + chr2L 19699298 3' - hobo 2570 1 76.24 GCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTGCATTGTGCAATTGCATTTTTCTTGCACAATATCCCAGCTTATATTTTAGATTTAATTGCCATGGTC:1 - chr3L 5504991 3' - invader3 5365 2 70.30 GACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGG:1 - chrX 23078689 3' - INE-1 549 1 79.12 AAAAATTGAAATTAAAAATCAAATCCCAGGCCCCCAACTTTCTGATTTACTCGTAGTTTCATGGACGCTCTGAGATAGTGATGAACGGATTTGGGA:1 + chr3R 5264554 3' + P-element 2640 1 76.04 TCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTT:2 - chr2R 5214940 3' - F-element 12 1 72.28 TACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTTATAGAGTGTTCCAATAAAAAAGCAATTCATTTAACGAAATTTGCAAATCAATTTAGCCG:1 + chr2R 24244591 3' - hobo 2506 1 63.37 CTGCCATAAGTTAATATGCNATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTTAGCTAGCACTGTTTACTGTTTACTCTACTCGAAT:1 + chr2L 5304765 3' - 412 42 2 62.38 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATTCGTTATTATCTTTGCATACCTACATTTTAATAACTA:1 - chrX 15286488 3' + hobo 2913 1 55.81 AAATGAAAAAAAAAAACGAAAATCCAAAACCGCATCCCTAAAAAACTCTATTCACACAGCAGCCCCGCACAAGAGCTCCT:1 + chrX 6585692 3' + Doc2-element 246 1 75.00 CAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGACTTTTGTTTAACGACACTGATGAGCTATAAAAATTGTCA:1 + chr3R 25012557 3' - F-element 4216 1 67.33 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGAAACATTAAATGAACTCGGCGTTACAGC:1 - chr3L 27423375 3' - blood 48 2 70.30 AACTAAACTATTAAATTATGAATATATTAGCGTATCCTTGCACTGGGCCGCTTCTTAGTTCAGAATCTTTGTTTTCTATCATATGTGTAATTCCTTATTTT:1 + chr2R 1422514 3' + Porto1 4550 1 53.47 ATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTGGCACACACTCGCGCTTCGTAGTTTTGCCTTTTGAGTAGA:1 + chr2R 10227680 3' - invader4 2952 2 60.40 CTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGTGACGTCACATTCCAGTTTATTATAATGCGATAATCAGCGCGGTTAGAAGTCGCCCGATAAATTCTAGAC:1 + chr3R 22536277 3' - opus 7483 2 73.27 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGACATGCCCGGGTCATCATGGAAGCCATCCCAAGCCTTCACACAGAGCTGCGCCAAATTTTA:1 + chrX 14132161 3' - roo 13 2 67.00 TTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAAATGCACAAAATTTACTTTGTTTTCCACTTCGGCAATCTTAATCATTTC:1 + chrX 1102519 3' - micropia 5160 2 53.47 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATT:1 - chr2R 15160302 3' - Tirant 36 2 59.41 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAACAATTTTGTTGTCGCCAACGCAAACGAGATTAGCGAATCC:1 + chr3R 5503433 3' - blood 11 2 65.35 GGTTTGGGCACCGCGTCAATGGTTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTGAAGCGATCGGCCCCGTGTGCATGCACTTATTTGACTAATGTCTTTAATAAAAAA:1 + chr2R 19798118 3' - HMS-Beagle2 6773 1 54.46 GACACACAAACATAACCCACCAACTCCCCTGATGTCCTCCCATTTCCATTCCCATTATTCCATTGGCATTGCTTAGAGCAGAGTCCTTCGGCTGGCCCTGC:1 - chr3R 18888426 3' + I-element 4957 1 73.27 GAATTTATGACTTATATCCTAAGACATTCTATGATTTGGTGTTAACGGGTATATTATTCTTTGTTCTTATTTGATGTTTAAAGAAGACAAATAGTGTTATT:1 + chr3R 3457035 3' - Quasimodo 99 2 67.33 AATTGAAAAATAATAATAATATTTAATAATAAATAATAATAAAACTAATAAATAGGTGTTCGCTAATGGTCCACCAGTTAATCTAGTGGTTTAACTAGTAA:1 - chr2R 19982787 3' + invader3 5040 1 61.39 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGAGTTGGTGGCAAGTCCCGTGGCCTGCTAATGGCATAGTTTCCATCTGCTTTTCCGGTGTGGCTC:1 - chr3L 20079683 3' - mdg1 7044 2 70.53 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCAAATCAAGAGGCGAACGTACAAACGAAGAAGAGAACGAGCGAACCAT:1 + chr2L 16690496 3' - P-element 26 1 50.50 TGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCGCAATCACTCAGGCGTTTAATAATTGACTGCAT:1 + chr2L 1202033 3' + Stalker2 7623 2 60.00 AGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATAGGTGTATTTCGGGAGAGCTTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGAAAAGGGTTTCCCATTTCCACGG:1 + chr3R 16336947 3' - 297 243 2 76.24 TCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGACTCTGGTTGCATCCATGGCAAG:1 - chr2L 11894645 3' - I-element 5116 1 77.23 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTACTTGCTGTTCGATGTTGATTTTATTGAATT:1 + chr3L 14143375 3' + pogo 2059 1 69.31 TTTTGATGGACTCAATGGGNGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTATCCCCGCACTAGACCAAGCGAT:1 - chr3R 26787899 3' - hobo 2583 1 76.24 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTC:1 - chr2L 17168427 3' + flea 233 2 58.42 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGCATATATTAAGAAGTGCCGACCAGACTCGAGTGTCAAGCAAATGTCCAGCAGCGCTCTGATTTACA:1 - chr2L 16073062 3' - 412 26 2 72.28 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGAAATAAAACACAATAC:1 + chr2R 9369877 3' + pogo 2039 1 48.51 GCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAAGTTCAATTTAAATGACTGCGGCAGCTCA:1 + chr2L 5210434 3' - accord 45 2 74.26 AATGTGTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTTCAAGTAATTAAGTAAGTTATATAAACATATGTTCCATTAGGGCGGTCCGCTT:1 + chr3L 9250926 3' - I-element 458 1 60.40 CGACAACGCAAATCCTTGATAACATAGACATGGACGAGGACGCCCATTTTTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGATGTGGGTCG:1 + chr2R 4577118 3' + Chouto 6268 1 51.49 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGGAATTTAAAAACA:1 - chr3R 30284207 3' - blood 7038 2 53.47 ATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTACCTTTCATTTAGAACAACCAAACGACAATATTCATACCACAGAGAAACCACTTAATG:1 - chr2L 23381998 3' + jockey 4770 1 62.38 GGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGGTTCGGTTGTAGAAGACTAG:1 + chr3L 13142051 3' - F-element 431 1 67.33 TTTGTAAAAAAAACAGGTCNAATGCCCCATAGTGCAAAGGGGTTTTGCAAATGGCAGAAGGATTGGCCAAAATTTAAATCAATCAAATGAAATTGACTTGC:1 - chr2R 20948166 3' - hopper 13 1 63.37 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAAACGCTTAGAAATTCACACGCTGTTAACGAATCTCTTATGCTTCATTTAAAATGCTAATATGATTTTGCG:1 + chr2L 19698531 3' + hobo 2934 1 72.28 TCGGGCATTTGATTTTGATTATTGGCCTTTTGGCAAACAACATGCCAATGTCGCAGCACTGAAATTGGGCGGAAAATCGGAGGTTGGGAAAATGCTAGAG:1 - chrX 12354740 3' + 3S18 406 1 69.00 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTA:1 - chrX 9816250 3' - BS 5012 1 56.44 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGCGGAAAAGCGAGAGGGATAAAG:1 + chr3R 9094792 3' - hopper 20 1 59.72 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCTTCAAACGTATGCATGTTCATGTTTATTTTTCGGT:1 + chr3L 15390402 3' - pogo 39 1 65.35 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGCATAAGTAATTTATGGCATATCACATATATGATATGGAATGATGATGATTTTGCTTTAATGTTAT:1 - chr2L 4020678 3' - 412 11 2 67.33 GTGTGTGTTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGTGGAGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAAAAAAACA:1 + chr2L 4992766 3' - Tc1-2 486 1 53.47 CTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACAGCAGCCTGGGCATTGAGGCGATAGTCCCCAGTGCCCTGTGAGGTGGCACTGGAACTCGGTTGGGGC:1 - chrX 4269888 3' - 1360 430 1 73.27 TAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGGATTCTTTGGAATATATTGCCCATTTTAGC:1 + chr3L 27169157 3' - Tc1 1342 1 70.30 AACAACAATAATAATAATANTAATAATAATAACAACAATAATAATAACAATAACAACGGAAGCGGGCAAAAGAAATAAACAGTGCAGTGCAATGCTAAATG:1 + chr3R 9222637 3' + mdg1 34 4 45.54 CGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGATGGCTAGCGAGTGGAGAAAGAGAGAGCGGCGTGAGAGAGTGCGCGCACTATCAAAAAAAATGAACTTTGA:1 - chr3L 7856220 3' - blood 7182 2 77.23 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAG:1 + chr2L 20290316 3' + flea 5008 2 71.72 GCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGATAAATGATTTGTCTTTTGATTTTA:1 - chr3R 11065152 3' - ZAM 8127 2 75.25 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCG:1 - chrX 8308725 3' + opus 7470 2 60.40 AACGAACACACACACACACACACACACACAGTAAGGTCTTGAATTTTAAGGATCTTTCTCTTCACCGTCCACATTGATGCCCGCCTCCTTTTCCTTGTCGT:1 + chr2R 22226799 3' + accord 7026 2 49.50 GGACCTGATGCAGCTCCTTTTCATCACAATTGTACTTAAGTGAGTGAGTGGAGGCCAAGAACAAATATAAAACTTCCCCCACAAGATTTGCATAAAGTGGA:1 + chr2R 10538454 3' + gypsy5 447 1 59.41 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATCGCTGGATATATAACTACTAAATTCTTA:1 + chr2R 7186632 3' - jockey 58 1 71.72 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATAGCAGCGC:1 + chr2R 22269210 3' - jockey 4687 1 57.43 CATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAAATAGTTTCCTCCAATAATGAACGCCTTTAATCTACG:1 - chr3R 26241040 3' + Ivk 5339 1 63.37 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACT:1 + chr2L 3985140 3' + roo 9031 1 66.34 GATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCCGTGGAGTCCGGTTCGTTAACTCTCAGCTGCCCGCAGCCGCTTTATCCCCACTGCAGCGAA:1 - chr3R 902756 3' - Gypsy6A_LTR 351 1 54.46 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCAAATCAAGAGGCGAACGTACAAACGAAGAAGAGAACGAGCGAACAATGACCATG:1 + chr2L 16690503 3' - P-element 19 1 55.45 CCACACCCGCAGGTTATGATTTTTAAAACCCACTAAATTTTCCCCTTCCGCACTCACGTGTATGCCGTGTACATAGATATTCTATCCGAATTCCGTTTACC:1 + chr3L 17158309 3' - Gypsy12A_LTR 316 1 74.26 CAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTTCAACATTTGTCGACACACTTGTCAGCCGA:1 + chr3R 6143107 3' + Tirant 72 2 76.24 GACTAACAGATTTTTAATCAAGTCATATGAACTGTTTAATCTGTTTTCTTTCAATCCATTCGTATTCATATTCCCGTGGCAACAATAGCCATACA:1 + chr2R 21113922 3' - jockey 4886 1 44.21 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCNTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGCCACGAATGCCCCGAGTACACCAGCGGG:1 + chr2R 8528278 3' + Transpac 5210 2 58.42 CCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTAAATACCCATTTTGCGACTCTCTCCAGGATCTTTTTTAGTAAATTTATAGACCTCCTCGTTGACTC:1 - chr2L 9833010 3' + Transpac 4835 1 69.31 CGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAACAAATAGAAAATATACATATAAAAATACTAAAG:1 + chr2R 18407710 3' + mdg3 5400 2 68.32 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAAGAAGAAGCAAAAGGAGGTGGCGGCGGCGGCGGGAAAGAAGAAGCAGGGAAAAGTATACGTACAATTTTGTACTG:1 + chr3R 8114268 3' + jockey 4966 1 76.24 TATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATTATTCTAAGGTTGATAACCACTAGTTGAAAAAGCAATTGTCAATTGAAATATTAATGCAT:1 - chr3R 19498443 3' + copia 4883 2 61.39 TGCATTTTTAAGTTACCTGNATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATGTTTTTCAGTACATTAAATAAAAATA:1 - chrX 17385176 3' + pogo 2054 1 74.26 GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCGAATCTAGTATACCCTTTTTACTCTAAGAGTAATGGGTATAATAAATTCCTTTACAACGGATCACGTTTT:2 - chr2R 18487178 3' - INE-1 29 1 71.29 TCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCG:1 - chr2L 22136614 3' - INE-1 544 1 73.27 TAAACAATCCCACCCAAATNGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAAGGTTTTCATCATTTAGATTTTCCATTAC:1 - chr3R 26249160 3' + I-element 4895 1 70.30 AATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTGATATTTCACTTTGCAAAAATATATCTACATATGTATACACACAGTGTTCAACATTTGCGGCTCTTGTT:1 + chr3L 18407415 3' - Doc 4608 1 77.23 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATAATGTCCAAAAATATGTTACCAACACGTGTAGCCCGGCATGCGAAGAAATATG:1 + chr3L 4923767 3' - jockey 29 1 56.44 CTAACTGAAATTAAGAGTGGATGGAATTTGTTTTTTTTTTCTGATTTCACTGGGCTCACTGTGTTGTCCGACTGTCAACAGCTTTTAGGCCTCTTTTGGCC:1 - chr3R 28438705 3' - Circe 331 1 77.23 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAACACGTTTTTTTTTTGGAGCTGCGCTTTGCAAAATCGAACGAGCAGTGCAATGCGA:1 - chr2R 19616123 3' - hobo 18 1 61.39 AAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAGATATA:1 + chrX 21772505 3' - springer 7183 2 65.35 TACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGTCTCCGCCACTTACCACATTGGGCTTATGTTTTGGCTATTGGATTTCGGTGACT:1 - chr2R 17410721 3' + F-element 349 1 56.44 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAAATGAAAGGGTTGTTTT:1 + chr2L 16016278 3' - I-element 11 1 64.00 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGACTGCAGTTCTCTGTCCCCTATGTGACGGAATGTGTGCCTAGATGGGATTTGATTGATTGCGGTATGGGATAGAATCTGATG:1 + chr2L 10020862 3' + hobo 2927 1 67.33 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAGCATCATTTAGATTGTTTAAATACCAGCAAACGTGAGGCTGG:1 - chr3R 22938652 3' - I-element 33 1 56.00 CAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCATTTTCTGAGGTGGCAAAAAGCCGTAGGTATGGAATTGTTATGATTCCCATTCAAAAATGCGTTGGC:1 - chr3R 27088412 3' - X-element 4246 1 68.32 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTTATATTTATACCATTAAGAAAGTGATATGCCGTTCTTTCAGGCAACATCTGCAGATCCCC:1 - chr3R 13710640 3' + roo 391 2 44.55 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACGTCAGAAGTATTGGAATTTTAATTAACTACAGCTCACCTGCAGATAAAAGCAGGGAATAACTCAAT:1 + chr3R 7645078 3' + mdg1 377 2 66.34 AAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACAAATAAGCAATTGTCATTGTGGCGCGCGCATGTTGCCTCCCCAGCAGAG:1 - chr3L 12310577 3' - R1A1-element 5096 1 59.41 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGATCAATTCTGATAATAATCAATAGCTGATAATGCACCTCTATT:1 - chr2L 22256815 3' - F-element 43 1 57.43 TTGTGACACTTTGTCAAAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACACACAAGCAACCAAAAACGGGGAAACGAGAGGTCCGGGGAGAAGCAAAC:1 + chr2L 439360 3' + Stalker4 7025 4 55.56 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATCGGAGGACTCCAAGGACTGAAGGCAGCGCCA:2 - chr2L 22747290 3' - transib2 45 1 72.28 GCAGAAGAGCAGCGTATATNTATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7206 2 80.77 TTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATATAATGACTGAAGTATCTGATGTTCTGGCGCAACCCTCGGAAGGCGGCAACGTTGAAGGACGAAGGACAACGGCG:1 + chr3L 13744072 3' + Chimpo 452 1 68.00 AATAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGCACTCTGGGGAAATGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCCAACAGATTTACTCTGATTTTCACATA:1 - chr2R 6130469 3' + Porto1 4256 1 69.31 CGGGACCACCTTATGTTATNTCATCATGGTGGCGATCATAATGTTTAACTGCGGCGTAATTATACACATTTTGTGTCTAATTGTAATAAAGTTTTTACGTG:1 + chr2L 7991912 3' - P-element 7 2 68.32 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGTAACAAGGATTTACATCAACCTGCTTCGGGCATTGCATCTAGAATT:1 - chr2L 10658465 3' - I-element 33 1 56.44 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAAAATTCAGCTTAAGCCAGACGCAAATCGCACTGAAA:1 - chrX 19356246 3' - FB 41 1 65.35 TTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACTGAGCTAAGCCCCGTGGGGATCGATGGGG:1 - chr3L 13049418 3' - Idefix 7056 2 68.13 AGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAACAGTTATTAAATTGGAAATTTACCTAAATTAATATAGACTTCGGTATTCG:1 + chr3L 15005272 3' + flea 316 1 56.44 TCGGGTTTTTCTGGGTTTTNCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAAATTCCTATATATACATATATATTGTAGCTTTTTAGGT:1 + chr3R 10715892 3' + copia 4724 1 61.39 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCGCCTTTTATTTTTAGCCACGCCAA:1 - chr2L 12800977 3' - hobo 51 1 74.26 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCATACTGATAACTGAGCAAAAGCACGTCTAACTAA:2 + chr2L 9724257 3' - 1360 43 1 66.34 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCTCCCAAATGTCCAAAGTTCTATTGCATCAATGAAAGCTTCGGCAGAAAGCTTTCCTCTGGCG:1 + chr3L 15976983 3' + flea 5005 2 63.37 AAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACGTACAACGACATCGGAATAATGCAA:1 + chr2R 19645503 3' + Ivk 4931 1 80.20 GCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCACAATGTTAGGTTTAAGTTAGTCTTAATTTACAAGTGCGAGAATAAAG:1 + chr3L 25186297 3' + Max-element 80 2 56.44 CTTCGTTGTGGCCGTCACTTCAATCCGGGAGGGGAGGAGTTACCGGTTCTAACCGGCACACAGACCCTCCAGCGAAGCCACCGCGGCTTACTCTGGAATTG:1 - chrX 21939635 3' + gypsy5 6903 1 65.35 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTT:1 + chr3L 25059151 3' + mdg1 7434 2 55.45 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACACACTATGTGGGCAATGGGCTTCGGTTTTGAATTCGGTGTCGTTGTTTACCGCTTCGC:1 - chr3R 8812544 3' + P-element 2869 1 62.38 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCAGACAGCCGGGGGCAAAACAAAACTTTTCGCATCGCCCAGAAGCC:1 + chr2L 10924284 3' + hobo 2909 1 56.00 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTATGCATAAATTGGCGTTAGTTAGTTAGTTCTCGTAGGTGCCGATGTAGGCGCT:2 - chr2R 22658996 3' + 297 6960 2 53.47 TGTAGATTCGCGTAAGCGACTTCTCTCCACCCGGCCACGGTAAGTAAATCTATCCATTATGGGTTTTTGATTTTCCTCTCGACTCAGCAACGCTATATCTT:1 - chrX 11564672 3' - Doc2-element 4585 1 80.20 GCTAACTATCGATGTAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATGGATAAAACCTG:1 - chr2L 13598169 3' - pogo 13 1 66.34 CTATTCAAAGTTGAAAATTNTTTCAAACAACTACATGTTATTTGCTGTGTATCGACTGCAATCAGCTATAAAATGTGACGGTTTTGCGCTCTGAAATTGAA:1 + chr3L 13582654 3' + hopper 1026 1 61.39 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGACCTCG:1 - chr3L 2809769 3' + pogo 2048 1 71.29 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCG:1 - chr3L 15777025 3' - I-element 52 1 71.29 AAGCCTCTTACCCTCCCTTTCTAAACTATGGGAGAGACTTATTTCCAATTGGACACGCCGACATTATAACCACAGATACAGCGTTGGAAGCTTTAAATGGA:1 - chr2L 9579157 3' + Helena 195 1 62.38 TATCACAATAATAATAACAATAATAGTGGCAGCAAGTACAATTACATGGGTGCAGTTGGGTCTCGCATAGTGGCTCCCATGCCCGGGATTTTAGAGAAGG:1 - chr3R 31791371 3' + mdg1 19 2 56.00 AATAAAAAAAACAAAAAAAAAACAGTCGAGTGTCAAAGGTCAGCTTCTTCTACGGCCTGGGAGGCGACTTTAAATGCCAGCAACAATAAAATGGAAAAAGG:1 - chr3R 13991003 3' + Rt1a 5078 4 76.24 GATTTACTTATTGTCACACTTTTTTAAGACAGATTGTAAAGATAAGGAGAAAAAAAAATTATTATGATTTACGTCGACACATCCACGATATTCTCAAAGTG:2 + chrX 20385813 3' + G4 3811 1 50.50 TTCCATGGGTAGACGACGANATCTACAGACACAGCGTGAGATAGTGCGAGTTGCAGATGCAGAGGAGTCACAGTCGCGTTTCCACCTCGAATCCCAGTTGA:1 + chr3L 22106723 3' + G2 2803 1 61.39 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATGTGAATGGGAAATCTTTTAAT:1 - chrX 8308698 3' + opus 7497 2 75.25 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCCGGAATCTGGTTCTACCAATTATAACAAGTTTAATAATCTATTTGCTACCGACATGGGCTATGATTTGATT:1 - chr3L 10283506 3' - Doc 37 1 68.32 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCCGTTCTCTGATTCCGACCCCTTTCTACCAACT:1 + chr3R 25369503 3' + hobo 2917 1 63.64 TCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGGCTGCGGCTTGAACATGCCGACAGAAAATTAC:1 + chr2L 20299886 3' + jockey 4641 1 68.32 TTGGGTAGGGGTTAAGTATNATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCCGAGGCCATTTGTCAACCTTA:1 - chr2R 10752617 3' - G2 2960 1 78.22 GTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTAGCAATAACGGAACAATATTGACTGAGA:1 - chr2L 21369827 3' - rover 6 2 74.26 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAACTGAAGGCAAAAGGTCAAGTTTCGGAGATTTTCATTATCA:1 + chr2L 20992981 3' - I-element 15 1 62.38 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGGGAAAAGCACGAAAAA:1 + chrX 19887166 3' - P-element 7 2 73.27 AATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAA:1 + chr3L 11257381 3' + 1360 13 1 47.52 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGTGCAACTTGAAAGGCGATTTTTAGGCCATTTTT:1 - chr2L 5244425 3' - transib2 38 1 63.37 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATCATGTCATGGTCAAAAAGCATAAATATTTACTTAAGCCCATTATG:1 - chrX 915536 3' - flea 25 2 57.43 TTTACGCAGCTAGTGTGAATGCGAACGAGATATTTCATAATTTTTTTTTGAGAAACAATAGCCACAACAACAATCAATTCAAAGGGAGAGAAAGCAGCTCG:1 - chr3R 15720145 3' - INE-1 534 1 54.46 GAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACAAGGTGCTTTTGAAAAATGCAGTGTTCCCAAACAAACTTACATAAAACTTCGACAAGA:1 - chr2R 4848991 3' + roo 75 2 61.39 ATCTTCGATATTAACTGGACCTGTGTTAAGAACATGTCCGTCGGGGTTGAAGTTCAGATGAGTCAAGCCATATTTTTGTTCA:1 - chr3L 17434918 3' - Porto1 39 1 81.71 GCATACTTGTAAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCATCAAATAACCCAATGATGATGATCTTTTTATAATAATGA:1 - chr2L 14981450 3' + hopper 1380 1 60.40 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGNGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAACC:1 - chr2R 15160276 3' - Tirant 10 2 70.30 GATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTGTCGCCGGCTTTGGTTCGGTTTTC:1 - chr2L 18720191 3' - F-element 4297 1 76.24 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGACTTTGGGTCCAGTCGGCCACTGAATTATGCTCAAAAGTTCGCCACTTAAGCGTC:1 - chr3R 27448226 3' + hobo 2920 1 58.42 AAGTCTTCTTATTTGGGATNTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGCCCAAACCCTTTTCGAATTCACCAAAAGATCGATTTCAGTTTTG:1 + chrX 9439256 3' + roo 405 1 71.00 GATATGGATGTGATGTCTTTGCTGATATAGTTAAGGGCTCTATGGACGGCAGTTATGGATATGGATGTGCTCCCCGGGGTATGAGCTGAGCGTTTTCCAAG:1 - chr2R 21862194 3' - Ivk 418 1 57.43 TTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGGTTGATTATTATTTAAGTTTAGTTTAGTGCGAGGCTAAAGAATGTTCTTTCCACGGCGAACGTTGTA:1 + chrX 18572085 3' - Juan 344 1 66.34 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGACATGCCCGGGTCATCATGGAAGCCATCCCAAGCCTTCACACAGAGCTGCGC:1 + chrX 14132152 3' - roo 8681 2 61.05 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACTATTTCGTTATCTGCACGTCGAAAATCAATGGAGAAGTGTGTGAAATAATGTGCG:1 - chr3R 13686545 3' + 412 473 2 56.44 TGTGTTAGAGAGAGATGACNATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGATGTATGTGTACACAAAATGCGCTCTGATGATTCT:1 - chrX 15482583 3' + invader4 2915 2 65.35 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTATACACGGCAGCGCCCCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAA:1 - chr3R 1135323 3' + Tabor 7309 2 64.36 TTACTTTACATATTACTTACTTAACAGCACTGTAGACTTATTGCAACGTATTAACTATTTGTATGCCGCCAGCGTAAATATTTAAATCTCCAAATGAA:1 + chr3R 16041369 3' - Stalker3T 44 1 56.12 AACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGTTGATAGTGTGTGTGTGTGGAAGGCTTTGTCTTTGTGCGTTCG:1 + chr3L 10014042 3' - jockey 187 1 54.41 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTTCCATTGCAATTGGTGGTGTCCCTTTGTTTTTGCTGCGTACATAAT:1 + chrX 2911338 3' - hopper 27 1 52.48 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTTTAAGTATTCTAAACATTAAATA:1 + chr2L 4020750 3' + 412 7496 2 73.27 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGGAGGATTCTGTGTGAGCTCGCGCAT:1 + chr2R 20441319 3' - I-element 8 1 69.31 AATAAATAAATAAAAAAAAACAGCAGTCCTTAAGTGATAATTAAAGGCTTTATTAACATAACAATTTTTTTATGTTTAACTTTATTTTAATTTGTTTCAAT:1 + chrX 13337995 3' + Tc1-2 481 2 87.13 AATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAA:1 - chr3R 11118054 3' - BS 46 1 73.74 AGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTAATATTAATTTCTCGACCCCATCCCGCCATCGTGGCCAATCAATTTGTTAAGCTCCTGGCCGGGAC:1 + chr3L 13568302 3' - Stalker3T 98 1 63.37 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACCCCACTATTTCGTTATCTGCACGTCGAAAATCAATGGAGAAGTGTGTGAAA:1 - chr3R 13686554 3' + 412 7518 2 51.00 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTTAAGTGAGCCACGACAAATGTCACGTTACCCAAA:1 + chr3R 24612234 3' - roo 40 2 67.33 AATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGTATATACATGGCCATAATGACCGCATCATTCACCATACAGACCCCGAAACCCTATTTACAACT:1 - chr3R 20891983 3' + invader4 3076 2 68.32 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTGAAGTTTTATTAATTAATTGTGTGTGTTGTG:1 - chrX 354935 3' - I-element 52 1 69.31 CGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAGAAGGCACCGTGTGGCCCACAAGTGGAGGGGATACTGAAGTCCCAACTGGGTA:1 - chr3L 21393241 3' + Quasimodo 6965 2 54.46 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTT:1 - chr3L 22327296 3' + hopper 1373 2 70.30 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATTCGAAGAGGCTGCTAATTAAACAAACTTTGAATTAATCAGC:1 - chrX 19383973 3' + pogo 2071 1 59.41 ACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACACAGATCAACAAACACAACAACAATCACAATTCAAACAGATCTCATCCAAACTGACTTTAGTAATGTTT:1 - chrX 17137541 3' - 412 100 2 72.28 TAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAATTTTTTTCTGCATTTAACGGTGCAATGATTTTTTTTCTGATAAGCAGCAATTTGAATATATTATCATCTCG:1 - chr2L 5710 3' - 1360 303 1 68.32 CACCACTTCTCGCGGCGCACAAGCGTAGGCAGGTACTCCATGACCCACTCAACCAGCCCCACAAGCCCGCGTTTTATCCACTCACCTGAACTGAGCTCTTG:1 + chrX 12179154 3' - aurora-element 3790 1 58.42 CGATATTAACTGGAGCTCTGTTAAAAACACGTCCGTCGGAGTTGAAGTTCAAATGATAACTAATTGGATAAAATAAGATTATGAATAAAATTGAAAAGGG:1 + chr2R 4915722 3' - Porto1 34 1 53.00 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTAT:1 + chrX 19607300 3' - Tirant 8145 2 61.39 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACCTATTGAAACCTGGCCAAAACCCACGAAATG:1 + chr3R 7582688 3' + 297 6936 2 67.33 GCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCAGTAAAATGCCGGAAAAGTGGGGAGTTTCTTCCATGCGGAACTTTT:1 - chr3L 22974374 3' - X-element 4436 1 74.26 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCAAGCGGCTAGCACTCCCAGTTTACTAGAC:1 - chrX 9828456 3' + Tirant 8461 2 71.29 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTGACCCTGTCCGTCCGATTGCTCCGAAACTTTCGTCATGAAATTTAA:1 + chr3R 4191171 3' - 1360 30 1 65.35 GCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGTGT:1 - chr2R 17402735 3' - invader4 52 2 75.25 AATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCTAATGCTAGGCCAAACACAACGCCCACACACACGCGCGGTGCGGAAAATGTTTACACGCCTCGCCAA:1 + chr2L 7400387 3' + 1360 3165 1 70.30 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTGCAACTGCAACAG:1 - chr2L 13310232 3' + mdg3 5484 2 54.64 CGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTAGCTCTAGAAACGGCCACAAGAAAGAAATAAAACGAAAAAATTGTAATCGTGGTTATGA:1 + chrX 7183855 3' + 1360 25 1 60.40 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATT:1 - chr3R 19449982 3' + roo 9048 2 63.37 CTGTTGCGCCGCTGCCGGCGACGATGATGGTGACGATGATGTGGAGGTGGCTGCTTCACAGAGAACGCATATAACACGCTGCAACAACACACATGCTCTAA:1 + chr3R 22676516 3' + HMS-Beagle 6918 2 53.47 TTTAAATAACAAAAATAAAATAATATTTCTGATGGGCATAAAAAGGAATTTTAGTTGGGATCTTAAAATATTTAATGAGGTGTTACTAGGTTTAAGAATTT:1 - chr2R 14929636 3' + G7 1146 2 85.15 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGAGACAGAAATACATTTCGTACAAAATTCCGCCCTGCA:1 + chr3R 10093901 3' - P-element 14 1 42.57 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGACCTCGGATCGTGAGGCATTCTGG:1 - chr3L 2809751 3' + pogo 2074 1 54.46 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAATAATTGACAGTTGAAAAGTCTCAGCT:1 - chr2L 3581945 3' + transib2 2815 1 68.32 TGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTAACAGGACACACACGTCAATAA:1 - chr2L 12884291 3' - HMS-Beagle 9 2 70.30 TTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTTGGAAGTGAGAAATTGACGGGGCTTGGGAACATTCGCTATCGCTATTGCCTTCATATTCAAA:1 + chr3R 21435974 3' - Bari1 1652 1 67.33 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTTGAATTGTACATTTGTATGCTTATGAGTGTTTTAACTTTGTATATT:3 - chr4 333596 3' - Doc 3 1 73.27 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAA:1 + chr3L 23456283 3' + 1360 3386 2 72.28 CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATCCATACGTACTCCAAGAAAAGGGACTGCGACTCCATGGGG:1 - chrX 4235724 3' + Quasimodo 7339 2 60.40 TCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGG:1 + chr3L 11826451 3' + INE-1 152 1 68.32 GGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCACGTGTATGTGTGTGTGTGGGAGAGAGGCAGAACGCCGAAGTTAGTAAATTCTCTCCACTTCTCTGTGTTTGTGCATT:1 - chr3L 7156304 3' - Tirant 8106 1 74.26 CTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTCATTCACCATCCCCGCTAGGTCAGAATTCAGGACGCAGGACTCGCTTCTCCTTGGAGCGTAATCAGCAACGTGCC:1 + chr3R 26252773 3' + 412 492 2 76.24 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGG:1 + chr3R 20425415 3' + roo 9041 1 59.41 CTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATATGATATAGATATTCAAAGATATCACAACTTTTAAATTTTGTTGTTTATTTTCAGCTTTCTAG:1 - chrX 15290214 3' - pogo 8 1 68.32 GACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAAAAAGTACCTAAATAAATA:1 - chr3R 3922959 3' - Cr1a 51 1 61.96 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTATTTAACGTACTCCTTAGTACCAGTT:1 - chr2R 21151136 3' - pogo 46 1 76.24 GAGTAGCACCTGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGAGACCTTGGCTGGCATAAAAATA:1 + chr3L 7463323 3' - hobo 51 1 72.73 ATCCGCACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGACAGCAACTCGCCGCACCCCCCTCTGATGTCACATCCCCGTG:1 - chr2L 976318 3' + Chouto 425 1 74.26 CATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGCTACCAAATGGGTGATAAGCTAAAATATACATATAAAATTCATTAATGTGTGTTGTTTGCTTAATGTTTTT:1 - chr2R 13743315 3' + hopper 93 1 69.31 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGAAATAAAACACAATACGCAACGAATTAG:1 + chr2R 9369889 3' - pogo 45 1 73.27 GAGGCATTGTGCAAAGTACNCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACACCGATGCCGAGGGAGAGCGAGATCTCTGAGAGTGGGAAAGCGGG:1 + chrX 9584736 3' + pogo 2077 1 51.55 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAACTGAAGGCAAAAGGTCAAGTTTCGGAGATTTTC:1 + chr2L 20992974 3' - I-element 22 1 55.45 ACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCATGGTTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTGTTATGCGTACCATTATCGAAATTCAAGCGTCGGGGTCACCATTTA:1 + chr2R 5022187 3' - Idefix 7044 2 54.46 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTCCCGCAATTTCGGTGGCAATCGAATGAGGAACGAATTGGGGAACTT:1 + chr3L 16666707 3' + I-element 5327 1 52.48 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCAAAGCCGTTTCAGCTGTTTGTTGTGTGCACTAAAAATTGAATTGAA:2 + chr3R 26498601 3' - roo 20 2 60.40 AATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGAGTACTTACAACAACGGCGTTTCCTATAAAAATAA:1 + chrX 23291093 3' - G6 1976 1 65.35 GAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCGTCTCCGTTTCTGACTTTAACTTTCCGCCCCACTCCCT:1 + chr2R 15703603 3' + hobo 2604 1 62.38 CTTCTCATTTGGGATTTTACACTAGAAAATATAAATGCTTTTCTTTTGATACGTAAATGGGAACTAATTAAAATGGTTTCATCCATGGCAATATGATTTAA:1 - chr2R 8254752 3' + roo 409 1 79.21 CCGTACTCTGTGGTGACCAACACCACAGAATGGTTCGGGCCCAATTAGAGGGTTCCCTGCCCCTTTCCTGGGAAAGGTTGTGGTGGCCGCGCTCTCTGGCC:1 + chr3L 4280921 3' - baggins 4959 1 75.25 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAAGTATCCGTTGGTAGAGAGAGTCGTTATTAGGGTC:1 - chr2R 10528316 3' - pogo 36 1 62.38 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTTCTTATGGAATGTTAAGTGA:1 - chr3L 22327277 3' + hopper 1392 1 56.44 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGCCGCCCCTTCTTCCTTGCCAATTAAACGCATTTGATAAAAAACAAATTTTGGAGC:1 - chr2L 18230072 3' - hopper 18 1 61.00 ATAAGATTTACTTATTGTCACACTTTTTTAAGACAGATTGTAAAGATAAGGAGAAAAAAAAATTATTATGATTTACGTCGACACATCCACGATATTCTCAA:1 + chrX 20385809 3' + G4 3807 1 54.46 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATACACATATTTATATAGCCATCTTTGAATATATATATAGATATCAGCGATTGAAGTTTTTATTTAATAA:3 - chrX 5271290 3' - mdg3 5261 1 69.31 AACAATTTAAATTATTTAANAATATTGCGAATCGTACATAAAACCACCATCAAGTATACGCAGTGTTTACGAACGAACTCATATGAAACCATATTGAATCG:1 + chr3L 18022458 3' - HeT-A 5808 1 86.14 CCATTGCTCTGTAAAAGACATATGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGGATTTCGTTACGGGATTTGCTCGGGAAAATCTTTCTCATGAAGGA:1 + chr2R 12092375 3' + hopper 374 1 53.47 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCT:1 + chrX 7970997 3' + P-element 2833 1 25.74 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGAGTCTTGTTTTATGGCGGACTGACGGG:1 - chr3R 13441886 3' - 1360 20 1 64.38 TGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGATCGGATTCATATTGTGCAATCTCTGGTGAT:1 + chr2R 9191428 3' + gypsy6 132 2 70.30 AGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAAGCGTTTTACTTCGCTTATCTCGGCTTGTTATTTATTTTTT:1 + chr3L 18833408 3' - jockey 156 1 59.41 TAAATATATGTCAGCCCGANGGCTGCCTTCTACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACTATTTCGTTATCTGCACGTC:1 - chr3R 13686580 3' + 412 441 2 74.49 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCG:1 - chrX 21667998 3' + Tabor 461 2 50.50 TTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGAGGCGGAGTCTGGCCGACATGTGTGGCCAGGCATGAAGGAGC:1 - chr3L 20724265 3' + mdg1 317 2 57.43 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGAGCATGTTCTTCTCTAGGTCTGTATTAAAACCAAA:2 - chr2L 9724209 3' + 1360 3349 1 67.33 GGATCTTCCCAATATGGTTNTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACTCAATGGGTAAGGGGTTTGGGTCACAAAATAAACGA:1 + chr2L 3495016 3' + 1731 4589 1 60.61 TGATTGTTATTATTATTGTNATTATGTTGGTATATACTACAGATTGAATGGCAAATGTTTTCCCTTAACACAATTTATGGTCCAAATATTCTTTATAGCTT:1 - chr2R 12525577 3' - mdg1 20 2 40.59 GCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCACCAACGAATACCCAGCAGCAACTCCAGCCACC:1 + chr2L 1938934 3' + R1A1-element 279 1 67.00 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAAACCAAGCCGCCCACTTCACCCAGAACAATTGCCAAAAAGTCCTT:1 - 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Transpac 7 2 73.27 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGTGTGCCTTTGGCTCTGATTGTGGCTCCATCTCCGAGGCCTCGACT:1 + chrX 6388361 3' - hobo 3 1 76.24 TTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGAATTCGACACGAGCTGGTTGCCGACACATGCAGCAGGCAGTGAAAAGGCAGAATGCAGGCGACATTTCG:1 + chr3L 5073622 3' + GATE 209 2 69.00 CTAGTATATTACCGATGCATGATACTGCATTTAATATGACCCTAAATTAAAAAATTCCAAGTGCAGTGTGTTTCTCGATTCGTTCACGTTTCGGTTGCCAG:1 - chr2L 8106039 3' - Gypsy12A_LTR 108 1 55.45 TTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTTTGGCGCTGCCCCCTTTTTTTTGTTTGTCTTTGATTTGCGTTTTCAAGGCTGCTATTAA:1 - chrX 9152246 3' + 1360 41 1 65.35 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAATTACACGAAAGACATAAGCAGTGAACAACCTC:1 - chr3L 16494730 3' - jockey 4711 1 68.00 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTTTTGTGTGCCGAAGGTACGATCATCAAAGTTTGATAT:1 + chr3R 4712754 3' + pogo 2065 1 64.36 TTCAATTTATAAGATTTAAATGTAGGTACTTAGCTACTTTTGGGATATGTATAGTTTATTTTATACTACTGTAATCCTTAAGCTCTTCTATACTATATAAT:1 + chr3L 9955275 3' + Tc1-2 1410 1 55.45 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCGAACACAATTAAATATTGACTCTACATTCGTCAC:1 - chr2R 6830679 3' + hobo 2928 1 57.14 TAGCCGGTAATCGTCCTGGCGATTTTGTTTTGGGCAGCCTTAATGCGTGTATGTGTGTGTCACCGGCAAATAAATATGAAAATTCCTGTTTATCGGTTTTA:1 + chr3L 2378084 3' - BS3 1380 1 55.45 CGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTC:1 - chr3R 1440168 3' - G-element 3 1 63.49 GCTAAAAAAAAAATAAAAAAAAAACGAA:1 - chrX 9944009 3' + G-element 4325 1 96.43 AGTACTTAATGTTTATATACTAGGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTTCATAAACATATTCAAAAAAAAAAGAAAA:1 + chr2L 11080455 3' - invader2 4909 2 90.82 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAATAAATAGTTTAATCCTGCCTGTCTAGCATTTATTTTATGCAGCAA:1 + chr2L 13622031 3' + opus 7474 2 62.38 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGTGAATAATAGTGGTTATTGTGGGTTATTGGATTCATGT:1 + chr2L 11832594 3' - roo 8701 2 65.35 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAGTTTTCAAAATCAGC:1 - chr2R 25203747 3' + 1360 3380 2 70.30 GTTGTTATTATTATTATATGATACACCATTGCAATGGCCGTTTTGTTGCCTGTTGGCTGCCGAGCAAAATTGCTCTGAACTTTGCTGCACTTTGGCAATTC:1 - chr3R 10473573 3' - invader3 5055 1 64.36 GGAACTCTACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTAGTGGATTCCTGGTTACATTTGTGTTATTATAAATCGGTTAAGAGTAATATGTTTTTATAAAAGT:1 + chr3R 9188756 3' + INE-1 573 1 70.30 GTTATATCTATATTAAGCATACCTAAGCTTAATATAATATGCCTTAGGCATATGCCTAATATGCCTTATATGCCTATAAGCCTTTATATTCCATTTTATAT:1 - chr3L 14537050 3' - transib3 290 1 42.57 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGT:1 + chrX 7971009 3' + P-element 2845 1 37.62 TTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCATTTGGGATTATTGCCGCCATTGGCATTAGTGTCACCGCACATA:1 - chr3R 8544086 3' - Tirant 8219 2 57.43 TCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGGGAGGGCTGGGCGGAAAAGCTTCCATTGGAAGGTGGCGCACAC:1 + chr3L 3963675 3' + invader1 78 2 56.57 ATATTATTATTATTATTGTNATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTCGAACTGGGGAGGATGGAGCTGGATTTCGTTACCTGTCCCCTGGA:1 - chr3R 7599039 3' - mdg1 32 2 54.46 CTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTGACATTCGTATCTGTGTGTGTGCCAGCGAGCGGGGTGTT:1 - chr3R 26498986 3' + roo 8952 2 61.39 TCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGAGTGCAAATGACCACCACCACA:1 - chr2R 24397303 3' + opus 7168 4 79.07 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACGACATGACGATCCAATCCTCAAGCTGACGGGCTTT:1 - chr3R 17803059 3' - Doc 49 1 64.36 CATACGCGCGACACAACCGNTCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCAC:1 + chrX 20999585 3' - BS 18 1 52.48 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATATTTTAGGGGTAAAACTCACTCAATTTTTCG:1 + chr2R 16639735 3' + opus 7480 2 58.42 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGAGAAAGTGGCGGAGCAAACGGAAGGGAAAGTGGCCTCAAATGTGCTGTCAAATCCTGCACAC:1 + chr3L 22327376 3' - hopper 11 2 68.32 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTTATTTGCTCATT:1 - chr3R 24464798 3' - 412 7094 2 65.35 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATACTCGTATAACATACGTACGTAAAAAAAGAAGAAACTCAAGTCATTTAT:1 + chr2L 10942383 3' - 297 6602 2 56.44 CGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCCAGCCCTTCAACATCAGTTATGTGT:1 + chr3L 8526835 3' - Transpac 422 1 75.25 GTGGGTCTATCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGTGCCCGGAGTGAGGGTTAAGATATTGGACGAAGCCGGCCGAAGTCTGGGACACGGAGAGACGGG:1 + chr3R 19784887 3' - I-element 178 1 69.07 TTTTGAAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTAT:1 + chr2R 1076506 3' + FB 242 1 74.26 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAATATATATCTGCTGATAAATATAAGTATATTGTCGCATATGGCAAACTTTTAGCTGCATCGAAGTTTTGCGA:1 - chr3L 15390306 3' + pogo 2100 1 78.22 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCGAAATTTCGTGACAGCTGCAGCTGGAGAAGAAGAAGAGCATGAA:1 + chr3L 7156412 3' + Tirant 370 2 56.44 CAAAAAAAAAAAGGAAAATGAAAATAAACGGAGGAAT:1 + chr3R 21939172 3' + Doc2-element 250 2 75.68 ATGTACCCGAGCGGGCCGTGCGTTAAAGGGAAAATAACGAGCTCCCCGCGGCCTATAAAGGGTCGGCGCAAGCGCAGACCAGGATGTAAAAACCAAACACG:1 - chrX 22828189 3' + gypsy8 291 1 74.26 GTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGCTCGACTCCGGTAAAATTTGGGTTTTGGTGTTGTTGAAATCGGTTGAAGATTGTGTGATTAGTGCGATTG:1 - chrX 7580359 3' - I-element 4938 1 53.47 CATACAAAGCTACTTAGTTNCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCATGCTACAAAAGACATGCCCAGAAAAACCTACCCCCAGCCAGCCGGA:1 - chr2R 1922425 3' - gypsy 30 2 53.47 GGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGC:1 - chr2R 20520219 3' - Max-element 51 2 74.26 AGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGGCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAAC:1 + chr3L 23678148 3' - Osvaldo 25 1 75.25 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTTTACATATATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTCCTAGT:1 + chr2L 14979230 3' - Ivk 30 1 60.40 AATAAATTGTAATTATTTANTTATATGTTTTGAACACCTGGTGATTGCCAAACTGGGCCGAAATCCCAATCAGTCACGGAAAACTATGTTGTGTGTTTGCG:1 + chr3L 21275855 3' + HMS-Beagle2 7195 1 58.42 TTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATTTTTTTCAACTTATTTCCGGCTTGCGGGAGCTTCGACTTTCCGGATTTGCCAAGTGTTCGGATTGTGTTAA:1 - chr3L 2960417 3' + Cr1a 55 1 68.32 CAAATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTATTGTCCCCAATTAAATTAAGTGACCAACGA:1 + chr3R 9121497 3' + roo 9031 1 68.32 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACATTTCGGATCTTTTGAAACACCAAAGCCAGTAATATTTTGTACAAAATATGGGTGA:1 + chr3R 5993357 3' + Tabor 7305 2 59.41 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAA:1 - chr3R 10093716 3' - P-element 59 1 20.79 GTGAGAGGCACGACTTATCNCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTGTGATGCAATTTATATAACATAGATACCAATAAGTGATCACTTTTCCAAGTGCAG:1 + chr3R 17256006 3' - I-element 22 1 53.47 TACAAACGTATTTGGTTTAATTTACACATGCTGAATAAAAACCAAATAAAGATAAATATGCCAGATTGGCATTTACTGCTGGCACTCGCTCGCATTCACCC:1 + chrX 16169357 3' + gypsy10 343 2 59.41 CCGATTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACGTCCTCTTGTTTTCGCTTCCATTTTCGTTTTTAGAGGGGGGTGAAAAGTGGAAGGGGCTGGCGGTTCGGT:1 - chrX 18146948 3' + INE-1 547 1 59.41 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGAAATATAATTAAGTTTGACTTTATGGTT:1 + chrX 6496693 3' - I-element 49 1 75.25 CACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGGTGTGCGGCTTACTGCATCTTTTGATTTTGCGCCAGATATTTTACACT:1 + chr3R 13167953 3' - I-element 5007 1 52.48 CTTCCACCCATACAAATTTNAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGATTTCTTTCCCGCACACAAAGTTTTTGGCTGGCCTGCTCGTTGCAC:1 - chrX 3562062 3' + hobo 2674 1 53.47 AAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAAATATGTAAATACAATTTGGAGTTAACTTACCGTTAGGTTAAGATAGA:1 + chrX 7405140 3' + S-element 1690 1 60.40 AATCTATCGACTACGAGTCGATGATACTAATTGCTGGCGCGGGCCCAAATTATATGTGCGTTGATATTTTTGAAAACAAAGTTATTTTAAGTCCCTAATAA:1 + chrX 10446857 3' + G5 433 1 54.46 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGTATTATTAACGATTTGGTGAAAACAAAAACAAAGAGGTGTTAAGCT:1 + chr2R 19775189 3' - 3S18 29 2 52.48 AAAAAGGGAGAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACTAGATTTGTAATGGCGGTGATATTGAAAAGTGCGTTGGGGAAATACT:1 - chr2L 14728177 3' + Bica 347 1 55.00 AAACCTTATATATCTCTGTGAAGAAGATAAACAAAAAAACAAGTAAAAACAATAAACAAACACTTAACAAGCGCAATCCTTTTGGTTTGATTGCGTAATAC:1 - chrX 3562789 3' + Porto1 137 1 61.39 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAAAGCAAAAAAATAAAATAAAGATGAAAGGAATATAAGATTCGTAGCCATCGGGCTTATCAGCTTGGTGGA:1 - chr3R 6238983 3' + jockey 4978 1 60.40 TTATTATCGCCTTGTATATTGCCATTCTATTATGTAATTCTAGTTATTGGATAAAGTTTGCAATGAAAGCAGTTGGCAGGCTCTCAAATAGAGTTTTTTAA:1 - chr3L 26325027 3' - Porto1 4239 1 59.41 AACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTATAACGATCTAACGCTTATACATAAGCCTAAGCATACAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATG:1 - chr3L 9218281 3' + Stalker4 7082 4 54.00 CTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGTCCAACGGTACTTTAAACTGGCTTTCCAATATAAATTTCAATTAAAAATATTTGTTTAGCACCCGCTTCC:1 - chr2R 13622073 3' - opus 7268 2 65.35 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACCTGGAATGGTAGGACTCCAGTTC:1 + chr3L 6399540 3' + roo 352 2 78.22 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATAATACAATATTATGCAATATAATTGCTTGAAGTTCAGAAGAAATAAATATTTCGAA:1 + chr2R 20821422 3' - 297 6595 2 64.36 CCAAGCTTAAGGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAACGAGAGCGCGAGAAGGAAAAGGAGCGCGAGAAGGAAAAGGAGCGCGAGCGGGACAAGGATCG:1 - chr3L 3959755 3' - diver2 4694 2 67.33 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGAGATACGCTTTACTCGTCTAGTTTTAGTTCA:1 - chr3R 5594962 3' - 1360 43 1 70.00 CCCAAATCATTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACTCCCACGCTGTGTTCCTTTAATTTATTTATA:1 + chr3R 29065721 3' - Tc1-2 180 1 67.33 CGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGTGCGGGAAGTGTGGCATTTCCGTCCGTTCGATAACCCAAATGGCATACGTAAAAACTTAAATCAATTTTTGAGAAAT:1 - chr3R 1705176 3' + Cr1a 4410 1 75.00 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAAATTTCATATTTTTTGTAGACCAAATTA:1 - chr3L 7215504 3' + copia 5078 2 68.32 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTCTTAGGCAAATCTTAACGATAAAAGGGTTTACCTGGCCACCCCAATACAGAGACTTTACATATTT:1 + chr2L 21199216 3' + roo 400 1 70.30 GTACTTGCGGGTGCACACTTTAGAATCCGGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTTTTGGCTAAACGTTTTCATTATTTATGAATTGATCAATTTGTTGC:1 - chr2R 11738479 3' - gypsy12 10154 2 58.42 AATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATT:2 - chr2R 5277147 3' - invader4 42 2 72.28 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGGAATTTAAAAACATATGA:1 - chr3R 30284202 3' - blood 7033 2 56.44 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCCATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAA:1 + chr2L 2622777 3' + blood 350 2 51.49 TTATGTGTTGTAATTAATATATTGCCCCACTGCAGTGGGGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTTTGTGATGGAGCCGCCCTGAGTTGTATGCTACA:1 - chr2L 11537502 3' - hopper 1118 1 64.36 CATAAGAAAAGTACGCGTTGTTACGTTGAATTGAGAGCCGGCGCTCGTATTGCTCACGCAGGCCGTGCGTCTGGGCAACTTGAAGCGCTTCGGCGACGTGG:1 + chr2L 19053111 3' - Doc2-element 351 1 54.46 AATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCGCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCAGGTCAGCAGTTCTTCATCCGGTCTGATCACTCG:1 + chr3R 1588096 3' + Doc3-element 4507 1 66.34 AAAAGCTAGAAGGTTAAGATTTAGTATACAGATTCTAGAGACACGCATACACGCAGCTCTAGTTTGTTGACCCATGCTGTCACGCTCACTCTAACGCCCAC:1 + chr3L 22511714 3' + INE-1 165 1 89.11 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTGGTCTCGCCGTTGAATTGTAATTTCATTAAGCGGAA:1 + chr2L 19290620 3' + roo 9031 1 64.36 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACACAGAAATAAGGTATTTCAAAAAAAATTTTCAAATTTAAATTGTAC:1 - chr2R 22369558 3' - roo 8693 2 60.40 TTTCTTTTTAATATTTTAGTTCTTTTGTGCATGTACAAATAAAGTATTAAAGACAATTCTTAACAATATCTTGATAAGAACCAAATTTATATCAAACTCGA:1 + chr2L 16519123 3' - HB 1355 1 69.31 GTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTATTAGATATGTATGATAATTCACATTTCAATAAATGGCTGCA:1 - chr2L 20225683 3' + pogo 1895 1 59.41 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCC:1 - chr2R 11664334 3' - Tirant 8156 2 80.65 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTAATAATTGGATGTTTAGTACAAGATATCAGACATCGTTTGTTGCATTCTAAATCAATAAG:1 + chr2R 22369645 3' + roo 391 2 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAGAAAATATAAATGCTTTTCTTTTG:2 - chr2R 8254805 3' + roo 9019 2 81.19 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGTTTGTGTTAATTGAGTTTATGTTATCAAAGATGTGCTTTGTTGTGGTTT:1 - chrX 12881927 3' - hopper 26 1 53.47 GATTCACTAGAAACTATATACCTCTTATCTAAAATAAAATAAATTCATCGGGTGAAGTAAAGGCATTTATAAAGTATATACACTCCTCTCTAGTCTCTGGC:1 + chr2L 2644530 3' + Cr1a 4119 1 73.27 TGTATTATTTAGTTCTGAACTGACAGCCGAAATAAAGTTACGTTATCGTAAAACAACTGCCGTTGGTACGCATATGCTAGCAGCACTTTCGGCCACTTTTT:1 + chrX 5210766 3' + Chouto 123 1 62.38 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGGTTGGAAAAA:1 - chrX 7970963 3' - P-element 42 1 37.62 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCCAACTTCCCAAGGGTATTCAAAGCGAAAGGATGCGGAAACGAGCAAGGTTCCCTGGATAACGACTTCATTCGAA:1 + chr3L 1904260 3' + hobo 2937 1 77.23 AAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGTGATTCTATATGGTTTTTCACTTTTGCTGAAATGCAAAACAAAAAAAT:1 + chrX 7965328 3' - I-element 269 1 57.43 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAAC:1 - chr2R 5214993 3' - F-element 64 1 79.00 AGCGGCAGTTGTGCGCGCTTTAGTTAGAGAAGTAGGTTTAAGATTTACAATTTCTAGGAACATTTTTTGATTTGCTTGGCGGCTTTTTTTTTT:1 + chrX 12979304 3' - TART-B 10395 1 76.34 CATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTCAATGTTGCTATAGTTAAGCCAGCCTCCTGTAAATATGTTTTGTAC:1 - chr3R 1497788 3' - Doc3-element 4403 1 64.36 CCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGTGTTCCGAATATAAGCACACGTTTTCAGATAGACAACTGACCCCAAAGGTTATCGCTATCAGCCG:1 - chrX 21276825 3' + X-element 4503 1 70.53 CTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATCAAATAAATTTGGGAATAAAATCATATTTCCAATACTGGACTGCTTCAACTTTAATTTAATATATTTTCAAAAATG:1 + chr2L 4049468 3' - jockey 4566 1 78.22 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACAAGTTAACACAAGCCCAC:1 + chr2R 3097970 3' - roo 52 2 84.00 GTGCAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACTCTGCGGTACCCCACGCTTGCACCCCACACTTTCCGACCAACTT:1 - chrX 689384 3' - 1360 29 1 70.30 CAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATATATAGATTATGCCAGCGGCGATATAACTAATTTACAATGCAGAGAAACAATAAAAT:1 + chr2R 19352288 3' + 17.6 7406 2 65.35 TTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGGCACAGTTGGGTAAAAGTTAAGATATCGGTCAGTGGC:1 + chr3R 10187570 3' - McClintock 288 2 65.35 CACTCTAACGTCCACAAACCGCCAAAACCATCCAACCGGCTACGCCTGTCTCTCTATGCAATTAAGTACCTCCTCTACCCCAGTACTTCGCGTCGGATAAA:1 - chr4 590871 3' + INE-1 221 1 58.42 TTACATCTCTCCCCTTAGTCTGGAATACAAAGTACTCCTCTACAACTTTTTGCTTAGCCAGCTTTTCCGAATTATTGTGGCCACAATGGTGGATAGGACCT:1 - chrX 1625236 3' + Doc2-element 4299 1 62.38 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACCAGAAAATCTATTAACCAATTTCTTTGGCCTTGTAA:1 - chr2L 12764971 3' - Doc 37 1 66.34 ATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTATGTTTAAACAGATCAGCACAATTGAAA:1 + chr2R 5043341 3' + roo 9026 1 73.27 AACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAA:1 - chr2R 4673573 3' + Quasimodo 7366 2 70.13 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTACAATGCAGGAGATAACAATGTGTTTTCTCTCTGTGT:2 + chr2R 20145140 3' + opus 7470 2 62.38 AGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCCGCCCCCCTTTCCACCCACTGACCCGTACCGCCCCCTTTTGGGCTGCCCCATCGGCTTCC:1 - chrX 2336229 3' + G6 1693 1 62.38 ATCTTCTTATTTGGGATTTTACATCATCTTTTAAGTGAGCATTCAATCAAATTGGATTTCCTAATAACACGAAAATCTGTGTCCAACACCTATTTCAACA:1 + chr3L 20192502 3' + roo 407 1 51.00 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACTTAGTGCCGCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGG:1 - chr3R 15801081 3' + P-element 2851 1 43.00 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTATCTATGCCCTACCGAAGTTGCCACTTGAAGCAAT:1 + chrX 19607333 3' - Tirant 8112 2 76.24 CAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATAT:2 + chrX 21772504 3' - springer 47 2 66.34 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAACTTTAAGCATGATAAATGAGTGCAATTGTTGTTGCCGTGTTGGTGTTGCTGCTGTC:1 + chr3L 15777075 3' + I-element 5340 1 59.41 AGCTATTACTTATTACTTATTACAATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATCTTGCTTATCCAGACGACCTTTTTTAATGGCGGTCTAATGACT:1 + chr2L 16994868 3' + Stalker2 7649 2 43.56 CAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCCCCATTCGCCTAACCCTTTTCCCTTTTTTCCCTTCC:1 + chr3L 9220169 3' - BS 36 1 63.37 TCCTCCGGGTAGGGAGTTCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGAAGCTGGAGGGGATTAAGAATGCGGGATAAGTGGGACTCGCACTCGGACTC:1 + chr3L 4190168 3' - G5 4657 1 54.46 TGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTAGCAATAACGGAACAATATTG:1 - chr2L 21369834 3' - rover 13 2 67.33 TAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGAAGGTTCATCTAAGTATGTTCCTGTGTCGGGCAGAGTTCAAAGTGAGG:1 + chr3R 15841967 3' - I-element 5159 1 56.00 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGCCTGAGTTAATTTGAACGAACGCAA:1 + chr2L 22747355 3' + transib2 2802 1 57.43 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGCATCTATGCCCTACCGAAGTTGCCACTT:1 + chrX 19607325 3' - Tirant 8120 2 66.34 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTTTTATTTTATTATATAAATACTATACGTTCATGAATGGAGTGAAAGA:1 + chr3R 6239058 3' - jockey 4669 1 53.47 TTTGAAATAATGGAAGTGGNTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGTATTAATGGGAGACCGCATACCCTTCGACTCCTCAATGTAAA:1 - chr2L 9075568 3' - 297 26 2 61.39 CACACACACACACATATACATAGCCGAGCAAACCTACTAACCGTACTAACGCCTGCCAACTTGCCACGCCCCCTTATCCTGCGCCTTCGTCCTTGTCGAAA:1 - chr3L 9184700 3' + Quasimodo 38 5 68.32 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATGTGTATACATATAGCTTAACAAATACATTTATTTGGAAGTGGTAAACATTTTT:1 - chr3R 29607429 3' - 297 6596 2 65.35 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTGGGATGG:1 + chr3R 19094261 3' + P-element 2855 1 43.00 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCAT:1 - chrX 9439173 3' - roo 8709 2 75.25 TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATATATATTATAAGTTTGATTATATTTATTTGATCTTATCCATAACAGTGATGTTGACG:1 - chr3L 21275750 3' - HMS-Beagle2 6899 2 63.37 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAG:1 + chrX 11454360 3' - P-element 56 1 23.76 GAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGA:1 - chr2R 6438351 3' + Stalker 7223 4 59.41 AAATATTTTATTGATTTTATGTTTTTCGGTAGTTTTTGTAGCAACAATACTTAGCATGATATAAATGGATATGTTAAGGCAGGGTATGCCCAAAGTCGACC:1 + chr3L 5704691 3' - transib1 1924 1 76.24 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCCCCTATGTGGCGGAATGTGTGCCTAGATGGG:1 + chr2L 10020827 3' + hobo 2902 1 64.84 TAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTTGATTTGATTTTGTTGGTGTGGTCAAGCGGGGCTTTAATTGCATTTGACCGGCAA:1 + chrX 17722117 3' - I-element 5154 1 60.40 GCCGTGGAGGAGCTTCGAGNACAAGCATTGGCCGCTTGCACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATTTATGGACGTGTCCTT:1 - chr2R 9640365 3' - Max-element 56 2 75.00 TACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGCTTGTTCAGTGTCCTATGTTTTCTGTGTGGTTTGCGGTTGGTTTGTTGGTTGGTTCTATCATC:1 - chr2R 10461878 3' - Idefix 7089 2 69.70 TACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATGTTTATGTTAGTTAATCCAAACACTTTGCCAGCCCCGCTCATTAACATACTT:1 - chr3R 20836344 3' - 17.6 121 2 59.41 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATGACAAAACATTTAATTAAATTCGTTATAACATTTTTATTAGTTCTTGT:1 + chrX 23537695 3' - HMS-Beagle 24 2 55.45 CAACTTTTAAGTCTCTTTCAATAACTCGGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCAGATTTGAATTATATTATATATGG:1 - chr3L 25272486 3' - G5A 2551 1 73.68 GCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7198 2 80.00 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTAATAATTGGATGTTTAGTACAAGATATC:1 + chr2R 22369613 3' + roo 358 2 82.18 TTTTAATGTCAAAATTATTATTGGTTAATTATTATTGGCAGTGGCAAATCAAAAGACTGAGGCAACAAACTTGGTGCTCAAGCAAGTTCAATTGGCATGGT:1 - chr3L 3103446 3' - P-element 2506 1 59.41 TTATATGCTTTTCCTTCCTTTATAAGCTTAAGAATTAACATTGCTCGCGAGAAATAGAATGCTCATGAAGGAGCTTTAAAATTTAATGAATTGTGAAAAAG:1 + chr3R 28410516 3' - HB 406 1 55.45 CTAGCTGCAGTAACTACCAGCAGGGTTGCCTCTCTCACAACTATTGAAGATACAACAACAACTACTGAACGTACAACAGTCACAATCGGCGATGAATCACG:1 + chr2L 8239080 3' + Doc4-element 262 1 58.42 ACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGGACGACGACGAGGCTATTGACATGGACGATTTCGAGGAGAGCGGCATGCTGGAGCTGGTCGAT:1 + chr3L 18749900 3' + Doc 223 1 70.30 ATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACAGTATACAACCCATTTATATTTATACCCATATATGTATT:1 - chr3R 12379287 3' - 1731 4352 2 60.40 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACCAAAATAAATTCGTGCATAACCTGATTGTAAAGAGTA:1 - chr2L 11174931 3' + Transpac 5194 2 65.35 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCCGTGTTGAGCAGAAAACGCACGTTGTTGAGCAGTGAGGTCTTTTTCACG:1 + chr3R 5360027 3' + 412 7543 2 75.25 TGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTAACTCTGCCAAACGTTTGGTGTTTATATGTTAACTTTCCAGAGCGTTAAGAGATAGAATTTTGATTC:1 + chr3L 25162655 3' - Bica 4563 1 68.32 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTGATTCGATTTGGCAA:1 - chr3L 8749975 3' - Doc 47 1 68.32 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAAAAAAAAAATACTGAATGGAATCATGTTAAGTCAGAGGATAATCCAGCAGATTTAGCATC:1 + chr3R 19446467 3' + jockey 4971 1 61.39 CGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGATACAGTGACATTATTTTATTGTATAAAGGGTTTTAAAAGTATTTGTTGACATACAT:1 + chr3L 13840553 3' - G2 2969 1 62.38 CATCGAGGCATTGTGCAAANTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGTTCAAGCTGAAACTGAGGCAAACAAATGGAAACTAGCTAGCTGTTC:1 - chr3L 20148231 3' + pogo 2073 1 57.43 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGATAATTGTGTGCTTTATTACCCAAACAAATCATTAGCACTTT:1 + chr3R 13710723 3' - roo 33 2 60.40 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCGAGCTGTG:1 + chrX 20015550 3' - transib2 47 1 73.27 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACGAAAATAATTTTGAAACAATTTCGGAGTTAATATTGCATCAGCAATTCTGAACAGC:1 - chr2R 9191816 3' - P-element 16 1 63.37 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTGGGTGTGCTGATGTCCGTCTGAAAATGTTTAATTTGATAGCACTTGGCGTTACCAATCGAA:1 - chr2L 261594 3' - hopper 16 1 63.37 ACTGCTTGGCCGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATGCTGGCGAGTGAGCAGGACGGCGCTAGTCAGTGACAGCCGCCGACTGTTATACGC:1 + chr3R 6007517 3' + Ivk 382 1 60.40 TTATGGAAAATTACTAGAGNGCATTACTGATTTTTTTGAATAATGGGTTCCGGGGTCGAGAGAAATATGGCCAGTCAGCTGTCGATTAAGTTTAGTGCCTG:1 + chr2L 9075385 3' - 297 6641 2 56.44 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTGGGGTTCAAAAAAATATGCACGCAACGTAGTTATTTAGGATG:1 - chr3R 8856935 3' - rover 26 2 55.45 TTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTA:1 + chr3L 27415311 3' - transib2 20 1 59.41 GCCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGG:1 + chr3L 24566085 3' + gypsy8 211 2 76.24 AACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCACTGCCTCATCGGGTATATACTCCACGGA:1 - chr2L 9053384 3' + flea 251 2 70.30 ATTTAACGCTGGGCTGGTTTGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTAGCTGTATATTCGAATAAGTTTTCTTGCTGCGAGTGGGTTGCCCCAGTCG:1 - chr3R 10176370 3' - Doc3-element 4589 1 76.34 CAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATCACCGCCCATTTTTTTAAATTATACAATTTA:1 + chr3L 23579377 3' - McClintock 5993 2 76.24 CGTGGCCACTTGCGCCGCTTGGTTAGAAAGGGAAAATTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAACTCCTGTTGTTGCGACTCTCCT:1 + chr2R 22988606 3' + micropia 5210 1 74.26 AAGATCTCTGGACCTACTGGAAAAAGACACTGGACCAGTTTTCCGATCATAGCAGGCCCATTAATTACACATTACACATGTACACACACAGGCATACGTAT:1 - chrX 19846784 3' + gypsy 424 2 73.27 TTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGTTGTATAAACATAATTATAGATTCCTTTAATAGTTTGTTAAGGCAACGTCTTTGCATTTAATATTTCCGTTTTTA:1 - chr2L 7596201 3' - roo 8663 1 44.55 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGGAGGATTCT:1 + chr2R 20441303 3' - I-element 24 1 53.47 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTCCCATCACCAAAATAA:1 - chr2R 18850584 3' + P-element 2829 1 21.78 GTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAAGCAAATGCAATGAAATGAAAAGGATGGCCCCAGCGGGAA:1 + chrX 3135066 3' - 412 111 2 64.36 GACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGCCAACTAAGCTCATAAAATCCCACGAACAAGTGCCCAAGTGTA:1 - chr2L 16071109 3' + 412 7511 2 53.47 ATGAGAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTTTTAATTCTTTTCTTTATAATGGTATTTCTTTAATTATTGTAGAATGTTTGAAAAAAATAT:1 - chr3R 7848236 3' + Dm88 354 1 63.37 AAAACCAATGTATAGCCGTTACGCATCTTGTTATTTAGGGTCTTAGCTCCGCCAAAATGAGCAGCAGCAGTAAAATCGGCTGAAAGAATATGAGAGTTAGT:2 + chr3R 17539307 3' + 1360 3363 1 54.46 CGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACCTATTGAAACCTGGCCAAAACCCACGAAATGGAAACCAAAGTCAATATGTGTGAAAAATTTT:2 + chr3R 7582719 3' + 297 6967 2 70.30 AATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATTCTAGAATAATTCTAGTGTCTT:1 - chr2R 6086002 3' + 1360 454 1 94.06 AATATAAAAAATACTAAATATATTACTTACTCTTAAGCTTCTTTATTGAAGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTAAAATTAAT:1 - chrX 20880638 3' + HeT-A 5893 1 71.29 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATGATAAACAACAATAACCTCTAAATGTGCTCAAATAACTTTCTAA:2 + chrX 11624426 3' + roo 9041 1 63.37 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTG:1 - chrX 14317414 3' - 1360 35 1 60.40 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCC:1 - chr2L 13598205 3' - pogo 49 1 75.25 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATAAGGAAAGCAGACTTTACTTTAATCACTGCTGCA:1 + chr3R 22520984 3' + opus 499 1 78.22 GGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCTC:1 + chr2R 5651922 3' - Tirant 8118 2 70.30 TTATTATTATTCTTATTATNATTATTTTTTTTATTCTTCTGCTTTT:1 + chr3R 24572881 3' - mdg1 26 2 76.09 AATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTCGACGGCAAAGGCGTAGATTTATGTTGTTGACAAATGGAATAATGGGTATAT:1 - 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chr3L 4788684 3' + HeT-A 341 1 80.20 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTT:1 + chr3L 17136051 3' - BS 11 1 61.39 TGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATGCACGGGGCAAGCTGCAGGCAGTTCCGACTACCCC:1 + chr2L 12884379 3' + HMS-Beagle 7005 2 64.36 TAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTGTTACTCCGTCGAACGATGTGCAATTCGTGTTCATGTTGTTCTACCCAT:1 + chr3R 10103170 3' - I-element 4967 1 51.49 GATATATTGACATAAAAATNTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCA:1 + chr3L 27415292 3' - transib2 39 1 62.38 CTGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGCTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTGCCTTTCAAAGGATAATTTCACTTTGTTCTGATTTATAA:1 - chr2R 9627926 3' - I-element 439 1 61.39 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTCGCGGCGTGATTTTAGATCATTAGCTCACCG:1 - chr3R 10168117 3' - FB 44 1 68.32 AGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGCCATGCCCCCTTTCAAGTTTCCCCGCGCACTTAAGAAACC:1 + chr3R 19572893 3' + Quasimodo 7069 2 60.40 TATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAGAAT:1 - chr3L 27357539 3' + mdg1 402 2 57.43 TATAATTATTATTAGTATTACTTCAAAAAACAACTGAAGAAATTTGTTTCCTGTATTGTTATATTCCATATATATGACATTTTTTTTAACTTGGCTTAAAA:1 - chr3L 22634699 3' - mdg1 7084 2 72.28 GTATGTACATATGTATATACAAGCCCAAGTTAATAAGTAAAAGCTATCGGCATACGTTATATTTAAATTTGTGCCAACTGTACACACGTTTGATAATTAT:1 - chr2R 8338511 3' + invader3 5088 1 70.00 TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTT:1 + chrX 13134917 3' - BS 5035 1 50.50 AGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTGTGGAGATCGGGGAAAATATCTGGAGGAGGGGAGGTGGTACTTGGGCGGGAAAACGATAAAGTGGAAACG:1 + chr2R 19618805 3' - S-element 343 1 72.28 ATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCTGCATCAGTCGTGAAAATAAAACAAACGAATGTTGAGAAA:1 + chrX 11305979 3' - Cr1a 4321 1 64.36 AGCTGCAGGTGCAGGGCTCGACGGTCTTCGGCTGGCGTCCAAGTCGAGGGCGTACTCTTTGGCGCCGGTAGATCCTGGATTAGCCGTGGCGTTTG:1 + chr2L 3917251 3' - Chimpo 4189 1 74.74 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTAATTTATGTGCTAAAATGTTATCGTTGTTATCGCCGCCTTTGTGTGAGTGTGCCAGTTGTG:1 - chr2L 17245681 3' + 1360 3354 1 60.40 AGCAGAGGCAGTAGTTATCNATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGG:1 + chr2R 5532331 3' - G4 3770 1 50.50 CTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTGCGTCTCGTTGATAATCTCCGTCAGCTTCTTGCCATCGATGAGCTCCTCGTAGACGAACATCGTCAC:1 - chr2L 5944332 3' + 1360 3211 1 75.25 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAGTTTTTGGTTTCTCCACTTTTCCCGTTGGCTCGACTATTTTTAATTTTTGTTAGTTTTGGGGTCGCCAGA:1 - chr2L 17131509 3' + mdg1 417 2 70.30 TATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATGTATGTTAGGGTCAGGTTCATTGACTTGAGCAAGTATA:1 + chr2L 6170196 3' + invader3 5463 2 78.22 CTAAGGGGGCGAAGTCAAGNCCTCCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTGTACCACAATATCAAGTGCC:1 + chr3R 17814512 3' + gypsy 350 2 79.21 CAGATCACGGTGAAGGGTANTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACCGCTTTCAAAAGTGGGCGGGGCTGAGAGCTACTTTT:1 + chr3R 16193777 3' - BS 4785 1 61.39 GTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACAAAGTTTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAACAATTTGACGCCTCAGCAGCTTCCGCC:1 + chr3R 30220103 3' - 1360 370 1 73.27 TGCAGCTAACTATCGATGCNGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACAACTCTAATGA:1 + chr3R 28333605 3' - pogo 17 1 62.38 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAACTTAAATGCAAAACACTTCAAAATTGTCTGATTACGAACGCTGAA:1 - chr2R 6824659 3' - Doc 38 1 54.46 CTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACAGGACGAAGGGAAGGCAGCCAGAGTGAACCTGTTGCGCACAACAACAACAAACTGCACGAAA:1 - chr3L 4976622 3' + Doc 4517 1 62.38 GCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTAT:1 - chr2R 5260087 3' + 1360 3223 1 65.35 ATATAAGGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAACGGACACTCTTTTGAACGGACAACCTCAATCTAAAA:1 + chr3L 7215550 3' - copia 4904 2 62.50 CTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGGTGAATGCCTAGAGGGGTGCCAC:1 + chr2L 17166588 3' + flea 4805 2 77.23 CCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCGCCCAGCAGTAGTGCTAATGTTTTTGATTCTCCACGGCAACACG:1 - chrX 1486999 3' + Doc 4503 1 61.39 CCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAATAAAATGAAAACAATGCGAACGAATGGAA:1 + chr2L 7285948 3' + I-element 68 1 79.21 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACTAAGCGTTAATACGTTAAAATAATGAAATGTGTTTGTTTTTGTGATT:1 + chr4 1043600 3' - Doc 40 1 53.47 TCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGCAGACTCAA:1 + chr2R 6482760 3' - gtwin 6926 2 69.31 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTTTTTCTTCTTTTCTTTTCGCTTCTTTTGCTGTGAAAAATGAATTGCCCACTTTTGGGGGCAATTTTAATTGACAGT:1 - chrX 11182720 3' - jockey 7 1 81.19 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGTATTAATGGGAGACCGCATACCCTTCGACTCCTCAATGTAAA:1 - chr2L 9075568 3' - 297 22 2 60.82 AACTCAACGAGTAAAGTCTNCTTATTTGGGATTTTACATTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATATTTT:1 + chr2R 9871587 3' + roo 9055 2 62.38 ATATTGTGCGTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTACAATCCATCAAGAATGAATAGTATGATCGTGATCGTAGCTGAGAATGTATAACTGATT:1 - chr2L 22108175 3' + Bari1 1691 1 63.37 TGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTGAGGTCAAGCGATACATTAGAAAAATGAAGAACGAAGAAATACAATGAAGTTTATGTTAAGTTAAG:1 - chr2L 23390700 3' - G2 2959 1 62.38 TGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTAACTATATATACATACTCGTATAAAATACGTACGTAAAAAAAAAAGAAACTCAAGTCATTTATCTTGA:1 + chr2L 10942388 3' - 297 16 2 59.41 TTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 10435 1 73.20 CACAAAACCCCCAATCTCCGAACACTTGCGAAATTTCTTTACGTATACCTACGGTGCCTAGTACTGGGACAACACTGCAACGTTGCATTTCTACATTTATC:1 - chr2R 10529291 3' + Doc2-element 481 1 79.21 AATTAAAAAAGTTCAAAGTTTTGTCATGGAAAACAGTAGCACAGGTATTACATATTTCTACTTACTGTAGAATTTCACCAACTATTGCATTGATTTGTTTT:1 + chr3L 3863708 3' + transib1 245 1 47.52 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTAATAGATATTAAGTG:1 + chrX 17098419 3' + roo 9031 1 77.23 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCACATGCCAACGAGATGGAGAGTTGGAGGAATACTTAGAG:1 - chr3L 6619771 3' + 412 459 2 58.42 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACGTGCTCGCTTTTTCTGTCC:1 - chr2L 13549274 3' - P-element 53 1 24.75 TATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGGAGTTCTGTGCTCCGGCAAAG:1 - chr2R 20392780 3' - G4 178 1 78.79 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCTTTTCAAATTGCCAGAGACATTTGTTTGCTTGTGTGTGTGTACACAAAATATTATTTTCTTAATTGGTGTTT:1 - chr3L 13589529 3' + hopper 1414 2 76.24 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGA:1 - chr2L 9521673 3' - P-element 57 1 22.77 TTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCAGATTAGTTTTCTTGCGAGGAAATATCTGTAATTGCTATATTTATAAACATTACATTACAATATAAATCG:1 + chr3R 10445169 3' - Doc 4533 1 56.44 ACAGTGTAGGCGGAAACAGCTCAGCAACAATTTAATCATTCCCCAAAAGGGCAGCTTTTAAATAACATAAACAATAAAAATAACAAAAAAAAACAAATTAT:1 + chr3R 23150788 3' + gypsy5 7101 2 74.26 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTTTTGAACTCCTATCTAATTTTGCATATTTCTCTTGTATTG:1 - chrX 11624358 3' - roo 34 2 60.40 GAGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTGCAACATTGTGCAAATTACGCAAATCCTTGTGAAGCACATTAATGCGCAC:1 + chr2R 20973093 3' + hobo 2918 1 56.70 ACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATATACGGCTCATCGGGACGAAATATTTCCGCTCAATTTTACAATTTTTGTTTTTTT:1 + chrX 12685343 3' - McClintock 13 2 49.50 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATA:1 + chr3R 14049402 3' + transib2 2778 1 71.29 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAAAAAATACAACAGCCTTTTAGGATTTCCCTTAGTCA:1 + chr2R 18043992 3' - pogo 36 1 71.29 CACACGTCGGCGATCGAATTGATTGATCAATTCTGATAATAATCAATAGCTGATAATGCACCTCTATTCTTCTATTCTTGCTGTCGTCTGCTATGTTGTCT:1 - chr2L 22256782 3' - F-element 11 1 55.45 CACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGAGGATGTTACTAGAAGGGCTTCTTCTATTTATGGGGTGATAAGAG:1 - chr3R 3005958 3' - Ivk 32 1 54.46 CTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCCAAGTCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCATTTTCTGAGGTGGCAAAAAGCCGTAGGTATGGAATTGTTATGATT:1 - chr3R 27088433 3' - X-element 4264 1 50.00 AGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAACAAAAAACAAAAAACATTTTGTGGCCGTAGAACCCGTGCGAAAAATAAAATAAATAAAAATAGCACG:1 - chr3R 17891853 3' + Doc2-element 4753 1 57.43 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGATGTGGATATCCCCCACCCAATTTTTTGCCCGAGGTCCACACACGTGCCACGAGTCAGTCT:1 - chr3R 7582601 3' - 297 6589 2 71.29 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTATTTAAAGTGTCCGCGAAAGATGGCCAGCTATAATGACGTCAAAGTTGTC:1 + chr2L 9075655 3' + 297 6954 2 57.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATC:1 + chr3R 18883826 3' + roo 9037 1 57.43 ACGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGCACATGGCATAGCGTATTCATAATGTGTTGTATACATCTAGTGGTTAGT:1 - chr3R 20381092 3' - jockey 36 1 50.50 AAATTGAAATTAAAAATCAAATCCCAGGCCCCCAACTTTCTGATTTACTCGTAGTTTCATGGACGCTCTGAGATAGTGATGAACGGATTTGGGAGGCGG:1 + chr3R 5264559 3' + P-element 2642 1 78.79 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTGGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTTCCGAAAAAATCATTACC:1 + chr3R 20134035 3' + 412 437 2 81.19 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACACACTATGTGGGCAATGGGCTTCGGTT:1 - chr3R 8812575 3' + P-element 2838 1 31.68 GAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCACCGTCCATTGTTGAACCGGCACCGGCACTTCTCCACCTGCTTAACCACCTGGGTGGTGTA:1 + chr2L 7256102 3' + micropia 5300 1 63.37 CACTAATCATGTGAGGACTNACATGTGTGTATGTGTGCCTGCGTTTGGGCGACTCTATGTTTGTGTGTGTGTGTAGCCCCAAAAGCGGGCTACATAAAAAA:1 - chr3R 17362856 3' - BS 4994 1 77.23 CTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATACCGTGACGTATGTATTAGATCAATGATTTAGTTGCACCTGCTAGTTGCTGTCGTCA:1 + chr2R 21082925 3' - Bica 430 1 53.47 TCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1 - chr3L 25232769 3' + accord2 174 2 54.08 GTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGC:1 + chr3L 23678125 3' - Osvaldo 27 1 72.28 TTTGCTTTTTGATGCACTCAATGGGTGCCACCAATTTCGAACACAAGAAATATTTGAAATTAAAGACGACATTTGTTGATTTTTTAATAAAAAATAGG:1 - chr2L 13803041 3' - hobo 2589 1 72.45 AGCTGTGTAAGCATTTTTGACCCTCTGGTGCTGATGCTGCTGCTGTGGCGACGGGGGTGCCAATGTGATTGTTGGGCAGGGCGTGGTTCATAAGGGCGTTT:1 + chr2R 22499564 3' - Quasimodo 345 2 73.27 GGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGTTGATAGTGTGTGTGTGTGGAAGGCTTTGTCTTTGTGCGTTCGCGTTTTGCCGGCAAAACCCAGAT:1 + chr3L 10014065 3' - jockey 197 1 59.41 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCGCATGAGTCGTCTCTTTAAATGAGGTTGCC:1 + chr2R 6074445 3' + 412 7520 2 56.44 ATGCACGCTGTGTTGTATTAACCGAACATCCGGCTATTCTGCGTGGAGCGGCAATCAAACATGTAACTTCCTAGCTTCCTACATACTTATACACATAT:1 - chr3R 3267542 3' - mariner2 197 1 71.43 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACATATATATGTAAATGGTTTTAATTACGTGATTACGCTTACTTGTGTCTCGG:1 - chr3R 19955212 3' + hobo 2934 1 68.67 AGATACTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAGCACTGATTAAATGGTAGTAGCGCCTGTTGATCGAAGGGCGGGCTGGCTGGGAACCCCTTTGGCCACAGT:1 - chr2L 2536996 3' - Chimpo 473 1 57.43 TCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAATCTGAAACACATCAATTCCCTTTGCTCCATCAACGATAGCATCTGGTAAGGAAAACGCAACA:1 + chr3L 25730997 3' + Quasimodo 7042 2 65.35 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCGATTGGGGACCTTATTCCAGT:1 - chrX 17106184 3' - HMS-Beagle 6846 2 77.23 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAAACTTGGTTTAAAATTGCCATACATTAACAACGTGT:1 + chr3L 11523341 3' - hopper 37 1 62.38 AGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCG:1 - chr3L 26852654 3' - 1360 51 1 71.00 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAA:1 + chr2L 20992941 3' - I-element 46 1 70.65 CACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTTTCTGCTCCTCGTCCCCGGACATAAATAATTATAAATA:1 - chrX 17175751 3' - I-element 319 1 73.27 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGCACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCA:1 - chrX 8308734 3' + opus 7464 2 66.33 TGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGC:2 - chr2R 6482688 3' + gtwin 423 2 77.23 CTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAACAGGGCCAATAGAAAAGCTGGCAAACAAAATAAATGTGTAAATGTGAAGAAGCAAAAAACTGGCAA:1 + chr3L 17182255 3' + Doc3-element 4535 1 72.28 ACATAATTAGATATTACTAACACTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTGCCCATTTCTGTACGCCTTTAAAATTAATAACATTTTCCAT:1 - chr2R 20756669 3' + Cr1a 4285 1 63.37 CGTGTTCAGTTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGTCATGGCTGTGGAATGCCAGCCCCTATAATGGTGTACCTCCTGGCCGATTCCCTACCT:1 + chr2L 18895539 3' - invader2 164 2 62.38 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTG:1 - chr2L 21369858 3' - rover 37 2 66.34 CACACTTTTATTTAAAAAAATAATTGTTAATTTAAAATACCGTGTAAATAACTGTCAGCCAATTGTTGTTTAATCGCCAGCTTAGCTCTGTTTCTCCATCC:1 - chrX 3554936 3' + transib2 2628 1 59.41 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATGGCCATGGACAGAGTCACCTTCTTTCCATTCTCC:1 + chr2L 18239475 3' + hopper 1365 1 64.36 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACAAATTACATAAATAATAAAGTTTTATGACACTTGTAAATACAACTTTTTAGCAACTTTTAAAACCGCTTTTCCAG:1 + chr2L 18585958 3' - Doc 41 1 43.56 GAAAAAAATCACAAGGGGGCAGATCGGGAGAGCGTGCCGGCTTTTCCAATTCGCCCCTAATTGAGATAAGGCGCTAAACGACGGGTTCCAGCCACTGACGA:1 - chrX 22825460 3' - mariner2 581 1 74.26 AACGCGTACTTCTCCTACATCTCACCAACAACCCCAAACGCAGACATGGCGATACAAAAACCCACCATATAGATTCGCAGCGATATGTGAGCATTAATTGT:1 + chrX 18406262 3' + F-element 264 1 57.43 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGATGTGGATATCCCCCACCCAATTTTTTGCCCGAGGTCCACACACGTGCCACGAGTCAGTCTTT:2 - chr3R 7582599 3' - 297 6587 2 73.27 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCGGGTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTTGGTGAGCGCCTAGTTGTAGGCAAT:1 + chr3L 2325490 3' - hopper 17 1 57.43 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGATGTCAAGGCAGGTCAACTTTACGAAAAAAAAGAGGAGAAAATTTGGGGAACAAATTGGAGTATGGGAAA:1 - chr3L 2325375 3' - hopper 5 2 71.29 AAAAAAAAAATGAAAAAGACAAAAATCCAGCTTTGCATACTTGCAACGTCTGATTAATTTACATTTAAGTATCATATGCCTTAAGTTTGCAACAAGTGGGG:1 - chr3R 9914999 3' + Doc2-element 233 1 60.40 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGCGCCGGTGGAAATAGCGACCGGCGA:1 - chrX 15498968 3' + P-element 2836 1 27.72 TGGACGTAGAGTGCGAGTGNCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTAAACTTTCACTATCTGGCTTTGCAGCACTAATTGAATTTTTTAGTATGTGAATGCCTAG:1 + chrX 1716720 3' + hobo 2923 1 63.37 GGTTGTTACCGCTGCGGCGAAGCTGTTGCCATTCCACCTCACTCTAGATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCATCTCGTCCCCGCACATCTC:1 + chr3R 2831900 3' - Rt1c 5244 1 55.91 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATGTGCTCGGGGGCAAAAAGGTG:1 + chr3R 29375025 3' + mdg3 222 2 56.44 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATAGTAGTTTA:1 - chr2R 13647833 3' - blood 42 2 65.35 TGTTGTTATTATTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTAGTATTCTCGTATATTCTGTGAGCATGTCCAATTGCCG:1 - chr2R 12577087 3' - mdg1 19 2 50.62 AAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTTCATATTTAATTCCCATCCATCTTGCTGCGCTGGATGTCCTGTTCAACTTCTCCGTCTCCGGT:1 - chr3R 22204480 3' + micropia 350 2 56.44 TTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCCAACTCACTTTTTAGAAAATAATGATCATTTCGGAAAGTTCTTGAACAAATGAATATCTATATTTCACA:1 + chr3R 5363298 3' - HB 297 1 65.35 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAA:1 - chr3R 10093713 3' - P-element 56 1 23.76 ACCGTGTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCCGCTTGCCGTAGGATGGTTATTTTTCTTATTAAGCGAAATACCAATAACTAATTTAGTGCGCAATTTG:1 + chr2L 3284242 3' + GATE 8151 1 55.45 CAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCATCTGTTCGCCCTGCTTATTGGGTTA:1 - chr3R 30335407 3' + F-element 4425 1 75.25 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTATACTGGAATACCTTTCTA:1 - chr3R 19446656 3' - HMS-Beagle 32 2 58.42 CGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAAAACAAACAACAAAGGCTTCTTAA:1 + chrX 21087676 3' + mdg3 237 2 58.00 CGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTTCGCTAGAACTTAATGACCGTCAAACAAGTTGTA:1 - chr3R 1439625 3' + G-element 8 1 69.31 CTAGAGGGTTGGTGTTGTTNAATATCGCACTTAAACCGGATAAAAGGTGAATGTGATTCCCCCAAAACAGAGTGACACATTTTAATGAAAGGGAGACGCGG:1 + chr2L 10305717 3' - I-element 5091 1 78.22 ATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTTTTATTGTTTTATCGGTTGAGCCCCCAAATGTAGGATATTTAT:1 + chrX 22426240 3' - 1731 32 2 53.47 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTGGAGCTTACAATAGCAAAGTACTAGGCAGCGATTAAAAGTAATGTT:1 - chr3R 18549900 3' + pogo 2076 1 53.47 CCTGACGGCTGCACCCAACNGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGGATGCATGAGAAAAATCGCAGACAAAGG:1 + chrX 4279543 3' + blood 7342 2 71.29 CGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCCGCGATGCAGGGCGTCGTCCGAGAGCTCCTCGTCCTCGAGCGCCCAGTGGCCACCAGGCTCGGCGATGACCGAG:1 - chr3R 29683449 3' + gypsy8 30 2 66.34 GCAATTTGCAAATTATTTTCGAGCTGTCATAAAAATCAGCAGGTTATCACTTTCGGTTTCTGAGATGTGACTCCTAGTTGTTGTTGTTGCGTTTTCAAGG:1 + chr3R 6995034 3' + Juan 235 1 75.00 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAAAAAATAAAAAAATATCACATGAAAACCATTTGTACGCCCTCGAATATTGCACGCCCCCGTCAGAAGGA:1 + chr2R 11524545 3' + I-element 5336 1 56.44 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCAAAGCGTTCGTCTCTAGTTTTGTACAAGTGCTGTGCAAATAATGCACAAAAGTATTCTA:1 + chr3L 13589645 3' + hopper 1401 1 65.35 TGATCTTGTGTTTTCGTGCAAAGTGGTCTTATTTTAGATAAACATGGAAACCGAAATGTTGTCTGCTTTTAGGCGCCAGAGTGGGCGTGGAGAAAATGTTT:1 - chr3R 25750904 3' + Cr1a 392 1 70.30 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCG:1 + chr2L 19907961 3' - Tirant 8147 2 66.00 TTCGGATCAGCGGCAGTTGTGCGCGCTTTAGTTAGAGAAGTAGGTTTAAGATTTACAATTTCTAGGAACATTTTTTGATTTGCTTGGCATTAATGGCTCCG:1 + chr2L 16247156 3' - TART-B 10403 1 75.25 ATCATTGTTTTTTTTTTCTTTTTAACGCGCAGATG:1 - chr2L 16261503 3' - transib2 2641 1 91.43 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAATAAATTTAATTAAGTCGATTTTGTAAGACCCATTTCCTTTAGTTTGGTCT:1 + chr2R 7940826 3' + Juan 4181 1 58.42 GATATCTTGCCGATGCAGCNAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTACATTTTATAATTAATTTAAACCAAAAAATACTCTCGATT:1 - chr2L 12773928 3' - pogo 30 1 68.32 AACAGGAGGAAAAGCTTGAGAAAAACACCGGTGGAATCGTGTTAGCGGATTCCCCCGACCCTCCTTCACCATTCCTTGCTTTTTTGACATTTTTTATTTTA:1 + chr2L 20518074 3' - Gypsy12A_LTR 2015 1 52.48 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGGATCACGGCTCCATAAAA:1 + chr3R 7085764 3' + P-element 2830 1 22.77 TTTCCTTTTTTTTTTCCTTTTTTATGTTTACTTAAGCTTTTGAAGGAAAACAAACATCTTACCTTTTTGTTAGTAAAACTGTGATTTTAACTATGTTAAA:1 + chrX 7805177 3' - Doc2-element 245 1 59.00 TGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATTTCTTCGTTTCTAATTTACCATTCGGCTTTTGTGATTGTTCTGAGCATTTTTTTTTTTGTTTTGATTCC:1 + chr3R 15877209 3' - Porto1 4401 1 89.00 TTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCCCTGTGCGCGGTGTTTAGCACCTGCCTGTCGGAAGACGAGACCC:1 + chr3L 16129960 3' + P-element 250 1 48.51 CCGACACGGCCATCCTGACCTTTACACGTCCTCGTGTAATTATAATTTTCTTTAAGTCGGTTTGCGCAAACTTTCCTTTATGTCAAACTTTCGTCCTGCTG:1 - chr2R 19954929 3' - invader4 2744 1 68.32 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTC:1 - chr3R 10741083 3' + 1360 3369 1 58.42 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGGACCTTTAGGTTAATCGAAAAACTTTTACCAAATCATTCCGGCAAATTGCCACTGAAAATAGCCGGCTAACCGCA:1 + chr2R 18073335 3' - hobo 1 1 76.24 GTCATATCAAGGTGAGGTANGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATGTATATTCAAAAAAAAATTTAAACTACTG:1 + chrX 23035800 3' + opus 7453 2 77.23 GGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTCCCATTCTTATCGATCACGCATCCACCCAAACAATCCTGGCTGCAGCAGGTGTGCTCATCGATGCAGTTGTTTCT:1 + chr3R 21578691 3' - Juan 4026 1 76.24 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGG:1 + chrX 19607295 3' - Tirant 43 2 66.34 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGC:1 - chr2L 13598209 3' - pogo 53 1 79.21 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTATCTATGCCCTACCGAAGTTGCCACTTGA:1 + chrX 19607327 3' - Tirant 8118 2 70.30 GAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATATTTGCCAAGAAAAGCAATACTTATGTTCGTGAGATGTATTCAAAAGGATTCGAGCA:1 - chr2L 18589649 3' - Cr1a 283 1 56.44 ATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTCACCCCGTTGAGTTCACATATCACGAGTGTGAAG:1 + chr3R 13441927 3' + 1360 3347 1 70.30 GCGAAGCGAGGCTTTAGGCNGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAACTGAAGGCAAAAGG:1 + chr2L 20992955 3' - I-element 40 1 58.00 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGACTGATTGTTAACTGTGTA:1 + chr3R 13686601 3' - 412 7110 2 79.21 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAACAGCAATAAAATAAGAAATCATAATAAAACTTAATGTGCCGAGAAATATATTTTCGTAAATGGCTA:1 - chr3R 14596208 3' - 412 68 2 72.28 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGATGGCATGGCTGAATAACAATAATTGCTTAAATAAACACCACGACAAATGCACATTAATAAACATCA:1 - chr3L 10161713 3' - Doc 4 1 75.82 TATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAGTTTTGATATATATTAACAGAGTTTGCGTTGCTCAAGAGGGCGGAATTTAGTTCGTATTG:1 - chr3R 10718038 3' - Juan 4042 1 61.39 GCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCGCCAGCAGGAGGACAAATAGAAGCCAAGCAAAACAAAAAAAGTATGATGCGAGAGAAACGTTGGAAAATG:1 + chr3L 7213887 3' - Cr1a 4076 1 67.33 TAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGTATTATTAACGATTTGGTGAAAACAAAAA:1 + chr2R 19775172 3' - 3S18 43 2 68.37 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGAGTCTTGTTTTATGGCGG:1 - chr3R 13441895 3' - 1360 49 1 79.57 CTTATCTCTTCGGAGGTCGNAGTGGTATTGAAGTGGTATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCAAGACACTTTATAGCTAAATAAATGTTGTAGCTTGT:1 + chr2L 7552499 3' - I-element 9 1 52.48 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGG:1 + chr2R 9871574 3' + roo 9042 1 54.46 ATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGGCCTGACTATTATAATTTTATAGCTTTTTAATTTTTTTATATTCCAAATTGCTGCTTTGTGTATTTAA:1 + chr2L 13806812 3' - 1360 3097 1 67.33 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCG:1 + chrX 16272495 3' - pogo 40 1 64.36 TTTTTTTTTTATTTGCCTTTGCTTTATTTCTAACCTAATTAAGTGTTCCCTACTTTTCGTTCAGTTGTTGTCGGCTATCTAACCACTGTGCCAAGGAGGTT:1 - chr3R 8040617 3' - F-element 4679 1 80.20 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATAAAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATGGTATTTCCTTCTCTTAAGAGGTTTA:1 - chr2L 4923256 3' - BS 5045 1 70.30 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGATCAATTCTGATAATAATCAATAGCTGATAATGCACCTCT:1 - chr2L 22256818 3' - F-element 46 1 60.40 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGCC:1 + chr2R 8528252 3' + Transpac 265 2 70.30 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCAC:1 - chr2L 13310247 3' + mdg3 213 2 57.43 TTATGGAGTGTGGAGTTACTTAAATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCAGTGTTTACACCGCCCAGAATTCATTTGCAAGCCG:1 - chr3R 22663978 3' - Helena 1178 1 62.38 AAGATAAGATAAGATAATANAATACGATCTGCTTAGCTAGTTAATGCCAAAATTAATACTATAAAAAACCATAAAAATACATATATTATATTCCAGACACA:1 + chr2R 23051908 3' + Stalker3T 203 1 76.24 AATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGATCATAATGTTTAACTGCGGCGTAATTATACACATTTTGTG:1 + chr2L 7991886 3' + P-element 2855 1 45.00 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCGGTCCTCATATTTTCCTGCCAGAGTCGCTCGATTATTATTCATATTTATTGCGTTTC:1 - 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BS 31 1 58.42 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCACGTCATCCCAAAAGAAAACACACCCACACACACAGCCACAGAGCGCCCTAA:1 + chr2L 261685 3' + hopper 1389 1 53.47 CGTGTTTCGTCCTTTTTGACAAACAGCAGTGCATTGTGGATCATTTTAAGTCCATTTATCTCCCATTTTTCCCAGTGCATGTGGGGTTCCAGCTTGATTCT:1 - chr3L 964124 3' - Tc1 492 1 52.48 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCGGTCCTCATATTTTCCTGCCAGAGTCGCTCGATTATTATTCATATTTATTGCGTT:1 - chr2R 21454299 3' - hobo 19 1 59.41 ATTATTATATTATTATTATTGTTTTCGGAATATAGATGATCTGATTTCCCAGAGCGTTCCCTCCGGATTTCGTATACCCATCTCTTTCGTTGGGAATCGC:1 - chr3R 10557744 3' - invader3 5046 1 73.00 TCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAAAAGAAAGTAACTAATTTTCTAAAACCTCATGTGTCGGCCT:1 + chr3L 21674678 3' + Doc3-element 4431 1 70.30 GACGGGACATTAGTTCGACNCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTACCTGTTTATGTGTGGCACACACCTCCAAAACAATTATCAT:1 + chr3R 20556034 3' + 297 6952 2 60.00 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTAACTAAAAATAAATAATAATGATTAACAATTTT:1 + chr3R 7134399 3' - blood 42 2 66.34 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGATAAAATATA:1 + chr2L 12485472 3' + roo 9046 1 61.39 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATGTGA:1 - chrX 8308715 3' + opus 7488 2 63.44 TATTAACTACATCAGAAGTGTTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATG:1 + chr3L 25059157 3' + mdg1 402 2 61.39 AATAATAATAAAAATAATAAAAAAAAAAACACCACACAGAACCCGAAAACACTAACAAAGCGGACTCCTCTCGGCTGTCGGACATACTTTGCATACAAAGA:1 + chr3L 2735497 3' + mdg1 25 3 68.32 CTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAACAAAAGTGCGAAAACAGCAACGTGCG:1 + chrX 14696168 3' + F-element 472 1 82.18 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTAACGATTGGCCGGAGTGGCCGGTGATCAATGCCGAGCT:1 + chr3L 20079768 3' + mdg1 7423 2 60.40 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTACCAAACGAAAACGAATAAACATTTCGAGTCATTAAGCAAACAAACAA:1 - chr3L 5512419 3' + pogo 2078 1 54.46 CTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATATTGAAACAGTCCCTGTAGCCTCGCTGGATTGGTTG:1 + chr4 605521 3' + accord 39 2 66.34 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGG:1 + chrX 19034166 3' + hopper 1367 1 71.29 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAATAACACAACATTTACATACACATGTACATCGACATGAGGATGTGTGAGTTGGGGGCGGGACCCTATGGT:1 - chr2R 20389397 3' + pogo 2098 1 72.28 TAGCCACGACATCTATAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGCGCCAACGACCGAACATTAGTCATC:1 - chr3L 18210626 3' + gypsy7 5450 2 75.25 TTGCATACTTGTGAAAAACNCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGGTGCCACGCCTTCTCACGGACACAAATGCACACTTAG:1 - chr2R 13316135 3' + hopper 1378 1 60.00 CGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAAAACAAACAACAAAGGCTTCTTA:1 + chrX 21087675 3' + mdg3 5489 2 57.58 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACACCCACGCACAATGCGAATTTTCGAGCGACCAAAAATAATGCTGCATACTT:1 - chr3R 13395393 3' - jockey 4785 1 49.50 GCACCTTTTCAACAAACAACAAACTCAATGGGTAAGGGGTTTGGGTCACAAAATAAACGAATGAAATGTTTTGGATAGTGCCACATTTCACCATCCTTAAT:1 + chr2L 3495057 3' + 1731 316 1 73.27 ACAACGAGTAAAGTCTTCTNATTTGGGATTTTACAATACCTATAGGGAAAATGTAAAATTAGGCTGCCAAGAGAGCGATTGCGTAATCGGATTCTCAACCC:1 - chr2R 8674116 3' + roo 395 2 65.35 ACCAAAGACACTAGAATATTCTATTCTATTATTCTAGTGTCTTTGCACAAACTCTCTGAGCTAGCCGCTGCAATCCGTAGCGAGCGAAAATAGAAAATCAG:1 - chr2R 601790 3' - Tc3 312 1 72.28 CTGTGTAGTATATAAGTATACTAAGTATTGAAATAGTATAAACCATCGTAATAATAGAAATAAAACATAAATGAAATAATCACAAAATAGACCAACAAACT:1 - chrX 7470209 3' + Doc2-element 158 1 36.63 TTTATCAGTCTTCTATGATGTATGGTCATGTTATATTTGATTTTAAAAAATGTTGCATACTTCTACGGGGGGATTTTTTTATTATTTTTATTTATTTCATT:1 + chr3L 18649983 3' + Transib5 2765 1 65.35 GAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAATGCAAAATTATTAGCGAAAAGTAAAAAA:1 - chr2R 5652579 3' - Tirant 382 2 71.29 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTATGTAATTATTTGCAATTAGAAACCCGTCACATGCAACGCGGGTAGAAGCTTGTTGGAGAAATCCCTTGGA:1 + chr2R 20690606 3' - mdg3 5259 1 71.29 CACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCTATATTGGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATTTCTTAGTCCATCCGTTCCCATA:1 + chr2L 21391314 3' + Idefix 388 2 77.23 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAATGCGTAACAA:1 - chr3R 11118041 3' - BS 35 1 63.37 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTC:1 + chr3R 20154783 3' - jockey 58 1 72.28 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACAAGTCGATACTAAGACGCTGGAGGTCAACTGCAGCTTTAGATTGAT:2 + chr3R 10078480 3' - Doc 37 1 54.46 CTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACATGCTTAAGTAACTGGCGATGCACAACAACAACAGCATCCATGCCGGCAGCTAGAGCAAAAGCAACA:1 + chrX 17265641 3' + X-element 4406 1 72.28 GCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTTTTCCTTCTTGGACGTTGACTACGACTACTTAA:1 + chr2L 18706437 3' + copia 4938 2 79.12 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGTCCTTCACGCCCCGCTCTGCTCCAC:1 + chrX 7971033 3' + P-element 2869 1 61.39 GGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTATTCAGCTGCCTAACTTTA:1 - chr2R 21776295 3' - I-element 217 1 51.49 TAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCTTCTTTTTTTTATTAGTTCTTTCCCCATCA:1 + chrX 12838874 3' - I-element 496 1 70.00 AAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTACAGCTGAGTGAGGTCCTTTTTGGCGGCCATTGCAGCCATGTTTGTGTTATATGTCTAGG:1 - chr3L 9203315 3' + invader4 2837 2 57.43 TCTTGGGCACAATTTAACCAACGGATTTTTTTTACCAAAATTTTGATTTTGCTCTGCGCCTTTTATCTTTTTCTGTTTCCTGGGACATTCAATCACGTGTT:1 - chrX 7554973 3' - HMS-Beagle 357 1 61.39 TTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGAGTTGGTGGCAAGTCCCGTGGCCTGCTAATGGCATAGTTTCCATCTGCTTTTCCGGTGTGGCTCGGACTGCAGG:1 - chr3L 20079673 3' - mdg1 7040 2 74.26 CACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCATCAGCATTGCCGTAGCCATCGCCACTAATTAAAAGCGTATCACCCGACAAATG:1 - chr2R 13745687 3' + hopper 1396 1 60.40 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTTTGTATCTTCAGAACAAATATTGTTTTGCTACTTGTT:1 + chr3R 17952996 3' + copia 253 1 59.41 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGA:1 + chrX 21668085 3' - Tabor 6861 2 57.43 TTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTTGGTTTTGCTATTTAATTAGAGGT:1 + chr2L 2931427 3' + 297 272 2 76.24 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGGGGAACTCGGACTTAATGCGCTAAACGGCCC:1 + chr2L 3582026 3' - transib2 43 1 68.32 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGATGTCAAGGCAGGTCAACTTTACGAAAAAAAAGAGGAGAAAATTTGG:1 - chr3L 2325398 3' + hopper 1387 1 51.49 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATATTTCCTATCAGTACTCCATATAATTTAGAGATATACAAAAATAGAAAATATAAATGAAATTTTTGGAGAGG:1 - chr2R 20229339 3' - pogo 1 1 77.23 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGAGAAAGTGGCGGAGCAAACGGAAGGGAAAGTGGCCTCAAATGTGCTGTCAAATCCTGCACACTG:1 + chr3L 22327378 3' + hopper 1414 2 76.34 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACTAGAATGGATAAAACCTGACGA:1 - chr2L 13598165 3' - pogo 9 1 68.32 TAGTGAATCTACTTTAAACCGAAAAATTAAGCCACGAATAAGCTTACGAACTAAAAGGAATTCCTGGCGATAATTTACATAATGTTAAGGTAACTAGTTAA:1 - chr2L 1160135 3' - Cr1a 4106 1 58.42 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCAAAGCGTTCGTCTCTAGTTTTGTACAAGTGCTGTGCAAATAATGCACAA:1 + chr3L 13589635 3' + hopper 1391 1 55.45 GCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACTACGCATTTGCCTCCTGCATTCCCGCCCTGACGGTA:1 + chr3R 13261752 3' - Copia1_DM 442 1 72.28 TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAACTGCCATGACGAACTCAGGCGAACTTTAATGGCGTGCAAAACAGGAAGAAGAGGCATTCCTCACAAGTC:1 + chr3R 9978688 3' - jockey 4799 1 65.35 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAACCAGAAGTAGAAGTAGAAATATTACGGGTGGAAGGAATCGGAATCGAACCCGC:1 - chr2R 18944409 3' - roo 18 2 69.31 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTACAGTTTTGGTAGTTTGATTGCTTGAATTTGAAGTTGAATAAA:1 - chr2L 9867878 3' - jockey 4792 1 55.45 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGAAAAGATCAACTCCTCTGACACTTTTAGTTCTACAGACACTGAAGT:1 + chr2L 16164118 3' + pogo 2073 1 58.42 CGTCCTTCGCGTCGAACAAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTACATGGTTGAACCACATTAACACATGGAACCCACCTGCAAGCTCACCCACGGCGAGTT:1 - chrX 21343628 3' - Dm88 470 1 59.41 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTAACTCTGTTACTGACTTTTTCTAT:1 - chr2L 11832510 3' + roo 397 1 69.31 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAAA:1 + chr2L 16016263 3' - I-element 27 1 53.47 CTGCGCTGCCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACGTGTGTATGTATTGTATATGTGTTTATATATATATATGTGTGTTTGTATAAAC:1 + chrX 7074647 3' - 297 6684 2 55.79 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATGATTCTCTCCCTAAGGAAGTTGGGCCCATTCCATTGACAGTAAGCCAAAACGATAAGTAACATAT:1 - chr3L 1930418 3' + roo 396 1 61.39 GAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTCTTGTCTGCACTTTTAGTTCTCATTTTCTTTTCACCCCATCTCCTTGTTGTTGCTTTTGCTATTGAGGAAGGC:1 - chr2L 12543077 3' - 1360 3270 1 82.18 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAGGCATAAAAAAGGGATATTGTCTGGCTG:1 + chr3R 29413114 3' + hobo 2915 1 62.82 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTCAATAACATAATGGAAC:1 - chr2L 7552455 3' + I-element 5299 1 84.16 CAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAA:1 - chrX 22426169 3' + 1731 4598 1 52.48 AATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCGAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTCGATTTTAAGCTTGTATAAGTCCTCT:1 - chr3R 958882 3' + Doc3-element 4531 1 74.26 AGGCTCCACCCTCGATCACGGATTTAACTCGGGCTTATGGCATTTTTTAATAAATTTCCCAAACCATAGATGAGTACTCACATGGCGTGTGATTCGGTGTG:1 - chr2L 19907873 3' + Tirant 8498 2 68.32 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAACAATTTTGTTGTCGCCAACGCAAACGAGATTAGCGA:1 + chr3R 5503429 3' - 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chr2L 23337932 3' + gypsy8 307 1 77.23 TGTGTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGATTGTGTGCATGGATACATATATGTACGCTTGATTTTTTTGTGCGAAATTCCATTTCCAATGTCCGCCTCTCA:1 + chrX 4064864 3' - accord 190 2 54.46 ATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCATAGTGATGCGAACCGGAAGCTCCG:1 - chr3L 21519354 3' - R1A1-element 5239 1 75.25 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACCTCAAGTCATGCAAGATTATAAATTCCCGTCATAATGACGCACTCTATCTAAAGTATCGCGA:1 + chr2R 10528404 3' + pogo 2090 1 68.00 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGGAATTTAAAAACATA:1 - chr3R 30284205 3' - blood 25 2 53.47 TCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCATACACATATACACATATATATAGATAAAGGAACATTTGTGTGTCAGGACAAAGACAATGGCATACA:1 + chr3R 24455473 3' + HMS-Beagle 7036 2 67.33 CTACAACACACACACACACACAACCACGGCAACAACAACAGCAACGTGCGCTGAGGTAATTTTGCTATTTTTTCCGCCCATTGTTTATGTAGAACGGTGG:1 + chr3L 2761537 3' + gypsy3 421 2 79.00 AAAATATTTAAATTATTGAATATGCAATACGCTGCAAGATTTCAAGAGTTTAGCAAAACTGTCAAGTCATCCCTCACCTCTGGCAGCATTTTGCCTTTCCG:1 + chr2L 4001808 3' + Bari1 314 1 73.27 TGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATCAATTTCATTGTAAGAAATAAATTGACCATTTCATGGTTATA:1 - 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Tirant 8113 2 75.25 GGACGCCTGAGTATTATGGCGAGCCTGCTGATCATTGTTTCTCCGACTCCTTACTTGACCACTGGACAATCATACAACAACGTCGTTTCGGGC:1 + chr2R 11550647 3' + TART-B 301 2 26.88 GCTGCTGTTGTTGCAGCTGGTGTTGATTCTAATGTCGCTGTTGTTGCTGCTACTAATGTGTAAGACAAAAAGGAGCACGTCCACCAGATACCGGATTGTCC:1 + chr2R 6596336 3' - TART-B 152 2 60.40 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAATGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGG:1 - chrX 21668012 3' + Tabor 448 2 58.00 CCTAATTGAGATAAGGCGCTCATCCGAGAAGATTTTTTAGAGCAATGGCACAAAAAGTGCAACCAGCTTACGGGACTAATTAAACGGCACTTTTCAGATGC:1 - chr2R 5180305 3' - mariner2 526 1 73.27 GCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACTTATGACAACAGAGGAAAATCTTTCTGAGGACAAAATGCCTGAAATTTCCATGTCACTTGGCAGTTAATAA:1 - chr3R 4555074 3' + roo 8853 2 78.22 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAGTTTTAGTTTTTTAATA:1 - chr3L 5025597 3' + roo 9051 2 57.43 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGGATTCGCTGTCAAACT:1 - chr3L 16129602 3' + P-element 2828 1 22.77 ACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCGAGAAGCTGAGAATCATTGTTGGAT:1 + chr2L 21289118 3' + Tirant 82 2 75.00 CCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATAAAATATAAAAAAAAACGCATTGGCAAGA:1 - chrX 4281187 3' + blood 134 2 67.68 GCTGCCTTCAACTTAAAACNGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCCGTGTTGAGCAGAAAACGCAC:1 + chr3R 5359999 3' + 412 7515 2 57.43 TGGACCTATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCCATGTATAGACCGCAATCCCAGTAGCAGTAGCCTTCCAGTTGAAATGGCTGTGT:1 + chr2R 1922525 3' + gypsy 458 2 75.25 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGG:1 - chr3L 25272552 3' - 1360 42 1 66.34 GCAAAATAAAATAAAGTAAATAAATGAAATAAATATTCCTATTAACTCAAACACCATTGTATTCCAGAATTCTTCTGGAAGGGGGCAACAACAAAAGGCAG:1 - chr3R 30271410 3' + F-element 86 1 72.28 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCGCCATCCACGTCCCTC:1 - chr2R 13956866 3' - P-element 58 1 21.78 TGTGTGTGTGTGTATGTACACACACATGGCGGTGGGGACTTTTGGGGCTGTTTTATTCCTGCGGCTGCCATTTTTTGTACATACCTAGAAATCAGGCGATT:1 - chr2L 3056908 3' - G3 39 1 57.43 CAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTTTCCCAGGCTCATAATGATGAGATGCTTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCT:1 + chrX 12649919 3' + 412 101 2 66.34 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGAATCCCATGAAGAGGGCACAAGGAAGTG:1 - chr3R 11846668 3' + roo 361 2 74.26 TACATTTCCATATACATACATATTCATATACATCTCCATACACACTACACTCGCACACGACTGATTTCAATTGATTGCAAGGACACGCGGAAGC:1 - chr3R 5600078 3' + ZAM 188 2 61.70 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACAAGTCGATACTAAGACGCTGGAGGTCAACTGCAGCTTTAGATTGATAAGAAA:1 + chr3R 10078486 3' - Doc 31 1 53.47 AGCCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCTGGAGCCGCCTTTCTGCTACAGCAGCAACTGCACATCAAGCCCGAGACTCAGACGCACCTGCACCA:1 + chr2R 8390762 3' - baggins 5233 1 75.25 CAACAAAAACAACAATACCNCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAAATCGAACCAAAAACAAACCGCGAATTTTGCAGGTTAGCCCACCCGAAAGAGGCA:1 + chr2L 20311711 3' + I-element 135 1 58.42 CAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGTCAACGCAGTCAACGAGTCCACTTGGAGCATTATTATCGCATCGCGTAAACAATTCTC:1 + chr3R 27515593 3' - micropia 406 2 67.33 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTGCAACTGCAACAGGAGCAAA:1 - chr2L 13310225 3' + mdg3 235 2 59.41 TTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTC:1 + chr2R 6482731 3' - gtwin 39 2 65.35 GTTTATTTTTAATTTCAATATAAATATGATTGCAACTTATCGGAATTGCCCCTCGAAG:1 + chr2R 22232702 3' + hopper 188 1 89.66 AAAACCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGGCGAATTTGTCTAATCAAGAACAAAGGATTA:1 + chr2R 392529 3' + Porto1 4259 1 72.28 GATGGCGTTTAAATCTTCTTCTCGTTCTTGGCCGGCACTTTTGTGCCCAAATTATCGCATTATGCTCGAATCGCGCGTATGCTTATGCTCGAGAGTACTGA:1 + chr2L 9587545 3' - jockey2 3165 1 74.26 CAAATCAGAATTTTTATCAGAGTTCAGTTTGAGACAGAGATTGGGTGAGAGCGTTGAGATCCTCACAGGCGCCTGTGAACTCACCTCGGAGTCGGTAGCCC:1 - chr2L 5274188 3' + Idefix 455 2 71.29 CATGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCAAAGTCAGAACAGAACTTGTGGCATTTTGTGCTTATTATTGGGCATTCAAATTGCCTCAAGCATGAATTATGTGC:1 + chr2L 16100494 3' - invader4 2710 1 74.26 AATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTAATAATATACATATGTACAACATAGGTTTCTTTTACGTATGTTAATAAACTTGGATTAAAACC:1 - chr2R 19775107 3' + 3S18 6091 2 51.49 CAATCATTTTCATTGAGTTCTGGTCGAAGAGGATTTAAAGGATAGCAGTCCTTCCACTTAATCAAATTGAATTGCCGGGAAGAGGAGCCAGCTGTAAATA:1 + chr3R 18811187 3' + mariner2 862 1 68.00 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATTATGAGCGCAGTCACACATGCACATAAACG:1 + chr3R 26292592 3' - jockey 58 1 68.32 CCTCTCCCTGTGCTTTCTTTGCCGGTTTTCGCTTTATCTCGCTGCTAAGTATGATTTGGTATTATATTTCTCTTAAATCAAACTTTAAGTTTAAAAAGTCG:1 - chr3L 20744125 3' - G6 460 1 63.37 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAA:1 - chr3L 2016887 3' - Tabor 6887 2 69.31 AAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAATAATTGACAGTTGAAAAGTCTCAGCTATGATT:1 - chr2L 3581939 3' + transib2 2821 1 74.26 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGATGGCATGGCTGAATAACAATAATTGCTTAAATAAA:1 - chr3L 10161744 3' - Doc 45 1 70.30 CCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAGTTGAGTAACTCTGGCATGTTTCTAATGCTTTTGT:1 - chr3R 18541252 3' - jockey 4602 1 65.35 AGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCACCTTCGTGGCTCCTTTTTTCCCTGAATTTCGGTTTCAAGACATGTGTGCGGAAAATT:1 - chrX 16774119 3' - 1731 166 2 55.45 AAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTCCGCTCTTAGCGTAAGCGAGCCGGACATAGGGCAATTTTGTTGGCTTCTTTGTGTGTTGCATACGGCAAGGCTAT:1 + chr3L 16446845 3' + 1360 3268 1 57.43 TATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTTCCGTCAGCTAATGCGGCGGG:1 + chr2L 6411539 3' + P-element 2865 1 38.57 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - 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Doc 4629 1 65.35 CAGTTGTACAAGAGCAAAGCCAGGAAGCAAAGAAAATACGGGCTGAAGGGGAAAAGGGAA:1 + chr2R 8503044 3' + Bica 417 1 75.00 TTCAATATATTTGTTTGTAACTCACAGATTACAAAAACACGAGTTGTTTAATAATTTAGTCATTAACTAAAATAAAAACACTTTGTGCTTATACTGTTTTT:1 + chr2R 12323016 3' - Tc1-2 1588 1 77.23 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAACTATACTGTATTTTGTTTCTGCATTTGACCGATTGCGTCGCGAAATGG:1 - chr3R 15213582 3' - pogo 39 1 66.00 TACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAGCCCGAATCCTTTATCCTTCAGTCGAGCTCTAGTCCTAGTCCTAGACCTAGACCTGGGGTCCAAAACAAA:1 - chrX 4279462 3' - blood 5 2 74.26 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTGGATGCACACGAAAAAATTCAGGGCTTAAT:1 - chr3R 22237021 3' - 297 34 2 67.01 GTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACCCAAACCAGTTGCCTTCATCACTCACTTCAATCATGTGTCCTAAATCCATGTATTCATTCATGAATTTAGTGTA:1 - chr3R 19445131 3' + roo 9070 1 64.36 ATTTATTTTTCCTTTTTTTTTTTGCCTAACGGCTTAGCAGTTGTTGCAA:1 + chrX 10811334 3' - Doc2-element 233 1 87.76 GCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATCTAAGGCCATCCACGATCTTCACTCTTCTCCTCCAACTTGTTTTCCTTTTACTTAGCTGCACGACACTGAA:1 + chr2R 13944897 3' + copia 4938 2 73.74 GGTTGAGTGTCCGATGATTNGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCGGTGTTGCACATATATTATGATAGTGATAGATATAAT:1 + chrX 9828507 3' - Tirant 40 2 63.37 TTGCCCGTTTTGCCAAGGTNATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGAGCAATGGCAGAGTCATCTCCACT:1 - chr3R 5886687 3' + I-element 5009 1 76.24 TGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATCGTCAAAGAAGACAACGTGGCATCATACCGGTGTA:1 - chr3L 24860614 3' + invader4 2843 2 65.35 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAG:1 - chr3L 2029677 3' + roo 392 2 58.42 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTGATTCGATTTGGCAAG:1 - chr3L 8749974 3' - Doc 46 1 67.33 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGGTGCCACGCCTTCTCACGGACACAAATGCACACTTAGTGGGAGGAT:1 - chr2R 13316126 3' + hopper 1386 1 52.48 TCTATTGGCTCCGACAGACGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGTAGATAGACCGACAACAGAGTGGGCGCGACCGTTTTACAAGACTAATAAAATTA:1 - chr3L 26657793 3' + F-element 389 1 54.46 ACAATCTTAAGTCCTTGGCAATTTCCAGGTCCACGTGATTACATGAAATGTGGTGGTCCAATCCAATTTTTATTAGCCTTTCTGTTATCTTAAACAGAACG:1 - chr2R 9758939 3' + NOF 3929 1 74.26 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTGCGGGAAATATTCATGATTAACTGTTATACGAGGATCGTAAACTTGGTGGCTAG:1 - chr3L 16666634 3' - I-element 21 1 59.41 TATTTTCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATGATAAACAACAATAACCTCTAAATGTG:1 + chrX 11624409 3' + roo 9025 2 77.00 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTACCAAACGAAAAAGAATAAACAT:1 - chr3L 5512444 3' + pogo 2053 1 77.23 ACGACCGACGCGTTCGATGATCCAATTCGCTCTTCCCTTATTTCTTAAGGTGCCGAAGTGAAGGCCTAAGTACCCGCAAAGCCAATTGTCGAGAGCAGAGG:1 - chr3R 15050344 3' - gypsy7 123 2 63.37 AGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGATAAAGGATAAAGGA:1 - chr3R 29374915 3' - mdg3 5251 1 81.19 TATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACAGTATACTTCCGTTGCTATCTCTCGATCTAACCATACGATACAAATCCATAGCA:1 - chr2R 20883912 3' + copia 229 2 58.42 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCACACCTTACTTTGTGAACAGCGCTTGTAAGTATGCAGC:1 + chr2R 24242950 3' + hobo 2901 1 65.35 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAGTTTTTGGTTTCTCCACTTTTCCCGTTGGCTCGACTATTTTTAATTTTTGTTAGTTTTGG:1 - chr2L 17131519 3' + mdg1 7445 2 60.40 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATGAACTCATATTGTGCAGACT:1 - chr2R 5043309 3' - roo 55 2 82.18 TAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATTCCTACCTTATTTTCAACGAAAAAGTTGCTCCGGGAGCAAAGGCCATTTTGTCATTGCGAATCTCGTCCA:1 + chr3L 20299007 3' + F-element 4221 1 76.24 CATCAACACACACACACACACTCGCCCGCCCCACACACACACGCACACACCCCCACCCACACAGACTTGGGGGAAGACGGAGCACCGGAGCACATGGCGTA:1 - chr2R 12477314 3' + accord 180 2 60.40 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGTAAAGGTCTTGCCAGCAAACTAAGAAGAATACTAACACATTAATTAGTATAGTACAT:1 - chr2L 3985072 3' - roo 8680 2 52.48 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACCACCACCTCCGCGAGAGAGCAGCGAAGAAGAGGAAGACGTTGTGGCAG:1 + chr3L 5360227 3' + P-element 2861 1 55.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTGTCCTACTATAAGCGTTTTTCTTGGTGCATGCATGTTTGCCAAC:1 + chr3L 11763255 3' + pogo 2074 1 57.43 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACCAGAAAATCTATTAACCAATTTCT:2 - chr2L 12764983 3' - Doc 49 1 54.46 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAACAATTTTGTTGTCGCCAACGCAAAC:1 + chr3R 5503418 3' - blood 7037 2 50.50 GGGCAAACGATTCCACCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTATAACGTGTAATTAAATTTATATATAAATT:1 + chr3L 20490716 3' - FB 44 1 75.25 GAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTTTGTATCTTCAGGACAAATATTGTTTTGCTACTTGTTTGTTTTGCCCATCAAACTCTTATTCCTCTCGTA:1 + chr3R 17953029 3' + copia 252 1 75.25 TTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTGTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTT:1 + chr2R 2994311 3' - gypsy8 113 2 45.54 ATAATTCCGGACAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGAAAATCACGCACATCGTCTCAGAAAACCGAAT:1 + chrX 9473975 3' + Fw2 3689 1 56.52 TTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCAGGTCAGCGACGTCGACGTCAGGGCCACCGTTGTGGGCGATGGTGAGGCTCCACTCGACGAGG:1 + chr3L 20240059 3' - R1A1-element 5325 1 72.28 AAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCGGGTGTCCACTGTATGACCCAGACGTTAACAGCACTGCTTATCGGAAC:1 + chr3R 8264947 3' - S-element 406 1 52.48 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGATGGAAAAGCTGTCACGCC:1 + chr2R 18850601 3' - P-element 49 1 29.47 GGGTTGACACGACAAAAGGTCATAACTTTACACTACATCCATTTACATATCATATATATGACATCAACATATACTACATCTATATAGTGACATATCCATAA:1 - chr3L 24486372 3' - Q-element 684 2 72.28 AAATATATTCTTGATCAGGATCATTAGCCGAGTAGATTTGCCCAATTAAATGCCACATATGTCATAGGCATAATCTCCCTACCCCAGCAAAAATCCGCGAA:1 + chr3L 5079445 3' + INE-1 80 1 63.37 ACTCACACAGGCGAGCAAATTCTATTTTTAGATTTGTTACGCTCAATTCTACACAAATGCCAGGGGCAGGCAGACAGAAAGCAGACCGGGAGAACATTAAC:1 + chr3L 16203043 3' + 1360 3256 1 56.44 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCAT:1 + chr3L 24761232 3' - 1360 80 1 70.65 GACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCTTTCCACCCTTAGAGGGTCGGACCATCGTCGGACACTCGTCCTCAAAGGTAGAG:1 + chr2R 25095690 3' + accord 7133 2 65.35 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGCGCCGGTGGAAATAGCGAC:1 - chrX 15498974 3' + P-element 2830 1 22.77 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACAGTGGCAAAGAAGCCGAGAGAGAGCAGGCAGTGTGGCTATCTAAAATTCCGCTTCAACGAGGACTGA:1 + chr3L 11518111 3' - P-element 4 2 36.84 TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTTTTACCTGACTCACCTGTAATACGTATTCCCCTATCTACTCCAACCATCCCCCCTGCGTCCGACGAACAAGAGTCA:1 + chr3R 18006540 3' - accord 7099 2 53.47 CCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATGGACGG:1 + chr2R 14849024 3' - flea 4707 1 64.36 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGCTGACCGAGTGTGGGCGTG:1 - chr3L 15745345 3' - hopper 35 1 62.38 TCTTGCATCGCATAGAGCGTCACTTTCGCTTTTTGTCTTTGAAAAGAAAAAATTCATGA:1 + chr3L 26540473 3' - F-element 127 1 93.22 TAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCAGCGAGATTGAAACATTGGAAAAACGGTGTAAACCTTACCATAGCATTGTAGATAGA:1 + chrX 17107301 3' - HMS-Beagle 59 2 61.39 CCAGTTTTTTGTTTTTTTTTTTAGGATTTTTTTTATGCGGTTGCGATATTAGCTGGAGCTGAAGATATGTGCGGCGAATGGAGCTGAGCTATTTTGGTATT:1 + chr2L 11642949 3' + hopper 141 1 80.20 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATATTTCCTATCAGTACTCCATATAATTTAGAGATATA:1 - chr2R 20229375 3' - pogo 37 1 66.34 GAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTTGGTTGTGTCGTTCGACCTGCTGCACGGATTTAGTTACATAAAATTTACTTTGCATACATTCGG:1 + chr3R 27380949 3' + Cr1a 4390 1 62.38 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGT:1 - chr2R 11664311 3' - Tirant 8141 2 59.41 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTTACAGGAGCACAAAATTA:1 + chr3L 17708331 3' - jockey 4760 1 75.25 ACACACACAGACACACACATAATACACGCTCCCTGTTGATTTGACAACAAATCTGAAAAAAAGGGAGGAATGGAAAACCTAGTCATTC:1 + chr2R 20417757 3' + Quasimodo 39 2 76.14 TTTTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGCCCCACTGCAGTGGGGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTTTGTGATGGAGCCGCCCTGAGTTGTATG:1 - chr2L 11537507 3' - hopper 1123 1 59.41 CGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTATGTTTAAACAGATCAGCACA:1 + chr2R 5043334 3' + roo 355 2 80.20 TCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAATCGTGTGAGTAGTATTGTTTTTGAAGGAT:1 + chrX 16125640 3' + 17.6 7203 2 72.28 TTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAGGCATATAATTATTTTTTATGAAACATTCCAATCATTTA:1 - chr3L 2016843 3' - Tabor 4 2 74.26 TGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGGTGGGAATAAACACGAGTCCTGGGGGTCAGGACGAGGGTGGCTGTCAGCACAGTTTGCTTTATGATTTTTTA:1 + chr2R 23484695 3' - Porto1 286 1 77.23 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCCGGAATCTGGTTCTACCAATTATAACAAGTTTAATAATCTATTT:1 - chr3L 10283533 3' - Doc 64 1 56.44 AAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGAAGTTGACCTGCCGGATGGTAGGTGGCACCTGCTGGCAACTGTTGGCGAGGATA:1 + chr2L 11524964 3' - Cr1a 69 1 72.84 AAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTCACCCTGTTGAGTTCACATATCACGAGTGTGA:1 + chr3R 13441925 3' + 1360 3345 1 72.28 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATA:1 - chr3R 19450190 3' - roo 8723 2 55.45 AAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCATTTGACTTTGACTTTGAGGTTTACATGAACTAGGTGTATCCATATTAAATATCTATT:1 + chr2L 17593509 3' - Tc3 314 2 66.34 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAATGAGTATGGCACGGCTACGCATAGCAAAGTAATTGATTTCTTACAGCTCG:1 + chr2L 2832803 3' - roo 8693 2 52.48 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCATTCCACGTCACGAACCACCGAGAAAGCGGCTGCCTGCTACGACTGCTGCTTAGTTGT:1 + chr3L 16129655 3' - P-element 18 1 61.39 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGTCTACACTTTTTTCCAAGTATTTCCCTCTCAGTGCTACTGACCT:1 + chr3L 13704591 3' + opus 496 2 77.23 GGCGGGAGGTGTGGCCGGGGGACCCGTGCGAAAAAAAACACGCAGCACTTGCTTCCTCTTTCGTATGCTAAGATCTGGCCATTTTTCATTTCCCATCCACT:1 + chr3L 17084382 3' + Cr1a 4433 1 56.44 TAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAACATGTAACGTACAAATTATTAGATTGCA:1 + chrX 9816304 3' + BS 5043 1 71.72 AATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAA:1 - chr3R 11118052 3' - BS 46 1 72.28 GTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAATAAATAAAAGTTAAACATTTGTTGAATTGACGACCATATTTTTGAAAATTTTTTGGATATATTTTTGT:1 + chr3L 20853194 3' + HB 1466 1 67.33 TTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGGAGGGAGTAACTATTCTCGGGATGCAAACCGCAAAGCAGG:1 - chr2R 23923898 3' + R2-element 3439 1 60.40 CAGCTATTTTGGCCGCAGGTGTACCGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACAGTTAACCAATTGGCACACCACGAGACTATCGTGCTC:1 - chr2L 12095022 3' - Bari1 445 1 68.32 TGTTGTAGTTTTTAGAACTNGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCTGACCCATTCATTACCATAAAAAGCG:1 + chr3R 11941221 3' - Doc 58 1 71.29 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTGCAGCAGCGGCAGGTTCTCCTTTC:1 - chr2L 10924215 3' - hobo 29 1 53.47 AAAAAAAACAAAAAAAAAATGTAGGAAGAAAACCTACATAAACTGGGGGGGACAAGAAAGAAAACACACCAGAGATGTAGAAGCCTCTCGGATAGCCCTCA:1 - chr3L 19026802 3' - hopper 141 5 49.50 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATAGGGAAAATGTAAAATTAGGCTGCCAAGAGAGC:1 - chr2R 8674141 3' + roo 9033 1 66.34 TGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATTTCGCACAACGTGTTGCTTTCTCATTCTGCTGTTTG:1 + chr3R 24613421 3' - roo 8769 2 64.36 CATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTTTTATTGTTTTATCGGTTGAGCCCCCAAATGTAGGATATTTATTGTTTAACACAATTGTTTATCTTAGTA:1 + chrX 22426267 3' - 1731 5 2 72.28 TGTAACAGGTAGAATGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATTCTTGTATTCAGGATCAATTGCCGAGTTGATTTGGCCCTGTCCGTCTGTCCATATGAACG:1 + chr2R 7182414 3' + INE-1 31 1 80.20 TTTATTTTCATTTTTTTTTTCTTGCGATTTTCGTATATTCCACCTTCAATCGCAATCTCCGGCGCTTGTTAAACGGCGAAGAGAATCGCACCCGAAACTTG:1 - chrX 10834325 3' - invader2 298 1 56.44 GTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGCTAAGGCCAGATTGCTGAAGAGGGCCAATGGCTATAAGCCTTGGCTATATAGCGTCAGTTTCGACGGCTGTCAG:1 + chr3R 29025293 3' - S-element 1713 2 71.29 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTCGAGTGCCTGAAAGTATGCAAGCCATTTGAAAGT:1 + chr3R 20154816 3' - jockey 24 1 61.39 TCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGAGGAGAGCTTGCTTTGATATTTGTGCAAGTTGTGTCTCACATGCTGGTCTGGTGCTTAAGTTACCAAGGCTTTGTCGAAG:1 - chr3L 24759711 3' - F-element 4466 1 63.37 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGACAGGCAGCGGGGT:1 - chrX 6417714 3' - Quasimodo 38 2 68.32 TTTTTTGTTTTTCTTTTAATTTACCAGCATCTGTGGGCTGATAAACCAATTTGACATTTTCAGCCGGTTGCGATGATCGATGGCTGCGCGAGATTCCCTCG:1 - chr3R 23505375 3' - Doc 4699 2 70.30 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGACATGCCCGGGTCATCATGGAAGCCATCCCAAGCCTTCACACAGAGCTGCGCCAAATTTTATGGCCAGGA:1 + chrX 14132170 3' - roo 8669 2 75.25 TTAGAACTTGCTATTCGTANCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACGACATGACGATCCAATCCTCAAGCTGACGGGCTTTTG:1 - chr3R 17803057 3' - Doc 47 1 61.39 AACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTATGGGTACAACTGCCCTGCCCAGCTCTGCGGACTGCAACTGCTATCCGTTGCGTT:1 - chr2L 6175640 3' + hopper 1396 1 60.40 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAACAATTTTGTTGTCGCCAACGCAAACGAGATTAGCGAA:1 + chr3R 5503430 3' - blood 7024 2 63.00 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATATCGGGGGATCAAACTGCATACGCGTTAGCTCTAGTATTAATACATTAATAATACAATTTGTAATTGCAA:1 + chr2R 7718598 3' - hobo 2709 1 80.41 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATAAAGCTTTTTGCTGTTTGGAGCTTAAAAATA:1 - chr3R 8261999 3' + S-element 1678 2 68.32 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGAAACTGGATGGATACCTACACCTACCTGGCCAGGTGCGGCAAGTGGCAAGGACCAA:1 - chrX 18322552 3' - jockey 4692 1 52.53 ACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGATTGCTTTGCTTCTTGGCCGTTTTGTGTGTGCCGGAATAATAAGCAGAAAATAATGCACTCCCTCCGGGGACT:1 - chr3R 8467127 3' - gypsy7 45 2 78.22 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCTATGG:1 + chr3R 30284286 3' + blood 7364 2 50.51 CACACTAGCTGAGTAACGGNTATCTGATTAAAAAACAAATAAAACTGTATCGCTTGATTATAGAATTATAGAAATCTGGCTTTTATTGGATTTATGGGTCA:1 + chr2L 21687363 3' + INE-1 539 1 79.21 AAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGTTTCGTCTTTTTGGCCCGGCTA:1 - chr2R 20217094 3' + diver2 4594 2 78.22 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTCCTCGGATCTGTGCACTCGAAATTATGCTGTGGCCAGGACTTTGCCTTTTGGCCTCAT:1 + chr3R 28447461 3' + blood 359 2 58.42 ATTACTTATTACTTATTACACCGCAATCACTCAGGCGTTTAATAATTGACTGCATCTGCGGTCGAATCCCAATCGAATCGGGGTGGGTGGGTTGTTTAATG:1 + chr2L 1202079 3' + Stalker2 405 1 81.19 AAATGGCCTATATTCAACANACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACTATTATTATCAGATATATTGATAATGAATAAAATAGAAAATCTATGAAAGAAC:1 - chr2L 16958054 3' - 1731 4338 2 54.46 GCAGATCGCAAACGGAGAGGAGCAAGAGGGACAGAATGAGCCAGGATAAAATTAACTATTATCGCAAAGCGGTTGGAAAAACAC:1 - chr2L 4310237 3' + invader2 4995 2 73.81 TATCGATATCCCAGAAAAATTTCGAAATTTAGCGTCTGCGATAGTCTGGGAAGTCGACTATAGTATTTCCACTTGTTTTAAATGTGAATTAAGTGCTTCCA:1 + chr3L 24400791 3' + INE-1 503 1 61.39 GCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGAGTTCCTGGTCCGGATCGTCC:1 + chr2L 4444497 3' + jockey 4643 1 78.72 TTTACAAGAACGGCTAAGTGCCGCTGCCAAAGAATTCTTTATTAGAAACGGATGTTGCAGCATAACTTTCGGCGAAAATGCCTCGCATATGGTTCGGTTCT:1 + chrX 22735689 3' - 17.6 189 2 56.44 ATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAATGAAATTGGGTGTATTTTTCATTTAGGACGCTAAATTTATACAACAAATTCGCCCCCAGACTT:1 + chr3R 28203768 3' - FB 471 1 57.29 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAATGTTTGCGAGAACTAAACGGAATGTTCAACCGATTTTATTTATGCAAAT:1 - chrX 6451072 3' - pogo 22 1 57.43 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGGCAAA:1 - chr3L 2029672 3' + roo 397 1 63.37 GGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTATTCAG:1 - chr2R 21776308 3' - I-element 230 1 61.39 CAAAATCAAATAAAAAAAAAAACACAACAATGTGGATGTGTGAAGGAAATAGAGAACCACATATCAAAATATCCAACAATGTCAATCGCACCAACATGCTA:1 - chr2L 9180641 3' + F-element 4680 1 92.08 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCATCAAATAACCCAATGATGATGATCTTTTTATAATAATGAT:1 - chr2L 14981449 3' + hopper 1381 1 61.39 TTGTGTTTAACTTTCACTANACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTA:1 - chr2L 12765014 3' - Doc 80 1 80.20 TTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGTGAGGATCTGGAGAATGGTGCTTAGGACCTCGTCCTCCTGCAGGTCTTCTGCCCGCAGCAAC:1 - chr3R 21525148 3' + copia 116 2 62.38 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATCTACCGTACCGAATTTTTTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGTCT:1 + chr2R 6433229 3' - Doc 32 1 60.00 GGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAGTTTCACACCATCTTCTTTTGCAATGCACAAAGAGAGCGGTATGGTGGAGCAAGGGAGCAAGGGAA:1 - chr2L 17860459 3' - Rt1a 4896 1 59.60 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATC:1 + chrX 21668079 3' - Tabor 14 2 59.77 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTCATGTTATTTCATCATGATCCGTTCCGTCAGCTAATGCGG:1 + chr2L 6411535 3' + P-element 2830 1 22.77 CGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTTTCCAAAGGGGGTGGTGTTCCTTAGGGGAGCCGAAGCGGGAATCT:1 - chr3R 17974381 3' - mdg3 5224 1 57.73 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAGTATACTTTGGTTCGGCCAACTTGACCTCGTTTATCATTTATCATTAAGCCGCACAAC:1 + chr2L 9042697 3' + jockey 4980 1 61.62 CCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCCCCAACCAATCGATGCATGTTGCAAGCGCAA:1 + chrX 17175606 3' + I-element 15 1 69.31 CAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGAAGAATGGGAGACTCCACGGACGAAGCTTGTTGATGTTGGCTACTATTTCAATCACCGGAGCTTGTTAGTGGCTCA:1 + chrX 12968313 3' + mariner2 730 1 63.37 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATG:1 + chr3R 18549961 3' - pogo 50 1 82.18 AACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACTATATAGTGCTTACTATATAGTGCTTTATAAAGCAAGATTACTTTCCAATATGC:1 - chr3R 30137508 3' + flea 238 2 47.52 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTGTTATTTTTGGGGGTTTCAGTTTT:1 - chr3L 10811558 3' + Juan 4197 1 57.61 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTAAGGAGGACTTATACACCCC:1 + chr3R 22237068 3' + 297 6926 2 85.15 CGTTGCCAGATCAACCGTGTGATCAGTGTTGTGTTGTTGGTAGTCACTGGTGGTGTATGGATTCAGTGTGCGCTTTCCCGCAGTTACCGCATGTGGC:1 - chrX 23453164 3' + Rt1b 40 1 70.10 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCA:1 + chr2R 22269186 3' - jockey 4711 1 70.30 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTGCAACTGCAACAGGAGCAAAAGCCACAAAA:2 - chr2L 13310215 3' + mdg3 245 2 69.31 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTATTGTCCCCAATTAAATTAAGTGACCAACGAAAAAAAGCTGGCTATAAAAT:1 + chr3R 9121517 3' + roo 388 2 54.46 ACTGGTGATCGGGAATCAGGCCAGCTTCGTCCATAACTGGCAATGCTCTTGGACCTCTCGGTCACTGGTGCTTCTGAATCAGATTCCGATGGGGTTTCGAT:1 + chr2R 13251028 3' - G7 351 1 58.42 CCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGAGTCCTTCGTTTTGCGCAGCCGCTCGCCGATTTCGCGGTAAAAAAAAAATAAACAGGAATGAAGCAATAGAAGG:1 - chr2L 16690394 3' + P-element 2885 2 77.23 CCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAGGCATAAAAAAGGGATATTGTCTGGCTGCCTGCGATGAATGTGTGAGTGTGAGTGTG:1 + chr3R 24410575 3' - hobo 2728 1 59.00 AAAAAAGAAAAAAAAAACCAATTTAAAAAGTGATACTGATTCTTTCAAGTGGAGCATTAGAGTTAATTGGTAAAAATAACCATTTTTATACTTTCACTTA:1 - chr3R 13170420 3' + gypsy7 5010 2 67.00 GCATCGGACTCAGCAGAGCGCTTAGTCGTCCCCTCGTGCCGTCTGGAGTTCCATGCCTTCGACGGCCACCGACTCCCCCCATGATGCCCGCGTACCCGCTG:1 - chr3L 27353144 3' - gypsy10 5860 2 73.27 AAAATCGGAGGAAGCAAATTAATACATTCGGAAGGGGACAGTTCTAGAACAGGAGGAAAATCGCGGAAAATAAAGGGACCGGACTGAAAAGTGCCACATAA:1 + chrX 21483005 3' - Gypsy12A_LTR 2062 1 59.41 GCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGTTTCGGTTGTAGAAGACTAGAGCTTTTTAAACGAAAATA:1 + chr3L 13142070 3' - F-element 412 1 52.48 CATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTTGACGCACCAAGTTGCGTTTACCGTTGGCCAACCTCA:1 + chr3L 2427964 3' + I-element 5045 1 63.37 CAAGATATCTGCATTATTTNTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTAAGAGAAATAGGACGACGAGAAATCCGATTGAGATTCCACAT:1 + chr2L 7165088 3' + pogo 43 1 57.43 TTCAGTTAATATATTTTTTTTTTGCGAGGGGAGGGTCCTTTTTAGATTTATGGACTTGTGGGTCAGCACAGCACGAAATTGCCTTTGGTATTT:1 - chrX 7019846 3' - transib1 40 1 79.57 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCAACTAAAACTCGCTCTTGCACTTCCAAACTGGG:1 + chrX 14979148 3' + hobo 2898 1 69.31 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTCACCCTGTTGAGTTCACATATCACGAGTGTGAAGTTCTTT:1 + chr3R 13441933 3' + 1360 3353 1 66.34 TATCATAATAAAAAAAAATAAAAAAATATCACATGAAAACCATTTGTACGCCCTCGAATATTGCACGCCCCCGTCAGAAGGAGTAACCCCTTATGGGTAAC:1 + chr2R 11524564 3' + Rt1a 5072 1 75.25 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATAAGGAAAGCAGACTTT:1 + chr3R 22520966 3' + opus 481 2 60.40 TTGAAAAGTTAAAAAAAAAATAGGTTTATACTACGGATAAGGATAACTGACATACAATTTTATAACCAAAGCTTTAGTTTGCTTAGCAATATAAATATCTA:1 - chr2R 8523039 3' + TART-C 11093 1 69.31 GCCGCTTGCACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATTTATGGACGTATCCTTAGCAGCACTAGGAACTCAATAAGCCAGGCCA:1 - chr2R 9640334 3' - Max-element 8261 2 51.49 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTA:1 + chr3L 17136015 3' - BS 41 1 69.47 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTGGTCTCGCCGTTGAATTGTAATTTCATTAAGCGGAAAGGATAATAATGAAAAGCGTTGGT:1 + chr2L 19290644 3' + roo 392 2 58.42 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCATATATATCTGCTGATAAGCACAGAAATATACCCA:1 + chr2R 7775518 3' + pogo 2063 1 66.34 TAGGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAACTGAAGGCAAAAGGTCAAGTTTCGGAGAT:1 + chr2L 20992970 3' - I-element 26 1 51.49 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAG:1 - chr2R 11664295 3' - Tirant 16 2 64.65 TCTAGAGCCACGGCGAAAANATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTT:1 - chr2R 4830337 3' - 1360 54 1 93.07 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTCACCCTGTTGAGTTCACGTATCACGAGTGTGAAGTTCTTT:1 + chr3R 13441933 3' + 1360 3361 1 61.29 TAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTAT:1 + chr3L 27415312 3' - transib2 19 1 60.40 TGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGTGCGAAAAAATAATGTTAAACACGCTCAACAACACG:1 - chr3R 1291836 3' + hopper 296 1 64.36 CTGAGGAAGATTACAGGCGNTCCTTGGTATATGAGGACCAGAGATATCGAAAGCGATCTGAATTTACTTATGAGTAATCTAATTAATCTCGCAGAGAATCG:1 + chr3L 9623164 3' + jockey2 2979 1 61.39 TGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTATTCAGCTGCCTAACTTTATTCTATATTATCCCTCCACAAGTAAAT:1 - chr2R 21776268 3' - I-element 190 1 78.22 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGGCTCAGGTTCAGGTTCAGGTTCAGCCGCTCGTTCGGTAGCCGCTAGACTTGGACATTAATCGATAACA:1 - chrX 4471665 3' - jockey 4751 1 73.27 TATATATACATATATATATTTCCAAACTTCAGTGGAAAAAGTACTGTTGCATACTTTTAAACAGCTTTGTAAGTTAATTAAATTAAATTATTTTAAATATT:1 + chr3L 23689829 3' - 1731 4408 1 73.27 CACCCAATGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCCATTCCCCATTTTGGAAAACAAA:1 - chr3R 19551947 3' + Idefix 6991 2 77.23 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAACTCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 4987 2 53.00 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTCTCAATGCCACAGGTTGCCTTTGTTACTATCACCTACATAAAAAAAAAAAGAAAAGCTACGCTTGACAAAA:1 - chrX 9351892 3' - FB 7 1 67.00 TTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATTGTCTGCCGCCTTTTCAACACATTGAGTTGTTTGCTCTGGGTACGCGCTCCAT:1 - chr2L 19629908 3' + copia 232 1 53.47 TTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAG:2 - chrX 21668027 3' + Tabor 432 2 75.25 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATGCACGGGGCAAGCTGCAGGC:1 + chr2L 12884364 3' + HMS-Beagle 7009 2 74.39 TTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGGGGATAAAGTTTAGTAATATTCAATGAGTATCCCTAAGTCTATGCATTGTTCTGGAGCCGAA:1 + chr2R 15162313 3' - Tirant 8380 2 54.46 CGTATTTGATCTGTTTTGTGGTCAGTTAAGCAAGCTATTTTGTAAATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAGAGCAATAGTAGTTAGTGATATTT:1 + chrX 20996696 3' + BS 272 1 81.19 TAATAGTAATAATTAATAATTAGTAATTTTGAATAAGAACTATTGATAGATGTGTAAGCAAAGTACCTTGCTTTCTTTGGCTCAAATACATTTGTTAATAC:1 + chr2R 17676849 3' - Tc3 270 1 76.24 TACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTACGTGCCCTGGCGTTTGCTTTTAGTTGCGCTACACGCTAATGC:1 - chr3L 15449707 3' - P-element 411 1 49.50 TGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGAAATCATACAGCGAGCACAAAATGAGAACTTAATTGAAACATCGCTGTCCACGGTAATAAATGCCGTGTAATT:1 - chr2R 13422785 3' + F-element 4286 1 57.43 CGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACCGACACTGCCAATATGATAAAAATATGAACTTGCAAAACAAGCGGCAAAAAATGAGCAATGTTTA:1 + chr3L 4875260 3' + P-element 2719 1 70.30 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTAAATACGGTAAATGCTGTCCAATCATTAACAT:1 - chr3L 13639866 3' - hobo 44 1 67.33 TTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTATTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCCCACTCTCACACCCACTCTACCCTGCAATCCCGAT:1 + chr2R 15282071 3' + Cr1a 239 1 75.76 CGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' + 1360 3295 1 88.12 AGACTATGTGAAACCACAAGATGTTGGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTA:1 - chr2L 12884312 3' - HMS-Beagle 6826 2 51.49 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTAAATACGGTAAATGCTGTCCAATCATTAACATAATTGAATTACAAACAAGCCCAA:1 - chr3L 13639843 3' - hobo 21 1 58.42 CCTTTTGGGAACACCTGCCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCTGCACGTTTCGTAGTAATAAATTTCTATTTTCCTGTTGTTCTGGCTTGTAGTG:1 + chr2L 9108227 3' + baggins 5018 1 59.41 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGAGTTGGTGGCAAGTCCCGTGGCCTGCTAATGGCATAGTTTCCATCTGCTTTTCCGGT:1 - chr3L 20079690 3' - mdg1 7057 2 59.41 CCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGAGCTTAGTACTCAGTGCCCAGTACACTGGGTACAGTGAATATTCCGGCTTATGGTGAG:1 + chr3R 22527720 3' - opus 347 2 54.46 ACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAACGACAGGCAACAGTTTCATAAAATTTCCACTCGACTGCGCAGAATCTCCGCACAAGGAT:1 - chr2L 8791079 3' - Cr1a 225 1 57.43 ATCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACTTCAATTATATAGCGACTAAAATTAACA:1 + chr2L 9293311 3' + jockey 4604 1 71.00 ATAAAGTAATTGTTGAAATNTATAGGATCTTGAGTACTTGAATATTGCTAAGTTATAATTATATACATCTAATATCATAAACTAGATTTAATGAAAACTTT:1 - chr2L 6122431 3' - 1360 375 1 75.25 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCGCAAAGTATAGTGGGAAAAT:1 + chr2L 9045823 3' - jockey 31 1 55.00 CGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAACAATTCCGCCCAC:1 - chr2L 23506311 3' + Max-element 95 2 62.38 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTTTACATATATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTCCTAGTA:1 + chr2L 14979231 3' - Ivk 29 1 59.41 ATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAACATTAGCTACGGGAATATATATTTTTTGTTAAGCTGACGAAATTTAATCTCTTGAAGAGG:1 - chr2L 16033396 3' - I-element 5332 1 57.43 TGCACACACACACACACACATCGAAAAATTGTTTTAAATA:1 + chr2L 4277548 3' + accord 182 2 90.00 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAACATTTTTGGTCGAGAATTCTAAGGTCGGAAATCCGCCTATGCTTAAAAGCTTTT:1 + chr2L 6112882 3' - blood 7025 2 60.64 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTTCTCGCTGGAGCTTGGCACACGTTTCGC:1 - chr2L 12485412 3' - roo 47 2 73.27 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTTTTGTAAACATATCAATGGGCTT:1 + chrX 17175225 3' - I-element 52 1 77.00 TCAGCCAGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATGATGACTTTGTTTCCCTGAAGGCGACATATCAG:1 - 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Tirant 8107 1 81.19 AGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAGCGAAAATAAACGAATGGAGAAATAACAATTGCCGCCGCATATG:1 - chr2R 19630155 3' + 17.6 7082 2 55.56 AGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAAGTTCAATTTAAATGACTGCGGCAGCTCAATTGAGTTCCAGTTGGTTTT:1 + chr2L 5210454 3' - accord 25 2 54.46 TATCTACACATTACATTTTACAAAAAAACTTTTCATTGAACATATTTACATAAGTCCACGTATGGATATAAACAGAGCAATGTCGATGCAAAACCCTTTGA:1 - chrX 22509750 3' - HB 106 1 78.22 GAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCG:1 - chr2L 20360643 3' - micropia 4981 2 59.41 ACTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATGGTCGAATGTGATGGAGATGGCGGCGAGGGGACA:1 - chrX 15491213 3' - INE-1 531 1 66.34 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTTTGTATCTTCAGAACAAATATTGTTTTGCTACTTGTTTGTTTTGCCCATCAAACTCTT:1 + chr3R 17953017 3' + copia 240 1 65.35 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTAAAATTTACATAATCTATGTGCACGAAAATAAATGAGA:1 - chr2L 18239392 3' - hopper 2 2 77.23 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGG:1 + chr2R 9871567 3' + roo 9035 1 62.38 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATAGGGAAAATGTAAAATTAG:1 - chr2R 8674155 3' + roo 9019 2 80.20 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCCCTTATTCACCTGCAGCCAGCTGGAAATTTCGCAACCCTTTCGCGCAGCCGTTGTTGCACTAG:1 - chr3R 9074032 3' + hopper 1403 2 63.37 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTCTTAGGCAAATCTTAACGATAAAAGGGTTTACCTGGCCACCCCAATAC:1 + chr2L 21199199 3' + roo 9046 1 53.47 TGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAAATATATATACATATATAGGTAGGTAGTC:1 - chr3R 18851018 3' + invader4 283 2 75.25 CAATAAAGCAAAATAGATCNCTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACA:2 + chrX 20999559 3' - BS 44 1 74.26 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCAGCGCTCTATGCTGGGACCGTT:1 + chr2R 1276183 3' - blood 7067 2 77.23 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAATAAATAGTTTAATCCTGCCTGTCTAGCATTTATTTTATGCAGCAACATGAG:1 + chr2L 13622037 3' + opus 7480 2 58.42 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGCAATTATGCTATAACATTGT:1 + chr3L 2424899 3' - jockey 61 1 75.79 CACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTAGGAAGTCGACAGTGAGGCGATACCAGAAGGGCTCTTCGACGGGGACGT:1 - chr3R 18666406 3' - flea 293 1 57.43 CCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGGAGAGCGCGCTTTCGGTTAAAGCTCTCTCTCCGCACTCACACGGACGCA:1 - chr3R 10093659 3' + P-element 2885 2 77.23 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGG:1 - chrX 19034110 3' - hopper 29 1 56.44 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAG:1 + chr3R 14049437 3' + transib2 2813 1 66.34 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTGGGCAGAATATGCCTTATTTCTGGCCTTACTACCGAGGTTTCAGCATTTAG:2 - chr2L 13621945 3' - opus 7024 2 56.44 AAGGACAACGCTAAGAAATACAAAATTATCGGAAAAGGGGTGCAATATTTATTGCACTTTATTTATTCAGTTGCCCAGCAAGTTGGGTTTATTTCCTTGGG:1 + chr2R 3397336 3' - 297 341 2 73.27 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCATAAAT:1 - chr2R 9061916 3' - jockey 4693 1 51.49 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAAACGCTTAGAAATTCACACGCTGTTAACGAATCTCTTATGCTTCATTTAAAATGCTAATATGAT:1 + chr2L 19698525 3' + hobo 2928 1 66.34 AAATTTAAAATAAAATAAAAAAAAATGTAAAATATTCAAATACTTTCTTCATAATAAATGAATATTGGAATGAAATCCTTTCCTTTA:1 - chr3L 14813067 3' + TART-C 11097 2 68.97 GATAAAACCAAACCTCTCAGTAATCATAGAAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTAGAGTCT:1 + chrX 13134936 3' - BS 5011 1 61.46 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAAAAACATCATCGTAAACTGAAAAAAAGATGTATGGGTGCGTGGTGCGG:1 - chr2R 7605049 3' + jockey 4955 1 68.42 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTTTACATATATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTC:1 + chr2L 14979225 3' - Ivk 35 1 64.36 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATTGCTTGTCTTTCTCATTTTTATCTGAATACAA:1 + chr3L 26567341 3' - opus 39 4 68.32 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCATCAGCATTGCCGTAGCCATCGCCACTAATTAAAAGCGTATCACCCGACAAATGTGC:1 - chr2R 13745684 3' - hopper 2 2 73.56 GGGACATAAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTCTTTTAAGATCTCCTAAACTCCCTCATAGCTTCCATTTTGTACTTACATCTT:1 + chr2R 13058958 3' + 297 6955 2 48.51 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTAATAGATATTAAGTGAGAATAAACAATGCGACGTTC:1 + chrX 17098440 3' + roo 9052 2 64.36 TGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATTG:1 + chr3R 1960323 3' + gypsy9 219 2 88.89 GAGCCACTGCAAAAAAATCNTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCT:1 + chr3L 23090531 3' - 1360 50 1 95.05 CTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAAAATCCCAAAATATCGAAACCACTATAGC:1 + chr3R 6478705 3' + P-element 2704 1 43.56 GGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACA:1 + chrX 983349 3' - Juan 3855 1 73.27 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGTGCAACTTGAAAGGCGATTTTTAGGCCATTTTTGCAGTAAATGTAGCAGTACTTGAAGCATTTTG:1 - 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Doc 52 1 69.00 GTTTTTTTTATTTTTTTTTGTTTTGTGCTCTAGCCATGGCTCCACCAGCCCGGAGCCAAATGATTCTGCCACAAAAGCAAAA:1 + chr3R 22980890 3' - gypsy7 5004 5 45.12 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAGGCATATAATTATTT:1 - chr3L 2016867 3' - Tabor 6867 2 50.50 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGGAAGCAGCTAAATAATCGAAG:1 - chr3R 5264484 3' - P-element 50 1 27.84 TCTTTATTATTATATTATTATTGTATAAAATAAAATTGCATAAATACGATCTGCAAAGGATTTTGTTGTAGCTACATAACTATCCAATAACTATGGCTAGA:1 + chr2L 13925776 3' - invader3 5051 6 78.22 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGGATAGGCTTGCCTCAACACGAGGACTCTGCTTTTT:1 - chr2L 20290225 3' - flea 34 2 64.36 TGAAGATTATTTTTGAAGCCCTGTATTACTCTTTCAGTTTGGCGCCATCACCTCGCATTTGTTCGCCTCTTTGTACCTGTCGCAGAAACTCCTGCTTGAAT:1 + chr2L 14602163 3' - Q-element 275 2 71.29 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCNCCCTTGCAGTTCTCTGATGTAAATACGGTAAATGCTGTCCAATCATTAACATAATTGAATTACAAACAAGCCCAATCGCAA:1 - chr3L 13639837 3' - hobo 15 1 64.36 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCAGAGCTTCCCGAGGAGCATCTGGTCGGAGATTCTAGGGAGTAGCGTCTCTGCTGCT:1 - 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chr3L 15776992 3' - I-element 19 1 57.43 ATCGATAGAAATTTACAAGACTAAAGTTGAAAATTAATTTTGAAAGTTTCTGACCACTCTTGTGGGTGTGCGTGCATATAGATGTGTGTGTGTGTGTGTAT:1 - chr3R 22676778 3' - INE-1 300 1 81.19 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGGATTACTTCGCTTGCGGCCTGCCATTCAATTAAGTCATCATCGCCATGCATTTTGACAGCATTTAA:1 + chr3R 11846745 3' - roo 9 2 70.30 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTATGCATAAATTGGCGTTAGTT:1 - chr2R 22659028 3' + 297 347 2 80.20 AACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTTAACCCTTAGATGATATAATTTATATATACTATATGTATACATACTGTTTAGAATATATTTTCCTAAAT:1 + chr2R 13378041 3' + flea 5010 2 64.36 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAATGTTTGCGAGAACTAAACGGAATGTTCAA:1 - chrX 6451092 3' - pogo 42 1 71.29 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACTCAAAACTCTA:1 + chr2R 17402812 3' + invader4 321 2 75.25 ATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATAAATAAGTTAAAAGTCTATTATCAGGAACCA:1 - chr3R 4164648 3' + HMS-Beagle 7003 2 76.04 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACAGTGGCAAAGAAGCCGAGAGAGAGCAGGCAGTGTTAGGCAACGTCA:1 + chr2R 19424151 3' - P-element 31 1 46.53 TTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGC:1 + chr3R 11547763 3' - G2 308 1 56.44 TATAAAATGTTCGTTACAATTTCTAGCTGTTTATAATCTGCGAAACTAACTAATTAATAAAACGTTACGTAAATGATTAACATAATTATTGCATTTAAATT:1 - chr2L 11591741 3' - invader5 3711 2 87.13 CTACACACACACATACATGCTGTGATATTTTTTGTGGCAGG:1 + chr3R 28935122 3' + accord 256 2 56.10 ACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCGGGTACCACGACAGGCTAGAGCGCCACAGTGCTAGTGTGTGCTAGTGT:1 - chr2L 16287408 3' + BS3 1431 1 81.19 TTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGTAGAGCCTGGTTCCATGCATTCGAAAGCGGAATCGTGAATAAAATCACCTGGGATGCCTATCGGGAGTCAGTTGGCC:1 - chr2R 11699227 3' - roo 8663 1 80.20 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAGGGGTTAAA:1 - chr3R 26498515 3' + roo 9045 1 55.45 GTACAGCGATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTGGAAAGAATTGGGAATAATTGTGCTGCTTTTGTTGTTTTGCAGATAGTTTGAC:1 + chr3L 10194468 3' - 3S18 5707 1 57.58 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGGTTATC:1 + chr3R 20425420 3' + roo 9046 1 55.45 CACTTCTTAGTCTGTCGGAAGAGACTACGAGTACTTGGCAGCCCGTAGAGATCTGCGTGACGGGAAGAATGGGGCGGAAAATGCACGAGTGGGTTTTTTGG:1 + chr3R 11560095 3' + diver2 218 2 56.44 TGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAGGCGAATGGGGAAGTAGTGCCCAAAAGTATACAATGCAT:1 - chr3L 9220126 3' + BS 5057 1 59.41 TATGAGATCATCATCATCTCCTGGTTCTCGTCAAGGGCGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCTGTCTCCCGTGACGCCTTGGGTTCTTTGTACTGTGTGTG:1 + chr2R 5097043 3' - BS3 1613 1 68.32 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAACTATTGAACTCGTCTAAATCTGCATACAA:1 - chr2L 5304722 3' + 412 7498 2 71.29 GGAAAAACACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGTCTGTTTGGGTGAGTTTGATTTTCGAATTTAAACCAATTTCCATATATTGACTAAATTACTAAATTAG:1 - chrX 13265981 3' - Burdock 6171 2 61.39 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTACAGTTTTGGTAGTTTGATTGCTTGAATTTGAAGTTGAATAAATCTTAAGAATTTAAT:1 - chr2L 9867863 3' - jockey 4777 1 54.46 ATGGAGGAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 4989 2 53.47 TATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGA:2 - chr2R 1751256 3' + INE-1 81 1 97.03 CAAATTAATATATTCAAAAGAAGATAGTTCTAGAAGAGAAGGAAAAGCATAAGAAATTTGTTGCTAGCGGGTTATATTGGCAGG:1 + chr3L 24253901 3' - Gypsy12A_LTR 2048 1 82.14 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATA:1 + chr3R 14049404 3' + transib2 2780 1 69.31 GCTAAGTCAGCATCCCCACNCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATATGTTTATTTAAGTTTCAGTGTGCGTGTCGTTTTGGCAAAGATTTCATTAATAGCT:1 - chr3R 30284013 3' + blood 7132 2 60.40 TTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAG:1 + chrX 8027509 3' - Juan 16 1 63.37 GAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATTGTTTAATTTA:1 + chr3R 1960332 3' + gypsy9 226 2 89.11 CTTTTATTCCTTCTTTCTTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGGTGCTCCACCTAATTTTTATTTAAAAAAATTGGTCCCCTAAAATTTCTATTAAGCATTA:1 - chr3L 18308607 3' + copia 4984 2 63.37 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACATACATACAACTATGCAAATCGGAACGAAAATGCTGTCTTCCTGCAGTGTATCCTATAGCTAAAA:1 - chrX 19689652 3' + S-element 1712 2 65.35 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGT:1 + chrX 6388317 3' - hobo 43 1 67.01 CTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTGAAATGGTTTGTTCAGTTGAGGATTTAATTGATTTCTGAGAATTTT:1 - chr3R 27071852 3' - jockey 12 1 73.27 CACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAACGTTCGAGGTATGCTCTACTTTGTACTCCCTGCTTTCGTCGCGATTC:1 + chr2R 8672091 3' + roo 8679 2 53.47 TAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACCGTATCGCGGAAGCAGTTCACCCGCACTATCGA:1 - chrX 11322194 3' - accord 394 2 67.33 TTAAGAAAGGAAATATAAANTATAAATTACAACAGTTTGCCTATGGCTCGAGCGATGCCACACCCCCCGCCCTTAGCACACACATGTATAAAAA:1 + chrX 18990347 3' + copia 243 1 63.83 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATCGAGTGACTAAAAAAACATCATACGACTTTTTTCAACAGAACAGGAAGTGGAATTACTCAC:1 + chr2R 16127109 3' - FB 16 1 61.39 ATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAAT:1 + chr2R 21421075 3' - springer 44 2 73.27 ATTAATAATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGG:1 + chr2L 20290297 3' + flea 241 2 55.45 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCACTGCACGCAACAATCACTCGTCGATCGCTCGCTCAGCG:1 + chrX 15499011 3' - P-element 36 1 43.56 TATTTAATTATATTTATTTAAAATTGCACTTTTCATAAAAATGTTTAACAAACTAATAGATAGATAACAGACAAAATAATTACTAAATATTATAGTTTCA:1 - chr3L 3747226 3' - G7 1146 1 90.00 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGTGTGCCTTTGGCTCTGATTGTGGCTCCATCTC:1 + chrX 6388348 3' - hobo 16 1 63.37 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGA:1 + chr2R 20389481 3' - pogo 49 1 78.22 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCTTCAAACGTATGCATGTTCATGTTTATTTTTCGGTATGGAGCTGCGCCAAATTTAATCCGGAGATAGTT:1 + chr3L 15390436 3' - pogo 5 1 74.26 GAGGGAAACATTAACTTAAGCGTGGGCGCTTTTCCAACTGCCGGAAGAGCTTTTCCATTTCCCATCTTAGTGCTCTCTTGAATTATGCTTTGCGTCTTTGT:1 + chr2L 18206870 3' - G2 2999 1 48.51 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAGCAATAGCTGGGGCATCGGCACCGTGAGC:1 + chr3R 27605332 3' + opus 7456 2 74.26 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAATGGGTATCAGGGGTATATTGCCTACCCAGAGGTTAATCATTTATTCAAACTGATTATAAATATTA:1 + chrX 8896250 3' + 1360 3380 2 69.31 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGTTGTTTATTCCCTGCAGTGTCTTCATTTATAAATCCTAAAATAAGATACATTTTAGCATACCAAACCCTTTAA:1 + chr3L 16759798 3' - Transpac 1 2 37.62 TTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGCCCCACTGCAGTGGGGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTTTGTGATGGAGCCGCCCTGAGTTGTATGCT:1 - chr2L 11537505 3' - hopper 1121 1 61.39 CCTTTCTTATAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCGGTGGTCCGCCGCATCAATACCAGTCTGTAAACTTTATTGCGATGGCAAATATATATTTTATTA:1 + chr2L 20301067 3' + Tom1 16 1 48.51 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCCAAAGTTGGTTCAAGCTAAGTTTCGCTGGAAAGTTGTCGATTTTAATTTAA:1 + chr3R 12599363 3' - BS 21 1 52.48 ATTGCTCATCTCCCAAGCGAATTATGAGCGCAGTCACACATGCACATAAACGGAGCAGTTCAAATTAAATGTAGCATACTTTTATGGGCCAGTGCAAAATG:1 + chr3R 26292641 3' - jockey 8 1 73.27 GTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCAATGGGAGTCGGCCTTTGAACTCGAGTTCGACGCGGAGGCCAGTTCCCAGCAGATGAGTG:1 - chr3L 4709616 3' - accord 7088 2 68.32 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAGATATTACACGTTTTTTTTCATAAAATATCGATCATTG:1 - chr4 194728 3' - Quasimodo 37 2 66.34 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATAAAGCTTTTTGCTGTTTGGAGCTTAAAAATAATTG:1 - chr3R 8261995 3' + S-element 1682 2 64.36 AAAATCAAATCGATAACTGTAAATATTAACTTATATCGATACCCCAGAAAATAAAATTCGGGTTCGCATTCCCACCAGCTGAGTAACGGATATCTGATAGT:1 + chrX 15903342 3' + HMS-Beagle 236 2 69.31 TATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCATTGAGTGCGCCGTATGCCGTCTGTCTGTCTTTGGTCGTA:1 - chr2L 16691735 3' - P-element 399 1 41.58 ATCTACACATTACATTTTACAAAAAAACTTTTCATTGAACATATTTACATAAGTCCACGTATGGATATAAACAGAGCAATGTCGATGCAAAACCCTTTGAA:1 - chrX 22509749 3' - HB 105 1 78.22 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATAT:1 + chr3R 24228966 3' - 297 6598 2 62.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACCAAAAGGGGAGTGGCTGTGCGTTTGCAATGCGAGCGCTTT:1 - chr3R 11831419 3' - roo 35 2 62.38 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATCTTGTCATATTATTA:1 + chr3R 18883840 3' + roo 9051 2 60.40 AATTCTTCAGACTCTACTGATTGTGAAGAGTTCATAGGTGGGTATAACGGGTACATAGCTCATCCTCCGGCGTTTCACCGTGCAATAAAGTCTAAAATCTG:1 + chr2L 21326809 3' - hopper 239 1 58.42 GCTTGAAAGAAACACGTCTNCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTGATTCGATTTGGCAAGCACTGACAATTTTGCTTG:1 - chr3L 8749956 3' - Doc 28 1 54.46 TGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATGAAAGAGTCGTGATCATATGTTAGCCACGTCAGGTTGAAGAACATCCAGAGCAGATTTGTTATTTC:1 - chr2R 25088719 3' + HB 455 1 69.31 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTTATTGCTTTGTACATTGGTTTAACGCTTCCTTTTTTCCCACATTT:1 + chr3L 4769625 3' - roo 8694 2 58.42 CTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTGGCCACTGATGAGCTCGCAGGTTCGAGCGGTCGGCAAAGGATCGT:1 + chr2L 15477067 3' + HMS-Beagle2 6980 2 65.35 CGTATATATATATGTATAANAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 183 2 82.26 ACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATTAATATACATATATTTACCAAATAATATAACATATTTATGCTCTAAAGTATAT:1 + chrX 15826831 3' + accord 7031 2 81.19 GTTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAAC:1 - chr2R 15160277 3' - Tirant 8118 2 69.31 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTTCCATTGCAATTGGTGGTGTCCCTTTG:1 + chrX 2911319 3' - hopper 46 1 68.32 TATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTGTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCACATGTCA:1 - chr3R 13439584 3' + gypsy7 5068 1 52.00 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTACTGTTCGTACCAAATATTTCGATTTTCCTGCTATCATTTTGACCACAAGTGTACTCTAC:1 - chr3R 23788368 3' - pogo 11 1 39.80 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGC:1 + chr3L 17708287 3' - jockey 4804 1 66.34 CACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACTCAATGGGTAAGGGGTTTGGGTCACAAAATAAACGAATGAAATGTTTTGGATAGTGCCACATTTCAC:1 + chr2L 3495047 3' + 1731 306 1 63.37 AACTTTTCACGACTTGACTTCACGTCGATTTGATTAGAAAAGAAATAAAACGAAAACTTTAATAAATTATTTTTCCCGGCAACAAAGACTAACAGCTAAAG:1 - chrX 12810548 3' - Gypsy12A_LTR 282 1 57.43 CGACAAATAAACAACTGTCCCTGGTATACATATACGCAACTCGACCATAAAGTGGGCATGGGAAATCGATAGATATTTACAAGACTAATAAATATGTGAAA:1 - chr2L 22063440 3' + Helena 1150 1 69.31 ACTATTATTTTTTTTATAAAATGCATATATCAGAAGTATTTTATTCAATACTAATTAGTAACAAATATAATGCTATTGAATGTATTTACTTTGATTGACAA:1 + chrX 17547029 3' - TART-B 10455 2 90.10 TAGTAATTTAAATTAATGACAAACCCTTACCATATTTTGCCTATTTTTCATGTAAATAAAATTGGTAAGGATTACATTATTATTTTGTGATTGAGTTCCAC:1 - chr3R 21931378 3' - Transib5 2589 1 86.14 GTTTCTAGTGAATCTACTTGGAATAGAGAGGTTAAGCTAGAAAATATTATCTTTTTTATTATGCAAGGAATGAAATATTCACCATTTTACAATAAGACAAG:1 + chr3R 8145571 3' - Cr1a 4111 1 75.25 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTATAATCTCATTGAAAGCAAAAGTAAC:1 + chr2L 17168491 3' - flea 47 2 76.24 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACATATATATGTAAATGGGTTTAATTACGTGA:1 - chr3R 19955233 3' + hobo 2895 1 71.29 TAATTTATAAGCAAATTAAATATAGAAGAAAATTCCCAATGCATATGCAAAACCTATAAATTGTATCCAAATACCGCCTGCCGCTTTACTCTCAGAAATTT:1 - chr2R 15001507 3' + S-element 1595 2 59.41 GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGCCCTCCACCATAAACCTAAAATAT:1 + chr3L 24761281 3' - 1360 40 1 77.23 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATAT:1 + chr3R 24228966 3' - 297 6597 2 62.63 CTTTCACTCGCACTTATTGNAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACCACCACCTCCGCGAGAG:1 + chr3L 5360196 3' + P-element 2829 1 23.76 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCACACTCTATGGTTTCGGACCCACATTTGGCACATC:1 + chr3R 27448296 3' - hobo 41 1 67.33 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCAAATTTTGTGACGAAATATGACAACACATTCTATTAAAAACTAGTTTCTTACATTTTATAACCAGCACCT:1 - chr3R 4712657 3' - pogo 3 1 76.24 GGGGTTTAGGGGGCGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCG:1 - chr2R 11664307 3' - Tirant 8114 2 66.67 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGTGTGCCTTTGGCTCTGATTGTGGCTCCATCTCCGAGGCCTCGACTG:1 + chrX 6388362 3' - hobo 2 1 77.23 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTTCTCGCTGGAGCTTGGCACACGTTTCGCCTTTGTCAGCTATGA:1 - chr2L 12485397 3' - roo 32 2 58.42 CGGTGGCATATATTGGTTTNTTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCAAGGGTTTGAAAAT:1 + chr2L 2622801 3' + blood 374 2 75.25 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTAATCAGTTTGAAGGCGCGTCGAGGCCTCTACCTTTCTCCTACATTCAATGAACT:1 + chr3L 1227373 3' - 412 21 2 56.44 TGTGTAGCTTGACCACTTGAGCTGCACAGTGCATGCTCAGCGTCCCTCGGTCATTTCGTTTAAGGACTTGGGCTGACAAATTTCAGCTTGTTCAAAGGATT:1 + chrX 3585258 3' - Stalker2 7457 2 64.36 CCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCACCCGTTCCCATTTTCTCCCGCCTACACCCACGTCATCGAGG:1 - chr3R 16534421 3' - X-element 4487 1 57.58 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCC:1 + chrX 20015542 3' - 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Rt1a 5017 1 79.21 TGCGCTGTTATGTTACTGTTAGTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGCAAAATATAAAGAACACAAATTTAACA:1 + chr3R 26021446 3' + BS 5047 1 71.29 AATATTTGTTTAGACATGATAAGTAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTCGAGTGATCCTTAAAGTACTAGGATGCATTTGTCCGCGAAGTCAAGATGGTGTAAT:1 - chr3R 3610673 3' + rooA 7 2 68.32 ACAAATTTTGCAAAAGTGTGGGCGGTTTGTAGGCGTTAAAGTTGGCGAAAGCCACACTACGTTTGTTATCAATTTTAGAACGATTGATTTTTTAGTTTGAA:1 - chr2L 21292770 3' - INE-1 257 1 63.37 TCTTAATTGGAGTTCATCANTACAATACCTCACTGAGCTCGTAATAAAATTTCCAATCAAACTGTGTTCAAAAATGGAAATTAAATTTTTTGGCCATATT:1 - chr2L 14421049 3' + 412 491 2 70.00 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATGATGACTTTGTTTCCCTGAAGGCGACATATCAGAATCTGGGAA:1 - chr3L 9697955 3' + 412 462 2 56.00 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCATAAATTCACAATAACTTTTGAAT:1 - chr2R 9061898 3' - jockey 4674 1 68.00 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTGCAACTGCAACAG:1 - chr2L 13310232 3' + mdg3 228 2 52.48 GGGTGGATGATTTGGCACTNGCGGGCGTCTGACACGACGAAAGGGTTATGGCCAGC:1 - chr2R 13639039 3' - Doc3-element 324 1 67.86 CGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGGCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCG:1 + chr3L 23678163 3' - Osvaldo 10 2 62.38 TTCAAATTCAAATTCAAATTTCTTAGACAACAATTTTTATTATGTGAACAAATGGCACACTTGTATTATTCAAATTTACTGTAATTCATATATTTTGTTCT:1 + chr3L 14920471 3' + Rt1a 312 1 80.20 ACGTTAGAATTTTCTGTAAAAATACACATAAATTGGAAGAGTTGGCGAGTATTCTTAAGAAGCAGTGCACCTAAAGGGGTGCAACCCAAAAATTAGGATA:1 - chr2L 22323442 3' - transib2 370 1 70.00 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTGAAAAAATGGTGGAAAAAATGGAGGAACTACTGCAACTGTCAAATGCATTATCATG:1 - chr2L 16566264 3' - 297 6591 2 68.32 TTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGAAAGGAGGTGCGCAAAAATCGAATCCTCTACTGCAAAGGACAGGACACTCAATAAGA:1 - chr2L 5586772 3' - micropia 5037 2 62.38 ATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGAT:1 + chr3L 25350816 3' + baggins 5409 1 49.50 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTGGCAACGACAAAATAGCCGCATGCTGTCAAT:1 + chr3L 15745404 3' + hopper 1376 1 65.35 GTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATGGCAACATACAGGCAAACACATATAC:1 - 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X-element 39 1 54.17 CCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCACCACCGTTGAACGTGTGTACTTATTTAAGCTTTCATTGCCTGGCACGCCAACCACGACACGCGAATGCG:1 - chr2L 14063754 3' - Bica 4738 1 69.31 TCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAACTCCTAGCGAACTACTAGCCGCCTATTATGGAGGTAACACAATCGTACATCCGGATATCGACAATGAC:1 - chrX 17243414 3' + 297 19 2 75.25 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAACAAAACAGGTGCGTGGTGGCATAGTGAATATATGTATGTATATGTATGCACACGAATATAGGTGTGG:1 - chr3R 31194723 3' + blood 7333 1 62.38 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATTAAAAATCGCAGATGGTATGAATGGAAAAACTCTGAG:1 + chr3L 5533621 3' - pogo 37 1 67.00 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTA:1 + chr3L 13366420 3' - hopper 41 1 64.36 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCC:1 - chr2R 11664314 3' - Tirant 8144 2 62.38 TGTGGAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACCGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGTGGCAGGTAACAAGTTGAAAACTGCAGTTTGCAT:1 + chrX 2548416 3' - Circe 7177 1 64.36 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTT:1 + chr3L 14311493 3' + roo 9036 1 62.38 CCGGTTGAGTGTCCGATGANTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTT:1 + chr2L 19907950 3' - Tirant 8149 2 73.63 TAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAG:1 - chr3R 26498525 3' + roo 9035 1 63.37 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACGTGCTCGCTTTTTCTGTCCGTTACCGTTACCTCGTGTCTGCGTTCGC:1 - chr2L 13549246 3' - P-element 25 1 50.50 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCAAAGCGTCTAAATGGACACGCA:1 - chr2L 14970085 3' - hopper 52 1 77.23 CGCATACCTCACCTTGATANGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAATGGCTCTGGTGGGGCGAGAAGGTCAAGAGAGTGCTTCCACCAA:1 + chr3R 22525023 3' - opus 7454 2 56.44 GGATTGGGTTTTCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTACTATATAACCAGCACTGGAAGCAGGAGTCGCAGCTGCTGCCTGTTGACATTTCAGTGCCTTCAGC:1 + chr2R 9368958 3' - I-element 5113 1 72.28 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTATGTACATAGGCATGTATACATTGTCTTGGCTTTTCGATGTGTGTGCGTGT:1 + chrX 19384068 3' - pogo 19 1 56.57 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAATAAAACACAAGAAATAAGAGGTGGGTAAGGAATTAAGAATGGGCAAGGGTTTCCG:1 - chr3L 14301560 3' - roo 16 2 63.00 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAAGTATCCGTTGGTAGAGAGAGTCGTTATTAGGGTCTTGATTTTACTTGATTCAATGCTGAATCACAACT:1 - chr2R 10528282 3' - pogo 2 1 75.25 AATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCGATGAGGGCTTATTATACGAAAAAACATTTGT:1 + chr2L 9073536 3' - 297 213 2 68.32 AGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTTTAAAGAATGTATTCCTTTCCACTGTTGCGC:1 - chr2L 21951436 3' - Transpac 5062 2 69.31 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTGCAGCAGCGGCAGGTTCTCCTTTCCATTCTCCTGGTGTTTTTTT:1 - chr2L 10924195 3' - hobo 7 1 67.68 CAGTAGTTATCCATTAATCNCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGC:1 + chr2R 5532339 3' - G4 3762 1 44.55 TTTTTTATAATATATTCTTTTAATGCACAAGAAAACTACACATAAAAATATACTAGAGTCACCACTTCCTTCCTATATCTCAGCTGGTCAATAGCTTCCTC:1 - chr3L 18177090 3' - BS4 727 1 43.56 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTCCGTCTCCCGTTTGC:1 - chr2L 17168413 3' + flea 247 2 70.30 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTA:1 + chr2R 5237899 3' - Doc 34 1 52.48 AAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACTTCAATCGCAGCTTGCCAACTTCCAGTGGCACTCAGCCCCACACACAGATACATGCATTACATAC:1 - chr3R 17889237 3' + I-element 5079 1 69.31 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCT:2 + chr3L 17708310 3' - jockey 4781 1 56.44 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAAGTATCCGTTGGTAGAGAGAGTCGTTATTAGGGTCTTGATTT:1 - chr2R 10528309 3' - pogo 29 1 55.45 AGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAATCCCTTTACACGTTTTTATAACATTTCGAAAA:1 - chr2L 21786711 3' - Max-element 8281 2 69.31 AAAAGTAAGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGA:1 + chr3L 15099639 3' - G4 3812 1 38.61 TATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGTTAACTCAGATATATATTGGCTTTCAACGAAAGATAAA:1 - chr2L 3494963 3' - 1731 4351 2 60.40 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTCTTTTAAGATCTCCTAAACTCCCTCATAGCTTCCATTTTGTACTTACATCTTGAGATTGCCCTTGGACGGA:1 + chr2R 13058977 3' + 297 6974 2 67.33 AGAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCCGGGTTCCGATATGAGCAATCTCCCACCTTCGCCACCTTTTTTCAGCTTTTAGAGTGGACCTTG:1 + chrX 18338288 3' + gypsy8 433 1 40.00 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGACGAGACGAGTCTGGTCGAAAAGGGACGGAGGAAGATGGGGAGACAGAGC:1 - chr2L 9521624 3' - P-element 8 2 71.29 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTATTCTCACTTTGCTCGTTTAAATGGGGCTCAACTTGAATCAAATATTGCTAAGCAAT:1 + chr2L 22241812 3' - pogo 16 1 63.37 TGGTTGCTATTAATTCAGCCCTTTCAGGCTGCAATCTCTGCTTCAATAACGCCCACACTTAAAGTCAGTGGAAAATAATTC:1 + chr2L 16162561 3' - BS3 1710 1 53.09 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGT:1 + chr3R 24228981 3' - 297 6584 2 76.24 TTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGTTAACCCCAAGCATAAGCCAATAAACAATGGCAAAGGGAAAGAAAAGAGGGCACCCTTTTTACTCC:1 - chrX 1048720 3' + Stalker2 393 2 68.32 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTATACTCGAAAAGGCTTTTTTCGGCGGACGGCAGCTTCAAAGTT:1 - chr3R 11814483 3' - blood 7042 2 54.46 TTAAATTAAAATTTAAAATTTACAAAAAACCATGATACTTCTTGTTTCGATACGTGTAAACTGGCAGTCAATTGTGGGTGCCTCCGATAACGATAACAAGA:1 - chr3L 16844996 3' + 1360 3052 1 66.34 TTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGACCCAAACTGTAGACGCCAGTTTGTCGACCGCCCAAATGTCGCAGCATACTTTTCGGCGTACGCTGTTAAACT:1 + chrX 14961107 3' - jockey 4639 1 71.29 GATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTCGCTCGCACATCTAAGCCGAACTAGAAGGCCAATTTGTCCGCTCAAAATGGCTCTGATCCAGTTGGCT:1 - chrX 9380862 3' - micropia 317 1 71.29 AAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTAC:1 - chr2L 23295814 3' + micropia 403 2 73.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAA:1 + chrX 9439209 3' + roo 9020 2 85.15 TGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCCCCATTCGCCTAACCCTTTTCCCTTTTTTCCCTTCCTGTGGCAACACCGCAC:1 + chr3L 9220185 3' - BS 20 1 50.50 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTA:1 + chr2R 5651908 3' - Tirant 8132 2 56.44 AGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATGATTCTCTCCCTAAGGAAGTTGGGCCCATTCCATTGACAGTAAGCCAAAACGATAAGTAACATATTTTTCTGACA:1 - chr3L 1930408 3' + roo 406 1 71.29 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCACATGCCAACGAGAAGGAGAGTTGGAGGAATACTTAGAGCTAGAGCTGGGAATTGGACTCGTGTGAGTGCA:1 - chr3L 6619739 3' + 412 491 2 72.28 GGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGCCAATGCAAACAATCTTTTCAGGAGAAAGAG:1 + chr2L 21369915 3' + rover 307 2 68.32 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTT:1 - chr2R 25203770 3' + 1360 3357 1 54.46 ATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACAAGCCGCTAATGGCTTAGATGAAATGCTAACACCAGAAG:1 + chrX 20854539 3' - copia 182 2 63.37 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAA:1 + chrX 21668093 3' - Tabor 14 2 65.35 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGA:1 + chr3L 25876133 3' + copia 5083 2 66.34 TTTTACTTATTTATTTATTTTTTTTTGTCGTGATGTCCTTGTGTTTGTCTTGCTGATTCCGCTGGATGTTAAGCTTCCTGTTTCTGCTGCTGCTCCTGTCG:1 + chr3R 20472754 3' - Juan 4215 4 67.33 AATTGTTGCCCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTACCGTTTTTCGCGGCTCATTTTAGAAAA:1 - chr3R 4576774 3' - Tc3 1333 1 77.23 TTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTACGATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGTTTTCCAGCGGAG:1 - chr2L 23189402 3' - 1360 3049 1 68.32 GGTTTCCATGTTTATCTGACATCAGACCACTGTGCACGAAAGCACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCCTGGGGATACAGCAGGATCC:1 + chr2R 16362309 3' - Cr1a 422 1 78.22 TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCACACTCATTCGCACCGTGACTTGACTTTTGTTTACCTTTTTCACGTCGATTGTAGATGCAAAAGTA:1 - chr2L 18485317 3' + P-element 2803 1 66.34 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGA:1 - chr3L 27357557 3' + mdg1 384 2 57.43 ACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACATCCCAACAATTCCCTGTTGCCA:1 - chrX 6260196 3' + Doc2-element 428 1 77.23 AATTAGAAAAACAAAAAAAAAAACAAGAGAAAAAACATTGTATCAACTAAAAGGTTATTCCCATAAATTGAATGTGTGATATCCTAGCG:1 + chrX 3928792 3' + Doc 4700 4 55.06 ATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAAACCACAGGCACACAGACCCAGAG:1 - chr2R 23565186 3' + accord 365 2 76.24 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAGTTTTAG:1 - chr3L 5025607 3' + roo 9041 1 57.43 ATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTACAATCCATCAAGAATGAATAGTATGATCGTGATCGTAGCTGAGAATGTATAACTGATTTT:1 - chr2L 22108173 3' - Bari1 14 1 66.00 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACACCG:1 + chr2L 20269033 3' - hobo 48 1 74.26 GCAACGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATAGAGCGAGCAACTGATGGTGCTCCTGATGCACTTTTGCTGTTTAAGCCAACTGACCCAGTTGTACCCAAC:1 + chr3R 31531358 3' + F-element 4290 1 65.35 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGGTTATCTCTTCGGCCCAAGCAAAA:1 + chr3R 20425438 3' + roo 401 1 69.31 ATTTCTAGGAACATTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTCTGTTTCGGTGTGTGAATCTGAAAGTATATTGATAATGAAAGAAAGATGAATTAGCTAAGCTT:1 + chrX 4203510 3' - TART-B 10346 1 80.20 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAATAAAACACAAGAAATAAGAGGTGGGTAAGGAATTAAG:2 - chr3L 14301578 3' - roo 8699 2 62.38 AAATTAAAATATATTTTAGCATGGCATCATAGCTGAGCATATTTATTATTCATTGTCTCATTGTTAATGAGGATTTAATAATATTGAAGTACTTAATAATT:1 + chrX 3308673 3' + P-element 2603 1 71.29 CTAGTTACAATATAATAATAGTCTTAAAAACGTTTTATTAAGTAAAATTTAAACCTTTTCACTCTGCAGCCAGGTGTCTTTTCCCAAAAATCTGTGTGG:1 - chr3L 14557733 3' - Burdock 462 1 80.81 TAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACATCGTACAAAACTACCACCGA:1 - chr4 1220423 3' + jockey 4934 1 83.67 CTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATCTGCGAAAAGCAATAAAAACAGCCACCTTCGAAAATTCGCACGCTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2R 11797723 3' - accord 499 2 72.00 TGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTCTTGCTGTCATTATATGCCCACCTGACATGCCATT:1 + chrX 9075325 3' + gypsy6 166 2 75.29 CGGGTATCTGATAGTCGGGATATATATTTTGTTAGCTCACCATCTGGGCAACGCACAAGCGGTGCCACTTTTCGAAATTTGATTAAAACGTTTCCCTTTGA:1 + chrX 12813991 3' + INE-1 555 1 52.48 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTTGAATTGTACATTTGTATGC:1 - chr4 333622 3' - Doc 29 1 57.43 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTA:1 + chr2R 13316189 3' + hopper 1374 2 61.39 CTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTACTTACCGCAAATGCTGTTTATTAAACAAAAA:1 + chr3R 18643014 3' - Porto1 4307 1 68.32 AGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCACCCTCATACTCGGTGTTTCGCTAGTTTTGGGC:1 - chr2L 19411875 3' - I-element 4933 1 67.33 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCAT:1 - chrX 21667992 3' + Tabor 7308 2 57.58 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCATGGCAACTGCACATTACCGTTTCGTACTTTTTCATGCATTCATTTCGATAG:1 + chr2L 11537608 3' + hopper 1396 1 60.40 ACTATCAGATACCTGTTCCTCAGCTAGTCTAGTGTGAATGTGAACGCGAAAAGAAGGGTGGTAAAATAAAAATTGTATACCATAAAAAGAGATTCCTCAGA:1 + chr2R 25130557 3' - INE-1 548 1 60.40 ACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACTGCACAACAACTGCAACAGCATCAAC:1 - chr3L 20914802 3' + F-element 207 1 74.26 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGAATTAAATGAAATGGGCTAAATTTAGATGCTCTTTGGAAGTAAATGTT:1 - chr2L 15159478 3' - jockey 4699 1 54.46 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTAGCTTGCCTAGATAGAGTGGCATCGCCAT:1 + chr2R 8254837 3' - roo 8712 2 73.27 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCGAGCTGTGGATCCGGGGATCCGGGGATCCGGGGATCCAGG:1 + chrX 20015574 3' - transib2 12 1 58.16 CGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGTTTTGACATACTAATACTACAACATATACTACTATTGTCACATACT:1 + chr2R 5924411 3' + jockey 4730 1 48.51 CTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCA:1 - chr2L 21400702 3' - Doc3-element 14 1 48.51 CAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTT:1 + chr2R 13745754 3' + hopper2 1563 1 73.74 ATAGTTTAGGAGGTATTAANTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCA:1 - chrX 19034115 3' - hopper 34 1 60.40 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTTCTTATGGAATGTTAAGTGATTTTTTATTGAATTT:1 - chr3L 22327262 3' + hopper 1407 2 71.29 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCATACTGATAACTGAGCAAAAGCACGTCTAACTAACGTTCGCGATGGGACTTGTGATTTGGGT:1 + chr2L 9724285 3' - 1360 15 1 66.34 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCAT:1 - chr3R 19589928 3' - BS 5026 1 53.47 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTTCT:1 + chr3L 25345161 3' - Doc 36 1 53.47 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGT:1 + chr2R 13316184 3' - hopper 46 1 71.29 TTTACAAGCAGCGTAACTCAAAGCAGTAGCGTCACCACAACAACGGTGACTGGGGGGGTGTCCAAAAACTTGGCAGATTTTTGCTCATTTTACTCATTTG:1 + chr3L 9228805 3' + BS 467 1 55.00 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACGCAGATTTTTCATCAATCATTTTGCTTGACTACGCCTAGTTCACATTTTAGGGCA:1 - chr2L 9884258 3' - hobo 17 1 62.38 CATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTCTGCGCACAAAAAAGTTGTAGTATCTTTGTAACCAAAGCGTTAATTCACATTCTATA:1 + chr3L 23271735 3' + invader2 38 2 56.44 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGGCAAACACAT:2 - chr3L 2029667 3' + roo 402 1 68.32 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCTTGGATTTATAATGAACGTAGAAGAATAACTTTAATAA:1 + chr2L 16866486 3' - Transpac 4954 2 60.40 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATTATGAGCGCAGTCACACATGCACATAAACGGAGCAGTTCAAATTAAATGTAGCATA:1 + chr3R 26292618 3' - jockey 31 1 50.50 CATGTTTATTGCTGCCCATAAATATAACATATTTATAGTTTGTCTAAACACATATTTTGTTTAAATTCTGCAACAAATGAACGGTATTCTTCAAGCTACAG:1 - chr2R 5018795 3' - rooA 54 2 55.45 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTAAGCGACCCAATTGGGGTGGAAAGTTGTTGTTG:1 - chrX 2911969 3' - pogo 38 1 67.33 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCTATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCTTTAGCGTTTTTTATT:1 + chr3L 16019572 3' + 1360 3342 1 77.14 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGC:1 - chr3L 15745363 3' - hopper 53 1 80.20 TAATAATTAAATTAATAATNAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCACTGCCT:1 - chr2L 9053406 3' + flea 4990 2 56.57 ATCGTAAATTAACAGAGGTAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATG:1 + chr2R 5532321 3' - G4 3780 1 59.41 AAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCCAATCCGCCTGGCCCCACCATACAACATTGCTTGATTACTTTTCATGTTCTGTGACTGCTTGG:1 - chrX 14980007 3' + hobo 2622 1 64.36 TAAGTAGGATTTATATCAAGTCCCGGGGAGATACACCGATGTAATCGTTCCCTCTGAAGTCTGCAGCTGCACTTCCAAAAACAGTTTTTCTTCGCCGAGCT:1 + chr2R 12233010 3' - jockey2 3210 1 71.29 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCGGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTAC:1 + chr3L 13366428 3' - hopper 33 1 56.44 TTAGCTTTAATGAAATGTANATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTGTTATTTT:1 - chr3L 10811574 3' + Juan 4173 1 76.00 CACGTAAACAAAACACGACACAGTGCAAGGATGGCAAATGGGGGCGGCCGAGAAGGTCCTGCCAACGGTGGGCGGGGCCGGCCGGAAGTGGTACGGGGTGG:1 + chr3L 17201277 3' - transib1 346 1 75.25 GGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAGGGAATTGTTTTTATGACGCGACCCCTCCGATTCCTCAGTTTCCCTGCCGC:1 + chrX 13792809 3' - Idefix 250 2 60.40 ATATTAAAAATAATTAGTAAAATCATAATGTAAACGATTATTTAATAACAAATTTTTAAACAGAGAAAAGTGGATAGTGCTTTAATTTCAAACTATTTTTT:1 - chr3R 18775467 3' - Tc1 1488 1 65.35 CGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTATTTCTCCTACGTCTCACCGACCCTTTGCTGCACTTTTCTTTCCCAAACCCCTCG:1 - chr3R 7062736 3' + Doc2-element 315 1 67.33 AACCTTTTAGCTTTTATGGTTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGACGGACAGACGTCCTTTGCCACATCGACCCACCATTGAGTATTTGCCGCCCTCCAC:1 - chr2R 5680303 3' - INE-1 158 1 72.28 ACACGTGTTCTCCATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGC:1 + chr2L 2622786 3' + blood 7371 2 60.40 GGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTCCTAGTAGCGGTTTCGGTGGTTGCTTGTAGTGCGAGAAAAGAGAGTCTGTGGTGGGTTCACTGGGAGCAG:1 - chr2L 16814730 3' - Quasimodo 7001 2 76.24 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAACTTTAAGCATGATAAATGAGTGCAATTGTTG:1 + chr3L 15777050 3' + I-element 5315 1 68.32 TTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATC:1 + chr2R 5532312 3' - G4 3789 1 70.30 AAGTCACTCTATTTACGATAAAGAAATTATCCCAAAACTTTCCGGGAGCTGCTGAAAGATTGCAAAATCTGCCCTTTTTAACCGCATTTTAAACGATAAAT:1 - chr3R 3345152 3' - 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Chouto 331 1 71.29 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGAACAATTATTAACAGTTTTTGATTTTACAACTTTAAAAT:1 + chr3R 15920717 3' - BS 5062 1 58.24 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGGATAGGCTTGCCTCAACACGAGGACTCTGCTTTTTTCATTATGTGAGCCCAGTA:1 - chr2L 20290206 3' - flea 15 2 61.39 CCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTCTGCCTTGGCTGGGTTTAAATCTGCTGCTGAACCATCTGCAATGCTTGAC:1 + chr3L 240016 3' + hopper 365 1 69.31 GCTGGGTCAGCACTATGATATTATGTTTTATACACTGAGCCGAGGTCAGAGAAGAGATAAAGAAGAAAGCAGCGTGCGATAATGGCACATGTGTGGCATCC:1 - chr2L 4713240 3' - Gypsy6A_LTR 51 1 73.27 ACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCAGTCGTGCGGCTCAAACAAAACTTGGCAAATTCATAATATGCATGGCGAATGGAATAGCAAACGATTGGGGAAAA:1 - chrX 10287571 3' - gypsy12 10166 2 78.22 TAATGCAGATATCTTGCCGNTGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTACATTTTATAATTAATTTAAACCAAAAAATACT:1 - chr2L 12773935 3' - pogo 37 1 75.25 CAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCGCTTTTAATATCTATAAGTTAGTTTGGTAAATCGA:1 - chr3R 19137085 3' + Bari1 1668 1 65.35 CGCGGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTATCTATGCCCTACCGAAGTTGCCACTT:1 + chrX 19607325 3' - Tirant 13 2 68.32 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTTTATTTTGCGTTACGCTGCTGGGGCAATTTTTATTTCCACTGAAAATGAGGGAT:1 - chr2L 897571 3' + roo 9052 2 59.41 TTTCCAACTGTTCTATGATTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGCCTTCGGGACCGCTTGACTAGCGACGG:1 - chrX 7575165 3' - F-element 4568 1 73.00 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATCTTATAACACCGGATCATATTACATTACCTA:1 - chrX 8559869 3' + S-element 1674 1 69.31 ATTAAGCTGGAGACCGTAGATGTATGTGGGCATGAGATCATCGCAGGAACAAGGCGCCCGCTGGTATGCAATACTTTTTCTCACGCCACCATTTTCCCCGC:1 - chr3R 7886171 3' - jockey 499 1 78.22 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCACGTCTGAACAGGTTGACATGCCCGGGTCATCATGGAAGCCATCCCAAGCCTTCACACAGAGCTGCG:1 + chrX 14132151 3' - roo 18 2 60.00 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGACTTGCTATCTGCGTCGCCCTTGTTGTGTCTGTGTGTGCGGGTATAAAAATTA:1 + chr2L 17308026 3' + hobo 2920 1 55.10 GAGAAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAACCCACTCAGTGAATGAAGACTTTAATTAGTTTAGCTGGAAACTCACGCGGTTTAA:1 + chr2R 9504966 3' - McClintock 231 2 61.39 AACGGGTCGCAGCCAGCGACAAGGAGACGCAAAGAAGGCCAGCGGCAAGAGCTGGGCAAAAACAATTTCAATGGGAATTCAAAAATTAATTAAGCCAGCCC:1 + chr3L 6110217 3' + aurora-element 322 1 80.20 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGACACCTCAAGTTTCCAACCATTTTCATTCATATGCAAAACGTCGAATGGTAACAATTTAATA:1 + chr3L 16571817 3' + hobo 2925 1 63.37 AAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAG:1 - chr3R 26498523 3' + roo 9037 1 61.39 GTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCTATCCATGCCACACACCCTCAACGGGACCGAT:1 + chr3L 9685980 3' + Idefix 173 2 65.59 CACGTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGGCGTCACGGACATGGACATGGTCACAGCCACGGAAACGGGCATGGACATCATCATCATCACCATCACCACCAC:1 + chr2R 12226084 3' - G5 4473 1 71.00 TTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAATATCAAAAATGACTAGGAG:1 - chr2R 1571530 3' + 1731 311 1 75.25 AATTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGTATTATCCACCCTCATAAGCGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTCAATCAATTGTATGGCACAA:1 + chr3L 1320926 3' - gypsy7 5093 1 59.41 TTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGACTGGATTAGCTCTGTTAGTGGCATTTGAGATCATTACTTCATCAAAACTAAACTAAATGAATAAAGGGAATGGAT:1 + chr2L 8999440 3' - Quasimodo 7161 2 77.23 AAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACC:1 + chr2R 2879456 3' + Stalker 6962 4 55.45 GACTATCGGATACCCGTAACTCAGTGCGTATGTGGGTGTAAACTAGTGGTAGGGGTCAACAAATTTTCCGATTTTCCACTGTGACAGTCTATAATTTATAT:1 - 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opus 111 2 69.31 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACC:1 - chr2R 4606231 3' + 1360 3342 1 75.25 ATTTAAATTAAAATTAAATTAAATTATTTAAAATGCGTATTCATGATCATGTCGTTTCCCATGGTTTTTTTTTCGCGCAGGCGTCTGCAATATGGACCCCA:1 - chr3L 13467851 3' - Rt1b 128 1 71.29 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGCTAACTAAATTTTTGGCTCATTATGCATTGGCTC:1 - chr3L 21326972 3' + hopper 1379 1 62.89 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGT:1 + chr3L 27415272 3' + transib2 2765 1 77.23 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAATTGAAGTGGTATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCAAGACACTTTATAGCTAAATAAATGTTGTAGCTTG:1 + chr2L 7552498 3' - I-element 10 1 51.49 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAAC:1 + chr2L 3985139 3' + roo 9030 1 67.33 CCTAATTGGGATTGGTATGNTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTATT:1 - chr2R 21776311 3' - I-element 224 1 59.78 GTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTATTCAGCTGCCTAACTTTATTCTATATTAT:1 - chr2R 21776284 3' - I-element 206 1 62.38 AAAATAAAAGCAAATAAAAATATTTGGCATTTAATGTATTATGTTTTTTAAATATATACCTTTAGTTTTATGTTATGAGCTGAAATACCGATATTAAAT:1 - chrX 20991145 3' + HeT-A 326 1 63.64 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGC:2 + chr3R 30284260 3' + blood 7336 1 76.24 AAAACACACAACCAAAAACGTTGCGCGTAGTGGTGTTGTAGCTGTGCTAAGGCCGTCCTACATTATATTCTGGGGCTACTGAAGGTAGCTGGTGTATCGTT:1 + chr2R 3170317 3' + Tc1-2 499 1 72.28 GTGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCAAGCTCGACGTTTGAGTTACGGAACTTTTCGGTGGGGGTGCACTACACCG:1 + chr2R 23558571 3' + R1A1-element 4994 1 69.31 ACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATATAGTAGATCAGATCGGAACAGCTCTCTTTATTACATTTTT:1 + chrX 6854444 3' + diver 200 2 53.19 GGTGCCTAGAGTACCGAGTNTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCAACTAAAACTCGCTCTTGCACTTCCCAAC:1 + chrX 14979144 3' + hobo 2894 1 72.28 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCTATGGGCGCCTGTCTATCGAACGGCGC:1 + chr3R 30284308 3' + blood 7384 2 69.31 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAATGAGTATGGCACGGCTACGCATAGCAAAGTAATT:1 + chr2L 2832787 3' - roo 8708 2 67.00 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACTGTCCGTGCGCAGTTCTCTTTTGCGCTTCATTCGTGCTCTGCCCGTCGGACGTGTCCGTACGAT:1 - chr2R 19424060 3' + P-element 2875 1 69.31 CATTTTGCAAAAGTGTGGTCGTGGAAGTTTTGTTCATGGCGACATGGGTCAACAAATTTGCGGCTGTCTATGCGGAATTCCACACACCTGTAGCTTCTCCT:1 + chr3R 3626803 3' - INE-1 254 1 61.39 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTT:2 - chr2R 5214979 3' - F-element 51 1 65.35 CGGGACATTAGTTCGACTCGTAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTCTTTTAAGATCTCCTAAACTCCCTCATAGCTTCCATTTTGTACTTACATCT:1 + chr2R 13058957 3' + 297 373 2 48.51 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTGGATGCACACGAAAAAATTCAGGGCTTAATTCCACACATCATTATGTGTGGTT:1 - chr3R 22236998 3' - 297 15 2 63.37 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTCATTTCTGTGTGTGTATTCGTTTGGCT:1 - chr2L 1858323 3' + pogo 2059 1 71.29 CCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGGCCAAGCGGAGGACCCACCGGAGGACCAACCACCAGATCCACCGCCGCTCTTCCAGCCGCCGCCTGAGGAACCA:1 + chrX 17223265 3' + R1A1-element 320 1 78.22 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCATACTGATAACTGAGCAAAAGCACGTCTAACTAACGTTCGCGATGGGACTTGT:1 + chr2L 9724276 3' - 1360 24 1 57.43 TAGTTTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGACATAATAGAAACAAAGAGAGAGAATGGTAAAGTAAGGAATGAAATGGAGAAAGAGGTGTG:1 - chr2R 1370050 3' + gypsy 7200 2 64.36 TCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCATCAACATGTGTGGCTCATTAAATATGCTGCGAACACAC:1 - chr2L 12120483 3' + jockey 366 1 62.38 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTAATCAGTTTGAAGGCGCGTCGAGGCCTCTACCTTTCTCCTACATT:1 + chr3L 1227364 3' - 412 7083 2 52.48 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTTTTTCGATTCCTTTCTTGCAT:1 - chr3R 27199796 3' + roo 353 2 80.20 GAGAAGGTTCAGATTCAGCATACAGCCTCTAGAGACATAGACCATGTTGCCCCGCCCACCAATGACGCTCCCATCGAGCGTTGAAGTGGCGCGACGCTTAG:1 - chr3R 7088580 3' + INE-1 171 1 56.44 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGTAAAGGTCTTGCCAGCAAACTAAGAAGAATACTAACACATTAAT:1 - chr2L 3985085 3' - roo 29 2 58.42 CCAACAATTATAACCGATTTGCCATTTTGCCCGATGATTTAGACGATCTAGCTGGCACGGCATTCCATTCTAGCCAGAAAGTTATAAAGGACGACGTCACC:1 + chr3L 15864011 3' + Fw2 126 1 57.43 AATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACTATTATTATCAGATATATTGATAATGAATAAAATAGAAAATCTATGAAAGAACT:1 - chr2L 16958053 3' - 1731 25 2 55.45 ATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTA:1 - chr2R 21776313 3' - I-element 235 1 66.34 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTTTTTTGAACGGCCCGAGCAGCTGACAGTTGCGCTTCAGAATTAGACCAAAGTAGTTTGACTTTTTAG:1 + chr3R 10093782 3' + P-element 2882 2 72.28 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACTATTCGCTTGAAATACAAAAACTTT:1 + chr2L 3985164 3' + roo 9055 2 70.30 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATAAATTTGACCAAGCTTTTGCTTGCACT:1 - chr3L 16058698 3' - FB 50 1 76.24 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACCCATTTGCTCATCTGCTTGTCTCGTTTGGTTGGTTCCATTGAATGCGCCGCTTC:1 - chr3L 5533542 3' + pogo 2082 1 56.44 TGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACAGTATACTTCCGTTGCTATCTCTCGATCTAACCATACGATACAAATCCATAGCATATCGAACGATCAGCCC:1 - chr2R 20883895 3' - I-element 5338 1 75.25 CCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGTTGATAGTGTGTGTGTGTGGAAGGCTTTGTCTTTGTGCGTT:1 + chr3L 10014040 3' - jockey 222 1 63.37 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTCCCTTCATATGATTTAGGCAACAACAATACAATAAAGATCCGTTATATTTCGT:1 + chr2R 5413493 3' - Juan 4048 1 57.43 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAGGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAGTATTA:1 + chrX 11454365 3' - P-element 51 1 28.71 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTAGGTACGATACTTTGACTTAATCAGGAGAAAAAACAAGGACTTAGGGGGGAATGCTAACCATGCCGAAAAA:1 - chrX 15183719 3' + hobo 2937 1 73.96 TTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAGGACCATAGAAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGTTCTCTGTTTTCGTTTAGGGGGCTACAACTCCTCTTGT:1 - chr3L 10035612 3' + mdg1 430 1 59.41 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAAGACAACATTTTTTTTAGTTGCTAAACGTGTGGTCTTTTCTTAATTTTCCAAGA:3 + chr2L 12774019 3' - pogo 19 1 52.48 TCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCAACATGCCCCTTATAGGTGATTGTATTACTTTTATGCTTCATTTGGTCTGC:1 + chr2L 14095063 3' + G-element 4160 1 57.43 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTA:1 - chr3L 15777012 3' - I-element 39 1 58.42 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGGGGAGCAATCAGGAGCACACCTTCACTTCTGCCACATGCAGACCACATGATCATCTTGTGC:1 - chr2L 10020759 3' - hobo 15 1 64.36 CTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTTCTCTTTATGCTCTCAAAAACTGTCACA:1 - chr2R 20520178 3' - Max-element 8245 2 67.33 TATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACAGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCACCCCTACCCAACGGTGTCAAGTTCAGCATCAACATCAACATAAA:1 - chr2R 20443625 3' + Doc3-element 403 1 67.01 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAA:1 - chr3R 13582236 3' - BS 5039 1 67.33 CTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCTTTTGACCCCCTCTCCGTTCTGTT:1 - chrX 7589268 3' - R1A1-element 256 1 76.24 CTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCTGGAAAT:1 + chr2L 22216555 3' - diver2 80 2 57.89 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGGAGAGCGCGCTTTCGGTTAAAGCTCTCTCTCCGCACTCACAC:1 - chr3R 10093666 3' + P-element 2878 2 70.30 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTTTTGAACTCCTATCTAATTTTG:1 - chrX 11624376 3' - roo 8716 2 78.22 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTGGATGCACACGAAAAAATTCAGGGCTTAATT:1 - chr3R 22237020 3' - 297 6612 2 63.16 CACTTTGATTATTCGAATAAGCCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATTGAGGATAAAGCGGCTGGGTATGTTGTTG:1 - chr2L 11984996 3' + Stalker4 7284 4 69.31 GCGCGTTCTCACTCCCGAACTCCTTCCTTCAATGCTCCGTCTCACTATCTTCTTCCATGCGCGGTCTGGCTACAGTGGTGAAGACCCTCTTCTTCGGGCAG:1 - chr3L 27248924 3' - gypsy8 438 1 70.30 GTTGTCGTATTTCATACGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTGGTTAACTTGTAAATAATGCTTTTGGTTTCTAAATTCCAATTGTGCAGATCTATCATCTA:1 - chr3L 23354628 3' - gypsy2 28 2 57.43 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTCGAGTGCCTGAAAGTATGCAAGCCATTTGAAAGTCAATC:1 + chr3R 20154821 3' - jockey 19 1 66.34 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTAACCATAAAAACACTTCGCATAAACGTAGAATGTATGTTTTTGGATCCGTAGAAAAACCAACATTGA:1 + chr2R 7542255 3' - mdg1 7049 2 66.34 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTAAATTTCGGGTGATTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATCTCACCATCCAGTTGGAAATCAATGGCCC:1 - chr2R 12343898 3' - Burdock 41 2 66.33 AAATTATAAATTACAACAGTTAAAATTTCATATTTTTTGTAGACCAAATTAAATATGATATATTATGCATATACATATTTAATGGTTTAATTAGTAATAGT:1 - chr3L 7215454 3' + copia 259 1 82.18 TCTATTGATATTCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCATTCGCATTTACTCGAGCTGAGTAACGGGCATCTGATAGTCGAGAAACTCGAATATAGCATTCTCT:1 + chr2L 3964500 3' + INE-1 501 1 77.23 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATGGCTGATATAACATCATTAATCCGATCAGATATCC:1 - chr3R 4769459 3' - copia 42 2 63.37 AACAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTGGGTTCGGCAATCCAAGAACGTCCTCCACGAAAATGAAACCAAAACTGTGATTCTGGGTGTGTTGTATATTACG:1 - chr3L 15537252 3' + Circe 7031 1 76.24 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGT:1 - chr2R 9871070 3' - roo 8696 2 77.23 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCGATCCA:1 + chrX 16272500 3' - pogo 35 1 59.41 CCAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAACAGGCACACGTCAGATCCTTT:1 + chr3R 30220232 3' + mdg1 7402 2 77.23 CCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATAAGCTGCTTTCACCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGCGACAGCTGGCATAACTCAGTAATTT:2 + chr3R 29432853 3' + Transpac 309 2 79.21 TTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATCCATACGTACTCCAAGAAAAGGGACTGCGACTCCATGGGGATGATGACTATC:1 - chrX 4235712 3' + Quasimodo 7351 2 64.36 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAAGCGACACCTATTCTCAAG:1 - chr2L 2016744 3' - Doc 39 1 55.45 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATC:1 - chr2R 5250069 3' + 1360 3339 1 88.12 TAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGCAATAAATCAAGCAATCTGCTTAATTAAAGTGCAACTTAGAACATTTAGATGCAATTTATTTTAATG:1 + chr2L 15390460 3' - invader2 4686 1 79.21 TAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGCAGGCGGCCCTGAGAACGCGGCCTGCAGGCACTTCACATCACTCAACAGGGGCGCCTCGTCAAGGG:1 - chr2R 5813551 3' - HMS-Beagle 6802 2 73.27 ATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACAGTATACTTCCGTTGCTATCTCTCGATCTAACCATACGATACAAATCCATAGCATATCGAACGATCAGCCCCG:1 - chr2R 20883893 3' - I-element 5336 1 77.23 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCCTCCCTCCACCTATGGTACAGCGGCAGATGGTAAGCGTGAAGAAGCCGAAAGCTTGGATGGCT:1 + chr2R 21335517 3' - Tirant 8119 2 54.46 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATACAATTTTATACAGTGCTGTGCTGGATCGTGTTGCTATGAATATGTATCAGTCAACGATGCATGAAATAA:1 + chr2L 13614938 3' + copia 249 1 72.28 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATGGTGAAAGA:1 - chr3R 4474153 3' - copia 4883 2 65.35 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTAATAATATACATATGTACAACATAGGTTTCTTTTACGTATGTTAATAAACTTGGATTAAAACCGATTTCTCAC:1 - chr2R 19775097 3' + 3S18 6101 2 65.35 AGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAAATCACTGGATGGAAACGCAAAAAGCGAAA:1 - chrX 9977919 3' + blood 440 1 69.39 ACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATGTACCTGTACCATATTTTTTATTATTAAAGTCATACA:1 + chr2L 10706408 3' + invader4 3053 2 61.39 GAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATGTGATAAACTAAGTACCTATCATTAAAGTTATTGTTTAATTTTATAT:1 + chr3L 17879562 3' - 1360 3153 1 61.39 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGCGGAATGCCGAACAAGTCGATACTAAGACGCTGGAGGTCAACTGCAGCTTTAGATTGATAAGAAA:1 + chr3R 10078486 3' - Doc 31 1 53.47 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAAATGTAATAAATCTTTTTATTGGGTCAACA:1 - chr2R 19430483 3' - 3S18 5813 2 75.25 CAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAGTGGACT:1 + chr2L 20290322 3' + flea 253 2 76.24 GATGACGAGGCAGAGCGGGCTGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGCACAAGGGGATGGGGGAATGCAGGCAACAAGGCTGCAACAAGCCTGC:1 + chr2R 16030501 3' - F-element 448 1 51.49 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCACATCATCATTTGGCCCGGCTTTAATTGCGGGTTA:1 + chr2R 18111509 3' + hobo 2900 1 66.34 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAGTACTAACTATTACAACTATTCAACTTTCACAT:1 - chr3R 5359942 3' - 412 45 2 66.34 AGTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTGCTCCCATCATGAAGAAACCTCTGGACAAAAACGAACCGAACAAGTAAATTTTATGGTAATTATAAACTTTATGGT:1 - chr3L 5711410 3' - HMS-Beagle2 489 1 56.44 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGCCTGAGTTAATT:1 + chr2L 22747342 3' + transib2 2793 1 59.79 AATAAAAGGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATAT:1 - chr2L 21795759 3' - HB 73 1 45.56 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTCCCATATATGCAACGCTTTTGTTGGTGCCCG:1 - chr3L 22334959 3' - jockey 4708 1 76.24 TTTTTTTTTAAGTGGCAATAACTTTAACTTACCCGATTATATAGTCACTTGTAAGGGAATCACAATTTGCATACTATTCTCGCTTCTATACTTAACTTAGT:1 + chr2R 9065971 3' + FB 188 1 78.22 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAATGCGTAACAATGCC:1 - chr3R 11118037 3' - BS 31 1 59.41 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGCTCGCCTGTGAAGACTATTCAACTACTGGACTTACATGGCATGGATTGATTTATTACATGGCGACCG:1 + chr3R 991869 3' + blood 332 2 69.31 GACTTGGCGGCCTTAATAAATTTTATTTGTAGTTATCTCGTAACAGACCAGAATTCTGACGCAATATACAAGTAAACTAAGCACAAAAAACACACTGGACC:1 - chr3R 21216754 3' + gypsy10 251 2 53.47 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTA:1 - chr2L 18239429 3' - hopper 39 1 65.35 GGCTAATAGGACAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATTGCAATATACAAGGCGATAATATAACAATATGCATACCTAAGTTTATTACATTTTCCG:1 - chr2R 16511012 3' + Porto1 4195 1 74.26 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGG:2 - chrX 21668012 3' + Tabor 447 2 60.40 CAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAA:1 - chr3R 11118053 3' - BS 47 1 73.27 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATGCCTGTGGCATACGCGCCCTACG:1 + chr3R 20432482 3' - roo 18 2 59.41 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGT:1 + chrX 19607298 3' - Tirant 8147 2 63.37 CATCAACACACACACACACACACACACACAAACACAACAAAAAGGAACAACAAGGACTTGGTACACCGAGCCAGACAATTTACAGACCAGTTAACTTATTA:1 - chrX 5157645 3' + accord 180 2 64.36 ACCCATGTGTTTAACGGGAAACCCATGAGTGTTTTGCTTTTACTCTTTTTGCTCGCTGTTTTGCCTTTACTCCAGTCTTCATCCTCTGACTCGCTCTTGAT:1 + chr2R 24946987 3' - hobo 231 1 67.33 CTTGTGAAAAACACATTTTNGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTTCGCCATGGCTTTAATTG:1 + chr2R 13745771 3' + hopper 1385 1 57.43 AAACGATTGGATAAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACATAGATGATAGCCAGATACAAGATACAAGACAGCCAATAA:1 - chr3R 23432722 3' + Bica 369 2 58.76 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGCTAACTAGGCATATATTTCACTGGTGAAATTTATTGTA:1 + chrX 19199011 3' - pogo 33 1 61.39 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAGCAATAGCTGGGGCATCGGCACCGTGAGCTGGAGTAGGTGAATAGGCGCCCTCGTCATG:1 + chr3R 27605362 3' + opus 484 2 65.00 ATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGTCAAACTGTAGCTGTAAATATAAATTCTGCATTAATAAGTGTATTATAATCATTAAAAAAAACTTGCTTAA:1 + chr2R 17266938 3' + S2 1698 2 55.45 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCATGGGAAAACCGGCAAACAGAAAAC:1 + chr2R 11699340 3' + roo 388 2 56.44 ATACGTTAAGTGGATGTCTNTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGTCCTTCACG:1 + chrX 7971017 3' + P-element 2853 1 45.54 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCATCGATAAATAATGATTTTTGTAGCATGCTTTCGGGCGCTTAAGATTGC:1 + chr2L 9287232 3' - jockey 17 1 67.33 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGAGACCTTGGCTGGCATAAAAATAATATTGGG:1 + chr3L 7463331 3' - hobo 44 1 67.00 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACTTTGCGGATCAGTCATAAAAAACGACTTGTAATACTTGTAATAAAATGCCTTGTTTATTCGCAAAAACACT:1 + chr3R 20507404 3' - jockey 10 1 46.53 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATGTGCTCGGGGGCAAAAAGGTGCAC:1 + chr3R 29375028 3' + mdg3 225 2 58.42 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTTCTCGCTGGAGCTTGGCACACGTTTCGCCTTTGTCAGCTATGAATACC:1 - chr2L 12485392 3' - roo 8691 2 53.47 AAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTTATATTTATACCATTAAGAAAGTGATATGCCGTTCTTTCAGGCA:1 - chr3R 13710656 3' + roo 9068 1 43.66 TTAATTACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATTACTCTACATTCTACACTAAGTGCGGCTTCTGCTGTTATCCCTCGTAT:1 + chr3R 9070245 3' + hopper 1123 1 56.44 TTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATTGTT:1 + chr2L 19907979 3' - Tirant 8129 2 59.00 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACAACTCTAATGAAAACCTATCCTAATGA:1 + chr3R 28333621 3' - pogo 1 1 78.22 TGCCAACTTGGCGCAGCGAGCGAGGCGTTGCCAGATCAACCGTGTGATCAGTGTTGTGTTACATGAATATTCGATTAATTCGCAGGCCAATGAGGCCAT:1 - chr2R 5876205 3' + Rt1b 3 1 62.63 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCGCCATCCACGTCCCTCGCAAATTACGTCACGAATCGACGAAGAAGTTCGTGTCGACAGGTT:1 - chr2R 13956821 3' - P-element 13 1 64.36 TATTTCCAAATAAATTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATGATAAACAACAATAACCTCTAAATGTGC:1 + chrX 11624410 3' + roo 9025 2 76.24 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCAGACAGCCGGGGGCAAAACAAAACTTTTCGCATCGCCCAGAAGCCGCCACAAAACAAAAATGGTA:1 + chr2L 10924304 3' + hobo 2928 1 62.38 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACCTCAAGTCATGCAAGATTATAAATTCCCGTCATAATGACGCACTCTATCTAAAGTATCGC:1 + chr2R 10528402 3' + pogo 2087 1 65.35 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCG:1 + chr3R 24228961 3' - 297 6603 2 57.00 GAGGCTTTAGACTGAGAGGNACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACTTCAAATTACTTTTGATACACTTGAGTGTTTTAAAAATTAC:1 + chr2R 18939174 3' - I-element 33 1 57.43 CAAATCGGTGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTAGGTTTCTCGCTAAAACCAATGTAGTGGGGTCATCCCGCGGTCGGCCCACGTGAA:1 + chrX 15332848 3' + Doc 312 1 60.40 ATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGAGCGACATTTGGCCCACACA:1 + chrX 6040638 3' + BS 4770 1 81.19 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTTTTTTGAACGGCCCGAGCAGCTGACAGTTGCGCTTCAGCATTAGACCAAAGTAGTTTGACTTTTT:1 + chr3R 10093780 3' - P-element 7 2 72.28 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGAATCCCATGAAGAGGGCACAAGGAAGTGGCAGAGGAA:1 - chr3R 11846659 3' + roo 9035 1 63.00 AAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTAGGAATATCGGCAAAAGGCAAATTATTCC:1 - chrX 8057282 3' + jockey 4814 1 72.28 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCTCATTTGACAGATTCTCAGCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTA:1 - chr3R 19446735 3' + roo 387 2 46.53 GTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGAGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCCCACGTGTGCGCACATAGAAGCCAATGGTCCAGCCACCAATTAGGA:1 + chrX 16654245 3' - 1360 227 1 63.37 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACGTTTTCTTGATTACTTTAATACGCAACATAGTTTCA:1 + chrX 20555763 3' + roo 9032 1 65.35 ATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATA:1 - chr3R 3922959 3' - Cr1a 60 1 64.36 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTACATGCAATAAATCGAATTTAAACATCATA:1 - chr3R 14228028 3' - Transpac 41 2 70.30 ATGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTTTGTAGGCGTGGTGGTTTAGTAGTAGTATTGTGAAGTATATCAGAACATTG:1 - chr3R 31875359 3' - ZAM 8048 2 66.00 TCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTGTAAGCTTATGACTAGATTGGCAATCTGTTTGGCTATGCCACGCCCCCGTCCGCGCACCC:1 - chrX 19071213 3' - mdg3 106 2 62.38 TGAGAGTAAACAAAACATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACGAC:1 - chr3L 24791908 3' - Cr1a 204 1 61.39 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCAT:1 - chr2R 9061920 3' - jockey 4697 1 55.45 TGCCAGGTTATAAAACTTGAGCAGCCAAAAATGATTTGTTGGCAAGTGTGTTTTGATGCCAAGACATCAAGCAATGGCAAAATATCCTGAATGTGGCACGA:1 - chrX 16143095 3' + Cr1a 474 1 64.36 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGGATAGGCTTGCCTCAACACGAGGACTCTGCTTTTTTC:1 - chr2L 20290223 3' - flea 32 2 62.38 GCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTGCAGTTTTTACCTACTTCTCTTTGTT:1 - chr2R 10536148 3' + jockey 4706 1 74.26 ATACCCAATCATTTATAGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTTACTTTTTATGTATTTTCCAGATTTTTTTTTCTTTGTTTTGCCGCCT:1 - chrX 4758221 3' - Stalker4 30 4 58.42 GGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATAAATAGTGACGTATT:1 - chr3R 2472940 3' - rover 117 2 86.14 ATATTTCCCTAAGTCCCTANCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAATTCCATCGCAAAATTAAAGCATCCCAAAAAGCCGGCCCGACAAACA:1 + chr3R 7508632 3' - HMS-Beagle2 7101 2 57.00 TGGGAAGATGACTGTCTTCCTTAATGCATTTGGCTTAAGGGGTTTTATTCATTGAACACAATTTAATGGAGGTTGTTCTTGTTGTTTATGCTTATCGCTTT:1 + chr2R 19821572 3' - gypsy3 246 2 78.22 GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATAATAGCCAGGCTTTGGGGGC:1 + chr2R 5813626 3' + HMS-Beagle 193 2 81.19 GATATATTGACATAAAAATNTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAA:1 - chr3R 14049354 3' - transib2 39 1 63.37 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGAATCCCATGAAGAGGGCACAAGGAAGTGGCAGAGGAAAGCAGATAAGGAGAGAGA:1 - chr3R 11846641 3' + roo 9052 2 59.41 ACGTTAAGTAGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGGTGGTTTTAGC:1 - chr2L 16548163 3' + P-element 2855 1 48.51 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATTAATAAAACTGTACTGGTTATTTCA:1 + chrX 354957 3' + I-element 5303 1 77.23 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTATTTTGGCCGCTGTTTAGCGAGTTTTTTCT:1 - chr2R 3170363 3' + 1360 3334 1 79.21 TTTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGACACCGA:1 + chr2R 5627650 3' + TLD2_LTR 96 1 75.25 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGTAAAATGCGCTACACGCTTACTAAGACACAAAAGAAGGCACTTAGGTATAAA:2 - chrX 17098350 3' - roo 23 2 57.43 GCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATATTAAAAGGTTTTTGATTTGTTGTAGAATGAATGCTCTGATTGAATTCTTTTGCGGCTCTAATAAA:1 + chr3R 2648021 3' - 1360 3250 1 66.34 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAAT:1 - chr3R 13582242 3' - BS 5045 1 73.27 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTT:1 + chr3R 24228936 3' - 297 6620 2 77.17 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGGGAACAACCAACGTTTTGGACACCCAACCGCAGACTACTTCTAGTTATTTTAAGAAATA:1 + chr2L 791527 3' - 412 17 2 62.38 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGT:2 - chr4 333642 3' - Doc 49 1 77.23 TTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGAGAATAAAGTGAAAAGCGGTTGAATCGAAAAATGT:1 + chr3R 13348800 3' - X-element 4585 1 66.34 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATCTTTGATTTGAAAATGTTCTCG:1 - chr3L 25333359 3' + pogo 2055 1 78.00 TCCGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTAAAATAAGGTATATATAAATAAACGTATAAAAAAAATAAAACGTAAAGTATAACTG:1 - chr2R 5524127 3' + INE-1 94 1 57.43 TATGAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCCGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCTCAATTATCTTCGGCGTCTGAAAGCATAG:1 - chr2R 21769954 3' - ZAM 190 2 70.30 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGCTGACCGAGTGTGGGCGTGGCTCCACCCAC:2 - chr3L 15745334 3' - hopper 24 1 56.44 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGAC:1 - chr3L 2809773 3' + pogo 2052 1 76.24 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAGCTTATTATAAATAAATATGAGTTGGATAAAAATGCTAGTCTCGAAAT:1 - chr3R 26798620 3' + pogo 2077 1 59.41 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGAAAAGATCAACTCCTCTGACACT:2 + chr2L 16164095 3' + pogo 2050 1 81.19 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTATGTACATAGGCATGTATACATTGTCTTGGCTTTTCGATGTGTGTG:1 + chrX 19384063 3' - pogo 26 1 55.45 GTTGAATAGTATATTCCAACATATGGCTGATATAACATCATTAATCCGATCAGATATCCCCCAATATGGCGGCCTATTTCGCTTATCCTAATTTAACAAGT:1 - chr3R 4769417 3' - copia 4869 1 79.21 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTAATAGATATTAAGTGAGAAT:1 + chrX 17098424 3' + roo 9036 1 72.28 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAGGCATATAATTATT:1 - chr3L 2016868 3' - Tabor 6868 2 50.50 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCCCTTTTCTTGGGTCATTTAGA:1 + chr2R 18204486 3' - roo 8719 2 82.18 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATAGAAAATTAACCCAGTTCGCACGTCTATGCCGAAACAAACAAAAGTTTGCGAGGCAAACGA:1 + chr2L 20330115 3' - 297 6590 2 71.29 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGGTCATCATTACAGTACGCCGGCAAAAATGGGGGTATTGTGATGTCTT:1 - chr3L 21118572 3' + 412 7502 2 59.41 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGAAACGCTCTCGTGTGAATACAAATAGCAGAAAGTAAAATAAAAAAATGTTCG:1 + chr3R 4555456 3' + roo 386 2 56.44 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCACTGCCTCATCGGGTATATAC:1 - chr2L 9053392 3' + flea 243 2 62.38 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTT:1 + chr3L 25345158 3' - Doc 39 1 56.44 TCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTTTCGGAGTGCCCAGTATTTCTTCATTGAGTATTTTGATGCGCGATCCAGC:1 + chr3R 14307736 3' - F-element 4377 1 52.48 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCCCATTCGGTTCCTTATGGCCAGTGGGCGTTTATCTGCTTGCCTCATTTTGATTTGATTATTCAGTTT:1 - chr2R 18204414 3' + roo 402 1 70.30 TAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAA:1 + chr2R 13745749 3' + hopper2 1556 1 79.21 AATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAGTGGACTC:1 + chr2L 20290323 3' + flea 5013 2 77.23 GTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTG:1 + chr2R 2879475 3' + Stalker 132 4 60.40 GGTCATCATAAGTACGGGATGTTGTTCAGAGGCGGAAATTGCGCAAATTGTAAAGCGCCACTTTCCGGCCATTCTGTCGGCCTCTCTTTCCTTTTGCCTAT:1 + chr3L 10162315 3' - HMS-Beagle 6743 1 81.19 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACAGTGGCAAAGAAGCCGAGAGAGAGCAGGCAGTGTTAGGCAACGTCAAGTGGA:1 + chr2R 19424157 3' - P-element 25 1 52.48 AATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATA:2 + chr2L 22224562 3' + Rt1c 5399 1 58.42 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATACACATATTTATATAGCCATCTTTGAATATATATATAGATATCAGCGATTGAAGTTTTTATTTAATAACGTT:1 - chrX 5271286 3' - mdg3 5257 1 73.27 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGGCTCGAAAAAGGATAGATAATCTCCTGCTAAGTTTCTATTGCATAGGA:2 + chrX 11415748 3' + roo 9045 1 54.46 TGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGCCGGGGGGAGCGGTAGTCGTACTGCTGGAATTTGCCTGCGGACGATGATGCGACTCAT:1 + chr2R 24202576 3' - accord 166 2 63.64 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATCGCTGGATATATAACTACTAAATTCTTACATCCATGGGAAGGTAGATTACGCAATTCACTATT:1 + chr2R 7186667 3' - jockey 24 1 61.39 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACTCGATCCGGTGGCTTTACGAGTATTAAAAGCTTATGATTTGCAACCGAAAAAA:1 - chr2R 16127020 3' - FB 24 1 50.50 TCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTGTGACTGATTCTGTAAGTAAATCCGAGTTCGAGTTGATAAGTGGGGAATTAGGAAAGG:1 + chrX 21504963 3' - mdg3 5368 2 62.38 GAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAGAAGTATCTCCACTAAGGAGAATAAAATAGTTGTTAACAAATCACAAAACAAACGAAAGCAAG:1 + chrX 8431479 3' + mdg3 5103 1 62.38 AATTACTTTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATAATTAAACTTTAGCGATGTGCTCAGATCATCTCTTTCATGAATTAT:1 - chr3R 3579551 3' - Tc1-2 1456 1 59.41 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACTTAACAATTTGTTGCAATTTGTTTATTAAAGTATTTTTATCATATATTTTGCATAGTA:1 - chr2R 16453493 3' - roo 8678 2 53.00 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAAAAAATACAACAGCCTTTTAGGATTTCCCTTAGTCACTAGGCATGTACAATAG:1 + chr2R 18044009 3' - pogo 19 1 57.43 GATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCATTTTCCGCTGTCCGCTGTCAGAAAAGTTGAGCAAATGATATAGTGCCTTCTGCCTCTATTTGGGTAAGTGGTT:1 + chrX 21385379 3' - F-element 4387 1 74.26 CTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAACAGACGTTATCCTATTATCTGAAATCTTGACTCACTTGCCGGAATCCGAGCTCCGAGATCACTCAATAGTTCG:1 + chrX 9076553 3' + Cr1a 4185 1 60.40 CAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTTTGAACACCTGGTGATTGCCAAACTGGGCCGAAATCCCAATCAGTCACGGAAAACTATGTTGTGTGTTTGC:1 + chr3L 21275854 3' + HMS-Beagle2 311 2 57.43 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACGCAGATTTTTCATCAATCATTTTGCTTGACTACGCCTAGTTCACATTTTAGGGCATGTAGTTT:1 - chr2L 9884250 3' - hobo 9 1 70.30 TTGAATACTTATTGTTAGTCTCTAAAGTAAAAGGGCAGATTCAATAAATAAGTCCTCTACAATTCCTTCACCGTAGTGCTTGCCTCGCAACGCCATGTCGT:1 - chr3R 958839 3' + Doc3-element 4673 3 54.46 GACATCTGTTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGCGGCTTAGAGTGGAGTTATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGA:1 + chr2R 24427518 3' - Q-element 285 2 66.34 TGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAAAGAGAAATATTGTCTGCCATTTTTAGTGAAG:1 + chr2L 5647411 3' - invader3 5233 2 70.30 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTTTTGTAAACATATCAATGGGC:1 + chrX 17175223 3' - I-element 55 1 79.21 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCTACGAATTCGTGGAGGTAAACACTCGGGCCAAGGAGAACTTCTC:2 + chr2R 18407061 3' - mdg3 5286 2 55.45 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATCGCTGGATATATAACTACTAAATTCTTAGATCCATGGGAAGGTAGATTACGCA:1 + chr2R 7186657 3' - jockey 33 1 50.00 AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGC:1 - chr3R 14049333 3' - transib2 18 1 61.39 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTCGGTTGCCAAAGTGGACTCCAAGTGGATGCCGATGCCAATCC:1 + chr3R 31649951 3' - roo 8698 2 60.40 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCA:1 + chr2R 5237881 3' - Doc 52 1 42.57 TTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGTGAGTCCTGCTACACCCGAGCGGTCGATATCTGCGAACAGACGCTGAACGGCACGG:1 + chr2L 19365304 3' - BS 4927 1 60.40 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGT:1 - chr3L 25059061 3' - mdg1 7054 2 62.63 CAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTTCTAACAAAAACTAAAAACATACAAAAACTTTACAAGAAAATACAGAAAAAAATTTTCTGA:1 - chr2R 2879143 3' + TLD2_LTR 105 1 65.35 AAAGAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAGTAAGCGGTGGCGCGCATTTAGATGAATTTTGTCCACAAGTCCCTCAACTCTCTGCATTCCACGCACAGTCGCA:1 - chrX 11438699 3' - hopper 146 112 57.43 GTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAA:1 - chr3R 1440157 3' - G-element 28 1 51.52 GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATATTTTTACAATTTTACTCTACGAGTAACGGCTAAAATGTAACAAGTAGTTGCATAATTCTTTCTGAAATATATGT:1 + chr3R 18377465 3' - INE-1 34 1 78.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTTGTTTTAGCTCTCTTACTA:1 + chr3L 14311511 3' + roo 391 2 59.41 CAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGCCAAAGAAAAAGCAACAATTATTAATCTATAGAAATCGACTGGCTGGCAGTTCGAAATTGGCCGAACACTGGAC:1 + chr2L 17206513 3' + Bica 425 1 79.21 GTCAGCCCGACGGCTGCCTNCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCCGTGTTGAG:1 + chr3R 5359987 3' + 412 450 2 69.31 TGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGATTAGATTAGAATGATTATAAAAACTACAGGAAATATGAAAGTATCATATATT:1 - chr3R 5886344 3' - I-element 4879 1 47.52 CGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGA:1 - chr2R 6438363 3' + Stalker 7211 4 66.34 TTTAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCCCTGCCCGTTATGGCCATCGGCTT:1 - chr3R 11711986 3' + Doc 338 1 73.81 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATG:1 + chrX 19034169 3' + hopper 1370 1 68.32 ACGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGATCAGCTGGACACATGCTCTACGCAAGATTGTGATCAACTGCTACAAGTACCATGGAAGGGAGGATCTGCTGCC:1 - chrX 273319 3' + INE-1 156 1 77.23 TTATCAAAGCTTACCCCCTCAAAGTGATGGAAGAGGAGGGCTGAGGAGATAAAGAGGACTCCCAAGGACTCCATTGCCAGGCAATTCCCAGGCGACTATCG:1 + chr3R 21806179 3' + Porto1 315 1 72.28 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTC:1 + chr2R 6041624 3' + opus 459 2 70.30 CAAAAATAAAAATAATATAAAAATGGTCAATATAATATATATGTTACAGTGTTTATATTAGCTTAGTTGCAAGATTTAAACCTTTCATGGGGAATTTATAT:1 + chrX 6664857 3' + Tc3 1569 2 60.40 TACATAACATGTTTTAATACTTAAAACCTGTCAGAGAGATCTAGCACGTGAAATCTGCAGAAATAAATAAGTTTTACGTTATGCATATAAACGTAATTATC:1 + chr3L 26305740 3' - G4 3727 1 55.45 ATACAAACAGTCAAGGAAACTATTAAAAAAAAAGCAGCAAAATACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAAGTTAAATATCGCCTTAACG:1 + chr2L 20817897 3' + Porto1 4410 1 86.73 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCTACGAATTCGTGGAGGTAAACACTCGGGCCAAGGAGAACTTCTCTG:1 + chr2R 18407063 3' - mdg3 5266 1 55.42 AGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAAAGTCGACATAATTAAAAAGAAACACCATGTATTTAAATTATATGCATGGCGATTGCTCAATTTGAAAGTT:1 - chr3R 7599640 3' - mdg1 72 2 70.30 CGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTGCAAACAATATTTATTGCATTCTGTAGATTGATACCACTTGCCATTT:1 + chr3L 9544449 3' - X-element 4388 1 67.44 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCACACACATATCACATGCTAATGCCCTTGATGTCCTGCAAAGGACGT:1 - chrX 20116032 3' - Doc 91 1 54.46 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGATAAAATATACTGGAACCTCCTTGTTAACGAGTGT:1 + chr2L 12485497 3' + roo 408 1 77.23 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGATCAATTGCATTTTATTTGAATTACTTTGGGAAATGGTTAACCGAATGCAGTTAAATATGCCGTAAATT:1 + chr3L 18635384 3' + copia 248 1 71.29 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTAATAGATATTAAGTGA:1 + chrX 17098420 3' + roo 9032 1 76.24 ATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATATATAGATTATGCCAGCGGCGATATAACTAA:1 + chr2R 19352262 3' + 17.6 453 2 73.27 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCTGACCCATTCATTACCATAAAAAGCGGAGGGGGCTA:1 + chr3R 11941231 3' - Doc 48 1 62.38 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGGTTATCTCTTCGGCCCAAGCAAA:1 + chr3R 20425437 3' + roo 400 1 70.30 AGAGGAAAAAGAAAAACAAAAACCCAAACACACACACACACCGCAACTGAAACAAAAGCCAAGCAGCAGCATCAGCAGTCCAAGTGCCATGGCACTACTC:1 - chr3R 11099160 3' + Doc2-element 240 1 63.00 ATTGTGCGTTGTGAAAATAATTTTGACCACCTCTGTAGATCAAGACAACTGCTTTCAAATTTAAGCTTTATTATCGTTATCAGATTAAGAACTATCTTTGC:1 + chr2L 22108281 3' + Bari1 1693 1 65.35 GACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATG:1 + chr2L 12485442 3' + roo 9016 2 83.17 AAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCAATGCAAGATCGCTTAAATATTAAAGAGGGCTCATTGCGGTGCTGCCAGTTGAGACTGCCATAACATAC:1 - chr3R 6572877 3' + F-element 108 1 56.44 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAGCTTATTATAAATAAATATGAGTTGGATAAAAATGCTAGTCTCGAAATTTTTTGATATTTTTGACG:1 - chr3R 26798602 3' + pogo 2095 1 75.25 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCATCGATAAATAATGATTTTTGTAGCATGCTTTCGGGCTGCTCAGACCC:1 - chr2L 9288382 3' - jockey 17 1 56.00 TTAAGGGGACAACACGATTTTTTGTTAGTTTTATGGCCACAATTTTCATTGCCCCAGCTTAAATGTACAATATTTTCATATCCATACACTACACACATCCA:1 - chrX 22916650 3' + Transib-N1_DM 182 1 69.31 AGGGTAGCCCAAATGCATGTCGTGCCGCTCGTGATTGTTGTTACTCTCTCCACCTTTTTCTTCACATAGTTTGCGCTTTTTTGCTAATAAGCCAACCAATG:1 - chr2R 2950828 3' - G5A 2509 1 72.28 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAATAAATAGTTTAATCCTGCCTGTCTAGCATTTATTTTATGCAGCAACATGAGCCCTCATGAACTCA:1 + chr2L 13622051 3' + opus 491 2 72.28 CACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTATAAACGATTGGGTGCTCGACCAGACACTAGATAATGTGAAAGACATTATAATACCCAGTGACTTGACGCCCGATG:1 - chr2L 7888570 3' - McClintock 6094 2 78.22 AGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGAATTTAATTAATTTTTTATGAACTGCGTGCTCGTAT:1 - chrX 15286262 3' - hobo 351 1 65.35 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGATATATACTATATACGTATCTATGAGATTGCCATTGCAGTGTTTGCCTCACTCGCACTCTG:1 + chr2L 14715185 3' - pogo 6 1 72.28 TCCTTCCTTTTAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCCGAAAAGGTCCTGCGGGGGTGCCACCAGTTGGAAAA:1 - chr2L 9598125 3' - invader3 248 2 63.27 ATACCCGTTACTCAGCTAGTAGTGGTCGAGTGGGACCAAACAACCCCACCACGCCGTTGAACAACTTGGATCCCAAGTTCTACGATACGCCGCGTAGTCAT:1 + chr3L 2593232 3' - INE-1 540 1 66.34 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGATAAA:1 - chr3R 29374925 3' - mdg3 5261 1 71.29 TAAGAGGATATATAGTACCCCTACAGATATGTGATTTGGACAAGGAAAACATTCAAAATTTTTAGCACCGAGCTGAATGTAAAATTCAAATATAAATAACG:1 + chr3L 21882259 3' + invader2 5100 2 72.28 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACAACACCCACAACAACATACTGA:1 - chr2L 21199145 3' - roo 53 2 77.23 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCGCCATCCACGTCCCTCGCAAATTACGTCACGA:1 - chr2R 13956850 3' - P-element 42 1 35.64 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATATCGGCCATCTCCAATAATCAGGCGCTGACTGCACCACTTTCATGTCCACTAT:1 - chrX 11415662 3' - roo 8683 2 60.00 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGGTCATAAAAGCCACATTTTGCCTTTTTAATATTGCCCC:1 + chr3R 7599102 3' + mdg1 383 2 61.39 AACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTTTTGGCTT:1 + chr3L 17136058 3' - BS 4 1 68.32 AATTTCGTTATTTTATATCAATCCGAAGGAATGCACTTAATTATTACACCTCTGCTGTTTGGCCCTCGTTTATTGCACATTGATGAAGAGGTGCTGAAAAA:1 + chrX 3513975 3' - Bari1 1405 1 88.12 AAACAAAATCTTAGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGA:1 + chr3L 25322741 3' + Transib5 2929 1 67.33 ACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTACAGCATTCTTTTTTGTTTTAGGATTTGGAATTAATCTTTCATTTAAGGCATAGCTTGAGTTTAATGTTTC:1 + chr3R 4248413 3' + INE-1 554 1 59.41 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGTTTGTCGTCGCACAGAACAAATGTTGTGCCCCTGTGTTTGCAGCAAATGTCAACGTCGCAACAAAAGGC:1 - chr3R 31411300 3' - FB 9 1 70.30 GTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATTTCACAGATTATAACTACTAAGGACACAGTGTAGCTCGTTTAAA:1 + chr3L 3474830 3' - mdg1 7150 2 60.40 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTCATTTCTGTGTGTGTATTCGTTTGGCTTGTGTCAGTTTATCGTTATTAATT:1 - chr2L 1858299 3' + pogo 2087 1 63.92 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAATGGGTATCAGGGGGATATTGCCTACCCAGAGGTTAATCATTTATTCAAACTGATTATAAATATTATA:1 + chrX 8896252 3' + 1360 3382 2 69.31 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTTTTGTAAACATATCAATGGGCTTATTATCACTGTTCCAATTTATTGCCTACCCCAAAAATAAACAAAT:1 + chrX 17175270 3' - I-element 8 1 70.30 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGNCCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGATGTGGATATCCCCCACCCAATTTTTTGCCCGAGGTCCACACACGTGCCACG:1 - chr3R 7582610 3' - 297 17 2 62.38 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTCTATATTGCAGCACAACACCTGCCTCG:1 - chr2L 12064704 3' + opus 453 2 76.24 GATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATGAAGTTTCCTCCCCATCCCGAGAAG:1 - chrX 2671926 3' + F-element 4373 1 73.27 ATCAGTTACCAACGCAATCNCGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGATTTATCGATAATCGGACGAAGT:1 + chrX 4181405 3' + F-element 4411 1 77.23 CAAAAAGGGAAATAACGGGNTTCCTGCGGCCTATAAAGGGTAGGCGCGAGCACGGATTGCAGCGGCTAGCTCAGAAAGTTTGTGCGTTCGTCCCGCCAAAT:1 - chr2L 22407582 3' + gypsy8 313 1 55.45 CGCTTACACTGCCGCTCAANTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATCATTCAAGAAGGGGCCATTCTAAGAAATGGAAA:1 - chr2R 1905132 3' - Max-element 24 2 61.45 AAACTACCCTAATATGTTCAATGTAAATTCATTTCCGCCCAGACAACAAAACAGAATTAATGAACAGGCTTGAAACGCGACCGCTTGAAACAAAGTGACAC:1 - chr3R 833108 3' + 1360 3140 1 65.35 CAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAAT:1 - chr2R 5284562 3' + Doc4-element 2614 1 52.48 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATATGATATAGATATTCAAAGATATCA:1 - chrX 15290260 3' + pogo 2055 1 81.19 TGACAGCAACGCTTCTAGTTCGACCTTGCATTCATTTGTTTTCATCGAGTATGATACACGGTCCATACCAGGGATGGAACCTTTGAGTGACTTGAGGGTAA:1 - chr2R 4581224 3' - Chouto 5965 1 53.47 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAGGTACAGTTTACCCTTTTTCCGTGGATTTATACTAGACTTTATA:1 + chr3R 7452006 3' + Juan 4187 1 46.53 TCGGAAGGCCCTATCAACCNTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGCCACGAATGCCCCGAGTACACCAGCGGGAGTCATTTC:1 + chr2R 8528287 3' + Transpac 300 2 67.33 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGC:1 + chr3L 13739653 3' - BS 5015 1 56.44 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTCGGGGATCTTGAGAGGAACAGAAGAATCATTTGTCTTCTAATTATGATTTCAATGGCTTGG:1 + chr3L 13059776 3' + transib2 2812 1 67.33 CTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATACTGCCGGGAAAAACAAGTTTTGGGCGCCAGATGGAACAAACTGATTTTAATTGGTCTGCTTGTTACG:1 - chr2L 22699410 3' + INE-1 577 1 79.00 ATGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTATGTAATTATTTGCAATTAGAAACCCGTCACATGCAACGCGGGTAGAAGCTTGTTGGAGAAATCCCTTGGA:1 + chr2R 20690606 3' - mdg3 5259 1 71.29 ATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATA:1 + chr3R 11547745 3' - G2 326 1 74.26 CGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACATGCAGAATGCAGAATGGGGCCATGAGGACCGGAAG:1 + chr3R 31191046 3' + accord 6980 2 63.92 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCGAAATTTCGTGACAGCTGCAGCTGGAGAAGAAGAAGAGCATGAATGATCGCTCAAGGACTCGGTATCGTC:1 + chr3L 7156438 3' + Tirant 8503 2 76.24 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAA:1 - chr2L 3581971 3' + transib2 2789 1 60.40 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCAC:1 + chr3R 30284275 3' + blood 7351 2 61.39 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGATACAGA:1 - chr2R 11664288 3' - Tirant 11 2 70.30 TTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATTTCTTTTATTTAGAATTTTGTTGCTGATGTTATTAACTGTCATATGT:1 - chr3L 89487 3' - Porto1 4194 1 69.31 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTCGAGCTCTTATTTCTGCAAATAAAATTTAGTTGCATATTTTGCGGCGCCAAATGGCAGCCACAAAAA:1 - chr3L 7463255 3' + hobo 2930 1 69.31 TATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGGCCAAAAAATTATTAAAGCACACAAAGCAGAACATA:1 + chrX 3031199 3' + gypsy4 314 2 77.23 GAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTG:1 + chr2R 17402766 3' + invader4 3034 2 78.22 ATGGTTTTAATGTAATTTTTTTTAAATATTCTAATACTAATATTCATTAAAGTGGCATCGTTAAGCTTTCTTGTTTTGGCCAACTTTTCACAATTCATTTG:1 + chr3L 17206847 3' + transib4 26 1 79.21 ACGTGTTCTCAATTGGTGACATATATTGGTTTATTACAATACGGCTCTTATAATGAAAATGTACCAGTTTTGAAATAACAACGTTGTATCGTTTTCAGAAT:1 - chr3R 7134324 3' + blood 361 2 63.37 GTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTTGACTGACCCCAATAGAAAGTGTTACAGTTCAATGTCTGAGAGGCTGAGGCTTCCGCCTGTTGTATT:1 + chr3R 31547789 3' + copia 4709 1 70.30 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTGGTCTCACGTAAAGGTATGACCGCGCTGGGG:1 - chr3L 20356805 3' + roo 9027 1 69.00 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTGTGTAGCTGCGGAAAACGCCGACTTTGTCATAATTATACCATAAATATGCTCGCAGAGTATAC:1 + chr3R 24185074 3' - mdg1 7051 2 66.34 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTAACAGGACACACACG:1 - chr2L 12884298 3' - HMS-Beagle 6812 2 63.37 TTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGTCTTTGACAAAACAATGTACTATCAATAAGAAAACCACA:1 - chr3L 24766215 3' + 1360 3289 1 61.39 CGATAGTCGAAGAGTGGGAAAACCCGCAGCAAAACGATCCAGGTCTCTTTGATACCATTTGGCCAAAGCTGGTTAGCTACAACTAACTTTTCAAACTTCG:1 + chr2L 2357283 3' + S-element 1323 1 79.00 CAACTGCGTTTTGAGACTTNATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGGTCATAAAAGCCACATTTTGCCTTTTTAATATTGCCCC:1 + chr3R 7599102 3' + mdg1 383 2 62.38 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTAACAG:1 - chr2L 12884308 3' - HMS-Beagle 26 2 53.47 TGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGCCCACATGTTGGTCCACTCCCGCATTGGCA:1 - chrX 17260068 3' - Ivk 5166 1 76.24 CTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCTTACAGATAAAAGTAAGTAACAACAAAAATCGCAGTCTTTAACGAACCTGGAGAAAAAC:1 - chr3R 20886683 3' - diver2 4689 2 53.47 TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTTCGCCATGGCTTTAATTGCAGC:1 + chr2R 13745775 3' + hopper 1389 1 54.46 TATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCCTGAAGCTCACTTAAGCAGCTCAAGTCGAAATAGATTTCGGG:1 + chr2L 20990622 3' - I-element 4982 1 58.42 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAGTAGTTAACTTATACATTAAATTATAATA:2 + chr3L 2029745 3' - roo 48 2 78.22 AACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCCATGTATAGACCGCAATCCCAGTAGCAGTAGCCTTCCAGTTGAA:1 + chr2R 1922515 3' + gypsy 448 2 65.35 CAAAAAAAAAAAGGAAAAACAAACTAAATCTGGTATAGGAATTTGATTAACTTTACTGAGTTTTTAAACGGCAGTGCAAGCTATGTGGATATGAAACGTGC:1 + chr3R 11104366 3' + Doc2-element 231 1 68.32 CCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGCCCTCCACCATAAACCT:1 + chr3L 24761274 3' - 1360 47 1 70.30 CAATTTTGGCCGTCACTAANAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 + chr2L 16999511 3' + 1360 3325 1 89.11 AATGTTATTTTTATTTTCATTTTTTTTTTTCGTATGTGTGTTATATTTGCTTTTTTTAATTGGCAGGGAACCGCAGCGGGTTATAAATATTTT:1 + chr3R 14069709 3' - TART-C 415 2 70.97 TACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGCGAATAACGCGTATGACAAACAAAATCTAAGGAAAAGCGGAGGAAAAGCTGTGGGAAGACCTGCCTGCTCAACTGCC:1 + chr3L 7177568 3' + HMS-Beagle2 329 1 57.43 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTAATACAAAACTATATATATTGTAATTCAGATTCATTCATTTATGCACTTGACTAATTAGGCACAGTGGGT:1 - chr2L 7180583 3' + pogo 2099 1 68.32 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGAGTCTTGTTTTATGGCGGACTGACG:1 - chr3R 13441888 3' - 1360 50 1 74.26 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTCGTGTGCGTGTGTGAGTGAGAGTATGTGTGTGTGTGTTTTT:1 + chr3L 20885881 3' + jockey 4955 1 58.42 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTGAAGTTTTATTAATTAATTGTGTGTGTTGTGTAATGAA:1 - chrX 354928 3' - I-element 45 1 62.38 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGCTAACTAGGCATATATTTCACTGGTGAAATTTATTG:1 + chrX 19199009 3' - pogo 34 1 63.00 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGATGTACACGCCATAGTTGAACTGCAGCACGGCTGTAAAATGGAGGAGCAACTGCACCGCCTTGTT:1 + chr2L 286423 3' - Quasimodo 54 2 73.27 TATCGATGCAGCTAAGCGANTTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACAACTCTAATGAAAACCTATCC:1 + chr3R 28333615 3' - pogo 7 1 72.28 TCAAAACTATTTATTGCAGCCATTTATTTGCAATTATATACATATATATAGATTATGCCAGCGGCGATATAACTAATTTACAATGCAGAGAAACAATAA:1 + chr2R 19352285 3' + 17.6 7405 2 65.66 CAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGACAAAATAAAGCACCACACTAAACCATGTACAGTGAAATGTTGATAACTTAAA:1 - chr2R 13993992 3' + GATE 8213 1 60.40 ACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAGTATGCAAAGTCGGAAAGGTGGCCAGGCTTGAGATCGAGATCTCCGGGCAACCGCGCATGTATATTT:1 + chr2R 291005 3' + flea 5011 2 74.26 ATTTTTTCTTTTTTTTTTTGAACTCATTTGTCTATTAGGGAATATGTTTCTTTCCCTTGTCATTCGAAAAAGAACCAAATGATAATTTTTTATT:1 + chr3R 12928593 3' + Tc3 89 1 70.21 GGGGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACAAACAAGAGACGGCAACCTGATAATAAAACCAAAAAATCGAATATTGGTTGTCGTACATATAGCAAAGTATATAAG:1 + chr3L 124507 3' + I-element 340 1 62.38 TGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGCAGA:1 + chr2R 6482755 3' - gtwin 15 2 64.36 TCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCACTTCCTTGAATTCTCCGGCGTTGGGGTTCGACCTT:1 + chrX 22765740 3' - flea 4934 1 67.33 TTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCA:1 + chrX 983347 3' - Juan 3857 1 75.25 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAGGTGCATAAAAACAACACTTATTAAAGTCTTTTTATGCATTGTGACATATTTTGAATACATTTCTAAAAGGT:1 + chr2L 8702883 3' - roo 8664 1 74.26 TACAAGCAAGACCACTACACCCAACGCCATCAGCTAGAGCCGGTCTCTAAAGCGTGCACCCTCAACCACTTCAACAGCAGCTTGCGCAACAACACCCGCAA:1 - chr3L 14027194 3' + gypsy12 10126 3 64.36 ATATATAATAAAAAAAAAATAAGCACAATAACTTCTATATTTGTAAACACGAATTCTGAAAGTGAAAACTGGGTCATTTGGAAAAAATATTTATAAAAAAC:1 + chr2L 10144244 3' + BS 5096 1 51.49 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTACAGTTTTGGTAGTTTGATTGCTTGAATTTGAAGTTGAATA:1 - chr2L 9867880 3' - jockey 4794 1 57.43 ATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTGGCATTCTGCAGGTGTTTTATCATGCAAATGCCTACGATTTATTAATCACTGTTTGCACAAATGTTCAAC:1 - chr3L 2743411 3' - Doc3-element 384 1 51.49 GTTATGGGTGATTGGCCGCTCGCTGTCGTGCTCAAGTGGATTTTAAGCCTGTTGATGATGAGGTGGAATTCTGGTAAGGGATCGTGTGAATGAATTCTTGT:1 - chr3L 14485129 3' - Doc2-element 395 1 78.22 ATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTGTCGTAGTGATCGGCATCGGTGAAGATAAT:1 + chr3R 12209714 3' - I-element 5197 1 70.30 AGTTGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCATGGTCGCACAGACTCCAAATTTTTTAGTTTACACACAAAATATAAGCAACGTGTTAGTAAAACACAATCCA:1 + chr2R 1091333 3' + transib2 2688 1 52.48 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATGATAAACAACAATAACCTCTAAATGTGCTCAAATAACTTTCTAAATTCGAGGGCTATCGAAACGA:1 + chrX 11624447 3' + roo 399 1 66.34 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATT:1 + chr2L 19907976 3' - Tirant 8133 2 55.45 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTAATATACGAGTAACATTTTATTCCGAACAAAGTATGCTCAGCCTAAAAGTAATTGGTAA:1 - chr2L 22104368 3' - Quasimodo 12 2 68.32 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATAATGTCCAAAAATATGTTACCAACACGTGTAGCCCGGCATGCGAAGAAATATGAAAAACAAACGAA:1 + chr3L 4923780 3' - jockey 16 1 69.31 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGAAAAGATCAACTCCTCTGACACTTTTAGTTCTACAGAC:1 + chr2L 16164110 3' - pogo 36 1 67.33 TGCTTGAGTGGAAAAGCCAGTCTAGCTTTTTCAGTTTCAATATGGAATTGCAGCAATTTGCCGCGAGAAGCTCAGGAAGCTGAACTGGATACTAGGACCAG:1 + chr3L 23611011 3' - G5A 2353 1 55.45 ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATATATATTATAAGTTTGATTATATTTAT:1 - chr3L 21275780 3' - HMS-Beagle2 6929 2 73.27 CTAATTTGTTATTATTATTATTATTATTTCTGTACTCTACAGGCTTAAAACGCTTAGCTAATGATCCCCAAAGTGAATGAATTTCCCGAAAAAAGTACA:1 + chr3L 9548732 3' - invader3 5062 1 56.57 GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATATGTGCATATGTGCACATACGCAGACAAG:1 + chrX 21177029 3' - 1360 40 1 70.65 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGTGACTCAATCCAAATAG:1 - chr3R 28447369 3' - blood 7034 2 57.43 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATGCAACAATGCTGCAAATAAGTTGCTCAACTATTGCGAAAGTAGTTT:1 + chr2R 13647895 3' + blood 7360 2 53.47 TAGAAAGGGAGGGTAAGAGTCTTATAGGCCGATATGACTCAGAACCCCCTTCTCGTTTCATAGCCTGACCTTCATTGTTGAGTTGCTTCTAACATTTAAAT:1 - chr2R 18868515 3' - Helena 196 1 62.38 AGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATAGTCGAATATTTGGGGTCCAGCAGACTTTTGCTACCAC:1 + chr3L 2348425 3' + jockey 19 1 62.38 CCTTTCGTTCTTTATTCACGCACAGGGAAACTGGGTAGGGGGATAGCCAGTTCAATGACCAACTCTTGGGTCGCTTTCAGCTTTCATCAATGGTTGCGCTA:1 + chr2R 16810354 3' - Max-element 204 2 81.19 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACTGTCCGTGCGCAGTTCTCTTTTGCGCTTCATTCGTGCTCTGCCCGTCGGACGT:1 - chr2R 19424071 3' + P-element 2864 1 58.42 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGCTTTTGCGCGACGGTCACACCGCCAGTGGGCGAAAAAAAAACATTCGTGAATTCACCGTCGTCGAACGA:1 - chrX 11454292 3' + P-element 2882 2 72.28 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGACCTCGGATCGT:1 - chr3L 2809763 3' + pogo 2062 1 66.34 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGT:1 + chr3R 14049432 3' + transib2 2808 1 61.39 CTGATTCAGCGTCGTCGATGTCGTCTTTGGCCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGTTGCTATGAGTGTGCCTGATTTATGGAGTGTCGCTGACGAATTT:1 + chrX 6637375 3' - gypsy10 5715 2 57.43 TTTGTTTTAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTCTTCTCCCGCTCACCAAAACCGCTGCAAATTTGAATTAATGGTTCAC:1 - chr3L 8081689 3' - transib2 2627 1 56.57 ACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGC:1 - chr3R 178125 3' - BS 45 1 72.28 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTT:1 + chr3R 14049415 3' + transib2 2791 1 58.42 ATGTACATAGATTTGGCTATTCCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGAAGGAATGGCGTGATCGGGTATGACTGGTGATGAGGCAATGAAGATTGTCAT:1 + chr3L 27382907 3' - 1360 341 1 57.43 AATCGTCTTATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGATCACCTACCATATTCATCTCCTCGAAAAAGCACTGGGCCACACACTGACCT:1 - chr2R 22703037 3' - Bica 4522 1 59.41 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATT:1 - chr2R 11664304 3' - Tirant 24 2 56.12 TGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATTCCCATCCCATCCCATCCCATCCCATCCCATTCCAACCAGCCATCCTGCAATCCAAGCAATTTGGCGTG:1 - chr3R 5889330 3' + I-element 5027 1 71.29 CAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGAATTATCCCAAGGACCAAATGTTTCTGTCCTTGGATGTGGAGGCTTTTGGGTGGCTGGGAGCCTTCTGTTTG:1 + chr3L 10820182 3' + I-element 414 1 77.23 CGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTT:1 - chrX 21087564 3' - mdg3 5261 1 66.34 CTTGTGAAAAACACATTTTNGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGATGTCAAGGCAGGTCAACTTTACGAAAAAAAAGAGGAGAAAATTT:1 - chr3L 2325400 3' + hopper 1385 1 52.48 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCC:1 + chr2L 6170151 3' + invader3 232 2 70.30 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTATGTTTAAACAGATCAGCACAATTGAAAATTGGGAAACAAAACATGTAATTGTATATATCTTGTGAATGT:1 + chr2R 5043383 3' + roo 405 1 75.25 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGGGTGTGTTTATTGCGGAAGTTGTTGTTGAGGTCCCGAAATTGTTTCA:1 - chr2R 1577731 3' - 1360 51 1 46.53 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGTCTGTGTGTGAGTGGGCTGTGAGCCGGCTTTGCTCCGCGTCTTTATCGTTTATTTTTATTTGGTCA:1 - chr2R 20948340 3' + hopper 1408 2 72.28 TGATCCACCAATGGGCAATGTTATGCCGATAAGTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTCTCAAACAATTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAA:1 - chr3R 19446712 3' - HMS-Beagle 482 1 79.21 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTATTTAAAGTGTCCGCGAAAGATGGCCAGCTATAATGACGTCAAAGTTGTCAGGG:1 + chr2L 9075659 3' + 297 6957 2 60.40 ATTGTAAGTCTTTAAATATNTTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACTTAACAATTTGTTGCAATTTGTTTATTAAAGTATTTTTATCATATATTTTGCAT:1 - chr2R 16453497 3' - roo 8683 2 48.51 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCA:1 - chr2R 25203775 3' + 1360 3353 1 59.00 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAGGGAACCTCCAGGGCAGCCAAGGTCAAT:1 - chr2R 18407011 3' + mdg3 197 2 72.28 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAACACACATTCATACGTATATAGC:1 - chr3L 17136001 3' + BS 5037 1 78.22 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCAGCATTAATAAATTTGTGTACTTTTTGTGTATTTCACGCAAGCATTTATGATTTATA:1 - chr3L 18635279 3' - copia 20 2 57.43 TTGGGCGGTTTTAGGGCGTTACAGTGGACGTGGCAAGAATTTTTTTTTTGCAAATCGATGACTATTTACAAGACTAATAAAAATGTGTAAAAA:1 - chr2L 22063437 3' - INE-1 342 1 69.89 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCATAAATTCACA:2 - chr2R 9061911 3' - jockey 4688 1 56.44 AGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAAT:1 - chr2L 21795753 3' - HB 78 1 46.53 GATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGCAACTCAAGTTGCCAAAA:1 - chrX 15284610 3' - jockey 110 1 78.82 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTTTGTATCTTCAGAACAAATATTGTTTT:1 + chr3R 17952986 3' + copia 243 1 69.31 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAGCTTGCTGAAAAGACTTTCTGTCTGCTGTTTGTTTTGTTTGCTCATTAACCGATA:1 + chr2R 7635429 3' - jockey 28 1 59.41 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAATGACCCATACATCTATGCAGCCGCAACACAATCACAGACACGACGATACTATTGCCTACCTGGAGGCGCA:1 + chr2R 7605103 3' - jockey 13 1 64.00 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCATTTTTAACATGTATTTATGATTTC:1 - chrX 9439150 3' - roo 8686 2 55.45 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCG:1 + chrX 20015543 3' - transib2 54 1 80.20 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTAAAA:1 - chr2L 18239426 3' - hopper 36 1 62.38 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAATCAAACCGCATCCACACGTATGTATGTTATGTA:1 + chr2L 16461918 3' - hopper 68 1 65.35 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATA:1 + chrX 20999566 3' - BS 37 1 68.32 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCGAACACAATTAAATATTGACTCTACA:1 - chr2R 6830687 3' + hobo 2909 1 70.37 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGGTTGGAAAAATCAGCGGCCGAACTGGAAAACAATGC:1 - chrX 7970937 3' + P-element 2880 2 69.57 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGGTGGTTTTAGCGGGCGGTGGGTTAGTTGGGCGGGCTGCTT:1 - chr2L 16548134 3' + P-element 2885 2 78.00 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACCAGAAAATCTATTAACCAATTTCTT:1 - chr2L 12764982 3' - Doc 37 1 62.22 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAACTATTGAACTCGTCTAAATCTGCATACAATTACCAATTTATTTAATGTACGACGAACAAATCGACAGA:1 - chr2L 5304683 3' + 412 484 2 69.31 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGATA:1 - chr2R 11664292 3' - Tirant 15 2 66.34 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAACTTAGGCAATAATTTTCTGTGAGTGCAGGCAATAGATCTTTGACCAGAGTCAAC:1 - 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pogo 19 1 58.42 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCGTCGTCATCATCATCATCAAAGACATTCTTTCCCATCTTGCTTGGTGCGCATTTAAATTT:1 - chr3L 13580608 3' + jockey 4965 1 63.37 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATA:1 + chr3L 23456267 3' + 1360 3370 1 56.44 TACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCGTCTTAAGATTGACTGAAAATCCAAGATGTTAGCAAATGGAATGTAATTGATAGAAAAGTAGATTAG:1 + chrX 7714825 3' - FB 287 1 75.25 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATG:1 - chr3L 19274788 3' - transib2 15 1 64.36 TCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGAAGGACACAGATTAATTACGAATTTAAGCCCTAAAGTATTCATTTCAAATAATCCAGCCATCT:1 + chr3R 31458474 3' - jockey 350 1 58.42 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTCGAGCTCTTATTTCTGCAAATAAAATTTAGTTGCATATTTTGCGGCGCCAAATGGCAGCCAC:1 - chr3L 7463260 3' + hobo 2925 1 64.36 AGTCTTTAAATATATTCGTNTTCATGTGTGAACAGCAACAAATAAAACACAAGAAATAAGAGGTGGGTAAGGAATTAAGAATGGGCAAGGGTTTCCGAGT:1 - chr3L 14301557 3' - roo 8677 2 66.00 TGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGTAACGGTTTTCTTTGTGCATGCATATATTTTGACATTTTGACATGCATTAAAT:1 + chrX 6521374 3' - G2 107 1 56.44 TGTGACAACATGCAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAACGGCAGCCCTCTGGTGTCATTCAACGCCAACGCCTGGAGACC:1 - chr2R 3339553 3' + flea 4669 1 58.23 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAGATGGCCATGTCCGTCTGTCCTTGACCCATGTTTGCCACGCATTTTAAAATGTACACCTGGCACAGGCTTAATCATG:1 - chr2R 25205329 3' + INE-1 92 1 62.38 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAA:1 + chrX 19887146 3' + P-element 2861 1 54.00 AGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7196 2 81.82 GTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAATGTTAATTAAATCTGGCTCTCTTCCTTGCTTTCTGCTTTTTTTTTCTATTTTGGGTGGTTAGT:1 + chr3L 13641023 3' - hobo 2493 1 66.34 AAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGATCTATCGTACTACCCCTCCACGTTCAAAGAGGACAGGTGGATTAAGCGCTCCACGCCAGCCTCGCGCGCA:1 - chr3L 20496161 3' - baggins 5423 1 55.45 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAATACGCACTTTATGTATGTGT:1 - chrX 1716661 3' - hobo 54 1 78.00 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCG:1 - chr2R 4606218 3' + 1360 3355 1 62.38 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACACATGTACACATATTCCTGATAA:1 - chrX 16272447 3' + pogo 2053 1 77.23 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACACCGTTACACAG:1 + chr2L 20269041 3' - hobo 40 1 66.34 TCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAACCTGCATACAAAGCTTTACTTTCACATATTAAAA:1 + chrX 17284911 3' - jockey 4712 1 65.35 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTACTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCATAAATTCAC:1 - chr2R 9061912 3' - jockey 4688 1 58.00 TTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGAAACCGAGGAGTTAAGCCGACTAAACAAGTAGGGACTCTCAATAACCTAGAAAATCCCTTTCGGG:1 - chr2R 16246312 3' - Cr1a 4094 1 77.23 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGTTTACCATTAAAAACGAGGAAGAACGAA:1 - chr3R 8462963 3' - blood 39 2 70.97 GAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACAGCGTCAACACAAACACGACCAGACAAAGACAGATATTCGCAGGCAATTGCGGTGC:1 - chr3L 14889106 3' + Rt1b 4911 1 60.40 CAAATAATAAAAACATCATCATTAAAAAAAAAAATCAAATATATTTATGCACCTTTATACACAACTGTATACACAATGGGGAAATCTTGCAGTGCCCCTGC:1 - chr3R 15882598 3' + jockey 4989 1 44.55 GGGGTGCGTGTGAAGCTTGCAGCGGATATATTCCCAGAAGAGTGCCACATGTGTCGACATACAAAGATTGAAAAAATCATAAACAAATTTACACAAATGAT:1 - chr2L 13489157 3' - F-element 4453 1 73.27 ATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGT:1 - chr2L 21369859 3' - rover 38 2 67.33 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGAAACTGGATGGATACCTACACCTACCTGGCCAGGTGCGGCAAGTGGCAAGGACCAAGAAGGGCCGGCAACAGGCATTAA:1 - chrX 18322529 3' - jockey 4671 1 74.26 GGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGCTTTTTTATTGCAACCTGTCAGGCGCAGCAATACATTGGTTTACCATTTGAGAGTGT:1 - chr2L 10178851 3' + Cr1a 4424 1 77.65 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTCTGCTGGTGGCTCATTTGCATATTTTAATTGTCCA:1 + chr2L 14970129 3' + hopper 1395 1 57.14 ATTAACTACATCAGAAGTANTGGAATCCTAATTAACTACAACAGGCACACGTCAGATCCTTTCGAGGCGCAAATTAATCTCGATCCTGGCAGCGAGTGGCG:1 + chr3R 30220271 3' + mdg1 7441 2 60.40 TTTTATTCTTGTTTTTACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTGTTACTGGTCTGGTTGTTAAAGTAAATCCCTTTATAATATACTTTTTTATGAACTCCTCTT:1 - 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chr2L 12064713 3' + opus 7447 2 83.17 CGTTAAATAATTATATCACCGGATGAATTTAGCTCCATATACATATACATATACATATACATATATATACATATATCTTGCTTTCTATATACCTCTATACC:1 + chr3L 21802258 3' - G3 4557 1 80.20 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAATAATTACATTAATTAGCCTTTCTGTTTTTTAATGACAA:1 + chr3L 5512498 3' - pogo 34 1 63.37 TTTGATTGTTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGTCACTGTGATGATGTCGCCGTTT:1 - chr2L 5866977 3' - jockey 4813 1 74.26 ATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCAAAAACGTGTTTTAGCTTTTTGGTCGAAAAAAAAAACCC:1 - chr3L 488197 3' - HMS-Beagle 6739 1 62.38 CGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACCCGAACCAGTAGCGCCATGTACGTGACATGTGCT:1 - chr3R 6546077 3' - opus 267 2 66.34 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAGCAATAGCTGGGGCATCGGCACCGTGAGCTGGAGTAGGT:1 + chr3R 27605342 3' + opus 464 2 64.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACTTTGCGAATGGCTCGCTAACAATTGACCC:1 - chrX 21217514 3' + pogo 2074 1 62.35 TTAAAAAAAAAAAGAAAACCAAAAATTAGTTGAAAAAGCTTAGCTTGAATAAAACAAATAAAAAACGCTGTGGAAAAATGAATTATTTTCGCATATTGGG:1 + chr3R 11320232 3' - 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roo 8700 2 58.42 TCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAAAGAGAAATATTGTCTGCCATTTTTAGTGAAGCCT:1 + chr2L 5647414 3' - invader3 5230 2 67.33 TTTTGATCAGGATCAATAGCCGATTTTTACACAACGTTTCTATACAAACTAGTCTCAGTTTTCTGAAAATTTCGTTGCGTCTATTCTTAGCCTAGGATGTC:1 - chr3L 16380632 3' + INE-1 88 1 74.26 CTCTTGTTTTTGATTTTTATTTTTTCATTTGCTCCTTCGTAGTGCAATCTTTTTGGCATTCACAACGAAACCGACCACATGCTCGGCATTGAGAAACAGCA:1 - chr2L 12207731 3' - P-element 2649 1 57.43 GAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAG:1 - chr3R 18346615 3' + INE-1 574 1 65.35 CAGAACTAAACTATTAAATTATGAATATATTAGCGTATCCTTGCACTGGGCCGCTTCTTAGTTCAGAATCTTTGTTTTCTATCATATGTGTAATTCCTTAT:1 + chr2R 1422511 3' + Porto1 4547 1 56.44 GTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTATTGTCCCCAATTAAATTAAGTGACCAACGAAAAAAAGCTGGC:1 + chr3R 9121509 3' + roo 9043 2 56.44 TAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGCGCGTCAGATGTTTGCCCTTCATGTTGCCCTGAAAGCAAAA:1 - chr3L 3831709 3' - G2 2938 1 59.41 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGGAAAGTTAAAGCGACGCAAATCGAATCGTCGAGCAAGCCAACGAG:1 + chr2L 12801041 3' + hobo 2925 1 63.00 AAGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTAACAAAAAATATGACATATTTTTAATGAATACATAACGAATATATTAAACAAGAAAACTA:1 + chr2L 16025781 3' + 412 479 2 63.37 TTTTATATAATTTATATTAATTGTGATTGATTTTATATGGAATCTTAAAATAATCTTAAAACTTAAAGTTAAGCTCTCAGTTTATTTATATTTGTATTCCA:1 + chr2L 1285046 3' - Doc2-element 4694 1 55.45 GAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTAAATTTAATAAAACACTTACCTCACTGACAGCATACAATTGCCGTTGAAGCAGGAGGG:1 + chrX 11426378 3' - TAHRE 10412 1 43.56 AATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGTGCAAAAG:1 + chrX 22694472 3' + Burdock 6385 2 72.28 CCACGTTCAAAGCTCGGACCCGAAATCCCGATCTATTAAAGAGTTACATCTTTCAGCACATAAAAATCTTTACTCCTCGAACTAAATTAGTGTAGAACGTG:1 - chr3R 30918713 3' + Idefix 7068 2 73.27 AATTGAATAAATATATGTCGGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGAGAGTTCATCATTACAGTAATTCAAATAATAAGTTG:1 - chr2R 24293803 3' + 412 7487 2 73.27 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGCTGACC:2 - chr3L 15745358 3' - hopper 48 1 75.25 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATGTATATGGCAATATCTATGAAGCCATCGATAGTTACTTTTTTCAA:1 - chr2R 16068618 3' - Burdock 6162 2 59.41 TCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGGAATTCTAAAAGCTAAAATGTTGAGATATTTTCTTGGTATCCTGTTCGTCATTAG:1 + chr2L 9037533 3' + INE-1 112 1 71.29 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGCCCAAACC:1 + chrX 9439220 3' + roo 9032 1 74.00 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATAGAAGCGCACATTCACACAAAC:1 + chr2R 22269224 3' - jockey 4672 1 70.00 TAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTGAAGTCTATAACAAGCGAGTGACCGCCT:1 + chrX 18604506 3' + jockey 4886 1 75.25 TTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTATGGAACCAAATTAACCACGAGGCAACTCAGGGAATGGGGAAAAAGAGAAACAACGCATTGAAT:1 - chr2R 8693061 3' + invader2 4938 2 68.32 GGACATATGGATGTCAACTNTGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAG:1 - chr2R 5284576 3' + Doc4-element 2600 1 65.35 GCCTGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTCTAATCTTGGCTCTCTTTGCTGAGCTGGAGTTCTTCCCATTGCCT:1 - chr2L 22737257 3' + Cr1a 4177 1 69.31 TCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACAC:1 - chrX 21852455 3' + gtwin 7359 2 57.43 AAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCTATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGG:1 - chr2R 982342 3' + rooA 7540 2 64.36 ATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATAATAGCCAGGCTTTGGGGGCGTTATGGCATTCTCACGCTTCATTTGGCATAAAGACCAAAAATAAC:1 + chr2R 5813672 3' + HMS-Beagle 239 2 72.28 CGTTCATACGGACAGACGGGCATGACCAGATCGAATTCTGCTATAATTTATGCTCGTCACTTTCAGTTACAGGCTCTTATTCCCGGTAAAACTTTGATTAT:1 + chr3L 21731643 3' - INE-1 124 1 74.26 TCTCCACGCGAGGGCGGCTGGAAACAGGCTCTTAGTCCCCAGAATCATATATACATATAAATATTTATGTACATTCGCTTAGAAGCCTCGATTAGTTGCCG:1 - chrX 11963366 3' + baggins 96 1 72.28 CCCGACGGACGTGTTTTTAACAGAGCTCCAGTTAATATCGAAGTGTAAGCGCTTTAAAATCGAAAAGGACTAAAACTAACAGAACAGTACGCACAAAAGG:1 - chrX 17408156 3' + Porto1 16 1 55.00 GCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATGCACGTGTTTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGCACTCCAAAAATCAGAAAAACTGCCAACTTGTGTGTGG:1 + chrX 7544739 3' + Ivk 5046 1 55.45 GTTACCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCGTCAACTCCGACTAAATGTCACATTTTTATTTCTTACTCTTGGCCTTTGGGAAAGACCAAATAGTTATGTA:1 + chr2L 18689614 3' + Gypsy6A_LTR 180 1 67.01 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTGATATATATATATATATATTTTTTTTTGGTTGCTTTGGTTTTTTATGCCGTGAAA:1 - chr2L 2832720 3' + roo 390 2 56.44 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAAAATATGGGGAAGAGATCAAGTGCTAA:1 - chr3L 13704503 3' - opus 7160 4 76.24 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGGGGATATTAACGAACGAAAGTTCTATTGGAAGCTAAGGATGTGACCT:1 + chr2R 13956908 3' + P-element 2857 1 52.48 CTTTGAAATAATGGAAGTGNCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGATATTGGGAGAGAGACGATGGTTTGGCACTTCCGCCCCCC:1 + chr3L 7099855 3' - 297 27 2 58.00 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATATTATTATTCAAAGCCCATAAAAATACGAATATACTGTAGATACAC:1 - chr3R 15523293 3' - 412 7083 2 54.46 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCACACACACACACACATCCTACTCTTTCGTGCTCCATCTACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' - hobo 2 1 51.49 GGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGTGCTCAATTAAAACATATTAGCATATAGAGTTTTTTTCGAGTG:1 - chrX 21280739 3' - F-element 457 1 57.43 TAAAATAATTTAAGCAGAGCTAGTGGAGATTAAACTAAAAAACATCAAAAAAAAAAACAAAAAAACGTATTCATAAACGTCATAAAAAAAGATGCTATAAA:1 - chr2L 9819600 3' + jockey 4934 1 81.19 ATCGTGATTGCTGTGCTGGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGGAGATTTCCAGCTTATCGAGTTCCAAACTGGGTGAGGGTGTGTGCATGG:1 - chr3R 4897931 3' - Doc3-element 486 1 51.49 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAATAAATTTAATTAAGTCGATTTTGTAAGACCCATTTCCTTTAGTTTGGTCTCCTTTATTGTATTTAAAACA:1 + chr2R 7940846 3' + Juan 4201 1 66.34 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATCTTGTCATATTATTATTAGAAAAT:1 + chr3R 18883849 3' + roo 397 1 69.31 ACATTATTGTAAAAAATACNGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTCACGATACAAAACGTTTATTTTGCGCATAATGGG:1 + chr3R 17897211 3' + hopper 1397 1 61.39 CTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATCTGCAAATATATGGAGGGGAAAAACAAATTAGTTTGATATTACTTATTATAATGTCATGTTTCGGTCTCG:1 + chr3L 4963239 3' + Bica 66 1 73.27 ATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATATATTTATTCGTTAAAATTATATCTAACCAATGTATCCTCATCTTTTCTTTCAGGTAAGTTCAACTTCCTTTCCT:1 - chr3R 9121405 3' - roo 8664 1 76.24 CGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCCTTTGGTTAGCCAGTGGAGCGTTGGGCGTAAAAACCGCTTGGAACTGCATTGGACATTGT:1 - chr3R 26296393 3' - jockey 255 1 67.33 TTTTACATATTTATATTTATGTTGATTATTGAAACTATGTATATGTAATCTTGCATAGCCAAAGGAGTTACTTGTTATGTTAACTGCCTTTAATTTTATCT:1 - chr2R 4605127 3' - 1360 2961 1 68.32 CTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAG:1 - chrX 21087589 3' - mdg3 5286 2 57.43 GCCCTATCAACCTTCCACATAACAATATAATCTTGTGTAAACTTGCGATTTTTTTTACATTTTGAAATTTT:1 + chr3R 14228088 3' + Transpac 5226 2 63.38 TGATATGGACGGACGGGCGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 5411 2 52.48 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTGTTGTGGATCTATGGCCAAAAACGCTTCCAGCGGGATATTGAGTTTATGTTGGGCCAGCCATTTGC:1 - chr2L 7714491 3' + roo 400 1 68.32 GAGCTCCAACAGAACTAAACTATTAAATTATGAATATATTAGCGTATCCTTGCACTGGGCCGCTTCTTAGTTCAGAATCTTTGTTTTCTATCATATGTGTA:1 + chr2R 1422502 3' + Porto1 4538 1 65.35 ATTGTATAAGAAAATTTTTAGCATGTAGTGTGGATTTAAGGGAGGCGGCATGCCGTAGTACTGCTGGAAGGGATTGCCCTGGGGCGACATGAAAACAGGCT:1 + chr2L 2034331 3' - TART-B 10178 1 80.20 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTATTCTCACTTTGCTCGTTTAAATGGG:1 + chr2L 22241781 3' - pogo 47 1 72.28 CTCTTTCTTGAGTTATTGGCAATGGTAAACTTGTCGAGTTATGGGTGATATACCAGAACAAGCTTATCGTTATTGACTTTCTTTCATTTTATACCGAAATC:1 - chr3L 19112030 3' - Doc2-element 432 1 59.41 AGTTTTTTTGAGGAAAAGTTTGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATTTATATTTTAATGCCCTAATTTTGTTTGCTCCATT:1 - chr3L 13204370 3' - I-element 5153 1 62.38 AATGAAGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGCCCCCACCTATCATTCTGTCTGCTGGCAAAAATCGACACAGAACGCTGAGCATTAGATCTCCACCGAACAA:1 - chrX 15735197 3' + G4 134 1 51.49 CGTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAGTATTACCATATAC:1 + chrX 11454373 3' - P-element 43 1 36.63 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTACATTTTATAATTAATTTAAACCAAAAAATACTCTCGATTTAAA:1 - chr2L 12773924 3' - pogo 26 1 65.35 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGTCCTTCACG:1 + chrX 7971017 3' + P-element 2853 1 45.54 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGTCCGAATCAACCACTGGTACTCAAGCTTTGAC:1 + chr2L 14981506 3' - hopper 41 1 69.00 CGTTGGATGATTTCTACGTTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGATAGCTGGATAGGTCCAGGGGCATGCGCTACCTACACACCTCGCCTTTGAGAG:1 - chr3R 4496915 3' - Fw2 3588 1 66.34 TACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAACGCCACACACAGACACACACACACACT:1 + chr3R 18994319 3' + accord 7103 2 73.27 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCAAAGCCGTTTCAGCTGTTTGTTGTGTGCACTAAAAATTGAATTGAACTGCAAATGCTGCTTGGAA:1 + chr3R 26498620 3' - roo 8665 2 79.21 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACGTGCTCGCTTTTTCTG:1 - chr2L 13549277 3' - P-element 56 1 21.78 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAAACGCTTAGAAATTCACACGCTGTTAACGAATCTCTTATGCTTCA:1 + chr2L 19698506 3' + hobo 2909 1 61.39 TATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAGGGAAATTTGCATAAATGATAACTTTATCGAACTAACCCAATGAATTGGATAGTT:1 + chr3R 23442673 3' - accord 410 2 61.86 ATGTTTATTATTAATTTAATTCGAATCACATCCGCCGGAAATGGGCAACTTCTGTCGGAGGCGACTAAGCCAACTTGGAGTTGCTGGCGGCAAGTTATTA:1 - chr3R 30144989 3' - flea 234 2 83.00 CGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATATGCAAACTAACAAATTTCAAAAACCCTTAGAAA:1 + chr3R 8857005 3' + rover 309 2 67.33 AAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAAGCAATCTAAACACTAAACACATTTTGCTGAAAGAATTTGTAAGCACTTAGACATCATTAAA:1 + chr3R 22907127 3' + TAHRE 10344 1 68.32 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACTATTCGCT:1 + chr2L 3985147 3' + roo 9038 1 59.41 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTC:1 - chr2R 9061929 3' - jockey 4706 1 64.36 TGCAAATTAATACATTCGGAAGGGGACAGTGAATGTGAATGGAAATCTACTAAACAAACGGGGCTCTCTGCCGACGCTGACGTAGACTGCGCTGCCAGCGT:1 - chrX 12666133 3' - Gypsy12A_LTR 2050 1 72.28 TACATCCGCGTTCGACAAGNGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAGTATTTTACATTTTGCACCAGAAGGACACTTGAC:1 - chr3L 14878625 3' - Juan 15 1 65.35 AAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGCACCGTGAAGTCCACCACAGAAC:1 - chr2L 5557352 3' + invader2 274 1 81.25 TTATAGCAAATTATAATACCTTGAGGTAATTCTAATATTTTGTATTCATTCCCTCAACAATACAAAGGAACAAAAATTAAGCTATGAATTTTTAGATGCAA:1 + chr2R 2054639 3' - S2 1450 1 54.46 TCGCACGGGTCCCACGGCCACCCCGCCCGACCAACCGACCGAGGGGCAACGCCGCACAAAAAAAACAATATCGGAAGGTGAACACAAAGGTGGAGG:1 + chr3L 25479196 3' - Cr1a 4442 1 53.12 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCAT:1 - chr2L 23372624 3' + 1360 3354 1 65.35 ATGCCGGACTCATGGTGCCATGTGCCTTGTCAGCGTGAATCTGGAAATGCAAATGGTCTTTTACATAACTATTCAGGATCTGAACGAAGCGAAAATAAAAA:1 + chr2R 5152886 3' + R1-2 3051 1 75.25 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTATATTTCATTTTTACGAAATTAGGTTGTTATAAAATTCTAT:1 - chrX 6496652 3' + I-element 5320 1 64.36 CGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCACAAATTTAGCACTGTAGGTAAT:1 + chrX 6451136 3' + pogo 2051 1 79.21 AATCGATAACTGTAATTATNAACTTATATAATGCACGGGGCAAGCTGCAGGCAGTTCCGACTACCCCCTTTTCACCTGACCGAGCAAACGCACGCCATTGT:1 + chr2L 12884413 3' + HMS-Beagle 243 2 76.24 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTACTAACTGTTAACTTTAAATACCCCACAAAGCCGAAAATACCCACTTTAGATTCCGAAACCCGATGCAAA:1 + chr3L 8323849 3' + mdg1 7077 8 58.00 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGTCTGTGTGTGAGTGGGCTGTGAGCCGGCTTTGCTCCGCGTCTTTATC:1 - chr2R 20948359 3' - hopper 25 1 54.00 ACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTTTGTGCTGTTGTGTTTGCAGTCGCATTTGTTGCTGGGCAGTTTTATGTGCTTTATAGTCACAGTTCGGTTGT:1 - chr3R 11471230 3' - accord 7044 2 87.13 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCGCCATCCACGTCCCTCGCAAATTACGTC:1 - chr2R 13956854 3' - P-element 46 1 31.68 GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTTGGTTTTGGTTTGATTGGATATTCAGGCAGTGCTTCGGTTGCAAGTTTGAACACAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 17644692 3' - I-element 5141 1 73.27 TAAGAAATCTAAAAATTGAATTTGCTTGCTTGATTAGCACGGCCGCAACATTTTGGCTTCGCTTTTGGTTAGCATCAACGGGCTCGGTCAACTGGCAATCC:1 - chrX 6542364 3' - 1360 3273 1 73.27 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATATGATAAACAACAATAACCTCTAAATGTGCTCAAATAACTTTCTAAATTCGAGGGCTATCGAAACGACAAGGTT:1 + chrX 11624454 3' + roo 406 1 73.27 AAAAAAACACAAAAAAAAAAACAAATAAGAGTAAATAAACCGAAACAGGGAAGATGAAAAAACTAACACTGAGGCCGTAGTGAAATTTTTCCACCACCAGC:1 - chrX 14414757 3' + HMS-Beagle2 488 9 91.09 CACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGGAGGCGCCCGATAAGAAAGCCCAAAGGGTTGTGGCGAGGTATCTACAAAGCGAAGCGAGCCGTTTTTAATAA:1 + chr2L 17438026 3' + F-element 4478 1 78.22 CTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCACATTG:3 - chrX 21852445 3' + gtwin 453 2 61.39 TCATTTACATAAGATATGANCGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATATACTAATCTTACTAATCAGAT:1 - chrX 8579190 3' - roo 50 2 76.24 CAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAAGTATGGCAAATGGGTAAGAAGTCTGGTAATAAAGGAAAATTATGATGATTTTCTATTT:1 - chr2L 20963447 3' + Bari1 1688 1 60.40 TAAATATAAAAATATAAATATATGTACTAGCTTATAAATGTAGAAAAAATTATAGACATCATGAAAAATTAAATATTTCACTTTCATATTAACTGCAAATA:1 - chrX 3431819 3' + Stalker4 88 4 76.24 CGACAATCAGATACCCGTTACCCAGCGAATGTTGTATACCCTTTACTCTCCGAACAAAGGTTATGAAAATGTGCATTGTATTTATATGTAACATATGGAA:2 - chrX 22672186 3' - INE-1 550 1 71.00 ATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCGGTCATCAGATGAGCCTTCGGCACATGTTTGGCCAA:1 + chr3R 8715625 3' + mdg3 110 2 64.36 GGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTGGGCAATGGTAAACTTATCCCGGTTGAGGGTCTTAATCGAGAATGA:1 + chr3R 11895823 3' - Doc2-element 471 1 75.25 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCATCGCTGATTATAAGGAA:1 + chr2R 23313774 3' + pogo 2046 1 81.19 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAAATGAAAGGTTTGTTTTG:1 + chr2L 16016279 3' - I-element 11 1 66.34 GAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCAAGCCGATGGTGGATCCAACGCCAATTATTAAAAATTGTTTTACTTTTTTTTCACAT:1 - chr2R 327861 3' + INE-1 157 1 62.38 GCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGTAATTTAATAAGATACAGCCTGGACTTTT:1 - chr2L 12763785 3' + Doc 288 1 71.29 ACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGTTGATAGTGTGTGTGGGTGGTTGGTTTGGCAGAGTG:1 + chr3R 18198058 3' - jockey 227 1 68.32 CAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCT:1 - chr2L 21369863 3' - rover 42 2 71.29 GTTTATTATTAATTATCAATTTATCAAGGAAGCTAATTCTCAAAAAATCTATTAAATTTACTTTAAAAAGAATAAACCACGTACTTGTTTTGTTTTCCGCT:1 - chr3R 14664270 3' + INE-1 421 1 77.23 CGACGGGACCACCTTATGTNATTTCATCATGATCTGTCCCATCACCAAAATAATAGTTTCTCGTGGGCATCGTCAAAACTTTGGTTGGATTTTTAACCCTT:1 - chr2R 18850536 3' - P-element 10 2 69.31 TAGCGAGGCTTTAGACTGANAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTGAAGTTTTATTAATTAATTGTGTGTGTTGTGTAATGAAAT:1 - chrX 354926 3' - I-element 37 1 55.79 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCGCCTTTTATTTTTAGCCACGCCAAAGCTG:1 - chr2L 12800972 3' - hobo 46 1 69.31 TATGGCGGCAAGGATGAGCAGTTACCATCGTCCGACTAGCTGTCTGACCTCCACATGTCAACACAACTCATTATGTTGCAATCAGTGTTGCACCCTTCGGT:1 + chr3R 5724317 3' - TART-A 13008 1 67.33 ATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGCACATACACATGTGCACAATCGTACAC:1 + chrX 1617438 3' - BS 4831 1 77.00 TGCTGAGAGCGGAAGAGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGAGAGAGTTGAGAGTGTATATATTGGAGAATGTGTCAGTTTTGGCT:1 + chrX 19883645 3' - Porto1 474 2 76.24 AAATAACTGTATTAAATATTAGTGCTAGAAGGATCTAATTATGTATTAAAAAAAGTTAAAATCGATTGACGACAGCGCGACTGGCAGCAATCGTTTTATAC:1 - chr2R 14486676 3' - Cr1a 4307 1 65.35 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATTGAAGTGGTATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCAAGACACTTTATAGCTAAATAAAT:1 + chr2L 7552487 3' - I-element 21 1 41.58 TTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACTTTCT:1 + chrX 21668103 3' - Tabor 4 2 75.25 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATATCGGGGGATCAAACTGCATACGCGTTAGCTCTAGTATTAATACATTAATAATACAATTTGTAATTGCAA:1 + chr2R 7718598 3' + hobo 2937 1 77.23 TAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAAAACAAATACATCATAATATTTGCATTGTTTTTTCTATG:1 - chr3L 15748803 3' + hopper2 1281 1 66.34 TAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATACAGAAACACGAAATCTGCTTATGGAGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATGCAGTATATTGGTCCCGCTCTGC:1 + chrX 19696946 3' + Tc1 1578 1 45.54 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACCGATTTCTCGGCTCTTTGTACGGATGCCTCTAGAGGCATTCGG:1 + chr2R 6604046 3' - roo 8695 2 59.00 TTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCCACCTCACTTTGTGGCATTGTTTTCCAGTTCGGCCGCTGATTTTTCCAACCGGCTTTCGGCTGG:1 + chrX 7970965 3' - P-element 389 1 77.27 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACCACCACCTCCGCGAGAGAGCAGCGAAGAAGAGGAAGACGTTGTGGCAGTGGTACTGAA:1 + chr3L 5360237 3' + P-element 2870 1 64.36 AGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTTTCCTTGTTGTTTTTTTTTTCCTGACTTTGGAAATATGCCA:1 + chrX 12854363 3' - Doc 105 1 59.41 GTTGGATGGGAGGTGTGGCCGTGGGACAAGTCGAAACAAACAAAAGTATTCGTAGCCAACATGTCCTTGGCTTAATTAATGCAAAAAGGCTCAAGGAGCG:1 - chrX 5439176 3' + Cr1a 4429 1 60.00 AATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAAAAAAAACAACATTTTTGTGAAATTATGAAATAATATGGTCAGGGCTATGAACAACTTTTAG:1 - chr2R 25248681 3' + HeT-A 6042 1 62.00 GAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTACAATTTACAAATTATTGTTTCTAGTTTAATGGCTTTTGTATTGGTTGCCTTTTTTCC:1 + chr2R 21775745 3' - I-element 465 1 52.48 TGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTATCTGGGCATATATCCTCTGATATCTGGACAATACATCTGTGTGCATTT:1 - chr3L 10126397 3' + hobo 292 1 56.44 ATTTCTTGGCGTTATCCTTNGTCAACTGTCGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAAT:1 - chr3R 24228900 3' + 297 6925 2 72.28 AGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATAATCTTGTCGACCCTACTTCCCTCCGACATCTGAAGAGAATACAAGAAAAAAGGGATGGGAGGATTCTTAAAAC:1 + chr3R 2446797 3' + G5A 2626 1 70.30 TGGCTTCTACACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCGGTGTCCCTTGCTTCTTCTTGCTATCTCCCTTTTTCCTTTTATCTGCCTGCAGC:1 + chrX 8271484 3' - micropia 329 2 56.44 CGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCATAATCGAACATTATAATCATATGTGCTTCTTGTATCGTGCATTCAAGCATATGGA:1 + chrX 5791077 3' - Cr1a 4087 1 61.39 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGC:1 - chr2L 13598197 3' - pogo 41 1 67.33 ATTATAATAATTGATTTAACATTTAAGGGTGTAAATTTAGTGTTGTTAAAAACAGCAGACATAAAAATAACATATTTTTACATTTATCTAAATCATTTACA:2 + chr2R 17032232 3' - jockey 4850 1 65.35 AACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAAAGCATTCTCTATTGTTTTTTTTTAATTCAGTTGAGAACACAAAATAAAATTAACGACAACAACAA:1 + chr3L 11119795 3' + INE-1 553 1 89.00 ATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAAGACAGCACAAGCCAATAATGAAGCCTACGATTTTGTATGTTTAAGCCTCTTTTTAATTCTACAAAATAA:1 + chr3R 16019097 3' - Stalker 20 4 77.23 GTCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAATTTGTTTTTTTTCAGTGCATTCTATCGCTATACCGAAGGTTCAATGGATAC:1 + chr3R 10067181 3' + diver2 271 2 54.46 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATCAAACTCATCACTCTGCATTTTTTTCGTTTTTCAACCATAAAGTCAAG:1 - chr3L 11399493 3' - jockey 60 1 56.44 ATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTTTATATACATTA:1 - chrX 15572239 3' - HMS-Beagle2 6908 2 51.00 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGACTTTGGGTCCAGTCGGCCACTGAATTATGCTCAAAAGTTCGCCACTTAAGCGTCAATT:1 - chr3R 27448222 3' + hobo 2924 1 62.38 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACTTAAAGAAGAGCCACCTGACTATAAAGATTAGATT:1 - chr3L 25504389 3' + copia 250 1 62.38 AGCGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATATAACCTCCAAAATATCAGTTTATATCAGTTTTTTACCATTTGG:1 + chr3L 5025677 3' - roo 32 2 58.42 TTTTTTATTTTTTTTTCTTTTGCCCGATGGAGGAAAATCGGTTGCTCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAAAAGGCAGGGAAAATAAATGAAAATCACTTGAAAA:1 + chr3R 22803382 3' - G2 3077 6 63.37 ACATCAGAAGTGGGATCGGCACCACCCCCTATATTTACTGAAGAACAGTGGCGCGTAATTTTGCAAATGCAAAATCAAAATATGTTGGAGTTTT:1 + chrX 10568309 3' + invader6 391 1 48.94 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGAGCATGTTCTTCTCTAGGTCTGTATTAAAACCAAAGATAGTCATAGCGATACTTTTAAGAGTACCC:1 - chr2L 9724178 3' - 1360 9 2 68.32 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATGTGAATGGGAAA:1 - chrX 8308707 3' + opus 7488 2 66.34 CACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGGAGAGCGCGCTTTCGGTTAAAGCTCTCTCTCCGCACTCACACGGACGCAC:1 - chr3R 10093658 3' - P-element 1 2 78.22 TACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACGGCCACCGCTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 10 2 60.92 TCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATAATCGAGGTGGAGCTTTGGGCCTTCAGCTGCTGGGCCAGCGAAGCCGC:1 - chrX 3280461 3' - Tirant 8074 1 52.48 AGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGACGACCAGATGGCGATGGCAATGCAACCAGATCG:1 + chr2L 6168830 3' - invader3 330 1 66.33 TCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAATATCGTC:1 - chr3R 1440150 3' - G-element 23 1 57.43 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTGCAGACACCAGTTTTGTTTGATTTCAATTCGGTAGCAATGTTCTTAATTTTTGAAAATTCAGGACACGACA:1 + chr2L 16566387 3' + 297 6974 2 73.27 GATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTATAGATAATAGGATAAAGATTATTATAGTCAGAACATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2R 1982173 3' - Cr1a 4245 1 67.33 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTA:1 + chrX 17098405 3' + roo 399 1 83.93 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGTGCAACTTGAAAGGCGATTTTTAGGCCATTTTTGCAGTAAATGTAGCAGTAC:1 - chr2L 5244406 3' - transib2 19 1 60.40 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGGACCTTTAGGTTAATCGAAAAACTTTTA:1 + chr2R 18073288 3' - hobo 48 1 70.30 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGGAGATTAACCAGGATTTTGGTAAGCCACGCAAAATAAATTAAACGCTTTAATTCGCTAATTAAAAAG:1 + chr3R 9117152 3' + Transpac 5220 2 70.30 TATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGCCACGAATGCCCCGAGTACACCAGCGGGAGTCATTTCCATTTGTCTTG:1 + chr2R 8528298 3' + Transpac 311 1 78.22 GGTATTAATTTTTGTAAAANAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCTGTTGCGTGAGTGCTCTCATATAACTAATATTTATACCGTATAAAGTCA:1 - chr2R 23111301 3' - hopper 23 1 56.44 GCCCATTTGGGCGCGTCGGCTAACTAATCAATAACCAACCAGTCGGTAATTAAAAGCACCCATATTCTCCT:1 + chr2R 13434014 3' - X-element 4639 1 70.42 TATGTTTGTGTGTGTGTGTTCTATACAGTTTTTTTTATTGATTGCTAGCGAGGATCGCTGCTGTTGTAGATGCGGGGAAGCGGTAACTGAGGCCGCTGCCG:1 - chr3R 15795085 3' - accord 7028 2 66.34 TCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACAGTATTGAACGAAGTGATTTGGTTTCAAAACAACATCTC:1 - chrX 16969243 3' + Porto1 4212 1 68.32 GGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAAAATGTGTGGGCGTTCAGGGCAGTAAAGTCCGGTAGATACTAAA:1 - chr3L 6694892 3' - accord 7081 2 61.46 AAAACTAACATGCCCAACAATGATAACCGAATTGCCATTTTGGCCGATGATTTAGACGATCTGCCAAATACAAAAATGTAGAACCAAAACCGCAGATACCG:1 - chr3R 14450039 3' + Fw2 113 1 62.38 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGAGCATGTTCTTCTCTAGGTCTGTATTAAAACCAAAGATAGTCATAGCGATACTTTTAAGAGTACCCTTTAAAA:1 - chr2L 9724171 3' - 1360 2 2 75.25 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGGCGATTTAGCGATGCTTGTCTTATTTAGTT:1 + chr2L 16071159 3' - 412 48 2 69.31 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTAATCAGTTTGAAGGCGCGTCGAGGCCTCTACCTTTCTCCTACATTCA:1 + chr3L 1227366 3' - 412 28 2 50.50 GCCAATCCAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCGTCCCATGTCGGCGGGACCCATACTGCATCGCTCACAGCCAGCATCACATTATCAGACAGGC:1 - chr3L 13884228 3' + mdg3 65 2 67.33 GCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATAAATAAGTTAAAAGTCTATTATCAGGAACCAACCCCGTT:1 - chr3R 4164640 3' + HMS-Beagle 210 2 69.31 CACTTTTCCTTTGTTTTGTATTTTTTATCCCTTTGTCCCATTTGTTTGTGTCTCCCCTGGCTGCAATTTTTAATGTGCCTTTTCCGATGCGCGTTCTTTTT:1 + chr3R 14590121 3' + S2 232 1 56.44 TTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTAACCAACACACCAGAAGATGATCTCGTGCTCGTCGTGTTCTTGCTCTTGTTTTTCCGGCTTGA:1 - chrX 19435106 3' - baggins 4983 1 52.48 CCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATTAAAAATTCCAGCATTATATGAAGTAAATCTTTCCTAGTTGACAAGACATTTTTTTTGCACTTCTTTTACTTT:1 + chr2L 18566947 3' + roo 8965 2 68.32 CGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCATTGAGTTGAGTCGGCTGCATTTCAAATGCGAGTGCATAATGCACTAATTAGGCGGGCGTTAAGTATACGCCGTG:1 + chr2L 13310336 3' - mdg3 5255 1 72.28 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGCTGACCGAGT:1 - chr3L 15745354 3' - hopper 44 1 71.29 GGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGATAGCGCCTGCGTTGTCACTAAAAAATACTGCGGTCCGCATAGCCGCC:1 + chrX 1240153 3' + I-element 272 1 52.48 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTC:1 + chr3L 17708281 3' - jockey 4810 1 72.28 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGGCGATTTAGCGATGCTTGTCTTATTTAGTTTTTAAATAAATGG:1 + chr2L 16071172 3' - 412 35 2 56.44 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTAATTATTATAATATAAAAC:1 - chr3L 18406638 3' - Doc 59 1 79.38 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAAAACTCTCGCAAAGACCCTAGAATAACAA:1 + chrX 14317412 3' + 1360 3342 1 74.00 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCGGTGTTGCACATATATTATGATAGTGATAGATATAATCAAGTTG:1 + chrX 9828514 3' - Tirant 33 2 57.43 TGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCGAGTAGTCGCTGTCACTGAAGTTGTCGTTGGAGTCGTTGTTCTCAATGGTTTGGGAGTTGTATTTGGT:1 + chrX 1555077 3' - I-element 414 1 76.24 TCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGACCAAGAATATATATACTTTA:2 - chr2L 16293752 3' - INE-1 153 1 88.12 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTTTACAACTTGATGAGAATTTGATCAAGATAACATTAAAACACAATCTGCTG:1 + chr3L 20354082 3' - 412 7078 2 55.45 GGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAGCTTTGTGTATCTTAAGTGGACGCCAAGTAGCTCCAATCTATTCGGATCGTAT:1 - chr3R 16533150 3' - X-element 4630 1 71.76 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATGCAACAATGCTGCAAATAAGTTGCTCAACTAT:2 + chr2R 13647881 3' + blood 334 2 67.33 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCCGGAATCTGGTTCTACCAATTATAACAAGTTTAATAATCTATT:1 - chr3L 10283534 3' - Doc 65 1 57.43 AAATATGTAAATATTTAAATATCAGCCAAAAAATGTAAATATTTACTAAACTGGATATTTATTTCAAAATTCATATTTAAATCATTTTCCCAGTAATTTAG:1 - chr2L 4136644 3' + G3 4505 1 69.31 GCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCGTTGGGATTATTATCATTTAAAATGTTTAACTTGCATATTAGTTTGAGATAAATATAG:2 - chr2L 16179695 3' + F-element 303 1 60.40 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACAT:1 - chr3R 24228857 3' + 297 387 2 73.27 GCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCCGTTAGGTGGTTGGTGTGAGCCTGAAGCCGGTGTAGCGTCGGACGCCGTACCCCATATTTGGATGCAATAGGGCAA:1 - chr3L 27363448 3' - Doc 4567 1 79.00 TATCAACCTTCCACATAACTATATAGAAAATCTAGTTCATGATAATGGAATGAAGTCTTGGGCTATTTAAAAATGTCAATGGATAAGCGATAGTTTTTATT:1 - chrX 1203160 3' + Transpac 311 1 57.43 ACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGCCATTGGGTTTTCCCATCCTTTTTTCTGGTCAACGGCATATTAAATTAAAGCGTCTGGTCGTT:1 - chr2L 3955791 3' + R2-element 3126 1 53.47 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTTCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTG:1 - chr3L 8749989 3' - Doc 56 1 79.17 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATATTTTAGGGGTAAAA:1 + chr2R 16639719 3' + opus 461 2 69.31 CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTAT:1 - chr3R 4973112 3' - 1360 3388 2 52.48 ATAATAATAATAATAATAATAACAATGCAATTAACAATTACAATTATTATGTTGGCATACCTACGGGTTAAGTCCCATGTTGGGCGCACAAATATCTCGCC:2 - chr2L 4744024 3' + mdg1 29 8 53.47 AATATGTGTGTGTGTGTGGGTGTTAGACCAATATTTTTATGCAAGCCAGTAGCAGCATAGATTAGTTGTGCATATCAAATGGCCGAAAGGAG:1 + chrX 4838610 3' - accord 7030 2 89.13 GGTGTGAGTCGAGTGGTAANAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGGACCTTTAGGTTAATCGAAAAACTTTTACCAAATCATTCCGGCAAATTGCCA:1 + chr2R 18073312 3' - hobo 24 1 55.45 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATA:1 - chr2R 5064833 3' + Stalker3T 203 1 68.32 CTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTATTAAAATTTCTACGGTGCAACACACAACCGACCCTCACACAGATACTCGCTGACACACACACACACAC:1 - chr2L 945737 3' - BS 4806 1 69.31 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACATATGTAGATATAAAGCCTTTCATGAAGTGCATGTTTGAGCATACA:1 + chrX 915619 3' + flea 4989 2 56.44 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCATTGAGTTGAGTCGGCTGCATTTCAAATGCGAGTGCATAATGCACTA:1 + chr2L 13310308 3' - mdg3 5283 2 52.48 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCC:1 + chrY 311345 3' + 1360 3379 2 53.47 TAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTCAATTAAAATTTTACACACGAATAAATGCAAAGCCACGCCCAGCACATTAGATTT:1 - chr3R 15530040 3' - mdg3 5271 2 58.42 TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCCGGAATCTGGTTCTACCAATTATAACAA:1 - chr3L 10283549 3' - Doc 80 1 72.28 CCTCCACCAGCAAAGTTAAAACCGCTGCAATCTACACACATTGATGCGCGTGTGTGTAAAGGATTTATGAGCCTACCCGGTTGCACCTACTTTCACGGAAC:1 - chr2L 16696214 3' + HeT-A 6061 2 50.50 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCG:1 + chr2R 22269178 3' - jockey 4719 1 76.24 CTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAAAAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTATTCTCC:1 + chr2R 14848993 3' - flea 4725 1 65.91 TTTTGGGTGGTTGTAGGGCGTTATAGTTCGTGTTTCAAATACGTTTTCTCTGGTGTTTGGTTTTCCTACGCGAATTGCATCAGCATTTTATTGGACTC:1 - chrX 2546039 3' - INE-1 344 1 71.43 TTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTTCGTAAAGAAATTCCTCGGATTAAC:1 - chr2R 18096512 3' - R1A1-element 269 1 75.25 TAGATAGGCCGTTTTCGTTCACGCGCACCTTAGCGCGTCTGACAACTCCACAAGCTTGCGCTTGGCCTCCTCGTTCTCCAGCGTCATGTTGGACTCCAGG:1 - chr3R 24130692 3' - aurora-element 3951 1 58.00 CCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAATTCGTGGACCATTCTGCCAGTGGTTAAGGAGAAGGATGACGGACTGGAGGCGA:1 - chrX 16095519 3' + Tirant 13 2 59.00 GAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATGTATGTTAGGGTCAGGTTCATT:1 + chr2L 6170180 3' + invader3 264 2 64.29 CCGATGTTGTCGTATTTCATACACCCGTGGGAGCGACGTGAGCAGAATATTTAAAGCTATTGTTATTGTTTGAAAATCATCTCATTCTCTTACTTTATTA:1 - chr2L 2592741 3' - gypsy2 33 2 67.00 TCGAATTTTTGAAATTTGAAAGGTGGAATCGTTTGCACATTTTTTACTCGCTCCTTTTTTTTTATTCACATTTTCATTGCAAGTTACCTGGCAATGCCTTT:1 - chr3R 10990578 3' + FB 28 1 66.34 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGC:1 - chr3L 2029686 3' + roo 9046 1 51.49 TATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGA:1 - chr2R 6438334 3' + Stalker4 392 1 64.00 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCAAAGCGTCTAAATGGACACGCACGGCTAACCCAAAAAACGGAGATAACGGTGAAGGGGTGTGCGTTTTTGACC:1 - chr2L 14970034 3' + hopper 1414 2 78.22 CCCCGCCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAATCGCTGCAGGCTGGCGGATCAAATGGGCATTTAATTTGATTTGTGGCTT:1 - chrX 13377723 3' - INE-1 553 1 65.12 CTTCACTACTCCGAGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCGAGTCGCCGACGGACTTCGCGTAGCTAAGAAAGGCGGCCAGGAAGCAAATGGA:1 + chr2R 21126407 3' + G-element 302 1 55.00 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGAGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATA:1 + chr3R 22520951 3' + opus 7483 2 52.87 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATAGAAAATTAACCCAGTTCGCACGTCTATGCCGAAACAAACAAA:1 + chr2L 20330097 3' - 297 27 2 63.37 AATAATAAAAAAAACAAAAAAAAAACAGTCGAGTGTCAAAGGTCAGCTTCTTCTACGGCCTGGGAGGCGACTTTAAATGCCAGCAACAATAAAATGGAAAA:1 - chr3R 13991006 3' + Rt1a 5075 3 73.27 ACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAATATAACCCAAAATAGGAGGATCCCGCCCCAAAG:1 + chr3R 24558775 3' + hopper 51 1 67.33 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTGT:1 - chr3L 10811580 3' + Juan 4166 1 83.17 AGGTGATTATAAAAAATCAATTTAAATATTGCTTATCTGCGAAGAATTAAAATTAAAAATTTAAACTTTGTAAAATCCTTTTTATTATGTGCCTACAGAAT:1 - chr3R 25167561 3' - S2 437 1 75.25 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCCCTTATTCACCTGCAGCCAGCTGGAAATTTCG:1 - chr3R 9074063 3' + hopper 1372 1 67.33 AGCGGCAGCTCGTCAACTCNGACTAAATGTCACATTTTTATTTCTTACTCTTGGCCTTTGGGAAAGACCAAATAGTTATGTAATCGGAAAATTAAAAGAAC:1 + chr2L 18689633 3' + Gypsy6A_LTR 195 1 48.51 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTTTTACAGGGGGGAGTACCGGACGATGAAAGTCTGACC:1 - chr2L 19567492 3' - pogo 36 1 63.37 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATTAACGTTACGGATATTTTCCTACCAAATTGCAAACACGGAGAG:1 + chrX 22597252 3' + hopper 1406 2 70.30 GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTATACTGGAATACCTTTCTATTAATTCGTAA:2 - chr3R 19446645 3' - HMS-Beagle 6817 2 63.37 TCATTAGTGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCTGAATAATCGCTTCCAAACAGCTAACATCAGCA:1 - chrX 486666 3' + 1360 410 1 67.33 CGCCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGACTCACGACCAGCTGTCCCAAGCGCTCAAAATGGACCTGTCGATGCAACAGCTTCCTCGGCTTTAATCACACCAGC:1 - chr3L 3797977 3' + BS3 127 1 75.25 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTATACTCGAAAAGGCTTTTTTCG:1 - chr3R 11814504 3' - blood 52 2 75.25 TATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCACTTGCGATGCAGACGTGGTGCAGTTCGAGTGGTTTTCGGTGGTTTTTGTCGTACTGGCTCGCAGTCTTTTT:1 - chr3L 19288478 3' + diver2 4588 2 61.39 TATTGGGGTGTATATGTTGNAAGTGTATTAGTATGTAGGCGTTAGGAGAGAAAGAGAGTAGAACATTGCATACGGAAAAAATACTTTAGTTGAAAAAATCC:1 + chr2L 7647597 3' - Idefix 55 2 70.30 CGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCCAAAGTTGGTTCAAGCTAAGTTTCGCTGGAAAGTTGTCGATTTTAATTTAATATAATATAG:1 + chr3R 12599373 3' - BS 10 1 63.00 CGTTCGATGTCTCTTGTTCNCATATACCAAGGAGCCCCCGAAGTTGAGTAACTCTGGCATGTTTATAATGCTTTTGTGCCAGTAAGTCTGTGCG:1 - chr3R 18541235 3' - jockey 4578 1 48.94 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAGGGAACCTCCAGGGCAGCCAAGGTCAATTTGACGGCACGAACTGGTGGACTTGCCTCCAAGCCGT:1 - chr2R 18406974 3' + mdg3 5497 2 74.44 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTGGCAACGACAAAATAGCCGCATGCTGTCAATCAATATGC:1 + chr3L 15745412 3' + hopper 1384 1 57.43 TTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATAAACCCATTATGCTTTCCCTTTGTAAGCGTGTCATAATTCTACAAGTTTAATTAACAAAAGATACTT:1 - chr3L 5736932 3' - 1731 4270 1 63.37 GAGCCCAAAATTGTAAGTCNTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTTTTGAACTCCTATCTAATTTTGCATATTTCTCTTGTATTGATGTAC:1 - chrX 11624352 3' - roo 8692 2 53.47 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTAAGGAGGACTTATACACCCCCTGCTGTTGCTGCCAC:1 + chr3R 22237084 3' + 297 6942 2 69.31 TGTGTGTATGTGTGTGCTCATGCAACAATGGAGGAGGCGATGGGGCCGAAGGGGGNNNGGCAAAGAGGGCTAAACGACAAAAGCTGACAAAGTGA:1 - chr3L 15865249 3' - accord 7026 2 78.95 CATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGCGGCAGCGCCGACGACTGTTGCTTGGCGTAATGTCGAGAGTGTTTAAAATGCATAAAAAGA:1 + chrX 2287719 3' - 1360 3275 1 73.27 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATATTTTAGGGGTAAAACTCACTCAA:1 + chr2R 16639728 3' + opus 470 2 60.40 TCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGATAAATTGTTCTACTGGGTATAATATAGTCGAAGCCAAGTCCTCTAACTGTTCGCTATA:1 - chr3R 11077636 3' - flea 4721 1 68.32 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTGGTCGGCTCATTTCGAATTCATTTCCATATCCTAGCAATCTTCCTGAATGCGGCAAAAAA:1 - chr3L 22489982 3' - F-element 23 1 62.00 GATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAAGAAAAAAATATGCAAAAATA:1 + chr3R 9359386 3' + Cr1a 4215 1 71.29 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAGCCCGAATCCTTTATCCTTCAGTCGAGCTCTAGTCCTAGTCCTAGACCTAGACCT:1 - chrX 4279477 3' - blood 20 2 59.41 GTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTCTTCTTGCTATTTTCTTTTCGTATAAATATAGTTTCTGTGTAGTTT:1 + chrX 11221780 3' - Porto1 238 1 57.43 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGTGGGGAATAAATATTCCGCAAATGTGGTGTTCATAAGTGTGGCCAAAAGGGGCGGAATATTTTTA:1 - chr2R 21112090 3' - jockey 4748 1 63.37 CATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGG:1 + chr2R 14849015 3' - flea 4714 1 56.57 GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTACTACATCAAATAAATTCCATGGCTCAATAAAATAGTGATATCGTA:1 + chrX 16471261 3' + mdg1 7371 2 59.41 TCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAGGACGTTTTGTCAGGAGCTATGGATCTCAGTGGTGCCC:1 + chr3R 16326576 3' - F-element 385 1 62.38 GAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTTAAAATGGCCAAGTAGTCATGAAAAGAGTGCTGGTTATTTTGATGCTAGCTCACTCACTTCAGCCGCCTTA:1 + chr3R 29025003 3' - S-element 1685 2 59.41 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACGGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCAC:1 + chr3R 30284275 3' + blood 339 2 61.39 AGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAAAAAAAAAGTGTCATAAGACCGCCCCATAAAAAAACAAACACAAAAGGGGGAACTGAA:1 - chrX 1105693 3' + Bari1 462 1 58.42 GTCCAGAAAAAGTGGTCAAATTTCCCATAGTGCGCCGGCGAAGGGAACATCGAGAGAAAGGGAGGACACAAAACACTTACATAAAGAACAAAATCTGCGAT:1 + chr2R 24457828 3' - Transib-N1_DM 11 1 63.37 CTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAAC:1 + chr3R 5503394 3' - blood 50 2 73.27 TTAATTTAGTTAATATCTAATTTCCTGTTCTTGCTGCTTGGCGGATGAATCTGTGACTAATTCTGTTTTGTCATACTTAGTTGTTGTTGCTGGATAAAACT:1 - chr2R 5948723 3' - I-element 5242 1 76.24 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCGCCATCCACGTCCCTCGCAAATTACGTCACGAATCGACGAAGAAGTTC:1 - chr2R 13956834 3' - P-element 26 1 51.49 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGATACAGA:2 - chr2R 11664288 3' - Tirant 11 2 70.30 ATCCGCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGAAGGCACACATATGTGGCATATCCTGGTAATAGTTGGCATTACA:1 + chrX 14514022 3' + Ivk 5042 1 54.46 AAAAAGGAAATTATCCTGCCGCACCCTGTATTTATACGAATACTAAACTCTCACTCCAATCAATCGCTACCCCCCCATTTCATGAACATTCCTTTTAGGTC:1 - chr2R 2949233 3' + mariner2 885 1 73.27 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCATATCCCGTGCGGGTTGCCAAG:1 - chr3R 26350845 3' + hobo 2899 1 77.53 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTATGACAAGCGTCGGGGGTCGGGAAAAATTCTGGAA:1 - chr3R 29413050 3' - hobo 19 1 60.40 AGCAGGTGTTGAGCCAGGAGTGGCGTTTGCATACGTCCATCGACGGATCCAATACTTATTTACGACTTCCCGCCTCAAAAGCTCATAACGCGGCCTAATTA:1 - chr2R 7189220 3' + jockey 413 1 78.22 TTCCCCCCGTAGAAGTATGCAGCATTTTTTAAATCAAATGACCATACATCATACAAGACTGATAAAATCATAGCTTATGGTATATTTTTAAAATGTAGTAA:1 + chr2L 20062500 3' - Transib5 2817 1 89.11 ATATGTAGAATTTTTGATTTTAGCTTAAAAAAAAAATGTAATACCTATATTTTCTATATTCTTTTACAGTTACATTCAAGACAGTTACGATACAATATATT:1 + chr2R 13924590 3' - S-element 1682 2 63.37 TTCAAAATCAGTATGGAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCGAAGGTGAGTTAGCATGTC:1 - chr2R 5652484 3' - Tirant 8374 2 77.23 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATTGATTCGAAATTGAATTTCCCATTTTAGAACATTCGAAATTTATGTATAT:1 - chr3R 17952925 3' - copia 4894 2 53.47 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAGTTCTTTAAGTATAAGATGAGCAGAGTTTTTCTCAATGTAGAAATATTAATTAAAAATTTAG:1 + chr3R 28771436 3' - jockey 4774 1 56.00 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTGGTCTCGCCGTTGAATTGTAATTTCATTAAGCGGAAAGGATAATA:1 + chr2L 19290629 3' + roo 9040 1 55.45 TGGAAGTGCAATTACCCTCTCCACGCGAGGGTGAGACGGAGCGAATACTGCAAGACAACAGAAGAACAGATAGTGTCTGCTTGTAGATTTCAA:1 + chr2R 3381302 3' + baggins 79 1 74.19 CTGCCTTCAACTTAAAACGNACTTGTGTTCCTAATTGGAGTTCATCATTACAATGTACAGTAACAACTAAAGCTTTTAACGGATATTTTTC:1 + chr3R 15523359 3' + 412 463 2 58.24 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCGGTCCTCATATTTTCCTGCCAGAGTCGCTCGATTATTATTCATATTT:1 - chr2R 21454307 3' - hobo 27 1 51.49 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAG:1 - chr3R 14049366 3' - transib2 51 1 76.24 CACAAAAAGAAAACAAAAAACTACTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 22817787 3' + I-element 110 1 80.56 CCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTAGACCTAGTTATGGATCTTAAATCAACTTGAATATTGAGGTGCTGACGGTGCGATGTGGGTAAAAGTG:1 + chr2R 9757327 3' + X-element 4519 1 73.27 TGACGTACAAAATCGCGAANTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGTATATACATGGCCATAATGACCGCATCATTCACC:1 - chr3R 20892012 3' + invader4 288 2 63.37 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTGAAGTTTTATTAATTAATTGTGTGTGTTGTGTAATGAAATGGTGTATTTA:1 - chrX 354916 3' - I-element 33 1 50.50 CCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCATTAAACTAGAAACAATAATTTGTAAATTGTAATCTAAATAGTTCCTTAAGGTGCTTAACCATTAAT:1 - chr2R 21775673 3' + I-element 381 1 63.37 TAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGTAAATCAGCATAAATCCTGTGGTTTAATTT:1 + chr2L 17766410 3' + invader4 2671 1 70.30 TATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCCCTTTTGAAATCACCCACCCAAGAGGGCCACAAATTTTGAGGTCAG:1 - chr2L 12236546 3' - Circe 7197 1 56.44 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCA:1 + chr3R 28333584 3' - pogo 38 1 66.34 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTCGACTTTACTATACTCTAACGACTAAAACAACGAAGATGGATCA:1 + chrX 21469030 3' - pogo 30 1 58.42 CTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTTTATTGCACACTAAAAATGATCCACAACGGCATTGGATTGAATGCGAT:1 + chr3R 16533873 3' + X-element 4428 1 63.86 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGCAATTATGCTATAACATTGTTGAT:1 + chr3L 2424903 3' - jockey 63 1 73.27 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACT:1 + chr3L 13366429 3' - hopper 32 1 55.45 TGAATGTCCTTATATGTTTTGCCTTCCTTTTTAAAACTGCCACCCGCTTGGTGTTGGCATCGATTTACAGAAACTAATGGCCATCTTCAACTTTGGTATGA:1 - chr4 843397 3' - HB 415 1 62.38 TAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCAGGTCTATAAATTTCGATATTTACTTTTTATATTGCAAAAATTTTTCTGCTGACG:1 - chrX 1546475 3' - roo 273 2 64.36 AGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATATACTGAATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGAATTCTACTTTAAACACAGTTG:1 + chr3L 19340849 3' + Tc1 191 1 76.24 ACTTTTGTTAGCCGGCGGGCCTGAAAGGGGTCACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTT:1 - chr4 353466 3' + BS3 1685 1 79.21 TATTTATTCTAACTTACATTTAACAAAACAAAGAAATGTCAAAACGATTTTTAAATGTGTGGGTGTACCAAATTTTTTTGGCAACTCGATAGAAATTTAC:1 - chr3R 31957624 3' - Stalker 261 4 76.00 CTGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGCATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGTCAAGTTAAACGATTGCTTAGATTAATATTCGCTTGATTACT:1 + chrX 19810298 3' - INE-1 17 1 69.31 CGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTACACACTATTATTAAGAATTATATTTAAGGCTACGAAAGCCACACATGATAGTTAGCGAATTATCACCA:1 + chr2L 23403016 3' - gypsy6 10 2 69.31 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCTTCAAACGTATGCATGTTCATGT:1 + chr3L 15390390 3' - pogo 51 1 77.23 AGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCTTTTCCGCCTCGCTCATTGTCGTTCCT:1 + chr3R 24050626 3' - micropia 5341 2 74.26 GCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCTGCGGTGTCCTCTTGGCACCTCCTGCA:1 - chr2R 4997833 3' - 1360 3246 1 73.27 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATACTCGTATAACATACGTACGTAAAAAAAGAAGAAACTCAAGTCATTTATCTTGACAGGAATT:1 + chr2L 10942396 3' - 297 8 2 69.31 GTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGGGAGACCTAGAGACGGGACACTGATGAAAAATCGAAACTTTAATTGTTGCCAATTTG:1 + chr3R 7134567 3' + blood 498 1 70.79 GATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATA:1 + chr3R 14049402 3' - transib2 123 1 52.48 ATAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGAGCACAATGCTAGCGGAGTGCAGACGTCCCAAA:1 + chrX 19076836 3' + rover 383 1 67.33 GGACGTAGAGTGCGAGTGGNGGGCTGCAGTTCTCTGTTATGCACTTCACTGATTTTTATTTCACTTAACCTTGTTTGCCGCTCTT:1 + chr2L 9969568 3' + hobo 2924 1 57.65 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCTGACCCATTCATTACCATAAAAAGCGGAGGGGG:1 + chr3R 11941228 3' - Doc 51 1 65.35 ACGATCTGCGCAATTGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAAGAGCGCATCGCCGCTTTTGCCCTGCTTGCTCTTGAG:1 - chr3R 7310708 3' - jockey 87 1 61.39 GGTAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTACAGTGGACGTGGCAAGAATTTTTTTTTTGCAAATCGATGACTATTTACAAGACTAATAAAAATGTGTAAAAAT:1 - chr2L 22063436 3' - INE-1 349 1 71.29 TGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCTATATGTGTTTGTGCACGAGTGTGAGTGCTGGCTGCTTGGTTTATTTGGCCCAGACAATTGGCCAACTGGCTC:1 + chr2R 7201852 3' - accord 188 2 72.00 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGCTTTTGCGGTTTTTTATTAATCCTTTCTGTGTACTTCTGTGTTAGAGCGACAAATTTACGGTTTAC:1 - chr3R 4705099 3' - mdg3 5312 2 71.29 AAAAATGCATTACGATTATTACAATGTAGTTTAAATATGTCTAATATCTTACAGGCCGTAAAATGAAAAGTTCAGCCACAAACAAGTGCTGGCAAAACAAT:1 + chr3L 20032347 3' + Tabor 484 2 76.24 TCTCAATTGGTGGCATATANTGGTTTATTACAAAGTATCTGCTAGATACCACTGTGCGGAACTGGGCCACAAATTCACACGCAGTGTGTGACAAAGGACTT:1 + chr3R 6761089 3' + blood 7379 2 72.28 GGCTATTGATCCTGATCAAAAATATATATACTTTATATAGGCGAAAACGTTTCCTTCTGCCTGTCACGGTCGCCATGTGATAGGTTCAACAAGTAGTACG:1 + chr3L 24104299 3' - INE-1 87 1 67.00 GAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTTTACATATATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTCCTAGTAATTTTATAGTTGTGAGCCGCACTTCCTT:1 + chr2L 14979259 3' - Ivk 1 1 76.24 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTAT:1 - chr3R 29413083 3' - hobo 52 1 73.27 GAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTTGTTAGTTGCTGCTTGGTGATTGGTGATATCAAATGATTGAC:1 + chr2L 15728366 3' - Doc 388 1 64.36 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGTACGACAAAGGACGACAAAGGACTCGGTTGTGTGTGTCTGTTAGTGGGTGTGTATGTGTGTGTGGCAT:1 + chr3L 3911649 3' - hopper 6 2 71.29 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATTGAAGTGGTATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCAAGACACTTTATAGCTAAATAAATGTTGTAGCT:1 + chr2L 7552496 3' - I-element 12 1 49.50 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCACATGCCAACGAGATGGAGA:1 - chr3L 6619790 3' + 412 7494 2 77.00 TGTTCCCAATGTTCTGATTNGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAGGCATATAA:1 - chr3L 2016873 3' - Tabor 6873 2 54.46 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCGAACTCGGCTCCGAGCTCAAATTATATTACCAAGACCATTCCGACCATGTGCCATGTGATCCC:1 + chr3R 10168188 3' - FB 14 1 63.37 GAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCCATGTATAGAC:1 + chr2R 1922482 3' + gypsy 415 2 70.30 CTACCGACTGCGCAACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTCTATGACGAAGACACAAACAAATAGTGAGAACTCAAACCCTATCCAA:1 - chr3R 3374385 3' - rover 360 1 67.33 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGTACAGTAACAACTAAAGCTTTTAACGGAT:2 + chr3R 15523352 3' + 412 446 2 72.28 GTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCTTTGTATGACCAAAGCAAAGACACTTGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGAGCATCATATCGTTTTGATGCT:1 - chr3R 3626138 3' + 1360 461 1 77.23 GAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATTGTGTTTTGTATTGTATTTCCTGCAGGAAATTAATGGCGACACTTTAGTTGCGCTCGATATTGTTTG:1 - chrX 9829430 3' - Tirant 225 2 70.30 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGAATCAGCTTGAAA:1 + chr3L 13366416 3' - hopper 44 1 68.00 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGTGTGCCTTTGGCTCTGATTGTGGCTCCATCTCC:1 + chrX 6388349 3' - hobo 15 1 64.36 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGAGGATGTTACTAGAAGGGCTTCTTCTATTTATGGG:1 - chr3R 3005968 3' - Ivk 42 1 62.38 CAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTTTTCAAAGAATCTAGTATACCCTTTTACTC:1 - chr3L 23746964 3' - invader4 43 2 68.32 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAATCCCTTTACACGTTTTTATAACATTTCGAAAATGT:1 - chr2L 21786708 3' - Max-element 8278 2 66.34 CTCCATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCAAGGGTTT:1 + chr2L 2622795 3' + blood 368 2 69.31 TTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTGGCGTAACGTAAACCTCACTCGTAATGCTTACACCTACACTGTGTGTGTGCCTAAGCCTTATCTTATCTAATCAGTG:1 + chr3R 18170319 3' + 1360 299 1 51.49 CGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAAGTGCGTTGAGCATTTATCGTTCGTGGGGATTTGTTGGCTTACATTAAATTTAATGCATCA:1 - chr2L 19265101 3' - TAHRE 10084 1 61.39 CTAAGAAAAAGAGCAAAACAAAGCAGGAAAACAAAATATTAATAATCAATAGCCCGCTAAAAGGCATCGATGGAGTCGGTCGAGTTGGTCGCGATGGTTGA:1 + chr2L 11213013 3' - S-element 250 1 81.19 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGG:1 - chr3R 30284219 3' - blood 39 2 65.35 CGTTAGCATTCCAAATAACNATTTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACG:1 + chr3R 11547791 3' - G2 279 2 72.28 GGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTTTATGGGTTGTTATTGGGTGCTTTTACAAATTTGA:1 - chr3R 24015324 3' - Doc 4542 1 71.29 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTTCTT:1 + chr3L 25345162 3' - Doc 35 1 52.48 AACTGGTAAAACAAAAAAAAAAAGTGTTGAAACTATTTTCAGAAACAAAAACCTAAAATTCATCACTTAAAGTCCTGAAAAATCATCCGTAAATTGAACGT:1 + chrX 15021909 3' - Tc1 1477 1 79.21 CCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTAC:1 - chr3R 4973105 3' + 1360 8 2 45.54 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGACTTGCTATCTGCGTCGCCATTGTTGTGTCTGTGTGTGCGGTTATAAAAATTAGCCTCATTTTGTTTGGCT:1 + chr2L 17308044 3' + hobo 2935 1 75.25 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTT:1 + chr2R 9871579 3' + roo 9047 1 54.46 AGAAACCCGAAGGACACGGAAGGACGATCATGAAAGAGTGAGTGGGGCCGAGAGGGGGAGGGGGTCTGAAGATGCTGTCAAGGTCGTTGGTGTTCGCCTT:1 + chrX 11506416 3' + gypsy8 494 1 69.00 GATTTTTCCTTAAATATATATATTTAACTATTATATTTCGCCAATTAAGTGATCATAGAAACTCTTAAAAGTTCTTCCTAAAAACCTATGAAATTCTTTGT:1 + chr2R 10556019 3' - TART-A 13347 1 47.52 TTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAAAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACGAAAAAAAAAAACAAAATAGCACTG:1 - chrX 12038842 3' - Tc1 1546 1 85.15 CTCCGAGCTTTGAACGTGGNAACGTGACGATGGGGTTAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTGTTGCCATATGACGACTGCGACTGGCGACTGGTGCCGGGCTG:1 + chr3L 13430715 3' - Idefix 7065 2 55.45 ACTCGCTGCTGCAAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATATGCAATGTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 9224361 3' - rooA 7537 2 82.14 GTACCCTCGATATATGCACNTACTACAGAGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGTGACTCAATCCAAATAGCCCGATGTCTAAAT:1 - chr3R 28447355 3' - blood 7017 2 71.43 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGATCACACCAAACATCCCCCACAAAATAAT:1 + chrX 20844338 3' + copia 243 1 68.32 ATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGACCCAAACTGTAGACGCCAGTTTGTCGACCGCCCAAATGTCGCAGCATACTTTTCGGCGTACGCTGTTAAACTATTA:1 + chrX 14961111 3' - jockey 4635 1 75.25 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAATAAAACACAAGAAATAAGAGGTGGGTAAGGAATTAAGAATGGGCAAGGGTTTCCGAGTGCA:1 - chr3L 14301554 3' - roo 8675 2 68.32 TATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGAAATGTGCGAGAATACTAAGAATAAAAAGCAAGAAGAAGCATAAGG:1 + chrX 8533989 3' - hobo 2711 1 54.46 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAAGTATATACCATCTGCGACAAAAGG:1 + chr3R 6171192 3' - 297 6627 2 78.57 GGGTAGGGGTTAAGTATGATAAGTCGCTCGGTTATCTGCGGGGAGCGGCGGG:1 - chr3L 3929381 3' - G2 2958 1 69.23 ACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACCCGACTCTACTGCTGCATACATTCGGGCGCTTCGCTCGGGACACATTGCACATA:1 - chr3L 21192494 3' - flea 156 1 57.58 TCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTTGTCATTGGGTAAAATGAGTTCGGACAGCGCGGAGGTAAGTCAAAGTTTGTGTTTTATTATGTTTATGTGTGT:1 + chr3R 4512383 3' - flea 4756 1 80.20 GTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTGGGTATGATAGAAAGGGGCTTTGTTGTAGTTCTGTTTGAAGTACGTATTTAAGTGGC:1 + chrX 17172072 3' - I-element 5120 1 62.38 CGCACGAGCGCATTCTGCACGCTGAGAAAGATTTTCCCGTTTGTGTATCTTCTTCTGGTCGCTGGGCTTGCGAAAACTTAACTTGCACGAAGATCA:1 + chr2R 23568826 3' - Cr1a 342 1 76.04 CCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGAAATATATGGAATTTAAAAACATATGAATTTTATTTACTTTTCTGAT:1 - chr3R 30284182 3' - blood 7013 2 74.26 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTCTTATAGAGCTTTGCTAATCTTTTTCATTGCTGGCACTTTAATAACCGCTCCTTC:1 + chr3R 27199856 3' - roo 8683 2 60.40 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGAGATATTTATTTCTGTTTTTTGTATTGGGTTACACTAGGCTATAT:1 - chr2L 15332598 3' - jockey 9 1 75.25 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGAGACCTTGGCTGGCATAAAAATAATATTGGGCAATGCTT:2 + chr3L 7463339 3' - hobo 37 1 59.41 TTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCTTTTTGTTTTAAATGTGATATTATAACAATGTTTCAATTATA:1 - chr2R 705595 3' - Bica 117 1 58.42 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGTAACGTGAATGTGGATGCGGGAATGGTTTG:1 - chrX 15599647 3' - jockey 4746 1 70.30 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCA:1 - chr2R 15160279 3' - Tirant 8120 2 67.33 AAAAATTAAAAAAAAAAATTAAAATGCCAGAGAGGGAAGTGCTAAACAA:1 - chr3L 7809945 3' + Doc 4697 2 91.84 TATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCA:1 + chrX 21772490 3' - springer 61 2 52.48 TTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATTTATATTTTAATGCCCTAATTTTGTTTGCTCCATTTATA:1 - chr3L 13204366 3' - I-element 5149 1 60.40 TAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGAAGTGACAACCCGCAATAAAAAATATGAGTATTG:1 + chr2R 8267527 3' + R1A1-element 275 1 67.00 AAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGGTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACTTTCTACAACTGATAACTAGAA:1 + chr2R 13315948 3' - pogo 1785 1 76.24 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAAATGAAAGGTTTGTTTTGTTCTTT:1 + chr2L 16016285 3' - I-element 5 1 72.28 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATATCGGGACACCCTGTGACCATATTTCACTTTCGCAATTCTCTAGTTC:1 + chr3R 10026304 3' - FB 28 1 53.47 AAATAATTAAAAAAAAAAAGAATACTCAGTAATTTTGAATTTTCACATACGTGCAAAATATGTTTTCGACCAATTGACGATACTACTTATTGGCTATTTAA:1 + chrX 14367321 3' + BS 5098 7 72.28 CTTGAAGACGTGCGTACAAGTTCTCAGGTCCTTACAAATGAAAACAGGTGGTTTAGCATGATGCGCTGCCGGTGGCGTCCAGGAGTTATGGTAACCGATAG:1 + chr3L 7317417 3' - Chimpo 3946 1 68.32 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATCAAAATTCACTTTTCATATACAACCTACCCACC:1 - chr3R 20432410 3' + roo 9028 1 71.29 GGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGGTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATC:1 - chrX 4349889 3' - G2 3000 1 70.30 CGATTCATTTACATAAGATNTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACCAAAAGTAACAGTAAGTGCAG:1 + chr2L 7714561 3' - roo 54 2 81.19 TGCAAAGAAAATGGATCATCGTGATCCGAATCCGTGTCGCTATCACTGCTTCTTTTAAGTTTCCGATTGTGAATATGTTTTTCTTTTGATAAAGCATAATA:1 - chr2L 22685706 3' - transib3 2567 1 56.44 TGTTATTATTATTGTTATTNTGTTCGTATATACTACACTGTCAGTCGGAAATGTCTTTCTCTTTTTCGGCCCACTGCCTTCTTTTATCATTGGAATAATGC:1 - chr3R 30220172 3' - mdg1 16 2 63.37 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGCGGAAAAGCGAGAGGGATAAAGTGGCAGAACGAGATGGCGAATGTGGGTCAACTACTGCGTTACC:1 + chr3R 9094835 3' + hopper 1409 2 73.27 ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATTGTATATACTCCAATCGTTTTTCCGAGGGCAAGCAAAGCCAAGGTCCCGGACGAAAAGC:1 + chrX 8308822 3' - opus 9 2 70.00 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAAACCAAGCC:1 - chrX 1157619 3' - 297 6628 2 76.24 GCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAAAGAGAAATATTGTCTGCCATTTTTAGTGAAGCCTTGGAGTAGAGAAACTATTTGGG:1 + chr2L 5647436 3' - invader3 14 2 60.22 ACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAGGATGATTTACTGAAGAAGTGTGTTTTAAAAGGATCATAAATTGTGTGGTGTTTTGTATACTGCAAAT:1 + chr2L 16937206 3' - copia 5023 2 74.26 GAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTAGGGTCAAGTGACATTCTTTAATATAACTGCCAGCATAATGGTCAGCAAGTGGCGTGGTGAATCCGAAAAGAT:1 - chrX 3315418 3' + flea 4642 1 70.30 ACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGCGGCGACCATCTGGTGCGGCGTGGCCAGGTGCAGACCGCCGCCCAGCAGGCTGCTGGACGTGCCATT:1 - chrX 9754886 3' + accord 31 2 76.29 TCTTCTTATTTGGGATTTTNCATTGTAAAAGCAAGACACGTTTTTAAACTGTTATATATTTATTAGTTCGTATCTCTAAAATGAATCTTTACATTTGTCAG:1 - chr2R 13577213 3' + roo 408 1 70.30 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGCAGTGTCAGTGAAAGTGTGGGAGTGAGCGAG:1 + chr3R 23803887 3' + P-element 2843 1 35.64 ACCAGCAAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGCCGTTATGACTACAGATTTAGGTCCTAAGTTTTAACA:1 + chr2L 16353663 3' + G5 4499 1 71.29 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAA:1 + chr2L 16016262 3' - I-element 28 1 54.46 AAAATAAAAAACAAAAATGGGGCGCGCCTTCGTTTGGCGGGGGGCTTAAAAATCGCTTCCAGCGTCTTTGATACTTTGGAACCAAAGCCCAGAGACAACAG:1 - chrX 4587703 3' - hopper 139 1 78.22 TCATTACGTATATCTTCGTTCCTAATGTACCATTAGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTTGTTTATAGTTTGTTTAATCTTTATAATACTTTTGTAT:1 - chr3L 7819928 3' - Porto1 4381 1 62.38 ATTTTGTTTTCTATTCAAACTTGACCATTTCTAAAAGAAAATATTATCCAGCATCACAAATTTGCAAATTTTGGACACAATTTTTTTGTTGCATACTTTTT:1 - chr2R 11778436 3' - P-element 445 1 78.22 GAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCT:1 - chr2R 20520218 3' - Max-element 50 2 73.27 ATCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCTCATCTATTGGCTCAGAATTTAAATTTGCGCTTATAGATACCGGTGGTGGTGGGGGCGGTACAGTTGGTTCTGGT:1 - chr3R 1845644 3' - Cr1a 4414 1 73.00 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCGAAAAGCGTATATGTCCCTGCATACATACATATATACATATGTACATAATTGTACACATGACAACAGGAGCC:1 + chr2R 21454414 3' + hobo 2935 1 37.37 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTCGACTTTACTATACTCTAACGACTAAA:1 + chrX 21469013 3' - pogo 47 1 75.25 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGACT:1 - chr2L 13598186 3' - pogo 30 1 56.44 CTGGTTGCGCAAAACTCGGGTTCTGAGACCCAGAGACTAGTGTAATTGGAGCAATAGAGATAGCATTATTGAAAGCCTTTAAATTAATTATTAACTTTTCA:1 + chr3L 26010650 3' + R1A1-element 5069 1 70.30 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTNTCTGGTGTGCAACTAAAACTCGCTCTTGCACTTCCAAACTGGGGAAACAGCCACTTTGTTGCTGGTTTGGACCGAGTTGAA:1 + chrX 14979202 3' + hobo 2936 1 42.57 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACG:1 + chr3R 14049431 3' + transib2 2807 1 60.40 TATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCCCTTGCGCTGCTTGAGTCGCTTAGCCTTTGGCCTTTTGTGGCG:1 - chr2L 13637518 3' + micropia 204 2 71.29 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTTTTTTGAACGACCCGAGCAGCTGACAGTTGCGCTTCAGCATTAGA:1 + chr3R 10093760 3' + P-element 2860 1 50.50 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGCCC:1 + chrX 9439215 3' + roo 9026 1 79.21 TAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGAACAAGAAATTTTTAACTCTCACTGTAACTGACTTGTCCACTAACTGGCGTCAGACGGCTGTCGAATTTAAGCGTTT:1 + chr3L 19338574 3' + Tc1 105 1 66.34 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATAAGGAAAGCAGACTTTACTTTAATCAC:1 + chr3R 22520977 3' + opus 7495 2 71.29 ACATAAAAATTTAGACTTTNTGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGCGCGCTGGGAATATTGTTGAATATATATATACAACTAGCGGATGTGAATTGTG:1 - chr3L 25483061 3' - transib2 30 1 50.50 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTACCAAACGAAAACGAATAAACATTTCGAGTCATTAAGCAAACAAACAAAATATACCAGTATTTTTA:1 - chr3L 5512401 3' + pogo 2096 1 72.28 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTGAACAACTCTAATGAAAACCTATCC:2 + chr3R 28333615 3' - pogo 7 1 72.28 ATTTATTTGTGCTTTATCCNTTATATATATATATGCATATATCAGACAAGCGGAGTTAATCACGACTGCAGTTTGCGGAGAAAAACTCTCGAATAGCCGTG:1 - chr3R 18780052 3' - Juan 4203 1 77.23 TTTTGTAAATTGTATTTTGAAGATAAATATATATTGTGAAAGAGCATACATAAGGAACACCAAAACGATTTCGAAACATGTTCCCTTTGATGTGTTTGATG:1 + chrX 17509350 3' + transib3 45 1 70.30 GTCCCGGGTAACTGTAACACTTTACAAAACGGCAAGGAAAACAGAAAACATCGTAAGGCGTACAAGAACAACAAGGGCTACACATGTGCAAATAACAAGAG:1 + chr2L 2013921 3' + Doc 477 1 77.23 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAA:1 - chrX 21668025 3' + Tabor 434 2 73.27 TAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCGACCCGACCAAATATTAGAAG:1 - chrX 2911284 3' + hopper2 1556 1 74.26 TAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATACCCTTTTTTTATTCATTTGGTCAAGTGTCTTTTGCTGTGCTGATG:1 + chr2R 630576 3' - gtwin 29 2 52.48 GTGCAGTATCCTCTTGTTTGGACATATTCTTGACAGTTCCTGCATTGGACTGACCCTTTGCGCATACTCTACGGCGTTTGTCATTCAATTTTCAGTTATCA:1 - chr3L 12208413 3' - Fw3 487 1 62.38 CGGCATGAACACACACACANACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGGTGAAAGTGAAAATGAGATTTAGGCCTATTGAAGCT:1 + chrX 6233831 3' + accord 7023 2 63.37 GTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATCAATTTCATTGTAAGAAATAAATTGACCATTTCATGGTTATAAAACCACAA:1 - chrX 4349839 3' - G2 2950 1 79.21 TTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATCACCTCTTTCCTTATTTAAGCTCCCCTCTCTCGCGAGCTCTTTCTCTTGTACTATCGCACCTACA:1 + chr2R 4374869 3' + diver2 157 2 70.30 CGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTATGTAATTATTTGCAATTAGAAACCCGTCAC:1 + chr2R 20690566 3' - mdg3 5299 2 66.34 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACTGTCCGTGCGCAGTTCTCTTTTGCGCTTCATTCG:1 - chr2R 19424090 3' + P-element 2845 1 39.60 AAACACCGTGCGCATTTTAACTGGCCTTCTTACGGCCAAATTCATTGCAGACACATCCGGAGGTTGAGGAACACGCAAATCTCCTGCGACAACATAAATA:1 - chr2L 1435961 3' + baggins 5112 1 74.00 TTCTTGATCAGGATCACTAGCCAAGTCGATCTGGTCATGTCTATGAATGTGGTTTATAACAGCTAGAAGGACTTGTAAGACTTAAGCATTCTCTCTTGTTA:1 - chr2R 13565204 3' + INE-1 87 1 80.20 CTGAGATAACGCAGGCATTAAATGATAAGGGTTTTAAGGTAAAAATCGTCTTCAACATTCTGAACAAAGCCAAAAATGCGCAATTTGACTGTACGAAAATA:1 - chr3R 21938613 3' + Fw3 236 1 68.32 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCTCATTTGACAGATTCTCAGCTCCT:1 - chrX 14132093 3' + roo 357 2 75.25 AGTATCGCAAGACGCTGCGNTCAATCGTTATATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTTAC:1 - chr3R 3590973 3' + Gypsy6A_LTR 384 1 60.82 TATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCGCTGTCAACCACACACACACTTTATCCACAGTTCCCGTTTCCGTTTC:1 - chr3R 12873145 3' - opus 7274 2 53.47 ACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAAGGGTT:1 + chr2R 3550650 3' + Cr1a 4402 1 63.37 ATGCACATAAACTGCACCTTTCGCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATGCGCTTTCACAGCCAATCGCTAACTGCAGCGTTCTATTTG:1 + chr2R 17272005 3' + Cr1a 269 1 60.40 AAAAAAAAAATAATGGGAAAAAACTGTGTAGCCCATTGTGTTGTTCTTGTTATTTATGCGCAAGCACAATATGTGAGCAAAGATTAATTTTCTTTTATTTC:1 - chr2L 8230770 3' + Tc3 137 1 88.12 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGG:1 - chr2L 12884326 3' - HMS-Beagle 6840 2 69.31 CCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTTGAATTGTACATTTGTATGCTTATGAGTGTTTTAACTTTGTATA:1 - chr4 333598 3' - Doc 5 1 71.29 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTCGACTTTACTATACTCTAACGACTAAAACAACGA:1 + chrX 21469020 3' - pogo 40 1 68.32 ACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAA:1 - chr3R 1440171 3' - G-element 44 1 63.37 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTCGCGGCGTGATTTTAGATCATTAGCTCACCGGTTAGCAGAAATTCTCGCATTTTTCAGTCTCTCTTTTAGGA:1 - chr3R 10168076 3' - FB 3 1 79.21 CGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCGACGGCAGTGCAGCTGACCGGTACAG:1 - chr2R 6482636 3' + gtwin 475 1 77.23 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTGGCCCCCTCCTACCGACCGATGTCCAATGGCAGGACATAAATCAAAGGGAAGCAAAC:2 - chr2L 15331740 3' - 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chr2L 14980918 3' - hopper 122 1 62.38 TCTTTACTGTGTTTTTGAGTTGCGGACCAAAGGTGAGCCGTTTATCCAGGGTTAGCTGCCTCTCTGCTGTCCCTGGTATACATATACGCAACTCGACCATA:1 - chrX 21639997 3' - Helena 943 1 71.29 CTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTCTATTTACATTTCCACACTTTTGGCCAGGAATTATTTCTTGTACGAGAATTGAAAATGGCCAGGCATTGTTGAGTAGTT:1 - chrX 2291608 3' - Doc2-element 218 1 78.22 GTGTTGCTGTGTACTTATANGTACAGTGTAACCTCGATATATGCACATACTACAATTGAAACATTAAATGAACTCGGCGTTACAGCTAAATAGCTAAAA:1 - chr3L 27423362 3' - blood 7044 2 53.54 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGTCTGTGTGTGAGTGGGCTGTGAGCCGGCTTTG:1 - chr2R 20948374 3' - hopper 41 1 65.35 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCATTGAGTTGAGTCGGCTGCATTTCAAATGCGAGTGCATAATGCACT:1 + chr2L 13310307 3' - mdg3 5284 2 53.47 TTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGAACCGCAAATCGAAAATCAATTGTTACATGGGGACTACATTCAGGCGGGAGGATGGAAAAGGAACGAAGGACGTC:1 + chr3R 20462998 3' + mariner2 235 1 71.29 CCTTCAAAGCGAGCAAACATTTGTTGGAAGCTGGGTGGTGCAGGGCTTGCTGATAGAGGTGGCCGGTCTGGATTTGGTGGCTTGCTCTGCCTTTGCCTTTG:1 - chr2R 5893687 3' - G2 167 1 64.36 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACTATTTCGTTATCTGCACGTCGAA:1 - chr3R 13686577 3' + 412 7494 2 75.25 TTCTTGGCGTTATCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGG:1 - chr3R 24228898 3' + 297 346 2 73.27 TAGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGACCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTG:1 - chr2R 2146570 3' - I-element 177 1 56.44 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCGAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:1 + chr3L 25232906 3' - GATE 8272 2 48.51 AACATTTGTTCCATGTTACNGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTCTTTGTGTTTCCATAAAACTGACCCCATGGGCA:1 + chr2L 7357252 3' - G2 152 1 66.34 TATGCCTTAATAAATAAATTAAAAAAAAAATTCAAATCGAGATCGCTGAGTACGATTTTTTCTTTTCCAACTTACTTCAGTTTCTCGCAGTGCATGCCAAC:1 + chrX 11846667 3' + X-element 4708 1 73.27 AGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGTCGTCGTCGCGAACAAAAAAAATAATTTCCCCTACTTTTGCAGTTCTTTCTT:1 - 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chr2L 9523054 3' + P-element 2818 1 77.23 AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTTGAACCCCGAATCCTTATCAAAGATTCAGCTGTTCTATTGCTTCTGACTGGAAATTGCCACAGAG:1 - chr2L 5647336 3' + invader3 5452 2 67.33 ATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTCCTGTTCCCAGGACCCTGATCCCTGGCTCCTGTTCCTCCCTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTA:1 - chrX 7978949 3' - jockey 414 1 72.34 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTTAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCATTTTT:1 - chrX 9439169 3' - roo 41 2 69.31 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTGGATGCACACGAAAAAATTCAGGGCTTAATTCCACACAT:1 - chr3R 22237012 3' - 297 29 2 57.43 AACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGAGTTCGATCGCGACTTATATAATAATATGAATCCATTTT:1 - chrX 23431559 3' - G6 57 1 74.26 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAACACGTTTTTTTTTTGGAGCTGCGCTTTGCAAAATCGAACGAGCAGTGCAA:1 - chr2R 19616128 3' - hobo 23 1 56.44 CGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGCGAGTTAATCATTTGGCAGTGAGATTTTTTACAGAAAGTAAATATTTATTTATAGTAAGATAGAAT:1 + chrX 14458942 3' - 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Tc3 1301 1 53.47 TATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTAACTGTTTTCGCCGTGTGCAAAGCGATTCTTTTATTTGCACATTTTTTGGAGGCCATAA:1 - chr3L 4729622 3' - Chimpo 69 1 55.45 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGTCAGTCGGAAATGTCTTTCTCTTTTTCGGCCCACTGCCTTCTTTTATCATTGGAATAATGCTAG:1 - chr3R 30220169 3' - mdg1 7051 2 66.34 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGCCACGAATGCCCCGAGTACACCAGCGGG:1 + chr2R 8528278 3' + Transpac 296 2 61.46 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTT:1 + chr3R 19449388 3' - roo 8677 2 70.00 ATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATGTACATATCTGCGTGGGAGGCTTTGCTGGGAAGCATAT:1 + chr3R 20892067 3' - invader4 2800 2 62.38 GTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAAGTTTGTGAAA:1 - chrX 22426159 3' + 1731 296 1 62.38 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCATCGATAAATAATGATTTTTGTAGCATGCTTTCGGGCGCT:1 + chr2L 9287223 3' - 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hobo 10 1 68.32 TCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCCAACTAAAGACATACACATCGACATTTATTACGCGCAAAGTCTTATTTTCTTAACTGGTATTGACGCGTATTCA:1 - chr3L 24355099 3' - micropia 197 2 79.21 ACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGATTTAACTCGGGCTTATGGCATTTTTTAATAAATTTCCCAAACCATAGATGAGTACTCAC:1 - chr2L 19907893 3' + Tirant 371 2 51.49 AATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTATGCATAAATTGGCGTTAGTTAGTTAGTTCTCGTAGGTGCCGATGTAGGCGCTGCAGTTGGGGCAGTAG:1 - chr2R 22658980 3' + 297 395 1 69.31 TAAACATTGGTGACCCCGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCATTAATTAATGCACTTACCAGAAACGCTAAGAGGCGTTGAATGCGATCCATACCTTATT:1 - chr2R 5064734 3' + diver2 380 1 58.42 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTAACGATTGGCCGGAGTGGCCGGTGATCAATG:1 + chr3L 20079761 3' + mdg1 7416 2 67.33 TTGATACAGTGCTTATTCGNTATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCT:1 + chrX 21668091 3' - Tabor 6855 2 63.37 ATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTCG:1 - chr3R 21678310 3' + Idefix 7110 2 80.20 AGGAAAAGGTCACAAAAATNGCAGAAGCGGCTGATCACAAGAAAGAGACGGAAGAGTGAGTCAAGAAAGTGACAGTCCGAGGGCATGAGAAAGAGACAGAG:1 + chr2R 18074412 3' + hobo 446 1 66.34 ATGACAGAATTGGAACCAAGAAGATAAAAAAACAAAAAAAAAACAGATTGTAATTTATTAACAAGTTCATTTGATGTACGTAAGAAGTAGTTGGATTCTAG:1 + chr3L 19223490 3' + Porto1 4504 1 60.40 TTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCAACTATTATGACTTCACTTAAAAATCTTTATTGAACACCTGATTCTTTAGAAAATATTT:1 - 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chr2R 4634309 3' + S-element 1707 1 66.34 ACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTGCATGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 10376 1 78.22 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTGTCCTACTATAAGCGTTTTTCTTGGTGCATGCATGTTTGCCAACCGCTTT:1 + chr3L 11763261 3' + pogo 2080 1 51.49 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACATAAAACCGAGCGCACATGATAATTCTTCCAAATTTATATATAAATTTTA:1 - chrX 23431592 3' + 297 371 2 57.43 ATTAATAAAATATTGTAGAAGTTTTTCCATTGAAAAAATAACTTTTCAAGATCATATTGATGTGGGATCTTATATTCTTTGGGTCAACAACTTTAAACAAA:1 - chr3R 18917417 3' - S2 1392 1 88.12 TAGAGCCACGCCAAAAAAATCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTAGAAGCGTGTTAGCTATTGTGTCCAATAATACGGACGGTTTCATAGGG:1 - chr3R 22733032 3' - 1360 52 1 92.08 AACCACTTGAGTTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCTGATCGTCGGATTCATTGTCACAAATGAGGTGAGTTCACAATCGATTTGTAATCA:1 - chr2R 18808864 3' - Stalker2 7447 2 61.39 TTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGATAACGCCAAGAAATAAAAAATTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTA:1 - chr2L 22076770 3' - 297 379 2 62.38 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATACATATATATTAATAATGGTTCATTAAGAGATTTTCTCTA:1 + chr2R 13248781 3' - 297 26 2 65.93 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGTTCAAGCTGAAACTGAGGCAAACAAATGGAAACTAGCTAGCTGTTCCAGGT:1 - chr3L 20148226 3' + pogo 2078 1 56.44 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTGTCCTACTATAAGCGTTTTTCTTGGTGCATGCATGTTTGCCAACCGCTTTTCAC:1 + chr3L 11763265 3' + pogo 2084 1 54.46 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGC:1 + chrX 9439213 3' + roo 9024 2 81.19 CCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCTGGGATTTGTTTTTTATGTACTGTAACTAATTGACCTTCTGACTTTACTGACAAGGAACTAACTAGGTCATTGAG:1 - chr3L 17283557 3' + 412 344 2 74.26 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGAAAAGATCAACTCCTCTGACACTTTTAGTTCTACAGACACTGAAGTTTTGAGTGTTTTGTATTAATACGA:1 + chr2L 16164142 3' + pogo 2097 1 73.27 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATATATTTTAATACATTTTAACGAAAACGTTCGTTTCTGTTAAGCATAAGTAATACAT:1 - chr3R 6104352 3' + pogo 2088 1 66.34 TACTGAACTCGGCTAATGTTTCTCCGGAAATAGGGCTCTAAATCAACAAAGACTAGGTTGAGGAGCTTTGTTTTGTTGGAACGTCTTCTAGGTC:1 + chr2R 5640653 3' + Gypsy12A_LTR 1879 1 63.83 ATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCCCCATTCGCCTAACCCTTTTCCCTTTT:1 + chr3L 9220160 3' - BS 45 1 71.29 ATAAAAGAGACACGTGAAANTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAGGGAACCTCCAGGGCAGCCAAGGTCAATTTGACGGCACGAAC:1 - chr2R 18406997 3' + mdg3 5463 2 57.43 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATTAGCGCACGGAAGCACACATCAATCAAAATCGAACGGATATAATC:1 - chr2R 19352194 3' - 17.6 6954 1 55.45 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAACAATTTTGTT:1 + chr3R 5503403 3' - blood 41 2 65.35 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGGTCTTAAGCTGCTGGCACCGAAATGCACTAACCGCTTCCGTTTTTTGAAAAGCAACTGA:1 + chr3R 20696543 3' - jockey 27 1 58.42 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTA:1 + chrX 19034161 3' + hopper 1362 1 76.24 ACCAAGCAAGATATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAAAAAGGGTTGTATGCCAGGATTTGATTTGATGCCGTGATTTCCTCTTTTGT:1 - chr3R 17238320 3' + I-element 5076 1 55.45 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACTATTCGCTTGAAATACAAAAACTTTGTCGAGCAACT:1 + chr2L 3985175 3' + roo 403 1 81.19 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATTATGAGCGCAGTCACACATGCACATAAACGGAGCAGTTCAAATTAAATGTAGCATACTTTTATGGG:1 + chr3R 26292628 3' - jockey 21 1 60.40 AATTTTTCTGGTATATCAATAGATCTTGGTGAATAAAATTAAATTAAAGTGCTAATAGGCTAATACATACATTATTATATGCTGATACATTTTCCATATTC:1 + chr3L 22982478 3' - INE-1 502 1 63.37 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGAGCCACAAAAAATGCGTAACAATGCCACCGACTTTAAATGTCAGCCCGAAA:1 - chr3R 11118012 3' - BS 6 1 60.40 AGCAAGTGAACATAAAACATAAAAACATTAAAAACATTAAAAGTTGTTTCAGAGTTGATCTTTGTCGTCGTTATTGACGGATCATTTATTCGACTGACAAA:1 + chrY 473358 3' + I-element 459 1 61.39 CTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCTATAGTATTCATGATGCTGCCAAAAATGAAAGGTTTGTTTTGTTCTTTAAT:1 + chr2L 16016288 3' - I-element 2 1 75.25 CCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTCTAGGTGGTCTCATAGCAGTGCAAAAGG:1 + chr3L 7814285 3' - I-element 5186 1 72.28 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACCACCACCTCCGCGAGAGAGCAGCGAAGAAGAGGAAGACGTTGT:1 + chr3L 5360222 3' + P-element 2855 1 49.50 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAAATCCAGAAGATTTAGAAG:2 - chr3R 28333537 3' + pogo 2051 1 78.00 TTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTATAGTGGGCTTGACAACATGGGTCAACAAACTGACGCTGCGTCTTTGTGTCTTTGTGCTTTTTTCAACGAATCTAGTATA:1 + chr2L 21794173 3' - INE-1 343 1 62.38 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCCGCGGAGGAGGACTATCTGGTGCACGCATCATTTGCTCG:1 - chr2R 8528196 3' - Transpac 4952 2 57.43 GTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGGCAAACACATATACA:1 - chr3L 2029662 3' + roo 407 1 73.27 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGCCGAAGCCAATTAATTAAATACATATCTACGTAAGTTAAACACACAAGCCA:1 + chrX 4325616 3' + Tirant 343 2 57.43 ATATATAAGGGATAAAGCAGAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGAAATGACCCAGAGATATGAA:1 - chrX 983301 3' + Juan 4197 1 55.45 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTTGCCAACGGAGTACAGATGCTCTCACAAATATACTTTCGGGTAATATTCGGGTATTTCTGGCA:1 - chr2R 18043905 3' + pogo 2095 1 70.30 ATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTCCTCACAAAGTAGAGGCGAAAGCTTTTTTTTAGATTTTTATGTATGTCACTATTGATATTTTTCGGTGCATATG:1 - chr2R 981547 3' + 1360 3229 1 66.34 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTTAGTGGCTTATAGTATAAGTATCTTATCCCTAC:2 - chr2R 6074350 3' - 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rover 51 2 80.20 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTC:1 - chr2R 1373100 3' + pogo 2082 1 62.38 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATATACCCGGAGAAGGGAAAATCCATACGGGCGAGTGCCATCGTATTTTCGTTTTTA:1 - chr3R 29432737 3' - Transpac 4936 2 63.37 CGGACACGATCCACCCAAAAACAGTTTTCTGAGCGACCATCGTCCCTGGGAGCCAAAGACACCGCGAAGCCTCTTTTCGCTGGAACATGCGAACACCAGCA:1 - chr2R 7204940 3' - GATE 8154 1 63.37 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTCCAAGGACAACTATTAGGGGGAAATATATGTATGTGTG:1 - chr2R 18073245 3' + hobo 2900 1 60.40 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAG:1 - chr3R 19450171 3' - roo 8704 2 64.36 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTAACAAAAAATATGACATATTTTTAA:3 + chr2L 16025746 3' + 412 7497 2 72.28 AGTCGAGTTCCCAGACTATCAGATAGCCGTTACACAGCTGTATATACTCTTTGAAGCAAAGATCACTATTTATTCGAACACTCCTGTGTAGGGCAGCTTAA:1 - chr3R 4130919 3' - INE-1 562 1 69.31 GATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCAGATTTGTGTTTGTCGATATGCCTGCGAATAGTACGCATTTCTTGTGAATTTATTATTGAAAATGAA:1 - chr3L 16272682 3' - 1360 235 1 66.34 AAAAATGCATTACGATTATTACAATGTAGTTTAAATATGTCTAATATCTGTCCACCCGTCCACCCATCTGTGCAATCAAATCCGAAACTGTCGAAACTGTC:1 + chr3R 7010254 3' + Tabor 484 2 55.45 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTGTACCCGAGTATTCGTGTATCT:1 - chr2L 20269005 3' + hobo 2896 1 74.44 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACTTAGTGCCGCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGGAGCGCTTAGGTTGCAGTTGCAACAGATAGA:1 - chr2R 18879103 3' - P-element 7 2 72.28 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAA:1 - chr2L 12884322 3' - HMS-Beagle 40 2 65.35 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTGTGTAGCTGCGGAAAACGCCGACTTTGTCATAATTATACCATAAATATGCTCGCAGAGTATACTAGTTAGG:1 + chr3R 24185082 3' - mdg1 4 2 75.00 CAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTAATTTCCCATC:1 + chrX 983392 3' - Juan 3811 1 71.00 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATTCTAGTTTCTA:1 + chr3R 18549974 3' - 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hopper 197 1 71.58 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCATTGAGTTGAGTCGGCTGCATTTCAAATGCGAGTGCATAATGC:1 + chr2L 13310304 3' - mdg3 34 2 56.00 TTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAA:1 - chr3R 3922961 3' - Cr1a 62 1 66.34 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACGTCAGAAGTATTGGAATTTTAATTAACTACAGCTCACCTGCAGATAAAAGCAGGGAATAACTCAATTTTAATTTCA:1 + chr3R 7645088 3' + mdg1 7425 2 56.44 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCT:1 - chrX 19034102 3' + hopper 1394 1 56.44 TATACTTACACACACACACACACACACATACCACATAGCAACAGCCAAACCACAGACAATCGAAGGAAACTTTCGATT:1 + chrX 20090247 3' + Quasimodo 32 2 57.69 AGATGTAAGAGCAAGTGAACATAAAACATAAAAACATTAAAAACATTAAAAGTTGTTTCAGAGTTGATCTTTGTCGTCGTTATTGACGGATCATTTATTCG:1 - chr2R 3146361 3' + I-element 450 1 52.48 AAATTTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAAAGCAAAAAAATAAAATAAAGATGAAAGGAATATAAGATTCGTAG:1 - chr3R 6239008 3' + jockey 4953 1 66.34 AGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTT:1 - 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chr2L 21786719 3' - Max-element 8289 2 77.23 CGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAAAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAG:1 + chrX 21087677 3' + mdg3 237 2 58.42 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAACACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAAGGTGCTCACGAAGTGGC:1 - chrX 19887057 3' - P-element 14 1 67.33 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGG:1 - chrX 21668012 3' + Tabor 7288 2 59.60 TTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGTCTACTATGGATAACTTTTTCTATAAGGTGCAGCGGAAACATCCCACCATTCTGGACGAC:1 + chr2L 20495147 3' - Tabor 6856 2 65.35 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTTGCCAACGGAGTACAGATGCTCTCACAAATATACTTTCGTGTAATATTCGGTT:1 - chr2R 18043915 3' + pogo 2085 1 64.36 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGCAATTATGCTATAACATTGTTGATCAAGTT:1 + chr3L 2424909 3' - jockey 57 1 67.33 GGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCAGTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCACAATCCAAACCCAAACCTCTAAGAATAAGGGAAACTATCAA:1 - chr2R 1410901 3' - 1360 468 1 59.41 GAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTTTTAGTTTGCAATATGCGGACGGCTTTAAAATCGATAAAAATCTATTTAAGTTGCCACCG:1 - chr3L 13890064 3' - mdg1 7139 2 67.33 TAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAACTGTGTCAAGTTCTTTTCACTTTCCTGCCTCTCGGCTTTTTTTTTTGGGTTTTGAGGGG:1 + chr3R 12590628 3' - 1360 214 1 68.48 TGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGTCCATGGTTAATAACACAACCACTAACCCCAGGACACCGGAGGAGC:1 + chr3L 20167143 3' - Ivk 231 1 68.32 TATTTAAATAAAAAAAAAAATAGAGTTGTTTTACAAATGACTACATTTACCATTCCCATTTCCGCTATTTATAGACTAGATCAACTATAAAATTAAGGCAC:1 + chr3L 8256294 3' + TART-B 10632 2 81.19 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTAAATTCCAACATCCTCCTTAGCTCTTTTCCTAAACCAAGAATTC:1 - chr3L 18314585 3' - copia 4916 2 71.29 GAAAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTCAGATACCCGTAACTCAGATTCGTGCGTGCGCAGTTTGCGGTATTTTTGGCGCTACTAAGGTAAATTCTA:1 + chr4 1027871 3' - INE-1 575 1 51.00 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCACACACACATAAACATGTCCAACGAAGCGTTCGAATCGAGAGAGGGATATTCATGAAATGGAATA:1 + chr3R 31627184 3' - jockey 37 1 68.32 TTGTAAGAACTGAAATTGTTCAGCAGAAGGCTAAATATGCAGCTGCCTAGGTTCAATAAGTCACAGGGTTTCAATTTGAAAACACTCAACTCCTCCGCGGA:1 + chr2R 5581334 3' + Doc4-element 2747 1 60.40 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGATTTAACTCGGGCTTATGGCATTTTTTAATAAATTTCCCAAACCATAGATGAGTA:1 - chr2L 19907898 3' + Tirant 8473 2 56.44 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAAGTATCCGTTGGTAGAGAGAGTCGTTATTAGGGTCTTGATTTTACTTGATTC:1 - chr2R 10528299 3' - pogo 19 1 60.40 TTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTAT:1 + chr3R 11547794 3' - G2 277 1 75.25 TTTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATAAGGACAGACGGACATGGCCAGATCTACTCGGCTATTGATGTGATTTAAAATATATATACTTTATATAGTC:1 + chr3L 12364634 3' - INE-1 147 1 79.21 CTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTATGGTGAACTGAAGTTTCTGTGTAACAATTTTGATTATAACCAATCC:1 - chr3R 7593014 3' - 297 6528 1 63.37 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAACTATTGAACTCGTCTAAATCTGCATAC:1 - chr2L 5304724 3' + 412 443 2 73.27 AATCGAGCCGTACGATGTACGGCAGCGCCCCTCCGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGAACACGCCGCAGAGAAAACCTTTGATATGATACGAGTAAGATTATC:1 - 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chr2L 16456777 3' + BS 5051 1 63.37 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCNCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGTAAAGTTAAAGCGACGCAAATCGAATCGTCGAGCAAGCCAACGAGTTGGTATTAAGTG:1 + chr2L 12801054 3' + hobo 2937 1 77.23 GTACATTAAGCCTTTCCATNTATTTTTGGGCGATGTTTTTATTTTATTATATAAATACTATACGTTCATGAATGGAGTGAAAGACTTTTTGAAGTCTACTT:1 + chr3R 6239075 3' - jockey 4652 1 63.37 ATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGGTGGTTCTGAACCACTCATGGGTTTTCCGGGGCGTGTGGAAAACAGGGTTAAAG:1 + chr3R 9074133 3' - hopper 20 1 60.40 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGACTTGCTATCTGCGTCGCCATTGTTGTGTCTGTGTGTGCGGTTATAAAAATTAGCCTCATTTTGT:1 + chr2L 17308038 3' + hobo 2929 1 69.31 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTATTGTCCCCAATTAAAT:1 + chr3R 9121483 3' + roo 353 2 82.18 GGGTGAGTTTGTGGCTTGGGCGTGGGGGGGTAGTTTATAATTAGTATTTTTTTTT:1 + chr3L 16016127 3' - HeT-A 5928 1 81.82 AAGTATTTTGCAATTTTCTTCTTAGTGCGGAAAAAAACTGGGAAAAATTGAAAATAGAAGGAGCGGAGAATT:1 - chrX 6436856 3' + Cr1a 184 1 70.83 AGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCATCTTCAGTGTGACCGTGTGCGTCGGGTGTGG:1 + chr3R 26912848 3' - Doc 327 1 68.32 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTAAGTAAATACCCGTACTTTATTTTTAGTACTTAGCCGTTTACTAA:1 + chr3R 6104445 3' - pogo 30 1 53.47 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAAATGCAATCCACTAAGCGTTAATACGTTAAAATAATGAAATGTGTTTGTTT:1 + chr4 1043592 3' - Doc 48 1 59.41 ATGACTAATCATGACATCCNCAAAGACATGGAACTTCCACTTGTTAAAGACGAAATAAAGTCAACTGTGGCGGTAATCATACATCATACAGGGTTGTCTT:1 + chr3L 27362048 3' + G3 4304 1 63.00 AGAGCGCCATATCTCAATTAGAGAAGGTTTGGAATGGCCGGCACGCTTTCCCAATCTGTTCCCTTGTGATTTTTTCTATTGTGTTCATTAAACTTGTATGC:1 + chr2L 22008971 3' + mariner2 526 1 66.34 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATAAAAATGATAGAGGTAATTCAAAAGTATTAGGACGATTTAATGCAGTTTTAATTACATTTACAGTATCAG:1 - chr2L 20992882 3' + I-element 5346 1 64.36 TTTCGCCAAATCGATTTTTTTATTTTGAGACGATTTTTGTTGATATTTATTGGATAAGAAGACTTCTATCACTTTGCGTCTGTCGCAACATCGAAGCCAAA:1 + chrX 16469128 3' - transib3 2454 1 68.32 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTGTGTAGCTGCGGAAAACGCCGACTTTGTCATAATTATACCATAAATATGCTCGCAGAGTATACTAGTTAG:1 + chr3R 24185081 3' - 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chr2L 18207991 3' - G2 3058 1 78.22 CATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCATATGCGAATGCATCTTTATCGCACCCACACAATCGGTCTCGAGTGGGTAGTAATAATACGAATTA:1 + chrX 5055649 3' + opus 7218 2 67.33 GACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATGGACGGGATTAAG:1 + chr2R 14849031 3' - flea 4700 1 69.31 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCTACTTCTAAGTCGTATATTATAATCCACTCGACC:1 - chr2R 5302275 3' - FB 47 1 96.04 GTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATGTATGTTAGGGTCAGGTTCATTGACTTGAGCAAGT:1 + chr2L 6170193 3' + invader3 5460 2 75.25 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATCAAAATTCACTTTTCATATACAACCTACCCACCGGGAGCTTG:1 - chr3R 20432401 3' + roo 9037 1 59.41 TTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTC:1 - chr2L 20117924 3' - flea 12 2 63.37 ATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTGCCCATCCGCCCATTTAAA:1 + chr2L 925835 3' + FB 298 1 58.70 GAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - 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G4 3816 1 34.65 CCGAAAACACGAGAGCCGANCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATTGCTTGTCTTTCTCATTTTTATCTGAA:1 + chr3L 26567336 3' - opus 157 4 72.28 CAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCAGTCGTCGTCTTGGTCTTCTGGGCAAAATGCAAATTCTCCGGCGGCGAAAATGAAAACAAGC:1 + chrX 21249081 3' - Cr1a 378 1 72.28 AGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCGACCCACCCACCGGTTCGCTTCACCTTGACATTTCTGATATACTCTGTTACCCGTTGAGAAATGCGTTTTC:1 + chr3R 21203174 3' - Circe 7212 2 58.42 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTTTTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGG:1 - chr3R 26498531 3' + roo 9063 1 53.73 AAATTTTGCTGCAAAGCTGNGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCATATCCTCCAATGCGTCCTGCG:1 + chrX 21025525 3' + P-element 165 1 20.79 AGTGCTTATTCGATATGTGNGCACATTAAAATGTCTACTATGGATAACTTTTTCTATAAGGTGCAGCGGAAACATCCCACCATTCTGGACGACTTGCGAGC:1 + chr2L 20495155 3' - Tabor 9 2 71.29 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGTAAAGTTAAAGCGACGCAAATCGAATCGTCGAGCAAGCCAACGAGTTGGTATTA:1 + chr2L 12801050 3' + hobo 2933 1 73.27 AGAGCCAAATCATTCACCCGGTCAATAACCTATCCCCTGCAGAATGCAAACGATAGCAGTCTTGCTCACCCCGAAAAACTCCTTCCCGAAATGTGACAAT:1 + chr3R 4848841 3' + Doc3-element 327 1 68.00 ATGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGGTGGTTCTGAACCACTCATGGGTTTTCCGGGGCGTGTGGAAAACAG:1 + chr3R 9074125 3' - hopper 28 1 52.48 TTCAAGTCTGTAGCTCAATNTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCCGGAGTCCTAGAGGAATGCATGACGCACATGG:1 - chrX 20015505 3' + transib2 2783 1 65.35 CGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAAGCATTCGGTGCTTTAATTAGAAAGTCGAGGTCAGTGCAGAGTCTCCGATTTAG:1 - chrX 8310763 3' - opus 7467 2 59.18 GGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGCACATTAACATTCTGTTTTGACAGGCGGCAGTCAAATG:1 - chr2R 19799286 3' - 3S18 133 2 67.74 CCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGCCTCAAGCGAACTAAACGCAGTCTATCACAATGATTTTTGGAATGATTTTTCAAAATTATTTGCATTACTTTGATAC:1 - chrX 20868141 3' + jockey 4726 1 76.24 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTG:1 - chr2R 9061933 3' - jockey 4710 1 68.32 ATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATATATTTTAATACATTTTAACGAAAACGTTCGTTTCTGTTAAGCATAAGTAA:1 - chr3R 6104357 3' - pogo 18 1 61.39 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCATAAACAAGGTTCAAGGTGCGGGTCGGACTGCAA:1 - chr2L 9969511 3' - hobo 42 1 65.35 GGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTCCCATGCCCACTGCACCACGGCACGACCATCATATATCAGTGGAAAAGTT:1 + chrX 18192764 3' + BS 4693 1 55.45 ATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGATGAGCGAGTGTTAAATCGCGCTGGCGACATGCGTTGACCCAGTTTTTGGGCAGTACTACCCT:1 - chr2L 7507489 3' + micropia 194 2 64.36 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCTA:1 + chr3R 30284283 3' + blood 7364 2 51.04 TTGAAGAAATTCCATTTCCCATACTATATCCATCAATCCCAGCAAAGATCCCACCATCAAAGCCTCGTGCGCCAGAGCACTAAGAAGCACCGCTCGCAACA:1 - chr2R 3384226 3' + 297 6508 1 57.43 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATGAATTTAATTTTTAGTTGTATTAGATCGAGTAGATTATCTATAAATTACTAT:1 + chr2R 19430811 3' - 412 7078 2 54.46 GCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGGATAAGTGTGCCTGTGAGTCCTGCCGTATCTGTCAATCCAAGTGTTCTCTTCCTTCG:1 - chrX 3509816 3' - 1360 3246 1 52.75 TGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAAAAAACATTGTGCTCCTGCATTTGAAAAAGAGGGAAACAGAAAGAACAGAAAACGCTTGC:1 - chr3L 23773660 3' + invader4 2887 2 64.36 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACATTTAGGATCTTTTGAAACACCAAAGCCAGTAATATTTTGTACAAAATATG:1 + chr3R 5993352 3' + Tabor 7305 2 55.21 TTACTATTTTTTAATTTTAAAGGATTATTATATGTCCAATTTAAGATTGAAATCCCTAAAGGCCAAACATATTAAAAGATCCACTTAATTTGGAAATCAAG:1 - chr2R 10668371 3' - 1360 3027 1 60.40 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTCGGTTGCCAAAGTGGACTCCAAGTGGATGCCGATGCCAATCCCCATCCATTCTAAGACCAAGTGGCCA:1 + chr3R 31649977 3' - roo 8 2 71.29 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTAAAATTTACATAATCTATGTGCACGAAA:1 - chr2L 18239402 3' - hopper 12 2 67.33 GGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATATGAAGGGAATGTTTTAAAGTTCAGACAAATAGATCAAAAGTGTCAATAAAACAAAGGCAGACAA:1 - chrX 19046339 3' + Juan 4206 1 38.38 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTTAATGATGCCGCCCCAGCCGGCAAAACGGAAAATGGGGAAAACCCAGGAGGGTGGCTGGATGGGAGTTC:1 + chr3L 3475678 3' + mdg1 415 2 73.27 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATGTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATATTATTATTCAAAGCCCATAAAAATACGA:1 - chr3R 15523310 3' - 412 47 2 69.31 TTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATT:1 - chr3R 20001639 3' + FB 59 1 52.48 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGACCCAAACTGTAGACGCCAGTTTGTCGACCGCCCA:1 + chrX 14961069 3' + hobo 2937 1 44.55 ATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAACCAAGTCGATCAGGACACTCTGCTGCTCTTATAAACTTCCAGCTTGACTAGCGCCAACAG:1 + chrY 2971733 3' + TAHRE 10412 1 59.41 AACGACAATTACATAACAATCACCAGAATCACAGAACCAGAATTATGAACGAAATAAGCCGCCAAAATGATTCAAAGTGTTAACCGGTTTGTCGAGCAACA:1 - chrX 13555388 3' - X-element 4583 1 65.35 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCGGTGTTGCACATATATTATGATAGTGATAGATATAATC:1 + chrX 9828508 3' - Tirant 39 2 63.37 TGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 6051 2 79.21 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTC:1 + chr3R 1977622 3' + micropia 5411 2 52.48 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTCATTTCTGTGTGTGTATTCGTTTGGCTTGTG:1 - chr2L 1858319 3' + pogo 2063 1 67.33 AAGTTACCTGCATCGAGGCNTTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAAC:1 - chr2R 1373125 3' + pogo 2063 1 68.42 GAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGATTTATGTTCCTCTGACTTCTCAGGCTGTGCTATCGAATCTCCTGCCATTTGTCCTCGTCTGTTGTCCTG:1 - chr2L 18579376 3' + jockey 432 1 73.27 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTG:1 - chr2R 5214991 3' - F-element 63 1 77.23 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTTGTACAATTTTAAAATGCTA:1 - chr2R 20441259 3' + I-element 5303 1 81.19 CCTTCCACTGCGAATCATTAAAATATCCCAAAAAGGGGGAGAGGAAAAAAAACGGGAAAAAGACAGGAATGTTAACGACTCAATAAGAGATGCAAACAAAT:1 - chr2R 18873812 3' - P-element 294 1 78.22 CAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGGATTTAATAAATAACTGTTTCTGCTCCGCCCCCGCCCTTTCGTCG:1 + chr2L 21786764 3' + Max-element 267 2 55.45 CTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAACAGGCACACGTCAGATCCTTTCGAGGCGCAAATTAATCTCGATCCTGGCAGCGAGTGGCGAAAAA:1 + chr3R 30220276 3' + mdg1 408 2 65.35 CCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAACATAAACCAACCGAATTACAACCGAATTATCCTCATAGCCTAGGGATAATATAAACTAAAACACGCGTAATAAGGGT:1 - chr3L 16461536 3' + Cr1a 4447 1 82.18 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGACTTCCTCGCGTGTTTTTGGTCCCTTTCCATTCTAAAGAATCTTAAGCCCAAAGAAACTCCCAGTCAAGTAA:1 + chr3R 14164271 3' - roo 8669 2 70.30 AATAATAATAATAATACTACTACTACTACTTATAATAATACTACAACTTCTACTACAACTTTTCCCACTCATTTGTGACATTTCTGCTCTATACTAAGGTA:1 - chrX 5334982 3' + mdg1 37 2 45.54 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATGGTATTTCCTTCTCTTAAGAGGTTTAAGAGCAAGTCAA:1 - chr2L 4923244 3' - BS 5033 1 60.40 ATTAATATTATTAATTTAAGCTCCAACCGTTTGCAAATCACCTAAATTTAGTAATCATGGCATTTTCTGTGACTTCTTATTCAAACTTTTCGCTTTCAATG:1 + chr2L 2633943 3' - transib3 2663 1 76.24 TGTAAGTATGTAAACGTAANATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTAGCAATAACGGAA:1 - chr2L 21369842 3' - rover 6972 2 59.41 TTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACCATCTGAATTTCCTGCCATATGGCAGATGCATCAAGTAT:1 - chr2L 5865028 3' + Doc 4436 1 61.39 TTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGATCATGCGTACTCCTTCAGTTGGAGGGCTGCAGAAGAGGGCTGCGGGCTGAGCTGTTGGATTAGGGGCGTGGCTAGG:1 - chr2L 18352673 3' + R1A1-element 81 1 51.49 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGTAGCCACAGGTATGCATGTATGAAAACGTGAGAATGTCGAGTTGGCTGATTAAATGTCTTCATACTACCA:1 + chr2L 19677387 3' + hopper 1412 2 75.76 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGGTTATCTCTTC:1 + chr3R 20425425 3' + roo 394 1 62.11 ATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCTATTTTACTTTTTAGTCTGCAAATTTA:1 - chr2R 11667277 3' - Tirant 8280 2 73.27 CATAAGCACACACACACACACACACGCACGCACGCACTCGCACACGCACACACACACCTAGACAGTTCCCTGTTTTCCCAAAATGGTCAAAACGGGCCATT:1 - chrX 13301038 3' + accord 7026 2 48.51 AATTAGAATTAAACTAATANTTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTC:1 - chr2L 9053418 3' + flea 4976 2 67.33 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGTGTCTTGTAATAGTAAAATTGTAAAAATTCT:1 + chr3L 25333407 3' - pogo 41 1 68.32 ACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGTACTGACACACACACAAACACATACACGTCCGCAGGGAGGAGATTACAAAGCAACCCCAAA:1 + chr3R 4865367 3' - Copia1_DM 170 1 66.00 AGTCTGCCCTTTTTTTCGGGAACCAATGTGTGGGGATGATGGCGTCTTGGTTTACTCAGAGCAACGTTGATCACGTAATCGATTTTATAATACAACATATA:1 - chr3L 2727035 3' + aurora-element 41 1 75.25 CACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCGGTCGCGTCCAGTCGCTGGGAAGAAT:1 - chr3L 20792733 3' - McClintock 142 2 74.26 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCTTTGTATATGTATTCTGCAGATAGCAAAGGATAGATAAGGGTAACCCACAACAACAATATT:1 - chr2L 14715066 3' + pogo 2094 1 67.01 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAAGCGACACCTATTCTCAAGAACTGCAA:1 - chr2L 2016736 3' - Doc 31 1 51.49 AATAAAAAGATTTTACTTGNTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTGTCTTTTTTATTTATTTATTGTCTTTTT:1 - chr2L 102436 3' - P-element 2578 1 27.72 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCCGTGTTGAGCAGAAAAC:1 + chr3R 5359995 3' + 412 7511 2 62.38 TACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGGCACTGAAAGAAAATTTGACATTTCATAAGTGAAGTA:1 - chr2L 14575113 3' - Idefix 7089 2 63.37 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTTAAGTGAGCCACGACAAATGTCACGTTACCCAAATTATATTTCTCAAATGAAAATTAATTGGGCAAA:1 + chr3R 24612267 3' - roo 8671 2 72.28 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAATAAATAGTTTAATCCTGCCTGTCTAGCATTTATTTTATGCAGCA:1 + chr2L 13622030 3' + opus 7473 2 63.37 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGCAACTCAAGTTGCCAAAAAAAAAA:1 - chrX 15284604 3' - jockey 87 1 64.71 GTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTGCCCCCTTTTTCTACCCCCTTGTGACCACTTG:1 + chr3R 8481713 3' - 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chr2L 5244426 3' - transib2 39 1 64.36 TAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATAAATATTTCAAGTTGAATTGCCTACGAGAACTTAATCCAAAATCGTACGGACACGTCCGACGGGCAGAGCACG:1 + chr2R 19424070 3' + P-element 2699 1 75.25 AGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCCAGTGCACAGGGGCAGATAGTAACTGAGATCCTTCAGC:1 - chr3R 16065948 3' + jockey 4691 1 62.38 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTTACAGGAGCACAAAATTAAT:1 + chr3L 17708333 3' - jockey 4758 1 77.23 GAAAAGATAAAAGAAGGCTNTACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAGTTCACTTAAGACCAGTGAACAC:1 - chr3R 15119848 3' + P-element 399 1 28.71 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGGTTGGAAAAATCAGCGGCCGAACTGGAAAACAATGCCAC:1 - chrX 7970934 3' - P-element 13 1 66.34 AAAGTAATTGTTGAAATTTATAGGATCTTGAGTACTTGAATATTGCTAAGTTATAATTATATACATCTAATATCATAAACTAGATTTAATGAAAACTTTTG:1 - chr2L 6122429 3' - 1360 373 1 76.24 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAGTATTACC:1 + chrX 11454367 3' - P-element 49 1 30.69 GTGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCACATACGATGGGGCAGACCCCACCTGCTCGGAGGTTCGTGCCCAGCCACATGGTTCAATATCTTGGGT:1 - chr3R 10822251 3' + R1A1-element 379 1 75.25 AAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGAACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATGAG:1 + chr2R 13316193 3' - hopper 4 2 60.29 CCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTATGTTTAAACAGATCAGCACAATTGAACATTG:1 + chr2R 5043345 3' + roo 9030 1 69.31 GTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACACATGGCGCCCGGAGCTAGTTACACACAGCAGACAATGCAGCCAGGTAGAAGTGGAAGAAAAGCAGCA:1 - chr3R 28359553 3' + Doc 192 1 73.27 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGG:1 - chr3L 2016891 3' - Tabor 52 2 73.27 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTTCTCGCTGGAGCTTGGCACACGTTTCGCCTTTGTCAGCTATGAATAC:1 - chr2L 12485393 3' - roo 28 2 54.46 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACACGCACACGAGACGGGGATAATATGTTGCC:1 + chr3R 24442491 3' - jockey 4714 1 77.23 GACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATGGAC:1 + chr2R 14849022 3' - flea 4709 1 62.38 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGACCATGCGATGCATTAAAATATTCGCAAATTTAGTA:1 + chr2R 6830729 3' - hobo 38 1 67.33 CCAAAGCACTGATTAAATGGTAGTAGCCCTTTGTTTTCCCAACTTCCCAGTCTCTCTCGGCTCAACATTTGCAGACCGAATTCGTTCAGCTTCCGGGTCTC:1 - chr2L 20145275 3' - Chimpo 447 1 81.19 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAACTTTAAGCATGATAAATGAGTGCAATTGTTGTTGCCGTGTTGGTG:1 + chr3L 15777064 3' + I-element 5329 1 55.45 TATTATGTTCGTATATACTNCATCCAATTTTTTATTGATGCTTTAATTAAGTTGTTGGTTTTTGCGCGCCTAACACGCCCACGCCAGACGCCTCCCCTGCC:1 + chrX 7614771 3' - mdg1 7039 2 76.24 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTAAAATTTACATAATC:1 - chr2L 18239415 3' - hopper 25 1 54.46 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAAAGATCTACACACTTGCAAACCGGAGAGAAAGATGCAAATGGTCTTTTCTCCAA:1 + chr3L 21118640 3' - 412 7074 2 58.42 TCACGACCAGCTGTCCCAAGCGATCCAAGTGGACTTGCCGATGCAACCAATCACTTTGCTATCAAAAATCTGAATAGCCTAATCGAGCCCAAAACCCCAAC:1 + chr2R 625440 3' + BS3 154 1 57.43 ACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACCCGACCCGAACCCGTACCGCCCAAAACTTGCAGGTTAATATGCACACCGAATTGCATATTCAA:1 - chr3R 11124019 3' + Porto1 442 1 69.31 GCTGTCTTTTCTTTCTTGCTTGTTTTGTGTTCCAGGACGCAAAGATCTTTGGGCTTCGATGGGATCCGCCGAGGAGGATTTGTCACTAATGGGAAAACAAC:1 - chr3L 17495313 3' - Osvaldo 1442 1 72.28 TATTATTCTCATTTCACACNTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACG:1 + chr3L 25232820 3' - accord2 62 2 79.21 GGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGCGTAAATATGGCAGGAAGCATTTGAATGCAACT:1 - chrX 12321837 3' + Stalker2 7244 1 47.69 AAGTTTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCACTTACGCTAACATTATTTATTATTGTTGTTGCTGCTGTTGCTATTGTGGTGTGTTAAAAA:1 - chr3R 22219522 3' - roo 8678 2 64.36 TTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGCCGGCAATGGAGGACATGCAAATGATGTGGC:1 + chr2L 12064047 3' + mdg1 465 1 72.28 TATTCGTTTCAAATATTTATTGTGACTGATCTACAGCACACTGAGCTCCTGATTTTGTGCATGGATAAAAACGATAAGCCTATGTGTGGGATAACACGAAC:1 - chr3L 21683449 3' - Dm88 4537 2 75.25 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAG:1 - chr3L 19274801 3' - transib2 28 1 53.47 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACGTTTTAGGCATCATTGTCCAAACATTCTA:1 - chr3R 10063302 3' + roo 9026 1 73.27 GCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTCCCTTCGATTAAGGGCTTATAATTTATGTAGAGGATAATGC:1 - chr3R 24010134 3' - Doc 4488 1 66.34 CTTACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTATTGTCGCTTTGGAGTAGCCCCTATTGAACGCGAGGAAAACACGAGCATTGCTGCTAGCAGCCTTAGCCAA:1 + chr2L 19606525 3' - mariner2 327 1 60.40 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGCGGAAAAGCGAGAGGGATAAAGTGGCAGAACGAGATGGCGAATGTGGGTCAACT:1 + chr3R 9094824 3' - hopper 17 2 62.38 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAATAGATACACATAAAAGTAGTAAATGTGTAATTGAAGTGTTTTCCTTTAAT:1 + chr3L 13204434 3' + I-element 5328 1 54.46 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAGCTTATTATAAATAAATATGAGTTGGATAAAAATGCTAGTCTCG:1 - chr3R 26798624 3' + pogo 2073 1 61.39 TTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAATGTCTTTGTTCGTTATCTTCGAGATACATTCGCTACGTTCGATTCG:1 + chr2L 7544299 3' - I-element 5019 1 53.47 TGCATACGCTCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCCAAAGTTGGTTCAAGCTAAGTTTCGCTGGAAAGTTGTCGATTTTAATTTAAT:1 + chr3R 12599364 3' - BS 20 1 53.47 AAATATCTCCAATAGTTTANGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGTCCGAATCAACCACTGGTACTCAAGCTTT:1 + chr2L 14981503 3' - hopper 45 1 71.29 GAATTTTCAAAATCGTTTCTTCACGACTTCTGATAAGGGTATAGAACAAAGCATTAGCTTGGTATCATTGGATTACCTGGGCATAGTAGCTGCTCGATTGC:1 - chr2R 4712205 3' - Tc1-2 1247 1 71.29 GATTCCAGCTTTCAAATTTNAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAATTTTTTGGCTGTATGCCTGTGGCAATTTTGTGGTTGGACTG:1 + chrX 19356298 3' - FB 36 1 63.37 CAAGGCTGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGCGGTGTTGCACGAGCCGTGCAGTTCGCATATAATTTTAGAC:1 - chr3R 8718597 3' + Gypsy6A_LTR 262 1 59.79 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGC:1 + chr3L 13739637 3' - BS 5031 1 61.39 TCAATGGTCAATCGTCTTTCTTAGTGGCTCAAAATCTCGGAGCAGACTTTGTGTTGTTGGCGCCCAAACGGAAAATAACCCAGTTTCTCTAACTCTTCGAC:1 + chr3L 24870838 3' + G3 367 1 71.29 ATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTAATTACAAATGTGAGTGAGAATTAAAGGAGGATGGCCTGTATGGATGACATGTCATAAACGTTTAT:1 + chrX 20380670 3' - McClintock 6241 2 69.31 TTTAATGCGTAGTGTGCTTATAACAGCAGATCTATGGAAAGTCGTTTGTGGTCAATTTGTGTTATTTCCAATACCTCGATCTACTGTGCATAGGAATGCCC:1 + chr3R 11370322 3' + Copia1_DM 388 1 55.45 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAGGCAATTAGCCAGCCGAAAGCCGGTTG:1 - chrX 7970969 3' - P-element 48 1 31.68 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAGTTTTAGTTTTT:1 - chr3L 5025602 3' + roo 9046 1 53.47 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAATACATAGTATAGGTTGATTCTGCAATTTGGCGAGGAAACAGCTGCTCAAGGTTCGCTTATTCTGTTAAGA:1 + chr2L 4916564 3' + hobo 2934 1 71.29 TGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGTTGATAGTGTGTGTGTGTGGAAGGCTTT:1 - chr2L 18205503 3' - jockey 234 1 76.00 CCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTTGCCTTGTAGTTAAATGACTGAAATTTCCAATGGGGG:1 + chr3L 18336777 3' + X-element 4527 1 81.19 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCAACACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAAGGTG:1 - chrX 19887070 3' - P-element 26 1 52.00 TCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAACTGTATATTATGTTTAGAGCTCAGCCTTCGCCCACAATAG:1 - chr3L 12072559 3' + HB 1585 1 66.34 TGTGAATGTGTGTGTGTTTGTGGGGCCAGGTACAAACTGTCCTAAGCGAAAAAAGAAGCGAAAGGCAAGGGGAAGAAAATCTGGGATGTTGAGAGCTTGAG:1 - chr3L 6922098 3' - accord 188 2 59.41 CCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACATGCACAATGCAAAGCAGGAGGCGTTGACGTCGCCGCTCGACTGCAGGGGGTTAAAACGAGGCATGGCGGCC:1 + chr3R 27785889 3' + gypsy12 10191 2 72.28 TTGTTTATTTTTTTTTTTATTAAATGTTGTTGTTGTTTTTCTAGGCACACATACTTACACCAACCACACTCGATCGAAAGCAGTATATTTCAAACA:1 + chr3L 10582791 3' - BS 5101 3 59.38 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATATATTTATTCGTTAAAATTATATCTAACCAATGTATCCTCATCTTTTCTTTCAGGTAAGTTCAACTTCCTTT:3 - chr3R 9121408 3' - roo 8667 2 73.27 ATAAATTAAAAATTATTTAAATTTGATTTTTATTGTGCCACGAAGCCCCCGCGCCCCAATGCCCAGCGGTCTTTCAAAACCATAATTATCTCGCACTAGTG:1 + chr2R 18785179 3' - blood 6926 1 59.41 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTAATAATTGGATGTTTAGTACAAGATATCAGACATCGTTTGTTGCATTCTAAATCAATAAGTTACAACTG:1 + chr2R 22369654 3' + roo 9063 1 70.30 CAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACAAAAAGCGAAACACAATGCCCTAGCTGCACACCAAGTTCTACTCCTCTCCGGATTGGCCGGAGAAGCGCTGG:1 + chrX 9654583 3' - jockey 213 1 75.25 GGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGGCCAGAATCCACCGAGTACTGAGTTCAGTGGGGCGTTAAATTGAATTGTTG:1 + chr3R 17840797 3' + micropia 255 2 56.44 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTAGAATTTATTTTAAAATTGCTTGCTTTAAAATATTCCACTTTGAAA:1 - chr3L 4669212 3' - mdg1 32 2 61.39 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTGACGCGGCCAATCTACTGTTCTGCTGTTAGAGAATTGTCATTTG:1 - chr2R 4870383 3' - blood 24 2 52.13 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATTGTTTACC:1 + chr2L 19907983 3' - Tirant 8126 2 62.38 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGCTACATATATTTTTCGGAACAGCCACAGTCAGCAGAGTACACATCATAATAGCATTATTAATTTAAT:1 - chr3R 7644999 3' - mdg1 7048 2 69.31 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTAACGATTGGCCGGAGTGGCCGGTGATCAATGCCGAGCTTTTTGCACTAATTAACATGG:1 + chr3L 20079788 3' + mdg1 405 2 62.38 TCGAATAAATGATCCGTCTATGACGAAGACAAAGATCAACGCTGAATCCCGAAATAAATCTAACACACCCATTGAACTAATAAAAATAAAACCAATAGAAC:1 - chr2L 2283715 3' - Tom1 366 1 59.41 GTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGGTTACCTAGTCGTTAACTTTTCGCACTTGGCTATAATGTGAGTTTCAATTAAGGCATGAAA:1 + chr3R 8333307 3' - F-element 304 1 73.27 TTGCGTGCTCAGCGGCAAAAATACCACTCCTCGATCCATCCATTTAGTCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCTATTCATTTATACAGCTATTCTCAC:1 + chrX 3563499 3' + Doc3-element 236 1 77.23 TATATATATACATATATACATAGCATCACAAAATATAATACAACATATTACTACATTGATATACAAACAAAAGAAAATGAAAAGAAACGAAGAAACCAAA:1 - chr3L 25731477 3' - G3 4508 1 74.00 ATAATAATAATAATAATAATATATACTTTTTATGGTACTTTTTACGCTTCCTTCTGCCAGTTACTTCTTAACGAACCTAGTATATCCTTTTACTCTACGAG:1 + chr3L 25245594 3' + mdg1 7070 3 49.50 TCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAGTATTTTACATT:1 - chr3L 14878647 3' - Juan 37 1 62.38 TGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAATGTCCTTTCAGCTGGCCACGTGTTTTTGGGGCGTTCTTCGTGTGTGTGCCACCAGCACGAACGACCACATTTA:1 + chr2L 9971685 3' - hobo 2658 1 74.26 CAACCAGTCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTGTATTCTCCGAGTCACATCCACGTCCACTCCCACGACAGAAATAATACTAGAAAAAACAAAGC:1 - chr2R 8521678 3' + Q-element 433 2 54.26 CCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCCATTGATGGACATTAGTAGAGCGTATATGCAGTATCGGTAAATTAGTTCG:1 + chr3L 13825719 3' - jockey 139 1 61.00 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGCCCAAACCCTTTTCGAATTCAC:1 + chrX 9439234 3' + roo 9045 1 60.40 AAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGATTATTGAATAAATTTGGTTCTCAAAAACAATTTTCCTA:1 + chr2R 6671442 3' + 297 399 1 62.38 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGTGTGTGCTCCTTTGCGGTTGGCTGTTATTACGAGCCCAACGCGGTGCCACTTTTGCCACCCATTAAGA:1 + chr2L 9488805 3' - hobo 7 1 66.34 CGTGTTGTGCTAGAAGACGATTCGCGATCCTGATCCCTATCCCGATCGAGAATCTATAACCTATGTTCATATGAGTTCATCTTGTTGGCTGGAGTTTTGCT:1 - chr3R 29048086 3' - 1360 3202 1 79.21 AAAATTCTTCAGACTTTACTGATTGTGAGGTCAGAGGTCAGATAGTTGCAATATATACACAAGACTCGCAGCGAAAGTGAGGAAGGAGCCTGGGAAAAAAA:1 + chrX 12881107 3' - hopper 241 1 78.22 AGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCG:1 + chr3L 23678124 3' - Osvaldo 28 1 72.28 CTCTCAGTTGCAGTACTGGNTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 7605 2 50.00 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTC:1 - chr3L 25059079 3' - mdg1 7074 2 62.38 ATAATGTAGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATTTATTTTTTTAAAATGAAATCTGATAGGTGACATCCCCCATTCTCTTTTATATATTTAAGGTTTTCA:1 - chrX 22518876 3' - mariner2 811 1 78.22 AGATAAGTCACCGACTGGTAGACTAAACATCCGTTGCCCAAGTTTATAATCCCTCAATCAAATCCACACTCTCCACCAAAATCAAAATCATACCCAAGTA:1 - chr2R 10491182 3' + Idefix 6983 2 63.00 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTGAGCATCAGCAGAACAAACAAACACATCCTCGTCCTGTCCTCATCCT:1 - chr2L 6221837 3' + 1360 3353 1 72.37 TAATAAATATATTGAAAATTTACTGATCGACTGGCCGCAATCCGTGATGTGCAGGGACGCACACTGAGCCTACAAGTGGGAAAATAGCATTTAGAATAATA:1 - chr2L 18531388 3' + Burdock 6376 2 70.30 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCGCACC:1 + chrX 683622 3' - jockey 4757 1 51.49 CTTGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAAATACTTCATATGACACCTACATCACGCACCC:1 + chr3L 18253238 3' - INE-1 129 1 79.00 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGAC:1 - chr3R 19450163 3' - roo 8696 2 72.28 CAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGA:1 + chr2L 20290315 3' + flea 253 2 74.47 GAGGGAGCGGAGAGCGGGANACAGTCCAAACCACGTAACTTGAACAATCCCCAAAAATTTAACAATATCCCTCTTAAGAAATATTATATTTTTTATTTTTT:1 + chr2L 9435800 3' - GATE 8269 2 45.54 TATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTTAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAAT:1 - chr3R 3922960 3' - Cr1a 61 1 63.37 TTTTTTTATTTTTATTATTTTATCATTATTTTCGTTATTTTCATTTAAGGGTATCATATAATGTTTTCTGATTTTTTTTAAACACACTTGAGTTTCCCTT:1 - chr3L 24710191 3' - Rt1a 5072 5 76.00 CACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGG:1 - chrX 21668014 3' + Tabor 481 2 56.92 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCTGACCCATTCATTACCATAAAAAGAGGAGGGGGCTAA:1 + chr3R 11941232 3' - Doc 40 1 58.51 TTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGG:1 + chrX 21668084 3' - Tabor 6862 2 56.44 ATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAATTTCAATTG:1 + chr3L 16047740 3' + Tc3 317 2 33.66 TAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGATGATCGTGTGTAGGTTGGCTGAATGCTCGTCTACAAAAACCTGCTTGTATGCTTGG:1 - chr2R 4550531 3' - roo 175 2 65.35 GTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATA:1 - chr2R 5284564 3' + Doc4-element 2612 1 54.46 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTCTTAAAACATAATACAATACAAATCACCATGTTCCACTCATTTCCTTTATTTATGTA:1 - chr3R 18883745 3' - roo 8681 2 53.47 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACTCATAACCCAAAAAAAAGGGAAACAATTTGATGGTTTTTGTGGCCAAGTTGGTTCGCCAGCTC:1 + chr2R 23111403 3' + hopper 1406 2 69.31 GCAATCGAATGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGGATCAGAGTAATTTTCATAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTGATAAAAGGCATAAAAATAACAA:1 - chr2L 16352415 3' + G5 4504 1 80.20 TAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTCTGATGTGACTTTTGTAATAAACAGTTTTCATATTTTTATTTACCGCTGCCACAGCTCAATTCATTGCA:1 + chr2L 20523525 3' + Tc3 239 3 72.28 CTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGCGCAAAACTAGAACCAAAATCGGCTTCACATGTAGCATGTATCTCAAATATCAGTAGTCAAATAAGAGCTTTGC:1 - chrX 1157414 3' + 297 495 1 70.30 CTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATCAATTTCATTGTAAGA:1 - chrX 4349874 3' - G2 2985 1 57.43 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATTCCTTATAAAATTAAACAGTAGCGAGAGATAGAATTAATCATAGTAGAACGGTAAG:1 + chrX 14797656 3' - opus 15 2 48.51 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACTAAACACAAAACACACATACACACACTGCTGCACATGTGGAATGAAATTCGCTTTTGTTTTAT:1 + chr2R 18879217 3' + P-element 2878 2 70.30 CTTTATTATTAAAATGATAAGTTAAATTGTTATGAACTTCTGTTTCCATGCTTATAATGGAATTATACACCCTTTTTGGTGGGGTTGTCTCGGGCAGATAC:1 + chr2L 22348323 3' - transib4 2180 1 72.28 TAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGA:1 - chrX 21087588 3' - mdg3 5285 2 57.43 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATTAGCGCACGGAAGCACACATCAA:1 - chr2R 19352216 3' - 17.6 49 1 77.23 CTGAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTTTAAGTATTCTAAACATTAAATATTAATCAAAGATTAATGGGCTTTTAAGCTTTACAAAAATCGACCAGAC:1 + chr2L 4020798 3' + 412 492 2 73.00 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAATTTGCTACATTTATATAGAATTGA:1 - chrX 21468972 3' + pogo 2053 1 76.24 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGACGAGACGAGTCTGGTC:1 - chr2L 9521657 3' - P-element 41 1 38.61 CTCGAAGTGAGTCGTGAGAAACGGAAATGTCTAGTCAGCATATTTGTGGGGTTTGGTTTTTACCGAAGTGAAAAAGGCATGCGATAGATATTTAGGTACTG:1 + chr4 1060045 3' - rover 187 2 60.40 AAAAAGAGAAAAAACATTAAAAAATTCCACCTACCAGATATCAACATTTAATTTATTTAAATTTTAATATTGCATTAATATTCAGCACACTCTTGATTTTT:1 - chr3L 18736051 3' - INE-1 471 1 59.41 CAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCACTGCCTCATCGGGTATATACTCCACGGATA:1 - chr2L 9053382 3' + flea 5012 2 72.28 CGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTC:1 + chr3L 25350819 3' + baggins 5412 1 46.53 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTT:1 - chr3R 17897120 3' - hopper 6 2 66.27 GAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCA:1 - chr2L 20360643 3' - micropia 4981 2 58.42 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATTTATATTTTAATGCCCTAATTTTGTTTGCTCCATTTATAAAAAGTTACTTAAACCTTTCTTACTCTGTGTAAATGAT:1 - chr3L 13204328 3' - I-element 5111 1 73.27 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACAAATATAGATAAATTCTTCTTCCTTGCGTTGCAAGAGCTTGCAACAC:1 + chr3R 4674842 3' - FB 30 1 55.45 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAAATGTAATAAATCTTTTTATTGGG:1 - chr2R 19430489 3' - 3S18 53 2 74.00 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGGAATTTAAAAACATATGAATTTTATTTACTTT:1 - chr3R 30284188 3' - blood 7019 2 70.30 TGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTGCAACTGCAACAGGAGCAAAAGCCACAAAAG:1 - chr2L 13310214 3' + mdg3 251 1 73.96 GTAAATCTTAAACCTACTTCTCTAACTAAAGCAGCATCAACAACAGCAATGTTAGCAGCAACAGAAACAACAGCGAAACAAACATCAGAGAGAACAGCA:1 + chr2L 17559080 3' + TART-B 10369 1 72.73 ACACGATCTGCGCAATTGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAAGAGCGCATCGCCGCTTTTGCCCTGCTTGCTCTTG:1 - chr3R 7310710 3' - jockey 89 1 63.37 CAAAATAAATAATCAAAAAAAAAAGATATACACCCAATTAGTAATTTTGTGTGCGGGTTATCCATTTGTGAACTATTGCCCTTTAGACCTGCGCTTGTAAT:1 + chr2R 25219788 3' + BS 5092 2 90.10 GCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGTAGGGTTTGCTGAAAGGGGTGGCCGAAAAAGGGGCGGGGCATGCCGAGCAGCAG:1 + chr3L 10021928 3' - G2 58 1 69.31 CAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATACACACTGGCTTTTTGCCCGTTTGTCTTAGCCCCACTTCA:1 + chr2L 2509852 3' - invader4 236 2 70.30 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCATCAAATAACCCAATGATGATGATCTTTTTATAATAATGATTA:1 - chr2L 14981447 3' + hopper 1383 1 59.41 TGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATCATTCAAGAAGGTGCCATTCTAAGAAATGGAAATAATATTGTGAACTATTCTCATTTAAACGGTTCATATT:1 - chr2R 1905094 3' - Max-element 4 2 76.24 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTATACTGGAATACCTTT:2 - chr3R 19446659 3' - HMS-Beagle 35 2 61.39 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCGAGCTGTGGATCCGGGGATCCGGGGATCCGGGGATCCAGGG:1 + chrX 20015575 3' - transib2 14 1 56.44 TTTTTTGGCACATGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGATCTTTGTGGATGTTTTACTTCTTCATAAAGAACAGCAAATAATGCCAAAAGG:1 + chr2R 15375585 3' + 1360 40 1 63.37 GTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGACTCCTGATCTCTGGGGCAAATGGCAACGCGTGCCAACAAACTGTTGATTACCAGC:1 - chr3R 18316409 3' + 1360 3155 1 60.40 AATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCATCATAGGCGGAGATCTCGTTGTAATTCTAATGGTTCATCTGCTGGTG:1 + chrX 18611999 3' - accord 83 2 63.37 AAAAAAATTAAACAAACTTTATATTTTTTCCAGCTTTTATATGTGTAAAAGCATATATAAAATTTATGGTGTATGGGAAACCTTGGTTTATGAGAGAAGGT:1 - chr2R 8509298 3' + HB 325 1 63.37 ATAGATAGAATAGTTTACANAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGAATATATATTTTTTGTTAAGCTGACGAAATTTAATCTCTTGAA:1 - chr2L 16033400 3' - I-element 5336 1 62.38 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGTATTAATGGGAGACCGCATACCCTTCGACTCCTCAATGTAAAGCTTCAGGGCT:1 - chr2L 9075557 3' - 297 6596 2 51.49 GCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACCCTTTTCTTTGGTTTCTTTTTATATAAATCAGTACAATTTTTTCTCAGTGCCTAAGA:1 - chr2L 7161287 3' - pogo 16 1 55.45 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACCAAAAGGGGAGTGGCTGTGCGTTTGCA:1 - chr3R 11831432 3' - roo 48 2 75.25 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTAACAAAAAATATGACATATTTTTAATGAATACATA:1 + chr2L 16025756 3' + 412 454 2 62.38 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATG:1 + chr3R 18883821 3' + roo 9032 1 65.35 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTCGAGTCTCC:1 + chrX 8027519 3' - Juan 6 1 73.27 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGAC:1 - chrX 8038626 3' - 297 6619 2 71.00 TCACTAATCATGTGAGGACTTACATGGGTGTATGTGTGCCTGCGTTTGGGCGACTCTATGTTTGTGTGTGTGTGTAGCCCCAAAAGCGGGCTACATAAA:1 - chr3R 17362859 3' - BS 4995 1 72.73 CAGCAACTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTACACACTATTATTAAGAATTATATTTAAGGCT:1 + chr2L 23402979 3' - gypsy6 7466 2 75.25 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACAGTTGCCTTTGGCGCAAAAAAAAACAACTACAACGAAATTTGCTATATTGTTTCGGTC:1 + chr3L 14301662 3' + roo 386 2 55.45 ACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCAGCGCACTAAATCGAATGCGTTTTTTTTTTTGCCTCATCTATTTATTATTAATCCCA:1 - chrX 16941453 3' + R1A1-element 444 1 61.46 ACCCTGATGCAAGTGGAACNTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGTCTACACTTTTTTCCAAGTATTTCCCTCTCAGTGCTA:1 + chr3L 13704584 3' + opus 7492 2 70.30 ATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCGTCCGTGGAAAGGGACTGGAAGTTCAAACAGTTGACACTCAAAAAAAAAGGAGTTTCTCTTGACAAAGAATA:1 - chrX 18554802 3' - Quasimodo 7124 2 71.72 TCAGCCTGGGAAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGCGGCACCCGTAACTCGCGCACGCGTGATAGATGGGGAA:1 + chrX 7082632 3' + accord 7335 2 77.66 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGG:1 + chr2L 20290314 3' + flea 5004 2 68.32 TGCGATGCCCACAGTGCAAACCGCTGTTCGCGCACGCATTTATCTGTACGGGGAGTTCGACTGCGGCAAGGGCGACATATCCGACGAACTGAACTGTAAG:1 + chr2R 8209609 3' + diver2 4620 2 53.00 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAGTATCTGCTAGATACCACTGTGCGGAACTGGGCCACA:1 + chr3R 6761059 3' + blood 337 2 64.36 TGCATGAGCATACGTGTGCACACATACCATTCTGATTTTGAAAAAAAACCGAAAAAGAAACGCATAAAACCGAAGAGAAACCAAAAACAATCTAGATTTTA:1 - chrX 5071286 3' - 1360 181 1 58.42 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCACGTCATCCCAAAAGAAAACACACCCACACACACAGCCACAGAGCGCC:1 + chr2L 261681 3' + hopper 1385 1 56.44 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACTAAACACAAAACACACATACACACACTGCTGCACATGTGGAATGAAATTCGCTTTTGTTTTATGATTT:1 + chr2R 18879222 3' + P-element 2883 2 75.25 TTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCAGCTAAATGCTTCTCTTTTTTTTTTTCTGAATTTTGTTGAATTTTCTCCTTGATTTTCTGGCTATCAAAA:1 + chr3R 21920477 3' - Doc2-element 215 4 79.12 GTCTTCTGTATTCATAAAGCCATGCTTCATTCTCACTGAACAAACACCTAGAGTAAATAC:1 - chr2R 19003301 3' + invader5 84 2 61.67 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTTTTTCTTCTTTTCTTTTCGCTTCTTTTGCTGTGAAAAATGAATTGCCCACTT:1 - chrX 11182744 3' - jockey 31 1 59.41 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGCAGTC:1 - chr3R 10741065 3' - 1360 2 2 76.24 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACAC:1 - chr3R 19589939 3' - BS 5037 1 64.36 CTTTAGTGCCCTACGTCAGGAGAAACATCAGCCGAGTCAGTCATTTTTCTAAAATGATTGGATGTTTAACATTAAATTCTGCATTGGAATTTTGCAATCTT:1 - chr3R 19446927 3' - gypsy12 9854 2 59.41 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTGTCCTTGGTCGAGCTTTCACTTTCTTCCTCTCGGCGCACGCGCTCTCG:1 + chr2R 6040382 3' - opus 22 2 51.49 TTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACTTCTGCCGCTTCGCCCGCTTATATTGTC:1 + chr3L 23773467 3' + 1360 3190 1 72.00 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTTAGTGGCTTATAGTATAAGTATCTTATCCCTACTAGAGGAGTATGTT:1 - chr2R 6074336 3' - 412 10 2 37.62 GAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACGTCGTAGTCGTCGCATTAGACGACACTAAAA:1 - chr3R 28389747 3' - 1360 208 1 71.29 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCTCCTTAGCTCTTTTCCTAAACCAAGAATTCACTCCAAGTCTCATTCG:1 - chr3L 18314568 3' - copia 30 2 56.44 TTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCGTTTGAGGACCACTACACTTGTGGGGCACAACACCTTCCGCAAGCGTTAAGCGCGG:1 + chr2L 22383510 3' + diver2 149 2 62.24 AATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCATCCTTAGTTTCGGTGGGCCAGGCCGCCAGAAAGCCGTCAAAATACG:1 + chrX 1624262 3' + F-element 251 1 54.46 ACAAGATTCAGGAAATAGCGAAAAAATACAACGACTAATATCTCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGTAGAGCGGGAGGAGATTGCGGTAC:1 + chr3R 4502786 3' + jockey2 3058 1 76.24 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCCTCAGGTGTTGTGACTGAGTTTTGCTTGTCGACCCACAGGTTTCCGAGTGAGATGGGTGAAATG:1 + chr3L 19459404 3' - Doc 23 1 67.33 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCATCAAATAACCCAATGATGATGATCTTTTTATAATAATGATTACACTTTTTGGTGTGTTGTGGCATGCTTTT:1 - chr2L 14981418 3' + hopper 1412 2 74.26 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATGTGCTCGGGGGCAAAAAGGTGCACTGCC:1 + chr3R 29375032 3' + mdg3 5485 2 60.82 CACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGAAACAGGGATGTCATATACATGTTACCCACACACTGAAGGTTGTGACTCACTGGGAGAAATGATTTATTATT:1 + chr2R 20211246 3' + accord 7044 2 77.23 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTGATTCGATTTGGCAAGCACTGACAATTTTGCTTGGAATCATTGCAAAAC:1 - chr3L 8749941 3' - Doc 13 1 69.31 CATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGGCTATCATGTACACTGGAAAGAGTCC:1 - chr2R 9866484 3' + roo 54 2 82.00 AGTGAAGATTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCAGTTACACACGGCGGATGTGTGATATTTATAGTCAAAGCTCAGCTGCTGTTGCTATGCTTC:1 - chr2R 10449576 3' + invader4 247 2 66.00 AATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGCGTGGGCGCTTTTCCAACTGCCGGAAGAGCTTTTCCATTTCCCATCT:2 - chr2L 18207966 3' - G6 1993 2 53.47 ATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAAATATCCAATGTAGAGAGTACTTATCTTATTATTATTTTTAATTGATCTACTTTCGACAATTTG:1 + chr3L 20158304 3' - Copia1_DM 16 1 63.37 CACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCGCTCCTCAGCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCCATTCCGTTCTGCATTGTGAATGTAAATACAT:1 - chr2R 13097202 3' - micropia 5329 2 64.36 GTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATACAAATTCTTCAGACTCCACTGACGTCTTTCAAAGCCATTGAATGCAAATCGGTTTAAACTCTCCGAACCACTCAA:1 + chr3R 16176090 3' - hopper 267 1 58.42 AACTATTCTATCTATCATAATAAAAAAAAATAAAAAAATATCACATGAAAACCATTTGTACGCCCTCGAATATTGCACGCCCCCGTCAGAAGGAGTAACCC:1 + chr2R 11524552 3' + I-element 5343 1 63.37 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTATAATTGATTATTTTTTTAATAGATATTAAGTGAGAATACACAATGCGACGTTCGTTTTGACGTCATCGC:1 + chrX 17098456 3' + roo 405 1 78.22 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATATTATAGTGAAGTGCATCTGCTAGATGCAAATTGCGTATACTGAATATTTTATGTGCCAATTTACGCAT:1 - chr2R 16639622 3' - opus 7116 3 79.21 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACTATTTCGTTATCTGCACGTCGAAAATCAATGGAGAAGTGTGTGAAATAA:1 - chr3R 13686551 3' + 412 474 2 54.26 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGGCTGTATATATATAAGTATATATATTTATAGGCCATAATCTTGGTGGAATACTTACGCGCAGCA:1 + chr2R 16068712 3' + Burdock 247 2 64.36 CCGCTGCCCAGCTGCCACGCGGCCAGAACGTATTAAAAACTTTACAATTTGTGCAGTGTAGTCAAGTTTAATTTTTTGGTTGAGTTCATGCGAAAATTGCA:1 - chr2L 14903305 3' + X-element 210 1 78.22 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATC:1 - chr2L 23372629 3' - 1360 10 2 58.42 TGTGTGTGTGTGTGTGTTCATAGTTTGTCCAGCACACATTGGGGCCAAACTGAACGTCTCGTAAATCGTAAATTTTCCGCTCGTTTTTCCCAGTTTCCTGC:1 + chrX 5459430 3' - accord 180 2 76.24 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGA:1 + chr2L 20290311 3' + flea 5002 2 66.00 CGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCCTGCAGCCAGAGGAGTGGCAAAAGCAGAGCATCAGGACATGGTCGAGATGGTATGGAAAGGTGGAA:1 + chr3R 11525814 3' - rooA 7566 2 71.29 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGACAGTAAGCTAGAACCCGCGGAGAAGGTCGGACAGTAAGAAACGCGCAGGACATAGATGAAA:1 + chr2R 1861782 3' + copia 241 1 64.36 AACAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTA:1 + chr3R 15768308 3' + 1360 439 1 58.42 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAG:1 - chr2R 5485050 3' - 1360 15 1 64.36 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGTAGAGCCTGGTTCCATGCATTCGACAGCGGAATCGTGAATAAAATCAC:1 - chr2R 11699256 3' - roo 9 2 60.98 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAACGGACACTCTTTTGAACGGACAACCTCAATCTAAAAAA:1 + chr3L 7215552 3' - copia 4907 2 64.36 TTTTCAAATGTGTGGGCGTGACAGTTCTGGTCGGTTTACGGGAGTGGCAATATGGGTCAAGTCAATTGTGTGGCGTCGATTTCTGGTCGTGTTCGTAAGGG:1 - chr3R 6808292 3' - INE-1 251 1 59.41 ATATATTTTTTAAATTTTAATTTGTTATTTAAGGAATTTACATTTCAAATGATGACTGCACTTTCCGCTCAGCAAATACTTATATGAAAAGATTTCGATAG:1 - chr2L 7111772 3' + copia 4671 1 59.41 AGGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACTCCAGGATGGCCGCCAACTGAAGAAAGTCGGCGCCACGCCGAGTAAAATTATGCATACCACAATGGGGCAGG:1 + chr2R 15160212 3' - Doc 379 2 72.28 GGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATAATTAAGACAAACCTATTAAAGGAAGACCCCA:1 + chr3R 3347282 3' + invader2 378 1 70.71 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCG:1 + chr3R 24228961 3' - 297 23 2 56.44 GGTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGGCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAA:1 + chr3L 23678147 3' - Osvaldo 24 1 73.74 ATTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGTATTATCCACCCTCATAAGCGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTCAATCAATTGTATGGCACAAG:1 + chr3L 1320927 3' - gypsy7 5092 1 60.40 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTATGACAAGCGTCGGGGGTCGGGAAAAATTCTGGAATATAAGAT:1 - chr3R 29413042 3' - hobo 11 1 68.32 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCGATCCACAGGTAGCTATATCGAGAGTGCCGCC:1 + chrX 16272526 3' - pogo 2 1 75.53 TATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGATATTATAGTGCGGCAGGATAGAACGCTTTAAGTCGAATG:1 - chrX 5301250 3' + Cr1a 462 1 64.36 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCATCAAATAACCCAATGATGATGATCTTTTTATAATAATGATTACACTTTTTGGTG:1 - chr2L 14981435 3' + hopper 1396 1 60.00 GAAGAGAGATAGTCGGTGANTGTTTTACATTTATATTTTACATATTGTGCTCAAACAAGTAAAGTTCCTAGTAATTTTATAGTTGTGAGCCGCACTTCCAT:1 + chr2L 14979259 3' - Ivk 1 1 72.28 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTGGCCCCCTCCTACCGACCGATGTCCAATGGCAGGACATAAA:1 - chr2L 15331756 3' - 1360 35 1 59.41 CAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATAATCACAAAACCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATAGATAAAAGCCCTAGAATATCGAT:1 - chr2L 22997454 3' + Porto1 4317 1 74.26 TTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATCATGTCATGGTCAAAAAGCATAAATATTTA:1 - chrX 915551 3' - flea 40 2 71.29 TGCTAACTGTGCTGCAAGTNATGTTCGCGCTGCCTACGAATAAAATACGTTTGAGTAAAACAAGATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTAGGGCATGCCAC:1 - chrX 21531059 3' + Stalker 482 1 63.37 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTTTTTGTAATATTTGTAAGAATGCACAAA:2 - chr3R 6761015 3' - blood 49 2 75.25 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTAAACTCCAAAGCCGACTGTTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAAATTAATCATATTGAGTTCG:1 - chr2L 19698419 3' - hobo 7 1 65.35 TTATTTATTTTATTTTAATTGGTTTTCCTTATTCCCATTGTCCATTGAGCCCAACAAAAGGGGAGAATTATTTGAAACTCGTTTGGCTGGCGCGGCATTTT:1 - chr3L 8703090 3' - F-element 87 1 60.40 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTC:1 + chr3L 14311474 3' + roo 353 2 79.21 ACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTCGCCAGTATATACAGTATATACACTACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 10369787 3' + accord2 7249 1 63.37 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTACGTAACCTATTACCGTCCATAGCCTAAAGCATTTAAAGAAAATTATAGTTAATCCCTAAGAAATCTAGT:1 + chrX 10821975 3' - jockey 4806 1 72.28 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 33 2 53.47 AATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGAAACTCTTGCAACAGGAGAAACTCTTGCAACAGGAGAAACTCTTGCAACAGGAGAAACACTTGCCACAGGAGCGACAG:1 + chrX 8426714 3' + Bica 4566 1 76.24 ATGTGATGCAAGATCGCTCAAATATATATAATGTAATTTATATATGCGAACGCCACGTTTTATATGTCCTTTGCAATTGGCCACATCGGGAATGAATTGAA:1 - chrX 11960818 3' + F-element 136 1 77.23 CACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAA:1 + chr3R 11547766 3' - G2 305 1 53.47 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTTCGCCATGGCTTTAATTGCAGCTGATGCGAGGCGAAACCAACT:2 + chr2R 13745796 3' + hopper 1411 2 70.00 TTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTA:1 + chr3L 19339420 3' - Tc1 35 1 54.46 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATGTGGTTCCATCTACCATCTCCAAAGCTGTGCGTAAGCTAAGCTGTGCTCGAGTGCACAGAGTGACTCACCGGC:1 - chr3R 27605241 3' - opus 111 2 81.19 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGAAACTTGTGTACTCAAACACTCAAGTTGCCTGCGAGAAAAGGTTAATT:1 - chrX 22381954 3' + opus 7477 2 55.45 ATCGGGTAACTCGACTATAGCACTCTCTTTTGCATTAGTATGTTTCCAAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAAACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACC:1 - chr3L 27588 3' + INE-1 568 1 63.37 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATAGAGAACCCTAAGCACTAGCGTCATAA:1 + chr2R 22659072 3' - 297 37 2 72.63 AATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAAAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTCTTATGATTCGTTTTTTCCATGTAATTCA:1 - chr2R 11756979 3' + FB 670 2 76.24 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCA:1 - chr3R 14049332 3' - transib2 17 1 62.38 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACTTTTTTATGATATATTGTACATAAGTTGCCAAACCATATGTGAGTAAAGATTAATTT:1 + chr3L 16926110 3' + flea 241 2 66.34 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCAACTAAAACTCGCTCTTGCACTTCCAAACTGGGGAAA:1 + chrX 14979152 3' + hobo 2909 1 62.77 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGC:1 + chr3L 17708308 3' - jockey 4783 1 54.46 CTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGAGTTTTGGGGGGGCGTGGCAAACGGAGGCGGGAGTGGACGGAATGCCACTGCGTGTGTTGTACATTAAAA:1 - chr3R 22935833 3' - Quasimodo 299 2 77.23 CATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCAAGGGTTTGAA:1 + chr2L 2622798 3' + blood 7383 2 72.28 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCCCTTATTCACCTGCAGCCAGCTGGAAATTTCGCAACCCTTTCGCGCAGCCGTTGTTGCACT:2 - chr3R 9074034 3' + hopper 1401 1 61.39 ACAAAATAAAAATCAGGGCGCAAAAAAGACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATAGACGTTTTTGCTTTTAGTTTTTATATTGATGTTAAAGTCGTCGGC:1 - chr2R 3693457 3' - Cr1a 32 1 65.35 ACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCACTCTACGCCCAACGATACTCCCCCCCACCAACCACA:1 - chr2L 9081567 3' + 297 6497 1 61.29 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGAT:1 - chr3R 29374928 3' - mdg3 5264 1 68.32 GGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCTTGTCGGTCTTGCACGGTTTTAGCTGCTTGTAGTATTTTGGAGCACGGACAACGGGCGGTTTGCAT:1 + chr2R 14666371 3' + R1A1-element 5309 1 73.27 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCCTATCAGAATGCACAATATTTGTTTGCAGT:1 + chr3L 2016925 3' + Tabor 438 2 72.28 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAAT:4 + chrX 21668054 3' - Tabor 6892 2 76.24 AAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACAAGGATTAAGCTTTTGGCCAGCGGCAAGCAGCACAACCAACCCACAAACGACCTTCTTCTGCCGTGGAAGTA:1 - chrX 19089218 3' + Stalker3T 203 1 70.30 CTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAGTTGAGTAACTCTGGCATGTTTCTAATGCTTTTGTG:1 - chr3R 18541251 3' - jockey 4601 1 64.36 CGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTTTAAGTATTCTAAACATTAAATATTAATCAAAGATTA:1 + chr2L 4020764 3' + 412 457 2 59.41 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAGTTTTGATATATATTAACAGAGTTTGCGTTGCTCAAGAGGGCGGAATTTAGTTCGTATTGATAAC:1 - chr3R 10718033 3' - Juan 4037 1 66.34 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACACTTAACAATTTGTTGCAATTTGTTTATTAAAGTATTTTTAT:1 - chr2R 16453511 3' - roo 8697 2 59.41 CATGTATACCCTTACATACCCGGCCAAGCAAATAGAAATACAAAATAAATATTGCTTACTTAAACTTTCGCCATATGCTGCTCAGTCAGCAACAAAAACTG:1 + chr3R 29431957 3' + Transpac 4 2 76.24 GAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGCCTATTTTATTTGATGAGGGATTGAGTTGCCTTGGCGATCGTTTTCAAGGTATCCAATTTATTCTGTCAAAATAT:1 - chr3R 5122225 3' - Doc 3 1 76.24 TAAAATAAAACAAAAAAAAAAACGAAACGTATGAAAGACACCAGACGAGCATAATGCTCGGACATACC:1 - chr3L 1378711 3' + F-element 4685 1 88.24 ATGATTTGTTTAGAGGCGTNGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCG:1 - chr2R 15160295 3' - Tirant 27 2 52.53 AAGAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGCGCCGGTGTGCCCGATGTAAGAGTTTGAGTGGATATGTACGTAACGGCAAGAATAGTATTGATAATCATTTT:1 - chr2R 5273366 3' - Q-element 498 2 73.27 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTT:1 + chr3L 14311484 3' + roo 9027 1 70.30 TAACAATCTTATTCTTATCTGGTAGCTGTTGGGTACATCCGGAGTATTTTTGTTAATGTATATATGCATATATTTTGTTCGTCTGTCTGTTGGTTTTCCT:1 - chr3L 21265388 3' - Idefix 111 2 54.00 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCCTACGTAAGTGTATGTGCACGCGCGCCAGTATGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTATG:1 + chr3R 9418247 3' + hopper 1404 2 59.41 TATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATTTGTTTGGGCGCCAACTCTAATCATAATTGTTGCACGCTGACAGACTAATTAAATTTTAATAACGCTCA:1 - chrX 10756924 3' - Burdock 299 1 64.36 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGGGGAGCAATCAGGAGCACACCTTCACTTCTGCCACATGCAGACCACATGATCATCTTGTGCACTGA:1 - chr2L 10020754 3' - hobo 10 1 69.31 AAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACATCTGCTTCTCCGTTTTCTT:1 + chrX 3271219 3' - hopper 145 103 90.70 TCAAAATACAATTTACAAAAGTTTTTGACATTATGCCAAAAAACAGGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTCTGTTTTTGT:1 - chr3R 447121 3' - transib3 43 1 58.42 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAATTGAAATTATTTGAAAATTTTAGAATGGAAAAT:1 - chr2R 2262983 3' + Juan 4168 1 71.29 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGGGGATATTAACGAACGAAAGTTCTATTGGAAGCTAAGGATGTGACCTTTCTACCAAAACATAAA:1 + chr2R 13956925 3' + P-element 2876 1 70.71 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTCATTTCTGTGTGTGTATTCGTTTGGCTTGTGTC:1 - chr2L 1858317 3' + pogo 2065 1 65.35 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTCTGCTGGTGGCTCATTTGCATATTTTAATTGTCCAAAA:1 + chr2L 14970132 3' + hopper 1381 1 61.39 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGGGGGTATGCTCTGCACACACTTATGACAAAACCAGATGGAAGCTAAAC:1 + chr3R 19963456 3' - 1360 27 1 53.47 TCTCTTTTGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCTCAGCTCGTTTTCCCCCGCCCGTCTCTTCAGTGCATCAAGTTTTG:1 - chr2L 16103421 3' + invader3 5344 2 55.45 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTAC:1 - chrX 9816263 3' - BS 5025 1 62.38 TAGCTCGTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATCCTCAGCTTTCCCGTGCCCCCGCACATTTTCACATTTTCTCCTCCATCTCGATGCAAGCGTAACATT:1 - chr3L 10813306 3' + diver2 262 2 71.29 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAGCGGAATGTTAGTCAAACAATTGGTATGGGGAA:1 - chr2R 9281875 3' - FB 44 1 71.00 ATCTTGCCGATGCAGCTAANTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTGTGATCAATTTTAAGCCCGCAGCTTTTCATAGCGAACTTTTTG:1 + chrX 15290323 3' - pogo 27 1 56.44 ATACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGTACGACAAAGGACGACAA:1 - chr3L 13366384 3' + hopper 1359 1 75.25 CCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATA:1 + chrX 21772503 3' - springer 48 2 65.35 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAAT:1 + chrX 21668075 3' - 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jockey 190 1 66.34 ATAATAATAATAATAATAATAACAATGCAATTAACAATTACAATTATTATGTTGGCATACCTACGGGTTAAGTCCCATGTTGGGCGCACAAATATCTCGC:1 - chr2L 4744025 3' + mdg1 38 8 53.00 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGCATGTATTTTAACCTGTGCTGAATCGATAGTTGAGAAGTAATCCGTGTC:1 + chr2R 15794770 3' + pogo 2077 1 55.00 GTAAAAAAAACAGGCCAAANGCCCCATAGTGCAATGGGGCACCACCCACCCATAGGGCTGACCGAGTGTGGGCGTGGCTCCACCCACTAATGATACGCTTC:1 - chr3L 15745320 3' - hopper 10 2 69.31 AATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTCACGAAGCATTAATACACGTAAATCATATGCATATACATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGG:1 - chrX 13590512 3' - gypsy7 5011 2 81.00 GACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCAAGTTTGTTCCCATATCTGATCTCAAGTATTTTATTACCGCATTGCCCAATCTGTGATTTT:1 - chr2L 14979951 3' + Ivk 268 1 60.40 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTTTTATTTGATAAAGTCAATAACAGAAGAACAACATATCC:1 + chr3L 23041589 3' + copia 253 1 62.38 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACT:1 + chrX 20999568 3' - BS 35 1 66.34 GGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGTATGTATGGTAGGTTCTACTAGGGACTCGCACCGTTTCGGTCCACTTGGTGTAGGCACTTTGAATCAGC:1 - chr3R 4646294 3' - 297 6581 1 78.22 CATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACGTATGTGGGTGAGCTGAATTATCCCGAAATGAGCTTCAATGCCAAAACACCC:1 + chr2L 17940326 3' + Stalker2 7482 2 61.39 CACACACACACACATGCACACAGAGGAACGAACACACACTGGCACAAATGAGGGGGGGGGTAGTAAATATTTCAGGGCAACATTGCTCTTGCTTTCGCTCA:1 + chr3R 24079860 3' + accord 190 2 61.39 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTATGACAAGCGTCGGGGGTCGGGAAAA:1 - chr3R 29413059 3' - hobo 28 1 51.49 ATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCCATGTATAGACC:1 + chr2R 1922483 3' + gypsy 7414 2 65.56 TTTTTTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTG:1 + chr3L 24916684 3' - Porto1 155 1 62.38 GTCTAACGAAGAAATTTAACGGCCCTTGCACTTTGGCAGCTTTTTTTTTCATGCTTCAGCTTCGGTTGAGGCTGACGCCCCCAAGGAAAATTGAAAAACTA:1 - chr2L 9468915 3' + looper1 432 1 76.24 AAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTAGATAAACGACAAATGCGCTTTCCACGAAC:1 - 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chr2R 9061922 3' - jockey 4699 1 57.43 AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGGCTGTATATATATAAGTATATATATTTATAGGCCATAATCTTGGTGGAATACTTACGCGCA:1 + chr2R 16068709 3' + Burdock 244 2 61.39 CGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCACGCCTACCAGCCAACCAACCAGACTGCCGCCACC:1 - chr2L 19632053 3' + F-element 485 1 64.21 GTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAATAGTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATAT:1 + chr2L 16958112 3' + 1731 4579 2 70.30 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTTTTATTTTATTATATAAATACTATACGTTCATGA:1 + chr3R 6239045 3' - jockey 4682 1 66.34 AAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATGTTGGTGTGCGGTTTGCGCTAAATATTTGTTGTGTT:1 + chr3L 8748752 3' - FB 984 2 65.35 AAATTGATGGAAGGGAAGGGAACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAATCGGAGTGCGGGCGCAAGGCCACTTTGCCAACAATGTGCTGTCAACTTCCG:1 - chr3L 12619004 3' - Gypsy12A_LTR 2241 1 56.44 TTTAGATTTCTTACGCTCTCATCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCCAGTCTCTTCCAAATGCGGCAGGAAAGTATACATCAAGGAGCGG:1 - 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roo 8718 2 77.23 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGG:2 + chrX 21668070 3' - Tabor 6876 2 60.40 CCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATCAGATCAAATCCCATTCCAGATGGTGAAAATGAGCCATGG:1 - chr2R 23583929 3' + McClintock 6166 2 63.37 CTCCAATAGTTTAGGAGGTNTTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATG:1 + chr2R 13316191 3' - hopper 39 1 63.37 TTTTGTTTTTAAAAAAATAAAAAGTATTCATATTTGGATACTAAAATCAATGTAAAATATTTATCGAATTAATCCATGACTCATTCTCACTTACAATGAGT:1 + chr3R 23303940 3' + Tc3 1558 1 90.10 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATACTGCAAATGCTTATCTGAAA:1 + chr2R 21508012 3' - 297 49 2 79.21 AAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGGGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTGGCAACAAATTAACTGCCAACCGCCCACT:1 + chr3L 3928526 3' - G2 2937 1 69.31 ACTATACAAGCTAGAAGGTTAAGATTCAGAATACAAATTCTAGAGACAATGATGACCACCGCCCACTGTTTTATTAATTTGAAAGCATTTCGAGTACTTTG:1 - chr2R 21027544 3' + INE-1 160 1 63.37 AAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTGATAGCGTTTTGGACTTCATCAACGAAGATATACATTAAATTAAGTAAAT:1 + chr3L 23287637 3' + invader2 5032 2 51.49 TGACAAGGGTCAGCAGAAGCTGACACTTATCATAAACCTTTTATATTATTGTTATGTATTGTATTTATTGTAATTCAGTTGTTTAAGTATTTGTTAAGTAA:1 + chr2L 3607809 3' + X-element 4531 1 72.28 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTA:1 + chr3R 18883810 3' + roo 357 2 76.24 TCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCATGGGAAAACCGGCAAACAGAAAACAAATGTCGATGGGTATGCGACGG:1 + chr2R 11699363 3' + roo 411 1 79.21 TACCATTAGCTTTAATGAAATGCATATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAAAATTAAATTGCTGTTGAAAAGATTTATG:1 + chr3L 14878682 3' + Juan 4168 1 70.30 ACTTGGGCAGGGGTTAAGTAAGATTAAGTATGTTGAGTAAGGATCAAATCAACCGAGAAATCACAGCTCTCAGCGTTTTTGTGCG:1 - 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HMS-Beagle 18 2 65.35 AGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTATAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGA:1 - chr2L 18177046 3' + INE-1 542 1 67.35 TAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAGTGGACTCGG:1 + chr2L 20290325 3' + flea 256 1 79.21 ACAGCATGTTGGTTGTCATNTCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCTGTTGCTGTTCCTCTTCGCTGACTGCTCCACTGTGTCCCAGGGAGTGTCTCTTCC:1 - chr3L 5697364 3' + opus 7439 2 63.37 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATATAACCTCCAAAATATCAGTTTATATCAGTTT:1 + chr3L 5025665 3' - roo 8708 2 72.28 GTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAAAACTTATGGACAAGTCCAGAATACTGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTAT:1 + chr2R 545172 3' + X-element 54 1 54.46 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGG:1 + chrX 683591 3' - jockey 4788 1 79.21 TATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAGTTCAATTTTCCTCTCTGTTTATCTTTG:1 + chr3L 13227831 3' - roo 8890 2 76.24 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACAGTTGCCTTTGGCGCAAAAAAAAACAACTACAACGAAATTTGCTATATTGTTTCGGTCTCGATGTTG:1 + chr3L 14301671 3' + roo 395 1 64.36 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCC:1 - chrX 21667994 3' + Tabor 7304 2 54.46 CAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTGTGCGGATTGTGGTGCGGCGAGGCGGCGAATTCGATAT:1 + chr3R 6709994 3' - Porto1 351 1 62.38 ATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTAGTATTGAAGTAGGAATGCGCACAAATCCGCGTAGATGGGCATTGAGTGCTATTTTT:1 - chr3R 17729835 3' + gypsy4 413 2 54.46 TTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGATAAAATATACTGGAACCTCCTTGTTAACGAGTGTTA:1 + chr2L 12485499 3' + roo 410 1 79.21 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGGGAACAACCAACGTTTTGGACACCCAACCGCAGACTACTTCTAGTTATTTTA:1 + chr2L 791520 3' - 412 7077 2 55.45 CTGCTGTTGTTGCTGCTGGAGTTGTTGCAACTGCTGCTGTGTAATGATGGACTTGGTTTCGATGGGAGAGAAATGGCTGGAAGAGCTTGATTGATGGGGAT:1 + chr2R 16219307 3' - TART-B 151 2 64.36 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACTGGCAATGTCCGGCCAATCAAAATGATGAAATTTCAATTCTTCTCCGTGGGCCTCG:1 + chr3R 22165202 3' + opus 7494 2 57.43 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCT:1 - chr3L 2029705 3' + roo 9027 1 66.34 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGGTGGTAACGGTGGCCGTAAACTTTTCGCCATGGCTTTAATTGCAGCTGATG:2 + chr2R 13745780 3' + hopper 1394 1 59.41 TCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAAATTTTTGAATACATGTATACTTATTTTGGGTGAATCAGCCTGTGTAAGCCCCATTTCGGTACTATAGTTA:1 - chrX 3343293 3' + Cr1a 4244 1 62.38 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCGCTTTTATTGAAAAGTATCTTTCGTGGTGCAAAGAACCTTTT:1 + chr2L 7161369 3' - pogo 32 1 59.41 AACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGCTG:1 - chr2L 20360646 3' - micropia 19 2 58.42 GAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGC:1 + chr2R 5303157 3' + FB 246 1 70.30 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAACATTTTTGGTCGAGAATTCTAAGGTCGGAAATCCGACT:1 + chr2L 6112866 3' - blood 7044 2 58.76 TGAGATCTCGACGTTCATACGGACGGACAGACTGTCGAGACGGACACACAGGGACGATCACTGCAAGTGAAGAACGGAGAAACGCAGCGATTCACGGAG:1 - chr3L 23933391 3' - INE-1 135 1 67.68 CATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCAAGGGGCCTTAAATTAGGTTCTTCGTTGTCCAGAACGTGTTCTGTGTTATGATGCTGGACTGGCTC:1 + chr3R 31562432 3' - Quasimodo 397 2 79.79 ACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCTCCCCCACAAAATGATTTAGTGTAGCATTTCTCCCATTTTCTCGATTAATTTCGATGGTC:1 + chr2R 8000171 3' - invader3 5440 2 65.35 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTTTTTCGATTCCTTTCTTGCATAACTTTAAGTAGAATATTTCGAGATATGGTGAAATATAT:1 - chr3R 27199757 3' + roo 393 1 56.44 GTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTCACGCTTTCCAACTTTTATTTCTAATCGAATCTCTTTAATCCAGGAGCTGTTAGATGCCGGTTGTAAATT:1 - chr3L 25987397 3' - Stalker 6794 2 67.33 CCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCATCGATAAATAATGATTTTTGTAGCATGCTTTCGGGCGCTTAAGATTGCGT:1 + chr2L 9287234 3' - jockey 15 1 69.31 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCCAGGCATCGAAGCTGAAGTGCTTATATACGCCACTGTTTGAGAAA:1 - chr3L 13059683 3' - transib2 28 1 54.46 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGATCATAATGTTTAACTGCGGCGTAATTATACACATTTTGTGTCTAATTGTAATAAAGTTTTTACGTGG:1 + chr2L 7991913 3' + P-element 2881 2 69.31 TTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCTGTGTGCAGTTGCAAATTTAATCAATTGATGAGGCAGTTGCAACTAGCAACTTGCAGGTTGCAGGTTGCT:1 - chr3L 7578033 3' + jockey 76 1 73.27 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGGC:1 - chr3L 2029675 3' + roo 394 1 60.40 TCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTGTATATGATGGCTGGGTATGATGCCCCAGTCATGGGAAAGTTTTGCGTCATTTTGGGAGCAGGCAAGTCTGGT:1 - chr2R 23311890 3' - Doc 4492 1 67.00 CGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGCGATTCCCAATGTGCTGCATATTGCTACGGGGTCTTGAATCCCTGCATCGCGAGCATGGGCAATT:1 + chr2R 11414740 3' - accord2 7428 1 65.35 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAGGTGCATAAAAACAACAC:1 + chr2L 8702829 3' - roo 8718 2 80.20 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAGTTTTAGTTTTTTAATAGTACGCTA:1 - chr3L 5025589 3' + roo 396 1 64.36 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCTACTGAATAAAGAAAAGTGCTTCT:1 - chr2R 4850780 3' + roo 9020 2 80.20 TTAAATTAATTAAATTAATTAAATTACACTATACTTCATATAAATTTTCTTTAAAGTTACTACCCTAGATTGTTTTAGCAACAACATAATTTACGTAA:1 - chr3L 10118473 3' + transib3 2666 1 69.39 GCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCC:1 - chr2L 21369864 3' - rover 43 2 72.28 GAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCCTC:1 + chrX 22383363 3' - invader1 3620 2 37.62 AATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATATATCGCAGACAAAGGATATAGAACATGTATTTT:1 - chr2L 5419802 3' - 297 21 2 67.78 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGTGAATAATAGTGGTTATTGTGGGTTA:1 + chr2L 11832582 3' - roo 8713 2 77.23 CAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGCTACTTTTAATTCGTTTTTTTTTTGTTGGAATTGTAACTTCAAAGCTTGCGGACGGCTGTTTCGCCAGCT:1 + chrX 14345760 3' - accord 185 2 73.27 AAAAATGCATTACAATTATTACAGCCTATCAGAATGCACAATATTTGTTTGCAGTTTTAAAATTCAATGTGATCGGTGTAAAATTTGAAACTATTAAGCTT:1 + chr3L 2016971 3' + Tabor 484 2 68.32 CACACACACACACAGACTCACAAAAGTGTAGTGGTAGCACACACACACAGGCAGCAAAATAACGGTTACTGTCGAAAATATTACTGGGAAAAGCCACGAC:1 - chrX 8640656 3' + accord 188 2 49.00 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATAAGGAAAGCAGACTTTACTTTAAT:1 + chr3R 22520974 3' + opus 7492 2 68.32 GAGTGTTTATCGGGTGGACNTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACATTAATGCATAATGAATGAGAGGAGCCAGGCCCAAACTGCAGG:1 + chr3L 13639921 3' + hobo 2909 1 56.00 CAGCAGCAACAACAGCAGCGGCGCTTGCGACAGCAGCAGCAGGGAATTGGTGTTGCCATATGA:1 + chr3L 13430685 3' + TART-B 155 2 60.32 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTCGTGTGCGTGTGTGAGTGAGAGTATGTGTGTGTGTGTTTTTGG:2 + chr3L 11247428 3' + jockey 4957 1 56.44 CACTCCCCTACACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCACAATACATAGAACCGAAAACAATTGTAAACATTCTAACCATTTTTAACCAACTACTAC:1 - chr3R 14562806 3' - gypsy8 4673 2 70.30 TGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGT:1 + chr3L 25350823 3' + baggins 5416 1 41.58 GTTTGGTTTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTCATGTGGGCAATTGTTTTACTGGGCGCGGGTATCGAGAATACTTTAGTATTGACTCAGTTTTTTGGGGTAA:1 + chr3L 16630814 3' - I-element 5061 1 75.25 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGGAGAGCGCGCTTTCGGTTAAAGCTCTCTCTCCGCAC:1 - chr3R 10093672 3' + P-element 2872 1 64.36 ATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTACTAAACAAGGGCTTCGTGGAGTTCTG:1 + chr2R 16042285 3' + I-element 313 1 77.23 TTGATTTGTTGGTAGAAGANGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTAGTCTTTCGTTTCAAAGGAACTCCGACTGGT:1 + chr2L 18959584 3' - F-element 341 1 68.32 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATATATATTATAAGTTTGATTATATTTATTTGATCTTATCCATAACAGTGATGTTGACGTTAGATG:1 - chr3L 21275743 3' - HMS-Beagle2 6891 2 71.00 ATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGCCTACTTGGCCGCCAAGGGAGAAGATTTGGGCCCTGAATGTTATGTGTACACCACCAAG:1 + chr2L 19759356 3' + micropia 5380 2 64.36 CTTCTTTTACCAACAAATCNAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTGCCTCCAACAACACTCACCACATTCGG:1 - chr2L 5944437 3' + F-element 342 1 79.21 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACAATCACGCAGTTCGAATACCAAAATCCATTGCATACTTGCAGGCACACTCCGAAAAT:1 - chr3L 16493926 3' - jockey 4809 1 63.37 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTACAATGCAGGAGATAACAATGTGTTTTCTCTCTGTGTAGCAGACTGGGCCT:1 + chr2R 20145154 3' + opus 7484 2 48.51 TATTTATATATTGATATTTATTACATTTAAACTCTTTTCATTTATTTCATTTTTCAACCTCACAAATTAGAAAATTATATACTTTCGAAAAATGTGCGATA:1 - chr3R 12881780 3' - Stalker 6935 4 45.54 CTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAA:1 - chrX 4349891 3' - G2 3002 1 73.27 AACAGCTACAATGGCCGATTTATGTGAGTCAAAGAGCATTCCAAGTGGCCGCCCGAATCCGCCCAAATTCGTCATGCAGCCTGGCAGAATCCAGTTTTCAG:1 + chr2R 14313858 3' + Doc4-element 402 1 81.19 GAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGTGGCAGGTGCAAGCTACACCCGAAACACCAACAAAATACAAACAT:1 - chrX 15261686 3' + F-element 312 1 59.41 TATGCTGTGCTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCTCCCAATGCTGGGTCAGCACATTGTTATTAGGTTTCATACCTTGATCGCAACCGACTACGGGAACTTG:1 - chrX 17329827 3' - Gypsy6A_LTR 92 1 75.25 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGAAAATCTAGTTCATGATAATGGAATGAAGTCTTGGGCTATTTA:1 - chrX 1203192 3' + Transpac 279 2 59.41 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACCCATTTGCTCATCTGCTTGTCTCGTTTGGTTGGTTCCATTGAATGCGCCGCTTCCTTCCGT:1 - chr3L 5533535 3' + pogo 2089 1 63.37 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATAGTAGTTT:1 - chr2R 13647834 3' - blood 43 2 66.34 CTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGTACATTGTTAATGGTGAGTGGGC:1 + chr2R 14641315 3' + Doc 4380 1 77.23 AAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGCCAAAACAGCCGACTGCAAAGCGCTTTCGGCCACAT:1 - chr2L 15958350 3' + Quasimodo 309 2 69.31 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTAACCATAAAAACACTTCGCATAAACGTAGAATGTATGTTTTTGGATCCGTAGAAAAACC:1 + chr2R 7542247 3' - mdg1 19 2 58.42 AATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCAGACTCCAGACTCCTGTTTCTTGCCCTGCCTTTGGCTTTTTGGGCTCACGCACTTTGGCATCTTTC:1 - chr3R 13958247 3' + micropia 105 1 64.36 TCTTGGCGTTATCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGG:1 - chr3R 24228897 3' + 297 6928 2 72.28 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGATGCCAGGTAACAAGAATTTCAGTCTTGATTAAAGCACC:1 - chrX 18050587 3' - 412 7090 2 60.40 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGGATGCATGAGAAAAATCGCAGACAAAGGGCTCCCATTTCAGTGAAAGCAATTGAGCGAA:1 + chrX 4279574 3' + blood 361 2 62.38 AAGAAAAAAAAAATAAATGAAAAAAAAGAAACCA:1 - chr2L 10269554 3' + Doc2-element 226 2 85.29 TTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAA:1 + chr3R 1844823 3' - Cr1a 152 1 69.31 AGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGTATTTACTTTACTTTCTTGGATTAACAAACTAGCAATCTCGTCAGGTATAGAATATTTCTGC:1 + chr4 171668 3' + flea 4892 2 70.30 CTGAGCGCCTCGAGTATTGCCAAGAATCCAATTAATCACAAGCAAGGAAAACTACAAGAAAAACTCAACAAATGGCAGCGTTTATTGTAAATTGTTCAGCA:1 - chrX 16838217 3' - frogger 425 1 60.40 GAATATCAAGTCAGAGCTACGACCCTGCTACCGGCTAAACCAGGTTGGTAACGTTTGCAACCACGTAAACAGCTACAGCGGCCTACTTAAATTTCTTCAAT:1 + chr2R 4578479 3' + Chouto 186 1 68.32 CCAATATGCGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTCGCTCAAAGGCGTGCCTTCTGTTTCTGTCCATTTGTCCGTATCACAGAGCTGACAATATGGCTATTTTCC:1 - chr3R 14011873 3' - gypsy7 393 1 75.25 GAGAGAGCCTGGAGCCACCNCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCA:1 + chr3L 24761248 3' - 1360 73 1 56.44 CTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCTATGTGATATATTTATGACCTTGAATTTAAATTATTTTTAAAATGCATTTAACTTTTCAAAATTCGGTTCTTTT:1 - chr3R 28591417 3' + Tc1 6 1 69.31 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCAGACAGCCGGGGGCAAAACAAAAATTTTCGCATCGCCCAGAA:1 + chr2L 10924281 3' + hobo 2907 1 58.59 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTAATCAGTTTGAAGGCGCGTCGAGGCCTCTACCTTTCT:1 + chr3L 1227356 3' - 412 7091 2 60.40 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATTGTCTGCCGCCTTTCAACACATT:1 - chr2L 19629937 3' + copia 5071 2 79.21 GGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAGCAATAGCTGGGGCATCGGCACCGTGAGCTGGAG:1 + chr3R 27605337 3' + opus 459 2 68.00 AGCTTTGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGAGGACAAGGACGGAGATTCGATTCCTTTATGAGCGGGGCACG:1 - chrX 4664596 3' - Ivk 236 1 58.42 AAAATCTTAGATGTACTGGGTTAGTGGGTTGTTTCCTTGACAAAACGCCTCCTCCGCGGAGACCAGCTGGGCCATTTTGTGAGTGGTTATACGTTGGTGGG:1 - chr3R 11365908 3' - Tom1 245 1 69.31 GCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTA:1 + chr3L 13739617 3' - BS 5050 1 81.00 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAA:1 - chr2L 3581982 3' + transib2 2787 1 68.48 CATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTCCGGACAACGTGCCGCATCAGCAAACGTCTTGTACCGTAGCCATGTTCAACCATGT:1 - chr3R 28564472 3' - micropia 4990 2 59.00 ACCATTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCGAGGGCAGAAAATATCGACGAAAATACATTTTTGTGCAAGACAAGCCAAGCCACGTTTCTCATTTCGAATC:1 - chr2L 21235373 3' - INE-1 158 1 68.32 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTAAAATTTACATAA:1 - chr2L 18239417 3' - hopper 24 1 53.54 AGAGCTCCGCTATGACATCAACTAACTAAATGGCGATGATCAAGGCTCGCCGAGAGCTACATCTGAAAGACAAAGCCGTGAAGAAGCTAGGGAGGAA:1 - chrX 4777089 3' - mariner2 51 1 68.04 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAACGGACACTCTTTTGAACGGACAACCTCAATCTAAAAAAGTACTGTCAGTATAAA:1 + chr3L 7215568 3' - copia 22 2 51.49 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACTAAGCGTTAATACGTTAAAATAATGAAATGTG:1 + chr4 1043585 3' - Doc 55 1 68.32 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATCTGCATTAATGACACACGTGTCACTTAGCAT:1 - chr2L 11894808 3' + I-element 5313 1 68.32 AATTCAGTGCACGTTTGCTCGTTGAGAGGAAAGGTTGGTGCTGGTGTATTGCTGTTTCGGTTTCTGCTTGTGGGTTTATGCAATCCAGGGGTACAAAATCA:1 - chr3R 10094349 3' + P-element 62 1 65.35 GTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTACGCTCAACTCCGGCCCCCAGGATATTCTTCCTTTCAATTACACACCC:1 + chr2L 11233469 3' - F-element 4415 1 52.00 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCCCATTCGGTTCCTTATGGCCAGTGGGCGTTTATCTGC:1 - chr2R 18204444 3' + roo 9035 1 60.40 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCT:1 + chr3L 13739649 3' - BS 5019 1 54.46 CGCTATGGCCGTCGCTTCAAACTGGGGAGGGAGGAGTTACCACCATCACCACCCCCAACCCCTCCATTTCGCACTTGATATTGTGGTTGTTGCTCTTTTAT:1 + chr2L 8094137 3' + Tirant 8076 1 60.40 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCCCGATCTGAGCTTGCGTACCTTAAGAC:1 - chr2R 1861714 3' - copia 50 2 73.27 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTG:1 + chr3L 19274871 3' + transib2 2788 1 61.39 AGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTG:1 - chr2L 13598190 3' - pogo 34 1 59.41 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCTCCTTAGCTCTTTTCCTAAACCAAGAATTCACTCCAAGTCTCATTCGATTTTCAT:1 - chr3L 18314560 3' - copia 4891 2 48.51 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAAGATAATGTAGAGTCAGATTTCCCAAT:1 + chr3R 3258926 3' + mdg1 7411 2 72.28 TCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCCAACCCCAAAACTCAATCTCGTTAATTTTTAATC:1 - chr2R 20519090 3' - Idefix 371 2 66.34 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGAGCATGTTCTTCTCTAGGTCTGTATTAAAACCAAAGATAGTCATAGCG:1 - chr2L 9724196 3' + 1360 3362 1 54.46 TTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGCCGTGCTTAATTTCACTTTCAATTCCTTCTATCTATCTGCATTTCCTTACCCGCTCCCCCAAAGG:1 + chr3R 14189432 3' + R1A1-element 5016 1 70.30 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGG:1 - chrX 21668009 3' + Tabor 450 2 57.43 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACACGCACACGAGACGGGGATAATATGTTGCCCCATAAAGTATGCTA:1 + chr3R 24442506 3' - jockey 4699 1 62.38 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTTGTTGTTTATGGTTGTCATTATCAGGAGGAATTACCATT:1 - chr2L 18561275 3' - jockey 90 1 61.39 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAACCATACA:1 - chr2R 15160271 3' - Tirant 5 2 75.25 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTTGTGGAGAGTTTAAAGACTCTTTCA:1 + chr3L 25876160 3' + copia 241 1 72.28 AAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATGAGTTCGGCGCGAGTGTGTGGGTTCTGCGGGAAAACT:2 + chr2R 13316227 3' + hopper 1412 2 76.24 TCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTG:1 + chrX 21087630 3' + mdg3 249 1 57.50 TTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCCGGTCAGATCTACCAAAGTTTAAAACGTCGATCAGGTTTACCGAAGTGACAATAGTGACAAAG:1 + chr2R 2110190 3' + transib2 2669 1 70.30 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCACAGATTTCCTTTATATCTAAGCAATAA:1 - chr3L 21110283 3' - 297 41 2 74.23 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGATTTAACTCGGGCTTATGGCATTTTTTAATAAATTTCCCAAACCATAGATGAGTACTCACAT:1 - chr2L 19907891 3' + Tirant 8480 2 50.50 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACGTGCTCGCTTTTTCTGTCCGTTACCGTTACCTCGTGTCTGCGTTCGCGTATCCGTGTGTCTGTCCGCG:1 - chr2L 13549225 3' + P-element 2883 2 71.29 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATATTATTATTCAAAGCCCAT:2 - chr3R 15523320 3' - 412 57 2 81.19 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGTAAAGTTAAAGCGACGCAAATCGAATCGTCGAGCAAGCCAAC:1 + chr2L 12801038 3' + hobo 2921 1 61.39 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAATAATATAATAATATTATGATGAA:1 + chr2R 25071818 3' - Doc 78 1 77.23 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCT:1 + chr3L 17136034 3' - BS 28 1 52.48 CTCAACTGTTTGCGCCCTTNTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTTCTCTTTATGCTCTCAAAAACTGTCACA:1 - chr2R 20520178 3' - Max-element 10 2 67.33 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACACCGATGCCGAGGGAGAGCGAGATCGCTGAG:1 + chrX 9584722 3' + pogo 2059 1 68.32 ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGA:1 - chr2R 4673595 3' + Quasimodo 7320 2 79.21 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCCAGCCGAGTGATTGATCGAAGGTTGAACGACCGCGTATATGTATGTACATATGTGGT:1 - chr3R 19108856 3' - roo 5 2 56.44 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAA:1 - chr2L 2016762 3' - Doc 54 1 72.45 CCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTGCACGCGCTGACACTTGTCAGATGTATCGCAAATAAAGCA:1 - chr2R 7426442 3' + Stalker4 180 4 60.00 AGGAAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAATATATATCTGCTGATAAATATAAGTATGTTGTCGCATATGGCACACTTTTAGCTGCA:1 - chr3L 15390320 3' + pogo 2099 1 69.32 AAAAATTCATACATTTTAATAAAAGGCCTTTATTTTTACAGTGAAAGTCCAAAATACGACTTCAGTATAACCGGTAGGTAAACATTGACAAAATAAGAAAT:1 + chrX 18066473 3' + S2 1638 1 56.44 GAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCACTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATCATTCAAGAAGGTGCCATTCTAAGAAATGGAAATA:1 - chr2R 1905130 3' - Max-element 8275 2 65.35 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACCCTTTTCTTTGGTTTCTTTTTATATAAATCAG:1 - chr2L 7161312 3' + pogo 2060 1 78.22 GTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAATCGTAATTAATGGACCTTCGACCCCGGTAAAGCG:1 + chr3R 2446906 3' - 1360 3236 1 69.31 CGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACAGGACTAAAAGTTTTCCTGTAGAATTGAGTTGAAAT:1 + chr2R 17734535 3' + Stalker4 7335 2 69.31 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATTGGAAACATTTAATAATAAATACGTAGGGAGATA:1 - chr3L 11523284 3' + hopper 1376 1 64.36 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTTTTTCTTCTTTTCTTTTAGCTTCTTTTGCTGTGAAAAATGAATTGCCCACTTTTGGGGGCAATTTT:1 - chrX 11182730 3' - jockey 9 1 70.97 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGGTCACAAACGGGGTGGGTCTATTGCGA:1 - chr2L 1201994 3' - Stalker2 50 2 75.25 TGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTT:1 - chr3L 14878662 3' - Juan 52 1 77.23 TTAATTTTGTTATACAAAATAAGTAGACGTGGCATTTTCTCGCAGTGCAGATATGAACTCACCTTGACAACCTCGCTGGCGGCGAAGGGTTCACGGGATAT:1 + chr3L 11183651 3' + Ivk 5376 1 67.33 GCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAATATCGTCGTATCA:1 - chr3R 1440144 3' - G-element 16 1 64.00 TTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATG:1 + chr2R 8528247 3' + Transpac 260 2 75.25 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGTGTGCCTTTGGCTCTGA:1 + chrX 6388333 3' - hobo 31 1 52.48 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGGAGAGCGCGCTTTCGGTTAAAGCTCTCTCTCCGC:1 - chr3R 10093674 3' + P-element 2870 1 62.38 AACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACCGAATATAACCCGTCCACAACATGGCATATAGTCGGG:1 + chr3R 31045895 3' + INE-1 142 1 79.21 AATAATTTTGAAAGGACAAATAAAAGTGTGCCAAATTTTAAAAGTTTTCCCATTGCCAAGTCGCATTGTCCCGTCCTTTTCTCTTTGAGCTATATTTCCCT:1 + chr3L 15406113 3' + P-element 2509 1 61.39 ATATCAAGGTGAGGTATGCNGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGT:1 + chr3L 13704548 3' + opus 453 2 75.25 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCCAAAAGAGCTGCAAGTCACTCTACGGATCGGAGCTCCAGGTGGCTGATTCTCTAGGGGGATTCAAGAAA:1 - chrX 19034084 3' + hopper 1412 2 74.26 AACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATTGCAAGTTATCCAACCCGTAAATATAGCACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAACTTCAAACTCCAATCTTA:1 + chr2R 3514882 3' + Porto1 4207 1 69.31 TCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTTTGAACACCTGGTGATTGCCAAACTGGGCCGAAATCCCAATCAGTCACGGAAAACTATGTTGTGTGTTTG:1 + chr3L 21275853 3' + HMS-Beagle2 7193 2 56.44 CGGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAATTCGACTTTAATCCATAGTTTACTATATAGTAAACAAGGAATTTTAAGTGCCTCGATCGTCATTCCAACACAT:1 - chr2L 9781564 3' + INE-1 549 1 65.35 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCCGCGGAGGAGGACTATCTGGTGCACGCATCATTTGCTCGGCATACGTACGTGAGTGACAACATTAAA:1 - chr2R 8528168 3' - Transpac 4924 2 74.26 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCAAAGCGTTCGTCTCTAGTTTTGTACAAGTGCTGTGCAAATAATGCACA:1 + chr3L 13589634 3' + hopper 1390 1 54.46 TTTTTTTATTTTTTTAAATTTAGAATTCCATATTATATGAATAGTACTTTTTAAGTAGTTGATGCAGGTTTGTTTTTATAACAACCCATCAAGGATCAGTA:1 - chr3L 18038300 3' - TART-C 11096 3 71.29 AATAATTGAATAAAACTTAGATTTTGTGGTCGCTCATTCGGTTGGTATCTTTTACAGGGTGATCTTCCGCTGGCAGTACGATTCGCATTCGAAACTTCCGT:1 + chr3R 14812213 3' + Bari1 324 1 76.24 TGTTGATTTTTTTTTTATTTTTTTAGAAAAACATCGGAAGTCCAAGCATTGGAACTCCACTGTCTACGGCCTCAATCACACTCAGTAATCCCCCGTTCGTG:1 + chr3R 23535523 3' - gypsy7 5011 2 71.29 GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAAATGTAATAAATCTTTTTATTGGGTCAACAAGTCATTAAATTCGGTAACAACACCCATCGACATAC:1 - chr2R 19430447 3' - 3S18 12 2 67.33 TAAGGCTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTCCTAGATATGTTTGCACGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACCTTGAAATGGCCAACCCAATGT:1 + chr2R 4915955 3' - Tc1-2 1255 1 52.48 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGNCTACTACAATATTTCAATTAAAATTTTACACACGAATAAATGCAAAGCCACGCCCAGCACATTAGATTTCCCCGCTCGCTC:1 - chr3R 15530028 3' - mdg3 5259 1 70.30 CAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAAACGAATCAAAATTT:1 + chr2L 4247433 3' - McClintock 479 1 66.34 GGTTCGTAACTTACACGAACAACAAAAACATCAGCAACCGAAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACTAGCACAACAACAGTAGCAACATCCGC:1 + chrX 5838227 3' - opus 7106 2 82.18 AAAAACGAAAAAGTAAAAAAAAAAACGAAAATATCTCTGCCCGGCCCATAAAACGTAACTGGCATTTACCATTCGATCAATGAAGACCAAAGATTTCTTGG:1 + chrX 14621483 3' + Doc2-element 238 1 54.46 TTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTTAAGAAATTCTTTACACAAATCGTTTTCCTCTAACAGTGCCCTTA:1 - chrY 685064 3' - S-element 1555 2 79.21 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACCAGGTAACGGTGTGTGTGGGGGATTAC:1 + chr2L 9521697 3' + P-element 2838 1 31.68 AAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTTGAACCCCGAATCCTTATCAAAGATTCAGCTGTTCTATTGCTTCTGACTGGAAATTGCCA:1 - chr2L 5647341 3' + invader3 5447 2 62.38 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCAT:1 + chr2L 19907975 3' - Tirant 27 2 54.46 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTCGATTAATGAACAGTTTGGGAGCCACTGCATA:1 - chrX 14961045 3' + jockey 4948 1 67.33 TTTGTTTCAAACCTAACGGTTCTTTCTAAAAATACAATTAAAGTTATGCACACGTGTTCTGGGGGCCTTTGGCTATATGGGTCTTTGGG:1 + chr3L 8699154 3' + Transib5 112 1 66.29 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACTCTCGATGGCAGCGCCATGATTGGGATCCCCTAGCACGGTTAATT:1 - chr2L 16025693 3' - 412 7084 2 55.45 TGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATCGAAAATTGTTATTGGGAATCGGGAATCGGGAATCGGGAATTGGACCCACATCAAGGCGACCGCCATTATCTAGCTG:1 + chrX 8669091 3' - Quasimodo 34 2 79.00 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATGTATATTCAAAAAAAAATTTAAACTACTGGATGCACCATTATATTTTTTTTTAACTAAATCAGCAAAG:1 + chrX 23035839 3' + opus 7493 2 71.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTAACTCT:1 - chr2L 11832528 3' + roo 9042 1 54.46 ATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGAATATATATTTTTTGTTAAGCTGACGAAATTTAATCTCTTGA:1 - chr2L 16033401 3' - I-element 5336 1 64.00 GGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTGGCCGAAGAACTATTATTTTTGTGCTATGTGGAAAGTTGCTTACTGTAAAAAGTT:1 - chr2L 5626779 3' - I-element 4887 1 61.39 GAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGATCACCCTTTAGTCTGTCAAAATCACTGACAGTAAATACTCTTACCAAGGATAAATTAGTGTATTATATACAAATCAA:1 - chr3R 20362535 3' - 297 154 2 74.26 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGTCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGCTT:1 - chr3R 19094189 3' + P-element 2861 1 53.47 GTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATAAATCACATTCGCATTTTTCCATATTTAAGTTATCTACAGCTCATTTGAGCTTTAC:1 + chr3L 16197969 3' - Circe 7234 2 52.48 GCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACTTT:1 + chrX 21668101 3' - Tabor 6 2 73.27 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTAGCAATAACGGAACAATA:1 - chr2L 21369837 3' - rover 6967 2 64.36 AAGTGGCCGGTTTGGACCACTCAAATACGACACTCTCCTTCCACTTTTAAGCCGGTATTACCAGGTGCTTGGTCTGGATTTA:1 + chr2L 15040355 3' - 297 13 2 51.22 AGCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTTTTACGGGGCATTGCTGAATCTCACATGCATTATCATTGGCAGAATTCCAGGGCCAACTTCCTTTGCATATTCTCTT:1 - chr3R 19449286 3' + baggins 5116 1 63.37 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAAACAATATAATCTTTACGTACCAATTCCCATATTTCTGATTTTACAAACCAAATTAGCCTTATAC:1 + chr3R 23788524 3' + pogo 2094 1 53.47 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGACTTGCTATCTGCGTCGCCATTGTT:1 + chr2L 17307998 3' + hobo 2891 1 73.74 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCAT:1 + chr2R 14849012 3' - flea 4719 1 53.47 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCC:1 + chrX 16272485 3' - pogo 50 1 74.26 TTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAGAGGCACTCCCTTTGACGAAGGCGAGGAGG:1 + chr3L 5778153 3' + Bica 375 2 70.30 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTT:2 - chr2L 13310245 3' + mdg3 215 2 55.45 AAAATGTTCTCACAGATAATAGATAAATTTACTTAACTTACTATTATTGAACCAATTTGAAAAGAGGATATCTTAAGGATAAGGATATCCAGGATGAACAC:1 - chr3R 13937965 3' - Juan 44 1 44.55 CGTGGCGAGTAGCACCCGCNCACAAAATTGGAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATG:1 - chr3R 29413090 3' - hobo 57 1 76.77 TCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGG:1 + chr2R 5532322 3' - G4 3779 1 60.40 TATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGTTTGTTGGTGCTTGAATTTTGCATTTTAATTTTATATACGTAT:1 - chr3L 9660220 3' - I-element 5118 1 61.39 TAATAATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCT:1 + chr2L 20290299 3' + flea 5002 2 53.47 GGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTTTGTAAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - HeT-A 6051 2 75.25 ACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAATATCGTCGTATCAGAA:1 - chr3R 1440141 3' - G-element 14 1 66.34 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTATGACAAGCGTCGGGGGACGGGAAAAATTCTGGAATATAAGATGGGCACTTC:1 - 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I-element 5008 1 61.46 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAATACGCACTTTATGTATGTGTAGATATCGGTGTAGTTATGTGAGTATGTGTGTATGAGTGTC:1 - chrX 1716620 3' - hobo 14 1 66.34 CGTTCCGATCAGGGGGACTGCCCCCCACTGCGCTGTCCATCAACTGATGGTAGGCCTTGTAGTCGGCTAATTGGATTTCATTTGGGCAGAAACAACGCAGA:1 - chr3R 21498027 3' - Rt1b 401 1 53.47 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAG:1 - chr3L 14878658 3' - Juan 48 1 73.27 GGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATATATAGATTATGCCAGCGGCGATATAACTAATTTA:1 + chr2R 19352266 3' + 17.6 457 2 69.31 TATATAATTTTTTTTTGTTTGTTGGTCTGATTTCTGTCCTCCGAGGTCCTCCTTCCTTCCGCAGCCCTCTATTTTATTCCCTGCCCTTCTATTTTAATTTA:1 - chrX 13881988 3' + Tc3 83 1 65.35 GATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGAATGAGCAGCCAAGATGGAGCAGCACAGTTGGTAAGTAGGAAGGGCGCTTCAAACTTCCAGGGC:1 + chr2L 17567374 3' + Doc 4642 1 67.33 TATCGATGCAGCTAAGCGAGTTATACTGTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACACCACAAAAGAAGTCAAACGATGCGTTGTAAAAATGTTTTG:1 + chr2R 20389523 3' - 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pogo 50 1 76.24 GAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTCCCAAAGTTTTCCACA:1 - chrX 6263312 3' - micropia 4984 2 54.46 AGCAGAGAAAAATGTAAAATACAATGAAACACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAAACTGTATTATTTCCCTATACAATAAAGCCATCTTCATTTGT:1 + chr2R 5106494 3' + Doc3-element 4485 1 58.42 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTC:1 - chr2L 11832545 3' + roo 361 2 68.32 TGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCACTTGATCGAAAGTATAATATACTCTCAGTTCTCTTAGTTAGTAGT:1 + chr2L 18787722 3' - Stalker4 409 1 54.46 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTT:1 - chr3R 13582221 3' - BS 5024 1 52.48 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTACATATATATGTAAATGGTTTTAATTACGTGATTACGCTTACTTGTGTCTCGGTAA:1 - chr3R 19955209 3' + hobo 2919 1 59.41 TATGAACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACGATGGCTGGTCTGCGATCAGCACTGGTTAATTG:1 - chr3R 31045669 3' + INE-1 138 1 48.51 TATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAAAAAAATATATATATATACACTTTTGGGGAGGGAAAGGCATCACG:1 - 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chr3R 30284182 3' - blood 7013 2 76.24 GCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGCCGTGGCATTGCATTTTCCTGT:1 + chr2L 16424603 3' - F-element 430 1 77.55 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACTTTAAGTTGAGGAGAGATAATCAGGTTTAATTGGCGCACAC:1 - chr3L 7882237 3' - FB 36 1 62.38 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTACATGCAATAAATCGAATTTAAACATCATAACATCTGTTTTAGCACAGTTTAATACTTAT:1 - chr3R 14227998 3' - Transpac 11 2 67.33 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTG:1 + chr3L 23871311 3' - Doc 44 1 61.39 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTCTTGACCATTGACCAGCAACGCTCAGAGTTGAGCTTGACTGGAGGCAATCCATAAAGCCGAGCCAA:1 + chr3L 7153654 3' - Tirant 8127 2 74.26 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGGATTCGCTGTCAAACTTCGTGCGTCAGTGGGGCCAGGGCTGCGTCAAC:1 - chr3L 16129570 3' - P-element 27 1 52.48 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATAAACATCGAACGTAGCGCTTTTGGCCATTTTGCAAGAACCGAAAGGCCAACAAATGG:1 + chr3L 10005520 3' + jockey 4915 1 69.00 CAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCCAAGCCAACGCGGCGTATACTTG:1 + chrX 8312086 3' - blood 7205 2 60.82 TCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTTTTCCCTTTCTCCTCGGAGCTGTGCTCCTTCTTCGGGCTTTTCTTCTCTTCCTTTACCTGCTTAGCGATT:1 - chr3R 4907721 3' - flea 4652 1 74.26 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTCGCAGCTGCTATTACCATATCACACAGGACCCTAGATATG:1 + chr3R 9116539 3' - jockey 17 1 67.00 AAAATACTTCACTTTGTACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTCAGTTCCAGAATTATGCTACAAATTTATGAGACGACA:1 + chr2L 17852988 3' - gypsy4 452 1 69.31 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGCCTATTTTATTTGATGAGGGATTGAGTTGCCTTGGCGATCGT:1 - chr3R 5122258 3' - Doc 36 1 60.40 TAAAAATTGCTGCCAGGTTATAAAACTTGAGCAGCCAAAAATGATTTGTTGGCTATTGAAGTTGGAGTTTTTAGCCGAGGCACTGGAAAAATAAATGTAAG:1 - chr3L 11369040 3' + Cr1a 464 1 55.45 ACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAAGATGACCCATTTGTAAAGTGCAAAAAGTTGTAAAGTTTTAAATAAAAAGTTTGTGAAATTTCGCAAGTTTT:1 - chrX 22426146 3' + 1731 309 2 74.26 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACCAAAAGTAACAGTAAGTGCAGCAA:1 + chr2L 7714564 3' - roo 48 2 78.57 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTTTTGTGTGCCGAAGGTACGATCATCAAAGTTTGATATTAAAGAATATAAATATTACTATTCTTACAG:1 + chr3R 4712784 3' + pogo 2095 1 72.28 TATTATGTTCGTATATACTACACTGTCAGTCGGAAATGTCTTTCTCTTTTTCGGCCCACTGCCTTCTTTTATCATTGGAATAATGCTAGGATGTGGATGGG:1 - chr3R 30220157 3' - mdg1 7039 2 78.22 AGGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGTATTATTAACGATTTGGTGAAAACAAAAACAAAGAGG:1 + chr2R 19775180 3' - 3S18 5803 2 59.41 AAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATGCCAATGCAAACAATCTTTTCAGGAGAAAGAGTAATTTAATAAATG:1 + chr2L 21369929 3' + rover 323 2 55.56 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAATTTGCTACATTTATATAGAATTGAA:1 - chrX 21468971 3' + pogo 2054 1 75.25 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTAATTATTATAATATAAAACCTTGAAACACAACAA:1 - chr3L 18406623 3' - Doc 43 1 63.54 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTT:1 + chr3R 20154782 3' - jockey 59 1 73.27 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCGATCCACAGGTA:1 + chrX 16272506 3' - pogo 28 1 53.00 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTAGCTTGCCTAGATAGAGTGGCATCGCCATTGTCCATTTCA:1 + chr2R 8254848 3' - roo 8701 2 62.38 CGACACATAAAAACAAAAACCAAGCGACATAATGGCTGCCACCGATATCGCCGAGGAGGCCTGAAATCCGACTTTCGACTCCGTTTAAAATTTTGGGTAAT:1 + chr2L 7433796 3' + BS4 445 1 61.39 ACTTGTGAAAAAAACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTATGGGTACAACTGCCCTGCCCAGCTCTGCGGACTGCAACTGCT:1 - chr2L 6175652 3' + hopper 1384 1 53.47 TTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGAT:1 + chr2R 5651880 3' - Tirant 8160 2 76.24 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCTGCGGAAAAGCGAGAGGGATAAAGTGGCAGAACGAGATGGCGAATGTGGGT:1 + chr3R 9094819 3' + hopper 1393 1 57.43 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACCTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTAATCATTAATAATTTATGGCCAATAGG:1 + chr3R 24464843 3' + 412 446 2 75.25 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATAATGTCCAAAAATATGTTACCAACACGTGTAGCCCGGCATGCGAAGAAATATGAAAAACAA:1 + chr3L 4923775 3' - jockey 21 1 64.36 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' + 1360 3388 2 67.33 AATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCATAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAACATAATCTATTTTTCTATCTATGGTTGGGA:1 - chr3R 14724691 3' - transib2 2509 1 67.33 AGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAGATGCAAAATAGTTTGTATATTTGTTTAAGCTACTGCACAAATCACAAGAAGAGCGCACTCCTCCGCAGGA:1 + chr2R 15403210 3' - Cr1a 206 1 75.25 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTGTACCCGAGTATTCGTGTATCTGTGTGCTTGGCAGTTATAACACGCACATTTCGC:1 - chr2L 20268972 3' + hobo 2931 1 67.05 GTCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGCCAGCTCCGCCTCGTTTAGCGAATGGGTCGAAATACCTGCGAGTTGTCAAAGTTAGAGAGTCGGTC:1 + chr2L 19506370 3' - Cr1a 4196 1 66.34 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGGATAGGCTTGCCTCAACACGAG:1 - chr2L 20290238 3' - flea 47 2 77.23 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAATCCCTTTACACGTTTTTATAACATTTCGAAAATGTTTAAAATGTGGAGACGTGGA:1 - chr2L 21786688 3' - Max-element 8258 2 55.45 GAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATATTTCAATTAAAATTTTACACACGAATAAATGCAAAGCCACGCCC:1 - chr3R 15530054 3' - mdg3 5285 2 53.47 CTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAGGAAATTCCTAATATAGAAGAAGGGCAAATAGTTTTATTAAAGGATGAGAATTGTCATCCTGCAAGATGGC:1 + chr3R 19447969 3' + mariner2 859 1 76.24 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATTAATAATGGTTCATTAAGAGATTTTCTCTACCG:1 + chr2R 13248784 3' - 297 6599 2 62.79 AGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTATTACCTCCCACTCCGGCACAGCCAGCTGGAGGCCCA:1 - chr3L 22061373 3' - Doc 4239 1 63.37 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCGGTCCTCATATTTTCCTGCCAGAGTCGCTCGATTATTATTCATATTTATTGCGT:1 - chr2R 21454300 3' - hobo 20 1 58.42 TAATAATAACAACAATAATAATAACAATAACAACAGCACAAGCAACAGCCTGGAGGCCGCCTTAAACAAAATCAAACAAAATATATCGGCAAACAGCAATG:1 + chr2R 13003612 3' + mdg1 27 2 89.11 CACACACACACACACATATATAAACCTCCACATATACATATATACGCTATATGCTATAGCCAGCAAGGCCCAGTCCGATCTCGAACAAAAATATCACGACG:1 - chr2L 21356307 3' + accord 186 4 57.43 AGTTTGAGCACATCTACCCNAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTT:1 + chrX 983374 3' - Juan 3830 1 52.48 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATTAAATTAATATTTTGTAGCTGTGTGGTGAATCTCTTGTAAAAGCATTTT:1 - chr3R 22198499 3' + Juan 4188 1 54.46 GGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTTCCCTCTTTCATTCTCTGCCTCTCTTTCTTTCTCCTTTGGTCCTGCTCTCTGTGATTCTTTTTCTGCTTAGCAATATGT:1 + chrX 17966291 3' - F-element 335 1 75.25 TCACTTCAAAGATATCTTGGAGCAAACAGTCTGGAAGCGGAAGAGCGAGAGAGCTAAACAGCGGGGCTGAATGGGCCGAAGGAGGTGCATTCAGGCATACA:1 + chrX 2833058 3' - hopper2 343 1 78.22 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTT:1 - chrX 21087565 3' - mdg3 5262 1 65.35 GTAGGACATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAACGCCATTTAAGCAGGCCGGAAAAA:1 + chr3L 7154845 3' - Tirant 422 1 74.00 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCGCAAAGTATAGTGGGAAAATGAGAGCAAGCCAAAGAAAAGTT:1 + chr2L 9045845 3' - jockey 9 1 77.00 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATA:1 + chr3L 27357640 3' - mdg1 13 2 66.34 AATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATAAATAGATTCGTGCAGATGAAAACAAAA:1 + chr3R 19446711 3' + HMS-Beagle 199 2 75.25 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCATGAATAAGTCATAACTAGTGTTGGCCTTTGCCGT:1 + chr2R 16580426 3' + pogo 2060 1 65.35 GTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTCTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTTTCAATCAGGTTTACACTTCGAGTTACATCGGCC:1 - chr3R 15023916 3' + Cr1a 245 1 67.33 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGCAATTATGCTATAACATTGTTGATCAAGTTATTTCTTCAGCAATGCCAGCCAGTTG:1 + chr3L 2424935 3' - jockey 30 1 54.46 GATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAA:1 + chr3R 11547739 3' - G2 332 1 80.20 GAGTGGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCTACATTAATCAGTTTTTGGGAACG:1 - chr3L 16571752 3' - hobo 51 1 76.24 CCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATG:1 - chr3L 9218281 3' + Stalker 6990 4 60.40 TTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTGCCGCATATAT:1 + chr2L 15955336 3' + Quasimodo 7354 2 66.34 ACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATGTATATGGCAATATCTATGAAGCCATCGATAGTTACTTTTTTCAACTTTTCCCCA:1 - chr2R 16068608 3' - Burdock 6152 2 61.39 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAGGGGTTAAAACACCTGCCCCACAGTTGC:1 - chr3R 26498496 3' + roo 9064 1 68.32 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACAATTAAATAAATGCAGTATGGCTGAAGTTTG:1 + chr3R 15213635 3' + pogo 2058 1 76.24 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTTAAGTGAGCCACGACAAATGTCACGTT:1 + chr3R 24612227 3' - roo 39 2 72.04 CTTCGTTGTGGCCGTCACTTCAATCCGGGAGGGGAGGAGTTACCGGTTCTAACTGGCACACAGACCCTCCAGCGAAGCCACCCCGGCTTACTCTGGAATTG:1 - chrX 21939635 3' + gypsy5 6903 1 65.35 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTATATGCTTATCGATAAATCTATTCGATAAGT:1 - chrX 10326405 3' - P-element 40 1 30.69 GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - GATE 8266 2 54.46 CTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTT:1 + chr2R 1076523 3' + FB 259 1 57.43 GGGTCGGCCGAGGACGGCCTCAATCTTGGGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCT:1 - chrX 21772501 3' + gypsy3 6538 1 78.00 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAGCTTGCTGAAAAGACTTTCTGTCTGCTGTTTGTTTTGTTTGCTCAT:1 + chr2R 7635420 3' - jockey 37 1 54.46 TTTATAGTTCATGAAATCTCGACGTTCATACGGACAGCCGGACACGGCCAGATTGACTAGGATAATTTCTATTGATCCCTTATGAAGGTCCTGCCAAAGTT:1 + chr3L 6231934 3' - INE-1 146 1 58.42 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGATGCCAGGTAACAAGAATTTCAGTCTTGATTAAAGCACCAACATTATTA:1 - chrX 18050577 3' - 412 27 2 52.48 TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAAATATATATACATATATAGGTAGGTAGTCGGTCTCAGCTTGTTTGCCAGGAGACGGCCCTTTCGG:1 - chr3R 18850982 3' + invader4 3078 2 62.38 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATAAATTTATTATTAAATTTGTATTAGCCGATTCGTTAAGTTATCAATATATTTTAAATAGTAAGTAAAGTATTAA:1 + chr2L 13155882 3' + copia 251 1 69.31 ACTGCATCAATGTTCTCAGNTGATCTAACGGGTCGAGCGATTTCGAAATGCACGCTGTGTTTACTTTAAGTTTGGTTATTTTAGCGCTCTCCCGCCTGACA:1 - chr2R 22976523 3' - mariner2 351 1 35.64 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATAAAGCTTTTTGCTGTTTGGAGCTTAAAAATAATTGAAATTGCTAGCCGACTACTATTCTCTATT:1 - chr3R 8261966 3' + S-element 1711 2 76.24 TATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTAGCAATAACGGAACAATAT:1 - chr2L 21369836 3' - rover 6966 2 65.35 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGC:1 - chrX 21668023 3' + Tabor 436 2 71.29 TGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATTACCGGCATGCTCCGCCGCTTG:1 + chrX 20238179 3' + opus 7220 2 77.78 TAACGTGTAACGAAAAAAATTGATGGAAGGCATATTAGGACAACTTTTGCATCCTTTCCTCGGATTTCTGGGATAGTATCGAGGAATCGAGTCCTGCAATA:1 - chr2R 25175473 3' - Gypsy12A_LTR 2257 1 74.26 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGGCTTTGGGTCCAGTCGGCCACTGAATTATGCTCAAAAGTTCGCCACTTAA:1 - chr3R 27448231 3' + hobo 2915 1 51.49 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACGTTTTAGGCATCATTGTCCAAAC:1 - chr3R 10063308 3' + roo 9020 2 79.21 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACCCGCAGCAACACTCGATGAGCATCTGACGAAG:1 + chr2L 13549309 3' + P-element 2846 1 38.00 TTTAGATTTCTTACGCTCTGAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGTCCGTGCTCTGCTGGCCACGCACTTGTTAAATAGTTAAGCAGCCCGGAG:1 - chr2L 19917826 3' + 1360 3282 1 54.46 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCA:1 + chr3R 30284268 3' + blood 332 2 68.32 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGAGAAAGTGGCGGAGCAAACGGAAGGGAAAGTGGCCTC:1 + chr3L 22327351 3' - hopper 36 1 59.41 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGTGGATGCACACGAAAAAATTCAGGGCTTAATTCCACACATCATTATGTGTGGTTGTCTTTT:1 - chr3R 22236991 3' - 297 8 2 70.30 CTTTAAAAATATAATTAACAATTTTTAGTTTTGCTTATAAACTCAGCTAAAAAGTTTAACTAACATAATTAATCACTTCAATCGTGCCTCAAATATTTCGA:1 + chr3L 9816899 3' + hobo 483 1 80.20 CCACAACCAAAGGAATCTCTCCGCCCACTCCATTTCATTGGGCTAGCGAAGAAGCCAGACTGCAGCTGAACTGACTTTGTACTTGAACCAGTCTCTGAAAA:1 + chr2R 9640426 3' + Max-element 8520 2 58.42 ATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCTGAAAAGGCTATTCTAAATTGATTT:1 + chr2L 18211369 3' + flea 275 1 74.75 CAAAATCTTAGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTT:1 + chr3L 25322744 3' + Transib5 2932 1 64.36 CGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTCTTGGCATGTTTTAGTGACCAATTTTTGTTTTCAATGTTAGCTCTTCTTGTTGTTGTCATTTG:1 - chr2L 18385818 3' - Porto1 221 1 68.32 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAGGCATAAAAAAGGGATATTGT:1 + chr3R 29413107 3' + hobo 2886 1 78.00 ATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACGCCACAGGCAAAGTTTGGCCAGCAGGCAGGCT:1 + chr2L 11894494 3' + I-element 5131 1 73.27 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTC:1 + chrX 6388314 3' - hobo 50 1 71.29 TCGTAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGAGCGATGTTCGTTCTTGGCAAGCAA:1 - chr2L 11248539 3' - ZAM 8032 2 72.83 CTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTTTTTTATGCGTTGTCGTCAGGCAAACACAGG:1 + chr3R 7893120 3' + jockey 4734 1 72.28 AAAAGCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCATTTGGCTTTTCCATAGTATTGCTTATTTACATTTTTTTGCGTTAATTTGTTTTTACGTTGTTTGCTTGGT:1 + chr2L 2921807 3' + blood 164 2 66.34 ATGTACATACACACACACACATATACATTTAACCTGCAGCACGTGCGTGCCTCTGAAAACGAGAAAACATTATCGGCTGATGTAAGCGATGCGCGGTGCTT:1 - chr3L 11684686 3' + accord 7027 2 74.26 CATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGATTCGCTGATGTCCGAAAGTGTACGGCACTACAC:1 - chr3L 212783 3' + Bica 4846 1 67.33 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTGCAGC:1 - chr2L 10924234 3' - hobo 48 1 76.24 ACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACACTGACTTCCCGATGTGTTAATAATTTTGTTTTGATTTCAGGGATTCGAAAAGCCTACTTTG:1 - chr2L 21238905 3' + blood 396 1 64.36 ATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACACACTATACTGATATTTCTGATATTTTCCTCCATAAATCTTCATC:1 - chr3R 9991064 3' + Bica 108 1 66.34 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTACTGTTCGTACCAAATATTTCGATTTTCCTGCTATCATTTTGACCACA:2 - chr3R 23788380 3' - pogo 26 1 53.47 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAAAAATATATCAAAACTTTGTTCAATCTAAATTTAGATGGCAGCGAACATCATTTGAGCAGTACAATTA:1 + chr3R 10718129 3' + Juan 4204 1 64.36 TAATCATAATAATAATAATAATAATAATAATCATAATATTGGTAATATATTTTAGAAATGGATCAACGTTTACAGTTCGTTATCATATTTTCTCGCTATGC:1 - chrX 22544383 3' + mdg1 30 8 64.36 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTATGTTTAAACAGATCAGCACAATTGAAAATTGGGAAACAAAACAT:1 + chr2R 5043358 3' + roo 9043 1 58.42 CAATTTCGGATCAGCGGCAGTTGTGCGCGCTTTAGTTAGAGAAGTAGGTTTAAGACTGATAAGAGAACACAAGAGAGCACTAAGCTAAACGTACTGTAAAT:1 - chr3R 19794092 3' - TART-B 10528 2 54.46 CACTCACACATATTCACACATACTGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 25705522 3' + accord 7038 2 63.64 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAAC:1 + chr3L 24761238 3' - 1360 63 1 59.26 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCACACCTACTATCTTATCTGTCGGGTGAA:1 + chr2L 15331803 3' + 1360 3340 1 75.25 ATGTAAAAACATTAATGATAAAAAAATTTTAATTTCACGGGGAAAAAGTTGGGCGCGAAAGGGTTAAATAGAAAGCTTCATCAAAACCCAAGGGTTAAAAC:1 - chr3L 26695740 3' + looper1 1819 1 69.31 TCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATG:1 + chr2R 14849019 3' - flea 4712 1 59.41 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCGTTTAAAAGGCATTTTGACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAACC:1 - chr2R 15160276 3' - Tirant 8117 2 66.34 TACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTT:1 - chr2R 20520205 3' - Max-element 37 2 62.38 AGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCTTGCAGATACAAAGATACTTTTCGAATGCGGTTTTGCGGATT:1 - chr3R 5121493 3' + Doc 259 1 58.42 TTAGACTTTATGCCAAAAANAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCGAGCTGTGGATCCGGGGATCCGGGGATCCGGGGA:1 + chrX 20015576 3' - transib2 20 1 57.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTAACTCTG:1 - chr2L 11832527 3' + roo 9043 1 53.47 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGCCCAA:1 + chrX 9439217 3' + roo 9028 1 77.23 TCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAACATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTCAAAGACACTAGAATAATTAT:1 - chr3L 21773109 3' - 1360 226 1 79.21 CCGCAGGCCAAGTTAGGCAGATTATCGCTGAACTACAGACGGCCGAGGGCGGCCTTAATTCTGCCGGCTGACTATTTTTAGCCCTCGAGTCGTTCGTATCC:1 - chr3L 5223490 3' + gypsy6 7349 1 62.38 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGTATTAATGGGAGACCGCATACCCTTCGAATCCTCA:1 - chr2L 9075575 3' - 297 32 2 69.00 ATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTTCCAAATAAATAAATATAAAAAAAACACACACAACTACTGAAACAACAACCCTAAGGACTCAGCGAGT:1 + chrX 4218398 3' + Tc1-2 444 1 63.37 ATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCTTTTGAAAGAGCATAAGAAAAGAAGGCTAGGGAAGAGTGCGTTGAGTGCTATAAATTGCACGGCG:1 + chr2L 5648147 3' + invader3 133 2 55.32 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATGTATATGGCAATATCTATGAAGCCATCGATAGTTACTTTTTTC:1 - chr2R 16068620 3' - Burdock 6164 2 61.39 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATTGTTTACCGGGAATAA:1 + chr2L 19907991 3' - Tirant 8118 2 70.30 ATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTACATATATGTACGGAAAAGGTGGAAAAGCGAAGGTTGCGACCGGCGAAATGGTTTCTGGG:1 + chr2R 12343977 3' + Burdock 250 2 70.53 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTC:1 - chr3L 19274813 3' - transib2 40 1 65.35 TCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCAAATTTTCCATGTTTGAACGAAATCCGCC:1 + chr2L 11889785 3' + I-element 4991 1 72.28 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGT:1 - chr3R 26498544 3' + roo 9016 2 82.18 TTTGTTCTTTTGTTTTTAGAGTTTTCATTCAATTTCCTCCTTTCCCTCCACTTTCCGATCTTACTTTCCATATATCTAAACATATTTGCTTTATTTGGGTT:1 + chr2R 16429543 3' - 412 414 2 63.37 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATCAAGACAACTGCTTTCAAATTTAAGCTTTATTATCGTTATCAGATT:1 + chr2L 22108266 3' + Bari1 1689 1 56.67 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATCTTGTCATATTATTATTAGAAAATATTATTG:1 + chr3R 18883856 3' + roo 404 1 76.24 TATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCAACGCCCTTTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTAAAACGCACACATTTTTGAAAATTTGTTG:1 - chr2R 5185187 3' + accord 91 2 66.34 TTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCT:1 + chr3R 1844811 3' - Cr1a 164 1 79.21 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGGGAATCTCAATCGAGGGTAAAGTTA:1 + chr2L 12801004 3' + hobo 2891 1 76.29 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCAGCGCTCTATGCTGGGACCGTTCG:1 + chr2R 1276185 3' - blood 7065 2 75.25 CAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7205 2 81.82 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGTAATAATTGGATGTTTAGTACAAGATATCAGACATCGTTTGTTGC:1 + chr2R 22369629 3' + roo 9038 1 66.34 TTTGTATCTCAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTGAGATATATTTAGTAAGTGGATCGATCTAAAGCAGTCAAGAATTTTTAATT:1 + chr3R 4728054 3' + HMS-Beagle2 240 2 57.43 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAG:1 + chrX 20999582 3' - BS 21 1 52.48 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAA:1 - chr2R 5214994 3' - F-element 47 1 75.61 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGTACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACCAGAAAATCTATTAACCAATTTCTTTGGCCTTGTAAT:1 - chr2L 12764970 3' - Doc 33 1 67.35 ACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTATTGTTCCCTTATCGAAGCATCCATTAACACTTCCCCCTTTTCTAATGGGCGGCT:1 - chr2L 18599563 3' - Doc 4451 1 58.42 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACTTAGTGCCGCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGGCGCGCTTAGGTTGCAGTTGCAACA:1 - chr2R 18879109 3' - P-element 9 2 67.01 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTACAAAAAATAATGAAACCCATTTCGGAAT:1 - chr3L 15776984 3' - I-element 11 1 65.35 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTCTTAGGCAAATCTTAACGATAAAAGGGTTTACCTGGCCACCCCAATACAGAGACTT:1 + chr2L 21199207 3' + roo 391 2 61.39 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGTCCGCAGAGAAACGTAGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATA:1 + chr2R 9871583 3' + roo 388 2 56.44 CAATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATCTTGCTTATCCAGACGACCTTTTTTAATGGCGGTCTAATGACTTGGGGAAACTGCAGGCCAGCAC:1 + chr2L 16994890 3' + Stalker2 7638 2 65.35 ATAAATATGTAAATATGTTTATCTTTCTCTTTCTTGTTTTTTCCGCTCACCCTGAAAGTCTCACGAATTTTTTTTTCAGTGCCCCTTCTTTGGTCTGTTGC:1 + chrX 19105407 3' + G3 4503 1 66.34 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCATCAAATAACCCAATGATGATGATCTTTTTATAATAATGATTACACTTTTTGGTGTGTTGTGGCATGC:1 - chr2L 14981422 3' + hopper 1408 2 70.30 TCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTGGCAACAAATTAACTGCCAACCGCCCACTTACCAAATACACAAACACACAGGGAGATAATTTTTCCAGGCGA:1 + chr3L 3928569 3' - G2 2894 1 71.29 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGTATGCTCACAAGAGGCAACAAAATCAAGATGGAGCAGGCCGGAGCCGAGGAGCCAGCCAGGTGGGG:1 - chr2L 19677268 3' + hopper 1410 2 71.13 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGCACATGGCATAGCGTATTCATAATGTGTTGTATACATCTAGTGGTTAGTTCTGTGTTTAGCTGCGATTTTC:1 - chr3R 20381070 3' - jockey 14 1 72.28 TATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACAGTATACTTCCGTTGCTATCTCTCGATCTAACCATACGATACAAATCCATAGCATATCGAACGATC:1 - chr2R 20883900 3' - I-element 5343 1 70.30 CATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCAACAGAAATGGAACTGGAACTATCGCAGGTTG:1 + chr2R 20888453 3' + I-element 4999 1 68.32 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTC:1 - chr2R 9871066 3' - roo 28 2 77.23 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGAATCCCATGAAGAGGGCACAAGGAAGTGGCAGAGGAAAGCAGATAAGGAGAGAGATTTTGAT:1 - chr3R 11846634 3' + roo 396 1 64.36 GTTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTATGTTGGAATTTGCTTATTTACTTAGATTTAGATTTTTATCATTTTGCGGATGTTTTTCGCTTTCTT:1 + chr3R 5086125 3' - TART-B 10306 1 57.43 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGA:1 + chr3L 25232910 3' - GATE 8267 2 53.00 TTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTACCACTTTGAAATTGAATTTTAAATTAATAAACGGCGCGGTTGCATCAAGAATTACAAATTTATATGCATCGTCCT:1 + chr2L 19677141 3' + hopper2 1384 1 75.25 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTT:1 - chr2L 11832537 3' + roo 9034 1 60.00 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATA:1 - chr2R 13647841 3' - blood 50 2 73.27 CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTC:1 + chrX 20999596 3' - BS 7 1 63.37 AAGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCG:1 - chrX 19820625 3' - Rt1b 4969 1 62.38 ATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTAGCTCACTTAAAAGTTTAAGTTAATGCAAATTACTATACAAATTGCATTAGTATTGACCGCAGA:1 - chr3R 28334881 3' + pogo 1989 1 69.31 CTTACGCGAAGCGGGGCTTTAAACTGCGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGAAATAAAAGTTGGCGAACATGATAAACATGATGGTCGCGG:1 - chr3R 23924122 3' - I-element 45 1 60.40 GTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCGCAACGCCCCTTCGTGCGTACACGTGGC:1 + chr3R 4509766 3' + INE-1 32 1 63.46 GTACGTGTAGAACTCACAGTTATGTTCCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTCATTACAAAATTTGAGCATTATGCATACAGTATTCATATGGATCATCACAA:1 + chr3L 5065743 3' - Juan 496 1 69.31 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCGGGAACATAATTACATATTGTG:1 + chr3L 10720304 3' - hobo 13 1 60.34 AATCGCATGGCGTTACTCATCTTGTTATTATACTCTCTAATTTCATTGAAAAATACATAGCTAAAAACCTTTCCCATTGCCATTTTAATAAAATGTGGGAA:1 - chr2L 21747950 3' - 1360 20 1 69.31 ACCAACCGATGTGGGCAAAGAACCAACCACGTTGCGAATTCCTTGGCCAGGCCCAAAAACGCCCACACATCGGAGGAACTGGATCTTTCCTGGAAAGCATA:1 + chr3L 11025332 3' + BS4 463 1 67.33 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTA:1 - 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transib4 2581 1 51.49 CGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTTCTCTTTATGCTCTCAAAAACTGTCA:1 - chr2R 20520180 3' - Max-element 12 2 65.35 AAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAAGTAGAAGAATCTAAGAGCACTTGCCGTGAAAGAGACGAAAGCAACGTTGACGACCATGGACAATGTTCTTGT:1 + chrX 13281201 3' + Idefix 7100 2 58.42 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGCCATGGACAGAGTCACCTTCTTTC:1 + chr2L 18239467 3' + hopper 1357 1 74.26 GATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACAAATCTTTTTTTGTATTAATTGTTAGATTGCTGCATTTAAACCAAAAGCATTAAAAA:1 + chr2L 16684321 3' - P-element 446 1 56.44 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAAACTTGGTTTAAAATTGCCATACATTAACAACGTGTGGATT:1 + chr3L 11523346 3' - hopper 32 1 57.43 ATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAATGGCCAGCTAATGGCTAATGGAGTGGTAAAGGGACTGTGGTAGATCAAATTAG:1 - chrX 13505901 3' + F-element 4333 1 56.44 GACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAAACACCTTTAAATTGCCAGTTAAAGTTTTTTTTTCTGATTTCCCACCTGAGCAGCATCG:1 - chr2R 13651418 3' + blood 403 1 63.37 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACAGATGCACAGCAACACAGATACACCGTTACACAGATACTAACACGCACACGT:1 + chr2L 20269059 3' - hobo 21 1 59.00 GACTATATTTCGGGTGTTTNGTGATTGTGTTAACTTATACATATATCCCCAATCAATACAATGTAACTACCAATTTTGAACCCATTCCCCAACTCCATTCC:1 - chr3L 6982490 3' - Burdock 14 2 61.39 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTACGAGCATGAATTATAGAAACCAATAAAATTAAGTGCATTAATTTATTTCTGTTGCTCTTG:1 + chr2L 9887412 3' + hobo 2924 1 65.00 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGGAGGATTCTGTGT:1 + chr2R 20441307 3' - I-element 20 1 57.43 GTTTTTCCAACGGCGTTTANTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAAATTAAGTGAAAATATATAAGGGAATCGTTCGTTGGCAGTGCGGTAC:1 + chr3L 15462550 3' + Max-element 426 1 73.27 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGGCGATTTAGCGATGCTTGTCTTATTTAGTTTTTAAATAAATGGCCAAGGATGTTAAGTTGGCTTTGG:1 + chr2L 16071196 3' - 412 10 2 69.00 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCTACGAATTCGTGGAGGTAAACACTCGGGCCAAGGAGAACTTCTCTGAGGA:1 + chr2R 18407067 3' - mdg3 28 2 49.50 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCATGAATAAGTCATAACTAGTGTTGGCCTTTGCCGTTCTGCGATTGGTTA:1 + chr2R 16580440 3' + pogo 2078 1 51.55 AACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATATTAGCCCCCTTTCTCCGTGCTCCTTTCTCCCTGCTCCTAGCACACGAGTGGTTGCGGATGAT:1 + chrX 16534561 3' - opus 7431 2 44.55 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTTCGCAGAAAGATGTTGCAGCTGACTTGGCATTGTTTTCCCCATTTCAG:1 + chr3R 20148953 3' + hobo 2871 1 53.47 TCTTTGAAATAATGGAAGTNGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTT:1 + chr3R 24228956 3' - 297 28 2 58.42 TCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTTTTCAAAAAGTTTTACTTTATTGCCGACCGTGATTTTATGGCCAAAATGCTCATTAAGTTAACGGCAATTTGCCG:1 - chr3R 28785785 3' - HMS-Beagle 444 1 62.38 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATCTTGTCATATTATTATTAGAAAATATTATT:1 + chr3R 18883855 3' + roo 403 1 75.25 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGACAGTAAGCTAGAACCCGCGGAGAAGGTCGGACAG:1 + chr2R 1861755 3' + copia 249 1 64.00 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAG:1 - chr2R 25203761 3' + 1360 3366 1 56.44 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGTATTAATGGGAGACCGCATACCCTTCGACTCCTCAATGTAAAGCTTCAG:1 - chr2L 9075561 3' - 297 6600 2 55.45 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGTCCGACTAATTCAGCAAAGCGTATCTAATTCCGTACTTATCCGCAGACAAATGTGG:1 - chr2L 7020644 3' - FB 22 1 57.43 ATATAAAAAATTTAACAACAAACCATGATGGAATGATATATGCTCTGGATTGAAAATCGTATTGACCAATAAGGAAGTACAAAACGGGTAGCACAAATATT:1 - chr3L 7610310 3' + I-element 120 1 63.37 TAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTATCTTCAAAATCCCAAAGTCTTGTTCCTTACCACTTGCATTGATGGA:1 + chr2R 22211989 3' + gypsy4 6598 2 54.46 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGATCACACCAAACATCCCCCAC:1 + chrX 20844330 3' + copia 235 1 76.24 GCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCAAATATAGTTTTTTAAATACAATAGTTATTGAGTGGTGATACCAACGGAAACAAACATACCACTCCACTTTC:1 + chrX 21255877 3' - hopper 263 1 79.21 CCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTACAAATAAGGAAAAGGCCTA:1 + chr2R 20588367 3' - F-element 4211 1 80.00 GCCGATGCAGCTAACTATCNATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGTGTCTTGTAATAGTAAAATTGTAAAAATTCTACGTCTTGAGGCTATTTTT:1 + chr3L 25333426 3' - pogo 22 1 57.43 TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGG:1 + chr3L 17708292 3' - jockey 4799 1 61.39 TATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATTAGGACTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACTTTGAAAATCCGAATTTCTGATTAGGTT:1 - chrX 7711107 3' - mdg1 7057 2 65.35 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAACTTAGGCAATAATTTTCTGTGAGTGCAGGCAATAGATCTTTGACCAGAGTCAACAAGAGG:1 - chr3R 23445552 3' + copia 241 1 65.35 TTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAA:1 - chrX 4349892 3' - G2 3003 1 75.25 ACAACGGGTCAGACGCCGACATCCGCCCAAAAAGCAGCCTGAAACGCCCCCAAGCAAAACGGAAAAGGAGCCGGAGCCAACTAAGCAGATAAAGGAAGCCA:1 + chr3L 9479666 3' + ZAM 116 2 70.30 AGTACTAAAATACTTCAAANTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACT:1 + chr3R 17897172 3' + hopper 1358 1 74.26 TGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAAGTATGGCAAATGGGTAAGAAGTCTGGTAATAAAGGAAAATTATGATG:1 - chr2L 20963458 3' + Bari1 1679 1 52.53 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCATCGATAAATAATGATTTTTGTAGCATGCTTTCGG:1 + chr2L 9287218 3' - jockey 31 1 53.47 TTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAACCTCGAATGAATTCCCGTATTAAGTAAAGGCTTTATGCCTAAAAAGCATTGTTACGAATAAGATTGGGGA:1 + chr3R 6594491 3' + Doc 4436 1 72.00 TGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACATACTACGCTGGCACAGCACCCAGAGTTAGTGGCTGG:1 - chr3R 12746608 3' + Tirant 8183 2 60.87 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGAAGTGGCCCAAAGAAAAACGCGACCAACATTGTTGCCTGAGATAAGA:1 + chr2L 5244487 3' + transib2 2791 1 56.44 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTATGTACATAGGCATGTATACATTGTCTTGGCTTTTCGATGTGTGTGCGTGTGTGCATATACGGGT:1 + chrX 19384082 3' - pogo 7 1 72.28 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGCCAGACAACTCATACACAAACACATGGAACAGTTGTCTTTTGTTTATCTTGCGCACA:1 + chrX 7490101 3' - hobo 62 1 61.39 AATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACATAAAAATTGGTCCTTCGAGCCGGATCTCCGGAAAGTGAGGGAGAGAAAGGAAGAGAGAT:1 - chr3R 4419647 3' + 3S18 320 2 70.30 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTCCTCGGATCTGTGCACTCGAAATTATGCTGTGGCCAGGACTTTGCCTTTTGGC:1 + chr3R 28447456 3' + blood 354 2 53.47 TACACCCACAAGTGAGCATNTGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCCGCCGCACCAAGTGAAATTTTTTGAAAATGAAGA:1 - chr2L 3828093 3' - R1A1-element 5256 1 65.35 ATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGAATCACCCACCAAAGGGAGCAATCCACCACCAGCCACCCGAGCCACCCACCTATCAGAGCAAC:1 - chr3R 18266889 3' + G6 1775 1 68.32 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCGGGAACATAATTACATATTGTGCGCTG:1 + chr3L 10720309 3' - hobo 51 1 72.28 CGCGGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAAATAATTGGCGCTCAACTAACGGGAAATACGCACCCGTCCATATCATACATAATAAACAAAATAATTACAGA:1 - chr3L 27396714 3' + gypsy6 370 4 52.48 AAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTTACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTTATACAGGACCTGCTGGACGAG:1 - chr2R 4634354 3' + S-element 1662 1 74.26 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTA:1 - chr3R 19589924 3' - BS 5022 1 49.50 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGTAAGCTCGTCTACTATAAGCTCTCCCGCACAGTAGGCCAATTGGGGGGATTA:1 - chr2L 9887322 3' - hobo 24 1 53.47 TTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCATTTTCTGAGGTGGCAAAAAGCCGTAGGTATGG:1 - chr3R 27088446 3' - X-element 4280 1 68.32 TTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCTTCCGATTTGGATATATTCGATTTGATACGATTCTGCTGTACAGCTAGTTATGTTATTGATATG:1 - chr3R 16034911 3' - Porto1 241 1 69.31 AGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAGGTAATATACGGTTTGCATCCCCATTTAGGCGCCGCACGGCAAAAAGTAAGAATTTTTTTTGG:1 + chr2R 2007459 3' - Cr1a 4211 1 59.41 TTTTTTTAAATAAATAAAAGAAAAACAAAATAACAATAAAAAGCCATCGCTGCATTGTCGACCGCAGAAGGTCAATGAATTATTGATTTGGGCCAAGG:1 + chr2L 2124174 3' + G7 1142 1 54.08 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTTCTGGA:1 - chr2L 13598188 3' - pogo 32 1 58.42 GGAAAGTGGTCATAGGTAGGGTAGGGCAATCCGCAAACACAATTACACTAGAAAGGAGTAGAGAGTAGTTTGGATTACTGGAGGTCAGTCTTCTGGACCCA:1 + chr2R 5603384 3' + Gypsy12A_LTR 1946 1 60.40 TATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGA:1 + chr3R 1844815 3' - Cr1a 160 1 75.25 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAGAACACAATATCAGCTGCTCACATTTATGGTTGGCGATACGAATGTTCTTAACTGCATTTACACAGAC:1 - chr2L 16994780 3' - Stalker2 7258 2 67.33 CCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGAGAGACATGGTTGGGGGGGTTCGATTGGATTGCTTGTGTGAGAGCGCGAAAGAAGACCTTAGATTTG:1 + chr2L 5972334 3' + R1A1-element 4985 1 55.45 AGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTAGTTGTGGACCGATTCCGGTGGCCAGAGGCATTGGAAAATTGTGTCGGCCAGCCACTTTAACTTT:1 - chr3R 25795721 3' - I-element 5098 1 62.38 CTTGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATC:1 + chr3L 24761233 3' - 1360 88 1 70.30 TAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGAC:1 - chrX 21667996 3' + Tabor 463 2 48.51 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACAAAGGAAAACTCAGTGGGGGAGCAAGGGATACAAAAATTGGGGGAGGGGAAAAAGGGAATCTGTAAC:1 - chr2L 9522055 3' + P-element 2878 2 71.29 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAGACACTTGTGTAGCTCCCGAGCTGTGGATCCGGGGATC:1 + chrX 20015562 3' - transib2 35 1 61.39 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTT:2 + chr3L 17708314 3' - jockey 4777 1 58.42 AATTGTAAGTCTTTAAATANATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCAAATAAAGATTTTCTATCTCTTCGCGAGCTTTCCTGACCCCAATGCATCACTAG:1 + chr2L 1776040 3' - roo 8684 2 59.41 AGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAAAAATAAAAAAACAAAAACAAAAGATAAATAAGCAAACACATACACACGCATTCCATATTTTCTGCCCAC:1 - chr3R 2239359 3' + Doc 4661 1 74.26 AACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTC:1 - chr3L 27356069 3' + Tc3 1693 1 77.23 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATGGCAATTTCTGTAATTTGCATTTCACATATAGTATTTCATATACATATATTATAAAT:2 - chr3R 9978589 3' + jockey 4973 1 54.46 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGCCATGGACAGAGTCACCTTCTTTCCATTCTCCTTTGGGCCAAGCTGGTGAAAAATGG:1 + chr2L 18239500 3' + hopper 1390 1 56.44 ACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATTGATGGGCGTTTAATTGAAAATTTATTTTCGAGAGTCCGCGGCGACAGCGCTCAATTATGT:1 + chr3L 16761564 3' + Transpac 441 1 59.41 GAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATACAAAAATTGTTTTTGCCATAATATTTGCACCATGACAACA:1 - chr2R 21251462 3' + micropia 342 2 63.37 TCACTCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTTCCAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTTATTTACATCAACAGGATGCACAGGCTCACCATCGGTTGCT:1 - chr2R 5436354 3' + Cr1a 295 1 41.41 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATTAAACTTTCACTATCTGGCTTTGCAGCACTAATTGAATTTTTTAGTATGTGAATGCCTAG:2 + chrX 1716720 3' + hobo 2923 1 63.37 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTAAGCGACCCAATTGGGGTGGAAAGTTG:1 - chrX 2911975 3' - pogo 44 1 73.27 AGCTCTAGCGGCCCCTTTAGTGCTCTACGTCAGGAGAAACATCAGCTGATATGGCAAGAATTTTTAAATTTATTATCAAAATTTTATTATGGGTGATAAGC:1 - chr3L 24298310 3' - gypsy12 9868 2 62.38 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATTTAGAATACCTAACGAAATGTAAGTACAAGCGCAAAATCA:1 - chr2R 9369828 3' + pogo 2071 1 60.40 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTATTTACCAACCAAGATGAATTGCCCAAACCC:1 + chrX 9439221 3' + roo 9032 1 73.27 TACTAGATTCGTTGAAATGTGTGTAGCAGGTAGAAGGAAGCGTTGTGAGAAGAACTAAATATAAATGAAAATGCTTTCTCCGAAAGCCACAAAAACGGAAC:1 + chrX 22745384 3' + INE-1 10 1 63.37 CACACTGGAGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACCATCACTGACACACATTCACGACCAGACGTTCCGCACCTCATCACCAGCCGCGGGCGGAG:1 - chr2R 6928803 3' - invader4 2933 2 72.28 TGTTTGGTGGGTCTATCATGATTGTTGGTTAAAGGCTTAAGGTCCGTTTGGTGATAAATGTGTGTTATAAAAGTTTTTTGGGATTTTCAGGCATGGGATT:1 + chr2L 18779449 3' - I-element 184 1 68.00 ATGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCA:1 - chrX 21087562 3' - mdg3 5259 1 68.32 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATTTACGCTTTTCACCAATGTTTGGAGTAATTTCTAAGTTTACTATAAGATTATTG:1 - chr2R 20821318 3' + 297 6959 2 60.40 CTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTCTACGACTAGCCCCGTCTCTTTCTGGCCCCCCACCCTGACCCCCTGAACCAACCGG:1 - chrX 15499519 3' - P-element 403 1 58.42 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACATTTAAGTTGCAAATTGAATTTTG:1 + chr2L 897631 3' - roo 53 2 82.18 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAGTATCTGCTAGATACCACTGTGCGGAACTGGGCCACAAATTCACACGCAGTGTGTGACAAA:1 + chr3R 6761083 3' + blood 7373 2 66.34 GGCTGCCTTCAGCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACATCATCAATTCGGGTGTGTTTTAAGACATTTATATTGTGATTTATA:1 - chr2R 19430735 3' + 412 7514 2 54.46 GTGGAGATCGCAATATTGACGCTCGCACTGCTTAAACATTCTCAGGTGCTGTAGGTGATGGTGGTGTGCTGGTATCGCTCCTTGTAAATGTGCCCCCTTTA:1 - chr3L 21918412 3' - mariner2 377 1 54.46 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGCTCCATTTGAAGTGGATTTTGATTCGATTTGG:1 - chr3L 8749978 3' - Doc 50 1 71.29 TGGTGATGTTGAGAGTCCCGACGTGATTAGTCGGCTTAACGGACGCGAGTGGCTCGCCTCCCAAAA:1 - chr3L 8458117 3' + Cr1a 4063 1 60.61 AGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTCTGCCACTGCCACGCCCACCACCGACCACCCGCCCACCTTGAATGGGGGCCGGGCTGGCATTTCGTTTGGTTG:1 + chr3R 12556827 3' - I-element 135 1 67.33 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACGCTGAGGCTAAGCATAAAACCATTTACAAGCACTTAGTTTGCATATA:1 + chr2L 2505662 3' - jockey 36 1 52.48 ACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTACTTTCAGTTCCTCCAATGCTGCTTATACCCC:1 - chr2L 9055389 3' - flea 297 1 69.31 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATACACTTTAATATGGCGG:1 - chr3L 2917039 3' - hobo 44 1 84.88 AAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCATTGCACTAAAAGTACCAATGCAGCCACGCAGCCTCTTGTCACGCCCACTCTTCCAG:1 - chr3R 23987673 3' - R1A1-element 114 1 59.00 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGCCATGATCTATATCGTGTAAATATGTATTTAAATCATATGCTGTATATTTTGTTGTT:1 + chr3R 25478006 3' - pogo 16 1 65.35 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGATGTGGATATCCCCCACCCAATTTTTT:1 - chr3R 7582635 3' - 297 6615 2 65.59 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCCCTGTTTTTTTCACGAACACTTCAAAGGAATCTGGCTGTGGTGATGTTTTT:1 - chr3R 4555370 3' - roo 8688 2 55.45 TTAATTAGTTTATTTTATTTGTTTAATTTATTTTGTAGCTTGCTTTGAGCTTTAACTTTGCTGGTAGTTGAACTTGGAGGCCACAGCAAATTGCAGCTCTT:1 - chrX 13951102 3' - F-element 87 1 68.32 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTCGAGCTCTTATTTCTGCAAATAAAATTTAGTTGCATATTTTGCGGCGCCAAATGGCAGCC:1 - chr3L 7463262 3' + hobo 2926 1 64.29 GAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGATATGTCGCTGGTTTCGCGTTTGAGCAGCTGCTGATTCTG:1 - chr2L 19909624 3' - accord 7031 2 60.40 CCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCTATTGTTCAGCGGCTGCCTGCGATCGTTTCTGC:1 + chr3R 9483658 3' - Rt1b 4824 1 71.29 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGATAATTGTGTGCTTTATTACCCAAACAAATCATTAGCACTT:1 + chr3R 13710722 3' - roo 8698 2 61.39 CATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTTCATAAAAATTTTGATTATTGTGTAAGCC:1 - chrX 357614 3' - Porto1 4249 1 71.29 CTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCCACGGAAGTAT:1 - chrX 9816230 3' - BS 4992 1 74.26 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTCGGGGATCTTGAGAGGAACAGAAGAATCATTTGTCTTCTAATTATGAT:1 + chr3L 13059763 3' + transib2 2799 1 54.46 ACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGCATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTAC:1 - chrX 21667977 3' + Tabor 7321 2 67.33 TGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTATTTTCCATTCTTTTTATCGTTTCTTGATATTCCTGTAACCTTACAATATGGATGAACGCCTTGTGA:1 + chr3L 27396589 3' + S-element 1503 1 70.30 TAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGCGCCCACTTAAACACGTTAGCGAATTTGAACTTGAATTGAAAGCGGCTTGCAACACCCAATGGCGAATTTCGCC:1 - chrX 19663817 3' + G5A 2601 1 54.46 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGATTAAAAGTTGTAATCAAAAGTTTACGAAATCCAACTTTGGTGAAGCGAA:1 - chr2R 19355877 3' - jockey 34 1 51.49 ATTAAACTAATAATTAAATNAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCCTCCAACCAC:1 - chr2L 9053411 3' + flea 4983 2 62.38 TCAAAAACAAAAAAAAAAAGAATGAATCCAAAAGGGCTGGG:1 - chr3L 12020765 3' + R2-element 3584 1 90.24 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTTATATTTATACCATTAAGAAAGTGATATGCCGTTCTTTCAGGCAACATCTGCAGATCCCCAA:1 - chr3R 13710638 3' + roo 9056 1 45.54 TGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAATGCGATTTGTATGGCAAGGAGTTGGACGAATTTGTGTGCACACACCAGAGATTCATTGATGACGTTG:1 + chr2R 10676089 3' + hobo 2591 1 62.38 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGGTGGTTCTGAACCACTCATGGGTTTTCCGGGGCGTGTGGAAA:1 + chr3R 9074121 3' - hopper 32 1 55.45 GCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTAATCGAAGTGCATTACCACCTGGGTAGCAACAGCACAAAGCAAAAGAT:1 + chr3R 8512394 3' + accord 404 2 53.47 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAATAATTGACAGTTGAAAAGTCTCAGCTATG:1 - chr2L 3581942 3' + transib2 2818 1 71.29 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATCTTTGATTTGAAAATGTTCTCGATCTCG:1 - chr3L 25333353 3' + pogo 2060 1 72.28 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCTCCTTGTCTGTCCTTCACGCCCCGCTCTGCTCCACTCT:1 + chrX 7971036 3' + P-element 2872 1 64.36 CGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTTTTTTGCGCCTTTTTTTTCGTGTAGTTTCAGCGACAACAGCTGCCCCGTTTGGGCAAATAAAAATAAA:1 - chr3L 6672828 3' - Bica 19 1 66.34 ATTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTAACTGCAAATTTAAGCTGAAACTTAAAATGATTCCAAAGCATCATGAAAGATATCGCCTCC:1 + chr2L 18687414 3' - Gypsy6A_LTR 201 1 76.24 AGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTACATATAGTAGATCAGATCGGAACAGCTCTCTTTATTACATTTTTCAGCCAGTGATGCTTTATATTCTTTACT:1 + chrX 6854473 3' + diver 221 1 75.25 GTAGTGTTGTTTAACGTTANTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTAAATGCACCAAATTCCAGGCATTTAAATCCAGAAAGCGTTTTAAGCC:1 - chr2L 13155783 3' - copia 28 2 54.46 ATTGTAACTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACATTTAAGTTGCAAATTGAATTTTGCATAATCCCAGGCGCCGCAGCGATGCCACTTGG:1 + chr2L 897664 3' - roo 19 2 61.00 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAAGCGACACCTATTCTCA:1 - chr2L 2016746 3' - Doc 41 1 57.43 AACGGGTATCTGATAGTCGAGAAAATCGAAAGTTTACAGAATAATAACAAGAGTTATGATATTGGATCGTTAGGTTTATGAAATGTTTATTGAATTTTGT:1 + chr3L 15158952 3' + INE-1 553 1 68.00 CTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTTTTGGACATACGACAAAATCTGTAAAATAAAATCAAG:1 - chr3R 19377051 3' + Doc 4517 1 66.34 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCT:2 - chr3R 29374945 3' - mdg3 29 2 53.47 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTCAATTACCTCAAAGTCAAACTGGAAGAAC:1 - chrX 21326218 3' + 1360 3351 1 69.31 ATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCTGCAAATGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGCGAGTGCTTTCAAGTTTGCTGCAGTTTTATTTTTTCCTA:1 - chr3L 17600494 3' - I-element 164 1 59.41 AAAAGAAAAGACGCTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAATAAACCATAAAAAAAAATAAATCAAGAAATACAGCATG:1 - chrX 7661393 3' + Porto1 100 1 65.00 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCATTTTTAACATGTATTTATGATTTCAGTGTAAGACTC:1 - chrX 9439138 3' - roo 8674 2 67.33 AAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGCTGATCATTTGCATCTGAATTTTTTCTTAGTGGTCTACAAAATACGTCAATGACCTCTAGAGTTAGAACTTT:1 - chr3L 25264432 3' + Q-element 360 2 71.29 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTGCTATTTATTAAGTGGTCTAATTAGGTATTTTAGTAA:1 - chrX 3967737 3' - pogo 34 1 60.40 TTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGCCAGAGGGACTAGCTGACTGACAAATCAATCAA:1 + chrX 5349788 3' - Doc2-element 217 7 90.91 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACCAAAAGTAACAGTAAGTGCAGCAAACTGTGTGCTAATATAA:1 + chr2L 7714581 3' - roo 8698 2 62.38 TTTCAATTTATAAGATTTAAATGTAGGTACTTAGCTACTTTTGGGATATGTATAGTTTATTTTATACTACTGTAATCCTTAAGCTCTTCTATACTATATAA:1 + chr3L 9955274 3' + Tc1-2 1409 1 56.44 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATGCCTTAACATTTACCTTGTTGGC:1 + chr2L 16548210 3' - P-element 51 1 28.71 TTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGG:1 - chrX 292421 3' + G3 4552 1 56.84 ACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTATAATAAGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCCCTGGCACTGTGATAGTGTGTAAACACGTCGCA:1 - chr2R 5736191 3' - Cr1a 3986 1 67.33 GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTGGCGAATAAATCTTCCGTTTCGATTTAAAGTGTAGCGGGGGTCCCC:1 + chr3L 413658 3' - I-element 5052 1 63.75 GTGATTGTTTTTTTTTTTCATTTCGCACACACACACACATCCACACACCCACACATGTGTGGCTTTTTCAGTGCATTTTGGGTGGTGCGGAGGTGTCCAAA:1 + chrX 7279981 3' - Doc 4592 1 77.23 TTTTTATTTTTTTTTTTAACAATTCAAGCACCAAACGGTTACGAAGAGACCTTCGAACT:1 - chrX 14149841 3' + hopper 154 2 89.83 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTCGCAGCTGCTATTACCATATCACACAGGACCCTAGATATGC:1 + chr3R 9116540 3' - jockey 17 1 67.33 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGAAAAGATCAACTCCTCTGACACTTTTAGTTCTACAGACACTG:1 + chr2L 16164114 3' + pogo 2069 1 62.38 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCATCGATAAATAATGATTTTTGTAGCATGCTTTCGGGCGCTTAAG:1 + chr2L 9287227 3' - jockey 13 1 68.48 TTAGTTTCTTACAAAAACTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATCAAAATTCACTTTTCATATACAACCTACCCACCGGGAGCTTGGTC:1 - chr3R 20432398 3' + roo 9040 1 58.42 TAAAAATAAACTTAAATTGATTTTAAGTCAACCAAAAATGCAGCCAAAAACGACAGGCGACAGCTGCCTTCTACAGCCACGCCTCCTCCCAGAAA:1 - chrX 14425636 3' + NOF 3958 1 63.16 TCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAAACATAAAATGGCCTTAAAATTCGGTTATGGTTCTTTT:1 + chr3R 19518782 3' + Cr1a 378 1 70.30 CACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATCTTGCTTATCCAGACGACCTTTTTTAATGGCGGTCTAA:1 + chr2L 16994863 3' + Stalker2 7644 2 38.61 TGCCTCACGGTCGCCATGTNATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTGCAGGACCTCCGTCCGGGATATATACACATACATATGTATAT:1 + chrX 21279746 3' - blood 393 1 57.43 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTTAATGATGCCGCCCCAGCCGGCAAAACGGAAAATGGGGAAAACCCA:1 + chr3L 3475655 3' + mdg1 392 2 52.48 TGATTTCTTTGAAATAATGNAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTGAAAAAATGGGGGAAAAAATGGAGGAACTACTG:1 - chr2L 16566287 3' - 297 6614 2 70.30 GAGCTATTACTTATTACTTATTACACCGCAATCACTCAGGCGTTTAATAATTGACTGCATCTGCGGTCGAATCCCAATCGAATCGGGGTGGGTGGGTTGTT:1 + chr2L 1202074 3' + Stalker2 400 2 76.24 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGAAATAAAACACAATACGCAACGAATTAGAAATGTGGTTGCCATCATTATCG:1 + chr2R 9369912 3' - pogo 22 1 57.43 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATAGAAAATTAACCCAGTTCGCACGTCTATGCCGAAACAAACAAAAGTTTGCGAG:1 + chr2L 20330107 3' - 297 6598 2 63.37 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGAATCCCATGAAGAGGGCACAAGGAAGTGGCAGAGGAAAGC:1 - chr3R 11846656 3' + roo 9037 1 62.38 GTGCATTACTGATTTCTTTNAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATA:1 + chr3R 24228942 3' - 297 6623 2 72.28 CGATGCAGCTAACTATCGANGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCACAATCACTTTGGTTTGACTTTAGTAAGTCAGGCGGACGAACGAA:1 + chr3L 20148311 3' - pogo 20 1 55.91 CTCAGAGAGAATAGAAGATNTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAGTATTTTACATTT:1 - chr3L 14878646 3' - Juan 36 1 60.40 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGAAGTTTATGTATTCAAAAAAAAATCGTTATTACTCAAAGATGT:1 - chr2R 18939116 3' + I-element 5326 1 61.62 GTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTATGTCAGCATATGTGTGGCACATTTAGTCCTTAGTCCAT:1 + chrX 13497597 3' - accord 7160 2 69.31 AATGCTCAGAATAATCACAAAAAAAATAACTAAAAGGCAAAAATCTAACAAAAAAGCAACAAGCGAGCAAGAGTCACGAAAATGCAAAACACTTTTGAAAC:1 + chr2R 15070733 3' + Porto1 4343 1 81.19 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCAT:1 - chrX 21667992 3' + Tabor 7306 2 56.44 GCTCTAGAGGTGGCTCCAGTATCTCTCGAATTTTTGTTTAAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCTCTACAACTTCTATGGCTTCATGTTTCCTTTTGCGTTTTGC:1 + chr3L 16730548 3' + 1360 68 1 67.33 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACACATACGTACACTAGCGATGGTTATCTGTGAGTTGTA:1 - chrX 21939058 3' + HMS-Beagle2 272 2 67.33 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTTTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTCATCCAGTGGACATAATTGGAGGAC:1 + chr3L 9698005 3' - 412 51 2 71.29 TCTCTGCCGGTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGTAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGT:1 - chr4 281583 3' + Cr1a 4244 1 77.23 CTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTTGTTTTAGCTCTCTTACTATAAGCCATTCCAGTTAAG:1 + chr3L 14311529 3' + roo 409 1 77.23 ATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACCATTCTGAAGTTAAAAAAATAATGAAACGGCAAAACCCCAACTCTAACTCCGACACCAACAACATCACATTAG:1 + chr2R 15202619 3' - 1360 182 1 69.31 TCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGACTTCGAGTAGAATGGTAACGAGAG:1 + chr3R 1329896 3' + Quasimodo 211 2 72.28 ATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAACACATCAGATTAGTTCATCTTTTCTTCGTTTTCATCGCACACATG:1 - chr3R 3640155 3' - Circe 7167 1 71.29 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATCTCACCATCCAGTTGGAAATCAATGGCCCGTCTACTCTTTTCTAATTAGAAATGGCATGCAAC:1 - chr2R 12343864 3' - Burdock 10 2 69.31 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCTAGGTGATTGCAGGCAGCCGCAAAGTAGGCAACAAAATGTTAATTTCATTCGCGGCATCATTAGAAAT:1 + chrX 15183835 3' - hobo 7 1 68.32 TGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 214 2 86.46 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAG:1 + chr2L 19907954 3' - Tirant 8148 2 69.15 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCT:1 - chrX 21087612 3' - mdg3 43 2 78.22 TCCCGGCTCTCGTCAAGGGGGACCTTATGATAAGGTCCTTCGGCTGTCTCCTGTAAAGCCTTCTTTGTGGGCGAGCGGCGGCGAGTGTGGCCAAAAAAAAA:1 - chrX 12354615 3' - BS3 1595 1 75.25 ATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCG:1 + chr2R 1076532 3' + FB 268 1 53.47 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAGTAGTAAAATTT:1 - chr2L 18239423 3' - hopper 33 1 59.41 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGA:1 - chr3L 27415223 3' + transib2 2799 1 54.46 TCGTGGATGCGGAACAGAANTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAATCACAGCTGTATAAACAAAATAATTAATTAATAACAAAC:1 - chrX 12613073 3' + HeT-A 6025 1 62.38 GTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCCAAGCCAACGCGGCGTATACTTGATGCTGGTTTTCAACTAATTTGTTAAACTTCATCTTAAACTCCTTGCTTAAGCC:1 + chrX 8312128 3' - blood 7179 2 74.26 GCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGAAGGGCCGTGGTGGCCGCCAAGCGTACATGATTGCTCGGCTCTACCTTTCTCATGC:1 - chr2L 20736674 3' + Stalker 410 1 65.26 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGACTTTGGGTCCAGTCGGCCACTGAATTATGCT:1 - chr3R 27448249 3' + hobo 2897 1 67.33 CTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATCAACATTACTTGATCCCACGACAACAGGCGCTGCAACTCGGGATCGCGGATTTAGTCGGCCAGCACCATCA:1 - chr2L 3794717 3' + 412 7377 2 75.25 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGT:1 + chr3L 13704548 3' + opus 7456 2 76.24 TCATATTATAATTATTATTNATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGTCAGTCGGAAATGTCTTTCTCTTTT:1 - chr3R 30220208 3' - mdg1 7090 2 77.23 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAAGC:1 - chr2L 2016760 3' - Doc 55 1 71.29 CGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGNNNCGCCTNNTTGGGGACACTTGTGTTCTNNCNGCACTTTGCGCCACTTTTCGACTCTC:1 + chr2L 17032895 3' - F-element 482 1 55.00 AAAAGCAGGCCAAATGCCCNATAGTGGATTGGGTGGTTCTGAACCACTCATGGGTTTTCCGGGGCGTGTGGAAAACAGGGTTAA:1 + chr3R 9074131 3' - hopper 5 2 70.24 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTAAATACGGTAAATGCTGTCCAATCATTAACATAATTGAATTACAAACAAGCCCAATCGCAAGCAGAGA:1 - chr3L 13639830 3' - hobo 7 1 72.00 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCCGGAATCTGGTTCTACCAATTATAACAAGTTTAATAATCTATTTGCTACCGACATGGGCTATGATTTGATTT:1 - chr3L 10283505 3' - Doc 36 1 69.31 ATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTACGGATCATAGAATATGTTGTCTATGCGTCCATTCACATACAGATATTGCTGAATGCCTGAAGGAAGA:1 + chr3R 27258198 3' + McClintock 5994 2 74.26 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTCCGTCTCCCGTT:1 - chr2L 17168416 3' + flea 244 2 67.33 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGCAGTGTCAGTGAAAGTGTGGGAG:1 + chr3R 23803879 3' + P-element 2837 1 28.28 CAATCAGCAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTGGTTAGCCCCGATTCGGGCGTCTTTACCTGTGTACGACTGA:1 + chrX 2496768 3' + hopper2 76 1 58.33 TAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGACTTTTATTATTTTTGTAGCTGCCGCAAATGATTGGGGCAAAGTTTATCCAAATATGTCTGGAGAT:1 + chr2R 5020343 3' - rooA 224 2 62.38 ACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTATTTTTTTTTTGCTGTTTTTTTTCAGTTGTAAGCTGTCTGATTGGTTTATTTTAGTACCTCTAT:1 + chr3L 22792480 3' - Doc 4451 1 69.70 CGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGAG:1 + chr3L 21773110 3' + 1360 112 1 74.75 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATTGCTTGTCTTTCTCATTTTTATCTGAATACA:1 + chr3L 26567340 3' - opus 40 4 69.31 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTACATATATGTACGGAAAAGGTGGAAAAGCGAAGGTTGCGACCGGCGA:1 + chr2R 12343964 3' + Burdock 6367 2 55.45 CATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCTCAGTTGCATCTCTCTCAGCCCTCAGCTGCTGCAACGAATTTGATAGATCT:1 + chr3L 13144603 3' + F-element 466 1 58.00 AAAAACGTGTACATTATGTTATTAAAAAAGTTATCATTGCAGTTTTATTTTGAAAATAATGTTATATTTTATTCACTACAGTTTTTGGTCTATTTTGGTGA:1 - chr3L 18265189 3' + S2 1388 1 69.31 GACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTAGTTATTGCGCGACGAGGAA:1 - chr3R 6939483 3' - G4 169 1 84.16 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 424 2 54.46 GCTGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAACATTTTCCATTTTTCGGAACTTTGTTTTAATCGTTACTGTGTTATCTTCAAAGTCATCTTCGG:1 - chr3R 2471363 3' + Cr1a 4434 1 88.12 AAAATATGAATTTCTAAAAACTTAAATGCTGACTCGGCTGATGTGTGTGGTGTGGGTGGTGTAGAGTGCCCGGTAACTCGGCTTAGTGCCCACTAAATTCG:1 - chr3R 29485234 3' + gypsy12 9808 2 58.42 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGTAAAATGCGCTACACGCTTACTAAGACA:1 - chrX 17098374 3' - roo 8711 2 75.25 CAATAGATCCGACTGGGTCGAATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTC:1 + chr3L 25350810 3' + baggins 5403 1 51.49 CACCTTATGTTATTTCATCATGGACAGTGGCAAAGAAGCCGAGAGAGAGCAGGCAGTGTTAGGCAACGTCAAGTGGAGATGTTGAAAACAACTAAACTGAA:1 + chr2R 19424181 3' + P-element 2886 2 76.24 CGAGTTCCCCGACTATCAGNTACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTAGCA:1 - chr2R 10552684 3' - INE-1 559 1 89.11 GTCCCCGGTAATGCTAAACTCGTTTAGCAGCTAATTTGAGCGGCAAAACTTTTCCGATGACTATTGGCTTGGAAATTTTTTAAAGCTTGTGGCTAATCAAG:1 + chr2L 130338 3' + R2-element 147 1 58.42 TTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATATGTGTGCGTGTTGTGTCGGTCAAGCGGAGTCAAGTTTGTGGGAATTTTTTCGCTCATTTAGATAT:1 - chr3L 765649 3' - 1360 3244 1 59.41 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGNCTGCAGTTCTCTGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGACCCAAACTGTAGACGCCAGTTTG:1 + chrX 14961058 3' + hobo 2927 1 45.00 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATGTGAA:1 - chrX 8308714 3' + opus 7481 2 59.41 AGATCGACTCGGCTATTTATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCAGACATGATTGGATCGGTGGGTACGCCCAAACTGCTGGATGG:1 + chrX 13197812 3' - INE-1 97 1 58.51 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACTATTC:2 + chr2L 3985144 3' + roo 9035 1 62.38 GCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGTGAAAATAAGCCAGGTGAAAATTGGGGAAAATTCACG:1 + chr3L 10208911 3' - Doc 4545 1 63.00 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACCAAAAGGGGAGTGGCTGTGCG:1 - chr3R 11831438 3' - roo 54 2 81.19 GCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAACAATTTATAGATATTGAATCTAATG:1 + chrX 10296155 3' + I-element 5306 1 71.29 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAACTATACTGTATTTTGTTTCTGCATTTGACCGATTGCGTCGCGAAATGGATGTGGACAAGATCTGTCTTACCTGC:1 - chr3R 15213556 3' - pogo 14 1 65.35 AATAAAATCAGTTTCTTACTAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATGATTCTCTCCCTAAGGAAGTTGGGCCCATTCCATTGACA:1 - chr3L 1930444 3' + roo 9033 1 60.40 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGCCCTCAACCCCGGTTCCTTCTCTCTCATGTTTGGGCGGAGAC:1 + chr3L 22398614 3' - Doc 40 1 55.45 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACCCATGAATTATTCACATCATGTT:1 - chr2R 10167825 3' - opus 7160 4 76.24 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAGGTACAGTTTACCCTTTTTC:1 + chr3R 7451982 3' + Juan 4163 1 70.30 GATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATATTTTACTTGCCTCCTATTTTCTTGTATTTTTTTTT:1 + chr3R 27815836 3' + roo 359 2 72.28 AAGCATAGTTCTGCGGATAGCTAGGGACGGTAAAACAATGAATTTGAAAGTGCGCTATTAAAATACTTTAAATAATATTTTTCAACAGCATTCTAAAATCT:2 + chr3R 20018339 3' - Cr1a 4012 1 77.23 AATAACAATAATAATAATATTAAGTGATTTGTATCCATAACTGTTGGGCATGTGGTATTACAGATACATACGTATCCTTAAGGATAATATCCATCACCTAT:1 - chrX 4284444 3' + mdg1 7069 2 65.35 AAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTCACCCTGTTGAGTTCACATATCACGAGTG:1 + chr3R 13441922 3' + 1360 3342 1 75.25 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTTGCGAAGGGCTGTTGC:1 - chr2R 4606195 3' + 1360 3379 2 67.00 GGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAAAAATATATCAAAACTTTGTTCAATCTAAATTTAGATGGCAGCGAACATCATTTGAGCAGTACAATTA:1 + chr3R 10718129 3' + Juan 4205 1 65.00 CGTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGCATAAGTAATTTATGGCATATCACATATATGATATGGAATGATGATGATTTTGCTTTAATGTTATGAAGC:1 - chr2L 4020673 3' - 412 6 2 72.28 TAATTCAGCAAACGCAATCAAAAACATAAAATAAAAAAAATGAAGGAACACAAAAATACAGAGACAGCTGAAAAAATTAAGGAGGGAGAGTGCCAAAGAAA:1 - chrX 10114433 3' + Porto1 4321 1 79.21 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACAAAGATCTACACACTTGCAAACCG:1 + chr3L 21118609 3' - 412 7105 2 75.25 ATCAAAACAAAAAAAAAGAAATGCTCAGAATAAACACAAAAGACCAGGTGGCAAACAAAAAGGATATCTCGCATTGCTGTGTGGGTAAATTCAAATGATTG:2 + chrX 3274808 3' - Tc3 89 1 66.34 TAATGCAGATATCTTGCCGNTGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCAAATTTTGTGACGAAATATGACAACACATTCTATTA:1 - chr3R 4712691 3' - pogo 37 1 66.34 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTAAAAGCCAAACTGCGGGCCAAAAAACTTATTCCTTATACGTCGGTTATCTCTTCGGCCCAAGCAAAAAT:1 + chr3R 20425440 3' + roo 403 1 73.27 ATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGAATATATATTTTTTGTTAAGCTGACGAAATTTAA:1 - chr2L 16033409 3' - I-element 5345 1 71.29 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAGCAATAGCTGGGGCATCGGCACCGTGAGCTGGAGTAGGTGAATAGGCGCCCTCGTCATGTGGCCATTCGG:1 + chr3R 27605373 3' + opus 494 2 75.25 AAGCACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACG:1 + chr2R 3341939 3' + Copia1_DM 4127 2 66.34 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGTGGGCAACTCGCTCGTTTGCCAGCGAAGAAGAGGAAGACGTTGTGGCAGTGGTACTGAAAGATTGATTCG:1 + chr3L 5360248 3' - P-element 6 2 49.50 TGAAATAAAAAACAAACTTTAAGCAATTAAGATAAGTATAGTTTCTATAACTCTACTTTTGAGAGCTGGAATCTAGGGGATGACAGGAACAACGCAGATGA:1 + chrX 18868209 3' - hopper 183 1 44.55 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTATGCATAAATTGGCGTTAGTTAGTTAGTTCTCGTAGGTGCCGATGTAGGCGCTGCAGTTGGGGCAGT:1 - chr2R 22658982 3' + 297 393 2 67.33 AGGAGCTTCGAGTACAAGCNTTGGCCGCTTGCACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATTTATGGACGTGTCCTTAGCAGCAC:1 - chr2R 9640357 3' - Max-element 8284 2 67.33 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGGTGGTTTT:1 - chr2L 16548166 3' + P-element 2862 1 50.55 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCGAAATTTCGTGACAGCTGCAGCTGGAGAAGAAGAAGAGCATGAATGATCGCTCAAGGACTCGGTATCGT:1 + chr3L 7156437 3' + Tirant 8502 2 75.25 AGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAACTCAATGGGTAAGGGGTTTGGGTCACAAAATAA:1 + chr2L 3495012 3' + 1731 271 2 66.34 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACT:1 - chr2R 5214992 3' - F-element 64 1 78.22 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATGATTCTCTCCCTAAGGAAGTTGGGCCCATTCCATTGACAGTAAGCCAA:1 - chr3L 1930435 3' + roo 9042 1 54.46 TGTTGAACTGCGTTTCATATAACACGTGCTGATATTGTTGGCATGTGCATCGACCAGCACCGGCATGTCCTAAGAAACCGACAGTGTCACTCTAAGGGCAT:1 - 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diver 212 1 73.27 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTT:1 - chr3L 27357551 3' + mdg1 390 2 51.49 AAAAAAAAAAATTTATAAAAAAAAAAGAGCAAACTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGTGGCAAACTTACCTCTTTGATTTAGACGCTGGCC:1 + chr3L 10996227 3' - Tc3 80 3 79.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGCGATCATAATGTTTAACTGCGGCGTAATTATACACATTTTGTGTCTAATTGTAATAAAGTTTTTACG:1 + chr2L 7991910 3' - P-element 9 2 67.33 TATCACTGTATGCGTAGAAACAAAAATTCGAGAGGTCAATTTAGCCGTCACCAAATATTTCTAATGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGAAACGGGTATAACT:1 - chr4 431225 3' - 1360 144 1 71.29 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCCCAGTCGTTGGTTGCAGTGGTTGGTGATCCCGTGGCTCTT:1 + chr3L 14796435 3' - roo 8690 2 51.49 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCTCATTTGACAGATTCTCAGCTCCTTTCAACGCTAGCATCTTGATGTTAAAGGGCCACATGGAG:1 - chrX 14132054 3' + roo 397 1 67.33 GTAAATGTTTGGTGGGTCTGTACGTATTGTACATATGTAGTAGTAGTTTCAGCTATTCAGCTGCCTAACTTTATTCTATATTATCCCTCCACAAGTAAATA:1 - chr2R 21776267 3' - I-element 189 1 79.21 GCCATATACTGATCAGGTCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCTTGAGATTCCGGACTCGCAATG:1 + chr3L 13424715 3' - invader4 378 1 77.08 TCTTATTTGGGATTTTACATCATCTTTTAAGTGAGCATTCAATCAAATTGGATTTGCTAATAACACGAAAATCTGTGTCCAACACCTATTTCAACACTTGT:1 + chr3L 20192507 3' + roo 411 1 53.47 AAAATTTTTGTGCTCATGTNTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCTCGCACAAAAAAAAAAGATTTCAATTGTTTAACGAACAAAAAATCCATGC:1 - chr3L 17501670 3' - hobo 2609 1 53.47 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGTCAGTCGGAAATGTCTTTCTCTTTTTCGGCCCACTGCCTTCTTTTATCATTGGAATA:1 - chr3R 30220176 3' - mdg1 7058 2 59.41 CATACATATTACATACATATTTATTTTTTGTGAATGTGCTATTTATATATTGTATTGTATATAGTTACCGAAGCCATTTGTGTAACTTAAATTAGTTAGAC:1 - chr2L 9675302 3' - Dm88 4367 2 83.17 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTAGCTGAGATAAGGCTAAAAAGCGAGGAGAGCGCGCTTTCGGTTAAAGCTC:1 - chr3R 10093683 3' - P-element 26 1 53.47 GAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAAGTAATTCAGATCTAGTTGTTTTTAAATTACTGAAAAAGAGGCTATACGTTTGGTT:1 + chr3L 17546687 3' - 1360 50 1 60.40 TGGAAAATCCCAAAATTTTCCGGATCGCGACGTCTGAGCCCAGTAGGGCTTTTGTCGCCGCCAGTCTACCCAATGC:1 - chr3R 4054674 3' + Rt1c 43 1 57.89 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACCAGGTAACGGTGTGTGTGG:1 + chr2L 9521689 3' + P-element 2830 1 23.76 CCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTTCTCTTTATGCTCTCAAAAACTGTC:1 - chr2R 20520181 3' - Max-element 8248 2 64.36 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGTTTTGTAAACATATCAATGGGCTTATTATCACT:1 + chrX 17175234 3' - I-element 44 1 68.32 AATTTCTCCTGGCTTACTTTCTCCTCTACGTCTTTTGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACA:1 + chr3R 4357549 3' - TAHRE 313 1 46.53 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGC:1 + chr2L 22747331 3' + transib2 2779 1 72.00 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTGCCAGTTTTTAATTTTTCTTGACTTTTTCGCTGCTCTTGATTTGCGGCGAATTTTTCTGCGCTCGAT:2 - chr3R 9094715 3' + hopper 1408 2 72.28 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAAC:1 - chr2R 15160277 3' - Tirant 11 2 69.31 TGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTAGCCGGCGCTGAATGCCAGTCCAAGGTGTCCTGTTTCTCG:1 + chr2L 17004978 3' - F-element 4371 1 67.33 GTGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCT:1 + chr2R 5651921 3' - Tirant 12 2 69.31 TTTAGACTTTATGCCAAAANAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAATAATTGACAGTTGA:1 - chr2L 3581957 3' + transib2 2803 2 56.44 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGTTCAAGCTGAAACTGAGGCAAACAAATGGAAACTAGCTAGCTGTTCCAGGTGCGGC:1 - chr3L 20148221 3' + pogo 2083 1 61.39 TTTCTGTATTTAATTTATTTATTTTTAAATCCTTCTAAAATAATGTAATATTCAAATAAGAAATTTTTGGTTTTTGTTTTCGGGTTTTTGCAAGTTCGCTT:1 - chr3L 14399389 3' - X-element 4717 1 63.37 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTG:2 - chr2L 10924238 3' - hobo 52 1 76.24 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACCACCACCTCCGCGAGAGAGCAGCGAAGAAGAGGAAGACGTT:1 + chr3L 5360220 3' + P-element 2867 1 55.17 ATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCCGCCCCAATAACTTTCAATAACCTTTGTTGTTTGCTCCAATAAAAGCATTTTAATCGATACTCTTGACTTGTGT:1 - chr2R 15920111 3' - Idefix 7094 2 66.34 AAAAAAGTGGCTGCATAGTNCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCACACCTACTATCTTATCTGTCGGGTGAACA:1 + chr2L 15331805 3' + 1360 3342 1 72.28 TGTGATATCCGGTCGGTGTGCGCTTTTCAACTTATCTACCATACAAACTAAAATTAATTGTACAAGATTCTGGCCCACTTATTTGTGTTTTTTTCTGGTGC:1 + chr2L 14853935 3' - Chouto 5915 1 69.31 TTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATCAATTTCATTGTAAGAAATAAATTGACCATTTCATGGTTATAAAACCACAAA:1 - chrX 4349838 3' - G2 2949 1 80.20 TAAACATAATTCACATCAAACACACACACACACACACACACACACACACACATACAGCGGCTGCAATTTAAAGTCCTTTGGAGTCTGCTTCACACTCTT:1 - chr2R 9461253 3' + Stalker2 87 2 71.72 ATTTAAAAAACATAATACATTAAATGCCAAATATTTTTATTTGCTTTTATTTTGTAAAGTTTTAATACGAGTAACTTCAATCATATCAAATTATATCATAT:1 + chrX 20991297 3' + HeT-A 339 1 71.29 CATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACA:1 - chr3L 27356085 3' + Tc3 1677 1 61.39 TGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCATGCACATCTGTTGCATAAAATGTTCAGACTTTGAATAATGTAGATTGCCCCACCGTGAG:1 + chr2L 13083081 3' - invader2 305 1 68.04 AGGCGGCGACACACTCACCAGCAGCAGCAAAACTGCAATTGATATCAAATAGAAAAATGGGTTTCTTCACGACTAAAGATGAGCGAATGAATACCCTGTAA:1 - chr2L 13989442 3' + TART-A 101 3 69.31 CCATCCAAATATGGGGAACAGCCTCCAAACACCAACTGGAGAGGCTGAAAACTATTCAAACAAGTGCTGCTCGACGTGCGTTAGGGCTTCCTTGGCACGTC:1 - chr3L 24120303 3' + G5A 2438 1 77.23 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGC:1 - chr2L 3581987 3' + transib2 2773 1 76.24 AACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATGAGTTCGGCGCGAGTGTGTGGGTTCTGCGGGAAAACTC:1 + chr2R 13316228 3' + hopper 1413 2 77.23 TTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAATTGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAAGAGCGCATCGCCGCTTTTGCC:1 - chr3R 7310723 3' - jockey 102 1 76.24 CTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTCCTTGCTACGTGAACTTTAAAGGGATTT:1 - chr3L 993087 3' - Porto1 4505 1 72.28 AGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCCTCGCGTAAGCCCAAAACATCGCCATGGTTGACTGCGGCCCAGACGGAGATAATAAGTCCAACATG:1 + chr3R 26959624 3' + I-element 22 1 53.47 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACCTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTAATCATTAATAATTTATGGCCAATAGGCCTTCG:1 + chr3R 24464849 3' + 412 452 2 69.31 ACATATACATATACATATGCATATACATATACATATACATATACATACGGTTCTGAATCAGATTGCGAATCTGAATCTGTGCGCTCTGGGTGTAAAGTTG:1 + chr3R 27870578 3' - Stalker 244 4 77.00 AACCTTCAAAACAAAAAGAAAAAATCGTCATGCAACTGTGGTACTTCAGGCCGGAGCTTTCTGAGCTTTCGGAGCTGAAAAACTATAAACTAACTATAATT:1 + chr2L 8601631 3' + Doc2-element 211 1 64.36 GATCACGATGATCCATTTTCTATGCATTTCGATGTAGATATAAGCGCCACTGCAGGTTATGCCGGCATCGCTGCTCCTCGATTTAGGCTTACAAAAGATAC:1 - chr3R 1141929 3' + transib3 2563 1 66.34 TTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTTTGGCTTCTATATACGAATTAACTTTGTGATGAGCCG:1 - chrX 19168500 3' + roo 464 2 65.35 GGTAAATGCAAATTCAAACNGAAACTTAAAATGATTATATAGCTTATAGCTTAACTAAAATAAACTTTACTCTGAAGATCGAGATCTTTGCACTCAAAAGC:1 + chr2L 19436752 3' - Gypsy6A_LTR 164 1 51.49 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGGCAA:2 - chr3L 2029673 3' + roo 396 1 62.38 GTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACCAAGAATACTTTATATAATTACCGCTTTTTAGGCGCCAACAGCAGCTTACTGCGAA:1 + chr2L 20261743 3' + flea 145 1 70.30 GAGCACGTGTATTCATTTTNCGGCGTCCACACTTTGAACCCCGAATCCTTATCAAAGATTCAGCTGTTCTATTGCTTCTGACTGGAAATTGCCACAG:1 - chr2L 5647338 3' + invader3 268 2 68.04 GAGGTATGCGGCAGCGAGTNCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGTCTACACTTTT:1 + chr3L 13704558 3' + opus 463 2 65.35 GCACGCACACACACACACACACTCGCCCACCCATCCACCCACACACGCACGGGCAGACAGAGACAGAGACAGCGATAGCGCTAGCCCCATTGCATTAACCT:1 - chrX 22461671 3' + accord 7025 2 81.19 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTTTTTCATCATGCAACACACTATGTGGGCAATGGGCTTCGGTTTTGAATTCGGTGTCGTTGTTTACCGCTTCGCTA:1 - chr3R 8812542 3' + P-element 2871 1 64.36 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCTGCCTCCAGGCTGAGCCCGAACACTGAACTCCTCTCCATAGGTAGTGCGCCTCATGA:1 + chr2R 13377105 3' - flea 4806 2 59.41 TGTTGTGGGATCTTATGCCATTCTTCTAGTATAGCAGCTTTCAGTGCTGCTCGGTTGTTTGGTGACCTTTTTGCATCTTATGTTCTGAAGCACTAGCACAA:1 + chr2R 3905357 3' - S2 1334 1 76.24 TCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGGCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTC:1 + chr3L 23678154 3' - Osvaldo 19 1 69.31 ATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGGTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGC:1 - chr2R 3341945 3' - Cr1a 76 1 89.16 TGAAGCGCTTTGGACATGAGGAGGAGGATGTGGCCGCGTTGGCCAGAGGTGTTGGTGCTTCCATGTGCAACTTCCTGC:1 + chr3R 29467379 3' + Rt1c 5039 1 71.79 AAAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAATAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGAACAGTCAACTTTATGAGGATTTCCGAGAGCGACTTCAAGGAA:1 + chrX 5259110 3' + Doc2-element 237 1 57.43 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTACAAAAAAT:1 - chr3L 15777004 3' - I-element 29 1 49.49 TGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGT:1 + chrX 21668067 3' - Tabor 6879 2 63.37 TGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAATAGTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATATTTGGAAAGATCTTGTCTCAACTTTTATT:1 + chr2L 16958140 3' + 1731 295 1 58.42 AAGATTGTATGTACAATTANTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCT:1 - chr2L 21369863 3' - rover 6992 2 70.00 CTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTTCTCTTTATGCTCTCA:1 - chr2R 20520190 3' - Max-element 8257 2 55.45 ATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCGATTTTTTCGTTTCAGGTGACCTTATGGACATCTTGGCGCT:1 + chr3L 2299766 3' + pogo 5 1 65.35 CGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTTTTCTACCAGTGGGTTCTTGGCTCAGTGGTCGGTCTGTACCCTGCTCGT:1 - chr3L 3234298 3' - Idefix 7038 2 66.34 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATAATCGATTTACCGTCCAGACAAGCCATGCAAATGCGGTTAAAGCCACCTGACCTGCACACCTT:1 + chr2R 13540980 3' + 297 389 2 74.26 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTTTAAGTGAGCCACGACAAATGTCACGTTACCCAAATTATATTTCTCAAA:1 + chr3R 24612248 3' - roo 26 2 53.47 GGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCTGCCACTTTTGGAGCCACTGCAGAAGCTGCGACCTTTGGTTGCCGACCAGGATATGAGCAGTTTACTCCGACGCC:1 - chr2R 17864213 3' - 1360 3358 1 77.23 GCTGCTGTTGCTGCTGCTGGTGGTGCGCTGTCTGCAGGATATATGCTCCATAGGTGGATTGAATGTAAAGTAGCGCAAAACGCTGGCAATTGTGTGGTAAT:1 + chr3L 9950838 3' - TART-B 152 2 71.29 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACCAGTGATTAAGCATTTAAATATAATGCTACAGGC:1 + chr2L 9045300 3' - jockey 4718 1 69.31 AACATCCAAAGAGACTTAANTATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGCAACTTAAGGAGATGTTGCGCATACAGAAAACGATTAAACATTTTTAGATACA:1 - chrX 16458605 3' + F-element 4385 1 57.43 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTCTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTACATGTAGTAGACCCCTCAT:1 - chr2R 13540901 3' - 297 50 2 81.19 ACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCAACTTTTTTTGCCCATTATTTAAGGCGCTTGCCTTGGCAGCTTGAGTTCCTTTTCCCCTCG:1 - chrX 12391752 3' + Bica 120 1 61.39 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTATCTATGCCCTACCG:1 + chrX 19607313 3' - Tirant 20 2 59.38 CACACACTTACACACACACACACACTTACACGCACA:1 + chr2R 15531622 3' + Quasimodo 30 2 80.56 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATTGTTTACCGGGAATA:1 + chr2L 19907990 3' - Tirant 12 2 69.31 GATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTTATTTTATTTATTTTTTTTTTGTTCGTCGCCAGCAGATGATTACAAATGATCATTGATAAAAATAACAGCA:1 + chr3L 3448285 3' - Tc3 1585 1 67.33 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGTAGCCACAGGTATGCATGTATGAAAACGTGAGAATGTCGAGTTG:1 + chr2L 19677361 3' - hopper 31 1 53.47 TACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCTAGAAGGACTTAGATAAAACACGAAATGGCCACAAAAAGGATCTTGTCGCTAAGAG:1 - chr3R 10716154 3' - baggins 5176 1 60.40 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATG:1 + chr3R 20432460 3' - roo 40 2 68.32 CGGTTTGCCTTCTTTTCAATCTGAACAATCAACGCGTCAAGTTTCGAAAGTGCGTCAAAGAATTTTAACTTGCGGTCACAGGGCCACAGAGATAGCTCGCA:1 - chr3L 11367643 3' + gypsy12 243 2 69.31 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGAGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGCAAAAAAAAACGAGGAGCTGCGGAAAATCCAAGA:1 - chr2R 14724981 3' + jockey 4950 1 72.00 AATGGAAGTGGCTGGTTTGNACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATAGAAAATTAACCCAGTTCGCACGTCTATGCCGAAACAAACAAAAGTTTGCGA:1 + chr2L 20330106 3' - 297 18 2 62.38 AAAAGAAAAAAGAAAAACAGGATGCTAAGACAGCGATTGATGCGTGACATGGGATGGGAATGGAATCGACCAGAACAAAACTCGAATGCTAATGACAAAAA:1 - chrX 6508880 3' + Doc2-element 224 1 62.38 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAATTCTTTCTAACACACTGAATTAC:1 - chr3R 4512299 3' + flea 4964 2 76.24 AACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAGCGTAACTCCGGTCCCAAGCTCCCGGCGGACCGCACCCCATGCAT:1 - chr3L 12302342 3' + I-element 5097 1 53.61 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATTAATAATGGTTCATTAAGAGAT:1 + chr2R 13248773 3' - 297 6625 2 79.21 GCGTCAGCATTATTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGTAAGTTATGGCAGTCCGAACGACTACCTTA:1 - chr2R 4248088 3' - gypsy 7031 2 67.33 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTG:1 + chr3L 25345144 3' - Doc 53 1 70.30 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCTACGAATTCGTGGAGGTAAACACTCGGGCCAAGGAGAACTTCTCTGAGGAGTTTCTGAAG:1 + chr2R 18407077 3' - mdg3 5270 2 59.41 AGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTT:1 + chrX 983374 3' - Juan 3830 1 52.48 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATGATTCTCTCCCTAAGGAAGTTGGGCCCATT:1 - chr3L 1930453 3' + roo 360 2 71.29 ATACCGTGCTGAAACCCATNTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGTTAAATAGTGGAGAAACGAGGAAGTTGCTTATGCGAGGATACACCAAAGTGGAGG:1 + chr2L 23310494 3' + Doc2-element 4343 1 63.37 GTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATCATTCAAGAAGGTGCCATTCTAAGAAATGGAAATAATATTGTGAACTATTCTCATTTAAACGGTTCATATTT:1 - chr2R 1905093 3' - Max-element 3 2 77.23 TTACGCGAGGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATTGAAGTGGGATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCA:1 + chr2L 7552464 3' - I-element 44 1 62.38 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGAGCATGTTCTTCTCTAGGTCTGTATTAAAACCAAAGATAGTCATAGCGA:1 - chr2L 9724195 3' + 1360 3363 1 53.47 CCCACTAAGGAAACCCACAACAACACACACGAACACTCTCACATGCGCCAACCCCTAGCCCATAAACCAACTCCCTTGGCACATTATCTGCGTCGGCGG:1 - chr3R 27623182 3' + gypsy3 404 1 72.73 TTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGGCAAATACAAAAGCACAACTAGAAGTAAAGAGAGAGAAATTCGTAAAAAACG:1 + chr2R 9321223 3' + micropia 5228 2 58.42 TTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGATTTTTTGACTTTGAGCCGCTCAAAACCTGATTACTGTCCTAGAGCTGAATTCTCCACTCCTACTATTA:1 - chr2L 4290028 3' - TAHRE 10429 2 64.36 GGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTTTTATTGTGTCGGAATCATCGAGTCCCACTGGTTCCAAGCGCTTTTCTCGCCCACAAGGGTGGCTCATTGGGA:1 - chr3L 704115 3' - Porto1 271 1 76.24 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCCTCCCCAGATTCCCGGCTCGTACCATCCCGCACTGCTGCCC:1 - chr3L 16301816 3' - jockey 57 1 61.46 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGACCAGAGATTAAGCATTTAAATATA:1 + chr2L 9045289 3' - jockey 4709 1 75.31 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGCTAACTAGGCATATATTTCACTGGTGAAATTTATTGTAATTAAAATTAAATAAATGACCGCTGGTGAA:1 + chrX 19199041 3' - pogo 3 1 68.32 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATATATATAATAAATCTATGTACAAGATATAGCTATGCTGGTGCTACAATTATTGTTTATGTT:1 - chr2L 20329995 3' + 297 6970 2 74.26 AACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTGCTCAATTTTGAGTGATTGCACTTTTGTAACGTAATGCGGCTCTCCTGGAACAA:1 + chr2L 10014388 3' - hobo 2473 1 53.47 TGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACAACACTTCGATTTAAAATTGCGGCGCGGGAGCTTCCAGGATATTTATGAATCCCAAA:1 - chr3R 5963171 3' - R1A1-element 346 1 57.43 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAACAGGCACACGTCAGATCCTTTCGAGGCGCA:1 + chr3R 30220241 3' + mdg1 373 2 70.30 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAATGTAGTTTAAATATGTCTAATATCTT:1 + chr3L 20032296 3' + Tabor 433 2 73.27 ATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATGTATGTTAGGGTCAGGTTCATTGACTTGAGCAAGTATAT:2 + chr2L 6170197 3' + invader3 278 1 79.21 ACAGTTTACTAAATAATTAAATAAATTTGTTTTATTTAATTTGCAACAAAGATATATCTTTTTACACTATAGCATTAGCAGCCATTTGATGAAACAAAACA:1 + chr3R 24893547 3' + HeT-A 22 1 66.34 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAATGCGTAAC:2 - chr3R 11118043 3' - BS 37 1 65.35 GGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGTTAACTCAGATATATATTGGCTTTCAACGAAAGATAAAAAAGAAAATCGAAACCG:1 - chr2L 3494946 3' - 1731 22 2 57.43 ATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATA:1 - chr3R 26498526 3' + roo 9034 1 64.36 AGTAAAACTAAAAAACAAATAGACAACGAGCGCCAACTCATTTGCAACTCAATTTCAATTTCCCCCGCCGTCAATTATGACATTATCACGAGCAGACATCT:1 + chr2L 1101628 3' + Doc3-element 173 1 69.31 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGT:1 + chr2R 13316176 3' - hopper 54 1 77.23 GCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGG:1 + chr2R 5532338 3' - G4 3763 1 46.53 GCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTTGCTGTCCAGCACCGAAGCCCAGAGGGCTCCCCTATAAGGTGCGGGTGTGCAGCCCTTC:1 + chr2L 5213439 3' + accord 6920 2 60.40 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTTAGCTAGCACTGTTTACTGTTTACTCTACTCGAATTA:1 + chr2L 5304767 3' - 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chr3R 24571064 3' - Transib-N1_DM 288 1 67.35 AGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTGGGCAGAATATGCCTTATTTCTGGCCTTACTAC:1 - chr2L 13621963 3' - opus 110 2 66.10 AAGTAATTATTATTAATAATTATTGATACCTAAAGAAGTGGAAGTGAGATTTGGCACCTTCTAATTTATGTATTCATTGCGGATCTAAGCCGTCAAAAAA:1 + chr3R 5320304 3' + gypsy9 297 4 66.00 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCTAGGTGATTGCAGGCAGCCGCAAAGTAGGCAACAAAATGTTAATTTCATTCGCGGCATCA:1 + chrX 15183827 3' - hobo 15 1 60.40 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTT:1 - chr3L 25059060 3' - mdg1 17 2 62.38 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTTAGTGGCTTATAGTATAAGTATCTTATCCCTA:1 - chr2R 6074351 3' - 412 7078 2 48.51 CTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTGATAGTGCCTGATGAGCCGAGACGCTCGGGAAAAGTTGGCGCACCGCCGTATTGGGACGCAG:1 - chrX 10916414 3' - Bica 4553 1 53.47 AAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGAACACGCACACCAATACCAGGAAATTCTTAAGCACACTCCAATACATAGG:1 + chr2L 7940637 3' + flea 4601 1 54.17 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACATTTAAGTTGCAAATTGAATTTTGCATAATCCCAGGCGC:1 + chr2L 897646 3' - roo 8692 2 63.74 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTCTACAGCTTCCTTACGTATAACTCTTTAGAATGCCATTTCTGGCATAGATTTAATGTGGCTTCCGTCATTATGTGATAGG:1 - chr3R 19449230 3' + roo 9067 1 56.44 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTG:1 - chr3L 25059063 3' - mdg1 7058 2 59.41 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATATTTAAATACGTCTTCCTTCTTTTTACGAG:1 + chr3R 11814540 3' + blood 7344 2 70.30 GGATGGGGAGAGCTTGAGAGATACGCTCTCAGTGCTTACGTGTGCATGTGTGTGGCGCAAAAAACATGCATTGGTTGGTAGTGGTGGTGGTGGGAGTGAG:1 - chrX 19129429 3' - Doc3-element 442 1 63.00 GAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGACTATTGTTTGGACCACCAACACCACCACAGTTGATGTACCCA:1 - chrX 5065864 3' + F-element 4433 1 58.42 ACTACATGAGTCAGTCACTTAATGGATGAAGATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAAT:1 + chr3R 19448648 3' + roo 156 2 81.19 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCCGGAATCTGGTTCTACCAATTATA:1 - chr3L 10283553 3' - Doc 84 1 76.24 ACATAGGTTCTTAATTGTAAGCAGATGGTCAAATCTGAGACCTGGAGCAACTTGCGCATGACGACGGACACCGGGTGTATGTCCGCCATAGTGGGCTTCCA:1 - chr3R 29936705 3' - Tirant 195 2 80.20 AGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCT:1 + chr3L 23871326 3' - Doc 29 1 51.49 TTTCCAAATAAAATCAGTTNCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATAGGGAAAATGTAAAATTAGGCTGCCAA:1 - chr2R 8674147 3' + roo 9027 1 68.32 TTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGACGGACGGGGATTCCTTGTTTGTGTATGGGATTG:1 + chr3R 10719347 3' - Doc 4445 1 67.33 GAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCC:2 + chr2R 1922472 3' + gypsy 405 2 80.20 GCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATA:1 + chr3R 11547786 3' - G2 285 1 67.33 ATATTTGTTTTTTTGTTTTACTTTTCTCCTTTCGTTTTGCCTTCAAATCGTATGGTACTCCACGTTGGGCGCCATTTGTTTTTAGCCCCTCAACATATTTA:1 - chr2L 16661759 3' - Doc3-element 173 1 70.30 CTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGTCCCTTACAGAGTATTATGTTCTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCCATT:1 - 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INE-1 518 1 84.16 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAGGGGTTAAAACACCTGCCCCA:1 - chr3R 26498503 3' + roo 9057 1 61.39 GCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACGGGGCGCGAAAAGTGGTTTCTATTTATTTATTTATATTCCCATTGTGC:1 + chrX 14664220 3' + Doc2-element 387 1 52.48 CTGAGAGGCACGACTTATCNCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATTGAAGTGGTATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCAAGACACTTTATAGCTAAATAAA:1 + chr2L 7552486 3' - I-element 22 1 41.58 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACCTATTGAAACCTGGCCAAAACCCACGAAATGGAA:1 + chr3R 7582691 3' + 297 6939 2 64.36 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACAGTAGCACGGAGTGAGGCCCGTAACGA:1 - chr3R 557204 3' + blood 7338 1 75.76 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCGCAAAGTATAGTGGGAAAATGAGAGCAAGCCAAAGAAAAGT:1 + chr2L 9045844 3' - jockey 7 1 78.35 GGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGTTTCGGTTGTAGAAGACTAGAGCTTTTTAAACGAAAATATTAGCTCTAAAACTGAAAAAAGA:1 + chr3L 13142093 3' - F-element 389 1 75.25 TTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCACTATGAATACATCATACGTAGCCGCGATTTTTACGCGTTAATCAATAAAATATAATTCCGTGCGACGT:1 + chr2L 14076505 3' + rover 7049 2 70.30 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTAAGCGACCCAATTGGGGTGGAAAGTTGTTGTTGAACT:1 - chrX 2911965 3' - pogo 34 1 63.37 AAACCTATCTGGACTTATGNCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGATGAACACCCAGATATGTTACCTATGTTACCGATCTTAAATGAAGATTGAACT:1 + chr3R 13633753 3' + Doc 4280 1 47.00 CCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATAAAAATACTTTATATGGTCGAAAA:1 - chr2L 22136610 3' - INE-1 137 1 77.23 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAGTTTTTGGTTTCTCCACTTTT:1 - chr2L 17131558 3' + mdg1 7406 2 77.23 TTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAACACACATTCATACGTATATAGCGCGCTCGGCAGCAGGTTTAGCTGGTTGTGTGAGTATGTGTGCAGGCCTGTGT:1 - chr3L 17135949 3' + Tc1-2 476 1 73.00 GTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCTGCGGCTAGTCCATTAAACACATTGCACATAAAATATAA:1 + chr2L 16928824 3' + opus 93 2 61.39 AAAAACATATAAGGACATTNAAAAACTCAGTTTCGCACGCAAATTAAGAGAATCGAAAGCAAATGCAGCAACGGTAGCCGCTCTCCATGGTTAGGCTCAG:1 - 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chr3R 31984455 3' - springer 7089 2 73.27 AAGAGCTTTATTTATTTATGATTTATTGGACTTCCTTCGTTGTTTTATTGCTAATTGCCTTTTGTGATCCAATTTACACTTTTCTCTTCGTTTTATTAATT:1 + chr3L 16711399 3' - G3 346 1 74.26 TTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATATTGTTTTTATTCCTTTTTAAATTCGATAAGTATTTTTTTGCGCTTTGCCTTAAAGTA:1 - chrX 18123221 3' - 1360 2988 1 65.35 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGA:1 - chr2R 9871040 3' - roo 8666 2 49.50 GATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTAGTATACCCTCTTCCTCTAGGAGTAACGGGAATAATCAACTGCAATCTTTAAAGATG:1 + chr2R 25107315 3' - INE-1 80 1 60.40 TAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCGAGTATGTCTTGGTCGCCAGTGGATTTTTT:1 + chr2L 217430 3' - HB 1328 1 70.30 GTTTTTTTTGTTGCTTTTTTTTTACTCCTCACACTCCTTTTTTGCGTGCGGCGTTTTAAGCAGCCCCTTCTTGCCACGCCCCTCCTTTTTTTAGGG:1 - chrX 7478962 3' - Porto1 4434 1 81.25 AAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTCTTTTTTTTTTTATCTCCGTTTTGTGCCGCAAATCTGTTGGTTTAAGCTCATTGCTCTCAATGTTTGCCGAGT:1 - chr3R 11902249 3' + 1360 19 1 76.24 TGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACCCATGAATTATTCACATCATGTTACAATTGTATAATTATTGCC:1 - chr2R 10167805 3' - opus 7140 4 55.45 TTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGCTGTTCCTCAGTAATCTCGCTTGGGTTTTCCATTTTTTCCATAACAATCTTTAGCGAAAAA:1 - chr2R 21773379 3' - G2 2885 1 63.37 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATTGGTAATTAAATATATAGTGAAACATGTTTTGT:1 + chr3L 6982570 3' + Burdock 216 2 67.00 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATGTGCTCGGGGGC:1 + chr3R 29375016 3' + mdg3 213 2 57.43 GGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCGAATCG:1 + chr2R 1076537 3' + FB 274 1 59.00 TTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGAATTACCTGTGCGGGGCGTCGAAGTGGGGTGGCACTGAGCCGGATTCTACGCCCCCCTGGCCAACCA:1 + chr2L 12277719 3' + Stalker4 6944 2 75.00 TTTAAAAATAAAATAAAATTATACCTTATATTTCTCTCTCTGTACCCCTTCGTCTCTGGGCATGGTGTCAAATGCAAAAACCGGATGCGGAAATGCAGGCG:1 + chr3L 13159420 3' + NOF 3956 1 73.27 TAGTTAATATAATAAATTTAATCATAATTTTTTATTGATAGCTGCCATCGATAAACAGAGTCACCAACACTCACGCAGTCGCAAAGTCCCGTTAAGGGAAG:1 - chrX 20583157 3' - transib3 2665 1 77.23 GTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGACACGCAGGACATTCAATGGGCTGTGGCGAAAGGAGCGAAGCCATCTAGTGGCGTAGCCAATA:1 - chr3L 7430153 3' - Max-element 366 1 68.32 TGCTGCCATAAGTTAATATNCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGACTGATTGTTAACTGTGTATAAATGAAAAT:1 + chr3R 13686612 3' - 412 44 2 66.67 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCCCTTATTCACCTGCAGCCAGCTGGAAATTTCGCAACCCTTTCGCGCAGCCGTTG:1 - chr3R 9074041 3' + hopper 1394 1 54.46 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTTATTTGCTC:1 - chr3R 24464801 3' - 412 44 2 68.32 TTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTATTTCTGTTTGACTCCCCTTATTGCCGTCTCGGAGGCTTTTCCGCAAGTCATCGGGTAAC:1 - chr3R 6796603 3' - invader5 3890 2 61.39 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTTCTCGCTGGAGCTTGGCACACGTTTCGCCTTTGTCAGCTATGAATACCAAATA:1 - chr2L 12485387 3' - roo 8686 2 58.42 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGACTTCCTCGCGTGTTTTTGGTCCCTTTCCATTCTAAAGAATCTTAAGCCCAAAGAAACTCCCAGTCAAG:1 + chr3R 14164268 3' - roo 8671 2 68.00 TGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTGGAGAACTAGTGGCTATGCCAATAACAACAATGGAT:1 - chr2L 16053568 3' + accord 182 2 64.36 GAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGTGTGTTTGTGTGTGATTTTCCACCCCTCGTGGAAAACGTGAAAAG:1 - chrX 12218677 3' - 1360 3278 1 60.00 AGACCTCAAGTTAGCCACTGTCATCGAGGCTATAAACATGCACTCCTCCGCACTGGAGCTCTTTTGTTCTGCGCCCTGGATACAGTGGCCCCCCCTCGTCC:1 + chr3L 20710915 3' + BS3 1435 1 60.40 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTATTTGAATAAGTTTACTCTCCGTTC:1 + chrX 3334696 3' - 297 6626 2 78.22 TTAAATATTATTTAATTTTTTATTTTTTCTCTCACAAATATTGAAGTACCTACTTGCAAAGTATAACTTGCAAACATTTATTCTCTACTCTGGCTCCATTT:1 + chr2L 11684207 3' - Tc1-2 387 1 61.39 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTGGGGAAGAAAATGAGAAAAAACATATTCCGTATTTTGCACAGACTTGCTTTCGAGAAC:1 - chrX 22765030 3' - HMS-Beagle 6810 2 61.39 GCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTTTGTGCTGTTCTGGGCCAAGGAAATGCATGGAAAATGGAAAAGCGTCTGGTGAGGGGTGGTGGTGTGGGCTTT:1 + chrX 14008261 3' - accord 257 2 74.26 TAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTATAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAA:1 - chr2L 18177041 3' + INE-1 544 1 68.32 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAATACGCACTTTATGTATGTGTAGATATCGGTGTAGTTATGTGAGTATGTGTGTATGAGTGTCGAGCTATGCAC:1 - chrX 1716609 3' - hobo 3 1 77.23 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATGAGTTCGG:1 + chr2R 13316198 3' - hopper 32 1 57.43 TATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTGGGGCAGGGGTAGCAGTGGGTTA:1 + chr3R 17248992 3' - I-element 5027 1 77.23 AACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCTCTTCACCCGAATGCCCACAATATCAAACACAAAAACAACAACAAAATACAAAAAA:1 + chr2L 15438865 3' + I-element 128 1 55.45 TTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGCAAAACAGGACACTGAGTTGGTGGCACTCCTCTATCCGGCGTGTCCTGCTGTAAA:1 - chr3L 15381713 3' - Idefix 7078 2 60.40 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTCGAGTGCCTGAAAGTATGCAAGCCATTTGAAAGTCAATCAAGCCGTATTT:1 + chr3R 20154832 3' - jockey 8 1 77.23 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGTGACGCTGCTCGCCGTCTCCGTTTTGCGGCTTCGTTC:1 - chr2R 16580367 3' - pogo 36 1 62.38 TGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGTGGAGGTGGAAGTGTGGAACCCCAAAACTTGAGAATACAGTTTGGAGGCACACGACCCTAATAGC:1 + chr3L 12162545 3' + diver2 199 2 73.27 GTAAAAACAAAGACACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTAAAGCAAATTTAGCAATTAAAAA:1 - chr3L 11314399 3' - Tc3 317 1 45.54 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTC:1 - chrX 9439182 3' - roo 8716 2 83.84 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTCATCCAGTGGACATAATTGGAGGACCAATGTTA:1 + chr3L 9698013 3' - 412 43 2 65.35 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAAT:1 + chr3L 13739631 3' - BS 5036 1 67.00 AAGTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAACAAAATCAAGTACAAATTGCTTCACAGGCGACTGCCAAATTTCGGGGGAGTGGCAAATAAATCAAAGCGCGTAG:1 - chr3R 15050298 3' - accord2 7265 1 58.42 GCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATT:1 - chr3L 27356100 3' + Tc3 1662 1 75.25 ATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCCAATAGGTTGCACTCGAAGAGCCATAAAAAGTATTTGTCCACAATTTATATAAAGTGC:1 - chr2R 9466154 3' + hobo 2565 1 67.33 TGATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGG:1 + chr2L 20290308 3' + flea 5002 2 64.95 CATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATTAATTTTTCACGCTACCCTCCCTTGA:1 - chr3L 12088220 3' + F-element 4315 1 74.26 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTCGA:1 + chr3R 20154785 3' - jockey 56 1 70.30 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCATACACATGTTACACACACATATAAACAATATATGACGAACATTCCAGTGACAA:1 + chr2L 9724502 3' - 1360 23 1 49.50 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAATGACCCATACATCTATGCAGCCGCAACACAATCACAGACACGACGATACTATTGCCTACCTGGAGGCG:1 + chr2R 7605101 3' - jockey 16 1 61.39 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCCCTTATTCACCTGCAGCCAGCTGGAAATTTCGCAACCCTTTCGCGCAGC:1 - chr3R 9074046 3' + hopper 1390 1 52.00 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGAGTCCTTCGTTTTGCGCAGCCGCTCGCCGATTTCGCGGTAAAAAAA:1 - chr2L 16690422 3' + P-element 2857 1 49.50 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGG:1 - chrX 21668007 3' + Tabor 452 2 55.45 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACTGTCCGTGCGCAGTTCTCTTTTGCGCTTCATTCGTGCTCTGCCCGTCGGACGTGTCCGTACGATTTT:1 - chr2R 19424057 3' - P-element 9 2 72.28 CAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCCCGCCTGGAGCTCGCTGGCCAGTCGACTTACACA:1 - chr3R 10662561 3' + blood 49 2 66.34 TGAATAGCCTGGATCCTTTTTATTTGGCTGTCGCATGCCGGCTCCTTTTGGATTACTTCCCGTTTTGGGCATATTTTTTAGGGTTTTTGTTTTAGGGCGCC:1 + chr3L 3562846 3' - X-element 4279 1 65.35 TTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCCAGGACTCCGTATAGCCTTTTAAATCAATTTCATTGTAAGAA:1 - chrX 4349873 3' - G2 2984 1 56.44 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGCAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGCCTATTTTATTTGATGAGGGATT:1 - chr3R 5122277 3' - Doc 53 1 76.77 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACTATTTGCCGTTGGCAAAGTTTTCATCACGGGGTTATAGAGGGGTTAAAACACCTGCCCCACAGTTG:1 - chr3R 26498497 3' + roo 9063 1 67.33 TGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCGGGAGAATGAGACGCACACCTGAGAGCGAGAAATGCCTGCGTTGCCAACTATTTTGCCGTTT:1 + chrX 5047296 3' - blood 7180 2 74.75 TTAGCCGGCGCCCCTGAAAGGGCTGAATTGATAGCACTTCAGGTATCGCAACGGGCAGCTTCTGCGTGGTGGCTCCTATGTACATTTCGGAAATCGCGGAG:1 + chr3R 5837134 3' + BS3 1692 1 68.32 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTGTATGTACTTGACCTGGAAACGTTATGCCCGCAATGGGAGAGCTGATGGGTAGCTGTGGA:1 - chrX 18053775 3' - 297 10 2 70.30 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGGGGAACTCGGACTTAATGCGCT:1 + chr2L 3582017 3' - transib2 52 1 77.23 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGATAATTGTGTGCTTTATTACCCAAACAAATCATTAGCACTTTTCGA:1 + chr3R 13710727 3' - roo 29 2 56.44 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACGTTTTCTTGATTACTTTAATACGCAACATAGTTTCAACGA:1 + chrX 20555767 3' + roo 9036 1 61.39 GAAATATTTATATATATTTTTGTTAGAAACAAAGTTCAAAATATCTTAAAAAAAAAGTTTTAATGTCCTAAATAAAATCAGATTTTGGCTTTTTGGCAAAA:1 - chr3L 10267191 3' + copia 4660 1 36.63 CAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATATTAGCCGAAAAGGTTAGATTGAAAATTCAACAAT:1 + chr2L 22097805 3' + accord2 7241 1 66.34 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGCATAAGTAATTTATGGCATATCACATATATGATATGGAATG:1 - chr2L 4020702 3' - 412 34 2 64.00 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAATGTTTATGCCACGTTATGAAATAGAGAGACGAGCCCCCCGCGATGTCTATTCTTTCGTTTAGGGG:1 + chr2R 11664405 3' + Tirant 391 2 69.31 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTTGTTTTAGCTCTCTTACTATAAGCCATTCCAG:1 + chr3L 14311524 3' + roo 9067 1 72.28 CCATTTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGCTTTCTCTTTTTTTTATTAACGCATGTCCATGGGGCATTGCCAACGAACCGGGCAGCAACAAACAGATTACAAC:1 + chr3R 28058576 3' + hopper 141 1 67.68 GAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCCTTAAG:3 + chr3R 1844865 3' - Cr1a 111 1 74.26 TTAGTTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGGCGATTTAGCGATGCTTGTCTTATTTAGTTTTTAAATAAATAGCCAAGGATGTTA:1 + chr2L 16071184 3' - 412 15 2 59.14 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCGACCCGACCAAATATTAGAAGAATTATGATAGGTCCACAGTTACCCACTTTCGCCGGCCATTCCCGAT:1 - chrX 2911237 3' + hopper 1410 2 72.28 AAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTTGAACCCCGAATCCTTATCAAAGATTCAGCTGTTCTATTGCTTCTGACTGGAAATTGCCACAGA:1 - chr2L 5647337 3' + invader3 5451 2 66.34 AAAGGTTTTTATTGCATTTTTTTGTTTTACTAGAAGTACCAATCTTCTGTGTGTATTAATAATGGTAAAAAGAGACAGACGCTACGGCAAACCGATGTGCA:2 + chrX 8659243 3' + Tc1 309 1 66.34 GCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGCCAGCCACCAGCCCGGCACCG:1 - chr2R 22499690 3' + baggins 5320 1 78.79 AAATTAAACACTGAATAAATTCGGTTTTGGTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTTGATTGCTTGGCGCAGTTTCGTTTGTGGG:1 + chr2L 12119072 3' - McClintock 346 2 71.29 GCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTCTTGATTAGATGCATTGATGTCTGCCAAAGTTAAC:1 + chr3L 2921187 3' + 1360 200 1 67.33 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTACATGAGGGGGAACTGGTACGATTCACTTTGTGACTCATTGTAATT:1 + chr3L 2809827 3' - pogo 27 1 54.46 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCGCTTTTATTGAAAAGTATCTTTCGTGGTGCAAAGAACCTTTTCTTGC:2 + chr2L 7161374 3' - pogo 27 1 54.46 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGCCTATTTTATTTGATGAGGGATTGAGTTGCCTTGGCGATCGTTTTCAAG:1 - chr3R 5122251 3' - Doc 29 1 53.47 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAAACAATATAATCTTTACGTACCAATTCCCATATTTCTGATTTTA:1 + chr3R 23788503 3' + pogo 2073 1 60.40 AGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGTCCGATTTTTTCGAAACAAATTTTGTTTGGCAACTTCATTTCGTACCGTTTATTGACAGCGACAACTG:1 + chr3L 7301925 3' - F-element 132 1 72.28 AGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATATAAAAATTTGGTGCCGCAGCCTCCGAAAG:1 - chr2L 11032621 3' - 1360 212 1 72.28 TATATGAAAGTTGACCAAATCACTTGTGAAGATTCATCATTTCGAATTTCTGCCAAAAAAAAAACCACAAAAAA:1 - chr3L 6775478 3' + transib1 2030 1 62.16 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTGCTCCGAATGTGTATATAAATACGTATAGTGTTGCGACACTACATTCTGTCGCCG:1 - chr3L 3122898 3' - hobo 31 1 61.39 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCATAAATTCACAATAACTTTT:1 - chr2R 9061902 3' - jockey 4679 1 65.35 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAAAG:1 - chr2L 18239434 3' - hopper 44 1 70.30 TGGAACTATAAAAGCTAGAAGTTTAAGATTAAGCATATAGATTCGTTGAAACGTATCTAGAGTAGGCTTATATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGT:1 - chr3L 27146229 3' + INE-1 156 1 61.39 TGTTAAAAACCTTATATATCTCTGCACATGGCACAAACACCACACGACATCACCATTACCACCCACCAACCACCACCCCCCACAGCCCCCAGCTTGCTAAT:1 - chr2R 9321246 3' + Porto1 131 1 79.21 AACCTTCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAAAAACAACAATACCGCTAACCCGAGCGCCCTCCATTCGCTGTCAATTTGTATGCTCTCTGGCGCATTTGCA:1 - chr2R 12802692 3' + I-element 13 1 50.50 TATTAATAATAATAATATTAATTGGTATTTGAATTACTCTCAGTGCATTGAGAGAAAGGGGCTGCAGAACTTAGTAGAGAAACGTTGGTAAGGGACGGAAC:1 + chr2L 17243696 3' + mdg1 7074 2 86.14 CTATTCGTAGCTTGAAAGANACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCAATGCCTATTTTATTTGATGAGGGATTGAGTTGCCTTGGCGATCG:1 - chr3R 5122259 3' - Doc 37 1 60.40 TAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTACCATTAATCTAATCTTTTTGCAATAGCCTTTAACTATGACGTTAACAATCA:1 - chr3L 487787 3' + jockey 4839 1 64.36 AAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACCATCCACTCACAGCACCCAAGAGCACCCAGAACCACCGCCAGTGAAACTGACCACAACCACCAC:1 - chr2R 22092729 3' + Doc 4461 1 70.30 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTACATGCAATAAATCGAATTTAAACATCATAACATCTGTTTTAGCACAGTTTAATACTTATTCACGT:1 - chr3R 14227992 3' - Transpac 5 2 73.27 TTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTT:1 + chr3L 27415310 3' - transib2 21 2 58.42 TTTATTAAGAAAGGAAATANAAATTATAAATTACAACACAAAACTTAGGCAATAATTTTCTGTGAGTGCAGGCAATAGATCTTTGACCAGAGTCAACAAGA:1 - chr3R 23445554 3' + copia 239 1 63.37 TATTTAAGTTAAGTGAGTAAAATGATGCCGGGGATCAAAATCCGACTTAAAAAATAACTTCTAGTTCCAACCCATGTTAGGTATATTCCCACTAAAAATG:1 - chr2R 5075955 3' + Tc1 1561 1 77.00 CCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGCTACTTGGCGATTAAATCAAATGGCGAAAACAATGAGTGATATTTCACGAGGTCTGCATAATTTACCGCTCCGGAAG:1 + chr2R 17248813 3' - I-element 5186 1 77.23 GAACACTTTGGTTAGATTTTGCCTAAACTAAGACAACAACAATAACAACAACAACAATCAGAGTTAGATGGGTAGAGTGGAAAGGTAACAATATGGCCAGC:1 - 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412 13 2 66.34 TTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTCCCTTTTGGTTTCTTCGGTTTTTGCCCAGCGCTTCCT:1 + chr2L 14932422 3' - invader2 404 1 63.37 ATATACATAAAAATGCCAGNTTCATGCGGCTGTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAA:1 + chr2R 545174 3' - 1731 4452 1 68.32 ACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTGTTCCATTCGTCCATATTGCTATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGAGTGTTTTCACTTTTGTCATCTACATCTATAGT:1 - chr2R 6939488 3' - Porto1 4283 1 76.24 ACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAACTGCAAATGCTCCTGCTTCTGGCCCATAAAATGCAACATAA:1 - chr2L 4070429 3' + I-element 380 1 62.38 GAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTCTCGGGCTACTGGCAACTAAATGCTTTACCTTCATGCACAAGACCATGGACCGTTCGCCACAGTCCTTGACCAT:1 - chr3R 6260503 3' - Doc2-element 451 1 78.22 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATCTTGTCATATTATTATTAGAAAATATT:1 + chr3R 18883852 3' + roo 400 1 72.28 ATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTT:1 - chr2R 5277128 3' - invader4 2782 2 57.43 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCATGAATAAGTCATAACTAGTGTTGGCCTTTGCCGTTCTGCGATTGGTTAGACATAAAAACGGAGTATGTACGAA:1 + chr2R 16580465 3' + pogo 2099 1 74.26 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTAT:1 - chr2L 23295811 3' + micropia 407 2 72.00 CTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATGTGCACCTAGGCAAAACGTAAAAGAAAAAGAAACAAACAAACCATTTGTCGACCGATTTAACA:1 + chr2R 25090918 3' - HB 19 1 60.40 TTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGCTGCTGCTGGAGCTCTGTCGCCTGTCTTTTTTGTGGTTGCATCTCTCT:1 - chr3R 14011989 3' - Stalker4 7134 4 56.12 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACC:1 - chr2L 12884314 3' - HMS-Beagle 32 2 57.43 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTGTCTATACACAAAAACAACAACACTTACATGAGAATAGATCTACTTACATACATTCCTAAA:1 + chr2R 20884005 3' + I-element 5343 1 65.35 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACTCATAACCCAAAAAAAAGGGAAACAATTTGATG:1 + chr2R 23111373 3' + hopper 1376 1 64.36 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGAT:1 - chr3R 10741085 3' + 1360 3367 1 56.44 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGGATAGGCTTGCCTCAACACGAGGACTCTGC:1 - chr2L 20290230 3' - flea 4796 2 69.31 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTCCAATTAGGAATATCCAAAGAATACCAATCAATGCCTG:1 + chr3R 28333591 3' - pogo 31 1 59.41 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCCCGACACAAACGCGCACACACACACACACAGCCACTCGAGTATATGCATACATACACAC:1 + chrX 13434590 3' + hobo 2922 1 54.46 CTATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGA:1 - chr2R 6438334 3' + Stalker4 391 1 63.37 TTATAATAATAATAATAATAATTCGATAATTCGATAATAGAAATAGATCACATTAACACTTTTCTAAAGATTTAACTTGAGTTTGTTATTATGTAGAATAT:1 - chr2R 7728700 3' + mdg1 39 10 60.40 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTCTATATTGCAGCACAACACCTGCCTCGAAGCGCATCTTCGACGTCC:1 - chr2L 12064685 3' + opus 7475 2 57.43 CTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAGGCGAATGGGGAAGTAGTGCCCAAAAGTATACAATGCATGTGCT:1 - chr3L 9220121 3' + BS 5062 1 54.46 TCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAGAAAGAGAGGGCGCATTCAACGAATGTAAGCGGCCAAACGAAAGACTTAGGCAACGAACGCGGCGCAAACACATTG:1 + chr3R 19321444 3' - gypsy6 7566 2 75.25 TCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATGCATGAACGATTTTAATGGGTTTTCGAGTTGAACAAATGAGCCAAC:1 + chr2R 25045310 3' - G5A 2701 1 54.46 AACCTCTCACTAATCATGTNAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCCC:1 - chrX 9816240 3' - BS 5001 1 67.00 GGAGGCGGGGAAGTAGATGTAGGTACTGCTGATGTGGCTATCTTGCTCAGCTGCTGCTGCTGCAGGGTGGTGGACGTGGGCGTTGTTCCTGTGTTGGTGGA:1 + chr2L 5320578 3' - gypsy5 6951 2 67.33 CCTCGTTCCTGTTCTTTTTTATATCGCGTCTATCCTCTCGGGAATCGAGCTGTACGATATACGGCAGCGCCCATGCACGAGGGATCCGGCGTCGTGGGCG:1 + chrX 19013109 3' + Cr1a 4345 1 70.00 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGACGA:1 - chr2L 9521670 3' - P-element 54 1 25.74 TACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAACATGTAACGTACAAATTATTAGATTGCATTACAGCATATTTTTAAATTCATGC:1 + chrX 9816329 3' + BS 5066 1 54.46 TTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACCGCAGTGTTCCCCTTTCTTTTGCTTGACTCGGACTTGCCTTGCATAAATTAAAACTCA:1 - chr3L 5970400 3' - hobo 2461 1 59.41 AACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAAAGCATTTCCTAAGCTCTGCAAT:1 + chr2R 15160351 3' + Tirant 8455 2 77.23 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGGAAGCAGCTAAATAATCGAAGGAGAAGCAGCAGAACATGACACAGCTGATGACATATCGCTCATAT:1 + chr3R 5261504 3' + P-element 2878 2 38.61 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATGTATATCCTTTAAGCACCAAAAAAAATTGCAACAATTACAATCGGAATGTATATACTAGTTGGAGATTTTGC:1 + chr2R 22341775 3' + mdg3 5494 2 75.25 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGA:1 + chr2R 9871537 3' + roo 356 2 97.03 ATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTATATCATAACATATAACATATAACATATATCATAA:1 - chrX 19807400 3' + accord 376 2 77.23 TCAAATATTGAGATTCTACNACGCTACCAATCAAAAAAATTAGGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTGTTTATTCTGCGCTGCCGAT:1 - chr2R 8839849 3' + G4 3468 1 75.25 TAACTGTAATTATTAACTTATACATAATAGCCAGGCTTTGGGGGCGTTATGGCATTCTCACGCTTCATTTGGCATAAAGACCAAAAATAACCGCTGCCATC:1 + chr2R 5813682 3' + HMS-Beagle2 7198 1 82.18 AGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATAACTTAATGTTTATATACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAAAATAAAACTTCACTCTGATTTT:1 - chr3R 2253313 3' - invader2 78 2 76.24 TGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCCACGCACACACACACACACACACCCGCAGGCAGACAGGGAAAGAGATAGCTTGAGAGGC:1 + chrX 18155945 3' + accord 215 2 58.42 AGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAGTATACTCTATAATTGAATCTAAAGTCTGAGCGCTAAAGTCCCCTAAAATAAAAAATTCCCATGTTTTACTGATAAG:1 + chr2R 14638444 3' - opus 110 2 76.24 ATGAAAAAGTGTCAGAAAATACAGAAACACGAAATCTGCTTATGGAGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATGCAGTATATTGGTCCCGCTCTGCCCGATCG:1 + chrX 19696953 3' + Tc1 1585 1 65.35 TAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTACATATATGTACGGAAAA:1 + chr2R 12343935 3' + Burdock 6376 2 74.60 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTACATATATGTACGGAAAAGGTGGAAAAGCGAAGGTTGCGACCGGCG:1 + chr2R 12343963 3' + Burdock 230 2 56.44 CATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCATTTTAAGTTTGCTTTGTAGCTAGTTGAACTTATGTTTTATGAAG:1 - chrX 8354078 3' + copia 4701 1 56.44 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATACACATATTTATATAGCCATCTTTGAATATATATATAGATATCAGCGATTGAAGTTTTTATTTAATA:1 - chrX 5271291 3' - mdg3 5262 1 68.32 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTTAAGACACACAATAAACTCAATTAAAATATCTTTGCTTAACATACAACATACTTGTAC:1 + chr2R 17248175 3' + I-element 5337 1 60.40 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTACATACATATATGTATGTAATTGAATTTGTAAATACTTTCACTGGAGTTCTAAAAATGATTCATT:1 + chr3R 19955308 3' - hobo 11 1 64.36 CCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCGCTGCGTAGGCCAGTTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACCCTTATTATACCCGTTATTGCTTGTT:1 - chr2L 21200361 3' + roo 271 2 55.45 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAAAGCATTTCCTAAGCTCTGCAATTTGCGTCGCCTCACCACCGGAAATGA:1 + chr2R 15160377 3' + Tirant 374 2 54.46 CTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGATATGTTGGAAAAACAATTTCAAATTTGTAAGATTTATTTCCTAAAGATAGCAG:1 + chr3R 3875560 3' + R1A1-element 4968 1 58.42 TGGCATATATTGGTTTATTACACAGCAATCGCTTTTGTTATTGTCATCGTGCTTTGTTGTTTTTGCTGCTATCAGCTGGCTATGTGCAAACAGATGTTAAT:1 + chr2R 13585757 3' + blood 377 2 72.28 TAGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGACGCCGGCGGATCGGGTGACTCCTGGCCCGACGTCCTCCAGCCGATCGCTTCCGCCTCCTCCCAGACACGGGCTT:1 + chr2R 4295456 3' + Osvaldo 1470 1 55.45 GAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAACTGGGATTCATTCTCACTCCTCTAGGGCACAAAAGATCCTTATCTATTTCCCCAGG:1 - chr3R 13576174 3' + I-element 272 1 65.35 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCGCCTTTTATTTTTAGCCACGCCAAAGCTGAGGCAACCAAATTGCTTTTGAAAAGCATTTCGCCTAGCT:1 - chr2L 12800933 3' - hobo 7 1 72.28 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACTT:1 + chr3L 13366430 3' - hopper 28 1 53.06 TTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCAATTAAGTTTATGTTATAACTAGAGTTTTACATCGATAATTAGAAAAGGGAAATTTT:1 + chr3L 17660274 3' - Doc 450 1 63.92 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCCGCGGAGGAGGACTATCTGGTGCACGCATCATTTGCTCGGCATACGTAC:1 - chr2R 8528186 3' - Transpac 23 2 56.44 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATAGTAGTTTAAATACCTCGCG:1 - chr2R 13647822 3' - blood 7042 2 54.46 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGCGTACCTGCCAAGAACATGAAAACGGAAAATTGCATTGCGCTCAGAAGTATGCTATGCTTTTTTCGCTTGCCTTATCAACGT:1 - chr3L 17254699 3' - jockey 4672 1 74.26 TCTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAATA:1 - chrX 7480759 3' - Bica 339 1 64.36 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTT:1 + chr3L 13739643 3' - BS 5025 1 55.45 TGGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTACTACAATCATACGTATTATATCAGTATGGTATGGTTATGGAGTTGGTC:1 - chr3L 25484337 3' + Porto1 4379 1 50.50 TGATGGTTTTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGGTGTAGGAGGCCTTGCCGTACACTTCAGTGACGAGCTCCACCAGATCAGGC:1 + chr2R 17090086 3' - F-element 4334 1 54.46 GTGCTGCAAGTGATGTTCGCGCTGCCTACGAATAAAATACGTTTGAGGAAAACAAGATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTAGGGCATGCCACGTGTAGCA:1 - chrX 21531051 3' + Stalker 490 1 69.31 TGAAGACATCGAACCGGGAAGCGTTGCGATACAAAGTCGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCGTGGCATGCCACATTCGCATCC:1 + chr2L 10189106 3' + ZAM 8025 2 78.22 TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACAATATATATATGTACTGTCGCCGA:1 - chr2R 6460549 3' - Quasimodo 20 2 76.56 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATGTGCTCGGGGGCAAAAAGGTGCACTGCCGG:1 + chr3R 29375034 3' + mdg3 231 2 63.37 TTTTTGTTTTTTTTTTTAAACTACTATTAAACTGATCGCGCCAGCAGGACTGGCATAAAATTAGCACAATAAAAACACATAAATGCGGCACAAAAACATGA:1 + chr2R 19685272 3' - TART-C 11098 1 62.38 TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACTTTTTTATGATATATTGTACATAAGTTGCCAAACCATATGTGAGTAAAGATTA:1 + chr3L 16926106 3' + flea 237 2 62.38 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCA:1 + chr3L 25345141 3' - Doc 56 1 73.27 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACATAAGTTATGTTCCACAGTATTTGTAGGATATTAAATAAAATGTTA:1 - chr3R 21931492 3' - 412 7083 2 56.44 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCGATCCACAGGTAGCTATATCGAGAGTGCC:1 + chrX 16272523 3' - pogo 11 1 68.00 TCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGATACACCATTGTGTTTAGCAAATAAATTGATTTATGCCTCGAGCTACGGAAT:1 + chr3L 17064114 3' - Porto1 4503 1 58.42 ACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGTACGACAAAGGACGACAAAG:1 - chr3L 13366382 3' + hopper 1361 1 74.26 AAACGGAGCTATGCTCCAAAAAAACATCTAAAGGATTTCATCTATAAAACTTGGATTGGAGAAATACAGAAACGGAATTTATGACAAACGGTAACGAATCA:1 + chr3L 21438769 3' + gypsy11 404 2 58.42 ATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTGGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCGACGGCAGTGCAGCCGACCGGT:1 - chr2R 6482640 3' + gtwin 471 2 73.27 GGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCG:1 + chr3L 25232908 3' - GATE 35 2 50.50 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGTAACGTGAATGTGGATGCGGGAATGGTTTGGAAATGGATTGAAACGGGTGGGC:1 - chrX 15599624 3' - jockey 4710 1 55.68 AATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTG:3 + chrX 20999570 3' - BS 33 1 64.36 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCTCGGTAATTGCCCGCCTAATTGGATGCATCAACATCCGTGTTGTCATCTTGGCCA:1 + chrX 19034198 3' + hopper 1399 1 63.37 AAAAGTGCCACCCTTACAGTTCTCTGGTACGCACGCATATTTTTCATCAATCATTTTGCTTGACTACGCCTAGTTCACATTTTAGGGCATGTAGTTTAAGA:1 - chr2L 9884246 3' - hobo 5 1 68.32 AAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCC:2 + chr3R 5359979 3' + 412 7495 2 76.24 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGGAGGATTCTG:1 + chr2R 20441304 3' - I-element 23 1 54.46 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATGCCTTAACATTTACCTTGTTGGCCCGAAGTTGTCCACCAAACATTTGTTGCACT:1 + chr2L 16548241 3' - P-element 20 1 59.41 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACAAATGAAATAAACTGTATACATTTTTAGAAAATCCCAACTAGACATTTGAATTTTAAATATAAT:2 + chr3L 6164838 3' + hopper 1407 2 65.35 CTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACCCTTTTAACAACCGCTGCTTTACTTACCCTTCTGGAGGACACTCTGCCGGCCGAAACGGGTTTAGGATGTTAT:1 + chr3L 26023391 3' - Circe 7182 1 58.42 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACTATTCGCTTGAAATACA:1 + chr2L 3985156 3' + roo 9047 1 62.38 CAATGTAACGGCGATAAGCTGGGCGATGGTAATTCCGCGATAAGTAGGAAAAGCCGAAGTGTGGTTAAGAAAAATATTAATTTTAATTCAAGTTACGCATA:1 - chr2R 3463589 3' - Ivk 85 1 59.41 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAGTATTACCATATACTAAAATTCTCTGAAGCGCAGATAGCTGATAACCGATAGA:1 + chrX 11454412 3' + P-element 2883 2 75.25 TTTGTTTGTTTTTTATTATTATTTAACCACTAGGTGAGTTGAGGGGTATCTTACAGTTCTATAACTCGATCATAGCGTTCATAGCTTCCTTGTTAAAATAT:1 + chrX 21291007 3' - Rt1a 5073 1 63.37 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTAGAAGTTGTAGCGAACTAATTACCTTTTACA:1 - chrX 22738545 3' - 297 5 2 76.24 CTCGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTGCACTTCGCAAATAATACACTTATATGCAAGGAAGTATCTATAGCGCCATAATTTTTCGTTGTTATTATA:1 + chr3L 23436337 3' + INE-1 577 1 78.22 GTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTAATTGGTGGTCTTTGAGAGGATATGCATAAAGTTGGCAGTCGGAACCTCCGAT:1 + chr2R 5813309 3' - HMS-Beagle 6638 1 54.46 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCACCCTTTTGATTGATTTGATAAGGTCTGAAAAAGTAAT:1 + chr2L 19567562 3' + pogo 2066 1 61.39 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCAGACAGCCGGGGGCAAAACAAAACTTTTCGCATCGTTTTGAAAAGCCGGATACCATAGTAATCCCGTTGGCCAAAC:1 - chrX 12091826 3' - hobo 2709 1 46.46 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCGACCCGACCAAATATTAGA:1 - chrX 2911286 3' + hopper2 1554 1 76.24 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTGTTTATTTTGCGTTACGCTGCTGGGGCAATTTTTATTT:1 - chr2L 897589 3' + roo 9034 1 68.32 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAGTTTTAGTTTTTTAATAGTACGCTAA:1 - chr3L 5025588 3' + roo 397 1 65.35 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTG:1 + chr2R 20441277 3' - I-element 50 1 72.28 AATAATATTCTAGTGTCTTTGTACAAGGGGACTTTGACGATTCCCAATGATGTATTGCCGCCTGTGGTGATTGATTCATGATTTCCTGGCATGATATACAA:1 + chr3L 23182083 3' + Tc3 311 1 70.30 CTTTTTCCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTGGTTTTTTTTTTTGCACAGGGCGCGCTGCTGGGGCTGCCTTTTCACATTTTTCAATTTT:1 - chr2R 21470355 3' - Doc2-element 229 1 83.70 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATATGCACAAAAGAGCAAAGCAAATATTGCTGTAATGAAATATTTTTTGCT:1 + chr3R 4164712 3' - HMS-Beagle 26 2 58.42 ATCTTGTGCCCTCACTTTGCTCCCACGAAAAGTCTGACGAAATTGAGTTTTGTGTTTCTTTCGCGAATGAAGATACTAACGAAATGCTTTTGGTAGCACAT:1 - chr3R 2876333 3' + transib4 2331 1 75.25 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATTGTCTGCCGCCTTTCAACACATTGAGTTGTTTGCTCTGGGTACGCGCTCCATGGTCTCAGGACCTCC:1 - chr2L 19629893 3' + copia 246 1 69.31 TAATTAATTTACCATCCCTNGCTAACGATGCTTTGAACAGTGTTTATTTGTAATCTTATTCGTGGTGAAGTTAGATTTTGTAGTCTTGTCAGTCGTTGATA:1 + chr2R 22922119 3' + Cr1a 3993 1 70.30 TAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAAAAAGAAATAGCGCTGGCAAAATAGACGTGCTGAGCGCTGTAAAAAGTCAGATTCGTGTTGAAATTGGAAT:1 + chr3L 9698391 3' + 412 3 2 75.25 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTCTATATTGCAGCACAACACCTGCCTCGAAGCGCA:1 - chr2L 12064697 3' + opus 7463 2 69.31 CTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAATGGTAAAACAAAAGGCAGGAAAAATCACAGCGATGAAAAAAGCTGAAAGAAAACTCGGTGGCTACGGCAGAAAT:1 + chr3L 1927664 3' - FB 74 1 75.25 ATTTACACACCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGCGCAGACCCGAATCTGTAAAGTATACCCTCCTCTTGGTGGAA:1 + chr3R 5722199 3' + Tirant 8474 2 58.42 CAGTCATTATATCAGCATCCAAAGCACTGGTTAAATGGTAGTAGCGCGTCCCTTGGGGTGATTGAAGAAGACCAGGACCGACCAGTGGATCAGCCAGGTGC:1 + chr3L 16786010 3' - Chimpo 465 1 56.44 GTTCCGGTGCGAAGGGAGTCGGCGCTGTCTTACTTATTTTTGTTTTTAGCAACCGAAACAGAAGTCGCGGCACGGGGGCTATCACGGTGTAAGCTGATCTG:1 + chr3R 4771566 3' - Doc3-element 271 1 78.22 CCTCGATATATGCACATACTACAGAGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGTGACTCAATCCAAATAGCCCGATGTCTAAATGAGAGC:1 - chr3R 28447349 3' - blood 2 2 76.00 TTTTTGTTAGAGAGCGAGATATGCAGGCAGTTAACTAAATAATCACATTTAAAAGGCGCCAAGTGGTTCGATAAAGTAAGAAAAATTACTGGAAAATCGTT:1 + chr3R 10591381 3' + 1360 98 1 67.33 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCCCATTCGGTTCCTTATGGCCAGTGGGCGTTTATCTGCTTGC:1 - chr2R 18204440 3' + roo 9039 1 56.44 CAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAATCCTATTCTAAGCTAATTCTTAAACATCGATGAGGAGTTAAGTGAATCTTGGTCAAAAAAAAAT:1 - chr2R 11237015 3' - roo 108 2 56.44 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGGCGATTTAGCGATGCTTGTCTTATTTAGTTTTTAAATAAATGGCCAAGGATG:1 + chr2L 16071181 3' - 412 7079 2 53.47 CTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGTTGCTTGGTTTGGGAGTTGACTTTGAA:1 - chrX 6733664 3' - F-element 4525 1 73.27 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTCGAAGTGAA:1 - chr2L 18239436 3' - hopper 46 1 72.28 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATCGCTGGATATATAACTACTAAATTCTTACATCCATGGGAAGGTAGATTACGCAATTCACT:1 + chr2R 7186664 3' - jockey 26 1 59.00 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATATCGGGGGATCAAACTGCATACGCGTTAGCTCTAGTATTAA:1 + chr2R 7718569 3' + hobo 2908 1 60.40 CGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGTTGAGCAGGCGGTTGTCGTTGCTTTGGTTGTACTGGTGTCCTCGGGGCCTTTTGGTTGGAAAGTCTCATC:1 + chr3R 18754256 3' - Idefix 245 2 68.32 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTGGTCTCGCCGTTGAATTGTA:1 + chr2L 19290604 3' + roo 351 2 80.20 TTATTATTATTATTATTGTTATTAAAAGTTATAGCGGCACAACAACCACCTGCTCGCGGAGATTATTCATTATGTTTACGTATTATTATGGCTGGGTT:1 + chr2L 17665190 3' - mdg1 20 4 55.10 TGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACTTCGTCAGCGGCCCAACGATCCTGTCGTCATCTGCTGCTGCCGCTGGTGCAGC:1 + chr3L 10991541 3' + Doc 497 1 64.36 AAGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGATGCCAAGTCGCACTCCATCTTCTTTTGCGATGTACAGCATCGTGCCGCCCTGCACCTCCCCTCCCCCATCCCT:1 + chr2R 10598292 3' - Rt1a 4897 1 79.21 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCGACCCGACCAAATATTAGAAGAATTATGATAGGTCCACAGTTACCCACTTTCGCCGGCCATTCCCGATT:1 - chrX 2911236 3' - hopper 3 2 74.00 GCGGATCGCATATAACTAAGTTACAATAAGAGGATAAATAAACATGGCTAAGAGCAGATGAAATTCCAGGGTCCAGCAGATGCTGCCCCCGAGATGAACTC:1 - chr2L 10757709 3' + Tc3 1669 1 61.39 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCTTCAAACGTATGCATGTTCATGTTTATTTTTCGGTATGGAGCTGCGCC:1 + chr3L 15390415 3' - pogo 26 1 53.47 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATAAGTATGTATGGTAGGTTCTACTAGGGACTCGCACCGTTTCGGGCCACTT:1 - chr3R 4646316 3' - 297 6601 2 54.55 GCACCTTTTCAACAAACAACAAATAGTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATATTTGGAAAGATCTTGTCTCAACTTTTATTGGGAAATAAAGTTGTAAATTA:1 + chr2L 16962896 3' + 1731 316 1 48.51 AAATTAAAAAAAAAAATTAAAAACTGTGTGCAAAAA:1 + chrX 8854750 3' + Doc 4699 2 88.89 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGC:1 - chr2R 5214951 3' - F-element 23 1 61.39 ACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATGCTGTTAAATTTAATGCTTTAATTTGCTACTAGTTACATTTCTCTTTATGCTCTCAAAA:1 - chr2R 20520187 3' - Max-element 8254 2 58.42 CTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATGTACATATCTGCGTGGGAGGCTTTGCTGGGAAGCATATGCGGACGTGCAATGATTACATACGATTGTACAGA:1 + chr3R 20892101 3' - invader4 7 2 71.29 AAGTGATAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGCTACCTTGGACTTTGCAGTAGTAGTTTCACCGGCATACCTTTTGAGTTGTCTGCCACTCTT:1 + chr3L 26345254 3' + Porto1 336 1 72.28 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGAGACCTTGGCTGGCATAAAAATAATATTGGGCAATGCTTTGGAA:1 + chr3L 7463344 3' - hobo 32 1 54.46 TTCTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGGCCGGAAGTATCAGCGGCAGTATCCTTGTCGATTGTGCCACTTCTTTATTCAATTGCAACCTTCGTTCCTATTTGCCT:1 + chrX 6210413 3' - Doc2-element 232 6 90.10 TACTATATATACATACATATATATATATGTAGCACATACCATTGCAGACATATCCTAGCGTAGTTTAGCTCTTTTGCCCACCTCCCCCCACACTCCCCCAA:1 - chrX 17933786 3' - 1731 4411 1 72.28 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTG:1 - 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jockey 14 1 67.33 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTA:1 - chr3R 10741088 3' + 1360 3364 1 54.46 AGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTTTGCAGCTCAATTTAGGTCCTCTTTTT:1 - chr2R 21893021 3' - P-element 229 1 32.67 GTAGTTTTTAGAACTTGCTNTTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAACTTAAATGCAAAACACTTCAAAATTGTCT:1 - chr2R 6824675 3' - Doc 54 1 69.31 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTCATCCAGTGGACATAATTGGAGGACCAATGTTAAGAAGAAG:1 + chr3L 9698021 3' - 412 35 2 57.43 GTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTGAACTGAGTAGGGTTTTAGTCCCATATCTGTATCTGTGGCCGCAGCTACAAGTTGCGTTTATCATCTG:1 - chr3R 31886283 3' - F-element 4429 1 71.29 TATTTAAATAAAAAAAAGAAATACAACTTAGTATAATGCATGAGACGCGTGAAAATCAGTGAAGATAACAATCCTTAAGCTAAAGTCTATATACATAGATG:1 - chr2R 18652556 3' + Bari1 1404 2 54.46 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGG:2 - chrX 21668006 3' + Tabor 7293 2 54.00 GTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCTTAGCTTCGACTTCTTCTTATGTACTAAAAAGAAAATTTTAAATGTTATTCAAT:1 + chr2R 4691814 3' - HMS-Beagle 6685 1 64.36 AAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTCTGTGGGACAGTAATTTGTGTATTATTTTTAGCTGATTTATCCGAAACAAATGCG:1 - chr2L 5874344 3' - jockey 4864 1 53.47 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACGTTTTCTTGATTACTTTAATACGCAACATAGTTTCAACGACATTTAAGG:1 + chrX 20555776 3' + roo 9045 1 54.46 GTTTTAAGCTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCCTTTGATTCCAGAGTAGGCAGAAAATGGTTTGTATATTAGAAATAATGA:1 + chr2R 19428572 3' - 412 459 2 71.29 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTATACATATTTATATGACCTTATGCTGCACATGGTATCTTGTCATATTATT:1 + chr3R 18883839 3' + roo 387 2 59.41 GTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAAATAGTTTCCTCCAATAATGAACGCCTTTAATCTACGGCTTAAATAAG:1 - chr3R 26241029 3' + Ivk 5365 1 52.33 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACACACTATGTGGGCAATGGGCTTCGGTTTTGAATTCGGTGTCGTTGTTTACCGCTTCGCTACCCCTGAAG:1 - chr3R 8812533 3' + P-element 2880 2 73.27 GCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGTATATACATGGCCATAATGACCGCATCATT:1 - chr3R 20892016 3' + invader4 284 2 69.31 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTACATATGTACATATATGTACGGAAAAGGTGGAAAAGCGAAGG:1 + chr2R 12343951 3' + Burdock 218 2 68.32 ATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAAC:1 + chr2L 20290304 3' + flea 248 2 58.42 CACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGACGAGACGAGTCTGGTCGAAAAGGG:1 - chr2L 9521649 3' - P-element 1 2 68.12 ATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTT:1 + chrX 983375 3' - Juan 3819 1 59.34 TTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCACTCTGCTCATATGATATTAGCGAGATACATT:1 - chr2R 9661201 3' + Stalker 169 6 78.22 ATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTGGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGA:1 - chrX 10445559 3' + INE-1 536 1 72.28 TGTGCGTTGTTCGCAGTTCTTTTAACAATAAAAATGAAACTAATACTTAAGTCACACGTCCTTAAGTATTAGTTTCATTTTTATTGTTAATTGAATTTCG:1 - chr3R 29735378 3' + Cr1a 230 1 54.00 CCCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTA:1 - chr3R 19450187 3' - roo 8720 2 50.50 ACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACATCATCTTTTAAGTGAGCATTCAATCAAATTGGATTTCCTAATAACACGAAAATCTGTGTCCAAC:1 + chr3L 20192489 3' + roo 393 1 39.60 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTGCAGCAGCGGCAGGTTCTCCTTTCAATTCTCCTGGTG:1 - chr2L 10924202 3' - hobo 16 1 61.39 CTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCACTGACCCACTACCACAATCACCAATGCCACCAAATCACGAATTTGTATATGAAA:1 - chrX 11960550 3' + accord 494 2 57.43 CAGAGAGACAACAAATGGTACTTATTATTCATGCAAACTGACTTAAAAAAAATAATTTGATCATTGAGATATTAAAGCTACAATAGACTTTTTTAGTTAAC:1 + chrX 4255662 3' - Tc1 107 1 64.36 AACAATTACATGGCGACCGTGACAGGACTAAAAGTTTTCCTGTAGAATTCAGTTGAAATTGCCTGGACCCAACTCTCACTGAATGTCGTCGAGTAGATATC:1 + chr2R 17734577 3' + Stalker4 421 2 78.22 TGTAAATCATAGGGATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAACTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCA:1 - chr3L 12072565 3' + HB 1579 1 70.30 TCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGGCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTC:1 + chr3L 23678151 3' - Osvaldo 22 1 72.28 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACACATGTACACATATTCCTGATAAACGGTCTAAGT:1 - chrX 16272436 3' + pogo 2064 1 66.34 TTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCCATTTAGCAATGTTCATCCGTCTGCCTTTG:1 - chrX 366092 3' - G5 4622 1 70.30 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATATGCACAAAAGAGCAAAGCAAATATTGCTGTAATGAAAT:1 + chr3R 4164702 3' - HMS-Beagle 6832 2 68.32 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAATGTATTATATATTTTCCAGTTTCATATCC:1 - chr2L 9053420 3' + flea 4974 2 72.28 AAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATATTGTGGTTGCTGCGGTTTTAATCTTATTTATACTTGTGAGGGTGCTCTTATATTGCT:1 + chr2R 9320465 3' - I-element 4989 1 60.40 TACTTTACCGCCAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAAATGAATTAATCTTTAAATTATCCTGCTGGCTATTGTATT:1 - chr3L 19240335 3' - transib2 472 1 69.31 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAATGCG:1 - chr3R 11118047 3' - BS 39 1 68.69 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGTCTGTGTGTGAGTGGGCTGTGAGCCGGCTTTGCTCCGCGTCTTTATCGTTTATTTTTATTTGGTCAGC:1 - chr2R 20948338 3' - hopper 5 2 74.26 CTCAAAATACCTTTTTTTTGTCCTGCAAATTTATGTATAAATTTAAAAAAATATTTAATATCGGCCATAAAATAAGAAAAGTGGAAATCAAAGTTAAAAGG:1 + chr3L 3638818 3' - invader5 3614 1 81.19 TATGGGTTAAAAGCCGCAAATTTTGGTATAAATGTAATTTTTTTTGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATT:1 - chr3L 12836032 3' + transib4 4 2 67.33 GGTGAGCAAGACCGCGATCGTTGGCATTCTGCAGGTGTTACGTACAGCTCAGCGATGTGGAATTCTCGTTCTTTGGATACGCTGTGGTCACCGCCGACGTT:1 - chr3R 20623489 3' - Doc3-element 375 1 66.34 AGAGGAATATTGTGTTAGCNTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGG:1 - chrX 21791531 3' + gypsy11 335 2 36.63 AAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCGTTCCCACGTTCGGTTCGGTGTGTTTAATTAGAGAAT:1 - chr3R 10511851 3' + Idefix 6987 2 75.25 ATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTTGACATTAGCGCCCTTTTGAATGAG:1 - chr3R 24238154 3' - Stalker2 7400 6 75.25 TTAAAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGATTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGATATTCCTTCACGAGGTGTCGTTTTGCCTGCCC:1 - chr3L 23401641 3' - Cr1a 4032 1 67.33 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTTAAGTCTAATCTAATTGACGTGGAAACTACCGCATGCCA:1 - chr2L 17003971 3' - F-element 52 1 61.39 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCCGCGGAGGAGGACTATCTGGTGCACGCATCATTTGCTCGGCATACGTACGTGAGTGACAACATTA:1 - chr2R 8528170 3' - Transpac 7 2 72.28 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTA:2 - chr2L 11832533 3' + roo 9037 1 56.44 TCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGTAAAGGTCTTGCCAGCAAACTAAGAAGAATACTAACACATTAATTAGTATAGTACATTCTCTGGCAATGAGATTA:2 - chr2L 3985054 3' - roo 8662 1 70.30 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAAT:1 - chr3L 25059055 3' - mdg1 12 2 67.33 GGTTGAGTGTCCGATGATTNGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCG:1 + chr2L 19907961 3' - Tirant 8147 2 65.00 TTTTTTTGCTTTTTTTTTTAGCTTTTCTTCATTTTTGTGGCCCGTTTTCGTTTTCCACTTGGAATCGCGAGGGGATGAAGGAGGGGGGCAG:1 + chrX 19495771 3' - G-element 4325 1 69.23 TCAGGTACCCCCGTCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAGCAACTATGGCTTCGTTGTGACCGCGGGAC:1 + chrX 16807408 3' - HeT-A 5742 2 70.10 TACAATAATTTGCATTTTTGAATATAGCATTACATGTGGTGAGTTTGGTGTGGCCAGAAATTTTGTATGTTGGTATTTTTATTACTTTAGTACATGACACT:1 + chr3R 9015370 3' - TAHRE 10333 1 56.44 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACG:1 + chr3L 23871308 3' - Doc 47 1 64.36 CGACGATGGGGTGAGGGTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGAGGAGGGGGGGCCACCTCCGAGGCCTAATCAAAAGAGCATTGTAAACTAAGC:1 - chr2R 23577881 3' - Idefix 224 2 52.48 ATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATTTATACAAAATATATATTTCGATTTGGTGGTGATATGATGTG:1 - chr2L 20495056 3' + Tabor 456 2 57.89 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGCCACTTATGCG:1 - chr2L 7991854 3' - P-element 64 1 18.00 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATATTTTAGGGGTAAAACTCACTCAATTTTT:1 + chr2R 16639733 3' + opus 475 2 56.44 TAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAGGTGGTTAGCAATAACGGAACAATATTGAC:1 - chr2L 21369832 3' - rover 6962 2 69.31 AACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGCTTTTGCGCGACGGTCACACCGCCAGTGGGCGA:1 - chrX 11454327 3' + P-element 2846 1 38.61 ACATACACACACACACACATATTTAGCCGCTGAAGTGCGTGGAGCAGGGGCCTACACTGACATAAAAAAGGTAAAAATAATATATTAGATATACGTTAAAT:1 - chr2R 19886313 3' + Quasimodo 35 2 58.42 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATCAAGACAACTGCTTTCAAATTTAAGCTT:1 + chr2L 22108248 3' + Bari1 1660 1 69.31 TAATAATATTAATGTTAATTATTACAATCTACTATAGCCTTAATTTAGATTAACCAGCCCTCTTTTGCGAGACGTTAATTTCGTTCTATTCATTCTCATCT:1 + chrX 7374249 3' + mdg1 45 2 67.33 CGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTGCATGCTCAGCAATTTGGTCACTCGGCCGAGGA:1 - chr3L 728964 3' + Doc 317 1 67.33 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACCTCAAGTCATGCAAGATTATAAATTCCCGTCATAAT:1 + chr2R 10528378 3' + pogo 2063 1 65.35 TTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTTAAGTTTCGCAAGC:1 - chr2L 7991236 3' + P-element 169 1 19.80 GATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTTGCGCATTTCGAAAAACGATGGCTCCCCGATGCCCCAATGCCCATCAATGTCACT:1 - chrX 2307384 3' - R1A1-element 351 1 60.40 ACCTCCACACACACACACACACACACACACACAAACATACACAAACACACTCAAATGCGGATGACTGTCTTTACTTGTGAGGTTACAAACGTAATGAAAAC:1 + chr3R 22871272 3' + accord 254 2 55.45 GAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATAATAATTTTTGGTAAGGCAAATGAGTGTTCCAAAAGCCAAGCTAATAGTAAATAACATTGTTTTTG:1 - chr3L 21731985 3' - 17.6 311 2 72.28 ATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTTTTGGAGTCCCTTAGTTTCCTTTTTTTTTATTAATT:1 + chr2R 14964343 3' - X-element 4705 1 54.69 CACACACACCCATATACACACACACACACCCATATACACTTGGCCTCAAGACAGGCAGCCGTGCATGGCGGGCTCTTGAATTGCAATGCACCAATTAC:1 - chr2R 17938794 3' + accord 190 2 77.55 TTTTTTTTTTAGAATTTATTAATCACCTAAACATCTACAATATTGTACTTTCTGACATACACCCAAACCACTGTGCGCCCGCCAAAATG:1 + chr2R 14444796 3' - BS3 1767 1 62.92 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTGTGATCAATTTTAAGCCCGCAGCTTTTCATAGCGAACTTTTTG:1 + chrX 15290323 3' - pogo 27 1 56.44 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTTGTGTATAAGATAATAGGATTCGGGTTAGATAGAATACAAAAGAAGTATATAGTTTTCCCCCAGCCGTTT:1 + chr3R 15882684 3' - jockey 11 1 70.30 ACCAAAGGGTCAAAACCGCNAACGCAGCTCAAGTTCTCGTCTCATAGGCGCTCTCGAGGTATTCCTAGACCTTGGCGTGGATGACCCGGATCTTATCCTTC:1 + chr3L 25518432 3' + Quasimodo 215 2 65.35 ACAAGTTCGAGAAGAAGATTAAAACGCCACCACCCTCAAGACCTGACTGACCGGAACATGACAGTGACTAAATATATATTTTTCGAGTAATTTAGTCCGTC:1 + chr3R 18330539 3' + jockey2 3156 1 62.38 GCACTCGTTATTGCAGTGTCACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGATCAGGCTCTCTGGACTGCCGGGCATCACAGTCGCGG:1 - chrX 2134515 3' - Doc 490 1 61.39 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTT:1 - chr2L 11832540 3' + roo 9030 1 63.37 AGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCA:1 + chr2R 2868558 3' + Rt1b 4737 1 36.63 CGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACT:1 + chr3L 17136050 3' - BS 12 1 60.40 GTGTGGGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCAACACAAACGTCTTCGTGAAGTCGGGG:1 + chr3L 23678166 3' - Cr1a 303 1 66.34 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGATAA:1 + chr2L 12485466 3' + roo 9040 1 66.34 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATATTACTGCTCGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTG:1 - chrX 16473179 3' + 297 6956 2 71.29 GCTGTCTTTTCTTTCTTGCTTGTTTTGTGTTCCAGGACGCAAAGATCTTTGGGCTTCGATGGGATCCGCCGAGGAGGATTTGTCACTAATGGGAAAACAA:1 - chr3L 17495314 3' - 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Fw3 2896 1 53.47 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGATTAAAAGTTGTAATCAAAAGTTTACGAAATCCAACTTTGGTGAAGCGAAATTTGTT:1 - chr2R 19355870 3' - jockey 27 1 56.44 GTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTGTACATATTAGGATTAGGTCTACGCGAAACACCAATTTCCAGCTTC:1 - chrX 9194216 3' - Doc 467 1 54.00 CTGGTTTGATGTTTTATGTACTGATGAAGTTGCGTTTCAGTTTCAGGGATCCTTTAGCAAGCATTTTTATGCATCTCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chrX 14321910 3' + Bari2 642 1 77.23 TGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:2 - chrX 12649915 3' - blood 7182 2 74.07 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATTCGATTCAAGGTGTCACGTCCATAAATTCGTCTCGATTCCGAATCGATTGGCTGTGGATTGTTATGTGCTGGGAAAT:1 + chr2R 17248444 3' - I-element 5111 1 78.22 ATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCAGCTGGATGATCATTTCCGGTGTTATAAGGTCGTAGCCGGGGGATTTTTTCGGGTTGAGAT:1 - chr2R 4798540 3' - Stalker 7012 6 64.00 ATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7187 2 81.82 AGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTTGCAGTATTTTACATTTTGCAC:1 - 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Tirant 9 2 72.28 AGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAA:2 - chr3R 23020834 3' + INE-1 557 1 49.50 GTAGCGCCTTTTGCCTAAATTTGTCTATGCTCTTTATATTTTGCCTTTTAAGACAAGTTTGGGATTAGCCGATGGGTTCAGCGCAGTCTTGTTGCAAAAGG:1 + chr3R 2468423 3' + transib3 492 1 76.24 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGACGTGCTCGCTTTTTCTGTCCGTTACCGTTACCTCGTGTCTGCGTTCGCGTATCC:1 - chr2L 13549240 3' - P-element 19 1 56.44 CCAAAGGGCCAAAACCGCTTACGCAGCTTAATTTCCCGGCCATCCGCCAACTCGCTCCCATTGTCAGCGGCCACGGGGCGTATGCGTATTGTAATCAAGTC:1 + chr3R 17841059 3' + Quasimodo 6944 2 38.61 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGCACTTTTAGTTAGTAAACTGAAACGCACAATCTTATCTTCTGCAGTCGTCTGCAAACTTTGGTGAGGGGTATCCAATA:1 + chrX 3381958 3' - Quasimodo 37 4 77.23 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAATATATATCTGCTGATAAATATAAGTATATTGTCGC:2 - chr3L 15390342 3' + pogo 2064 1 68.32 CCAGCGTCAGCGCGAGCATNACGAACGCCGTATAAAACGCGTATAATTTCTAGGGGCGAGTAAACTTTATCGAAGGACAAACAAAACAAACACCTGAACCA:1 - chr2R 25215991 3' + F-element 215 1 52.48 TCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATTGTCTGCCGCCTTTCAACACATTGAGTTGTTTGCTCTGGGTACGCGCTCCATGGTCTCAGG:1 - chr2L 19629899 3' + copia 240 1 63.37 CACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTTTAATTCAAATAACACCTCCGATAGGATGGGTAATCAAGCA:1 - chr3L 27413020 3' + hopper2 1337 1 59.00 ACAACACACACACACACACAGGTCCGTCAGAGTGCGAGAGCGGGAGGAGGTGCTGAGTAGTCCTGCGACTCCTTCTGCTGGCGAAGCTCAAAGGCCGGATG:1 + chrX 6914146 3' + gypsy3 423 2 62.38 CCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGAGAATTCTACTACATACAAATGGAGAAA:1 + chr3R 11391535 3' + jockey 442 1 72.28 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATCAAAATTCACTTTTCATATACAACCTACCCA:1 - chr3R 20432412 3' + roo 9026 1 73.27 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGTCCGACTAATTCAGCAAAGCGTATCTAATTCCGTACTTATCCGCAGACAAATGTGGCAG:1 - chr2L 7020641 3' - FB 19 1 60.40 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGTGTCTTGTAATAGTAAAATTGTAAAAATTCTACGTCTTG:1 + chr3L 25333415 3' - pogo 33 1 60.40 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATATATAGATTATGCCAGCGGCGATATAACTAATTTACAATGCAGAGAAACAATAAAATA:1 + chr2R 19352289 3' + 17.6 480 2 66.34 AGAATCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATATTTTAGGGGTAAAACTCACTCAATTTTTCGAATGGGGAA:1 + chr2R 16639744 3' + opus 486 2 65.35 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATCAAAATTCACTTTTCATATACAACCTACCCACCGGGAGCTTGGTCTATATGTCTGAATG:2 - chr3R 20432384 3' + roo 9054 2 61.39 AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGAGGCAGGTAATCCAAAAAGGTGGATTCCTAG:1 - chr2L 21369861 3' - rover 6991 2 69.31 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAG:1 + chr3L 17708275 3' - jockey 4810 1 76.84 TTAGGTGCCCTATGTGCGGAGAAACACAAGCCGAGTTCAAAATAAAGAAAATCACATTACCGGTTATCTGCTTCCTGGAGCACACCGCAAACTGCTCTCAT:1 + chrX 14713828 3' - Gypsy12A_LTR 1899 1 66.34 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATAGAAAATTAACCCAGTTCGCACGTCTATGCCGAAACAAACAAAAGTTTGCGAGGCAAACGAG:1 + chr2L 20330116 3' - 297 8 2 72.28 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACCTGGAATGGTAGGACTCCAGTTCGTCACATAAATATTTATGGATGTTAATGTTGTGACGTGAATT:1 + chr3L 6399582 3' + roo 401 1 73.68 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTT:1 + chr3R 30284280 3' + blood 7356 2 56.44 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATAAGGAAAGCAGACTTTACT:1 + chr3R 22520969 3' + opus 484 2 63.37 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTGGCAACGACAAAATAGCCGCATGCTGTCAATCAATATG:1 + chr3L 15745411 3' + hopper 1412 2 66.67 CGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAATATCGTCGTATCAGAAA:1 - chr3R 1440140 3' - G-element 13 1 67.33 ATATATGTATATACTTTATATGTTAACATTTTCAAATTTGTGTAACATTTAACTGAACGTCTTATTATAAGATTTACAAACTGAAAACGATATATCGTGAA:1 + chr4 668362 3' - INE-1 60 1 78.22 TTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGAGTTTGCAGTTTTATGTGCGGACGAATGAGTTTTC:1 - chr3R 28465514 3' - I-element 248 1 65.35 CCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTAGATGGGCTGGGGAAAATAATTCCAGGGAGATTAAATTGTGGTTGGCATCTGTGGGCAGG:1 + chr2L 15118993 3' - I-element 334 1 64.36 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATA:1 + chr2R 22269203 3' - jockey 4694 1 53.47 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTAATCAGTTTGAAGGCGCGTCGAGGCCTCTACCTTTCTCCTACA:1 + chr3L 1227362 3' - 412 32 2 54.46 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATA:1 + chr2R 16639705 3' + opus 447 2 83.17 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTT:1 - chr3R 24464809 3' - 412 7105 2 76.24 CTTTTTCATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTTGACTATTATAAGACCGCTGCTTATTTCCTCTACTGTTTCGATGT:1 + chr3L 25162877 3' - Porto1 4218 1 55.45 CTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCTTTACATACATACATATAATATACCCAGTTCGCTGATCA:1 + chrX 6659209 3' - Circe 7199 1 71.29 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACT:1 - chr3R 19450028 3' + roo 405 1 64.36 GTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAAATGTAATAAATCTTTTTATTGGGTCAACAAGTCATTAAATT:1 - chr2R 19430471 3' - 3S18 5801 2 67.33 AGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCATTGCCGACTTCAGAGCTCTCGAATTGGCAACGAATGTTGCTAT:1 - chr3R 15943289 3' - BS 4893 1 57.43 AATATTGACATAATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTTGTGCGTTCGTCGTATGGCATAATGGGGCGTATACGCAAT:1 - chr3L 17307156 3' + F-element 4307 1 64.36 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTCACCCTGTTGAGTTCACATATCACGAGTGTGAAGTTCTTTAAA:1 + chr3R 13441936 3' + 1360 3356 1 63.37 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTCACAATATCACCACTTCTGCCCGCCGTGTTGAGCAGAAAA:1 + chr3R 5359994 3' + 412 457 2 63.37 GAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAAAAAAAAATAAGGAACGATGGAAGATGAGATGGCAAAAGAGGTGGACTTGTAAA:1 + chrX 4963645 3' - gypsy12 10008 2 61.39 TTTTGAAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAATATGGACGAAATATTTAATTCTGATTTTTCATTATGCACACCACTGATGCACACATCGTTCTGAAAG:1 + chr3R 10719784 3' - copia 8 2 65.35 TTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTCCATAGTTTCCCCCTTCAATTTCCCGGGCTCGATTTTTT:1 - chrX 20900781 3' + hopper 144 108 66.67 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGCATGTATTTTAACCTGTGCTGAATCGATAGTTGAGAAGTAATCCGTGTCATCGTTAGGATTAGAAAAGCTC:1 + chr2R 15794792 3' + pogo 2098 1 74.26 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTNGGGGTGTACAACACACGCACACGAGACGGGGATAATATGTTGCCCCATAAAGTATGCTACAAATTTTATACTTTCGAGCAT:1 + chr3R 24442528 3' - jockey 4677 1 70.30 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTAACAGGACACACACGTCAAT:2 - chr2L 12884293 3' - HMS-Beagle 11 2 68.32 AATATTACAATTTCATCAGNATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTATATCCCACGCACTTCGTGGAG:1 + chr3R 18851042 3' - invader4 2809 2 79.00 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGCGCCGGTGGAAATAGCGACCGGC:1 - chrX 15498970 3' + P-element 2834 1 26.73 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAACAGGAGTTCATCATTACAGTACAAAAGAGAAGGGTAGATAGACAGCGAGCAGGTGTTGTATAGTCGC:1 + chrX 5257006 3' + 412 463 2 49.50 ATTATGTTTGTATGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGATCCAATTTGGGTAGGATTGTTCTATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAAT:1 + chr2R 2745201 3' - I-element 4951 1 73.27 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTTACAGGAGCA:1 + chr3L 17708323 3' - jockey 4768 1 67.33 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCT:1 + chr3R 30284282 3' + blood 7358 2 54.46 TAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGA:1 - chr3R 1440187 3' - G-element 60 1 79.21 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAA:1 - chr2R 4673573 3' + Quasimodo 7345 2 56.12 TCTCAAGTCCAAAGCACTGNTATTTTTCTGAACACAACTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGTTTTAGAATGCTA:1 - chr3L 12072535 3' + HB 1609 1 54.46 ATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGGAAACGAGACTTTGCAGGACCTTTTTGGGGGCACTTGGCGCGAGGACGTCGCCGCGGCGAACA:1 - chrX 14749010 3' + micropia 198 2 71.29 CAGATATCTTGCCGATGCANCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCGATCCACAG:1 + chrX 16272503 3' - pogo 32 1 55.45 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCT:1 - chr2L 12884313 3' - HMS-Beagle 31 2 56.44 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGAAATAAAACACAATACGCAACGAATTAGAAATGTGGTTGCCATCATTATCGATTGGTTCTATTGAACA:1 + chr2R 9369929 3' - pogo 5 1 74.26 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCTGTTGCGTGAGTGCTCTCATATAACTAATATT:1 - chr2R 23111318 3' - hopper 40 1 63.37 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCAAATTTAATTTGCACAACCACACACAGAAAAAGAGCACGCACACACGTGC:1 - chr3R 18554855 3' + hobo 2913 1 53.47 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGAGTCTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGC:1 + chr3L 17136023 3' - BS 39 1 63.37 CACACACACACACACACATATGTGGTCCACTTGGGCTTAAGAGATTGCAGCATTGGGTGGCGCTTAACCCAAACCGAGAATGTGTATATGTGAGTCACACC:1 + chr2L 9810510 3' + accord 7030 2 78.22 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGATTTTTCTCTTTGTGGGCAAAACTTCTTT:1 + chr2L 4177764 3' - FB 49 1 75.25 GAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATATTATAGTGAAGTGCATCTGCTAGATGCAAATTGCGTATACTGAATATTTTA:1 - chr2R 16639639 3' - opus 17 2 62.38 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTT:2 - chr3L 25059059 3' - mdg1 16 2 63.37 TTATAAGAAAAAAAAAAAGAAATTTTTACAAAAAAATCTATTCTTAGACGGGTTATGCAATAACTTTAGTATTAAAAGCGCCAGTTTAAGTAGCTAAAGTC:1 - chrX 4445495 3' + HMS-Beagle2 481 1 54.46 AAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCGCGTAGTATAAACAAATATCTGTTACGAGACAGAAGCCCAACAAACAGAAAGAAAAAAAAAAATGCAAA:1 - chr2R 11523634 3' + I-element 124 1 70.30 TGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACTCATTGTTGGCCACTGTTCTGGATGCTGTCCGCTCCAGTGGCAATCAGGATGTGCACGTCCGCATTGG:1 - chr2R 9175348 3' + jockey 4571 1 73.27 TGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTT:1 + chr2L 19907950 3' - Tirant 8159 2 77.23 GATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATACCGAGCGGTATCAACTTACCACGAACATG:1 + chr3R 29375005 3' + mdg3 5455 2 68.00 GCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTAGATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGAC:1 - 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pogo 27 1 54.46 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATGTGGTTCCATCTACCATCTCCAAAGCTGTGCGTAAGCTA:1 - chr3R 27605275 3' - opus 144 4 62.00 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGGTCATAAAAGCCACATTTTGCCT:1 + chr3R 7599087 3' + mdg1 368 2 78.22 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTATGTAATTATTTGCAATTAGAAACCCGTCACATGCAACGCGGGTAGAAGCTTGTTGGAGAAAT:1 + chr2R 20690598 3' - mdg3 5267 2 63.37 TGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGCCACATGGCGTATGATGGATTTATGT:1 + chr3R 17962292 3' - accord 229 2 61.39 CACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTATCGACCCATTGGTGCCACGCCTA:1 - chrX 21667978 3' + Tabor 481 2 68.32 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCTCATT:1 + chr2R 5651925 3' - Tirant 8 2 73.27 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGT:1 + chrX 21668088 3' - Tabor 6858 2 60.40 GTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAGTTGTTTACAGTCGGCCCTGTGTATATATGGACTTACCGACCCAAAGGATATACATATATACACAGGGCCG:1 + chr2R 17231294 3' - diver2 304 2 48.51 GAGGAATAGAAAAAGGCAAAGAATCGCAACCGGTTAAATTCGGGCTCGGATACTGCAGAAAGCACCTTTAGTTTTCCCTCAGTTCGGGTTTTATGAAAAAC:1 + chr3R 11403492 3' + Bica 465 1 73.27 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCGATTGGGGACCTTATTACAGTTGTTATGTTCATTTCTTTCCTATTTTTTATCT:1 - chrX 17106152 3' - HMS-Beagle 6814 2 61.39 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATAAAGCTTTTTGCTGTTTGGAGCTTAAAAATAATTGA:2 - chr3R 8261994 3' + S-element 1683 2 63.37 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTACATGCAATAAATCGAATTTAAACATCATAACATCTGTTTTAGCACAG:2 - chr3R 14228010 3' - Transpac 4942 2 55.45 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATTGAAGTGGTATTGAAGTGTTATTGAAAATACATCGTCAAGACACTTTATAGCTAAATAAATGTTGTAGCTTG:1 + chr2L 7552498 3' - I-element 10 1 51.49 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATGCCGTTTTAGATGAGAAAGAGCAAGGTTTACCCAGAAAAAT:2 - chrX 9584658 3' - pogo 30 1 57.43 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGCAGTGTCAGTGAAAGTGTGGGAGTGAGCGAGTGT:1 + chr3R 23803890 3' + P-element 2846 1 38.61 AACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGAGAAGGAGTGGA:2 + chr2L 20290320 3' + flea 251 2 74.26 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATCCCCAATCAATACAATGTAACTACCA:1 - chr3L 6982519 3' - Burdock 43 2 74.26 ATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATGGTGAGAAACAATTTAGTTAGCAATTTTTAACGAATTTAATATATATTTTTACTTGACGAGTAAAT:1 + chr4 653654 3' - Cr1a 3975 1 73.27 ATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGTAGAGCCTGGTTCCATGCATTCGAAAGCGGAATCGTGAATAAAATCACCTGGGATGCCTATCGGGAGTCAGTTGGC:1 - chr2R 11699228 3' - roo 8664 1 79.21 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCC:1 - chrX 8038610 3' - 297 6599 2 60.42 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTATGTTTAAACAGATCAGCACAATTGAAAATTGGGAAACAAAACATGTAATTGTATATATCTTGTG:1 + chr2R 5043378 3' + roo 400 1 70.30 GATAAGGACACGATCTGCGCAATTGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAAGAGCGCATCGCCGCTTTTGCCCTGCTT:1 - chr3R 7310717 3' - jockey 96 1 68.32 AGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCGTTTGGCTATTAACTTTTAATTGTGAGTTTCATACCGAAACGCATAAGC:1 - chr3L 18215369 3' - Stalker2 352 2 55.45 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGAGTCCTTCGTTTTGCGCAGCCGCTCGCCGATTTCGCGGTAAAAAA:1 - chr2L 16690423 3' + P-element 2856 1 48.51 AAACCAACAAACCGCGAAGNTGTAATTATACATACATATGCAGAATGCACGCATGGACTGTCAACACTTTGAACTGTTGCACCCGAGCTCCCATTTCCCAG:1 - chr3L 18738176 3' + Quasimodo 7361 2 70.30 AAAAAAAAAAATTGAAAAGAGCGAGAAAAGGGGGGCAAATTT:1 + chrX 10671585 3' - FB 172 1 52.38 TTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACCAGAATCACAGAACCAGAATTATGAACGAAATAAGCCGCCAAAATGATTCAAAGTG:1 - chrX 13555410 3' - X-element 4605 1 44.55 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACC:1 + chr3R 30284272 3' + blood 336 2 64.36 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTGTATGTACTTGACCTGGAAACGTTATGCCC:1 - chrX 18053805 3' - 297 26 2 68.97 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATAGTAGTTTAAATACC:1 - chr2R 13647827 3' - blood 7047 2 59.41 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGTCTAGCTGCGCGTCGCTC:1 - chr3R 19094217 3' + P-element 2833 1 25.74 TAATAAATAAATTAATTAAAAAAATTCCCAGTTGCCAGGGAAGAGAGGTGACGAATGCTGACGACTTTCTTGGGGTTGTGCTTTATTACGCA:1 + chrX 21273615 3' + X-element 4715 1 71.74 GAAGATATTTCCAAATAAANTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCATTGTTTTTAAGCAAATTGGCTA:1 + chr2R 16453554 3' + roo 356 2 78.22 GATATGATGCACTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATATATTTTAATACATTTT:1 - chr3R 6104391 3' - pogo 134 1 76.24 ATGGTATAGTCTGTACCAAAACGACTTCAAAAGGTGATAGACGCTAAGAGAGAGTATATTTTGTATTAATTTAATTTAATTTTATAGTTTCGTATCGTACA:1 - chr2R 6170142 3' + Tc1-2 1310 1 78.22 AAGATATTATTAAAAAAAAATGTTTTGATTACGATTAGGGCGGGGGCTAACCTGTGGTTTGGCTCTTCAGTGGACAATAGCCAGCACACGCTTATTTCTTT:1 + chr3R 30670142 3' + HB 1546 1 72.28 GTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGACCATTAATCACAGCATCTTACAAGTGCTATCTAGACTCCATACTGATC:1 - chr2L 5474847 3' - Tirant 452 1 51.49 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACTCATAACCCAAAAAAAAGGGAAACAATTTGATGGTTTTTGTGGCCAAGT:1 + chr2R 23111389 3' + hopper 1392 1 55.45 GATGGCAGCGGAGACTATGNGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTCGATTGGGGACCTTATTACAGTTGTTATGTT:1 - chrX 17106175 3' - HMS-Beagle 41 2 67.33 GTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATGTTTATAATGCTGACTGTCCTGAGATATGGCGGCACTTCCTATAATCAATGCTGTTCTTTGCCAATT:1 - chr2L 6170072 3' - invader3 9 2 72.28 TTTTCTTTTTTTTGTTAATTTTTTCTATTTTTTTTTCAGAACCCATAGAGTCTAACATGAGCAACTGAGTACCAACGAAACTAAGAGAAAATCGACGAGGA:1 - chr3L 6692529 3' - Doc 4698 2 77.23 TTAAGTTTAGTGAGTAAAATAATGAGAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAAAGCTGGGACAAACACGAAATGTGCATTGAGTTTTAAGAGTATTATGCTCTTGA:1 + chr3L 9327345 3' + Tc1 1564 1 71.29 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTGTCCTACTATAAGCGTTTTTCTTGGTGCATGCATGTTTG:1 + chr3L 11763250 3' + pogo 2069 1 60.40 GTGCGATTAAAAAAATTCGTTGGGGATACGACTCCTGTTGGATCACCTTGATCAAATCCTTTAGAGCATTGCGGCGG:1 + chr3L 16785844 3' - Chimpo 3799 1 66.23 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACTCCACAAAAGAAGTCA:2 + chr2R 20389498 3' - pogo 32 1 61.39 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTT:1 + chrX 13134918 3' - BS 5034 1 49.50 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACAAATGTAATAAATCTTTTTATTGGGTCAACAAGTCATTAAATTCGGTAACAACAC:1 - chr2R 19430459 3' - 3S18 24 2 55.45 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATCTGCATTAATGACACACGTGTCACTTAGCATTTTTTAATGA:1 - chr2L 11894798 3' + I-element 5323 1 59.41 AAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGGCAAACACATATA:1 - chr3L 2029664 3' + roo 405 1 71.29 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAGTGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGGGTGGGGGTATTA:1 - chrX 21668001 3' + Tabor 458 2 49.50 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATC:2 + chrY 311344 3' - 1360 11 1 53.47 CATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAATTTCTGTTACTTTCTATTAAACAAAACCTAAAAAATGCTTCGATTGTCTGCCGGCCGTGTCTGACTCGCCT:1 - chr2L 7007829 3' + 17.6 146 2 75.25 GCCCTTCACCGTAGAAGTTNTTAGACTTTAAATCTATATTTTTTTTCTTTGTTTTTTTTTTCGGGTGGTTTGAGCTGTGCGGCTGTTTTGAATAATTGAGC:1 - chr3R 28652395 3' + 1360 223 1 69.31 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATAAGTCACTATATGTATGTACATGTAGTAGACCCCTCATTAAAGCCCTCGGGAAATTGAAA:1 - chr2R 13540879 3' - 297 6603 2 56.84 ATAAGTTCACACTGGCTTTAGTATAGCTTTGCATAAACGGACTTTATTTTTTTAAATATTTTTTTTTTGTGAAAATCTCGCTGTTGCCCGTAGATTAGGCT:1 + chrX 5182967 3' - G4 3416 1 52.48 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTTCTGCTACTGCGGCTGCCAT:1 + chr2L 9287185 3' - jockey 65 1 79.21 AAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGCTACATCTAGCCGCAGACACACACAAC:2 - chr2L 16456624 3' - hopper 45 1 70.30 GTTTTGAGACTTTATTAACNACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACAACAGGCACACGTCAGATCCTTTCGAGGCGCAAATTAATCTCGATCCTG:1 + chr3R 30220258 3' + mdg1 390 2 52.48 TCACTAATCATGTGAGGACTTACATGTGTGTATGTGTGCCTGCGTTTGGGCGACTCTATGTTTGTGTGTGTGTGTAGCCCCAAAAGCGGGCTACATAAAAA:1 - chr3R 17362857 3' - BS 4995 1 76.24 ATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCGATGGGTGGTTCGTGGGTTGGG:1 - chrX 4050098 3' - F-element 4476 1 74.71 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCTTTATCAGTTTTGAGTGCTAGAAATTGATAGGGAATCTTGTACGATAATGAAGTGTGTCTCATTC:1 + chrX 19167993 3' - roo 10 2 69.31 TGAAGAAATTCAAAAAAAAAAATCGTGTAAAATACATTTATGATCAATACAATTCGATTGATTTTGAGCCCGGCGGGAAAATGCGTAGAAAAAGTGAAAAC:1 - chrX 3103646 3' + TART-A 13401 1 78.22 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCAGCTACTAGAGTCTTGGATTTT:1 + chrX 13134944 3' - BS 5008 1 69.31 TGTCAGCCCGACGGCTGCCNTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACAGTACGCCGGCAAAAATGGGGGTATTGTGATGTCTT:1 - chr3L 21118572 3' + 412 7502 2 60.40 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTCGTATTTCGCGTACCATCTCCATCTCCATTCCCATTTCCATCCGCATCCGCATCC:1 + chr3L 13347357 3' + roo 9036 1 58.42 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTATGGGTACAACTGCCCTGCCCAGCTCTGCGGACTGCAACTGCTATCCGTTGCGTTAAGCTGCCGTATACA:1 - chr2L 6175625 3' + hopper 1411 2 75.25 TGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCTGTTGCCTCTCTCTTAACCCCTCCTAACTGCCCAAATGCAGCGCACTTGTTTGCGTC:1 - chr2L 605487 3' - opus 7304 2 59.41 AAAGAATAAAATAAAAAAAAAAACCGGTGAAAGACTGAGAAAGAGACG:1 + chr2L 14967694 3' + Rt1b 5148 2 81.25 ATATGTATATATGTACATATATATATGAAAGTCGAGGCGTGAAAACAACAAAGGAAGAGGCTAAAAATCGCTGTCTAAACTCATTGTG:1 - chr3R 8050374 3' + G3 4507 1 53.41 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACTTCAAATTACTTTTGATACACTTGAGTGTTTTAAAAATTACAAGAATTGCATGAAAATATCTTTTAATGTA:1 + chr2R 18939204 3' - I-element 3 1 70.30 CGAGGCATTGTGCAAAGTANTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATTCGAAGAGGCTGCTAATTAAACAAACTTTGAATTAATCAGCTAATC:1 - chrX 19383968 3' + pogo 2076 1 55.45 CAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACAGGACTAAAAGTTTTCCTGTAGAATTCAGTTGAAATTGCCTGG:1 + chr2R 17734542 3' + Stalker4 386 1 62.38 CGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCAAAATAGGAACTGTTAATTCAAAGCTCCTGGACCATGAGGAAGTGAAGACGATTCTGAGTG:1 - chr3L 24368391 3' - Doc3-element 4583 1 63.37 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAATGTAGTTTAAATATGTCTAATATCTTACAGGCCGTAAAATGAAAAGTTCAGCCACAAA:1 + chr3L 20032328 3' + Tabor 465 2 57.43 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCTCATTTGACAGATTCTCAGCTCC:1 - chrX 14132094 3' + roo 356 2 76.24 ATTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTATGTATATTGGCGTAGAATGGCTCATAACTCTTTGCATGGATGCCATTCTTGAAAAACACAAAGAAGCGATTGTC:1 + chr2R 7093804 3' - Tc3 239 1 61.39 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGATGTTTGATGTCGTCTTCAGTGCCG:1 + chr2L 17475995 3' - F-element 61 1 77.23 TCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTATTGTAAACAATCAAATACACACATTAATGTCTAA:1 + chr3L 26003384 3' + Quasimodo 281 2 76.24 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATTTATGATTAGTGTATAATTTCGTTTTCAATAACTAAACTGGCAAGTATACCCTTAACTAAATTGAATGTTT:1 + chr2L 9053512 3' - flea 4758 1 65.35 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGAAACTGGATGGATACCTACACCTACCTGGCCAGGTGCGGCAAGTGGCAAGGACCAAGAAGG:1 - chrX 18322547 3' - jockey 4689 1 56.44 ACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAACCAATCCGAAAACCTCACACCGCTTC:1 + chr3R 22789389 3' + F-element 4435 1 73.27 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGCTGACAATATGTTTATATCACATATGTTACTTGTAAATTGGCTCCATTTGACCTAA:1 + chrX 720880 3' - jockey 4792 1 60.40 GTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTAATTTCGCTTAGCTTGGAAAGAAATCAATATTACTAATGTAACTATTAAATACTGAATTTATAAACGATA:1 + chr3R 25795160 3' - 297 206 2 74.26 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAAACTTGGTTTAAAATTGCCATACATTAA:1 + chr3L 11523333 3' - hopper 45 1 70.30 GAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCCCACGATTTTAAAAAATGTTTAGATTTTTTTTGCGCTTAACTTTGTGGCTCCATCTGCTGGTA:1 + chrX 20996628 3' + INE-1 109 1 68.32 TGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGTATATACATGGCCATAATGACCGCATCATTCACCATACAGACCCCGAAACCCTATTTACAACTCGTATTGC:1 - chr3R 20891975 3' + invader4 3084 2 76.24 AAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCTTTCAACGAACAAGTACTATCAAGTTGCT:1 + chr2R 9761217 3' - X-element 61 1 73.27 TTTTTTATTTTTTTTTATTATTTTTCTCCCAGCAACGACAGCTGCACAAAAAGGAAACCGATAAAAAGTCCAGCAATCTAATTTTGTTGACCGCGGCCAAT:1 + chrX 14518268 3' - BS 5099 3 75.25 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGATATTAAAACATCTACTAGTATGTTTAAGGAATATATGGA:1 - chr3R 30284218 3' - blood 7049 2 64.36 CGAGAAATGTTTGTTTATGTAACGAGGCCAACAACACTTATTATTTTGTTGTCGAGTTGAATTACATTAAATGCACATGAGGAAATCACACTGGGGAACAG:1 + chr2R 18357106 3' - Tom1 78 1 77.23 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCAAATCAAGAGGCGAACGTACAAACGAAGAAGAGAACGAGCGAACCA:1 + chr2L 16690495 3' - P-element 26 1 50.00 AGGCATTGTGCAAAGTACTNGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGCATGTATTTTAACCTGTGCTGAATCGATAGTTGAGAAGTAATCCGTGTCAT:1 + chr2R 15794772 3' + pogo 2078 1 56.44 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACGCAGATTTTTCATCAATCATTTTGCTTG:1 - chr2L 9884285 3' - hobo 44 1 68.32 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAA:1 + chr3L 25345147 3' - Doc 50 1 67.33 TGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTT:1 - chr3R 3269646 3' - Gypsy6A_LTR 90 1 77.50 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGCATTGAGTTGAGTCGGCTGCATTTCAAATGCGAGTGCATAATGCACTAATTAGGCGGGCGTTAAGT:1 + chr2L 13310326 3' - mdg3 5265 1 62.38 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATTCGTGTGCGTGTGTGAGTGAGAGTATGTGTGTGTGTGTTTTTGGG:1 + chr3L 11247429 3' + jockey 4958 1 55.45 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCCCGAAATTACAGTTAACTCACTTATTTGCTCATTCG:1 - chr3R 24464796 3' - 412 39 2 63.37 GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATTTATATTTTAATGCCCTAATTTTGTTTGCTCCATTTATAAAAAGTTA:1 - chr3L 13204358 3' - I-element 5141 1 52.48 AAAGTAAAAAAAAAATAAAAAATATTTTTCCGCATTGAAAAGGGTGCATAATTATGCACAGGATTTTCCGTAACCGTGACTAATCTTCGGTTAAAGTAGCC:1 + chrX 4692864 3' + Doc 4699 5 69.31 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAAACAATATAATCTTTACGTACCAATTCC:1 + chr3R 23788487 3' + pogo 2057 1 76.24 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTGAAAAAATGGTGGAAAAAATGGAGGAACTACTGCAACTGTCAAAT:1 - chr2L 16566275 3' - 297 6587 2 67.44 CTGATAGTCGAGCAACTCGACTACAGCTTTCTCTAGCGATAAAAAACATTTCTAATTTGGTACATGTTTGCAAGCTGCAATAGGACCTACTAGTTTTTAAA:1 + chrX 22585480 3' + INE-1 562 1 72.28 CCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTTAAAGAGAATACATGTCTAAAGCGAATACGATCCGTCATCAACGTTTCAGGGGAGAGGATC:1 + chr2R 21095336 3' + G5A 2635 1 68.37 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGAAAATAGTCATCCCCAGCCCCTCTCCTCGACT:1 - chr3L 6399506 3' - roo 8681 2 58.67 CCAGAGTTCTATTCCATACGGTCATATTGGTTTTATTTATGAGTAAAGTCATTTTCTTGTTTACTTCGTTGTAAAATTCTGTAATGGTCATACGTCCCTGT:1 + chr3R 908382 3' - Porto1 4271 1 71.29 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGCAGTCAACAAAAGCGAGATAATAGGAGAGCTAAAATAGGATTCAGGTGG:1 - chr3L 14143306 3' - pogo 16 1 59.78 ACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGGAAATGCGAACGCGAAACTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAAATAGAGTGAGCGTGGCAACTCGATAGA:1 - chr3R 31957631 3' - INE-1 548 1 68.32 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGAAACTGGATGGATACCTACACCTACCTGGCCAGGTGCGGCAAGTGGCAAGGACCAAGAAGGGCCGGCAACAGGCAT:1 - chrX 18322532 3' - jockey 4674 1 71.29 TGTGCATGGATATAGATCAGCCGAGATTGAGAATTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTATATGCATATGGA:1 + chr3L 24360334 3' - 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transib2 50 1 74.26 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTGTCGCAAGTTAATAAGAGAAACTGTATAAGCGGAGTTA:1 + chr2R 22367498 3' + roo 9032 1 60.42 AACACTTCCCAGAATGCACGCCACCCACATTTATCAGTTATGGCCACACATTTTCCTGCTCGAAAACCTTTTTCGTGGTACGAGAATTTCCACCTTTCTAC:1 - chr3L 12343104 3' + copia 4776 1 74.26 AAATAAAAAAAAAATCAAAAAACAGAGACATTAATAAGGTGACTAACCTTTT:1 + chr3R 23536419 3' + F-element 4687 5 84.62 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCTCATAAAAGGTTAGTTTAAACAAATAAACACGTGGAATTTAAT:1 + chr2L 16456682 3' + hopper 1386 1 58.00 CTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTGGGCTTCTCGATTCGGTTTTGGGATTTGAGATGCACAATAATTTGAACAATTGCTACTTGAATGCAATGTTTA:1 + chr3L 1461050 3' - F-element 342 1 77.23 GCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTGAAAATAGAATAAGGTATCTCAGCAGCAATGAAATGTAGG:1 + chr2R 4260465 3' - 1360 3203 1 60.40 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTACTGTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTTGAATTGTACATTTGTATGCTTATG:1 - chr4 333617 3' - Doc 24 1 52.48 ACAGCCTAAAAGTTGTGATTTTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAAACAAAACAAGAGAGAAGTAAACAGTGGAGCAGAAATTAGCGAAACGTGTGGAGAG:1 - chrX 8455526 3' - HB 190 1 57.58 TGAGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTTCTTCTCTGCTGTTGTCGTACTGCACAATTATATTTTTTTTTTCACAAATTATTGCGTGGGTGCTGCC:1 + chr2L 9622589 3' - Doc3-element 4505 1 53.00 GTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAAAATGTGTTAAGGAATTTTTACCTTAAAACAATCGCTCTTGGGAGGAATATTACATTATATAATATAACAA:1 - chr3R 20433145 3' - roo 96 2 76.24 GTGGGACACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGTGGCATGTGTCAAAGCCTATAACGAGTAGAAAGCACTCTGTGCAGAACAAATTACTTTCACAT:1 + chr3L 17863517 3' - hopper 112 1 87.63 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACATTTACACAGGTTCTATTCGAAGACCTCGGATCGTGAGGCATTCTGGTTT:1 - chr3L 2809748 3' + pogo 2077 1 51.49 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGACG:1 - chr2L 9521671 3' - P-element 54 1 25.00 CTGTGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGATTTTCACTCTTAGTTTTACCCTCAATAATGGAAG:1 + chr2R 4544195 3' - baggins 5144 1 60.71 TTTAACTACAATTACATAACAATCACCAGAATCACAGAACCAGAATTATGAACGAAATAAGCCGCCAAAATGATTCAAAGTGTTAACCGGTTTGTCGAGCA:1 - chrX 13555391 3' - X-element 4586 1 62.38 TCCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACAATAGCATTCTCCCTTGTTTTGGCAGCACTTGCAAAAACTGCTAAAACA:1 + chr3L 14348537 3' + INE-1 531 1 68.32 TGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTACGCACACCCACACCTTCTATGGGCGCCTGTCTATCG:1 + chr3R 30284300 3' + blood 364 2 59.41 GGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACTTATCCACATGTATAGATACTCAAATCTAGTGAGCGACTTGGAAATACCCAGTGGTCAATGTAGA:1 - chr2L 15147129 3' + I-element 493 1 58.42 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACCTGGAATGGTAGGACTCCAGTTCGTCACATAAATATTTATGGATGTTAATGT:1 + chr3L 6399569 3' + roo 9045 1 56.44 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAA:1 - chr3R 13582240 3' - BS 5043 1 71.29 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGAGGAGTAGCTGCCCCATAGAATCCCCGTATTC:1 + chr2L 6175712 3' - hopper 42 1 71.29 CATTCGGGCGCTGCTTCGTGCGGTGCTTGGCATTAGTCTTGTGTCTGGCGACGTCCAGTATTTAACCGCCCATCAAACGGAGACGCAGTCCAACTCGGACT:1 + chrX 15174419 3' + BS 105 1 78.22 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGAGTCTTGTTTTATGGCGGACTGACGGGTGCCAAAAGCAACAATCTTTGTTACTACACTTGTGTTT:1 - chr3R 13441848 3' - 1360 10 2 70.30 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCGTATGTATATATGTACAAGAAATAAAATATTAATGCCTTTGATCAAAGCGAAGCATACCGTAAAACTTG:1 + chr2L 10171800 3' + 297 393 2 64.36 TCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGTT:1 - chr2L 23286582 3' - Tirant 414 1 57.43 TTGCATACTTGTGAAAAACNCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGTATGCTCACAAGAGGCAACAAAATCAAGATGGAGCAGG:1 - chr2L 19677296 3' + hopper 1378 1 58.42 GCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATTAGGGCTGCAGGAAAAACAAACTGTGTGTATGTTTAATTAAATAGTCAACTGTTTGGCCTGTGGCTACCAA:1 + chr2R 10621530 3' + Doc 4565 1 74.26 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATGCCTGTGGCATACGCGCCCTACGGAGGCTCTATTTCA:1 + chr3R 20432496 3' - roo 4 2 73.27 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATAGAGAACCCTAAGCACTAGCGTCATAACCGAGAAAAATTGAACTGTAAATACACATG:1 + chr2R 22659102 3' - 297 12 2 68.00 TAATATCAATAATATTTATAATCTATCTATAAATCATGCATAAATATTTATGTAGTAGATAAATTATGCTCGTAGTTTACACTTTTCTGAGTGCAGAATTT:1 - chr3R 17182106 3' + mdg1 7086 2 82.18 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTACATATACACTGGGCACTTACTTACATATGTACATATATCAACTGATAATTCGGTGCCTTTT:2 - chr3R 20555929 3' - 297 6589 2 70.30 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGTAAAGGTCTTGCCAGCAAACTAAGAAGAATACTAACACATTAAT:1 - chr2L 3985085 3' - roo 8685 2 54.84 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGTACAGTAACAACTAAAGCTTTTAACGGA:2 + chr3R 15523351 3' + 412 445 2 73.27 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATG:1 + chr3R 24228973 3' - 297 6592 2 68.32 CTCCGGAGAAGCACGAGACTTTTGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTGCGGGGCAGCACATTGGGAGCTCGAGGAGAACCGGGACCCATTGGACCTGCAGGACC:1 + chr3R 16556263 3' - X-element 426 1 73.27 ACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATAT:1 + chr2R 3760468 3' - accord 41 2 65.35 ATAAGATATGAACGGAGCCNAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAG:1 + chr3R 20432447 3' - roo 42 2 77.78 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGGGTTTATTAAACGTTTTCTCTCTCCCTCTTCTCCGATCCAC:1 + chrX 16272501 3' - pogo 33 1 58.00 GTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGCAAGTTAGTCCTAACCGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGTGCAGCAAGCCTAGTGTTTGTTTAATTTGT:1 + chr3R 14927142 3' - Stalker 6882 4 69.31 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGAAACGCTCTCGTGTGAATACAAATAGCAGAAAGTAAAATAAAAAAATGTTCGTAAATAAATAT:1 + chr3R 4555467 3' + roo 397 1 67.33 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGGAGG:1 + chr2R 20441298 3' - I-element 29 1 51.49 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTNAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTACAGATTTTCCGTTTCGGTTTATT:1 + chrX 1157659 3' + 297 347 2 77.23 TCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCATATACAGTTGACTAATGAATTCGCTTTTTTGTGTTATATGTA:1 + chr3R 13581623 3' - BS 5060 1 58.42 GTCAGATCACAAACGGAGAGGGAGTGAGTCGAATGCTAAGTCGTTTTAATGGCCAATAAAAGCAAAATGTTGTCACTTTTTTCGAATTTGTATAAATTTTC:1 + chr3R 30666159 3' + invader2 4994 2 66.34 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTNCAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATAGCAGCGCACATTCACACAAACAC:1 + chr2R 22269226 3' - jockey 4669 1 74.75 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAATAAATTTAATTAAGTCGATTTTGTAAGACCCATTTCC:1 + chr2R 7940813 3' + Juan 4168 1 71.29 ACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTTAATCATCTATATATGATAACTAGATCGAAA:1 - chrX 16891583 3' + accord 207 2 73.27 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTCTGTCTGTTTGTGTGTGTGTGCTAGTGGGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGCAAGTTGAAAATCTGCATGAAATAT:1 - chr2L 19698294 3' - accord 7030 2 43.56 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGTGAGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCGGTGTTGCACATATATTATGATAGTGATAGATATA:1 + chrX 9828505 3' - Tirant 40 2 61.62 AGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAGCAATAGCTGGGGCATCGGCACCGTGAGCTGGAG:1 + chr3R 27605337 3' + opus 460 2 67.68 CACCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCTTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCAGTAATAACAGCAGTCGGCCAAAAGATGCC:1 - chr3R 13571275 3' + G-element 4114 1 68.32 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGAGCATGTTCTTCTCTAGGTCTGTATTAAAACC:1 - chr2L 9724212 3' + 1360 3346 1 70.30 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAATGGTAATTAGAACTAATTATTTAACTGAAATTGT:1 + chr3L 21519037 3' + 1360 3349 1 68.32 CGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAGCCTCTCACTAATCATAGTAATACCTCTCTTCATTAGAAAATTATGATTTGATGGGTTATTTATTTTATGCA:1 + chrX 13134923 3' - BS 5029 1 48.51 CGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATCATGG:1 - chr2R 3919664 3' - 1360 32 1 55.45 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCCCGATCTGAGCTTGCGTACCTTAAG:1 - chr2R 1861716 3' - copia 4921 2 75.25 ATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGG:1 - chrX 21668013 3' + Tabor 7310 2 50.00 CAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTTAGAAGATTTATGTGACCCGGCACTCGAAACCGAATCGGAGCGGAAGATTGAGGGGAAAACTTTATTTC:1 + chr3R 24441405 3' + jockey 4681 1 74.00 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAATCTGGTTAACTTCGTTTAGAAAAGAACCGCGCAAAGTATAGTGGGAAAATGAGAGCAAGCC:1 + chr2L 9045834 3' - jockey 21 1 65.35 TTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTACTTGTTTTGAGAACACACACGATTCAAGAGTTACCTCAACCTGAGGTACGGATCATATAAATTTCGAAT:1 + chr3R 17893318 3' - hopper 967 2 75.25 TAAAAAAATTAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCATAGTGCACGGTTAGTCCTGTATTAAGTGTCACAATGT:1 + chr2R 4549671 3' + transib4 2588 1 68.32 TTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATG:1 + chr2L 6170159 3' + invader3 257 2 54.76 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCATGGCAACTGCACATTACCGTTTCGTACTTTTTCATGCATTCATTTCGATAGTTAGCCGGG:1 + chr2L 11537617 3' - hopper 10 2 69.31 TCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCAAAAAATACGAAAAAATAAAAAAATGACAAAAAAAAAATTAGCGGGCGTGCGACGATCTTGCTAATTGCTGG:1 - chr3L 10521898 3' + jockey 4988 1 75.25 CGGGGATATGATCGTATGCTTCTCTCTACCGCTATGGGCTTCATACCTAAGACGATGCTTTGGGGTACGAGAAAAAATATCAATAAATTTGCAATCCTTTT:1 + chr3L 20043043 3' - invader3 55 2 58.42 CTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTGCTGTGGATTTGGCAG:1 + chr3R 5502771 3' + blood 7186 2 75.00 ATATTAATATTAATAATAATAATAATAAAATCAGCAGCAGCGCAACTTTAACAACTATAATGGTCCAAGGAACAACAACTACCAGCAACAAGGCGGCAGCA:1 + chr2L 6910839 3' + mdg1 44 3 72.28 TGCAAAGGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCAGTATAAGAAAGATATTTGTCAGTAACATTTAGTCTTAAGCTGAGATCA:1 + chr2L 22076767 3' - baggins 5153 1 51.49 TGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGCGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTA:1 - chr3R 10741098 3' + 1360 3354 1 62.38 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTACAATGCAGGAGATAACAATGTGTTTTCTCTCTGTGTAGCAGACTGGGCCTATGCCCTTGCAAAA:1 + chr2R 20145168 3' + opus 7498 2 54.46 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATATATATTATAAGTTTGATTATATTTATTTGATCTTAT:1 - chr3L 21275770 3' - HMS-Beagle2 36 2 63.37 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTGACAAGTATCGCACAAAACATTA:1 + chrX 10326447 3' + P-element 2839 1 27.72 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTGTCTCCAGTGCAACTGTTAATGTCGTCGGCCCTCTGCAAA:1 + chr3L 23485751 3' - 1360 30 1 70.30 TCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACATATGCAGAAATAACGCGGAGAGCGCCGAGCTGG:1 + chr3R 11787769 3' + Porto1 228 1 70.30 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATATTAACAATTTTGTTGTCGCCAACGCAAACGAGATTAG:1 + chr3R 5503426 3' - blood 18 2 58.42 ACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTCGCGCCCCTTTTGTACGTGTGTGAGTGTGTGCTTATGAGTTCGGCGCGAGTGTGTGGGTTCTGCGGGAAAACTCA:2 + chr2R 13316229 3' + hopper 1414 2 78.22 GAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACAAGCACTAACACCACCTTTCAGCCACTCAAAATGCTTAAGGA:1 - chr2R 20399125 3' + Porto1 237 1 59.00 ATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTGATCACCCAATCTAATTACATCTTAGTAAATGACAAGTCACCAACACAA:1 + chr2R 5616789 3' + Tc3 1604 1 55.45 CACACACACACACACATGCACACAAACAACATGTCATTATTGTTATTATTATTATTGCACATTAATTGCGCGCACACGCGGCCAGGGCAACTTTATTAAAA:1 - chr2L 10070826 3' + accord 7034 2 76.24 CTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCATGTACTCACACTCTCCGGCTCCTAGTCCGTGTCCGTGTCCACTGCCATGTCCGT:1 + chr2L 3916804 3' + Doc 362 1 64.58 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATCATATAGAGATTCAGCTTTTAAAATTCCATAACTATTCGCTTGAAATACAAAAA:1 + chr2L 3985160 3' + roo 388 2 66.34 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACAAAGTTCTCCGCTTGGAAAGAGAGGGCAAGCTGCCGCGCGAAAGAGATGGACAGAGGGTGAGGGGTTGGGATTCTT:1 - chr3R 30281192 3' + blood 7348 2 81.19 GCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCAGCAGCAGCAACAACATCAGCGGCAAAAGGCAGCAAACATGTTAGGTAAATACAGCAACAACAACGATAGCAACA:1 - chr2L 17250946 3' - Cr1a 251 1 80.20 ATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCAGTAACAATAATTTGTGTGTTATTAATAGGCACGGAATGAACTAATTTGTTAA:1 - chr2R 969336 3' - Cr1a 3979 1 51.49 TATCGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACATATGTATATACATGGCCATAATGACCGCATCATTCACCATACAGACCCCGAAACCCTATTTACAACTCG:1 - chr3R 20891981 3' + invader4 319 2 70.30 TGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGCA:1 + chr2R 6482753 3' - gtwin 17 2 62.38 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGGTGGTTTT:1 - chr2L 16548166 3' + P-element 2852 1 45.54 TATTCGATATGTGTGCACATTACACAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTAATATACTTTCTT:1 + chrX 21668104 3' - Tabor 3 2 76.24 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTACTTGCTGTTCGATGTTGATTT:1 + chr3L 14143366 3' + pogo 2050 1 78.22 ACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTGGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTAGGGCCTAATATTTCAATTTAGCTGAAAGAGTTTCCCTTAAAATTT:1 + chr3R 16948548 3' - HB 1389 1 65.35 TTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACC:1 + chr3R 1844819 3' - Cr1a 156 1 71.29 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTACAAAAAATA:1 - chr3L 15777003 3' - I-element 30 1 49.50 TTACATTTTATTAAATATACATATATTTTTACGATTTTAGATATATTTTGAGGAATCCATATATTTAAAGCCCTACGTCAACGGTATTCACTCTTACGTAT:1 - chr2L 18576469 3' - Dm88 4386 2 44.55 GTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAANGCTGTCCATGCACTTATACNTNNNNNNTTCGAGTGGGTTGAAAATAATNGCAATTTAATTCA:1 + chr3R 24474517 3' - 412 7265 2 63.83 AATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATACTGCTGTATAGATATGTATACCTGTCAAATTTTTTTCTGGAAACGCTAT:1 + chr3R 12379351 3' + 1731 4599 1 53.47 TGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCTGTGGCTAATTAACGCAACTACATCGAACAGAAACGGGTCACAGCCTCCTAGTTGGATTTGCGCTTGGCCAACT:1 + chr2L 283890 3' + Quasimodo 6984 2 73.27 GATGGATAAGACCAATGCCCATCCTCCGCTTTGGTTCACGTTCTGGCCGTCCATTAGTTGTTTTATTACTGCAAAACTTCAGCATATTTTACCTTAACTAT:1 - chrX 3023198 3' - TART-A 12970 1 61.39 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTACAATGCAGGAGATAACAATGTGTTTTCTCTCTGTGTAGCAGACTGGGCCTATGCCCTTGCAAAAGGG:1 + chr2R 20145171 3' + opus 499 1 58.00 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCACACTCTATGGTTTCGGACCCACATTTGGCAC:1 + chr3R 27448293 3' - hobo 44 1 70.30 GATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCAAACGCTGGAAAGCATGCTACGATTTTTGCGTGGGAGTTGGGTGCCTTATTTGATGAGCTGAC:1 - chr2L 18845981 3' - Ivk 412 1 72.63 GAGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTCGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAGGCATAAAAAAGGGATATTGTCTGGCTGCCTGCGATGAA:1 + chr3R 29413125 3' + hobo 2909 1 53.68 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAACATTTCAAGTTTAGAATTTCCTCTTGAACCGTCT:1 - chrX 10284630 3' - roo 8702 2 64.36 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGAGGATGTTACTAGAAGGGCTTCTTCTATTTATGGGGTGATAA:1 - chr3R 3005961 3' - Ivk 35 1 56.44 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTTTATTAAGGTGAGTTCAAGAGATCGTT:1 - chr2L 10457173 3' - jockey 57 1 71.29 TCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTTTTCTAAAAATTATTTTTTTTAGATTTAT:1 - chr2R 2833294 3' - Stalker 322 4 71.29 GCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTTGGGGCAGGGAACGGGAAACATTCCACAGTTGTTCAGATTTTTTA:1 + chr2L 777961 3' + 412 7149 2 55.45 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGTCAGTCGGAAATGTCTTTCTCTTTTTCGGCCCACTGCCTTCTTTTATCATTGGAA:1 - chr3R 30220178 3' - mdg1 22 2 57.43 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGAT:1 - chr2R 11664293 3' - Tirant 8123 2 65.35 TTCATCATTCTTGATCTTGNCACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTATATCATAACATATAACATATAACATATATCA:1 + chr4 96892 3' + accord 7219 2 75.25 GTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACTGAGGAAAACGCGAGCAGCGCAAACAATTCGCA:1 + chr2L 17002760 3' + F-element 196 1 72.28 GCCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAACATCAGCAGCAACAAGCGACAGACATTGTAAGCCCCTTGCAAACTGAACCGTCAAACGGTTGATGGGAA:1 - chr3L 13592581 3' + TART-B 150 2 81.19 AAGAAAGAAAAGACAGCACACATAAGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGGCGCCGGCGGGCCAGGAGACTTCCCGCGATGCGACTCCCAAGTATTGCCTCA:1 - chr3R 3905989 3' + Osvaldo 1447 1 71.29 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAATGTAGTTTAAATATGTCTAATATCTTACAGGCCGTAAAATGAAAAGTTCAGCCACAAACAAG:1 + chr3L 20032332 3' + Tabor 7308 2 61.39 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAATGTTTGCGAGAACTAAACGGAATGTTCAACCGTTTTTATTTATGCAAAT:1 - chrX 6451072 3' - pogo 22 1 55.45 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAACAAAAATGAGGCACCGACAAAAAAACCG:1 - chrX 2918703 3' + hopper2 1543 1 69.31 TCCGCGATCGGCTTATGCATAAGCGTTAGATCGTATAACTTGGGCGCTGGAATGCTAAAGTAGTTGTTGGCGCTCTTTGAAAGCCACTTCTCGGCAAAAAC:1 + chr3L 14816062 3' - Stalker 169 6 77.23 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTCCTCGGATCTGTGCACTCGAAATTATGCTGTGGCCAGGACTT:1 + chr3R 28447445 3' + blood 7355 2 57.43 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGGCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTT:2 + chr3L 23678153 3' - Osvaldo 20 1 70.30 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGG:1 + chr2R 20441295 3' - I-element 32 1 54.46 TATTTTACATTATATTAATTTCATCGTTTCTGTTCTAAATCAAACCAAGTTTTCTTTTTATTTAAATGGGGTGGTGAATTTTATTGAATCTTCTCTTGGTA:1 + chr2R 5284495 3' + Cr1a 4324 1 62.38 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACGTTTTAGGCATCATTGTCCAAACATTCTAAAGCTTTTCCTCGAACTTTA:1 - chr3R 10063282 3' + roo 9046 1 53.47 TGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCCATCCATCATGCTTGCTCTCATATCACCGTCTTTCTCGCTGTA:1 - chr3R 14024691 3' + F-element 193 1 57.43 ATTAAGCCTTTCCATATATNTTTGGGCGATGTTCTGGACCCAAACTGTAGACGCCAGTTTGTCGACCGCCCAAATGTCGCAGCATACTTTTCGGCGTACGC:1 + chrX 14961098 3' - jockey 4648 1 62.38 CTAGAGTGCATTACTGATTNCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGATGTGGATATCCCCCACCCAAT:1 - chr3R 7582640 3' - 297 47 2 76.24 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATAATCGATTTACCGTCCAGACAAGCCATGCAAATG:1 + chr2R 13540951 3' + 297 6941 2 66.34 ATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATAATTTCTTAAAATTGAATATTTGCAACATCAAATTTTGTTGGATATTTTTCTTTGAGTGTAAAAGC:1 + chr3R 15528931 3' + mdg3 77 2 67.33 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAGGTGACGAGAGGGGTTGGGCGAGGCGGTGATATATGC:1 + chr3R 20432461 3' - roo 8703 2 67.33 AAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGGGATTGCCCTAACTC:1 - chr3R 1440168 3' - G-element 41 1 60.40 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTTAATGATGCCGCCCCAGCCGGCAAAACGGAAAATG:1 + chr3L 3475644 3' + mdg1 384 2 62.24 ATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATTAGCACTACTAAGTTAGGATTAGAACGATTCCTCACAGTTCAAATATTGCATAAAGAATC:1 - chr3R 24355950 3' - rover 161 2 65.35 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chrX 23065112 3' + opus 7461 2 70.53 AGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACCTCATTTGACAGATTCTCAGCTCCTTTCAACGCTAGCATCTTGATGTTAAAGGGCCACATGGAGCCATTCTA:1 - chrX 14132046 3' + roo 405 1 73.27 ATGAAATGTACATATTTATATTTTCAGTGAGATTTAAAGACTAAAGTATAATTTTTTGACTAGTGACTCAGTTTAATTGTAATAATATTGAAAGTATTGGT:1 - chr2R 19173235 3' + Juan 4182 1 76.24 GTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGCAGCTATCCGAAAAGCATACATTGTTGATGGAACTCCATATCTGATCTGTAGG:1 - chr3L 21779986 3' + R1A1-element 5287 1 66.34 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGTCTACACTTTTTTCCAAGTATTTCCCTCTCAGTGCTACTGACC:1 + chr3L 13704590 3' + opus 495 2 76.24 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGAGTTGGTGGCAAGTCCCGTGGCCTGCTAATGGCATAG:1 - chr3L 20079710 3' - mdg1 39 2 62.38 TTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTATTGTCCCCAATTAAATTAAGTGACCAACGAAAAAAAGCTGGCT:1 + chr3R 9121510 3' + roo 381 1 54.46 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACTCCGAATTTGAAAACAAAACTTGAAGTCATCCAACTAAAAAAGGAAAAGTTTGCCATTATAAATTAAC:1 + chrX 12854506 3' - Doc 32 1 72.63 GATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATGGACGGGATT:1 + chr2R 14849028 3' - flea 4703 1 68.32 CGAATAGGATTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTATATGGTTATCTAGGGAAGGTTAATTAATTAAAAGTAGTACTTAGCCCTGCGTTTTTTCTCG:1 - chr3L 10209463 3' - Cr1a 4041 1 77.23 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGGTTAAATAAACTTGAACTAGAAAAA:1 - chrX 14564670 3' - Doc 62 1 80.20 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCAAATTTTGTGACGAAATATGACAA:1 - chr3R 4712703 3' - pogo 49 1 79.21 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCCCATTCGGTTCCTTATGGCCAGTGGGCGTTTA:1 - chr2R 18204449 3' + roo 9030 1 65.35 ACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTTTGGCTTGTTATTTACAA:1 - chr3R 3269628 3' - Gypsy6A_LTR 93 1 77.23 ATGTGTGCACATGTGTGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCTATCCTTTCAATTTTTTTGGTCACTTCACTCAACTGTTCATTTGTTAAT:1 + chr2R 1918198 3' + 1360 178 1 59.41 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACATACACTTTAATATGGCGG:1 - chr3L 2917039 3' - hobo 47 1 85.39 ACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGGTGCTCGGCAGATAAGAGCAGAGCAGAGCAAAACAGAGCGTTGCACATAGCGGTAGATGATTCGGATCG:1 - chr3L 13391919 3' + R1A1-element 367 1 73.27 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTAC:1 - chr3L 15777011 3' - I-element 38 1 57.43 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGTAAAGTTAAA:1 + chr2L 12801006 3' + hobo 2897 1 68.82 AGCGATCTTGCATCACATAGAGCGTCTTTTTCACTTTCGGATTGAATCACAAAATCGATTTCGGATTACACAGAGAGTGCGCGAGTTACCATAACAGCGAC:1 - chr3R 442996 3' - F-element 132 1 63.37 CTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTATCTGATAAATGGCTGTGGCTAATTGTTGGGGATTTGCATGGCTCAGGAATAAACGGGTAGTGGAAATTGTATTCA:1 - chr2L 4300197 3' - F-element 4438 1 70.30 CGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAAAACTGCCAACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTGACATTTTTATTAGTC:1 + chr2L 22063437 3' + INE-1 147 1 48.51 GTAACGGGTATCTGATAGTTGGGGAACAAGGTTATAGCATTCTCTCTTGTTACATTTTATGTTTTGCCATTCAGGTTTTTGCGGCTGCTGGGTGATACGT:1 + chrX 22838758 3' + INE-1 551 1 71.00 TGAAAAAAAAAGAAAACAAACATTTTAATTCCCATTGAGTTCCTTATGTACGTAATTTAAATGGTTTAAAAGTGTTTTTTTTTTCCAACCAACAAGGGCCA:1 - chr2L 4026708 3' + mdg3 5080 1 49.50 AGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGCGGTTGCCGGTTTGTCGTTTAGAGAGAGGCAAGACGACTAGCT:1 - chr3L 332225 3' - Porto1 370 1 57.43 ATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGCCATTTGTCCTCTTCTTCCTCCGGCTTGTGTAAGGCGTTTACT:1 - chr3R 5284237 3' - Doc 4553 1 55.21 CTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGTGTGTGTGACTGCACACAAAAAGCTACTTTCGACGCGTTTGTGTTGGTGTTCTGGTTTCGAGTCCTCAAAA:1 - chrX 20288924 3' - P-element 2841 1 74.26 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGAGATACGCTTTACTCGTCTAGTTTTAGTTCAACGGAAAGGCATCTTCTAAAGCAAACTCGTGGTGCTTCCAAG:1 - chr3R 5594920 3' + 1360 3387 2 75.25 GTTAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTCACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATACATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTC:1 - chrX 13590514 3' - gypsy7 5014 1 81.19 AAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAATAGTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATATTTG:1 + chr2L 16958115 3' + 1731 4582 2 67.33 CAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCCCGCCTGGAGCTCGCTGGCCAGTCGACTTACAC:1 - chr3R 10662562 3' + blood 49 2 67.00 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACC:1 + chr3R 19094249 3' - P-element 41 1 36.73 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAGGTACAGTTTACCCTTTTTCCGTGGATTTATACTAGACTTT:1 + chr3R 7452003 3' + Juan 4184 1 49.50 ATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTT:1 + chr3R 846260 3' + Stalker 6940 4 74.26 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCTGTTGCGTGAGTGCTCTCATATAACTAATATTTATACCGTATAAAG:1 - chr2R 23111304 3' - hopper 26 1 53.47 CTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTTGCAGGCATCGGGATTGGCAACAGCCGCGCACATTGACTGCTAACCGACTGACACAG:1 + chr3R 26390191 3' + gtwin 10 2 60.40 ATTATAATAGTTGATATAAGATAGTAATTATTATTTATTTTATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAATTGCCATGACGAACTCAG:1 + chr3R 9978637 3' - 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Transpac 4949 2 55.45 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACG:1 + chr2L 12485447 3' + roo 357 2 85.15 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTTCTTATGG:1 - chr3L 22327289 3' + hopper 1380 1 63.37 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGT:1 + chr3R 20154780 3' - jockey 61 1 75.25 TAACCAAATTATTCCAAAACATTCCTGGTGCTGCTGATAAAGAGATTAATATCGTCTAGTATATTCTAGTATATATGCATAATACTGCATTTAATATGACC:1 + chr2R 8535886 3' - Gypsy12A_LTR 163 1 67.33 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATAGCAGCGCACATTCACACAAAC:1 + chr2R 22269224 3' - jockey 4673 1 71.29 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAGCTTATTATAAATAAATATGAGTTGGATAAAAATGCTAGTCTCGAAATTTTT:1 - chr3R 26798616 3' + pogo 2081 1 63.37 GGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTATA:1 - chr3R 19446672 3' - HMS-Beagle 47 2 74.00 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATGCGAGTGTGTTGGTGCTTCACCCTTTATCAGTTGAGCATTTTTGCCCTGTTTTTATTTGACTTT:1 + chr3R 11303645 3' - Quasimodo 38 2 60.40 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGACATGCCCGGGTCATCATGGAAGCCATCCCAAGCCTTCACACAGAGCTGCGCCA:1 + chrX 14132154 3' - roo 21 2 59.41 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTATAGCTTCCAAAAAAACTGACACCTGTCTACACTTTTTTCCAAGTATTTCCCTCTCAGTGCTAC:1 + chr3L 13704585 3' + opus 490 2 71.29 TTTCGCGTTCACACTAGCTGAGTTAAGGGTATGTGGTAGTGGGCATAGGAACACGGTGATTCATTGGTACGAGGATTGGGTGACGTGACGGTCATTGAAAT:1 - chr2R 4721188 3' + INE-1 530 1 61.39 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATCCCCAATCAATACAATGTAACTACCAA:1 - chr3L 6982518 3' - Burdock 42 2 73.27 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCCTCAGGTGTTGTGACTGAGTTTTGCTTGTCGACCCACAGGTTTCCGAGTGAGA:1 + chr3L 19459393 3' - Doc 34 1 56.44 TGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAGGCGAATGGGGAAGTAGTGCCCAAAAGTATACAA:1 - chr3L 9220131 3' + BS 5052 1 64.36 ATGCTATAGTCGAATTCCCCGACTATCAGATACCAATTATTTTAGTTCAGACTTTGTCGAGATGCGCAACTTTTAAATATAAACAAAGCAATTTTAGGTAA:1 - 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chr3R 19955201 3' + hobo 2927 1 67.33 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTATCTATGCCCTACCGAAGTTGCCAC:1 + chrX 19607323 3' - Tirant 8122 2 66.34 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTTCAATTATATGCAGATAGATACATACAGTAAATTTGTTAA:1 + chr2L 7328315 3' - I-element 37 1 60.40 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGATACAGAT:3 - chr2R 11664287 3' - Tirant 8117 2 71.29 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTGACATGCCCGGGTCATCATGGAAGCCATCCCAAGCCTTC:1 + chrX 14132138 3' - roo 8700 2 60.00 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCAAATAAAGATTTTCTATCTCTTCGCGAGCTTTCCTGACCCCAATGCATCACTAGTTGCGGTTCTTCTCCTCGC:1 + chr2L 1776059 3' - roo 1 2 78.22 CCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGGAAAGCCGTTTCAAATCCACACGCACGATCCAATTAGAACCGGGTAAACGG:1 - chr2R 24581407 3' + Quasimodo 339 2 55.45 GCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGGATGCATTGTTGTGTTGTCAGGCTTGCCAACGCTGGAGGAGTTGAAGC:1 + chrX 5347379 3' - 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Tom1 294 1 31.76 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCTTTGTATATGTATTCTGCAGATAGCAAAGGATAGA:1 - chr2L 14715092 3' + pogo 2064 1 68.32 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGGTTATCATATATATTAATGCCTTCT:2 + chr2L 16016238 3' - I-element 52 1 78.22 AAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAA:1 - chr3R 3922966 3' - Cr1a 67 1 70.30 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCCGTATTATCTTTTGTCTGACTATCGTCAGATCCAAACCAACCCATTTT:1 + chr2R 3169741 3' + mdg1 394 2 52.48 CTCAGCGTGCAGACTGCTCNCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTGGTCTTGTGTTTTCTTCTCGATAGAAAGCTGGAGCCAATGGCCATTT:1 + chr2L 15873896 3' + Cr1a 338 1 66.34 TCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCCACCACGCATTAATTAAAAGTCTACAACGGCAAATTGAAGTGCAACACAAAGTGCA:1 - chr3R 27787027 3' + gypsy12 10025 2 58.42 CAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATGTACATATCTGCGTGGGAGGCTTTGCTG:1 + chr3R 20892057 3' - 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chr2R 6438371 3' + Stalker4 7310 4 75.25 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:1 + chr3R 1977623 3' + micropia 5412 2 51.49 GAACAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTGTAGCAAAAGTATTCCTTATGTTTTTGTGAGGCAGAAAGAAACATGATACATTCATGATTAGGCTATAACTTATC:1 + chr2R 20811772 3' - Porto1 463 1 62.38 TTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGTTGATACTGATAAAGAGTATATTGTCTTTATACGTAATCAAATATCTCCATTAGTGATTCGCTTACTT:1 + chr3R 4522914 3' + flea 433 1 70.30 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGCACATGGCATAGCGTATTCATAATGTGTTGTATACATCTAGTGGTTAGTTCTGTGTTTAGCTGCGA:1 - chr3R 20381075 3' - jockey 19 1 67.33 ACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACCGAATATAACCCGTCCACAACATGGCATATAGTCGGGG:1 + chr3R 31045896 3' + INE-1 143 1 79.21 CTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGGGACCCAACAATTACTCTCAGCAGCAGAAGAACCAAATAAAAGAAAAGAA:1 + chr3R 26394663 3' + Porto1 324 1 76.24 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATATTTCCTATCAGTACTCCAT:1 - chr2R 20229391 3' - pogo 53 1 82.18 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGCACGGAGTGAGGCCCGTAACGAATGTATGG:1 - chr3R 557196 3' + blood 7344 2 70.30 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATACCTCGGCATGCCTCACATGCTGCATGCTTCGATGCGCTGCTGTAGGTCTCC:1 + chr3R 21467011 3' + Tirant 378 2 58.42 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCTGTTGCGTGAGTGCTCTCATAT:1 - chr2R 23111328 3' - hopper 47 1 72.45 AGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTATAATATTATATAAATTTGATTATATCAAAAAAATGTACGATTTTTATCAG:1 + chr2L 13765633 3' - Stalker4 7098 4 52.48 CTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGAGCTACTGTTCCATTTTTAATTTTTTCGCCTTTTTACTTTACTTG:1 - chrX 15696624 3' + copia 112 2 55.45 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCCATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGA:1 + chr2L 2622754 3' + blood 7339 1 71.29 AATAATTCATATTATATATTTTAGTCAGTATTATTTTAGATGTGTTAGCTATTCTTGACGACTTTTTTGACTTTTTTCAGTGTTTGTGGGTGGTGGTTAG:1 + chr2L 7262247 3' - Tc3 256 1 74.00 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACATAAATTAATGACACGCCTTAGCCTAAGGGGAAAATCACAGACACAAA:1 + chr2L 1858389 3' - pogo 28 1 56.44 GAAATGATGTTGAAATATANGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACATATATATATATATATATATCATCAGCATAGCATTTGTCGCC:1 + chrX 22651964 3' - HMS-Beagle2 6914 2 54.46 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGGTGGTTCTGAACCACTCATGGGTTTTCCG:2 + chr3R 9074108 3' - hopper 45 1 68.32 ATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTGTGTTCTCCAGTTAGTTTTTCTGCCGAAGCATCCGGCATTTTGGGGCACGGTTTGTTTTGTGACCATTATAT:1 - chr3R 16675470 3' - hopper2 1198 2 78.22 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTTTTTCGATTCCTTTCTTGCATAACTTTAAGTAGAATATTTCGAGATATGGTGAAATATATTTGCTTC:1 - chr3R 27199750 3' + roo 400 1 63.37 TTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAG:1 + chr3L 19339421 3' - Tc1 34 1 53.47 TGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACTGGCCCTTAGCTGACCAGCTGCAACAACATCAGCGACGCAGTCTCCACCAGCAGCAACAACAGCAGCGG:1 + chrX 4698521 3' + TAHRE 10420 2 39.60 CTCCTTCGTTGTGGCCGTCACTTCAATCCGGGAGGGGAGGAGTTACCGGTTCTAACCGGCACACAGACCCTCCAGCGAAGCCACCCCGGCTTACTCTGGAA:2 - chrX 21939638 3' + gypsy5 6900 1 69.31 CAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCCCTGCCTGCTTCGGCTCCTCTTGTTTTCCGTGTGGCCAGCACTTTGGCCCACACGATTACACGCAAGCTTAGGGAG:1 - chr3L 1698066 3' + Doc 374 1 65.00 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTCGTACTCTTTGTACGAATAGATTAAAACTTAAGGA:1 - chrX 983320 3' + Juan 4178 1 63.37 GTTGGAGGTGGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGTTGCATGAAAGGGTTTCGGTTGTAGAAGACTAGAGCTTTTTAAACGAAAATATTAGCTCTA:1 + chr3L 13142079 3' - F-element 403 1 61.39 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTAAAAATAGTTTTTCGATATTTTAGGGGTA:1 + chr2R 16639716 3' + opus 7461 2 72.28 GATCGTGTTCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCGATTTCTAATTTCAACTCTGCG:1 - chr3L 463385 3' + jockey 103 1 76.24 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGCCTGACCCATTCATTACCATAAAAA:1 + chr3R 11941218 3' - Doc 54 1 73.40 ATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCGACGGCAGTGCAGCCGACCGG:1 - chr2R 6482641 3' + gtwin 7387 2 75.00 ACATTATATTCATTTCCTCGCTTCCGTTTCACTGCGTCCTGCACATGTTCACACTGCACTGCCAGGGCCGCCGGCACATCAACACTTGTGCACCCTCTA:1 + chr3L 22934077 3' + Cr1a 4330 1 77.78 AAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGGCCACACTCACACAAGTGCCGCCGTCTAGCACACACACACACGCAC:1 - chr2R 22674710 3' + S-element 156 2 55.00 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCGTATATATCTATGTGTATATATCTCTCTGTAAAT:1 - chrX 13882317 3' - BS 5030 1 66.34 TTTATTTATGCAATGCAACNAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAGAATCAAAGATTTTGCTCTATA:1 + chr3R 5503389 3' - blood 55 2 78.22 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACATATTAAAGTGATTAAGGTTTCGCCGCCTTTTCTTGCATTTGTTTTAGCTCTCTTACTATAA:1 + chr3L 14311514 3' + roo 9057 1 62.38 TCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACAGGACTAAAAGTTTTCCTGTAGAATTCAGTTGAAATTGCCTGGACCCAACTCTCAC:1 + chr2R 17734555 3' + Stalker4 399 1 56.44 AGTTTAATATTCTCCTTTTTGTTCGTTTTTGAAAAAATTACGTTTTTGTAGATGAATACTTGTTTGGGCTGGCATCGCTGCTATCCTGCCCAAGTCTCAGT:1 - chr2R 11174291 3' + transib1 494 1 74.26 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCTGAACGCAGCAAATAATGAAATTATG:1 - chr3R 29413082 3' - hobo 51 1 72.28 GGGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTAATCGATAATTTATTGCTGGACGGGGAACAATGCGAACCAGGCATCGGCAATGGCATCGG:1 - chr2L 5253333 3' + opus 7289 2 66.34 TTTGATTATTGTTTGTGTATTTGCCATTGGACGCATTCACCGAGGTCTGGGAGCGGTAGGAGGCTGCGCCTCCACCGACAGCCATTTC:1 - chr3R 24633624 3' - Porto1 301 1 75.00 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGG:1 + chr2L 19907955 3' - Tirant 20 2 62.16 AAGAACAACAAACAAAACAAAATAATACAAAAACGAGGGAAACTAAAAACAGGCCAATAACAACAACTACGAACGTTGCCCCATCCGTACAATTGGCCATT:1 - chrX 6159787 3' + gypsy9 406 1 55.45 GAGTGCATTACTGATTTCTNTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTGAAAAAATGGTGGAAAAAATGG:1 - chr2L 16566298 3' - 297 44 2 77.23 TTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTATTGAATGTCTTTAAAAACCTTTCACTCACAATCGAATTGTCTGTCATTTCCGCATCGCGATGTTTAGAAGC:1 + chr2R 19472801 3' - F-element 4401 1 70.30 GGGTGCGTTCTCTGCAGGGGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTGGCAACAAATTAACTGCCAACCGCCCACTTACCAAATACACAAACACACAGG:1 + chr3L 3928549 3' - G2 2914 1 51.49 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTGTGAGCGAAAGCTCTGTAAGTGTGGCCTGCTCCTGCGGTTTCCCC:1 + chr2L 4766998 3' - jockey 4682 1 61.39 AATTCATTAGAATAATCAAATAAATATATTGCAGTGTTATGTTCTTATCAAATCTATTAATTTTACTAATGATAAAAAGGATACCCATTATAAAGTCTTGT:1 + chr3R 24442017 3' + jockey 4815 1 79.21 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGCAAGGTGCATAAAAACAACACTTATT:1 + chr2L 8702834 3' - roo 49 2 75.25 CTACAAGGTGCTGTTATACAACACAGTTGTATAAAAAACCATAAAACCAATATGGACATATGGCTGACAACTACAGCAACAATAGAAAAAACGGGGCCAG:1 + chrX 10472937 3' + Doc4-element 2559 1 63.00 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCACACCTTACTTTTTGAACAGCGCTTGTAAGTATGCAGCATCTTT:1 + chr2R 24242956 3' + hobo 2910 1 64.29 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGG:1 - chr3L 27415204 3' + transib2 2818 1 73.27 GCCGACGGGACCACCTTAAGTTATTTCATCATGAGTGCGCCGGTGGAAATAGCGACCGGCGATCGCATGCGACGGAACTGC:1 - chrX 15498946 3' + P-element 2875 1 58.02 TTTTATTTTCCTTTTTTTTTTAAGTTTGCCTTGTAGCTAGTTGAACTTATGTTTTATGAAGTGATATCCTTTTTGGTACTACGACTATTGTTT:1 - chrX 8354046 3' - Doc2-element 251 1 79.57 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTACACGGCGGCTACGCAATATTGCGTATACGAGGCC:1 - chrX 9816241 3' - BS 5003 1 65.35 GATATTTTTTTTTATTTTTNGCCGCATGAAACGGGGTCAAGAGCTTCAACCAGGAGCAACTGGCAGGTTGGGTCCGTCCCAGTTCAACGGTGCAACGGTTT:1 + chr3L 21113006 3' - Transib5 20 1 80.20 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAATAATTGACA:1 - chr2L 3581962 3' + transib2 2798 1 51.49 GTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCT:1 + chr3R 3854443 3' + INE-1 20 1 51.49 CTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAA:1 + chr2L 22224575 3' + Rt1c 5412 1 48.51 GACAGTATCGCAAGACGCTGCGATCAATCGTTAAATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTTACC:1 - chr3R 3590972 3' + Gypsy6A_LTR 381 1 80.20 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAAATATATATACATATATAGGTAGGTAGTCGGTCTCAGCTTGTTTGCCAGGAGACGGCCCTT:1 - chr3R 18850986 3' + invader4 3074 2 58.42 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATTGATTCGAAATTGAATTTCCCATTTTAGAACATTCGAAATTTATGTATATTTTCTTAAGATATATATT:1 - chr3R 17952907 3' - copia 4876 2 69.31 TGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTGGGCAGAATATGCCTTATTTCTGGCCTTACTACCGAGGTTTCAGCATTTAGGCAGAATATA:1 - chr2L 13621935 3' - opus 11 2 66.34 ATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACTATTATTATCAGATATATTGATAATGA:1 - chr2L 16958080 3' - 1731 52 2 79.21 ACAAATAAAACTTGTCATTGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAACCACAGCCCATAGACGGGTCAGCGAAAGAGGCAGAAACAAGCGG:1 - chr3L 21330757 3' + Doc3-element 4458 1 56.44 TAACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTATATAATTTGCATAGCCCATGGGCACTCGCCATGTATAGACCGCAATCCCAGTAGCAGTAGCCTTCCAGTTGA:1 + chr2R 1922514 3' + gypsy 7434 2 64.36 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTGCAGCAGCGGCAGGTTCTCC:1 - chr2L 10924219 3' - hobo 32 1 57.00 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGAAATAAAACACAATACGCAACGAATTAGAAATGTGGTTGCCATCATTATC:1 + chr2R 9369911 3' - pogo 23 1 56.44 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTGGCAACGACAA:1 + chr3L 15745384 3' + hopper2 1549 1 85.15 TCCAACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTTGTGTGTCTAATCCACATGCCATCACAACCCAACTCCTCTGACACAACTCAAACCATTTATTCAACA:1 - chr3L 17929147 3' - invader4 2745 1 54.46 AGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAAATAGTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATATTTG:1 + chr2L 16958115 3' + 1731 4583 2 67.00 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATTTACTAAAATGATAATTTATACAATTCTTGTTTCTAACAAAATTTGCTTTCATTAAATAGATGGTTCGTTCGG:1 - chr3R 12101026 3' + Burdock 6367 2 55.45 AACGCTGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTACTCGTGGTGACGTAGCTTAAGTCCAACGTAAGATTATTGCCACTGACTGCCGAGGGAATCGAGA:1 + chr3R 15509585 3' + Cr1a 4024 1 58.59 TCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGCGTCGAATACAGAACTTCGCAGGCAGGGGGCAGCAGGCAGCAGGATGTGGGATTCG:1 - chr3L 20808966 3' - blood 7297 2 58.42 ATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCGTCGTGCAAAAAAACCTCTCCCGTTGCGTTCTTGCTCCACGTTGATCGTCGTCTTCTGGAATTTTCTCGATCTCGT:1 + chr2R 4023508 3' + Doc2-element 412 1 77.23 GAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTAGTTTCAAATGTAACAGCTATTTTTAAAGG:1 - chr2R 7525812 3' - Doc 4645 1 74.00 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTGTCCTACTATAAGCGTTTTTCTTGGTGCATGCATGTTTGCCAACCG:1 + chr3L 11763257 3' + pogo 2076 1 55.45 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAG:1 + chrX 6106828 3' + HMS-Beagle2 7176 2 60.40 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACCCTTTTCTTTGGTTTCTTTTTATATAAATCAGTACAATTTTTTCTCAGTGCC:1 - chr2L 7161292 3' + pogo 2080 1 58.42 AAATGGAAAAATAATGCTGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTACATTTTATAATTAATTTAAAC:1 - chr2L 12773946 3' - pogo 48 1 77.23 CAATTTTACTTTAAAGCTGATAACTTTTGTTATGATTTTAATTGGTATTTTACTTTATCAGATGTCGAGATGAAAACTTTGATAAGCTTTCTTTCGGTGCA:1 - chr3L 3503275 3' + TART-B 10196 1 77.23 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACA:1 + chrX 19887148 3' + P-element 2870 1 60.22 AAAAATAAAAAGGATATAAAAGGACAACCTTTCTCTACAAGGTTAGTAAAAGGATAACATTTTCTTCTTTTGTGCCCATAGCTAAAATTCAGAATTGATTT:1 + chr3L 11763195 3' + Tc3 1570 1 69.31 AAATCTTGATACACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAAAAAATAAAAAACAAAGGTCTATATAAAAAGGTTTAACAAAATCACAAAG:1 - chr3R 31734883 3' + I-element 86 1 54.46 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTTGACATTGGCATTTCTCTTCCTCT:1 + chrX 7970999 3' + P-element 2835 1 27.72 TTAGTCTCTTAAAACAAAGGGAAGATTCAGCGCTCTAGCTGGTGGACAACTATCTCAGTCTTTATTTTTTTCTTGTCAAGTAGTATTTCAAAGGCGCAGTC:1 - 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chrX 8962888 3' - G2 3060 1 68.32 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAA:1 + chr3L 24766003 3' + 1360 3380 2 76.24 CACTGGACCAAAGACACAAGAACTAAACAATCATTATGACTTTTGCAATAAACAATTTTATTAGAAATTTCTGTGCTGGCAGAGGTTCGTCTGAAAATATA:1 - chr3R 22232243 3' - hobo 343 1 71.29 CGATGCAGCTAACTATCGTTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGCTAACTAGGCATATATTTCACTGGTGAAATTTATTTTAATTAAAATTAAAT:1 + chrX 19199024 3' - pogo 20 1 49.50 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCAT:2 + chr3L 25059134 3' + mdg1 379 2 67.33 TTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTG:1 - chr3L 10811581 3' + Juan 4165 1 84.16 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATGATTCTCTCCCTAAGGAAGTTGGGCCCATTCCATTGACAGTAAGCCAAAACGA:2 - chr3L 1930430 3' + roo 9047 1 49.50 ACTAATCATGTGAGGACTTACATGTGTGTATGTGTGCCTGCGTTTGGGCGACTCTATGTTTGTGTGTGTGTGTAGCCCCAAAAGCGGGCTACATA:1 - chr3R 17362861 3' - BS 4993 1 76.84 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGT:1 - chr2L 17168449 3' + flea 4970 2 74.26 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTTAATGATGCCGCCCCAGCCGGCAAAACGGAAAATGGGGAAAACCCAG:2 + chr3L 3475656 3' + mdg1 393 2 51.49 GTCTGTCGTTCGCTGAGGGNAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCCAGACTGAAGTATCATGTGTTTACAAAAAGCAC:1 + chr3R 5121929 3' - Doc 357 1 66.34 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAG:1 + chrX 19887119 3' + P-element 2833 1 26.73 TTATGCCTTCCTCATAATTCACTTATACAAAAGAACGACCGCGGTGGTCCGCCGTATTAAATGCAGTGGCAAGAAATTTACTATCATGAATCTGTATTTTT:1 - chr3L 6471087 3' + Tom1 11 1 59.41 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTACATGCAATAAATCGAATTTAAACATCATAACATC:1 - chr3R 14228023 3' - Transpac 4955 2 65.35 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATCCCCAATCAATACAATGTAACTACCAATTTTGAACCCA:1 - chr3L 6982507 3' - 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chr3L 6013604 3' + Idefix 7208 2 68.32 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGATACCTATTGAAACCTGGCCAAAACCCACGAAATG:1 + chr3R 7582688 3' + 297 6955 2 59.76 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGTCTACTATGGATAACTTTTTCTATAAGGTGCAGCGGAA:1 + chr2L 20495125 3' - Tabor 6878 2 61.39 AAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAGGAAAAAGAAATAACGGAAAACAGTACTGCTAAACTAATA:1 + chr3L 2492394 3' + invader2 426 1 60.40 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAAGTGTGAGTGTGTATTTTTGTGGGAATAACACGCGCCCTGTTGC:1 + chr2L 6647643 3' + 1360 3358 1 58.42 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACAATGTAGTTTAAATATGTCTAATATCTTACAGGCCGTAAAATGAAAAGTTCA:1 + chr3L 20032320 3' + Tabor 7296 2 51.49 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTGTTGTGGATCTATGGCCAAAAACG:1 - chr2L 7714533 3' + roo 360 2 78.57 CTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATAGCAGCGCACATTCACACAAACACACAC:1 + chr2R 22269230 3' - jockey 4667 1 77.23 CGGAGACTATGTGGAACCANAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGCAGGCGGCCCTGAGAACGCGGCCTGCAGGCACTTCACAT:1 - chr2R 5813578 3' - HMS-Beagle 6829 2 57.43 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGATAAAATATACTGGA:1 + chr2L 12485477 3' + roo 9052 2 58.00 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAACTAAATCGAGAGGGGAATTTAATTAAACGCATCACAATGATGTAGATGTGGTTCAG:1 + chr2R 24435598 3' + Juan 4189 1 60.40 TCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGT:1 + chr3R 1844856 3' - Cr1a 120 1 65.35 ATTAATTTTATTTTATTTTTTATAATTTTTTTTTTAAAAGCTTTAAGTTTAAGTAAATCTAGCAAGTTCCCAAACTTGCGGTCCACAATGGTAGCCCGGAA:1 + chr3R 27005848 3' - NOF 3957 1 78.22 TGCAGTTCCTAGCTTTCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGCTGGGGATGAAGATTAATTAGATGAATAGATTTGTAAGCAAATTAATGCCTACTTTTGGG:1 + chr3L 4901107 3' - jockey 4687 1 62.38 AGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCG:1 + chr2R 5532340 3' - G4 3761 1 45.54 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCACATGCCAACGAGATGGAGAGTTGGAGGAATACTTAGAGCTAGAGC:1 - chr3L 6619764 3' + 412 7519 2 51.49 TAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAGCCGTCGACTCGGTGACACCAACGAATCGCGCTGTGGTCATACC:1 - chrX 8526202 3' + F-element 182 1 56.44 AGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGCCCCACTGCAGTGGGGCAACAGCAGCAGCAGCA:1 - chr2L 12536977 3' - hopper 1162 1 67.33 CTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGAGCAAACAAAAAGTGAACTGTGAAACGTGGACCGGAATCGAAGTCCATCCGTCTGGGAGCT:1 + chr2R 8794913 3' - Transpac 5120 2 66.34 TCCTTCAGCTGTCTTCTGTGGAGCCTTCTTCGTGGGCGAGGTCCAAACTGACTTAACTATACTCAAGGGTATTCGCATGACCACCCACTGCCATCAAAACT:1 - chr3L 23815149 3' - BS3 1560 1 56.44 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGCAAATCAAGAGGCGAACGTACAAACGAAGAAGAGAACGAGCG:1 + chr2L 16690490 3' - P-element 32 1 44.55 GTGGCATATATTGGTTTATTACAATCCACTGTAACTGGTGCATTGCAGCACTCCGCACACCCACACCTTCTATGGGCGCCTGTCTATCGA:1 + chr3R 30284301 3' + blood 376 2 70.00 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCC:1 - 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297 6617 2 67.33 CCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATATGCATAAATG:1 + chr3R 13533138 3' + Stalker 6997 4 79.21 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGACCATATAGAAAAAAGAGCAGAGAGGATAAGAAGAAGAATCAACG:1 + chr3R 2161339 3' + 412 463 2 53.47 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAAT:1 + chr2R 5651917 3' - Tirant 11 2 68.75 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGACAAACACGCAGACATTAGACC:1 - chr2R 15160297 3' - Tirant 31 2 54.46 TTCAGATGAAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGTACATCTGTGAAAAAAAAAAAGGGGAAGGGAACGCCGATTACAGATAGAACCATAA:1 - chrX 5068845 3' + Doc2-element 4526 1 60.40 GAGTTCCCCGACTAACAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACA:1 + chr3L 23871826 3' - INE-1 558 1 66.34 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCTAGGTGATTGCAGGCAGCCGCAAAGTAGGCAACAAAATGTTAATTTCATTCGC:1 + chrX 15183820 3' - hobo 22 1 53.47 AGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTC:1 + chr2L 22225077 3' + G5 4785 1 78.22 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTA:1 - chr3R 17897145 3' - hopper 49 1 72.28 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACATTTAATTCCCTACTGTCTAAAAATCGTACGCAAATTGCACAT:1 - chrX 9440263 3' + roo 9040 1 59.41 AGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGAGAATGGTCCGCAAGAGAGAGAGTCGTGCGCAGGGAGCGCCAAAATACTGTAGCCTAACCCAAGG:1 + chr3R 24092810 3' + BS 4984 1 71.29 CTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCGACAACTGGGGCACACAATGTTGCCACGAATGCCCCGAGTACACCAGCGGGAGTCATTTCCATTTGTC:1 + chr2R 8528295 3' + Transpac 310 1 76.77 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCTGATAAAAGCGCGATTGACTCAGTTGATTTGATTGCTT:1 - chr2R 13585664 3' - blood 7051 2 66.34 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGTACAGTAACAACTAAAGCTTTTAACGGATATTT:1 + chr3R 15523356 3' + 412 450 2 68.32 TTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAAGGGTTTCTTTCAAATCAACGGGTATCATAAAAATAAATAAAATACAAATGTGCGACGC:1 - chr3R 31687666 3' + I-element 307 1 64.36 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGCTTGCATGGCGGCTAAAATTGTTTCGAGTGCCTGAAAGTATGCAAGCCATTTGAAAGTCA:1 + chr3R 20154818 3' - jockey 22 1 63.37 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTG:1 + chr2R 5531195 3' - 1360 65 1 62.00 CCGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTCAGAATAAACGGGGAAGTGGTTCCAGTGGTGGATTACATTCG:1 + chr2L 20619587 3' - gypsy6 324 2 54.43 CGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCTTTCTCTCTCCCCCTCTTGCTTACTCCACCTTACTCCCCTCTCTGTTGCACACTCCTTATTTGCC:1 + chr3L 7225789 3' + Doc3-element 413 1 71.29 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGGGGAACTCGGACTTAATGCGCTAAACGGCCCAAGTAAATGACCAATAATCA:1 + chr2L 3582046 3' - transib2 23 1 56.44 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTTCTTATGGAA:1 - chr3L 22327287 3' + hopper 1382 1 61.39 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCCGCGGAGGAGGACTATCTGGTGCACGCATCATTTGCTCGGCATACGTACGTGAGT:1 - chr2R 8528180 3' - Transpac 4936 2 62.38 TCTCCCCGTTCCAAACGGTGTCAAGCTCTTCAGCTACCAGCACAGCAATCACGATATCGACTGCAACTACACATTTATTACAAAAAGCGAAACAAGCGAGC:1 - chr2L 10884489 3' + Doc3-element 453 1 74.26 TTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCAAAATACCATGCAACGGGCTGAGAAGGACACGGAGCGTGAAACCTCGAGGGCTGCCCACAATGGAGAGCGGGAAACG:1 - chr3R 20771011 3' + transib2 2693 1 62.38 TGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCGAGTTGGAAAACTGAGCGCATTAGATGATACGAAATGTATGAGAATGCTTAAGTTGCAATAATATCAATAATCCGA:1 - chrX 5596395 3' + GATE 8216 1 73.27 GTCATCATTGTTGGTTTAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTCGACGATTGCTCGCTTTTCGGGGTTGTTTT:1 + chr2R 22700530 3' - I-element 170 1 70.30 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATTTTACAAAATACTTAAGACGCAGCTGGGGAGAAAGGGAAGTGGGAGGATTCTGTG:1 + chr2R 20441306 3' - I-element 20 1 57.00 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCATGGGAAAACC:1 + chr2R 11699326 3' + roo 9037 1 61.39 CGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCCTGTGTGAATGCGAATGCGACATTTCATAATTTTTGTGAGATATTTATAGATTTTGGGGAATAAAATGAGAAACA:1 + chr4 809181 3' - INE-1 550 1 75.25 ACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGA:1 - chr3R 1440180 3' - G-element 53 1 72.28 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGG:1 + chr2R 5237895 3' - Doc 38 1 48.51 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCT:1 - chr2R 9871072 3' - roo 8713 2 92.08 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAAT:1 - chr2R 9061941 3' - jockey 4718 1 76.24 TCGGACCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATTGTCCATGTAATGTCTGAATGGATTAGGTACTCATTCCTTAAAATCTAGTTTTTGCAATA:1 + chr4 956516 3' - 1360 3179 1 60.40 TAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAAAATATTCAATAATATATTAAAGATATAGCCAGCAACCCG:1 + chr2R 15798215 3' + Doc 485 1 61.39 TATGTTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTATGTTAGAAATTGTTTATGGCAAGTACAATTTTTGAATATTTTTATAGAGTTAAGATACTTTTC:1 - chr3R 6268884 3' - TART-B 10309 1 63.37 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAAC:1 - chrX 8308738 3' + opus 454 2 73.27 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAAATTATATTAAAATAAAAATGTATAAAACTTTTCGTATTTCGAATATGA:1 - chr2R 20145072 3' - opus 147 4 62.38 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTACTTTCCTAATTAAAGTCCAGGGCACCTCGGTTGAGCAGCCAGGGCAGGATAGCC:2 + chr3R 25323332 3' + Juan 4195 1 57.43 GTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTCCCGTTTGTTTTCACTGCCGCTTAATGTGTTTATATAATTTACAAGTATT:1 + chr3R 7570762 3' - TAHRE 10415 1 53.47 CTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACTAAACGATAGATAAATACTCTGCTGCGGCTCAACTTTGCTGTTGGAGTTGTTCGAGTTGTTGT:1 - chr3L 18012982 3' - F-element 480 1 68.32 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGT:1 - chr2R 5214980 3' - F-element 52 1 66.34 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGTCTAC:1 - chrX 9816274 3' - BS 5036 1 73.27 ATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTAGAGGATGGCATCCGTTTTTAGT:1 - chrX 18051476 3' - 412 7383 2 78.22 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGATA:1 - chr3R 29374927 3' - mdg3 5263 1 69.31 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAATGC:1 - chr3R 11118048 3' - BS 37 1 68.75 TTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATAGCTGGCTTAAGCCAACGTGCCCAGTGGCTGCCATAATGGCTCAATTTGGGACTTTATCGATGGCACAG:1 + chr3L 22655950 3' - F-element 4414 1 77.23 CTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATAAATGAAAGAGAGGGCACGACATTAGGGACTGAAAGAGATGG:1 + chrX 4352211 3' - blood 233 2 64.36 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATGTGAATGGGAAATCTT:1 - chrX 8308703 3' + opus 489 2 70.30 AGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCAGTGTCTCTGCCTCTCTCTCTCTATATAGTATATATAGATCGTAG:1 + chr2R 14281642 3' + blood 120 2 74.26 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAGTA:1 + chrX 11454362 3' - P-element 54 1 25.74 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACCTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTAATCATTAATAATTTATGGCCAATAG:1 + chr3R 24464842 3' + 412 7498 2 76.24 TTGTACGTTTTTTGCTGTGNGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATTAAAAGTTATATTAGAAAACAACATGTTTTAGTAAACACCGGCTAGAAA:1 - chr3R 25070102 3' + copia 136 2 53.47 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCACTGCACGCAACAATCACTCGTCGATCGCTC:1 + chrX 15499003 3' - P-element 44 1 35.64 AGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCCATGCAACAATAACAAATAAGCGGCGCGGGTATAAAGAACTCCACGAAACTCAACCGGCGGCAA:1 - chr2R 19801240 3' - R1A1-element 210 1 68.32 AAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCGATCTTCCGTGTTAAAGATAAGGTTATTGCCACCTTTATAGTTTTTTTCCACAAGTTTTCT:1 - chr2L 21372517 3' - accord2 7305 1 63.37 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCGCGTCCAGCATGTCGATGGAACCGTTGCCGTTGGTTGTGTGC:1 - chr3R 2629064 3' + 1360 3355 1 61.39 TATACATATATATATTTATGTTTGGTCAATTAAATAAGAGTGGTAGGGAATTAAATGTAATTCCGAATTTTTGTGTCTTTCCCAGGTTTGTAAAACTGAAA:1 + chrX 14116413 3' - 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hopper 49 1 73.27 TTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACATTAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTTTTTTGAGAAATTTCATTTTT:1 - chr3R 26997619 3' - hopper 219 1 66.34 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAGTTCTTTAAGTATAAGATGAGCAGAGTTTTTCTCAATGTAGAAATATTAATTAAAAATTTAGATGA:1 + chr3R 28771440 3' - jockey 4771 1 59.41 ACAGAAGAACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATATACAATTCATTTGGCACAGGG:1 - chr3R 21022352 3' + springer 7466 2 81.19 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATACGTTACATGTGAATATTGTTTTCACTTGT:1 - chrX 9816278 3' - BS 5040 1 77.23 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTATGACTTAGAAAAGAAAATTATATTAAAATC:1 - chr2R 25246076 3' - 3S18 47 2 67.33 GGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGTTACGTTATATACTTATTTATAAGTTTATTTGATTTTAAATTGAGACCAAAAGATGAGGATGTTATATTA:1 + chr2R 9507325 3' + Bica 27 1 76.24 ATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGTAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGAACCGCAGCTGCCAGGAACTAGCCAGGGAGCACAGTCGTATAGCC:1 + chr2L 15116951 3' + R1A1-element 370 1 53.47 TAGTTATCCATTAATCCCAACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAG:1 + chr2R 5532342 3' - G4 3759 1 47.52 AAATAATAAAATAAAAAAAATAAAATAAAATTTTCCAAGACCCTTTCGATCCCAATTTGACCCCAGGTGAACTTACGATTGCAGGGTCGAGAGATTTGTGG:1 - chrX 16812037 3' + Rt1b 5148 2 65.35 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGAACAAAATAAGCTTAGTTTAATGGCACCAGAAAATCTATTAACCAATTTC:1 - chr2L 12764984 3' - Doc 50 1 53.47 TTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAGAAACACATACACACACACACACACATATACACACCGACAGTCGAGGGACCACCGAAAGCAAT:1 + chr3R 17362955 3' + BS 5078 1 54.46 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCCGCCATCCACGTCCCTCGCAAAT:1 - chr2R 13956860 3' - P-element 52 1 25.74 CAAAAACTAATAATTAATTAACACAGAACTAAAAACACTCAATTCTAAATGAAACATTACACATCGTTTATTGTTTGGGATACGCATACACTAAATGAGAT:1 - chr2R 11360491 3' + Transib5 308 1 92.08 GCTGAAAATTTTCAAAAAAAAAGATAAACAATTTCGAGTAGGAGGGAGTGCAATATAACACGCCTATTAATAGACAATCGAGAATATTTGGCATGGTAATT:1 + chr3L 7611916 3' + TART-A 13399 1 80.20 AACTAAAAAAAATTAAAAAAAAAATACTTTCACTCTCGCCACAACGTGGCGGCATCGAGAGG:1 - chr3L 13902016 3' + Doc 4690 1 91.94 AATACATTGTTAGTTGTTANCTTGCATGCTACAAAAGACATGCCCAGAAAAACCTACCCCCAGCCAGCCGGATTACGCGAAAGTCGCCAAACCTGACAGCA:1 - chr2R 1922396 3' - gypsy 6988 2 78.22 TGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCCAAAAATTAAGATTGCGATAGGTTAAATGCTTTGAA:1 - chr2R 2262468 3' - 297 6939 2 64.36 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATTTCTGAATAAATGTTTAGCAACCTAAA:1 + chr3L 7260526 3' - Burdock 42 2 71.29 GTTCACGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCCTGAAGAAATAAGCCAAAACACCTAAATGAAGGGGGAAAAAA:1 - chr3L 25354618 3' - baggins 5310 1 56.44 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGATACAGATAC:1 - chr2R 11664285 3' - Tirant 8 2 73.27 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGAGTCTTGTTTTATGGCGG:1 - chr3R 13441895 3' - 1360 37 1 79.01 GTCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATTCGGG:1 + chr3R 10741150 3' - 1360 3357 1 42.57 ACTGCTCTCGTGCGGTTCCTTTAACAGCTCGCTTGAATGTTTACAATTTGAGCTACGTAAATGGACACATAAAATGTGAGGCCAGAAGATGATGGGCAAGA:1 + chr2L 15390263 3' + Cr1a 350 1 66.34 TAATTAAAAAATTTAGGATCAAACTTCGATTTAGTGTTTATATGTTATATGTTATGGATTTCATTGATGAGTTTCTTTAAGGCAGTCTGGTCTTTACTTAA:1 + chr2R 16300512 3' + S-element 1464 1 69.31 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGGATTACTTCGCTTGCGGCCTGCCATTCAATTAAGTCATCATCGCCATGCATTTTGACAGC:1 + chr3R 11846739 3' - roo 15 2 64.36 TTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGGGCGAAAGTGGCCGCAAGTTCGTCA:1 + chr2L 7144563 3' - I-element 5110 1 74.23 CTACGTTATGTGGTTTTGTNTGTGAATATGTCACTATATATATTAGCGCACGGAAGCACACATCAATCAAAATCGAACGGATATAATCAATCCTATTGAAG:1 - chr2R 19352181 3' - 17.6 6941 1 64.36 TATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCAACACTTCTCCGCTGCGCCGCTGCGATGCTGCCGTCGAACTGAAACACTACAACCTGG:1 - chr2L 9792338 3' + HMS-Beagle 6855 2 71.43 TGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATTAGCGCACGGAAGCACACATCAATC:1 - chr2R 19352214 3' - 17.6 47 1 75.25 AACAATAATGTACACACTTTTATTTAAAAAAAAATTAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGATACGTACTCGGTGGACGTGGTGA:1 + chr2L 2760039 3' + transib2 2616 1 73.27 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGG:1 + chrX 19887151 3' + P-element 2865 1 58.42 ACGTGTTCTCCATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTTATTTCTATTTGAACATATATGCAGAATTGCGCACCCGCCTGAGAGGAAAATTAAAGCCA:1 + chr2L 2622788 3' + blood 361 2 62.38 AGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCTACTGTAGTCTTCCACAAACCCATTTTTCTAGTTTTTCCAACTTTTCATTGGCTAA:1 + chr2R 9026997 3' + F-element 4346 1 59.41 GTCAGCTCAAAAAATATACAAAATTAATCAAACCGACTGAGGTGTGGTAACTGTGAAGAGTTTTAAGTCTGCATCGACATCAAATTAAATACCTCAGTTTT:1 - chr3R 17935889 3' + transib4 2531 1 54.46 TCTCCGCCACACTTGTGTTAACCGCCAGCTGCAGCTCCGGCCAGTGCTCGTCCTGGCTTTTGTGACGTTTCTGGTTGTTGCTTATCCTGCCGCCATTATCC:1 - chrX 14318775 3' - Osvaldo 1054 1 53.47 CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATGACAAAACATTTAATTAAATTCGTTATAACATTTTTATTAGTTCTTGTATGCAAA:1 + chrX 23537702 3' - HMS-Beagle 6813 2 62.38 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCTCATTGATTGC:1 + chr2R 5651931 3' - Tirant 8109 2 79.21 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAGCC:1 + chr3L 27357643 3' - mdg1 7048 2 69.31 GCCGATGCAGCTAACTATCNATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTATTCTCACTTTGCTCGTTTAAATGGGGCTCAACTTGAATCAAATATTGCTA:1 + chr2L 22241806 3' - pogo 22 1 57.43 TAAATGCAGTATTATGCATGGGGAATATACTAGACGAGATGCAACTCTTTATCAGCTGCACCCGGAAAGTTACTTTTGACGGCAAGGAGGGCTGCTCTG:1 + chr3R 16845677 3' + Gypsy12A_LTR 97 1 69.70 TTTAACAAAAAAGAAAAAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAGAAAACACAATATTGAGGTAGGTCGTAATTTGGGCATGTTAACCATAAACCAA:1 + chr2L 18418080 3' + TART-C 11100 1 54.46 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGTTTGCCATGGTCTAAACTCAAACCCACCACTGACCCAAACCCTTTCCTTTAACGCCGCCGACTCGTTTGCTGT:1 + chr3R 22202990 3' + hopper 1414 2 74.26 CACAACCGATCTCTATGAANGCAGATTTGCGACTCCCCCATTCGCCTAACCCTTTTCCCTTTTTTCCCTTCCTGTGGCAACACCGCACAATGCCTGTCAAA:1 + chr3L 9220198 3' - BS 7 1 63.37 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAG:1 + chr2R 5531197 3' - 1360 64 1 63.37 GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACTGCTGTCAGAATTAACCGTTGACCTGTGCCAAGATATGTATG:1 + chr2L 6170163 3' + invader3 5430 2 58.42 AAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCACTTGGTACCGTTCTTCTCCCTCAGAACACTCGTAGCATTGTTGTAGATGCAGCTCACCCTGGAGGCA:1 - chr3L 15340266 3' + 1360 2 2 68.32 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATATTTTATTTACACATATGT:1 + chr2R 9871601 3' + roo 406 1 76.24 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCCATATACAGGGCAATAAATCCATACAGGTAGGTGTATCTATG:1 + chrX 19607305 3' - Tirant 8134 2 53.68 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGATATTGGGAGAGAGACGATGGTTTGGCACTTCCGCCCCCC:1 + chr3L 7099855 3' - 297 6604 2 57.29 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCAGTTGTCATAAATTCACAATAACT:1 - chr2R 9061905 3' - jockey 4682 1 62.38 GCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGATG:1 + chr2R 3760473 3' - accord 36 2 58.42 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAACTGAAGGCAAAAGGTCAAGTTTCGGAGATTTTCATTAT:1 + chr2L 20992979 3' - I-element 17 1 60.40 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAAGATTACTTTTTTGCCCGCTGCAGCAGCGGCAGGTTCTCCTTTCAATTCT:1 - chr2L 10924209 3' - hobo 23 1 54.46 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACCTGGAATGGTAGGACTCCAGTTCGTCACATAA:1 + chr3L 6399549 3' + roo 9025 2 69.31 TCTGCATACATATGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCATCCACATTCACCCACCGGAGTGATTTGTGTTGCACGTGGGTGG:1 + chr2R 12694521 3' + Stalker2 7495 6 57.43 TCCCGTCAGTTGACTGAGGACAACACTAAGAAAAAAGTTTATGTAAAAAGGTTTTAAAGCTCTAAAGTTGATTGAATTATTAGTAGAATCGATTAAAATCC:1 + chrX 22577455 3' - 297 6937 2 64.36 ATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGTCCAACTTGTAATGCAGAGCGCTACTCCATCGATGGGAAAAAGTGCAGAAGAAGAGCTGGAAGTGGC:1 + chr2L 17318065 3' + invader1 3621 2 68.32 CGTTACGCATCTTGTTATTNTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCC:1 + chrY 311345 3' + 1360 3379 2 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCATTGTTTTTAAGCAAATTGGC:1 + chr2R 16453552 3' + roo 355 2 79.21 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTACAGTTTTGGTAGTTTGATTGCTTGAATTTGAAGTTGAAT:1 - chr2L 9867881 3' - jockey 4795 1 58.42 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTCGCAGCTGCTATTACCATATCACACAG:1 + chr3R 9116526 3' - jockey 26 1 56.25 AGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAATATCGTCGTATC:1 - chr3R 1440145 3' - G-element 18 1 62.38 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAAC:1 - chr2R 15160277 3' - Tirant 9 2 70.71 GTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCAACCAACAACCAACTCAGTCCAAACTCCCCAGTCGAAAAGCCAAGA:1 + chrX 16693076 3' + Doc 484 1 64.36 AAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGACGCAATAAGTCTACAATGACAGAAGGGCGTAATTACTGTCTAGTTATTAACGGACTTAATAAATTTATTAGCAGT:1 + chr3L 21443780 3' + Tc1 420 1 76.24 TCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGT:1 + chr2R 14849016 3' - flea 4715 1 56.44 CTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGC:1 + chr3R 11547774 3' - G2 297 1 55.45 AAAAAAAAAAATAAAAACTTTTCCATTTTCCCGCCCCCCTTTT:1 - chr3L 9545488 3' + HMS-Beagle2 492 1 86.05 GATTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAGTAATAGTAAAAATAAACTAATCAATAATCAATAATCAATCAATAATAAAACTAATCAAAATGTTTATAAAGA:1 - chr3L 15172631 3' - INE-1 558 1 32.67 CAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCTCGGTGACTTCAAGG:1 - chr3R 31595181 3' - Quasimodo 7290 2 60.00 ATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGCCCTCGTCATTCGATTGACATGATTTGCATTTGAAAATCTTGTGGAAATTAAAAAGGGAAAAC:1 + chrX 4235483 3' + Quasimodo 7274 2 66.34 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGG:1 - chr3R 29374930 3' - mdg3 5259 1 71.28 CACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCACCCCAAACGGTTAACAAAGCAAAACATAAGCAAAATTCCTTTCGAATTTGTAATACCCTGAG:1 + chr3R 11861558 3' + F-element 483 1 61.39 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGCCCCATTCGGTTCCTTATGGCCAGTGGGCGTTT:1 - chr2R 18204450 3' + roo 9029 1 66.34 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGAAATAAAACACAATACGCAACGAATTAGAAATGTGGTTGCCATCATTATCGATTGG:1 + chr2R 9369917 3' - pogo 17 1 62.38 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCTTTATCAGTTTTGAGTGCTAGAA:1 + chrX 19167951 3' - roo 52 2 78.22 TACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTAACCGTGCAAAATCGTTTCTCGATGCACCTTCGCGTTATGAA:1 + chr2L 2967004 3' + 1360 3156 1 58.23 CACTCACTAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTGTTGCCCCGTTTAAGGACACTCACATTCTGGCCATTTTGTAGCTAAAATGTATCAAATA:1 + chr2R 19600429 3' + accord2 7336 1 60.40 GTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTAGTCAAAGAGTCGAAAGGCATCCTCATATATATCGTACAACTTGCGTATGGCA:1 - chr2L 16885935 3' - accord 7142 2 56.44 TATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATCAAGACAACTGCTTTCAAATTTAAGCTTTAT:1 + chr2L 22108251 3' + Bari1 1663 1 66.34 GTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGCGTGGGCGCTTTTCCAACTGCCGG:1 - chr2L 18207989 3' - G2 3056 1 76.24 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTAGCTTGCCTAGATAGAGTGGCATCGCCATTGTCCATTTCA:1 + chr2R 8254848 3' - roo 23 2 56.32 AGCCCGACGGCTGCCTTCANCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACCACTATTTCGTTATCTGCACGTCGAAAATCAATGGAGA:1 - 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P-element 17 1 62.38 ACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTGCATGAATTCATCCACAGCTGGTTCACTGATCTC:1 - chr3L 7321031 3' + Stalker4 329 4 66.34 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGAAACGCTCTCGTGTGAATACAAATAGCAGAAAGTA:1 + chr3R 4555439 3' + roo 9032 1 67.33 CGTTGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACGCGACGCGAAGTGGCTGGACGAGCAGCGGGACGGGGAGAGGAAGGAAAAGGGG:1 + chr3R 8187672 3' - G6 120 1 61.11 TGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTT:1 + chr3L 11826437 3' + INE-1 140 1 66.67 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTGTTATTTTTGGGGGTTTCAGTTTTGGTTGGCAACCATTTG:1 - chr3L 10811542 3' + Juan 4204 1 62.38 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTTTAAGTATTCTAAACATTAAAT:1 + chr2L 4020749 3' + 412 442 2 74.26 CATTTTGTCAAGAAAGTGTTTACACAAAACATTATAGACGGGATACAGAAAACATTTCTACTAATTCTAAAGAAAATTAAGAAAAATGTTAATAAGACATA:1 - chr3L 26505266 3' + S-element 1 2 65.35 TTTTTCTTGAATATCGATAGATATTGGTTAATAAAATGAGAAAAAAAGTTAAAAACTTAATAAAATTTGGACCGCTAATAATCATATTTTGCAGTTTT:1 - chr2L 20637052 3' - INE-1 500 1 56.12 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGTCTACTATGGATAACTTTTTCTATAAG:1 + chr2L 20495114 3' - Tabor 6889 2 72.28 AAAATTTGTATGAAAATTCATTCTGTTGTGCCCTCTGACTTTTGGTCCCCCTCCGATTTCATTCGAGCCCGAATTTGGTGTATCCCTTTGTTTTTTGCACG:1 - chrX 8673086 3' + pogo 84 1 72.28 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGAC:1 - chr2R 15160298 3' - Tirant 32 2 53.47 GACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATATTTCATTTTAGGCAGTTAGTTTTCCGGCGCAGGAAAATGCTGGTGGAAAA:1 - chr2R 24210687 3' + 412 458 2 56.44 CTGGTAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGGACCATGTAGCCACCTATTACCTATCCGACGAGCACACGGACGAGCTCTACTCCAAGATGCACAATCTCTGCGGC:1 - chr3L 21138425 3' - jockey 162 1 78.22 GATCTGTGCCACACCCAGCATTTTCTGAGGATCAGTGCTCGAGAAGGATGCGCACTTATCCTTGAGCCGCACAGTACTGCATTCCGGTTTAATTGCATTCA:1 + chr2R 23303435 3' + micropia 487 1 75.25 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTAACTCTGTTACT:1 - chr2L 11832522 3' + roo 385 2 57.43 CAGGCAGTAGTAAAGATGTAATCTCTGGCCATTTTGGATTACACTTGAACTAAATGGCATATTATAGCCTCTTGAGCTTTGAACGTTTTCAGAGTTCGAGT:1 - chrX 23183453 3' - Helitron 211 1 63.37 TAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAACATCCATCCCCATCCGCATCAATCCACCAGCCTCCATTGCTCCTCCTTTTGCTTTTAACCAATTCCCCCGTTGGCC:1 + chr3L 7216201 3' - Doc 120 1 51.49 TAAGCTTCGGCTTACGACGNGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGAAGTAAGCCGCTAAATAAGTATTACCATATACTAAAATTCTCTGAAGCGCA:1 + chrX 11454392 3' - P-element 24 1 55.45 TTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATGGAAAGAAGAACTGAATCTCACCTTGAGGCGGGCCAAC:1 + chr2R 11525122 3' - I-element 4890 1 59.57 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAAGATAATGTAGAGTCAGATTTCCCAATGGTAAAAAATATGAATCTGTTG:1 + chr3R 3258948 3' + mdg1 395 2 53.47 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCATACTGATAACTGAGCAAAAGCACGTCTAACTA:1 + chr2L 9724256 3' - 1360 44 1 67.33 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCAAAGCCGTTTCAGCTGTTTG:1 + chr3R 26498575 3' - roo 8710 2 71.29 CTACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGGCTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGCGTGGCCGAGGACTGACTGCTACT:1 - chr3R 24232120 3' + R1A1-element 4943 1 64.10 ATAAAAATATCTAAATATATATATATAGATATTAGGCTCCTCCATGTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTATACTCTGTACTCCTCTGTATTTTTCCGCTGC:1 - chrX 2529235 3' + G3 4501 1 57.00 CTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCATATCCACTAACCACTCGCTTGCCTTCTTTCTTGCTGAAAAGCTTTCTCAAAA:1 - chr3R 12859581 3' - R1A1-element 377 1 55.45 AATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTGAGTTGCTGGGGAGTGATAAAAAAGGGAAGGGGGGCG:1 - chr2L 4887862 3' - 1360 3255 1 61.05 TAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCGTCGTTCCCACGTTCAAAGCTCTCTTGCAAAGGCGACACCAAGCACTAACAGAC:1 - chr3R 11438866 3' + Idefix 185 1 68.32 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCGGGTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTTGGTGAG:2 - chrX 7290561 3' - hopper 35 1 60.40 CACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCAAAACACTCACACCCATTGACCTAGAACACTTATTA:1 + chr2R 11444044 3' + accord 7038 2 64.36 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATCTACCGTACCGAATTTTTTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGT:1 + chr2R 6433227 3' - Doc 34 1 62.00 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTT:1 + chr3R 24228946 3' - 297 38 2 65.35 ATTAAAAGTGAAATCGTTTTATGAAAATATATTGTATTCAAAATTAAACCTATAACTTTCGTTTCAGTACGGAAAAATAAGACTTTTATAACACATATCAG:1 + chr2L 3142872 3' + gypsy9 421 1 25.74 TAATAATAATATAATAATATAATAATAATTAGGCAAATAATAAATACAAATATCATACTATTAGAATGGTTTAAGTGTGGACAGTAATTAAGCAAATAATA:1 + chrX 5323171 3' + invader3 5050 6 60.40 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCACATGCCAACGAGATGGAGAGTTGGAGGAATAC:1 - chr3L 6619777 3' + 412 453 2 64.36 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAATGAACACAAATTTTTTTAACAAAT:1 + chr3L 5171870 3' - F-element 65 1 80.20 GACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAAAAATGCCTCGCACTTTTGAGGGGCACCCTCAGCGCTTGTAAACGAAATCTTTGCCACG:1 - chr3L 19272511 3' + Doc 241 1 60.40 AAAATTACTAGAGTGCATTNCTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAAA:1 - chrX 1157626 3' - 297 6635 2 82.18 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAAATTAAATAGTGTTTGGGGTGGTCCTGTTATTTTTGGGGGTTTCAGTTTTGGTTGGCAACCATTT:1 - chr3L 10811543 3' + Juan 4203 1 61.39 CTACAGCTCCGCTCGGCTCGGTGTAATAAAGCATTAAAAGAAACTCCACAAAACGCATCATTGGCGTGGAATTGCTTTGACTAATTTCCCAATGAATCGGC:1 + chr2R 7624770 3' + gypsy2 6711 2 65.35 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTGCTTGCTTAAAGTTTTGCATTGAACGCGTGCAAGCAATTTACAA:1 - chr3L 15777009 3' - I-element 36 1 55.45 AAAGAAACTAGTGAAAACAATAAACTAATTTCGATGCACCGAGCACAAGATCATAATCCTGGTGCAACTTCCTCCTTCCCGTTCCCCTCTCGCTTACCATG:1 - chr3R 22122817 3' + Porto1 175 1 78.22 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCTCATAAAAGGTTAGTTTAAACAAATAAACACGTGGAATTTAATGAAGAAACGTGTGTGGCTCCATGAATT:1 + chr2L 16456709 3' - hopper 3 2 76.24 AAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATGAGACGACACAATTTCCAAGTACCAGGCCCGCCAGCCGGTTTCGATTCACTTGCAGATACAG:1 - chr2R 11664289 3' - Tirant 8119 2 69.31 TTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATAATTGGGCCGAAATCATCACTCATTCTTAAAGTTTCCTC:1 + chr3L 18401875 3' + Doc 117 1 61.39 AAGAGACACGTGAAATTGTNTTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAGGGAACCTCCAGGGCAGCCAAGGTCAATTTGACGGCACGAACTGG:1 - chr2R 18406994 3' + mdg3 5467 2 54.00 AGCTTATTGCCGTTACATTAATCTTTATCATCTTATCTTCTTGACCTTACCAACGCGTACGTGCAAATCCAACGGCACTTCCAAGGTGAGTACCCAACTGA:1 + chr2R 17472429 3' + Ivk 87 1 69.31 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGGCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCTCTATCATTTTAATGATTACCAAC:1 + chr2L 20992942 3' - I-element 54 1 72.28 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATGTATATGGCAATATCTATGAAGCCATCGATAGTTACTTTTTTCAACTTTT:1 - chr2R 16068613 3' - Burdock 21 2 56.44 CGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTATGAGAAACGAGAGGCGTTGAATTGTGACATGTATTCCAAGAATTAAGTTAACTACTGCCGTACCACC:1 + chr3L 3818196 3' - F-element 291 1 65.35 CATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATGTAACCTTAGCCAGGCTCTGTTG:1 - chr3R 6103858 3' - pogo 1724 1 77.23 ACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCG:1 - chr2R 5617509 3' + invader1 3983 2 59.41 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACATAAAAATGAATTCCAAATGTAACGCCGGCCAAACGTGTGA:1 + chr2L 12485463 3' + roo 9037 1 69.31 CTTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTCCTCGGATCTGTGCACTCGAAATTATGCTGTGGCCAGGACTTTGCCTTTTGGCCTCATTCC:1 + chr3R 28447464 3' + blood 7374 2 61.39 AAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAATGAGCGAGAGTAAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACATCGCATCGAATGTGTCGTCCT:1 + chr3L 12379175 3' - Cr1a 316 1 77.23 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATATCTCACCTCTTTCTATTTTCAACTTTCAACTTCTTTCTAACTCTGTTACTGACTTTTTCT:1 - chr2L 11832512 3' + roo 395 1 67.33 TGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACGAAACCAAAGTTGTTTACATTGATTTTGATTTACTTATGATTTTACCCACTCCG:1 - chr3R 18428222 3' + accord 7195 2 59.41 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTCGCAGCTGCTATTACCATATCACACAGGACCCTAGA:1 + chr3R 9116535 3' - jockey 22 1 62.38 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATCGCAACATACAGG:1 - chr3L 2029676 3' + roo 394 1 60.00 ATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGATACATATGTACATATATAACT:1 + chrX 19295739 3' - hopper 1379 1 78.22 ACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAGGCTTGCGAAAGTGGAGGTCACGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCC:1 + chrX 22638561 3' - INE-1 113 1 74.00 TTCGTTAGATTTTTTTTTTTAAATTTCTCTGCAAGCATTTAATTTACATTTTCAAAGCGTCATTTTCCTCAGTGCAGAACTCAGGCAGCTTAACGTCAGCT:1 - chr3R 20689567 3' - gypsy2 434 1 78.22 CGGTTTACGCAATGTATGGCAAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCAGTCATTTGATCTTACGAAGTTTGACATTCATTATTAATCTATGCCCAGATGT:1 + chr3L 27362495 3' + mariner2 737 1 58.42 TTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAACGTTTAAGAATGCGGTGAGGGTTAATATCGTAG:1 - chr3R 9041930 3' + copia 118 2 67.33 AACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAATTGCGACAAATAGGAAAAGTTTTTATAAGCTACTTTAGCCTAGCCTTTA:1 + chr3L 9596619 3' + 1360 3218 1 52.48 ATAAATTATAAATTACAACATAAATTTATTATTAAATTTGTATTAGCCGATTCGTTAAGTTATCAATATATTTTAAATAGTAAGTAAAGTATTAATCATTT:1 + chr2L 13155888 3' + copia 257 1 74.26 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAGCCAAACAAAAAACTATCTTGAATGTAGTATATATGTAGATAGATATGTAATT:1 - chr2L 15773304 3' + hobo 2931 1 65.06 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACACACAGCAACCGAGTGCCACAAAAAATGCGTAA:1 - chr3R 11118044 3' - BS 37 1 66.00 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTATTGTCCCCAATTAAATTAAGTGACC:1 + chr3R 9121492 3' + roo 362 1 73.27 GCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTT:1 + chrX 22386782 3' - hobo 65 1 51.49 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTGAAAAAATGGTGGAAAAAATGGAGGAACTACTGCAACTGTCAAATGCATTATCATGGCATCTT:1 - chr2L 16566257 3' - 297 6584 2 75.25 TGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGGGCCGCGCCAAGTGAAATGTTTGATTTATTTTTTATTTGCCATTGAACGTGTTTATTT:1 + chr2L 1839622 3' - I-element 4954 1 66.34 ACGGCTGGTTTGGCAAACAAAAAATAAGAATCGAACACGACCGTTCGCTTTGAAAG:1 - chr2R 3341946 3' - Cr1a 50 1 91.07 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAAACCAAGCCGCCCACTTCACCCAGAACAATTGCCAAAAAGTCCTTTCT:1 - chrX 1157580 3' - 297 6589 2 72.28 TAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTATTTTTCTGTGTTTTCTGTGTCCCTTTCTTTTTGGC:1 - chr3R 5895754 3' - Porto1 4385 1 75.25 CCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATTGTTCTTATTGCTTACGCGTATCGAGGACTTGAAGTTGCCCTTGGTTGGCAGCTTCA:1 - chrX 9019444 3' + accord 139 2 66.34 CTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCTTATGTCTAGTAATAAATATATTCACTAACTAAACTATTAATTTAGCTCGCGCG:1 - chr2L 9730815 3' - diver 413 2 57.43 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTTACAGATTTTCCGTTTCGGTTTATTGC:1 + chrX 1157661 3' + 297 349 2 76.24 GCCCGAAAACACGAGAGCCNAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATGTGGTTCCATCTACCATCTCCAAAG:1 - chr3R 27605289 3' - opus 46 4 75.25 AATTTGCTTGATTTTATAATATTTGTATACAAATATATAAGTCTTACGACTTAAAATGTATTTTAAAGGGGCGATTTTGAACCAACGCTAATCTTATCGTA:1 - chr2L 11615894 3' - TAHRE 31 1 60.40 TTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTGAACGGGGGCAGGGATTTTCGATTTTAGGCTTAACACGGCCGAGCGAAAAGTTCAACTCGTTG:1 + chr3L 13827113 3' + jockey 248 1 60.40 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTGAAAAAATGGTGGAAAAAATGGAGGAACTACTGCAACTGTCAAA:1 - chr2L 16566276 3' - 297 6603 2 56.44 CGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAAAATGGAAACCAAATACACCCGTTATCTATTATTGAACT:1 - chr2R 15794693 3' - pogo 34 1 62.38 GGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAATTTCGAATTTCTTTCTCATAAGTATAAGTATCTATATAAGTAGGAAGTACTTGATAGCCGAGTTATATTTTTGGA:1 - chrX 19228586 3' + INE-1 157 1 69.31 TGATATTTGGTCTGTCCTCGACCTTTGTCGTCGTCCTGTTGACACACATATAGAAATTGGATTTATTGCCACT:1 - chr2R 18465711 3' - Rt1b 201 1 64.38 TTGGCGTTATCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTT:1 - chr3R 24228895 3' + 297 6930 2 70.30 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTTTGAAGAGATTTTGTTGTATTTAAGTCCCTATTTTGAAGTTTTAGTTTTTTAATAGTACGCTAAATTTA:1 - 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jockey 4811 1 59.41 GCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGGATCTCTAGTTAAGTGGACACTGTAGCCCTTATCCCCAATACAT:1 + chr3R 3702497 3' - Doc 4523 1 56.44 GCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTCGCAGCCACCACAGGCACCCCCACCAACACACAGGACT:1 + chr2L 12772339 3' + Chimpo 4131 1 65.00 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGGTTAAATAAACTTGAACTAGAAAAACTAAAATATGGTTCAGAATCTTGTTTATATATATTGTA:1 - chrX 14564632 3' - Doc 24 1 56.44 TTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTCTTTTTGCGGTATGGTACATATTATAAAGAATACAAACGTTGCGACCTTTTGGATAA:1 + chr3L 8352339 3' - TAHRE 46 1 60.40 GATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGCCCAAAGAAAAACGCGACCAACATTGTTGCCTGAGATAAGAAAACTTGGCTGGCGAGAGGAA:1 + chr2L 5244508 3' + transib2 2812 1 65.35 CATTTACTTTAAGATGCGANTCTCATGTCACCATCTTTCCCAAGCGCCTCAGCACGCTCCAAGGCGGCGACTGGCGGGCTAATTTAAGCGATTCGGATCTG:1 - chr3R 27071355 3' + roo 314 2 74.26 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATCTTTTGAACTCCTATCTAATTTTGCATATTTCTCTTGTATTGATGTACATATGTAT:1 - chr3R 32013359 3' - roo 20 2 49.50 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCCGCGGAGGAGGACTATCTGGTGCACGCATCATTTGCTCGGCATACGTACGTGAGTGACAACATTAA:1 - chr2R 8528169 3' - Transpac 4925 2 73.27 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAACTTTAATAAGCATTACCAAATGGGAA:1 + chrX 18193142 3' + BS 5042 1 79.21 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATGCCGTTTTAGATGAGAAAGAGCAAGGTTTACCCAGAAAAATGGGAGAGCAAGTTTGCGTAGC:1 - chrX 9584637 3' - pogo 9 1 71.29 GCTATTCGTAGCTTGAAAGNAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACTAAGCGTTAATACGTTAAAATAATGAAATGTGTTTGTTTTTGTGATTTA:1 + chr4 1043602 3' - Doc 38 1 50.50 GCCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCTTTTTCCATTTATTCCTTTGCTGGAGCGTATGC:1 - chr3R 19447887 3' + roo 299 2 64.36 ATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCCTCTCCATGTTCCCTTAATTCTTTCCAAATCCAGTTATATCCCATTTTCTGGCATATTCGTCCTGGCATTGGCTCTT:1 - chrX 19547604 3' + micropia 110 1 66.34 ATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCCGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTAAATTTGATATTAATTTGTGTGGTGTATTT:1 - chr3L 22642277 3' - G4 3384 1 74.26 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCGTTATTATCTTTGCATACCTACATTTTAATAACTAATATGCCGTATCGCATTTATGTGCCATCA:1 - chrX 15286459 3' + hobo 2927 1 67.33 ATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAAGAACAGACAGTATTAACGAAATTGACTAAAAATATATACAAGCTCAAGATCTCGGAA:1 - 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invader4 3015 2 57.43 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATATGCAAACCCCCAAAACAAATACATATACACATA:1 + chr3R 24708768 3' - 297 6623 2 72.28 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGAAAAGATCAAGTCCTCTGACACTTTTAGTTCT:1 + chr2L 16164104 3' + pogo 2059 1 72.28 ATTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTT:1 + chr2R 16880920 3' - 1360 9 2 78.22 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTGGTGGCTATGTAGAGCGAGACGAGACGAGTCTGGTCGAAAAGGGACGGAGG:1 - chr2L 9521642 3' - P-element 26 1 53.47 CGTGGCTGCATTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCCCTGAGTTGTGCGAGTTGTACGACTGTCTGGATTG:1 + chr3L 27413082 3' - hopper 1227 1 61.39 TATTATTATTATTATTATTNTTATATTATTCTGTATAAAAATTATGTACTTTGGAATTAATTATTTTATTATTCCATAGTTCCGTTTCTATCCTAAACATA:1 - chr2L 10534458 3' - mdg1 7069 15 72.28 ATAATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTG:1 + chr2L 20290301 3' + flea 245 2 55.45 TGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAAATTTCCATAGCACACGGGCTTTTATGGATGAAAGATTAAATCCGGTGTTTAAGCTGCAAATGGGCTG:1 + chr3R 8261532 3' - S-element 348 1 66.34 AGAGGGAGTGGAGAACGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGGCACTTCATTTATCTCGTTTGTTTCTTTTCATGAAGTGGTTACTCCTCATGTG:1 + chr2L 20832660 3' - GATE 8270 2 54.46 CCTGCATCGAGGCATTGTGNAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAATATATATCTGCTGATAAATATAAGTATATTGTCGCATATG:1 - chr3L 15390337 3' + pogo 2069 1 62.38 TTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAACATCCTCTAACTACGCCTTAGAAGACGAATTAAGAGAATCTAACGTATTTAGATTAGAACA:1 + chrY 1810295 3' + Ivk 5363 1 63.37 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACAAATGAAATAAACTGTATACATTTTTAGAAAATCCCAACTAGACATTTGAATTTTAAATATAATATA:1 + chr3L 6164841 3' + hopper 1410 2 68.32 CTAGAGTACCGAGTGTTTANCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGGAAAGTTAAAGCGACGCAAA:1 + chr2L 12801016 3' + hobo 2899 1 60.40 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCATGGCAACTGCACATTACCGTTTCGTACTTTTTCATG:1 + chr2L 11537593 3' + hopper 1381 1 57.43 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACT:1 - chr2R 5214964 3' - F-element 36 1 50.50 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATCAGCTTATTATAAATAAATATGAGTTGGATAAAAATGCTAGTCT:1 - chr3R 26798626 3' + pogo 2071 1 63.37 ACAGCAAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAAACAACTGTATGTATGCGGTTTGTAGGGTATTATTTAGTGTAATAATCTTTATTAGAAAAATG:1 + chr4 613899 3' + 1360 131 1 54.46 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAACCATCCCTGATGCGTTTTTTTTAAGGGAGGCGAGGGACCTCCCCATTGTTTACCGGGAATAAACAAAT:1 + chr2L 19907997 3' - Tirant 8112 2 76.24 TTAAAAAAAATAAAAAAAAAAATTGCGCAATTTAAAATTTCAGCTATAAATTGCACATTGAAGTTTGTAGACA:1 + chr3L 13911273 3' - hopper 151 4 82.19 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTACAATGCAGGAGATAACAATGTGTTTTCTCTCTGTGTAGCAGACTGGGCC:1 + chr2R 20145153 3' + opus 482 2 48.48 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGATAAAGGA:1 - chr3R 29374922 3' - mdg3 5258 1 74.26 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTTTTTCTTCTTTTCTTTTCGCTTCTTTTGCTGTGAAAAATGAATTGCCCACTTTTGGGGGCAATTTT:1 - chrX 11182730 3' - jockey 17 1 67.33 AGAGAGCCGGCGCTCGTCTNGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGATGACGAGAGGCGTCCGTTTGAAGAGCATTCCGAGTTAGCCGAAGGGGAAGG:1 + chr4 377495 3' - Doc 251 1 56.44 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATG:1 - chr3R 13582211 3' - BS 5014 1 58.42 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATGTTTTACTGTTCATTACATTCGATGACCATTTTTAACATGTATTTATGA:1 - chrX 9439154 3' - roo 26 2 56.44 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTATCTACATGTAGCGCATAGATGGGGATGTGCAAAAGTTTCCTTCTCGGCTGGGATCAGGGATAA:1 - chr3R 29374926 3' - mdg3 5261 1 71.00 AATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGAAGAAGGCAAATATTTTTTACCGCACCAGGCAGTGATTAGAGATTCAAGCC:1 + chr3R 19445215 3' + roo 8735 2 51.49 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATTATGTAAGCAACAACAACAACAACAACCGGCGACAGCAACAGACGGTAGTGCTTTCACCTTTCTCCTCCT:1 - chr3L 3475557 3' - mdg1 6 2 74.26 TGCTGCATAGCGCCAAACCAATGTATGTCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCATTGTTTTTCGGCTATGTTTTTGATGTGTGATTTGTCCCCACAGC:1 - chr3L 25304813 3' + 1360 3350 1 61.39 TCTAGATAAGTCACCCAATGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCACCACATATTCATTCCGATACCCCAAATCCACA:1 - chr2L 7193537 3' + Idefix 6980 2 67.33 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACCACCACCTCCGCGAGAGAGCAGCGAAGAAGAGGAAGACGT:1 + chr3L 5360219 3' + P-element 2860 1 50.54 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAG:1 - 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I-element 92 1 74.26 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTC:1 - chr2R 5214978 3' - F-element 50 1 64.36 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCATATCGGCCATCTCCAATAA:1 - chrX 11415697 3' - roo 52 2 81.63 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGACATTAGACCCGTCGCACACAAACATCAACCAT:1 - chr2R 15160274 3' - Tirant 8 2 72.28 CATCATATCTTCACAAAAGACTCCACCCGCGATCACGGACTTAACTCCCGCCAAGCGGCTAGCACTCCCAGTTTACTAGACATATGCAAATTTTCCCGAAA:1 - chrX 9828436 3' + Tirant 8481 2 54.46 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTACCTGTTTATGTGTGGCACACACCTCCAAAACAATTATCATGC:1 + chr3R 20556036 3' + 297 367 2 61.39 TTGAAAGTTCAAAAATATANTAGTGAAATATCAAGTTATTTTATTATATAATATTACTTACAGTAGATGAATAGATTTTTATACATATACTCTTTTGTTT:1 + chr3R 26303239 3' + TAHRE 17 1 80.00 ATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAACTTTTTCATATGCTGCGCAGTGCGTACTTTGTTTGTTTGTCTGCCAGCCGAATGGAAGCTGATGGAAAT:1 + chr3R 24721552 3' + Stalker2 7397 6 71.29 ACGGTATGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGG:1 + chrX 22386760 3' - 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chr3R 32065840 3' - INE-1 129 1 62.35 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGCCCTCAACCCCGGTTCCTTCTCTCTCATGTTTGGGCGGAGACATCG:2 + chr3L 22398618 3' - Doc 36 1 51.49 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTCCTAATTTGCTTCTATTTAGCTATCCTCGCCTGTGGACATGTGTCCATC:1 - chr3L 2029688 3' + roo 9044 1 52.48 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACATAAAACCGAGCGCACATGATAATTCTTCCAAATTTATATATA:1 - chrX 23431599 3' + 297 364 2 60.40 ACGCATCTTGTTATTCTGGTGTCTTTGCCAGCACCCTGAGTGAAATGATATACCCCCTACGATTCTCCTTCACCCTCCTCGTTCGGCAGCTCTATCTTTCA:1 - chr3R 9201411 3' - 1360 6 2 54.46 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAAACCAAGCCGCCCACTTCACCC:1 - chrX 1157606 3' - 297 29 2 59.38 AATTCATCCAAATATCTCCGATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTTCAACATAATGAAAATGTC:1 - chr2L 18239444 3' - hopper 54 1 78.22 ACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGACGACGACTGCGAGTGACATGATAACATTTTGGCCTAAAA:1 - chr3L 13750975 3' - 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chrX 12140816 3' + McClintock 6039 2 75.25 GAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAAGTGCGTTGACCAACGCGGCGTATGCGCAATCAGTTGACAACCTACA:1 - chr3L 2738474 3' + transib2 2436 1 54.46 TATTTGTGATTATAGTATTCAGCTTGCGATAATTTTCAGTTTACATACGTGACAAGCCATTCAGGTAAGAAAATAAAGCCCATTGTATATTGCGCTATATA:1 + chr3L 26043389 3' + 1360 404 1 72.28 TTCGCTTTGCAAATTAGATGTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTTGCGATGAATTGGTAAAATGTGATAGGGATAACTATTTTTT:1 - chr4 176792 3' + Quasimodo 7251 2 59.41 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCAC:1 - chr3R 19589944 3' - BS 5042 1 69.31 TGCAAGTGGAACTTGCGTTNACTTGTATACAGCTGTGTTCTAGTAGTATTTGCACAGTTGTAGCAATGATAAGGAAAGCAGACTTTACTTTAATCACTGCT:1 + chr3R 22520981 3' + opus 496 2 75.25 ATATAAAAAAAAAAATATTTTAATATAGTTTATTCGAAATTGTATTGGAGGATATTGGAAATGTATTTGGTTCAGTGCTTTTTTTGTTTTGTCAGTGGGCG:1 - chrX 7494210 3' + Stalker2 7179 1 88.12 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAATCACCTAGAGTTGTGGAGAG:1 + chr3L 25876144 3' + copia 225 1 56.44 AAAAAAAAAAAGAAGGAAAATGTGCCTGGACTGAAGCTAAAAAGTT:1 - chr2L 12518360 3' + Doc2-element 229 1 80.43 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATGCCTCAATGCCTTGCTCCACTTACAGGCTCAGACGTCTTGCCACTTG:2 - chr2L 13310244 3' + mdg3 5468 2 54.46 CCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTAGAGGCAACCGAGGTGGCTAGGTGGCAAGAACGATTGCGAAACAAGCTAATTTCATTGAAAGTGATGCTCGTTTGTGGCC:1 - chr2R 16065923 3' + R1A1-element 410 1 79.21 TTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCGCAACAAATTTATAGGTGAAACAATTGCCAATGATGT:1 + chr2L 13278778 3' + copia 4729 1 63.37 TTTTATTTTTTTTTTACTTTTTGATAAGTTGCATCCAACTGGTAAAATAAAAGCTATGGCCTTTGCCATTAAGCCGATGAGAAGGGCAAAGGTTAGGAATG:1 - chrX 4692747 3' - Doc 4697 2 71.29 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAAGTATATACCATCTGCGACAAAAGGTACACTTTCATGGACTTTTCTACATATATAG:1 + chr3R 6171223 3' - 297 18 2 62.38 ACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAAACCCAATTCAATGGTGGAAGCCCACAAACACACTGAAGCCCTGAAAAGAAGGCCGAGAATGGTTGAAAGA:1 + chr2R 15730693 3' + I-element 4960 1 68.32 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTCTCAGTGTATGCGTCCTGGTCAGGTTGTCCTTTTTTCGGGATTGCATTTCCGTCTCCC:1 - chr2L 17168419 3' + flea 241 2 64.36 GCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTCTTTTCCGGCTTTCCCTGGAGCTTCTTCACTCTTTTCTTTTATTTTGTGATCACCTT:1 - chr3R 10244211 3' - I-element 440 1 61.39 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAAGATGATCCTTGAGGAACCACTTCTTGCTCATGGGAAAACCGGCAAA:1 + chr2R 11699332 3' + roo 9043 1 55.45 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGTCCGAATCAACCACTGGTACTCAAGCTTTGACACCCGA:1 + chr2L 14981512 3' - hopper 36 1 63.37 TTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCC:1 + chrX 983377 3' - Juan 3827 1 55.45 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATATATTTATTCGTTAAAATTATAT:1 - chr3R 9121457 3' - roo 52 2 80.20 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGGAATCTCAATCGAGAGTAAAGTTAAAGCGACGCAAATCGAATCGTCGAGCAAGCCAACGAGTTGGTATTAAGTG:1 + chr2L 12801054 3' + hobo 2937 1 77.23 TAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAGAGCTTGCATGTGCGACCTCTGACCCCGCCCACTT:1 - chrX 5736512 3' - R1A1-element 255 1 68.32 AGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATGGGTAGATATTGGGGAATAAAATGTTTGTTTTAAATGCT:1 - chr2R 4973635 3' - INE-1 542 1 78.22 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGA:1 + chr3L 25345155 3' - Doc 42 1 59.41 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTGTTGTGGATCTATGGCCAAAAACGCTTCCAGCGGGATATTGAGTTTATGTTGGGCC:1 - chr2L 7714501 3' + roo 390 2 60.40 GTATATTGCTATTTTATTATATAATTCTAGTTTTGAGTGTTTACCTAGTCGTTAAGATTTTAAACGAATACGTTTTTTTCTAGATCGTCACATTTTATTTT:1 + chr2R 2642636 3' - Porto1 4226 1 63.37 ATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTT:1 + chr3L 27415320 3' - transib2 11 1 68.32 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTTGTACGGCTGTGTGTGTAACGTTGAAAGCTTCTTGTGGAATGTTAAGTGAT:1 - chr3L 22327276 3' + hopper 1393 1 55.45 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACTGACACTGCAAAGACTACATTTAGAAGCAAAAGAGGGG:1 - chrX 21668013 3' + Tabor 7314 2 52.78 CGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATTCT:1 + chrX 19820787 3' + Rt1b 4977 1 78.22 AAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATATTCTCTTTCTGGTGGATATATAATTTT:1 - chr3R 31512169 3' - Stalker 453 1 73.27 GTGAGTCGAGTGGTAAAAANGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGGACCTTTAGGTTAATCGAAAAACTTTTACCAAATCATTCCGGCAAATTGCCACTG:1 + chr2R 18073315 3' - hobo 21 1 58.42 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGAGGACAACAATCAGGATGGTGTGTGTCCGTGTGCCT:1 + chrX 6388323 3' - hobo 41 1 62.38 CTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTCGGATTTCTCAAGCTGAACAGCTTTTTTAATGCTCCTG:1 + chrX 7290315 3' + roo 59 2 55.41 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAGGCATTTTGATACTTAAAACCATATGGGCAACCGCAGGCATATAATTATTTTTTATGAAACAT:1 - chr3L 2016855 3' - Tabor 16 2 62.38 GTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGTTTGCAATGTCTGGCGGCAAATTAATTGCCAGCGTGCTTCGCTTGTGCACTGT:1 + chr3R 30341317 3' - 1360 168 1 61.62 AGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGATGTGTGTGGATGGAGCTCAGAAAATATACTAGTTCAAAAGTGGCAGGGGAAAAATAGAATAGAAAA:1 - chrX 12883495 3' - 1360 3220 1 75.53 CAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATACTGCTGTATAGATATGTATACCTGTCAAATTTTTTTCTGGAAACGCTATCATATGATGAT:1 + chr3R 12379362 3' + 1731 298 1 60.40 ACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCTATCCGTTTCATTCATGGCTCCGTTGGTATTGTATTTTGCGTTGACAGTATCGATTGATCATTGGCACGTGATTGAA:1 + chr3R 28663517 3' - invader5 3848 2 69.31 ACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGATATCATTCAAGAAGGTGCCATTCTAAGAAATGGAAATAATATTGTGAACTATTCTCATT:1 - chr2R 1905109 3' - Max-element 8254 2 61.39 CCAGTATTCTGGACTTGTCCATAAGTTTTTACTGCGAAAACTAACTTCACTTGTTCCACAATTCAGCGCACACAACACACTTACAAGCATTTCGTCAACCC:1 + chr2R 5616829 3' - X-element 83 1 63.37 ATGTATATGTGTGTGTGTGTATGTACATTCATATGTACATACATTTAGGGCATTGCCATACCAAACTTTTGAAAAACTCATTTCAAAAACGTAGCGTTGAA:1 - chr3L 11681858 3' - Quasimodo 37 2 54.46 ATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGC:1 + chr2R 2875186 3' + TLD2_LTR 97 1 51.49 AATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCAAAAATCGATTATCTTTTTTGAAATCGTTACAAATGCTCTTAATGTGGGGTCTTTAGCAATTATTGCA:1 + chr3L 22745257 3' + FB 149 1 73.00 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATACACGATGGCTGAGTGGGTGAGCTTGTCGTTGGG:1 - chr2L 16548173 3' + P-element 2853 1 41.94 ACGCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGCGTGATTTAGTTCCGTGGAAAAATACGCTTTAAATTTAAACTGCCCACATGGACTGTTGATCCAAATATTAAA:1 - chr2R 8558705 3' - accord 259 2 55.45 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGCCATGGACAGAGTCACCTTCTTTCCATTCTCCTTTGGGCCAAGCTGGTGAAAAATGGCGCG:1 + chr2L 18239504 3' + hopper 1394 1 60.40 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATACTTATCGATTTCCTTTCACACACAATCTGCGCTGGCTCACTTGTCATAAATTCACAATAACTTTTGA:1 - chr2R 9061900 3' - jockey 4677 1 63.37 CGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGT:1 + chr3L 11826443 3' + INE-1 144 1 70.30 CTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATATTTGACTTTACATAAGATATTTTTTACAACTT:1 + chr3R 13582313 3' + Tc1-2 478 1 72.28 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAACTTAGGCAATAATTTTCTGTGAGTGCAGGCAATAGATCTTTGAC:1 - chr3R 23445568 3' + copia 225 1 60.40 GGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTTGGAATGGTTAGACTAGTAGTTGCTTTGATTTGATTATAGTTATATATGTATAAAAGTT:1 + chr2R 1373387 3' + gypsy 7420 2 57.43 AAGATTATTATTATTATTGCTATAATAATTTATAGTATTGGTTCTTGGCTCTTGCAGCGATTCATTTCGTTAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTTTCACAG:1 - chr3R 19255383 3' - mdg1 7071 2 37.62 AATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGTGCTCCTTTTAATTCCTCGAAA:1 - chr2L 13310703 3' - mdg3 416 1 72.84 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATGAATTTAATTTTTAGTTGTATTAGATCGAGTAGATTATCTATAAATTA:1 + chr2R 19430807 3' - 412 7081 2 55.00 GCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCATTTTCTGAGGTGGCAAAAAGCCGTAGGTATGGAATTGTTATTATTCCCATTCAAAAATG:1 - chr3R 27088419 3' - X-element 4253 1 59.41 CGGACACAAGCACTTAACAATCATTGCCCTTATAATTTTTCACACGTCACAATCAGATTACTTAAAGACTAATAATAAAACAATAAATCAAAGCACAAATA:1 - chr3L 27287383 3' - 1360 457 1 51.49 ATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGCATTTTCGTACAAATTTTCTATAGTATATGAGTGCAAATCGGTGTATCTTTCT:1 - chr3L 2413662 3' - pogo 128 1 67.33 ATATTAAAAGCCGTGCGACCAAAACGCCGCTGAGCACTTAACGCTTGAAAGGCTCACATAAAAATAGGTGGACCATCTGCCTTTTAGCTTGAATATTTTCT:1 + chr3R 10712149 3' + G4 477 1 80.20 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACT:1 + chr3L 25059150 3' + mdg1 395 2 54.46 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGAGTTGGTGGCAAGTCCCGTGGCCTGCTAATGGCATAGTTTCCATCTGCTTTTCCGGTG:1 - chr3L 20079689 3' - mdg1 18 2 60.40 ATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAA:1 - chr3R 460076 3' - F-element 92 1 73.27 TGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTACCATGCGAATGCGTTTATTAAGGTGAGTTCAAGAGATCGTTCGAATATATGTAAAT:1 - chr2L 10457158 3' - jockey 35 1 50.53 AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGATACTCGCGTCTGGGGGCTTTGCATAAAGAATAAGGAAATAATTGACAGTTGAAAAGTCTCAGCTATGA:1 - chr2L 3581941 3' + transib2 2819 1 72.28 AATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTTTAGGTTGCTTATACGGCCATGGTAACGGACCTCAACTTCATGTCGATCTGGACCCTAAAACCCA:1 - chr2R 14592222 3' - 297 6794 2 62.38 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCTAGGTGATTGCAGGCAGCCGCAAAGTA:1 + chrX 15183794 3' - hobo 48 1 72.28 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCGGATTGGGGGGCTATCAAGTTGCCTGTGAAGTGCTTAT:1 - chr2L 17049918 3' - hobo 38 1 62.38 ACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTACTGGTAGTGCAAAAGATAAATTGCGACATTGTTTTGGCATATCGATAAAAAAATTTAAAAATGTTTGTGGTATGC:1 - chr4 1100526 3' - INE-1 548 1 71.29 GTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAATGCTGAAAATACGTCTCGATAAGTGATTGCCCTAACTCGTGACAAAAAATATCGT:1 - chr3R 1440151 3' - G-element 20 1 58.76 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAATGTTTGCGAGAACTAAACGGAATGTTCAACCGATTTTAT:1 - chrX 6451082 3' - pogo 32 1 61.39 CTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGCATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGTCAAGTTAAACGATTGCTTAGATTAATATTC:1 + chrX 19810287 3' - INE-1 28 1 58.42 CCTATCAACCTTCCACATAACTATATAACATAACGATAGATATAATGCTATATGCTGGCATTTTAAATAAAGAATAGAACTTATGATATAAGAACCCTTAT:1 - chr3L 16759680 3' + Transpac 309 2 58.42 CAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAAAAAAAAAATTCAAATCGAGATCGCTGAGTACGATTTTTTCTTTTCCAACTTACTTCAGTTTCTCGC:2 + chrX 11846654 3' + X-element 4695 1 60.40 GAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTTGATGGAAGACGATCGGCAAAGGAGATCGAACCCTGACTGATTTGCATT:1 - chrX 2392151 3' - blood 7165 2 55.45 AATCCTTAGCGGTGACTACCACCAGTAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCAACACGTGACTTTGGCTTGTTGCGGTTA:1 + chr2L 12237322 3' - R1A1-element 237 1 78.22 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTAGCATCAGTAAAAGCTCTCTGAAACAATAGCATTTAAAGTACAG:1 + chr3R 4646400 3' + 297 6947 2 54.46 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACACATATGTATGAATGTACGTAAACAGATATACAGTATGTGCTGGCTTGAACGTGGGGAAGGAGTG:1 + chr2L 20290318 3' + flea 5009 2 71.00 CTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATGTGGTTCCATCTACCATCTCCAAAGCTGTGCGTAAGCTAAGCTGTGCTCGAGTGCACAG:1 - chr3R 27605255 3' - opus 12 2 67.33 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCATGAATAAGTCATAACTAGTGTTGGC:1 + chr2R 16580417 3' + pogo 2051 1 74.26 TAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTTTCCTTGTTGTTTTTTTTTTCCTGACTTTGGAA:1 + chrX 12854355 3' - Doc 113 1 67.33 TCGGCTCTCAGTTGCAGTANTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:1 - chr3L 25232766 3' + accord2 7601 2 51.49 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGTCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGCTTT:1 - chr3R 19094188 3' + P-element 2862 1 54.46 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAGGGAACCTCCAGGGCAGCCAAGGTCAATTTGACGGCACGAACTGGTGGACTTGCCTCCAAGCCG:1 - chr2R 18406975 3' + mdg3 233 2 65.35 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAATTCTTTCTAACACACTGAATTACCATTTAAAATTCATTTGGTTTCATTCATTCTTTAAACA:1 - chr3R 4512261 3' + flea 243 2 70.30 AAAAGGTAGCATATTGGATGCAATATTGGAGAGGAATCTCTAAATGTACTTGTATATGTATGTATAT:1 - chr2R 15349505 3' + Q-element 81 2 67.16 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTG:1 - chr3L 27415237 3' + transib2 2785 1 65.35 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTTTACTCTAGGAGTAACGAGCATAATTAACCGAATTTGAATTTATGATATTCAAATTTATGAG:1 + chrX 152815 3' - roo 10 2 70.30 TGTACACCAAAATGTTCTCNGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACAGCAATTTAAATGTGAGTATTTACTT:1 - chr3L 14878662 3' - Juan 52 1 76.24 GTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGCTTTTCCGCATGCCCCTTACTTTTTGCCACACGCTCGGCACTAATTCACTTTTG:1 - chr3L 6620468 3' - 412 7447 2 54.46 TTACGCATCTTGTTATTCTNGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAGTTTTCAAAATCAGCA:1 - chr2R 25203746 3' + 1360 3381 2 71.29 AATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTAATTTGGGGCTAAGCCAATAACCACTGGGAAACAGGAACCTAACAGGACACACACGTCAATAACACTCATA:2 - chr2L 12884283 3' - HMS-Beagle 1 2 78.22 TACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAATACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATG:1 - chr3R 17897143 3' + hopper 1368 1 71.29 TGCATTACTGATTTCTTTGNAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCTGAACAGGAGCCGAA:1 - chrX 1157627 3' - 297 6622 2 80.46 GTTTTTCGGGATTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCGGGCGGGCGGTGGAAGTATGGCACACACCGAAATGCAGTCGG:1 - chr2L 5730011 3' - Idefix 265 2 58.42 TTTAAATAATTGAAAATAGATTTGTGTCATTTTTTCTCTCCGTGTATGTTCAGATTCAGGCGGCCGCTAAGCGCAAAACGCTCAAAATTACAGCAACAAAC:1 - chr3R 29651535 3' + Transib5 258 1 72.28 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCTCATAAAAGGTTAGTTTAAACAAATAAACACGTGGAATTTAATGAAGAAACGTGTGTGGCTCCATGAA:1 + chr2L 16456707 3' + hopper 1410 2 74.26 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCGCAACGCATCCACACGGATAGCAGCGCA:1 + chr2R 22269211 3' - jockey 4686 1 58.42 AAATATATATATAATATGTATGTCCCATTTAGCACCATTTCTTGCAATTTAGTTCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACC:1 + chr2R 14793493 3' + Dm88 4367 2 48.51 ACGTGTACTCATTTTTCGGCGTCCACACTTTGAACCCCGAATCCTTATCAAAGATTCAGCTGTTCTATTGCTTCTGACTGGAAATTGCCACAGA:1 - chr2L 5647337 3' + invader3 272 2 71.28 CCTTTGATCCCAAGCCAAAAGCTCGACTCTTATCGTGAAAGCTTCCCAAGTTTATGGAGCACATGCATCAACCTCAACCCGACGTAGAA:1 - chr3R 20489821 3' - gypsy7 70 2 67.42 CAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATGGTGCGAGGTAGAAAAAAAAAACTAGAGGGAAGGAGTAGGGAATGAGCTGGATGGCTGGTTG:1 + chr2R 9622137 3' + HMS-Beagle 6644 1 68.69 TTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAATCCCAGGCCCCCAACTTTCTGATTTACTCGTAGTTTCATGGACGCTCTGAGATAGTGATGAA:1 + chr3R 5264543 3' + P-element 2624 1 61.39 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGG:2 + chr3L 23871312 3' - Doc 43 1 60.40 CACATATTTTAATTTATTTATTTGCAGCTGTAGCTGGAAAAGCAGTTTCTCTTCAGGACTAAGCCTTTTTTGCCCTTTTTTGCTAGTTTCTGAGCTGTCAG:1 + chr3R 5934194 3' - G7 1150 1 78.22 ACCCTCGATATATGCACATACTACAACTTTTTGTAATATTTGTAAGAATGCACAAAACCTCGTTTCATTCAGAGATTTCTAGTTTCTAGTCAGATGACTAA:1 - chr3R 6760970 3' - blood 4 2 69.31 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCTCCTTAGCTCTTTTCCTAAACCAAGAATTCACTCCAAGTCTCATTCGATTTTCATATT:1 - chr3L 18314557 3' - copia 19 2 49.50 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCAAAGCGTTCGTCTCTAGTTTTGTACAAG:1 + chr3L 13589614 3' + hopper 1370 1 68.32 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATCAAGTCGCTGTATTCGAGTAGTTGCGATTAAATCGGCTTATCATCATACACCTCATTTGATTGGTAGC:1 - chr4 546107 3' - roo 8737 2 44.55 AAAAAAGAACGAAAAAAGAACGGTGTGGTAGCCCCACATATCGGATATCCACTGTACCTTTTAACTTATAAACACATTGTAGCACCAAAGACCCTAGAATA:1 - chr3R 4215904 3' - rover 7089 2 78.22 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTATTTAGCCGTTATCCGCTGATTTCATCAACGTACATGCGTACATATGTAAGTAAAAATGTCTA:1 + chr2R 5651922 3' - Tirant 11 2 69.31 CTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACAGGACTAAAAGTTTTCCTGTAGAATTCAG:1 + chr2R 17734528 3' + Stalker4 7328 2 76.24 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTTT:1 + chr3L 25345159 3' - Doc 38 1 55.45 GGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTT:1 - chr3L 23797689 3' - Helena 1149 1 44.55 GTGAAAATACTTTTGACCATGACTGTATGTACAATCCATCAAGAATGAATAGTATGATCGTGATCGTAGCTGAGAATGTATAACTGATTTTACAAATACAT:1 - chr2L 22108163 3' - Bari1 5 1 75.25 TTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATTGTCTGCCGCCTTTCAACACATTGAGTTGTTTGCTCTGGGTACGCGCTCCATGGTC:1 - chr2L 19629904 3' + copia 235 1 58.42 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTCATGTGTGCAAAGCCGTTTCAGCTGTTTGTTGTGTGCACTA:1 + chr3R 26498587 3' - roo 8698 2 59.41 ACTCCTCCCTCCCCAGTTTGAAGCGACGGCCATAGCGAAGGTATTGCTGGAGCGTAAATAGGCAGCTGTTATGGACTCTGTGTGCGACAGGGACTCCAAGG:1 - chr3R 27081673 3' - Tirant 8091 2 64.36 AAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTTTAAGTATTCTAAACATTAAATATTAATCAAAGATTAATGGGCTTTTAAGCTTTA:1 + chr2L 4020782 3' + 412 7528 2 58.42 AGCGAACGGCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCCCTCTGCCCCTCGGCTCGCCACCATTTCCCCCAACCCTGGCAAGCAACCAACGTGGCCC:1 + chr2L 18437056 3' + Doc 365 1 66.67 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAAAATGGAAACCAAATACACCCGTTATCTATTATTGAACTAATTTTTGGTAAT:1 - chr2R 15794680 3' - pogo 21 1 53.47 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCCCTGTTTTTTTCACGAACACTTCAAAGGAATCTGGCTGTGGTGA:1 - chr3R 4555377 3' - roo 8695 2 58.42 GAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTT:1 + chr3R 11547757 3' - G2 314 1 62.38 TAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACATTTCGGATCTTTTGAAACACCAAAGCCAGTAATATTTTGTACAAAATATGGG:1 + chr3R 5993354 3' + Tabor 7302 2 56.44 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCTACCGAATGAAACTAAAGTCCTTTTATTTTAAAGCG:1 - chr2L 2016759 3' - Doc 54 1 70.30 ATTCAACACACATGTGGGCNTTGCCTATATTCAACAGAGTTAACTCAGATATATATTGGCTTTCAACGAAAGATAAAAAAGAAAATCGAAACCGATGGAGG:1 - chr2L 3494939 3' - 1731 15 2 64.36 GGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGTTGGTTAATCCCAGGATGAATATAGTCACT:1 - chr2R 23870823 3' + jockey 347 1 70.30 TTAATTTTATAGAATAAAATTAGGAGATTTAAAGTAATGGTTCACGTTTTTGCTTTTTCGACACATATTTTATGTTTTATTATTATTTCTTTTTATTTTAT:1 - chr3R 3525628 3' + TAHRE 73 2 40.59 TAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTTGGTTCGGAATTCCACATGTTGTCTGTCTGCCTTCGTTTCAGCTT:1 + chr2R 19668254 3' - 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chrX 6451077 3' - pogo 27 1 56.44 TAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAGAGTCTTGTTTTATGGCGGACTGACGGG:1 - chr3R 13441886 3' + 1360 3341 1 73.27 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAACGGACACTCTTTTGAACGGACAACCTCA:1 + chr3L 7215542 3' - copia 48 2 74.26 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTGTGATGCAATTTATATAACATAGAT:1 + chr3R 17255976 3' - I-element 52 1 74.26 GGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTTTGTAGTGGACGAAAATAATTTGTAAATTGTTTGGTGGAGTTATATTCTTTTTGGAACT:1 + chr2L 15835584 3' - Juan 273 1 70.45 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGGTCATAAAAGCCACATTTTGCCTTTT:1 + chr3R 7599090 3' + mdg1 371 2 73.27 CATCACCATTTATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGCGGAGGAGAAGTTGAGGTATTTACAACGTGTTAACAAGAGCACGGCCATTTTTCATGGTCT:1 + chr2L 12661412 3' + I-element 299 1 54.46 TTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATATTTAATAACCGACACAGAGCCGAAAAAGAAATA:1 - chrX 21276083 3' + X-element 4603 1 67.33 AATAATAATAACGTTAAGGCAATACAAATAATAATTTTAAAGCATGGTGGTTTATATTAAAAACTTTCGTACAATAAGTACATAGATACGGATGATTATAT:1 - chr3L 14427810 3' - 1360 305 1 78.22 TCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTGCATTATTGTGGGCGGGGCAACATGGGCCAAGACACTGCGCTGTGTGCCTCTTCGTATTATGATGACCGTTG:1 - chr2R 21847089 3' + 1360 271 1 74.26 CTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAACTTCGATGCCATGAAGCGAGCACTGGCGGAGCCAACTGAGGCCGC:1 - chr2R 8730155 3' - R1A1-element 5090 1 55.45 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGAATCAAAAATTTATAATAAAAAATGAAAGGAAATTAGCTGACTTTGTAATCGCAATCGGA:1 + chr3R 13685035 3' + 412 443 2 74.26 GTTGGGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCTGTTTAAAAGGCATTTTAACAGGGCAAACACGCAGAC:1 - chr2R 15160305 3' - Tirant 39 2 60.40 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGGGGCCAAGGACAACTATTAGGGGGAAATATATGTATGTGTGTGCTACAGTACACACA:1 - chr2R 18073229 3' + hobo 2916 1 51.49 TTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATTATGGATTAAGCCAACAGCAACAG:1 + chrX 1204341 3' + Transpac 411 1 76.24 TATATTTTGATAATTGGTTTACGTCTGTAAGCCTTCTGATTTCGTTGAAGGAAATAGGAAACTTAATATAGGTAGAGCCCAAAATCCTTTAAACTTCCAAC:1 + chr3R 3376896 3' + looper1 1424 1 56.44 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATTTATATTTTAATGCCCTAATTTTGGTTGCTCCATTTATAAAAAGTTACTTAAACATTTCTTACTCTGTGTAAATGAT:1 - chr3L 13204328 3' - I-element 5111 1 71.29 AGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTGTCCTTCTATTACTTCAACTTTTCTGGTCACTTCACCAAGTTGGACATTTATTAATCGGTTAGTTAATTGCCA:1 - chr4 293104 3' + 1360 4 2 73.27 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATACAGTACAGTACGTATGAATGCAAAACATCATGCAGAGCGGATAATGTGAATGGG:1 - chrX 8308710 3' + opus 482 2 63.37 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCACATCATCATTTGGCCCGGCTTTAATTGCGGGTTATCGC:1 + chr2R 18111513 3' + hobo 2904 1 62.38 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGATGTCAAGGCAGGTCAACTTTACGAAAAAA:1 - chr3L 2325415 3' - hopper 45 1 71.29 ACTTATAGGTACGGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCTTAATTTCACATAACTATTTAATAGTAGTTTAAATACCTCGCGCCATTCCACT:1 - chr2R 13647812 3' - blood 21 2 58.42 GAGTTGTTGGTTAATGAGCGATGGCTCTTTATTTTATGAGTGTCCAAAACGAACTGCTTAAAGCTAACAATGCTTGGTCAGCAATGTGTAGCAACGACTGG:1 - chrX 15152383 3' - gypsy3 6736 2 68.32 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAGGAGAAGGCACAAAAACGCATACACTCGC:2 + chr3R 9116502 3' - 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