Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score AAGGAGAGGAGATACAAGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3L 15435525 5' + blood 7036 2 54.46 TTATTGAGGAAAGAAGCTACATAAAAATTCCCGATCATTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:2 - chr2R 8717710 5' - 297 361 2 63.37 GACGTACGTCACCCACAAACCCACCAAAGGAAAAAAAATAAATTAAATAATGAAAATTAAAAAATACACACACACACACACACAT:1 + chr2R 6229567 5' + accord 181 6 69.41 TGGATTGCTTCTTGAAGTTGCTGTCGCACTTGAAGTTTGAAAATGTGAATGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 31473966 5' + roo 8689 2 56.44 GAAGGCGGTGACATTTTGTNCGCTTTTTTCTGCATACGAAAATTGCGTTGGCCCCACGGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACT:1 - chr2R 23120356 5' - hobo 310 1 60.40 AGGGTGGCGAGGTCATTAGAGCATGCCAGCTTCCCAAAGCGCCAGCAACTAAATCAAAAAAGTTTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAAC:1 - chrX 21791457 5' + G4 3358 1 66.34 TTAATTGTCCATTTAAGCCNGGAAATTTAGACCTGATGTAGTTTAGATAATAAATCAAACATTTTGCACTTTTTACAGATACAAAAAAAGAAAAAAAATAA:1 + chrX 19022711 5' + G2 3075 2 70.30 GGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAA:1 - 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hobo 2541 1 74.26 AAGTAGCATTTGTAATGATTGCACATTTCTTCGATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 7132499 5' + opus 40 4 72.28 GGGAGGAAGTGAGGCGAATGGGGGAGTGGAGAAGAGGTCGTGGCACTGCCTGATGAATATGTTGAAATCAATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 15117699 5' + roo 8669 2 72.28 TGAAACTAAAAAGTGTTGAAAAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:2 + chr3L 11697047 5' + pogo 19 1 58.42 AACGTCAAGAGGTTCCGCGTGGACATTGAATTTTTCCTAATGTTAAAATTTGTACTCTTCGTTGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTT:1 + chrX 693771 5' + FB 14 1 68.32 ATGCTAAAGGAAAATGCAAAAGATAAATGAAGTTGTGCTAAATGCGTGCTGTGCTGTGGAAAATCTGGGAATATGGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACA:1 + chr3R 12882620 5' - 412 488 2 75.25 ATACAAAATGATGAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3R 18342457 5' + F-element 43 1 56.44 GATTGAAGTTTCCAGTACGGTTAGTTGCAATTGACCTGTCATATCTTTTACTACATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3R 23683364 5' + 297 15 2 63.00 ATACATGTACTGCCAGCTGTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr3R 18171751 5' - 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hobo 2920 1 61.39 CCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 - chr2R 24555699 5' - hopper 1389 1 53.47 TAAGCAAATAGCTGAATTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chr3R 28628071 5' + 1360 37 1 64.36 TTGGGGTTTTGGGTGGGGACACCCGAGATAAATGGCCAGATACAATTGGATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 + chrX 19219280 5' + Doc 5 1 68.18 GGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGGAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2L 23372628 5' - 1360 3350 1 65.35 GAACCGGCACACAAGAGGTGGGTACACCGTCGCCCACTCGCTCCCCAACTCCTCCCCCCCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATA:1 - chr3R 10738636 5' + F-element 309 1 68.32 AAGTAACTGCCATTTTATTTTCCTATGCTCACTTCGCGATATTATTGCTTATTGCATTGCTCCTTTTATTTATCAGCCATCTTAGTTGCTGCATTCTTTGG:1 + chr2L 2325420 5' - BS4 477 1 65.35 AAGCGCGTGATATATATATTTTATGTCATGTGTAATGATGAACTCCCGTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chr3R 16806060 5' - 412 7497 2 69.31 GCTTTAAATGGTTTTGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3R 16806028 5' + 412 52 2 78.22 TAATTGTATTGTATGTTTTGTTTTTAAAGCTTAATCTATCTATCTAATCTAATAACAAGGTACAGTGTCTTATAAGTAAAGCTCGATCTATAAATAGGAAA:1 + chr3L 5566199 5' - Burdock 52 2 63.37 TTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3L 23456270 5' - 1360 3373 1 59.41 TATGACGTTATGCTACTGTTTGTATCGTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2L 21628919 5' - P-element 2841 1 34.65 AGCGTACTGAGAGTAAAATATGACAATACAACACTTTAATAATAGGTAATTACATAGGTAGTTTGTTTACAGATAATGAAATAATCTTAATATTAATAATA:1 - chr4 583773 5' + mdg1 40 2 59.41 AGTGGCAGATAGACCACAGAAGGCTTCGAAGCGGTGACCTGAGCCGCATTTAACCGAAGTTGAGTCCTAGGAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGA:1 + chr2L 8435605 5' - G2 2891 1 73.27 GTTTGAAGAAGTTACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 8434248 5' - roo 385 2 55.45 AGGAATAAAGGAGACCCAAAAATACATCGAATGCGTTCCGATTCCACAGTTCCATCAACGCCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCC:1 - chrX 2656271 5' - F-element 4266 1 68.32 AGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 + chr3L 19274811 5' - 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chr2R 6798294 5' - Tirant 327 2 65.35 TTCTAAAAGAAAGAAACACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chrX 17873160 5' + 412 7073 2 58.59 ACAATTTCTAAAAGAAAGAAACACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chrX 17873155 5' + 412 17 2 62.38 TCGCTTCGAGTATATATCGCCATTGCCCCTGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAAA:1 + chr3L 8037670 5' - invader1 70 2 73.27 AATAAATGAAATTAATGCGTATTTGAAAGAGCCACACAGGCAAATTCAATGAACTCGAAACTTGCTGATAATACTCGCAATAATAACAATAATAGTAGTAA:1 - chr3R 26524250 5' + mdg1 29 2 66.34 GTCAGTCATGCGCGCGATGAGCAGCTGAGCTGCGCCAGCTGCCCGAGGAGCGGCCACCAAGATGATGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3R 16595037 5' + P-element 7 2 74.75 GAGAAGAAAGCATTGCCCAGCAAATTAAGTCCCAAGGGGGTAGGTAAGCCTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chrX 22713814 5' + 1360 17 1 59.14 AAATATTTTGCACTTATTTAATCATTTGATTTATATTCAATCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 5088353 5' - roo 9036 1 63.37 GCAGATGTTAAGGACATCTGCGACCGGGCTTGTATTACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 14980488 5' - 412 7505 2 62.38 TGTAGATTGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3R 8705358 5' + jockey 27 1 58.42 TGATGCAGGGCAGATCGACTCTCGATGGATGTTATTTTCTCGTTTTCTTTAAGGGCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 12937501 5' + roo 8686 2 58.42 ATTTCAAAAGACCATAGAGGATGGAACCTTTTATACAGCTGCGTTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCGTAAAAAAAAATTATTAA:1 + chr3L 24034788 5' + Tc1 47 1 69.31 AGATATTGATAGTTGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 - chrX 153031 5' - mdg1 7426 2 61.39 AAGGCCGCAACTGGCGCCACTTCCGCCGCCGTCAAGTGGCGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr2R 6769512 5' + 412 7089 2 62.38 TTGAGATGCCAATGTCAAGCCGAGATCTCCCCACGCGATATCGGTGCATATATGTACATATACTCGTAGTATAGTGCATATATATATACAGATATACATAT:1 + chrX 15543356 5' - G3 4507 1 74.26 ATCGGCATTGCAGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - 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hobo 2900 1 61.39 ATCCGAGTGGCGCCCAGGTACAATGCTTTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATA:2 + chrX 17217744 5' - R1A1-element 5276 1 72.28 GCAATGCAATTTGAGACCACTTTTCGGAGTTCAAGTGCTTTCCTAGTTAACCTTTTTGGAATATATATTATATTTTAAACATAATTATTACAGATCCGTTC:1 - chrX 4239159 5' + Cr1a 111 1 72.28 ACACCTTAAAGCCTTACAAAAAAAAAATAAAGTAGGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCGGTCGAATGCTAAAGCT:1 - chr2L 7553995 5' + invader2 157 2 65.35 GCGTTTCACATTTCATTTGAATATTTTACTCGAATGTTTTTTGCTGGCTGTCGTTAGGCATCAAGTCGGGGCATCTTGACCCTTCACATACCCTTCTCCGT:1 + chr3L 18413492 5' - gypsy8 4482 1 55.45 ACGCAGGTTGTATGACGTTNTGCTACTGTTTGTATCGTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2L 21628929 5' - P-element 2851 1 43.56 ACTGCGCCTCATTCATGCGGAGATCGCAGACGGCCGCCGGACCAATGATGCCCATGCCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3R 16613119 5' + 412 7072 2 63.37 GAGAACGCAAACAATAGCTGGTCGTAGCAGTTGCGATGCCCACAGTGCAAACCGCTGTTTTCTCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTCT:1 - 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Gypsy6A_LTR 384 1 53.47 TACACTTCGTTTCAGTCATTCAGTTTTAAAACAAGTTTTGACTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3R 14708782 5' - roo 9038 1 60.40 ATGGCTGTTAATTCATACTGCTGAGATTGTTTGATTTAGTCTGAGGATTGTTTATTTGAGAAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGC:1 + chr3R 19242072 5' - I-element 5122 1 57.43 TTTTAAACTTTGCTGGTTTAAACTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTG:1 + chr2R 25286854 5' - TAHRE 10408 1 78.41 TGTCACAAATGAAATGTAACACGAGTCCGAAAATGCCATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCG:1 + chr2R 8387396 5' + F-element 190 1 63.37 TTCTGCAAAGTGCTATTTTNCAACCTGTAGTCGAGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 28475867 5' - roo 9033 1 61.39 CTCTTTATAAGTAACTAATNAACTTTTCACAGTTTCAGGGCACCTGGTCGCCTGCCCCAACTCGATTTCCTACATGGCAGACTAGCTGGGGACAATGTTGC:1 - chr2L 16981040 5' - Tirant 143 2 50.50 TTATCAATTTTGGCCAAAAGCTGAAAATAAATAAAATTAAATAAAACAACTCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr2L 18191263 5' + F-element 31 1 53.12 GTACAAAAATTATTATTAAAAGAAGAAAACAAATTTTTAATTAGCAACAATTTGATAGTTATGTAGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAA:1 - 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INE-1 564 1 47.52 GTATGACTCAGGAAAATCAGAGATTTTATTTCGATGGCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr2L 4110923 5' + Doc 10 1 72.28 TAGAGAGAGAAACAGTGAGACGGAACAAAGTAGAGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chrX 21400835 5' - P-element 2848 1 40.59 AAAATATTTAAAACATTTATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chrX 21581099 5' + 297 6608 2 54.46 ACCAATGAACCATCGAGACCTATGCTTGTATATGCGTGTATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3R 11191074 5' + hobo 35 1 63.37 TAGTGGTTCTCCGGCCCTCGAAAGAGACTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3R 15537321 5' - P-element 2842 1 34.65 AAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTCT:1 + chrX 4246258 5' + Doc3-element 283 1 51.49 ATGGCTGGGCTACTACTCGCGCCTGGCCGCGCTGCGGCACAGCGTTTCCAAAAGGACGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCC:1 - chr3R 21223121 5' - 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chr2R 13712236 5' + mdg3 5258 1 55.45 AAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTAGTTACAAA:1 - chrX 22386754 5' + hobo 78 1 62.79 ATATTAAGAAAAAATATATACACATTTTCTGTGGCGCTCGTGTCGCTTCTGTTCCATGTTACCGGCTGGAGTGCATGATTATTGCCTCGAAGACA:1 - chrX 9019809 5' - BS3 1453 1 66.32 ACCCAGTTCTGGCCCTTTCCATGCTTTTGCTGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 + chr2L 14057401 5' + F-element 12 1 50.50 AAAGAAAGAAGAACTGTGAGATGAAGAGCTGGTAGTGCGCTTAGTGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr3R 26799011 5' + P-element 28 1 49.00 AATTGTCTTTTGCAGTTCCCAGTGAAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTGAACCTTCTAGCTTTTAT:1 - chr2L 21724515 5' - INE-1 163 1 73.27 AAGTAACGAACGACGGTGGAACCACGGAAGGACATAACTTCCGTCAAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAAT:1 - chrX 6698381 5' + F-element 4476 1 56.44 GCGCTAGAAAGTATGCTACAGAATTATGGCGCACTCGCTGTCAATTTTGCAATTTTACAATTTTACTTGTACACCCCAANAGCCTAGCAAGGAANCTAGGA:1 + chr2R 23441702 5' + jockey 4681 1 64.36 ATTTTAACCGGAAATGGGCGCATGTGTGTGCGTGTGCCGATGTGTACAATTTGTGAACTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACC:1 + chr2R 24741439 5' - gypsy12 10177 2 58.42 TAAAAGTGAAATTACTCAATTGGATGGTGATTATTTATTTTATGTCTGTATTTTCACGCATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 + chrX 3691511 5' - jockey 4978 1 46.53 GCAGCGAGATGTCTGGCGTTGGCATCTACAGCATTCAATAAAGAATGTTTGCGATTTTTATCTTGCTGCCGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 + chrX 7534605 5' - Tirant 8504 2 76.24 ATGGAGTGGGGGAGCAGAGAGTAGCAGCTTTGATTTTGATTCCATTTTTTATCTTGCATAACAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGGCTTATTGCATA:1 - chr2R 12550408 5' - Helena 399 1 55.45 GCATGACAAATTCCAATTATGGAAGGCCCATTCTTTCGCTGCCCCACTTAAGCTCAGCTTAAGACTCTTGACACATTCTCCTGCACACACACACACACACA:1 - chr2R 15889857 5' + accord 7026 2 70.30 AGACGTTGTTTTCGACAAANACCCAAAACCCCCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3R 6437514 5' - 412 447 2 68.32 TGTATTAAGTGCGCCTTTCGCCAGTCTCGCCAAGGCAACAGATGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 13544146 5' - roo 9041 1 55.45 ACGACGGCATTATCTATTACCAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:1 - chr2L 8007869 5' - copia 5069 2 79.21 AGTATGCATGTGTAGATACATCTTTAAACATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGCTGTA:1 + chr3R 19469507 5' - hopper2 1561 1 39.60 TTTACAATGTCTTTCTTCTTCCAGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAG:1 + chr4 273773 5' + Circe 179 2 76.77 GATAATGAAGCTCTGGCCACATTTGCATATCGCCAATTTGCAATCCGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCG:1 - chr3R 15522420 5' + X-element 48 1 54.46 GTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACC:1 + chr3R 23020819 5' - INE-1 572 1 56.44 ATATTTTTCCCTGTGTACATTTATGCTTCTAAGGACTTGCCTTCTTACAATTCTATCGCCTCTGGTCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTGGGGAAC:1 - chr3L 5231653 5' + INE-1 556 1 72.28 AAAATGTTTTGGGTTTTCGAATCCTCAGTTTGTTTGAGTAGTCTGTAGATATGATCTTCGACATTGTAGATGTTGCTTCTCGATGCGATGCCCCAT:1 + chr3R 19011103 5' - Doc3-element 4341 1 70.83 GGTGGGTTTTTCCCAGGAAGTGCTGGGTTTTAATATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTA:1 - chr2L 18818067 5' + jockey 178 1 67.33 ATTGTTAAAATATTATGTTAAAGCACAATGTGGCACCTTACTTATTTTGTTTTTTTCTTTCCAAGCTGTTGGAATTATTTTAAATTTATTTATTTAAAAAT:2 + chr2L 8745202 5' - G7 1143 1 91.09 GCCATGTTGGCCAACTTGTTGTTACCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 - chr3R 20345145 5' - transib2 2774 1 77.23 ACCTCATGTTAATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 19446186 5' + roo 8701 2 66.34 TGTGAAAAACTTCTGAACTNTAACATCTCCACCACGGTATCAGAAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAG:1 - chr2L 17986240 5' + F-element 4469 1 59.41 AAAACCAAAAAAAAAAATATGGTATATCACTTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATG:1 - chr2R 21697974 5' - accord 450 2 69.31 TTATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 22494706 5' - 1360 3362 1 63.74 AAGCAGCTGCAACAATCGTCGCTGCCCAGCGGCAACATGTCCTCGGTGACGACGACAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTTACCGACAATCCCAAACGCA:1 + chr2L 16559059 5' + F-element 284 1 61.39 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGCACATATATGGCCAGCGGC:1 - chrX 12649915 5' - blood 144 2 91.49 AATCGCTTTGTTGTAAAAAGTGTTCCGTCATGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr2L 8690504 5' + Tirant 9 2 70.30 AAAAAATCGACTCGGCATGNATTCAATTAAATATTAAATAAACGATATCAGCAAACAGCCATTTTCCGCTCGCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGC:1 - chr3L 1697516 5' + Tirant 403 1 75.25 ATTACTAAGGGTATGCCATTTTTCTCATGCCACACGAATGGTTACAAATTTATAAATATTTTAAGTTTTTTTAAATAGTAAAAACAAAGACACTAGAATAT:1 - chr3L 11314526 5' - Tc3 315 1 40.59 ATTCTGAAAATGTCAAAATACCTTCGAAATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCT:1 - chrX 8447038 5' - jockey 4580 1 72.28 GTCTAAGCTTTTAAATTATATAAATCCTTTGTTTATTTTTGAGTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGG:1 - chr2L 15818034 5' - I-element 5321 1 64.36 AATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 - chr2R 5531189 5' + 1360 72 1 55.45 TAGTTGGGGTAATGCATTCGCAGACGCCATAAAATGCAAATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATAAAAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTT:1 + chr2L 14004929 5' + G4 3512 1 64.36 GCATGCAACCAATGTAAAGCTAACCAAGAATAATACCTCGTCTGCTCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAA:1 + chrX 14990150 5' + mdg3 5181 1 55.45 AGCCACTTCACAGCGGCAAAATATTCATTTCAATAGACTACACTCCTGAACTTGTGTACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTG:1 - chr3R 26170473 5' + X-element 26 1 50.50 CACGAATCAAAACCATATTNATAGTGGTCTGTTTCTATTTGAATTGTTTGTTTAAAAAAAAAAATAAAAA:1 + chr3R 7627769 5' + TART-B 10632 1 90.00 TTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAA:1 - chr2L 12636389 5' - Porto1 4587 1 78.22 GCCTTGATTGTCAATCTGCNGACATACAAATGAGAATGCATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGG:1 - chr2L 13913320 5' + HMS-Beagle2 34 2 60.40 TAATGTGGAATGAGATTAGATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 2270533 5' + roo 8714 2 76.24 GGACGAGTGTGTTAATATATATATGGATAGACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAC:1 + chrX 16175863 5' + I-element 4946 1 70.00 TATAGGCTCTTGCGATTCGAGCCAAAACACAATGTCAGTCCAACAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGAATACCACCAATAAGCTTCTCACAG:1 - chr3L 5089352 5' - R1A1-element 220 1 54.00 GTTTCCAGGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 14690972 5' - roo 9023 2 77.23 AAGGAATACCGTACACCTTTTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAA:2 + chr3R 4536181 5' + Ivk 27 1 52.48 ATAAGGCTTTAGGATAAAAGTGCGCTTGTGTTTGTTCGCATAAATGGCTACATCGTAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:2 - chr2R 19594683 5' + roo 8682 2 63.37 TATTTGTGTCAGGGTCTGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTCTTTTT:1 - chr2R 24555717 5' - hopper 1407 2 71.29 TTAAGAAAAGCACTTCTTTAATTTGAATTTTAACCTAAACTAACTTACTTTCTTCTTCGACACGATTTACAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCA:1 - chrX 12522777 5' + Doc 442 1 65.35 AACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2R 19594625 5' - roo 9015 2 78.22 TGAAGAATATAAAGTGCCAGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAAT:1 + chrX 7802873 5' + hopper 53 1 80.20 TGTGATATTTATGACTAGGCCATAATTCAGATTGTATTATATAATATTATCGAAGTTTTTCAAGACTTCAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGAC:1 + chr3L 2990432 5' - flea 4654 1 63.37 GTCAATCTGCTGACATACAAATGAGAATGCATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:1 - chr2L 13913311 5' + HMS-Beagle2 43 2 69.31 GTTCCGCATTGAAAGCCGCCTGTGCCAGTCGAGTCTGGCTGTCTTTCGGGTTTTCCCAGCACCGCCTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 16607563 5' + 1360 10 2 69.31 AACTGGGCGAGCAGAGGGGTAAATAGAAACCGGAAAAGGCCCGCAGAACATGCCCCAGCCAAAATGAAAATTAAGCGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3R 12937391 5' - roo 408 1 74.26 TTTATGTGCAGTCTATTATAAGTTTTCAGTCTCAGCTGTTTTTGCTAATATACTTGGCTATGTTAAACTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 + chr3L 1927396 5' + mdg3 5263 1 69.31 TGTAAATCGCTTTGTTGTANAAAGTGTTCCGTCATGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr2L 8690500 5' + Tirant 8112 2 73.27 AGGTGTTAGGCTTTTTGCGTCATTTGTTTTGTAGCTGGGATCGGTGGGACTGGAATTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 + chr4 718659 5' - copia 253 1 53.47 TACAGTTTAACTTTGTTGCNTTTGCTATTCATCGTTTTGGTCTTATTTTGGCAATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAAT:1 + chrX 21401623 5' - P-element 338 1 57.43 GCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr2L 19207921 5' + 412 7101 2 71.72 CATGTTATCTTACATATTAAATTGGAAAACGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:1 - chr3R 9858915 5' + BS 17 1 56.44 TACCACCTTCTGCAATTGATTGTAGAACCCGACTTGCGCCAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGG:1 - chr3L 8699308 5' + accord 40 2 65.35 GAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTC:1 - chr3R 10736144 5' + McClintock 1 2 76.24 CCGCAGACTGAGAACTTTTCACCGCAGCAGCGCAGTTGCGCTCAATCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr2R 8232477 5' - P-element 2858 1 50.50 TAATTTTGGATTTCTTACTGTTTGAATGCTCACAAAGCTCATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3L 10560242 5' + pogo 33 1 65.35 GAATTCTTCTCACAGAACGATCACATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACA:1 - chr2R 4802884 5' - mariner2 274 1 32.67 AAAGGAGCTATGCTGGTTAAGGAGCTTCCTTCACTTGTTTCATTTTTAATAACATATCTCATATCAAGACCATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 + chr2R 8706991 5' + flea 4758 1 78.22 AAAATGAATGCCACCAACCACGCCATCGTCCAAACAAAACCCCAAAAAAGCGATCCTCTACATTACTTTGTTATTCAACGCTATAGTGAGGCTGCAATACT:1 - chr2L 19699884 5' + BS3 338 1 75.25 ATACTTTTTTAAATAAATTATAAGGTTCAACATGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 - chr3L 23104102 5' + Max-element 8279 2 70.30 TGCATAGGAGAAGCGAAGGTGGGCTTTGTTTGCCAAGGATGCAAAGTGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCCAACTGG:1 - chrX 2163931 5' + Rt1b 4816 1 62.50 TTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCACT:1 - chr3R 2689420 5' - diver2 4465 1 55.45 TATAACTAGGAGTTATGTGGATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr2L 19207958 5' + 412 13 2 64.36 GCGACTTTTTGATTCCCCATTTGTCTGCCTTCCTTTTCTTGTCTCACTAATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTG:1 + chrX 21494165 5' - G6 1861 1 56.44 TGTTTTGGCCGTAATAAATTCGGACAGCTGTAAGCAAGCAACAAATGGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGA:1 + chr3R 5957002 5' + Tirant 8201 2 53.47 ACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr3L 455613 5' + Doc 56 1 81.19 TAAAAACACTGCAATTTGTATTTGAAATTGCCGCAAAATCCCAACAGCACCGTAACTAAAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAA:1 + chr2L 15145938 5' - 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jockey 4940 1 70.30 AAATTAAAAAGAAGAAAACACATAAACTGCGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAG:1 - chr2L 20147911 5' - G2 2877 1 70.30 GAGATGTTCATTGTTGCGGAAAAGTAAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 + chr2R 13446634 5' - roo 9058 1 63.37 AGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGC:1 - chr3L 16047626 5' + Cr1a 455 1 60.00 ACTTCTAATGTAATCAACATCTTGTAGTTTTAATTGCATTTAGCGTTGCGAGCAAGGAATTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTG:1 - chrX 14658769 5' + X-element 26 1 52.48 ACACACACAGACTGAGTCAAACGAGTAAGAAGCAGCAGCACATTATACGTGGAATACAAAAAGTAACCGACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTT:1 - chr3R 21632355 5' - HeT-A 5975 1 72.28 GCATACGCAGCGTTGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chrX 11025596 5' + hopper 8 2 71.29 AGCGTAAACAATGACAGGAAATGGCACAATTTCCCCCGGCAACATCTTTATTTTTCATCTCCTTTGTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGT:1 + chr2R 10162295 5' - Tc1-2 1182 1 66.34 TTTGCACTTTGTGTGAAATTTGACATTTTGCGGGCATTTTGGTTTCGACCAAAAAATTTATACTTAGAAAATATAGGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAT:1 + chr3R 20173141 5' + FB 277 1 62.38 TTTATATTGTTTTTCTAAATCTGGTAAGCCAACAAAGTGCAGCATTTTCCCACGGCCAGTGTCAGATAGCCTTACACGCAATGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr2L 13215083 5' + roo 8663 1 77.23 AAAGAGATATGAAAGATTGATTCAGAATACCCCTCTAACACACTATTCTTGACAACCCGATCGGACCTCACGCAGCTGCAGAGGTTGTTCGTGCCTCTGCC:1 - chrX 148150 5' - invader4 97 2 70.30 TTTGCATTTTGTTTGGCTCTTCCCCATGGCGTTGTCTGTCTGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAA:1 + chr2R 11937266 5' - Doc 168 1 60.40 AAAGTCGGACAAAAACCAANTTGTAATTTGTACACTTGTTCGAAACGAACCTGAGCACTTTCGGCCATACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:1 + chr2R 22898700 5' + Transpac 5 2 74.26 GGCTGCTGTTTCAGCAAAACTGAAGGCACGACACGGCCAACAAAAGTTAAAGAGCTCTCCACCAAAAGATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2R 10778194 5' - roo 401 1 68.00 ATCTGGTAAGCCAACAAAGTGCAGCATTTTCCCACGTCCAGTGTCAGATAGCCTTACACGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 13215065 5' + roo 17 2 57.43 TGGGGCAAGAAGTTTTTCCTTTTGATGCCGCTGTCGCTGGCTGTGTGCGTGGGCGGTTGAAAGTGCGTGTGTGTGGTTGTGTGCGTGTTTTGGGGAGGCAT:1 - 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chr2R 19513447 5' + roo 8680 2 57.43 TATCCACCGCCACTAAGCTGAAAATGGAATTTATTTACCGTAAAGTGACCAGAAAAATTAAGAGGATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTG:1 + chr2L 22296689 5' + gypsy4 315 2 66.34 GATGTTATTTTCTCGTTTTCTTTAAGGGCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 12937474 5' + roo 8705 2 73.12 TATATAAAAATATATATAAACACTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCTTAGCTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTTGCGGTTTTTTGAGAA:2 + chr2R 5943529 5' - hopper2 1116 1 77.23 AATGAATCAAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3R 26434171 5' + hobo 41 1 65.35 ATGAATTATTTTCCATTTATGTATAAACCTTATAAAGGAAATCAACCGGAAATACTTTCCAAATGAAGTGTTGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGC:1 + chr2R 18355823 5' + R2-element 3560 1 55.45 AGTCTACGCACACACACCAACACACCATTCACCCACAACATGACCATTACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAGCCATA:1 - chr2R 20288542 5' + invader1 3964 2 54.46 TATACCAGGGCCAACAGGTGGCGCTCCAAATGGCGCTAAATATCCTTGTGCTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCAAATGTTT:1 + chrX 16637437 5' - Q-element 556 2 76.24 TTAAAGCGCAAGAGTTTTGAGCTCCCAGGACCTCAAAGTCCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGGTCATATTTAAAAAGAAAAAGGAGTGC:1 - chr4 810156 5' + Tc1-2 1206 1 69.47 ATTCGATGATGCATTGCTGTTATTTTTAATTACGCCCCGGCAACATTGTCGCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3R 19270423 5' - pogo 2079 1 57.43 TAATTTTCGATCGGGTTTCTTTTTTTCGCTCACGTGCAGCCCAAACAGCTGCTGGGGGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 + chrX 21374151 5' + P-element 17 1 65.35 GCACTCCTAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCT:1 + chr3R 19950444 5' + BS 5008 1 60.40 TTTTTTTTTAATTTTTTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACATATTAAAAAGAAAGACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTC:1 + chr2L 18726350 5' + HB 1401 1 68.32 GGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr2R 18988463 5' + hobo 55 1 76.24 AGACGGAAGACGCGAAGAGCGAAACAAGTGTAAACAAATCACAAAAGGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCAC:1 + chr3L 16712712 5' - accord2 7235 1 59.41 GAACGCAAACAGAGCGGGATGAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:4 - chrX 11030899 5' - roo 9019 2 77.23 TGGAAAGATTGCAAAACTTGGAAATAAGCTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 10434609 5' - 1360 3344 1 69.31 TTTAGTTCTAACAGTGGATCCAGTAAATGTTTCGTAGAATCCATATTTGTGGGATATAATTATGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chrX 11987960 5' - 412 476 2 65.35 TTAACGACGAGCGCACGCACACAGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 11278360 5' + hobo 4 1 66.34 GGTAGCGGTCGGCTGTTGCCAAGAAGTGATAATTGGGATTACAAAAACGAAAAGACCGTAGAAGCCAGCATTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTCTGAGAG:2 - chr4 957243 5' - Tc1 122 1 75.25 GCCTCACGTGGGTATATATATGTACATGTTTGGTGGCCCAGTATGAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGA:1 - chr3R 16707767 5' + rooA 7360 2 60.40 TTGTGCGCAGGTAAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2L 15907154 5' - pogo 2063 1 64.36 TATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 - chr3L 21912313 5' - Bari1 1654 1 78.22 TTACATATCACTGAAAAAATGTGTCTAATACTATTAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr2L 3740544 5' - hobo 2899 1 63.16 ACAAAAACAATCAAATGGCNCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr3L 455613 5' + Doc 56 1 81.19 AAGCGAAATAGGACGCCATATTGGGGGATATCTGATCGGATTAATGATGTTATATCAGCCATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACACAAATAACGTTA:1 + chr3R 4769434 5' + copia 17 2 60.40 GGCAGCGGCGGCCGGAAAGAAGAAGTACAAGAACAAAAAGAACTCAGCGGAGAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGA:1 + chrX 1342506 5' + invader2 4813 1 57.43 TTTTACAAGCGCCTCCACAGTACATTACTTGCAGGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 + chr3R 8460866 5' + BS 34 1 62.00 AAATCAAATGCGATCCGCTTTGGCCAGACGCGCTGACTGGACACTAAAACTTTGCTGGGCATGCTAGTATTCTGAGTACAATGTACTCAGAATACTAGCAT:1 - chr3R 11876984 5' + gypsy11 4025 2 63.37 AAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3L 11697067 5' + pogo 39 1 66.34 GCACGCAGGACATAGGACATAGGACATAGAACGTGGGGCAGAGAGTTCCAGGGGTCGAGCACTAAAACTTATTCAGCGACTGTTAATTGGTGCCCACGGCA:1 - 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gtwin 7374 2 62.38 AAAATACAATTGTTGACTCGATGTTCAGACGGACGGACAGATAAATGGATAAAAAATACGTAAACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 16200044 5' + roo 8675 2 69.31 TATGCGAAACATTTTTTGGAGTCCGGCCAGCGCACTATGGGGCTTTTGGCCTGGTTTTTTTACAATAATGTGATTTTAACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 + chr3R 12178222 5' - hopper 1367 1 63.37 GCGATGAGACCGATGAGCTGCAGAAGTTCCCCGGCAAGATGCCACTCGAGCTGGACTTGAGTGACCTGGCTGCCTTGGGCGTTTTGGATACTAATAAAATA:1 - chr3L 5569192 5' + gypsy3 132 2 73.27 TAGTTGTCAGTTTTTCGCCTTTCTTGCTTTAAAAAATGAACTAAACTTGAAGTTCTAAACAAATAAATACCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATA:1 + chr2R 13712122 5' - mdg3 241 2 48.51 TTTATTTATAAATCATCTCATGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2R 11661160 5' - 1360 3359 1 58.42 TGTGCACACACGCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGATGACCCTCGGACTAG:1 + chr3R 13520189 5' + jockey 4716 1 74.19 AAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTT:1 + chrX 23431614 5' + G6 38 1 58.42 CGAGATGTTCATTGTTGCGGAAAAGTAAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 13446633 5' - roo 9059 1 64.36 GTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 153596 5' + 1360 46 1 70.30 ACCCGCACTCATGTGAAGGAAAATAAAGGAAAACTTCAAGCAATCAAATCGAGAATACCCTTTCCTTAATAAAAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGAT:1 - chrX 17727148 5' + 17.6 7001 2 79.21 AACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr4 311565 5' + 1360 53 1 77.23 TATCGCCTAAACGGAACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3R 18171853 5' + 1360 17 1 63.37 ATATAGTCTCTCGCATTTCCTCAAGCTGATGACAAATGGGTTTGTTAAGCATTTAAAATTTCAATTTTTTTTTAATTACAATTTTAAAATTTCTTAAATTT:1 + chr2R 7400201 5' - 1360 3031 1 65.35 AAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTA:1 + chr3R 4357535 5' - Tc3 1685 1 52.48 AATGAGTTACGAAATGCATAAATCTAATCCGATTGCGAGAACGTGACCCCTACAAAGAATGTCCATTTGTCCGACTGTTCGTATGAACGTCGATATCTCAG:1 - chr2L 3897796 5' + INE-1 136 1 68.32 AAAATAGGTCCAGAAATTGTGGAAGAACTCCTGCGAGTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 19513350 5' - roo 9051 2 57.43 TGTGTCAAAGTAGGCACGTATGGTGCCTACATACGAGGCCAACTATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGGTGTTTGAAAAAATTTTCAACTT:1 + chr3L 24149472 5' - hopper 1033 1 60.40 GAAGGGAATTTGCTTCAATGTAACGAGTGCCAGTAATGTGATTGCTAAATCCTCAATTGAATATACACAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTT:1 - chr2R 9811382 5' - Quasimodo 7366 2 77.23 AATTAAGCACATGAAAATTTCGCCCTGTGCACACACGCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 + chr3R 13520164 5' + jockey 4699 1 53.47 TATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 28628089 5' + 1360 55 1 80.20 AAGGCGCAAATAAATACACCGCCCGCATATAGAAGGTGGGCGAGAGGTCCTTTGTTTGCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 - chr2L 15848312 5' - hopper 1401 1 65.35 GGATCATTTAAAGTGGAGAAGGTTATTCGAACGCACGCCCAAGAAGTCCGCCTCCTCCTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTG:1 - chrX 15072048 5' - F-element 222 1 64.29 GCTGCATGCAGCCAGCCATGAAATCTGTACAACCTTTGCCCCACCATCCACACATCAACACTTACTGATGAGAACGACGCTACCAACATGCCAACTATG:1 + chr3R 22647261 5' + Ivk 5100 1 56.57 GCCAATTTTTGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCT:1 - chr4 1271912 5' - 1360 85 1 64.36 TGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chrX 3649746 5' + jockey 28 1 66.34 GCATCGCTGGCCAGGAATCGGGCGTGGGTGGTTGGGGGGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGTTGAGA:1 + chr3L 7093504 5' - F-element 4407 1 70.30 ATAAAAATTATTGTAATAGTTTTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGA:1 + chr3R 25844288 5' - Stalker4 390 1 58.42 TAAGCAGGCCACAAAACCAAATCAACGGAAGTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGTGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGC:1 + chr2R 13333271 5' - Doc 438 1 67.33 TTTATTTTCTCATATGTATNTCACACCAATTATCCAATCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 + chrX 18584907 5' + Burdock 6164 2 56.00 AGCAAAGAAGTTTACGCCTATCTTATGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2L 15907242 5' + pogo 9 1 70.00 AGATGGAGGCGGCGCCCCCAATTGCTGGCATGTAAGTTGTTTTACTCCAAATTTTAATTATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 11758347 5' - roo 393 1 58.42 GTTGCAAATGGTGCAGTGCCACATACATTTTGGTGTTACTCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGT:1 - chr2L 18500373 5' - Tirant 365 2 59.41 TTTCCAAGTCTCCTCTGCCGCCTCGGTCCTCCCAGCCAGCCCACAAGTTCGATTGCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCG:1 - chr3L 568230 5' + blood 7214 2 62.38 GCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr2L 4110966 5' + Doc 46 1 73.40 AGCGTGTCTGTTGCATATCAGTGACCAAAATATCGTTATTCCCCTATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3R 26343118 5' + blood 7040 2 52.48 GTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:1 - chr2L 12199501 5' + Stalker2 7299 2 76.24 TTGGCTTTGTATTATACCATTAGCATTTAAATGCAGTATAATTTTTAGTCATTGCGCTTGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 18769662 5' - roo 397 1 62.24 ACCTCGTTTCGTTTTATTTTTATTATTGTGTTCAGTTACTACGTAGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTAATTATTAGT:1 - chrX 8973017 5' - flea 4988 2 54.46 ATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 - chr3R 19963461 5' + 1360 22 1 48.51 GCGCCAGGAAATAATCAGGCGTCGTCGCCAACGCAAACGCAAAAGCTAAAGCAAAGTCGGCGGAGTCCGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTCAACCT:1 + chr3R 17060076 5' - INE-1 96 1 68.32 TGCAATGTGGACTGCACATGGGAACGCACCTTGTCGCGCAAATCACGTATTTCTGGGCGCTGCACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chr2L 13792264 5' + blood 7022 2 66.00 GAACGCGGACACGGCTCCCTTGGCTATTTAAAATTTACTCTCAGCAAAGCAAAAAGCTACAAAAAAAATAAA:1 + chr3R 30769910 5' + G2 3068 1 84.72 GGCACGCCCGATTGAGCAGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr3R 27455521 5' + 297 9 2 71.29 TGTGACGTAGGAGAAGAGAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGGAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGAC:1 - chr3R 11197507 5' + micropia 5332 2 80.20 AGGGCAAATGTATGACTCAGGAAAATCAGAGATTTTATTTCGATGGCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 + chr2L 4110914 5' + Doc 1 1 80.20 AGGTGTGGGAAGCCCCATAAAAACATAATCACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTT:1 - chr3R 16590260 5' + Tirant 8284 2 71.00 ATGCATGTAATCTGTCCCAGTGTGCCACCACTGTGTGCCACCACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr2R 19557974 5' + 412 7080 2 52.48 GAAAACTGAAAACAGAATTTTTTTGTATACAGAAATGAATGAAAATTGAAAACGCAGAAAAAAAAACAGAAACCGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAACAA:1 - chrX 20771245 5' + Doc2-element 219 1 49.49 ATACTCAGAAAGCCAAATTNTTTAATAGTAAATAAACCAACAAGGTGTTGTGTTCGAGTATATAAATTGTATAGCTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGT:1 + chr2L 14038361 5' + 3S18 5767 2 74.26 ACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 + chr3R 18342472 5' + F-element 58 1 69.31 ATACTGTTGAGATTACTTAGAAGATATTGATAGTTGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chrX 153052 5' - mdg1 409 2 66.34 TTTTGGAGCGACTGAAATGTGATAAAAGCCCGACTACAGTTTGAGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chrX 15137392 5' + jockey 4701 1 58.00 ATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chrX 4422675 5' + jockey 31 1 55.45 ATTTATTTATAAACCGACTNAGTAAGATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr2R 16979751 5' + 297 46 2 82.18 TTCGATTCATATTTCCGCGNTTTCTATTTCTATTGGTTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCC:1 - chr3L 26159769 5' + F-element 440 1 97.03 GCAATAGATGTCGTCGAACTTCTGGTTCTTCAGCGACTGCTCTACATCACGAGGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCT:1 + chr3R 11347238 5' - flea 142 1 62.38 ATTTGTGCTCCTGGGGCTCCGGCTCCGTTTGTGCACCAAAAAATTGTAAACTTTCTCATTCGCACTCCTGCTGGGAGCTGGGTAACGGGTATCTGATAGAC:1 - chr2L 15533796 5' + INE-1 549 1 69.31 GACATTGCTACCACATTCGGTGCGTGGACTCTGAAAGCTCTGAGTGTTTTGTTTATGCAAAGCTTTTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3R 19671662 5' - P-element 2880 2 72.28 TACTGAAAAACCCACTTAAGTATGCAATGCTAAAAATTCAAATGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3R 28728645 5' + hobo 24 1 52.00 AGTTTCAACACGGAAAATAAATTGCTATCAATGATTTATATGCCGATTGGATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 - chr3L 2339836 5' - roo 9046 1 54.46 GTGTGGGGACTTTTGTTTGATGACAAATTAATTTAATAATAACAGCTGCAGAAACATTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTACT:1 - chr3L 7969244 5' - jockey 24 1 57.43 AGGCCATGATAGGACCCGTCCTGCCCAGCAATTTGACCCGGGAAAAGTCTCCTTCAGGTGCTCGTATTTGTTTACTTCCGAGGGTTGCGCCAGAACATCAT:1 + chr3R 14888187 5' - Chimpo 493 1 52.48 GTGATTAGAAATTAAATCAAATTAATTAAATACGGCTTACACAGCAACATTTAACAAAATCCCGCATATACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chr3R 20872801 5' + copia 4876 2 70.30 GAATGCGGGACACTGTCGTTTGGGGGATGGCCAAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 13194703 5' - roo 390 2 60.40 GACACGTCGCGGGTGCAAGTCACCAAGCTACTAATGGCAGACGTAACGCTTGCACGAAGTGTCAAGAGATTTGACCACGCGGGAGGTGATTAGCGCGGTTA:1 + chr3L 23452979 5' + rooA 7392 2 57.43 AGTTAGGTTCTTGCATGCCNCTCTCTGTGTGATCTTCCCGTTTTTCTCTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTT:1 + chr2R 8866227 5' - Bica 84 1 64.36 GAAGCCCTGGCCAACTATGATCCGGTGCTCAATGAATACTTTTTTGATCGCCACCCCGGGGTCTTCACCCACACACACACACGCACACACATATTG:1 - chr2L 9384707 5' + accord 185 2 73.96 ACTTGAATTTTATTAAATTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr2L 13334838 5' + hobo 38 1 63.37 CAAATCAACAGAACTACCAGCTGCAGCTGGTGGAGTCACAAGTTTCATCACGAACACTATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chrX 1762917 5' + jockey 4687 1 61.39 AGTTTCAGTTCAACTTCCGCACTTGTAAAGTCAGCTCACAATCATGGGTTTGTTTTTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTAC:1 + chr2L 4378703 5' - Juan 4189 1 52.48 GATTAAATATAGGAATCCTACTGTATTTGAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 7494007 5' - roo 398 1 68.32 ACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr2L 8690545 5' + Tirant 8157 2 74.26 GCCGTCATGCAATGCAATTTTGTGGTTTGCAATCCGGAGCTGACCACCACCACCTCCCTCTTCCCTTAAATTAAATATTATTATTATTTTTATTTTTATT:1 - chr2L 12303814 5' - mdg1 7063 5 51.00 GCTCTCGTGCTCGTTATATTCATAAAGCTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2L 20821762 5' - 1360 3342 1 73.27 TGATCTAAAAGATGCATTTTGTCAAATCCCTCTTGATAAAAACTCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr3L 25059145 5' - mdg1 7428 2 56.44 TAAAAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2R 19594608 5' - roo 9032 1 62.38 TGCAACAGGAAACAATTACAGCACAGCCGGAATCTCAACCTTCTAGCCGTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTCCCGTTACATACTTTTCAACGAATCT:1 + chr3R 31675095 5' - INE-1 14 1 69.31 ATGCCGTCGACTGCGGACGCGTCATCTGCCCACGCTCCAGCTGCCTACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGC:1 + chr2R 6769446 5' - 412 462 2 52.48 CACAAATGTCAGCTCCAATTAAAATGCCGTTTGTTTGTTTGTCCACTCTGAACGTCGAGTGCACTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTC:1 + chr2R 25017959 5' - invader3 264 2 66.34 ATCGGTGGCCCTCGGGGGCTTGAGTTGGGTTTTTTATATACACTCTTTCGGAGTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 771750 5' - roo 389 2 56.44 AAAACAAGCACGGTTCTGGCGTCGCAACTATTAATCTTAATTTCGAAAGCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGT:1 + chr4 729142 5' + 1360 3223 1 57.43 GATTTTATTTCGATGGCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2L 4110944 5' + Doc 30 1 52.00 GTAACTATGTGAAATTAAACAATAATAAAAGTTACAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 3475275 5' + roo 40 2 73.27 AAAATCCAAATTAAATATTTCCGCATGAAACTCAATTCTTACAACTGATTGAATAACCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 - chr3L 7204118 5' + Tabor 22 2 53.47 GAATTAGCCCCCGGCAAATGGTAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAG:1 - chrX 14628000 5' + pogo 1813 1 78.22 GTGCAACCGGAAACGGAAGTCGACGCAGACAAACACCAGATACGAAAGGGCGCCATTGTGATGGGGAAAAGTGATCTGTTGGTTGACGCGAAGGCTCTAAC:1 - chr2R 24447927 5' + Gypsy12A_LTR 474 1 64.36 TTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACACCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr3R 13685211 5' + Tirant 8133 2 66.25 GGAAATGACACAGCCGCCATGTTGGCCAACTTGTTGTTACCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr3R 20345160 5' - transib2 2790 1 62.00 ATTCTGCATATGCCTATCAAAGTTAAGAAACAATGAAAGCACATGAATTGTCCAGTAATATTTGTATGTAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr2L 8966983 5' + 297 2 2 78.22 TTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATT:1 - chr3L 11257381 5' - 1360 13 1 47.52 TTGTTAAATTAGGATAAGCGAAATAGGCCGCCATATTGGGGGATATCTGATCGGATTAATGATGTTATATCAGCCATATGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 + chr3R 4769419 5' + copia 2 2 77.23 GTGCCCCATCATATCTTTTATATCTTTTGTTAGCTTGAAAACTGCGGTATCAGTTAGTCGGCTACAATATCCCTTTTTTTTTACTCAAACACAATA:1 - chrX 7060946 5' - Stalker2 494 1 79.17 GTAGCAAGATTAATGCCTGCATTATCTTTCCTCATTTGTCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTGCTGGGTAGACCGAGAGAGGGGA:1 + chr2R 15793969 5' + accord2 193 1 61.39 GGCAGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr3L 19271017 5' + 1360 51 1 75.25 TGATGATCAATCAGAAGTGATCTCATCCAGAGGCTGGGTTCTTTCAGCTTTCATATTTGCTCATTTCTTTTGCTAAGTAATAATAATAACAATAACAATAA:1 - chrX 3406479 5' + mdg1 7064 2 81.19 TTGAAATTTGCTCTCAGTTAATCTTAGTATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr2L 20526341 5' - 412 456 2 55.45 ATTTATCTCAGGGGGACTTGCTATTTTTATATGCGAAATAATGAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2L 20147261 5' + jockey 4683 1 60.40 TGAACTGCGCCCAAGCGTTAATTAATTTAAAAACGCTTTGAAGGGGGTGGGGGTGTGAAAACCCATTGTTTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 30327310 5' - Bari2 911 1 90.70 TGGGAAATGATTTACTGTTNTGGCCCAGCCGCAGATTCCACGTGTTTTTAACGACTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 + chr3R 13205743 5' - hopper 1392 1 55.45 GAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr2R 11661139 5' - 1360 3338 1 79.21 TATCGGCACGACGAAAAGCTCTTAAAGGGGGAGGGCCTAGATGGAGTTTGAGTTTAAGATTTTTTTTAAAAT:1 + chr3L 13188317 5' + Penelope 334 1 66.67 GAAAAGTATGTAACATGTAACAGTTAGAAAGCATTTCCGATCATATAAGGCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:2 - chr3L 24727890 5' - Transpac 5208 2 58.42 AAACATGCGTACTTCAAAAGGATTTCTTTAATAATAAAAACACACACAAAAAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3L 19088008 5' + 297 14 2 65.35 TTACTATGTTTAAATTTGAAATTAATATTTCCATTTTTAAATCTTTTTAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAA:1 - chr2R 22912913 5' + Transpac 169 2 56.44 AATAAATGAAATTCAGAAACACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCA:1 - chrX 4748677 5' - accord 6994 2 79.35 GAGCGAAAAATACTTTGTTGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCA:1 + chr2R 6771063 5' + P-element 2828 1 22.77 TTTAATTCAAATTATTTACTTTTGTATTTAGTAGCAAAAGTAACAGGTAGAGCGAAGCGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 20375807 5' + roo 8682 2 59.41 GCTTAGTTTTTGCATTCAAAGCGAAAGAAAATTCAGTTCCTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTAATTTT:1 - chr3L 25397122 5' - roo 9036 1 55.00 AAAATGATGAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 + chr3R 18342461 5' + F-element 46 1 60.00 AACTTTCCAAATATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:3 - chr3R 4474247 5' - copia 231 1 54.46 ACAATATCATCGGATTATACGTATATCAATGGATATCTGGACGAGATAGAAAGATTTGTTTTTTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr3L 16478355 5' - pogo 2092 1 58.42 ATGTATACTTTTGTACAGATCTAATGGAATTTGCTTTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACT:1 - chr2L 2416761 5' - 3S18 6064 2 63.37 ATATCATCGGATTATACGTATATCAATGGATATCTGGACGAGATAGAAAGATTTGTTTTTTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3L 16478358 5' - pogo 2089 1 55.45 TTTTGTTAATATACTTGGCTATGTTAAACTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3L 1927435 5' + mdg3 5302 2 73.27 GCTCTTTGTCATTTTGTTTGCTTCTCGTTTCTCGTTTTCATTTCACTTTTATTTTTTGTGGTGTATAATGTGTATGAGACCAAGTGGTTTCTTAGTTATTA:1 + chr3L 3955887 5' - G5 4738 1 74.26 TACCCTATTAATAAACATTTTTAGCGTAATTCAAATACCTGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCGTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 + chr3R 10229388 5' - copia 253 1 56.44 GTTTCCATGCATGTAATCTGTCCCAGTGTGCCACCACTGTGTGCCACCACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2R 19557968 5' + 412 21 2 58.42 AGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCG:1 + chr3R 4357550 5' - Tc3 1670 1 67.33 TAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr2R 24555679 5' - hopper 1369 1 69.31 AGTAACTTAAGCCACTTGGCCCGCATTTCGTGGGGCATATACATATATATTTTTGGGACACTTTTCAAGGTTCGAGGCCGATGGTTTTGTCTCCGGATCCT:1 - chr2L 19154421 5' - Burdock 337 1 42.57 AAAATAAAAAAAACAAGAGGGAATGCTATAGTAGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCCTTATTTCGCATTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chrX 3029742 5' + INE-1 542 1 49.50 TTTGCACTACAAAATACTATTGAATATAAATTGCGGAATGTTAAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACAACGGCTGGGTT:1 + chr3R 16882006 5' - Cr1a 61 1 56.67 AGACATGTAACTGCTAGTTAAAATATGAATAATACTATGGCTTGCTTTTCCTGTGTATTATTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 21187885 5' - Doc2-element 233 9 56.79 GGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTA:1 - chr2L 12199518 5' + Stalker2 33 2 59.00 AAATTGCTGCCCGTCTCAACGCATTTAAAGTCTAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2L 15983421 5' + hobo 43 1 66.34 GTGCCACATACGTGCAGTTNGTTTATTACTTCTTTATGACCTGTTGATTTGGTTGGGTATAGCCAGACACTAGAATAACATAGCATATTTTGTCAAATTTA:1 - chr2L 17453531 5' - 1360 206 1 42.57 GTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCA:1 + chr3R 12611988 5' - Stalker4 7159 4 78.22 TTGATATTAGAAACTTATGAATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATGGCA:1 - chr3R 7618709 5' + Doc 39 1 57.43 GTCGAGTGTAGTTGAGTGGTTGCTCTCGCACTTTCGGCGGACAGACCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3L 5355414 5' - P-element 2858 1 51.49 TATATCGCCTAAACGGAACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr3R 18171855 5' + 1360 15 1 65.35 ATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:2 - chr3L 25232911 5' + GATE 32 2 53.47 GTTTGAGTGGGCGTGGCAGGTTAGGTCAACGAACTTGCGCCTCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAACCTTAACCTTTTAGCTGTTATAGTTCCTG:1 - chr3R 15673024 5' - INE-1 155 1 73.27 AATGTAGAAGTGTACAGTTTCATCACCTTGAACTTCGTTCTTAAAATACGTTATATCTTGTATATGCATTTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr3R 19931707 5' + jockey 4675 1 71.29 ATTAAAAATTTTCTTTTGTTCTGGGATGCGGAAACTAATCAGGAAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAA:1 + chr3L 3103540 5' + 1360 489 1 65.35 GCATTATGAAAATTACGTTCTCTTTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr3L 11105041 5' - pogo 2055 1 74.26 TGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chrX 3464219 5' + P-element 39 1 40.59 AGATCCAACTTCAGGAGAGAAAAAATGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAAT:1 + chrX 14766394 5' - Doc 4435 1 75.25 AGCAACCGATTTTCACGGTTCAGCCGGAGTTACGAGTCATCCAGACCAGTGTCCTACTATCGCTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 9542591 5' + roo 8677 2 64.36 AACGAAAATCGTACGGCTTTTTGCATTATACGCTATCTAAATTGAAGAACGGCTAACACTATCCCAAGACTCAATTGTCAGATACCCGTTACTCAGCTAGT:1 - chr2L 22196146 5' - INE-1 542 1 72.28 AAGTGTATATGTTCATGAAAGGGGAAAAGGGGGGGGAAACGATCATACGTTGGGTGTGCAGTGCTCTGGTTTCCCGTGGGACTACATACACGCCCAG:1 + chr2R 15596903 5' - baggins 5287 1 70.10 AACGAGGTGGCTGCCTGACNACGTGACTGTACAAAAGTTGGGTAAAGTCGCGAGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGGGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3R 16005437 5' + Doc 27 1 52.48 AACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr2R 6074395 5' + 412 56 2 80.00 AGATTAAGGAAGAAGTAAGGTTCTTCGAATCAAAAAACATCTTGATCGCGTGCGCCGCGGGACTAGGCACTCAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 + chr3L 23875072 5' + Doc 292 1 68.32 TTTTCCCCTGTGTGCGGGAATCAGAACGGTTGTGTATAGGAATCCTTTAAAGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACC:1 - chr3L 10719797 5' - hobo 88 1 59.41 TACGGCTTACACAGCAACATTTAACAAAATCCCGCATATACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 - chr3R 20872771 5' + copia 4906 2 61.39 AATGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATCCAACTGGCTATGTACTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3L 9695489 5' - hobo 2922 1 61.62 TGTGTGTGTGTGTGGGTGTAAATAGGGAGGCGCCGGTGGGTGGGGTGTGTAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr2L 20360938 5' + 412 26 2 53.47 GGGAGGCAAGTAGAAAGGTCCTTTAAGGAGAGGAGATACAAGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr3L 15435501 5' + blood 1 2 78.22 TACTCAAAACCCTCGATGTGGGCGAGAACATGATCAGTCAGATCGAGAACACTAGCATCACCCAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCAT:1 + chr3L 15237475 5' + F-element 447 1 71.29 AACCATTGCCACAATAAATCAATCGGAATTGTTTGCAATCAGCCGGACTTTATGGCTGTTGCTTCTACGGTTAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 - chr3R 22494796 5' + 1360 3 2 77.00 GGTTAAGGTGGGTGAGTTGNGGTCCCTGGGCTTCGCTGGTCGGGCTTATGCACTACAAATTTGTGTAGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCG:1 - chr3L 15355608 5' - F-element 4467 1 71.00 TTTGACATATTGTGAATCGCTTACGAATGACGAATGTGTTGTTGTGCCATCGCTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATT:1 - chr2L 7624801 5' - Circe 7114 1 55.45 TTGGTTTCGCAAAGTTTTCAGGGTTGCCGGACTAGGGTTTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 - chrX 4238835 5' + 1360 37 1 62.38 AAGAAAATACCACAATAAAATGGATCACGTCCGAATAGACATTATACGGTAAGGGTGGCACTGCACTACACTAAAAAAAAACTTAAATACTGAACTCGGCT:1 - chr2R 5173081 5' + Gypsy12A_LTR 1871 1 76.24 TTTTTAAAAAAAGTTTTTAAATTTTTAAATTAAATTTTTAAAATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 + chr3L 15305078 5' - I-element 5317 1 62.38 GAAGACATATGGATTTGCAGTTAAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr2R 20460982 5' - hobo 2886 1 76.24 TAAAGGCAGGCCAAACAAACGCGCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATG:1 - chrX 7294172 5' + hopper 50 1 72.28 TAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr2L 15817987 5' + I-element 51 1 76.00 GCCAGTCGAGTCTGGCTGTCTTTCGGGTTTTCCCAGGACCGCCTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3R 16607540 5' - 1360 3356 1 56.44 TGCTCCGAATTCAATAAACGTCTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGGGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 + chr2L 12199473 5' - Stalker2 356 2 70.30 AATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGG:1 + chr3L 21912256 5' + Bari1 27 1 59.41 ACACGTTCAGGTCCATGACNAAAGCCCGCCTTCTACACATTGGCACATCAAAAGGACTCCGCACAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACACGGCGA:1 - chrX 16260408 5' + Tc1 496 1 61.39 GGCCGCAACTGGCGCCACTTCCGCCGCCGTCAAGTGGCGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 6769510 5' + 412 7091 2 64.36 ATGGCATCCGTTTTTAGTGTGCAATACACAGGAGTTACTTTTCCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGGTTTTAGAACTGTGTTTT:1 - chrX 18051472 5' - Doc4-element 2576 1 55.45 GCTAGAAAACCCCCGAATGGCCAGCAACCAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGTATGCCGGTTAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCT:1 - chr2L 2749620 5' + Circe 7413 2 69.31 TGAATATAATGTGAACGAGGCTGCCTAAAAATCCATTAACTTCGCCCAGTTGTGAAGCAACGTAGAAATCATCCAACGAGCCCAATCGAAATTCCTGAGTA:1 - chr2R 14367590 5' + Fw2 3611 1 56.44 AATAAACTAGGTGGGTTTTATAGATGTTCCCAGAAATTTCTAGGCTGATTTTCCCTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 19221433 5' - Bica 337 1 77.14 ACTGCTCTTTTTGTTGAGTACAAATACAAATACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 - chr3R 17896914 5' + jockey 4809 1 70.30 AAATGGTAGCGCCTAAAAACTGGGGTTCGTAGCATCTCCCCAGGCATAAATGTACGAACGACTTATGAGAAGATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr2L 19207841 5' - 412 490 2 73.27 AATGCAATTTTCTTGGGAAAAAGCTGCAAGCATGAGGTGGCAAAAATGTACCCTTTTTTTAAGGTGCTGCCAAGGCTACAGGAGAGTCACCTAAATTGGAT:1 - chr2R 15022884 5' + Bica 4704 1 50.50 TGCACGGCCAGTGCTCTCACGAAATAAATATTTGGCCAATGCAGTAATGTTTGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3R 28216784 5' + blood 23 2 56.44 AAGTTTAGGAAAACGGTACTTGTACCTTGGAGTAGAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chrX 10996526 5' + 1360 15 1 55.56 AAGACATCGAGTTTGTTTTACAAAGGGGTGTAATTAAGCACATGAAAATTTCGCCCTGTGCACACACGCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 + chr3R 13520133 5' + jockey 4668 1 75.25 TACTGGAAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACC:1 - chr3L 25350824 5' - baggins 5418 1 40.00 ATATGTTAAATTCAATATTTCAAAGAAGTCCGATGAAAAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 - chr3R 11498642 5' + BS 25 1 56.99 TTACTAAAAAAGCATATTAAAATTGTGGGCTACTAGCTTTAAGCAACCCACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 - chr3L 5808248 5' - 297 6954 2 58.42 TGCCTCAGTATTTATGTGTTCCCCGAAATATATGATATATGCGAAACATTTTTTGGAGTCCGGCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3R 12178185 5' + hopper 11 2 69.31 GAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chrX 21056947 5' + Tirant 8160 2 80.20 AAAATGGTTTATCTCAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chr2L 2309445 5' + Burdock 6178 2 70.30 AAACGCCAATCTTAAAATATCTTAAGATATTTGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGGCACACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3R 3282476 5' + 1360 63 1 68.32 AGTGGCAAAAAGAAAAAATGAAAGACATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTGATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 - chr3R 27455606 5' - 297 6933 2 74.26 TATGTATATATATCTGATGAAGGTGAAAGTAATTAAAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3L 17146814 5' - pogo 2062 1 66.34 ACATGGGCTCTTTTCTTAGGAATTTTTGAGAGTCAGGTGAGCTTCTTTTCTTATACGGAATCTAGGCCATCGGCTGAAATCACGATCAGCTAAAAGTCACT:1 + chr2L 22672799 5' - Gypsy12A_LTR 195 1 50.50 AAACGTGGCGACTTTCTGCTGGGCGAACCGATTGAGGAGGGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGG:1 - chr2L 3871810 5' + micropia 234 2 56.04 ACAAAATACAATACACAAAGCAGGGAAAGCGTAACATGAAAGGAGCAGGCCAGAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATT:1 + chr2R 19580559 5' + INE-1 67 1 54.55 AGGCAAAGTCCGTTAAGCGGATTTAAAATGCAATCTGCCAATCGCCGCCTATCCCCATCCCTCTCTCGCCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 5206643 5' - roo 402 1 72.28 TTTGTCTAGTTTCCTGTGCCTGTTTAATTTGTGTTCCTTTAAGCTGGCTTAGCAGGGAATTATATTTGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGT:1 - chr2R 8518321 5' + invader1 3622 2 66.00 AATATAGTAACCACTTTTTAAAAAACTAATTACATATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3L 11697116 5' + pogo 49 1 75.25 TTGTAGTTTCATGATTTTTGATTAGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAA:1 - chr3R 20950664 5' + jockey 4521 1 76.00 CCTTAAATGTTTATATATATGCAGTCCTTTGAACTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3L 8905719 5' + pogo 38 1 68.32 AGATTAGATTAAAGTGTATCCTCAAACCTATAATAAATATTAAGACAAAATGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCCTAAAGACTTAGG:1 + chr3L 20596017 5' + G4 3547 1 67.33 GGATGAGTCGCGGTCTTGGGATCTAAGGAGCCCAGAATAAATGGAAGAAGGAAATTGAGTTGAAGGAGTTACCCTGAATCAGCCCCTGCAAGCAACATAT:1 - chrX 15665367 5' + Helena 882 1 70.00 CGTGTGTCAGTGTTTTCATGTGTGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTT:1 + chr2R 22772735 5' - Doc 253 1 77.23 AGCTAGCTTGGAAATAAAATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 11475514 5' + roo 8721 2 89.11 TATCCTTTATTCCACTCCATTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCAAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAA:2 + chr2L 16122318 5' + jockey 4532 1 79.21 TTGCACAACAATGCGAAGGTTGATTCTCAGTTCGTGGAGGAAGTCGGTGAAGAAAGGGGGCCTTCGAAGGGACACGGAACTATTGAACAGGTCCAC:1 - chr3L 11382042 5' + Helena 312 1 70.83 AGCCTAGCCTCAGCCAATCGAATTCCAAAGAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 31474028 5' - roo 9028 1 69.39 GATGAGGATCTACACTTTTNCAGATTTCAACCGAAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chr3L 10683523 5' + opus 7024 2 55.45 TCTTGACTGAACGACACAGCGGAGGAGGCTTACCTCCGCCACATTTACAACATTTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 + chrX 21499241 5' + Quasimodo 21 2 60.40 GTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 7494071 5' + roo 8709 2 82.76 TTTATATATTTTCTTCATCCACCAAAATTGGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr2R 10777904 5' + pogo 2 1 77.23 AAGAAAGTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:2 + chr2L 15817949 5' + I-element 14 1 67.33 TCGTTTCATATTTTGTTGGTTCACCAGTGTAATCGAAATGCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chr2L 13566791 5' + FB 37 1 61.39 GTTTCATATGATACCCCTTGCGATAAGATGGCTCGTATAACAATATCACATATGTAGCTAAAGAGCACATTCGATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 - chr2L 14221354 5' + BS 5012 1 81.19 GCCCTATGCCCTATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2L 9319139 5' + jockey 7 1 75.25 TCTTCCGGTGGCATTTTGCGCCATCGCAGCTGGATCTTCATTTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chrX 15268212 5' - roo 402 1 72.28 GCAGTTTTGTATATTTTGTNAATTGTAATAAATTTGTTGCCATAATAATTTCAAATGGATTTTAAGAATGTGGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGA:1 - chr2L 16831678 5' - jockey 4776 1 75.25 CAGGTGAAGGGGTTGGCTTACATGTTTAGCATGTGGCACATACACGCCAGCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACGATAATGTGTTTT:1 + chrX 2898305 5' - hopper 1392 1 56.44 GTACACCAATTCAAAGAAAACATTTAAGTTACTTTTTCTTTCGTGTTTGTCAAAATTAGGATTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGAT:1 + chr3R 20150937 5' - F-element 4411 1 60.40 GTATTTCTTGCATTTCATTTACTGTCAAATTCGCGTGTGTGCTTTGGTGATGTGAAATTGGCCAAAACTCCAAATATGTATGTAAATTCTTTTCTTGGATC:1 + chr3L 24763896 5' + 1360 3160 1 51.49 AAAATTGATCCTATTATGACATACAAAAAAAAAATTGTGCAAACAATTTTTTGCCAGTGTCAAATCTGTGCAAAGTACTTAAGCTATCTTAGACTTATAAT:1 - chr3R 23137762 5' - S2 1472 1 51.49 TTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCAT:1 - chr2L 21657044 5' + invader1 3644 2 76.24 GAAGGTCAGTTAATAAGGGAAGTACGTTAGGGTTTTAAGGGTTTAATAAATTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 14708708 5' + roo 22 2 58.16 GAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGTTTTGAGT:1 + chr3R 18342469 5' + F-element 55 1 66.34 AGCAACTAATTTTCAAGCTGATGCAACAGCAGACGACGACGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr3L 13366426 5' - hopper 1380 1 60.40 TTCTTCATCCACCAAAATTGGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2R 10777894 5' + pogo 12 1 67.33 AAATGCCTTATCTTAATTGCGAATGAAACACACACATAACATATTCCACTTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chrX 19385299 5' + FB 27 1 53.47 TACCACTGCTTCGACTCGATGGCGGAAACGGAAAACAAGGCTGGCGGACAAAATAAACGGCCATGCGACCCAGAAAACAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13774525 5' - hopper 144 110 89.47 TTTTAATCGGACAGACAGCGGCGTCGACTGCGATGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chr3R 26170824 5' + P-element 43 1 36.63 ACTTTCACGAGAATAAGTTTGAACCGAAAATATAAGTCTAAGTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:1 - chr3L 1927483 5' - mdg3 211 2 57.43 AACACTTGCGAAATGAATTAACTTTAAGCCGCAAAATTTGTACTCTTGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr2R 23122645 5' + hobo 30 1 57.43 AAAAAGTATGCTTTAAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2R 18807826 5' + jockey 29 1 56.44 GGAGTTGAAACAAAAAAAAAAAGAAGGAAAAACAAAAAA:1 + chr3R 9205582 5' + Doc2-element 235 1 76.92 TTGAGATTTTCGCTTTATGNAATTGGGTTGAGTCCCGTCTCAGTCTGTGTTGGGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTA:1 - chr3R 22185579 5' - Tirant 8128 2 63.64 AGAAAGAGAGAGAGAGAGGGACAGTCAGAAAGGCCTAAACACAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGCCATCCACTTAACGTAT:1 + chr2R 18232679 5' - P-element 2853 1 43.56 ATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr3L 27357566 5' - mdg1 375 2 66.34 AATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chrX 5997260 5' - 1360 3340 1 74.26 AAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr2L 16939882 5' + opus 27 4 55.45 GTGATTCTGCAATTGGAATAATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 - chr3L 13367738 5' + mdg3 51 2 71.29 GGTTGCCGACTACAGCTTCCCAAAAATTGGCATTGCAGACGGTGAACTCTGTCGCTTCTTCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGATT:1 + chr3R 28669977 5' + baggins 5233 1 74.26 GTCAAATTGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCACTGCTATTTCTGCTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAAATATAAAAAAAAAAAGAA:1 - chr4 924102 5' + TART-C 11095 1 76.24 AGTTTTGCGGCACTCGAGTACTTATACAAGTACTTTACGCCCCCAACTTGGCCCAATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chrX 15412756 5' - hobo 2920 1 61.39 AGGGTTGACTCGATATTGGAAATGTATGTAAGATTGGTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chr2L 22052537 5' - flea 4960 2 77.23 GGGGGATGGCCAAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2R 13194682 5' - roo 9032 1 66.34 TTGCGTTGCGGAGACTAACGTTGTTGGCTCAAATTATTTCCGTATTTTAGCATTAAATCATTGTTTACACATGAACACGAATATA:1 - chr3L 11758445 5' + roo 3 2 65.88 AGACCGCTGGGAGAGCTTATAAAATTTTGTCATGGTAACATGCCATTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACATCGGAGGGAAATAG:1 - chr4 863362 5' - G5A 2666 1 54.46 GCTGCTGCTGCTTTATGTTTGCCTTTTATTTTGGCCACAAGCCTTTCGTTAGTACATCTGCAACATTTTTATCAGTGGGTACATATTCAAGAATTATTTCA:1 - chrX 17559137 5' - Copia1_DM 4177 1 65.35 TTGACATGCCACAAAAGATGCTCGCTCAGCTCGAAAACGTCATGAAAATGCAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCACACTGATTTTGAACTTCAAGAAA:1 - chr2R 19214418 5' + Tirant 277 2 56.57 GAAAGTTGACAAATGTATTTAGAGGTATTCAGCAAGTCGATCGATTGCATTGGAATAGTAAGGAACGTGCCTTTGCCTTTGAGGCCTAATTTTCAAGCGGA:1 + chr3L 4222821 5' + mariner2 169 1 55.45 AAACGGGTTGACTACACTTGCGAAAACGTTGTACAATGATTTAATATGCATTAAAAAAAAAAGGGTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTT:1 - chrX 3851469 5' - Doc 4601 1 69.23 AACTAAGAAAGGCAATAAANATAACATGGAGTCATAACAGCAATAATGAATTTAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTA:1 + chr3L 27337317 5' + I-element 496 1 54.55 TTGACTAAAAAAAACGTATATAGATAATAATATCGCAGAGATTCCCTTTTTTTGGCATAAAGTCAAATTATAAAGCTCTCTGCATTTTTGTAGAATTGGTG:1 + chr3R 1835369 5' - transib3 2805 1 65.35 GCCCCTCTTTATTTGCCTTGTGGTTGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chrX 8343657 5' + hobo 50 1 76.24 GTGGATTTAAGGATTTTTGCAAGTAAAAAATTATTCATATTTATACATTTTTTTTTGTATAAATAATATATACATACATACATTACATACATACATACATA:1 + chr3L 14284509 5' + 412 223 2 67.33 ATTATGGTGGCTTCGATTGCTCGAAAAGTTGAAAGGTAGATGGAAGTGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAATCG:1 + chr3R 17443626 5' + INE-1 93 1 78.22 TTTTGGGCTTGAGCGCCAGGAACTATCCGGCTTGTGATATCAAGGTTCAATTTCCGAATAATCGGTATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 - chrX 21581200 5' - 297 388 2 72.28 TGACTTTCTCCGCTCTATCCCTGAGAATGACTTCCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2L 20271191 5' + blood 12 2 64.36 TGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTAAGACAATAAG:1 + chr3L 15099551 5' - G4 3817 1 73.00 ATCAACTTCTGCATATCCAAATATGAAAGAAATTTTTTTTAGCCAATGCAAGCATGACTTGCGCGTTGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGT:1 + chr2R 18299044 5' - Idefix 53 2 73.27 AGTTGCAGTTATACGATACTTAGGTGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chrX 8982971 5' + 412 49 2 71.29 AAGTGATAGCTGAATTATTAAAAGCGTCGGTGCCTGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2R 3021388 5' + Tirant 8146 2 64.36 AGTCCTATCACAGGGTTTAAGGAGTTTCTGTAGTTCTCGACGAGCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 + chr3R 29605672 5' - Quasimodo 6993 2 57.14 GCCATTTTAGAGCAAGCTTTCAACTTTTAGGGACCATATACAACTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGTCCTAGCTGTTGTAAACAATTCGCGAAATA:1 + chr2R 15224615 5' + diver2 4816 2 61.39 AAGGACCAAGGACTGCGTTCCAACTCCTGGCTAAGGCAGATAAAGTTGCGAAAAAAAAAATAAAAAAATAAAACGAAA:1 + chr3R 18838827 5' + Doc3-element 84 1 64.10 TGTTTATGTTAGCAATGAAAGCATTTATATTTTGCGTATATTTAAAAGGAAAAAAAA:1 - chr3R 21554028 5' + HB 301 1 70.18 ACTGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 - chr3L 25345143 5' + Doc 52 1 70.71 AATCCCAAAAGTATGCAATGAACTCGAGACGTCATCTTTTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr3R 13239944 5' + hopper 35 1 60.40 GACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAAAACGTATCGCAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:3 + chrX 8037613 5' + roo 21 2 47.52 GAACACCTGCATGCTCATTTCTGATAACTGCTTTCACATATAACGAATATCCATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chr3R 22467021 5' - mdg1 7436 2 55.45 AGGGTGTGTGTATGATGATGTAGTTGATAGCGTGTGTACGAGTGTATGCTACTATACGAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3R 19270324 5' + pogo 15 1 60.40 ACATCTTGTAGTTTTAATTGCATTTAGCGTTGCGAGCAAGGAATTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAG:1 - chrX 14658753 5' + X-element 42 1 59.41 CGATTCATCCGCAGATCAGAGGGACCTTGCTCCCCAAAATGGGAACGGGAATGGGAATGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr2R 6918513 5' + hobo 16 1 63.37 GGGCTGAAGAATAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr3L 4001367 5' + HMS-Beagle2 483 6 78.12 AATAACTAGAATTAGTAGTCGAAAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACT:1 + chrX 15961358 5' - BS 4997 1 77.23 ATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACA:1 + chr3L 21912261 5' + Bari1 32 1 64.36 AGCATCAATCACATCCGCCTTAATGCTGCTCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAA:1 + chr3R 25487520 5' + Burdock 392 1 70.30 TCTCTTCAACAGTATGGCATTAAACATTGAAAAATTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2L 13214990 5' - roo 9031 1 66.34 TACAATATCACATGATATGCAAATAAATCTGCCTACACTTTTATTGTAATTAATTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTA:1 + chr3R 5213205 5' + G2 3055 1 47.52 TTTTTGATTGAAATCAATTGCCGACCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chr2R 6918028 5' + F-element 68 1 80.20 AAGGATTTATCAGTCCCGTCAACTGCCATCGAAACGAAGGGCAATAACCGATTAAGCTCCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCA:1 + chr3L 17677887 5' + R1A1-element 4943 1 66.33 CGAACTGAATTTATTCTCCACTTTAAGGGTGCTCTCCCGCCCACCAATTGTTATTCCGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCA:1 - chr3R 28052300 5' + R2-element 3155 1 66.34 CCAATGGCAAAGCCAAGTCCTGCATTCGGGATGATCAGGTGAGTGATCGAAGTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2R 13518791 5' + roo 8676 2 56.44 TGTCGTCGTTTGCAAATAAATATTCGCCACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chrX 5997226 5' - 1360 3374 1 64.36 GCAGAGGGTACTACATACATATTTAGGCATAAGTTTGGAGTATTGAATGATAAGTCAATAAAGTGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAA:1 + chr3L 13306330 5' - Doc 300 1 65.35 AGCAGCGGATAGTTGTGTTNTGTGCAGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATT:1 + chr3L 22650354 5' - Burdock 269 1 74.26 TGAGTATATGGTTTGTGGAGTTTAAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr2L 12076671 5' + jockey 60 1 77.23 ATCCGCAGATCAGAGGGACCTTGCTCCCCAAAATGGGAACGGGAATGGGAATGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr2R 6918519 5' + hobo 21 1 58.00 GGACTGGGACTCAACCCCACTGAATTGTTATGACGTCGGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr3L 8905782 5' - pogo 2066 1 62.38 ATGGTTGCTGCGTTCAATCTTCGCCCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:2 + chr3R 7411825 5' + 1360 50 1 73.27 GCTAAATCATGGTTTCTAGGCGGTCCTACATATAAAAATGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAAT:1 + chr3L 4235624 5' + jockey 4598 1 58.51 CAAATAACGAAGACAGCAAAATAAAAGGGCGAAAAATCGAAACGAAAACAAGAGTGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAG:1 - chr3L 5277822 5' - INE-1 547 1 56.44 CAAAGAAGTTTACGCCTATCTTATGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATAGATAGTTAG:1 - chr2L 15907240 5' + pogo 12 1 67.33 TTTTACTAAGGCTTGCATAAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTACAGGACTAAAAAAATGTGAAAAAATATCAGCACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCA:1 - chr2L 22045860 5' - INE-1 250 1 58.42 AAAAACGTATTTAATTTACNGAACAATTAAAGTGGGATACACTGAACCATTTCGAACCATTTCGATTTTAAAACCAATGAAGAGAGAAAAAAAATGAAAAT:1 + chr3L 9648979 5' + invader2 295 1 84.16 AAAAATTAAAAAAAAATCCTAATCAGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2R 14536939 5' - roo 357 2 79.21 TTGTACGACGGCATTATCTATTACCAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr2L 8007873 5' - copia 5073 2 75.25 ACCAAGTTTAGGAAAACGGTACTTGTACCTTGGAGTAGAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chrX 10996523 5' + 1360 32 1 59.41 ATTCACACAAAATGGAAAGAAGGAACTCGCGGAAGCCCGTAGAAACTACTAATTAGCTAAAATAATGTGGATTCCTGGTTGTTCACACTATAAACTTGTAC:1 - chr3L 3060489 5' - rooA 365 2 61.39 GATTAAGTTTTAAATATTCTATTATTTACCCTATTAATAAACATTTTTAGCGTAATTCAAATACCTGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr3R 10229362 5' - copia 245 1 66.34 TGTCCGTACCGACTTATAAATGCGGTTTAGCTTCCATCTGGTTTTGTCATAAGTGTGTGCAGAGCATACCCCCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3R 19963480 5' + 1360 3 2 61.39 TAGCCCGGTCGGATAAGGTTTAGACAAAGACACTAGAATAAAAAGATGTAACTGCCATACATTGGTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTCGCTCTAGAG:1 - chr2R 3941859 5' + 1360 55 1 73.74 TAATATAAATTAGAAATAAATTATATGCATAGGCTTAAATATTAAAAAGAATATTATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 11475574 5' - roo 9053 2 52.48 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCG:1 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 5323 1 51.49 ACCTCCCGCGACAGGCGCTAAATACAAACTGAGAGGAACCAAACGACACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr2R 10874713 5' - P-element 2858 1 48.51 GTGAGGCGTGTTTCCCACGCTATTTGGGTTAATCCCCTCGCAAGCCCCTCATCCATAAAAGTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr2L 12779693 5' + flea 10 2 64.36 GAATACCGTACACCTTTTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:1 + chr3R 4536184 5' + Ivk 30 1 52.48 ATGTAGTACAACTTTCCAAATATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:2 - chr3R 4474256 5' - copia 240 1 63.37 GCATGAAGTTATGCTAAACNAACCAGGAGCGGATTTAAAAAAACTGCCGTAAATATCAAGTCGGAGCTACAACCCTGCTACCGGCTTATTCCAGTTGG:1 + chr3L 10976507 5' + Chouto 212 1 62.24 GTTTGTTTTGTGATTTGTTAACAACTATTTTATTTACACTTAACTTAGGTTCCATTAGATTTGATTTGTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTCATTTTCTTTT:1 - chrX 8431470 5' - Doc2-element 218 1 54.46 ATGTTTATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3R 22494702 5' - 1360 3356 1 63.37 GGCAAAACCATTCTATAGCNAATATAATTCATCGAAGTGACAGTGCTATTATGTTAACGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 + chr3R 14521053 5' + I-element 19 1 57.43 ACATTTAGCTATCTCTCAGCGTTTTACAAAAATTAGATTTGATTTAAATGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTC:1 - chr2R 15689639 5' + springer 7163 2 53.47 ATAAAAATGCAGATGCAGATGCACAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:2 - chr2L 15548794 5' - Tabor 435 2 75.25 GGCGCAGCTTTCGAGGGACAGGTTCCTGCGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACATGTG:1 + chr3R 16422122 5' + Bica 44 1 71.29 GCAGGATTTGCCAAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 - chr3L 3428060 5' - roo 9031 1 68.32 GTTAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 + chr3R 26342935 5' - blood 339 2 61.39 GTATTAATTAGCAAAGCAGCGACGTCGAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCA:1 + chr2L 3889364 5' - jockey 4723 1 73.27 ATGCACATTATTCAACTGACAAGCTGTTTCACGAATTACCTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr2L 20550836 5' + jockey 4707 1 64.36 GGAGGCAGCAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:2 + chr2R 18105756 5' - roo 9033 1 64.36 TAGCGTTTTTCTGCGTTCGTGCTTTGCATGGCCATTTGTTACGTATACTTGTGCGCAGGACTGTCGTACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 + chr2R 12252821 5' - opus 7451 2 60.40 ATCCGTTTTCAAGGACACGGTGATGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr2L 7461125 5' - roo 9035 1 62.38 ACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGA:1 - chr2R 4181303 5' + gypsy5 6968 2 53.47 CCGTTTTCTTCCCCCGGCATTCGGGCAGTCTGATTAAGTCTTTCTGAGGGTAACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTT:1 + chr2L 19092270 5' + 1360 24 1 63.37 AATGGAACACCCTCGTCCTGCATTTCATATTGCTAAAGCGCGAACATTAAGTGGCAGTGTCGTCCTTTCGCCGGAGGCGGGAACGGCTGCTG:1 + chr2L 2275053 5' - F-element 4504 1 79.35 GTCCTTGTTTTTTTTTGTTATTTTTTTTT:1 + chr2L 9020934 5' + hopper 146 109 86.21 TCTGGAGATTTGGGGTTTTGGGTGGGGACACCCGAGATAAATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chrX 19219271 5' + Doc 9 1 70.30 GGCTTAGTTTATTCAGCGTCATTAGACGATTGTGGGTGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chrX 5194514 5' - hobo 2900 1 67.33 ACACATGTCAATTCAAATGAACATTTTGTGTACTTCTCATGACTATAGATAAAGTATTAGATGAATCATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr2L 7259494 5' + I-element 9 1 63.37 GTTCTCGCATTCGCCAGATACATTTAGACTGGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGC:1 - chr2L 9671594 5' + F-element 4285 1 69.31 TATTTTCAGTAAGTTTCGCCTTTGTTTTGTCATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATC:1 + chr3L 13367699 5' - mdg3 5455 2 65.35 TAAAATGTCAAGGCAATCTATCAACGTGCTCATTATCATATTATCATTGAATTTCGCTGTTCTGGGCTTGAGGAGATTGAGTGAACCTCATCGTCAGAAAA:1 + chr2R 16304769 5' - TAHRE 474 1 56.44 GGCGTCGCTGCTTGTCGGCGTTTCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2R 21713275 5' + P-element 1 2 73.33 AGCAATGGGTTGACATTGGTACTAAAAATCAAAGAGGAATATTTTATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 - chr3L 22112908 5' + diver 32 2 53.47 AATAGGAATCAGAGCAGCCNAGTGCTAGACCGAAAAAGGGAGCAAGAAAAACCGAAACAGAAACAGCGCCACGCACACTTATACGCATTCTCGTCTCTTGT:1 + chr2L 16766568 5' + 1360 3230 1 76.24 AATAAGGCTAAAAGGAAAACTGGAAAAAACTGTTGCCTACTTTTAGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr2R 18988508 5' + hobo 3 1 67.02 CAAAAAGTATGCTTTAAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr2R 18807827 5' + jockey 28 1 57.43 ATCATATTTAAACACTTTCTTTTGCATTTTTTAAAGATTTAAAAAGTTATAAATGTATAAAAGCTTGCATATTTGTTATTGTTTTTTTTTTCTTTTAAATA:1 + chr3R 21656319 5' - transib2 2636 1 58.42 TACTATATCTTTAGGTAATGCGCTAGAAACTTGACAACTTAACACAAACTAAAATTAATTGTACAAGATTCAATAATAAACATAGTCTTTCCTAGTATTTT:1 - chr3R 19448223 5' - Chouto 5837 1 63.37 TTTGTGATATAGTAGAATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 20284803 5' + pogo 29 1 59.41 ATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3L 24150536 5' + blood 7057 2 72.28 CCAGCCAGCGAGCATCGGTTAGGCAATACGGCAATCCAGCCATCCAATGGAGTTTTCACCATCAAGTTTTTCTATTTGGTTTATTGATGAACTCATTT:1 + chr2R 22907067 5' - Dm88 315 1 55.10 AACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCAACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3R 7869135 5' + 297 49 2 72.28 TGTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr3R 18171768 5' - 1360 3364 1 55.67 TGGAGTCAAGATGCGAGTTTACAATATCGAATGAATTTTAAAAAGCATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3R 25121668 5' + pogo 28 1 57.00 TTATACGGCACATTCCAGAAAATCACGCACTTACACGGCGGAGTAAAGTGGAGTGAATTCTGCTCAATTCCTTCACTTGTTTTTAACTTTTAAAAAACTCT:2 - chr3L 12590417 5' - TAHRE 9 1 72.28 TTTACAACATATACCGTTTGGCCGCTCCGCCTCCTTCCAACTTCACGATTTTTTTATTTTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGA:1 + chr3L 15466548 5' - F-element 4650 1 51.49 ATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAAAGTCATCAGAAAGCCCTTCTTACTCTTCACTACTCTC:1 - chr2L 21052773 5' - invader1 3988 2 67.16 TATTAAAAGCCCTTAAGGAAGAATAGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATTTGGTGCAAATGGCTGTGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGT:1 - chr2R 4525904 5' - baggins 5131 1 75.25 AAGGTAAACATGATTTTTGGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACA:1 - chr2L 12199536 5' + Stalker2 16 2 59.41 ATGGTAAAACGAAAAAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2L 18297894 5' + hobo 35 1 58.42 GGCGACTAATGCCGAACATCGCGAATCAACCAAGAAACTTGCGCTGCGTCTATATCTCTTGTATCTGTATGCATAATGTTGAAAATATGTATGTAATATGT:1 - chr3R 7686154 5' + Dm88 4364 2 69.31 TTGTATTTGTTTATTTGGCTGCAAAATTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACA:1 + chr3L 19700230 5' + Quasimodo 36 2 68.75 AAGTCGTCGGGAGTTTCGAAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr2R 17402683 5' + invader4 2759 1 79.21 GGTAATTAAATATTTTCGCTCACAGAATTTTTGGCAAAAAGTATGCTGTGCATTAAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:2 - chr3R 7688947 5' + Tirant 8130 2 58.42 GATCCGATATCGATCTTTAATGCTGAAGAGGCTTAACATTTAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 18105815 5' + roo 8699 2 61.39 TGGCGTTTTTATGGCTTGCAGCAAATTTGTTTTATTTGCAGAAATTTAGCGGTCAGTTGTTTGCAAACCTTTGTAAAGTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 6920247 5' - HMS-Beagle2 492 2 72.63 GCGTGCACAGAATGTAAATTTCCCCGGTATTTAATGCTCAGTTGGAAAAAGTTTGTCGCAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCG:1 - chr2L 13517093 5' + G6 1958 1 65.35 GTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCA:1 - chr3L 16047625 5' + Cr1a 457 1 58.42 AAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTA:1 + chr2L 18177033 5' - INE-1 552 1 63.37 GGAGGAGTGGCTATTGCTCTCACCCCTATAACGACATCGTAAAATGAATGAGATTCTTCACATATTACGCTTACATAAGCATTGTACATACGATCTTGCAC:1 - chrX 22260223 5' + rover 45 2 51.49 TAACCAGTTACTTTGCTAAAAATATGAATTCTCTGTATAACTTAATATCCATAATCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACT:1 - chrX 19591816 5' - hopper 316 1 58.42 ACAATAAAAGGAGGCAGCAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 + chr2R 18105747 5' - roo 9042 1 54.46 ACAAAAGTTTGTCAGTCGCACGCCGACCCACCGACAAACTGGAGCGTAAAAGTTTTGCCCTGCAAGTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATG:1 - chr3R 8460937 5' - BS 5084 1 66.34 TTATACATTTACGTATTTCGTTTGTAAACTTGTATATTTTTTTTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTG:1 - chr3L 7208857 5' - G2 3021 1 64.36 GCGTTAGTCTAGTCCTAACTTTAGTGGGTGAGTATCTAAGTGATATGTGAATGTAACCCACAATCTAATGGGAATCCCAATCACTATATATAATAAGATTA:1 + chrX 19724113 5' - Tc3 281 1 79.21 CTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 26123036 5' - roo 351 2 82.18 AAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3R 28628115 5' - 1360 3339 1 75.25 AATCTTTGCGACTCGATTGCAATTGCAAACAGCGAATAACTGTTTGTATGTATAGCAAACATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACG:1 - chr2L 19543054 5' - R2-element 3467 1 56.44 TTGGATTTGGGGTGGTTATGCACTCACTCACTCTCCGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr2R 8232538 5' + P-element 40 1 39.60 AAATTGGCTTTTTGAGACACGACGTGCGTGCACGTATATACTTACATAATATAGAGAGTACAAATTTCTTGCTCAGATAGCCAACATATTGTACTTATTAT:1 - chr4 952808 5' - Tc1 101 1 59.41 GCAGGGGCGTTGAAATGAAACGTGCAAATACTGGAAATAATCAAATTCAATTCAGTCAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 14070645 5' + Doc2-element 218 1 74.07 GCCCATCGCGTAATTGCAAAGTTGCAACTTGCAACTTGTTGCCATCGCTCGTTTATTAATTGCTTTTTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCACC:1 + chr3L 10284790 5' + Juan 3805 1 70.10 AGCTTGGTACCGTTGCTTTCCTTAAATCGGCACGCCGACGCTCTCAGTTCTCCTGTAGTCCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chrX 21400759 5' + P-element 15 1 65.35 GGACCTAGAAGAACCTGTTGACACTCTCACCCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACT:1 + chr2R 5615711 5' + Rt1b 4814 1 69.31 GTGGTCCACTCCAACGAACATACATATGTGTGTGCGTTTGGTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTTTTA:1 - chr2L 15168113 5' + F-element 23 1 62.38 AAATGGTACATAATGTCGTTAATTGCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCG:1 + chr3L 22112825 5' - diver 6085 2 51.49 GGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCT:1 + chr2R 6438365 5' - Stalker 360 4 74.26 GTACAAGTTGTTTAAAAATNTTATAGTACGCTGATTTCTATCTTATACCTGCAAGTGAATTTAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 - chr3L 10395960 5' - copia 243 1 63.37 AAATTATTTACTTTTGTATTTAGTAGCAAAAGTAACAGGTAGAGCGAAGCGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 20375799 5' + roo 8690 2 55.45 AATATCAACAAAAACAATTACAACCGGGAAGGAATTATAATAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCAT:1 - chr3R 25273394 5' + F-element 212 1 56.84 ATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3L 27357563 5' - mdg1 378 2 63.37 ACAAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3R 12115346 5' - 1360 3356 1 58.42 TGGGTGTAGAATAATATTGTAAACACTTCTACAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTT:1 + chr2L 19919292 5' - hobo 2608 1 68.32 TAAGCTTTTAAATTATATAAATCCTTTGTTTATTTTTGAGTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAG:1 - chr2L 15818031 5' - I-element 5318 1 66.34 CGGAATGCATTTGCAAGCCACCAGTTGACCCTGGGACCCATCTGGTGATGGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTGCGTTTTAAGTTG:1 - chr3L 6866248 5' - 412 470 2 55.56 GAAAATTGCTTCGAAATTGTTATACGCGTTGACCCATGCTGTCACGGCCACAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTATAGATAACAAAGACTCACA:1 + chr2R 3785757 5' - Gypsy6A_LTR 127 1 54.46 TGGCACTTTGAAACCAGTGGGATCCTTGGCCTCATTTGGCTGCCTTAGGTGTTCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTT:1 - chr3L 23450304 5' - baggins 5003 1 52.63 AACCACCCAACCCCACCCANAAATCCCCGCCTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCA:1 + chrX 15184148 5' - R1A1-element 5308 1 69.31 AATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3L 22112640 5' + Doc 39 1 63.54 GCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAGAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 8434268 5' - roo 9028 1 71.29 TTTTGGAATACACGACTGTTTAGCTTGATTTCATTTTTTTGACATTTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 + chr2L 22052485 5' + flea 27 2 58.42 TTTTACCTTTTTCGTTTTTCCGTGTAAACTAAATTGTTTATATTCTTTATTCTGCTATATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3L 3992468 5' - pogo 2090 1 68.32 GGAATCGTTGTTTTGTGAGTATTCCGGATGTACGGCTAATGGGTATGGGTAAACGGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTA:1 + chr4 220211 5' - Tc1-2 97 1 53.47 TGAAAAAATGTGGCCAAAAGCTTAACTAACGAAATGAATCGCTGCAAGAGCCAAGAACCAATACTATAAATTATTATAGCAATAATAATAATAATCTTTAT:1 + chr3R 19255386 5' + mdg1 7074 2 34.65 GAGACACCATTACAATGAANAACTCAACTGTGCAAGACAGTTCACCGCAAGTGCCACAGAATGGCAATACATACTGATTAGTTGTGATGCCTCACTGCTTT:1 - chr2L 11651932 5' - diver 219 1 64.36 ATGCTGCCAGCGTTGTGTTTTACACAATTAATTCCACGTAATTAAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAT:1 + chrX 21056706 5' - Tirant 8446 2 56.44 GGAAGAAGTACCAGTTGAAGAACATATTCTGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAG:1 - chr2L 5269471 5' + Doc2-element 369 1 79.21 AAATCACGTATTTCTGGGCGCTGCACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr2L 13792225 5' + blood 51 2 73.27 AGAACTCGAAACTCCCGCTTTCCCAACAACAACTACAACAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATCTCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATA:1 + chr3L 19295019 5' - 412 243 2 60.40 ACGCACGACGAGTGATGACNGCGTCCTTGAAATACACATATACCAACATAATTAGTTTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGCCCACATCA:1 + chr3R 11770963 5' + gypsy6 425 1 59.41 AACTTCTTAAAATAAATTTNTATCTGAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 11009548 5' - roo 358 2 76.24 TTATTTTTCGGGCCGGCAAAACTAACTGGGTAACTTTCCCGAAGGGGGAGCTCCAATCAAATTGCAGGCAAACAGACTCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGA:1 + chr2L 9471171 5' - roo 408 1 77.23 GCCCACAGATTAACGCTCTATATACGACTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chrX 18121842 5' + opus 7158 4 75.25 AAAATGTTTTTTGTCGATTCTGGTAAATTAATCCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3R 10648236 5' + I-element 41 1 65.35 CTGTGTGAGTTGGTTTTTCTTCATTTGACGTACTCAAAGCACTCATACACACAAACACACACAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:2 + chr3L 5976299 5' + hopper 10 2 69.31 TAATAACAAAACCCACGAAAAGAGACCAAGCTGCACACAGATGCACTCCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr2R 12096560 5' - hobo 2912 1 53.47 ACAAAAATAACGGTCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTAGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGGTTGCTT:1 + chr2L 21628895 5' + P-element 60 1 19.80 TGAACAGAGTACTAAAGTCTGCATGCTTTATTGTATTTATTTGTATGACTCTTCGACATCAGTAGTGGGATCGCCTATACCTACTTTGAACAATGAAAATA:1 + chr4 909922 5' + invader1 445 1 54.46 TTAATCGACGAGAATATCGCTAGTGTACTTAGGCGTGAGTTCGCGCTGGAGGAACGGCGGGAATTTGAATATGGGGACTTTTTTTAATTGGTTTTTTCGTT:1 + chr3L 18865636 5' - Bari2 918 1 43.56 GAATAAAACAGATGGATGAGTTTCAGACTGCCAACATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr2R 11941182 5' + Doc 15 1 66.34 AGTTTGGGCCACGCCCACTACCACCTAGACAGCCTTACCCGTCCACACCCACTTGGGAGCTGTAGAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGACTGCAAT:1 + chr2R 13098421 5' - baggins 5317 1 66.34 AATGATTTATATGCCGATTGGATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 2339807 5' - roo 353 2 78.22 GAGATTTGGGGTTTTGGGTGGGGACACCCGAGATAAATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 + chrX 19219275 5' + Doc 13 1 66.34 AAGCAAAGAAAGTATATGCCCTCAAGATCCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTAAACTCATTAAGTGTACTCACAAGTTTATAGTGTGGACAT:1 + chr3L 6603989 5' + rooA 366 1 71.29 TTGCCACTCAATTAGCGTGGCCATTACTGAAAAACCCACTTAAGTATGCAATGCTAAAAATTCAAAAGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3R 28728621 5' + hobo 1 1 77.23 TGTCGGTTTATTTTTCAAGCTCTTCCTAAAGTGGTCTATATGCATGTTTCTTCCTGGAGTGTGTAGTTCACTTGTTAAAATTCTTTTTTTTTTAAA:1 - chrX 14845386 5' + FB 178 1 60.42 GATTTAATTTTAACGTTGTNTCTATAAGCCAATATACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTT:1 + chr3L 14864025 5' + Circe 62 2 74.26 TCAATGCTGCGTATGAGTTATAAGGGTCATGAAGCGCGAACAATTTGAGTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGA:1 + chrX 1856988 5' - R1A1-element 5049 1 52.48 AGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGA:1 - chr2R 4339493 5' - G5A 2768 1 82.18 GAGCATTAATTACTTTACTTAGCATCTAAACGTAATAGGTGTACCTTGTTTCAAATTTGCCAGACGCAATGAACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATG:1 - chr2L 3424428 5' - mdg3 47 2 80.20 TGGATCTTCATTTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chrX 15268242 5' - roo 9035 1 63.37 TGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3R 26434158 5' + hobo 54 1 78.22 GGATTGGAACTTGAGTGGANGACATATGGATTTGCAGTTAAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chr2R 20460965 5' - hobo 2903 1 59.41 GAATTATGTATTAAGTGCGCCTTTCGCCAGTCTCGCCAAGGCAACAGATGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 13544152 5' - roo 9047 1 54.46 TGTCACGCATACTCCGCGTATGGCAAACTCACACTCACACACATTCACACAT:1 + chr3R 28949720 5' + accord 7037 2 82.69 GGATCACTTCACTCCTTATGACTTCGCCAGGACAGAGCAAATAAGAGAGACTCATTAGTACTTAAAAATGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGA:1 - chrX 22727594 5' + Ivk 5069 1 67.33 ATTATCTGTGGGTAATAAAAAAAATTGAGGTTAATATTTAATGCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGA:1 - chr3R 7843718 5' - Transpac 5153 2 57.43 ATGCGGTGGCCCACGGGGCGTATGGGGTATAGGCTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGG:1 - chr3L 7109114 5' - Quasimodo 6971 2 66.34 GAAATTCCCAATATTTCCTTGGCCTTCCACTGACCCTAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chrX 22774819 5' - opus 7466 2 63.37 TGGGGGCATGTGCAATTAGAGTGACGTACGCTTTATTGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAG:1 + chr3L 17202701 5' + P-element 342 1 39.60 TGCATATTTCATATTTTATTATTTTTTTGGGTTAACATCTATCTTTTTATATACGTATATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 - chr3R 22517340 5' + jockey 4690 1 58.42 ACATGGAATATAATATTTCTTCATAATTTGAAAATTCGATGCTAGCAAAGGCTTTAAGCAATGAGCAAAAAAATCGTATGGCGTTATTCATCTTGTTATTC:1 + chr3R 11805714 5' - 1360 12 1 68.32 AATCGGAATGATTATCCTGGGTAGGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCGTACATTGGTTTTGCACTATGCAGCTACTTTTTTAGTGAC:1 + chr3L 23241889 5' - 1360 3336 1 73.27 TGAAGAGGGCTGAAGTGATTTAATCTAATTAAGTGAACGGAATGAATAATGTCTCATTCAGTGCACAAACTGCAGACCTAAAAAAAAGAAAAACAAAAAAT:1 + chrX 8582289 5' - hopper 143 7 48.51 CGGTTGGTCATCTCTTCTCTTTCTCTGCTTTCTCTTTGGTGGCTGCAAAAATGTTTTTGAAGTGATTTTGTGAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTG:1 + chr2R 14534360 5' - I-element 179 1 57.43 AAAACAAAATAAAATACCCGAGACCGAATCCAGTTTTCTGTGTCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chrX 2123688 5' - P-element 2856 1 48.51 AACGGGTAATACCTTTTATCTTATACAACTTATTACTTATTATTAACGAAATAAGTTTATGAACAAGGCCAAGGGAGAAACCTGTACTTGCGGGTGCACGC:1 + chrX 19595889 5' - gypsy12 10158 2 53.47 ACCATGTAAGTGGAATGCGACCATGTTTCGCGTGAAAACCGGGGCACTAAAGGGGCCGCTAGAGCTATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTAAGGTAGGGTAGG:1 - chr2L 3813272 5' + gypsy12 9903 2 59.41 TTTGAAAAATGTCACTGATGGTTTGGGGATGTATCTCCAGCCGTGGAATGGGAACTGGTAAAACATTTAAAAATTTTATAAAATAATTTAAAAATTTAGGA:1 - chr2R 4659350 5' + S-element 1460 1 47.52 GGCTGGCTACGTATTTCCGTGCGTTCACAGAAGGGATATGAACAACATCCGGCGAATTCGGGCCATCATTTCCAACAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCTT:1 - chr2L 2625902 5' + Gypsy6A_LTR 353 1 79.21 CCCGTGCTTGCTTGGGTGCCAAACGAATTAAGCAAATAGCTGAATTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 28628043 5' - 1360 3380 2 73.27 TGATATGTCGCCCGGTCGGGTCTCCATTCATATCGCTTTAGCAGGCATTCGACTCTATGTATGTATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTAT:1 - chr3L 19778864 5' - flea 248 2 73.27 GAGCGCATCATACACATTCCGTACGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGACCCATAGGTCCAGATAGGTTTC:1 + chrX 13709414 5' - F-element 4255 1 76.24 GAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAA:1 + chr2R 17402729 5' + invader4 46 2 69.31 AACGATTGCGAACGCGTCGTATCTTGTTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chr3R 13685240 5' + Tirant 8125 2 63.37 TTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAG:1 - chr3R 3268044 5' + mariner2 104 1 62.38 GGTTTCGCAAAGTTTTCAGGGTTGCCGGACTAGGGTTTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - chrX 4238833 5' + 1360 38 1 64.00 TACATTTCCACAGGTGCAGNATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTC:1 - chr2L 23084406 5' + gypsy5 6959 2 58.42 TAATAACGCCCAACTTTTGGCCATCCAAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCAT:1 - chr3R 22953801 5' + G6 1859 1 73.27 TGGCCAGATGCAGTGAGAAATTTGCTACGCTCCAGTTTTGAGATTTCCGAATTGGCTGACTACAAATGTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chr3R 19810900 5' - opus 496 2 58.42 ACCGTAGATGTTGGAACCCCATGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAAA:1 - chr3L 1314902 5' + BS 4736 1 77.23 ACATTTTCGTGTTATTTCTGTGTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTT:1 + chrX 10119542 5' - FB 24 1 67.33 ACTCATCGTGCAACATGCAGACTATGTCAAATAAATGCAACTAATTTCTGTGCATTTAATAATAAATATAATATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAA:1 - chrX 3474954 5' - hopper 328 1 74.26 GTGTACATGAAAACACGCACACACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 10547640 5' - P-element 2875 1 68.32 CATAACTCCGGCAGCAGCCGCCAATGCAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATT:1 - chr3R 21673696 5' + F-element 4233 1 78.22 GACCGCGCTGGACCTTGGACTCGATCCAGTCGATCGGTAATGGTGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCT:1 + chr3R 2533847 5' + Max-element 8308 2 54.17 TGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3L 19349933 5' - 1360 3371 1 57.43 AATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 19446196 5' + roo 47 2 76.24 GATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGA:1 - chr3R 7869191 5' - 297 365 2 58.42 CCGCAAAGCTTCTTGATCTTTGTCGTTGATTTCTATGGCGATGATGACGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 - chrX 720664 5' + INE-1 153 1 55.45 AAAATGATTATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 4422684 5' + jockey 22 1 64.36 GATGCTCACCATCCAAGAAACAATGGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 16613180 5' - 412 7493 2 77.23 GAACAGATCGTTACTATTCCCATATCGCCCAACAAAGGGTTAAACCTTTTCCTAATGCCAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 4571296 5' - roo 391 2 59.41 TGGCCAAAGACTGCGACCTAACTGCTTTGTAAGGAAGTGTTCTCGCAGTGTATCACTCTAAGGAAAACTATCGGCAGCCATGGTTCTGTCAGCTCAACGTC:1 + chr3L 22277436 5' - 412 384 2 74.26 AGTTTGCTTTAAATGGTTTNGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 16806023 5' + 412 47 2 73.27 ATCTCGTGCAGGAAAAACAAGGAACGAAAACATGGTTGAAAGGCGCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAG:1 + chr3R 19965066 5' + 1360 105 1 59.41 AAGTTGAAAGCTAAATGATNGCCCAACTTACTAATGAAGCAAAAACTGCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3L 17146889 5' + pogo 22 1 54.46 TATTTGTGGTTATTACACAGTCGGTTCTGGCCCTTTTCGATTTTTAATTTCATTTTT:1 + chrX 15247785 5' - P-element 2641 1 66.67 GTGTGCGTCTGTCTACACGTGCCACGCAGCGTGAGGTGAAAGGAGAAAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 - chr2L 18413907 5' - hopper 1389 1 51.49 GTTTCTGGAGTCAGAGTTGATGAGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAACTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCT:1 - chr2L 23352617 5' + accord 7 2 69.70 AATAGCTTACACATTGACTAAATATAAGACCCAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr2L 20835808 5' + 297 43 2 73.27 AATGTTGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAGCGCACTCTTCGCTCTAAGATTTTGGAGCTTGTCAACGACGAAGAGCAAGAGTGCGCTCT:1 - chr2R 18885050 5' - Doc4-element 121 1 83.17 AAATGTTTCTATTGCAAATATTTGCAAAATAACTATTCACATCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAAC:1 - chr2R 12565395 5' + Juan 39 1 39.00 AATAACATTAATAAAATAGCCGCCAATCTGTCAGCCAAGGCCGAGGCCAGCCGACTAGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGAA:1 - chrX 2154319 5' + Doc3-element 387 1 60.40 ATGAATCAAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr3R 26434170 5' + hobo 42 1 66.34 ATGGCGTTTATTTATAAATNATCTCATGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2R 11661166 5' - 1360 3365 1 54.46 GAAAAAGTGTGCTACGGAAAAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3R 22469221 5' + hobo 19 1 57.58 AAAAGTATTACTTCCATTTAACCAATCTTCTGAGAAATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTA:1 - chr2L 12337299 5' - I-element 5319 1 60.20 TACCACTTTTTAAAGACTTGCAATTGCGCAGACGTTAAGATTCATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGG:1 - chr3R 19930597 5' - jockey 4778 1 57.43 TGGTATATACAATCTCAGCCACTTCACAGCGGCAAAATATTCATTTCAATAGACTACACTCCTGAACTTGTGTACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATA:1 - chr3R 26170489 5' + X-element 10 1 64.36 AATTTCAGAGCAATGAGGGCCACAATGTTATTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCGGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 - chr3R 28216848 5' - blood 7344 2 74.26 GGATTTATGCATTTTTACGTTGCATTTTCTTTTCCACGGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr3R 12906597 5' - hopper 1380 1 63.37 AGTAAATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr2L 8967083 5' - 297 360 2 74.26 AAAAACACTTAAAGACTGTGCATTAAAGTTTCTGCTGACACATAGACAAGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGC:1 + chr3L 21397526 5' + Doc 418 1 51.49 AAATACGCAAATCTGAAACGCAGCTGGATATTTCATATATATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTT:1 - chr3R 26774659 5' - Stalker 28 4 69.31 GTCTTTTCGGCACTTCACCAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCC:2 - chrX 14164012 5' + jockey 4613 1 78.22 TAATTGTTTTGCGGCTTCGAATTAAGTATACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:2 - chr3R 14980572 5' + 412 8 2 72.28 AACTTCGAACTCTCAAAACNTCCAAAGTTTTTGCTCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr2R 20584424 5' + P-element 39 1 39.60 AAGACGATAAAGCCCATGGTTTAATTAGGCCCCAGCGATTCTTGGCCGCTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 + chr3L 7938783 5' - opus 428 2 52.48 ATGTTTTTGAATTTTTTTAAAAAATCTCATACTTGCAATTGTAGTACATACATGCATGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 - chr2R 16907586 5' + opus 9 2 68.42 AGAGAATTAACAATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3R 13239986 5' + jockey 22 1 56.00 TGCATAAGTTGTACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACT:1 - chr3R 7869208 5' - 297 6963 2 67.33 ATTTGCATACTTAAAATCTTGACTGAACGACACAGCGGAGGAGGCTTACCTCCGCCACATTTACAACATTTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 + chrX 21499225 5' + Quasimodo 5 2 79.21 GCATGTCACCTGGATTATACACGTATTTTTCTATCAACTTAAAGGCGAAAGCACTAACAGAAGTAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 - chrX 15258375 5' + BS 9 1 63.37 TGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr2L 15817965 5' + I-element 30 1 54.46 GCCGCCGGTTAATGTTATTACCTGGCAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr3R 4591813 5' - 297 387 2 73.00 AGTAGGAATTTTTCGTGGCATGGGTATGATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTAT:1 + chr3L 14512130 5' + hobo 2642 1 70.21 GATTCGGTGATGGAAGATATTGGTAAATATTCAAAAGTCAAGAAACGCTTTGCATGCACAAGCATAGCTCACGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGC:1 - chr3R 16613309 5' + 412 7224 2 77.23 TAAAAGTGTTTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAAAGACAAAGAAAAACACACGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGC:1 - chr3R 29011379 5' + 1360 3006 1 68.32 TTTTAAATATTGCTTAGCCNTAAATGTTTATATATATGCAGTCCTTTGAACTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3L 8905702 5' - pogo 2080 1 55.45 AATAGTTGCCTTGGTCCAAAAGATGTAACGCGTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chrX 22771517 5' + opus 7151 4 67.33 GCAAATTAATTTATGCATTTTTTCCTACGTAATCACATATGTTGATTATTGATATGTTGATATGTAATTAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 - chr3L 2989888 5' - flea 5011 2 77.23 AACTCGAGCAGGAGCTGTCAAGATTGAGGCTAAACTTTTTATTTTTTATTATGTCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 13544065 5' + roo 8685 2 58.42 GGAAATTGCTAGACATATTTAATTAGAAAGAACGAATGAAATATTTAATGGAAACTATTTAATATGCGTCATCTAATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGA:1 + chr3L 2989757 5' + flea 4756 1 78.22 GTGAGACGCCTCCCAACGCGACACCTCTTCTTGTTCATGATAACCATGATTGCGCGCATCCTACAGCTCTGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCC:1 + chr3L 1608068 5' - Gypsy6A_LTR 282 1 69.31 TTCATTCAGTTGCTTTCATGCATTCAATGCCCGCCTTTTGTCTGCGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGGTTAGTTTT:1 + chr2L 12817061 5' - Doc 4513 1 53.47 ACTTCTTCCGATACTCCTCTTATATTCCAGCAGACAACGGCCAGAACGACGACAGCCAACATTTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 - chrX 21497006 5' + Quasimodo 12 2 59.41 GGAAGGCTTAATAAGAGACGCCAGAAAGTGTGAAGAACGCACGAAAAGGGAGGGGGGGCAGTGGGCACAGCTGCGGAGTGGAAAATTTCCAAAAATTTATT:1 - chrX 17741877 5' - R1A1-element 149 1 75.25 TATTTAATTTTAACTTTTTTTGGTACAGTGCACGCCCACGCAAAATGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTA:1 - chrX 3694819 5' + Quasimodo 348 2 52.69 GCCGAGCTCTTAATTTATTAATGACACCCGCCACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chrX 12284061 5' + Transpac 40 2 68.32 AAATATGAATATATTTTATTTATGGGCTGCAATAAACATGTCACTGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATG:1 - chr3L 9910214 5' + roo 8898 2 64.36 ACGTACTAGCAACTAAATGGAGAGAAAGCGAGACAGACACCGAGTCAAACAACATTTGAATACGAAATTGCCCAGCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGTG:1 - chrX 12071780 5' - hopper 142 3 72.73 GAAAGAAACACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:3 + chrX 17873168 5' + 412 30 2 56.44 GGTGCCATGAAAAGTGTGCAAAGCAATCCTATGAATTATTCGTTGTCCGTTTGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAG:1 - chr2R 11575186 5' + INE-1 148 1 62.38 ATTCACTAAGCAAGTGAGCTGCACACAGCTCGAGTTTGGGAATTCTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 19446268 5' - roo 395 1 64.36 AATACAAAGAAAACATGCGTACTTCAAAAGGATTTCTTTAATAATAAAAACACACACAAAAAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3L 19087998 5' + 297 6585 2 75.25 ACAAATTCGTAGGTATGTAACGTACACATGTTTACATACCCGTCTATCTACATTCTCCACCGTGTGTGTGCGTGATCAAAGACACTAGAATAACAAAATGC:1 + chr2L 14022014 5' - 1360 3385 2 75.25 AAATGTGAAAATTTCAACGCACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGG:1 - chr2L 9200052 5' + hobo 250 1 81.19 AAGGATTTCAGCCCAGAGAGCTTTCCTTGGGTGTTTATACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGT:2 - chr3R 25844361 5' + Stalker4 40 4 64.36 AAAACAAAACCTCTCCTAATGCCCTTTTAAATCTTTTGTTATATTACAACAAAATCTAGACAATTCTTGTTCTTCGTGTCTAATGTACCATTCGGCTTTT:1 + chr2R 21552515 5' - Porto1 4361 1 79.00 GGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3R 12115294 5' + 1360 46 1 72.28 CTGCGATTCCCATTACGTTGCTCATTTCAAATGCCGTCGACTGCGGACGCGTCATCTGCCCACGCTCCAGCTGCCTACTGTAATGATGAACTCCCATTA:1 + chr2R 6769416 5' - 412 494 1 78.79 AGAGGCAAGTAGAAAGGTCCTTTAAGGAGAGGAGATACAAGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3L 15435502 5' + blood 2 2 76.24 ACAATTATATTTTAAATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGAGCGAGGAGAAAAAAACAAGAATGCTATAATCGAGTTCACCGACTATCAGATACCCGT:1 - chr3L 87179 5' - INE-1 554 1 60.40 GTTTTTGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTA:1 - chr3R 1844825 5' + Cr1a 150 1 67.33 ATATCGTGGATGTGTCGACGTAAATCATAATAATTTTTTTTTCTCCTTATCTTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTGTGACAATAAGTAAATCTTATAATTAA:1 - chrX 20385803 5' - G4 3801 1 60.40 GAGCAGGTGCAAGTACAGGCAAAGGTGCGAGAGGGTTGGTTGGGTTGGGGCTGGGATTTGGTAAGGGAAGGGATGCAGCGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAG:1 + chr2L 9090604 5' + R1A1-element 414 1 77.23 AGTTGGACAAAAGGAATTTTCTTTTTTTCCTGAAACTAAACCATTTTGCTTTAGGACCGAAAAAGTAATCAAACATTTTAACAAAAATTAATTTTTTT:1 - chr3R 30978512 5' - Tc1-2 1465 1 77.55 ATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAA:1 - chr3L 19350009 5' + 1360 3197 1 52.44 TGGTACTACAAAAGCAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 8012909 5' + Doc2-element 217 1 86.67 TTTTCAAGTTAAGGCGCCGCTGTTGCGGTTGTTTTTCCTCGGTTTTCTGTAGTCGTTGGGCTGTCAGGAACAGAGACGGAAAGTTTTTATATATATTTTAT:1 + chr2L 8572120 5' - mariner2 792 1 76.24 ACCTATATAGTCCTCCCCCACCCCCCCCCC:1 - chrX 5867955 5' + accord2 222 1 63.33 TTATTTGGGAAACATATTAATTGAATACACCAATAAGAAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2R 4030058 5' + Doc 42 1 60.40 GAACATTTCTGCGCAACAATAGAATAAGAACCTTTAATGATCAAAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAA:1 - chr2R 1076524 5' - FB 260 1 56.44 GCTCTTTCTGTATATATATNAGCTATCTCGGAGAGAGATACTATAGGCACATATATAGCGGGAGAGAAAAAACCGGCAAAACGGAGGCATTCCCCAAATCC:1 - chr2R 24631025 5' + gypsy5 189 2 81.19 AAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3L 153598 5' + 1360 48 1 72.28 GAAATTAACTATGATTCACCAAGAGGGGGGGTTTCAGTAATAACTGAAAAAGGAGACATAACAACGTCGTATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACG:1 + chr2R 3190636 5' + INE-1 124 1 66.34 TGGCCCGACGACATAACCAAATGGCCGATCGAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 10369785 5' + R2-element 3581 1 63.83 GAAAAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr3L 11697064 5' + pogo 36 1 63.37 GGGTTGACATTGGTACTAAAAATCAAAGAGGAATATTTTATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACAT:1 - chr3L 22112902 5' + diver 5926 2 59.41 TGGCACGTTAGAAAATTAGTAGCGAGGATGGGAGTTCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTA:1 - chr3R 15529594 5' - P-element 2723 1 42.57 GGGACTGTTCAAGGAGGATNCGTGGACGCACAAGGCTAAGGAACTGCTACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCA:1 - chrX 16597946 5' + G6 400 1 52.48 TGCACATTATTCAACTGACAAGCTGTTTCACGAATTACCTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chr2L 20550835 5' + jockey 4708 1 65.35 ATCCAGACCAGTGTCCTACTATCGCTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3L 9542553 5' + roo 51 2 75.25 TATTGCGCCAGATGCTGTAGCTGTTGTCGAACTTCAGCAAATAGACGCCCTCGCCCGGATAGGAGCGGGAGACCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTG:1 + chrX 19702289 5' - F-element 352 1 68.32 GGGCGTAAGGATGAAAATCAGTGAACGTGGCGGCACAATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGT:1 + chr3L 11423789 5' - 412 7274 2 63.37 GCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGCCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 15268258 5' - roo 9019 2 78.22 GGGTCTCAGGTCCAAAAACGTGCAGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAA:1 + chr2R 15997057 5' + P-element 193 1 27.72 GAAATGAAAACAAACTGACGACGGTGTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 12266779 5' - P-element 2838 1 30.69 ATGATAACGATTACGTGTATAGAGTGTAGAGAGAAGAGTGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTC:1 + chr2L 14601040 5' - Doc 202 1 66.34 AGGACTGTTGGACACAAAAGTCCCCTCTCGTTCTCTGCTATCTGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAAT:1 - chr3R 2471048 5' - 1360 97 1 66.34 AAATGAAAGCCGTTTTTCAAACTGAAGTCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTT:1 + chr3R 4773351 5' - Tirant 353 2 72.28 GGAACGAAAGTTTTCCGGAAAAGAAGGCGAAATAAAAACCTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr2L 10177790 5' + copia 36 2 61.39 ACACCGCAGGAAGGTATATAAATGCAAAGGCAAAGGTGAGTCTTTGTTATCTATAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTACCAGAATAAA:1 + chr3R 29083137 5' + Gypsy6A_LTR 172 1 65.35 ACCAAATACTCTATAATAAATATCTTTGCCTAATAACAAAACAAGAGGGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCAACTATCACATACCCGTTACTCAGCTAGTGT:1 - chrX 19243504 5' - INE-1 540 1 62.38 AGGGAAATACGAAATGGAANTGCGGCTGGGTTATTGGCTCGACATTTCCCATCTTCCCTCACGCCATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr2L 15479640 5' + blood 7014 2 73.12 AGGAGAGCGATCGAAACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTA:1 + chr2L 16456768 5' - BS 5060 1 54.46 TAATTAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:2 - chrX 17109708 5' - roo 9030 1 63.37 GCGTGTGTTGCTCCCGAGTCGGCGATGTTGCTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCGTTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACGGGCTACTTTA:1 + chr2R 8521855 5' + gypsy4 6737 2 70.30 AAAATAATTTTCGTGCGGCGTTGGGAAATTTCGCGTTTCGTCTCTCGTTTTTTTTTCATTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAA:1 - chr3L 15711316 5' - flea 242 2 50.50 GTGCGGTGTTTAAGATCTGAAATATGGAGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chr2R 6041661 5' - opus 496 2 77.23 AAGAAGGATGTGCTCTACGAGTTGGTGGTGGAGGTGGCGATGGTGGCAGGGATGTGGGGGCAACTGAAAATGACATGATGAAAAATAAATAAACAAATAAA:1 + chr3L 14880468 5' + HeT-A 307 1 61.39 AAATAATATATAAACAATTTGGCTGGGGCAGCGTAATTCATTTGCCAGGGTGAATACAAGATAGAGCATTTTTAAAGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTC:1 - chr3R 9237299 5' - Q-element 420 2 55.45 TAAAAATTAAAAAATAATTGTTCAATAACACTTTTGAAAATACCATACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAG:1 + chr3L 20951626 5' + 1360 3249 1 54.46 TATGTATATCCGTATGTGTACTCTCTTACTATGTATTTTGATTGTATTTATCTTGTATTCTCCGAGTCACATCGTATGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGT:1 + chr3L 7532603 5' + Q-element 489 2 57.43 AATAGAGATAGATACATTTTTTGGACATTCAATGTCTACAATCCACTACCTAGACATAAAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - chrX 3691587 5' + jockey 4777 1 61.39 TTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:2 - chr3R 13685214 5' + Tirant 8151 2 72.28 GATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1 + chr3R 21276564 5' + BS 5043 1 69.31 GGAAAATGCGGCATGTTGCTGCCGTGTTAATTGCAACTGCAACAACATAATAAATAACCAACTGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGAT:1 + chr3L 741183 5' - Circe 31 2 63.37 TATTTTTAATGCATGCTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTA:1 + chr3L 23027541 5' - INE-1 566 1 54.46 TGACTCTGTGTTATTTTTGCTGCCTTTGGGTACAGCTACCCGTACAGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGAGTGTTTATG:1 + chr2R 9806369 5' - Stalker2 122 2 54.46 ATATAACTAGCGGCAAAATCATCAGCTTTTAGTATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAATCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCAGGCAACATT:1 + chr2L 740580 5' - Cr1a 469 1 76.24 ACCAACGCATATGTGGCTCTGAACTTATTACTTATTATTAACGAAATAAGTTTATGAACAAGGCCAAGGGAGAAACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAA:1 - chrX 19595113 5' - gypsy12 10153 2 58.42 TCGATAATGTGAAGCTCAGACTAGTTGCCAGTCCGTTTGCGTTTATTTTTTTGTGCATTTTTGATATTTTTCGAGCGCATAAACAAAAGGGAAGATTCAAT:1 + chr3R 29256366 5' + Doc3-element 4696 1 67.33 AGACCAATAAAAATATGAAAAATATCAAAAAATGTGCGGGTTAGAGTAGTCGTGTTAAAAACACTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 1670554 5' - roo 397 1 68.32 TTAAATTACAATAAATGTGATCCGAAAACAAAATTTACCTCGAGGGGCCACACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2R 12097743 5' + hobo 37 1 57.30 AAAATGTGACACTTTCCTGCATTTTTTGACAACAATAAATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTTAATTTTTGACTTTAA:1 + chrX 5280754 5' - S-element 1681 2 65.35 TGGGTTGTGGATGCCAGAGNTGTTACCATGGAGCTGAAGTTCCAACGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAG:1 + chr3R 23712269 5' - Chimpo 50 1 69.31 AATTTTCAGTTCTTGATATTAGAAACTTATGAATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 - chr3R 7618721 5' + Doc 27 1 50.50 AGTTCGGACCAAGGGATACCTTTTGCCAAATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3R 30611333 5' + blood 3 2 74.49 CGCCCCATTTCGGGGGATCNGGGATATATGTATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 10090319 5' - pogo 2061 1 73.27 AGACATTTTTAAGCAAGCGNACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2R 6041625 5' - opus 7463 2 69.31 AACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTGTGTAAACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGT:1 + chr3L 16973394 5' + S-element 1585 2 73.27 TTGTTTGAAAAATCTACTTTATCCATTCCAGTCACTAGTTTCTTTTTGAAATTTCCATTAAACTTGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGC:1 - chr2R 4265363 5' - mdg3 5264 1 64.36 GTATGCTGATATAATTCTANATCTGATCTTGGTCTTGAAAAATTCACATTTATTGACATTTAATTTAAGTCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAG:1 - chr2R 3648765 5' + Stalker 6857 4 75.25 GAAATATAATGTGGAATGAGATTAGATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 2270527 5' + roo 44 2 70.30 GAGAATAGTTGAGGTGCGTNCTTTGTTGTGTGCCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 3766302 5' + hobo 43 1 70.30 ATTAGTCATCACTTAGTATATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCGGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr2R 8717658 5' + 297 6630 2 79.21 TCTATAATTTTCAACACTTTATCCTATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAAGCACGAAGTACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTT:1 - chr2R 20486488 5' - 1360 449 1 75.25 GGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCAC:1 - chrY 3648908 5' - Stalker 7075 4 80.20 AGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3R 22469159 5' - hobo 2892 1 74.26 TAAGAAGAATTACGAAATAGTAAATGACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCT:1 + chr3R 14985298 5' + Ivk 38 1 52.48 GTATGATGATGTAGTTGATAGCGTGTGTACGAGTGTATGCTACTATACGAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 19270333 5' + pogo 24 1 51.49 AATGGCAATGCCGCAAGTCGTTGTTCTACACAATTAGCAGCTATTGCCATTTCGACCCCCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTGCATACGG:1 + chrX 14774710 5' - INE-1 135 1 45.54 TATTCGATCTTTGGTTGATTGGTTCACGTTGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAA:1 - chr3R 27057801 5' - Doc 4341 1 71.29 ATTTACCCTATTAATAAACATTTTTAGCGTAATTCAAATACCTGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr3R 10229385 5' - copia 256 1 55.45 TTGTTGTCGTCTAAACTCGCTGGCAAGTGATGTGTGCAAAGTGGAGATGACGCTGACTTCCACTCGACTC:1 + chr3L 2988676 5' - flea 126 1 75.71 TTACACGCTCGCACACACACACACACATGCACA:1 - chrX 18366844 5' + accord 7034 2 90.91 GGGGAGCAGGTGAACTTGAACTTGGAGAGGCGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3R 15537362 5' + P-element 26 1 43.37 AACATAAAGCGTTCTAGATATTTTCGGGGTTTAAATTTGTAGAAATAGGACCAATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTTAACCCTCTAGCTTTTATAG:1 + chr3L 23035266 5' - INE-1 161 1 50.50 AAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCGGAAAACCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr3L 27357551 5' - mdg1 390 2 51.49 TAATTGAATAAAAGCGGTCGCGATATAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3L 3822446 5' + pogo 44 1 73.27 AGTGAGAGAGGCGTTTGCGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCAACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chr2R 18988446 5' - hobo 2884 1 74.49 AGTCTATCAGTCGAGTTCTCATGGGCCGGGATATTAATTGAAATTGCCCAGGGATTAGGTAGCCAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 + chrX 5452533 5' + mdg3 5266 1 64.36 AATCCAGTTTTCTGTGTCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chrX 2123714 5' - P-element 2831 1 23.00 TGTCTGTATGTGTGCGGTGTTTGTGCACGTGTTCATCTCTTCCCCCCAGTGTGTTAGTGTGCTAGTACGTGTGCGATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTT:1 - chr3R 21811856 5' - accord 253 2 76.24 AGAGGTGACAAAAAATTCCAGCGCGGAATTCCAATTCCCCGCGATCCTGCAACCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chr2L 15479540 5' - blood 7367 2 56.44 AATTATCCATGGACAAATATATAAATCCAGTTTCCCCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3L 153462 5' - 1360 3348 1 63.37 GCCGCGTTCTTAGCGTCGCGTTGCTGGGTATTTCCGCTCCGAATTTGCTTGGGCTGGGATTGATGGATATAATGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTG:1 - chr2R 24105834 5' - 297 6502 1 53.47 CTAACTGCAAGTTTGTTTCAAAAGCAGAGCTTGAATTCCACAATTCCGTGTGTTAGTATATAAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrX 13268953 5' + 1360 9 2 70.30 TCCCGGAATATATATATATATGTGCAATATATATACTCACTAAATGCCCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATTTAAGTATTCTGAGTA:1 + chr3L 14175430 5' - gypsy11 53 2 52.48 TAAATAAAAGCATTTAAAAAAAAATACTATAAAAATGCTTTACATATCACTGAAAAAATGTGTCTAATACTATTAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr2L 3740504 5' - hobo 2932 1 63.37 GACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGC:1 + chr3R 14985323 5' + Ivk 63 1 74.26 GTGCCGAGCGGTCGTAAAAATCGTAACAATATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGA:1 + chr3R 28990608 5' - flea 286 1 71.29 TATTATTCTATTCGATCTAAAAATGCAACCTTAATTATCGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGC:1 - chr2R 3120377 5' + 1360 3215 1 63.64 CCTGAAGATCTTCTTTTCTTAGCAAGCGTAGGAGATACATTTTCAAAGTTTGGTAGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 - chrX 18584994 5' - Burdock 237 2 61.39 TTATAAGCGCGCCAAAAAGTATGCAAGTAATTTTTTACAAGCGCCTCCACAGTACATTACTTGCAGGGCAGAGTCGCAAATCTGCCTTCATAGAGATCGGT:1 + chr3R 8460834 5' + BS 3 1 69.31 ATGGGCCCAATATCAGAGGTCGATATGGTATGAATACAATATAGAAATATAGAATTTAATTAATTAATTACTTAATTAATAATATTATTAATTATAATTAT:1 + chr3L 17831163 5' + mdg1 7083 2 46.53 TACCTTTTAGTATACCGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 + chr2L 22113023 5' - 1360 3332 1 84.16 TGTGGGTGGGAAGAGCGGGAGAAAATGCAAAGGGAAATGTGGGGGAGGGGTGGTGTGGGGAGGTGAGTTCTGGGCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACG:1 - chr2L 19461719 5' + R1A1-element 5044 1 78.79 GAAGTGCAATCGACCTGGATGGACATCCCCAGAAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr3L 24150502 5' + blood 12 2 65.35 TGGCTTTGGGGGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chr2R 6074471 5' - 412 493 2 76.24 GGGCGCATGTGTGTGCGTGTGCCGATGTGTACAATTTGTGAACTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGC:1 + chr2R 24741454 5' - gypsy12 10162 2 57.43 AATTCGCATTAAGATTAAATCAACCAAAAGCAAGGAAGTTCATTCAAAATAAAACTAAGCATATAATTTGTAAAATGGCAAAAACAAAGGAGCTATCAGTT:1 - chr2L 21850859 5' + Bari2 260 1 55.45 ATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATATATATAGTAAATTTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chr2L 8967078 5' - 297 374 2 71.95 TGGTTATTATAGTAAAAAATATTATTTTTTTTTCAGTGTAATCCCGCTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3L 7966846 5' + jockey 30 1 55.21 TAAAACAGATGGATGAGTTTCAGACTGCCAACATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGAAGTGTT:1 + chr2R 11941185 5' + Doc 18 1 63.37 GGAAGATGGGTAGAAAACCCGAAACTCAATTATAACAATATGCCCAGATTTTCCCTTTTGGCCCGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTAC:1 - chrX 17781652 5' + Stalker4 7332 2 74.26 TTGGCATCGCTGGGAATGGCAAGGCCAGTAAATGAATAGACCGGCTAAATACACAAATAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 17109633 5' + roo 16 2 70.30 CAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3R 7869126 5' + 297 6621 2 65.35 AATCACACACACAGGCCGCCGTATTGTCGTTTGTGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2L 17865678 5' + hobo 43 1 70.30 TTTTTATTTTGAAGTTTATTCCTTTTTTGTTAAAAATTTAATTGTTTAACTATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCAGCTCTCCGCTCCCTCTTA:1 - chr3R 3629168 5' + GATE 37 2 51.49 TTTTTTGCGGATCCACCTACTCGTTTGCCTGGCATTTGCTAGAGGCCTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTG:1 - chr2L 18414349 5' + hopper 1210 1 54.46 AAATGAAGAGCTATTTCTTTAGCCCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr3R 29158100 5' - P-element 2835 1 27.72 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCCGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGG:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 16 2 70.41 GGGGGCTGTGAGGAGGAATGCTTTTGCGACGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 - chr2L 14054827 5' + F-element 12 1 73.00 AGATGGATGAGTTTCAGACTGCCAACATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr2R 11941191 5' + Doc 24 1 57.43 GGCCCATTCGATAGCCCGCTTGTTTTTCTATTTCGCCACCAATACGGACTTGCTCTACGCCGGAGCCGTTGTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAA:1 - chr3L 16492455 5' - Bari1 102 1 74.26 GATTAACATTATTGTCCGTNATCCCAAATGTCCATCGCCAATCCTCTTCGCACGATCCACAGTCTTGTGTAACACGAATATCGTCTTCTAGCACAACACG:1 + chr2L 20818600 5' + 1360 3202 1 82.00 ATCAGCAACTTTCACTCACCGGCTAAATGACGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCG:1 + chrX 9033005 5' - F-element 400 1 70.30 ATTTTACTTTTTGATATTTTTTGTGTTAATTCGCTTTTGCTGCTTCTGCTCGCTGATTGGGTTTTTTCTTTTTGGTTTTTTTTTTTAAATATTTTTTTTTT:1 + chr3R 12561480 5' + FB 174 3 80.20 AAGATCCAAGAAACTGCATGTATATTACTAAAAAATGTGGTCAACTTATTTACTTTAAGAATGAGGATCTTGTGAAAAATATTTGTATTTAATTAAATAAT:1 - chr3R 18862648 5' - transib1 1939 1 46.53 GTTCTTTTATACTACAAACGACATAGCTTAGTTGTAGTTAAACGATTAAATTCACTTTTTTTTTTTAAATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATT:1 + chr2L 13666946 5' + Tc1 1519 1 67.33 GTAAGTTGTTTTACTTCAANTTTTAATTATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 11758378 5' - roo 361 2 74.26 TGTGTACCCAACCCACTGACCCTCGCCAATATGCATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 + chrX 13294042 5' - mdg3 206 2 65.00 ACTTAAATATAGGTAACCATTTCATTTGACTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 8434310 5' + roo 47 2 74.26 CGAAAATATCAACAAACCATCACAGCTGGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGAT:1 - chr2L 18185598 5' - F-element 467 1 64.10 TTTCAGAGCAATGAGGGCCACAATGTTATTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr3R 28216846 5' - blood 7342 2 78.22 GGGGATTTGATAACACGGCCATGACAACACCTTGTCCCTGGTTTGGTATTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTA:1 - chrX 13636653 5' + jockey 239 1 52.53 GTTTTGGTTATAATCGAATAACAATAGTGATTAGTCATGAACGCTATATTAAATACTCTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTA:1 + chr2R 1982193 5' - flea 400 1 59.41 GGAATCGAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:2 + chr2L 6322546 5' - roo 9027 1 74.26 ACATCTATCTTTTTATATACGTATATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:2 - chr3R 22517300 5' + jockey 4724 1 75.25 GCGGTAATGACTGTCATGAAACTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGG:1 + chr3R 4699426 5' - Quasimodo 6895 2 78.22 AAAACAGTGTCAAGGGGATCGAGGGAATGAAGGATCCAAGACCAGCCAAAAAAAAAAATGGCAAAAAAAGAACAAAGAATTATTATTTTTATTTATTTAA:1 - chr2R 13659118 5' - HeT-A 38 1 79.00 GCCCCTTCTCCGGCAAACCGATATGCCATAGACGTTTTCCCCGGAAAGCCTCGTCCCGGTCCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTC:1 + chr2R 20857766 5' - hobo 2925 1 65.35 ATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATTCTAGCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:1 - chr3R 4604461 5' + Ivk 47 1 67.33 TACTATGCGACATTAATTACAGACTAATGTATCGTGCATATTGTGCGTTGTGTACATATTGTACATATTGTACATATTGTACATATTGTACATATGGTGTA:1 - chrX 20455899 5' - Stalker2 269 2 74.26 GCTGGTGATGATGGAAGTAGGTGCTCTAACGAATTGTTGTAAATGTTGGGCTTTTAGCTCTTCGGAGGCTGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2L 13433997 5' + hobo 5 1 74.26 AAGTTGATAAATCTACGCAGATTTAACATATCAAGTGGGTGGCAAAGTTTGCATTTCCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr2L 20609983 5' + copia 19 2 65.35 AAAATCAAATTGAATTTTATGGCCGTAATAACCGCCAGCAGCAATGGATTTAAAGACTTAAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTAGAAAGG:1 - chr3L 14165239 5' - transib4 2446 1 73.47 TCTAGTAGGGATAAGATACTTATACTATAAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2R 6074346 5' + 412 20 2 43.56 TGGTGTGTGTGTAAACTAAACACGCGCGTTGTTGCAGAAGCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGC:1 - chr2R 17266012 5' - Stalker4 301 4 56.04 ACCTGGAAGGGGAAACATGAGGGGTTACCGACAGTCGACACAATTGATTTGTAGCGCAGTTGTCTTAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chrX 19615004 5' - 1360 3383 2 74.26 AATGCCAAGTTGTTTAATATTTTGTTATTCACTTTTTTCTTTGCCCCAGCTCGGTGTAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr3L 10683424 5' - opus 7487 2 65.35 GCCGGCCGATGAATTGATCGCCGATAATTATTATTATTAAGATGGGCTTGTAGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACC:1 + chr3L 24259127 5' - baggins 5396 1 73.27 GAATAGTTTGAGTGAAGGGCATAGAAAGAATACAGTTGAGTTCTATTAGCATCGACACATAGAATGTTAATCCGCTGTTA:1 + chr2L 10858271 5' - diver 5931 2 71.25 ATGTGGGGAATGGAGCACGGAACGGAGAATGGACGAGGCGCACAAACATGTCAGGCAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr3L 11657824 5' - Tabor 7305 2 59.41 GAGCGGGGAGCAGGTGAACTTGAACTTGGAGAGGCGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 15537366 5' - P-element 2847 1 39.60 GTGGCATTTCATTTGGCTGCATCAGCACAAAGCGAGTCCGCAGCTCAGACTTAATTGATTTTCATACTTTATGCCATCTGCGCAG:1 - chr3L 12991501 5' + 17.6 135 2 68.24 GCGCTTTTTTACCAAATCTGATTGCCAACTAAAAAAGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr2R 18077042 5' - Transpac 273 2 62.38 GCCTAACATAAATAGAGATATCGAAGAACAGTTCTACATCAGTGTCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCT:1 - chr2R 3118967 5' - baggins 5322 1 56.44 AATATGTACTTATTTATTTTCTCATATGTATATCACACCAATTATCCAATCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:3 + chrX 18584895 5' + Burdock 6153 2 62.38 CATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3R 18342473 5' + F-element 59 1 70.30 TTCGATATAAACGTTACCGTCCTATGAAATAGATTTCGTTTTGGAGCTCAGAGCCTCTGCTCTGTTTGAATCGGTTTATTCGAATGAATTCATATTGCTGT:1 + chr3R 20459327 5' - Stalker3T 273 1 72.28 AGTGTCACACTAATAAAGTATTCTTTGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 14601809 5' - roo 9023 2 74.26 TAATTCGAAAAGTGCACGTCTTGACTTTATTAACGCTTCTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACAT:1 - chr2L 12455313 5' + jockey 4983 1 61.39 GGAGGAATGCTTTTGCGACGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr2L 14054816 5' + F-element 24 1 61.39 GCCACCTCCATAAGCCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 - chr3R 13516874 5' + jockey 4721 1 75.25 CTTTTAAAACTCTCTTCAAAACTTCTTAGTGATCCTTTTTTTCATTAACGTCTTGTAATTTCTATAGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTG:1 - chrX 6613475 5' - Doc 4489 1 65.35 AGGGTCTGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr2R 24555707 5' + hopper 4 2 71.26 TAGCGTTTTTCTGCGTTCGTGCTTTGCATGGCCATTTGTTACGTATACTTGTGCGCAGGACTGTCGTACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 + chr2R 12252821 5' - opus 7456 2 63.54 TTTTTTATTCCCGCCCTTACATGTTTGTAATTAATTTAAATTTTTCTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTA:1 - chr2R 20092543 5' + Cr1a 4314 1 62.38 TAATAGTAAATAAACCAACAAGGTGTTGTGTTCGAGTATATAAATTGTATAGCTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:2 + chr2L 14038383 5' + 3S18 5789 2 53.47 GAATATATGTGAATAAGTTTCAACAAGATGCGTAATGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 + chr2R 10706118 5' + 1360 74 1 80.20 AAAGTAGGCTACTTAACAAAGTCAATGAACGTAATAATTATACTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2L 18077455 5' + hobo 30 1 53.47 AAATTATTTAAAACTTTTANGGGAAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2R 2078158 5' + jockey 57 1 74.75 GAGCAAAGTTGAGTTTTTAGTAGTCGGGTGATTAGTTCAACGCGAGAAATGAAAGAATATTAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr3L 10686963 5' - opus 7474 2 73.00 AATTATGAAAGTTTAGTTCATTTATATAATTAGTTTGTTTCTCATTTCTGAAGCCTTGTCACTTTCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAG:2 + chrX 3016608 5' + diver 5887 1 80.20 AGTTATTAAGCTCTGAGCGNTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr2L 6583303 5' + hobo 11 1 67.33 AGAGTCCCAGCAACATTCAGCGGCCCGACTGCTTCGGCTACTTACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTC:1 + chr2L 3767706 5' - hobo 2580 1 58.42 GCGATAACGCCGCTGACATCCACGCTTAATAATATCCCTTTCGCGTTGGAAAAACAAAAGCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 949256 5' - roo 395 1 65.35 AAAGTTGCCATAACAATAATAATACGTTTCGAATAATAAAAATAATAAAAAAATAATACTAATGATAAAAATCATAATAATAATAATAATAATCATAATTA:1 + chr2L 12297093 5' + mdg1 44 3 75.25 TACCAATTAACTCTAATGCTCCACTTGAAAGAATCAGTATCACTTTTTAAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr3R 13170448 5' - gypsy7 5009 1 68.49 ATCCCCTCACTTCCCGCAAGCCCCCACAAGCCAGTATCTAGATTTCTTCCATTGAATATATATATATATATGCAGTAATAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 + chr2L 14089656 5' - BS 5043 1 71.00 GCCGCACTGTGTATCTTGTATCTTGTATCTCCGATCATTGATCGTTGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 - chrX 7534734 5' + Tirant 5 2 74.26 AACTGGCACAGGCCATCGCATCGTGGACAACCTAGCCAGGTAAGGGCAGAGAACCCTCTAATTAGGCGCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAG:1 + chrX 15016783 5' + baggins 4954 1 72.00 GAGCACTCGCCACTGAATATCATTCATACGCCGAGTGGTCCGGGTCACCGAAGTCACCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATATAATGTATTTATATTTA:1 + chr3L 12828094 5' - diver2 452 1 56.44 GCCACCTGGAAGGGGAAACNTGAGGGGTTACCGACAGTCGACACAATTGATTTGTAGCGCAGTTGTCTTAGTCTTACCAAAGACACTGGAATAACAAGATG:1 - chrX 19615007 5' - 1360 3386 2 76.24 ACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGTATAAAGTCTAAATT:1 + chr3L 19274796 5' + transib2 23 1 56.44 ATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAG:1 - chr4 1271898 5' - 1360 71 1 78.22 AACCTGAACAGTACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr2R 5200923 5' + 1360 22 1 55.45 ACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr2R 6074459 5' - 412 7534 2 64.36 TGAGCAAATGCGATCCACAAGAGAGCAAGTTCAAGTTCGTTTCTTGTGGCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACC:2 - chr3R 25208398 5' + P-element 26 1 53.47 AGCTATGCTGGTTAAGGAGCTTCCTTCACTTGTTTCATTTTTAATAACATATCTCATATCAAGACCATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 + chr2R 8706996 5' + flea 4763 1 73.27 AGGAAAAGAGCACAATCTGGGCAAGAAAAACAGGGAGCCGCGGAAGCCGTCTTTTTGATGAACAGCGAAGCGCAGATCGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chrX 22861404 5' - INE-1 543 1 63.27 GTTGTTTCTGGAGTCAGAGTTGATGAGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCC:1 - chr2L 23352620 5' + accord 6 2 73.27 GTGTGGAGTGGGATGTTGTTCATGAATTTTCCAGAGATCAGCACTTTAAGCCAATATGATTTGGAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr2R 8707115 5' - flea 247 2 72.28 TATAGATTTTTTATTGCACNGCAGGAATCAATAGGTATAGTGATATTTAATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 + chr2L 20396916 5' + Transpac 23 2 56.44 AGCGTATCTATTAAAGCACATAAAAACATTAATGAGCACTAAAGTAACCGTTAGTTATTTGACAATTTGCCTGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAG:1 + chrX 19889889 5' + roo 195 2 76.00 AGACGAACTGCGTCTCAATTAAGCCAAATCTCTGGGATCTGCCGTGTAATGAAGTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGGAAATG:1 + chr3R 10487858 5' + jockey 383 1 61.39 TATTAGAAACTTATGAATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATGGCAAGTT:1 - chr3R 7618705 5' + Doc 43 1 61.39 GTTAGCCTAATCCACGCCGCTTTCTATTCTACCTGCTACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATTAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGA:1 - chrX 1028536 5' + McClintock 275 2 63.37 TTTTGCGACGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 - chr2L 14054806 5' + F-element 34 1 51.49 GAGGATGAGTGAAGATATGATTCGGACGCAAGTTAAATGGCAATTCCGCAGAGGGCAAAAGTGTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATT:1 - chr2R 21588985 5' - Doc 314 1 59.41 GAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAATCCCTAAGACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTAGATGTACTCC:1 + chrY 1428630 5' + G2 2978 1 57.43 TGCAGGTTGGCCTTTGTTTACGCGAGTGTCGATGCATCCCAAACAAGAGTAAACATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTA:1 - chr2L 11415265 5' + Juan 3996 1 57.00 GCCAAGCAGGAGCGAGAAAAACAGGAACGGGATTACCAGCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTC:1 + chr3L 21422289 5' + Doc2-element 346 2 61.39 GCAAAGAATTTAAAAAAAGAATGAATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chr3L 15831264 5' - 412 7493 2 76.24 TTGGCGATCATTAAAAGCCAAAAAAACACTTAAAGACTGTGCATTAAAGTTTCTGCTGACACATAGACAAGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAA:1 + chr3L 21397503 5' + Doc 397 1 68.32 TGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr3R 14049332 5' + transib2 17 1 62.38 TTTTAAACTTTGCTGGTTTAAACTTTGCTGGTTTCACTTTGCTTTTTTTTTTGAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCA:1 + chr2R 25286854 5' - TAHRE 10401 1 77.78 GTTCGCTATGTCCCACCCCNACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATAT:1 - chr2R 19061429 5' + accord 7031 2 48.61 AATGTGTACTTTACAACACTACTGCCTGGAATCGCTTAACTCAGAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr2R 11403937 5' - mdg1 389 2 55.45 ATGCTCCTGCACCTCCCTCCTCATCGTGCCTTCTCTGTCTCCACAGCACTCGTGCTGTCTCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2R 8385195 5' + hobo 18 1 59.41 GCTTTGCGGCGGGAGCGATATCCGGATCGGTAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chrX 19614923 5' - 1360 3345 1 71.29 GTTGTGTTTTCAGACAGGAATTCGCGAACTGCGAGCTGAGTAGCTAAGCTATGTGGGTGCATTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr2L 13566714 5' + FB 15 1 64.36 GAAGAACTCCTGCGAGTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2R 19513371 5' - 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chr3R 20599656 5' - opus 458 2 68.82 ATAGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAACATCTTTGCGGGGTAATTAATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr3R 27083043 5' - jockey 4962 1 54.46 CTTTCGCCAGTCTCGCCAAGGCAACAGATGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 13544132 5' - roo 9051 2 59.74 GTGTAAGTATTGGGTGTTACACGCTGCCAAGTACTCCCCAAAGTGCCCCTAAATGCAAGAAATGACAGTCATTTCATATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTT:1 + chr3R 28115172 5' - Tirant 22 2 81.19 ACTGAAAAACCCACTTAAGTATGCAATGCTAAAAATTCAAAAGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3R 28728646 5' + hobo 26 1 52.48 AATCTCGAGTTGTTCTTTTCTGGCCTGTGGCCGCCGGCAGACCTTTAGATTTTCATGTTAACTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 + chr3R 17615916 5' + HMS-Beagle 12 2 67.33 TTTCATCCCCTCCCCGCCCACACGAGGGCTTCTCCAGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTACAGA:1 - chr2L 11918443 5' + X-element 488 1 71.29 ACTACATCGATTACATCTATATTATATAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2L 3475359 5' - roo 400 1 73.27 GCAGTGCTCTGCACTTGATGTTGTCAGCATTCCCCGCGTCATTTAATTGTATTTATCATTATCAGCTCTCTGCAACTCTGGATGCGTGCCACTTGCATTAT:1 - chrX 590401 5' - TAHRE 10000 1 81.19 AAAAACAGAGAAACCCCAAAGAATCGTGCGAGCGGGATGGAGCGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 5206549 5' + roo 32 2 57.43 ACCACACTAATTGACTTGTGATTTACAGATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAGCGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCAAAATAT:1 + chr2L 2737394 5' + gypsy4 74 2 68.32 AGTGCGGAGCGTTATGGCAGAAGCATGCACCCACCAGCTGCACTGGGAAAAAGAACAATGTCACATTGCCACATTGCTAGCAGAATGGAGAACCACCACAC:1 + chr2R 8769718 5' + G2 2851 1 72.28 GGGGAGCTCAAGTACATGGAGTGCGTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 7494106 5' + roo 24 2 55.45 GACGATAATAACGGTCACTCTGACTGACTGCTTTTCGTTTTCGATTTCGTTTAGCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 - chr3R 16594562 5' - Tirant 8488 2 61.39 TTGCTGGCATGTAAGTTGTTTTACTTCAAATTTTAATTATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 11758368 5' - roo 9035 1 64.36 ACAGGACTTCGCACACTCGAGAACCCATACTCCGGCACAATTGCGCACATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGAT:1 - 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INE-1 149 1 73.12 CTGCAACACTGGATACGTCCGTTCTCGTTCTCGTTCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGC:1 - chrX 9094176 5' + F-element 454 1 65.35 TATGTATTGTTATTTGAAAAGCAAATTTAGTCATTCGAAAATATTGCTTAAGTAATATACTAATATTCTTGAAGCTTTTTTGAATTACAATTAACTTAAAA:1 - chr3R 19533313 5' - Juan 4008 1 72.28 AGCGATATATGTGTACATATGTGATATATATGATCTGATGACCTAAGGAATATGCAGCATCAAGCAGCAAATCACACGATCTATTTATATAAAATAAAGAC:1 - chrX 17743710 5' + Bari1 1402 1 61.39 TAATACATGTACTGCCAGCTGTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:2 + chr3R 18171749 5' + 1360 10 2 69.31 ACGCCCGATTGAGCAGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 27455524 5' + 297 6593 2 68.32 CTAGCGGGAAATATATTACNACCCTTAAGACCTACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACA:1 + chrX 15746311 5' + jockey2 3242 1 57.43 GCTCTGTATATGTGTGAGTGTGGGAGCGCAATGTGTGAAGAGGCATGATGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGAT:1 + chr3R 22098988 5' - F-element 309 1 54.46 TGTGTGTGTGACTGTTTTGAAACCGTGGCACTTAACTAATAAGACACTAGCGCTGCTTAATCTCAACCTTCTAGTTCCTCAGATCTCGACGTTCATACGGA:1 - chr2R 5969072 5' - INE-1 134 1 57.43 GCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2R 20461015 5' + hobo 43 1 67.00 AAATTAAGATAAGTCATAGATTGCACAAATAAATAATTAGCAATTAATAAAAAAGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAA:1 + chrX 13616862 5' + X-element 32 1 49.50 AATGTTCCTTAATGATTACCCACAACAATTGTATATACATACAGGGTATATATACAAATTTCGTTCCCGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACA:1 + chr2L 21996563 5' + 412 187 2 66.34 GGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chrX 153018 5' - mdg1 7413 2 74.26 TGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr2L 15907217 5' + pogo 35 1 64.36 TAAAAAATGGTTTATCTCAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 - chr2L 2309448 5' + Burdock 39 2 67.33 TATTAATTTAACACCAATGGCCAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 15412675 5' + hobo 24 1 52.63 ATATTGTTTAGACCACGAGAAAATTGCCTTTTTATATAAATATACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 3146603 5' + roo 31 2 60.40 AGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATC:1 + chr3L 27356090 5' - Tc3 1672 1 65.35 TTAAGGCGGTACTCCAGCCNGCTTCATTCTTGCCTCTTCCACTCCACATAAATGGAACTAATAGAAGGTTTAATAAAGTATTTTCCATTCCAGTTTTCCGG:1 + chr2L 17892155 5' - ZAM 481 1 56.44 TAGCCCCGCCCGAACTGGAATCCCACCCCCAGCATCTGAAATGCTGTGGCTGACTAAAAACAAAGGAGCTATCAGTTGGGCATCGAGTCGAGATTGTCACT:1 + chrX 1166432 5' + Bari2 284 1 62.38 ATTAATAATCGTCAAGTCAAATACAAACATTATGCCAAACTTACTGCTCTCTGCCGCTCTGAAAGCAATTAATTTTAACTTTTTTAATACATAATTAGATC:1 - chr3L 23800733 5' + Cr1a 4276 1 49.50 ACGTTTGTAAAATTCCATTCGAATGTATATGCACAATCGAATGTATTCTAGTAAATTAGTCTTCGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 16127680 5' + roo 11 2 72.28 TTTTTGCTCCTGATTGTGCCGCAACCCGTACGGCCACGCCCCCTGCCGCATTGTAACTGATGGGATATTTAAGTTTCTTTGAATGTTTTCACTCCGAACGT:1 + chr2L 11733679 5' - F-element 4371 1 48.51 AATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGA:1 + chr2L 23299988 5' + invader4 354 1 67.00 AATTAAAATTGCATCTCTGNTCATCAAAAAGCTTTGAAGGCAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACTATTAG:1 + chr3L 13553852 5' - X-element 114 1 61.22 GTTGTTAGTTTTATCTATAAGTTACGATCGGGTGTCATAGGTTGGGGTAGGATGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACA:1 - chr3L 10077742 5' - Doc 4308 1 56.44 GAAAAAGTTAAGATATCCAAAATTATTAAAAACAGAACACTCTCCTATATATTGTCAAATTTACAATGCATGGATACGTGTGCACACACACAGTTGTCTGC:1 + chr4 958080 5' - 1360 166 1 54.46 AGTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2R 15376181 5' - 1360 3367 1 54.46 TACAGCCCCAAATAAATAGNTGTCCACAATCAGAATCGCACTCACACCAACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAAC:1 + chr3R 20168109 5' + accord 7146 2 51.49 AAGTAAAACCCTCGGATCCGGGGATTTCGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGAT:1 - chr3L 13368979 5' - mdg3 395 1 72.28 ACACCCGAGATAAATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chrX 19219298 5' + Doc 36 1 57.43 TATCAACCAGTTCTCCTTTTTTTTTTTAATAAAATACAGACGCCCCTGCTGGTAGACACATGGCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATT:1 + chr3L 9199184 5' + Ivk 407 1 70.10 TATTTATTTATAAACCGACTTAGTAAGATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr2R 16979750 5' + 297 45 2 81.19 GGTTTACCGAACGGAAAATTACCCGATTATCCGAAAAATGCAAAGCGCATAAAGAAATGTGGTCACAGATCACAACAGCTGAGATGGCTGATGAATAGAAG:1 - 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chr3L 21912326 5' - Bari1 1667 1 65.35 AAAGAATATCTTTACTATTNTTGGATGATCATTCAATACCTAATTTCTAAAACCCCTCTCGACCAAGCTTGGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCG:1 - chr3R 4997074 5' - 1360 127 1 76.24 CAGCGATAAAAAGCTATAAATTTCGCCCGCTTCGCGGTGAGTGTGTATCTGTGTGTGTTTGTGTGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATAT:1 - chr2R 9381327 5' - Idefix 6 2 63.37 TAACTGGGCGAGCAGAGGGGTAAATAGAAACCGGAAAAGGCCCGCAGAACATGCCCCAGCCAAAATGAAAATTAAGCGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3R 12937390 5' - roo 409 1 75.25 GTGAGAGTTTCGGGGAGTTTTTTTTTCCCCTATCTGGAATTACTTTATCGGCACACACTCACTCGCGCAATTAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGT:1 + chr3R 30931487 5' + Doc 4612 1 71.29 TATACGTGTTAATTTCCCTTTTTTTTTTGCTTATTTAAATTATTTACCCAACACAAAATTTTTTTAATTTT:1 - chr3R 26726696 5' - HB 328 1 76.06 AAGGTATTGTACCACAATCCACATATTTAAAGGTCTTAATCTAGCTTTGGGCACCTCTTAAAAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 32022949 5' + FB 877 1 56.00 TGCTACATAAAAAACACAGACAGCGAAAGAGACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr2R 8385128 5' - hobo 2894 1 67.33 TTAAATTGCTGCCCGTCTCAACGCATTTAAAGTCTAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2L 15983423 5' + hobo 41 1 64.36 GATTCCCTGATGGGGCTGGTGTGAACTTTGGCACTCGCCATGCAGCTTTTTCTGCGGCTTATCCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAAC:1 - chr2R 13081976 5' - I-element 496 1 66.00 AATGCCGGCGTTTGTTTGGGTCAGTCTGCCGGAGTGGCTTTTCGTGTTTACATCCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAA:1 - chr3R 22530572 5' + hobo 2718 1 60.98 ATAAATCTATCATTTTAAGTACCCATAAATTAGCGAATCAAACAGCTGCTAGTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCT:1 + chr3L 16807099 5' - P-element 362 1 59.57 AGCGAGGAGTTGGCCGATGGCGACTTCTGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAGCAGGAGCGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAA:1 - chr3R 23974497 5' - Cr1a 4313 1 72.28 GGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGGGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAA:1 - chr2R 5627648 5' - TLD2_LTR 97 1 73.47 ACTCACCTCGTTTCGTTTTATTTTTATTATTGTGTTCAGTTACTACGTAGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTAATTAT:1 - chrX 8973021 5' - flea 4992 2 58.42 GTGCCAAGGAAGCCCTAACGCACGTCGAGCAGCACTTGTTTGAATAGTTTTCAGCCTCTCCAGTTGGTGTTTGGAGGCTGTTCCCCATATTTGGATG:1 + chr3L 24120306 5' - G5A 2439 1 77.32 AGTACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCT:1 + chr3L 21912271 5' + Bari1 42 1 74.26 TTCGACCACTCTCTTTTCATCGATCAGACAGATGAGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2R 21362766 5' + Tirant 8145 2 62.38 TGTGCGGTTTGTGGTGTGCNGTGGTTTTCTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGATAAGGGAATGCCGAAAATTGAGAAGAGACAAAGCA:1 + chr2L 18753388 5' + micropia 5270 2 71.29 TTAAAATGCGCCCTTCTATGCGCTTCTCATTGTGTTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGT:1 - chrX 19084365 5' - jockey 92 1 65.35 AAATATGTTTTTAAGTGCTGCTCACAATCAGAAGCGAACCGTTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCATGTG:1 + chr3R 17552481 5' + Doc 43 1 55.45 TGACTGCACTTTACGCATCGCAAAAGGAGGACTTGAATTTTATTAAATTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr2L 13334808 5' + hobo 8 1 71.29 GTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTT:1 - chr2L 23295869 5' + micropia 24 2 51.00 AGCGTCATTAGACGATTGTNGGTGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chrX 5194528 5' - hobo 2886 1 78.22 GTTTTTGGGCCAAAAACTGNCACAGCAAATATTTTTCGACATCCCATCCGAAATGTGCGAGTATATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 - chr2L 12765776 5' - flea 250 2 56.44 AGCGCTTATTTGTATGTTTTATATTTAAATAATAAATGGGGGCAGCAACTTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chrX 12873571 5' - hobo 2916 1 52.48 AAATGACAATTTTTATACANAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chr3L 12983183 5' + diver 5928 2 62.38 GGACATTCAATGTCTACAATCCACTACCTAGACATAAAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 - chrX 3691565 5' + jockey 4799 1 65.35 TGGAAGGATGTGCGGCCAGAAAAAAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr3L 25345141 5' + Doc 55 1 73.00 AAAATAGCTGTATTGGAAGNATTGAAGAAATTTAAGTAGTAACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACA:1 - chr2R 4578499 5' + Chouto 481 1 59.41 TGTTTGCCTAGTGGCTGCTTTCTGGGTGGGATTGGACTATGTCTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGC:1 + chrX 8609124 5' - invader2 484 1 57.43 AGCGTCATTCGATTCGATGATGCATTGCTGTTATTTTTAATTACGCCCCGGCAACATTGTCGCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3R 19270434 5' - pogo 2090 1 68.32 TTTATTTTAAAATCAATTAGTTTGCCTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCA:1 + chr2R 19555761 5' - 412 72 2 74.26 GTTTCCCTGCTCCACATGTNGCCAATGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 + chr2L 12357064 5' - blood 297 2 78.22 ATAAAGTCAGAAAAGCAAAAGTCACTTTTTCAATTTCCAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCC:1 + chr3L 13612785 5' - 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F-element 357 1 70.30 TTTCGAGGTCATTAAGTTGAACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGG:1 - chr3L 3328982 5' + G2 2663 1 53.06 GGCAGATAATTGGGAAAAGACCGTACTGGTTTGAAGTGTGACCAACGGAGTTATTGAAAGCGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAACTTCC:1 + chr3R 19861318 5' + G5A 2578 1 60.40 GAACTGCGAGCTGAGTAGCTAAGCTATGTGGGTGCATTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAACATGGAATC:1 + chr2L 13566739 5' + FB 36 1 59.79 AATTGATCCTTTAAATTCTCAATTCCGTGCAACTTCAAATTTCAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chrX 11987861 5' + 412 17 2 61.39 GACCACGCTGTGGATGAGCTTGTGGGCCTTTAGTGAGTTAGATTGCGTAAATCGCGACTTGCAGATGTCGCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATA:1 + chr3L 7355017 5' + mdg1 7260 2 76.24 TGTGTACTTTACAACACTACTGCCTGGAATCGCTTAACTCAGAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr2R 11403939 5' - mdg1 387 2 57.43 GGAGTGCTATAAATATATTAAAACAAATTTTCGGCAATTTAAGAGAAATTAGCAGGACATTAGTAGATATTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGA:1 - chr3L 37102 5' - HeT-A 6055 2 73.27 TGGTGATGATGGAAGTAGGTGCTCTAACGAATTGTTGTAAATGTTGGGCTTTTAGCTCTTCGGAGGCTGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - 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hobo 2918 1 56.44 AAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTA:1 + chr3L 20224133 5' - Chimpo 172 1 65.35 TTCAACTATATCAACTGCTTTTCAATTTATTTATAGAATTTCAAATGAGGCGCCGTGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTA:1 + chr3L 6997788 5' + 1360 307 1 57.43 AACCATACGAAAACACTCAAGACCATTCAACATGCCACACGCTTCCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCT:1 - chr2R 22533476 5' - P-element 386 1 48.51 GATTTTCTTCGTGTTGCGCAAGAAGTCGAGCCAAGTTACCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGC:1 - chr3R 4444407 5' - R1A1-element 34 1 61.22 AATTGCGAGAATTTCACTACCTTTTCACATAGCTGGCATCATCATCAGCAGCAGCAGCAGCATTATTATTATTATTCTTATTATTATTATTTTTATTATTC:1 - chr3R 22643346 5' - mdg1 27 2 53.47 TTCCTTTTAAAATTCGAACTTTGAACACCTGCATGCTCATTTCTGATAACTGCTTTCACATATAACGAATATCCATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 + chr3R 22466999 5' - mdg1 420 2 77.23 TAACGAAGCTCTCCAGGAACTCCGGATACGAGTCCAGCACGTCCAGCAAATCGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTG:1 - chr2R 24052535 5' + flea 4665 1 55.00 TGTAGCTTAAATATAGATCAAAATTTATTTTAAAAATTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - 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Rt1c 5180 1 56.44 GACCTTTTCCAGCCACGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAAAAA:1 - chr3L 11714638 5' + Idefix 289 2 65.96 TGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3R 8705322 5' + jockey 64 1 79.21 ACACATGTTGCTGTCCCGCAGGCAGCTTTCACCATTGCCCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr2L 18413835 5' + hopper 35 1 64.36 AGGTGGAAAGCAAAAGAAGAACGAGGACTGTCATTTCCCTGTGTATTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCACACATCGAGCGGTCAATAACCC:1 - chr3L 3625340 5' + F-element 306 1 58.42 TACAATTTTTTTTAGTGAAAAGGCACTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGACATTGCAGAAAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAG:1 - chr2L 21263188 5' + baggins 5205 1 79.21 GTGATTGCTGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAAAACGTATCGCAATAATGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chrX 8037594 5' + roo 1 2 63.00 GGGCATTTTGCACCCACACCCGCAAACAGACATCTGCTGTTGTGAAATTTACGTTTTCCGTTCGATGTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGT:1 - chr3L 6193878 5' - invader2 475 1 73.27 TGAGCATGTCACCTGGATTATACACGTATTTTTCTATCAACTTAAAGGCGAAAGCACTAACAGAAGTAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGT:1 - 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Doc 4488 1 81.00 AGTCTTTTGTTTCCATGCATGTAATCTGTCCCAGTGTGCCACCACTGTGTGCCACCACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:2 + chr2R 19557960 5' + 412 13 2 66.34 AAGACAATAAACAGTCATTCTAGCGGGCAACGCAACTTGCCACTCGGCCTGGTCATAAAGCAGGTCTCGTCTCCTGTTTTGCCATTAACGCCAACGAACG:1 + chr3L 4609763 5' + HMS-Beagle 55 2 66.00 AAAACAATACGTTTGTAAANTTCCATTCGAATGTATATGCACAATCGAATGTATTCTAGTAAATTAGTCTTCGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 16127672 5' + roo 3 2 79.21 TAACTTCAAGAAGTAAGTATTGCAATCAAATGACAATTTTTATACAAAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTC:1 + chr3L 12983156 5' + diver 5901 2 64.36 ATTGAAAGCTGATTAATTTTCCTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2R 19628371 5' - Doc2-element 247 1 72.97 AAACGTTGAAGTGCTCTTTTTTTTTGCCACACTTTTTTTTTTTGAATAATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chrX 3546298 5' - pogo 2089 1 57.95 CAGGGGATTGGCCTGCACCCACACACACACACACACACACACACACACATATAT:1 - chrX 14042277 5' + accord 7031 2 68.52 AGTCTGGCAACTGGCCATATTCTATTCTCATTCACTCCATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 + chr2L 2309384 5' - 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jockey2 24 1 69.31 AGAAATAACATTGATTTTATATGGATTATAACGATTTTTCCTACTAAAGATAGATAAAAACCTATTGATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 + chrX 16237875 5' - mdg3 5492 2 72.28 TGGCGCGTGTTAGCCGCTTCCTTTGTTGTTGTCACGCCTCGACTTTCCATACACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACAAGCCACTTCCA:1 + chr3R 8050409 5' + 297 6597 2 64.36 ATGCCAGGCGGAAACTTAAAATAGTTTAAGCGCCGTGCACTTGCAGTATTCCAATTAACACTTAATACTATTCATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACC:2 - chrX 21214532 5' + X-element 16 1 60.40 TATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr3R 14049406 5' - transib2 2782 1 67.33 TAATTTTCCGAACCAACATGTTTTTATGGCAGCTAAAGCTACAAATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTT:1 + chrX 14974225 5' - 1360 371 1 60.61 AACTTTGCTGGTTTAAACTTTGCTGGTTTCACTTTGCTTTTTTTTTTGAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAA:1 + chr2R 25286859 5' - TAHRE 10394 1 80.20 AGGGTCCTCAGGTGATCCACTACGCTCTCTAATGGCTGGGTGTTGTGCTTCTTACACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGG:1 + chr2L 6640829 5' - F-element 4471 1 65.31 GCTACTACAACTTTTTATAAAGAAGGAAGTATCTATCTTACTTGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTT:1 + chrX 602646 5' + Circe 61 2 57.43 GTCTTTTGTTTCCATGCATGTAATCTGTCCCAGTGTGCCACCACTGTGTGCCACCACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr2R 19557961 5' + 412 14 2 65.35 AATTATGTATTAAGTGCGCCTTTCGCCAGTCTCGCCAAGGCAACAGATGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 13544151 5' - roo 9046 1 53.47 TATGTCAGGCTTTTTTTTAATTTTTTTAATT:1 + chr3R 23601113 5' - HB 321 1 74.19 TGTCAATTTTGCAATTTTACAATTTTACTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2R 23441741 5' + jockey 4718 1 74.00 TGTCGCATATTAAAAAGTTATTAATATTTTCTTTTTTAGATCAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:2 + chr3R 25121594 5' - pogo 2071 1 57.43 GATTCTAGTAAAGACTGTGTGACTGGACGTGTAGTTTAGAGTCACAGAATATTAATTTAAACTATTTTACAATGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr3R 17415337 5' + roo 8666 2 72.28 GCCCAGTGCCTCTGCCTCTGTTTACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr3L 455643 5' + Doc 26 1 55.45 TTCGCCGCGGCAACACCTACAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2L 15527057 5' + pogo 29 1 61.39 TGCCAACTCTGCAAAACGAAATTTGTTTCAATTTCGCATTGAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3R 25950155 5' + 412 32 2 54.46 GGGAGGGTGCACTGTACATACAGCTTGTATGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAAGA:1 - chr3L 12139415 5' - 297 242 2 65.35 GCAGGAGGGGGGCTTTGGGGCTGGTAAAGCCGGCAAGATGAAGACGACTCTGGCTCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTTCCTCACT:1 + chr3R 28387853 5' + Doc2-element 454 1 49.50 AACAACACCAACAACAACAGCCACAACAACACCTATACCAACGCCAACAGAAGCGCAGCCAACGAAAGTGAAAAGACAAAAAATGCAAAATACTTTATATA:1 + chrX 11795766 5' - Cr1a 178 1 73.27 AACACCGAACCTTGCTGGTTGTCGCGCATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr3R 16594490 5' + Tirant 46 2 70.30 GATTTCTCAGCCTCGAACAAAGGAAATTGGGTGTTTTTCTGGGCTCGGGGATCCAAATTAAGTTATCCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATA:1 + chr3R 15804716 5' + I-element 5118 1 74.26 AACATAAATGCATTAAAATCGACTTTAAAAATAAAGGGCATTTAGATATCGATAAGGAGCTATAAGGAGCTAAGGCGCCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 - chrX 21057031 5' - Tirant 400 1 76.24 GTGAAACATTTACGCAACGCTGGGTATGGGGTTAGCTTCTCGCTCCCCACACGGGATTGGGTTTCCCGGATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATC:1 + chr2R 8190386 5' + FB 8 1 71.29 TAGTCAGCTTGCGTACGCTTGCCACTGAGCGTGGTGATCATGAAAACCATTAACCTTCCAGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 - chrX 22689226 5' + Transpac 4931 2 66.34 GGAAGTACTTTCTTTGTTANTAATATTATTTGAAAAAAAAAAATAATTTTAA:1 - chr3R 5144164 5' - 1360 3096 1 80.77 TGGAGTTAGATGCGGCTTAATTAAACATTGTTCCAGGAATTAAATAGAAAAGAAATTGCAGAAAACGCCATTAATTAAAATTTATTTTGAAGAGCTGAGCT:1 - chr3R 17762760 5' - FB 462 1 62.38 GACGGTCTGCATTCAGTTTAAGCTTAAAGCGATCTTTGTCCGAACTCATTTTATTTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTA:1 - chr3R 4536252 5' - Ivk 5352 1 52.48 GGATATGAAATAAAAATAAATACGTTGAAAAAATATTTTACTATGATATGTTACTAAATATTCAATTGTAAATATATATTCTTTATCAGGATCACTAGCCG:1 - chr3R 4134974 5' + INE-1 88 1 75.25 AACGGAGTCTGTAGAAAGAGAATTAGAGAGAGAAACAGTGAGACGGAACAAAGTAGAGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chrX 21400858 5' - P-element 2871 1 61.39 TGAAAAATATACAAATATACAAAAAGACCAATCTTATCCTTCTCGTTTCTCTATCATTGGCATCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTAAATGCCTT:1 + chrX 7904713 5' + Stalker4 218 4 59.41 GTATACATATGTATATGTATAAATGTAAGAAAGAAAACATAGATAAAAGCAA:1 - chr3L 9218284 5' + Stalker 7121 4 84.62 GCAGTTCACACGGAGCACAGTTTCAACACGGAAAATAAATTGCTATCAATGATTTATATGCCGATTGGATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 2339854 5' - roo 9064 1 72.28 AGTCACGTAGTCAGGCAGCCACCTCGTTCCTCCCACTGCCACCCACCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGC:1 - chr3R 16005443 5' + Doc 490 1 56.25 TATGCACAATCGAATGTATTCTAGTAAATTAGTCTTCGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 16127707 5' + roo 8702 2 67.33 ATACATTTTAATTAAAGCACCTCGAGCAACTAATTACATTGCCAGAATGCCGGAGCAGTGCACTGCAGTGTGAGTGTGTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chrX 7759164 5' + hobo 2708 1 68.32 TTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr3R 14049335 5' + transib2 20 1 59.41 TGCAGATGTTAAGGACATCTGCGACCGGGCTTGTATTACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 14980487 5' - 412 453 2 61.39 GTCATAGAAAAACTAGTGTATAGTTGGCAATTAAAGCGTGGAGAACCCAAATATAATTACATGTTATATTGTTTTATTTTTTTAAATTTAAAATATATTTT:1 + chr2L 12503768 5' + P-element 2598 1 37.62 AAACTATATTGTATTGTATAACTTGGATGTACTAATGATCTCAACGCACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATA:1 - chrX 16210892 5' + Stalker 31 4 73.27 AAGTTGCATCCACATCTTCAGAGCTCAGCTTCTATGCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGG:1 - chr3L 2563794 5' + R1A1-element 5260 1 71.43 TGGATAAAGGTAAACATGATTTTTGGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAC:1 - chr2L 12199542 5' + Stalker2 10 2 65.35 GGCCAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chrX 15412693 5' + hobo 48 1 71.29 TGTTTATTACCCTTCGCGTGTTTTCTTTGACCTGATTCAGTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 6417583 5' + hobo 33 1 55.45 TGCCAAGTTGTTTAATATTTTGTTATTCACTTTTTTCTTTGCCCCAGCTCGGTGTAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3L 10683426 5' - opus 7485 2 63.37 TGATCCTCCAGGGCCAGTTCCGTTTCACCACGGGCCCAAACCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGA:1 - chrX 8022859 5' + P-element 2790 1 47.52 GAGGGCTCGAACTCGCGCTTTGGTAAATTGCTTTCTTCATGTGCCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3L 18896583 5' - P-element 2857 1 47.00 TATAGTTTTAAGCTGAAAATATTCTTTAATACTATTTAATATACATATAATCAAAATGTTCTGCATTTTTATTTTCAGACGATCTTTTGTTTATATTAAGG:1 - chr3L 6178923 5' - transib3 2424 1 81.19 GGCGTAGTTAACAAATGAATCCACTGTTGTATTTACATTTTGAGAAACAATATAACAAAGAAATTCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTTAAGAG:1 - chr3L 19405065 5' - TLD2_LTR 145 1 68.32 GCACTTATATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 16127758 5' - roo 9028 1 70.30 ACTACCTCTGGCGCAGTGTGGGACGTCTGCGCCGCCAAGTATGCACGACGATCGTTTCACCAGCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAAT:1 + chrX 10596266 5' - R1A1-element 79 1 72.28 ATATCGTTACTTTTTAAGTATCCATTTAATTTACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:2 + chr3L 16199964 5' - roo 9030 1 67.33 GTTCTCGGGTAAATAATTAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 17109721 5' - roo 9043 1 51.49 TTGGTTTTCTCTTGCCTCCTTTATTTACTTGTAATTACTTCTATCCTGACGAGATGCCCGCTCATGTGTGTGTGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTC:1 + chr3L 9177954 5' - jockey 4737 1 69.70 TTCATAAACCGAGCTGAGTTGATAGTTCGATGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATG:1 - chr3L 18357976 5' + F-element 4253 1 70.30 AATTGGTTTGACATTTGAATAATTTCGAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3L 5256010 5' + jockey 26 1 72.28 AGCAACAGTTGAAATTGAATAAAACATGAAGTTTTTGAGGCATAGCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTG:1 + chr2R 12549193 5' + baggins 5003 1 55.45 TATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCAC:2 - chr3L 19350020 5' + 1360 3205 1 53.47 GAGCAGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3R 27455534 5' + 297 22 2 59.41 AAAACATTTATTTGTGCTCTTAGTTTTTAAGAAAGGAAGGATGGAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2R 10399200 5' + pogo 27 1 55.45 GAGAGCGATGTGAAAGCAATGAGTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGATTGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGTATTGTTTAAATT:1 - chr2L 5156465 5' - Idefix 7023 2 73.27 ACATAAGTTAAACAAATATACTGCGCACCCGCACACACATAAAAATGCAGATGCAGATGCACAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 - chr2L 15548832 5' - Tabor 7312 2 66.34 TTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3L 22112625 5' + Doc 29 1 55.45 GCCAGAAAGTCGCGCCGACAAGTCTGGAAATGCGAGTTTGTCGCCCTCTGCGTGTCTGTTGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 19997279 5' - roo 396 1 63.54 AAAAAATAAAAAAAAATGGGATCCGAAGTATTCATTGCTCTGTAAAATACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGCTTCAACAAAAGAAT:1 - chr2L 4125186 5' + hopper 422 1 81.19 AAAGATTTTGACGGTATAGTGGGACTTAACCTGCTTATGCAGGTGTTATGTTGGCAATTTCCTCTTGGATGTTGGTTTTCTTGTAGGGTTCTTGGACGGTG:1 - chr3L 24540966 5' - mariner2 635 1 62.38 AGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAG:1 - chr2L 23352595 5' + accord 31 2 56.44 TAAGTATCAGCAAATACTATACCGCATATATACAGAATATATATTCGCCGTATGCATTTGCAATGATTTGTGTGCTCAAAAGACCACCAACAACTACATAA:1 - chr2L 13441820 5' + Stalker 6963 4 79.21 GTAAGTCGTAACGAAGTGATACATAATTCTTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chr2R 13659036 5' + Ivk 46 1 69.31 GCATTGCAGCATAAATATCNTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 4650479 5' - roo 360 2 71.29 GTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTG:2 + chr3R 5773174 5' + Stalker4 50 4 76.24 TGCGACTAGGTGGCAACGCTGCGAGCACTCTCTCGCGCTCGGGTATAAATGAAGAGCTATTTCTTTAGCCCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr3R 29158054 5' + P-element 6 2 73.27 GAGCCTTGTGAAACGGAAACGAAAATAGCTGAAGATATCAGGATATATAGGGCAAGTCGGCGTGGGCGCATTTGTTGCCAACTAATAGAAAGAAATAATCA:1 + chr2L 7808497 5' + transib3 2682 1 55.45 ACGGTGTGATCATCGAGTGGCTGAGCAAGCACGGGCGCGAACTTTCCATTGGATCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGG:1 + chr2R 21086863 5' - Tirant 17 2 56.44 ATCTCGATATTTGTACGCGTGTGCGGGACAATGGAAAGGCCACATAGTATAATGATTTTAAACTTATAATGATTATAATTATAATAATAATAATTATAATA:1 + chr3L 20144835 5' + mdg1 7087 3 63.37 ATTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTGCAAAAAAACTTTTGGCACGCCCTCTCTAACGCCCAAAAGCCGCCAAAACAGTCACGCCCACACTTTGGAACAA:2 - chrY 9413 5' + INE-1 252 1 80.20 ACACACTTACGCACACTTGAGTGTGTGGCTGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATC:1 + chr3R 28240394 5' + I-element 5171 1 70.30 ATTATATAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 - 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mdg3 5490 2 70.30 AGCACATTTGAAAATTGCANTCCGAAACTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chr3L 9763199 5' + jockey 4724 1 71.29 GACTGCACACATACATATTGGCCCACACCCACCCAGTTATGTGCGAGTATATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:2 + chr2L 12779590 5' - flea 4995 2 52.48 TAGAAGCTCGCAAATCGAAATGCCCACAGTTGGGTGGCCACTTAAAAGTTTTCATTTCTCAGGGAATTGATGTTTTATTAGCTGTAACAAAACAATA:1 + chr3L 22124014 5' - BS3 1666 1 81.44 ATATACCTACTCACATACACCTACATCTATGTTAAAATCTAAAAATCGAAATTATTGTACCTATATATTACTAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTG:1 - chr2L 15905514 5' + TAHRE 10375 1 72.28 AATTTGCACACTAATTTGTTTACCAGCTGCGTGTTCATATGTGTATACATATGTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 15546999 5' - pogo 2077 1 56.57 TTCTATGGTTGCTGCGTTCAATCTTCGCCCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3R 7411821 5' + 1360 46 1 69.31 AAGGCGATCATCGACGCGATAAGGCAGCGCGTGATATATATATTTTATGTCATGTGTAATGATGAACTCCCGTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr3R 16806084 5' - 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Tirant 8322 2 75.25 AAAAAAAAATACCAAATAACGAAAATGAAAACGGCAAAATGAAAAGAAATTGAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATT:1 + chr3L 9134494 5' + Juan 423 1 54.46 GAGGAGAGCGATCGAAACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAG:1 + chr2L 16456767 5' - BS 5062 1 53.00 AAATAAAATACAAAGTTTTGGATTCCCCCAACTTTGGCAGACTCCATGCTCAAGTTAAAGCCGAAGTCATACAAGTTATACAAAATAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2L 15813412 5' + G2 3076 2 60.40 ATTGCGCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2R 20461020 5' + hobo 39 1 62.38 AATGGACGAGATATGGTTTATCGCTGTGTACAAGGGCAAAACTATTAATATCCGTTCCTCGTATAACTGAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCA:1 + chrX 22681507 5' + Transpac 4796 1 48.51 GGTGGTTATGCACTCACTCACTCTCCGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2R 8232528 5' + P-element 50 1 29.70 GCAAATGCATCGACGACAACGAAAAACGAGTGCAACAACCACAGCAGCTGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 12897037 5' - accord 187 2 74.70 CTTGATTTCATTTTTTTGACATTTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 + chr2L 22052508 5' + flea 4807 2 81.19 AGTCCTCGTTTCCGATTCATCCGCAGATCAGAGGGACCTTGCTCCCCAAAATGGGAACGGGAATGGGAATGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr2R 6918501 5' + hobo 4 1 75.25 ATTCTTCATTCCCTGTCCGTGGTTGTTGCTCTCCTTTGGACTGCCTTTATTTTTTAGCTTTCTTCTCTTCTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr3R 26484276 5' - jockey 4985 1 74.00 GAAAAAGGCTTCACGAGATTGTCAGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGA:1 - chr2L 1013785 5' - I-element 4998 1 76.00 AAGGGTGCTCCATCCATTTCGGGAGTTCTATGCATATGCACTCCATGCCAGTGCATCGTTGTTGGCTCACTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATC:1 - chr3R 25898088 5' - roo 8745 2 77.23 GGGACAAATCAACAGAACTACCAGCTGCAGCTGGTGGAGTCACAAGTTTCATCACGAACACTATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chrX 1762913 5' + jockey 4683 1 65.35 ATTTTATTCGAATTGTACACAGATTTCTGCTTTCCAAAGAATTATATGAAATGTAAACTGCTCTGAATCTCACCCTTCTAGCGTTTATAGTTCCTGAGATC:1 + chrX 14978443 5' - INE-1 150 1 64.36 TGGCGCTGGCTCAGCAAAATACGTTTGATTCGCCTTTTGCATTACAGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2L 12184229 5' + Doc 44 1 54.46 AAACACACACTTAAATATAGGTAACCATTTCATTTGACTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 8434318 5' + roo 39 2 66.34 GTAAGGTAGATCACGGAGCNAAGGTATATAAGGTTGTGCTCGGTGAGCACAATAGCCTAAAGGAAACTGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTG:1 - 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roo 9053 2 59.41 AGGGGAAATTGATCCTTTAAATTCTCAATTCCGTGCAACTTCAAATTTCAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chrX 11987855 5' + 412 11 2 67.33 GCTATAGCCATTTATTGGCTTTATGGCCAAATGTCCATCGACCTCTGACAGCACTGCTGGCAATACTGGCTGATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2R 15201460 5' - P-element 2886 2 76.24 CTGCTGTTTCAGCAAAACTGAAGGCACGACTCGGCCAACAAAAGTTAAAGAGCTCTCCACCAAAAGATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 10778196 5' - roo 398 1 67.33 AAAAAATTTGATTTGACCACTGACGTCAACGAAATAACATTTTCTTGCCAAACGTGATTATAAAAACATAAAACAGCAAGATATTGTACTTAGTAATTAAA:1 - chrX 3672118 5' + Chimpo 158 1 78.22 TGGCGATTAATTTTCGATCGGGTTTCTTTTTTTCGCTCACGTGCAGCCCAAACAGCTGCTGGGGGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 21374144 5' + P-element 10 2 72.28 AATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATG:1 + chr3R 19589922 5' + BS 5020 1 51.49 AAACCAGTTTGATTTGCGCTGCCAATTAAAAGAAGCAAATATAACACACATACGAAAAAAAAAAATGAAAATAAAAATAACATT:1 - chr3R 14072418 5' + TART-C 415 2 50.00 GTGCGTGACAAACGGGCGAGATCGGCGTTGTTTTTGTGGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - 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Cr1a 4151 1 77.23 AAACAGCTCAATCCAGTGACAATACCCGGCCAACTACTCTACTCTACACTCTCCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGT:1 + chr3R 23272548 5' + F-element 4546 1 56.44 AATTGCAAGACGGAGATTTTATTCTAAACAATACTATAATAAAAGAGGATGTTTAGAATTCTGAAGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTT:1 - chr3L 27412468 5' + hopper 1264 1 71.29 GTAACAACTAAGTTTGTATTTATTTTATTGAAGCGGTTTATAACAAGTTGTTTGGGAAAGTCTTGAAACATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCC:1 - chr3R 15879579 5' + Gypsy6A_LTR 309 1 68.32 AGCGGAGCCCACTAAAAGCTAAAGATAGTTAATACAATTAAAGGCTAGTATAACATATAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr2R 16732064 5' - 297 6960 2 50.50 ACGAAAATATATGCATACTGTGGCATTTCGATGGCACTTCTTCATTTGCCCGATGGCGTGTCACGGGAATTGGCCTCTCTTTGCTGCTGGTTGAATGTGTT:1 - chr3L 2145792 5' - gypsy7 5240 2 69.31 ACTAGATTCGTTGAAAACTGTGTAACAGCTTTCCGACCACATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATTAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTG:1 + chr3L 21418734 5' + INE-1 112 1 77.23 ACAAGTATTTAAACAACGAACAGATATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAATCACGGCACCCTAT:1 - 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chr2L 2538514 5' - springer 484 1 36.63 CAGAGCAACAAAATGTGAGTAAAGTAGCATTTGTAATGATTGCACATTTCTTCGATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2R 7132478 5' + opus 19 2 60.40 GGCCATCGTTTAATGACATTCGATTCGTGTGTACCATGCCTGCACCATGCTGAGTCTGCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2L 17549281 5' - mdg1 7441 2 61.39 AATACTTTGACGTCTTTTTATTGTGTGCTCTTATTTTATGCATTAAATTTGCTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCAG:1 + chr3R 27510788 5' - invader2 4681 1 53.47 TATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 15268255 5' - roo 9022 2 76.24 TGGCGAAATAGCGCACCCTATTACATTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 6058191 5' - roo 9018 2 76.24 AGATAAGTTTCACTGTACGCGGCGGGGGTAAAATTCTGTCTGTTTACATATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 15268297 5' + roo 15 2 47.37 TGCTATGAAATCACATTAGCATAAAGTAGGCTACTTAACAAAGTCAATGAACGTAATAATTATACTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTT:1 - chr2L 18077477 5' + hobo 7 1 72.00 TTAAAATTTTTTCCCCCAGAAAACTGATGAAATTTTGCGATCGCCTTTCCACTAGCTAAGTAACGTGTATCTCATGGTAGGGGAAGTCGACTATAGCATTC:2 + chr3L 22848563 5' + INE-1 571 1 74.26 ATGTTTGCCATGTTTTCGACGTTTTTATGTTGCTCCTCCAAGATGAAATTTACCCGGATGCACACGCACACACAAGCACACACACACACACACACACATGA:1 + chr3R 22848926 5' + Quasimodo 39 2 71.29 AACAATAACAATTCAAACGAATATCTGGCGAATTACGCATCGAATTGATATTGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2L 8913303 5' - mdg1 7437 2 56.44 GACATCGGTGGCCCTCGGGGGCTTGAGTTGGGTTTTTTATATACACTCTTTCGGAGTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 771747 5' - roo 9055 2 59.41 GTTGTAAATGTTGGGCTTTTAGCTCTTCGGAGGCTGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2L 13433962 5' + hobo 34 1 64.21 TTAATAACTAGCTAAAAACAATCATTCTTTCTCATTGAATACATGCACATCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3R 6609701 5' - Transpac 5204 2 53.47 TGCGTTATTTCCTGCTTAAAACGATTTGTACATACATGCATACATACATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr3R 4591914 5' + 297 25 2 62.38 ATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTT:2 - chr3L 21912316 5' - Bari1 1657 1 75.25 TATATGTATGTATATACATATATATTGTAGGTAAAGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGCGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 2486396 5' + roo 8704 2 66.34 TGTTTAAAAACCCATTCGAAACTTTATAGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAACAGAATGTCAAAGCAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 + chr3R 11498479 5' + BS 5006 1 58.42 TATGCTGATAAAAAGACACAAAATTCAGCAAATGCGAAAATAAAACCAAAACTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAG:1 - 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Doc 269 1 53.47 GTACAGTTTTGCATTTGATTTCTCGGGCTTAGTTTTTGCATTCAAAGCGAAAGAAAATTCAGTTCCTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 25397148 5' - roo 398 1 71.29 AATTGGCACTGCTGCCTCCCTCGTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCC:1 - chr3R 30692441 5' + gypsy5 71 2 69.74 AGTCGCTTCCTCTGAGAAAACAATCAGCAGATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCAACTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAA:1 - chr3L 15710104 5' + G2 147 1 68.54 ATATTTCGATTAAATTCAAAAGAAGGCAACAACTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr3L 16653584 5' - P-element 2845 1 35.64 AGTCCTTGTTGTCCTGCCGCCGTAACCGTTACAGAGAACTGCAAGGGTGACATTTGTTGCCACTCGACTCACACTCAACAATTTTGAGTGCGGGTGCCACT:1 + chr3R 29088538 5' + hobo 50 1 71.29 TATATTAGCGTTTATCTTAATCGTACATTCCAAAATTTTTTTCTTGTTATTTACATTATTTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAA:1 + chr3L 27383514 5' - 1360 305 1 66.34 GCCAGCTGGGGGAACCCTAAATACTATCATCAACGAAATGAGGTTGCAGCGAAGGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 4571390 5' + roo 8685 2 58.42 GACAATACGCAGACAGCCAAGAATCCTACATCCTTCCTCCTTCAATCCTGCGTGTTCGAAAGTCCTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGTGTGAG:1 + chr3R 17838293 5' + Stalker 447 1 76.00 AAGTCGACTCACTTGCGAAATCTTTTTTCGATGTTCTCCAACTCTCCGAGTGTGTGTCGGTTCTACTAATTTGGCTTACCAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 15155110 5' + R2-element 3585 5 58.42 AAATTCTGATCACAGGTCAGTTGCCGCGCCACGTGGATCTGCTAAATTTAACCGCGTCCAAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCAT:2 + chr3L 20467151 5' - G2 264 1 65.35 ACGAAATCCAGCCAAGAAATTGTGCAGATTTAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 31962064 5' + Doc 49 1 67.33 AGTAATCAAAGCCGGACACATTAAAGTGACGCGGCTGGAAGTCCATAAAAATAAACTACATAAAAGCAACTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATG:1 + chr3R 25907576 5' + 1360 436 1 75.25 AGGCTACGCATTATGGTCTGCTGGATGCTGGTGCTCCGCCGGCTCCTCCTGCTCCTCCTGCATCTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACA:1 + chr2R 19597774 5' - roo 8804 2 60.40 TTCTGCAATTGGAATAATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1 - chr3L 13367734 5' + mdg3 5307 2 75.25 TATTTGTGTACCCATATAANAAAACAACGATGTTGTACAGAAGATATTGATTTAAAGTACAGAGAGCCAGATGGGCACGGCTATTGATCCTGATTAAGAA:1 + chr2L 5608531 5' - INE-1 87 1 57.00 GAACATACATATGTGTGTGCGTTTGGTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr2L 15168098 5' + F-element 38 1 49.50 TGAATTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3R 28628083 5' + 1360 49 1 74.26 TTCCTTTGAAGGGGTTCCATTACACTAAGAAAAAAGAGCCACATAAAAAGTTAAAAATTATTTGAATGCCTTCTATGAAAATGAAAAATTAAAAAGAGAAA:1 - chrX 8092599 5' - Tc3 43 1 54.46 GGTGGTACATTGTTTTGCCNAAGAAAGTCGAAGGAATTCAGCTGAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2L 1432022 5' - opus 7475 2 61.39 ACTGCCCATGGCGACATAANTGTAGCAACTCTTTGTTTATTTGTTTGTGTTGTAGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCG:1 + chr3L 14137571 5' + opus 369 2 57.43 ATACACGTATTTTTCTATCAACTTAAAGGCGAAAGCACTAACAGAAGTAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 - chrX 15258359 5' + BS 25 1 53.47 TGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 15117618 5' - roo 361 2 67.33 TTGTTGATCTGCCTAACTTGATCCAGAACGTGTGTTATATTATTATTTACGTAGAGAGGAACACTTCTCTTTTAACTGTCAACCTTGTGGTCTGGCAGAGT:1 + chr3L 20839555 5' - Gypsy6A_LTR 248 1 62.38 GGCGAAAGAAAGAAAGAAAGTACTGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 15117595 5' - roo 9048 2 57.43 ACACAGCGGAGGAGGCTTACCTCCGCCACATTTACAACATTTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chrX 21499254 5' + Quasimodo 34 2 65.35 TCTAGTAAATATGTAAAGCATAATTGATTTGACAGATAGCGTTCAGGCGGAGGAGCGATAGGTACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 6322621 5' + roo 13 2 62.38 ACCTTGCCGATCGAAAAGGAATACCGTACACCTTTTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 + chr3R 4536166 5' + Ivk 12 1 67.33 GCGGTGTTCTGAAATCTCATCTAAATCATCGATAAATGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr2L 16939787 5' - opus 486 2 66.34 AAGTGTGGCTTGTGTTCGTTGTGTTTAAGGGTTGAACAAAAAAAAAACAAAAAAATGG:1 - chr2L 2937573 5' - hopper 141 1 60.34 GCTTTCTCTCTGTGAAATTCCCAATATTTCCTTGGCCTTCCACTGACCCTAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chrX 22774832 5' - opus 7479 2 55.45 ACTGCGTAGATTTCTCATGATTTGCTCGTTTCAATCGGAATCAATAAAAGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTA:1 + chr2L 11919273 5' + X-element 31 1 53.47 TGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr3L 5255971 5' + jockey 66 1 66.34 AAAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 - chr2R 17402791 5' - invader4 300 2 54.46 ACCCTCTTGTTGTTTTAATAATATATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 + chr2L 4764039 5' + Tabor 52 2 73.27 ATTTAAACACGCCCCATTCNTAAATAATTTGCCGCTAATTCTCATATTTAAAAGGGCAATAAATTTAAAAAATACACATTTTTTAGTGGGTAGAGGACAGC:1 + chr2L 7511584 5' + HB 345 1 59.41 GCGAACGCAAACAGAGCGGGATGAGGATGTGAAAAATGCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 11030901 5' - roo 397 1 53.23 GACTATTGATATAGTAAATTTCCAAGGAAATCTTAGAGATGCGCAAGTAAACCAAAACGGTTTGAGTTGCCGCCATATCTAGGTTCTGTAGACGAAGGGTT:1 + chr3R 29547353 5' - X-element 493 1 66.34 GCCAGTAACAAATTGATCGTTAACATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3R 14521107 5' - I-element 5305 1 79.21 AACAATTAAGTTCCCCGAAAGCATTCCAATCTCTATATTAAACAGATATTGCAAGTAGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 11953888 5' + hobo 18 1 62.38 TATAACCTGTACAGTTGATAGCGACGGAACCCATTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTA:1 + chr3L 3186015 5' + 412 215 2 70.30 AAAAACACGAAAATGTGTGCTTTTCTCCATTGTTTTGGCCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTATAT:1 + chr2L 3379161 5' + Circe 7150 1 59.41 GACTCCTCGAGACGGCATGCCGTCTCGAGGAGTCGGCTCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCCGGGGGCCTAACTCAATGAG:1 - chr2L 16210052 5' - R1A1-element 4971 1 58.42 ACTGAACTGAACGCCTAATGAAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGGGTGTGTGCTAAGAAAAAAAAAAACAGCAAAA:1 - chr2L 9213446 5' + gypsy7 5014 1 79.52 CTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 - chr3R 18171835 5' + 1360 35 1 62.38 AAGATAGATAAAAACCTATTGATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:2 + chrX 16237921 5' - mdg3 5446 2 73.27 ACAGTTGGCGCATACTTTTCATTGCGGAAAGGCAAGGAAAGGAACAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGC:1 + chr2R 12884211 5' - diver2 4635 2 58.42 GGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGA:1 + chr3R 5773178 5' + Stalker4 7009 4 80.00 GCTATCCTTCATATCTCTACAATCCGTACATGCCGTATCCTCCGTATCCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAA:1 + chr2L 10972848 5' + Quasimodo 7151 2 53.47 TATACCTCTCCTAGTAATACACTGCCCGTTCCTTCTGATCATCAGCTTAAAGTGGATATACATGGTTATATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr3R 4769549 5' - copia 249 1 70.30 GAGTCTGCCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGC:1 - chr2R 6482758 5' + gtwin 6928 2 67.33 TAACTTTATAACTATTTAATAATACTTTGGTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTG:1 + chr2R 19330290 5' + McClintock 5993 2 70.30 AGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chr3R 30611295 5' + blood 44 2 68.32 TGATTTACCCGAAAAAGTGTGCTACGGAAAAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3R 22469231 5' + hobo 11 1 66.34 TTTTGGTTTTGGCTTTTTGCAATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 95856 5' - roo 9047 1 53.47 TGGATTCGGGATCGGAAAAGGGAAATGAAACGAAAAACAGGGACTCCACTCTGACTGACTTGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGA:1 + chrX 7544419 5' + G2 164 1 64.00 AGCTGAGCTGCGCCAGCTGCCCGAGGAGCGGCCACCAAGATGATGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3R 16595059 5' - P-element 2856 1 51.49 TTGTTCCCAGTGCAGAATCTCAGGTTCAAAGGCATGTAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGG:1 - chr3R 4535277 5' + Ivk 197 1 63.37 GTATAATCTCGTGATATGGNTAATTTATGAGATCTTTCAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3L 16478445 5' + pogo 37 1 65.35 AAATATTATTAGTTATAAGGTATGCAGACCGTCGGATTTTTTTCACATTTTAACAATGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr2L 7804332 5' - 1360 3373 1 64.36 ATACCGTTTGGCCGCTCCGCCTCCTTCCAACTTCACGATTTTTTTATTTTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATA:1 + chr3L 15466558 5' - F-element 4640 1 61.39 GCGCTTCTACCAACTTGGCCACGTTCTGCAAAAAGGCGGTTCACGACACCTGCGCCAGGCAGTTACATGCCGGAGTTACCACATCTACATCTAC:1 + chr2R 3132632 5' + gypsy5 6939 1 77.66 TGGGCATTCAGTTTTAGAGCGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAG:1 - chr2R 2972135 5' + invader4 307 2 80.20 AAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCAGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr2R 1373165 5' + pogo 52 1 74.26 AATAGGTCCAGAAATTGTGNAAGAACTCCTGCGAGTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 19513352 5' - roo 9049 2 54.46 GCGACATTTTTCAACGGCTACGTAATAATTCGTAACAAATTCGCCGACTGATAAAGAGTTGTTACAAATTAAATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAA:1 + chr3L 16866581 5' + rooA 7511 2 71.29 TAGAGTGGGCGTGGCAACATAGATCAACAAACTTGCTCTAGGATCGGTCTGCTTAATATCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCAT:1 - chr4 71477 5' - INE-1 139 1 77.23 AAACAAAAATATAAATGTCGCATATTAAAAAGTTATTAATATTTTCTTTTTTAGATCAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3R 25121579 5' - pogo 2086 1 60.40 AATAGCGCTAATTGTCTTGGGCTCAGCATAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr3R 16305533 5' - pogo 2061 1 70.30 ACTAGAAACCACTGGACAGGCCACTACGCGCGTGGGCACTCAACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCTTCTAATTCTGAGGAGAAGAGGTGTGCGGC:1 - chr3L 3156721 5' + gypsy6 7725 2 65.35 ACAATTGATTTGTAGCGCAGTTGTCTTAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGT:1 - chrX 19614965 5' + 1360 45 1 70.30 TTATATCGCCTAAACGGAACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3R 18171856 5' + 1360 14 1 66.34 AAATATGTGATAGGTGATAATCTGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chrX 2743843 5' + P-element 53 1 26.73 AATTTACGCAGCCATAAAAAACAGAGAAACCCCAAAGAATCGTGCGAGCGGGATGGAGCGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 5206533 5' + roo 8680 2 63.37 AGCATTCATGAAGGTTGTCAAGAATTGGTGGGATTTTTTTTTGAAATATAATGCATATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr2R 16907478 5' - opus 488 2 67.33 TATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3R 26123022 5' - roo 9029 1 68.32 AGGCGGCGAAAGAAAGAAAGAAAGTACTGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 + chr3R 15117591 5' - roo 389 2 61.39 TGGAACTGGTCAACGAACGATGACAGAAGTACGGACCTGCAAATGTCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAA:1 + chrX 13431902 5' + jockey 4647 1 54.46 AAATCGTTAAACCTAAAATAAACTCCGCTCAGCTTATTTCACTCTTCCATTTCTTTCTTCATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATA:1 + chr3R 25508722 5' + Rt1a 39 1 65.35 ATTAAATATAAGTAAATTTTTAGGATAACTGCATGAATTTTTTTGCAATTCAATTTCGATCGGATTGAATATTGGATACGTCTACAAGTGTTTGTTGCTAG:1 + chr3L 23436219 5' - ZAM 337 2 50.50 GAAAGGAGGGAGCGAAAAATATGTTGCCTACTTTTGTGGGCTGTGCATAATTGGGCAGCATGAATAATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 25378657 5' + jockey 18 1 70.00 AAACACTGTCTATTGTGCCAAAATTTATTGAATGAACGCGCTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 + chr3R 13445477 5' - Transpac 5195 2 59.41 GTTTTAATTGCATTTAGCGTTGCGAGCAAGGAATTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGG:1 - chrX 14658743 5' + X-element 51 1 69.00 TGGCACAGTGTGTGAAAGGCAACCACAAAACACACTGCCCGCGGCTCGAATAAGGAAGTAAATAAAATGCAGTTAAAAAATAAACAAATAAATTTAAAATA:1 - chrX 9748861 5' - S2 99 1 72.28 ATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAG:1 + chr3L 23456271 5' - gtwin 7360 2 52.48 AAATTAAGTGGAAGTAAGTCGTAACGAAGTGATACATAATTCTTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 + chr2R 13659023 5' + Ivk 33 1 56.44 GTTTGAGGCCAGGGAGACGNTCAAGCTGGAGCTCCTTTGCGTTGGCTATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCC:1 + chr2L 1109162 5' - rooA 7329 2 54.46 GCACACAGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr3R 11278376 5' + hobo 20 1 50.50 AGCAGCTGAAGAAAGTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chr2L 15817941 5' + I-element 6 1 75.25 CAAACATTTGGAGCCACCCGACAACCACTTTGCACCACCAAACCATCAAAAAACCCTTGAATGTTTTCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAAT:1 + chrX 4864158 5' + HB 468 1 55.00 ATGTGAACCCCACTTGAAGCAGCAACACAACTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAG:1 + chr3R 14466444 5' - jockey 131 1 76.24 ATAATTGCTTGATAGTTAGTTCTCGAGGGTTTCATGTTTGGAGTAGTCAAAATAATAAACATTGGCTAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAACGAT:1 - chrX 11408772 5' + invader2 4730 1 66.34 AAACAGCCTTGTCTCGTCTTTCTTTTCGCTGCTTCTTTTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGT:1 - chr3L 5976718 5' - hopper 941 1 63.37 TCCGCCGGTCTATTAGTGCCCTGGACAGGTGCGATTAATTTGCCGGGAGGAATACATCCTGCTGCATAGAGGAGGAGAGCTTTGCACATATTATATGTGAC:1 - chr3L 25351942 5' + baggins 5232 1 64.36 ATTCCCATATCGCCCAACAAAGGGTTAAACCTTTTCCTAATGCCAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2L 4571311 5' - roo 9039 1 56.44 TTTAAGACATAAAAAATGCACTGCTATCGTTCTTATGTTTTGTTTAAATAAATATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTT:2 - chr2L 21052826 5' - invader1 4007 2 74.26 CGCAATTGCAGTCAAACGCAATTGTTTTTGATTGAAATCAATTGCCGACCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2R 6918052 5' + F-element 43 1 56.00 TTCAGCAATTTGTTTTGGTCTCGATTTCGTTGGAAAGATTGCAAAACTTGGAAATAAGCTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3R 10434639 5' - 1360 3374 1 64.36 GCAAGCAGACATGCAGTACAAAACACAAACATAAATAATAAATGAAATTATGTTACCTGGGCGCTGATTAAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTAT:1 + chr2R 19399374 5' + Tirant 475 1 71.29 GTGAACCCAAAAGAGAGATCTTTCAAAAGTATACGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2R 13432887 5' + 297 34 2 65.35 GTTTGGATTTTAAGATGGTTAATTGCAATCGAATCGGGTTGGTATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr3R 29157490 5' + pogo 19 1 56.52 ATTCGCCAAAAAAAGAGGCTTATTGTTTTGAGGGCTAAGTTTTCTTTTTATTGTTATGTAGCGATCCATTCCAAATATGTAAATTCCTTTCTTGGATCAGA:1 + chr3R 14118342 5' + 1360 3163 1 47.52 ATAAATTTCGCTTGTTCGTGGAGAACAGATTTATATATAAACATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAGTA:1 - chr3R 12858085 5' - I-element 4911 1 58.42 GAAATAAATGTTAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr3L 22112608 5' + Doc 12 1 72.28 GCCTGCAGGCCGCGTTCTCAGGGCCGCCTGCGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:2 + chr2R 5813587 5' + HMS-Beagle 42 2 67.33 GTTGCTCGCCGCATTTGATGACGCCCATAAAAATCAAAATTTTATTGAATGAATTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr2R 7173707 5' - mdg1 401 2 60.40 ATAGGGCGAACAAAAAGAGAGTTGCAAAGTAGCAACGCTAAACGACAAAAATAACGGTCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chr2L 21628851 5' + P-element 15 1 64.00 ATTTCACAAATGTTGTTAACAATATATCTGAATGGCTAAGGGTTGACTCGATATTGGAAATGTATGTAAGATTGGTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 - chr2L 22052575 5' - flea 4998 2 64.36 GATTGTTGACTGTTGACTGGAGTTGTTTTATTTTTTGTTGGCCATTATCCGAGTGGCGCCCAGGTACAATGCTTTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTA:1 + chrX 17217698 5' - R1A1-element 5322 1 67.33 AGCTGCAAAGTTCAAAAACTAAGCTAAAATGTTTTTTGTCGATTCTGGTAAATTAATCCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr3R 10648261 5' + I-element 15 1 63.00 GCATTTACATATTCGTGTTGTCGGTCAACCGGAAATTGACCAACCCAGCAACACAATAAACATTTCAGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGC:1 + chr3R 9139023 5' - 17.6 7285 2 69.31 GTAGTTAAGAGCGGGGAGCAGGTGAACTTGAACTTGGAGAGGCGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3R 15537374 5' + P-element 26 1 50.53 TGGCATTTTGCGCCATCGCAGCTGGATCTTCATTTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 15268220 5' - roo 394 1 64.36 CATATCGACAAATGGAGAACGAGAAGCAGATAAAACAATGTGAAGTACGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTG:1 - chr3R 11840282 5' - copia 71 2 54.46 TGTCACAAATTACAATTGTTATTTTTAAATCTACGTTGGGATTCAAACAATATTATCTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 15766373 5' + pogo 16 1 58.42 GTCGCCCGGTCGGGTCTCCATTCATATCGCTTTAGCAGGCATTCGACTCTATGTATGTATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTTTTTATTATT:1 - chr3L 19778858 5' - flea 5003 2 68.69 AAATCCCCCGGCAACGCAANAACAAACCCAATTTTATGACGAACCATTAAGTTCACACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 30801592 5' + pogo 20 1 58.42 GGCAATGCTAATGGCAGCATTATGTTGGAACGCCCCAAATTTTTTTTTTTCTTTTTAATAATATATTTTTAAGGTTTATTTTTGATTTCAATATTGTATAA:1 + chr3L 9587786 5' + hopper 194 1 69.31 AAACAACCGAACAACTTGTTGTTGGCCAATTTTTTGGCGTCTGCGCAATCCATAAGAGGGCATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATA:1 + chr3R 9613412 5' + invader3 5203 2 63.37 TACGTGTCAGTCTTGTCATTGGCAGTTGCTCTCTCGCTCGCACCGGATGCTGCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCC:1 - chr2L 13049048 5' + Doc 4282 1 56.70 ATTGAAAGTATATTTAATTGAATAAAAGCGGTCGCGATATAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:2 - chr3L 3822460 5' + pogo 30 1 59.41 AACTATTAAATGGGGTTTACTTTAAGCTGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr3L 3822362 5' - pogo 2093 1 67.33 AGGGGTTTTCTCATTAGGTTTTCAATTTAAAGGTGCATTACGTTGCTTTCTTTTTCATTCGGTAAAGAAGGGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTG:1 - chr2L 4764116 5' - Tabor 481 2 74.26 TGCCCGTGCGGAAGTTCGGGGTCTGCTGTGGATTGTTGTTACCCACGAGGCCAGGTTTGCTATTTTTAGATTGTCCTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 - chr3L 1567447 5' - HeT-A 6057 2 54.46 AAACGGTACTTGTACCTTGGAGTAGAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 + chrX 10996536 5' + 1360 45 1 72.28 GGTGTGCGTGACAAACGGGCGAGATCGGCGTTGTTTTTGTGGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 6437565 5' + 412 7089 2 59.41 GGCTTGCGTGCCGGAAATGCGCTTGTCTCCGGTCTAGACGATGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGA:1 - chr2R 10703362 5' + 412 418 2 59.41 TGATATAGTAGAATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 20284799 5' + pogo 33 1 63.37 ACATCAAACGCATTTAACGCATTTCAGGTCTTCCACTCTAGGACTGCTTTGGCCCCCACCTGCCCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGC:1 - chr2L 2072553 5' - F-element 4361 1 67.33 TTGTTTTCGACAAATACCCNAAACCCCCTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3R 6437519 5' - 412 442 2 73.27 GCTACGACATTAGTTTTTCCGGGCTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 23512565 5' - Transpac 260 2 75.25 AATTGAATCTAAATCCAAANAGAATGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAA:1 + chrX 2807385 5' + Juan 157 1 76.24 TTGTGTCATCGCAATCGCTTCGAGCTGCCACTGGTGCTGGTCCTGGTGCTGGTACTGCTCCTAGCCCAATTCCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAA:1 + chrX 18455470 5' + INE-1 139 1 50.50 TTACATATTAAATTGGAAAACGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGAG:1 - chr3R 9858906 5' + BS 26 1 54.46 ATAGCTGTGAAGTGCCTCGTCGCAACCCGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 13099115 5' + roo 49 2 72.28 TTCATCAGCTCCACGCTTTCCGTCATCGCTCTCTACTGAAAGGGTTCTTCTTTGGACATTGCTTCAATTTCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAA:1 - chr3R 29125418 5' + Transpac 342 1 43.56 AAAAACTTGCTCAAAACAAAAATACGTTACACCATAGTTATCTACCGCTCCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTG:1 - chr3R 14380911 5' + I-element 331 1 54.46 TGGAGTGCGTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 7494090 5' + roo 8704 2 66.34 GTTTCAGTCATTCAGTTTTAAAACAAGTTTTGACTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3R 14708774 5' - roo 9030 1 68.32 ACACAGCTCGTGGTACTATCTGCATACATATACGCTTACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chrX 4240751 5' + 297 31 2 69.31 TATTCGATTCCACCACCATGCTGTTGGCATCGACGTACTCTTCCTCTTGACATCCGGCATCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGG:1 + chr2R 12846974 5' - Bica 4894 1 63.00 TTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTCAGCATAC:1 + chr2L 18159053 5' + INE-1 172 1 41.58 GTTTTGAACCCCGAACCCCAATTAAGTGGGCTATCTTTTCTGCTAAATCATGGTTTCTAGGCGGTCCTACATATAAAAATGCTCCTTGGTATATGAGAACA:1 + chr3L 4235583 5' + jockey 4564 1 78.22 GGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:2 + chr3R 14049347 5' + transib2 32 1 57.43 ATGCCATTACAACTTTACATTATGTGTTATTTAATAATTTCGTCAGCCATCTAATTTTTATTACTTATTTATACTTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTA:1 - chrX 10394842 5' - HeT-A 313 1 72.28 GGACTTTATGGCTGTTGCTTCTACGGTTAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr3R 22494752 5' + 1360 47 1 74.00 GCACCGAACGCACGAACCTCCCGCGACAGGCGCTAAATACAAACTGAGAGGAACCAAACGACACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr2R 10874698 5' - P-element 2873 1 63.37 AACACTGACTCAAAATATTCAGAGAGATCTTTTCTTCGAACTCGTGTTCTGGGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 2845733 5' + roo 8689 2 54.46 GGGTGCCTCGATTTGTAGCTGGTAAAAAATGGTTTATCTCAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 - chr2L 2309470 5' + Burdock 6153 2 62.38 TATTTTTATGAAATATTTATTTCTCAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 + chr3L 22599698 5' + diver 5939 2 73.27 ATATCGCCCAACAAAGGGTTAAACCTTTTCCTAATGCCAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 4571317 5' - roo 9033 1 63.37 AAAATAAATTGCTATCAATNATTTATATGCTGATTGGATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3L 2339823 5' - roo 9035 1 60.61 TTTGTTTTTATCAACTAACAGGATCCGAGCATACCGCTGAGAAAGGAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGT:1 - chr2L 21148136 5' + Juan 47 1 54.46 AGCTTGATTTCATTTTTTTGACATTTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 + chr2L 22052506 5' + flea 48 2 79.21 ATTTATTTGGCTTGAGGAANGGTGCTGAACACATATGCCATATATAGATACATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chrX 8972929 5' + flea 4776 2 59.41 GTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 7494082 5' + roo 46 2 73.74 CAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGG:1 + chr4 311188 5' - 1360 3378 1 67.33 TATTATTCTTTTTGTATATTTTTGTGTTTTTCCCAGCGTTTCTCCATTTTCTGAAACTTTTTCAAAAAAAATAATTGTTAAAACAAAAAAAACCTTCAAAT:1 + chr4 1047186 5' - Tc1 1467 1 79.21 AAATTATAGCTAAACTTCTTAAAATAAATTTTTATCTGAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 11009560 5' - roo 9034 1 68.32 TCATCCACGAATAATAAACAAAGATTTCTAATATCTTAACCCTGTTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chrX 3546381 5' + pogo 27 1 61.39 TAGCAAACAACCGTCGCGTCCTGCTTTCTCTCTGTGAAATTCCCAATATTTCCTTGGCCTTCCACTGACCCTAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:2 - chrX 22774854 5' - opus 498 1 77.23 TACATGTAAGCCTTTGTTTTGATAATATCATGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAG:1 - chr2L 6560132 5' + 412 121 2 70.30 GAAAGAGTCTTTAAACTCTCCACAACTCTAGGTGATTGAGAGAGTTTCCCAGTATCAGAGTTGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr3L 25876159 5' - copia 244 1 74.23 TTTTAATAACATATCTCATATCAAGACCATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 + chr2R 8707034 5' + flea 44 2 72.28 GCGTTTATTTCAAAAGACCGAATGAGAATGGAAGAATAGGACGAAAATCGCAACTATCCCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr3L 16807700 5' - P-element 2872 1 65.35 ACAAAAAAAAAGAATATTGTATATAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGA:1 + chr3L 16753013 5' + Doc2-element 237 4 91.49 TTTTGCCTTCCAAGGTGGTGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAGGGTGTGTTTATTGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTAAGTAAATAATTACAATTTA:1 + chr2R 16314043 5' - HMS-Beagle2 7197 1 41.58 AGAGAAGAAGGAAGACAGCAAAGTTTGCAGCGCATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTT:1 - chr3R 31192109 5' + hopper 1182 1 68.32 GTAGTATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTATTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTC:1 - chr2R 5924413 5' - jockey 4732 1 46.53 ATGCTGCATGTAAATCGAANAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGT:1 + chr3L 23027553 5' - INE-1 554 1 48.51 ACATTGCTAAAAAAAATATATGGTACGACTCAATACCCACCCAAACAGTCTGCAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCA:1 + chr3R 16041675 5' + jockey 4740 1 42.57 ATGCAATGAACTCGAGACGTCATCTTTTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGG:1 - chr3R 13239932 5' + hopper 47 1 72.28 AAATACGGCTTACACAGCAACATTTAACAAAATCCCGCATATACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 - chr3R 20872774 5' + copia 4903 2 58.42 AGATGCATAATGGACAACCCACCTCAATTACGTAATAATTATGGTGCGCCCGGTTTAATTGTGTTTATTATATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2L 20709481 5' - roo 404 1 74.26 GAGCGCAGTATATGGAACATGGTAGTTAAGAGCGGGGAGCAGGTGAACTTGAACTTGGAGAGGCGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 15537395 5' + P-element 6 2 71.88 ATTACGACAGTGTCTAAACACAAACAAATAGCACAACAAGAAGGTGTATATGAAACCATATGGCAAAAAGAGTGCCAGACGAGAGGTGATTATGTGTAGT:1 + chr2R 2144816 5' - G3 484 1 61.00 TATTGAGTGGATCGAGCTCGATTCTTAAAAACAAGCACGATGAAATTGAGACCTAAAAAACGAAAGGAGAACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2L 22155469 5' + pogo 4 1 75.25 GCGAGCTTTCGAGGTCATTAAGTTGAACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTG:1 - chr3L 3328988 5' + G2 2660 1 52.48 GAGACTCTGCATCAATTGCCGCGGTGTCCGCTATTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTAATGACCTCCCTAACCTGG:1 + chr3L 4237047 5' + jockey 4766 1 56.98 GCCTCAGAACTCTAGAGGAAACTTCCAAGAACATAGTAAAACAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCC:1 + chr3R 2463568 5' - Tc1 1426 1 65.35 AAGTGAAAATAAATTAAGTGGAAGTAAGTCGTAACGAAGTGATACATAATTCTTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 + chr2R 13659013 5' + Ivk 23 1 56.44 AGAAATAGACGCGATCGGGTTTTTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAG:1 - chr3L 24253663 5' + Quasimodo 47 2 73.27 ATTTGGGAAACATATTAATTGAATACACCAATAAGAAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2R 4030060 5' + Doc 44 1 62.38 AAACTGAAGCTAGAAACTAGAATCATCCTAATCGCTGCCTAGTACTTTGCTATTGTAAGCTCCAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr3R 18549984 5' - pogo 2093 1 41.58 TTATATAACGGATATTGTGGCGGGGTCAACCACCCAACTTACTATTTTTTCACATTATTTTTTTTTT:1 - chr2R 10452263 5' + FB 175 2 79.10 AGATTTCTCATGATTTGCTCGTTTCAATCGGAATCAATAAAAGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAA:1 + chr2L 11919280 5' + X-element 37 1 51.00 GTGGCGTCAGTCTCAATAGAGCGGATAGAGCGGTATCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr3R 4773420 5' + Tirant 21 2 60.40 GCTTTATAAAATCGAAACTNTATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr2L 4110966 5' + Doc 53 1 74.26 AATAACAATTCAAACGAATNTCTGGCGAATTACGCATCGAATTGATATTGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr2L 8913306 5' - mdg1 396 2 52.48 AGGGAAAAATTTGTTTACCAATTTTGCATGCGTAAAACAGTAAAGGAAAAAGAATAAGCTTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAC:1 - 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copia 246 1 69.31 TTGGCATAATTGCAAAATGCACTTTTCCATTGCCTATTTCGAAGGATTTCATGTGTGAGCCCTTGTGTTTCAGCGGAGCAATTAAAATCGGGAGAAAACAA:1 + chrX 10068064 5' + gypsy5 346 2 75.25 GACCAGGATGCGGATACGGATGCGAATGCGGGGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTC:1 - chr3R 24729216 5' - BS 5017 1 68.00 TGGCTTTTTAATGGAGTCTCGTTTACAACTGATGATCCTTCGCTTGCATCCACTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATGGATTAATCGCTTCTAAATAA:1 + chrX 17142802 5' + BS 5078 1 51.49 AGTCTGTGTTGACAAAGTGGCCCCCACGCTGCAGCCCCCAACCTAAAATAGCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGA:1 + chr3R 11058706 5' + Ivk 5074 1 56.00 GTTTGCGCTGCCATGTTTATTGATCTGCTCAATGCGCATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 + chr2L 435216 5' + FB 40 1 64.00 TTCTGATTTAATTTTTCTTCGTTTTCATTATTACCTAGATCAGTTTATTGATATACAGAACGTTGTTGATATTCATTTAAAAAACTAATTGGTAGGCAAAC:1 - chrX 15945891 5' - FB 79 1 76.24 AAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 - chr3R 19950498 5' - BS 5042 1 75.25 TATGCTGCAATATGAGTATACTCCATGCTATTAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr2L 3740598 5' + hobo 45 1 71.29 GAGTGTGTTGGCAACTCGCACACTTTTTCACGCCCGTGACCCCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr2L 8646674 5' + Tirant 33 2 58.42 TGACAGTGCAATTTTCCCACTGTACCTGGGCGCCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATA:1 - chrX 17217764 5' + R1A1-element 5307 1 66.33 GAGGAGTAATGAAGTCGCTCTAGAATATAAATAAACAATTCATTAATTAAAATTAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTC:1 + chr3R 4434002 5' + Juan 28 1 53.47 TAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:3 + chr3R 7869114 5' + 297 28 2 53.47 GACAGTGCAATTTTCCCACTGTACCTGGGCGCCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTT:1 - chrX 17217763 5' + R1A1-element 5311 1 68.32 AATGAAAACAAACTGACGACGGTGTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr3L 12266781 5' - P-element 2836 1 28.71 TGGGGACGCGAACCAAACCAAGCCGAACCGAATGCGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGT:1 + chrX 1626611 5' + Doc3-element 452 1 64.21 ATGTTGGGCAGCAGAGGCGCCAGGAATCCAGCATGTTGGACAGCAAGATCGCACGTGGAAGGAGATAGTGCGTCGGAGCGTTACCAGAAGGAGTTCGGGAG:1 - 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TART-B 151 2 56.76 GAATCGAAGCGTTTCGCATNACTGTTCTCTGATAACGAAGAGGGTGATTCTTTTTTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 2845820 5' - roo 388 2 57.43 AAATACAGCTCTAAGGCAGATAAAATAATATACATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 + chr2L 22107364 5' + flea 4798 2 75.25 ATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCAATGCGGCGGCTCTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 28728718 5' - hobo 2909 1 53.54 TAAATAATGTGCAGTTGTTGCACAAGCGTGCCCATGTGCTGGCAATTTGTATTTAACATATCATTCATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 - chr3L 13164930 5' - I-element 5341 1 70.00 GTTAAGGAGCTTCCTTCACTTGTTTCATTTTTAATAACATATCTCATATCAAGACCATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr2R 8707006 5' + flea 4773 2 63.37 ATTGCATACTTTGCAGCGCNATTTCGGGCATAGAAACAACAGCGAAATACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 3908460 5' + jockey 35 1 52.48 GCAGTTTTTACAATGAATTTTACATTTAATTTCTATTTGGCTTTAATTGATTTAAATTCTTTTTAAAAAACGGAAAGTATTGTATTTATATTAAATACA:1 - chr3R 18433615 5' + Bari1 1399 1 84.85 AAAACGGAAGCTAAATCAANTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 + chr3R 25514131 5' - 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hopper 1404 2 68.32 GTAGGATTTACTACTCAGTTTTGGCCTTGCAATCAACAACGACGAATTTGTATACCAGCTATATTCTATATTCTCTTGCACGCTCAATTATTGATCTTATT:1 - chr3L 22935693 5' + Gypsy12A_LTR 2117 1 58.42 GCGGCGCTTTGTCAGCACCAATAACTGTGAAATCAATATCAAAACCTTCGGCGACCTTTTGCCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCC:1 + chr2L 11346677 5' - R2-element 3200 1 72.34 TACATTTCATATTCATTTTAAAATTCCATTGCTTTGCTTATGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chrX 16237962 5' + mdg3 5292 2 58.42 TACTGAAAAACCCACTTAAGTATGCAATGCTAAAAATTCAAAAGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 28728645 5' + hobo 25 1 53.47 AATTTCCATGCCGTTCAAAAACAAAATGAGAAGAACAATATCAGAGACACATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGA:1 - chr3R 1728269 5' + Dm88 4217 1 59.41 TTGGCGCGTGTTAGCCGCTTCCTTTGTTGTTGTCACGCCTCGACTTTCCATACACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3R 8050408 5' + 297 6596 2 65.35 AATCGATTATACGACTACTTTATAAATACAGCTCTAAGGCAGATAAAATAATATACATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 + chr2L 22107341 5' + flea 18 2 61.39 TATACAGCAAATTAATACTTTACAAAATTAAGCAGTGGATACATAGTGCAAAACTAATAGCACACGTGGAATATTTTTTTTAAAAATATATTT:1 + chr2L 7023085 5' + hopper 161 1 70.97 TGTATTTGAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3L 7494028 5' - roo 9040 1 60.40 ATGTCTTAATAATAATAGAAAACTAATAATAATAATAGCTTAATTTCTAACACGCCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATGTGATAGTTGGG:1 + chr3R 20460762 5' + INE-1 552 1 63.00 TAGGTGCGTGTGCGCAACCACGCCAAGATGGTGGACTGCTACCTGAACACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATA:1 + chr3R 13777907 5' + Idefix 284 2 54.46 AAACATATTTAACACTGCCAATACTGTACTATCTGCATTATCTCTGCAACATGGAACTTAAATTTAGCATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATG:1 - chr2L 17761165 5' - invader2 4883 2 70.00 TGTCGGCAACGATAATGAAAGTAAAATGCCACAAATACGTCACTATATGTATGTATACCAAGCACGGTATTGTAGAGGAATACAAAGTACTCCTCTACAAT:1 - chr3R 4591960 5' + Doc2-element 4323 1 40.59 GAAAAGTGGAAAAGCGGGTAGAAGAGGACTGGAAAGGTGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCG:1 + chr3R 10461127 5' + accord 39 2 68.32 ATGTAATTATGTACGTTCGTTATACATTAAATGTATTAATGTGTTATTTTTTATCTAAAAAGTCACAGAAGAATTCAATACTTAAAATTAAATAAAAATTC:1 - chr2R 14799943 5' - Rt1b 123 1 73.27 GCCGACCTTGGCGGCGCCACCGCCATTTGGCATTGACATACGCACAAATAAATAGACGCTATAAATTCAATTACCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATA:1 - chr3R 18882617 5' - G4 104 1 75.25 ATCCTTCTGAATCTATATGCCCACACCCGTTGTCCGTTAGCTCCTCATCCTTTCCCTTAAGTGCATTCGTCTTTTCGCAGTGCCGCTATGAATGTCTGTAT:1 - chr2R 14371936 5' + gypsy9 202 2 74.26 GGAGGTAAACGCTTGTTTGCTAATGAAAGAAAACCATTCGCCGGCAGAGAACTCCAGCTGGCAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGT:1 - chr3R 9980254 5' - roo 427 1 65.35 GGATCTAGACTTTTGCAGATTTCAACCGAAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3L 10683518 5' + opus 26 4 52.48 AAGATGTAAACATATATACACACTGTGCTATAGGAATTTTGGAGATATGGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 + chr3L 8534295 5' - Tirant 326 2 56.44 TGCATCTACGATGACTAGTATGTGACTATACTTATTTTTTGGTGATCTCCATCGGTCCTACATGATCTATACGTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGT:1 - chr3R 2469011 5' + micropia 7 2 73.27 CTTGCCCCTTGAGTTCCGTTGAGGTGTGTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCGTAAGCGGTT:1 + chr2L 1901474 5' - Quasimodo 6956 2 72.28 TTTTCTGGATACGTATCTTGGGCCTTTTCATTGTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 15703588 5' - transib2 2642 1 91.49 GCCTCAAGTGTTGCGGCTTCTTGTCGGGAAGCTCTGGACAGTGCCGTGGCTAGGCGTGGTCGTGATACCGGCTGGAGTGCATGTTTACTTCCT:1 - chr2L 7611867 5' - BS3 1461 1 73.12 GAGGCAAATTGTTCCATTCAATTTGCGCAAATGCCCTCGTCAGGATAACAATAATGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr2L 20226753 5' - 412 7521 2 53.47 AGCTTGGCAAAGCATTCATGAAGGTTGTCAAGAATTGGTGGGATTTTTTTTTGAAATATAATGCATATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 + chr2R 16907468 5' - opus 498 1 77.23 GAAAATGTTTAAGGTATTTNTTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr2L 3475327 5' - roo 9031 1 70.30 AGTATGCAATGCTAAAAATTCAAAAGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 28728663 5' + hobo 43 1 65.35 ATTGTTTAGACCACGAGAAAATTGCCTTTTTATATAAATATACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 3146601 5' + roo 8697 2 62.38 TACATACCTAGTAGATTTAAAATCATGGACAAAATTGCAGTATTTCCATTTAAGCTGTTTTTGCAAAGGAACCAATTTTATTAAATTTCAAACAATTTAAC:1 - chr2L 15484619 5' - HB 1519 1 79.21 GTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr3R 8705325 5' + jockey 61 1 76.24 CCTGATATGCATTTATATTAATTGTTTGATTTGTTATTTACAAGACTTCTTCTAGGTTTAATAGTTCCTGAGATCTCAGATCGACACGACTATTGATCCTG:1 - chr4 104548 5' - INE-1 95 1 65.35 CGAACAGGTTATTCATGGGTTGTTCATAATGCTGAGCATAAATCTCTTTCCGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCC:1 - chr2L 9156813 5' - baggins 5276 1 59.41 ACACGCCATACAAATGCGCTGGATAAGCGGGTTTTAATCAGAAGAGATGTAAACTCTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTT:1 - chr2R 22467384 5' - 1360 341 1 62.38 AACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAAAAA:1 - chr3L 24916683 5' + Porto1 156 1 63.37 AGTTGCTGTCGCACTTGAAGTTTGAAAATGTGAATGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 31473981 5' + roo 40 2 71.29 GTCCCAAAGTATTTTAGTACCAAGATGTGTACCCAACCCACTGACCCTCGCCAATATGCATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAA:1 + chrX 13294017 5' - mdg3 5482 2 62.38 ACCTTTTGGGGCAGTTTATTGCGATCGAATGGGTTCGTTGCGATAGATATGATTATGAGTTGTGAAGTGATCTTTAAATAAATATAAATTTAGGTTCACCT:1 - chr2L 2685314 5' - I-element 243 1 77.23 AAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 - chr2L 16939878 5' + opus 31 4 59.41 GCAAAAAGGTTCCGAAACTCGAGTGTTTGGCAAATACTGAAAAACGTGGGCGTTGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATAT:1 + chr3R 7688855 5' - Tirant 8485 2 58.42 GGCTCTGCTTGAGCCAGATATTGCTGCCGGGCAGGATTTGCCAAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 3428090 5' - roo 398 1 67.33 GGGGCTCTTTGATGTGTGCTTTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAG:1 - chrX 769551 5' + 1360 3245 1 86.14 GAAATCGGGGTATGGCGCCTAGCAAAAACCGCAGCGAAAGGATTGTCCTCGCTTGAGATACATCTGTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 + chr2L 18927450 5' + mdg1 11 2 68.32 AGTTTCCACTTCCCAGTTGCCAGTGCGAGTCCCTTTCCCTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACT:1 - chr2R 9200590 5' - F-element 4414 1 61.39 TGCAGCTTGATTAAATGTAAATTAAAGTGAGTTCACTTGGCATCTGTATTTTCTTTGGCACAATAATGTATCCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr2R 15595306 5' - hobo 2936 1 73.27 TGGCGTTTATTTATAAATCATCTCATGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr2R 11661165 5' - 1360 3364 1 54.46 ATTTTTAGTAGTTTCAGAGGGCGTTAGAGTAACAGCATTTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTAAAGGGAGGGAGTGCGACCTTGCCTC:1 + chr3L 10658851 5' + Rt1b 4942 1 59.41 GCGGCCACCAAGATGATGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3R 16595086 5' - P-element 2829 1 24.75 TTGATTTAAGTAACGGCAATACAATTAGGCTAAATTTAATTGCCAATAAATCTTTGATTTATATGTTTATTTATTTTAATCGTTTTATTTAATTATTTTAT:1 + chr2L 16166628 5' - Doc3-element 82 1 59.41 TGGCAGCTTAAAATTATGCTACACACACGCACACGAACACTCGACTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGCTCTCCTGAAAGTTTTAATCTTGTGTTTTTGTGC:1 + chr2R 13344399 5' + Cr1a 389 1 56.44 TACGCCTATCTACACTGCGAAAAGTAAGAGTGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTC:1 - chrX 19219099 5' + Doc 328 1 69.31 TGCATAATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr2R 6041554 5' + opus 138 4 55.45 TAATGTAATATCAATTTAATTATGATCAAAGAAAATACTGAGATCTAAGGGTTTTAGGAACAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - chr3R 10229467 5' + copia 17 2 60.40 TAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGA:1 + chr3R 11162682 5' - Copia1_DM 132 1 70.30 TATGCTTAAGTGATAGAAAGTTTTCATAAAACTGATGCGAAAACTTCTTTATTGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3L 25120253 5' - pogo 2082 1 62.38 ACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chrX 10547670 5' - P-element 2845 1 38.61 TAAAAGCAAGTGAAAATAAATTAAGTGGAAGTAAGTCGTAACGAAGTGATACATAATTCTTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGA:1 + chr2R 13659006 5' + Ivk 3 1 72.73 ATTATAGATTCCCAATTGACTTCATTTCTAATAACATAAAATATGTTTTTAAGTGCTGCTCACAATCAGAAGCGAACCGTTCGGCACTCCACAGTCTTCGG:1 + chr3R 17552443 5' + Doc 5 1 59.41 TATTTCACGCACCTTGGACTACTTTGAGGCGTTGTCATCGGTCAGCGGGCCAAACAAGTTTCCCCAGCCAACACACACATACTCACACACTCACACACAT:1 + chr3R 9905645 5' + Quasimodo 33 2 81.00 GAGCAATGAGGGCCACAATGTTATTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 - chr3R 28216841 5' - blood 7338 1 83.00 ACCACCTACAAAATTAAAAATCCACACCGCAATGGCGAACGCAAACAGAGCGGGATGAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 11030935 5' - roo 392 2 62.38 ATAGATGCAGAATCTCGTTCGCTAAGCCCAATAAAATCGCATCCTTCGAAATCGCTACATAAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTAATTGTAAGC:1 + chr3R 1838509 5' + Cr1a 4034 1 64.36 TTAAGCTGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3L 3822383 5' - pogo 2072 1 57.43 CTGACCCGTAGCGAAGAAACTAGCAATCTGTTGAGTGAAAGTTATGCGTATATATCTGAGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTA:1 - chr3R 16005764 5' + Doc 4571 1 67.33 AATTGAATTTATAGTTTATTTATGCAGCTACTAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chr3L 17276526 5' + G2 3073 1 70.83 AGAATCGGATTTAATATTAGTCAGCTTGTCAGCTAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAG:1 + chrX 11438387 5' + flea 4960 2 66.34 ATTGGTATTGAAATCTGGCTAGCTTAAGATCCATGCTCACTTCGAAATGATCAGAGTTTGTTTTAGTGCATCCTCTACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chrX 19117942 5' + jockey 4763 1 70.00 GTATAATTTTTAGTCATTGCGCTTGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 18769627 5' - roo 9022 2 75.25 TATATTTATATATATTTTTACATATGCACAGTAGTCAATGGATTGATTATTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 8037710 5' - roo 9047 1 53.47 ATGCGAACCAGAGGTTTTTATTATTTTCCAGAAGTCCGGGGAAAGAACGTAGTGTATGTTCGATGGCCTGGCTCATTTTGCGCACGGCCCGCCCGCGTACA:1 - chr2R 10434044 5' - gypsy8 292 1 78.22 GCACCTATCAAAAGGTCAATCTGTGAACGCTGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCTCAATCTCAAAATCTATTAGGAGCCTGAACCGAAATCTTAGGCTTCTA:1 + chr3R 3853283 5' + Transib5 2928 1 67.33 ATTCGCTTTTATTTGCCTTTTTTGGCCGAGGTATTTTTCGTTTGTTTCTAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 + chr2R 20588762 5' + Tabor 6868 2 50.50 GTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATC:1 - chr3R 18052450 5' - TAHRE 10399 1 69.31 ACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr2R 5200935 5' + 1360 34 1 59.41 GGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAACTCCTACGTGTTACTTGCGATGATTACCCCATTATGTTTCTCTATCATTGGCATCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCA:1 - chr3R 443024 5' + Stalker 7052 4 38.61 TTACAACGTAATTAATATAACTATTAAACTAAATATTACTCATGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTG:1 - chr2L 7094391 5' - Doc3-element 4506 1 58.42 AGATGGCAAAAGGCAGTCTCCCCAAAATTCGCCACACATTTTATCTGCACTTGCCCAGCAGCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACA:1 + chr2L 1581231 5' + roo 8659 1 69.31 TATTACCACAGTTAATTTACATCGCCAACAAGGTTAAAATTTAAACAAGAGCATATTCGCTCCCAAAACGTACCTGAATAAAATTCGGGTTCTTCAGGCAA:1 + chr3R 4689897 5' + jockey2 2952 1 79.21 GAGTTTGGAGTCTTTGGCAGCAGGTGCACTTCCCCCTCATGGAGACTTTACGACGACCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 + chr2L 15548730 5' + Tabor 6858 2 61.39 ATTTGATTATCTATGACTGCACACATACATATTGGCCCACACCCACCCAGTTATGTGCGAGTATATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 + chr2L 12779576 5' - flea 250 2 63.37 GTTAGGGGTTTCAAGAAGATAGGAACTTATCCTTTATATCCTTTTATCTTTTACAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 24169990 5' + roo 8686 2 58.42 AGAATCGTGCGAGCGGGATGGAGCGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 5206568 5' + roo 51 2 76.24 AATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 7494048 5' - roo 9020 2 73.27 AAATCTAAAGTACAAGTTAAAGGGAATTTGTATAGGAAATAAAAATATAGTAACCACTTTTTAAAAAACTAATTACATATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr3L 11697159 5' - pogo 2095 1 74.26 ATGTAATTTCCGAGGAAATACTTAAGAACCGCATTTAAATTGGAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAA:1 + chrX 18464652 5' + hopper 1076 1 65.35 GCATTCAATAAAGAATGTTGGCGATTTTTATCTTGCTGCCGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAT:1 + chrX 7534635 5' - Tirant 367 2 58.42 AGAATTAAGATAGGCATTCCAATTATGACATCACAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 + chr3R 10434564 5' + 1360 41 1 64.36 ATGATTATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chrX 4422681 5' + jockey 25 1 61.39 GTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 22469134 5' - hobo 2917 1 55.45 ATGTGAGCGAAGGGCTGGCTCGCCTCAACTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAAC:1 + chr3R 16350977 5' - P-element 2670 1 31.68 TGTAGACACTAAATATCTANTTTGTATAGGGTCATACGGAAAGCAGTAGCATACACTAGTAGACATAAGTATTTGGACAAGAAATATATTCAATATATTTC:1 - chr2R 21321764 5' - Tc1-2 1597 1 59.41 AAATATGCATGTGAAAATGGTACATAATGTCGTTAATTGCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCAT:1 + chr3L 22112811 5' - diver 211 1 64.36 TTAGGGGCCTCCAAGGCCANCAAGGCCGCAACTGGCGCCACTTCCGCCGCCGTCAAGTGGCGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 6769533 5' + 412 15 2 63.37 CCTTGGTCCAAAAGATGTAACGCGTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chrX 22771525 5' + opus 7159 4 75.25 ATTGCACTTCAGCAACGAGCACTAAGTTCACTTTATTATTGCAAACTCGGCGAAGTCACTTCCTGTAAAATCCCCAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 13358755 5' - roo 392 2 63.37 ACCCAAGTCCAAGGAAGAAAAGAAAGCCAGAAGTCAGGAGGCGGCGGCCACAACAACAACAACAGTGCCCCACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCT:1 - chr2R 22247011 5' - G-element 3903 1 64.36 TAAGCCTGGGCAACACTTTCAAGTCGGCTTCAATTACACAGCCTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:2 - chr2L 13732811 5' + Doc 38 1 57.43 AAAGTTTTATAAAGTTCTAAATATATAGACCATAAATTTGTTTTACATTATACGAATAGACGGATGGACAGGGCCATATCGACTGGGCTATTGATCCTGAT:1 + chr3R 11575908 5' - INE-1 93 1 54.46 ACATCAGCGCATGAGCATTCAGCTCGACGCCTTCCTATTCTTCAGTTGTGCACACACACGCACACACACACACACACACACATGTAC:1 + chrX 2511513 5' + accord 185 2 57.47 ACCATTTGACTGCACTTTACGCATCGCAAAAGGAGGACTTGAATTTTATTAAATTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2L 13334802 5' + hobo 2 1 77.23 TTTGAGCATCATTTATATTNACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr3L 22112644 5' + Doc 48 1 69.31 ATGGCTAATTTATGAGATCNTTCAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3L 16478430 5' + pogo 52 1 77.23 TACGGCGTGGCCGATGATGCTGCTGATTTGGATCTTCTAGTTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGG:1 - chr2R 25111215 5' - mdg3 5402 2 60.40 AGCTGAACTAGCAATGGAACTAAATAAAACTTATAGTAAGACATTTATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 + chr3L 2714470 5' + BS 42 1 54.46 TGGCTTTTGCCATTTTAATCAACTTTTCTTGGATGCACGACAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr3R 26342999 5' + blood 31 2 55.45 AATCGGGGTATGGCGCCTAGCAAAAACCGCAGCGAAAGGATTGTCCTCGCTTGAGATACATCTGTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATA:1 + chr2L 18927452 5' + mdg1 7051 2 66.34 TAAGTTAAGCGTTCTCTCACCAAAAGCGACTTGTACACCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAA:1 + chr3R 26339903 5' - Juan 3888 1 69.70 ATTTTTGTATCTGCTCCAGATATCCAAAGCAATACGTATAATCTCGTGATATGGCTAATTTATGAGATCTTTCAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:2 - chr3L 16478480 5' + pogo 2 1 75.25 TAAAGAATTTATTCAAAATAATTTCAGCTTAATTTAGTTCTAAAGGAGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGGCAATCAAAAAT:1 - chr2L 17213085 5' + Porto1 4324 1 53.47 GTGGTGGGCAATAAATTTTGACGGATTAGTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCC:1 + chr3L 11391606 5' + FB 947 3 71.29 GTTATTCATGATTTAGATCAGCATATCGTAAAATTTTGTTTAAAAATCGTTCAGGGTCGTTCTGACCCTGTCCGTCCGTATAAACGTCGCGATCTCAGGAA:1 - chr2R 5211589 5' + INE-1 139 1 45.54 AGCATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr3R 7869099 5' + 297 6594 2 67.33 GAAGCGGACTGGCATCGCGGGGCTTGAAGCGGCTCAATGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTCACAAAATCACTTCAAAAACATAC:1 - chrX 13955532 5' + I-element 210 1 66.00 AGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr3L 19349947 5' - 1360 3357 1 61.39 GAGCCACAACTTCGGCAATTATACCAGCAACCATCACATTCTTGATTCATACAGTCGCCTGAATTACGTGTTTTATTTGAAAATAGAATAGAAATAGCCAA:1 - chr2R 4829583 5' + 1360 329 1 76.24 ATATATGAAAGTATATAAATATACTCGATATGGCTGTTTTCGATGCTGAAAAGTTTAACGTGTAACGAAATAAATTTATGGAAGGCAAGGGAAACTGTT:1 - chr2L 21652544 5' - Gypsy12A_LTR 2235 1 63.64 GATTGTGTGTGGCAAAATAATTTTACATTTCCAATTACCTAATATTCATCGATGAATAGGCAGTCCTGCGCAGGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGGAACTAA:1 - chr2L 18325835 5' - G5A 2416 1 77.23 GGTACGATGTGCTACCATAAAAACTGTAAAAAAATAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGTAACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGA:1 - chr2R 4578529 5' + Chouto 451 1 68.32 GGCAGCGTTTTTTGTTGTTTCAAGGCAACTTTATTTCTTGACTCTTTTTTTTGTATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGGTGAATTTTGTATAAA:1 + chr3L 18820124 5' - Tc1-2 445 1 57.43 AAAACCATACAGAATACAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAG:1 + chr3R 23711920 5' - G5A 2786 1 63.00 AATTAGCCTGACTTTTGTGGCAGGGATTTGGTTTATTTTAGTATATGCCTATGCTATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 20226689 5' + 412 21 2 50.00 TTTCTCATGATTTGCTCGTTTCAATCGGAATCAATAAAAGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATT:1 + chr2L 11919283 5' + X-element 40 1 54.00 ACGGAACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chr3R 18171843 5' + 1360 27 1 54.46 AAAAAACAGAAGTACATAGTATGTAGATAGGTTCAACCGAAGCGTACGAGACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCG:1 - chr2R 22775699 5' + flea 4705 1 52.48 AGCTGTCGCTTATCGTTAATCGCTATAGCTGCTGAGCTGATCTTCTCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACA:1 + chr3L 17922557 5' + BS 4937 1 54.46 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTCTGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGC:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 5110 1 59.41 CTAAAAGAAAGAAACACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chrX 17873162 5' + 412 7077 2 55.45 AAAACTTTTGCCTTTCGGCTCCGTTCGCTATGTCCCACCCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATA:1 - chr2R 19061451 5' + accord 7030 2 62.37 AATTCAAGCGACCATTAGGTAAATATATGTACTAATTTATACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTG:1 + chr2R 7368748 5' - HMS-Beagle2 261 2 59.41 GCTCGCAAGCAGACTTTGTNTTTATCTTTGCCGTCGCCTCTTCCAGAGTTGGCAAGCCCCTTTGCTTTGTGGGTACTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 29328207 5' - 1360 3388 2 63.37 GTGGAGTCTATAGAGTGCGCCAATAAGTAATTTATCCAGCTTTTATTCCAGCCTTTGAACCTCGCCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGACTCACGACCAGCT:1 + chr3L 23295463 5' + BS3 144 1 70.30 GTCGACAGAACTATGGCCACATTAAATCGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr3L 15444840 5' - mdg1 377 2 70.30 TGCTCAAGCAGGCAACTTAATGAGCACTGACAGTCGTCGACAGAACTATGGCCACATTAAATCGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr3L 15444805 5' - mdg1 412 2 69.31 GATACATACAACGAATCCGTATTTGTATTTGTTTATTTGGCTGCAAAATTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 + chr3L 19700208 5' + Quasimodo 19 2 61.39 ATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 16127750 5' - roo 9020 2 78.22 AGATTGCCCAACATAATCCGATTTATTAAACGAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTC:1 - chrX 18705973 5' + I-element 4978 1 68.32 GGGGTTCGTAGCATCTCCCCAGGCATAAATGTACGAACGACTTATGAGAAGATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr2L 19207862 5' - 412 469 2 52.48 AGTAATAGTTGTTAATTCGCTTAACACACACTGGTTATCCCTGCCGTTTGGTCTTCGTCGAGGGAATGCCGGTCGCTCAAAAGACCGTGTTTGGGTGGATC:1 + chrX 9669520 5' + GATE 8147 1 57.43 GCTGAAGTGGGTGGCCAGCTCTTCACCCACATATGTACATATATATATTACATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 + chr3R 26782392 5' + mdg3 5272 2 64.36 ATGTGAGTATTATCATCTAGCATTATCCTTATCTTCAATCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chrX 17873235 5' - 412 457 2 59.41 AAAACACCGAACCTTGCTGGTTGTCGCGCATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACACTCACCC:1 + chr3R 16594488 5' + Tirant 40 2 62.89 ATTTTGCGCCATCGCAGCTGGATCTTCATTTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 15268224 5' - roo 390 2 60.40 TTGAATATCGTTCATAAATNCTTCCTGCCAACTCTGCAAAACGAAATTTGTTTCAATTTCGCATTGAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 - chr3R 25950180 5' + 412 7 2 71.29 GGAGATTCCTTATGCTTTCTGCTTTTTGCGGTTTTCCCGGTCGCATCTCGTTGTATATTTTTTTTTAATCTACCGTATCACTGTCTACAGTATTGAAACTG:1 - chr2R 17191577 5' + Circe 7315 1 65.35 AAGCGGCACCGATGTGACATCTAAATTATGCTTAGAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2L 9471262 5' + roo 41 2 65.35 GGTAATCAGATAGCGCATATCCTGTCAAAAAAGTGATTGCCAAAATAAGACCAAAACGATGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGT:1 - chrX 21401691 5' + P-element 2837 1 62.38 CAAACCTCTTATCAAATCCTTTTAAATTCAGTTGAAGAGTAATTGATCCTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAA:1 + chrX 11696571 5' + TLD2_LTR 94 1 75.25 AAATGAAGCTGCAAAGTTCAAAAACTAAGCTAAAATGTTTTTTGTCGATTCTGGTAAATTAATCCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3R 10648267 5' + I-element 10 1 68.32 AGCATCATCAGCATCAGCCAATAAATGGAATCAATTCTCAGTGCTCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAAGCTCTTGGACGCCAGACTTCCGGCACAAAGGCGG:1 - chr3R 29506501 5' + invader3 393 1 75.25 AATTACAGTGCATTTAGTGTGTATATGTCAGTTTCATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr2L 21220768 5' + I-element 42 1 71.29 GTTCGAGTGTGTGCGTCTGTCTACACGTGCCACGCAGCGTGAGGTGAAAGGAGAAAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr2L 18413915 5' - hopper 1398 1 60.00 CTAAGAAATTGATTTAGTGCATCAGGGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGG:1 - chr3R 30366915 5' - hobo 2677 1 74.26 ACATTTTTGGACCGCCGATAAACACTGAAACCGAGGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATAAATATATTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 + chr3R 20472175 5' + INE-1 96 1 65.35 TAACGTTGTTGGCTCAAATTATTTCCGTATTTTAGCATTAAATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3L 11758430 5' + roo 34 2 61.39 TTGGGGCAGCTATATTGCAATTGTTTGCTGCGAATTTGTGTTGGGTCTTAGCCTTAAGCCTGGCAGTAACAAATACTTGTGCATAAACACAAACACAAACA:1 + chrX 12966384 5' - 412 77 2 67.33 GTGTGTGTGTGTGCGTTTAGAGTGTGTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 16673861 5' + hobo 51 1 77.23 AGCGAGTAAGAGAGCAAAGAGCCGCCAATAAATGGCAAATATGTGATAGGTGATAATCTGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chrX 2743879 5' + P-element 17 1 62.38 AGCGGCCTGAAATAATAGCCTCAAAGTATGCATTGGCAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chrX 4238778 5' - 1360 3365 1 59.09 GCCGTTGCTGTGTAAGTTTTTATTAAAATGTTTTAGTCGATGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGAAGATCGGTCGTAGCCGTCACCCGGTTA:1 - chr3R 29841148 5' - gypsy6 13 2 58.42 TGCCTACTTATGAGCGCCTCTGATGGAGCAAGGGAAGGGGGGTGTGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chrX 12873645 5' + hobo 25 1 51.58 AAGCCCCGAACAAGTTCTCGGGTAAATAATTAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 17109734 5' - roo 393 1 64.36 TCCTATGCTCACTTCGCGATATATGCAAGCGCTAATCCGACCCAGAAAGCATCCAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAA:1 + chr2L 2325440 5' + F-element 4363 1 63.37 GCTGTGGAAAATCTGGGAATATGGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3R 12882672 5' - 412 7490 2 74.00 TTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCAAGTCGTTTTCGTTATTTCGAATGAAAATCATTGTAGTATTTA:1 + chr3R 6729439 5' + Tc1 1545 1 45.95 TGTTTAGAAATATCTAGTAGTTCGCTGGCATCAAATTGATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCC:1 + chr3R 25271663 5' + invader4 2792 2 55.45 GGTCACAAATATTTAAAAATAATTGTTTTGGTTTTGGCTTTTTGCAATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 95831 5' - roo 409 1 78.22 GGAAGCTACTTGATTTCACGATAATTCACTTCAAAATATTGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3R 25422055 5' - copia 221 1 62.38 GGGGCGCGTTGCTGATTGTGCGCAACGCTCGGTTTTGGACCCTTTGCAATCTCATTTTGTTAGAATCGGACCCGTACCCCAACTTTCAACTTAAGACTGAT:1 - chr3L 23611172 5' - McClintock 273 2 78.22 GATTGAGCAGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 27455530 5' + 297 6599 2 62.38 GGAAAAGAAATTGGTTTGACATTTGAATAATTTCGAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3L 5256018 5' + jockey 18 1 80.20 AAAACGAGTGGAAGTAATCCACTGTCAGGACGAGGCTAATTCCGTGGCTGCCGATGGGAATGGGATTGGGGATGGTGCATCGCACAGAGCGTCCCTTTCGC:1 + chrX 14532141 5' - Doc2-element 112 1 74.26 AAGAAATACAGTCCAGGAGTTACTGGCCAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 95920 5' + roo 8708 2 70.30 TTTAAGCCGCAAAATTTGTACTCTTGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2R 23122667 5' + hobo 50 1 78.79 TAAATAATGAACCAAATCGTGCAAATTCAGCTGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAGCTTTCTATCCCAGGGTTCAAGTTTTGGCTA:1 - chr3L 16363691 5' + X-element 270 1 73.27 ATCGTTTGGCGCCAAGGCGCGAATTACGCCGAAACTCTGCGAGGACAATTGGCCCCCAAAATCCAACCGAAAAGGAGATGGTGTGCAACTTGGCACCACAT:1 - chr2R 18516723 5' + Rt1a 4875 1 72.28 TTTTGGTTTGCCCTACTTGTCTTAGGTTTTACGGAATCTTGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGCC:1 - chr3R 32009703 5' - gypsy12 9877 3 66.34 GATGGTAGTGACCGACTATCTGCTCCGTCAGTATGTGCTTTGTGCCACATAAAATACAACACAAGAGAGCATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 - chr2R 4641008 5' - INE-1 561 1 66.00 CGGCTGAAAAATCTGTTTACGCGAAAGAAGAAGATTCAGGCAAAGGGCCAAGATATCACAGATCTATCCACAGAATTGCCGCTGGAGGCCTCAGGAAACAT:1 + chr2R 21099483 5' - TAHRE 10070 1 76.24 TTTAATAATAAAAACACACACAAAAAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTACATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3L 19088034 5' + 297 6611 2 73.63 GGAGCAGCATGAAATTTTATGCTGATATGAAAACAACAAAACGAAACGACAACGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 - chr2L 15909906 5' - Tirant 377 2 57.43 AATGCAGATGTTAAGGACANCTGCGACCGGGCTTGTATTACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3R 14980485 5' - 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flea 238 2 50.50 AATTAAATTGGACTTGTCGTAGCCTTTGCAGACGACCAATTGAATCTCGTTCCCAGCGTTGCGCAGCACATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTG:1 - chr3R 26580005 5' - jockey 4689 1 75.25 GCTAAAACAATGGCAACAACAGCAGCAATATTAATACGAAATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGG:1 - chr3L 19513280 5' + F-element 4357 1 70.00 TTTTGTGTACTTCTCATGACTATAGATAAAGTATTAGATGAATCATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr2L 7259471 5' + I-element 32 1 56.44 AATGGCGATGGGGAGCCACNAGTGCCCAAGAAACGCGGTCGTCCACCACAGAACAAGTCGGGTAGCGGTGGCAGATTACTGAGCCATAGCAGTCTTCGTGC:1 - chr3R 9239007 5' + Helena 1268 1 76.24 AGTCGGATTTTTTTCACATTTTAACAATGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTA:1 - chr2L 7804303 5' - 1360 3344 1 74.26 ACGAGATACAGAAGGCGATGGGTGTCAATTCCAGTGAAAAATGACTGGATGAAAAATGCAAAGGTCGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCA:1 + chr3L 5974324 5' - hobo 2509 1 70.30 TGGATTAAAGAGAATTAACAATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr3R 13239994 5' + jockey 15 1 63.37 TTTTGGCTTAACAATTTTCTGTAAGGCTGCGTAAGCGGTTTTGATGTCGCGAAAGCCCCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTG:1 - chr3L 7352712 5' - Quasimodo 7006 2 76.24 TTTTTAAGGAATTATACACTATACACTACTCTTAAATGTCTAATTCCGCTTTGTTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 17976720 5' - copia 233 1 49.50 GTTTTCCTTGGCCAAAACTNAACTGAACCAAACAATTATTTGTACAATACTTTAAACACTTCGTGTGCGTCCTGCAATGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTG:1 + chr2L 7463274 5' - gypsy11 449 3 63.37 ACCCAGTTTTCACGAGATGTTCATTGTTGCGGAAAAGTAAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 + chr2R 13446621 5' - roo 9071 1 76.24 AGCGTCTGCCGAGCCAAACAATGTGAAACGGGCTGTAGATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTA:1 + chrX 11032192 5' - invader3 238 2 62.38 ATATTATATAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 3475341 5' - roo 9045 1 56.44 ACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:3 + chr3R 7869132 5' + 297 6627 2 71.29 TGTTGATGATGGAGCAGCAGTTTGTTTGTGAATGCACAGCGAAAATTGAATGCTGCAAATTTGATAATAAAGACAATAAACGAAAAATCTATAAGGATCAG:1 - chrX 15202294 5' + Transpac 4773 1 66.34 ATGCGCAACTCCCTCCGAACTCCCAACTCGAATCCACTTTGTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTT:1 - chr2R 15117556 5' - Quasimodo 226 2 57.43 AACCCTTGCAAAGGGCATGCCCGTAGTTTCCATAGTTTCTTTTTCCTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTCAATTGATT:1 - chr3L 17196855 5' - invader2 432 1 54.46 TATATACTTATATGTATAGATGGACACAAACACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:2 + chr3L 3433506 5' + hobo 43 1 65.35 TACAGGTCCACCGAAAACCAGTCGGAAGCTGCCACAGAATTTGTAAAAAGTATCCAGGAGTATTTCATAATGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTACCAA:1 - chr2R 20614752 5' + Stalker 10 4 66.34 AATGAATTTCATTAGTTCGTTATTATTGGAGTTACCTGTTGCATTGAAATGACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTT:1 - chr2L 12063282 5' + copia 216 2 61.00 ATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGACACCAAG:1 - chr3L 26007749 5' - G5 4755 1 51.02 TTATGTATACTTTTGTACAGATCTAATGGAATTTGCTTTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACA:1 - chr2L 2416763 5' - 3S18 6066 2 61.39 CATGAACAGCAATCGACGCATTCCTAGAAGAGAATCGCCCACAGATTAACGCTCTATATACGACTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:1 + chrX 18121806 5' + opus 6 2 71.29 TATAATATTTATTAATCAGGGGACAGTTTGCTTTAAATGGTTTTGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:3 + chr3R 16805999 5' + 412 7076 2 56.44 ACACAACAAAGCAGCTGCCGTTGGAGTTGCAGCGGCTGAGTTGGTGGAGGAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATA:1 - chr3R 11301706 5' + invader1 3768 2 64.13 GGAGGACGCTCGATGACAAACAGTCGAGATGTGTTTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAATTTATATTTGATATG:1 - chr3R 11840621 5' + copia 43 2 66.34 AAGACTGTTTCGCTTTGTTTGCAAAACAATCAAAAGCGAACGTAGTCGCCATGTTCATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCC:1 + chr3R 8706039 5' + hobo 2661 1 60.40 GGGGGTAGGTAAGCCTGTACAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 - chrX 22713779 5' - 1360 3332 1 84.16 TTAGATTTTTTGGTATCTTTGAGCAGCGACAACCACTTCATGCTTTTGTAATGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCAAGCTT:1 - chr3R 12404872 5' - Stalker4 479 1 67.33 GGCTTTGTATTATACCATTAGCATTTAAATGCAGTATAATTTTTAGTCATTGCGCTTGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 18769660 5' - roo 392 2 58.42 GTCTCAGCTTAGTAGACCCCGTCGTTCAGCATCTCGACTTGATTCGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCATAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATC:1 - chr3R 2451632 5' + Cr1a 4126 1 66.34 TCCAGCTCTTTGGTGCTCCGGATGCACCGATCCCCCGGGTTTTTCCTCCCCCGATTAGCTGCAATCGGATCCGACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCT:1 - chr3R 8468794 5' + Cr1a 3994 1 76.24 ATTAAAATCGACTTTAAAAATAAAGGGCATTTAGATATCGATAAGGAGCTATAAGGAGCTAAGGCGCCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 - chrX 21057020 5' - Tirant 389 2 65.35 TACCGTTATTTTATCGCACTTGTTAACGGCTTAAATATCATAAAATAAATATTTAAAGCTTTTGTTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGT:1 - chr3R 28731140 5' - accord 213 2 72.28 GAGAAGAGATTTTTCCCAAATGTGGCCGTAAAATGTGAACGAGTCGAACTTAAAGTGCCATATTTAACAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTT:1 + chr3L 20625790 5' + invader4 2683 1 75.25 GAGAAGAGCACGCGCTTCGGGAAATTCGTTGTGATCTCGAACTCATCCGGCGAATCGGGAATCGTACAATCTCATTGCGACTTTATGCCAAGACAATCGAA:1 + chr2L 18706654 5' + transib2 2808 1 59.41 TTGGGGATTCAGCTGCAATGTGGACTGCACATGGGAACGCACCTTGTCGCGCAAATCACGTATTTCTGGGCGCTGCACCACTGTAGTATGTGCATATATCG:1 - chr2L 13792277 5' + blood 7010 1 78.22 TAGCTTTGGCCCTTCTCAGTTTGAAAGAGAAATGCGTCGGGCTAAGCTAAAGGATTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 + chr2L 18894614 5' - Quasimodo 7052 2 58.42 ACCACGAGAAAATTGCCTTTTTATATAAATATACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 3146592 5' + roo 8706 2 71.29 ACGCATCTTGTTATTATAGTGTCTTTGGTAATACCTAACATTTTTTCTTTAAGTCAATGAACTCAAAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGA:1 + chr2R 1982173 5' + invader1 3609 1 64.36 ATTGCAGTTTATAACACCAAAAATTAACGCGAAAGATTATAATAGATTATTAAAAATTGCATTTCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 21372918 5' + roo 8674 2 69.31 AGACAATCACTGATTGATGNCCTGATCGAAATCTTAGCCGTGACCAATCAGCTGCCAAAAATCTCTGAAAGGGTATCGTGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 - chr3L 15435632 5' - blood 376 2 75.25 GGAGAATGGACGAGGCGCACAAACATGTCAGGCAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 + chr3L 11657847 5' - Tabor 7282 2 63.37 GCCGTGCATGGCCATAAACNACAACGGCAACAAAGATGGCCGAATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTA:1 + chr3L 17178814 5' + hopper 33 1 55.45 GACATCACACTTACACGTTGCATGCCACAGCCTTTTACGTTCGCTTCGCAAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATT:1 - chr2L 20749381 5' + Cr1a 169 1 63.37 GAAATCCAGCCAAGAAATTGTGCAGATTTAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:2 + chr3R 31962066 5' + Doc 51 1 69.31 GCGGCTTTAATTGATGGCGTTTATTTATAAATCATCTCATGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr2R 11661179 5' - 1360 3378 1 68.32 CATAGAACGCCAGACAATGGCCATTATAATGCTATAAATCCAGTCATATCTGCTCCGCGGTTGTGTGTGCTCGTGCGGGCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 12674848 5' - accord 185 2 68.32 TAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr2R 6041616 5' - opus 7454 2 76.24 TTTTGCAGTTCTTCTGTTGGCGGTGACACAATTCTGGTTCTTGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTGAATGTTTGGTGGGTCTGTCA:1 + chr2R 19563707 5' - I-element 188 1 60.40 TGTGGAAGAACTCCTGCGANTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 19513367 5' - roo 9034 1 60.40 ATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 7869118 5' + 297 6609 2 55.67 AACGCGCACGACTTACTCATCTGATTAACTCCACTTAGTGCTATTTCCAACTACACACAACTAAACAACAAGAAACAACCCAAACCAACAGACATAAACAT:1 - chrX 1650570 5' + Quasimodo 293 2 46.53 AATCGGAACGGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 + chr3R 9870355 5' + F-element 50 1 61.39 TTGGTTATAAGTATCGATCGAAATTCTCCAAAAGATTTTGTTGCTAATATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAA:1 - chr2R 13258792 5' + F-element 13 1 73.00 AGGGCAAAGCATAATGAACACTTTGTCCTCGGACTGGAAACTTGTGTCATTCAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATTTTAGACCG:1 + chr2L 20067239 5' - baggins 5047 1 58.42 TACCCCTACATATAGTACCGCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGC:1 - chr3R 1977613 5' - micropia 5404 2 60.61 AATCCGTGAGCCAAAGCCATAACTCGAAACCGGTAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGC:1 + chr3L 16989086 5' + Doc 4236 1 76.24 TAATTGCAATCGAATCGGGTTGGTATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3R 29157509 5' + pogo 47 1 72.28 AGTCAGCTTGCGTACGCTTGCCACTGAGCGTGGTGATCATGAAAACCATTAACCTTCCAGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:1 - chrX 22689225 5' + Transpac 13 2 65.35 AAACTTTTTAAGATTTAAGACACGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCATACATACAAATTATTTATTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTA:1 + chr2L 22077577 5' + Tc3 1670 1 80.20 GATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAAAACGTATCGCAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chrX 8037624 5' + roo 8696 2 58.42 TGAATTCCCAAATCCAAGGACACCTACTGATGCCGGCGTATTCCCCGAGCGATTCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 12882732 5' + 412 7074 2 58.42 AGTATGCAATGCTAAAAATTCAAAAGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 28728663 5' + hobo 23 1 56.79 GTTCTTTTTGCCGAGTATTNATCATGTTTATTACCCTTCGCGTGTTTTCTTTGACCTGATTCAGTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 6417559 5' + hobo 9 1 69.31 GGTGGACAATTATTTTCGCTTACAATCTATATTTATGCTATATCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAG:1 + chr2R 15634049 5' + copia 159 2 58.42 GCTCTTTTTGCTTTTTGCTNTTGTTGTTATTTGTTTGGTATGAATTAGGCCGAAAAGTGGATCAAAACGTGACACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 6075311 5' + P-element 4 2 74.26 ACGATGAAATTGAGACCTAAAAAACGAAAGGAGAACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2L 22155505 5' + pogo 40 1 66.34 CGATTAAGCTTGCATTCAAGAGATACCCTGTAATTGTGCATTATGAAAATTACGTTCTCTTTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr3L 11105004 5' - pogo 2092 1 65.35 TGATAGCGTGTGTACGAGTGTATGCTACTATACGAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3R 19270348 5' + pogo 39 1 64.36 TTATAATTCCTTTCTAAAGACTGTTTTACTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr3R 1726092 5' - 1360 3338 1 76.24 AACAGCAGCGGCAGCACAANCTTGGCCAATAACTTAACTTGGCTCAAATGCTCCCCCCTGCCACCATGCACCCCCAACACACACACACACACACACATATC:1 + chr2L 7094214 5' + Quasimodo 40 5 70.30 TAAAGGTGCATTACGTTGCTTTCTTTTTCATTCGGTAAAGAAGGGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAG:1 - chr2L 4764089 5' - Tabor 7293 2 57.43 TATTTTGACAAATGATTTGCGTCTCTGCGGAAAAGCCAAAAAAAAACGATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 + chr3R 29465569 5' - 412 7521 2 58.42 TACGTTTATTCATTAACTGATTGCACTAAAAGTTGCAGTTATACGATACTTAGGTGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chrX 8983002 5' + 412 7072 2 60.40 ACGGGCATTTCCGAATCCGATAGGCGGAGTCTTCGCTCTCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr3L 749343 5' - P-element 2850 1 42.57 TTACCACGCGATAGTCCAAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3R 19671726 5' - P-element 2828 1 20.79 TGGATTTTTGAAGGTTTTCGACTGCTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATT:1 + chr3R 18704082 5' - F-element 4261 1 75.25 TGCCACTGCCGCTGTCACAGTTTCGCTTTTTGTTTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2R 13194629 5' + roo 8704 2 67.33 ATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 22469140 5' - hobo 2911 1 55.45 TGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCAT:1 + chr3L 21912251 5' + Bari1 14 1 63.44 ACGGATTCTGTGGGTGGTTGGGTGCCTTCTTGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCAC:1 + chr3L 14140771 5' + Quasimodo 318 2 70.30 AATTAAGAAATATCTGTAAAAATACTGGCGATTGCCTTGAAAGTACATTATTAAAAAAAAA:1 + chr3L 7012525 5' - hopper 162 1 93.44 GCAGTTTGTCTCCGATAACGCCATGGTGGTGCGGGATGCCCACGATATCTACTGCTTGGATGCGGGCATCAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 + chr2R 20114683 5' + flea 4798 2 71.29 TATGTGGTCCACTCCAACGAACATACATATGTGTGTGCGTTTGGTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTT:1 - chr2L 15168116 5' + F-element 20 1 65.35 TTTTAAATAAATTATAAGGTTCAACATGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGATGCTCCTC:1 - chr3L 23104096 5' + Max-element 50 2 74.26 ACACAAAACTGAGTGGCATGCCCCTCCGAATGAATTCCGATCGATGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCT:1 + chr3R 19786460 5' - 1360 3213 1 56.00 TTAGTGTGGCCGAGATCCACCTCCAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCCTTAATGATCCTGATCAAGAATATAT:1 - chrX 19999611 5' - INE-1 82 1 73.00 CATGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGAGCTGGGCGCACGAGGTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2L 8690532 5' + Tirant 8144 2 59.41 GGCATATAAAAGATTATTTAATGCAAAATCTGATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTA:1 - chr2R 20526967 5' - Quasimodo 7201 2 73.27 GGCCGCCGGACCAATGATGNCCATGCCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3R 16613150 5' + 412 7096 2 73.40 TTGTTGTTTCACGTTGATTTTAATGGCACTGGCTGCGTACGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chr2L 15909828 5' + Tirant 22 2 58.62 AAAACACTTAAAGACGGTGCATTAAAGTTTCTGCTGACACATAGACAAGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCC:1 + chr3L 21397527 5' + Doc 419 1 52.48 AAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATT:1 + chr2R 5582177 5' + Cr1a 450 1 58.00 AGCACTTCGGAGCGGGGATTCTTTTGATTGCCACTACTCACGGAGACCCATCATGGACTCAATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCT:1 + chr2R 13270174 5' - Quasimodo 220 2 67.33 AATTGATGACGTTGCGGAGGAGCGCTCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGAGCTGACATATATTTA:1 - chrX 10426931 5' - 412 7494 2 72.28 GTTCGCTTCGGCGTAATTCTCAATCAGAATTCAGACACACATGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGGCAGTCGAATGC:1 - chr3R 25825860 5' + invader2 5008 2 61.39 ACAAAAATACTCCGAAATGCTAATGCGAATGATCGATCAACAATTCAATTATACATTCAAAAAGTCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAGGATCAACTC:1 + chr3L 24008821 5' - McClintock 6326 2 59.41 TGGCATGTAAGTTGTTTTACTTCAAATTTTAATTATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3L 11758372 5' - roo 9031 1 68.32 GGGTGGAGGGTCTTGAAATAAAATATTTAAGGCGAGTATGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTG:1 - chrX 9459483 5' - Doc 328 1 61.39 AGTATGCAATGAACTCGAGACGTCATCTTTTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 - chr3R 13239935 5' + hopper 44 1 69.31 TTGGCTTTTATTTATAAAAATTAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2R 15376200 5' - 1360 3386 2 75.25 ATTTTTAAATCCAACGACANACCATATAAAGTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3R 27582761 5' - pogo 2058 1 70.30 AAAGAAATACAAAGGTCTAAGGAAGGAGGAAGGAACCGACACAAACCAACAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGG:1 - chr3R 17909378 5' + Burdock 324 1 54.46 GCTCATGTCGCACCATTGTTGGCCTGTCGTCCTGGGTGGCATGACTCTTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 11720697 5' - hobo 2911 1 54.46 AGCCAAGGAAAACGGAGCATAAAACACTGTTCGAAGTTGATCACCAATTGGTCGCAAAAGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3R 6190322 5' + copia 4885 2 63.37 GAGGAAGGCTTGTTGGCGCGCCTGCTCGTTGAGGTGACTCCAGGCTCTCTCGAGTTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAAC:1 - chr3R 31729792 5' + 1360 121 1 65.66 ACTTGTCATAACATGCACCACCTACAAAATTAAAAATCCACACCGCAATGGCGAACGCAAACAGAGCGGGATGAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chrX 11030951 5' - roo 408 1 78.22 GAAGGTGTTGTGGCCGCCGACAAAGTGGCATCTTCATCACCAAAGTTAAGGTTGTATGTTTTCAACAAATATATGTGGAATAAAATGGTATTAATGCTTTT:1 - chrX 22505633 5' + transib4 482 1 59.41 AACCCCAAAGAATCGTGCGAGCGGGATGGAGCGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 5206560 5' + roo 8700 2 65.96 AACAAGTGTAAGTGCAAAGCAAGTGATATGCTAAATGCATAAGCAGAGAAAAGAAAATAAAAGCGAAAGAAAGAGAAAGAAAATAAAATAAAATAAATAAA:2 - chr3L 3787542 5' + F-element 88 1 61.39 AGCCATTATTAATTTAACACCAATGGCCAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 15412669 5' + hobo 24 1 55.45 AATAAAAATAATACAAAACTTTGGCGCAGTTTTGACGATTTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chrX 10547723 5' - P-element 2852 1 44.55 ATTTCATAAAGTCTCATATTTATCAATTTTGGCCAAAAGCTGAAAATAAATAAAATTAAATAAAACAACTCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chr2L 18191282 5' + F-element 17 1 68.32 GTCGCTATGCCGCCCTGTGTCCGCCCGGATGGCCCTGGGCCCCCCAGCGACTGCCCTTCCACAGTCCCACTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGT:1 + chr3R 17565489 5' - Ivk 5063 1 69.31 ACGCCTGCGGCTCGACGATAATAACGGTCACTCTGACTGACTGCTTTTCGTTTTCGATTTCGTTTAGCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 - chr3R 16594575 5' - Tirant 399 1 78.12 AATGACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCAT:2 + chr3R 14985320 5' + Ivk 60 1 71.29 AGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr2R 18988464 5' + hobo 54 1 75.25 TCACATCGCCTATTCGCAGAACGACGATAACTACCATTAACAGAAATTTAAACTAAAAGGAGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACG:1 + chr2L 297229 5' + Porto1 205 1 68.32 GATTGTCCAACTGCCTGAGGAGGAGCATCAAGCCAATGGCAATCCCATCGAAACTCATCCGAACCAATCCAATCCAATCCAAACACTTGCGAAATTTCTCT:1 - chr3L 12263537 5' + Doc2-element 499 1 81.19 GCGAACAAAAAGAGAGTTGTAAAGTAGCAACGCTAAACGACAAAAATAACGGTCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2L 21628856 5' + P-element 21 1 56.44 TGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCG:1 - chr2R 17402776 5' - invader4 3044 2 68.32 TATATATACTTATATGTATAGATGGACACAAACACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:2 + chr3L 3413158 5' + hobo 41 1 63.37 CAAAATGCCATTAAATGTGTAGCCTTTGAAGGATTTGTAATGATGAACTCTTATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 6084373 5' - 412 7503 2 66.00 ATGTAGCAGCTGAAGAAAGTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chr2L 15817937 5' + I-element 2 1 79.21 ATACCAATCCTGCTTATTAATTTATTTATAATAATATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTC:1 + chr3R 26122988 5' - roo 9063 1 67.33 ATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr3R 18171798 5' - 1360 3361 1 81.43 AAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3R 22469202 5' + hobo 40 1 69.31 GGTGTTGTGTTCGAGTATATAAATTGTATAGCTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 + chr2L 14038404 5' + 3S18 5810 2 69.31 ACACCAATGGCCAAAAACCNACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 15412685 5' + hobo 40 1 63.37 AAAGAAGTTTACGCCTATCTTATGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:2 - chr2L 15907239 5' + pogo 13 1 66.34 GATAGGCTTTTACTTAAATTTCATGACGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3R 4191184 5' + 1360 17 1 63.37 AAATAAATATAAAAATTATTGTAATAGTTTTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGAT:1 + chr3R 25844280 5' - Stalker4 398 1 66.34 AGGTAAACATGATTTTTGGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:2 - chr2L 12199535 5' + Stalker2 17 2 58.42 AAAACATTTTCGTGTTATTTCTGTGTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGAT:1 + chrX 10119539 5' - FB 27 1 70.30 TATTTATTTGTGTAAGTATAAAAATTATAATAGCATTTATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTT:1 + chrX 22576332 5' - Burdock 6290 2 53.47 AAAAGGAGGCAGCAGCAGGNGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2R 18105752 5' - roo 9037 1 60.40 GCTTTTATTATTATGACTTGCTTCCCCACCTTCTTTTGGGGGGGGAGAACACAAAAAAACAAAAACAATGAA:1 + chr2R 23797889 5' + transib2 2641 1 84.72 ACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGAAATAGGTAAACAATGAGGAAACTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 - chr3L 9762231 5' + jockey 4704 1 51.49 ATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr2R 6041560 5' + opus 144 4 61.39 TTAGTTTGGTCAACACTCAAAACTACTGGCTTGATTATATATAAGAACTAAAATGTTATTTCAAGATTTCATTTAATCTCTCAATTAAGGTTTTTCTTCTC:1 - chr2L 15174203 5' + Juan 4025 1 77.23 ACAATTTTTATACAAAAGTNGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 + chr3L 12983188 5' + diver 5933 2 67.33 CCTTCGCGTGTTTTCTTTGACCTGATTCAGTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCTCACCCTACACTTTTGTGTGCGGG:1 + chrX 6417593 5' + hobo 43 1 61.39 GATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2L 19207939 5' + 412 7085 2 54.46 TAGAGGCGAACGACGAGTCCGAGCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGTTGTGAAATGATAATGATAATGAATTCT:1 - chr2R 6075808 5' + accord2 7502 2 73.27 GGAAAAATAATGGCCACCTTTGACCGTTTTTAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAAC:1 - chr3R 25935221 5' + gypsy7 270 1 70.30 AGCTTATTCCAGACCAAGCTTGATCAAATGCAAAATCTGGTCAAAGTCATTGCAAAGGAGCGTGCCTTTGCCGTTGAGGCATACTTTTCAAGCGGATGCTC:1 + chr3R 12012139 5' + mariner2 174 1 63.37 GCTAGGTCTAACTTCTTCANTGTGTGTGTGTGTGTGATTACCTTAATGGTTTTTTTAAGCTTGACAGGCTGAATATTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 - chr3L 15831342 5' + 412 2 2 71.29 AGCAAATTAAGTCCCAAGGGGGTAGGTAAGCCTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTAGCC:1 - chrX 22713796 5' + 1360 43 1 67.33 AGAAACCAAGGATCCAGCANACAGCAGCCACAGCCTTCGATTCAAGTTGTTTGCCCTCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 - chr3R 9825192 5' + Doc 24 1 54.46 ACCAAGTACCATTTTCACATTGCATACAAATAAATTTACAAAGATAAAGAGTAACAATTATTAATTATTAAAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGT:1 + chr2R 8078501 5' + P-element 356 1 75.25 AGTGACGAAAGTGGAGGGTTTTTTTTTGGCAAATTTT:1 + chr3L 11673278 5' + Tc1 269 1 56.76 AGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTAC:1 + chr3L 20224134 5' - Chimpo 171 1 64.36 TATATACTTATATATTCATACACCATATATCCAAAATTTTCAAGTGAAATACCTCAAGTATTTTCAGAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3R 20599697 5' - opus 7494 2 72.28 TTTAAATTAATGTTACAAAAATTAAATGCTCATAAATAAGACAAAATTTTAAAAATGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTT:1 - chr2L 14537050 5' - INE-1 344 1 63.37 TCGGTTGTGCGAGTGGTTTAGTGTGTGAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr3R 13685167 5' - Tirant 354 2 72.28 GGTGCGAATAACTCCATAAATTATATGTGTGTCCAAGCGATGATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3R 25950077 5' - 412 7523 2 56.44 AAAAGTGAAATTACTCAATTGGTTGGTGATTATTTATTTTATGTCTGTATTTTCACGCATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 + chrX 3691512 5' - jockey 4977 1 46.53 GTGGCGAGTGTATTACACTGTGGAGCAAAATAGCAGAACCGGGAGACCAGATAGGCGAATTGTTCAAACAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCC:2 - chr2L 3937818 5' + Burdock 6139 2 76.24 GGTGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3L 6866180 5' + 412 40 2 68.32 GTTCGTGAATTTTTTTTTCCACTCTTTGTTTTCGTCTATTCTCACGTTCATCAATTTGATATTTTACAAAAACAGAACGGAAACGAGGAAATGAATATAAT:1 - chr3R 1845882 5' - Cr1a 4332 1 76.24 AACGGAAACGAAAGAAACGGAAAGCAGTATCGAAACGAAGAGTATTTGTATGGTGAACGATAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAG:1 + chrX 16503775 5' + Doc 487 1 66.34 CAGTGTGAGCATGGTGCGAATAACTCCATAAATTATATGTGTGTCCAAGCGATGATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTC:1 + chr3R 25950065 5' - 412 482 2 68.32 GAAATCTTTAAATCCCACGGATTTATGCATTTTTACGTTGCATTTTCTTTTCCACGGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr3R 12906615 5' - hopper 1398 1 64.36 TTAGTTCCCCCCTATAGTTTCATGCCAAACGGAACCTACATTGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr2R 11661090 5' + 1360 31 1 60.40 ACATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr2R 11941215 5' + Doc 48 1 51.49 AACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACAT:1 + chr2L 16456782 5' - BS 5056 1 64.84 GTAACCAGTGTATGTCTGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACA:1 + chr3L 21912235 5' + Bari1 6 1 74.26 GCAACTGGCCATATTCTATTCTCATTCACTCCATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:2 + chr2L 2309390 5' - Burdock 218 2 63.37 TTAAAGGTGCATTACGTTGCTTTCTTTTTCATTCGGTAAAGAAGGGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 - chr2L 4764090 5' - Tabor 455 2 56.44 AGTTATTTGTTTCAAAAGAAAAAAAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAAT:1 + chr2R 2864469 5' - pogo 1877 1 76.24 ATAACGCCGCTGACATCCACGCTTAATAATATCCCTTTCGCGTTGGAAAAACAAAAGCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGCCTTTACTCGT:1 + chr3L 949259 5' - roo 398 1 66.32 GGATTTCTTGTGAACATTTATGCATCTAGAAGATGGGCATTGAACGCACCTCACACAAAAACTATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGG:1 - chr3L 1258083 5' - Quasimodo 7364 2 73.27 GGGCTTATCTTTTGCATTCACAATAAAAGGAGGCAGCAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 18105728 5' - roo 398 1 66.34 AAATAAATGTTAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 + chr3L 22112609 5' + Doc 13 1 71.29 GAATGTTTCAGCTTAGCATNCAAATAAATAACCAGCACAACAACCCCCACACACACACACACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTAT:1 + chr2L 8607092 5' + accord 7135 2 65.35 TCGGGAGTACTGGGTGCAAAATGATTTTCACATGTTTTCCTTTATTTTCCCCTTGTGCATTTGTAACCTTTCTAGTCGATTTTTAATTAAATTTTTTTTTT:1 - chrX 14696228 5' - Tc1 387 1 62.38 AAGATATAAAATTATTGAGTGCCATTAGATTAGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2R 16680133 5' + 412 7098 2 72.28 AGCTGCAGCTGGTGGAGTCACAAGTTTCATCACGAACACTATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chrX 1762935 5' + jockey 4705 1 59.41 GTTTAGCCCTCGGAAGCAGTAAACCATGAATAAAGCTGCTCCACTGGCCAACGACTGCGGCAACTGGCTGTGACGATGCTAATAGAACTCAACTGTATTCT:1 - chr2R 7521622 5' + diver 75 2 77.23 GAATCAAATATTATTGTTTATGGCCTTGATTTGCACAAGTATTACACTAATAAATTGTTCACTTTTCGCGTGTCACTAAATGTTTATTGTTGCCGCGGCTT:1 + chr3L 10342952 5' - HeT-A 163 1 75.25 AAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chr2R 13194671 5' - roo 9021 2 77.23 GAGCAAGTTTTACAGAATAAAAATTTAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGG:1 - chr3L 23753306 5' - blood 7147 2 66.34 GCTGCAAAGTTCAAAAACTAAGCTAAAATGTTTTTTGTCGATTCTGGTAAATTAATCCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr3R 10648260 5' + I-element 17 1 61.39 TTTCTAAGCTTTAAATTGACGCTAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATT:1 - chr3L 12983222 5' - diver 171 2 76.24 AAGTGTAGCCAGCATTGCAGCGCTAAACATGCAAAGTGCACAAGTGCTGATAGCTGTGTGTGTGTGTTTCTCAATGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 24484715 5' + roo 4 2 76.24 GTGACTTTTCAAATTGTTTTTGGTAAGTCAATGAGCGTTTAAGGCATTCCCTGGATATTGTCGGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2L 21127188 5' - 1360 3375 1 79.21 AGTGACGCGCATGAATGGANTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACGCGCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 2 1 56.44 TGTTCGAGTGTGTGCGTCTGTCTACACGTGCCACGCAGCGTGAGGTGAAAGGAGAAAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr2L 18413916 5' - hopper 1398 1 60.40 AATCGGGCACAAGCGCTGACATAGAGCGATGAGGAAAATGGAGAACGGAGAATGGAGTGCGACTTGGCATCACATCCTGCTCACCGATGAATTACTTTGAC:1 - chr3R 9208710 5' + Rt1a 4901 1 56.44 TCTCTGATAACGAAGAGGGTGATTCTTTTTTCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 2845795 5' - roo 9026 1 72.28 AGCTCAAGGTTCCCCAGTCNCTTAATCATGGTGAGATGACGCAGATTCCTGCCAATCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCAC:1 + chr2L 3374346 5' + R1A1-element 4925 1 57.00 GTCACTGATTGATATGTATCAATACATATTAAGTTTATATTTTCCTTGAATTTGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTTTTTATTCTTGTTTTCACTTTG:1 - chr3R 20585963 5' - gypsy4 496 1 57.43 ATGCGGGTTCCTAGGGGATAAAAAAGCTGCACCTCATCGATAATTCCCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 - chr2R 6042959 5' + opus 7073 4 62.38 GCGCCAAAAAGTATGCAAGTAATTTTTTACAAGCGCCTCCACAGTACATTACTTGCAGGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 + chr3R 8460842 5' + BS 11 1 61.39 GGAGAGGAGATACAAGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3L 15435527 5' + blood 27 2 55.45 AATTGAGTTAAATAAAAGAACAAAAACGTGGCACGAACAACTTTTCAAAAAATGCGTGGTACATTGTGTAAGAAGACGGTTTTCTGGCCGAAATCAATTCT:1 + chr3R 17424162 5' - 1360 3182 1 66.34 GAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGC:1 + chr2R 12185338 5' - accord 7347 2 64.00 AAACTTTCTTGAATTATGATTGTGAGTATATGGTTTGTGGAGTTTAAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2L 12076649 5' + jockey 37 1 55.45 GTCCTGGTCCTCGTCCTTGATGGGTGTCCAGGACTTGAGGTAGCCCGTGCACTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACAT:1 - chr3L 9826694 5' - R1A1-element 5196 1 57.43 TTTTATCGGACAGGAGAACTGGAAAACAGTAAATGCAGTAAAATGGTAGCTTTCCTTGGGAGTGTCGGATTGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGCGA:1 - chr2L 19872968 5' + Rt1c 5236 1 70.30 TTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 28628087 5' + 1360 53 1 78.22 GGGCAGGATTTGCCAAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 3428062 5' - roo 9033 1 66.34 TTAATATATGTACAGTAAATAAGTGAGTAATATAGTATAAACTGTTGAAATACTTCTTAAAGTCATAACCCCACCAGCCCAGTCGACATCTTGCATATAGT:1 + chr2L 8690375 5' - Tirant 492 1 70.30 ATCTTTTCTTATCAGAGGTGACACAATGCCGATTCGGCGTTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 - chr3L 12903877 5' + Doc 52 1 68.32 GTGGGAGTGCTATAAATATATTAAAACAAATTTTCGGCAATTTAAGAGAAATTAGCAGGACATTAGTAGATATTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 - chr3L 37105 5' - HeT-A 6058 2 76.24 ATTTTCCGGCCTGCCCATCGCGTAATTGCAAAGTTGCAACTTGCAACTTGTTGCCATCGCTCGTTTATTAATTGCTTTTTTTTAATCCAATATTAATGTAT:1 + chr3L 10284778 5' + Juan 3797 1 77.23 GCATCCCCAGCTACATTTCCAGCGGCATTTGCAACATCTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 30252343 5' + 412 7090 2 60.40 AACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCC:1 - chr3R 10736114 5' + McClintock 31 2 63.37 GATTACTGGGCACTCTGATCATGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCG:1 - chr2L 18602131 5' - Quasimodo 237 2 78.22 GTGGATCAGATAAGTTTCACTGTACGCGGCGGGGGTAAAATTCTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chrX 15268304 5' + roo 33 2 60.40 GTGGATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 19207942 5' + 412 7082 2 51.49 GTTGTTATTAATGCAACCTTCACTTTGTATTTAATAACAACTCTAAATGCTCTGTTTTCCTTAAGCTGGTATGTGTGGTACTTCACACAATCATTACTAAG:1 - chr3L 3124761 5' - G4 326 1 72.28 AGGGCGTTAGTCGCTGGTGCATCCCGTGCCAGTGGATCGTCGTCGTCTCGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTT:1 + chrX 17854488 5' - Quasimodo 6973 2 56.70 AGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:2 - chr2L 16939873 5' + opus 149 4 64.36 AGAGCGGTATCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAATCAACCGGGAAGA:1 - chr3R 4773394 5' + Tirant 47 2 70.30 ACTATAACTTACGATTTGTCTGTCGTTTTCTCTTTCAAATTTATTTTCAACGCCCTCTTACAAGATTAATATCGGTTAACTGATAGTCAGGAAATTCGACT:1 + chr2R 4711341 5' + INE-1 562 1 58.42 GGCTTATCTTTTGCATTCACAATAAAAGGAGGCAGCAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 18105729 5' - roo 397 1 65.35 CCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAAT:1 - chrX 22824234 5' - Gypsy12A_LTR 2259 1 52.48 GAGTACTTATACAAGTACTTTACGCCCCCAACTTGGCCCAATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 15412741 5' - hobo 2905 1 59.41 TGAGGCAATATACCCAAAGACAAGTGGTCACCCAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTA:1 + chr3L 20688435 5' - roo 35 2 68.32 GTGCGTGACAAACGGGCGAGATCGGCGTTGTTTTTGTGGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 6437562 5' + 412 7092 2 62.38 ATAAAGTAAAACAGATAAGAGACAAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGT:1 - chr3R 26124925 5' - roo 8780 2 76.24 GTCGGGGTTTAAATTTGTAGAAATAGGACCAATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTTAACCCTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCAT:1 + chr3L 23035288 5' - INE-1 139 1 71.29 GAAAAATATGCTAGGAAATGCAAAAGCGAAACAAGAGCACAAACATCAAGGCACAACTCTATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTCAT:1 + chr3L 11214665 5' - accord 7027 2 69.79 TGGGGGAGTGGAGAAGAGGTCGTGGCACTGCCTGATGAATATGTTGAAATCAATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 15117681 5' + roo 8687 2 56.44 AAATGAAGCGAGTGCACAGTTCAAACTGGGTAGTCTCATCTTTGGGCATCCGAAAGGGTGCGCTTTCGTAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCC:1 - chr2R 11304337 5' + F-element 4389 1 72.28 GTTACGCCGACGCGGTAGAGAGTGATGCCGAGTATAAAAGTAATTCAGATCCAACATATACCATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr2L 22490466 5' - flea 5002 2 70.00 GTAAGCAAACAAAACTGATGGAAGATAATCTACTTGAAGCATACTTTAAGGCGTATCTAACGGTCCTTTTAATGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 + chrX 12378655 5' + hobo 2710 1 78.22 TCTGTGTTGGATAACCTACCCCAATCTCTCTATCGAAATATCTCTGGAAATTTGTGCAGCCACAGATGCAATTAAATGTGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 + chr3L 5403208 5' + copia 4871 2 77.23 TATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAG:1 - chr2R 1751256 5' + X-element 4405 1 66.32 TTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTT:1 - chr3L 10795198 5' - Quasimodo 309 2 77.23 ACTCCGAGTGCGAACTCATTGGATTTGGGGTGGTTATGCACTCACTCACTCTCCGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chr2R 8232556 5' + P-element 16 1 58.95 ATGACTTCCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:2 + chr2L 20271217 5' + blood 38 2 62.38 TGCCACCACTGTGTGCCACNACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2R 19557996 5' + 412 7102 2 72.28 TAGCAAAATCTTCAAAAATTAATCGTTTTAAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTT:1 + chr3L 5432575 5' - jockey 150 1 70.30 GGAGGGGCGCATGAATGGAGGGGAGTTGACTTGTGGTCAGGGTGCACGGGCTTGGAACTGGAACTGGTCTGGTGGCAGTGTCATAAGCCTCAAGTGCTATT:1 + chr2L 13699552 5' + Burdock 6169 2 50.50 GACAGCACTGAGAAAAATCAAACTTAATAGCCTTAAATCTATGCATTAAATTGCTTCAGAAGTTTAAGAACTATATTTCATTATATAAAGTAAAGTAAAGT:1 - chrX 16856827 5' + TART-A 13105 1 80.20 GGATTATACGTATATCAATGGATATCTGGACGAGATAGAAAGATTTGTTTTTTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:2 + chr3L 16478366 5' - pogo 2081 1 51.49 TAAAAATTGAGGTACTAAGATCTCGACGTGCATACGGATGATCCTGATCTAGAATATATCAACTTTATGGAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTATAC:1 + chr3R 18377335 5' - INE-1 30 1 65.35 GGGATGTTGTTCATGAATTTTCAAGATATCAGCACTTTAAGCCAATATGATTTGGAATATACATGTAAGTTTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 - chr2R 8707106 5' - flea 4998 2 60.00 AAAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr2L 18297881 5' + hobo 48 1 71.29 GTTATAAACACTTCATATTGATCCGATATCGATCTTTAATGCTGAAGAGGCTTAACATTTAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2R 18105834 5' + roo 8680 2 63.37 ATTTTCCTCTGGCTGATTCGTTTCAATTTCATGTATTGTAAAAGATCGTAACGTAGAATAAAAGGGTATACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 + chrX 22781765 5' + INE-1 21 1 72.28 GGCCAAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2R 13194675 5' - roo 361 2 73.27 TGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCATACTACATCTATACCTGTTACATTTTAAAACTATTACATGGCGACCGTGACT:1 + chrX 21852454 5' + Stalker 400 1 58.42 ACGTGTGTTAGTATATAAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chrX 13268907 5' - 1360 3335 1 80.20 ATGTCACAAAGAGGTAAGCGCGGTAATCAGCAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTT:1 - chr3L 198566 5' - HMS-Beagle2 152 2 68.32 AGATGCGATCCAGGTCCACCAGCTGCTTCTTTTTTTTTGGCCCTCTGCGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCA:1 + chr2R 19870555 5' + G2 133 1 52.48 TGTCAACAGCAAATGCCGTGGCTACCGCAATGAGGGAACTAGCCAACAGCACTATCCCTCGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGG:1 - chr2L 13200546 5' - opus 7127 2 72.28 GGAAAAAACTATTTTAATGTTTATATAAAAAGAAATGAAACTGACATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:1 - chr2L 21220817 5' - I-element 5312 1 65.35 GCGAAAGTGATCCTTTCATCGGACTTTTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATT:1 + chr3R 11498613 5' - BS 5044 1 75.25 TACACTATGCAATAATGTGGTGCTTTTAATACAATACATCTCTAGATATAAGAACAGATCACGGCGCAGAAGAGTTCCTCGACTAACAGATACCCGTTACT:1 + chr2L 14381364 5' - INE-1 550 1 51.49 TAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTT:2 + chr3R 19950451 5' + BS 5015 1 53.47 GGTTTCGGCAGCGACGACCNGTTTATCGCCAATAATTAAGTTTGTATAAACGGACTTGATTAATTCCAAATAGAAACTAGCTATTTCACCATTTATCTTCA:1 + chr2R 11931621 5' - copia 331 1 91.09 TTAAGCAGCGATTATCCTGNCCCTGTTCCGGCCTAACCACTCCACCCACTACCATCCACTTCCCCCGAATCCACTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGC:1 + chrX 14713426 5' + accord 45 2 58.42 GGTCGTGCGTAAAGTTTGGAAAGTGGTGGCGCGCGCGAGCAGGGAAATATCAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr3R 31887372 5' - jockey 4962 1 53.47 AATGCAAATAATGGGAAATTGTTGCTATTCAGCACTGAAACTGCTTTTACGATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTG:1 - chr2L 21777029 5' + Ivk 194 1 53.47 TTGGCAATAATAATTTCAAAATTACAAATTCACAAACCGAGGTGCAGACATTGCGCATAATTTCGCGTACGTTTTGTGAATTTGTAATTTTGAAATTATTA:1 - chr2L 16438630 5' - P-element 2508 1 67.33 AAGGTTTTCGTTGTTATTGGTTAGCCGAGATTAGCGTTTCCATTTTCCGCTTTTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAT:1 - chrX 16372551 5' - F-element 13 1 58.42 TTTTGTTTGCCAAAGATGTCAACACATATCGGTCACCATCAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAGATC:1 + chr2R 1370345 5' + Bari1 1589 1 60.40 GCATCGTTTCCACATCACAAAACAGGCGGCGAAAACGCTTCCCAATCCCCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTAT:1 - chrX 8729394 5' - R2-element 3395 1 54.46 TTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 15268253 5' - roo 360 2 74.26 ATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3R 12115271 5' + 1360 23 1 51.49 TACCTTGGTCTCTAATTGANCTGCTTAAGTCGCTTATCCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 3428007 5' + roo 8703 2 61.39 GAGAAAGAGAAGCCGAAGCAAAGAAAAGAGCACCAAAGCGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATG:1 + chr2R 17794369 5' + 1360 3351 1 65.35 TGAAAATGCCCAACTAAGTCAAAAACTAAAGACAAACAGCACTATTTGGCCAACACAAAAAAAAAGTCGTATGAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCC:1 + chr3L 9984895 5' + FB 797 3 77.23 AGTGTCCAAAATTGTCCTTCCTAAAATAGCATCGAAACCTATATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTT:1 - chr3L 24151960 5' + Idefix 312 2 58.42 TATTTTCCAACCTGTAGTCGATTGCATGACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 28475854 5' - roo 9035 1 68.13 TGCATGTGAAAATGGTACATAATGTCGTTAATTGCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAA:2 + chr3L 22112816 5' - diver 206 1 59.41 TGGAGATCCTCCAGAGAGTNGACAGCGCTTCAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTT:1 + chr2R 14847687 5' - R2-element 3415 1 69.31 GCCGCGAAATATTTTTGGAATTGCTTCACTCGAAATAAACGCTAGTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1 - chr2R 20588832 5' - Tabor 7290 2 56.44 ATAAAGTATACCTTGCCGATCGAAAAGGAATACCGTACACCTTTTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 + chr3R 4536157 5' + Ivk 2 1 77.00 AAAGTAGGCTACTTAACAANGTCAATGAACGTAATAATTATACTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2L 18077455 5' + hobo 30 1 53.47 AAGTTGATCACCAATTGGTCGCAAAAGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr3R 6190289 5' + copia 4918 2 75.25 ACTTTGGGGTATGATGATTTGGGTACTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 + chr3R 30611256 5' - blood 7339 1 78.22 AAAGGGGCCAGTCAGAGAAGCAAACATGAAAAATAAACCCAAAATCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTG:1 + chr2R 16727625 5' - 297 6819 2 56.44 AAACCCGAAGAACCCGGTGAAAGATTCCAGAACCGAGAGGCAAACGCCAAAAACCACAATTAAAATGCAACATGGTTTTTTTCCCGTGTGTCATTATGGTC:1 + chr3R 26012515 5' - baggins 5091 1 69.31 GGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGA:1 + chr4 123985 5' + HB 112 1 58.42 TAAACTTTTTATTTTTTATTATGTCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:2 + chr3R 13544095 5' + roo 51 2 80.20 GATTTTTCCTACTAAAGATAGATAAAAACCTATTGATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTT:1 + chrX 16237907 5' - mdg3 208 2 59.41 TTAACCAAGTTTAGGAAAACGGTACTTGTACCTTGGAGTAGAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chrX 10996520 5' + 1360 29 1 56.44 ATGAATATGTCAATTTTCGGATGAGGTCTTTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAAT:1 - chr2R 22541038 5' - Doc 4364 1 71.29 TGCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACT:1 + chr3L 22112848 5' - 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invader4 2769 2 77.23 TTTGCTGGGGATTTTCCCCTGTTGCATGTCCCACTTTGTTGTACCGGTGCAACATGGCGTATAAGCGATTGTATTGTGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1 + chr3L 3489983 5' - jockey 4982 1 76.24 TGTCAAGAAGCTGCTGACCAACTCCAAATGGATATCGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGA:1 + chr2R 17791889 5' - accord 7129 2 65.35 TTTCGATGAGTATGTTTATACTTGCAAACGTTAACACCTGATTCTTGCATAATCCCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGG:1 + chr2L 22322321 5' - Gypsy6A_LTR 353 1 59.00 AGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAG:1 + chr4 123977 5' + HB 103 1 50.00 GCAGTTGCTGCAGATGCGCCCGCATCTTCAGGCCAATCTTTCCGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAAC:1 - chr3R 23898931 5' + jockey 475 1 58.42 TTACCGCGCAACACCCACTTGGCTTCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGATTTTAGTGAAGTAAATAGTTGAGTACGTTCGAAGTTTGTGCAACTTGGATGT:1 - chr3R 2206767 5' - HMS-Beagle 6630 1 68.32 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATG:1 - chr3L 6630130 5' - 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jockey 4627 1 71.29 TTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3R 7869123 5' + 297 6615 2 61.22 AAGCAAAATCAAAGCTGCANGCTTGAGACATACTATTCAGAGATAGGAAATTATATTTATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGT:1 - chr2R 19330365 5' - McClintock 6413 2 61.39 TATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 22112642 5' + Doc 46 1 67.33 AGGAAATGGATTTTGCATGAGTAAAGTTAGGGAAATCGTTTCTCATTGCGAATTCGGGTCAGTGGGTATACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGA:1 - chr3R 19189307 5' - 297 103 2 70.30 TACTTTAATATTTTGGAGAGAGTACACATAAAAGACATATTCAAAAGACCGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 - chr2R 18077115 5' + Transpac 4943 2 53.47 TTAGTAACTTAAGTTCTTTTAGTTTTATACATAAGAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2L 1432096 5' + opus 7150 4 75.25 TGAAGTTTCCAGTACGGTTAGTTGCAATTGACCTGTCATATCTTTTACTACATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3R 23683367 5' + 297 19 2 59.41 TGAATATGCACATTTTTTANAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGC:1 - chr2R 11661140 5' - 1360 3339 1 77.23 AATGTATCTCATAGATACACAAGTTACAAGTTGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chr3L 11657894 5' + Tabor 6883 2 67.33 GAGCACCGACTGCCGGCACAAAATTGAATTGATAGCAGCATGAGTTGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCG:1 - chrX 18032260 5' - F-element 243 1 54.46 GGCAAAGATCTGTAGTCATCAATAAACCATCCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTC:1 - chr2R 19192374 5' + G6 1979 1 70.30 AGCATGCATTTAGGCGCTCTGCGGTTTGACAGCCGCCCGCCTGCAGCCTCTCTCGTTGCTTTGGTGTGCGTGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3L 13557147 5' + hobo 7 1 71.29 AAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCAT:1 - chr3R 3268034 5' + mariner2 114 1 72.28 AAGCCGCTTAAGTTCTCTTTTTCATTTGTACTCTTTTTCCCGCACATTTCGAGGACCTGTTTATTTTTATCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGAC:1 + chrX 446436 5' - F-element 4518 1 72.28 GCCTTCGTCCTTTGCCTTCGATGATGCTGCGCTTTCGGTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAA:1 - chr2L 18101015 5' - R2-element 3363 1 62.00 TACCCTAGCCTGGTGTATACCCTTTCTCCAGGGCGGGTCATAATAGTTTTGTATAAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3R 10957299 5' + blood 22 2 57.43 AAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATC:1 + chr2R 5284567 5' - Doc4-element 2609 1 57.43 CGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGAGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 - chr3R 9858886 5' + BS 45 1 72.00 TTAAAATTTAAATTTTAACTTGTCCACCCCAATCACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2L 1136412 5' + 1360 6 2 71.00 ATATTTAAAACATTTATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chrX 21581102 5' + 297 30 2 57.43 AAGCCTTCCACCGCTGGCTTTATCTTCGTCACATAGCCAATAATTAATTTTTGGCTGCTCAGGTTGTAAAACCTGGCAGCAATTTTTATAAAAGCAGACCA:1 + chr3R 9754529 5' - Cr1a 451 1 73.27 ATTTAGACACTGTAGTACANTACTAAAACATAAATATAACCACCAATGCAACAACAATAATGCAATGCCCATAAAATATAAAATAAATATTGTTTAATTAT:1 + chr3R 10220407 5' + S-element 1607 2 75.25 ATGAAAGCACATGAATTGCCCAGTAATATTTGTATGTAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr2L 8967015 5' + 297 6605 2 69.23 ATAAAACCGACGTTGGCCATCCCTTTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTT:1 + chr2L 20714943 5' - F-element 4383 1 75.25 CGGGCAGGATTTGCCAAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 3428063 5' - roo 9034 1 65.35 GACGGCGGTGGCTTTAAGATACCCTAGGATGCCAAATGCAAACTTACTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:2 + chr2R 17123556 5' - mdg1 392 2 55.45 ATGGAGGCGGCGCCCCCAATTGCTGGCATGTAAGTTGTTTTACTTCAAATTTTAGTTATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 11758349 5' - roo 9054 2 56.44 AGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCTAGAAGACGATTT:1 - chr2L 21643131 5' - 1360 3201 1 74.51 GTTGATATGATCCTCGTATATGGAGTTCGATTGCATGACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 9542509 5' - roo 9034 1 62.38 ATAAATATATTAAAACAAANTTTCGGCAATTTAAGAGAAATTAGCAGGACATTAGTAGATATTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 - chr3L 37305 5' - TAHRE 10417 1 65.00 GTGATCCCTCTACATGCTTTTAGCTTCACGATTACACACATTTATATGTACATACATATTCAACAATTATTTCATTTTTATTAATTTTGTCCCTTATAAAA:1 + chr3R 8836287 5' + frogger 354 1 63.37 ACATCGGACATAGCAACTATGACTAGACTGAGCGGACAAGGCAATAAGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chr3R 26434111 5' - hobo 2910 1 54.46 GCCCAAAAGTATGCAGCGAAAAAGGTGTCAACTGCATTACTCATCAGATTGATTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 - chrX 19640832 5' - BS 5069 1 48.51 TTTATGGTAAACTGAACATAATAAAAACCATCGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATAT:1 + chr2L 8008065 5' - copia 4962 2 72.28 TACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGT:1 - chr3L 19350008 5' + 1360 3217 1 41.58 AAAAGCGTAAAGTATGCTTGCGATATAAATTATCTTTGCTTGAAACCATGTAAAGTATATATAAATATATTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTGG:1 - chr2R 1594655 5' + INE-1 99 1 57.43 ACGATGTGCCTACATGCCCAGCTGTGCGCGAGTATTTGTGTTTGCGTTCGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAT:1 + chr3R 13605174 5' - accord 7100 2 79.80 ATTCCATGGAGGACGCTCGNTGACAAACAGTCGAGATGTGTTTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAATTTATATT:1 - chr3R 11840628 5' + copia 4905 2 59.41 ACTCCTCTTCCCCTTGGTTGCGCTTATTTTCAGTAAGTTTCGCCTTTGTTTTGTCATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr3L 13367675 5' - mdg3 227 2 58.42 AATGGGGCATATTGCCACATGGCCAATTACCGCTTTATGAGGGTGGATCAGCAGTATCTCAGCGGGATACCACAGATAATAGTCTTTAATATTTGTAATTT:1 - chr3L 1320906 5' + gypsy7 5094 1 71.29 GTTGAACAAGTTTTCAAAANTTGTGCTCTGCCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATC:1 - chr3L 3328967 5' + G2 2680 1 69.00 CGGCTGACCAATTGTGTTGNATACTTTTTAGCTCTCTTCTAAAAACGGTCAAATATAATTTCTAGCGATTTTATATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 19253939 5' + jockey 10 1 61.39 TAGCAGGGGGTGTGGCCGGTGGCAAAGGGCACAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 6338894 5' - P-element 2842 1 32.67 GGCCAACTCCCACACACAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAA:1 - chrX 4540393 5' + Doc2-element 233 4 92.31 AACAAAACCCACGAAAAGAGACCAAGCTGCACACAGATGCACTCCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr2R 12096564 5' - hobo 2908 1 57.43 AAAAAGTTTGGCCAAAACGGATGCGTCAAGTTGAATGGCTATAAAAGCGTTGAATGATGTTGCGTTGATGATGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCA:1 - chr3R 11855847 5' + 412 7167 2 79.21 GGAGAAGAGATAGAGATAGCCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr2R 7024972 5' + P-element 54 1 25.74 ATATAAAAATAAAAATAATACGGAAGATTAAGTGAGAGAGGCGTTTGCGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 18988416 5' - hobo 2911 1 49.50 GTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAGAAAACATTATTCTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chrX 23211130 5' - roo 410 1 77.23 TCACAGAGCATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACA:1 + chr3R 5773139 5' + Stalker 14 4 66.00 AGCCTTGTCACTTTCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGA:1 + chrX 3016659 5' + diver 50 2 72.28 TACGGGGCCCAAATAAGATGGCTAAAGGGTTTCCTTTTTAGCTGACACCAAAATTTTCCACTCTTTGTTCGCGGCGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATAC:1 - chr2R 16197258 5' + accord 336 2 78.22 ATGGCTGCGGTCACGATCTTTGGTTTGTTCAGCTTCAGCAGATTCGTCTCCAGTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTC:1 - chr3R 8292877 5' - R1A1-element 4927 1 64.13 TGAGAATGACTTCCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr2L 20271212 5' + blood 7044 2 57.43 TATTTAATTTGAATTTAATTATGCGTTTCTGGTTTCGTTTTTTTTTCATTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 - chr2L 20174786 5' - flea 232 2 56.44 ATTATGGCAAGAATAAAATATAAAGTCTAAAAGTATGCTGCAATATGAGTATACTCCATGCTATTAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr2L 3740631 5' + hobo 12 1 52.48 AGGTCATTCCCCTTGAAGGAATGAACAACACCTACCCTGGAGGACCCAATGCAATCGATTCTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCC:1 + chr2L 13226806 5' + blood 7322 1 65.35 AGGTTAAGTTCGCGCCTTTCTATGCGCTTCTCAACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTT:1 + chr2L 10569044 5' - micropia 5258 2 73.27 GATATTTAATTATTTGAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGATCTACAATTCTATTTTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGT:1 + chrX 5711584 5' + F-element 4262 1 80.20 AAAAGAGACCAAGCTGCACACAGATGCACTCCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr2R 12096577 5' - hobo 2895 1 70.30 TATCCTCAACTAGACCAGAACTAATTTAGTTATCTATTAAAAACATTTGGTTGCTTTCATTTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATA:1 + chr3L 19944207 5' + Juan 4049 1 55.45 AGTTTAATGAATTAATTTTGCTTTCCAAAATGGTTTATTTCGCTTTACTGAGGCTGCACTGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACT:1 - chr3L 11656337 5' - Gypsy6A_LTR 272 1 42.57 TTTTTGGGAAAATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCC:1 - chrX 158250 5' + INE-1 87 1 75.25 GTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 19450173 5' + roo 42 2 62.38 GAAAAACCCACTTAAGTATGCAATGCTAAAAATTCAAAAGCGAGTCGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 28728649 5' + hobo 29 1 51.49 AAAGACCGAATGAGAATGGAAGAATAGGACGAAAATCGCAACTATCCCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3L 16807712 5' - P-element 2860 1 53.47 TTTGAGGATCCGGTTCATCAGCACTCGTCGTCCCTCAGGCGTCGACATCCTAGCATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTA:1 - chr2R 16099256 5' - invader2 4796 1 56.44 TTTTTGATATTTTAAAGTTTCGTACTGTACTTTTCGATCGAAATTTCGCTTAGTTGGTCCACTGTATCTGCGCTATGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCC:1 + chr2L 18500269 5' + Tirant 8105 1 77.23 ACGCCTGAAAGTATGCAGANAAATCCAACCTTTTGTTTTTTCTTTCATCTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 + chr2R 18687767 5' - jockey 4971 1 57.43 AGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr3L 22112648 5' + Doc 52 1 73.27 GTCACAGTTTCGCTTTTTGTTTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2R 13194642 5' + roo 53 2 80.20 ATTAACAGCCGCTGTTACGGCAACGGTCAGATGATGTTCCAATTGGAGTGCGAACGGACGTGTGGTGCTAAACTTTCTCAAATAATAAAAAAAAAGAATAA:2 - chr2R 6715892 5' + BS 5098 2 69.31 TAAAGGGGAAATTTCGATTTCGTGTTGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACTTCCCCGTATGCCTT:1 - chr2R 24589167 5' + X-element 4694 1 74.26 AAATAACAGACGAAAGACAAAATATAGAATTAAGATAGGCATTCCAATTATGACATCACAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr3R 10434539 5' + 1360 16 1 64.36 GAAAGCTAGCTTGGAAATAAAATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3L 11475511 5' + roo 54 2 84.16 AAATCACATTAGCATAAAGTAGGCTACTTAACAAAGTCAATGAACGTAATAATTATACTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr2L 18077470 5' + hobo 15 1 64.36 GGGAGAATGAACTGAGAAAGCTATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCC:1 - chr3R 24260482 5' - micropia 5171 1 79.21 AGCCTGCGGCGAGTTTGTGGGCGTTGAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACAC:1 - chr2L 10065651 5' + G2 2966 1 74.26 TGCGGCACTCGAGTACTTATACAAGTACTTTACGCCCCCAACTTGGCCCAATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chrX 15412751 5' - hobo 2915 1 56.44 ACAATTTGTTAGTTTAGCACGTCGGGCAAGTATAGCAAGTATAACAGACTGAGGGACAGACGGATGGACAGTGCCAGATCGACTTGGCTATTGATCCTCAT:1 - chr2L 21727803 5' - INE-1 93 1 60.40 TGAAACGGGCCCATGGCATTATGACCTCTGTTACGTAACTTGGATGTTGTGTTCTGGCAGCCAAAGTATGGAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAG:1 + chrX 19458326 5' + Doc2-element 51 1 76.60 AAAGTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 + chr2L 15817952 5' + I-element 17 1 64.36 TACATGCACACACGCCTTCGGTTGTGCGAGTGGTTTAGTGTGTGAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGT:1 + chr3R 13685150 5' - Tirant 371 2 55.45 AAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 13446659 5' - 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chr2L 6207139 5' + INE-1 28 1 77.23 ATGTTGTTCAATAAATTTAAATATTTACATTCAACTTGCTTACAACAAGTGTGCCCAGAAATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTAGTCTGATTTTAGATAAAC:1 + chr3R 22493715 5' + Cr1a 413 1 68.32 GCTAAAAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTAT:1 + chr2R 19594606 5' - roo 9034 1 58.42 GAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGT:1 - chr2R 4181294 5' + gypsy5 6977 2 62.38 ATCTTTTCTTCGAACTCGTGTTCTGGGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 2845759 5' + roo 8715 2 77.23 TTGCTTATAAATAACGAAATTAAATATGGCCAAAAGCCAAATAACTCAACTAGCAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTC:1 - chr3R 31548416 5' + Doc 4540 1 59.41 AGTATATTTTTCACTTTTAACGCAGCAAATTCATATTAGGACATTTAGGGGCTCCCTAGCCATTCATTTTCACGCACGTACGATTTTTTCGCACACAATTT:1 + chr3R 7594248 5' + 1360 36 1 53.47 AAATGTTTTGATTTATGGGGCTGATAACAAGAATTGGCATTTGCAAATTTCAACTCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTA:1 + chrX 11981947 5' - 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chrX 8566542 5' + Bica 122 1 57.43 GTAATCAGCCTAGGCAAGCCAATCCGGGAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chr2R 8190456 5' + FB 51 1 74.26 AAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chr3R 7869134 5' + 297 48 2 73.27 GTGTAGATCTAAATTGTGTCTCCAAAATTTCCCTCTGTCCGCTCGCTTACGCATAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGCGTGAG:1 - chr3L 26133446 5' - 1360 3257 1 78.57 TATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 - chr2L 9319128 5' + jockey 18 1 64.36 CTAATTTTCAGTTCTTGATATTAGAAACTTATGAATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr3R 7618723 5' + Doc 25 1 52.48 TAAGACTAGATTTTTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 + chr3R 20872720 5' - copia 5080 2 69.31 CGTTTGTCAGCACAGCCAGTTGGCTCTGTAAACAGAGTGTGTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3L 5973986 5' + hobo 31 1 52.48 AATTTTAAAATAATAGTTCCGAATAGAACCACGTACAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - 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roo 9026 1 71.29 AGCGGATAGAGCGGTATCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAACCAAC:1 - chr3R 4773401 5' + Tirant 39 2 59.00 TGAAGGTTGTCAAGAATTGGTGGGATTTTTTTTTGAAATATAATGCATATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr2R 16907486 5' - opus 7483 2 59.41 AAATCTCATCTAAATCATCGATAAATGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2L 16939798 5' - opus 7478 2 55.45 CATAAAATATGTTTTTAAGTGCTGCTCACAATCAGAAGCGAACCGTTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 17552477 5' + Doc 39 1 55.45 TGCTGTCCTGCCACTTTTGTAGTCTTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr2R 552781 5' - 1360 3339 1 72.28 ATAAACACACGTCACCAAACAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCCAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGC:1 + chr3L 14855501 5' + Quasimodo 400 2 79.21 AGTCTCTTAGAAATAAAACTCGCGATTTCATTTATTTCTTTTATTGTACTTTCCGCCCACTCCACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTT:1 - chr2R 5771751 5' + F-element 4629 1 53.47 GATATCCTTGTGGATGCGGGCACTGGCATAAAGGTCCTTTCTAGGCGTTAAGTGCTTGTTGGTGGTGCTTTCCCAACCTCTAACACCGAGTCCTCTCTTGC:1 - 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invader4 282 2 61.39 TTAGAGCTGCCCTGGCGATAACGCCGCTGACATCCACGCTTAATAATATCCCTTTCGCGTTGGAAAAACAAAAGCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 949242 5' - roo 409 1 79.21 AGTTTTGACTTTTGCTGGGTGCGTGGTGCCTGCTTTATGTATAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chrX 14324745 5' + 297 26 2 65.35 GCGGACCCACGGCCTGGACTTGTAGCCACACACAAGCACTTGGCGGATTATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAA:1 + chr3R 19812071 5' + opus 485 2 52.48 GATTTGCCAAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 3428056 5' - roo 9027 1 72.28 ATACATAACTAGCAGTAAATCAAACACGTTCTTTATAAACTGGTTAAGGAAGTATAGGTCGGAATTGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTA:1 + chrX 11975457 5' - F-element 4417 1 70.30 AGTTAAAACACTTGTATACCTAACATTAGTCGTTTAGACAATCTTTCAAGTAATCACACCTGTTAAATACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 17415221 5' - roo 403 1 60.40 TTTAACAGAGCTGTTTTGTCTACTAATCAGGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGGAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGA:1 + chrX 14676772 5' - Quasimodo 144 2 68.32 GAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 6322552 5' - roo 357 2 80.20 ATTAATTAAAAGTAGTCTAGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGGAGCCCCTTAGTGTCCTTCTTTTCTATT:1 + chr3R 12100171 5' - X-element 4667 1 71.88 TATGCAAAATATAAATATTTATAGTTAAATCTCAACCATTAAGGGATTGATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACT:1 + chr3R 12907680 5' - hopper 954 1 52.48 AAATTCGAACTTTGAACACCTGCATGCTCATTTCTGATAACTGCTTTCACATATAACGAATATCCATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr3R 22467008 5' - mdg1 411 2 68.32 AAAGGAAACTGGAGGCGTGTCCAACTTAAATAAAAACAAGAGACGAGAACGCGATATGGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAAT:1 + chrX 567671 5' - 1360 3185 1 70.30 TATCGTCGCCACAAAAGAAATCGCAGGTCAATACACTCCTTGCAATAACAAATGTATGTACATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 + chr2L 6081842 5' + Transpac 7 2 72.28 AGATCGCTGCAGTTCCACGTGGCGGAATCAGCGATCCAGCGCCAACATGCAGATACACGATCCACACTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTG:1 + chr2L 2219392 5' - Quasimodo 337 2 73.27 AACACAAACCAGATGACATCCAATTCCACTGACAGTGCAATTTTCCCACTGTACCTGGGCGCCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTT:1 - chrX 17217793 5' + R1A1-element 5281 1 63.37 GACTTTAAAAATAAAGGGCATTTAGATATCGATAAGGAGCTATAAGGAGCTAAGGCGCCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 - chrX 21057011 5' - Tirant 8487 2 58.42 AATCAAATTGCAGGCAAACAGACTCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTAATCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 9471225 5' - roo 353 2 81.19 TAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGG:1 - chrX 20996640 5' - INE-1 107 1 45.45 TTTATTAAAAATTACCAATATTTTTATGGAAACTTTAACTTGTTTTGTTTTGACTTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chrX 20282927 5' + 412 7073 2 52.00 ACATAGGGTTAAACCTTTTCCTAATGCCAACTGTAAAATCCCAAATGAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2L 4571327 5' - roo 9032 1 68.48 ACTATAAAAGCTAGAAGGTTGATATTAAGCAGACCGCTCCTAGAGCAAGTTTGTTGATCTATGTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCACA:1 - chr2R 1751258 5' + INE-1 215 1 69.66 GAATGAATCAAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3R 26434172 5' + hobo 40 1 64.36 GCACAATTGGAATTTAGAAACCAAAAGCATTATTTACAAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGTATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCA:1 + chr3L 23354642 5' + gypsy2 6530 2 71.29 AATTGAATTTCATGTGGGGCTCATATTGAAATTTTAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCTACATGGGTGCATTGCTC:1 - chr3L 14693209 5' + roo 111 2 66.34 TATCCGTTTGTCATCGAGATATCGGGAAATGAGGGGTGTTCCCTTTCACCCTTCATTTCTTAGATAATCTCGCTTCCGCCCATACAAATTTTATGCATACA:1 - chr2R 5747528 5' + hobo 2681 1 65.35 GAGTTCGGACCAAGGGATACCTTTTGCCAAATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3R 30611334 5' + blood 7014 2 74.75 TTCACCTTAATGGACGCGGAGTTCTGGATTCTGGGAGATGTTTTCATCGGTCGATATTAAGGGATTACTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGTCAGGATGG:1 + chr3R 17412252 5' + invader1 3585 1 56.44 GGGGAAATTGATCCTTTAAATTCTCAATTCCGTGCAACTTCAAATTTCAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chrX 11987856 5' + 412 12 2 66.34 GATGGCAGACAGTTGGAGAGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCTTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 - chr3L 17110755 5' + hopper 54 1 78.22 ATTTCTAGGCAGTAAATTTGTTACATGAGAAAATTGTTACACCACGAGAAGCACATTAATGATATTTTATATCTATATGCTTACTACGTGAATGGAAAGTT:1 + chr2L 1706498 5' - Dm88 4105 1 60.40 ATTTGACGTATCAGTTTATTCAATCTGGCTCTGCCCTTCCGTTTGAATAAACTGATACGTCAAAATTCTTATAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGT:1 - chr2L 21259786 5' - Stalker4 404 1 59.41 AGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAG:1 - chr2R 4181295 5' + gypsy5 37 2 61.39 ACGTACACATACACAAAAAAATTTAATTATGTTCTAATTATGACTTTTGATGACTAATTGATGACTCGTCCATCAGCTAAGCCGAAATTATTTTTTAAGTT:2 - chr2L 16077739 5' - P-element 2702 1 70.30 GTATTATATAAGATCAGGTATACTAAACTTTTTTGGAATCTGCGTGCCTAATCTCAACATTCTAGCTTTTAAAGCTGAGATCTCGACGTTCATATGGACAG:1 - chr2R 5696961 5' - INE-1 131 1 71.29 TTGTTCATATTTTTAATGTCAGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chr2L 18077410 5' - hobo 2884 1 77.23 AACATTGATTTTATATGGANTATAACGATTTTTCCTACTAAAGATAGATAAAAACCTATTGATTAAGTTTAGCCGTCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 + chrX 16237881 5' - mdg3 5486 2 65.35 GGTGAGGGGCAGAAAGGGGATGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAATAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 21374214 5' - P-element 2837 1 30.69 AGTTTATTATTTTGTTTTCATTTTTTTCCCTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGG:1 - chr3R 12153130 5' - mdg3 150 2 70.30 GCTGAATTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:2 + chr3R 28628081 5' + 1360 47 1 72.28 ATTTTTAAATCCAACGACATACCATATAAAGTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3R 27582761 5' - pogo 2058 1 70.30 AATAAAGGAAATATTGTATAAATTGCTGACGTGTCATTACATTTAAGTTTGCCAATTAGTTGTAAAAATAAAGTTTCCTTTCATTTTATTTTATTTTCTTT:1 + chr2L 15176633 5' + transib1 1902 1 64.36 CAGTGCTCTCACGAAATAAATATTTGGCCAATGCAGTAATGTTTGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 28216792 5' + blood 31 2 53.47 AAGAGGCACAATTGCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACTGGGGCGGCATTCACAATGTGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr2R 6918631 5' - hobo 2936 1 73.27 GTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chrX 4422650 5' + jockey 57 1 74.26 ACAGTTATACAGAAACCGACGCACCGTTGCCAACTGGCCAACCACCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCGTAAGCGG:1 - chr2R 13269151 5' - Quasimodo 6958 2 52.48 ATATCTTGATGCATTTCAAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTC:2 - chr2L 16939899 5' + opus 123 2 69.31 TTAAACTAAAATACAATTGTTGACTCGATGTTCAGACGGACGGACAGATAAATGGATAAAAAATACGTAAACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3L 16200051 5' + roo 8668 2 74.26 ACCATAACGAGTAAGTAGATTGGGTAGATTGTGCACCCAACCTGAAATTTTACAAAATAATACGCCTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACAC:1 + chr3R 13000964 5' + I-element 4961 1 59.41 AGAAGTGCAATCGACCTGGATGGACATCCCCAGAAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3L 24150501 5' + blood 7022 2 66.34 CTGGCATCCCGATTTGAATCCCACCACTTCCACACTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTT:1 - chr2R 6113325 5' - Stalker4 7081 4 71.29 AAGCTCTTCCACACAAATGNTTCTAAATTCATCATTCACCTGACGATCAAATATCTGTGTATCCCTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 24152098 5' - roo 397 1 65.35 TATCCAACACAATTTCTCTCCCTATCCTCTTTTGTCCTTTTGTGAACACCTACCAGTACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCTTGAATATAACCATAAAA:1 + chrX 9031027 5' + baggins 5062 1 72.28 GGGATCCATTAATGCCGCTCAGCCCCAAACAACCTGCTAAACTTTGCACAGAAAATTACAAGCTCAAATGCGCCGCAGGCGACCGTATATGTGTACACCAA:1 - chrX 1585984 5' - accord2 7210 1 78.22 CTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTG:1 - chr2R 12824514 5' - gypsy3 421 5 80.00 ATGCACTTTTCCTATGTCANATATATAGTGTTTTACATAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTT:1 - chr3L 19569229 5' + BS 35 1 64.36 GGAGAAAAGTTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2R 7895354 5' + TART-C 11102 11 93.75 AAATAAATGTTGCCCACAATTAGAATGCACAACAATAATTACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGC:1 - chr3R 23552558 5' + Quasimodo 7072 2 60.40 TTGAGCATGTCACCTGGATTATACACGTATTTTTCTATCAACTTAAAGGCGAAAGCACTAACAGAAGTAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTG:1 - 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chr4 700909 5' - INE-1 150 1 68.32 ACATAAAAGACATATTCAAAAGACCGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr2R 18077090 5' + Transpac 49 2 74.26 TATTAAGTACATATTTTGTAATTGTTCTAAGCTTGATTTACGTATAAAATGTGTCTTGATTAGGTATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTC:1 - chrX 4906237 5' - P-element 7 2 67.33 AATAACAGACGAAAGACAAAATATAGAATTAAGATAGGCATTCCAATTATGACATCACAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3R 10434540 5' + 1360 17 1 63.37 TGCGGACAACCGCATACGGATAAAGGTGCTCAAGGACATTTCGGCCACCGCAGCGCACACAGCACACCATCCACACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTT:1 + chrX 7759045 5' + hobo 4 1 73.27 GCACGGCCAGTTTGCTCATACGCGTACCACCAACACCACGACGACTACGTCTGCCGTTCAGGCTCACAAGAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACA:1 - chr3R 11748115 5' + Quasimodo 7020 2 77.23 GAGCGGAATGCGGGACACTGTCGTTTGGGGGATGGCCAAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 13194708 5' - roo 395 1 65.35 GCACTTGTCAACTTTTTAGTATTCTTTCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATT:1 + chr3L 4531858 5' + I-element 5029 1 73.27 GTTGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chrX 153020 5' - mdg1 377 2 72.28 GGACAAAAACAAATGGTAAAACGAAAAAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr2L 18297906 5' + hobo 23 1 56.44 GGGTCTGGCTTTTTGTGCTGTTTCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATG:1 - chr2L 18467495 5' - Doc 4493 1 80.20 ATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCATTGATTGAAGAAGGCGAAAAAATTCAAGCAGGCATTATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGA:1 + chr3R 19448823 5' - Chouto 191 1 73.27 TAATAGAAATTTATATATAAATTTAATTACACGTTATAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGGTGGAATCG:2 - chr3L 20490723 5' + FB 37 1 68.32 AGGATACAACAATAGTCTGCCAAAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAAAATTAAACTATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGGAA:1 + chr3L 23269482 5' + Porto1 4577 1 77.23 GGGATATTAATTGAAATTGCCCAGGGATTAGGTAGCCAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chrX 5452560 5' + mdg3 5293 2 63.37 AATAAATATAAAAATTATTGTAATAGTTTTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATG:1 + chr3R 25844281 5' - Stalker4 397 1 65.35 TTGTTCTTCCAATCAACTTTTTATTCCATGGAGGACGCTCGATGACAAACAGTCGAGATGTGTTTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 - chr3R 11840650 5' + copia 4883 2 65.35 AATTTAATTTACTTATAAGCTAGAAAATGTTATGTAGGTTTATCAAAAATCAAAGCATCTTCGTCGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATAT:1 + chr3R 6660399 5' - mdg3 116 2 71.29 GAGTAACCGAGCAGCAGCAACAGTTCCCAGGAAAAGAAAAATATTTCATTTTGAATTGATGCCATTGGGATTTATACATATGTACATAGA:1 - chr3L 20234075 5' - invader3 5087 1 61.11 TGTTGCCTACTTTTGTGGGCTGTGCATAATTGGGCAGCATGAATAATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3R 25378636 5' + jockey 24 1 57.65 ATAGTCTTTAATCTTCTTAAGTGAGACTGCCCTCGCATCGGGCACAGCTGCTGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 + chr2L 14799094 5' - hopper 1396 1 60.40 TTAATTTGCGTTGGTTGTCGCCGATTGCCTCGCTGATTAATTTGTTTTGCGTCTGATCACCTCGGTGAATTCCGAAACGACACCGTGACGCTCAGAACCGC:1 - chr2R 14832523 5' - Rt1a 122 1 64.36 GGCAACACCTACAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 15527049 5' + pogo 37 1 69.31 TAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACATAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2L 9319089 5' + jockey 58 1 72.28 TACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 - chr3R 11151897 5' + mdg3 5278 2 52.48 TACGGTTAGTTGCAATTGACCTGTCATATCTTTTACTACATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 23683379 5' + 297 6612 2 65.35 ATCCACGAATAATAAACAANGATTTCTAATATCTTAACCCTGTTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chrX 3546379 5' + pogo 29 1 63.37 TTTTAAGCACTTTAAATAATTACTATACCTCAACTGAAATGTATCAATCTGATGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAA:1 + chr2R 10857688 5' + BS 4897 1 47.52 AAATATTCATTTCAATAGACTACACTCCTGAACTTGTGTACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTT:1 - chr3R 26170455 5' + X-element 44 1 59.41 TTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAAC:1 + chr3R 25844309 5' - Stalker4 7325 2 61.39 GTTGTCATAGTTATTAAGCGCTGAGCGTTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr2L 6583295 5' + hobo 3 1 74.26 GCGCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - 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chr3L 5255970 5' + jockey 67 1 67.33 TGAGGAGAGTCCTCCTTGAGCTCCTACTCCGTTCCTGCTGCGGTGCCTGTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr3L 12238910 5' - jockey 4972 1 51.49 ATGCAAATGCAGTGCAATCAACTGTAGGATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 - chr3L 18928885 5' + mdg1 48 2 85.71 ATATTAAACGCATCTGTTTNCTAAAGTGGGCGTAAAACTAATGCAAGGACAATAAATTAAAAAAA:1 - chr2R 13690607 5' + HB 310 1 92.31 AGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 8434274 5' - roo 9022 2 76.24 TGTAACCAGTGTATGTCTGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCAC:1 + chr3L 21912234 5' + Bari1 5 1 75.25 TTTTTGCTGTCGTCATGCAAAAATCAACGAAATCTCCTCCATCTATGTACATGCACATGTACATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 10089242 5' + pogo 11 1 42.57 GCGAAATTCAATAATTCTTCGCCGTTGGAACCCATTGCAATTCCTTCGGTTACTAACTGATCTTCAGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGT:1 + chr3L 21441135 5' + Tc1 172 1 73.27 ATCCGTTTTCAAGGACACGGTGATGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAATTTTA:1 - chr2L 7461125 5' - roo 9035 1 60.40 TTAGCCATCACTTCTCTATATCGGAGTACATATATATTCCTATTCCTATTTCAATTTCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 17364977 5' - hopper 1374 2 65.35 TAAATGCTTCCTGCCAACTCTGCAAAACGAAATTTGTTTCAATTTCGCATTGAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 25950166 5' + 412 21 2 58.42 GATGCCAACAAGTATATTTCATTTGTTGTGTGTGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr2R 23877732 5' + Transpac 35 2 63.54 AGGAGTTATGTGGATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr2L 19207951 5' + 412 7073 2 57.43 TTGAGATTTCCGAATTGGCTGACTACAAATGTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr3R 19807418 5' - opus 459 2 70.30 GAGGGATTACTCGCTGGCTCCGTTCCACAAAAAGTTCGTGGTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGC:1 - chr2R 12189166 5' - accord 370 2 59.41 AGTAGTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAAT:1 + chr3R 22469130 5' - hobo 2921 1 59.41 GTCTTCAGGTGCCCCATGTCTGCCCGGCGATTCCCTTCCGACTTGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTA:1 - chr2R 16795556 5' - 1360 15 1 56.44 ATTTTGTACTTTAATATTTTGGAGAGAGTACACATAAAAGACATATTCAAAAGACCGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 - chr2R 18077121 5' + Transpac 4937 2 59.41 ATAATTTTAAATAAATGTTAATGTTTTAATACTCATTACATAATGTATAGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr3L 11428750 5' - mdg1 395 2 52.48 ACCTACCAGCCCACGCCTCTAGGTCCTTTTTTGTTATTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACAT:1 - chr2R 22032654 5' - Dm88 4218 1 73.27 TAAACAACGAAAGCCCGAGGTCTGAAAATCGATTTAATCCCCCATACTTTCGCCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chrX 9463344 5' + hopper 20 1 59.41 TATATATATATATATAGACGGACATATATATATATATGTATATATTCTTGACCCAGTCGAACTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCC:1 - chr3L 4409896 5' + INE-1 126 1 47.83 GTAATTATGTACGTTCGTTNTACATTAAATGTATTAATGTGTTATTTTTTATCTAAAAAGTCACAGAAGAATTCAATACTTAAAATTAAATAAAAATTCTA:1 - chr2R 14799941 5' - Rt1b 121 1 75.25 CCTGGCGATAACGCCGCTGACATCCACGCTTAATAATATCCCTTTCGCGTTGGAAAAACAAAAGCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 949252 5' - roo 399 1 69.31 ACCCAATAAATTATCCCAAATTCAAAGTTTAAAACCCCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTC:1 - chr3L 21912364 5' - Bari1 1705 1 77.23 CAGCCTCTCCAATTCTTTGNCGTTCACAGACATTTGGCACTGAGTCAACTTTTCAGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 3525999 5' + Doc 33 1 49.50 AGATAAAAAGAGAGATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 5201015 5' - 1360 3372 1 62.38 GAACAACTTGTTGTTGGCCAATTTTTTGGCGTCTGCGCAATCCATAAGAGGGCATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAG:1 + chr3R 9613420 5' + invader3 5211 2 55.45 TTATTGAAGGTCAGTTAATAAGGGAAGTACGTTAGGGTTTTAAGGGTTTAATAAATTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 14708703 5' + roo 8684 2 55.45 ATGAGTTTCAGACTGCCAACATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2R 11941197 5' + Doc 30 1 51.49 GCCCTATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 - chr2L 9319132 5' + jockey 13 1 69.00 AGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGTACCCCACACTTATATTAATTTACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAATTTT:1 - 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Juan 3809 1 61.39 TGATCGTTGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 7534696 5' + Tirant 43 2 68.32 GGGGCAGAAAGGGGATGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 21374209 5' - P-element 2832 1 25.74 ATAAAGTTTGTGGCCCCATATTGCAAACGATTCTGGCTGCCATCTTCCCAACGCCCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr2L 3778463 5' + 1360 21 1 52.48 TACCCAGTACACTGGCAGANAAAAATATGCTAAGTTGTGCAATAAGTTGTTTATAACAATCGTTTAAAGTAAGTAAAGTAAAAGGCGTGGCCTTTCATAT:1 + chr3R 29711537 5' - copia 60 2 44.00 GATCTTTCAGCCAAGAGCAGCTGCCATTGATCCTCTTTCTATTCAAAATTCCTCGTGCTCTTTGCGGTCTTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGT:1 - chr2L 429375 5' - FB 363 1 75.25 AGCATCGACATCGATACTTTGCACCACCAAAACAATAACAGTGCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chr3R 5367523 5' + FB 34 1 63.37 AACAACAATGAAACTTATATTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACT:1 + chr3R 16123198 5' - Tc1-2 1588 1 47.52 TGACTTTCTTTGATTCTACTTTAAGCTTAACTCAAAAAATTGTAAATTATAAGCTATTTTTGGCTAACTACCACACCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chrX 5194603 5' + hobo 2 1 73.27 TGTGGACATCTTGACTTCTGGAAAAAAAATAAATATTTAAGTATTACACTATTTCTTATTTACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGCGAATAACGCG:1 - chr2R 17403884 5' + HMS-Beagle2 342 1 64.21 ACGGAAGATTAAGTGAGAGAGGCGTTTGCGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr2R 18988435 5' - hobo 2892 1 68.32 ATAGTTAAAAAGTTTAATTCAAATTATTTACTTTTGTATTTAGTAGCAAAAGTAACAGGTAGAGCGAAGCGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 20375819 5' + roo 8670 2 71.29 AACATGGGTCAACAAACTTGCGATTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTACGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:3 - chr2R 5296381 5' - INE-1 137 1 85.15 GTGAAGACCAAAGCTTCCAAGGGCTACGAAGAAAACTACTTCTTCGTGATGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTC:1 + chr3R 4776658 5' - GATE 8265 2 53.47 TATGTTGCCTACTTATCGGCTGTCGCTAATTTATGAACTCCCACAAGGACCTTGATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTAT:1 + chr3R 29466297 5' - 412 238 2 50.50 TTAGGATAAAAGTGCGCTTGTGTTTGTTCGCATAAATGGCTACATCGTAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 19594675 5' + roo 8690 2 55.45 CATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:2 + chr3R 7869117 5' + 297 6612 2 56.44 TGCGTCCCCAGGTCCCGCTTTCGAAATTGTTGCCAAAAAACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCG:1 - chr3L 19509076 5' + F-element 4506 1 61.39 TTAAATGTAGGCCAAGTGCGTTATTTTACTTTTTAAAAATAAGGGATATAGTTCGGCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAA:1 + chr3R 4493088 5' - S-element 5 2 55.45 TTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATAAGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGA:1 + chrX 17324738 5' + invader1 3649 2 90.10 TCAGACTTTTATACTGCAATAGGAAGGCGAGTTGAAATGCGGGTTTTCAATATATTGAAGATTTATGCCAATTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAAC:1 - chr2R 5961908 5' - transib2 240 1 79.21 TTTAGCATACCAATCCTGCTTATTAATTTATTTATAATAATATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACT:1 + chr3R 26122982 5' - roo 9069 1 73.27 TGCACCTGCTCCATCTTGTAGTTGTACTTGCTGAGTATTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGAC:1 + chr3R 22621435 5' - HMS-Beagle2 6989 2 62.00 TTTATTATGCCATTTTAATTTAGATTCCTATCAATCAGTAATAAGCATTGTGTCCACCCGCACAGACAGCAAAAAAAACAAAAAAAAAGGAAAACAGAAAA:1 - chr3L 2710283 5' + Doc2-element 253 1 76.24 TCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGGTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGC:1 - chr3R 3268040 5' + mariner2 108 1 64.36 TTTATGCATGGGATTTTGAATTAATTTAATGCGCTCAGTCCCAAAAACGAAGCTGAAAACAAACCGTTTCGATCTGGACCCTCATCATAATTGTTTCGCAT:1 + chr2L 9851059 5' - pogo 1781 1 75.25 TTGCCACCGATCGAAAAACTTACGCTCGCCCTAATTTTCGGCTTCTTCATTGCCTACCGCCAAATTCGAGTCGTTTTGGCTGTGCAAAAAGAATTGAC:1 + chrX 6460949 5' + G3 17 1 75.51 TGTGCAGTTCCCCAAAATATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr3R 19807376 5' + opus 43 4 83.52 GTGTATATATTTTTCTCATTTCTTTATATTTATTTATAAACCGACTTAGTAAGATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr2R 16979724 5' + 297 6600 2 62.38 TTAGATGGCTCACAGACGTGCTCGACGACAGTTTATGCAAATTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTT:1 + chr2L 17643800 5' - jockey 4637 1 58.42 AAGGGAAACCATCTCGATTGACAAACATTTTCTGCATGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr2R 24500832 5' - Tirant 8481 2 58.70 GCAATGAACTCGAGACGTCATCTTTTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGAT:1 - chr3R 13239930 5' + hopper 49 1 74.26 TACTGAAAATTGTGATTCGGTAATTTTTTTTAATTTTATGTAATAAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCT:1 + chr3L 15415278 5' - Burdock 346 1 68.32 TTGAAATCATGCGAGACCTNGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAA:1 - chr2R 25051870 5' + G5A 2666 1 61.22 TAAGTGATTTCGAAACCCTTTTTTTCATGGCGCTAAAAAGTGTGCGATGAAATTCCAAAGACAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACA:1 - chrX 14988799 5' + jockey 4904 1 65.35 AATACCAAACCCATTGCGCAGCAACGTCTTGCAAGCGAAGTGGTCAAACTATGTTTATAATATGACAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATA:1 + chr3L 25766106 5' - invader6 65 2 70.30 AAAATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCAAT:1 - chrX 158242 5' + INE-1 95 1 75.25 TTTTTGCATAAAAATATTTTGCATAATAGCATAAAAATAATTTTAGAACATAGAACGAGTTATCGTTATTTTTGGCACGCTTTCAACGCCAGCTGATTCAG:1 - chrX 12767364 5' + transib4 155 1 53.47 TTAGTTGTAATTTTATTTTTCCTTTTTTTTT:1 + chrX 13961770 5' - Doc2-element 234 1 70.97 AATACAGAGCCGTCGAGTTTGTTTCGCTCGGATTGCAGCTGCATATTTGACGGTTGTGTATTTTTTGTAGTTATTTTTTTTCATTTTTTTTTTTATTTT:1 - chr3R 26828410 5' - F-element 4686 7 64.65 TTTAATTTATTTTATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTTAACTTTTTCTTTGCTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTTTAACTTTGCTG:1 - chr3R 13438422 5' - TAHRE 10437 1 70.30 AAGTTGTCTAGCCATTGTAAGCTATGAGTGTGCATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCC:1 + chrX 154433 5' - mdg1 275 2 77.23 GAACGCACCTTGTCGCGCAAATCACGTATTTCTGGGCGCTGCACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:2 - chr2L 13792243 5' + blood 7044 2 55.45 AAGTTGGTTTTTTTTTCTTTTTTTGGGATTTCCGTCGATGTGTATCGCCACATTTAGCACTTAAAAAATGACTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATG:1 - chr3L 4986672 5' - hobo 2682 1 56.44 GTTTCTGCCTTAATTTATGGGCCTTTTGTTTACCGTTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 + chr2L 3937723 5' - Burdock 219 2 60.40 GTGTGTGTGTGATTACCTTAATGGTTTTTTTAAGCTTGACAGGCTGAATATTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3L 15831319 5' + 412 7080 2 56.44 GATGACAGTATGAACTTCGAACTCTCAAAACATCCAAAGTTTTTGCTCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2R 20584412 5' + P-element 27 1 52.48 TAAAGTTTCTGCTGACACATAGACAAGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGC:2 + chr3L 21397549 5' + Doc 441 1 74.26 ATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr2R 6074436 5' - 412 7511 2 65.35 TGCCGAAACGCACCCAAGCACACCTATTATTAAGCGCACACAAACAGGACAAAGTGATTCTGCAATTGGAATAATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTC:1 - chr3L 13367791 5' + mdg3 5250 1 83.17 TCAGGCAAACGAATAATTTAGGCCATTTTACGAGTATAAACTCGTAACATTCGGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 13072048 5' - roo 9051 2 56.00 ACACCAACTATTTTGAGCGNAGAAGGAATCCTAAATTTATGATATTTTATAATTATTTTTTATATCAACAATATAAGGAACGCACTGTTACCTATGTGGCA:1 - chrX 5672169 5' - jockey 4963 1 62.38 GCAGGGTGTGTGTATGATGATGTAGTTGATAGCGTGTGTACGAGTGTATGCTACTATACGAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3R 19270322 5' + pogo 12 1 63.00 TTTTTAAAATTATTCGCCGTTGTTATTTCGTAGATAAATCGGTAGTGGTCAACTTTTTTTTATTAACTGTCAGGCCAAAATGGCTCTCTTTCCGCTCGCTC:1 + chr3L 357860 5' - 1360 3307 1 79.21 TAATTTATTTTTCAATTTCNTGCAAAAGCCAAAACAATTTAAAAAATTTTTT:1 + chr3R 25094326 5' - transib3 39 1 80.77 GTACTGTGATTACGATTCGATTTATTTCGAACTAATGGAATAAATTTATATGGAATAATGGAATAATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCCATACAATGC:1 - chr2L 21111537 5' - BS 5070 1 70.30 GGCGTGTAAGCCAACACCCATGTTGGTCATATTACCTGGTAGTATAAGTAGTAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAA:1 - chr3L 15938568 5' - Tirant 8397 2 57.43 AAGAAACTATATACATTAAAAAATTGTTATTAATAGTGTTAGTTATTGGTAATATTAGGTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATA:1 + chr3L 207497 5' + R2-element 3376 1 65.35 TGAACTATTAACTTTTCGGAAGTAAATAGTTGCTGTTCACACATGAACACGAGTATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 4551444 5' + roo 8683 2 91.78 AGTTACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 8434257 5' - roo 9039 1 59.41 AGCTGTCATGTCCAGTTGTNATTCATAAATGTGTACTTTACAACACTACTGCCTGGAATCGCTTAACTCAGAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 + chr2R 11403910 5' - mdg1 416 2 68.32 AAAGGAAGGGGAACCCCAGGGAACTCATTAGTTTCAGTTCAACTTCCGCACTTGTAAAGTCAGCTCACAATCATGGGTTTGTTTTTTTTTATTTATTTATT:1 + chr2L 4378674 5' - Tc1-2 481 2 81.19 TAGTTTGTTCAACGTTTGGCATTCGCTCCTGCTGTTATTGTATCAAGCAATAGTTGCAACGATTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAAC:1 + chr2R 12885861 5' - I-element 5335 1 67.33 CTAGTATTGTAAAGACACCTGGAAACACAAGCTCCCGGAAGACGATCCTCGCTCTTCATGTACAGATTTGAGATCAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCT:1 + chr3L 21440700 5' + 412 7500 2 80.20 GTCGATGTGTATCGCCACANTTAGCACTTAAAAAATGACTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGG:1 + chr3R 22538778 5' - hobo 2649 1 62.38 AAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2R 19594611 5' - roo 9029 1 65.35 GCTTAAAAACATATGATTTCCAAAGATCATTTTTTAACTGCATATACGATCATATGCTTATATTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr3R 29157589 5' - pogo 2092 1 70.30 GGAAATTCCATGCTAAAATGGAAATGGAATGGTGGTTTTCAGAGTTGTGAGGTGATTGATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTT:1 + chr2L 17225184 5' + X-element 4599 1 50.50 TTCATGCCAAACGGAACCTACATTGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr2R 11661108 5' + 1360 49 1 76.24 ATGACTCAGGAAAATCAGAGATTTTATTTCGATGGCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 + chr2L 4110925 5' + Doc 5 1 75.53 TTACCTTCCGCCATTTCTGCAAGTGCAACGATAATAAAATGTTATAAATATATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACGAT:1 - chr3R 20791739 5' - pogo 2082 1 60.40 AAAGAAGTTATAAACACTTCATATTGATCCGATATCGATCTTTAATGCTGAAGAGGCTTAACATTTAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 18105840 5' + roo 8674 2 69.31 GAGCGATTTTTTATGTAGATTGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTG:2 - chr3R 8705371 5' + jockey 14 1 71.29 TAAATGGAGAAACTTTGCGAGCGCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAG:1 - chr2L 14244397 5' - Idefix 189 1 77.23 TCATGCACGACTTTTTGGCGGAAAAATTTTTTGGAAATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATC:1 - chr2L 2261165 5' - Stalker 42 4 72.28 GGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2L 14054797 5' + F-element 43 1 56.44 AGCCTTTAAAGAGTTCTCACTGATTGCCAGTGGCTCTGTGCTCAAGCAATTGGGGTTTTCCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCG:1 + chr2L 20732323 5' - roo 188 2 65.35 TTTCATATGTTATGTTATCATCGGATGAAACTTCGAATCGTTTTATTTAAATGAATCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTT:1 + chr2R 7457242 5' - Stalker2 290 2 63.37 AACTGATTCTAGTAAAGACTGTGTGACTGGACGTGTAGTTTAGAGCCACAGAATATTAATTTAAACTATTTTACAATGTGTGTGTTCACACATGAACACGA:1 - chr3R 17415341 5' + roo 8662 1 74.26 GCCACTTCAAGGCCACTTTTCCCGTTTTCTCTTCAACAGTATGGCATTAAACATTGAAAAATTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 13214963 5' - roo 395 1 67.33 AGGGCTTTTGAAAGCTTATCTAAATTAAGATTTTTTATTGGATCTATCTATAAAACTCTTCAGTTTTTATACATTTTCATGTTTACTCAAACTTTTAGTTG:1 - chrX 21574523 5' + Transib5 401 1 73.27 TGGGTGTGAAAAGATTTTCACTTGATTTGACTTTGGTCCACGAGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTC:1 - chr2R 21878842 5' + McClintock 6183 2 57.43 TGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTC:1 - chr2L 21794176 5' + invader1 3620 2 69.00 TTTTTATTTTTTTTATTTTGTTGATTTTTTTTGATAATTTGTGGTGTGTGTATAAGGGTTTGTGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCAC:1 + chrX 17539364 5' + gtwin 6930 2 64.36 AAAAAGTGTTGAAAAGCACNCGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 11697054 5' + pogo 23 1 52.04 TGTCAGTTTTTCGCCTTTCTTGCTTTAAAAAATGAACTAAACTTGAAGTTCTAAACAAATAAATACCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 + chr2R 13712126 5' - mdg3 237 2 45.54 GGGCTTAGTTTTTGCATTCAAAGCGAAAGAAAATTCAGTTCCTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3L 25397124 5' - roo 9037 1 54.46 TTACTTTTTTGTTGCAATTTTCGACGCTGATTTGTTGTCTTTTTAATATCGCGTCGTTATCTTCTCGCAAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCC:1 - chrX 11164641 5' + Cr1a 4401 1 61.39 GCAAGTAGAAAGGTCCTTTAAGGAGAGGAGATACAAGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3L 15435506 5' + blood 7017 2 73.27 ACCGAAATTTGTTGTTTGTAGATTTGTCGTCTGATTTTTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 - chr3L 3644153 5' - jockey 4958 1 66.34 AGCCATCAAGCAACAGAGAACATCAGCGGCAACAAGAACAACGTCAATTTGTGAAGAAATGCACGTTGGGCGCCAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGT:1 + chr3R 29089359 5' - gtwin 7385 2 60.40 AGGACATCTGCGACCGGGCTTGTATTACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTT:1 + chr3R 14980498 5' - 412 442 2 70.30 TAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCGAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTA:1 + chr2R 5582168 5' + Cr1a 442 1 64.36 AGCGACTCGCTGCAAATATATAATAATGACCCTCTTTAAAATAAACAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGTGTTCCGTTATTGTTCAAAGGTGTGGGCGTG:1 - chrX 20340747 5' - INE-1 253 1 44.44 ATGCCCTATCTGATGAGCCCACAATCTGTAAAATAAAGCAGCAGCCACTCCACCACCTGCCTCCCGATGTCCATACGTTATACATATACATGTGTATACAC:2 + chr3R 22066724 5' - Stalker2 7496 2 77.23 GAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAAAATACTATTCAACCAACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 + chr3R 4474177 5' + copia 28 2 60.44 TTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:1 + chr3R 3492277 5' + accord 46 2 72.00 TAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAAT:1 + chr3L 20224131 5' - Chimpo 174 1 67.33 ACTTCCCGTCGTTATTTATNTGAAATCTCTCCGTTTGTTGTGCTCTTTTTGCTTTTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATT:1 - chrX 6075352 5' + P-element 107 1 56.44 GACAAGATGGCGATTAATTTTCGATCGGGTTTCTTTTTTTCGCTCACGTGCAGCCCAAACAGCTGCTGGGGGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chrX 21374137 5' + P-element 2 2 80.00 ACATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAGGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3L 23871323 5' + Doc 32 1 49.50 TGGCATTGCAGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 4650481 5' - roo 9026 1 69.31 ACTAACGAATAGTCTTTAANCTTCTTAAGTGAGACTGCCCTCGCATCGGGCACAGCTGCTGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr2L 14799086 5' - hopper 1404 2 67.33 ACAAAGGTAAACGGCGCACNCACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCAC:1 - chrX 22386791 5' + hobo 56 1 59.41 AAAATGCTTAGTAATTAAATATATAACTTTTAAGCTAAACAAAGTGGTTGATTTTAACAAAATGTTAGCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACG:1 - chr2L 12596874 5' - opus 7392 2 69.07 TGACTTCTCGGGTGATCGCCGTCTGCTGCGCGGCGTTGCTCCTACGACGCCTTGCCTACTTTGTCCTGTGTGTCGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCT:1 + chr2R 3068332 5' + Stalker 6854 4 70.30 TATATTTATTTATAAACCGACTTAGTAAGATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr2R 16979748 5' + 297 6624 2 79.21 GATTTTTCTTCATACCCATTTTTGTAGCATACATTTCGGGGCCTCATTTTTTTTGCGCCTCATTGGCTTTCAGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 11160629 5' + jockey 12 1 67.00 GGCAGGAGATAATGAGTATTTATAGAAATATAATAGTATATAGAAATTTATTTAGAAATGATGCCATGTTTTTCCTGTAAATTTGTATGTTTTTTTTTTTG:1 - chr2L 13744452 5' + Tc1 1466 1 62.38 AACCAAGAGCAAAAAATGATAAGTAATTAAGCTTTTTATAGCGAAAGATATTTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGT:1 + chr2L 12780365 5' + flea 270 1 55.45 ACACCGTTTTTATTGTATAATTACATATTATCTAGCGAGCTCTGTCACTGAAGTATAAAATCATAATATTATAATAAATAATAATAAAAAAAATAAAAAA:1 + chr3R 22827995 5' + Rt1a 5074 1 65.00 GAGTTTATCAGGGCATAAATTTATAATTAAAAAGCTTGAATGTGATTCGAAAGATACTTGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCAC:1 - chr3R 25886163 5' - R2-element 3509 1 53.47 TTGCGATGAGGATGAGTACCGTGGCCTGACCTTCAGCCGAGAAATCTCATTAGCATTGCTGGCTATACGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGA:2 + chr3R 26850604 5' + flea 467 1 74.26 AACTTTGCCCTTTCAACTGCGCCTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGAT:1 + chrX 4826147 5' - hopper 1160 1 77.23 AATTTATTTATTTATTTACTCTGGCTCAAATGTAGGAAAAAGCGGGTCAAAACAAGAGAGAATGGTATAGTTGATTTCCCCGACCATCAGATACTCGTTAC:1 + chrX 22741629 5' - INE-1 551 1 69.31 AATCTTACTGCATTTGTGATACTCAGAATCTAGAGTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chr2R 7132557 5' - opus 462 2 65.35 ATATGCCTTCTATATAAATATCGTTTGTTGTTTGGTTTTTGTAATTTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCT:1 + chrX 12518611 5' - mdg3 5023 1 55.45 ACAACAATGGGAGTGAAGANTATAAAGTGCCAGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGAATACCTCCTAAACTATTGGAGA:1 + chrX 7802860 5' + hopper 40 1 67.33 TACTCGCGCTCTCAAAAACGAAAAACTTGTTTAGCCGCCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3R 25208334 5' - P-element 2847 1 41.58 TGTTTTGCACTTGCATTTTGAGGTCGACTTCTGCGGCAAAAATCACATTACCCTGAACGGAAATAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chrX 22892744 5' - copia 240 1 62.38 AACTCATCCATGATTCCAGCACAACCCGAAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr2R 10777810 5' - pogo 2061 1 70.30 TGTATTTCGAGAACTTTATTAGCCAATAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 - chr2L 9618710 5' + FB 49 1 73.27 TGAACCGCTATGTATCTGTGTGTATTATCCTTTTTATTGCGTGTTCTCTCGCCGTGCAGCCAGTTTTAATCAGCAGCATTAATTTAATTTAATTTGATTTA:1 + chr2R 6576999 5' - TAHRE 42 1 53.47 AGCACCGGTACCACCATCATGTCCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTC:1 + chr3L 16792536 5' + Chimpo 4027 1 55.45 TAATTAATATTTGTAGTTATCGTCGGAATCTTGTATATGTCGAAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCC:1 + chr2L 21656624 5' + invader1 33 2 65.35 AAGATGCAGCGTGCACATAATGCACATTTTTTTGAACATTTTTACAAAGGAAAACGAAGCCAGACTTTGCTTAGCACAGAATTTTATTTAATTAACTTAAA:1 - chr3L 13771131 5' + TAHRE 75 1 94.06 ATAATAATGACAACTAATTGTTGACTGTTTTCTTTTAATTACGCTGCATAATTTTTGACTATTTTTGAACAGTTGAAATCATTATTATTATTCTTTAATTG:1 + chr3L 19104835 5' - invader3 5039 1 43.56 TTTGGAATTGCTTCACTCGAAATAAACGCTAGTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 - chr2R 20588819 5' - Tabor 438 2 69.31 ATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:2 + chr3R 11151808 5' - mdg3 5480 2 61.39 ATTAAACGTGCCAGTCCCAAAGTATTTTAGTACCAAGATGTGTACCCAACCCACTGACCCTCGCCAATATGCATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAA:1 + chrX 13294004 5' - mdg3 5495 2 75.25 ACGTGATAAATACAAAATGATGAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGC:1 + chr3R 18342448 5' - F-element 259 1 47.52 TTTTGGTTATGAATATTTCATAGAGAAATCCTGGCGAAATAGCGCACCCTATTACATTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 6058160 5' - roo 9049 2 56.44 TTGGCTTCTCCGGCTCCCCTTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTT:1 - chr3R 20430799 5' + hopper 56 1 77.23 AACTCTAAGAGAAAGACAAGACACTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTG:1 + chrX 21097037 5' - INE-1 155 1 73.27 ATGTCAGTCGAATGCGTGCGAGTGTGTTGTCTGTGTTTGTGAAGGGGACAGTAGGGCGCGAAATTCAAAATTAAATTTAAAATTAAACCGTTGAAATTTAA:1 - chrX 7776545 5' + Rt1b 110 1 61.39 GGTTCAACTTTAACTTCGATTTTCAATATTCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGATGGCCAGC:1 + chr2R 12731613 5' + X-element 4436 1 56.52 AGGAATTAAAAAAAAGCCCGGTTCTCCTCAGGACCACTTTTTTATTCTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTA:1 - chr3L 24109635 5' - blood 7176 2 73.27 AATTTAGTGTAGTCAACCTTAAGTTTTTCATTTCTTTTTCAAGCTATTTTTGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAG:1 - chr3R 19445120 5' - micropia 49 4 54.46 ACGGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGTTGCCGACCACTGAAGCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr3R 9870362 5' + F-element 51 1 59.41 GCAGCACTTTCAACTCGATCTCAGCCACATGTTATGATTGGTTCGTGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTC:1 - chr3L 776260 5' + Tc3 314 1 58.02 AGCTTACGATAACTACAGTAAAGTTATACATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 3146549 5' - roo 360 2 74.26 GAGGGTTGGTTTCAGCCCAGTACCGCATGTTTTGTTTGTTAACCGACCCACATAAATGAAATTTATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCACACAT:2 + chr3L 23649965 5' - mariner2 190 1 70.30 GCAACTCATAGTCCTCCGTNCTACCTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGT:1 - chr3L 8724806 5' - Tirant 59 2 76.24 AAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1 + chrX 7480789 5' + Bica 340 2 50.68 TGAATCAACACTGACTCAAAATATTCAGAGAGATCTTTTCTTCGAACTCGTGTTCTGGGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 2845727 5' + roo 8683 2 60.40 AATATAAATAAACAATTCATTAATTAAAATTAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 + chr3R 4434025 5' + Juan 51 1 76.24 GCCCTCCTGGAGGATTCCATTCACCTCTTTGTCCACATAAATTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCA:1 + chr3L 3356876 5' + 1360 3321 1 59.41 TATTGAGTACCTTATTACCTTGGCTATTTTGGTATTATACATATATATTGTATTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAATCGAACTAATGTC:1 - chr2L 20836545 5' - 297 376 2 58.42 GTGTAATTTGAGCAATGTCAAAACCCAAGCCCGCTAATTGAAAGTCGTTGCTGTAGTAGTTTTATCCGTTGTCCACTTTTGTGTTTTTTATGTGCCTTTTT:1 + chr2R 7166206 5' + transib1 353 1 57.43 GTCGAACCAGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr3L 153638 5' - 1360 3346 1 69.31 GATTTCTATCTTATACCTGCAAGTGAATTTAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr3L 10395928 5' - copia 245 1 69.31 GAGTTATGTATCATCGAACTATAAATAATAAATAAATACGTAAGTACGTTATGATGTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTAC:1 - chr4 621493 5' - copia 5025 2 59.41 ATTTGTTGTGGCGACAGAAAAATATTTACAAAGGATGGACTGAGAACCGGTATTTTTAAATTTTATATAGAGTCTGGACTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCC:1 - chr2R 18890252 5' + Chimpo 1 1 81.19 GTATGCAGCGAAAAAGGTGTCAACTGCATTACTCATCAGATTGATTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGT:1 - chr2R 10857753 5' - BS 5061 1 56.44 ATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr3R 20284787 5' + pogo 45 1 75.25 GCGGCTTTTCCGACATTATTTTCACTTTGAGAATATCGTGGATGTGTCGACGTAAATCATAATAATTTTTTTTTCTCCTTATCTTTACAATCTGTCTTAAA:1 - chrX 20385835 5' - G4 3833 1 57.43 CACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAG:1 - chr2R 4181304 5' + gypsy5 6967 2 52.48 ACGAACCTGAGCACTTTCGGCCATACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chr2R 22898744 5' + Transpac 4968 2 74.26 TTCAGGGCTGAGCTTTAAAGTCTCCAAAGCTGAACTAGCAATGGAACTAAATAAAACTTATAGTAAGACATTTATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCG:1 + chr3L 2714443 5' + BS 14 1 70.00 GGCAGATGGAATTGAGCAGGGGGCTTAGGGGGGCAAATCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAG:1 + chr3R 18342194 5' - F-element 275 1 63.37 AAAATGAAGGCTGGATTGCTAAAGTGCCAACGGACCGACCGACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACG:1 - chrX 18727854 5' - Cr1a 4399 1 58.02 GCATCGTCGTCCCTTTCCGCATAACGCACTCTCTCTTTCTCTCTCGTTTTTTTTTTTGCGCCCCGATTTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTT:1 - chrX 1060297 5' + Cr1a 54 1 56.44 GTATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACC:1 - chr2R 5424285 5' + 1360 3347 1 65.35 TTAACAATTTCCCTTTTGCTCGGCATTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATC:1 - chr2R 20458554 5' - hobo 422 1 74.75 AAGGAAGAACTAGAGCTTTTGGATTATCACTTGGTTGGATAATAGACTTCGAAGTTGAAGTGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCG:1 + chr2R 4103365 5' + Rt1a 4729 1 60.40 AAGTTCGAGGAGCCAGACCTAGACGTAAATCTGCCCGAGGATATCGCCTGTGCAGCAGCTATTTAAAGTGAAAAACACGAAACGCAACAACA:1 + chrX 8716432 5' + TART-C 182 2 52.17 GAAGTCGCTCTAGAATATAAATAAACAATTCATTAATTAAAATTAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 + chr3R 4434012 5' + Juan 38 1 63.37 AAGGTAACTTTTATTGGGCATTTACTTGTTAGGTTGCAAATCAGAAACGAAAAAAAAAATAGTTGAAAAAA:1 - chr3L 1906982 5' - FB 174 1 73.24 ATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 + chrX 5997264 5' - 1360 3336 1 78.22 TCCGAATAGAACCACGTACAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chrX 19812405 5' + Transpac 4955 2 74.70 TAAAAGTTCATCAAACTATTTACAATTGTTATAAATGTATGGCATTATGTACGGTATAAGTCCTAAAGTGTAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCA:1 - chr2R 12298495 5' + rooA 98 2 40.59 TGAGTTTGAGTTGGACACATTTACTTTGTCACCCTATAACAGAATAATAAAAAAATATCATAAAATTTTACTTTACTTTTTAAATTTCTATGTTTTCTAAA:1 - chr4 774196 5' + TAHRE 10156 1 76.24 GTGGGAAATTGTCGGTGTCACTTGGACTAGCTGAGTAACGGGTATAATTAGACTGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3R 2210507 5' - 1360 3370 1 68.32 GTAGTAAAGTCTAACCCTTGAAGACATTTGGTAAACTGCATCATGGCAAATTGTCTGCGGACTCACTGCCTCCATTTCACATATATATACATACATACATA:1 - chr2R 14336839 5' - G3 4508 1 59.41 GGATTACTCTCGCTTTTGCGGAAAAGGAAAGGAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTAT:1 - chr2R 24444009 5' - Doc 228 1 77.23 ATTAAAAATATTACGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTAATATGGACGGACG:1 - chr3R 11146224 5' + micropia 5404 2 76.67 GTAGCCCCATATATATAGTGGTTCTCCGGCCCTCGAAAGAGACTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3R 15537306 5' - P-element 2857 1 49.50 TTTATTTCAAAAGACCGAATGAGAATGGAAGAATAGGACGAAAATCGCAACTATCCCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3L 16807703 5' - P-element 2870 1 63.00 GACATGCCACAGACACACCAATTATCCCCATCAAAACTCAAGTGAAAGCCCAACCGAAATGGGAATGAATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTC:2 + chr2R 8518210 5' - invader1 4003 2 71.29 AAATCAACAATATCATCGGATTATACGTATATCAATGGATATCTGGACGAGATAGAAAGATTTGTTTTTTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr3L 16478349 5' - pogo 2098 1 64.36 GAGAACTATGTCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAA:1 + chrX 22726204 5' - Helena 1264 1 51.49 TAAAAAAAACAAACAGAAANATATATTACATATGAAGACTGCATTTTGATCTTTAACTATATAATAAATTCGCAGATAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTC:1 - chr4 264717 5' - INE-1 580 1 61.39 GTATAAATGCAAACTATGCCACTCCATCATACCAGCTAGAATGATAACCAAGTTCCTAAAGGATGTTGGCGTTACCGTCTTGGACTGGCCACCTCAAAGTC:1 - chr3L 3979792 5' + Tc1-2 1151 1 67.33 CAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAAAACGTATCGCAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 8037605 5' + roo 13 2 51.49 TAATAATAAACAACGAAAGCCCGAGGTCTGAAAATCGATTTAATCCCCCATACTTTCGCCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 + chrX 9463338 5' + hopper 14 1 65.35 TTAGTCAAGAAAACCCCCATCAACCCAACTCATCAGCCCCACTAAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCC:1 - 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chr2R 19015133 5' - diver 86 2 59.41 GCAATTTGTTTTGGTCTCGATTTCGTTGGAAAGATTGCAAAACTTGGAAATAAGCTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3R 10434635 5' - 1360 3370 1 60.40 TGGTTCGAAGCCCCAAACGAAAATCCCCGAAGAAAGAAAGGAAAATGCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACACTTCTATATTTAAACCA:1 - chr3R 15928518 5' + F-element 4240 1 52.00 AATTGAATACACCAATAAGAAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr2R 4030076 5' + Doc 60 1 78.22 ACATTAAATGACGGAAGAGTGCCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAG:1 - chr2L 16626433 5' - mdg3 250 1 78.22 CAGAAATGAAATTCTTGAATTAATCCGCTGATGATGTCAAATAAATGTCAAAGAATGCGTAAGTGGAAGCTCAAAGAAGATGGGGTCGGAAAAATCGAATT:1 + chrX 19385210 5' + FB 13 1 67.33 TTGGATGTAATGTAATATCAATTTAATTATGATCAAAGAAAATACTGAGATCTAAGGGTTTTAGGAACAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAT:1 - chr3R 10229474 5' + copia 4879 2 67.33 GTAAATTTCTTAAGATATATTAATCTTAATTACAAACTGAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chr3R 13085479 5' + F-element 47 1 59.41 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTG:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 126 1 59.41 TGATAATATATGTATCTCCATATTTGCCGAAAACTTGTTTTGGCAGATGAATGTTTTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAAC:1 + chr3R 15825271 5' + McClintock 6009 2 62.38 TAGGTTTTACCTGTTCCTGGTGGCCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATT:1 - chr3L 14074897 5' - Juan 3744 1 80.20 TTTCAAGTTTTGCGGCACTCGAGTACTTATACAAGTACTTTACGCCCCCAACTTGGCCCAATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chrX 15412761 5' - hobo 2925 1 66.34 AACGGTCACTCTGACTGACTGCTTTTCGTTTTCGATTTCGTTTAGCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 - chr3R 16594553 5' - Tirant 8479 2 53.47 TAAGGCTTTAGGATAAAAGTGCGCTTGTGTTTGTTCGCATAAATGGCTACATCGTAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 19594682 5' + roo 8683 2 62.38 TTGCACTTAATGCGCCTTAATTAAAACAAAACTCTCCCTACCCGCCGTAGGTAGGCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACC:1 - chr3L 13597280 5' + 412 7248 2 47.52 GTCGAAAGTTTCCAGGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3L 14690979 5' - roo 9030 1 70.30 GCTCGCAATAAGGCTAAAAGGAAAACTGGAAAAAACTGTTGCCTACTTTTAGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr2R 18988514 5' + hobo 4 1 68.32 AAAATACCGTACCATGGCCATAGAGTCACGCTCTACGAGCACTGCAAGTGAAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATAC:1 - chr3R 25759168 5' + Transpac 421 1 57.43 AGGTTATAAGTATCGATCGAAATTCTCCAAAAGATTTTGTTGCTAATATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr2R 13258791 5' + F-element 15 1 70.30 CATAAAATCTTCCCTTTTAGCCAGGCTTATGACACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGG:1 - chr2R 21757225 5' - Doc 4558 1 67.00 GAGACGACGACATGTGTTTGTGATATAGTAGAATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr3R 20284819 5' + pogo 13 1 67.33 TGAAGGTTGTTAAGAATTGGTGGGATTTTTTTTTGAAATATAATGCATATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr2R 16907486 5' - opus 480 2 57.43 CAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATA:1 + chr3L 19274785 5' - transib2 2812 1 64.36 TTAATGCGCTTTTCCTGCTCTACAAGAGCATGAAGCCGCAGTTTTTCTTGACAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATG:1 - chr3R 30006617 5' + HMS-Beagle 6673 1 53.47 GATATTTGAAACAAATTCATTTCTATTTTGTTTCTTGCCGACGCTACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCGACGCCT:1 + chr3L 27253233 5' + Ivk 5138 1 59.41 GGAGTCACCAGCACACAACGACTTGAGACCAGGATCCAAGCGATGGACGCCCGCAGAAGATTAGAGGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1 - chr2L 20340418 5' - jockey 4935 1 72.00 AAATGAAACTTTCTTGAATNATGATTGTGAGTATATGGTTTGTGGAGTTTAAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr2L 12076644 5' + jockey 32 1 50.50 ACAAAACTTTAATATTTTCGAATTTTCTATTGAAATGCCAAATACAAATACAAAAACAAATCTCAGAAATGTTCGGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 3095293 5' + 1360 3 2 69.31 TTTACTTTAAGCTGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr3L 3822377 5' - pogo 2078 1 52.48 AAAGCTTGATAAAACGATACACCCGTTTTCTTCTCTATGTGTGACGGGTAAGCCAATTCTTAGTTTCAAGGATAAGCAAGAGAGTATGCTATAGTCGACTT:1 - chr2R 5741266 5' - INE-1 575 1 76.24 GCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCA:1 - chrX 22913201 5' + gypsy7 14 2 61.00 AATTGCCTGAATACCATTTCATGCTTAATATATTTATTTGATTAAATCCAGTATCAATCTTTGTGTAATCATTTAAAATTTTTTTTCTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 13910613 5' - Doc2-element 232 5 67.33 GCACACAAGCAGTCAAAAAATAAAAATGGTCATACAAACTTACGCTGAGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGT:1 - chr3L 4729455 5' - INE-1 160 1 67.33 ATTGGCATCGCTGGGAATGGCAAGGCCAGTAAATGAATAGACCGGCTAAATACACAAATAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chrX 17109632 5' + roo 15 2 71.29 AATGCGGGGTTGGCATGCAGTATAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCTGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCG:1 + chr2R 12315962 5' + springer 349 4 77.23 TCAAGTAATCACACCTGTTAAATACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 17415256 5' - roo 9021 2 76.24 AGGACCTTCAGGTGGCTTTTTTGCAACTCCTAGCACGGCGGGTTCTGAAGTTGAGGTGGCGGCTTCCCCTCCGTTCAGCCGGGCACTCTTCCTGGGGG:1 - chr3R 12418250 5' - aurora-element 480 1 68.37 GGAATACCAGAGATATGTATGTATGTATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr3R 26804054 5' - I-element 5303 1 75.25 ATTATAAGCGCGCCAAAAAGTATGCAAGTAATTTTTTACAAGCGCCTCCACAGTACATTACTTGCAGGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGG:1 + chr3R 8460833 5' + BS 2 1 70.30 AGCTGAATGCTTCTAAGCTCTTCTTTATATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chrX 13379700 5' + 297 30 2 73.03 TGCAAACAAGGCCATAAAATTGAAAATATTTAATTAAAACGATGCGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr2R 15915321 5' + FB 32 1 57.43 GTGGGATGTTGTTCATGAATTTTCCAGAGATCAGCACTTTAAGCCAATATGATTTGGAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 - chr2R 8707108 5' - flea 240 2 63.37 ACCGCATCCGTTATCAAAATCTATTACCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 - chr3L 5974036 5' - hobo 2891 1 70.30 CACACAAACAGGACAAAGTNATTCTGCAATTGGAATAATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAA:1 - chr3L 13367755 5' + mdg3 34 2 54.46 TGTTTGTATGGGTGCTCTCCTGTTTGTTTGCTTCCTTGTGTGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTG:1 + chr2R 14552222 5' - Doc 252 1 58.59 TAGTAGATACGAGATAATGTTCTACCGACCGCGCTTGCATTGTGGGGCACTGGTCCACCAAATATACATTTGTACGATGTATGTATGTATGTATGTAAAAT:1 + chr2R 9710375 5' - 412 7276 2 71.29 TGGTTTGACATTTGAATAATTTCGAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:2 - chr3L 5256007 5' + jockey 29 1 69.31 AGGAGGCAGCAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 18105755 5' - roo 9034 1 63.37 ATTTTGTGCTATGAAATCACATTAGCATAAAGTAGGCTACTTAACAAAGTCAATGAACGTAATAATTATACTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr2L 18077483 5' + hobo 2 1 77.23 GTCGACACAATTGATTTGTAGCGCAGTTGTCTTAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - chrX 19614971 5' + 1360 38 1 65.00 GATACAAATGTATCTTCAACCGAGAAGAGATACATTGTGCGTGTGACACAGGTGGCCTACAGTGGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGTCATGGGTTC:1 - chrX 20732601 5' - Burdock 5928 1 68.32 AATTGCCTGATAAATAGGTTTCAAGGCTACATCTTGTATGTTATTATACCCGTTACTCGTAGACTAAAAAATGGTATACTATCGATATCCCAGAAAAATGA:1 + chr2L 22092709 5' + INE-1 503 1 66.34 TTTATAAGCATATCTAGCACAGTTGTTAAGATTTGTAATGTAAGTAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATA:1 + chr3R 9278421 5' - Tirant 8421 2 55.45 TTTGAACCCCGAACCCCAATTAAGTGGGCTATCTTTTCTGCTAAATCATGGTTTCTAGGCGGTCCTACATATAAAAATGCTCCTTGGTATATGAGAACAAG:1 + chr3L 4235585 5' + jockey 4566 1 76.24 GCAAACTTAAATCGTCCCAGACTCCACGGCTCGAGTGACGGCACAAAACTTTTGCCAGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTC:1 + chr3R 27851433 5' + Max-element 8293 2 69.57 AGCCGCTCGCGGAAATTTAATCACCTCAAGTGCTGGGAAAAGGACCTGGGAATAGCGGTGGAAAAGGCGTTGCTACCAGAGAACTGCAGGCCGCCACTCGC:1 + chrX 9904568 5' - hobo 2935 1 73.27 GAAGAATAGGACGAAAATCGCAACTATCCCCAAACCATGATGTAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3L 16807730 5' - P-element 2842 1 35.64 AATATGGAGCCATAAAAGAGCATGTACCGCAAATCGCGTACCGCTGCCAAAACGCAACTAATTCATCTTCTGTGTGTGCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 + chr2L 2937604 5' - blood 168 2 69.31 TGTACATGGAATGGCAAAGCGAACTACCAGCTAGAATTAACATAACAGAACGTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATA:1 - chr2L 13084115 5' + F-element 4428 1 55.45 TGTCGACCTCGGGCAGTGGNATCAACCCACTGCTACCACCGCCGCCTCCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGT:1 + chr2L 17788319 5' + baggins 5065 1 53.54 GAGAATGTTTTGGAGAACCGCTGCTGGGGGAGCAGCAGAATTCTGCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTC:1 + chr3R 20430762 5' - hopper 491 1 48.19 TTGCAATCAAATGACAATTTTTATACAAAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGGTGTCTTAAAAGCGGAT:1 + chr3L 12983175 5' + diver 32 2 50.50 TGTAATTTGTACACTTGTTCGAAACGAACCTGAGCACTTTCGGCCATACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr2R 22898721 5' + Transpac 26 2 54.46 GTTTCACATTCTTTTTTTTTTTATATTTTCGAAAATATAGATTAAAACAAGCAGAAATAGCAGTGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTC:1 - chr2L 2938634 5' - HB 1402 1 77.23 GAAAAATGTATTTATACGCTCGTTAAAAAATCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGA:1 - chr3L 19780490 5' - flea 389 1 70.30 ATGCTGACCGTTGGGTTTAGTACTAATCTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3L 24150575 5' - blood 7341 2 74.26 GCATCTTTGGAGGCTCCTCTGCGGCTCCTCAGCTGTGAGTATTTTCAATTGTTTACTAACTAACGTTCTAGTGATCTTGATCAACAATATACACACTTTTT:1 + chr2R 5473328 5' + transib2 2616 1 39.60 GTTGTAGTGCTTGCCCTGCGTGATCACAATGACGCGGCCAGCTTTCAGTTCCTTTTGGATCTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGTTTCAATACTG:1 + chr3R 23770293 5' - Circe 7323 1 68.32 GTGGATGTGGAAAATCAGAGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chrX 10426907 5' + 412 7105 2 82.29 ATAGTTGCCTTGGTCCAAAAGATGTAACGCGTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chrX 22771518 5' + opus 7152 4 68.32 GTTTTCAAAGGTTCATCGGTTTGGTGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGACGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAG:1 + chrX 4277589 5' + R1A1-element 413 1 73.27 ACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCC:1 - chr2R 2529357 5' - 1360 3376 1 36.63 TTAAAAAGTGAAAATTCAGCGCTCTTAATGAGCATCGTTGAGTTCAATTAGCATCGACACATAGAATGTTAATCCGCTGTTATGACAGCTGTAGCACCGGG:1 + chr2L 11775946 5' - diver 5912 2 64.36 TAAATAATTACTATACCTCAACTGAAATGTATCAATCTGATGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAA:1 + chr2R 10857700 5' + BS 4909 1 59.41 TAAATATTCGCCACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:2 + chrX 5997242 5' - 1360 3358 1 58.42 ACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGT:1 - chr3R 19950517 5' - BS 5061 1 56.44 AAAATGTTATTTCAAGATTTCATTTAATCTCTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1 - chr2L 15174148 5' + Juan 4074 1 69.31 TTTATATATATTTTTATATATATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTCTTCAAAGTTGCAATTTTTTTCAAACAGCTACATGTGGATATCAC:1 - chr2R 5943527 5' + hopper2 1255 1 76.24 TTTATAATGGTTTTTGCGTGGCCACAACTGCACTGCACTTTTTTTCAAAATCTTTTCTTATCAGAGGTGACACAATGCCGATTCGGCATTTCACAGTCTTC:1 - chr3L 12903928 5' + Doc 3 1 70.30 GTTTTCAGTCTCAGCTGTTNTTGCTAATATGCTTGGCTATGTTAAACTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr3L 1927417 5' + mdg3 5282 2 54.55 AAGTGGGAATGGGAAATTGCGTCCAGAGTGAGGGTGGGATTCTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTG:1 - chr3L 675871 5' + BS 61 1 58.42 AAGTTTTACCTTTCTTCTGCAAAGTGCTATTTTCCAACCTGTAGTCGAGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 28475881 5' - roo 9047 1 55.45 GGTAAAGAGTTGACTCTCAAGTTCACTGTAGTCTAGTATCTGCAATTTGGAGTGGGGATGGCATTAGAAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGT:1 - chr2L 1191616 5' + transib2 2723 1 64.36 TGCAAACAGATGGCCAGTTTTAAATACCCTAATATATGTCAAAAAATAATTAAATTACCCAAATGTATGTATGTATGTATGTAATGTATGTATGTATATAT:1 - chr3L 14284656 5' + 1731 95 1 68.32 TAATTATAATAAACGTCGCNGGATTTTCAAATTGACTAAAAAAAACGTATATAGATAATAATATCGCAGAGATTCCCTTTTTTTGGCATAAAGTCAAAAAG:1 + chr3R 1835338 5' + transib3 23 1 64.36 TTCTTTTTATTGTTTATTGAGGAAAGAAGCTACATAAAAATTCCCGATCATTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chr2R 8717723 5' - 297 6955 2 59.41 AATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr3L 3822398 5' - pogo 2057 1 72.28 GTTAGTAGTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 22469127 5' - hobo 2924 1 62.38 AAAATGTGCTAATAATCACAGTCGACTGATCTTAGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACC:1 - chr3L 27411696 5' + hopper 474 1 66.34 GCGGGCACAACACTTTCCCACCGCAAAGTGCATCGAATGAATCAAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - 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S-element 1246 1 62.38 GGGTTTCAAGAAGATAGGAACTTATCCTTTATATCCTTTTATCTTTTACAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 24169985 5' + roo 8691 2 56.44 GGATATGCACTTTTCCTATGTCAAATATATAGTGTTTTACATAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCT:1 - chr3L 19569233 5' + BS 30 1 60.00 GAAATATTCAATGCTTTCCGCGCCGCCTTTTTCCTCTGTGTAATACCCCTATCAGCACAGGATAACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACAT:1 + chr3R 5962579 5' + I-element 5197 1 72.28 GAACCGCTGCTGGGGGAGCAGCAGAATTCTGCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGAGATCTT:1 + chr3R 20430776 5' - hopper 459 1 67.33 TTCTGCTATCCCCAAAAAACAAAAATTAATAACGAACATCACCACCAAATCCGAAATCTCAAAATAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTG:1 + chr2R 13809728 5' - S-element 1522 1 65.35 ACTTAACAAAGTCAATGAACGTAATAATTATACTCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 18077445 5' + hobo 40 1 63.37 ACGATGTGCTACCATAAAAACTGTAAAAAAATAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGTAACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTG:1 - chr2R 4578526 5' + Chouto 312 2 65.35 ATATGCCTCTTAAATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - 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chr2R 24555687 5' - hopper 1377 1 62.38 AAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3R 7869127 5' + 297 6622 2 66.34 TGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTATTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGG:1 - chr2R 5924407 5' - jockey 4726 1 52.48 TGTATATCACTAATGTTTTGTTTACGGTGTAAATAAGTATGTTATGAGTGGCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGT:1 - chrX 14691619 5' - BS 4843 1 55.45 TGGCGACAATGCACTCAAAACAAAAAAGCCTTAAAAAGACTTAAGTTTCACACGCCGCAAGCTGAGTACTCTTATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATT:1 - chr2L 5756055 5' - 1360 386 1 55.45 AAATCGTTTTAGCATGTTTTCCACACCAACTAAAGTTAAACCAGTTAACTAAATGCAAAGTCACAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2L 13433885 5' - hobo 2926 1 67.33 AACGAATATATTCCTGTTTTCATAATAATGTTTCGATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chr3L 19778775 5' + flea 4794 2 63.37 TGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCT:1 + chr3R 11151839 5' - mdg3 197 2 72.28 GCCAATTTCTATCGGTAGTCCACAGACACGCCAAGACTTTTGAACAATTTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTATTGATATCCCAGAAAAAT:1 + chr2R 6165465 5' + INE-1 501 1 55.45 ATAAATTTATGGTCGGCCCTTCTGGGCTCAATAATAAGTAAAAATTTTCGATTATTCGGGGTTTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTT:1 + chr3R 11098700 5' + opus 108 2 60.40 TTTAACAAACAAATTTAAAAAACTTTCAAGTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGA:1 + chr3L 10951226 5' + 1360 3163 1 71.29 AGGTTTAATTTTTTTTTTGCATGTTCATTTTCTCAATTTTTGTTTTATTTTACAGAAAAACATTGAAATTTAGGACTGATGTTGCTTAATTTGTTTCTTTT:1 - chr2R 21959107 5' - HeT-A 5763 1 56.44 CAAGATCATGAATGAGAAAGTCTCAGTGGTGGAGTAAGATATTTTTATACCCGTTACAAGAGTCTTCTTCTGTTTCCTTAACGAAACGCTTTCTGGCACGT:1 - chr2R 3065952 5' - invader5 3963 2 57.43 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3370 1 56.44 CTGCTCATTCGCGTTGTTTAATCGATGAGCAGAGCGAAAGCTGTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chrX 6338946 5' + P-element 33 1 47.52 TTAGCATGAAAAATTAAACNACAAGCGCTACACAAAAATAAATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGC:1 + chrX 15561087 5' - 1360 200 1 67.33 CCAGTTTTGCGCAAAAATTCGCTTTTATTTGCCTTTTTTGGCCGAGGAATTTTTCGTTTGTTTCTAGTGTACTGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr2R 20588746 5' + Tabor 7 2 66.32 TGAAAGCGAAAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3R 28628124 5' - 1360 3348 1 68.32 AAAATGTGTGCGCCATTTCGCATATATAATAAATCAACGTAAACCGAAAAAAAAAAACTAATTTGCGGAATTCGACAAAATGAGTGTGCCAATTCAAATAG:1 - chr3R 25508826 5' + Copia1_DM 329 1 56.44 TTTAATTTGTGTTCCTTTAAGCTGGCTTAGCAGGGAATTATATTTGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATG:1 - chr2R 8518299 5' + invader1 3645 2 61.39 AGCCTAGACTAATCCTAAAAAACAACGTATGGAACTTTAGTAGTCCGCATATCCCCTTCCTTGGTTGCCATACCGCGGGGGGTCCTGGATTTGCCCTCCTT:1 - chr2L 9547312 5' + Rt1c 5358 1 71.29 AGGGCGACGGCCAGAATCACCAGGTGCGTCGCCGACATTTTGCGGATCTACCCAATTTGCGGGATCGGTTGCGGCTGAGTAATGGGGATCTGATAG:1 + chr2R 13234860 5' + INE-1 547 1 78.12 TTCTTATGCTTGTATAAACGCTGCTTCTTGTGGCACGCAATAAATAGTTATAGTGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3L 13597198 5' - 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roo 9034 1 68.09 GGCGGGCGGACAGGGGTGGATCGGGTAGGGATTCTCCGATGATTGCGTTGACCCAATTCTTTTTCCCGTATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr2L 3344034 5' + hopper 148 103 50.00 GTACATAAATCACAATTTCTTTTTTTTTGAATAAGAACTATTTTTATTTATGTATATCCTAAATCTCTGCACTTCCGGTGCTATTATTTTGACCGCAGCTG:1 - chr3R 24574243 5' - Tc1 3 1 81.19 AACCCCAATTAAGTGGGCTATCTTTTCTGCTAAATCATGGTTTCTAGGCGGTCCTACATATAAAAATGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAAC:1 + chr3L 4235596 5' + jockey 4577 1 65.35 ACACACAGGCACATGTGCACAGAGATAGAAGCACTTCCTCGTATCAAATTTGCACACCTCATCAATGAAAGGGGTTTATTTATTTTTTATTTAAAAAAATG:1 - chr3R 16517758 5' + Transib5 2795 1 77.23 GCCGAAACGTGTTTGCGGTGGCAGAAGCAGAAGCGGCAACAAAAACACTTTCATTTCCAGCTGCATCGCCTTAGCTTTATTTTATTTTTTTTTTGTAATTT:1 + chrX 8262088 5' - Doc 4699 1 75.25 AATGGCGAAATGCCATCTGCGCGATCGGCATTGCAGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 4650506 5' - roo 388 2 59.41 AACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATT:2 + chr3R 4536209 5' + Ivk 55 1 77.23 AATGACGATGGCAAGGGCGGCCAGGCGGAGCCCCAGTTCGAGAAACTTAACTTTGTATTTTTGAATGAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTA:1 + chrX 15486199 5' - X-element 137 1 76.24 TTTTTTGGGTTAACATCTATCTTTTTATATACGTATATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chr3R 22517312 5' + jockey 4712 1 63.37 TGTAGTTTCATGATTTTTGATTAGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGA:1 - chr3R 20950663 5' + jockey 4523 1 77.23 TATACAAACATCATTTTTTGTAATAAATTATTTGTGCGCAGGTAAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:2 + chr2L 15907123 5' - pogo 2094 1 72.28 GTGTCTGCCGCAGAAGGCGTGAGGTGAAAGCGAAAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3R 28628148 5' - 1360 3372 1 58.42 ATATTAAAATTGTGGGCTACTAGCTTTAAGCAACCCACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr3L 5808235 5' - 297 6941 2 68.32 GACGTTGCCCGAGTATTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGATGTGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGA:1 + chr3L 13430284 5' - mdg1 462 1 63.37 ATTATTTACTTTTGTATTTAGTAGCAAAAGTAACAGGTAGAGCGAAGCGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 20375797 5' + roo 8692 2 57.43 GCTCCTGACTTTGTCAATGGTGAATCGGATTGTGAATAAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGGATTTTTATTG:1 - chr3L 4570913 5' - Quasimodo 7339 2 60.20 GAAACGTCTTTAGTCACCCGAATCTTGAGCAAACCATAGGAGCGATTAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCTTGCAATA:1 + chr3L 12438504 5' - P-element 2843 1 51.49 AGAGCTCTGTTAGCATTGCAGAAGTGTTTTAACACACCCGAAATTCGGACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3L 12266834 5' + P-element 26 1 54.46 ATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chrX 3649747 5' + jockey 27 1 67.33 AAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 3475326 5' - roo 9030 1 71.29 GGCCGTCAAAAAATCGATGAGCGGAATGGGAATGAGTCACTGAATCGGCCGCCGCCCCCTGCATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGC:1 + chr3R 8705437 5' + jockey 405 1 69.31 ATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:2 - chr2L 14054788 5' + F-element 52 1 65.35 AATTCCCCGCGATCCTGCAACCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 + chr2L 15479572 5' - blood 7339 1 79.38 CTTTAAAGTGGATTCAAATGAGCACTTCAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1 - chr3L 12634232 5' + BS 5021 1 53.47 AACATGGCCTAAGGAAACGAACAGGTCCTGAATTTCAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAA:1 + chr3L 7988223 5' - McClintock 6080 2 64.36 AGTAAGGAAAAGATTCTAATGGTTTTCCAAGGACTAATAATTCAAATGCAACACTATATCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGGGCTGGATTAGAC:1 + chr2L 7193922 5' - F-element 4491 1 65.35 AACCCAATGGCTAGGACCCCCGCCGCCCACTGCCACGCCCGCTCTTGTCAAACGCCCACCACTTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 + chrX 11025487 5' + hopper 16 1 63.37 ATTGTAAATTTTTCATAAAAAACTAATGTAACTAATGTAAGGAAGTGCGGACATAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTCAGACGCCGCAAGA:1 + chr3R 16912527 5' - 1360 425 1 59.41 ATAAATACCTGGATAAAGGTAAACATGATTTTTGGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTA:1 - chr2L 12199551 5' + Stalker2 1 2 74.26 GGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGAC:1 + chr3R 5773178 5' + Stalker4 7010 4 80.20 AGGGAAAAATTTGTTTACCAATTTTGCATGCGTAAAACAGTAAAGGAAAAAGAATAAGCTTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAG:1 - 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diver2 4704 2 58.00 ATCTGGCGAATTACGCATCGAATTGATATTGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr2L 8913325 5' - mdg1 377 2 67.33 CTTTTGTAAGTGTGTGAGTTTGCTGGGGGGCCACCATTATTGTATTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAAT:1 - chr2R 23873415 5' - baggins 5150 1 76.39 TTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGAACGCTATAGACGATTTACTCAACTATCAGATACCCGTTACT:1 + chr2L 18177062 5' - INE-1 550 1 56.76 TAGATAAAAAGAGAGATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr2R 5201016 5' - 1360 3373 1 63.37 GACACACCAATTATCCCCATCAAAACTCAAGTGAAAGCCCAACCGAAATGGGAATGAATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTAC:1 + chr2R 8518221 5' - invader1 383 2 60.40 AAACCCCAAAGAATCGTGCGAGCGGGATGGAGCGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 5206559 5' + roo 8706 2 67.33 AATTGTGAAAAATATCCAACATATATTCAAGCTTTTATAGTTCCTGAGATTTTGACGTTCATACGGACAGACGTTCATAGATCCTGATCAAGAATATATAC:1 - chrX 22484897 5' - INE-1 80 1 70.30 AGGTACATCAGCAATTGAGTATGCTCACTGTCAGGGGCTACTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAA:1 - chr3R 23682546 5' - R1A1-element 257 1 81.19 GGGGTGCAGTAAGCATATCCATGTCCAAGGGGGGTGGAGTGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTGCCGGGAAAATCTAGCTTTTCATTGTCGTGTAA:1 + chr3L 10682598 5' + aurora-element 4176 1 60.40 AACCGGCTAATTGAAATCGTTTGTCAGCACAGCCAGTTGGCTCTGTAAACAGAGTGTGTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 5973969 5' + hobo 14 1 65.35 GAAAAGTTTCGGCTGTGTAAATATTTGTTTAAAATTCCGTACGCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 771832 5' + roo 28 2 58.76 ATTAAATTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 13334849 5' + hobo 33 1 69.41 TCAAGGCCACTTTTCCCGTTTTCTCTTCAACAGTATGGCATTAAACATTGAAAAATTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 13214969 5' - roo 389 2 61.39 GCCGCGCACGTGTGTGGCTATTAGAGGTGGAACCGTATCGATTTTAACGGTCAATCAATGCCTCCTACTACTACTAGCTAAAAAACACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 14601176 5' + G-element 4325 1 57.14 AACAGATTTGATATAGTAAAAGGCATACATTTGCATGGCAACAAAACATACACACACTTCTTTTCTTTCGAGCCACGTTGTCATTTGGCACTCTTTGCGTT:1 + chr2L 231521 5' - invader5 457 1 64.36 AACTTTCATAAAGATATAAAATTATTGAGTGCCATTAGATTAGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2R 16680123 5' + 412 7088 2 62.38 TTGCATTTGATTTCTCGGGCTTAGTTTTTGCATTCAAAGCGAAAGAAAATTCAGTTCCTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 25397140 5' - roo 390 2 63.37 TAATACCTTTTATCTTATACAACTTATTACTTATTATTAACGAAATAAGTTTATGAACAAGGCCAAGGGAGAAACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAAA:1 + chrX 19595895 5' - gypsy12 10152 2 59.41 AAAGGATTCCAACCACATTAACATTGGTAATTAGAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGT:1 + chr3R 10453191 5' - I-element 4952 1 66.34 AAGCTTAGAGATTGGAAAGAGTACTTAGTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2R 24169927 5' - roo 9025 2 72.28 TACCAATCCAAATTGGTTAATAGTGCGATTCCATGGATATATAGCGTTTGCAATTATTTGATTTTTGAGAAATACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGTTTG:1 + chr2R 12102736 5' - HeT-A 5932 1 55.45 AGTTCGGTTTGCGAGCATCGAGGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTCACCTTTCGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCGGA:1 - chr3L 1128627 5' - Quasimodo 191 2 77.78 GGATGGCAAGGAGGTTCCACTTCCAGGCCCCCAATTACCCATGCTCGTATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGA:1 + chr2R 11820897 5' + gypsy6 26 2 53.00 TGTTATCTAAATAAGAACAAACTGTTATTTATCTGGCCATAAGGGTATGTAAGGATCTCTAATGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAT:1 + chr2L 14931098 5' + F-element 92 1 68.00 ATCGAAGACACTCTGCAAGCATGAAAGCATCAAGGATGTTGGACAAGCGATCCATTTTAGAGTTATATTCCATACGTCCATATTAGTTTTATTAACGCCTT:1 - chr3L 15066580 5' - Porto1 4248 1 64.36 TGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 7534689 5' + Tirant 43 2 73.40 CTGGCTTAATTAACCAAAACGTGGTCAGGGCCAAAATCAGAGCCTGGAAAATGAACCCTCTGCCCATACACCACAAAAAAATAAAACAAAAACAAAAAAAA:1 + chr3L 20718348 5' + Rt1a 5078 4 89.11 ACTAACTGAATGCCTACTAAAACGCCTAATTGGAACTAAATACGAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATT:1 + chr3L 11523736 5' - jockey 4833 1 55.10 TGGTTTTGGCGGCTTTAATTGATGGCGTTTATTTATAAATCATCTCATGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2R 11661187 5' + 1360 3 2 76.24 TGAACTAGCAATGGAACTAAATAAAACTTATAGTAAGACATTTATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 + chr3L 2714473 5' + BS 45 1 57.43 TGCATAAAGTGCGATAAAAGGGGAGACACTGAAAGAAGCAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATAC:1 - chr3R 13684431 5' - Tirant 223 2 57.43 GAAATGTTGATGGGCCAAGTTAATATGAATGAATGATGATAAATGCGCAATGTTTTTGTTCATAATTAATTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 - chrX 13567713 5' + FB 7 1 70.30 ACATTCTTAGCCCCTTCTTGTTTGAAGAAGTTACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 8434229 5' - roo 404 1 74.26 TTGTTTATGTGCAAAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 7461074 5' + roo 45 2 70.30 ATAATAATACTTTTATTGACAATCCTCTCTGCTAATCTAAGGAAAATCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 11009495 5' + roo 8694 2 56.44 TGAAGAAAGTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 + chr2L 15817947 5' + I-element 12 1 69.31 CGGACATATAGAGAGAGGCTTGGGGTACAACGCGAGAGCTGCAAGTCACGCATCTGGGCTCCCCTGGTACGTGACGAACAAGGTAATCGAAAGAGGTCTGA:1 - chrX 7139130 5' + G5 4501 1 66.34 GGATATGGATGTCGGGAGTCGAAAGTTTCCAGGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 14690996 5' - 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chr3L 14322829 5' - Bari1 283 1 65.00 CTCAGCTGTTGAAAGAACTTCTTAGTAACTTAAGTTCTTTTAGTTTTATACATAAGAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chr2L 1432117 5' + opus 13 2 66.34 GCTCTCACTACATCGATTACATCTATATTATATAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:3 - chr2L 3475365 5' - roo 406 1 79.21 ACCGAACCTTGCTGGTTGTCGCGCATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 + chr3R 16594493 5' + Tirant 8156 2 73.27 GTCACGTATTTATATAGGTGAACCCAAAAGAGAGATCTTTCAAAAGTATACGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr2R 13432904 5' + 297 14 2 64.29 AATTGAAGTTGTAAATCTTGTTCTTTAGTTTTTGGATTGGCACTTCCTTTAAATTGCCAGTGAAGGCAATCAACTTGGGTTTAACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3L 16047739 5' + Tc3 237 2 34.65 GGCCACCAAGGCCGCAACTGGCGCCACTTCCGCCGCCGTCAAGTGGCGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2R 6769519 5' + 412 29 2 55.45 ATTATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 + chr3R 27083001 5' + jockey 4716 1 70.30 AAAAAAATTTATTTTTTTTTAGAACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTTAAAACTACAACAGT:1 + chrX 16243361 5' + Doc 60 1 80.20 TAAGTTTAATTTTGTAGTAATTCGTTTATAGTCGCAAGATAAAGCCGAATCTATGCTCAAACACATTCTATTTGTTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 12182580 5' - roo 408 1 71.29 GGTGAGGGGCAGAAAGGGGATGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:2 - chrX 21374214 5' - P-element 2837 1 30.69 TAATAAACGAATTAAAAAAAAACTGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGC:1 + chr2L 7660851 5' - G5 4559 1 68.92 GTTGGCAACTCGCACACTTTTTCACGCCCGTGACCCCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2L 8646680 5' + Tirant 8146 2 64.36 TGCCTGACTACGTGACTGTACAAAAGTTGGGTAAAGTCGCGAGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3R 16005448 5' + Doc 32 1 54.74 GAGTTAACTACGGTTACTATAGCAGAATGTATTCCATCTGCTTATCATCCGTTTTTAATGCACAATTCTTTGGCAGCGGCACTTAGCCGTTCTTGTTAACA:1 + chr2R 19184631 5' + 17.6 7118 2 62.38 TGTGATATAGTAGAATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 20284801 5' + pogo 31 1 61.39 ATGTGGTTTCGACCTCCTCGGAGTCTGGCTCATCCCCACTACCGGAACCTGGTGGCAAAAGTAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATTATCACAA:1 - chr2L 17486756 5' + 1360 351 1 55.45 TTGAGTGGAAGACATATGGATTTGCAGTTAAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2R 20460975 5' - 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chr2L 5345396 5' - Doc 4698 2 61.29 TGATTGCGACTACAACGCATTTGACCACATACTGCAGAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTTATCCACATCGTCAGGTGCGTATTGTTAGACAA:1 - chr2L 16181813 5' - X-element 19 1 63.37 TACTTCAAAATCAGCCTATACCAGCAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3L 5808182 5' + 297 6628 2 74.26 TTTGTGTGTGTAATTTTATNGAGAACACGCATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3L 25120177 5' + pogo 41 1 70.30 TTCTGCAAAGTGCTATTTTCCAACCTGTAGTCGAGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 28475867 5' - roo 9054 2 52.50 ACCCAGTACTTTGGGGTATGATGATTTGGGTACTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 + chr3R 30611249 5' - blood 7346 2 71.29 GTGTTACCAAATGGCTGTAAATTAGAAAACATAACCATGAATATTTAAAATACACTTGTCTGATTACTGCCAAAATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTG:1 + chr3R 19271087 5' - 412 7450 2 81.19 TGGCTCAATATGAAACTATCTACCTGCATCGTTCTGGTTCCTAGAATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAG:1 - chr2R 3515259 5' - Porto1 4211 1 55.45 AACACTTAAAGACTGTGCATTAAAGTTTCTGCTGACACATAGACAAGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTC:1 + chr3L 21397529 5' + Doc 421 1 54.46 ACAAATTAAGATAAGTCATAGATTGCACAAATAAATAATTAGCAATTAATAAAAAAGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGAACCTGACAAA:1 + chrX 13616860 5' + X-element 23 1 55.32 GAATTAAGTATACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:2 - chr3R 14980554 5' + 412 26 2 54.46 TGGGAAGTGGACACATATGGGTATGGTAGACAGAGTTCAAAAGCAAAGTCGCGGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAA:1 - chr3R 26970437 5' - FB 33 1 58.76 GTTAAAAATTATGCACTACTTGGCTTGTAGTTCGTTTTGCAGTATTTGGTGTGAAAATACGTTTCCACAAACCCATGGCTAATGAAATGTACATATATATA:1 - chr2L 4378800 5' + Juan 4180 1 74.26 TAACAGGCTCATATTTGAGNTGTTTATCGGATGGCAAGGAGGTTCCACTTCCAGGCCCCCAATTACCCATGCTCGTATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGG:1 + chr2R 11820869 5' + gypsy6 7418 1 79.21 TCTGTAGCTCTTTTTGTTTNTTTATTTTACGGCAGTCGCCGGCTTGAGGTTAAGTCGGGTTTCGTTTGGGATGGGGCTCACGTCATCATCGTCACCATGA:1 + chr2L 7705222 5' + Rt1a 4716 1 68.00 TGATGGAATGCTGTTTGATGTTTGATTGGTTTGCCGTTCCAATGGCGACATTGATATGAGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCA:1 + chr3R 15046239 5' - X-element 422 1 65.35 TTAAAAATAAAGGGCATTTAGATATCGATAAGGAGCTATAAGGAGCTAAGGCGCCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 - chrX 21057007 5' - Tirant 376 2 54.46 GTAATGAAGCTGCGACGAAATGCTCCTTCGCAAATTGGGTATTGTTGCATTACCAACGGGAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAAT:1 + chr3R 8706563 5' + jockey 286 1 68.32 TATGGCCACATTAAATCGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:2 + chr3L 15444851 5' - mdg1 7404 2 81.19 ACGTTTTTACTCTTGAAATATACATATGTACATATGTACATATGTACATGTGTACATATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chrX 2164276 5' - mdg1 403 2 51.49 GTAGGGATAAGATACTTATACTATAAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 6074350 5' + 412 24 2 47.52 AAAAGCCACTGCAAATGGCAATAGGTGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGT:1 + chr2R 16990552 5' + R1A1-element 77 1 74.26 TAATTTTATTTAATAAAATTAAACGTGCTTCGTCTGCAAAATATTCTCACACATAAACATAATTAAAATCGACTTTCAAGTTTAAAAATTAAAAGTTTAAA:1 + chr3L 22293797 5' + TAHRE 153 2 84.16 AAATATTCGAAAAAGGCGACTGAACACCGTCAACAACCCATTTATTCCGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAA:1 + chr2L 7540994 5' + Doc 4517 1 54.46 GACGGTAATGTAATGGAATATTTGGCCATGAGGGCATATTGATGAATTGATAAATATAAGTGAAATTCCGATTATAGCTTTAATAGTTCCTGAGCTCTCGA:1 - chr3R 4779185 5' - INE-1 146 1 74.26 AGCTGGGAATTTCAGGTTGGAGACCCCAGCAAAAGAAGTACTGTTGTTCCGAATGTACACTCGCTTAATAAAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACT:1 - chrX 153637 5' + mdg1 7404 2 53.47 AGGGCTTAATTAACTTTCGAGTACTCGCTGGCGGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTTCTTT:1 - chr3R 24732946 5' + BS 40 1 64.00 AAATAATTATAAAAGGCACTAGGGAGTGAAATAACTTGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAGCACAGGTGGAATCGTGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAA:1 + chr3R 26104447 5' - Gypsy12A_LTR 1957 1 66.34 GTAAAACAAAAATGTTCTAATAGTAATTCGAAAAGTGCACGTCTTGACTTTATTAACGCTTCTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTG:1 - chr2L 12455336 5' + jockey 4960 1 50.50 AATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGC:1 + chr3L 27356100 5' - Tc3 1662 1 75.25 GGCATCGTTTGTACAAGTTGTTTAAAAATCTTCTAGTACGCTGATTTCTATCTTATACCTGCAAGTGAATTTAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 - chr3L 10395970 5' - copia 253 1 72.28 GTAACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 + chr2L 22699411 5' - 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chr2L 7804322 5' - 1360 3363 1 56.44 ACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCC:1 - chrX 22386796 5' + hobo 51 1 65.35 ATGATTTCGGACTGTTACTAATTCCGAGCTAAGCCGTTATCACGGCACCATATTTGAAATCGATCTAGAT:1 - chr3R 21098328 5' - Q-element 644 1 54.29 GGGATTCGGTGTAGGAGCAACCACCTGACCTGCCAACCAATTGGCGTATGCCACCAAATGCCTTAAATGCTAAATCTATCTGTGCTGCAATAAAGATAAAA:1 + chr3L 21884102 5' + looper1 1608 1 59.41 GATAGAAAGTTTTCATAAANCTGATGCGAAAACTTCTTTATTGATATATACAGTATAGTTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr3L 25120242 5' - pogo 2071 1 62.38 GTTTTGTATCTGCAGCCTANGTTTTAGTTATTTATTCACGCGTTTATTGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 + chr2L 9618660 5' + FB 30 1 55.45 AGCCTTCTTTCAGGCTAAGATCAACACAACATCTTTGCGGGGTAATTAATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 - chr3R 27083041 5' - jockey 4960 1 56.44 GTCTCCTGGCGGCGGTAAGCTATCGCCGCAGCCCGGCCAGCAAAGCAATGTCCGTCTATCCGACTGTCCGTCTGCCCGTATGATCGTCGAGATCTCAGGAA:1 + chr2R 6614696 5' + INE-1 139 1 55.45 AAACTAACTATGCGATAAAGAGCAAAAACGAAAGGGGTGCAATAAACATGTCACTGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGGGGCCT:1 + chr2L 14873959 5' + rooA 105 2 67.33 TTGGCTTGTAGTTCGTTTTGCAGTATTTGGTGTGAAAATACGTTTCCACAAACCCATGGCTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAT:1 - 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hobo 2646 1 65.35 TATCTATGGGTGGATTTTTTTTAAATGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 7505361 5' + FB 175 2 92.11 GCTGCAATATGAGTATACTCCATGCTATTAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr2L 3740595 5' + hobo 48 1 74.26 GTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:2 - chr2L 9319125 5' + jockey 21 1 61.39 GAAGAAAGAGTTTCAAATACATTTTAAGTTGCGATACATTAAGAGCTATATATTTTATATTTTTTTTAGGAAATCAAATTTCCACCTGCAGTAGTGCTATT:1 + chr3R 30665734 5' - Tc1 19 1 66.34 AGTTGTCAGTTTTTCGCCTTTCTTGCTTTAAAAAATGAACTAAACTTGAAGTTCTAAACAAATAAATACCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 + chr2R 13712123 5' - mdg3 5492 2 47.52 GATATGTAGGCAATGTTTTTTATAAGTGCCATGCACATTATTCAACTGACAAGCTGTTTCACGAATTACCTTGTACACCCCAACAGCCTAG:1 - chr2L 20550866 5' + jockey 4667 1 75.82 GTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAAC:1 - chr2R 12185423 5' + accord 11 2 64.36 TGAAGATAAGAATTGTTATATTCTTTCATTAAAAAAAATTTATTTTTTTTTAGAACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3L 25782381 5' + Doc 29 1 52.48 GAGCTCGAATAAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCT:1 - chr2R 4339520 5' - G5A 2795 1 78.22 GTCAATACTTCGTTAATACTTTTTTCTCACATATAAGTAGACTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3L 12717795 5' - pogo 2074 1 55.00 TGGGCTGGAACTGGATTTGCAGTGTGTGCACGAAGATGATCAGGAATTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGG:1 + chr3R 22532855 5' + hobo 2925 1 73.24 ATTCATTTCATATTTGGATTTATTTTACAACATATACCGTTTGGCCGCTCCGCCTCCTTCCAACTTCACGATTTTTTTATTTTTTTTTACTTTGCTTTTAT:1 + chr3L 15466525 5' - F-element 4673 1 70.30 TGCAAATAAATATTCGCCACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chrX 5997236 5' - 1360 3365 1 55.00 TCACAATAAAAGGAGGCAGGAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 18105745 5' - roo 9044 1 54.46 GCCCGATTGAGCAGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 27455526 5' + 297 14 2 66.34 TAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:2 + chr3R 26342937 5' - blood 337 2 63.37 TAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chrX 21087611 5' + mdg3 42 2 77.23 TATCGGTTCGGCAGCGCATCACACACACAACGCGAAAAAAAAGAAAAAAATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAG:1 + chr2L 10003849 5' + transib2 2688 1 64.36 ATTCCTTGAAAAGTATGTAACAGGCATAAGGAAGCGTTTCCGACTATAGAAATTATATATATTCTTGATCAGGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAG:1 + chrX 124082 5' + INE-1 129 1 86.14 AGCAGCCGCTCGGTGAAGCTCATAGTTAATCCCTAAAGCAGTCGCTTGCACATTTCATCCCACCACTTTTAGGGTATATGATAGTCGGGACACTCGACTGT:1 - 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chr3R 14708774 5' - roo 9031 1 68.00 TATCCTCGTCGGCAACAAAAGCAAACAATTTGCGCTTTGTTATTGTTTCTCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGA:1 + chr3L 16748207 5' + HMS-Beagle2 6863 1 58.42 GTATTGACACTATCTAGATAAGAATAAGATTGTTATATGAT:1 + chr2L 20908930 5' + Idefix 117 2 65.85 ATATTCATTTTAAAATTCCATTGCTTTGCTTATGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 - chrX 16237954 5' + mdg3 5300 2 66.34 AACCTTGAATACTAATTGTTGTTTCACGTTGATTTTAATGGCACTGGCTGCGTACGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2L 15909813 5' + Tirant 21 2 60.40 GCGTCGTATCTTGTTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chr3R 13685227 5' + Tirant 8137 2 59.00 TTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCCCGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGG:1 - chr2R 1949128 5' - Cr1a 4418 1 71.79 AGTCAGACGATGACGAAGATAGTCAGAGTCAGGAAAAGTCCGGATCAAGCTCGACTCAGTCAGTGTAAATGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCT:1 + chr3R 6125649 5' - Doc 207 1 69.31 AGCCATTATTAATGCTAAAAAGAGAATAAACTAGTCAGAATTCAAAAACATATATAGTACCAAATTTTATGAACAGGAACGAGGAAATGAATATGATGTAA:1 - chr3L 25120886 5' - Cr1a 4328 1 72.28 TAGACTTAATAAAACTTATTTTTATCACTCTTTTCCTCATACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGT:1 + chr3L 7304803 5' + copia 4816 1 60.40 TGGTAGTTCTCTTTTATCTACGAAGATTTTCCATTAAGTTTACTCAGTTCAGTTGGTATTTATCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTGT:1 - chr3L 12007727 5' - Porto1 4456 1 56.44 ATTTTTAGTCAATTTCTATTGATATTCGGACATTTCTTGCCAATTATTAAGTTTTTTTTTCATTTTACTCCCCAATATCTATCGATATTCCAGAAAAATTA:1 + chrX 22963344 5' + INE-1 503 1 50.50 AACTTGCAATAAGGGAAAGAACTTTGGAGAAATCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGT:1 + chrX 12153194 5' - Doc 335 1 67.00 GGAGGCAAGTAGAAAGGTCCTTTAAGGAGAGGAGATACAAGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3L 15435502 5' + blood 2 2 77.23 TGGGAGTAGTCCGGTCTCGACCCGGGCACAGTAAAAATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGC:1 + chr3L 13568811 5' + jockey 431 1 64.36 GGGTTTAAATTACGCCGGAGCCCCAGTAAATGAAGTGGGGCGATGGCAAAGCCATGACAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATC:1 + chr3L 12214339 5' + F-element 4333 1 64.36 TTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 - 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Quasimodo 37 2 52.48 AGTATTTTACAACGAGCTGCTTCCCCAATATTTCATCATCATATTATTATATAATTAAATCCTACTAACACTAACATTTAATATAGTTATTTTACATTATA:1 + chrX 7088477 5' + Cr1a 4316 1 57.43 GCCAAAAGTGTACAAAAGANTTATCAACATACATATACATATGTGCGTGTGTGTGTGTGGGTATTGCTTCTTGTTCTTTTTATTTTATTTTATTTATTTTA:1 - chrX 14957883 5' - G7 1147 1 68.32 GTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2L 16939875 5' + opus 147 4 62.38 GTGGTGGAGCTCACTCCCGCTCCCGCTCTCGTGCTCGTTATATTCATAAAGCTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 20821738 5' - 1360 3366 1 55.45 AGCTAAATGATGGCCCAACTTACTAATGAAGCAAAAACTGCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3L 17146881 5' + pogo 30 1 60.40 ATAAGGGAAGCGCAGTGTTNAAGACGCAGCGCTGAAGAAGATTTTAATAAAGAGGAAGGAGGAAGACGAGTAAGCGAATCTTGATTGTCCTCGCGAAGCAA:1 - chr2R 4396943 5' + Rt1c 5314 1 67.33 GTATTTTTCTATCAACTTAAAGGCGAAAGCACTAACAGAAGTAAGTCGCAAATCTGCATCCATAGAGATCGGTTGTGGCGCGCGAATGCAAAAGTGATCTA:1 - chrX 15258353 5' + BS 31 1 53.47 GGGGTTGGGTGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:2 + chr3L 6866173 5' + 412 33 2 57.43 AGATCGCAGACGGCCGCCGGACCAATGATGCCCATGCCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3R 16613139 5' + 412 7090 2 63.64 TATCCGAGTGGCGCCCAGGTACAATGCTTTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTAT:1 + chrX 17217743 5' - 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roo 403 1 73.27 TAACACCAATACCATGTTCCGGTTAACCACATTGTGATCGAGGACGTGTGCTGGTCAGGAAGGCCGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTT:1 + chr3R 8515518 5' + invader6 10 2 60.82 ACTTTTTAAGTATAGGCAGACCAATGTTTTGACAATACAATTGCTGAAGCGGTTCAATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 9867530 5' - roo 9053 2 60.40 ATTTTTCGGGCCGGCAAAACTAACTGGGTAACTTTCCCGAAGGGGGAGCTCCAATCAAATTGCAGGCAAACAGACTCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACT:2 + chr2L 9471173 5' - roo 406 1 75.25 AGCAAACACGACACCAAGTGCAAAAACAAATTAGCACAGTTCTTGGCTGGCTGTTGATGCTGTGATGTATTTATGTATGTTATGTAGTTGTTGGTGGTCTT:1 + chr3R 7630922 5' - Stalker 6963 4 69.31 CGAACCACTTAATAAGCACGACCAACGCACCCACACACACACACACACACACATATCGTCCCTTGTTCGTGTTGATCTATAAAGAACACAATAATGCATTC:1 - chr2R 18486794 5' + Tabor 7313 2 53.47 CAGTCTGGCAACTGGCCATATTCTATTCTCATTCACTCCATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 + chr2L 2309383 5' - Burdock 225 2 56.44 GAATTCTTCATGATGATCTTTAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTAACTCAA:1 + chr2R 4802900 5' + mariner2 521 1 71.29 TTTGTTATTCACTTTTTTCTTTGCCCCAGCTCGGTGTAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr3L 10683444 5' - 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chr3L 12903917 5' + Doc 14 1 57.43 AGTTCAAGTTCGTTTCTTGNGGCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3R 25208371 5' + P-element 53 1 25.74 CAGATGCATAATGGACAACCCACCTCAATTACGTAATAATTATGGTGCGCCCGGTTTAATTGTGTTTATTATATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr2L 20709482 5' - roo 405 1 75.25 AAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAATACATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATC:2 + chrX 15903172 5' + INE-1 96 1 45.54 GTGGATTGAGTAGATACAGATAGATACAGCTGCAATAGGTAGAGATGGGTATGTGTGGTGACGATAACATTGCCGGCTACCTCTTATAATGGCTAAAGCGG:1 + chrX 15164362 5' - gypsy7 5137 1 51.49 AGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAG:1 + chr2R 5582184 5' + Cr1a 458 1 50.50 AATTTTTGTAGATAAGCTANAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGA:1 - chr4 1271909 5' - 1360 82 1 67.33 GGCAGCATGTAAGCCCGCANAGGAAAAACCGAAGAAAAGAAAGGAAAAAATAAATAAACTTGAAGCCCCGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATA:1 + chr3R 8070482 5' + invader3 41 2 71.29 TAATTGATAGTGTCGTGATTTGGCTTGTGCTGCAGTCGGAATCTAGTTTGCTCATTCCAGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGGTGCAATACG:1 - chr3R 21681548 5' - Ivk 4983 1 51.49 GTTGGTTTTTCTTCATTTGACGTACTCAAAGCACTCATACACACAAACACACACAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGT:1 + chr3L 5976307 5' - hopper 1397 1 61.39 TGCTCACTTGAATGTATGTTTCAAGAATATTAATATTTATGTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3R 20791653 5' + pogo 47 1 49.50 AAAATACATAAATAATATGTACTTATTTATTTTCTCATATGTATATCACACCAATTATCCAATCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACC:1 + chrX 18584882 5' + Burdock 2 2 76.77 AAAGCGCACATTAAACTCTAAGAGAAAGACAAGACACTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCT:1 + chrX 21097024 5' - INE-1 168 1 62.38 GCCTGACATGCCACAGACACACCAATTATCCCCATCAAAACTCAAGTGAAAGCCCAACCGAAATGGGAATGAATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTT:1 + chr2R 8518206 5' - invader1 398 2 75.25 AATAAAAACTTTGCATACAAGAATTAATAAAAATGTTATAACGAATTTAATTAAATGTTTTATCATTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGA:1 - chrX 23280085 5' + flea 4756 1 78.49 GGCGTCTAAAGAGGCCTTGATGGCATTTCAAATATGTTTCGTTCTTTTCGACAAACAGCACTGCTTTGCGGATCATTTTGCTTGAACAACCGACAATGC:1 + chr3L 455127 5' - Tc1 447 1 65.66 GCGCCTGCGGTGGGTTGGTGTCTATGCTGTGCGCTGCAACGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3L 22616989 5' - hopper 1376 1 58.42 GATTCTCGTAATTCTCAATTAATCAGCTAAATTTGAATATATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTC:1 - chrX 19960989 5' + INE-1 110 1 59.41 TATCATTCTGTTAATCCCTTCTAGTAAATCAATTGGATGAAATTGTTGATGTGGCTGGCTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCA:1 + chr3L 1124343 5' + hopper 448 1 63.64 GGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3R 22469195 5' + hobo 47 1 76.24 GAACTCAAATGTGGACTTCAAAGCATTCGAATCCAGCTCAAGCTCATGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGT:1 - chr2R 7729669 5' - 412 479 2 50.50 TTAATATACACACAACTGTACGAGCAAATTCAGTAATTTTATCATTTTCACAAAAAAACTGCAGCTAAATTAAAAAACTTTTGTTTATAAATAAAACCGCC:1 - chr3R 15880994 5' - 3S18 342 1 79.21 TTTTCTTATTTCTGAAATTTGTCATAAATTCAGCTAAAAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2R 19594574 5' - roo 403 1 70.30 AGCCAGCAGCAGGTGTTCTTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAG:1 - chr3R 22909213 5' - Tirant 8073 1 81.44 ATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:2 + chr2R 11941217 5' + Doc 50 1 53.47 GTTCCCCTTTCCCGGATGCCAATCGACTTTTTGGAGCTTTGCCTTTTGCTTCAGCTTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAG:1 + chr3R 28660046 5' + 1360 485 1 63.37 ATGTTCTAATAGTAATTCGAAAAGTGCACGTCTTGACTTTATTAACGCTTCTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAA:1 - chr2L 12455325 5' + jockey 4971 1 49.50 TGTACATATTCATAAGTAGATATTATTATAGATGATACTTATTATGTAGTAGCTCATTTTCGACTATATAAAGTATATAAATTATTGATCAGGATCAATAG:1 - chr2L 21794147 5' + INE-1 85 1 56.44 ATAAGTTAAACAAATATACNGCGCACCCGCACACACATAAAAATGCAGATGCAGATGCACAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATAT:1 - chr2L 15548830 5' - Tabor 7310 2 63.37 TCGGAGGCGTCCGCAAATTCGTGAATCTGAATGACTGAAGAACTGTTTGAATTAATTCACCTTGGGATTCGAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 - chr3R 19446128 5' + Transpac 4923 2 73.27 TTAATGCCGCTCATATTTCGCGCACAGGAGCACACTATGGGGCATTTGGCCTGCTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 + chrX 20290468 5' - hopper2 1560 1 66.34 TCACAGAATTTTTGGCAAAAAGTATGCTGTGCATTAAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr3R 7688928 5' + Tirant 8149 2 69.31 AAAAATAGGGCATTTCAAAAGAGATTGAAAGCTGATTAATTTTCCTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 19628394 5' - Doc2-element 246 7 78.69 TGTCAATGCTCCCGCTCCTGGCTAGCGTAGCCTAGCCTCAGCCAATCGAATTCCAAAGAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 31474056 5' - roo 390 2 60.40 AAGAACTTCATATTTTATATATCTGAAAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 19513415 5' + roo 48 2 80.20 TAATGCGAGTGCATAAATTAATTAAATTACGTTATAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCT:1 + chr2R 20160181 5' + Quasimodo 421 2 65.35 ACTCCCAAATATATTCTTTTTCTGTTTCCATCGCGAAGCTGACTGTTTTTTTTTTATCACAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAGCCGTGGTAG:1 - chrX 22841777 5' + HB 490 1 64.36 AGATATCCAAAGCAATACGTATAATCTCGTGATATGGCTAATTTATGAGATCTTTCAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:2 - chr3L 16478463 5' + pogo 19 1 58.42 CAACGAGGGATTTTTTCTTCTCCACACTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 + chr2L 8627476 5' + hopper 145 103 75.51 TAAGCCATTAATGAGGATGCTTCCTACCTACCGATGATGATAATAATGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCAACCACAACCGCCCCCTTGCGCAGCGCGCAGGGC:1 + chrX 4454661 5' - jockey 222 1 80.20 TAGTTTCATGCCAAACGGANCCTACATTGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chr2R 11661104 5' + 1360 45 1 72.28 GATGTCTCATTATTTTGTTGCCTTCGTTTGGGGCTTTAATCAGGAAGTTTTTAATTGCGTCGTACGTTTTACCCGGCGACTATTATTATTATTGTTATTGT:1 - chrX 7590400 5' - mdg1 29 2 70.30 AAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3R 12115344 5' - 1360 3354 1 60.40 CCGTATAATGAACATTTTTGAGAAATTATTACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 - chr2L 20396985 5' - Transpac 5187 2 73.27 ACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:2 + chrX 17873177 5' + 412 7092 2 65.35 TGCTCCTACGACGCCTTGCCTACTTTGTCCTGTGTGTCGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGC:1 + chr2R 3068368 5' + Stalker 38 4 64.29 AACTGGTGTAAGATTCCAGCCATAAAAGATGGCACTATTACCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACGAAGGCTATCCAGCCAAGTATTAGGCCCGAA:1 - chr3R 4820096 5' + HB 1336 1 58.42 TTAATCTTCTTAAGTGAGACTGCCCTCGAATTGGGCACAGATGCTGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 + chr2L 14799101 5' - hopper 1402 1 54.55 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAATGGCTATATTGA:1 + chr2R 11367658 5' + Tc3 475 1 66.34 GACTCGAAAAGAAAGAAGAACTGTGAGATGAAGAGCTGGTAGTGCGCTTAGTGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chr3R 26799018 5' + P-element 22 1 55.45 ATATAACTAGGAGTTATGTGGATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr2L 19207959 5' + 412 12 2 65.35 AATGCACAATGTTATTTTAAGCAAAAATTGAAAAGCGTTCGTCAGTTAAGGCGCTATTTCCCGTCACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACC:1 - chr2L 16884140 5' + Tirant 8103 1 68.32 GTAGCCTTTGAGTGTCTCTGGCCCCTTGGGTGAAAACCCTCAGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 + chr3R 21924008 5' - transib2 2793 1 57.43 TCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr2L 15817970 5' + I-element 35 1 59.41 GCATTTGCTACGCTCCAGTTTTGAGATTTCCGAATTGGCTGACTACAAATGTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3R 19807438 5' - opus 479 2 60.40 GGAGTCTGTCACTTTTTCCATTCTTTTTTTTTT:1 + chr3L 9952519 5' - Doc2-element 229 1 87.88 TGGACGTGACAACCTGCGTCAACAAACAAAAATGTTTTTCCACTCCCACTCTAACGCCCTAAAGCCGCCAAACCGTTCACGCGCACACTTTTGAAAAATTT:1 + chr3R 2742667 5' + INE-1 255 1 62.38 GGCTTACCTCGTTATCATGAAGGCGGCCAGGTTGGCAGTGTATATGGCCAAAAATACCACAGCTCAGATGACCTGAAAATATGTAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 1490962 5' + TART-B 10632 1 62.38 AAGTAAAAGTCAAAATAAAGAGTTGCAAATGGTGCAGTGCCACATACATTTTGGTGTTACTCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGT:1 - chr2L 18500394 5' - Tirant 386 2 64.36 TGCATGCGTAAAACAGTAANGGAAAAAGAATAAGCTTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATAC:1 - chrX 12186785 5' + invader3 42 2 67.33 GCATGTAAGTTGTTTTACTTCAAATTTTAATTATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 11758374 5' - roo 9029 1 70.30 TAGCAACGCTAAACGACAAAAATAACGGTCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2L 21628880 5' + P-element 45 1 34.65 GCGAGTTTCGGCGCTTGGATTGTGTGAGAAATTCCCTTAATCAGCACTGCACTGCACCAGACCACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCG:1 + chr3L 8166704 5' - Transpac 60 2 71.29 TTTTAATGCAGATATGTTCTTGATAGCTTACCATCGCTGCGTCTTTGTCTTTAGATTCTGTACGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGA:1 + chr2L 180769 5' - INE-1 152 1 67.33 AATGAAGACTTTATTTTCACCCCTAGAAATTTTAGTCAGCAGAATCTTTAATCTTGTTGGAATATTTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACA:1 + chr2L 12603465 5' + opus 417 2 71.29 GGTAAGTCCGTTGGATGGGNGATGAGGGCGATGAGGGGGGTGCAGCAGCTTAAGGACACGCACGCTTGTGTATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTG:1 - chrX 6405754 5' - accord 180 2 94.00 ATATTGAGCAAAGGGTATCTTGCCGCCGACTCAGCCACTCTCTCGTCTTTCCCTCCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3R 26798930 5' - P-element 2867 1 59.41 AGGTAACTCGTTTATACATTTTTAAAATATACTATATAATTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTGGCGGAGACGTAAGAGAAG:1 + chr2R 4029943 5' - Doc2-element 362 1 62.38 GTTGATTTACCCGAAAAAGNGTGCTACGGAAAAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr3R 22469233 5' + hobo 9 1 67.33 ATAGAATTGTATGCTAAATAACACGGAATGACCTGAATTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCA:1 - chrX 11171009 5' + invader3 39 2 63.00 GATTTGCCAGAGGTGGATGAGGTGCGGATTTGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGATCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTG:1 + chrX 6006265 5' - jockey 4689 1 67.00 GGAGAGTGAGAAGAATCGGAGAGAAGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCT:1 + chr3L 3249975 5' + 1360 3369 1 79.21 TTACGCGAGTGTCGATGCATCCCAAACAAGAGTAAACATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAA:1 - chr2L 11415248 5' + Juan 4012 1 62.63 TGTGCAAGACACAAACAAANACCTGGTAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTG:1 + chr2R 24557391 5' + hopper 977 2 73.27 GAAACTCGAGTGTTTGGCAAATACTGAAAAACGTGGGCGTTGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGT:1 + chr3R 7688868 5' - Tirant 8472 2 59.41 TGACTGGAGTTGTTTTATTTTTTGTTGGCCATTATCCGAGTGGCGCCCAGGTACAATGCTTTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCC:1 + chrX 17217711 5' - R1A1-element 5309 1 54.46 ACTGTGAAAACAAAATAAAATACCCGAGACCGAATCCAGTTTTCTGTGTCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:2 + chrX 2123682 5' - P-element 2862 1 54.46 GCCTCTGCACTTTTTCTTTCGTCACTAAGCCTGGGCAACACTTTCAAGTCGGCTTCAATTACACAGCCTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 - chr2L 13732836 5' + Doc 13 1 68.32 GTGCAAATAGCCGCGAAATATTTTTGGAATTGCTTCACTCGAAATAAACGCTAGTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTG:1 - chr2R 20588841 5' - Tabor 7299 2 51.49 CTGGTAGCCAAATATGGTGCAGATGCAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAATTGATGGGTTATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGT:1 - chr3R 19445522 5' - F-element 4363 1 72.28 GCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 + chr3L 22112849 5' - diver 173 2 75.25 AATTGAAGTATTTGGGGTGGGCATGCCAGGTCTTCTGACACCCAAAATACAAACAAAATCGATTTGCATTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr3L 5403330 5' - copia 249 1 71.72 GATCAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr3R 25514124 5' - hopper 1371 1 70.30 ATCCAAAGCATCGTGCCAGTTTAGCTTCGCTTCCTTTTCGATGTAGTAGTATTTGCTTTCGGGAGTACGTTGTTGTTCAAAGTGATCGAAGGGTAGTCTTG:1 - chr2R 11414991 5' - Fw3 3106 1 55.45 AATACTATCATCAACGAAATGAGGTTGCAGCGAAGGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAGATCTT:1 - chr2L 4571371 5' + roo 8704 2 63.37 TAAGCCGCCATTTTTTGTGNTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chrX 4422672 5' + jockey 34 1 52.48 ATGTTAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr3L 22112615 5' + Doc 19 1 65.35 ACTCGCCGCTTCTCCGTTTNGAGTTTCCTGCCCCTCGTCCTCCTGTCCTGTTTTTTGTTTCTCTTGTTGTTTTTTTTTTTGTTT:1 - chr3R 19557577 5' - gypsy7 5013 2 61.90 AAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAAGTTTTTATCGTGCTCCGCCCAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr2L 14054786 5' + F-element 54 1 63.37 ATATGCTTTCGAAAATAAATTTTTTTAAAGGTCAAAAATTGTTAGAAAAAGACGCACACAATAAACAAATATATTAAGAGGAACACATAATACAATCCTGA:1 - chr2R 10278244 5' + hopper2 1333 1 65.35 ATATACAGCGAGATGTCTGGCGTTGGCATCTACAGCATTCAATAAAGAATGTTTGCGATTTTTATCTTGCTGCCGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAG:1 + chrX 7534601 5' - Tirant 401 1 81.19 GTAGGATATGCACTTTTCCTATGTCAAATATATAGTGTTTTACATAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGAT:1 - chr3L 19569236 5' + BS 28 1 57.43 AAGCTTAACTCAAAAAATTGTAAATTATAAGCTATTTTTGGCTAACTACCACACCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chrX 5194581 5' + hobo 24 1 53.47 TTTGGCTGCCAACTCACGTATGTGGCAGCACATTGGGGGCTCGGGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTAAA:1 - chr2L 19953605 5' - X-element 330 1 73.12 AAACTAATTGTTTTGCTTCTGAGTTTAACAGCACAAAGATCCGCAAGTTAAAGATGGAAAATTGCGTCGACCAATATCTATTGATATCCCAGAAAAATTGT:1 - chr2R 17055374 5' + INE-1 504 1 71.29 AATTTTCTTGCAGTTTTAGGTTACGTTTTTGGCTTTTACCACTGATGCCAGCTCCTTTTATGCCGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTA:1 + chr2L 14139350 5' - accord 7309 2 67.33 ATTCACTTTTTTCTTTGCCCCAGCTCGGTGTAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr3L 10683450 5' - opus 458 2 66.34 TGCTTACTTACAGACTTTTCTTTAATGTGCATTACCAATTATGAAGAAGTTGTATATTTCATTGACGAGCTGTGTTGAATTTGATTTTTAAAAATATATAG:1 - chr3L 5921643 5' - TART-C 11033 1 51.49 TTGTACCGGTGCAACATGGCGTATAAGCGATTGTATTGTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 + chr3L 3490021 5' - jockey 4944 1 66.34 GACCCAGTTTTGGATTTCCCGCGCTATCTCAGAAGATATCTCTGTTTTGTACATAAGTGTTTTGTTCTTAAGAGTACATAGGTTCTTAAATGTAAACATAA:1 + chr2R 9006853 5' - Tirant 8298 2 62.38 GTAGTATATCTTACTAGTATATTATGTACTTGGTGTGCTTAAGTATTCCCATTTTCCGTTATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 - chr3R 6609798 5' + Transpac 12 2 72.28 TTTTCTTTTCCACATACGATACCAGTTTTTGACTGTTTTTATGCTTATATGGGCATACAGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTAT:1 + chr2R 12569079 5' - X-element 4665 1 56.00 GCTAGTGCCAAACCTGGGACTGGAGTACATACCATCTCCCAACTATACCGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3R 24190679 5' - 1360 3364 1 55.67 GAGCGCACGCACACAGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 11278368 5' + hobo 12 1 58.42 ACAACTTTCCAAATATTATTGTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 4474249 5' - copia 233 1 56.44 ATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 20284783 5' + pogo 49 1 79.21 AGGAGCATGGAACAAAGGAACTATAAAATCCATGTATGGCCAGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGT:1 + chr2L 5820886 5' + GATE 40 2 58.95 AAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAGAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 - chr3L 22744711 5' + FB 30 1 66.34 AATTCGCTACTGCAAACTAACTTTCATAAAGATATAAAATTATTGAGTGCCATTAGATTAGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2R 16680105 5' + 412 7070 2 62.38 GTTTTTTATATTGAGCAAAGGGTATCTTGCCGCCGACTCAGCCACTCTCTCGTCTTTCCCTCCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3R 26798923 5' - P-element 2874 1 64.36 ACGCTTTAAATAATTATTGCAAATACCCAAAAAAAACTCACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATTTAGA:1 + chr2R 15135121 5' + I-element 5116 1 61.39 CCATCAGACAATACCAGTACATTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTT:1 + chr2R 982342 5' - rooA 305 2 66.34 AAATAAAACAAGCAGAAATTACAACAGGCGGCAACTATTCCAGGAGCCCACTCCACCCCCAGTGCCACGTGCTGGTACACCAACAAACGGTACTTACCGT:1 - chrX 20346949 5' + G-element 266 1 68.00 GAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 + chr2L 4888755 5' - BS 5048 1 71.29 ACAAATATTTAAAAATAATTGTTTTGGTTTTGGCTTTTTGCAATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3L 95835 5' - roo 405 1 74.26 AGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTT:1 + chr2L 23295813 5' - micropia 404 2 73.27 TGCAGTTGCACTTTTGCGCTGACCATTTGCACACCTGACCCCAGTGGTAGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chrX 9904668 5' + hobo 26 1 53.47 AAATTAAATATTTCCGCATNAAACTCAATTCTTACAACTGATTGAATAACCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chr3L 7204111 5' + Tabor 29 2 50.50 GAAATTTCGCTTAGTTGGCCCACTGTATCTGCGCTATGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2L 18500308 5' + Tirant 8144 2 61.39 AATGAAACTTACTTAATAGCTATGTTATTATAATTTCAATAAAATATCTATATGAGTCTCTAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGT:1 + chr2L 15002972 5' - copia 4960 2 70.30 AACATAAAATATGTTTTTAAGTGCTGCTCACAATCAGAAGCGAACCGTTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr3R 17552475 5' + Doc 37 1 53.47 AGAAATTACGCGACAAATAAAATTATGAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATG:1 + chr3L 24000625 5' - Quasimodo 7282 2 78.22 GCAAACACAAAAAAAAAAAGAAAAGTAAAAACAA:1 - chr3L 14869031 5' + gypsy7 5009 1 79.41 AGTAGGGCAACTTGCCGGTCATTAGAGACAACTTTTGAAGGTTCTGATAGCTCACTTCGTGTACAAATTAATGTGTTCATCCTTCGGGATGTGTCCTGTGG:1 + chrX 21933203 5' - gtwin 460 2 63.37 AAATGTGGCCGCGCATACGAAATTCGGATAGCCGAATATTTTTGGCTCCAGATGGATACCTGTTGGCTGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGCGAGC:1 + chr3R 6536726 5' + X-element 234 1 74.26 TGAAAAATGTGTTAAATTGTATATTCATATATGTACTTGTTTTTCTCCATGTGTTCTCCATGTCTCCGGCCGTTGGGCGTAAATTAAAATTAAATTCAAAT:1 + chr3L 11397340 5' - Rt1b 125 1 51.49 AGTTATGTGGATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2L 19207948 5' + 412 23 2 54.46 GATTTTATAGGTCGCACAATTTGTGGGTGCTCACTTGAATGTATGTTTCAAGAATATTAATATTTATGTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 20791626 5' + pogo 4 1 76.24 TGTACATATGTATGTACATTCTCTATTTTGGTACGTCCACTGAAACAAAATTATAGTACTCCTCATTTGCAGCACCTCTGAAGATCAATCATATCACCGTG:1 + chrX 13695906 5' + Q-element 185 2 66.34 GTGTCTAAGCTTTTAAATTATATAAATCCTTTGTTTATTTTTGAGTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chr2L 15818036 5' - I-element 5323 1 63.37 AATGATTAAGTTTTAAATATTCTATTATTTACCCTATTAATAAACATTTTTAGCGTAATTCAAATACCTGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3R 10229359 5' - copia 248 1 69.31 GCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGGCTCAAAATTGTTGTGTGTGATTCGAGAGGCAAAAAATGGCACCCTTGCAGTTCTCTG:1 + chr2L 15081435 5' - hobo 1 1 59.76 CATGTACTGCCAGCTGTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr3R 18171754 5' - 1360 3374 1 64.36 TTTTGTCTAATATTTTTTTTTTTAGCAGCAACTCGGATCATACAGTTTACGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTT:1 - chr2R 19350041 5' - Bica 476 1 63.37 AAAGGATTTGCTGTCACATTATAAACGCTGGCCGGGTTGACAATGTTGTGGGTCGTTCTTTTCAATTTATGGTACGGCGACCAGCATCCGAAGTATAACTT:1 - chr2R 16528075 5' - Chouto 52 1 56.44 AACTCGCGTATCTGCAACATTAGTGTCTGCAGGCTACAAGGTTCTTGAGAATACGCCTAACATTATGCATTCACACTAGCTGTGTAAAGGGTATCTGATAG:1 + chrX 19121224 5' + INE-1 547 1 59.41 AATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTA:1 - chr2R 8642971 5' + Doc2-element 4715 1 53.47 ACGAGGCCAACTGCGCCTCATTCATGCGGAGATCGCAGACGGCCGCCGGACCAATGATGCCCATGCCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3R 16613110 5' + 412 10 2 72.28 AGCCATCCATAAATCACGANAGCCAAAACCGGCGAGATAAGCAGTGGCATTTGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAAACGTA:1 + chr3R 12960486 5' - F-element 279 1 57.43 AAAATCAAAATTTTATTGAATGAATTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chr2R 7173678 5' - mdg1 373 2 73.00 ACGGAAAAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3R 22469208 5' + hobo 34 1 63.37 AGAATACAGTCTGGCAACTGGCCATATTCTATTCTCATTCACTCCATTTGTATACAAATTATCANTTTAGTGGATTTTCNATATATTTATTAG:1 + chr2L 2309377 5' - Burdock 239 2 60.22 ACTCGTTCGAATATCCAAGGCACTGAAAAAAAAAGAAGTTATGGACAGTCCATGTCAAAGAAAAGAGCTCTGCACACCTTGTTGTCGTTTCATTATTATTT:1 + chr2L 2084166 5' - X-element 145 1 56.44 TATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr2R 13258745 5' + F-element 61 1 76.24 TTTAAAAAATCTCATACTTGCAATTGTAGTACATACATGCATGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2R 16907571 5' + opus 30 4 63.37 GCGAATTGAATTTGTAGAGAAAAAATAAGAAAGTGCGCGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:2 - chr2R 24500891 5' + Tirant 8150 2 66.34 ATTAGTGCCTACATTTCGAACACTAATTACAATATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3R 5993122 5' + pogo 41 1 70.30 TAGAAGCCGTTCAATTGAATTCGCTGAGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACTAAGAGGGCTGCACAGTTTCCGCAGCCATCAACGTCAACGAACGCTT:1 - chr3R 5198082 5' + HMS-Beagle 58 2 77.23 GAATATCTGGCGAATTACGCATCGAATTGATATTGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2L 8913321 5' - mdg1 7419 2 63.37 AAATATAAGAGAATTGAGAGAATTTTTATGTATACTTTTGTACAGATCTAATGGAATTTGCTTTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATT:1 - chr2L 2416788 5' - 3S18 326 2 43.56 ACACGTACTAGCAACTAAATGGAGAGAAAGCGAGACAGACACCGAGTCAAACAACATTTGAATACGAAATTGCCCAGCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGTG:1 - chrX 12071782 5' - hopper 142 3 73.27 GTAAAACTGAAGCTAGAAANTAGAATCATCCTAATTCTGGCCTGTATATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3R 18549987 5' + pogo 19 1 57.29 GCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 - chr2L 14054794 5' + F-element 46 1 59.41 AAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTA:1 + chr3R 178121 5' + BS 41 1 68.32 TACCCTAATTGTTTTTTTTTTTCCTCTTTGTTATTGTGTCATAGCTGAATGCTTCTAAGCTCTTCTTTATATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 + chrX 13379657 5' + 297 6581 1 78.22 AATTACAGTGCATTTAGTGTGTATATGTCAGTTTCATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 + chr2L 21220768 5' + I-element 31 1 67.78 GCCAGGTTAGGTAAACACTTGCGAAATGAATTAACTTTAAGCCGCAAAATTTGTACTCTTGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2R 23122632 5' + hobo 17 1 62.38 GATTTGGTTAATTGTCGACTTCCTTGTGATTTTGGTTTAGGTTTATTGGTCGTTTTTGTTGCACATTGAATGGGAGTTATTGTTATTATTATTATTATTAT:1 - chr3R 14601079 5' - mdg1 17 2 75.25 TTGCTTTGTCAAATGTAATNCTAATAGCTAGAAATTGCAGAAATAGACGCGATCGGGTTTTTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 - chr3L 24253701 5' + Quasimodo 5 2 74.26 GACGTCGTCTTCCGGTGGCATTTTGCGCCATCGCAGCTGGATCTTCATTTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chrX 15268205 5' - roo 409 1 79.21 GATGGATGAGTTTCAGACTGCCAACATGCCTTCGAAAACAATGCATTTAATTCTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chr2R 11941192 5' + Doc 26 1 52.48 TGGTTACGAATTGCGTCGAAACAAATCTAAGGTGCTGTGCAGCCATGGGACAAGTGGTTATTATACTTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAG:1 - chrX 15082747 5' - Porto1 356 1 57.43 TAGGGGTACTATATGTAGGGGAATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACTTTGGTTTATTTGATACTTCCCGTGTTCAGCTTT:1 + chr3R 1977612 5' - invader2 5031 2 72.62 ACACCAACACACGCAACACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTCAGC:1 + chrX 4423707 5' + jockey 181 1 82.00 ATTTTTATTATTGTGTTCAGTTACTACGTAGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - chrX 8973002 5' - flea 214 2 67.33 ATTTTCCGCATAAACAGTTTGATTACATTTTCGGATACTTTTTGTGATTTTTTGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGTACAACGCTAAGAAAT:1 - chr2R 24320141 5' - 297 6925 2 71.29 ATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTG:1 - chr3R 14049401 5' - transib2 2777 1 72.28 AGGTAAACAAGATGGGAAAAACAACACAGATCGAATAATCATATTTATATCTGTAGGTATGTACATATATGTGTATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATT:1 + chr2L 7126732 5' - Burdock 256 1 78.22 TCAAAGCTGCATTTTTCAATCCATACAAAATTTGATTAAAACGCTAAATTGTGAAATATATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGC:1 - chr3R 13078332 5' + F-element 204 1 64.36 TTATTTCAAAAGACCGAATGAGAATGGAAGAATAGGACGAAAATCGCAACTATCCCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr3L 16807704 5' - P-element 2868 1 61.39 GCGCAAAATGGGTTAAAACTTTTACCCCACTCTGTACGTTTGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAG:1 + chrX 14087842 5' - accord 155 2 65.35 ACTGTACTTTTCGATCGAAATTTCGCTTAGTTGGCCCACTGTATCTGCGCTATGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2L 18500292 5' + Tirant 8128 2 56.44 TAGCCAAAGTTCTTATACGAGCTTCGTTCAGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2L 15526993 5' - pogo 2058 1 71.29 AAACACCAATTAGAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chrX 21056935 5' + Tirant 41 2 68.32 ACGCACACTTGCGGAAATGATGCTGACTCCGAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 28065556 5' - roo 9052 2 67.33 GTGTTCCGTCATGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr2L 8690523 5' + Tirant 28 2 52.48 AAGTTCAAGTTCGTTTCTTGTGGCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTTAATTCAGTG:1 - chr3R 25208372 5' + P-element 49 1 28.57 GGCCAGACAGTGTGAGAAATTATACCCATGGCGTCCAGCCCTCGTAGAGCACGGCCAGGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTT:1 - chrX 6837298 5' + R1A1-element 29 1 63.37 ACACACAAACACGTGCATGTAATACCATACGCCCACCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACAC:1 - chrX 7544700 5' + accord 7021 2 65.35 AGATTTCTCATGATTTGCTCGTTTCAATCGGAATCAATAAAAGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAA:1 + chr2L 11919280 5' + X-element 38 1 51.49 TCCAAGTCATGTCCGAATCCTTAACTTTGTGTGTGTGTGGGTTGTTGTCTTTTGCCGAGTGTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 + chrX 19412538 5' - Quasimodo 324 2 61.39 AGTGAACGGATGCAATTACTCAATTACTCTGGCCTTTGTGCATTGTCTGTAGATGCCAATATGTGTATGTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 + chr3R 16305440 5' + pogo 3 1 74.26 AATCCAAGGGTATTAAAATCACACAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTAAACCCAACCAAGGCAAAAACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCATTTAAAGAG:1 - chr3L 6845119 5' - hopper 380 1 77.23 TTTGCAACTTTTATTTTTGTTGTCCACTACCAGTGTGGAATATATAAAAGTTTGAAAATTTATATACAAACCTGTACAGTTCCTGAGATCACGACGTTCAT:1 + chr2L 21998665 5' - INE-1 139 1 59.41 AAATAATTTGCATTACTCTTCTCGGAGAAATGCGAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCCCCCCTGCACGGTTGT:1 + chr3R 15883446 5' - 3S18 5743 1 64.36 GGATGGGGCCGGGGGAAGGGGTCGCAAATCGGATTTCCGAAGTTACACGCGGATATACATACATATGTTTGTATGTATATGTGTATGTATGTATGTACACA:1 - chr3L 22122242 5' - 1731 73 2 68.32 AATACCGGCACTCTGAACCCGATGGATCAGATCGTTGATATGATCCTCGTATATGGAGTTCGATTGCATGACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:2 + chr3L 9542476 5' - roo 404 1 72.28 ACGAGATGTTCATTGTTGCGGAAAAGTAAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 13446632 5' - 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roo 361 2 69.31 GAGCAAATGTTTGGGCCCANAAGGGATTGGGATAAGGGTTTTTTGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACA:1 + chr2L 16951738 5' + opus 318 2 56.44 ACCCAACAAGAAATGCGAACGATTCACCAGCAACATGTGCATTCCAGAGTTCGAGTAATACGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCG:1 - chr3L 4504445 5' + Stalker2 7404 6 54.95 AAGGGGGAGAGGGAGATATNGGGGCTGTAGGCGTGGCAGGGGGCTGGAGGCTGGCGGCTGTCAGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr3L 9981872 5' + FB 15 1 63.37 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTT:1 - chr3L 11720528 5' - R1A1-element 4964 1 54.46 TTCGATTGAATCGTTCATCGGTGAAATCGGAACGGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 + chr3R 9870331 5' + F-element 26 1 62.38 CGGCTATTGTCATGAAAGGGAGGGTGACAGGGGGGGAGCAAGCGAGATAGGCAACCAACCTAGTCACCCCATTATAATAATTCAAATCTTCTAAATATTAC:1 - chr2R 6529533 5' + jockey2 3232 1 73.27 AAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 7869134 5' + 297 6628 2 73.00 AAGGAATAAGTATCGCAGCATCGACATCGATACTTTGCACCACCAAAACAATAACAGTGCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 + chr3R 5367507 5' + FB 18 1 62.38 ATTACGAGAAGGTGAACCCCCAGTTGAGCAAAAGGAGCGGCGCCATTGTAGGAATCATTGGTATCCGGAGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAAGGT:1 - chrX 1218823 5' - HMS-Beagle2 6773 1 72.28 AATGCGCATACGCAGCGTTGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chrX 11025601 5' + hopper 3 2 76.24 ACAGTGTTTAACTTTTGTGAAAGGGCCTTATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGGAAATAGTCCCCGC:1 + chr3L 13072324 5' - roo 281 2 68.04 ATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGCTGGAG:1 + chr3L 25272573 5' + 1360 88 1 71.29 ACGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCC:1 - chrX 23108342 5' + BS3 1406 1 69.31 GGTGATTATTTATTTTATGTCTGTATTTTCACGCATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 + chrX 3691536 5' - jockey 4953 1 70.30 AAACACGCGTTAAATTAATTTTGCCTTTATTTGCAGCAAAAGTATGCGAAAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCG:1 + chr3R 17636538 5' - 1360 430 1 58.42 TTGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - 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hopper2 1552 1 74.26 TTTATTTTGATAAATATTTTGCACTTATTTAATCATTTGATTTATATTCAATCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 5088342 5' - roo 9047 1 53.47 CAATCCTCTCTGCTAATCTAAGGAAAATCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 11009514 5' + roo 8713 2 75.25 TAGGAATCCTACTGTATTTNAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 7494016 5' - roo 9052 2 58.42 ACACAAATTAGTTCGCGTAGAGCCATTTGTTTCGCACCCAAGTTGCGGTCTCATCCTCGGGTTTCCGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTTTAC:1 + chr2L 11504280 5' + blood 7181 2 66.34 ATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2R 13258744 5' + F-element 59 1 76.53 GGTCTGTGTGGAGTGGGATGTTGTTCATGAATTTTCCAGAGATCAGCACTTTAAGCCAATATGATTTGGAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 - chr2R 8707120 5' - flea 5011 2 77.23 GTGCAAACAATTTGAATTTGGCATTCAAAGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAAGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chrX 8982933 5' - 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Stalker2 249 2 68.32 TTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGC:2 - chr3R 15021690 5' + invader4 2747 1 45.54 GGTGGCATTTTGCGCCATCGCAGCTGGATCTTCATTTTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 15268218 5' - roo 396 1 66.34 GTCCTTCTGGTCCTTTTGTNTGATTAGTTTGGGAGGGGCCAAGGCCAGGGCGGTGCTCTGCACCGAAAAGGAGATGGTGTGCAACTTGGCACCACATCCGG:1 + chr2L 19269470 5' + Rt1a 4879 1 54.46 TAATAAATTATTTGTGCGCNGGTAAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr2L 15907143 5' - pogo 2074 1 53.47 GCCAGTTGCCCAGAAAAGTATGCTTTAATATGTTAAATTCAATATTTCAAAGAAGTCCGATGAAAAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTG:1 - chr3R 11498669 5' + BS 5 1 61.00 TTTAACACAGACCTGCTCGATTATACAACCCAATCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCA:1 - chr3R 29941080 5' + BS 4765 1 69.31 AACACATTTAGCTATCTCTCAGCGTTTTACAAGAATTAGATTTGATTTAAATGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCG:1 - chr2R 15689642 5' + springer 7160 2 56.44 AATTAATATTGATTTGCAAAAGTTGTTGCGGCTCTTTAGCCAGCTTTCGGTTACGCTCTTTGGTCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 7411895 5' - 1360 3378 1 72.28 GATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr3L 11257415 5' + 1360 6 2 70.33 CGTACTGTACTTTTCGATCGAAATTTCGCTTAGTTGGCCCACTGTATCTGCGCTATGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr2L 18500289 5' + Tirant 8125 2 59.41 GAATAATAACACAGAGCAACAAAATGTGAGTAGAGTAGCATTTGTAATGATTGCACATTTCTTCGATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1 + chr2R 7132467 5' + opus 8 2 69.31 AATTCTCAATTCCGTGCAANTTCAAATTTCAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chrX 11987874 5' + 412 30 2 57.43 GGAGAAATATTTTCACCATTTTTTAATGCTATGAAAGTAGTAGTAAATTCAATATTATAACATATTTACATTTTTGGATTTGCGGTATTTATACGCGCTTA:1 - chrX 14522613 5' - TART-C 10979 1 61.39 GTTTTATCCAACACTGAAACTAAAAAGTGTTGAAAAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 + chr3L 11697033 5' + pogo 3 1 73.74 TTTGACTGCACTTTACGCATCGCAAAAGGAGGACTTGAATTTTATTAAATTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr2L 13334806 5' + hobo 6 1 73.27 AAGTTCCATAAACCAAATGACCAGACAGTCCGAAGTTAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAA:1 + chr3R 26342901 5' - blood 373 2 74.26 ATTGTTGTTTCACGTTGATTTTAATGGCACTGGCTGCGTACGGAGCGAGTTACCACACCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr2L 15909827 5' + Tirant 32 2 60.20 GTTGCGACCGCAATCCGCAAAAAGGTTCCGAAACTCGAGTGTTTGGCAAATACTGAAAAACGTGGGCGTTGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 + chr3R 7688839 5' - Tirant 400 1 78.95 AACATCAACAAAGTCGAGACGACGCCCGCGGAAAATTGCATTTCTGTATTAACCCCAAGAGCTATATCGAATGCACAAGCTTAGTCTCTTCCGACAAACGA:1 - chrX 20771753 5' - diver2 225 2 63.37 CGATAATGGTGGAGGAGTCCAGCCCAGAGGATCACTTGAGTGGAAGACATATGGATTTGCAGTTAAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 15425366 5' - hobo 2928 1 35.64 AATAATTTAAATTTTAATTTTTTAATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAA:1 + chr2L 19832455 5' + Cr1a 102 1 84.00 TTCAAATCCAATCGATAGTTTCCTGCAGTGTTGCCGCATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGGTTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCAT:1 + chr2L 21708308 5' - invader4 3083 2 75.25 TACAGATAAAGATTGCAAATTTGGGTATAGCGATTCTAATTTTAACAGATAGCCTGGATCCTTTTGATTTGGCTGTCGCATGCCAAGCCCCAGATTTGGC:1 + chr2L 22345433 5' - X-element 4246 1 53.00 ACATTCCATTTAGATGGCAATAATAGGTTATTGAATTTAGAGCTTCAAAAGTTTAGTTTTTCTATAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACA:1 - chr2R 14821113 5' - Stalker4 407 1 29.67 ATGCTGAAGAGGCTTAACATTTAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 18105796 5' + roo 53 2 80.00 TCACGCGATGCCATTGGGGGGTTGGGGAAATATCGACGTATCCTCGGAGGTTTTCAGAGATGGGTATAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACAATAAA:1 + chr2L 1761743 5' + R1A1-element 133 1 73.27 TAAGAGAAATTAGCAGGACATTAGTAGATATTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACTATTTATTTTG:2 - chr3L 37274 5' - HeT-A 6016 2 67.33 AAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGTG:1 + chr2L 7461087 5' + roo 58 2 81.19 GAGGAATTTGCGTAGGCATGATCAAATTCTAAAACTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 - chr2L 8690594 5' - Tirant 363 2 63.00 TGGCAATAATAGGTTATTGAATTTAGAGCTTCAAAAGTTTAGTTTTTCTATAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTT:1 - chr2R 14821099 5' - Stalker4 383 1 50.50 GGGTAAACATTAGCAATAAGCTTTAAAGGGCTCTACCTGCCACCTCCAGACTAGTTGATACCCAATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATT:1 - chr3L 1273367 5' + INE-1 517 1 64.36 TATTTCGAAACGTTTTCCGAACGCTTTTAATTGGGCTGCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTG:1 + chr3R 28113515 5' - X-element 4361 1 62.00 ATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCAC:1 + chr2L 23299983 5' + invader4 350 1 62.38 AATGAAGTTGTGCTAAATGCGTGCTGTGCTGTGGAAAATCTGGGAATATGGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGC:1 + chr3R 12882645 5' - 412 7518 2 51.52 AACAAGCTGTCTTGCACACACACAAGCGAAGGAGGCACCACCACACATACACATACAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGA:1 + chr3R 13239767 5' + hopper 940 1 59.41 AAAATAAGAAAGAACAAAATTATGAATAATGTGCGAGCAAGAGGGTTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGT:1 - chr2R 13337552 5' - opus 101 2 54.46 GACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGCACCCCACACTTATATTAATTTACATACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACA:1 - chrX 21907813 5' + gtwin 24 2 48.51 TGAGTGGGCGGGTGGGTTCGTGGGAATCGGTGGATTCGGTGGATTCAGTGGGTGTGCTGCACGGCAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGA:1 - chr2R 12095147 5' - gypsy12 9970 2 69.31 ACTGTTTTATTATAAACGTNATTCCCATAATAATACTTTTATTGACAATCCTCTCTGCAAATCTAAGGAAAATCTCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 11009469 5' + roo 8668 2 68.32 TAAAGTACCTCTGCCAATTATAAATACCTAACTGTTGTGAAGAATTGGCTGGCTAACTGGCGTTTTACAATCAATGAGCAGAAATGCAAACATGCCACAAT:1 - chr3L 18245092 5' + Doc4-element 2336 1 73.27 TGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:2 - chr3R 8705324 5' + jockey 62 1 77.23 ATAGCTTAGTTGTAGTTAAACGATTAAATTCACTTTTTTTTTTTAACTTTTTATTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGTCCAACCGACTG:1 + chr2L 13666968 5' - Cr1a 4423 1 58.76 TAGCTTTTCAAATTTTCCANAAAAATATTTTCGAAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr3R 20599608 5' + opus 38 4 72.28 GCAACAATTAATAAATTAATAAATAGTAGGCGAATTGTAAATTGTGGTGCAACCTGGTCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAG:1 - chr2R 19519148 5' + Doc 4544 1 67.33 TTGCAATTTTGGCAGCTGCCAGGTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATT:1 + chr3L 17110725 5' - hopper 1366 1 72.28 ATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATT:1 - chr2R 25051862 5' + G5A 2677 1 63.37 TGCACTTTCAATCCAATCAAGAAGTGCCCCATACTCGTAACTCGTACTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGA:1 + chr3R 14048108 5' - blood 7029 2 58.42 GTGTTTGTGTTTGGCCTTTTTTATACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr2R 14586502 5' + Doc 26 1 53.47 GTCTGGCTGTCTTTCGGGTTTTCCCAGCACCGCCTATACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:2 - chr3R 16607531 5' - 1360 3347 1 70.30 GCGCTAGAAAGTATGCTACAGAATTATGGCGCACTCGCTGTCAATTTTGCAATTTTACAATTTTACTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chr2R 23441702 5' + jockey 4681 1 64.36 GTGGTCAATACACCCTGTCCCATAACATCCTAATCCAATTCGACTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTC:1 - chr2R 3068425 5' - Stalker4 7330 4 58.42 TGATACCCAGGACTTCCCGTTCCGAAACCCGATTCTTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTTAAGTATTTTAGTAT:1 - chr2R 21568981 5' - hopper 1359 1 63.00 ATGGAATGAAAAGGGGGAAGAAACAGAGAGGAAAAACAGTGTTGAAAAGTGTTTTTTTTATGCTGAATGGTGA:1 - chr2R 10861320 5' - I-element 301 1 87.67 ATGTGTATGAACCAGCTTCATACCTACCTTTGACTGGAGTTGAGCAAACAAACCCAGAACTGGCAGTTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - chr2R 10969477 5' - mdg1 412 2 67.33 GTTTTCCATTGCCTGATTGNACGTCGGCTTGTGCCTGTCTGTGTGTCCGTGTCTCAACCTCAATATCAACCCTTTAGCGTTTATAGTTCCTGAGATCTCTT:1 + chr3L 9441884 5' - INE-1 146 1 61.39 TACAGCAAAAATGGTTTTTNTTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGT:1 - chr3L 19350008 5' + 1360 3217 1 42.57 ATTAAGAAATGCCAGCCAGAGTCCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3L 13568160 5' + jockey 64 1 73.27 GAATCTATGCTCAAACACATTCTATTTGTTGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 12182626 5' - roo 9025 2 73.27 AAAACTGGAAAAAACTGTTGCCTACTTTTAGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 18988493 5' + hobo 25 1 49.50 ACGATAATAACGGTCACTCTGACTGACTGCTTTTCGTTTTCGATTTCGTTTAGCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 - chr3R 16594561 5' - Tirant 380 2 60.40 GTTAACGAGGCCAACTGCGCCTCATTCATGCGGAGATCGCAGACGGCCGCCGGACCAATGATGCCCATGCCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr3R 16613106 5' + 412 6 2 76.24 GGACTTACAAATTTTGGCATTTACTTTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACACGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2L 13334881 5' - hobo 2901 1 65.56 AATCTTATTATTAGTCATCACTTAGTATATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr2R 8717649 5' + 297 39 2 72.00 AATGCTGAAGAGGCTTAACATTTAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 18105797 5' + roo 8717 2 79.21 AACCGCTGCTGGGGGAGCAGCAGAATTCTGCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGAGATCTTG:1 + chr3R 20430777 5' - hopper 458 1 68.32 ACATATGTATGTAAATGGGNTTTATATCGAAAAATACTTAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 10584397 5' + TART-B 10630 1 72.22 TTCCTATGTCAAATATATAGTGTTTTACATAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGCGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chr3L 19569221 5' + BS 43 1 70.30 TAATGTTATTACCTGGCAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr3R 4591822 5' - 297 377 2 63.37 GAACATTTTTGGCTTTGTANTATACCATTAGCATTTAAATGCAGTATAATTTTTAGTCATTGCGCTTGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAACCTTTAC:1 - chr3R 18769670 5' - roo 402 1 67.33 AATCGTGAGGCAGGCGGCGAAAGAAAGAAAGAAAGTACTGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTC:1 + chr3R 15117580 5' - roo 9063 1 72.28 CCCGCACACACATAAAAAGGCAGATGCAGATGCACAGTTGCGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGCTTCA:1 - chr2L 15548805 5' - Tabor 447 2 57.00 AGCTGGCTTAGCAGGGAATTATATTTGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTT:1 - chr2R 8518280 5' + invader1 3664 2 80.20 AAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3L 24150534 5' + blood 44 2 70.30 GTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTT:1 - chr2R 1247765 5' + Doc3-element 110 1 65.35 TAAATTCAGCTAAAAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 19594598 5' - 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chr2L 15174185 5' + Juan 4043 1 59.41 TGCCCCAGTCTGCACGCAAACAACCTTTAGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGAC:1 + chr3R 12010218 5' - Quasimodo 223 2 71.29 ATGGCCAAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr2R 13194677 5' - roo 9027 1 71.29 ATTTAGCGCTTGTTGCAAAATGAAAGCCGTTTTTCAAACTGAAGTCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTA:1 + chr3R 4773334 5' - Tirant 370 2 55.45 ACGGAAGTGAAGTGAACTGTGGAATGACTTTTGGTTGTTAATGGTGAGTTTTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 - chrX 20603355 5' - Quasimodo 235 2 53.47 GACACGAACTCAAATGTGGACTTCAAAGCATTCGAATCCAGCTCAAGCTCATGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAG:1 - chr2R 7729674 5' - 412 484 2 53.47 GCCGTTTTAATGCCAGGTTAGGTAAACACTTGCGAAATGAATTAACTTTAAGCCGCAAAATTTGTACTCTTGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr2R 23122621 5' + hobo 6 1 73.27 GGTCAGGGATTTCGTGTCTGCCGCAGAAGGCGTGAGGTGAAAGCGAAAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - 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Quasimodo 35 2 86.96 GATGGCGATGGCAATGGCGATGGTGATGGGGCTGGAGATGGATATGGGGTCCATGATGACGATGGCCATATCTTGATCCTCCTCGCAAAGCAATGCTTCA:1 + chrX 8380389 5' + Rt1c 5321 1 68.00 ATCAACATCTTGTAGTTTTAATTGCATTTAGCGTTGCGAGCAAGGAATTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACG:1 - chrX 14658757 5' + X-element 12 1 54.67 TAATCTTTAGAAAGTTAGACATAAACATATTATTTATTATTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chrX 22897202 5' + copia 37 2 64.36 TAGGGTCCGCAAGGTGCTGGCCCTAAAAATTATATTATATAGTGATCGATATTATCTATATATGATAACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCAT:1 + chr2R 4997907 5' - 1360 497 1 62.38 GACATATGGATTTGCAGTTNAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGGTAACCACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chr2R 20460985 5' - hobo 2884 1 75.00 AAGACGTTAAAATACAGATAGCTTTTCAAATTTTCCAAAAAAATATTTTCGAAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:2 + chr3R 20599590 5' + opus 20 2 59.41 AATTATGCACTACTTGGCTTGTAGTTCGTTTTGCAGTATTTGGTGTGAAAATACGTTTCCACAAACCCATGGCTAATGAAATGTACATATATATATAAGG:1 - chr2L 4378794 5' + Juan 4185 1 71.00 GCGAAACTGCTGTCAATGCAGGCGCAATTGCAGTCAAACGCAATTGTTTTTGATTGAAATCAATTGCCGACCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 - chr2R 6918074 5' + F-element 22 1 64.36 ACAGCGCACAAAAAGGATGCCACAGAACAGAAAAACACCATTATAATTTCCGGAATTCTTCGTTGTCCTTTTGATCGAGGGGCAGTCTTGCCGGTTGAGTG:1 + chr3L 27979686 5' - Fw3 3095 1 54.46 CATTAAACTTTATACGGCTGCAGACGCCACAACGATTTCCGTGCCCACTCCAGCCTAAATTGGGATTACCTCCTTATTCCAGTAAACTACTTTCAATTA:1 + chr3L 22633384 5' + Cr1a 3977 1 56.57 GCCCCCCAACTATCCTTTATTCCACTCCATTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCAAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAG:1 + chr2L 16122308 5' + jockey 4522 1 69.31 AATACAAAATGATGAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr3R 18342456 5' + F-element 42 1 55.45 AACCTCAAGAACGAAAGACGTGTTTAAAATTTTTTTTCACTTTTCTTATCGTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTAGCCAATGTTTATTATTTTG:1 - chr3R 2247499 5' - invader2 4698 1 80.20 TATTTTTTTAAGCCCAAAGAAATTAACAATGATTTGGCAAATAATGCAAAAAATCATTTAAATAATCAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr2R 13432797 5' - 297 387 2 56.44 AAGAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2L 18297882 5' + hobo 47 1 70.30 GAAGCCTTTATTTGTTTATCAATTACTAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCT:1 + chrX 12186743 5' - invader3 228 2 77.23 TGATTGAAGTCCGGCCGCTCCCATATGCTCTTGACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGT:1 + chr3R 19424162 5' + Idefix 222 2 67.33 AACTTACTAATGAAGCAAAAACTGCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3L 17146865 5' + pogo 46 1 76.24 GAGTGTTGGTAGAAAAAAGTGCGCCGCAGTCAAGCGTCGTCTGCAGGAAACACTCCGGTTGGCCAGAAATGCAGTTTCATACAAATCTGATGGGCAAAAAC:1 - chr3L 14592418 5' - TART-B 418 2 17.82 GGGGCTGGGCTTTGCAATTTGTTGGGTTCTGACAGAGGACACGTGAAATCTTTTAAATCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGT:1 - chr3L 22521757 5' - G4 3643 1 58.42 AATATTTGATTTACTTTTCACTGAGTTTTCCGTTCGCCGTGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCAG:1 + chr2R 13483141 5' - HMS-Beagle2 6867 1 59.41 ATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr2R 5201001 5' - 1360 3358 1 56.44 AAGCGGGACGGCGCTATTCGGATAGAAAGAGAAGACCTAGAGAATTGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATTGACATT:1 + chr3L 21670110 5' + Bari1 1292 1 58.42 GAGGTACAACTTGCGGAAGCTACTTGATTTCACGATAATTCACTTCAAAATATTGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 - chr3R 25422069 5' - copia 235 1 67.33 GACCTGGATGGACATCCCCAGAAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3L 24150513 5' + blood 23 2 54.46 ATTAATTGTTTAGAAATATCTAGTAGTTCGCTGGCATCAAATTGATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCA:1 + chr3R 25271657 5' + invader4 27 2 50.50 TAAATATAGGTAACCATTTCATTTGACTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 8434307 5' + roo 50 2 77.23 GTATAGGTGAAGAAAACGAGGAAAGCAGAGTTTGACCAAATATAAGAAAAATAGAGTCTAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGG:1 + chr2L 6908093 5' + Bica 459 1 67.00 CTAAACGGAACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 18171847 5' + 1360 23 1 57.43 GTCCGAAGTTAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr3R 26342928 5' - blood 365 2 58.54 ATTAATTACAGGGTAATGCGATTCCAGACAGCTCACACACATGCTGGCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCGATCTTCCGAA:1 + chr2R 21805555 5' + gypsy6 7443 2 54.46 ATGAACAGCATTTTGCATAGTTGCATTTTGTGTCAACAATTTTTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCAGGCTTCAGTCTGGGCGCCAC:1 - chr2R 13062989 5' - Chimpo 2 1 55.45 GATTTCGATTGTCACAGGAGGGATTTACACAATGTATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chr2R 16805511 5' + P-element 16 1 40.59 TAGCATACAAAAAACGGTTNGTGCTGAGGGGATTTATCGGCATTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAAG:1 - chr2L 20995843 5' - Doc 4423 1 56.44 TATGAACACGTTCGCTTATGGGCTTAGCCACGGGCATTCCTTTCTCCCGATCCCTCTGAATTCCTTTTTTTTTTCCTTTTTC:1 - chrX 4020593 5' - Doc2-element 244 1 56.10 GAGGGTAAGGGGATGCAATGGTCCAAGGGTTGTAGGTCAGTAGACGAGGGCAGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCACCGT:1 + chr3L 16537578 5' + springer 7161 2 56.44 ACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGT:1 - chrX 11025558 5' - hopper 1369 1 72.28 TGCCAAACAACCGAACAACNTGTTGTTGGCCAATTTTTTGGCGTCTGCGCAATCCATAAGAGGGCATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAG:2 + chr3R 9613408 5' + invader3 5199 2 66.34 ACCGATCCATTATCAACAANATCGTCGTCTTTGGCTTTGACCTGTAAGTAAAAAAATTAAAAAAATTTTTT:1 - chr3L 20017763 5' + HB 325 1 71.83 ATGCGAGTCATAATATACTCGTACGTACACACGAATCCCGGTTCTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCTACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTAC:1 + chr2R 11530782 5' + I-element 5052 1 60.40 TTCAAGGGGATGGGTCTTAAATTCAATGTTTAATTGCCGTTGAGAAAACATTAAGAGCACGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAG:1 - chr2L 12949131 5' + R1A1-element 205 1 64.36 TGGATGGCGTAGCATACCTCTGGGCGTCTTTCAACATCGCTCTATCTCGCTTGATACATGCTTGTCCTGTGGTGAGTTCGGACCAGCATGGATCAAGCGAG:1 + chr3L 19660386 5' + invader6 4718 2 41.58 GTGATTACGCCATCTCCATNTGAGAAGCACCGCATTTACCAGTTTAACGATTTCACATTGAATTTATGGCCGAGCAGCAAAATAAAAATTACAAAAAAAAA:1 - chr2L 5599763 5' + Doc 4693 1 53.47 ACCAACAAATCTTATTATTNGTCATCACTTAGTATATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr2R 8717642 5' + 297 6614 2 65.35 TACATTCTTAGCCCCTTCTTGTTTGAAGAAGTTACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:3 + chr3R 8434228 5' - roo 405 1 75.25 AAGCATTACTTTAATTTTGCTTTGACTTTCGACCAAACGGAAGTGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCACGTGGGGTTTGACGGG:1 - chrX 16251871 5' - G2 122 1 67.33 TGTTGTCCGGATAATCCTTATGCAATTTACTGAGTCTCTTATCCTTTCACTTCATTCACTTTCTGCACCGATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 - chr3L 16339084 5' + Ivk 57 1 75.25 TGATTTGTTTCAAATGAGCAAACATATACATATAACTAATAACGTAGATAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr2L 4404623 5' - pogo 2077 1 57.43 TAATTTATGCGCGAGTAATGATAAAACGCAGCCATCATCATATAGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTAT:1 + chr2L 10614275 5' - Burdock 111 2 56.44 GTTATTTTTGGTCTTTATGCCAAATGAAGCGTGAGAATGCCATAACGCCCCCAAAGCCTGGCTATTATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGAT:1 - chr2R 5813672 5' - HMS-Beagle 7035 2 72.28 TGGATGTGGGGAATGGAGCACGGAACGGAGAATGGACGAGGCGCACAAACATGTCAGGCAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:2 + chr3L 11657821 5' - Tabor 469 2 62.38 GAGTGTAAGTGCAAAGCAAGTGATATGCTAAATGCATAAGCAGAGAAAAGAAAATAAAAGCGAAAGAAAGAGAAAGAAAATAAAATAACATAAATAAAAAA:1 - chr3L 3787539 5' + F-element 91 1 57.43 AAACGATTCTGGCTGCCATCTTCCCAACGCCCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 - chr2L 3778439 5' + 1360 45 1 67.33 AGGCAATAACTTTTAATAATATTGCTAAAAATCACTGAAATCCGTGAGAAAAGTGGTTTCACACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCA:1 + chr3R 29528127 5' + G6 1849 1 57.43 ATTCGGTGCGTGGACTCTGAAAGCTCTGAGTGTTTTGTTTATGCAAAGCTTTTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGC:1 + chr3R 19671676 5' + P-element 21 1 58.42 AATCAAGTGGCTGTGGAACTCGAATAACATTAATTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 15547072 5' + pogo 38 1 66.34 TTCTGCCAGAAACCAAGGATCCAGCAAACAGCAGCCACAGCCTTCGATTCAAGTTGTTTGCCCTCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 - chr3R 9825199 5' + Doc 17 1 62.38 GAGAAGTCAAGAAGTCTGAAGCAAGGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 17758942 5' - roo 9023 2 74.26 GGCCATTTTACGAGTATAAACTCGTAACATTCGGAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 13072028 5' - roo 9031 1 68.00 ATTTTCTCATATGTATATCACACCAATTATCCAATCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 + chrX 18584910 5' + Burdock 32 2 59.41 GCTTTGGGGGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 - chr2R 6074469 5' - 412 491 2 74.26 AATAGATCTTAAAATAGAATTCCACTAAATACGTCCATTGTAGTGCCAAAGACACTAGAAAGACACTAACAAGACACTAACAAGATGCGTAACGGTCATAC:1 + chr2L 3778363 5' - 1360 3372 1 75.25 ATAGGATTACCTTCTTATATATTTTTTTTTGATTTTTAATTTAATTTTTT:1 + chr3L 21795222 5' - P-element 2640 1 74.00 GCCAGATCTCAAAATCAAGTGGCTGTGGAACTCGAATAACATTAATTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 15547084 5' + pogo 26 1 59.41 GTAAATGTTTCGTAGAATCCATATTTGTGGGATATAATTATGTAATGATGAACTCCCTTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chrX 11987938 5' - 412 454 2 63.37 TGAATGCTAAAATTGCATTAATTAGGAAGCAAAAACATATAAGGACATTAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGA:1 + chr2R 15178179 5' + HB 466 1 72.28 CTAGAAAGAGTCTATATAAAGTTGCTAAATTGTCTAGCACAGTATTAAACAAGCTCGACCGATTTGCTTTTGATTCAACAAATAAATAAATAAATTGAAAT:2 + chr3L 14464606 5' + Doc3-element 85 1 90.10 AACCCCCGCATAGCGTCTCTCACCTCCACGCAACAACAACACACCCAAAAGAGACGCACTGGAAGCATAAAAAGCAAATAGACAACGAACAAATCGATAGT:1 - chr2R 17683264 5' + Doc3-element 193 1 74.26 AGAAAATGATTATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chrX 4422686 5' + jockey 20 1 66.34 GGCCGGGGTCCTTTGAATGTTGTGCCCCTCACGGGTACGCTTTCATTGGGCAATTTATGAACGCGTTTTGGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 - chrX 15264278 5' - Tirant 8471 2 71.29 TTTTCGTGTGCCAAACAACNGAACAACTTGTTGTTGGCCAATTTTTTGGCGTCTGCGCAATCCATAAGAGGGCATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGC:1 + chr3R 9613400 5' + invader3 5191 2 74.26 TAAGAAATTTCAGAACCGGCAAAGCCAAAAGAGCGTTGCCAACAAAAAAAACACGTTTTTGTGTTTGCAAGCCAAAAAACAAAAAAAAAAAGATAACGAAA:1 - chr3R 31936454 5' - Circe 7280 1 50.50 AAACAATTAATTAACACTTTTAGCACATTTGAAAATTGCATTCCGAAACTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr3L 9763178 5' + jockey 4703 1 50.50 GAACTCCTGCGAGTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 19513374 5' - roo 9027 1 67.33 TCATGCCTAAGGCTGTTCCGGTTTTCTTTGAAAGACGCAGGTTGTATGACGTTATGCTACTGTTTGTATCGTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2L 21628963 5' + P-element 2 2 78.22 AAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 3428048 5' - roo 355 2 80.20 ACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3R 8434261 5' - roo 9035 1 63.37 AAAATCCTTAAACTTTTCAATCGCGAACATTTTTCCACTAAAACTTGTTTCGATCGGATCACTAGACGGGTCATTCAAGCCATATCCGACTGTCCGTACG:1 + chr3L 17888376 5' + INE-1 120 1 61.00 GCACACAGATGCACTCCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCCCCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGAC:1 + chr2R 12096592 5' - hobo 2880 1 79.21 TATCGAAAATAACAATGTGCCCGAAGTTAGAGCCAAACATTTTCATTAACCGGACAACGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTC:1 - chr2R 11706504 5' + Max-element 8534 2 65.35 TATAAGACAAAATCAAATTCCCTTTGCGTCCAATGTGGGTACAGTACCGACTATTACACATATTACACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTA:1 - chr2L 18306955 5' + 1360 2958 1 58.42 TTAATTACCGGCCAGAAGTTCATGAAAGTGCCAAGAAGTTTCCCACTACCCCGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 - chr3R 25514192 5' - hopper 1394 1 58.42 TTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAAC:1 - chrX 23108298 5' + BS3 1450 1 70.30 ACAAAAACAAATGGTAAAACGAAAAAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 18297904 5' + hobo 25 1 54.46 GAAGACGTGTTCTTTAATANATTTATAAACATACAAACTCAAATTAAACACAACATAAACATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 + chr2R 999453 5' + F-element 28 1 51.49 GTAAAAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCCTTTTTGTACACATATACTGACTAGACGTTCC:1 - chr2R 6803002 5' + rover 7115 2 60.40 TTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTC:1 + chr2L 6583343 5' + hobo 51 1 72.28 GAATTAGCTATTAGAAATCGTCATTGTGCTTATTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCG:1 - chr3R 25271723 5' - invader4 3044 2 68.32 AAACTGGAAAAAACTGTTGNCTACTTTTAGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2R 18988492 5' + hobo 26 1 47.52 AAAACAAAATCAGAGAAAATCATAAGCTTACGATAACTACAGTAAAGTTATACATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 3146525 5' - roo 385 2 55.45 ATTATATTATTATATATCTTAAGATTTTGGTTCTCAATGACAGCAGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATCATCAAAGTGTGTTGAAGTTGGGTTCAGC:1 + chr2L 13558109 5' - Stalker 309 4 51.49 ACTAAGTGAAGCATATAAGTAGCAACTAATTTTCAAGCTGATGCAACAGCAGACGACGACGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr3L 13366446 5' + hopper 15 1 64.36 TCTGATAGTGCAAAAAAAATGTTTAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3R 15924660 5' + Quasimodo 43 2 81.19 GCGAACGCTCCAGATCGTTTTTCAGCCGCTCGTTCTCCAGCTCCAGGCGGGCGATCCTCTGCTTGGTGGTCTTTTGCTTACTTACATATTAACTCTACT:1 - chr2R 9528604 5' - Stalker3T 28 2 65.66 GTGGGAAGTATTGCCCTCCCCAGCTTATTAATCAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chr3R 4474229 5' - copia 5082 2 70.30 TACGAAATATCGTTACTTTNTAAGTATCCATTTAATTTACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 16199958 5' - roo 9036 1 61.39 ATTCAGTTAGGCGGACAGTTTAGGGGGAAGCAACAGAATATGGGTAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 + chr3R 9085034 5' - mdg3 217 2 54.46 TGATCCTCGATATCCATGACAATAATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTCCTGTAAGAGCGGCAGAGAGTTAAGATT:1 - chrX 15802969 5' - Cr1a 4235 1 74.26 AAAACAAGAAAAAATAAACAATGCACACCTCGAACGAAGCACAACAACAACAGCAAAAAACGTACAAGAAGAAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTC:1 + chr3R 24520478 5' - copia 4971 2 53.47 TGGGGGGTAAATGGGGGTGAGCTGGGGCTTGCCCGAGCACTGCTCGAGTGACCCCTGCGATTCAATACTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTAT:1 + chr3R 8815564 5' - mdg3 5345 2 79.21 ATTATCGAAGGTCAGTTAATAAGGGAAGTACGTTAGGGTTTTAAGGGTTTAATAAATTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 14708702 5' + roo 8683 2 61.39 TAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCA:1 - chr3R 3268035 5' + mariner2 113 1 71.29 TGACAAGCTGTTTCACGAATTACCTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chr2L 20550820 5' + jockey 4723 1 78.22 TGCTTATTAATTTATTTATAATAATATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 26122998 5' - roo 390 2 57.43 TATTAAGTGCGCCTTTCGCCAGTCTCGCCAAGGCAACAGATGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 13544144 5' - roo 9039 1 57.43 ATGGAAAATTTAAATAAAGGAGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCAGCCTCCTA:1 - chr3R 10534934 5' + roo 8839 2 75.53 TTTGGCTTTTTGCAATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3L 95863 5' - roo 9040 1 58.42 ATCGGCCACATAGCTATGGTTGAAAGTGAAGGAAATATAATGTGGAATGAGATTAGATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 2270496 5' + roo 13 2 64.36 TTAAAAAAAAAAACTATTTAGAATTTTTCTTTTTCCTAGTTTTTTTTT:1 - chr2L 11954295 5' - Doc2-element 231 1 79.17 AGACTTAACTTCAAGAAGTAAGTATTGCAATCAAATGACAATTTTTATACAAAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGT:1 + chr3L 12983151 5' + diver 5896 2 69.31 ATGTAGTATATCTTACTAGTATATTATGTACTTGGTGTGCTTAAGTATTCCCATTTTCCGTTATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 - chr3R 6609800 5' + Transpac 4929 2 74.26 AATTCATTTACTCGGAAATCTTCTGCGCACTTTATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTA:1 + chrX 20819354 5' - R2-element 3436 1 67.33 AGTACATGGAGTGCGTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGNTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACNTACAATTTTGGGCT:1 - chr3L 7494096 5' + roo 27 2 55.32 GACTGAGGGTATGGGCCTTCCGTAGCCCCATATATATAGTGGTTCTCCGGCCCTCGAAAGAGACTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3R 15537285 5' + P-element 9 2 70.30 ATGAACTGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTC:1 - chr3L 25799746 5' - 1360 95 1 59.41 TATATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATTAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCAATGCGGCGGCTCTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3R 28728745 5' - hobo 2935 1 73.00 ACATTTCAGGCAAACGAATAATTTAGGCCATTTTACGAGTATAAACTCGTAACATTCGGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 13072053 5' - roo 9055 2 60.40 GTATCTTGTATCTTGTATCTCCGATCATTGATCGTTGGGGGGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 7534724 5' + Tirant 8 2 69.15 TATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 + chr3R 11151820 5' - mdg3 216 2 55.45 GCCGCCACCAAAAAGGGAAAAAGGGGGACAACAGCTACCAAAAACCCTTTCAATTACCAAAAAAAAAAGAAAAGGAAAAA:1 - chr2L 19344880 5' + Doc2-element 228 6 33.75 TACGAGCCACTTGAGTTCTTTCGTGGGTGCCTGTATTTATGACCGGGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTT:1 + chr2L 21910813 5' + Cr1a 489 1 53.47 TAGATCGACAGACACCTGGTGGGTGGTGGTCGCCCAGAACGGTTAACAAGGTCAACAGGCTTCCGATTGACCCTCATCTTTTCATGAAAAGTACATATATA:1 + chrX 19211902 5' + Juan 4178 1 78.22 GAGAAAATTCAACTAAAAAGAAAGTAGAACAGATATAGAGACGATAGAGAGAGAGAGAGGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGG:1 - chr3R 20793258 5' - I-element 5069 1 60.00 ATTGAGGCTAAACTTTTTATTTTTTATTATGTCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 13544087 5' + roo 8707 2 72.28 AAAATTAATTCTATGACATTTTAAAAAGTCATGTCACTAGGCTTCGCCACTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGG:1 + chr3L 11902036 5' + Tirant 413 2 58.42 AGTGTCTTTGTTAAAACCAGTCGCAATGATAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 - chrX 22897251 5' - copia 243 1 70.30 GTTTCTGAATCTTAACGAAGACGTGTTCTTTAATAAATTTATAAACATACAAACTCAAATTAAACACAACATAAACATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 + chr2R 999437 5' + F-element 12 1 68.32 GTTAAAGCAGGAAGCTATTAATGACCCTTGCTTCGGGGATTCCCTTAGTAAAATCAAAAACTGTTAATAATTGTTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTAT:1 + chr3R 18611853 5' + BS 5036 1 49.50 ATAATAGATTATTAAAAATTGCATTTCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 21372956 5' + roo 48 2 77.23 AAGTTTCACTGTACGCGGCGGGGGTAAAATTCTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 15268293 5' + roo 8706 2 70.71 AAGATTGCAAAACTTGGAAATAAGCTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3R 10434605 5' - 1360 3340 1 73.27 ATCACATATCTTTAAAGATAAAGATATCTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTAGT:1 - chrX 20996670 5' - INE-1 102 1 57.43 TATAAATCCTTTGTTTATTTTTGAGTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chr2L 15818016 5' - I-element 5303 1 78.22 TGTGAACTTTTTGATTTGATTTCGTTTGGCACTCGCACAACTCCTTTTTCGCCATATCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCATGGTGGGCGAGATCTGTTTA:1 + chr3R 22979409 5' - X-element 4462 1 62.38 AACTGGGCCGAGCTCTTAATTTATTAATGACACCCGCCACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chrX 12284055 5' + Transpac 4953 2 62.38 CCCCAAAACATCGACTAGTTATTGACTATAAAAAATTAAACGAAAGCACAATACCTGACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGG:1 - chr3L 26507205 5' - Doc 448 1 65.35 TACGATGTGCTACCATAAAAACTGTAAAAAAATAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGTAACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACT:1 - chr2R 4578527 5' + Chouto 453 2 66.34 ACGCGTGAAAAATGCTGCAAACAATAAAAAGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTG:1 + chr3L 15342397 5' + 1360 3226 1 60.40 GAATGTACGTTAAAATGATTATTCTATCTGTACGCTCTTTATTTTTTCGTTTTGAAGCTTAGGCTTGGTTGGGAGAAATTGTGTAGAAAGAAAAAAATTTT:1 + chr3L 22965633 5' - Stalker 6767 2 75.25 GCTCATCATCATGTTCCCTNCTTCGCAGACCAATTGAATTCTATTTTAGAGGAGGTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chr2L 13792164 5' - blood 356 2 58.42 TGTTACTTTTTAAGTATAGGCAGACCAATGTTTTGACAATACAATTGCTGAAGCGGTTCAATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 9867526 5' - roo 397 1 66.33 GAATTTGGCGCGCAAATTCGTAGCTGAGTCGGCGATTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr2R 7247608 5' + jockey 4710 1 64.36 AGGACGGAGCAATGATAATTGAGAGGATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCA:1 + chr3L 11949904 5' + hobo 384 1 74.26 AATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCTGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chrX 21581125 5' + 297 6634 2 78.22 GGCGCGCGAGCAGGGAAATATCAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 - chr3R 31887343 5' - jockey 4933 1 78.22 CTGAGCTGCGTCAGCTGCCCGAGGAGCGGCCACCAAGATGATGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3R 16595061 5' - P-element 2854 1 47.52 AGGACCTGTTTATTTTTATCGCCTGCTTTTTGTATTTGTTTGTATTTTTCTTTCTTTTTGACTAATGTGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAAT:1 + chrX 446487 5' - Stalker4 6930 2 69.31 GCCTTTGTTGAAAGGTTGCTATGCATTAACTTTTGTCATTCGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2L 12326326 5' + hobo 35 1 59.41 AATTAGCCAACTGTTTTGTTTGCGGGGTTGGGTGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3L 6866150 5' + 412 10 2 67.33 ACTGCTGTAATAATTTTACCTTTTTTTTTTGTATT:1 + chr2L 21115460 5' - Bica 337 1 88.57 CTTGACAAAATTCCAGTGGTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAGAAAATATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 + chrX 17622043 5' + INE-1 91 1 95.79 GTGGTGATCATGAAAACCATTAACCTTCCAGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 - chrX 22689196 5' + Transpac 4961 2 71.29 TGGCTGCCTGACTACGTGACTGTACAAAAGTTGGGTAAAGTCGCGAGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3R 16005444 5' + Doc 34 1 53.47 TGCACATTATGGCTCAAATTATCAATGCCCATAAAGTATTTCCTCTTTGGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTAC:1 + chrX 17545272 5' - Cr1a 4400 1 69.41 TTTTAAAAGATTTATTTGCGAAATAAAACCACTCCAACATGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAGGATCGTTATAAGTTGTAGC:1 + chr2L 17554359 5' + mdg1 457 1 59.41 TGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3R 20284786 5' + pogo 42 1 75.26 AAGGAAGGGGTATCTAGTAGTCTGGACCATAGGGTTCTCTATTTGTGTGATGTTATACAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGG:1 + chrX 21082610 5' - gypsy6 7788 2 60.20 ATTTACCCACCAGCAGGATATATTTAAGACCACAAAAGACCACAAATGTGTTGGCCAAAAATTGAGAAGACACAAAGCAGGCTGCACGAAGCTGGAGTGAG:1 - chrX 18268011 5' + micropia 307 1 59.41 TGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chrX 4422651 5' + jockey 56 1 73.27 GGTCTAAATTGAGAAATCAAAGGGATCAAGGCCCTAGACTCCACGCAATACACACATCAATACTTACTGATGAGAACGGCGCTACCAATATGCCAACTATG:1 + chr2L 16116601 5' + Ivk 5100 1 53.47 AAACGTCGCTAGTTGTTATGGGAAATGTAAATGTATCTCATAGATACACAAGTTACAAGTTGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1 - chr3L 11657923 5' + Tabor 6854 2 64.36 CTTATTACTGAGAGCAGTGCTGCTTTGCAAAATTTTATTTTGCTTCGCGACTTAGAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGC:1 + chr3R 25579151 5' - HMS-Beagle 268 2 77.23 GGGTGAGACGCATTGTATTGAATTAGTTTTCACGAATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTC:1 + chr2L 9386206 5' - 297 453 1 79.21 TGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCTGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chrX 21581122 5' + 297 6631 2 75.25 AGTAATTCTCATGATTTCAACTTTGAACTGAGTCTCTGCCGTCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTT:1 + chr2L 16568628 5' + pogo 1967 1 59.41 GCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:2 + chr2L 4110966 5' + Doc 53 1 74.26 TCGCCCTGCATGCCCACCGACAACCAGCCAACTTACCCACCTACCAAAACCAAAACCAAAACCAAAACCAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACA:1 - chr3L 20584468 5' - Circe 53 2 73.27 TGACGTAGGTAAATACAGTGCAACTCCGCGAAGTTGAATTCTGGGAACTCAAAGTAAATGCGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGT:1 + chr2R 8064321 5' - HMS-Beagle 6647 1 63.37 ATATATATGCAGTCCTTTGAACTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3L 8905731 5' + pogo 50 1 79.21 TCCAATCAAATTGCAGGCAAACAGACTCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTAATCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 9471222 5' - roo 9020 2 78.22 TATATGTATGTATATACATATATATTGTAGGTAAAGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 2486396 5' + roo 8704 2 68.32 TACGCCCCGGCAACATTGTCGCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr3R 19270393 5' - pogo 2049 1 78.22 GTGTTGAGATAAATAAGGCAGAGGAGGCCCACAGGAAACGCACACACACACTTTCCTTCCCCCCCCCCACCCCCC:1 - chr2L 14900019 5' + accord2 224 1 80.00 TGGTGCGTCACTTGGGGTCACCTATTGGGAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGACCTAC:1 + chr2L 20951034 5' + G2 2648 1 78.22 GCTATTAAAACGTTTATGGGTATAGAAAACATGTAGGTAAATGAATAGATTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 + chr3R 21608756 5' + copia 4896 2 53.47 TAGCCCCTAAAGCTCTTTTTATTTTAACTACAATTACAGGAATTCAAGACAACAAAAAACACACAATTAATTAAGTATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCG:1 + chr3R 22197468 5' - invader6 372 2 68.32 ATACTCAAATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCG:1 + chr3L 26719149 5' + Tc1-2 25 1 62.38 ATCCGAGCCCCCTCGAAAGACCCTCCCACAAGATCTCCCAATCTAGGAGAAGATATGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTGCACC:1 - chr2L 13941899 5' + springer 367 4 45.54 TGGGAATGGCAAGGCCAGTAAATGAATAGACCGGCTAAATACACAAATAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chrX 17109643 5' + roo 26 2 60.40 AAAATACAATTGTTGACTCGATGTTCAGACGGACGGACAGATAAATGGATAAAAAATACGTAAACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3L 16200044 5' + roo 8672 2 71.43 AGAACGAGACGACGACATGTGTTTGTGATATAGTAGAATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3R 20284824 5' + pogo 8 1 70.30 AGCGAAAGATTATAATAGATTATTAAAAATTGCATTTCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr2L 21372945 5' + roo 8701 2 66.34 TAATGTGCGCCCAAGCATTTGTTTGTCTGCGTCTCAGCCTCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATATACACACA:1 - chrX 2841716 5' + accord 190 2 69.31 TATTAACTTGGAATTTAGAAGGACTGCTGCAAAAATTGTCTTTATTGTTTTCACTAGTTTCTTTTGTTTATCTTGTTCACAGGTTTTTAACACATATAAAT:1 + chrX 4292073 5' - Porto1 122 1 60.40 ATTTCACATTATTTATGATGAGCTGAAAAGTCCAAGGCGCAGAGATATGCATACATTATGTACTGTAGTTAATTATAATTCCAATACTACTGATGTAGTTA:2 - chr2L 18927556 5' - mdg1 405 2 62.38 GGCGGCTTTTTCACCTGGCCGGAAAAGTGGGAAATCGGAAACAAAACCAGCCTCTAACACGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAATGTTTGGGAGGAAT:1 - chr2R 9747827 5' - HB 1258 1 57.43 GCAGTCCCACATCGTCGGGGCTCACATTTGGTTTTTGTTTTCGGGTTTTTACATTGCTCAGAGTGATAAAAAGAGAAAAATAAAAAAAAGAAAACAAGA:1 - chr3L 14399429 5' - HB 156 1 53.54 GCAATGGCGAACGCAAACAGAGCGGGATGAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:3 - chrX 11030907 5' - roo 9027 1 69.31 GGGCGTTAGAGTGGGCATGAAAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACT:1 - chr3L 22511712 5' - INE-1 110 1 62.38 AATACACTTTCTTACCTTTGAACAGAACATGATTTGCTCGTTTCAATCGGAATCAATAAAAGTAATTTGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGA:1 - chr2L 12190857 5' + X-element 19 1 38.61 AACACTACTGCCTGGAATCGCTTAACTCAGAGATGTAGGTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2R 11403951 5' - mdg1 7419 2 65.26 AATGTGTAACATACCTTAAGGGCGTTTTCTTTTAATGTTTTTACTGTTATGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 - chr3L 5538090 5' + jockey 4695 1 56.44 GATAAACTCTTATGACCCACATTGGCGCGGTGCTGAGGGGTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr2L 8646736 5' - Tirant 366 2 58.42 TTGACAAACAAATTTCAAATTCCCATCTCAGCAGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACG:1 - chr3R 1207766 5' - Doc 231 1 64.13 TTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 30611287 5' + blood 7063 2 76.24 AATGTTAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3L 22112614 5' + Doc 18 1 66.34 GGTTCTTTTTTTGCCACACNCTTTTGCCTTTGATTACAGAGTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGGTGAGTT:1 - chr2R 20564607 5' - TAHRE 10310 1 79.21 AAAAGGCAAACATAGTAATCATATTGCATTGGATGAGTGACTGTCTAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 15983364 5' - hobo 2909 1 52.48 AACTTTCCACTGGCCCCCGAATTCTAAGAGTCATGTCTGACCTAGCACAATGTAGTATGTTCATACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTC:1 + chr3R 9215601 5' - R1A1-element 224 1 74.26 GGCTGCAGATGTGAACTGTTTATACATACATATACATATGTACATATGGCACTGTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAG:1 + chrX 15870885 5' + accord2 169 2 68.32 GTCTTAGAAATTAAATTACTTTCACTATCAAAGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAGCCTTCAACATCTT:1 + chr3L 10335347 5' - invader2 4642 1 68.32 TTTGAACACCTGCATGCTCATTTCTGATAACTGCTTTCACATATAACGAATATCCATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chr3R 22467018 5' - mdg1 7439 2 58.42 TATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCA:1 - chr2R 5424284 5' + 1360 3348 1 66.34 TTTTGGCCAGTTGCGAGAGNACAATGCCCAACAGCGCTTTGCAAGATCTGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATT:1 - chr3R 30512139 5' + 1360 190 1 51.49 GAAAGAGAATTAGAGAGAGAAACAGTGAGACGGAACAAAGTAGAGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chrX 21400845 5' - P-element 2858 1 48.51 CGGATATCTTGATGCATTTNAAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTC:1 - chr2L 16939902 5' + opus 120 2 71.29 ATGCCGCCATCTCTTTCCCATTCTGTCGCGGCTCAAACGGCGGCTTCGTGTCGTCATTAAGCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 - chr2R 21362851 5' - Tirant 8494 2 65.00 TGAAATGTGTTTTGCGTGCCGCTGCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATTCGAAGTATTT:1 - chr2L 20228188 5' - hopper 1365 1 70.30 GCCCAGAGCAGTTGGCTACCTGTCTTTGGCCTGGTATATAAGTATGGGCCAAAGAGCACCACCTGTCAAAGGCAGCCGGAGGTTTCGCGGCAAAATTGGCC:1 - chr2R 12980743 5' + Osvaldo 1350 1 58.42 TGCATGTAATCTGTCCCAGTGTGCCACCACTGTGTGCCACCACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGGATA:1 + chr2R 19557975 5' + 412 28 2 51.49 TAGAAATCACATACTTTTAATACCACCGGATATCATCAACGAAGAGTCATCCGCCGACAAACCGCAAAAAAACTGCCACCCCCACACTTCTGAAAAATGTG:1 - chr3R 28927070 5' + INE-1 256 1 54.46 TATGTTCTAAAGTCGACTTGATAGATTTAGGGTTCCAAAGTATTTGAATATTTTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGA:1 + chrX 2349845 5' - Bica 167 1 62.38 AATAAATTTAACACGAGTTATATAAGGCATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chr3L 782743 5' - Transpac 5212 2 68.92 TTTAATTTATTACAACAAAAAAAATTCTAAACAACTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr3L 13383947 5' + opus 149 4 64.36 GCTGCCGCTGACAGAAAGCGCGCGAAAATGCCAGGACTACAAATACTGGGGCGGCATTCACAATGTGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:2 - chr2R 6918618 5' - hobo 2923 1 60.40 TTTGCACAATATAGAGTCGNTTTCAGCGCATTAAGATTGAAACGCTGGACGAGGCTGAGAGTGAAACTGGCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAAG:1 - chrX 17633211 5' - HMS-Beagle 264 2 75.25 TGGGACAATTGAAATGGAAAGTGTCGCACATGCCGAAGGCCACAGCTTGACCCACCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGA:1 + chr2L 13876395 5' + G6 1786 1 60.40 AGCAAAACGGGTGCAGTTGCTGTCATCATCACCATCGACTTCATAGTAATCGGAATAATCGAACATTATTGTAAAAAAAACATTTTAATTTGAGTAATTGA:1 - chrX 20882114 5' + Circe 487 1 59.41 ATCCCGAAATTTTAAAGCTAGCTTCGATATACACTGTTCTGCAACACTTCTTGTATATTTCTGATTAACTTTCTCACTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTA:1 + chr3L 23773384 5' + Transib5 2947 1 80.20 GATCGAAAAGGAATACCGTACACCTTTTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 + chr3R 4536174 5' + Ivk 20 1 59.41 TATGGATTATGATCACGACNTGTTTTTTCCCCTTTCAAGACCCACAAACATATGGCATTCGCTGATCTTTCGAAGTCGACAATAATTAATTAACAAATAAA:1 + chr3R 22779936 5' + HeT-A 307 1 91.09 ATGTATATGTATATATACATATATAGGATTATTTAAGAATAAAAACGAGAGAGAATCCCATAGTCGAGTTCCCCGATTGTCAGATAAGCGTTACTCAGCTA:1 - chrX 16920442 5' - INE-1 544 1 73.27 ATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr3R 22494708 5' - 1360 3350 1 69.31 GCGTTCTCCATTGTTCGCCGGTCTTCGAGTTTGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTT:1 + chr3R 6797217 5' + Ivk 70 1 71.29 CGGGGAATTATTTCTTGGGAACACCAACAAATCTTATTATTAGTCATCACTTAGTATATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr2R 8717620 5' + 297 11 2 67.33 ACTACGTGGCCTTAGTTTCAGGCTGTGGTGCAGAAAGCTCGTTTGAAAAATGATAGGTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCC:1 + chr2R 18414393 5' + invader2 4654 1 59.41 GTTGGCTTCCAACCAAGTGATTTATGAGAGATGGTTTTGAAAGAGGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTGTGCGA:1 + chr3R 5315608 5' + Doc2-element 112 1 57.43 TAGAGATTAAGTTTCATAACGGAAATATCAAAGAGGGTATCTTTTATTATACGCCCATCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATC:1 + chr3R 29471481 5' + 412 487 2 54.46 GAAAAATATCTGACATGAGTTCTGGGAAATTGGTTTAGTCTAGCACTGCAAAATGCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGCAGACGG:1 - chr2L 9584940 5' + Tirant 50 2 54.46 TAATGGTGATGCGTCTAAAAACTCGAACTTAATAGTTTTTTTGCGCAATATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:3 - chr2R 15376179 5' - 1360 3365 1 54.46 GCACACAAACAGGACAAAGTGATTCTGCAATTGGAATAATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 - chr3L 13367756 5' + mdg3 5283 2 52.53 GCTAATTGAAATCGTTTGTCAGCACAGCCAGTTGGCTCTGTAAACAGAGTGTGTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3L 5973974 5' + hobo 19 1 60.40 GACCATTAGTCAGACTCGCAAGTATATAACCTAGTTACAAAACATTCTTCACAGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1 + chr2L 16132517 5' + GATE 35 2 51.49 TCACTGAACGGCGCTTCTACTGCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2R 7024995 5' - P-element 2835 1 27.00 TAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr3L 23871306 5' + Doc 49 1 66.34 GTTTTTGCACTCGCGTCGAACCAGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 - chr3L 153652 5' - 1360 3360 1 55.45 ACCTTATGTCATTATCGGGGGCCCAAGAAATACAGTCCAGGAGTTACTGGCCAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 95944 5' + roo 8684 2 59.41 AACCACTACAACTACCACTTTCAAACCAGTGATCACAAGCACTGAGCACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAAC:1 + chr2R 5926044 5' + I-element 4959 1 53.47 GCAGTATGCCACCTCCGAGAAATCTAACGATGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCCCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTG:1 - chr2L 8386773 5' - Bica 4919 1 70.30 GTGCTGGGACGAAGAGACAAGCGCATCCTGGAAAGCTACAATATCCCCGAGATAGTTAAGAACTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGA:1 - chr2R 21064092 5' + F-element 292 1 54.46 TCAGCAACTAGATGATCGCTTTCATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCATGGTTGTTTAAATTAGGGGACGG:1 + chr2L 22124176 5' - Idefix 197 1 77.23 GAGAGAGTTTGGAGGAACGGAGTCTGTAGAAAGAGAATTAGAGAGAGAAACAGTGAGACGGAACAAAGTAGAGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chrX 21400873 5' + P-element 1 2 75.25 ACCGAACGCACGAACCTCCCGCGACAGGCGCTAAATACAAACTGAGAGGAACCAAACGGCACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2R 10874700 5' - P-element 2876 1 62.50 TGTGGCTCCGATGACAACTCCAAAGTCGGAAGATTGAGCCCCAAACCGAGCGAGACGTATTGGTTCGCAATATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCA:1 + chr3R 12830434 5' + invader2 118 2 65.35 GAAGGCAACACTCGTCAGACGAACGAAGTGGGGAACAAAAAAATATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 + chrX 4422609 5' - jockey 4962 1 54.46 TTAAATAAATATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTCCT:1 - chr2L 21052783 5' - invader1 3964 2 76.24 GTGGCCACAACTGCACTGCACTTTTTTTCAAAATCTTTTCTTATCAGAGGTGACACAATGCCGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr3L 12903911 5' + Doc 19 1 54.00 AAAAACTTTTGCTGGATCGCGAAAAATCACAGATTCCATTTTTAAGGTTACCTGGATTGCATTTGAATTTGACAGTCTTGAAAATTTTTTTATTTTTTTTA:1 + chr2L 7535244 5' - HB 324 1 31.68 TAATTTATTTATAATAATATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr3R 26123005 5' - roo 9046 1 51.49 AGACTATTAGAGAGTCACGTAGCATTCGACAAAGTATGGCATGTTGGATTATTATGCAAGATAAAGACCCTTCTACCTGCGCCCTACTGCTGTATTTTAAA:1 + chr3R 30308807 5' + Helena 467 1 76.24 AGAATTCTATAGGGCGAACAAAAAGAGAGTTGCAAAGTAGCAACGCTAAACGACAAAAATAACGGTCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr2L 21628843 5' + P-element 8 2 71.29 GAGATACATACAACGAATCCGTATTTGTATTTGTTTATTTGGCTGCAAAATTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 + chr3L 19700206 5' + Quasimodo 17 2 63.37 TTCACGACCAGTGTGACCGATTGGGGTCGATGAGAATACCAAGCAGATTAGAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 27582834 5' + pogo 20 1 60.40 AATGTCCCAGTCAGTCTTTTGTTTCCATGCATGTAATCTGTCCCAGTGTGCCACCACTGTGTGCCACCACTGTAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 + chr2R 19557948 5' + 412 1 2 78.22 CTGTATTTTCTTTGGCACAATAATGTATCCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2R 15595263 5' - hobo 2893 1 73.27 TAGAATGCAAGCCATGGCAACACCATCAATCCGTTTTGGGCCAAGAATTTTATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 + chr3R 9300695 5' - Burdock 233 2 57.43 ACCACCAGCCACCTCCACCTGTTTCACCCTTTCGACCACTCTCTTTTCATCGATCAGACAGATGAGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 21362736 5' + Tirant 8115 2 73.27 AAAATGGCTTAAATGGAAATTGTTGTACCACTCGAAACCGAGGAAAGTGGGGGAGGGGGGGCGGTGGCCGGGGGCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATT:1 + chrX 15261036 5' - copia 4761 1 50.50 TAAATGTTGCTGCTGCCATTTGCTCTTCCTGGGATTAAATACTTTCCATGCACGTCGTAAGCATAAAATATCATTATATAAGAGAACTGTATAAGAACAAT:1 + chr3R 17674033 5' + Dm88 4153 1 58.42 AGTTGCCAAAAGCCAGCGGNAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2L 1136327 5' - 1360 3350 1 66.34 ATTTTCACTTTGAGAATATCGTGGATGTGTCGACGTAAATCATAATAATTTTTTTTTCTCCTTATCTTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTGTGACAATAAG:1 - chrX 20385818 5' - G4 3817 1 46.00 TTAAATAACTGACGACTGAAAAATCGAGCAATATATAAATAAAAAACAAAAACAAAACTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGGT:1 + chr2R 4402688 5' + transib2 144 1 66.34 GATTAAACGGTTCAATCACAGAAACACTCTTCTCTCTTAACCCACCGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGAT:1 + chr3L 25469032 5' + mdg3 478 1 59.41 TTCATTCAGTCAAGTCCGCGGCAAGATTCGCACAAAACATGCTTACTTACTTACGGGGCCACTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAA:1 - chr3R 5248985 5' + Burdock 6370 2 67.33 TTTGACAAATGATTTGCGTCTCTGCGGAAAAGCCAAAAAAAAACGATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 29465572 5' - 412 465 2 61.39 GAGACGAATCAGTCGGCAANACCATTCTATAGCGAATATAATTCATCGAAGTGACAGTGCTATTATGTTAACGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 + chr3R 14521039 5' + I-element 5 1 71.29 TAATTGGACAAACAATCACAGTTTAATTGCTGCAATCAAGCTGAACAAACTAATTTGCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATT:1 - chr3L 5091459 5' + Juan 4010 1 61.39 TTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATAC:1 + chr3R 19205511 5' - Porto1 4573 1 80.20 ACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2L 20271232 5' + blood 53 2 77.23 TGAAAGCTGACAGCAACATGCAGCAGACACGACACACAAGCCTCAATTAAAAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACA:1 - chr2L 10788593 5' - X-element 4612 1 53.47 GAGGGAAGTACGTTAGGGTTTTAAGGGTTTAATAAATTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 14708722 5' + roo 8703 2 73.27 GAAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 - chr3L 10683491 5' + opus 7169 4 79.21 GTAGAACGTATAAAACTGCAAATAAAGCGGTTAAATCTTTCGAGAAAACAAAACTCTAGTTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chrX 20283023 5' - 412 479 2 62.38 ATAAAACATACATACATACNACAGCCGAGCAGCCAAATAACAAATAAAAAATACGCTGAAATTGGTTGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAATGATCAGCAA:1 - chr3L 15635811 5' + Tc1 459 1 65.35 TTAAAATATTTAAAACATTNATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chrX 21581097 5' + 297 25 2 52.48 TTTTATTTGCCTTTTTTGGNCGAGGTATTTTTCGTTTGTTTCTAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 + chr2R 20588768 5' + Tabor 6874 2 56.44 TTTCGCGTCTTTCTCCTCGCCCTGCTCATTCGCGTTGTTTAATCGATGAGCAGAGCGAAAGCTGTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chrX 6338967 5' + P-element 12 1 66.34 AAGGACACCTACTGATGCCGGCGTATTCCCCGAGCGATTCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 12882717 5' + 412 7089 2 62.38 TAGCCGTTTTATGTCGGTTGCAAAAATGTTGGGACTGTCCTTTGTTTTCGGTTGAGTTAGAAACAGAAGGAGTCTGTCACTTTTTCCATTCTTTTTTTTTT:1 + chr3L 9952451 5' - Doc2-element 229 1 89.11 TACTATATCATATATATTTATTCTTAATCTTACTGCATTTGTGATACTCAGAATCTAGAGTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr2R 7132582 5' - opus 487 2 68.32 CACAAATTCCAGCGAAATCTTTAAATCCCACGGATTTATGCATTTTTACGTTGCATTTTCTTTTCCACGGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr3R 12906628 5' + hopper 4 2 77.23 GGTAAATAAGAAAGGAATCGACGCTTAATTCCAAAATGTTGGTGTCCCAAAGAAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGC:1 + chr3R 17976955 5' - copia 4952 2 53.47 AGTGGAAGTAAGTCGTAACNAAGTGATACATAATTCTTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:1 + chr2R 13659029 5' + Ivk 39 1 62.38 AGCTCGTCCAAAAAAGCTTNAGAGAAATTGTTGGACCAGTCGGTGAGGGGCAGAAAGGGGATGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chrX 21374255 5' + P-element 7 2 71.72 AAGTTTAGGAAAACGGTACTTGTACCTTGGAGTAGAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:1 + chrX 10996526 5' + 1360 35 1 62.38 TATAACACGAAAGCCAGCAAGTATAATGAATAAAAAATGAATAATATAATGAATAAATAAAAAACAAACACGCTTCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCT:1 + chr3R 4616020 5' - INE-1 14 1 74.26 GAAATGGAAATGCGGCTGGGTTATTGGCTCGACATTTCCCATCTTCCCTCACGCCATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr2L 15479630 5' + blood 21 2 58.42 TTTTAAGACATAAAAAATGCACTGCTATCGTTCTTATGTTTTGTTTAAATAAATATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCT:2 - chr2L 21052827 5' - invader1 4008 2 75.25 GCAGTATATATATTATACATTATACAAATAAGACAGAGCAGACACTAAATAACAAGATGCGTAACGCCCATACATTAGTTTGGCACTAAGCAGCCACTT:1 + chr2L 22993210 5' - 1360 3346 1 68.69 GGGACACTGTCGAATACTTGTCATTCATTTCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGA:1 - chr3R 22717777 5' + roo 9043 1 70.30 AAAAGAAATTGGTTTGACATTTGAATAATTTCGAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3L 5256016 5' + jockey 20 1 78.22 TTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr2L 4110968 5' + Doc 55 1 76.24 GAAACTAAAAAGTGTTGAAAAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3L 11697048 5' + pogo 20 1 57.43 GCATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 7869100 5' + 297 12 2 67.68 ACAAAGTAGAGTCAGTACAATATCACATGATATGCAAATAAATCTGCCTACACTTTTATTGTAATTAATTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATA:1 + chr3R 5213190 5' + G2 3040 2 58.42 TGTCCCATCCTATGGCCGCCTGATTGTCATGCTAAATGGGTGAAGTGAAACTACGACTGCGATTTCGGCCTGTCGTTAGGCATCTCGACCCTTCACATATC:1 + chr2R 16217721 5' - gypsy8 4491 1 72.28 TTTCTGTTCATGCTGGCCATGTACCTACACGCGGCAGTGACACCGTCTTTACTATTGTGAGCCAGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAAT:1 + chr3R 13089854 5' - F-element 252 1 74.26 AAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 19450178 5' + roo 8711 2 57.43 GCACGCACACAGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3R 11278372 5' + hobo 15 1 55.00 TAAGTTGAACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACA:1 - chr3L 3328970 5' + G2 2678 1 66.34 TGGGTAAATATATTCTTTTTACATATAAAGATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCA:1 - chr3R 9273014 5' + jockey 4626 1 70.30 TGGAAGTTACGATAAGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAA:1 - chr2R 8642994 5' + Doc2-element 4692 1 76.24 ACAAAATGTGAGTAAAGTAGCATTTGTAATGATTGCACATTTCTTCGATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2R 7132485 5' + opus 7025 2 56.70 AAATGTTTACTGTGCATCAGAAACTCTTCTTTTTTTTGTACTCTTGCTGGTGGAGGTACGGAGTTTTTTTCTTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATA:1 + chr2R 18995859 5' - TAHRE 10415 1 58.42 GTGCGCTTCTAGTTAAATTGGTTAATATTATTATTATATAGTATATATATTATTATTTTTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr2R 16731933 5' + 297 6587 2 66.34 TAAATTGCTGCCCGTCTCAACGCATTTAAAGTCTAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 15983422 5' + hobo 42 1 65.35 TTTACGAAGCGAATAATTTAATGCGCCATAAATTCGCATGTTCGCTTGTAAAATTGTTTTTTTTTGTATAATACACTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 - chr2R 23441794 5' - jockey 4988 1 56.44 TACAGCAAAAAATAAATACTTTTTAGCCTAGAAATTAAATAGTTGATATAGCAAAAAATACTCCTGTATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGA:1 - chr3R 14979080 5' + 412 256 2 61.39 ACCCGAAAAAAAGTGCTTGCACATTGTACATATTTATTTTAATAGCTTGCGCCATTTGTCGAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTAG:1 - chr2L 16684217 5' - 412 398 2 74.26 ATGCAAATGCTGGACAATTAAATCGCTTAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACA:1 - chrX 17516895 5' + 1360 493 1 73.27 AAGTGAAGAGTTGGGGCACCAGCTCACACAGACACACGCACACACATACACCCACAAGCGGGACAACAGCAATGACACACACACGCACACACACATACATA:1 + chr3L 18084086 5' + Quasimodo 38 2 57.43 TATTTAAGCTTTCATGGATCCAAACTCATTACTTGTTGAACAATTGTAACTTGAAGTTGGATTGGAGTATATACGAACATAATAAC:1 - chr3R 22467113 5' + mdg1 7041 2 67.44 ATTTTTGAAATCTGTATTTATACAGGCTTAATCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCACACTGCCAAAATTCTGCGCTGAC:1 - chr2R 12632760 5' + invader4 496 1 68.32 TAGTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chr3R 22469132 5' - hobo 2919 1 57.43 GAGCGGTATCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 - chr3R 4773393 5' + Tirant 8154 2 73.00 AAAGTGACTTGCTGTGAGGCGTGTTTCCCACGCTATTTGGGTTAATCCCCTCGCAAGCCCCTCATCCATAAAAGTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCT:1 - chr2L 12779706 5' + flea 4754 1 77.23 GTATCTTGTATCTTGTATCTCCGATCATTGATCGTTGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chrX 7534724 5' + Tirant 8122 2 66.34 GCCACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chrX 5997251 5' - 1360 3350 1 66.00 TAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTG:1 + chr3R 5773149 5' + Stalker4 6981 4 55.45 TGTGTACTTCTCATGACTATAGATAAAGTATTAGATGAATCATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 - chr2L 7259468 5' + I-element 35 1 59.41 GACAACGTCGGCGATGAGTTGCATAATTAAAACAATAGAGGTATTATAAATTTAATTAAAAACAAGAGTGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 + chr3L 13087690 5' - INE-1 561 1 73.27 AAAAGAAAATTTTTTTTTTTGAAACATGCACCCATACTCTCACTCTTTTAATAGAAATAAAATATTCAAATTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGA:1 + chrX 14583543 5' + gypsy3 6578 4 76.24 AGCGTTGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAACTGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 - chrX 11025588 5' - hopper 1399 1 61.39 GACCGCGCTGGACCTTGGACTCGATCCAGTCGATCGGTAATGGTGCGCCCAATGCTTGTAATCAAAGCTCCTCCAC:1 + chr3R 2533847 5' + Max-element 53 2 61.84 AAAAATCGGAGTAATAATAATAATGTAACTGTTGATACCGATAACACGCACGCACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCGTAAGGTTCGCCGGCTGAG:1 - chr3L 13597177 5' - G-element 133 1 79.21 AAACGGTTGTCATTCTGCAGTTGTTGTTTATGCTAGTTCGTAAGCACTTGTAAGGGGGAGGGGGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCT:1 + chrX 898724 5' + Circe 13 2 65.35 GCCGGGATATTAATTGAAATTGCCCAGGGATTAGGTAGCCAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chrX 5452557 5' + mdg3 5289 2 60.00 GACACTCGGTTTTGGGACCAGAGATAAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCG:1 + chr3L 20438099 5' + Tirant 89 2 73.74 TGTACCCAGTACTTTGGGGTATGATGATTTGGGTACTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr3R 30611246 5' - blood 337 2 68.32 AAACTAACTTTCTTTGTGGGTGAAATTCGTAAAGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 18769587 5' + roo 8707 2 69.31 TTCACCAAGCTCTTTAAAAGAAGAATATTTTTGGTGGGTAGTAAAAAATATAAACACTCAGTTCTGACTATCAGAAAAGAATAAATAAAATAAATAAAAAA:1 + chr3L 14399749 5' + X-element 4716 1 53.47 AACATACTCAAATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTG:1 + chr3L 26719146 5' + Tc1-2 22 1 59.41 ATACATTCGTTTTTCCCATTCTCAGCTCGAAAAAATATAGTTTTAAAATTTGAAAGCTGGAATT:1 + chr2L 13363382 5' + FB 36 1 90.62 GATGTAGGTGCACTGTGGAAGTGGATACATGGTGGATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATC:1 + chr2R 7456065 5' + Circe 1 2 62.24 TAGGAAAGTGTGGTGCATAGTTCACGGCATATTTGCTGATATTAAATCTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chrX 18160944 5' + 297 6594 2 67.33 CTCATGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 11661144 5' - 1360 3343 1 74.26 GAGGGGAAATTGATCCTTTAAATTCTCAATTCCGTGCAACTTCAAATTTCAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chrX 11987854 5' + 412 10 2 68.32 AAATAAAGCGGTTAAATCTTTCGAGAAAACAAAACTCTAGTTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chrX 20283004 5' - 412 7513 2 59.41 AGGGCCTTCTGTTTAACGGAGTTCTTGGCAGGACCTTCTCGCATCTTGGACATTGAGGGCTCTCTTCGCCGTGTTTCCTTCTTTTCGACAAACAGCAATGC:1 + chr3L 17621125 5' - Tc1 482 1 53.47 TGCATTCGCGTTTTGGGGCTTTAACCGTAATTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACATCTTTG:1 + chrX 17707477 5' - gypsy4 429 2 69.31 TGGCACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTGCGGGTGTGATGCTATGTATGATGGTGAGAGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACACACCTTC:1 - chr3L 19708300 5' + accord 7031 2 72.28 GTTATTGTGTCATAGCTGAATGCTTCTAAGCTCTTCTTTATATGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chrX 13379687 5' + 297 6610 2 63.37 AGCCCCTGCTGGGCATTTTNACACTAGAAGGGGGCATGGTTAAGTCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCA:1 - chr2L 17982125 5' + roo 9011 2 56.44 GCGTTTGTGTGTTAGTAGTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr3R 22469117 5' - hobo 2936 1 73.74 GTTGCGTCGATATTTTCTACCACCACTGTGCAGGACACACAGACACTTGCCATCTCGCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACT:1 + chr2L 19161379 5' - copia 475 1 60.40 ATACACGACTGTTTAGCTTGATTTCATTTTTTTGACATTTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 + chr2L 22052492 5' + flea 34 2 65.35 GATTTTTGCTCATTAAATGATATTAAAATGGTTTTGCTGATTCATTGGTTTTCTTTTATTTACTTTCAACTACTTACGTATATTTAAAAGTTTTTTTTTAT:1 + chr2R 19068165 5' - Transib5 27 1 51.49 GGTCATGGGGCATTCCAATGCCAAAACGGGTGGGTAAGTAGTTGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTAC:1 + chr3L 21399256 5' - Doc 4439 1 57.14 AATTAGCAACAATTTGATAGTTATGTAGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAA:1 - chr2L 14038441 5' - 3S18 6055 2 75.25 TTTAAAAAATACTTTTTTAAATAAATTATAAGGTTCAACATGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGT:1 - chr3L 23104110 5' + Max-element 36 2 62.38 GCGTCATCTGCCCACGCTCCAGCTGCCTACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr2R 6769464 5' - 412 444 2 70.30 TGTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTC:1 + chr3R 12611987 5' - 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pogo 2082 1 60.40 AGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2R 18988464 5' + hobo 29 1 67.11 AGATTAAATTATACGAAAATATGGCCATCAACAAACCCATAAACAATGGCACAACAAATTATAATATTATACAAAACAAAACAGAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr3R 14980048 5' + gypsy7 5004 1 54.46 TAATTAGATGGTACCCCGCCGTCGTCTGCTGTCTATAATTTCTCTCAGAAATTATGATTTTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTTAGTTACGGGTATCTGA:1 - chr3R 18338412 5' + INE-1 544 1 69.31 GCCAGCCCTACCGTAAGGTATTCATTTAATAATTTCCTACTCTGAAAGCGTATTGAACGCTTTCGAGCCGCCACTGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCT:1 - chr3R 9026024 5' - 412 7388 2 78.22 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCT:2 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 77.23 AGAGCGCTCGAAGAGCGACCTTCTTTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGACGAGATAAAGCGAAA:1 - chr2L 5983538 5' + G6 434 1 75.00 AACGAAAGGGTGCCTCGATTTGTAGCTGGTAAAAAATGGTTTATCTCAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chr2L 2309477 5' + Burdock 6146 2 67.33 GCGGACACGCGTCGCTTTACGCACGTCTGCTGGCTGCGGATGCGGACGCGGATGCGGATGCGGATGTTTATGTCTGGTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGG:1 + chrX 21018035 5' - Quasimodo 277 2 57.43 TAAAAAAAAGGCAAAACCANAAATCAAGAATTATGTTCCAAATAAAATTGGGCGACATTGTTTTTTTTTTTAACAAATTTATGATTCAAA:1 - chrX 17400220 5' - Tc1-2 333 1 63.33 TGCCGGTTTCTTTCTCGTCGGTTTTTGCTGCCTGTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 + chrX 1835254 5' - jockey 4957 1 66.34 AATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr3L 11257425 5' - 1360 3383 2 73.27 AAAAAGTGTGCTACGGAAAAGAAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 22469220 5' + hobo 21 1 54.00 TTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr2L 16939866 5' + opus 7046 4 71.29 GGTATCTGAAAGATACAAAATATGCTCAGCAATTTACCTTTTTCAAGTTTCCGCCACCACATGCATGACTGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGG:1 + chr3L 11387144 5' - accord 189 2 50.00 TGTGGACACCCGGACACCTNTCCAACCCATCCAATGATTTCGTCATTTGAGGCTGCAGCGACGCATGGCGAGATCAAGTCTTATATATACATATATACATA:1 - chrX 14533350 5' - invader3 5089 2 67.33 GCTAGAAACTAGAATCATCCTAATTCTGGCCTGTATATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3R 18549976 5' + pogo 35 1 67.33 GATGAAGATGAATTAGTAATACTATTGTATTAAATATAACATTAAATATATTTACAAATTTACAAGGATGTATCTTTTACATATTTCAATATTTATTAGAT:1 - chr2R 14434642 5' - Penelope 153 1 79.21 CTTGAATGTGTCGCCTTTTCTGACTGCCTTTCTATCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGATTGCGTGGCGCTTTCCATCAGGAGGAA:1 - chr3L 5297548 5' + baggins 5258 1 65.35 AGGCAGACGTTGTGCCTCCCAAAATTCGTATATAAATAGTAGGCTTTCTCGACTTCTTTCAATAATAATACAGTACATAACAAACACATATAACAAATAG:1 - chr2R 917924 5' - X-element 4569 1 65.00 TTTGGCAGTCCTGCCAAGTCAGACTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTA:1 - chr2R 23317778 5' - F-element 4625 1 76.24 TTTAATCTTCTTAAGTGAGACTGCCCTCGCATCGGGCACAGCTGCTGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr2L 14799100 5' - hopper 1390 1 54.46 GACATCCACGCTTAATAATNTCCCTTTCGCGTTGGAAAAACAAAAGCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 949270 5' - roo 9044 1 54.46 GCAGTTCCTCCCACTCCGCCGCCCACTCACCGAACACCACCACCGCCCATGCGGAAGTCAAGCGGACAGAGGTCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGC:1 - chr3L 20692975 5' + 1360 3331 1 67.33 AACGCTGTTAATTAGCAAAGTTGATAAATCTACGCAGATTTAACATATCAAGTGGGTGGCAAAGTTTGCATTTCCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 - chr2L 20610000 5' + copia 4871 2 82.18 AGTAAATTGTTTATCTAAGGTTAGCATGTAAAAAATCAACAAACCTCTCCAACCTTGCCACGCCCACACTTTTGCAAAATGTATT:1 + chr3L 23230241 5' + INE-1 258 1 48.24 TTTTTCTGCACATGGACGGGGTTTGGGCCTAATCTACCCTCTTGTTGGGTTTCACATGAAATTTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3R 20284706 5' - pogo 2091 1 69.31 TTTTTGGTGCGTCACTTGGGGTCACCTATTGGGAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGAC:1 + chr2L 20951030 5' + G2 2644 1 74.26 GGCAGAAAGGGGATGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 21374207 5' - P-element 2832 1 24.24 AGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3L 153630 5' - 1360 3345 1 75.53 ATTAGGCTGCCCAAAAGTANGCAGCGAAAAAGGTGTCAACTGCATTACTCATCAGATTGATTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 - chr2R 10857769 5' - BS 5077 1 51.49 TGGATCGTGGACCAGCACGGGAATAGCGAAAGCCAGCATGTAGTCAGGTAGTATGTGTAATGATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAA:1 - chr2R 12032264 5' - Stalker 7087 6 71.29 GGGCACAACACTTTCCCACCGCAAAGTGCATCGAATGAATCAAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr3R 26434204 5' + hobo 8 1 69.31 AAGTTGCGCATGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAA:1 - chr3L 25232866 5' + accord2 12 2 64.58 TTAATTAATATTAACATTGAGTAGTTTATGCTTGAGTGTGTGTTGGATACGGTAGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTT:1 - chr3L 13511068 5' - Quasimodo 7037 2 72.29 AAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr3L 153599 5' - 1360 3359 1 70.30 TATTTATTAGTGGTGCCCCAGAGGCAAATTGTGTGCTGGGAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAA:1 - chr3R 28204189 5' + P-element 417 1 45.54 ACAGGGATCCGGTGTCCCACTGCCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGCCATAGGTCCAGGTCGGTCTTAGGACG:1 - chr2L 10065930 5' - Fw2 3532 1 78.22 GAAGTTAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 + chr3R 26342932 5' - blood 7355 2 58.00 CCTACTGCCCACAAACTTCTACTCCGAGATGAACCAGCAGTACTACAGGAGATTTAAAAGGATGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCC:1 - chr2L 5956626 5' + BS 4951 1 54.46 TAATTTAGGTGCACAATGCACTTACTCAATTGCGCCGCCTGCCTTGAAATGGAGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTG:1 - chr3L 12850801 5' - 1360 3220 1 57.43 AGCTTAAACATTTAGCCTAGGAAAAAAAAGGTTTAATTATTTCTTAAATACAATTTTTTTGTCTTCGTATTTTTATTATTATTATTATTATTGTAATTATA:1 - chrX 7676129 5' - mdg1 16 4 69.31 TACACGCGCCCCATTTCGGGGGATCGGGGATATATGTATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr3R 10090313 5' - pogo 2067 1 67.33 CCATAGCTATTAAAAAGTTCGTTCTTAAAATTAGATATTTCATAAAAAGTTGTTCACATATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 25322249 5' + roo 8694 2 59.41 AACCGCTTTTCACTTTATTCTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTT:1 - chr3R 13348786 5' + X-element 4599 1 80.20 AAAGGGTGGCTTTTCAAAGGGGTCCGGGTGCAGCAGGTGACAACACGTAAATGCTATCAGCTGTATTGTCTGATGCAGATGATCTGATTAATTACC:1 + chr3R 30406525 5' - Rt1a 175 1 59.38 GTTACAAAACATTCTTCACAGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCATTCCCTCTTACGCTCTCCCGCT:1 + chr2L 16132550 5' + GATE 8284 3 78.22 GAGAGATCTAGAATTTCCGGTTTTTACAGCGCAACTTGCAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAAT:1 + chr3L 15952714 5' - Stalker 6917 4 64.36 GCTGCTGCCTGCAATGTGTGTTTGAGATTATTTTTACTGCCTGTCGGCTGCATAATCGAATAAGTTTTCTTGCAAGGGGATTTGGACGTGAGGTTAGTTTT:1 - chr3L 2129966 5' - Doc3-element 4512 1 57.43 AAAATCTCATACTTGCAATTGTAGTACATACATGCATGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr2R 16907566 5' + opus 35 4 68.32 TTAAGGCCACTTTTCCCGTTTTCTCTTCAACAGTATGGCATTAAACATTGAAAAATTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 13214969 5' - roo 9052 2 59.41 AACTAAACAAATATGAGATGGGTTTTATTGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 + chr2L 8007841 5' + copia 49 2 75.25 AAGGGCAGTGCTTGCAACAGGAACATTGAAAGTATATTTAATTGAATAAAAGCGGTCGCGATATAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 3822484 5' + pogo 4 1 75.76 TTACTCAATTACTCTGGCCTTTGTGCATTGTCTGTAGATGCCAATATGTGTATGTGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr3R 16305455 5' + pogo 18 1 59.41 GACATCTGCGACCGGGCTTGTATTACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTAT:1 + chr3R 14980500 5' - 412 7493 2 72.28 ATTCGTTTGCTACGCTCACGAGAGCGGACGTGCAGTGCGGAAAAATCTGACAAAATCAGGCAAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGACAGAC:1 - chr2L 21069867 5' + F-element 423 1 65.35 AATTGATTCTTTTATGCTTATACTCGGTAGCGGCACAATTAGCATTCTTATCTGATTCTTTTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 14601880 5' + roo 10 2 68.37 GACTAGAAAGAGTCTATATAAAGTTGCTAAATTGTCTAGCACAGTATTAAACAAGCTCGACCGATTTGCTTTTGATTCAACAAATAAATAAATAAATTGAA:1 + chr3L 14464604 5' + Juan 4215 1 90.10 TGATTCAATCTAAATTCACAAGACAAAAGCGGTAATTTCGGTGTTTTTTTTTTTCTAGTTGGTGACTCAGTTTAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAG:1 + chr3R 6974929 5' + invader4 170 2 74.26 GGAATGCTTTTGCGACGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr2L 14054813 5' + F-element 27 1 58.42 TGTGTCGCCGCGCTTAAGTAGGGTTTTATGTATCCTCCCACTAGGAACAAAATTGAAGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAAC:1 + chr3L 19581194 5' - G6 1848 1 67.33 AAGGTGCATTACGTTGCTTNCTTTTTCATTCGGTAAAGAAGGGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 - chr2L 4764087 5' - Tabor 452 2 59.41 ACCTTCATACCGTTGCATGTCCTCTGGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATATAT:1 + chrX 2988627 5' - Quasimodo 29 2 57.89 TTTCTATGTTTGTTTACTTCGTCGCTTTGGTTGAATACCCTGAACAACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAG:1 + chr2L 14827453 5' + G2 2961 1 53.61 AATATTCAGAGAGATCTTTTCTTCGAACTCGTGTTCTGGGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:2 + chr2L 2845746 5' + roo 38 2 64.36 GACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2R 6041624 5' - opus 7462 2 70.30 TTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2R 21713299 5' - P-element 2851 1 41.58 TACGCTTCGAAAGTGAGAAAGTGCCAACTTGTGCCAAAAACTAATAACTAAAGTGTTTACTCAAAACTGTTATTAAATTGATGTTAGTAACGCCTTTT:1 + chr3L 3326311 5' + transib3 482 1 81.63 AATGCTATCGTTCTTATGTTTTGTTTAAATAAATATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTC:1 - chr2L 21052807 5' - invader1 3988 2 54.46 AAGAGACAGACATCAGCTGNCCGAACAAGGGCTAAAAAGCAACAAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAACAA:1 + chrX 13024322 5' + Doc2-element 220 1 71.01 ATGCATCATGTTATCTTACATATTAAATTGGAAAACGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 - chr3R 9858921 5' + BS 11 1 62.38 TGCGGATAATTTAAACGATNGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chr2L 23372625 5' - 1360 3353 1 66.34 TGAATTTTCCAGAGATCAGCACTTTAAGCCAATATGATTTGGAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:2 - chr2R 8707093 5' - flea 4984 2 59.41 GCTCATTCGCGTTGTTTAATCGATGAGCAGAGCGAAAGCTGTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chrX 6338944 5' + P-element 34 1 46.00 AAAGTTGGTTATAAGTATCGATCGAAATTCTCCGTAAAGCTATTGACCTTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr2R 13258796 5' + F-element 41 1 50.50 ATGAACGCCAAGTGGGATACGGTAAGTTTAGCTAGCCCGCACATACTCTTTTCCATCGTTCGTTTATCATCGTTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGT:1 + chrX 8068763 5' + mdg1 7023 2 56.44 AAGCATGCATTTAGGCGCTCTGCGGTTTGACAGCCGCCCGCCTGCAGCCTCTCTCGTTGCTTTGGTGTGCGTGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3L 13557148 5' + hobo 6 1 72.28 TTGCTGGGTGCGTGGTGCCTGCTTTATGTATAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chrX 14324734 5' + 297 6618 2 76.24 AAGGTCATCGATCAGCTCCCACCTCTCACGAAGAACGAACTCATCAAACGATAACGAGTCCGCTAAATGGTCTTCAAAAATAGTCTTCAAGCAGATGTCAT:1 + chr2R 5612245 5' + Q-element 287 2 71.29 TATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 - chr3L 25232912 5' + GATE 8266 2 54.46 TTTTGGGTTAACATCTATCTTTTTATATACGTATATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 - chr3R 22517310 5' + jockey 4714 1 65.35 GATGAAAATTATTTGACGACGAAGATAAGTAATATTATTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACAT:1 - chr3R 20192585 5' + Quasimodo 37 2 68.32 GGGGAGCGGTGACACCTCAGTGCGGAGTGAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTGAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTG:1 + chr2L 6558227 5' + gypsy4 315 2 80.20 AAGTCAAGCCATTGACTGACTAGCCAAAGTTCTTATACGAGCTTCGTTCAGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr2L 15526973 5' - pogo 2080 1 57.58 AGAACATGTAAATTCAATTTTCACCTTGCAAGTCAATCTATCGAAGGCGTTGTTGTTTTGGGCTGTGATTGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:2 + chr3R 6190210 5' - copia 251 1 75.25 CCAAAAGGCATAAAAACAGATAAAACAAAAAGCCAAAAAGGCATAAAAACATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTC:1 - chrX 12508330 5' + Stalker4 120 4 65.35 GGGAATTCTAGAGTTATCCAGTAGTTCCACTGCAACCACCTCACCACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGG:1 + chr2L 19077922 5' + blood 7380 2 55.45 ACTTTTCCCGTTTTCTCTTCAACAGTATGGCATTAAACATTGAAAAATTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 13214977 5' - roo 9044 1 54.46 TTGTTTCTCATTTCTGAAGCCTTGTCACTTTCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 + chrX 3016642 5' + diver 25 2 51.61 TTTTGAGTTTCATTTCAAAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATT:1 - chr2R 17402807 5' - invader4 317 2 71.00 GGTGTGGTCGATGATGGACGGATTGATGACGGGTGGAGTTGATTGCCTTTCCTGGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATT:1 + chr2L 2289146 5' + hobo 2636 1 58.42 GTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGG:2 - chr3L 3328958 5' + G2 2690 1 78.22 ACGAATAAGCGTTGTTACTTTTTAAGTATAGGCAGACCAATGTTTTGACAATACAATTGCTGAAGCGGTTCAATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2R 9867514 5' - roo 406 1 76.24 ATCAGCGATTTCAGGTTACAAAGGTGGAACTTAATGTGTCATCTCCCCAGCAATTATCCGCCCAAGCAAACATCACTGAAGGGATCTTCTTACATTTCCCT:1 + chr2L 19145037 5' - invader4 2982 2 73.27 AAGGGATACCTTTTGCCAAATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2 - chr3R 30611323 5' + blood 16 2 64.36 ATTATGAATTCATTTCTAATAAGGTCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACCATGCAGCCAC:1 - chr2R 12702170 5' - 1360 3348 1 75.00 AATCAACACTGACTCAAAATATTCAGAGAGATCTTTTCTTCGAACTCGTGTTCTGGGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 2845729 5' + roo 8685 2 58.42 TACGAGGACTATCATTCCAAAAAATCAACTAATTTAGTTGACGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATAAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGA:1 - chr3L 25670756 5' + Cr1a 4099 1 59.41 AATGATCATCAAATAATAGTTGAAACTTTCACGAGAATAAGTTTGAACCGAAAATATAAGTCTAAGTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAA:1 - chr3L 1927507 5' - mdg3 235 2 68.32 AAGGGAGCAGCAAAGTCCTGCCCAAGATGATGCAGAGCATAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATC:1 - chr2L 15984497 5' - hobo 333 1 60.40 AAGAGTTTTCCCCCATCGACGACATTTGACATGGCAAACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTC:1 + chr3R 19807298 5' - opus 329 2 63.00 TTTTACGCCCATCTGCCACCGCACTCCCAAAAACAAAAGCTACCAATCTAAGTCACTTTTAAGAAGTTTTAAATTTTTTTTTTATTTTTTGAATTTTTTCA:1 + chr2L 18729764 5' - TART-A 13401 1 42.57 ATCAATGGGTATATGGGTTATATCAGGGATGTGGTAAAAAAAAACTACCCTACATACTACCAACTATCCGGATGACAGCCAACACGGAGGTGCGGCGATTC:1 - chrX 10015214 5' + G5A 202 1 55.45 GAATGACTTCCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr2L 20271215 5' + blood 36 2 60.40 AAGTTCATATGTGGTCCACTCCAACGAACATACATATGTGTGTGCGTTTGGTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTA:1 - chr2L 15168123 5' + F-element 13 1 72.28 TTAACTTATGCTCTCCTGCTTGCCTACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATT:1 + chr2R 20411441 5' + I-element 5012 1 75.25 CAGTGATCGTGTACATGAAAACACGCACACACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chrX 10547632 5' + P-element 4 2 76.24 TTTTAAGTTGAAAAACGGAATCAATTATCTCTTTTATTATTTAAACATCAAATGCAAATGCAGTGCAATCAACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 - chr3L 18928936 5' + mdg1 7045 2 69.31 ATTATTGTAAAATGAAAAGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 15375349 5' + 1360 23 1 56.44 GAAATATAAAAATAAAAATAATACGGAAGATTAAGTGAGAGAGGCGTTTGCGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:2 + chr2R 18988413 5' - hobo 2914 1 52.48 GAAGCAATTATGCAGTCCGAAGACATGGCCCAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCTCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTA:1 - chr2L 11041023 5' + opus 365 2 67.33 GCTGGCAATTTACTTGACGCTCCAAAGTAGGCAACACTCGTCAGACGAACGAAGTGGGGAACAAAAAAATATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chrX 4422583 5' - jockey 4988 1 72.28 ATCTCCGGGTATATCGAACCGCGAGATGGCCAGCGTATAGAGCTCCTGCTGACCCTGCGATTTGCTTGTGGCTTTTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTGC:1 + chrX 17104846 5' - gypsy7 5005 2 70.00 GTGGGGCAAGTGGGTGGCTNGGGTTGGTTGGAATGAGTATGGATGGATGGTTCTCCAAATGCAGGAGTCATATTTCGCGAATTAGTTGCAGTCGCGCTG:1 - chrX 17039822 5' - gypsy4 66 2 62.63 ATAAGTATCGATCGAAATTNTCCAAAAGATTTTGTTGCTAATATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr2R 13258786 5' + F-element 20 1 65.35 ACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGGTATGAACATACATACATATATGTATGTATAGTTGGTTATGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCG:1 - chr2R 22661281 5' + gypsy6 1 2 76.24 AAAAGAAAGTGCAGTTAGTGTAGTTCTTAATTATTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 - chrX 12420342 5' - jockey 4956 1 69.31 AGCACCAGCCGCAAAAAAAGAAAATAAAAAAAA:1 + chr3R 18919214 5' + R2-element 3585 5 87.88 AAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACGT:1 + chr2R 11575011 5' - INE-1 143 1 55.45 GTACACACTTTTCGAGAAAATATTTTATGTATAAGAAATCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATT:1 - chr4 626848 5' + diver 39 2 61.39 GATAAGAATTGTTATATTCTTTCATTAAAAAAAATTTATTTTTTTTTAGAACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3L 25782385 5' + Doc 33 1 56.44 AGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr2L 15168070 5' + F-element 66 1 77.23 TACATGTACTGCCAGCTGTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 18171752 5' - 1360 3384 2 72.04 TTATTTGCACACACAAAAGACACATTAAAACTAAATTATTAAAATTTTTGCAAAACTGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTG:1 + chr2L 5488682 5' - Quasimodo 7104 2 59.41 GTAATGGACAACCCACCTCAATTACGTAATAATTATGGTGCGCCCGGTTTAATTGTGTTTATTATATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 20709475 5' - roo 398 1 67.33 GGTGTTCTGAAATCTCATCTAAATCATCGATAAATGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr2L 16939789 5' - opus 7487 2 64.36 ACAGATAGCTTTTCAAATTTTCCAAAAAAATATTTTCGAAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr3R 20599603 5' + opus 141 4 65.62 AATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 + chr2L 16939825 5' - opus 448 2 76.24 GTCACATGTCAGCTCACGCGATTTTTGCCGTCCAGGCACTGACCTTTTGGCCTCATTGCGTCCCCTGCATTGATTGAAGTTTTTCGTTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr3R 27427717 5' - Doc2-element 234 1 77.23 TACGAATCTCAATCTGAAATAAAATAGGAATTCTATTTCGCTGAAATTTATAATCAGCTGTTGCATTTCTGTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr2R 22665957 5' + pogo 1 1 48.51 TGGCCATATTCTATTCTCATTCACTCCATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGC:2 + chr2L 2309395 5' - Burdock 6349 2 68.32 AGTTGTTTTATTTTTTGTTGGCCATTATCCGAGTGGCGCCCAGGTACAATGCTTTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGA:2 + chrX 17217718 5' - R1A1-element 5302 1 47.52 GCGTGTAATTTTGGATTTCTTACTGTTTGAATGCTCACAAAGCTCATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAACGGCAAGATA:1 + chr3L 10560237 5' + pogo 28 1 58.42 TAGCAAAATAAAACCAATCTTAAGAACTCACAAATCGGACATATAGTAAAAACAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCAAAA:1 + chrX 3684694 5' + 1360 3345 1 61.70 GCATAATAGTAAAGAAAATGATTATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:1 - chrX 4422698 5' + jockey 8 1 76.24 ACAACAATGGAGGATAGGCAAAAAACCGAGAAATAGAAATCCAAAATGAAAGGAGAGCAATCAGCCAAAGAGCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACA:1 - chr3L 3410385 5' - accord2 7152 1 77.23 TAATTTTTAGTCATTGCGCTTGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18769624 5' - roo 9028 1 76.09 AAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAAT:2 + chr3R 4357547 5' - Tc3 1673 1 64.36 ATCCAAACATCCACATCATNATTGACGAGTTGTTTCCACGGCATCCCATCAAGTAGTCTCTGCCTAGCCTTCGTTGCATACGGACGTTCGCGATTGCCTAG:1 + chr3L 18564061 5' + jockey2 13 1 77.23 TAAGAACTAAAATGTTATTTCAAGATTTCATTTAATCTCTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 - chr2L 15174156 5' + Juan 4066 1 61.39 AGATAGAATTCTATAGGGCGAACAAAAAGAGAGTTGCAAAGTAGCAACGCTAAACGACAAAAATAACGGTCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2L 21628839 5' - P-element 2883 2 75.25 TTTGCAAATAAATATTCGCCACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTGCCATACATTGGT:1 + chrX 5997234 5' - 1360 3366 1 56.44 GAGCTTCCTCTTGGCCGAGGCACAAAAGTTCATGCAGTTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAG:1 - chr2R 24741511 5' + gypsy12 41 2 63.37 AATTTTGTGGAAAACATGTTATTCTCCATGCCTTTCAACTCTCGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAA:1 + chr3L 8899386 5' - pogo 303 1 58.42 ACGAAATTTAAATTAATTAATACTTCACAGTTGCCCCACATTGCGTAACGCCATACTATTTTTTGGTACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 + chr3L 8146212 5' + 1360 61 1 59.41 AATACATGTACTGCCAGCTNTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3R 18171750 5' - 1360 3378 1 67.33 TTACGTGTATAACTTATGGCCAGTAGCAGTCAGTGTATAATTAAGTGTTTGGGTGCAACAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTGGAAGGAGC:1 - chrX 19840098 5' - mdg3 5264 1 63.37 ATCAAATCACAGGGACTTTTGGGAAATTTATGTTTAGATTGAATGGGGAATAAGATTAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTA:1 + chr3R 21240755 5' + invader4 2935 2 63.37 AGCAAGCGCCAAGCGTTTAGTTTCAATTTGCTAGCGTATTATACCCACACCTCCACTCATTTTTTTCTCAGCACACCCCACACACACACACACATGTACAC:1 - chr3L 10053029 5' + accord 7033 2 85.15 GCTTTTTGCAATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3L 95867 5' - roo 9036 1 62.38 TTGATAGTTGCCAATTCTGAGAAAGTTGTAAGACTAGATTTTTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1 + chr3R 20872692 5' - copia 239 1 61.39 TGTAGGCGGACATGTTGCTGCTGTCTGACGATTTGTCGCTGCTTTTGTTTTTAGAGTAGGCAGACATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACTGAGTCTCTCT:1 + chrX 19741128 5' - 412 7423 2 55.45 TTACACTGTGGAGCAAAATAGCAGAACCGGGAGACCAGATAGGCGAATTGTTCAAACAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 - chr2L 3937806 5' + Burdock 15 2 64.36 TATCTAATCACTAAACCAACTCATTTGCCTAATGGCATCTTACCTTTAGAGGGTATTTAGAGTGCCGTTTCGCCATTTTTTGTTTGTTTTTAAAAAATATA:1 + chr3R 7804116 5' + transib4 454 1 43.56 AATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 95876 5' - roo 9027 1 69.31 GGATGGTGATTATTTATTTNATGTCTGTATTTTCACGCATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 + chrX 3691532 5' - jockey 4957 1 66.34 TGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 6866182 5' + 412 42 2 66.34 TATGTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3R 3181119 5' - opus 7473 2 53.47 GCAAACGATACGGATATGGCTGTCGGGAGTCGAAAGTTTCCAGGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 14691007 5' - roo 395 1 59.41 GCCATTGACTGACTAGCCAAAGTTCTTATACGAGCTTCGTTCAGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2L 15526980 5' - pogo 2071 1 58.42 ATAAAGGAATGTAAGTTATTGTTGTATTTCAGGAAAATATTTAATCAGAAATGTGCGCTCTGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chr3R 13084615 5' + F-element 72 1 60.40 GTACGATGCTCGGGCTTACATTGGACAGCATTCCATCATTGTGCGGGCCAGATGTCAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAA:1 + chr3L 19516442 5' + flea 389 1 59.41 GAGAATTAACAATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:2 - chr3R 13239985 5' + jockey 24 1 54.46 ACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAAAGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCTAAGTCCTCTCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 - chr3L 13739651 5' + BS 5017 1 54.46 TTTCTTTCTTTTCTTTTTTTCTTCTTTCTTTTTATATGTAAATTAGAAAAAGGGTTGGCCGGCGATTAACGCGCGCGGCTTTTACTAACCAAGTGTCAGGC:1 + chrX 4519272 5' - gypsy2 6781 2 75.25 GCCGTCGCCAAGCAACAGAAAATATTTTCTACGCCCGACCGCTACAAACGTACACATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCC:1 + chr2R 6482656 5' - gtwin 455 2 59.41 GCACTTAACCCATGAGAAAACAATAACAATTCAAACGAATATCTGGCGAATTACGCATCGAATTGATATTGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 + chr2L 8913285 5' - mdg1 417 2 74.26 TTGCGCTTATTTTCAGTAAGTTTCGCCTTTGTTTTGTCATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 + chr3L 13367692 5' - mdg3 210 2 58.42 GCTCTATGTATTAATTATATAATATTTATTAATCAGGGGACAGTTTGCTTTAAATGGTTTTGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:2 + chr3R 16805982 5' + 412 6 2 73.27 CGCATGCGCGCATATTTCGCTTTAATTGGCAAGCGGAAAAAAGGAGAATCCCAGCCATGGGCACCTCCAACGATTTGGGCGGTGGCAAAAGTATTTAGACA:1 + chr2L 5507644 5' + Tc1-2 202 1 73.27 TTTGGGGCAGCTATATTGCAATTGTTTGCTGCGAATTTGTGTTGGGTCTTAGCCTTAAGCCTGGCAGTAACAAATACTTGTGCATAAACACAAACACAAAC:2 + chrX 12966383 5' - 412 7131 2 66.34 AACAGCAAGCTTCCAAAGCACTAAAGGCGTTAATTTCAGTTTTCACAATGCAGCGAAGGCTAGAGGCATATTTTTTCAAATTTCCAATGCATGAGCATACG:1 + chr3L 11880086 5' - 1360 189 1 66.34 TCTTTGTCGACTGCCGTTTGGAACTGTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCGGATTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAA:1 - chr3L 16816434 5' + Cr1a 4109 1 75.25 AAAAAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2L 18297883 5' + hobo 46 1 69.31 AAACGCATTTAATTCTATTGGTTTACTGTGCCAAATCACGAAACTAATGTATTCATATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 - chr3R 22671233 5' + I-element 4883 1 60.40 AAATGATGGCCCAACTTACTAATGAAGCAAAAACTGCAAACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3L 17146877 5' + pogo 33 1 64.00 AGGTATCAATTTGCCCACCGGCAGGATGATGCGCATTTCGGCCGCAAAGCAGCATAAAATTAAAATCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACT:1 - chr3R 14860048 5' - BS 4990 1 69.31 GTTGTAAAAAGTGTTCCGTCATGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr2L 8690513 5' + Tirant 8125 2 61.39 ACACGCACTTAATTATAATTCATATATGTTTACTTAAGTTAATTACGCTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAA:1 - chrX 3016711 5' - diver 6082 2 53.47 GCGAAATGCCATCTGCGCGATCGGCATTGCAGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2L 4650502 5' - roo 385 2 56.00 AAAATTGCGGGAAACGGAAAATCAAAACGAAAGGCTCGAACACATTTGCCACCACCGAAAAGTGCGCTCAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATTG:1 + chr3L 7125219 5' - accord 7026 4 76.24 AATGATTCCAAACTAGCACCAAGGTAACCAACACACTCACAGAGCACCCTCGCACACACACGCACACACACACAGAGCACCCTCGCACACACACGCACACA:1 - chrX 12838671 5' - Stalker 449 1 80.20 GACTGAATTAAACTCAAGTCGTATCCGTTTTCAAGGACACGGTGATGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 7461147 5' - roo 394 1 64.36 TACGTGAAAATTTTTGACAGTTATTTTAATGAAATTATGAAAAAAAAA:1 - chr2L 12321546 5' + HB 1544 1 81.25 GTGTGGTTGCTCTCGCACTTTCGGCGGACAGACCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3L 5355401 5' - P-element 2845 1 36.63 ATTGATAGTTGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chrX 153027 5' - mdg1 384 2 65.35 GATCGATCACTTTTTCATTTTAAAAACTGATATATTTTAAAAATATTTTAACTTCACTTTTGCATTGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 - chr2L 18472853 5' + Doc 13 1 44.55 TTTATTTTTACATAAATAACCATTTTCGACTTATTCATATCATATAGCTTTTTAAGCGTACCGATTTCCCTCCTAATTTTTGAATTTAATAATTTTTTTTT:1 - chr2L 14778274 5' + accord2 341 1 70.30 AAACTCTAGCTCCGGCCACAGTCGATGCCTCCCGCTCAAATAACAAATTGCATTCAATATTTCTTTGTACTGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGAT:1 - chr3R 17616036 5' - HMS-Beagle 244 2 78.22 GCGGCGGTGGTGCTGGTGCGGGCTTGATGTCCACTTGGTTGAGTTGCTACTGCTTTGAGTTACGCTGCTTGTAAAGCGTTGAATTGCTGATCGGCACTCGT:1 + chr3L 2721026 5' - BS 441 1 66.34 AAATGCACTGCTATCGTTCTTATGTTTTGTTTAAATAAATATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACT:1 - chr2L 21052813 5' - invader1 3994 2 61.39 GCCAGTGCTCTCACGAAATAAATATTTGGCCAATGCAGTAATGTTTGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 28216790 5' + blood 7040 2 51.49 GGCCAGCCACATGCAATCAAAATGAAACATTTTGCTGCTGTTTTCATTGCAATCGATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCG:1 + chr3R 9288172 5' + Tirant 8333 2 55.45 ATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGA:1 + chr2L 23299989 5' + invader4 356 1 68.32 AAGATAGGAACTTATCCTTTATATCCTTTTATCTTTTACAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:2 - chr2R 24169975 5' + roo 8701 2 66.34 AACAGCTTGCATCGTTAAGTACATAACACTTAACCAATGAACCATCGAGACCTATGCTTGTATATGCGTGTATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 11191106 5' + hobo 3 1 72.28 TTAAAGTCTTTATCTTTTCTTTTGACTTTTTGTATTTTGATCCGGATGTGTCTTCCCTGGGGGAGTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACGCAAGGTGCAAAA:1 + chr3R 29437288 5' - transib4 2325 1 60.40 TTCAAGTAATCACACCTGTTAAATACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 17415255 5' - roo 9022 2 75.25 AAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCG:1 - chrX 22386783 5' + hobo 64 1 52.48 TTGTACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCC:2 - chr3R 7869200 5' - 297 6955 2 59.41 GAGTGTGTTGGCAACTCGCACACTTTTTCACGCCCGTGACCCCCGCGCGAGGTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr2L 8646674 5' + Tirant 8139 2 56.00 CTTATATCGTGAAGCAACCNAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 16127755 5' - roo 361 2 73.27 GGTGGTGAGGGGGTGGCAGTGTAAGGGCCAAAGAGAAGGGTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 + chr2L 9319053 5' - jockey 4960 1 60.40 CAACGACGAAGACGAAGAAAATGCCCGAGACGAAGACGACGTTGTTATAAATTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTT:1 - chrX 12378467 5' - hobo 2574 1 52.48 AATAACCTTGACTTTAGGCNGCTTAGGATGTAGCAAAATAAATAAGAAATAAAAAAAAA:1 + chrX 11371378 5' + BS 5096 3 71.19 TTGTGCTCCGACATATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGATAAGTCTTTA:1 - chr3L 24283404 5' + Cr1a 4025 1 66.34 GCCTGCATCATTATCACGGATCATTAAAAATTGCAGTGAAGCTGAGCTGGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGC:1 - chr3L 8252744 5' + 297 6744 2 51.49 TGGTTTCCTTCCGTTCCTCCTTCTATGTTCTTTAGATTTTTCTCCATTTTTCCTATTTTCCGCACATTTTTTTTTTCGTTTCACTGTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chrX 3737395 5' - transib2 2641 1 54.46 ATTGTAAGATCAACTGCACACTATCGCTTTCATAAATCGACTGACGCTGCGAGTCTTTGTTAGGTATAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGTAT:1 - chr3R 3269477 5' + Gypsy6A_LTR 159 1 58.42 TAAAACACTTGTATACCTAACATTAGTCGTTTAGACAATCTTTCAAGTAATCACACCTGTTAAATACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 17415224 5' - roo 400 1 57.43 GTTGGGTTTTTTATATACACTCTTTCGGAGTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 771774 5' - roo 9029 1 70.30 TAGCCTAGTATCAAGTGGATGAATATGCCGCGCAGAATTGAGCGTAGGGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAAC:1 + chrX 8455272 5' - roo 8767 2 55.45 GTATATCAATGGATATCTGGACGAGATAGAAAGATTTGTTTTTTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3L 16478375 5' - pogo 2072 1 60.40 GGCTTTTTGCAATCCATGANGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3L 95866 5' - roo 9037 1 61.39 TGCACAGGTCGCATGGTAGATGATAGATCTGCACAATTGGAATTTAGAAACCAAAAGCATTATTTACAAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCG:1 + chr3L 23354612 5' + gypsy2 6500 2 58.42 ATAACGCAGCTGTACCATTTCAAGAACTTCATATTTTATATATCTGAAAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 19513436 5' + roo 27 2 59.41 TTGCAAAGATTGATAGATACAGTAATAATCTGTGGTACTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTT:1 - chr2R 12901686 5' - roo 8799 2 62.38 GCCCCCTGACCAAGACCCCTGTCGCTCTGCTTCTTCCTGTGCACTTCCTGCGCCGTGGCCGCAATTATGATGCGTCAATTTTTTGGTGTTCTTTTCTTTTT:1 - chr2R 14525370 5' - mdg3 5101 1 75.25 GCTGCTCAAATCCAATAACAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCCCAATGCCT:1 + chr2R 15436715 5' - pogo 2078 1 71.01 AGAGCTTCTTTGCTTGCTATGTGCGTATGTTAGTGTATATACATATGTCTTCTTCATGTCCGTCTGTTCGTATGGACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAA:1 + chrX 20879155 5' + INE-1 147 1 59.41 ATAAATACGCTTGGCGGCCAAGAGCACACGCGCCAAGCGCTCCGTTGCCGATGCAGAGCGACAGAGAGGCATCCGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chrX 1714073 5' - hobo 2937 1 79.21 GGAGAAGAGATAGAGATAGCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2R 7024972 5' - P-element 2837 1 25.26 AGTTAGCGCCTGCGGTGGGTTTGTGTCTATGCTGTGCGCTGCAACGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chr3L 22616984 5' - hopper 1381 1 53.47 AAGAAGAATTACGAAATAGTAAATGACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:1 + chr3R 14985299 5' + Ivk 39 1 51.49 GCCAGCCTCTCGTTGCCCTCGTAGCGCATCATTTTCGTATGTATACAGCGATATATTAATTTATATTTTTGATTATTTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAA:1 + chr2R 14157373 5' - Rt1b 5126 1 79.21 ACCCGAAATTCGGACACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGTAAGCCGA:1 - 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INE-1 127 1 76.24 ATTCAAAGTTTAAAACCCCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCA:1 - chr3L 21912345 5' - Bari1 1686 1 58.42 ATGCCCCAGCCAAAATGAAAATTAAGCGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 12937440 5' - roo 358 2 79.21 TAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr3R 11151809 5' - mdg3 5479 2 60.40 GGACCTTTGCCGTAACCGGGTACTACGAGCCGTGCGTCAAGCGGCAGTCGCCCCTCGCGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAA:1 - chr3R 17652260 5' + Cr1a 4446 1 74.26 TCTGCCTCTGTTTACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 455633 5' + Doc 36 1 61.39 TGAGAATTAAGATCGCACTAGCCGAGCATGATACTTCCTTGTGAATCAGTCAACTCTCGGCCTTTGTCACACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTT:1 - chr3L 21270576 5' - Quasimodo 6947 2 75.00 AATTATTGATCGACATGTTAGCTTGTTAGGTAACCAGAGTCTGTTGCCAAATTTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTC:1 + chr3R 23731292 5' - F-element 204 1 51.49 AGTGATTTTCTTGAATGGGCCCAAATGGGTCAAGTTTGTGTTTACATTTCCTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCAT:1 + chr3R 23785984 5' + Cr1a 253 1 58.42 TAATAGTTGAAACTTTCACGAGAATAAGTTTGAACCGAAAATATAAGTCTAAGTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr3L 1927494 5' - mdg3 5474 2 55.45 ATTTGTGTACCCATATAAGAAAACAACGATGTTGTACAGAAGATATTGATTTAAAGTCCAGAGAGCCAGATGGGCACGGCTATTGATCCTGATTAAGAATG:1 + chr2L 5608532 5' - INE-1 85 1 61.39 AGACACGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCATACATACAAATTATTTATTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAA:1 + chr2L 22077594 5' + Tc3 1682 1 79.17 GACTAAGCACATACGGAAATGCAGAAATATAAATAAATAAAGTTGTAATGTGTGACGTTTTTCTTCCTCCAGTGACTTTAGTATGCCCCGTACTCTGTGGT:1 - chr3R 17321555 5' - baggins 4967 1 63.37 GACTGCTTTTCGTTTTCGATTTCGTTTAGCGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:2 - chr3R 16594537 5' - Tirant 356 2 69.31 TGCTGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAAAACGTATCGCAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chrX 8037599 5' + roo 7 2 57.43 GCATTGTGTCAGAGTTTGGACAATGGTGCACGATGGCGGTGGCATAAAGCCAAAGGCAACAAAACAAAAAAAA:1 + chrX 5133715 5' + G2 3069 1 57.53 AGCGGTGCATTGCTGCTCCTGGCACAGCGCGACTCCTTGGCGTTTTTGCATTGGTTGGGTTTAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGG:1 - chr3R 20770589 5' + hopper 450 1 57.43 ATGAAAGAACGGTGAATGTTTAAAGACAAATTTAATTAATTTGAACTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 + chr3R 4474171 5' + copia 4901 2 62.38 AAAAGTTTCATAAGAAATTAGTATTATACTAGTTTTTAATTAGTTTTATAGGCTAAAAAAGGGATATATAATTCATAGAAATGTGCAAAGTGCAGTATTTT:1 - chr2R 8722630 5' + gypsy4 452 1 60.40 TGAAAGAAATATAAAATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCACAGTCGCGATCGAACACTCGACGA:1 + chrX 23431581 5' + G6 3 1 75.76 AGCGGCAAAATATTCATTTCAATAGACTACACTCCTGAACTTGTGTACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAA:1 - chr3R 26170462 5' + X-element 37 1 52.48 TAAGTAAGGCGAAACCCCAAACATTTATGGCACTATACACTATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr3L 3992377 5' + pogo 28 1 59.41 TTGAAATTAGTTTGTGCCTGGCTTTCAAAACTCCTCCAAGTCCAGCTACACATGCACACATACACGACTCCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATA:1 + chr2R 8323211 5' + I-element 240 1 78.00 ATGCATTAAGACCGTACCCTCATCAATCGACCCCGCCGTACCCTCTACTTGCAGTCTGCCAAGAGGAAACCCACTTCTTCTCCCGGTCCAACTTC:1 + chr3R 29179992 5' + G5A 132 1 74.74 ACGTGGCGGGGGTGTGGCTNCTGCTGTGCTCAAGTTTACAAATACAAAAAAAAA:1 + chrX 11521043 5' + G3 4583 1 96.30 GCTAAAGGTGGAACAATTAACTACGAATTTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGATCC:1 + chr3L 12136722 5' + Tc1-2 1295 1 67.33 TGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTC:1 - chr2R 12185426 5' + accord 8 2 67.33 TGACGAATTTAAGGACCTAGAAATAAAACTGCGAGGAAGGTCGAGCAAAACCTCCAATCACTTTCACTCATTGCATACATTTTCTTTTTAATGTGTTAATT:1 - chr2L 21673238 5' - HB 1356 1 79.21 ATCTGCTCAAGGTAGTTCTCAGAAATGTGGCTCATCATATACCAATTAAAATCGATTTGTATATATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 2270606 5' - roo 9057 1 57.43 AACAATTTGTTGGCACTTATATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr2L 16127770 5' - roo 9040 1 58.42 TTGCAAACTCGGCGAAGTCACTTCCTGTAAAATCCCCAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 13358793 5' - roo 9017 2 77.23 ATTATCGATTTCAACTTTTTATGAAAGTGGAGTCAAGATGCGAGTTTACAATATCGAATGAATTTTAAAAAGCATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr3R 25121695 5' + pogo 2 1 75.25 GTAATTCTAATAGCTAGAAATTGCAGAAATAGACGCGATCGGGTTTTTTAAAAATATATATAGTAGCATATATGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr3L 24253687 5' + Quasimodo 19 2 61.39 TGGCTTTTGCAATCATTTTACGTGTTTGTGTTTGGCCTTTTTTATACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr2R 14586523 5' + Doc 5 1 72.28 AGTTCATATGTGGTCCACTCCAACGAACATACATATGTGTGTGCGTTTGGTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAG:1 - chr2L 15168122 5' + F-element 14 1 71.29 TTATTCAGTTAAATAAAATTATATTTTTTTGACTTATGCAAATTTCAAACTTGTAATTATATATAAAAATATCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 + chr2R 3928740 5' + Max-element 5 2 73.27 ATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 26123023 5' - roo 9028 1 69.31 TATGTTTAAATACTTTTCAATCTTTAAAATGAGTTCGTAAAGATATTAATTTTTAAATTTTTTAATTTT:1 - chr3L 7957186 5' - 1360 3031 1 81.16 ATTTTTTTTCTAATTTTCAGTTCTTGATATTAGAAACTTATGAATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3R 7618732 5' + Doc 16 1 60.40 GGGGTAAATCGATTTAAGTTAGAAGTTTTCAATGCAGTGACGATCATATACTCCTACTCGATTCCCCGCGTTATGAGAGCTGGAGTTCCGCAGGGCAGCGT:2 - chr4 409392 5' + BS4 71 2 51.49 GCAAGTCCATTAAACAAAGCTAAGCTGAAATTGAGCGTGGCGCCCGAAAAGGGACCCCAATGTGGTGGACAGTGGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chrX 18332927 5' + 1360 2 2 75.25 TAGAAGGACATGGATGTGGGGAATGGAGCACGGAACGGAGAATGGACGAGGCGCACAAACATGTCAGGCAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 + chr3L 11657811 5' - Tabor 479 2 72.28 GTTGTTAACAATATATCTGAATGGCTAAGGGTTGACTCGATATTGGAAATGTATGTAAGATTGGTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr2L 22052564 5' - flea 4987 2 53.47 GTGGTAGCTCCAGGTTGCAGTGGCGACCGGAAGGGCGAGTCAGGAGGTGTTGGCCAGATGGTTAGGGTGGTTGTCCAGTCGTTTAGCGTATCTCTCGCTGA:1 + chr2L 7072141 5' - G-element 4082 1 56.44 AGTGCGTTGCTTTAGGGGATGAAATAATGAAAGGGCAGCGCACCGAACTCTATATGCTCTCTGAAGTGTGTATGCGTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCT:1 + chrX 15816255 5' - invader3 136 2 54.46 TAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 - chr3L 19274856 5' - transib2 2774 1 78.22 AGACAGTTTTTCCAACCGCTTCCTTCGCCTATTTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTT:1 - chrX 15029171 5' + blood 169 2 69.23 GAACCCTTGACCGCAAAATGTGTGGATTTTCTGGTTTTTTCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCG:1 - chrX 11286204 5' - R2-element 3420 1 60.00 TTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTC:1 + chr2R 12185313 5' - accord 7371 2 64.36 GAGGAGCGGCCACCAAGATGATGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr3R 16595081 5' + P-element 53 1 29.70 TAGTCCGGCAGACAGGCGGGGGCAATGTGGCATAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGC:1 - chr2L 12602840 5' + opus 2 2 66.18 ATCGTTTAATGACATTCGATTCGTGTGTACCATGCCTGCACCATGCTGAGTCTGCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2L 17549285 5' - mdg1 7437 2 57.43 TTTCTGCACATGGACGGGGTTTGGGCCTAATCTACCCTCTTGTTGGGTTTCACATGAAATTTTGAGTACAGTATAATTCGATTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr3R 20284708 5' - pogo 2094 1 70.83 AGGCCTGTGGAGCCTTCGTCTTTCAGAAAATGCATAAATCGCTGTGCAGCCACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAGTTCCTATGATTTACAGTTTTAATAG:1 - chr2L 11458912 5' - HB 1569 1 58.59 GTAAAGAAATTTCCTAGCCAAATATAAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAG:1 + chr3L 14674499 5' + micropia 5383 2 76.92 ATTTGGGTCCCATGCAACANAAAGTGTAGCATACTTCAAAGGGCACACACGCTTTGAGCGATCTGATGTTGCCATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 - chr3L 16662490 5' + jockey 4673 1 74.00 AAGTTAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr3R 26342933 5' - blood 341 2 59.41 GCGCCTCTGCACTTTTTCTTTCGTCACTAAGCCTGGGCAACACTTTCAAGTCGGCTTCAATTACACAGCCTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr2L 13732838 5' + Doc 11 1 70.30 GAATGGACGAGGCGCACAAACAGGTCAGGCAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTGTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr3L 11657850 5' - Tabor 442 2 63.64 AAACCGATATGCCATAGACGTTTTCCCCGGAAAGCCTCGTCCCGGTCCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACCCTACGTCCACCCGCTAA:1 + chr2R 20857780 5' - hobo 2915 1 53.61 TCTGTCTCTCTCTTTCTCTTCCGGTCGTGGGTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 + chr2R 19457090 5' - Tabor 7294 2 67.06 ATAAATCGTTTTTGACAAATTTCCTCTTTAAAGTGCGGACACACGCACTCAACAATCATTGCCTTCATTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCG:1 - chr3L 23318640 5' - 1360 127 1 70.30 AATTGTCATGTTGAATATTGTCAAACAATTGTTTAAGCCCCAGCACAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr2R 20123532 5' - Transpac 276 2 55.45 GATAACTTTATAACTATTTAATAATACTTTGGTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCA:1 + chr2R 19330288 5' + McClintock 36 2 67.35 GATGGGGATGCGGATGTGCCTGAATGATGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCT:1 + chrX 11727128 5' - jockey 4691 1 73.27 CCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr2L 20271233 5' + blood 54 2 78.22 GGTACAAGGTCCAACAGTTNTACCGTTAGTTAACGGTGCGTACTCTTTGTGCACGCACCGTTA:1 - chr3L 24566082 5' - gypsy8 4886 4 95.24 AACGGCGAATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAGGTATT:1 - chr3R 31897208 5' - HB 1538 1 53.47 TATACGAGTTCATGTCAGACCTTTGCAAAAGTTGTTGGCATAATTTTCCTGTTTTTTTCTTCGACTTCTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATT:1 - chr3L 9311884 5' - F-element 4668 1 69.31 TTTTGGATTTCTTACTGTTTGAATGCTCACAAAGCTCATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr3L 10560245 5' + pogo 36 1 68.32 AGTAGCTGAATGGTTCAGCATGCAAAGGTGTATGGGTAATGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGAT:1 - chr3R 20426190 5' - hopper 372 1 61.39 AAAATTCTGTATTCTGCACTTTGGCGAAGGTCAGAAAATAAGAGAAAAAAGTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGACAAATAC:1 + chr2L 2577093 5' + F-element 4429 1 55.45 GGGCGTGGCAATTTTGTGCGGTTTGAAGGATTTATAGCACAATCTTAAACAATCTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTTTTATAGTTCCTGAGATCT:1 - chr3L 19271023 5' - INE-1 149 1 46.53 GGCTATTACACAGTTTTTAAGCCAGATTCAATATAGCCTTTGATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATA:1 - chr3L 27357643 5' + mdg1 7048 2 69.31 TGTTGTTGACGACGGTTTGGGTGTGCAAAAAAATGTTATATATTGGTGTTAAGTGAATGTTAAGAACGAAAAACTTAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAA:1 - chr2R 7672341 5' - blood 7176 2 64.36 AAATAGGTCCAGAAATTGTGGAAGAACTCCTGCGAGTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 19513351 5' - roo 9050 2 56.44 TAATTCGGTGATGGCTATTGATTTGTTGGGGCTTATGCTTGATAGGGATATTGAATTTGATACGTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGA:1 - chr3R 6947481 5' - Max-element 8335 2 66.34 TTGGTTTTTCTTCATTTGACGTACTCAAAGCACTCATACACACAAACACACACAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTG:1 + chr3L 5976308 5' - hopper 1396 1 60.40 TTAAAGCACCTCGAGCAACTAATTACATTGCCAGAATGCCGGAGCAGTGCACTGCAGTGTGAGTGTGTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 7759153 5' - hobo 2931 1 57.43 GCAAATAGCCGCGAAATATTTTTGGAATTGCTTCACTCGAAATAAACGCTAGTGTAATAATCGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 - 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chrX 22386797 5' + hobo 50 1 66.34 AATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACTGAG:1 + chr3R 19449912 5' - roo 47 2 66.30 TGGTACCGTTGCTTTCCTTAAATCGGCACGCCGACGCTCTCAGTTCTCCTGTAGTCCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chrX 21400763 5' + P-element 15 1 63.92 AAGGATTACGGGGGGCGTTGCAGGGGGTGTGGCCGGTGGCAAAGGGCACAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chrX 6338877 5' - P-element 2859 1 51.49 GCGAATCTGCTGCCGACCGAGAGGCAGATGCCGATGCCGACACCTTTGTAGATGTGGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGA:1 + chr3L 9006764 5' - F-element 383 1 59.41 GGGTCAAATAAGCCAAGTCAGAGACGTGAGCATGAATCAACCTGTCAAAAGTCTCGTTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCT:1 + chr3L 9033505 5' + 1360 49 1 64.36 GCGAAAGCTCGTCCAAAAANGCTTGAGAGAAATTGTTGGACCAGTCGGTGAGGGGCAGAAAGGGGATGGGCCACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 21374260 5' + P-element 4 2 75.25 GTCTTGGAGAGCTGGAGTGCCCGGGGTCCTGTGTTGGTTCGTTTAATTTGCATTTTATTGCTGGAAAAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGG:1 - chr2L 3586460 5' + I-element 356 1 72.00 ATGGAGTGCGTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 7494091 5' + roo 39 2 65.35 TGTGCCGATGTGTACAATTTGTGAACTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGGGCACGCTTTAGAGGCCGG:1 + chr2R 24741471 5' - gypsy12 10146 2 72.00 AAATCGAGAAAACTCGCCANCTCGAAAGCATTGCATACTTTGCAGCGCAATTTCGGGCATAGAAACAACAGCGAAATACTCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 + chr2L 3908431 5' + jockey 6 1 78.22 ACGCCCGCTCGGGTACAGGNTCAAACCTATTTACCGTTAGATCACGGAGCGTCCTCTTAGTGCGTCTTCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTA:1 - chr2L 22524633 5' - gypsy8 223 2 60.82 ATGCTCAAGCGTGTGAAAATACCAGAAAGACGTGTTGCTATCAAATGGTTCGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 1713970 5' + hobo 25 1 54.46 AAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 22112636 5' + Doc 40 1 61.39 ATTATTATCAGTGTGATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr2R 1373214 5' + pogo 3 1 76.24 ACATAAAAGATTTGATTGAAGCGGATCTGGGCTGAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGTTCGGGGC:1 - chr2R 23628593 5' + mdg3 412 1 78.22 AACTGAAAGATGAAAAAATCTACTACGAAACTAATAAATAGATTTTAGATGGTCGCATATTTTGCAGGGTGTACCAGAATTTTATTTTGATTTCACTGCC:1 - chr3R 20409343 5' - gypsy5 298 2 51.00 GATTCGAGGTACGCTCGGGCGTAGCTTCTGCATGCAGGCTTCCCAAGTGCCCAACACTCCAGAGGATTCCACCCACTCTAACGCCCTAAAACCACCCAAAA:1 - chrX 20672283 5' + INE-1 344 1 70.30 TTATCATTTGCCTTTGCAGTTGCACTTTTGCGCTGACCATTTGCACACCTGACCCCAGTGGTAGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 9904682 5' + hobo 9 1 69.39 TGCACACAAAAAAAAGATGCACAAAATGGGTGCACGGCGATCTGCTCCTTGCTTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGATTGTGACGATGGGGTGAGGCTT:1 - chr2R 19016222 5' - Idefix 227 2 46.53 GCTCGTCAAAAATCGGAATTTTGCCATACCAAGCAAAACTTTAGCCTATTTGGCTGCATCTTTCCTCCAACCGAAGACTTGGCGGCCTGAATAAATTTGAT:1 - chr3R 31832290 5' + gypsy10 255 2 65.35 AAGTAAACATGTTGCTTATTCTGCTGAGTAAATCAACTATAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 28475807 5' + roo 8698 2 67.33 TTATTTATGCCCAAATGTCATAATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGA:1 - chr2L 13435063 5' - hobo 455 1 77.78 ATTTACATACTCGATGCGAACGTTCAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAA:1 + chr3R 29608322 5' - Quasimodo 6938 2 73.27 AGTACATGGAGTGCGTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3L 7494096 5' + roo 8698 2 60.40 AAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTGCAAAATATTTTGCATATTTG:1 + chr3L 20289114 5' - Cr1a 174 1 79.21 TCTAAATCATCGATAAATGAATTGTCGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 + chr2L 16939806 5' - opus 467 2 57.43 TTAATGAAGTAGCTAAATTTTTGATGAAAATTATTTGACGACGAAGATAAGTAATATTATTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr3R 20192607 5' + Quasimodo 6 2 69.57 GGGCGGATTACAGAGGCACGTGTTGGTGGAAAGTCAGTGGCGAGAACGATTTCCCAGCCGATAAGATGTCCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAA:1 + chr2L 5876012 5' + Circe 7204 1 70.30 GGGGAGAGGGAGATATAGGGGCTGTAGGCGTGGCAGGGGGCTGGAGGCTGGCGGCTGTCAGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTT:1 + chr3L 9981875 5' + FB 16 1 56.57 TGCGCGATCGGCATTGCAGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2L 4650489 5' - roo 9034 1 61.39 AGTGGCAAATCTTCATTCTCCGATTTCCTCGAAATCAATACCACATTATTGGTACCTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAC:1 + chr3R 9644119 5' + 1360 3199 1 65.35 GTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chr2L 15168073 5' + F-element 63 1 74.26 GGACAGTTTAGGGGGAAGCAACAGAATATGGGTAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGA:1 + chr3R 9085046 5' - mdg3 205 2 66.34 AAATTATGCACTACTTGGCTTGTAGTTCGTTTTGCAGTATTTGGTGTGAAAATACGTTTCCACAAACCCATGGCTAATGAAATGTACATATATATATAAGG:2 - chr2L 4378795 5' + Juan 4185 1 71.29 ATTTGAAAAGTAGGTTCATAAAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAACTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGG:1 - chr4 831776 5' - Cr1a 3978 1 79.21 AGCGACAGCCGATAAGTAGGCAACATATTTGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCT:1 - chr3R 29466302 5' - 412 7159 2 70.30 ATCAGAAAAATTTTTACGAAGAACTACCTCAAAAAGCAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGTCGCTCGTCTTGTTCA:1 - chr3L 2871852 5' - Doc4-element 30 2 59.38 GCCAATCTATTCGGGAATTNAGATTTAAGGCATGAGCCGATGAACACGAGGGAAGCTTTACGCAAGAATCGATTTGCCGGTAAAATCATGTGATGTTCTTG:1 - chr3L 19590331 5' - McClintock 110 2 80.20 GGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr3L 19349917 5' + 1360 2 2 73.27 GGAAGGAGAGAGATAGTCCGAGAGAGATAGAGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATG:1 + chrX 20804707 5' + INE-1 164 1 66.34 TGCCATATAGTTCAAACGGCAAACAGCGAGCCAACAGATATATGAACAGAAACTTACTGATGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTATCTTGGGACAGCTTAGT:1 - chr2L 17576437 5' + R1A1-element 257 1 59.41 TACAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2L 15527040 5' + pogo 34 1 75.28 TTTTAGCCCCCTACTTATTACGCTGTCGAGCAGCAGCATTGAAGACTTTTCAACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 11757551 5' - roo 9018 2 58.42 GTGTATTATTTGATTGTTTTATTTAGTTTGTTATTAATTAATTATTTTGTTTATACAGCTGTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAAT:1 - chr3L 10364166 5' - TAHRE 10412 1 43.56 GACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGT:1 + chr3R 4357538 5' - Tc3 1683 1 55.00 AATCACAACCTTAACTGCGCCATCCTAAACGATTCCTTTGTGCTGAGCCCATCCCAAGAGTTAACAAACAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAA:1 + chr3R 17671914 5' - micropia 5175 1 77.23 ATAACATGGCGGCCACCTGCTGCGGCTGCACTTGAGTCGATTTCCCTGTTGTATTTTACATTTTTCTCTGCTTTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAG:1 - chr3R 15899325 5' - Doc3-element 4455 1 61.39 GATGCATTTCAAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTC:2 - chr2L 16939892 5' + opus 130 2 62.38 GGATGTGGCAGCTTGTTGATGATAAACTCTTATGACCCACATTGGCGCGGTGCTGAGGGGTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 - chr2L 8646756 5' - Tirant 8494 2 56.00 AGACATGCGTGCGAGCACACACACACACACACACACACACACACTCGCATACACAAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2R 23122708 5' - hobo 2921 1 44.90 TGGCCAACTTCCTAAGAACCAAACTCACATGCTGCTCATCTAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCA:1 + chr3R 25789002 5' - R2-element 3287 1 59.41 TACTCGGAAACAAAGTGCTATAAAAGTCACGCCCGAGGCGAAATGAGTTTTCAGTTGCTGCCCGGGGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAG:1 - chr3L 3972266 5' - Porto1 487 1 73.27 ATAACAATTCAAACGAATATCTGGCGAATTACGCATCGAATTGATATTGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr2L 8913307 5' - mdg1 7433 2 52.48 GTATTTGGGTCCCATGCAACACAAAGTGTAGCATACTTCAAAGGGCACACACGCTTTGAGCGATCTGATGTTGCCATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr3L 16662492 5' + jockey 4671 1 77.00 ACCACAAGCTAAACACATTTGTGGGTCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTCAATGAA:1 - chrX 1563808 5' + roo 8715 2 75.25 TATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:2 + chr3R 19450175 5' + roo 44 2 60.40 GCAACTGCAACACACCCGCTGCGTATTTCGGCCAGGGAACAGACCAACCAAAAAGAAGCCATCATCAGCAGCTTTTGTTCATCGTTTTTTTTTTTCTTT:1 - chr2L 12611911 5' - transib2 2641 1 72.73 GGGTCGCAGGACAACTGCCNGCCGTCCTGTGTAGGTATAGCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCA:1 + chr3R 22947908 5' - hobo 170 1 65.35 AGGCGTGAGGTGAAAGCGAAAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr3R 28628134 5' - 1360 3358 1 59.41 GGCACCGATGTGACATCTANATTATGCTTAGAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 9471258 5' + roo 45 2 69.31 GCCTATCTTATGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:2 - chr2L 15907227 5' + pogo 25 1 54.46 TCAGTCTACTGTATGAGATTTATGCCGTTTTGCCAATTAGTCCATTAATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTACATACTTTAGCGTTGAGGATGGAAGCA:1 + chrX 20120896 5' - G2 240 1 54.46 TTTGGCCACGGCTACCCAACCCGGCCAAAAGTCAGACATCTGGTATAATCTCAGTTTTGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAG:1 + chr2L 424946 5' - gypsy5 39 2 61.39 GGGCCTGGGGCCGAAGAGTTTTACGATCGCTCGGTTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr3L 5355352 5' + P-element 39 1 40.59 TGTCAGGACAGAGCTTGGTAGAGGTAGTAAACTATGCGGAGATAGATCAAGACAGTTTAACGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGC:1 - chr3L 27412387 5' + hopper2 1553 1 53.47 AATGGCTTTTGCAATCATTTTACGTGTTTGTGTTTGGCCTTTTTTATACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTC:2 - chr2R 14586525 5' + Doc 3 1 74.26 GAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2L 8690538 5' + Tirant 8145 2 65.62 GGAAAGCCAACATAAGTTTTGGGGCTAACTTGTTATTTTTGTAATTGGCACTTTGCAGTTTTATTGAAGCGGTGCACTATGGGACATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chrX 20377188 5' - hopper 1409 2 70.30 ACGGGGTTTGGGCCTAATCTACCCTCTTGTTGGGTTTCACATGAAATTTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3R 20284721 5' - pogo 2076 1 54.46 TAGGCGGACAGTTTAGGGGGAAGCAACAGAATATGGGTAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 + chr3R 9085041 5' - mdg3 210 2 61.39 AGAGAGAAACAGTGAGACGGAACAAAGTAGAGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chrX 21400832 5' - P-element 2845 1 37.62 AGTTGTTGCGGCTCTTTAGCCAGCTTTCGGTTACGCTCTTTGGTCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr3R 7411875 5' - 1360 3358 1 57.43 TGCAATGACCCACATTTCTGGTGGTACATTGTTTTGCCAAAGAAAGTCGAAGGAATTCAGCTGAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2L 1432003 5' - opus 7494 2 72.28 TAAATTTTATAGGTTTTCCTCTTTGGGGGCAAACATAATTTCGATAACTGCTATGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTG:1 + chr3R 12899483 5' - P-element 2752 1 60.40 ACCCCGTGAGGCGGGACTAGGACACACAAAAAGACCAAGTACCGGCTGCGTCTTTATCTGTTGAATCTATATGCCGAATCTTTTATAGTTCCTGAGATCT:1 - chr3L 11016380 5' - INE-1 149 1 56.00 ATTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCCACCATATAAAGTATGTATAAGTTAACTAAGGTAACCGGACCGCTCGTCCGCTGACCAG:1 + chrX 124082 5' + gypsy3 6593 2 59.00 GGCTTAGAAACTTAAAGAGTTATAACTCGATAAAAGAAGAATCGAAAAAA:1 - 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mdg3 233 2 42.57 ATCGATATCCAGTGTAAAATATAAATCCTACTACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTGTATTAATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCG:1 + chr3L 11717290 5' + Cr1a 4353 1 79.21 TTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTATTAATACTATCATTAGTAAAGTTATACATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 19449843 5' - roo 391 2 49.50 AAAAACAGCGATGATATTGCGATGTGTAAGCCACTGCGTTTGGTGCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCC:1 + chr3L 7286788 5' + blood 196 2 52.00 TTGACAACTCGTGAGATAATTTTTCTAAAATGACGATACATATTGGGGAATAAAATAAGACAAAATTTTAAAAATGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTT:1 + chrX 2324754 5' - INE-1 246 1 71.29 GAGGCAATGGTGGCAACAANGGAGGAGGTGGCGGCGGTGGCCGTGACCACATGGATGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCA:1 - chr3R 9509511 5' + Doc 344 1 56.44 GGAAACTTTGTAGTCAACAGCCTACTCATTTGACTCTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chr3L 20936803 5' + I-element 53 1 65.35 AGAATTGTTTATGTGCAAAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 7461070 5' + roo 41 2 66.34 TTGACATTGCTACCACATTCGGTGCGTGGACTCTGAAAGCTCTGAGTGTTTTGTTTATGCAAAGCTTTTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 19671660 5' + P-element 5 2 74.26 GTGTAAGATGGTTTCAACCAACTAGAATTAAAACCCTTCAACAAGCAGCAAACGACAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTA:1 - chr3L 18089165 5' + Doc 4619 1 63.00 TACGCTTAGGGAGCCATAGATCCAAGTCGTGATCTATACAACCTACAAAGTTAATATTAAGCAAGCCGGATCGGTTTTGCTTAGAAGGTCTAGAGGGTTAG:1 + chr2R 1345977 5' - I-element 5101 1 71.29 TTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 13239952 5' + jockey 57 1 73.00 AAACTCGAGTGTTTGGCAAATACTGAAAAACGTGGGCGTTGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 + chr3R 7688869 5' - Tirant 366 2 59.60 GAACAAGTTCTCGGGTAAATAATTAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 17109727 5' - roo 9049 2 57.43 TTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCAAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAA:1 - chrX 21668934 5' - Cr1a 4326 1 71.26 AAGCTAATTCCCAAAAGGAGCCTAAAAGTAGGTAAGTTATTGCTGGCTCCGTCTTTTCGGCACTTCACCAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAAC:1 - chrX 14164062 5' + jockey 4563 1 64.36 TGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:2 + chr3L 3822389 5' - pogo 2066 1 63.37 GTTGACCCTGGGACCCATCNGGTGATGGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATA:1 - chr3L 6866225 5' - 412 7498 2 68.32 GTTTTGCTGCGCTGCACAAGTTTCGGCGGTATAAAACTCAGCCCCGTCATTTACCAACGATTTTCCCGCATTTTTCCTACTTTGTCTTGCTCTTTTACTTA:1 - chrX 17971323 5' + S-element 249 1 76.24 TTGTTAAATTGTTCGGGCTTAGTTTATTCAGCGTCATTAGACGATTGTGGGTGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 5194499 5' - hobo 2915 1 55.45 TTTGAGGAGCAATACCTAGTGCACACTCACACTCGCACTCACATTTGTAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTT:1 + chr2R 23979883 5' + McClintock 6248 2 62.77 ATAACTGTCGGCCGGCTCAATGTTATAATTTAACCAACATTTTGCAACGCTTTTTTGTGATTTGCTGTCTTTGTATCGCAACGCTTCCCGGTTCGATGTCT:1 + chr2R 7746308 5' - ZAM 66 2 75.25 AAGCCATGTCAAAGGGTTAGGACAGGTTCGCTGGCTTTAGGGCGTTAGAGAGGCAAATCGATAAAAATTTACAAGACTAATAAAATTATGAAAAATAT:1 + chr2L 4282921 5' - INE-1 400 1 72.45 GTATGCAGAGAAATCCAACCTTTTGTTTTTTCTTTCATCTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 + chr2R 18687777 5' - jockey 4961 1 67.33 GGCCAAAAAAATATTTATAACACGCTGCGGTTCGCTGCCAATTAAAAGAAGCAAATATAACACACATACGAAAAAAAAAAATGAAAATAAAAATAACATTT:2 - chr3R 14069716 5' + TART-C 416 2 78.22 GTTGACCCTGGGACCCATCTGGTGATGGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATA:1 - chr3L 6866225 5' - 412 7498 2 68.32 ATATTTTAAAGTTTCGTACTGTACTTTTCGATCGAAATTTCGCTTAGTTGGCCCACTGTATCTGCGCTATGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 + chr2L 18500275 5' + Tirant 4 2 73.27 TAAAACAACCCCTATCTACATACAGGTCTCTAATTGAAGAGTTCAAATCTCGAGCCGTGGATAGAACGGAATCATGGCGAAATAACGTTCCATCTAACGCA:1 - chr3L 1911149 5' + Rt1c 4982 1 53.47 CCTTGAGTTATTTTAGGTTGGATACACTTCGTTTCAGTCATTCAGTTTTAAAACAAGTTTTGACTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 14708804 5' - roo 397 1 66.34 ACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAG:1 - chr3L 3328962 5' + G2 2686 1 74.26 TACTATGTGCTTTTATTATGCGGTAAATTCAGACATAGAATCTAATGGTTAAGTGACCTTAACCTTGTTCCGCAATTGTATGTTGTTATTTATATTTTTTT:1 - chr3R 18629592 5' - mariner2 791 1 55.45 GTCGCCCTCTGCGTGTCTGTTGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - 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gypsy6 7510 2 72.28 TGAAAGTGGATTTCAGTTTNTTTCAAAATTAATAATAAATGTTTTTACGCGTTTCACTCAGGCGCCATGTAAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAAT:1 - chr2L 3262590 5' + invader2 22 2 77.23 GACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 11278407 5' + hobo 51 1 79.21 AAAACGTCAGTGTAATAAAACGTTGATAAACCGCAGCGCAAAAGAGGAGGAGGTGGCGAGGAACGGACACAACAGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTG:1 - chr3L 22389447 5' - Doc 281 1 78.22 GATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAGAAACTA:1 - chrX 21587707 5' + INE-1 142 1 75.25 TCCTAATATTCAAATATCCTATCTATCCAAACCCTCATAAATCAACTATTTGCTTAAGGGTCAGCAAGATTGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATT:1 - chr3L 3975126 5' + 1360 3170 1 73.27 ATTTTGTGTACTTCTCATGACTATAGATAAAGTATTAGATGAATCATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chr2L 7259472 5' + I-element 31 1 55.45 GCTGAAAAAGCATTTCCATGTCACTGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chrX 4240691 5' - 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Cr1a 26 1 66.34 GCTGGGAATGGCAAGGCCAGTAAATGAATAGACCGGCTAAATACACAAATAACCAGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 17109641 5' + roo 24 2 62.38 CAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chrX 15412696 5' + hobo 51 1 74.26 ACAAAGGTTTGATGTTTCATAATCAACCTACTTTGTTCAATATCATCGAAATATATCGAGTTCTAGCTTAAGGAAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTA:1 + chr2L 2416703 5' + 3S18 3 2 61.39 TATGCATTTTGTTAACGTTTCCGGTGACTTCGCGCTAGAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 - chr3R 5133660 5' + Tabor 6878 2 61.00 GATGCTGAACGGGTAGGAGAAGCACACAACGCAAGTGGGCGATTTTGTGCTCTTCTCCACCTATCTGATGGAATTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGAT:1 + chr3R 15856538 5' - 1360 254 1 41.58 ACACACACTTAAATATAGGTAACCATTTCATTTGACTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 8434316 5' + roo 41 2 68.32 TTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3R 4322606 5' + 1360 31 1 59.18 GCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTT:1 + chr3L 20224124 5' - Chimpo 181 1 74.26 GGTAGTTAAGAGCGGGGAGCAGGTGAACTTGAACTTGGAGAGGCGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chr3R 15537375 5' + P-element 30 1 49.00 ATTTGTGATTGCTGGCAGGTTGCGACCCTTTTGCGATTATTTCAGCTGAGGTTCGAGATAAACAAAAAACGTATCGCAATAATGTTCACACATGAACACGA:1 + chrX 8037590 5' + roo 8662 1 66.34 AGATGAGGAGTTGAGTATTTCAGGATATTCGTTGTTGGTGTACGTGTAGATGAATTAGGCGCGTATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATGGTTGGGTCT:1 - chr2L 14380529 5' - Porto1 376 1 70.30 ACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTCGATTCGCG:1 + chrX 10295828 5' - Cr1a 4387 1 75.25 AAGCAATATTCGCTACGTGTTTGTTTCGCTGGTATATTAAAATTTAAAGGCATTGAAAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1 + chr3R 15880874 5' + 3S18 5772 2 69.32 GCGTAAATGATAAATGGAANTGAAGCGAACACTTTTCGGTGCACTGTCTTTTTTCTCGGTTTGCGGGTACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAAT:1 - chrX 10094005 5' - Cr1a 3975 1 69.31 TTTGACGGGTCGTGGCAGTTTTTCCGCGAATCGCGACAATTGCCAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGGT:1 + chr2R 10399658 5' - copia 90 2 54.46 TATTACACAGTTTTTAAGCCAGATTCAATATAGCCTTTGATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATA:1 - 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chr3L 10644112 5' - G2 238 1 67.33 ATCCAACACTGAAACTAAAAAGTGTTGAAAAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:2 + chr3L 11697038 5' + pogo 10 1 67.33 TTATGGTATAATGGTCAGATGCTTCAAGATACAAATCCAGTTCTATTATATTTCTCAATGCATTCTTTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGA:1 + chr3R 12744623 5' - I-element 5349 1 70.30 TGTTAGTAGTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 22469126 5' - hobo 2925 1 63.37 AATTGTTGACTCGATGTTCAGACGGACGGACAGATAAATGGATAAAAAATACGTAAACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 16200037 5' + roo 8682 2 62.38 CAGCTGCCAAAAATCTCTGAAAGGGTATCGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 - chr3L 15435584 5' - blood 7349 2 72.83 GTGTATGCTAAGAAAATGTTATTAACCGGGCTATCATGTGCGTAGAGGAAATGTACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr2L 18818588 5' + jockey 71 1 49.50 GTTATAAGGTATGCAGACCGTCGGATTTTTTTCACATTTTAACAATGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2L 7804321 5' - 1360 3362 1 57.43 AAACACACAACAACCAACTAATAAAAATTACAATAACAATTATAACACGAACTGACAAAAGCAAAGGAACCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTACTTA:1 - chr2R 4634503 5' + Q-element 511 1 67.33 TTGCGAAATGAATTAACTTTAAGCCGCAAAATTTGTACTCTTGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr2R 23122650 5' + hobo 35 1 62.38 AAAATCAATGCGTGCATGCATAAGTGTGAGTGAGTGTGTTCGTATGTGTGTGTGTGTGTACAGCCAAAGATACGTGCAAACACACACACACACACGCATTC:1 - chrX 6194403 5' + accord 185 2 60.40 TACTGAGTGTTGTTGGTTCTTGTTCTGTAGGCGACTGTTGTTGTTGTTGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGG:1 - chr3R 16637269 5' - BS 4902 1 51.02 TCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGTGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr3R 4773385 5' + Tirant 8123 2 65.57 GCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3L 22112649 5' + Doc 53 1 74.26 AGATACAAACTAGCATAAAACCATTGTAACATGCATTACAAAATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:2 + chr3R 7869088 5' + 297 6583 2 78.22 AATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3R 30611305 5' + blood 34 2 58.42 ATTCCTCCATGTGCCATATAGCTCATCCTCCCGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTGTATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGGTGAATTT:1 - chr3L 15752557 5' - Tc1-2 453 1 69.31 TGCGTGAGTGTGTGTGAGCCATTCCACACATGCAAACTGGGAAATCACACACACAGGCCGCCGTATTGTCGTTTGTGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - chr2L 17865720 5' + hobo 1 1 78.22 TGTAGCGAAACGAAAGCGGAAAGATAAAATGAAATAACTTAAGTTTTTTTTATATGTTTATACAAGGAATGATGATGTTTGAGACATAATTGTAAAAGGTC:1 - chr3L 5556996 5' + Idefix 484 2 79.21 GAAGAAGTTACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 8434252 5' - roo 9044 1 54.46 AGTACGGTTAGTTGCAATTGACCTGTCATATCTTTTACTACATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr3R 23683377 5' + 297 6610 2 63.37 AGTAACGGGTATCTGATATTCGAGGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGG:1 + chr2L 16936427 5' - G2 131 1 68.83 TTTGCAAATAAATATTCGCNACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chrX 5997234 5' - 1360 3366 1 55.45 TTGGCTGCAAGTGTATAAGCCCGGCCATAAGCTGTGCGGCGAAACTTTCGACAGGCAAACAAAACAGAAACAAAAAAACAGATTCGGCATTCCACAGTCTT:1 - chr3L 17127076 5' + Doc 2 1 68.32 TGACCAATCGCGTTCGATTGTCTTTAACCATCGTCTTTAACCATCTGACATTAAGAGTCTGGAGAATTTTTATCAGCTTCAAATTCGCAAGTTAACATTTC:1 + chr2L 10032488 5' + hopper 272 1 60.40 ATGGGCGAGGCAATCGCCACCCACTCGTGGCCACTGATCACATTGAGGGATATGGCAAAGATGCCCTTTACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATAT:1 - chr3L 8614967 5' + 1360 240 1 65.35 AAAGTGCTATTTTCCAACCTGTAGTCGAGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 28475861 5' - roo 9027 1 67.33 TTTCAAATGAGCAAACATATACATATAACTAATAACGTAGATAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr2L 4404616 5' - pogo 2070 1 59.41 ATCAATAGAATATCAATACTCAAGCATTACTTTTTAATTTACATTTGTGCTTTACAACCTTTGTCAATTTATATAGTGCATGTACATAATATGTATGTATA:1 + chr3R 19936460 5' + Dm88 4371 2 90.10 TAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGTAACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACT:1 - chr2R 4578495 5' + Chouto 485 1 63.37 AAATGGTTTATCTCAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 - chr2L 2309444 5' + Burdock 43 2 71.29 AAGCCAAATCAAAAGCCGTCAAAACACCGAACCTTGCTGGTTGTCGCGCATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 + chr3R 16594468 5' + Tirant 8130 2 57.43 TTTATGAAAGTGGAGTCAANATGCGAGTTTACAATATCGAATGAATTTTAAAAAGCATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3R 25121678 5' + pogo 19 1 57.43 AATTGAGTTGCATGCCACGGCGCCTGCAATGAACTCTCATCCGCGGGAGGATGAAACTGTGGAGCATGCAACTCCTACGCCACAGTTTTGGCGGCTGCATG:1 - chr2L 8911112 5' - diver2 9 2 57.43 AGATAGATACATTTTTTGGACATTCAATGTCTACAATCCACTACCTAGACATAAAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGT:1 - chrX 3691582 5' + jockey 4782 1 56.44 AAGCCAAATTATTTAATAGTAAATAAACCAACAAGGTGTTGTGTTCGAGTATATAAATTGTATAGCTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAA:1 + chr2L 14038370 5' + 3S18 5776 2 66.34 TTTTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGA:1 + chr3R 25844307 5' - Stalker4 371 2 59.41 AAAAGCCACTGCAAATGGCAATAGGTGTGGACAGGAAAGGGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGA:1 + chr2R 16990552 5' + R1A1-element 74 1 65.35 GAGACTGTATGGAGTGTCCTTACCCATATACATATTATTAAATATACAAATCATAAACAAGAGGGAACGCTATAATCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCC:1 + chr4 515510 5' - INE-1 556 1 75.25 ACAATTTTGTTCATCTTTTCTGTGGCCATTGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTC:1 + chr3R 21675431 5' - invader4 374 1 70.30 TTTAGAAGTGCAATCGACCTGGATGGACATCCCCAGAAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:2 + chr3L 24150498 5' + blood 8 2 69.31 AACCAAAAAATATTCAAATTTTAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 19462367 5' + 412 7091 2 65.35 TAAAGCATAATTGATTTGATAGATAGCGTTCAGGTGGAGGAGCGATAGGTACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2L 6322608 5' + roo 25 2 54.00 GAATAATAAACAAAGATTTCTAATATCTTAACCCTGTTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chrX 3546373 5' + pogo 35 1 69.31 TTATATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 16127754 5' - roo 9024 2 74.26 AATTAATAACGAAACGCGCTCACAATCAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 20709402 5' + roo 49 2 76.24 TGATTTTCAGAGCCATAATCGTTCTGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCAGA:1 + chr3L 1973912 5' + R1A1-element 5315 1 74.26 AAATGAAGCTCACAGTAGCCCAGTAGCCTAGTACGACCAGGCTCCACTGACAGCCCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGG:1 + chr2R 15050624 5' - R1A1-element 5022 1 59.00 GCATAACTAGCATGGAAAAAAAAGTGAGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2R 15595229 5' + hobo 31 1 65.06 AAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr2L 14054790 5' + F-element 50 1 63.37 GCGACTATAGACTATATTTNGACACATTAAAAGGGAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 398254 5' + G2 3067 1 59.18 AAATAGGAAAAGTTGCTGGCGCGTGAGTGGTAAGCTTAATACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCC:1 + chr2R 19137508 5' + F-element 389 1 61.39 AAAAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2R 19594609 5' - roo 9031 1 63.37 TGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTA:1 + chr2R 17402728 5' + invader4 2804 2 68.32 AATTGCCAACGTTTAGATTGTCCATCAAGTGTAAACGAAGTCAATTTTTTTAGACCAAGTAAAATCCGCCGCTGACTGTTACTTAAAAAAAAAAATAAAG:1 + chr3R 7722167 5' + pogo 2027 1 61.00 AAACTACTGGCTTGATTATATATAAGAACTAAAATGTTATTTCAAGATTTCATTTAATCTCTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAA:1 - chr2L 15174184 5' + Juan 4043 1 59.00 TAGATACTCAATTGGATTAGTACTACTGTTTAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chrX 10996582 5' - 1360 3350 1 68.00 GATGGCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2L 4110955 5' + Doc 42 1 63.37 CTGTGACGAAGCTTTGGAACCTGAACAGTACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2R 5200906 5' + 1360 5 2 71.29 ATGTAGAATGCGATTGCTTGTTCAATAAAATATTATTAATTATATGAATGAAAAAACGTTATTTTATTTTTTTAAATATTTTTATTCATTTTTTTTGTTA:1 + chr2L 4000756 5' - gypsy7 5003 1 48.00 AAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACA:1 - chrX 23182901 5' + Idefix 38 2 67.33 TGAAAATAAGAGGCCAACAAAGGCAACAAAAGCAATAAAAATAATACAAAACTTTGGCGCAGTTTTGACGATTTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chrX 10547756 5' - P-element 2885 2 77.23 AAAGCTAGCTTGGAAATAAAATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTAGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3L 11475512 5' + roo 8719 2 85.15 AAGGGAGCACCAAGGAGATCAGTGACAGCCCACATGCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 + chr3R 12906538 5' + hopper 39 1 65.35 TAACTGAATCTTTATCAATGTGTGCCTTTAGGGCGCCTAGTGGGCGTGGCAACATTACGCTGCGTCTATGTCTTAAGAATCTGTATGCTAAATCTCAACCT:1 - chrX 22608786 5' - INE-1 175 1 77.23 GCTCATATCTTATCTGCTCAAGGTAGTTCTCAGAAATGTGGCTCATCATATACCAATTAAAATCGATTTGTATATATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTT:1 - chr3L 2270617 5' - roo 9068 1 68.32 GCAGACCTTTAGATTTTCATGTTAACTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 + chr3R 17615952 5' + HMS-Beagle 6844 2 74.26 AGCTATTCCTTAAGGTTTTTCCACGATTCGAACTGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTC:1 - chr3R 7689690 5' - Tirant 8221 2 66.34 ACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 19450160 5' + roo 29 2 75.25 ACTAGCAGTAAATCAAACACGTTCTTTATAAACTGGTTAAGGTAGCATGCCGCCCAATTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 11975464 5' + hopper 138 1 57.53 GTGTGGAAGCCACGCGACCGATTGTAATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGG:1 - chr3R 12350508 5' - I-element 4973 1 76.24 TTAAAATCCAAATTAAATATTTCCGCATGAAACTCAATTCTTACAACTGATTGAATAACCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:2 - chr3L 7204120 5' + Tabor 20 2 55.45 AGCAGGTGCACTTCCCCCTCATGGAGACTTTACGACGACCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1 + chr2L 15548748 5' + Tabor 37 2 58.42 GTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - 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Porto1 122 1 57.43 GCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 - chr2L 14054794 5' + F-element 40 1 56.84 AGATTTGGGGTTTTGGGTGGGGACACCCGAGATAAATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chrX 19219276 5' + Doc 14 1 65.35 TTACTACATTTCGGCAAGTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3L 153579 5' + 1360 20 1 56.52 TTAAAATATAAATATTGATTCAGCTTTGAATTAGCTGAAAAACTCAATTTTTGTTTTGAACTATAGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTAT:1 - chr3R 14112415 5' - Juan 4208 1 70.30 TGGGCATCCCGCTAATCTCNCAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 8479435 5' + blood 166 2 95.35 AGCAGTATATCTTAAATAGGAATAGCGACAGTTGCTTTAAGGAAATACTACATGGATCGAAGCTAAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGA:1 + chr2L 13214593 5' + roo 8656 1 72.28 TAATTGGTTTCTGGTCAGCACGAAGGATGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGA:1 + chr3R 10423804 5' - hobo 2676 1 72.00 ATGTAACCAGTGTATGTCTGTCAAATGTATGAGTGTCAAATACTATCCATAGATATTACACTTCAAGAGCTTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCA:1 + chr3L 21912233 5' + Bari1 4 1 76.24 ACTGCAGCATGCTTTCAGGNCTTGGCAACTCTCTGTTGGACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTATACACA:1 + chrX 14384434 5' + accord 188 2 88.10 TAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - 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hopper2 1564 1 64.36 GTGCGCCCGGTTTAATTGTGTTTATTATATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 20709438 5' - roo 9024 2 75.25 TAGTTTTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTT:1 + chr3R 25844304 5' - Stalker4 7338 2 52.69 TTAGTGTTTGATTAAAAATTACATTTTTGTCAACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTG:1 + chr2L 23050197 5' - R1A1-element 5243 1 67.71 AAACCCAGGCAGTAGAAGGCAACTTTTAAAGGCTTTTGCCACTGGCGGAAACAGCACAAATATCTCCCAAGGTTGTGAA:1 - chr2L 3181162 5' - McClintock 6135 2 75.95 ACAGTCGACACAATTGATTTGTAGCGCAGTTGTCTTAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 - chrX 19614974 5' + 1360 36 1 62.38 GACGCATTCACCATGTATAAAGGCAGGCCAAACAAACGCGCACAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTA:1 - chrX 7294189 5' + hopper 33 1 55.45 TTTTTTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTT:1 - chr3R 19449407 5' + roo 8647 1 72.28 GCCGGGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACATA:1 - 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chr4 304679 5' + INE-1 90 1 73.27 GATGTTTAGTCTACCAGTGNATGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 970739 5' + 1360 55 1 97.03 GAGCAGGAGCTGTCAAGATTGAGGCTAAACTTTTTATTTTTTATTATGTCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 13544070 5' + roo 8690 2 55.45 AGACAAAAGCCGAGCCGAGGCTAGCAAACCAGGTAGGCAATAGCTGCCAAAACGCACCTGAAGAAAATTTGGGTTCTTCAGGGAAAAACTCTGAGGAAGAT:1 + chr2R 19684864 5' + jockey2 2968 1 56.44 GATTGCGAATGGCCGGCAGCTGGACATTTATGGTCATCCGTTTGGACGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAAGGG:1 - chr3R 17454427 5' - Tirant 8124 2 60.00 ATACTGCTGACACAGCTACTAAGTAAACATGTTGCTTATTCTGCTGAGTAAATCAACTATAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 28475787 5' + roo 14 2 65.35 GAGTAATAGGGTATACTAGATTCGTTGAGAAGTATGTAGCAGGCAGGAGGAAGCGGTTCCGACTATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATCCATAGC:1 + chr3L 23746964 5' + INE-1 86 1 78.22 TACGAGTATAAACTCGTAACATTCGGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 13072020 5' - roo 358 2 76.24 TGAAGTTGCTGTCGCACTTGAAGTTTGAAAATGTGAATGCCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCGTA:1 + chr3R 31473978 5' + roo 36 2 66.00 GTTCTTATCAGCATTGATAGTTGCCAATTCTGAGAAAGTTGTAAGACTAGATTTTTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr3R 20872679 5' - 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chr3L 771817 5' + roo 8711 2 77.23 GTTTAACAATTGTTTCTTTTAAATTTTTTTTTTTATTTAGTGAGTGTGTATTTTGAGTGTACTTTGTGTTTGTTCGGAGTTCGCTTTCTATTTGTTTTTT:1 + chr3R 23471384 5' - Doc3-element 182 1 67.00 GAGAGAGACGCATAGGATTGTTATTCGAAATTAACATTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTC:1 + chrX 16281737 5' - invader4 250 2 64.36 AAGCGAGAACGAGGGAGAGNGATGACTAAGAGAGAGAATATATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCG:1 + chrX 8087933 5' - G4 1 1 72.92 GACCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATATGTCATTGTTACGATTCAAAACATTTCTTTTGAAGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGC:1 - chr2R 14884039 5' + Juan 8 1 72.28 TTATAATGGTTTTTGCGTGNCCACAACTGCACTGCACTTTTTTTCAAAATCTTTTCTTATCAGAGGTGACACAATGCCGATTCGGCATTTCACAGTCTTCG:1 - chr3L 12903927 5' + Doc 4 1 68.32 AATTAGACTTAACTTCAAGAAGTAAGTATTGCAATCAAATGACAATTTTTATACAAAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 + chr3L 12983147 5' + diver 5892 2 73.27 TAATGACATTCGATTCGTGTGTACCATGCCTGCACCATGCTGAGTCTGCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr2L 17549291 5' - mdg1 393 2 51.49 ATACGACGTTTGCTAAATGGAAAATAAATTGGCTTATACTGTGCAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGT:1 + chrX 10363107 5' - I-element 5156 1 57.43 AGCAGCTGAGCTGCGCCAGCTGCCCGAGGAGCGGCCACCAAGATGATGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr3R 16595056 5' - P-element 2859 1 54.46 AGAAAACTTCATTTCAGTGAGTCAGGCCAAAGACAGTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGAC:1 + chr2R 4262579 5' - 1360 3336 1 74.26 GACACTGGCCAGTGAAATGAGCACTACGATAAGTGTGGGGCGGATCATGATCACCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGC:1 - chr3L 1257188 5' - Quasimodo 238 2 52.48 TAATAATTAACAAAACCTATGATATATCTAACCAAATTGACTTTACTTGCATTCTGCAAACTAAAAGCAAACTAGTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGC:1 - chr3L 12330847 5' - Gypsy6A_LTR 117 1 81.19 AAAGGGCTTAATTAACTTTCGAGTACTCGCTGGCGGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTT:1 - chr3R 24732948 5' + BS 39 1 64.36 AACCATAATTACAACTAATTCTGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAA:1 + chr3L 10839163 5' - Ivk 282 1 78.22 ACACACACAGACACACACACACACACATACACACATATATATACTTATATGTATAGATGGACACAAACACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chrX 10730491 5' + hobo 6 1 50.50 TGCGAAGTGCGGAGCGTTATGGCAGAAGCATGCACCCACCAGCTGCACTGGGAAAAAGAACACTGTCACATTGCCACATTGCTAGCAGAATGGAGAACCAC:1 + chr2R 8769713 5' + G2 2846 1 79.21 ATAAACATACAAACTCAAATTAAACACAACATAAACATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr2R 999477 5' + F-element 52 1 65.35 AAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCGCAG:1 - chr2L 23390132 5' - rooA 7468 2 53.47 AGTGTTTTTTAAGCACTTTAAATAATTACTATACCTCAACTGAAATGTATCAATCNNNTGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTG:1 + chr2R 5426716 5' + BS 4885 1 46.32 ATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGG:1 + chr2R 4260437 5' + micropia 5123 2 81.40 GTTTGTTTCGCTGGTATATTAAAATTTAAAGGCATTGAAAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACAT:1 + chr3R 15880892 5' + 3S18 38 2 59.41 AAGCATTGCCACGAGACCGAGCCATCAATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGA:1 - chrX 1139658 5' - 1360 91 1 73.27 TGATAAACTCTTATGACCCACATTGGCGCGGTGCTGAGGGGTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 - chr2L 8646737 5' - Tirant 368 2 57.00 ATGCATATCTGAAATGAGTTTTGGTAAACCGTTGGATTCGTTCCCTTTTCGATATTTTCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2L 12602750 5' - opus 7494 2 67.68 ACGCACTTTAAGGCACATTTTCAGATGCCAACCTAAATTATGTGCCCAACTATTTAACTACTTTAAAAACATACCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCT:1 - chr3R 25056551 5' - BS 4909 1 75.25 TGAGTGTGTGTGAGCCATTCCACACATGCAAACTGGGAAATCACACACACAGGCCGCCGTATTGTCGTTTGTGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2L 17865716 5' + hobo 5 1 74.26 TAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr2L 3475333 5' - roo 9037 1 64.36 AAATACAAATTACAACAACTATTCAATACAAATTTTATTTGTGTGTGTAATTTTATAGAGAACACGCATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr3L 25120140 5' + pogo 4 1 75.25 TTTGGGTGGCTGCTGCTCCTCTGCCTCCATATCGCGCCGGATCGATCGTTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAG:1 - chr2R 21903583 5' + F-element 348 1 53.47 GCTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCT:1 + chr2R 6438358 5' - Stalker4 7323 2 67.33 TAAAAAAGTGCGCATAAGAGATTTCCGGGCATAATCATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAA:1 + chr2R 17898540 5' + Quasimodo 7084 2 69.31 AAAAATATAAATGTCGCATATTAAAAAGTTATTAATATTTTCTTTTTTAGATCAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3R 25121583 5' - pogo 2082 1 56.44 TGGCAACTTTGCCTCCGTGTGGCCACCTCTTCCGACACCACGGAGAATCAGTTCCTCTGGTTCTTCAGCACCTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTA:1 - chrX 476148 5' + I-element 18 1 78.22 GGTAGCGGCGCAGTAGCTTTCATGTGCGTTATCCTTTGTGTCATCCGATGCCAACTGTTCCAATCATATATTTATATATATTTATCATATTT:1 + chr3R 29540724 5' + copia 4666 1 73.91 GTTCATGGGCGCTCATCATNATGTTCCCTGCTTCGCAGACCAATTGAATTCTATTTTAGAGGAGGTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr2L 13792154 5' - blood 366 2 68.32 AAATTATTTGTGCGCAGGTNAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr2L 15907147 5' + pogo 47 1 47.52 TGGCGCACTCGCTGTCAATTTTGCAATTTTACAATTTTACTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr2R 23441729 5' + jockey 4707 1 62.38 GCTCGATAGCCCAGTGCCTCTGCCTCTGTTTACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 - 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chr2R 5864892 5' + Doc 4536 1 74.26 ACTTAGAGCTGCCCTGGCGATAACGCCGCTGACATCCACGCTTAATAATATCCCTTTCGCGTTGGAAAAACAAAAGCGCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr3L 949240 5' - roo 411 1 81.19 AGGGTGAATGCTCCATTGAGCATTGGGAAAAGTAACGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3L 15435541 5' + blood 41 2 69.31 GCTACGCTCCAGTTTTGAGATTTCCGAATTGGCTGACTACAAATGTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3R 19807432 5' - opus 7476 2 56.44 GACAGACTGTCTGGCCTGACTCTGCCGACGCCTCTGCTCGCGTCGCTGCCTCGGTCGACTGCGACGCCTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chrX 7294097 5' + hopper 8 2 74.26 ACCAATGCGTCCATCATTTCATTCACGGGACTTGTATTAATCGATGGGCCATACATACAATTTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGT:1 + chrX 5335864 5' + hobo 353 1 65.35 ATGCATAATAGTAAAGAAAATGATTATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCA:2 - chrX 4422700 5' + jockey 6 1 78.22 CAAACGAATTAAGCAAATAGCTGAATTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 28628062 5' + 1360 28 1 55.45 GCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - 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chr3L 15633551 5' - G5A 2621 1 66.34 GCCATTAAAAAATTAATTGGCTGCCTTCCCTTCGGGCGGAACACGCCCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACA:1 + chr2L 18629971 5' + hobo 2713 1 54.46 TGCGTGCACGTGGTGGTTTGGGAGGACGGAATGAATATAACACACTACGCAATTTGTACAGCTGTGCGCATTCAACAAGTCCACTTGAGTCTGCTTTGGCT:1 + chr3L 25676509 5' - micropia 346 2 59.41 GTCAGGGTCTGCCAGCACTTAAGATCATAATTAGTGTTTCTTGGACGGCCTTGCCTTGAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAA:1 - chr2R 24555710 5' - hopper 1400 1 64.36 GCGAAAGGCATTTAGATTAAAACTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAAT:1 - chr2R 15203231 5' - P-element 2688 1 26.73 GAACCAGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 153635 5' - 1360 3343 1 72.28 GTTGGCAAATTAACACACACATTCAGGGGCATACGTGAGCCTACACAAACATATACACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chr2L 15848211 5' + hopper 18 1 61.39 TTATGCTTGTATAAACGCTGCTTCTTGTGGCACGCAATAAATAGTTATAGTGTAATGATGAACTCCCCTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3L 13597201 5' - 412 7517 2 51.49 TTGACATGGCAAACGATTAGTTAGTTCCCGCCTCGCTGACACACATATTATCATTGTGCAGTTCCCCAAAATATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTG:1 + chr3R 19807323 5' + opus 112 3 78.22 AGTTCTTAAACCCTTGAAATAGTCTCACTAGCATTAATTTCCCATATTTATTGTAAATTGTTTCAGTTTCGGTTTTCCATTTTTCTTTCTTTATTATTATA:1 - chrX 692281 5' - Rt1a 5072 1 58.42 AACATGGGTCAACAAACTTGCGCTTTGTCTTGCGTTTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGATTCTCAACCTTCTAGATTCGACGTTCATACGGATAGAC:1 - chr2R 5296381 5' - INE-1 129 1 66.67 TGGTAAAACGAAAAAATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr2L 18297893 5' + hobo 36 1 59.41 TGCCACAAACTGTTGGCACTCACCTCGTTTCGTTTTATTTTTATTATTGTGTTCAGTTACTACGTAGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 - chrX 8973038 5' - flea 5009 2 75.25 TATCAAGCACTTAACCCTTTGTTGCCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chrX 7802904 5' - hopper 1366 1 70.30 TTATTTTTTATAAATTTTCTCAGTTCCTTTGATTTCCCCATGTTAAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGAACGT:1 - chr3L 18415000 5' - Tc1-2 322 1 84.00 AGATTACGGCTGTGTGTGTGTGCGCTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGAAATCGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCT:1 - chr3R 24426159 5' - diver 5779 1 77.23 AATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAATACATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCT:1 + chrX 15903173 5' + INE-1 97 1 45.54 TAGACCACGTTTACCACGTAATTCAAATAAACCAGTCAAAACTCAACACTAGAACGTTTGTTAGTAAACAATTGAAAATACTCATAAGCAATACATTGGAC:1 - chr2L 22239592 5' - transib4 349 1 50.50 AGCAGCGGCAACAGCACGTNATCAAGTTGGCAGCAAATCAGCAAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAA:1 - chr2L 18235281 5' + F-element 4363 1 61.39 ATGCATTTCAAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACACGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTC:1 - chr2L 16939891 5' + opus 130 2 62.00 TTACCCAGTTTTCACGAGATGTTCATTGTTGCGGAAAAGTAAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAA:1 + chr2R 13446619 5' - roo 410 1 78.22 GCTCACAGAATTTTTGGCAAAAAGTATGCTGTGCATTAAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr3R 7688930 5' + Tirant 40 2 67.33 GGCACAATTAGCATTCTTATCTGATTCTTTTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 14601849 5' + roo 44 2 72.28 ACGGTCTGCACCTCGGGTCCTCCGTAAACATTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAA:1 + chr3R 24872954 5' - Quasimodo 7054 2 70.30 GGCAATGAACTATAGACTGAATGGTACCTTTTTGCAAATCTATAGAAATTTACTATACTAATAAATGTGTGAAAAAATATCAACACGTTTTTCAAAAGTGT:1 - chr3L 8249266 5' - INE-1 260 1 70.30 GGTAAAATTTCAAATTTCGCGGCATGTACTGCTTGTGTGTTTGATGCACTGCTTGGACTGCTTGCAAGCAGCTGGCGCCAAATTTAAATTTATTTTTAAAC:1 - chr3L 9824461 5' - NOF 3955 1 83.17 AATGATAGTATCATAAAACNCGTCAACCTGCCAAGATGTAGATATTGCTATACTGTCTGATAGTTAAGCAGTTAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGA:1 - chrX 7020310 5' - FB 161 1 57.43 AACACCCCTTTTCCAAGTAAATCCAAAATAATACGCCTATTTTCGCTTATCAAGCACTTAACCCTTTGTTGCCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chrX 7802951 5' + hopper 2 2 73.27 GTTTTTGGTACTCACCCGCCTCCTGAAGCGACGAGTTTCTATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTG:1 + chr2L 20654743 5' - Transpac 454 1 60.40 ACATTTTTCGATTCAACCGCTTTTCACTTTATTCTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAA:1 - 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mdg3 214 2 54.46 AAAACTCACCAGCTCGAAAGCATTGCATACTTTGCAGCGCAATTTCGGGCATAGAAACAACAGCGAAATACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2L 3908439 5' + jockey 14 1 69.31 ATAAGCCCGGCCATAAGCTGTGCGGCGAAACTTTCGACAGGCAAACAAAACAGAAACAAAAAAACAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3L 17127062 5' + Doc 16 1 54.46 GAAACTATTAAATGGGGTTTACTTTAAGCTGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 3822360 5' - pogo 2095 1 69.31 ATTATTGAGTGCCATTAGATTAGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr2R 16680143 5' + 412 7105 2 81.63 GGGGTTTACTTTAAGCTGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3L 3822373 5' - pogo 2082 1 56.44 TTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 13446670 5' - roo 9022 2 78.22 TGTTAAGGACATCTGCGACCGGGCTTGTATTACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCT:1 + chr3R 14980493 5' - 412 448 2 65.00 AAATAAATATTTGGCCAATGCAGTAATGTTTGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3R 28216805 5' + blood 43 2 66.00 CGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGTACCCCACACTTATATTAATTTACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAATTTTAACATTG:1 - chrX 21907808 5' + ZAM 8209 2 59.00 AAAATAAACAACAATAATTAAAAAGATTACTAAACTCTGCGGGATTTAATGGCAATTCCGCAGAGTTCCGTTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGC:1 + chr2R 22108117 5' - Porto1 4251 1 58.42 GCAATAAAATACTTTTCAAGCGAAACTCATAAATTTCCCTGCATTTTCCCCTTCTACATTTTCGATGTTCGATTTCAGTTGCTTCTGCCGCTGTTGTTGTA:1 + chr3R 30721012 5' - TART-A 132 2 67.33 TAGCATGTGTGATTATAAACAGTTTTCTTATGAAAGTAATAAGTTATAATAAAGTATTGAATATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr3L 12717895 5' + pogo 9 1 68.00 GAAAGTATAAAAATGGTTATTTTTACCAATTAACTCTAATGCTCCACTTGAAAGAATCAGTATCACTTTTTAAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr3R 13170425 5' - gypsy7 5009 1 76.04 ATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTTATTCTAGGGT:1 - chr3L 11257373 5' - 1360 6 2 48.00 GATTCTGTCTTTCCATTTTTTTTTTTGCACCGCTGCCATAGTATAAGCCACAAACAACAACAGCAACAGTCTCTTTAACTCAAACGATTCAGTCAACGACC:1 + chr2L 9058680 5' + Doc4-element 348 1 48.51 CGCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2R 20461016 5' + hobo 32 1 60.00 TTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATACTGAACTCGTCTGATGTTTCTCTGGACA:1 + chr2R 4774809 5' + Gypsy12A_LTR 1887 1 78.00 TTATACATATGTCCATATGCTTTTTATTCCAGAAGTTTGTTTTTTTTTGGGGTTTACTAAGTACTAGAATATATTAAACACCAGCAGCCACAACAACAACA:1 - chr3L 4042571 5' + TART-A 120 2 80.20 TGCCGACTGTTCTTCACCACGCATCGGTAGTGGCCACTGTCCTCCACCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCGTTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAAAAG:1 + chr2R 15962200 5' + gypsy4 154 2 57.43 CAGTGGCGTCTGTCCACGGGTATTCGGCATTCCGAGAAATGGAATGGGATGGGATGGGATGATGACGGAATGTAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACG:1 - chrX 13341421 5' - invader3 5459 2 74.26 GCCAAGCGCTCCGTTGCCGATGCAGAGCGACAGAGAGGCATCCGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chrX 1714042 5' - hobo 2910 1 54.64 GTATGTTTGGGACCCTATAAAGTCTTATACTTTTGAGCCTAGGGGATCTGGATACTTCATACCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTT:1 + chr2R 5541934 5' - invader3 5447 2 60.40 TTTGCATTGGAAAAATCATAAAATTACCTCATATTTCACACAATTACAGTGCATTTAGTGTGTATATGTCAGTTTCATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:2 + chr2L 21220727 5' + I-element 1 1 78.22 TAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr3L 22112639 5' + Doc 43 1 64.36 AAGTGCAGTTAGTGTAGTTCTTAATTATTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chrX 12420336 5' - jockey 4950 1 75.25 GGAATATGTGGATATTTGCGGTTTTGGTAAGTCAAATTGATAGGGTAATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGA:1 + chr2L 13909635 5' + HMS-Beagle2 7044 2 53.47 TGATTATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chrX 4422680 5' + jockey 26 1 60.40 TTGCTACTTAATTTACGTCACGGCGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTCGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGATCG:1 - chr3R 26013098 5' - gtwin 7269 2 76.24 AATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATA:1 + chr3R 23020832 5' - INE-1 559 1 50.50 GGTTTGACAGCCGCCCGCCTGCGGCCTCTCTCGTTGCTTTGGTGTGCGTGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 13557125 5' + hobo 29 1 54.46 CTGGAAAGGATGTGCTGGGATCTCATTAGTTCGATCGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chrX 5997301 5' - 1360 3348 1 70.30 AAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 - chr3R 11151892 5' + mdg3 5283 2 55.45 GATCGAAAAGTACAGTACGAAACTTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGGAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTT:1 - chr2L 18500286 5' - Tirant 8394 2 74.26 TTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chr3R 4536200 5' + Ivk 46 1 68.32 ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAA:1 + chr3R 1875807 5' - Rt1b 4745 1 41.58 ATTTCAGTCCCAACATACTTTAGTATAGCACTGAGTATTTCAAAAACTGTAAAATCAGAGAGACAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATT:1 + chr3R 12881961 5' + 412 385 2 55.45 TAAGGAGGGAGCGAAAAATATGTTGCCTACTTTTGTGGGCTGTGCATAATTGGGCAGCATGAATAATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 25378656 5' + jockey 20 1 67.33 AAAGTTGTAGACGCTGTGCGTGAGCAGCACCAACGAAGCGGACAATTGCAAAACATCCATCGCAACTATGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr3L 7358526 5' + opus 7047 4 68.32 AAACGAGGCCAGATAACAAACAGCAGTTTCACAATTGTATTTACACAGTGGCAGTCAAGAAATGCTGAGTCGGCTTGCCGACTTGTGG:1 + chr3L 2216044 5' + gypsy 7149 2 71.59 ATACAAACATCATTTTTTGTAATAAATTATTTGTGCGCAGGTAAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr2L 15907124 5' - pogo 2093 1 71.29 GGTGTGTCTGCAATGCAACAAGGAATATGTTGACACCCATCGCTGTTGTGTACGAACCGAGCGAAGCTTTAATATGTAGTTCCTGAGATCTCGACGGACA:1 - chr3L 22721511 5' - INE-1 140 1 70.00 GATTCTCTTTTCTTAGAAACTGCTGTAGCTATAATTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATA:1 + chr3R 1251662 5' + Stalker 65 4 79.21 AATTCGATTGGGCTTATCTTTTGCATTCACAAGAAAAGGAGGCAGCAGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2R 18105719 5' - roo 407 1 73.27 TTAGCCTGACTTTTGTGGCAGGGGTTAGTTTTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2L 20226691 5' + 412 16 2 54.93 TAGGAATGAGTCTCAGAATGAATCGAAACCAGACGCACTGGCCATGGGATAAATCAATTTTATTTATTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chrX 18706967 5' - I-element 5338 1 56.44 AGTGAAATTACTCAATTGGNTGGTGATTATTTATTTTATGTCTGTATTTTCACGCATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chrX 3691515 5' - jockey 4974 1 49.50 AAATCCCATCATTTCGAACTACCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTG:1 - chr2R 17811102 5' + Doc 338 1 78.22 TTTGCCAAATAACAAACAGNGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr3R 30611312 5' + blood 7037 2 53.00 TTACAGCTACAACAAACTTTTTTAAGTGACAGATAGAGAAAGAGAGAGGTAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGC:1 + chr3R 20400513 5' + 1360 133 1 65.35 AAAATCTGAACTTCGATGCTCCCTCACTCGTCCTCGTCCATAAACCCTGGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTC:1 - chr3R 28447185 5' + F-element 361 1 55.45 TACAAATTATAGCTAAACTTCTTAAAATAAATTTTTATCTGAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 11009563 5' - roo 9037 1 65.35 TATAAACAGATAATCGTAGNTTTTGGCACAAGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTCTGAAAGGGTCTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAAC:1 - chrX 8525360 5' - Ivk 243 1 69.31 TTTGGATTTCTTACTGTTTGAATGCTCACAAAGCTCATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr3L 10560246 5' + pogo 37 1 69.31 TTGCTTCTTCCATTAACTANTAAACCTTCGCTTTTAGAACCACTTAATCATCATTCTAACACACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chr2R 11549674 5' + mdg3 5305 2 63.37 CGACGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr2L 14054801 5' + F-element 39 1 52.48 GTATGGCATTGGACTAGCTNATAAATCATTGTGGTTGTGGTGTACTTCGAGTAGGTTTGATGTGGTTAACTAGATATTTTTAAAGGGTTTTTTTTTTGTT:1 + chr2L 8059603 5' + Tc1 1468 1 54.00 TAACACTTAACCAATGAACCATCGAGACCTATGCTTGTATATGCGTGTATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3R 11191083 5' + hobo 26 1 54.46 GGGGGAGTGAATCAGTGGGAATAGCGAAAAAGATACAGGGGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACG:1 + chr3L 10927037 5' + R1A1-element 5044 1 60.40 GGCCCACCGATATACTGTTATTCGGGTTCGGGCCATGTCAGCACCCAGCTACAGGGTGGCATCAAGGACATAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 4233875 5' + accord 7028 2 57.61 CACCATGTGAGTATTATCATCTAGCATTATCCTTATCTTCAATCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chrX 17873239 5' - 412 7514 2 55.45 ATTATCATATTCGTGGAGACAAAGCGACGCGTGGACAACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAGCCAA:1 - chr3R 6003838 5' + HB 1322 1 63.37 GGGGAAAATTAATAACTTTTAAAGCGGCAGTTAAATTGGGTTGTTGCCTGCGGTCATTCTGCATGCACGCAAATCCATTAATGTTTAAAAATGAAAAAGAA:1 - chrX 6455247 5' + invader2 492 1 71.29 GATATACAAGACGACCATANCGGCCATTTGGTAGCTGTGTTATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 27390345 5' - 1360 3354 1 97.03 CTCGAGTACTTATACAAGTACTTTACGCCCCCAACTTGGCCCAATGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chrX 15412744 5' - hobo 2908 1 56.44 TTTATCATGTTTATTACCCNTCGCGTGTTTTCTTTGACCTGATTCAGTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chrX 6417576 5' + hobo 26 1 52.48 AGGGGATACACATCCAACTGCCAAATAAATAACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAAC:1 + chr2R 8317013 5' - R1A1-element 5290 1 69.31 GTGTGGAGCGGAATGCGGGACACTGTCGTTTGGGGGATGGCCAAAAATCAGCTGTTTGGCGCAATGTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2R 13194713 5' - roo 400 1 70.30 TGTAACAATCGCAATAAGAAAAATATTTTATATGTGTAATTATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 + chr3R 27082963 5' + jockey 4678 1 69.31 GCTGAAAAGTATGTTGGGAATTTCACTTTTGGTCAGCTTCTAAGCTTTCCCTTGATCTGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTT:1 - chr3R 11065515 5' + pogo 1880 1 64.36 GTATACATTAATTTTATGTCCAGTAAGTTTAAGCTAACTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGGAAAA:1 + chr2R 12801896 5' + Doc2-element 246 4 71.21 ATCCAAGGACACCTACTGATGCCGGCGTATTCCCCGAGCGATTCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3R 12882721 5' + 412 7084 2 58.00 ATCAAAGTTAAGAAACAATGAAAGCACATGAATTGTCCAGTAATATTTGTATGTAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr2L 8966998 5' + 297 17 2 63.37 AACTATTTTAATGTTTATATAAAAAGAAATGAAACTGACATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chr2L 21220811 5' - I-element 5306 1 72.28 GTTTACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3L 455624 5' + Doc 44 1 67.00 ATTTTTTCGCTGTCTGTTTGCTTGCAAGTCTACGAATTTTTGAAGTGAACGAATCAGACGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGA:1 + chr3L 3488229 5' - Doc 4261 1 59.41 GAATATTAAGCATGATTTCGCAAAATCTCGCTGAGTTCGCTGGGCTGCGCTGATAAGAAGGTCCAGATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTT:1 + chr2R 7253257 5' - hopper 1078 1 81.19 TGAATGGTAATGGCCAGCATGTTGATCATCCCGTTCAGACTCTCCGCTGGAATGCTGCGCAGTTGAGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTT:1 + chr3L 20459064 5' - 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Stalker 7003 6 58.42 AACTGCACAATTATAGATGAAAATAATGGAAAGTTAGTGTTATATAATCCAAACATTCAATTAATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTAGC:1 - chrX 12856522 5' - G2 256 1 72.28 AAGAAAGTGCAGTTAGTGTAGTTCTTAATTATTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chrX 12420340 5' - jockey 4973 1 64.63 GATGCCTTGCTCTCTTTCGTTTACACAACTCTCGCTCCAATCGGAGTTCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACAT:1 - chr3L 4071853 5' + jockey 4983 1 53.00 ATGGGATAACGAGATATCAGGCTCAGGATGCCTAATATAGTTTCTGTTTGTGCAGAAGGCGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCA:1 + chrX 21445349 5' + opus 7338 2 57.43 TGTTGTTTTTGTTTTAGGTATGAAGAAGGGTTTTTGGATTACGCGAAACGAGGCTTTAAGCTGAGTGGCACGAATTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAC:1 + chr2L 11902895 5' - I-element 3 1 75.25 AAATAATGGCATTTCTTAGGAAATATTCAACTTTCATTATATTGAATTTTTAAATTTGTTTCCCCACTCCACACACACACACACACACATACACACGGTG:1 - chr2R 11705783 5' + accord 7104 2 65.00 GTATAATGAACATTTTTGANAAATTATTACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2L 20396983 5' - Transpac 5185 2 75.25 ACAAATTTTCGGCAATTTAAGAGAAATTAGCAGGACATTAGTAGATATTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGC:1 - 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chr3L 20615232 5' + hobo 368 1 66.34 AAATGTTTATATATATGCAGTCCTTTGAACTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3L 8905723 5' + pogo 42 1 72.28 TTTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGACGTGGGATT:1 + chr3R 10672727 5' + invader4 339 1 49.50 AGCCTCAAAGTATGCATTGGCAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 + chrX 4238794 5' - 1360 3336 1 78.22 TTTTTAATTTCCGTCAGTTNCCGCTGTCTCTCTCTCTCTCTGATTTTACAGTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGG:1 + chr3L 22204707 5' - 412 311 2 66.67 GGGCCACTGACAGTTTCTCAGCTAGTGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGTGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCA:1 - chr3L 3760016 5' + Cr1a 4093 1 74.26 ATTTTATTTATTGGTCACGTATTTATATAGGTGAACCCAAAAGAGAGATCTTTCAAAAGTATACGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr2R 13432917 5' + 297 6585 2 75.25 ATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr3L 24150545 5' + blood 7066 2 81.19 TTTTTTGCAATGATATTATTTTATATTTATTTTTATTTTTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr3R 23921661 5' + Doc 41 1 60.40 ATCGCCCACAGATTAACGCTCTATATACGACTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chrX 18121839 5' + opus 7036 4 70.53 GTTGGGTGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3L 6866176 5' + 412 7089 2 60.40 AATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 - chr3R 19950537 5' - BS 5081 1 64.36 AATATCATCGAAATATATCGAGTTCTAGCTTAAGGAAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 + chr2L 2416741 5' + 3S18 41 2 61.39 GGCAACATTCTACTGAACATGGCGCACATTGTCGAATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGG:1 - chrX 10492671 5' - R2-element 3339 1 62.37 AGAGATACCACTCGCTCCAACGGCTGATTACGACTTTGATGAGGTCCTTCGGATGTCTTCTGTGGAGTCTTCTTGGTGAGCGAGCTCTGGACAGTGCCTT:1 + chr3L 7718275 5' - BS3 1526 1 66.00 ATTGAATTGAATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr2L 2157852 5' + Doc 31 1 27.55 GAAGGTGTGTCTAAGCTTTTAAATTATATAAATCCTTTGTTTATTTTTGAGTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 - chr2L 15818042 5' - I-element 5329 1 57.43 ACTCATACATCCCCAACCCATCCACCAACAGTCCCATAGCTCGACAAACATTTAGTCAGACTCAATAAGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCA:1 - chr3R 11855570 5' + P-element 2817 1 61.86 GCCCTGGTCACATACAAATNGGAATACCAGAGATATGTATGTATGTATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chr3R 26804034 5' - I-element 5323 1 58.42 TCGTTAATTGCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 + chr3L 22112840 5' - diver 6072 2 65.66 AAGCCATTATTAATTTAACACCAATGGCCAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chrX 15412668 5' + hobo 23 1 56.44 GGTGAAATCGGAACGGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr3R 9870350 5' + F-element 45 1 56.44 GAGTAAAGTAGCATTTGTAATGATTGCACATTTCTTCGATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr2R 7132494 5' + opus 7037 4 67.00 TGCATGTTTATGAAAGTGAGAGCATCCATGCATACAAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATA:1 - chrX 22689883 5' - Transpac 8 2 64.36 GCTACGGAAAAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3R 22469211 5' + hobo 31 1 60.40 TACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3L 455621 5' + Doc 48 1 72.28 CAGCAATATTCTTATCTCCAAGAATATTGAGCTAAGCTAACGACTATATTTTCTGCTGAGTTAAGGGTATGTGGTAGTGGGGGAACTCGACTATAGCATTT:1 - 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chr2L 15479614 5' + blood 33 2 57.73 TGCTGCTATAGATTTAATGGACATTTTTGAAATTCATTCAAATATAGGTGTAGCGTATAAATAAACCAATTAATTGGTTAAATTTTGCTAAATTTTGTTAA:1 - chr3R 25711611 5' + looper1 1791 1 69.31 AAGAATTGGTGGGATTTTTTTTTGAAATATAATGCATATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2R 16907497 5' - opus 7477 2 62.50 AATAAGAAGAGTTCGGGGTGTAACACCATTAGTAACTTCGCAGATGTCTTTTACAGAAAAATGGATACTTTGGATCCCATAATATCATCAAGAAATTTAAA:1 - chr2R 1638262 5' - hopper 337 1 76.24 TTTAAAGTATGATCGGTTTTGGTTATGAATATTTCATAGAGAAATCCTGGCGAAATAGCGCACCCTATTACATTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTAC:1 + chrX 6058144 5' - roo 402 1 72.28 AAAACTAATATTGTTTAGACCACGAGAAAATTGCCTTTTTATATAAATATACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 3146610 5' + roo 24 2 55.45 AAACCAAATGACCAGACAGTCCGAAGTTAGAACAAACTCCCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr3R 26342910 5' - blood 7377 2 64.00 TTGTGATTCTCTTCAGATACTCCAGGCGCCCGTGAGAATGAATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATC:1 + chr2L 21960371 5' - GATE 419 1 76.24 GGATCCCTAAACTGCAATATATTTCGCCTAACAAACCCAAGCATTGGGAAACCCGTGCGCAGCCAGCAAGCACAGCATATTTGCGTGGCCGCTTCGAGTCT:1 + chr3L 23144554 5' + Gypsy6A_LTR 114 1 62.38 GGGCGGAGGGCACCACTCTGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 13071993 5' + roo 8720 2 81.19 TAATATTTGTGCATTCTATNCAATGGATAATTAAATGGAATCGAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 6322510 5' - roo 400 1 69.31 AGCCTCGCAAGAATAATTCCCTTAAAGTTTCACAATATCTCAGTATTATTACTGTAAAGTCTCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 21570991 5' - roo 9044 1 50.50 AAAACATTTTCATAGAAGCCTTTATTTGTTTATCAATTACTAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTC:1 + chrX 12186729 5' - invader3 242 2 63.37 TGTGATTTATGGGGCGCAAAGAGAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 19997215 5' + roo 8715 2 77.23 GGGGCGTCCCGGGCTGTTANCTGACCGTTACAATCGAATTAGGCGCCGCTCGCAACGCTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTG:1 + chrX 14658691 5' - X-element 4695 1 57.43 GTTTCAAAAGAAAAAAAAGATCGGCATTAATGAATTGTAATCCTGGCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2R 2864477 5' + pogo 26 1 55.45 ATTTGGGGTGGTTATGCACNCACTCACTCTCCGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTGTACACTTAAATT:1 - chr2R 8232534 5' + P-element 44 1 34.65 GTAAGACACCATTATAGAAAGTTGGCAAAGAATTGTTTATGTGCAAAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 7461042 5' + roo 8677 2 65.35 AATTCACTTTTTAAACGCACACTTAAATTGGGAAATGTGTTCACACATGAACATGACATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr2L 15766477 5' - pogo 2084 1 60.40 CTTTGGGGGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 - chr2R 6074468 5' - 412 7543 2 73.27 ACCGACGGCATTACAAGCCCAACATTCCCAATCCCGTCGGCATTTTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATT:2 - chr3L 12295763 5' - hopper 1042 1 54.46 AATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 17109702 5' - roo 9024 2 69.31 AATCTTATTATTAGTCATCACTTAGTATATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr2R 8717649 5' + 297 6621 2 72.28 GCAGAGACAAATAAAGTGCCAACCCTCTTGCATAACTTTTGTTAATTGGCTTAAAACAAACACTCCGTTACAATTGAGGCTTTTTCCTGTTTTGTTTTTTT:1 + chr2R 8269999 5' - Doc2-element 229 1 77.23 TACCCCGACTATATGCCATGTTGTGGACGGGTTATATTCGGTTTTTAGATTATGCTTAGGTTGAGGTTGAGATCTTCCTTTATAGTTCCTGAGATATCAAC:2 - chr3R 31045898 5' - INE-1 145 1 79.21 GGAAAAGAGCGGTAGTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAA:1 - chr2R 20582781 5' + P-element 145 1 21.43 CAGAGGGAGTCCCTTTGGANAATAGCTACAGTTATCGGCTTATGTATTGAATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTG:1 - chr3L 3811240 5' - Stalker 122 4 67.33 GAATGCAATATATATATATGAATCAATACATATATGTACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3L 107322 5' + 297 6612 2 75.25 GCGGTGGGCGCGGATTGTGGATGTGGAAAATCAGAGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chrX 10426891 5' + 412 41 2 67.33 CACCAACTAAAGTTAAACCNGTTAACTAAATGCAAAGTCACAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 13433908 5' - hobo 2911 1 56.99 GCACCACAAGCCGCGCTCAGTGCCCACTGGGCAAAATCAAACGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGACTTCTTTATTACAAAT:1 - chrX 6124374 5' + accord2 7513 2 60.82 GAGCGATTTTTTATGTAGATTGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATC:1 - chr3R 8705371 5' + jockey 9 1 75.00 AGTTTGAGTTTTGACTTTTGCTGGGTGCGTGGTGCCTGCTTTATGTATAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chrX 14324751 5' + 297 20 2 59.41 TGCGACAAAACACATGTTGCTGTCCCGCAGGCAGCTTTCACCATTGCCCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 + chr2L 18413826 5' + hopper 26 1 55.45 GGTTGGTGGTCCATGTGGTCTAATCCAACTGCCCAGGCACCGAGAGCTTTTCCGGTTTTGTGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGT:1 + chr3R 6239749 5' - X-element 4465 1 65.35 ACACAGAGCTTACACGCAGATGTTGCAATCCTCGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCG:1 + chrX 5051939 5' + accord 157 2 68.32 TATAAGAATGTAAAACATTGGGTGCCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3L 11953827 5' - hobo 2892 1 76.29 ATAAACTCTCAAGTACGAAGAAGCGGCCAGATACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAAT:1 - chr2L 21147781 5' + Juan 420 1 69.31 GATGGCTTACTTTGAAGTAAATCTAATTTTTTTTTTTAATTTTTTTAA:1 + chr3L 13845280 5' - Doc 4693 5 60.42 GCAGCAGCAAAAATCAAAACAATAAAAAACTAGAGAAGACAAAAACGTGAAAACATAATAAACGCCGAAATAAATAAAAACTCCAAATGAATCCGCTTTGC:1 + chr3R 1966447 5' - Tom1 315 1 73.27 GATAAAGGTGCTCAAGGACATTTCGGCCACCGCAGCGCACACAGCACACCATCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chrX 7759063 5' + hobo 22 1 57.43 TTTGAATTAGCTATTAGAAATCGTCATTGTGCTTATTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCA:1 - chr3R 25271726 5' - invader4 288 2 65.35 GTGTTCAGAAAGCGTTTCGAGTGCCCTGCCGCTAGTGAATATGAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 - chr2R 15303186 5' + FB 33 1 59.00 GCAAACACATGTTTCACAGATAAATACAAGTGCACGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAA:1 - chr2R 11045752 5' + Doc 332 1 65.35 GTGAGGAGAGCGATCGAAACCAAGGGTTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 + chr2L 16456765 5' - BS 5063 1 52.48 AGATTTCCAACAACGTTTTTAAAGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 21372989 5' - roo 9020 2 79.21 AGTTGAGTGGTTGCTCTCGCACTTTCGGCGGACAGACCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3L 5355405 5' - P-element 2849 1 42.57 TATTTATTGGTCACGTATTTATATAGGTGAACCCAAAAGAGAGATCTTTCAAAAGTATACGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr2R 13432913 5' + 297 6589 2 71.29 GTGGGCGTTAGAGTGGGTGTGGCAACATGGGTCAATAAACTTTTTATTTTTTTGTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGA:1 - chr3L 14047678 5' - F-element 4650 1 77.66 TGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGACCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTA:1 + chr3R 19589937 5' + BS 5035 1 60.40 TTTATTGCCTACTTTCAAGGGCGGCATATAAAACTGCTCTTTTTGTTGAGTACAAATACAAATACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 - chr3R 17896946 5' + jockey 4776 1 63.00 TGGCTCTGATTTTGGCTTGCAAAACATGCACTCCACTCCCCGCTTTTGTCTGACTCGCTCTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCC:1 - chr3R 18004605 5' - Doc 4382 1 73.27 GTTCCTCGTTGAGCGGCCGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chr3L 18896624 5' + P-element 58 1 24.75 GGCTACTTACCACGCGATAGTCCAAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3R 19671732 5' - P-element 2835 1 27.00 GGCGTCACAGGGGTGCTTGAGTTCGATATCGATAACAGCTCACATTCTCGTCATATGCAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATC:1 + chr3R 13683840 5' + Tirant 8463 2 65.35 TAAGCAGGTGCAAAAAAAGCACAACAAGCCAGAGTCAAAAGAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTA:1 + chrX 7707289 5' + P-element 424 1 51.49 AAATGCCATTAAATGTGTANCCTTTGAAGGATTTGTAATGATGAACTCTTATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3L 6084375 5' - 412 7500 2 68.32 ACTAACTCTACACCTTAAATGTAATTTTCAGATAAAATAAGAAGTCATATTCATTGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTC:1 - chr3L 27391093 5' - 1360 3183 1 52.48 AACACGTGACGAATAGTAAGACCTTGTGCAGCTATCTGTTTTTTTTGACACTGGCAGCATTGTTTTCGCCATTTTCGCACAAGGGGTCAGATCGGAAGAGC:1 + chr3R 9821140 5' - mariner2 570 1 76.24 GGCCCTTGACCGACAGTTGAAGGGTGAGCTGTCCAACTTTGGCATTAACAATTGATGACGTTGCGGAGGAGAGCTCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAA:1 - chrX 10426980 5' - 412 490 2 76.24 TAATATTTGATTAAAGCTTAAACAATTAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGCTTATAAAAAAAAGTATTCTTATTGATCAAAAACTTAAG:1 + chr3R 20192528 5' - Quasimodo 7325 2 71.29 TGATGGCCGGACCATAAAGTTTGTGGCCCCATATTGCAAACGATTCTGGCTGCCATCTTCCCAACGCCCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2L 3778476 5' - 1360 3381 2 65.35 TGGGGCACCCGCTTCGCTAATGAAAGGACATTCAGTTAGGCGGACAGTTTAGGGGGAAGCAACAGAATATGGGTAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGT:1 + chr3R 9085005 5' - mdg3 246 2 78.22 ACTCCAAGGGGCCATTAAAAGTAGATTGCAGAGTGTTATGGAAATATGTATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 6058244 5' + roo 21 2 53.68 GAATGAAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAA:1 + chr4 300251 5' - Transib5 2766 1 64.36 ATGAATATTGACACATTCCGAATAAGAGTATGTTTCATGGGGGCCGTGAGAATGAATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGA:1 + chr3L 22231463 5' - GATE 433 1 57.43 TGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr2L 16939823 5' - opus 450 2 74.26 TCACAATTGCGCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 20461025 5' + hobo 34 1 57.43 ACTGTAATGCTATCTAACTGTAATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATCGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 + chr2R 19907482 5' - I-element 5300 1 75.25 TTTTGTTTAAATAAATATTAGTGTTTGGAAAGTATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACG:1 - chr2L 21052789 5' - invader1 361 2 72.28 TGGTGGAAATGATGGTAGTGCGGTACTTTGGTACTTTAGCACTCTGGTACTTGGGCACTACTGTTTGCAACTACACTCTACACGCGAGGGCGGCTGGAAAC:1 + chr3R 10520997 5' + baggins 99 1 66.34 AGATAAGAATTGTTATATTCTTTCATTAAAAAAAATTTATTTTTTTTTAGAACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3L 25782384 5' + Doc 32 1 55.45 TAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 8434263 5' - roo 9033 1 65.35 GCGGGATCCGAGTGGCGTCAGTCTCAATAGAGCGGATAGAGCGGTATCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr3R 4773431 5' + Tirant 10 2 71.29 ACTGTATTTGAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 7494026 5' - roo 9043 1 54.00 GCTCTGAGCAAATGCGATCCACAAGAGAGCAAGTTCAAGTTCGTTTCTTGTGGCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCT:1 - chr3R 25208402 5' + P-element 22 1 57.43 ATCCCACATTCAGTTTTAAATTATTAACCAAGACTTAGCCAAAGATAAATACATTCGGACATGGCCATATCCACAGGGCTAATGATCCTGATCTAGAATAT:1 + chr3R 18250706 5' - INE-1 84 1 38.61 TTTGGGGCAGCTATATTGCAATTGTTTGCTGCGAATTTGGGTTGGGTCTTAGCCTTAAGCCTGGCAGTAACAAATACTTGTGCATAAACACAAACACAAAC:1 + chrX 12966383 5' - 412 78 2 64.36 ACAAAATCGTTGTTTTAGCGGTTTTTCACTTTTTATATGTATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGTACAAGAAATATATTCAATATATTTCTTTATAACTC:1 + chr4 221382 5' - Tc1-2 1587 1 61.39 TTTGTTTGTTGTTCATGGATGTCGTGGATGTTTAAGTGCCCGACGTGATTAGTCGACTTGACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCATTAGAAACTATATACC:1 - chr3R 8193899 5' + Cr1a 4119 1 62.00 TGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2L 7461102 5' - roo 9012 2 85.15 CACTGCGACAAGCAGTGCTTCCAAGCCAAACAGGCAACAACTCTGGGGTAATGTCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTACAACACTACCAATCAAAAATAT:1 - chrX 21084279 5' + G4 3486 1 63.37 GGTGGTTGGCTAGCCCAGGACGAAAGCGTGTTTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chrX 12378743 5' + hobo 43 1 69.31 AAATAGTAAATAGTTGCCTTGGTCCAAAAGATGTAACGCGTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chrX 22771509 5' + opus 7030 4 59.41 TAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCA:1 - chrX 22386784 5' + hobo 55 1 58.06 AAAACAGTAAAGGAAAAAGAATAAGCTTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATC:2 - chrX 12186776 5' + invader3 5237 2 76.24 GACCCAGTGATTGTTGATACCAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGCTTC:1 - chrX 11982085 5' - blood 7176 2 83.61 ATTACCCTTCATAAGTTTTACCTTTCTTCTGCAAAGTGCTATTTTCCAACCTGTAGTCGAGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 28475893 5' - roo 9059 1 67.33 ACAGAAATACCAACAGCCGTACAGTTTGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTCCAAATTTGACAAAATATGGCCACTTTAGAAGTTCTTAGGCTTTAGATC:1 + chr2L 19012729 5' + 1360 235 1 74.26 AAAACCCTTTTTTGTTTTCGCGAAACATGAAGATACACGATGGAGATAAGCTATTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCT:1 + chr2R 17402701 5' + invader4 18 2 61.39 GCATTGCGCTGGGAATTTCNTTGATTGCGTATAATTTGTGTATTGAAATCGATATTTTTGTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGA:1 - chrX 9870898 5' - Idefix 7062 2 71.29 TAATCGAATGTCAAGTCAACAAATCCTAGCCCATAAGACACAGGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTATAGTGAA:1 + chrX 21562836 5' - Cr1a 4121 1 57.43 ATTTATGATGAGCTGAAAAGTCCAAGGCGCAGAGATATGCATACATTATGTACTGTAGTTAATTATAATTCCAATACTACTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2L 18927546 5' - mdg1 7433 2 52.48 AAAATGCCGTCTCGACTTCTGCTCCCCTTCGCCCTCTCACAAGAACACACACACACGCACA:1 + chr2R 20891266 5' + accord 7026 2 67.21 TAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 - chr3R 11151907 5' + mdg3 5268 2 61.39 AATCATCTATTAGTGCCTACATTTCGAACACTAATTACAATATTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 5993114 5' + pogo 33 1 62.38 GAATAAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATG:1 - chr2R 4339514 5' - G5A 2789 1 74.26 TAATGATCATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAGTCAGTTCCTCGACTATTAGATACTCGTTACTCA:1 + chr2R 9236993 5' - INE-1 548 1 76.24 GTGTCCAAGCGATGATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:2 + chr3R 25950105 5' - 412 7495 2 69.31 CACCAGTTGACCCTGGGACCCATCTGGTGATGGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - chr3L 6866230 5' - 412 453 2 67.35 ATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAA:1 + chr3R 4357555 5' - Tc3 1665 1 70.30 AATCTACCCTCTTGTTGGGTTTCACATGAAATTTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 20284736 5' - pogo 2061 1 67.33 ACAAAGTTTATATGGATTCTAAAAGTGCTGTATTTGATGGAACCTACCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGAG:1 - chr3R 27165849 5' + Cr1a 4045 1 58.00 ACAAACACATTTTTAGCGCNTAAGTGAAAGATGGAGGATATATGTATGTTTGCATTTCCAATGCAAGAAAGTAGTAGATATTATTATTATTATTATTACTA:1 + chrX 9025372 5' - mdg1 42 8 69.31 TGCTTACTTTTTTAATGACTTTTTCACCTTTGATTTTTTTGCGACTCCAAAATTGTCAGCAAACTATTTTCATTGTTCAAAGTAGGTATAGGCGATCCCA:1 + chr2L 21051679 5' - invader1 431 1 64.00 TTTTGGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:1 - chr2L 12199522 5' + Stalker2 7278 2 55.45 AACATGACAAGGACGGGAANAAATATTCACAAATTTCAATTTCGCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATC:1 + chr3L 19781032 5' + flea 249 2 56.44 GGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 3428045 5' - roo 352 2 83.17 GTCTTTTTGCCTTTGTGTCNTTGCTGGCGTTTTGTGTTTGCTGTCTATGCTTTTGTTTTTGGATTTTGTGGTATAATTTACTTTTTTTGAGGAGAAGTATG:1 + chrX 2306815 5' - I-element 5153 1 56.44 ATCTGCTGTGCTGCGATCGATGCCCCTCCAGCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAAT:1 + chrX 6295852 5' - BS 4756 1 73.27 TATCTTGTTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:2 - chr3R 13685221 5' + Tirant 37 2 65.35 AATTTGTGGCCACGTTATCNGTGGACAGTTGAGGGTTCTGTTATTCTCTAATTGCATTCACACTTACGTGATCGGTGTTAATTTCACAATTCTGAAAATCC:1 - chr2R 13711181 5' - mdg3 496 1 54.46 ATTAGTCAGACTCGCAAGTATATAACCTAGTTACAAAACATTCTTCACAGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTA:1 + chr2L 16132521 5' + GATE 8272 2 50.51 GGCGATACAAACAATGATGTGCGACGAATACAGTCGATTAAAAGTTAGCAAAGTAGGGCTTATTGAATAATGAAAATTATTATTAATTAATATTATTATT:1 + chr3L 14957609 5' + Tc3 272 1 87.00 TTATAATCCTTTCGAAACTAAAATTATATATTAATATATTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCAATCTCACTTTTTAGAAAATAATGATCATTT:1 + chr2R 25086363 5' - HB 256 1 66.34 CTATTCTATAATATTGTGCATACGCGTATAAAGGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCTGCTTATTTA:1 - chr2R 22512673 5' - 1731 4434 1 67.33 TATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3R 8705343 5' + jockey 31 1 53.33 TGAACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACA:1 - chr3L 3328965 5' + G2 2683 1 71.29 AAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3R 27455542 5' + 297 30 2 67.33 TGAAAATCGATTTAATCCCCCATACTTTCACCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGA:1 + chrX 9463366 5' + hopper 38 1 67.01 ACCTAGTATAATTTTTAATACAAAGTACTAAAAGAGGCCAGAAAAAAGCCAAAGCCACCTCTAGAGCCACCGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTAT:1 - chr3R 21465197 5' - 1360 34 1 55.45 GTGCAGTGCAAAAAGGTTTCGAGTGCAAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCAATGCAAGATCGCTTAAATATAT:1 + chr3R 28778820 5' + F-element 141 1 69.31 ATTAAATAAACACCAGCTGGATTCAGAAGCAGTTGATCTGGCCATCTGCGTTTGTCTGCCCGTCCTTATAATCGTAGATATCTCAGTACCTATAAAAGCTA:1 - chrX 8003673 5' + INE-1 151 1 70.30 TTAAAGGACACACTTTCGACAGACCGCAGGAGAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGT:1 - chr3R 11305440 5' + hobo 497 1 71.29 CAAGCTTTACCCAAGTCAGCTGTGAATGCGCATAGTACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACA:1 + chr2R 9538364 5' + roo 408 1 52.94 GGGATGACAGTATGAACTTCGAACTCTCAAAACATCCAAAGTTTTTGCTCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr2R 20584410 5' + P-element 25 1 54.46 TAAGCTGTGTGATAAACTTTAAATGAATGGACGGACAGACGGACATGGTCAGACCGACATCGCTATTGATCCTAATCAAGAAT:1 + chr2R 15003615 5' - INE-1 86 1 74.70 AGTTTATTCAGCGTCATTAGACGATTGTGGGTGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATNAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chrX 5194519 5' - hobo 2895 1 71.29 TAAATGGCAAATAAATTGCATTTGCAAATGGAGCTGAACTTGATACCGTTTGGAATGGGGGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTAGGGTTCACTTC:1 - chr2L 3216295 5' - Doc3-element 414 1 65.35 ATTGGCGAGTGGTCGCGTGGCAAGGGCTTTTAGGTTGGGCGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGCTGCTGCTTGCTGTCTT:1 + chr2L 21691557 5' - Bica 4572 1 66.34 TTTATTATGGCCAAGAACAACAGCGAGGCAGATACGGTTGAAACCTGAATTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chrX 10575167 5' - jockey 4947 1 59.41 TGAATGGTGGGTGTGCGATAGTACTGGCGGTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGC:1 - chr3L 7747723 5' - Doc 4483 1 70.30 AGCCTTGAACAACAGCTCGCTGTGGAAATCAGAGCTCTCTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 - chr2L 13791335 5' - blood 297 2 61.39 AACATTTATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCTGTAAT:1 + chrX 21581110 5' + 297 38 2 63.37 GTAGACTTTGGCGTTTCCTCATTCACTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGC:1 - chr2L 204692 5' - micropia 5178 1 77.23 GGAAGGAGAGGAGGAATAGGCTCCGCTAATGACTTCCTATTTTGGTGAACTTGTGTCAATTGACCATCGATGGGGGATTAAAGAAAACTAAAGTAAAGTAA:1 + chrX 3840085 5' + TART-A 13142 1 80.20 AAAGGCGATCATCGACGCGATAAGGCAGCGCGTGATATATATATTTTATGTCATGTGTAATGATGAACTCCCGTTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3R 16806085 5' - 412 469 2 55.45 TGGCAACTGGCCATATTCTATTCTCATTCACTCCATTTGTATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2L 2309388 5' - Burdock 220 2 61.39 TTAATCGGATATCTTGATGCATTTCAAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGA:1 - chr2L 16939907 5' + opus 2 4 77.23 ATACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3R 14980545 5' + 412 35 2 61.39 ATGCCTGCACCATGCTGAGTCTGCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr2L 17549316 5' - mdg1 7406 2 76.24 TTTGTTTCTTTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTCATTATGTTTCAAAACCGCTTTATCTTTTTTTTCCTTTCCTCCCTCGACCACAGGATTGTAACTGGCG:1 - chr3L 5134263 5' - accord2 7433 1 63.37 ACAGAAAATTGCATGTCAACGGGATGTGCGGATCGGGATCAGGTGGTGTCCACGATCGGTGACTATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATAAGCCGGTAGCAG:1 - chr2R 16529751 5' - Chouto 210 1 75.25 ATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2L 17861775 5' + Doc 49 1 40.59 ATTAATTTAAACTATTTTACAATGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:2 + chr3L 17310220 5' + roo 8716 2 81.19 GTGTGCTTAAGTATTCCCATTTTCCGTTATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr3R 6609766 5' + Transpac 44 2 72.28 GGGCTTCACATAATTAGACCAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2L 20840280 5' - mdg1 7402 2 82.18 GAGGACTTGAATTTTATTAAATTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 13334834 5' + hobo 34 1 59.41 GTCATTTGGACCCTTTAACCATAATAAATTTTATATTTAACTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTA:1 - chr3R 27735834 5' + Max-element 8272 2 75.25 GAGCCTGAAATCAGTATTGGGGATTAGATACGAAATATCCAGCATATCGATAGATATATACTTTATATGCATACTTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTA:1 + chrX 15017938 5' - INE-1 10 1 52.48 GATATAGATAAACAGTGAATTTCTATTAATTTTTTACATTTTCCCAATATTTATCATGTCATTTAACATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chrX 11993675 5' + 297 5 2 70.30 GAGTGGGATGTTGTTCATGAATTTTCCAGAGATCAGCACTTTAAGCCAATATGATTTGGAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAA:1 - chr2R 8707110 5' - flea 242 2 67.33 TTGATAAGAATATGTATTTATGAAAAGCAGCAGAAAAACGAGAAGCAAAAAAAGAAAAAAAAATGAACCGAGGGGGGCATTTTTTTTTCTTTTTTTAGATC:1 - chr3R 27187408 5' - R2-element 3582 1 79.21 TATAAAGTCTTATACTTTTGAGCCTAGGGGATCTGGATACTTCATACCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAA:1 + chr2R 5541949 5' - invader3 5432 2 53.47 GTCGAGAATTCATCAACAATATTCGTTTGTTTGCCACGCCAACACATCTACTCGCACGCTCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAACTCTTG:1 + chr2R 10917842 5' + HMS-Beagle 6810 2 63.37 TTTGGTCTATGCTAACGTACGATATCAATTTGTTAATTGGGCTAACAAACTGGGCTTAAAGAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATA:1 + chr3L 16463300 5' - INE-1 559 1 57.43 AGATTGGCCAAGTAGCCAAAAGATTTCGGGATCAGGAAATCGAAGTGAAGGCGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTC:1 - chr2R 24367825 5' - accord 241 2 56.44 TGGACATCTAATGAACCCGCAGCTGAATGCGACGCAGGCCAAGTAAGGCAGATTATCGCTGA:1 + chr3R 16504187 5' + gypsy6 7358 1 64.52 TAAAGTTCAAAATCAAAGTTTTCTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCG:1 - chr3R 29465700 5' - 412 319 2 77.23 TATCAGGTGAAGGGGTTGGCTTACATGTTTAGCATGTGGCACATACACGCCAGCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACGATAATGTGT:1 + chrX 2898302 5' - hopper 1395 1 59.41 GGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 + chr3R 11151823 5' - mdg3 5466 2 58.00 ATCGAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 6322549 5' - roo 9024 2 77.23 ATAAATATAAAAATTATTGTAATAGTTTTCAAGCTTCTGGTTGTACTTGGCAGCAGGCAGAGTATTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGT:1 + chr3R 25844282 5' - Stalker4 396 1 64.36 GCCAAACACCAATTAGAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chrX 21056932 5' + Tirant 36 2 64.65 AAGTTAGGTTTGCTCATTGGTTTCATTAAATATAGGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2L 4404549 5' + pogo 38 1 69.31 TACGATAAGAAATTTAAATNATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATT:1 - chr2R 8642987 5' + Doc2-element 4699 1 68.32 AGGGAATAATGGCAGCCAGTCCGTCAAGGAAGAAGTTTAGCAAGGGTGATAGGAAGGCCTCCTCCGTCCGTATCCACCTCGAGATCTCAGGAACATTAAAA:1 - chr2R 10710632 5' + INE-1 147 1 61.39 GCCCAGTTTCATTGCAATTNGATTGTATTTCTCTTGTTGGTCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr2R 13715485 5' - mdg3 222 2 60.40 CCCTTTGCTGCTAAAAGCAAGTGAAAATAAATTAAGTGGAAGTAAGTCGTAACGAAGTGATACATAATTCTTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGT:1 + chr2R 13658995 5' + Ivk 5 1 74.26 TTAGTGAGTTGATATATAAATATTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 11960514 5' - gypsy11 3936 3 92.11 ACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 14980543 5' + 412 37 2 63.37 TCTTTTGGCTTCCATTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chr3L 4001381 5' + hopper 143 6 77.14 GTGAGGTACAACTTGCGGANGCTACTTGATTTCACGATAATTCACTTCAAAATATTGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr3R 25422071 5' - copia 237 1 68.32 GAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTT:1 + chr3L 20224152 5' - Chimpo 153 1 60.40 GGCTCAGGGCATAACAAAATTGCAATTAATCAAGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTATTAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAA:1 - chrX 6205669 5' + Burdock 246 2 65.35 TTGCATTTCATAAAGTCTCATATTTATCAATTTTGGCCAAAAGCTGAAAATAAATAAAATTAAATAAAACAACTCGATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAA:1 - chr2L 18191286 5' + F-element 13 1 72.28 AGGTCGCTGAAGATAGAAAATTAGATTAGAAACAGCTGCTGTTGCGCTCTTATTGTATTTTTGATTCATACTATATTTTATTTTATTTTATTTTTTTTTTT:1 + chrX 16815607 5' + transib1 1900 10 66.34 AGCCCCTTCTTGTTTGAAGAAGTTACTAGAAGCAAAGAGCTATAAGATTAACACAAAGCTCAAAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:2 + chr3R 8434237 5' - roo 396 1 66.34 ATCCATATTTGTGGGATATAATTATGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 - chrX 11987922 5' - 412 7491 2 81.19 AAATTTAATAACTAGCTAAAAACAATCATTCTTTCTCATTGAATACATGCACATCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr3R 6609697 5' - Transpac 289 2 57.43 ACCCGCTTCGCTAATGAAAGGACATTCAGTTAGGCGGACAGTTTAGGGGGAAGCAACAGAATATGGGTAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 + chr3R 9085011 5' - mdg3 5492 2 72.28 TGTAGTTTTAGCCACCAGTTTTTTGTTTTTTTTAGGATTTTTTTTTATGTGTTGTAATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAGAATTTGTA:1 + chr2L 11642869 5' - hopper 1083 1 65.35 TAAATGACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 + chr3R 14985318 5' + Ivk 58 1 69.31 TGCCACTTTCCACCTTTTCCAGCATACCATCGCCATCGGAAAGTTGACTTTAATATTTCATTCACCTTTGCCACGTAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAA:2 - chr3L 10139465 5' + opus 344 2 74.26 ATTTATAAACATACAAACTCAAATTAAACACAACATAAACATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr2R 999473 5' + F-element 42 1 57.89 AGTAGTATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTATTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAG:1 - chr2R 5924414 5' - jockey 4734 1 45.00 ATTTTTGGCAAAAAGTATGCTGTGCATTAAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr3R 7688921 5' + Tirant 49 2 76.24 GCAGGTAAATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2L 15907160 5' - pogo 2057 1 70.30 GTTTTTGGATCCTGCTGCATATTCAACGCCTCTTAGCTCGCCCAGCATTTGGAAATTCCTCTTAACAAGGTTCTCCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCA:1 - chr3R 7359989 5' + 1360 3305 1 75.25 GGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTA:1 - chr3L 11257395 5' - 1360 27 1 47.52 GCTTGAGCCAGATATTGCTGCCGGGCAGGATTTGCCAAGGGGAAACCGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 3428084 5' - roo 398 1 63.16 CCCTTTTAAAAATACGAATTATCTAACCAAACTCACGTTTTAGAAAATATTGTATTGATAATTTAAAAGTTGTGATTTTACTCAAGAATGTAAATAAGAAA:1 + chr3L 22636682 5' - HB 168 1 61.39 TTGGGTAAGTGCTCAATTAAAAAATTTCAAAATAATAGTTCCGAATAGAACCACGTACAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1 - chrX 19812444 5' + Transpac 15 2 64.36 GTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACATAAGT:1 - chr2L 9319115 5' + jockey 31 1 51.49 AGACACACACACACACACGCAGACTCACAGGCAAATAAAAAAAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAA:1 + chr3R 13617394 5' + I-element 4969 1 69.89 TCTGGAGTGGGCGTGGCATGTTTGTCTGTGGCTGCCACTGCGGCCATACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAA:1 - chrX 18464215 5' + hopper 29 1 53.54 AACATCCCCTCACACTTTTCCCACCCCCCTGCCATGGAGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTAGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 25531723 5' + hobo 33 1 58.00 AGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAG:1 - chr3R 19950497 5' - BS 5062 1 70.00 GAAAAGTTTCCTTAAGCAAATTATGCCATTTTTTCTCTAGTCTTTGGTTTTGGTATTTCTTGAAAGGTTTTTTGTTTTGTTTTTGTTAAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 10330038 5' - gypsy2 436 2 62.38 TACATGTACTGCCAGCTGTNCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 + chr3R 18171752 5' - 1360 3376 1 65.35 AAAGAGAATTAACAATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:2 - chr3R 13239988 5' + jockey 21 1 57.43 GCTTGCCAATTCCCCGCTGTCGGTTTCCCCCCGGTTTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGT:1 - chr3R 31162340 5' - Porto1 4454 1 64.36 GGATCCATATCGCTATGGCCAGCCGCTGCCAGGTGGAAAGCCTCCACAACAACAACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGA:1 - chr3R 17716272 5' + X-element 4295 1 64.36 TAATTAGCCAACTGTTTTGTTTGCGGGGTTGGGTGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr3L 6866149 5' + 412 9 2 68.32 TAGATGGCATTAAAGATAAGTATCGGTATGCGCTCTAATCTTCTAAGGCAGTTAAGACAGTTAAGTGTGCTGGTAGATAAAGAACTTGACACCGTTTGGA:1 + chr3L 17579098 5' - Doc3-element 462 1 73.00 ACTGTCATTAGTACTATTAAGATGAAGTGCTGAATCCTTTTTAAAAGGAGATGGTAGCCTATTCACTTTTATGTCCGCGTGGGCTGGGCCCATAACCTATT:1 + chr4 474610 5' - Dm88 195 1 61.39 TGTAAGCATGCTTTTTGATCTATTTCTATTCGATATATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTA:1 - chr3L 6740284 5' - Quasimodo 58 2 70.30 ATTTTATATGGATTATAACGATTTTTCCTACTAAAGATAGATAAAAACCTATTGATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chrX 16237888 5' - mdg3 5479 2 59.41 TGAAGCCCCAAGCTCCATTAGAATGTGCCCCGCCAGCAATCTGAACAGCAACCAACACAACATAAACATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr3L 22071302 5' + F-element 21 1 54.46 AGAATTTTTGGTTTTTTGTGCCGATGCCGCTTTTTGTGGCGATGTCTTTACTTAACTTTATATTCTCCTTCCTTTTGCTTGTTTTTTTATTTCCTTTTTTT:1 + chr2R 9370473 5' - gypsy7 5008 1 57.43 AGTGTAAACAAATCCGAAGAGTTATCTTCACATCTTAAGAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACG:1 - chr3L 5975758 5' - hopper 86 1 61.39 ACCATGCCCCAGACGGAGGCCATCATGAAGAATAACAGAATGGGGTCCAGCAGGATGTACTGGTTGAGGGTCAAGGTGCGTCGATTTGTAGAACCACCTTT:1 - chrX 785780 5' - HMS-Beagle2 6735 1 72.28 ACCGCAGGGTGTGTGTATGATGATGTAGTTGATAGCGTGTGTACGAGTGTATGCTACTATACGAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3R 19270319 5' + pogo 10 1 65.35 GTGTGCGTTTGGTGAGCTTNCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chr2L 15168084 5' + F-element 52 1 63.37 AGCTTCGGAGAAGAGATAGAGATAGCCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 + chr2R 7024966 5' + P-element 48 1 31.68 GTCCAGGGCTGCCTCCTCCCCGCTGTCGATCAGCGCGATGCCAGCATCGCCGCCGTCGCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTA:1 + chrX 20028199 5' - invader1 101 2 66.34 GCACTGTATCATTTTCATTACATGTTAGATTCGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAG:1 - chr2L 20550172 5' - jockey 4685 1 68.32 GGCAGCTGTGCAAAAATCATTGCCTACTTATGAGCGCCTCTGATGGAGCAAGGGAAGGGGGGTGTGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 12873665 5' + hobo 11 1 62.38 TAGCCACCAAATGCAGTAAAACTTGCTCCTGTGAGTTTGGCGTGTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCA:1 - chr2R 21862526 5' - X-element 4429 1 56.44 GCGTAATATACATCGTTCAGGAGCACGGAGTGAGCCAAGACTTTTGTCTTTTCGGCAGATGTAATTTGCAATGCTGGGTCAGCACTTTGATATTATGTTTC:1 - chr3R 25989511 5' - Gypsy6A_LTR 44 1 77.23 ACCTGAAAAAATTTTAAAATATATTGTATAAACCGTTTTTGCTAGGTAAACACGATAATTTCTACACTGCTGTAATAATTTTACCTTTTTTTTTTGTATT:1 - chr2L 21117851 5' - Bica 337 1 66.00 TTGCGCTGACCATTTGCACACCTGACCCCAGTGGTAGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chrX 9904655 5' + hobo 39 1 63.37 AAAGGTAATTTTATATCGCCTAAACGGAACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 18171866 5' - 1360 3385 2 76.24 TGATGTACACATAAACATACGTAACAATTTAAGCTAGGGCGGCTGGAAACAGGCTCTTAGTTAGGTCATGTCTCTGCTAAGGGTGCTGGCTAATCATAGTT:1 + chr2L 22312651 5' + baggins 150 1 63.37 AATCAAATGACAATTTTTATACAAAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 + chr3L 12983179 5' + diver 5911 2 52.27 TTACAACAAATAAAATTCTAAACAACTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr3L 13383956 5' + opus 44 4 73.00 AATGTATTTCGTAAGACACCATTATAGAAAGTTGGCAAAGAATTGTTTATGTGCAAAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 7461032 5' + roo 8667 2 75.25 TTACATCTATATTATATAANAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 3475349 5' - roo 390 2 62.38 AATCAAAATTTTATTGAATGAATTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr2R 7173676 5' - mdg1 7408 2 75.25 ACACCCAAAATACAAACAANATCGATTTGCATTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr3L 5403293 5' - copia 244 1 67.33 TCAGTCGAGGAGCAGGCCAAAAAAGGAATAAGTTCCGGGTTACTCGGACCTGCATAATGATCTGCACACCGATGGTTCTTAAAGCAATAATAAATAAATAA:1 + chrX 21252861 5' + Juan 4209 1 76.24 TACTTTTATTGACAATCCTCTCTGCTAATCTAAGGAAAATCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 11009502 5' + roo 37 2 63.37 TAAGTCAGGATAGCTGTTAGTCCAAGACGCGAACCCACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAAC:1 - chr3L 15835430 5' - 412 7440 2 64.36 GATCCAAAAGATGAACATATATACATGAATATACAGAGGAATATAAGTAAAACAATAATATTTTAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAC:1 - chr2L 15818151 5' + I-element 4951 1 72.28 TTTTCAGTTCTTGATATTANAAACTTATGAATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr3R 7618719 5' + Doc 29 1 49.50 ACATTTTAACACATGTGGGCTTTATAGTGGGTCTTTGTGTCTAGAATCTGTATTCTGAATATTAACCTTCTCTTTCCTGATATATCGACGTTCATACGGA:1 - chr3L 27908645 5' - INE-1 134 1 68.00 TAATACACCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAA:1 - chr2R 5532329 5' + G4 3772 1 55.45 TTTTGAGTAAAGCACTAATGAGTGGTAAGTGGTAATATAGCCCCAAGAGGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACC:1 - chrX 21398205 5' - F-element 64 1 56.44 GTACACATGGGAAATGATTTACTGTTCTGGCCCAGCCGCAGATTCCACGTGTTTTTAACGACTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 + chr3R 13205736 5' + hopper 16 1 63.37 GGGCTTAATTAACTTTCGAGTACTCGCTGGCGGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 - chr3R 24732945 5' + BS 42 1 67.33 CGCCGTTCTTAAAATATTTAAAACATTTATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chrX 21581089 5' + 297 6598 2 58.42 AAAGTTTCTGCTGACACATAGACAAGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACC:1 + chr3L 21397550 5' + Doc 428 1 71.26 AAAAAATAATTCTTCATTAATTTAGTTTACTCAAGGCACGTTGATTTATCTGGATGAAGCCGACAACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCTTTTAGCAATTA:1 - chr3R 6063022 5' - diver 291 1 68.32 TTGAAAATGCAACTCAACAGAAACGTAATAAACCAACGACAACGCTTCTCCCTTCTCTACCAGCTACTATCCCTTACCTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGA:1 + chr2L 20174906 5' + S-element 251 1 62.00 ATATCCATATCCGTATCCATATCCCTATCCCTATAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATT:1 + chr2R 10832877 5' - FB 613 3 66.34 GCTTAATTAACTTTCGAGTACTCGCTGGCGGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTA:1 - chr3R 24732943 5' + BS 44 1 69.31 AAATACAAAATGATGAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr3R 18342455 5' + F-element 41 1 54.46 GGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 - chr3L 24761239 5' + 1360 82 1 66.34 GACATCTAAATTATGCTTAGAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 9471247 5' + roo 8720 2 80.20 TGATGCATTTCAAAGAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACT:1 - chr2L 16939893 5' + opus 129 2 63.37 TGAATGAAAAGAAATATGATTGAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCAAAATCCTCTGGCAAGAAAAATTATTCGAGTA:1 + chrX 15153533 5' + Doc3-element 4539 1 78.22 GAAATAAATAATATGGTTAATTATATTCGATAGTCTTGCTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGTCAACGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTT:1 + chr3R 7748880 5' - micropia 350 2 60.20 TAGCCATTAGCCAGGCACACCGGAACCGCATTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTT:1 - chr3R 18106240 5' - P-element 2695 1 39.60 TGGTGCGCAATCAACTGCGATACCAAACCGCATTCGTATCTTGATTATTTTTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTT:1 - chr3R 4829635 5' + Circe 7003 1 69.31 TATACAAGAAGAGGAATTTTTGCATACTAAATTTAACGAACCTATACGGAAATTGCAAATAAAGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCT:1 - chrX 18039900 5' + F-element 4440 1 66.34 AAGAAATATAAAATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTG:1 + chrX 23431584 5' + G6 6 1 72.73 GAAAGAAATATAAAATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTA:1 + chrX 23431582 5' + G6 6 1 73.27 TTGTCTAGTTTCCTGTGCCTGTTTAATTTGTGTTCCTTTAAGCTGGCTTAGCAGGGAATTATATTTGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGT:1 - chr2R 8518320 5' + invader1 3624 2 64.36 ATTCCGTGCAACTTCAAATTTCAAAAAACTTTACAAATTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:2 + chrX 11987882 5' + 412 7091 2 65.35 AACGCTGATTCGTGATACCTGTTAGTAACAGGCTGTTACTCAGCTAGCCGACATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTT:1 + chr3R 5167518 5' - Tc1 1621 1 67.33 ATGCAGTATAATTTTTAGTCATTGCGCTTGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 18769632 5' - roo 9027 1 70.30 TTACTGATCTTTAGATTTCTTGTCGCCTTTCGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAG:1 + chr2R 11929616 5' - 297 6866 2 70.00 TGTTTGTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAACTAA:1 - chrX 22577186 5' - 297 6961 2 36.63 GTGTTGGCAACTCGCACACATTTTCACGCCCGTGACCCCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2L 8646678 5' + Tirant 8144 2 62.38 GTATGCAATGAACTCGAGACGTCATCTTTTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr3R 13239934 5' + hopper 35 1 67.03 AACTTTTTCAATTCGCCGCNGCAACACCTAGAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2L 15527068 5' + pogo 16 1 57.58 TTCAAAATGTTATTCGAAAGCTAATTCAATGGCGAAAAGTTAACGTACATATATTTTATGGTTTTTTTTAATTTAGTGCTGAGTAATGGGTATCTTATAGT:1 + chr3R 19440268 5' + INE-1 548 1 81.19 GGTCCTATCAAAGCAAAACTACAATTCGACACACTAATAAAGGTGGGTGAAATAAAAAAAATTAAATAAAGCGTTATTGAGACATAATGACGTGCAAGTGC:1 - chr3R 16369837 5' - accord2 7281 1 55.45 TACGTATGAATATATGAATGTTCGCATTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTA:1 - chr3R 22519758 5' - jockey 4886 1 74.26 AATATTCAGGTGCTGAAGGCTGGGTGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACAT:1 - chr2R 15849841 5' - Bari1 1503 1 76.24 TTTTTACATTTACTACATTTCGGCAAGTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3L 153570 5' + 1360 20 1 60.40 TGGGAGCACAGTCGAAGGTGATTAGGAAACTCGGAGACGTTGAGCTGACAGAACCATGGCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAG:1 + chr3R 14983470 5' + 412 7481 2 66.34 AAATACGAAATGGAAATGCGGCTGGGTTATTGGCTCGACATTTCCCATCTTCCCTCACGCCATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr2L 15479636 5' + blood 7019 2 69.15 TGGAGTGAACCCGACGCAAAGTTGAAATGAAAACAAACTGACGACGGTGTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr3L 12266756 5' - P-element 2861 1 53.47 GCAATTGACCTGTCATATCTTTTACTACATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 23683390 5' + 297 6623 2 76.24 AATAGAGCTTGTAAAGCAACCACCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr2L 15907167 5' - pogo 2050 1 77.23 AAATTAACGTTCGACCTCTTTCTTGACAGAGCGATGCTGAAATAGTTTCCTTCAATTCAGTTTGGCATGGGCATGAATGAGTCCGGTAAAACTCACCACAG:1 - chr2R 2009133 5' + invader5 161 2 67.33 AATTATTTCTTGGGAACACCAACAAATCTTATTATTAGTCATCACTTAGTATATGCATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr2R 8717625 5' + 297 6597 2 62.38 TTCCAATATTTACCTATTAATATCCTAAATGCACTATTTTTTTATTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 2532748 5' + roo 37 2 50.50 ACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTG:1 - chr2R 25051875 5' + G5A 2664 1 63.37 TGTGCAACTAACTCTCTGTGCGAATCATTCGTTGCCTATGGGCCTCGTTTTATTTATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTT:1 + chr3R 29078813 5' - Transpac 469 1 62.38 AGGGCTGAGCTTTAAAGTCTCCAAAGCTGAACTAGCAATGGAACTAAATAAAACTTATAGTAAGACATTTATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATG:1 + chr3L 2714446 5' + BS 18 1 66.34 AAGCGCCGTGCACTTGCAGTATTCCAATTAACACTTAATACTATTCATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGT:1 - chrX 21214505 5' + X-element 43 1 57.43 GCCATGTCAATGCTCCCGCTCCTGGCTAGCGTAGCCTAGCCTCAGCCAATCGAATTCCAAAGAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - 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chr2R 11423895 5' - Tabor 444 2 63.37 GTATAGGAAATAAAAATATAGTAACCACTTTTTAAAAAACTAATTACATATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr3L 11697130 5' - pogo 2066 1 60.40 AAAGTCTTGATAAATATGCAGAACGTACATATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCA:1 + chr2L 7540956 5' + G6 1849 1 70.30 AGTACTGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 15117613 5' - roo 9030 1 62.38 AAGTTGTCATAGTTATTAAGCTCTGAGCGTTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr2L 6583293 5' + hobo 1 1 78.22 AAGGTGCTCAAGGACATTTCGGCCACCGCAGCGCACACAGCACACCATCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chrX 7759067 5' + hobo 26 1 53.47 AAGTATTAATTCCAAATAAATGAATAAATTTGCAACAGTTTTTAAAAATGGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 + chr2R 10875588 5' - P-element 2783 1 41.58 GGAAATCGTGGGCCAGTCTGCAAGTCGGCTGCCTTTCTCCAAGCTTTCCTCCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACT:1 - 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1360 183 1 53.47 AGGAAAGCCCTGCAAGAAAACCCGCATGGACCGGGGTCCACAAGGTAACGTCCTGGCAACGTTTGGGGGGAATTTTTGCCATGCATCCTGGACAACTTGCC:1 - chr2L 21148073 5' - HB 1229 1 69.31 ACCCTTCATAAGTTTTACCTTTCTTCTGCAAAGTGCTATTTTCCAACCTGTAGTCGAGTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 28475890 5' - roo 9056 1 64.36 ACTGGAAAAAACTGTTGCCTACTTTTAGGCGGCACATAAATTTAAACCGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 18988490 5' + hobo 28 1 49.50 TATGCCCTATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2L 9319135 5' + jockey 11 1 71.29 GTATATGGAGTTCGATTGCATGACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 9542524 5' - roo 9019 2 77.23 TGGGTTCACTAACTCACCTTCAGTCTGCAAAGACCCTGAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCG:1 - chr2R 19340825 5' + McClintock 6097 2 62.38 ATTTTGTTGCTAATATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 - chr2R 13258758 5' + F-element 48 1 63.37 AATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTTAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689422 5' - diver2 4474 1 61.70 AGATCCCCTGAAGTATGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTG:1 - chr3R 14860233 5' + BS 5003 1 70.30 TAATTACTTAATGTTGCGATGCCTAAGCTCACTTAATTTGCACAAATGGCAACTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTCCTCCACGA:1 + chr2L 7934712 5' - micropia 5322 2 55.45 AATACGGACATCGGTGGCCCTCGGGGGCTTGAGTTGGGTTTTTTATATACACTCTTTCGGAGTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 771741 5' - roo 398 1 65.35 TATGTGTAATTATGGACAAGTTCTTTTACCCCGCAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 + chr3R 27082993 5' + jockey 4708 1 62.38 TTTCAAATCCAATCGATAGTTTCCTGCAGTGTTGCCGCATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGGTTACATATATGTCGGCCAAACAGGAGTCTCA:1 + chr2L 21708307 5' - invader4 325 2 76.24 TCCGCATGAAACTCAATTCTTACAACTGATTGAATAACCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 - chr3L 7204099 5' + Tabor 6880 2 62.38 ACCGAAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - 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chr3L 3787548 5' - transib1 1904 1 66.34 ATAATTAAATGGAATCGAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2L 6322536 5' - roo 9037 1 64.36 TTAAACTCAAGTCGTATCCGTTTTCAAGGACACGGTGATGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 7461140 5' - roo 9050 2 57.43 AGAGCTTTCTCTTTCGGCTACTTACCACGCGATAGTCCAAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3R 19671747 5' - P-element 2849 1 41.58 GCTGGTTAAGGAGCTTCCTTCACTTGTTTCATTTTTAATAACATATCTCATATCAAGACCATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chr2R 8707002 5' + flea 4769 2 67.33 AAGTTAAGAGATCGTAACTATGTGAAATTAAACAATAATAAAAGTTACAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 3475262 5' + roo 8691 2 60.40 GACGACGACATGTGTTTGTGATATAGTAGAATGCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3R 20284817 5' + pogo 15 1 65.35 AGATACATTTTAAAACATAGTTTCTAATATTAGCTCCCGATGTTAACTTAGTCTGTTTTTCGGAGGCTAAACAATTTTATAGCTGGTCGAGGTACGGAGAC:1 - chr2L 10682538 5' - HeT-A 6052 2 64.36 GGCCATTATCCGAGTGGCGCCCAGGTACAATGCTTTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACG:1 + chrX 17217737 5' - R1A1-element 5286 1 64.29 AAGGAGGGAGCGAAAAATATGTTGCCTACTTTTGTGGGCTGTGCATAATTGGGCAGCATGAATAATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3R 25378655 5' + jockey 21 1 67.33 GTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr2L 15817955 5' + I-element 20 1 61.39 GGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 3475315 5' - roo 355 2 82.18 TGAGCGGCTGCAAATACAAACAGAACTGTGCGCAGGAAAAGCCACATATACGCGTTCTGGTCTCTTGCTTTTACTTACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTT:1 - chr3R 9460534 5' + 1360 3263 1 58.42 AGCGAAAAAGGTGTCACTCAATGCTAAGAACAAAATAGTTTTGAAATCATCAGATTAGGCACATTAATCACATAACTCTAATTTTGTTTATTTGTTTTTGC:1 + chr2R 11670516 5' - Stalker2 7324 2 68.32 TGGCTCGACAAATACTATAGCTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr2L 6583369 5' - hobo 2886 1 78.22 GATCCAAATCAGCAAGAGGTGTGTACGAATAAAATTGAAAATATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTA:1 - chr2R 12139981 5' + Stalker 7166 4 58.42 ATCGGCATTGCAGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 4650483 5' - roo 9030 1 66.67 ATTGGATTACGACCACAATTTGTCTGCGGGCCAAACACCAATTAGAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chrX 21056903 5' + Tirant 8 2 73.00 TAACGGGTCCTTTTCGCGTCTTTCTCCTCGCCCTGCTCATTCGCGTTGTTTAATCGATGAGCAGAGCGAAAGCTGTGCCCATGATGAAATAACATCAGGTG:1 - chrX 6338978 5' + P-element 1 2 77.23 GCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr3L 19349949 5' - 1360 3355 1 63.37 AGAAAGCGGCCTGAAATAATAGCCTCAAAGTATGCATTGGCAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chrX 4238774 5' - 1360 3356 1 60.40 ACAATGCAACCTCAAACGTCAATGGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGATAAGGG:1 + chrX 17970978 5' + R2-element 496 1 69.07 AACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTC:1 - 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chr2L 12186972 5' + transib3 2770 1 80.82 TATGGATGTCGGGAGTCGAAAGTTTCCAGGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 14690993 5' - roo 9044 1 56.44 ATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr2R 5200943 5' + 1360 42 1 67.33 TTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCA:1 - chr3L 11257391 5' - 1360 23 1 47.52 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGGGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTT:1 + chr2L 20360644 5' - R1A1-element 146 1 70.41 GAAGAGGAAGACACTTGATGACTATGTCGATGCCGATCCTTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTC:1 - chr3L 21711488 5' - 1360 3307 1 60.40 GAGTGGATCGAGCTCGATTCTTAAAAACAAGCACGATGAAATTGAGACCTAAAAAACGAAAGGAGAACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:2 + chr2L 22155473 5' + pogo 8 1 71.29 TTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3L 5255973 5' + jockey 64 1 64.36 GGAGCACAGTTTCAACACGGAAAATAAATTGCTATCAATGATTTATATGCCGATTGGATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 2339843 5' - roo 9053 2 61.39 GTAAATAATTAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 17109713 5' - roo 9035 1 58.42 GACATACATATGTGTGTGCGTTTGGTGAGCTTGCGGTGCGTGTGTATGAATTCAATTCAATCGCCGACGTGTGTAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr2L 15168097 5' + F-element 39 1 50.50 TGACATCGCGTCGCACACAAATTGCAAAAACGGCGCCTTGACTCGCATTTTCGACACTTTTCCAATCGTCGCTCCACCAATTCCTCCGTTATGGCCGTCGC:1 + chrX 6422320 5' + gypsy5 6899 1 63.37 TATACATATGTGGTCGGAGCAGGATTTTGGGTCCGTCAGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGT:1 + chr3R 20333525 5' + roo 8826 2 62.38 TTTAAAAAAAAATGTTAAGTGTAGGTGTGGCATAAGGATTTTTAGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGA:1 + chr3R 5240610 5' + 1360 97 1 65.35 TGGATGTTATTTTCTCGTTTTCTTTAAGGGCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 12937476 5' + roo 8711 2 73.27 ACTAGAAAATCTGCTCTCCTCTTTTTGTAGAAACCAAAAGTGGAAATGTCAGTTTTAACAATGTGTAACTGTATGTATAAATATGTAAATATGTAAATATG:1 - chr3L 15161381 5' + G3 4506 1 63.37 AATAGCCGAGATACTCAAAACAGAGAAAGCAAACAAATATCTATTAAAGTTTGCATGTCGCATGGCAATGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATC:1 - chr3L 18602813 5' + G2 2680 1 74.26 ACACGGAAAATAAATTGCTATCAATGATTTATATGCCGATTGGATTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3L 2339829 5' - roo 9039 1 56.44 AACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCT:1 - chrX 22386753 5' + hobo 94 1 71.29 GGGGGGTTAAAGTTCAGAACAGATGAGGAGGAAAGCGAAAGGGGCCGAAGGGAAGACAATGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 13071198 5' - blood 168 2 67.86 GCACATGAAAATTTCGCCCTGTGCACACACGCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr3R 13520170 5' + jockey 4705 1 59.41 ACACACAGGCCGCCGTATTGTCGTTTGTGGTCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr2L 17865672 5' + hobo 48 1 74.00 AAATTCAAAGTTTAAAACCCCGAAGCAACACACTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTG:1 - chr3L 21912347 5' - Bari1 1688 1 56.44 GTGATTTATGGGGCGCAAAGAGAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:2 + chr2L 19997216 5' + roo 52 2 78.22 TGTAGGGAATGGGAAAATTTGCCACGTTTTCCATTGTTTTCCCAGCGAGATAAACAGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 13899144 5' + Porto1 159 1 82.09 CTCGGCTCAAATCACTTCTNCTTCTCTTTCTCGGCCACCGCTCGTCTGAAATCCGCGTTCGACACAAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGCT:1 + chr2R 7735554 5' + 412 65 2 63.37 AGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGG:1 - chrX 392288 5' + X-element 4406 1 63.37 TAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTGTTCCTAA:1 - chr2R 4339481 5' - G5A 2756 1 80.20 GGCGTATGCGTAATGCGACTGTCATTGCCACCTAGCCCGCTCTGCTTAGCTGAAGTCCATGAAAACGCACTGCCTCCAAGGAAGAATGCATA:1 - chrX 9963048 5' - Copia1_DM 3890 1 59.78 TAGACATTGGGAGGGCTTAAAGCTGACGCGCCGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGC:1 + chrX 10846357 5' + micropia 5273 2 71.29 CATGGGGGAGTGGAGAAGAGGTCGTGGCACTGCCTGATGAATATGTTGAAATCAATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 15117683 5' + roo 8685 2 57.43 AATGCAATCAATCAATTACATTCAAGAACATCTCATGCAATTAAACACACGCAAATCACACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTA:1 + chr3R 13651689 5' + HMS-Beagle2 7112 2 63.37 AGAGATACCCTGTAATTGTGCATTATGAAAATTACGTTCTCTTTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3L 11105022 5' - pogo 2074 1 55.45 TTAAAGAGAATTAACAATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 13239990 5' + jockey 18 1 60.00 GGATGCGGGTTTATGGATTAGTACTTTGTTTGTTCTGAACACTAACCAGGACTTTGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATGTAACCATAAAAGATTCAA:1 + chr2R 5098925 5' + baggins 5069 1 62.38 ATGATGAAGGTACAAGAGATTTGTGAAGTGACGTCGAAATCATCACCATCCATATTTGAGTTGCTGGTAGTACCCCAGAGCTGTATGCCATAAGTCAAAAC:1 - chr2R 5541433 5' - G4 3426 1 53.47 AGTCGAGTTCTCATGGGCCGGGATATTAAGTGAAATTGCCCAGGGATTGGGTAGCCAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 + chrX 5452541 5' + mdg3 22 2 52.48 TAGTTTCCTTTATTTTTGTTGTCGGTTACCCATCTCGTGTATGTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTAT:1 + chrX 4528194 5' - BS 5103 7 67.16 AAGCTAGTCAAATGCATTACCAATTGTGGAGCACACGATTTTTTCACCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAATGCG:1 - chr2R 16990890 5' + 1360 92 1 69.07 TTAGTACTAAGAAATGTTGATTGGTTTCATTCAATAAAAACCTATCATGTAACAATTGATTTGCGGTCTGGGATGGGAGCCAACTGGGCTAAATAAAAGCG:1 + chr2R 24114427 5' - mariner2 227 1 55.45 TGCAACCAATTGTACAATTGTCTCGGTTTCTGTTTGTCTGCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAA:1 - chr2L 15981355 5' - hobo 378 1 60.40 TTACTTTTGTATTTAGTAGCAAAAGTAACAGGTAGAGCGAAGCGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 20375792 5' + roo 33 2 62.38 AATTGAATCACTGTGCGTTATTTCCTGCTTAAAACGATTTGTACATACATGCATACATACATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr3R 4591927 5' + 297 6593 2 64.36 GTAATTCTCAATTAATCAGCTAAATTTGAATATATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGT:1 - chrX 19960982 5' + INE-1 117 1 66.34 GGAAATAAAAGAAAATTAATCTTTGCTCACATATTGTGCTTGCGCATAAATAACAAGAACAACACAATGGGCTACACAGTTTTTTCCCATTATTTTTTTTT:1 + chr2L 8230769 5' - Tc3 138 1 89.11 GCAGTTGCCGCTATCACGCATGCGGAAGTTGTCCACTACAATTGATCGCACCGTTTTGCGATGCTGTCGTAGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGTCAGC:1 - chr3L 25996782 5' - Gypsy6A_LTR 266 1 68.32 GGAATGGCAAGGCCAGTAAATGAATAGACCGGCTAAATACACAAATAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 17109645 5' + roo 8692 2 58.42 AAAATTCATTCATTTCATATTTGGATTTATTTTACAACATATACCGTTTGGCCGCTCCGCCTCCTTCCAACTTCACGATTTTTTTATTTTTTTTTACTTTG:1 + chr3L 15466518 5' - TAHRE 10440 2 78.22 ATTGCGACTGCGACTGCGACTACGAGGGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGATTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGG:1 - chr2R 22395614 5' + Rt1b 4997 1 73.27 AAATATATCCATACCAAATATGAAACGCATAATTAAGGCAGCGAAACCTCGCTCCACTGCAGACAGCTATTAAACAAGGGGTTTTTATATCGCGTCTATAT:1 - chr3R 8040189 5' + Cr1a 4360 1 78.22 GCAATGACCCACATTTCTGGTGGTACATTGTTTTGCCAAAGAAAGTCGAAGGAATTCAGCTGAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2L 1432004 5' - opus 490 2 71.29 AAAGTATATTTAATTGAATAAAAGCGGTCGCGATATAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3L 3822456 5' + pogo 34 1 63.37 AATAAGGAACGCCGCTCCTGGCGACGACTTCTGCCACGGTAGTCCCATGTCCCACATCCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTCCTC:1 - chr3L 1432081 5' - R2-element 219 1 59.41 AACTGTTCAAATATAATAATACTTGTCAATACTTCGTTAATACTTTTTTCTCACATATAAGTAGACTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr3L 12717771 5' - pogo 2097 1 75.25 AAGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTAAATAGGGAGGCGCCGGTGGGTGGGGTGTGTAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 30018057 5' + 412 7074 2 58.42 AAACAACCGTCGCGTCCTGCTTTCTCTCTGTGAAATTCCCAATATTTCCTTGGCCTTCCACTGACCCTAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:2 - chrX 22774850 5' - opus 7497 2 73.27 GATTAGAATTTGCGCCATCACTGAAGCGGGGGCGATAAAAGCGGAGCATTTTATTGATTTATCTGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAG:1 + chr2L 2908272 5' - hobo 2561 1 68.00 AAGTGAAAGCCCAACCGAAATGGGAATGAATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCT:1 + chr2R 8518249 5' - invader1 355 2 74.26 AGCTTAAATTTGTGTGCCCACATTCTGTATGGTATTAAATATGCATTAGCTGCGGCTACTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chrX 5452635 5' - mdg3 229 2 59.41 ACATTATTAAAATTTGCAAAGATTTCAGACTTTGCATATATGTGATTACTTCGAAACTAATTTTTTTTGCCCTAGTCTTTATAAGTTTCATTTTGAATTTC:1 + chr3L 18104225 5' - Rt1b 90 1 78.22 ATATCATTGAAATAACGGAAACTATTTACCTAACTCCCGAATTATATAAGGTGGGCAAACGTTAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTA:1 + chr3R 4322446 5' - FB 642 3 58.42 ATTATTGATACAAACTCGANCGGTATTTCAACATAATTATGATCAACACACGGATCAAGAATCACAAGGAGCCTTCATGCTGGACGACGCATTGGCGGGCG:1 - chr4 644012 5' + diver 5864 1 76.24 ATTCTTAATCTTACTGCATTTGTGATACTCAGAATCTAGAGTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2R 7132563 5' - opus 468 2 59.41 ATAAGTTGTACATCGATTTTTTCGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAAT:2 - chr3R 7869205 5' - 297 6960 2 64.36 TATTTTATAAGCGTGAGTTGGCAGCCCAGATGCCAACAAGTATATTTCATTTGTTGTGTGTGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr2R 23877704 5' + Transpac 12 2 66.34 TGCGAATTGAATTTGTAGAGAAAAAATAAGAAAGTGCGCGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr2R 24500892 5' + Tirant 42 2 65.35 GAGCTTGACAAATAATTTTCGCGTCCTAACCACTGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTA:1 + chr2R 7173638 5' + mdg1 7082 2 68.32 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 19450184 5' + roo 8717 2 51.49 GAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACAC:1 + chr3R 2412144 5' - R1A1-element 5273 1 64.36 AGGTTTCATTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 12556930 5' - gypsy11 3933 1 85.19 AAACTTCTTAAAATAAATTTTTATCTGAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 11009549 5' - roo 359 2 79.21 TATGCATCTAGAAGATGGGCATTGAACGCACCTCACACAAAAACTATATATATATATATAATTACAACCTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAA:1 - chr3L 1258065 5' - Quasimodo 7355 2 60.87 TTTTTTATAATATTTTTATATATATAAATATAAAATATAAATATGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr3L 24728120 5' - flea 4985 2 65.35 AAACAAGCTAAACGTGCACTTGACATGACAGACAACGCGAAGGAGAAAAATAATACAGAAACCGTGGAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGG:1 + chr3R 16859444 5' - I-element 4985 1 75.25 ACAAAGTAATTTGGAAATAAGTGTGGATCTTTTCAGACATAAAAAATTTATCTAGAAAAATCTAAATTCTGTAAAT:1 + chr3R 27333735 5' + TLD2_LTR 150 1 43.42 TTGATGAATGCAAAGGCCTTTCAAGCAATTCTCGAGGGTTGATTCGAAGGCGCCACTAGCCAGTTTGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGGACCACTAGCGCTC:1 + chr3L 23649932 5' - mariner2 66 1 37.62 TGAAATGAATTTTATTAGGCAGATGCGCTGGCTGGAACTTCCTTGCCCATTTCCCATTTCCCACTTGCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTT:1 - chr2L 14054713 5' + hopper 1174 1 73.27 TTTTATATCGCCTAAACGGNACCCTGCCCTAAAATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3R 18171858 5' + 1360 9 2 69.39 AATTGCAAAGAATTTAAAAAAAGAATGAATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3L 15831260 5' - 412 444 2 72.28 AGCATAAATATCCTTTAAGTGCCGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2L 4650472 5' - roo 353 2 78.22 AAGTAAACGTAAAAAAACGNGAAATTGTCTTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAAAAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTGC:1 + chr2L 22216131 5' - diver2 315 2 93.07 GATGGATCAGATCGTTGATATGATCCTCGTATATGGAGTTCGATTGCATGACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 9542496 5' - roo 385 2 53.00 AAGCGCTTTGTGCCTGCCAGCGCTTCGTCGGCGTCGAAGATCATGCAGGCCAATATTTACACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCA:1 + chrX 13292565 5' + mdg3 131 2 60.40 CTTCAAATGTAAATCGCTTTGTTGTAAAAAGTGTTCCGTCATGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCC:1 + chr2L 8690493 5' + Tirant 8105 1 81.19 GAAGGTAGTAGTTTTTGATTTCATAAAATAATGTTTGTTCGTCTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 - 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Bica 379 2 57.43 TGGAATCGGATACTTTATAATACCATAATACTTCATAATTATATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTGT:1 - chr2R 1873417 5' - TLD2_LTR 151 1 90.10 GCCTTCGTGTTTTGTAGTTGTCGTACATGCAATTTCAACTGTTGTTGTCGCAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGT:1 - chrX 13226426 5' - Idefix 41 2 55.45 TATAATCGAAATCAAATGCTTATTTTGAATTCAAATGTACCCACTTATAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1 - chr2L 16456836 5' + BS 5022 1 52.48 AATCTGAAACGCAGCAGGGAAAACAGGGAAAATCGGCCAGATTCGAGCTGCTAAGGAGGTGAAGTGGTATCTTCAGAACGAGAATATACACAGAGACTTAC:1 - chrX 6460357 5' + Doc3-element 4438 1 56.44 CATTATAGAAAGTTGGCAAAGAATTGTTTATGTGCAAAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 7461051 5' + roo 22 2 56.44 TTTTTTTTTGCCAGGCGTGCGTGATGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAAATA:1 - chr3R 30557029 5' - McClintock 35 2 74.26 AAAATAATTAATTCACGTTTTTTTTATCCACTTTTCATTCATTGGCATCACTAGCAAGTTGCGAATTTGAAAGTCCCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGA:1 - chr2L 3962756 5' - micropia 135 4 61.39 TCGATGCGCAGCAAAGAAGTTTACGCCTATCTTATGTAATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr2L 15907251 5' + pogo 1 1 78.22 AGCTCCCTTCACACATATANATTCGTATTCGTTTTTCATATATCCCAGCAGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCGAGCT:1 + chr3R 28443998 5' + gypsy7 5286 2 56.44 ATACATTTATGTATGAATATGAAAAAAAATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATA:1 - chrX 7292110 5' + hopper 1411 2 77.78 GCCATGAACCCAATGGCTAGGACCCCCGCCGCCCACTGCCACGCCCGCTCTTGTCAAACGCCCACCACTTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chrX 11025481 5' + hopper 10 2 69.31 ACGTTTCAGCGCTATGTCACCTGAGAGGACGAAGACATCGGATCTGTAAAAGGGAATCCCAGTCATATCGTGCTGCTCGCGATTGCATTACTGTAAGCCTA:1 + chr3R 18999781 5' - G5A 2478 1 60.40 ATATTCATTTCAATAGACTACACTCCTGAACTTGTGTACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTT:1 - chr3R 26170453 5' + X-element 46 1 61.39 GCCCCGTCACTATTCCGGATCTTGGTACCCCACCTCTCTTAGCGAAATACCCATCTCATCGGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATATATGGAACGACTTAAT:1 + chr4 714304 5' + jockey 4648 1 65.35 AGTGGGGAACAAAAAAATATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATT:1 + chrX 4422635 5' - 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chr2L 15521267 5' - Doc 4315 1 46.84 GCGTATCTAACGGTCCTTTTAATGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chrX 12378705 5' - hobo 2908 1 67.47 GAGTGTGTGCGTCTGTCTACACGTGCCACGCAGCGTGAGGTGAAAGGAGAAAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr2L 18413911 5' - hopper 1393 1 55.45 AAAGTTATAGTTTTGCTTAGCCATATTCCTCGTAAAATCTGTTTACTTGTCTGCCAGTCTTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACC:1 - chr3R 16839183 5' + Max-element 67 2 79.78 TTAGAAGATATTGATAGTTGTGATATCTAGCCGTTTTCTAGTCTTGTCTTCCGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chrX 153036 5' - mdg1 393 2 50.50 GAGTTACGAGTCATCCAGACCAGTGTCCTACTATCGCTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 9542565 5' + roo 8703 2 63.37 TAAAAAATAAAACTTTAAAAACTGGTAATACAGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3L 12121304 5' - 1360 3348 1 75.25 GAGCTTCTAATACTGTGAAACGGGGGGGGGCAGTATACGGCCGCTAGTGTAAGGAGAGGGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGAT:1 - chr2R 3622920 5' - Stalker2 388 2 62.00 TGGTTGGGGCTACGAAAGCTGCGCGAAATAGCACAACAAACAGGCAGCAGCGGGGAAACTAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAA:1 - 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chr3R 4833015 5' - Tc1 1591 1 76.24 GGTTAGTATTCGTGACCTCGGGGAGCTCAAGTACATGGAGTGCGTCATCAAGGAGTCGCTGAGGATGTATCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3L 7494125 5' + roo 8669 2 72.28 GCACTGGAAATTGGCCGACGGACAGGCACAGGTATTCATGCAGTGCTCGCCGTAGAACGATGCTTGGAACCGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTG:1 + chr3L 1717476 5' + Cr1a 4043 1 59.38 ATTATGTTTTAATTTTTTAAATTTAATGTAGGAAACAAATCTAAGGTAAATGGTTTGAAAGCGACCTTCGTGAAATGTCTTTTAATTTAGGTTCTTTTTAA:1 - chrX 11261439 5' - looper1 260 1 48.51 AAACTCGTGCAGATTTAACCTAATAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGCCGCCCGCCAATGCGTCGTCCAGCATGAAGGCTCCTTGTGAT:1 - chr4 625806 5' - diver 5845 1 76.24 GATAAGCGTTATTTTAAACGAAAGTCAACACAAACTGCAATTTACACTTTGTGTTTA:1 + chr2L 18197253 5' - Doc 93 1 59.65 AGCCACCTGGATCTACCCGAAAAAATTGTGTTAAGAAGTGCTAAGCCGAGGTCGGAGGTTCCATCGGAGTGAGGGAACAAGGGTGGCCATACCAAATCCTA:1 - chr2R 4716366 5' + Tc3 1422 1 35.64 GGTGCTCCTGTAGGATATGCACTTTTCCTATGTCAAATATATAGTGTTTTACATAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCG:1 - chr3L 19569245 5' + BS 14 1 54.17 GCTTAAAAAGCTATGGAGAATCGTGTTCGAAGGGAGAAAGTAAACCAGGAGAAATTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTATTTAAAAAGACGATCTAAACTG:1 - 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chr2R 11212277 5' + P-element 121 1 47.00 GCAGTCTAAGCAAAATAAAAAAAAAACAA:1 - chr3R 21675474 5' + F-element 4682 1 86.21 AGGTCTTAAATATGCATGTGAAAATGGTACATAATGTCGTTAATTGCATTCATTATAACAGAATTTAATCCAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTG:1 + chr3L 22112804 5' - diver 218 1 71.29 GAAGGGAAAAATTTGTTTACCAATTTTGCATGCGTAAAACAGTAAAGGAAAAAGAATAAGCTTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCAT:1 - chrX 12186811 5' + invader3 16 2 63.37 TGGAACCTGAACAGTACTGGGCAATGTTCGCATGGTAAGACACGTATGCAGTCATGCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2R 5200920 5' + 1360 19 1 58.42 TAAAAATAAAGTATTGCCAAATATAAAACATTTATTTGTGCTCTTAGTTTTTAAGAAAGGAAGGATGGAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:2 - chr2R 10399224 5' + pogo 3 1 76.24 ACATCGATTACATCTATATTATATAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2L 3475356 5' - roo 397 1 70.30 GCCACACATATGCAACTAATTGATATTATATGAATGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr3L 13164855 5' + I-element 40 1 69.31 AAAGGTGTCAACTGCATTANTCATCAGATTGATTTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCG:1 - chr2R 10857741 5' - BS 5049 1 68.32 TGATAATCACATCGTAGCTAAAAAGTACATCTTAATTATTAACAAATCAAGAAAGAGCGTCCTGCTCTGCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTA:1 + chr3L 11203458 5' + F-element 395 1 55.45 TTATTAATCAGGGGACAGTNTGCTTTAAATGGTTTTGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 16806007 5' + 412 31 2 57.43 AAGGTATGCAGACCGTCGGATTTTTTTCACATTTTAACAATGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr2L 7804316 5' - 1360 3357 1 62.38 TTAAACCTGTGTTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 + chr2L 4888723 5' - BS 5081 1 63.00 ATGAAATCAACTAACCTCACGCTCCCATCCCTATTCGCCAGTGCAGTATCTTGCCATCTCTAGCCAGCATCCGGTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2R 10874813 5' + P-element 1 2 76.24 TGTTTGTGTTTGGCCTTTTTTATACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 - chr2R 14586501 5' + Doc 27 1 54.46 GTCAGAAACCACTTGTTAGNCAAAGCCATTATTAATTTAACACCAATGGCCAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chrX 15412646 5' + hobo 1 1 77.23 GAATCGTTCATCGGTGAAATCGGAACGGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chr3R 9870338 5' + F-element 33 1 55.45 AAACAAACCAAACAAAACCAAATAGTGGATACAAAAATTATATACATGCATATTTACTATAACTCCGGTCAGTGAACCGAAGATCGCTTAAATTCATTGTG:1 + chrX 9179006 5' + F-element 145 1 56.44 AATTTGGCTAATTAGGCTTNTGGAATACACGACTGTTTAGCTTGATTTCATTTTTTTGACATTTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chr2L 22052468 5' + flea 4766 2 69.00 GTCAGCAGCCACTGAGCACTTTCGCAGATTAGGAGGGGGTAAATTAAACTAATTATGTTGGTATAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGT:1 - chr3R 19614538 5' - gypsy6 348 4 61.39 GAAAATTCTTGTTCACAATATCATAAGCTGCTAAGCGGGGGAAGTAGATTTGTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGGGCATTA:1 - chr2L 23174862 5' + invader1 181 2 58.95 ACTGCAGGAATCAATAGGTNTAGTGATATTTAATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr2L 20396933 5' + Transpac 40 2 66.34 GAGAAAGTTGTAAGACTAGATTTTTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr3R 20872710 5' - copia 221 1 59.41 TTGTGTGTCATCGTTTGATTTGTCATTATCATCGCGCACATTTCGTGTCCAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATAT:1 + chr2L 11321273 5' + opus 7275 2 53.47 TATATTGAGCAAAGGGTATCTTGCCGCCGACTCAGCCACTCTCTCGTCTTTCCCTCCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr3R 26798929 5' - P-element 2868 1 60.40 GCTTTTGGGGGCTGAAACTGGGAAAGAAAGAGGCAACGGCTGAAGCTCTCAACTCTCTAGCTTTTACAGTTCTTGAGATCAAGACGTTCATACGGACAGAC:1 + chr2R 16552067 5' - INE-1 129 1 57.43 GCTTTCTGATTTCTACAAGGAATACGTCCAGGCCTGGCAGAAAATGGAACAAGAGAAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAAT:1 + chr2L 15547946 5' - Tabor 403 2 67.33 GAACCAAAACACGCTGATCCAATCCGTAAATAAGTGGTGGATGCTGAGGTGGCAATTCGGAAATGGTTGTTGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGTA:1 + chr2R 5330975 5' + rooA 7245 2 65.35 AACATCAAACGATAAGAATGTTGAAAGAGCTGCCAATAAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACC:1 - chr3R 14964635 5' + Stalker3T 74 1 62.38 TACAGTATTTTCTAAGCTTTAAATTGAAGCTAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:1 - chr3L 12983230 5' - diver 179 2 68.32 GAGAGCAAAGAGCCGCCAATAAATGGCAAATATGTGATAGGTGATAATCTGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chrX 2743870 5' + P-element 26 1 53.47 TGAAGGAAATATAATGTGGAATGAGATTAGATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 2270522 5' + roo 39 2 65.35 AGATCGGCTATTGATCCTGATCATAAATATATTTCTCTATATAGCCGGAAACGCTTCTTTTATATTGCACATCTAGTCAACCAATTACTTATTGTTATTTT:1 + chr2L 21737996 5' + Porto1 4631 1 59.41 TTTAAAGTGCCAAAAATGGAGAGAGACCGAAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGCAGGCAAAGCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATTTGTTTACAAGAACG:1 + chr3R 19740945 5' - 17.6 7126 2 52.48 GATGAGGATCTACACTTTTGCAGATTTCAACCGAAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chr3L 10683523 5' + opus 7024 2 56.44 ATGTTTAAAAATGTTACCATAGTGTCACACTAATAAAGTATTCTTTGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 14601789 5' - roo 9043 1 56.44 GCCTGAAAGTAGGCAACATTGTTGTATTTGATATTTATCAATTGTGGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chr2L 8267330 5' + jockey 4701 1 60.40 GCATTCCAATCTCTATATTAAACAGATATTGCAAGTAGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3L 11953868 5' + hobo 14 1 55.84 GGCAACAAAAGCAATAAAAATAATACAAAACTTTGGCGCAGTTTTGACGATTTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chrX 10547735 5' - P-element 2865 1 57.00 GTAGATTGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3R 8705357 5' + jockey 28 1 57.43 GGGACTGGGACTATGGGGCCTGGTCCCTGGTGTTGTTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGTCGTTTCTGCCATTATTGTGACCCTTTTCTTTGGCTTC:1 + chrX 7618572 5' - hobo 438 1 61.39 GTAGGGATAAGATACTTATNCTATAAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 6074350 5' + 412 24 2 47.52 TTGGAAATGTTCTTCAGAATAACGCAGCTGTACCATTTCAAGAACTTCATATTTTATATATCTGAAAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:2 - chr2R 19513454 5' + roo 9 2 64.36 TAATAGTGGATAGATTTAATAAAAGGTTTTAATTTTAAGGTAATAGCACCACAAAAAAAAAAATATTTAAAAAAA:1 + chr3L 18447016 5' - FB 174 3 73.33 TTATGCCCTTGCTGTTCGGTAATTTGGCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 15268254 5' - roo 9023 2 75.25 GAGCAAATTGATCGGTAGAAAATGAAGGATTCGTAGTAGTACATTTCATATTCATTTTAAAATTCCATTGCTTTGCTTATGTAGTAGGCTGCTCCTCCTAC:1 - chrX 16238001 5' + mdg3 5253 1 60.40 AGATTATAATAGATTATTAAAAATTGCATTTCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2L 21372951 5' + roo 8707 2 72.28 GCCAAAAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCT:1 + chr3R 3269641 5' + Gypsy6A_LTR 106 1 66.34 TTGGCTCTATTATCGAGAATAGTTGAGGTGCGTGCTTTGTTGTGTGCCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 3766288 5' + hobo 29 1 56.44 TTGCAAATGGTGCAGTGCCACATACATTTTGGTGTTACTCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 - chr2L 18500372 5' - Tirant 8471 2 60.40 AAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 + chr3R 12115282 5' + 1360 34 1 61.39 TCTAGAAGAACAGATCGTTACTATTCCCATATCGCCCAACAAAGGGTTAAACCTTTTCCTAATGCCAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 4571289 5' - roo 9061 1 66.34 GCAACATTGTTGTATTTGATATTTATCAATTGTGGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2L 8267342 5' + jockey 4713 1 72.28 AAAAATATTTTAACTTCACTTTTGCATTGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2L 18472809 5' + Doc 51 1 82.18 TTAATTGAATACACCAATAAGAAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr2R 4030074 5' + Doc 58 1 76.24 GAGATTATGTGTGTGCCCACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCTATGA:1 - chr2R 9737550 5' + Circe 206 2 82.65 TGATTTTGTTGGGGGCGACTTTCAATTTTGCCCGCTTTTTTTTTTACGATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 - chr3R 28791668 5' - jockey 4964 1 62.38 TTACATTTACTACATTTCGNCAAGTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 153573 5' + 1360 23 1 56.44 GTTTGTTTGTTGTCAGTAGTGCGAGGGAAAATAAATAAATTATTGGTGCTGCCGAGAAAATTCTCGCAGCCGGTGATGAGTATTGCTACCTTTTTTTGA:1 + chr2L 2916707 5' - X-element 4298 1 66.67 AACTAAAAAGTGTTGAAAAGCACACGACGTTTTAAATTTTACCTCTTATGCTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3L 11697050 5' + pogo 22 1 55.45 TTGCATACTTTGCAACAGCNTTAAAAGATACTTCAATCTTTTGTGTGCTGAAATTGAGAATGTATACATATTTTTTTTTTAAACTTATTTCGTTATTTATT:1 + chr2R 8642883 5' - Doc2-element 4759 1 66.34 GGGAAAAGCAAATATGTGANAAGCAACTGCTTTCCACGTCCACCAAATCACACACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGAAAGACCGCGTTCTTGCTCTC:1 + chr2R 24140681 5' + Doc2-element 447 2 56.44 TTTACCCGAAAAAGTGTGCTACGGAAAAGGAAAGGACCGCACGCTTTGAGTGTAGTGTGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 22469228 5' + hobo 14 1 63.37 GCATACTATAGAATTAAGCTGATGTAGCTGCTTTTAAAATATATAAAAATGTATAAATAAATATATAAATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 + chr3R 18520998 5' - opus 499 1 43.56 AGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:2 - chr2R 5531199 5' + 1360 62 1 65.35 GCATTTCGTTGTTTTCCCCACCGCCTGTGTGTCTGTATGTGAATGTGTGAGTGCGGTGAGCTCGTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGT:1 + chr2L 12076210 5' - jockey 495 1 68.32 AAGTTGAGGTTTTTGTGATATTGGTTAGGTATTTCTTGTAGTGTTCGTTTTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTA:1 + chr3L 22639877 5' + G4 3561 1 56.44 AACAAAACGAAACGACAACGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1 - chr2L 15909872 5' - Tirant 8450 2 84.16 TGCAGGGAAATACGAAATGGAAATGCGGCTGGGTTATTGGCTCGACATTTCCCATCTTCCCTCACGCCATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr2L 15479643 5' + blood 7019 2 71.29 ACCATAAGCAAGGTACACAAATTGTCACAAGCAGAATTATTTGAAATGCAAATGTCAAACGGCGTAATGGTAATTTGCGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 10563109 5' - accord 255 2 70.30 AAATAACTATAATCGATAGGCTTTTACTTAAATTTCATGACGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3R 4191198 5' - 1360 3386 2 77.23 AACACCCCTGCGATGTCCAAACCCCGCGCTTCGCATGCCAGCGCTTTCGTTGTTGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCATCCAATT:1 + chr2L 18904037 5' - Bica 4718 1 54.46 TAAGTGGGCTATCTTTTCTGCTAAATCATGGTTTCTAGGCGGTCCTACATATAAAAATGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCA:1 + chr3L 4235605 5' + jockey 4586 1 56.44 TAATTTTCAAAATTTTAAGATATTTTGCTTGAACTGTAAAATGTATAAACATGTGTTTTTTCGGGGGTAATTAATACAATTTATTATTTTTTTTTTTAATT:1 - chrX 3578942 5' - Doc 4700 4 60.40 GTTGCGGCGACTAACGTTGTTGGCTCAAATTATTTCCGTATTTTAGCATTAAATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 11758441 5' + roo 8686 2 54.00 GTTTCAATTTCCTGGTCCACCACCTCTTTCTGCTTCTGCGGCTGCGCGGGCTCCTGTGCCTCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTA:1 + chrX 5876211 5' - Doc2-element 4418 1 63.37 GCTGCGAGCACTCTCTCGCGCTCGGGTATAAATGAAGAGCTATTTCTTTAGCCCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3R 29158071 5' - P-element 2864 1 56.44 GAATTCCTTCGATTTCCTCGCGTTGCCGCCATTTTGAATATTCTCTCTCCCGAAAGTTGTAGAGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2R 20584504 5' - P-element 2876 1 70.30 TAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACGG:1 + chr2L 20840154 5' - INE-1 127 1 68.69 ATAGCCATTTATTGGCTTTATGGCCAAATGTCCATCGACCTCTGACAGCACTGCTGGCAATACTGGCTGATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2R 15201463 5' + P-element 4 2 73.27 AAGCCAAATCAAAAGCCGTCAAAACACCGAACCTTGCTGGTTGTCGCGCATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3R 16594468 5' + Tirant 8128 2 59.18 ATTTCAGTTTCTCCTGGCCAACGACTCCGGCTCACTTTGTTTTTCCATTTTTTCTCCATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACT:1 + chr3L 22158031 5' - F-element 4647 1 61.39 TGTGCAAAAATCATTGCCTACTTATGAGCGCCTCTGATGGAGCAAGGGAAGGGGGGTGTGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chrX 12873659 5' + hobo 6 1 63.33 AAAAGTTTCGGCTGTGTAANTATTTGTTTAAAATTCCGCACGCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - 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1360 3361 1 57.43 TATAGCTACATCCACGACCAACTATAAAAGGACAATAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAA:1 - chr3R 26368119 5' - R1A1-element 48 1 64.00 AAGAAGAAAAATAATACGGNGAAATCATATTAAAAATGCTTTTGAAGGTTACATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGG:1 - chr2L 18471907 5' - Doc 4388 1 56.44 AAGTTTTACGAGACAAGGACAGTATCGCATACTGTCGTTGTTTCGTTGCTTCGCCGCAGCGATAACAACCGAGCTCAGAAGATCTGAGAGAGCCAGGAGGG:1 + chr3R 2465665 5' + Rt1c 5275 1 53.47 TTATCAGCGGCGGCAGCGTCAAAATGCCATTAAATGTGTAGCCTTTGAAGGATTTGTAATGATGAACTCTTATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGA:1 + chr3L 6084354 5' - 412 469 2 53.00 AATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chrX 19219310 5' + Doc 48 1 69.31 GTTGCAGCCCTTGAAGATGGGAATGCACTTGAACATGCTCGTCTTCGGCCGCGTCGGCTGTGACTGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTT:1 - chr3R 26537637 5' - Porto1 206 1 74.26 AATTTTTATACAAAAGTTGCAAAAATTAGTTAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATAT:1 + chr3L 12983190 5' + diver 47 2 69.31 GAACCAGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - 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diver 6079 2 56.44 GCCGAATAAGGCTTTAGGATAAAAGTGCGCTTGTGTTTGTTCGCATAAATGGCTACATCGTAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 19594688 5' + roo 8677 2 68.32 AAGCGAGAACTGGAGAGGGCTGGTAGATGAGGAGGTCTAATCAAATTCGGGGATAATTGCTGAAATGTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr2R 21407529 5' - 1360 3325 1 75.25 GATTTCCGTCGATGTGTATCGCCACATTTAGCACTTAAAAAATGACTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAA:1 + chr3R 22538771 5' - hobo 2656 1 55.45 AGTAAGGGGCGTGGGGGACAAACAGGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTC:1 + chr3L 17229951 5' - Tirant 8171 2 81.19 TAGGTTGTTGTTAAATCAAACAGATCGTGGAGTATTGTCAGGCTGTAATACTTCCCTTCTTAGTGGAAGCTCGGGATAATTTCCATGATCCACAAGCCTGG:1 - chrX 12945536 5' + Helena 137 2 69.31 ACAAAACGCCCCAAAAAGTATGCTTTAAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2R 18807838 5' + jockey 16 1 69.00 GGCCGAAGAGTTTTACGATCGCTCGGTTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr3L 5355360 5' + P-element 47 1 32.67 TGAGCCAGTATCTAAAATGATTGCGCAGAAAGTTAAGATTATTTTTCAACCTCAAAGTGCGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACA:1 + chrX 152947 5' + mdg1 7054 2 63.37 TTTAACACCAATGGCCAAAAACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:2 + chrX 15412681 5' + hobo 36 1 59.41 ATCATTTTCCTATTTAAGTNCTATTTTCGTTTGTGTTCGATTTTGTTTTTTTTTTCGGTCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAC:1 - 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chr2R 18107690 5' - roo 8714 2 66.34 ATGTGTGTTTATCTTTTATTGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGT:1 - chr3R 24564959 5' - roo 9017 2 79.21 TGTGAGAACTTAAGAGATTTCAGCAAAGTCAACGAATATTGGAAGAGCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTCGGGTTCAGCT:1 + chr3R 21528433 5' - Stalker 308 4 63.37 TGCTGCTATAGATTTAATGGACATTTTTGAAAATCATTCAAATATAGGTGTAGCGTATAAATAAACCAATTAATTGGTTAAATTTTGCTAAATTTTGTTAA:1 - chr3R 25711611 5' + looper1 1791 1 69.31 ATGTGGTTCGAGAGATGTTTCTTGGAGTGATCGTGGCAACATCGGCTAACAAACTTGCGCTGCGTCTACGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTTATCCT:1 - chr3R 22968393 5' - INE-1 175 1 77.23 GAGTTTCAGACTGCCAACANGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2R 11941199 5' + Doc 32 1 50.50 AGGGTAAAACAAAAATATAAATGTCGCATATTAAAAAGTTATTAATATTTTCTTTTTTAGATCAGCAAATACAGTATAATTAGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr3R 25121573 5' - pogo 2093 1 66.00 AATTGCATACATGCACACANGCCTTCGGTTGTGCGAGTGGTTTAGTGTGTGAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 + chr3R 13685143 5' - Tirant 8486 2 58.00 TTGAGTTTTTATGTTCTGGTCACCGCCTTTTAGAGCTGACAGTGTTGCCATGAGCAACAAAAGTAGGGTTTGGCTAGAGCTTCTTTCCTTTTTCCATTCTG:1 - chr2R 5712932 5' - jockey2 498 1 73.27 GTTTCATTTCAAAAACAAGAAGAGTTGTAGGATTTCAGTAATAGATATACTTGTTTGTTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATT:1 - chr2R 17402801 5' - invader4 3069 2 64.36 ATAAATTTTTAGCATGTGTGATTATAAACAGTTTTCTTATGAAAGTAATAAGTTATAATAAAGTATTGAATATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3L 12717904 5' + pogo 1 1 74.26 TTTGCCGGGGAATTGGACAATTGCGGACGTAAGGTGGATAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGG:1 + chr3R 25921271 5' - F-element 4480 1 60.42 AATTTGCACACTAATTTGTTTACCAGCTGCGTGTTCATATGTGTATACATATGTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 15546999 5' - pogo 2075 1 55.45 AATACAAAAGTAACACGTATGCAAAATTGGGAGTACAGTATAATTCACTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCAGCAAGATATCT:1 + chrY 1978378 5' + pogo 31 1 63.22 ATGTTTTGTTTCATCAAATGGCTGCTAATGCTATAGTGTAAAAAGATATATCTTTGTTGCAAATTAAATAAAACAAATTTATTTAATTATTTAGTAAACTG:1 - chr3R 24893548 5' - HeT-A 23 1 65.35 TGGCTAACTCCCTGACTGCTTTTGGCCAGGTCTTCATGGCTGCCTACCTGCCTGTCTGGTTGGCCATTCAAATTTCAACCATTTTCTATTCACACAAAAAA:1 - chr3R 19268794 5' - pogo 68 1 78.22 AACCAAAACTTTTGCTTCCAACGTCGCAGTTTGAACTTTTGTCCAGGGGAATGTATGAAAAAGGAAGACAATTTAGTGACACTGAGCCCCTAGTTGAAGCA:1 + chr4 835485 5' + Tc3 1309 1 62.38 TACCCCAATCTCTCTATCGAAATATCTCTGGAAATTTGTGCAGCCACAGATGCAATTAAATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 + chr3L 5403224 5' + copia 18 2 61.39 AAATGTAGATATTTACAAACGAAATTTTCGTTATAACTTGGCTAACTTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGC:1 + chr2L 4633830 5' - Doc2-element 4625 1 54.46 ATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATT:1 + chr3L 14971177 5' - 1360 2990 1 79.21 AACAATTATGTTTTATTGGTTTTACCGAAATTTGATATAATGAATGACTTCTTTCGGCAAAGCGATTATTTTGTTTTGAGGCGATCTTTTGTTTATATGTA:1 - chr2L 22678434 5' - transib3 2426 1 55.45 AAGCTGTGCGGCGAAACTTTCGACAGGCAAACAAAACAGAAACAAAAAAACAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:2 - chr3L 17127048 5' + Doc 30 1 54.46 TTTAAATGTAAAAACAAAACGCTAAATAAATTATTTAAAACTTTTAAGGGAAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr2R 2078185 5' + jockey 25 1 57.89 AATAAGTATCGCAGCATCGACATCGATACTTTGCACCACCAAAACAATAACAGTGCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chr3R 5367511 5' + FB 22 1 58.42 TCGTTAGGCGTTGCCAAGGTTGCCATTGCCAAACATGCAGGTTAGTTCGTGAATAGTTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGA:1 + chr3R 11919461 5' - I-element 5092 1 62.38 ATTCCTTCGATTTCCTCGCGTTGCCGCCATTTTGAATATTCTCTCTCCCGAAAGTTGTAGAGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2R 20584502 5' - P-element 2874 1 68.32 AATTAGGCAGCCCCACACCCACACACACATAAACAGGCAGACAGACCGAGTGAAAGGTTGCGTAAGAGGCTTAAAGTGCGAACGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2R 22793866 5' - accord 7031 2 81.19 AGAATTGGGCAATCAAAAAGCAAAAGCTTAATAAAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAG:1 - chrX 150667 5' + mdg1 7433 2 69.89 TGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3R 22469147 5' - hobo 2907 1 61.22 GGCTTCGAATTAAGTATACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 14980560 5' + 412 20 2 60.40 GTAAATGGTAGCTATTAGTTATCTAAGTGAATTTCTGATCGGCGGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTG:1 + chr3L 1259628 5' - Quasimodo 139 2 63.37 AGAAAAACAAGAGTCTATTTTGTAAGGGCTTCTTGTTAGTATCCACTTCGATATTTCTAGAGAATACAATTCTTTTTTTTTCTTATCTACACATTCCATTT:1 + chr4 520293 5' - HB 110 1 76.24 TTACATGAAGATAACAACGACGATGCCGAAAAGGATGGCGACGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCT:1 - chr2R 11149250 5' - F-element 229 1 58.00 GTTCTCAGAAATGTGGCTCATCATATACCAATTAAAATCGATTTGTATATATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAA:1 - chr3L 2270592 5' - roo 9043 2 59.41 GCCAGTCTCGCCAAGGCAACAGATGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 13544127 5' - roo 9022 2 74.26 AACACCAATTAGAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chrX 21056936 5' + Tirant 8149 2 69.31 TTTCGTAAGACACCATTATAGAAAGTTGGCAAAGAATTGTTTATGTGCAAAAGCAAAATGGATTCTCTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2L 7461038 5' + roo 9 2 69.31 TTAGAGTCATATGCAGTGCACATAAAAATCATTTTAATAGTTGTGAAACCTATTTGCATAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2L 14700863 5' + pogo 12 1 43.56 CACACACACACATATGGATACACGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chrX 6703615 5' - pogo 2051 1 78.22 ACAATAATATTATTGCAAATGCCGGCGTTTGTTTGGGTCAGTCTGCCGGAGTGGCTTGTCGTGTTCACATCCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAA:1 - chr3R 22530589 5' + hobo 2718 1 71.72 GAAGTGCTCTTTTTTTTTGCCACACTTTTTTTTTTTGAATAATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chrX 3546305 5' - pogo 2070 1 59.00 AGTCCCAAAGTATTTTAGTACCAAGATGTGTACCCAACCCACTGACCCTCGCCAATATGCATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:2 + chrX 13294016 5' - mdg3 231 2 63.37 TTTAGTCGTTTCAAGCGCGTCATCGTAAACGTCATTATGCCATAATGATTTAAAATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACTGAGAAGTT:1 - chrX 2649246 5' - Cr1a 4100 1 59.41 GGTTTACTTTAAGCTGTTAGCTAAATACTCAGAAGTAAAGTTTAATTGTAAATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3L 3822375 5' - pogo 2087 1 58.51 AAATATGCATAATTTTGCACTTACAGAAAATTTTCACATTTCATAGATTTTACTAAATATTTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAAT:2 - chrX 3431960 5' - Ivk 5362 1 56.44 ATCTGCAGCGTCATTCGATTCGATGATGCATTGCTGTTATTTTTAATTACGCCCCGGCAACATTGTCGCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr3R 19270440 5' - pogo 2096 1 74.26 AGAAGGACATGGATGTGGGNAATGGAGCACGGAACGGAGAATGGACGAGGCGCACAAACATGTCAGGCAAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTC:1 + chr3L 11657812 5' - Tabor 478 2 70.30 AGCATGCTACATAAAAAACNCAGACAGCGAAAGAGACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr2R 8385124 5' - hobo 2898 1 63.37 TATTAAATATGCATTAGCTGCGGCTACTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCT:1 - chrX 5452603 5' - mdg3 197 2 76.24 TGTGCGGTGTTCTGAAATCTCATCTAAATCATCGATAAATGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr2L 16939784 5' - opus 7495 2 71.43 AAAGAATTATGGGTGCGCAGCGAATAAAATCCGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCC:1 - chr2L 18770986 5' + P-element 254 1 42.57 GGCCCCGTTTTATTAACGGGGGATGTACTTTTTCGCCTTCGCAGTGGCTGTGCCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAG:1 + chr2L 4703564 5' + P-element 422 1 53.00 ATGACGATTCTAGTGCTGCGACTGGACAACAGCGGAAAGTCCTCGATAATCAATCCAAAATACAACAAGAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATC:1 + chr4 843598 5' - INE-1 564 1 58.42 GCTCCACTCGGTTTTACGTAGTTATTTTCGTTAAGAATTTTTGTTTTTCCTCCCTATTTTCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 29465674 5' + 412 16 2 63.37 AATTGATGACACGCTGTGTAGTCGTCCTAAGTTTTCATCTTTAATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTT:1 + chr2L 14303335 5' - Stalker 288 4 57.43 GTAGGAATCCTTTTGACCAGAAGTCAATTTCTAACACACGTAAGCACCAAAGGTCAAACTAAAGTCAGCTCGGATTTGCTTTTCACTTTTATTTGATCTTC:1 + chr2R 23937489 5' + 17.6 7255 2 77.23 TGTAAATTTAGCATAATATGAAATTTTTAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 14698201 5' + TART-B 10629 2 59.52 TTATAGCGAGATTTAAAAGTTACGCTTTGTTCGAGTCTCTTTACTATTAGATACTCGTTTTCAAGCGAAAGGATGTGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCG:1 - chrX 21082725 5' + gypsy6 7420 2 64.36 GGCGATAAACTCAGAAAGGGACCTAGAAGAACCTGTTGACACTCTCACCCTTTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGA:1 + chr3R 2878534 5' + Rt1b 4793 1 55.45 ATTAAATGGAATCGAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 6322539 5' - roo 9045 1 63.33 GACCATAGGGTTCTCTATTTGTGTGATGTTATACAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTATCCGG:1 + chrX 21082634 5' - gypsy6 7761 2 71.29 TGGTCATGAATATAAGTTTACCCGTTTACATATCATATTTTCCGCTTCTGCCCGCCGGTTTGAAATACTTAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr2L 10177880 5' - copia 249 1 70.30 GCCAAACAAAAGCAACATGTGTTACTTGTATGCCATGCCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTC:1 - chr3R 32040594 5' - G2 2859 1 62.38 AATGTATTTATTATGAGTGATTTATCTAAAAAAAAACAAAAA:1 - chr2R 16020350 5' + transib2 2634 1 80.95 AATCCATGAAGAAGCATGAAGAAATTATTGATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:2 + chr3L 95876 5' - roo 9027 1 71.29 TCGATGATGCATTGCTGTTNTTTTTAATTACGCCCCGGCAACATTGTCGCCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3R 19270421 5' - pogo 2077 1 54.46 ACTCTGCAAAACGAAATTTGTTTCAATTTCGCATTGAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 25950150 5' + 412 7090 2 59.41 AACATAAATCTATACATTCCATTTAGATGGCAATAATAGGTTATTGAATTTAGAGCTTCAAAAGTTTAGTTTTTCTATAGTGTAATTGTTTTAAAAATATA:1 - chr2R 14821126 5' - Stalker4 410 1 43.56 AAAGAACGAATGAAATATTTAATGGAAACTATTTAATATGCGTCATCTAATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr3L 2989783 5' + flea 24 2 55.00 TTTAAAAAAGCAAAACAATTTGTTGGCACTTATATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 16127783 5' - roo 9053 2 60.40 GCTCGAAACTAATTAATTAAGTTGCTCGCTTAGTGCTGCGCTTTCAGTGTTTTTGTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACG:1 - chr2R 9544658 5' + 1360 169 1 58.42 TTGTTGCTCCCATTGCTGCAATTTCACATAGGAGATAGTTGGAAGGAGCGGAGGACCGTGAATTAACGGTACCGCACTGGACCTTGGACTCCAGCGGGCCA:1 + chr3R 8889801 5' + gypsy8 4756 2 68.32 GGCAGGTAGGGCTGTGCGANGGATTGGCCGGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATGGCGTCAATACATTGTGAC:1 + chr2R 8627328 5' + Stalker 54 4 70.30 ATTCTCACACTTTAATAACAACACTAAAAGTAATCAGTTAAGAAACAACTATCTAACTATTTTTCAAATTATATTAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATT:1 - chr3L 11443618 5' + 1360 3082 1 69.31 TTGTTATATTCTTTCATTAAAAAAAATTTATTTTTTTTTAGAACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr3L 25782393 5' + Doc 41 1 64.36 TACGCAGACGATGTTAAATTATGCCGCCCAGCACAAGGACATATCTCGCCATTTGGACTTACAATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTTT:1 + chr2R 1005988 5' + Cr1a 4178 1 57.43 TGAGGTGTTTATCGGATGGCAAGGAGGTTCCACTTCCAGGCCCCCAATTACCCATGCTCGTATGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCG:1 + chr2R 11820884 5' + gypsy6 7433 2 65.35 TGGGCCACACAAAAATGTCTAGTTTATTATGGAGCTCTTGGTTTCATAAATTAAGAACATAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 2339745 5' + roo 16 2 63.37 AAATTAAAAATATTTATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 16487994 5' + TART-B 10628 2 89.29 CAACAATAGCCAAATAAGTNTAGGATTCCGACGATGTGCGTGATATTCTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGG:1 + chrX 13617401 5' - Tirant 83 2 54.00 ATATGCACAATCGAATGTATTCTAGTAAATTAGTCTTCGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:3 + chr2L 16127706 5' + roo 37 2 66.34 ATATATATCAAATATAGCTAACCTCTTATGATTTCAATTAATTTTTTGTTGTAAATATATTTGGTTTGGTTTGGTTGTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 521270 5' + Circe 7279 2 52.22 AATCTCATCTAAATCATCGNTAAATGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2L 16939799 5' - opus 7477 2 53.47 TATATGATTTTAAAGTGTCAATAATTATGTATATATTTTTTCAGACCAATAACAATAGCAATACCGAAAAAAGTTCATGTTTTGTTGTTTTTTTTCTTATG:3 + chr2L 15546299 5' - gypsy11 3930 1 62.38 ATGGAGACCACTCCTCTTCCCCTTGGTTGCGCTTATTTTCAGTAAGTTTCGCCTTTGTTTTGTCATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATCTTCTA:1 + chr3L 13367666 5' - mdg3 5488 2 67.33 TATGCCCAACTTGGCCATAATTCATGTGGCTTAGGCGAGCACCAAAAAACGGAAGGATGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAT:1 + chr3R 25746833 5' + roo 8788 2 52.48 GCACGCCGACGCTCTCAGTTCTCCTGTAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chrX 21400788 5' - P-element 2843 1 34.65 AGCAAACAACCGTCGCGTCCTGCTTTCTCTCTGTGAAATTCCCAATATTTCCTTGGCCTTCCACTGACCCTAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chrX 22774853 5' - opus 498 1 77.00 AGAAGTTTGCAACGCAGTACAGCAGTAAAGCGACCATTTTCAATTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTT:1 - chr3R 4535930 5' + Ivk 163 1 56.44 ATGTATGCTACGACATGGCTACGACCAAGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 - chr3R 18171825 5' + 1360 45 1 72.28 GTTGGCCGTGGCACAAAGTAAATGAAGCCGCCGCAGCAGCCTCAATTTAAAATTAAGCTCATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCC:1 - chr2R 21747485 5' - roo 8963 2 59.41 GATGATTCAGACATGGAGGCACACACCCACTATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGG:1 + chrX 14166552 5' - jockey 4777 1 69.00 ACCTCTTATCAAATCCTTTTAAATTCAGTTGAAGAGTAATTGATCCTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAAAAT:1 + chrX 11696574 5' + TLD2_LTR 97 1 72.28 AAGTTGTGCTAAATGCGTGCTGTGCTGTGGAAAATCTGGGAATATGGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 12882649 5' - 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chr3R 13239986 5' + jockey 23 1 55.45 TGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2L 8690537 5' + Tirant 42 2 66.34 AAAGTAGGCAACACTCGTCNGACGAACGAAGTGGGGAACAAAAAAATATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 + chrX 4422606 5' - jockey 4965 1 51.49 ATGGCTGTTATATCTGATTGACTAGGCTGGTTTGCCCACTGAATTAGCTAAGATCTGTGCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTG:1 + chr3L 12178301 5' - opus 7325 2 60.40 GCTGCAATTAGGGTTTAACCAACTGAAGCTGCAAATGAATTGAAATTGAATCATTATGGGTGCATATTTTATACTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 16721012 5' - Porto1 172 1 77.23 GCACCTTTTCTCCAGCAGCGTGGGTGAGGAAGTTTGTTGACCCATCTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCATATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGA:1 + chr4 982736 5' + INE-1 299 1 73.27 GAATAAGCGTTGTTACTTTTTAAGTATAGGCAGACCAATGTTTTGACAATACAATTGCTGAAGCGGTTCAATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 9867516 5' - roo 404 1 74.26 TAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3R 22494719 5' - 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Stalker2 41 2 71.29 TTTAATGCACTCCCGTATTTTGAATAAGCTTAAAAATTAAGTGGTTAATATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 + chr2L 4888734 5' - BS 5069 1 51.49 ACTCCATAAATTATATGTGTGTCCAAGCGATGATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 25950087 5' - 412 7513 2 51.49 AATTGAATAAAAGCGGTCGCGATATAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr3L 3822445 5' + pogo 45 1 74.26 AAATATCAATCTTTCTGTGGCCACCACCACGATCAATAGCCGAATCAATCTGGCCGCATGAACGTCTCGATCTTAGGAGCTATAAAAGCAAGAATGTTTAG:1 - chrX 16540047 5' + INE-1 161 1 65.35 TTTTTTTATTTTTTTAATTGGGTGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGA:1 - chr3L 26029448 5' + accord 7140 2 77.23 GAGATGTTTGCATGTTGATGACGATGCCGATGGGCGCAGCTGCTAATTGGCCACGTTCACCTTACCTCCTCGAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTAT:1 + chr2R 20213342 5' + Tc1-2 1256 1 80.20 GGGGGAAAAGGAACTTAAGAACCGAATATTAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAGAA:1 - chr2L 15816723 5' + Porto1 4215 1 70.30 TTTACACATGGTTTAAGTTTCATTGGAACTTCAAATGGGCAATGCTACCCACTCGCTCGCTCTATCGCTCTTTCGCTC:1 + chr3L 3759873 5' + Cr1a 295 1 70.51 ACATTCCTGTTATCTTTCAATTCAACCATTTGAATTAGCTATTAGAAATCGTCATTGTGCTTATTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 - chr3R 25271754 5' - invader4 316 2 67.33 ATATTGCTTAGCCTTAAATNTTTATATATATGCAGTCCTTTGAACTCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr3L 8905708 5' + pogo 27 1 57.43 TGCTTTGCTTATCCCTTTTGGCCTTGGTCTGTTTACACTGTACCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAA:1 + chr3R 7727492 5' - 412 55 2 58.42 AAAGTAGGAGAGATGGTGAAAGAAAGGGGGGAGAAACGACGAGCAAAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAA:1 - chr2L 15830146 5' - flea 432 1 54.46 GTCATCGTTGGTGGTTTTCTCAGTACGAATTTTTCTCGGTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGG:1 + chr2L 3889501 5' - jockey 4684 1 61.39 TGCACGACAGATTTGCGCCTTGACCCCGACCAAATAAAAATAATAAGACTTCGACTAGGACACACAAACATGACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTC:1 + chr3R 22670869 5' + I-element 4978 1 74.26 GCTTTAATATGTTAAATTCAATATTTCAAAGAAGTCCGATGAAAAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGA:2 - chr3R 11498648 5' + BS 27 1 54.46 TGGGTAAGTGCTCAATTAAAAAATTTCAAAATAATAGTTCCGAATAGAACCACGTACAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 - chrX 19812443 5' + Transpac 4935 2 63.37 AGCTGATCTACCCTTTAGTTCCCCCCTATAGTTTCATGCCAAACGGAACCTACATTGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2R 11661076 5' + 1360 17 1 63.37 GTTAAAGCTCGATGATCTATAAAGTTGGCTGAAAAGAGTTGAATTTGTAAGTAATAAGTGTTATTTTTAAAACATAACAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 14213095 5' + G2 3076 1 51.02 GATCAGGTGCGGTCTGTCCGTCGGCTAGAAATTCACTGAACGGCGCTTCTACTGCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr2R 7025027 5' - P-element 2866 1 58.42 TTTTAGTTTTCCTTTTTAACTTAGCAGTGTTCTCTTCAAAAATATCCTTCGTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGAGCGATGGCTAACTATAGTTAGCTT:1 - chr3L 20267689 5' - X-element 4625 1 56.44 GGGCACTCATGACTAGAAAAAAATATATATTATTTCTTAACACAAATCCGATCAGTGGTGTTTACTTACAAGATACCTGGAATCACAAGGAGCCTTCATGC:1 - chr2R 22732919 5' + diver 5843 1 68.32 AGTCATTCAATTAACTTTTTTGCATTTTCTAACAGTGGTCACCGTTGTGACTAAATGCATGCATTTAATATTACATATATTAATCGACCGACTTTCAAAAA:1 + chr2R 16581820 5' + Transib-N1_DM 452 1 77.23 GTCGTCGGTGAACACTTATNAAAGCAAGGAATCACCTAAATAAGGTCGGGGTTCTACAAGCCAAGTCCCTAAGAAAAATTTCCTTGGTACATGAGAACCAG:1 - chrX 21157352 5' + jockey2 2998 1 23.76 TGTATGTATGTGCATACATATGGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCTATGTTGCTGTCTGTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTT:1 + chrX 2572440 5' - Stalker2 7541 2 75.25 AGTACTACTGTTTAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAGGATGCGTAACGTCCATAAATTGGTTTGGCACTATGAAGCCACTGTTTTGGTGACG:1 - chrX 10996564 5' - 1360 3335 1 75.26 ATGCTCTGGTTTACCCGTGAACTTTTTGCGCAGCTCCGGATCCTGGGTGGCAATGCCCACGGGACAGGTGTTCAAGTGTGTCCAGTCTGACGATATCAGAA:1 + chr3L 16791424 5' - Chimpo 83 1 75.25 ATTTTTCCGTTCACAATTGCGCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr2R 20461035 5' + hobo 24 1 55.45 ATGTTGTTGAACCAAACAAACACACACTTAAATATAGGTAACCATTTCATTTGACTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 8434335 5' + roo 21 2 58.00 TAAGCGACCGTTACATTTTTCAAGCTACCGTTACCACCAATCACCAGAATGTTTGGCTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr3R 15249824 5' + P-element 17 1 63.37 TACGAATATTCTATACCTAAAAGTTATTGATATTGTGAAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCG:1 + chr3R 26926812 5' + 1360 3173 1 61.46 GAAGGCCAAAAGGACTACTATGGCTCATCCTATCCACCGTATCCAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTACGGAGCATTGCCGGCTTCACAGCC:1 + chr3L 22358925 5' + baggins 5146 1 56.44 GGGACAGTTTGCTTTAAATGGTTTTGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGACTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 16806018 5' + 412 42 2 66.34 GATATCCTACTGGTGGAGCAACAAGTGTTTTGGCCAAGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTG:1 + chr3L 17823005 5' + F-element 453 1 60.61 AACAACAATTGCCATTGCACTTCAGCAACGAGCACTAAGTTCACTTTATTATTGCAAACTCGGCGAAGTCACTTCCTGTAAAATCCCCAATGAGAAGACTT:1 + chr2R 13358742 5' - roo 9068 1 76.24 TGAGCGTGGTGATCATGAAAACCATTAACCTTCCAGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chrX 22689201 5' + Transpac 4956 2 66.34 GCAAAGCTTAAAAAGAATTAACGCGAATAAGACAAGGACAAAGCAAGTGCTAAGATGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCA:1 + chrX 4869288 5' + P-element 447 1 59.41 ACAGGTTTCGGAAGGGTCCATCTCTTTGCCACTGTGACACTCGGTCTCCTGCAGATGCTCACCATCCAAGAAACAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chr3R 16613233 5' - 412 7546 2 78.22 CACATTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAACCTTCTGTTGCATTCCTTTGTATGTATGTGCATTTTTTTCATTGTTTTTTTATTTTTA:1 - chr3R 19447105 5' - transib2 2642 1 62.38 AAATTTCTATTACATCATTGTTACAATATTTGGTTTAATTCGATCAACCGTTTGAGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTG:1 - chr3L 23698099 5' - Bica 444 1 62.38 AATTAACGACGAGCGCACGCACACAGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3R 11278358 5' + hobo 2 1 68.32 AAATTGGGCGCCATTGGAAAATAGGTCCAGAAATTGTGGAAGAACTCCTGCGAGTCCTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 19513333 5' - roo 405 1 72.28 TAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGC:1 - chr2R 1949148 5' - Cr1a 4417 1 78.79 GCAAGGTTATAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTATAAAAATTATAATAGCATTTATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATT:2 + chrX 22576297 5' - Burdock 6320 2 66.34 GAAGGGGTCCTGTTGCTGTCCTGCCGCAATGGGCATCAAAGGCTGACTAGGTTATTTCATCTCCTTCTGCCCGCCTGTGGCTGCCCCAGTCGAACCTTGGG:1 + chrX 1868208 5' - Gypsy12A_LTR 421 1 56.44 GAAAATACATAAAAAAAAAAAGTTCGCAAAAATAAAAACCCGCAACCGAAACCTGCCTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGC:1 - chr2R 19213395 5' + Tirant 406 1 57.43 CACTCCTCGTCCTTTTTATCCAGCTCTCCTACAATCTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGTCTTTAAACGGTGCTAACTGTGCTGCAAGCGATGTTCGC:1 + chr2R 24282042 5' + Stalker 488 1 64.36 ATGCAAAGTCCTGGAAAATGAAATTTACATCATTTGTTTATTTGTATCGCTCATGTCCTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACA:1 + chr2R 14822367 5' + invader2 245 2 54.00 GTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 11257409 5' - 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flea 230 2 58.42 TGGTTTTTCTTCATTTGACGTACTCAAAGCACTCATACACACAAACACACACAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGT:1 + chr3L 5976309 5' - hopper 1395 1 59.41 AAAGTATAATTTTAAATAAATGTTAATGTTTTAATACTCATTACATAATGTATAGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr2R 5485971 5' - mdg1 7438 2 53.47 TTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chrX 10547679 5' - P-element 2837 1 30.00 ACAAATCAACAGAACTACCAGCTGCAGCTGGTGGAGTCACAAGTTTCATCACGAACACTATTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chrX 1762916 5' + jockey 4686 1 62.38 AAAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTAT:1 - chr2L 21570271 5' + Dm88 4370 2 71.29 GATATACCCGTTACTCGTAGAGGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATCAGGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATATCCGTC:1 + chr2R 5490289 5' + INE-1 110 1 78.22 TTTAAATAGTCCTCTCGCTGTCCTCGTTTGTCCCTCTCCCACTAAAATATATATATATATATATTTTTTTTTTGCCCTTTTAAACATACGAGTTAACTTAA:1 + chr3R 20490542 5' - HB 289 1 64.36 AGATGATGACGATGATGCGGATTGTGTGGGAATGCTTTAATAGAACTGAACTGTGTACATAACTTCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAG:1 - chrX 8538839 5' + frogger 2390 2 71.29 ATCCTTCGGGTAGTTCCTCCCCTTTGTGACTTCCACTTGCGATCCTCAAAGGTCTTATACGGGTAGGCTTACAATATTAAAAAGTATGAGATTAGTCTACT:1 - chr3R 31937932 5' - diver2 31 2 68.32 TGAAGTTAAATCACTTATTTCGTTTTGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATTCATTGCTCTGTAAAAGACATCT:1 + chr3L 5977388 5' + hopper 375 1 72.16 AGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2L 1136294 5' + 1360 5 2 74.00 GGCGAGAAGACAAAACAAGNGCTCAAATAAAGTGGGAGGTAGTACCCGAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCGTAAG:1 + chr3R 20199115 5' - Quasimodo 6961 2 50.50 ACCCAAGCACACCTATTATTAAGCGCACACAAACAGGACAAAGTGATTCTGCTATTGGAATAATGCAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chr3L 13367780 5' + mdg3 5261 1 70.30 AAAGAAGAAAGAGGGAGAANCAATTAGAAATGTTTGAAAAGTAATGGAAAAAATTGGATTATTTGAAAAAAAATGTCAATCTAAAGCTGGACGTGGGCAAA:1 - chr2R 13686652 5' - FB 101 1 77.23 TGATAGATAGCGTTCAGGTGGAGGAGCGATAGGTACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 6322592 5' + roo 42 2 66.34 ACTGCCGCTGTCACAGTTTCGCTTTTTGTTTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2R 13194633 5' + roo 44 2 71.29 GTAAACCTCAACAGCCTCTNCAATTCTTTGCCGTTCACAGACATTTGGCACTGAGTCAACTTTTCAGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3R 3525988 5' + Doc 22 1 46.53 GTACGCATATGCATGCCTCGTGCGAAGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTTGCAATCCCACCAGAGAACTGCAGACCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 22469134 5' - hobo 2917 1 46.53 TATCTAAGCCGCCATTTTTTGTGGTTGTAGAATCCTTTATCCTATATTTTTTTGTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chrX 4422676 5' + jockey 30 1 56.44 GAAACAGGGACAGGCGTCATTTTAGAGCGTAGCCTTTGAGTGTCTCTGGCCCCTTGGGTGAAAACCCTCAGCCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 + chr3R 21923980 5' - transib2 2821 1 76.24 AATATTTCAAAGAGCAATGGATGACATTCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:2 + chr3L 22231511 5' + Doc 53 1 77.23 GAAAGTTTTCCGGAAAAGAAGGCGAAATAAAAACCTTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr2L 10177795 5' + copia 4910 2 66.34 TGCACTACAAAATTTTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAA:1 + chrY 424991 5' - McClintock 450 2 57.43 TACAGTGCAGATGACACAAGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCACGCCTAACGGCCACAAGCCGCATATAACTGCCGCGACTTTTGAAAAATGTGTAGATC:1 - chr3L 22087354 5' + INE-1 262 1 74.26 TGGTCAGTATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCCTCTGTCTGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGACGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr4 571346 5' + INE-1 162 1 86.14 TTTTATACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 14586483 5' + Doc 44 1 71.29 AAATCAAATGCATAACAAATGGTGGATATTTCTTAGATGTTTTTTTATACAATTCACTTGTGAAGAGAGATTAAAATTTAACGCTTATACATAAGCCGATC:1 - chr3R 15587735 5' + Stalker4 7120 6 70.30 AACTGGACCGCAATCAAATAGGAAGCGAATTGCGTGACCAGTTCAAAGACATTGTCTTTGAAAAGCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACAT:1 + chr2L 22225107 5' + accord 191 2 67.33 GGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 4571528 5' - hobo 2907 1 60.00 GCAAACAGCGTTTTGTCCGCAGGCTCCCGGGCAGGGATCGCGACACTTTTGGTTGATACACGCCAGCTGACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTAT:1 + chr2L 4510554 5' + opus 7407 2 71.29 GAGGTTAGCGTCGATACTGTTGGCGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAA:1 + chr3R 13274428 5' - Doc 152 1 76.00 ACCAATGCCGGCTGACAGGCTGGAAAATCAGCAGCCGGCGGTGCCAACAAAAGCTAGATTGCTGGCCTTTTAATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTT:1 - chr3R 7385855 5' - HMS-Beagle2 7198 1 72.28 TTTATTTATATTGTTAGTTCTCGATTTATAGTTGGAATGGGATTTATATAATCACAAAGGTGTCTTAAAGAACACAAAAATGTATGTATTTATATTAGTAT:1 - chrX 19088904 5' + 1731 4415 1 57.43 TAATGCGCCTTAATTAAAACAAAACTCTCCCTACCCGCCGTAGGTAGGCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACA:1 - chr3L 13597273 5' + 412 7255 2 52.48 GACGAAGACAAGAGGCCCTAAATCTTACAGATACTTCAAAATCAGCCTATACCAGCAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr3L 5808151 5' + 297 16 2 64.36 AATAACGGCAGTGTTTGTTGCAATTACAGTTTGCAAGAGTTGCCTGGTGAAGCACCTGGAGGAGAAGAAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGC:1 + chr3L 16588991 5' + Doc 444 1 70.30 ATACACCATATATCCAAAATTTTCAAGTGAAATACCTCAAGTATTTTCAGAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr3R 20599680 5' - opus 474 2 55.45 GCTGTCACAGTTTCGCTTTTTGTTTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2R 13194639 5' + roo 50 2 77.23 AATTCAGGCGAGCGACCTCCTAAGATGTTTTTCTCGAGTCAGTTGCCATTTCCATTGCCCTCCTATTAAGAACACCAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr2R 19557535 5' - 412 7514 2 63.37 GGGATTTGAAATAAATGTTAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 + chr3L 22112601 5' + Doc 5 1 79.21 GGTTTCACTCCTTTCTGCTGATCAATAAAACGGAAGCTAAATCAATTAGCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr3R 25514105 5' - hopper 1390 1 51.49 TTATCCTTTAAAGTGGATTCAAATGAGCACTTCAAGGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTA:1 - chr3L 12634237 5' + BS 5016 1 58.42 ATAGAAAGTTTCACCCCGAAAATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 + chrY 3572884 5' + Transpac 50 2 76.24 GCTGGAGCAGCAAACAGAAGACAGAAACTGGAAGTCAAAATAAAAATGTGTGGTAAAGTGAAAAAGCCAAAGGAAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2R 13358867 5' + roo 4 2 75.25 TTACTGCAGCAGCAGCGGAGATAGCGGCGAGGCAACTGGTTTGTCGTTGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTT:1 - chr3L 17528452 5' - BS 4717 1 53.47 ATAATTATTATCCCTCTAATATATTTCTTGATATTCTCTAATTACAGTTTTAAGTAAACACATCAGTTATTAGTTTTTGGCACAAATCATTTCTGACTCCA:1 - chr2L 15266046 5' - transib3 408 1 62.38 AACAGCAGCAGCGGCTTTAATGCCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTC:1 - chr3R 9613472 5' - invader3 5408 2 76.24 ACAAATTGCATTCAATATTTCTTTGTACTGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 - chr3R 17615994 5' - HMS-Beagle 6998 2 71.29 ATTAGTCAGACTCGCAAGTNTATAACCTAGTTACAAAACATTCTTCACAGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACG:1 + chr2L 16132521 5' + GATE 8274 2 51.49 GGAGAATAGTTGAGGTGCGTGCTTTGTTGTGTGCCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2L 3766301 5' + hobo 42 1 69.31 AGGCGCTCTGCGGTTTGACAGCCGCCCGCCTGCAGCCTCTCTCGTTGCTTTGGTGTGCGTGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 13557136 5' + hobo 18 1 60.40 AAGTATGCTTTAAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2R 18807823 5' + jockey 29 1 55.10 TATAAATACCTGGATAAAGGTAAACATGATTTTTGGGATTTCCCCTTTTTGGTCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACT:1 - chr2L 12199552 5' + Stalker2 7248 1 75.25 GCTCACCAAATATATTCACTTTATGTCGCCCTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACT:1 + chr2R 9809696 5' + 412 464 2 70.30 AAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1 + chr3L 11257354 5' + 1360 3380 2 48.51 ATTATGTCCAAGTCAACGTTGAGAGTTGAGAGACAAGCGCCAGTTGCCACAGAGTTTTTTTCGTTTTTTTTTTTCAACTCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 6481541 5' + FB 175 1 81.32 TAAGTTGAAAAACGGAATCNATTATCTCTTTTATTATTTAAACATCAAATGCAAATGCAGTGCAATCAACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 - chr3L 18928933 5' + mdg1 7046 2 66.67 AACTTTTTCAATTCGCCGCGGCAACACCTACAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 15527068 5' + pogo 18 1 59.41 AGTTCATGGGTCGCCGGCTATTTTCTTGATGATCTTTCTGATGAGCTGCTGCTGTGCTTTTTTTGGGGGGGGGCTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGG:1 + chr2L 4807048 5' - Doc 475 1 77.00 AAAATGCCATTAAATGTGTAGCCTTTGAAGGATTTGTAATGATGAACTCTTATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 + chr3L 6084374 5' - 412 7501 2 67.33 AACCGCATACGGATAAAGGTGCTCAAGGACATTTCGGCCACCGCAGCGCACACAGCACACCATCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chrX 7759052 5' + hobo 11 1 68.32 AAATGTTAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr3L 22112613 5' + Doc 17 1 67.33 ATAGCCTCTTGCTTCATCAGTGGCGCCTTCATCAGGGCCGTAAAGACATTGGATTGGCCACTTCAAAGTCCAGACCTCGACATAATAGAAAACCTGTGATC:1 + chrX 11867995 5' + Tc1-2 1182 1 62.38 TTTTGATAATGATTATTGATTCGTGGACAGACATTGTGTGGGGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGG:1 + chr3R 14168227 5' - I-element 4903 1 60.22 ACCTTGAACTTCGTTCTTAAAATACGTTATATCTTGTATATGCATTTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr3R 19931683 5' + jockey 4699 1 53.47 TACAATTGTTGACTCGATGTTCAGACGGACGGACAGATAAATGGATAAAAAATACGTAAACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 16200040 5' + roo 15 2 65.35 GCGCTCTCAAAAACGAAAANCTTGTTTAGCCGCCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3R 25208339 5' - P-element 2842 1 35.64 TCGCCATCAGCACCAGCATCTCATTGTGCAAATTAAACTAATTATGTTGGAGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTATCCGGGAGGC:1 - chr2R 11820954 5' - gypsy6 337 2 70.30 ACCAAGCCAGCATCAGTCAAATCATCTACAGCGACACCCGCGCCAGCTCCTCCGACAGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCT:1 - chrX 2712490 5' + McClintock 70 2 61.39 GGTGAAGATGAATTAGTAATACTATTGTATTAAATATAACATTAAATATATTTACAAATTTACAAGGATGTATCTTTTACATATTTCAATATTTATTAGAT:1 - chr2R 14434642 5' - Penelope 153 1 77.23 AAGCTTTGGCTGTTAATTAAAAACTCCAAGGGGCCATTAAAAGTAGATTGCAGTGTGTTATGGAAATATGTATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 6058266 5' + roo 5 2 72.28 AACTGACATGCACAAGAAAGCCGCAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTA:1 + chr3R 4607304 5' - Stalker 6914 4 76.24 AAAGCTATGCAGTCCAAAGAAGGATTGCATATTTTCAGGCGGTCTGAAAAAATAAGCAGCAATGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr2L 2288457 5' - hobo 2930 1 68.32 ATCAAATAAACTGCCAGAACTTGTGTTGCGCAGGCAATAAATTCTCAAGCTATTCCTCCTCTTCTAGAACTTCCTCCTCCTTTCGAAAATATTAATTTGCT:1 + chr3R 20726017 5' + Gypsy12A_LTR 2050 1 69.31 ATCCATCTAGGCAAAGACATGCCGCATTAAAATTGACAGTCAACAAATCATTTTTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCAC:1 + chr2R 19092129 5' - Cr1a 245 1 63.37 AAAAATAATACGGAAGATTAAGTGAGAGAGGCGTTTGCGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr2R 18988426 5' - hobo 2901 1 59.41 TTTTGAAAAACATATAGATNTGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGC:1 - chr3L 20224214 5' + Chimpo 35 1 64.29 TACAGACAGTAATGAATAAGATTGAACGTTCTTGCGACAAAAGAATATAGGATTTATAATAAAAAATCGGAGAAAGCAAATTAATATATTCGGAAGAAAAG:1 + chr2R 5580522 5' - Gypsy12A_LTR 2045 1 90.10 AGATTTAACATATCAAGTGGGTGGCAAAGTTTGCATTTCCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 - chr2L 20609965 5' + copia 4906 2 62.38 ATCCTGGCCACCGATACGAGGGCGGCGGGGGCGATACGGGCTATGTCTACTAGAATACTACTACGCTTTTAGCTTGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGG:1 - chr3R 14627608 5' + Rt1b 4890 1 54.00 TAAAGCTCTACAGCTCTGCCTGCGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTG:1 + chr3R 22515776 5' - R1A1-element 377 1 78.22 AGCGAGTAGGCTATTATTAACTACATTTTCTGGCATATCATATTCGAAATTTTTTCAGGATCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCA:1 - chr3L 27858750 5' - TLD2_LTR 188 1 80.21 ATAGATTTTTTATTGCACTGCAGGAATCAATAGGTATAGTGATATTTAATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2L 20396917 5' + Transpac 24 2 56.44 AAACTGATGGAAGATAATCTACTTGAAGCATACTTTAAGGCGTATCTAACGGTCCTTTTAATGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chrX 12378666 5' - hobo 2930 1 68.00 GTTGAATGTGGGCGTATGGAAGTGGGATGAAGTGGGATGAAGTGATGGGGAAAGGGTAGAAAGGGAGAGCAAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCT:1 + chrX 14669741 5' + Doc 375 1 49.50 TACAGGACAAGCTATGATCGCAACTCGCAGGACATTCGGATCGTCCACAAATTGAACCATTTGGTTATCGTTTTGCATCTATCGTATTTCTGTCTACAGTA:1 + chrX 13004565 5' + Circe 95 1 62.38 TATCTAGAAATTCCTGACGACTCTCCCAATTCAATGTGCCTTCAACTTTGCAAAACATAAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCA:1 - chr3R 30604224 5' - F-element 4236 1 61.39 ACGCCTTTGTTACATTAAATGCAAACAAATGACAGAAATATTCCCCCTTTTCTCCCCGCAAAAAAAAAAACCAATTAAATT:1 + chr3L 13701811 5' + transib2 2644 1 58.02 GCACTTTCTGCAACGGGCTTACCAGCCAATTTGTGTTCTTATAGTATGTGCATGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGT:1 + chrX 16085836 5' - Tirant 8480 2 53.47 TTCCTAATCGTTTTATTCGGTCTGGTTGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACAT:1 - chr3L 7942342 5' - Doc 245 1 73.00 AAGAAACTTGTTGTATCCTTAGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 17758972 5' + roo 54 2 80.20 AAGCTACCGTTACCACCAATCACCAGAATGTTTGGCTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr3R 15249845 5' + P-element 38 1 42.57 AGATCGTAACTATGTGAAATTAAACAATAATAAAAGTTACAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 3475270 5' + roo 8699 2 68.32 GTCCGTTAAGCGGATTTAAAATGCAATCTGCCAATCGCCGCCTATCCCCATCCCTCTCTCGCCCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 5206636 5' - roo 395 1 65.35 AAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3R 26434163 5' + hobo 49 1 73.27 TTTTAAACTTTGCTGGTTTAAACTTTGCTGGTGGTTTAACTTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAAT:1 + chr2R 25286854 5' - TAHRE 10393 1 76.24 GAATGTTTGCGATTTTTATCTTGCTGCCGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 + chrX 7534647 5' - Tirant 8462 2 70.30 TTGGCCAATTTTTTGGCGTCTGCGCAATCCATAAGAGGGCATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGC:1 + chr3R 9613433 5' + invader3 5224 2 59.41 TAAATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chrX 3649750 5' + jockey 24 1 70.30 TCATATATATTTATTCTTAATCTTACTGCATTTGTGATACTCAGAATCTAGAGTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:2 - chr2R 7132575 5' - opus 7483 2 61.39 GTCGAGCTTTTCGAGGCCATCGAGCACAGTGCCCGAGATGAGATACTGTCCTGCGGCGGATCACGTCCGCACTTCCCGGCATCTCGCAAGCAACTCC:1 - chr2R 14930486 5' - Bica 28 1 67.01 AAATGTAAAAAAATATTCAAAAATATTTCTCAGAGATTAAAGTCAAACGAAATATTATCAATAAATATTTTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATGG:1 - chr3L 20467292 5' + FB 364 1 71.29 AACCAACTTAAAGTGAGCTTCATTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTTGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chrX 15412700 5' + hobo 55 1 76.24 TAAATGTTTTGATTTTAGACTCTTAGTTAGTATAACTCGTATTCTCATGGACCATTTCACATCATACTTGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGAAATTCGAC:1 - chr2L 19764880 5' + INE-1 561 1 68.32 AAGCTTAAGCGACCGTTACATTTTTCAAGCTACCGTTACCACCAATCACCAGAATGTTTGGCTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 + chr3R 15249819 5' + P-element 12 1 68.32 GTTTCCGCCAGACGCCAAATACTTTAAAATGGCAGCCTTACCCGGCGTATGCGTAATGCGTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGT:1 + chr2R 8314870 5' - Quasimodo 188 2 67.00 GCATAAACGTCGCTAGTTGTTATGGGAAATGTAAATGTATCTCATAGATACACAAGTTACAAGTTGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGT:1 - chr3L 11657927 5' + Tabor 6850 2 68.32 GGAAGTTGCCGGCAAAGATCTGTAGTCATCAATAAACCATCCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTT:1 - chr2R 19192384 5' + G6 1969 1 60.40 GAGGTATTTTTCGTTTGTTTCTAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 + chr2R 20588789 5' + Tabor 56 2 77.23 AGCGACTAAAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCC:1 + chr3R 821128 5' + gypsy5 6943 2 74.49 GCTCTATATGGACGTCTGGCTAGAATGCCGATATGATATTATATGATATGATCTTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGAT:1 - chr2R 7710268 5' - R2-element 3216 1 59.41 ATTAAATAGCTAGTTAACATACAAGCTAATAGAAATTTATATATAAATTTAATTACACGTTATAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAA:1 - chr3L 20490749 5' + FB 11 1 64.36 TTTGAGTTTGAGTTTGAGTTTTGACTTTTGCTGGGTGCGTGGTGCCTGCTTTATGTATAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chrX 14324761 5' + 297 6591 2 69.31 ATCACAATATAGAATTGTATGCTAAATAACACGGAATGACCTGAATTATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGA:1 - chrX 11171017 5' + invader3 32 2 55.45 TAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTC:1 - chr4 1271901 5' - 1360 74 1 75.25 AAATTTCAAGCTTCATAAGTTATGAATACAGTGGATCAGATAAGTTTCACTGTACGCGGCGGGGGTAAAATTCTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chrX 15268334 5' + roo 8667 2 72.28 ATTTGTCCTTTACTTGTATTCATATTCAGCGTGTGTCTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGAGGGTGCTCTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGAGG:1 + chrX 12838574 5' + Stalker 448 1 75.25 ACCTCCCTCCTCATCGTGCCTTCTCTGTCTCCACAGCACTCGTGCTGTCTCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2R 8385185 5' + hobo 27 1 50.00 AATGGTTTATCTGAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:1 - chr2L 2309443 5' + Burdock 44 2 72.28 ATAGAAATAGCAATGCGGCGGCTCTCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - chr3R 28728699 5' - hobo 2888 1 73.27 AGTACAAATGTGTATTTCAATTCAACTGAGTTCAATTTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTT:1 + chrX 14900888 5' + 1360 246 1 65.35 TTAGTTGCAATTGACCTGTCATATCTTTTACTACATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 23683384 5' + 297 6617 2 70.30 GTGGCAACATTCGCGTAGCACTTCTTGTTTTAATTTCATTGTTTTATAGAGACCCAGTGTTTAGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAGTGGCGG:1 - chr2L 3027313 5' + hobo 2924 1 53.85 GGTTTAAACTTTACGGCTTTAGGTGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATATCGTGCAGT:1 - chr2R 22418460 5' - Doc3-element 407 1 75.27 ATCCCAAATTCAAAGTTTAAAACCCCGAAGCAACGCATTTATTTATTAATATAGAAATTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAAT:1 - chr3L 21912352 5' - Bari1 1693 1 65.35 TTACTATCCAAAGAATAGTNACATTTTGGGTCAAGGCTTAGGCGGCAACTCCGACAGCTACAACGGCAGTTCCCCACACCTGGATGGCATAACTCCACGTT:1 + chr2R 12919093 5' - G5 4380 1 71.29 GAACAAACTAGATACTCAATTGGATTAGTACTACTGTTTAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chrX 10996590 5' - 1360 3357 1 60.40 GCTCAAGCGTGTGAAAATACCAGAAAGACGTGTTGCTATCAAATGGTTCGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chrX 1713972 5' + hobo 27 1 55.45 TACAGCCCGCCTACTTTGCAAAAAAAAAAATTATGACGTCCTTTTCTATTTTATTATTCGTTTTCCCTTTTTTTTATTTTTTATAAATAAATCAAATAAAA:1 - chr3L 950815 5' + G7 1144 2 83.17 GTTTGGGGTTTCAAGAAGATAGGAACTTATCCTTTATATCCTTTTATCTTTTACAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 24169990 5' + roo 8686 2 56.44 ATCAGTTGCTTTATATTCANATAATTATAAAACCAATCACAAGATAGACATGTCTGAGTGGAGAGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAG:1 - chr3L 5573098 5' - opus 83 2 67.33 ACTTAATCAACGGTGCGAGCAACGTGGCGTATACGCAATGCGAGCAGAAAATATCCTTGAAACGCTGGGCTGGGTTGGTCGTTCCGGTGTAGTCGGCTTTC:1 + chr2L 15640139 5' - Doc3-element 4567 1 69.31 TGATGTTCTTATCAGCATTNATAGTTGCCAATTCTGAGAAAGTTGTAAGACTAGATTTTTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr3R 20872675 5' - copia 256 1 77.23 GTAACACCAAATACGTCTCTAAATATACCGTTTATATGGTAGCTTTTACGACCAATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATT:1 + chr3L 482510 5' + copia 4671 1 53.47 TTTCAATTCAACCATTTGAATTAGCTATTAGAAATCGTCATTGTGCTTATTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 - chr3R 25271740 5' - invader4 302 2 53.47 GGGCGGTGATAAATGTGAGTCATTTTATAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:1 - chr2L 12199502 5' + Stalker2 7297 2 75.00 ACACTCGGCGGCATAGCCACAAGAACCAGGACAGGGATCTATACACTTCTCCCGTATGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATAC:1 + chr2L 4512750 5' - accord2 7573 2 59.00 TTTGTGTGCGTATGCGTGTGTGTGTGTGCGTTTAGAGTGTGTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chrX 10649323 5' + hobo 36 1 62.38 TTTGAATAACAACATTAGATTGATAGCTGCTCATGATTAAAGTGTCTGTTGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCG:1 - chr2L 14416503 5' + Rt1a 4729 1 52.00 ATTGGGCAGCATGAATAATATTCGCTTGGGAGATGGGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr3R 25378608 5' + jockey 61 1 75.27 TAAGATAAAATGATTTATTCCCCTCTTAACTTAACCCACACACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCCGGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chrX 6135679 5' + I-element 52 1 61.39 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTT:1 + chr2L 20360644 5' - R1A1-element 146 1 72.45 TAAGCTATGGATTTATAAAAACAATTGAATTCGATTCGCAGTGGTCGCTAGGAATTTCTTCCCGATGTTCCTTTTGCTATTATGCGTGTTCATATTTATTG:1 + chrX 413380 5' + micropia 155 2 57.43 ACGGTACGGTGATATGATGGAATTGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCT:1 + chr3R 5773171 5' + Stalker4 5 4 54.24 AAGATGGCACAGAGTGACAATAAACTAACTTTCTTTGTGGGTGAAATTCGTAAAGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 18769566 5' + roo 22 2 53.47 TAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCT:1 + chr2L 23299976 5' + invader4 343 3 55.45 TGTTTTGCGGCTTCGAATTAAGTATACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 14980568 5' + 412 12 2 68.32 ACTCAAAAAATTGTAAATTATAAGCTATTTTTGGCTAACTACCACACCCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chrX 5194574 5' + hobo 31 1 57.43 AGCAGGTGACCCTGAAATTCAAGCTTGATCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:2 + chr2R 18105765 5' - roo 360 2 73.27 GGGGGGGGTGCGTGGCAATCTGGGGAGCTGTGCCAGCTGAAAACTGATAGAAATTTACACGACTAATAAAATTATGAAAAAATATCAACACATTTTTCAAA:1 + chrX 6215096 5' - INE-1 265 1 61.39 ACAAATAATTTTCGCGTCCTAACCACTGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATG:1 + chr2R 7173645 5' + mdg1 7089 2 75.25 TGTATTTCCGCTTTTCTTTTCAAAACACACAAACTCGTCAACGGCTCAACAATTGTAACTGTTCATTGGCTGAGCGTTTTATATTATTTTTGATTAATTAG:1 - chrX 2641637 5' + 1360 257 1 71.29 ATTATTTAAAACTTTTAAGGGAAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:2 - chr2R 2078156 5' + jockey 61 1 77.23 AAATCCAATCGATAGTTTCCTGCAGTGTTGCCGCATGTGTTATCGCGCTGCCATGACCATCATTGGTTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCA:1 + chr2L 21708311 5' - invader4 321 2 72.28 TATAGCTAAACTTCTTAAAATAAATTTTTATCTGAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 11009556 5' - roo 9030 1 72.28 ACTTTATATCTTATTGTTCCTATAAATTTTGTGAATTTCTTCAAGACGGTTCTTAACGTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTTGAAGTTCATACGGAC:1 - chrX 20831333 5' - INE-1 133 1 49.50 TGGAAGGCTGCGGAAAAGTTAGGGAGGTGTGTGTTTGTTTGCGTAGTTCGAGAACGAGAATCTGCCGCTCAACTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCAACT:1 - chr3L 11195483 5' + gypsy7 5011 2 59.41 AGGGGAGAACTGGAATAGCTCCATATAAGTTTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCA:1 + chr2L 21282429 5' - jockey 4771 1 70.30 AATGCGAGCTTTCGAGGTCATTAAGTTGAACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAG:1 - chr3L 3328991 5' + G2 2657 1 55.45 ATAATTACTTATATATGGTATATATAAGGTAGTAATTTAATGGACGATATTAAATACATGAAATGAAAAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGT:1 - chr2R 15196356 5' - P-element 2757 1 71.29 AATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr2R 11661138 5' - 1360 3339 1 79.80 TTTAGCTATAGCCGCGACTACTACATCAACAATGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTG:1 + chr2R 7648578 5' - P-element 176 1 41.58 GGATACCTTTTGCCAAATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3R 30611320 5' + blood 7030 2 61.39 GAATGCCAGGCCCCACCCATCGAACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGCCGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3R 28303021 5' + 297 3 2 75.25 TATTTTTCTGTATATCCGCGCTAGGCGAGAATACTAGGCAGTTGTAATTATAACTTTCCTATACAACTTTTATGGACACCACGCCAGTAGGTACCACACGG:1 + chr2L 11749760 5' + baggins 7 1 55.45 AGATGTGTACAAAAATTATTATTAAAAGAAGAAAACAAATTTTTAATTAGCAACAATTTGATAGTTATGTAGCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTAC:1 - chr2L 14038485 5' - 3S18 334 2 77.23 GATGGAAGTAGGTGCTCTAACGAATTGTTGTAAATGTTGGGCTTTTAGCTCTTCGGAGGCTGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 13433988 5' + hobo 14 1 65.35 AAAATTACAAGCGAAATAGCGTTAAAAACAGAGCGAACGTTTTAGTCGCGTTTCTCGACTATGTAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCATTAGCCGAG:1 - chr2L 21266551 5' + INE-1 90 1 59.41 GAGCAGTGACAACATGGGCGATGGACTGGACAGCAAGTCAAAGGAGCTAATTCGGTTCCAGGACTGCCTCATTTCCTTTTCCGTTGCCGAGTAGTTCCTCT:1 - chr2R 20267499 5' - Osvaldo 38 1 76.24 GGCTTTTCCGACATTATTTTCACTTTGAGAATATCGTGGATGTGTCGACGTAAATCATAATAATTTTTTTTTCTCCTTATCTTTACAATCTGTCTTAAAAA:1 - chrX 20385833 5' - G4 3831 1 55.45 ATGCTGCTGGAAGTGTCGCTGGAAGTGCGGCAAATGCTGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr3R 30252283 5' - 412 457 2 61.39 GACATTGGTACTAAAAATCAAAGAGGAATATTTTATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTAT:1 - chr3L 22112897 5' + diver 5931 2 64.36 AAGTGTGGTGCATAGTTCACGGCATATTTGCTGATATTAAATCTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chrX 18160939 5' + 297 18 2 62.38 AGTTTGCGTTGCGGCGACTAACGTTGTTGGCTCAAATTATTTCCGTATTTTAGCATTAAATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 11758448 5' + roo 16 2 60.40 TACGATGCTTGCTGGCGAATCCAATAAGTTAATGACTTCACACATATAATACGAATTCTAAACTTTCATATTTGCGGAAACAAGCGGACAGATCGGAAGAG:1 + chr3L 9700643 5' - mariner2 571 1 56.44 ACCAGTTGACCCTGGGACCCATCTGGTGATGGTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACG:1 - chr3L 6866229 5' - 412 7502 2 68.32 AAAGACCATCGAACATGTATGCACACGGCTAATCACAATAATTATTGTGATGCGCGTGCTGTTTATTGCAAATATTTTCTGCAACTAATCTCCAAATGCGT:1 - chr3L 21418462 5' - looper1 143 1 66.34 AAGACTTTCTAAGTCAACTTGTCATTGTCCATCCGACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGG:1 - chrX 14133122 5' - Quasimodo 198 2 65.35 AAGTCCATGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 - chr3R 3320512 5' + 1360 40 1 81.19 TGATGGGTTTTGTTGTGCTAATGATAAATCTAATCTAAACCGTAAAATCCGTAGTAAAAAGATCTAGAAATCAAGGTCTCGTACTCGGGTTTTCTTTGAAA:1 - chr3R 4830715 5' + gypsy10 434 1 62.38 ATAATATTTAAATCTTTTTTCTTATATTTCGTGTGTCCGCTTTACATATCGAAAAAATCGTAAAAAAAACCGAATAATAATTAATAATTAATTTTATA:1 - chr2L 22249215 5' - Tc3 262 1 73.47 ATTGCATTTTGCAGTTACTCAAATTTGCATATCATTCCATTCCGAAAACTAAACTAAAACTAAATAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTAC:1 - chr3R 30674668 5' - invader2 5048 2 67.33 AAAAAAGGGTTGATTGATAATGAGTATAATCAAAGTTGTGGACTTCAAAGCGTGCTTTCTCCTATCGCGCTATCTCTAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 3512194 5' + G-element 4323 1 74.47 ATTGTTGTATTTGATATTTATCAATTGTGGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2L 8267347 5' + jockey 4718 1 77.23 ATTGTTTAGAAATATCTAGTAGTTCGCTGGCATCAAATTGATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 + chr3R 25271661 5' + invader4 31 2 54.46 ATGCTTTAATATGTTAAATTCAATATTTCAAAGAAGTCCGATGAAAAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 - chr3R 11498650 5' + BS 25 1 52.48 TGTCCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATG:1 + chr3L 16792555 5' + Chimpo 4046 1 64.36 GTGTAATTTTATAGAGAACACGCATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3L 25120184 5' + pogo 48 1 79.21 GTATATTATGTACTTGGTGTGCTTAAGTATTCCCATTTTCCGTTATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 - chr3R 6609782 5' + Transpac 28 2 56.44 GCACACTGCCAAGAATGTGTGCTAAATAGCTAATACGAAGCTTTATTTGAATACATACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAAT:1 + chr2L 20086467 5' + Quasimodo 74 2 62.38 GATCTTATGCAGCACCTGCTTTTCATGGTCGTGTCGATGTGCAATCTGCTTATGTCGTAGACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAGCTATTTTGGC:1 - chr2L 8179932 5' - Bari1 454 1 59.41 AAGGACCTGCTCGCAAATCTCCGAACCTCGAATATTGCTGGCTGTCCACCGGTCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACA:1 - chr2L 10285379 5' + Doc 354 1 53.47 TGAAGATATTGACTGCGGCAAGACCTTCACTGTGATGATGTCCTGGCTATTGTTTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAA:1 - chr3L 13379354 5' - Bica 4490 1 57.43 GATACTTTTCCTGATACTTNCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 - chr3R 7869179 5' - 297 353 2 70.30 GGAAGTGGAAGAGCGAACATCGACTGGAGCACTTGCCATTAGAAATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTC:1 - chr2R 23215128 5' - F-element 4397 1 56.44 AAATTTTATTCAGCACATGCGCCTAGGAATCCAGGGCTGGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCA:1 - chrX 13258993 5' - jockey 110 1 61.39 TATGGATATTTTATAAGGCGGTTCCGTATGTAAATAGTTTACACGCAGAGAATAAATTGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGT:1 + chr3R 10361116 5' + Stalker4 279 4 62.38 ACGCTGGGCAGGATTGCTCNGGAATGTGCGGATTTATTTTGTATGTTAGTTTCAGTTTCAAATAATCATTTATTTTAAACGATCGCTTGCGATCTACAAAA:1 + chrX 10854764 5' + HMS-Beagle2 7165 2 66.34 CGTGTGTACCATGCCTGCACCATGCTGAGTCTGCTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2L 17549306 5' - mdg1 7416 2 66.34 GCTACAAAGAATAACAGAAAGGACGAGAAATCGAATCAAAAGAAATTGTTAACTAAATTCAAAATATCGTTGGAGTTCGTGGCATATACCAACAACACGCC:1 - chr2R 9312407 5' - accord2 302 1 56.44 AATAACGCAGCTGTACCATTTCAAGAACTTCATATTTTATATATCTGAAAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 19513437 5' + roo 26 2 58.42 TAGGTAAACACTTGCGAAATGAATTAACTTTAAGCCGCAAAATTTGTACTCTTGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2R 23122639 5' + hobo 24 1 55.45 AGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr3L 10683489 5' + opus 55 4 81.19 AATTTATGTATTAATATTATTATGTATTAATCTCTTAATGAAGGTTCGATTGTTATGTAGTTTTCACATATGTAGATAGATAAAATATATACTTACACTTT:1 - chr2L 17759471 5' - TART-B 10440 2 49.50 ATAGTGTCACACTAATAAAGTATTCTTTGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTAGGAAATA:1 + chr3R 14601807 5' - roo 9025 2 70.30 TAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACG:1 + chr2R 11575010 5' - INE-1 144 1 56.44 GTAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 7494046 5' - roo 358 2 72.28 AAAAAAGCAAAACAATTTGTTGGCACTTATATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 16127780 5' - roo 9050 2 57.43 TATTTTCAAATAATAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 4826127 5' + 1360 63 1 68.32 TGAAAGCGAAAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr3R 28628124 5' - 1360 3349 1 69.00 TGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGG:1 - chr3R 3320505 5' + 1360 47 1 74.26 TATTTTTCTGCACATGGACGGGGTTTGGGCCTAATCTACCCTCTTGTTGGGTTTCACATGAAATTTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr3R 20284704 5' - pogo 2093 1 71.29 TACTGCCTGGAATCGCTTAACTCAGAGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr2R 11403956 5' - mdg1 370 2 74.26 TGCTGGAGCAGAAGTGCCATCGTGATAACTTCATAACTTAACGCATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 + chr2L 8879887 5' - I-element 5327 1 55.45 AGAAAGAAAGTACTGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr3R 15117605 5' - roo 9038 1 54.46 TTATAATCTATAAACTATAAGCAAAATGACGACCTTAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGTTAAACCAGCACTCAAGTAGATATCATGACAGGTTGGAGC:1 - chr3R 21820187 5' + X-element 4413 1 70.00 TTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAA:1 + chrY 425005 5' - McClintock 6388 2 71.29 GCTCAAGGACATTTCGGCCACCGCAGCGCACACAGCACACCATCCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 7759072 5' + hobo 31 1 56.44 AATCTCCTCAAGCGTTTCGTCAATCACTTTCATGGCCAAAAGACAAGAAAAACAAGAAAAAAAAA:1 + chr3R 12155022 5' + Porto1 159 1 66.15 AATTAGCAAAAACAAAAAATAAAACGAAGAAAAATTTAAAAATTTATCAAAAGTGTCGCCGTGATAGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTA:1 + chrX 16750490 5' + Circe 7135 1 33.33 GCATTCAAGAGCAAAGAGGTTTGAAGGATGTTTAATAAAAAAAGTGTATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTT:1 + chrX 973234 5' - R2-element 256 1 54.46 AATTCCATAATTCATTTAAATAAAAATACAAAAATATATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAG:1 - chr3R 5333195 5' - jockey 4767 1 63.27 TATACCTTGCCGATCGAAAAGGAATACCGTACACCTTTTTAATAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 + chr3R 4536163 5' + Ivk 9 1 70.30 TAATTTTGAATTTTTTATTTTTATTATTTTTTTTCTCCCAATTTCCACCGATATTCCAAAAAAATATTAAAATGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTAC:1 + chrX 15903282 5' + INE-1 555 1 80.20 GGGTTGGGTGTGTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3L 6866174 5' + 412 34 2 58.42 ACACAAAACTGAGTGGCATGCCCCTCCGAATGAATTCCGATCGATGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTA:1 + chr3R 19786460 5' - 1360 3212 1 56.44 TAACATATCAAGAGATTATGCTGCTTATTCCCCCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTAT:1 - chr2R 5076112 5' + Tc1 1618 1 56.58 TATTTTTGAAATTTGTCATAAATTCAGCTAAAAATATAATATAATAACCATTATATTCTGTCAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 19594580 5' - roo 397 1 66.34 TTGACTACTGCCTGGATTTCTGGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTT:1 + chr2R 13270149 5' - Quasimodo 286 2 77.32 AAAAATGGTTTAATCAAACCTAATAGCATAATCATCTATCGTCATGCTTAATCTTAACCTTCTACCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGGCGTTCATACGGA:1 - chr3L 22724102 5' - INE-1 134 1 57.43 GAGCATTCGAATGTACAAAAAAAAAAATTTTAAAAAA:1 + chrX 12441573 5' - FB 174 1 78.38 ATGCAAACATTTCGCGGATCGGAAAATCCTGAGAACTGTGGCTATTTATCTTCTTATTAGAGCTTAATGTACATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 - chr3L 19630210 5' + FB 6 1 75.25 AGATACCGAAAAACAATATGAATGATTTGAATTATCCATGGACAAATATATAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTT:1 - chr3L 153491 5' - flea 460 1 57.43 GTATGGGGGTGACAAAAAAAAAAGAAGGAAAAACA:1 - chr3R 10108639 5' + Doc2-element 230 1 88.57 GTCCGAGGAGGGCCATGAACATGTCAGCAAGCCATGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTG:1 + chr2R 9497758 5' - Stalker4 7320 2 70.30 AACATTTTTAGCGTAATTCAAATACCTGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr3R 10229401 5' - copia 240 1 71.29 AATCCAGCCAAGAAATTGTGCAGATTTAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3R 31962068 5' + Doc 53 1 71.29 AATTCGCCGCGGCAACACCTACAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2L 15527059 5' + pogo 27 1 59.41 TGTCACACTAATAAAGTATTCTTTGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTT:4 + chr3R 14601811 5' - roo 9021 2 76.24 AATTAGAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 + chrX 21056942 5' + Tirant 47 2 75.00 GGTTTGTGCAGGTGTTGTGTAAGAAGAATTACGAAATAGTAAATGACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGT:2 + chr3R 14985279 5' + Ivk 19 1 71.29 AGTTAAAGAAATATACTGCGCACCCGCACACACATAAAAATGCAGATGCAGATGCACAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:1 - chr2L 15548827 5' - Tabor 7307 2 59.41 ACAGCAGCAACCACACAGGCCAGAAAGTGCAATAGTCGAAATCCAAAGTTGATCTAATCAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTT:1 + chr3R 28238191 5' + opus 7409 2 61.39 GGTCTCGATTTCGTTGGAAAGATTGCAAAACTTGGAAATAAGCTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:2 - chr3R 10434623 5' - 1360 3358 1 55.45 GCACATTAAACTCTAAGAGAAAGACAAGACACTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTAT:1 + chrX 21097029 5' - INE-1 163 1 67.33 AAATTCGTTTTTGCACTCGCGTCGAACCAGGCAATGGCGTGTGGAAGAGGGTCGTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3L 153658 5' - 1360 3366 1 56.44 TGAGAATATCATCATTTGTACAGCTTTTGTATTTAACTGTTCAAAGGAAGCATTTATTTAAATAGTACAGAGTTTTATATTCTGACTATAATAGACTTTAT:1 - chrX 19029127 5' + Cr1a 4201 1 68.32 AAAGAAAATACTGAGATCTAAGGGTTTTAGGAACAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr3R 10229440 5' + copia 4913 2 67.33 TAAGACATTTTTTAAGATCTGGGGAAATTTTATTTGCATGAATCGTAATGAAGTAGAAATATCACCGATCAAAATTAAATAAATTAAATAAATTAAATAA:1 + chr2L 11081744 5' + HB 318 2 89.00 AGAACATGACGCATTGTTTGCATTTGTATGGCCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATA:1 - chrX 5763864 5' - F-element 173 1 64.36 GACCATCGTTTTCGTGAACTATCTGCCCAACTTGAGATTCTGCTTCCTACGGAAGTTCCCCAGAGTTCTATTCTATATTGATTTTATTATCGCCTTGTATA:1 + chrX 17691283 5' - Porto1 4243 1 59.41 TTGTTATTTCCCGTTCAATTGGCTGAATCTCCTCAAGCGTTTCGTCAATCACTTTCATGGCCAAAAGACAAGAAAAACAAGAAAAAAAAAACGAATAAAAG:1 + chr3R 12154997 5' + invader2 298 2 67.33 GCCCATAAACCATACAAAAAAAAAAACCCGGGGGGGGGCAAAAAAAAAAAGGAAAGGAAAAA:1 - chrX 10656193 5' + Doc2-element 252 1 45.16 GGTGGGCATGTCCTCCTCGGCCGCTTGGTTCTCGCATCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCG:1 + chrX 9695895 5' - HMS-Beagle2 127 2 66.67 AACGCAGGGCCAAGAAATGAAGTAGGACTAATGTGCGAAAAGATGACGCCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGG:1 + chr3L 12904512 5' - Doc 448 1 54.12 TAGATGGTGCGAACAGCACCTGGTATCTTTACTTTCTCTAATTCCATTAGCTGAGAAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCTCG:1 + chr2R 4819307 5' + INE-1 576 1 58.42 TGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACC:1 - chr4 1271903 5' - 1360 76 1 73.27 GCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1 + chr3R 14049360 5' + transib2 45 1 70.30 AACAGCCCACAAATATTTTTCTCGTTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAA:1 - chr3R 23612520 5' - Doc 181 1 78.22 ATATTTGTGGGGGCCGCCAGAGGGAAAGCGGGAAAGTGCCATGTCATACGTGACCATAGTTCACAGCCGTAAGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTA:1 + chrX 6797306 5' - Doc2-element 4339 1 56.44 GAGGTGGTTGGCTAGCCCAGGACGAAAGCGTGTTTAAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGGACTTTTTT:1 - chrX 12378745 5' + hobo 7 1 58.21 AAACTAAATTAAATTTTTCAAGACCAAATGTTTACACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 10684929 5' + roo 8744 2 65.35 ATATATATACTTATATGTATAGATGGACACAAACACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 3413157 5' + hobo 40 1 62.38 GAAAAGAAATTGGTTTGACATTTGAATAATTTCGAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3L 5256017 5' + jockey 18 1 80.00 AAAAACGGTGTAGCTTTGGTATTTTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAA:1 - chr3R 13546153 5' + roo 9040 1 76.24 AATTCTTATGCACAAAACAAATGATAAAGTGAAAATTCCGTATGAAAACTGCGTCGTCTGCGCGTGTGGACCGCTTATTTCTCTGCAACTCGTGGGAACCA:1 - chr2L 13296430 5' + baggins 377 1 64.36 GCCGTCGACTGCGGACGCGTCATCTGCCCACGCTCCAGCTGCCTACTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr2R 6769448 5' - 412 7513 2 54.46 AATGTATCTCATAGATACACAAGTTACAAGTTGTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr3L 11657894 5' + Tabor 6882 2 67.00 ATCCTGCTTATTAATTTATTTATAATAATATGCATGCGTTTACTAATAACAACTTTTTTATTAAATGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 26122994 5' - roo 9057 1 61.39 GTTAAAGGACAAGGCGAGGCGAATGTTAATTATTAAGCTTAGAAAGGAGGTAAAAACATATATGAACATTCAAAAAACCCTTGAATGTTCTGCCAAAATGG:1 + chr3R 9074148 5' + HB 444 1 78.22 GTAGTCGGACTCATCACCCGAATTGCTGCGGTATACAACAGCCTCCACCAAGCAGTATTTGATTTTTAAGTGCTTTTAAATCAATGATATTTGGTACAGAA:1 - chr2R 18296315 5' - Tc1-2 424 1 49.50 GTGATCTTCATATCCTTCTTCTTTTGGATGATCTTTTCCCACTCTTCGACTATCGCAGCCATGAGTTGTTGTCGTGTTTTGGGGCCCCTTTTTGCAACCTT:1 + chrX 22426833 5' - S-element 1277 1 71.29 GAGCCAGATATTGCTGCCGGGCAGGATTTGCCAAGGGGAAACTGTCGATTAAAATTGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 - chr3L 3428080 5' - roo 9051 2 57.43 AGAAAGCTAATAGATCCTCAGGTCGTCCATCGTTTGTGATCTTTCTAAGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTA:1 + chr2L 18489525 5' + G2 3024 1 52.48 TAAATATCTCCACGTTCATNTAGACTAAACGCGAAATATGGATAGGAAGACCGTGAGGACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCC:1 - 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chr2R 2144082 5' - G5A 2787 2 68.32 TATAGGAATCCTACTGTATTTGAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 7494014 5' - roo 9054 2 61.39 GTAAAATACATAAATAATATGTACTTATTTATTTTCTCATATGTATATCACACCAATTATCCAATCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACC:1 + chrX 18584880 5' + Burdock 2 2 77.23 GAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTAAATAGGGAGGCGCCGGTGGGTGGGGTGTGTAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 20795876 5' + 412 19 2 60.40 AGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3R 27455538 5' + 297 26 2 63.37 TGGTTAACAATACGTTTGTNGCCCTCTCAAATCAGTCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATT:1 - chr3R 4672194 5' + FB 148 1 64.36 TACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr2R 14586478 5' + Doc 49 1 76.24 GCCGCGAAACGATCGTCGAAAGGCGTCCAAGTGCATAATTACTCCAGAACGGGAAAATCAACAAGTCATCAAAAAACAAAAAAAAAAAG:1 - chrX 3841344 5' + R2-element 3583 1 68.54 GAAACTCAGCTCATCCAGATCCACGCAGCCCGTGCAGGTGACGGCCCAGGTGGTGGGTATCGAGTGGATAGCGACCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCG:1 - chr2R 19249908 5' + jockey 430 1 81.00 TATTACGCGAAATGAGCACCCGCACGGAAAAACAAAAAAAACCTACTGAGCTGGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 - chr3R 29158155 5' + P-element 23 1 54.46 TTTTGTCGATTCTGGTAAATTAATCCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr3R 10648228 5' + I-element 49 1 73.27 GTCCAACTTTGGCATTAACAATTGATGACGTTGCGGAGGAGAGCTCTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chrX 10426950 5' - 412 7513 2 55.45 ATGCTCCACATTAGCCTCACACTCCTTGTACACGAAGTTTATGTCAGGTGAAGCTGGTGGCAGCGGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAA:1 + chr2L 21669599 5' + HB 1318 1 75.56 TGCATGGTTGATATATTTGGTGGATTAAAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTC:1 - chr3L 22669423 5' - Doc 425 1 72.28 AAGTTCTACAATGATAACTTTATAACTATTTAATAATACTTTGGTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCG:1 + chr2R 19330276 5' + McClintock 5979 2 56.44 AGTCACACAATTTTGAAAGTTCATTGTTGCGCTCGTAACAGCTAAATATCGGGTGTACATATAGTCTAATCTTAACTTTCAAGCTTTTACAGTTCCTGAGA:1 + chr4 390232 5' - INE-1 152 1 67.33 TAGACTTTTTAAATATATTNTTGTGGCCTTAAAAACTAATAATTTTATGGATATTGAATTTGGATTTGCACGTACGCGTTGAAAAGAAGATCAAGAAGATA:1 + chr3L 4364295 5' - Ivk 120 1 62.38 GAGGCCATCTCCATCGCCATCGCCATCAGCACCAGCATCTCATTGTGCAAATTAAACTAATTATGTTGGAGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCTGCGTAG:1 - chr2R 11820973 5' - gypsy6 357 4 49.00 GAAAATGCAAAAGATAAATGAAGTTGTGCTAAATGCGTGCTGTGCTGTGGAAAATCTGGGAATATGGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGT:1 + chr3R 12882629 5' - 412 479 2 66.34 GGCTAGAAATTCACTGAACGGCGCTTCTACTGCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2R 7025005 5' - P-element 2844 1 36.63 TATTTATATTTCTTCTATGGTTGCTGCGTTCAATCTTCGCCCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr3R 7411809 5' + 1360 34 1 58.42 TAAATAATATGTACTTATTTATTTTCTCATATGTATATCACACCAATTATCCAATCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 + chrX 18584890 5' + Burdock 12 2 67.33 TAAGGTATGCAGACCGTCGGATTTTTTTCACATTTTAACAATGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr2L 7804317 5' - 1360 3358 1 61.39 AAATGAAGCGTGAGAATGCCATAACGCCCCCAAAGCCTGGCTATTATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 - chr2R 5813651 5' - HMS-Beagle 7014 2 56.44 AATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATA:1 + chr2R 5284579 5' - Doc4-element 2597 1 69.31 GTAATAATTATGGTGCGCCCGGTTTAATTGTGTTTATTATATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2L 20709450 5' - roo 9036 1 63.37 GCGAGGGGTGAGTTTATACATTTGTGGATCAGTTGTTATAGCTATTTTTGTATCTGGTCGAGTAACTGTTGCCTTATTGCAGGGTGTATGTGTGTTTGTA:1 + chrX 22498241 5' - accord 257 2 80.00 ATTACGTTTATTCATTAACTGATTGCACTAAAAGTTGCAGTTATACGATACTTAGGTGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chrX 8983004 5' + 412 17 2 62.38 ATCATTTGCACCTTTGTGCCATTGCTTAAATTCCGCCAGTGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCAGACTGATTTTGAAC:1 + chr3R 27785226 5' + Tirant 8375 2 55.45 ATAAATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chrX 19219307 5' + Doc 45 1 66.34 TGAATTAAACTCAAGTCGTATCCGTTTTCAAGGACACGGTGATGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 7461144 5' - roo 391 2 61.39 ATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGT:1 - chr3L 27859895 5' - INE-1 576 1 63.37 ACTACATTTCGGCAAGTAAAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3L 153581 5' + 1360 31 1 56.44 AATAATGTTTTCTATATTGAGCAAAGGGTATCTTGCCGCCGACTCAGCCACTCTCTCGTCTTTCCCTCCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3R 26798917 5' + P-element 7 2 72.28 AATGTGACTAAGGACTTGCCAAAATCAGGTTAAGTGAAAACGGGAAAAAAGTTAACTGAGAGTGAAAAAAGTATACACTTTAAAATTAAATTAAAAATAAA:1 + chrX 12880303 5' - Rt1b 121 1 55.45 GTGCAAGAGAACGTGTCGTTTAAGTTTTTGCCTATTCTGGATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTA:1 - chr2R 6482737 5' + gtwin 6949 2 59.41 TGAGATGAAAAGAAAATTGCACAAAAGCCATGACGAACAAAAGGAAGTGCAGTGGAAATGCCAGAGGCAGCAGTTATCCATTAATCCCTACTACATACTCC:1 - chrX 12939975 5' - G4 3750 1 62.38 AATCATTTTACGTGTTTGTGTTTGGCCTTTTTTATACTCCATTTTTGTTTTCATTTCGTATTTGTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:2 - chr2R 14586513 5' + Doc 15 1 62.38 TTTCTGTGTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCT:1 + chrX 10119556 5' - FB 11 1 54.00 GTACCTACAATGCCACCCTCGACTCCATCGGCACCGAGACCATGTTAAAGGTGCAGAAGTGAAATTTAATCAGCAAGTAGATTTTTATGTCAATATATCGT:1 + chrX 15928044 5' + transib2 41 1 61.39 TATAACTACTACCGAGTTACTACTAGCCGAGTCGATCATGTCAGTCTGTCCATATGAACGTCGAATTCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATT:1 - chr4 185704 5' + INE-1 164 1 77.00 GTGGAAGACATATGGATTTGCAGTTAAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:2 + chr2R 20460979 5' - hobo 2889 1 73.27 AATATCAAATGGATTAAAGAGAATTAACAATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATCATGGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chr3R 13240003 5' + jockey 6 1 72.28 TTGGTGGCCCAGTTTTGCGCTCGCGTTGGCGTCGTTAAAGAGACTAAAAATACCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATAT:1 - chr2R 14988413 5' - flea 304 1 55.45 AATATTTATTAATCAGGGGACAGTTTGCTTTAAATGGTTTTGGCAGAGTACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3R 16806002 5' + 412 7079 2 53.47 ACTTAATTCGAAAACAAAAGAAAAAAATAAACTAAACAAAA:1 + chr2R 19592912 5' + Porto1 187 1 82.93 ATGCGTATTTATGATATACGGAGTACGTTTTTCTGGGCCCCTTCTGAAGTTTACATTATCATTTGTCTGCAGCTTCAGCGG:1 + chr3R 6940201 5' + 3S18 5828 2 61.73 GCTGGCCGCCACCCACCCATAGGCCATCATCCACAGCCCAACGTTTATTCACATTCATATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAA:1 - chr2R 15303070 5' + FB 19 1 60.40 GATTGGAAATTCGGTTGCCACACCGAAAAGGCAGAGAATTTTAGTTTGCAGGGTACTTGATTTTTAGCTATTCTTTTTCTTCTGTTTTTTTTTTAATAATA:1 + chr3R 26044716 5' + hopper 156 1 53.47 AATTACCTTCAAATTAATTCGGGACAAAGACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2L 12182665 5' + roo 8711 2 76.24 AACAAAAACTGTTTGTACACAGGATAAATGGTATCCATTTGCAACCACCCAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGT:1 - chr2R 24227146 5' + hobo 2547 1 63.37 GATAACTGCTTTCACATATAACGAATATCCATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATAT:1 + chr3R 22467043 5' - mdg1 376 2 67.33 GCCAAATTATTTAATAGTAAATAAACCAACAAGGTGTTGTGTTCGAGTATATAAATTGTATAGCTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACA:1 + chr2L 14038372 5' + 3S18 5778 2 64.36 GACAGCACTGCTGGCAATACTGGCTGATTGGACCATGATGAAATAACATAAGCTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr2R 15201506 5' - P-element 2841 1 33.00 TCATTCAGTTTTAAAACAAGTTTTGACTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 14708767 5' - roo 359 2 75.25 AACAGATCCACAATGAGATGGGCCAAGCGCATGCGGGTAGCGTCCTCATCATCCACCTTATCTTCTCCCGGCTCCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGC:1 + chr3R 13681090 5' + Tirant 8057 1 77.23 AAGGGTTGAGTATGCAAGTGGGTGTTTTGATGCCTATAACCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCAAATCTCTTGACACTTCGGCAATAAGCCGC:1 + chr3R 28609313 5' - rooA 7355 2 71.58 TTTGGGAAATATTTATGATTGGATTGGGGCACCTTTTCAATAAACAACAGGTTAATGGGCCCAGCGCCCTAGGAGCTGCCTAAAGGAGAAACGTGTAGTGA:1 + chr3L 15739704 5' + 1731 367 1 75.25 GAGCACTGACAGTCGTCGACAGAACTATGGCCACATTAAATCGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 15444826 5' - mdg1 391 2 56.44 TGCACCTCCCTCCTCATCGTGCCTTCTCTGTCTCCACAGCACTCGTGCTGTCTCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCTACTCACACCC:1 - chr2R 8385188 5' + hobo 25 1 52.48 GATATGACAACAATTAAGTTCCCCGAAAGCATTCCAATCTCTATATTAAACAGATATTGCAAGTAGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3L 11953896 5' + hobo 10 1 70.30 ACAACGCGGGTGATCGGAGACCGTTGGACGGATATGAACATGCAGCGACCTTCAGGTGTAGGTGTGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTT:1 + chr3L 9087926 5' - 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roo 388 2 57.43 TAAAATAAAATCATGGGTTTGAGTTACTGAAGTGTAAAAACTAACCACAGCGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTCTGGTGT:1 - chr3L 10634052 5' + GATE 182 2 70.30 ACGCCTGCTCATGCATTCTCTTTGCAGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATT:1 + chrX 8345655 5' + hobo 2636 1 74.26 GACCAAGGGATACCTTTTGCCAAATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr3R 30611327 5' + blood 7023 2 68.32 GGACCAATGATGCCCATGCNCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr3R 16613157 5' + 412 7110 2 83.17 GTCGTCGACAGAACTATGGCCACATTAAATCGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3L 15444837 5' - mdg1 380 2 67.33 AGAAATATCTAGTAGTTCGCTGGCATCAAATTGATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGA:1 + chr3R 25271668 5' + invader4 2797 2 59.41 GAACCAACTGGGCCGAGCTGTTAATTTATTAATGACACCCGCCACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chrX 12284050 5' + Transpac 29 2 57.43 ACAACACTTTCCCACCGCAAAGTGCATCGAATGAATCAAAGCTGTTGATTTTGGAGTGCAGTTCTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 26434200 5' + hobo 12 1 65.35 TTATAAACAATTTGGCAAATGAATGCGAAATATTCGTTATAAAACTGGCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2R 22898806 5' - Transpac 5206 2 56.44 TATAATCTCGTGATATGGCNAATTTATGAGATCTTTCAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3L 16478444 5' + pogo 38 1 66.34 AACTGATTCTAGTAAAGACTGTGTGACTGGACGTGTAGTTTAGAGTCACAGAATATTAATTTAAACTATTTTACAATGTGTGTGTTCACACATGAACACGA:1 - chr3R 17415341 5' + roo 8662 1 76.24 AAACTGAATAAAAGAAAGTGCAGTTAGTGTAGTTCTTAATTATTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chrX 12420351 5' - jockey 4965 1 60.40 TTGTTTATTGCATATCAAGTCGCATGTCTGATTAAAGACTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAAA:1 + chrX 14930521 5' - invader2 4687 1 62.38 CAGAGGAACGTTTCTAGTTTTGCGTGCAGTGGAATGGATTAATATTTAAATATATTCGGAAATTTGGACTTAGAAAGGACCAAAATGTTGTGTTGTAGGGG:1 + chr3L 14464305 5' - GATE 257 1 42.57 ATTCAATGACTCTGCCCGACAGTATTTACCCAAAACGGCAACCTAGTTTGGAATACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATA:1 - chr3L 19253693 5' - transib2 472 1 59.41 AGATCAGAGGGACCTTGCTCCCCAAAATGGGAACGGGAATGGGAATGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2R 6918525 5' + hobo 28 1 56.44 TTGCCGCCGATGGGGAAATACGAATGGTGCGGAATGGCGAATTGTCCTCTTCCTTGCTTAAGCCCTTGCACCATCATCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGG:1 - chr3R 15575367 5' + Idefix 246 2 59.41 TATTCTATACCATTCTATAACTATTTGGTTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTTTCATCTGAAATATTTATTAA:1 - chr2R 10487898 5' - Juan 4115 1 56.44 AATGGATAAAAAATACGTAAACTTTGTGTTCAAACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 16200001 5' + roo 8718 2 77.23 AAAACTATTAATCAAGAACCCATTAAGGTTATAATCTGATAATTTTTTTGTATCTTATATTTCAACGCAACAGAAGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 - chr2L 13464048 5' + 3S18 1 2 23.76 GTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr2L 4110964 5' + Doc 51 1 72.28 TATGTGCTTATGATTATGATTTTTCATGTTTTCCCCCATATTTATTGATATCCCAGACAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTTACACTAGCTGAGTAAC:1 + chr2L 18879045 5' + INE-1 534 1 70.30 GCAGCAAATCCTCCAGCGGTGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAAC:1 - chr2R 10233238 5' - 297 105 2 71.43 ATGGTGCGAATAACTCCATAAATTATATGTGTGTCCAAGCGATGATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3R 25950075 5' - 412 472 2 58.42 GTTTGTTTGGGTCAGTCTGNCGGAGTGGCTTGTCGTGTTCACATCCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAA:1 - chr3R 22530563 5' + hobo 2718 1 60.27 TTAAATTTCATGAGGAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCAAAGAAACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 - chr3R 4191171 5' + 1360 24 1 61.05 GTTGCCCTGGTCTGAGTGCNGACCGGAATGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAAC:1 - chr2L 14848130 5' + Doc 4456 1 75.25 TGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATG:1 + chr3R 4357543 5' - Tc3 1677 1 60.40 GCTTGCATTTGCTCCGCAGAGAGAAAAGTTAGTGATTTGAATACGTTGGTTTGTGCTCGAGCACTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTCC:1 - chr2L 17807447 5' + HMS-Beagle2 6888 2 56.44 TGGATAGACGTTTTCAGGCCGCTTCACCGTCCACCGTCCGCCCTCCACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 19207941 5' + 412 7082 2 52.00 TTTTACGGCAAAGAAGTCCAGCGGAAACCGAAACTCTCTCAACCATTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTGTGGAAAATA:1 + chrX 10732810 5' - transib2 2372 1 60.40 GGTAGAAGGCCTAAATGGTTTTACATTAATAATATCAAATATTTTAATCATATTTCATATTCTTCAGAGCAAGCGGGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAA:1 - chrX 11990698 5' - F-element 346 1 77.23 GAAATTCCCAATATTTCCTTGGCCTTCCACTGACCCTAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chrX 22774819 5' - opus 7473 2 60.64 TATCTGGTTAATTACCTCCGCCCCCATGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCT:1 - chr3R 18399944 5' - G2 2791 1 73.27 ATCATCTACATATTTTATACGAATCGTGTCGAACTGCAGTTTGTTTTACTTTTGAGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACA:1 - chr3R 26435876 5' - hobo 55 1 61.39 AGAGGTGGAGCATCCGTTTTAATTGATGTGACCAAGCCCAAAAGTATGCAAAAGGCTCATCCTCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 + chr3L 5255901 5' - jockey 4978 1 62.38 AGCGAATGGCTCACGTTATGGTCAGCATATTAAGGTAATGGCCTGGAAAGTCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTG:1 - chr2R 12778341 5' - F-element 403 1 65.66 AACTTTTATTGCCTACTTTNAAGGGCGGCATATAAAACTGCTCTTTTTGTTGAGTACAAATACAAATACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 - chr3R 17896950 5' + jockey 4773 1 65.35 AGCGGATTTGTTCATTTGAATTTCGAGCGTGTTTTAAACTCATCCATGATTCCAGCACAACCCGAAAATCTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 + chr2R 10777774 5' + pogo 3 1 70.00 AGACTGGCTTTTGCCATTTTAATCAACTTTTCTTGGATGCACGACAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr3R 26343003 5' + blood 27 2 52.48 GCCGCCGTTCTTAAAATATTTAAAACATTTATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCTACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chrX 21581087 5' + 297 15 2 58.42 CACCTGGATCTTTTTGCTTNGTCTCTTCCACAGCCTCAATAATCCTCATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATAAGTCTT:1 - chr3L 23594399 5' - Bica 101 1 57.43 GATTGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3R 8705354 5' + jockey 31 1 54.46 TTTTAAACTATGCGGAAAGCTGCTACAAATAAGTAAATTTTAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGT:1 - chr3L 22997118 5' + FB 95 1 64.36 GTCACACTAATAAAGTATTCTTTGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 14601812 5' - roo 9020 2 77.23 GAACCGGCTAATTGAAATCGTTTGTCAGCACAGCCAGTTGGCTCTGTAAACAGAGTGTGTCTGGTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3L 5973968 5' + hobo 9 1 69.07 ATACGTTCATCTGTTAGTCTTCGTAATCTGCTTATGAATCTAAATAAACGAACAAAAATGTAAGCAAGTAACATTCACACTTAACCGGCAAGACTACCCTT:1 + chr3L 23083387 5' + Fw3 3097 1 65.35 ATACTCCTCTAGTAGGGATAAGATACTTATACTATAAGCCACTAAACCACGACTCCACATAACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr2R 6074339 5' + 412 12 2 37.00 GGGGAAGGATCCAAAGGATTATGAGCCCATTTTCACAACTGCTGAGTAAACGCTTTCCGTCGCATTTCATTAAAAAACACATTATCGTAAAAAAAACA:1 + chr3R 21016383 5' + hopper 1395 1 76.53 GATGTTAGGCCGTCGAGGTNCTCGGTCATCTATTTAAGCATTTTTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGT:1 + chr2R 6556221 5' - Tirant 330 2 59.41 ATTATGTTTTCTATGCCCAAGTGTTTCTACTTACTCCCTTTCTCCTTTTTTTTTCAGGGGATTCTACACACTCTTTTTATTCCTTCTTTTCTTCTTGTACG:1 - chr3R 17977074 5' + copia 121 2 50.50 AATTACAAAAATATATCCAAAAAATTTTCAAAAATATGGTCGTCAATTCAACAAATGTTTAACTTTTATTTATTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAA:1 + chr2L 4951728 5' - HB 1470 1 63.37 TTTAAGGTATTTATTGATTNTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 3475320 5' - roo 360 2 77.23 TAGCCATTACTAGCGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTACT:1 + chrX 15746302 5' + jockey2 3233 1 57.43 GATCTTATAGTTGCTGGTTATTATAGTAAAAAATATTATTTTTTTTTCAGTGTAATCCCGCTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3L 7966860 5' + jockey 21 1 60.40 GTTCTCACGTTTAAATCAAGTCAAGACCTTCAGATTTTTCGAAGCCTTGCCGTTTGAGTCGTCTCAGAGGTCGAGCGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGA:1 - chr3R 6572048 5' - Helena 1281 1 61.39 ATATAAAAAAAAATATAAAACAATCGCTATACTTTCATATCAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCAGTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAG:1 + chrX 21392073 5' + Idefix 7160 2 59.41 AAAAAAAGATGTAACTTGAATGCTATGTATCAATTTAATCGATACTTA:1 + chrX 12414151 5' - jockey2 3317 1 70.83 AATACCCCCCACCACCCACTGCCACCCAAGTTGGAATGCAACTGCAGTCGCTGCCTCGTAACCATGTGGCCTTTCTCCAAAAATTTTCAAATAAAAC:1 + chr3L 22839932 5' + transib3 251 1 73.20 AAAGTAAACGAGAAAATAAACAAGAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 22071056 5' + Doc 4693 1 69.05 AGCTCCGGCCACAGTCGATGCCTCCCGCTCAAATAACAAATTGCATTCAATATTTCTTTGTACTGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 - chr3R 17616029 5' - HMS-Beagle 7033 2 71.29 GAGTTTTTGTTTTCATTTTTAGACTGGCTTTTGCCATTTTAATCAACTTTTCTTGGATGCACGACAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 - chr3R 26343023 5' + blood 7 2 72.28 AATCGATAGGCATAAATTACTGAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAGAGTGGTATTCTCTCAC:1 - chr3R 6188319 5' - copia 98 2 80.20 TTACTAATAATTAAAATGTCATCATTAAGAAATATGAAAAAGTCAACAGAGGCCCGCCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:1 - chr3L 7962561 5' + jockey 4756 1 58.42 AGTTCCCTTTGGCTTTATGTTGGCTTAACTAATCCAGTTACCGAGAGCTATTATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGATGAGTGCCCATT:1 - chr3L 23233725 5' - Ivk 4944 1 58.42 GTGCACTTCCCCCTCATGGAGACTTTACGACGACCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1 + chr2L 15548753 5' + Tabor 6881 2 63.37 AATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTC:1 - chrX 23108310 5' + BS3 1438 1 58.42 TCGCAATAAAAGATTACATCTCAAAGCAATTTATATGGCGTTTCTTTTGCTATATAGCTGCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGT:1 + chrX 2497097 5' - Stalker 6882 4 58.42 ATAATACTTGTCAATACTTCGTTAATACTTTTTTCTCACATATAAGTAGACTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3L 12717786 5' - pogo 2082 1 60.40 GATGAGGACATAGATAAGATATTTAATAGTAACTGCGGCCAACATTTTCTCCCCGCCTACCATGAATATTTATGCAAAAACACACACACACACACACATGC:1 + chr2R 24160458 5' + accord 185 3 53.47 GGGCCATCAACCGTCGTCANCCTGCTCGTGTGAACAGACGCCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGG:1 - chrX 18264845 5' + Doc 298 1 68.00 TACCAACAAAAGAGGTAACTTAAGAGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTCCCTTTTTTTTTGTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTT:1 - chrX 17817878 5' - Bica 312 1 75.25 TGGTAAGTTCTGTTTCATGTTTTTTTGCTTTTTCGAAAATAACTACTAAATCACTGTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCG:1 + chr3L 11606015 5' + I-element 231 1 61.39 GGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr3R 9870364 5' + F-element 52 1 68.09 AAAACAATTTGTTGGCACTAATATCGTGAAGCAACCCAATTGAAAGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 16127772 5' - roo 9042 1 56.44 GTTCCCAAGGAAAGAGAAAAAAAAAGAAATGCAAAA:1 + chr2L 10114420 5' + gypsy2 406 1 88.89 TGTTTGGATTCGTTTCGTTTTTTAGTTTACTATTTTTATTGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATT:1 + chr3L 2149677 5' - Porto1 4497 1 65.35 ATTCCACACCTTTCCCCCATATCTCACCAACCAACATCCCCTCACACTTTTCCCACCCCCCTGCCATGGAGTGTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3R 25531691 5' + hobo 2 1 72.28 GCACCGTCAATATCATGGGATGCTATGCTCAAGTTCACTAATGTAAAATTAGAATTTATAAGTGATAAGGTGATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTATTGCG:1 - chr3L 25624605 5' + opus 1 2 78.22 TTGCAAACAAGGGAAATATATATATAAAGTCATAATACGTTATTGCCCACTCTAACTATGCGTCTATATCTGTGGTTTTATGTATGGTACCACGGTTTTCG:1 - chrX 15046768 5' - HB 497 1 60.40 TAGCTCGACAAGACTATAAAGCTAAGATAGCAACAACTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGT:1 - chr3R 1011766 5' - Doc 4395 1 64.36 GATCTAATATATCAAAGTGTGTGTGCGTATGAAAGACCGATTCTTAGGCACCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCAGAGAACTTGAGCTGCGT:1 + chr3L 1258918 5' - Quasimodo 6964 2 58.42 GTCAGAGTAAAATCAATCAAGCTGTAGTCACATTTGATCTGGAAGAAAATTATACTATTGAAAAGAGAGAGAAAGTAAGTACAAATTAGATTTAGATTTTT:1 - chr3R 17473408 5' + Quasimodo 7258 2 86.14 TGAGAGGTGGAGCATCCGTTTTAATTGATGTGACCAAGCCCAAAAGTATGCAAAAGGCTCATCCTCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 + chr3L 5255899 5' - jockey 4980 1 64.36 TATGCATGAATAACAAATTTATTATTACCTTAATTCTCCAAAATTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCTTAGGTGAAAGGCAGTGCTGGCTAACAA:1 + chr3L 17247486 5' + HB 1307 1 67.33 TATATAATCTATTCAGTGCACATCAAATATTAATAAACTTACACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTT:1 + chr2R 7131270 5' + G5A 2637 1 67.33 GACGGACGACGAGATTTCACTCATGCAGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 6947772 5' + roo 8685 2 73.27 TTTAAAAGTACAAATTAAGATAAGTCATAGATTGCACAAATAAATAATTAGCAATTAATAAAAAAGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACA:1 + chrX 13616851 5' + X-element 21 1 60.40 AGAGTAGAAATAAAAATTCATTCTGAAAATCGAAAGCAAAACGAGCAGACGTTTAATCCAAACTCGACGACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACA:1 - chr3L 27414460 5' - invader4 2633 1 69.31 AAAATATGTTGCCTACTTTTGTGGGCTGTGCATAATTGGGCAGCATGAATAATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr3R 25378642 5' + jockey 34 1 54.46 AATATAGGAATCCTACTGTATTTGAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 7494012 5' - roo 393 1 63.37 AATTGCTGTGTGGGTGTTTTATATTCCGTGGCTGTTTGTTGTTGTTGTTGGTGGTTGTCCAGTCGTTTAGCGTATCTCTCGCTGAAGCGGGAGATCTCCT:1 - chr3R 24683141 5' - G-element 4067 1 56.00 TGCCTGTGTGAGTTGGTTTTTCTTCATTTGACGTACTCAAAGCACTCATACACACAAACACACACAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr3L 5976296 5' - hopper 1408 2 72.28 AACTAAATTACATTAAAAGTAGACATTCAAGTTGAATTGCCAAAATGTGTAGGAGAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAAC:1 - chr3R 30366225 5' - gypsy5 58 2 59.41 ATTTCAGGCAAACGAATAATTTAGGCCATTTTACGAGTATAAACTCGTAACATTCGGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 13072051 5' - roo 390 2 58.42 GCGGATTTGAAAACAACACAGCCGCACCAGCGACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAG:1 + chr3R 8712959 5' + F-element 348 1 68.32 TTGAATAATTTCGAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3L 5255996 5' + jockey 32 1 63.44 GTGCTACTGTAGGGAGTTAAAACGAAGTTCTCTCGCACATATCGTTAGTCCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGATAATTGAA:1 + chr3R 4489263 5' - Tc1-2 153 1 53.47 TTGAGACCGTGGTCTATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCA:1 - chr2L 13338781 5' + gypsy5 67 2 70.00 AAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2L 3475330 5' - roo 9034 1 67.33 TAACATAAATTTCAAAACGAGAAAGATCAAGTATATTACCTACTTACTTAGACAACTTTTAAATAATTCACCTTCCCTAGGTAACCGTAGAACGATGCTTG:1 + chr3L 23015660 5' + Cr1a 4013 1 69.31 TATGTTTTAATTTTTTAAATTTAATGTAGGAAACAAATCTAAGGTAAATGGTTTGAAAGCGACCTTCGTGAAATGTCTTTTAATTTAGGTTCTTTTTAA:1 - chrX 11261437 5' - looper1 260 1 49.49 GTTTCGAAATATAAAAATAAAAATAATACGGAAGATTAAGTGAGAGAGGCGTTTGCGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2R 18988408 5' - hobo 2927 1 62.37 AGTACTAGATAAAAAGAGAGATTGCGCAATCTCTTCTTTTTATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr2R 5201021 5' - 1360 3378 1 68.32 AATAAGCTTAGAGCTTAGAGAAAATATTAGAGATTAAATTTATTTATTTATTTTTTTTATTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 + chr3R 4594925 5' - Juan 4181 1 53.47 GCCAGAAGATCACTGGGGTCCACCATGTACCCGGTAACCATGGGCGTGTTGTTCATGTTGTAGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCC:1 + chr3R 20541224 5' - I-element 4956 1 69.31 TAACTGCAACGGCCAAATGGGATTGGTCTATGAATTGTTATTAATTAATATGAGGATAATGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCGTTATTAATTTTT:1 - chrX 1757607 5' - 1360 439 1 59.41 ATCTACTTACCAAATATCCACGGATGCGGCGACCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAAT:1 - chrX 17262967 5' - hopper 1164 1 70.30 TATGTAACGGTAAAAATTGTTTGCATATTGTTTCGGCCTGGCCAACACGGCCATTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTTGTTTATT:1 + chr3L 10080239 5' - Porto1 193 1 61.00 TTTAGCCAGCTTTCGGTTACGCTCTTTGGTCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3R 7411861 5' + 1360 9 2 60.00 AAACCCGTATTTTAATAGGCAGCATAGGGCACAGGTCCACGCCGACCCGCAAGGTACCAAAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAA:1 - chr3L 25783674 5' + Stalker3T 104 1 62.24 AATTTTAAATAAATGTTAATGTTTTAATACTCATTACATAATGTATAGTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chr2R 14624240 5' - mdg1 393 2 53.47 GCCAAAGAAAGTCGAAGGAATTCAGCTGAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chr2L 1432038 5' - opus 456 2 77.23 GCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr2L 4110959 5' + Doc 46 1 67.33 GAGGAGGACTGTTTCCGAATTCCTTGACTTTGGTCCCGGAGTCAACTGCATCGGCACGCATATATCACATTATATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chrX 7538227 5' - Tirant 379 2 78.22 AACAAGCACGAGGGCGTCGTCTTCACTTGCTTGGTCAATTGCCATGTGAGTGTGTGTGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAG:1 - chrX 1587302 5' - G2 79 1 58.42 ATCACATCACTCACTCTATCCGACTTCCAGTCCCTGGGTAATTATGGGTTATGCAATGGCAAAAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAAATC:1 - chr3R 15647563 5' - S-element 1546 2 67.33 ACTGGAATTAGCCAGTTTTGTCACGGACATGCAGCCACCGCATCCGTTATCAAAATCTATTACCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chrX 15412940 5' - hobo 2927 1 38.61 TGATTTTGTTGGTGGCGACTTTCAATTTTGCCCGCTTTTTTTTTTACGATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 - chr3R 28791668 5' - jockey 4964 1 62.38 TGCAGGTGTTGTGTAAGAAGAATTACGAAATAGTAAATGACTACAAATATGGGAAACATTTTCAACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 + chr3R 14985285 5' + Ivk 25 1 65.35 GTGTGAGCATGGTGCGAATAACTCCATAAATTATATGTGTGTCCAAGCGATGATATTTGGCTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAGGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 25950067 5' - 412 480 2 66.34 AAATGTGCCCCTTCTCCGGNAAACCGATATGCCATAGACGTTTTCCCCGGAAAGCCTCGTCCCGGTCCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTC:1 + chr2R 20857760 5' - hobo 2931 1 70.30 TTTATTTATTGGTCACGTATTTATATAGGTGAACCCAAAAGAGAGATCTTTCAAAAGTATACGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2R 13432915 5' + 297 6 2 73.27 AAATACAATAAAAAAAAGCNTTAAGAAAAGACATTGCCAACTTGCCTTAATACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAA:1 + chr2L 22062987 5' + TAHRE 10317 1 55.45 TATGAAAGTTTAGTTCATTTATATAATTAGTTTGTTTCTCATTTCTGAAGCCTTGTCACTTTCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCA:1 + chrX 3016611 5' + diver 2 2 77.23 AATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTA:2 + chr3R 4357554 5' - Tc3 1666 1 70.30 GCCATAGCTGTGAAGTGCCNCGTCGCAACCCGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 13099118 5' + roo 8710 2 69.31 AAGAATATTAATATTTATGTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAG:1 - chr2L 582022 5' + pogo 69 1 60.40 GTATCGACATATTTGGCATNCCTAGTATTTGCGTGCTATGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGA:1 + chr3L 975786 5' - F-element 4389 1 66.34 TAAAGTCATTTTTGAAATTTATTATGTGACATTATGTACATAGATTCGACTATTACGATTTACGATTCGTGTCTTTGGCTCGACTATCTACGAGACCACCC:1 - chr2R 5260087 5' - hobo 289 1 58.42 AAACTGTTCGCCAAACGGTACTCCAATTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTATTCTCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTG:1 - chr3R 7527346 5' - BS 4876 1 79.21 TTTGTGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATAGATCAACAAACTTGCTCTAGGATCGGTCTGCTTAATATCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATC:1 - chr2R 1764014 5' - INE-1 150 1 72.28 GTCAAAACAAACTGCATAATTTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGCA:1 - chr3R 10907158 5' - Doc 4257 1 77.23 GTTAATTGTTTAAGTAACANTAAGCTATCGGATAATCACTATATAGATCATCATTAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGCTAAATAATAATAACAACGTCAG:1 + chr3R 29573395 5' + G4 3661 1 57.43 TTATAATACATGTACTGCCAGCTGTTCAGATCGATATCTCTTAAGCCTGCAGATCGGTTGCATGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 18171746 5' + 1360 7 2 72.28 GACATACGTTGCCGTTTTCCATCATCATTATCGGAATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACCG:1 - chr4 1107738 5' + baggins 5337 1 66.34 TAATGACAATAACATACTCAAATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAG:2 + chr3L 26719136 5' + Tc1-2 12 1 49.50 GCTTAGTATATACAATCTCAGCCACTTCACAGCGGCAAAATATTCATTTCAATAGACTACACTCCTGAACTTGTGTACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACA:1 - chr3R 26170492 5' + X-element 7 1 69.31 TCAAGGTCTAGAACACATTTAGCTATCTCTCAGCGTTTTACAAGAATTAGATTTGATTTAAATGTACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCA:1 - chr2R 15689653 5' + springer 7149 2 67.33 AATAGATTATTAAAAATTGCATTTCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 21372958 5' + roo 50 2 79.21 GCCAAGAAATTGTGCAGATTTAGCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3R 31962074 5' + Doc 59 1 77.23 AATTAAATCAAATTAATTAAATACGGCTTACACAGCAACATTTAACAAAATCCCGCATATACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3R 20872792 5' + copia 4885 2 61.39 AGAGTCTATTTAGAGGACTTGTTTATTTATATTTCTTCTATGGTTGCTGCGTTCAATCTTCGCCCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 7411786 5' + 1360 11 1 74.26 GCGAATTATATGTAACTGATGTGCACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCAC:1 - chr3L 14427226 5' - P-element 20 1 24.75 AAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATAATATATTACTATCTTACTATCCTTCAGCCTTCGAAGGGAGATGGGATTAACTAGGATATTTGC:1 + chr2L 16013815 5' - G5 4603 1 58.42 TGTTGCGAAAATTTTACAAATTTAATTGCCTTTGTCGATGGAACGCACCCGTCCAACGAAGCAGAAGCAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGGAAAA:1 - chrX 10332795 5' + Doc2-element 227 4 55.45 GCCGTGGCTCAGTGTGGTTGTGGTGGTTCATGGTTTCCTTGACCCTGCACTGGGAAACTTTGTGGTCAAATCCAAGGCACCTATGGCAAGCATAGGTGTGG:1 + chrX 15409146 5' - R1-2 485 1 71.29 ATAGAGTCAACAAAGGGGAATGTTTACTATTAGGTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCC:1 + chr2R 9805856 5' - opus 7320 2 75.00 AGACTTGAGTAATTGGATCTTATAGTTGCTGGTTATTATAGTAAAAAATATTATTTTTTTTTCAGTGTAATCCCGCTTACCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chr3L 7966875 5' + jockey 6 1 75.25 TAAAAGAAAGAAACACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chrX 17873163 5' + 412 25 2 54.46 ATAAACCAAATGACCAGACAGTCCGAAGTTAGAACAAACTCTCTGTCTGATTTTGCCATTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr3R 26342908 5' - blood 366 2 67.33 TCTGTTTACCATAAACAAAAACAATCAAATGGCGCCATACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr3L 455627 5' + Doc 42 1 66.34 GAGAAAATTGCCTTTTTATATAAATATACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2L 3146587 5' + roo 8711 2 76.24 GCACGATGACAGTGGCAAAAAGAAAAAATGAAAGACATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 - chr3R 27455616 5' - 297 6943 2 66.34 GTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACT:1 - chr3L 23678148 5' + Osvaldo 25 1 77.23 TTATCCACCAAAATTGGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2R 10777890 5' + pogo 16 1 61.39 ACGGTTAACGTTCCTAGAGCCAACCCACACAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACGTA:1 + chrX 3036513 5' + baggins 5023 1 72.28 TACATGAAACTCTGAATATNTTTAATGTACATTATAGTTGCAAGTATTATAATTTGTATTAAGCTGTTTATGAAATTTTTAAATCAATAAATTAAATAAAA:1 + chr2L 13673049 5' + X-element 4714 1 68.32 ATAATAGAGCGCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr2R 1373105 5' - pogo 2088 1 64.44 TGAGTTATTTTAGGTTGGATACACTTCGTTTCAGTCATTCAGTTTTAAAACAAGTTTTGACTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 14708801 5' - roo 394 1 63.37 GCAAGGCAGAGGACTTGCCNCCAAAAGTGAATTATTTAAGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr3R 13239881 5' + hopper 35 1 58.42 AAGATTTTGAAGCACAATTGTAGGTGTCTAGAGATATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTC:1 + chr3L 9680899 5' - Juan 2 1 46.53 GAGCAACTAATTACATTGCCAGAATGCCGGAGCAGTGCACTGCAGTGTGAGTGTGTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chrX 7759141 5' - hobo 2919 1 51.49 TTGTTTGCTGTCCGCTGCTTGTGCCTTTTTCACGTTTTCGTTTTGTTTTTCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACT:1 + chr2R 21902140 5' - F-element 496 1 73.27 GGGCTTTGGATCACGCGATGCTAACATTTTTTTTATTATTATTAAGATGGGCTTGTAGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTA:1 - chr2R 13543819 5' - baggins 5401 1 72.28 AAATGAATTGTTGCCTTTATGGTCCATAGCATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 + chr2L 16939820 5' - opus 7456 2 71.29 ATAAAATTGAAAATATTTAATTAAAACGATGCGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCA:1 + chr2R 15915334 5' + FB 45 1 70.30 TGCTCCTGGAGAACTGTGCCGGCTGCAAGAATGCCAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGGCTGCACGTAATGAACCAGAAAGCACTGAGAGCG:1 - chr2L 6697340 5' + Doc3-element 419 1 76.24 GCGTCAAAATGCCATTAAATGTGTAGCCTTTGAAGGATTTGTAATGATGAACTCTTATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3L 6084369 5' - 412 453 2 62.38 ACTGCATTTCCGCGGTTCATTGGCCACTTTCGAGGCGAATTTGGCGCGCAAATTCGTAGCTGAGTCGGCGATTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chr2R 7247572 5' + jockey 4674 1 74.26 AAGAGTCTTTAAACTCTCCNCAACTCTAGGTGATTGAGAGAGTTTCCCAGTATCAGAGTTGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3L 25876157 5' - copia 238 1 68.32 AAACCCTTGGATTCGTTCCCTTTTCGATATTTTCTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:2 + chr2L 12602775 5' - opus 7467 2 66.34 TGGGAATCGCACTGACTTACAAGAAGGTCTTCAAACGCAATCGAAATTTAAGTAAAAAAAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAATTCCCGTGAGTTA:1 - chr2L 12802302 5' + HMS-Beagle2 437 1 58.42 GTGTGCTGAAATTGAGAATGTATACATATTTTTTTTTTAAACTTATTTCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATC:1 + chr2R 8642925 5' - Doc2-element 4717 1 70.30 GCTTCTTTTTTGGCCAGGATGTGGCAGCTTGTTGATGATAAACTCTTATGACCCACATTGGCGCGGTGCTGAGGGGTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCG:2 - chr2L 8646772 5' - Tirant 403 1 72.00 GAGTGGAAGACATATGGATTTGCAGTTAAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr2R 20460977 5' - hobo 2891 1 71.29 GAAAACGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGAGATCTATTTTGCTTTA:1 - chr3R 9858891 5' + BS 41 1 69.31 TATGCTAAAGTAGGACCTCNTGTTAATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 19446172 5' + roo 23 2 55.45 AATGAACCATCGAGACCTATGCTTGTATATGCGTGTATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3R 11191071 5' + hobo 38 1 66.34 TAATATGAGGCCGTTTTTTGCCGTTTATGCATCCACCACTTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCG:1 - chr2L 12190103 5' + flea 4710 1 68.32 GGTGTTGGTGATGGTGGTGGTGGTACCACTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGAT:1 - chr3L 7582567 5' + hopper 49 1 73.27 CAGACATCGCCACCTTGCACACCGGGCTCCCTCGGCGTACATGTGGCCAATTCGCACTTCTCAAAGATCAGCCAAGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAG:1 + chr3R 10602838 5' - hopper 395 1 71.29 AAATCTGTTACAGCCAAATTCATCGAACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3L 153599 5' + 1360 49 1 73.27 ACACAAACCAGATGACATCCAATTCCACTGACAGTGCAATTTTCCCACTGTACCTGGGCGCCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTT:1 - chrX 17217792 5' + R1A1-element 5281 1 63.00 AATAAACATTTGCAGGACACTCTAGGAAGTCGACAAAAACAATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr2R 6041559 5' + opus 30 4 60.40 AATCACTTTTAGGTTATACCCTAGTAAAATATCGAGTTCCTCCAACTTTCCTCGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACT:1 - chr3R 3595318 5' - HMS-Beagle2 16 2 50.50 AGAGGATGTGCCGCTGGCTGCAGCCCCGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCCTAACATCATCAA:1 - chr3R 16020375 5' - hopper 347 1 74.26 GAATAGCGACCCGCTTTTGACTTTGCGCATTTGTAACCGCTTGTTTAAAGAGATCCCTCTCTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 - chr2R 11404021 5' + mdg1 7055 2 60.40 AATTTAATCCAATAAATACTATGTTTATTGCATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 22494682 5' + 1360 9 2 67.01 AGCCCCAAAACTCCCGGCTTTCATTCAGACTCGGATAGTAAACCAAAAAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTACTCGGCTAG:1 - chrX 21271277 5' - INE-1 543 1 55.00 TAGCGTTTTCGAAAATATTGTTGGGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr2L 7804266 5' + 1360 49 1 79.21 ATATATAATAATACGTATAGCAAGCTACACCAGAATAAACTAATACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAAT:1 + chr2R 17366543 5' + Juan 3966 1 61.39 TAAACTCAAGTCGTATCCGTTTTCAAGGACACGGTGATGCTGATTCGGTTTATGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 7461139 5' - roo 386 2 56.44 ACAAACAATTAATTAACACTTTTAGCACATTTGAAAATTGCATTCCGAAACTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chr3L 9763176 5' + jockey 4701 1 49.50 AATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGC:1 + chr2R 5260086 5' - 1360 3223 1 61.39 AATGCTCCCGCTCCTGGCTAGCGTAGCCTAGCCTCAGCCAATCGAATTCCAAAGAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 31474052 5' - roo 9049 2 56.44 ATATAGGAATCCTACTGTATTTGAAGTCGGTCTGCAATTTGCGCCCTACGATGGGCACTGGTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 7494013 5' - roo 9055 2 62.38 AGTTAATAAGGGAAGTACGTTAGGGTTTTAAGGGTTTAATAAATTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 14708715 5' + roo 32 2 66.34 GAAAATTGGAGTGAACCCGNCGCAAAGTTGAAATGAAAACAAACTGACGACGGTGTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3L 12266750 5' - P-element 2867 1 58.42 ATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAA:1 - chr3L 20224230 5' + Chimpo 22 1 58.42 GATTCATATTTTTTACCATTGGGAAATCTGACTCTACATTATCTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr3R 3258943 5' - mdg1 390 2 55.45 TTGTATATTTGTATATTTTTCAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chrX 7904713 5' + F-element 63 1 81.44 TAGATTGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 8705356 5' + jockey 8 1 71.25 GAATCTCAATCTGAAATAAAATAGGAATTCTATTTCGCTGAAATTTATAATCAGCTGTTGCATTTCTGTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 22665960 5' + pogo 4 1 45.54 TGGTTTGGCTTGGTTTCGCNAAGTTTTCAGGGTTGCCGGACTAGGGTTTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chrX 4238844 5' + 1360 28 1 54.46 ATCTCGATAGATGATCCCCAACTGATGCAGTTGCTCCAGGGCCAGCACCACCTCGGCTATGTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATAT:1 + chr3L 11083201 5' + 1360 201 1 68.32 GGTTGCCTAGTCTGTTTGGTTTTGAAATGAAAAGTAAATTCATTTAAAGCATTTAGCTGCAGCTGATGGAAGGCATCAAGAGCTGGGAATGCGCACTGTAT:1 - chr2R 11176222 5' + Helena 1037 1 79.21 GCTAGACCTCTGAAAATGNCGCACTACGAAAAATAACCAACTGTCCCTGGTATTTAAGTAATTCCACACTCCATAAGGACCTCAATCTTTACACAGTTGA:1 - chr3R 18853942 5' + Helena 1202 1 79.00 TAATGGCAGACTAATGACAATAATCGCCTGGCCCGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTAT:1 + chr2L 12890224 5' + invader1 228 2 66.34 AATACAAACACAATGGCCACAATCAGAACGGCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 7869129 5' + 297 43 2 68.32 TACGCGTGGGCAGCAGCAGGATATTGGATACACGCGCCCCATTTCGGGGGATCGGGGATATATGTATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3R 10090285 5' - pogo 2095 1 73.27 TTAGGCACGCCCGATTGAGCAGCAAAAGATGTGACTCTGGATTTGGTGTTTTATAATATTTCCTCTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 27455518 5' + 297 6587 2 74.26 AGAATACGTGCGTTTATTTCAAAAGACCGAATGAGAATGGAAGAATAGGACGAAAATCGCAACTATCCCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr3L 16807691 5' - P-element 2881 2 74.26 AGTGTTTCCGGAATTGAAAAATTCCTAAGCTTGGAGCGTGGCCGCGATGACTCGGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATATCGTGCTGCTCGCG:1 + chrX 11905072 5' - G5A 2498 1 56.44 GAGAAGAATAATAGAGCGCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr2R 1373098 5' - pogo 2084 1 64.36 GGTGAGGGGACTTGACCGGCAGATTGGCCGGCCACCGTTTAGGGGATTTATTGAGACTTTTTAAGCTGAGCAATAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGT:1 - chr2L 15605450 5' + Tc1 140 1 70.30 TAACATAAATCTATACATTCCATTTAGATGGCAATAATAGGTTATTGAATTTAGAGCTTCAAAAGTTTAGTTTTTCTATAGTGTAATTGTTTTAAAAATAT:1 - chr2R 14821127 5' - Stalker4 411 1 44.55 GATACTTGAGGTGAAATACNAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2R 1373200 5' + pogo 17 1 61.39 TATCTTACATATTAAATTGNAAAACGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAA:1 - chr3R 9858910 5' + BS 22 1 52.48 GTGGCAGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGCTTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr3L 19271019 5' + 1360 49 1 71.29 GCTAGCGATAAACAGGCGGCCACTGAAAGGCGTAAAGAAACCTTCTAATTGGGCCCGCACCCAATTAGTATGGGGCTTACTTAAGTCACTGGAGGAAGAAA:1 - chr2L 972280 5' + baggins 4987 1 74.26 ACCCGGGAGAGCACGATTGTAAGGACCGCTCCTGAAGTGATCAACCTCGTACTGTCGTTCGCATTCTTACTAACTGAGTAACGGGTATCTGACAGTCGGGG:1 + chr3L 25243597 5' + INE-1 553 1 55.45 AACCCGCCGTAAACAAGGAGCGTGAATACACTTTCTTGTCTGGTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTCACCTATCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAG:1 - chr2L 9166001 5' + Circe 101 1 70.30 ATAACTCATAGAGGAAAAGGGTATACAAGTTGGGAAAGAGAGACCGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAA:1 + chr3L 25481525 5' - Cr1a 4196 1 57.43 AAATGTACTAATATGTTTGCCAGCAGCAGCTATTAACCCACTTGTTGGCAGTCACAAAAATATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAA:1 - chr3L 19465053 5' + Burdock 6142 2 49.50 ACACTTTTAGCACATTTGAAAATTGCATTCCGAAACTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:2 + chr3L 9763191 5' + jockey 4716 1 63.37 TCATTAACTGAAATTTGAGAACAGCTAAACAAAAATTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTG:1 + chr3R 29324154 5' - I-element 5123 1 65.35 GCAAATAAATACACCGCCCGCATATAGAAGGTGGGCGAGAGGTCCTTTGTTTGCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr2L 15848307 5' - hopper 1396 1 60.40 GGAACCCTAAATACTATCATCAACGAAATGAGGTTGCAGCGAAGGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 4571380 5' + roo 31 2 56.44 TCTCGTAATTCTCAATTAATCAGCTAAATTTGAATATATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGT:1 - chrX 19960986 5' + INE-1 113 1 62.38 AGTTTGTTTCTCATTTCTGAAGCCTTGTCACTTTCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chrX 3016639 5' + diver 5918 2 52.48 GTATTATTTACGTTCAAAAGTCAACGACATGATGACCATAAAACGAATAAGCACAAATTATTACTGGTTCATAAAATACCTGTAACTATTTAAAAAAAAAA:1 + chr2L 11725698 5' + TART-B 10504 2 82.18 TTTATTCAGAGTCATTAGACGATTGTGGGTGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chrX 5194521 5' - hobo 2897 1 73.20 TGTGGGCCTGGGGCCGAAGAGTTTTACGATCGCTCGGTTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 + chr3L 5355349 5' + P-element 36 1 43.56 AAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chr3R 9870372 5' + F-element 67 1 78.22 GCACGAACCTCCCGCGACAGGCGCTAAATACAAACTGAGAGGAACCAAACGACACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2R 10874707 5' - P-element 2864 1 54.46 GATATATTTTCTAAAATACCTTAAATTATTAAATAGGGATTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAAT:1 + chr4 626793 5' - diver 186 2 61.39 AGTCATAGATTGCACAAATAAATAATTAGCAATTAATAAAAAAGCGATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGT:1 + chrX 13616873 5' + X-element 43 1 56.44 AATGAGCAGCAGGCGGCGTCACAAAAAGCCCAAGGCAACAACAACAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGATTGATCGTCCGCTCACCAGCACCGGT:1 - chr2L 9556016 5' + springer 25 2 52.58 AAAAAACAACATTTTAATAATTAAATGGAAATATATTCGAAATTTTTAATTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCA:1 + chr2R 12278730 5' - Juan 4183 1 58.42 GTATGACTCAGGAAAATCAGAGATTTTATTTCGATGGCTTCGTGCTTTATAAAATCGAAACTATATTCAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr2L 4110923 5' + Doc 9 1 73.00 TGGTGGAGGGCTTGCGAACTGATGATCGGGTTGCGATGATGAATGGCTGAGAGCTCAAGTTTCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGA:1 - chr3L 24761267 5' + 1360 54 1 63.37 TGTGTGCGCGCACAGAAAAAAGGTCCTGGCTAAGGACTCCAAGCAAAGTACGTGTGTGCGTGTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATGTATTCTG:1 - chrX 19549384 5' - 1360 3181 1 63.00 GTTTTTTTTTAATTTCAATTTTTTTTTT:1 + chrX 10792484 5' - P-element 2635 1 85.71 AATTGAAGAAAGTCCTGGTAGGAGCAGCGAAGCTCTCTTGCCGCAGGACCTACATCCGATGGAGTATGAGACCCCGACGGACGTGTTTTTATCAGAGCTCC:1 - chr3R 10237943 5' + Porto1 23 1 75.25 TAGTTGCCAATTCTGAGAAAGTTGTAAGACTAGATTTTTCATTTAACAACATTTAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr3R 20872696 5' - copia 235 1 57.43 TGATCACCGTGATCACGCCAATTTGGCTAGCGCCAAAATTATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAG:1 - chrX 17267634 5' + I-element 5004 1 59.18 TATATCGTCCCGCTAAATGTCCGTTTACTTCCTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAAT:1 + chrX 808373 5' + micropia 5137 2 78.22 TATCTGAATACTTTGAATCNAAGCTTCTTAGAAGAAAGTTGTAACAATTAGCCAGTCTAATGTTTTATGCACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATAT:1 + chrX 16237755 5' + mdg3 98 2 73.27 TGGTTTTTAAGGAATTATACACTATACACTACTCTTAAATGTCTAATTCCGCTTTGTTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 - chr3R 17976723 5' - copia 236 1 47.52 AAAGTTAAGAAACAATGAAAGCACATGAATTGTCCAGTAATATTTGTATGTAATATATAAAGTGACGAATATGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr2L 8967001 5' + 297 11 2 64.13 GGCATTCGGCCATAATCTTNTGGGTAACTCACCTGTAAATAAATCGCAAGAGAGAGAGACGTCATCTTTTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3R 31909278 5' + hopper 3 2 59.60 ACATCGAATGCCAAATCGATGCGTGTATCATTAGTCCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGACGGGGGTACCTG:1 + chrX 17569241 5' + HeT-A 5741 2 64.36 TTTGATGTTTCATAATCAANCTACTTTGTTCAATATCATCGAAATATATCGAGTTCTAGCTTAAGGAAAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 + chr2L 2416710 5' + 3S18 10 2 53.47 TGGCACATTATGTGGAATTAGTTTTTGTGTGGCTGCTGATAGAAATGGCGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - 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chr2L 4404630 5' - pogo 2084 1 64.36 AGTGTGAGCGTCCTAACTTACCAAATAAACTCCCACAGCAGCCGATACGTCGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATTATCTTGTCGACCC:1 - chr2L 15073702 5' + G5A 2645 1 77.23 GTCTAAACTTTTTCAATTCGCCGCGGCAACACCTACAAACGCGCAAGCACTCACGTACTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:2 - chr2L 15527073 5' + pogo 13 1 64.36 GACTCGAGCTGCTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGCATAGATGTAATAGATTTGGTTTC:1 + chr2R 6438348 5' - Stalker4 7337 4 53.61 TAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 17109704 5' - roo 9026 1 67.33 TTTTTATTTTATAAATTTTTATTTTCTACTTCGTATTATTTTTATGAAATATTTATTTCTCAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAG:1 + chr3L 10436944 5' + diver 5903 2 65.35 AAAGATTTTGTTGCTAATATTACAAAAAAAAATTTTATATTTCTATATATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr2R 13258762 5' + F-element 44 1 59.41 ATTACTCACCCAAAAGGGAAGATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2L 18297878 5' + hobo 51 1 74.26 ATAAAGTGATAGCTGAATTATTAAAAGCGTCGGTGCCTGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2R 3021385 5' + Tirant 36 2 61.39 AATTCCATGCTAAAATGGAAATGGAATGGTGGTTTTCAGAGTTGTGAGGTGATTGATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAA:1 + chr2L 17225187 5' + X-element 4602 1 47.52 TATCCCCTGAGCAAAGGACACGGTCTGCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr2R 5200981 5' - 1360 3339 1 76.00 GTCCCAGGGCAAATTGGTGCTGGCCAAACCGCAACCGTATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGAGGCTAATCGCTGACGCTCACCCATACCATGA:1 + chrX 3315210 5' + G-element 4001 1 73.20 AAATTAATTAAATACGGCTTACACAGCAACATTTAACAAAATCCCGCATATACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr3R 20872783 5' + copia 4894 2 52.48 AGCTGCACACAGATGCACTCCGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chr2R 12096588 5' - hobo 2884 1 81.19 CCATATATCCAAAATTTTCAAGTGAAATACCTCAAGTATTTTCAGAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr3R 20599675 5' - opus 469 2 58.42 TATAGAAAAATATATTTATATAACATATTACGAAATATCGTTACTTTTTAAGTATCCATTTAATTTACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 17063524 5' - roo 401 1 72.28 TAGCAGCTGAAGAAAGTAAAAAACCTGTTGTCAGTTATTTCGACGCCTAAGTACCCTACACTAATGAAAATAACTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:2 + chr2L 15817940 5' + I-element 5 1 76.24 TTCTTGCTTTGTTTCTGAACACACCTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr2L 19092440 5' + 1360 42 1 76.60 TGTGAAGTGCCTCGTCGCAACCCGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2R 13099110 5' + roo 8718 2 77.23 ATTATTGGTTTTCGAGAACGATATTTTTATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAG:1 + chr3R 7377952 5' - F-element 4238 1 73.00 ATTGCGAACGCGTCGTATCTTGTTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCAACGCCTCTAAACAA:1 - chr3R 13685236 5' + Tirant 8129 2 59.41 TAATGGTTTGTTTATTTTCGCCACTCGACTGGAGAAATTTGCATAATGCCTAGCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTT:1 + chr3L 8904195 5' - pogo 380 1 55.45 TTTTGCATTTGATTTCTCGGGCTTAGTTTTTGCATTCAAAGCGAAAGAAAATTCAGTTCCTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 25397142 5' - roo 9055 2 65.35 AAATAGGGAGGCGCCGGTGGGTGGGGTGTGTAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3L 6084426 5' + 412 45 2 70.30 CAATTAGCATTCTTATCTGATTCTTTTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 14601845 5' + roo 8712 2 76.24 GAAAGGATCAGAATAGCGATGAGGAGCAGGAACAGAATGCAGTCACGTCGCCTAATCACCTTTTTCCGATCCGGCCATTTCCCCTTACGGCCATCTCTTCG:1 - chr2L 10205640 5' - accord2 250 1 57.43 GGCACGCAAAAGCTACTTCGAAAGCTTCGGAGAAGAGATAGAGATAGCCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr2R 7024944 5' + P-element 26 1 53.47 TTGAGAGCTTTTTGGACTTGAGTCGCGACAAGATGCGCGATGCCGTTCAGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAGGTCGCGGACAG:1 + chr3R 13056230 5' + Rt1b 190 1 52.48 TGTATCTGCAGCCTATGTTTTAGTTATTTATTCACGCGTTTATTGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chr2L 9618664 5' + FB 34 1 59.41 GTAAATTTGTTATTATTATTGTATGATGCATAATAATAATAGATGTTGCAATTATTAAATAAACATTAAAAACACCACAGTGTTTTTTTTTATTTTTTTAT:1 - chrX 14023225 5' - Tc1-2 482 1 54.46 GATCGGGTTTCTTTTTTTCGCTCACGTGCAGCCCAAACAGCTGCTGGGGGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 + chrX 21374159 5' + P-element 24 1 58.00 ATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTT:1 - chr3R 5773205 5' - Stalker 357 4 74.26 AGTTGGCGGCAGCGCAGAAATATTAAATTGACTGTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTA:1 - chr2L 18568053 5' + Cr1a 4251 1 55.74 ATAAAAAGAAAATGTTTAAGGTATTTATTGATTCTACAATACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2L 3475334 5' - roo 9038 1 63.37 TAACTTTAGTCGAAATCTTATAATCTCACTAAATGCATTTCTCAATACCCAGGTAATCAATGTCTGCGTGGCGACGACCGACGCGTTCGATTATCCAATTT:1 - chr2R 9286379 5' - gypsy7 117 2 58.42 AGTCCATGGCGCAGAGATATGCATACATTATGTACTGTAGTTAATTATAATTCCAATACTACTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr2L 18927528 5' - mdg1 7428 2 64.77 AAAATGATATTCCGAGACANAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 + chr3R 7272586 5' - hopper 1359 1 77.23 AAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTT:1 + chr3R 13001033 5' + 1360 3261 1 63.37 TATAAAATTATTGAGTGCCATTAGATTAGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2R 16680137 5' + 412 7102 2 76.24 CCATAAGCTGTGCGGCGAAACTTTCGACAGGCAAACAAAACAGAAACAAAAAAACAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr3L 17127052 5' + Doc 25 1 50.00 TGGTCTGCTTACAACACTATTTAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCG:1 + chr2L 2972479 5' + jockey 4988 1 78.22 AAGAGTGAGGAGAGCAAACGATACGGATATGGATGTCGGGAGTCGAAAGTTTCCAGGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:2 - chr3L 14691020 5' - roo 408 1 72.28 GACTGAGCGGACAAGGCAATAAGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chr3R 26434136 5' - hobo 2885 1 79.21 ACCCAGTTTTCACGAGATGTTCATTGTTGCGGAAAAGTAAGAGAAACATTTTCAATCAAATGAACACCTACAGTGGGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAG:1 + chr2R 13446621 5' - roo 409 1 77.00 TTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACAAAGTACGGACACAAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 10590622 5' - 1360 3354 1 60.40 TGCTATTAAAACGTTTATGGGTATAGAAAACATGTAGGTAAATGAATAGATTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 + chr3R 21608755 5' + copia 4895 2 54.46 ATATCACACCAATTATCCANTCCGGGAATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGAT:1 + chrX 18584924 5' + Burdock 46 2 73.27 TGTGCTGCTATGCATTTTGTTAACGTTTCCGGTGACTTCGCGCTAGAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chr3R 5133668 5' + Tabor 32 2 53.47 TAAAATCGAATTATAAAGTTTCTATACTTACCAACGAACTATTAACTTAAAAAAGAAACAAATCACAGTAGGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGAT:1 - chr2L 14424227 5' + ZAM 8033 2 71.72 TACCGGCACTCTGAACCCGATGGATCAGATCGTTGATATGATCCTCGTATATGGAGTTCGATTGCATGACCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 9542478 5' - roo 402 1 70.30 GAAGGTGTTAGTCGCCCCGCTGGCGCAGTTCCTGCGGCCAACATTTTCTCCCCGCCTACCATGAATATTTATGCAAAAACACACACACACACACA:1 + chrX 13480400 5' + accord 180 5 56.84 GAACCCGACGCAAAGTTGAAATGAAAACAAACTGACGACGGTGTGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3L 12266762 5' - P-element 2856 1 48.00 GCAAAAATCTCGAGTTGTTNTTTTCTGGCCTGTGGCCGCCGGCAGACCTTTAGATTTTCATGTTAACTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAA:1 + chr3R 17615911 5' + HMS-Beagle 6803 2 71.29 GTATGCTTTAATATGTTAAATTCAATATTTCAAAGAAGTCCGATGAAACGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAA:1 - chr3R 11498652 5' + BS 23 1 50.50 AAGTTAGACATAAACATATTATTTATTATTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chrX 22897213 5' + copia 4917 2 75.25 TTGAATTAGCTATTAGAAATCGTCATTGTGCTTATTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAG:1 - chr3R 25271725 5' - invader4 287 2 66.34 ACAGGGCTAAAACCGGGGCGTCCCGGGCTGTTAGCTGACCGTTACAATCGAATTAGGCGCCGCTCGCAACGCTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCAT:1 + chrX 14658677 5' - X-element 4709 1 70.30 ACGATCGGACTTCCTCTCCAGCCAGCTGAGCAGCAGTTAAATGAACAACCAAATTGCATCATGTTCAAGCCACCTACATAAACGGGAATGCGC:1 - chr3L 5807838 5' + Ivk 5013 1 59.14 TCAGGGATTTCGTGTCTGCNGCAGAAGGCGTGAGGTGAAAGCGAAAATGCTCGTAATGCGGGTCTATGTAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3R 28628159 5' - 1360 3384 2 69.00 GTGGCGATAGTGGGGATTGTCCCGCAGCGGATTTATGTCACTGATCTGATGACAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAAC:1 + chr2R 17691592 5' + Cr1a 4284 1 53.47 GCAATAACTTATATATATATATTGATCACGGGCTACCATGCCAGCATA:1 + chrX 8856026 5' + accord 6954 2 77.08 GCAATTTAGTTTGATTTTTTAACAGCCAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 12878993 5' + roo 49 2 78.22 GTGATTGTTTTGCAGCATTTCTAGATACGTGGACAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTA:1 - chr3R 9522102 5' - Cr1a 4288 1 62.38 ATTCCCCCGGCCAGCCGACGAAAGTAAATCCAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATT:1 - chrX 18577622 5' - Burdock 27 2 70.30 AGTTATTAAGCTCTGAGCGNTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2L 6583303 5' + hobo 9 1 68.69 GGTATAATAATAAGCTATTATCTATTAAATAGCTATTGACATACATTCGTTTTTCCCATTCTCAGCTCGAAAAAATATAGTTTTAAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr2L 13363342 5' + FB 33 1 88.12 GCAGAATAGGAAAGAAATCTACCTAATCTGATGATTACCCCTTATCATATATATATGTATATATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr2L 2288344 5' + hobo 8 1 72.28 AGCTTACAGATTTTAAGTACATTGAATAACTTAAATTGGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCT:1 - chr3L 12089858 5' - roo 8742 2 68.32 AGTGTGTTGGCAACTCGCACACTTTTTCACGCCCGTGACCCCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2L 8646675 5' + Tirant 34 2 59.41 TGCATTTTTACGTTGCATTTTCTTTTCCACGGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3R 12906590 5' - hopper 1373 2 70.30 AACAAAAATGTTCTAATAGTAATTCGAAAAGTGCACGTCTTGACTTTATTAACGCTTCTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTT:1 - chr2L 12455332 5' + jockey 4964 1 46.53 ATTTCCACTAGGAAAAGTGNAGTAGAAGTGGAGCACATTTGGCGAAATGAAGGCAGGCAATCAACAGGTCCAGCAATTAGTTAAGAAATTAGATATTAACT:1 + chr3R 18093635 5' + I-element 5235 1 72.28 AGATAGGCATTCCAATTATGACATCACAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 10434571 5' + 1360 48 1 71.29 GCTTCAAGATGAGGATCTACACTTTTGCAGATTTCAACCGAAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGA:1 - chr3L 10683530 5' + opus 14 2 63.37 AAAAACACAGACAGCGAAAGAGACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chr2R 8385137 5' - hobo 2885 1 76.24 AAAGAGTAAATTAAAAGTTACTTATAGATCGATGTGGAAACGTGGGAGATCAAATCTCTTTTTACTATTTAATTTTATGCAACTGTG:1 + chr3R 7305679 5' - micropia 5366 2 51.72 AGAGTTTTACAAACGTCTTAAACGATTGCCGAGCACCTGACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAG:1 - chr3L 12343862 5' + Transpac 247 2 57.14 GGTGGCTGCCTGACTACGTGACTGTACAAAAGTTGGGTAAAGTCGCGAGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3R 16005442 5' + Doc 32 1 51.49 GGTGACAAAAAATTCCAGCGCGGAATTCCAATTCCCCGCGATCCTGCAACCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2L 15479543 5' - blood 352 2 53.47 GTGTATGATGATGTAGTTGATAGCGTGTGTACGAGTGTATGCTACTATACGAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 19270331 5' + pogo 22 1 53.47 TTGCGACGTTGTAATTAAGGCCTCGGCAAGTGGGGGCAATGGATTCCTTTCAGGAATGCTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 13099047 5' - roo 392 2 61.39 ATCAAATAAATATATGCTTAAGTGATAGAAAGTTTTCATAAAACTGATGCGAAAACTTCTTTATTGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr3L 25120265 5' - pogo 2094 1 74.26 TAATAAAATGGTCAAATAATGTGCGATCTTAAGCCCTAATTTAATATTTAATGCAATGAAGCGAAAATAATGGACAGCCCTATTGGAGTTATGCCTACGTA:1 + chr3L 20766685 5' - Rt1b 5050 1 57.43 GCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTG:2 + chr3L 25497422 5' - gypsy8 125 4 76.24 TACCAAATGTCGGCACGCCCTCTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAG:1 - chr3R 25515198 5' - hopper 52 1 83.15 AGTAAGCGAGCTTTTAATTTTTGGCATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 22469159 5' - hobo 2893 1 74.00 AACTCCGGTTTCATGCAAATGTGCCCCACTTCGGTGTTGTTTTTCCGACGAGTCGCCCCCGCTTGGCCATCAAATTGCCCTCACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr2L 1335387 5' + jockey 4671 1 79.21 GGGCACTTTTATAGCTTTCTTTTACTATTTTTGATAGTCGAATAAAATAGATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGC:1 - chr2L 17560197 5' - 3S18 6037 2 56.44 AGAGATTGGAAAGAGTACTTAGTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 24169933 5' - roo 355 2 78.22 ATAAATATTCGCCACTGCCAATAATCATAACATTAACTCAACCGCCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chrX 5997241 5' - 1360 3359 1 57.43 GAAATATCTAGTAGTTCGCTGGCATCAAATTGATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAA:1 + chr3R 25271669 5' + invader4 39 2 60.40 AAAAGTTTCGGCTGTGTAANTATTTGTTTAGAATTCCGCACGCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTGC:1 - chr3L 771831 5' + roo 33 2 55.45 AAAACATTCTCTGTCACACAGCTCGTGGTACTATCTGCATACATATACGCTTACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chrX 4240766 5' + 297 16 2 64.36 ATTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCG:1 - chr3R 15021691 5' + invader4 2746 1 44.55 AATAAATCCCTGTGTTTTATTTTTGGCTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGA:1 + chr3R 15573945 5' - roo 53 2 78.22 TAAAACTGATGCGAAAACTTCTTTATTGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3L 25120227 5' - pogo 2059 1 78.57 AAAGTGTTACAATGTTTTGCTGATATTTTTAAACGCGTTACTCACCCGTAAAAGGGTATATTAGATTCGTTGCAAAGCGTGTAACAGTCAGAAGGAAGCGT:1 - chr3L 23490410 5' + INE-1 31 1 82.18 TTCTCCTTTTGAAAAATCTCCTCTGGGGAATCCTGGGCAGACAGTTTTTGACGAGCACTTCTTAATTTTTAAGTAGAAAAGGAAAATTTTATCTAGTTATT:1 - chrX 4012213 5' - G5 4708 1 67.33 AAAATTAAGTATTGTTTTCAAGTCAGTGATGGAAAATAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAA:1 + chr3L 16663764 5' + jockey 4911 1 41.58 GTGGGTAAACGCTTAAATTCGACAGCCGTCTGACGCCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAGAGAACCGTTACATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGTTCAGAGAG:1 - chr3L 19338580 5' - Tc1 122 1 62.38 ATGAAAATTTCGCCCTGTGCACACACGCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr3R 13520174 5' + jockey 4709 1 63.37 GAAAAAAGAGGATATAGATCCGGCTGTTGGCCGAGATTAACTCGAATGAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAA:1 - chr3L 10548256 5' - Cr1a 211 1 56.44 GCCTCACGCCTCACTACACACATCGAATTCATTTCATATGCCAACCCGTCATCAGAATCCCCCCTCGTCTTCAAGCGAGTGGCATCTGTTAAGAAACCACT:1 - chr3R 16558865 5' + Chimpo 3972 1 70.30 GCCACGTGTACGCACGAAGGGGCGTTGCGAAACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCCATCTTGTATACAATTTTACCAAAGACACTAGAATAA:1 - 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chr3R 14980565 5' + 412 15 2 64.36 GCGGTGTTTAAGATCTGAAATATGGAGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chr2R 6041659 5' - opus 7497 2 75.25 AATATAAGCCCCGAACAAGTTCTCGGGTAAATAATTAAATATGTATCTTGACTCTTTATATTCGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 17109739 5' - roo 398 1 69.31 TTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCC:1 - chr2R 12185413 5' + accord 21 2 54.46 ATGGAGTTCGGACCAAGGGATACCTTTTGCCAAATAACAAACAGAGCTAGTTGGTCCGGAGTAAGCAGCACTCACCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr3R 30611337 5' + blood 7013 2 76.24 TGGTGAGGGGGTGGCAGTGTAAGGGCCAAAGAGAAGGGTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 + chr2L 9319055 5' - jockey 4958 1 62.38 TTGCACTTGCAAGTAGTTGCACAGAAATCATTTACTATTATTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACTTCCCGTCCGGCTCGATTCGCGAGAAGAGAT:1 + chr3R 2561830 5' - Cr1a 4378 1 60.40 AGTTGCAAATGGTGCAGTGCCACATACATTTTGGTGTTACTCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr2L 18500374 5' - Tirant 8473 2 58.42 AGTAAATTCTTATAAAAGAGTTGAAGTTGTGTGGCCAAGAGAAGCAACATCAGCTGCTTCGATTCTGTCTGGGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGC:1 - chr3L 17199896 5' - Doc 498 1 78.22 GTTGGTCCTGCGTGTTTGTGTCCACGCTAGTTAGCGCCTGCGGTGGGTTTGTGTCTATGCTGTGCGCTGCAACGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTT:1 + chr3L 22616956 5' + hopper 6 2 73.27 GGCGGTGGGAGGTGGTTGGCTAGCCCAGGACGAAAGCGTGTTTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chrX 12378753 5' + hobo 33 1 59.41 AAATCATTCCAAGCCCCTCTTCTATGTGGCATCCATCCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTTCCTC:1 - chr3R 5133144 5' + Doc2-element 451 1 62.00 GTGTTTGCAAGCTGTGAGTTGTAAGTTGTGAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3L 6866185 5' + 412 45 2 69.31 ATAGAGCGGTATCTCAATCCGGATCGAGTGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACAGGGAA:1 - chr3R 4773396 5' + Tirant 8152 2 68.32 GAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGTAACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCAC:1 - 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INE-1 559 1 53.47 ACTCAGTGAAGTTCCTTCTCCAGCTTGCCCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCA:1 - chr2L 5958121 5' + I-element 4979 1 72.28 GTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGGCACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACATAAGTCGCG:2 - chr2L 9319111 5' + jockey 35 1 50.50 AGTTCTCCTGTAGTCCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 + chrX 21400804 5' + P-element 60 1 20.79 AGAGTGACAATAAACTAACTTTCTTTGTGGGTGAAATTCGTAAAGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 18769576 5' + roo 8696 2 58.42 TGTGAGGTACAACTTGCGGAAGCTACTTGATTTCACGATAATTCACTTCAAAATATTGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3R 25422072 5' - copia 238 1 69.31 ATATAAAATTATTGAGTGCCATTAGATTAGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 16680136 5' + 412 7101 2 75.25 TTGTGATGTTAGCGCATTTTACGTTACGATACCCTGCATCGTCTTCCCCCCTTCCTCCCCACCGTTTGGGTTTCTTTTTTTTTTTGTTTATTCCTCGAAGT:1 + chr3R 29564632 5' - Osvaldo 1514 1 72.28 TGGGAAATTGTCAACATTAAGCGGGTGGCAATGTATGTACATACATATATATGTAGAAGGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAAATATAA:1 - chr3L 17836667 5' + mariner2 781 1 56.44 AATTAAATATAAACTAAATTAATGTTGTTTTTTTTTTTAATTTT:1 + chr3R 20332727 5' - gypsy7 5011 3 90.91 ATTGATCGTTGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chrX 7534698 5' + Tirant 8142 2 64.21 CGGGGGCGGTTCACACATGTGTGTTGGGTTAGTTGGAGATAGGTTAAGAGCAATTGGTCTTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACA:1 + chrX 13268847 5' + 1360 17 1 59.41 AATTAAGTATACGCAGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3R 14980553 5' + 412 27 2 53.47 AAATAACAATGAAATTGTAGAAAAAACCCGAGCCTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCC:1 - chr3R 13799424 5' - micropia 5213 1 66.34 TTGATTGTCAATCTGCTGACATACAAATGAGAATGCATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 - chr2L 13913317 5' + HMS-Beagle2 6920 2 63.37 ATAATAATACTTGTCAATACTTCGTTAATACTTTTTTCTCACATATAAGTAGACTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 12717783 5' - pogo 2085 1 63.37 TTCAATTCTGAAAGCACTTAATACCGGTTTTTCCAAGTGTAAGTCAAAGATCTTGCGAGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr2L 11234898 5' + hobo 37 1 62.38 GGGTTTGCTCTTGAAATCAAACGTATGACTAACCGCCTGATTGTTTTCCACTTTGCAGCAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAC:1 - chr2R 15947643 5' + Doc 451 1 62.38 TAAAAAGTTTTAAGTGAAAATGCGAATTGAATTTGTAGAGAAAAAATAAGAAAGTGCGCGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:2 - chr2R 24500912 5' + Tirant 8129 2 57.43 TGAGCTCCTACTCCGTTCCTGCTGCGGTGCCTGTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1 - chr3L 12238894 5' - jockey 4969 1 62.50 GCCGACGTCAATAACCACCCACTGAAGTGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAATTCAAG:1 + chr3R 16694408 5' + Max-element 358 1 72.28 GGCGGGGCACATTCTAATGGAGCTTGGGGCTTCAGCAGTTGCATATTTCCTGTGAGTTCCCGGCTAGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGTTGGAAGGAGGAGC:1 + chr3L 22071290 5' + Rt1b 4900 1 59.41 CAAAACAATTAAAAACAATCTCTGCGTGTGCACATAGCTGTTTTCCTATTATTAATTGCATATCAAGGAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATT:1 + chr2R 1339964 5' + hobo 2636 1 72.28 TTAGATTTCGAAGCCTACTATGGAAATCACCACAAAACAAGAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTTAAT:1 - 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chr3R 5773234 5' - Stalker4 386 1 56.44 TGAGGCAGGCGGCGAAAGAAAGAAAGAAAGTACTGGTAACGTGCCTTGCTTTTTGGCTAACCTGATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 15117585 5' - roo 396 1 68.00 GTCGAACAGTTCTCGTCGTGGTCGTCGTCGTCATCAAAAATCGTTGATTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCG:1 + chr3L 12261275 5' + P-element 348 1 49.50 TATTCAATACAAATTTTATTTGTGTGTGTAATTTTATAGAGAACACGCATAGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 25120159 5' + pogo 23 1 56.44 AATGAGGTGTTGAGGGTGTGATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATGGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:2 - chr3R 7618690 5' + Doc 58 1 76.24 GTGTATACGTCGGTTAAAACGCCGTATCAATTAATTTTTTATATTTATGTAAGATTGGTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 - chr2L 22107423 5' - flea 222 2 60.40 AAAGAAGATGAAGTATAGCAGCAATCGAATTTGAGTCGGGCGGTAGACATTCGAGTGTACAGACCATGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chrX 2123771 5' - P-element 2878 2 63.37 AGTTGTACATCGATTTTTTNGATGATACTTTTCCTGATACTTTCAATACTTAGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3R 7869202 5' - 297 6957 2 60.40 TGTTTCAATAGCCGCCTGTCGCTAATCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACAT:1 + chrX 9463160 5' + diver 38 2 60.40 GGAACGGCCAAGGAAAGTTGCTGTCAGGTGGCCGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr3R 9870359 5' + F-element 54 1 65.35 GGGCACAAGGCAAATAAATCTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 14690965 5' - roo 352 2 84.16 ACAAAACCTAATCTCGTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTG:1 + chr2R 5284539 5' - Doc4-element 2640 1 65.31 GCGCTAAATACAAACTGAGAGGAACCAAACGACACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr2R 10874727 5' - P-element 2844 1 34.65 ATTTCGACGGCGTCCATGGCTAGCCTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGC:1 - chr3L 22976565 5' - G2 2695 1 75.25 AGCGAAACAAACATCAGAGAGAACAGCAAAAGCAACTTAAAAAGAGCAACAAAAGAGGAAATTCAATGGAAATCTTTGGGAAACACTAAGCTTTTTCTCTT:1 + chr2L 17559074 5' + Idefix 366 2 78.22 TCTTGTATCTCCGATCATTGATCGTTGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 - 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chr2L 21220826 5' - I-element 5321 1 56.44 AATTAAAATCGTGTTAATTTCACATTAGAGCGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCA:1 + chr3R 22318031 5' - R1A1-element 341 1 69.31 GACGTTAAAAGGAAAGTTTCTTAACCGTACAAGATAGTAAATGTTCATAAGCTTATTCGTGCTGATGTTGAGAGTCCCGCTAGATTCACTAGTAACTATAT:1 - chr2R 4938400 5' + Cr1a 4116 1 53.47 AGGGTTGGGCGGGTAGTTAGTACGGAGTTTTGTAATCAAGCCCTCGTTATTGTGCGCTACGGCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 - chr2L 12720825 5' - Tirant 8489 2 62.38 GCATTTTTTACACCGAAAATATTAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:2 - chr3R 20284785 5' + pogo 47 1 77.23 ACACCCACCCAGTTATGTGCGAGTATATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr2L 12779614 5' - flea 213 2 76.00 AATGATTTGCGAAAACTGGATGAAATAGAGGTTATATGAACTATCTACCTTTATTTATATAAAGGTAGATATGGTTGGTGCAAAGACACTAGAATAATAAT:2 + chr2R 11728508 5' - Tc3 311 1 73.27 GACAGCACTGCTGGCAATACTGGCTGATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr2R 15201506 5' - P-element 2840 1 32.67 ACCAAAATTGGGAATATGTATGGTGTCTTAGAAGGCGACATAAATTATTGCTTTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTGGCTGC:1 - chr2R 10777884 5' + pogo 16 1 61.05 TAATTAAGAAATGCCAGCCAGAGTCCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:2 - chr3L 13568162 5' + jockey 62 1 71.29 ATCCACTAAATACTGTTCCATATATCAAGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr3R 22494713 5' - 1360 3345 1 74.26 GTTCCGGTTTTCTTTGAAAGACGCAGGTTGTATGACGTTATGCTACTGTTTGTATCGTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr2L 21628949 5' - P-element 2871 1 64.36 GACGGAATCTAACGATTGCGAACGCGTCGTATCTTGTTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3R 13685250 5' + Tirant 8 2 73.27 ACGGAGCTAAACACGTAACCGAAAACTTACATGCACAAAATGCTATGCAATGGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAG:1 - chr2R 8301881 5' - blood 148 2 69.07 TGATTACGTTTATTCATTAACTGATTGCACTAAAAGTTGCAGTTATACGATACTTAGGTGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chrX 8983006 5' + 412 7068 2 63.37 AGCTTCAACCACTGATGTTTTCTGTGAATAAATGTCTGTGTGTGCTTATAAAACTGTACAGGGGTGCAGAAAATAAACGTTATTAATAAATTATTATTATT:1 + chr3L 11836801 5' - invader3 5048 5 90.10 AAGAAGAGCGAATCAAATGGCATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCATGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3L 10683490 5' + opus 7030 4 70.27 AGTTTTATGTAAAGCAATGGGTTGACATTGGTACTAAAAATCAAAGAGGAATATTTTATATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 - chr3L 22112920 5' + diver 20 2 60.40 AGCAGCTCTGGCCGAATGAAGGTAATAAAAATCGTATAAATAACCAAAGCTAAAGACAACAGCGGCAAAAGGACTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGAC:1 - chr2R 19866316 5' - G2 2748 1 75.25 TTTTATTTGTATTTAGTATGTAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2L 13334855 5' + hobo 50 1 79.17 GTTTACCTTATCACGAAATTAATAAATTTCAACTTGCTTTAACGCGCCTTGAAGTCCACTTGTTTGTCTTTTCGATTTTATATGATGGTTGCACTTGGGCA:1 - chr3R 13502908 5' - Porto1 76 1 71.29 ACTCTGTTCTACCTGTTGACTTGGCCGTTTTTATTACCACAACTTGTCACACTGACTGAGTTTTCCCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGAT:1 + chr2R 10778506 5' - accord 7222 2 69.31 TGAGAATGACTTCCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr2L 20271212 5' + blood 32 2 57.00 TTGCTCATTCGGCCGTTCAACGTTCGCCGTCTTCAATTTTTCGCATCAGTTGTAATCCGGCTCGAAGGACCAGTTTTTTTTTATGTTCATAAATAAACCCG:1 - chr3R 24972207 5' - 3S18 344 1 57.43 TTTGCACACCTGACCCCAGNGGTAGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 9904643 5' + hobo 51 1 75.25 GATCATGAAAACCATTAACNTTCCAGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1 - chrX 22689191 5' + Transpac 4966 2 74.26 TTCTGTATGGTATTAAATATGCATTAGCTGCGGCTACTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:1 - chrX 5452613 5' - mdg3 5459 2 66.34 GGAAGAACTCCTGCGAGTCNTTGTTATTCAGGTCTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2R 19513370 5' - roo 9031 1 63.37 GCCTTAAAAGCCATGAACATGTCATTGTCAAGGACTTGCTAACTCAAAAACACAACTCAAAAATACGAGGCACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chrX 13012189 5' - hobo 2936 1 74.26 GAGAATTTTCGTTTGCTGCTCACGTCCATAGAATCCAGCTAGAGGATGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 5255984 5' + jockey 36 1 55.29 AGATAATTTACAAATAAAGCAAATTTCTGTTTTAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr3R 11840574 5' - copia 247 1 64.36 TATATATTTTTCTCATTTCTTTATATTTATTTATAAACCGACTTAGTAAGATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr2R 16979727 5' + 297 6603 2 59.41 GCATTTCAATTTCAATTTTGCAATTTTGGCAGCTGCCAGGTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 + chr3L 17110708 5' - hopper 1383 1 57.43 TACTCCTGCTGCGTGAGGCTGTGTCTATGCGTTTTTGTCTCTAAAATCTGTACGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTGGAT:1 + chr3R 22946947 5' - INE-1 151 1 66.30 AGTGCTATTTTCCAACCTGTAGTCGAGGGTAATTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 28475859 5' - roo 9031 1 68.42 TTTCCAAAGCATCAAGCTCATTACAGTGGCAACTGCCTGCTGATGGACGGTCGGTTCGGTGGGGCTTATGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAAC:1 - chr2L 15246870 5' + baggins 5055 1 75.25 GAACAAAATATATGAATTACAGTAAATTTGAATAATACAAGTGTGCCATTTGTTCACATAATAAAAATTGTTGTCTAAGAAATTTGAATTTGAATTTGAAA:1 - chr3L 14920470 5' - Rt1a 311 1 79.21 GCCCAAACTTTTCAAAAATGTGTTGATATTTTTCACATTCTTGTAAATTTCCATCGATTTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGC:1 + chr4 1221164 5' + INE-1 567 1 46.53 TACCCAATATTTAGGTGCAATTTAGTTTGATTTTTTAACAGCCAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 12878977 5' + roo 33 2 62.38 TTCGAAGACAGATTAAAAGTATAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGGCTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAG:1 + chrX 19458408 5' - Doc 4505 1 77.23 GAAACACAACTTCTGCATGTCCTTTGTGTGTAAATGCATGTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chrX 17873172 5' + 412 7087 2 60.40 TTTATTACTAAAAAAGCATATTAAAATTGTGGGCTACTAGCTTTAAGCAACCCACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 - chr3L 5808252 5' - 297 384 2 67.02 AATTCCAATTCCCCGCGATNCTGCAACCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr2L 15479566 5' - blood 7341 2 74.26 TAAATATTACCGAGGAGCAGCGTGTGTTGGGACTTCAGGTAAGTCCAAGTCCTTACTTTCAACGTTCAATAAATAATAAATAAAGTAATATATTAAAA:1 + chr2R 10317700 5' + BS4 723 1 65.31 AGGAAAGTCTTAAAAAAGGTCTTCAAACGTACTAAATATAACAAATAATATATATGATAATATTTATGCTACTCATACATAAAAATAAAATATAATTAATT:1 + chr3R 29325518 5' + NOF 3958 1 67.33 TACATGAAATTCTATATCAACGAATAATAATACAGTACATAACAAACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAA:1 + chr3L 22946871 5' - X-element 4530 1 78.22 ATGGCCTGGCACGCTGACTGATGCCTTGATTGTCAATCTGCTGACATACAAATGAGAATGCATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCC:1 - chr2L 13913342 5' + HMS-Beagle2 6 2 71.58 TGAATATGCACATTTTTTAGAGGGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACGAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - 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chr3R 2689428 5' - diver2 4473 1 63.37 GCTTTTGCGACGGCGCAAAAATAAATTAAGTAAAAATTAATGTCACAACAACGCGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 - chr2L 14054808 5' + F-element 32 1 53.47 ACGATTGCGAACGCGTCGTATCTTGTTTTTTGCATGCATGACAATGTGTGCAGAATACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 - chr3R 13685239 5' + Tirant 19 2 62.38 TTAATAATCGATTTAAAAAACAACCAAAATATGTAAAATTTCTTTGGATATTTTTATATAATCATATTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAA:1 + chr3R 4554455 5' + INE-1 311 1 56.44 GTGTTTTGTCTCCATTTCCATCCAGAAACTGATGATACAGCAAGGCTCTGCAGGCATTGGCATAAGTAAACTCTTTTCTTCATTAAAGAGAAGAAAAGTAA:1 - chr3L 12805454 5' + invader2 4741 1 75.25 AAAAGGATTTCTTTAATAATAAAAACACACACAAAAAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr3L 19088023 5' + 297 6610 2 67.33 AGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3R 11278382 5' + hobo 26 1 54.46 GTCCAGGAGCTAGCACCGGTACCACCATCATGTCCAGAGATTACAATGTGCTCGGCTTTGCCCTGTTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTG:1 + chr3L 16792525 5' + Chimpo 4016 1 66.34 AAGGTTGTCAGTGTTTGGAGGGTGGTAATGGCACTATGAGAATCGGGGGCTTGAGGAGCTGCGCAGCTGGGATACATTATTGAAAATTACTAAAGTGCATT:1 + chr2L 20391295 5' - 297 6638 2 65.35 TAAATATTTCCGCATGAAACTCAATTCTTACAACTGATTGAATAACCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAC:1 - chr3L 7204107 5' + Tabor 6872 2 54.46 GCCTCTCCAATTCTTTGCCGTTCACAGACATTTGGCACTGAGTCAACTTTTCAGCATTCAACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr3R 3526001 5' + Doc 28 1 45.74 AAGCCCAACCGAAATGGGAATGAATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCG:1 + chr2R 8518255 5' - invader1 3973 2 76.74 TGAATCAAAATCTTTTGGATGTTATGGAAATCTTTTTTATGGTTTCTCTTTTTGGGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 18042811 5' - roo 9050 2 50.50 AGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTC:1 + chrX 23431615 5' + G6 39 1 59.41 TGTGGAACTCGAATAACATTAATTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 15547061 5' + pogo 40 1 75.00 AATGTAACGAGTGCCAGTAATGTGATTGCTAAATCCTCAATTGAATATACACAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAA:1 - chr2R 9811366 5' - Quasimodo 7350 2 63.37 AACTGTGTTTCGAGTTCATTTTTGATTCGATCGTTTGTTTTTTGATTGTTATCGATAGGCTCTAGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCGAATGTGGAAGGATTT:1 + chrX 11728796 5' + aurora-element 4096 1 59.41 ACATTGAAAGTATATTTAATTGAATAAAAGCGGTCGCGATATAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:2 - 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Gypsy6A_LTR 162 1 81.19 TTATAAAGAATTTTATTAAACGATTTAAAATTATTTAGATTATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCA:1 - chr3L 12595992 5' - Tirant 8424 2 59.41 GAAAAACTTTAAGTAATTCAAGTTGCCAGCCGGAAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTAC:1 - chr2R 15107283 5' - Ivk 5015 1 66.34 TTGACTTTTGCTGGGTGCGTGGTGCCTGCTTTATGTATAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:2 - chrX 14324741 5' + 297 6611 2 69.31 TTTAAGATCTGAAATATGGAGCCATGAAAGACATTTTTAAGCAAGCGGACAGTATATCCCCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 - chr2R 6041653 5' - opus 7491 2 69.31 GTTGCTAATTGATATTTATNCTTTTTTTGTACAAATTTGTCTTGTATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGG:1 - chr2L 7433965 5' + gypsy4 6602 2 70.30 GACATCGAGTTTGTTTTACAAAGGGGTGTAATTAAGCACATGAAAATTTCGCCCTGTGCACACACGCTCACTCGTCGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 + chr3R 13520135 5' + jockey 4670 1 73.27 AGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGA:1 - chr3R 4604457 5' + INE-1 160 1 58.42 TAAGCTTAGAGATTGGAAAGAGTACTTAGTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 24169926 5' - roo 362 1 71.29 TTTATATAATTAGTTTGTTTCTCATTTCTGAAGCCTTGTCACTTTCAATTAACTCTAGCGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 + chrX 3016628 5' + diver 19 2 60.40 GGGTTCACAAATCATAGGGTTTTAAAAATGTTTTTATATATTTCTCATATATATCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chrX 13379772 5' - 297 374 2 60.40 TAGATCTTCTTAAAGATGTCGCTTTCGTATATTTTCGAACTAAGCTTAGAGATTGGAAAGAGTACTTAGTCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 24169886 5' - roo 402 1 71.29 AAGTTTGTGTATGAAAGCANTTCTTTTGATTCTTCTATGGCTTGTCGTTGTGTTGTTCATTCATCTCTTCTCATTTCGATTTCGATTTCAATTTATTTGTT:1 + chr3L 5633053 5' - Doc2-element 96 1 68.32 ATAAAACAATTTGACATTTNGTGACCCCTTGTATATTCATTATGATAACTCTTTGGAATTTAACAAACATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATAT:1 + chr3L 17905391 5' - copia 4673 1 70.30 TTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTAT:1 + chr3L 20729694 5' + micropia 3 2 74.26 GAATGGTGCACTGGCAGAATTGTATTTCAGAACCCCAACAACGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGT:1 - chr3R 32033118 5' - hobo 2664 1 58.42 AAACACCCCTTTTCCAAGTAAATCCAAAATAATACGCCTATTTTCGCTTATCAAGCACTTAACCCTTTGTTGCCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chrX 7802952 5' - hopper 1414 2 74.26 AACGCACCAAATGCAATAAAGCAAACTACGCACTACGCGTAGTTTCCCCAAGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAA:1 + chrX 11060739 5' - R1A1-element 5267 1 57.00 ACGAAGAACCCAAATTAACGAAGATTGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGAGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 - chr3R 9858887 5' + BS 45 1 71.29 TATGGCCCAGTGCCCAATCCAATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATTAATAAAAGGCGAAACCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAAC:1 - chr3R 3622519 5' + rooA 7552 2 79.21 TACTAAACACAAAGAAAAAGGCCAATAATAATGACACTTAATAAGACATTGAATGATTTAAAATCTAGGGAGGCATGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTG:1 - chr3L 457131 5' - Doc 219 1 73.27 TATAGTACGCTGATTTCTATCTTATACCTGCAAGTGAATTTAAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:2 - chr3L 10395939 5' - copia 256 1 58.42 AACGACGAGCGCACGCACANAGCTGCAGCTGAAGCGGCCGACTCTGACAGGTCTCGCAGATCTGATGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 11278362 5' + hobo 6 1 63.37 TTGCATATTTGTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTAAAT:1 - chr3L 5749462 5' - transib2 2637 1 77.78 TCATCCAACAGTTCGCCATTACCTTCCGCCATTTCTGCAAGTGCAACGATAATAAAATGTTATAAATATATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr3R 20791757 5' - pogo 2100 1 78.22 ACCCACTTTTCCGTACGAGAAACGTCTGGGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAAT:1 - chr3R 16150122 5' + F-element 274 1 71.29 AAGAGCTCCTTTGGCGTTGTGGAGCCGACGTTTAGTTTCAGCTTTGCGGCGGGAGCGATATCCGGATCGGTAAGACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chrX 19614883 5' - Tc3 312 1 79.17 AAAAAATTTTTATAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 + chr3L 13260939 5' + HMS-Beagle2 481 1 83.87 AGTGCTCTCACGAAATAAATATTTGGCCAATGCAGTAATGTTTGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:2 + chr3R 28216793 5' + blood 32 2 54.46 ATGTTTTGGAGAACCGCTGCTGGGGGAGCAGCAGAATTCTGCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCT:1 + chr3R 20430766 5' - hopper 469 1 59.41 TGTTGGCCAACTTGTTGTTACCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTAAGATACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1 - chr3R 20345141 5' - transib2 2770 1 77.23 CAGACAGGCGATGCCCATTTGGCGGTTATTGCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTA:1 - chr2R 11583494 5' + Doc 4609 1 69.31 AGATTTAACCGCTTTATTTGCAGTTTTATACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGTAATTCAGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCAT:1 + chrX 20283007 5' - Ivk 4945 1 77.23 ACAATGTTATTCATTTAGCTTTGCGCTCGGACATCACCTGCTCCCACCCGCACACCATCTTTACGGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGA:1 - chr3R 10783027 5' - Doc 64 1 73.27 TGAGAATGGCGAGAATGGAGCGGTGGGCGCGGATTGTGGATGTGGAAAATCAGAGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chrX 10426872 5' + 412 7074 2 57.00 AAAAAAGCGCCAGCTGGTGAGTTAGTTGTGAGGATATGGTGCTTTTGGGGGAATGTAAATGCTTAACAGATTTGCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTA:1 + chr3L 7173582 5' + opus 365 2 74.26 AGTGTGAGCGACTATGCAAAAGGCAAGACGGAAGTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 14980539 5' + 412 7094 2 67.33 AATTTGTCTGCGGGCCAAACACCAATTAGAATCGGGCGAGATATGGAATTGTGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chrX 21056919 5' + Tirant 17 2 61.29 GGAAAGGACAACGTTATAACCAAGGAAACAGATAAAACAATTAGAAGCAATGCTCTTAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATT:1 - chr3R 908312 5' - 1360 253 1 65.35 TGTACGATAGCTGATCTACCCTTTAGTTCCCCCCTATAGTTTCATGCCAAACGGAACCTACATTGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 11661068 5' + 1360 9 2 70.30 TGGGCAACCGCAGGCCTCACCCTTGAGTTGGTCAGTTTATGATTGCTACACTAATCACGGCCCACTTCGATGGGTGCACGCTTTAGAATCCGGCTCTGGCT:1 + chr3L 11407570 5' - Gypsy12A_LTR 2200 1 73.27 GGGAAGATTTCATGACGATTGTGCCTAAAAGTATGCAAGAAACGGGGATCATCCCAACTTAAGGCATACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTT:1 + chrX 10921810 5' + pogo 1745 1 75.25 GTTTATAGATGCCATGAAAAGTGTGCAAAGCAATCCTATGAATTATTCGTTGTCCGTTTGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACT:1 - chr2R 11575193 5' + INE-1 141 1 69.31 GGCTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCA:1 - chr3L 12634202 5' + BS 5051 1 80.20 AAAAACTGAAAAAATTCATTTCGGCCCAACACCCCACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCT:1 - chr3L 14616116 5' - invader2 4779 1 65.35 ACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAA:1 - chr3L 23678150 5' + Osvaldo 23 1 75.25 AATCAAAATCTTTTGGATGGTATGGAAATCTTTTTTATGGTTTCTCTTTTTGGGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2R 18042813 5' - roo 385 2 52.48 GTAGGCAACATTGTTGTATTTGATATTTATCAATTGTGGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr2L 8267338 5' + jockey 4709 1 68.32 GGCCACCGCTCGTCTGAAATCCGCGTTCGACACAAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGA:1 + chr2R 7735586 5' + 412 7150 2 66.34 GAAACTCCTTAAACCCTGTGATAGGACTGCTCCGCAACTCGGCTTTGTACCACGGCGCGTATGTGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGA:1 - chr3R 29605678 5' - 1360 3192 1 63.37 GGACAGTAATGTAGGAGGCAACCTCATTTAAAGAGACGACTCATGCGGTTCACCCTTTCTTTTATTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:1 - chr2R 6074461 5' - 412 7536 2 66.34 AGCTGGTAAAAAATGGTTTATCTCAGTTTCTGTTTGAAATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr2L 2309454 5' + Burdock 6169 2 61.39 TATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCTAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACG:1 - chr2R 7516827 5' + X-element 4371 1 69.31 AAATCGCTTTGTTGTAAAANGTGTTCCGTCGTGGTGAGATCCACAGTTTTGAAGCCGCGGGTGCTGGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 + chr2L 8690503 5' + Tirant 8113 2 69.70 TGTCCTGAGTCTTTAAACCTGTTTGCAATTGAGGCAACGTTTTTTTTCCCTGAGGAGGGGCTCTAACTCGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCC:1 + chr2L 21147065 5' - Juan 304 1 73.27 TTTATGGGATCAATTGTGTATGCTCAAGGGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAG:1 - chr2L 17748367 5' - Doc2-element 4381 1 71.29 GACAGTGGCCTTGAGCGTCCGCCTGCAGATGCGATACTACGTGCCCGCTAGCCTGTCGTGGTACCGGCTGGATTGCATGTTTATTGCCTCAAAGA:1 + chr2L 13307440 5' - BS3 1455 1 52.63 TTCCAATTTACTTTTTTTCTTCTGCTGTCGTTTTTTTTTTATTGATTTCTTTCAAGACCGGAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGGTGA:1 - chr2L 19949973 5' + transib2 146 1 61.62 GGGTGGGGACACCCGAGATAAATGGCCAGATACAATTGTATCTTTATTTGAATGCCTTCGGCATTCAACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chrX 19219290 5' + Doc 18 1 59.34 GTTTCGACTATGCGCAGCGGACAGACTGATATTGTGGGCCTGGGGCCGAAGAGTTTTACGATCGCTCGGTTCGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3L 5355317 5' + P-element 4 2 75.25 GGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCTGTAATGCACTCTAGTAAT:1 + chrX 21581123 5' + 297 51 2 76.24 TTGAGAATTGGCAGGACACGTGCCCTTTGAATGTATTTTTGTTGATACTGCCGTTATTGTCTCAATGGCAAGTTTTATTTGTAAGTCTCGGTGTATATTCT:1 + chrX 6147247 5' - Doc3-element 4439 1 55.45 ATATTTTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATCATTCATAACCGTCTTCCTTTTCACAATCAGGTTCCTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACA:1 + chr3L 23969667 5' + hopper 268 1 61.39 AGCTCCAATCAAATTGCAGGCAAACAGACTCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTAATCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 9471219 5' - roo 359 2 75.25 AGCAATGTGACGTTATCTTATCACTGAAAATGTCGAACTGCATTTTCCTTGTGCCCCTTCGACCATATAAAAAATATATATTCTTGATCAGGATCAATGGC:1 - chr3R 16005111 5' + INE-1 86 1 68.32 TATGGTAATATTTGTGCATTCTATCCAATGGATAATTAAATGGAATCGAAAATGAAAACATTGACATATGTGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:2 + chr2L 6322505 5' - roo 405 1 75.25 AAACACATCGCGCCGAACATGGAGACCTAACTAAATATAATTATGCAAGTGCCGCAACTTTGTTTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATGCTTCACTTTGC:1 - chr2R 18095071 5' - gypsy4 457 1 70.30 GCTGATGATTTGCCTTTCCGACTGGTGGTGGTCTGTTTGGTCAATAAAAGGGCAACGTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chr2R 23450284 5' + jockey 4757 1 58.42 AAACAGATGGATGAGTTTCAGACTGCCAACATGCCTTCGAAAACAAATGCATTTAATACTGAAATTTTAATTAGCTGAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr2R 11941187 5' + Doc 20 1 61.39 ATCACACACACAGGCCGCCGTATTGTCGTTTGTGGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2L 17865677 5' + hobo 43 1 71.00 TGGCAGCCAATTTAGGCAATAACTTTTAATAATATTGCTAAAAATCACTGAAATCCGTGAGAAAAGTGGTTTCACACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAAT:1 + chr3R 29528114 5' + G6 1836 1 70.30 GGTCATTAAGTTGAACAAGTTTTCAAAAATTGTGCTCTACCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCT:1 - chr3L 3328976 5' + G2 2672 1 60.40 GTGATAAATACAAAATGATGAAACATCAAATTTGCATTATCTAAATACTCCTGTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 + chr3R 18342450 5' + F-element 36 1 49.50 ACCATCAGACAATACCAGTACATTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTT:1 + chr2R 982341 5' - rooA 306 2 66.34 AAAAACTGTCAACTCTGCTTTCTTCCCCAAAAGCGAACACGGAACAAATGAGACCTCGGGTAAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTA:1 + chr3L 18378089 5' + Porto1 4255 1 74.26 AAATCAAAAGCCGTCAAAACACCGAACCTTGCTGGTTGTCGCGCATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 16594473 5' + Tirant 8136 2 53.47 AACTCCAACTCCAGCTCCAACTCCAACCGTTCTCCGCTCGATTTCTTTTCATATAATAATTGCATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3R 28591558 5' - blood 363 2 64.36 TGGGAATCGAAAGCCCACTTAGCTACAGCCCATTGACCAAGAAACCATAATGACCATGGGCAACTACTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTT:1 - chr3L 17082054 5' - I-element 136 1 72.28 TGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTA:1 + chr3R 19589937 5' + BS 5035 1 62.38 GAACTTTTCAAAGAACTTTAACCAAGTTTAGGAAAACGGTACTTGTACCTTGGAGTAGAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:2 + chrX 10996503 5' + 1360 12 1 67.33 AATTATAGCTAAACTTCTTAAAATAAATTTTTATCTGAGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chrX 11009559 5' - roo 9033 1 69.31 TTCAGGTTATCTGCCGGCAGCTCTTCGCCGGCACCCTCTTGTTGTTTTAATAATATATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 + chr2L 4764007 5' + Tabor 6859 2 59.41 GGAAATGCGAGTTTGTCGCCCTCTGCGTGTCTGTTGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2L 19997254 5' - roo 9030 1 62.00 AAGACAATGACGAGGACTATTCGCCAAAGAAATCGGTCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCGCGGAACTTAAGGAAAAATACCAT:1 - chr2R 7524080 5' + F-element 4432 1 62.38 AATGAAGACATAATTTGACATAAGCGATGTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTA:1 + chrX 13937272 5' - flea 294 1 71.29 AGCAGTGGCAACTACCACCACTGCATTCACAGACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr3R 20345104 5' + transib2 42 1 67.33 ACAATTTTTATTCTTAATTTTTGTATCTAAAATTGTTACTATTGTTTTACAGCATAATTTTATTATTTACAAATGAATTAAAAATAATATTAATAATAAAT:1 + chr2L 15852478 5' + mdg1 43 3 32.67 GATTTCAATCATAATGCTTTTTAATGGTTTAATTTATCACGAGGGGAGTAAACTAAGCTGTTGTCGTGTTTCAGGGCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTA:1 - 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chr2L 14054815 5' + F-element 25 1 60.40 AATTAACTTGTCTTGAGGTTTTCACAAAAAAAAAAAGAGGAAAAAAAAA:1 - chr3L 9873369 5' + Doc2-element 251 4 87.76 GGAAGATAATCTACTTGAANCATACTTTAAGGCGTATCTAACGGTCCTTTTAATGTTTAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chrX 12378674 5' - hobo 2921 1 58.42 TGCCCACATTCTGTATGGTATTAAATATGCATTAGCTGCGGCTACTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 - chrX 5452621 5' - mdg3 5467 2 58.42 TAATGCGCATACGCAGCGTNGTACGTTGTACATTGCTGGTAAAAACGCGGCCAACGTCAAAGGCAAATGGCTCAAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chrX 11025602 5' - hopper 1413 2 76.24 AAGATAATTCACTTCAAAATATTGCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3R 25422038 5' - copia 5073 2 79.21 TTGCATGAACAGCAATCGACGCATTCCTAGAAGAGAATCGCCCACAGATTAACGCTCTATATACGACTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 + chrX 18121803 5' + opus 3 2 74.26 ATTGCTGCCCGTCTCAACGCATTTAAAGTCTAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr2L 15983419 5' + hobo 45 1 68.32 TGGGTTTTTTATATACACTCTTTCGGAGTGGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 771776 5' - roo 9028 1 72.00 AGGGGCAGCTCCACAGCATCCACAGCATCCATGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTGACGCTACTGCTTTGAGTTACGCTGCTTGTAAAGCGTTG:1 + chr3R 13545639 5' - BS 461 1 69.31 TGCGCCATAAATTTGTTTTGCGCATGAGTCAATCTTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2R 20461018 5' + hobo 35 1 62.11 AACGAAATGAGGTTGCAGCGAAGGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2L 4571359 5' + roo 8716 2 77.23 AACGTCGTCGGTCCCAACGACAGCCAGATATCTAACCGTACCGGAGCGCGTGCTAAATGTCACCTTCGTCTTCGGAAGAGGCTAAACTTGTGCATTCGATA:1 + chrX 4949240 5' + diver2 4772 2 65.35 AGCTTTTACAACTCCTAGGATCAAACTTTGACATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATAT:1 + chrX 3507027 5' + Quasimodo 7191 2 70.30 AATCGACCTGGATGGACATCCCCAGAAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3L 24150509 5' + blood 7030 2 58.42 AGAAGCTCTCGTTTTTCAGNTTGTTAAAGTAGAATAGCTAGATCGAATTTGGGGAGAAGAATAGTATAATAGTTCATGACGTTCATACGGACAGACAGAT:1 - chr2L 20998743 5' - INE-1 125 1 91.00 TGCGAATTGTGGGTCAAAATAGTACAGTATTTTCTAAGCTTTAAATTGAAGCTAACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGG:1 - chr3L 12983252 5' - diver 201 2 54.46 GTTGGGGTGAGAGAGCTCAAATGTGAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chrX 7534691 5' + Tirant 48 2 73.27 TGGATACACTTCGTTTCAGTCATTCAGTTTTAAAACAAGTTTTGACTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 14708786 5' - roo 9042 1 58.42 GACTTCCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr2L 20271219 5' + blood 40 2 64.36 TGGCAAATGAATTGCCAGTGGGAAGAGCTGAAAATAAATAAGGATTAACAGAGCGGCGGGAGAATAGGGGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAA:1 - chr2R 13651722 5' - Cr1a 262 1 68.37 TAGCTCTTCTGTAGTGTAAATAATATTTGAGCATCATTTATATTTACATCAATTTGCATGCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr3L 22112619 5' + Doc 23 1 61.39 TTTCACGTTGATTTTAATGGCACTGGCTGCGTACGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2L 15909834 5' + Tirant 8149 2 70.30 AGGTGCAATTTAGTTTGATTTTTTAACAGCCAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3L 12878989 5' + roo 45 2 74.26 AGAAATTGTGTGAATGTAAGCCGTTTAACCTATCCCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3L 24150532 5' + blood 42 2 68.32 GTCGTGTTTCGTGCTGCTNTTCAACTATTGCATAATCAATTNNNAAATNNNTCACAAAATCAGTGAAATNNNNNNNCAAAACGAAATTCGTGAGCAACGTC:1 + chrX 23155890 5' + Doc4-element 4 1 84.16 AATCACTTACATATGTATGTACGTAAAAGCTGAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:2 - chr2L 15907214 5' + pogo 38 1 67.33 AACATTCATTACCACTTCAATAAGTTTACATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTT:1 + chr3L 6907347 5' + jockey 4866 1 72.28 AAGCGAGATACTCAAACGAAATGAGTATAGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTG:1 + chrX 17358059 5' + blood 7211 2 64.52 GGAGGTTGTATGACGTTATGCTACTGTTTGTATCGTTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2L 21628927 5' - P-element 2849 1 40.59 ATTTTTTATAGGTCTTACTAAACTTCTTTAAGTTTATTGCATCGTCAATACGTTTTCATCAGGGCTTGTTTATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACC:1 - chr2L 7126865 5' + Burdock 2 2 66.34 GAATGCATTGGGTATAAAATCGTAGTGGAGATACTTCTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCGTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATT:1 - chr3R 9078537 5' - mdg3 5077 1 74.26 TAGCAACTACACCCATTAAAATGAGTTCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGT:2 + chr3R 4536205 5' + Ivk 51 1 73.27 ATGAACAGCAATCGACGCANTCCTAGAAGAGAATCGCCCACAGATTAACGCTCTATATACGACTGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chrX 18121807 5' + opus 7 2 69.31 AATATAAACAAAAAACAGGAATTTAAAAAAAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCAGAT:1 - chr3L 19293050 5' + Doc3-element 4617 1 67.33 GCCTGGTTTGATAATGGCGCCAATCATTTTCCCTAGAATTGGAAAGCAGAAACATTTTTAATGCAATATTTATTAAGTAATTTTGCTTATCAACGATAAAA:1 + chr2L 14957493 5' - Circe 6982 1 77.23 TCCTTCCACACACACACACACTCACGAGTGTGTTGGCAACTCGCACACTTTTTCACGCCCGTGACCCCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3R 22251806 5' + Tirant 8115 2 69.31 ATGTTTTTTGTCGATTCTGGTAAATTAATCCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3R 10648233 5' + I-element 40 1 67.01 TAACGAATTACTCATGCTACTTGTAATGGAATGTCATAAATATTACAATAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 18179178 5' - roo 396 1 49.50 TTTAACTGTAGGAGTAATCCGTTCTACATGGAAATTTGCTTTAAAAATATTTGCTAACACAGCCGGCAAAATTTAGCTTTTCATTGTCGTGTAAGAGTTGG:1 + chr3L 11870360 5' + aurora-element 4183 1 68.32 AGTATGAGAAAGCTGAACCAGGTAATGATCAAGGCCATAAACAATAGGAAATGCAAACGTTTGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATA:1 - chr3L 6321213 5' + R2-element 3473 1 65.00 TGTGAGATACATTTGCTTTTTTGGCTTTTTGATTATTCGCGTCTTAAGATTACTGGGCCTGCTCGCTTTACGATTAAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGT:1 - chr3R 31370780 5' - I-element 5150 1 80.20 GGAGTTGAAATGGAAAATAAGCACCGTGACTGGTTGTAAGTCGCTCATTGTTGGCGTTTTATTTTTTACTTTCGTTTCGTTTTTTTTTATTCTTTTTTTTT:1 - chrX 3094772 5' + hopper 149 108 87.13 GGCATGCACTTAAAGAAAATTAACCTATGCCAAATAAAAATAAAGACCGAATCCAGTTTTCTGTGTCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 20422142 5' + P-element 8 2 50.50 CGGCGGCGACAGCTGTGGGGCGTTATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTACTCTG:1 + chr3R 7142859 5' - R2-element 217 1 72.63 ATTCTCATACATTTCGTATCATCTAATGCGCTCAGTTTTTTATATGGTTAATTTGGGATGTCTTAATGCATAGCATTATACTTGCTAATGCTTTTTCGTCC:1 + chrX 5596425 5' - Dm88 487 1 68.32 AGTTGTCCACACTGACAGCAACATCACTGGGGCACCGTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCA:1 + chrX 8510621 5' + F-element 4409 1 82.18 GGGGGAGCAGGTGAACTTGAACTTGGAGAGGCGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chr3R 15537363 5' + P-element 43 1 35.64 AACTACTCCCTGCACCACGTGCATATACACCCGTACATCATGTCCGGGGCATTGTTGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTA:1 + chr3L 17309122 5' + blood 7238 2 62.38 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCAT:1 + chr3R 22494745 3' - 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chr3R 25271642 3' - invader4 2771 2 64.36 GTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCGTAATTAACTTAAGTAAACATATATGAATTATAATTAAGTGCGTGTTTTTCCCTGTGTAAAAATAGCA:1 + chrX 3016733 3' + diver 216 1 70.30 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAAT:2 - chrX 15412676 3' - hobo 31 1 54.46 AATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACCAGACGGGAGCTCAGCTAAGTGAAATCTGCTAGAAA:1 - chr3R 15060347 3' - hobo 460 1 64.36 AAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCGAAAGCCGACTACACCGGAACGACCAACCCAGCCCAGCGTTTCAAGGATATTTTCTGCTCGCAT:1 - chr2L 15640176 3' + Doc3-element 4530 1 77.23 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACATGCATGGAAACAAAAGA:1 - chr2R 19557962 3' - 412 15 2 64.36 GAATATAATGTAAAATAACCATATTAAATATTACTGTTAGTAGTATCGAATTATGTAATTAAATGGACATTTCGACAGCTTGACATGTGTGTACTCGTAGG:1 + chr3R 31020656 3' - Cr1a 4319 1 62.38 AAGGGACCACCTTATGTTANTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAGAGCGTCGGCGTGCCGATTTAAGGAAAGCAACGGTACCAAGCTGGACTTT:1 - 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accord 7100 2 79.00 TAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTAC:1 + chr3R 10736129 3' - McClintock 5967 2 63.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAATTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACG:1 + chr2L 7461122 3' + roo 385 2 57.65 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTAAACAA:1 + chrX 6338933 3' - P-element 46 1 34.65 TTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATCATGAGAAATCTACGCAGTTTTTTTTG:1 - chr2L 11919265 3' - X-element 23 1 61.39 AGCCCAAAATTGTAAGNCTTTAAATANATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTCTTTGTCCCGAATTAATTTGAAGGTAATTTCGATACTCTGTCCATGTAA:1 + chr2L 12182685 3' - roo 27 2 54.46 AAATCATTTTAAAAATTATGATATGGAATTATATTGAGTGAATGGGATTTAATATATTACATTCGTTCTTTATGAGAAAGTATGTTTACAGGAAC:1 - chrX 19130016 3' - Juan 3777 1 87.37 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCACTTAATACATAATTCGTGTA:4 + chr3R 13544157 3' + roo 9052 2 59.41 TTTGAGACCTTATTGTAGAAGGTCGGTGTTCTTCTGAAAAAAAGTTTTGAACGCAGGCGCCTTGCCAATTTTTGTATCATACTTATAAGTGGA:1 - 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Juan 3850 1 75.25 GAAGACTGTGGAATGCCGACTGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAAAAGGCCAAACACAAACACGTAAAATGATTGCAAAAGCCATT:1 + chr2R 14586525 3' - Doc 3 1 74.26 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAA:1 - chrX 21056921 3' - Tirant 27 2 54.46 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTATGCCACATTGCCCCCGCCTGTCTGCCGGACTAATTAGCTTCCTTGGCTGCTTGGCTCCTTGTGTGATCT:1 + chr2L 12602877 3' - opus 111 3 79.21 AAGAAAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGC:1 - chr2R 18937307 3' + Doc2-element 220 1 70.30 TAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGTGTGGATCGTGTATCTGCATGTTGGCGCTGGATCGCT:1 - chr2L 2219421 3' + Quasimodo 308 2 63.37 GGCCCTATCAACCTTCCACNTAACTATATTTCTTTTTTAGTTGGCAATCAGATTTGGTAAAAAAGCGCAGGCCTTCATAATGCACTTCTGCAAAGTTTGCA:1 - chr2R 18077009 3' + Transpac 306 2 69.31 TGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAGAAAAAAATATGCAAAAATA:1 + chr3R 9359386 3' + Cr1a 4214 1 71.29 AGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCATTCTGCTAGCAATGTGGCAATGTGACAGTGTTCTTTTTCCCAGTGCAGCTGGTGGGTGCATGCTTCT:1 - chr2R 8769736 3' - G2 2869 1 56.44 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTATTGAGACTGACGCCACTCGG:1 + chr3R 4773424 3' - Tirant 17 2 64.36 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTAT:1 + chr3R 4773405 3' - Tirant 36 2 61.39 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATGAAAGCAGAAAAATGTGAGGCCATAAAAATATGTTACAA:1 + chr3R 20430851 3' - hopper 4 2 74.26 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGAC:1 - chr3L 25059052 3' - mdg1 9 2 70.30 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTGGCTGGGGCATGTT:1 - chr3R 12937437 3' + roo 361 2 76.24 TATATAGACAAATTATTTAAATGGCATAAATTGAAAAGAAAAAAATCGACTAAAAAATTATAACTTAATAAGGAACTTGGCCATTAATTAAGTCTTATACT:1 + chrX 16917019 3' - Tc1-2 1423 1 74.26 TTCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGGGGATGCCAACACGAAACCTAAACGAACTTTAAAATTATATTTGATAGCTGTCATTATTTGATTACCC:1 - chr2R 5879123 3' - INE-1 552 1 60.40 ACACAAATAAACATAAATAACATCATCTTGCTTATAAAATACCAACTTTTTTTTAGCTAGAAAGAAAAGAGTTACTAACCTGATAAGTTAGTTACTTATAC:1 + chr3L 1977764 3' + Stalker2 7328 2 41.58 TTTTATAAGATATTAATTATTTTTTGATTCAAGTAGTATTGTGGCAACTATCATATCTATCAGATAGACAAAAGCGAAAGTAGTGTCCAAATTTTTGTTTT:1 - chr3L 10928059 3' - TLD2_LTR 106 1 83.17 GTAGCTTGAAAGAAACACGNCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTTCTAAAAAAAAATAAATTTTTTTTAATGAAAGAATATAACAATTCTTATCTT:1 - chr3L 25782383 3' - Doc 31 1 53.47 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTTTGAGCTTTGTGTTAATCTTATAGCTCTTTGCTTCTAGTAACTTCTTCAAACAAGAAGGG:1 - chr3R 8434240 3' + roo 393 1 63.37 ACATATCGAATAAGCACTGCATTTGAAGAATCTGGCCCAGCAGCAGTACAAGTCCACGGAGCAACTGGAGGCTCGTCTCAGGCAAGATCGGGAGCTCCTCG:1 - chr2L 6419099 3' + Tabor 6852 2 81.19 TTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCATTTCATTGACCGCTGATCACAGACCTGTGATCACCAATCACGGATTGTGAATCA:1 + chr3L 15696495 3' + hobo 338 1 74.36 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCACACACTCACACTGCAGTGCACTGCTCCGGCATTCTGGCAATGTAATTAGTTGCTCG:1 + chrX 7759142 3' + hobo 2920 1 50.50 GATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTAGTTTTCGGGTTTCTTTCTGATTTTACATTATTAATATCCTAGCGTTAG:1 - chr4 212163 3' + X-element 4522 1 52.04 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGCGTTGTGTGTGCGATGGGGG:1 - chr2L 4277517 3' - accord 181 2 73.81 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATATAAAATCGCTAGAAATTATATTTGACCGTTTTTAGAAGAGAGCTAAAAAGTATGCAACACAATTGG:2 + chr2R 19253932 3' - jockey 17 1 55.45 TTTATTTTATTTTATTTTCTTTCTCTTTCTTTCGCTTTTATTTTCTTTTCTCTGCTTATGCATTTAGCATATCACTTGCTTTGCACTTACACTTGTTGATT:1 + chr3L 3787546 3' + transib1 1902 1 65.35 ATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAGGGAATCAAAAAAAGCAATGCAAATGAGCGCAAATACGGA:1 - chr3L 7822168 3' + I-element 5142 1 60.40 ATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATACAAATGGAGTGAATGAGAATAGAATATGGCCAGTTGCCAGACTGTATTCTGCACTTTGACA:1 - chr2L 2309366 3' + Burdock 6378 2 66.34 CACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGACGGACATTTAGAGGTTAACTGGAAAATTC:1 - chr3R 7369134 3' - Doc 489 1 70.30 TTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAGTCGTCATTGCAACAGCACCAACACCATAAAATGCATCCCATGCATC:1 - chr2R 22699937 3' + Burdock 6240 2 53.47 TTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGCAAG:1 + chr3R 9613496 3' + invader3 246 2 53.47 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTTGGCCATCAGCGGATCCTTGGGATTGCAGTCGGTGAGTAGGGAGCAAATTGATAGCAGAATCTT:1 - chr2L 1334629 3' - jockey 4678 1 69.31 TAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGGTACTCGGTGACAGCTGTTTGA:1 + chr3L 14352293 3' - Doc 324 1 78.22 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGCGGTGGCCGAGAAAGAGAAGA:1 - chr2R 7735573 3' - 412 84 2 53.47 ACAAAAACTCAACGAGTAANGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACGACTTGAGTTTAA:1 + chr2L 7461140 3' + roo 387 2 57.43 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCGGTCTTTTGAATATGTCTTTTATGTGTACTCTCTCCAAAATATTAAAGTACAAAATTTAAGTAAACACTGGT:1 + chr2R 18077137 3' - Transpac 2 2 73.27 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCTACGC:1 - chr3R 21924006 3' + transib2 2795 1 55.45 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCCCAGGCTTAGTGACGAAAGAAAAA:1 + chr2L 13732826 3' - Doc 7 1 69.41 TGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATTAAAACTTCTTATAGGGCACACTGAAAAATCA:1 + chrX 17799366 3' - Juan 93 1 68.32 GCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACTCCAACATAATTAGTTTAATTTGCACAATGAGATGCTGGTGCTGAT:1 + chr2R 11820949 3' + gypsy6 332 2 75.25 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATTCATTCTTTTTTTAAATTCTTTGCAATTATTCGGTTC:1 - chr3L 15831251 3' + 412 7506 2 63.37 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAATAA:1 + chrX 8972995 3' + flea 207 2 74.26 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACACACTACACTCAAAGCGTGCGGTCC:1 + chr3R 22469195 3' - hobo 47 1 76.24 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGGTCGTCGTAAAGTCTCCATGAGGGGGAAGTG:1 - chr2L 15548756 3' - Tabor 45 2 66.34 TAGATCGACTTGGCTATTGATCCTGATCAATTAATGTAGTACACCCGTAACTGAGCACGGGGCCAATAGGCTGCTATCGGGGAGCCGGGAAGATCGTCAAG:1 + chr3R 5832751 3' - INE-1 98 1 62.38 GGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTA:1 + chr3L 25350824 3' + baggins 5417 1 40.59 ATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGAACTGAACTCGAACTCAAGTTGAAGGAGGCCCGAAAACCGTTTGGTCATTTTGGCAGCGGGAAGAT:1 - chr2L 3589352 3' - copia 4784 1 62.38 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAATGAAAATCCAAGTCTTTGCCGAA:1 - chrX 6041017 3' - jockey 4805 1 56.36 CCCGTTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTCAGTTTGATGTGTTTATCTACACGTAGATGTAGAATAGCGCCATCTAGTTGTTAAATTTGACTTG:1 - chr2R 21251750 3' + gypsy6 113 2 69.31 TGCTATTCGTAGCTTGAAANAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGGAATCCTGCGATTT:1 + chr3L 25345158 3' - Doc 39 1 55.45 ACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATCAATTTGATGCCAGCG:1 - chr3R 25271685 3' - invader4 2814 2 76.24 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTATGGCCGAAAGTGCTCAGGTTCGTTTCGAAC:2 - chr2R 22898737 3' - Transpac 42 2 67.33 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAAAGCGACA:1 - chr2R 24169902 3' + roo 386 2 55.45 TTATTAAGGAATACGAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGTTTT:1 + chr2L 15174185 3' - Juan 4043 1 59.41 TGGAGTACCTGCCTACGCTTGTGCGCCGCGAGAAGTGGTGCCGACGAACGGAGCCCATCCACCAGGTTGATGTAGCAAATGAAGGCAATGCCAAAGTACTC:1 + chr3R 19659401 3' + aurora-element 3772 1 72.28 TTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCACCATCAAGTTTTTCTATTTGATCGACGAACTTGGGGCATAGTAAACACCTTATAAGC:1 + chrX 3044012 3' - Dm88 377 1 63.37 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTAAGTTTGCATTTGGCATCCTAGGGTATCTTAAAGCCACCGCCGTCCTGGTGCCCTTTT:1 - chr2R 17123543 3' + mdg1 405 2 55.45 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGGCAACAAAGGGTTAAGTGCTTGATAAGCGAAAATAGGCGTATTATTTTGGATTTACTTGGAAAAGGGGTGT:1 + chrX 7802950 3' + hopper 1412 2 72.28 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGCATCTGTGTGCAGCTTGG:1 - chr2R 12096585 3' + hobo 2892 1 77.08 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGATTAGTACTAAACCCAACGGTCAGCATGGAAGCGTGCGGAGCTTGCG:1 - chr3L 27284729 3' + blood 7361 2 54.46 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATGTGTGAACCGCCCCCGG:1 - chrX 13268846 3' - 1360 15 1 61.00 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTG:1 - chrX 7534633 3' + Tirant 8476 2 56.44 GGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAATGGAAGTATTAAAATATCCCACTTGTTGTATTCACAATCACT:1 - chr3R 23702202 3' + Quasimodo 6981 2 58.42 TTTTTTTCTGTTTTTTTTTTTAGTTGAGGCTTTTTTTCTGATGCAAAGTTGACCAGGAAATTGCATGATTTCTGAATATATTTATTCGAACGGGCTTGCGG:1 + chr3L 19935603 3' + hopper 150 13 55.45 GCGGGGCAGTCAGTTGGACAGCAAGATCGCGAGTGGAAGGAGATAGTGCGTCGGAGCGGGTATTTTCCGATAACGATATCGCAGGTGTATCGGTGTAGCTT:1 - chr3L 8394792 3' + gypsy8 370 1 58.42 TATTATTGTTATTATTGTTATGGCCGCCGTTTGCGTAGTATTATTCAAATTTATTTGTTTAGAACTTAAATATTGCGGAAATAAAAACATTGATTCGTTA:1 + chr2L 8987664 3' - mdg1 31 2 69.00 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATAAAATATTCCTCTTTGATTTTTAGTACCAATGTCAACCCATTGCTTTACATA:1 + chr3L 22112915 3' - diver 5913 2 55.45 TGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAACTCCGATTGGAGCGAGAGTTGTGTAAACGAAAGAGAGCAAGGCAT:1 + chr3L 4071852 3' - jockey 4985 1 54.46 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGAGCTCTCCTCCGCAACGTCATCAATT:1 + chrX 10426931 3' + 412 441 2 74.26 AATTACATAACAATCACATATCAATCACCTCACAACTCTGAAAACCACCATTCCATTTCCATTTTAGCATGGAATTTCCGTACTCAAAGTCAGTCGCACAA:1 - chr2L 17225162 3' - X-element 4577 1 72.28 AAAATAATCAAAATCCATAATTGAGAAAAAGTGAATACAATCATTTGAAATTAAGTTTATGATTAAACTAGTATATTTAAGCTGCAAGATATTCATGTTCT:1 + chr2R 12260701 3' + transib4 2541 1 89.11 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATATGTTTCCAAATGATTTAAGTCAATGTGAGTAACAACTTTTCAATT:1 + chrX 21499328 3' + Quasimodo 7341 2 56.44 TTTTACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATACCGGGGCTCAAGATGCATATGTATGTACATACATTTGGGATTTGCCAAAATC:1 + chrX 16372413 3' - Circe 7377 1 65.35 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTCCGAGGCCAAATCCATTGAGATTTTCATAGGCCGCGCACGG:1 - chr2R 7173598 3' - mdg1 4 2 75.25 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGAT:2 - chr2L 4110938 3' - Doc 25 1 57.43 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGC:1 + chr2L 20709434 3' + roo 356 2 79.21 AAAAAAAAAATAAAAAAAAACTTAATAACA:1 - chr3L 13329529 3' + HMS-Beagle2 489 1 86.67 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGATTGAAGATAAGGATAATGCTAGATGATAATACTCACATG:1 + chrX 17873236 3' + 412 7511 2 58.42 TCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCCCCTCTCCATCCACAAAAGTGTTGTACGTGCCCGTTGTTAAAATAAATTTAATATTGATTCAGCTT:1 - chr3R 15559722 3' + Doc2-element 384 1 70.30 ACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATTTCAGACGCAAAGTTGAGAAAATTTTCAATTTTTACCTCTCTTTCCTACGGCACACGATATTTCGTG:1 - chr2L 20513209 3' + R2-element 250 1 73.00 GAAAAACTAGCCTCACATCCAACTTTTTTTAAATGAAAAAATTGAAATAATACTGGAAAGAGGACTGCATATTAATGTGTTTTGGAAGAGGTAACCCAAC:1 + chr3R 1588626 3' + Doc3-element 4510 1 77.00 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACACTAAGCGCACTACCAGCTCTTCATCTCA:1 + chr3R 26798995 3' - 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chr2R 22898700 3' - Transpac 5 2 75.25 TGTTTTTGAGCAATGCACCNATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCCGTTGCTGTAGCACATTTTTTTCGTATTCTACCAACAATT:1 + chr2L 12605234 3' - roo 8782 2 59.41 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCA:1 - chr2L 20271218 3' - blood 39 2 63.37 GTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGGACATGAGCTTGAGCTGGATTCGAATGCTTTGAAGTCCACATTTGAGTTCGTGTCGAG:1 + chr2R 7729677 3' + 412 7540 2 56.44 AAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGCAGGGACTCGTTCCTCGAAAGTGGTAAAGGGTAGAAGCGAAAGG:1 - chrX 11255623 3' + F-element 4439 1 54.64 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTACCTGCGC:1 - chr2L 15907158 3' + pogo 2059 1 68.32 AATAAAGAGCAATCGCTCATAAAGCTTACTCCGGCAACTGTCGTTATCATTATAAATTACCATAGCTACCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCC:1 - chrX 21907815 3' + gypsy3 150 2 66.34 ATAAAGCAAAATAGATCTCTTTTGCATACGCGAGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTT:1 + chr3R 9858890 3' - BS 42 1 68.32 TGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGC:1 - chr2R 6482688 3' + gtwin 7339 2 77.23 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATGAAGTGTTTAT:1 + chr2R 18105831 3' - roo 19 2 60.40 GTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGCAAATCTGTTAAGCATTTACATTCCCCCAAAAGCACCATATCCTCACAACTAACTCACCAGCTGG:1 - chr3L 7173591 3' - opus 374 2 65.35 TAATAATTACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAATAATAAAAATAAAACGAAACG:1 + chrX 8973013 3' + flea 4990 2 53.68 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGTTCCTAAAACCCTTAGATCTCAGTATTTTCTTTGATCATAATTAAATTGATATTAC:1 + chr3R 10229463 3' - copia 21 2 56.44 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTAAATTCACTTGCAGGTATAAGATAGAAATCAGCG:1 + chr3L 10395932 3' + copia 250 1 65.00 GCCGTGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGAAATTTCTAGTATTTGCGTTGCGAACGTAGTCTGGTCGCGGATGCCTAATGGTCGATAGCTGAACGCTATGC:1 - chr2L 6648064 3' + invader1 3606 1 69.31 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTACATGTGCATGTACATATACACTCGGCTATATAGAACAACCCACAAG:1 + chr3R 10090391 3' - pogo 24 1 58.42 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGCCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATAGGGCATAGG:2 + chr2L 9319137 3' - jockey 9 1 73.27 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGCACAGCACGCATTT:1 - chr3R 12882659 3' + 412 449 2 61.39 AGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATTCTAATACATTTTTTAAAAATGAAATGACAATTGTCTTTATTTAGTTTAAAACAATTAATAT:1 - chr2L 12184023 3' - roo 27 2 63.37 GTTTGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAACTAGAATGTTGTGATTAAGCATACAGATTTTAAAGACCCCGATATTTGAGCGTTCTGTTG:1 - chr3L 3455729 3' + INE-1 133 1 70.10 ACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTC:1 - chr2R 12185309 3' + accord 7375 2 66.34 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCA:1 + chr3R 30611286 3' - blood 51 2 76.77 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAACGGGAGTTCATCATTACACATGACATAAAATATATATATCACGCGCTGCCTTATCGCGTCGA:1 + chr3R 16806074 3' + 412 458 2 55.45 AAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTCGAATTGGATTAGGATGTTATGGG:1 + chr2R 3068407 3' + Stalker 7205 4 76.24 GGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTAGTTGACGCTGGGCACTTTTTAATCAGATTTATT:1 - chr2L 8110070 3' - F-element 306 1 69.31 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGC:1 + chr3R 9613493 3' + invader3 243 2 56.44 CACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTTATTAAATTCTCCGTTGTGCTAAAAGCGGACGCTGCATAAAAAA:1 - chrX 15411885 3' + hobo 456 1 59.77 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATT:1 - chr2L 13792195 3' + blood 7337 1 76.24 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTACATTA:1 - chrX 15412678 3' - hobo 31 1 55.56 ATCCATTTTCAAAAAGAAATGTGATGATAAAACCTTCCAATTTCTCGCTGTGCTGCAGCCCATTCAGAAACCATTCAGCGGCAATTAATGTTAAATTTAAA:1 + chr3L 14319397 3' - G5 395 1 86.14 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGAATGTGGGCACACAAATTTAAGCTCTAAACA:2 + chrX 5452642 3' + mdg3 5488 2 66.34 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCAT:1 - chr3R 7869118 3' - 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chr3L 2339758 3' - roo 8693 2 62.38 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTCCCGGTTCTGCTATTTT:1 + chr2L 3937792 3' - Burdock 6165 2 56.44 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACAACTTGTAACTTGTGTATCTATGAGATACATTTACATTTCCCA:1 + chr3L 11657905 3' - Tabor 33 2 56.44 GAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTGCCAACTCGGAGCCCACCTGGGTGCACGAGATCTTTCAGGGCATACTTACGTCCGAGACCAGGTGCC:1 + chr3R 22775647 3' + P-element 2736 1 66.34 TTATTTATTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAGCCATGGGTTTGTGGAAACGTATTTTCACACCAAATACTGCAAAACGAACTACA:2 + chr2L 4378775 3' - Juan 4205 1 51.49 AAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGATGGAAATGTAAATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCA:1 - chr3R 19449708 3' + roo 8797 2 72.28 GTACTTATCTGTTGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGATAGGAATGTATCTTAAAATTAATTAATAGACCACAATTTGATTGCTGAAGCAAATTACGATATA:1 + chrX 3651879 3' - rooA 91 2 66.34 AGATGGGATTAGCTAGGATNTTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTATAGCAATACACATGTTGTTTT:1 + chr2L 1300601 3' - G5 4606 1 78.22 TGATTTGGAGTTTCCAATTNACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCATATTTGAGCCACGGCCAACTTGTGGTCCGTACTCATGTTACAGCGGCAAAAGGCT:1 - chr3L 21580439 3' - P-element 2670 1 71.29 ATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTACATACATATTACACAAGCACTGGGTGTTTTGCCACCCTGGTTTTTTGTGGTACGAGCCAAAAAACACCC:1 + chr2L 4764770 3' - Tabor 409 2 71.29 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGTACCGTTTTCCTAAACTT:1 - chrX 10996526 3' - 1360 35 1 62.38 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGTATGTGGTTAGTTTGCCATTCTAGTGCTCTTTTCGCTGTGTTTGTGCTCCTGGGA:1 - chr3R 14832492 3' - jockey 27 1 60.00 TAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGTGCCGCCCTCCTCGTCGATGCGAAAGCGGTAGAGGA:1 + chr2R 6768260 3' + 412 494 1 43.56 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGAGAGCCGCCGCATTGCTATTTCTATGAGCGCTGTCCTTTTTCATTGCCTTTATTTTGCTACTT:1 + chr3R 28728737 3' + hobo 2926 1 66.34 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATATTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAA:1 + chr2R 8707089 3' + flea 4980 2 61.39 ATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGCTTCTGCCCCTCTGCGGCGCCTTTGTGAATGAAACCACTG:1 - 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Quasimodo 32 2 78.22 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAATATTCAGCCTGTCAAGCTTAAAAAAACCATTAAGGTAATCACACACA:1 + chr3L 15831316 3' - 412 30 2 59.41 GATAATCTGCCTAATTTGGCCTGCGGATTTTCTCGCCTCAGTGAAACGTCTAAAAATGCCCCATAAAAAGACGAAGCATTTGAAAGCCGTGGTACCTGGCA:1 - chr2L 18676887 3' - gypsy6 7353 1 55.45 GTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGCTGACCAACTCGCATGTGTGCGAGTGTAGC:1 - chr3R 18843366 3' - jockey 4618 1 70.30 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAGTTTCTAATATCAAGAACTGAAAATTAGA:2 + chr3R 7618724 3' - Doc 24 1 53.47 GAAATCACGATCAACTGAAAGTCACTCTATTTACGATAGCCAAATTATCCAAAAGCTTTTTTTTAATGAAGATATCTTGCAGAAAACCCCCTATTTTTCAG:1 + chr3L 14379558 3' - Gypsy12A_LTR 199 1 74.26 TAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTCGTGAGTGTATCGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGG:1 - chr3R 15589973 3' - Doc 4640 1 56.18 GAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTACCTACCCCATGTGTGACGATAATTAAGGTTGCATTTTTAGATCGAAT:1 + chr2R 3120368 3' - 1360 3221 1 65.62 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGTCACGTTTTGATCCACTTTTCGGCCTAATTCATACCAAACAAATAACAACAAA:1 + chrX 6075292 3' - P-element 23 1 56.44 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGCGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGATATCTAATCTCATTCCACAT:1 - chr3L 2270535 3' - roo 52 2 76.24 TGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCAGTGCTTTATAATAAACACACATCGACCGACCTTGCCTTCGTGTCTGGGAGCGATTGTGCCCCTCGTT:1 - chr3L 6370453 3' - 17.6 4 2 76.24 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGGTTATTATA:1 - chr2R 19594619 3' + roo 357 2 73.27 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATACCGATTATTCGGAAATTGAACCTTGATA:1 + chrX 21581163 3' + 297 6932 2 74.26 GACTGTCAGATACCCGTCACTCCATTACATTTTGTTTGAAAAAAGCGCCATCTGTTGATAATTTGTTCCTTAACAAACGCCACTGGGCACCGTCCAGATTG:1 + chr2R 14888594 3' - INE-1 549 1 65.35 GCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTTTTCTTTCTGTTGTCGTTCTTCTCCAGCTCTGTGCTGGTTTTTTATTTCGTTCTCAGTACTTTTCATTGTA:1 + chr3R 7412299 3' - 1360 3331 1 75.25 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTAATAATTTCTCAAAAATGTTCATTATAC:1 + chr2L 20396983 3' + Transpac 5185 2 75.25 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAGATGAAAGAAAAAACAAAAGGTTGGATTTCTCTGCATACTTTCAGGCGTCCATCAA:1 - 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INE-1 132 1 73.47 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAACACCGAAGTGGGGCACATTTGCAT:1 + chr2L 1335375 3' - jockey 4683 1 67.33 TACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATT:1 - chr3R 10736030 3' + McClintock 460 2 61.39 GAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATTCATTCCCATTTCGGTTGGGCTTTCACTTGAGTTTTGATGGGGATAATTGGTGTGTCTGTGG:1 - chr2R 8518216 3' + invader1 3997 2 65.35 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTATTG:1 + chr3R 4773407 3' - Tirant 3 2 68.57 ATCACTTTTAATTTCAACTTAACTCTAAATTTGTAATTTTTAATGCGCTTTGATGTTGCCACGCTAACCGCCTTTTTGTGACGCACAGGCTGCGGTTCCTG:1 - chr2L 69459 3' - G4 418 1 62.38 TGTGTGCAATCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGAGATTGGGGTCCCTTAGCCTCACATAATCCACGGAGCTCGACATTGCCGTGGCATT:1 + chr2L 11573926 3' + opus 227 2 59.41 TTAACAGCTCACTTGAAAGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCGCCAGGTGTGGGGGCGTTCCTGAGGGCGTGGCAGGTGGAAGAAGATCAAAACCCTGCTGT:1 + chr2L 18287663 3' + Cr1a 370 1 56.44 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATAATGTATGCATATCTCTGCGCCTTGGACTTTTCAGCT:1 + chr2L 18927536 3' + mdg1 7423 2 61.39 GCAGAGCAAAATCAAAATTTTGGTAAAAAAAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAATTCCTCAAAAGTGTCAAAGCAATCAACAAAAAAATGGAAAAA:1 + chr2L 19279518 3' + HMS-Beagle 322 1 62.38 AACTTTGTAAATAAATGTAGCTTAGTGAAGCAGTCGAGTTCAACGTTTTTTAAATCTATACCATTTTGAAAAAGTTAACAAGCTTAATTCACAATATATTT:2 - chr2L 12519909 3' + I-element 5272 1 73.27 ACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAACCAGCGAATATAAAGAGTCAAGATACATATTTAATTATTTACCCGAGAACTTGTTCGGGGCTTATATT:1 + chrX 17109739 3' + roo 398 1 69.31 AAAATCGTGTGCCAAAAAANCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTT:1 - chr3R 12115285 3' - 1360 37 1 63.37 AAAAATATAAACATTTATTCATTTAAGATTTTTTCATCGATTTGAGCAGTTACTTACAGTTTTGAGTTGGACGTTACGCAATGCGCAGCAGTTAGTATCAG:1 - chr2L 14768963 3' - Tc1 61 1 26.73 TTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGGCATTTGAAA:1 - chr2R 6769440 3' + 412 7521 2 53.47 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCTACGCTCT:1 - chr3R 21924003 3' + transib2 2818 1 66.67 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTC:1 - chr2R 18105772 3' + roo 9017 2 80.20 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTGTAACTTTTATTATTGTTTAATTTCACATAGTTACGATCTCTTAACTTTACAAGTAGTC:1 - chr2L 3475251 3' - roo 16 2 64.36 ATGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGGGGGGAGGAGTTGGGGAGCGAGTGGGCGACGGGGTACCCACCTC:1 + chr3R 10738622 3' - F-element 323 1 54.46 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGCCACAAGAAACGAACTTGAACTTGCTCTCTTGTGGA:1 + chr3R 25208385 3' - P-element 39 1 40.59 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACAATGTAATAGGGTGCGCTATTTCGCCAGG:1 - chrX 6058189 3' + roo 356 2 74.26 AATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGGTAGAGCACAATTTTTGAAAACTTGTTCAACTTAATGACCTCGAAAGCTCGCATTGTT:1 + chr3L 3328994 3' - G2 2654 1 58.42 TCGACGTTCATACGGACATATGTGTAATGTAGAGTTGACGTAGACTTTAAGTGTCCAATTTTTTTGTGTAATAAAGTTTCATTTTATAGACCTGCCAGCAC:1 - chr3R 27998139 3' - INE-1 128 1 51.49 ATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGATAAGGGAGGTTGAACTCACAGCAAATGGAGTTGTTAGGAAAAGAAATCATTTATTT:1 + chr3R 4127808 3' + R2-element 467 1 67.33 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGTCTGTCCGCCGAAAGTGCGAGAGCAACCACTCAA:1 + chr3L 5355403 3' + P-element 2847 1 40.59 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAATTTGTAAAGTTTTTTGAAATTTGAAGTTGCACGGAATTGAGA:1 - chrX 11987877 3' - 412 7086 2 60.40 AACCATTTCTGCCTACTCTNAAATCAAAAGAAGAAATTCGACAAATGGCGCAAGCTATTAAAATAAATATGTACAATGTGCAAGCACTTTTTTTCGGGTAG:1 + chr2L 16684219 3' + 412 400 2 75.25 AAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGGTGATAGACGGAAGGTATAGGTAAATCGATATGCTAGA:1 - chr3L 15235168 3' + Tc1-2 1280 1 72.28 GTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGG:1 - chr3L 16792540 3' - Chimpo 4030 1 52.00 GCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCGTTTTTAATATTTTGTAAACATGTGCGAAATGATTATTCGTTAGGGAAAACGGTAAATTTTCTTGAA:1 + chrX 695560 3' + FB 904 3 75.25 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGGCATGGGCATCATTGGTCCGGCG:1 - chr3R 16613153 3' - 412 47 2 76.84 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGCCTGAGCGAGAGAATTGAATTTT:1 + chr2L 8504801 3' - jockey 4813 1 76.24 TATATAGGTACAATAATTTCGATTTTTAGATTTTAACATTGCATGTGGTGAGTTTGGGGAATGTGTTTGCGTGTACGCTTCAATATGATCGGTGTTTGGCG:1 + chrX 15856087 3' - TAHRE 10341 1 58.42 TTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAGA:1 - chr3L 27357541 3' + mdg1 400 2 55.45 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGACAAGACTAGAAAACGGCTAGATATCACAACTAT:1 + chrX 153023 3' + mdg1 7418 2 69.31 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGAGCAAAAACTTTGGATGTTTTGAGAGTTCGAAGTTCATACTGTCATCCCGCTCTAAACCTCTGCATTCCA:1 - chr2R 20584389 3' + P-element 2883 2 75.25 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTATTCTGCACACATTGTCATGCATGCAAAAAACAAGATACGACG:1 + chr3R 13685226 3' - Tirant 28 2 58.76 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCATTTCTATCAGCAGCCACACAAAAACTAATTCCACATAATGTGCCAATCTACATAAAAAATCG:1 + chr3R 8705368 3' - jockey 17 1 68.32 ATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCATTACCATAAGTCCATGGAGGATATAGCGATCTGTTGCT:1 - chrX 2350789 3' - Doc3-element 4376 1 69.31 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTGCTGTTTGCTGGATCCTTGGTTT:1 + chr3R 9825190 3' - Doc 26 1 53.47 GATTTGTTTAGAGGCGTGGNGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGG:1 - chr2R 21362753 3' - Tirant 25 2 56.44 AAACCGAAGATATTTCGAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACAACAGACACGCAGAGGGCGAC:1 + chr2L 19997240 3' + roo 351 2 74.26 AAAAAAAAAAAGGAAAAAGGAACCCAAATCCAATAAGCCC:1 - chr2L 12818395 3' + Doc2-element 232 1 92.50 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTCCCGGTTCTGCTATTTTGC:1 + chr2L 3937794 3' - Burdock 6163 2 54.46 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATAACGGAAAATGGGAATACTTAAGCACACCAAGTACATAATATACTAGTAAGAT:1 + chr3R 6609791 3' - Transpac 4938 2 65.35 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACCTTATTACTTCAGCAACCGTCCAGAGACTTGCCTCGAGTCTACAAAT:1 - chr3R 11466155 3' - accord 7030 2 79.31 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATTATTCATGCTGCCCAATTATGCACAGCC:2 + chr3R 25378619 3' - jockey 58 1 70.30 TATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAAAAAGCAAAAAGAGCACAACAAAC:1 + chrX 6075320 3' - P-element 139 1 27.72 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCAACCGTTCCGTTCTTCCGTACAGTTCATTTTTAGCCACACAAGCGCAAGGTTG:1 + chr2R 21713370 3' - P-element 23 1 58.42 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTACCTGCGCACAAATAAT:1 - chr2L 15907149 3' + pogo 2068 1 59.41 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGATTGCACTGCATTTGCATTTGATGTTTAAATAATAAAAGAGATAATTGATTCCGTTTTTCAA:1 + chr3L 18928929 3' - mdg1 7052 2 62.38 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTCGACTCGCTTTTGAATTTTTAGCATTGCATACTTAAGTGGGTTTTTCAGTAATGGCCAC:1 - chr3R 28728637 3' - hobo 17 1 61.39 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTACCTGC:1 - chr2L 15907160 3' + pogo 2057 1 70.30 TGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGGCCAGGAATAGTTTTCCCGCCTGTCCGCAGACCGACGAAGTTTG:1 - chr2L 17797948 3' - Doc 4543 1 71.62 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACTCTACAACTTTCGGGAGAGAGAATATTCAAAATGGC:1 + chr2R 20584477 3' + P-element 2849 1 43.56 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAACAGCCAGCGACACTCGGCAAAAAAA:1 - chr3R 23113336 3' + 412 441 2 76.24 GGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATAATTCAGGTCATTCCGTGTTATTTA:1 + chrX 11170995 3' - invader3 54 2 77.23 GTATATGTATGTATATATTTTACCCCCCCTTTCCCTACGCCCATGTTTTTAGAGCA:1 + chr3L 11903298 3' + 1731 4411 1 67.86 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACTTTTGCGACCAATTGGTGATCAACTTCGAACAGTGTTTTATGCTCCGTTTTCCTTGGCT:1 + chr3R 6190322 3' - copia 4885 2 63.37 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGT:1 - chrX 21087572 3' - mdg3 5269 2 60.40 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCT:1 - chr2R 18105768 3' + roo 357 2 76.24 GCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGGGAATGAACTTGAAAAGTTGAAAGATGGGTGAAGCCCCCACTGAGGTTACTCATACA:1 - chr3L 4142099 3' - I-element 144 1 62.24 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCCAACTTCAAGTTACAATTGTTCAACAAGTAATGAGTTTGGATCCATGAAAGCTTAAATATATTGGTT:1 + chr3R 22467121 3' - mdg1 7048 2 65.35 ACAAAATTGTAGGGTGTGANTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATTGG:1 + chr3R 11191073 3' - hobo 36 1 63.37 AAGTTGTGCAGGATGCATTGGCAAAAATTCCCCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCAAGCCGTGTTTGTGGATCTGGAACCCACTGTGGTCGATG:1 + chr3R 7087438 3' + HB 1232 1 67.33 TAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCGTGCTCCATTCCCGA:1 - chr3L 11657827 3' + Tabor 7302 2 54.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTC:1 - chr3L 95883 3' + roo 9020 2 78.22 GCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCGCCAGCGAGTACTCGAAAGTTAATTAAGCCCTTTGAAGCGGCAGCGCCCATAAG:1 + chr3R 24732968 3' - BS 19 1 53.47 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACAAGAGTACAAATTTTGCGGCTTAAAGTTAATTCATTTCGCAAGTGTTTA:1 - chr2R 23122643 3' - hobo 28 1 55.45 TTTTAGAACTTGCTATTCGNAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGC:1 + chr3R 9825166 3' - Doc 49 1 67.00 ATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATA:1 + chr3R 21666970 3' + INE-1 103 1 65.35 TTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGC:1 - chr3R 19950460 3' - BS 5024 1 56.44 TAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTACACAGTGTTACCAGATCGGCCGAGCGGCTTTAAACCAAAAACT:1 + chrX 19579813 3' - I-element 232 1 56.00 AGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATAACACACAAAACCGCGATAAAGGCTGAATGAACGGGTTTTGATTGAAAACTGATTGCAA:1 + chr3R 28907600 3' + Quasimodo 18 2 76.09 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCC:1 - chr3L 11657842 3' + Tabor 7287 2 58.42 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTGCTGCTTATTTTTTCAGACC:1 + chr2L 2288417 3' + hobo 2892 1 73.74 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTATAAAAAAAACAGGCCACAAGGACTCACCCACACATCCACACACCC:1 - chrX 656603 3' - hopper 65 1 69.31 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATGTATGTATGCATGTATGTACAAATCGTTTTAAGCAGGAAATAA:1 + chr3R 4591910 3' - 297 6607 2 65.31 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCGGACTCCAAAAAATGTTTCGCATATATCATATATTTCGGGGAAC:1 - chr3R 12178202 3' + hopper 1387 1 52.48 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATACATATTTCCATAACACACTGCAATCTACTTTTAATGGCCCATTGGA:1 + chrX 6058242 3' - 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chr2L 10353266 3' + Transpac 5121 2 64.36 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATACCAACCCGATTCGATTGCAATTAACCATC:1 - chr3R 29157503 3' - pogo 41 1 66.34 GACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCCTTTTCGATCGGCAAG:1 - chr3R 4536168 3' - Ivk 14 1 65.35 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCG:1 + chr2R 7025006 3' + P-element 2862 1 45.24 TATATGATCCTCGAGAATGNAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGTCACTTTATTAGTAATCTACTCCATATGCCAACGCATTTCAGCC:1 + chrX 2867599 3' + Idefix 131 2 55.45 ACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAACGACGTCCAGACATCTGCAGGCGGCACAAAATTCAAAAA:1 - chr3L 15436318 3' + blood 7273 2 61.39 GGGGTATATAGTTTCTAGTNAATTTAAGTCGGGACTCTCAACATCCTCACGAATAAGCTTACAAATAAACTTGTAAGAAAATGTTTAAATCTAACTTCTTT:1 + chr2R 8543974 3' - Cr1a 4121 1 67.33 AAGCACAAATAAATAAATAAAAAAAAACAAACCCATGATTGTGAGCTGACTTTACAAGTGCGGAAGTTGAACTGAAACTAATGAGTTCCCTGGGGTTCCCC:1 - chr2L 4378681 3' + Juan 4211 1 74.26 ATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTTTAACCAATAAAACAGCAGCTATAGTGGTTATAGAAGGCGTTGGTCGCCAGGGGGGGTTGT:1 + chrX 14086897 3' + hopper 1120 1 69.31 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACT:1 - chrX 21400804 3' - P-element 60 1 20.79 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGTTTAACATAGCCAAGTATATTAGCAAAAA:1 - chr3L 1927434 3' - mdg3 49 2 72.28 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCAAAGAATACTTTATTAGTGTGACACTATGGTAACATTTTTAAACATAAAACCAAGAAAAAATTACGA:1 - chr3R 14601768 3' + roo 401 1 71.29 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACAGGAAGTGACTTCGCCGAGTTTGCAATAATAAAGTGAACTTAGTGCTCG:1 - chr2R 13358770 3' + roo 9040 1 54.46 GGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGGCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGATTTCAAGGGGTA:1 + chr2R 25051876 3' - G5A 2662 1 63.00 GAATTTTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTAAATAATTACAATTTATTGATTATTATTTTTCTAGGTAAGTTTTCCTTAG:1 + chr3R 3598288 3' - HMS-Beagle2 359 1 76.24 TTGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGTCGTTTGGTTCCTCTCAGTTTGTATTTAGCGCCTGTCGCGGGAGGTTCGTGCGTTCG:1 - chr2R 10874702 3' - P-element 18 1 59.41 CATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGACTATGATGGGTT:1 + chr3R 20934728 3' - jockey2 3194 1 64.36 AAAATGGAAAAATAATGCANATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAAT:1 + chr3R 20284783 3' - pogo 49 1 78.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCNTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGATTTATTTGCCTTGTGCCCTGGAAACTTTCGACTCCCGACATCCATATCCGTATCGT:1 + chr3L 14691003 3' + roo 391 2 57.43 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGTGTTTTTAACACGACTACTCTAACCCGCACATTTTTTGATATTTTTCATATTTTTATTGGTCT:1 - chr3R 1670554 3' + roo 397 1 68.32 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGAGCATTCCTGAAAGGAATCCATTGCCCCCACTTGCCGAGGCCTTAATTACA:1 - chr2R 13099056 3' + roo 9046 1 52.48 ACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGC:1 + chr2R 5532332 3' - G4 3769 1 52.48 ATGCGGCAACTTAATTTGAACTCCGATTGGAGCGAGAGTTGTGTAAACGAAAGAGAGCAAGGCATCGTAGCGAGAGAGCGAAAGAGTTGAGCACTTGTTGA:1 + chr3L 4071888 3' - jockey 4949 1 80.20 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATAATCCAATCGGCATATAAATCATTGATAGCAA:1 + chr3L 2339815 3' + roo 9025 2 70.30 GCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTTTTACCTGACTCACCTGTAATACGTATTCCCCTATCTACTCCAACCATCCCCCCTGCGTCCGACG:1 + chr3R 18006529 3' - accord 185 2 62.63 GGTCCTCCTTTCTCTACTCNTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAAATATTTGAGATATGCTCCCAAGGCAGGGCCATTATGCAAATGCTTGATTGGG:1 - chr2R 13294671 3' - accord 7356 2 67.33 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAACAGAGGCAGAGGCACTGGGC:1 + chr3L 455643 3' - Doc 26 1 55.45 AAGGTGAGGTATGCGGCAGNGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAATTACACCGAGCTGGGGCAAAGAAAAAAGTGAAT:1 - chr3L 10683450 3' + opus 7461 2 65.35 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCCTAAAAGTAGGCAACAGTTTTTTCCAGTTTTCCTTTTAGCCTTATTGCGAG:1 + chr2R 18988513 3' - hobo 5 1 67.33 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGGCCCCCACAAATGCCGCTTGCAACAATCAGGCAGAAAGTGGCAG:1 - chr2R 13270054 3' - Quasimodo 25 2 55.45 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGGCTATCTCTATCTCTTCTCCGAAGCTTTCGAAGTAGCTTTTGCGTGCCGA:1 - chr2R 7024942 3' - P-element 24 1 55.45 TTTAAAAAATATTTATTTTTTTTTTTAACTGAAATGATAAGCAAAAAAGCGAGCCAGTTCAAATTGGAATTTAAGTTTGTTTTACTTTATTCAAGATATA:1 - chrX 13262454 3' - gypsy11 3945 2 80.00 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGAGCTCTCCTCCGCAACGTCATCAATTGTTAATGCCAAAGTTGGAC:1 + chrX 10426950 3' + 412 7514 2 55.00 TAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAAAGCAATGGCAACGGCTGCGGAAAGATTATGCTGTTTTCTGGCCACAGAGCCTTATGGATTTGACGGAGCCTTTGGG:1 + chr2L 16809232 3' + HeT-A 1 1 76.24 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTACC:2 - chr2L 15907163 3' + pogo 2054 1 73.27 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACATTGAATGTCCAAAAAATGTA:1 + chrX 3691575 3' - jockey 4789 1 55.45 AGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCAACCGGCGGAGGGAACACATCTTCATGTTGAGAATGGAATGTTGGCAGAGAAAGAGCAACC:1 - chr3L 15132526 3' - 297 6889 2 61.39 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTGGGGATGTCCATCCAGGTCGATTGCA:1 - chr3L 24150506 3' - blood 7027 2 61.39 GCACCGAGAGCATCGACGTCAGATGAAAAGTCCTTGGTCCTTCGAGCCCGATACTCAACCTCCGGCAAGCACACAGCATTACCATTAAGTCCGAAGACAAA:1 + chr2R 23514781 3' + invader4 452 1 52.48 TGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACATGCATGTATGTACTACAATTGCAAGTATGAGATTTTTTAAAAAAATTCAAAAA:1 + chr2R 16907583 3' - opus 18 2 61.39 GCGTAACGGGTATCTGATAGTCGATGAACTCAACTATAGCGTTCTCTCTTGTTTTATCTTAGAGATACATATATTGTATAAAGATTTGAGGTTTTAGGCAC:1 - chr2R 7377150 3' + INE-1 549 1 62.38 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATTGGTTAAGTGTTATGTACTTAACGATGC:1 + chr3R 11191098 3' - hobo 11 1 64.36 TTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:1 + chr2R 10572710 3' - F-element 4382 1 60.40 ATAAAAAAATAAATAAATATTTTTAAATTTTGTTTGATATTTTTAATAGAAGATGTGTAGATATAATATTTTTTGCATGACTTTTATTCCATTAGTGTCTA:1 - chr2R 14432473 3' + mariner2 829 1 37.62 GTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAG:1 - chr2L 23372503 3' - gtwin 2 2 77.23 AGGCGACCGTATATGTGTACATCATTCGCTGATAAGGCCGTTCGCTGCTGAGGAATGCAAATTTTTGCTTTCAATTACATATTAATTTTTGTTATTATTTT:1 + chr2L 5492112 3' - accord2 7213 1 68.32 AAATCAGGTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATAT:1 - chr3L 9542513 3' + roo 9037 1 61.70 AGATAAATTGAACATTTGTTCTTGATAACGTGTTACTACCTACTTTTATTTCATTAAAGTGTATTTGTTCTTGAATAAGTCTAAAATGTAATCTCTTTGAT:1 - chr2L 5619676 3' + Tc1-2 285 1 59.41 AAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGCAAGGCGATTGCAAGTAGCCAGT:1 + chr3R 9613515 3' + invader3 265 2 66.34 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAACATCCCA:1 + chr2R 8707107 3' + flea 239 2 64.36 TGGGTTATTGGCCGCTCGTTGTCTGCGTTTGCAGTTGTCGCGAAGGCATTCAGACCCGGAAGTTGCCCGGGTGAACTCAATTCGCTGCTGGGCGAGTGAGG:1 + chr3R 28609812 3' - F-element 307 1 60.40 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATAACTGGAACCCAATACGAAATCAACCGCAGAAACCTCAAGCAAAATGACTTTCGTTTTGGCCAAGTATTG:1 + chr2L 8913408 3' - mdg1 7043 2 74.00 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGACAAGACTAGAAAACGGCTAGATATCACAACTATCAATATCTTCTAAGTAATCTCAACAGTATT:1 + chrX 153053 3' + mdg1 410 2 67.33 AAGAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCAGGAGCAGCAAGCAACTTGGGAGCCGCATA:1 + chr3L 4212694 3' - roo 328 2 54.41 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTATCCTCATGCATCATGGGTATCATAACGCTCTTTGTGGCATTTACTCGAAA:1 + chr2R 17123633 3' - mdg1 26 2 52.00 GATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTTTCAATGCCTTTAAATTTTAATATACCAGCGAAACAAACACGTAGCGAAT:1 - chr3R 15880881 3' - 3S18 5792 2 53.47 TAGTGGGTAGAGGACAGCACTACTCCCAGGGGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAACATATAACCTCTGCATTTCCTCGAACAAT:1 + chr3L 22745332 3' + HB 349 1 72.28 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCAACATGTTTACTTAGTAGCTGTGTCAGCAGTATTGAAGAC:2 - chr3R 28475780 3' - roo 8671 2 70.30 AATTATTATTAATATTATTNTTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCGCACTTTGAGGTTGAAAAATAATCTTAACTTTC:1 - chrX 152974 3' - mdg1 7081 2 69.31 ATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCCCAGCTCGGATCCAAAACAAATTGTGAATGCATAATGTGAGC:1 - chrX 5830554 3' + Idefix 195 1 73.00 ATGAACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGTTTGTATATAAATTTTCAAACTTTTATATATTCCACACTGGTAGTGGACAACAAAAATAAAAGTTGCAAA:1 - chr2L 21998665 3' + INE-1 139 1 59.41 TGAGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTTTCCCAACAATTTTATATCAGAAAGGAGATTTTTATGAAATGTGTAGCTAGTAGCTAGCTAGGTGGGCTTCAG:1 + chrX 13352459 3' - accord 7032 2 66.34 TTTCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGAT:2 + chrX 21587710 3' - INE-1 139 1 75.25 ATTTATTTCTTTTTTTAATGTATTATATGTTCACGCCCGAGAGGAATCAAGCGGTCCGCACGATCGAGATGGGAGGGCGCCTATGGCACCAGCA:1 + chr2R 2749069 3' - mariner2 825 1 70.21 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTA:1 - chr3R 11151809 3' + mdg3 5479 2 60.40 AATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAATACAAACAGACCATCAATCTTTATCTTTTACAATCTCAGATAAAAACCGGAACGTAG:1 + chr3L 25208190 3' + I-element 233 1 60.40 TTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAGGGAGATGAAATAAAACACTCTGACAGGCAAGCAGTATTTTGTTGAAATTAAATTTTCCAAC:1 + chr4 511182 3' + Tc3 239 1 38.61 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGT:1 - chrX 10996543 3' - 1360 37 1 75.58 TTAGGATTCAGTATGATTTCGAAGCCAAAGAAAAGGGTCACAATAATGGCAGAAACGACTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAACAACACCAGGGACCA:1 - chrX 7618592 3' + hobo 418 1 81.19 TGATATTTTTTATATTTAAAATTTATATTCTGTTCATAAGAAGTTTTAAGTGTGACGGAAGTTAAATTTAGTTTAAGGACGCTTACAAAATTTCCATTTCA:1 + chr2L 17104654 3' - transib4 2577 1 21.78 AATGTAGCAAGACAGTTTGAGGACCATCTTCTTTCACAGACACGCACAGCGGGAGAGGGAGGTGAGGATTAAGGGGGCAGCACGCGACGCATTCGCTTGCG:1 + chr3R 23239901 3' + baggins 449 1 70.30 GCTATTCGTAGCTTGAAAGNAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAACAGAGGCA:1 + chr3L 455631 3' - Doc 38 1 61.39 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCCGTGGAAAAGAAAATGCAACGTAAA:1 + chr3R 12906584 3' + hopper 1367 1 76.24 TTATTAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATAAATTTCATTTATGTGGGTCGGTTAACAAACAAAACATGCGGTACTGGGCTGAAACCAACCCTCGAGAATTG:2 - chr3L 23649957 3' + mariner2 198 1 66.34 GTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACGACACACAGGACAAAGTAGGCAAGGCGTCGTAGGAGCAACGCCGCG:1 - chr2R 3068360 3' - Stalker 6882 4 57.43 GGTGGCTTGAACATGATGCNATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCATATAGGTCTATCATCATTATTTGATTCAAAGGGTCTTCTTA:1 - chr3L 17628038 3' - Ivk 4986 1 57.43 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGATATTTCCCTGCTCGCGCGCGCCACCACTTTCCAAACTTTAC:1 + chr3R 31887364 3' + jockey 4954 1 57.43 ATGCGTCGTCCAGCATGAAGGCTCCTTGTTATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATATCGACATAGGGTTCACCTGTTTGTTTAATGCGAATATATA:1 + chr2L 3141828 3' - diver 5855 1 59.41 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCGAATTGTGGATACAATCCAAATAAATAAAGTTTAGCTCCGAGTTTAG:1 - chr2R 10399122 3' + pogo 2074 1 55.45 AACGTTAACCAAACGGTAAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTAAAGAATCAAGCACCAATTTACAGAAAACATCAAATGAAATATTATACAAAGTAT:1 + chr3R 7028260 3' - Circe 7271 2 57.43 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCTTTTGCATACTTTTG:1 - chr3L 5255939 3' + jockey 4940 1 74.26 GACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTATCGCCTGCTTTACTTATTTATATACTTGCCCGCTTTCGACCATTTTGTGTTTTT:1 - chr3R 24939268 3' + F-element 234 1 56.44 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAA:1 + chr2R 8707087 3' + flea 219 2 65.35 TTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTCAATTAAATGTACATTTTTATGGA:1 - chr3L 8608733 3' - jockey 106 1 76.24 GCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAAT:1 + chr3R 14860186 3' - BS 5050 1 79.21 TATGTATATATGTATGTATATGTATATATGTATATGTATGTATTTGTGGTAAATACTTTAAATTTAATGCAAGTGCCGGCAGAGGAAAAGCCAGCTCCTTG:1 + chr2L 18021053 3' + G3 4508 3 57.43 AACCGATCTCTATGAATGCNGATTTGCGACTATCAGTCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTTCCAATTTAATATGTAAGATAACATGATGCATTTCAGGG:1 + chr3R 9858928 3' - BS 4 1 67.33 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACC:2 - chr3R 9870350 3' - F-element 45 1 56.44 ACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATGTCAAGGACAAAAACGTAATTAAAGCGTTGGCGCGGCATTGCCAAAGTATTTATAGA:1 - chr3L 19521212 3' + R1A1-element 5254 1 65.35 GTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAATGCGTTGGATATTAAGTTACTGCGATGCAGTAGTCAGGATGTCACGTTACGGCCTCCTCCTCTCCAGGAGTTG:1 + chr2L 3484478 3' + F-element 4366 1 75.25 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGG:1 + chr2L 13792236 3' - blood 35 2 60.42 AGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACCCTCCACCCTCTCTCTTCTTTTTTCCATTCA:1 + chrX 9903891 3' + hobo 2603 1 75.25 TTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTCGGCAGTTTTTGGACTTTTGCACACTCGTACGTATATTACGTATACGCCAGCGTCGCCGCCGTTGTCACTTG:1 + chr3R 21180744 3' - INE-1 252 1 68.32 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTCCGAGGCCAAATCCATTGAGA:1 - chr2R 7173618 3' - 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opus 7024 2 58.42 ATCAAATTAAGTTGCCGCANGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAATAATTAAGAACTACACTAACTGCACTTT:1 + chrX 12420337 3' + jockey 4951 1 73.27 GAATATCAGCTTAAGACTGAAACAATTGTGGTGAGAAAATCTGAAGAACTTAATGGGGTGATAAGGCAAATTAGGAAATATATAGACTATTTTATTTATTT:1 + chr2L 1636281 3' - Tom1 280 1 64.36 TGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGC:1 + chr3L 5206597 3' + roo 355 2 77.23 GCATTCTGATGACTCTTCGNCATATATACTTTCCAAACACTAATATTTATTTAAACAAAACATAAGAACGATAGCAGTGCATTTTTTATGTCTTAAAATG:1 + chr2L 21052829 3' + invader1 402 2 78.00 ACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAGGACTGGTCATTGAATGTAGTCATCTCTTTAATGGAAATCCTTTATCAAATTGGATTTAC:1 - chr2R 10849675 3' + R1A1-element 4924 1 50.50 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGCCTTGTCTCTGTGATTTTTCCGTGCGAGGGGAAAAGTGAAAAGGAAAAGCGCAGCTCGCAAA:1 + chr3L 949361 3' - roo 8678 2 65.35 ACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAATAATAAAAATAAAACGAAACGAGGTGAGTGCCAACAGTTTGTGGCAAA:1 + chrX 8973040 3' + flea 252 2 77.23 GAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACACCAGTGCCCATCGCAGGGCGCAAATTGCAGACCGACTTCAAATACAGTAGGATTCCTATATTTAATCGC:1 - 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BS 51 1 79.21 GACTCGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATATACTTTATATAGAACTGGCCTTAAATAATGAAATCTCAAAATTGCA:1 - chr3R 17188007 3' - INE-1 92 1 56.96 TTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTTTTTTTTTACAGTGCAGCCAAGTCAGCGTTTTTCAATTAAGCTTGCATTTCATTTAATATAGGAGAGAAGTCT:1 - chr3L 8231633 3' - F-element 341 1 74.26 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAAGAGTTCATCATTACAAATCCTTCAAAGGCTACACATTTAATGGCATTTT:1 - chr3L 6084374 3' + 412 453 2 65.62 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATACTTTTATGGATGAGGGGCTTGCGAGGGGATTAACCCAAATAGCGTGGG:1 + chr2L 12779680 3' - flea 23 2 54.46 ACCATGTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAATCTAGTGGCCTTTGCTTTGATT:1 - chr3R 6437995 3' + 412 7454 2 76.24 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACA:1 - chr3R 6437520 3' + 412 7495 2 74.00 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGTGACTTTGCATTTAGTTAACTGGTTTAACTTTAGTTGGTGTGGAAAA:1 - chr2L 13433901 3' + hobo 2910 1 53.47 TAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATAAATGTCTTACTATAAGTTTTATTTAGTTCCATTGCTAGTTCAGCTTTGGAGACTTT:1 - chr3L 2714459 3' - BS 31 1 53.47 AATAAATAAAAAAAATTAAATAATAACTTTTATTATGTGACTAACCCACTGTGATAGTGTGTTTCAGAAATTTTTGCGCTCTGTCTGCAAATGAAGTCTGC:1 - chrX 2822535 3' + Doc 4687 4 80.20 TAAATATAAAAATAATTAATATTTTAAACGTATAACAAACGCTGTGAAAATTACATAATGGACATAGTTGCTCCTTGAAAGTCTGAGAAGCCTGAA:1 - chr3L 3375135 3' + gypsy9 288 2 85.42 AATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCCCACTTCAAGGTGCCCAGATATGTGATCCCCATAGATGCATTCCCTAAAACCAC:1 - chr2L 5339304 3' - Rt1b 5111 1 55.45 TAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAAATGCATATAAAGGGCAGCGTAGATGTTGC:1 + chr3R 12098251 3' + R2-element 3356 1 71.00 AAAAATTAAAAAATGAAAAAAATCACAAAAAAAGAGGAAGGAAACATGAGAAAGCGAAAATGAAGATGGAAGGGCCACACAGGAAGCCTCTATCTCTTGTG:1 + chr3L 3720065 3' + Doc 4697 1 70.30 TGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGATGCAACTGCAGCCATCGGGATTTCCTATGGTGCATTATTCGCTGCAGTTGAGGTTGATGTTTT:1 + chr3R 21924100 3' - transib2 10 1 65.35 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCTTTTGCATACTTTTGGG:2 - chr3L 5255937 3' + jockey 4942 1 72.28 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTGGAGGGCGGACGGTGGACGGTGAAGCGGCC:1 + chr2L 19207925 3' - 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chr2L 9471218 3' + roo 9024 2 74.26 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTG:1 + chr3L 21912342 3' + Bari1 1683 1 55.45 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACT:1 + chrX 16237967 3' - mdg3 35 2 53.47 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATGTATGTATGCATGTATGTACAAATCGTTTTAAGCAGGAAATAACGCACAGTGATTCAATTTGT:1 + chr3R 4591930 3' - 297 6590 2 67.33 GTGCCAAACCAATGTATGAGCGTTACTTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTAGTCGAGTGAAAGTTCTCCAGCGCAACGGACGTGCCCAGCCAGAAATTCGAA:1 + chrX 21093855 3' + 1360 3359 1 56.44 GAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTTAAGTGTGTCCTATATTGCAAATTGGATGAAGTTCAAACCGGCCAATGGCGAGGAGG:1 + chr3L 23602646 3' + Bica 4660 1 61.62 TATTAATATTACTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAG:1 + chr2R 11404001 3' - mdg1 37 2 59.41 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTA:1 + chr3R 30611290 3' - blood 7060 2 73.27 TAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGTTTTTACTATATGTCCGATTTGTGAGTTCT:1 - chrX 3684716 3' - 1360 3374 1 70.30 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATCTATTCATTTACCTACATGTTTTCTATACCCATAAACGTTTTAATAGCAAAGGGTATTCCCAGCTT:1 - chr3R 21608738 3' - copia 4878 2 71.29 GCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATGGGCGGTATGAAAAATGAAACCGAAATACCCAGC:1 + chr3L 4864376 3' + invader2 4995 2 66.00 ATTTACATAAGATATGAACNGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATC:1 + chr3R 12937474 3' - roo 48 2 74.00 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTTATTGCCTTGTCCGCTCAGTCTAGTCATAGTTGCT:1 - chr3R 26434122 3' + hobo 2900 1 65.00 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCT:1 - chr3R 25950112 3' + 412 435 2 76.24 TCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATTACTTCTGGTCTGTTGCTTTTTAGCACATTTCAAAA:1 + chr2R 19328354 3' - McClintock 6219 2 64.36 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1 - chr2R 981624 3' - 1360 63 1 70.30 TGTCATCTTGGTCTCTATTAATTCAGCCCTTGCAGGCGGGCCGCATAACCGTCCAGGGCGGAGTGAGCCAGCTCAGCCAGTCGGGCGTCGTGAGACGCGTG:1 + chr2R 24849275 3' - BS3 1718 1 64.36 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGGCAACATCAGATCGCTCAAAGCGTGTGTGCCCTTTGAAGTATGCTACACTTTGTGTTGCA:1 + chr3L 16662478 3' - jockey 4686 1 60.40 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATATGTAATTAGTTTTTTAAAAAGTGGTTACT:1 + chr3L 11697111 3' + pogo 2047 1 79.21 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAACAGATTT:1 - chr3L 153599 3' - 1360 49 1 73.27 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATTTCAACTTGCAGTTTCTTTTTACTAATTTACTAAACTAT:1 + chr2L 8967090 3' + 297 367 2 67.33 TAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAGACCGAGTGTCACAGTGGCAAAGAGATGGACCCTTCCGAAACCTGTG:1 + chr3R 16613234 3' + 412 494 1 79.21 AGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATCGTTCCGTGTTCGGTTTCTTTGCTTACGCACATAAGCATTCAGTATAACCCGTCTCGCTCGCCTCCGTCT:1 + chr2L 22218231 3' - F-element 4461 1 78.22 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACATTGAATGTCCAAAAAATG:1 + chrX 3691573 3' - jockey 4791 1 57.43 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCGGAT:1 + chr2R 15201552 3' - P-element 37 1 42.57 AGTGCTGCCATAAGTTAATNTGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATTACACACCCCACCCACCGGCGCCTCCCTATT:1 + chr3L 6084425 3' - 412 46 2 70.30 GTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTCGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGGCGCAAAAATGTTGCAACGACATTTATTGTGCAT:1 - chr3R 20194225 3' - Quasimodo 7094 2 59.55 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCAATATCAATTCGATGCGTAATTCGCCAGATATTCGTTTGAATTGTTATTGTTTTCTCATGGGTTAAGTG:1 - chr2L 8913286 3' + mdg1 7454 2 73.27 GATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCCACACTGAAAGCAGCGAATGTGGTAGCATCAGCACAAAGTCTCC:1 - chr3L 1810552 3' - R1A1-element 351 1 55.56 TATTCACCAGGTGAGCGCCGGTGGCTGTGCTATAGTTGGATGCCATACGTCCAGATTGGCCTGATCGCTTTATATATGGGAACCTACACGAGCACCTACAC:1 - chr3L 5542535 3' - G7 886 1 81.19 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACGACGAGTGAGCGTGTGTGCACAGGGCGAAATTTTCATGT:1 - chr3R 13520172 3' - jockey 4707 1 61.39 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAAAAATCATCAGATAGATTAAGCCGGTGCAAAAGTTGG:1 - chr3L 1257986 3' - Quasimodo 31 2 63.37 TGGCAAAAAGTTTTTTTTTCAAATCTCAATTTATTTGCATTGTAAACAAGAGAATATTGTATGTATAGGAGCAATCATAAAGCAAAGGAAACAAACCGAAG:1 - chr2R 8242614 3' - INE-1 323 1 78.22 AATCAATAAATTAAATAAAAAAATCACTTTCACACATTTCATTTTAACCAAAGATTATTGTTGAATATTTTTCAAATAAATGTTTTTGTTCTCGACTGATC:1 + chr2L 13673229 3' + X-element 4716 1 92.08 AACGTAAGAGGGAGCGGAGNGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACTGTGAAGAATGTTTTGTAACTAGGTTATATACTTGCGAGTCTGACTA:1 - chr2L 16132523 3' - GATE 41 2 52.48 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATACATATTTCCATAACACACTGCAATCTACTTT:1 + chrX 6058227 3' - roo 8708 2 70.30 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATCAGCCAGTATTGCCAGCAGTGCTGTCAGAGGTCGATGGACATTTGGCCATAAAGCCAAT:1 - chr2R 15201473 3' + P-element 2873 1 63.37 TTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCAAAGTTTTCTAGGCCTC:1 + chr2R 2879970 3' + TLD2_LTR 187 1 92.08 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATGTATGTATGCATGTATGTACAAATCGTTTTAAGCAGGAAATAAAGCACAGTGATTCAAT:1 + chr3R 4591926 3' - 297 13 2 61.39 TTTTAAGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAA:1 - chrX 22398535 3' + Gypsy6A_LTR 155 1 58.42 AATGAAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGCCAGGATTACAATTCATTAATGCCGATCTTTTTTTT:1 - chr2R 2864487 3' - pogo 36 1 58.42 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAACACCGAAGTGGGGCACATTTGCA:1 + chr2L 1335374 3' - jockey 4683 1 67.00 AGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGTTTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCAACAAGCTGACAAACATTCCAAACAAACAAAAATGTTTCTTTATTTG:1 + chr3L 14467239 3' + hopper 486 1 54.46 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTAT:1 - chr2L 12779600 3' + flea 4985 2 62.38 AAGGTGGCCTGACGGCTGCCCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCA:1 - chr3R 30611260 3' + blood 7335 1 80.20 GGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACTAGACCACGTAATAATAGCAACATAAGGCCTA:1 + chr2L 2447765 3' - opus 103 2 68.32 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCACGCACACCAAAGCAACGAGAGAGGCTGCAG:1 + chr3L 13557107 3' - hobo 2 1 57.14 TAGTCCGAGGGACAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATAGTGTTCGTGATGAAACTTGTGACTCCACC:1 - chrX 1762945 3' - jockey 4715 1 67.33 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGTATTTTAGTGTGAAGCCCCGTAAAAACGTACGCACAAAAGTATGCAATGAAAGA:1 + chrX 3649742 3' - jockey 32 1 62.38 GATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCCGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTGATAGAAAAATACG:1 + chrX 15258354 3' - BS 29 1 56.00 TTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGGAAACTTCTTTGTAATAATCAGGAGAGCTTTGAAATTATCTGAATAGGGGTAAAAACCAAAGG:1 - chr3R 12938807 3' + roo 52 2 60.40 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACACCAGTGCCCATCGTAGGGCGCAAATTGCAGACCGACTTCAAATACAGTAGG:1 - chr3L 7494023 3' + roo 9049 2 54.64 CAATTACATAACAATCACANATCAATCACCTCACAACTCTGAAAACCACCATTCCATTTCCATTTTAGCATGGAATTTCCGTACTCAAAGTCAGTCGCACA:1 - chr2L 17225163 3' - X-element 4578 1 71.29 ATATAATATAAATATATTAATGAACTATGCACAGCGCCAATTGGTTAAGTTTGTTGTTTTTTTTTTCTTTGGCAACCTTGCGAAAAGTGGCAAAGTTTCCA:1 + chr3L 19694872 3' - gypsy7 5062 1 68.32 TTAGAATAACAGGATGCGTAACGTCTTACGATTTTTTGGCCACGATTTTCTGAACATTTAACATAATAAGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGAAA:1 - chr3R 19447210 3' + 1360 9 2 67.33 AGACACGTGAAATTGTATTNGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGAATGTGGGCA:1 + chrX 5452621 3' + mdg3 5470 2 56.12 AACCCACACACACACACACACACCATCGCACACGTACTAGCACACTAACACACTGGGGGGAAGAGATGAACACGTGCACAAACACCGCACACATACAGACA:1 + chr3R 21811856 3' + accord 7099 2 76.24 AATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAATTCCTTGCTCGCAACGCTAAATGCAATTAAAACTACAAGATGTTG:1 + chrX 14658755 3' - X-element 40 1 57.43 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATTAGAAGCACAAAAACATTGTGCCCTTTATGTACATTATTATGTCAGGTTAATAAATCAAATAT:1 - chrX 11170938 3' + invader3 263 2 50.50 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATGAATGTGAATAAACGTTGGGCTGTGGAT:1 + chr2R 15303042 3' - FB 47 1 73.27 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGAAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTGCTGTTTGCTGGATCCTTGGTTTCTGGCAGAAA:1 + chr3R 9825200 3' - Doc 13 1 61.22 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTAAGCGTATATGTATGCAGATAGTACCACGAGCTGTGTGACAGAGA:1 + chrX 4240759 3' - 297 23 2 61.39 AATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTACTGTGTTTTTAATATGGGCTCATTATTCAAATCTGTGGGAGCAATTGTTCGCTAAATGTTT:1 - chr2R 10354655 3' - Idefix 188 1 66.34 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTATGCTGAGCCCAAGACAATTAGCGCTATTGCCAAATGAAACAGCGGCGCAC:1 + chr3R 16305555 3' + pogo 2084 1 62.00 ACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGCAGCGGGAGCACCATAATTTCCATTAGAATTGCCCCGGGAGAAAACCGAGTCAAAGGCAGCCATTATCCCAACA:1 - chr3L 11918974 3' + R1A1-element 5312 1 80.20 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATGTATATTTATATAAAAAGGCAATTTTCTCGTGGTCTAAACAATATTAGTTTTACTTAAGATAAC:1 + chr2L 3146622 3' - roo 8676 2 67.33 ATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAGTGAGTCTGAGTAACTGAATAATACGAGCGACTTGTTGCCTTGTTGTTTTCCATAGCC:1 - chr2L 5897741 3' + 1360 412 1 61.39 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAAT:1 + chr3L 17708299 3' - 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INE-1 544 1 62.38 GACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTCGCTGGGTGGATGAGTGGATGTTTAC:1 - chr3R 9185176 3' - Quasimodo 354 2 79.21 TTTTATATATTTGTATATTAATAAATTTATATTGTATATAATTTCCTAGAACACAATCAGTTCAAATGCAAATGTATCTTCACAATGTATCTGACGACCTT:1 + chr2R 21869117 3' - Stalker4 7049 4 87.13 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTATAACTTTACTGTAGTTATCGTAAGCTTATGATTTTCTCTGATTTTGTTTTGAATTACA:1 - chr2L 3146517 3' + roo 393 1 62.38 TTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTGTTTGGTGTTGTTGTTTTTC:1 + chr3R 23295170 3' + Cr1a 169 1 82.18 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGCGTTAAGTTATGAAGTTATCACGATGGCACTTCTGC:1 - chr2L 8879894 3' + I-element 5320 1 60.40 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATCCATCGAGAGTCGATCTGCCCTGCATCAAAGTGCAATATAT:1 + chr3R 12937514 3' - roo 8672 2 72.00 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAGAGATATGTACGTGGTTGGAGAGTGGAGACTGGGGAATGTG:1 - chr3L 749265 3' - P-element 15 1 63.37 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAGAACTGCACTCCAAAATCAACAGCTTTGATTCATTCGATGCACTTTGCGGTGGG:1 + chr3R 26434190 3' - hobo 22 1 55.45 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTACATATGTATATTTCTACTTGCAACAGCAACGCCAACTGCGATAGAGTACGTGATTATCCTGTG:1 + chrX 2164347 3' - mdg1 7050 2 68.32 GAAATAAGTAACAAAACTAATTATTACATACAAAATAAATATATTATGTATTAAGTAGTGTTAAGCGCAATTGCAGTGTAAATAATTACCTTTTTGTACAC:1 + chrX 16843141 3' + Copia1_DM 291 1 43.56 ACGTCTCCACCCGAAGACTNTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAAAAGGCCAAACACAAACACGTAAAATGAT:1 + chr2R 14586512 3' - Doc 15 1 62.00 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGTGCCCTTTGCCACCGGCCACACC:1 - chrX 6338902 3' + P-element 2834 1 26.73 AATATTGCATAGGCACATACTACACCCCACAAAAACAACGCCGATCTCGCCCGTTTGTCACGCACACCAAAAACACAACAAAATAGACAAAAATAATAAAA:2 - chr3R 28403835 3' - 412 3 2 74.26 ACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTCCACACAGTACGGCAACGGTCTTGGTCAATTGCGAC:1 - chr3R 25162587 3' + accord 193 2 69.31 ATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCCAATACCCCATGATCCCCAAAGAGATAGCTAACGACATAAAACAAAGGACAGGACATGCGTTTGGCATCGC:1 + chrX 9757543 3' - 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Juan 489 1 57.43 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTCAAATGAAATGGTTACCTATATTTAA:1 + chr3R 8434308 3' - roo 8706 2 74.47 ATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTGTTATTGTTTGTTATTGTTATTGTTATATTTGGTCACTGCATCGTTTAGTTTGGCCTTATATATGT:1 + chr2L 22093207 3' + diver 5955 2 75.25 TATTTTATTAAGCGTTGAAACCATGCATTCTGATTAGCATCTTAACAACACATATAAAAACAAATCTTAATGAACCAGATATACTAAGGCAACCAGCGCTT:1 + chr3R 4584443 3' - BS4 712 1 76.24 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGTAGTGTTGTAAAGTACACATTTATGAATGACAACTGGACATG:1 - chr2R 11403916 3' + mdg1 7448 2 63.37 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAATTTGTAAAGTTTTTTGAAATTTGAAGTTGCACGGAATTGAGAATTTAAAGGATCAATT:1 - chrX 11987861 3' - 412 7070 2 61.39 AGTATTTTTTGAACAGTTGTTTTATTTTTCCAACTCAGAAGAATGTTCAAAGATGTTTTTCCCACTTGCATCGCCGACTTGTTTTTGAAAAAATTCTGTTG:1 - chr2R 25141647 3' - F-element 4594 1 59.41 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACAACATTTTTCCCGCAGTGCATATTTTCTTTTAAGGCTAGGCATTTCCATGTGTATGAAAGATTGCATGGCGTCGGAT:1 - chr2L 15179083 3' + copia 205 2 76.24 AATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGCAAAGTGAACAATGCCGGCGAACAATGGACTCGGCGACGGCGAAAGTAGTGGC:1 + chr3R 4354130 3' + I-element 404 1 59.41 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATGCGTGAAAATACAGACATAAAATAAATAATCACCAT:1 - 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copia 5055 2 69.31 ATTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTTTCGTTCTGCCCGCTTCTTCTTTCTTCTCCTCGGTTACTACCTACGTTTCACATTTCTTGCATAAAAT:1 + chr3R 14740224 3' + blood 164 2 58.42 GGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCTAATGAGCCCATGCCTATGGTTGCTGCAGCACCAGCAACACC:1 - chr2R 14609267 3' - P-element 301 1 47.52 GTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGAAAAGTATCTTGGCCAGCTACCAAAAAG:1 - chr2L 18192681 3' - F-element 472 1 72.28 CTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAAAAGGCAGGCAGCACGTCAATTTATATGAGCCATGGGATGGGGAATCACACGTTGATGGGGGATGTAGCAGAC:1 - chr2L 15167867 3' - F-element 4318 1 76.24 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCAACCACAAGGCAAATAAAGAGGGG:1 - chrX 8343658 3' - hobo 51 1 77.23 GATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCCGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAATGTACTTACTCTTCGGCCACGCAAGTTTCCATCTTCT:1 + chrX 19630751 3' - opus 368 2 60.40 GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTCCCGGATTGGATAATTGGTGTGATATACATATGAGAAAATAAATAAGTACATATTATTTATGTATTTTAC:1 - chrX 18584880 3' - Burdock 2 2 77.23 AGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTG:1 - chr3R 11151845 3' + mdg3 191 2 78.22 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTACCTATCGCTCCTCCACCTGAACGCTATCTATCAAATCAATTATGCTTTACATATTTACTAGAGTAAAGTGAA:1 + chr2L 6322631 3' - roo 8667 2 76.24 AAAAACTCAACGAGTAAAGNCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGAGCATTCCTGAAAGGAATCCATTGCCCCCACTTGCCGAGGCCTTAATTACAACGTCG:1 - chr2R 13099050 3' + roo 9052 2 58.42 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTTATTAACTGACCTTCGATAATGAAATCATGATGATGA:1 - chr3R 14708686 3' - roo 3 2 77.23 AGATATTTCCAAATAAAATNAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATAG:1 + chr3R 28475855 3' + roo 9022 2 72.00 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGAAAATAGGGAGGAAAAACAAAAATTCTTAACGAAAATAACTACGTAA:1 + chr3R 29465661 3' - 412 7082 2 52.48 ACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTGCCGAAGGGAATGCGCAGATTTCCTCC:1 + chr2L 3481439 3' + Doc 335 1 73.27 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACTATTATTTTGAAATTTTTTAATTGAGC:1 + chrX 19812434 3' - 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jockey 67 1 76.24 AGATCGACTAGGCTATTGATCCTGATCAAGAATTTATATACTTTATATGACCGGACACGCTACCTTTTGCCTGTTACATAATTTTCAACGAATC:1 - chr2L 21902491 3' - INE-1 97 1 80.85 AACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCCAAGTTTTAAATTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTGTCAATTTTTAAGCGTTGCAATTTTTTATACTTTCAT:1 - chr3L 24996290 3' + S-element 1663 1 61.39 GACACAACCGATCTCTATGAATAAATGTCTTACTATAAGTTTTATTTAGTTCCATTGCTAGTTCAGCTTTGGAGACTTTAAAGCTCAGCCCTGAAAAGTAG:1 - chr3L 2714437 3' - BS 9 1 75.25 GTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCTCGTTAAGTATTTTTCTGCATATTTAAATCGATCCCCTACAAAAGTAAGTGCTACACCTTTAAGCTATGTGC:1 - chr2R 1600935 3' - Fw2 3618 1 70.30 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACACGAATCGAATGTCATTAAA:1 - chr2L 17549289 3' + mdg1 7433 2 53.47 GCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTATCCACCTTACGTCCGCAATTGTCCAATTCCC:1 - chr3R 25921278 3' + F-element 4468 1 69.31 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACTCTACAACTTTCGGGAGAGAGAATATTCAAAATGGCGGCAACGCGAGGAAATCGAAGGAATTCGC:1 + chr2R 20584506 3' + P-element 2878 2 72.28 TGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGC:1 - 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chr2L 2799193 3' + jockey 394 1 70.30 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAAAGCAAACTGTCCCCTGATTAATAAATATTATATAATTAATACAT:1 - chr3R 16805987 3' - 412 10 2 69.00 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGGGCGTTGGGAAGATGGCAGCCAGAATCGTTTGCAATATGGGGCCACAAACTTTATGGTCCGGCCAT:1 + chr2L 3778474 3' + 1360 3383 2 65.98 TCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCAAGGCAGGATACACTAACCGAATGTTGGCTTCTGTCGCACCAT:1 + chr3L 24149856 3' + blood 7138 2 54.26 TGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCCTTT:2 - chr3R 4536180 3' - Ivk 26 1 53.47 CACCGGACACGATCCACCCAAACACGGTCTTTTTTCGCTTGCCAGCAGCGTTCTTAATCTCGTTTATGACCTCGTATATCCTTGGCAGGGAGCGCAGCTCC:1 - chr3R 16792811 3' - GATE 8157 1 69.31 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCAAGGGCATAAAATGAAGATCCAGCTGCGATGGCGCAA:1 - chrX 15268227 3' + roo 9050 2 57.43 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATGAATGATATGTTAAATACAAATTGCCAGCACATGGGCACGCTTGTGCAA:2 + chr3L 13164913 3' + I-element 5323 1 52.48 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTGGATTCTTATTGATTTGCTTGAGGTTTTGTTCTTCAACTGCTGACTCTGAAAGTTTCT:1 + chr2R 18686665 3' - jockey 4858 1 56.44 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGTATTTTAGTGTGAAGCCCCGTAAAAACGTACGCACAAAAGTATGCAATGAAAGAAGCATT:1 + chrX 3649748 3' - jockey 26 1 68.32 AAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATAACAAGCCAAAAAATAATTTGGAAATCTAAATCCCCCTATTGTTCTCCGATTTGG:1 - chrY 1542948 3' + I-element 361 1 57.43 TATGTGTTAAAAACCTTATGTCTCTCTGTGAACATGATAACCCAAGCAAGAAATGCATGAGAGAAAAATGCTTTGGAAAATGGTCTTGTTTTTCCCCAATG:1 - chrX 8986187 3' + Porto1 127 1 72.28 TATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGTAGTAGTGTCATAAGTAGTGCCTCAAAAAAATATATTATAAACTTAGTTAATTGGATTGAATTT:1 - chr3R 10674959 3' - I-element 5347 1 70.30 TATTGTTAGACACGAACCTTTTTTTTGTACACAAGTTCAGGAGTGTAGTCTATTGAAATGAATATTTTGCCGCTGTGAAGTGGCTGAG:1 + chr3R 26170476 3' - X-element 10 1 61.36 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACAGAGTGGTGCCCTCCGCCCGCCTGCATTAGCATTTAAATGGTGGCCACATTTCCGC:1 - chr3L 13071956 3' - roo 8683 2 60.40 TAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTCCTTCATTGTTGTACACAAGCTTTTACCTAAGTGCATTTTTAGG:1 + chr2R 16980335 3' - 297 6550 2 64.36 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAA:2 + chr3R 28475850 3' + roo 352 2 78.22 ACTCGACTGACTGCAACGCNGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGAGTACCGGATATGCATAGCAAACCGCAGAAAGTGGTG:1 + chr2L 9626909 3' - flea 140 1 63.00 TTTTTTTAATATTTTATTGTATTTTATTGCTATTTTTACCTCATTGATTATTTTCTGATTCCAACTCGCTTGTTTGGCCACATGCCCGCCCACTTGTTTGA:1 - chr3L 8576082 3' - BS4 726 1 58.42 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATTGGGCCAAGTTGGGGGCGTAAA:1 + chrX 15412723 3' + hobo 2893 1 75.79 ATTCGTAGCTTGAAAGAAANACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCATTTATCTCGGGTGTC:1 - chrX 19219297 3' - Doc 35 1 55.45 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGCATTCTCATTTGTATGTCAGCAGATTGACAATCAAGGCATCAGTCAGCGTGCCAGGCCATT:1 + chr2L 13913343 3' - HMS-Beagle2 6894 2 68.32 GCTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATATTACAGAAACTCTATAAGCTTAACAGTCATCAAGCTAATTCTGTTTGAAAAAT:1 - chr2L 15097163 3' - Gypsy6A_LTR 176 1 63.37 GGTAGAAGGAGCAGCCTACNACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTT:1 + chr3R 11151921 3' - mdg3 5254 1 75.25 TGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTACCAAGAAAAACATGTTCACACTAACAGAAAACATCGATAGCGATTT:1 + chr2R 24743728 3' + gypsy12 10107 2 54.46 TACTTGTTAATATGTTTTTTATGGGATTTTGTGGTAGTAGTAACAAAGTTGTTAGAAAATAAAAAAAATTTCACATTAGTTTAGTTTTTTAGTTTCTTCAA:1 - chr3L 17461493 3' + S2 110 1 89.11 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCAGGCACCGACGCTTTTAATAATTCAGCTATCACTTT:1 - chr2R 3021387 3' - Tirant 38 2 63.37 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATC:1 + chr2R 8232535 3' - P-element 43 1 36.63 GGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACGACAAGAGGCGAATAACCTAGATCAGACAATCCAACCAACTCAGCTCCAGCAGCCACATTCCCATCATCA:1 - chr4 838041 3' + Doc4-element 2608 1 77.00 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCATGCAAATTGATGTAAATATAAATGATGCTCAAATATTATTTACACTACAGAAGAGC:1 - chr3L 22112621 3' - Doc 25 1 59.41 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTAATTCATCATGCCCCAAACCGAAACCGAAGAGAGCGCAAAAGTAAGCGGAGAGCGAAAAGT:1 + chr3L 16807785 3' - P-element 30 1 49.50 GTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATAATATATGTATATTTATTTGGAGATCCATTTCTTTATTTATTTAG:1 + chrX 12851193 3' - invader1 3637 2 59.41 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAAATTTCATGTGAAACCCAACAAGA:1 - chr3R 20284745 3' + pogo 2052 1 76.24 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGCATCTGTGTGCAGCTTTGTCTCTTTT:1 - chr2R 12096577 3' + hobo 2929 1 55.22 TTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACATCTTAGCACTTGCTTTGTCCTTGTCTTATTCGCGTTAAT:1 - chrX 4869304 3' - P-element 463 1 43.56 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGAGAGCGAAGACTCCGCCTATCGGATTCGGAAATGCCCGTTCGGGGGGTATAAAAGCGGGCGCTC:1 + chr3L 749368 3' + P-element 2875 1 67.33 GCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAAAGGTGACCCAGCGAGCGCCACGAGTTGCGCCCTCTCCTCGTTTCACGGCTCCCATCTCTTTTCTCTCTCTCTCT:1 - chr3R 20293122 3' - Rt1a 4661 1 66.00 TACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACAATGCAGCCGTACTATATATTCTGGAAGGGAGTTGGGCAATCTGGGGGATTGGC:1 - chr3L 18413098 3' - 1360 186 1 70.73 ACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAATATAATAGACTTGACGATTAAAGTCGTTGGCAAGTGTCCCGCCACATATTCGCCTCTCGCCTTCTGTAG:1 - chr2L 23026102 3' + hobo 457 1 77.23 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTACGATGTAGCCATTTATGCGAACAAACACAAGCGCACTTTTATCCTAAAGCCTTA:1 + chr2R 19594682 3' - roo 19 2 62.38 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCATATCACGAGATTATACGTATTGCTTTGGATATC:1 + chr3L 16478462 3' - pogo 19 1 58.00 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACC:1 - chr3R 30611226 3' + blood 357 2 60.40 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAG:1 + chr3R 30252345 3' - 412 35 2 58.42 AGTGTCTTTGGTTTTACACTTTATTGTTTAGCTAATTGAACTTAAGAAAGTTTCATAGTTCGTTTAATTATCAGCAGAGAGTATTAGAAAG:1 + chr3L 15490209 3' + Tc3 322 1 74.73 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGGGCGTTGGGAAGATGGCAGCCAGAATCGTTTGCAATATGG:1 + chr2L 3778448 3' - 1360 36 1 58.42 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGGAATCTTCCCTTTTGGGTGAGTAATTTT:1 + chr2L 18297881 3' - hobo 48 1 71.29 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGTGGCTCTCTGTGCGCGAGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGTGCCTGTGTTGACACAACAATTAAAACCATTTAAA:1 - chr3L 13557026 3' + hobo 2937 1 77.23 AGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCTGAACGCGCATGTCTTACACAATCCAAATCCCAGTGACGCCGTAC:1 + chrX 7211182 3' + gypsy4 174 2 68.32 ACCCGAAGACCGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCATTTATCTCGGGTGTCCCCACCCAAAACCCCAAATCTCCAGAAA:1 - chrX 19219269 3' - Doc 7 1 72.28 TGGGTAACAGTGCGTTGATNAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAATACATTAACAACGTGTGGATTGTGATTTCCGCTGTATACTTTTCGGAGA:1 + chr3L 11523374 3' + jockey 4970 1 49.50 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCGCATGAGT:1 + chr2R 6074423 3' + 412 445 2 78.22 AAGTTTTAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTGCTTTTCGAATCAT:1 - chr3L 24889854 3' + transib2 2779 1 74.42 TGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTCGGTGCGTCATGTAACTGAAAACATAATTTATATGACTTCCATTCCGTATAATGAACATTTTTGA:1 - chr2L 20396986 3' + Transpac 4879 1 65.35 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCTTTGCCAACTTTCTATAATGGTGTCT:2 - chr2L 7461045 3' - roo 8680 2 62.38 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATATTCAATACTTTATTATAACTTATTACTTTCATAAGAAAACTGTTTATAATCACACAT:1 + chr3L 12717891 3' - pogo 14 1 63.37 GCTGCAGCATTTCTTCGTTTGACTAGTGAAGAAAGGGCAGGCTTAAAGCTGCATGTTTAATTAATTTTTTTCATCTTGTCGGCTTGTTATCATCAAACACT:1 + chr2L 16247228 3' - Chouto 6127 1 51.49 GAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACATACGGGCTATTCTCTTATATATTACGAGAATATATGAACACTTCATTTTCCATTATTCATA:1 + chrX 23283834 3' - R2-element 3557 1 64.36 AGAATGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCAGCTTACTCAGCTAGCTGTTGTGAATGGTCAGTGCAATTCACATAAAATTTCCAGCTAACCTT:1 - chrX 11879005 3' - INE-1 572 1 58.42 TGCCAACCGGGTTGTTGCCNGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTAGATGACGCATATTAAATAGTTTCCATTAAATATTTCATTCGTTCTTTCT:1 - chr3L 2989781 3' - flea 4780 2 56.44 AAGCTTTTTTTTTTTGTTTTTTGC:1 - chr2L 9565501 3' - HMS-Beagle2 490 1 87.50 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGAATATTATGTTCTATTTAATTTCCACTTACCCGACCGATTATTGTTCAGTCT:1 + chrX 11993792 3' + 297 6956 2 57.43 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAGCATAAGAGGTAAAATTTAAAACGTCGTGTGCTTTTCAACACTTTTTAG:1 - chr3L 11697052 3' - pogo 24 1 53.47 CGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCCAAGACACCGCCCTCTGCACTGCGGCACCAAATCAAACCGCAGTTCCACAGCCTGCCAAGATGGCATGGC:1 + chr3L 13514337 3' - jockey 10 1 74.26 GATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTA:1 + chrX 14173240 3' - pogo 275 1 78.22 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACATGCAGAAAATGTTTGTCAATCGAGATGGTTTCCCTTGATTGGGTTAATAAATTCCTAGAT:2 - chr2R 24500808 3' + Tirant 8496 2 67.33 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGGTC:1 - chrX 11025501 3' - hopper 30 1 50.50 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACAGAGTGGTGCCCTCCGCCCGCC:1 - chr3L 13071990 3' - roo 53 2 78.22 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACAGAAGCATGAACTAAGAAACAAGTCAAGTCG:1 + chr3R 13238562 3' + Burdock 6365 2 69.31 GCTATTGATTCTGAACAAGAATATATATAGTAACGTAATTATGCCTTCCTCATAATTCACTTATACAAAAGAACGACCGCTATCGCCACGCCGCTGAAGAA:1 - chr2R 7255295 3' - INE-1 86 1 69.31 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAGGTGTGTTCAGAAACAAAGCAAGAAATTGAAAAAAACGCTTTCAAAGCAAAATACCCTGGCAAAC:1 - chr2L 19092397 3' + 1360 3380 2 69.31 GTTATGACCGCAAAATTACAAGTTCCCTTTAGAAAGAATACAGTTGAGTTCTATTAGCATCGTCACAGCCAGTTGCCGCAGTCGTTGGCCAGTGGAGCAGC:1 + chr2R 7521588 3' - diver 107 2 60.40 GCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCGAGTCCGATCCAGACCCCACATAGAATGCCAAACCCCGAACTGCAAAGACCACCTCCAACTCCA:1 - chr3L 11354059 3' - diver 5748 1 54.46 GCACTAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCTTGTTTTGTTTTTTACTACGTTACTTTTGTCCAAATCTCTTTAT:1 - chrX 19809873 3' + INE-1 540 1 75.25 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACAACAGACACGCAGAGGGCGACA:1 + chr2L 19997241 3' + roo 9016 2 75.25 GCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACATTATTGTTTCCATTGTGTTCGATATTTGTATTTTCTTGTACTTTTGTTGCCCGGGCACACA:1 - chr3R 6478104 3' + P-element 35 1 65.35 AAAATTTACCTTATAATTTGAAGACCTTTAAGTCTTTTGCAGTGTAACTACGTCAGCTAAAGCTTCATAACTGTAATTACGTATTTGGGCACTCGGCTGTG:1 - chr3L 9322765 3' - invader5 22 2 62.38 TACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCTGAGAATTGTCATAAGCAGGTAGCCCAAATAGCCCATCCCAAAATATTCCACT:1 - chr2L 8276495 3' + FB 286 1 58.42 TGTCTCAACTGTGTAAATATTGAGGTCTTTATGGAGTGTAGAGTTACGTACATGCGCTTGGCTTTAATAACTACGTTCAAAACAAGTCCCGGTATGGGTTA:1 + chr3R 7478997 3' - Helena 1206 1 54.46 ATAAAATATATATAAAAACTTTCCGTCTCTGTTCCTGACAGCCCAACGACTACAGAAAACCGAGGAAAAACAACCGCAACAGCGGCGCCTTAACTTGAAAA:1 - chr2L 8572120 3' + mariner2 792 1 76.24 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGC:1 + chr2R 8707075 3' + flea 4966 2 77.23 AGCTAACCCGCATATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACAATATACATTAATTGTATTTTTTAGGGTTTAAGTTTTTAGAATTTTT:1 - chr3L 17546383 3' - Stalker 290 4 61.39 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGAGGAAATATTATAAAACACCAAATCCAGAGTCACATCTTTTGCTGCTCAATCGGGCGTGC:1 - chr3R 27455522 3' - 297 10 2 70.30 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCGTGTTAGTGTGCCTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGGGGGCTTTGCGGGCATTTTATGT:1 + chr3R 11278449 3' + hobo 2937 1 40.23 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGGGCGTTGGGAAGATGGCAGCCAGAATCGTTTGCAATATGGGGCCACAAACTTTATGGTCCGGCCATCATTGT:1 + chr2L 3778480 3' - 1360 4 2 69.31 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTACATTTCCTCTACGCACATGATAGCCCGGTTAATAACATTTTCTTAGCATACACTTAGGGATATT:1 - chr2L 18818577 3' - jockey 60 1 58.42 TTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAAAAAGCAATTAATAAACGAGCGATGGCAACAAGTTGCAAGTTGCAACT:1 - chr3L 10284809 3' - Juan 3828 1 53.47 GAATATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTGTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCACATGT:1 - chr3R 13439586 3' + gypsy7 5065 1 54.46 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAGAGCGTCGGCGTGCCGATTTAAGGAAAGCAACGGTACCAAGCTG:1 - chrX 21400758 3' + P-element 2873 1 66.34 TATTTCCAAATAAAATCAGNTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATG:1 - chr2R 13446667 3' + roo 9025 2 74.26 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCGTGTAAGGCTATCTGACACTGGCCGTGGGAAAATGCTGCACTTTGTTGGCTTACCAG:1 + chr2L 13215063 3' - roo 18 2 58.00 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATTTAATGTGAAACAAGGC:1 + chr2L 15983436 3' - hobo 28 1 51.49 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAACCAGCGAATATAAAGAGTCAAGATACA:2 + chrX 17109698 3' + roo 9020 2 73.27 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAATAATAAAAATAAAACGAAACGAGGTGAGTGCCAACAGTT:1 + chrX 8973031 3' + flea 243 2 68.32 AAAAAAAGAAAAAAAAATGGGGGAGCTTGTCAACTTTCGCACATAAGGAAAACAAATAGTCTGAGGCAGAGACTTACATGCATATTCATTGTGGAGCAAAT:1 + chr3L 5392249 3' - hopper 139 1 54.46 GGGCCCGAAAACACGAGAGACGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAAT:1 - chrX 18121850 3' - opus 48 4 80.81 AATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAAAGCAAACTGTCCCCTGATTAATAAATATTATATAATTAATACATAGAGCAAA:1 - chr3R 16805979 3' - 412 3 2 76.24 TTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAATTAATTACAATAAAAGTGTAGGCAGATTTATTTGCATATCATGTGATATTGTACTGACTCTACTTTG:1 - chr3R 5213191 3' - G6 2001 2 57.43 GTGGTAGATTATCATCCTTTATAATGACTAAGTCGTTGATGCTAAGATTATCTTTGAGTGACTGCTGCTGGTGTTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGAGAG:1 - chrX 996072 3' - diver 5659 1 58.16 TTGTATTGATTCATCGCTTNTAAATAAATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTTTCGCTGCATACTTTTGGGCAGCC:1 + chr2R 10857765 3' + BS 5073 1 48.51 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAATTACACCGAGCTGGGGCAAAG:1 - chr3L 10683462 3' + opus 446 2 78.22 ACAAGGTCCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGCTCACGGATTATACAAACGCCCAATTGCCAAAATCCCTAAGACTTCCTCGTCAGATTGTGACTAAACACGT:1 - chr3R 15885890 3' + 3S18 5657 1 64.36 TTACAAGCGCTGCATTATATAATTATATGATAAGAACCAAATGGGGCGGATGAATAATGCTGATGTTTATGGGCCGACTCGCCCGACTCTTGGCCAACTTT:1 - chr3R 30089542 3' + rooA 243 2 66.34 AGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCTGTTGTGTCCGTTCCTCGCCACCTCCTCC:1 + chr3L 22389402 3' + Doc 254 1 65.06 ATCTGATAGTCGGAAAACTCGAGTATAGCCTTATCTCTTGTGTGTGATATAGTGTTTTTAGAAAATTGATAACCCACTTGTTTAACTATTAATTGCAAATG:1 + chr2L 5117493 3' + INE-1 560 1 76.24 GTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTTTACCTTTATCCAGGTATTTATAG:1 + chr2L 12199553 3' - Stalker2 7247 1 76.24 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCGAAAGTACTACCCATATTCTGTTGCTTCCCCCTAAACTGTCCGCCTAACTGAATGTCCTTTCATTAGC:1 - chr3R 9085020 3' + mdg3 235 2 64.95 GTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGGATGGTCCTCTGACACAAACACCAACAAGGATCGATACACACACA:1 - chrX 10425779 3' + 412 7156 2 60.40 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGAATGTGGGCACACAAATTTAAGCTCTAAACAGCTCGG:1 + chrX 5452648 3' + mdg3 5494 2 72.28 TTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAAAATGAGTTCGGACAAAGATCGCTTTAAGCTTAAACTGAATGCAGACCGTCGATGGCACTTCCATGAAAAAGTTT:1 + chr3R 4536276 3' + Ivk 5376 1 76.24 GACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCACATTCGTTACCAGT:1 - chr3R 1418271 3' - BS3 208 1 46.53 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTTAAACTCCACAAACCATATACTCACAATCATAATTCAAGAAAGTTTCAT:1 - chr2L 12076646 3' - jockey 34 1 52.48 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAAGAGTCATGCCACCCAGGACGACAGGCCAACAATGGTGCGACATGAGCAAC:1 + chr3R 11720700 3' + hobo 2914 1 54.46 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATCTTTGCGGGGTAAAAGAACTTGTCCATAATTACACATATAAAATATTTTTCTTATTGCGATTGTTACATC:1 - chr3R 27082961 3' - jockey 4676 1 71.29 ACGAAATAAACAAGCACTCNAGCAGATACCATGTAAGTGCAATTACTGCGGAAAATTGGATTTCCTCGCTACGGAAAAGCTCTCTGGCTGGCTGGGATGG:1 + chr3L 16893364 3' + X-element 4390 1 69.00 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCCGTGGAAAAGAAAATGCAACGTAAAAATGCATAAATCCGTGGGATTTAAAGATTTCGCTGGAATTTCTG:1 + chr3R 12906628 3' + hopper 1412 2 76.00 ACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTACTGTTCTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chrX 13235224 3' - P-element 163 1 47.83 TTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAATCACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACGTGAATAACAGCTGACTGTAAACTCATACA:1 - chr2R 16196389 3' - 3S18 227 2 70.30 GGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACGAATACGCAAAATGGCTGTATCGATTATATATAATACATAAATATTTGTTTTGTTTTTATATATTGTA:1 - chr2R 11464194 3' + 297 212 2 77.23 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTCAGCTAATTAAAATTTCAGTATTAAATGCATTTGTTTTCGAAGGCATGTTGGCAGTCTG:1 - chr2R 11941205 3' - Doc 38 1 43.56 GACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAACACCAGACACTCACACGCACAATCGTGGGCACACAAAACGACGAGCAAAC:1 - chr3R 22969360 3' + F-element 4397 1 61.39 GGATTAGTTTTCTTGCTAGGGGATTTGGATGGGTGGTCAGATTTTCTAACTTGGCTCCATTTTTCTCTCGGTTTTTGGAGATTTTTTATGTCTTGATTAAG:1 + chr2L 632496 3' - Doc 4502 1 64.36 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCG:1 - chr3L 16807741 3' + P-element 2831 1 24.75 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGCTAAATCTGCACAATTTCTTGGCTGGATTTCGTTATTGTTGCCAGCCATCC:1 - chr3R 31962046 3' - Doc 31 1 53.47 GCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCCTGCAAGTAATGTACTGTGGAGGCGCTTGTAAAAAATTAATTGCATACTT:1 - chr3R 8460850 3' - BS 19 1 51.49 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATCGTTTTTTTTTGGCTTTTCCGCAGAGACGCAAATCATTTGTCAAAAT:1 - chr3R 29465570 3' + 412 472 2 57.29 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGAG:1 - chr3R 18171783 3' + 1360 3346 1 72.00 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGTACGACAAAGGACGACAAAGGACTCGG:1 - chr3L 13366375 3' + hopper 1387 1 64.63 TCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTAAATTATGCCACAAATCAAAAACCCACACACAAAACACCCCACCCAAGCGATAAAGCAA:1 - chr3R 23128550 3' + I-element 5117 1 60.40 GCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATACTATCGAACTTTCCATTTCGTTTC:1 - chr2L 17645666 3' + jockey 4696 1 75.25 ATCAATTGTTAATATATATTTTATATTTTAAGAATAAATATTAATATTAATTTGCTTTTGTCTCTTTCTCGGTATAAATCATGCAAAACTATCATGCCCCT:1 - chr2R 10698939 3' + TART-C 11022 1 76.24 TATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTAAAGAATTTGCGAACAAACTCTGGTTTGGAAAC:1 + chr2R 1765498 3' - Burdock 370 1 68.32 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGACAAGACTAGAAAACGGCTAGATATCACAACTATCAATATCTTCTAAGTAATCTCAACAGTATTCT:1 + chrX 153055 3' + mdg1 412 2 69.31 GTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTGCCGCCGGTTGAGTTTCGTCGAGTTCTTTATACCCGCGTCGCTTATTTGTTATT:1 + chr2R 19801274 3' - HB 1521 1 61.00 TCTTAATAGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAATGAACTGAGTGGCTGGAGATGCGATGCCGCCAATT:1 + chr2R 19558037 3' + 412 7544 2 63.37 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTAAGTGATTACA:1 + chr2L 15907217 3' - pogo 35 1 64.36 CTCAAAACAACCGATTTTGTGAGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATCGAGTTGTTTTATTTAATTTTATTTATTTTCAGCT:1 + chr3R 27444757 3' - F-element 54 1 69.31 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGTTTAACATAGCCAAGTATATTAGCAAAAACAGCTGAGACTGAAAACTT:1 - chr3L 1927415 3' - mdg3 5282 2 55.45 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAACAGAGGCAGAGGCACTGGGCTATCGAG:1 + chr3L 455650 3' - Doc 19 1 62.38 GTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATAAATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCGTCAAAATAAGTAA:1 + chr3R 11100045 3' + R1A1-element 5305 1 80.65 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATGAAGAATTGCTGTACAAGCAGAGGCTGAAAAATATCGCTGATGCTAATAAAATAATAAAAA:1 + chr2L 5962862 3' + I-element 5346 1 63.83 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTT:1 - chr3R 11151832 3' + mdg3 5456 2 65.35 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAAAGCGACATCTTTAAGAAGATC:1 - chr2R 24169888 3' + roo 400 1 69.31 GGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAATAATATTACTTATCTTCGTCGTCAAATAATTTTCATCAAAAATTTAGCTACTTCATTAAACCAATTG:1 + chr3R 20192615 3' - Quasimodo 7 2 71.29 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAAGAA:1 - chr3R 17615928 3' - HMS-Beagle 24 2 55.45 TGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCT:1 + chr3R 25271718 3' + invader4 280 2 73.27 AAAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATTGTAAGTCCAAATGGCGAGATATGTCCTTGTGCTGGGCGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTA:1 - chr2R 1005988 3' - Cr1a 4178 1 57.43 AATAAGAAAATTTAAAAAAAAAAATTATGATTTAAATCAATTAAAAGACTCGCACTTCAACGAACTTTCTGTTGAGGAACCCAATCGGTTGGATGGATGA:1 + chr2L 5690831 3' + Doc 4691 1 60.00 GTATGGCCGTTAGGCATCTTGTCATTTCAATGTCTTTGGACGAACCTTAGCACAACTTCTTCATTGTCATACAGCACGAGGCCAAAATGCTGGCATCAAAT:1 + chr3L 11835949 3' + 1360 3372 1 52.48 CATAATGACTTAAACATACAAACAGTCAAGGAAACTATTAAAAAAAAGCAGCAACACACCGAACTCCTTCTCAAATCCACTGTCTAGTGCAAAACCGTTGC:1 - chr2L 225103 3' + Porto1 4395 1 55.45 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCC:3 - chr3R 4536183 3' - Ivk 29 1 51.49 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAGCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGAGGCGATTGGCAG:1 + chr3L 5206609 3' + roo 9032 1 64.00 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCTCTTATTGCAAGCATACGTTAAGTCGTTGCTCTTGCCGAGATCCTTGTCCCACACGGTCAGGATGAGCATCTCC:1 + chrX 10749953 3' + P-element 2813 1 53.47 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATA:1 + chr2R 18105808 3' - roo 8706 2 68.32 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTGTGATGTCATAATTGGAATGCCTATCTTAATTCTATATTTTGTCTTTCGTCTGTTATTTCT:1 - chr3R 10434537 3' - 1360 14 1 66.34 GGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTATTACCACTGTACCCTAATAAAAAAAAGCACAAAGCGGAGATATAATACACAACTCACGGTGAGAAGTC:1 + chr3R 21824463 3' + INE-1 571 1 67.33 TTAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAACTCTGATACTGGGAAACTCTCTCAA:1 + chr3L 25876124 3' + copia 5074 2 74.26 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCCAACTTCAAGTTACAATTGTTCAACAAGTAATGAGTTTGGATCCATGAAAGCTTAAATATATTGGTTAA:1 + chr3R 22467123 3' - mdg1 8 2 67.33 ATAATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATTTTTTGAAATTTTCTACATCTGAACTGGAAAAGTCTCGAAA:1 - chr3R 16932228 3' + accord 376 2 57.00 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGA:2 - chr3L 9542522 3' + roo 9021 2 75.25 AAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATGGTCATGTTGACAGAAGTAAATCTCTTGAATTATCGCATTAGATGCCGCATTCTCACAGA:1 + chr3R 16750430 3' - copia 4712 1 74.44 AAAAAAATCTAAATCTAATTTGTACTTACTTTCTCTCTCTTTTCAATAGTATAATTTTCTTCCAGATCAAATGTGACTACAGCTTGATTGATTTTACTCTG:1 + chr3R 17473406 3' - Quasimodo 7260 2 85.15 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGC:1 - chr3R 7869100 3' - 297 6585 2 73.63 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACATGCATGGAA:1 - chr2R 19557970 3' - 412 23 2 56.44 TATTTAAAAAAAAAAACCAAAAAGAAAAAACCCAATCAGCGAGCAGAAGCAGCAAAAGCGAATTAACACAAAAAATATCAAAAAGTAAAATAGAAC:1 - chr3R 12561475 3' + TART-B 10632 1 77.08 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAATTAGATGAATCAACCTGTATAA:1 - chr2L 7259438 3' + I-element 5311 1 77.08 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGGCTATCTCTATCTC:1 - chr2R 7024978 3' - P-element 60 1 16.83 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTCAAGGCAAGGCCGTCCAAGAAAC:2 + chr2R 24555675 3' + hopper 1365 1 73.27 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAGAGCGTCGGCGTGCCGATTTAAGGAAAGCAACGGTACCAAGCTGGACTTTGGAC:2 - chrX 21400748 3' + P-element 2883 2 76.24 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAACACTAAAAAAACACGCATGCAACAGATCTGGGAAGGATTCCAGTTTCCGCTTACATTCAAAGCCGGCA:1 + chr3L 8896844 3' + jockey 4980 1 67.33 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTGTTCCTGCGGTTGCCAAACACCGACGACACACG:1 - chr2R 10969393 3' - mdg1 7078 2 67.33 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGCTTTTGTGCTTTGGCGCCAGATGTGCG:1 - chr3R 16594443 3' - Tirant 8107 1 79.21 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGGCTATCTCTATCTCTTCTCCGAAGCTTTCGAAGTAGC:1 - chr2R 7024955 3' - P-element 37 1 42.57 AACTACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATAATGTATGCATATCTCTGCGCCTTGGACTTTTCAGCTCATCATAAATAATGTGAAATA:1 + chr2L 18927557 3' + mdg1 406 2 63.37 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACCCCCAGCAGCTGTTTGGGCTGCACGTGAGCGAAAAAAAGAA:1 - chrX 21374167 3' - P-element 33 1 49.50 AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACCTACCATATGTTGCTTCTCACGTTACGCAGCAGACAGCAAAAGTCATATCAGTTGGGATTG:1 - chrX 714143 3' + roo 9054 2 62.38 TTTGAAGGTGTGACATTGGAACAGCCATCTTAAGCGAAATACCATAACCTTGTGGATACAATAATGACTACCATAATTTACAGGTTACCGGTAGAAAAGG:1 - chr3R 4584959 3' + BS4 367 1 55.00 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTCAATGCGAAATTGAAACAAATTTCGTTTTGCAGAGTTGGCAGGAAGCATTTATGAACGA:1 + chr3R 25950173 3' - 412 14 2 65.35 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGAGCTCTCCTCCGCAACGTCATCAATTGTTAAT:1 + chrX 10426937 3' + 412 7500 2 68.32 TTATGTTCACTTGCTGTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTGGGGTTTTTACATTCGCTGTACAAGG:1 + chr2R 6724432 3' - I-element 452 1 78.22 TTCGCGAATTAGTTGCAGTTGCGCTGACGTTACTGAGGCCGCGTACGGTCTTTTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTCCTCACAAACCGTGTAGTCACTGTAC:1 + chr2R 10098831 3' - gypsy4 6640 2 69.31 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGCGCACTCGCATTCCGCGCTGAAATCCATATGGATATTTT:1 + chr2L 435267 3' - FB 38 1 61.39 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAAC:2 - chr2L 8646680 3' - Tirant 39 2 64.36 GGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCGTGCACATAAACTGCTTTTCGCTCTCAACTCTTTGTTTATTTGAAAAAAAAAATCTCTCATGTAATTTTACTGCAGT:1 + chrX 22119902 3' + Cr1a 246 1 58.00 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCATTTCTATCAGCAGCCACACAAAAACTAATTCCACATAATGTGCCAATCTACATAAAAAATCGCTCG:1 + chr3R 8705372 3' - jockey 13 1 72.28 GGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGAGTGTGTGTGTATGTGTGTGGTGGTTGAGACATAAATTCATGTGAGAGTG:1 + chr3R 27376751 3' - Quasimodo 77 2 61.39 TGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGCCTAACTATATCCCTTATTTTTAGAAAGTAAAATAACGCACTTGGCCTACATTTAAACGTTCT:1 - chr3R 4493081 3' - S-element 1699 1 61.46 ACCCAACTGCAAGGAAAACNCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTGGTTGCAGGATCGCGGGGAATTGGAATTCCGCGCTGGAATT:1 - chr2L 15479553 3' + blood 7354 2 60.40 AAAACTGAAATTGTCCAGCNGAAGGCTAAATACCTAAAGCGAATTGCAACGCATCTAAATCAGTTGGCATTTTGGTTCTTCAATCATTTTTCAACAGATAT:1 - chrX 11631574 3' + Doc4-element 2752 1 66.34 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCCAGCACCCGCGGCT:1 - chr2L 8690555 3' - Tirant 40 2 77.78 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCTT:2 - chr2L 7461069 3' - roo 40 2 65.35 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCTGAAAGCCAATGAGGCGCAAAAAAAATGAGGCCCCGAAATGTATGCTACAAAA:1 + chr2R 11160610 3' - jockey 32 1 55.45 TTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGAAAACCCCAATTGCTTGAGCACAGAGCCACTGGCAATCAGTGAGA:1 - chr2L 20732337 3' + roo 174 2 55.45 TGATGAAGCGTTTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGACGGCGGGTATCGAGTCAAGGATGCCGG:1 + chr2L 13899880 3' + Rt1b 4777 1 79.00 ACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAACGGTTCGCTTCTGATTGTGAGCAGCACTTAAAAACATATTTTATGTTATTAGAAATGAAGTCAATTGGGAATCTATA:1 - chr3R 17552445 3' - Doc 7 1 57.43 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAATTTTGTAGGTGGTGCA:1 + chrX 11030938 3' + roo 395 1 65.35 ACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGG:1 + chrX 22386760 3' - hobo 86 1 64.00 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGA:1 - chr2R 24169910 3' + roo 378 1 54.46 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGCATTCTCATTTGTATGTCAGCAGATTGACAATCAAGGCATCAGTCAGCGTGCCAGGCCATTC:1 + chr2L 13913344 3' - HMS-Beagle2 10 2 69.31 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAGTTTCTAATATCAAGAACTGAAA:1 + chr3R 7618718 3' - Doc 30 1 50.50 ACTCCAACATAATTAGTTTAATTTGCACAATGAGATGCTGGTGCTGATGGCGATGGCGATGGAGATGGCCTCGCCCCATGAT:1 + chr2R 11820983 3' + gypsy6 7804 2 71.95 TTGTGCCGGAAGTCTGGCATCGAAGACCTTCCAACCACTTCTTTAGTTGGGGCAATGCGAATTTGGTTTGCGTCTTGATTTTTGGCCAATTTTCTGATGAT:1 + chr3R 17879695 3' - invader3 387 1 53.47 AACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTCGAATTGGATTAGGATGTTATGGGACAGGGTGTATTGACCACGGCCAATGC:2 + chr2R 3068434 3' + Stalker4 383 1 52.48 ACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAGAAAGGTGGCGCACAACCGCCGCTGCAACATCCGCAGTT:1 + chr2L 16003141 3' + blood 260 2 69.31 GATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACATACCCATTTAAGATGATCTTTATTAAGATGAATATCGAATGTCTTTTGTTTTTAAAG:1 + chr3R 2690566 3' - diver2 4553 2 52.48 TAATATTTTATACTATCCTNCGGGTAGGGAGATCGGTGGGGTGGATGAATACGGATCTGGTTGAACTCCTAGTGGGAATATGAGGGAGAAAAGGGCG:1 + chr2R 5732601 3' - G5 4672 1 69.07 AATGGAAAAATAATGCAGANATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAAT:1 + chr3R 20284783 3' - pogo 47 1 77.78 AAGCCGCTTTCATTTGTATNTAAATATATTTTTCACTTTAAGGATTGTTTTTGTGGGCAGTTGTGAAGGCGTGGTCAGATAAAAAAACAAACAAAATCCGA:1 - chr2L 11810238 3' + transib4 2452 1 78.22 AAACCATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAAAAATATTTATTGATAATATTTCGTTTGACTTTAATCTCTGAGAAATATTTTTGAATATTTTTTTACA:1 + chr3R 29197310 3' - FB 367 1 74.26 GCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATC:1 - chr2L 11919291 3' - X-element 49 1 62.38 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTCATGGATTGCAAAAAGCCAAAACCAAAAC:1 - chr3L 95855 3' + roo 9048 2 54.46 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATTTCTCAGAAGATTGGTTAAATGGAAGTAATACTTTTAAAAAACCATTTTATATCCACATA:1 + chr2L 12337323 3' + I-element 5340 1 58.42 TTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 5325 1 52.48 TGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTTTGGTAATCACATTACTGGCTACCACGCGCTATCCATTTAATTTCAACAATGCCACCGCATTTAATATTTCACGATT:1 - chr3R 27455357 3' + 297 6815 2 79.21 AAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTTTTATTGTTCGCTAAATTGAATTTTACCTTGCGTTTTGAA:1 - chr3L 8905926 3' + pogo 1935 1 63.00 GCTTGCTTGTGTGAGTACAAACAAGAGAACGCGAATGGGGAGCGAATAGTGGGTGGCAGGAGTTTTGAGGCAGCTACAAAAAGCTTAGCACATGCGAACAT:1 - chr3R 8415865 3' - 1360 3250 1 69.31 ATTTTAAATGTTTTAAACTTTGGAGCAGACCAATTCAACGAACTACTTATTTCTTACAAAATGGAAATGACAATTCTTATCAGTTACCAAGTCTTCGAAAT:1 + chr2R 21458431 3' - gypsy3 489 1 83.17 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAAAATACAAAGTAGGAGATTGTTTTAAATTTATTTTACCCATATTAATTTTGCCCTAG:1 + chr2L 20840336 3' - mdg1 20 2 58.42 ATTATTATTGTTATTATGTNCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAG:1 + chr3L 27357641 3' - mdg1 12 2 67.33 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAGGGATACACAGATATTTGATCGTCAGGTGAATGATGAATTTAGAAGCATTTGTGTGGAAG:1 + chr3L 24152093 3' + roo 9055 2 61.39 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACAGAGTGGTGCCCTCCGCCCGCCTGCATTAGCATTTAAATGGTGGCCACATTTCCGCCCTCGAGGGAAAGCCA:1 - chr3L 13071940 3' - roo 3 2 76.24 TTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTGCTATTTTTGCTCGTTCCTAGTCTGTATATCTTTTC:1 + chr2L 18868540 3' - 412 407 2 64.36 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCCTAAAAGTAGGCAACAGTTTTTTCCAGTTTTCCTTTTAGCCTTATTG:1 + chr2R 18988509 3' - hobo 9 1 63.37 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTAC:1 - chr2R 5200933 3' - 1360 32 1 57.43 TGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAGGCGGTGCTGGGAAAACCCGAAAGACAGCCAGACTCGACTGGCACAGG:1 + chr3R 16607545 3' + 1360 3375 1 59.77 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGTACGCAGCCAGTGCCATTAAAATCAACGTGAAACAACA:1 - chr2L 15909829 3' - Tirant 37 2 65.35 CGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTCTCGTACGCTTCGGTTGAACCTATCTACATACTATGTACTTCTGTTTTTT:1 + chr2R 22775699 3' - flea 4705 1 52.48 ATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCATGGCTGGAGGAGAGCTCGTAGAAAAGCGCGTCGATGTACAATTAACCCAATTG:1 + chr3L 18509920 3' - pogo 1648 1 53.54 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTT:1 + chr3L 13366412 3' - hopper 49 1 72.28 GAACTATCACTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACAGTTTAAGTTCAATTAAGAGAGTCGTCGCCATTTTGCTGC:1 - chr2L 1070776 3' + Doc2-element 4445 1 60.61 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCTTTCCAGTGGAATCCT:1 + chr3L 25345151 3' - Doc 40 1 61.05 GTAACGAGTATCTGATGGTCGGGGAAATCAACTATACCATTCTCTCTTGTTTTGACCCGCTTTTTCCTACATTTGAGCCAGAGTAAATAAATAAATAAATT:1 - chrX 22741629 3' + INE-1 551 1 69.31 ATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCTTGAGATTTAGCGCAGTAAGTGGCATATTCTACCGGTTTAATAATGATAAATTCGG:1 - chr4 471892 3' + 412 94 2 60.40 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTAACGGTTATGTAAGTTAAGACCAGAACAGACACAATCAGACTCACCTTTGTCC:1 + chr2L 4570666 3' + roo 9042 1 60.40 CTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACATTTAATAAAAAAGTTGTTATTAGTAAACGCATGCATATTATTATAAATAAATTAATAAGCAGGAT:1 - chr3R 26122994 3' + roo 9057 1 61.39 GTCAAAGCAGTGAGGCATCNCAACTATTCAATAGTTCTTTATGCCTGCTACATACTTTTGAATAAATCTAGTAAAGTCTTTTACTCTTCGAGTATAAAAAG:1 + chr4 518895 3' + diver 216 1 55.45 GATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAAGTTAGCACATCTTCCGACTCGATGGCCACTCGCTGATATTCCTTTTATGGGGCTG:1 + chr3R 22893541 3' + 297 429 1 59.60 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGTTGCAGCGCACAGCATAGACACAAACCCACCGCA:1 - chr3L 22616994 3' + hopper2 1564 1 63.37 AATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGAGCTCTGGAAAATTCATGAACAACATCCCACTCCAC:1 + chr2R 8707113 3' + flea 257 1 77.53 ACTAAAAATAATAATAATAATAATCAACTATGATATGTATTTAGGATATATTTCATTTGTATTATACAAAATTCCTAAATGTTA:1 - chrX 15671265 3' + mdg1 7069 2 82.14 AATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATACAAATGGAGTGAATGAGAATAGAATATG:1 - chr2L 2309399 3' + Burdock 6381 2 56.92 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGTGTAGACAGAC:1 + chr2L 18413901 3' + hopper 1383 1 55.45 GCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTAATCAAGAAATATGGGAAAGGGAACTTGTGCTGTACCAAAATTAAAGACCCTAT:1 + chr3R 21565074 3' - jockey 4663 1 63.37 GATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCAGGACTACAACCGTAATCAGAATAACTATGGACGCACCACCACCACTCAATCCTCC:1 + chr3L 9093870 3' + BS 4665 1 58.42 TCAACGAGTAAAGTCTTCTNATTTGGGATTTTACACAATAATAATCAATCCATTGACTACTGTGCATATGTAAAAATATATATAAATATAGAAAAAGGCAC:1 + chrX 8037721 3' + roo 395 2 64.36 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTGTTCCTGCGGTTGCCAAACACCGACGACACACGAGCCTTTAAGTGGGCGTCTCTAATTGAAAAG:1 - chr2R 10969362 3' - mdg1 7046 2 71.00 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGATATCTAATCTCATTCCACATTATATTTCCTTCACTTTCAA:1 - chr3L 2270515 3' - roo 8696 2 58.42 ATTGCGTTTTGAGACTTTANTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGTAGTGTTGTAAAGTACA:1 - chr2R 11403941 3' + mdg1 7423 2 56.44 TGCATGACCCAACATCCTCCCCCCGTTCGATTGCTGATCCTCGCGGTCATTGAAGTTACGAGGAGCTCCTCCTTGGTAACGATTGCCATTTCCACCTACAG:1 - chr3R 30727034 3' - diver2 4525 1 77.23 GTCGAACCATCCCATCTCTTGTTAGAGTCTTCTTAAAAAGACTGCTTCTTTTGCTGTTGTTGAGGGTTGTTAGTTGTTAGCCCTTTGATTCGACTTGTGTC:1 + chr2R 11952037 3' + frogger 477 1 60.40 TAAGAAAGGAAATATAAATNATAAATTACAACATATACTTAAAGAAGAGCCACCTGACTATAAAGATTAGATTATGAAATCTAAAATTTTAACATTAGCAA:1 - chr3L 25504361 3' + copia 244 1 67.33 TATATTTTTAAATAAATAAAAGAATGCTGAGCTGATTTCATAAAATCTGCACACATTTTCTGTATCTTCTGCGAGTTGTGGGCTCGTGTCATCATTAAATC:1 - chrX 5105878 3' + G7 1140 1 74.26 GGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTGGTAATATATAACATAAAACCGAGCGCACATGATAATTCTTCCAAATTTATATATAAATTTTA:1 - chrX 23431592 3' - G6 16 1 63.37 AAATTAATAATAAACAATAATAATAACCAATCTTACATACATTTCCAATATCGAGTCAACCCTTAGCCATTCAGATATATTGTTAACAACATTTGTGAAAT:1 + chr2L 22052575 3' + flea 239 2 64.36 ACACATGTGGGCATTGCCTNTATTCAACAGAGTTAACTCAGATATATATTGGCTTTCAACGAAAGATAAAAAAGAAAATCGAAACCGATGGAGGCGAGGCT:1 - chr2L 3494932 3' - 1731 4320 2 71.29 TACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATTTTTTAAGTGCTAAATGTGGCGATACACATCGACGGAAATCCCAAAAAAAGAAAAAAAAACCAACTT:1 + chr3L 4986672 3' + hobo 2684 1 57.58 AACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAGAAAACAACTAAGGCTAATTGCACAGGCGTAAATTCACCATCCAA:1 + chr2L 7179827 3' + I-element 5075 1 55.45 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTTGCGGTAGCGAGTTGTAGTTGTGCTTGGTTATGAGGTTGTGGGGACGGTGTCCCTGATTGGACACACT:1 + chr3R 4204958 3' - jockey 4810 1 74.26 GTTAGTACCTGTTTTCGCCNTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGT:1 + chr3L 20224219 3' - Chimpo 33 1 59.41 TTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGT:1 - chrX 392288 3' + INE-1 80 1 96.91 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCACACACTAAACCACTCGCACAACCGAAGGCGTGTGTGCA:1 - chr3R 13685154 3' + Tirant 8474 2 59.41 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTCGACTCGCTTTTGAATTTTTAGCATTGCATACTTAAGTGGGTT:1 - chr3R 28728653 3' - hobo 33 1 55.45 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCCCAGGCTTAGTGACGAAAGAAAAA:1 + chr2L 13732826 3' - Doc 23 1 58.42 ACAAACAAGACCACCACACCCAACGCTATGAGCTAGAGTGAATGAGCTGAGCTGATTGAATTGTTAGAACGTTTTACGTGTGCGGCATCTGAAATGCGCAA:1 + chr3R 7431649 3' + Gypsy12A_LTR 2169 1 57.43 TTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTGGGGATAGTGTACGGCCAGGGGGACAAGACAAAATGAAAAGAGCCCACGAAACGCAAATAAGAATAATAC:2 - chr3R 26588185 3' - rooA 338 2 56.44 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACA:1 - chr2L 17549308 3' + mdg1 7414 2 68.32 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGCTTTTGTTTTTCCAACGCGAAAGGGATATTATTAAGCGTGGATGTCAGCGGCGTTATCGCCA:2 - chr3L 949254 3' + roo 397 1 67.33 TATTTTACTTTGTTTTTATTTTCGACTTTGGAATTTCTAAAGCAATAAGATTAGAAAGATAATTCAGTGTCGTAAAAATATGCTCAATCAATTATCCACCT:1 + chr3R 19294910 3' - F-element 4670 1 86.14 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAAAAAACAAATCTTTCTATCTCGTCCAGATATCCATTGATATACGTATAATCCGATGATATTGTTG:1 - chr3L 16478353 3' + pogo 2094 1 60.40 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCA:1 + chr3R 11151878 3' - mdg3 5297 2 69.31 GAGGAAGAATTCTTCACCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGCCAATAACTTGTCCTAATTTTGAATCAATTCTACTT:1 + chr2R 12605792 3' - Rt1b 4851 1 64.36 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATGATTCATCTAATACTTTATCTATAGTCATGAGAAGTACACAAAATGTT:1 + chr2L 7259475 3' - I-element 28 1 52.48 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAATTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAGTTCAAAGGACTGCATATATATAAACATTTA:1 - chr3L 8905722 3' + pogo 2060 1 73.27 GTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAATGAACTGAGTGGCTGGAGATGCGATGCCGCC:1 + chr2R 19558033 3' + 412 7540 2 67.33 GGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGAGGCAAAGGCGATGGAGGTGAAAGTATAATAAAGGCACAGTTACGTATATATATTCTCGCTG:1 + chr3L 18724069 3' + flea 311 1 67.33 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCTCTGATTTTCCACATCCACAATCCGCGCCCACCGCTCCATTCTCGCCATTCTCACTAGTCCCACTCT:1 - 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P-element 58 1 21.78 AATTAAAAACTATTTAAATNGCAACTACAAACCGACTGTTGTTGGCTTCCTCCTGAAGACTGCAATGAGACTTCCTGCAGCTGAAGCTGACGTGGTCGCCC:1 - chrX 352505 3' + McClintock 481 1 53.47 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGAGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATGTATGC:1 + chr3R 14049411 3' + transib2 2791 1 61.86 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGATTT:1 - chr2L 4110936 3' - Doc 23 1 59.41 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAGAACTGCACTCCAAAATCAACAGCTTTGATTCATTCGA:1 + chr3R 26434174 3' - hobo 38 1 62.38 AAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACAGACAGAGACGGAAAAAAAACCGAAAGTTTCGTATGTTTTGAGCGAAAACAGACAATCGAA:1 - chrX 4238286 3' + F-element 4392 1 59.41 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGTGTGGTAGTTAGCCAAAAATAGCTTATAATTTACAATTTTTTGAGTTAAGCTTAAAGTAGAATCA:1 + chrX 5194593 3' - hobo 12 1 63.37 AGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAAACGCAGACAGACAAACGGATACGAAATACATATAAAAGAAAAAAAGTAAATATTTATTA:1 - chrX 17865546 3' + I-element 491 1 71.29 AGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCACTGTTTGTATACAATTGACTACAGTGACGTAAGGCGGCGAGCGGAGCGGCCTACTAACGACCTCATTAAT:1 + chrX 2251563 3' - 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Quasimodo 22 2 61.39 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTGTTTGTGTCCATCTATACATATAAGTATATATATGT:1 - chr3L 3413155 3' - hobo 38 1 60.40 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTCAAGGCAAGGCCGTCCAAGAAACACTAATTATGATCTTAAGTGCTGGCAGACCCTGACACAAATA:1 + chr2R 24555717 3' - hopper 8 2 71.29 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGATATTTCCCTGCTCGCGCGCGCCACCAC:1 + chr3R 31887350 3' + jockey 4940 1 71.29 AGACTAAGAACACATGAAAATAGCTTAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACATCGGCAGGTGACATGCGCCCCAGTGGACAGGGAAATATTTGCTTCC:1 + chr2L 17641200 3' + G4 3621 1 54.46 TAAGGACAACGCTAAGAAATAAAACATTATCGGAGAAATTACAGAAGGCCAA:1 + chr3L 21672288 3' - 297 342 2 75.00 TTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAGCACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAA:1 - chrX 22398535 3' + Gypsy6A_LTR 155 1 58.42 GTTATGTTGGGATGCCTATGAAGCCTCTTTATGTACCGATCGCTGCACTTCTTTATCTCTTCCTCCACCCTGGCTGCCATTTTCTCCGCTTCTGCGTTCGC:1 + chr2R 4933187 3' - G7 979 1 61.39 AAAAGAAAAAGAAATAAAAATATAAGATCAAAAAGGCAGAATAATTTAGCTAGATATTTAAATTTTCAATGTTTCTTTGATCAGCATTTCCTAGTCAAAGA:1 - 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hobo 28 1 51.49 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAAAGCCCCGC:1 - chr2L 1136306 3' + 1360 3371 1 61.39 AGGAAGCGTTTTCGACCATATATAGTGTGTATATATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGTGTAATTTAAAAAGCCTACTGATTTTGATGAGTATCTTAACTG:1 + chrX 152297 3' + INE-1 44 1 60.40 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGAGGAAATATTATAAAACACCAAATCCAGAGTCACATCTTTT:1 - chr3R 27455541 3' - 297 26 2 63.27 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGATTTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACTACGAATCCTTCATTT:1 + chrX 16237982 3' - mdg3 5271 2 41.00 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGAGAGCGAAGACTCCGCCTATCGGATTCGGAAATGCCCGTTCGGGGGGTATAAAAGCGGGCGCTCTGAG:1 + chr3L 749372 3' - P-element 8 2 71.29 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTTAATTGCATCTGTGGCTGCACAAATTTCCAGAGATATTTCGATAGAGAGATTGGGG:1 - chr3L 5403226 3' - copia 17 2 61.22 GGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCATGGACCATTTTGGGCAAGCGCTAAGCAATTCATTTTTTTTTCAGCCAGCGGTCCTTGT:1 + chr3R 5090814 3' + hopper 57 1 63.37 TTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAG:1 - 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hopper 45 1 69.31 TGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTGCCAATGCATACTTTGAGGCTATTATTTCAGGCCGCTTTTTTT:1 - chrX 4238772 3' + 1360 3358 1 57.43 GGTTAGGGAGGCCATGAGGGTGGGATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGATTTATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAG:1 + chr3R 17896948 3' - jockey 4763 1 70.79 TTATAAAAATAAATAAATATCTTTCGATGCCTACAAAAGTTTTCCTTTAATTTCCTTTTTAGTTTTTTTTCGACGCCAAACTAACTTGCCGTTC:1 - chr3L 21848836 3' + mariner2 829 1 58.51 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGAATCGCTCGGGGAATACGCCGGCATCAGTAGGTGTCCTTGGATTTG:1 + chr3R 12882724 3' - 412 7082 2 55.45 GTTACTCGATATTGCGCATCCACTCAAGCCGTACCTCCAAATTGCGCAGCACACCGATCCCCACCAGCAAACCGGCGACGGCACCGGACAAATGCGCCACA:1 - chrX 11605257 3' + Tom1 92 1 71.29 AACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAATTTAAACGTATATACACGACAAAGTACC:1 + chr2R 7334367 3' + hopper 1263 1 79.21 AAATATTATACTAATAAATTTATATATTAATAGTTACACTTACAATTTACAACTTTTCCGAAGAACTTACTTTCTGCACATTGTTTCAAGGACATTTTT:1 - chr3L 9909467 3' - INE-1 410 1 82.83 AGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACAAATATAATTCCCTGCTAAGCCAGCTTAAAGGAA:1 + chr2R 8518288 3' - invader1 3656 2 72.28 TATATATATAAGGGAAAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAAAACAAACCCATGATTGTGAGCTGACTTTACAAGTGCGGAAGTTGAACTGAAACTAATGA:1 - chr2L 4378698 3' + Juan 4194 1 57.43 ACAGAGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAAGTGCGAAATTGAATTGTTTGTGTGGCAAGCCAGAGCTCAGGCATTGCATATTTTGTGGCTGCAAC:1 - chr2R 21564449 3' + Porto1 35 1 64.89 GATCAATAAAAATACTTTTATTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTATTCACAATCCGATTCACCATTGACAAAGTCAGGAGC:1 + chr3L 4570913 3' + Quasimodo 7336 2 61.39 ACATTTTTCAAAAGTGTAGGCGTGGCATTTTTGTGCGGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGGTAGCCAAACGCTAAATCAAGCGAAAGACGACATGTTTATG:1 - chr2R 9448515 3' - INE-1 255 1 58.42 TGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCCCATTTTATCCTGGACTCGTTGGGCGTAAAGTCAACAATATGGTTAGTGCT:1 - chrX 13485399 3' - hopper 1278 1 59.41 ATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAATGCGAAATTCTTATTGAAATATATAGCATTTATACGGTTTTATATCTCTTTCCGTTTCCGGCTTTTCCAC:1 - chr2R 19104460 3' - INE-1 540 1 64.36 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCGCATGAGTCGTCTCTT:1 + chr2R 6074431 3' + 412 7506 2 70.30 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACGATTTAATGTGGCCATAGTTCTGT:1 - 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chr2L 3908431 3' - jockey 6 1 77.23 ACGTTAATTAGGCGCTCTCNTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTATAACGTAATTTAATTAATTTATGCA:1 - chr2R 20160190 3' - Quasimodo 7158 2 73.27 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGAAAATAGGGAGGAAAAACAAAAATTCTTAACGAAAATAACTACGTAAAA:1 + chr3R 29465663 3' - 412 7080 2 52.48 TATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGCGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCCT:1 - chr3L 17869899 3' - 1360 15 1 39.00 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACGCCACTTGACGGCGGCGGAAGTGGCGCCAGTTGCG:1 + chr2R 6769507 3' - 412 7094 2 67.33 GACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTTATATAAGCGTTAGATCGTATTACTTGGGCGCGTGGCGAATCCTTCTGAGCGGAAATCCTTTGGCACGATTTGG:1 + chrX 1289647 3' - Stalker4 7166 4 58.42 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCAAAATTACAC:1 - chr3L 10560239 3' - pogo 30 1 62.38 TGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAAATGTTGTAAATGTGGCGGAGGTAAGCCTCC:1 - 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chr2R 6608488 3' - INE-1 499 1 59.41 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGA:1 - chr2L 20271223 3' - blood 7052 2 67.35 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAAACCCTAGTCCGGCAACCCTGAAAACTTTGCGAAACCAAGCCAAACCAAACC:1 + chrX 4238848 3' - 1360 24 1 56.44 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACT:1 - chr2R 23877742 3' - Transpac 50 2 75.25 TTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAGTTTCGGAATGCAATTTTCAAATGTGCTAAAAGTGTTAATTAATTGTTTGTACG:1 - chr3L 9763173 3' - jockey 4698 1 52.48 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATCTTTTGGTGGAGAGCTCTTTAACTTTTGTTGGCCGAGTCGTGCCTT:1 - chr2R 10778216 3' + roo 378 1 56.44 AGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAACAACCAAGGGGAGCAGCGGCCAGAAATCCAATTTCAGCAAGTAG:1 - chr3R 28043173 3' + I-element 345 1 58.24 AAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATTTTAGCTCTATGTGCCCCATTGTTT:1 - chr2L 17675173 3' - R1A1-element 5096 1 74.49 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCAGTGACATGGAAATGCTTTTTCAGCTGTCAATGGGAACATTTGGCGGAAGC:1 - chrX 4240665 3' + 297 6956 2 61.39 AGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGG:1 - chr3R 23020824 3' + INE-1 567 1 50.50 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGTGTGGTAGTTAGCCAAAAATAGCTTATAATTTACAATTTTTTGAGTTAAGCTTAAAGTAGAATCAAAGAAAG:1 + chrX 5194600 3' - hobo 5 1 70.30 AGAAACGACTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACTTACTCAGTTGCCAATAAACATATGCAAATATTAGCCGACGAGATAAAAACAGCTGGAA:1 + chr2L 1987251 3' + hobo 468 1 62.38 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAACCCTTCTCTTTGGCCCTTACACTGCCACCCCCTCACCACCCGCTCCCCACCACG:1 - chr2L 9319039 3' + jockey 4974 1 47.52 TCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCTGCCGTAAAAATGCATTCGA:1 + chr3L 13739673 3' - BS 4995 1 76.24 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATAATTATATCCCACAAATATGGATTCTACGAAAC:1 + chrX 11987932 3' + 412 448 2 71.29 TATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAAAACG:1 - chrX 2164277 3' + mdg1 402 2 50.50 GTTTACAGAAGTTTATATTTTAAGTTCTACTTGAATTCATACCGGCAGCTGAATTCGCTCCAATTAATGCTGGAATTTGTGCTAATTTTGATAAAATGGTT:1 + chr3R 24434089 3' - mdg3 5488 2 59.41 TAGAGTTTCTGCCGAACGTNGTCTGTTCATTTCATTTCCGTTTCTCATCTTAAAGAATCTAAGAGCTGGCATCGTGTTAATGCTGTGCGAAGACGGTCCAC:1 - chr3R 23455309 3' + invader1 3710 2 76.24 TTTGCCCACCAATTATTTTTTTTTATCATTTAGAATTTTGACATCTTCGCCGCTATAGAAGTCACCTCGGAGATAGCCCGGTTGAGCAACACCCTTTTGG:1 - chr3L 12887289 3' + FB 80 1 61.00 AATCTGAACATGCAGACAANACACCCCGTTGTGTGCGCACACTCATACCAATTCAACAACTAGAAAAAGACAACAAGACAAAGTGGTGGAAGCAACAGG:1 - chr2R 15675797 3' + hobo 111 1 64.65 AATTGTAAGTCTTTAAATAAATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCGCTCCATCCCGCTCGCACGATTCTTTGGGGTTTCTCTGTTTTTTATGGCTGCG:1 - chr3L 5206539 3' - roo 8684 2 58.59 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACCCCCAGCAGCTGTTTGGGCTGCACGTGAGCGAAAAAAAGAAACCCGATCGAAAATTAATCGCCAT:1 - chrX 21374143 3' + P-element 2878 2 73.27 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGATGAATTTATTGAAATGTTTCCTTTGTGCGCCACTCGAGGTCCCACCGACATATGCCTGAATTTT:1 + chr3L 5970999 3' - 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blood 7022 2 68.32 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATT:1 + chr3R 11191071 3' - hobo 38 1 66.34 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACACTAGCGTTTATTTCGAGTGAAGCAATTCCAAAAATATTTCGCGGCTATTTGCACGCGTTCGTTGAC:1 + chr2R 20588853 3' + Tabor 7311 2 63.37 AGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCTTTTTTATTAATTGCTAATTATTTAT:1 - chrX 13616890 3' - X-element 60 1 73.27 ACATTATCGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCTGGCGTGTATGTGCCACATGCTAAACATGTAAGCCAACCCCTTCACCTGATAA:1 - chrX 2898301 3' + hopper 1397 1 61.00 GACAAACACGAAATATGCTTATGGTGCTCAGTCTCTGATAGCCAACTCTCGGAAGCAGACCGATAAGCGCTTTTCGGGCAATTCCGCCAAACCAAAACAAC:1 + chr3R 9874731 3' + Tc1 1618 1 75.25 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGCGCTACTTTGTTGCTAGTCCAACCCAG:1 + chr2L 4268724 3' - jockey 4814 1 73.27 GGGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGGATGCCTCTCTGTCGCTCTGCATCGGCAACGGAGCGCTTGGCGCGTGTGCTCTTGGCCGCCAAGCGTATTTAT:1 + chrX 1714073 3' + hobo 2937 1 79.21 AGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACGCTAGAGTTAATTGAAAGTGACAAGGCTTCAGAAATGAGAAACAAACTAACTATATAAATGAACTAA:1 - 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roo 14 2 65.00 TGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGCTTTTGTGCTTTGGCGCCAGATGTGCG:1 - chr3R 16594443 3' - Tirant 8107 1 79.21 ATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCATTTGTGAAGGATTTACAACTTGAAAAGGATTTCTTTTTTGTAGGCATCACATATGTTTATATTT:1 + chr3R 8051974 3' - 297 6598 2 70.11 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTACATAGACCCGCATTACGAGCATTTTCGCTTTCACCTCACGCCTTCTGCG:2 + chr3R 28628140 3' + 1360 3364 1 53.47 GCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCCTGCAAGTAATGTACTGTGGAGGCGCTTGTAAAAAATTACTTGCATACTT:1 - chr3R 8460850 3' - BS 13 1 56.84 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCGCCAGCGAGTACTCGAAAGTTAATTAAGCCCTTTGAAGCGGCAGCGCCCATA:1 + chr3R 24732966 3' - BS 11 1 57.14 ATAAAGCAAAATAGATCACNTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCGCCAGCGAGTACTCGAAAGTTAATTAAGCCC:1 + chr3R 24732945 3' - BS 42 1 66.34 GCGTGAAATTGTATTAGAANATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTACCCATATTCTGTTGCTTCCCCCTAAACTGTCCGCCTAACTGAATGTCCT:1 - chr3R 9085029 3' + mdg3 222 2 54.46 ATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTATTGTTTCCATGTTTGTCTTTTTTTTTTAATATAAACGGCAGGAAAATGAAATCAACAAAAACAAAGAATTGAAAA:1 - chr2R 17393090 3' - Cr1a 449 1 78.22 TATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAA:1 + chr3R 1844817 3' - Cr1a 158 1 73.27 TGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATGCTAAATTTAAGTTCCATGTTGCAGAGATAATGCAGATAGTACAG:1 + chr2L 17761142 3' + invader2 4859 2 63.37 AAACACACACACACACACACATACATGCTCATTTTAAGTTATTAATATCGATAACCCGATACGCGTATGGGTGGCATGGCCGGGAACGATAGATATATCTG:1 + chrX 17652615 3' + accord 183 2 55.45 ATTAGCGGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCTTTGTAACAAGACCTTCTGCAGCAAAGCAAGCTGTGTCCGCCACC:1 - chr2L 3170297 3' - blood 434 1 56.44 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACACGAATCGAATGTCATTA:1 - chr2L 17549291 3' + mdg1 7431 2 51.49 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACCATGATACTTTTGGGATGCACGTGAAAGCTTCTCTGCTCAGGGAAAATTGT:1 + chr3R 13239977 3' - jockey 32 1 48.51 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGA:1 - chr2R 21713308 3' + P-element 2842 1 32.67 ACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCAACGCTGCGATCTCTCGGATACAGATACTCGAGCGCTAGCCAGATACAGATACCTTTTC:1 + chr2R 24551143 3' + accord 7039 2 65.35 AAAGTTTGTTTGTTTTTTTTTTCCTTTGCAACGCGACAATTGGCAGCCAAGTCAAGTCAAATGAATGCAATTGGCACACACCCAG:1 - chr2L 13055207 3' - HMS-Beagle2 491 1 68.24 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAAT:1 + chrX 16237959 3' - mdg3 5295 2 61.39 TCCGTTGACGTTTTGCAAAAACGTAGCGATCCAGTCTGCATGACCGCCGCCGCCATAACCTCCTTGTCCTCCGTGGCCACCTGAAATGAATATACAGGTTA:1 - chrX 17222258 3' - Doc4-element 490 1 62.38 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTACACACGTCGGCGATTGAATTGAATTCATACACACGCACCGCAAGCTCACCAAACGCAC:1 + chr2L 15168082 3' - F-element 51 1 64.29 TTAGGGGGTGGGGTGGTAANTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAATATTTAATTACCAACACGCAGCAATACCAAAT:1 + chr3R 7688967 3' - Tirant 8109 2 79.00 GATCCCGGCGGTCTTCCGCTCCTCGCATAGGCAGCTCCCTTGTTCCTTCCACCTTATCCTTCTGTTGTCCTGCATCCTTTATGGCATATTATGGTATATAC:1 - chr3R 22976620 3' - gypsy8 4593 1 78.22 GCGTTACGCATCTTGTTATNCTAGTGTCTTTGCAAAAACCCTAGTCCGGCAACCCTGAAAACTTTGCGAAACCAAGCCAAACCAAACCCAACCGTCTTGAC:1 + chrX 4238861 3' - 1360 11 1 69.31 TATTAACTCACGGGAATTTCTTGGGCACAATTTAACCAACGGATTTTTTTTACTTAAATTTCGATTGCGTTTGAAGACCTTCTTGTAAGTCAGTGCGATTC:1 + chr2L 12802299 3' - HMS-Beagle2 440 1 59.41 ATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGAT:1 - chr3R 14980503 3' + 412 7493 2 74.49 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAACGATACAAACAGTAGCATAACGTCATAC:1 + chr2L 21628920 3' + P-element 2842 1 35.64 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTTATGTAGCATGC:1 - chr2R 8385125 3' + hobo 2897 1 64.36 ATATTTTTGTTTTGTTTGTTCTTATCGTGCTACTATGCTCGGAAGCCAGTTCTTCCTGCATCTGCTGGATGCTCATCGCTCCTGGAATACCCGATGCATTA:1 - chr3L 7538930 3' - Porto1 191 1 56.44 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATGTAGCAT:1 - chr2R 10552683 3' - INE-1 558 1 90.10 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGCGTTAAGTTATGAAGTTAT:1 - chr2L 8879911 3' + I-element 5303 1 77.23 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTG:1 - chr3R 19450183 3' - roo 8716 2 52.48 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTCCCAACGCTGAAATCTTAAAGAATGCCAATGAAAACAGAAAATATTTCAAAGTATTTCTAACTC:1 + chrX 21141114 3' + S-element 1707 1 66.34 CAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCGTAATTAACTTAAGTAAACATATATGAATTATAATTAAGTGCGTGTTTTTCCCTGTGTAAAAATAGCATT:1 + chrX 3016735 3' + diver 218 1 72.28 GAGTGTCCGATGATTTGTTNAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAAC:1 + chrX 7534691 3' - Tirant 8143 2 66.29 CATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAA:1 - chr2R 8707034 3' - flea 44 2 72.28 GTAAGTTATCACTTCGAACGTACCACGGTGCTCCGGCACAGCACCATTCCCATTGATTTGAGGCGGATGTCCATTTAGATACTGATGGTGTGACTGCGGCT:1 - chr2L 10401463 3' - Fw2 3653 1 69.31 TGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTGTACATACGGAGCACAGATGTAATGTAGCGCGGTTGCACTTGTAATCCGCTCTC:1 + chr2L 2755580 3' - roo 8799 2 61.39 TTGTAAACTATTCGATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATTACAGTTAGATAGCATTACAGTTACACTTTCACTTGGCAACAAAAAGTGCCGGGCTCCGG:1 - chr2R 19907444 3' + I-element 5338 1 62.38 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTTATTAACTGAC:1 - chr3R 14708712 3' - roo 8693 2 63.37 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCGTGCTCCATTCCCCACATCCATGTCC:1 - chr3L 11657816 3' + Tabor 7319 2 71.58 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCGGATCCAGATGTTCGACCAA:1 + chr2R 15201568 3' - P-element 21 1 58.42 TAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTGGGAGTGTGTGTGTGTTTGTTTGGCAGGGGGAGTGAGGGTAAGGATATCCTTGTGCACACTGATTGATAC:1 + chrX 19046491 3' - Stalker4 7099 4 70.30 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGACACAGAAAACTGGATTCGGTCTCGGGTATTTTATTTTGTTTTCACAGTGGAAGGGGGCGCACAGTCGGG:1 - chrX 2123661 3' - P-element 4 2 75.25 TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATTTACATATTTTTTGAATATCGCGCGGACGGATTATTTTGCAGCCGCTGCTTT:1 - chr2R 9811263 3' - Quasimodo 14 2 66.34 CTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATAGTGACGTATTAATATAATTAGCACTGTTCAAAGAAAAGAATAT:1 - chr3R 2472907 3' + accord 45 2 57.43 GGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGGTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGA:1 + chr2R 3760471 3' - accord 38 2 58.42 GTATACATATGTATATGTATAAATGTAAGAAAGAAAACATAGATAAAAGCAA:1 - chr3R 11271731 3' + Stalker4 242 4 84.62 AAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATGTATGCATATACTAAGTGATGACTAATAATAAGATTT:1 - chr2R 8717648 3' - 297 22 2 60.71 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACGATTTAATGTGGCCATAGTTCTGTCGACGACTGTCAGTGCTCATTAAGTTGCCTGC:1 - chr3L 15444812 3' + mdg1 405 2 62.38 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAAAGCGGGTCGCTATTCAACA:1 + chr2R 11404025 3' - mdg1 13 2 64.36 AAAACATAGAGAAATAAAAGGTGGCAGGTGGGAAGGGGAAAACTCGCAGAGGAGCCGTGGAGCAAAGATTTATCAAAACTGGGCAATCTGCCGGAATCTGT:1 - chr3R 17979997 3' + invader5 3606 1 70.30 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAAAACAATGTACCACC:1 - chr2L 1432022 3' + opus 472 2 61.39 TCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAGTCAAGGT:1 + chrX 21907836 3' - ZAM 219 2 73.00 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCATGGTCTGTACACTCGAATGTCTACCGCCCGACTCAAATTCGATTGCTGCTATACTTCA:1 + chrX 2123763 3' - P-element 17 1 55.45 AAACACATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTCCTGTGCGCGAAATATGAGCGGCATTAAAAATTAGTCCAAAGTACTGCTAAGTG:1 - chrX 20290442 3' + hopper 1393 1 57.43 TGTGGAGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTAAGTGTAGGCCATGTGGGCTCCACCTTCCATCCCTTCCCGCCACCCTATTTTGCGACAATTTGTA:1 + chr2L 11863689 3' - Rt1b 4945 1 66.67 AAAATAAAATGAAATAAAAACATAACGGAGTAAAATGATTAAGAGAATGATT:1 - chr3L 8428104 3' - transib1 1898 1 88.46 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGAGA:1 - chr3R 18171782 3' + 1360 3347 1 71.00 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAAC:1 + chr2L 1335352 3' - jockey 4705 1 54.00 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGATTTTCCTGAGTCATACATT:1 - chr2L 4110920 3' - Doc 7 1 75.25 GCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATA:1 + chr3R 10736111 3' - McClintock 28 2 64.21 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAGTACGTGAGTGCTTGCGCGTTTGTAGGTGTTGCCGCGGCGAATTGAAAAAGT:3 + chr2L 15527067 3' - pogo 19 1 58.42 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTT:1 - chr3R 14708722 3' - roo 8703 2 73.27 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTTTACGAATTTCACCCACAAAGAAAGTTA:1 - chr3R 18769591 3' - roo 8711 2 73.27 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGAAACGACTCTGCCAAAAAGGACGCAC:1 - chr3L 14690937 3' - roo 8712 2 76.00 ATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTTATCCATTTAATGTTCTTTTCAATGGATATTTTCTTAATGTTTTTACGGTGTATATGTACGA:1 + chrX 8334521 3' - BS 5010 1 63.37 AGCACAAATAAAAAAATAAAAAAACAGCACAAATACCGGCAATAGCTTATAGAAAATAAACTGCAAATGGCTCAAAATACCGAAATACAATAAATAAATGG:1 - chr3L 18339183 3' + Juan 4212 1 53.47 AAAAAAAAACAACAACAAACTTTGTTTGGAAACAAAACAATAAACAAATTATTCAGTTCTTATGAAGAAAGACAAATGATTGAAAGC:1 + chr2R 18386285 3' + gypsy7 5016 1 89.66 ATTATTATTATTGTTATTANTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACATACCATTCTGC:1 + chr3R 5700162 3' - mdg1 7065 2 54.46 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCAGCGATAGTAGGACACTGGTCTGGATGACTCG:1 + chr3L 9542559 3' - roo 8709 2 69.31 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCTCTCTAATTCTCTTTCTACAGACTCCGTTCCTCCAAA:2 + chrX 21400866 3' - P-element 8 2 69.31 TAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTGGAAATATTTTGTTTAAACTTGCCGAAGTTAGATTTTTCTAATATACAACTAAAAATTTGTGA:1 + chr2L 21713449 3' + FB 197 1 64.36 TAATGGGAGTTCATCATTACAATTCATTCTTTTTTTAAATTCTTTGCAATTATTCGGTTCACTTCATATAGTCGTGGTTTTATTAAAGACGTTTGCAAAGA:1 - chr3L 15831210 3' + 412 494 1 73.27 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCATTGCACAAATAGTGTCCCGTGTTATCGCGTCGCCAT:1 - chr3R 16000683 3' - 1360 73 1 63.37 ACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAATCAACAAAACCGAGCTGCTGGCATCTGGCAACGCCCGCTATATGCATAAA:1 + chr2R 7463135 3' + F-element 307 1 55.45 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTTATTTTCATTAGTGTAGGGTACTTAGGCGTCGAAATAACTGACA:1 - chr2L 15817968 3' - I-element 31 1 56.57 ACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATTATTGTTATCCTGACGAGGGCATTTGCGCAAATTGAATGGAACAATTTGCCTCCGGCCATCAACAGTT:1 + chr2L 20226768 3' + 412 483 2 68.32 AATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGCCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTAATGTTGAATGCTTATATTTATGCTAATAATTAATTATATGTAAT:1 + chr3L 21736106 3' + 1360 402 1 71.29 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAACGGGAGTTCATCATTACACATGACATAAAATATATATATCACGCGCTGCCTTAT:1 + chr3R 16806066 3' + 412 450 2 63.37 AATTAGGAGACAAGCTCCANAACATCGCCCGAAAATATATGGAAAGGCGTTGACCTTGATAGACGCCAGTTAAATATATAATTAGCATGCACAAATGTT:1 + chr3L 2462149 3' + jockey 4617 1 59.60 ACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTTTGCTATCGTCGTGTTTTCGCTTTGGTTTTCCACATAAAACCGAAAG:1 - chr3R 28401171 3' + hopper 493 1 53.47 AAGGCATACGAGGTAGCTGAACGAGTCGGACAGCGACAACGCCGAATATGACC:1 + chr3R 11742349 3' - BS3 1747 1 75.47 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGACTGTCATCAGAGGAGAATGTGAGTTGGTAATAAAGCAAGC:1 + chr2L 14799178 3' - hopper 30 1 58.42 TGGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTATCTGTGGTTTTCGGGTTTCTAAGTATATAACATACGAATGCTGCATAGCCAATCCAGATGCTAAA:1 - chrX 9029097 3' - accord 186 4 76.24 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGAGCAAAAACTTTGGATGTTTTGAGAGTTCGAAGTTCATACTGTCATCCCGCTCTAAACCTCTGCATTC:1 - chr2R 20584391 3' + P-element 2881 2 73.27 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGGGGGTATGCTCTGCACACACTTATGACAAAACCAGATGGAAGCT:1 + chr3R 19963452 3' - 1360 31 1 57.43 GAATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAATGAAAACATACACAGAGAACACAATTGCAACATTTAATTATCGTAAACAACTATGGACAACGTTTAAGGT:1 - chr3R 20799576 3' + Doc 4374 1 61.39 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACAACAAATAGAATGTGTTTGAGCATAGATTCGGCTTTATCTTGCGACTATAAACGAATTACTACAAAAT:1 - chr2L 12182588 3' + roo 400 1 63.37 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTATATGTGCTAAAGGTCACACTCGCAA:1 + chr2R 14344480 3' + 297 354 2 78.22 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACAGATGTATCTCAAGCGAGGACAATCCTT:1 - chr2L 18927487 3' - mdg1 7086 2 70.30 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGCGATTCTCTTCTAG:1 - chrX 18121829 3' - opus 7032 4 62.38 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGA:1 + chrX 7534705 3' - Tirant 34 2 59.41 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCC:1 + chrY 311345 3' - 1360 71 1 78.22 AAAGAACGAAAAAAAAAAACAAAAATAGAATAAGGGCCGACTCCCAGTGTGTGTGTAGGTGTATGCTTTTATTTGTCAAGCGAATTGAATCCGTAAC:1 + chrX 8978824 3' + gypsy7 5009 1 52.58 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTAGACAGTCACTCATCCAATGCAATATCATTACT:1 - chr2L 15983377 3' + hobo 2896 1 65.35 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATG:1 + chr3L 7494092 3' - roo 35 2 63.27 AATTTACTTATTGTCTTACNTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAG:1 - chr3L 15099556 3' + G4 3811 1 67.33 AAATCAAAATCGCCAGGACGATTACCGCCAGGCGAACCTCTTCGCCCAGTTTACGAGCAATAAGCGGGACACTGGGATACAGACGCAGTGCCTCCTTGAT:1 - 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roo 480 1 79.21 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCAAATAGCTTATAGCACCTGCATGTTGGTCTTATCTTTATCTAGATGCTCTTTAAAATGTCAC:1 - chrX 8508330 3' - hopper 12 2 70.71 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGGCAACATCAGATCGCTCAAAGCGTGTGTGCC:1 + chr3L 16662449 3' - jockey 4715 1 68.32 GGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGACAACGGCTCCGGCGTAGAGCAAGTCCGTATTGGTGGCGAAATAGAA:1 + chr3L 16492430 3' + Bari1 77 1 54.46 GGAACGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTTTTAC:1 + chr2R 6803002 3' - rover 7115 2 60.40 TATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATGTGGTTGCTTATAGATGGATGGATTGATATTGATAAATGAGAGGGGGCTTAATTTGCTCTTTGCATTTCACAGC:1 + chr2L 19608714 3' + diver2 4892 2 64.36 TCTGCTTGTTTGGCTATTGNCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGTGAAACCACTTTTCTTACGGATTTCAGTGATTTTTAGCAATATTATTAAAAGTTATTGC:1 - chr3R 29528129 3' - G6 1851 1 53.47 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGCATTCTCATTTGTATGTCAGCAGATTGACAATCAAGGCATCAGTCA:1 + chr2L 13913328 3' - HMS-Beagle2 26 2 53.47 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTACCTATCGCTCCTCCACCTGAACGCTATCTA:1 + chr2L 6322589 3' - roo 45 2 69.31 TGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATAC:1 - chr3L 21912259 3' - Bari1 30 1 62.38 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAAAACTGAATGACTGAAACGAAGTGTATCCA:1 + chr3R 14708786 3' + roo 9042 1 58.42 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATAATATAAGGTATTAGTTTTTTACATTTCTATCGACTCTTGCAGTTCTCTGATAGTAATACAAATTTATTCT:1 - chr3L 23634962 3' + pogo 2100 1 75.25 GACAAGATCATTCGCCAACTTGTTGGGGTGGCCGCTAAGTCATCCACAATAAGGTTCCCGTAGGTGTAACTAGTATACAGGAGGATCTAAAGATGTGCCCC:1 - chr3L 24408733 3' - G5A 2640 1 59.41 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTAT:1 - chr2R 16680138 3' - 412 50 2 77.23 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATAGCAC:1 + chr3R 28475858 3' + roo 9024 2 70.30 ATTTAATCATTTTCATATTTCATTTCATTTAATGCCGAAACTTCCGAATGACTAGAATGACAGACACTTCTTCACCGTAACAGTGTAGTTGACCAGGTGTT:1 - chr2L 23337379 3' + Bari1 344 1 71.29 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCGTAATTAACTTAAGTAAACATATATGAATTA:1 + chrX 3016696 3' + diver 6067 2 68.32 AATAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTCGCACGAAGTTTTTCTTCACTATTTGCTTATATCCAATAGAGAACGTG:1 + chr2R 16728385 3' - HB 69 1 57.43 TGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCATTGTTATATAATTGCTATGCAAAATAATCATTAATTTGAAAAATATTTCATTCTGAACTTTCTTTACCC:1 + chr2R 16680204 3' + 412 488 2 34.65 AACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGGCCAAGAATCGCTGGGGCCTAATTAA:1 - chr3L 7938803 3' + opus 408 2 72.28 AACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTTTTTGCGAATTGCTATCGCTATTCCAACCAAATTATATATCTTCCTATAAGTACCATT:1 + chr3L 22845429 3' - INE-1 532 1 65.35 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTAGACAGTCACTCATCCAATGCAATATCATTACTATGTTTGCCTTTTGC:1 - chr2L 15983362 3' + hobo 2912 1 52.00 CCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGCCCTTCCTCGCAGACTGCTTTTTGTTTGGATACATGTGGGTGCTGCG:1 - chr3L 19669606 3' + F-element 385 1 53.47 AGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGCCCTATATTTTCGGTCAATTGTTAACGGCTTTTGATAAGTGTTGATATTGATTGCCATTGTTGCTGCC:1 - 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BS 5024 1 53.47 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATTATTCATGCTGCCCAATTATGCACAGCCCACAAAAGTAGGCAACATATTTT:1 + chr3R 25378642 3' - jockey 34 1 54.46 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGA:1 - chr2L 13214995 3' + roo 9026 1 71.29 TGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCAGGTGAGTTAGACGCCCAAAGGATCGCGAACCAGCCGTAGGTGGATGCCGCCCTTGGCTTGGGTT:1 + chr2R 12188788 3' + accord 171 2 69.31 ATTCATATCAAATATAAAGNAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACTTTTGCGACCAATTGGTGATCAACTTCGA:1 + chr3R 6190292 3' - copia 4915 2 71.29 ACAACTGTATGTGTGTACACGTGTGCTCATTCATTGTAAAAAGAATATATTTACCCATTTTCAGTTGCCCGCAACACTTTTTGCCCATTTCCGGTCACCCT:1 + chr3R 9273058 3' + 1360 170 1 64.36 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAAGAAATGGCGATGCTCGTGGAATTTTATTGGCTG:1 - chr3R 8705299 3' + jockey 4961 1 65.96 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGATTGTGAGCGCGTTTCGTTATTAATTGCCGATCGATTCGATTCGTTCGATGGTTCACACGATGGCGGCG:1 - chr2L 20709359 3' - roo 6 2 74.26 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATCCATCGAGA:1 + chr3R 12937482 3' - roo 8705 2 67.33 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAGAAAATATCGAAAAGGGAACGAATCCAAGGGTTTAC:1 - chr2L 12602773 3' + opus 467 2 64.00 ATACACCATATGTACAATATGTACAATATGTACAATATGTACAATATGTACACAACGCACAATATGCACGATACATTAGTCTGTAATTAATGTCGCATAGT:1 + chrX 20455898 3' + Stalker2 268 2 73.27 GTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACACACATATAATTTATGGAGTTATTCGCACCATGCTCACACTGTTTCA:1 - chr3R 25950060 3' + 412 7540 2 73.27 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGT:2 + chr3R 22494750 3' - 1360 50 1 76.24 GGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCCAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCAGTTTTGCAAAAATTTTAATAATTTA:1 - chr2L 5488713 3' + Quasimodo 7073 2 72.28 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATAATTAAAATTTGAAGTAAAACAACTTACATGCCAGCAAT:1 - chr3L 11758367 3' + roo 9036 1 63.37 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATC:1 - chr3L 10560250 3' - pogo 41 1 73.27 GAGAGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACAGCACCCCCCTACAACCCATCATTTTTTATTTCTTCCATCAGCTATTTCTATTTATTTCGTGA:1 + chrX 23080453 3' + GATE 8451 2 72.28 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACTCCCTGCCGCCCGCCTGCCGGTTATAAATGAG:1 - chr2L 18415717 3' + hopper 1391 1 47.52 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGG:1 - chr2L 13214975 3' + roo 9046 1 55.45 TACATTTGGTGCATCTAAAAGATTTATTACTTCTTCCGGCAAAGCGGTTTTTCCATTCGCATCTGATCCCCCGCAATTAGCACTCCACTTCGAACACAAAT:1 + chrX 8060830 3' - transib3 2487 1 53.47 TGAATTTATATAATAAATTTAAATATTCTAAATCAATCACGTGAATCTTTTTCACAATTTACGTTGGCTGAATAAAAGTTAGCTTCGCAAGCTGGCTGATG:1 + chr3L 16651708 3' - transib3 2666 1 66.34 AGTCTTCTTATTTGGGATTNTACACCGAGCATTCCTGAAAGGAATCCATTGCCCCCACTTGCCGAGGCCTTAATTACAACGTCGCAACAAGAACAACACGT:1 - chr2R 13099033 3' + roo 406 1 75.25 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATATATTTATAACATTTTATTATCGTTGCACTTGCAGAAATGGCGGAAGGTAATGG:1 + chr3R 20791742 3' + pogo 2085 1 63.37 ATCACTGTCTACAGTATTGAAACTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAGATCCAAAAGGAACTGAAAGCTGGCCGCGTCATTGTGATCACGCAGGGCA:1 - chr3R 23770304 3' + Circe 7312 1 57.43 TTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATATAAAATCGCTAGAAATTATATTTGACCGTTTTTAGAAGAGAGCTAAAAAGTATGCAACACAATTGGTCAGCCGAAA:1 + chr2R 19253942 3' - jockey 7 1 64.36 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGTTTAACATAGCCAAGTATATTAGCAAAAACAGCTGAGACTGAAAACTTATAA:1 - chr3L 1927411 3' - mdg3 26 2 54.46 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACAAGAGTACAAATTTTGCGGCTTAAAGTTAATTCATTTCG:1 - chr2R 23122653 3' - hobo 38 1 65.35 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTTATTAACTGACCTTCGATAATG:1 - chr3R 14708701 3' - roo 8682 2 62.38 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTACATGTGCATGTACATATACACTCGGCTATATAGAACAACCCACAAGTCGGCTGG:1 + chr3R 10090399 3' - pogo 4 1 74.16 TTTTATTATTTTTTTTTTAATAATTTCCTTAATCTCAGTTTTTGTGTAGTTCGTGTTGTGTGTGATGTGTTGTTGTGAAACGGGCAATGGCAACTGGGCAG:1 + chrX 8481585 3' + hopper 153 1 61.39 GTCTGTGGGCATATCGGCTGCTGTGGAAGTTTGTTTAGAGCTCCCAGTTCTCGGTTCCCTGGCTCACAGTTTCCCAGCTTCAGTTTCTATTCATGTTCATG:1 - chr3R 30754206 3' - G5A 2602 1 68.32 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTGGTTGCAGGATCGCGGGGAATTGGAATTCCGCGCTGGAATTTTTTGTCACCTCTTGGGTTTA:1 - chr2L 15479532 3' + blood 7375 2 64.36 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATATGTAATTAGTTTTTTAAAAAGTGGTTACT:1 + chr3L 11697111 3' - pogo 54 1 80.20 AGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGACATAGTTCTCAAGATTATTTGT:1 - chrX 22726192 3' + Helena 1276 1 48.51 ACGCGCACAATAAACAATATATTAACAGGAACACATAATACAAACCTGAAGTTTGGCCAAGTAACAATTAGTCAACAGACCCGGGCACTGAGCAAATATAA:1 - chr3R 31451631 3' + hopper2 1306 1 53.47 ACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTCCCACTCTGATCTGGGATTTTTCGCCAGCCTGGCTGGGGAAATCGACAGAGGCTCCAAGGC:1 - chr2L 2458803 3' + Porto1 473 1 58.42 GCAAATATGCTGTGTTTGCNGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCAATGCTGGGTCAGCACTATGATATTATGTTTTATAAGACTGATGGACTGAGAAAATT:1 - chr3L 25842862 3' - Gypsy6A_LTR 97 1 78.00 TAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAAATGAAACAAGTG:1 - chr2R 8707022 3' - flea 32 2 59.41 TTAGGATTTAAATAGAATTTTGGATTTTGTTTATTTTTTGATCTGACAACGCCTTCTTCTCCGCCCACAAAAACTGCCGACTTGATGAATTATAGAAGTAA:1 + chrX 4854552 3' - transib4 2556 1 73.27 ATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGCCTACCTACGGCGGGGAGGGGGAGTTTTGTTTTAATTAAGGCGCA:1 + chr3L 13597270 3' - 412 7258 2 55.45 GTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTGAAATCTGTGAAAATAAATTTATCAAAACGACAAAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGTCAATT:1 + chr3R 19445004 3' + transib2 2472 1 73.27 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAG:2 - chr3R 30611257 3' + blood 7339 1 79.00 TTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTGGCTTTGCGGACGTAGGCAACATATCAATGAAGGTTTTTTTTTATGGCCACACAACGGGCTCATAGTCTCAGGC:1 + chr3L 13157338 3' - I-element 122 1 76.24 TATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCACCCGATACAGT:1 - chr3L 27356083 3' + Tc3 1679 1 58.42 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGGATGCCTCTCTGTCGCTCTGCATCGGCAACGGAGCGCTTGGCGCGTGTGCTCTTGGCCGCCAAGCGTATTT:1 + chrX 1714071 3' + hobo 2935 1 77.23 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATGCGTGTTCTCTATAAAATTACACACACAAATAAAATTTGTATTGAATAGTTGTT:1 - chr3L 25120153 3' - pogo 17 1 62.38 ACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGA:1 - chrX 7534639 3' + Tirant 8478 2 59.14 TGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGACCCGGTTCCCCGATTGTCCACGACGG:1 + chr2R 24128066 3' + R1A1-element 341 1 74.26 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGACACAGAAAACTGGATTCGGTCTCGGGGATTTTATTTTGTTTTCACAGTGGA:1 - chrX 2123679 3' - P-element 21 1 56.00 TCTGATCCTCATGTACCACGGAGAGCCTGAATCTTCCCTCGGCATCCAACCCCGTCTTTATCTTGGTCCTTCC:1 - chr3R 4508180 3' - jockey2 2999 1 65.75 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAAAAAACAAATCTTTCTATCTCGTCCAGATATCCATTGATATACGTATA:1 - chr3L 16478370 3' + pogo 2077 1 55.45 AGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGAATAAAGCTACTTTACTTCGTGCTTACACAAAAATCACGCTTCA:1 - chrX 15991608 3' + Stalker2 7442 2 56.44 GCGTGCACCCGCAAGTACAGGTTTCTCCCTTGGCCTTGTTCATAAACTTATTTCGTTAATAATAAGTAATAAGTTGTATAAGATAAAAGGTATTACCCGTT:1 - chrX 19595889 3' + gypsy12 10158 2 53.47 TACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATATGTTTCCAAATGATTTAAGTCAATGTGAGTAACAACTTTTCAATTTCACGAG:1 + chrX 21499335 3' + Quasimodo 7348 2 60.40 TTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTGGTGCCCACACAACTGCGCAAACATTGCGAA:1 + chr2R 10871498 3' - Circe 7204 1 67.33 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACT:1 + chrX 19812408 3' - Transpac 51 2 76.24 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTT:1 + chr3R 14049414 3' + transib2 2790 1 59.41 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAG:1 + chr3L 16973472 3' + S-element 1711 2 72.45 AATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGGTATATATTATATATTAATGTGTTCGGGGAGAGGTGTGTGATTCAGGCAGTAATTAGATTGGGA:1 - chr2L 13913230 3' + HMS-Beagle2 7185 2 65.35 TATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTAAATAAGAAGCTAAAATAAAACTGCTCTTATCAA:1 - chrX 23183557 3' - Idefix 30 2 61.39 TTTAGAAAATATTGATCATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAGAACCAGACACTGCTATTCATATGTCAGCCGGTCCAGGAAAAGCGGAAAAAGCTAAGAAA:1 - chr2R 23118518 3' - HB 255 1 61.00 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCTTCCACAAT:1 - chr2R 19513365 3' + roo 9036 1 58.42 TCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGGAGATGGAAGGAGCAAATGAGAGGAAGGCAGACAAGAGGTTGGAGACGGAGATCGTG:1 - chr2R 4028091 3' + Doc 339 1 68.32 TGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTCGCTCGAGCTCTTCCTTCGGCGGTGTCTCCTTTGAAAAT:1 + chr2L 2425053 3' - 3S18 5837 2 61.39 AAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTCCGTCGGTTGGTTAAACAAATTAACTGAGCCGCATAAAAGGCTGAAATGG:1 + chr3L 10575809 3' + McClintock 423 2 52.48 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTGTTCCTGCGGTTGCCAAACACCGACGACACAC:1 - chr2R 10969394 3' - mdg1 41 2 68.32 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCTGACATTAAAAATATGAACAAAGTTGTGTGAAATAT:1 - chr2L 18077395 3' + hobo 2899 1 62.38 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAATTTTACCTCCATCTTCAGTTTTAATCCTGATAATAAAGTGAGTACCACT:1 - chr3L 24152003 3' - roo 26 2 54.46 AAAATGGAAAAATAATGCANATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTCGTATAGTAGCATACACTCGTACA:1 - chr3R 19270358 3' - pogo 49 1 73.27 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATTGGGCCAAGTTGGGGGCGTAAAGTACTTGTATAAGTACTCGAGTGCCGCAAAACTTGAAAGCT:1 + chrX 15412764 3' + hobo 2928 1 69.31 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTATAAAAAATAGGAAGAGAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTG:1 + chr3R 19446247 3' + roo 9037 1 59.41 GCATTTTTAAGTTACCTGCNTCGAGGCATTATGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACGAGCTTTTGAGCTTTGGAAATGC:1 + chr2R 22666038 3' + pogo 2055 1 71.72 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATACATACATAGAGTCGAATGCCTGCTAAAGCGATATGAATGGAGACCCGACCGGGCG:1 + chr3L 19778856 3' + flea 240 2 65.35 GCCCTGATTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATATCCGCTCGAATTAGCTACCGTTCGCCGATCGTGCAAGACAATTTGTTATTAT:1 - chr2L 17397163 3' - 1360 3065 1 68.32 GGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAACTTTAATTATTTAATAATCTGCATACACACTGTGGAAAGTTATGGCATCTAAAGTCTGTCTGCACTGCCCA:1 - chr2L 1927268 3' - Quasimodo 6973 2 69.79 TACCGAACTGATAGAAAAAAAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTATGGCTCCGGAACTCTCCAGATATCATAAAGGGGGAGAGACGGGTTTAGT:1 + chr2R 18345643 3' - Circe 436 1 80.20 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTGCCAGTTTTATAACGAATATTTCGCA:2 + chr2R 22898783 3' + Transpac 264 2 74.26 GGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGCTTTTGTGCTTTGGCGCCAGATGTGCGAG:1 - chr3R 16594441 3' - Tirant 8105 1 80.20 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTTATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGT:1 + chr3R 17896952 3' - jockey 4770 1 69.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAAAGCGACATCTTTAAGAAGATCT:1 - chr2R 24169887 3' + roo 401 1 70.30 AGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGCGACTTACTTATTAAACATGATCCTGAAGTGAAATTCTATGGCTTCCAAAGG:1 - chr3R 851794 3' - F-element 264 1 54.74 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTG:1 - chr2R 21362741 3' - Tirant 13 2 68.32 ACCTCCCCCCCCCCTCCCCCCCTCCCATCATTTGGGGAAGAAATTCGGAATAATAGGTGACAACTTCTGATGGCACATAAAAGGGTTT:1 - chrX 16671728 3' + accord2 224 1 53.41 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGATTGACTTGCAAGGTGAAAATTGAATTTACATGTT:1 - chr3R 6190212 3' + copia 249 1 73.27 ATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGAGGCGCTGCTGGGCGGATTCTCTGACCAAAATTCGCCGCCGCCATTGGTGGTGGTGCCAGCAGCTG:1 + chrX 9630401 3' - R1A1-element 444 1 61.39 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAAC:1 - chr3L 771779 3' + roo 360 2 75.25 TTTATCCGAAACAATAATGAAGTTAGTTGGATTTATTTGTATTCAGTTTAATTTAATTGGTGAAGAAGGTATTTCTTTTTGATTATTCTAGTTGTTTCTCG:1 - chr3L 17980320 3' + pogo 1778 1 74.26 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTATTCTGCACACATTGTCATGCATGCAAAAAACAAGATACGACGCGTTC:1 + chr3R 13685231 3' - Tirant 27 2 55.45 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAGCAAATGCTGCTG:1 + chr3R 30252357 3' - 412 7076 2 56.44 GCACGGGTCCCACGGCCACACCTTCCGCCCAACCGACCGATGGGCGCTGCCGTGTATCGTACACTATAAATCGCTCCATAGAAAAAGTGTAAACTATGCTA:1 + chr3L 3715352 3' - Cr1a 4440 1 61.39 TTAAGTTTTTGATCAATAANAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTATTCACAATCCGATTCACCATTGACAA:1 + chr3L 4570903 3' + Quasimodo 7326 2 72.28 CGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGACTGTAGTATTCTCTCTTATTCTTATTCAATTGTGTAATAACTTTTCGCTGCACATAAGGGCTGTTTTCTTTA:1 - chrX 19330554 3' + INE-1 555 1 56.57 ACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTAGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGGCATTTGAAATGAGCAACGTAATGG:1 - chr2R 6769425 3' + 412 483 2 66.34 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATCCAATGAGTTCGCACTCGGAG:1 + chr2R 8232555 3' - P-element 23 1 54.46 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATTGGGCCAAGTTGGGGGCGTAAAGTACTTGTATAA:1 + chrX 15412735 3' + hobo 2906 1 62.77 AAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGAAGAAAAAGGAAGAAAAGCAGAACAATGTTAACGATCTAGTTGCGATCAGACGTACTCAGTACTCATAAAT:1 + chr2R 4975039 3' - Tc1-2 177 1 75.25 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTATTTGTGTATTTAGCCGGTCTATTCA:1 - chrX 17109665 3' - roo 48 2 76.24 ATCATCTCATTCGTAGAAGTGTACTCTAACACAACGTGACCGAATTAGGAGTACAACTTTGAAAAGTGAAATAACCCTGGCGTAAGATGAAATTCAGTTCG:1 - chr3R 14138273 3' - 1731 4187 1 62.38 GGCAAGTCGACTCAGCATTCCTTGTGGCTCCCGAAGGAAAAGGAGGAAGAAAAAAACAAAAACAA:1 - chr2L 19685841 3' - gypsy 153 2 46.15 TATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCACTGTTTGTATACAATTGACTACAGT:1 + chrX 2251518 3' - G2 3043 1 75.25 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAAAGCGACATCTTT:1 - chr2R 24169897 3' + roo 391 2 60.40 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTACATATGTATATTTCTACTTGCAACAGCAACGCCAACTGCGATAGAGTACGTGAT:1 + chrX 2164338 3' - mdg1 21 2 61.39 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGTGTAGACAGACGCACACACTCGAACACACAT:1 + chr2L 18413921 3' + hopper 1403 2 65.35 GATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGATGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAACCAGAAACTCTACCGAAAGGGCCATACAATT:1 - chr3R 24832926 3' - Circe 7104 1 69.31 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGGCATGGGCATCATTGGTCCGGC:1 - chr3R 16613154 3' - 412 7103 2 78.35 AGACCGCTAGGACAGAGGAGCACGGAGAAGGATATGTGAAACGAAATTATGCATTATGCATGGAAAACATGCAGTGCCAGCAGGCCAGATCCTGCCAGACT:1 - chr3L 13614331 3' + gypsy8 4461 1 64.36 TGTCTTAATTCATGCGGAATTTTATTTTGGTGGCAGGCTTTCGGTGTGGTTAACGACAATTGCGATGGCTCTTCGATTCCGATTCAGATCCCA:1 + chrX 2150848 3' + Dm88 391 1 82.80 AGACATTAAAAAACGTAAANATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGTGACGAGTCGACACACTTTTGAGCTTGGCAATGTTTTT:1 - chr3R 19750694 3' + hobo 2511 1 61.39 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTG:1 + chrX 15268298 3' - roo 8703 2 66.34 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATTTGTTCTTAGAAAATGAATGAACATATTTCAA:1 - chr3R 5993083 3' - pogo 2 1 77.23 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCCATAACCTTTTTGTGAGCAACAACAAAATAAAGTTTGTTGTAAGCGTCAATAATGCAAATTGATAAGACAAAA:1 - chr2L 18297801 3' + hobo 2937 1 78.22 GTGCGAGTGGCGGGCTGCANTTCTCTGCTTCATTGGGCCAAGTTGGGGGCGTAAAGTACTTGTATAAGTACTCGAGTGCCGCAAAACTTGAAAGCTTCGAT:1 + chrX 15412769 3' + hobo 2933 1 74.26 TACATTTACACATCATATCNTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAA:1 - chrX 7534638 3' + Tirant 364 2 60.40 TTTAAGACTTATTGAACTTTACTGTGCTCAACTGCACCAGGAAATACTGTGTGACAATGCGCGTGGAAATTAGGGTGAGTGGCAAATATTCTACTAATATT:1 + chr2R 19332841 3' - McClintock 6251 2 82.18 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCC:1 + chr2L 9471258 3' - roo 8709 2 69.31 AAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTTAAAAACACGTGGAATCTGCGGCTGGGCCAGAACAGTAAATCATTTCCCATGTGTACCTGGCTCCGTA:1 - chr3R 13205725 3' + hopper 1410 2 74.26 GCCCAAGTGCAACCATCATATAAAATCGAAAAGACAAACAAGTGGACTTCAAGGCGCGTTAAAGCAAGTTGAAATTTATTAATTTCGTGATAAGGTAAACA:1 + chr3R 13502909 3' + Porto1 77 1 72.28 TTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGTATGAAGTATCCAGATCCCCTAGGCTCAAAAGTATAAGACTTTATA:1 - chr2R 5541949 3' + invader3 5432 2 53.47 AAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTTGCCACTGCTGGCTTTTTGCTAGATGGGCTTGTTTGTCGCTTTGAAACGAG:2 - chr3R 20345063 3' - transib2 1 1 78.22 GTCGAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTTATCAAAATAATTACTTGACCACACGACCACTTTTTATTGAAGCTTCCCGA:1 + chr4 148057 3' - I-element 4897 1 57.43 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGGTGCGTTCCCATGTGCA:1 + chr2L 13792252 3' - blood 7035 2 53.47 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTCGACTCGCTTTTGAATTTTTAGCATTGCATACTTAAGTGGGTTTTTCA:1 - chr3R 28728648 3' - hobo 28 1 50.50 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCATTCTACTATATCACAAACACAT:1 + chr3R 20284808 3' - pogo 24 1 56.44 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGCGGCTAAACAAGTTTTTCGTTTTTGAGAGCGCGAGTAAGCGGATATTTCGGGAGAGGTCTTTGGG:1 - chr3R 25208306 3' + P-element 2876 1 70.00 ACGGATCCTTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGAGCGTGCCCCAGGGCAATCCAAACTTAGCCACAATCAACTGCGA:1 - chrX 2231778 3' + McClintock 6413 2 55.45 ACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTACAGCCGGCTTTAAATAAAAAGTCGTGGGCGAAGAGAGTGCAAAGAGAGCGAAAGAGAGAGTGCCGTGCAGCGAAT:1 + chr3L 6551091 3' - hopper 462 1 75.25 AACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCAAATTCTAAAGAGCTGAGTTAGTCGCCAGCCAATACTTTTGCAAGTTAACATGCCCCCTCTCTCCGACCACAGGG:1 - chr2R 5061554 3' - 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chr3R 27005746 3' + NOF 3957 1 45.54 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTTCGGGTTGTGCTGGAATC:1 - chr2R 10777821 3' + pogo 2050 1 81.19 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGCTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGATGCTAC:1 - chr2L 19207869 3' + 412 7521 2 52.63 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCTCGCGACTTTACCCAACTTTTG:1 - chr3R 16005468 3' - Doc 58 1 77.23 GTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAAAGCATTGTACCTGGGCGCCACTCGGATAATGGCCAACAAAAAATAAAACAACTCCAGTCAACAGTCAACAAT:1 - chrX 17217699 3' + R1A1-element 5321 1 66.34 ACAAAATCGCGAAGTGAATNAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAATTCAAATGGTTG:1 + chr3R 25271732 3' + invader4 294 2 58.42 TATTAGGTCCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTATGGGATAGTCGAGCTTCCAATAAGACTCACCAACTAGCTAAACACGATTTGATTTTGGTACACACA:1 - chrX 307857 3' + G5A 2414 1 56.44 AGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATAACTACCAAGGGCACGCACAGAAAGGTGCAATGCGACCAATACCGATGGGCAGAATAATCAG:1 + chr2R 5271298 3' + Cr1a 4115 1 73.27 AAAGCAAATTAATATATTCGGAAGAAAAGGAAGAAAAGCATGAGAAATTTGTTGCTAGTGACACACCGCTGTTATTGTTTTAATTACACGCGTTTTTCCGC:1 + chrX 1098616 3' - Gypsy12A_LTR 2052 1 79.21 AACCAACACACACAAACACACACACACACACACACACC:1 + chrX 17971843 3' + gypsy3 421 1 86.84 AAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATATTTATTTAAAGATCACTTCACAACTCATAATCATATCTATCGCAACGAACCCATTCGATCGC:1 + chr2L 2685294 3' + I-element 223 1 57.43 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACTCCATGGCAGGGGGGTGGGAAAAGTGTGAGGGGATGTTGGT:1 - chr3R 25531720 3' - hobo 31 1 57.43 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTTATTGTGAATGCAAAAGATA:1 - chr2R 18105733 3' + roo 393 1 61.39 TATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTTAAAGATACCAAGGAGCCAGTCAGCCCGAAGGAGCCAGTGA:1 - chr2R 10840838 3' - Tc3 237 2 50.50 GAATCACAAAGTTGACTAAAAGATTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTGATCAAACAAGAATATAAGCTAAATAAGTCCTGCCAATCTTTGAAAGA:1 - chr4 166980 3' - transib3 209 1 61.39 TTTGTATGGGTGGAAGCGTNACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATGAACATGGCGACTACGTTCGCTTTTGATTGTTTTGCAAACAAAGCGAAA:1 - chr3R 8706046 3' - hobo 2668 1 53.47 ATATTTCGTCAAATTTACAATGCAAGAACATACTTGTGAACACATAAAGTGGAAGTACGAACACACCAACTCTCTGAGCAAGCCGGTGCAACTCATAGCGA:1 - chr2R 4520044 3' - 1360 201 1 63.37 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTTATTTTCATTAGTGTAGGGTACTTAGGCGTCGAAATAACTGACAACAGGTTTTTTA:1 - chr2L 15817956 3' - I-element 21 1 60.40 ACTTAATCAACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAATTCCTTGCTCGCAACGCTAAATGCAATTAAAACTACAAGATGTTGATTA:1 + chrX 14658759 3' - X-element 34 1 50.51 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGGCAAAAGG:1 + chr3R 30611315 3' - blood 24 2 56.44 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTGATCCACTGTATTCATAACTTA:1 + chrX 15268319 3' - roo 18 2 59.41 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAATTATTATATGAAAAGAAATCGAGCGGAGAACG:1 + chr2L 20271271 3' + blood 336 2 68.32 GCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATACCAAAGTATTATTAAATAGTTATAAAG:1 - chr2R 19330293 3' - McClintock 5996 2 73.27 ATTAATTACAATTATAAAGATAGCGACTTGATTTACTCTCAACAAGGATACGCAAGGGTTAAGAAAAGCAATGGCAGGCAGAAGAGGGTTAAAAAGAGATA:1 + chrX 17562464 3' - transib4 2605 1 77.23 ATTATCCTGGGATATCGATAGATATTTGGCAATAAAATGAGAAAAAATTTCAAAATTGTTCCATTTCCTTTGTGCCGTGAAATTTCGAGGTTTGGAGTGGG:1 + chrX 21510399 3' - INE-1 501 1 53.47 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATGTTTC:1 - chr2R 13446663 3' + roo 9029 1 71.29 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAAT:1 + chr3R 7688936 3' - Tirant 8141 2 61.39 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTATGCTGAGCCCAAGACAATTAGCGCTATTGC:1 + chr3R 16305535 3' + pogo 2065 1 67.68 GTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGG:1 + chr2R 6482751 3' - gtwin 16 2 62.24 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTG:1 + chr3R 22494761 3' - 1360 39 1 65.35 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCC:1 - chr3L 25059067 3' - mdg1 7062 2 55.45 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTATACATAAAGCAGGCACCACGCACCCAGCAAAAGTCAAAACTCAAACTCA:1 + chrX 14324753 3' - 297 18 2 61.39 ATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACAACGGTAAACAAAAGGCCCATAAATTAAGGCAGAAACGAACCGAGATATACACGTATTCGGGAATATA:3 - chr2L 3937692 3' + Burdock 250 2 70.30 GTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAGTTCGCCGGCAGCCGCTCGTTGATATCGGGGGATTTGGACGGGTTTGGCAATGTCAATAGGGC:1 + chr2L 21234446 3' + mdg1 419 2 72.28 TGTCACCCGGTTAACTTAGTTAACTTATAGCCTGACAGTTTTGTTGTTAGTTTTTCCAAGCAGCGGTTTCCCGCCTCAGCTTGGGTTTAGTTTAAATCTAT:1 + chr2R 17373248 3' - gypsy6 4 2 75.25 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGCTTAATGACGACACGAAGCCGCCG:1 + chr2R 21362814 3' + Tirant 349 2 76.24 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTATTGAGACTGACGCCACTCGGA:1 + chr3R 4773425 3' - Tirant 8123 2 65.35 GGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTCTTTTTTTGTGGGCTTGTGGGCGGGGAAGGATGTGTGCCTCCTCCATGGACGCCCCCAAAAAAAAGTCCCTG:1 + chrX 15433699 3' + INE-1 572 1 63.37 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACCGATGTCCGTATTTTCCCACT:1 - chr3L 771733 3' + roo 406 1 73.27 TAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACAATGTAATAGGGTGCGCTATTTCGCCAGGATTTCTCTATGAAATATTCATAACCAAAACCGATCATACTTTAAAT:1 - chrX 6058143 3' + roo 403 1 73.27 AGTACTACCGTATGTTGGCGGGGCAAGGTTTTTGTTTAGTACGTAATAATCCCTCAGCTGATGCCTTCATTAGGGTGGCTCAAGCCAATTTCATCCGGCTT:1 - chr2R 22322508 3' + Rt1a 4786 1 59.41 AGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAAGTGTATTATACAAAAAAAAACAATTTTACAAGCGAACATGCGAATTTATGGCGCATTAAA:1 + chr2R 23441778 3' + jockey 4972 1 49.50 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAAACCCTAGTCCGGCAACCCTGAAAACTTTGCGAAACCAAGCCAAACCAAACCCAACCGTCTTGACCAGA:1 + chrX 4238865 3' + 1360 3382 2 73.27 AGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACTCCTTGCTTAAGCCCTCCTCTGGCCAAAAAGAGCGGGAAGGGTAGTGGATATCTTCTGCCCGACTTGAC:1 - chr3R 28580498 3' + Idefix 186 1 52.48 GCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGGACACGAAATGTGCGCGATGATAATGACAAATCAA:1 - chr2L 11321287 3' - opus 7289 2 65.35 AATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTT:1 - chr2R 5582176 3' - Cr1a 450 1 58.42 GGCAAATCCTGCCAATTCCTGGAGCTTGCGGTTGCGCCATTTTTCCAGCTGATTCAGTCAGTAATTCATATAAAACTAAAATTAAGACTTTTGTTGACTAT:1 - chrX 18858234 3' - Helena 7 1 79.21 GATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAATCGGAAACGCTTCCTTCCTTAATACATTAGGATCAGTGCATGATTAAAACAAATTGAAATTAAATTAA:1 + chr2R 21433849 3' - INE-1 80 1 48.51 GTCGTATTTCATACGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTGGTTAACTTGTAAATAATGCTTTTGGTTTCTAAATTCCAATTGTGCAGATCTATCATCTACC:1 - chr3L 23354626 3' - gypsy2 25 2 55.00 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCA:1 + chr3R 30611286 3' - blood 7064 2 77.23 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAAAAAACAAATCTTTCTATCTCGTCCAGATATCCATTGATATAC:1 - chr3L 16478375 3' + pogo 2072 1 60.40 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAACATGCATTTACACACAAAGGACATGCAGAAGTTGTGTTTCTTTCTTTTAGAAATTGTA:1 - chrX 17873154 3' - 412 16 2 63.37 AGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAAGTATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGGGAAGCGGGGCTCAACTTCTTCTAGTAA:1 - chr3R 5026008 3' - Chouto 200 1 70.30 GCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGATTTATGTCTCACTTTTCCTTGTCCCACCTGTGGCCCTATTCCTGGCTTTTAA:1 + chr3R 31960441 3' + Doc 438 1 53.00 GCGAATTTTTAAAAATGATTTTTTTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCCAATCCATATACTCGAATCAGAATTAAGCATCCTTAGACAGGGACGTATGAC:1 - chr3R 908389 3' + 1360 3087 1 52.48 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATATTTTTTTGTTCCCCACTTCGTTCGT:1 - chrX 4422627 3' + jockey 4944 1 72.28 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAACAAAAAAATATAGGATAAAGGATTCTACAACCACAAAAAATGGCGGCTTAG:1 + chrX 4422673 3' - jockey 32 1 54.00 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGT:1 - chr3R 12115301 3' - 1360 52 1 79.00 TGCGGACCTCTTGGCCTTCCAGGCGCGCCAGCCCACAATGGCAACACATAACAGGAACCGCAGATCGCATAAAGTGTGTGTAGTTTATTAAGCGCGCCGGG:1 + chr3L 20708857 3' - gypsy2 6401 1 55.45 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGGAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTTACAGGAG:1 + chr3L 17708321 3' - jockey 4770 1 63.37 TATTTAATTGTTCTTAATANTGCATAGGCACATACTACAGTGTGCACCTAAGTATCGTATAACTGCAACTTTTAGTGCAATCAGTTAATGAATAAACGTAA:1 + chrX 8983003 3' - 412 7071 2 61.39 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAACATCCCACTCCACACAGA:1 + chr2R 8707118 3' + flea 5009 2 75.25 AAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCATTTCGTGTGTATATTAACATAAGGTGTATTGTGCTTGCATATGGAACCAATAGATGACGAAAGTCGATG:1 - chrX 7592757 3' + 1360 449 1 70.30 AGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCT:2 + chr3L 19350005 3' - 1360 3220 1 45.54 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATG:1 - chrX 15412672 3' - hobo 27 1 52.48 AATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACAACTAATTACGCAAATCAAGATACAAAAGATGGCTCTCAATAGA:1 - chr2L 18496596 3' + Quasimodo 160 2 56.44 ATAAATACCCTGGCTTTTAGTTTGTGTAGTCTCCTTTAGTTTAATTCCAGGAAAACGGTCAGGTACGGAACTTAAGGAGGTGTATACACTATTAACAGCCA:1 + chr3R 19449040 3' - 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roo 8663 1 69.31 TTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCATTCAAGAAGTCCACGCTTACGTTCGTCTTATTTTTTCGCTTCTGT:1 + chr2L 9203505 3' + F-element 346 1 54.46 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACACAGTGCGGCGT:1 + chrX 7534736 3' - Tirant 3 2 76.24 TTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGTGTATATTCAATTGAGGATTTAGCAATCACATTACTGGCACTCGTTACATT:1 + chr2R 9811366 3' + Quasimodo 7350 2 63.37 ACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGCCCACGCACATTTTCGGAAACGCACGTAGGCCGCTGACTACTGGAAAAAACTGAGTG:1 + chr2L 481883 3' - Doc2-element 4587 1 62.38 AAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGCACAGCACGCATTTAGCACAACTTCATTTATCTTTTGCAT:1 - chr3R 12882633 3' + 412 475 2 62.38 AGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chrX 706056 3' + Juan 14 1 77.23 TGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCC:1 + chr3L 18592072 3' - Cr1a 479 1 46.32 GACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGAGAGCGGGAGAAGAGCAGAACGTTTTTGGGCGGCTAGTGGTGGCACCGTGAGCATGC:1 + chr3L 18840656 3' - Tirant 159 2 59.41 AAAATCTACTAAAATGATANTTTACACACAACGGTAAACAAAAGGCCCATAAATTAAGGCAGAAACGAACCGAGATATACACGTATTCGGGAATATAGCCA:1 - chr2L 3937688 3' + Burdock 6390 2 76.24 ACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATATGTTTTCAATTGTACGTACTCCTAAGATCTAAATACCATTTCATACCGTTTCAATCTA:1 + chr3R 12903115 3' + hopper 1132 1 65.59 GCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAAGTATCATTTTCATTTTGACAGCCCACGATGAGGGGGGCCAACAGACGAGAAGTCCTGGGCGATGGAGGAGAGGGAGAG:1 - chr3L 12325189 3' - 3S18 66 2 50.50 TAGTATTGTATACTATATTNAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAAAATGAGTTCGGACAAAGATCGCTTTAAGCTTAAACTGAATGCAGACCGTCGATGGC:1 + chr3R 4536258 3' + Ivk 5358 1 58.42 ATACAGTGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTAGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAGAGAGAATCTTAAATTAAAGCGCAAT:1 + chr3R 16297909 3' + F-element 4319 1 70.30 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATAACTGGAACCCAATACGAAATCAACCGCAGAAACCTCAAGCAAAATGACTTTCGTTTTGGCCA:1 + chr2L 8913401 3' - 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copia 229 1 76.24 GGCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTGAATATGTTGGCTTTGTGTATGATAGTGTGTGTGTTGGTTGGCCACACCATCTACCCACCGGAAAAAGAAAAAC:1 + chrX 3646748 3' - accord 7031 4 72.28 GCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCAGCTACATTGCAGGCATAAACTAGAATCCAA:1 - chr3L 13898103 3' - P-element 474 1 37.62 AGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGTGCGCAACTCACCGGACACAATGCGGCTTATC:1 + chr2L 18298931 3' + hobo 13 1 60.98 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAAT:2 + chr3L 3428055 3' + roo 9026 1 73.27 TAAACATAAAGATCGACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAAAATATTCAAATACTTTGGAACCCTAAA:1 - chrX 2349870 3' + Bica 142 1 70.30 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATAATGTATGCATATCTCTGCGCCTTGGACTTTTCAGCTCAT:2 + chr2L 18927539 3' + mdg1 388 2 58.42 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAACCAGCGAATATAAAGAGTCAAGATACATATTTAATTATTTACCCGAGAACTTGTT:1 + chrX 17109726 3' + roo 9048 2 56.44 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACAATGCAAAAGTGAAGTTAAAATATTTTTAAAATATATCA:1 + chr2L 12210696 3' - Doc 40 1 71.29 TGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTACCTTCTAGCTAATGTGTCGACGTTCATACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 + chr2L 21738001 3' - INE-1 173 1 76.24 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAACATTGCGCCAAACAGCTGATTTTTG:2 + chr2R 13194672 3' + roo 9022 2 76.24 AGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGTGCGAAGAGTAGTAGTGCGTCCTTCAGCAAAGCCTCCTTT:1 + chr3R 7912444 3' + Doc 4482 1 60.40 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTGTGATGTCATAATTGGAATGCCTATCTTAATTCTATATTTTGTCTTTCGTCTGTTATTT:1 - chr3R 10434539 3' - 1360 16 1 64.36 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCACTTTTAACTGAATTTAGGAATCG:1 - chr3R 934842 3' - Max-element 53 2 75.25 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACCCTCTAAAAAATGTGCATATTCATGAGATGATTTATAAATAAACGCCAT:1 + chr2R 11661166 3' + 1360 3365 1 55.45 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAGAACTGCACTCCAAAATCAACAGCTTTGATTCATTCGATGCACTTTGCGG:1 + chr3R 26434186 3' - 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roo 17 2 51.49 TTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTC:1 + chr2R 6482731 3' - gtwin 39 2 65.35 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTTGCCACTGCTGGCTTTTTGCTAGATGGGCTTGTTTGTCG:1 - chr3R 20345075 3' - transib2 12 1 67.00 TAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCCGGCATGTAACTGCCTGGCGCAGGTGTCGTGAACCGCCTTTTTGCAGAACGTGGCCAAGTTGGTA:1 - chr2R 3132639 3' - gypsy5 14 2 65.35 GACTATTTACTTAGGCCTCNGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGAGCTTAATTTTAAATTGAGGCTGCTGCGGCGGCTTCATTTACTTTG:1 + chr2R 21747472 3' + roo 286 2 53.47 CTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTCTACGAGGCATCTATGCTATCAATCGCTCTGAGCTATCCCGAGCCAACTGGACCCAACTGACTGGCTAACTTTC:1 - chr3R 7894146 3' - Tirant 8244 2 78.22 ATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 9 1 63.37 TGTGTTTTTGGTCGGAGAAAATTATCTACGTAACTATGTTGTCATAATCTCTGCGTGAGTAATTTTTTTCAGCTACTACTTTCTGCCAGTGCATGTTTCAC:1 - chr2L 12337204 3' - gypsy4 469 1 78.22 GCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAATCCATTGTGAGCTATCTCTGTTTACTGGAAATTTGGTTATATTTTGTTTATTCGTTTAC:1 + chr2L 7219144 3' - FB 255 1 58.42 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGAC:1 + chr2L 13792232 3' - blood 7055 2 66.34 GTCGAGATCTCAGGAACAATAAGAGCTAGAAGATGAAGCATACAGATTTAAGTATATGAGCGAAAATTTCTTTACATTCGAGTAAACGCGGTGCTGATTG:1 - chr3L 22785756 3' + INE-1 145 1 52.00 ATACAGTGCTTATTCGATANGTGTGCACATTAAAAAACAACTTGTAACTTGTGTATCTATGAGATACATTTACATTTCCCATAA:1 + chr3L 11657908 3' - Tabor 13 2 59.52 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTATGTTCTTAATTTATGAAACCAAGAGCTCCATAATAAACTAGACATTTTTGTGTGGCCCATTAATCAGTACAGTT:1 - chr3L 2339730 3' - roo 8665 2 78.22 ACATTAGTTCGACTCATAANTAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGGGTTGCTTAAAGCTAGTAGCCCACAATTTTAATATGCTTTTTTAGTAATAAA:1 + chr3L 5808252 3' + 297 377 2 62.38 ATTAGTATTTTTTGTATTCNTGGCTTTTAGACAGTAGCATGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAGGCTTCATTAGCCGGCTCCGTGGAATATGCAAATG:1 + chrX 17478582 3' - HeT-A 5889 1 69.31 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAAGAAATGGCGATGCTCGTGGAATTTTATTGGCTGACGCAGGCCTTGTTCCGCAGCCCAAAA:1 - 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BS 5041 1 67.33 ACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATAATTATATCCCACAAATATGGATTCTACGAAACATTTACTGGATCCACTGTTAGAACTAAAAGGAATA:1 + chrX 11987967 3' + 412 7536 2 72.28 TTAACAATAATAACAATAATATTGGTAGCATGCTCCGAATGTTTGCCGCATGATCTCACTAACAAATAAGACCCATAGTCCGCCTTATCGCGATTTTAACC:1 - chr3L 4133403 3' + mdg1 32 2 71.29 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAGCGTCCAGCATAATTATTTATAATGGCCAG:1 + chr3R 12178266 3' - hopper 41 1 68.32 TGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGTAACTTGGCTCGACTTCTTG:1 + chr3R 4444389 3' + R1A1-element 24 1 77.78 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGCCTTGTCTCTGTGATTTTTCCGTGCGAGGGGAAAAGTGAAAAGGAAAAGCGCAGCTCG:1 + chr3L 949357 3' - roo 18 2 61.39 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTCTGAAATTCCATTGCT:1 + chr3R 28216856 3' + blood 7352 2 68.32 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCCGTTCTCTGGTGGGAATGCCAAAAATTAAAA:1 - chr3R 22469170 3' + hobo 2901 1 76.54 TACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTCGAATTGGATTAGGATGTTATGGGACAGGGTGTATTGACCACGGCCAATGCTCGGC:1 + chr2R 3068439 3' + Stalker4 395 1 61.70 AGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATCCCTATTCAATAATTTAAGGTATTTTAGAAAATATATCAATATTTAAATACGAGTAAAAAAATCAAAATATAA:1 - chr4 626751 3' + diver 221 1 75.25 TATTACTTCGATTACTAATTTGATTTAGTTGGCCAGGTCAGGGTTGGATTTGGACAATTGATAGCCAAGCGAAATTGAATTCATAAATTGAATTTCGGCTA:1 - chr3R 7627977 3' - Doc 4432 1 81.19 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATG:1 + chr3R 4571525 3' + hobo 2903 1 63.37 AAGTAGTGTTGTTTAACGTNATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCA:1 - chr3R 4474169 3' - copia 4899 2 59.41 TTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTTCCAATTTAATATGTAAGAT:1 + chr3R 9858909 3' - BS 23 1 53.47 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTGCTGGGATAGGCTG:1 - chr3L 5808193 3' - 297 31 2 77.03 TTACAAAAACTCAACGATTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGAGTCTGTTTGCCTGCAATTTGATTGGAGCTCCCCCTTCGGGAAAGTTACCCAGTT:1 - chr2L 9471194 3' + roo 385 2 54.46 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCGTAATTAAAAATAACA:1 + chr3R 19270406 3' + pogo 2064 1 64.65 TTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATATGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTAGTTGTGGACCAAGTTGTGGGTCTTCTT:1 + chr2R 6623840 3' + R1A1-element 5229 1 74.26 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCATTCTCAG:2 - chr2L 20271211 3' - blood 7043 2 56.44 TTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACGTTTATACAGACGGACAAGCTGACAAACGGACAACGAATAATTCATAGGATTGCTTTGCACACTTTTCATGGCATCTA:1 + chr2R 11575188 3' - INE-1 146 1 66.34 TTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAACCTGTTGCAGGAATTGATCGTTAATAGATGAGCATGAACCTGTTGCTTGAAACCAGCCCTGTGC:1 - chr3R 11245058 3' - roo 331 2 70.30 AACACGTCTCCACCCGAAGACTCAGCTAATTAAAATTTCAGTATTAAATGCATTTGTTTTCGAAGGCATGTTGGCAGTCTGAAACTCATC:1 - chr2R 11941196 3' - Doc 18 1 58.89 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACAATGTAGGTTCCGTTTGGCATGAAACTATAGGGG:1 - chr2R 11661098 3' - 1360 39 1 66.34 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGTTTTTTTGTTTCTGTTTTGTTTGCCTGTCGAAAGTTTC:1 + chr3L 17127036 3' - Doc 42 1 66.34 GGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAGCCACCGGGAAAAGAAAAGAAAACCGAGCGCAGGCAGACGCATTACAAATTCACACCAAGTGGCACCCACAGC:1 + chr3L 732830 3' + F-element 85 1 78.22 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTGTAACTTTTATTATTGTTTAAT:1 - chr2L 3475288 3' - roo 53 2 86.14 GTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCAT:1 + chr2R 12185418 3' - accord 11 2 62.50 ATACAGTTCTCTTATATAATGATATTTTATGCTTACGACGTGCATGGAAAGTTTCATTTTTCACTAAGCACTCGAAATGAGCCATAGATGGAATCTATGTG:1 - chr2R 19107198 3' - Dm88 4144 1 69.31 GAACCCTATTGAAAATTTGNGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGCCCTGAAACACGACAACAGCTTAGTTTACTCCCCTCGTGATAAATTAA:1 + chr2R 8460850 3' + S2 1239 1 74.26 AGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGGACAGTCTTTCCAAATTTAGTACCTTCACGAAGGATGTGAGCAGCAAGACGGCTACGTATGTCAAGTACCGGAACC:1 - chr2R 24579193 3' + Cr1a 4012 1 71.00 TACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGCACCAGAGGACATGCAACGGTATGAAGGTGAATATGCGCTTCCGTCTTTGGCGAATT:1 - chrX 2988599 3' + Quasimodo 34 2 71.29 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCATAGCGCAGATACAGTGGGCCAACTAAGCGAAATTTCGATCGAAAAGTACAGTACGAA:1 - chr2L 18500287 3' - Tirant 16 2 61.39 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATCGGCGGTTGAGGTAATGTTATGATTATTTGCAGT:1 - chrX 5997254 3' + 1360 3358 1 67.42 GTACCTAGTAAAGTGATAGGGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACACCACCATTTAAATTAAGATAATATTTAACTTTT:1 - chr2L 21620248 3' + P-element 369 1 39.60 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAACAGAGGCA:1 + chr3L 455631 3' - Doc 38 1 62.38 TCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTT:1 + chr2L 21400809 3' + Doc3-element 4713 1 29.70 GCAGGATGGCCGTGTCGCAGATCATTGTGGCCCCAAATTGGCCTCTTTGCTGCGCTACTCCGTGGTCTACGACAATCGGGATGGAAACGTATTCC:1 - chr2R 14988548 3' + invader1 3598 1 80.00 TGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTAAAGAAATACTGTAAAAGATTGATTGCACATTCTGTAGAGATTTAGTTTTAAGTGCTTCCA:1 - chrX 17700038 3' + Doc 104 1 72.34 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAGGCATGCATATGCGTACTACTAA:1 - chr3R 22469128 3' + hobo 2928 1 62.50 GAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGACGGGGATCGCATTTGCAAAGTGGCTTTCG:1 + chr2R 11373672 3' - blood 7175 2 65.33 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACATTGAATGTCCAAAAAATG:1 + chrX 3691573 3' - jockey 4783 1 53.76 GATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAGAAAAAAATATGCAAAAATAA:1 + chr3R 9359387 3' + Cr1a 4215 1 71.29 GGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGGCCCCCACAAATGCCGCTTGCAACAATCAGGC:1 - chr2R 13270066 3' - Quasimodo 41 2 65.35 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAAGGGGAGTTCATCATTACACTATAACTATTTATTGCGTGCCACAAGAAGCAG:2 - chr3L 13597218 3' + 412 7500 2 68.32 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATATATTTATAACATTTTATTATCGTTGCACTTGCAGAAATGGCGGAAGGTAATGGCGAACTG:2 + chr3R 20791749 3' + pogo 2092 1 70.30 AGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAATTCTGCACCTGTGGAAATGTATTTTTTA:1 + chr2L 23084413 3' - gypsy5 13 2 66.34 AGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGTGAATGCGAATGTCCTAACCGAGCTGTGCCCGCCTTTCGGAGACAATG:1 + chr2R 23755064 3' + Stalker 6992 4 57.43 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTACCCATATTCTGTTGCTTCCCCCTAAACTGTCCGCCTAACTGAATGTCCTTTCATTAGCGAAGCGGGTGCCC:1 - chr3R 9085007 3' + mdg3 244 2 76.24 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGGGGTGCATCTGTGTGCAGCTTGGGCTCTTTTCGTGGGTTTTGTTA:1 - chr2R 12096563 3' + hobo 2909 1 56.44 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACC:1 - chr3L 771778 3' + roo 361 2 74.26 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAAAAAACAAATCTTTCTATCTCGTCCAGATATCCA:1 - chr3L 16478384 3' + pogo 2063 1 69.31 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGACAGCGGCAGTGGCAGTAACCCTTAGACACGTCTG:1 - chr2R 13194609 3' - roo 20 2 59.41 AGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGT:1 + chr3L 19339424 3' - Tc1 31 1 52.48 GAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGAT:1 - chr2R 11575006 3' + INE-1 148 1 60.40 TAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATATTCTAGAGCG:1 - chr3R 4434017 3' - Juan 43 1 67.33 ATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGACACTTTTGCCCTCTGCGGAATTGCCATTTAACTTG:1 + chr2R 21588957 3' + Doc 286 1 76.24 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTGGTGTTCTTAATAGGAGGGCAATGGAAATGGCAACTG:1 - chr2R 19557574 3' + 412 7475 2 76.24 AAAACTCAACGAGTAAAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGATTTATTTGCCTTGTGCCCTGGAAACTTTCGACTCCCGACATCCATATCCGTATCG:1 + chr3L 14691002 3' + roo 390 2 56.44 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCTTCCACAATTTC:1 - chr2R 19513362 3' + roo 9039 1 55.45 GAGTTTCTCGACTATCAGATGCCATTTACTACAAACCTATAATTATAAAATAGTTATTTTCTTTTATATATTTATTACCTTTAAGATAAGATAAG:1 - chr3L 18702667 3' - INE-1 558 1 70.53 TGTGCATGCGAAAAACAACAACACCAAACAAAACTGCGAACAACGCACAAAAAGGAGGGTAAACAAAACAAATGTTCAATAGCAAATGATATCGCATATTT:1 - chr3L 17971039 3' - Cr1a 254 1 59.41 TTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTACTTCTTTGCCTTCCAAGGACCCACCCTCCTGTTGCTTGTTTACCCAGGCTTCCTTTCTAA:1 - chrX 13012768 3' + hobo 353 1 68.32 ATTCTATCTATCATAATAATAATAATATGAATGATATGTTAAATACAAATTGCCAGCACATGGGCACGCTTGTGCAACAACTGCACATTATTTATTCGCTG:1 + chr3L 13164937 3' + I-element 5347 1 76.24 TACGCGTAATTCGGATTTTGTGAAGAGAGATTGGGCAACATGGGCAACACCCAAGCCCGACAACTGGAGAACCGCCAAGTGCCGAATCGGAGGAGCAGTG:1 - chr2L 6012176 3' + invader1 3878 2 69.00 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAACAGGAGTATTTAGATAATGCAAATTTGAT:1 - chr3R 18342474 3' - F-element 60 1 71.29 GCACCCGCACACAAAATTGNAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTACATACTAAATACAAATAAAATTTAATAAA:1 - chr2L 13334846 3' - hobo 46 1 70.30 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATGTGTGAACCGCCCCCGG:2 - chrX 13268846 3' - 1360 16 1 60.40 TATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACAAAAACTCACGCTTACCAATACAATACACATTTAAAACTAACATACTAACAATA:1 + chr3L 10686446 3' + opus 7294 2 57.43 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTACTGTTCAGGTTCCAAAGCTTCGTCACAGCTG:1 - chr2R 5200903 3' + 1360 3387 2 74.26 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCAACCCCAGCTGCAACCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGGCCCTTGTTAA:1 - chrX 12768233 3' - FB 49 1 60.00 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTTAAACAGTAGTACTAATCCAATTGAGTATCTA:1 + chrX 10996582 3' + 1360 3349 1 68.32 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGG:1 + chr2L 21645248 3' + 1360 3385 2 74.00 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGAGTGCTTTGAGTACGTCAAATGAAGAAAAAC:2 - chr3L 5976311 3' + hopper 1393 1 57.43 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAGCACCCAC:1 - chr3R 20791648 3' - pogo 42 1 54.46 TTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGC:1 + chr2R 4677369 3' - invader3 2 2 76.24 GTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 22 2 60.44 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATGATTCATCTAATACTTTATCTATAGTCATGAGAAGTACACAAA:1 + chr2L 7259470 3' - I-element 33 1 57.43 AACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGTTTAAGCCACAAACAGCAAGTAAAAACCGCAATATGAATGCTGCAAAGCTGTGTTTGAAAAATTATTAC:1 - chr3R 9902377 3' + F-element 4257 1 72.28 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATA:1 - chr3R 4434027 3' - Juan 53 1 78.22 TTTGATTTGATTTTATTTTATTTATCACTTCCAGCAACTGCAAAAATTTGAAATCTTCTTTTGCATTTAGAGCGAGTAACTTTAAACATTTATAACCATTT:1 + chrX 16673583 3' + transib1 1896 1 79.21 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGAGTGCTTTGAGTACGTCAAATGAAGAAAAACCAACTCACACAGGCACA:1 - chr3L 5976294 3' + hopper 1410 2 74.26 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGTCTGTCCGCCGAAAGTGCGAGAGCAACCACTCAACT:1 + chr3L 5355405 3' + P-element 2849 1 42.57 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCGGACTCCAAAAAATGTTTCGCATATATCATATATTTCGG:1 - chr3R 12178207 3' + hopper 1382 1 56.44 TCGGGTGGTTTGTGATTGTCTTAACTTATATATAAACAAGCCCTGATGAAAACGTATTGACGATGCAATAAACTTAAAGAAGTTTAGTAAGACCTATGAAA:1 + chr2L 7126862 3' - Burdock 5 2 70.30 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATGTCATGTTCATGTGTGAACACATTTCCCAATTTAAGTGTGCGTTTAAAAA:2 + chr2L 15766470 3' + pogo 2077 1 53.47 GTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCTGCTTTGCCTAACCATTAACTT:1 - chr2L 11626537 3' - accord 240 2 78.22 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAGACCGAGTGTCACAGTGGCAAAGAGATGGACCCT:1 + chr3R 16613221 3' + 412 481 2 66.34 TGCTTGGCCGAAAATCTGCNACCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCTAATAAAATTAATAAAATTATTCCCTTGGAGTTTTATTAATATTAC:1 + chr2L 9747844 3' + G4 3358 1 57.43 TTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTTAGGGGATGTGAAGCCCGAATGTC:1 + chr2L 20950509 3' - G6 2018 1 77.23 ATTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTAGGAATTAGAGAGGTGGGGG:1 - chrX 10489800 3' - Bari2 911 3 92.86 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATTTAATGTGAAACAAGGCATAATTCGCAATTGCAG:1 + chr2L 15983453 3' - hobo 10 1 69.00 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATAATCTTTCGCGTTAATTTTTGGTGTTATA:1 - chr2L 21372927 3' - roo 19 2 60.40 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATAATCCAATCGGCATATAAATCATTGATAGCAATTTATTTTCCGTGTTGAAACTGTG:1 + chr3L 2339839 3' + roo 9049 2 57.43 AATATTGCATAGGCACATANTACAAAAGTTTCAATGCGAAATTGAAACAAATTTCGTTTTGCAGAGTTGGCAGGAAGCATTTATGAACGATATTCAATCTG:1 + chr3R 25950184 3' - 412 3 2 76.24 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCGTGCTCC:1 - chr3L 11657835 3' + Tabor 455 2 51.49 GTTACTTTACTTTACTTTAATTTACTTTACTTTACTTTACTTTCCTTCGCGCCTTATTTTGGGCATATTCGATTTCTTTAAGATTCGGGTTCATCTTGCTT:1 + chr3R 12708728 3' - TART-A 13148 1 55.45 ACGTCACGCATCTGGGCTCCCCTTGGGGATCAGATTAATTTTCATAGCAGCCGTTATACCGATAGGACTATAAAGGGCTATTTGAAATGTGTTTGCCTTGT:1 + chr2L 1454475 3' + G5 4464 1 65.35 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGCAAACAATTCCGATTGATTTATT:1 + chr3R 22494784 3' + 1360 3380 2 69.15 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGATTTCTTATACATAAAATATTTTCTCGAAA:1 + chr4 626839 3' - diver 48 2 68.32 TTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCTCTGTTTGCTCACATTCATGGGAAGATGGGCAAAGCAAGTGCCTTACTCCCCGCCA:1 + chr2L 7292336 3' - invader4 130 2 75.90 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTGTCGCTTCTCCTCTGTGATTCCAGGAATAAATGTTTTAAATATTTTAAGAACGGCGGCTGTTGGGAG:1 - chrX 21581078 3' - 297 5 2 70.00 GGCGAACAGCGGGGCTTGGNAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCA:1 + chr2R 2868558 3' + Rt1b 4730 1 42.57 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCACCATAATTATTACGTAATTGAGGTGGGTTGTCCATTA:1 + chr2L 20709474 3' + roo 397 1 67.33 TGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGATTAAGGCAAATCGCGGATAAAGCGGAGTTTAATGTCCTTAGGGTTCCACGA:1 + chr2L 9992938 3' + R1A1-element 5017 1 57.43 TTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCAAAGTTTGCCTTTTATTCGAGAGTTCCCAA:1 - chr3R 15250960 3' - P-element 145 1 31.58 TTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAATTAAACTATTTATTATTAGAATTTGTATTTGCTTTTGCATTTGTTAACAACGATCATTCCGC:1 - chr3R 13077772 3' + Porto1 4513 1 58.42 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGCACCTAAGTATCGAATAACTGCAACTTTTAGTGCAATCAGTTAATGAATAAACGTAATCAAGCTCT:1 + chrX 8983012 3' - 412 9 2 66.34 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATGT:1 + chr3L 7494093 3' - roo 8701 2 63.37 GCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGAAGTTTTAGTGTCTCCAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGATAAAGGTCCTGCGATATGAATTCG:1 - chr3R 7273737 3' - Chimpo 123 1 78.22 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGTGTAGACAGACGCACACACTCGAACACACATCCATCTGTGTG:1 + chr2L 18413932 3' + hopper 1414 2 76.24 AAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTG:1 + chr2R 5531179 3' - 1360 82 1 56.44 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACCATGATACTTTTGGGATGCACTTGAAAG:1 + chr3R 13239954 3' - jockey 56 1 71.29 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCATATACTAAGTGATGACTAATAATA:1 - chr2R 8717654 3' - 297 6626 2 77.23 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACGCCACTTGACGGCGGCGGAAGTGGCGCCAGTTGCGGCCTTGGTGGCC:1 + chr2R 6769519 3' - 412 29 2 55.45 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCAATATCTGGCTCAAGCAGAGCCGTGT:1 + chr3L 3428094 3' + roo 402 1 71.29 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCCACATGT:1 - chr3R 28475813 3' - roo 40 2 73.27 AAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCCCCGATAATTAAATGAATTCCAAATGAACAAATAGGTAGCAGGAGCAATTGTTTGCGTTT:1 - chrX 4172611 3' - Doc3-element 32 1 52.00 CTGCAATACTTCCCTCCACAGTGGAAGCTTGTTAGGTGGCATTTTTCTAAAATGATTGGATGTTTAACATTAAATTCTGCATTGGAATTTTGCAATCTTCC:1 - chr3R 19446925 3' + BS3 350 1 76.24 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACA:1 - chr3L 24150540 3' - blood 7061 2 76.24 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTGCTGCTTATTTTTTCAGACCGCCTGAAAATATGCAATCC:1 + chr2L 2288436 3' + hobo 2909 1 55.45 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCATTCTCATTCG:1 - chr3L 16807718 3' + P-element 2854 1 47.52 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAATAAT:1 + chrX 8972996 3' + flea 208 2 73.27 ATAATTATAAATTTCGGTTCGCCTAATCGGTGTGGTATGGCCAGCAGAAGAGGTCAATGATTTTGGCATTACAGTATTCATGTGTGCACGTGTGTAAGTGT:1 + chr2R 7986625 3' - I-element 245 1 74.26 TGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTTGGGACTGCGAGATGCAAGGTGTATTTTGCCATTACCATTTGACAAC:1 + chr3L 19522978 3' - Quasimodo 7187 2 53.47 GACTTATGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGCCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCC:1 + chr2L 9319113 3' - jockey 32 1 50.00 GTGAGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTTGCGAATTGTTTACAGCAGTAGGGCACCAATGGAGAGCACTGAGAA:1 - chrX 20887782 3' - diver2 4866 2 78.22 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACACATATGTCAATGTTTTCATTTTCGATTCCATTTAATTATCCATTGGATAGAATGCACAAATATTACCAT:2 - chr2L 6322506 3' + roo 404 1 74.26 AAATATATTCGTGGTCATGTGTGAACACACTTGTAACTTTTATTATTGTTTAATTTCACATAGTTACGATCTCTTAACTTTACAA:1 - chr2L 3475257 3' - roo 6 2 69.41 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCATTCTC:2 - chr3L 16807723 3' + P-element 2849 1 42.57 CAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGC:1 - chr3L 25497422 3' + gypsy8 4776 4 76.24 AAAAAAAAATAATTTAAACAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGCGATTTTATAGCTAGTTTAT:1 - chr2R 19253876 3' + jockey 4930 1 75.25 GTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGAGAGAAATGCCAGGAAACGAAATGAAAATGTTCAATTCACCTAAGCCTCAACGCATTTGGTTTATTTATA:1 - chr2R 21415752 3' + hobo 2668 1 39.60 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGCGGTGGCCGAGAAAGAGAAGAAGAAGTGATTTGA:1 - chr2R 7735560 3' - 412 71 2 58.42 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAAAGCGGGTCGCTATTCAACAGCTT:1 + chr2R 11404029 3' - mdg1 7047 2 68.32 CCTTGACTGGAAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCATGAGAGGGCAAGCTAACAGCGCTGTTAGCGCTAACAGTGGGGCTGTTGGGCGT:1 - chr3R 21199070 3' + Rt1b 4987 1 63.37 AAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAAGTGTGTGGCAAAAAAAGAAC:1 + chr2R 20564606 3' + TAHRE 10309 1 80.20 TTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTGAAAGTTAATTGAAAACGACACTTTCGCTGCCAGCGGCAGG:1 - chr2L 6583472 3' + flea 491 1 66.34 GGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGAAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGCGATTCTCTTCTAGGAATG:1 - chrX 18121824 3' - opus 7140 4 54.46 AAGATACCACCTACGGTCCNTAGGTGGCATGCACTATTCATAAGCCCTATTGGAATTATACCTACATACCTATGCATGCGGTCCATTTAGAACAAGTTCG:1 + chr2R 4265493 3' - Rt1b 5096 1 68.00 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAG:1 + chr2L 16127755 3' + roo 361 2 73.27 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGCCATTTGATTCGCTCTTCTTCGGTTGAAATCTGCAAAAG:1 + chr3L 10683509 3' - opus 7150 4 61.00 AAAACAAAAAAAAAACGGAAAAAGTTCCAGAAAAAGGAGAGCCATGGGGCGAAATACCCATGCAGATGGAGACAACTTGCTCCTGGT:1 - chr2L 7941620 3' + Doc2-element 246 2 88.51 GACATTAGTTCGATTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAATACAATATATATGTATAATACCAAAATAGCCAAGGTAATAAGGTACTCAATA:1 + chr2L 20836545 3' + 297 376 2 58.42 TAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATAATCAAATTTGGCA:1 - chr2L 12779570 3' + flea 256 1 71.29 AAACGCTCAAGCCCTTTCAAGACCAGAGAGCGAACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCAAGAACAGTCCCAAAATTATACCTTTTAAATCCAAATCACACTAA:1 + chr2R 1954037 3' + Doc4-element 95 1 75.00 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACA:1 - chr3L 25782394 3' - F-element 64 1 81.19 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAACTGGCTGTGCTGACAAACGATTTCAATTAGC:1 - chr3L 5973974 3' - hobo 5 1 70.11 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCAATATCAATTCGATGCGTAATTCGCCAGATATTCGTTTGAATTGTTATTGTTTTCTCATGGGTTAAGTGTC:1 - chr2L 8913284 3' + mdg1 7456 2 73.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGNCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATAGCACTTTGCAGAAGAAAGGTAAAACTTATGA:1 + chr3R 28475885 3' + roo 389 2 60.00 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGGTCCTAGCCATTGGGTTCATGGCCA:1 - chrX 11025479 3' + hopper 1407 2 71.29 GTGCTGAGACCCAGAGATCNGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAATGATTTGCAGTGAAGTTCACACCAAA:1 + chr2R 11445708 3' + R1A1-element 5088 1 73.27 GGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGCACAGCACGCATTTAGCACAACTTCA:1 - chr3R 12882647 3' + 412 7514 2 49.50 AGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAACTGCATGAACTTTTGTGCCTCGGCCAAGAGGAAGC:1 + chr2R 24741509 3' - gypsy12 43 2 65.35 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAAAAAGCTTTGCATAAACAAAACACTCAGAGCTTTCAG:1 - chr3R 19671692 3' - P-element 37 1 42.57 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTATT:1 + chr3R 4773406 3' - Tirant 8142 2 60.40 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATTTCAAACAGAAACTGAGATAAACCATTTTT:1 + chr2L 2309446 3' - Burdock 6177 2 69.31 ACGTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTT:1 - chr2R 11575011 3' + INE-1 143 1 55.45 TAACAGACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAAACGCCATTTCCCCAGCCGAAAGCGGCGAACTATAAAATAAAGTAAATTAGTCCGTCGGTTG:1 + chr3L 5319517 3' + gypsy10 291 2 61.39 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGGTTATTATATTATATTTTTAGCTGAATTTATG:1 - chr2R 19594596 3' + roo 9044 1 59.41 TCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGAGACATTTAATTGAAAATGGTAAGCATGTA:1 - chr2L 12601407 3' - opus 7412 2 71.29 AACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATAATAGCCAGGCTTTGGGGGCGTTATGGCATTCTCACGCTTCAT:1 + chr2R 5813649 3' + HMS-Beagle 7012 2 58.42 GTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTGTACTTAATAAAGCTCAACGAAAAAAGAAATCGGGCCAACAACCGCAGTTGGTTTCCCTAGTT:1 - chrX 18945951 3' + gypsy6 7554 2 55.45 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCAATATCAATTCGATGCGT:1 - chr2L 8913337 3' + mdg1 7403 2 79.21 GGGTGACTTGTTCGCGTATACGGGGTGTCTCGTTCCCAAACATTGGTGTTAAACTTTTCAACTTATCACTTTATTACAAGACGCTTATTGTTATCTATTTA:1 - chr2R 3583932 3' - 3S18 5786 2 59.41 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACATTCCCATTCCCGTTCCCATTTTGGGGAGCAAGGTCCCTCTGATCTGCGGATGAATCGGAAACGAG:1 - chr2R 6918505 3' - hobo 8 1 71.29 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGTCGTTTGGTTCCTCTCAGTTTGTATTTAGCGCCT:1 - chr2R 10874725 3' + P-element 2846 1 36.63 TTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATATAAAATCGCTAGAAATTATATTTGACCGTTTTTAGAAGAGAGCTAAAAAGTATGCAACACAATTGGTCAGCCGAA:1 + chr2R 19253941 3' - jockey 7 1 65.00 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGTCTCGTCCATTCT:1 - chr3L 11657849 3' + Tabor 449 2 62.37 GATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTAAAGGGCATCTTTGCCATATCCCTCAATGTGATCAGTGGCCACGAGTGGGTGGCGATT:1 + chr3L 8614956 3' - 1360 251 1 54.46 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACTATACATTATGTAATGAGTATTAAAACATTAACATTTATTTAAAATTA:1 + chr2R 14624241 3' + mdg1 394 2 52.48 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGCTAAATCTGCACAATTTCTTGGCTGGATTTCGTTATTGTTGCC:1 - chr3R 31962054 3' - Doc 39 1 57.43 GGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATGTTTACTCTTGTTTGGGATGCATC:1 + chr2L 11415235 3' - Juan 4027 1 76.24 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAAAACTGAATGACTGAAACGAAGTGTATCCAACC:1 + chr3R 14708789 3' + roo 9045 1 55.45 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCAACCACAAGGCAAATAAAGAGGGGCTTGGTCGTGGCACACAAAGCCAGGCCAAAACAAAAC:1 - chrX 8343621 3' - hobo 14 1 63.37 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTCTTTCATGGCTCCATAT:1 + chr2R 6041640 3' + opus 475 2 56.44 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAAAGCGGGTCGCTATTC:1 + chr2R 11404021 3' - mdg1 17 2 60.40 AAGTTTATTCGTATATTTAAAAGGGCAAGAAATTTAAAAAA:1 + chr3L 14344069 3' + HB 291 1 90.24 TACGGCAGCGCCCCTCCGTCGGTTGGGCGGGAGGGGTGGCCGTCTGACCCGTGCGAAAAAAGTTTTAATGCTTTTTTTTAAGTGCCAAGGAAGCTTATGTT:1 - chrX 17545631 3' + Cr1a 4408 1 78.22 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGATTGTGAGCGCGTTTCGTTATTAATTGCCGATCGATTCGATTCGTTCGATGGTTCACACG:1 - chr2L 20709368 3' - roo 15 2 65.35 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCCTAAAAGTAGGCAAC:1 + chr2L 13539251 3' - hobo 40 1 62.00 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGAGGAAATATTATAAAACACCAAATCCAGAGTCACATCTTTTGCTGC:1 - chr3R 27455536 3' - 297 23 2 61.00 TACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAGCGCAAGAAATGTGGCAGAAAATTTCGCTTGAATCAAATATAGATTGTGATTGACAGGAAAAGTCATT:1 - chr2L 15019798 3' + I-element 229 1 70.30 ATCGCAGCCCAAAGCCATCGGACAAGTTCGAGAAGAAATTAAGGTAAAGTTAGTTGTTGTGTTGTGTTTGAGAAAAAGATTTGTGCACTAAAATAGTTGTG:1 - chr3L 28007472 3' + jockey2 3135 1 69.31 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTAAGACAACTGCGCTACAAATCAATTGTGTCGACTGTCGGTAACCCCT:1 + chrX 19614985 3' + 1360 3364 1 55.45 GTCCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATC:1 + chr3L 25059135 3' + mdg1 380 2 64.36 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGTTATTCAATCAGTTGTAAGAATTGAGTTTCATGCGGAAATATTTAATTTGGATTTTAAA:1 + chr3L 7204121 3' - 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hobo 363 1 68.69 TATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCACTGTTTGTATACAATTGACTACAGTGAC:1 + chrX 2251521 3' - G2 3040 2 72.28 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACGCCACTTGACGGCGGCGGAAGTGGCGCCAGTTGCGGCC:1 + chr2R 6769510 3' - 412 7085 2 62.11 TTAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCAAATTCTAAAGAGCTGAGTTAGTCGCCAGCCAATACTTTTGCAAGTTAACATGCCCCCTCTCTCCGACCACAG:1 - chr2R 5061556 3' - accord2 7389 1 42.57 GGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAAT:2 + chr3R 934253 3' + Rt1b 4747 1 50.50 GATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATACCAAAGTATTATTAAATAGTTATAAAGTTATCATTGTAGAACTTTTGGTAGACGATATAATTGGTCT:2 - chr2R 19330253 3' - McClintock 5956 2 76.24 ATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATCGTTCCGTGTTCGGTTTCTTTGCTTACGCACATAAGCATTCAGTATAACCCGTCT:1 + chr2L 22218216 3' - F-element 4476 1 63.37 TGAAACTCGCAACGGTATTNGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCAAACACAAAAGTGTTGCCAGCAACATGCTGTG:1 + chr2L 7398804 3' + X-element 4369 1 68.32 GAAGATATTTCCAAATAAANTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGATTTATTTGCCTTGTGCCCTGGA:1 + chr3L 14690969 3' + roo 356 2 79.21 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCTTTCCCCGAACTATTTGCTCAGCGCCCATCGACAATAAAGGTAAAAAAAAGTA:1 + chrX 9463437 3' + hopper 1395 1 64.36 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTA:1 - 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chr2L 15577383 3' + 1360 419 1 65.35 AATTAACATATAAAAGATANAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTA:1 - chr3R 19950462 3' - BS 5026 1 57.43 ACTCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCGCAACTAAAAGAAGCAGCTCGTCCAGAGAACGCTTATGCAGTGGTTACAGTGCGCCAAAAGAAGAAACAGAA:1 - chr3L 2376911 3' - INE-1 553 1 72.28 ATGGCCGTTACGTATCTTGNTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGA:1 + chr2R 2529355 3' + 1360 3374 1 38.61 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGGGAAATGCAAACTTTGCCACCCACTTGATATGTTAAATCTGCGTAGA:1 + chr2L 20609972 3' - copia 4899 2 55.45 AATTGGAGTTCATCATTACACTTCATCGTTTTTTTTTGGCTTTTCCGCAGAGACGCAAATCATTTGTCAAAATACGAGAGTACGCAGCAAAGTTGCTGCCT:1 - chr3R 29465542 3' + 412 495 1 63.37 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCGTAATTAACTTAAGTAAACATATATGAATTATAATT:1 + chrX 3016701 3' + diver 184 2 63.37 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATGTTTATGTTGTGTTTAATTTGAGTTTGTAT:1 - chr2R 999483 3' - F-element 58 1 71.29 AAAAGATAGAACCAAACCTNTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATAC:1 - chr3R 21276536 3' - BS 5015 1 58.42 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCTCTC:1 + chrX 21400833 3' + P-element 2846 1 38.61 AAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAATTCCACAGGACATGCAATTGTTGTCGTCCCTCTCCCGCCTTCTACTTTCGTGCCACGCCCA:1 + chr3L 18504228 3' + G5A 2555 1 59.41 TGATGTGTGGATTGGGTGTGCATTTTTAAGTTTTGTTTATAATCGCCAACTGGAGAGCAGCAACAATGAAAGTCAAAGTGGAGCGCACAACGAAAAAGCCC:1 + chr3R 29773614 3' - Ivk 5058 1 74.26 ACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGCCTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCA:1 - chr3L 4235609 3' - jockey 4590 1 52.48 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACAGCCTCCGAAGAGCTAAAAGCCCAACATTTACAACAATTCGTTAGAGCACCTACTTCCATCAT:1 + chr2L 13433990 3' - hobo 12 1 67.33 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAGCTGGAAAGGCTTCCACAGTATTACGAGCTAATCGGGGACTTGTAATGCCAGGCCCA:1 + chr3L 15444911 3' - mdg1 18 2 55.45 GTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCCAGCTGCTCCACCGAAGTTTGGAACCACTCCAGTTGCCACCGTCTTCGATCCAGAC:1 + chr2L 9066234 3' + micropia 114 1 61.05 TATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGGAAGGTGACGCAAATTTTCCACAGT:1 - chr2R 5037282 3' + Doc 133 1 75.25 AATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATGTCCAATATTACTTATCTGTAAAAATAAATATAAGCCCACTCGATTATTGGGAATGCTTTGCCAAA:1 + chr3R 3580016 3' + Tc3 1712 1 38.61 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACTT:1 - chr3R 15924589 3' + Quasimodo 7343 2 56.44 TGAGATCTCGACGTTCAGACGCACACTTTTGAACAATTTTTTAATTTTTATTCATTTTATTTAAGCAGACATCTTTGCCTTAGTACAATTTCTACTTATGT:1 - chr3L 23216167 3' - INE-1 135 1 79.21 GTCAAATGTACAATGCAGGAGCTCTTCCCGCTCTCTCGCTCAGCGAACAAAAATTCGAAACAAGCGAACACACGCCGAAAGAAAAGTGTGCAAATAAAA:1 - chr3L 2858481 3' - 1360 194 1 56.57 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTGTGGTTGCTAGAAAACAAAACGTCGAAA:1 - chr2L 17865640 3' + hobo 2890 1 72.28 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAATACATTAACAACGTGTGGAT:1 + chr3L 11523345 3' + jockey 4979 1 65.08 ACTATGATGCCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAATCAGTATGTATTGCCATTCTGTGGCACTTGCGGTGAACTGTCTTGCACAGTTGAGTTTTTCATTGT:1 + chr2L 11651921 3' + diver 208 1 58.42 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGACAGCGGCAGTGGCA:1 - chr2R 13194629 3' - roo 40 2 67.33 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTTTACGAATTTCACCCACAAAGAAAGTTAGTTAATTGTCACTCTGTGCC:1 - chr3R 18769571 3' - roo 27 2 53.47 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAG:1 - chrX 21400801 3' - P-element 56 1 24.00 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGGTACTTGGGAATACTTTAGTTTGAATATGAAATTTAAAATT:1 + chr2L 13558920 3' + roo 9036 1 64.36 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCA:2 + chr3R 17896912 3' - jockey 4811 1 72.28 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATTGATTTCAACATATTCATCAGGCAGTGC:1 + chr3R 15117657 3' - roo 47 2 76.24 AGTTAACTATTCCCCCCTCAAGTTGGAGGCCGCCCTCGGCCGACCTGATTCCGGCAATCGCCTCATTCAATTTACACTTGATTTATTTATGAGCTACACAC:1 + chr3R 16286524 3' - gypsy3 6562 2 72.28 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTATGCCACATTGCCCCCGCCTGTCTGCCGG:1 + chr2L 12602836 3' - 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chrX 22729101 3' + BS3 1754 1 88.12 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACATTGTTAAAATGTGAAAAAAATCCGACT:1 + chr2L 7804303 3' + 1360 3345 1 75.00 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACCCAACAATATTTTCGAAAACGCTAAAAATACTCAGTT:1 - chr2L 7804253 3' - 1360 36 1 66.34 TGTGTGAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACACACACACACG:1 - chr3R 9418241 3' - accord 7036 2 67.33 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAGCAAATGC:1 + chr3R 30252352 3' - 412 28 2 51.49 TCAACTTTAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAAACAATAGCCAGGACATCATCACAGTGAAGGTCTTGCCGCAGTCAATA:1 + chr3L 13379348 3' + Bica 4484 1 56.44 TAAAATACTTCGAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAA:1 - chr3L 17110731 3' + hopper 1363 1 72.16 GGGAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATGGATGAATGCAGGCGGAGAACTACCA:1 - chr3L 5394045 3' - Quasimodo 6906 2 72.28 AGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCTGTATTCCCGTTTTTTCGTTTTTGTTTGCTTGTAAAATAAAAATTACGTA:1 - chr3L 22500638 3' - Doc 4435 1 50.50 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAACACCGAAGTGGGGCACATTTGCA:1 + chr2L 1335374 3' - jockey 4684 1 66.34 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGTTTGTTGTCGCGCATTTAGGAATTATGTC:1 - chr2L 4998418 3' + S-element 1673 1 73.27 TTTAAGTGTATACTTCGGTNAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACATTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTAAAC:1 + chrX 6338931 3' - P-element 42 1 34.74 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACCCC:1 - chr3R 30611224 3' + blood 359 2 62.38 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCACGACGACGATGAGTTGGGATTTCGGCGGAACGACATCATAACAATCATCAGTCAA:1 + chr3R 15221223 3' + hobo 2899 1 58.42 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAACACACTCGTGAGTGTGTGTGTGGGTGGAAG:1 - chrX 5418728 3' - Tirant 10 2 65.35 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCCTAAAAGTAGGCAACAGTTTTTTCC:1 + chr2R 18988487 3' - hobo 31 1 52.48 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCATT:1 - chr3L 16807726 3' + P-element 2846 1 39.60 TGGGTTTGCTAAGAAGGTTTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTTGTTAATTGCTGCCGTATATATGTACATTGTAAAGTTTTTCTAC:1 + chr2R 22136223 3' - I-element 5109 1 56.44 GTTTAGGAGGTATTCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCTGGCACTTTATATTCTTCACTCCCATTGTTGTTGCTTACTT:1 - chrX 7802851 3' - hopper 31 1 58.42 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGA:1 - chr2R 6769467 3' + 412 441 2 73.27 AATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGCACCATCGCAATTCCAGC:1 - chr3L 22489174 3' - P-element 2806 1 24.75 TTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGAATAGTATTAAGTGTTAATTGGAATACTGC:1 + chrX 21214490 3' - X-element 58 1 72.28 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGCACAGCACGCATTTAGCA:1 - chr3R 12882655 3' + 412 7506 2 57.43 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGATGAACGATTCAATCGAAAA:1 - chr3R 9870329 3' - F-element 24 1 64.36 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAACAGGAGTATTTAGATAATGCAAATTTGATGTTTCATCAT:1 - chr3R 18342464 3' - F-element 50 1 63.37 ACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATGATTCATGTCTAAAGATTTGAATTTGTTTTCTGGGCTGGAA:1 + chr2L 18353791 3' - hopper 1000 2 63.37 ACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTT:1 - chr4 123974 3' - HB 101 1 49.50 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTAAACACGCTTTCGTCCTGGGCTAGCCAACCACCTCCCAC:1 + chrX 12378749 3' - hobo 32 1 59.38 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAGACCGAGTGTCA:1 + chr3R 16613199 3' + 412 461 2 58.59 GAAACTCTCAAAAATTTCCACATCTCCGGGCCGGACTAAGGTGGCGGTGCTTGTTATTCGACCATTTCCACACAGGCACGACAGCGATTTAAAAATTGCTT:1 + chr3L 13574006 3' + baggins 184 1 65.35 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACACGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTGTAGATG:1 - chrX 7534627 3' + Tirant 8482 2 55.45 GTATGGCCGTTACGCATCTNGTTATTCTAGTGTCTTTGGATCGGCGGTTGAGTTAATGTTATGATTATTGGCAGTGGCGAATATTTATTTGCAAACGACG:1 - chrX 5997229 3' + 1360 3372 1 62.00 AACACTTCGGACTCGCGCGCTGCACTACAACAGTGAACAGCAACACAAAAACAAAACAACGCTGCACATAGTATATGAAATGCACAGGCGCACCGAAGACG:1 - chr2L 18749518 3' + gypsy10 455 1 67.33 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTTGGACTATCGCGTGGTAAGTAGCCGAAAGAGAAAGCTCTCTTATACGGAAGATGAAGAG:1 + chr3R 19671767 3' + P-element 2873 1 63.92 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAGAGATATGTACGTGGTTGGAGAGTGGAGACAGGGGAATG:1 - chr3L 749267 3' - P-element 16 1 60.00 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGACCAAAGAGCGTAACCGAAAGCTGGCTAAAGAGCCGCAACAA:1 + chr3R 7411873 3' + 1360 3356 1 59.41 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTCCTTTGGCTTTTTCACTTTACCACACATTTTTATTTTGACTTCCAGTTTCTGTCTTCTGTTTGCTGCTCCA:1 + chr2R 13358865 3' - roo 5 2 74.00 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGCATCTGTGTGCAGCTTGGTCTCTTTTCGTGGGTTTTGTTATTATTGTTGGCAGCCTTTTAGG:1 - chr2R 12096541 3' + hobo 2933 1 72.73 AGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCA:1 - chr3R 17615943 3' - HMS-Beagle 39 2 64.36 TACAGTGTACCCTCGATATNTGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTGGGGATGTCCATCCAGGTCGATTGCACTTC:1 - chr3L 24150502 3' - blood 12 2 65.35 AACTATGGGGCAATGCATGNAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATT:1 - chr2R 5284561 3' + Doc4-element 2615 1 50.50 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTTATTGTGAATGCAAAAGATAAGCCCAA:1 - chr2R 18105726 3' + roo 400 1 68.32 GAGAGCAGGAGCGGGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCATTTGATGTCACGCTTCGAGAG:1 - chr2L 18307388 3' - F-element 363 1 78.22 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATAAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATGACAAAACAAAGGCGAAACTTACTGAAAATAAGCGCAACCAAG:1 - chr3L 13367687 3' + mdg3 215 2 51.49 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGACATAATAAAAAATAAAAAGTTTAGCCTCAATCTTGACAGCTCCTGCTCGAGTTGGTTCTTGT:1 - chr3R 13544056 3' - roo 8676 2 67.33 GCTGCATAGTGCCAAACCNATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAAGCTTATTTCCAAGTTTTG:1 + chr3R 10434598 3' + 1360 3351 1 74.70 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATCAATAGGTTTTTATCTATCTT:1 - chrX 16237921 3' + mdg3 5446 2 73.27 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGAATATTATGTTCTATTTAATTTCCACTTACCCGACCGATTATTGTTCAGTCTTTCACCATTGCTG:1 + chrX 11993805 3' + 297 388 2 70.30 CATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTATTTTGGAAAATACATTATATTTGTCACAGTGATCTCAG:1 - chr2L 13735442 3' - Doc 4509 1 63.37 AGTGAGGAAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGAGCCAGAGTCGTCTTCATCTTGCCGGCTTTACCAGCCCCAAAGCCCCCCTCCTGC:1 - chr3R 28387853 3' - Doc2-element 454 1 49.50 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTATTTCGCTGTTGTTTCTATGC:1 - chr2L 3908487 3' - jockey 63 1 79.21 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAAC:1 + chrX 11025578 3' + hopper 1392 1 55.10 TTATTACTTTATTTTTCAAAAATATTTTATATAGCGGGTTAACTATTTCCGCAAGCATAAAAAGTTAAATTGCGCATCAGTTCTTGCTGTGCCGTCTGCTG:1 - chr3R 31944305 3' + mdg1 7009 1 55.45 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCTACGCCCTAAAATGACGCC:1 - chr3R 21923992 3' + transib2 2810 1 63.00 GCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCAACTCTTCCGTTCTCTGCGAGAAATCCTAACCACCAAAATGAAAGCTCTGTTGGCCGAGCCAGAA:1 - chr3L 4752937 3' + Porto1 454 1 52.48 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCCCAGGCTTAGTGACGAAAGAAAAAG:2 + chr2L 13732827 3' - Doc 22 1 59.41 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATT:1 + chr3R 7688922 3' - Tirant 8155 2 75.25 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAACTAGCAGAAGGCAAGTAGCTTTCCAACAACCACAACAACAACCACACGTC:1 + chr3R 16142776 3' + 1360 3378 1 77.53 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTA:1 - chrX 21056910 3' - Tirant 16 2 65.35 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATTGGTCTGCGAAGCAGGGAACATGATGATGAGCGCCCATGAACGATGTCAC:1 - chr2L 13792146 3' + blood 7386 2 77.23 GTGATAAGGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAGCTGGCTAAGGGTCTGGGGAAACTACCGACACGCTACCGAAAACAGCAACTGCAATTAGTGCAGCCTGCC:1 + chr2R 20399421 3' + frogger 49 1 78.22 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCAACATGTTTACTTAGTAGCTGTGTCAGCA:2 - chr3R 28475791 3' - roo 8682 2 61.39 TTAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGTTG:1 - chr2L 19207873 3' + 412 469 2 54.44 AGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATACTTTCCAAACACTAATATTTATTTAAACAAAACATAAGAACGATAGCAGTGCA:1 + chr2L 21052810 3' + invader1 382 2 58.42 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAACTCAAAAATAAACAAAGGATTTATATAATTTAAAAGCTTAGACACA:1 + chr2L 15818037 3' + I-element 5324 1 62.38 TGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTCCGATATGTGGTTCTGTATGTGAATATGTCACTATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTC:1 + chr2R 20670578 3' - 17.6 41 2 74.26 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCC:1 + chr2L 13732803 3' - Doc 46 1 65.35 TGAGACTGTCAAGACACTCTTTTCACAAAACAATATATCTACATGTTTTATAGCCCACCATTGTAACCGTCTTTATTAATATCGCCTATTCGTGATAAAG:1 - chr2R 15260372 3' - S-element 1508 1 71.00 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTAAGTGATTACATA:1 + chr2L 15907219 3' - pogo 33 1 62.38 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACA:1 - chr3R 6437520 3' + 412 7494 2 74.26 AAATAAACAATATATCAATAACGCACTTATCTTTAAAATCAAATTATCTCATACAACACATAACTCCACATACACAAATACGAAAGGAAAAGCTATACATA:1 + chrX 7736696 3' + hopper 1109 1 57.43 GGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATTACAACACTGACTACGCTTCCCACGTGAAGTCGGATAAACGAAATAAAGCACAC:1 + chr2R 6988872 3' + accord 223 2 57.43 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATGCGTGTTCTCTATAAAATTACACACACAAATAAAATTTGTATTGAATAGTTGTTGTAATTAGTATTTGA:1 - chr3L 25120138 3' - pogo 2 1 75.25 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATCTTACTAAGTCGGTTTATAAATAAATATAAAGAAATGAGAAAAATATATACACATTGTGAAAT:1 - chr2R 16979714 3' - 297 6590 2 72.28 AAAAAAATTACATTAAAACCATTTAGTCTTCAACAACTCTATTTTTACATTCGACAGTGCTTTGACTAAATTGGCTTAACTAAACTAAGCTTAAGCTGTCT:2 - chr3L 17206717 3' - transib4 26 1 64.36 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCATCCTTGTTTTGTGGGCTTATGTCTGGGACGTGCCTTCTTGGCCAATTGGAAATTTTATACCCATAGATTGGCAATTT:1 + chr2L 16553295 3' - accord 183 2 60.40 GCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGCTGAGCTGTTAAACGAAACCCATGGCAG:1 - chr2L 5673348 3' - Doc 381 1 72.28 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAGCTAGAAAGGCTTCCACAGTATTACGAGCTAATCGGGGACTTGTAATGCCA:1 + chr3L 15444905 3' - mdg1 24 2 51.49 GAGTTACAAAGAAATATATTGAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGTCTACTAGTGTGTGCACTTTTGTCTGTTTTCGCATGTTGCGTATTATTTTTTA:1 + chr3R 22909673 3' + Tc1-2 1587 1 58.42 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGTAATTCGTGAAACAGCTTGTCAGTT:1 + chr2L 20550823 3' - jockey 4720 1 75.25 TGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTTCCAATTTAATATGTAAGATAAC:2 + chr3R 9858912 3' - BS 20 1 53.47 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGG:1 - chrX 11025506 3' - hopper 35 1 55.45 ACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTATCAAATGGCCAGCGCTGCGCCGCCGGCCGTCGGCTAAGTGACAAGCAAAACCGCGAATTGACCAGAGAAAG:1 - chrX 20609370 3' - 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G4 3728 1 68.32 ACTATCTTCTTCCACGAGCGATCAGACTGACTGATCCCTACTCTCCGCTCAAGATTACAAATCTTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATGG:1 + chr2R 5284562 3' - gypsy8 395 1 50.50 GCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACTCCGCCAAGCCGGCCGGCTATTTATTCCACCGAAAAAGCAAAGCAAAGTCGTAT:1 - chr2R 7587388 3' - invader4 428 1 59.41 AGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATCACCATTCAAGCGTAAATCTTATTTAATTTAACATCCGGAACTAAATTTGTAAC:1 + chr4 629451 3' + diver 302 1 57.43 AGACATTATTCTGAGTGTTCACGACTTCTGTCACGCATAAACGGGCTGCATTTGAGTTGGCTTGGAGCAGATGTTTCCTACCCTCACCGAGAAATATCTTA:1 + chr3L 110033 3' + frogger 308 1 72.28 TATGTATTTATATATATTATTATTATTATTTCCAATTATTTACATATTTATGCATGTTCAAATATATGAAGGTTGGTATTATTACGTTGAAAGTGGGAATT:1 + chr3L 17773313 3' + 1731 4414 1 56.44 GGTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATGCTTTTACTTTTTTTTACTATTAAAACAAATATTTTTTTTTAA:1 - chrX 7082217 3' + Gypsy12A_LTR 1965 1 53.47 TAAATACTTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGCAAT:1 + chr2R 6164613 3' - Tc1-2 1 1 43.56 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTAAGCGTATATGTATGCAGATAGTACCACGAGCTGTGTGACAGAGAATGTTTTGAAAATTGTC:1 + chrX 4240776 3' - 297 6 2 74.26 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGCTTCTTATTGGTGTATTCAATTAATATGTTTCCC:1 - chr2R 4030064 3' - Doc 48 1 66.34 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTATATGTTTGTGTAGGCTCACGTATGCCCCTGAATGTGTGTGTT:1 - chr2L 15848222 3' - hopper 29 1 53.47 AGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACGGTGACATCGTCGCAAGACCAGCGGCCGAATAGCTTGATCTCCGGCAGCTCAGTGGTGGA:1 + chrX 17147079 3' - Quasimodo 7330 2 62.38 TGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGACAACAATTCTCCCTCCCACTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTACTGGGGGTCCCTCACATTCTCGG:1 + chr3R 30451170 3' + hobo 2633 1 66.00 ACAAAGAGCCCTTAATTTTGTAATTAAATACCATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATTTTCTGCACCATTCAGCATCGATTGT:1 + chr2L 21396596 3' - S2 58 1 77.23 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGAACCGAGCGATCGTAAAACTCTTCGGCCCCAGGCCCAC:1 - chr3L 5355350 3' - P-element 37 1 42.57 GACTTTATGCCAAAAAAAANGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGATGCAACTGCAGCCATCGGGATTTCCTATGGTGCATTATTCGCTGCAGTTGAGGTTG:1 + chr3R 21924093 3' - transib2 17 1 58.42 AATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAAACTCTAATGACAAATATCACAAAATAAATTTCACAATGAACAAGGACAACTCCAGCATGA:1 - chr3R 18252675 3' - 1360 424 1 48.24 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGAGATATCGATC:1 - chr3R 18171774 3' + 1360 3354 1 63.37 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCAGCACAATATTCCCCCATTCTCTGCGGCTTATTGTCAGTGTGGGGTGAGGGGAGAGGGGGGG:1 - chr2R 20973003 3' - hobo 9 1 68.42 GTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTTGAGGAGTTTTCTATGGGGTTGTCTAAGGGGTATTTCAGGAGGTTTCTC:1 + chr3L 9986778 3' - I-element 4940 1 51.49 AAAATAGATCACTTTTGCANACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCGCCAGCGAGTACTCGAAAGTTAATTAAGCCCTTTGAAG:1 + chr3R 24732952 3' - BS 35 1 59.41 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACACCCACAATCGTCTAATGACGCTGAATAAACTAAGCCCGAACAATTTAACAAGCCCAAAATCGAGCATC:1 - chrX 5194482 3' + hobo 2932 1 72.28 ATTTTTTTTTGTTTTAAATTTTAAAATGTCCTTAGGCTAAGTTTTATAGGTTTTTTTTTAGCTGTTTTAAGGATGTATTCAAGGTATGTACGTATTTGGA:1 - chrX 5797578 3' - TART-C 11096 1 75.00 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTCAAGCATTTAACGGGGCAATAATTTTTTTCTGATTAGCAGCAAATTGAAAATATTATCATC:1 - chr2L 5379 3' - HMS-Beagle 13 2 42.57 GCACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCTGGAAATAAA:1 + chr2L 22216558 3' - diver2 83 2 55.45 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCAACATGTTTACTTAGTAG:1 - chr3R 28475802 3' - roo 29 2 62.38 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAA:1 - chr3R 19589933 3' - BS 5031 1 58.42 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGAGATATCGATCTGAACAGCTGGCAGTACATG:1 - chr3R 18171754 3' + 1360 3374 1 64.36 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTGTAGATG:1 - chrX 7534627 3' + Tirant 375 2 55.45 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTGGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATGTACTTG:1 + chr3L 7494098 3' - roo 8696 2 56.44 AGACTAATAAAATTATGAAAAAATATCGAAAAATGGTGACTGGAGATGCCCAGGAAACGGCCTTGGCCATTGGTAAGTAATTAAGATCTTTCGTTAGATAG:1 + chr3L 22778832 3' - 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opus 7154 4 64.36 TAATAATTTTGTTATTACAAATTGAGTTCCAGTCATACGTTGTCGAAGTGGAACCTATTGAGTTTTTCTCCTCAAGCGTCAGGCGAATTAAAACGGAAATA:1 - chr3R 10360613 3' + P-element 2508 1 54.46 AATAAAAAGTAAAAAAAAATAATTTGATTAATCGCACTCAATTGCCTTTAATTGAATAAGCTGATTTTCAATTCTATTTATCTTGTCCTAAATTCACGTTG:1 - chr2L 3690620 3' + Doc 4694 1 80.20 GCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCGTGTTAGTGTGCCTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGGGGGCTTTGCGGGCATTTTATGTAATGTCGTCTGTAATTTGG:1 + chr3R 11278468 3' - hobo 2708 1 49.50 ATTTTTTATTTTTTTAACTTTGTCATCTGAATTTCTAGCCCCCTCCATTTTAAGTTGGCACGCCTCTCGTTTACAAATATTTTGGTATCTCAGCTTACTTT:1 + chr3L 10548908 3' - TAHRE 10440 1 68.32 TGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAG:1 + chr2R 6164609 3' - Tc1-2 5 1 43.56 ACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCGTGCGGCATTGTTGGCCGTTGGATCGCGTGAGGCAGTCGCTGCCTCCTACGAAGATACTGCC:1 - chr3R 24204285 3' + jockey 4672 1 63.37 GGCTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTGACATGTATTACCATCCCTCTTATCCTTAGATATTTTTGTAGTAGCTTCAACTTTAGAAAAC:1 - chr2R 13841233 3' - flea 132 2 70.30 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATATTTTGGGGAACTGCACAATGATAATATGTG:1 - chr3R 19807363 3' - opus 153 4 72.28 GTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATCATGGC:1 - chr2R 3919663 3' - 1360 31 1 54.46 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGACAGGTCAATTGCAACTAACCGTACTGGAAACTTCAATCGCAGCAAGGCGA:1 - chr3R 23683352 3' - 297 4 2 72.28 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGT:1 + chrX 16237961 3' - mdg3 5293 2 59.41 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTTATATGCCGCCCTTG:1 + chr3R 17896931 3' - jockey 4792 1 53.47 AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCTACGCTCTAAAATGACGCCTGTCCCTGTTTCG:1 - chr3R 21923979 3' + transib2 2822 1 77.23 GCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATAAGACGTCTTTGTGACGTCTTTGTATTCGTGACTTGG:1 - chr3R 12352072 3' + jockey 4709 1 63.00 GTATGAACGTTGAGATCTCAGTAACTATACAAGCTAGAAGTTTACATTAAGAATACGATTATTGGTTTACCCCAAACTCTCACTCCTACAATTGAAAGTTA:1 + chr2R 5436783 3' + INE-1 137 1 65.35 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTT:1 + chr2R 10857742 3' + BS 5050 1 67.33 GTAGGTTGAATAGGATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTTGCTGTGTAAGCCGTATTTAATTAATTTGATTTCATTTCTAATCACT:1 + chr3R 20872802 3' - copia 4 2 70.71 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGCCCATCCCCTTTCTGCCCCTCACCGACTGG:1 + chrX 21374220 3' + P-element 2843 1 36.63 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACGACTTGAGTTTAATTCAGTCGCTA:1 + chr2L 7461151 3' + roo 398 1 68.32 TAATTAGATCCTACTAACATTAATATTTATTTGAGGTTTTTTACATTATATTCATTTCCTCGATTCTGTTCTCCGAGTTCTTCTTTGTTCAAATGGTATGT:1 + chr2R 4947398 3' + Cr1a 4288 1 72.28 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATAATCTTTCGCGTTAATTTTTGGTGTT:1 - chr2L 21372930 3' - roo 8686 2 57.43 AAGACAATAAGTAAATTTTNTAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTT:1 + chr3L 15099645 3' - G4 3806 1 44.55 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAACAGGCACCGCAGCAGGAACGG:1 + chr3L 12238882 3' + jockey 4944 1 79.21 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGCATCTGTGTGCAGCTTGGTCTCTTTTCGTGGGTTTTGT:1 - chr2R 12096565 3' + hobo 2909 1 57.58 TTAAAAAAAAATTCACAGTAAAGTTTTATTTTCTAGAACTAGTGATATAAATATATATAAAGAACGCAATTAGCATAAATTCAAACGATTACTTACAGACA:1 - chrX 19279985 3' + HB 1555 1 80.20 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACTGAACGAAGCTCGTATAAGAACTTTGGCTAGTCAGT:1 - chr2L 15526987 3' + pogo 2064 1 65.35 GATCAATAAAAATACTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGC:1 - chr3L 24253602 3' + Quasimodo 7336 2 57.43 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAAGATTGACTCATGCGCAAAACAAATTTATGGCGCAATTGTGAACGGAAAA:1 + chr2R 20461033 3' - hobo 26 1 53.47 TTTAAACGGCCCTAATAATNTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGATAATATCGCCATCAATCAGGACCCCGAAAACAGATCCGATAT:1 + chr3R 18343060 3' - F-element 4551 1 57.43 ACACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTCATAATTTTATTAGTCGTGTAAATTTCTATCAGTTTTCAGCTGGCACAGCTCCCCAGATTGCCACGCACCC:1 - chrX 6215101 3' + INE-1 260 1 66.34 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGGATACATTATTGTGCCAAAGAAAATACAGATGCCAAGTGAACTCACTTTAATTTACATTTAATCAAGCTGCAAAAG:1 + chr2R 15595310 3' - hobo 2710 1 77.23 GTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGAAAAAATTCGTACTTTGGAGTACGAAATGCGTCGTTTAAAGCTCGCAATATTCTTTAA:1 + chr3R 14160185 3' + P-element 496 1 25.74 GGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAA:1 + chr2R 12185413 3' - accord 21 2 54.46 ACAAGTGAGCATATGGTGCNTGTGTCAAAATAAAAGACTAGACGAGAAGCTGTCGTAAATTCCGTTGCCCATCTGCAAGCAGATCTTGTAGAACATGTCAG:1 - chr3R 21567235 3' - R1A1-element 5249 1 39.60 AAAAAAAAAAAGTAAAAAAAATATTTCCCAAATTCTCCACTGCACTGCAGGCTGTATGCTAAGCAGAGCGACCATGTCACTTTGGGGGCCAAAAATG:1 - chr2R 18005066 3' - hopper 143 8 77.32 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTGGAGGGCGGACGGTGGACGGTGAAGCGGCCTGAAAA:1 + chr2L 19207931 3' - 412 7089 2 60.82 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAAT:1 + chrX 8972993 3' + flea 211 2 74.74 GAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGCTTCCGCTATGACAGCACGTTACG:1 + chr3L 17467550 3' + roo 9020 2 75.25 AAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGAAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCTGTAATCACGCCAACTATATGTATATGAAGCTA:1 - chr3L 17768166 3' + Bica 449 1 67.33 GTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAGTGAAACCCTT:1 - chr3R 25514102 3' - hopper 22 1 57.43 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAAATGTTGTAAATGTGGCGGAGGTAAGCCTCCTCCGCTGTGTCGTTCAG:1 - chrX 21499247 3' - Quasimodo 27 2 59.41 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACCCCCAGCAGCTGTTTGGGCTGCACGTGAGCGAAAAAAAGAAACCCGATCGAAAATTAA:1 - chrX 21374150 3' - P-element 16 1 66.34 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATTGGGCCAAGTTGGGGGCGTAAAGTACTTGTATAAG:1 + chrX 15412736 3' + hobo 2914 1 58.62 AGTCTACTGCAAAGTTTTGGCGGTCTACATCTGTGTTTTCATAACCAGCTTATTTGTCTAGTTGCTCACGTTGCGCCAGCAAATATC:1 + chr2L 3237078 3' - diver2 4549 2 78.16 AATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTTCATATTTACTAACTTATGCAGAAAGTGCCAGCCGCTGTCG:1 + chrX 7807318 3' - P-element 203 1 49.50 AAATATAAATTATAAATTACAACAATTATTTTTATATTTTATTTCTGACCACTATTCTATTGCTTTTATTAGTTGAGGGGATGTATCAGAACAGAACTTCT:1 + chr3R 21608859 3' + copia 253 1 72.28 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAACTGGCTGTGCTGACAAACGATTTCAATTAGCC:1 - chr3L 5973973 3' - hobo 18 1 61.39 TAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTG:1 - chr2L 16456785 3' + BS 5043 1 71.29 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAGTTTCGGAATGCAATTTTCAAATGTGCTAAAAGTGTTAATTAATTGTTTGT:1 - chr3L 9763176 3' - jockey 4701 1 49.50 ACCACAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAAAAAGCCAGCACGAATATGCAAAAATAAAAAGTTGATTTTGTTGTTTTATAGTTTCGCATATG:1 + chrX 6923077 3' + I-element 5182 1 60.40 GGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCTAACGCATGCTGGTGAATGGCAGCCGCTGTATCTTGGTTGTAGTATGAAGGTTGCCCCAGGTAATAC:1 - chr2R 11210443 3' - roo 324 2 72.28 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAGGTGTGTTCAGAAACAAAGCAAGAAATTGAA:1 - chr2L 19092434 3' - 1360 43 1 72.28 TTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTAGTAATTCAAATCCTTTTAGCTTATCTACAAAAATTGGCATAATAATAATAAT:1 - chr3L 13357407 3' + 1360 99 1 47.52 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATTGGTCTGCGAAG:1 - chr2L 13792184 3' + blood 7348 2 65.35 TATATTTAATTTTGTTAAANAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTGCAAAATTATGCATATTTTGTAGTGCG:1 + chrX 3431969 3' + Ivk 5371 1 65.35 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAAAATGAGTTCGGACAAAGATCGCTTTAAGCTTA:2 + chr3R 4536234 3' + Ivk 5334 1 68.32 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTGGGGATGTCCATCCAGGTCGATTGCACTTCTAAA:1 - chr3L 24150498 3' - blood 7019 2 69.31 GAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGC:2 + chr3L 19350004 3' - 1360 3221 1 46.53 GAAAATAAACTAAAATAAAATAAATCTAAGCACACAGACACACATGTTGGGCGGAAAATAACTGAGAACATTCCGTTAAAGATACAAATACCTCGAAAAAT:1 - chr3R 9222328 3' - transib1 1899 1 58.42 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTGATTATTTAAATGATTTTTTGCATTATTTGCCAAATCATTGTTAATTTCTTTGGGCTTAAAAAA:1 - chr2R 13432800 3' + 297 388 2 55.67 GATGTCTCTTGCCGACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGACAGAC:1 + chr2R 7025016 3' + P-element 2865 1 52.75 GACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGT:1 - chr2R 5284575 3' + Doc4-element 2601 1 65.35 ATTTATTATAAATTTTAATTTATTTTGCGTTCTACAGCTCACAAGAGGAAACTGGATTGCTTGGTAATAGCCGAGCTTGCTGGGATGCCAAGGCGAACTT:1 - chr3L 15656747 3' + INE-1 428 1 66.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGACCCACAAATGTGTTTAGCTTGTGGTGCCAGGGGATGTCTGC:1 + chrX 1563824 3' - roo 8699 2 61.39 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACACAGT:1 + chrX 7534729 3' - Tirant 8117 2 71.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATAATCCAATCGGCATATAAATCATTGAT:1 + chr3L 2339810 3' + roo 356 2 75.25 GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGG:1 + chr3R 9613492 3' + invader3 244 2 56.57 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCCGCTTTAAGTTGCGCATTTAATTCGAAAGCCATCGCGATGGC:1 + chr2L 9471299 3' - roo 2 2 78.79 AATACGAATCATTTATTCGACTCAAAAGATAAACAAACTGAGAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTGCCGTCTAAATTTGAAAGTTTTTTTATTTT:1 + chr2L 3886124 3' + Tom1 368 1 77.23 AAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTATTTAACAGGTGTGATTACTTGA:2 - chr3R 17415256 3' + roo 357 2 76.24 TCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGCACCTCTGCACCTATGCTCTGTGACCCTTT:1 - chr3R 5773133 3' - Stalker4 6965 4 71.29 TAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGCGTTAAGTTATGAAGTTATCACGATGGCACTTCTGCTCCAGCATTCCCCTAGTATGA:1 - chr2L 8879873 3' + I-element 5341 1 61.39 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTGACGCCACCTGGGCCAACCGAGTTATTGGAACTACCGCTG:1 - chr3R 22457329 3' - P-element 42 1 49.47 TACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATTTTCCGACAGAGAACGCGGAACAAACGCGCGCGGCGTG:1 + chr3L 8578528 3' + Stalker4 6988 4 62.38 TTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGAATTTGGAAGGGAACCAACTACCCAGTCATACGTTAACTTCGAATCTAGGCGAAAATTGCAGA:1 + chr2L 3936915 3' + Burdock 104 2 65.35 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCGTTGCTCAGCTTTTGGAATCCTTAACTCCATTTTGGGCCGCTAAAACGCTTATTTGCCTTAAAT:1 + chrX 693873 3' - FB 13 1 66.34 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCATAGCGCAGATACAGTGGGCCAACTAAGCGAAATTTCGATCGAAAAGTACAGTACGAAACTTTAA:1 - chr2L 18500280 3' - Tirant 8116 2 68.32 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGATGCCGAATAAGTCGGACAATTTTGGAGTCTGCGCAGGAAATACGCCGT:1 - chr3R 26170765 3' + P-element 2859 1 47.52 GAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAGAGTAATTAAAAATTCAGTCAACAAATCTCTCACCACTTTCACCGTCTTCCATTTCCCATTTTCCCGTTTTCC:1 - chr2L 12860649 3' + roo 493 1 72.00 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAACTGAATCAGGTCAAAGAAAACACGCGAAGGGTAATAAACATGATAAATACTCG:1 - chrX 6417570 3' - hobo 20 1 59.41 ATGGCGGGGAAACGTTTTTTATTTGAAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 8978901 3' - FB 491 1 65.79 ACAAAAGGCTCCACCCTCGNTCACGGACTTAACTCGCGCGACTTCAGTTTGAAAAACGGCTTTCATTTTGCAACAAGCGCTAAATTGGTTGGGCAAACAGC:1 - chr3R 4773318 3' + Tirant 8493 2 66.34 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTCAAATGAAATGGTTACCTATATTTAAGTGTGTGTTTGTTTGGTTCA:1 + chr3R 8434328 3' - roo 29 2 56.44 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATATCAACGATCTGATCCATCGGGTTCAGA:1 - chr3L 9542487 3' + roo 393 1 61.39 TTCGATATAGCTCTTTGTCGGACCTCATAAACAATTCTCAACGTAAACAGAATCGAAAAATAAACAAACTTTTTTCGGCTTTTTATTATTCGCA:1 + chr2R 6142329 3' + diver2 4787 2 82.98 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATT:1 + chr3R 30611305 3' - blood 34 2 58.42 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTGCCA:1 + chr3L 19271018 3' - 1360 50 1 74.26 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATATTTTGGGGAACTGCACAATGATAATATGTGTGTC:1 - chr3R 19807359 3' - opus 7039 4 68.32 AAAATGCGGTGTGCATTAGNATTGATGTGTTTGGACTGGAGTGAGTTGACACCGTGTAAAAAAAGCCACTGGCGAGGAAAAAACTAAGCCGAAACTACTGA:1 - chr3L 14531825 3' + invader1 3794 2 64.36 AGTCACTTGAGATCGTTCCNCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCATAATCAGTGTATCAAAGTTCTCAAGGAAGGCCATGCTGTTAATAGGAC:1 + chrX 10316713 3' + roo 8832 2 51.49 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCAGCTCAGTAGGTTTTTTTTGTTTTTCCGTGCGGGTGCTCATTTCGCGTAATATAAGTGT:1 + chr3R 29158162 3' - P-element 16 1 59.41 AGTTTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGGAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACC:1 - chr3L 9920611 3' + copia 4662 1 74.26 AATTTGTACTTGATTTTGTTTGTTTTTTTTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTCATTATGTTTCATTGTTTCTCATTAAATACATAATAATCAAAAATATAT:1 - chrX 8431859 3' + accord2 7242 1 62.38 AACCTCCACGCCAGAACCANTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACAAAACTGAGATTATACCAGATGTCTGACTTTTGGCCGGGTTGGGTAGCCGTGGCC:1 - chr2L 424949 3' + gypsy5 36 2 58.42 TATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCCGTCATTATGTGATAGGAATCTATCTCAAAATTATAAATTAAATATTCGGACGTTGTATGCACCATTATTA:1 - chr3R 19449176 3' + roo 8685 2 76.24 TTTTTTTTTAATTTTTTTATTTTGTGCGAAGGCGTTGCAAACACTCGCCATATGCGTGCAGCATGCGGCAGGCAGCCACTTAAACTTCACTTCTCTCAT:1 + chr3L 12099570 3' - F-element 4687 3 70.71 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTTTACGAATTTCACCCACAAAGAAAGTTAGT:1 - chr3R 18769589 3' - roo 45 2 71.29 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGATGCAACTGCAGCCATCGGGATTTCCTATG:1 + chr3R 21924066 3' + transib2 2780 1 67.33 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACTCAAAACTCTA:1 + chr2R 17402812 3' + invader4 321 2 75.25 AGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAACTCCAGTCCGAGTTGCATCTTCTGCGAGATAAATGCAATG:1 + chr3R 5675872 3' + INE-1 156 1 59.41 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATAGATGCAATTATTGTGTGCACCTGACATTGTCAGAAAGTC:1 + chr2L 4998480 3' - S-element 31 2 61.39 ATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACGACACACAGGACAAAGTAGGCAAGGCGTCGTAGGAGCAACGCCGCGCAGCAGACGGCGATCACCCG:1 - chr2R 3068340 3' - Stalker4 11 4 63.64 TGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGAACCTACCAAGGAGTTAACTGGCGCAGACGGTAGTTCCAGGTCTAAGGACGAGTCAAGAGGATTC:1 - chr2R 3463827 3' + GATE 33 2 64.36 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCG:1 - chr3R 9870363 3' - F-element 58 1 69.31 GCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAATCG:1 + chr3L 24402220 3' + INE-1 534 1 60.40 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGACATAATAAAAAATAAAAAGTTTAGCCTCAATCTTGACAGCTCCTGCTCGAGTTGGTTCT:1 - chr3R 13544059 3' - roo 8679 2 64.36 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAG:1 - chr3L 9542521 3' + roo 9022 2 74.26 TAAATATAAATATACAAATACCCAAAAGACCGCCTCTTTATACATATATTGTCCGTCCCGATCAGAAAGTAGCCATCAGTAGTCGCCCACCTACTGAGGGC:1 - chrX 7559995 3' + Stalker 88 4 72.28 GAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGAC:1 - chr3L 26852652 3' - 1360 50 1 69.31 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATATATACAAATCGATTTTAATTGGTATATGATGAGCCACATTTCTGAGAACTACCT:1 + chr3L 2270597 3' + roo 9048 2 55.45 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGCGTCGCAGTCGACCGAGGCAGCGAC:1 - chrX 7294138 3' + hopper 1365 1 71.29 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCACCGCTTCAATAAAACTGCAAAGTGCCAATTACAAAAATAA:1 + chrX 20377156 3' + hopper 1379 1 58.00 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTAAACAACGCGAA:2 + chrX 6338939 3' - P-element 40 1 40.59 GTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTT:1 - chr3R 3269645 3' - Gypsy6A_LTR 103 1 67.02 TATTATCTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATA:1 + chr2L 20491469 3' + Cr1a 4225 1 51.49 ATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATGTTTACTCTTGTTTGGGATGCATCGACACTCGCGTAAACAAA:1 + chr2L 11415253 3' - Juan 4009 1 58.42 ACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATA:1 + chr2L 15622432 3' - micropia 7 2 71.29 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATGGTGAAAGAGT:1 - chr3R 4474151 3' - copia 4881 2 67.33 ATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCAT:1 + chr3R 14860219 3' - BS 5017 1 56.44 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGTCTGCCCGTAATTATCACGCTAATGAATCAAGTGTACTCGCTCGTAACTAATAGATATGAGAAAAGTCTGG:1 - chr3L 22590290 3' + roo 8617 1 74.26 AAGAAATGAAAAAAAAAAACAAAAACCGAAAACCGAAA:1 - chrX 15647292 3' + gypsy7 5009 1 73.68 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATGTACTTGAGCTCCCCGAGGTCACGAATGCT:1 + chr3L 7494121 3' - roo 9 2 70.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTNCTTATTTGGGATTTTACATACCCAAAAAGAGAAACCATAAAAAAGATTTCCATAACATCCAAAAGATTTTGATTCAAAATT:1 - chr2R 18042806 3' + roo 392 2 44.55 AGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTGTAATGAATATTAATCCAATACAGTCATTTATGAAATTTATTATATG:1 + chr2R 5426843 3' - 1360 449 1 81.19 ATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTCCAGACCACATCTGACTACCCGTGCCGACTGTCGTCCTTGAAATAAGA:1 + chr2R 20857852 3' - hobo 31 1 50.50 AAAAACTACCCTAATATGTATCATGTAAAATCGTTTCTTCGATCAGAATTGTATATCATGCCAGGAAATCATGAATCAACCACCACAGGCGACAATACATC:1 - chr3L 23796359 3' + 1360 3138 1 48.51 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTAAACAA:1 + chrX 6338933 3' - P-element 14 1 50.72 TTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTAATTACATATCAACATATCAATAATCAACATATGT:1 + chr3L 2989854 3' + flea 4977 2 67.33 ACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTCCACGCAGAGGAGTGGGATATCAAAGAGCTTCTAGCCTTCCGA:1 + chr3L 19487903 3' - Stalker4 40 4 61.39 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGGGTTGCTTAAAGCTAGTAGCCCACAATTTTAATATGCTT:1 + chr3L 5808239 3' + 297 6945 2 64.36 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGTTAACATAATAGCACTGTCACT:2 - chr3R 14521088 3' - I-element 54 1 78.22 AGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTGGTCTGGTGCAGTGCAGTGCTGATTAAGGGAATTT:1 - chr3L 8166732 3' + Transpac 4951 2 65.35 AATCAGTTTCTTACAAAAANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTTA:1 - chr2R 18105751 3' + roo 9038 1 58.42 GCTTCGGCTTACGACGGGANCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCGGATCCAGATGTTCGACCAA:1 + chr2R 15201568 3' - P-element 21 1 58.42 TATGTGTGTGTGTGTGTGTNTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAATTTTGCAGCCAAATAAACAAATACAAATA:1 - chr3L 19700227 3' - accord 182 4 66.34 GAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGTATGAAGTATCCAGATCCCCT:1 - chr2R 5541974 3' + invader3 222 2 77.00 AGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGAGGTCTAGAAGGTTGACGGCTGAAAGCGGTAGTGCCAAC:1 + chr2L 16085789 3' - G2 2923 1 75.00 TATGTGATTGCGTGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCATCGATATCCAGAATCACGCGATTC:1 + chr2R 16172288 3' + baggins 5246 1 76.24 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAAAACGTA:1 - chrX 2164275 3' + mdg1 404 2 50.50 GTGGAGGCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTCACACAATAAAAATATTGTATTGCTTATAAAAGACTAGATATAAGTCCAATTATG:1 + chr2L 18505119 3' - Tirant 378 2 62.38 ACCACCTTATGTTATTTCANCATGGGGTGGCCCATCCCCTTTCTGCCCCTCACCGACTGGTCCAACAATTTCTCTCAAGCTTTTTTGGACGAGCTTTCGCC:1 + chrX 21374261 3' - P-element 3 2 77.23 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGGTTTTATTTT:1 + chr3R 12115344 3' + 1360 3369 1 53.49 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAAAACTGAATGACT:1 + chr3R 14708769 3' + roo 361 2 73.27 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCA:1 - chr2L 20840239 3' + mdg1 7431 2 56.44 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATT:1 - chr3L 11657851 3' + Tabor 439 2 67.33 ATGGCGTTACGCATCTTGTNATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTACTGTTCAGGTTCCAAAGCT:1 - chr2R 5200915 3' - 1360 14 1 63.37 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCATTCTACTATATCACAAACACATGTCGTC:1 + chr3R 20284814 3' - pogo 18 1 62.38 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAACGCGTTACATCTTTTGGACCAAGGC:1 - chrX 22771524 3' - opus 7158 4 74.26 TATAAATTCGCTCAAATCCTTTTTCCCCATGTTTACTTCATTCACAGCCAAAATATAATATGGTGTACTCACTCCCCCACTGTACAACAACTTAGTGTACG:1 + chr2R 4707667 3' - Tc1-2 367 1 78.22 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTAGACAGTCACTCATCCAATGCAATATCATTACTATGTTTGCCTTTTGCTGC:1 - chr2L 15983359 3' + hobo 2920 1 57.89 ATTTATGCAATGCAACTAANTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCA:1 - chr3L 24150542 3' - blood 52 2 77.23 TTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATTAGCTGAGAATTTCCGCTTTCGATCGACTGAAG:1 - chr3L 7100787 3' - Idefix 7081 2 58.75 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCACGCACACCAAAGCAACGAGAGAGGCTGCAG:1 + chr3L 13557107 3' - hobo 10 1 56.25 ATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTAACCAATGATGGTCATGGCAGCGCGATAACACATGCGGCAACACTGCAGGAAACTATCGATTGGATTTGAA:1 - chr2L 21708308 3' + invader4 324 2 75.25 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATACAAATGGAGTGAATGAGAATAGAATATGGCCAGTTGCCAG:1 - chr2L 2309387 3' + Burdock 221 2 60.40 GTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACGAAGGCTATCCAGCCAAGTATTAGGCCCGAATTAACATATTAAAAAGAAAAACTAGTCATAAAAAATTGTCAAGT:1 - chr3R 21863776 3' + HB 1301 1 76.24 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCACTTAATACATAATTCGTGTACACATTATA:1 + chr3R 13544166 3' + roo 398 1 68.32 TAGAATATAAAATAAAATAATATTTCCTTAATTTTTTTGATTTTTTCCCAAAACTAAAGACACCAAATCTAATGTATTTCCTTGCGAGACCTTTGATTGCC:1 - chr3L 10295018 3' - transib1 1901 1 85.15 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATAT:1 - chr2L 12779604 3' + flea 4981 2 66.34 GGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACTCTACAACTTTCGGGAGAGAGAATATTCAAAATGGCGGCAACGCGAG:1 + chr2R 20584488 3' + P-element 2861 1 55.00 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAGCACCCACAAATTGTGCGA:2 - chr3R 20791637 3' - pogo 31 1 65.35 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGCTTTTGTGCTTTGGCGCCAGATGTGC:2 - chr3R 16594444 3' - Tirant 1 2 77.23 TGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAACACAAATAATAAAAAAAATAAATAAATAAATTTAATCTCTAATATTTTCTCTAAGCTCTAAGCTTATTTT:1 - chr3R 4594923 3' + Juan 4183 1 49.50 TTATGATTAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAAACTATCTGGGGGGTATGATGTTGGG:1 - chr2L 12388076 3' - I-element 295 1 75.25 GGAAAAATCGAATTTTTGANATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAA:1 - chrX 10119545 3' + FB 21 1 64.36 AAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATCTCCCAGTTGCTAGAATCTTCCGGTCATTGTTTGCCATCAAAGGAACAACCA:1 - chr3R 19936280 3' + Ivk 5248 1 51.49 ATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAATAATTCTTTGTACTTTTTTTGCCATTTTTTTTTTTGGCTGGTCTTGGA:1 + chr2R 13659084 3' + Ivk 5350 1 56.44 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTT:1 - chr3R 4536209 3' - Ivk 55 1 77.23 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAAAACGCCCTGATC:1 + chr2L 22044557 3' + S-element 1701 1 64.36 GGAAGGAGCACGTGTATTCNTTTTTCGGCGTCCACAATTAGAAGCACAAAAACATTGTGCCCTTTATGTACATTATTATGTCAGGTTAATAAATCAAATAT:1 - chrX 11170938 3' + invader3 263 2 50.50 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTGCTGTTTGCTGGATCCTT:1 + chr3R 9825185 3' - Doc 31 1 49.50 AATAATAATAATGATAATAATAACGGTAGCTGTAGTGGTAGTGGTATTAGGGGCGA:1 - chr2L 2123451 3' + mdg1 37 11 92.86 AATGGAAAAATAATGCAGANATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATT:1 + chr3R 18549964 3' - pogo 47 1 78.22 GATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGTACGTATAAAGTGTTAAGCAGTAAGCATCTATCTTTGCTTCGTTCTGGACAAAACTTTAAGAGCTTCCG:1 - chr3R 7270000 3' - hopper 344 1 73.27 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGATCGTCTAGGCTATTGATGCTGATCGTGGCAAGAAATCCATACGATCCTCCAAGTCCTCCCAGCCAGCCAGTT:1 + chr4 748724 3' + 1360 3387 2 53.47 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGTCGTTTGGTTCCTCTCAGTTTGTATTTAGCGCCTGTCGCGGGAGGTTCGTGCGT:1 - chr2R 10874705 3' + P-element 2866 1 56.44 TAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGTATCTTTTTATATATACTATACCTATCTATATCTTACAATTGTGTATCTTGGTCATCTTGTTCTGAAG:1 + chrX 13704261 3' - P-element 478 1 76.24 TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCC:1 - chr3R 14049348 3' - transib2 33 1 58.42 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCAGCTTACTCAGCTAGCTGTTGTGAATGCGAACTTGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGG:1 - chrX 23078696 3' - INE-1 558 1 91.09 ATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGAAGTGAACTGGGGAAAATAAACTATAAATATAACTAAGTGGTTGTATGTTTACATGCAAAAATTTATG:1 - chr3R 28325368 3' + copia 4690 1 72.28 GCTGCATTTTTAAGTTACCNGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCGTAATT:1 + chr3R 19270396 3' + pogo 2052 1 74.26 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTGGGGATGTCCATCCAGGTCGATTGCACTTC:1 - chr3L 24150502 3' - blood 12 2 65.35 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGAGCAAAAACTTTGGATGTTTTGAGCGTTC:1 - chr2R 20584430 3' - P-element 42 1 30.61 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTCAAATGAAATGGTTACCTATATT:1 + chr3R 8434305 3' - roo 8703 2 73.86 GGACCACCCAAATACGTCACTATATACATGTATGTATGCATGTATGTACAAATCGTTTTAAGCAGGAAATAACGCACAGTGATTCAATTTGTGGCATTTTA:1 + chr3R 4591939 3' - 297 6581 1 76.24 AAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTTATCCATTTAATGTTCTTTTCAATGGATATTTTCTTAATGTTTTTACGGTGTATATGTA:1 + chrX 8334518 3' - BS 5013 1 60.40 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTTGGACTATCGCGTGGTAAGTAGCCGAAAGAGAAAGCTCTCTTATACGGAA:1 + chr3R 19671758 3' + P-element 2860 1 52.48 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGAGGAAATATTATAAAACACCAAATCCAGAGTCACATCTTTTGCTGCTCAATCGGGCGTGCCTAAG:1 - chr3R 27455517 3' - 297 6585 2 76.00 ACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATAAAGTCATTTTAAAGTTATATAAAGTCATTTTTTAAATT:1 - chr2R 5260090 3' + 1360 3233 1 56.44 AAATCGCCACCACCCTCAAGACCGGAACTTGATCATAATTGTCAGCGGCAAAAAAAAACAGAAAATATACAAAAATATGTATAGAGCGTTTCATTTGCGTT:1 - chr3R 14054993 3' + jockey2 3176 1 74.26 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAGATGAAAGAAAAAACAAAAGGTTGGATTTCTCTGCATACTTTCAGGCGTCCATCAAAGA:1 - chr2R 18687757 3' + jockey 4981 1 47.52 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTCTCTTTGCGCCCCATAAATCACAAAATAAATTTT:1 - chr2L 19997204 3' - roo 8704 2 66.34 GGGTCGAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCTTTTTTCCACGGCTTCGTGCATATTACAATGTCACTCCTAATGCAAACGGAATGCGGCC:1 + chr2L 5704435 3' + Quasimodo 344 2 67.33 TAATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTATTTTTAATTTAACTTTGCTGGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 19 1 79.21 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATATATACATATATATATGATAAGGGGTAATCATCAGATTAGGTAGATTTCTTTCCTAT:1 - chr2L 2288349 3' - hobo 13 1 67.33 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCCAGCACCCGCGGCTTCAAAACTGTGGATCTCACCATGACG:1 - chr2L 8690529 3' - Tirant 34 2 58.42 GGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAATATAGTATTCTGATTCTAAAAACCATAAATTTAT:1 + chr3L 17711449 3' + Tc1 205 2 65.35 TATTTTTGTAGGTTGAATANTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATGGTGAAAGAGTC:1 - chr3R 4474150 3' - copia 11 2 68.32 GATTAGTCTTGTAAATTTCTATCAATTTGCCACTCTAACGCCCTTCAAACTAAACAACAACCCGCCAACCAACAATCTGTCAATACTACTTCATTTTTATA:1 + chr4 738798 3' + INE-1 296 1 64.36 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGCCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATAG:1 + chr2L 9319129 3' - jockey 17 1 65.35 TGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAAAAAGTTAAATTAATAATAAATAGATAGAAA:1 - chr3L 18740228 3' + Bica 75 1 70.30 AATTAAAAAAAAAAGAATAAAAATAATCTGTCATTTTTTTATTAAAGGAAACCCTTTTCCTACATATAAATTATTTTCTACATTTGGCCGTACGTAAC:1 + chr2L 19915308 3' + Doc 4700 2 55.10 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCCAGCACCCGCGGCTTCAAAACTGTGGATCTCACCATGACGGAACACTTTTTACAACAA:1 - chr2L 8690511 3' - Tirant 16 2 63.37 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCCAGCACCCGCGGCTTCAAAACTGTGGATCTCACCATGACGGAACACTTTTTACAACAAAGCGATTTACATTTGA:1 - chr2L 8690495 3' - Tirant 8107 1 79.21 ATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTGTCCAACAATAATTATTTGTAATAAAAACAAGCCATTAAGGTTTCAAGTTTCAAGCAGTCATAAAAA:1 - chr3R 29481785 3' - Cr1a 4178 1 65.35 TTTGTATGTTATCTAAATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTGAGTTTTTTTTGGGTATTTGCAATAATT:1 - chr2R 15135132 3' - I-element 5127 1 72.28 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGC:1 - chrX 18121842 3' - opus 7158 4 75.25 ATTCATCCAAATATCTCCAGTAGTTTAGGAGGTATTCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCTGGCACTTTATATTCTTCA:1 - chrX 7802873 3' - hopper 53 1 78.22 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTCCCGCAGAGTTTTTCCTGTGCT:2 + chr3L 13739654 3' - BS 5014 1 53.47 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGATTAGTACTAAACCCAACGG:1 + chr3L 24150568 3' + blood 7334 1 81.19 TACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCACATGAAGAAAGCAATTTACCAAAGCGCGAGT:1 - chr3L 18896593 3' + P-element 2846 1 36.63 AGGGAGAGTAAACAAAACTCTAAAGACTCAAATTAATTAATTTATTTCAGAGTGCGCCTTTGTATTACTCATGTATTCTCGGCGTTAACCTGTG:1 + chr3L 8827288 3' - Cr1a 206 1 80.85 TTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTAATTGAAAAGGTTTTTTGTAGCTGTT:1 + chr3L 16690658 3' - gypsy7 5012 2 77.19 TCTTTAAACATAGTTCATAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTTATTTTTTTGGTTAGTTTTACCATTGTCGACACTGGCTATTGAACCATTTT:1 - chr2R 4719823 3' + Tc1 1358 1 67.33 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACATACACATATTGGCATCTACAGACAATGCACAAAGGCCAGAGTAATTGAGTAATT:1 - chr3R 16305453 3' - pogo 16 1 61.39 TGGACGGAAGCAGCAGTAATAATGTTCAAAAAGGAAAAACAAATAACGGCAAAGACGGAAAAAAGCACATACGAGTTATGTTTATAAAAAGTATTTAAAAG:1 - chr3L 24241894 3' + invader2 472 1 56.44 TTATTATTCTTATTATTATTATTATTATTCAAGCTTAGTGTTTTATCCAATTATCTCAAAGATCTCTTACATTTTCTGTAACAAAAAATCAAGTTTTTGTT:1 + chr3L 8959596 3' - mdg1 38 11 69.31 AGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATCAATCACCTCACAACTCTGAAAACCACCATTCCATTTCCATTTTAGCATGGAATTTCCGTACTCAA:1 - chr2L 17225176 3' - X-element 4591 1 58.42 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACACTGAAATCTAAACATAAATCTCA:1 - chrX 6075236 3' - P-element 51 1 28.71 GGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGAGCGCCGATGACACTCGGCACTCATAACGG:1 + chr3R 1465946 3' - gypsy5 6987 2 70.30 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGNTCTCTGGTGTGCGTGTTAGTGTGCCTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGGGGGCTTTGCGGGCATTTTATGTAATGTCGTCTG:1 + chr3R 11278460 3' + hobo 2934 1 41.58 AAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATAATTATATCCCACAAATATGGATTCTACGAAACATTTACTGGATCCACTGTTAGAACTAAAA:1 + chrX 11987961 3' + 412 7530 2 66.34 ACCCTCGCACACACACGCACACACACACAGAGCACCCTCGCACACACACGCACACACACACACGCAGACACACGCTGAATATGAATACAAGTAAAGGACAA:1 - chrX 12838576 3' - Stalker 450 1 73.27 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAAGAAATGGCGATGCTCGTGGAATT:1 - chr3R 8705309 3' + jockey 4944 1 78.22 TGGAGAGGGAGGCGTTGCCAGTGCAACGGTGCGACCAGTGCTGTGTTGCGCCAGTTGGGCGCGCAATTCAAAATTAACATAAATTGAATTGCATTTGCAT:1 - chr3R 27192338 3' + Rt1b 28 1 77.00 AAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGA:1 + chr2R 5531180 3' - 1360 81 1 56.44 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATAGTGTTCGTGATGAAACTTGTGACTCCACCAGCTGCAGC:1 - chrX 1762936 3' - jockey 4706 1 60.40 TTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGCGAGTGTGAGTGTGCACTAGGTATTGCT:1 - chr2R 23979890 3' - McClintock 310 2 72.28 GAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGATTATGCCCGGAAATCTCTTATGCGCAC:1 - chr2R 17898547 3' - Quasimodo 7091 2 76.24 GCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTAGAGAGCGCATAAACCGCGGCGATAAATTGTGTAGTGATTGTGACGTAGGAACAACTAAATC:1 + chr3R 7187135 3' + invader4 367 1 62.38 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTTATTGCCTTGTCCGCTCAGTCTAGTCATAGTTGCTAT:1 - chr3R 26434120 3' + hobo 2929 1 57.53 TTTGAATTTGCATTTTCCAGCACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTATGGGCCCA:1 - chrX 22398522 3' + Gypsy6A_LTR 168 1 69.31 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGG:1 + chr3L 5206596 3' + roo 9032 1 75.86 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCAAAATTACACGCA:1 - chr3L 10560236 3' - pogo 27 1 59.41 AGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGTGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTACGATTTATTACAGGTAGCTGATAATACGTATCCGAATA:1 + chr2L 8965778 3' - 297 236 2 69.31 AGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATATAACTTGTTAAATTCGGGTTCATTTATTAA:1 - chr3L 19089534 3' - 297 369 2 70.30 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACATACACATATTGGCATCTACAGACAATGCACAAAGGCCAGAGTAATTGAGTAATTGCATCCGTTCACT:1 - chr3R 16305440 3' - pogo 3 1 74.26 AATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATCAATTTGCATTATTGACGCTTACAACAAACTTTATTTTGTTGTTGCTCACAAAAAGGTTATG:1 + chr2L 18297852 3' + hobo 2625 1 67.33 ATGTCAGCCCGACGGCTGCNTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCC:1 - chr2L 19207883 3' + 412 448 2 70.30 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGATGCAACTGCAGCCATCGGGATTTCCTATG:1 + chr3R 21924066 3' - transib2 38 1 67.37 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCGATCGAACTAATGAGATCCCAGCACA:1 + chrX 5997291 3' - 1360 51 1 74.26 TTTGACAGCGGCACTTAGCNATTCTTGTAAACAACACACATAATAAGGAGCAAAAAGTACAATACAAATTTCGCTTGTTTCATCCTCGAAAAATTGTATTG:1 - chr3R 1272591 3' + 17.6 180 2 72.28 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTT:1 - chr2R 6074394 3' - 412 7109 2 79.21 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCTACTTGCAATATCTGTTTAATATAGAGATTGGAATGC:1 + chr3L 11953868 3' - hobo 38 1 61.39 CGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATGCCCTCTTATGGATTGCGCAGACGCCAAAAAATTGGCCAACAACAAGTTGTTCGGTTGTTTGGCACAC:1 - chr3R 9613405 3' - invader3 5196 2 70.30 TCCGCTCGCTCACGCTGAGCACGTAAGAAATCTAAAAATTTGAACATGCAAGTTTATGTTGGGCAAACGGCATGGAGTCTGC:1 + chr2R 19675971 3' - 1360 3296 1 59.76 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAAATGAAACAAG:1 - chr2R 8707024 3' - flea 4782 2 58.70 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTGATCAACTGTATTCATAACTTAT:1 + chrX 15268320 3' - roo 16 2 59.00 TTATAAATATTATTGTTATTATTACTAAGGTATATTTTATTTATAATGGAAATTAAAGAAAGTAGGTTCCATAAACATACGAACCATTTATGTCAATATAC:1 - chr2L 7588180 3' - mdg1 29 5 81.19 ACCCAACTTCAGCACACTTTGATTTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTGAGCTCTTCTTTCATTAAATCTCACGGACCCAGAGTTTCATC:1 + chr2R 4721060 3' + Stalker 7163 4 73.27 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCGGCATTGTGTCACCTCTGATAAGAAAAG:1 + chr3L 12903875 3' - Doc 54 1 72.28 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCAATATGTACATATATCT:1 + chrX 17268398 3' + Juan 4190 1 52.48 TGTTCCAGTAGACTACTTTTAATAAATTTACCTTTCCTTACCGAATTGTTAATTGTAACTAGCGATTTTTGGGTACTTTCAATTTATTCTTGCTATATAAA:1 + chr2L 21272322 3' + Cr1a 3974 1 56.44 AAAAAAAAGTGAAATATTGAAACCACAAGCAAACAAAGTTATTTCAATATACCTTCTGGCTGGTTCCTTTCTCGAATTAAGTCAATCGCTTA:1 + chr3L 1991208 3' + P-element 145 1 60.87 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAGCGTCCAGCATAATTATTTATAATGGCCAGGCAGGCGG:1 + chr3R 12178274 3' - hopper 23 1 56.04 TGATCCCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGATCCGTCGAAAGATTTGCGGCGAAAGAAATCAA:1 + chr2R 21664686 3' - R1A1-element 5086 1 67.33 TTGCGGAACTTCGGTTCATATACATGCACGAACGATAAATGACTACAATAAAATCTCGTTTATGACATGCTACTAAAATTTACATTTTATTTGCATGTCAT:1 + chr3L 10522854 3' + R2-element 3475 1 54.46 GGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGGTGACGCTGCATGGCGCTTGTGGAGGCGGATTGCTGTAACGCC:1 - chr3R 29732414 3' - Max-element 8345 2 54.55 TGAATACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTAGTGTATGTGTGTATTACACACTAGTGTATGTGTGTATTACACACTAGTGTATGTGTGTATTACACATT:1 - chrX 11037807 3' - accord 7032 2 74.26 ATCCTATTATCTCTAATCTTGGCTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTCTATAAATTGCATTTGTGCAAAATTAAGTTCAATCTTTACCGAGTCGCG:1 - chr2L 11074871 3' + Cr1a 4221 1 58.42 TAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTCCTTTCCAGTCCCTCATTAGCCGAACTCTCGCTCTGAGGTCGGGGATTGTTCCATTTCCTTG:1 - chr3R 28114802 3' + X-element 4493 1 68.32 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGTAGTGTTGTAAAGTACAC:1 - chr2R 11403940 3' + mdg1 7426 2 57.58 TGGAGAGCGACAGTAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAACCAAGGCGGAGGCTGTGCAGCCAGCGTGTGTTAAACAAAAGGGAAGAA:1 - chr3R 20240435 3' + R1A1-element 386 1 57.43 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATTTGTTCTTAGAAAATGAATG:1 - chr3R 5993095 3' - pogo 14 1 65.35 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATTAAGTGAGTCCGTGTGTC:1 - chr2L 20840220 3' + mdg1 415 2 46.94 GGATTTCCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCACGTAAGTGTGAATTCGATGAAATCATCAAGTAATTGAAAATATATATTTAACCACGCCCTCCCACAC:1 - chr2L 7490187 3' + mdg3 496 1 58.00 GCACTCAGGGTGAGGGGTCNACGGGGGAAGCGAATTGGCAGGGGGCTATGGCCACTAGAATATCCTTGCAATGCCGGGCCCAGTCCACAGTCATAAATTTG:1 - chrX 10167760 3' + opus 257 2 74.26 ATGCACATAAACTGCACCTTTCGCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTCGGCTCAATCTAGCGCTCTCTCCCTTTTGTGCCTCGCCTTCCTTCGCCTCGCCCGCT:1 + chr2L 8416563 3' + Cr1a 269 1 77.23 ATAATAATAATAATAATAACAACAATAATAATAATAAAACTGTCAGTGGACAACACGCGCTGCCACACCAACAGCCCGAATTATCTTGTGAGTTTTTAATA:1 + chr2L 17936492 3' + mdg1 17 2 62.38 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGCCATTTGATTCGCTCTTCTTCGGTTGAAATCTGCAAAAGTGTAGATC:1 + chr3L 10683517 3' - opus 27 4 53.47 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCACACACTAAACCACTCGCACAACCGAAG:1 - chr3R 13685165 3' + Tirant 373 2 64.29 GTTTTTATTTATGTTTTTTAGACTTGTGCTATATATCATTTAAGAAATTAAGATGCCAAGGAGTAAAGAAATAAAATATTTAATTATATTTTTCTATTTAT:1 + chrX 15380275 3' - mariner2 789 1 81.19 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCTGACATTAAAAATATGAACAAAGTTGTGTGAAATATATTGTTCTTT:1 - chr2L 18077385 3' + hobo 2909 1 52.48 TTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAGTCCGATGAAAGGATCACTTTCGCTGAAACTTCTCGAGT:1 - chr3R 11498598 3' + BS 5059 1 60.40 TAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAAAGCAAACTGTCCCCTGATTAATAAATATTATATAATTAATACATAGAGCAA:1 - chr3R 16805980 3' - 412 4 2 75.25 GCCTAGAGTACCGAGTGTTNATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAAACATTAAAAGGACCGTTAGATACGCCTTAAAG:1 - chrX 12378698 3' + hobo 2897 1 65.35 AATAGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTTAGCATTCTCTTATGTTTTAAAATACATTTGACATTCACAGTTCATTTTGTGACGCTG:1 + chrX 21421876 3' + INE-1 542 1 86.14 TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCA:1 - chr3R 19589937 3' - BS 5035 1 62.38 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGCGACAGTGTCGTTTGAGATTTTGAC:1 - chr3R 6437484 3' + 412 7530 2 60.40 TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGAGAAACAATAACAAAGCGCAA:1 - chr3L 16748236 3' - HMS-Beagle2 9 2 80.20 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGGGCAATGGTGAAAGCTGCCTGCGGGACAGCAACATGTGTTTTGTCGCATTTCTATTTATGACGTGCGACG:1 - chr2L 18413804 3' + hopper 1411 2 76.24 TGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGAGGAAAGCGGGTTCGTTTTCGGC:1 + chr3R 11362706 3' - blood 7182 2 65.31 TAATGCAGATATCTTGCCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACGAGCTTTTGAGCTTTGGAAATGCACTTTG:1 + chr2R 22666044 3' - pogo 37 1 52.48 GCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGTAAAATTGTAAAATTGCAAAATTGACAGCGAGTG:1 - chr2R 23441734 3' - jockey 4712 1 66.34 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTACGAGGCCAAATCCATTGAGATTTTCATAGG:1 - chr2R 7173608 3' - mdg1 7 2 68.09 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAATTTCGATTTTTTCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACTGAAGATTTAAGAACTCCATAG:1 - chr2L 21701219 3' - FB 55 1 74.26 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACAT:1 + chr3R 5700152 3' - mdg1 7075 2 65.35 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACACCGAATGCTGGCTAGAGATGGCAAGATACTGCACTGGCGAATAGGGATGGG:1 + chr2R 10874790 3' - P-element 23 1 56.00 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAG:1 + chr3L 13366421 3' - hopper 40 1 63.37 AAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGCATAAATCGGATCTCAT:1 - chr3L 21913110 3' + Bari1 1706 1 61.39 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATTAAATATCACTATACCTATTGATTCCTGCAGTGCAATAAAAAATCTATAAGACTTTATAAGAG:1 - chr2L 20396902 3' - Transpac 8 2 72.00 GCATATAATTACACACACACACACACACATTCACAGAGCCACATAGTCCTGCGAACTTTTGCCATTACATATGTGTGTGCGTTTTTTTCCTCCCTTTATAT:1 + chr2R 21272720 3' + Quasimodo 29 2 74.26 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTCTGAAAATACTTGAGGTATTTCACTTGAAAATTTTGGATATATGGTGTATGAATATATAAG:2 + chr3R 20599691 3' + opus 485 2 66.34 AAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCTTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGGATTCCGCTAAGTTTT:1 - chr2L 6775653 3' + P-element 327 1 22.77 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTG:1 + chr3R 14049416 3' + transib2 2792 1 57.43 GCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATAGCTTCTTGTAAACTGCTCCTACACTTGCTA:1 + chr3L 8632940 3' - F-element 4341 1 69.31 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTAC:1 - chr2R 7132510 3' - opus 164 4 83.17 TTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTGCCAGTTTTATAACGAATATTTC:1 + chr2R 22898780 3' + Transpac 5180 2 77.23 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCACATGAAGAAAGCAATTTACCAAAGC:1 - chr3L 18896599 3' + P-element 2840 1 30.69 ATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCAC:1 + chr2R 5532314 3' - G4 3787 1 68.32 TTGGTTTTGCATTATGCAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCAAAATTGCTCTCTTTCGCTGCTTCGTGGCATTCTCCTTCTCTCTGCCGCTGACCATGTCG:1 + chr3R 16324474 3' - 1360 3349 1 64.65 ATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATGGTGATGTCGTCGCTCAGAAGGTGAGTGCAATTCACATTGCAATCGTTGAATGCATAGTA:1 + chr2R 13445987 3' + roo 8940 2 65.35 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTGGCATTAGGAAAAGGTTTAACCCTTTGTTGGGCGATATGGGAATAGTATCGA:1 - chr2L 4571303 3' + roo 9049 2 53.54 AAATCTGACATCATTTCGAGACCCATCTTAAGCAGCGGCGTCACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGTGAAGTTATTAACGCTATGAATACTGTACT:1 - chr2R 21147496 3' + gypsy4 6386 1 68.32 GTAAGTCTTTAAATATATTNGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTCAAATGAAATGGTTACCTATATTTAAGTGTGTGTTTGTTTGGTTCAACAACATTGTTGC:1 + chr3R 8434341 3' - roo 8680 2 63.37 AGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGTATGAAGTATCCAGATCCCCTAGGCTCAAAAGTATAAGACTTTATAGGGTCCCAAACATACAATTTTAC:1 - chr2R 5541926 3' + invader3 5455 2 68.32 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTGCTGGTATAGGCTGATTTT:1 - chr3L 5808188 3' - 297 6631 2 79.59 TAGTACAGCATTTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGTTTGGCATGAATTAAATATTTATTTTCCGCTTAGCCAAGTTATTAATTTTGAATGCCAAGGC:1 - chr3L 15939945 3' - Doc3-element 124 1 66.34 AAACACACACTATAAATCTGCACGTTAACAGATAACTAGCTGACGGCTTCACAGCTCAAAAAAAAAAGTTCGCGTAGTGGCCAAATCGAGGTTAAATTCAA:1 + chr3L 25850887 3' + hobo 97 1 80.20 GGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGCCTTCCGAGATCTTGAGCTTGTATATATTTTTAGTCAATTTCGTTAATA:1 + chr3L 25255881 3' - Burdock 379 1 52.48 TAATAATATTATCAATTGATTTGCACACAACCATTCACTAAATATAGTGAATTAGGTCCTGAAAAATAAATAAAAATTCCAAGTAAAACCTTTCAGCTAAT:1 + chr3L 15762912 3' - invader2 431 1 39.60 AGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATAGTTTTGTGGGCTTGGTGGGTCAGTTTAGTCAC:1 - chr3L 20569525 3' + jockey 4588 1 68.00 AATCAGTTTCTTACAAAAAATCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACACATATGTCAATGTTTTCATTTTCGATTCCATTTAATTATC:1 - chr2L 6322535 3' + roo 9038 1 61.39 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTTAAAGCATACTTTTTGGG:1 + chr2R 18807829 3' - jockey 26 1 59.41 GCCCTGGCCTAACTGCGTGNATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGCGGTGGCCGAG:1 - chr2R 7735583 3' - 412 7147 2 62.38 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAATTTGTAAAGTTTTTTGAAATTTGAAGTTGCACGGAATTGAGAATTTAAAGGATCA:1 - chrX 11987864 3' - 412 17 2 60.20 TTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACAAATTTAACAGCAGCCACCAGCCACACCGACCAACGGACCAAGGATCC:1 - chr3L 25263359 3' + mdg1 7230 2 53.47 AGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGCAAGGCGATTGCAAGTAGCCAGTAACT:1 + chr3R 9613519 3' + invader3 5455 2 70.30 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGCGGCGATTAGCAGATTGCATTTTAAATCCGCTTAACGG:1 + chr3L 5206634 3' + roo 393 1 61.39 AGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTTTAGTGTGGTAATTTATTGTGTTAATTATTGTTGTTGCTGCTTTCG:1 + chrX 3767994 3' - F-element 461 1 54.46 AGTGAGATCTAATTGAGTGNAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCAAGCAATTAGAGACGGTAAAATCGAATTGTTTAA:1 - chr2R 22745861 3' - Ivk 5168 1 65.35 AAAAACAAAATAAAAAAAAAACTGAGACTGCAAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGTATTCATACACACATACATACTATATATGTATGTATAT:1 + chr3L 17330272 3' + HMS-Beagle2 488 4 74.26 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATTATATTTGTATATATTTATCCCAGTCAAAAAACTATGATAAATGCTAAGGAACT:1 - chr2L 10698352 3' + roo 9053 2 48.51 CTAATGTAATATAATTAAATATGGTACTCTAATAAATCATATTTTGTGACTTTTCGATTTTATTATCTAAATGCAGTCATAAATCTGTTTGCTTATCTGCT:1 + chr2R 14652297 3' + TAHRE 433 1 71.29 TTTAAAATATTAAATTAAATTTATATATATTGACATTTGTTTTTTCCCTAATTTGTTGCCTCGAATTTTTCTTAGTGCTCCTATCTGCAGTATAACACT:1 + chr3L 5954093 3' - 1360 3048 1 82.83 GGTGGCTGCGAAATCTGTTGGTCAGTCGGTTGATCCTCGTGGTGGTTCGTCACATTGGGATCGGATGCTAGTATCAAGTCATGGGAATAACTTCAGTGGGA:1 + chr3R 23894057 3' - Chimpo 4161 1 56.44 ACATTTGGTGCATCTAAAAGATTGATGACATCTTTCAACAAAGCCATTTTTTTTTATTTTGAGACGATTTTTTGTTTGGATGAAATAAGTTCATAACCGTT:1 - chr4 904062 3' - transib3 2486 1 76.24 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCGCCTTAGCTCCTTATAGCTCCTTATCGATATCTAAATGCCCTTTATTTTTAAAGTCGATTTTA:1 + chrX 21057018 3' + Tirant 390 2 65.31 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCAGTGACATGGAAATGCTTTTTCAGCTGTCAATGGGAACATT:1 - chrX 4240675 3' + 297 365 2 64.36 AAATAATAAAAAAAAACAAAACAAACTTGCGGCGGCGTTAAGATGTACGAAAACGTTCTCTCGCCAAAAATTTGTGAATAGAATAGCAGTAGCAATCTATC:1 - chr2R 12589066 3' + Rt1b 5148 2 72.28 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGATTAGTACTAAACCCAACGGTCAGCATGGAAGCGT:1 + chr3L 24150583 3' + blood 337 2 66.34 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTATTCACAATCCGATTCACCATTGACAAAGTCAGGAGCAGAACAGCGATGGCGGGAACAGGAAC:1 + chr3L 4570939 3' + Quasimodo 7362 2 73.27 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGGTTCTGACAAAAGATAACTCCATTAAATACTTATAAATACATAAAATAGAAAG:1 + chr2R 13712223 3' - mdg3 19 2 44.55 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCAGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 34 2 49.50 AATTTGCAAAAAAGTAAGTTTTAAATATAAAATTCTTAATCAATTAAAGATAATCCTATCCTGCTTTCAAACTAACATCCTGCTTTATTTGTTTAACAGTC:1 - chr2R 13868955 3' + Tc1-2 1459 1 51.49 TGTTATTATGTTCGTATATNCTACAGTACAGATGTATCTCAAGCGAGGACAATCCTTTCGCTGCGGTTTTTGCTAGGCGCCATACCCCGATTTCGACGCTA:1 - chr2L 18927443 3' - mdg1 7042 2 75.25 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGT:1 - chr3R 178123 3' - BS 43 1 70.30 AGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATGCTTGTGGGTGTGTGGAGTGCAGTCGAGTGGTTCCCAGGGAACTTGAGCTTAAGCCATGAAA:1 + chr3R 20377880 3' + invader4 2859 2 64.36 ACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGCTACATAACTATCAAATTGTTGCTAATTAAAAATTTGTTTTCTTCTTTT:1 + chr2L 14038462 3' + 3S18 6104 2 75.34 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTATTGAGACTGACGCCACTCGGATCCCG:1 + chr3R 4773430 3' - Tirant 8118 2 70.30 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACACTTCCGTCTTGCCTTTTGCATAGTCGCTCACACTGCGTATACTTAATTCGAAG:1 + chr3R 14980558 3' - 412 22 2 58.42 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACTCCATGGCAGGGGGGTGGGAAAAGTGTGAGGGGATGTTGGTTGG:1 - chr3R 25531717 3' - hobo 28 1 54.46 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCATGGTCTGTACACTCGAATGTCTACCGCCCGACTCAAATTC:1 + chrX 2123745 3' - P-element 35 1 37.62 TGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTA:1 - chr3L 10596451 3' + transib2 2485 1 62.38 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATGTATATTTATATAAAAAGGCAATTTTCTCGTGGTCTAAAC:1 + chr2L 3146598 3' - roo 36 2 65.35 ATCGAGGCATTGTGCAGAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTGATCTAAAAAAGAAAATATTAATAACTTTTTAATATGCGACATTT:1 - chr3R 25121591 3' + pogo 2074 1 52.48 TTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGCATGTAAATGCATCTGTGTTTTGCAAAAGATACGGATACGCGATAAG:1 - chr2L 13463943 3' + 3S18 310 2 52.48 ATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGTCACGTTTTGATCCACTTTTCGGCCTAATTCATACCAAACAAATAACAACAAAAGCAAAAAGCAAAAA:1 + chrX 6075307 3' - P-element 8 2 71.29 TAATAAAAAAAAAAAGGAAAAAACTGGC:1 + chr3R 10028794 3' + Doc2-element 228 4 92.86 ATCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATCGCAGTCGACGCCGCTGTCTGTCCGATTAAAATTCAGTTCTCATGC:1 + chr3R 26170838 3' - P-element 29 1 50.50 GTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACCCCAGTCCAGCTGTCCGTCC:1 - chr3R 30611207 3' + blood 376 2 79.21 TAGGTGGTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTTTTCCTTTAGTTTTCTCTCCCTTATGCATTGGCAATTGCTTAGCGCTAACCTTCAAGTGACCTTAAACGTAT:1 - chr3L 9358339 3' - baggins 5013 1 74.26 CATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCCCGCTCTTTGCAGCCCTGGTTGATGCTAATCGATTCAATTCTGTAA:1 + chr2R 7791381 3' + 412 7245 2 59.41 GTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCTTTATTTGCAATTTCCGTATAGGTTCGTTAAATTTAGTATGCAAAAATTCCTC:1 + chrX 18039890 3' - F-element 4450 1 56.44 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGCCCATCCCCTTTCTGCCCCTCACCGACTGGTCCAACAATTTCTCTCAAGCTTT:1 + chrX 21374243 3' + P-element 2866 1 59.41 ACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCCACTACCTGTCTCTTTTCCGCCCGCCGAG:1 - chrX 9727462 3' + Doc 251 1 68.13 TTTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATGATGTGGCCACAGTTTAACGAGATTTGTATAAACATTTTGCAAC:1 + chr2L 11873328 3' - gypsy4 497 1 56.44 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGGCAACAAAGGGTTAAGTGCTTGATAAGCGAAAATAGGCGTATTATTTTGGATTTACTTGGAAA:1 + chrX 7802942 3' - hopper 10 2 65.00 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGTTTTTTTGTTTCTGTTTTGTTTGCCTGTCGAAAGTTTCGCCGCACAGCTTATGGCCG:1 + chr3L 17127055 3' - Doc 23 1 47.52 GATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCA:1 + chrX 5452606 3' + mdg3 5455 2 72.45 AAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTGATGGTTTAAACGTGATTTTCCAGCCAGTCCAT:1 + chr2L 18198249 3' + F-element 106 1 67.33 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGAT:1 - chr3R 9870347 3' - F-element 42 1 53.47 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAACAAAAGAAGTCAATTGAAAAGGAACTGTTTTGCTTCTTAAATATAAACAGCCTGCCGAAATGTA:1 - chrX 20349234 3' + mdg3 174 2 70.00 GAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATATATTTATAA:1 - chr3L 14303569 3' + pogo 2033 1 90.10 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAGTGCCAACAAATTGTCTTGCTTTTTTAA:1 + chr2L 16127782 3' + roo 389 2 57.43 ATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATGA:1 + chr3R 20430814 3' - hopper 41 1 60.40 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGATATTTCCCTGCTCGCGCGCGCCACCACTTTCCAAACTTTACGCACGACCGAAAGTTTTGGCAA:1 + chr3R 31887386 3' + jockey 4976 1 67.33 AAATCAGAGTAATTATGAGAGTTCAGTTTGAGGCCTAATTATAATCGGTCGGAGTGGGCGTGGCGTGCCAACAATTTGCAATATTTAGCATAAAATTGCG:1 + chr3L 8776804 3' + Idefix 7273 2 54.00 AGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGGAAGCTTCAGGAGACGTTGCAGGTGAGTATTTGTTGCAGATTTTGTGCATTTATCATGAG:1 + chr2R 19799688 3' - HeT-A 5740 1 79.80 GGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAAGGTATGTTGATCTAAGTGGTTTATTTTGAATAAATATTAATCATTTTAATCCCTTAACCA:1 + chr2L 14928457 3' - accord2 7433 1 67.33 AATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATAAAAATGCATACATGTGGTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAA:1 - chr2R 22063111 3' + G3 4506 1 52.48 ATAATTAATTTTATTTTATTTTTTATAATTTTTTTTTTAAAAGCTTTAAGTTTAAGTAAATCTAGCAAGTTCCCAAACTTGCGGTCCACAATGGTAGCCCG:1 + chr3R 27005845 3' - NOF 3960 1 76.24 GGATTCTGAATTAGGGTCATATTAAATGCAGAGTTATGCATCGGGAACGAGGTGAAAGGTCTGGCTTAAAATATCCAACGGCTGGAACGTGAGATGAAAAA:1 - chr3L 13833884 3' + Gypsy12A_LTR 75 1 54.46 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAGAGCGTC:1 - chrX 21400795 3' - P-element 51 1 29.70 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATTGGTTAAGTGTTATGTACTT:1 + chr3R 11191090 3' - hobo 19 1 56.44 ATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATTTTTTAAGTGCTAAATGTGGCGATACACATCGACGGAAATCCCAAAAAAAGAAAAAAAAACCAACTTG:1 + chr2L 19868629 3' + hobo 2683 1 57.43 ACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTAGATATATTACGTAATCTAAGAGGAGTTACACGATTTACAATTACTTTAAACTGATTAAGAGCGTTGAGACA:1 + chr2R 18525225 3' + Stalker4 6895 2 58.42 GATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGATGGGCGTGGCGTTCAACAAGTTGGAAAAGGGTCCGGGCATCTCCTTCTTCGCAGC:1 - chr3R 15195059 3' - opus 351 2 60.40 GCTTGTGTCCGCACTTTGTGCTTTGTATGACCAAAGCAAAGACACTTGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGAGCATCATATCGTTTTGATGCTATAATGA:1 - chr3R 3626131 3' + 1360 468 1 70.30 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTTATTAACTGACCTTCGATA:1 - chr3R 14708704 3' - roo 21 2 59.41 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACATATATCCCCGATCCCCCGAAATGGGGCGC:1 - chr3R 10090318 3' + pogo 2062 1 72.28 TGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTATAAACACCCAAGGAAAGCTCTCTGGGCTGAAATCC:1 + chr3R 25844359 3' - Stalker4 6998 4 66.34 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGACGTTCCATACATAACGGGTTATTTTCTAACCAACTGAACTGAACTGAATAAATCAATA:1 - chr2R 14907169 3' + 1360 3373 1 67.33 GGACTCCAGTTCTTCGTTTTGTCGCACTTGCAGTTTGCCTGACGCCGACGAAAGGTTAAGGCATGCATCGCTTCCATCAAATTAGACGCATTTTCGACGCG:1 - chr3L 18562787 3' - mariner2 314 1 68.32 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAGTGCCAACAAATTGTTTTGCTTTTTTAA:1 + chr2L 16127782 3' + roo 9052 2 59.41 AACTACAATTACATAACAATCACATATCAATCACCTCACAACTCTGAAAACCACCATTCCATTTCCATTTTAGCATGGAATTTCCGTACTCAAAGTCAGTC:1 - chr2L 17225168 3' - X-element 4583 1 66.34 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGACAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAAGAACAACTCGAGAT:1 - chr3R 17615917 3' - HMS-Beagle 6809 2 66.34 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACTGTGTAATAG:1 + chr3L 27357641 3' - mdg1 7050 2 67.33 GAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGGGCAGCCAATCGAGCACGTCGAAAACTAATTTCTCTTGATTACGCGACGTCTTGCGAGAAGAAGTTGAGAAAAGA:1 + chr2L 10605055 3' + R1A1-element 4927 1 75.25 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCATTTATC:1 - chrX 19219306 3' - Doc 43 1 65.00 TGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAAGGTATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATCTGTCGATCGATGTCTTTTCCATTGTGTGTTTATTCTAGCGC:1 + chr3R 10229051 3' + copia 63 2 60.40 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCAC:2 - chr3R 30611241 3' + blood 7354 2 63.37 TTTATACGGTGTGCTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCC:1 + chrX 22386756 3' - hobo 91 1 66.34 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCGTAATTAAAAATAACAGCAATGCATCATCGAATCGAATGACGCT:1 + chr3R 19270434 3' + pogo 2090 1 68.32 TACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAAAAGAGAACGTAATTTTCATAATGCACAATTACAGGGTATCTCTTGAATGCAAGCTTAATCGA:1 - chr3L 11105003 3' + pogo 2093 1 66.34 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGCTTTTGTTTTTCCAACGCGAAAGGGATATTATTAAGCGTGGATGTCAGCGGCGTTA:1 - chr3L 949260 3' + roo 391 2 61.39 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCGGATCCAGATGTTCGACCAAATCTCAGGGAAGC:1 + chr2R 15201581 3' - P-element 8 2 71.29 ACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCATTATTTTGTGCTGCCTTGTTTGTTGTCGTTACTGGCACCAAGCAAAAACGACAAAGGAGGCAAACT:1 + chr2L 19230408 3' + mdg1 34 4 57.43 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACATATATCCCCGATCCCCCGAAATGGGGCGCG:1 - chr3R 10090317 3' + pogo 2070 1 69.15 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAA:1 + chr2R 14586483 3' - Doc 36 1 68.82 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTGTAAAAGATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTCCTATCTTCTTGAAACCCCTAAC:1 + chr2R 24169990 3' - roo 22 2 58.42 TGTGCCAAAAAATCGTATGNCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGTACCGTTTTCCTAAACTTGGTTA:1 - chrX 10996521 3' - 1360 30 1 56.44 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTCGTATAGTAGCATACACTCGTACACACGCTATCAACTACATC:1 - chr3R 19270340 3' - pogo 31 1 56.44 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATCAGGTTAGCCAAAAAGCAAGGCACGTTACCAG:1 - chr3R 15117617 3' + roo 9026 1 66.34 TAAGTACGATTGCAGCGACCTAGTGCCGAAGAACCACTTGAAGAGCTCCAGGTACGTGTTGATGTCATGATTCAGGTTGCCTAGCTGGTAGGCGAATCC:1 + chr2R 12340354 3' + rooA 106 2 75.76 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACCACAATTGATAAATATCAAATACAACAATGTTGCCTACTTTCAGGCAGACTA:1 - chr2L 8267324 3' - jockey 4695 1 54.46 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCATCGACCCCAATCGGTCACACTGGTAGTGA:1 + chr3R 27582833 3' - pogo 19 1 58.59 GCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACAACGGCGGCGAAAAAATGTTCGCCTGGGATTTTCCTTTTTGTT:1 + chr2R 13648774 3' + accord 216 2 58.42 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGAGTCTCTTTCGAGGGCCGGAGAACCACTATATATATGGGGCTACGGAAGGCCCATACCCT:1 - chr3R 15537290 3' + P-element 2873 1 65.35 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGAGCCCCGAAAAGGGCGCTCGGGATT:1 - chrX 20377110 3' - hopper 49 1 73.27 AAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTTTTCCTTTTCGGCGGTGCGCGTAATGAGCTTCCGCAAGCTTCCATTTTGCCTTGTACACGG:1 - chrX 17468662 3' + hobo 2826 1 70.30 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGACCAAAGAGCGTAACCGAAAGCTGGCTAA:1 + chr3R 7411860 3' + 1360 3343 1 72.28 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATTATTCATGCTGCCCAATTATGCACAGCCCACAAAAGTAGGCAACATATTTTTCGCTCCCTCCTT:1 + chr3R 25378655 3' - jockey 21 1 67.33 TTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATA:1 + chr3L 21912353 3' + Bari1 1694 1 66.34 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTATGTTCTTAATTTATGAAACCAAGAGCTCCATAATAAACTAGACATTTTTGTGTGGCCCAT:1 - chr3L 2339744 3' - roo 8679 2 64.36 TTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGAATACAGATTACAGTGTTTTATATTAAATACTATTTGATGTAGAAGTTCGAAAGCTTTTCACTATTAGCCACTTAAATG:1 + chr2R 20542883 3' - Cr1a 4238 1 50.50 GATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTGATGGTGACCGATATGTGTTGACATCTTTGGCAAACAAAA:1 - chr2R 1370345 3' - Bari1 1589 1 60.40 GCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATCAATTTGATGCCAGCGAAC:1 - chr3R 25271682 3' - invader4 2811 2 73.27 TTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATAGATTCATACATATATACGGGTTCAATTTTGTTGCATCTCAATAACGGACCAAGATAG:1 - chrX 18160833 3' + 297 6965 2 70.30 AAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTTGGAGAGCAAATGCGATCGGATCGGGTTTAGA:1 - chr3R 27213387 3' + Quasimodo 7014 2 68.32 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAAAATACAAAGTAGGAGATTGTTTTAAATTTATTTTACCCATATTAATTTTGCCCTA:1 + chr2L 20840335 3' - mdg1 21 2 57.43 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGG:1 - chr2R 19558001 3' - 412 7107 2 77.23 TTTTGAATATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTGTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCAC:1 - chr3R 13439590 3' + gypsy7 5061 1 58.42 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAG:2 - chr2L 12779586 3' + flea 240 2 53.47 ATTAGAAACGAAGATATATGTACATATTGATTTAAACATAGAAACAGCCAACTTAAGCTTAAGCCATTCGAAAAGCCTGGTTTCGTCT:1 + chrX 19573818 3' + Porto1 4377 1 53.41 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGC:1 - chrX 19219314 3' - Doc 52 1 73.27 AAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAA:1 + chr3L 19349991 3' - 1360 3234 1 59.41 AAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTTAAAAACACGTGGAATCTGCGGCTGGGCCAGAACAGTAAATCATTTCCCATGTGTACCTGGCTCC:1 - chr3R 13205728 3' - hopper 8 2 71.29 AGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAACAACCACAGGCGCCATGCTCATTTATATACATACACAAATAATGC:1 + chr3L 24421456 3' - Rt1b 5075 1 58.42 AGTTTTTATTTATATTTATNTGCATATAATAAATTTTACTTCTTTGGTTAAACCTTATTCTTTTTTTTTTGCTCCCTTATTTTAAACCAATATGTTACTAC:1 - chr3L 12180512 3' - mariner2 790 1 54.46 GAAACACGTCTCCACCCGANGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGATTTTCC:1 - chr2L 4110933 3' - Doc 20 1 62.38 GGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGT:1 + chr2R 2529357 3' + 1360 3376 1 36.63 GTCATCGGCGTTGCAGTTTCGCACAGTCTGCAACGTCTTCTTTCTCCAAAAACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGT:1 - chr3L 26696873 3' - looper1 1561 1 84.16 GCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTCTGAAATTCCATTGCTCTGAAATTCCGCAGTGGAATGTTCTTCAGACTGCCATCA:1 + chr3R 28216895 3' + blood 379 1 76.24 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTCAACGTTGTTCAGGTTTC:2 - chr3L 24253582 3' + Quasimodo 7357 2 63.37 GTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCTCAGCGGCATTTTCTGCGATTTTGGTGGTTTTTTGTTGTAGGAAATTAAAAAAGGATATCGATGGGT:1 - chrX 7676887 3' - F-element 4444 1 69.31 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTGCGATACGTTTTTTGTTTATCTCGAACCTCAGCTGAAATAATCGCAAAAGGGTCGCAAC:1 - chrX 8037608 3' - roo 16 2 48.51 TTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATCATTCATAACCGTCTTCCTTTTCACAATCAAGCACCACACACGGAGTAATATTTAGAAAGTCCCATCGA:1 - chr3R 29039711 3' + hopper 182 1 55.45 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACAATGTAGGTTCCGTTTGGCATGAAACTATAGGGGGGAACTAAAGGG:1 - chr2R 11661086 3' - 1360 25 1 55.56 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAACTGGCTGTGCTGACAAAC:1 - chr3L 5973987 3' - hobo 32 1 53.47 ATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTGTAAGCCGTCGGACGTCATTGGTC:1 + chrX 18120831 3' - opus 350 2 76.24 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTATTTCGCTGTTGTTTCTATGCCCGAAATTGCGCTGCAAAGTATGCAATGCTTTC:1 - chr2L 3908454 3' - jockey 29 1 56.44 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGTCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGGCCTTGAAGTGGCAGT:1 - chr2L 13214960 3' + roo 398 1 68.32 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGACAGACCGCACCTGA:1 + chr2R 7025025 3' - P-element 23 1 56.44 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATAATTAAAATTTGAAGTAAAACAACTTACATGCCAG:1 - chr3L 11758371 3' + roo 9034 1 66.67 GCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACATAACCAACTATACATACATATATGTATGTATGTTCATATCTCCTTATGTATCGACGGCGTCAATGTGGTGTC:1 + chr2R 22661282 3' - gypsy6 7419 1 79.21 TTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCATAGCAGTTATCGAAATTATGTTTGCCC:1 - chr3R 12899509 3' + P-element 2726 1 34.65 GGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATCCTTGCTGGCTGTCATCATTGCCAATGTTGCAGCGACA:1 + chr3L 11741771 3' + gypsy4 6622 2 62.38 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGGCACCCGATGTTTTACATTCTTATAAAGAACGGG:1 - chr3L 11953818 3' + hobo 2899 1 67.68 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAG:1 + chr3R 16613188 3' + 412 7502 2 70.00 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTTTGGTGGCAAGTCCTCTGCCTTGCGATTGCATGCCAT:1 - chr3R 13239868 3' + hopper 1393 1 57.43 GATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGGTCGCCATGGCAATCGTCGTAGCTGTCGCCCCTCGCATTTTCC:1 - chr2R 9223346 3' - 1360 251 1 57.43 TGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAAT:1 + chr3R 25271721 3' + invader4 3042 2 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTG:1 + chr2L 7461110 3' + roo 356 2 77.23 TAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGACTGCCAGAAACATTCC:1 - chrX 10445551 3' + INE-1 544 1 78.22 TAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGA:1 + chr3L 19339422 3' - Tc1 32 1 52.00 GCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGACGTGGTGGACGTGGACAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTCCGTCCATGTCTCTGGAATCTGCAAGTGAACAAACGA:1 - chr2R 16056508 3' - INE-1 221 1 74.26 TGTATGCTGACGAGAACAACTGGGAACTATGTGGGGGACGTAGGAAGCGGGATGAGGGACGGCGAACGGTTGACTTCCTGACTCTTGTCAAAGTTTGCTGA:1 - chr3R 16700065 3' + invader1 210 2 80.20 GGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTTTACCACCATAGCAACTACCCCGTCTCAGTCAGCGACGGGATAACAACTTGCATGGATTCAGTGGC:1 + chr3L 8567651 3' + R1A1-element 267 1 60.40 GACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACA:1 - chr3L 21912258 3' - Bari1 29 1 61.39 GTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATTAAGTGAGTCCGTGTGTCCGCATGA:1 - chr2L 20840213 3' + mdg1 419 2 52.48 ATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATATATCGAATAGAAATAGATCAAAAAGCATGCTTAC:1 + chr3L 6740283 3' + Quasimodo 57 2 71.29 ACGCGATAAGCAAAGCTCANACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTTACTATTTC:1 - 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X-element 4575 1 55.45 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTNGGCTGTTGGGGTGTACGTTGTTAATGTATGGCAATTTTAAACCAAGTTTGCAATGATTGGAAACATTTAATAATAAATACG:1 - chr3L 11523294 3' - jockey 4684 1 66.34 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACAATGTAATAGGGTGCGCTATTTC:1 - chrX 6058195 3' + roo 9023 2 78.26 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGCTAACAAG:1 - chrX 15412657 3' - hobo 11 1 68.00 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATG:1 - chrX 13268862 3' + 1360 3356 1 61.39 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATCAATAGGTTTTTATCTATCTTTAGTAGGAAAAATCGTTATAATCCATATAAAATCAATGTTATTTCTTGAA:1 - chrX 16237871 3' + mdg3 5496 2 75.25 TAAGTGTATACTACGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATCCAA:1 + chr2R 8232538 3' - P-element 40 1 39.60 TATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAAATCTACTAAATTTTGAAAGGTTACTCTTGAGAATATGTACTAACAGAATATGT:1 + chr2L 7578604 3' - blood 7311 2 55.45 TTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCACTGTTTGTATACAATTGACTACA:1 + chrX 2251516 3' - G2 3045 1 77.23 ACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTAGCAACTCAGACAATTACCAGGAAAAATCTTGGCAGGACTCTTCTGAAGCT:1 - chr2R 25017576 3' + Doc 4496 1 58.42 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCGTGCTCCATTCCCCACATCCAT:1 - chr3L 11657820 3' + Tabor 470 2 63.37 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGAGTAACACCAAAATGTATGTGGCACTGCACCATTTGCA:1 + chr2L 18500371 3' + Tirant 8470 2 61.39 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCTCACTTTTTTTTCCGGGAATTGGCTGAAAAAGGAGCGAAAAAGCATTTATGGCT:1 + chr2R 15593803 3' - hobo 22 1 46.53 ATTATTATTATTATTGTTANAATAATTTATAGTATTGGTTCTTGGCTCTTGCAGCGATTCATTTCGTTAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTTTCACAGTGC:1 - chr3R 19255380 3' - mdg1 30 2 40.59 GGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTAATTCGCCAATTAGGGCATTTTTAAGTTGCTCATATGT:1 + chr2L 23352592 3' - accord 34 2 59.41 TTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTAGTCGTTTTAATTTCTTTAATGCAATTGGTTTTCGTCTTATCTTTCCCTTTTGAGATTAATCG:1 + chr3R 1295839 3' - hopper2 1271 2 74.00 TATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAGGGCGCATTCCTGCACTTTTCAGCTT:1 + chr3L 5974118 3' - hobo 2711 1 74.26 TCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCAATATCTGGCTCAAGCAGAGCCGTGTATA:1 + chr3L 3428097 3' + roo 411 1 78.95 TATTATGTTCGTATATACTACAATCCAACTTCAAGTTACAATTGTTCAACAAGTAATGAGTTTGGATCCATGAAAGCTTAAATATATTGGTTAATCTAGTT:1 + chr3R 22467130 3' - mdg1 1 2 74.26 GGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCACAATATGCCTATGTAAAGATGTGCAGCATCATTTCAACAGCTTA:1 + chrX 7684427 3' + GATE 299 1 56.00 AATATGAAATCACAGAAGGNATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGTGTATCTTCATGTTTCGCGAAAAC:1 - chr2R 17402714 3' - invader4 2790 2 55.45 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAAGGTTTTTATTTCGCCTTCTTTTCCGGAAAACTTTCGTTCCGATGTAGTCGTGTTGCCATTGTTGACTAC:1 - chr2L 10177761 3' - copia 4876 2 72.28 GAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAA:1 + chr3L 25232913 3' - GATE 8265 2 55.45 GAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTTATCTGTAATGTGCACTTAAGCACATTA:1 + chr3L 24766140 3' - BS 4814 1 80.20 GAGGAGCTTCGAGTACAAGNATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCACTTTTAACTGAATTTAGGAATCGGA:1 - chr3R 934840 3' - Max-element 50 2 72.00 AGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCGACGGCAGTGCAGCC:1 - chr2R 6482647 3' + gtwin 464 2 68.32 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGTGCCCTTTGCCACCGGCCACACCCCCTGCAACG:1 - chrX 6338892 3' + P-element 2849 1 38.54 GATCACGGACTTAACTCGCGCCACCCCTCAGCACCGCGCCAATGTGGGTCATAAGAGTTTATCATCAACAAGCTGCCACATCCTGGCCAAAAAAGAAGCAG:1 + chr2L 8646774 3' + Tirant 404 1 73.27 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGTATGTGGGCACACAAATTTAAGCTCTAA:1 + chrX 5452639 3' + mdg3 5485 2 61.39 AATTTAATTAATAATAAATAATAATAATAATTAATAAATTAATTTAATTTATTACAATTCCCTTTTATTTCAAATTCGTTAGAACCATAAGAGAACAAATT:1 - chr2R 4879097 3' + flea 4994 2 54.46 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAACACTCAAAACAGCAACAGCGCAAATAGAAGTAGAAACCGGAAAGTGAGACAAGTCGACT:1 + chr3L 5976409 3' - hopper 13 1 67.33 CACCCCTTCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTTTTGCTATTTAAATCGAAACAACAAATTACTATTAAAATGTGGACGGAACAGATATCCACACCGATGCT:1 - chr3L 18990353 3' + Idefix 233 2 73.27 TGCCATTTCGCATCACCCTGCAGCATGAATGGGGCTAGGTTATCCGCAGTCAGTCGGGCGAAAAGCCATTTGGTGGTTTATATTTAGGCGA:1 - chr3L 15164648 3' - Rt1c 5210 1 58.24 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCTTATATACTACACTATCCTCATGCATCATGGGTATCATAACGCTCTTTGTGGCATTTACTCGAAACTCCGG:1 + chr2R 17123639 3' - mdg1 21 2 55.45 TTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAAAAAGCAATTAATAAACGAGCGATGGCAACAAGT:1 - chr3L 10284823 3' - Juan 3842 1 67.33 AAGACCTCGATCTGTACACATCATACATATGTACATATGTATGGTGTGCTCAAGTGAGAAGGGATTAAATAGGATTGTGGAGAATTTAACTAAAGTCAAAA:1 + chr2L 15868332 3' + Transpac 109 2 75.25 AAAAATTCGAGAGAGCCTGNAGCCACCTCTAGAGCCACGGTCTGGAGTCCAAAGGGAGGAGTACGAGTAGGTGGCTAATGGCTGCACGCAACCCAGCGAG:1 + chr3L 1209763 3' - 1360 81 1 67.00 GTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTATCAGGCTGGGATGGAGATGTTGGTCTAGCTGATTCCTGCGATTTGCGCTTGCTCGAATCCGTTTTTT:1 - chr3L 17436687 3' + R1A1-element 5148 1 71.29 GCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' + 1360 3296 1 88.00 TAGTCCGGCCCGGAGATGTGGAAATTGAGATCTACCAGCTCCAGCCCAACTTTGCTTTAGTCTTTAGCAGAATATTGGGGAATTGCAGAAGCTGTCTCTGT:1 + chr3R 5186159 3' - baggins 200 1 61.39 GTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAAT:1 + chrX 11030923 3' + roo 380 2 52.48 AACTTGCCATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAGTTTCTAATA:1 + chr3R 7618705 3' - Doc 43 1 61.39 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATG:1 - chr2L 20271225 3' - blood 46 2 70.30 AGTTAGCTGCATTTTTAAGNTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCG:1 + chr3R 19270391 3' + pogo 2047 1 79.21 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAACGCGTTACATCTTTTGGACCAAGGCA:1 - chrX 22771523 3' - opus 154 4 73.27 GGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTTGTCGGTTTGATTTTATTCTTTTG:1 - chr3R 8861000 3' + Transpac 4915 1 76.24 AAGAGAGAATGCTATAGTCGTGTTTCACGACTATCAGATACCCATTACACGGTTAGTGCGAGCGAGAAGTTTTAACATTTTGTTCGCATGTCGAAG:1 + chr2R 7019643 3' - INE-1 577 1 61.46 GACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCTTCGAACTGGATGGAGATGGTCAGTGGCTGTGCTGAAACATATTACGTGTTTGCCAAAAATAATCAGTAT:1 - chr2R 5404018 3' - 1360 3187 1 67.33 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTGTAACTTTTATTATTGTTTAATTTCACATAGTTACGATCTCTTAACTTTACAAGTAGTCGAGGATCTC:1 - chr2L 3475242 3' - roo 8671 2 73.27 TGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGGGAAAGGGACAGGCAACCTAAGCCATCGAACGAGCCGGTGTCCTTGCT:1 + chr2L 2098536 3' + hobo 339 1 53.47 GTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATATTCGTGTTACACAAGACTGTGGATCGTGCGAAGAGGATTGGCGATGGACATTTGGGATTACGGACAAT:1 - chr2L 20818610 3' - 1360 3213 1 72.28 ACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGGAAAGCGCCACGAAAAAATACGAAAATATTGAGAGAAAAAAAAAAACAAGCGAAAAC:1 - chr3R 7281668 3' - 1360 441 1 65.96 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTG:1 + chrX 15258341 3' - BS 43 1 71.29 GAGTGAATAGCTGCTCTTTATTAAAGCTCTGGCTTAAGACTAAATACTGTAAACAAGAATTATAAAATAAATCACAGACAACAGTTCAGGAAAAAAAAA:1 - chr2R 18222263 3' - gtwin 269 2 61.62 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGGTTTTATGC:2 - chr3R 7869100 3' - 297 6595 2 66.34 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTATATGTGCATGTACATATACACTCGGCTATATAGAACAACCCACAAGTC:1 + chr3R 10090393 3' - pogo 22 1 57.43 TTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGCGACAGTGTCGTTTGAGATTTTGACGTTTGATGAGGCG:1 - chr3R 6437471 3' + 412 490 2 73.27 CAATGCGTCGTCCAGCATGAAGGCTCCTTATTACTCAAAGTCCGGTTGCGACTAATTCAAGCGAGATCTTGCAAAAACTTAAATATTTTTGGTTGAAA:1 - chrX 3953387 3' - diver 5857 1 73.47 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTAATTGTTTAAGCTTTAATCAAATATTATGTGTAGTATATATGATCTCTCTTGATATATGAT:1 - chr3R 20192495 3' + Quasimodo 7359 2 66.34 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATACATACATACATATCTCTGGTATTCCCATTTGTATGTGACCA:1 - chr3R 26804038 3' + I-element 5319 1 60.40 ATTGAATATATTTCTTGTGCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATTCATATACATTTTATTTGTAGCTTTGTGGTCTGTGGCCTCGCATGTGTAACTATG:1 - chr2R 1578292 3' + Tc1-2 1604 1 76.24 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAAAATACAAAGTAGGAGATTGTTTTAAATTTATTTTACCCATATTAATTTTGCCCTAGTTTATA:1 + chr2L 20840342 3' - mdg1 14 2 64.36 TGCATTTTTAAGTTACCTGNATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTTTAATTACTTTCACCTTCATCAGATATA:1 - chr3L 17146822 3' + pogo 2054 1 73.27 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAAGGTTTTTATTTCGCCTTCTTT:1 - chr2L 10177809 3' - copia 4924 2 80.20 ACACAAACCAAATTTAGTGAAGAATACCAAAAGATAGTGAAGATTCATCATTTCGAATTTCTGCCAAAAAAAAAAACAGGAAAAAACTTAAACATCCGGGA:1 + chr2L 8352515 3' + transib1 2092 1 76.24 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAATAAAAGAAAGGGTGAACCGCATGAGTCGTCTCTTTAAATGAGGTTGCCT:1 + chr2R 6074446 3' + 412 7521 2 55.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCTTCCACAATTTCTGGAC:1 - chr2R 19513357 3' + roo 391 2 56.04 AAATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGTGCAAAA:1 + chrX 22694471 3' + Burdock 248 2 71.29 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAATATAAGCATATGATCGTATATGCAGTTAAAAAAT:1 + chr3R 29157561 3' + pogo 2064 1 66.34 GTTTATTGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTAAAGTATATGCCAAAATTTGTAAGTCCCAAGTATGGTTTCATTCGCAC:1 + chr2L 13334902 3' + hobo 2913 1 52.53 AGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGAGTTTCGAGGCGTTGCCCCCGCCGCTCGTGAATCCAGCGCCCATTGTCGCCGTGGTGGAGAACAAGCTGCCA:1 + chr2L 2368864 3' - 412 7297 2 74.26 GCCGAGGAAAGGGCGCAACNCGTGGCGCTCGCTGGGTCACCTCTCAGCCGTTTGGGATGGGCTGAACTTTGTTTGTGAACTCAAGTGGCTTACTTAGCCGC:1 + chr2L 14346310 3' + Rt1a 4616 1 54.46 ACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGTGTTATTGTTTTCGATTTACGACAACCATAAATCAATAGCTTAATTGATAACTTGACGCTATTTAC:1 - chr3L 8705769 3' + Rt1b 4992 1 75.25 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTACATGTGCATGTACATATACACTCGGCCATATAGAACAACCCA:1 + chr3R 10090387 3' - pogo 14 1 59.77 CTATGGGTTATTGACCGCTNGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTCCACTGAGAGAATACGTCATAAACTGCAGAAGTATGGCTT:1 + chr3L 7330198 3' - F-element 310 1 59.41 GTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATATCAAATGTACGACTTAGTTATAATTATGTTAAGCATTTTCCTCGAGCGCTA:1 + chr2L 16117463 3' + hobo 2636 1 55.45 ATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAAGGAAACAATAAAAAGTTCATCAAAAGTTTCATCAATCAATGACAATTTAATAAAATATAGAT:1 - chrX 19217288 3' + Doc 245 1 69.31 GAACATGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAGACAAATATTCTATGTTACAGTGTTGTTATGAATTTTTATACAGTTACCTTAATGAAAAACTAAATTGT:1 + chr3R 12850842 3' + HMS-Beagle 274 1 64.36 GTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTACTAGAAGCTACTAGACAAGACCATTAA:1 + chr3L 25414196 3' + Doc 382 1 72.28 AAAGAAACACGTCTCCACCNGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAGTTTCTAATATCAAGAACTGAAAATTAGAA:1 + chr3R 7618725 3' - Doc 23 1 54.46 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGAGATTTATTTGCCTTGTGCCCTGGAAACTTTCGACTCCCGACATCCATATCCGTATCGTTTGCTCTCCTC:1 + chr3L 14691014 3' + roo 402 1 68.32 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCCAACTTCAAGTTACAATTGTTCAACAAGTAATGAGTTTGGATCCATGAAAGCTTAAATATATTG:1 + chr3R 22467118 3' - mdg1 13 2 62.38 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCAC:1 + chr2L 16127747 3' + roo 9017 2 79.21 CTGAATCTCATCCTTCTAGCTTTTACAGTTTTAGGATCAACGAAGCGGGAAAGAGACGGCACGCATTCCGACGCACAGCTGCTGTCTCTGTCGCCCACCCA:1 + chr2L 11950968 3' - INE-1 167 1 71.29 TGTGTGTGTTGTTGTGTGTTTCCTTAGTGGGGCGTGTTTTTTTTTGTTGCTGTGTTGTGTTTGCAGAGCGCAAAGAAGAGGAAGCAGAGCTAAGAGAGAA:1 + chr3L 543388 3' - gypsy3 413 1 67.00 AGGTATTCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCTGGCACTTTATATTCTTCACTCCCATTGTTGTTGCTTACTTTCTTTCC:1 - chrX 7802844 3' - hopper 24 1 53.47 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACA:1 + chr2L 9471250 3' - roo 53 2 75.25 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCTTGATATATGGAACAGTATTTAGTGGATGCAATAAACATA:1 - chr3R 22494701 3' + 1360 3357 1 62.38 ATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGGGTAGAGCAGACTAATTTGCGCATAATTAAATATAAATTGTATGCGTCATTGTTTGTTATGCTGCTCTTCCCAAAT:1 - chr3R 10946330 3' - accord 183 2 81.19 GGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTCCATGACCACGTCCAGGCTGAAACGGGTCTAGCGACCAAATTGCCGTACA:1 + chr3L 13824680 3' + 297 424 1 53.47 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGATT:1 - chr3R 6190244 3' + copia 251 1 60.40 AAGTTCGGAGGGATCCGAAAAAAGCATTGTACCTGGGCGCCACTCGGATAATGGCCAACAAAAAATAAAACAACTCCAGTCAACAGTCAACAATCATGAG:1 - chrX 17217693 3' + R1A1-element 5328 1 73.00 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATGACAAAACAAAGGCGAAACTTACTGAAAATAAGCGCAACCAAGGGGA:1 - chr3L 13367683 3' + mdg3 219 2 50.50 TCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACAGTTTTAGAATTTGATCATGCCTACGCAAATTCCTCGCTAAGGTTTTGCA:1 + chr2L 8690608 3' + Tirant 376 2 56.44 CTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCGGAATAAATGGGTTGTTGAC:1 - chr2L 7541022 3' - Doc 4544 1 80.00 ATTAAGCGTGCTTGCAACAAAAGAATATAGGAGCTTGTAAACAAAATCTGATCGATTGCTTTGTTTAATTACACAAATAAATACGAAAAAGATATTACAAC:1 + chr3L 10193943 3' - gypsy12 10061 3 56.44 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGAATCGCTCGGGGAATACGCCGGCATCAGTA:1 + chr3R 12882708 3' - 412 45 2 71.29 GATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTGTGTTATAAGTGTGCCAAATTTGAGGGCTTTTCGACTAAGAGG:1 - chrX 4364012 3' - P-element 2672 1 49.50 ACACAAAATTGTAGGGTGTNAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACACTCCATGGCAGGGGGGTGGGAAAAGGGTGAGGGG:1 - chr3R 25531728 3' - hobo 38 1 64.00 GTATTGACGCTATGTTATAACCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACGACACACAGGACAAAGTAGGCA:1 - chr2R 3068384 3' - Stalker 6895 4 76.67 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTTCGGGTTGTGCTGGAAT:1 - chr2R 10777822 3' + pogo 2050 1 82.00 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGCGACAG:1 - chr3R 6437503 3' + 412 7511 2 57.43 TGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTCATCTAAGCGTCGGCTTTGCCCCTTCAGTTCTCTGCAGCAAATGGAGCACACGG:1 - chr3R 28630194 3' - 1360 3243 1 49.50 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGC:1 - chrX 15412664 3' - hobo 19 1 60.40 GATCCTAATCAAGAATATATATACTTTATAAAGCGATATGATATAAATGTAAATTAAAGTAAGCAATCAATAATTATTACGAATCAAATATAAACAAATAG:1 + chrX 14137870 3' - INE-1 80 1 74.26 AGGTTATAAATCCTGAGCAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTTGTTGTGCTGATAATGCTGTGTAT:1 + chr2L 19006222 3' + Cr1a 478 1 74.26 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCTTTGGTGT:1 - chrX 15412685 3' - hobo 40 1 63.37 GTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCTAATTATAAATTGTAAAATTATATGGATGTAAATGTAAAAAGGATGTACATTTCACA:1 + chr2R 6770131 3' + 412 7434 2 64.36 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGGTGCGTTCCCATGTGCAG:1 + chr2L 13792253 3' - blood 23 2 54.46 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGTTAACATAATAGCACTGTCACTTCGATGAATTATATTCGCTATAGAATGGTTTTGCC:1 - chr3R 14521053 3' - I-element 19 1 58.42 TACGCCTTTAGGGGTCGCANTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATATCTAGATGTGTTTACGTGACCCAGTCTGCAATCTCT:1 - chr2R 20043045 3' + mdg1 7223 2 62.38 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACTTTAAAAACGTTGTTGGAAATCTAGAATGGC:1 + chr2L 21372997 3' + roo 9028 1 71.29 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTTCACCCTCGATCACGGTAGAAGAGCCGCACAAACGCAACAGCTACTGTGCTCGCGCAGCACATGTT:1 - chr2R 18290311 3' + Tirant 361 2 48.51 TGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGTGAAACCACTTTTCTCACGGATTTC:1 - chr3R 29528163 3' - G6 1884 1 75.00 ATGACTAAGAGTAAAGGAAAAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACTACGAATCCTTC:1 + chrX 16237978 3' - mdg3 24 2 47.52 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGCCTTGTCTCTGTGATTTTTCCGTGCGAGGGGAAAAGTGAAAAGGAAA:1 + chr3L 949346 3' - roo 8693 2 60.40 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGATTGAATATAAATCAAATGATTAAATA:1 - chr3L 5088367 3' + roo 9035 1 73.86 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGAATATAAAATTCTTTAAGCTCTGTTGTTATATTTGTGATTAAAATTTT:1 + chr2L 12132779 3' + mdg1 7432 2 51.49 TAAACGTCGAGATCTCAGAAACAAAAAAAAGCTAGAAGGTTGAGAGTGTGAGTGATCCAACATAACTTGGAGAATTTGAGGGATCCCCAGGCGA:1 + chrX 22694689 3' + INE-1 140 1 58.51 GCTTGCAGCTACAACAAAATGAGACAACAAGCTGCTGCTGGCCACAATAACAACAGCAGAAACGATGAAGCAAATGATGGTCACTCCCGAAAAAGACA:1 - 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chr2R 18949221 3' - Tc3 1289 1 69.31 ATCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGA:1 - chr3L 16047627 3' + Cr1a 4414 1 61.29 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGAGCATTCCTGAAAGGAATCCATTGCCCCCACTTGCCGAGGCCTTAATTACAAC:1 - chr2R 13099054 3' + roo 9048 2 54.46 TGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATACGAGCATGGGTAATTGGGGGCC:1 - chr2R 11820922 3' - gypsy6 52 2 76.24 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTTTACCTTTATCC:1 + chr2L 12199541 3' - Stalker2 11 2 64.36 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACGATTTAATGTGGCCATAGTTCTGTCGACG:1 - chr3L 15444839 3' + mdg1 378 2 69.31 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGGCAGGGTTCCGT:1 + chr3R 18171843 3' - 1360 27 1 54.46 GAATTTAAGTGTATACTTCNGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTAAACAAC:1 + chrX 6338934 3' - P-element 45 1 35.64 TTTATAACTGATCTTAGTGTGGATCTGCCTCTTGAATGCGCTCGGTTATCGCCACTGGCCACACCCAATCCCGCTGACATTGTCGAGATCACCACACAGAC:1 + chr3L 8389188 3' - mdg1 302 2 42.57 GGGAGAAGAAATACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGCAAATTAGTTTGTTCAGCTTGATTGCAGCAATTAAACTGT:1 + chr3L 5091442 3' - Juan 4027 1 58.42 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACATCAGATCTGCGAGACCTGTCA:1 - chr3R 11278406 3' - hobo 50 1 78.22 ATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACAAAACAAATGATTAAAACCAGGCCC:1 - chr3R 17896424 3' - jockey 4862 1 75.25 AGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCGGGCTTGAATTAGTTAGAATTTTAGGAAACCTGATAAATCATATACGAAT:1 + chr2L 3938339 3' + Burdock 70 2 54.46 GTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAACTTGCGCTTCGTCTTTGTCTCTAGGATCTGTGTGCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAG:1 + chr4 829452 3' - S-element 351 1 72.28 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGCACCTAAGTATCGTATAACTGCAACTTTTAGTGCAATCAGTTAATGAATAAACGTAA:1 + chrX 8983003 3' - 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chr3R 7869126 3' - 297 40 2 65.35 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGGCTATCTCTATCTCTTCTCCGAAGCTTTCGAAGTAGCTTTTGCGTGCCGAA:1 - chr2R 7024941 3' - P-element 23 1 56.44 TGAAAGTTGAGATCTCAGGAACTTTGAGGATGATTTAAACAAACGTTGACTCGGCTAAGCATGGCCAATACAAATGCGGCTGTTTTGCCTGTCCCAGACTG:1 - chr3L 27293194 3' + INE-1 140 1 76.24 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATTTAATGTGAAACAAGGCA:1 + chr2L 15983437 3' - hobo 26 1 53.00 TATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATT:1 - chr4 123979 3' - HB 106 1 52.48 TGATTAGGTTTAGGAAAATNTATCGGAATATTATCTTTAAATACTTTATTTCTACAAATATCCTAGATCATTCAAACATTTTTTATTTTGGTCTAATGTAG:1 - chr3R 16209005 3' + Circe 7053 1 69.31 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACCGATGTCCGTAT:1 - chr3L 771742 3' + roo 397 1 64.36 TGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTA:1 - chr2R 11575018 3' + INE-1 136 1 48.51 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGGAAATGCAAACTTTGCCACCCACTTGATATGTTAAATCTGCGTAGATTTATCAACTTTGCTAATTAACAGC:1 + chr2L 20609997 3' - 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hobo 30 1 62.92 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTATACATAAAGCAGGCACCACGCACCCAGCAAAAGTCAAAACTCAAACTCAAACT:1 + chrX 14324757 3' - 297 6595 2 65.35 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGAATCGCTCGGGGAATACGCCGGCATCAGTAGGTGTCCTTGGATTTGGGAATTCAGCTTT:1 + chr3R 12882737 3' - 412 7069 2 63.37 ATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTCTGTTTCGTAAGGTAATTCATTTTGGCTTTTATTTTTATTT:1 - chr3R 21607690 3' + copia 4955 2 59.41 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTAATAGCATGGAGTATACTCATATTGCAGCATACTTTTAGACTTTATATTTTATT:1 + chr2L 3740620 3' - hobo 22 1 49.00 GTGTGTGTGTAAGTATATGNGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTAAAAATCATCAGATAGATTAAGCCGGTGCAAAAGTTG:1 - chr3L 1257987 3' - Quasimodo 27 2 62.50 AATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCGCAGAAGGACGGCAAATACCTGATCATGAAGG:1 + chr3R 23681988 3' + 297 6804 2 68.32 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAAATATTTAGTAAAATCTATGAAATGTGAAAATTTTCTGTAAGTG:1 + chrX 3431943 3' + Ivk 5345 1 60.40 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAAGGTATACATGACTATATGAGCTGGAAGGTTAATGGTTTTCATGATCACCACGCTCAGTGGCAAGCGTACGC:1 + chrX 22689216 3' - Transpac 22 2 56.44 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTATTTAACAGGTGTGATTACTTGAAAGATTGTCTAAACGACTAATGTTAGGTATACAAGTGTTT:1 - chr3R 17415226 3' + roo 398 1 55.45 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACCCTCTAAAAAATGTGCATATTCATGAGATGATTTATAAATAAAC:1 + chr2R 11661161 3' + 1360 3360 1 57.43 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATTTAATGCTAAAATACGGAAATAATTTGAGCCAACAACGTTAGTCGCCGCAACG:1 + chr3L 11758442 3' - roo 8686 2 54.46 TAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAATAATATAAGACATCTGATAATTGGTCAGGGTTCAGTGTTTGGTCACAACGCATCA:1 + chr3R 4463748 3' - S-element 1538 1 64.36 AACACTTGTAACTAAGCGCGTATAAATACCGCAAATCCAAAAATGTAAATATGTTATAATATTGAATTTACTACTACTTTCATAGCATTAAAAAATGGTGA:1 + chrX 14522601 3' + TART-C 10967 1 52.48 TTAGATTTTTTTTTTTGAATTTATTAATTTTTACTCAACCAATCGAAACCGGA:1 - chr3R 25460442 3' - gypsy2 430 1 90.57 AGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGA:1 - chr3R 19950448 3' - BS 5012 1 56.44 GAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAGAAAAATTTAAATTAATTACAAACATGTAAGGGCGG:1 + chr2R 20092533 3' - Cr1a 4324 1 72.28 GCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCCATTCAGAGCTACGAGAAGGTA:1 - chr2R 17061215 3' + R1A1-element 381 1 76.09 GGCTATTGATCCTGATCAGAAATAAAATACTTCTGGGATGGAAACTTTCCTAATACCCTACATTGCACTCTAGGGTAGCCAAATAGTTTGTGTTGCGTGTG:1 + chr2L 22192004 3' - INE-1 87 1 64.36 AACCGCTGCTTTACATACCCTTTGGGGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTCTACCCCATATAATTTTGTATATCTGATAGATTTGCTCGTGGTTG:1 - chrX 1100163 3' - Circe 7146 1 70.30 TACAGTGTACCCTCGACATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTCTAAAAATGAAAACAAA:1 + chr3R 26343018 3' - blood 12 2 67.33 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACATTCCCATTCCCGTTCCCATTTTGGGGAGCAAGGTCCCTCTGATCTGCGGATGAATCGGAAACGAGGACT:2 - chr2R 6918501 3' - hobo 4 1 75.25 ATTACAACCACGGCACCCTNTACACCCACAAGTGGCGCCCAGGTACAGTGGGAAAATTGCACTGTCAGTGGAATTGGATGTCATCTGGTTTGTGTTCGTGT:1 + chrX 17217798 3' - R1A1-element 5276 1 66.34 AAATCGATAGAAATTTACAAGACCTATAAATATATAAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGGGGATGGATGAGCTGTTATGGTATGTGTATGGGGGCCGCA:1 + chr3R 16191501 3' - INE-1 302 1 60.40 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGGCAACAAAGGGTTAAGTGCTTGATAAGCGAAAATAGGCGTATT:1 + chrX 7802922 3' + hopper 1385 1 53.00 AAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCATCCCAGATCTTCAACAATTTTCTTTCC:1 - chr3R 10392377 3' + I-element 4988 1 76.24 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGCACCTAAGTATCGTATAACTGCAACTTTTAGTGCAATCAGTTAATGAATAAACGTAATCAAGCTCT:2 + chrX 8983012 3' - 412 9 2 68.32 AAACAACCGATTTTCTACGNAGCTCAATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAGTGTTCAAAAACACCAGCTGATTGTATAATAAGAATAACAGCCATGA:1 - chr2R 9242611 3' - Doc2-element 42 1 56.44 GTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATCATGAGAAATCTACGCAGTTTTTTTTGTGC:2 - chr2L 11919262 3' - X-element 20 1 64.36 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCATTTGCATACTTTTGGGCTTGGTCACATCA:1 - chr3L 5255924 3' + jockey 4955 1 68.32 TTTGACTCTAGTCCGAGGGNCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATATACGTATATAAAAAGATAGATGTT:1 + chr3R 22517301 3' - jockey 4723 1 73.27 ATTAGGACAAATTTAACATTTTAGATACATCCAGGATAGGGTATTCATTGAGGGATTATATGTACATATATCTTGAGATTGGACATGAGTGCTTTTCCTAA:2 - chr3L 7111509 3' - 1731 4261 1 86.14 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGCGATTCTCTTCTAGGA:1 - chrX 18121827 3' - opus 27 4 60.40 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAATATTCAGCCTGTCAAGCTTAAAAAAACCATTAAGGTAATCACACACACACACACAA:1 + chr2L 4866615 3' - 412 21 2 54.46 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCCCATGAGAACTCGACTGATAGACTCGATGGA:1 - chrX 5452526 3' - mdg3 5259 1 71.29 TAATATTGTACAAGAAAATTTTCAAAACAAAGCGAGCGTACAAAAAGTACTACCTTTAATGTGAACCACATTGCAGGGTATTAAAGAGAAAATCAATGCAA:1 + chr3L 8979297 3' - TART-B 10182 1 51.49 TGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGGTAGAGCACAATTTTTGAAAACTTGTTCAACTTAAT:1 + chr3L 3328972 3' - G2 2676 1 64.36 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGACTTCAGTTTGAAAAACGGCTTTCATTT:1 - chr3R 4773351 3' + Tirant 8464 2 71.13 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTCACAACTTACAACTCACAGCTTGCAAACACACACC:1 - chr3L 6866180 3' - 412 40 2 68.32 AAGCATAACATTTCCTCCGGTATGGCTCCGGAACTCTCCAGAAAGCCTCCTTCAATAGCCAGCATACATGTGTGCAGAGGATTGGAACACTATCGCAT:1 - chr3R 21268163 3' - Circe 405 1 67.35 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATCGCAGTCGACGCCGCTGTCTGTCCGATTAAAATTCAGTTCTCATGCGGC:1 + chr3R 26170841 3' - P-element 26 1 53.47 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATT:1 - chr3R 7869140 3' - 297 43 2 76.67 GCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATCATGCACAGGTAATTGAATTAAAATATAAAT:1 - chr2L 23278653 3' + invader2 324 1 69.31 CCAACAATTACTCTCAGCACAGAAAAGGTCTGATCAACCAAAAAAAATAAAAGAAAACCCAAAAAAAAAAATATATATATATATTCTTCTAAGAAAGTTAA:1 + chr3R 3953119 3' + Porto1 380 1 58.42 TTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGACTTGCCCCTTTTGCGTGCTTCTTTTGGGGTTGCAAAGTTTTGGCATTCCGGGAGTTGT:1 + chr3L 18065617 3' + 1360 427 1 63.37 TACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCA:1 - chr2L 11919295 3' - X-element 53 1 66.34 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTT:1 - chr2R 18105752 3' + roo 9043 1 55.79 GTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCATTTACACTGACTGAGTCGAGCTTGATCCGGACTTTTCCTGAC:1 - chr3R 6125676 3' + Doc 180 1 58.42 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTACATACTAAATACAAATAAAATTTAATAAAATTCAAGTCCTCCTTTTGCGATGCGTA:1 - chr2L 13334819 3' - hobo 19 1 60.40 TATACATACCTAATTATACNTAGCCAATCCGCTCATTGTATACAATCAATATCCCAAGCGGGCGATCTCGATCGCGAAATAATATAAACAAAATAGCAGTT:1 - chrX 21088057 3' + mdg3 43 2 70.30 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCCCAT:1 - chrX 5452553 3' - mdg3 34 2 56.44 TGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACC:1 + chr2R 2868557 3' + Rt1b 4729 1 44.55 AAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAACCCTGACTTCTTCTTCCGAGATTACATTACATATATATGTTTCTCCATACCTAAATACATA:1 - chr2R 2323722 3' - Max-element 409 1 60.40 TTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGCTTCAAACTGACATCCAAAACGAATCGGGAAAGTCCTACAGGAAGAGAAAGCTAAATCAAATAAGCGAACATCTCGTT:1 - chr3R 11278226 3' + hobo 431 1 80.20 GAATCGTTCAGTTAATTCCNCTGAACTTAGCCTAATGTTAGTCTAGAATTCTTGCTTAAAGTGTGCAAGCTAGCATAATCTTAAATTTGACTTCCATTATA:1 - chr2L 20124707 3' - G5 4796 1 67.33 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTGGG:1 - chr3L 24150529 3' - blood 7050 2 65.35 TGAAAAGGATAATCAACCTTTATATTAAATCAAGTGGCGAGCGGCAAGCGCGCTTATGAAACCCACAGCCATCTCCTCTCCTGGCAATCCAAACAAACAAA:1 + chr3R 12874330 3' - hopper 1148 1 75.25 GATTGATTATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGTGATCTGATCTGATTCTGATTTCTCCTTATTGTTTCTTGAGCAACTTGATGTTTCCCGACACCACCAC:1 - chr2R 16328280 3' + hopper2 1356 2 67.33 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTACATATGTATATTTCTACTTGCAACAGCAACGCCAACTGCGATAG:2 + chrX 2164328 3' - mdg1 7069 2 56.44 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATCCAATGAGTTCGCACTCGGAGTGAGATTTAAGTGAGTATTT:1 + chr2R 8232575 3' + P-element 2884 2 74.26 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTTAATTGCATCTGTGGCTGCACAAATTTCCAGAG:1 - chr3L 5403249 3' - copia 4909 2 69.39 GCCAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGGACCGGGACGAGGCTTTCCGGGGAAAACGTCTATGGCATATCGGTTTGCCGGAGAAGGGGCACATTTGTTG:1 - chr2R 20857756 3' + hobo 2935 1 75.25 GTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGAACAGCAATACCTGGAAAACGCAGAACAATATGTGTCTAAAGTTGAGGGCAGTGAGGCACAAGAATAT:1 - chr3L 27719974 3' + G2 2634 1 72.28 GTTGTCGTATTTCATACGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTGGTTAACTTGTAAATAATGCTTTTGGTTTCTAAATTCCAATTGTGCAGATCTATCATCTA:1 - chr3L 23354628 3' - gypsy2 28 2 57.43 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACAACAGACACGCAGAGGGCGACAAACTCGCATTTCCAGACTTGTCGGCGCGACTTTCTGGCCACAG:1 + chr2L 19997284 3' + roo 397 1 66.00 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTT:1 - chr3R 11151848 3' + mdg3 219 2 75.71 TTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCAC:1 + chrX 21907815 3' - gtwin 6938 2 50.50 GCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTTTTACCTGACTCACCTGTAATACGTATTCCCCTATCTACTCCAACCATCCCCCCTGCGTCCGACGAT:1 + chr3R 18006531 3' - accord 185 2 61.39 GCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGCCTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCACTTAATTGGGG:1 - chr3L 4235598 3' - jockey 4579 1 63.37 AAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACAGCAGCTGTGCCCGATGCGAG:1 - chr2L 14799125 3' + hopper 1365 1 69.31 CATACTTTTCAACGAATCTAGTATAGTATTATATCCCATCGATGTAATTTAATAAAGGTCTCAGTTTGTAACTCGTTGATATTTAGCAAGACAGGGTATTT:1 - chrX 20453583 3' - INE-1 11 1 65.35 TTGCCATGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTGACACGCCCACACATTTGGAAAATGTGTGGAAATTTTTTCTCATTTTTTTTTT:1 - chr3R 28630797 3' + INE-1 211 1 74.19 ACAATGAACGGTGGCTTGCGATCACAAAAATAAAGGAAAATACTTTCATATTTACGATTGTAACTTATCTAATTTATTATCATCTTCGTCTTATTAGGACT:1 - chr3L 6064938 3' + HMS-Beagle2 7157 2 51.49 TTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCG:1 - chrX 15746295 3' - jockey2 3226 1 50.50 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGGGCAATGGTGAAAGCTGCCTGCGGGACAGCAACATGTGTTTTGTCGCATTT:1 - chr2L 18413823 3' + hopper 1392 1 57.43 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCT:1 + chr3R 30611295 3' - blood 44 2 68.32 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATGGCTGATATAACATCATTAATCCGATCAGATATCCCCCAATATGG:1 - chr3R 4769449 3' - copia 4900 2 53.00 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCA:1 + chrX 11025569 3' + hopper 1380 1 63.37 GCATCTGGGCAGCGGAGCTCCACCTCGAATAAATTTAGTGTCTTTTTTTTGTATTGAAATTGTTTTCTTTTACTAGGAGAGAAAGAGATAGAATGCCACAG:1 - chrX 9588235 3' - X-element 203 1 64.36 TTTTTAAGTTACCTGCATCGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATATATTTATAACATTTTATTATCGTTGCACTTG:1 + chr3R 20791720 3' + pogo 2058 1 68.37 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAACACTCAAAACAGCAACAGCGCAAATAGAAGTAGAAACCGGA:1 + chr3L 5976391 3' - hopper 31 1 55.45 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCA:1 + chrX 11025569 3' - hopper 28 1 51.58 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAAATGTATTAAAGCCTGTTTTACTGATATATCAAGAAGTATACAAACATCACTGCATTTC:1 - chr3R 24945051 3' - transib2 64 1 62.38 AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATG:2 + chr3R 14049446 3' + transib2 2822 1 75.25 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCGCACTTTGAGGTTGAAAAATAATCTTAACTTTCTGCGCAATCATTTTAGATACTGG:1 - chrX 152951 3' - mdg1 7058 2 59.41 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAACTTAGACTTATATTTTCGGTTCAAACTTATTCTCGTGAAAGTTTCAACTATTATTTGATGAT:1 + chr3L 1927503 3' + mdg3 231 2 64.36 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTCCGTGACCTCTGACCTACTGGTAGCCCT:1 - chr2L 4149078 3' - FB 49 1 72.28 ATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACTCCAACATAATTAGTTTAATTTGCACAATGAGATGCTGGTGCTGATGGCGATGGCGATGG:1 + chr2R 11820963 3' + gypsy6 346 2 61.39 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCGGTCTTTTGAATATGTCTTTTATGTGTACTCTCTCCAAAATATTAAAGTACAAAATTTAAGTAAA:1 + chr2R 18077130 3' - Transpac 4928 2 66.34 ACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCAACGCCCACGTTTTTCAGTATTTGCCAAACACTCGAGTTTCGGAACCTTTTTGCGGATTGCGGTCGCAACTTTC:1 - chr3R 7688835 3' + Tirant 8505 2 78.22 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTGAAACTGCCAATTAAAATGTT:1 + chr3R 14860182 3' - BS 5004 1 66.67 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACATTTAATAAAAAAGTTGTTATTAGTAAACGCATGCATATTATTATAAATAAATTAAT:1 - chr3R 26123003 3' + roo 9048 2 52.48 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAG:1 + chr3R 7688929 3' - Tirant 8148 2 68.32 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTC:1 + chr3L 153635 3' + 1360 3346 1 71.43 GAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAATTGCCCAGCATCACGGTTGATGCCTCCCGCACCATGGCGACCCCAACTCCG:1 - chr2L 3749032 3' - roo 345 2 60.40 GCCGAGAACCCTGATGCAANTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAAAACAATGTACCACCAGAAATGTGG:1 - chr2L 1432012 3' + opus 482 2 63.37 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCAATAAGGCCAAAGTTCGTACTATTTCAACGCCATTGCCAGTCAAATTTGTCAATAAAATAATTTTGCA:1 - chr2L 13470580 3' - 3S18 5788 2 70.30 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATC:1 - chrX 7534657 3' + Tirant 8497 2 64.29 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGA:2 + chr3L 16973473 3' - S-element 7 2 71.29 TATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 5414 2 53.06 ATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATA:1 + chrX 23108302 3' - BS3 1446 1 66.34 ATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACGTAGAGTTACTCAAATTGCCA:1 - chr3L 18551970 3' + Juan 320 1 79.21 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGTCGTTTGGTTCCTCTCAGTTTGTATTTAGCGCCTGT:1 - chr2R 10874723 3' + P-element 2849 1 39.00 ATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAGCAACGGTAACGGTTAAAAAAAAAAGAAGGGGAGGCAGAAAAATATGAAGGAGCAGTGCGACAAG:1 + chrX 2984244 3' + Bica 487 1 61.00 TTTTATTTCCTTTTTTAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 12679922 3' - copia 239 1 83.33 TTGCATGTCCCTTACAGATTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTAGGTAGAATCATATGACTGCAACTAATTACGGGCCTAAAGAAAAAAC:1 - chr3L 22534485 3' + Cr1a 4175 1 54.46 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTAATAATTTCTCAAAAATGTTCATTATACGGAATGGAAGTCATATAAATTATGT:1 + chr2L 20397008 3' + Transpac 5210 2 60.40 ATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACTGCTGATTGGCCGATCTCTTTCTCTCACTCTGTT:1 + chr3R 9420486 3' + 1360 3091 1 66.34 AGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTTAAGCCCAGTTTGTTAGCCCAATTAACAAATTGATATCGTACGTTAGCA:1 - chr3L 16463309 3' + INE-1 550 1 66.34 AGGGTGAGTAAAAACAAGAGACGTGCCAGAAGACGAGCCGAAGACGATTTCCAGCACGGCATGTGGTTGCTGCGGCTTCTGGCGTTGGATAGATTGGAGG:1 + chr2R 18258525 3' - 1360 3243 1 49.00 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCATATTCACTAGCGGCATATTGGCGATTTGGGTTTTGGGATCAGTTGGTCGCTTTGGGTGC:1 - chr2R 15302976 3' - FB 16 1 61.39 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTATGCGTGTTCTCTATAAAATTACACACACAAATAAAATTTGTATTGAATAGTTGT:1 - chr3L 25120154 3' - pogo 18 1 61.39 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTACATATGTATACACATATGAACACGCAGCTGGTAAACAAATTAGTGTGCAAATTTGAGGCCCATTGTTCGATGTTTT:1 - chr3R 15546976 3' + pogo 2098 1 78.22 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTT:1 - chr3R 21276555 3' - BS 5034 1 60.40 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATAATTAAAATTTGAAGTAAAACAA:2 - chr3L 11758383 3' + roo 356 2 79.21 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCAACGCAACACCCTTTTGTGTGAGTATGTGTATGTGTGTA:1 - chr2L 448066 3' + hopper 1375 1 61.39 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACCATCACCAGATGGGTCCCAGGGTCAACTGGTGGCTTGCAAATGCATTCCGAGAAACGGGA:1 + chr3L 6866258 3' + 412 478 2 64.36 GCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACACACACACCACACACACGTGCGCGACACGTATAAATATATATTACAAAGGAAGAAAATAAT:1 - chr3R 27565099 3' + accord 7075 2 69.00 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGA:1 - chr3R 18171784 3' + 1360 3344 1 73.27 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATATAAAATCGCTAGAAATTATATTTGACCGTTTTTAGAAGAGAGCTAAAAAGTATGCAACACAATTGGTCAGCCGA:2 + chr2R 19253940 3' - jockey 9 1 63.37 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATACCGATTATTCGGAAATTGAACCTTGATATCACAAGCCGGATAGTTCCTGGCGCTCAAGCC:1 + chrX 21581195 3' + 297 6964 2 67.33 AATGCATTACAATTATTACACAACTGTGCATCTGCATCTGCATTTTTATGTGTGTGCGGGTGCGCAGTATATTTGTTTAACTTATGTGTGTCGGATTC:1 + chr2L 15548843 3' + Tabor 487 1 79.59 AAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATCAAACTTTTTTTCTCGTCGTTGTGCATTTGCGATATTTACTTCAC:1 + chr2L 17877270 3' - hobo 365 1 57.43 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTCGGGGCGAAAGTATGGGGGATTAAATCGATTTTCAGACCTCGGGCTTTCGTTGTTTA:1 - chrX 9463344 3' - hopper 20 1 55.45 GTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCGTACAGATTCCAGAGACAAAGACCAATCGCAAGTTTGTTGACCCATGTT:2 + chr2R 5296381 3' + INE-1 137 1 85.15 AAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCGGCACGCGGCCAAAGATACCTCCACCCACCGCTCCAAAGCCGCAATTAAA:1 + chr3R 26585246 3' + hobo 2622 1 56.84 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCAATGATGTCATGACCCCGCCGCCTCCCAAATTGAATTTATTTTCGGGGTTCCCAGCGGCATATTACGT:1 - chrX 9077562 3' - jockey 4748 1 74.26 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCACAGCTTTATGAATATAACGAGCACGAGAGCGGGAGCGGGAGTGAGCTC:1 - chr2L 20821744 3' + 1360 3360 1 55.45 ACATAACTTAATCTAATAANAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACTATTATTTTGAAATTTTTTAATTGAGCA:1 + chrX 19812435 3' - Transpac 24 2 55.45 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATTGGCTAATAAAGTTCTCGAAATACAGCTGAATTTGCAGAACGAAAATGCGG:1 + chr2L 9618736 3' - FB 21 1 57.58 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTAGCTATTAGAATTACATTTGACA:1 + chr3L 24253695 3' - Quasimodo 11 2 69.31 TGTGTCAGATACTTTAATTCTAAGAACTTTAACATTGTAACACACACACACACACACACACACAGGGAGCTGTATAAATAGACGGCCGACTAACACTGGAC:1 - chr2R 10002622 3' + ZAM 8194 2 61.39 GATATGAGTTTGAGCACATNTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGGTAAAGTAGAAATACAATA:1 + chr3R 27547666 3' - Juan 3836 1 63.37 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTAATAGCATGGAGTATACTCATATTGCAGCATACTTTTAGACTTTATATTTTA:1 + chr2L 3740618 3' - hobo 25 1 51.49 GGCAATAATCATGCACTCCAGCCGGTAACATGGAACAGAAGCGACACGAGCGCCACAGAAAATGTGTATATATTTTTTCTTAATAT:1 + chrX 9019809 3' + BS3 1462 1 62.79 ATTTAATATAAATACAATACTTTCCGTTTTTTAAAAAGAATTTAAATCAATTAAAGCCAAATAGAAATTAAATGTAAAATACATTGTAAAAACTGCGTTAA:1 + chr3R 18433620 3' - Bari1 1396 1 87.13 GTTTTGAGACTTTATTAACNACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATAATGTATGCATATCTCTGCGCCTTGGACTTTTCAGCTCAT:1 + chr2L 18927539 3' + mdg1 390 2 56.57 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAAAATTGTTTTATTGAAGTCGTCTTTTAAATTTAATCAAATCAAATTTAAAACTATTGC:1 - chrX 23008461 3' + S-element 1702 1 62.38 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTACCTATCGCTCCTCCACCTGAACGCTATCTATCAAATCAATTATGCTTT:1 + chr2L 6322607 3' - roo 8691 2 52.48 AGTGCTGTCCTCTACCCACTAAAAAATGTGTATTTTTTAAATTTATTGCCCTTTTAAATATGAGAATTAGCGGCAAATTATTTATGAATGGGGCGAGTTTA:1 - chr2L 7511587 3' - HB 348 1 62.38 GGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAAT:1 + chr3R 934261 3' + Rt1b 4755 1 58.42 ATGCACGAGCATACATGTGCACACATACAGTTGTCTGCCATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGACGGTCATAGAGTTGACAAAAGAGACAGCAGAACAGCAG:1 - chr3R 23195990 3' - 1360 182 1 61.39 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATCTATTCATTTACCTACATGTTTTCTATA:1 - chr3R 21608776 3' - copia 4916 2 73.27 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTAATAGCATGGAGTATACTCATATTGCAGCATACTTTTAGACTTTAT:1 + chr2L 3740612 3' - hobo 31 1 57.43 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTA:1 + chr4 311566 3' - 1360 51 1 76.00 ATACACGGCATCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGG:2 - chr3L 16047628 3' + Cr1a 4405 1 56.44 AAAGAGAACAGAAACGAGGGAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATTATTAGTGTGAGCAGGACCTAATTATGTAGTAAAAAATTTAAAA:1 + chr2L 259004 3' - Cr1a 4342 1 74.26 TCACAATTCCCTCATATATACATACGCAGACGATGTTAAACCTATTATCCTAAATGGAGGTCCTCTAAATCCGCCAGCGCCGCCACCACACCGCAGCTGCC:1 - chr2R 22109622 3' + Q-element 31 2 69.31 TTGGGGAATTGCGACCAAATCGAATTATAAACACTGGCAGTGACTTCAAAGGGCGCAGACTCCTAGATACTTCTTGTTTAATTTTTAAGTGCAATTTTAA:1 - chr3R 7479071 3' + Helena 1089 1 73.00 TTCTTGTTCAGAATCAATAGCCGAGTCGATCGGTTCCGAAAATAAATGTACCTTAACCACATCATCGGTTCCGACCATCACAAAAATCGTTGGCGATGACA:1 + chr3L 23961566 3' + INE-1 87 1 70.30 AGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAA:1 + chr3R 25514154 3' - hopper 32 1 78.38 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTGCATTATTCCAATTGCAGAATCACTTTGTCCTGTTTGTGT:1 + chr3L 13367754 3' - mdg3 35 2 55.45 ATAATGCTGCTTTCATTTTTTTTACAATTCAGAAAGATTATATCGGTTATTCGTTCATAAAAACCCCGAATGGCTCAGGTGCCCATTTGAGCAGTTTTCAG:1 - chr2L 8603557 3' + transib4 61 1 82.18 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATATATTATTAAAACAACAAGAGGGTGC:1 - chr2L 4764037 3' - Tabor 6889 2 71.29 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTATTGTTGTCAAAAAGACCGCAGAAAGAGACAACAGCAGTGGGCCACAAATCATATAAAACACTTT:1 + chr2R 9950241 3' - S-element 6 2 73.27 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATATTTTTTTGTTCCCCACTTCGTTCGTCTGACGAGTGTTGCCTACTTTGGAGCGTCAAGTAAATTGCCA:2 - chrX 4422585 3' + jockey 4986 1 70.30 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACATTGAATGTCCAAAAAATG:1 + chrX 3691573 3' - jockey 4789 1 56.57 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAACGATACAAACAGTAGCATAACGTCATACAACCTGCGTCTTTCAAAGAAAACCGGAACAG:1 + chr2L 21628951 3' - P-element 14 1 66.34 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTTTGAGCTTTGTGTTAATCTTATAGCTCTTTGCTTCTAGTAACTTCTTCAAACAA:1 - chr3R 8434246 3' + roo 9050 2 57.43 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCGACCATAAAAAATCCGCAACGCTTCCC:1 + chr2L 3766341 3' + hobo 2892 1 76.00 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTACCCATATTCTGTTGCTTCCCCCTAAACTGTCCGCCTAACTGAATGTCCTTTCATTAGCGAAGCGGGTG:2 - chr3R 9085010 3' + mdg3 241 2 73.27 TAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTATAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACAAATTTATATTTATGTTTAAACATTTTTTCATTTTAAGATGCGAAA:1 - chr4 336457 3' - 1360 3010 1 74.26 ACAACGCCTAATCGAACCANAGACAGCTCTGCATAGACCCGAGGACCGAAAAGGACGAAAGAGCAGTGGGCAAAGGAGCGAAGGAGCAAAGGATCTGCGCC:1 + chr2L 10915708 3' + gypsy9 4945 1 59.41 TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAAAACGCCCTGATCTCG:1 + chr2L 22044560 3' + S-element 1704 1 67.33 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAAAGCGGGTCGCTATTCA:1 + chr2R 11404022 3' - mdg1 7054 2 61.39 ATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATGTGAACACGACAAGCCACTCCGGCAGACTGACCCAAACAAACGCCGGCATTTGCAATAATATTATT:1 + chr3R 22530587 3' - hobo 2719 1 70.41 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAACAGGGTTAAGATATTAGAAATCTTTGTTTATTATTCGTGGATGATTAGAAATTGTTAGGG:1 + chrX 3546397 3' - pogo 11 1 67.33 TTTTATATATTTGTATATTNATAAATTTATATTGTATATAATTTCCTAGAACACAATCAGTTCAAATGCAAATGTATCTTCACAATGTATCTGACGACCTT:1 + chr2R 21869117 3' - Stalker 93 4 86.14 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGACACAGAAAACTGGATTCGGTCTCGGGTATTTTATTTTGTTTTCACAGTGGAAGGGGGCGCACAGTCG:1 - chrX 2123663 3' + P-element 2881 2 73.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTATTGTAGAATCAATAAATACCT:2 + chr2L 3475316 3' + roo 356 2 81.19 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGTCACGTTTTGATCCACTTTTCGGCCTAATTCATACCAAACAAATAA:1 + chrX 6075285 3' + P-element 2857 1 49.50 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTT:1 + chr3L 12634228 3' - BS 5025 1 56.44 TTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATGCTTCCTCTTCCCACACTCCCTCTTTTCAACGTGTGTGTCTGTGTTTCTCTGTGCTCCATG:1 + chr3L 16807260 3' + P-element 2769 1 65.00 CATTCAGATCGCTTTCGATATCTCTGGTCCTCATATACCAAGGAGCGCCTGTAATCTTCCCCATTTTTGAGTTGACATCGTTTTGGCCACTGCTGCCACTT:1 - chr2L 2083844 3' - jockey2 3021 1 59.41 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCACACACAACAAATGAAATATAC:1 - chr2R 23877743 3' - Transpac 4970 2 76.24 GAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAACCATCAGATGTAACAAGTAACGAGCTGACGCGGAATGCACAATTAAAAGTCTGCGGAT:1 + chr2R 12664422 3' - F-element 363 1 64.36 AAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCATTTATCTCGGGTGTCCCCACCCAAAACCCCAAATCTCCAGAAAAAAAA:2 - chrX 19219264 3' - Doc 2 1 77.23 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTAT:1 + chr3R 30611304 3' - blood 7046 2 59.41 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACATACCATTCTGCAATAAACTTTGGCACTAG:1 + chr3R 5700180 3' - mdg1 9 2 70.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGTCTGTCCGCCGAAAGTGCGAGAGCAACCACTCAACTACACTCGACAACAAAACAGTCATTTATTT:1 + chr3L 5355434 3' - P-element 9 2 71.29 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACAAATATAGATAAATTCTTCTTCCTTGCGTTGCAAGAGCTTGCAACACTTATGAGG:1 + chr3R 4674850 3' - FB 22 1 57.43 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATGTATGTAGGTGGTAGTTGTTTGCTATGGGCC:1 + chrX 17266304 3' + I-element 5308 1 68.32 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGATTGTGAGCGCGTTTCGTTATTAATTGCCGATCGATTCGATTCGTTCGATGGTTCACACGATGGCG:1 - chr2L 20709362 3' - roo 9 2 71.29 ACACACACACACACACATATATACACATTCACCCAAACCAACCAATGTTGTCTGCCATCTTTCAATTGGAATAGAGTGGTTACACCCATGCCTAACTACAT:1 - chr3R 4973116 3' + accord 185 2 68.32 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACAGCCTCCGAAGAGCTAAAAGCCCAACATTTACAACAATTCGTTAGAGCACCTACTTCCATCATCACCAGC:1 + chr2L 13433997 3' - hobo 5 1 74.26 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCCATAACCTTTTTGTGAGCAACAACAAAATAAAGTTTGTT:1 - chr2L 18297835 3' + hobo 2903 1 63.37 CTGTGAACACGTCCACTCGNTTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCATTTCTATCAGCAGCCACACAAAAACTAATTCCACATAATGTGCCAATCTACA:1 + chr3R 8705358 3' - jockey 27 1 58.42 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGCATTTCGATTACACTGGTGAACCAACAAAATATGAAACGAATAAAAATATGAATTTTTTATATA:1 + chr2L 13566815 3' - FB 13 1 64.36 CGTCGCAAGCTGAATGCTCTAATGATATTTATTCTAATATAGTCATTTTTTAAATTTTTTGATGCTATTCCAGATGGACGGCCCTTAGAGATTTCTTCTAC:1 - chr2L 21151963 3' - 1360 413 1 56.44 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGACAGGTCAATTGCAACTAACCGTACTGGAAACTT:1 - chr3R 23683369 3' - 297 6602 2 57.43 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTATCCTCATGCATCATGGGTATCATAACGCTCTTTGTGGCATTTACTCGAAACTCCCGGGGATATGTGGCCT:1 + chr2R 17123653 3' - mdg1 7045 2 71.29 TTTTTCAAAAACAAAAAAAAACTTGCATAGAACTGACACGACGGGGTTAAAAAACCATAGTATTTCTTTTCCTGTTTAAATTGGGAAGGC:1 + chr2R 20842823 3' - Tc3 1552 2 31.11 TTTGGGCGGACGTGAAAAANAAGGTTTCTGAAGCCGAAAGAGACAGCGAGTGTGGTGGTCCGGAAGGAAAGGAAACCACTTCAAACATTGACCATATTTAT:1 + chr2R 14517022 3' + Tc1 1173 1 68.32 TATAAATTATAAATTACAANATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTATCATTGCGACTGGTTTTAACAAAGACACTAGAATTCTAGTGT:1 + chrX 22897264 3' + copia 256 1 45.54 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTAA:1 - 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McClintock 28 2 60.40 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAGTTCAAAGGACTGCATATATATAAACATTTAAGGCTAAGCAATATTTAAAATTT:1 - chr3L 8905699 3' - pogo 18 1 57.43 GATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCTTACTGCTTACTCATTGCCACTAAGTTCCCATACTCCCGTAGAAACTTGGGGATGGCTGTTGATCAGCTACTTGA:1 + chr2R 1774481 3' - Burdock 6051 1 67.33 AGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCCAGGGTTTATGGACGAGGACGAGTGAGGGAGCATCGAAGTTCAGATTT:1 + chr3R 28447184 3' - F-element 362 1 56.44 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGA:1 - chr4 311220 3' + 1360 3346 1 70.30 TTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAATAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCTTGATTAATTGCAATTTTGTTATGCCCTGAGCC:1 + chrX 6205669 3' - Burdock 6382 2 65.35 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTGATCCACTGTATTCATAACTTA:2 + chrX 15268319 3' - roo 8681 2 60.00 AAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTGGCCACTGAAGATTCGGTTACACAAGTTCAGTTAGAAGGAAGTCGCGCGAAAGTAGCGAT:1 - chr2R 7622347 3' + Rt1b 4892 1 64.36 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACATACATACAACTATGCAAATCGGAACGAAAATGCTGTCTTCCTGCAGTGTATCCTATAGCTAAAAA:1 - 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roo 8708 2 72.28 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGGTATTTATTTGTTTAGAACTTCAAGTTTAGTTCATTTTTTAAAGCAAGAAAGGCGAAAAACTGACAAC:1 - chr2R 13712124 3' + mdg3 5491 2 46.53 ATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACACGTTCTCCCAAAAAAAAAAA:1 + chrX 8443403 3' - Doc 4314 1 58.33 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCATCCTCTAGCTGGATTCTATGGACGTGAGCAGCAAACGAAAATT:1 + chr3L 5255981 3' - jockey 56 1 56.44 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTCACAACTTACAACTCACAGCTTGCAAACACACACCCAACCCCGCAAACAAAACAGTTG:1 - chr3L 6866157 3' - 412 7070 2 60.40 TTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATATAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTC:1 + chrX 19192431 3' - INE-1 14 1 72.73 TACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTATGGTTGGAATGGGAAGGGGTGGGGAGTGGTGGAGGGGCACCAGGAGCACGCCTTTATCTTT:1 + chr2L 8419676 3' - Q-element 249 2 75.28 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTATTGGTGTGTATTCCGCTGAGCTCGTGCGTGTGTGCGTTTGCGGAGTATTTACATGGGAGTTTTTC:1 + chr3L 19792048 3' + roo 401 1 71.29 ATAAGAATATTTGTCATTAGAATTTTTCTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTA:1 - 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chr2R 13574607 3' - Cr1a 4324 1 37.62 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACACCCACAATCGTCTAATGACGCTGAATAAACTAAGCCCGAACAATTTAA:1 - chrX 5194502 3' + hobo 2912 1 55.45 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGTTTTGAG:1 + chr2L 15174188 3' - Juan 4040 1 62.38 ATAACAATAATAATAATATTAATTAATAATAATTTTCATTATTCAATAAGCCCTACTTTGCTAACTTTTAATCGACTGTATTCGTCGCACATCATTGTTTG:1 - chr3L 14957616 3' + mdg1 32 8 80.20 CTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAAGAGTTCATCATTACAAATCCTTCAAAGGCTACACATTTAATGGCATTTTGACGCTGCCGCCGCTGATAATGATG:1 - chr3L 6084349 3' + 412 7526 2 57.43 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCATGCAAATTGATGTAAATATAAATGATGCTCAAATATTATTTACACT:1 - chr3L 22112631 3' - Doc 26 1 54.35 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATCCATCGAGAGTCGATCTGCCCTGCATCAAAGTGCAATA:1 + chr3R 12937511 3' - roo 8676 2 68.32 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATACATACATAGAGTCGAATGCCTGCTAAAGCGATATGAATGGAGACCC:2 + chr3L 19778847 3' + flea 4990 2 56.44 TATAGGTATAGCTCGATCTATAAATAGGAAACACACTTGAGGCTTACGACTATATTTCTTTATTTGTTGCCAGCTTTGGAGACACAATTTAGCGGCAGCTC:1 + chr3L 25262936 3' - Burdock 6197 2 57.43 GTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTAGCAGTGGGTAGTGGTGTTGGAAAAGGGGACGGGAAATGGGGGGTTGTGTGTGCGCAACGGCCTTCG:1 - chr3L 10721444 3' - accord 187 2 32.97 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACCCCTCAGCACCGCGCCAATGTGGGTCATAAGAGTTTATCATCAACAAGCTGCCACATCCTGGCC:2 + chr2L 8646761 3' + Tirant 391 2 60.40 AGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATAAAGGTGTGTGAAGGAGCTTTCATTCAGCGAGAATATACCATATCACTTAAGTTTTAA:1 + chr3L 7488761 3' - Cr1a 4333 1 53.47 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCACACCCCCCTGTTGACTCCTCCAGTGGCTGCCCAACAACCTTTACCTCGCAGCTTTGCATCACGTTTGC:1 + chr3R 14593752 3' - hobo 7 1 65.35 GGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGCTAGTCTCCGCCCCCCTGTTTTACCA:1 - chr2R 22347804 3' - X-element 4499 1 74.26 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACTTAAGATCTAATAAACTTTACATTTGTTTGGCTTG:1 - chr2R 18061281 3' + Tirant 8429 2 65.35 TAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGTATGGATGTTTGTTCTTGCAAAGAACTCGTTTC:1 + chr3R 5545290 3' - accord 226 2 63.37 AATAGTGTGTGCTCTTAGTNGTTAACTTACACATCCAGAATAGGCAAAAACTTAAACGACACGTTCTCTTGCACGCAATTACCATGGGCAGACTCAATGGA:1 + chr2R 6482764 3' - gtwin 6922 2 73.27 GACTGGTAACATTAACATATTGCAAAGTTTGTTTACGTTTAACAAATTAAGTTATATTACAAAAAACATTGAAATACATAATGTATATAAAACTATTTTCA:1 + chrX 6043313 3' - HeT-A 5848 1 74.26 ATAATGCAGATATCTTGCTGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTT:1 + chr2R 1373179 3' - pogo 38 1 60.40 ATTTAAATGTTATAAATTGAAAAGAAAAAAAAAGTCAACTAAAAAACCAATTAAAAAATCGTTCATTTGGGCAAACAAATGTGTTATGATTTTTACTAACA:1 + chrX 2419982 3' - Tc1-2 1409 1 63.37 TCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTACAAATGCTACTTTACTCACATTTTGTTGCTCTGTGTT:1 - chr2R 7132474 3' - opus 14 2 65.00 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTATTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGT:1 - chr2R 11403957 3' + mdg1 369 2 73.27 TATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGTGTATATTCAATTGAGGATTTAGCAATCACATTACTGGCACTCGTTACATTGAAGCAA:1 + chr2R 9811373 3' + Quasimodo 7358 2 71.00 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAGCAATATTTTGAAGTGAATTATCGTGAAATCAAGTA:1 + chr3R 25422049 3' + copia 5084 2 68.32 TGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATCATGAGAAATCTACGCAGTTTTTTTTGTG:2 - chr2L 11919263 3' - X-element 21 1 63.37 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACGACTTGAGTTTAATTCAGTCGCT:1 + chr2L 7461150 3' + roo 397 1 67.33 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAAGCTGCAATTTTGTGTTTAGATCCAAGTTCATAGACACCTTTCGGCCGAA:1 + chr3L 12879068 3' + roo 386 2 50.50 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGCCACAAGAAACGAACTTGAACTTGCTCTCTTG:1 + chr3R 25208381 3' - P-element 42 1 37.00 AAATATATGTCAGCCCGACNGCTGCTTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACTTTGAATGCCAAATTCAAATTGTT:1 - chrX 8982938 3' + 412 7495 2 72.28 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTAAACTTTACTTCTGAGTATTTA:1 - chr3L 3822396 3' + pogo 2069 1 67.03 TAATAAAGCAAAATAGATCTCTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTT:1 + chr3R 9858888 3' - BS 44 1 71.29 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCATTCTCATTCGGTCTTTTGAAATAAACGC:1 - chr3L 16807700 3' + P-element 2872 1 65.35 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGAACCGAGCGATCGTAAAACTCTTCGGCCCCAGGCCCACAATATCAGTCTGTCCGCTG:1 - chr3L 5355331 3' - P-element 18 1 61.39 TTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAGCCATGGGTTTGTGGAAACGTATTTTCACACC:1 + chr2L 4378753 3' - Juan 4198 1 52.78 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATGTTTCTCTTACTTTT:1 - chr2R 13446653 3' + roo 9039 1 61.39 AGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTCGAATTGGATTAGGATGTTATGGGACAGGGTGTATTGACCACG:2 + chr2R 3068426 3' + Stalker4 375 4 57.43 ATGTGGTTTAAGAACAAAATGTAATCTGGCAACATTTAAAATTTTAATACTACATTTATTCATTTTTAATAAAATGCTTATCAATTTCTCCTATATTTCCT:2 - chr2R 16159447 3' + transib2 2754 1 72.28 ATTTTTTTTAATTAACACTTATTTCCGCTCGACAAATGCTCCGTGCTCTTTTTTGTCGGCAGAAACCTTTTACTTTCCTCTACAACTCGCCTCTGCTTACA:1 - chr3R 25738263 3' + S2 91 1 65.35 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACCGATGTCC:1 - chr3L 771746 3' + roo 393 1 60.40 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAA:1 + chr2L 7461118 3' + roo 9028 1 69.31 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGGTTCTGACAAAAGATAACTCCATTAAATACTTATAAATACATAAAATAGAAAGTTCT:1 + chr2R 13712227 3' - mdg3 5267 2 46.53 TGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGATGTCCTTAACATCTGCATTTAAATGTGGTGGAGAAGAGTAATACAATTAA:1 - chr3R 14980454 3' + 412 7539 2 71.29 AGAGAAGATCCAATAAATAACGAAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGC:1 - chr2R 8642894 3' + Doc2-element 4748 1 52.48 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAGCAATAATTTATGTCGCCTTCTAAGACACCATACATA:1 + chr2R 10777870 3' - pogo 36 1 66.34 TAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACT:1 - chr3R 15924590 3' + Quasimodo 7342 2 56.44 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTCCGAGGCCAAATCC:1 - chr2R 7173625 3' - mdg1 31 2 55.45 TTTTTTTTAATATACATATATTTTATATGGCCACATTTAAAAGCCGACTATATCCTGGACAATATGTAGTAAAACGGATTTCCTTTTGGCCAAAATCACCG:1 + chr2L 5104792 3' + S2 92 2 52.48 GGATCAAAGGCGAGCTTAAGACAGAAGGGCAGAAATGAACCGGAGCGAAGCACTGCGCTTTATTTATTCATCCTGCATGCATATGTAAAGAGACGCTCAGG:1 - chr2L 13471704 3' + gypsy7 82 2 76.24 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGTTATTCAATCAGTTGTAAGAATTGAGTTTCATG:2 + chr3L 7204095 3' - Tabor 45 2 66.34 AAAGTCTTCTTATTTGGGANTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCGATTCCCGTACTCCAGAATCACAAATGTGG:1 + chr3R 25198890 3' + roo 404 1 67.71 GGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGCTTTTGTGCTTTGGCGCCAGATG:1 - chr3R 16594447 3' - Tirant 8106 1 79.17 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTAT:1 - chr3R 19446202 3' - roo 8717 2 82.18 TAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCACCATAGTGGACTGGTACGACAAAGGACGAC:1 - chr3L 13366386 3' + hopper 1363 1 72.63 AAATAAAACAAAAAAAAAACAAAGAAATATGTATAAAAAAAAGGGGGGAAAAATAGAAAA:1 + chrX 16507563 3' + F-element 4687 2 85.00 TGAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTCCTTGACAAACTGTATGTATGTAGGTAATTTCCGAGACCTAATTGAAAATGCAAATTA:1 - chrX 22560600 3' + S-element 1681 3 91.09 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACCC:1 + chr2R 5952569 3' - 1360 62 1 77.00 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGAACCGAGCGATCGTAAAACTCTTCGGCCCCAGGCCCACAATATCAGTCTGTCCGC:1 - chr3L 5355333 3' - P-element 20 1 59.41 GGAACCACGGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGCAGAACACGAACGGCGATACAAGTAAAAAACTGCCAGAGAACACA:1 - chr2L 3816603 3' - HB 491 1 60.40 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTTTCGCTGCATACTTTTGGGCAGC:1 + chr2R 10857764 3' + BS 5072 1 47.52 GTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATATCGATGACTTGGCCATTGAGTGGCTGCCTGGATGCTGGCATATGTA:1 + chr3R 8199378 3' - Doc 4467 1 53.47 GTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGAATCTGCTCGACTCGATTCCATTCATTAGAAATGCTCACTAATGTGCCCGACTTAATAATAATCAAATTTATATGCATGG:1 - chr2R 14804353 3' - accord 254 2 78.22 ATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAACCCCATAAATTAAAAACAATAACCGCATTAAGTTGAAAGTGAATAACAAATATCC:1 + chrX 8224487 3' + Transpac 451 1 54.46 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATAAACAAGCCCTGATGAAAACGTATTG:1 + chr2L 7126820 3' - Burdock 6183 2 73.27 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGAGCATTCCTGAAAGGAATCCA:1 - 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chrX 10547676 3' + P-element 2842 1 33.67 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTTAATTGCATCTGTGGCTGCACAAATTTCCAGAGATATTTCGATAGAGAGATTGGG:1 - chr3L 5403227 3' - copia 19 2 59.60 GTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACTTAAAAGACCAGACTACCTGCCACGCGCTGAACACACTTGGAAATCATTGGA:1 - chrX 748277 3' - Chouto 109 1 59.41 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAAAACTGAATGACTGAAACGAAGTGTATCCAACCTAAAATAACTCAAGG:2 + chr3R 14708804 3' + roo 397 1 66.34 TTTAGGGGGTTGGGTGGTAACTCGCGCACTTTCTTATTTTTTCTCTACAAATTCAATTCGCATTTTCACTTAAAACTTTTTAACTTGGTTGGCCTGAAAGG:1 + chr2R 24500931 3' - Tirant 3 2 76.24 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGATGCCGAATAAGTCGGACAATTTTGGAGTCTGCGCAGGAAATA:1 - chr3R 26170771 3' + P-element 2853 1 41.58 TGTCAGGTGCGTATTGTTANACACGAACCTAATCGCTTTTTTATTAATTGCTAATTATTTATTTGTGCAATCTATGACTTATCTTAATTTGTACTTTTAAA:1 - chrX 13616851 3' - X-element 21 1 60.40 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGGTGCGTTCCCATGTGCAGTCCACATTGC:1 + chr2L 13792263 3' - blood 7024 2 64.36 TTTGTGTACTCCCACTGGGATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGTCCTACTTAAAGTTTTCC:1 + chrX 5475964 3' - P-element 417 1 29.70 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAAAGCGACATCTTTAAGAAG:1 - chr2R 24169891 3' + roo 397 1 66.34 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAGGTCGGCAATTGATTTCAATCAAAAACAATTGCGTTTGACTGCAATTGCGCCTGCATTG:1 + chr2R 6918061 3' - F-element 35 1 53.47 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATGTTGGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATG:1 + chr2R 18105821 3' - roo 8693 2 51.49 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTGTAACTTTTATTATTGTTTAATTTCAC:1 - chr2L 3475283 3' - roo 48 2 81.19 GCCTATAATATTTCTTGAGGCGCTGGTTGGCTTGGTTTCTCTTTTTTAGGATATTTAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATATAAGCGCTGAAAAATATG:1 + chr2L 18581331 3' - G7 765 1 60.00 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACCCCTCAGCACCGCGCCAATGTGGGTCATAAGAGTTTATCATCA:1 + chr2L 8646740 3' + Tirant 370 2 54.46 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTT:1 + chr2R 15376159 3' + 1360 3346 1 69.31 ATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAACAGTATGGATTTGGTTAGTACTCTTGATGGCTA:1 - chr2R 9993817 3' - P-element 2872 1 34.65 ATGAGCACACACACACACACACTCGCATGAGGGGAAAACCCGAAGAATTCCGCTGCACACACACACACACACCCTTGGACGGCCATGAATGCTAACACACA:1 + chrX 3567502 3' + accord 181 2 63.37 CATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTTCCAATTTAATATGTAAGATAACAT:1 + chr3R 9858914 3' - BS 18 1 55.45 ATTGTTATTATGTTCGTATNTACTACAATATAGCTAGAAAGGCTTCCACAGTATTACGAGCTAATCGGGGACTTGTAATGCCAGGCCCACATTGGTAAATC:1 + chr3L 15444923 3' - mdg1 6 2 69.31 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATGAGGCGGAAGTCTGTTTGTTTTTGTGCCTCTT:1 + chr3R 30282030 3' - jockey 4804 1 68.32 ACAGGTTACTGAATATCGGGGGGAAAAGTGATCTGTTGGTTGACGCTTGATCTCGGCGGACACACATGCACCTATACACAGAGAGATAGTAATCAAACTTT:1 - chrX 22818279 3' + Gypsy12A_LTR 444 1 61.39 TGATTCCGATGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATGATAATGTAAACTTCAGAAGGGGCCCAGAAAAACGTACTCCGTATATCATAAATACGCATA:1 - chr3R 6940200 3' - 3S18 81 2 51.00 TATTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGTGCTGTGCAGTCTTCTTTTTATTTTTTAAAAAATGTTTAAATACTTTTCCC:1 - chrX 20081017 3' + Tc3 87 2 61.25 TATAAAAAAAAGTATTTTTTGTACTCGCTTGACATTTTGTGGATACGTCGGCCGATTGTCGGTTGTCGTCCTCGCGACTTTTCTTGTTTATTTTTTCAACT:1 + chr2L 12656614 3' - Quasimodo 7340 2 51.49 AGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACTCAAAACTCTACTTATA:1 + chr2R 17402818 3' + invader4 327 1 80.20 GATCTCAGGATCTATAAAAGCTGGAAAGTTTAAGTTGAGCACACCGTGCTGGGGCGTGGCACTCCCGCCCATCTGTTTGCACCGCGGGAATTGCCTGACTG:1 + chr3R 27452750 3' + INE-1 150 1 52.48 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATGCTTTTTAAAATTCATTCGATATTGTAAACTCG:1 + chr3R 25121655 3' - pogo 42 1 70.30 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTTGCTGTGTAAGCCGTATTTAATTAATTTGATTT:1 + chr3R 20872788 3' - copia 20 2 57.43 ATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATTCTTCATGGTCCGCTTGCCAAGTATTCAGAAAGTGGACAGGGTTATGAACGCCAGTGATTT:1 + chr3R 4535240 3' - Ivk 191 1 65.35 AGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAGGCTTACCTACCCCCTTGGGACTTAATTTGCTGGGCAATGCTTTCTTCTCTGTTGAGT:1 + chrX 22713822 3' - 1360 17 1 62.38 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATCCAATGAGT:1 + chr2R 8232543 3' - P-element 35 1 44.55 TATTAGAGCCAACTGCTCTNAATTCTGGTCTATTACGAACTAACAGCCAACTAACAAAATTCACGTCAATCCGGCTATTCATGTTAATCCGGATTTCTTAA:1 - chr2R 14868633 3' - gypsy10 5946 2 57.43 ATGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGCCTGAGCGAGAGAATTGAATTTTTGCAGAAGTGGCATTTTGCGCAAGAAAGTAGGCAACACAAAATGATCAAAAGG:1 + chr2L 8504853 3' - jockey 4760 1 71.29 TAGTCGGGGAACTCGACTTTAGCATTCTCCCTGGTTGGAGGTTTAGCTTTGAATCGTTGCTTCCTTAAAATAGGCACGCTGGCGCTCTCTTTCATC:1 - chr2R 5197415 3' + INE-1 566 1 58.33 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAATAATAATCTATTCATTTACCTACATGTTTTCTATACCCATAAACGTTTTAATA:1 - chr3R 21608758 3' - copia 4898 2 52.48 TACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGAATTTCCCTGCGCCGCAGCCCAGTTGTGGACCGAA:1 - chr2L 13462094 3' - 3S18 6080 2 65.35 TTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTT:1 - chr2L 16456782 3' + BS 5078 1 56.52 AGTGCATTACTGATTTCTTNGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGACAGGTCAATTG:1 - chr3R 23683391 3' - 297 6624 2 76.24 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTCTTTCATGG:1 + chr2R 6041632 3' + opus 7470 2 62.38 GACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGATGTACAACT:1 + chr3R 7869202 3' + 297 376 2 61.39 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCACCATAATTATTACGTAATT:1 + chr2L 20709456 3' + roo 9042 1 57.43 ACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACATATAAGTTTGAATGAATGAA:1 + chr3L 19393992 3' + hobo 2664 1 79.21 TTATTTATTTATTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAGCCATGGGTTTGTGGAAACGTATTTTCACACCAAATACTGCAAAACGAAC:1 + chr2L 4378771 3' - Juan 4209 1 48.51 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACATATATCCCCGATCCCCCGAAATGGGGCGCGTGTATCCAA:1 - chr3R 10090308 3' + pogo 2077 1 60.42 GAGAGCCGAGCGCTGGTGANTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGCCATTTGATTCGCTCTTCTTCGGTTGAAATCTGCAAAAG:1 + chr3L 10683509 3' - opus 147 4 60.00 TGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCAAAAATTGACGAGTTGCTTTGGTTTTATTTTTTCTTTATTATTATTATTGCTGCTATGCACATGTCTAT:1 + chrX 4436988 3' - 1360 3343 1 71.29 AAACACGTCTCCACCCGAANACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCATTTATCTCGGGTGTCCCCACCCAAAACCCCA:1 - chrX 19219281 3' - Doc 19 1 60.40 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGGTGCGTTCCCATGTGCAGTCCACAT:1 + chr2L 13792260 3' - blood 7027 2 61.39 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTAAATTCACTTGCAGGTATAAGATAGAA:1 + chr3L 10395925 3' + copia 242 1 72.28 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTCTTTGTCCCGAATTAATTTGAAGGTAATTTCGATACTCTGTCC:1 + chr2L 12182679 3' - roo 33 2 62.38 GTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Cr1a 487 1 51.49 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTTCGGGTTGTGCTGGAATCATGGATGAGT:1 - chr2R 10777811 3' + pogo 2060 1 71.29 TCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATTCATTCCCATTTCGGTTGGG:1 - chr2R 8518258 3' + invader1 346 2 83.17 CTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACACGCATACACACTTCAGAGAGCATATAGAGTTCGGTGCGCTGCCCTTTCATTA:1 - chrX 15816279 3' + invader3 112 2 72.28 TGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATTTCTATTTGCGTTCGTTGTCAAGAGACAATTGACAAAGTTTAGCA:1 - chr3L 16528642 3' - Quasimodo 34 2 91.18 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACAT:1 - chr2R 19557978 3' - 412 7084 2 54.46 GTTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCGCACTTTGAGGTTGAAAAATAATCTTAACTTTCTGCGCAATCATTTTAGATACTGGCTCAGAACTTT:1 - chrX 152940 3' - mdg1 9 2 70.30 AATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTGCATGGGGTGAGGGGCCGTTGGGTGCGGGGCGGGATGTGCTTGTATAGTGGAAAGCGCAT:1 + chr3L 1772078 3' - HeT-A 5974 1 52.48 AAAAGTAAAAAAAAAAACAAAAGAGATGGAAAAAACCCTAGCATTTTTTTCGCCTTTATTGCGTGAATGTTGGACGGACACGCAATAAATAAATTACG:1 - chrX 9015135 3' + Doc 4698 2 91.84 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGACAGACCGCACC:1 + chr2R 7025022 3' + P-element 2863 1 54.55 AAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAACCAGCGAATATAAAGAGTCAAGATACATATTTAATTATTTACCCGAGAACTTGTTCGGGGCTTATATTACCTTT:1 + chrX 17109745 3' + roo 404 1 75.25 GATATCTTGCCGATGCAGCNAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCAATTAATGTTATTCGAGTTCCACAGCCACTTGATTTTGAGATC:1 + chr3R 15547080 3' - pogo 30 1 57.43 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCACAATACAATCGCTTATACGCCATGTTGCACCGGTACAACAA:1 - chr3L 3490018 3' + jockey 4947 1 63.37 TTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACCGAGTCTCTCTGTTTGCTGAGGCCTATTTTCGGGCAGCTTTTCTTTATCTTTACCGGCTC:1 + chrX 10425688 3' - 412 400 2 55.45 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGTTTTTTTGTTTCTGTTTTGTTTGCCTGTCGAAAGTTTCGCCGCACAGCTTATGGCCGGGCTTATA:1 + chr3L 17127063 3' - Doc 15 1 55.45 GCATAACATGTTTTAAAACTTAATACCTGTCAGGGTTCTGAAAGCACTGATACATTTTTAACACCAAACTGCGGTCCGTGAACAACCATACGGAAAGCCAA:1 - chr2R 78312 3' - G4 3726 1 71.29 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTGCGCATTGAGCAGATCAATAAACATGGCAGCGCAAACGGTC:1 - chr2L 435212 3' - FB 36 1 59.41 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTGCTGT:1 + chr3R 9825172 3' - Doc 31 1 56.82 AATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGATCTTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTGCGTATTCATATTTGAATATTATACAATTTGAGACG:1 + chr2R 11940598 3' - Doc 4562 1 60.40 GTTTTTTTTTCTTTTATTTTGTGCTAGGCACAAACGCTTCTTCTGCTATTTTCCGAATTGTTTTTATTTTCATCTTGTTCACGTTACATTACGGTCGTTAC:1 + chr2R 24523242 3' - gypsy7 5005 1 70.30 ACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTCCCTTTAACCAAAAACTATGTCAATATTTCA:1 - chr3R 12549750 3' - F-element 4492 1 72.28 ATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCGGGAACGAAATTTGTATATATACCCTGTATGTA:1 - chr2L 21996598 3' - 412 7275 2 67.33 GGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTTATGTGTGTATACGGTTTGCTGTTAGTGCTGGTGTTTGTTTGTATATGATCAGCATCTTTGCTTGTTTTGCCATTTG:1 - chr3R 22943696 3' - G5 4787 1 73.27 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGA:1 - chr3R 6190246 3' + copia 249 1 62.38 GCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCCTTTTCGATCGGCAAGGTATACT:2 - chr3R 4536161 3' - Ivk 7 1 72.28 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGATGGTGTGCTGTGTGCGCTGCGGTGGC:1 - chrX 7759088 3' - hobo 47 1 72.28 TTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGAGACATTTAATTGAAAATGGTAAGCATGTACACTTTTGAGTTATTGATTTCTTGTTAGAGATTTTTG:1 - chr2L 12601370 3' - opus 372 2 78.22 AAAAAATATAAATAAAAACTTTAGACCTACATTATAAAAATAAATGGAAATTTGCAAATCAAATTACTAAGCTTCCTGCACATTAGCTGCTCGTTCTCCGT:1 + chr3L 2337628 3' + mariner2 792 1 65.35 AGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCATTTCACGATAAACGGGCGGTGGAAGGGAGTCTCCCTTATCGGACGGACGGTTGCAT:1 + chr2R 7838337 3' - Bica 50 1 61.39 TTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGACATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCT:1 - chrX 22726185 3' + Helena 1283 1 55.45 TGTTTTAACAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCAAGTTCTTGCTCTAACTCCTGACAGTCTTCGGCAGCAAATTCGGACGATGCTCAAATGGTACCCTTGTAT:1 + chr3L 23750300 3' - transib2 2598 1 72.28 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGGCGAACACACAGACTGGCGTACATACACACTCGCACACAAGCACA:1 + chr3R 23320015 3' + hopper 1390 1 52.58 TTTTTTTTATTTTTTTTTTGCAATTTTGACTTAAGCTGGCTAGTCGCAGAATCTTTAAAGCGCTTAGCCACATAATATTTAACTGGAAAGTTGACTTTCTT:1 + chrX 3291990 3' - G2 3075 5 57.43 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACATTGTTAAAATGTGAAAAAAATCCGACGGTCTGCATACCTTA:1 + chr2L 7804317 3' + 1360 3358 1 61.39 GTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGAGCTGTAGGATGCGCGCAATCATGGTTATCATGAACAAGAAGAGGTGTCGCGTTGGGAG:1 - chr3L 1608077 3' + Gypsy6A_LTR 273 1 60.40 AAACGTCTTCACACGTCGGNGATCGAAGGTCGGCAATTGATTTCAATCAAAAACAATTGCGTTTGACTGCAATTGCGCCTGCATTGACAGCAGTTTCTCAT:1 + chr2R 6918076 3' - F-element 20 1 68.32 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTTTTCATAGGACTTCTTTGAAATATTGAATTTAACATATTAAAGCATACTTTTCT:1 + chr3R 11498658 3' - BS 17 1 47.52 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAACTTTATATGGTATGTCGTTGGATTTAAA:1 - chr3R 27582764 3' + pogo 2055 1 73.27 AAAACACAAATGTGGCAAAATGGGTTAAGTGGAAAGCGAAACTGACTATAATAATACACACAGGTACACCAGCCATCTGGCAATTGAATTCCAGGTACTAA:1 + chrX 19080377 3' - transib1 209 1 62.38 ATTTTGTTTTATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGAGTTTGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGTATAATTTTCAACGAATCTAGTATCCCATTTT:1 + chr2L 21794180 3' - invader1 3617 2 72.28 GAATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGGACATGAGCTTGAGCTGGATTCGAATGCTTTGAAGTCCACATTTGAGTTCGTGTCGA:1 + chr2R 7729676 3' + 412 494 1 60.22 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCACCATAATTATTACGTAATTGAGGTGGG:1 + chr2L 20709464 3' + roo 390 2 59.18 TGCCTGTTTTGTTTTTAGANTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTACGTATACAAAATGTATAAGGATGCTCCCTAGAAT:1 + chr2R 23698545 3' - I-element 5188 1 65.35 AAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCGCCGCGAACAAAGAGTGGAAAATTTTGGTGTCAGCTAAAAAGGAAACCCTTTAGCCATC:1 + chr2R 16197242 3' - accord 352 2 62.38 TATATATACATATGTACATACATGCATACATACATACATACATATATAATTATAGAGCATCGGAGCAACGTGATGCGTTGGGTGGCAGAATCAGGTCTAAA:1 + chrX 5604885 3' - invader3 5087 1 76.24 AAATTTTCTGGGATATCGATAGAATTAGTAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGTTCAAAAGGAAGTGTGTATATGTAAGTCGGACTAGTCGGATCGGATCA:1 + chr2L 21643420 3' - INE-1 502 1 60.40 TTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAATTAATTACAATAAAAGTGTAGGCAGATTTATTTGCATATCATGTGATATTGTACTGACTCTACTTTGTCG:1 - chr3R 5213188 3' - G6 1998 2 60.40 AGAGCAGCGTATATATATATGTATGTGAGAGAGATAAAGAGAGCATGTGAAGTAAGCGGAACAAGAAGAAGATAGGTGTT:1 + chr3L 7804826 3' - blood 7201 2 80.00 AAAACAGGCCAAATGCGCCATAGTGCGGTGGGGCAATGGTGAAAGCTGCCTGCGGGACAGCAACATGTGTTTTGTCGCATTTCTATTTATGACG:1 - chr2L 18413811 3' - hopper 4 2 74.47 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGAT:1 + chr3R 14860231 3' - BS 5005 1 68.32 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCA:1 - chr3L 16807728 3' + P-element 2844 1 37.62 TTTGGAGAAGATGGACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGAAACTATCCGCAAAATGTGTGGAGGCAATGGCTCTGCAGGCGGATACCGAACTG:1 + chr3L 14795040 3' + G6 312 1 57.43 TGTTTCGCTTAAATCGGATNGCATATGACTAAGTTATAACGCTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCAT:1 - chr3L 27356106 3' + Tc3 1656 1 76.24 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGAAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGGTAACACGCGAATTTAAAAATATTTT:1 + chr2R 4995019 3' - F-element 69 1 96.04 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATCTACTACAATGTACATATGTATATTTCTACTTGCAACAGCAACGCCAACTG:1 + chrX 2164322 3' - mdg1 7059 2 54.12 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTACATTTCCTCTACGCACATGATAGCCCGGTTAATAACATTTTCTTAGCATACACT:1 - chr2L 18818587 3' - jockey 70 1 50.50 ATAATACAAATATAACAATNAACATTATAACAATTATGAGATCACGACTACAGAAGCTCCGTGGAATGCCGACGATATCTGTCAGCAATACACTAAAAACA:1 + chr3L 3185894 3' - BS3 1647 1 64.36 TTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTA:1 - chr2R 5200934 3' - 1360 33 1 58.42 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTTTTGTAGCATGCTTTT:1 - chr2R 8385121 3' + hobo 2923 1 53.16 TTAATCTTATTATATATAGTGATTGGGATTCCCATTAGATTGTGGGTTACATTCACATATCACTTAGATACTCACCCACTAAAGTTAGGACTAGACTAACG:2 - chrX 19724114 3' + Tc3 280 1 79.21 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACCTATATTTAATGAAACCAATGAGCAAACCTAACTTGTGTAAGTCAA:1 - chr2L 4404538 3' - pogo 27 1 58.42 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAG:1 - chr3R 12882673 3' + 412 7488 2 75.25 TGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAAT:1 - chr3R 23020828 3' + INE-1 563 1 46.53 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGATTGCACTGCATTTGCATTTGATGTTTAAATAATAAAAGAGATAATTGATTCCGTTTTTCAACTT:1 + chr3L 18928932 3' - mdg1 11 2 65.35 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGCTATGGACCATAAAGGCAACAATTC:1 - chr2L 16939824 3' + opus 449 2 75.25 TATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCTCTCTTTTTCTTACAAAAATCAGGCGTAAATATTGACTCGAAGG:1 - chr2L 10187101 3' + copia 4923 2 63.37 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATAAATTTTAGG:1 + chr3R 18171831 3' - 1360 39 1 66.34 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCGGTGTGGACTTCGGGACGTTGAACTAACGGGACATTGGTTGGACCTTTATCGTCTTCCTCCTTCCTCTTTATTAAAAT:1 + chr2R 4396903 3' - 1360 13 1 73.27 GGAGTATCGTGGTGGCTGTGTGTGTGGGAGTGTG:1 - chr3R 20973945 3' + R1A1-element 4995 1 58.82 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCCTAAAAGTGTTCTTAGAGGTATATATTGCATT:1 + chr3R 5993176 3' + pogo 2060 1 69.31 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAA:1 + chr3R 24074844 3' - hopper 33 1 60.40 TACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGCGAGCGGAAAATGGCTGTTTGCTGATATCGTTTATTTAATATTTAATTGAATCCATGCCGAGTC:1 + chr3L 1697508 3' - Tirant 411 1 68.32 TTGAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCT:1 + chr2R 8505078 3' - Quasimodo 19 2 48.51 TGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTCCTCTTGCTACCGCCGATGGCAAGTCCAA:1 + chrX 19617149 3' + 1360 3331 1 71.29 AAATTTGAGGGATTTTTTTTTTGTCTGGCAATTGGATGAATATGGCGGAT:1 + chr2R 23789562 3' + Tc1 1465 1 88.00 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGGCATGGGCATCATTGGTCCGGCGGCCGTCTGCGATCTCCGCATGAATGAGG:1 - chr3R 16613125 3' - 412 7075 2 59.18 GTAGCCGCTGCGTTTGGTTCATATTGGTCCTAGGGTGATTAAAGGCGATCAGGTGGGCAGTAGTTCGTTTCGGGCAATGATACTGCTGCAATATGCAGGCC:1 + chr3R 6038121 3' - R2-element 329 1 76.24 GATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCGTTGGAGGTGCCCATGGCTGGGATTCT:1 - chr2L 5507688 3' - Tc1-2 246 1 77.23 AGGGTCAGCATTGACCACANCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATAGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTTAC:1 + chrX 21208649 3' - jockey 4708 1 76.24 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAA:2 - chr3R 6437522 3' + 412 7492 2 76.24 GCGCGAATTTTTAAAAATGATTTTTTTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCCAATCCATATACTCGAATCAGAATTAAGCATCCTTAGACAGGGACGTAT:1 - chr3R 908392 3' + 1360 3085 1 50.00 AACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGCTACATAACTATCAAATTGTTGCTAATTAAAAATTTGTTTTCTTCTTTTAATAATAATTTTTGTACAC:1 + chr2L 14038481 3' + 3S18 6095 2 73.27 ACAACAATTTGTTCAAATTNGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCTTCTCGAGAGAAAAAATTCCACATGTAATCCGATTGTATAGAGA:1 + chr3R 25513153 3' - hopper2 1204 2 55.45 TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCTGGAAGGTTAATGGTTTTCATGATCACCACGCTCAGTGGCAAGCGTACGCA:1 + chrX 22689217 3' - Transpac 21 2 57.43 AATAATTAAATTAATAATANACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGC:2 - chr2L 12779594 3' + flea 232 2 55.45 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCACAAACGACAATACGGCGG:1 + chr2L 17865663 3' - hobo 54 1 84.54 AAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATATATCAAAAAACAATAACAACTTTAAATAAACCTTTTACATTTACAATCAATACCTACCATGTAAGACC:1 + chr3L 26013698 3' - S-element 1611 2 75.25 AAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCTTTATCTCCATCTGATTTCTGGATCGTATTTATCGAGTCAGTAAGCTCGTTTAGTCTATCTTGAAAT:1 - chr2L 21556065 3' + 1360 51 1 76.24 TGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTGTTATTTGTTTATGTGGTGTAATTAATATAATTTTAAAATTGA:1 + chr3L 8242087 3' + S-element 1536 1 62.38 TTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCAACCACCGCCGAGAACACCCACTACAGAGCAACTTTCACCGCCGCCGGCGAGACCACCGAAA:1 - chr3R 15098516 3' - 1360 3325 1 68.75 AATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTACATACATAGAATGTATACATATTGAACGTATTAATTAAAACAAGAAGCTGGAATTATGATTTAAATTT:1 + chr2R 8642978 3' - Doc2-element 4708 1 60.40 GTCAGCCCGACGGCTGCCTNCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGT:1 - chr3R 6437511 3' + 412 450 2 64.36 GTGAAGATTTCCAATAAAGNATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGTAGTTTATTGTCATATCACAGCACTAAGCGAGTGTTGCCAACTTG:1 + chr2L 15907702 3' - Tirant 308 2 67.33 TAAAATAAATAAAATAAAATAAAAAGAACAAGAAGCAATACCCACACACACACACACGCACATATGTATATGTATGTTGATAAATCTTTTGTACACTTTTG:2 + chrX 14957881 3' + G7 1147 1 71.29 AATAAATAATAAAAAAAAAAACCTACGTTCATATGGTATTTTAATTGGCCACACAAAATTGGGATTACGACTTCTTTACAAATCCTGAATTCATAAAAACT:1 - chrX 3476358 3' + BS 5095 1 63.37 CTATCACACGTCCTCGTGTGCTAGTAATCCCTTAATATCGATCACTAGAGCGTCCTGATGACTTTTCGACATATGTATATGATGCGTGCATTGCAGTTCAT:1 + chr2R 4285205 3' - invader1 3575 1 69.31 AGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTACATTTAAATCAAATCTAATTCTTGTAAAACGCTGAGAGATAG:1 + chr2R 15689631 3' - springer 34 2 61.39 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAG:1 - chr3R 20791655 3' - pogo 49 1 47.52 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTATTCTGCACACATTGTCATGCATGCAAAAAACAAG:1 + chr3R 13685218 3' - Tirant 8147 2 68.32 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTGCATTATTCCAATTGCAGAATCACTTTGTCCTGTTTGTGTGCGCTTAATAATAGGTGTGCTTG:1 + chr3L 13367777 3' - mdg3 5264 1 69.31 GGCGTTACGCATCTTGTTANTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTAT:1 + chrY 311343 3' - 1360 12 1 50.50 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTAGTTTACAGATGTTGACTGCGTGGAATCAGATTCCGCAATGATAATTGCTGTTCTGATC:1 - chrX 409707 3' - Tirant 8169 2 61.39 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAATTTGTAAAGTTTTTTGAAATTTGAAGTTGCA:1 - chrX 11987888 3' - 412 7097 2 71.29 TAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGCATGTAAATGCATCTGTGTTTTGCAAAAGATACGGATACGCTATAAGAACATTTT:1 - chr2L 13463935 3' + 3S18 6083 2 54.46 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATGAATGATATGTTAAATACAAATTGCCAGCACATGGGCACGCTTGTGCAACA:1 + chr3L 13164915 3' + I-element 5325 1 54.46 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGACAGCGGCAGTGGCAGTAACCCT:1 - chr2R 13194621 3' - roo 32 2 59.41 TTTATTTAATATAAATATAATTTAAATCATTTGAAAAGTAAGACAGTGAATATTGCCCCCCTTTTGAAAATGTCTACTATTTGTATATAATTTTTTATTAT:1 - chr3L 6101372 3' - transib3 2625 1 39.60 GCCAAAAAAATCGAATTCTNGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCTACGCTCTAAAATGACGCCTGTCCC:1 - chr3R 21923986 3' + transib2 2815 1 70.30 GAGAAGAAGTAAACAGCGANTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACTTC:1 - chr2L 20360639 3' - micropia 4986 2 53.47 GTTAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCAATGAATTTTAAACTAGATTAGCCGGTACCTACGACATTTCGA:1 - chr3R 13358090 3' - jockey 4860 1 69.31 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCGTTACTTTTCCCAATGCTCAATGG:2 - chr3L 15435553 3' - blood 53 2 81.19 TAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTAAGTGATTACAT:1 + chr2L 15907218 3' + pogo 2062 1 49.50 TTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATCTTATGTCAAGTTATGTAAATAAACAATTACGAGCGTTTATGTATGCACAC:1 - chr2R 23122732 3' + hobo 2503 1 60.40 GGTAAAAATGGGCAAACGATTCTATTTTTCCGTGCCCAGCTTCTTTGAGATGAGCACTTCCGTAGCGTAAATCACACACCTCTATCGAAGAATCGCGGATG:1 + chrX 22354529 3' - FB 53 1 65.35 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAACATGCATTTACACACAAAGGACATGCAGAAGTTGTGTTTCTTTCTTTTAGAAA:1 - chrX 17873159 3' - 412 7074 2 58.42 TGCAAAAACAAATAAACAAAATTAGAGTTATGTGATTAATGTGCCTAATCTGATGATTTCAAAACTATTTTGTTCTTAGCATTGAGTGACACCTTTTTCGC:1 - chr2R 11670517 3' + Stalker2 75 2 69.31 TTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCTTTTTTATTAATTGCTAATTATTTATTTGTGCAATCTATGACTTATCTT:1 - chrX 13616867 3' - X-element 37 1 50.50 GGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGACCTTGTTTAGTGGGTAGAAATCCCTGGATTGCAAGAATGCCGAGAGA:1 - chrX 7908143 3' + opus 7052 4 52.53 ATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTTGAATGATTACTAATGCGTGCATGCATTGTGTCCTCTTAGAAAGTTAAATCTGATCAAAATCAACT:1 - chr2L 5099310 3' - R1A1-element 5257 1 76.24 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAACATGCATTTACACACAAAGGACATGCA:1 - chrX 17873185 3' - 412 7100 2 73.27 GCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGCTAACGAAAACGAGGGGGGTTCGGAAGAGGGGGGCCAAGCAGAACAAGAAGTGTGTTCCGACGTAGAAGGAGA:1 - chrX 3779400 3' - 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chr2L 17549284 3' + mdg1 400 2 58.42 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGATGGATATTCGTTATATGTGAAAGCAGTTATCAGAAATGAGCATGCAGGTGT:1 - chr3R 22467023 3' + mdg1 396 2 53.47 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTCGTATAGTAGCATACACTCGTACACACG:1 - chr3R 19270354 3' - pogo 33 1 66.29 ACACACATATTCACACATANTGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGTGTGAGTGATTAGTTATCAGAAATGAA:1 - chr3L 1868364 3' + accord 7041 2 50.50 TACAATTACCAATTTACGTCAGTCAAAGAGCAATCCAAGTGGCCGCCCAAATTCGGTCAGGCAGACTGGTATGGATCGCTACGTTTTTGTAAAACGTAAAC:1 - chr3L 16730798 3' + Doc4-element 408 1 69.31 TTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGGCATGAGAAAAATGGCATACCCTTAGTAATAAT:1 + chr3L 11314529 3' + Tc3 318 1 40.59 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGACAAGACTAGAAAACGGCTAGATATCACAACTATCAATATCTTCTA:1 + chrX 153035 3' + mdg1 392 2 57.43 TTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACATTGGTGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACATGAA:1 - chr3R 10470958 3' - copia 5049 2 80.20 AGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTAGTAATTCAAATCCTTTTAGCTTATCTACAAAAATTGGC:1 + chr4 1271912 3' + 1360 85 1 64.36 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTT:1 + chr3L 12634217 3' - BS 5036 1 67.33 TGCCATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAGTTTCTAATATCAA:1 + chr3R 7618709 3' - Doc 39 1 57.43 GGAGAGAGGGGGCATGTTAACTTGCAAAAGTATTGGCTGGCGACTAACGATTGG:1 - chr3R 566220 3' + accord2 203 1 48.15 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCATCGA:1 + chr3R 27582808 3' - pogo 46 1 76.24 TTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTAGTATTTTTTTTAGTTTTTTTGAGGTGTGTTAGCAACCTCATTGTTGCTTTAGCCTAG:1 + chr3R 23186452 3' + hopper 145 110 86.25 TCTCATTTGGGATTTTACAGTTGGCATTAGGAAAAGGTTTAACCCTTTGTTGGGCGATATGGGAATAGTAACGATCTGTTCTTCTAGAAAATTTGTATATA:1 - chr2L 4571276 3' + roo 411 1 79.21 TCTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTTCCAATTTAATATGTAAG:1 + chr3R 9858907 3' - BS 25 1 54.46 TGTGTATGTGTGTGCGTGTGTACTATGTGTGTTTACCCAGTTACGAAATTGTCCAAAATCTGTGCCGCATGTGCAACAGCCAAAGGGGCTTTCGCAATGGG:1 + chr3L 11857794 3' - Quasimodo 38 2 58.42 TGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACACACATATAATTTATGGAGTTATTCGCACCATGCTCACACTGTTTCAA:1 - chr3R 25950059 3' + 412 7541 2 74.26 GTAAGTCTTTAAATATATTNGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCAACATGTTTACTTAGTAGCTGTGTCAGCAGT:1 - chr3R 28475789 3' - roo 16 2 63.37 TTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTCAA:1 + chr3L 16047737 3' - Tc3 238 1 33.00 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAAATGTTGTAAATGTGGCGGAGGTAAGCCTCCTCCGCTGTGTCGTTCAGTCAAGATTTTAAGTAT:1 - chrX 21499231 3' - Quasimodo 11 2 73.27 AGTGAGAAGTCGAATAAAGNGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTGATCTATTGATGGAAGTGTGTGACATTGATAAAACAGT:1 - chr2R 4757394 3' + invader3 5410 2 61.00 TAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTTTGTACACAAGTTCAGGAGTGTAGTCTATTGAAATGAATATTTTGCCGCTGTGAAG:1 + chr3R 26170468 3' - X-element 31 1 46.53 AATGAAATATAATATTTGAACTACGAACATAGTGCGCTTTTCGTATGTTTCCCAACCATATTTGAATATTTGTGCTGAAATCGAAGTGGGAGGACACTCAC:1 - chr3R 29041426 3' + G7 1154 1 53.47 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTGTGATGTCATAATTGGAATGCCTATCTTAATTCTATATTTTGTCTTTC:1 - chr3R 10434550 3' - 1360 27 1 53.47 AATTAATACCAAAATGTCCGGTATTACGCATAGTGCAATGGGGCAAATGAGCGTGCGCAGGTCATCATCGGGGAGGGCGGCGGAGAGGCAGAAGCAGCAGC:1 + chr2R 21580302 3' + transib4 2620 1 73.27 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATATATACAAATCGATTTTAATTGGTATATGATGAGCCACATTTCTGAGAACTACCTTGAGCAG:1 + chr3L 2270604 3' + roo 392 2 55.45 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAAGAAATGGCGATGCTCGTGGAATTTTATTGGCTG:1 - chr3R 8705299 3' + jockey 4954 1 68.32 AAATGATTAAATTTAATTTTGAATTATGCTTTATTATCACAGCTCATTTATTTTTCTAAACTAATTCCAACTGATTGTCGGGGAAGCATGGTTACTGAAGT:1 - chr2L 7570058 3' - Bari1 334 1 29.70 GAACTTAACCAATAAATGANAATTAACAGTTACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAAGTTTTTTAATTTAGCTGCAGTTTTTTTGTGAAAATGATAATA:1 + chr2R 6623741 3' + 3S18 6071 2 53.47 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGG:1 - chr2R 19558001 3' - 412 53 2 77.00 TTGTTTTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGCTGGTGAAGTGCCGAAAAGACGGAGCCAGCAATAACTTACCTACTTTTAGGCTCCTTTTGGGAATTAG:1 + chrX 14164059 3' - jockey 4565 1 63.00 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTGCATAAATATTCATGGTAGGCGGGGAGAAAATGTTGGCCGCAGGAACTGCGCCAGCGGGGCGACTAACACCTTCTGG:1 - chrX 13480397 3' - accord 7029 2 53.47 GGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTTACTATTTCGTAATTCTTCTTACACAACACCTGCA:1 - chr3R 14985285 3' - Ivk 25 1 65.35 TGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCGAGTCAGGATTTGAGCAGAATTTCAAT:1 + chr3L 21780558 3' - I-element 5164 1 73.27 ATATATCTGAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGCGTAAAGATTGCATTTACATTTTGCTCAGTATTTAGCTTTGTGTTTTTG:1 + chr3R 12449346 3' + Cr1a 99 1 57.14 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAATAGATAACTAAATTA:1 - chr3L 19944228 3' - Juan 4070 1 61.39 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCAATAAAGAAGTTTTCGCATCAGTTTTATGAAAACT:1 + chr3L 25120235 3' + pogo 2064 1 71.29 TTTTATTAAGCGAGTGTACGTTCCAGATGCTATGGTAAAAATGGGTAGTATTACCAGAAGTAGATGGCGCTGCAAAACAGATCAGTATATCGTTTTCT:1 - chrX 11320083 3' - mdg1 7378 2 78.57 GGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACACACACACACATACATTTATGCACTGCTAGATATTTTAGGTAACTATTTCTATTTTATC:1 + chr3L 16800124 3' + P-element 2755 1 61.39 TTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAAT:1 + chr3R 19450060 3' + roo 8757 2 61.39 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATA:1 + chr2L 15907203 3' - pogo 49 1 78.22 GTCTTTTCATTTGGGATTTTACATTTAATAAAAAAGTTGTTATTAGTAAACGCATGCATATTATTATAAATAAATTAATAAGCAGGATTGGTATGCTAAAT:1 - chr3R 26122981 3' + roo 9070 1 74.26 AAAATAAAATAATTTTTAANAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTAAAATTTGTTTGTTAAAATCACCTCTAAAAATTATACAACATACA:1 + chr4 1165810 3' - 1360 3092 1 74.26 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAATATTTAATTACCAACACGCAGCAATAC:1 + chr3R 7688962 3' - Tirant 8 2 73.27 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCATCGACCCCAATCGGTC:1 + chr3R 27582820 3' - pogo 34 1 64.36 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGA:1 + chr3R 7869184 3' + 297 358 2 65.35 TTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGATTGCACTGCATTTGCATTTGATGTTTAAATAATAAAAGAGATAATTGATTCCGTTTTTCAACTTAAAATTAAA:1 + chr3L 18928941 3' - mdg1 2 2 74.26 ATTTTTAAGTTACCTGCATNGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCAATAAAGAAGTTTTCGCATCAGTTTTAT:1 + chr3L 25120228 3' + pogo 2057 1 77.23 GTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTGGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTGAACACAGGTCTGGGAGTTCTC:1 - chr3R 3621131 3' + 1360 461 1 76.24 GTGATGCCAGACCGGGCTTNAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATC:1 + chr3L 20224238 3' - Chimpo 14 1 66.34 AACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCAT:1 + chr3R 5773205 3' + Stalker4 357 4 74.26 TCTAAATGCGGTAATTATAGAAAGTATTCTTAAGATTTTTAAAATAACTTTAGCTTGAGCTTTTAGTTTTAATGAATCTAAAATTAATATTATATTTTTTT:1 - chr3L 19514569 3' - flea 202 2 70.30 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACACCGAATGCTGGCTAGAGATGGCAAGATACTGCACTGGCGAATAGGGATGGGAGCGTGAGGTT:1 + chr2R 10874801 3' - P-element 13 1 66.34 AATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGTAGTGGCTCTAGAGCTCTATATGTATAAGAGTTTCTAGAGTATCAGATGCC:1 - chr3L 17876914 3' + 1360 13 1 65.35 CATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGAAGAGGGGCAAGAGGGTTTTTGGCGAATGAGTTGACATGTGCCAAGCACACGACAAT:1 + chrX 7642955 3' + opus 7236 2 65.93 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGATGAACGATTCAATCGAAAAGCCTGAAA:2 - chr3R 9870321 3' - F-element 16 1 72.28 TGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAATGAGAAAGCGACATAATGAAAAAGAAATGAAAGATATCCGTAGAAACAAAGCATTCACACGCACATATT:1 - chr2L 21856366 3' + micropia 5206 1 51.49 AGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTCGCTAAGTGAGCTGGAAATGCAAGTAAATTTTTCAGTTATCTCTGTTATTAAATTGTGTTA:1 - chr3R 31427009 3' - I-element 5143 1 58.42 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATTAAATATCACTATACCTATTGATTCCTGCAGTG:1 - chr2L 20396932 3' - Transpac 4958 2 65.35 GGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCAC:1 - chr3R 17615942 3' - HMS-Beagle 38 2 64.36 TGTTAGACACGAACCTTTTNTTTGTACACAAGTTCAGGAGTGTAGTCTATTGAAATGAATATTTTGCCGCTGTGAAGTGGCTGAGATTGTATATACTAAGC:1 + chr3R 26170492 3' - X-element 7 1 69.31 TAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCCCCCGAGTTTTGCGCAACCTGGACCTGAGCTCAAACACCTTAACGCACATATCGCCAAAGATCGAGAATC:1 - chr3R 13698114 3' - R1A1-element 5098 1 56.00 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGAGTAACACCAAAATGTATGTGGCACTG:1 + chr2L 18500360 3' + Tirant 8459 2 72.28 ATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAA:1 + chr3R 14860210 3' - BS 5025 1 55.00 GATTTGGCTATTTCTAATATATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAGTTTGATCGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGAT:1 - chr3L 2485977 3' - 1360 332 1 54.46 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACTCTACAACTTTCGGGAGAGAGAATATTCAAAATGGCGGCAACGCGAGGAAATCG:1 + chr2R 20584495 3' + P-element 2867 1 61.39 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATAGATTTCGAAAATATTTTTTTGGAAAATTTGAAAAGCTATCTGTATTTTAACGTCTTCCCATAAAAGGGG:1 - chr3R 20599577 3' - opus 7 2 70.30 GAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGCTGACCAACTCGCTTGTGTGTGTGCAAGACAGCTTGTTTGCTCGTTAATTGCTTCGCGTTCCG:1 - chr3R 13239742 3' - jockey 4585 1 53.47 GGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCTTCTCTTCTGAGAAAAAAACAAGGGCAAGACAGTTTATATTAATTGTTTACCTGTGCAACAATCTTTTGTT:1 + chr3R 4337849 3' + invader2 136 2 76.24 GAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGCTCAACATTTTAGCAGATGATTGATGGGAGTTTCGGAGCAGACGCGGGTACAGGTCC:1 + chr3L 18708545 3' - Ivk 5165 1 61.39 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGCGGCGATTGGCAGATTGCATTTTAAATCCGCTTA:1 + chr3L 5206630 3' + roo 389 2 59.41 AATCAGTTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCACTTAAT:1 + chr3R 13544143 3' + roo 9038 1 56.44 AACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACCATGTCCTCGTCGTCGACGTCCGGCGGCCGGAAGCAACCCACTGCTGTG:1 - chr3R 17533876 3' - jockey 231 1 60.20 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGAAAAGAATCAGATAAGAATGCTAATTG:1 + chr3R 14601845 3' - roo 48 2 76.24 ATGGACATGGCAAGATCGACTCGTTTGGTATACATATATAAATACTTAATGGGATCGAAACCGCTTCCTTCTACCTACATACTAATTAATGGAGAGACGGC:1 + chrX 20373736 3' - INE-1 109 1 54.46 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTACATATGTATACACATATGAACACGCAGCTGGTAAACAAATTAGTGTGCAAATTTGAGGCC:1 - chr3R 15546992 3' + pogo 2082 1 62.38 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGATGCTACGAACCC:1 - chr2L 19207863 3' + 412 469 2 52.00 ATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATAAACAAGCCCTGATGAAAACGTATTGACGATGCAATAAACTTAAAGAAGTTTAGTAAGACCTA:1 + chr2L 7126857 3' - Burdock 6146 2 65.35 TTAATGTGTTACAATAGTTNTATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCAGCTATAGAATACTTATACATAT:1 - chr2L 6894573 3' - Bica 107 1 77.23 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACGATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGCCAGGTAATAACATTAACCGG:1 - chr3R 4591817 3' + 297 382 2 67.33 AACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACATTTACGAGCCACCCTAACACACACAAACATACAAATTTCGGTTGTTGTATTAAAAATAATATCGTCGT:1 - chr2L 528992 3' - Cr1a 241 1 74.26 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACACACATATAA:2 - chr3R 25950097 3' + 412 7503 2 61.39 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTCTTTGTTTAGACAGCATGAGACTGTTTCGGAATCCCCTTTGCTTTACGACC:2 + chr2L 17549370 3' - mdg1 7064 2 53.47 TATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACAAAGACAGTGTGAAGCCAGCAAAATAAAAAGTTTGACCGCTACGAGGAG:1 + chr3L 20325545 3' + jockey 4866 1 65.35 AAAATCGAATTCTGGACCANAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTAT:1 + chr3R 14049445 3' + transib2 2821 1 74.26 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATATAACCATGTATATCCACTTTAAGCTGATGATCAGAAGGAACGGGCAGTGTATTA:1 + chr3R 4769535 3' + copia 235 1 56.44 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTAAGTTTGCATTTGGCATCCTAGGGTATCTTAAAGCCACCGCCGTCCTG:1 - chr2R 17123553 3' + mdg1 7433 2 52.48 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCAATAAAGAAGTTTTCGCATCAGTTTTATGAAAACTTTCTATCACTTAA:1 + chr3L 25120248 3' + pogo 2077 1 58.42 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCATCCTCTAGCTGGCTTCTATGGACGTGAGCCGCAAACGAAAATTCTCGAAATTATTCAAATGT:1 + chr3L 5256000 3' - jockey 31 1 61.46 AGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTTAAATTGCTACCAGTTCGATGAAAGTTTTGCCGAAAGTGTCAGT:1 - chr2L 17866323 3' - hobo 166 1 56.44 TGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGCTGGCAGTCGAGACTTTGTCGCAATGCCAGATAAGCGATTTCAA:1 + chr2L 13891913 3' - HMS-Beagle2 7000 2 56.44 AAAAAAAAAAGAAAAAATGGGTAACCTAGTCGAAACGGGATTAATTCATATACGTCTGTGTATAATAAGTATTCATCAGATAAATATTCCATATATATAAC:1 - chr2R 7746122 3' - hopper 139 2 73.27 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTCAAATGAAATGGTTACCTATATTTAAGTGTGTGTTTGTTTGGTTCAACAACATT:1 + chr3R 8434336 3' - roo 8685 2 58.42 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGGCCTTGAAG:1 - chr2L 13214967 3' + roo 391 2 63.37 ATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAAGTTTTTGTAAATAAGTGTAGGAATCTGGTGAA:1 - chr3L 14690095 3' + roo 8686 2 73.27 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGCGTGCGGAATTTTAAACAAATATTTAC:1 + chr3L 771816 3' - roo 8712 2 78.22 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATC:1 + chr2R 8707080 3' + flea 4971 2 72.28 TTAATAAGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' - 412 7085 2 55.45 ATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCTCGATATTCCTGATCCAGTTTTTGATGTTCTCGAAGGACTTTTCCTGG:1 + chr3L 19869199 3' + roo 415 1 52.48 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGG:1 - chr2R 19594627 3' + roo 9013 2 80.20 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAAATGTCAAAAAAATGAAATCAAGCTAAACAGTCGTGTATTCCAAAAGCCTAATT:1 - chr2L 22052477 3' - flea 4776 2 60.40 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAAGATGTTAATATTTACTCTATCATATCAAAATAACTCCC:2 + chr3L 5088413 3' - roo 37 2 65.35 AGCCCAAAATTGTAAGTCTNTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCGGCAAGCTGAGATGTACATTTTTTTCCAGGTGCGACGT:1 - chr3L 18597734 3' - roo 8691 2 79.21 TAAGATAAAATAAGATAAGATATGCAATATATTCTATGCTGATTTTGACACGTTTTTTTAAAGATTTTTATAAAGATGGTAGACTCACCATTTTCCATGGT:1 + chr2L 5241360 3' + Stalker3T 202 1 81.19 AAATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAAGGAACACTGATGCTGCT:2 - chr2R 24555647 3' - hopper 55 1 75.25 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCTGGCACTTTATATTCTTCACTCCCATTGTTGTTGCTTACTTTCTTTCCTGTTCACCCACTTTTAT:1 - chrX 7802827 3' - hopper 7 2 70.30 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTACCTATCGCTCCTCCACCTGAACGCTATCTATCAAATCAATTATGCTTTACATA:1 + chr2L 6322612 3' - roo 22 2 57.43 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCAAACATTACTGCATTGGCCAAATATTTATTTCGTGAGAGCACT:1 - chr3R 28216793 3' - blood 7043 2 54.46 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTAAATGTTGTTAAATGAAAAATCTAGTCTTACAACTTTCTCAGAATTGGCAACTATCAATGCTGATAAGA:1 - chr3R 20872681 3' + copia 250 1 72.28 AGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGCGTTGTGGGCTCCACGCGAAAATAAACAAAAGACCGCGTCGCCGAAGACAATACAGGTTGCCCAGCT:1 + chr3R 28730799 3' - FB 737 2 75.00 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTG:1 - chr2L 12779595 3' + flea 231 2 57.43 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCGTGTCGTAGCATACATTTTAGGGCAGGGTTCCGTTTAGGCGATATAAAATTACCTTT:1 + chr3R 18171866 3' + 1360 3385 2 74.26 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAGCTTTGGCTAAATATTCATAAATTCAGCTATTTGCTTAATTCGT:1 - chr3R 28628065 3' - 1360 31 1 58.42 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAAAACTGAATGACTGAAACGAAGTGTATCCAACCTAAAATAACTCAAGG:1 + chr3R 14708804 3' + roo 400 1 68.37 GTGGATGTCTCTTGCCGACNGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCTCTCTAATTCTCTTTCT:1 + chrX 21400846 3' + P-element 2862 1 51.02 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTGCGCATTGAGCAGATCAATAAACATGG:1 - chr2L 435226 3' - FB 46 1 72.16 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTCATGGATTGCAAAAAGCCAAAACCAAAACAATTATTTTTAA:1 - chr3L 95843 3' + roo 397 1 66.34 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGGTGCATGGTGGCAGGGGGGAGCATTTGAGCCAAGTTAAGTTATTGGCCAAGTTTGTGCTGCCGCTGCTGTTG:1 - chr2L 7094213 3' - accord 183 4 72.28 GAAATCAATTCTGATCGAANAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGGACTGCTCCTGGTAGCGGTTCAGCATACGGATCTGGGAGTCCTTCAACTCAT:1 - chr2R 17539740 3' - 1360 3172 1 55.45 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACAGGAAGTGACTTCGCCGAGTTTGCAATAATAAAGTGAACTTA:1 - chr2R 13358777 3' + roo 9033 1 61.39 GTGTCCGATGATTTGTTTANAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTGGCCAACACAC:1 - chr2L 8646676 3' - Tirant 8141 2 59.00 CTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAGCCACCAATGCGGAGCAGTACAATCGCCGACACGCAATTATCGTCAAGCATTCGCGAATTGTGA:1 + chr3R 24324672 3' + 297 6735 2 73.27 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTCGACTCGCTTTTGAATTTTTAGCATTGCATACTTAAGTGGGTTTTTCAGTAATGGCCACGCTAAT:1 - chr3R 28728631 3' - hobo 11 1 67.33 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAAGATAATGTAGAGTCAGATTTCCCAATGGTAAAAAATATGA:1 + chr3R 3258940 3' + mdg1 387 2 58.42 ACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAATAGAT:1 - chr3L 19944238 3' - Juan 4080 1 71.29 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCGCCTTAGCTCCTTATAGCTCCTTATCGATATCT:1 + chrX 21056988 3' + Tirant 8464 2 71.29 GAGTAAAGTCTTCTTATTTNGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTCATGGATTGCAAAAAGCCAAAACCAAAACAATTATTTTTAAATA:1 - chr3L 95840 3' + roo 400 1 69.31 AGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTCGGAAACTCTAGGGTCCTTAGCAGTCTAACCGCCCAACTGTCTGTAACTCTA:1 + chr3R 22869051 3' - R1A1-element 5150 1 56.44 ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTTTGGTGGCAAGTC:1 - chr3R 13239892 3' + hopper2 1562 1 68.32 AAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATA:2 - chr2R 24169915 3' + roo 373 1 60.40 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAAATTTCATGTGAAACCCAACAAGAGGG:1 - chr3R 20284742 3' + pogo 2058 1 72.45 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTTTATTTGAGCAAACGTGCGCTGGGCGCTCGTTGAATTGATGTCTAAAAGCGATAA:1 + chr3R 30593158 3' - jockey 26 1 59.00 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTATCATAAGTCGTTCGTACATTTAT:1 - chr2L 19207886 3' + 412 7536 2 57.14 GACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCATTCTGCTAGCAATGTGGCAATGTGACAGTGTTCTTTTTCCCAGTGCAGCTGGTGGGTGCATGCTTCTGCCAT:1 - chr2R 8769731 3' - G2 2864 1 61.39 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGCAGGCGGCCCTGAGAACGCGGCCTGCAGGCACTTCACATCACTCAACAGGGGCGCC:1 - chr2R 5813561 3' - HMS-Beagle 6809 2 65.31 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAG:1 + chr3R 30252345 3' - 412 30 2 56.25 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAA:1 + chr3R 4474243 3' + copia 227 1 56.44 CCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCCTAAGCCAGCACCTCTGATGGCCCACAAAGT:1 + chrX 22679030 3' - R1A1-element 247 1 69.31 ACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATT:1 + chr2R 21020035 3' - Porto1 4625 1 82.47 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAACAAAAAAATATAGGATAAAGGATTCTACAACCACAAAAAATGGCGGCTTAGATAATCATTTT:1 + chrX 4422684 3' - jockey 22 1 64.36 TAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAGACCGAGTGTCACAGTGGCAAAGAGAACGAGAAACACAATACTAAT:1 - chr3R 28702504 3' + 412 494 1 59.00 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGACCAGAAAACACTTTCGGTTCCCAGGCTTCTGTGCATATTTAATCAACGATTTCCGCTACAATTACAATTA:1 + chrX 14899500 3' - jockey 4827 1 75.25 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCACTTAATACATAATTCGTG:1 + chr3R 13544155 3' + roo 9050 2 57.43 ATATTAACTTCTGTAAACGNCGGCTAAAAATATGACAAAACAAAGGCGAAACTTACTGAAAATAAGCGCAACCAAGGGGAAGAGGAGTGGTCTCCATATGC:1 - chr3L 13367662 3' + mdg3 5492 2 71.29 GCCGGCGTTCGTCATGCTCNCGCTGACGCTGTGCGCGAGTATCGTGATAGATCCTAGATCGCAGATCCTTAAAAAAGTCACTTGCAAC:1 + chr3L 16773571 3' - F-element 225 1 54.55 AAGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTGATAGAAAAATACGTGTATAATCCAGGTG:1 + chrX 15258369 3' - BS 15 1 57.43 GCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGCGTCCATAGTTATTCTGATTACGGTTGTAGTCCTGATTTCCATAGCCA:1 - chr3L 9093822 3' - BS 4875 1 72.22 AAATCATTGTAGTATTTAANTTTAGTAAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAATGTTTTTAAGTCCATGTATCATCTAGAAGGTGACTTCTTTAAACTACA:1 - chr3R 5171658 3' + Tc1 1549 1 57.43 GCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGAGGGGGGGAGGGGGCGTGGCAACAGCCTCTCTGCGGCCAAAATGACGACGCGTTGGTATTTTCATTAA:1 + chr3L 5279948 3' + jockey 4683 1 71.29 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAATTTTGTAGGT:1 + chrX 11030932 3' + roo 389 2 59.41 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCAACGCCCACGTTTTTCAGTATTTGCCAAACACTCGAGTTTCGGAACCTTTTTGCGGATTGCG:1 - chr3R 7688847 3' + Tirant 386 2 66.34 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATTAAATATCACTATACCTATTG:2 - chr2L 20396944 3' - Transpac 4970 2 77.23 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGAGAAACACACACACACAGCTATCAGCACTTGTGCACTTTGCATGTTTAGCGCTGCAATGCTGGCTACACTTT:1 - chr3R 24484714 3' - roo 3 2 77.23 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTTGCACTTGTTGTAAAGGCGGATGGGGAAAGGGGTG:1 - chr3R 5670689 3' + 412 7504 2 65.35 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTTTGGT:1 - chr3R 13239900 3' + hopper2 1554 1 76.24 TGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTGATGCGAATGATGCCAGGGACTATGTGGATGGACTGCATCATGCGGCCCACTCGCACACGCATCCGCATTCGCAT:1 + chr2R 9524113 3' + Stalker 434 1 63.37 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGTTTGTTGTCGCGCATTTAGGAATTATGTCAGCGAGCATTGCTATGATATCATTTGAAACACAGCTT:1 - chr2L 4998381 3' - S-element 6 2 73.27 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTATACATAAAGCAGGCACCACGCACCCAGCAA:1 + chrX 14324734 3' - 297 6618 2 76.24 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGG:1 + chr3R 30611308 3' - blood 31 2 55.45 AAGTTACCTGCATCGAGGCNTTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCGTAATTAAAAATAACAG:1 + chr3R 19270407 3' + pogo 2063 1 63.37 ACCGGCTGCGCCAGTTACCATTCGGGCCGAACGATTTGGGACAGTAAGGACACTCGTACTCCTTCCGGTTCCGGTGAATCTTTAGGTGACTGATCAAATA:1 - chr2L 15112255 3' + accord2 7425 1 70.00 GTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGGCATTTGAAATGAGCAACGTAATGGGAATCG:1 - chr2R 6769419 3' + 412 7542 2 74.26 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATA:1 + chr3L 23871300 3' - Doc 55 1 72.28 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCCGAATGTTACGAGTTTATACTCGTAAAATGGCCTAAATTATTCGTTTGCCTGAAATGTG:1 + chr3L 13072054 3' + roo 393 1 61.39 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGGAGGGCAAAAACTTTGGATGTTTTGAGAGTTCGAAGTTCATACTGTCATCCCGCTCTAAACCTCTGCATTCC:1 - chr2R 20584390 3' + P-element 2882 2 67.33 AACCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCCCTGGAACCGGT:1 + chr3R 15249876 3' + P-element 2826 1 20.79 TTTTTATTACTTCAAACATACGGTTTGGTAAGGAATCATAATATTTTTGATCATTATTATCTATTTTAATTTGTCGGTACATCTTTTCAATGTCTGCCGAA:1 - chr3R 19445382 3' - Tc3 1397 1 60.40 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATAATCAAAT:1 - chr2L 12779576 3' + flea 250 2 63.37 AAAAATTAAAAAAAAAAACATAACACTCACAAAAACGATTTGTATACCTTTACATTTCTAAAGATGTTGTGTTTATTTTTATTTTACTGCGATAAGA:1 + chr3R 26883357 3' + Doc 4697 1 62.89 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTGTTTCATTCTCATTCGGTCTTTTGAAATAAACGCACGTATTCT:1 - chr3L 16807691 3' - P-element 6 2 70.30 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAAAAAAAAACAACGCACCCACCACACACACACACAC:1 + chr3R 5020465 3' - hopper 35 1 61.22 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACACTGAAATCTAAACATAAATCTCATTCATAAAGTATGCAGACGGCGCGCGTCGCTTTTCAGTTCTCTTTT:1 - chrX 6075190 3' + P-element 2882 2 72.28 AATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACATATATATATATACGTATCTTCTTGATCTGTCCGTATGTCGGTCCGTCCTTATGAACGTCGAG:1 + chr2L 10230173 3' - invader4 12 2 69.31 AATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATACCAAAGTATTATTAAATAGTTATAAAGTTATCATTGTAGAACTTTTGGTAGAC:1 - chr2R 19330267 3' - McClintock 18 2 62.38 GTGTACCCTCGATATATGCNCATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTCTAAAAATGAAAACAAAAACT:1 + chr3R 26343022 3' - blood 7019 2 71.29 CGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTTACGACGCGATGCCATTGGACATGTGGATGGATGTGTGAG:1 - chr3R 12393108 3' - Ivk 5108 1 56.04 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACCCCCAGCAGCTGTTTGGGCTGCACGTGAGC:1 - chrX 21374178 3' - P-element 44 1 38.61 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATG:1 + chrX 7534699 3' - Tirant 8147 2 65.35 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACGCTAGAGTTAATTGAAAGTGACAAGGCTTCAGAAATGAGAAACAAACTAA:1 - chrX 3016637 3' - diver 5916 2 51.49 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAACAAAAAAATATAGGATAAAGGATTCTACAACCACAAAAAATGGCGGCTTAGATAA:1 + chrX 4422677 3' - jockey 29 1 57.43 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTAACTAATTTTTGCAACTTTTGTATAAAAATTGTCATTTGATTGCAATACTTACTTC:1 - chr3L 12983165 3' - diver 22 2 57.43 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGT:1 + chr2L 21645249 3' - 1360 4 2 74.26 CGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGA:1 - chr2R 6769452 3' + 412 457 2 58.00 ACATGAAAATGATTTGGCATAATAATCAATAACCACTAAAGAAATTATTCTTTAAAGCTGTCAAAAAACATGAAAATGATTTGGCATAATAATCA:1 + chr3L 8226888 3' - Transib5 2698 1 33.68 GGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCCCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTGTTTTTTTTGGGGTATTAGCGTTGTCAC:1 - chr3R 18362035 3' - F-element 4495 1 70.30 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCCGCTTTAAGTTGCGCATTTAATTCGAAAGCCATCGCGATG:1 + chr2L 9471297 3' - roo 8670 2 75.25 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCGTAATTAAAAATAACAGCAATGCAT:1 + chr3R 19270415 3' + pogo 2071 1 56.44 AAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTATGGTATTTTCAAAAGTGTTATTGAACAATTAT:1 - chr3L 20951639 3' - 1360 3262 1 67.33 GACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCGTTGTAGGCCTCTGCTCAGCCGCAGACGTGGTGGTTCCCCTCTTGTAGAACACCGACAGTTCACCTGCCATG:1 + chr3L 10091234 3' - baggins 5185 1 83.17 GTACTTGCTTGCCGGGCAANCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGAAATAAACAAAAAAAA:1 + chrX 15425907 3' - R1A1-element 5149 1 73.33 TTGTTTTCTTTTATATGTTCATGTGGGCGGCTGGCTTTTTTCTTTAGACCGGTTTTCTGGGCCGATTTTACTCTCTTCCATTTCAAAGCCGTTAGGTCTTC:1 + chr3R 3695864 3' - gypsy9 443 1 66.34 AAACACGAGAGCCGAGCGCNGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGCGA:1 - chrX 18121840 3' - opus 7156 4 72.28 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCTCTCTAATTCTCTTTCTACAGACTCCGTTCCTCCAAACTCT:1 + chrX 21400870 3' + P-element 2883 2 73.27 TTACATACTTTTCAACGAATCTAGCAAATTATAGTTTACAAATTAATCGCTTGTCAAAATCGAATTCACGTCTCACCCACCTACCCACCAGGCCACTCTTC:1 - chr2R 9629046 3' - INE-1 14 1 69.31 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGCCGACCATAAAAAATCCGCAACGCTTCCCGTTCGGTACTTCG:1 + chr2L 3766354 3' + hobo 2904 1 61.39 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTTAGTGGCTTATAGTATAAGTATCTTATCCCT:1 - chr2R 6074352 3' - 412 7079 2 49.50 ACGCACTATCTCCTTCCACGCGCGATCTTGCTGTCTAACTGACTGACTGGCTGACTGACAGTCAGATTCGGTCTCTATCCTCCGGATCTGGCTTCAAAGG:1 + chr2L 14533319 3' - gypsy8 399 1 66.00 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAATAATATTACTTATCTTCGTCGTCAAATAATTTTCAT:1 + chr3R 20192584 3' - Quasimodo 38 2 69.31 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATACATATTTCCATAACACACTGCAATCTACTTTTAATGGCCCCTTGGAGTTTTTAATTAACAGCCAAAGCTTTTGG:1 + chrX 6058270 3' - roo 8665 2 76.24 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAAAGCGGGTCGCTATTCAA:1 + chr2R 11404023 3' - mdg1 8 2 67.02 GCTGTGTACTTATAGGTACNGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTC:1 + chr3R 26343002 3' - blood 28 2 51.49 AATAGAAAACCTCTGGTCATATATACAACAAAAAAAGGCGTGCAAACTTATCAAGAACCATTTGATCTAAAATACATAAGTCAAAATTTTATATTCTTCGA:1 - chr4 1225793 3' + Tc1-2 1186 1 53.47 TTGTGGGTGTATAGGGTGCNGTGGTTGTTTTTGTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTGTGGAATGCTTTGGTTTTTAGGAATGTTCAACTCCCTTATGCTTAAA:1 - chr3L 3988518 3' + R1A1-element 5267 1 73.27 TTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATTATTGTTATCCTGACGAGGGCATTTGCGCAAATTGAATGGAACAATTTGCCTCCGGCCATCAACAGTTTC:1 + chr2L 20226770 3' + 412 485 2 70.30 TGATGTTGAAGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTCTACCTCTTCGGGAAAAATTACCAATTTTTTAACATTTGTTGTTTTTTAACTTGT:1 - chr2R 658401 3' - gypsy7 312 1 58.42 GGTGGCATATATTGGTTTATTACACGATACCCTTTCAGAGATTTTTGGCAGCTGATTGGTCACGGCTAAGATTTCGATCAGGACATCAATCAGTGATTGTC:1 + chr3L 15435631 3' + blood 375 2 73.27 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTCAGCTAATTAAAATTTCAGTATTAAATGCATTTGTTTTCGAAGGCATGTAGGCAGTCTGAAACTCATC:1 - chr2R 11941196 3' - Doc 29 1 50.50 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAGCACC:1 - chr3R 20791651 3' - pogo 45 1 51.49 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATGGCGTGAGGGAAGATGGGAAATGTCGAGCCAATAACCCAGCCGCATTTCCATTTCGTATTTCCCTGCAA:1 + chr2L 15479644 3' - blood 7018 2 72.28 TTTATTGAAAGAGAGATTCAGTTGACCAAGAATATATTTAATATTTGGCGCCCACTTACCACGCTATTCCACGTATCCCCGTGGCGCCACTCTGAAAACTG:1 + chr3R 14642040 3' - Tabor 445 2 55.45 ATATGAACGGAGCCCAAAANTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACCTTCGCTGCAACCTCATTTCGTTGATGATAGTATTTAG:1 + chr2L 4571374 3' - roo 8701 2 61.39 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATTATATTTGTATATATTTATCCCAGTCAAAAAACTATGATAAATGCTAAGGAAC:1 - chr2L 10698353 3' + roo 389 2 49.50 TAGGTCCAGATGGGCTTGAGAATTGCCTTGTACACCAGGATTTTGTGGTTCTGCCTTAGCTTGGACCCTCTCCCAATAGGTGACCCCAAGTGACGCACCAA:1 - chr2L 20951033 3' - G2 2647 1 77.23 ATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATAAGCTACAATGTACTGGTCCCGTACTCAGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Stalker 44 4 95.79 ATTATTGTTTTTACATTTATTTCAAAAGACAACTGCATAATAAAATTATTTAGATATACTTCGCTTTTTCGGATTAGTATAGACTCATAAGCCTATCCAAA:1 + chr3R 10845534 3' - looper1 1813 1 66.34 TATATAATAAAAAAAAAAATAAGCACAATAACTTCTATATTTGTAAACACGAATTCTGAAAGTGAAAACTGGGTCATTTGGAAAAAATATTTATAAAAAA:1 + chr2L 10144243 3' + Rt1a 5070 3 51.00 GGCAAACACAGCATATTTGNGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTGGCTATGCTTTAATAATTTTTCTTTTAAACTTTACTTATGCGTCATCATGTGCAGCTC:1 + chrX 23508020 3' + Gypsy6A_LTR 99 1 63.37 AAATAAAATAAAATTAATTATAAAACGAAAATTTTGTTATCTTTCTAACGGTTGCTATTTCTATCGAGTAATTTGAAAGATAGTTTGGTAATTTCGTTGTA:1 - chr3R 27005742 3' + NOF 3961 1 49.50 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACATCAGATCTGCGAGACCTGTCAGAGTCG:1 - chr3R 11278400 3' - hobo 44 1 72.28 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACACACATATAATTT:1 - chr3R 25950094 3' + 412 7506 2 58.42 AGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATACCAAAGTATTATTAAATAGTTATAAAGTTAT:1 - chr2R 19330289 3' - McClintock 5992 2 69.31 ATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTCCTCGATGAATGTGTGCGAGTGTCCTGTGCGAAGTGACAAAAGCATTGACAGGAAACAAAACTGTCC:1 + chr3R 14139513 3' - R2-element 3246 1 74.26 TGCTGCTTTTTTTTTTCTTTTTTCAAA:1 + chr4 62074 3' - gypsy7 5011 1 88.89 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCACACCCACAATCGTCTAATGACGCTGAATAAACTAAGCCCGAACAATTTAACAAGCCCAAAATC:1 - chrX 5194489 3' + hobo 2926 1 66.00 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTCACAACTTACAACTCACAGCTTGCAAACACACACCCAACCCCGC:1 - chr3L 6866171 3' - 412 7084 2 55.45 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTCGTATAGTAGCATACACTCGTACACACGCTATC:1 - chr3R 19270349 3' - pogo 40 1 65.35 ATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAATTTCGAGCGAGGCGAAGTGAAGCCA:1 - chr2R 24582277 3' - G4 59 1 78.00 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACTTGTTGGCATCTGGGCTGCCAACTCACGCTTATAAAATACTAA:1 - chr2R 23877700 3' - Transpac 8 2 70.30 TGGAGTGTCCGATGATTTGNTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCT:1 + chr3R 4773403 3' - Tirant 38 2 60.40 GTTTTTTTTTCGTTTATCTTGTGATAAGGTTTTATCACATATAAATATGTGTTAGCGACTTTTCCCCAAAAATAAGTTGTTCCACTTGTTCATTTGCAAGG:1 - chr3L 23665018 3' - Porto1 158 1 42.57 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGATTTACGAATTTCACCCACAAAGAAAGTTAGTTTATTGTCACTCTGTGCCATCTTTTTGCTCCCTTTAAG:1 - chr3R 18769551 3' - roo 8671 2 68.32 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGCTTAATGACGACACGAAGCCGCCGTTTG:1 + chr2R 21362818 3' + Tirant 8460 2 72.28 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATAAAACAAAATGAGAATGCATTTTGCGGGTGGCTGGATTAAATGCTG:1 + chr2L 6081949 3' + Transpac 5210 2 60.00 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAACACACTCGTGAGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 5894468 3' - Tirant 15 2 62.00 AGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGCACATGTTTGGAGCCATTCTGCTGGCCTTTGGTACGGAGCTGAATAAACAGAGCTTATGGGTGTTCT:1 + chr3R 25213362 3' + Doc2-element 446 1 76.24 ACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATACAAATTAAAAAAAAAAATGTACTTATGACAATCGGAGCCATTTTCATTTAAAACAAAAGGAATCAATTTC:1 - chr2L 10317453 3' + Doc 4670 1 60.20 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAATAGATAACTAAATTAGTTCTGGTCTAGTTGAGGATAACAAACGCATTG:1 - chr3L 19944195 3' - Juan 4030 1 72.34 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCGCCTTAGCTCCTTATAGCTCCTTATCGATAT:1 + chrX 21056986 3' + Tirant 355 2 73.27 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTACATATGTATATTTCTACTTGCAACAGCAACGCCAACTGCGATAGAGT:1 + chrX 2164331 3' - mdg1 28 2 54.46 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCA:1 + chr3R 14860225 3' - BS 5011 1 62.38 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAACACCGAAGTGGG:1 + chr2L 1335363 3' - jockey 4695 1 55.45 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCGCTCCATCCCGCTCGCACGATTCTTTGGG:1 - chr3L 5206563 3' - roo 8710 2 71.29 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACAATGTAGGTTCCGTTTGGCA:1 - chr2R 11661112 3' - 1360 43 1 78.02 AACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCGTGTCATATCTGTGTTGTGGCACATCTATTGCATATACGTAAATTTATGTATTATTTTCTCCGCTCGA:1 - chr3L 19514496 3' + flea 251 2 41.58 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTATGAAAGTTAGTTT:1 - chr2R 16680118 3' - 412 30 2 57.43 GTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTTCGTAAGCACTCCAGCGCCCTGCATCTGCTTCACAGAAATCA:1 - chrX 17085871 3' + Stalker 6920 4 78.22 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATGTGTGAACCGCCCCCGGTATAGCATC:1 - chrX 13268837 3' + 1360 3382 2 69.31 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGATTAGTACTAAACCCAACGGTCAGCATGGAAGCGTGCGGAGCTTGCGTGT:1 - chr3L 27284726 3' + blood 7364 2 51.49 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAATACATTAACAACGTGTGGATTGTGATTTCCGCTGTATACTTTTCGGAG:1 + chr3L 11523373 3' + jockey 4969 1 50.50 TGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAATTCAAATGGTTGAATTGAAAGATAACAGGAATGTCAGATAGAA:1 + chr3R 25271763 3' + invader4 325 2 76.24 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACAGATGTATCTCAAGCGAGGACAATCCTTTCGCTGCGGTTTTTGCTAGGCGC:1 - chr2L 18927464 3' - mdg1 25 2 54.46 GCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGACGAAGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGCCATACAGGTCGGCTTCATGAATATCAAATTCAACTCTC:1 + chr2R 17002131 3' - 1360 3203 1 61.39 ATTATTTATGATAAATTTAAGCAATATTTCAAGTAAACTATCTCAGTATCTACGACAATATGCTTATCCTTTCTATTTCCCCAGTTAGTTCTTATTTACTG:1 + chr2L 8323054 3' + INE-1 425 1 49.50 TATATATGTACTTTTCATGAAAAGATGAGGGTCAATCGGAAGCCTGTTGACCTTGTTAACCGTTCTGGGCGACCACCACCCACCAGGTGTCTGTCGATCTA:1 - chrX 19211902 3' - Juan 4178 1 78.22 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTGCATTATTCCAATTGCAGAATCACTTTGTCCTGTTTGTGTGCGCTTAATAATAGGTGTGCTTGG:1 + chr3L 13367778 3' - mdg3 5263 1 70.30 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGA:1 - chr2L 20271228 3' - blood 49 2 73.27 GGGCAGCACATTGGGGGCTCGATAGAAACGCAGTATCCAACAAATAGGGCAAAAGCGATTCGTATGATAGGGGTGTCTCAAATCTGCAAAAGCATCATGTG:1 + chr3L 16238172 3' - X-element 379 1 62.38 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAATTGAAATT:1 - chr3L 17110715 3' + hopper 1377 1 64.00 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTGTTCCTGCGGTTGCCAAACACCGACGACACACGAGCCTTTAAGTGGGCG:1 - chr2R 10969377 3' - mdg1 7062 2 55.45 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTC:3 - chr3L 24150533 3' - blood 43 2 69.31 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGGGTCCTAAAACAGAGTCCTAATCTCAATCTCTCGCTGATACTGTTTTGACGCTCTGCTCTCTTCGCA:1 - chrX 15076749 3' + S-element 1710 2 88.12 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCTACGCATACATTGTGTAAATCCCTCCTGTGACAATCGAAA:1 + chr2R 16805509 3' - P-element 18 1 38.61 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACAGCCTCCGAAGAGCTAAAAGC:1 + chr2L 13433948 3' - hobo 54 1 80.20 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATTTGTTCTTAGAAAATGAATGAACATATTTCA:1 - chr3R 5993084 3' - pogo 3 1 76.24 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCATCGCAGTCGACGCCGCTGT:1 + chr3R 26170810 3' - P-element 56 1 23.00 GCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATGGTGCAGTTGAGTCTGCTTTAT:1 + chr3R 28383961 3' + pogo 129 1 78.22 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTAATCCAATTG:1 - chrX 21056901 3' - Tirant 8114 2 74.26 AACTCATGGCTGCGATAGTCGAAGAGTGGGCGTGGCTGACTGGAGATGAGGGCGAGCTGAGGACGAGGATGAGGTCGGAGCATTGAGTCTCGGATGGGG:1 - chr3R 17331834 3' + S-element 1311 1 48.48 TTTTAAACATTTTTTGGGTTTTTTTTTGTATTGTTGCTAATTGCCCTCGTAGTGTCTTGTGAACTTACCACCGTAGCTG:1 + chrX 2513632 3' - mdg3 5112 1 78.48 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGCTAACA:2 - chrX 15412659 3' - hobo 14 1 65.35 CACACACACACACACACACATTGCCCGCACGAGCACACACAACCGCGGAGCAGATATGACTGGATTTATAGCATTATAATGGCCATTGTCTGGCGTTCTAT:1 + chr2R 12674847 3' + accord 184 2 69.31 GTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCGCATTGCCGTCGAGTACATCCGGAGGCTTCAGGATCTGGTG:1 + chrX 396653 3' + accord 7125 2 59.41 GATCTCAGGAACAATAAAAGCCAGAAGGTTGAGATTTCGGTGCCAAAAAAAAAAATATTGTTAGAAAATAAAGAGGAAACTT:1 + chr3L 13883820 3' + INE-1 150 1 60.98 TTTTATTTTTCATTTTCCTTTTCCTTTTGGATTTCCACAGGCTACTCAGTTGCTAGTCCACAGTGGTTTGGTACTCTTTTTCACTACCATTTTCAATTTAT:1 + chr2L 4858433 3' - 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roo 8664 1 79.00 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAA:1 - chr2R 13446671 3' + roo 9021 2 79.21 AAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGTTCCCCATCTTGTGGTTGGCTTTCT:1 - chr2L 4110766 3' + Doc 313 1 75.25 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCACTTAATACAT:1 + chr3R 13544147 3' + roo 9042 1 54.46 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGT:1 - chr3L 19274784 3' - transib2 11 1 68.32 GGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCATCGTTATTGAGTAGTACGACGTTTGCTAGTATTTTTTAAGCCATTTTATATAGGAGCCGCTAGCGGGTGAAAAGG:1 + chrX 17826940 3' - Tc1 1281 1 64.36 GGGGAAGCGGATATAAAAGNAGCGGGGCGGGGGAAGAGGCAGAAATAAGGACAAAGCCCGAACCGCAGAAAGCATCGTCCGCATTGCCGTTGCG:1 + chr3L 16683519 3' + opus 280 2 58.51 ACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTTACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATCAAACATAAGACGTGGTA:1 - chrX 22689838 3' - Transpac 102 2 82.80 GGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCCAATGCGAGGAGACACCAAAGCGGAGGACCGCCGGAAACAGGGGGGAAATGTGAAAAATCCTATAACTCCC:1 + chr2R 979694 3' + Porto1 4291 1 72.28 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATTAACATGAGG:1 - 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jockey 4687 1 61.39 AACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGCAATTAAAATTTATGTTTGCACGCCATAAATTTGGGCATTCGGCTCAATAAATCAGCGACAAGT:1 + chr2R 16978876 3' - 297 6797 2 68.32 ATGCGCAAGGAAGAGGCAAATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGATTGATGGATTTTAAATGAAATTTTTATGAAAAATGTTTGG:1 + chr2R 18401638 3' + Bari1 169 1 59.41 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTACACACGTCGGCGATTGAATTGAATTCATACACACGCACCGCAAGCTCACCAAACGCACAC:1 + chr2L 15168084 3' - F-element 52 1 63.37 AAAATCTAAAAATAGAATTTTCATTCTTGAAAACAAGAGACGAGGACGTGAGAATCCAATTTAATTCTGCAATGGATAAAGTCGATGAGATGG:1 - chr2L 9251348 3' - 1360 3270 1 52.69 GTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCTTTGGCCCGAAAAAGAGTTTGGAAAAGGATCAGGCCGAGACGTGAGCTAATTAGCTGCTAACTGCTAACTGCTT:1 + chrX 1418138 3' - F-element 320 1 79.00 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGACCGTGGAAAAGAAAATGCAACGTAA:1 + chr3R 12906583 3' + hopper 1366 1 74.26 ATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTCAAGTTGATTGCCATTGCAATGGAATTAAGCCAATAATTTATACTCTTTAAAAGGTTTTAATTG:1 - chr2R 24432906 3' + Transpac 5109 2 73.27 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAGTCCGATGAAAGGATCACTTTCGCTGAAACTTCTCGAGTGGAACGACAAGTG:1 - 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P-element 451 1 38.61 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACACGAATCGAATGTCATTA:1 - chr2L 17549291 3' + mdg1 395 2 52.53 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATTTCAAACAGAAACTGAGATAAACCATTTTTTACCAGC:1 + chr2L 2309453 3' - Burdock 6170 2 60.40 TAATATTATTATTAATATTATTATTAATATTATCTATTTAGATATTTTTATCAGAAAAACTCTCTTTAGAGTTGGGTTTTACATCTTTCAGAATTTCGAG:1 - chr2R 18063056 3' - mdg1 7084 6 59.00 TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTGGCGGGGGTCATTAATAAATTAA:1 - chrX 12284070 3' - Transpac 44 2 76.04 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACTGGCGAAGTCCGTCCAAAGACCGTGGGATCGGCACTT:1 - chr3L 13383366 3' + opus 7475 2 63.37 AAATACTGAGGCTTCGCCTCAATCCAATTTACATTCGATTCCGCCCAGCTGTAATGAGATGCAAAAAGAGGTACGATGAGTTATCTGATAACTGATGATTT:1 + chr3L 19160717 3' + 297 239 2 69.31 AAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCAGCCCAGCTGTAAAAACTTAGTCCTGTCCAGCTCC:1 + chr3R 22347055 3' + Doc 4498 1 78.22 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAATTAGATGAATCAACCTGTATAATGATAGAAAACCTGTTCTATTGTCTTAAG:1 - 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mdg3 5277 2 50.50 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTGTGATGTCATAATTGGAATGCCTATCTTAATTCTATATTTTGTCTTTCGTCTGTTATTTCTGTGTACTCAT:1 - chr3R 10434527 3' + 1360 3385 2 76.24 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCAGCGATTTGCTGATTTGACGGGCTCTTTCGCAGCTTGACATCTTGTCAGCGAATGCGACCGCATGGG:1 - chr3R 24017675 3' - 1360 43 1 73.27 TTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAGAGTTTACATCTCTTCTGATTAAAACCCGCTTAT:1 + chr2R 22467362 3' + 1360 319 1 69.31 GGTTTCTTAACAGATGCCACTCGCTTGAAGACGTGTGTACAAGTTCTCAGGTCCTTACAAATGAAAACAGTCTCTTTAACATTTCTGTGGCTGCTGCTGCT:1 + chr3L 2161983 3' - Chimpo 3969 1 67.33 AATTTAAAAAATTAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGA:1 + chrX 8958629 3' + TART-C 11098 1 75.25 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAACGGGAGTTCATCATTACACATGACATAAAATATATATATCA:1 + chr3R 16806053 3' + 412 7490 2 76.24 TGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATATATTATTAAAACAACAAGAGGGTGCCGGCGAAGAG:1 - chr2L 4764027 3' - Tabor 6879 2 61.39 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTA:1 - chr2R 16680131 3' - 412 7096 2 70.30 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTTGCCACTGCTGGCTTTTTGCTAGATGGGCTTGT:1 - chr3R 20345081 3' - transib2 19 1 60.40 AAATCGAATTTTTGAAATTNGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTT:1 - chrX 10119541 3' + FB 25 1 68.32 TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAATTAGATGAATCAACCTGTATAATGATAGAAAACCTGTTCTATTGTCTTA:1 - chr2L 7259411 3' + I-element 5333 1 52.48 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAA:1 + chr2L 21737999 3' + 1360 3342 1 87.13 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTCTGAA:1 + chr3R 28216845 3' + blood 329 2 79.21 AATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTCAATGCGAAATTGAAACAAATTTCGTTTTGCAGAGTTGGCAGGAAGCATTTATGAACGATATTCAATCTG:1 + chr3R 25950184 3' - 412 3 2 76.24 GTAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGTTAACATAATAGCACTGTCACTTCGATGAATTATATTC:1 - chr3R 14521072 3' - I-element 38 1 60.40 TTTGTATGTTATCTGGATTGCGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTAGTTTTTTGTAATCCCCAGA:1 + chrX 20904505 3' - I-element 5127 1 72.22 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTCATTTGGGATTTTACATATATACAAATCGATTTTAATTGGTATAT:1 + chr3L 2270570 3' + roo 362 1 75.26 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTT:1 + chr3R 11151892 3' - mdg3 31 2 55.45 GTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACACACACACATGAGCGGGCATCTCGTCAGGATAGAAGTAATTAAAAGTAAA:1 - chr3L 9177977 3' + jockey 4712 1 50.50 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCACAAACGACAATACGGCGG:1 + chr2L 17865663 3' - hobo 50 1 83.87 TTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAATTAATTACAATAAAAGTGTAGGCAGATTTATTTGCATATCATGTGATATTGTACTGAC:1 - chr3R 5213200 3' - G2 3050 1 48.51 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGG:1 - chr3R 25950109 3' + 412 7491 2 73.27 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCTGACATTAAAAATATGAACAAAGTTGTGTGAAATATATTGTTCTTTATTGTGTGGTTGGGGACCGG:1 - chr2L 18077365 3' + hobo 2929 1 69.31 AAACTACCACGAATCAACCCACCAAAAGATCAACTCAAAGATCCACCGAGTCCCGCCAACGTGTCCCTATGTCTACTCTATGAGTAACGGGTAAAACTACC:1 + chr3R 28300367 3' + HMS-Beagle 6703 1 78.22 TTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCTATACAATAAATCTTAAATTTTTATAGGCGTAATTATAATGTGTTTCTCTCAGTGTC:1 + chr2R 7054496 3' + rover 7053 2 70.45 TGGCTGTGGTTGGTACCCANATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAGTGGGTCTGGTTCTTGTGCAGTTTGAA:1 + chr3R 4407385 3' + R1A1-element 5007 1 72.28 ATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGT:1 - chr3R 19950446 3' - BS 5010 1 58.42 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCAACCACAAGGCAAATAAAGAGGGGCTTGGTCGTGGCACACAAAGCCAGGCCAAAA:1 - chrX 8343627 3' - hobo 19 1 58.00 GTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAATGCAATCGTAGCAATTGAAGGGCTTGGCCAAGTTCTCGATGTGATTTAGTTCG:1 + chr2L 15897109 3' + pogo 1991 1 61.39 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACTATT:1 + chrX 19812411 3' - Transpac 48 2 73.27 ACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCGCTAAACGAAATCGAAAACGAAAAGCAGTCAGTCAGA:1 + chr3R 16594544 3' + Tirant 365 2 61.62 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCC:1 - chr3L 16807729 3' - P-element 56 1 36.63 GATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAAGAGCGAACATCGACTGGAGCACTTGCCATTAGAAATGGTATAGTT:1 - chr2R 23215095 3' - Doc 4267 1 59.41 TTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGTGCGCAAAAAGCGTTGTAAATTGCATGACCACTTACGTGCTTTGAATGAGCATGAAGGC:1 - chr2R 13433765 3' - 297 6820 2 63.37 GGAGGGATCCGAAAAGCATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGG:1 + chrX 23280891 3' + R1A1-element 5334 1 39.60 GGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAGTTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTCACAAGAGTTTTTCATACATATACATATACATATATTTTTTTCACGTTTA:1 - chr2L 19176625 3' - TAHRE 10416 1 56.44 ACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGCACCAAACGCAGTGGCTTACACATCGCAATATCATCGCTGT:1 - chr3L 7286792 3' - blood 7212 2 56.44 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATGTTCATCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATT:1 + chr3R 9300766 3' - Burdock 41 2 67.33 ATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAGAGTTAGAGTATTTGTTTAGCCTACCTCTCGATCTTCCTATTGATAGCTATGCGTTTGCTCATTATT:1 - chr3L 22246410 3' - rover 330 2 75.25 TGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - Doc2-element 452 2 53.01 ATTCATCCAAATATCTCCANTAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGTAGCGGGGATCGTCCCTCAAG:1 + chr3R 13205799 3' - hopper 53 1 76.24 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAACCCACGACCGGAAGAGAAAGAGAGAGACAGAGCGAGAGAGAGAG:1 + chr2R 14083834 3' + Tabor 457 2 54.17 AATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGGCGCAGTCGCTCACACTTTCACAGACTCACTAGAACTAATTTCGAAAAGCTG:1 - chr3R 24769339 3' + Quasimodo 7340 2 57.43 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGTAACAACAAGTTGGCCAACATGGCGGCTGTGTCATTTCCGTT:1 + chr3R 20345163 3' + transib2 2792 1 59.41 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATTGATTTCAACATATTCATCAGGCAGTGCCACGACCTCTTCTCCACTCCCCCATTCGCCTCACCTCCTC:1 + chr3R 15117697 3' - roo 7 2 72.28 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACAC:1 + chrX 7534726 3' - Tirant 8120 2 68.32 TATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTATCACTCTAAACCAATCACTGGCCAACAGGAAATGAATCCTTCGGTCAGAAGAGCACTCTTGATTAAGGAT:1 - chr3R 16326660 3' - Bari1 296 1 58.33 GGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCCGCCTTGAGCAATCGGCTGTTGGTTTTTCCAGGACGTGTGTTTGTGTTGCCATTTGGGCTTAAGTGTTCC:1 - chr3R 5774619 3' + Stalker 7037 4 57.43 AAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTTCTCTGTGCCGCAAACATTTCCGTCACATGTTTGTAATAAAGTTTCAG:1 + chr2R 17533951 3' - P-element 261 1 49.50 TAGTACTCATTAAATTTAANTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAAAATGAGTTCGGACAAAGATCGCTTTAAGCT:1 + chr3R 4536232 3' + Ivk 5332 1 69.31 GAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCTAGTCAAAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chr3L 12479529 3' + rooA 292 2 66.67 AGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAAC:1 + chr3L 23678148 3' - Osvaldo 25 1 77.23 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTATGTTACACATTTTCCAACTGCGC:1 + chr3L 5538102 3' - jockey 4683 1 68.32 GAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATCAATTTGATGCCAGCGAACTACTAGATATTTCTAAACAATTAATTGCTAAAAATAACGAAACTATTTTTA:1 - chr3R 25271631 3' - invader4 2757 1 77.55 ATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTAAAATCAAAAATTAAAAATGGTAGCTAGGAATGAAAAAGTGAAGAAA:1 + chr3R 12062999 3' - 1360 304 1 63.37 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATATACGTATATAAAAAGATAGATGTTAACCCAAAAAAATAATAAAATATGAAA:1 + chr3R 22517334 3' - jockey 4696 1 52.48 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGTGCCCTTTGCCACCGGCCACACCCCCT:1 - chrX 6338898 3' + P-element 2838 1 30.69 TAAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCCACCAGTACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTCAAATACACTTAGATTTTAAAAGCGCA:1 - chr3L 11924736 3' + Doc3-element 447 1 74.26 AAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTATAAACATAAAATATGGGACAAAAAAAA:1 + chr2L 20916416 3' + roo 29 2 69.70 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATAACTGGAACCCAATACGAAATCAACCGCAGAAACCTCAA:1 + chr2L 8913377 3' - mdg1 37 2 61.39 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATGTACTTG:1 + chr3L 7494098 3' - roo 8696 2 58.42 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCTGGCACTTTATATTCTTCACTCCCATTGTTGTTGCTTACTTTCTTTCCTGTTCACCCACTTT:1 - chrX 7802830 3' + hopper 1405 2 67.33 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTGATAGAA:1 + chrX 15258347 3' - BS 37 1 65.35 AAAAGCTTAGCGCCATGTGNATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTGGCGGGGGTCATTAATAAATTA:1 - chrX 12284071 3' - Transpac 50 2 77.23 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTCGTATAGTAGCATACACTCGTACACACGCTATCAACTACATCATCATACACACACC:1 - chr3R 19270326 3' - pogo 17 1 58.42 GTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGACTTCATGCTCGACGTTTGAGTTGTGTATACTATTGTTGTTGTATTCGGTGACCGGCGACTGCGGATTATCCTTCC:1 - chr2R 21184807 3' + R1A1-element 5015 1 60.40 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATACATTTGTAGTCAGCCAATTCGGAAATCTCAAAA:1 + chr3R 19807420 3' + opus 7464 2 68.32 ATAAAAAAATTAATAACAGATGTAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAGTTCAAATTTAGGCATTATTGAAAAATGGAACAGACTGC:1 - 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McClintock 5996 2 76.24 ACTTTATTTTTTTTTTTAAGTAACAGTCAGCGGCGGACTTTACTTGGTCTAAAAAAATTGACTTCGTTTACACTTGATGGACAATCTAAACGTTGGCAATT:1 - chr3R 7722167 3' - pogo 2028 1 83.17 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTATGCTGAGCCCAAGACAA:1 + chr3R 16305522 3' + pogo 2050 1 81.19 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTACAAAT:1 - chr2R 7132506 3' - opus 47 4 79.21 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGAGACTTTACAGTAATAATACTGAGATATTGTGAAA:1 - chrX 21571018 3' + roo 9017 2 77.23 TTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGGATGGCGAGGTTTGAGGTCACTTTACATGATTATT:1 - chr2L 8873609 3' - I-element 5149 1 65.35 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGGACTCTGGCTGGCATTTCTTAATTAGCTAAAGTTCGCTCCGCCATCAATGAAGATTCATATCG:1 + chr3L 13568200 3' - jockey 23 1 64.36 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGTGTATAGTGCCATAAATGTTTGGGGTTTCGCCTTAC:1 - chr3L 3992380 3' - 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jockey 4900 1 55.45 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACAACGGTAAACAAAAGGCCCATAAATTAAGGCAGAAACGAACCGAGATATACAC:1 - chr2L 3937707 3' + Burdock 6371 2 57.43 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATC:1 - chrX 5452562 3' - mdg3 43 2 65.35 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGATGGATATTCGTTATATGTGAAAGCAGTTATCAGAAATGAGCATGCAGGTGTTCAAAGTTCG:1 - chr3R 22467013 3' + mdg1 7444 2 63.37 GACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTGTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGT:1 + chr2R 2994305 3' - gypsy8 119 2 44.55 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCC:1 - chrX 21056930 3' - Tirant 8143 2 63.37 TGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCATCTGATTGGCAACCTAAATCCGAGCTATGACGTCTAAGAGCTTGGCAATCGGCCATCACGAAAAAGGATATGCA:1 - chr2R 16618285 3' - 1360 433 1 77.23 TCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGCCCTCCACCA:1 + chr3L 24761267 3' - 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chr3L 16792551 3' - Chimpo 4042 1 60.40 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTCTGAAATT:1 + chr3R 28216848 3' + blood 332 2 76.24 GGAGCCCAAAATTGTAAGTNTTTAAATATATTCGTGTTCATGGGTGAACAATCTAAAGGTTAAGCCTCTTCAGCATTAA:1 + chr2R 18105799 3' - roo 29 2 68.35 AATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACTGACGCGGATATCGATTGGAATTCTACA:1 + chr3R 18425736 3' + mdg1 7075 14 71.00 AAAAAAAATACTTTTATTTATAGCCTTTTATAAGCAATATCCATAGTAGTTTCAATCAATCCACAACGATTTAAAGTGCACGTAAGTGTGTCAATTAGCTT:1 - chr3R 25572002 3' + Quasimodo 7340 2 65.35 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAATGGCAAAATCAGACAGAGAGTTTGTTCTAACTTCGGACTGTCTGGTCATTTGG:1 - chr3R 26342913 3' + blood 361 2 62.38 GCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAACCCTCTTGCTCGCACATTATTCATAATTTTGTT:1 + chr2R 13337540 3' + opus 7092 2 66.34 TTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTTCACGACTAAAATGATTATGACAAAATATCCAACAACTTTTCAAATACTCTTTTAATATGCTCCAAACACACCCACC:1 - chrX 407901 3' - 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Doc 376 1 53.47 GAGAAGAAGTAAACAGCGANTACACGCACTGAAACTAGAACTCGATAAACACATCAAATGTAGTTGCCACATAGGTAACGTTGATCAAATAAAAAATTCCC:1 - chr2L 22276992 3' - micropia 30 2 79.21 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATAATTATATCCCACAAATATGGATTCT:1 + chrX 11987925 3' + 412 441 2 78.22 CATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGAATATTATGTTCTATTTAATTTCCACTTACCCGACCGATTATTGTTCAGTCTTTCACCATTGCTGTTT:1 + chrX 11993808 3' + 297 391 2 73.27 AAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAAAAAGCAATTAATAAACGAGCGATGGCAACA:1 - chr3L 10284826 3' - Juan 3845 1 70.30 ACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCGCCAGCGAGTACTCGAAAGTTAATTAAGCCCTTTGAAGCGGCAGCGCCCATAAGTAGG:1 + chr3R 24732972 3' - BS 15 1 57.43 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATTGAATCATAATTCAGCTTTCTCTCTCATTTTTTGAGCCATCCCTTCAC:1 - chrX 19554951 3' - hobo 29 1 54.46 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAGGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAGCTTTGGCTAAATATTCATAAATTCAGCTATTTGCTTA:1 - chr3R 28628071 3' - 1360 37 1 62.38 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACAATGTAGGTTCCGTTTGGCATGAAACTAT:1 - 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chr3L 10560232 3' - pogo 23 1 56.44 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAGCTAGAAAGGCTTCCACAGTATTACGAGCTAATCGGGGACTTGTAATGCCAG:1 + chr3L 15444906 3' - mdg1 7061 2 52.48 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATT:1 - chr2L 20840237 3' + mdg1 395 2 54.46 GAAAAGATAGAAAAAAAAAACACCATAACTAGGAGACGCCGCCCCAGACCCGGCTAGACTTTTGAAGTTTCTTAACTATTATAAAATCTAAATTAGGTT:1 - chr2R 5357221 3' - Circe 432 1 73.74 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAATAAAAAAAAAAATGAAACGATAACAAATTATTAAAAGTAGTGACTTTAAAATT:1 - chrX 13429429 3' + jockey 4977 1 54.74 AATATTGCATAGGCACATACTACATTACACTTCCGTCTTGCCTTTTGCATAGTCGCTCACACTGCGTATACTTAATTCGAAGCCGCAAAACAATTATAAAT:2 + chr3R 14980577 3' - 412 3 2 77.23 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAG:1 - chrX 11025528 3' - hopper 56 1 77.00 TGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCACAAAGTTCCCCGTTGGCGGGCATGAAGT:1 + chr3R 19504298 3' + flea 4806 2 72.28 GCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGCATTCTCATTTGTATGTCAGCAG:1 + chr2L 13913305 3' - HMS-Beagle2 6931 2 75.00 ATTTTTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGCTTAAGCGGGCGTAGGGGAAATAGGGGAAGTCGTTAAGCAGTTATATACGCGCAGATATGTATATGCAGCATAAC:2 + chr3R 20839448 3' - INE-1 253 1 71.29 TGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGCATCTGATTTCGCTGCGTATATTTTATTGGACACCAGAGTAGTTCACGTAAATAAAAATGAAATGAACCAAGTGGGG:1 + chr2R 18237004 3' - accord 7032 2 76.24 TTGAGTAAAGGAGAGACTTNTGAGTTACAGAGTATGAGGAAAGTTTGCGAAAGACTTCATAGCTTTGAAGAGCAATGTAGTCTAGTCTTAGATAATATGCA:1 + chr3R 19448450 3' - R2-element 101 1 73.27 AAATGTTATTTTTATTTTCATTTTTTTTTTTCGTATGTGTGTTATATTTGCTTCTTTTAATTGGCAGCGAACCGCAGCGTGTTATAAATATTTTTTTGGCC:1 + chr3R 14069716 3' - TART-C 416 2 78.22 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGCAGGCGGCCCTGAGAACGCGGCCTGCAGGCACTTCACATCACTCAAC:1 - chr2R 5813570 3' - HMS-Beagle 6803 2 66.27 GTCAGGTGCGTATTGTTAGNCACGAACCTTTTTTTTGTACACAAGTTCAGGAGTGTAGTCTATTGAAATGAATATTTTGCCGCTGTGAAGTGGCTGAGATT:1 + chr3R 26170479 3' - X-element 20 1 56.44 TACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTTTGGTGGCAAGT:1 - chr3R 13239893 3' + hopper2 1561 1 69.31 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAACCAGCGAATATAAAGAGTCAAGATACATATTTAATTATTTACCCGA:1 + chrX 17109717 3' + roo 9039 1 54.46 AGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACGTGTGCGATATGTTGTGTTGAACTATTTTTGAATGTTTGATATACCATAA:1 + chr2R 6887571 3' + 1360 165 1 50.50 CCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATAAAATATTCCTCTTTGATTTTTAGTACCAATGTCAACCCATTGCTTTACATAAAACTAATATTTTTTTTG:1 + chr3L 22112933 3' - diver 5895 2 72.28 TCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTTAATTCGCCAATTAGGGCATTTTTAAGTTGCTCATATGTGCTCA:1 + chr2L 23352597 3' - accord 29 2 54.46 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTTATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTT:1 + chr3R 17896953 3' - jockey 4770 1 69.31 TGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGCCTGAGCGAGAGAATTGAATTTTTGCAGAAGTGGCATTTTGCGCAAGAAAGTAGGCAACACAAAATGATCAAAA:1 + chr2L 8504851 3' - jockey 4759 1 71.43 AACTGGCAAAAACAAAGGANCTGGCCGAATGTATGTCAACGTTATTGTTCGCAAACACTTTTGTAATTAATTGCGCATGGCCAGCGCAAATGTCAGGACCT:1 + chr2L 8783545 3' + Bari2 253 1 54.46 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTTT:1 + chr3R 24074853 3' - hopper 23 1 56.44 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATAATATAAGGTATTAGTTTTTTACATTTCTATCGACTCTTGCAGTTCTC:1 - chr3L 23634985 3' + pogo 2077 1 53.47 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTAGAAACAAACGAAAAATACCTCGGCCAAAAAAGGCAAAT:1 - chr2R 20588772 3' - Tabor 6878 2 60.40 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATAGATTTAATATCAGCAAATATGCCGTGAACTATGCACCACACTTTCCTACTTT:1 + chrX 18160948 3' - 297 9 2 71.29 GGTGTAGCCGTGTGACCCGTGCAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chrX 3446870 3' + Cr1a 4440 1 92.50 TTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTG:1 + chrX 22913196 3' - gypsy7 5255 2 66.34 GTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAAAGGAATAAAAAGAGCTAAGGTTTAAACCAAGAAAGCA:1 - chrX 8040636 3' - copia 5038 2 76.24 TGGCTATGATCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGGTCTCCATTCTGCTAGCAATGTGGCAATGTGACAGTGTTCTTTTTCCCA:1 - chr2R 8769761 3' - G2 2884 1 59.34 CAGCATTCCCCCAGGAAGAGTGCCCGGCTGAACGGCAGAGCAAACACCGGAAACATACAGCCAGCCCGGCCAAAG:1 + chr3L 24059079 3' + aurora-element 473 1 60.00 ATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAAAAAGCAATTAATAAACGAGCGATGGCAACAAGTTGCAAGTTG:1 - chr3L 10284814 3' - Juan 3833 1 58.42 GTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAA:1 + chr3L 19350026 3' - 1360 3199 1 59.41 AAAAAAAGAAAAAAAAAAACAGCCATATTAACTCGAACAGCGAATGTGCCATCGCTTACGCTGACCCAATTTCGGCTCTCCAAGTGCAATTGGGGCCTGA:1 - chr3R 5623508 3' + gypsy7 5009 1 70.00 AATATTGCATAGGCACATANTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAGCAAATGCTGCTGGAGATGTTGCGCATGCAGCT:1 + chr3R 30252377 3' - 412 3 2 76.24 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTATGTTACACATTTTCCAAC:1 + chr3L 5538097 3' - jockey 4688 1 63.37 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATGACAAAACAAAGGCGAAACTTACTGAAAATAAGCGCAACCAAGGGGAAGAGGAGTGGTCTCCAGATGCGGCGG:1 - chr3L 13367657 3' + mdg3 5497 2 74.26 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCACATGAAGAAAGCAATTTACCAAAGCGCGAGTTCGAGCCCTCAAATTATAAGCCTCTCTCATCCA:1 - chr3L 18896560 3' + P-element 2879 2 69.31 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCGCTATTCTTGGGCTTTGTTTATGTACATATATTTTATCTTATATTTCAGCAATTATGA:1 - chr3L 3492130 3' - jockey 4678 1 60.40 TTTCTTTTCTTCTTGTTTGNTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGCGTTGATTAGGTTAATGTCCTTAAGGCAT:1 - chr2R 13702903 3' - mdg3 5093 1 70.30 AATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAAATACATATCTGCATATAGATGGGACGACAGGCGGCCCTTTGTGCCAT:1 - chr3L 4895358 3' - BS 5053 1 53.47 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAAAAAGCTTTGCATAAACAAAACACTCAGAGCTTTCAGAGTCCACGCACCGAATGTGGTAGCAATG:1 - chr3R 19671664 3' - P-element 9 2 70.30 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGATGCCGAATAAGTCGGACAATTTTGGAGTCTGCGCAG:1 - chr3R 26170777 3' - P-element 32 1 40.86 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAA:1 + chr2R 8232533 3' - P-element 45 1 34.65 AACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGAGTAACACCAAAATGTATGTGGCACTGCACC:1 + chr2L 18500364 3' + Tirant 356 2 68.32 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTTATTGTGAATGCAAAAGATAAGCCCAATCG:1 - chr2R 18105723 3' + roo 403 1 71.29 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGAGCAAAAACTTTGGATGTTTT:1 - chr2R 20584438 3' - P-element 53 1 26.73 TAAAAGCTAGATGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACCCGACGCAACGATAGTCGAAACGAAGGGAAGGACCTATAGCGAGGTTTTGACAACTGC:1 + chr3R 902005 3' + INE-1 164 1 62.38 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAACTGAATCAGGTCAAAGAAAACACGCGAAGGGTAATAAACATGATAAATACTCGG:1 - chrX 6417569 3' - hobo 19 1 60.40 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAAGAGTCATGCCACCCAGGACGACAGGCCAACAATGGTGCGACATG:1 + chr3R 11720694 3' + hobo 2909 1 57.00 AATAATAATAATAATAATAATATTGTTATTCCGATAAGACGAGTGAAAGAATTACGATACCATTAGTTAGTTCATAAACTAGAGATCCAATCGGC:1 + chr3L 1519686 3' + mdg1 7075 10 72.63 GAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGGTAA:1 + chr3R 25514188 3' - hopper 25 1 52.48 AAAACGTAAAAATCAACAAATGCCTTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGAAAGACAAAGCACGGCACCTCAATTAGCCTCCTGGTGG:1 + chr2L 17600572 3' + hobo 2520 1 60.40 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATTCACTAATTTTGTCAATTAGAAATGCAAGTG:1 + chr2R 16979800 3' + 297 6936 2 69.31 GAGTGGTAAAAAAGTGCCANCCTTGCAGTTCTCTGGTTGCTACCACTGGGGTCAGGTGTGCAAATGGTCAGCGCAAAAGTGCAACTGCAAAGGCAAATGAT:1 + chrX 9904680 3' - hobo 14 1 65.35 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATA:1 + chr3L 19274876 3' + transib2 2794 1 58.42 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCAATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCA:1 + chr3L 16478429 3' - pogo 53 1 79.21 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAACTTTATATGGTATGTCGTTGGA:1 - chr3R 27582770 3' + pogo 2049 1 79.21 CTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTGTAGATGCCAACGCCAGACATCTCGCTGTATAT:1 - chrX 7534601 3' + Tirant 401 1 81.19 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCGATCGAACTAATGAGATCCCAGCACATCCTTTCCA:1 + chrX 5997300 3' - 1360 42 1 65.35 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTT:1 + chr3R 20872756 3' - copia 4921 2 76.24 TTATTATTATTATTATTATTATCCATTGAATAATTGAAATACGCATTTTGTCACTAAAACTGATCTTATATTGAATTTGTTTAGTTCTTTTAATGTTTTTA:1 - chr2R 11653120 3' - mdg1 7067 8 64.36 AATTTAAAAATTATTATTATTAATTAATCTGTTATTTTATTGCCCGCAGTTATTAAGCAATTTCAAGTTAGAGTGTCTCCAATTCGCGTTTCTGGTGCTCT:1 - chr2R 16881875 3' - P-element 2502 1 58.42 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATATAACCATGTATATCCACTTTAAGCTGATGATCAGAAGGAACGGGCA:1 + chr3R 4769527 3' + copia 227 1 55.45 TGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCGACGG:1 - chr2R 6482657 3' + gtwin 7370 2 58.42 TAGTATACAAAATCGGAGGACGCAAATTAATATATTCGGCAGAAGACACTGGATGGAGGAGGTGTTGGGGTACAGAGAGGAAAACTTTCGAAAAGGTCCTT:1 + chr3L 18318069 3' - Gypsy12A_LTR 2070 1 59.41 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATT:1 + chr3R 7688922 3' - Tirant 36 2 71.91 GCATTGTGCAAAGTACTCGTGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTATGCTGAGCCCAAGACAATTAGCGCTATTGCCAAATGAAACAGCGGCG:1 + chr3R 16305552 3' + pogo 2080 1 58.42 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAAC:1 + chrY 3648876 3' - Transpac 35 2 64.36 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGGCAGGGTTCCGTTTAGGCGATATAA:1 + chr3R 18171856 3' - 1360 14 1 66.34 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTGATATTTCCCTGCTCGCGCGCGCCACCACTTTCCA:1 + chr3R 31887356 3' + jockey 4946 1 65.35 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATGAAAGCAGAAAAATGTGAGGCCATAAAAATATGTTAC:1 + chr3R 20430849 3' + hopper 1409 2 72.28 AGCTTGTGCCAAAAACTAANAACTGATGGGTTTACTCAAAACTGTAATTAAATTGATGTTAGTAGCGAAAAGTAGTAAGAATCCATAGCGTTTAATGAACA:1 + chr3R 20913501 3' + transib3 431 1 63.37 GGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGGCA:1 - chr2R 6769447 3' + 412 461 2 53.47 TAGAGTACCGAGTGTTTATNGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTTATTGCCTTGTCCGCTCAGTCTAGTCATAGTTGCT:1 - chr3R 26434122 3' + hobo 2900 1 64.00 AATAAAATCAGTTTCTTACNAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATATCAA:1 - chr3L 9542510 3' + roo 9033 1 62.38 TGGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGCCGCAAAATCAAAGCCAAAATATTGCCCAAGCAGTTATGACTTGTGGCTTAGAGCCCGCAA:1 - chr3L 3100923 3' + invader3 5447 2 59.00 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGATATCTAATCTCATTCCACATTATAT:1 - chr3L 2270530 3' - roo 8711 2 73.27 GATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTATGTAAAACACTATATATTTGACATAGGAAAAGTGCATATCCTA:1 + chr3L 19569235 3' - BS 29 1 58.42 GTATGGGTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATGTGAACACGACAAGCCACTCCGGCAGA:1 + chr3R 22530548 3' - hobo 2761 1 71.29 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACATTCCCATTCCCGTTCCCATTTTGGGGAGCAAGGTCCCTCTGAT:1 - chr2R 6918527 3' - hobo 30 1 58.42 ATAAAGTATCTGACACAGCTGAAAGTATGAGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAG:1 + chrX 21907829 3' - ZAM 8189 2 65.35 GTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTTGGGTTTTGTGCCCAGGTCTGATTGTATTTTAAG:1 - chr3R 24027016 3' + Rt1b 4981 1 66.34 GGGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTTAGTTCTTATATATAATCAAGCCAGTAGTTTTGAGTGTTGACCAAA:1 + chr2L 15174199 3' - Juan 4029 1 73.27 TATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATG:1 + chr3R 20430813 3' - hopper 42 1 63.37 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAA:1 + chr3R 14049436 3' + transib2 2812 1 65.35 TAAGTTTGTTTTAAAACTTGCACAATTTTGTGTTATTTTTTTGAGTGTAGAGTGGTCGCTGTGAGGTGGAAGGCAGATGACAGCTTAGATGCGGCCGTGTT:1 + chr3R 14912899 3' + transib1 1833 1 86.14 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATACCCCGGCCCATGAGAACTCGACTGAT:1 - chrX 5452538 3' - mdg3 19 2 57.43 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGCCATTTGATTCGCTCTTCTTCGGTTGAAATCTGCAAAAGT:1 + chr3L 10683510 3' - opus 34 4 60.40 ATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTAACCAATGATGGTCATGGCAGCGCGATAACACATGCGGCAACA:1 - chr2L 21708336 3' + invader4 3083 2 65.75 AGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAA:1 + chr2R 1873421 3' + TLD2_LTR 179 1 92.21 AGGCACATAAACAAAACACGACACAACTACACGCTTACAATGGTCGTGTGATGAGTTTTACTAGGGTTAGATAAATAAGCAGCAAAGAGGATGTAAAAAAA:1 - chr3R 20087640 3' - transib1 349 1 72.28 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGACTGTCATCAGAGGAGAATGTGAGTTGGTAATAAAGCAAGCCAAGGAGTTAACCCGCCAAG:1 + chr2L 14799198 3' + hopper 1408 2 69.39 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATTGGGCCAAGTTGGGGGCGTAAAGTACTTGTATAAGTACTCGAGTGCCGCAAA:1 + chrX 15412753 3' + hobo 2917 1 58.42 GATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTTTATGGGATAGGAAGCGTTACCGTTGGAATTTCACTTGAGA:1 - chr3R 26640915 3' + roo 275 2 60.40 CGCAGTCCCGAAAAACAAAAATATCAAATTATAAGCAGCAGAACCAAGAAGCGGTGGAAAAACAAGCACAAAACCGAACAGCAGACGACCACGAAG:1 - chr3R 24906423 3' + Idefix 7088 2 68.75 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCATGATAAATCCGCATTTACAGTCCCTTGTCTTTAAGAGTTCGTGGCTATGCCCTTTGGTTTAAATGACGCCC:1 - chr3L 25059048 3' - mdg1 7043 2 74.26 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAGAACTGCACTCCAAAATCAACAGCTTTGATT:1 + chr3R 26434167 3' - hobo 44 1 69.00 ACGCAGCTCAAGTTCTCTGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATCGAGAGTAAGTACACGCGGATCCCTGCACCGAAGCTCGGGCTTAAGGATGAT:1 + chr3L 1254350 3' + Quasimodo 6964 2 56.44 AATGCCCCGTCGGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCATGTGTCTATAATCAGCTTTCAATATTTAATTTAAAAGTATTGTCACCTAAAACT:1 + chr3R 19613769 3' - baggins 5131 1 52.48 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACAGCAGCTGTGCCCGATGCGAGGGCAGTCTCACTTAAGAAGATTAAAGACTATTCGT:1 - chr2L 14799090 3' + hopper 1400 1 64.36 ATTCGTTTTATTTTGTCCAAACAAAAATCTGGGGCTTGCGAATGCGTAATCCTCTGTTTTGAACTAAAAGTTGCACATAAGTCACTATTTTTTGCTAGCAA:1 - chr2L 1839996 3' + 17.6 403 2 63.37 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATACCCTTCTTTACCGAATGAAAAAGAAAGCAACGTAATGCACCTTTA:1 + chr2L 4764089 3' + Tabor 7293 2 57.43 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCTTGATATATGGAACAGTATTTAGTG:1 - chr3R 22494716 3' + 1360 3342 1 77.23 AACCACCTACCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACGACACTGCCACTTAATGTTCGCGCTTTAGCAATATGAAATG:1 - chr2L 2275073 3' + F-element 4475 1 57.43 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCTACTTGCAATATCTGTTTAATATAGAGAT:1 + chr3L 11953860 3' - hobo 46 1 69.31 ATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCCCAATCTTTGCCCTGCACAAAACGATAAGCTCTGCGGGAGG:1 + chr3R 13970193 3' - pogo 1798 1 58.59 AATATTTTAAGTCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTAGCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTAATGATGATCTATATAGTGATTATCCGATAGCTTAATGTT:1 - chr3R 29573410 3' - G4 3676 1 64.36 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTAATTACATATCAACATATCAATAATCAAC:1 + chr3L 2989848 3' + flea 4971 2 73.27 TTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTCCCGATGCTGACTGTAACTCTCGAAGTTGCGGAATATGGAGCGTTTCTC:1 - chr2R 12309319 3' - 297 458 1 54.46 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATTAAGTGAGTCCGTGT:1 - chr2L 20840223 3' + mdg1 7447 2 42.57 GACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAAATATATAAACAAAATGCTGTCAGTTTAAATGGTAAAAGAA:1 + chr3L 3682029 3' + I-element 5112 1 67.33 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGGCTTATATACTAACACACGG:1 + chrX 13268907 3' + 1360 3347 1 80.90 CTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCCCACCACGTCCATGCCCAGTTTATCATCTTTCATCTGCTCTGGCCGCCCATCTCCCTCGGTGCTCGTTGTCAA:1 - chr3L 7841614 3' + copia 4765 1 73.27 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAA:1 - chr3R 21924015 3' + transib2 2786 1 64.36 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGNCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAATGATCGGGAATTTTTATGTAGC:1 + chr2R 8717695 3' + 297 346 2 77.23 GAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATACTTTCCAAACACTAATATTTATTTAAACAAAACATAAGAACGATAGCAGTGC:1 + chr2L 21052809 3' + invader1 381 2 57.43 GGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCCTCAATTAGTTGCAGACGCACGATTCGCTTCAGGTTT:1 - chr3R 22896915 3' - invader2 353 1 63.37 TGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTAAGACGGTAGCTTGTTTCCGATTATGGGATAAGTGCGGGAGCATCGTTTATAAAGCCAAAGCTAACGAAC:1 + chr3R 17168038 3' + R1A1-element 4990 1 69.31 CTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAACCCAATCACTTTATGCTTGACACCACTTTATTTAATTGATTAAA:1 + chr2L 20128841 3' + I-element 336 1 56.44 AGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGAGCAGATCAAGAGCCATTGAGCGCCAATGAAACGTCTATTGAT:1 - chr2R 17863539 3' + invader1 3873 2 57.43 AAGGCTGGTGCTTCGCCTAGGTAACCTTAGGCCATCCTTCCTTTTTCTAGTACAACTAATGCGCAGCAGGCGATAAATTTAAATTTGGACGGCAATGTATG:1 - chr3R 19685247 3' + Rt1b 338 1 71.29 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAA:1 + chr3L 455622 3' - Doc 47 1 71.29 ATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATGTGAACACGACAAGCCACTCCGGCAGACTGACCCAAACAAACGCCGGCATTTGCA:1 + chr3R 22530576 3' - hobo 2733 1 57.43 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTACATGTGCATGTACATATAGGAGGAAGGATATGATGACAAATATGATGAAATAT:1 + chr3R 10087776 3' - pogo 17 1 49.50 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACA:2 - chr3R 11151800 3' + mdg3 236 2 69.31 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGACAGGTCAATTGCAACTAACCGTACTGGAAACTTCAATCGCAGCAGGGCGATGT:1 - chr3R 23683349 3' - 297 6581 1 78.00 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCGTTACTTTTCCCAATGCTCAATGGAGCATTCACC:1 - chr3L 15435543 3' - blood 43 2 71.29 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACCCAAAAAGAGAAACCATAAAAAAGATTTCCATAACATCCAAAAGATTTTGATTCAAAATTCGTAG:1 - chr2R 18042801 3' + roo 397 1 46.53 ATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGCTTTTGTGGCATCGGCTTTTCCAAGAGCGGCTGTGGCAAGCTCGGAAAAAGCCGCAACAACGCCCGCAG:1 - 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chr3R 19446199 3' - roo 50 2 79.21 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTACATGTGCATGTACATATACACTCGGCTATATAGAACAACCCACAAGTCGGCTG:1 + chr3R 10090398 3' - pogo 17 1 64.36 TAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAAACGGTGCGTGCTTAAGTGCTACCCAGTAACTAAATATGGTTTTTTTGCTTG:1 + chr2R 2961918 3' + F-element 4482 1 60.40 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAACAGATTTTACTTGCCGAAATGTAGTA:1 - chr3L 153580 3' - 1360 30 1 55.45 GAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGA:1 - chr2R 12185325 3' + accord 7359 2 51.49 TTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCCTCAATGTCGACCGTTGTCTGGCCCTCAAACCCCAACGAATCTAACCCCAGTT:1 - chrX 4280787 3' - Juan 169 1 55.45 GAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACATTTAATAAAAAAGTTGTTATTAGTAAACGCATGCATATTATTATAAATAAATTAATAAGCAGGATTGGTAT:2 - chr3R 26122988 3' + roo 9063 1 67.33 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGT:1 + chr3R 11151896 3' - 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INE-1 312 1 67.33 TAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCTATGCACGCCTAAACGAAAACATGATA:1 + chr2L 8175026 3' + Quasimodo 90 2 73.27 TGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATTCATTCTCACTGTCAACGGAATAATCAGCCAGGCGG:1 - chr2L 10938441 3' + GATE 414 1 74.26 TTTTGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 5326 1 51.49 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTAAGACAACTGCGCTACAAATCAATTGTGTCGACTGTC:1 + chrX 19614975 3' - 1360 35 1 61.39 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAATCGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTATTTTTATTGCT:1 + chrX 10547726 3' + P-element 2855 1 47.52 AGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTCATATTATAATTATTAATAATATTATTATCATAATTAATGGGTGAAAGAAGTTTATATAGGTTGGGATCAAAAAATC:1 - chr3L 24820668 3' - mdg1 7134 2 60.40 GGGGTGCCTAGAGTACCGANTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAACACAGTCCAACTACAAAGCGCACACA:1 + chr2L 12994792 3' + hobo 2892 1 70.30 TAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTCTGAAAATACTTGAGGTATTTCACTTGAAAATT:1 + chr3R 20599663 3' + opus 7460 2 69.31 GTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTTGGTTTGCTTAGAAAATGCGCTTAAAAT:1 + chr3R 21981596 3' + jockey 4715 1 75.76 ATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACAACGCATTTGACCACATACTGCAGAAGTTTAATTGTTTATCAGTGTAGGCCAAT:1 - chr2L 16181768 3' - invader2 4893 2 57.43 GCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATTTTCCTTGGCTCATTCGAATTTTTTTCTCATTCTTTTTGCACGGGAGAGTTCCGCACATGATTCACATCCG:1 + chr3L 12949753 3' - Bica 460 1 71.29 ATATAAGGGAAAAAGCACANATAAATAAATAAAAAAAAACAAACCCATGATTGTGAGCTGACTTTACAAGTGCGGAAGTTGAACTGAAACTAATGAGTTCC:1 - chr2L 4378693 3' + Juan 4199 1 62.38 TGCCGCATGGGTAACAGTGNGTTGATCAAATAATAAAAACATCACAATACAATCGCTTATACGCCATGTTGCACCGGTACAACAAAGTGGGACATGCAAC:1 - chr3L 3490003 3' + jockey 4963 1 57.00 TTAAAAAACAGAAAAAAAAAAACCACTAGACGACTAACTTAACCCACCTAGGGGAAATCGCAACAAACAAAACAAAACCTAAACTCCAGCCACAGAATGAA:1 - chr3R 7302778 3' + TART-C 11101 4 79.21 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACACACCGTCGTCAGTTTGTTTTCATTTCAACTTTGCGTCGGGTTCACTCCAATTTTC:1 - chr3L 12266750 3' + P-element 2867 1 59.41 ATTAATTTTAATTAATTGCATTTAATATTTGTGACAATTGATTTTACATATTTTAATTGAATTTATAACAATAATTCTTGAATACGAATATTCGGTCTATG:1 - chr3L 4518732 3' + HeT-A 379 1 38.61 AACACCGAGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTCCGACGCCCACCCCTCCATTGCCGCCCGATCCCGAGCCAGCTCCTCCGCTTGCCGGCT:1 - chrX 1914007 3' - R2-element 393 1 62.38 TGCGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTT:1 + chr2L 23390133 3' + rooA 7469 2 52.48 TTTTTTTTCTTTATTTTTTAAAGAACAA:1 - chr3L 20556527 3' - TART-C 11100 1 85.71 GTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTTATTGCAGAAATGAAAATAAATAATACCC:1 + chr3R 10716260 3' - F-element 4351 1 71.29 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGTAGTGTTGT:1 - chr2R 11403949 3' + mdg1 7415 2 67.33 ATTCGGAAGGGGACAGTTCTAGAACAGGAGGAAAAGCATATTTCAATACACAACCTTTGGTTATTTTTAAAATTAAATTATATTGACCAAACAATTTTATA:1 + chr2R 2261454 3' - gypsy12 9990 3 70.30 GCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTAGTTGTAAACATTTCTATTCTT:1 - chr3L 11434087 3' - Doc 490 1 78.22 GTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAAAGGTTCCAACTATATTATATCATTTTGTTTTTTGCC:1 - chr2L 17714631 3' - Transib5 2973 1 63.64 AAAAAAAAATAGAAGTGAAAACCGCAAATGCCAGAAAAAACGATAGATGGAGCAGAGTGAG:1 + chr2L 13157690 3' + Porto1 171 1 90.16 TGCGGATGTTTATTTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCGTGAGTGGATGATGTGCCGTGGTTCTGGTGCATGGATCCGTGGCCCTGATGGCTGTGGCTGG:1 - chr3L 6994061 3' - Quasimodo 298 2 57.73 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACAGGAAGTGACTTCGCCGAGTTTGCAATAATAAAGTGAACTTAGTGCTCGTTGCTGAAGTGCAA:1 - chr2R 13358756 3' + roo 391 2 62.38 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAACACACTC:1 - chr2L 8646674 3' - Tirant 28 2 56.25 GGCTGGTTTGACAAACATAAAATAAAAATCGGAGAGCAAAAAAAACACGACCGTTAGCTTTGAATAATGAATTGCAATTAGCGCAATTACAACAGATTGTC:1 + chr2R 23226889 3' - Cr1a 48 1 61.39 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTATCCTCATGCATCATGGGTATCATAACGCTCTTTGTGGCATTTACTCGAAACTCCC:1 + chr2R 17123638 3' - mdg1 7060 2 56.44 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACCTATATTTAATGAAACCAATGAGCAAACC:1 - chr2L 4404555 3' - pogo 44 1 75.25 AAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGA:1 - chr3L 16973370 3' + S-element 155 2 51.49 ATGTATGTAAATATATTAGGAAGCACTAAACTTTACTTGCCAAATGCAAAAGATATGAAATTTTCGATATCTTACCACTTACTAAAATGAATATCATACAG:2 - chr2L 7747969 3' + 1731 103 2 73.27 TGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCATCCTCTAGCTGGATTCTATGGACGTG:1 + chr3L 5255964 3' - jockey 73 1 73.27 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTATGAAAGTTAG:1 - chr2R 16680121 3' - 412 7086 2 60.40 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATAGCACTTTGCAGA:1 + chr3R 28475866 3' + roo 9032 1 62.38 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGTTTACGTATTTTTTATCCATTTATCTGT:1 + chr3L 16200008 3' - roo 8711 2 72.28 TTGAGACTTTATTAACTACNTCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCA:1 - chr2L 20840239 3' + mdg1 7431 2 55.45 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTATGCCACATTGCCCCCGCCTGTCTGCCGGACTAATTAGCTTCCTTGGCTGCTTGGCTCCTTGTGTG:1 + chr2L 12602873 3' - opus 7114 3 78.35 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCATATCACGAGATTATAC:1 + chr3L 16478445 3' - pogo 37 1 65.35 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACAACTTGTAACTTGTGTATCTATGAGATACATTTACATTTCCCATAACA:1 + chr3L 11657910 3' - Tabor 27 2 52.00 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGGGTGTGTCAATGAGTGTGTGTGTGTGTGGGCTTTGTAGTTCGCTTACTTTTCATTGTCACCGGCGACGCTGTCAT:1 + chr3L 7490266 3' - accord 184 2 55.45 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGACAGACCGCACCTG:1 + chr2R 7025024 3' - P-element 24 1 55.45 AAACAATATGTGTCGAAGAAGTCCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTGCCAAGTTGGAGGCGGTGGCGGCTGGAAAGGATTGGATGGCGTTACCAGGGGACC:1 + chr2R 18041132 3' + HB 1183 1 54.46 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGATTTTCCTGAGTCATACATTTGCC:2 - chr2L 4110916 3' - Doc 3 1 79.21 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCC:1 - chr3L 11657847 3' + Tabor 7289 2 60.64 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGGCTTATATACTAACACACGGAATTGTGGAATTCAAGCTCTGCTTTTGAAACAAACTTGCAGTTAGTT:1 + chrX 13268955 3' + 1360 3382 2 72.28 GACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTCCACGGTTTCTGTATTATTTTTCTCCTTCGCGTTGTCTG:1 - chr3R 16859472 3' + I-element 4957 1 63.37 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACATTGTAAAATAGTTTAAATTAATATTCTGTGACTCTAAACTACACGTCCAGTCACACAG:1 + chr3R 17415323 3' - roo 8680 2 58.42 GCGGTATGGCCGTGAAACATTGCTTCGCGAGGACAATCAAGATTCGCTTACTCGTCTTCCTCCTTCCTCTTTATTAAAATCTTCTTCAGCGCTGCGTCTTC:1 + chr2R 4396924 3' - Rt1c 5333 1 58.42 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACTACG:1 + chrX 16237970 3' - mdg3 32 2 55.45 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTC:1 - chr2R 1373100 3' + pogo 2082 1 62.38 ACCGCAACGAACTCCCAGCCCAGCAACAAACTTACGAGGGCATTAATCACAAACACTATCACAAAGTGAAATGTACAACAACTGAAAAACAAATGGGCGAA:1 + chr3R 6504092 3' + Doc 4548 1 68.32 AAAAAAAAAAAGGAAAAAAACAAGAAATCCCCGCCAATTACGATACTAGCCACTAGTCACCCACTACACACACTCCTCTGTTGGCCAAGTTTTGTAGTTCT:1 + chr3L 7508437 3' + Doc2-element 232 6 75.25 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGCGACAGTGTCGTT:1 - 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chr2R 7402809 3' + R1A1-element 5222 1 38.71 TTTTATGAAATGCTTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGACTGTTCGGGCAGGCAGATTGTCTGTGGGTGAAATCTTCATTATGCATAT:1 + chr2R 13736299 3' - Doc3-element 4624 1 53.47 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTACCCATATTCTGTTGCTTCCCCCTAAACTGTCCGCCTAACTGAATG:1 - chr3R 9085033 3' + mdg3 218 2 53.47 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGTTTAACATAGCCAAGTATATTAGCAAAAACAGCTGAGACTGAAAACTTATAATAGACTGCACATAAAA:1 - chr3L 1927395 3' - mdg3 5262 1 70.30 TACACAGCTAGTGTGAATGCAATCGCGAAATTTCATCATTTATCCCAGAAAAATGGATATTGGAGAATAAAAATTGTTCAAAATGATGAAAAAATATCCAA:1 + chrY 1803447 3' - INE-1 532 1 38.61 TGTGAATACGTTTTTATCGAGCTCCGCTTAAAACCCCTTGTTCAGCACACCTGATACCCCAACTACATAAACTTGGTGAGAGGGTGTAAGTGTGGTTTCAC:1 + chr3R 10751679 3' + F-element 29 1 78.22 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTCCTTTGGCTTTTTCACTTTACCACACATTTTTATTTTGACTTCCAGTTTCTGTCTTCTGTTT:1 + chr2R 13358856 3' - roo 15 2 64.36 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCGCTCCATCCCGCTCGCACGATTCTTTGGGGTTTCTCTGTTTTTTATGGCTGCGTAAAT:1 - 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chr3R 9870332 3' - F-element 27 1 61.39 AAATTAAAAAAATTTTTTTTTTTCAAAAACAACAAAGTGGTGTTAGGGACAGTAACTATAGATTATCAGCACCACAAAACAGTTGTTCTTGCCTCTGTGTG:1 - chr3R 22343541 3' + HB 329 1 76.24 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACATACATACAACTATGCAAATCGGAACGAAAATGCTGTCTTCCTGCAGTGTATCCTATAGCTAAAAA:1 - chrX 19689651 3' - S-element 3 2 66.34 GAGTAATAAAGTTGCCAGACAGATGATATGCAATCTTATATTTCCAACAGTGTTCTGTGCGACCGCTAAACAAATAGTTAGTTACTTACTTATTAAGTAAG:2 + chr2R 20423419 3' + frogger 157 1 55.45 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACATATCTTGAATTACATTGTTTTTATGGCAATAAAAACTTAAATCCTTCACATT:1 - chrX 19466458 3' - GATE 35 2 72.28 AACATAAGGGATTCCCAAGTTTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAAGAGGCTGTCACCGCCCACCCGACACCCGGCCAGTGGCTGCCAAACTGTGT:1 + chrX 8223225 3' - G4 3560 1 60.40 TATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAAACGCAACTGCAGCCAATTGCATATCCGTGATGGTGACGAGCCCATTATCAC:1 + chrX 15644715 3' + Doc 196 1 57.43 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGGTCAGAGGT:1 - 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Doc4-element 350 1 51.00 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATAATGTATGCATATCTCTGCGCCTTGGACTTTTCAGCTCATCA:1 + chr2L 18927541 3' + mdg1 7428 2 56.44 TTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCCGTATATGTGATTCACCACAAATGTAAGATTCTTCGGTGGAGTGTCGTAGTCTTGAGC:1 + chr2L 18490726 3' - 1360 3003 1 70.93 AAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAATTTTTCAAATTTGGAATTCGTAAAAATATATGTGTCGGGGTTTTTCTTAATTGGCT:1 - chrX 3490034 3' + Doc2-element 234 3 82.72 AAAAAGCTTAGCGCCATGTNTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACT:1 + chrX 19812408 3' - Transpac 4970 2 75.25 GTTTTTGCATCTTGTGTCCTAACTTCGCTCACTTCACCACTGGTCTCAGAGTACTCCTCCTCGGAATCAGAGTGATTACTGCTGGCACTGCTAATACCCTT:1 + chr2L 2159729 3' + transib4 2323 1 78.22 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCCCATGAGAACTCG:1 - chrX 5452544 3' - mdg3 24 2 54.00 GTGTGTAAGTATATGTGGTNTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAATAATATTACTTATCTTCGTCGTCAAATAATTTTCATCAAAAATTTAGCTAC:1 + chr3R 20192599 3' - Quasimodo 23 2 55.45 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATTTAATGTGCAACAAGGCATAATTCGCA:1 + chr2L 15983446 3' - 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Quasimodo 315 2 66.34 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACATTGTTAAAATGTGAAAAAAATCCGACGGTCTGCATACCT:1 + chr2L 7804315 3' + 1360 3356 1 63.37 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATATCAACGATCTGATCCATCGGGTTC:1 - chr3L 9542490 3' + roo 398 1 63.44 TTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCGCGTCTTGAAGTACGGCAACTGGTTGGAAAACACTTTTCCACGCCGAGGAAAATGTTAAA:1 - chr3R 9427426 3' + F-element 4462 1 63.37 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTCAATGCGAAATTGAAACAAATTTCGTTTTGCAGAGTTGGCAGGAAGCATTTATGAACGATATTC:1 + chr3R 25950178 3' - 412 9 2 70.30 GAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAAACTTTCCCAAGATTTGCCAAATGATTTTCCCAGGCCG:1 - chr3R 21457406 3' + Stalker4 6911 2 63.37 GGTTGTGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAA:1 - chr2L 8646681 3' - Tirant 40 2 61.39 ATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCTCCTTTCCGCCTGCTGCACAACCTGTCGGTCAGCAACCATGT:1 + chr3L 10872414 3' + baggins 5078 1 58.42 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTC:1 + chr3R 28216841 3' + blood 7337 1 83.17 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGATGCTA:1 - chr2L 19207870 3' + 412 461 2 58.42 TATTAATATTTATTTTTAAGCCTCTCCTGTCCTTGTAATGCAAACTTTTTCAGCAAACTTTTTTTTCTGCATCATTTGGAAGTTCGTTTCATTTTTATTTC:1 - chr2R 16729082 3' + NOF 3869 1 46.53 AGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCTAGATGGGTTTCATTTCATAATATGTTTGTTTTTCATTTGTTTTTTGTGTGTTTTGT:1 + chrX 2025300 3' - Doc2-element 4387 1 55.45 TTTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCT:1 - chr3R 21924010 3' + transib2 2791 1 57.43 TATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAGCTCAGCAAATAATGGGTAACTTGCCAAAAT:1 + chr3R 19447165 3' + Juan 295 1 69.31 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCTTTGCCAACTTTCTATAATGGTGTCTT:1 - chr2L 7461044 3' - roo 15 2 63.37 TTCTTATTTGCGAACCCCANTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTTAGCTTCAATTTAAAGCTTAGAAAATACTGTACTATTTTG:1 + chr3L 12983238 3' + diver 187 2 59.41 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAACT:1 + chr3L 12634239 3' - BS 5014 1 60.40 TATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCC:1 - chr3R 5773169 3' - Stalker4 7001 4 71.29 GTACCGAGTGTTTATCGGGNGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATGTGTCTAATGAGGGTCCTGGCTCTAAGCTACCTGCCA:1 - chr3R 11191014 3' + hobo 2904 1 59.41 AGTGTTTATCGGGTGGACGNAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTGCCACTTTTGATTGTTTTGGCCATAATATTTGCTGCCCTGGCA:1 + chrX 8343703 3' + hobo 2910 1 60.42 GAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGATTGACTTGCAAGGTGAAAATTGAATTTACATGTTCTG:1 - chr3R 6190209 3' + copia 252 1 76.24 GCAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTATGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGGAAATTCTGTATCATTGGCTGATCCTGTGTATTGTGTTC:1 + chr3R 6743353 3' + 1360 3262 1 67.33 TAAGGTATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATAT:1 + chr2R 18105809 3' - roo 8705 2 62.38 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTATATCGCGACCGCTTTTATTCAATTAAATA:1 + chr3L 3822450 3' - pogo 40 1 69.31 GCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGATTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATTTCTCAGAAGATTGGTTAAATGGAAG:1 + chr2L 12337289 3' + I-element 5306 1 69.31 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGTGTCTCGGAATATCATTTTGGATGGCCTGCCTAA:1 - chr3R 7272571 3' + hopper 1374 2 64.36 GTCCATACCTTCCCTATGGCCGTCGCTTCGAACTGGGGAGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCTCTAACATGGCTTTTTCTTCGTAAGCCAACACATGCAGA:1 - chr3R 25373943 3' + Tirant 8065 1 64.36 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATACAAATGGAGTGAATGAGAATAGAATATGGCCAGTTGCCAGACTGTATT:1 - chr2L 2309379 3' + Burdock 229 2 53.47 TGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGTCCACTTTTTGGCCTTCTTTGCCCACTGTCCACCGGTCGGTGATTTGATTAA:1 - chrX 16173218 3' - G2 294 1 53.47 GTACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATTTTAAAAATGACTGGTCGAGGCAAGGGGAGTAAAGGGAAGTTGGG:1 - chr3L 21317873 3' - Cr1a 4331 1 48.10 ACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAATAAAGGAGAACAGAAAAAGTTCGAGGGCAGCAAATAGCGACAAAGAAAACTCATAAAAACGTTT:1 - chr3L 15199953 3' + invader2 475 1 75.25 TTGTTTCTTTTTTGTTGTTATTTGTGTGAGCCGCGCGGGGCGGTGGAAAAAGTTCCAGAAAAAGTAGAGCCATGGGGCGAAATACCCATGCAGATGGAG:1 - chr2L 7941636 3' - gypsy7 5001 1 51.52 TTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAGGATCAATTACTCTTCAACTGAATTTAAAAGGATTTGATAAGAGGTTTG:1 - chrX 11696571 3' - TLD2_LTR 94 1 75.25 ATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTTATCCATTTAATGTTCTTTTCAATG:1 + chrX 8334484 3' - BS 5047 1 73.27 TGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCGTTTAAAGTTAACAATTTATTTGCATTATTAATTTTCATGTTGGAGCTACACTCAAAGAAATC:1 + chr2L 4887999 3' + BS 5014 1 68.32 ATGAACGGAGCCCAAAATTNTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGATTGTGAGCGCGTTTCGTTATTAATTGCCGATCGATTCGA:1 - chr2L 20709388 3' - roo 8699 2 61.39 GGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAATAGATAACTAAATTAGTTCTGGTCTAGTTGAGGATAACAAACGCATTGCGGG:1 - chr3L 19944191 3' - Juan 4027 1 75.79 TATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGTATTCTGCTTTTGGTAAT:1 + chr3L 25059175 3' + mdg1 420 2 79.21 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCAGCTCAGTAGGTTTTTTTTGTTTTTCCGTGCGGGTGCTCATTTCGCG:1 + chr3R 29158150 3' - P-element 24 1 51.55 AGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTA:1 + chr3R 11151924 3' - mdg3 5251 1 78.22 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGGCAGGGCAATTGCAACTAACCGTACTGGAAA:1 - 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chr2R 13463089 3' - Tirant 8149 2 67.33 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACACAGTG:2 + chrX 7534730 3' - Tirant 8116 2 72.28 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATAATTAAAATTTGAAGTAAAACAACTTACA:1 - chr3L 11758377 3' + roo 9026 1 73.27 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATACCGCTCTATCCGCTCTATTGAGACT:1 + chr3R 4773412 3' - Tirant 8136 2 54.46 TTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAA:1 - chr3L 20224130 3' + Chimpo 175 1 68.32 TGTTTTTTTTTTCTTTAACTTTTTTTTTCGCTTTAGTCCAGAATCCACAGCTCGAAACAATGGGCGGACTATTAGCCAAAATGTTAAATGACACGTTGA:1 - chr2R 22050826 3' - TAHRE 10441 1 71.72 ATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTCTGATTTCTTATTTCGCTCGTCTCG:1 - chr2R 12812748 3' - 297 210 2 75.25 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACATTGTAAAATAGTTTAAATTAATATTCTGTGACTCTAAACTACACGTCCAGTCACACAGTCTTTACTAGAATCAG:2 + chr3R 17415339 3' - roo 8664 1 74.26 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCATCG:1 + chr3R 27582807 3' - pogo 46 1 77.00 ATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAATTTTGCAGCCAAATAAACAAAT:1 - chr3L 19700234 3' - Quasimodo 45 2 74.26 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAA:1 - chr3R 6190262 3' + copia 233 1 78.22 TGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACACACACACACACATAGGCACATGTCATTTTAATTAGCATATAGAGCAACACGCA:1 + chr2L 945324 3' + mdg3 5253 1 55.45 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAAGCTGCAATTTTGTGTTTAGATCCAAGTTCATAGACACCTTTCGGCCGAATTAAGTT:1 + chr3L 12879075 3' + roo 393 1 43.56 TTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGT:1 - chr2L 12779616 3' + flea 210 2 78.22 AGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAA:1 - chr3L 19944243 3' - Juan 4085 1 76.24 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCTTTGCC:1 - chr2L 7461065 3' - roo 36 2 61.39 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGCACTGTTATTGTTTTGGTGGTGCAAAGTATCGATGTCGATGCTGCGATACTTATTCCTTGGGAAAGAAATGTC:1 - chr3R 5367493 3' - FB 4 1 76.24 GATTCATAATATTATTATTATTATGGATAATCAAATAAAGAACCGACCCCAAATTCTGTTAGCAACGCATTGTATGTA:1 - chr3R 27080134 3' - mdg1 7093 2 87.18 GCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATACCTCTCCTCAATTTTAAGTACTTAGTCACTA:1 + chrX 18079491 3' + X-element 4448 1 68.32 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTCACAACTTACAACTCACAGCTTGC:1 - chr3L 6866191 3' - 412 51 2 75.25 GCAACCTTGGCCATTCGTGGTAATAATTTTTGTTTGCTTCTTCATCTTTTATTACATTTTCCACCCTTTTTAATGAGCGGGCGGCGTTGGAAATTTATACA:1 + chr3L 8032486 3' + looper1 383 1 74.26 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAGAACTGAATGACTGAAACGAA:1 + chr3R 14708777 3' + roo 9040 1 59.57 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTGATCCACTGTATTCATAACTTATGAAGCTTGAAATTTGAA:1 + chrX 15268337 3' - roo 8664 1 75.25 ATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCT:1 + chr3R 1977624 3' + micropia 428 2 50.50 ATGTTTGTGTGTCCTAGTCCAAGTCCATCTACGATTTTGGCTACTGCGCTTTGGATCTGACGAACTCTTATGCTGAGAACAGCGGTGTTTACACCTGTA:1 - chr3L 2098151 3' - I-element 4948 1 73.74 TATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTA:1 + chrX 15268294 3' - roo 43 2 69.31 AGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGCTAAC:1 - chrX 15412660 3' - hobo 15 1 64.36 ATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACAACAGGGACATGGGCAACAACAAGAGCAAGAGTCA:1 + chr3R 11908986 3' + Transpac 413 1 66.34 GAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATAAGGCAAGG:1 + chr3R 9613497 3' + invader3 250 2 51.02 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGGTCGTCGTAAAGTCTCCATGAGGGGGA:1 - chr2L 15548760 3' - Tabor 49 2 70.30 TTAATTCAAATCTTCTAAATATTACTGCCTAAAAATTCAATTTCTTTAAAACATAACATTCAACAAAACATATTATTATTTTGATCGTTTATAAGATTAGT:1 + chr3R 12403410 3' + jockey2 3229 1 62.38 GGGTGGACAACGCTCTATGACTGTGTTCGTTAGAGTTATAATTGGCGCCCAAACGTGGGACAGTCCGATGCCTGACCAATTTTGTCGGCATTGCCAATTTG:1 - chr2L 15540463 3' + Circe 7419 2 70.30 GTGTGTGTGTGTGTGTGTCCATGTGTATGTGAAGGAGGTCGTGGCTATAGCGATTCCAGCGATTTCG:1 + chr3L 5505167 3' - accord 7027 2 83.58 TTTGTTTTTTACTTTGCTTTTACTTTCTCACTCCAAACCAGCTGTTTATATCTGGCGGCACTCTGAGCCGCCTTTGGGTTTGCGTCTGCTCCGTCTGGCCA:1 + chrX 11440419 3' - F-element 4674 1 70.30 TTAGCAATTATTTTCTAATAGAAATACACGAAAAACGCTCGAGTTCCGTTCTGAAAAAAAA:1 + chr3R 30771950 3' + transib2 66 1 68.85 TAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGCTTCGTTTTCACTACCAACTGGTTAGGATAGACAAGTTTTGTAATGTATTTT:1 - chr3L 15468809 3' - F-element 4418 1 58.42 AGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAAGAACAACTCGAGATTTTTGCCTCG:1 - chr3R 17615907 3' - HMS-Beagle 6799 2 76.24 AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTGTGACTGCCAACAGGTTTTCGATGAAAATTCCTGGG:1 - chr3L 19465251 3' - Burdock 6158 2 54.08 GTCCACTCGATTGCTCATCATCCTCTAGCTGGATTCTATGGACGTGAGCAGCAAACGAAAATTCTCGAAATTATTCAAATGTCAAACCAATTTCTTTTCCT:1 + chr3L 5256019 3' - jockey 17 1 81.19 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGCAAACAAT:2 + chr3R 22494769 3' - 1360 31 1 57.43 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCGTTAGAGTGTGTTCGCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTTTAAAAATTGTTTAAAAGCGTG:1 + chr3L 24073179 3' + 1360 3371 1 60.40 TAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATATCAGGAACGTGAGCACCGGCAGCAACTAAACCTGTGACCTCGCGCTAG:1 - chrX 2077075 3' - micropia 184 2 52.48 GTATTCGATACCATTTTGGCAGAACATTCAAGGGTTTTTTGAAAGTCCTTATATGTTATTTTTTCCTACCAGTGCGATTGCCTCAACGTGCAACGTCCTCT:1 + chrX 11601657 3' - HB 454 1 72.28 ATTTACTCATAATATTTATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTAACTTGTTTAAATATTTTTT:1 - chr3R 16799766 3' - P-element 2722 1 32.63 ATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGATTTATTATTATGGGCAATATTGTGCAAGCTGCAACATTTCATTAACTTGGCC:1 - chr3L 2544803 3' - jockey2 3193 1 68.60 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCATTCTCAGGGATAGAGCGGAGAAAGT:1 - chr2L 20271193 3' - blood 7025 2 62.38 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACTATACATTATGTAATGAGTATTAAAACATTAACATTTATTTAAAATTATA:1 + chr3L 11428751 3' + mdg1 7434 2 53.47 ATAAAATTAATAGGAGTGATTGCACTGCTGTTTTTATGAGCGACCAGAAAGGTCTTGTGATGAAAATGAGTTGGGGTTATGAGGTCGGTCTTTTAGGGTCA:1 - chr2L 19105278 3' + Tc1 243 1 70.30 TGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAAATGTTGTAAATGTGGCGGAGGTAAGCCTCCTCCGCTGT:1 - chrX 21499256 3' - Quasimodo 36 2 67.33 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTATCATTGCGACTGGTTTTAACAAAGACAC:1 + chrX 22897250 3' + copia 242 1 71.29 GCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCGGCATAAAAGGAGCTGGCATCAGTGG:1 - chr2L 14139388 3' + accord 425 2 74.26 ACCCAACTGCAAGGAAAACNCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCAC:1 - chr3R 30611241 3' + blood 7354 2 62.38 AGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACAAATATAATTCCCTGCTAAGCCAGCTTAAAGGAACA:1 + chr2R 8518290 3' - invader1 45 2 70.30 AACCGAAGAGATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATATGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCAC:1 + chr2L 7461106 3' + roo 352 2 75.25 GATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACC:1 - chr3L 16792542 3' - Chimpo 4033 1 51.49 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTAGACAGTCACTCATCCAATGCAATATCATTACTATGTTTGCCTTTTGCTGCTGGGTAGAGACAGAC:1 - chr2L 15983344 3' + hobo 2929 1 69.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATATCAACGATCTGATCCATCGGGTTCAGAGTGCCGG:1 - chr3L 9542480 3' + roo 400 1 68.32 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCGCTCCATCCCGCTCGCACGATTCTTTGGGGTTTCTCTGTTTTTTATGGCTGCGTAAATTGAATTTC:1 - chr3L 5206526 3' - roo 8673 2 70.30 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTATCTACGTTATTAGTTATATGTATATGTTTGCTCATTTGAAACA:1 + chr2L 4404618 3' + pogo 2072 1 57.43 GATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGTAAAATTTATCTGGGCACGTCGTCTGTGTATTTCAAATGCAATCCATTGTACTCATCTGG:1 - chr3L 17783394 3' - opus 7342 2 69.31 TAAATATATGTCAGCCCGAGGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACA:1 - chr3R 25950106 3' + 412 7494 2 68.32 ATAAAAAAACAAAAAGGAAAAGCAGGAAAAGCTTGAAAAGAACCACAAAACCGAACGCAGAAACTCCCA:1 - chrX 13735645 3' + Bica 338 1 84.06 TAAAGTAGTGTTGTTTAACNTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATAAAACCCATCTCATATTTGTTTAGTTCTGATGGCCCAACAGAT:1 - chr2L 8007824 3' - copia 4901 2 57.43 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCGGACTCCAAAAAATGTTTCGCATATATCATATATTTCGGGGAACACATAAATACTGAGGC:2 - chr3R 12178186 3' + hopper 1403 2 68.32 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCCGGCATGTAACTGCCTGGCGCAGGTGTCGTGAACCGCCTTTTTGCAGAACGTGGCCAAGTTGGTAGA:1 - chr2R 3132637 3' - gypsy5 12 2 67.33 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACGAAATAACTGGAACCCAATACGAAATCAAACGCAGAA:1 + chr2L 8913370 3' - mdg1 7051 2 52.86 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAA:1 - chrX 5452566 3' - mdg3 47 2 69.31 TAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACCTTATTACTTCAGCAACCGCCCAGAGACTTGCCTCGAGTCTACAAATATTAATTT:1 - chr3R 11466147 3' - accord 7031 5 78.12 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGACAGGTCAATTGCAACTAACCGTACTGGAAACTTCAATCG:1 - chr3R 23683363 3' - 297 6581 1 74.42 AGAACTTGCTATTCGTAGCNTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAA:1 + chr3L 455623 3' - Doc 45 1 69.00 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAACAGATTTTACTTGCCGAAATGTAGTAAATGTAAAAAATAGTAAGAGTTT:1 - chr3L 153557 3' + 1360 3382 2 73.27 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATAATGTATGCATATCTCTGCGCCTTGG:1 + chr2L 18927525 3' + mdg1 7412 2 72.28 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCTCACTTTTTTTTCCATGCTAGTTATGCTGCCC:1 - chr2R 15595224 3' - hobo 44 1 66.34 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCTGACATTAAAAATATGAACAAAGTT:1 - chr2L 18077406 3' + hobo 2892 1 72.16 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTAACTAATTTTTGCAACTTTTGTATAAAAATTGTCATTTGATTGCAATACTTACTTCTTGAAGTT:1 - chr3L 12983157 3' - diver 5902 2 63.37 AGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATTCATTCCCATTTCGGTTGGGCTTTCACTTGAGTTTTGATGGGGATAATTGGTGTGT:1 - chr2R 8518222 3' + invader1 3991 2 59.41 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATATTCTAGAGCG:1 - chr3R 4434017 3' - Juan 43 1 68.32 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTTTCAGATATATAAAATATGAAGTTCTTGAAATGGTACAGCTGCGTTATTCTGAA:1 + chr2R 19513442 3' - roo 8685 2 53.47 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTGTGGTTGCTAGAAAACAAAACGTCGAAAAAAGTGATTCATGCCACAA:1 - chr2L 17865621 3' + hobo 2909 1 53.47 TTTGTATTACTTAGTTTCCAGCAATGGCTTCATTCACTCCATGCTGACTAGAAGGTTGGGACTGATTGTGGGCTGCTGC:1 + chrX 22881477 3' - HB 33 1 77.22 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACACACATATAATTTATGGAG:1 - chr3R 25950088 3' + 412 7512 2 52.48 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACTTATATGCTTCACTTAGTTTTTCTTAAGTAG:1 + chr3L 13366459 3' + hopper 1413 2 77.23 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAAATGTTGTAAATGTGGCGGAGGTAAGCCTCCTCCGCTGTGTCGTTCAGT:1 - chrX 21499246 3' - Quasimodo 25 2 61.00 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGAGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAATATTTAATTACCAACACGCAGCAA:1 + chr3R 7688959 3' - Tirant 11 2 70.30 GATTTCGGGCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTTTCGTCTCTTGTTTTTACACACACAAGATAAAATAGAACATTCAACAAT:1 - chr3R 3738449 3' + 1360 3188 1 72.28 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCTTGATATATGGAACAGTATTTAGTGGATGCAATAAACATAGT:1 - chr3R 22494699 3' + 1360 3360 1 60.00 TGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTAAATTTAAATGGCAAAGGGGTTCTGTTCTGAT:1 - chr3R 20448161 3' + hopper 303 1 73.27 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTT:1 - chr3R 7869134 3' - 297 6626 2 72.45 TATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACACGAGCCCATCCCTAAACTTCCGTGGGAATGTGTTCGAGGAAATGACACA:1 - chr2L 17139193 3' + hobo 2564 1 54.00 GAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACATTTCCCAAGAAGCAACTCGCAACTCTG:1 + chr3L 9820371 3' + mdg3 5103 1 73.27 AATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATAATCAAATTTGG:1 - chr2L 12779572 3' + flea 5013 2 69.31 GCGACGTTAGCTTTGGTTAACTTGTAAATAATGCTTTTGGTTTCTAAATTCCAATTGTGCAGATCTATCATCTACCATGCGACCTGTGCACACATAACTTC:1 - chr3L 23354601 3' - gypsy2 1 2 69.31 GAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATCATCCTCATCGCAGTCCCACAGATCTTAGAGGTGAGTGACATGTTCCCTGATGGCTTCGCCAAA:1 + chr3R 20296511 3' - 1360 213 1 69.31 GGTAGCAGTTTAAGGCAACTCCCTGGACGCACGACGACAGATGTGAGATGTGGACGGCGTTTGGCGCACCGTCTACGTGGGCAGCGACTGCTACTATC:1 - chr3R 17397284 3' + aurora-element 74 1 62.24 AAATGGAAAAATAATGCAGNTATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAGC:1 - chr3R 20791654 3' - pogo 48 1 48.51 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACACACCGTCGTCAGTTTGTTTTCATTTCAACTTTGCGTCGGGTTCACTCCAATTTTCG:1 - chr3L 12266749 3' + P-element 2868 1 60.40 ACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTGTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTC:1 + chr2R 2994306 3' - gypsy8 118 2 43.56 ATCCAAGTTGGCACAGATTTGACACTGTCAAGAAATTGTTTGCACACTTTTCTATTTGTTTTCTTTTTCTTATTTCTTGCTTGCTTTTTTTTGTTTGGTGC:1 + chrX 13858873 3' + S2 188 2 64.36 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCAGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGGTGCGTTCCCATGTGCAGTCCACATTGCA:1 + chr2L 13792264 3' - blood 12 2 65.35 AACCAAAGACCCTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCATCAACTTGAACTCAAAGTATTATTTTGTAAACCAAATATTCAAATTTGCATAGTTTTA:1 + chr2R 19673417 3' - Tc3 313 1 67.33 CCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTGAACCCTCTTGTGGGTGGGTGAGTGTGCACTGTGAGAAGGTATCACCGATAAATTGAATTGATATCAAGAATATATGG:1 + chr3R 15057723 3' - Quasimodo 351 2 68.32 CTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGGAGGATAACGAAAAGCCGACCACCAAAAGAAATGAAAAGAAAACTAAAAACCAAAA:1 - chr3L 14516037 3' + Doc 4424 1 62.38 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCTCGCGACTTTACCCAACTTTTGTACAGTCACGTAGTCAGGCAGC:1 - chr3R 16005446 3' - Doc 36 1 55.45 TGGGCGTGGTCCGATTTACTTGAAATTTCACGTACGTATTTTAAATACAATTTTATTTGACTTTATGTCAAAAATAAGGGAATCTGACCCAGTGTGCAGTG:1 - chr2R 402248 3' + transib3 2751 1 82.18 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATATTTTGGGGAACTGCACAATGATAATATGTGTGTCAG:1 - chr3R 19807357 3' - opus 34 4 66.34 TAACTTAATCTAATAAGAGNGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCTGGAAGGTTAATGGTTTTCATGATCACCACGCTCAGTGGCAAGCGTACGCA:1 + chrX 22689217 3' - Transpac 4940 2 57.43 TTTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGTGTGTGTGTGTGTGTTAGGTGTGTTGGGTGTGTCTTGATGGCAACCTGGACCTACTGTGCTAGCG:1 - chrX 8440747 3' - Quasimodo 39 2 57.43 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAGCGTCCAGCATAATTATTTATAATGGCC:1 + chr3R 12178264 3' - hopper 43 1 70.30 AAAGCGGAGAGACCGTGAATTAACGGTATCGCTCTGGACCTTGGACTTCAGCGGGCCAAGGGCAAACAGGGTCGGTGGATTTATTTGCTGATAACTAGCTA:1 - chr3R 7004433 3' + gypsy8 70 2 65.35 ATATTACTATTATTATTGTNATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAA:1 + chr2R 11404006 3' - mdg1 7070 2 53.47 TTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATCATGAGAAATCTACGCAGTTTTTTTTGTGCCTGAATAAATC:1 - chr2L 11919251 3' - X-element 8 1 76.00 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCACAAACGACAATACGGCGG:1 + chr2L 17865663 3' - hobo 25 1 77.94 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGNGGGGTGGCAACTCGCGCGTATTCTGCACACATTGTCATGCATGCAAAAAACAAGATACGACGCGTTCGCAATCGTTAGATT:1 + chr3R 13685245 3' - Tirant 8120 2 68.32 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTG:1 - chr3R 7869133 3' - 297 45 2 71.72 ACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCAACATTCAAACGCAAACCTCATTACGATTAGTTCAGACAAATCGAAATCAATATACTGCCAAGCTTATTC:1 - chr3R 11253432 3' + I-element 5098 1 75.25 GAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAA:1 + chr2R 1076527 3' + FB 264 1 53.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCTTCCACAATTTCTGGACCTATTTTCCAATGGCGCCC:1 - chr2R 19513338 3' + roo 400 1 69.31 GCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGTGAAACCACTTTTCTCACGGATTTCAGTGATTTTTAGCAATATTATTAAAAGTTATTGCCTA:1 - chr3R 29528126 3' - G6 1848 1 58.42 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTTTCAGATATATAAAATATGAAGTTCTTGAAATGGTACAGCTGCGTTATTCTGA:1 + chr2R 19513441 3' - roo 22 2 54.46 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATTAAGTGAG:1 - chr2L 20840230 3' + mdg1 7441 2 47.00 AGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCATTCTGCTAGCAATGTGGCAATGTGACAGTGTTCTTTTTCCCAGTGCAGCTGGTGGGTGCATGCTTCTGCCATAACGCTC:2 - chr2R 8769724 3' - G2 2857 1 68.32 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTTTCAATGCCTTTAAATTTTAATATACCAGCG:2 - chr3R 15880900 3' - 3S18 5811 2 67.33 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAGAATGCATTGAGAAATATAATAGAACTGGATTTGTA:1 - chr3R 12744652 3' + I-element 5320 1 62.38 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTCTAGATTCTGAGTATCACAAATGCAGTAAGATTAAG:1 + chr2R 7132560 3' + opus 7468 2 62.38 GTGAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATACATGACTACTCTGTTCCGTAGATGCGCTACGCTTCCGTGGTTCACCAT:1 - chrX 18329455 3' - GATE 38 2 59.41 AAACAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAACCGAAAAATTTTAAACAAAA:1 + chr2L 21109407 3' + Bica 337 1 84.44 GAGTTGGCGTGAATACGTCNCTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTC:1 + chr3R 10736144 3' - McClintock 5953 2 76.24 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACAAGAGTACAAATTTTGCGGCTTAAAGTTAATTCATTTCGCA:1 - chr2R 23122651 3' - hobo 36 1 63.37 TGACGTATGGCTGGTTTCCNTATTTTTTCTGTGTCTCCGTTGCTGCCATCTCTTGCTTAATTATTTCCTTGGCTAGAGCAAACAATCAACATAATTCCTGA:1 - chrX 21192060 3' - Transpac 357 1 70.30 TCGTCTTTTTAAATAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGATTTTACTTAAAGAGATTAACTTCTAGGCTCTATGGAAATGCCCATCATAGTTC:1 + chr3L 401552 3' - TAHRE 349 1 56.44 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTGCATTATTCCAATTGCAGAATCACTTTGTCCTGTTTGTGTGCGCTTAATAATAGGTGTG:1 + chr3L 13367773 3' - mdg3 16 2 65.35 ATAGATATGCAATAAGCCTNCGACAAAGTATGGCATGTTGGATTGTTATGCAAGATAAAAAATGGAATCAAAATCAAAGCTGCTACTCTCTGCTCCCCCAC:1 + chr2R 12550403 3' + Helena 394 1 59.41 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATATATTATTAAAACAACAAGAGGG:1 - chr2L 4764040 3' - Tabor 6891 2 74.00 GGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCTGGGTGGGCTCTGATGTTATGGCTCGGTGTTGGTTTCGTTTTCGGTTTTGATACCCAAGCGGG:1 + chr2R 21707001 3' - F-element 4478 1 74.74 TGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATTCATTCTCACTGTCAACGGAATAATCAGCCAGGC:1 - chr2L 10938443 3' + GATE 414 1 75.76 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTCTTTGCCGCCATGCAATTTGCCGGCGTTAAGCCG:1 + chr3L 15443035 3' + mdg1 365 2 66.34 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTAGACAGTCACTCATCCAATGCAATATCATTACTATGTTTGCCTTTTGCTGCTGGGTAGAGACAGA:1 - chr2L 15983345 3' + hobo 2928 1 68.32 TGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATTGGTCTGCGAAGCAGGGAACATGATGATGAG:1 - chr2L 13792165 3' + blood 377 2 74.68 TATTGTTATTATTATTATTATTAGTTTCTTCTTTTTTTTTTAATTGTGTTACCCTTTTCTGTTGAATGGGCATGAAAAAACAAAAGATAGGGCAAAAAAA:1 + chrX 13635833 3' - mdg1 7057 2 76.00 GCTTTGGACATGAGGAGGAGGATGATTGCCCATGGTGCGGAAGTGGACGGATCGAAAAAGGAGATGCTGTTATGAGAGTCCTTGGCAGTTCTACTATCAAT:1 + chr3R 2207488 3' + Rt1c 5045 1 59.41 AAAGCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTATTTCTGTTTCAGCAATTTTGAATGCAACACGAATTCTTAGGAATAAAATATAACTGATACGGATTTTCCCA:1 - chr2R 6991428 3' + HB 1619 1 74.26 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATGTGTGAACCGCCC:1 - chrX 13268850 3' - 1360 20 1 56.44 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTCACATTGTGAATGCCGCCCCCGTATTTGTAGTCCTGGCATTTT:1 + chr2R 6918594 3' + hobo 2938 1 59.68 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACACTTCCGTCTTGCCTTTTGCATAGTCGCTCACACTGCGTATACTTAATTC:1 + chr3R 14980554 3' - 412 26 2 54.46 ATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGCAACATCCATCCACAGTGAGGTCCAATTGTATTGTGCCCGGGGGCGCGACGATTTGAAAGGATATACTACTT:1 - chr3L 15229900 3' + 297 470 1 73.27 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGCGCATATTCAATATATACAAGGCTATTATTGGTATCTAATCAAATTACAATATGTA:1 + chrX 11945506 3' - I-element 25 1 49.50 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGC:1 - chrX 21087583 3' - mdg3 28 2 54.46 GATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGT:1 + chr3L 22016845 3' + INE-1 148 1 54.46 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCATTCTACTATATCACAAACACATGTCGT:1 + chr3R 20284813 3' - pogo 19 1 61.39 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGGTAATTAAAATCCACCC:1 + chr3R 25514201 3' + hopper 1404 2 68.00 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATTCATTCTTTTTTTAAATTCTTTGCAAT:1 - chr3L 15831261 3' + 412 443 2 73.27 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCTCAGATAAAAATTTATTTTAAGAAGTTTAGCTATAATTTG:1 + chrX 11009561 3' + roo 9035 1 67.33 GTGCGATGCAACATCGCTCGAATACCTATTCTGTGTAGTATATAAGTATACTAAGTATATAAATAGTATAAGTTCTTTACACATAAATAAAGCAAACTTGC:1 + chrX 16684537 3' + Doc2-element 128 1 74.26 TAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTT:2 + chrX 15258340 3' - BS 44 1 72.28 GAGGTATGCGGCAGCGAGTNCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATACATTGTCAGTCGATAACCGATCGATGATCGAGGGG:1 - chr3R 19810061 3' + opus 7466 2 65.35 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGCCTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCACTTAATTGGGGTT:1 - chr3L 4235596 3' - jockey 4577 1 65.35 TGCTTGAATATGACCTACAAAAACGTATCCATTCCCATAAAAAAAATGCTTCAACTTGGCATTTCATATGGTTTTATGCAGCTTTCGCTCCGAGTTTTTGA:1 + chr3R 25574385 3' + S-element 1350 1 55.45 TTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGAAAAGTGCTGTTGTTGTTGCTA:1 - chr2L 15478380 3' - blood 146 2 74.12 ACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCATAAGACCCAGAAGAACTTCACAATAGTATAAG:1 + chr3R 8629144 3' + jockey 4674 1 71.29 GTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAAAAGCCGCCAGGCAAACAGTTTAAAATGTAATTTATCGCGGGCTCATTCGAGCTCTTAGACCCAAAACGATC:1 + chr3R 22534208 3' + mdg1 464 1 73.27 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATA:1 + chr3R 11151889 3' - mdg3 5286 2 58.42 ACATCGCAAAATAATGGTTGTAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTCCGTCGATAATGGGTTAATGTGCACTGATATAACCGATATAGTGATCAGAC:1 - chrX 16892357 3' + R2-element 3416 1 69.31 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGGGCGAAGATTGAACGCAGCAACCATAGAAGAAATATAAATAAACA:1 - chr3R 7411805 3' - 1360 30 1 56.44 TTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACATTTGAACTGAACCCGACTCTCGCCGACTCTTCA:1 + chr3R 21714354 3' + invader2 4938 2 59.26 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTAAACTTTACTTCTGAG:1 - chr3L 3822402 3' + pogo 2054 1 76.00 CTGAACGGTTGTTCAGCAGAGAGGCAGTACAGCGATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTGTAATCGCCTATTGGTATGGGTGTAAGCTTCAATATCGTGTATTT:1 + chr2L 14039269 3' - 3S18 5733 1 59.41 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAATAGATAACTAAATTAGTTCTGGTCTAGTTGAGGATAACAAACGCATTGCGGGAC:1 - chr3L 19944189 3' - Juan 4031 1 73.27 AACCCCCAATTTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACGGTGACTAGTACTGTGACAACAACAACCACATCTGCGACTGCGTCTGCGACTGT:1 + chr3R 18011055 3' + Doc2-element 486 1 76.24 AGCTAAGTAACGGGTATCTGTTAGTCGAGGAACTCTTCTGCGCCGTGATCTGTTCTTATATCTAGAGATGTATTGTATTAAAAGCACCACATTATTGCATA:1 - chr2L 14381369 3' + INE-1 545 1 46.53 AATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTGCATTATTGTGGGCGGGGCAACATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTA:1 - chr3R 19450065 3' + 1360 273 1 55.45 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCCGAATGTTACGAGTTTATACTCGTAAAATGGCCTA:1 + chr3L 13072030 3' + roo 9032 1 66.34 AGATGTCAGGAACAATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATGTAGATATGAAAGATAGAAAGATACTATTTTCGTGATGGCACACCAAAGCCACCTAGCGGCAGTT:1 - chr2L 19634212 3' + INE-1 149 1 68.32 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATTAATTACCCCGCAAAGATGTTATGTTGATCT:1 + chr3R 27083024 3' + jockey 4943 1 73.27 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATAGTGTTCGTGATGAAACTTGTGACTCCACCTGCTGCAGCTGGTAGTTCTGTTG:1 - chrX 1762922 3' - jockey 4678 1 63.22 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATTCACTAATTTTGTCAATTAGAAATG:1 + chr2R 16979794 3' + 297 349 2 75.25 GATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGAATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGT:1 - chr3L 16792545 3' - Chimpo 4036 1 52.48 GTTACTGTTACTGCATTGTNTTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTTTCGCTGCA:1 + chr2R 10857750 3' + BS 5058 1 58.42 TAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCAGTGCGCAAATTGCCTTGGGTATTCCACAGCAAAATGTATTGGCGAAAGTGTAATGGGCGAGAGGG:1 + chr3L 5077739 3' - 1360 213 1 75.25 GTATTTATATTTATTGATTAAATCATTACTTCAACAGGCTTTATAATTGTAATGTTTCATTGCAATTGTTTGCTATTTAACATTTTAGTTTTTTGTTAATA:1 - chr2L 9051116 3' - diver2 443 1 90.10 GTCACTTTATTCAAGGGGGGGAGGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTCTTTTTTTTTATTCTTGTCAGGGGCGTAGGGGCTGAGGGTCAG:1 + chr2L 11338192 3' + gypsy5 6916 1 57.43 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGAGATATCGATCTGAACAGCTGGCAGTACATGTATTATA:1 - chr3R 18171747 3' + 1360 3381 2 71.29 ATAAAATAAATAAAATAAAATAAAAAGAACAAGAAGCAATACCCACACACACACACACGCACATATGTATATGTATGTTGATAAATCTTTTGTACACTTTT:1 + chrX 14957880 3' + G7 1146 1 72.28 GTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAAAACAGTGAAAAGCAATCAAAGTAATAAACGAAAAGGGGGGA:1 - chr3R 29194539 3' + invader2 355 1 58.33 TATGGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATAGGCGGTGCTGGGAAAACCCG:1 + chr3R 16607517 3' + 1360 3373 1 70.49 TTATTAATTTATTATTTATTAAATTATTTAACTTTTTAACAACTTTATTTCACTCTCTTATTTTTTTGGGAACCTTCTGTCATTAATATGAAATGAAACTG:1 + chrX 16193589 3' + INE-1 415 1 72.28 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTATGAAAGTTAGTTTGCAGTAGCGAATTATA:2 - chr2R 16680102 3' - 412 14 2 65.35 TAAATAAAATAAAATAATTAAAATAACAATTTTATTTGTAATGCAATAACCACACTTAATATAAAATTAATATTACTTATATGTGAAATAACAAACGCAAA:1 - chr2L 17038370 3' + G7 1152 1 63.37 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATGATTCATCTAATACTTTATCTAT:1 + chr2L 7259450 3' - I-element 53 1 77.23 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGATTGCACTGCATTTGCATTTGATGTTTAAATAATAAAAGAGA:1 + chr3L 18928909 3' - mdg1 34 2 65.35 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATATATTTATAA:1 - chr3L 14303569 3' + pogo 2043 1 90.11 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAA:1 + chr3L 25059127 3' + mdg1 376 2 73.20 AACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTT:1 - chr2R 5284542 3' + Doc4-element 2635 1 63.00 AAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAGAATACAATTAAAACAAAACTTTCATATTCAGAAAAATGTCTTTTTTATTGGAAA:1 + chrX 20374347 3' + X-element 4674 1 59.41 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGA:1 + chr2R 8707096 3' + flea 4987 2 56.44 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTGGGGATGTCCATCCAGGTCGATT:1 - chr3L 24150509 3' - blood 19 2 58.42 TCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCTCTCAGTGGGCGGTGGGAAGTTCTGGGTGTCTGGTGTCTGGGCGCCTTTCGGGCCTAAAGAGA:1 - chr2L 7774060 3' + jockey 4605 1 65.35 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTGCGACTGCCAACAGGTTTTCGATGAAAATTCCTGGGGCCAAAGAGCAAGGGTTAGGTT:1 - chr3L 19465229 3' - Burdock 6139 2 72.28 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACAT:1 + chr3R 18171825 3' + 1360 3344 1 78.22 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAAAAGATGACGTCTCGAGTTC:1 + chr3R 13239925 3' - hopper 54 1 79.21 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACAGTTTTAGAATTTGATCATGCCTACGCAAATTCCTCGCTAAGGTTTTGCAGC:1 + chr2L 8690610 3' + Tirant 8485 2 58.42 AAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAACAGAGGCAGAGGCACTGGGCTATCGAGCAACAAAGAGGTGAAAT:1 + chr3L 455667 3' - Doc 2 1 79.21 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGTGTGGTAGTTAGCCAAAAATAGCTTATAATTTACAATTTTTTGAGTTAAGCTTAAAGTAGAATCAAAGAAAGTC:1 + chrX 5194602 3' - hobo 3 1 72.28 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAATTCAAATGGTTGAATTGAAAGATAACAG:1 + chr3R 25271748 3' + invader4 3081 2 69.66 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAG:1 + chr2R 14586476 3' - Doc 39 1 75.28 TGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTA:1 + chr3R 19450088 3' + roo 8826 2 65.35 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTCCTTTGGCTTTTTCACTTTACCACACATTTTTATTTTGACTTCC:1 + chr2R 13358838 3' - roo 33 2 58.42 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAATTCATTCAATAAAATTTTGATTTTTATG:1 + chr2R 7173682 3' + mdg1 376 2 69.31 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGGAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCAATATCAATTCGATGCGTAATTCGCCAGATATTCGTTTGAATTG:1 - chr2L 8913311 3' + mdg1 7429 2 52.48 AATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAAGGAACACTGATGCTGCTT:1 - chr2R 24555646 3' - hopper 54 1 77.23 GTCTGTCCGTATGAACGTCTTGATCTCAAGAACTGTAAAAGCTAGAGAGTTGAGAGCTTCAGCCGTTGCCTCTTTCTTTCCCAGTTTCAGCCCCCAAAAGC:1 - chr2R 16552067 3' + INE-1 129 1 57.43 ATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACA:1 + chr3L 829961 3' - G6 34 1 54.46 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGT:1 - chrX 10547677 3' + P-element 2838 1 31.68 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTTGCTGTGTAAGCCGTATTTAATTAATTTGATTTAATTTCTAATCACT:1 + chr3R 20872802 3' - copia 6 2 71.29 ATTTTTGACTTTAATGGCCAACGGTATTTAATCTTCATATTTGATAAATAATAACC:1 + chr2L 14993453 3' + S-element 43 1 89.29 GTAGACTACTTTTAATTTATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAA:1 - chr3L 13306248 3' + Cr1a 3981 1 55.45 ATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTCAATACAATCAACGCAATCCTTGAATGCCAATT:1 + chr2L 14042170 3' - 3S18 6096 2 67.33 AAGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGCGGCTTATCGTGCACT:1 + chr3L 7719716 3' - G4 3625 1 65.35 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATGTGTCTCTTTGCTCTTTATATATATCTGTCCCAGCGACCACACAATGAA:1 - chr3L 4570821 3' - Quasimodo 13 2 64.65 GAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGCTTTCGAAATTAAGATTAATAGTTGCGACGCCAGAACCGTGCTTGT:1 - chr4 729145 3' - 1360 3226 1 60.40 GGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGACGACAATTGACGCGATGTAGCGGTAAGTTCCAAAACACTTCACTTG:1 + chr3L 2923926 3' + Doc2-element 4466 1 60.40 ACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTCTGGAACGCTTTTACAGCGCTGCGCTCAGGGGCTGTTAATGAG:1 + chr3R 18518544 3' + blood 138 2 57.43 TCCAGATAGGCTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATTCGCCATGGTTGGTATATTCCCGTTGCC:1 - chr3R 3321126 3' - Doc 4271 1 70.30 AGAGCGGGAGAGTGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGTAAGAGAGACGAAAAGGACGACGGCAAGGACACACAGACGCGCATCTTT:1 - chr2R 23573365 3' - GATE 51 3 57.43 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTTCGGGTTGTGCTGGAATCATGGATGAGTTTAAAACACGCTCGAAATTCAAATGAACAAATCCGCTT:1 - chr2R 10777773 3' + pogo 2098 1 70.30 TATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAACTGCATGAACTTTTGTGCCTCGGCCAAGAGGAAGCTCTTCCTGCGTG:1 + chr2R 24741521 3' - gypsy12 31 2 53.47 ACAAGCAACAATTCAATTCTCTTTACACCGAGTTAATAGCTCCAAC:1 + chrX 2534926 3' + Fw3 2991 1 91.30 GCGATGATAGCGACTCGGATTCGGATCACGATGTTCCATTTTATTTGCTCCTCGGGACCAGGATAGGATGTCCGGCATGCCGTCCCAGCAGCTGCAATCGC:1 + chr4 907133 3' + transib3 2540 1 70.30 ATGTTTAGCAATAGTATGGTCCGTCAGGAAATTCAGACCATACCTGGAGGACCACATGACACTAAAGGGTCTTCAGGATCCGTCGCTCCTGATGCTTGCCG:1 + chrX 18625036 3' + Osvaldo 66 1 65.35 TCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACTTAATAAAATCTCTAACCCCAGTAGTTGGGAAATCCAACTCAGAAAGTATTAGATGTGCATACTACAAGCGCTC:1 + chr2R 7881655 3' + gypsy7 392 1 59.41 AGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGTTCTTCCCCGAAAGATCGGGTTCGAAGCTGCGTTTTAATTGCGTCAGCTTGAAATTCTCATCGCGAGAT:1 - chr2R 18096824 3' - Quasimodo 345 2 73.27 TATTAAAAAAAAAAATAAANAAAAACTTAAAACTCACTGAATGTTTTGAATTCAATGGATATAGAGGACATATAGGGAATACAAATATTTAGTTTATTATT:1 - chr3L 9048715 3' - hopper 153 1 89.11 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTATTCATGTGTGAACAATATGTTATATATAAATATAACACGTGTGGTGCAG:1 + chr2L 10698423 3' - roo 8709 2 77.23 TAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATTGAGATTCTATTCATTAATTAACTAACTTGTAA:1 + chr3R 26241102 3' - mdg1 7154 2 67.33 GCCAACATACGGGGGTACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTACAGTCAGGCTTCCGTAACTAGAAGTATCACATGCCGCATAGAAAGT:1 - chr3R 20595411 3' - Rt1a 4783 1 55.45 AGCCCGACGGCTGCCTTCANCTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGATGTCCTTAACATCTGCA:1 - chr3R 14980487 3' + 412 453 2 60.40 GGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGGGGGGCAGGCGGATTGAGCCATGAGGCGTGCTGCTGCAATGAGTGCGACCACCAA:1 - chr3R 9824311 3' - Doc 4541 1 59.41 GACGTCTCATGAGGAGACANCCTCTCGATCTTCCACAACAATACAAGAACACAAGAAAGAGCTGGCGATATAGGAGCATTAAGCAGAACCGACAACTCCAA:1 + chr3L 16485284 3' + G6 1871 1 66.34 CTTAATTTTACTTAACTTAATTTTTAATTATTTTATTGTTCCCATCACCATCCCAATCCCATTTGCAACCTATTCCGCTCATTTGTATCTGTTATTTATAT:1 - chr3L 7425085 3' - Transib5 335 1 77.23 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACATTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATAAAAACCATCTCATATTTGTTTAGTT:1 - chr2L 8007841 3' - copia 4914 2 72.16 TTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAA:1 + chr3R 14049435 3' + transib2 2811 1 64.36 TTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGACAGAATACTTGCAATACCTTTAGCTCAAAGCACTTAA:1 - chr2L 15081395 3' + hobo 23 1 57.43 TGGTGGGAGTCGCGAATGCNGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTGCTGGGCATTGTGGCTTTCCTTT:1 + chr3L 5022536 3' - Quasimodo 7048 2 74.47 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGTGTCTCGGAATATCATTTTGGATGGCC:1 - chr3R 7272578 3' + hopper 1369 1 70.71 ATGTAAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCAATCACTTAGATCCAGCAACTCGAATTCCAAACTTAGAGAC:1 + chrX 19821322 3' - Rt1b 4946 1 60.40 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAG:1 + chr3L 5538076 3' - jockey 4709 1 63.37 ACACACACACACACAAACTCACAGCTCATCGCCCAGCCGAGGCAAGTATTGTGGTGGGAATTGTCGTGGAGAGGGTCCTCCAGTTGCTCTACAGCCAACAT:1 - chrX 13352343 3' + accord 187 2 67.33 TGGTTTGGACCAGCCAAATACGTCACTATATATGTATGTGTATGGAAAGTCGAGGCGTGACAACAACAAAGGAAGCGGCTAACACGCGCCAAGAAAGCCAA:1 - chr3R 8050399 3' - 297 6 2 74.26 AAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTGGTAGTTTAAAATTAATATAAGTACTAAGAGTCTTGAAA:1 + chrX 11029094 3' + roo 29 2 59.41 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCAGCGATAGTAGGACACTGGTCTGGATGACTCGTAACTCCGGCTGAAC:1 + chr3L 9542574 3' - roo 29 2 54.00 AACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAATAAATGTCTTACGTCAGTTTTGGCAGGCGGCAAT:1 + chr3R 8108015 3' + Doc 4415 1 65.35 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAACATTGCGCCAAACAGCTGATTTTTGGCCATCCCCCAAA:1 + chr2R 13194685 3' + roo 9038 1 62.24 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATCTTTTGGTGGAGAGCTCTTTAACTTTTGTTGGCCGAGTCGTGCCTTCAGT:1 - chr2R 10778212 3' + roo 9045 1 53.47 GTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCTTATTATCTTTAATCTTGAAATTGTTGAATCAACCCGCGTGAATGGCTTCGACTTCAGCTGT:1 - chr2R 4886642 3' + Cr1a 4185 1 57.43 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAGCGTCCAGCATAATTATTTATAATGGCCAGGCAGGCGGCGCTGCAGCCCGTATGCAGTGTGTGAA:1 + chr3R 12178301 3' + hopper 1409 2 69.31 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACA:1 - chr2L 19207891 3' + 412 7493 2 79.21 AGCTGTGAGAAGATTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTTGGGCGACGGTCGTGTCTTGAGCTCGCCAAGTTCGCATTTCAACTGAGCAAGT:1 + chr3L 9019227 3' + R1A1-element 218 1 60.40 ATTGTGAAATAGCATTTTTTCACATTCTTGTGAAATAGCTTTTTTTTCTACGCTGTAAAATTAGGTCAGATTTAACATATTCATTAGAACTTGAGCAGCTG:1 - chr2L 13075781 3' + copia 340 1 61.39 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATCGTTTTTTTTTGGCTTTTCCGCAGAGACGCAAATCATTTGTCAAAATACGAGAG:1 - chr3R 29465563 3' + 412 474 2 52.48 TGGGATTTTACATTTGGTCCTTCGAGCCGGATCAGCTCCAGTCATTAGGTCATCCATATAGAAATCATTCCTCATTATTGCACTAATAACTTGGTTTTTAC:1 - chr3R 19445570 3' + roo 418 1 68.32 ATTAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATACGTTTTTTGGTATAATATAATTAATTAGTATATGACTTTGAGTACTTCGAAATTCCATG:1 - chr2R 18525775 3' - invader2 4877 2 74.26 GATAAAATAATTTGAAAAAATTTGATAAAACTTGGGCTGCTGACAATGCAATAAAGACGAAAATATCGGACGACGCCACCGGATGTGAGCCGCATTTCAAG:1 + chrX 15405857 3' - 1360 3090 1 72.28 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAGCAAATGCTGCTGGAGATGT:1 + chr3R 30252364 3' - 412 7069 2 63.37 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAA:1 + chr3L 12634237 3' - BS 5016 1 58.42 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGTACCGTTTTCCTAAACTTGGTTAAAGTTC:1 - chrX 10996515 3' - 1360 23 1 56.00 TCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATAGCACTTTGCAGAAGAAAGGTAAAACTTA:1 + chr3R 28475882 3' + roo 9058 1 62.64 TTTGGCAAATCGATAGAAATGTATTAGACCAACAAATATAAAACGGATTTCTATAAGATAACCCTTGAAAATTTATTTAACCACCTTTCATTCCCATAAAA:1 - chr3L 55077 3' - INE-1 308 1 40.59 AACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCAC:1 - chr3R 19950458 3' - BS 5022 1 54.46 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCCTGCACAGCTAAAAAATGGCACCAATTTAGTGGAATTCTATTTTAAGATCTA:1 - chr2L 3778365 3' + 1360 3364 1 53.47 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAACTGGCTGTGCTGACAAACGATTTCAATTA:1 - chr3L 5973976 3' - hobo 21 1 58.42 CTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATTTTTTAAGTGCTAAATGTGGCGATACACATCGACGGAAATCCCA:1 - chr3R 22538768 3' + hobo 2659 1 52.48 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAAGGATACACCAGCTCACAC:1 - chr2L 3910396 3' - jockey 4795 1 79.21 GAAGATCGCAAGAAGAGGGNTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCTGGACACCCTCGAGTCCCAGTTCCAATAGCGATAGGGCCACGATAA:1 + chrX 16489398 3' - opus 120 2 53.47 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGCGTTAAGTTATGAAGTTATCACGATGGCACTTCTGCTCCAGCAT:1 - chr2L 8879886 3' + I-element 5328 1 54.46 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTG:1 - chr3R 6437509 3' + 412 464 2 58.43 TAATAATAAACAATAATAANAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATA:1 - chr2L 12779583 3' + flea 243 2 58.42 AATAAACAAGAATAACAAACAAAAATAGGTAAATGGGTAAATGGGGGGAATGAAGAAGACTGGGAAGCATTTCAAAATGGGTCTCCTGAGGCCCGGTGGAA:1 + chrX 16981396 3' + flea 247 2 78.22 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCTGAAAAGTTGACTCAGTGCCAAATGTCTGTGAACGGCAAAGAATTGGAGAGGCTGTTGAGGTTTACCAG:1 - chr3R 3525985 3' - Doc 19 1 50.50 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATGGCAGAGTGAACCGTGAATCTTGCGAAATATAAGTAAGTTTTA:1 + chr3R 18323601 3' + mdg1 377 2 57.43 GCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGTTCCCATCTTTCGCAAGAGAGCACAAATTGGTGAGAATGAGCCGCTAAAGAATATAAACAAA:1 + chr2R 7040719 3' - diver2 196 2 62.38 AACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGGCATTTGAA:1 - chr2R 6769441 3' + 412 471 2 54.64 TACGACGGGACCACCTTATNTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAGAGATATGTACGTGGTTGGAGAGTGGAGACTGGGGAATGTGTC:1 - chr3L 749263 3' - P-element 12 1 66.00 ATCATCCGCCTCCTCATGTCCAAAGCCATGTCCACTGATCAGCTGCGTTAGATGGAACGTCGCTCCACTGCTCGGTATCCGGGCGTACGTGTCAACGACTT:1 - chr2R 13905392 3' - Rt1c 5049 1 59.41 AATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGCCTCATTAGTTCTGGGTTGCGTTTGTCTATGCAACATGCCCCTGATCAGTGATGTAGTGTCG:1 - chr3L 17876371 3' + 297 6917 2 64.36 TAATTCTGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTTTAGTTTTCATCATCAAGTAATCAACGCACTGGCCGCAGACAAAGGCTCGGAT:1 + chr2R 9800038 3' - Dm88 391 1 64.36 AGGAATAAAAAAAAAAAGAAACAAA:1 + chr3L 3842328 3' + Osvaldo 1520 1 84.00 AGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGTTTGGACTAATTTCTAATTTGAATGGTGATTTATGC:1 + chr2L 15986747 3' + hobo 2 1 64.36 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTTAAAAACACGTGGAATCTGCGGCTGGGCCAGAACAGTAAA:1 - chr3R 13205753 3' + hopper 1391 1 51.09 TACTCTAAAGACAAATATTCTTATATAAAGTCAGTGAATAGAAATATTACAAAACCAATGCACCGGGCTTAAAAAAGGCTTCCAAAAGGAAATATGCAAAA:1 + chr3L 24323894 3' - 1360 399 1 70.30 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACCGATGTCCGTATTTTCCCAC:1 - chr3L 771734 3' + roo 405 1 72.28 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCGTGTAAGGCTATCTGACACTGGCCGTGGGAAAATGCTG:1 + chr2L 13215044 3' - roo 38 2 61.39 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACAGATGTATCTCAAGCGAGGACAATCCTTTCGCTGCGGTTTT:1 - chr2L 18927474 3' - mdg1 7073 2 57.43 GTGAGTATGTGTGTGTGAGTGTAGTGCTTGCTTTGCGGTGTTTGCGTTCTCTTGTGAAATTAAAATATGTGAGTTCGTTAAATGCAAGCGAACTTTAAAAA:1 - chr2R 22298215 3' - accord 7033 2 58.42 AGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGATGAACACATTAATTTGTACACGAAGTGAGCTATCAGAACCTTCAAAAGTTGTCTCTAAT:1 - chrX 21933223 3' + gtwin 7356 2 58.42 ACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCATCGACGAAAA:1 - chr2L 21400692 3' - Doc3-element 4 1 58.42 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTAT:2 + chrY 311343 3' - 1360 12 1 50.50 TACTGCACGCAGGCAGCCAACTTACAAGTTAAAGAGAGTCTCACAATAAGAGAAAGAAGCTTCTGGTTACCGTGACAAATATCGATTGGAAGCCCCGATGG:1 - chrX 8045141 3' - Dm88 4493 2 75.25 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTTAAGTACCACCACCAGGTGTTTTGATTTATTGCGGCTTGGTTAAGTGCGGCCACAA:1 - chr3R 11720615 3' - hobo 20 1 59.41 ATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAA:1 + chr3R 19449366 3' - roo 179 2 54.46 GAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGCTTATCAGATACCCCTTTATCAATGGTGGGAAATTCAGTGTTGAAAAGCGAATGTGGAAGTTAAGACAGAAACCAA:1 - chrX 284393 3' - INE-1 573 1 65.35 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTAT:1 + chr3R 14049395 3' + transib2 2772 1 78.00 GCCTGGAGCCACTTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACA:1 + chr3R 23893866 3' - 1360 67 1 73.27 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAACGGGAGTTCATCATTACACATGACATAAAATATATATATCACGCGCTGCCTTATCGCGTCGATGAT:1 + chr3R 16806078 3' + 412 7515 2 51.49 ACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGGGCATCTCGCTCCAACCCGCTTACGTCGTCCGTCGTTCGTTGACCGCCGTTTACGT:1 - chr2L 4614157 3' + jockey 4 1 55.45 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCGCCTTAGCTCCTTATAGCTCCTTATCGATATCTAAATGC:1 + chrX 21056994 3' + Tirant 8470 2 65.35 GTCCAGATGGGCTTGAGAATTGCCTTGTACACCAGGATTTTGTGGTTCTGCCTTAGCTTGGACCCTCTCCCAATAGGTGACCCCAAGTGACGCACCAAAAA:1 - chr2L 20951030 3' - G2 2644 1 74.26 AGGCGTCTTAGGGATTGGCTATGATCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCATTCTGCTAGCAATGTGGCAATGTGACAGTGTTCTTTT:1 - chr2R 8769766 3' - G2 2899 1 70.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGACACAGAAAACTGGATTCGGTCTCGGGAATTTTATTTTGTTTTCACAGTGGAAGGGGGCGCACAG:1 - chrX 2123666 3' + P-element 2878 2 68.32 AAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGATGTCCTTAACATCTGCATTTAAATGTGGTGGAGAAGAGTA:1 - chr3R 14980464 3' + 412 7529 2 61.39 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTATTCAAAAAAAAAAAGTGTGGCAAAAAAAAAGAGCACTTCAACGTTTGTTGAACAA:1 - chrX 3546289 3' + pogo 2085 1 59.41 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTACGATGTAGCCATTTATGCGA:2 + chr2R 19594648 3' - roo 8717 2 81.19 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCACCGCTTCAATAAAACTGCAAAGTGCCAATTACAAAAATAACAAGTTAGCCCC:1 + chrX 20377168 3' + hopper 1390 1 50.50 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCAGCGATAGTAGGACACTGGTC:1 + chr3L 9542548 3' - roo 5 2 60.00 GTGAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTAAAGCATTCTCTTTTGTTTTATTCAGGTCAATCAGGTCAGTGCATATATAATTGAATCTCGATGTGGTAC:1 + chr4 715492 3' + INE-1 551 1 56.44 AAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGCCATTTACTCTGCTCCATTGGGAATTTATTTGCCTTGGTTTTCCATTTAGTTATTTGCCCTTTC:1 - chr3L 14378231 3' + Transpac 37 2 72.28 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCCACAAAAACAACGCCGATCTCGCCCGTTTGTCAC:1 + chr3R 6437558 3' - 412 43 2 66.34 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATGAAAGCAGAAAAATGTGAGGCCA:1 + chr3R 20430835 3' - hopper 19 1 59.00 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGAC:1 - chr3R 19450163 3' - roo 8696 2 72.28 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCA:1 - chr3R 30611237 3' + blood 7370 2 56.18 TTTTTTTTACTTTTTATTATATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAGTTACTCCAGACAGTAACAAAACAAAGCGAGGCGCCCTTGAAAAC:1 - chr3L 17918347 3' - Doc 4690 1 73.27 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATAAGTATACTTTGTTCCTTTTCATAGGACTCTGACCAGTTTTTCGAATGGAATGGG:1 + chrX 12284127 3' + Transpac 5210 2 51.49 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGCGACAATGTTGCCGGGGCGTACTTAAAAATAACAGCA:1 + chr3R 19270409 3' + pogo 2071 1 65.26 TGAATAGTATATTCCAACANGAGGAAATGCAAACTTTGCCACCCACTTGATATGTTAAATCTGCGTAGATTTATCAACTTTGCTAATTAACAGCGTTTCCT:1 + chr2L 20610004 3' - copia 4867 1 83.17 GGAGTGCTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGGCATCGAGTTCCAGAATTCCACCAAGCTGAGCTTTGCGCCCGACTTAAATTGGTTATACATTCAATCGG:1 - chr2L 15892878 3' - Max-element 8365 1 72.28 CTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTATATGTGCTAAAGGTCACACTCGCAATTAAATGGTCCGAAA:1 + chr2R 14344495 3' + 297 6950 2 63.37 TGCCCTGGCCTAACTGCGTNCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGCGGTGGCCGA:1 - chr2R 7735584 3' - 412 95 2 63.37 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTTTT:1 + chr3R 24074854 3' - hopper 22 1 57.43 AGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCTTTTTTATTAATTGCTAATTATTTATTTGTGCAATCTATGACTTATCTTAATTTGTACTTTTAAATTTG:1 - chrX 13616847 3' - X-element 17 1 64.36 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACAGATGTATCTCAAGCGAGGACAATCCTTTCGCTGCGGTTTTTGCTAGGCGCCATACC:1 - chr2L 18927458 3' - mdg1 7057 2 60.40 TTTAACGTATGTAGCTAATATGTGTGTAGTTGTACTTTGCGTTTATTACTTGTTATTTTGAACTAAACGTTTTTAATACGTTTTCGAAATAAATGTGATTT:1 - chr2R 17730636 3' + transib2 300 1 66.34 AAAAAAATGTCTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACTAAATTTGAAGTATTTATGAT:1 + chr2R 13712268 3' + mdg3 5118 1 77.23 TATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:2 - chr2L 20360645 3' + R1A1-element 142 1 69.31 AATAAAAAAGGGAAAAAGAAAATCCTTATCCAAATACAACTTAATTACCAAAAGAACGAAAACTGAAACATCAAATTACACAACGAGAGAGTTCGACGAGT:1 + chr3R 28868676 3' + Doc2-element 233 1 74.26 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTATTTAACAGGTGTGATTACTTGAAAGATTGTCTAAACGACTAATGTTAGGTATACAAGTGTT:1 - chr3R 17415227 3' + roo 397 1 54.46 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACATGCATGGAAACAAAAG:1 - chr2R 19557963 3' - 412 7069 2 63.37 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGGCAA:1 + chr3R 30611311 3' - blood 28 2 52.48 AAACTGACACACACACACACATCCAAGTGCGGAAGAGATATCGGGGCTTTTTCCTGGACTTTTCTTGATTTCCTCGAACCTTTCACTTTTCATTGTGTGC:1 - chr2L 9406930 3' + Quasimodo 33 2 59.00 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCTCGCGACTTTACCCAACTTTTGTACAGTCACGTAGTCAGGCAGCCACCTCGTTCC:1 - chr3R 16005435 3' - Doc 25 1 55.45 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTTGAATTGTAAAAATAAACATAAACCTAAACATCAATAACCT:1 + chrX 17232321 3' - 412 77 2 64.36 TTGTAGCCTTTTATTTATTNTTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAATTAATTACAATAAAAGTGTAGGCAGATTTATTTGCATATCATGTGATATT:1 - chr3R 5213208 3' - G2 3058 1 49.50 GAGAATATACACAGAAACTTACAAATAAAACTTGTCATTAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAAATGGGAATGGCTTGGGGAATGGCTTTAAGTTCGTT:1 - chr3L 11424152 3' + Doc3-element 4438 1 62.38 AAATAATGCTAAAACAGTGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGCCTGGAAATGTTGCTTTATACTAATCTAGTATACCCTTTTCTTCTACAAGGTAATT:1 - chr3R 4578695 3' + Tc3 1443 1 66.34 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTAAACTTTACTTCTGAGTATTTA:1 - chr3L 3822396 3' + pogo 2059 1 70.30 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACT:1 - chr3R 22469159 3' + hobo 2904 1 70.79 AGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTCATCTGAAAAGTCGTATAACTATGGAGCGGGAAATTTACAGTGCGGAATACTTCGAGAGAGCTT:1 + chr3L 18114447 3' + F-element 4458 1 72.28 AGGAAAACACTCAAAACTATAATTACATAATAAAATAGCAATATGGACGAATGGAACAGAACTCTGGGGATATAATAAAAAAAATTAATGTGTTCATAAGT:1 + chr2R 982141 3' + Porto1 4202 1 69.31 AAATTTCAAAAATTCGATTNTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGATGCGACACATATCGGGAAAATGAGGCGGAAGGTGAGGGGCCTGAGAAATGCCCA:1 + chr2R 15915395 3' - FB 23 1 56.44 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACCCAACAATATTTTCGAAAACGCTAAAAATACTCAGTTAAACGATTTTGTCTATAAATTCAATTGGTGGTAA:1 - chr2L 7804219 3' + 1360 3387 2 71.29 TTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCTACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCGGTATAGAATTCCAGGGAAAATGCATCCAACAT:1 - chr3R 19787979 3' - HB 1307 1 60.71 ATGCTCACTTGTGGGTGAATAGGGTGTCGTGGTTAAGCAAAATGTATGGCATGGGGCGTTTTCAACTGCAGCAGTGTCCTTTCG:1 + chr3L 11400545 3' + R1A1-element 5259 1 66.67 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGGGAACTCTCTTGTTTTTATTTTATTGTTTATCTCTTAAGATAAGTTACAGTAG:1 - chr2L 12692392 3' - 1360 22 1 76.24 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCTACCTAAGCAGGGTACAGCAACAAGAACAACAACAGC:1 + chrX 12323129 3' - P-element 39 1 40.59 TTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGAATTTGACACTC:1 - chr3L 21912263 3' - Bari1 34 1 66.34 ATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATCATGAGAAATCTACGCAGTTTTTTTTGTGCCTGAATAAATC:2 - chr2L 11919251 3' - X-element 9 1 75.25 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAGATAATATTGTTTGAATCCCAACGTAGATTTAAAAATAACAATTGTAATTTGTGACACCAAATTATGCGTAC:1 - chr2L 15766358 3' - pogo 1 1 73.27 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTAC:1 + chrX 16237966 3' - mdg3 36 2 54.46 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATATTTTTTTGTTCCCCACTTCGTTCGTCTGACGAGTGTTGCCTACTTTGGAGCGTCAAGTAAATT:1 - chrX 4422589 3' + jockey 4983 1 67.00 GCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGATGAGTAATTAGTGTGAGCGAAAGAGAGAGTTTGGGGAGAGAGAGAAAAA:1 - chr3R 6007862 3' + diver2 4884 2 52.48 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCACGTATGCACCTGCCCTTCTGGAATAACATAGAGAATATGT:1 - chrX 15260742 3' - jockey 94 1 59.00 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATATATTATTAAAACAACAAGAGGGTGCCG:1 - chr2L 4764035 3' - Tabor 36 2 64.04 GTCCTCTTATATAACTCCGTTTTGAAACCCATATGGTTCATATGCTGTTGAAGGTACAGGACCCGATCCCTCTGCTGATGTCGAAGTATGCTCATCTTCCA:1 + chr3L 26057767 3' + Doc3-element 4288 1 69.31 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGAGCAAAAACTTTGGATGTTTTGAGAGTTCGAAGTTCATACTGTCATCCCGCTCTAAACCTC:1 - chr2R 20584398 3' - P-element 13 1 66.34 GACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTCTGAAGTTGAGCTGATGCTAGTCGCATAAGCCACTCAAAATGTTGGCATGGCCCGCGCTTTCACACAAAAGC:1 - chr3L 8009987 3' - Tirant 284 2 75.25 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGGCGAAAGTATGGGGGATTAAATCGATTTTCAGACCTCGGGCTTTCGTTGTTTATTATTATTTTT:1 - chrX 9463333 3' - hopper 8 2 71.00 TAAAGTCTTCTTATTGGGGNTTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGGTTATTATATTATATTTTTAGCTGAATTTATGACAAATTTCAAAAATAAGAAAA:1 - 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roo 8683 2 60.40 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCACAAACGACAATACGGCGG:1 + chr2L 17865663 3' - hobo 28 1 78.87 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTTGCCACTGCTGGCTTTTTGCTAGATGGGCTTGTTTGTC:1 - chr3R 20345076 3' - transib2 14 1 65.35 TGGTACGTGACGAACCAGGAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGGATCAGATCAATTTTCACAGCAGCAACAAATGTTGGATCAAGGTCAAT:2 + chr3L 21009347 3' + G5 4486 1 76.24 TTATAAACGTTCGCTCTCCCCTAAGTCTGAAGTACAAAGTAACTCCGCTATCATCGCCAGATGCCTCGCTTGCCGTTGCCCAAGTATGCCGGTAAGGCCA:1 - chrX 8486876 3' + Doc3-element 4250 1 57.00 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATGTGTCTAATGAGGGTCCTGGCTCTAAGCTACCTGC:1 - chr3R 11191016 3' + hobo 2903 1 62.00 TGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGCCTAGA:1 - chr3L 4235638 3' - jockey 4619 1 75.25 TACTGAGGTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCCAAAAGTGTTTATGATGTTGTCGCTGGCAATTTTGGCTTTAAGCGGTTTGGCATTGG:1 - chrX 22758731 3' - INE-1 532 1 47.52 GTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGGCGCCCAGGTACAGTGGGAAAATTGCACTGTCAGTGGAATTGGA:1 + chrX 17217775 3' - 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hopper 3 2 74.26 AAATAATTAATTAAATTATATTAATTAAATAATTAAAAACTATATAATTTTAATAACTACTTTAAACGATAAAATAAGATGAAAGTTTGTTGTTATCACCT:1 + chr3L 20883131 3' - NOF 3962 1 30.69 TAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAAAGTATTTGTTCAGACAAATTTATGGACGCTTAGC:1 - chr3R 8325677 3' + 1360 10 2 67.33 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATAATTAAAATTTGAAGTAAAACAACTTACATGCCAGCAATTGGGGGCGCCGCCTCCATCTTTTTGCGCTAC:1 - chr3L 11758336 3' + roo 404 1 71.29 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGAAGTCTAAAAAATGTATTGTTGATTAAAAATCTTTTGACCAAAACTATTGAAAAAATAGAATTTCGAAATGCTATA:1 - chr3R 4474419 3' + copia 227 1 77.23 TCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAAATCCTTTGGCTGCAACTGCAACAACAACCAATTCTGGCAGTTCGCG:1 - chr2L 2428958 3' + HMS-Beagle2 6747 1 53.47 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCACAAACGACAATACGGCG:1 + chr2L 17865662 3' - hobo 8 1 72.00 AGCCCAAAATTGTAAGTCTNTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGATACTTTAATGATTTATCATCCAAAATGATTTTAATAGTTATTAATAAAA:1 + chr2R 13446727 3' - roo 8691 2 52.48 AGAAAGGAAATATAAATTANAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAAGTATTTCAAACCGGCGGGCAGAAGCGGAAAA:1 + chr2L 10177843 3' + copia 246 1 63.37 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACATACCATTCTGCAATAAACTTT:2 + chr3R 5700172 3' - mdg1 7055 2 62.38 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACAACAAATAGAATGTGTTTGAGCATAGATT:2 - chr2L 12182627 3' + roo 9024 2 74.26 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGAC:1 + chr2L 12199501 3' - Stalker2 7299 2 76.24 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGAATGTGGGCACACAAATTTAAGCTCTAA:2 + chrX 5452639 3' + mdg3 5485 2 63.37 AAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAGCGTTGCGAGCGGCGCCTAATTCGATTGTAACG:1 - chrX 14658716 3' + X-element 4674 1 65.98 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAGTGAAACCCTTGGCCGGCA:1 - chr3R 25514094 3' + hopper 1401 1 65.35 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGATGTGCATGTATTCAATGAGAAAGAATGATTGTTTTTAGCTAGTTATTAAATTTAAATGATTGTAAACTCT:1 - chr3R 6609680 3' + Transpac 306 2 74.26 TGAATCTCAACCTTCTAGATTTTACTCCAGATCAAGAATATACATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTACAACGA:1 - chr3L 19471445 3' - INE-1 166 1 87.13 TGACTCCGCTCATAATCCGNACAACGCTAGGGTTAATTGAAAGTGACAAGGCTTCAGAAATGAGAAACAAACTAATTATATAAATGAACTAAACTTTCA:1 - chrX 3016613 3' - diver 5890 2 74.75 ACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAACAAAATCAAGTACAAATTGATTCACAGGCGACCGTACCCCAATTGGATAAAAGCGGCCAAATGCATAA:1 + chr2R 5602860 3' - accord2 7271 1 68.32 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGCATCTGTGTGCAGCTTGGTCTCTTTTCGTGGGGTTTGTTATTATT:1 - chr2R 12096558 3' + hobo 2929 1 61.63 GATTGTCCACCGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGATTTTCCTCTACTTTTCCATTAGAATATGGGAAATT:1 - chr3R 23688293 3' + mdg3 434 1 70.00 GCCATCAAACGGCTTAATATTACGTTTAGCCTTGTCTTATGCTACACATATTTCACGCTGCTTCCCTTTCATATTTCTTCGCAGCAGCGTGCCACGCGTAA:1 + chr3R 17968787 3' - copia 449 1 72.28 ATTTATAGTACATGTATACATAGAGTACAATGTTTTTAGAATAATTACATAAATCACTCACATAGATACGTTTACATACACACTTTGGTGCGAAAGCACGC:1 - chr2R 19269261 3' + gypsy11 3997 2 65.35 TGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTCTAGCGCGAAGTCACCGGAAAC:1 + chr3R 5133644 3' - Tabor 56 2 77.23 AACCGAAGATATTTCCAAANAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTTTGAGCTTTGTGTTAATCTT:1 - chr3R 8434280 3' + roo 9016 2 81.19 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTATCTATATATGGCATATGTGTTCAGCACCTTTCCTCAAGCCAAATAAATAATTCAGT:1 - chrX 8972921 3' - flea 4768 2 68.32 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATCCATCGAG:1 + chr3R 12937481 3' - roo 8706 2 68.32 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTATATATAATACTAAGAAATATTTGTTATAATATGAAATCATTTAAGCATTTATTTATTTACGCTTCA:1 + chr3L 19088121 3' + 297 387 2 73.27 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGGCAACATCAGATCGCTCAAAGCGTGTGTG:1 + chr3L 16662447 3' - jockey 4717 1 70.30 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAAAA:1 + chr2R 14586485 3' - Doc 40 1 68.69 TATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGT:1 + chr2L 18413891 3' - hopper 42 1 60.40 TGAGTAAGGGGTATCTGATAGACTATAGCATTCTCTCCTGTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTTTTTTGTGAGTGGCGCGTATGCAAGGACTAA:1 - chr3L 7488117 3' + INE-1 548 1 82.18 TATTGTTAAATAATTTAAATTGTTCTTTTCATAAAAATCATCCTTTCGAAATGCGTGTGAATATTTTTCTGAGAAATCACATTTGCTTGTCAGCTGCAGCA:1 - chr3L 18022328 3' + HeT-A 5806 1 65.35 AAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGTGCTGCGCAACGCTGGGAACGAGATTCAATTGGTCGTC:1 + chr3R 26579975 3' + jockey 4660 1 62.00 TATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAGCACCCACAAATTGTGCGACCT:1 - chr3R 20791634 3' - pogo 28 1 68.32 TTTTTTTTTTGTTTTTTAGAGATAGCGCGATAGGAGAAAGCACGCTTTGAAGTCCACAACTTTGATTATACTCATTATCAATCAACCCTTTTTTCCATGTT:1 - chrX 3512187 3' - G-element 4323 1 74.26 AGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTAT:2 + chr3R 10736105 3' - McClintock 40 2 72.28 TGTTTTATTTTTTTTTAATTTTTGGGTGGAGCTCTGGTTTTTTGGGTGGCTCAATGGCGGCTTCTAAATTTGAGGGTTGCAAACTTTAGTAGTTGTAAGCC:1 + chr2L 16470749 3' - Doc 4698 1 47.52 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAAT:1 - chrX 15412673 3' - hobo 28 1 51.49 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACAGTTTTAGAATTTGATCATGCCTACG:1 + chr2L 8690584 3' + Tirant 352 2 73.27 GATGGCGTATGTCAGTGTTGGACCAATGTAATGAGTCGCCATCAATATTATAGTCTTTTGGGTTTTTATTGCAGCTGCACTGTTGTGCTATGACTTAATTT:1 + chr2R 17301108 3' - G5A 2421 1 74.26 AAGTAATTTTTATTTTATAATGGTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAAAATCTTTGGTACCTTCTCCTCTCATAC:1 - chr3R 10351413 3' + blood 6930 1 72.28 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGAGAGTCCAACGGTCGACAAGTGCGTGCAATTAAAATGTAATGCACTTTTAATTCAC:1 + chr3L 2514620 3' + P-element 2821 1 61.39 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAAAAGAGAACGTAATTTTCATAATGCACAA:1 - chr3L 11105037 3' + pogo 2059 1 70.30 GTGGTTTAAGAACAAAATGTAATCTGGCAACATTTAAAATTTTAATACTACATTTATTCATTTTTAATAAAATGCTTATCAATTTCTCCTATATTTCCTTA:2 - chr2R 16159445 3' + transib2 2756 1 74.26 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTGATAGAAAAA:1 + chrX 15258350 3' - BS 34 1 62.38 CAGGATTTTTGATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCCATTGCCCAGCTTGACTCCGCCCCGCTGAGCCACGGGGTCGTACTCGCGACCGT:1 - chr2R 6753318 3' - Doc4-element 2658 1 58.42 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATTGGTCTGCGAAGCAGGGAACATG:1 - chr2L 13792173 3' + blood 350 2 53.06 GTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACCGAATATAACCCGTCCACAACATGGCATATAGTCGGGGTA:1 + chr3R 31045898 3' + INE-1 145 1 79.21 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAAAAAACAAATCTTTCTATCTCGTCCAGATATCCATTG:1 - chr3L 16478381 3' + pogo 2066 1 66.34 GAATGCAAAGCGGATTGATNTTGGTGAAGGTGGCATCTGATTGTAAGCATTTGTAACCAGTTATATTCTGCAGCATTCGGGTGAGTAGTCACGCCAGCGAT:1 + chr3R 22472993 3' - Chouto 6193 1 75.25 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCCTCCTTCGCTTGTGTGTGTGCGAGACAGCTTGTTTGCTCGTTAATTGCTTCG:1 - chr3R 13239749 3' - jockey 4786 1 57.43 GAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCTCCATCTGTTGGTAGTCGTTGTGTTAAAGATATCTTTATCTTTAAAGATATGTGATGAGAACA:1 + chrX 20996677 3' + INE-1 109 1 64.36 AAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCTGACATTAAAAATATGAACAA:1 - chr2L 18077410 3' + hobo 2884 1 77.23 TCAGGAAACAAATAAAACAAAATA:1 - chr3R 5039053 3' + G4 92 1 87.50 GTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATACCAAAGTATTATTAAATAGTTATAAAGTTATCATTGTAGAACTTTTGGTAGACGATATAATTGGTCTATGAG:1 - chr2R 19330248 3' - McClintock 5951 1 81.19 AACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGATTTGAAGCTCTCATTGACTAAATGGTACGATTGTATTTCTTAACGACGCG:1 - chr2R 6652660 3' + G2 149 1 61.05 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAGCTATACAATTTATATACTCGAACACAACACCTTGTTG:1 - chr2L 14038398 3' - 3S18 39 2 63.37 ATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACATAGAAACACACAACACCCCACACGCGTATCTTTTAAGTAG:1 - chr3L 20994185 3' + I-element 5046 1 59.41 TTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGATGCTTTCCCACGGTAGCTGTGTCCATTCGTTGAGCAGTTAACTAATACCCTTGTTGTT:1 - chrX 22897314 3' + copia 4686 1 64.36 AGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAATAGCTTATCTCCATCGTGTATCTTCATGTTTCGCGAAAACAAAAAAGGGTTTTCGAAACTCCCGACGA:1 - chr2R 17402686 3' - invader4 3 2 76.24 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTCTGAAAATACTTGAGGTATTTCACTTGAAAATTTT:1 + chr3R 20599665 3' + opus 459 2 68.32 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGCCTGAGCGAGAGAATTGAATTTTTGCAGAAGTGGCATTTTGCGCAAGAAAGTAGGCAACACAAAATGA:1 + chr2L 8504845 3' - jockey 4764 1 65.98 AATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTTCTGTGCGCGTTTGTTTGGCCTGC:1 + chrX 7294167 3' - hopper 54 1 77.00 GTGAGAGTTTTTTGCCGACGAAGCGCGTTTACTTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTGATTTA:1 - chr4 929083 3' - TAHRE 102 1 53.00 GTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCAAGCAGTGAGACAGGCAAGCGAAGTGAAAGCACGCAAGTGAAAGCGTGCTTTCGAGCACGGTGCTCAGGAGCGGGGCGC:1 + chrX 20826273 3' + BS 4819 1 48.51 ATCATTAAAAGAGCATTAAAGAGGCGCACAGATATCATAAGATAGTTTAGAAAGCATTCAAATTGCGTATGTACGTTTCACAGCTGAATGTTTGTAAATAC:1 - chrX 12538300 3' - Helena 80 1 63.37 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTCGGAGAACCTAGTAATTCCAGGAAAACGGTCAGGTACGGAACTTAAGGAGGTGTATACACTGTTAACAGCC:1 + chr3R 19449039 3' - roo 8700 2 83.17 GAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCTTTTTGTGATTTTTACTATCCATGATTTGGCATAAAAAGC:1 + chr3L 20609139 3' - Doc 319 1 60.40 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTGCAGACCGTGTCCTTTGCTCAGGGGATAAAAAGAAGAGATTGCGCAATCTC:1 + chr2R 5201004 3' + 1360 3361 1 53.47 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATTGGTCTGCGAAGCAGGGAACATGATGATGAGCGCCCATG:1 - chr2L 13792157 3' + blood 7375 2 66.34 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTGTTTGTGTCCATCTATACATATAAGTATATATAT:1 - chr3L 3413157 3' - hobo 33 1 59.57 GCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTAGTATATAAATAAGCGGATCAATTGGCAATGGCGATTGTTAGTTG:1 - chr2L 7727303 3' + gypsy5 6984 2 56.44 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAGTTTAATTTTAGAGCAGCCATCCAAAGTTCTAGAGAACACTAAAGCTAA:1 + chr2L 22155577 3' + pogo 2077 1 55.45 GCTGATATGGACGGACGGANGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 424 2 53.47 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACAACGGTAAACAAAAGGCCCATAAATTAAGGCAGAAACGA:1 - chr2L 3937721 3' + Burdock 221 2 58.42 ACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCC:1 + chrX 22383361 3' - invader1 3622 2 39.60 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAG:1 - chr3R 14049334 3' - transib2 19 1 60.40 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAACTGGCTGTGCTGACAAACGATTTCAATT:1 - chr3L 5973977 3' - 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BS3 1446 1 65.35 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGA:1 - chr3L 27357567 3' + mdg1 374 2 67.33 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTACCGATCCGGATATCGCTCCCGCCGCAAAGCTGAAAC:1 - chrX 19614917 3' + 1360 3351 1 65.35 AAATTCATCCAAATATCTCNAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCG:1 - chrX 11025526 3' - hopper 55 1 74.26 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCCCAGGCTTAGTGACGAAAGAA:1 + chr2L 13732823 3' - Doc 21 1 58.33 AAGTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTCTCGAGTCTGGCAAAAATGCTTAAATATTCACTTTCTCGGAAAATAAAGCCACTTACCTTCTCTCGCTTTCAAGT:1 - chr3R 31433871 3' - mariner2 791 1 60.40 AATATTTTAATATCTTTTAAACCAAAGCGTTTTTTTTTATTCTGCAAAATTAGTTGTATTGAATGCACACTTAAAAAATAAATAATGTTGACACTTAACG:1 - chrX 2094356 3' - Transib-N1_DM 287 1 60.00 GGGGTGCCTAGAGTACCGANTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAAGAGTCATGCCACCCAGG:1 + chr3R 11720667 3' + hobo 2892 1 81.11 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGGGCGAAGATTGAACGCAGCAACCATAGAAGAAATATAAATAAACAAGTCCTCTAAATAG:1 - 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FB 54 1 54.46 TTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGTCATGCAGGCGCCTTTTCTATCCTTTTGAGTTTAGAGTTAGAGTTTCTGCCGAACGGGGCATGTATATGATAAAAAT:1 - chr2R 5617196 3' + invader1 3638 2 65.35 AAAAATATTTATTTATTTTTTTATAAATATTTATTTGGCATAAAAGCATATCAGTAGTCAGAATTTTATTCGTGGTTAAATTGTCAAACTTCTGCTGCAT:1 - chr2R 14432830 3' - mariner2 831 1 75.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGACTGTCATCAGAGGAGAATGTGAGTTGGTATTAAAGCAAGCCAAGGAGTTAACCCGCCAAGAAGCAT:1 + chr2L 14799204 3' + hopper 1411 2 71.29 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCCAGCACCCGCGGCTTCAAAACTGTGGATCTCACCATGACGGAACACTTTTTACAACAAAGCGATTTACATTTG:1 - chr2L 8690496 3' - Tirant 8108 2 78.22 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCACATGAAGAAAGCAATTTACCAAAGCGCGAGTTCGAGCCCTCAAATTATAAGCCTCTCTCATCCAAGA:1 - chr3L 18896557 3' + P-element 2882 2 72.28 TTAGTTTTGGTGGCTAGGTAGTTTATTTGTTTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTAATTGTGTACATCAGATACATTTTTGCAGTTTTTGG:1 + chr2R 10810870 3' - Porto1 4464 1 64.36 GCTATACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACCAAAACGCAGAATTAAGTTGAAAAAGTTAAGGAAATTATGTCTGACTGTCTCTGAGTGTCGGG:1 - chr2L 8905116 3' - R1A1-element 5019 1 69.31 ACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATACGACCTCTTCAATGGGTGTGTGAGATGTGGACTGAATGGACTGAACAACAGTTT:1 - chrX 4028766 3' - invader2 15 2 64.52 AAAAATAAAATTTCTTTAATTTAATTTAATTTGAGGTGCTTTTTCAAACAATTTTAATGGATTAATGGGTTTAGGAATTTAAGTATATACATCTATCTATT:1 + chr3L 2342555 3' - HB 329 1 84.16 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGG:1 - chr3R 25950109 3' + 412 7492 2 73.00 TATTTTATTTATTTCAAAATACAATTTTGTGTAGACTGCGTTGTGCCGAGTGGTTTTTGTTTGCGGAAGGCAAATACAATTACAGATTGCGGTTAATTGTG:1 + chr3L 960812 3' - G7 1141 1 63.37 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAATAATTAAGAACTACACTAACTGCACTTTCTTTTATTCAGTTTGAGTTCA:1 + chrX 12420358 3' + jockey 4972 1 53.47 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAAATTTCATGTGAAACCCAACAAGAGGGTAGATTAGGCCCAAACCCCGTCCATGTGCAGAAAAATATATTTAT:1 - chr3R 20284697 3' + pogo 2100 1 78.22 AAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGAAAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAG:1 + chr2R 1751257 3' - INE-1 245 1 58.42 TACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGGCAAAAACAGGAAGAATGTTGTGCCCATTTGGGTGAATGCGGTTGATTATGGTCAAGAGGATAA:1 - chr3R 9159692 3' - Tirant 411 1 68.32 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAGCCTGAGCGAGAGAATTGAATTTTTGCAGAAGTGGCATTTTGCGCAAGAAAGTAGGCAACACAAAATGATCAAAAGG:1 + chr2L 8504853 3' - jockey 4760 1 71.29 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGAAAATAGGGAGGAAAAACAAAAATTCTTAACGAAAATAACTACGTAAAACCGAG:1 + chr3R 29465668 3' - 412 7074 2 58.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAGTGCCAACAAATTGTTTTGCTTTTTTAAATACAAGTTCGA:1 + chr2L 16127794 3' + roo 401 1 71.29 GGCTCGTCCAGTCCTAAATNGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATATTGTTACGATTTTTACGACCGCT:1 - chr3R 28990614 3' + flea 280 1 76.24 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAAA:1 - chr2R 8707033 3' - flea 4800 2 71.29 ATGTGATTGTTCCCAATGTNCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACAACTTGTAACTTGTGTATCTATGAGATACATTT:1 + chr3L 11657895 3' - Tabor 41 2 64.65 ACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTTCTGCAAGAGTCTAATTGAAACCTATCTGGCAG:1 + chr3R 29811344 3' + gypsy4 35 2 70.41 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAATATTTAATTACCAACACGCAG:1 + chr3R 7688956 3' - Tirant 14 2 67.33 GTGGTTATTAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATAAATTTCATTTATGTGGGTCGGTTAACAAACAAAACATGCGGTACTGGGCTGAAACCAACCCTCGAGA:1 - chr3L 23649961 3' + mariner2 194 1 66.34 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGGAGTGGGGAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGG:1 + chr3R 25514185 3' + hopper 1388 1 53.00 AGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTTTGCTAAAATATAAACCTGTTTTTCACTGGCTCACGCATTTCGGCAACAACACCGAGCACAG:1 + chr2R 10778094 3' + pogo 330 1 65.35 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGCTAACAAGT:1 - chrX 15412656 3' - hobo 11 1 68.32 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCAACGCCCACGTTTTTCAGTATTTGCCAAACACTCGAGTTT:1 - chr3R 7688869 3' + Tirant 364 2 60.40 TTTTTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAACGGAATGTTGGCTAATTTCATTCGGTTGCAAGCTTA:1 + chr3L 12879408 3' + Stalker 6779 2 62.38 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGGTATATATTATATATTAATGTGTTCGGGGAGAGGTGTGTGATTCAGGCAGTAATT:1 - chr2L 13913239 3' + HMS-Beagle2 7176 2 56.44 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAA:1 + chr2R 8232532 3' - P-element 46 1 33.66 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGCGGCTAAACAAGTTTTTCGTTTTTGAGAGCGCGAGTAAG:1 - chr3R 25208332 3' + P-element 2849 1 43.56 GGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATCAATCACCTCACAACTCTGAAAACCAC:1 - chr2L 17225216 3' - X-element 4630 1 73.27 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAACAGGCACCGCAGCAGGAACGGAGTAGGAGCTCAAGGAGGACTCTCCTCAATTCTGGCCATAG:1 + chr3L 12238923 3' + jockey 4985 1 62.38 AAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGGTAAAAAGTACGAAGAATTTCCACAGGTAAGACCTATATCTTTGTTTTT:1 - chr2R 2954974 3' + Dm88 386 1 56.44 TAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGGCTTTCCACCTCAACCCATTTGTCAGC:1 + chr2R 14450641 3' + R1A1-element 5203 1 73.00 TGCACACACACACACACACTGCCTACAAAGGGGGCGGCGCGTGGTTTCGGATGCTGCCGATTTTTAGCCAACAACTTGACATTCATGCTCGCCTGTTC:1 - chr2R 17439037 3' + accord 257 2 60.20 GAGAAAATAAAAAACACAACAACAAAAACAACAGCTCGTACTCGTGTTACTGCATTGATGGCTACACAGGGATCCAGTGCCAAACGAATTGGGACGAGTGC:1 + chr2L 2327449 3' + I-element 116 1 81.19 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACAACGGTAAACAAAAGGCCCATAAATTAAGGCAGAAACGAACCGAGATATACACGTA:1 - chr2L 3937704 3' + Burdock 238 2 58.42 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATATCAACGAT:1 - chr3L 9542506 3' + roo 9037 1 59.41 AAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCACTCAAATGCAGTTACAAAATCGAGCTAAAAAGAGACTTGCAGCGGCACATGTAAATTGCAAATTGA:1 + chr2L 1922256 3' + BS 4736 1 68.32 GTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCCGGTTAATTTCCCATCATC:1 + chrX 983395 3' - Juan 3804 1 77.08 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGATGGTGTGCTGTGTGCGCTGCGGTGGCCGAAATGTCCTTGAGCACCTTTA:1 - chrX 7759065 3' - hobo 23 1 56.00 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCG:1 + chr3R 22494753 3' - 1360 43 1 72.16 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCATTTCTATCAGCAGCCACACAAAA:1 + chr3R 8705329 3' - jockey 56 1 72.00 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACCTTCGCTGCAACCTCATTTCGTTGATGATAGTATT:1 + chr2L 4571371 3' - roo 8701 2 64.29 TTACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGATGAACGATTCAATCGAAAAGCCTGAAATGGA:1 - chr3R 9870317 3' - F-element 12 1 76.24 GGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTTAAGCCCAGTTTGTTTGCCTGTGATCGGTGTGTCCTTTATGCTCAGCTTTATCCCACTGCAAGCGTGGGCA:1 + chr3R 29160888 3' + INE-1 572 1 58.42 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGTTATTCAATCAGTTGTAAGAATTGAGTTTCATGCGG:2 + chr3L 7204098 3' - Tabor 42 2 63.37 GAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACAGCAATAGATATTTTTATGTAGCTGGGTGCAGGGATA:1 - chr2L 80893 3' + mdg3 5412 2 63.37 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAGAACTGCACTCCAAAATCAACAGCTTTGAT:1 + chr3R 26434166 3' - hobo 46 1 70.30 TAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCACCAATTGTTTTGAGGGGCTGTGCTTATGCAAATGTCGCGTTTTTATTAATTTTAATC:1 + chr3R 29763794 3' + Doc 4518 1 65.00 GGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTAGCGCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGTGGTG:1 - chr2R 21362735 3' - Tirant 6 2 75.00 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACCCAACAATATTTTCGAAAACGCTAAAAATACTCAGTTAAACGATTTTGTCTATAAAT:1 - chr2L 7804233 3' - 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pogo 3 1 75.25 TGTTCTCAATTGGGGCCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGGGGCCCTCATTGCTCTGAAATTC:1 + chr3R 28216849 3' + blood 7376 2 58.57 GGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGCTTTACAAGATTTTATTGCGACTTTTCGACTCGA:1 + chr3R 11365155 3' - Ivk 413 1 66.34 TAAATAAATAAAATAAAATATTAAATGCCACTATAAATTTGCCCAGCCAGGATTGCAGGATGCCGGGACTCAGCTGCCTGCAAGCGAAAAGGACAAACAAA:1 + chr3R 15072262 3' + G7 1148 1 61.39 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTT:1 - chr3R 6190253 3' + copia 242 1 69.31 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATTTGCGACCTTATCAATAGTGACATGCACAGGTGCTGGGTTTGATGTTGCGTCACTATCTTGGTTGTTTC:1 + chr3R 26969406 3' - FB 8 1 69.31 AAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCGCCAAATCGACGATGGCAAGACCGAAAATGAAACTGCTAACACAGGCCAAGTACACTGGGCCAAAAGCT:1 - chr3R 26433241 3' - hobo 2551 1 73.27 TAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACT:1 + chrX 21907824 3' - ZAM 232 2 60.40 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTT:1 - 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Stalker4 385 1 60.67 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCAGTGACATGGAAATGCTTTTTCAGCTGTCAATGGGAACATTTGGCGGAAGCGGGGTTATGTGGA:1 - chrX 4240652 3' + 297 6969 2 74.26 TAAGTTTCAGATTGAATTTNCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGAT:1 - chrX 22398532 3' + Gypsy6A_LTR 158 1 61.39 ATTATTATTTGTTTCATATTATAATTCGGTGATTTCGGTGTACATCACAAAAGCCCAACAGCATACTTTCTTTTTCAATTTTTTTCATTTTTATTAATTTT:1 + chr3R 5607353 3' + accord2 460 1 65.35 ACGGGTATCTGTTAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTTTCTATTGTTTTTAAATTCAAAACAAAGCCAAGCTCAATGAAAAAACGGGGCAATGGCAGCCG:1 + chr3R 23885993 3' + INE-1 554 1 58.42 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATTGGTTAAGTGTTAT:1 + chr3R 11191084 3' - hobo 25 1 53.47 ATTTGTCACAGCTTTGGCTNGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTGGGCGCCGGCGCCAGCAGCTGGAGTATACGGTGGAACTGGAGCCGG:1 - chrX 11074660 3' - gypsy4 323 2 60.40 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACAGAGTGGTGCCCTCCGCCCGCCTGCATTAGCATTTAAATGGTGGCCACATTTCC:2 - chr3L 13071958 3' - roo 8685 2 58.42 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTATTCTGCACACATTGTCATGCATGCAAAAAACAAGATACGACGCGTT:1 + chr3R 13685230 3' - Tirant 8134 2 56.00 TCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACTGTGCATCTGCATCTGCATTTTTATGTGTGTGCGGGTGCGCAG:1 + chr2L 15548812 3' + Tabor 7292 2 57.43 ACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGCTACATAACTATCAAATTGTTGCTAATTAAAAATTTGTTTTCTTCTTTTAATAATAATTTTTGTACACATCTTT:1 + chr2L 14038487 3' + 3S18 337 2 80.00 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACGACTTGAGTTTAATTCAGTCGCTAGACTTTAA:1 + chr2L 7461159 3' + roo 406 1 76.24 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTTAAGTACCACCACCAGGTGTTTTGA:1 - chr3R 11720646 3' - hobo 51 1 77.23 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATAGATTCATACATATATACGGGTTCAATTTTGTTGCATCTCAATAACGGACCAAGATAGTTT:1 - chrX 18160830 3' + 297 6968 2 73.27 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAAAGCGACATCTTTAAGAAGATCTAC:1 - chr2R 24169885 3' + roo 403 1 72.28 AGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGG:1 - chrX 6417715 3' - accord 184 2 71.43 TTCTGTATTTTCCTTTTTTTTTTACCTTACCTTTTTTTTACCTTTTACCTTTTTTTTTTGCGACTGAGATTTGCAGCACAACAACAGCAGCGACAGTTAGC:1 - chrX 13902657 3' - Doc2-element 253 1 76.24 GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGC:2 - chr3R 5773162 3' - Stalker4 6994 4 64.36 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCAGAAACACAAACACAGCAGATGTGCTGCAATAACTTTCTAACTAAGGGGTCATT:1 + chr2L 17495605 3' + Tabor 445 2 62.38 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCGACGTCATAACAATTCAGTGGGGT:1 + chr3L 8905769 3' + pogo 2053 1 75.25 AAATTTGTATGTTTTTTTTTTTGAACCCCCTTTTCTTTTATCCCCATTCTCGTGCGCCACTGTTGACACTGTTGACTCCTTTATTCCTTGCTGGTCAGCTG:1 - chr2L 13744295 3' + Tc1 1465 1 74.26 AACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGATCTCAACCTCAACCTAAGCATAATCTAAAAACCGAATATAACCCGTCCACAACATGGCATATAGTCGGG:1 + chr3R 31045895 3' + INE-1 142 1 79.21 AACTTAAAAAATAATTTCGGCTTAGCTGATGGACGAGTCATCAATTAGTCATCAAAAGTCATAATTAGAACATAATTAAATTTTTTTGTGTATGTGTACG:1 + chr2L 16077738 3' + P-element 2702 1 70.00 GCTCTTCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAAC:1 - chr2L 23506323 3' + Max-element 8333 2 67.44 AATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTACTTCCTTTCGCCTACCCGTTGCCAAATC:1 + chr3L 7999632 3' + 3S18 102 2 72.28 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACCGA:1 - chr3L 771751 3' + roo 389 2 56.00 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGGCGTCGCAGTCGACCGAGGCAGCGACGCGAGCAGAGGCGTCGGCAGAGTCAGGCCAGACAG:1 - chrX 7294103 3' + hopper 1401 1 68.32 GCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCTTTGATATATCACGAAAAACCTCAGTGGCACTGTAATATAGCTATATATCAAATTACCCTA:1 + chrX 21558388 3' + F-element 4468 1 63.37 GGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTGCCCCTTTCTTCCTTCGAACTTTTCGG:1 - chr3R 7944793 3' + blood 7154 2 69.51 TAAAAAGAAGCGGGCCAAGNTGGCTCCCTTGTGGGACACCGGTTGTGACTCTGACTTTTGCGGTCTTTAACTCTTGGCGCTGCGGCCAAATTACAACAATT:1 - chr3R 22194346 3' - Q-element 502 2 55.45 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAACTGCCAGTTCTGGGTTTGTTTGCTCAACTCCAGT:1 + chr2R 10969445 3' + mdg1 380 2 65.35 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTTGGGTGGTAACTCGCGCACTTTCTTATTTTTTCTCTACAAATTCAATTCGCATTTTCACTTAAAACTTT:1 + chr2R 24500909 3' - Tirant 25 2 54.46 ATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATCGAGTATACCCTCTTACTCTACGAATAACGGGTATATTT:1 + chr3L 27367110 3' - INE-1 56 1 83.17 GTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCGGATGTATACTGAAGACATATCCTATATAATTTATAAAATATGTAACGTTTAAAAATTGGTAGTACAATTCG:1 + chr3L 21968462 3' + Bica 61 1 56.00 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAG:1 - chr3R 19589910 3' - BS 5008 1 61.39 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAATTTTACCTCCATCTTCAGTTTTAATCCTGATAATAA:1 - chr3L 24152016 3' - roo 8703 2 67.33 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATAATTATATCCCACAAATATGGATTCTACGAAACATTT:1 + chrX 11987936 3' + 412 7505 2 67.33 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTTATTGTGAATGC:1 - chr2R 18105741 3' + roo 9048 2 53.47 TGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTCGTATTAATAGATTGGTAGATAACTGACTGGCGTTACAACAAAGTAAAA:1 + chr3L 3421719 3' - I-element 4899 1 69.31 AACAGACATGCCTCGCTCACGCCAGAAAACGTTATGCAGCGTGGCTTACATTGTCAGCGCGGCATTCATATGTGTATTTTGATACTGGGCACGGAAGTGGT:1 + chr3R 22448737 3' + invader1 3939 2 68.32 GAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGATGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCG:1 + chr3R 2533950 3' + gypsy8 165 2 53.68 ATACAAGGCGATAATAAAATCAATATAGAATAGAACTCTGGGGAACTTCCGTAGGAAGCAGAATCTCAAGTTGGGCAGATAGTTCACGAAAACGATGGTCA:1 - chrX 17691282 3' + Porto1 4244 1 60.40 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTACCGATCCGGATATCGCTCCCGCCGCAA:1 - chrX 19614926 3' + 1360 3370 1 64.38 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGACAGCGGCAGTGGC:1 - chr2R 13194630 3' - roo 8705 2 68.32 GCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTTATTTGTGTTTGTTATTGATTTTCTGCTCACTTCAAACTCCA:1 + chr3L 1882148 3' - R1A1-element 389 1 57.43 AGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATA:1 + chr3L 7319825 3' - 1360 3227 1 70.00 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCAT:1 + chr3L 24766010 3' + 1360 3387 2 77.23 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTNAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATTTCATAAAATTTGTATCTTTCTGCTGGAG:1 + chr3R 18521113 3' - opus 7152 4 72.28 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGAAACGACTCTGCCAAAAAGGACGCACATTGGG:1 - chr3L 14690931 3' - roo 8707 2 70.30 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGG:1 - chrX 11025509 3' - hopper 34 1 63.92 TATGAGGGAACTGTGAAGATTACAGAGATAAGGTAAACACTTTCTTGGAAGAGCTGACTAAGTGTTTTAAGTGCAACTAGATATCGATAACACTATTTCAT:1 + chr2L 21268452 3' - Q-element 25 2 67.33 TTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGAATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATTTGCATGTTGTGTTTCTT:1 + chr3L 13340702 3' + R2-element 3363 1 80.00 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGCCCCGAAAAGGGCGCTCGGGATTTTTG:1 - chrX 20377106 3' - hopper 45 1 69.31 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGA:1 + chr3R 26342981 3' - blood 49 2 73.27 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACAACAGACACGCAGAGGGCGACAAACTCGCATTTCCAGACTTGTCGGCGCGACTTTCTGGCCACAGA:1 + chr2L 19997285 3' + roo 397 1 66.34 GCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCCTTAATTACTTTTCGAAGAGCCCTTTTT:1 - chr3R 22507480 3' + 412 96 2 72.28 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTNAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGCCATTTGATTCGCTCTTCTTCGGTTGAAATCTGCAAAA:1 + chr3L 10683508 3' - opus 36 4 61.39 GTCTCGATCTCAGGAACTATAAAAGCTACGAGGTTGAGATTAAGAATACAGATTCTAGAGACAAGAGTGACATTTTTATATTTTATATTTTTTATGATAAA:1 + chr3L 18645521 3' + INE-1 145 1 62.38 TGCTCAGGTTTTATAACCTGACAACAATATTTATAACAACGACAATTAAATTGTATAGAACATTTCAATGTTTTTGATAGTTAGCTAAGTTTAGTTTCAAA:1 - chrX 12147887 3' - Cr1a 475 1 74.26 GTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTATTTTACAGATTGTGGGCTCATCAGATAGGGCATAA:1 - chr3R 22066722 3' + Stalker2 250 2 69.31 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGTTGTCGTTTCGTTTTGTTGTTTTCATATCAGCATAAAATTTCATGCTG:1 + chr2L 15909902 3' + Tirant 8480 2 54.46 ACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTTACTACTTAAATTTCTTCAATACTTCCAATACAGCTATTTTTTTACAGTTTTTATGGTAGCACATCG:1 + chr2R 4578525 3' - Chouto 313 2 64.36 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTGTGCGTGTTTTCATGTACAC:1 - chrX 10547640 3' + P-element 2875 1 68.32 ATATTTGTATTATTTTTTTTTTATTTTTTAGTAATTTCCCATTTCATAAGAATGTAAGACATAACTTGCCACCTCTATTGCACGGGTGAAAATTGTACTTT:1 + chr3R 14769772 3' + BS3 1656 2 70.30 GTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCCCAGACAGAATCGAAGCAGCTGATGTTGCTTCTCTTGGCCACACAACTTCAACTCTTT:1 + chr3L 17199882 3' + Doc 484 1 64.36 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAGTCCGATGAAAGGATCACTTTCGCTGAAACTTCTCGAGTGGAACGACAAG:1 - chr3R 11498587 3' + BS 5070 1 49.50 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTTGCCACTGC:1 - chr3R 20345105 3' - transib2 23 1 60.49 GCTAACTATCGAAGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATTCAAAAGTACTAACTTTGTTATTTCATCCAAGAAATCA:1 - chr3R 18555205 3' - pogo 13 1 43.56 GGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGAGCAAGATTAAGTGCTTTCATTTGCCTTCGCTTGAAAAATGATGCAGCCCTGAAGTCCTGCAACCG:1 + chr2R 16462721 3' - R2-element 3198 1 74.26 GTGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTTCAGGTT:1 + chr2L 3960226 3' - Quasimodo 29 2 73.27 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCCACAAAAACAACGCCGATCTCGCCCGTTTGTCACGCACAC:1 + chr3R 6437564 3' - 412 37 2 60.40 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTG:1 + chr3L 153627 3' + 1360 3335 1 79.21 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATACATATTTCCATAACACACTGCAATCTACTTTTAATGGCCCCTTGGAG:1 + chrX 6058243 3' - roo 28 2 54.46 TTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACACACCAGCCCAGCCTTAAATTTGTGTTGAGCTCACATCGTTAAAATATCCGTCAAAAACT:1 - chr3R 28563558 3' + Doc3-element 4550 1 60.40 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTG:1 - chrX 21400803 3' - P-element 58 1 22.00 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATT:1 - chrX 7534648 3' + Tirant 354 2 71.29 GAAATTGTAATAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCAGCTAAACTTAATCAATAGGTTTTTATCTATCTTTAGTAAGAAAAATCG:1 - chrX 16237906 3' + mdg3 226 2 47.62 ACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGATGAAATTTTTTGTGCTTATCCGGTATCTATGAGAATCG:1 + chr2R 4848680 3' - HMS-Beagle2 6865 1 64.29 GGTCGGTTGTGCGGAAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAGAGAGATGAACGCACCAAAACCTGACACAGATTAAACGCTCAACTATAAATTCCAAC:1 - chr2L 7312438 3' + Cr1a 4424 1 64.36 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATG:1 + chr3R 11151880 3' - mdg3 43 2 67.33 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAAAAGAGAACGTAATTTTCATAATGCACAATTACAGGGTATCTCTTGAATGCAAGCTTAAT:1 - chr3L 11105006 3' + pogo 2090 1 65.35 GACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACG:1 - chr2R 6769450 3' + 412 7511 2 56.44 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCC:1 + chr2R 18988463 3' - hobo 55 1 76.24 TAATATTATTCTTATTATTCTTAAATATTAAGAATAAATAGATAAGCTTATTCAAAATGTTTAGCAAAATAAGCATATTTCTTTATCTGCATTCATCCCTT:1 - chr3L 17177071 3' - mdg1 7072 2 59.41 ATGCAGCCACATGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAAATGTTAGGAAATGTACAATTTGTCATGGTTTTGTATTGCCTAATTAATTGATTGTTTTATA:1 - chr2L 16878884 3' + hopper2 1431 2 70.30 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCATTTGGCCAAGATGGGGGGGTAAAGTACTTGTATAAGTACTCG:1 + chrX 15412742 3' + hobo 2937 1 60.00 ATATCTATCGAAATCCCAGAAAATTTATGAAATTTCGCTTTCTCATTTTCACTAGCTGAGAAACGGGTATCTGTTAATCGTGCTCTCACTTCGAGTTCCAT:1 + chr3L 17278080 3' + INE-1 498 1 77.23 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTG:1 + chr3R 9825168 3' - Doc 48 1 66.34 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTGGCGGGTGTCATTAATAAATTAAGAGCTCGGCCCAGTTGGTTCTATTAAGTTAACA:1 - 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jockey 4798 1 60.40 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAAATTTCATGTGAAACCCAACAAGAGGGTAGATTAGGCCCAAAC:1 - chr3R 20284726 3' + pogo 2071 1 57.43 TCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATCTAAATCGGTCTCTTTCGCCGGTGGCTTTGCTGTCCGACAACTGGAAATGGAGTCGCCGAGGGAATAGGGAC:1 - chr2R 23454281 3' + jockey 4898 1 73.27 GCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCATTTTGACATTTGAGGTATCCTGCGCAATTATTAGGATCTAATTTATGCTGTCCTTCTCT:1 - chr3R 27002438 3' - R1A1-element 209 1 65.35 ATGATTCGCCTCTGGCAGGACACCAGATGCCTCATGGCAGAGCTGGGTCCATCATACCAGACCAATTCTACATATTAATATTGCACATTAGAGTTGAAATA:1 - chr2R 15104206 3' - R1-2 3132 1 67.33 AATTAATATTATGAGTTAANTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAAGGGCGAGGCGACACTTTTGTGGAATTGCTAATTTGCTTAAAGTCAGCCTTTC:1 - chr3L 3885201 3' + P-element 2724 1 60.40 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGTCACGTTTTGATCCACTTTTCGGCCTAATTCATAC:1 + chrX 6075274 3' + P-element 2846 1 38.61 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGTTAACATAATAGCACTGTCACTTCGAT:1 - 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chrX 8982943 3' + 412 437 2 76.24 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTATATGTTTGTGTAGGCTCACGTATGCCCC:1 - chr2L 15848236 3' - hopper 43 1 67.33 TATGTATATATGTATATATAAGACTTGATCTCGCCATGCGTCGCTGCAGCCTCAAATGACGAAATCATTGGATGGGTTGGACAGGTGTCCGGGTGTCCACA:1 + chrX 14533350 3' + G3 4508 2 61.39 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTTATTTTCATTAGTGTAGGGTAC:1 - chr2L 15817990 3' - I-element 55 1 77.23 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCGCTCCATCCCGCTCGCACGATT:1 - chr3L 5206570 3' - roo 53 2 78.22 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGGCGTAGGATGTCACCTGAAAACGATATTCTTAGTTAGT:1 + chr2R 23939366 3' - 1360 52 1 72.28 AAATGCGAACGAAAGACAACATGGGTGGGGGCTGAAAGGCAAGGCTAGCATAATAATAATAAGAAACAGAACCAACAACAGCAATTAAAATGGC:1 + chrX 11180246 3' + HMS-Beagle 292 1 76.60 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAA:1 - chrX 2164281 3' + mdg1 398 2 48.51 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACAC:1 - chr2L 17549307 3' + mdg1 7415 2 67.33 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGCAGGCGGCCCTGAGAACGCGGCCTGCAGGCACTTCACATCACTCAACAGGGGCG:1 - chr2R 5813563 3' - HMS-Beagle 18 2 61.39 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTCTGAAATTCCATTGCTC:1 + chr3R 28216857 3' + blood 7354 2 67.00 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTATGTAAAACACTATATATTTGACATAGGAAAAGT:1 + chr3L 19569225 3' - BS 39 1 68.32 GCCGACCGCGAATTTTTTATTAACTCACGGGAGTTTCTTCGGCACTAATTTTACCATTATTATTAATTTTTTTGCCAAACTGATATGTACTTATATATGTC:1 + chr2L 15162544 3' - HMS-Beagle2 457 1 60.40 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTATGGCCGAAAGTGCTCAGGTTCGTTTCGAACAAGTGTACAAATTACAAATTGGTTTTTGTC:1 - chr2R 22898707 3' - Transpac 12 2 68.32 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTAGGGTCAGTGGAAGGCCAAGGAAATATTGGGAATTTCACAGAGAGAAAGCAGGACGCGACGGTTGTTTGC:1 + chrX 22774852 3' + opus 7499 2 75.25 TCGAGGCATTGTGCAAAGTNCTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCTAAATTTCATGTGAAACCCAACAAGAGGGTAGATTAGGCCCAAACCCCG:1 - 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chr2R 15576486 3' - R2-element 3283 1 57.43 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGATGTCCTTAACATCTGCATTTAAATGTGGTGGAGAAGAGTAAT:1 - chr3R 14980462 3' + 412 7531 2 63.37 AGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTC:1 - chr2R 12185338 3' + accord 7346 2 64.36 AGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGATTGCTGAACTCTAGGAGCCACTAGCGGAGTTCTTTTTTTGGATGGCTTTTCGTTTGATCTTTCGA:1 + chr3R 15792279 3' - Quasimodo 388 2 70.30 TGAATTCGCAATTAAATAATTAAGTTGCTATCTAAATTATTCAACAACGGTCGAGGCACTGCTAAACTCAAATTTGTTTTAAATGGTTTAAGATGTCAATT:1 - chr3L 8085975 3' + invader4 2628 1 69.31 TTTAGAACTTGCTATTCGTGGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTA:1 + chr3L 455621 3' - Doc 48 1 70.30 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGTAGCGGGGATCGTCCCTCAAGGTCCTGTACGTAATTAAGGAGTGGGCGCAGGATTCCCCCAACCATGGTC:1 + chr3R 13205848 3' - hopper 4 2 75.00 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAGTGCAAA:1 + chr3L 153649 3' + 1360 3357 1 58.42 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAAT:1 - 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chr2L 17549312 3' + mdg1 372 2 72.28 GTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCT:1 + chrX 21907803 3' - ZAM 253 2 64.36 GATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGTTCGAAGAGCCAAAAGGAGCATATTGGGCCTTCAATGAAGCTCTCTAGCTAAAGCGAATTTTGTATTCC:1 - chr2L 14880324 3' - INE-1 80 1 69.31 TGAGTCCTGACGAAGAGCGNAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAACGCGTTACATCTTTTGGACCAAGGCAACTATTTACTATTTGGGCAGACA:1 - chrX 22771500 3' - opus 18 2 61.39 AAATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTGCGCGTTTGTTTGGCCTGC:1 + chrX 7294167 3' - hopper 55 1 73.27 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGACCAAAGAGCGTAACCGAAAGCTGGCTAAAGAGCCGCAACAACTTTTGCAAATCAATATTAATTGCTC:1 + chr3R 7411899 3' + 1360 3382 2 76.24 TTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAATACTCTGCCTGCTGCCAAGTACAACCAGAAGCTTGAAAACTATTACAATAATTTTTATAT:1 - chr3R 25844286 3' + Stalker4 392 1 60.40 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGC:1 - chr3R 9870365 3' - F-element 60 1 71.29 TGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCCAGAGTGTGCTTGTCATGCTGAACGGTTGACAGGCTGGGCAACTTGAA:1 + chr2L 20609314 3' + copia 467 1 60.40 GAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCACGGGTAAAAGTGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGACTAGGTTCAATAGAATGGTGTACCATAAACAAAAAGTAT:1 - chr2R 15198733 3' + invader1 3712 2 61.39 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACGAGCTTTTGAGCTTTGGAAATGCACTTTGAAAAATTCCAAAGCAGCAAGC:1 + chr2R 22666065 3' + pogo 2080 1 58.42 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGGCATTCACATTTTCAAACTTCAAGTGCGACAGCAACTTCAAGAAGCAATCCAATTAATCGGCT:1 - chr3R 31473955 3' - roo 14 2 64.36 ACAAATACATATACATACATATATATACTTTCTTGAAGGACGCAGCAAAAT:1 + chr3L 10084855 3' - 1731 4413 1 92.16 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTG:1 + chr3L 23871311 3' - Doc 44 1 61.39 AATTTTTTTATTTTTTTTATTTTAAATGTTTTTTAACTCACCGCGTAAACAGACTATCGATCTGTTCATCAAGACTCAGCTAATAAATTTTGCTATGAACT:1 + chr2L 7535395 3' - HB 321 2 78.22 TGTTTGGTCGAGTCTGGTCNAATTTGGGTGAGCTTAGTCATTAGCCCGCCGGCATTGTGAAGGGTATTTAAACGGCTCTCAAATTTGTAAAGGGGATTAGC:1 - chr3R 20138456 3' - I-element 4913 1 74.26 ACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATATTCT:1 - chr3R 4434023 3' - Juan 49 1 74.26 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCATTTCTATCAGCAGCCACACAAAAACTAATTCCACATAATGTGCCAATCTACA:1 + chr3R 8705358 3' - jockey 27 1 58.42 AATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGGCGTTGATGGAACTGTGGAATCGGAACGCATTCGATG:1 + chrX 2656247 3' + F-element 4244 1 62.63 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCCCATGAGAACTCGACTGATAGACTCGA:1 - chrX 5452530 3' - mdg3 5261 1 66.67 TACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAAT:1 + chr2L 12199524 3' - Stalker2 28 2 53.47 TCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATTCAATGAGCTACTGCCTGCCTGCCTGCTGTCTCATCATGACCCATTACCATTATGATTGCTGTTA:1 - chr3R 14915936 3' - 1360 216 1 68.32 AACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATAATCAAATT:1 - chr2L 12779575 3' + flea 5010 2 64.36 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTTGCTGTGTAAGCCGTATTTAATTAATTTGA:1 + chr3R 20872785 3' - copia 23 2 54.46 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTGGCTGGGGCATGTTCTGCGGG:2 - chr3R 12937430 3' + roo 9032 1 69.31 ATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACAGCAGCTGTGCCCGATGCGAGGG:1 - chr2L 14799123 3' + hopper 1376 1 66.30 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAACATGCATTTACACACAAAGGACATGC:1 - chrX 17873186 3' - 412 48 2 74.26 GGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGGTTTATCAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATTATTAGTGT:1 + chr3L 13905027 3' - Cr1a 4378 1 78.00 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGATTTTCCTG:1 - chr2L 4110931 3' - Doc 18 1 64.36 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTGGTTGCAGGATCGCGGGGAATTGGAATTC:1 - chr2L 15479565 3' + blood 7345 2 72.45 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCATTCTC:1 - chr2L 20271213 3' - blood 34 2 58.42 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCACAATACAATCGCTTATACGCCATGTTGCACCGGTACAACAAAGTGGGACATGCAACAG:1 - chr3L 3490001 3' + jockey 4964 1 58.42 GATAAAATAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTGTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAACCGTACCCATGATATTAGCTGTATC:1 - chr2R 11218797 3' - 1360 3095 1 75.25 TAACAAGAATAATAATAATATGTTGGCAGCATAATGCACAAACATTTACTAATTACGTAACATTCAAAATGTCGGCAAAGAAGGTGAGGCGCTTACTTAAT:1 - chr2L 18177365 3' + mdg1 33 2 69.31 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTACATATGTATACACATATGAACACGCAGCTGGTAAACAAATTAGTGTGCAAATTTGAGGCCCATTGTTCGATG:1 - chr3R 15546980 3' + pogo 2094 1 74.26 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAAGATTGACTCATGCGCAAAACAAATTTATGGCGCAATTGTGAACGGAAA:1 + chr2R 20461032 3' - hobo 27 1 52.48 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGNTGCAGTTCTCTGGTTTAAACATTAAAAGGACCGTTAGATACGCCTTAAAGTATGCTTCAAGTAGATTATCTTCCATCAGTT:1 - chrX 12378667 3' + hobo 2928 1 66.34 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTTCCAACAAAAACAAAAACCACACTGAC:1 + chr3L 11257403 3' + 1360 3385 2 64.94 GTATATGTGTGCGTGTCGTGCTAGAAGGCGATCAATAATTTATTGCGACATGGGAAGGGGGTAAACATTAATTAAACACACAGACGAAAACGTAATTCATC:1 + chr3R 25389665 3' - 1360 3213 1 76.24 AGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCTGGCAAAAGTTTTGTGCCGTCACTCGAGCCGTGGAGTCTGGGACGATTTAAGTT:1 - chr3R 27851436 3' - Max-element 70 2 60.40 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACGGATTGTGCAGAGGGTTAAGGGTTTCAGCGGGTTAAGGCGTACTTTCCCCTGATTCGCTTTTA:1 - chrX 16982348 3' - jockey 4750 1 64.36 ATTGAGTTAAGGCGCTCTGAAAAATGTGTCCCTTTAAAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTAAAGATCATCATGAAGAATT:2 - chr2R 4802901 3' - mariner2 522 1 74.26 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTGTAACTTTTATTATTGTTTAATTTCACATAGTTACGATCTCTTAACTTT:1 - chr2L 3475261 3' - roo 8690 2 59.41 CTAATGAATTTTAAAACTANGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACATTGAAT:1 + chrX 3691561 3' - jockey 4803 1 68.32 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCATCCTCTAGCTGGATTCTATGGACGTGAGCAGCAAAC:1 + chr3L 5255974 3' - jockey 63 1 63.37 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCCAGTTCGAAGGGACGGCCAGCTAATTTGATTTGCCTTTTTAGCG:1 + chr2L 953376 3' - Tirant 27 2 71.29 AGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGG:1 + chr3R 9613474 3' + invader3 5410 2 74.26 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCCTTTCCAAGCCGATGGATTGTCCTTGGCCAGGATCATTCTCGCCGGTCGTCTTGGCC:1 + chr3R 7246475 3' - Max-element 67 2 61.39 AAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTTTTTTGTCTGTTTTAGTTGGTTATGTGTCCT:1 + chr3R 10774551 3' - 297 6503 1 69.31 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTCTAAAAATGAAAACAAA:1 + chr3R 26343018 3' - blood 8 2 70.10 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTTATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAACG:1 + chr3R 17896959 3' - jockey 4764 1 75.25 GAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGCGCGTAGATGGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 1 1 48.51 ATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGGCCTTTTCTCCTCCGCCTTTTAGGCCGCCCCTAATCGGAATTTT:1 - chr3L 16466252 3' + hopper 143 7 82.09 TTTAATTTTGTTAAAGAAAAAATCACTTATATTTTCCTGGTCCTTTCTCTTCGGTAGCATTTTGCTATGTTTTCTATAGCAGCAGTGGAAATAC:1 - chr2L 21909315 3' + Ivk 5375 1 67.02 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCAGCATTTGCCGCACTTCCAGCGACACTTCCAGCAGCATTTGCAGCATCATGCGCAACATCTCCAGCA:1 - chr3R 30252254 3' + 412 486 2 71.29 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGG:1 - chrX 5452558 3' - mdg3 39 2 61.39 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGGGGGTATGCTCTGCACACACTTATGACAAAACCAGATGGAAGCTAAACCGCATTT:1 + chr3R 19963463 3' - 1360 20 1 46.53 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTGCCTCGTATTTTTGAGTTGTGTTTTTGAGTTAGCAAGTCCTTGACAATGACATGTTCATGGCTTT:1 + chrX 13012183 3' + hobo 2930 1 68.32 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATACCAACCCGATTCGATTGCAATTAACCATCTTAAAAT:1 - chr3R 29157496 3' - pogo 34 1 59.41 ATAATAATAACAACATCAGAACACACAAACACACGTAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGGGGACCAGATCAACAACCTTT:1 + chr2L 14674654 3' + G4 3664 1 74.75 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTAAGTGATTACATAAGATAGGCGTAAACTTCTTTGC:1 + chr2L 15907241 3' - pogo 11 1 68.32 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACCCCAGTC:1 - chr3R 30611220 3' + blood 363 2 66.34 AAGCACTCAACAATCATTGCCCAAATAATTTTTCACACGCCGTAAGATGAATACTCTAATGATATAAATATTCTTATATAAAGTCAATTTTTAAATTTATT:1 - chr2R 5260086 3' - 1360 450 1 87.13 AACTGTAATTATTAACTTATACATAATAG:1 + chr2R 19122630 3' + HMS-Beagle2 7199 1 89.66 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTGTATGGAAAGTCGAGGCGTGACAACAACAAAGGAAGCGGCTAACACGCGCCAAGAAAGC:1 - chr3R 8050402 3' - 297 6590 2 71.29 AATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTTATTGTCACGTCTCCGCCTGCCAACTTTGTGCCTGTTCAGCTAAATGCTGTTAAACTTTCATCTTGGGCT:1 - chr3R 11941922 3' + gypsy2 6735 2 56.44 TTAGATTTACAAATAAATAAAACGTACGACAAACGAATTCTAGTTATACAATATACATACGAAAATTGAAATATGAACTGCTACGATGTGAGTTTTGTGAA:1 - chr2R 14907474 3' + G3 4485 1 62.38 TGAGTAACGGGTTCCTGATAGTCGGGGAATTCGGCTATATAATAAGTCTGATATTAGATCAGATAAAAAAAGAAAGAAAAAAAACAGATAAGAAATGCAAA:1 + chr2R 14871476 3' + INE-1 548 1 66.34 AACTGTAAATTATTGGAATTTTGTATCAATTTGTAGATTCTGCAATCTCAATTACCTAGGCAAAAAACTTTCTCAGGGCGTTACCCAGATACAGTGACTCC:1 - chr3R 15930662 3' + HB 1576 1 74.26 AATAATAAAGCAAAATAGANCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTATGTAAAACACTATATATTTGACATAG:1 + chr3L 19569218 3' - BS 46 1 74.26 TACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCTTACATTGATCATTTCTTATCAAAGAATGTGATGTTCAGAAAATA:1 + chr3R 9462344 3' + Cr1a 4318 1 58.42 GTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTTATTAAGCGAGAGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTAAATGATTTAGCTTGCTTATG:1 - chr2R 24290766 3' - mdg1 7416 2 76.24 AAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGTCTGCCATGTAGGAAATCGAGTTGGGGCAGGCGACCAGGTGCCCTGAAACTGTGAAAAGTTCATTAGTTAC:1 + chr2L 16981030 3' + Tirant 133 2 50.50 ATATTGAAAATAGATGTTAAGCCGATGCCACGACAACGAAATCTTCAGACAATGGCCGAAAAGTGTAAACAATTAAATTTTAATTTGAATTCGCATCGCTT:1 - chrX 15218754 3' + Bari1 1430 1 67.33 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACA:1 + chr2L 15907201 3' - pogo 46 1 76.04 GTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGGTGCTAGCTCCTGGACAGGCATTAA:1 - chr3L 16792516 3' - Chimpo 4007 1 75.25 TGATTTGTTTAGAGGCGTGNGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGC:1 - chr3R 16594470 3' - Tirant 8133 2 55.45 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATAAAACCCATCTCATATTTGTTTAGTTCTGATGGCCCAACAGATGAGCACAAATC:1 - chr2L 8007813 3' - copia 4890 2 58.42 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACACTAAGCGCACTACCAGCTCTTCATCTCACAGTTCTTCT:1 + chr3R 26799005 3' - P-element 35 1 42.57 GATCTGGTGCAGGCTGCTACCGCTGCTCTTGCTTCTCGAAATGGCCGCCGATCCGTACACCTTGTTCTCCA:1 - chrX 5985513 3' - gtwin 423 2 91.55 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAACACACTCGTGAGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 29095469 3' - Tirant 8125 2 59.41 TTTAATTTATAATAAATAAAAAAAGTTAAATAAACGCTGATGATTGCGTAGGCAACAAAGAAATTATTGCTTGGACTTCTTATAAAATCTTTCACAACTGA:1 - chr2R 18378265 3' - INE-1 423 1 90.10 GGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGCGACAGTGTCGTTTGAGATTTTGACGTT:1 - chr3R 6437481 3' + 412 7534 2 64.00 AAATATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACGTTAAACTGTCTTGATCTATCTCCGCATAGTTTACTACCTCTACCAAGCTCTGTC:1 + chr3L 27412381 3' - hopper2 1559 1 51.49 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTGATCCACTGTATTC:1 + chrX 15268311 3' - roo 26 2 53.47 AATAAATAAAAAAAAATATATGTAGAGGGAGGAAACGACAGATTCCCGGAGGGACAAAAGGCACAACGGAAGTGGTAGGCGAGAGGGGAGGCGAAACTTCT:1 - chrX 5110701 3' + G7 1150 1 68.32 TGGTTGTGACCAACGTAAGGTCCCGAAATTGTTAATATTTTCAAAAAAGTGAGTTTCGTTTAGTTAATTTGCCCACTGAACCGGGGATGGCGCGAAGTGGA:1 - chr2R 20922102 3' + HB 231 1 66.34 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCAAACATTACTGCATTGGCCAAATATCTATTTCGTGAGAGCACTGGCCGTGCATCAA:1 - chr3R 28216780 3' - blood 19 2 58.42 AAAACTCAACGAGTAAAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGTCATGCAATCGAACTCCATATACGAGGATCATATCAACGATCTGATCCATCGGGTTC:1 - chr3L 9542490 3' + roo 390 2 58.42 TGTAACAGGCAGAAGGAATNGTTTCCGACTTGATCATGATCAATAGCCGAGTCGAATATTGTAAAGTGGAAGTGCGGGGCACTGTGCTCCTCTGTTATGAT:1 + chrX 22759754 3' + INE-1 31 1 53.47 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTGCTGGTATAGGCTGATTTTGAAGTATCTGTAAGATTTAGGGCCTCTTGTCTTCGTCGATGCCCGCT:1 - chr3L 5808141 3' - 297 6587 2 72.28 TTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAATTCCTTGCTCGCAACGCTAAATGCAATTAAAACTACAAGATGTTGATTACATTAGAAGTGCAG:1 + chrX 14658773 3' - X-element 22 1 56.44 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAAATGCATATACAAGATATAACG:1 + chr3R 19931659 3' - jockey 4723 1 77.23 AAAAATAATTTCGTCTAATNAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTTTTCATTTCATGTATTTAA:1 + chr2R 15196307 3' + P-element 2708 1 22.77 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCCGTGGAAAAGAAAATGCAACGTAAAAATGC:1 + chr3R 12906589 3' + hopper 1372 1 71.29 CTGTTTATTCGAATGATCANAGTGTGCTGAAGTTGGCTGGACAAGCCATTAAAGGAAGGTCGCCTCACTGCACACCGACAGCACAACCTTGGGGCTATGCC:1 - chr3L 7600757 3' - Stalker4 7286 4 64.36 ATTGTCACACTTTTTTAAGACAGATTGTAAAGATAAGGAGAAAAAAAAATTATTATGATTTACGTCGACACATCCACGATATTCTCAAAGTGAAAATAATG:1 + chrX 20385822 3' + G4 3820 1 46.53 GAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAACACTTGTTATAGTTGGGGTTTTGCCGTTTCATTATTTTTTTAACTTCAGTTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGT:1 - chrX 12950303 3' + F-element 4586 1 67.33 GGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCGCTTCTTCTGGGTTGTAGCCCGAGCCTGTCGGCCAACTGATCCTCCTCCAATGCT:1 - chr3R 6440081 3' - 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chrX 13046279 3' - gypsy7 5009 2 78.43 AATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAATAAAATTGATTTATCCCATGGCCAGTGCGTCTG:1 + chrX 18706938 3' + I-element 5309 1 69.31 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTCATTTGGAATTTTTCTAAGCTGCATTGAAAACATCCTTCTGGGGATACCTGGTGTATTGTCATATTTAG:1 + chr2R 4550681 3' + roo 9045 1 63.37 TGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAATTCAAA:1 + chr3R 25271726 3' + invader4 3047 2 65.35 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAA:1 - chr3R 4536199 3' - Ivk 17 1 54.79 CTACATACTAATACACTTACAACATATACATCCCAATACAACATACATTATTCCTTCTGTCGTTGTGGGTGCATTTGTAGTGGTCGATATATTATCAGTGG:1 + chr2L 14162244 3' + Idefix 39 2 53.47 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACAAAAGCTTATTTCCAAGTTTTGCAATCTTTCCAACGAAATCGAGACCAAAACAAATT:1 + chr3R 10434633 3' - 1360 20 1 59.00 GCTCAGATTTGGCAAGTTGNGCAGGATGCATGGGCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCTCTCGACTCCCAAGTGTAGTTTATAG:1 - chr3L 22452215 3' + HB 1219 1 73.27 ATAATCGTTGTCAACCCTAGAGCCGAGTGTCCGTCTGTGTAGAGTAGTGCATATTTGTTCTTGATATATATTTGTTTATATCAGTGCGGTTGAAGTTTGAG:1 + chrX 21084220 3' - rooA 7139 1 38.61 AAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCGTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCGTGCTCCATTCCCCACA:1 - chr3L 11657825 3' + Tabor 465 2 56.44 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTTTAATTACTTTCACCTTCATCAGATATATA:1 - chr3L 17146820 3' + pogo 2057 1 72.00 GTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGAAACGAGAGGGAACTATAATGTAATGGAAGAGTTTTGGGTTAATTTCTGTTTGCTCATATTTGTTG:1 - chrX 12697444 3' - F-element 4429 1 68.37 ATCCAAATATGGGGAACAGCCTCCAAACACCAACTGGAGAGGCTGAAAACTATTCAAACAAGTGCTGCTCGACGTGCGTTAGGGC:1 - chr3L 24120317 3' + G5A 2440 1 75.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTGGCTGGGGC:1 - chr3R 12937442 3' + roo 356 2 81.19 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTGTAAAAGATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACAT:1 + chr2R 24169992 3' - roo 8684 2 60.40 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATTCATTCTTTTTTTAAATTCTTTGCAATTATTCGGTTCA:1 - chr3L 15831250 3' + 412 454 2 62.38 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAAATGTCAAAAAAATGAAATCAAGCTA:1 - chr2L 22052505 3' - flea 47 2 78.22 TTTTTTATTTTTTTTCTTTTTTTGTATCTGTAAAAAGTGCAAAATGTTTGATTTATTATCTAAACTACATCAGGTCTAAATTTCCAGGCTTAAATGGACAA:1 - chrX 19022715 3' - BS 5105 104 67.33 TAGAATTTTTATTTAATTTTAAGTATTGAATTCTTCTGTGACTTTTTAGATAAAAAATAACACATTAATACATTTAATGTATAACGAACGTACATAATTAC:1 + chr2R 14799941 3' + Rt1b 121 1 75.25 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACAACGGTAAACAAAAGGCCCATAAATTAAGGCAGAAACGAACCG:1 - chr2L 3937717 3' + Burdock 225 2 54.46 TAAGCAAAACAATTAAAAGCTACAACGCAACAGAAAAAGACAAAAAAAAAAACAAACATCCAAGTTTTAAAGTTCGTAAGATTGAACAAAATGGCG:1 + chr2L 6000141 3' + Doc4-element 388 1 56.25 TAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAACAAACAAGTATATCTATTACTGAAATCCTACAACTCTTCTTGTTTTTGAAATGAAACT:1 + chr2R 17402802 3' + invader4 3071 2 66.00 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCCAAGCAGCGACGTCGAGGGCAAAAATCGTGTGT:1 + chr2L 3889387 3' + jockey 4941 1 67.33 CTCAAGATATGAACAAAGCAAAGGCGACTGCGCTGAGCAGTGCAGTCGCCTTTCTTTGTTCATCTTTTAATTATAAAGTGCGATAAATGTGACACAAA:1 - chrX 14632465 3' + 1360 489 1 71.43 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGGTCGTCGTAAAGTCTCCATGAGGGGGAAGAG:1 - chr2L 15548756 3' - Tabor 42 2 65.31 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACAACAGACACGCAGAGGGCGACAAACTCGCAT:1 + chr2L 19997250 3' + roo 9025 2 66.34 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCGCGTTGTTGTGACATTAATTTTTACTTAATTTATTTTTGCGCCGTCGCAAAAGCATTCCTCCTC:1 + chr2L 14054818 3' - F-element 21 1 64.00 TTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGAGAAAGTTTCCGGAGGCAAAAACCAGCGTGTCTGAATCCACAAGG:1 - chr2L 4958672 3' - jockey 218 1 60.40 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAGTGCCAACAAATTGTTTTGCTTTTTTAAATACAAGTTCGAATTC:1 + chr2L 16127798 3' + roo 405 1 75.25 TATCGAGAAACTTATCGACNAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTGCATTTTGCACCCGAGCATTTTCTA:1 + chr3L 13367093 3' + mdg3 5372 2 74.00 GATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGCGTAGGATTGCCGCAGGAGAGCCGGGCTAATGTGTCTTGTAATTTGCATGGC:1 + chrX 13923734 3' - 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chr3R 5213197 3' - G2 3047 1 51.49 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGGATGCCTCTCTGTCGCTCTGCATCGGCA:1 + chrX 1714028 3' + hobo 2892 1 70.30 TGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAGATGGGTCAACAAACTTCCGCTGCTAATCTTGTATGGCCAAAGCCAATTTTGGGGTTTTCTTTTGGTTTTATTATTT:1 - chr3R 22405031 3' - INE-1 213 1 57.43 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAGAGCGTCG:1 - chrX 21400794 3' - P-element 50 1 30.69 AAACGAAACTATTTTATTTTATATTTTCAGTTATCTGCTAAAGAACAATCGTAATGGTGTCGCGCGTGGCATTCAGCTGTGTAGCGTAGTACCGGGTTTAA:1 - chr3R 15347184 3' - jockey2 3383 1 57.43 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTAATCCA:1 - chrX 21056905 3' - Tirant 8118 2 70.30 GATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATACGGTGCATGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGTCTTTTGTGTAGTGACGTTGGT:1 - chr3L 388297 3' - R1A1-element 5277 1 74.26 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATAGCAGAATAAAGAATATAAACAATTTAGT:1 + chr3L 3992441 3' + pogo 2063 1 71.29 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAAAGACA:1 - 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Doc 20 1 56.44 AAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAATTAAAAATGGACACTTGAATAGGCAGCAAGATAGGCATAGCGC:1 + chr2R 14820929 3' + F-element 4383 1 61.39 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTTAGTGGCTTATAGTATAAGTATCTTATCCC:1 - chr2R 6074353 3' - 412 7080 2 50.50 AATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACGGACCGCTGGATGGGCGAGGTGGTGTTCGGGTCATAGGTCATCCCGTGGCCGCCATG:1 + chr3R 21770966 3' - 297 460 1 67.33 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATTTCAAACAGAAACTGAGATAAACCATTTTTTACCAGCTACAAATCGAGGCACCCTTTCGTT:1 + chr2L 2309477 3' - Burdock 6146 2 67.33 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAA:1 - chr3R 6190265 3' + copia 230 1 81.19 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGGCAAAAGGTATCCCTTGGTCCGAAC:2 + chr3R 30611332 3' - blood 7018 2 68.32 AACCAAATTATACCAAAACTTTCCGGGTGGCAGGAAAACGGCTGTGCCTGCCACGGGTTAAGAGTTGCTGCGGAAGCTTTAAAAATTTCATATCTATTTTT:1 + chr2R 16688124 3' - Gypsy12A_LTR 162 1 73.27 AGTGGGTTGATCACGAGCCAAAGAAGAAAATGGATATAATCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAATGCTGCAGGAGCTTGGCCGGTACGTTCTG:1 - chr2L 6072558 3' + invader2 275 1 69.15 AATACATAGATATAAGCAANGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATTAAAGATGAAAACTTAGGACGACTACACAG:1 - chr2L 14303348 3' + Stalker4 7231 4 69.31 ATTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACAATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGATGTTTTAATTTCAGTCATTAAAAGATGCGGATTCCCTAGT:1 + chr2R 23658762 3' + baggins 5041 1 60.40 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGGTTATTATATTATATTTTTAGCTGAATTTAT:1 - chr2R 19594597 3' + roo 9043 1 60.40 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTG:1 - chr2R 21362751 3' - Tirant 21 2 59.60 TACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAGCTGGAGAGACGCTTGTAAGAATTTGATTGTTTGATTGAATAAAAAAAAACGAAGA:1 + chrX 13228849 3' - R1A1-element 221 1 63.37 ATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGCCTACCTACGGCGGGTAGGGGGAGTTTTGTTT:1 + chr3L 13597257 3' - 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P-element 15 1 64.36 TAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGATAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGTGTTATGAGAGCCGAGTTACAATGGTC:1 + chr2L 3536009 3' - blood 7248 2 71.29 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACCACAAACGACAATACGGCGGCC:1 + chr2L 17865665 3' - hobo 56 1 83.17 GGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTATAAACACCCAAGGAAAGCTCTCTGGGCTGAAATCCTTTGGCTTTGCCTAAGCTCTGGAAATGAGATAAAGCGA:1 + chr3R 25844397 3' - Stalker 6853 4 70.30 AGCAAATTGGATAATCGAACGCGTCGGTCGTCGCCACGCAGACATTGATTACCTGGGTATTGAGAAATGCATTTAGTGAGATTATAAGATTTCGACTAAAG:1 + chr2R 9286376 3' + gypsy7 5349 2 55.45 ATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTACAAAAAGCTAGAAAATCAAGGGGGTTCTCCCCGTTGCGTTGTTG:1 + chr3L 2040289 3' - Juan 300 1 55.45 GGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATGGTCTGCCGAGTGGACTGCGCCGGG:1 - chr3R 26091607 3' - Doc 373 1 74.49 AGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGATCAAGGTTTATATCTTCGAGGTCCATTTGAAAGGATATAAAGACAGGA:1 + chr2R 9510066 3' + Quasimodo 24 2 53.00 TTGGTCATATCTTGAGGCANGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACACGCATTGGGGCGAAGTGAATGTCCTTCGGATTGTCAAACAGG:1 + chrX 18746790 3' - 1360 483 1 56.32 GACGAGAGCCAGGACATGATGATGATCTCGAATTGATATATTGTTAATTGTTATATTTGTTTTATTGTTTTGTTACAGCTAATAAAACATCAATTCCCTGA:1 - chr3L 22124072 3' + BS3 1603 1 81.19 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAGTGAAACCC:1 - chr3R 25514104 3' + hopper 1391 1 55.45 ACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCAACTCGAACAATGGCTTGCATGTGCAATGAGCGACGGTAA:1 + chr3L 3326777 3' + G2 2767 1 59.60 ACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCCGTCATTATGTGATAGGAATCTATCTCAAAATTATAAATTAAATATTCGGACGTTGTA:1 - chr3R 19449189 3' + roo 8672 2 63.37 TATTATTATTATATTAGCATTATTTTCATTACCAATTATTGAAAATTTTCCTTAATTTGGTATTAGTACTTTATAATCGAGATTTTATTTGAACCGAATTT:1 + chr2L 11868783 3' - invader3 5050 5 83.17 GCTCATGTCTTTGCTCTTTNATGGACTCAATGATTTTGCACTTTAAGTTTTGTTTGCTCATGTCTGGCTTCTCATCGTTGTTTTGCTTCTTTGCGCTTTTT:1 + chr2L 21066077 3' - hobo 2598 1 73.27 TAGAGTGCGGGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATGTGTCTAATGAGGGTCCTGGCTCTAAGCTACCTGCCAAATTGGCGAAAGGCGGGAAAGAAA:1 - chr3R 11190990 3' + hobo 2929 1 69.00 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGT:1 + chr2R 12133857 3' - jockey 9 1 75.25 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGCCACTCGATCCGGATTGAGATA:1 + chr3R 4773387 3' - Tirant 54 2 77.23 TTATTGTTATTATTATTGTNATTATGTTCGTATATACTACAGATTTTCCGAGGCCGGAACAAGCTGAAGACATTTCAAATGTATTTATAACACACATAAAA:1 - chr3R 24021023 3' - mdg1 7058 2 59.41 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCAATATCAATTCGATGCGTAATTCGCCAGATATTCGTTTGAATTGTTATTGTTTTCTCA:1 - chr2L 8913297 3' + mdg1 7443 2 62.38 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCA:1 - chr3L 19349933 3' + 1360 3371 1 57.43 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAGCAATAATTTATGTCGCCTTCTAAGACACCATACATATTCCCAATT:1 + chr2R 10777879 3' - pogo 27 1 57.43 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATAATCCAATCGGCATATAAATCATTGATAGCAATTTATTTT:1 + chr3L 2339823 3' + roo 9033 1 62.38 AATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTTCTCTTGTTCCATTTTCTGCCAGGCCTGGACGTATTCCTTGTAGAAAT:1 - chr2L 15547954 3' + Tabor 395 2 59.41 ACAATGTTTTTACATTTATTTTTTCATTTTTTTTTT:1 - chr3R 16940225 3' - looper1 1812 1 80.56 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAAAACGTATCTCTTAG:2 - chrX 2164267 3' + mdg1 412 2 46.53 CTTATAAATAAAAATACAAATTTGTTACTTTTTATTTGCTTTTTTTTTAACTGCAAAATGCATTTTGCTTTTACATCAAGTTGTATTTTGGTTTCTCGATT:1 + chrX 9626365 3' - S-element 1584 2 80.20 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAAGCTTATTTCCAAGTTTTGCAA:1 + chr3R 10434601 3' + 1360 3336 1 77.23 GTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACACAAGACCATATAGAGAGTTGGACGTTACTATTTCTGG:1 + chr2R 1717392 3' + Stalker4 7004 4 68.32 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGGATTGCATTCCTTGAATGCTCATTTGCCCCGCTTTTGCTGCGCTTTTACTGCAAGAGCTCCACACGAAC:1 - chrX 6406115 3' - hobo 6 1 74.26 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCACACACTAAACCACTCGCACAACCGAAGGCGTGTGTGCATGTATGCAATTTTTTGGGG:1 - chr3R 13685135 3' + Tirant 8493 2 66.34 ATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATGACAATACTCTGCCTGCTGCCAAGTACAACCAGAAGCTTGAAAACTATTACAATAATTTTTATATTTAT:1 - chr3R 25844282 3' + Stalker4 398 1 65.66 TGCATAGTGCAAAACCAATGTATGTCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCGCACCATGCAAATTGAATTGCATATGGCCACTCCGCCAGAG:1 - chr3R 28478510 3' + 1360 3353 1 64.36 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTGCTGTTTGCTGGAT:1 + chr3R 9825181 3' - Doc 7 1 61.64 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGTGTTCTGAACCCTTTCCTTCTCTCGCATTAAAGTCCTCTGGG:1 + chr2L 3889631 3' - jockey 4678 1 64.00 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTATTTGTGTATTTAGCCGGTCTATTCATTTACTGGCCTTGCC:1 - chrX 17109650 3' - roo 8697 2 61.39 AGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACATGGTGTATGAAAAATCGTCGACGGAAACGGAAATGTTGCACAACATATGTGCCAGTGCGGAGTTTTCTCTCC:1 + chr3L 10542135 3' + hopper 1220 1 71.29 TAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGTTTAGTTGAGTATTTGACAGTTAGACCTGTGCTATCGGCCTTGCCTTCGTA:1 - chr2R 19413499 3' - G-element 4237 1 57.43 TAAAAACTACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGAGCGCAAAAAAAATACGACCGTTTGCTTTGAAAGCTAATTATATTATTAAAAAGTGTTT:1 + chr2L 2636913 3' - Cr1a 58 1 71.29 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATATGCATTATATTTCAAAAAAAAATCCCACCAATTCTTGACAACCTTCATGAATGCTT:1 - chr2R 16907477 3' + opus 489 2 68.32 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCTGAAAGCCAATGAGGCGCAAAAAAAATGAGGCCCCGAAATGTATGCTACAAAAATGGGTA:1 + chr2R 11160617 3' - jockey 23 1 57.58 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATTTAATTGCATCTGTGGCTGCACAAATTTCCAGAGATATTTCGAT:1 - chr3L 5403239 3' - copia 4902 2 60.40 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTT:1 + chr2L 12199530 3' - Stalker2 7268 2 54.55 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTCGTCGTCTGCTGTTGCATCAGCTTGAAAATTAGTTGCTACTTATATGC:1 + chr3L 13366436 3' - hopper 25 1 54.46 TAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGATTCACATTTGTAGCTTACCTAATGATTTCAATGTTTCCTCAGGCCACTGGTCAACGAATTGGAACGATCAT:1 + chr2R 14250782 3' + transib2 2504 1 73.27 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTGCAGTTTTTGCTTCATTAGTAAGTTGGGCCATCATTTAGCT:1 + chr3L 17146881 3' - pogo 30 1 60.40 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGACAGCGGCAGTGGCAGTAACCCTT:2 - chr2R 13194620 3' - roo 8695 2 58.42 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAACCAATCTTACATACATTTCCAATATCGAGTCAACCCTTAGCCATTCAGATATA:1 + chr2L 22052553 3' + flea 4976 2 61.39 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAGACGATCTGGACACTCCAATCGTTTG:1 - chr3R 5700106 3' + mdg1 7409 2 73.27 GACGTGATCTTTTTTATATTTATATTTAACCAGATAAGCACTTGTGCGTTGTATGTTTAGAAATAACATTTTCTTGGCATTTTGAAAATATTCTTTAATTA:1 + chr3L 18128955 3' - transib4 2581 1 51.49 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGTTTAACATAGCCAAGTATATTAGCAAAAACA:1 - chr3L 1927432 3' - mdg3 47 2 70.30 GCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTTCGACATATACAAGATTCCGACGATAACTACAAATATTA:1 - chr2L 21656628 3' - invader1 3646 2 69.31 AAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTTTGTTATTGCACTGCTTTTACCAAAAACAAGTGTGCATTTAGCTTTTGTTGGAAGTTAAAAGATAA:1 + chr2R 8374924 3' - F-element 326 1 73.27 TGGGGACTGGCGAGGTTCAAAGGCTGGAATAAAAGCTGGATAAAATGGCTAGGTTTCGCTTGAGCGGGAAATTTGTAATGCTCCAAAGAAAAGGGGGCTCC:1 + chr3R 8682661 3' - BS3 117 1 70.30 AAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAAAGCATTGTACCTGGGCGCCACTCGGATAATGGCCAACAAAAAATAAAACAACTCCAGTCAACAGTCACCAATCA:1 - chrX 17217697 3' + R1A1-element 5323 1 66.34 AAAAAAAAACAAAAAAAAAACTTTTCCGAAATGTGGCGGCGTGGTCTCCATCAAAAAGAAAAAGCCAAACAGTAAAAACCAAAAAAA:1 + chr2L 16817454 3' + HMS-Beagle2 489 1 89.66 GGTGATACGGACGGACGGACGGAGTCCCGTATTTGTTCAAAGTACTGCATTGGCCACTATGCCTTTATAACTAATAATCTTGAAATTTAGAGATTATAGTG:1 - chr2L 8086324 3' + micropia 5409 2 59.41 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCACATGAAGAAAGCAATTTACCAAAGCGCGAGTTCGAGCCCTCA:3 - chr3L 18896582 3' + P-element 2857 1 47.52 AAAATAGGTTTTGGCCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCAAGAGGAAGAGTGAGCGAAATATGGGTTACAGTTGAACATCCACCCGACACTATA:1 - chr3L 21878702 3' + Transib-N1_DM 471 1 70.30 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCACCATAATTA:1 + chr2L 20709446 3' + roo 9032 1 67.33 ATTGCGCTGTTATGTTACTNTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGT:1 - chr2L 16456783 3' + BS 5045 1 68.32 ACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAATTGCAAATACTTCGTTTACGTTCAATATTTTAA:1 + chr3R 27259980 3' + Doc 4548 1 64.13 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCG:2 - chr3L 11657841 3' + Tabor 449 2 57.43 AAAGTGGAAAACAAACTAAAAAAATCTAACTACAAGTTAATCAAACGCAGCCACGTCAACAGGGCTGTAGCAACATGCCAATTCCAGCTGAACGATGGTGC:1 - chr2R 7313759 3' + gypsy2 455 1 74.26 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAAAGTTGTACTACATTTTTTT:1 + chr3R 4474262 3' + copia 246 1 69.31 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGG:1 + chr3L 17708285 3' - jockey 4806 1 68.32 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTGTGGGTGCTAGAAAACAAAA:1 - chr2L 17865648 3' + hobo 2922 1 68.85 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTAAAACAGAAATTTGCTTTATTTGTAAATTA:2 - chr3R 11840577 3' + copia 244 1 67.33 TCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGCCTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCACTTAAT:1 - chr3L 4235603 3' - jockey 4575 1 64.13 TATGTCTCCCAATTTGTGTCTCAACTGTGTGAATATTGAGGTCTTTATAGAGTGTGGAGTTACGTACATACATATGAGCGGCTCCAAAGTGTGAAAATGCA:1 + chr3L 9027244 3' - Helena 1222 1 70.30 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGCAAACAAAGGACCTCTCGCCCACCTTCTATATGCGGGCGGTGTATTT:1 + chr2L 15848301 3' + hopper 1390 1 54.46 GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGA:1 + chr2R 4677353 3' - invader3 5204 2 62.38 GAACTATAAAAGTTAGAAAGTTGAGTTTAGACATGCAGATTCCAGAGACATCTTTTTCTTTCATTATATATTTATCCTTTTGAGCCTTTACTTCCCGCTTC:1 - chr3R 4848510 3' + INE-1 158 1 67.33 AAAAAAAAAATTTATAAAAAAAAAGAGCAAACTGCAGCAATTTCTACGTTGCATGCACGCCTCGTTGATTGTAGTAGGTGGTCACCCTCGCCACATCG:1 - chr3L 10997854 3' - Tc3 79 4 66.33 AAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATTTGAATATTGATTTAAATTGCATGCATTTGGTTAATTCTGTGTTAATCAATTCAATTCAATAAGAGTG:1 + chr2L 1883319 3' - INE-1 302 1 68.32 AAAACGCAAAAAAAAAATAAAATAAAAGAAAACACAAATCCCTTCCGAAGATAAAGAATTAGGCACTTTAGAAAACAAACGTAGCAGCTGGCCAGCAAAAT:1 + chr3L 3609490 3' + Bari2 916 1 53.47 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTAACTAATTTTTGCAACTTTTGTATAAAAATTGTCATT:1 - chr3L 12983184 3' - diver 41 2 63.37 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACATTTAATAAAAAAGTTGTTATTAGTAAACGCATGCATATTATTAT:2 - chr3R 26123015 3' + roo 9036 1 61.39 ATTTTTTTTTCTTTTTTTTGTTTGGTTGCATCTACGCGATCTCCTTGGCTCTCGATGGGTAAATATGTAGTTAGCCGAGCTAATTTACACAGCACTTTGCT:2 + chr3L 9020657 3' + hopper 143 8 54.46 AAAAAAAAAAATGAAATTAAAAAAATCTTTTGCACTTTGACGGCTGC:1 - chrX 11254950 3' + Doc2-element 251 2 53.19 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAATTTGTAAAGTTTTTTGAAATTTGAAGTTGCACGGAATTGAGAATTT:1 - chrX 11987873 3' - 412 7082 2 56.44 TGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGTGCTGCGTCTTCGTATCTATATACTATAAATGAAACCACAATGATAATAATAATGAAATGTA:1 + chr3R 7627304 3' + 1360 3375 1 59.41 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTATGAAAGTTAGTTTG:1 - chr2R 16680117 3' - 412 27 2 55.56 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACCCAACAATATTTTCGAAAACGCTAAAAATACTCAGTTA:1 - chr2L 7804252 3' - 1360 35 1 65.35 TATGTATGACTAAGAGTAANGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCCCATGAGAA:1 - 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Doc 24 1 48.86 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAAAACAATGTACCACCAGA:1 - chr2L 1432019 3' + opus 475 2 58.42 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACATGTTGAACCTTATAATTTATTTAAAAAAGTATTTTTTAAAATGTACTTTCTTTTTTTTT:1 + chr3L 23104129 3' - Max-element 8252 2 63.37 GGATCTACACCAACATAATTAGCTTAATTTATATACATACATACATATAAAATGAAATGATATGAAATCGGCGAGTGTTTTCGCTGCGTCTTCAAAACGAA:1 - chr2R 22661156 3' + gypsy6 7798 2 67.33 GGGATCTGCTTACATGCCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCACCTAACTTATTTCAGCAGCCACTATACA:1 + chr2R 25046382 3' - invader4 2981 2 70.30 GAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCTATGTAGATTTACGATACGTAAACCCTATTTAGCATAT:1 - chr3R 7163795 3' + G6 396 1 62.38 TACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCGATGCCATTCAAGGTTGGGATAGCATCATGAACGGCACCAGTCACGATGGCAACAATGAGGAG:1 - chr3R 23232325 3' + R2-element 275 1 68.32 GCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCAATTGTCAGGGGGCAAAGAAGCAGCAACTTTGCGTGCCACATCGCGTATGATTTATGAGATTGGCTTGCTGCACAC:1 - chr3R 6191885 3' - 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Doc 3 1 78.22 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACGATACCCTTTCAGAGATTTTTGGCAGCT:1 + chr3L 15435583 3' + blood 7339 1 76.24 ACTCCCCGGAGGTAACTCGCGCGAGAAGCAAGTTGGCAGAGTGAGAGCTTTGCGACAAACGAGCTACATGGCTTATTTAGGTGAACGTGATGCATTCGGA:1 - chr3R 3753048 3' + ZAM 457 1 81.00 AGTGGATGTCTCTTGCCGANGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAACGATACAAACAGTAGCATAACGTCATACAACCTGCGTCTTTCAAAGA:1 + chr2L 21628939 3' + P-element 2861 1 54.46 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTCTTTCATGGCTC:1 + chr2R 6041635 3' + opus 7473 2 59.41 GCTAGAAGGTTGAGATTCANCATACAGATCTAGAGAAGTAGGCGCAGCGTAAGTTTGTTTTTTTAATGTTTATGGTTATTATAACAATATAATAATATTGT:1 - chr2R 4618108 3' + INE-1 169 1 57.43 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTATTGTAGAATCAATAAATACCTTAAA:1 + chr2L 3475320 3' + roo 9024 2 77.23 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACGAAGACTAATTTACTAGAATACATTCGATTGTGCATATACATTCGAATGGAATTTTACAAACG:1 - chr2L 16127681 3' - roo 12 2 71.29 TGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACGACACACAGGACAAAGTAGGCAAGGCGTCGTAGGAGCAACGCCGCGCAGCAGACGGCGATCACCC:1 - chr2R 3068341 3' - Stalker 6863 4 61.39 CCCAGTCGAACCTTGAGGTCGGGATGGCGGCGCTGCTGCGCCAAGCGAAGGAGACACAATTAGGCTCTGCCGCACCTCAGCTGAGCGATTATCT:1 + chr3L 25237853 3' - Gypsy12A_LTR 416 1 61.70 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCTTCCACAATTTCTGGACCTATTTTC:1 - chr2R 19513349 3' + roo 389 2 58.42 TAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGTATTTGACTTGGGGTTTTCTCTTTGTTTTCAGGTTAGATTTTCATTGGTTGCATAA:1 - chrX 3343514 3' - G-element 4232 1 58.42 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGATTGAGCGCAACTGCGCTGCTGCGGTGAA:1 - chr2R 8232494 3' + P-element 2856 1 39.53 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAAT:1 + chr2R 18105818 3' - roo 8696 2 58.42 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTATTCACAATCCGATTCACCATTGACAAAGTCAGGAGCAGAACAGCGATGGCGGGAACAGGA:1 + chr3L 4570937 3' + Quasimodo 7363 2 73.47 ATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGTACTACGGAGAGAAGGCGCGAACGCTAGATAAAAAATCCGGTACGGGGCGACGCGAGGCTAAGG:1 - 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chr3R 22824739 3' - G2 2899 1 74.26 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGCCTCTCCAAGTTCAAGTT:1 + chr3R 15537350 3' - P-element 56 1 23.76 GCCGAGAACCCTGATGCAANTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAAAACAATGTACCACCAGAAATG:1 - chr2L 1432015 3' + opus 7485 2 62.24 GTTATCGTCACCACACATAAACCTTCTCAAGAAGTCACTTTAGAACCCGACCTTAAAAGCTGCCCCGTCATGCGGCTATAGCCTGGCCAAGACAAAGTAAA:1 + chr3R 16135696 3' + gypsy7 5170 1 71.29 GACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTCACACACACATGCGGTGGGCAATCACGTAACAACAAC:1 + chr2L 9080714 3' + Idefix 24 2 63.37 ATATTAACTTCTGTAAACGNCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGAATGTGGGCACACAAATTTAAGCTCTAAACAGCTC:1 + chrX 5452646 3' + mdg3 240 2 70.30 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTGGCGGGTGTCATTAATAAATTAAGAGCTCGGCCCAGTTGGTTCTATTAAGTTAACAAGCATTTCA:1 - chrX 12284028 3' - Transpac 4926 2 73.27 AACCGATTTTGTGCGGAGCNCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCGCGTTGTTGTGACATTAATTTTTACTTAATTTATTTTTGC:1 + chr2L 14054794 3' - F-element 46 1 58.42 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACCCCCAGCAGCTGTTTGGGCTGCACGTGAGCGAAAAAAAGAAACCCGATCGAA:1 - chrX 21374156 3' - P-element 22 1 60.40 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACT:1 + chr2L 1335337 3' - jockey 4720 1 69.00 TGTTATTATTATTGTGATTATGTTCGTATATACTACAATATAGCTAGAAAGGCTTCCACAGTATTACGAGCTAATCGGGGACTTGTAATGCCAGGCCCACA:1 + chr3L 15444913 3' - mdg1 7054 2 59.41 TTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTGTTTAAGTTGATCTGCAAACGTAGTCCTCCAGGCTGCGGATTTGATCCGAA:1 - chr2L 13274021 3' - Quasimodo 88 2 52.48 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATAATCCAATCGGCATATAAATCATTGATA:1 + chr3L 2339811 3' + roo 357 2 74.26 GCCCCGGTGGATGATTTGGCACGCGGGCGATTGTCGTGTGATGATATGCCACTTAAACAGGTGAGTTTATCGTGTTTCGCTTTTTGGTGGAGCGCAACGGA:1 - chr2L 5325911 3' - Doc3-element 328 1 78.22 TGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAATAAAAAAATCGTGAAGTTGGAAGGAGGCGGAGCGGCCAAACGGTATATG:1 - chr3L 15466555 3' + F-element 4643 1 58.42 GCAATGCAACTAAGTGTTGNTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCAAACATTACTGCATTGGCCAAATATTTAT:1 - chr3R 28216807 3' - blood 7057 2 67.33 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGCGATTCTCTTCTAGGAATGC:1 - chrX 18121823 3' - opus 23 2 56.44 TGTTATTATTATTATTATTATCATCAAATGCGCTTCCTCTTCCGCCGCACAAAACGCAAAGATAATGAGCCGTAGTTGCGAACAGATTTCCTCCGCCCGC:1 - chr3R 12764484 3' - mdg1 16 2 70.00 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGCTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACA:1 + chrX 3691555 3' - jockey 4809 1 73.27 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGTACGCAGCCAGTGCCATTAAAATCAACGTGAAACAACAATTAGTATTCAAGGTTAAC:1 - chr2L 15909810 3' - Tirant 8116 2 69.57 TCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATAAGGCCCTTTCACAAAAGTTAAACA:1 - chr3L 13072328 3' + roo 273 2 75.25 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTCCGAGGCCAAATCCATTGAGATTTTCATAGGCCGCGCA:1 - chr2R 7173601 3' - mdg1 7045 2 72.28 TCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGGTGCTAGCTCC:1 - chr3L 16792530 3' - Chimpo 4020 1 62.00 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAGCGTCCAGCATAATTATTTATAATGGCCAGGCAGGCG:1 + chr3R 12178273 3' - hopper 32 1 60.61 TAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTGTCCGTTGCTCTTTAGCGGCGTCGTGCTTCCTGGTGCATAATATGTGACCTCTCCACG:1 + chr2R 11588410 3' - Rt1b 5056 1 66.34 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAATATTTAATTACCAACACGCAGCAA:1 + chr3R 7688959 3' - Tirant 8118 2 70.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGA:2 - chr2R 13446672 3' + roo 9020 2 80.20 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAGAGATATGTACGTGGTTGGAGAGTGGAGACTGGGGAATGTGTCT:2 - chr3L 749262 3' - P-element 12 1 66.34 GCGACTTCTGTGGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTTAAACTCCACAAACCATATACTCACAATCATAATTCAAGAAAGTTTCAT:1 - chr2L 12076646 3' - jockey 34 1 50.50 GAGGCAGCTAAGCGAATTANACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGGTACTCTGTCG:1 - chr2R 1373084 3' + pogo 2098 1 78.22 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGCGGCTAAACAAGTT:1 - chr3R 25208357 3' + P-element 2824 1 18.81 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCCGGTAATTAAAATCCACCCACAAATA:2 + chr3R 25514208 3' + hopper 1410 2 74.26 AGACTTTATTAACTACATCAGAAATATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTA:1 - chr3L 27357545 3' + mdg1 396 2 51.49 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATAGCACTTTGCAGAAGAA:1 + chr3R 28475870 3' + roo 9036 1 58.42 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATGTGTGAACCGCCCC:1 - chrX 13268849 3' - 1360 15 1 59.79 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCTCTGATTTTCCACATCCACAATCCG:1 - chrX 10426901 3' - 412 51 2 77.23 TGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCACTCGAATGGCAATTAAGCGACCCGTTAATGGGTCTGAAAACTAA:1 - chr3R 18379513 3' + 1360 3249 1 58.42 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCTTCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTAAACAACGCGAATGAGCAGGGCGAGGAGAAAGACGCGAAAAGG:1 + chrX 6338970 3' + P-element 2878 2 69.31 ATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAATTATAAAAGCTAGATGATTGAGATTCTGCGAATCTGAGACTAAGCCCGAAATCGTTGACTCCA:1 - chr3L 9240780 3' + INE-1 123 1 69.31 AAGATGTTGAAGGTCTTAAATTGGCCGCCGTTTGTCGAGTAGAAAATTGAAATTAAAAAGAAAATGTATAAAGGCAAAAAAAAAA:1 + chr2L 16379828 3' + invader2 4642 1 76.47 TTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAGCACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAA:1 - chrX 22398535 3' + Gypsy6A_LTR 156 1 59.00 GAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATATATGTGTATGCTCTATAATATTTAATCGG:1 - chr3R 30370114 3' - invader2 75 2 80.20 GAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTACTACCAAGGGTGCTCGGCGAGGCATGATGACTCGATCGCC:1 - chr3R 26803225 3' - I-element 4929 1 60.40 TTTTTTGCTTATCTTGTTCNCAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGT:1 + chr3L 24916686 3' - Porto1 153 1 59.41 CTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAAACTTGAGCTCTCAGCCATTCATCATCGCAACCCGATCATCAGTTCGCAAGCCCTCCACC:1 + chr3L 24761266 3' - 1360 55 1 62.38 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATACATACATAGAGTCGAATGCC:1 + chr3L 19778821 3' + flea 4964 2 79.21 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTATATTATTTTATCTGCCTTAGAGCTGTATTTATAAAGTAGTC:1 - chr2L 22107353 3' - flea 4787 2 64.36 GTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAATCACTTCCATATCAGCAGCTTAAGTAGTTCATTAGAAACCATTAGAATGATGG:1 - chr2L 7278672 3' + roo 8786 2 53.47 TTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATTTTTAAAAATATCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAA:1 - chrX 3464218 3' - 1360 3118 1 51.49 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTGCAGTTTTTGCTTCATTAGTAAGTTGGGCCATC:1 + chr3L 17146873 3' - pogo 37 1 68.00 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCATTCTCA:1 - chr2L 20271212 3' - blood 30 2 56.12 TAACATTCTAGCTTTTATAGTTCTTGAGATCTTTACGCTCTTACGGACGGTCAGACAGGCCGAGATACTCATCCGAGACAGCTGTCTTGGCATCTTAAGTG:1 + chrX 22797430 3' - INE-1 159 1 58.42 ACACAAAATTGCAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAACTGGCTGTGCTG:1 - chr3L 5973993 3' - hobo 38 1 57.43 GAAAACCTAAAACTCCTCCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAACAACCAACCAACCTAAGTACCGTTTAAATAGACATACAAATTCTACCAATTATAACTT:1 - chr3R 21572556 3' + G-element 3866 1 64.36 AAAAAAAAAATCAACAAAACAAACAAAAAAACTAAGATCGGAAAACACCTTAGAGCTGAAAAATTGAATAGATTTATATATATAATATATTTATATATATT:1 - chr4 290079 3' + gypsy11 3933 3 66.34 TAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGGGAGGGTGATTAATGGTGCTGGGATGGGGTGGGATGGTTTTCCCGGCGAGCAGCTCCCTCA:1 + chr3R 30290146 3' - mdg1 288 2 54.46 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGGCCTTGAAGT:1 - chr2L 13214966 3' + roo 9055 2 64.36 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGGTTATCCGGTATCATCATTAACCGGAGGCAAACGCCCGCTTTCACGCTGCCTCAGATCGGGAATAAT:1 - chr2L 4650403 3' - roo 9 2 70.30 AAATGTTGTCTGCTTGTATAAAATTTTACACATTTAGATTAATTTCTATTATTGTTCTTATTAATACGGACCATTTTGCTATGAAGTATTTACATTAGACT:1 + chr3L 18922979 3' + Cr1a 446 1 78.22 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCG:1 + chr3R 14860191 3' - BS 5045 1 74.26 AATGCAGATATCTTGCTGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTT:1 + chr2R 1373181 3' - pogo 36 1 58.42 ATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTTTTGGCCCAAAAGTTAACATTGCGTGCATGCAGCTCGACTGGACTTGGATTAAGTTTTT:1 + chrX 13348604 3' + ZAM 13 2 66.34 ATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAGCGCCTTCGATAGATTGACTTGCAAGGTGAAAATTGAATTTACATGTTCTGTTCCC:1 - chr3R 6190204 3' + copia 257 1 79.21 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGGGATTAAAATATGAGTAGTACATCTCTTGTAGTGGTTCCTAAAAG:1 + chr2L 4918187 3' - jockey 4782 1 51.72 TATACTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGAC:1 - chr3R 4577567 3' - INE-1 144 1 41.58 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAAAGCA:1 - chr3R 16806027 3' - 412 51 2 77.23 TACTCGCCACGCACATCGCGGGAACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACTTACAATCTGCCACTGAGACAAAATAAATGCCTTTTTGATATGTTTTAA:1 + chr2L 18950954 3' + hobo 68 1 54.46 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGGCGAAAGTATGGGGGATTAAATCGATTTTCAGACCTCGGGCTTT:1 - chrX 9463353 3' - hopper 29 1 57.43 AATAAAAAAAAATAAAATACTGAGAGCATCACAAATCTGTTCGCTGCATTAAGAGAGCATTCATCATTCGACTTTCTTCTGATATTATCCCTTTCACTGCT:1 + chr3R 30640494 3' + P-element 142 1 80.20 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACGATACCCTTTCAGAGATTTTTGGCAGCTGATTG:1 + chr3L 15435588 3' + blood 7344 2 71.29 GGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACATATAGGTCGTGCAACATTGGATTGTCTTCGATATATGTACGTGTACATAGGTTACATATA:1 - chr3R 16593041 3' + Tirant 8198 2 61.39 GGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCGGTGCTAGCTCCTGGACA:1 - chr3L 16792524 3' - Chimpo 4010 1 70.83 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCACCATAATTATTACGTAATTGAG:1 + chr2L 20709459 3' + roo 394 1 59.55 TTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGTGCGCTCTGTACAGTGGAT:1 - chrX 13774018 3' + R1A1-element 4975 1 58.54 TGTTAAATAATTTAAATTGTTCTTTTCATAAAAATCATCCTTTCGAAATGCGTGTGAATATTTTTCTGAGAAATCACATTTGCTTGTCAGCTGCAGCAGAT:1 - chr3L 18022325 3' + HeT-A 5809 1 66.34 GGGTGGACGTAGAGTGCGANTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCGGATGCCTCTCTGTCGCTCTGCATCGGCAACGGAGCGCTTGGCGCGGGTGCTCTTGG:1 + chrX 1714056 3' + hobo 2920 1 60.40 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACACA:1 + chrX 7534727 3' - Tirant 12 2 69.31 TATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGATGAATTAGATAGTATTGTTACCAACATAATGTTTAAGTGACGTGTCCTAACAGAGTGTTT:1 - chr2R 11889403 3' - F-element 4428 1 63.37 TCAGCGTTGATCTTAATTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATATGTATTGTCGCCGAGCGATGA:1 - chrX 23201817 3' + McClintock 438 2 76.24 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGGCAACATCAGATCGCTCAAAGCGTGTGTGC:1 + chr3L 16662448 3' - jockey 4716 1 69.31 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTATTGTAGAATCAATAAATACCTTAAAC:1 + chr2L 3475321 3' + roo 361 2 76.24 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATA:1 - chr2L 12779583 3' + flea 243 2 58.42 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATTTAATGCTAAAATACGGAAATAATTTGAGCCAACAACGTTAGTCGC:1 + chr3L 11758435 3' - roo 8693 2 56.44 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTCAAGGCAAGGCCGTCCAAGAAACACTAATTATGATCTTAAGTGCTGGC:1 + chr2R 24555700 3' + hopper 1391 1 55.00 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACAGCAGCTGTGCCCGATGCGAGGGCAGTCTCACTTAAGAAGAT:1 - chr2L 14799104 3' + hopper 1386 1 52.48 CTAGCTGAGTAACTGGTATCTGATAGTCGAGGAATGCGACTATAGCGCCTGCTCATGTTTATGTCTGCCATGCCATTAATTTTTGGCTTTCCTTCTTTTTT:1 - chr3L 3743977 3' + INE-1 543 1 65.35 TCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGCCACAAGAAACGAACTTGAACTTGCTCTCTTGTGGATCGCATTTGC:1 + chr3R 25208395 3' - P-element 28 1 51.00 ACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGAGAATTTTTAACACTACAAACTTTAACTCATGAATCCCTCAGGAAGTCCCATTAAACACGTAATTTAGC:1 + chr3L 21829624 3' + R1A1-element 4 1 77.00 GCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGAAGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTGGTTTTAGGCTGTCTGTGCGCGTTGGACTATAACGATCCAGTC:1 - chr3R 4051890 3' + 1360 3351 1 63.37 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTATAACTTTACTGTAGTTATCGTAAGCTTATGATTTTCTC:1 - chr2L 3146537 3' + roo 9036 1 65.35 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTTT:1 + chr2R 15376185 3' + 1360 3371 1 60.40 ATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCG:1 + chr2R 1076532 3' + FB 268 1 53.47 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTAAAACAGAAATTTGCTTTATTTGTAAAT:1 - chr3R 11840579 3' + copia 242 1 69.31 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTATGAAAGT:2 - chr2R 16680124 3' - 412 7089 2 63.37 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCCCAAGCGCAATGACTAAAAAT:1 + chr3R 18769622 3' + roo 9017 2 80.20 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCATATCACGAGATTATACGTATTGCTTTGGAT:1 + chr3L 16478459 3' - pogo 23 1 54.46 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAA:1 + chr3L 17708298 3' - jockey 4793 1 55.45 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAAGAGTCATGCCACCCAGGACGACAGGCCAACAATGGTGCGACATGAGCAACAAAA:1 + chr3R 11720704 3' + hobo 2937 1 71.95 TTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCC:1 - chr3L 11657860 3' + Tabor 430 2 76.24 TGCGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACAGGTGCAAGTAAATGGCGATGCCAGTGACACTCAAGTGGACTCACATCAGCTGCTGA:1 + chr3L 6191312 3' + Quasimodo 7145 2 62.38 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGTCTGTCCGCCGAAAGTGCGAGAGCAACCACTCAACTACACTCGACAACAAAACAGTCATTTATTTTGA:1 + chr3L 5355437 3' - P-element 6 2 74.26 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTTACTATTTCGTAATTCTTCTTACACAACACCTGCACAAACCGA:1 - chr3R 14985277 3' - Ivk 17 1 73.27 GATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCATTGATTGAGGTTGAAGAGTAATTTTGTCTGCTAAAAAAGAGCTCAAATCTAAACATGATTCAAGTTGTTCCTTGG:1 - chr2R 18076738 3' - Transpac 5175 2 79.21 TGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGCCTACCTACGGCGGGGAGGGAGAGGTTTGTTTTAATTAAGGCGCATTAAGTGCAATGTTTTATGGG:1 + chr3L 13597291 3' - 412 181 2 56.12 ATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTGTCTGCCAGATAGCCAGGCCCTC:1 + chr3R 13033126 3' + I-element 5137 1 77.23 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGG:1 + chr3L 5206591 3' + roo 9037 1 79.22 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGAGACAGCACGAGTGCTGTGGAGACAGAGAAGGCACGATGAGGAGGGAGG:1 + chr2R 8385184 3' - hobo 25 1 50.52 TTTAATTATTATATTTTTTAAAGGTTTGTTGATTTATCTTAGTATAATTCATTGCCCCACATGAATTATTTATATTAATAATCTAAAAATCGTTCTGTTTA:1 + chr2L 1206278 3' + Cr1a 89 1 32.67 ATAGCAAAACATAGTAAAAAAAATATATAAACGGACTAAGAACATATGAAAATAACTTAGCCTTAAATTTGGCACTGGAATAGTTAATGCCATATTAGTTG:1 + chr2R 15810160 3' + G4 3591 1 69.31 AGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACACCGGTTTGCACTTCTTAAATAAATACTTTTCTTTTTACCAACCTTCGGCCTTGCCTCTACTTCTTCTGTT:1 - chr2R 1320367 3' - diver2 4653 2 64.36 ATTAATATTAATATTATTAATATTATTATTAATATTATTATTAATATTATCTATTTAGATATTTTTATCAGAAAAACTCTCTTTAGAGTTGGGTTTTACAT:1 - chr2R 18063072 3' - mdg1 42 2 44.55 AGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGAGAGACCAAAATGGCGATGGTAAGCAAAGCCTCCATTCATACAGCATATAATATGATATCTCTCTCTCTCAGTACAT:1 + chr3R 4202359 3' + G5A 2557 1 72.28 AAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTTAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATCCACCATGTATCCACTTCCACAGTG:1 - chr2R 7456075 3' - Circe 14 2 73.27 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACCTTCGCTGCAACCTCATTTCGTTGATGATAGTATTTAGGGTTCCCCCAGCTGGCTCGCTAAACTAATT:1 + chr2L 4571404 3' - roo 8671 2 72.28 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAAAAATAAAAATAAATATAAAATAATATCATTGCAAAAAAAAAGTGAAAT:1 - chr3R 23921651 3' - Doc 31 1 50.50 GTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATCCGTTTGATGGACCTCGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' - Stalker4 7263 4 72.00 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAAGAATGCATTGAGAAATATAATAGAACTGGATTTGTATCTTGAAGCATCTGACC:1 - chr3R 12744635 3' + I-element 5337 1 58.42 AAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTTCTGAGTCCCATATTCATATGCACAAATGTGCATTGCTGGCATTATCAGTA:1 + chr3R 14056025 3' - transib2 25 1 55.45 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAANCGGTTACAAATGCGCNAAGTCAAAAGCGGGNCGCTATTCAACAG:1 + chr2R 11404026 3' - mdg1 7042 2 69.89 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGATTGACTTGCAAGGTGAAAATTGAATTTACATG:1 - chr3R 6190214 3' + copia 247 1 71.29 TTCTTACAAAAACTCAACGNGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACGACTTGAG:1 + chr2L 7461135 3' + roo 9045 1 52.48 TAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTCTTGGGGTAGATGATTCAGGTTTTGTTGGGTCCTCATGGACTGGTCGCCGT:1 - chr3R 3195419 3' - invader1 181 2 50.50 TCAAAATTTTGCTAAAAAAAATCCGTTGGTGAAAAGTTTGGGCATAAGGTAAAAGTTTGCGGGAGAGCTGGCAGAGGGGGCGTAGG:1 - chrX 4335219 3' + HMS-Beagle 333 1 69.77 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATGCGTGAAAATACAGACATAAAATAAATAATCACCATCC:2 - chrX 3691532 3' + jockey 4957 1 66.34 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACTTGTTGGCATCTGGGCTGCCAACTCA:1 - chr2R 23877717 3' - Transpac 4944 2 55.45 TACAGTTGCGGTAAAAATAAAAGCATTTTCTTGTAACTTCTACGATTTGTATAATTGTTTGTTAAAAATGGGGAATACATTCGAATATGATAAGTCTTAAC:1 - chr2R 15313144 3' - Tc1 1645 1 51.49 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCACTGACTTACTTACGAAAGTCAGTCAGTCAGGACCCCCGCATGTGCGTCAAATTACTTCCGCTGGATTTGA:1 + chrX 15431671 3' - INE-1 557 1 53.47 GCAGATATCTTGCCGATGCNGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATCCTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCATATCACGAGATTATACGTAT:1 + chr3L 16478449 3' - pogo 33 1 58.42 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCACAAGGTAATTCGTGAAACAGCTTGTCAGTTGAATAATGTGCATGGCACTTATAA:1 + chr2L 20550847 3' - jockey 4696 1 51.49 TGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTCTGTCGAAAGGAATCCAGTCCATG:1 + chr3L 20733049 3' + jockey 4713 1 76.24 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAGCTATACAATTTATATACTCGAACACAACACCTTGTTGGTTTATTTACTAT:1 - chr2L 14038385 3' - 3S18 5791 2 51.49 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGC:1 + chrX 6338918 3' - P-element 60 1 21.00 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAAAACGTAT:2 - chrX 2164274 3' + mdg1 7443 2 49.50 AACTGACGGGACATTAGTTNGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGCCAGG:1 - chr3R 4591833 3' + 297 6948 2 54.00 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACACTTTAGCCAAATATCATCGCTTGGACACACAT:1 - chr3R 25950101 3' + 412 7499 2 65.35 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACGAAGACTAATTTACTAGAATACATTCGATTGTGCATATACATTCGA:1 - chr2L 16127698 3' - roo 29 2 58.42 TAATGGTTTTTGCATCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCCACGCCAGTCCAGTCCACCAGGGAAGAATCTCGTGCTGCCCATACTGTGCAAAATTCGTGGG:1 + chr3R 9245591 3' + transib4 2318 1 64.29 ATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGATAGAATCTGTTAAATAAAGTCCTTTTAGTACGGTACTGATCCATTGAAGAATAC:1 + chr2R 2339646 3' + rover 332 2 65.35 ATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAATTAGATGAATCAACCTGTATAATGATAGAAAACCTGTTCTATTGTCTTAAGTTCTAGACCAAA:1 - chr2L 7259397 3' + I-element 5347 1 63.37 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGGCTATCTCTATCTCTTCTCCGAAGCTTTCGAAGTAGCTTTTGCGTGCCG:1 - chr2R 7024943 3' - P-element 25 1 54.46 GTTCTCAGCGTGAGCGAGCAGAAAGAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCA:1 - chr3L 23907450 3' + 1360 3296 1 74.26 TTGTTTAAAAATAGATTTAAATGCAAAATGACGTTTGAAAAGGGAAAGATG:1 - chr3L 16750636 3' + NOF 3953 1 92.16 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGCTATGGACCATAAAGGCGACAATTCATTTAT:1 - chr2L 16939818 3' + opus 7458 2 69.31 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACGATACCCTTTCAGAGATTTTTGGCAGCAGATTG:1 + chr3L 15435588 3' + blood 7344 2 71.29 AGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACAACAAACTCATAATGATTTTATCTAGCGATCTG:1 + chr2L 18294027 3' + hobo 446 1 67.33 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATGTATATTCAGCTACACATTCATTAAAAAACTTTCGGCGCAAGAGC:1 + chr2L 9630413 3' + flea 4988 2 59.41 ATTTAAAATTAAAATTAAAATTTTTTTGAGGGGCAGATTACACTCTGAGCTCGCATAAATTTCGCTGGACTTTTAGGTGTCCGTACGACCACCGTTCCTGG:1 + chrX 10993367 3' + 1360 3043 2 73.27 AATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCGTGGGAGTGGAGGGCAACACATTTATTAGAGAAAACCCAGTACAGGGAGGCATTTTACTAGAGGTGTTAA:1 + chr3R 7685504 3' - Tirant 8396 2 69.31 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATAGAATGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAG:1 - chr3R 30611257 3' + blood 7349 2 72.22 AATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGGGAATATTTTGTCAATGGAATCGCAGTGTTTCGTATGCTAATTTTCAATA:1 + chr2L 3809865 3' - 1360 255 1 65.35 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAGGCATGCATATGCGTAC:1 - chr3R 22469134 3' + hobo 2917 1 53.47 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAGTGGTGGGCGTTTGACAAGAGCGGGCGTGGCAGTGGGCGGCGGGGGTCCTAGCCAT:1 - chrX 11025493 3' - hopper 22 1 57.43 TAATTAATTAAAACGTTTTTTCCCCTGCTCTAATTGTTGTTTATTTTTTTAGGCCCACACTTTCGATTTGTTCAGTTGCAAACTACTACGTATAGTCAGCT:1 + chr2R 17361633 3' - Stalker2 7187 1 60.40 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATTTTATTTCCAAGCTAGCTTTCATTTTATATTATATTTTATAT:1 - chrX 7480426 3' - roo 33 2 65.35 TGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAA:1 + chr3L 25232863 3' - accord2 7451 2 60.40 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGATGTCCTTAACATCTGCA:1 - chr3R 14980487 3' + 412 453 2 61.39 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCTCTCTAATTCTCTTTCTACAGA:1 + chrX 21400851 3' + P-element 2864 1 54.46 GAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACACACACACATCAATGAAACATTCCTACCTCACCACATTAAAAGTGGC:1 - chr2L 11805057 3' + Ivk 5011 1 61.39 ATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATTGTTCTTAATAAACCAACTTAAAGAAA:1 - chr3R 13086197 3' + F-element 4316 1 77.23 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCTTTTTTAGTTGGCAATCAGATTTGGTAAAAAAGCGCAGGCCTTCATAATGCA:1 - chr2R 18077026 3' + Transpac 289 2 52.48 GCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAACCAGATTTGCTCGATCGAAAACGGAAATCGGCTTAAGGA:1 - chrX 11301464 3' + G2 2612 1 61.39 AGAAAAGAATAAACCTGAAGATCATCCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGCGGCACGCAAAAAATGTTTGAATACAAA:1 - chr2R 11663634 3' + Bica 133 1 72.28 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCAC:1 + chr2L 20709438 3' + roo 9024 2 75.25 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTAATTACATATCAACATATCAATAATCAACATATGTGATTACGTAGGAAAAAATGCA:1 + chr3L 2989875 3' + flea 239 2 64.36 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACACTAAGCGCACTACCAGCTCTTCATCTCACAGTTCTTCTTTCTTTTCGAGTC:1 + chr3R 26799018 3' - P-element 22 1 55.45 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGCTAAATCTGCACAATTTCTTGGCT:1 - chr3R 31962073 3' - Doc 58 1 76.24 ATCAGGATCAATAGACGAGNCGATCTGGCCATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCTAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCC:1 + chrX 14770551 3' + INE-1 93 1 68.32 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTACATTCACACAATTTCTG:1 - chr3L 24150531 3' - blood 41 2 67.33 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTGTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCTCTGATTTTCCACATCCACAATCCG:1 - chrX 10426901 3' - 412 51 2 75.25 ACACACACACACACATATATATATATAGGGTCGGAAAATGGGAAATGGTATCGGTAATGTGGGCAAGGGTGAGACAGGGG:1 - chr2R 10979651 3' + Quasimodo 39 2 62.50 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCGCTCCATCCCGCTCGCACGATTCTTTGGGGTTTCTCTGT:1 - chr3L 5206553 3' - roo 36 2 61.39 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGCAGGCGGCCCTGAGAACGCGGCCTGCAGGCA:1 - chr2R 5813586 3' - HMS-Beagle 41 2 66.34 TGTATGGTACGGCTCGATTCCCGGGGGTATATGCTAATGCTTCTGTGAATACAGATCTCTTGGCTGTGCACATAATTGTCCATTGTTGGCACTTATTTTT:1 + chr3R 7880250 3' - Cr1a 4388 1 71.00 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGATTGAAGATAAGGATAATGCTAGATGATAATACTCACATGGTGCATGACATCCCGGTGCGTGGC:1 + chrX 17873260 3' + 412 7535 2 65.35 GACCGCGGCGAGGGATCTANACCAACATAATTAGCTTAATTTATATACATACATACATATAAAATGAAATGATATGAAATCGGCGAGTGTTTTCGCTGCG:1 - chr2R 22661169 3' + gypsy6 367 2 55.00 ACCAAAAAAACAAAAAAATACTTCTGCAACACGATAAGTCGTCGGGCTAAAGAGACTTTCCTTTAGTTGAGTTACACAACTTTAGT:1 - chr2R 11156278 3' - Tc1 1397 1 91.86 TTATGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGCCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACG:1 + chr2L 9319116 3' - jockey 29 1 53.00 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTGGGCGAGTCGCACACTCAAAGTGGCC:1 - chr3L 3486215 3' - jockey 4677 1 74.26 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCACCGGGGCAATGGACTTGTCCAGGAAGGAGAGAGCCCAGGATATGTCATCCTCGCA:1 + chr3R 23957818 3' - jockey 4814 1 62.00 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATTCTAGTTTCTAGCTT:1 + chr3R 18549978 3' - pogo 33 1 65.35 TAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTCATGTCGTACAGCGCTGATTTCTGCTCATCCTCGATGCCAAATCGCACAAA:1 + chr2L 4453848 3' - jockey 178 1 55.45 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGAGACAGCACGAGTGCTGTGGAGACAGAGAAGGCACGATGAGGAG:1 + chr2R 8385179 3' - hobo 34 1 55.45 TTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCGGGGTAGTGGGAAACTTCTTGGCACTTTCATGAACTTCTGGCC:1 + chr3R 25514183 3' - hopper 30 1 55.45 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTG:1 + chr3L 3428049 3' + roo 356 2 79.21 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCNNNNTCTCTTTTGCCCTCTTGCGGCTTCTGTGTTGTCT:1 + chr3R 13684232 3' + Tirant 8450 2 59.14 GAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACTGAACGAAGCTCGTATAAGGACTTTGGCTAGTAAGTCAATGGCTTGACTTTTAGCCT:1 - chr2L 15526966 3' + pogo 2092 1 63.83 GAGTACCGAGTGTTTATCGTGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGGATACATTATTGTGCCAAAGAAAATACA:1 + chr2R 15595262 3' + hobo 2902 1 69.23 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACGATTTAATGTGGCCATAGTTCTGTCGACGACTGTCA:1 - chr3L 15444832 3' + mdg1 7423 2 62.38 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCGCACTTTGAGGTTGAAAAATAATCTTAACTTTCTGCGCAATCATTTTAGA:1 - chrX 152957 3' - mdg1 26 2 53.47 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAA:1 + chr3R 30611287 3' - blood 52 2 76.24 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAA:1 + chr3L 17708297 3' - jockey 4793 1 56.00 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCAT:1 - chr3R 11151821 3' + mdg3 215 2 56.44 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACT:1 - chrX 21400804 3' - P-element 39 1 26.25 TAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGATCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCAAATCCGCACCTCATCCACCTCTGGCAA:1 - chrX 6006268 3' + jockey 4686 1 70.00 TGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATGCGTGAAAATACAGACATAAAATAAATAATCACCATCCAATTGAGTAATTTCA:1 - chrX 3691517 3' + jockey 4978 1 47.37 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATATAAAATATTCCTCTTTGATTTTTAGTACCAATGTCAACCCATTGCTTTACATAAAACT:1 + chr3L 22112920 3' - diver 20 2 60.40 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACATGCAT:1 - chr2R 19557974 3' - 412 7080 2 52.48 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCATCGACCCCAATCGGTCACAC:1 + chr3R 27582824 3' - pogo 30 1 60.40 AGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCATCCAGCCGCATCTGCAACTCCAGAGCCCAACCCAAC:1 + chr3R 22439528 3' - R1A1-element 5111 1 66.32 AGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGCTTTGTAAATTTGACAAAATATCCCTTCACCTTTTCGTCCTTTTCGTCCCTATCGCCTTGCTCCTGTA:1 - chr2L 6246392 3' + 1360 168 1 61.39 AAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCAAAGAGAGTAACTTGATTGAGGGGGTGGAAAAAGCGGGTGCCAACG:1 - chr3L 21214433 3' + 1360 3272 1 60.00 GTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGCCGGGTTTATGGGTGTGAATAAATCAACGGAGCTGTCAGAGCTCGTCTATGGGTCAAAGGCAAGAGATC:1 - chr2L 8878714 3' - I-element 5080 1 71.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGCG:1 + chr3L 5206598 3' + roo 9020 2 77.23 AGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAAC:1 + chr3L 19350017 3' - 1360 3208 1 50.50 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATA:1 + chrX 7534723 3' - Tirant 8120 2 67.35 ACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCACACACATAGATACCGCATGACCCCCCTAATACCAACACCCACCCATACACAGAATGAATGCAAA:1 + chrX 11796856 3' - invader4 20 2 71.29 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCAACCACAAGGCAAATAAAGAGGGGCTTGGTCGTGGCACACAAAGCCAGGCCAAAACA:1 - chrX 8343625 3' - hobo 14 1 61.86 GTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACATAATTATATCCCACAAATATGGATTCTACGAAACATTTACTGGATCCACTGTTAGAACTAAAAGGAATATTTTTA:1 + chrX 11987973 3' + 412 7542 2 78.22 AATCTCAGGAACTATAAAAGATAGAAGGTTGAGATTAAGTATGCAGCTTCCGCATAGACGCAGCGCAAGTTTGTATCCAAATGTGGCCACGCCCACGAAAC:1 - chr2L 3995870 3' + INE-1 150 1 65.35 ACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATAAATGTCTTACTATAAGTTTTATTTAGTTCCATTGCTAGTTCAGCTTTGGAGACTTTAAAGCTCAGCCCTGAA:1 - chr3L 2714443 3' - BS 15 1 69.31 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAG:1 - chr3L 5974009 3' - hobo 54 1 75.25 AGGCAAAAAGTATAAGTGCNTGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATACAGTAATACGGTTGGAAGTAAAGTGCGAAATCTCCGACCATTAAGATAA:1 - chr3L 14994909 3' + 412 174 2 54.46 GCCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGCCTCAGCTAATTTGCTTTTTATTAAGAGATACCCGAGCATTCGCCACCAAGCAGAGTCAGCAGCTGCA:1 - chr3L 18504271 3' + 1360 3377 1 67.33 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATAGTCTACTTATATGTGAGAAAAAAGTATTAACGAAGTATTGACAAGT:2 - chr3L 12717791 3' + pogo 2077 1 55.45 AGTTCGGAGGGATCCGAAAAAAGCATTGTACCTGGGCGCCACTCGGATAATGGCCAACAAAAAATAAAACAACTCCAGTCAACAGTCAACAATCATGAGCT:1 - chrX 17217691 3' + R1A1-element 5329 1 74.26 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAA:1 + chr2R 8707100 3' + flea 240 2 62.37 GTCGATCTAGCCATTTCCGTCTCTGCGTCTGTCCGACTGTCCGTATGATCGGAAACGCTTCCTTTTACCTATTACTTACTTTTCAACGAATCTAGTATATT:1 - chr3R 28636009 3' + INE-1 111 1 57.43 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTTGCTGTGTAAGCCGTATTTAATTAATTTGATTTAATTTCT:1 + chr3R 20872795 3' - copia 4882 2 64.36 AATAAAGACTGTTCCAATCATCGTTCTACGGTTAGCTAGGGCATCTTTAGCGAGATAATGAAAAAAGGATAATAAATTGCATTAAATTTGACATCGTTGTG:1 + chr3R 18721622 3' - Cr1a 4027 1 65.35 AAAATGACCAACTGCGTTTNGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACAC:1 - chr2L 17549309 3' + mdg1 7413 2 68.32 TAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTGTGGGCCCAACAATCAGAATTATAGCTATACTGTTCCCCAATCAACGAATCAAGTTCATGTTGGTGCTAACAGAT:1 + chr3L 12782419 3' - 17.6 7377 2 79.21 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTTCTAAAAAAAAATAAATTTTTTTTAATGAAAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTAAAC:1 - chr3L 25782375 3' - Doc 23 1 54.46 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGNCTGTTGGGGTGTACATGGCAACATCAGATCGCTCAAAGCGTGTGTGCCCTTTGAAGTATGCTACACTTTGTGTTGCATGGG:1 + chr3L 16662482 3' - jockey 4682 1 66.34 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGG:1 + chr2L 20709433 3' + roo 355 2 80.20 ATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTACGGCATTTTCCACTTTGGGGCGTTCATGAATAATTATGTTGTC:1 + chr3L 15854564 3' + roo 360 2 56.44 AATTGTAATTATTTACTTATATGGTATATATTATATATTAATGTGTTCGGGGAGAGGTGTGTGATTCAGGCAGTAATTAGATTGGGATCTGCAAAGTCGCT:1 - chr2L 13913216 3' + HMS-Beagle2 7199 1 77.23 GAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGTTTCTGCTATTCCTGCATTGTTTAAGTAAATATTCATAATTGTTTTTCTGTTTGATATCGCATAATAA:1 + chr3R 24288552 3' - hopper 1158 2 71.29 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTGTTTAGGCCTTTCTGACTGTCCCTCTCTCTCTCTCTTTCT:1 - chr2R 18232679 3' + P-element 2853 1 43.56 GTCCCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAAAATCAACCACAAAGAGCATCTGCACATAATATGGCGAATTCACGGTGA:1 + chrX 4403493 3' + I-element 50 1 68.32 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACCATGATACTTTTGGGATGCACTTGAAAGCTTCTCTGCTCAGGGAAAATTGT:1 + chr3R 13239977 3' - jockey 32 1 48.51 GTAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCATTGTAAATTTGGCTTAGTG:1 + chrX 3465609 3' - hopper 58 1 95.05 GCTATAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCGATTACTCCGCTAGCATATTATTAGAATACCTATAGAAATTGACAAAAAAAATAATATATTAATTCAAA:1 - chr3L 7048203 3' - INE-1 567 1 43.56 TTTTGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCAGCTGACTGCTCGCATCCAAGTCGTAAATCTTAATTTGGCATGCGAGTT:1 - chr3L 15031642 3' - 1360 3345 1 52.48 AGCAATAGGTGGAGCTATCNCCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGGCAGCTCCTCATATGTGCGGCTTATGCAAATGGGCATACTCTC:1 + chr2R 15952585 3' + R1A1-element 286 1 54.00 GCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATC:1 - chr3R 4357558 3' + Tc3 1662 1 73.27 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTATCATTGCGACTGGTTTTAACAAAGACACTAGAATTCTAGTGTTATTAGTTATTCTAGTGTCTTCGGTT:2 + chrX 22897290 3' + copia 248 1 71.29 GCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAAATGAAACAAGTGAAGGAAGCTCCTTAACCAGCATAGC:1 - chr2R 8706997 3' - flea 4764 1 72.28 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGAACCATTTGATAGCAACACGTCTTTCTGGTATTTTCACACGCTT:1 - chrX 1713976 3' - hobo 29 1 58.59 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAACGATACAAACAGTAGCATAACGTCATACAACCTGCGTCTTTCAAAG:1 + chr2L 21628938 3' + P-element 2860 1 53.47 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCAACGCAACACCCTTTTGTGTGAGTATGTGTATGTGTG:1 - chr2R 10548361 3' + hopper 1374 2 63.00 TGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACTGTGCCACTATGCGATGTTGTAAGTATCGTTCACAGTGATGACTCACA:1 - chr3L 19370757 3' - Copia1_DM 56 1 80.20 TTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTATACCCGCGATATGGGTGGAGCTGGGAATGCTGTGAGTACTGCAAGCTGGGGGCTGG:1 + chr2L 3227461 3' - R1A1-element 5060 1 58.42 ACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTGTCAAAGGATCAGATACAACAGGGCGTATGAATAATTATCAGA:1 + chr3R 18094455 3' + Idefix 7147 2 64.00 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCTGAAAGCCAATGAGGCGCAAAAAAAATGAGGCCCCGAAATGTATGCTACAAAAATGGGTATGAAGAAA:1 + chr2R 11160625 3' - jockey 17 1 62.38 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATGTTTCTCTTACTTTTCCGCAACAATGAACATCTCGTGAA:1 - chr2R 13446629 3' + roo 9063 1 68.32 ATCATATCTTCACAAAAGGNTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTGTAGATG:1 - chrX 7534627 3' + Tirant 375 2 55.45 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCATGTGGGCTGTCACTGATCTCCTTGGTGCTCCCTTTTTCCACACTTATGTTTTTTTTTCGACT:1 - chr3R 12906510 3' + hopper 1404 2 69.31 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTACCTATCGCTCCTCCACCTGAACGCTATCTATCAAATCAATTATGCTTTACATATTTACTA:1 + chr2L 6322619 3' - roo 15 2 64.36 ACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTCGTCGACGAGCTCAAGCTGCTCGTCGCTCTCCTGCGCGTCCTTCCTTGAAATGCGAA:1 + chr3R 28405506 3' - 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BS 5048 1 48.51 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTGCGCATTGAGCAGATCAATAAACATGGCAGCGCAAACGGTCGTAAG:1 - chr2L 435207 3' - FB 31 1 54.46 TGTTCTTAATTGGAGTTCANCATTACATTGGATTGAAGATAAGGATAATGCTAGATGATAATACTCACATGGTGCATGACATCCCGGTGCGTGGCAGGCAG:1 + chrX 17873266 3' + 412 488 2 71.29 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACCTTCGCTGCAACCTCATTTCGTTGATG:1 + chr2L 4571363 3' - roo 8712 2 73.27 AGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCCAAGTTCACATTTCGGCCGGAGATAAAATATGTGTTTCTCACGGCGCCTTA:1 + chr3R 29346161 3' - F-element 258 1 59.41 ACTAATTTGATTTTTAGGTNTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTTGCATTAGCATATGCACACATATGTATAGCATGTAGGAA:1 - chr3L 899700 3' - Doc 4419 1 60.40 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGGACTCTGGCTGGCATTTCTTA:1 + chr3L 13568158 3' - jockey 65 1 75.00 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCCGTTCTGATTGTGGCCATTGTGTTTGTATTTTGTAATGCATGTTACAATGG:1 - chr3R 7869108 3' - 297 19 2 60.20 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGG:1 - 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Tabor 39 2 62.38 TATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGCAATTCATATTGATATTTTACTGATATTCTCTTTCTTAAAGG:1 + chr2R 5307393 3' - Burdock 6365 2 58.42 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTAAGACAACTGCGCTACAAATCAATTGTGTCGACTGTCGGTAACCCCTCATGTTTCCCCTTCCAGGT:1 + chrX 19615004 3' + 1360 3383 2 74.26 TTCTAAGGCTGGTGCTTCGCCTAGGTAACCTTAGGCCATCATTCAGTTGGCCAAGTTTACTTTAAGCCAGCAGTGACAGTGCCACATAAATGTCAACTGCT:1 + chr3R 17171062 3' + Rt1b 334 1 56.44 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTGGCTGGGGCATGTTCTGCGGGCCTTTTCCGGTTTCTATTTACCCCTCTGCTCGC:1 - chr3R 12937397 3' + roo 402 1 68.32 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCC:1 - chrX 5452556 3' - mdg3 37 2 59.41 ATGGAAAAGAAGGACACAAAGGCGGTCCAAGATTTCCCCGAATGCCTTAATAAATAAATTAATTTAAAAGTCCGAATAAAAGTTAATTTACAAGTTCATAT:1 + chr3R 6284301 3' + X-element 4668 1 68.32 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAACCCTTCTCTTTGGCCCTTACACTGCCACCCCCTCACCACCCGCTCCCCA:1 - chr2L 9319044 3' + jockey 4969 1 51.49 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCT:1 - chr2L 7461070 3' - roo 41 2 66.34 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTGCATTATTCCAATTGCAGAATCACTT:1 + chr3L 13367740 3' - mdg3 5301 2 69.31 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTT:1 - chr3R 20345113 3' - transib2 51 1 76.24 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACAGTGGTTAATATTAATTACAGAAATAATCTGTAAAAAATCATTGCATACTTCTAGG:1 + chr2L 4888807 3' - BS 5013 1 54.00 GGCTATTGATCTCGATCAAGAATATATATACTTTATACGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCCTGTTTTCGCCTGTTTTCCTACTCT:1 - chr3R 21248861 3' - INE-1 87 1 71.29 ATACCATAAAATAAAAAAATAAAAATACCAATAGATGCGGTAACACTTTCTCCATTCATCTCGTTAAATTCAATTGTGATAATCTTGCTCCGTGATGGGGA:2 - chr3R 22464053 3' + Doc3-element 77 1 78.22 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCAGTGACATGGATATGCTTTTTCAGCTGTCAATGGGAACATTTGGCGGAAGCGG:1 - chrX 4240663 3' + 297 6969 2 68.89 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGAGCATTCCTGAAAGGAATCCATTGCCCCCACTTGCCGAGGCCTTAATTACAACGTCGCAAC:1 - chr2R 13099046 3' + roo 393 1 62.38 AGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCA:1 + chr3R 5773215 3' + Stalker4 7323 2 64.36 GTATTTAAGTTTAGTAAGTAAAATGCTGCGATAAAAACATGTGTAGGCACTGGCAAAAAAAAATAGTAGTACTGCTAGAAACAAGCTTACAAAAATGTGTC:1 + chrX 8946298 3' + Tc1 1560 1 80.20 CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTAACTAACTATTTTTTATTACTTTGTGTAATCTTTTGATTATGCTGATTGAGTGCTATCGCTATAAAAAGACTACGATAG:1 - chr2L 8451806 3' + blood 7180 2 69.31 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCATAAATAATTTATAGCAGCAACGAACGAGGAAGTGTTGAGATCTAGGCAACAGCGAACATCCGAAAGTACACATAT:1 + chr2R 14044591 3' + 1360 3344 1 78.22 TTTAAAATTAAAAATAAATTAACTGTTTTTAAAACATATGAATTACTGTATTTTTCAAGGAGGCTGAATTTTTGGAAAAATTCAAAATTCTTGTAATGTAA:2 + chr3L 12853426 3' + NOF 3956 1 75.25 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGCCATTTGATTCGCTCTTCTTCGGTTGAAATCTGC:1 + chr3L 10683504 3' - opus 153 4 66.34 TTAAATTATAACGTAATTTCAACAATCTTTAACACTGCACAACTTTCGCTCGCCATCATCCAGTTTGGAGTAACCAGGCAGATCTGGGAACAAAGAAAAAT:1 + chr3R 18253789 3' - Copia1_DM 3 1 67.33 TATTAATTAATATTAATATTAATATTACATTAGTAATATTTTTCTTTATGTTTATAGACAATTTGTTCGCATTGGGATTACCTACATAGTGGAAAATCCTC:1 - chr3L 17754841 3' + Rt1c 5395 1 71.29 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATAATATAAGGTATTAGTTTTTTACATTTCTATCGAC:1 - chr3L 23634998 3' + pogo 2064 1 66.34 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCATGGTCTGTACACTCGAATGTCTACCGCCCGACTCAAATTCGATTGCTGCTA:1 + chrX 2123756 3' - P-element 24 1 48.51 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGGGCGTTGGGAAGATGGCAGCCAGAATCGTTTGCAATATGGGGCCACAAACTTTATGGTCC:1 + chr2L 3778468 3' - 1360 16 1 57.43 AGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGAGTCGAAACATTCGGTACTAAGCAAGTCACCGGATTGAGT:1 - chr3L 24362802 3' + Quasimodo 319 2 64.52 GAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCAAGGGCATAAAATGAAGATCCAGCTGCGATGGCGCAAAATGCCAC:1 - chrX 15268219 3' + roo 396 1 66.00 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAACAGGCACCGCAGCAGGAACGGAGTAGGAGCT:1 + chr3L 12238892 3' + jockey 4954 1 69.31 GTTTTGCTAGAAGACGATTNTCGGGTTTTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCA:1 + chr3L 19350025 3' - 1360 3199 1 59.00 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGAACCATTTGATAGCAACACGTCTT:1 - chrX 1713996 3' - hobo 51 1 79.21 AGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACATATATCCCGGGACTGGTAAAATATTCCTGAAAGTTATCC:1 + chr2L 20890690 3' - Ivk 103 1 61.00 TAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTGTTTCTGTGTGTGGGATGTGGGCTCCATTAAATTTTTATTAAGTGCAAAA:1 + chr3R 22233882 3' - Cr1a 462 1 55.45 ACAATTGGAAAGACACAGANGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATT:1 - chr3R 4536185 3' - Ivk 31 1 52.48 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATT:1 + chr3R 26342983 3' - blood 7044 2 66.67 ATGTATATAAATAAGTAAATAATTTTTGTTTAAACATTTTGTTAGCATAATTTAAGCAAGAAGCAAAATACAAGCAATTTGAATATGGAAATATTCTTCGA:1 - chr3R 7410495 3' + 1731 4419 1 24.75 AGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAACAATGTCTGGATCCTCACACAGCCAGTTTGATTCAAAACTGCAAAAGGACTCGGA:1 + chr2L 10336302 3' + roo 492 1 59.41 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGAGACAGCACGAGTGCTGTGGAGACAGAGAA:1 + chr2R 8385165 3' - hobo 48 1 69.31 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATGTGTCTAATGAGGGTCCTGGCTCTAAGCTACCTGCCAAATTGGCGAAAGGCGGGAAAGAAAGAGGCAAA:1 - chr3R 11190982 3' + hobo 2937 1 77.00 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATTAAGTGAG:1 - chr2L 20840230 3' + mdg1 7440 2 47.52 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCATTTAT:1 - chrX 19219307 3' - Doc 45 1 66.34 GCTCGAGGGGTTCCTCCAGGAGTCTAAATGACTGCATCAGCAGGAGAGCAGCGGCAATAAGGGGTAAAGACGTTTTTCTTCTGGCGCACATGGTTGCTGC:1 - chrX 8715448 3' - G7 111 1 76.00 GCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACGACAATTGGACGCCTGTGCCACGCTGAACAAATGCCTTGACAGTCTGGCCAGCG:1 - chr3L 15609678 3' - accord2 7594 2 59.41 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGATGAACGAT:1 - chr3R 9870340 3' - F-element 34 1 54.00 AAGATAAAACCAAACCTCTNACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAACTC:1 + chr3L 12634240 3' - BS 5013 1 61.39 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACAGTCGTATATAGAGCGTTAATCTGTGGGCGATTCTCTTCTAGGAATGCGTCGATTGCTGTTCATGCAAG:1 - chrX 18121802 3' - opus 2 2 75.25 ACAGATCAAAAATAAAAGANACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAG:1 - chr3R 11151838 3' + mdg3 5452 2 69.70 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGTAACAACAAGTTGGCCAACATGGCGG:1 + chr3R 20345147 3' + transib2 2787 1 72.22 ACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTTACTATTTCGTAATTCTTCTTACACAA:1 - chr3R 14985293 3' - Ivk 33 1 57.43 TATATCATAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGTGTCGACCCTTAAAGATTGATTTTGTCAAAGAAAAAGCAAAACTAAGCCACGTTTAGA:1 - chr2R 1072783 3' - Tc1 1362 1 62.38 GAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGACCTTCAGGGTATCTGTTTTTCCAGCACCACCATTTCCCATCCCTTAGTGCTCCCT:1 - chr2L 18189530 3' - F-element 4442 1 59.41 TTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATACATCTGTCTACTTCTAGACTCCGAAACCCAAAATTTTGTAGTGCA:1 - chrY 424991 3' + McClintock 6402 2 57.43 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGTGGTTGCTTTACAAGCTCTATTTACCTGCGCACAAATAATTTATTACAAA:1 - chr2L 15907139 3' + pogo 2080 1 57.58 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTCCCGGTTCTGCTATTTTGCTCCACAGTGTAATA:1 + chr2L 3937808 3' - Burdock 6149 2 66.34 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAGGCATGCATATGCGTACTACTAACACACAAA:1 - chr3R 22469120 3' + hobo 2933 1 68.69 GTACATATTATCACAAAATAAATTTCATAAATGACTTTATATTAGCTACGAAATTGGCAAAAACTATTTCAAATAAACAATTAAAGGGAAGCAAACAAATG:1 - chr2L 3250252 3' + 1360 357 1 42.57 GAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTGTTTTTTGTCTGCCGCCGCCTCCAAACACTTTTGCCT:1 - chr2L 14116049 3' + Doc 350 1 61.46 AAATAATAAAAACATCATCNAAAGTGTATTATACAAAAAAAAACAATTTTACAAGCGAACATGCGAATTTATGGCGCATTAAATTATTCGCTTCGTAAAAG:1 + chr2R 23441796 3' + jockey 4990 1 58.42 GAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGG:1 + chrX 21907826 3' - ZAM 230 2 62.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGAT:2 + chr2L 16127750 3' + roo 356 2 78.22 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTACATGTGCATGTACATATACACTCGGCTATATAGAACAACCCACAAGTCGGCT:1 + chr3R 10090397 3' - pogo 18 1 63.37 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTG:1 - chrX 15412666 3' - hobo 21 1 58.42 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGATGTGCATGTATTCAATGAGAAAGAATGATTGTTTTTAGCTAGTTATTAAATTTAAATGATTGTAAACT:1 - chr3R 6609682 3' + Transpac 5223 2 72.28 TTTTTTTTGTTTTTGTTCGTTGCATCTGTCGGATTTGTGAAATCATTTTCGCCGACTTGCCACCAAATAATAATCAGTAGCGATAATGGAATGCCCTTCGT:1 - chr3R 18041776 3' - gypsy2 395 1 74.26 AGGGTGAAAGGGAACACCCAAGGAAAAGGTCGTGCACGTGTTTTTTTTTTTGATGCAACCCATTTCGCATTCCCCCCCCTGAAAGTTTGCC:1 - chrX 5823385 3' - hobo 2631 1 74.73 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGCAAACAAAGGACCTCTCGCCCACC:1 + chr2L 15848278 3' + hopper 1380 1 70.45 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGACTAAGTACTCTTTCCAATCTCTAAGCTTAGTTCGAAAATATACGAA:1 - chr2R 24169909 3' + roo 379 1 54.46 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCAATCTTCGTTAATTTGGGTTCTTCGTTTTCCAATTTAATATGTAAGATAACATG:1 + chr3R 9858915 3' - BS 17 1 56.44 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAACTCCTTC:1 + chr3L 12634244 3' - BS 5009 1 65.35 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGCAGTGACGGAAAAATG:1 + chr3R 19950529 3' + BS 5075 1 57.58 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATGAATGTGAATAAACGTTGGGCTGTGGATGATGGCCTATGGGTGGGTGGCGGCCAGCAATT:1 + chr2R 15303074 3' - FB 15 1 64.36 ATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAATCAATCTGATGAGTAATGCAGTTGACACCTTTTTCGCTGCATACTTTTGGGCAGCCTAATTTATAAG:1 + chr2R 10857776 3' + BS 5085 1 60.00 AATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAACACTCTCCTTACACTAGCGGCCGTATACTGCCCCCCCCGTTTCACAGTATTAGAAGCT:1 + chr2R 3622919 3' + Stalker2 7633 2 61.39 TAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTAATTGTTTAAGCTTTAATCAAATATTATGTGTAGTATATATGATCTCTCTTGATATATGATG:1 - chr3R 20192494 3' + Quasimodo 7360 2 66.34 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCT:1 + chrX 21400830 3' + P-element 2843 1 35.64 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCTCTGATTTTCCACATCCACAATCCGCGCCCACC:1 - chrX 10426893 3' - 412 7096 2 69.31 CTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATAAATCCCTGTCAATCACACTCGGCTGTCATCATCATCAAAACAGTCATCAGCGCTCTAGAT:1 + chr2L 16412694 3' - 1360 473 1 70.30 TACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCC:1 - chr2L 16456769 3' + BS 5060 1 55.00 ACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCG:1 + chr2L 12199499 3' - Stalker2 7301 2 78.22 AGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCAGAGGACACATCCCGAAGGATGAACACATTAATTTGTACACGAAGTGAGCTATCAGAACCTTCAAAAGT:1 - chrX 21933233 3' + gtwin 7346 2 66.34 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAATTACACCGAGCTGGGGCAAAGAAAAAAGTG:1 - chr3L 10683453 3' + opus 455 2 69.31 GACTATAGCATTCTCTCTTNTTTTTTTATACTGCCGGGAAAAACAAGTTTTGGGCGCCAGATGGAACAAACTGATTTTAATTGGTCTGCTTGTTACGAGAT:1 - chr2L 22699406 3' + INE-1 580 1 78.22 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACCCCAGTCCA:1 - chr3R 30611218 3' + blood 365 2 68.32 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGACAAGACTAGAAAACGGCTAGATATCACAACT:1 + chrX 153021 3' + mdg1 378 2 71.29 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCCTAAAAGTAGGCAACAGTTTTTTCCAGTTTTCCTTTTAGCCTTATTGCGA:1 + chr2R 18988512 3' - hobo 6 1 66.34 AGATGCGTAACGGCCATAAATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTGGGTTCCGGACTCCCGTACGTCAGATCATTTTGGGTCTTCGAAGGACAAAAGCG:1 - chrX 6634580 3' - 1360 3369 1 57.43 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCA:1 + chr3R 20284786 3' - pogo 46 1 76.24 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAAAAATAAAAATAAATATAAAATAATATCATTGCAAAAAAAAA:1 - chr3R 23921658 3' - Doc 38 1 57.43 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCATATACTAAGTGATGACTAATAATAAGATTTGTTGGTGT:1 - chr2R 8717640 3' - 297 6612 2 63.37 AGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGG:1 + chr3R 10736102 3' - McClintock 5992 2 74.49 TTTTTTTTATTTTTTTAAATTTAGAATTCCATATTATATGAATAGTACTTTTTAAGTAGTTGATGCAGGTTTGTTTTTATAACAACCCATCAAGGATCAGT:1 - chr3L 18038301 3' - TART-C 11097 1 70.30 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACGACGAGTGAGCGTGTGTGCACAGGG:1 - chr3R 13520186 3' - jockey 4721 1 75.25 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCAACGCCTTTTCCACCGCTATTCCCAGGTCCTTTT:1 - chrX 9904605 3' + hobo 2905 1 64.89 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACCCCCAGCAGCTGTTTGGGCTGCACGTGAGCGAA:1 - chrX 21374175 3' - P-element 26 1 48.84 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTTTCAGATATATAAAATATGAAGTTCTTGAAATGGTACAGCTGCGTTATTCTGAAGAACATTTC:1 + chr2R 19513451 3' - roo 8676 2 61.39 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTA:1 + chrX 11025563 3' - hopper 41 1 67.33 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTTTCAATGCCTTTAAATTTTAATATACCAGCGAAACAAACACGTAGCGAATATT:1 - chr3R 15880878 3' - 3S18 24 2 56.44 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTA:1 + chr3R 14049394 3' + transib2 2778 1 77.42 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGAGTCTCTTTCGAGGGCCGGAGAACCACTATATATATGGGGCTACGGAAGGCCCATACCCTCA:1 - chr3R 15537288 3' + P-element 2875 1 67.33 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTCCATCCTTCCTTTCTTAAAAACTAAGAGCACAAATAAATGTTTTATATTTGGCAATAC:1 + chr2R 10399214 3' - pogo 13 1 66.34 GCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGCCTAGTCCTTCTCTCGGCGGCGTTGACAGTCGCAAGGTGTATGGCGGG:1 - chr3L 22374444 3' + Doc 438 1 57.89 TTGATTATTGGCCTTTTGGCAAACGATAATCTATAGATTCCTACATCGCTACTCGTCCTTTTCCGCCGCCAACATATCCCCCTTTCAGATTTCAATTAACG:1 - chr2R 21938482 3' + 3S18 420 1 57.43 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCAACCCCAGCTGCAACCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGG:1 - chrX 12768243 3' - FB 60 1 70.30 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGATATCTAATCTCATTCCACA:1 - 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copia 9 2 68.32 ATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAAACAAAAGCTTTAAATATTTATTTTATGATATTTAAGCCGTTAACAAGTGCGATAA:1 + chr3R 28731130 3' + accord 203 2 64.36 AGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTTATCCATTTAATGTTCTTTTCAATGGATATTTTCTTAATGTTTTTACGGTGTATATGTACGATT:1 + chrX 8334523 3' - BS 5008 1 65.35 GCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCGCAGCCTCTCGCGTTTGCCGACGATGTCCTTAATTATGTGCCAGCAGCCCTGACTGACT:1 + chr2L 14043651 3' + roo 152 2 66.34 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGCTATGGACCATAAAGGCAACAATTCATTTATCGATGATTTAGATGAGATTTCAGAACACCG:1 - chr2L 16939788 3' + opus 485 2 65.35 ATCAGGATCAATAGCCGAGNCGATCTGACCCTGTCCGTCAATAATTTTGAATTTTTTATTTTTATTATTTTTTTTCTCCCAATTTCCACCGATATTCCA:1 + chrX 15903306 3' + INE-1 93 1 79.80 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGGC:1 - chr2L 13214974 3' + roo 402 1 68.67 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTCAATGCGAAATTGAAACAA:1 + chr3R 25950133 3' - 412 54 2 76.24 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAA:1 - 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F-element 31 1 55.00 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGTAGGCACTAATAGATGATT:1 - chr3R 5993114 3' - pogo 33 1 62.38 AACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATTTTATAAG:1 + chrX 21587718 3' - INE-1 131 1 57.43 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCGGCATTGTGTCACCTCTGATAAGAAAAGATTTTGAAAA:1 + chr3L 12903885 3' - Doc 44 1 62.38 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAGAGATATGTACGTGGTTGGAGAGTGGAGACTGGGGAATGTGTCTCATTGG:1 - chr3L 749256 3' + P-element 2881 2 72.28 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGCATTAAGTGAGTCCGTG:1 - chr2L 20840224 3' + mdg1 409 2 42.00 TTTGTATCGCAACGCTTCCNGGTTCGATGTCTTCACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGAATTGAAGAAATCACAGGTGATGATTAAC:1 + chr3R 21427215 3' - ZAM 8038 2 75.25 ATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACTTAGAAAGATCACAAACGATGGACGACCTGAGG:1 - chr2L 18489540 3' - G6 1999 2 67.33 TCAATGTAACTGTTCTTTTTGTTTAAAGTTAACAAGCGAACAAATAACAAAAAGTCAACAACATTCACATAGAGCTCCTACAAAGCACCCCTCAACCCCTC:1 - chrX 9946837 3' + Tc1 149 1 80.20 TAAACATTTTTTGGGTTTTTTTTTGTATTGTTGCTAATTGCCCTCGTAGTGTCTT:1 + chrX 2513611 3' - mdg3 5109 1 65.45 TTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAAGCTCTTGAAGTGTAATATCTATGGATAGTATTTGACACTCATACATTTGACAGACATACACTGG:1 - chr3L 21912239 3' - Bari1 7 1 72.45 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATA:1 + chr2R 8232522 3' - P-element 56 1 23.76 GGTTGCATGAATAATAAGTACCATATATGTTGGCTCTCAGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGCTGGCTTCTACGGTCTTTTCGTTTTTGTAATCCCA:2 + chr4 957210 3' + Tc1 91 1 63.37 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATGAAGTGTTTATAACTTCTTTGGTTGC:1 + chr2R 18105846 3' - roo 8668 2 75.25 TTGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCTCTGTCTCTTTCTCGTGCTCCCTCTCGCATAGAAGTTACCTGTGCTGCTCCAC:1 + chr2R 15676327 3' + Cr1a 253 1 56.44 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAG:1 - 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chr3R 18769558 3' - roo 8678 2 61.39 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTCCCATATGAGTTGAGGTTGTATATAACTTTATCTTGCCATAAATTCTTTATATATAATGATAA:1 + chrX 23280026 3' - 412 12 2 67.33 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCCTGCAAGTAATGTACTGTGGAGGCGCTTGTAAAAAATTACTTGCATAC:1 - chr3R 8460852 3' - BS 21 1 51.49 GAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTGACTGGTCGTGTTGATCGGTACTTGCTGCTGCCGCAGCTACACACAGCTACAAATATTGCAA:1 - chrX 17258971 3' + invader4 2977 2 71.29 ATTTGGCCAGGCAGTAGTAAAGATGTAATCTCTGGCCATTTTGGATTACATGTGAACAAACCAAACAGGCCAACGAAATCACCACACCCGTTGACTACTCT:1 + chr3L 4286445 3' - Helitron 218 1 56.44 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGATCGACTCGGCTTTTGATTTTCCTTCTGCCTTTTACATACTTTTCAACGAA:1 - chrX 124083 3' - Juan 81 1 54.46 GTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAG:1 - chrY 680456 3' - invader2 4 2 66.34 GCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTATTTTTACAGACGCCCCCAATGCAAATTTCGCTTTTAAATCGAATAAGCATCGGGGA:1 - chr2L 16653257 3' - P-element 222 1 60.40 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTC:1 - chr3R 14049329 3' - transib2 14 1 65.35 TCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAATAAACAAAACCAAAACCAAACCAAAATCTGTAAACAAAAAAAATTTTTCAAATGTATTAAAAAAATTAAGA:1 + chr3R 4064544 3' + G4 66 1 75.25 ACAATCGATCCCGAAATTTTGATTAGTTTTATTTTGGCACATCTTCGCGTGGTGGGCAGGCCGTACTTGTTCAGCTTGGGGATCAGATTCTTGTAAGCGTT:1 + chr3L 2792081 3' + 17.6 382 2 64.36 GTCAAAAGCCTGTAATATGTGTTTCACCAGTCTGTGGACCTGTTCAATAGTTCCGTGTCCCTTCGAAGTCCCCCTTTCTTCACCGACTTCCTCCACGA:1 + chr3L 11382011 3' - Helena 345 1 67.35 ACTCACGGGAGTTTCCTCAGCACTAACTTAACCGCTACCCATCTCAATCCCAGCCTCTCTCACTTTCTCCACTTTCTCCGCCGCCCCGCTCACTCCCATTT:1 - chr2L 9882131 3' - HMS-Beagle2 435 1 88.12 GAAACTGGTGTGAGGGCATNAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGTTCCGCCCTGCCCTTTGTCATTGTCTTGTGTGGTTTG:1 - chr2L 379964 3' + micropia 5300 1 62.38 AGGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCGATAAGCCTGGACTGAAAGTGTTGGACTACGCCGCAGTCCGGGGAGTTGATAGGTTCTACTTGGAGTGC:1 + chr2L 9350670 3' + invader4 3010 2 72.28 TTAGTCTTGTAAATTTCTATCGTTATGCCAAAAAATTTGGCATTTGGCTCAGAATCTCTGGCCAGAACAATCACGAACAATGAAGACTGAACGGCGGAAAG:1 - chr3R 24909839 3' + INE-1 298 1 64.36 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTAAACATTAAAAGGACCGTTAGATACGCCTTAAA:1 - chrX 12378699 3' + hobo 2896 1 67.33 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTT:1 + chr3L 25059122 3' + mdg1 7405 2 79.21 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCCCATGCAACCGATCTGCAGGCTTAAGAGATATCGATCTGAACAGCTGGCAGTACATGTAT:1 - chr3R 18171751 3' + 1360 3377 1 67.33 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATCTCTGATTTTCCTGAGTCATACATTTGC:1 - chr2L 4110917 3' - Doc 4 1 78.22 GAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAACCAGGCATCTGCAAATAAGCGATTGATATATTGATTTTC:1 + chr2L 5004217 3' + X-element 4505 1 61.39 TTATTTTTTTTTTTCATTTTTACACATTTTCGAGCCAATGGGCGCCCCATCGAACATGCGACATTTTTTGTGCGCCTTCCGAAAGTTTTCTCCTTTTTT:1 + chr2L 12636831 3' - Doc 4696 1 66.67 ACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGCCTTGAAGT:1 + chr3L 12634209 3' - BS 5044 1 75.25 AACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAACATCCCACTCCACACAGAC:1 + chr2R 8707119 3' + flea 5010 2 76.24 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAACAGGCACCGCAGCAGGAACGGAGTAGGAGC:1 + chr3L 12238891 3' + jockey 4955 1 69.70 TTGCGATCTGACAGGTCGTTTGCCCAGTCTGCGTCGGCGAAGCCCATTACCTGTTCGCCGATATGCTGGTTGGGATTTTCCATAACCCTTGGCCAG:1 + chr3R 26885633 3' - Copia1_DM 3855 1 62.50 GTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTGACAGTTAACTCGGGCACAACCGTGTCCATCAA:1 - chr2R 5301535 3' - S-element 161 2 69.31 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGAGCTCTCCTCCGCAACGTCATCAATTGTTAATG:1 + chrX 10426938 3' + 412 448 2 67.33 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACAGATGTATCTCAAGCGAGGACAATCCTTTCGCTGCGGTTTTT:2 - chr2L 18927473 3' - mdg1 7072 2 56.44 GACATAAAAATTTAGACTTNATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCC:1 - chr3R 14049347 3' - transib2 31 1 56.44 AATTAGATTCGGCTGCAATTCCCCAAATCTGGAGGCGGCGGATCCGGAAAGAATTCAGCCCGATCGTGAGCAGAACCTAGCCAGCGGCGATACCAGTGCC:1 - chr3R 27126759 3' - Helena 1093 1 72.00 ATTTTTGTCTTTTGCATTCCTTTTTACAACGCTTCTATTGCAATTTTTTCACTTTGCTTAATTGGTAGTGACATTTAAAGTTATCACACGTGTGGTATGAA:1 + chrX 21501183 3' + S-element 293 1 58.42 AACCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTAGATTCACCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' + Cr1a 4039 1 62.38 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATGGCTGATATAACATCATTAATCCGATCAGATATCCCCCAATATGG:1 - chr3R 4769449 3' - copia 32 2 53.47 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCACGCACACCAAAGCAACGAGAGAGGCTGCAGGCGGGCGG:1 + chr3L 13557115 3' - hobo 32 1 61.70 TAAGTTACCTGCATCGAGGNATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTTTAATTACTTTCACCTTCATCAGATATATATACATA:1 - chr3L 17146814 3' + pogo 2062 1 65.35 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCGCCAGCGAGTACTCGAAAGTTAATTAAGCCCTT:1 + chr3R 24732947 3' - BS 40 1 65.35 TAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTTCAACAGATTTATGGACAAGACTTTGCTAGTTGAACCAC:1 + chr3R 14985363 3' + Ivk 5342 1 58.42 GTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGCGGCTTTTACTAACCGAAGTGACACGTATGTAATTACCCGCCTGGACATGGCCAGTCGGAGGAGCTGGCTGTGCGGAG:1 - chr2R 8039108 3' - gypsy2 6807 2 67.00 TTTTACTTAAGAGACTAACAATAGGTTTTCTAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATAATTTTATGAAATGATTAATAATTATTCAGAGCAAAAAAAAGG:1 - chrX 12508493 3' - Doc3-element 4683 1 74.00 GAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTACAAATGCTACTTTACTCACATTTTGTTGCTCTGTG:1 - chr2R 7132476 3' - opus 17 2 62.38 TGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTGCCGTGTTCGTGTGTGTGTTTTCGGTGTGTTGCAAGCTTCAGTTTCTCGGCGATTCTGTGGCCCACGGAGAGGTAAGTTC:1 - chr2R 16678973 3' - gypsy3 419 1 71.29 TGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGGCATCTATTTTTAATGCGCTTAAAAGTATGCAGGAAAGAATTTTAACGCTCAGAGCTT:1 - chr2L 6583310 3' - hobo 18 1 61.39 TGCATACTCGGATTAGTTTNCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTCCACATACTGATTTTGAAACAAGACGGTTT:1 + chr2R 4470955 3' - Doc 4511 1 69.31 TAAGTGGATGTCTCTTGCCNACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTGTGC:1 - chrX 10547656 3' + P-element 2859 1 52.48 ACTGACTGCAACGCTGACTTGCACTCGACTCCTTCGACGTGACCTACTATCTTCCCATTATTCAAATTATGCTCTTTGGATGACTAATTACCTCTGGATTA:1 + chr2R 12879677 3' - flea 4895 2 65.35 TAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATAT:1 + chr3R 9613488 3' + invader3 5424 2 61.39 CGCATCCTTCTGCCTGTTGCATACATAACAAACCTAACTAACACCTTTAAGCAAATTGACGATTGGGGCGACCACTCTGGCTCAGTCTTATCAAAAGACAA:1 - chr2R 5529291 3' - INE-1 30 1 27.72 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATGGCGTGAGGGAAGATGGGAAATGTCGAGCCAATAACCCAGCCGCATTTCCATTTCGTATTT:1 + chr2L 15479636 3' - blood 15 2 64.36 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCT:2 + chr3R 30252335 3' - 412 7098 2 68.32 TATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATACTTTTATGGATGAGGGGCTTGCGAGGG:1 + chr2L 12779659 3' - flea 4801 2 74.26 TGGCATATATTGGTTTATTACACGATACCCTTTCAGAGATTTTTGGCAGCTGATTGGTCACGGCTAAGATTTCGATCAGGACATCAATCAGTGATTGTCTT:1 + chr3L 15435633 3' + blood 7389 2 75.25 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATA:1 - chr2L 21372955 3' - roo 47 2 76.24 GGGACGATAACTTATAGGGNAATAACTTATATATGCATTCTCATTTGTATGTCAGCAGATTGACAATCAAGGCATCAGTCAGCGTGCCAGGCCATTCGATT:1 + chr2L 13913348 3' - HMS-Beagle2 6889 2 73.27 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTC:1 - chr2R 18105757 3' + roo 9032 1 65.35 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCAACCGTTCCGTTCTTCCGTACAGTTCATTTTTAGCCACACAAGCGCAAGGTTGGTTTCCTCTACTGA:2 + chr2R 21713384 3' - P-element 9 2 72.28 TTAAAAAATAAAAAAAACAATGATTTAATGACTCTTCG:1 - chr2L 20732768 3' + transib2 2639 1 55.26 AGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTGTGGCATTCCGCTGGCGGCGGGGTAAAAATGATT:1 + chrX 8450357 3' + jockey 4797 1 66.34 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTAGGGTCAGTGGAAGGCCAAGGAAATATTGGGAATTTCACAGAGAGAAAGCAGGACGCGACGGTTGTT:1 + chrX 22774849 3' + opus 7496 2 72.28 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATCCATCGAGAGTCGATCT:1 + chr3R 12937490 3' - roo 8697 2 59.41 TAATTAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTTTTAACTTTG:1 + chr2R 25286859 3' - HeT-A 15 1 75.25 AAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCCAGGTATCTAAGGTATCTAAGAAAATACTTATAAAATTCGCAAAACGAAACAGATATCGC:1 - chr3R 4475204 3' + I-element 113 1 71.29 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCGCACTTTGAGGTTGAAAAATAATCTTAACTTTCTGCGCAATCAT:1 - chrX 152963 3' - mdg1 32 2 59.41 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCATGCAAATTGATGTAAATATAAATGATGCTCAAATATTATTTACACTACAGAAGAGCTAACATT:1 - chr3L 22112614 3' - Doc 18 1 66.34 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGACTTCAGTTTGAAAAACGGCTTTCATTTTGCAACAAGC:1 - chr3R 4773341 3' + Tirant 363 2 62.38 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATT:1 - chr2R 19557982 3' - 412 35 2 58.42 AATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCGCCGCCAACATCCTTTCTTTTTTCATCT:1 + chr3R 6827706 3' - flea 4697 1 72.28 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGCCTTGTCTCTGTGATTTTTCCGTGCGAGGGGAAAAGTGAAAAGG:1 + chr3L 949343 3' - roo 32 2 63.37 GGCAATGTGAACAAGACGAGCGGCTTTTTCCTGGTTCTGCGCTTAACGTGTTGCCATTAAATTTTATGGTCAGGTCTTCCTCTCTTTGTCCGTGTTTG:1 - chr3L 19346493 3' + Doc 241 1 73.47 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCC:1 - chr2R 6769460 3' + 412 448 2 66.34 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCTTTGCCAACTTTCTATAATGGTGTCTTAC:2 - chr2L 7461042 3' - roo 13 2 65.35 GTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTCGGCGATTACATAGCAGCTCAGTCCCGATTGCAGCTGCATATCAATGAGCTTGCCAGGACTT:1 - chr3R 20194398 3' - Quasimodo 318 2 66.34 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAAAGCCCCATAGTGCATTAGCCAGCGAACAGCATCTACATATT:1 + chrX 22597210 3' - hopper 45 1 71.58 AGTTTTGTTGATTGTTTCTATGTTTAAATCATTAAGCTGAACTGCTTTGATTTTTTTTGCCGTCTTAATGTTTGTTTGTGTCGAGCCAAGTGCTATAAATG:1 - chrX 14909991 3' - Porto1 4409 1 72.28 GAGCGAGAGAGAGAGAGCAAAAGCACTTAAAAAGCCTAAAAATAATATGGCGGCAATGTCATGGTGATGATATCCTTTAAGATCGACAAGCAGCTGCAGAC:1 - chr2R 24384470 3' - Cr1a 287 1 54.46 GAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATATTCTAGAGCGACTTCATTACTCC:1 - chr3R 4434004 3' - Juan 30 1 55.45 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAGTAGCCGCAGCTAATGCATATTTAATACCATACAGAATGTGGGCACA:1 + chrX 5452623 3' + mdg3 217 2 56.44 GAGGGTAGGAGGAGCAGCCNACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACTACGAATCCTTCATTTTCTACCGATCAATTT:1 + chrX 16237997 3' - mdg3 5257 1 56.44 AAAAATCGTATGGCGTTACNCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAACCATTTTTCGA:1 - chr2R 5722309 3' - 1360 23 1 56.44 AGCAATAAACTTATTAGGGNATTAATGAAAAAAAAAACATGTACTGCTTGAGAAATAAAAGAAGAAGGGATTATAGGGACAAGGACATGAAATGACACAAA:1 + chr2R 17960118 3' + Doc 4569 1 67.33 GCCGACGCCCACACTTGATNGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTATATGCTTTTAAAGTGTATCATAATATTTGTTAAGAACGTT:1 + chr3L 9856627 3' + HMS-Beagle2 199 2 58.42 GATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTAGCAAAAACTTAAGATGCCGAAA:1 - chrX 13396341 3' - I-element 4882 1 77.23 AAATCAATTTTTACATGGGTCACTACATTCAGGCAAGGACAACCAGAACGTGCAGCTGCATCCGTCGACTTGTCTCGACCACAAGCCCGATTGGGTCATCT:1 + chr2R 7390543 3' + mariner2 266 1 67.33 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACTACCAAACTTTGAAAATGTATCTCCTACGCTTGCTAAGAAAAGAAGATC:1 + chrX 18584988 3' + Burdock 231 2 55.45 TTATTCTCGCACTTGTAAATTAAGACTAACTTAAAACTAACATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATGGAAAACCGGTTTCAGTTGCAGTTGT:1 - chr3L 3537104 3' - Max-element 8428 2 74.26 ATACTTTTCGTAATTGCGCNGCCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCTTACGAGGCAACACCTTAAAATAGTAGAACAGAGAAGTCATGAGTTTGTAACTCCT:1 - chr3L 18297840 3' - GATE 8412 2 62.38 TAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTCCATAAAGTTGATATATTCTAGATCAGGATCATCCGTATGCACGTCGAGATCTTAGTACCTCAATTTTTATTG:1 - chr3R 18377332 3' + INE-1 33 1 68.32 TTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTCATATCGCGTCTATATCTTTTCGCGAAAACGATGTTCTGGCCAACGAAGAGCTCGGCTACTA:1 - chr3L 8090853 3' + Cr1a 4327 1 65.35 AAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCGCCACCAAAGCTTCTTGCTCGACAGACTTTTC:1 - chrX 17133548 3' + Doc 4498 1 68.32 ACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAATACTCTGCCTGCTGCCAAGTACAACC:2 - chr3R 25844320 3' + Stalker4 7314 4 72.28 AGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAAGCAGCAAGCAGGACAAGGTGGAAAAAGAGTTGCCGTGTCGCATAATTTCGCATTGAAA:1 - chr3L 14362246 3' - McClintock 227 2 62.38 TGTTGTTTTAATTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACCATCTCAACAATGTCGTTGTGTTTTACAATTTTTATTTTTGTTATATT:1 + chr3L 10025448 3' - 297 385 2 50.50 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTGCTGGTATAGGCTGATTTTGAAG:1 - chr3L 5808184 3' - 297 6626 2 75.26 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCACAGCTTTCGCTCTGCTCATCGATTA:1 + chrX 6338928 3' - P-element 51 1 29.70 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCTTATTGCCTTGTCCGCTCAGTCTAGTCATAGTTGCTATGTCCGATGTTG:1 - chr3R 26434109 3' - hobo 2710 1 72.60 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCTTTTGCATACTTTTGGGCTTGGTCACATCAATTAAAACGGATGCTCCACCTCTCAT:1 - chr3L 5255898 3' + jockey 4981 1 65.35 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACATTGTAAAATAGTTTAAATTAATATTCTGTGACTCTAAACTACACGTCCAGTCA:1 + chr3R 17415318 3' - roo 20 2 54.00 ACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGGAAAAACTTTCTCCATTGCCAGCTCTTCAGTGCCTGG:1 - chrX 9432903 3' + Tirant 8122 2 63.37 AGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTT:1 + chrX 22386753 3' - hobo 94 1 71.29 TACAGTGGACCCTCGATATATGCACATACTACACAATGGCGTGAGGGAAGATGGGAAATGTCGAGCCAATAACCCAGTCGCA:1 + chr2L 15479620 3' - blood 12 2 57.32 ACGGGACCACCTTATGTTANTTCATCATGGGACACACCGTCGTCAGTTTGTTTTCATTTCAACTTTGCGTCGGGTTCACTCCAATTTTCGCACCGGAGGC:1 - chr3L 12266739 3' + P-element 2879 2 71.00 CTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGCAACACAGGCCATGAAATATGCAACGACAGCAA:1 + chr3L 565168 3' - I-element 5091 1 67.33 TTTAAAGCGCTGGCCGGCCGATTTCTGTGGCGCTAGCTGTTGGGCAAGCTGATCGTGCTCTTTGGTAAGACGTTCCAGTTTGTTCAGTTTATTGTCTTCAC:1 + chrX 13610776 3' - X-element 4444 1 72.28 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATACATATTTCCATAACACACTGCAATCTACTTTTAATGGCCCCTTGGAGTTTTTAATTAACAGCCAAAGCTTTTG:1 + chrX 6058269 3' - roo 2 2 75.25 ATATATACATATATACATATATACATATATACACGTATCTGCAAACTGGAGCGAAAAAAAGGAACGCCTTGAAAGCTTGATAACCTTTTCTTTTGAACTTT:1 + chrX 6618372 3' - G3 4505 1 68.32 TTTCATTTAAATGATCTGCGACAAATATAATTCCCTGCTAAGCCAGCTTAAAGGAACACAAATTAAACAGGCACAGGAAACTAGACAAAGCAAGCCAGAAA:1 + chr2R 8518333 3' - invader1 3611 2 77.23 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACGCCACTTGACGGCGGCGGAAGTGGCGCCAGTTGCGGCCTTGGTGG:2 + chr2R 6769517 3' - 412 7084 2 57.43 AATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGCATTGGAGGGAAAAGTTGCAACATCATCGCCAGATA:2 - chr3L 8829600 3' - F-element 4226 1 64.36 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAATGCAAATCGATTTTGTTTGTATTTTGGGTGTCAGAAGACCTGGCATGCCCACCCCAAATAC:1 + chr3L 5403323 3' + copia 240 1 63.37 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATTTCGGATGGGATGTCGAAAAATATTTGCTGT:1 + chr2L 12765755 3' + flea 229 2 66.34 ATTCAAGAAATAAAAGCAAAGTAAAAACAAAAAAAAATAAAAAAAAATGTATGGTCTAAAACAAGCTGCTACGGCTGTGCTGTTGTTGTTCTTTTTTTTTC:1 + chr2R 10219609 3' + F-element 4664 1 67.33 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTAT:1 - chr3R 12115299 3' - 1360 51 1 77.23 TCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCGTGCTCTTAATGTTTTCTCAACGGCAATTA:1 + chr2L 12949101 3' - R1A1-element 235 1 70.30 GTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTTTGTACACAAGTTCAGGAGTGTAGTCTATTGAAATGAATATTTTGCCGCTGTGAAGTGGCTGAGATTGTATA:1 + chr3R 26170484 3' - X-element 15 1 61.39 GCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTGGATTAAATTCTGTTATAATGAATGCAATTAACGACATTATGTACCATTTTCACATGCATATTTAAGACCTAGAT:1 - chr3L 22112800 3' + diver 222 1 75.25 AGCCCAAAATTGTAAGTCTNTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCAGCGATAGTAGGACACTGGTCTGGATGACTCGTAACTCCGGCTGAACCGT:1 + chr3L 9542577 3' - roo 27 2 50.50 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGGCAACAAAGGGTTAAGTGCTTGATAAGCGAAAATAGGCGTATTATTTTGGATTT:1 + chrX 7802933 3' + hopper 1395 1 55.45 GCAGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACTAAATTGTTGGATGTGAGCGAGCTGAGGGAACTTATGCC:1 + chrX 13854773 3' - hobo 96 1 80.20 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACATGCAGAAAATGTTTGTCAATCGAGATGGTTTCCCTTGATTGGGTTAATAAATTCCTAGATGCCAAGGAA:1 - chr2R 24500799 3' + Tirant 398 2 76.24 AGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTGGGCTGTGTACTAGGCTGTCTGTGAAAAATCATAGCAAACTAAGGCA:1 - chr2L 4113437 3' + R1A1-element 5100 1 57.00 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGCATGCAAATTGATGTAAATATAAATGATGCTCAAATATT:1 - chr3L 22112640 3' - 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Doc2-element 4709 1 58.16 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGTAATTCGTGAAACAGCTTGTCAGTTGAATAATGTGCAT:1 + chr2L 20550836 3' - jockey 4707 1 64.36 TGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACT:1 - chr3R 19449406 3' + Doc 214 1 78.22 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCCGAATGTTACGAGTTTATACTCGTAAAATGGCCTAAATTATTCGTTTGCCTGAAATGTGCACTCTATA:1 + chr3L 13072063 3' + roo 402 1 70.30 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGTAAAATTGTAAAATTGCAAAATTGACAGCGAGTGCGCCATAATTCTGTAGCATACTTTCTAGCGCGCGTTTTGAGCG:1 - chr2R 23441690 3' - jockey 4669 1 76.24 ACATTGTGACACTTTGTCACATAAATTATAATAAACATAAATAATATCAAAAGACCACCAACCTACATTTTAGCTCCCTGCAAACCCGTTTCTTCATCAAA:1 - chr3L 4122215 3' + Stalker 6915 4 61.39 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAATTACACCGAGCTGGGGCAAAGAAAAAAGTGAATAACAAAATATTA:1 - chr3L 10683438 3' + opus 470 2 54.46 TTTCTTTTGCCATTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTCTTCGTTTTTGTAGGGCCATTAATGTGAGACGTGCTGAGGGATACCCAGCACCTTTCGCCCCCCA:1 + chrX 8978032 3' - Doc2-element 232 1 67.33 ATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCAGTTTAGTTTCACTCGCCGTCGTCGGCAGTCCGCCGCTGATAATAATAAACCA:1 - chr3L 16194220 3' + 1360 336 1 56.44 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCCTGCAAGTAATGTACTGTGGAGGCGCTTGTAAAAAATTACTTGCATACTTTT:1 - chr3R 8460848 3' - BS 17 1 55.45 TACATAATTGGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTCCGTTGTGTTTGATCTTTTTTGTATTACATGGGACTTCTTTTAATAAATGTTTCATTTGG:1 - chr3L 13008076 3' + Cr1a 4284 1 68.32 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAAAAGGCCAAACACAAACACGTAAAA:1 + chr2R 14586508 3' - Doc 20 1 57.43 AAACAAACTCAAAAAAAATAAAATATTTGTCTGCGTTTGCAAGTATAAATTAATATTTTGCATTTTCCATGAAAATATTTAGATAAAGGAAACAAAAATAA:1 + chr2R 18897800 3' + gypsy2 425 1 88.12 AACAAAAAAAAAACAAAAAAGTAAAAGCTTTAGAATTGAATCAAAAAATAATGTTTTATTTAAGCCAACCTCCTCCACAGGTTTCAAAAAAGCTTGAAGT:1 - chr3R 9967454 3' + gypsy2 400 1 54.00 GCGCTACCGTGCAGCTTGAACCAAAAGATGTTCGTTGTGATTCTTCCCATTGGCCATCTTGAAGGGTGAATGTTCTCGATGTCTTAAATATTCCCAAGTTC:1 + chr2R 4032662 3' + hopper 474 1 41.58 ACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCAATCCAAATTCTGGTCAAAAAACTTGCCGTTGAAAGCTAACAAAAAACGA:1 + chr3R 10579374 3' + G6 1936 1 61.39 AGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAG:1 - chr3R 14985325 3' - Ivk 65 1 75.25 ACCGAAAACAACGACATGCCAATTGCGGGACACCGAAAAATCTATAAACAGTCCTGGCAGTTCCGCAGCCCTTATCGCTGTCCTTGTACTTGGGCTTTCGG:1 + chr2L 18290676 3' + Osvaldo 496 1 76.24 ATTTTTCAAAAGTGCGGGCGTAGCATCTTTGTGCTGTTTGTAGTCCAGTGCAAATTGAAAAGCCAGTGTTCGGGCAGCCATTGCAGGAGTCGCAGCCAGA:1 + chrX 2552854 3' - INE-1 253 1 64.00 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTACCGATCCGGATATCGCTCCCGCCGCAAAGCTGAAACTAAAC:1 - chrX 19614912 3' + 1360 3356 1 60.40 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCT:1 - chr3R 14049362 3' - transib2 47 1 72.28 TAGCATCGATATATAAAATTTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTAACTAATTTTTGCAACTTTTGTA:1 - chr3L 12983198 3' - diver 5943 2 75.25 GGTTCGATGTCTTCTACTTGTGCAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCACTCTGCCGTCAGCCTAAA:1 - chr2R 4969408 3' - ZAM 8018 2 76.24 GCAAAAACAAATAAACAAAATTAGAGTTATGTGATTAATGTGCCTAATCTGATGATTTCAAAACTATTTTGTTCTTAGCATTGAGTGACACCTTTTTCGCT:1 - chr2R 11670516 3' + Stalker2 76 2 68.32 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGTGTCTCGGAATATCATTTT:1 - chr3R 7272586 3' + hopper 1359 1 78.22 TTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACCCAAATGGCATTCGTAAGAATTCGAATTTTCCGTTATTTATGCGCGGACCGTTTTCACATATCCCC:1 - chrX 12246841 3' - Stalker4 6966 4 44.44 GTTTGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGACTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCACTTAATTG:1 - chr3L 4235601 3' - jockey 4577 1 61.46 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGCGGTGGCCGAGAAAGAGAAGAAGAA:2 - chr2R 7735569 3' - 412 80 2 49.50 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCAATAAAGAAGTTTTCGCATCAGTTTTATGAAAACTTTCTAT:1 + chr3L 25120241 3' + pogo 2072 1 64.65 TATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGGCGATCTAGCCATGTCCATCTGTCCGCATGAACGTCGAGATCTCAGGAAATATCGAAAGTGGCGCAGCAGTG:1 + chr2L 20636826 3' + INE-1 83 1 77.23 ATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTTTACCTTTATCCAGGTATTTA:1 + chr2L 12199550 3' - Stalker2 2 2 73.27 TTTAAAAGAAAAAAAAAACAATAACAAATATGCAAGCTTTTATACATTTATAACTTTTTAAATCTTTAAAAAATGCAAAAGAAAGTGTTTAAATATGATTT:1 - chr3R 21656317 3' + transib2 2638 1 60.40 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTGGTCTAATTATGTGAAGCCCTACATAAAGTATAGTCTTAATCTGGAGC:1 - chr2L 20840240 3' + mdg1 7430 2 57.43 GGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAAGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGGCTTCGGATTCGCCAGCACAATGCACT:1 - chr3R 13458451 3' + R1A1-element 267 1 78.22 TGTTTAAGGTAATCGCATGNGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCTACGAAAACGTGTCTTCCTGTTCTTATTGTTGCGTGGGCATTTCTTATC:1 - chr3R 26803163 3' - I-element 4879 1 51.49 GGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATAAACAAGCCCTGATGAAAACGTATTGACGATGCAATAAACTTAAAGAAGTTTAGTAAGACCTATGAAAAA:1 + chr2L 7126864 3' - Burdock 6139 2 72.28 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTGTAAAAGATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACATATC:1 + chr2R 24169995 3' - roo 17 2 63.37 GCACACAAAATTGTAGGGTNTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCAACCACAAGGCAAATAAAGAGGGGCTTGGTCGTGG:1 - chrX 8343647 3' - hobo 40 1 65.35 AATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCATGGCAGCAGCTGCAGGACATCGTAAGCGAGCATTGGCATCCCTGGGTCTGTGCCGACGAGGATAAAAGTCCAGCT:1 + chr3R 29903706 3' + flea 4848 1 72.28 TTGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATGTATGTAATATATTCGTTTTGCATACATATG:1 - chrX 22560078 3' - invader1 35 2 81.00 TAGTGTTGTTTAACGTTATNTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAAGGTTTTTATTTCGCCTTCTTTTCCGGAAAACTTTCGTTCCGA:1 - chr2L 10177788 3' - copia 4896 2 55.32 GTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTGGGATAAT:1 + chr3L 21912355 3' + Bari1 1696 1 68.32 GTGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACTAC:1 + chrX 16237969 3' - mdg3 5285 2 53.47 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACATACCATTCTGCAATAAA:1 + chr3R 5700168 3' - mdg1 21 2 58.42 GGGTACAATTAACCGTTTGCAGCCTGTTGGTCCACTCATCTGGGTTCCCGTTAAATATTGGCAAATCACTGTTGTGCTAATATATTGTACTTCAGCTCTAT:1 + chr2R 4577026 3' + Chouto 5999 1 73.27 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTTTATGTCTAGGTAGTGGATTGTAGACATTGAATGTCCAAAAAAT:1 + chrX 3691572 3' - jockey 4792 1 58.42 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATAACTGGAACCCAATACGAAATCAACCGCAGAAACCTCAAGCAAAATGACTTTCGTTTTGGC:1 + chr2L 8913399 3' - mdg1 15 2 64.36 TGGCTCATCTGAATAGCTTTTACCCTTTTGACTTGAAAAAGGTTGCATTCTTTTGTATTCTATTATTTAAGACATTCAATACCTGTTTATTTATAAAATGG:1 + chr2L 22135536 3' + Tc3 220 1 68.32 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGACAGACCGCACCTGAT:1 + chr2R 7025026 3' + P-element 2865 1 57.43 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAATAATTCTTTGTACTTTTTTTGCCATTTTTTTTTTTGGCTGGTCTTGGATCCTTCATTCCC:1 + chr2R 13659096 3' + Ivk 5362 1 58.42 ATCTCCAATAGTTTAGGAGNTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCATGTGGGCTGTCACTGATCTCCTTGGTGCTCCC:1 - chr3R 12906540 3' - hopper 41 1 66.34 GCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATAGTACGCTCATTTGTCGAGTTCGTCCCTCGATGCGTTTCGGATTAAGAGGACCA:1 - chr3R 13086436 3' + F-element 4295 1 59.41 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTAAGACAACTGCGCTACAAATCAATTGTGT:1 + chrX 19614967 3' - 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invader3 42 2 65.35 ATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAACTCCGATTGGAGCGAGAGTTGTGTAAACGAAAGAGAGCAA:1 + chr3L 4071847 3' - jockey 4990 1 59.41 AAAAATCAAGATAAGTACGGTTTTAAATCCTATTCTGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTCCCGCACCCTGCTCCCTTAGTC:1 + chr2L 20720520 3' + Max-element 370 1 76.24 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAAAACGTATCTCTTAGGTT:1 - chrX 2164264 3' + mdg1 415 2 47.52 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACAAGAGTACAAATTTTGCGGCTTAAAGTTAATTCATTTCGCAAGTGTTTACCTAACCTG:1 - chr2R 23122634 3' - hobo 19 1 60.40 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTGGAGCTTACAATAGCAAAGTACTAG:1 - chr3R 18549921 3' + pogo 2055 1 74.26 TATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAGATCAAAATAATTCCGCCATTTCAATGGTACACCTAAGTGACCGATTTTTTATGGAAATTTGTATAGGTTGCTACA:1 + chr3L 4597043 3' + Juan 4079 1 66.34 AGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGTGGAAGAGATGTATTTAATTTTGCTGTGACGTCATGCGGCGACTGCACCCAAAAACTAAAGAAAAATAATGCAAATT:1 - chr3L 11041006 3' + Cr1a 4414 1 77.55 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCTCGCGACTTTACCCAACTTTTGTACAGTCACGTAGTCAGGCAGCCACCTCGTTCCTCCCACT:1 - chr3R 16005428 3' - Doc 17 1 63.00 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGGCAGGGTTCCGTTTAGGCGATATAAAATTACC:1 + chr3R 18171863 3' - 1360 7 2 73.27 AAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGA:1 - chr4 311202 3' + 1360 3364 1 53.47 TTTATTAACTACATCAGTAGTATTGGAATTATAATTAACTACAGTACATCAAAATGCATTTGGCCATAAAGGACTGAGGAAAAAACCATTGTCGAGGTGCG:1 - chr2L 18931933 3' + mdg1 7438 2 54.46 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGAGAAACACACACACACAGCTATCAGCACTTGTGCACTTTGCATGTTTAGCGCTGCAATG:1 - chr3R 24484727 3' - roo 8680 2 64.36 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTGCTGGTATAGGCTGATTTTGAAGTATTTGTAAGATTTAGGGCC:1 - chr3L 5808164 3' - 297 28 2 56.00 AGACGATTTTCGGGTCAAAATCAATTCTGATCGAATAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTATTTAATACCGAAAACCTTTG:1 - chr3L 4825578 3' - 1360 3188 1 71.95 AAGATAAAACCAAACCTCTNACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACT:1 - chr3R 19589915 3' - BS 5013 1 58.42 TAAAAAAGAACAAAAAAAAAAACGTATCCTCGTTTTTATTTTTCCTTTTTGTAATGCACAGTGTGTATTGCTTTTGGGTTGAAGTTTGCCGAAAA:1 - chr3R 13647459 3' + BS 5104 11 72.63 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAGAGATATGTACGTGGTTGGAGAGTGGAGACTGGGGAA:1 - chr3L 749269 3' - P-element 18 1 60.00 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAACAGGAGTATTTAGATAATGCAAATTTGATGTTTCATCATTTTGTATTTAT:1 - chr3R 18342453 3' - F-element 39 1 52.48 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCACACACTAAACCACTCGCACAACCGAAGGCGTGTGTGCATGTATGCAATTTT:1 - chr3R 13685141 3' + Tirant 380 2 60.40 ATTGTTTTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTTATGTGGAGTCGTGGTTTAGTGGCTTATAGTATAAGTATCTTATCCCTACTAGAGGA:1 - chr2R 6074343 3' - 412 12 2 35.42 ATCCTGAACCCACCGCGGTATGGCCGTGAAGCAGTGCTTCGCGAGGACGATCAAGACTTGCTTACTCTGTTGCTTGCTGCCCGATCTGTAATGCTGTAGAC:1 + chr2L 22225875 3' - Rt1c 5347 1 66.34 AAAATAAATAAATAAATGGAAGCACTTGTACTCCAACCAGAACCACTCACACACTCACACACGCACACACACGCACATGCGGACTCACAGCCGGTTATGTC:1 - chr2L 6076322 3' + Doc3-element 84 2 77.23 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTTACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAAAACGAACAAACATTATTTTATGAAATCAAAA:1 + chr2L 16939867 3' - opus 42 4 70.30 ATATTTTAAAATTCTATACACATATAAAACTACTTATAAATGGCCCTAAAATATCAAAGTTAAAATAATATAAAAAACATTACTAAATTATGGAAATGATT:1 - chr2L 2538439 3' - springer 482 1 57.43 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTTGGACTATCGCGTGGTAAGTAGCCGAAAGAGAAAGCTCTCTTATACGGAAGATGAAGAGTGTGATTCATGA:1 + chr3R 19671779 3' + P-element 2881 2 73.27 AGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACAATTAAGCCACGCATATTAAGTA:1 + chr3L 15857537 3' + blood 7295 2 78.22 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGGTTATCCGGTATCATCATTAACCGGAGGCAAACGCCCGCTTTCACGCTGCCTCAGATCGGGAATAATTT:1 - chr2L 4650401 3' - roo 7 2 72.28 TAATTATTTAATTATTTATTTATTTCACAGAAGAGTTACAAAGTTCGATTTTGTATAAAATACATTTGCTTATGTAGATCTTGTATTTTTAGTTCATAGTT:1 + chr2R 7604846 3' - HeT-A 27 1 77.23 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAGGTGCTGAAGAACCAGAGGAACTGATTCTCCGTGGTGTCGGAAGAGGTGGCCACACGGAGGCAAAGTTGCCAA:1 + chrX 476149 3' - I-element 17 1 78.22 GGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGAAGTTAAAAATAAAGTTAAAAGTGATTGACAAGAAAAAATAAGCGAGTTCTAAATCAGTCGAAATTG:1 - chr2R 6124358 3' - FB 370 1 77.00 AGACCACAGGACACATCCCNAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCGAC:1 - chr2R 6482659 3' + gtwin 7373 2 59.38 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGATGCAAATGCAGCCATCGGGATTTCC:1 + chr3R 21924062 3' - transib2 32 1 68.24 GTGCACTGAATTTAAGTGTNTACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACACCGAATGCTGGCTAGAGATGGCA:1 + chr2R 10874762 3' - P-element 52 1 27.72 TAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTATACTCGCTTCATATTCAACAGTTTGGTCCAGGCGATTGCCAACTGTGTTTCGAGCAACAAAAATCTAAGTG:1 - chr3R 14629407 3' - Cr1a 4167 1 76.24 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAAATTGCAAAATTGAAATTGAA:1 - chr3L 17110712 3' + hopper 1394 1 54.02 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTTCTAAAAAAAAATAAATTTTTTTTAATGAAAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTAA:1 - chr3L 25782377 3' - Doc 25 1 52.48 GTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAAC:1 - chr3L 24272104 3' - gypsy11 72 2 76.24 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAGTACGTGAGTGCTTGCGCGTTTGTAGGTGTTGCCGCGGCGAATTGAAAAAGTTTAGAC:1 + chr2L 15527073 3' - pogo 13 1 64.36 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATAATCTTTCGCGTTAATTTTTGGTGTTATAAACTGCAATTCACAGG:1 - chr2L 21372911 3' - roo 8667 2 76.24 TTCATGTGCTAGATCTCCCCGACAGTGTTTGTATATGCGGGTTGGCAAGGATATGCCAATTTATTGCACACACGAGTGCATTAGAGTGGCAGAGTCCTTGC:1 - chr3R 12936751 3' + G4 3697 1 74.26 GCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACACTTGGTTTAATTGTTATTGATGTAATCGTAGCATAAAT:1 + chr3R 8319069 3' + copia 4755 1 61.39 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACACACTACACTCAAAGCGTGCGGTCCTTTCCTTTTCCGTAGCA:1 + chr3R 22469212 3' - hobo 30 1 59.41 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTTTTAAACTTTGAATTTG:1 + chr3L 21912348 3' + Bari1 1689 1 61.39 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGTCCGCTTCTTCATGCTTGTTAGGGGTATGTTTTATTTTATTACTTTTTTTTTTGTGTTTTTTTTCATTTAGTTTTCT:1 + chr3L 13426890 3' + 1360 3353 1 77.23 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGGCCT:1 - chr2L 13214972 3' + roo 9049 2 58.42 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTATATCGCGACCGCTTTTATTCAATTAAATATACTTTCAAT:1 + chr3L 3822460 3' - 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Stalker2 54 2 79.21 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGGATAAATTATTGTGCCAAAGAAAATACAGATGCC:1 + chr2R 15595268 3' + hobo 2910 1 59.55 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAA:1 - chr3R 4474168 3' - copia 29 2 59.41 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACAATGTAGGTTCCGTTTGGCATGAAACTATAGGGGGGAACTAAAGGGTAGATCAGCTAT:1 - chr2R 11661074 3' - 1360 15 1 65.35 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACTTGTTGGCATCTGGGCTGCCAACTCACGCTTATA:1 - chr2R 23877709 3' - Transpac 4936 2 63.37 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTGCATTATTCCAATTGCAGAATCACTTTGTCCTGTTTGTGTGCGCTTAATAATAGGTGTGCTT:1 + chr3L 13367776 3' - mdg3 5265 1 68.32 GCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTATCTACCAGCACACTTAACTGTCTTAACTGCCTTAGAAGATTAGAGCGCATACCGATACTTATCTTTA:1 - chr3L 17579108 3' + Doc3-element 451 1 62.38 AGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCAATGTGACTCCAAAGGCCGTT:1 + chrX 21976897 3' - 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chr3L 1257982 3' - Quasimodo 27 2 60.40 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCAACCCCAGCTGCAACCTGCAGTCACTCCTCCGCAGTTGGGCCCTTGTTAATATTGATGGC:1 - chrX 12768223 3' - FB 40 1 50.50 CGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCAAACAAAAAACTGAAAACGAAAATGGTGAGCACGGACCCA:1 - chr3R 19416473 3' + hobo 2667 1 67.33 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAAAAGGCCAAACACAAACACGTAAAATGATTGCAAA:1 + chr2R 14586518 3' - Doc 10 1 67.33 GCTTAAAAAAAAAATAAAAAAATACTTGCTGAATAACTTTTGAATTATTTCAATATCACTTTATATCAATTTCCA:1 + chr3R 18361521 3' + G-element 4325 2 69.33 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAATTTTACCTCCATCTTCAGTTTTAATCCTGATAATAAAGTGAGTACCACTTTTGGT:1 - chr3L 24151997 3' - roo 20 2 57.43 AAACACAGAGTGCATTTCGGAACAAACAAAACATGCGCTACTGGGCTGACACCAACCCTCGAGAATTGCATTGCTGGCGTTTCTGCACCAACTGCCCAGAT:2 + chrX 5491623 3' + mariner2 204 1 70.30 AAAGAAAATGAAACAAAAAAAAAAACAAACAACAAATCAAATCTAATGGAACCTAAGTTAAGTGTAAATAAAATAGTTGTTAACAAATCACAAAACAAACG:1 + chrX 8431471 3' + Doc2-element 219 1 53.47 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATATTTTTTTGTTCCCCACTTCGTTCGTCTG:1 - 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INE-1 135 1 54.64 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTGGAGCTTACAATAGCAAAGTACTAGGCAGCGA:1 - chr3R 18549914 3' + pogo 2062 1 67.33 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAA:1 + chr3R 7869174 3' + 297 6929 2 75.25 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCATGCGAACATTGCCCAGTACTGTTCAGGTT:1 - chr2R 5200923 3' - 1360 20 1 56.57 TACATTTACACATCATATCNTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGACTTCAGTTTGAAAAACGGCTTTCATTTTGCAACAAGCG:1 - chr3R 4773340 3' + Tirant 8471 2 60.40 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATG:1 + chr2R 15201532 3' - P-element 56 1 23.00 ACATCTATACCTGTTACATTTTAAAACTATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGATTCTGTCTCTGTGTTGTTGTTATTATCTCGGGAAATGGCC:1 + chr3R 19509054 3' + Stalker4 396 1 74.23 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTAGACAGTCACTCATCCAATGCAATATCATTACTATGTTTGCCTTTTGCTGCTGGG:1 - chr2L 15983355 3' + hobo 2920 1 59.60 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATCGTTTTTTTTTGGCTTTTCCGCAGAGACGCAAATCATTTGTCAAAATACGAGAGTACGCAG:1 - chr3R 29465556 3' + 412 481 2 49.50 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAA:1 + chrX 11030922 3' + roo 9042 1 55.45 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATAAATGTCTTACTATAAGTTTTATTTAGTTCCATTGCTAGTTCAGCTT:1 - chr3L 2714469 3' - BS 41 1 53.47 TACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATTTAGTCGAGAGTTGGCTTTAAAGTGGGTTGCTTGTATTGTATGCTTAAACTATCAG:1 - chrX 22535678 3' + Stalker4 7112 6 59.41 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTCTAAAAATGAAAACAAAA:1 + chr3R 26343019 3' - blood 11 2 68.32 TTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGCACAGCACGCATTTAGCACAACTTCATTTATCT:1 - chr3R 12882640 3' + 412 7521 2 55.45 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGAAAGTTGTGTTAAAAACATTTTCTATTTGCAGTTTTTATTGGCAGTGTCTGGCTATGGATGTCCTGTAT:1 + chrX 4145373 3' + 412 451 2 73.27 ATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGGTATGAAGTCCATTGTGCAATTAAATTAATGGCCATTCTCAAAATAATCCA:1 - chr2L 9319508 3' - jockey 159 1 58.42 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTCACAACTTACAACTCACAGCTTGCAAACAC:1 - chr3L 6866185 3' - 412 7098 2 69.31 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCAAAATTACACGCAATTTATGG:1 - chr3L 10560228 3' - pogo 19 1 60.40 AAATGCCTGTTTTGTTTTTAAATTATAAACAATCTTCCACCCAATGTAACAGTAGAAAGTCAGAAATCATTAGAAGACTTTTATTTACAGATTGGTCAAGC:1 + chr2L 5963098 3' - I-element 5191 1 79.21 AAACCGAAGATATTTCCAANTAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACAGGAAGTGACTTCGCCGAGTTTGC:1 - chr2R 13358795 3' + roo 9015 2 78.22 TACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTTAGCCCAACTTAAGCTTAATCCCTATACTGATTATTCCCTGACACCGCACACGTGGCGTATGCGTA:1 - chrX 4973285 3' + Stalker4 7233 4 68.32 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACCATGATACTTTTGGGATGCACTTGAA:1 + chr3R 13239952 3' - jockey 58 1 73.27 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAAT:1 + chr3L 27357601 3' - mdg1 52 2 81.19 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCTTCCATTCTCATTCGGTCTTTTGAA:1 - chr3L 16807708 3' + P-element 2864 1 57.43 GCTGACGCACAAAATCGCGNAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAATTCA:1 + chr3R 25271724 3' + invader4 3045 2 66.34 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGAGCAAAAACTTTGGATGTTTTGAGAGTTCGAAGTTCA:1 - chr2R 20584422 3' - P-element 37 1 42.57 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGA:1 + chr2R 7025011 3' + P-element 2850 1 42.57 TTTTTTATTATTTTTTTTTTGACAACTTTGCGTGTAAATAGGCTGGCCAAAGGACCC:1 + chrX 13481951 3' - R2-element 3584 1 89.47 TAGTCAGGCCGGCCGAGTTGTAGGATGGATACTTAAAAGGCCCACGAAAAAGAGACACATGTTATCTTTGTACACCGATGTGCTATGTACATATGCATCGC:1 + chr3L 20006888 3' + mdg3 5235 1 63.37 ACGAGTAAAGTCTTCTCATNTGGGATTTTACACGTTCCGACTCTCCAAATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTG:1 + chr3R 19449957 3' + roo 9061 1 54.46 TACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTG:1 - chr3R 25514127 3' + hopper 1368 1 73.27 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATAATCTTTCGCGTTAATTTTTGGTGTTATAAACTGCAATTCA:1 - chr2L 21372915 3' - roo 7 2 72.28 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGGCTATCTCTATCTCTTCTC:1 - chr2R 7024973 3' - P-element 55 1 24.75 TGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTAAGGCAGGTTCGCGAGCACTCGCCACTGAA:1 + chr3L 12828089 3' - invader1 3894 2 73.27 GACTGGGTCGCATTACACANACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCC:1 + chr3L 25350820 3' + baggins 5413 1 41.58 ATTGTTATTGATTTATTCTTTTCAGGTACCCCCGTCAGAAGGACGGAAGCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATCAATAATAAATCTTAATG:1 + chr3L 18822407 3' - TAHRE 10127 1 51.49 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCATTCTACTATATCACAAACACATGT:1 + chr3R 20284810 3' - pogo 22 1 58.42 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAATTGCTCTTAACCTATCTCCAACTAACCCAACACACATGTGTGAACCGCCCCCGGTATAGCA:1 - chrX 13268839 3' + 1360 3380 2 67.33 TAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTACACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGCAAGGCGATT:1 + chr3R 9613502 3' + invader3 5445 2 57.45 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCA:1 - chr3L 10560248 3' - pogo 39 1 71.29 AGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGCCCGCTGGCTGCCACAAATTGTTGCATTGAAAATGAAATTGCACACGTT:1 - chr3R 7952041 3' + 412 7314 2 61.70 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCGTGTCATATCTGTGTTGTGGCACATCTATTGCATATACGTAAATTTATGTATTATTTTCTCCGCT:1 - chr3L 19514499 3' + flea 248 2 40.59 TGCAAAACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCAAAAAATGAACTTGCCAAACACGTAAACGAAGGTCATACAACAGC:1 - chrX 22678380 3' + 1360 3360 1 56.00 GCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTAGATAGTTGGCGTTGTGAATAGCCACCACAACGATGAAAAAAGTAAACATTTTTTTTT:1 + chr3R 5655163 3' - FB 668 2 61.39 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATGTGTATACATATAGCTTAACAAATACATTTATTTGGAAGTGGTAACCATTTTTATCAGTG:1 - chr3R 29607422 3' + Quasimodo 7357 2 68.32 GAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATTGTTT:1 + chr3R 1960326 3' + gypsy9 220 2 89.11 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAGGTCGGCAATTGATTTCAATCAAAAACAATTGCGTTTGACTGCAATTGCGCCTGCATTGACAGCAGTTTCTC:1 + chr2R 6918074 3' - F-element 22 1 66.34 TAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTATAAACACCCAAGGAAAGCTCTCTGGGCTGAAATCCTTTGGCTTTGCCTAAGCTCTGGAAATGAGATAAAGC:1 + chr3R 25844395 3' - Stalker4 6962 4 63.37 GACTTCTGTGAACACGTCCNCTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCTGAAAGCCAATGAGGCGCAAAAAAAATGAGGCCCCGAAATGTATGCTACAAAA:1 + chr2R 11160610 3' - jockey 32 1 54.46 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGATTGACTTGCAAGGTGAAAATTGAATTT:1 - chr3R 6190219 3' + copia 242 1 66.34 TCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAAATGAAACAAGTGAAGGAAGCTCCTTAACCAGCATAGCTCCTTTC:1 - chr2R 8706990 3' - flea 4756 1 80.00 GCGTAACGGCCATACATTGGTTTAAGTGTGCGTACGTGCGCGCGATTTCATTTCTATTTTTAGAAAGCGAGTTAGGCGAAAGTTTTCAGCCCGTTTTGCGC:1 + chr2L 1136018 3' - 1360 3365 1 75.25 GCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGGAAATTGCAGGGCCGCCCCTTATCCACATGGCCATCAAATAAAGG:1 + chr3R 31117707 3' + blood 89 2 55.45 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGAGTGGAAAAACTGGCTGGGGGTTTTCTATATGTCCTCACATCCTACCTGGTGGGTCATCCCGGATATCT:1 + chr2L 15479824 3' + blood 372 2 70.30 GTGTGTGTGTGTGTACATATATTATTATTTACATATGTACATATGCGCACACTATAAAGCCCGACTTTTGCACACAAACCCTCCATTCGATTCACCCG:1 - chr2R 10446283 3' - Quasimodo 31 2 80.61 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGGGTCACGGGCGTGAAAAAGTGTGCGAGTTGCCAACACA:1 - chr2L 8646677 3' - Tirant 35 2 61.00 AATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAATAAGCACAATGACGATTTCTAATAGCTAATTCAAATGGTTGAATT:1 + chr3R 25271736 3' + invader4 298 2 55.45 ATTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACATTACTAATCAAAATGTGAAAAATATCAACACATATTTTAAAAGTGTGTCTGCAGATGGCTAACGGCATACGT:1 - chr2R 19333239 3' - INE-1 312 1 76.24 AATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAA:1 - chrX 21472693 3' + P-element 200 1 19.80 AATGTTATTAAATGTTAATTTAACTTTTTACGTGATATTTTACTAAAAAAGCAAAAGG:1 + chr2L 18292214 3' - I-element 5256 1 79.31 TTGCTATTCGTAGCTTGAANGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGA:1 - chr2L 4110953 3' - Doc 40 1 60.40 AGTATTATTATTGTTATTANTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACATACCATTCTGC:1 + chr3R 5700162 3' - mdg1 27 2 52.48 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACAATGTAATAGGGTGCGCTATTTCGCCAGGATTTCTCTATGAAATATTCATAACCAAAAC:1 - 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chr4 960025 3' + 1360 3383 2 73.27 AAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCACAATGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTATTTTAGTTGTTGTTAAGTAGACCTTACGT:1 - chr2L 7873690 3' - Gypsy6A_LTR 95 1 72.28 GTCAATATTGTGATCTCCGCGGCGTTCTGCGCGCAAACACGCATCCGCCATAGCCACCTATCTCGTGATTCTCATTCAGTTTCAACGGACCAATGGCTAAA:1 - chr2R 7391021 3' + mariner2 379 1 60.40 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAAGGGGAGCCGGAGAAGCCAACACGAAACTGTATGAAAGCAGAAAAAT:1 + chr3R 20430826 3' - hopper 29 1 52.48 GTCCACGAGCGCAACGAAANCACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 7 1 60.40 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCC:2 + chr3R 7688915 3' - Tirant 55 2 82.18 TTTTTTTTATTTTTTTATACATTTTTTATTATACATTTATTCATTTAGATACAGTATACAGTCAATTAATTTAATTTAATATTACAACTTATTTTCGAATC:1 - chr3R 13659728 3' - HMS-Beagle2 479 1 40.59 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAGGCATGCATATGCGTACTACTAACACACAAACGC:1 - chr3R 22469117 3' - hobo 2709 1 77.66 TAAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACGCTCTCCCGATCTGTCCCCTTGTGATTTTTTTTTTCTGCTAATCGTTACACCAAATAGTGCCTCTTGTTAAAAT:1 + chrX 23043052 3' + mariner2 543 1 58.42 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATA:2 + chr3L 23456277 3' + 1360 3380 2 66.34 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTGGCATTAGGAAAAGGTTTAACCCTTTGTTGGGCGATAT:1 - chr2L 4571317 3' + roo 9042 1 60.87 GATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAATGCTTCGATTTCGAGTTTTATTAAGATCTA:1 - chr3R 25778199 3' - roo 495 1 76.24 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAATCGCCGACTCAGCTACGAATTTGCGCGCCAAATTCG:1 - chr2R 7247607 3' - jockey 4709 1 63.37 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTTTCAGATATATAAAATATGAAGTTCTTGAAATGGTACAGCTG:1 + chr2R 19513430 3' - roo 8690 2 62.77 ATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCCATCCGCAAGCCTACCGCGAGGATAACCCCATATTTGGAGACACCAGTGCCGGAGGCTATG:1 - chr2R 9022474 3' - 1360 254 1 60.40 TTTATCAAAGTGACTTCTTTACCTGGCTTATGCGATATCGAGTGCAAGCTCCACAACACTCAACTAAAACTGTAATGGCCCCATTATTCATAAACTTGTGC:1 - chr2L 1262370 3' + Ivk 498 1 60.40 AAGATGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGACTGCAGAAGCGGACCAGCGACGAGGACGCATACGATTGTGAATGCAATTTGGA:1 + chr2L 21840764 3' + Quasimodo 283 2 56.44 TGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTT:1 - chr3R 14985319 3' - Ivk 59 1 70.30 ATAAAATGAGAAAAAAATTTTAATTGTTTAAAAGTTGTAGGCGTAAGAGTGGGCGTGGC:1 + chr2R 543216 3' - INE-1 473 1 83.05 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTTTACCTTT:1 + chr2L 12199537 3' - Stalker2 7263 2 60.40 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTTGGGTGGTAACTCGCGCACTTTCTTATTTTTTCTCTACAAATTCAATTCGCATTTTCACTTAAAACTTTTT:1 + chr2R 24500911 3' - Tirant 8130 2 56.44 TATTTTTGAGAAGTCCGAAAGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTCAGAATATATGTACATTCATGTTGGTATGTAATTTTT:1 - chr2L 10475493 3' + aurora-element 4086 1 61.39 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGGTTATTATATTATATTTTTAGCTGAATTTATGACAAATTTCAAAAATA:1 - chr2R 19594580 3' + roo 397 1 66.34 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGTTAACATAATAGCACTGTCACTTCGATGAATT:1 - chr3R 14521078 3' - I-element 44 1 68.32 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGGTCTTGATATGAGATATGTTATTAAAAATGAAACAAGTGA:1 - chr2R 8707021 3' - flea 4788 2 59.41 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGC:1 - chr3R 12882672 3' + 412 7489 2 74.26 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGGCATGGGCATCATTGGTCCGGCGGCCGTCTGCGATCTCCGCAT:1 - chr3R 16613133 3' - 412 33 2 58.42 GAGCGCCACAGGAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGTTCTTGTACTTGAAGTAATAGTCCCGAAAGATCTCGGCAATGTGC:1 - chr2R 14874126 3' + X-element 4431 1 53.47 AGAGTTTTTTAAAAGTTAAAAACAAGTGAAGGAATTGAGCAGAATTCACTCCACTTTACTCCGCCGTGTAAGTGCGTGATTTTCTGGAATGTGCCGTATAA:1 + chr3L 12590417 3' + TAHRE 9 1 72.28 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTTATGTAGCATGCTTTT:1 - chr2R 8385121 3' + hobo 2904 1 59.18 GAAACTATTAAAAAATGGCAGCAAAAAACACAGAAATCACCTCTTTAGCCACCTAAACGAAACTAATAAGCCCGAAACGCGACCAACTGCAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 9235385 3' + Porto1 4425 1 58.42 TTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATCGCAGACCAAATCAACACATCCGACAAGCAGCTCGAGTCGGCAGAAGAAGAGA:1 - chr2R 6438334 3' + Stalker4 394 1 59.18 AAGAGCTGTTCGCTGTAGCACTCTCCGCTCTCTCGCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGCTATCCCTTATCCTTGTCATCGACATGTAAAACTCAA:1 - chr3R 22822617 3' - 1360 125 1 53.47 TTTCTGTATTTTCCTTTTTTTTTTACCTTACCTTTTTTTTACCTTTTACCTTTTTTTTTTGCGACTGAGATTTGCAGCACAACAACAGCAGC:1 - chrX 13902667 3' - Doc2-element 254 1 73.91 GGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAAATGTTAAACGACAAACTGCCAGTCGAGTCGTCGTCGTTATGGCCTCAGCTACCGCTCTAC:1 - chr3L 7967022 3' + jockey 417 1 62.38 AGGAGAAAAGAATTTTAATTCTTAAGCTAAGAAATTAAGGAAAAAATCGTTAAAATGGTTAACATAAAAGGAAAACTGCCGTGGAATGGCTAAACAAATAA:1 - chr2L 3432143 3' + HB 376 1 61.39 ATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATAATAGCCAGGCTTTGGGGGCGTTATGGCATTCTCACGCTTCATTTGGCATAAAGACCAAAAATAACCGCTG:1 + chr2R 5813677 3' + HMS-Beagle 244 2 77.23 TTTATTAATTTATTTATTAAGGAATCATCAAAAGTGGATTCTTAATTTGTAAATTAGTAAGCTGACTAAAACTGCATACACTGCTGATATAATGTTATCAG:1 - chr2L 14700725 3' - X-element 4712 1 51.49 GTTATCGTAAGATACTTGCNGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCGGCTTATTCCAGTTGGTCACTTCAGCTATACCTATAAATACCAGCGC:1 - chrX 6282190 3' + Chouto 164 1 80.20 TTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGGAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACCTA:1 - chr3L 9920609 3' + copia 4665 1 77.00 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCA:1 - chr3R 19589911 3' - BS 5009 1 60.40 TTTGAAAATATAGATTAAAACAACATAATAGGCAGAAATTCTGGTTTTCACGAAATAAGTACAAAATACAAATCGTTGACCACTTAGCACTCATTTAGGAT:1 - chr3R 5364703 3' - HB 1468 1 58.42 ACAAGAGACGAGAACGCGCATATGTAATGATCAGAAATCGATAGGGAAGAGATGAGATCGCGAAGGAAACTCAACATCTGTGAGCATTGGCTTAGCACTTA:1 + chr3R 30369077 3' - 1360 3230 1 67.33 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCCGCTTTAAGTTGCGCATTTAATTCGAAAGCCATCGCGAT:1 + chr2L 9471296 3' - roo 7 2 74.26 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCGTTACTTTTCCCAATGCTCAATGGAGCATTCACCCTTGTATCTCCTCTCCTTAAAGGACCT:1 - chr3L 15435516 3' - blood 7027 2 63.37 GATAAAATATTAAAAAAAAAAAGATGAATATCGGAGAAAATTTGTTATACAATTGTAGTTAGTTAGTTCTGAAGCCATTTGGTCCAAATATCATACATAAA:1 - chr3L 2312767 3' + BS4 730 2 79.21 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTCGAATCCCAAGGTGAATTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGAATTTGCGG:1 + chr3R 19446118 3' - Transpac 14 2 63.37 ACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTACGAATGCGTGAATGTGTGAGTACGAAGTCGATAGATATTAGGGAATAAGATGGGAAAACGATTTTAAAATTGTTTA:1 + chr2R 25199464 3' - INE-1 538 1 38.61 GTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGCGTTTGAACAATTTTTAAATGTTTTTGTTTAATATTAATGTAGTTTGATTGTCAAAACGATATATATCTCATAAATC:1 - chr4 1250440 3' + INE-1 301 1 61.39 GGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTATAAGAATTTTGACGTATCAGTTTATTCAAACGGAAGGGCAGAGCCAG:1 - chr2L 21259767 3' + Stalker4 7336 2 54.46 ATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCCTCACATCACATTTTTTCACATCCCAT:1 - chr2L 16456743 3' + BS 5085 1 70.30 AAATTCATATAATCTTTGTAAAAAACTTAGATATTAAGAATCGTTTAAATTGATTGATTGGTTTTTTTTTTGGTATTGTTACCTATCATCGATCTAGCTGG:1 + chr3L 15863965 3' + jockey2 3283 1 58.42 ACCTAAAAGATCAAGTTGCCTTACTAGAAGGTAATGATTAACAGAGCGAATGCAAGACGTACCGAAAACTGAAGTCGGTTCAGAGCAAATGGGAGAGCATA:1 - chr2R 2009069 3' - Q-element 360 2 60.40 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGGGGGTATGCTCTGCACACACTTATGACAAAACCAGATGGAAGCTAAACCGCATTTATAAG:1 + chr3R 19963468 3' - 1360 15 1 49.50 GTTTCTTACAAAAACTCAANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACGACTTG:1 + chr2L 7461133 3' + roo 9043 1 54.46 AAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGC:1 - chr3L 17110727 3' + hopper 1364 1 74.26 ATTATTAATATTACTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAA:1 + chr2R 11403999 3' - mdg1 7077 2 61.39 GTTGCAGAATTGAGGACCGCGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAAAAAGCTGTGTCTGCTCCCCATTTGAGGAAGGTGAATCGTTCCTTGTTGCGCTGG:1 + chr3R 22723848 3' + diver2 4424 1 68.32 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAAGTATTTCAAACCGGCGGGCAGAAGCGGAA:1 + chr2L 10177841 3' + copia 244 1 66.34 GGGCAGCACATTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCTGCGCTGAGTTTGCCTCGTTTCTGCACAATTAGTTCGCCATCGTGTTTG:1 - chr3R 23242832 3' - X-element 379 1 51.49 GTTGGTTAAGGGCTTGAGCGCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTATTTTATTTATTTTATTTTATTTATTTTGTCTCTGAAAAATAAAACTCACGCTGTTT:1 + chr2R 999419 3' - I-element 161 1 61.39 GTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAATGAGTACGGTGTGGGGTCACCTCATCGGTAGCACCGGTTGGCTGTCTCA:1 - chr3R 26505410 3' + Doc 319 1 53.47 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTA:1 - chr2L 19207887 3' + 412 7513 2 70.59 TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTTTGGTGGCAAGTCCTCTGCCTTGCGATTGCATG:2 - chr3R 13239872 3' + hopper 1389 1 53.47 TATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGTATATTTTACTCGTCTCTCCTCTTTGTTTGCCTTTGCCAGCC:1 - chrX 10473285 3' - F-element 4601 1 58.42 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGTTATTTTCATTAGTGTAGGGTACTTAGGCGTCGA:1 - chr2L 15817979 3' - I-element 44 1 68.32 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACCATGATACTTTTGGGATGCACTTGAAAGCTTCTCTGCTCAGGGAAAATTGTTAATTCTCTTTAATCCATTTGATA:1 + chr3R 13240001 3' - jockey 8 1 70.30 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTTTTTTCTGGCCGCACATCCTTCCAGTGG:1 + chr3L 25345145 3' - Doc 52 1 69.31 ATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAATGAACCCAAAAAAAAGGGGCTCCTTTTTCGTTTTGTGTGCGCCGTGTCGTGTTTCCATTTC:1 - chr2R 7850071 3' + Dm88 4178 1 65.35 AAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAGCGCGAAAGCCGAGAAAACTAACAAAAAACGGGCACAATAAACTTGACTGCCTATAACAATATCTC:1 - chrX 2745966 3' + invader2 479 1 77.08 AACTGTAATTATTTACTTACACATTTGCCTTCTTGTTTACATATTTCACACCCCTAGCCGATGGCCCAAAGACCCACGCCCACCTAATTACACGTGG:1 + chr3L 1078787 3' + HMS-Beagle2 7199 1 61.86 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCTTCCACAATTTCTGGACCTATTTTC:1 - chr2R 19513349 3' + roo 400 1 65.56 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATAGATATACACAAACACACACACATACATATGTGAAAATAACGAAAGCGATGAAATAAAACAAAGCAGCCACAAAT:1 - chrX 10237311 3' - Quasimodo 31 2 82.18 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAACAGGAGTATTTAGATAATGCAAATTTGATGTTTCATCATTTTGT:1 - chr3R 18342459 3' - F-element 45 1 58.42 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCCATAACCTTTTTGTGAGCAACAACAAAATAAAGTTTG:1 - chr2L 18297837 3' + hobo 2901 1 65.35 TTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGGAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACCTAAT:1 - chr3L 9920607 3' + copia 4666 1 78.22 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACTACTACGAA:1 + chrX 16237972 3' - mdg3 5282 2 53.47 TGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCGCTAAGTAACTCAAAGCAAGCTTGCAGCAGCTTCCAAAATGT:1 - chrX 19535130 3' - 1360 3343 1 60.40 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCCACAAAAACAACGCCGATCTCGCCCGTTTGTCACGCA:1 + chr3R 6437561 3' - 412 7093 2 63.37 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCATCCTCTAGCTGGATTCTATGGACGTGAGCAGCAAACGAAAATTCTCGAAATTATTCAAATGTCAAA:1 + chr3L 5256004 3' - jockey 32 1 66.34 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGCGGCGATTGGCAGA:1 + chr3L 5206610 3' + roo 9032 1 65.35 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTATATTATTTTATCTGCCTTAGAGCTGTATTTATAAAGTAGTCGTATAATCGATTACCT:1 - chr2L 22107337 3' - flea 4771 2 65.35 AGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAAATGCTCGTCTTCGCCAACTTGACAGCTTCTTGGGTCTGTTCATTTCGGT:1 + chr3L 10209193 3' + 297 12 2 55.45 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAACAGGGTTAAGATATTAGAAATCTTTGTTTATTA:2 + chrX 3546370 3' - pogo 38 1 72.28 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCAATATCTGGCTCAAG:3 + chr3L 3428083 3' + roo 391 2 60.40 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGAACCATTTGATAGCAACACGTC:1 - chrX 1713998 3' - hobo 53 1 81.19 GGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGGACATGAGCTTGAGCTGGATTCGAATGCTTTGAAGTCCACATTTGAGTTCG:1 + chr2R 7729670 3' + 412 481 2 50.00 AAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAAAACTTTTTTCTCCTTGTATTTGGTTTTCATTGCTG:1 - chrX 6072742 3' + P-element 2582 1 40.82 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGAATATTATGTTCTATTTAATTTCCACTTACCCGACCGA:1 + chrX 11993778 3' + 297 6942 2 67.33 ATTTAACTACAATTACATAACAATCACATAAAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGAGAATAAAGTGAAAAGCGGTTGAATCGAAAAAT:1 + chr3R 13348798 3' - X-element 4587 1 66.34 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAACTGCCAGTTCTGGGTTTGTTTGCTCA:1 + chr2R 10969437 3' + mdg1 7410 2 73.27 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGGCGAAAGTATGGGGGATTAAATCTGAGAGCACCAGCGGAAATTGCATGCAATTCAATTGCAATCAAGGA:1 + chr3R 28112440 3' + hopper 1411 2 53.47 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATAAATGTCTTACTATAAGTTTTATTTAGTTCCATTGCTAGTTCAGCTTTGGAGACTTTAAAGCTCAGC:1 - chr3L 2714449 3' - BS 21 1 63.37 GAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCTGACATATATGTAACCAATGATGGTCATGGCAGCGCGATAACACATGCGGCAACACTGCAGGA:1 - chr2L 21708328 3' + invader4 3063 2 55.45 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTATCATTGCGACTGGTTTTAACAAAGA:1 + chrX 22897247 3' + copia 239 1 74.26 ACACACACACACACACATACGCGCTCGCTCGCACTAACTTGTGCGGCTTTGAAGTTGCTCCTTTTGTGTGTATTTCTCGTGTGGATTGTGCTCGAGAAGAG:1 + chrX 17978219 3' + accord 185 2 64.36 ACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATATGCATACAT:1 - chr2L 3218461 3' + Stalker 7022 7 65.33 ATCCACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGGGCAGCCTCAAGGGGTTTCAGTTTCAGTTCGCTAACACCATAATTCTACCAATTTTAAGTGGCAAATAA:1 - chr3L 19459779 3' + Burdock 257 1 70.30 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATATAACCATGTATATCCACTTTAAGCTGATGATCAGAAGGAACGGGCAGTGTATTACTAGGAGAGGTATAT:1 + chr3R 4769550 3' + copia 250 1 71.29 AATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTATGTATTCTATTTGCACCACTTTAAAGGTAAAGCTGTAATTGGTTTTTATTTCGAAATAAATCG:1 - chrX 14769941 3' + 1360 291 1 75.25 AAAAATAATCAAAATCCATAATTGAGAAAAAGTGAATACAATCATTTGAAATTAAGTTTATGATTAAACTAGTATATTTAAGCTGCAAGATATTCATGTTC:1 + chr2R 12260700 3' + transib4 2540 1 89.11 GGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTTCAACCTGCATAGTTTAAAGAACTGAACCTCTTAGTGCTGGCACTCAAATTGAGGTTAG:1 + chrX 12755994 3' + R1A1-element 4994 1 65.35 AAAACAAGAAACAAAACAACAAAACGGAAAGCAATCCCGTGAAATTGGAAATTATACAATAAACATTTTCAACTCCTGGAATTGATCTCGCTCTGTTATCG:1 + chrX 11123856 3' + Porto1 188 1 56.44 ATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATA:2 + chr3R 9613487 3' + invader3 237 2 62.38 AGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTCGGGGTT:1 + chr3L 21912332 3' + Bari1 1673 1 59.41 AATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCG:1 - chr2L 23372507 3' - gtwin 6 2 73.27 AACGAGTAAAGTCTTTTCANTTGGGATTTTACAATCAGGTTAGCCAAAAAGCAAGGCACGTTACCAGTACTTTCTTTCTTTCTTTCGCCGCCTGCCTCACG:1 - chr3R 15117583 3' + roo 9060 1 69.31 GATCACGTAGCGACTTGATATGCGGAAGAACATTCAAATAGATTTAAAGATGAAATCGATTTCACTGGCTAAATAATGCTTAATTAATTAATCCATCCTCA:1 + chrX 10969599 3' - R1-2 2948 1 70.30 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCAGAAAAGAACAACTCGAGATT:1 - chr3R 17615916 3' - HMS-Beagle 12 2 67.33 AACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGTTAGTCTGTGAAAAATGATCGTTTTATGAGTATACAAAATGAAAATAGCTCTAAAGCATATTTTTAA:1 - chr3R 14584795 3' - McClintock 6217 2 72.28 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATG:1 - chr3R 5993133 3' - pogo 52 1 81.19 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCAAACATTACTGCATTGGCCAAATCTTTAT:1 - chr3R 28216807 3' - blood 46 2 68.32 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTGTAAAAGATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACATATCATATCATTCATTTTAAA:1 + chr2R 24170012 3' - roo 8664 1 80.20 TAAATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGTGCAAA:1 + chrX 22694470 3' + Burdock 6383 2 70.30 ACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGCACAGTGCCCCTCCCTGCTCGCATCCTTTTTCGCCGTTTCGCACACAACTCACGCAGTCGAGTG:1 + chrX 12151793 3' + 1360 29 1 71.13 TAAAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGCCACAAACTATATTGATTGGGTTGGGATTTCAACTAGCAACTACATTG:1 + chr3L 8888179 3' - G2 381 1 52.48 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTAAACTTTACTTCTGAGTATTTAGCTAACAGCTTAAAGTAA:1 - chr3L 3822378 3' + pogo 2077 1 52.48 AGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCATGTGGCTGGTCAATTGGCTTCGGATGGTCAGTGATAGTGGGTTGCTCAGTTT:1 + chrX 15687198 3' - hopper 1261 1 60.47 AGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCGGCGCGTCAGCTTTAAGCCCTCCCAATGTCT:1 - chrX 10846358 3' - micropia 5274 2 72.28 GCAAATGCAAAATAGCTGGAAAGCGGGGAAATTATGCAGTTTCCCAGATGCCGAGAAAACAAGGCAATGGGGATAACAACGGGGAGCTGCTGTTTATGCAA:1 + chr3L 21085000 3' + G5 494 1 56.44 GACAGAGTTCACTGTCTGCAACACCAATCTTGTGCAAATGGAATGGGAGAGGACGAGAGAACGATGAAAGTTCGAGTAGGAAACACGCACGTCGATCAAAT:1 + chrX 7919389 3' - baggins 5185 1 68.32 AAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATCAGGTTAGCCAAAAAGCAAGGCACGTTACCAGTACTTTCTTTCTTTCTTTCGCCGCCTGCCTCACGATTGGCCC:1 - chr3R 15117575 3' + roo 9068 1 77.23 GAACACACACACACACACACAAGAAAATAACAATAACAAATACTATTAATAACTATGTTAAATTGTGATGGTCAAGGTCGTTGGCATGTGCGCTTTG:1 - chr3L 18033906 3' + accord 183 2 63.92 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAAGAATTATGTATCACTTCGTTACGACTTACTTCCACTTAATTTATTTTCACTTGCTTTTAGCAGC:4 - chr2R 13659001 3' - Ivk 11 1 68.32 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAAAAC:1 - chr2L 1432033 3' + opus 461 2 72.28 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCAAAATTACACGCAATTTATGGATGTGGCAGG:1 - chr3L 10560218 3' - pogo 7 1 69.70 ATAATAGTTGATATAACATAGTTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAAGCCAAAAAACTGACTCAACAGCCGGCGAAATGC:1 + chr3L 4234534 3' - jockey 4847 1 65.35 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGG:1 - chr3R 16594483 3' - Tirant 39 2 63.37 AAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGATGGAAATCTAATCATTCGATTTTGAAGCTTGCCGTTAAAATATTTATGAATTGGGA:1 - chr2L 11608860 3' - Ivk 368 1 62.38 TAAAGTCTTCTTATTTGGGNTTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACGGGAAAAGTGGCCTTGAAGTGGCAGTTCCCT:1 - chr2L 13214955 3' + roo 403 1 75.25 TGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACGCTCCTGCTGCTCCAGGAAGTC:1 - chr2L 2719004 3' - flea 151 1 78.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAGTGCCAACAAATTGTTTTGCTTTTT:1 + chr2L 16127779 3' + roo 9049 2 56.44 GTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTCCCACTCAGGTCGTGGGTCT:1 + chr3R 31208968 3' - accord 6935 2 78.22 TTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTATCATGACGTCGCGGATTTGCAGGGTCGGTGGTTCCACCAGGTTCCACTG:1 - chr3R 13845634 3' - hopper 956 1 50.50 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATAGTGTTCGTGATGAAACTTGTGACTCCACCAGCTGC:1 - chrX 1762939 3' - jockey 4709 1 63.37 ACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATTTTTTAAGTGCTAAATGTGGCGATACACATCG:1 - chr3R 22538780 3' + hobo 2648 1 64.00 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTCCGAGGCCAAATCCATTGAGATTTTC:1 - chr2R 7173613 3' - mdg1 19 2 60.40 ATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTT:1 - chr3L 27356071 3' + Tc3 1691 1 75.25 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCCAGCACCCGCGGCTTCAAAACTGTGG:1 - chr2L 8690543 3' - Tirant 8155 2 72.28 ATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTCCTTATTGGCTTCCACGCAATTGCCGCTCTCCAC:1 - chr3L 20224856 3' + Chimpo 159 1 59.78 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACAGCAGCTGTGCCCGATGCGAGGGCAGTCTCACTTAAGAAGATTAAAG:2 - chr2L 14799099 3' + hopper 1391 1 55.45 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGTAGCGGGGATCGTCCCTCA:1 + chr3R 13205797 3' - hopper 55 1 79.21 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCT:1 - chr3R 4474176 3' - copia 37 2 67.33 GCTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAAGAAACCAGTTCGGGAACACGCCCAGTGCTGATAGCGGGGCATGAATCAAAA:1 + chr3L 17131281 3' + Porto1 112 1 54.46 AGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAAGTAGAGTGTTTGATTGAACTTCGCTACGTGGATGCAATAAATGTGGCAAATGCGTG:1 - chr3R 5013421 3' - Doc2-element 454 1 66.00 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTTTAATTACTTTCACCTTCATCAGATATATATACATATACATACAACACCTA:1 - chr3L 17146805 3' + pogo 2077 1 51.49 GAAGACTCAAGCGACACCANCCTCATGATGTTTATACCGATCGACATACTTCTTACTGAA:1 + chr2L 12322159 3' + jockey 4746 1 58.33 TACTACCAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGGAAAGACTCATCAAGGTAGGTAAAAAGCATTAGAAACCGTTCTTGTACTCACCAATTTTCAGCAATATAAT:1 - chr2L 1248349 3' - INE-1 549 1 75.25 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAAACATAATTCAATATAGCAAGAGATGGTTAGATAATAAATTAGAA:1 + chr3R 26123088 3' - roo 8696 2 59.41 TTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAGTCATTTTTTAAGTGCTAAATGTGGCGATACACAT:1 - chr3R 22538782 3' + hobo 2645 1 66.34 AGCTACGCGGATTAGCCTAAGGCCAAATATATTCAAAAACTGAAAAATCAGAGAGACAGAGAGACTC:1 + chr2R 24806788 3' + 412 322 2 80.60 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTCACAACTTACAACTCACAGCTTGCAAACACACACCCAACCCCGCAAACAAAACAGTTGGCTA:1 - chr3L 6866153 3' - 412 13 2 64.36 GTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACGAGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGCT:1 + chrX 19113516 3' + Stalker 299 4 55.45 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTATATGCGGGATTTTGTTAAATGTTGCTGTGTAAGCCGTATTTAATTAATTTGATTTAAT:1 + chr3R 20872791 3' - copia 17 2 60.40 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGGGCGAAGATTGAACGCAGCAACCATAGAAGAAATATAAATAAACAAGTCCTCTAAA:1 - chr3R 7411794 3' - 1360 19 1 62.38 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAATTAGATGAATCAACCTGTATAATGATAG:1 - chr2L 7259432 3' + I-element 5312 1 72.28 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTAAAATATGAGTAGTACATCTCTTGTAGTG:1 + chr2L 4918176 3' - jockey 4802 1 69.79 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCGTGTAAGGCTATCTGACACTGGCCGTGGGAAAATGCTGCACTTTGTTGGCTTACCAGAT:2 + chr2L 13215065 3' - roo 8681 2 59.41 CGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCAGATTCAGGGGTACTTCACAATCCTCACCACAGTCCGAAATTCA:1 - chr3L 23241571 3' + 1360 25 1 59.41 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGGTTCGTTCGGCTGGAGAG:1 - chr3L 749305 3' - P-element 55 1 25.74 TTAGCTACCGTTTACACAGTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTTTCAACTCAATTGCATGGCAACTTTCGGTGGGTCGTCGCCATTTTTCCGCCTA:1 + chr2L 10708548 3' - 1360 2970 1 59.41 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACACTAAGCGCACTACCAGCTCTTCATCTCACAGTTCTTCTTTCTTTTCGA:1 + chr3R 26799015 3' - P-element 25 1 52.48 TTATTGGCCTTATTCTATANCCACCCTACCTGTGAAATCGACATTCTGCTGAAAGCGGCAATTTAACACTTTTCCTGCCAGGGAGCTGATAGGGAGGGCGC:1 + chr3R 26281623 3' - Circe 7207 1 65.35 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATTGGTTAAGTGTTATG:1 + chr3R 11191085 3' - hobo 24 1 52.48 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACATATATCCCCGATCCCCCGAAATGGGGCGCGTGTATCCA:1 - chr3R 10090309 3' + pogo 2071 1 63.37 AACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATGCCCTCTTATGGATTGCGCAG:1 - chr3R 9613452 3' - invader3 5243 2 78.22 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCATATCACGAGATTATACGT:1 + chr3L 16478447 3' - pogo 35 1 63.37 GGATTCCTCTTTTCTTATGNTCTCTGAAGTGTGTATGCGTTTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAACGCTGTTAAAAGCCCAATCACACAC:1 + chr3R 4607207 3' - invader3 170 2 78.22 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTGATA:1 + chrX 15258344 3' - BS 40 1 68.32 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGTG:1 + chr2L 18413892 3' + hopper 1375 1 64.00 AAAAAATAAAATAAAATCAAATAAAATGAAAAAGAAACACAGAAACAGAAGAAAATAAAA:1 + chrX 16930119 3' - transib1 1895 3 55.00 TACGACAAATAAACAACTGTCCCTGGAATACATATACGCAACTCGACACTCCATAAAGTGCTTTTGAGTGGGCATGGGAAATCGATAGATATTTACAAGAC:1 + chrX 15231530 3' + Helena 1148 1 46.53 AAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACATAAATCAGAGCCAGTTGATAATAAATACGGCCCAAGACGAGAAAACAGCTCTCCAGGGGGG:1 - chr2L 9776989 3' + X-element 4401 1 63.37 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAACAGA:1 - chr3L 153602 3' - 1360 52 1 76.24 GTGGTTATGTATGGGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGA:1 + chr3R 15924660 3' - Quasimodo 43 2 79.21 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTGGTAATAGATAATGCCGTCGTACAAGCCC:1 + chr2L 8007877 3' + copia 5077 2 71.29 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAACACCATTTATGCAGAGTACTCAAGTTTTTGTT:1 + chr2L 7592237 3' - BS 5075 1 71.29 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTGCGATACGTTTTTTGTTTATCTCGAACCTCAGCTGAAATAATCGCAAAAGGGTCGCAACCTGCCAGCAATCAC:1 - chrX 8037594 3' - roo 2 2 62.38 ATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCTCTCCAACTGTCTGCCATCCCTTTCCCTCTCGACGTTGTC:1 + chr3L 17110776 3' - hopper 16 1 54.76 AGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAA:1 + chr3L 19349987 3' - 1360 3237 1 61.00 GGAGCACGATAAAAACGTCNTCACACGTCGGCGATCGAATAGCGTATAGTAGCATAAATTACAAAATAAATAACATAAATTTTAGTTAGTTTCGCCGTCG:1 + chr2L 5686230 3' - F-element 32 1 67.00 TGCGCAACGGCCTTACATTGGTTTGGCACTATTACATTTATGTGTGTTCACCAATCACTTTGGAATTCGATTTATAATGAATAGTAAAATGAAGTCTTATT:1 - chrX 20627793 3' - 1360 3366 1 80.20 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACTTGTTGGCATCTGGGCTGCCAACTC:1 - chr2R 23877718 3' - Transpac 4945 2 54.46 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGTGTATATTCAATTGAGGATTTAGCAATCACATTACTGGCACTCGTTACATTGAAGCAAAT:1 + chr2R 9811375 3' + Quasimodo 7359 2 72.28 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCTTTCCCCGAACTATTTGCTCAGCGCCCATCGACAATAAAG:1 + chrX 9463424 3' + hopper 1382 1 56.44 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCAT:1 - chr3L 11657852 3' + Tabor 7277 2 68.32 AGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATATTGGGTATCAACTAGTCTGGAGGTGGCAGGTAGAGCCCTTTAAAGCTTATTGCTAATGT:1 + chr3L 1273361 3' - INE-1 523 1 58.42 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGTGTAATGGCAAAGATAACTTGAGAAATTGTATTATAATTAAA:1 - chr3L 25397060 3' - roo 34 2 64.36 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGGCA:1 + chr3R 18171834 3' + 1360 3353 1 69.31 GTGCTCTTTGTAAAATATTAAAATCAAAGAAGAGCGGAAATTTAAATTCCTTGATTACTAATTTACAATTAATGTAAAATGTACAAATAGTGGAAAGGCAA:1 - chr3R 7564382 3' - TLD2_LTR 111 1 91.09 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTGGGTTGCTTAAAGCTAGTAGCCCACAATTTTAATATGCTTTTTTAGTAATAAAAATAGCTCAAGAATCA:1 + chr3L 5808268 3' + 297 393 2 78.22 TACAGAAAATGACCTGCGGCCATCGTTGCTTGTGCGTCGCTCACCCAAAGAATTATTATTGTGGTATTATTTTTTTGATCGTACCACAAAACTCCAGGGT:1 - chr2L 4764756 3' + hobo 2731 1 47.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCTGCTGCCTCCTTTTATTGTGAATGCAA:1 - chr2R 18105739 3' + roo 404 1 66.67 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTGTGCCCTTTGCCACCGGCCACACCCCCTGCAACGCCCCCCGTAATCCTTGCTCTCTTTCGCCGTCCCT:1 - chrX 6338858 3' + P-element 2878 2 70.30 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATGTGTCTAATGAGGGGCCTGGCTCTAAGC:1 - chr3R 11191023 3' + hobo 2911 1 63.53 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCATATAAAGAAGAGCTTAGAAGCATTCAGCTATGACACAATAACAAAGAG:1 - chrX 13379681 3' - 297 6585 2 69.51 ACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACTCCAACATAATTAGTTTAATTTGCACAATGAGATGCTGGTGCT:1 + chr2R 11820946 3' + gypsy6 329 2 78.22 AGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGCACTCAGAAAAATTCAGTTTAAATGTCATACCTGAAATATATGCAGCAAAGTCCTCGTACTATTATGA:1 - chr3L 12238813 3' + jockey 4682 1 72.28 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGTTATTCAATCAGTTGTAAGAATTGAGTTTCATGCGGAAATATTTAATTTGGATTTTAAATGC:1 + chr3L 7204124 3' - Tabor 6855 2 59.41 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTG:1 + chr3R 30611300 3' - blood 7050 2 63.37 AATTTTAAAATTGTAATTAAAAAAAAATTGAAATTTTAAATGCTTAACAAACCATCAGTAATATTAACACGATCACGAACAACATCAGCATGCCGGAAATT:2 + chr2R 7401192 3' - 1360 3051 2 55.45 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTTGCCACTGCTGGCTTTTTGCTAGATGGGCTTGTTTGTCGCTTTGAAACGA:1 - chr3R 20345064 3' - transib2 2 1 77.23 GTGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8269 2 51.49 TCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCGACGAAGATGCTTTGATTTTT:1 - chr3R 6660443 3' + mdg3 5327 2 78.57 GATGTTATTGGCCTCATTCTATACCCACCCTCCCTGTGAAATCAATTCGTATTCTAAGCCTACAACTAGTCAAGCATACTTATCGAATAAACTGAGAAGCA:1 + chr2R 22079352 3' - Circe 7211 2 60.40 ACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAATAGACGTTTATTGAATTCGGAGCAGGTGAAAC:1 - chr2L 12199465 3' + Stalker2 365 2 66.00 GGTGATCCGGCTCGAAGGACCCTAACGAAAAGATTGAATAAAATAGTTCCTACTATATGCAAAAATAGGATATATACTTACAAGTGGAGTTCACATTGGGC:1 - chr2L 16445970 3' - GATE 276 1 61.39 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAACTGCCAGTTCTGGGTTTGTT:1 + chr2R 10969431 3' + mdg1 7404 2 79.21 GCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAAGAGTTCATCATTACAAATCCTTCAAAGGCTACACATTTAATGGCATTTTGACGCTGCCGCCGC:1 - chr3L 6084360 3' + 412 7515 2 53.47 TTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATTAGCTGAGAATTTCCGCTTTCGATCGACTGAAGCTCGTAAATTAACGAAAATTT:1 - chr3L 7100766 3' - Idefix 7081 2 55.45 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACTACCAAACTTTGAAAATGTATCTCCTACGCTTGCTAAGAAAAGA:1 + chrX 18584983 3' + Burdock 6362 2 58.42 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGCGGCGATTGGCAGATTGCATTTTAAATCCGCTTAACGGACTT:1 + chr3L 5206638 3' + roo 397 1 67.33 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTACATTTCCTCTACGCACATGATAGCCCGGTTAATAACATTTTCTTAGCATACACTTAGGGA:1 - chr2L 18818581 3' - jockey 64 1 56.44 TAATACATATGTAAATAATAGGAGTACAGAAAAGTTAGGTATCTTAAGGACTATCGTAATGTGTGCACATTAAATGAATGGCCCACATGCACACATAGACG:1 - chr2R 21112687 3' - Transpac 4852 1 69.31 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACACGCATATACAAGCATAGGTCTCGATGGTTCATTGGTTAAGTGTTATGTACTTAACGATGCAAG:1 + chr3R 11191101 3' - hobo 8 1 67.33 AAACGTCTTCACACGTCGGNGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGA:1 - chr3R 9870348 3' - F-element 20 1 58.97 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCTTTCAATTGGGTTGCTTCACGATATAAGT:1 + chr2L 16127756 3' + roo 9026 1 72.28 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACTGTGCATCTGCATCTGCATTTTTATGTGTGTGCGGGTGCGCAGTATATTTGTTTAACTTATGTGT:1 + chr2L 15548834 3' + Tabor 7314 2 68.32 ACAACATTTACTGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACTACTGTGCACGAAAACACAAGATTTCTGGGCACACTTGTTGTAAGCAAGTTGAATGTAAATAT:1 - chr3R 22493735 3' - Cr1a 433 1 60.40 GCAGCACTTCCGTGCAGCTNGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCCCTTACGCAGAATTCTGCTGCTCCCCCAGCAGCGGTTCTCCAAAACATTC:1 - chr3R 20430764 3' + hopper 471 1 56.44 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAGTTTCTAATATCAAGAACTGAAAATTAGAAA:1 + chr3R 7618726 3' - Doc 22 1 55.45 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACGCTAGAGTTAATTGAAAGTGACAAGGCTTCAGAAATG:1 - chrX 3016650 3' - diver 41 2 63.37 AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCAATCACAGCCCAAAACAACAACGCCTTCGATAGATTGAC:1 - chr3R 6190241 3' + copia 254 1 57.43 TGTGAAGAGTTTCTTGACACTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTGATATATTCAAGCTATATTTACCTTCTTCTG:1 - chr3L 9779899 3' + S-element 1505 1 75.25 AAACTTTGGTAAGGTCAATACCAAAAAGACTTCAAGCAGTTATATAACACCAGTTAGTCAAAAGATAAAAAAATATTTTAATTCTGTAGTTAATTAAATTA:1 + chr3R 23654780 3' + Bari1 1325 1 64.36 TGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTCTATTAACTGGTTTTTTAATAAAACACATTTGTCGGTGTTTTGCACTCGCCGCGACATTAGTTCAACGCAGT:1 + chr3L 12735048 3' + Cr1a 4373 1 74.26 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACCATCACCAGATGGGTCCCAGGGTCAACTGGTGGCT:2 + chr3L 6866233 3' + 412 7506 2 65.35 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGCGGTTTAAATTTATGTGCCGCCTAAAAGTAGGCAACAGTTTTTTCCAGT:1 + chr2R 18988490 3' - hobo 28 1 49.50 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGGCATGGGCATCATTGGTCCGGCGGCCGTCT:1 - chr3R 16613146 3' - 412 7088 2 67.78 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGCTAACAAGTGG:1 - chrX 15412654 3' - hobo 5 1 73.20 TAACGAAATAAATTGATGGAGGGCAAGGGATCCTTTTTCGCTAAAGACATTAATGCTAAAATTTATTATGCCAACAGACAATCGCTTTGGAGACCTGGAGA:1 - chr3L 5177313 3' - Gypsy12A_LTR 2250 1 54.46 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGCAAACAATTC:1 + chr3R 22494771 3' - 1360 29 1 55.45 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTCTTTGTCCCGAATTAATTTGAAGGTAATTT:1 + chr2L 12182666 3' - roo 46 2 75.25 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCGACTACTGTTTTATAGATGCAGTTCGCCGATTTAT:1 - chr3R 19449362 3' + roo 9014 2 68.32 ATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAAAGTTTTTTAATTTAGCTGCAGTTTTTTTG:1 + chr3R 15880938 3' + 3S18 6058 2 70.00 AATTAAAATATTTATTTTCTTAAATTTACAATTGTCTGCTATATATGAGTATAAGCTACCTAAAAATTCTTTCTTTTTTTGGATTAAATAACAATCAAATG:1 + chrX 14874977 3' - Stalker2 7182 1 62.38 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTTTGAGCTTTGTGTTAATCTTA:1 - chr3R 8434279 3' + roo 9017 2 81.19 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAACTTAGACTTATATTTTCGGTTCAAACTTATTCTTCTAACTATTATTTTATATTCATCCCATTTTA:1 + chr3L 17465201 3' + mdg3 234 2 36.63 GCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGCCTTCACTTCGATTTCCTGATCCCGAAATCTTTTGGCTA:1 + chr2R 24367813 3' + accord 229 2 61.39 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTCAATGCGAAATTGAAACAAATTTCGTTTTGCAGAGTTGGCAGGAAGCATTTATGAACGATAT:1 + chr3R 25950176 3' - 412 11 2 68.32 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTCTAGCGCGAAGTCACCGGAAACGTTAACAAAATGCATAGCAG:1 + chr3R 5133664 3' - Tabor 36 2 57.43 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCACATTCCCATTCCCGTTCCCATGTTGGGGAGCAAGGTCCCTCTGATCTGCGGATGAATCGGAAACGAGG:1 - chr2R 6918504 3' - hobo 1 1 74.74 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGTACCGTTTTCCTAAACTTGGTTAAAGTTCTTA:1 - chrX 10996512 3' - 1360 21 1 57.43 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGGGCGAAGATTGAACGCAGCAACCATAGAAGAAATATAAATAAAC:1 - chr3R 7411806 3' - 1360 31 1 57.43 GCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGGGATGCATGTGTGAAAGAGAAGATTTCTTGCTTTTGGGCAACAAAAACATATACACTTTTCTGATTAGTTCT:1 - chr3L 3755718 3' + 1360 3296 1 80.20 TTTTTGTAGGTTGAATAGTNTATTCCAACACATTTAATTGCATCTGTGGCTGCACAAATTTCCAGAGATATTTCGATAGAGAGATTGGGGTAGGTTATCCA:1 - chr3L 5403215 3' - copia 4878 2 70.30 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATATATAGTAGCATATAGTCCGATCGTGTTTTGGCATTAGAGCGAA:1 + chrX 18121915 3' + opus 479 2 60.40 ATGGACTGGTAACATTATCACATTGTATGTTATGTTTACATTTGATAATTTGAATTATTTAACAAGAAACATTGCCATATTTAATGTTTAATTATACTGCG:1 + chr3L 12943732 3' - HeT-A 5851 1 73.27 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACACGAA:1 - chr2L 17549304 3' + mdg1 7418 2 64.36 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTT:1 - chr3R 14049338 3' - transib2 23 1 56.44 AGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAACCAGCGAATATAAAGAGTCAAGATACATATTTAATTATTTACCCGAGAACTTGTTCGGGGCTTATATTACC:1 + chrX 17109742 3' + roo 401 1 72.28 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTCAGCTAATTAAAATTTCAGTATTAAATGCATTTGTTTTCGAAGG:1 - chr2R 11941220 3' - Doc 53 1 56.44 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGCTTCTTATTGGTGTATTCAATTAATATGTTTCCCAAATGAAGGT:1 - chr2R 4030054 3' - Doc 38 1 56.44 ATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGCACC:1 - chr3R 5773159 3' - Stalker 35 4 61.39 ATGTTATTGGAATTTAAAAAAATCTAGATTCTATCATGATTGATTCTGCTATCCAACTCACACATACTCACTTCGTGTACCTAGTATATAGAACATCTAAT:2 + chr2L 1627704 3' - FB 190 1 82.18 GATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTT:1 + chrX 22386754 3' - hobo 93 1 70.30 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACATATATCCCCGATCCCCCGAAATGGGGCGCG:1 - chr3R 10090317 3' + pogo 2063 1 71.29 AGCCACGGCCAAAAAATCGNGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCCTCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAGCTTTGGCTAAATATTCATAAATTCA:1 - chr3R 28628083 3' - 1360 49 1 71.29 AGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATATTTGCGCTGCTTACCATCTTAAAAAGTATTGACAATTTCATTTTGGCATAGAACATTTGTTTGCTCCCTGGCA:1 - chr3L 5003194 3' - hobo 2631 1 77.23 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGGGGAACTTGCGTTAACTGACATGCTATGGACCATAAAGGCAACAA:1 - chr2L 16939827 3' + opus 7458 2 71.74 ACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCCGGACTGCTTGCTCCTGGTGTCCTGGGGAACTGGATTTTAGTTGCTTACTCCAGAAAACCATCGCCC:1 + chr2L 1270940 3' - Stalker 430 1 73.27 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCATCATCTTGGTGGCC:1 - chr3R 16595088 3' + P-element 2862 1 34.85 TGAGTAATGGGTATCTGATAGTCTCAACCATTTCCTTTGTGAGCTTTTAGCCTATTGCAACATTAGCATATTTAATTGCAAGCCTTAAAAGCAAAACGTGC:1 - chr2L 3181989 3' + INE-1 548 1 88.12 GTCATCGGCCGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGACAAACCAATAACCGGGCAATGAAACTAATATTCATCAGGGACTCGAGATACATATC:1 - chrX 23073039 3' + F-element 464 1 56.44 AAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCTACACAAATTTGTAGTGCATAAGCCCGACCAGCGAAGCACAGGG:1 + chr3L 15355585 3' + F-element 4443 1 56.44 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGGCAACAAAGGGTTAAGTGCTTGATAAGCGAAAATAGGCGTATTATTTT:1 + chrX 7802927 3' + hopper 1389 1 49.50 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCATTCTCAGG:1 - chr2L 20271210 3' - blood 31 2 55.45 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATAACTATAGTTCAAAACAAAAATTGAGTTTTTCAGCTAATTCAAAGCT:1 + chr3R 14112394 3' + Juan 4188 1 52.00 AACTGAAACTAAGAGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGTTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGCAACAACAACAGCGGCTGGGAGAAGGAAA:1 - chr2L 16232129 3' - Circe 329 1 71.29 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGAGTCTCTTTCGAGGGCCGGAGAACCACTAT:1 - chr3R 15537320 3' + P-element 2843 1 35.64 ACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCTTTCCCACTGGGTTTTCTTATCTCCCTGCCTCCTCTGGTTTACTCTCCAACCTTTTCCCTATTTTCGTATTTTGTTG:1 + chrX 2794930 3' + Idefix 180 1 81.19 GCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCGGCTCAGGCGAAGGCAATGACAATACAAACATCAG:1 + chr3R 22398309 3' + Quasimodo 194 2 63.92 GATCAGGATCAATAGCCGANTCTGTCCGCAGCGAAAGTGTGTTTTCTGGGCCAGGGCGGACGACTCTAATCCACTTTGTCGCCGAGTCTGCCAATTATGCA:1 - chrX 17620947 3' + INE-1 92 1 62.38 GAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGA:1 - chr2R 11575007 3' + INE-1 148 1 60.00 AACTTGAACATTCCGCCCCCCTTGCAATCACTGGGGTTGCAAAACAGCCATCCTACGGCCGGCTGGTTGTACCGACACATTCCACACCGAACAGAAACGAG:1 - chr3L 23666481 3' - GATE 8224 1 62.38 TGGTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAATGAACTGAGTGGCTGGAGATGCGATGCC:1 + chr2R 19558030 3' + 412 7538 2 68.00 AAACAGGCCAAATGCCCCANAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAGTGAAACCCT:1 - chr3R 25514103 3' - hopper 3 2 70.37 GCTCTACCGCTCTTCACCTCAAAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGAGAGCCTAAAATTAACACTAATTCACCGAATACAATTAACTGACATCT:1 - chrX 14890288 3' + GATE 60 2 65.00 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGGTACGACAAAGGACGACAAAGGACTCGGTTGTGTGTGTCTGTTAGTGGGTGTGTATGTGTGTGTGGCATCCAC:1 + chr3L 12565368 3' + hopper 1413 2 74.26 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAGCTATACAATTTATATACTCGAACACA:1 - chr2L 14038409 3' - 3S18 5815 2 74.26 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCATATACTAAGTGATGACTAATAATAAGATTTGTTGGTGTTCCCCAGAAATAATTC:1 - chr2R 8717624 3' - 297 6596 2 61.39 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAAAGGAG:1 - chr3R 25514112 3' + hopper 1388 1 57.29 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGA:1 - chr2R 19557988 3' - 412 7094 2 64.36 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAACTATACATTATGTAATGAGTATTAAAACATTAACATTTATTTAAAATTAT:1 + chr3L 11428750 3' + mdg1 7433 2 52.48 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGGATAGGTTAAACGGCTTCCTTCTTGTCGGAGTGGGTAATGCATCAGCT:1 + chr3L 24150167 3' - blood 28 2 54.46 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATATATTATTAAAACAACAAGAGGGTGCCGGCGAAGAGCTGCCGGCAGATAACCTGAAACAACC:1 - chr2L 4764001 3' - Tabor 6852 2 65.00 GCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGAATTGGAGTGGCTTTGGTTAGTTACGTCTATTTTTTAGGTGGGTTGCTGTTGTTGATTTCTACATAAACAT:1 - chrX 8224609 3' - ZAM 165 2 71.29 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTG:1 - chrX 10547659 3' + P-element 2857 1 50.00 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCACTAGACAATTGGTCCTTTATTG:1 + chr2R 15436746 3' - pogo 50 1 79.21 ATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGACATTTGCAGGTCCGTACTTCTGTCATCGTTCGTTGACCAGTTCC:1 - chrX 13431903 3' - jockey 4648 1 55.45 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATG:1 + chrX 16237960 3' - mdg3 42 2 60.40 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTATAAAAAATAGGAAGAG:1 + chr3R 19446224 3' + roo 350 2 82.18 GTTTGCACAATGAAAATAAATGGTCTTTTACAATTACTTTGTTAACTGTAACTTGTAAACTTGTAACTTGATGTTGACTCTTCAATTATGTCATTCTAAAG:1 + chr2L 21400469 3' + S2 18 2 81.19 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAATTATTATATGAAAAGAAA:1 + chr2L 20271257 3' + blood 7335 1 82.00 ATAACTTCATTGTTGATTTNACAAAAATTACTTGTTTGCAAATTAGCAGTGGCATAGGAGCGAACAATTGTTCCGACTTTGGCTTTGACTTTGGCTTTTGG:1 - chr2R 19702441 3' - Tc1-2 1481 1 54.46 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTTCTGTTTTTTAGCTTAGGCCAACATTATTGGCATACAATACTATTATTCAATCTATTTTAT:1 + chr3R 30866954 3' - Doc 72 1 77.23 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGGCAAAAG:2 + chr3R 30611314 3' - blood 25 2 55.45 ATTCTTTAACTATCATATATTTAATAATTTACCCCGTCATTGCCATTCGAACGGTGAATGCACGGACCTTTGGCACACCTTCGCTTGTCACTGTCCCAGAC:1 + chr3R 24310784 3' + Cr1a 85 1 61.39 AATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAGTCCGAACGATGCGGCCATGTCACACGGGTTAGCCGGAGTACTGAAGTCC:1 - chrX 15211932 3' - F-element 4645 1 50.50 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAAAG:1 - chr2L 1136312 3' + 1360 3365 1 55.45 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGGCAAAAGGTATCCCTT:1 + chr3R 30611323 3' - blood 7027 2 64.36 TCCTAATGGGAGTTCATCATTACATTATTGTTATCCTGACGAGGGCATTTGCGCAAATTGAATGGAACAATTTGCCTCCGGCCATCAACAGTTTCGCCATC:1 + chr2L 20226776 3' + 412 491 2 76.24 ATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTTTTAATAAGGATATCTATGCATTATTTTTTCGGTGCATCCCATAAGTC:1 + chr3L 10284220 3' - Juan 4098 1 60.40 TATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAAAAACAGCAAAACGGCAGCCAAAGGGAAACGTTGATGCCCAGCCGATTGTTGGGCGGCTTTA:1 + chr2R 8385500 3' + hobo 432 1 72.22 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTGTGATGTCATAATTGGAATGCCTATCTTAATTCTATATTTTGTCTTTCGTCTGTTATTTCTG:1 - 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chr3L 10683436 3' + opus 472 2 53.47 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCACAGCCTCCGAAGAGCTAAAAGCCCAACATTTACAACAATTCGTTAGAGCACCTACTTCCATCATC:1 + chr2L 13433991 3' - hobo 11 1 67.33 ATTTAATTAATAATAAATAATAATAATAATTAATAAATTAATTTAATTTATTACAATTCCCTTTTATTTCAAATTCGTTAGAACCATAAGAGAACAAATTT:1 - chr2R 4879096 3' + flea 236 2 55.45 ATTTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCGGAACCCGTTGGCGTGTGCTTCGTGGTTATCTTG:1 + chr3R 29126661 3' + R1A1-element 464 1 79.21 GCTCCCACAATTTTCTCTTNATAGCACACTTCGGCACGTCCACTTCCACACGGATATGCGCAGGCATAAAGAATGCACTCCAAGTGCATTCCACTCCCAGT:1 - chr2L 19095396 3' - P-element 222 1 69.31 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTCTAGATTCTGAGTATCACAAATGCAGTAAGATTAAGAATAAATATATATGATA:1 + chr2R 7132577 3' + opus 7485 2 63.37 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAGTTCAAATTAATTAAATTTGTCTTTAAACATTCACCGTTCTTTCATCAAAATTATGGTGAAAGA:1 - chr3R 4474153 3' - copia 4882 2 66.00 GTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAA:1 - chrX 15746276 3' - jockey2 3207 1 67.33 TAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTAAGGTTCTGACAAAAGATAACTCCATTAAATACTTATAAATACATAAAATAGAAAGTTCTATTCACCTTGCAATC:1 + chr2R 13712242 3' - mdg3 5252 1 59.41 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCAGTAGAAGCGCCGTTCAGTGAATTTCTAGCCGACGGACAGACCG:1 + chr2R 7025018 3' + P-element 2862 1 52.08 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCGGATCCAG:1 + chr2R 15201556 3' - P-element 33 1 46.53 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGAAGTTGCTGCCCCCATTTATTATTTAAATATAAAACA:1 - chrX 12873585 3' + hobo 2905 1 62.24 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGTTAACATGAAAATCTAAAGGTCTGCCGGCGGCCACAGGCCA:1 - chr3R 17615936 3' - HMS-Beagle 32 2 58.42 ACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCGCAGTCCTTTCCCGGCTTCCTGGCGATGGCAACG:1 + chr3R 6501533 3' - flea 323 1 66.34 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTATGGCCGAAAGTGCTCAGGTTCGT:1 - chr2R 22898744 3' - Transpac 49 2 74.26 TCTAATAAATATACATACATATATCAACATCACAACTTGGATTTTATTGAAAAATTGCCTAAAACTCGTTATTATTAAAGTTGCCAAATTTAAAATTGAAT:1 - chrX 19428092 3' - 1731 4413 1 77.23 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAATTCATTCAATAAAATTTTGATTTTTATGGGCGTCATC:1 + chr2R 7173691 3' + mdg1 7423 2 60.40 AAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATC:1 + chr3L 19339404 3' - Tc1 53 1 69.31 GCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGGGGATATACTGTCCGCTTGCTTAAAAATGTCTTTCATGGCTCCATATTTCAGATCTTAAACACCGCACT:1 + chr2R 6041662 3' + opus 7500 2 78.22 TCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATCAGGTTAGCCAAAAAGCAAGGCACGTTACCAGTACTTTCTTTCTTTCTTTCGCCGCCTGCCTCA:1 - chr3R 15117585 3' + roo 9058 1 67.33 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACACGAATCGAA:1 - chr2L 17549299 3' + mdg1 385 2 59.41 TTGGTGGCATATATTGGTTNATTACAGCAATAACATTGTGGCCCTCATTGCTCTGAAATTCCATTGCTCTGAAATTCCGCAGTGGAATGTTCTTCAGACT:1 + chr3R 28216888 3' + blood 7385 2 70.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCCTGATTAGGATTTTTTTTTAATTTT:1 + chr2R 14536938 3' + roo 356 2 80.20 GTATTATTGTTGTTATTATTGTTGAGTAGGTCGGTGGTCAGTCTACTTGCGAGAACAAATTCTGGTCGAGCACTTTGCACATCAGCTCGAAGAGATCCACT:1 + chr3L 18754389 3' - mdg1 7061 2 62.38 TTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCAGCTCGTGTATTCCCAGCTCCTAAGTTGTCCTGTTTCTCTTAATCGTCTCTATCCGAGGTATGT:1 + chr3R 1848649 3' + Cr1a 264 1 71.29 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGAGACAGCACGAGTGCTGTGGAGACAGA:2 + chr2R 8385162 3' - hobo 51 1 72.28 GCGACACAACCGATCTCTATGAATAAATGTCTTACTATAAGTTTTATTTAGTTCCATTGCTAGTTCAGCTTTGGAGACTTTAAAGCTCAGCCCTGAAAAGT:1 - chr3L 2714439 3' - BS 11 1 73.27 AACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTCTTTTGCGGTTTTTTGAGAAATTTCACGACGGTCAACAAAGGAGTGCGCTCCAAAATGTAGCTAGTAATTTT:1 - chr3R 26657946 3' - hopper 936 1 54.46 TAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTT:1 - chr2R 12185341 3' + accord 7356 2 62.50 GTATGCGGCAGCGAGTGCCNAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGAGCCAACAACACGACGCAAGCGTAGTCCATTAAA:1 + chr2L 16927705 3' + opus 466 2 65.35 ATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAATTCTCTCTGACTTCCTTTAATTTTCATTTCGATCACC:1 + chrX 17475694 3' + Quasimodo 53 2 63.37 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATAAGTATACTTTGTTCCTTTTCATAGGACTCTGACCAGTTTTTCGAATGGAATGGGGGGGCATTAGTT:1 + chrX 12284139 3' + Transpac 5222 2 63.37 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCACCGCTTCAATAAAACTGCAAAGTGCCAATTACAAAAATAACAAGTTAGCCC:1 + chrX 20377167 3' + hopper 1389 1 49.50 ACAACTTCCACATAATACCTCAAAAAAAGGGCACCATCCACGAAACTATTCGGTTCTTCTCTTCCGCTCTTGTGGTATCTTCAAGGCAATTCAGTTAAGTG:1 + chr3R 7604264 3' + Fw3 54 1 49.50 TACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTAAGCTCATGTTAACCGAGTGCACGGTAGAGGGAAAACTT:1 - chr2R 5536715 3' + 1360 130 1 68.32 GTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGTGTATATTCAATTGAGGATTTAGCAATCAC:1 + chr2R 9811345 3' + Quasimodo 7330 2 71.29 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATATATACATATATATATGATAAGGGGTAATCATCAGATTAGGTAGATTTCTTTCCTATTCTGCTGGTA:1 - chr2L 2288339 3' - hobo 3 1 77.23 GATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAACCGAAATTCCAATGAGCGGGTGGAGATCCCTGCTAATTGAATTAAGCAAACACTTA:1 - chr3L 9094965 3' + BS 5080 1 59.38 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTATATGTTTGTGTAGGCTCACGTATGCCCCTGAATGTGTG:1 - chr2L 15848226 3' - hopper 33 1 57.43 AAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGAATAGTATTAAGGGTTAATTGGAATACTGC:1 + chrX 21214490 3' - X-element 45 1 68.18 AAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATAATCCTAATTTTGACAAACACGAAAGAAAAAGTAAC:1 - chr3R 20150964 3' + F-element 4384 1 65.35 ATAATAATAATAATAATAATAATAATACTAATTGTAATAATCATAAATATAAAGTTTAATAATAATAATAATGGTAAAACATCGATTTTCATAGTGGATCT:1 + chr3R 26254772 3' + mdg1 7067 8 62.38 GAGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCTACTTGCAATATCTGTTTAATATAGAGATTGGAATGCTTTCGGGGAACTTAATT:1 + chr3L 11953885 3' - hobo 21 1 59.41 CATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTATAATGAGCCCTTCCTTCTCTTTTTTTAATTTTGGCGTTTTCTGCTCGACATCTTCAACGTTGAT:1 - chr2R 15268859 3' - R2-element 3267 1 70.30 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAAAAGAGAACGTAATTTTCATAATGCACA:1 - chr3L 11105038 3' + pogo 2058 1 71.29 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATGAAG:1 + chr2R 18105824 3' - roo 26 2 53.47 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACATTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCG:1 + chr2R 15201549 3' - P-element 39 1 40.00 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGGCAGGGT:1 + chr3R 18171838 3' - 1360 32 1 59.41 TAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGATGTACAACTTATGCAAATGTTGAAGG:1 + chr3R 7869219 3' + 297 6974 2 78.22 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTACATAATGCACTGAAAAGGCCTTAAAAGTACACAATCACATACCATTCT:1 + chr3R 5700160 3' - mdg1 29 2 57.43 AATTCCGTACGTCCAGATTNGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGGTAGAGCACAATTTTTGAAAACTTGTTCAACTTAATGACCTCGAAAGCTCGCATTGTT:1 + chr3L 3328994 3' - G2 2654 1 58.42 TGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTGTACTGATTCTGGACAGCTGCACACGTTACCGGCGAAGCCTCA:1 - chr2R 13257824 3' - F-element 4479 1 57.43 TTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTCAATAACGACTTCAATCAACAGGCCAACTTGTCTGCGGCTCACTTTCTTCAAGGGAAAATGTACGGCGGG:1 + chr3R 7166979 3' + pogo 1912 1 76.53 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTCAGCTGAATTCCTTCGACTTTCTTTGGCAAAACAATGTACCACCAGAAAT:1 - chr2L 1432016 3' + opus 478 2 59.41 TGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCCATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGAGGTTCCGGATTACCAACTTTTGACAGGTCGCTGGAA:1 - chr2L 18419447 3' - F-element 340 1 66.34 GACCGCGGCGAGGGATCTANTCCAACATAATTAGTTTAATTTGCACAATGAGATGCTGGTGCTGATGGCGATGGCGATGGAGATGGCCTCGCCCCATGATG:1 + chr2R 11820984 3' + gypsy6 367 2 59.41 AAAAAATGGCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTGTGTGGCTAATCTAGACAAGTTTGCAGTCTCTTCATTTTCAAGGCTCTTAACAGTTAAAACC:1 + chr2L 15081581 3' - hobo 6 1 77.89 TTTTTTTTGTGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGATGCAACCAAAATAAATGTTTCCAAA:1 + chr2L 14082135 3' - I-element 5152 1 77.23 AATAAAAAAAACTAAAAAAAAATGTAGAAATGCTGAGACAAATGGTAAAAGTGAGAGGACTGAAAAAGTTTAAGGAAAAGTTCGCCATTCAAAAGAGGAAG:1 + chr2L 12235956 3' + BS 5102 7 65.35 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAGATTTTCGGGTTGTGCTGGAATCATGGATGAGTTTA:1 - chr2R 10777808 3' + pogo 2063 1 68.32 TAACAATACGTTTTCAAATCATATTCTAAACTAACTATCCTGTACCTCTTTCTCGCTAACAACCTTCCTTTTACTGACTGCTCTAGTGGTAATTTGGGTGG:1 - chr3R 773479 3' - Doc3-element 4668 1 63.37 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTAAGTGATTACATAAG:1 + chr2L 15907221 3' - pogo 31 1 60.40 AATTCTTTTGCAGCGGCACTTAGCTGTTCTTCAAACATCAAACTCGTGCTGTACAAGCTGACCCATAAAGCACAGCATAAAACCGATAAAAGAA:1 + chr3R 12311142 3' + 17.6 7102 2 72.34 ATACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCCACCATCCATCCAGCCACCCTGCCATCCTGCCATCCTGGCATCCAGTGTTTTG:1 - chr3L 11361788 3' + accord 7102 2 88.12 GGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCGTTAGTATTGATGTGTGTGTTCGGTTATGTACTTTGTACATATGTGT:1 - chr3R 4748653 3' + invader1 3754 2 72.28 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAAAATGAGTTCGGACAAAGATCGCTTTAANCTTAAA:1 + chr3R 4536236 3' + Ivk 5345 1 63.04 AAGGAGTTGCATTAAAGGTTTTATTTGAATTTGTTCCAACCGAGCTCCTCCTCATTGCGCGAGATTGCTGTTGCACCGGTTTTCATTACCATGGCGGCTCA:1 + chr4 680698 3' + Tc1 296 1 66.34 AGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGAGAATAAAGTGAAAAGCGGTTGAATCGAAAAATGTCTAATTGGCATATCAGTTGTGTTTTT:1 + chr3R 13348826 3' - X-element 4549 1 68.13 AAAAAAAAAAATTAGAAAATAGAATTTTATTATGTTTTCAGTTTTTAAAAATTTTTTAAGTGCGAGATTGGTAACTGAAAACTTTGCTTCTTAATTTTGAA:1 - chr3R 21695393 3' - FB 173 1 88.12 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTAAAAATGCTACTTTACTCACATTTTGTTGCTCTGTGTTATTATTCGT:1 - chr2R 7132465 3' - opus 6 2 71.29 TTTGAATATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTGTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCACA:1 - chr3R 13439589 3' + gypsy7 5062 1 57.43 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATATAACCATGTATATCCACTTTAAGCTGATGATCAGAAGGAACGGGCAGTGTATTACTAGGAGAGG:1 + chr3R 4769545 3' + copia 247 1 67.68 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCCCTGGAACCGGTTCCT:1 + chr3R 15249880 3' + P-element 2830 1 24.75 GCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTATGTGTACGTTTGTAGCGGTCGGGCGTAGAAAATATTTTCTGTTGCTTGGCG:1 - chr2R 6482661 3' + gtwin 7367 2 55.00 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTTAAATTCACTTGCAGGTATAAGATAGAAATCAGCGTACTATAAGATTTTTAAACAACTTGTACAA:1 + chr3L 10395962 3' + copia 245 1 66.34 AGCTTTCCTCCCTCGGCCANGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTG:1 + chr3L 25232867 3' - accord2 7447 2 62.38 TCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACACCAGTGCCCATCGTAGGGCGCAAATTGCAGACCGACTTCAAATACAGTAGGATTCCTATATTTA:1 - chr3L 7494010 3' + roo 395 1 65.35 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCC:1 - chr3R 14049328 3' - transib2 13 1 66.34 AGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGGTCTGAACAAGTTGCCTTCCCTGTTCAAGAAGAACGGCGTTGTGACTGCCGGAACAGCATCCGGAATCTGTGATGG:1 + chr2L 9916617 3' + R1A1-element 4956 1 73.27 TTTATTTTTTTTTTTAAACAAACAATTCAAA:1 - chr3R 7627806 3' - transib2 2634 1 87.10 AATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGAATAGTATTAAGTGTTAATTGGAATACTGCAAGTGCACGGCGCTTAAA:1 + chrX 21214508 3' - X-element 40 1 54.46 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCGTAATTAACTTAAGTAAACATATATGAATT:1 + chrX 3016695 3' + diver 6067 2 69.00 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTACACACGTCGGCGATTGAATTGAATTCATACACACGCACCGCAAGCTCACCAAACGC:1 + chr2L 15168080 3' - F-element 55 1 67.00 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGTGTATAGTGCCATAAATGTTTGGGGTTTCGCCTTACTTATCGCAATAA:1 - chr3L 3992368 3' - pogo 19 1 60.40 GCATACTTGTGAAAAACACNTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGAAAACAAAGGACCTCTCGCCCACCTTCTATATGCGGG:1 + chr2L 15848291 3' + hopper 1380 1 60.40 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAACAGGAGTATTTAGATAATGCAAATTTGATGTTTCATCATTTTGTATTTATCACGTTGACTCCAACC:1 - chr3R 18342437 3' - F-element 21 1 59.60 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTT:1 + chr3L 23635039 3' + P-element 2495 1 72.28 GAATAAGATTAAGAATTGAGCGTGCTTGCAACAAAAAAGGACAAAAGAAATGCTGCTGAGATTGGAGTTTGAAATTTGTTCGGGACAGAGTGCAATATTAA:1 + chr2R 5172419 3' - Gypsy12A_LTR 2118 1 77.23 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCAATATCTGGCTCAAGCAGAGCCGTGTATA:1 + chr3L 3428097 3' + roo 405 1 74.26 TAGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAATGAACTGAGTGGCTGGAGATGCGATGCCGCCAATTTGCGTT:1 + chr2R 19558043 3' + 412 497 1 57.43 GTGTTTCTGCTTGGCACGCNCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGATGGTAATAGCACAGTGGTTCTGGGTTTTGTTCCTCTGCCAGTT:1 - chr2R 9629945 3' + invader1 3642 2 55.45 AGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTTCAACCCGAGTGAAAACCGAAAGATTTACTGTGTGCGTTTC:1 - chr3L 10414648 3' + roo 8775 2 59.41 AAAAACCTTCATACATTTANACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCAACGCCCACGTTTTTCAGTA:1 - chr3R 7688889 3' + Tirant 353 2 77.17 CTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGCGACAGTGTCGTTTGAGATTTTGACGTTTGATGAGGCGTT:1 - chr3R 6437469 3' + 412 7545 2 75.25 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTATTACCTAATTTATTACGGTAGATTATGTTTTTAACTTTAAACCATAAATGTT:1 - chr2L 13982893 3' + jockey 4915 1 59.41 ATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTATAGAAAAACTAAACTTTTGAAGCTCTAAATTCAATAACCTATTATTGCCATCTAAATGGAATGTATAGA:1 + chr2R 14821118 3' + Stalker4 402 1 31.68 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAAAATACAAAGTAGGAGATTGTTTTAAATTTATTTTACCCATATTAATTTT:1 + chr2L 20840329 3' - mdg1 7065 2 51.49 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTACAAATGCTACTTTACTCACATTTTGTTGCTCTGTGTTATTATTCG:1 - chr2R 7132466 3' - opus 7 2 72.28 GCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAAGAATTATGTATCACTTCGTTACGACTTACTTCCACTTAATTTATTTTCACTTGCTTTTAGCAGCAAAG:1 - chr2R 13658997 3' - Ivk 7 1 72.28 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTGGCCCATCCCCTTTCTGCCCCTCACCGACTGGTCCAACAATTTCTCTCAAGCTTTTTTGGACGAGCT:1 + chrX 21374255 3' + P-element 2878 2 71.29 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGACACAGAAAACTGGATTCGGTCTCGGGTATTTTA:1 - chrX 2123697 3' + P-element 2847 1 39.60 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAGTTCAAAGGACTGCATATATATAA:1 - chr3L 8905729 3' - pogo 48 1 78.22 TGATATCGTCAGACTGGACNCACTGAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACTAGGGGAAATGGTCCTAGGCGAATCCAGAGCTTAAGGCAAAGAACGTTAACCAA:1 + chrX 12111165 3' + Chimpo 86 1 57.43 ATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCAATATGAACATGTTCGTCTGGTCGGACGGACATCATCCTTCCGGACGAAGATCGAAATCTCGGGAACAATAAA:1 + chr4 700783 3' + INE-1 86 1 54.46 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACATACACATATTGGCATCTACAGACAATGCACAAAG:1 - chr3R 16305473 3' - pogo 36 1 70.30 TGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGGAGGGACGGAAAAGGACTGCAACAATTATCAATAAGAAAAGTAAGAAA:1 + chrX 17506377 3' - Doc 344 1 66.67 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACAGGAAGTGACTTCGCCGAGTTTGCAATAATAAAGTGAACT:1 - chr2R 13358779 3' + roo 9031 1 63.37 GAGGTGGCCAATCTAATGTGTTTACGCCAACATCTTTCAGAAACTTCGTAATCAGTTTGGCCTTCTAACTGTATATAACCCAATAACAGAAACATTTATTG:1 - chr2R 25218599 3' - Tc1-2 1145 1 61.39 AGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCATTCTGCTAGCAATGGGGCAATGTGACAGTGTTCTTTTTCCCAGTGCAGCTGGTGGGGGCATGCTTCTGCCATAACGCT:1 - chr2R 8769725 3' - G2 2857 1 58.00 GATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCTCAAAACCCAAAAAAAAAAGCCGAGAGGCAG:1 - chr3R 12590615 3' + G6 1910 1 74.00 ATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATCTTCGAGCAGGAGTGG:1 + chr3R 4537646 3' - Ivk 5275 1 73.77 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAGATGAAAGAAAAAACAAAAGGTTGGATTTCTCTGCATACTTTCAGGCGTCCA:1 - chr2R 18687764 3' + jockey 4975 1 54.00 TAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTTACT:1 - chr3R 14985316 3' - Ivk 56 1 67.33 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAAAAATAAAAATAAATATAAAATAATATCATTGCAAAAAAAA:1 - chr3R 23921659 3' - Doc 39 1 58.42 AATAATCATGCCAAATCTACTCCTTAACTTTATATCCTAATATGGGCGGTGCAGTAGGGCTCAGGTGTGCGGCATGCAAATGTCGAATGACAATAATGCGC:1 - chr2L 3925554 3' + transib3 2696 1 58.42 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACCATATTCCCAGATTTTCCACAGCACAGCACGCATT:1 - chr3R 12882660 3' + 412 448 2 62.38 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATGGGGTGAGTGAGTTGTGGGTCTAGTGCCATGATATATGATTTTCGAATTCCTC:1 - chr3R 10221982 3' + 1360 3349 1 59.41 ATTATGTTGAAATCGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATTCCACTTGATACACAATTTTTTCCCGATCC:1 - chr3R 16536290 3' - diver 5800 1 70.30 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATGACAAAACAAAGGCGAAACTTACTGAAAATAAG:1 - chr3L 13367697 3' + mdg3 206 2 63.00 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCGAACCGAGCGATCGTAAAACTCTTCGGCCCCAGGCCCACAATATCAGTCTGTCCGCTGCGCATAGTCGA:1 - chr3L 5355320 3' + P-element 2883 2 74.49 AACAAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAGGAAATTAGATTTAATTTCGAAAACAGCAAAAAATGTCTCTTTTTAGCGCCGGCAGCCA:1 - chr2L 1504863 3' + I-element 5197 1 56.44 TAAGATATAATAAATAAATAAATTTAGTACTTCCATTTATAAAAGTAAATAATGGGAGCAGCTGAAAATTGAGGTTACAACTTTTCAACGATTTTATTCGG:1 + chr3R 24285051 3' + Doc3-element 78 1 80.20 AAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCGGTGGCTCTAGAGGTGGCTTTGGCTTTTTTCTGGCCTCTT:1 + chr3R 21465166 3' + 1360 3 2 77.23 AAAATTTACTTATTGTCTTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTA:1 - chr3L 15099558 3' + G4 3809 1 65.35 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGA:1 - chr3R 19450164 3' - roo 33 2 71.29 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACATGCATGTATGTACTACAATTGCAAGTATGAGATTTTTTAAAAAAAA:1 + chr2R 16907576 3' - opus 25 4 58.42 GAGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGAATCATGCCTGTTTCGAAATTATACCAATGAGAATGAGTGCCCATCTGGGGTTAA:1 + chr2L 2923956 3' - Tc1 1275 1 60.40 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAGATGTTGCAAATGCCGCTGGAAATGTAGCTGGGGATGCAGCAAATGCT:1 + chr3R 30252353 3' - 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Juan 4012 1 61.39 TGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTCTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGAGTTCAAATATTTTTGTTTATCTATTTTAAATTCA:1 - chr4 916075 3' - Porto1 314 1 69.31 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATAGATAATCAA:1 - chr2L 12779578 3' + flea 5007 2 61.39 TTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCG:1 + chr2R 1076525 3' + FB 261 1 55.45 TTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTT:1 - chr3R 4434030 3' - Juan 56 1 81.19 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATACAAATGGAGTGAATGAGAATAGAATATGGCCAGTTGCCAGACTGTATTCTGCA:2 - chr2L 2309374 3' + Burdock 6370 2 58.42 TATGGACTTTAGACTTTAGGGTTTTGTTAATGAAGAGAAAAAGCTTAGTGTTTCCCAAAGATTTCCATTGAATTTCCTCTTTTGTTGCTCTTTTTAAGTTG:1 - chr2L 17559106 3' - Idefix 7215 2 53.47 TACCCAGCACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGACAAATGAGGAAAGATAATGCAGGCATTAATCTTGCTAC:1 - chr2R 15793969 3' - accord2 178 2 54.65 GTACCCTCGATATATGCACNTACTACACTGGTGAGTGCTGCTTACTCCGGACCAACTAGCTCTGTTTGTTATTTGGCAAAAGGTATCCCTTGGTCCGAAC:1 + chr3R 30611332 3' - blood 7017 2 69.00 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAG:1 + chr3R 16613188 3' + 412 453 2 68.75 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAGG:1 - chr3R 22469149 3' + hobo 2910 1 61.29 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAACGCGTTACATCTTTTGGACCAAGGCAACTATTTACTATTT:1 - chrX 22771509 3' - opus 27 4 59.41 TAGTTTTAGCAAACTACGAGAAGCAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTATGTATAGGAAACGGATATTTGAAATCTATATAGGTTAACGAAATGAAATA:1 + chr4 126695 3' + Tc1 1419 1 76.24 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCA:1 - chr3R 21276527 3' - BS 5006 1 67.33 ATAGGTACAGGGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTGCCGCGCCCAGAAATACGTGATTTGCGCGACAAGGTGCGTTCCCATGTGCAGTCCACA:1 + chr2L 13792259 3' - blood 7028 2 58.42 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTAAAGTATATGCCAAAATTTGTAAGTCCCAAGTA:1 + chr2L 13334887 3' + hobo 2896 1 65.35 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATACACATATATGTACATACCTACAGATATAAATATGATTATTCGATCTGTGTTGTTTTTCCCATCT:1 - chr2L 7126741 3' + Burdock 6383 2 69.31 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAATGCAAATCGATTTTGTTTGTATTTTGGGTGTCAGAA:1 + chr3L 5403298 3' + copia 249 1 62.38 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGTGTATAGTGCCATAAATGTTTGGGGTTTCGCCTTACTTATCGCA:1 - chr3L 3992372 3' - pogo 23 1 56.44 GCTGGCCATATATGCGCATNAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTA:1 + chrX 9023559 3' + blood 7158 2 94.00 TAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAAGCGAGTGGGCTGTGCCTTCTCAGCGAATATTCCCATCCTTTTG:1 + chr2R 9602241 3' - copia 217 2 57.43 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTATTTGTGTATTTAGCCGGTCTATTCATTTACTGGC:1 - chrX 17109656 3' - roo 8703 2 67.33 GGTTGGTAGGTCCTTTCGCNGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTATTTGATGGTTTTATGGAAAA:1 - chr2L 20868067 3' - F-element 4522 1 79.21 GGCTCACCGGCTTACGGTGCCCAGCTTCCCCCCCCCTCCTCACTCCTTATCAACTTTGGAGGAGAACGCCGCCCCACCCGCAGCCGCAACAGCCGCGGGC:1 - chr2L 7799468 3' + G6 259 1 60.00 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGCGCTTTTGTTTTTCCAACGCGAAAGG:1 - chr3L 949292 3' + roo 9022 2 74.26 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAGTTTAATTTTAGAGCAGCCATCCAAAGTTCTAGAGAACACTAAAGCTAAGTGCCTCGATTAG:1 + chr2L 22155590 3' + pogo 2090 1 68.32 ATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGTATTGAATCGCAGGGGTCACTCGAGCAGTGCTCGGGCAAGCCCCAGCTCACCCCCATTTACCCCCCA:1 - chr3R 8815564 3' + mdg3 5345 2 79.21 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCATGCACATACTATAAGAACACAAATTGGCTGGTAAGCCCGGTGCAGA:1 - chrX 16085842 3' + Tirant 8474 2 58.42 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGGTATGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAGCTTTGGCTAAATATTCATAAATTCAGCTATTTGCTTA:1 - chr3R 28628071 3' - 1360 37 1 60.40 TATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAATATCAGCAATGTCTTGATAAGAAGTTTTGTTAACAATTTTTAATTTGTGTAATATCCAAACACATTGGACTC:1 - chr2L 22750768 3' - Tc3 1628 1 79.21 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGTAATTCGTGAAACAGCTTGTCAGTTGAATAATGTGCATGGCACT:1 + chr2L 20550842 3' - jockey 4701 1 58.42 GCACTCGAAGAGAGATAGTCCGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCCTTTTCGATCGGCAAGGTATACT:1 - chr3R 4536161 3' - Ivk 7 1 72.28 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAACACTCACCCCCGCCCGACCAACACGCCGCACCACACC:1 - chr3L 5976103 3' - hopper 35 1 59.41 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTCAGCTTTTACGTACATACATATGTA:1 + chr2L 15907207 3' - pogo 44 1 74.00 TTAATTTATATTTATTTTTTTATATATTATTTGTTTGCAAAACTTAAGGTCTAAGACATAATTAATTATACAAGGTTTGATTTTGAATTTTATTTCTTGAT:1 + chr3L 12731853 3' + S2 98 1 34.65 GTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCTTCCGCCTGTTTCATTCGCTTTCATGGCGAATTGACAAAAGAAAATTGTTGCTATAACA:1 - chr3L 7304295 3' - G2 2956 1 65.35 TATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATTTCAAACAGAAACTGAGATAAACCATTTTTTACCAGCTACAAATCGAGGCACCCTTTCGT:1 + chr2L 2309476 3' - Burdock 11 2 66.34 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGCGGTTACAAATGCGCAAAGTCAAAAGCGGGTCGCTATTCAACAGCTTAAAG:2 + chr2R 11404033 3' - mdg1 7043 2 72.28 GCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCCAGCCCTGCCCTGCCCTTCCCATTCCCCAATCCTCGCCAGCCACCTCGATTCGTTGTCGT:1 + chr3L 8277710 3' + R2-element 3143 1 60.40 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGGCTTATATACTAACACACGGAATTGTGGAATTCAAGCTCTGCTTTTGAAACAAACTTGCAGTTAGTTA:1 + chrX 13268956 3' + 1360 3383 2 73.27 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTCATGGAT:1 - chr3L 95877 3' + roo 9026 1 72.28 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTACTTGGGATTTTACAAGCCCCAAGCGCAATGACTAAAAATTA:1 + chr3R 18769624 3' + roo 9020 2 76.00 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGCGGCTAAACAAGTTTTTCGTTTTTGAGAGCGCGA:1 - chr3R 25208337 3' + P-element 2844 1 38.61 AAGTAAATCTTGAAATTTATTTCAATTTTCTTTCAATAAAACACAAAAGCACCGAAACAGAATAAATATATTTTATTTAATGCCTGCTGTTGTTGTTGTTG:1 - chr3R 9933641 3' - 1360 372 1 72.28 AAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACAAAAGTGAAAAGATGTTTATCATCGTACATTATTAATAACCAATTGTCTACTTCCTTGAC:1 + chr3L 11953982 3' + hobo 489 1 63.37 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATAATAAATAATATGTTTATGTCTAACTTTCTAAAGATTAGAT:1 - chrX 22897199 3' - copia 18 2 54.12 TCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACGCTCGGCTCGCGTTAAGATCTATCACTAGCATATACAGTTAGTTCTAGTCTAGTGCTAAAAGCAGCAAACAGAA:1 - chr3R 18588537 3' + 1731 4485 2 71.29 TGTCAGAATTTGGCAGATCGTCTAAATCATCGGCCAAAATGGCAATTCGGTTATCGTTATTTAGCTTTTGGCTCTGCTCCTCCTTATTTACCCCTGTTTTT:1 + chr2R 20136538 3' - Fw2 164 1 53.47 TGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTTCGACTGATTGTGATAGTACCGAAAGTTTAGCCGCTTTAATAAAGT:1 + chr3R 17521522 3' - Juan 3773 1 54.46 GTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGAGCGGTATAACCTGTTAATCAGATATGCAGATTGAGCCAAAAATTATGCCACAAAGCAGCTGCTGGGCGACAG:1 + chr3R 23043209 3' + mdg3 5237 1 80.20 ATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTCCCGGTTCTGCTATTTTGCTCCACAGTGTAATACACTC:1 + chr2L 3937813 3' - Burdock 8 2 71.29 ACTAAGTGTTGCTGTGTACNTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATACTTTGCGGTTGCGGTGAGCGGTATGAATGGAAGTCAT:1 - chr2L 20271217 3' - blood 38 2 61.39 AAGTAATTATTATTTATTTGTTAAAATGGCAAGGGAGTGATTGTTTAATGTAATCGACCCGTTGATTGTTCATTTGTTCTGGCTAATTTTATAAGACTTCA:1 - chr3L 7607842 3' - jockey 4829 1 81.19 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATTACACTCGACTACAGGTTGGAAAATA:1 + chr3R 28475854 3' + roo 9020 2 74.26 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACAGAAATGCAACAGCTGATTATAAATTTCAGCGAAATAGAATTCCTATTTTATTTCAGATTGAGATTCGT:1 - chr2R 22665958 3' - pogo 2 1 47.52 AGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATCGATATGAGTTAGCTACATTTGATTTCTAATATTTATGAATAAGTATGAATACACCCACA:1 + chr2R 9684784 3' + Doc2-element 66 1 66.34 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACA:1 + chrX 7534711 3' - Tirant 8135 2 53.47 ATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTTCGGCACATCTGGAGGATCTTCGCCGGAAAACACTCCGCTGGGTTACGGCTGG:1 + chr2R 16361758 3' + R1A1-element 302 1 57.43 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTGCAGTTTTTGCTTCATTAGTAAGTTGGGCCATCATTTAGCTTTCAACTTCAAGAT:1 + chr3L 17146895 3' - pogo 16 1 61.39 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCAATATCTGG:2 + chr3L 3428077 3' + roo 9048 2 54.46 TATTAGAATATTAACTTCTNTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGAAATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATC:1 - chr3R 11151807 3' + mdg3 5485 2 62.89 GCAAACGCACATAGAGACTACATGATATGAGCTAAGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAAGTGTTTATATATATTTTTATATATA:1 - chr2R 5943527 3' + hopper2 1129 1 72.22 TGGTGCTTTCCATCAGGAGGAACACACTCCTGGGCATGTAAATAAAATTCTGGCATTTATAATTCATATACTTAATACATATGTGAAGCGGACGGACAACA:1 + chrX 5059452 3' + baggins 5258 1 60.40 ATATAAAAACATATTTAATAGAAAAACGATATACAATAAACTGTAAAGTGCCACAAACGATATTATTTTAAAAGGTTAGGTTTCTTATTTTGGCATAAA:1 + chr3L 16694837 3' + Tc3 1583 1 43.43 GGAGCCCAAAATTGTAAGTNTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTTTCAGATATATAAAATATGAAGTTCTTGAAATGGTACAGCTGCGTT:1 + chr2R 19513434 3' - roo 29 2 60.40 GTTACGCATCTTGTTATTCNAGTGTCTTTGTATAGGCGGTGCTGGGAAAACCCGAAAGACAGCCAGACTCGACTGGCACAGGCGGCTTTCAATGCGGAACA:1 + chr3R 16607564 3' + 1360 3380 2 70.30 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTTTG:1 - chr3R 13239902 3' + hopper2 1552 1 78.22 ATAATAATAATAAAAGTAATAACAATAATAAGAAGAAGCGAAAACGAGAAGTAACAAGAAAGAATGCTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTT:1 - chrX 15903347 3' + mdg1 38 2 61.39 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCGTTAGAGTGTTTTCGCTTTTACTCTACGAGTA:1 + chr3L 22932761 3' + 1360 3344 1 82.00 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCAATTTTTCAATGTTTAATGCCATACTGTTGAAGAGAAAACG:1 - chr2L 13214985 3' + roo 9036 1 61.39 AAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAACGTAAGAAATAGAGAAAAAAGAAACGAAATGGC:1 + chr3R 14070720 3' + Doc2-element 238 2 73.68 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGCCCTTAAAGAAAACGAGAAAATAACATCCATCGAGAGTCGATCTGCCCTGCATCA:1 + chr3R 12937501 3' - roo 22 2 58.42 GCCTTTTTCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATCTCGGTCTGTCTGTCTCTGTGTGTTTA:1 + chrX 12785757 3' - Bica 460 1 73.27 AAGTAAGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATC:1 + chr3L 15099641 3' - G4 3810 1 40.59 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGACTACAGGAGAACTGAGAGCGTCGGCGTGCCGATTTAAGGAAAGCAACGG:1 - chrX 21400768 3' - P-element 24 1 56.44 TTGTTTATTGATATTGTTTATTGTATTAAAAGGAAGTAGGTTTCAACATGCTCCAATGGTTTTGTTTGAACTTCCCGCGCAATGGCAACGTTACTTTAGCA:1 + chr2R 16607555 3' - flea 5006 2 78.22 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAATCGA:1 + chr3R 7869193 3' + 297 6948 2 56.44 ATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAATTGCGTCGCATTAAGTAAAGCCTTCCTGGCCTGGTCCGTTGATTTTTCAATTGAAAAATTGCACA:1 + chr3L 10520308 3' + gypsy5 318 2 65.35 ATTTTATTTAAAAAAAAAAAGAAGCTGACCCCAGAATTACATAAAATTA:1 + chr2R 22553664 3' + transib2 2632 1 89.80 TCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAATGTCTCGGACACACTTTAAAAAAAAAATTTTGCAAATTTTCCATATTTTTATTAGTCTTGTAAATTATTTTTAT:1 - chr3L 9960275 3' + INE-1 134 1 75.25 CGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCAGCAGTCGTAGTCCGTGGCAATAGCCACCG:1 - 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F-element 32 1 50.50 GTTCAGCGATAATCTGCCTAACTTGGCCTGCGTACTTCCATCTCGGTGGCTCTAATCCGGGCCAGAATCAGTTCCCCATATTTGAACCGGCTGACTGACAG:1 - chr2L 19379027 3' - gypsy6 7360 1 72.28 TATATTTGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCCGCTTTAAGTTGCGCATTTAATTCGAAAGCCATCGCGATGGCC:1 + chr2L 9471300 3' - roo 8667 2 78.22 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATGCTTTTTAAAATTCATTCGATATTGTAAACTCGCATCTTGACTCCACTTTCA:1 + chr3R 25121674 3' - pogo 23 1 54.46 TGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTAGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTCTCATATGTGTGTGAGTGTAAGCTTG:1 - chrX 9501268 3' - F-element 4311 1 72.28 TTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTTCGTTTCGTCAGTTTTCCATAGTAACAGCTATTAATATTAA:1 + chr3R 22096131 3' - Bica 207 1 59.41 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAGAGTGTCCTGCAAATGTTTATTATGCACTTGAGCACTTTGCAGCA:1 - chr2R 6041536 3' - opus 7 2 72.28 TAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACATCCCAGAGAGGTCCTTTGTTCGGCTTTTTATTTGCGAATCGACGGCGCAAT:1 + chr2R 6847375 3' - Doc 4560 1 58.42 AGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATTACTCTACCCTAGGAATCGGTGGCCCTGATATACCACGACACTAAGGACTGCAG:1 + chr3L 22825538 3' + 412 199 2 61.39 TATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCTGTTTGCAGATATGCTCTATAGTTATTATCACTATGTCATACTAAAATGTTATTTAAATATACTGATGAACTTCTA:1 - chrX 21097392 3' + Tc3 316 1 74.26 TCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGTAACAACAAGTTGGCCAACATGGCGGCTGTGTCA:1 + chr3R 20345155 3' + transib2 2784 1 67.33 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCAT:1 + chr3R 27582805 3' - pogo 35 1 75.86 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTCTTTTTGCGCCCCATAAATCACAAAATAAATTTTGCG:1 - chr2L 19997201 3' - roo 37 2 62.38 AAAAAAAAAAATAAAATATGTTAAAAATTTAAAAATGGCTTTCATATTCTTATTTATGTTATGTGAACAGCTTACATTGAGCATA:1 + chr3R 25961711 3' - INE-1 465 1 76.47 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTATGAAAGTTAGTTTGCA:1 - chr2R 16680115 3' - 412 7080 2 54.46 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTATGCTGAGCCCAAGACAATT:1 + chr3R 16305524 3' + pogo 2052 1 79.21 GGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATGCCCTCTTATGGATTGCGCAGACGCCAAAAAATTGGCCAACAACAAGTTGTTCGG:1 - 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chr3L 7350528 3' + Cr1a 4441 1 66.67 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAATTTTGCAGCCAAATAAACAAATACAAATACGGATTC:1 - chr3L 19700220 3' - Quasimodo 31 2 62.38 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGTACCGTTTTCCTAAACTTGGTT:1 - chrX 10996522 3' - 1360 31 1 58.42 TAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGATGCTACGAACCCCAGTTTTTAGGCGCTACCATTTAATA:2 - chr2L 19207837 3' + 412 494 1 77.23 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAAGTCAAAACTTGTTTTAAAACTGAAT:2 + chr3R 14708765 3' + roo 9021 2 77.23 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCGTTGCAGCGCACAGCATAGAC:1 - chr3L 22617008 3' + hopper2 1550 1 77.23 GCAAGAAACCTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCAGGTCCAGATGCCAACTCAACTTCTGCTTTCACTGACTCCAAGAC:1 + chr2L 8207032 3' + Doc 4508 1 55.45 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAATCAGGTTAGCCAAAAAGCAAGGCACGTTA:1 - chr3R 15117621 3' + roo 358 2 70.30 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAATTTTGTAGGTGGTGCATGTTATGA:1 + chrX 11030946 3' + roo 403 1 73.27 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGAGTGCTTTGAGTACGTCAAATGAAGAAAAACCAACTCACACAGGCACAG:1 - chr3L 5976293 3' + hopper 1411 2 75.25 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCCCAGGCTTAGTGACGAAAGAAA:1 + chr2L 13732824 3' - Doc 25 1 56.44 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTCCTTGTTCACGACAACCATTAC:1 + chrX 20289256 3' + hopper2 1554 1 72.28 TAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGGAAGTATGAGTATGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTC:1 + chrX 21907813 3' - ZAM 8203 2 51.52 TGTGATTTTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAAAGGATAGCATAGAAAACTAACGACATTTTCTTCTGTTCCCCATCTGTGTTTATGCATTAAAGTTTTATGC:1 + chrX 8458367 3' - HB 177 1 61.39 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATGAAGTGTT:1 + chr2R 18105828 3' - roo 8677 2 63.04 TTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCAATGCTGACTAACAAATTTTTTTTTAAGTATT:1 + chr2L 17044251 3' + 412 91 2 69.31 GTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAATTGGCTAACACCGACGCTGCCATTGGCTCACGCACACACATGCACCCACACGCTCACAGATCGGAAGAG:1 - chr3R 23714358 3' - hobo 265 1 61.39 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGATGGATATTCGTTATATGTGAAAGCAGTTATCAGAAATGAGCATGCAGGTGTTCAAAGTTCGAATT:1 - chr3R 22467009 3' + mdg1 410 2 67.33 TGCTAAACTCGTTTAGCAGCTAATTTGAGCGGCAAAACTTTTCCGATGGGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGT:1 + chr3L 23635038 3' + R2-element 158 1 75.25 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCTTTTGCATACTTTTGGGCTTGG:1 - chr3L 5255932 3' + jockey 4947 1 67.33 GTGTGATCGGCACCCGCGATGCAGAGTGCCTCATTGATGCAAGTGACCGCACACACGGGTGTTTGTAAGTACCCGCACTCAAAATTGTTGAGTTCTCTGAT:1 - chr3R 10920280 3' - hobo 171 1 57.43 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTATTGTTGTCAAAAAGACCGCAGAAAGAGACAACAGCAGTGGGCCACAAATCATATAAAAC:1 + chr2R 9950236 3' + S-element 1705 1 68.32 ATTTTAACTTTTAATTTTGCAACTTGAAAGGCGAATTTAATAAAATTTGCGCGTGAGAGTTTTTTGCCGACGAAGCGCCTAATCCACATAGCTGTCGTCTT:1 - chr3R 16175311 3' - TAHRE 154 1 33.66 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAATAGTGTTCGTGATGAAACTTGT:1 - chrX 1762954 3' - jockey 4724 1 77.23 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATTTAATGTGAAACAAGGCATAATTC:1 + chr2L 15983443 3' - hobo 21 1 58.42 AGTCTTAGACGCTGTTCCCCACACTTGGTTGCCATAGTTGGATACACTCTGGAGCTTTCTAAAATTAGGGTTAGGGTTGCCAGTTGCGCAATAAGGCCGAA:1 - chr3R 2446168 3' - G5A 2448 1 77.23 AGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATATTCTAGAGCGACTTCATTAC:1 - chr3R 4434007 3' - Juan 33 1 58.42 GGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGCAAACATATTAAAAATGTCCAATCTCTATCTCCCAGTCAATGTGCAAAATAAGTCAAGTTGGAAGTCCTTTT:1 - chr3R 12738081 3' - FB 92 1 70.30 GGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGTTCTTAACTATCTCGGGGATATTGTAGCTTTCCAGGATGCGC:1 + chr2R 21064072 3' - F-element 312 1 58.42 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAATGAAGCTCACTTTAAGTTGGTTTTTGGCCATTGGTGTTAAATTAATAATGGCTTTGGCTAACAAGTGGTTTCT:1 - chrX 15412649 3' - hobo 4 1 75.25 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTAAATGTTGTTAAATGAAAAATCTAGTCTTACAACTTTCTCAGAATTGGCAACTATCAATGCTGATAA:1 - chr3R 20872683 3' + copia 248 1 70.30 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGCATTCTCATTTGTATGTCAGCAGATTGACAATCAAGGCATCA:1 + chr2L 13913324 3' - HMS-Beagle2 30 2 56.44 GAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATAGCTAGTTAGTTTGGCGGAAAGCCATTATCATCACTCAGGATTGTTTTTATCACTACATTTCATTA:1 + chr2L 21884995 3' - INE-1 134 1 67.68 TAATATAGATTTGAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTAAGGGCATATTTGTGGAAAACTGTACTTGTTTTCATATAATTTACATTTTTTTATTTGGCATTTGCA:1 + chr2L 9053759 3' - 1360 242 1 60.40 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAATTTTGTAGGTGGTGCATGTTAT:1 + chrX 11030944 3' + roo 401 1 71.29 GGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCTGCTCGCCGTTAAGTGCTTTAAAAGCGCATAAATCACGCGGTTGTTTGGCACTTTGGCGAAA:1 - chr3L 18376283 3' + invader4 97 2 65.35 ATGTATTATCCTACCGACTNCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATAGCTATGATGAGCTCTACTACGAACTGAACCGCGAGGAGAAGGT:1 + chr3R 8826544 3' - rover 370 1 55.45 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCCTTTTCGATCGGCAAGGTA:2 - chr3R 4536165 3' - Ivk 11 1 68.32 AATTTCACTTAATCCACTTNGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATCGCTTTTTTATTAATTGCTAATTATTTATTTGTGCAATCTATGACTTAT:1 - chrX 13616870 3' - X-element 40 1 52.48 GCCACAGAAATCGGCTGGCTAGCGCTCTAAAAAGGGCGCTGTAACTGAAAGTTTCACGAAGAACCTAATCAGATGAGGTTTGTATAAGGAAAATGTTGGTG:1 + chr3L 5544208 3' + X-element 4435 1 77.23 AAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATGTTTCTCTTACTTTTCCGCAACAATGAACATCTCGTGAAAACTG:1 - chr2R 13446624 3' + roo 9068 1 73.27 ACATGCATAAACACATGAAACCAATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATGTTGAAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTA:1 + chrX 23362219 3' + rover 7016 2 82.18 GAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGCATGACTGCATACGTGTCTTACCAT:2 - chr2R 5200951 3' - 1360 50 1 75.25 GGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAAGATCATATCATATAATATCATATCGGCATTCTAGCC:1 + chr2R 7710251 3' + R2-element 3199 1 70.30 GAAAGGAAATATAAATTATNAATTACAACAAAATGCAAATCGATTTTGTTTGTATTTTGGGTGTCAGAAGACCTGGCATGCCCACCCCAAATACTTCAATT:1 + chr3L 5403330 3' + copia 247 1 70.30 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGACTGTCATCAGAGGAGAATGTGAGTTGGTAATAAAGCAAGCCAAGGAGTTAACC:1 + chr2L 14799191 3' - hopper 15 1 61.62 TCATACATTTACACATCATNTCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGAGTAACACCAAAATGTATGTGGCACTGCACCATTTG:1 + chr2L 18500369 3' + Tirant 8468 2 62.38 TTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1 - chr3R 4571528 3' - 1360 329 1 51.49 AATCGGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATGTTTCTCTTACTTT:1 - chr2R 13446654 3' + roo 9038 1 57.43 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACATGCAGAAAATGTTTGTCAATCGAGATGGTTTCCCTTGAT:1 - chr2R 24500829 3' + Tirant 8475 2 59.41 GTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTCCAGACCACATCTGACTACCCGTGCCGACTGTCGTCCTTGAAATAAGAAACATGTC:1 + chr2R 20857860 3' - hobo 23 1 58.42 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCACACACTAAACCACTCGCACAACCGA:1 - chr3R 13685167 3' + Tirant 354 2 72.28 AGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAAAGCATTGTACCTGGGCGCCACTCGGATAATGGCCAACAAAAAATAAAACAACTCC:1 - chrX 17217716 3' + R1A1-element 5304 1 49.50 ACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAAAAAGCAATTAATAAACGAGCGATGGCAACAAGTTGCAAGTTGCAACTTTGCAATTACGCGATGGGCA:1 - chr3L 10284789 3' - Juan 3808 1 68.32 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCTGGAAGGTTAATGGTTTTCATGATCACCACGCTCAGTGGCAAGCGTACGCAAGCTGACTATAATTT:1 + chrX 22689232 3' - Transpac 6 2 72.28 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGATG:2 - chr2L 19207873 3' + 412 7511 2 61.39 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTAATC:1 - chrX 21056907 3' - Tirant 13 2 68.32 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACATATATCCCCGATCCCCCGAAATGGGGCGCGTGTATCCAATATCCTGCTGCTGCCCACGCGTACTG:1 - chr3R 10090282 3' + pogo 2098 1 76.24 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATGGCTGATATAACATCATTAATCCGATCAGATATCCCCCAATATGGCGG:1 - chr3R 4769446 3' - copia 5 2 66.23 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCAAGGGCATAAAATGAAGATCCAGCTGCGATGGCGCAAAA:1 - chrX 15268225 3' + roo 9052 2 59.41 ATAAACAATATCAATAAACAATTTTAAAGTTACGCAAGTCATATTTATTTTGATTTTCTTGAACATTAATCGCATATCGTATAGCAATTAAACGTTTTCAC:1 - chr2R 16607373 3' + flea 248 2 79.21 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGATATCTAATCTCATTCCACATTATATTTCCTTCACTTTCAACCATAGCTATGTGGCCGATGCTG:1 - chr3L 2270492 3' - roo 8673 2 68.32 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTATACATAAAGCAGGCACCACGCACCCAGCAAAAGTCAAAACTCAAACTC:1 + chrX 14324752 3' - 297 19 2 60.40 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTAGAAACAAACGAAAAATACCTCGGCC:1 - chr2R 20588785 3' - Tabor 52 2 73.27 AATTTTCTTATTAATTACAATTCACGAATTTTACCTTATTATAGAAAGTATATTGGCGTTCATAGCTAAAAGGCGTATTTGCCGATTGACATAGATGAAAA:1 - chr3L 18399018 3' - transib4 2614 1 76.24 AACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCGCCAGTTCCACCAAAAACCCGTCGTAGCGTTTGATCGCCCAGTTCAGCTCCCCTTTG:1 - chr3L 21673576 3' + 17.6 7136 2 58.42 TGTCAGCCCGACGGCTGCCNTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAG:1 - chr3R 6437512 3' + 412 7502 2 65.35 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTATATCGCGACCGCTTTTATTCAATTAAAT:1 + chr3L 3822449 3' - pogo 41 1 70.30 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTGCGATACGTTTTTTGTTTATCTCGAACCTAAGCTGAAATAATC:1 - 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Burdock 42 2 70.30 GTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCCCAGTTCGCTCGGCACCGTCTTCTCCGGACCCAGGAAGCCCATGGCCAGGAGAATAAGGTCTGCGGGGAAGTA:1 + chr3L 16788797 3' + roo 8919 2 76.24 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAACAAAAAAATATAGGATAAAGGATTCTACAACCACAAAAAATGGCG:1 + chrX 4422667 3' - jockey 36 1 56.12 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAGACAATGTTGCCGGGGCGTAATTAAAAATAACAGCAATGCATCATCGAAT:1 + chr3R 19270423 3' + pogo 2079 1 55.45 AAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTTGGACGCGGTTAAATTTAGC:2 - chr3L 20467191 3' + G2 224 1 80.20 TGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACTGCAGACTGTTTGGGTGGGTATTGAGTCGTACCATATATTTTTTTTAGCAATGT:1 - chr3R 16041675 3' - jockey 4740 1 42.57 GTGGTTCTCCATTCTGCTAGCAATGTGGCAATGTGACAGTGTTCTTTTTCCCAGTGCAGCTGGTGGGTGCATGCTTCTGCCATAACGCTCCGCACTTC:1 - chr2R 8769716 3' - G2 2846 1 78.57 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCACACACTCTAAACGCACACACACACACGCATACGCACACAAACATCCCGGCGGCGGGCAATCAATAAA:1 - chrX 13012066 3' - hobo 10 1 69.31 ATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATCGAATGTGCTCTTTAGCTACATATGTGA:1 + chr2L 14221309 3' - BS 5057 1 72.28 AATGCAACTAAGTGTTGCTNTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCAAACATTACTGCATTGGCCAAATATTTATTT:1 - chr3R 28216805 3' - blood 44 2 65.35 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAGATAATATTGTTTGAATACCAACGTAGATTTAAAAATAACAATTGTAATTTGTGACACC:1 - chr2L 15766371 3' - pogo 14 1 58.42 ACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGG:1 + chr2L 12199509 3' - Stalker2 7291 2 68.32 ACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTC:1 - chr3L 27356069 3' + Tc3 1694 1 78.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATGTATAAGTGTGCATGTGCATGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGGATCCTGGG:1 + chr3L 18005676 3' + roo 9050 2 51.52 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGAGTTCAAAGGACTGCATATATATAAACATTTAAGGCTAAGCAA:1 - chr3L 8905711 3' + pogo 2071 1 63.37 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATAATTAAAATTTGAAGTAAAACAACTT:1 - chr3L 11758380 3' + roo 359 2 76.24 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGC:2 + chr3L 3428051 3' + roo 9022 2 77.23 AAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCTAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAGTGTCTTGTCTTTCTCTTAGAGTTTAATGTGCGCT:1 - chrX 21097026 3' + INE-1 166 1 64.36 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTTAACTTTACTTCTGAGTATTTAGCTAACAGCTTAAAGTAA:1 - chr3L 3822378 3' + pogo 2077 1 51.49 TACTTTTGTTTTTCGGAATTGCGAGCCCGAATATAAACTGCGATGCCGGTGACGATGGCACATATTTTTCGCATGGGAAGCTTAAAGCGGCTTTAAGTGGT:1 - chr2L 10782270 3' - Idefix 7089 2 71.29 TTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATATATATAAGATACGCATATAAGCGTTGCTGCGCTGCAGGCTATGCCGGCAGCGCTGCTCCT:1 + chr2R 2308843 3' + Quasimodo 7356 2 69.31 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAGGCATGCATATGCGTACTACTAACACACAAACGC:1 - chr3R 22469117 3' + hobo 2934 1 72.28 TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATACATACATAGAGACGAATGCCTGCTAAAGCGATATGAATGGAGACCCGACCGG:1 + chr3L 19778853 3' + flea 4996 2 60.40 TTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTGTTCCTGCGGTTGCCAAACACCGACGACACACGAGCCTTTAAGTGGGCGTCTCTAATTGAAAAGCGCAGCC:1 - chr2R 10969355 3' - mdg1 7040 2 77.23 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACGATTATTACACTAGCGTTTATTTCGAGTGAAGCAATTCCAAAAATATTTCGCGGCTATTTGC:1 + chr2R 20588839 3' + Tabor 458 2 49.50 ACTTCGTGACTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTCATACGACTTTACGCAAAACCTAGTTATACAAATCAACTTTTCT:1 + chr2L 14358217 3' + 1360 480 1 67.33 ACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTATTCCTTTTCGATCGGCAAGGTATACTTT:2 - 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chr2L 6015402 3' - Cr1a 4165 1 69.31 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCACAAATACGAAATGAAAACAAAAATGGAGTATAAAAAAGGCCAAACACAAACACGTAAAATGAT:1 + chr2R 14586512 3' - Doc 13 1 63.27 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGGCTGAGACGCAGACAAACAAATGCTTGGGCGCACATTAAAAGCG:1 + chrX 2841722 3' - accord 185 2 76.00 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAAAAATAAAAATAAATATAAAATAATATCATTGCAAAAAAAA:1 - chr3R 23921659 3' - Doc 36 1 57.14 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTA:1 + chr3L 25059140 3' + mdg1 7423 2 61.39 TGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAACCTCCACCGAAACCCCCACCAAAACCGAGAAAAATTCGTACTGAGAAAACCACCAACGATGACCACTG:1 - chr2L 3889496 3' + jockey 4723 1 70.30 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAAAATTTCGAATATATTTCCATTTAATTATTAAAATGT:2 + chr3L 18552523 3' + Juan 4175 1 66.34 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGGCAACAAAGGGTTAAGTGCTTGATAAGCGAAAATAGGCGTATTATTTTGGATTTACTTGGAAAAGGG:1 + chrX 7802946 3' + hopper 1411 2 70.41 TTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGTTTATTATGAAGTAGACCTGAAGCAGGTGCTTCAGCAAATTTTGGGCAAACTGAAACTTTATGCAATTGGGCAAAT:1 + chr3R 17262456 3' - 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jockey 4953 1 76.24 GAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCTTGTCTATGTGTCAGCAGAAACTTTAAT:2 - chr3L 21397547 3' - Doc 439 1 72.28 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATCTATTCATTTACCTACATGTTTTCTATACCCATAAACGTTTTAATAGCAAA:1 - chr3R 21608753 3' - copia 24 2 56.44 ATTTATTTATTTTATTTATTTATACACAAACAAGTCGAGAGCCAATAGTGTGAAGAGGCGGAATTGCACTTGAATTTGGCCATTTGCCTTTGGGCCCGGCC:2 + chr3R 23010759 3' - HeT-A 1 2 76.24 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATAGTTTTTGTGTGAGGTGCGTTCAATGCCCATCTTCTAGATGCAT:1 + chr3L 1258064 3' + Quasimodo 7345 2 62.38 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATCCCTATTCAATAATTTAAGGTATTTT:1 - chr4 626805 3' + diver 6062 2 73.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGCACTGACAGAATATAATGGTTATTATATTATATTTTTAGCTGAATTTATGACAAATTT:2 - chr2R 19594588 3' + roo 9052 2 58.42 ATCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTCCCGGTTCTGCTATTTTGCTCCACAGTGTAATACACTCGC:1 + chr2L 3937815 3' - 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roo 34 2 57.43 CTAACTATCGATGCAGCTAGGCGAATTATACTGTAATTCAGCATAAGAGGTAAAATTTAAAACGTCGTGTGCTTTTCAACACTTTTTAGTTTCAGTGTTGG:1 - chr3L 11697040 3' - pogo 12 1 65.35 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAGAAAATATCGAAAAGGGAACGAATCCAAGGGTTTACCAAAACTAATTTC:1 - chr2L 12602760 3' + opus 479 2 60.40 AGCGACAGCAGCGTGAGTGNCTTGAGCGGAGAAAGCTCAAGAGAGCGCAGAGATGGAGATAGCCGGTGCCCGGGGGGCTCCGGATCGCCGGGGACAATGA:1 + chrX 10893270 3' + R1A1-element 391 1 77.00 CGCAAGTATGCTGTGCTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCAATGCTGGGTCAGCACATTGTTATTATGACTACGCGGCGTATCGTAGAACTTGGGAT:1 - chr3L 2593222 3' - Gypsy6A_LTR 98 1 71.29 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGTTTTT:1 + chr3R 12115339 3' + 1360 3350 1 65.00 TTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTAGTTTGCAGATCGAGTTCGTATTAATATGAAACTATCTTACTATACGATCAATACAGAATAAT:1 - chr2R 13709985 3' - mdg3 5102 1 69.31 ACACACACACACACACTTATACACTTGAAGTTGGCCCCACCCCCTTTGGATATCATCACTTTCATGCTAGAGAAATGTAAGTGGTCAAATGTGCAAAATTC:1 + chr2R 1920362 3' + accord 185 2 59.41 AGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGACCTAAGCCGAGCGTAAATCTGAATTCAAATAAATCAAATTGTAAATGCAGCCTGATTTCTGGCGATAA:1 - chr3L 5974884 3' + hobo 290 1 73.27 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTGGACTATGTTTATTAAATGATTACTTGCTGGATGCGGATCCAGATGTTCG:1 + chr2R 15201563 3' - P-element 26 1 53.47 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAGCAGACTCAGCATGGTGCAGGCATGGTACACACGAATCGAATGTCATTAAACGATGGCC:1 - chr2L 17549281 3' + mdg1 7441 2 61.39 TATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAACAAACGCACGCTACAAAAAAAAAATAAAAAAAAGGTATAGAAAACATGCTTAAACAGAATTTAACAACAAA:1 - chrX 10183670 3' + G2 3034 2 65.35 TTACCTTTTTTATTTTCTTTTTTGCAAATATGATTAATCCTGTATTGATTGAACCACAAAACAGTAGGCAACAAAGGCGGACTTGTTCTGGA:1 - chr2L 14432182 3' - Doc2-element 245 1 68.48 GTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATAT:1 - chr2L 23299983 3' - invader4 350 1 62.38 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTGCCGTGGTTGTGTTTTCCGCGGGGGCTTTTCTCGGTGGGTGGGGT:1 + chr3L 17176389 3' - hopper 28 1 54.46 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGAAGGATAACATTTAATTTACTTTATTACGGGTTGAGTTTGTG:1 + chr3R 7272631 3' - hopper 32 1 55.00 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTGGTTAGGACGCGAAAATTATTTGTCAAGCTCCGAGGCCAAATCCATTGAGATTTTCAT:1 - chr2R 7173611 3' - mdg1 17 2 62.38 TAAATATAAATAAATAAATATAAATTAAAGTTATTTTTAAATTCATTATCATCTGTACATTCTAAACTCACAACACGCACATTCCTATTTATGTAAATAAG:1 - chr4 871043 3' + Stalker4 88 4 72.28 AGCCACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGACATAGTTCTCAAGATT:1 - chrX 22726198 3' + Helena 1270 1 45.54 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTCCC:1 + chr2L 3937778 3' - Burdock 6149 2 57.75 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGTGTAGACAGACGCACACACTCGAACACACATCCATCTGTG:1 + chr2L 18413930 3' + hopper 1414 2 75.76 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGCCAGGCAAACAGACAGTTGGACTGGCACTCGAACCGATAGGCACAGTCCTCAACCGAACGTAGCACGGGCTGTCCCTA:1 + chr3R 26849012 3' - Quasimodo 37 2 52.48 ACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATAATAGCCAGGCTTTGGGGGCGTTATGGCATTCTCACGCTTCATT:1 + chr2R 5813650 3' + HMS-Beagle 7013 2 57.43 TAAAAAACAAAAAAGGGGCNATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACAAAGGATCCGGAACTGGGCTAATGCCGGGCTGAGCGGCCTCAGATGG:1 - chr3L 4558976 3' - hobo 377 1 51.04 AATATCTATCGATATCCCAGAAGAATAAAAAAATTTCGCATTCGCATTCACTTTTGAAGTGCTGATAAGTTGAAAAGTTCATAACTTGAGAAAGGCAAC:1 + chr3R 8846946 3' + INE-1 497 1 51.52 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTTACATATGTATACACATATGAACACGCAGCTGGTAAACAAATTAG:1 - chr3R 15547009 3' + pogo 2077 1 60.67 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATTCACTAATTTTGTCAATTAGAAATGCAAGTGTTTAATCAAGGTTCCT:1 + chr2R 16979816 3' + 297 371 2 57.43 AGTTTTTAGAACTTGCCATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATCACACCCTCAACACCTCATTCATAAG:1 + chr3R 7618696 3' - Doc 52 1 70.30 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGGCGAGAGAGGGATGGGGATAGGCGGCG:1 + chr3L 5206601 3' + roo 359 2 74.26 TAATGCTATACTATCTAAGNTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAATATTCTTAGCCACTTTTACGACATG:1 + chr3R 17595373 3' + I-element 5308 1 73.27 AAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAACAGGGAGAGTAAACAAAACACCAAGAAAGTGTTGGTTTAAATAATTTGACCAGTACATCATC:1 - chr4 925812 3' - Cr1a 245 1 64.00 AACTAATTAAAAGTAGTCTATTAGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCTAAAACATATATTAATACTAATAATAACAATGGAAAATTGGAAGGTATAAAA:1 + chr3R 1868704 3' - Cr1a 3980 1 56.44 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGG:2 + chr3L 3428050 3' + roo 357 2 78.22 AAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAATCAAATTTAAATAGTCCAGTTCCTCCCGATAAAATTAAAAAACAAGTATTTTTCACAAG:1 - chr4 844003 3' + 1360 2971 1 59.41 AAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTTTACGAATTTCACCCACAAAGAAAGTTAGTTTATTGTCACTCTGTGCCATCTTTTTGCTCCCTTTAAGTT:1 - chr3R 18769549 3' - roo 8669 2 70.30 GTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGCCGCAGAGCACACCACATGTGGGGTTTATTCTCGGGATCGAATGCATATAACCGAAAGCGGATTACCAACAAATGT:1 - chrX 22460403 3' - accord 179 2 57.43 GATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTACTGAGCAGTGACAACATGGGCGATGGACTGGACAGCAAGTCAAAGGAGCTAATTC:1 - chr2R 20267468 3' + P-element 4 2 62.38 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAAAAAGCTTTGCATAAACA:1 - chr3R 19671711 3' - P-element 56 1 23.76 TGCTGGCATGGTAGCTCGTNATCAATATATATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATAGAAGTCATCTGGATTGGTCCAGTTAAATAGA:1 + chr2L 7989453 3' - accord 106 2 40.00 AAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTACTGCACAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATA:1 - chr3R 3922963 3' - Cr1a 178 1 54.46 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGACATTGTTAAAATGTGAAAAAAATCCGACGGTCTGCATACCTTATAACTAATAAT:1 + chr2L 7804328 3' + 1360 3370 1 59.00 TTAATTAATTAACCTTCCCTAGATAACCATAGCGCTGAGACTGAAATCTGGGCTATCCAATAACTGTAGAATTCGCAATTGTTTAAAATACCAAAATGCAA:1 - chr3R 4821716 3' + Cr1a 3992 1 64.36 ATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTATGTGTTCTAGATAGAAGGAGATCAACGTTGGCAGGAGACATAGACGATCGCAGCC:1 - chr3L 9831507 3' + Tc1 1530 1 70.30 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCGGACTCCAAAAAATGTTTCGCATATATCATATATTTCGGGGAACACATAAATACTGAGGCACAGACCA:1 - chr3R 12178178 3' + hopper 1411 2 76.24 AATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAAATATAGTTATTAAGTGGTTGGATCAGATTTGGAAGCAGCTTAAATATTTGTAAAACAAGATTG:1 + chr2L 4571928 3' + F-element 251 1 71.29 TAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTATGTTTAAAATGAGTACGTTTACATAAAGTA:1 + chr3R 7466397 3' - roo 406 1 74.26 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTTAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTATTGTAGAATCAATAAATACCT:1 + chr2L 3475316 3' + roo 9021 2 79.00 TTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTTCACTCCACATAGACGCACATCGTAAAGGCAAGGAAACTTGCTTCATATGCAAACGTCTCCTTCC:1 + chr3L 13549630 3' - transib3 430 1 56.44 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAA:1 - chr3R 11151819 3' + mdg3 5470 2 54.00 TTACAACTGTCACAAAACCCCCAATCTCGACCAACGCTCCATACCCTTTTCGCAGAGTATTGAGGATGGGTGAGAAGCGAGATGCTGGCAAGCTTTTTATT:1 + chr3R 19728856 3' + Doc2-element 471 1 78.22 TCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGT:1 + chr3R 1844856 3' - Cr1a 120 1 65.35 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATTAATCCAAAAGCACCAAAAAACACAAAATGCCGATACCGAAAAAATGAACCTCAGCCACCCCC:1 + chr3L 5669282 3' + I-element 5343 1 40.59 TATATGTCAATTGCGCTGTTATGCTACTGTTACTGCATTGTATGATTTTCATCGTGTTTTGACTTTGTTGACAATTGAAATTGATTTTGCGGTCACTCACA:1 - chr2L 19267570 3' + BS 5036 1 63.37 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACTGTGAAGAATGTTTTGTAACTAGGTTATATACTTGCGAGTCTGACTAATGGACTT:1 - chr2L 16132515 3' - GATE 8268 2 55.45 AATTGTAAGTCTTTAAATAAATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTTTCAGATATATAAAATATGAAGTTCTTGAAATGGTACAGCTGCGTTATTCTGAA:1 + chr2R 19513442 3' - roo 8684 2 53.00 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGTCACGTTTTGATCCACTTTTCGGCCTAATTCATACCAAACAAATAACAACA:1 + chrX 6075290 3' + P-element 2862 1 54.46 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAACATTGCGCCAAACAGCTGATTTTTGGCCATCCCCCAAACGACAGTGTCCCGCATTCCGCTCCACAC:1 + chr2R 13194713 3' + roo 400 1 70.30 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAGCAATAATTTATGTCGCCTTCTAAGACAC:1 + chr2R 10777862 3' - pogo 44 1 74.26 GCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTTTTCATCGGACTTCTTTGAAATATTGAATTTAACATATTAAAGCATACTTTTCTGGGC:1 + chr3R 11498662 3' - BS 13 1 53.47 AAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATGCACAGCGAGAAAATAGTCTAAGGTTGTGAA:1 + chr3R 19570016 3' - McClintock 172 2 69.00 GATCCGGAGGTGTCTTACCTGGGAGATGGGCATTCGATCACGCGCCTTTGTTTTGGCCGTTAGCCAGCTAATTGCCACACTACCAGCCTTCGGATCGGTCT:1 + chrX 6754841 3' - transib4 2366 1 73.27 TAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCT:1 - chrX 15746293 3' - jockey2 3224 1 50.50 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTGAATAGATTTATGCTTCTTTGACAGGCACAAGATGTG:1 - chr2L 15982588 3' - hobo 32 1 55.45 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTAAACTTTACTTCTGAGTATTTAGCTAACAGCTTAAAGTAAACCCCATTT:1 - chr3L 3822369 3' + pogo 2086 1 60.40 AGACTGTGGAATGCCGAATGGTATGGCGCCATTTGATTGTTTTTGTTTATGGTAAACAGAGGCAGAGGCACTGGGCTATCGAGCAACAAAGAGGTGAAATG:1 + chr3L 455668 3' - Doc 1 1 80.20 ACCATATACCGATCGTTGTTGAAGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCAGTCGCTAGTCTGGGAAATCCCCGATTGGCTCAAGGGAAATT:1 + chrX 10632225 3' - Bica 4763 1 59.41 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAGCGGGATTACACTGAAAAAAAAATAATATTTTTTACTATAATAACCAGCAACTATAA:1 + chr3L 7966856 3' - jockey 25 1 56.44 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACGCCACTTGACGGCGGCGGAAG:1 + chr2R 6769493 3' - 412 7107 2 81.00 AGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGCTTCTGCAACAACGCGCGTGTTTAGTTTACA:1 + chr2R 17266003 3' + Stalker4 7245 4 67.02 AGTAATAATAATAATAATAATATCTACTACTTTCTTGCATTGGAAATGCAAACATACATATATCCTCCATCTTTCACTTACGCGCTAAAAATGTGTTTGTA:1 - chrX 9025371 3' + mdg1 7069 10 68.32 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCAAGGGCATAAAATGAAGATCCAGCTGCGATGGCGCAAAATGCCA:1 - chrX 15268220 3' + roo 394 1 64.36 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAATAATATTACTTATCTTCGTCGTCAAATAATTTTCATCAAAAAT:1 + chr3R 20192591 3' - Quasimodo 31 2 62.38 GTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTATCATAATAAATAATAGTAATTAGTTTTGAGCTTTTTGTGCTG:1 + chr2L 15910421 3' - Tirant 392 2 57.43 AGATCTCGACGTTCATACGGACAGATCTTGATCAAGAATATATATACTTTGGTTGCTTGGCTCTTTTCGTTTAGCGCACTTATGTAGATTAGCGGAACGCT:1 - chr2R 4596935 3' - INE-1 133 1 49.50 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTACATACAAATATTACTGGACAATTCATGTGCTTTCATTGTTTCTTAACTTTGAT:1 - chr2L 8966998 3' - 297 6598 2 63.37 TAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAG:1 - chrX 10996544 3' - 1360 52 1 80.00 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTCTGTGATTTGATTCGAATACAAGTTACACAT:1 + chr2L 15479105 3' + blood 7320 1 69.31 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCATTTTTATATGTAGGACCGCCTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCACTTAATTGGGGTTCGGG:1 - chr3L 4235592 3' - jockey 4573 1 69.31 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGTTTACGTATTTTTTATCCATTTATCTGTCCGTCCGTCTGAACATCGAGTCAACAAT:1 + chr3L 16200036 3' - roo 8683 2 61.39 GCCCAAAATTGTAAGTCTTNAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCAGAATTTTACCCCCGCCGCGTACAGTGAAACTTATCTGATCCACTGTATTC:1 + chrX 15268311 3' - roo 26 2 52.48 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTAAATGTTGTTAAATGAAAAATCTAGTCTTACAACTTT:1 - chr3R 20872713 3' + copia 218 2 62.38 TATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTGGTGGCCATGATGCCCGTGATGGTGCCCCTGGTTTAGCGCATCCGTGGGACTGCTCGAGGAGTCCT:1 + chrX 2064778 3' - R1A1-element 315 1 73.27 TACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCGAGGGATAGTGCTGTTGGCTAGTTCCCTCATTGCGGTAGCCACGGCATTTGCT:1 + chr2L 13200539 3' + opus 117 2 65.35 TAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTGATATGGAATGATACAAATTAATGAAATAGAATGGGCCCATGATTTTGAAATAAAAATGTGA:1 - chr3L 455854 3' - blood 6976 1 63.37 TAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCTAACAAAAGTGGCCAAAAGCGACTTTAAGTATACCTGATATTTTGTTATTTT:1 + chr3R 17955270 3' + hopper 38 1 53.47 TGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTGTCAAGAAAAACTGCGGCTTCATGCTCT:1 + chr3R 30006593 3' - HMS-Beagle 6697 1 72.28 ATATATTAGTGTTCCTGTGTGAACATTTACAAACAAAAAGCGATACTGTGACAG:1 - chr2R 13194640 3' - roo 8668 2 33.33 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCACTTTTGATTGTTTTGGCCATAATATTTGCTGCCCTGGCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 8376615 3' + hobo 2928 1 69.70 TGCCAACCGGGTTGTTGCCNGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAAATGTCAAAAAAATGAAATCAAGCTAAACAGTCGTGTATTCCAAAAGCCT:1 - chr2L 22052481 3' - flea 4780 2 56.44 CAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACAAATATAATTCCCTGCTAAGCCAGCTTAAAGGAACACAA:1 + chr2R 8518293 3' - invader1 24 2 61.45 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTNGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCGCATGCGCGACAACCAGCAAGGTTCGGTGTTTTGACGGCTTTTGATTTGGCTTTTG:1 - chr3R 16594465 3' - Tirant 19 2 60.61 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTG:1 + chr3R 7688927 3' - Tirant 8141 2 65.22 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCGACGTCATAACAATTCAGTGGGGTTGAGTCCCAGTCCCAGTCATTATCGCATTCACCCCACTTC:1 + chr3L 8905809 3' + pogo 2098 1 72.92 GTTTGTACAAAGTACTTAAGCTATCTTAGACTTATAGTTTATAACAAATTATAATAACTTGAGGTAATTATTTGTTGCATATGCAACCCAAGATAAA:1 - chr3R 16764764 3' - S2 1488 1 74.23 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATAATTTAAAAAAAAAAACAGTTCGGAGAGGGTTGACTCAATGCATTTCTATCGCAAATAAAAA:1 - chr3L 25624483 3' + opus 485 2 65.35 GTTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACGAGCCAGACGCACTGAAAATGCAAGAGGTTATCTCATAAAAAAATATTAAAAACTATTTGGTAATAGC:1 + chr2L 2416964 3' - 3S18 155 2 73.00 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCATATACTAAGTGATGACTAATAATAAGATTTGTTGGTGTTCCCAAGAAATAATAC:1 - chr2R 8717624 3' - 297 6596 2 61.39 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCAGCATTTGCCGCACTTCCAGCGACACTTCCA:1 - chr3R 30252290 3' + 412 7503 2 68.32 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTTGTCACCGCAAAAAGCATTCAACAACAATGACACGCTTGTTGGGCAAATGCCTCCTCCATTCGGCAACC:1 - chr3R 23637943 3' - Tirant 8169 2 75.25 ACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATATCCCAAACCCAATCCCATGGGCAGGCAACGGGCATGACTGTGGAGTGTTCGACCTGTCACGGGCTACGCA:1 + chr3R 20228973 3' + McClintock 6005 2 77.23 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAATTAAAACAACAATTTTACTATATATGTACTAAGTATTGAAAGTATCAGGAAAAGTATCATCGAAAAAAT:1 + chr3R 7869190 3' + 297 6945 2 59.41 GGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTCAAATTACTTTTATTGATTCCGATTGAAACGAGCAAATCATGAGAAATCTACGCAGTTTTTTTTGTGCCTGA:1 - chr2L 11919258 3' - X-element 16 1 68.32 TTTGCATACTTGTGAAAAANACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTTTCTCCTTTCACCTCACGCTGCGTGGCACGTGTAG:1 + chr2L 18413895 3' + hopper 1377 1 60.40 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTCAGCTAATTAAAATTTCAGTATTAAATGCATTTGTTTTCGAAGGCATGTTGGCAGTCTGAAACTCATCCATCTGTTTT:1 - chr2R 11941186 3' - Doc 19 1 62.38 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTGATTAATAAGCTGGGGAGGGCAATACTTCCCACAATAATATTTGGAAAGTTGTACTACATT:1 + chr3R 4474257 3' + copia 245 1 67.01 GACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTAACACACACGTGTATAACCAACTTTCTGTCATTTCTTCACCTCC:1 - chrX 10432957 3' + 412 7448 2 56.44 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCCCTTTAATTTGTTTTGTATT:1 - chr3R 12930904 3' - jockey 4780 1 80.20 TTACCCAGAAATTATGTTGAAATATAAGATGTGGAACAATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGCTGGAATAAGAGGGGAATGCAAGTAAGTTGGGCGG:1 - chr2L 18903620 3' - HMS-Beagle2 6921 2 70.00 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTTGCCTGACATGTTTGTGCGCCTCGTCCATTCTCCGTTCCGT:1 - chr3L 11657840 3' + Tabor 7289 2 56.44 AAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATTCATTCCCATTTCGGTTGGGCTTTCACTTGAGTTTTGATGGGGATAATTGGTGTGTCTGTGGCATGTCA:1 - chr2R 8518209 3' + invader1 395 2 72.28 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAACACCGAAG:1 + chr2L 1335359 3' - jockey 4699 1 51.49 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCCTAACGGGAGTTCATCATTACACATGACATAAAATATATATATCACGCG:1 + chr3R 16806057 3' + 412 7494 2 72.28 TAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATAAAATTCTTGGCCCAAAACGGATTGATGGTGTTGCCATGGCTTGCATTCTACAACAAA:1 - chr3R 9300688 3' + Burdock 240 2 64.36 ATGCAACTAAGTGTTGCTGNGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCAAACATTACTGCATTGGCCAAATATTTATTTC:1 - chr3R 28216804 3' - blood 7054 2 64.36 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTAGCTATTAG:1 + chr3L 24253681 3' - Quasimodo 25 2 56.44 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTATATCGCGACCGCTTTTATTCAATTAAATATACTTTCAATGTTCCTGTTGCAAGCACTGC:1 + chr3L 3822480 3' - pogo 10 1 70.30 TATTCTAGTGTCTTTGGTANAATTGTATACAAGATGGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCGCAACGCCCCTTCGTGCGTACACGTGGCG:1 + chr3R 4509767 3' - Tc3 237 1 61.39 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAAGTTGCGATAAATTCTGTACTTGCTGATTTGGAAACTTGTAATATCTAGCTT:1 + chr2L 8708188 3' - mdg1 24 2 53.47 ATATAAGGGAAAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAAAACAAACCCATGATTGTGAGCTGACTTTACAAGTGCGGAAGTTGAACTGAAACTAATGAGTTCC:1 - chr2L 4378693 3' + Juan 4199 1 62.38 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCAACCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTCAAATAAAGATACAATTGTATCTGGCCA:1 - chrX 19219312 3' - Doc 38 1 65.17 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTTTACGAATTTCACCCACAAAGA:1 - chr3R 18769597 3' - roo 53 2 79.21 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTGGCTACCTAATCCCTGGGCAATTTCAATTAATATCCCGGCCCATGAGAACTCGACTGATAGACTCG:1 - chrX 5452531 3' - mdg3 5262 1 67.68 GTGTCTAAATACTTATGACCACTAGTGTATACATATAAAAAGTGAAAAAACGTACTTACCAACACACTTATTTAGTGTAGCA:1 + chr4 222792 3' - Tc1-2 6 1 59.76 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACAGATTATCACCTATCACATATTTGCCATTTATTGGCGGCTCTTTGCTCTCTT:2 + chrX 2743872 3' - P-element 24 1 55.45 TGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTGTGTATTTGTGTTGCTCGTTGTTGTTGCATCCCAGAGACGCTGTTGTTGTTGTTGCTGTAGC:1 - chr2L 12678805 3' - Tirant 8162 2 66.34 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTGTAAAAGATAAAAGGATATAAAGGATAAGTTCCTATCTTCTTGAAACCCCTAACA:1 + chr2R 24169991 3' - roo 21 2 59.41 TTAATACCAAAGACACTAGAATTCTTATTCTATTGTCTTTGTTAATACTTTTTTACTATAATGTGAATGATTGGTTGAATTTAAATATAAAGCCACGAGAA:1 + chr2R 19502124 3' - Tc3 317 1 64.36 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGNTGCAGTTCTCTGCTTAAGAGTCATGCCACCCAGGACGACAGGCCAACAATGGTGCGACATGAGCAACAAAACAGATAGCA:1 + chr3R 11720713 3' + hobo 2928 1 68.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTCATCCCGCTCTGTTTGCGTTCGCCATTGCGGTGTGGATTTTTAATTTTGTAGGTGGTGCATG:1 + chrX 11030940 3' + roo 397 1 67.33 TTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATCAATCACCTCACAACTCTGAAAACCACCATTCCATTTCCATTTTAGCATGGAATTTCCGTAC:1 - chr2L 17225180 3' - X-element 4595 1 54.46 GGATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACTCCAACATAATTAGTTTAATTTGCACAATGAGATGCTGGTGCTGATGGCGATGGCGA:1 + chr2R 11820960 3' + gypsy6 344 2 64.00 AAACCTTAAAAATGAATTTTTAATGTTTTGATGAAATTATTTTTTTAAAATTATTTTACCATTTTAAAAGTATATTATTAGTCTTTTAATAAACATATTGT:1 + chr3L 7313530 3' - FB 974 2 74.26 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATAATCTTTCGCGTTAATTTTTGGTGTTATAAACTGCAATTCACAGGGAA:1 - chr2L 21372908 3' - roo 8664 1 79.21 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAG:1 + chr3R 16613185 3' + 412 7498 2 73.27 AATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACGTTTTTATTACATTTTCCCTCGTTCCCTACGCCTCG:1 + chr2L 3439356 3' + Cr1a 4211 1 77.23 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAACAAAGCGGAATTAGACATTTAAGAGTAGTGTATAGTGTATAATTCCTTAAAAA:1 + chr3R 17976720 3' + copia 233 1 49.50 GAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGCAATATGAATTGCGTACGCCAATTAGAATGACAATTTGCTGTGCCTTTGTTTTGTTGCGGTTCGCTTTTAATTACA:1 + chr3R 22643261 3' - G2 2706 1 75.25 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTAAATTAAATGGATACTTAAAAAGTAACGATATTTCGTAATATGTTATATAAATATATTTTTCTAT:1 + chr3L 17063523 3' + roo 400 1 71.29 ATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTCCCCAATTGCGGCATGAGCAATTTTCAAAGTTGTCAATGAAAAGACAAAGAGGTACCGAGTGATTAATAGA:1 - chr2L 1334942 3' - jockey 4983 1 73.27 AACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAGAATATAAGTGATTTTTCTCTGGATTCTATTATGTTATAAGCATTTAATACTTTTTATCTC:1 + chr3R 28804451 3' + jockey 4679 1 59.41 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTATCCGATTTTGAGAAAGGTCAAATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAAACT:1 + chr3L 27357632 3' - mdg1 21 2 58.42 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCCCACTGTAGGTGTTCATTTGATTGAAAATGTTTCTCTTACTTTTCCGCAACAATGAA:1 - chr2R 13446640 3' + roo 9052 2 57.43 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGAAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCACGCACACCAAAGCAACGAGAGAGGCTGCAG:1 + chr3L 13557107 3' - hobo 47 1 70.30 TTTTATTTTTTTTTAATTTTTGGGTGGAGCTCTGGTTTTTTGGGTGGCTCAATGGCGGCTTCTAAATTTGAGGGTTGCAAACTTTAGTAGTTGTAAGCCTA:1 + chr2L 16470751 3' - Doc 4696 2 47.52 TAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGACCCACAAATCCCATCTCTAATCTGTTTTCCCGGACTCTCCGGCTTCG:1 + chrX 2338813 3' + Doc 485 1 57.43 GGATTAGACCTCGCGCTAGNTGGTTGGGAGATAATAACCCTCTTTAAGGCAGCCACGATGATGTTTCCAAGTTCCCAGCGTTCAGAATTAATATAGTTAGT:1 + chr2R 7900696 3' - F-element 4478 1 76.24 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGACCCACAAATGTGTTTAGCTTGTGGTGCCAGGGGAT:1 + chrX 1563818 3' - roo 41 2 67.33 GACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATGTGCGCAATTGTGCCGGAGTATGGGTTCTCGAGTGTGCG:1 + chr3R 5929322 3' - invader1 288 2 61.39 AAAGTAAGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTG:1 + chr3L 15099638 3' - G4 3811 1 38.38 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCGTTACTTTTCCCAATGCTCAATGGA:1 - chr3L 15435552 3' - blood 7063 2 80.20 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATCCAATGAGTTCGC:1 + chr2R 8232547 3' - P-element 31 1 46.53 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCCGTGGAAAAGAAAATGCAACGTAAAAATGCATAAA:1 + chr3R 12906594 3' + hopper 1390 1 61.36 TTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGCACATACACATATACATATATATATATGAAACACTGGAAATAATAGCTAAGAAC:1 - chr2R 9950127 3' + S-element 1700 1 63.37 GTATGCATTCTAATAAACAAATCCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGCAGTTCTGCATCTTGAAACTCTTGTCCTTCAGCT:1 + chr3L 9842487 3' + 17.6 156 2 64.36 TCTATAGATGGGAAAACCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATTGTTTGAACAATTCGCCTATCTGGTCTC:1 + chr2L 3937776 3' - Burdock 45 2 70.30 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTCTAAAAATGAAAACA:1 + chr3R 26343016 3' - blood 7025 2 65.35 GTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGTATGCAATATATATAGATTCAATTAAAAAAAGGT:1 - chr3L 16487071 3' - TAHRE 10415 1 77.23 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTACCAAAAAATAGTATGGCGTTACGCAATGTGGGGCAACTGTGAAGTATTAATTAATTTAAATTTCG:1 - chr3L 8146213 3' - 1360 61 1 60.00 TTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACCCACTTATAGTATTAACTTATAACCCTTGGTTTCGATCGCTCTCCTCACATCACATTTTTTCAC:1 - chr2L 16456750 3' + BS 5078 1 63.37 GAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGGCTCACTCGGTTTGTTTTCTTATATTTATCTAATGTCAAACTAGACGAAAATATATAGCAAACAAGATGGG:1 - chr3R 24606269 3' - F-element 327 1 72.28 TAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTT:1 + chrX 23108322 3' - BS3 1426 1 50.50 TGAAGAATTGAATAGGGTTACTATCGCATCAACAATGCGAGTCACATCTGCGCTTAGCAGCTCATGAATATCGTATTAACTTTTACTTTTCGTGCCCTCAG:1 + chrX 7791540 3' - rover 404 1 69.31 AGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAAAAGCTGTTTGCAAATCGCTTTTCTCGTATAGCC:1 + chr3L 2432074 3' - blood 185 2 65.00 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTGCCTCGTATTTTTGAGTTGTGTTTTTGAGTTAGCAAGTCCTTGACAATGACATGTTCATG:1 + chrX 13012178 3' + hobo 2929 1 65.98 AAGGTATTTCCAAATAAAANCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCATGGGC:1 - chrX 15268258 3' + roo 9021 2 75.76 ATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTACCTAATATTACCAATAACTAACACTATTAATAACAAT:1 - chr3L 207519 3' - R2-element 3398 1 66.34 AAGTTTAACAATATAATAAAATAAAATACGTCTCTTCTTAAGGAACTATGTATGAATGTCAAAGAGACTAACCTCTCTATCCTTGCATTGCAGTTCCCCGC:1 + chr2L 5307551 3' + TAHRE 21 1 89.11 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGTAATTCGTGAAACAGCTTGTCAGTTGAA:1 + chr2L 20550826 3' - jockey 4717 1 74.26 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCTAATTGATTTAGCTTCCGTTTTATTGATCAGCAGAA:2 - chr3R 25514117 3' + hopper 1378 1 63.37 GATTTATACATATGTACATATACACTAAATTAGCTATGGATTATATTATGCCCTCGTCTAAGGTCTCTTTTTTCGGCTTGGCT:1 + chr3L 10547593 3' - invader3 5087 1 46.99 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACTATTATTTTGAAATTTTTTA:1 + chrX 19812427 3' - Transpac 4950 2 57.00 AATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCATAAAATTTGGTACTATATATGTTTTTGAATTCTGACTAGTTTATTCTCTTTTTAGCA:1 + chr3L 25120874 3' + Cr1a 4316 1 60.40 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTGT:1 - chrX 7534632 3' + Tirant 8477 2 55.45 GAAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGTACGCAGCCAGTGCCATTAAAATCAACGTGAAACAACAATTAGTATTCAAGGTTAACCAGAAACGAACCGCGA:1 - chr2L 15909794 3' - Tirant 8109 2 79.21 ACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACAAATATAATTCCCTGCTAAGCCAGCTTAAAGGAACACAAATTAAACAGGCACAGGAAACTAGACAA:1 + chr2R 8518320 3' - invader1 3624 2 64.36 GAGTGATACCATTTTCAAAAAGTTTTGGGAAAGCCGACAGTTTAGAGATTCCTTTGGAAGTATATTTAGGGATTTATTATTATTAGGGATTTGTTGATTTA:1 + chr2R 1655216 3' - Q-element 145 2 64.36 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAAGATTGACTCATGCGCAAAACAAATT:1 + chr2R 20461009 3' - hobo 50 1 73.27 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATAGTGTATAGTGCCATAAATGTTTGGGGTTTCGCCTTACTTATCGCAA:1 - chr3L 3992371 3' - pogo 22 1 57.43 ATGCGTTGTAATAGTGAGGATCGTGCGGGAGATATAATGATAAATGAATTACGTCGACAGACTGTATGTCTTCGTGCCTCCATTCTCATCTGGTTTCTTT:1 - chr2R 3288140 3' + mariner2 134 1 73.00 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCGTATACTTTTGAAAGATCTCTCTTTTGGGTTCACCTA:1 + chr2R 13432890 3' - 297 6607 2 60.42 GTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGACGGCCAACAGACAATGCATATAAAAAAGG:1 - chr3L 15399027 3' + Doc 192 1 73.27 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGTAGTAAAAGATATGACAGGTCAATTGCAACTAACCGTACTGGAAA:1 - chr3R 23683372 3' - 297 24 2 58.42 TTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAAATTTGGCAACAGACTCTGGTTACCT:1 - chr3R 23731319 3' + F-element 177 1 75.25 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTGGAGGGCGGACGGTGGACGGGGAAGCGGCCTGAAAACGTCTATCCACA:1 + chr2L 19207943 3' - 412 7081 2 50.50 GACGGCTGCCTTCAACTTANAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCAGCATTTGCCGCACTTCCAGCGACACTTCCAGCAGCATT:1 - chr3R 30252282 3' + 412 458 2 59.41 AGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATGCCTGCGGTGGTGCCCACCGTCACGAATTCCGAAATGGTCTTCAAGGAAGCGGCGGCCC:1 - chr3R 30989805 3' + F-element 4217 1 72.92 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGGATCAAATGGATCTGCGGCGTCAGCAGGGGGAGCTGTGCCTAATCCTGGTCAGGATCCAAA:1 - chr3L 21005965 3' - hobo 14 1 69.31 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTT:1 - chr3L 19274816 3' - transib2 43 1 68.32 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAA:1 - chr3R 16806031 3' - 412 55 2 81.19 AACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAACATCCCACTCCACACA:1 + chr2R 8707116 3' + flea 251 2 75.51 AACAAAGTGTCACAATGTANGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACC:1 + chr2L 12199498 3' - Stalker2 7302 2 78.22 GTGAGGTATGTGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACTGGCAATGTAAGTGTCTGACATAGAT:1 - chr3R 4723185 3' + opus 461 2 79.21 TCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCAAATAATTGTATATCCAGTGCTTGTCTGGCTGATAAGGGAT:1 - chr2R 18810512 3' + jockey 4605 1 59.41 AAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGTATGAAGTATCCAGATCCCCTAGGCTCAAAAGTATAAGAC:1 - chr2R 5541955 3' + invader3 5426 2 59.41 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAAAGCAATAATTTATGTCACCTTCTAAGACACCATACATATT:1 + chr2R 10777872 3' - pogo 34 1 67.33 TGTATATACATATACATATATACATATACATACATTATACATATATTATTAACGATAAGTATTTAATATTTGAAGAACACAAAGGACATTGATGTTCAACA:1 - chr3R 23723081 3' - Stalker2 253 2 69.31 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATAAATGACGGTATAGGGTTTCAGATACAGCCTTTTCTAACTTAAGATCTATTCATTTTTTGTCAATCTACC:1 + chr2L 18282090 3' + Juan 4168 1 69.31 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAACAACGTCTAGTTGC:1 - chr3R 6437508 3' + 412 7506 2 62.38 GCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGAAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGAGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1 - chr3L 25232774 3' + accord2 172 2 55.79 TTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGCATGCATTAGAAATCAGGAAAATAAATATTTCATGGAGCCA:1 - chr2R 167176 3' + Bari1 1487 1 58.54 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTACCGATCCGGATATCGCTCCCGCCGCAAAGCTGAAACTAAACGTCGGCTCCACAACGCC:1 - chrX 19614895 3' + 1360 3373 1 63.37 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAAAGCAAACTGTCCCCTGATTAATAAATATTA:1 - chr3R 16806001 3' - 412 25 2 54.46 GAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTTTGTTGGTGTACCAGCACGTGGCACTGGGGGTGGAGTGGGCTCCTGGAATAGTTGCCGCCTGTTGTAATTTCT:1 + chrX 20346936 3' - G-element 280 1 54.46 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCTTGAGGGAAAATGCCTATCTTCGACT:1 - chr3L 17708239 3' + 412 458 2 64.44 TTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTAATTTTAATTAATGAATTGTTTATTTATATTCTAGAGCGACTTCATTACTCCTCGTGTTATTGC:1 - chr3R 4433992 3' - Juan 18 1 62.38 TATTTGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATGAAGTGTTTATAACCTCTTTGGTTGCCAC:1 + chr2R 18105849 3' - roo 8665 2 76.24 AGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTCCTGTGCGCGAAATATGAGCGGCATTAAAAATTAGTCCAAAGTACTGCTAAGTGCGGAAGCAGCCGCGGCAAAC:1 - chrX 20290422 3' + hopper 1413 2 77.23 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTTGAAAATGTTTCCCATATTTGTAGTCATTTACTATTTCGTAATTCTT:1 - chr3R 14985302 3' - Ivk 42 1 53.47 AAGTGGATGCATAGTGCAAAACAGTGGTTTTCTTATCATTGACATTGGCTGGCAAGTTTTTGCCAGCCAATGTCAATGATAAGAAAACCACTGTTTTT:1 + chr3L 17581370 3' + 1360 3346 1 50.00 AAGCCAGATTCAATATAGCCTTTGATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 3262650 3' - Tc3 484 1 57.43 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATGGCGTGAGGGAAGATGGGAAATGTCGAGCCAA:1 + chr2L 15479607 3' - blood 7055 2 66.34 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGATATCTAATCTCATTCCACATTATATTTCCTTCACTTTCAACCATAGCTATGTGGCCGATGCTGGAGCAC:1 - chr3L 2270486 3' - roo 3 2 74.26 AAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCAGATGATGTCGGAATATTTGGAACGCAGCTCCCCCAGCTTTAGATAGTCCGGTCGAAAGTCATGTCCCCATTGGCT:1 + chr3L 14631438 3' + baggins 5053 1 77.23 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATG:1 - chr2R 6769468 3' + 412 7493 2 74.26 TGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATT:1 - chr2R 4260436 3' - micropia 5137 2 80.20 ATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGCCTTACCGCCGTGGAAACCTCACTGGAAAAGTCCACGTGACCGGGGGAATCAATCAAATTGATGAGGT:1 - chr3L 16420065 3' - Stalker 11 4 71.29 GCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACCCTGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGTTGGTGGAATTTGGGAATGAATTGAATTAGCCTTGGGTCCGTCGGCCG:1 - chr3L 16448105 3' + Doc3-element 320 1 52.48 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTACATAGACCCGCATTACGAGCATTTTCGCTTTCACCTCACGCCTTCTGCGGCAGACAAAAGACCAAAACGAAGA:1 + chr2L 7909551 3' + 1360 3388 2 57.43 TATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTTAAACATTTATTAACATCAAACTAAATAATCTCA:1 + chr2R 16234284 3' + 1360 262 1 70.30 ATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGTCCATATCATACATAATAAACAAAGTAGCCGAGCATGTTGGCATTCCCCCTGCTCAATGGGGGATGAA:1 + chr3L 6800154 3' + gypsy6 405 1 54.46 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATT:1 - chrX 7534648 3' + Tirant 357 2 70.41 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGCT:1 - chr2R 18105765 3' + roo 360 2 73.27 ATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTGCATGGGGTAAGTATTGGGCGATCGGAGATCGGGGATGGGGGCATCTTTGGCTGTTTGGAGCTCC:1 - chrX 5700516 3' - HeT-A 5969 1 60.40 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCGATCGAACTAATGAGATCCCAGCACATC:1 + chrX 5997293 3' - 1360 49 1 72.28 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTAATCCAATTGGAAG:1 - chrX 21056897 3' - Tirant 3 2 78.22 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATACTCGCACATAACTGGGTGGGTGTGGGCCAATATGTATGTGTGCAGTCATA:1 - chr2L 12779587 3' + flea 4998 2 52.48 CCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAG:1 + chr2R 1751257 3' - X-element 4410 1 67.33 ACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTTTATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCCAGAATACCAGGGTGATACGCCAGAGACC:1 + chr2R 18687600 3' + jockey 4544 1 69.31 AATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGATTGAAGATAAGGATAATGCT:1 + chrX 17873217 3' + 412 439 2 75.25 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCAT:1 - chr3R 12115277 3' - 1360 29 1 58.42 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATATAATAAACACAATTAAACCGGGCGCACCATAATTATTACGA:1 + chr2L 20709452 3' + roo 9038 1 61.39 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAAGCTTATTTCCAAGTTTTGCAATCTTTCCAA:1 + chr3R 10434610 3' + 1360 3345 1 68.32 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACACCGAATGCTGGCTAGAGAT:1 + chr2R 10874758 3' - P-element 56 1 23.76 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCAT:1 - chr2L 4110956 3' - Doc 43 1 64.36 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGATGTGCATGTATTCAATGAGAAAGAATGATTGTTTTTAGCTAGTTATTAAATT:1 - chr3R 6609698 3' + Transpac 5207 2 56.44 GATCGAAAAAAAAAAAGAAAAAAGGAAATGGAAAATCAGGG:1 - chrX 8731883 3' + R2-element 3582 1 87.80 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGATCAAGCTTGAATTTCAGGGTCACCTGC:1 - chr2R 18105766 3' + roo 359 2 74.26 GACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGTTGATAGAAAAATACGTGTATAATCCAGGTGACATGC:1 + chrX 15258375 3' - BS 9 1 63.37 AGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGCCAGCACGGCGGAAATCGGGGGAGATGCGGCTCCGACTTAGTGCTGCCCCGCCTGCATTTTCG:1 - chr3L 1865585 3' + Quasimodo 220 2 67.33 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTTAATGCACAGCATACTTTTTGCCAAAAATTCTGTGAGCGAAAATATTTAATTACCAACACGC:1 + chr3R 7688954 3' - Tirant 16 2 65.35 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACATTATATGCATAAAATAGAAATGTGTGTACACGGCCTATCTTGATAGCCCTAATATTTATCTTCTAGAAA:1 - chr2L 8708084 3' - mdg1 6 2 71.29 GGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATATCTCGGGTTTAGCACTTCATATTTATTACCTGTCGAGTGCACTCAAATCACTTGCAGCCGTTGT:1 + chr2R 5864886 3' - Doc 4542 1 66.34 TTAAGCCTCACCCCATCGTNACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAGTTCTTGTTTCTTCTCAGAACAA:1 + chr3R 14702718 3' + Idefix 7042 2 76.24 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACGAGCTTTTGAGCTTTGGAAATGCACTTTGAAAAATTCCAAAGCAGCAA:1 + chr2R 22666063 3' + pogo 2078 1 56.44 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACATGCATGGAAACAAAAGACTG:1 - chr2R 19557959 3' - 412 12 2 67.33 GCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGCCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATAGGGCATAGGGCTT:1 + chr2L 9319141 3' - jockey 5 1 77.23 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTACTCTGCCAAAACCATTTAAAGCAAACTGTCCCCTGATTAATAAATATT:1 - chr3R 16806002 3' - 412 26 2 53.47 TTGTACCAAAGACACTAGAATAATTATTTGTTATATATAGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCGTACCCAGTGAGATCGGTCAGGTAGGAAT:1 + chr3R 8848220 3' + Tc3 237 1 48.31 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATAACTGGAACCCAATACGAAATCAACCGCAGAAACCTCAAGCAAAATGACTTTCGTTTTGGCCAAGTA:1 + chr2L 8913405 3' - mdg1 7047 2 70.30 TGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCACATGAAGAAAGCAATTTACCAA:1 - chr3L 18896602 3' + P-element 2837 1 27.72 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGC:1 + chrX 22386763 3' - hobo 74 1 57.14 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTGTAATTAGTGTTCGAAATGT:1 - chr3R 5993132 3' - pogo 51 1 80.20 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTGTACGTGGTTCTATTCGGAACTATTATTTT:1 + chrX 19812416 3' - Transpac 39 2 67.01 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATCACTATGTTTATAAGCCATAATGATCGCAGATTGGCGAGAATAAACAATGATCATCGTT:1 - chr2R 14344395 3' - 297 6586 2 75.25 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGCGTGCGGAATTTTAAACAAATATTTACACAGCCGAAACTTTT:1 + chr3L 771831 3' - roo 33 2 63.37 AAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCATTTTTCCGCACCCACCCCTTTGCTAGTATTGATTTTCATTTTGGAAAGCGTGCAAGCAAAGGCGTCGGTTTATT:1 - chr2L 262972 3' - roo 9067 1 79.21 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCCGCTTT:2 + chr2L 9471263 3' - roo 8704 2 64.36 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACACGAGCTTTTGAGCTTTGGAAATGCACTTTGAAAAATTCCAA:1 + chr2R 22666055 3' + pogo 2071 1 58.00 TGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACCCCAGTCC:1 - chr3R 30611219 3' + blood 7376 2 67.33 ACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTGGTAATATATAACATAAAACCGAGCGCACATGATAATTCTTCCAAATTTATATATAAATTTTATATTTCTTTCA:1 - chrX 23431581 3' - G6 5 1 74.26 AGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAA:1 + chr3R 556458 3' - Juan 4131 1 61.39 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGC:1 + chr3R 22494762 3' - 1360 38 1 64.36 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGTTCCTAAAACCCTTAGATCTCAGTATTTTCTTTGATCATAATTAAATTGAT:1 + chr3R 10229458 3' - copia 26 2 51.49 TTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCAGGCTAGCCATGGACGCCGTCGAA:1 + chr3L 22976563 3' + G2 2693 1 77.23 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTAGAAACAAACGAAAAATACCTCGGCCAAAAAAGGCAAATAAA:1 - chr2R 20588769 3' - Tabor 36 2 57.43 TTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAGCAAAATCGTTATATGGGATATCCTCGATCGTCGTTCAATCATCATCTTCAACCTACA:1 + chr3R 28854064 3' - roo 8787 2 61.22 AACTATCGATGCAGCTAAGAGAATTATACTGTATATTATATTCAATACTTTATTATAACTTATTACTTTCATAAGAAAACTGTTTATAATCACACATGCTA:1 + chr3L 12717895 3' - pogo 10 1 67.33 ACACACTACAACTATCTGCAGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCACGAATTGAAGTACATTTCAATTTT:1 + chr3L 5180058 3' + Tirant 8433 2 72.28 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAATAATATTACTTATCTTCGTCGTCAAATAATTTTCATCAAAAATTTAGCTACTTCAT:1 + chr3R 20192604 3' - Quasimodo 18 2 60.40 AGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCAAAAATGATTTGTTGACTGTCAATTTTAATGCGGCATGTCTTTGCCTAGATGGA:1 - chr2R 19092130 3' + Cr1a 244 1 64.36 GAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGCAAGGCGATTGCAAGTAGCCAG:1 + chr3R 9613514 3' + invader3 5450 2 65.35 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTGTGACTGCCAACAGGTTTTCGATGAAAATTCCTGGGGCCAAAG:1 - chr3L 19465244 3' - Burdock 18 2 59.41 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTGAAAGATCTCATAAATTAGCCATATCACGAGATTATACGTATTGCTTTGGATA:1 + chr3L 16478460 3' - pogo 22 1 55.45 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGGCGAACACACAGACTGGCGTACATACACACTCGCACAAATCCCCAATGACATTG:1 + chr3L 6211234 3' + hopper 1395 1 44.55 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCATTTGATTCGGGAAAAACTACAATT:1 - chr2R 11613703 3' + pogo 2052 1 77.23 GATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAAAATACTTCAAAAACTAATTTCTTGCTTGCAAACTCATGGAACAACATGAAGAAAACAGATTTA:1 + chr2R 17112447 3' - micropia 5141 2 68.32 TTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAACAGGAGTATTTAGATAATGCAAATTTGATGTTTCATCATTTTGTATTTATC:1 - chr3R 18342452 3' - F-element 38 1 51.49 ATAATAGCAAAGGCAACATGGTGAAGAAGAACTGGGTGGCGTCACCTTAAAAGAGAATAGATATGTGACCCGGTGCGTTAGTAAGTCGGTGATATTCGCTT:1 - chr3R 21369406 3' - micropia 50 4 82.18 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTTAAATAATTCACTTT:2 - chr3R 13239904 3' + hopper2 1550 1 80.20 GCATACCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAAAACCCAATACAACTTGCGTCAGTATG:1 + chr3L 25768166 3' + Circe 7385 1 78.22 GATGCAGCTNACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTCTAATCTGCTTGGTATTCTCATCGACCCCAATCGGTCACACT:1 + chr3R 27582825 3' - pogo 19 1 57.14 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTATATGTTTGTGTAGGCTCACGTATGCCCCTGAATGTGTGTGTTAA:1 - chr2L 15848220 3' - hopper 27 1 52.48 CACACACACACACACACACATTGAGGGGGCGAGAGAGGCGTGGCGGCGTGTGACGTAAACAGACAAAAAGGGCAATTAGGGAGACTCCATTGTGTCAGCAT:1 - chr3L 12241991 3' + accord 184 2 71.29 ACAACCGATTTTGTGCGGANCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTC:1 - chr3R 9870353 3' - F-element 48 1 58.42 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATACATTTGTAGTCAGCCAATTCGGAAATCTCAAAACTGGAGCGTAGCAAATG:2 + chr3R 19807437 3' + opus 7481 2 59.41 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGAAAGCAACCAAATGTTTTTAATAGATAACTAAATTAGTTCTGGTCTAGTTGAGGATAACAAACGCATTGCGGGACCA:1 - chr3L 19944187 3' - Juan 4029 1 75.25 TTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTAGCTGCTGGGCAGCCTGAGACTCCTCACTCTTGTTGCCACACAACGCGGCTATCGCTTGCTTAATGTTTTCCAGACC:1 + chr3R 27516612 3' + invader1 13 2 77.23 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTCTTTGGAATTCGATTGGCTGAGGCTAGGCTACGCTAGCCAGGAGC:1 + chr3R 31474043 3' + roo 9043 1 55.10 ACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGACTGACTGGCTCTGCTGAATCCCCGACTGCCGCCTAACGAGCAGGACAACGACGTGAGTCG:1 - chr3L 10578961 3' + roo 393 1 62.38 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAAGTATTTCAAACCGGCGGGCAGAAGCGGA:1 + chr2L 10177840 3' + copia 243 1 67.33 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCAATATCTGGC:1 + chr3L 3428078 3' + roo 387 2 56.00 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGTTAAAAACACGTGGAATCTGCGG:1 - chr3R 13205771 3' + hopper2 1557 1 71.29 GTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAATGCACCGGCCGTCTGAGCGGAATTTATGGGCCGCACACATGGCGCCAAAGGTAAATGTGGGCGA:1 + chr3R 18506717 3' + P-element 430 1 77.78 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCGATG:2 - chr3R 9870346 3' - F-element 41 1 52.48 TTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATATATTATTAAAACAACAAG:1 - chr2L 4764044 3' - Tabor 6896 2 77.23 ATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGGTGATAGACGGCGGGCAGACTTAATTTTTTCCCC:1 - chrX 7157665 3' + Tc1-2 1276 1 76.24 AAGGTGATGGTGCTCGATCNCCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCTGATGCTGTGCCAGTGAATGAGTTCGGATTCGGTTTCTGATCGGTGCTG:1 + chr2R 22093997 3' - Doc 318 1 52.48 GCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGAAGCGGGGATCGAGAAGAGGGCGGAAAAACTCGTTTAGGCCAGATTCCCAGTG:1 - chr3L 21260347 3' + opus 7260 2 63.00 TGTAATGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGAATGTGCCATCAAGTGGGGACATGGATTTTGGGTGGCATTAAAGTAAATT:1 + chr2L 13679316 3' + Circe 7153 1 50.50 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTATATCGCGACCGCTTTTATTCAATTAAATATAC:1 + chr3L 3822453 3' - pogo 37 1 66.34 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAAAAGATGACGTCTCTCTCTCTTGCGATTTATTTACAGGTGAGTTACCCACAAGAT:1 - chr3R 31909292 3' - hopper 17 1 46.46 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAACAACTTGTAACTTGTGTATCTATGAGATACATTTACATTTCCCATAACAACTAGCGACGTTTATGCGA:1 + chr3L 11657929 3' - Tabor 9 2 70.30 GGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTT:1 + chr3R 10736114 3' - McClintock 31 2 63.37 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGACCTGAATAACAAGGACTCGCAGGAGTTCT:1 - chr2R 19513373 3' + roo 9028 1 66.34 AATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACTATGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCT:1 + chr3R 6842662 3' + hobo 2550 1 69.31 ACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAATCTATCCGAATCCTTATCTATCTTTGCAGATGCAGGAGACGCGAGTGGAGGGAAAG:1 + chr3R 11573713 3' + Idefix 369 2 76.34 AAGCTTAGCGCCATGTGTANTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCTGGAAGGTTAATGGTTTTCATGAT:1 + chrX 22689190 3' - Transpac 4967 2 76.24 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTGAAACGACTCTGCCAAAAAGGACGCACATTGGGTGGCGGTGGAGATAAAAGTTGCCCCACAGCTGAACG:1 - chr3L 14690895 3' - roo 6 2 63.00 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCCCATACTACAGGAAAGTCAAAACAAAACAAGTTAAAGTTTCCATAAAAATATTGGTAATTT:1 - chrX 20282935 3' - 412 25 2 50.52 TATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTTGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCACTGTTTGTATACAATTGACTACA:1 + chrX 2251516 3' - G2 3040 2 73.96 ACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATATGTATATATGCAACAACAAAAAAAAAAGGAGTATTATAAACGCTTCGCATTGTCGATTCGCT:1 - chr3L 16439738 3' + F-element 4637 1 67.33 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTCTTATGTATAAAACTAAAAGAACTTAAGTTACTAAGAAGTTCTTTC:1 + chr2L 1432107 3' - opus 23 2 64.36 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGATTGAGCGCAACTGCGC:1 - chr2R 8232506 3' + P-element 2842 1 25.00 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACGATTTAATGTGGCCATAGTTCTGTCGACG:1 - chr3L 15444839 3' + mdg1 7417 2 69.00 GAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCC:1 + chr3R 5773209 3' + Stalker 7210 4 70.30 AGTCGGGAAACTCGACTCTAGCATTTTCTCTTGTTTTCTATTTTTCTTCAGGCTTTTTTGGGGGTCCGGGGCTTTTGGCAAGTGCAACCAAATTGAAAGCA:1 + chrX 22743318 3' + INE-1 567 1 70.30 AGATCAAAAATAAAAGAGANGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATCAATAGGTTTTTATCTATCTTTAGTAGGA:1 - chrX 16237913 3' + mdg3 5454 2 64.36 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATATTTTTGTGACTGCCAACAGGTTTTCGATGAAAATTCCTGGGGCCAAAGAGCAAGGGTTAGGT:1 - chr3L 19465230 3' - Burdock 3 2 74.00 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAACATCCCACTCCACACAG:2 + chr2R 8707117 3' + flea 249 2 74.26 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGACTGTCATCAGAGGAGAATGTGAGTTGGTAATAAAGCAAG:2 + chr2L 14799177 3' - hopper 31 1 59.41 AAAATTTCAAAAATTCGATATTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAATTAATTATGAACAAAAACATTGCGCATTTATCATCATTCATTCATATTAACT:1 + chrX 13567696 3' - FB 24 1 55.45 GACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATG:1 - chr2R 5582160 3' - Cr1a 434 1 74.26 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGG:1 + chr3R 9613492 3' + invader3 5429 2 57.00 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGGCCCCCACAAATGCCGCTTGCAACAATC:1 - chr2R 13270070 3' - Quasimodo 45 2 69.31 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATATATAGAAATATAAAATTTTTTTTTGTAATATTAG:1 + chr2R 13258749 3' - F-element 57 1 72.28 GGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCACTTCTGTAGCTCATCTGTTATTAAGTTCCCCTGGCGAAAATAGCCGGGGAATTGA:1 - chrX 17493477 3' - Idefix 250 2 63.00 TATGAGCCAGAACGACACTCGCGCCAGCCCCCGAAACATCAGCAAATCCCACAGGCCAAACAACAGCAAAATATTCATGCAAAACAATTGCAAAATCAACA:1 + chr3L 16847326 3' + F-element 191 2 76.24 TAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTATAAATGGAAAAAGGAATCAATCAATGATTGCAAGCTGCATT:1 + chr2R 14541637 3' - roo 406 1 58.42 TTTGAAATAATGGAAGTGGNTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGCATATACTAAGTGATGACTAATAATAAGATTTGTTGGTGTTCCCA:1 - chr2R 8717635 3' - 297 6607 2 57.43 TTTAAATAATAATAACATTAAGACAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCCACAGTTACTCCATAACTTAATTGAACTGTAAAAAATTGGATTAGTTCGAGAAG:1 - chr2R 25133731 3' - 1360 309 1 44.55 TACATTTTTTTTAGTTTAAACCCATCCCGCCCGCTCCTATAACTCCCAGCCACCGTTTAAGGAAAACTTTGCCATAAGAGTGTCGACCCTATGAAA:1 - chr2R 22405211 3' - Dm88 4274 1 56.25 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTTTACCTTTATC:1 + chr2L 12199540 3' - Stalker2 12 2 63.37 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCTCTACTTTGTTCCGTCTCACTGTTTCTCTCTCTAATTCTCTTTCTACAGACTCCGTTC:1 + chrX 21400859 3' + P-element 2872 1 62.38 ACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTACCACTTCCGCGTTGCCCATAGAGTATATGTTCAAATTTGACTGACAGCGCGACAC:1 + chr3L 12882071 3' + diver2 4703 2 53.47 AAAACGCTTCGGACTCGCATGCTGCACAACAACAGTGAACATCAACACACAAACTTCATTGGGCGCCAAGGCCAAATCGAACTGGCCAGCTCAACGTCTGT:1 - chr2L 18031061 3' + gypsy10 453 1 62.38 TTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGATGAAATAAAATAATTTTTAATAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAA:1 + chr3R 12578699 3' - 1360 3252 1 72.00 AAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGATCTGGGGGCGTGGCACTTTGGAGGAAGAAGCGGAGGGTT:1 - chr3R 7931401 3' + hobo 259 1 57.14 AAAAAAAACAAAATAAAAAAATACAAAATAAAATACAGAGAAAAAATCAAGCAGACAGGAAATTCAGATAGGTGGGGATAGGTGGGAAGAGTTGAGTAAAG:1 + chrX 18637973 3' - hopper 143 10 54.46 AAAAACACATTTTTGTAAANAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTATCGCATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTC:1 - chr3R 24074767 3' + hopper 1391 1 55.45 AACGGAGCCCAAAATTGTANGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTACGATGTAGCCATTTATGCGAACAAACACAAGCGCACTTTTA:1 + chr2R 19594669 3' - roo 8696 2 59.41 GTAGCACCCGCACACAAAATTGAAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTACCAGACACACTCTGTTTACAGAGCCAAC:1 - chr3L 5974004 3' - hobo 49 1 64.36 TGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCTGTAAGATTCATTTTTTATATTCAGCTTATGTTTGACTTTAACAAATAGCTTTCTTTAATTTCTCGCACACA:1 + chr3L 16063239 3' + Gypsy6A_LTR 116 1 68.32 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTTAT:1 - chr2R 8385134 3' + hobo 2892 1 72.16 GACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGCGACAAACTTTTTCCAACTGAGCATTAAATACCGGG:1 + chr2L 13517071 3' - G6 1979 1 64.00 AATGCAGATATCTTGCCGANGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATACATAAATATTAATATTCTTGAAACATACATTCAAGTGAGCACCCACAAATTG:1 - chr3R 20791642 3' - pogo 36 1 60.40 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATC:1 + chrX 7534702 3' - Tirant 8144 2 60.40 ATAACTCTGCATTTAATATGACCCTAATTCAGAATCCACAAAGCTAAGCTCAAGCTTCCTAAGGTTTGCCTTTCCAGTGAGCTTTTAACTTTTAACTGCAA:1 - chr2L 8630082 3' - Gypsy12A_LTR 90 1 67.33 ATATATTCGTGTTCATGTGNGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATGTACTTGAGCTCCCCGAGGTCACGAATGCTAACCG:1 + chr3L 7494126 3' - roo 8668 2 75.25 AATAATGTTCGATTATTACCGAACTGATAGAAAAAAAAACATATAAAACCCACTATTTTAATATAAAGAGAAAGGGTTGAAAAACACAGAAAAAGGGGCAG:1 - chr4 408305 3' - Circe 452 1 59.41 TGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCACGGGCTTCGCCTTCTTCACGACCATGATCAATCTGTTCATCTCG:1 + chr3R 12696579 3' - 1731 4600 1 56.44 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCTTTTGCATACTTTTGGGCTTGGTCACATCA:1 - chr3L 5255924 3' + jockey 4955 1 59.41 GAATTTTTTTTTGCAAAATTTTATTTTGCTTCGCGACTTAGAATTGTGTCTGTCTTCTTGTGTTTCCCTTTCATATCCGGAATCCTCCATTATTCGTTGCC:1 + chrX 14572035 3' - HMS-Beagle2 399 1 57.43 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACAGGAAGTGACTTCGCCGAGTTTGCAATAATAAAGTGAACTTAGTGCTCGTTG:1 - chr2R 13358767 3' + roo 9043 1 53.47 GAGCTGTCTCTGGTTCGATTAGGCGTTGTCGTTCGAACCAGCGACAGGCGATGTAAACAATGCCTTATCTTTCTCTGTTTGAGGTCAAAATAACTTGGTGC:1 + chr3L 8986003 3' - gypsy9 4952 1 63.37 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGAAGGATAACATTTAATTTACTTTATTACGGGTTGAGTTTGTGATTAGTCGGAAATCAATTTACATC:1 + chr3R 7272655 3' + hopper 1407 2 69.31 TTTATTATTTTTTTTTTTATTATTTCCTCTGTTTGTAACGAAACGGCCGGAAAAACTTCCGCATGTGTTGATGGGTTAATAAATATTTGAGCACAAACAAA:1 + chrX 5600312 3' - Rt1a 5077 5 69.31 ATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACTAAACTCAGCTCAATTGCCACCGGACAAACAACAAACAACGTGTTTATCTTACGGCTAGGCTA:1 + chr3L 1006448 3' - R2-element 3474 1 67.33 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAATTTCTATATTAATAAATAAATGCGTTGCTTC:1 + chr3L 21912326 3' + Bari1 1667 1 65.35 TTTCGTTTGTTAAATTATTNAAACGCAAAATCAATTTTTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCACTTGCTGCTGCGGCATGACCTGATGATTGACTGTTGGTGC:1 + chr3L 21550411 3' - invader2 405 1 58.42 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACCATCACCAGATGGGTCCCAGGGTCAACTGGTGGCTT:1 + chr3L 6866234 3' + 412 7507 2 64.36 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGTAGTGTT:1 - chr2R 11403951 3' + mdg1 7413 2 69.31 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCACCTGGCAGCTGCCAAAATTGCAAAATTGAAATTGAAATGCGACTGCTGCTTCTGCTGCTGCTGTTGCTCC:2 + chr2L 12536976 3' - hopper 2 2 70.30 TGATTTGATACAGTGCTTANTCGATATGTGTGCACATTACACTAGAAACAAACGAAAAATACCTCAGCCAAAAAAGGCAAATAAAAGCGAATTTTTTCGCA:1 - chr2R 20588753 3' - Tabor 20 2 57.43 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTATTCTGCACACATTGTCATGCATGCAAAAAACAAGATACGAC:1 + chr3R 13685225 3' - Tirant 8108 2 71.01 TTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGAGATTAAATGAAATCTTGAAATAACATTTT:1 + chr2L 15174148 3' - Juan 4064 1 65.93 GCGGTTTGTGGCCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCACACGGAAACAAATTGCTAAACCCAAGTTCTATAGGGTCACGAAGGGTGCTACGTAGATTC:1 - chr3R 20741230 3' - INE-1 221 1 64.36 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACACTGAAATCTAAACATAAATCTCATTCATAAAGTATGCAGACGGCGCGCGTCGCTTTTCAGTTCTCTT:1 - chrX 6075192 3' + P-element 2880 2 70.30 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCAAGGGCATAAAATGAAGATCCAGCTGCGAT:1 - chrX 15268234 3' + roo 9043 1 55.45 AGTGAGGGTAGATACACTACACTATAAAATGACTCACATTTATCACCGACCAAAAAGGGGAAATCCCAAAAATCATGTTTACCTTTATCCAGGTATTTATA:1 + chr2L 12199552 3' - Stalker2 7248 1 75.25 TGCTAGAGGACGATATATTNACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTCTGTGAATGCAGTGGTGGTAGTT:1 - chr3R 20345113 3' - transib2 50 1 75.00 TAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCTCCTCCATGAGGCGCATAAAAATC:1 + chr2L 1284310 3' + roo 8773 2 76.24 TAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATATATACAAATCGATTTTAATTGGAATATGATGAGCCACATTTCTGAGAACTACCTTGAGCAGATAAGATATGA:1 + chr3L 2270615 3' + roo 9066 1 64.36 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACACTAAGCGCACTACCAGCTCTTCATCTCACAGTTCTTCTTTCTTTTC:1 + chr3R 26799013 3' - P-element 26 1 51.00 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGGCATGGGCATCATTGGTCCGGC:1 - chr3R 16613154 3' - 412 54 2 79.21 GTATGCATTTTCGTAGAAATTTCGTGTTGTTTCGGTGTTTTTTTGTTGTTAGCTTATTGTTTGTAGGTGGCAGTGATTAGTTGTTGTTGCGGTTGCTGTTG:1 - chr2R 18319736 3' - pogo 85 1 62.38 GTCGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATCGAAGAAATGTGCAATCATTA:1 - chr2R 7132511 3' - opus 52 4 82.18 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTG:1 - chr3R 14049361 3' - transib2 46 1 71.29 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGAGTCTCTTTCGAGGGCCGGAGAACCACTATATA:1 - chr3R 15537317 3' + P-element 2846 1 38.61 TTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTC:1 - chrX 21056947 3' - Tirant 8160 2 80.20 ACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGCCTTTATTGCCCTTAATCCATTTTGTTTTGCTCTCGTTGCTGCTCAGTTGAACTTTTGCAAATTGGCAA:1 - chr3R 11725545 3' + hobo 2513 1 71.29 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATTTAA:1 + chr2L 15983423 3' - hobo 32 1 60.87 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGCGTGCGGAATTTTAAACAAATATTTACACAGCCGAAACTT:1 + chr3L 771829 3' - roo 8699 2 65.35 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAA:1 - chr3R 4536198 3' - Ivk 44 1 66.34 ATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAACAGGGCAAAGCCGAGCACATTGTAATCTCTGGACATGATGGTGGTACCG:1 - chr3L 16792541 3' - Chimpo 4032 1 50.50 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGGTTATCCGGTATCATCATTAACC:1 - chr2L 4650447 3' - roo 53 2 76.24 GGAGTTTATTTGGTCTCCCAATGGGAAAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCCACATCCTTAGCCCTAATTAAGCAGTTTTTCCGCCACACATGTCCAGG:1 + chr2L 7769195 3' - G5A 2577 1 52.48 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGATAACTGGAACCCAATACGAAATCAACCGCAGAAACCTCAAGCAAAATGACTTTCGTTTTGGCCAAG:1 + chr2L 8913403 3' - mdg1 8 2 68.37 ACAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATTGGTTTCCGATTCGTTTCGGTCGTCATAAATTGTGGCACCTAATAAATTGACACTCTG:1 + chr3L 1046329 3' - Cr1a 4157 1 64.36 TTACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCCCATCGCATCTCAGCATC:1 - chrX 6611729 3' + Tc3 1629 1 75.00 AAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGACCTTATCATCATTCCCCTTATGCACCTTTTCCACCTTTCCTAAAGG:1 - chr3R 19447990 3' + Quasimodo 349 2 53.47 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTATATGTTTGTGTAGGCTCACGTATGCCCCTGAATGTGT:1 - chr2L 15848227 3' - hopper 34 1 58.42 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTATAATAAAATTGACCAAACAATA:1 - chr3R 15096551 3' + pogo 2052 1 79.21 TTATTTATTTATTTATTGTTGCAAAATGTTGAAAATGTCGAAGCATTCAGCTGAAAAATACTCCTCTTTTTGTTTGTTTGTAATTTTAAAATGCTGTTAAC:1 - chrX 7803330 3' - Juan 4213 1 73.27 CTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGCTCAACGTAGCTGACATTTAAGCAATTCCAAACGTTTTGCTAACAAATTTTACGGCAG:1 + chr2R 20200047 3' - R1A1-element 208 1 62.63 GGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAGCAACAAGGAGGCTACCAATGGCATGATGACTCGCCTCAATGACTGCGTAT:1 - chr2L 1585706 3' + Circe 7175 1 55.45 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACATTGTAAAATAGTTTAAATTAATATTCTGTGCCTCTAAACTACACGTCCAG:1 + chr3R 17415315 3' - roo 16 2 52.69 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCCGAATGTTACGAGTTTATACTCGTA:1 + chr3L 13072020 3' + roo 358 2 76.24 AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGTTGGCCGATTCTAAATATCAGGCAAGGCGATTGCAAGTAGCCAGTA:3 + chr3R 9613516 3' + invader3 266 2 67.33 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCCAGCTCAGTAGGTTTTTTTTGTTTTTCCGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 29158141 3' - P-element 37 1 40.59 TTTCCCTTATATATATATGNACATTTCATTAGCCATGGGTTTGTGGAAACGTATTTTCACACCAAATACTGCAAAACGAACTACAAGCCAAGTAGTGCATA:1 + chr2L 4378791 3' - Juan 4189 1 67.33 TTTTTTTTTTTAAGTTGGCTTTAAAAGGGTACATTTTAATGGCAAATGCAAAACTGTTTCTCCCACAAATGCTTTTTAATGCTTCGCTGCGTTTTTCTAG:1 + chr3L 8004072 3' - gypsy2 424 1 83.00 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGTTCGATGAATTTGGCTGTAACAGATTTTACTTGCCGAAATGTAGTAAAT:1 - chr3L 153577 3' - 1360 27 1 53.47 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTTATTAACTGACCTTCGATAATGAAATCATGATGAT:1 - chr3R 14708688 3' - roo 8669 2 75.25 TGCCGTCTTGACCAGCAAGACGGTAATCATGCTGCTGGGTGAGGCATCTGCCCCCGCGTCTTGACGATCTACCTCATCCTCTAGGCTGCTTTGACTTCTAG:1 - chr3L 20775158 3' + R1-2 2797 1 69.31 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAATAAAAAAAAAAATGAAACGATAACAAATTATTAAAAGTAGTGACTTTAA:1 - chrX 13429433 3' + jockey 4967 1 61.39 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTCTAAGCATAATTTAGATGTCACATCGGTGCCGCT:2 + chr2L 9471261 3' - roo 8706 2 66.34 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGT:1 + chr3L 17708305 3' - jockey 4786 1 51.49 TGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTGTGTGTTATTAATAGGTACGGAATGAATTAATTTGTTAACTGA:1 + chr3L 27383291 3' + R1A1-element 24 1 60.40 AGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTATAAACACCCAAGGAAAGCTCTCTGGGCTGAAATCCTTTGGCTTTGCCTAAGCTCTGGAAATGAGATAAAGCG:1 + chr3R 25844396 3' - Stalker4 5 4 69.31 GATTCCACCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTATAACGTGTAATTAAATTTATATATAAATTTCTATTAG:1 + chr3L 20490724 3' - FB 36 1 67.33 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCATTCTACTATATCACAAACAC:2 + chr3R 20284806 3' - pogo 26 1 56.44 AAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCCCCAAAACTGCGCACCTTAGATTTT:1 + chrX 9631602 3' - P-element 320 1 28.00 TTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTCGATAGTTATAGATTTTCCTCTTTGTTTTTTTCTTTTTTTGTTTAGCTGCACT:1 + chr3L 3964573 3' - F-element 4419 1 57.43 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGGCAGGGTTCCGTTTAGGCG:1 + chr3R 18171850 3' - 1360 20 1 60.40 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTTCTAAAAAAAAATAAATTTTTTTTAATGAAAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTAA:1 - chr3L 25782377 3' - Doc 23 1 53.54 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTACATATGTATATTTCTACTTGCAACAGCAACGCCAACTGCGA:2 + chrX 2164325 3' - mdg1 7072 2 59.41 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGGCCGCGTTTTTACCAGCAATGTACAACGTACAACGCTGCGTATGC:1 + chrX 11025596 3' + hopper 1409 2 72.73 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTTTCCTTAAGCTAGAACTCGATATATTTCGATGATATTGAACAAAGT:1 - chr2L 2416732 3' - 3S18 5797 2 52.48 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGGTATATGTTGGATCTGAATTACTTTTATACTCGGCATCACTCTCTACCGCGTCGGCGTA:1 + chr2L 22490464 3' + flea 4999 2 67.33 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGAAAATAGGGAGGAAAAACAAAAATTCTTAACGAAAATAACTACGTAAA:1 + chr3R 29465662 3' - 412 27 2 52.00 TGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGAATAAGACGACACCAACAAAAAACTGGAGCAAAATCGG:1 - chr3L 6340874 3' + BS 4800 1 75.25 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGAGAGCGAAGACTCCGCCTATCGGATTCGGAAATGCCCGTTCGGGGGGTATAAAAGCGGGCGCTCTGAGCG:1 + chr3L 749374 3' + P-element 2882 2 74.00 GTGGGAGAGCGAAAGAGTGAGAGCGAAACGTGGAGTTTATGTGCATGCAAAAAACACGGATTAGGCGAAACAGAGCGAGAAACGTCAAAACAAAAGGTTAG:1 + chr2L 6668871 3' - Cr1a 301 1 55.45 GCTCCAACGTGGAGCTATGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCATTTGGGGGCGCTAATCTGATGATGCAAAACACGTGCAAAGCAGAATAAAAAAGATAACT:1 - chr2L 21396782 3' + G5 4375 1 65.35 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATTGTTTTTGTCGACTTCCTAGAGTGTCCTGCAAATGTTTATTATGCACTTGA:1 - chr2R 6041549 3' - opus 20 2 59.41 CTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAAGGACAATCTAAAAATAGCAAACCTGGCCTCGTGGGTAACAACAATCCACAGCAGACCCCGAACTTCCGC:1 + chr3L 1567440 3' + TAHRE 10419 2 49.50 GTCTTTTAAATTTCTATCGACTTGCCACGCCCACCCCTGGGTTTCCCTTCCCTTCCCTTCGCTGCCCTATCCATCGTTTTATTCTGCTTTCTCCTTTCTCC:1 - chr2L 20612088 3' + INE-1 301 1 71.29 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGAAATGCAATTTTTAATAATCTATTATAATCTTTCGCGTTAATT:1 - chr2L 21372939 3' - roo 8695 2 60.40 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAGTTTCGGAATGCAATTTTCAAATGTGCTAAA:1 - chr3L 9763196 3' - jockey 4721 1 68.32 TGAACGGAGCCCAAAATTGNAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAATTTATTAAACCCTTAAAACCCTAACGTACTTCCCTTATTAA:1 - chr3R 14708717 3' - roo 8698 2 67.33 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCGGTTATCCGGTATCATCATTAACCGGAGGCAAACGCCCGCTTTCACGC:1 - chr2L 4650423 3' - roo 28 2 52.00 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGNGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACAGCCTCCGAAGAGCTAAAAGCCCAACATTTACAACAATTCGTTAGAGCACCTACTT:1 + chr2L 13433983 3' - hobo 19 1 60.40 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTCGTATAGTAGCATACACTCGTACACACGCTATCAACTACATCATCATACACACAC:2 - chr3R 19270327 3' - pogo 18 1 57.43 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGGAAATGCAAACTTTGCCACCCACTTGATATGTTAAATCTGCGTAGATTTATCAACT:1 + chr2L 20609982 3' - copia 20 2 64.36 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCAAAATTACACG:1 - chr3L 10560238 3' - pogo 29 1 61.39 TATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAAATGCATATACAAGATATAACGTATTTTAAGAACGAAGTTCAAGG:1 + chr3R 19931682 3' - jockey 4700 1 53.47 AAGCTTGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGGATCGATTTCAATAACCAAATTTATTTAAAAACTGGAATCTGATGAAGAGCAAATCCAGGA:1 - chr3L 22537399 3' + Idefix 7077 2 62.37 TAACACATATTTACATGTGTTAAAAATAAAAATAAACAAGTGAAAACAATAAGCACAACTACAACAAATAATACTTCATACACCAATATGCAAAAGAAAAT:1 - chr2R 4270234 3' + Porto1 114 1 58.42 AGTGTATACTTCGGTAAGCNTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCGGAGAGTGAGTGAGTGCATAACCACCCCAAATCCAATG:1 + chr2R 8232540 3' - P-element 38 1 41.58 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCG:1 + chrX 7534703 3' - Tirant 36 2 61.39 AACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATTCATTCCCATTTCGGTTGGGCTTTCACTTGAGTTTTGATGGGG:1 - chr2R 8518235 3' + invader1 370 2 60.00 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAGGGCAATTTGATGGCCAAGCGGGGGCGACTCGTCGGAAAAACAACACCGAAGTGGGGCACATTT:1 + chr2L 1335371 3' - jockey 4687 1 63.37 GAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAAAACGTCACTATATATATCTTACTAAGTCGGGTTATAAATAAATATAAAGAAA:1 - chr2R 16979742 3' - 297 6604 2 62.07 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAATTACACCGAGCTGGGGCAAAGAAA:1 - chr3L 10683459 3' + opus 449 2 75.25 GCTTCGCGTAAGCCCAAAANCCGTATAATCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAGGAATGGCTGGTGAAGAAACTGACTGTGGAG:1 - chr3R 4133956 3' + I-element 55 1 65.31 TGCAGCTCTCTAGCTTTATTATTTGACTTTACGCCAAAAAAAAATCTTAAATAGTGAAGCATTAGCAAATAGTCATAGCACACCAACTTTCATGCGATTTT:1 - chr2R 9184966 3' + transib3 2822 1 70.30 TTTGTTTTTATTTTTATTATTTTGTTTATTTATTTTTTAGCACACCAAGCGTACCTTCCACGACGCCCAAAACAAAGTGCGCCGTCAGGAATCTGGTTACT:1 + chr2R 19361436 3' - BS 5098 3 66.34 TGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTTGGGTAATTCTCTTGCTGAAGCCAATATATGTACATTTTCCATCCCCAATTTTTCAG:1 + chr2L 21911721 3' + Tc1 1594 1 59.41 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAATCGCCTCCAACTGGCTACCA:1 + chr3L 11929317 3' - copia 4922 2 79.21 AACTCCTCCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGTTGTTGTTGTTGTGGCCGCCGCCTCCTGACTTCTG:1 + chr2R 22246984 3' + G-element 3876 1 65.35 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAGCTATACAATTTATATACTCGAACACAACACCTTGTTGGTTTAT:1 - chr2L 14038392 3' - 3S18 5798 2 57.43 AAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCGTAAATTAAAGCCCCAAACAGAGATTAGATCATGGCTGAGGATCCGGTGAACCAGCAGGCATTCGCTG:1 - chr2R 11295776 3' + Doc3-element 4568 1 74.26 CCACGCAGTATGTGTGAATNTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCTTGTATCTTTTCGTTTATTTTCTTGCACTTCGTCTTTTTTCATTAAATAAA:1 - chr3R 9036897 3' - accord 7046 2 58.42 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCGGCACTTAAAGGATATTTATGCTGCAATGCCGATCGCGCAGATGG:1 + chr2L 4650494 3' + roo 9039 1 56.44 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAAATGTTGTAAATGTGGCGGAGGTAAGCCTCCTCCGCTGTGTCGTTCAGTCAAGATTT:1 - chrX 21499238 3' - Quasimodo 18 2 66.34 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTGTTTCTTGGATGGTGAGCATCTGCAGGAGACCGAGTGTCACAGTGGCAAAGAGATGGACCCTT:1 + chr3R 16613222 3' + 412 482 2 67.33 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTAGACTTTAAATGCGTTGAGACGGGCAGCAATT:1 + chr2L 15983420 3' - hobo 44 1 67.33 AAGACAACAACAACCACACACACAATCCCAGGAATAAATACCGAGCAAAAGGACGAAAAATTCCGGCTGTGGCTGGCACTCAAGTGTGAGGACAAACAAAT:1 - chr3R 22236397 3' - transib4 327 1 50.50 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGCACCTAAGTATCGTATAACTGCAACTTTTAGTGCAATCAGTTAATGAATAAACGTAATCAAGCTCTTTAA:1 + chrX 8983016 3' - 412 5 2 72.28 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCCTAAAAGTGTTCTTAGAGTTATAT:1 + chr3R 5993168 3' + pogo 2052 1 77.23 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCTAATCTAATGGCACTCAATAATTTTATATCTTTAT:1 - chr2R 16680130 3' - 412 7093 2 68.69 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGCCAAAAATTAAAAGCTCGCTTACTTCGCACGAG:1 - chr3R 22469150 3' + hobo 2938 1 65.62 ATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTAATCAACAGATGGCCTGGCCTTATGCCTCCCCTATGGGGGTTGTGAGACTAAACGAACCCAAGGAGAACCTTCGAA:1 + chr2L 11064629 3' + Quasimodo 6912 2 73.27 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGACAGCGGCAGTGGCAGTAACC:1 - chr2R 13194623 3' - roo 8698 2 61.39 TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTAGACGCTGTGAAGTACATTGAGTACTTTCCGTTTGAATTC:1 + chr3L 13739633 3' - BS 5035 1 65.35 TGGACCTATGGCGCACAGCTATGGGGCAACACAAGCATCAGCAATATTGACATCAAACAGCGAGCACAAACTCAGATACATAATGGATTTATTAGAAATGA:1 - chr2R 18434539 3' + F-element 4265 2 70.30 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCTCCTGATTCTACTGCTGCTTCCTTGCTGTCCAAAATGAATGACTCGCCAGCGGGCCAAG:1 - chr3L 5977032 3' + hobo 2895 1 60.40 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGACCAAAGAGCGTAACCGAAAGCTGGCTAAAGAGCCGCAACAACTTTTGCAAATCAATATT:1 + chr3R 7411891 3' + 1360 3376 1 69.70 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAATATAAGCATATGATCGTATATGCAGTTAAAAAATGATCTTTGGAAATCATATG:1 + chr3R 29157580 3' + pogo 2083 1 61.39 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTAGCTGGGGCATGTTC:1 - chr3R 12937436 3' + roo 9026 1 74.26 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTGAGAAACACACACGCACAGCTATCAGCACTTGTGCACTTTGCATGTTTAGCGCTGCAATGCTGGCTACA:1 - chr3R 24484718 3' - roo 8670 2 72.00 TTTTAAAGCTGTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTATCTACCGTTTACACATTTATATTTATCCCGGCAAATGGTGGAGAAAGGGGGAAAG:1 + chrX 4233153 3' - 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Doc 31 1 53.47 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGCCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAG:1 + chr2L 9319120 3' - jockey 26 1 56.44 TAGAATTCTAGTGTCTTTGGTTTCATGGCTCAATCGCGCACCGATCCGAACAAGAAAATTGCCTTCATGTATCGCGGCATGACGCCCGAAGAAC:1 + chr3L 11830322 3' + Tc3 313 1 71.28 ACAGTTGAGGCCCGGGCTGNTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAAAATAGCCGAAATATATCCTCTTTTTGGGCAGCAGTTGTGTTG:1 - chr3L 21914171 3' + Bari1 400 1 72.28 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTCCGAATTTCGGGTGTGTTAAAACACTTCTGCAATGCTAACAGAGCTCTGTAA:1 + chr3L 12266838 3' - P-element 22 1 58.42 ATTTTTGAAAATTTTTTTATTTTTTTTTTTATGCCATTTACGCAAATTACGTTTGACCTAGAGCGAAAGCATTCCATTTGTATTAAATTGATTGCGTTTAT:1 + chr2R 8858776 3' + 1360 3091 1 72.28 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACAATGTAATAGGGTGCGCTATTTCGCCAGGATTTCTCTATGA:1 - chrX 6058177 3' + roo 9036 1 60.82 AAGAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAACAGCACAAAAATGTCCAAAAGAAGCACCTTAATCAGTTCAGGGAACAAAAGGAGCTGGAGTTTTGCAGGCAGTTT:1 - chr2L 3959513 3' + Doc2-element 226 2 40.59 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACCGATGTCCGTATTTTCCCA:1 - chr3L 771735 3' + roo 404 1 71.29 ATAAGCGTCAGCTTCTGCGGAGAATAAAGTGAAAAGCGGTTGAATCGAAAAATGTCTAATTGGCATATCAGTTGTGCTTTTTTGCTCACCGTCGAGCGATT:2 - chr3R 13348492 3' - X-element 4539 1 60.40 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATCAGCCAGTATTGCCAGCAGTGCTGTCAGAGGTCGATGGACATTTGGCCATAAAGCCAATAAATG:2 - chr2R 15201468 3' - P-element 9 2 68.32 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCAACATGTTTACTTAGTAGCTGTGTCA:1 - chr3R 28475794 3' - roo 8685 2 58.42 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTTATGTAGCATGCT:1 - chr2R 8385124 3' + hobo 2909 1 58.89 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATATTTTTTTGTTCCCCACTTCGTTCGTC:1 - chrX 4422626 3' + jockey 4945 1 71.29 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCTCTGAGTTAAGCGATTCCAGGCAGTAGT:1 - chr2R 11403954 3' + mdg1 372 2 72.28 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTATGGCCGAAAGTGCTCAGGTTCGTTTC:1 - chr2R 22898741 3' - Transpac 46 2 71.29 TTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGGTGGAGAGAGATGGAGAATGAACCTTAAAAGCCTCGAAGAGA:1 + chr2R 8288378 3' + F-element 70 1 58.42 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAATAGACAAAATAAAAATAAACCCTGGGCACCAAAAGCGAAAAAAAAG:1 + chr3L 19565007 3' + BS 5050 1 67.00 ATCCTACCGGCTGCGCCAGNTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:1 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 57.43 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACATAAGCAAAGCAATGGAATTTTAAAATGAATATGAAATGTACT:1 + chrX 16237964 3' - mdg3 5290 2 56.44 TTAACAATAAATTTTTGGAAATTTTCCACTCCGCAGCTGTGCCCACTGCCCCCCCTCCCTTTTCGTGCGTTCTTCACACTTTCTGGCGTCTCTTATTAAGC:1 + chrX 17741872 3' + R1A1-element 144 1 70.30 TATAATCATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTTTAGTGAATCTACTTGGAAGCGACTTGCAACGCATCCAAATCAATTGTCCAAATCACTTACAGAAGTGA:1 - chr2R 5284640 3' - Cr1a 4139 1 54.46 ATTTTTGTTAAATAGAATGTGTAGATAGGGAAAAAAGAAAATTCCGTTAGTTTTTCATGTTATCCTTTGTTTCCGGTTTCATTTTGTTAATTTTACAACAT:1 - chr3R 26048983 3' + HB 101 1 69.31 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTCATGGATTGCAAAAAG:1 - chr3L 95868 3' + roo 9035 1 63.37 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTGGCTGGGGCATGTTCTGCGGGCCTTTTCCGGTTTCTATTTACC:1 - chr3R 12937408 3' + roo 391 2 57.43 AAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGAAATTAAAAA:2 - chr3R 12055781 3' + P-element 146 1 19.80 TGTGTGTATATGTGTGTGTGGGGCTTAGAGATGTCAATATTATTTGGGGAAATGGCCAACGAATGATTAATTTGCTAAAATCGTCTTGCATTGTTATA:1 + chrX 14381513 3' - accord 7036 2 67.35 AGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCATTCGCTTTGATTCGGCACTCGA:1 + chr2R 11936393 3' - Doc2-element 4428 1 77.23 GCTGTTCGCTGTAGCACTCTCCGCTCTCTCGCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' - 1360 121 1 69.31 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCAGCATTTGCCGCACTTCCAGCGACACTTCCAGCAGCATTTGCA:1 - chr3R 30252278 3' + 412 7515 2 56.44 GAAAGAGAGCAATTTCGGCCGTCACCAAAGAAAAGCAATGGGTTCTTATTCTAGCTGTTTATTCTATTGTTCTGTTTACAACTCCTTCGGAGATCTCGCTG:1 - chr2L 23197820 3' + 1360 3316 1 71.29 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATGAGCTTTGTGAGCATTCAAACAGTAAGAAATCCAA:1 - chr3L 10560247 3' - pogo 38 1 70.30 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAGGCTGTGTAATTGAAGCCGACTTGAAAGTGTTGCCCAGGCTTAGTGACGA:1 + chr2L 13732818 3' - Doc 29 1 51.52 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATCTTTGCGGGGTAAAAGAACTTGTCCATAATTACACATATAAAATATTTTTCTTATT:1 - chr3R 27082975 3' - jockey 4690 1 57.43 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTACATAGACCCGCATTACGAGCATTT:1 + chr3R 28628115 3' + 1360 3339 1 75.25 AAATCGATCTAGATCGGATTGTAAGTCCAAATGGCACGAAGTGTCCTTGCACTGGAAACATAAACAATAAAACAAGTCTACTGGCAAGTTGCCTCCCACC:1 - chr3R 8049048 3' - Q-element 636 1 54.00 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACATTTAATAAAAAAGTTGTTATTAGTAAACG:1 - chr3R 26123030 3' + roo 357 2 76.24 GTGAATACCTTGCAGGAAGGAAGTAGAGCGAGAGGGAGAAGAAATTATCACAAGCTTTGAAGAAAAGATCTAGGTAATTAATCTGAGTTGCAAACATATAA:1 - chr3L 23722311 3' - Max-element 8359 1 70.30 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTTTACGAATTTCACCCACAAAGAAAGTTAGTTTATTGTCACTCTGTGCCATCTTTTTGCTCCCTTTAAGTT:1 - chr3R 18769549 3' - roo 8669 2 70.30 AAATAAATAAAATAAAAGCAAAGTCGAAAAAATCAGACACCGCGTAATTTCAATGGAAAACAACAGAACGGTATGCACAAAATTTCATTACATATTCTTTG:1 + chr2R 18327764 3' + HeT-A 318 1 59.41 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGCGGCTAAACAAGTTTTTCGTTTTTGAGAGCGCGAGTAAGCGGATATTTCGGGAGAGGTCTTTGGGACTGGG:1 - chr3R 25208300 3' + P-element 2881 2 75.25 GCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTCACACACTAAACCACTCGCACAACCGAAGGCGTGTGTGCATGTATGCAATTTTTTGGGGTGGTATT:1 - chr3R 13685128 3' + Tirant 8500 2 73.27 AGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGAGGATGTTGAGAGTCCCCTAAATTTTCGATCACTTGGCGAGTAAACTGAAATAACAAA:1 + chr3L 24821398 3' + Cr1a 4022 1 63.37 TTACATAAGATATGAACGGNGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGACATAATAAAAAATAAAAAGTTTAGCCTC:1 - chr3R 13544090 3' - roo 46 2 74.26 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCGATCGAACTAATGAGATCCCAGCACATCCTTTCCAGATTTGTC:1 + chrX 5997308 3' - 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chr2R 17123578 3' + mdg1 7413 2 75.00 GATGTGTTTACTCAAAACTGTAAATCAATTGATATGATTAAAAATCAAAAGTAATAGCTACCTTAAATGATGCCTTCTGAACTTTACTTTGGCAAT:1 - chr3L 21701518 3' + transib3 455 1 79.17 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTTGTGTCGAACGCGGATTTCAGACGAGCGGTGGCCGAGAAAGAGAAGAAGAAGTGATTTGAGC:1 - chr2R 7735558 3' - 412 7122 2 60.40 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACACAGTGCGGCG:1 + chrX 7534735 3' - Tirant 8111 2 75.25 GCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGTAAAATTGTAAAATTGCAAAATTGACAGCGAGTGCGCCATAATTCTGTAGCATACTTTCTAGCGCGCGTTTTGAGCGA:1 - chr2R 23441689 3' - jockey 4668 1 77.23 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTGAATATAGTTTCGATTTTATAAAGCACGAAGCCATCGAAATAAAATC:1 - chr2L 4110944 3' - Doc 31 1 52.48 TGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAAATATGACCAAAGCAAAGAAACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGTGGGATGTACATATGTACATAAAAAACTT:1 + chr2L 7798964 3' + 1360 471 1 70.30 GGCAGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCGTAATC:1 - 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baggins 5179 1 55.00 GGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGGTGGGGGGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTGTTTTTTTTGGGGTATTAGCGTTGTCAC:1 - chr3R 18362035 3' - F-element 4495 1 66.34 ACTCCTTCTCAATGCAATATGTCAACCCTTACGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATTAAAACTACATTTTAAACCATATTTTTTCACAAATTAATT:1 - chr3R 9246671 3' - Dm88 4340 1 70.30 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTCCAAATCATATTGGCTTAAAGTGCTGATCTCTGGAAAATTCATGAACAACA:1 + chr2R 8707102 3' + flea 234 2 59.41 TATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCAAACCAGCTGAGTAACGGGTATTTGTTAGTCGAAGAACTGCAATTTTTGCCCAAACTTTCTTAG:1 - chr3L 19390100 3' + INE-1 509 1 63.37 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTACCCATATTCTGTTGCTTCCCCCTAAACTGTCCGCCTAACTGAATGTCCTTTCATTAGGG:1 - chr3R 9085019 3' + mdg3 5484 2 62.38 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCGCCATTTCTATCAGCAGCCAC:1 + chr3R 8705323 3' - jockey 63 1 78.22 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTCGTAGGTGATTAAATTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATT:1 + chr3L 23746964 3' + roo 9037 1 56.44 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACGAAGACTAATTTACTAGAATACATTCGATTGTGCATATACATTCGAATGGAATTTTACAAACGTATTGT:1 - 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Doc 47 1 71.29 GCTCAAGGCACTCACGCTGNTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCATTCAATTTCACTGCATTGCATAAACTC:1 + chr2R 14321178 3' - R1A1-element 396 1 72.28 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTAAGCGGGATTACACTGAAAAAAAAATAATATTTTTTACTATAATAACCAGCA:1 + chr3L 7966849 3' - jockey 32 1 54.46 ACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAAGAATTATGTATCACTTCGTTACGA:1 - chr2R 13659041 3' - Ivk 51 1 74.26 ACACAATAAACAATATATTAATAACAACAATAACAAAACGCAACAACAATAAGCAGCGACGCGACGTTGACCGCGGACAAATCGTATCGTTAAGCGATAAC:1 - chrX 620129 3' + hopper 1106 1 81.19 ATAGAATTTGCTTGCTTGTGATAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACTTACCATATCGCGATGCTCCACTTCA:1 - chr2R 21304255 3' - 1360 3259 1 74.26 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCGGCCACCTGACAGCAACTTTCCTTGGCCGTTCCGATTTCACCG:1 - chr3R 9870349 3' - F-element 42 1 54.55 TTTATTTTTTTGTTTTTCCTTTACTTTACTTAGCAATTTGTTTGTTTTTTTGCTTATTTTTATTGCTTTGCGCCGCTTCCAAAAAGAAAACTCCCAACGCA:1 - chrX 15611581 3' - 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chr2L 21628851 3' - P-element 16 1 63.37 TACAAAATATTTTCCATTTTTCGCTGGCGCACAAATCACACACAAAAAATGCCATCGTGAAAGTTCTGTCCGCCTGGCTAGCCCAGGAGACAACGGCCATG:1 + chr3R 6469845 3' + Cr1a 180 1 52.48 TTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGGCCACAGACGGTACTGATGCCGCTTCTTGCTCCAGTTCCTGCTCT:1 - chrX 19902856 3' - opus 372 2 56.44 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTACAGTGGTGGCACACAGTGGTGGCACACTGGGACAGATTACATGCATGGAAAC:1 - chr2R 19557968 3' - 412 7074 2 58.42 TGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAAACAATTACTTAGGAAAACTGAAAAAAAAAACAATAATACAGCACTTAGCACTTAAA:1 - chr3R 14350775 3' + Porto1 4371 1 56.44 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAACTTGGTCGTAGCCATGTCGTAGCATACATTTTAGGG:1 + chr3R 18171832 3' - 1360 27 1 61.11 GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTATTCACAATCCGATTCACCATTGAC:1 + chr3L 4570901 3' + Quasimodo 7324 2 75.25 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGGCAGCA:1 + chr3L 3428069 3' + roo 9040 1 59.41 GCGAACGACAGACCGCGTTGTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTGATGCAGCTGTGCCGCGCGAACTCCGACCAGGCCACCCTATGCTCTCCGTAC:1 + chr3L 21677750 3' + Doc 366 1 56.00 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATTCTAGT:1 + chr3R 18549969 3' - pogo 39 1 73.47 TAATTAAAGAAGATTATTAAAATAATGTTAATTGCAAGAAAAGAAAATTTGATTTTCGCAAGTAGTAGTCCATAAAAAAAGCAAGTGCATTATATTAAACA:1 - chr3L 7433181 3' - Cr1a 75 1 68.32 AAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chrX 10664377 3' - Juan 4158 1 59.41 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATG:1 + chr2R 18105821 3' - roo 29 2 55.45 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAACGACCCTCTTCCACACGCCATTGCCTGGTTCGACGCGAGTGCAAAAACGAATTTTAC:1 + chr3L 153661 3' + 1360 3369 1 59.41 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCTCTCTCTGATTTTGGCCGTTGTAAGTGAAGTTTTTCCAGTTACTTTTTTCGGACATGCGTGTAG:1 - chr2L 20609883 3' + copia 242 1 59.41 ATTCTTATTATTATTATTATTATTCAAGCTTAGTGTTTTATCCAATTATCTCAAAGATCTCTTACATTTTCTGTAACAAAAAATCAAGTTTTTGTTAGTAT:1 + chr3L 8959601 3' - mdg1 7077 12 74.26 ATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTACATACATAGAATGTATACATATTGAACGTATTAATTAAAAC:1 + chr2R 8642951 3' - Doc2-element 4735 1 59.41 ATCCGTTTGTCCGTATGAACTTTAAAAGCCAACATTTGGATATTTAACATTCAGATTCAAAGGCACAGAGACGCAGGTTTAAGTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr2L 9473036 3' + INE-1 125 1 39.60 AAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACT:1 + chr2R 5531178 3' - 1360 83 1 56.44 TATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCTTGGCTGGATCGATGGGAACTAAATGGTTCTAAGGCA:1 - chrX 14753259 3' + hopper 357 1 69.31 TTTATGTGCATGCAAAAAACAACCACAAAAACAGCAGAGCAAATGAGAAATACCTAGTAAACGGCCACGGTGGCGTATGCGTAATAATTACAGTAG:1 + chrX 9587993 3' - Cr1a 258 1 81.25 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTCAGCTAATTAAAATTTCAGTATTAAATGCATTTGTTTTCGAAGGCATGTTGGCAGTCTGAA:1 - chr2R 11941203 3' - Doc 36 1 45.54 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACTACGTAGTAACTGAACACAATAATAAAAATAAAACGAAACGAGGTGAGTGCCAACAGT:1 + chrX 8973030 3' + flea 242 2 67.33 TGATGCAGTCATTTAGACTCCTGGAGGAACCCCCCAAACCCAAAATTCGCAAAACCCAACCCTTGGCTGTCTCGTTTCGAGACCCTTGACAAGCTGCCAGG:1 + chr3L 10826651 3' + G7 94 1 68.32 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTAACCGTAGAAGCAACAGCCATAAAGTCCGGCTGATTGCAAACAATTCCGATT:1 + chr3R 22494776 3' - 1360 24 1 56.44 CATTCACACACACACACACACACACACACACCAACGCACGTGCACCCATACCAGCGCAAAAGTCTGGCCATATGTCAGGGCTTCAAATAAATATCATAAAT:1 + chr3R 27855933 3' + accord 7026 2 59.41 GGACTTGTGTTCTTAATAAGAGTTCATCATTACAAATCCTTCAAAGGCTACACATTTAATGGCATTTTGACGCTGCCGCCGCTGATAATGATGTTGTCGTA:1 - chr3L 6084341 3' + 412 481 2 65.35 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCAAAGAATACTTTATTAGTGTGACACTATGGTAACATTTTTAAACATAAAACCAAGAAAAAATTACGAA:1 - chr3R 14601767 3' + roo 402 1 72.28 ACAAATAAATCGAAAGCGAAAGTGACGCTCTGTGCGATGCACCATCCCCAATCCCATTCCCATCGGCAGCCACGGAATTAGCCTCGTCCTGACAGTGGATT:1 - chrX 14532156 3' + Doc2-element 97 1 59.41 GCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTCAAAAAACTGTAAATTATCACCTGGACCACTTATGT:1 + chrX 8979148 3' + 412 294 2 75.26 GTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATAACGAAAGTGGTGGTTGGCCCCATGGTGCAGCGTGAAAAGCTGCGAC:1 - chr2L 17547770 3' - mdg1 7131 2 54.00 TACTCACACACACACACACACACACAGACTGGGCTCTTGACTGACCGCGGCCACGTCCCTTCATCCCTCCCTCCCAAGAATCCCTCACTAAGTATCCGGCT:1 + chr3R 13022632 3' + Quasimodo 34 2 52.48 ATCGATCGTTCTAAAAAGAGCCAACGCGAATTGCGCTCTCAACGGCAAAAAGACCAAGACAAGCGCCGACTCTCAGCCGTTCACTGTCCCTTGACAGTGTG:1 - chr3R 8296978 3' + Doc3-element 206 1 73.27 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTAGAGAATCCATTTTGCTTTTGCACATAAACAATTCTTTGCCAACTTTCTATAATGGTGTCTTACGAAA:1 - chr2L 7461038 3' - roo 9 2 69.31 AATAAAACAACAATTTTACTATATATATGAATATTATGTTCTATTTAATTTCCACTTACCCGACCGATTATTGTTCAGTCTTTCACCATTGCTGTTTGCA:1 + chrX 11993811 3' + 297 395 1 77.00 ATTAATAATAAACAATAATAATAACCAATCTTACATACATTTCCAATATCGAGTCAACCCTTAGCCATTCAGATATATTGTTAACAACATTTGTGAAATAA:1 + chr2L 22052577 3' + flea 241 2 66.34 TTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAACCTCTGAGCACGGCACACAAAGCTTGGCGACGAGCGGTACCACCACTAAATCCACTATTAC:1 - chr2R 5971716 3' + Tirant 283 2 69.31 GCATCGCGGAGAACAATTTATAATTTTATTAATCGCGCAACGGCACTCTGGCAAATCCTGCATCTAACAGGAACGGCCAATTCGACGAGATTAACGTAATT:1 + chr2R 4955662 3' + S2 499 1 64.36 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGTAACAACAAGTTGGCCAACATGGCGGCTGTGTCATTTCC:1 + chr3R 20345160 3' + transib2 2789 1 62.38 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTAAATGTTGTTAAATGAAAAATCTAGTCTTACAACTTTCTCAGAATTGGCAACTATCAA:1 - chr3R 20872692 3' + copia 239 1 61.39 TGTATACTTACTTGCATTTATAAACTAATAGAAAATTCTTTCAAAAGTTGTCTCCCGAATAACCCGAATAAGTTGTATTCGGATAACCGAATAATATATTA:1 - chrX 21049546 3' - Stalker 259 4 69.31 CACACACACACACCTATACACACATACATGTGGAGCAAGTGTGCCATAAAGCGGCGTGTGAAGTTTTCCCAGTGGTCAGTTCTTGGGGAAGACCAACACCC:1 + chrX 15546323 3' + accord 188 2 71.29 AAAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCGAGGAATTCATGAAGGAGGAGATGCTGGACGAGGAGTTCCAGTTCAGCGAGCCGGACGACAGCATGCCGT:1 + chr3R 30040319 3' + 1360 439 1 76.24 TTTATTCAAAAAAAAAAGAAAAGGAAAA:1 - chr2R 10971717 3' + transib2 2634 1 82.14 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAATAAAATTGATTTATCCCATGGCCAGTGCGTCTGGTTTCGATTCATTCTGAGACTCATTCCTACT:1 + chrX 18706969 3' + I-element 5340 1 58.42 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCNGCAGTTCTCTGGTCTGGTAATAGATTTTGATAACGGGTGCGGTGGGGTTTTCGG:1 + chr3L 5974047 3' + hobo 2929 1 55.41 TGCAGTCGCGCTGACGTTTCTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGAGTTTCGTTTTCCTTTCCGCCCATGTTTACTTCATTCACAGCCAAAA:1 + chr2R 4707619 3' - gypsy4 6627 2 52.48 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATGGCTGATATAACATCATTAATCCGATCAGATATCCCCCAATATGGCGGCCTATTTCGCTTATCCTAATTTAA:1 - chr3R 4769422 3' - copia 5 2 74.26 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGTGTATATTCAATTGAGGATTTAGCAATCACATTACTGGCACTCGTTACATTGAAGC:2 + chr2R 9811371 3' + Quasimodo 7355 2 68.32 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACATCAGATCTGCGAGACCTGTCAGAGTCGGCCGCTTCAGCTGCA:1 - chr3R 11278385 3' - hobo 29 1 57.43 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATTTGTATTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTTATATCCCGCCCT:1 + chr3R 17896929 3' - jockey 4794 1 55.45 ATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAAAATCGATGGAAATTTACAAGAATGTGAAAAATATCAACACATTTTTGAAAAGTTTGG:3 - chr4 1221166 3' - INE-1 569 1 49.50 GCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAGGGACAACGGGCGCCTGTCGGCTGCCAACCTCCTGTTGACTGGGTGAGTTGC:1 - chr2R 7765032 3' + Transpac 59 2 55.45 ACTATATCTTTTTAAAAGAGAATGCAGTCGGATTTTCTGTGGCACAACTTTGTATTATAACTTAAAACATACCGCTTAATATTGTTATCGCCTAGTATCGA:1 - chr3R 21108014 3' + TART-C 11032 1 54.46 GCTCTTAGATTCTTGTAATTTGTTTATTGAAATCAACACTTTTGTTTTTCGGGAAAATCGAGGGGCCAAGCGTCTATAATTTGCATACAAATGCGGGGCCA:1 - chr3R 12925986 3' - Idefix 308 2 53.47 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTATTAATTACCCCGCAAAGATGTTGTGTTGATCTTAGCCTGAAAGAAGGCTATGATTTATACCATTAACTTTTCGTT:1 + chr3R 27083067 3' + jockey 4986 1 70.30 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACATACATATTTCCATAACACACTGCAATCTACTTTTAATGG:1 + chrX 6058233 3' - roo 8702 2 64.36 GTGTTCCTAATGGGAGTTCATCATTACAGTAGGCAGCTGGAGCGTGGGCAGATGACGCGTCCGCAGTCGACGGCATTTGAAATGAGCAACGTAATGGGAAT:1 - chr2R 6769421 3' + 412 7540 2 72.28 TTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTAAATATATGTATATAAATTTGTGCCGAGATTGCAGTTTTCCTTAAATGGTATGGGAGTACGATTCT:1 - chr4 1102465 3' + Tabor 7263 2 71.29 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACCATGATACTTTTGGGATGCACTTGAAAGCTTCTCTGCTCAGGGAAAATTGTTAATTCTCT:1 + chr3R 13239986 3' - jockey 23 1 55.45 TACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTACCACTCCGAAAGAGTGTATATAAAAAACCCAACTCAAGCCCCCGAGGGCCACC:1 - chr3L 771753 3' + roo 9049 2 53.47 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGC:1 + chr3R 26342991 3' - blood 7050 2 63.37 AGATCAAATTAAGTTGCCGNATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAGGATGAGCCTTTTGCATACTTTTGGGCTTGGTC:1 - chr3L 5255930 3' + jockey 4949 1 64.36 GTGCAAAGTACTCGAGGCANCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATTTACAATTAAACTTTACTTCTGAGTATTTAGCTAACAGCTTAAAGTAAACCCCATT:1 - chr3L 3822370 3' + pogo 2085 1 59.41 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCGCCTTAGACCGCTCGGCCACGCTGCCTGTAACCACACGTTGTC:1 + chr3R 30248691 3' + 412 7515 2 55.45 TTATATAAAAATATGTAAATATTTAATTTTTTTTTTTACTTATGAAAACTGCAGTTTTTTTTAGCATAAATAAAATTCTAAGTACATACTAATATTATGGC:1 + chr2L 7151054 3' + G3 4497 1 67.33 TTTTTTTTTAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTTTTGCATTTCGTACGTTTTGTTTGCTCTGAATCACATGCACACACGTCTGC:1 - chr2R 14899442 3' - Doc 4444 1 53.47 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCCATAGCGCAGATACAGTGGGCCAACTAAGCGAAATTTCGATCGAAAAGTACAGTACGAAA:2 - chr2L 18500286 3' - Tirant 8122 2 62.38 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATGAATAGGTATTGCTCCTTGTCGCTCTTTCCATTTTGGCATTTCAATT:1 - chr2L 9630330 3' - flea 4776 2 53.47 ACAACTAACTTAAAAACTANGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATGTTTACTCTTGTTTGGGATGCATCGACACTCGCGTAAACAAAGGCCAACC:1 + chr2L 11415261 3' - Juan 4001 1 52.48 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACAGAGTGGTGCCCTCCGCCCGCCTGCATTA:1 - chr3L 13071983 3' - roo 46 2 71.29 TTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCCATTTTGGCCTGACAGTTAATAAAAAAAAGTTGACCACTACCGATTTATCTACGA:1 - chr3L 357887 3' + 1360 3280 1 56.44 ACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCCGTTCCTCTTCACAAATCACGCCATTAAGCCAGACGAAAGCATGACCATTTG:1 + chr3L 4552400 3' + Tirant 8089 1 55.45 CAAAGACACTAGAATAACTAGGGTCTTTGGTAATACTAGTAAAAAAAAAACAGCTACTCTCGGTGCAATTATTCAAATCTCCATTTTTAATTAATGGTAA:1 + chrX 7151111 3' + 1360 1 2 61.00 AATAAAATCAGTTTCTTACNAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCAC:1 + chr3R 13544138 3' + roo 9033 1 62.38 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAACATTGCGCCAAACAGCTGATTTTTGGCCATCCCCCAAACGACAGTGTCCCGCATTCCGCTCCACACAACCC:1 + chr2R 13194718 3' + roo 405 1 75.25 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACATAAACCGAATCAGCATCACCGTGTCCTTGAAAACGGATACG:2 + chr2L 7461128 3' + roo 9038 1 59.41 TATGGAGAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCACATTTTGTGGCAAAATCAATTAAGCCGGAAATGCATGTAGACCATGGACTGAGTGAGTGAGTGGG:1 + chr3R 26362431 3' + mariner2 751 1 71.00 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGTTTAACATAGCCAAGTATATTAGCAAAAACAGCTGAGACTGAAAA:1 - chr3L 1927418 3' - mdg3 5285 2 56.44 AAATATATTTTTAAAAAAAATATTCCACGTGTGCTATTAGTTTTGCACTATGTATCCACTGCTTAATTTTGTAAAGTATTAATTTGCTGTATATATATATA:1 - chr2L 7023077 3' - hopper 161 1 73.27 CTACATCAGAAGTATTGGANTTCTAATTAACTACAACATATGTACACATGTACATATGTACATATGTACATATGTATATTTCAAGAGTAAAAACGTATCTC:1 - chrX 2164271 3' + mdg1 408 2 43.56 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAGGGGGTTTTGGGTATTTGTCGAAAAC:1 - chr3R 6437521 3' + 412 7495 2 74.75 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCACAATTCCATATCTCGCCCGATTCTAATTGGTGTTTGGCCCGCAGACAAATTGTGGTCG:1 - chrX 21056912 3' - Tirant 18 2 63.37 ATACACTTAATATTAATTGTTTTTTATTAACACGATCCGGCTGCCTTACACACCACTTGCGAGTTGGGGGCCTGTAGATATCGGTTGGTTGGTCCAACTGC:1 + chr3L 19321674 3' - 3S18 6049 2 59.41 AACATTGCTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGATCGAACAATTAACGGTGGCAAATGTCGCTAATGAATCATGGCCCAGAGCTACCGTCAGA:1 + chrX 18840048 3' - HeT-A 5765 1 67.00 CCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTGAAATATAACGAAGAAATCAGATAAGGAAAAACAATTGCGACGCTTTTATTTTAGTCTCGTAAGGTAATTTTTAA:1 + chr3R 6683654 3' - G4 3547 1 79.21 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGAGTTTTTATCAAGAGGGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGAC:1 + chr3L 25059149 3' + mdg1 394 2 53.47 TACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCACGCGACGTCGCCGTTGTCGG:1 - chr3L 9794937 3' + hobo 325 1 80.20 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTATGTAAAACACTATATATTTGACATAGGAAAAGTGCAT:1 + chr3L 19569229 3' - BS 35 1 64.36 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGCTTAATTTTCATTTTGGGTGGGGCATGTTCTGCGGGCCTTTTCCGGATTCTATTTACCCCTCTGCTC:1 - chr3R 12937399 3' + roo 400 1 62.38 AACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTAATACAAGCCCGGTCGCAGATGTCCTTAACATCTGCATTTAAATGTGGTGGAGAAGAGTAAT:1 - chr3R 14980462 3' + 412 478 2 63.37 TATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATTCACAGCTTGGTACTTGTACCGAAACGTCTTCAAAAGGTGATTGCCCGACTAAGGAAAAGCGAATGGTTCTTA:2 - chr2R 5535047 3' + Tc1-2 1275 1 69.31 GGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATGCCCTCTTATGGATTGCGCAGACG:1 - chr3R 9613449 3' - invader3 54 2 75.25 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTAATATTTTCGGTGTAAAAAATGCATTCTACTATATC:1 + chr3R 20284798 3' - pogo 34 1 64.36 TTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTTATACTCTTCACATTAAATTACAAAGCTTTAAAACTGTTAACTAAATTTGGGAACTG:1 - chr3R 12803246 3' + Chimpo 4129 1 68.32 AAAAAAAAGCAAAAAAAAATCACACGCAAATTCG:1 + chrX 764945 3' + gypsy7 5008 1 88.24 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGGGATAGTTGCGATTTTCGTCCTATTCT:1 - chr3L 16807732 3' + P-element 2840 1 33.66 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGNTGGGGTGTACTTTAAATGCATATACAAGATATAACGTATTTTAAGAACGAAGTTCAAGGTGATGAAACTGTACACTTCTAC:1 + chr3R 19931704 3' - jockey 4678 1 68.32 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTACGAAACGCCAGCTTCAGTGACTGGCAAAGGTGTGCAGAAACTACATTT:1 + chrX 8342151 3' - hobo 54 1 54.17 TAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTTGAGCCATTTGCCTTTGACGTTGG:1 + chrX 11025552 3' + hopper 1363 1 78.22 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTAAATGTTAAGCCTCTTCAGCATTAAAGATCGATATCGGATCAATATGAAGTGTTTATAACTTCTTT:1 + chr2R 18105840 3' - roo 8 2 70.71 AAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATACCCGTTGAGAGCAACTGGGAATTGTGCCCAAAACTATATCATGGCATCGAATATGATT:1 - chr2L 12765336 3' + roo 8730 2 64.36 TTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAATATTTTCCTCATCTAGCGCAGAATTCATACACCTGAAGGACGCTTGCAGGCGGACGACATGGAGCGCCCC:1 - chr3R 31904849 3' - HB 1503 1 73.27 ATAAAAAAAAAATATGAAAAAAGACTCGATAGTGTGTGGCCATTGGGATTTTTTTTTTATTTTGAGCGATTCGGGG:1 + chr3R 29386831 3' - FB 174 2 75.00 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGAATTTTACACTGGCCAAATTACCGAACAGCAAGGGCATAGAATGA:1 - chrX 15268249 3' + roo 9038 1 64.84 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGTCAAATGAAATGGTTACCTATATTTAAGTGTGTGTTTGTTTGGT:2 + chr3R 8434325 3' - roo 8696 2 59.41 ACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGAACTCATTTTAATGGGTGTAGTTGCTATTAAAAAGGTGTACGGTA:1 - chr3R 4536187 3' - Ivk 33 1 55.45 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTACATACAAATATTACTGGACAATTCATGTGCTTTCATTG:1 - chr2L 8967013 3' - 297 6613 2 70.30 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTCTAGATTCTGAGTATCACAAATGCAGTAAGATTAAGAATAAATATATATG:1 + chr2R 7132574 3' + opus 479 2 60.40 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATACAAGATACACAGTGCGGCGTTC:1 + chrX 7534738 3' - Tirant 8108 2 78.22 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCT:1 + chr3R 8165793 3' - 297 13 2 97.03 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATATTGCGCAAAAAAACTATTAAGTTCGAGTTTTTAGACGCATCACCATTAATTTTTATAAATAAAAGCCAAT:1 + chr2R 15376201 3' + 1360 3387 2 76.24 AAGTCTAAAGTCCATATTGGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAACGGCCTTAAACAGTTTGGTATTTGTCCTTCATCCCATTTCCTGGTA:1 - chr2L 7396483 3' + Idefix 404 2 54.46 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGGGCGTTGGGAAGATGGCAGCCAGAATCGTTTGCA:1 + chr2L 3778442 3' - 1360 42 1 64.36 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTCCTCTAAAATAGAATTCAATTGGTCTGCGAAGCAGGGAACATGATGATGAGC:1 - chr2L 13792164 3' + blood 363 2 63.83 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACCCTCTAAAAAATGTGCATATTCATGAGATGATTTATAAA:1 + chr2R 11661156 3' + 1360 3355 1 62.38 TAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACTGTGAAGAATGTTTTGTAACTAGGTTATATACTTGCGAGTCTGACTAATGG:1 - chr2L 16132519 3' - GATE 37 2 51.49 AACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATACTTTCCAAACACTAATATTTATTTAAACAA:1 + chr2L 21052787 3' + invader1 359 2 74.26 GAGCAGATACCATGACAGGNTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCAATCAGTAGCATGTGTGTGTCAGACCAGGCAGACAAGATCAGAACCAAGAAATCAA:1 - chr3R 13658140 3' + X-element 4409 1 58.42 CGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGACTGTAGTATTCTCTCTTATTCTTATTCAATTGTGTAATAACTTTTCGCTGCACATAAGGGCTGTTTTCTTTAAG:1 - chrX 19330552 3' + INE-1 555 1 55.45 ATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTCCCTTGTGGCGTCTAACATTGACTTTTCAGCGCTCGGCCGGCT:1 + chrX 21400647 3' - P-element 213 1 45.45 AAGTGATTATGATAAGACAAGATAATAATTGAGAGTGGGTAACAAAATTATTTATGAGCTATTAATTCATTCGGCCTATTAGAACCCTTGCAATTTCCTTC:1 - chrX 20539335 3' + Stalker3T 195 1 64.36 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCTGAGGGTTTTCACCCAAGGGGCCAGAGACACTCAAAGGCTACGCTCTAAAATGACGCCTGTC:1 - chr3R 21923988 3' + transib2 2813 1 68.32 AAAAAGTTAAAAGTTTTGTCATGGAAAACAGTAGCACAGGTATGTAGATTTGTAGTTCACTAACATTTTTGTGTATGTTTAATTTTTCTAGGAACGTGCTG:1 - chr2L 16666835 3' + transib1 250 1 76.24 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAAACAAAAAGCGAAACTGTGAC:1 - chr2R 13194642 3' - roo 8717 2 80.20 TATAATTATTATTAATATTNTTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATTAAAAGAATCATCAACACTTCTAAGTTAAA:1 - chr3R 3258887 3' - mdg1 46 2 70.30 CAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTGTCCAACTGATCCGTATTGGCACCATGATCCAGCAGCGTAGATATAACCTTACTATATCCT:1 + chr3R 28611719 3' - pogo 1703 1 65.35 GTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCTCGCCTTTGCACCTTCCTCAAAACTAGCCGCTCATTTGGTGTTCCGTAAAGATCCGATTTCGA:1 - chr2L 23371295 3' + roo 8814 2 66.34 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCGTGTTAGTGTGCCTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGGGGGCTTTGCGGGCATTTTATGTAATGTCGTCTGTAA:1 + chr3R 11278463 3' + hobo 2937 1 44.55 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTTATGCCTGGGGAGATGCTACG:1 - chr2L 19207868 3' + 412 479 2 55.29 CACATAGAGACTACATGATATGAGCTAAGAATTGAACACACTAAACCCACCAGACTTGCCAAATGCTCTGGCAAAGTGTCAAGAGCTAGAGTCTAACAATT:1 + chr3R 1682791 3' + hopper2 1136 1 66.34 TACATATTTATATTTATGTTGATATTTAATTCTAGCGTCTTTGATAGGACTTTTGCAATAAACAGTTTTCATATTTTTTTTTTATTTTATAAATTTTTATT:1 + chr3L 10436945 3' - 1360 2958 1 74.26 TTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTATCGTCGCCTAATCAGCCAAGCGACAAGTATGGCTGCCAGAAAAAATTT:1 - chr2L 15981382 3' + hobo 435 1 54.46 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGATCATTAACGAAATGAAGAAGGTCCTGGGCGAAGGGCCAAATAAATGTTGCCTACTTACAGGAGCACAAA:1 + chr3L 17708327 3' - jockey 4764 1 71.29 AGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAGGCAGGTTTCGGTTGCGGGTT:1 - chr3R 23174302 3' - Tirant 442 1 79.21 TTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTCACATTTGAGCTCTCTCACCCCAACGATCAATGATCGGAGATACAAGATAC:1 + chrX 7534717 3' - Tirant 8129 2 59.41 TCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGG:1 - chr3R 15924594 3' + Quasimodo 7338 2 60.40 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAGGGCAAACAACTTGAATCGAAGGCTGTGGCTGCTGTT:1 + chr3R 9825173 3' - Doc 37 1 58.95 TGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGGCATTAAAGCCGCTGCTGCTGT:1 + chr3R 9613471 3' + invader3 221 2 77.23 GTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTCTATAATTGAAAACTTTTCCTAGTTCTAACGAACTTCTTCCTTGCT:1 - chr3R 7329984 3' + McClintock 73 2 54.46 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAAC:1 - chr2R 21362756 3' - Tirant 28 2 53.47 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCCTGCAAGTAATGTACTGTGGAGGCGCTTGTAAAAA:1 - chr3R 8460865 3' - BS 34 1 61.39 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATATAACCATGTATATCCACTTTAAGCTGATGATCAGAAGGAACGGGCAGTGTATTACTAGGAGAG:1 + chr3R 4769544 3' + copia 244 1 65.35 GAGAGAATGCTATGGTCGACTTTTCCGACTGGAAGTGAGAACGCGAAATTTCATAAATTTCATAGCAAAACAATATGGAAAAAAAAGAAAAGATTATAACC:1 - chr3L 5786242 3' - INE-1 575 1 61.39 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAGGTCGGCAATTGATTTCAATCAAAAACAATTGCGTTTGACTGCAATTGCGCCTGCATTGACAGCAGTTT:1 + chr2R 6918071 3' - F-element 25 1 63.37 AATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACAAACTCAGCGCACATGGAAGTCATAGAAAATGGCATTAAGAGCTGTCATAAATCAAGGCTGATGGGTGG:1 + chr3L 19148686 3' - hopper 327 1 71.29 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAGTACCCAAATCATCATACCCCAAAGTACTGGGTACAACCACAGCACGGACAGGACCCCAGTCCAGCTGTCCGT:1 - chr3R 30611209 3' + blood 7386 2 77.23 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCGGTCTTTTGAATATGTCTTTTATGTGTACTCTCTCCAAAATATTAAAGTAC:1 + chr2R 18077116 3' - Transpac 4942 2 54.46 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAAAATACAAAGTAGGAGATTGTTTTAAATTTATTTTACCCATATTAATTTTGCCCTAGT:1 + chr2L 20840337 3' - mdg1 19 2 59.41 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATGTGTCTCTTTGCTCTTTATATATATCTGTCCCAGCGACCACACAATGAATGA:1 - chr3L 4570818 3' - Quasimodo 12 2 66.34 GCCAAAAATGATATGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGTTGGTTTTAATAGCCAAACAAATTTAAGAACAAGGAAATCCGTACAACAAT:1 + chr2R 1333679 3' + Cr1a 497 1 60.40 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCTGGAAGGTTAATGGTTTTCAT:1 + chrX 22689187 3' - Transpac 51 2 80.20 GTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATGCAGCGCGCTGCCATTCAATTAAGATTCTTTGCCACAGCCGCA:1 + chr2L 7754912 3' - Burdock 309 1 57.43 GCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGTTTTGACATACTAATACTACAACATATACTACTATTG:1 + chr2R 5924402 3' + jockey 4721 1 57.43 TTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATATTTGTGGCATCCTCTCTCTGAAGATGACTGCCTTGTTTTTGATCATGCCAAACTCC:1 - chr2L 387866 3' - Doc 4516 1 62.38 TGTTTAGGTTGTAGCTCTCGCTGGCCTGTGACGTCTAACAATTTTCCATTTAAACGGCATTTGTTGGCGATGCTTCTGCTCCTTTCGCTCCTGCCACTTGT:2 - chr3R 21968038 3' - Porto1 239 1 60.40 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGTCGTTTGGTTCCTCTCAGTTTGTATTTAGCGCCTGTCGCGG:1 - chr2R 10874718 3' + P-element 2855 1 44.44 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTATCTATATATGGCATATGTGTTCAGCACCTTTC:1 - chrX 8972945 3' - flea 4792 2 69.31 ATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTCTACAAAAAAGAGGATCAATAAAAACGAGCGTTGCAAC:1 - chr3L 13248889 3' + accord 7096 2 62.38 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACAATGTAGGTTCCGTTTGGCATGAAACTATAGGGGGGAACTAAAGGGTAGATC:1 - chr2R 11661080 3' - 1360 21 1 59.41 GAAAATTTAAAAAAAAAAATTATGATTTAAATCAATTAAAAGACTCGCACTTCAACGAACTTTCTGTTGAGGAACCCAATCGGTTGGATGGATGACAAGT:1 + chr2L 5690836 3' + TART-C 11095 1 65.00 ACTTATAGGTACAGTGTACNCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTGTCGTGCATCCAAGAAAAGTTGATTAAAATGGCAAAAGCCAGTCTAAAAAT:1 + chr3R 26343009 3' - blood 21 2 58.42 AATTGGCTTCCTCCGATTTNTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGGTAGCTATCGTCCTTCCTCACGCACCAGCAACACCCCAACCCCCAACCCTCAACC:1 + chr2R 13070192 3' + gypsy12 10017 2 62.38 GAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCTGCAAAGAGAATGCATGAGCAGGC:1 - chrX 8345657 3' - hobo 2638 1 76.24 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTATCAATAATTTCTTCATGCTTCTTCATGGATTGCAAAAAGCCAAAACCAAAACAATTAT:1 - chr3L 95849 3' + roo 9054 2 60.40 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACAGCCTCCGAAGAGCTAAAAGCCCAACATTTACAACAATTCGTTAGAGCACCTACTTCC:1 + chr2L 13433985 3' - hobo 17 1 62.38 TATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAACACTCTCCTTACACTAGCGGCCGTATACTGCCCCCCCCGTTTCACAGTATTAGAAGCTCA:1 + chr2R 3622921 3' + Stalker2 7635 2 63.37 GAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAAAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGA:1 + chrX 21087678 3' + mdg3 238 2 59.41 TAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAAC:1 + chr3R 1844825 3' - 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chr3R 18769579 3' - roo 35 2 61.39 TTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCGGCTCCAACCACCCAGCCACCAGACCCTCG:1 - chr3R 18524537 3' + I-element 5037 1 70.30 CCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAAATATGTACGCACATATACAAGCAAATTCTCAGCAATTAGTAAATAAAATGTTTCAACTA:1 - chr2R 16393691 3' + TAHRE 10305 1 60.40 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAACAGGCACCGCAGCAGGAACGGAGTAGGAGCTCAAGGAGGACTCTCCTCAATTCT:1 + chr3L 12238915 3' + jockey 4978 1 55.00 GCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCACACAGAAAGGCCGGTGGGAAAAAACCGCTTTTCGA:1 + chr3R 14979753 3' + 412 96 2 65.00 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACCTTCGCTGCAACCTCATTTCGTTGATGATAGTA:1 + chr2L 4571369 3' - roo 8706 2 67.33 AGTGGCTGGTTTGGACCACNCAAATACGTCACTATATATATATATATTTTTTGTGTGTGTTTTTATTATTAAAGAAATCCTTTTGAAGTACGCATGTTTT:1 - chr3L 19088007 3' - 297 6593 2 67.00 GGAAGAAGATAGTGCGTCGGAGCGTTAACGGAAGAAGTTGATCGTTGATTAAATAATAATCAGACTGGGTAAATGAAGACAACGACAAATGAAGGTCACC:1 - 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chr3R 6032189 3' - X-element 4366 1 74.26 GGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCAAATTTTTTATTTTTATTTTCATGGACTTGTAGCGATAAGCTCTCTTTCTCCTCCTCCATC:1 + chr2R 21496827 3' + hopper 103 1 57.43 ACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGCCACAAGCGTCCGGGTAAGTGCAGTAATTACATT:1 + chr3L 20615203 3' - hobo 397 1 71.29 GTCACAACGGTCTCTGCTCNGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCTTTTTTAGTTGGCAATCAGATTTGGTAAAAAAGCGCAGGCCTTCAT:1 - chr2R 18077032 3' + Transpac 5202 2 49.50 GTGCGAGTGGCGGGCTGCANTTCTCTGGTGCGTGGCTCTCTGTGCGCGAGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGTGCCTGTGTTGACACAACAATTAAAACCATT:1 - chr3L 13557030 3' + hobo 2933 1 73.27 TTAATATTAATGAATTCAATTAAAGGAGAAAGGGAGCGAAATGGGGAAAAAAACTGAGCAAAATCGAGCGTTGCATTCACTTCGAGTTC:1 + chr2R 9200168 3' + HeT-A 380 1 68.54 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAAAT:1 + chr2L 21738003 3' + 1360 3347 1 83.00 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGT:1 - chr3R 14860168 3' + BS 5050 1 72.00 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTT:1 + chr4 146068 3' - 1360 12 1 66.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCATCTGTTGCCTTGGCGAGACTGGCGAAAGGCGCACTTAATACATAATTCGTGTACACATTATAAT:1 + chr3R 13544168 3' + roo 400 1 70.30 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAAAGTCAAAACAAAACAAGTTAAAGTTTCCATAAAAATATTGGTAATTTTTAATAAAATT:1 - chrX 20282924 3' - 412 18 2 54.46 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAATTTTAATCGACAGTTTCCCCTTGGCAAATCCTGCCCGG:1 + chr3L 3428064 3' + roo 9035 1 64.36 AAACAGGCCAAATGTCCCATAGTGCACCGCTTCAATAAAACTGCAAAGTGCCAATTACAAAAATAACAAGTTAGCCCCAAAACTTATGTTGGCTTTCCGAC:1 + chrX 20377191 3' + hopper 1412 2 73.27 GTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTAT:1 + chr3L 24253659 3' - Quasimodo 51 2 77.23 CAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGAGAATAAAGTGAAAAGCGGTTGAATCGAAAAATGTCTAATTGGCATATCAGTTGTGTTTTTTGCGC:1 + chr3R 13348831 3' - X-element 4554 1 66.34 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCTTCTCATAAGTCGTTCGTACATTT:1 - chr2L 19207888 3' + 412 7496 2 76.24 TCGATGAAAACAAATGAATNCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACTATTAACCGTTTGCAGGATGAGGCCAGCACCGAGC:1 + chrX 11459921 3' + Chouto 5939 1 80.20 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTGTGTTTAGGCCTTTCTGACTGTCCCTCTCTCTCTCTCTTTC:1 + chr2L 2939617 3' + P-element 2854 1 43.43 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGTACGCAGCCAGTGCCATTAAAATCAACGTGAAACA:1 - chr2L 15909832 3' - Tirant 8147 2 68.32 AGGATCAATGGCCGAGTCGATCTGGCCCTTTTCGTCTGTCCGTTCGTATGTAAGTCGAGATCTTAGAAACTATTACTGCTCTAGAGTTGAGATTAGACATA:1 - chrX 22511263 3' + INE-1 96 1 70.30 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATTCTTTATTGAATGCTGTAGATGCCAACGCCAGA:1 - chrX 7534616 3' + Tirant 8493 2 66.34 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGTTAACATAATAGCACTGTCACTTCGATGAATTATATTCGCTAT:1 - chr3R 14521067 3' - I-element 33 1 57.43 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACACTTCCGTCTTGCCTTTTGCATAGTCGCT:1 + chr3R 14980533 3' - 412 7100 2 73.27 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTATAGTTGATTTACTCAGCAGAATAAGCAACATGTT:1 - chr3R 28475812 3' - roo 36 2 71.43 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTCTCTTTCGCTGTCTGTGTTTTTTATGTAGCATGCTTTTGAGCGCGACGCGAAATTATAA:1 - chr2R 8385100 3' + hobo 2922 1 64.36 AAATTGAATTCCATTCTGCNACCCTGAACTGGAGTGTTGCATGAGGAATCGCTCAGAAAGAATCCAGTTCCAAATCGCTGCGTGCAACATGGCCACTTTCT:1 + chr2R 24349785 3' + R2-element 3164 1 74.26 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGATTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGAGTCTGTTTGCCTGCAATTTGATTGGAGC:1 - chr2L 9471220 3' + roo 9022 2 76.24 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATATACAGGCCAGAATTAGGATGATTCTAGTTTCTAGCTTCAGTTTTACCCATT:3 + chr3R 18549992 3' - pogo 19 1 58.42 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGATACATCCTCAGCGACTCCTTGATGACGCACTCCATGTACTTGAGCTCCCCGAGGTCACGAATGCTAA:1 + chr3L 7494123 3' - roo 7 2 72.28 AAGATTAATATATTTCTATATAATTTTAAAATTATACTCCAAACTTCATTAAATCTTATAAACCGTTTATTAAACATAAAAGTAAAATCTGAAATAAGTCG:1 + chr2L 10856826 3' - Tc3 292 1 74.26 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTGGCGGGGGTCATTAATAAATTAA:1 - chrX 12284070 3' - Transpac 35 2 73.56 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACACTTCCGTCTTGCCTTTTGCATAGTCGCTCACACTGCGTATACT:1 + chr3R 14980548 3' - 412 32 2 58.42 AATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACTAGAATTATTCCTCGCCATTTGCACCTGGCCATCCGCAACGACGCGGAGTTAAACATGCT:1 - chr3R 2156983 3' + Quasimodo 7262 2 63.37 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGGACTGTCATCAGAGGAGAATGTGAG:1 + chr2L 14799161 3' - hopper 47 1 71.29 ATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACACCAACCAAATCGCTGGCTTCGCTTCAGTTTTTCCAGCTTTTCCTT:1 - chrX 13316338 3' + roo 8624 1 48.51 AGCGTGCAGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGCTCTCCTGAAAGTTTTAATCTTGTGTTTTTGTGCATAGTAGTCCTCCACATTCATGCTGCATCCT:1 - chr2R 18227579 3' + Cr1a 341 1 78.22 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTGGAGGGCGGACGGTGGACGGTGAAGCGGCCTGAAAACGTCTATCCACATAACTCCTAGTTATATATTTA:1 + chr2L 19207964 3' - 412 7 2 70.30 TTGTTAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTGGACTTTATATCTATATTATTGTTGATCCCTCGACCCGCCTTGTATTTACTGGCAATTG:1 + chr2L 3399820 3' + 1360 203 1 67.33 TAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTACTTCTGTTAGTGCTTTCGCCTTTAAGT:1 + chrX 15258339 3' - BS 44 1 73.00 GGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTGCATACGAGCATGGGTAATTGGGGGCCTGGAAGTGGAACCTCCTTGCCATCCGATAAAAACCTCAA:1 - chr2R 11820883 3' - gypsy6 7432 2 64.36 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCGGCAGCAAGATAAAAATCGCAAACATT:1 - chrX 7534648 3' + Tirant 358 2 70.10 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAACAAAGCGGAATTAGACATTTAAGAGTAGTGTATAGTGTATAATTCCTTAAAAAC:1 + chr3R 17976721 3' + copia 234 1 48.51 AGATCTCAGGAACTATAGAAGCTAAAGAGTTGATATTAAGCACGCCCACTAGCTTCCTAGTCATTGCTATCTTAAATAGTTTCGCCATCCATTAAGTATCA:1 + chr4 983738 3' + INE-1 149 1 51.49 ATGAAATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGAATCATGCCCGGTATCTATCAGTGCTCCGGGGGACATAAGGTCAC:1 - chr3L 13671309 3' + Rt1a 4908 1 55.45