Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score AATGTCCAACAAAACAGCGATGCCGGCAGCGCAGTAGCAGCGCAGCAACAGAGGCGGCAGCGTGGGAGTTTCGTTAACAGCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2R 14001142 5' - P-element 2848 1 58.22 TTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATAT:1 + chrX 5440006 5' + accord 6928 2 74.66 GTTGACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 27391436 5' + 1360 10 2 67.81 AGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCT:1 + chr2L 16107265 5' + Rt1b 131 1 53.42 AAAAAATAATTATAAATTTTTTAAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTATCCTCAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAGCGCT:1 + chrX 4938551 5' + Stalker3T 119 1 60.27 CAACAAAACGGCCGACAGCAGAGAGAATCTGGCAAGCTTCCAGGCTTACACTTAAATTTAAGGAGTTTTAATCATTTCTTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr3L 10370860 5' + copia 42 2 56.16 TTCAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chr3L 11669753 5' - Tabor 450 2 57.53 GAGATATTACATACAATTACATATACTAAACAAAATGCAAACCATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 23043086 5' + roo 22 2 69.72 ATAAAAACGTTGAGGTTGATCACCTGGTAACTTCTGTTTACATTCTAATTCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 + chr2R 18807714 5' + jockey 18 1 73.97 GGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTGCGGTTTAAAT:1 + chrX 17614383 5' - roo 347 2 61.15 TGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGG:1 + chrX 18193715 5' - hopper 1348 1 65.07 GTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr2L 17069570 5' + 412 61 2 71.67 TGTACTTTTTATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 - chr3L 24153303 5' + Tabor 31 2 65.07 GTAAAATATTTTTTCAAAAATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 14136584 5' - roo 360 2 48.63 AAAGAATTTTGCCAAAAATTTAACGACGCCTTTGAACCTGACGCCAGCTGGCTTTGGCGCTGGCGCAAGCGCCACATATTGTATACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTT:1 + chrX 20933650 5' + pogo 1716 1 52.05 AAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:2 + chr3L 20747058 5' + Burdock 26 2 67.81 GTTATAAGGTGGCATTGAATTAGTGATATGTGACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAAGAACTTTACAATTTTGAGGTAAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGACTAACAAGA:1 + chrX 21204916 5' - 1360 3388 2 75.34 AAAACGAATATAATTAGGTCTGAAGGAGGTCAACTCCGAAAGCTGCGAATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTA:1 - chr3R 3854501 5' - INE-1 33 1 62.33 TTTGTAACCATAAGTTGGTAACTTTTGCCACAGTGTCCTTGAGACGTGTATGTGTGTGTACGTGCGTGTGTGTGGGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGC:1 - chr2R 14518135 5' - accord 6967 2 58.62 ATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTT:1 + chr2R 5582170 5' + Cr1a 489 1 50.68 AAATATTTATAGGTCTCGGCCAAAGTTAAGATGTGGAAAATCCCCACGAAAAAAGCCGTCGAACCATTAAAAGTAAACGCTGTGGAAAACGAACGATTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTGTTGGATACA:1 + chr3R 6462417 5' - Quasimodo 122 2 65.07 AATACGTCCCCGAAACTAAGTCTTAACCACTCTCGCAAAAAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chrX 17469311 5' + blood 25 2 69.18 AAAACAAGTGGAGTTTCGAATAAGGTTAAACGAGGTGTTACTGTTGGGGAGACTATATTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGT:1 + chr2L 17638644 5' - blood 361 2 78.08 TCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:2 - chr3R 6842672 5' - mdg1 336 2 65.07 CTTTCCTTTTCCATTGCATTTTAGTTTTGCCGTTGGGAAATTCTTCTAATTGGCAAAAACCAGGAGTTTGAGCGATTCAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chrX 22591381 5' - copia 213 2 58.33 CTGAGCTTTAAGCTTTGTAAGCCCAAAAACGGTACTCTATATGCATACATTTTAAAACATTTGTAGATTTTGATACACGTTAAAGGTAGAGTAAGAGGTTATACTAGATTCGTTGTAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 - chr4 1126550 5' + INE-1 30 1 69.93 CAGTTAATAAAAGTTTAGAGAGCGTGTCAGAGAAACCTCTAGGGTTGTGTGAAATTTCTGCAAGTGCTGCAAAGTATGGAGTGAGATAAATAGCGTTGTGTTGTTTAAATTTTAAAATATACATGTGTATGCAGAAGTCATACATA:1 + chr3L 2666680 5' - Stalker2 236 2 78.08 TGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr3R 16041106 5' + jockey 67 1 60.14 CTATTCACACTGGTGAAATTTATTCAGTCGTTTTGAATTTGACAATTCTATTTGAATTTTTTGATGTAGATGTATAGCAAGGGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATCATTAGTCATATACCATTGAGCACCTGTGATTGTTC:1 - chr2R 5293570 5' - G3 4278 1 55.48 CAATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 10979099 5' - roo 345 2 63.45 AATAATACAAATACTTGTATTTGATACCATATTGCTTATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 + chr3L 16264565 5' + Burdock 6161 2 68.49 ATGGGAATTAAATGAATGAAATGCGGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3L 22221086 5' - 412 470 2 73.97 GATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAGATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chrX 12843588 5' + roo 65 2 63.70 AAAAAAAATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAA:1 + chr3R 23108059 5' + G-element 67 1 59.59 CTTATGTAGTACATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr3R 9345561 5' + pogo 55 1 58.90 GCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr2R 22867428 5' - hobo 2886 1 63.20 ATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chr2L 17069552 5' + 412 7122 2 64.38 CATCCGAATTTGAATCCAAAATAAACTTCGAGTAGCAACATCCCTGGCCGGCAATCGATAAAGCGCCGATATGCTCGAGCGATATATCGAGTGCCCAGTAGTTATCAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3R 9563594 5' + P-element 10 2 69.86 CATCCATCTTATGTAGTAGAAGGGTGATGGAAGCTACCGATCGAGAGATGTGTGTCAATCTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGAGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 22255469 5' + roo 8679 2 72.60 ATTATAAAATGCTTACTAGCTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 + chr2R 13574716 5' + diver 5914 2 65.75 GAGCTTTGCTTGGAGTAAACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr3R 6068268 5' + jockey 4703 1 58.06 ATTTATGTATATATTTCACAATCACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:2 + chr3R 10498774 5' + 297 6617 2 57.53 CGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 22846710 5' + 412 7121 2 63.70 ACAGATCATCTCGTCTTTGCTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr2L 19424628 5' + Tirant 8125 2 70.40 ATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2R 18123408 5' + 412 49 2 50.68 CTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTACGTACGATGCACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTAGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAACAAAA:1 + chr3R 25598583 5' + Cr1a 4449 1 65.38 CTCGGGAACTGTATTAGATAAAATATATATATATTCTTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCG:1 - chrX 20344374 5' + INE-1 559 1 74.66 ATTTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 - chrX 19231871 5' + mdg3 5282 2 65.07 ATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chrX 10979076 5' - roo 8988 2 79.02 AATAATTGCGATATATGATTAGGTTTTCGCTTAAGTTACCTTTGTATAATTATATCTAAAATGATCGTTACTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAG:1 - chrX 13460636 5' + Quasimodo 47 2 52.74 CGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGT:1 + chr3R 7739680 5' + blood 7076 2 59.59 GGTCAAAAATATATTAAGCCACTAAATTGGTGTTCATCCTTACAACTCTCATTTGCAGATTTGTAAGAAATCTAATTTTTGGCAAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTA:1 - chr2R 15679305 5' - Doc 145 1 58.22 CCCACCGCAATGCCCCTGCTCGAGCGCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chrX 15089601 5' + P-element 28 1 60.48 AAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 9951333 5' + hobo 40 1 58.22 GGCTGCAATCGCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTA:2 + chr2R 19076472 5' + F-element 171 1 77.40 GACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTCT:1 - chr3L 23678162 5' + Osvaldo 30 1 69.17 TGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr2R 20500063 5' - 412 408 2 78.08 GTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr2R 18048775 5' - opus 465 2 61.64 AATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAG:1 + chr3R 17316045 5' + 3S18 5819 2 56.30 GAAATCACCTATTTTCTATTAAATACGTAAAGAACAAAAACTGGTTAGTTTTTGTGAGAGTTAATTTATATTTGTTCCCTAAATAAAAAAAATCAGAGCCTTTTTGAGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGTGG:1 - chr3R 26341400 5' - G6 348 1 70.77 CTATTGGCATACCAAAAACATACCAAAACTGTCACGCCCACACTTTTGAAAAATTTTAAAATTTTTTCTTATTGTATTCCCCCATATTTATTGATATCCCAGACAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTTACACTAGCTGAGTAA:1 + chr4 700917 5' + INE-1 533 1 67.81 GTCGTGAGGAAAAGGGAGGGAAAAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCG:1 - chr3R 17316144 5' - 3S18 282 2 54.79 AGGGAAAAATATCCGAAATATTTCTGCAGCTTAAGGTGGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 + chr2R 23225798 5' + Transpac 80 2 72.60 CCGAAGCTTTCTATATATGCGAGTCCTGTGCACATACTTTTAGCACGTACTGTGCGCTCAGACGACACACCGCGAGAAAAGTGGGGCGTATAAGTTTTTTTCACGAGTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAT:1 - chrX 4858467 5' - BS 5072 1 65.07 CTATAATAATAAATAGCTTTGTAAAAACCATTTATTTCTTCTGTGTTTAAGTGTTCTAGTCTTAGCTTACTGTTTCCTTCTTTTTCCTTGTCCGAACATACCGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 12608010 5' - roo 389 2 52.74 AAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTG:2 + chr3R 18346607 5' - INE-1 541 1 50.68 AATCAACTGATTGGCCAAACGCACAAAGAAAACTAATTAATTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:2 - chr2R 13276548 5' - roo 8991 2 73.97 GTCGTCGCGTAAAGTTGCGATTTAAGTTAAAGTTTAAATTTGTGACACGAGGTGGCAAGAATTTATCTTTGGCAGCGCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTA:1 + chrX 19421687 5' + 297 169 2 58.22 CAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAA:1 + chrX 18193663 5' - hopper 1400 1 74.66 ACACACAACTTTTGCATCAAAACAAAAAAAGCCGCAAACCGAAAACAAATTTCCATACATGCACTTTCCGTAGAATCCCTTCGTATGTGTCGCATTTTGCTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr3R 18903350 5' - pogo 2081 1 71.92 AACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr2L 2357289 5' - P-element 2816 1 36.99 GATAGCTGCTCAATTTGTAGTCCAACATTTTACCTCAATAAAAGCGGCTTTTATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2L 9010554 5' - 1360 3365 1 69.23 TCAAGTACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGAGGCGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3R 23507686 5' + 412 7104 2 52.05 GTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGT:1 + chr3L 4710746 5' + Doc 90 1 73.97 GCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 4869165 5' - roo 8998 2 67.12 CAACTTTTTGACAGCACATTGGCACTTGAACTCCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chrX 17614346 5' - roo 9041 1 64.38 AGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCT:1 + chr3R 4913579 5' - 1360 106 1 69.18 GAAGGGATTGTGGCAAACGTATTGAAATGTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAA:1 + chrX 7480721 5' + Doc2-element 227 1 74.64 GCTTTTGTTAACAATTATGCAAATTTTGATTTTAGTTACGAAAGAGATGACTAGTGGGTTTTCTATCAACATCTTAATGCCGGCCGGTTTATTTTGAAATATTTTCGTATTCGCATTACCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCT:1 - chr2L 2884726 5' - invader4 199 2 80.82 CTGTAGAGTCTCGACAAACAAGCTAGAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr3R 11121657 5' + copia 20 2 67.81 ATTGAGGCGATGATCTACAGAAGAGCAAAATACGGACAAGGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGATGAGTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 11534454 5' - roo 9018 2 61.67 AGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 + chr2L 17162793 5' + blood 91 2 80.14 TGTTTTTTCCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGCACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3R 18665243 5' + 1360 54 1 57.24 TGGTTTATATATGACAAATCGGAACATACATATGCAGGAAACACATTGAATAAGATTCGTCAAAATAAACTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 7534698 5' + roo 51 2 54.11 GATAAGAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 - chr2R 18048913 5' + opus 53 4 61.64 TTTAGTTTAGACAACTTGCTAATATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chrX 21205106 5' + 1360 36 1 59.59 CCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 - chr3R 25521880 5' + blood 74 2 67.59 AGCTTGCATTAAACTCCATTACAGACAATTGCAATTTTAGTTTGTTTTTTCCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr3R 18665202 5' + 1360 13 1 76.03 AAAGAGTAAAGAGCTGTAGAGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chrX 5222833 5' - 412 7509 2 59.59 GGGATCCGAAGGCTCCTTTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCTGCCTGTAATATCATCAGTTCCTCTTTAAGATATTCCCATTGTGTACATGACCGTATCCGTATCTTTGTGCGCCTTCACTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGCAGA:1 - chrX 13096794 5' - Quasimodo 32 2 63.01 GATTCATTAAGATTCGGCCATATGAGCAGTGAAGCGCATGCAACTATCAAGGTCTATAAAGTTTAGTAATAACGATTTTAAGACTACAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACAC:1 + chr2L 14213484 5' + hopper 951 1 58.90 CCGCCTAAAGGTGGCAAAATCATATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr3R 4913696 5' + 1360 12 1 77.40 GGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 8397143 5' - roo 353 2 53.42 CCTGTCACGCACCCATCGCCAGCGGCCACACACACACAAGATGGCAGGGAAATTATGAATGCGATTTCAGTTAATTAAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATTATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 - chrX 685418 5' + BS 5038 1 54.79 CAAGTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr2R 16409996 5' - opus 463 2 58.21 CCAATACTCGCGTGCCTAAAAATAATACCCTACTAAATAAAGTGTAGTTGTTTTTGTTGCTTGCAGTCGACGTCATTGCGTCCGTTCACTTCAACCGCCCCCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chr2L 4419093 5' + jockey 4757 1 70.55 AGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3L 6096566 5' + roo 8753 2 82.19 CATTTACCACCCAACATACGGGCTATTCTCTTATATATTACGAGAATATATGAACACTTCATTTTCCATTATTCATATATATTCCTGAGATCTCTACGTTCATACGTGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGG:1 + chrX 23283779 5' - INE-1 107 1 60.00 ATCGACTTCCTGAAAATGGTCATTTGTTTTCAGTGTGTATGTGTCACACACTGCGACGTTTTTAGATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGGGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 + chr3R 21521311 5' + Bari1 58 1 56.16 AATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 10979077 5' - roo 8986 2 78.77 GCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGCGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAGATATTTA:1 + chr2R 9164832 5' - 412 441 2 50.35 GAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAA:1 + chr2L 14969901 5' - Tirant 8420 2 76.03 ATAGACAGCAAAACTTATTGTGATAAGTGTACATTTGTGTGTTTTGTTTAATTAAAAGATTGAAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 6096445 5' - roo 9059 1 76.71 ACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chr2L 20561466 5' + P-element 75 1 30.94 TCGTGGTATACACTTTTTAGCAGCAAGCACATGATATAAAATGGTTCATTTCTATTAAGACTGCTTATTATAAATTAATTTATATGAGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 - chr2L 19372159 5' - Bari1 1676 1 63.01 ATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr2R 23313092 5' + Tabor 6882 2 50.77 CTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr3L 23146470 5' + 1360 60 1 58.90 GTCTGTGGCTGCGGTTGGAGATTCAGCATTAGTTTTTCGGCTTTATTTTCGCTTACCAACTAAGGAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTT:1 + chr3R 11102860 5' - copia 89 2 59.20 TATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 - chr3R 4913630 5' + 1360 78 1 71.23 GCCGCATAAATGGATGCATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chrX 4789078 5' + 297 6602 2 71.92 TTATATGCACTTGATAAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 - chr3L 19274925 5' - transib2 2798 1 67.12 CTATAAAAAAGAAATTCTAATTATAATTTAACGCAAATTCGTTGTCTGCGCCATCGACAATATCCTTTGCATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chr3R 10498918 5' - 297 6931 2 55.48 GGCGTTAAAGTGCCAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr2L 4415998 5' + jockey 22 1 76.03 CGGTGGGTTCTCTGGTGCAGTTATGTGCTAATACGTCGCGAGCCTGATCTAATCAGTATTAAGCAGTAGCTTCTTGGCTTGGCATCAGGAACGATGGTTATTGAATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCG:1 + chrX 21393509 5' - R1A1-element 35 1 71.92 GCTGAATTCGGGCCAGATAGAGTCCGGTCTGATTATAATTTAACCACACACGGTCCGAAGAGATAATCCAGTTTTTGTTCCTCGTTTAAATCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTGATGAACTCGATTCTTTGAAGCTTTGCCTT:1 - chr2L 9819030 5' - pogo 376 1 55.94 ATAAATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr3L 10814643 5' + 297 6598 2 73.29 AAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGAC:2 + chr2L 15153216 5' + G-element 24 1 62.33 CGGACCAGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - chr3L 17447577 5' + Tirant 8110 2 80.53 TGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chr2L 19930146 5' + jockey 97 1 79.45 TAGTGCAAATAGGAATACCAATATCGTGTGTGCCAATAAAATGGCACTGTCTGTTTGTCAGAAGAATCCAAATTGAAAGCATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chrX 11814954 5' + flea 37 2 60.27 GGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 - chr2L 3734611 5' + mdg3 5268 2 52.54 CAAGATCGGGATTAGGAAGTTGCCTCACGGCAAATAAATGCACAGGAATCCACCTAGACACAATATAAATATAAATATAAATATGTTGGACCACCACCAGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCG:1 - chr3R 12684849 5' - R1A1-element 4946 1 47.18 AACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGT:2 - chr3R 8402628 5' - mdg1 347 2 65.75 AATTAAATATCATTGTGATATTAAATCAGCAATAATTTAAATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 - chr3R 21150687 5' + Burdock 6160 2 66.21 TATTCAAAGTTGGAAATTCTAATTTTTTACAAATCGGAGACTCTTCTTGAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCA:1 - chrX 11706190 5' + X-element 85 1 66.44 ATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 - chrX 3529834 5' - 412 432 2 57.53 ACTATAAAATACAGGATAGGCCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 20076904 5' - roo 9052 2 73.29 GTGGAAGACTACCGCTAATAGTCATGGAAATTCGTTATCAGACAGCCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chr3L 9430578 5' - P-element 2814 1 38.36 AATGGCTGTCTGGCAAACCGGGCAGGTCGGACACTATCTCTCAAATAAACGCTAATTAACGGAGGTTACAAATGATTTGGGGGCTCGCTAATGGACAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCAT:1 + chr3L 9544010 5' - 17.6 82 2 67.14 CGCCCACCCAACCCCCTTTTGTGTTTGCTCATTTCACACTGTCATCGTTTCTTCTTCTCGCATTTTATTTGTACTTAATTTTGCTTTGTGGACAACACATTACTTGCGCTATTACCATTATATTAATCAAAACTTTCTACGTCCAA:1 - chr3L 18781642 5' - transib3 2590 1 78.08 ATTATTTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACAT:1 + chrX 18034593 5' + Juan 41 1 43.15 CGATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chr2L 20561499 5' + P-element 30 1 58.73 CTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCAC:1 + chr3R 11461766 5' + 17.6 59 1 60.96 CCGATGCCGGACAACGCCAACTGACAACTGTCAACCCAAAACAAACATTTATCGCTCGACAAAAGCCTCGACCGCCGAGCAGACGGTACATCAATTTTTCATTTAATTTACAGAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATAT:1 + chr3L 16836607 5' - 1731 4347 2 75.34 TGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAAC:1 + chr2R 19076541 5' + F-element 242 1 68.49 CAATAGGCGAGCACGGTACGGGGTACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chrX 19498139 5' + P-element 55 1 29.25 CTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:2 - chr3R 8402655 5' - mdg1 7412 2 52.74 GCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr2L 4104073 5' + roo 86 2 76.71 CGATTGTTTGGTACGTTTCTGCACTTTTGCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr3R 4464109 5' - 1360 3363 1 67.81 GTTGGGTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 + chr3L 14898826 5' + jockey 19 1 76.03 TGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGA:1 - chr3L 14863910 5' - Transpac 5153 2 72.39 GTGCAGTTCAATCAACTTTCCGTGCGCTTTTCCCGTATGTTTGTCACACCCCCATTAACCCCATGGAAAAAGTGACATGACATTTTCCATATTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAAC:1 + chrX 4251631 5' - transib2 215 1 54.79 ATCGTCATGCTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chrX 14173171 5' + 412 27 2 67.12 TCCAAGTGGCGATAGAGATGAAAATGGATAGGGGGTGTGTTGCGGTAGGGAGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGGTCTGCATTGACAACTTGATT:1 + chrX 18991843 5' - HMS-Beagle 6608 1 63.70 CAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr3L 12863784 5' - Transpac 254 2 60.27 ATACAGTACTATAGTTTAACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGGTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGGACA:1 - chr3R 6107902 5' - Tirant 8321 2 76.15 ATTGATAGAGCGACCGGAAAGTGAAACAAATACCAGAAGTAGCAACATTGCTGAGATTCAACAAATTGATGTCCGTCACATAGAGATATGACCAAAGGCACTAGAATGGCGTAACGCTATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 + chr4 369895 5' + 1360 40 1 54.79 GTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGT:1 + chr3R 19537472 5' - hopper2 1554 1 52.74 AAAGCAACCGCAATAGCAACATGTACCAACATTTTAATAATACATTTATTTCTGGCTACTTAAAGCATCCCCAATAAATGGCCGTGCTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGGTAGTATAACAGTGCATTGTTAA:1 - chr3R 31918333 5' + hopper 1285 1 60.56 TGGCCACAAATGCCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATCTAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chr3R 24175795 5' + Burdock 42 2 56.55 TTTTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACAC:1 + chr3R 25508371 5' + Stalker2 62 2 59.59 TTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr2L 17069547 5' + 412 64 2 60.96 ACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAG:1 - chr3R 9616658 5' - roo 8999 2 67.59 GTGTCGCATTATAATCTTTAACGGCTGAAGCTGGATTTCCATCTGGGCCTTAAACTCCAGCAAGCTACTTGCTATGCGCATTTCCATTGTATCAATAATTGCCAATGTTTCGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATA:1 + chr2L 8392918 5' - I-element 5346 1 79.45 TGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCCAATAATAGTCAA:1 + chr2R 16410032 5' - opus 7418 2 77.40 CGCAGTCGAATGCAGGCCGTCGCAAGCAACATGCGTCACATGTACTAATCAGGCTAGTCATCCGCCTCTCACTCTCACTCTCACCCTTGCACTATGGGAAATTTACCCACTTTTTCTGGCTAAAATGAATAACTCCAGAACGGAG:1 + chr2L 21329663 5' + Transib-N1_DM 35 1 78.62 GTCCTTTCCCACTTCAGCGTCGCCTGCTCCTCTCTTCCCCCCCTCTCCCTCCACCGCAGATGCGAAACAAGGGGCAACTGTCGACAGCAACACAGTGCAAAAAAAGTGCAAAAGTACTGTGCTAATGGATAATCAATCTACAGGTT:1 - chrX 6937105 5' - hopper2 1348 1 56.16 GATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGT:1 - chrX 21667934 5' + gypsy2 72 2 69.86 GCAAGGACAAGAATGCAGTAACTCCACAGGATCCCATGATCTGTATGCACACAAAGGTGGAATTGGATGCGCCTGGCACTGTGGAGAAAACGCTGCCGCTTAGGTTCAATGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCT:1 + chr3R 20015186 5' - 1360 3182 1 74.66 CACAGCGATAACACACACGCCAGCCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACAAATTC:1 + chrX 13964077 5' + accord 7031 2 66.67 CTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3R 29708942 5' + blood 39 2 52.74 AACAAAACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 11526893 5' + pogo 38 1 60.27 CGACGGAAAAGCCTGAGATATTACAGTGAAAACTAATTGTCACTTATCTTTGATATGAGATTAGATGAAATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCC:1 + chr3R 25519749 5' + blood 440 1 52.74 AGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGGGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr3R 16194138 5' - mdg1 376 2 58.41 ATCGATTGGCTGAAGTTCGCACTCCTTGCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAT:1 + chr3L 12863706 5' + Transpac 5009 2 80.14 GCGGCTTTGTTAACAAATTAAATCGCACAATTGCAGCCATTTTCGGGACAACTGACTGACAGCTGAAATGTGACGTTTGTACGCAGCGCTGCCAGATGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCA:1 + chr2L 6062648 5' - roo 119 2 65.75 TAAAACGCTTATCTTACTTTACTCAGATCTTTCCTCAAATGTTCAATGAGAAGTTAAGTGAGCAAATTTTGCAACATTGCTCTAAAATTATGGAACCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAAT:1 - chr2R 5196749 5' - FB 771 3 65.07 GTCCGTCCGGTGAACCAAGTGACCTCTTCATTACCTCACGGCGATAATCTTAGCGGGGCTGTTTTATGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCTCAACTTGGGACTCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCTCGA:1 - chrX 15693515 5' - INE-1 154 1 72.66 TATAATTAATTTCGGTGAGATATGACAACAATTAAGTTCCCCGAAAGCATTCCAATCTCTATATTAAACAGATATTGCAAATAGGCACCCAATGTTTTACATTCTTATAAAGAACGGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 - chr3L 11953914 5' + jockey 4677 1 79.45 AAGTCTCAGTTACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCTGATGCTGACTGATGAGATTAATTAAGCAAGGCAATCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGTG:1 - chr3L 7205573 5' - Quasimodo 7156 2 59.03 ACTTAGTTTCGGGGACGTATTAAAAATCTCTGCATTTTTTAATCACGCTCGATTCTTGGCCAAAAACCACACTGATGAGGAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAA:1 + chrX 17469312 5' + blood 337 2 68.00 GACAGCAAACTGCTAAGCAGTTGGACGCAGGGATAGTGCCCGATAAGTTCAGGATGAGAACGGAGTGTGAGAGAGGGTCCCCCCACTCTCGCCAGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 + chr2R 6557343 5' - roo 8979 2 65.07 ATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chr3L 4869180 5' - roo 8983 2 77.40 GCGAAGGAAGTGCATATAGTTGCGTTCCCGATTCCCGATTCCCCGCAAAAACCGATTCACCCCTGAAATTACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 20552769 5' - roo 357 2 50.00 TTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 - chr2R 6052689 5' - mdg1 361 2 55.48 TCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTC:1 - chrX 14815843 5' + INE-1 101 1 75.34 ATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 23043132 5' + roo 8715 2 66.40 GAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chrX 8272425 5' - roo 341 2 63.70 GCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATA:1 - chr2L 19878229 5' + mdg3 91 2 78.08 AGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCG:1 + chr2R 19076524 5' + F-element 223 1 55.48 CACAAATGAAAAAGAAATTGTCTATGAGCTGGTAATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr3R 11096656 5' + copia 40 2 58.22 GAGATATGGAAATGCACCTGGCCGCCAAACACCTGTCAGCGATTTAAGTCCTCGCAGATTGGCCAACGCACCTGTACATACACATATGTAGTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTT:1 + chrX 19458096 5' + TLD2_LTR 177 1 62.33 GCTCTAAAAGCAAAAACTAAGCCATGTCTAGATGACATGACCATGTCAAATGCAATGAAAGTGGCGACCACGTTTCTCCGACTATAAAAAGGCAAAGGCACAGCAAGCCCCCAAACCCAGACCGGCCACACCTTTCAGCAAACCC:1 + chr3R 6280453 5' + G2 9 1 56.55 TGCGTGTGTGAAATGCAATATCCGACGGTCATACGCTGCGAATGAGCAATATAGTACTGTCATTTTCCTTTCATTTTCCTTTACAGCAATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTCTTTTACTCTTCCTTTTGTGCGT:1 - chr3L 5417043 5' + Cr1a 215 1 60.96 ACTCATCGTTGAGCTCCTTGAGAAAAATAAATCAATTTCAGAATTTAATTGCTTGTATGCAGATAGGTAAAGAAATTCATGTATAAATTAACTAAAGATAAATCGCACCGTCTTGCGATACTGTTGTCGTCAGGATTCCTCCAGAG:1 + chr3L 11596237 5' - Gypsy6A_LTR 360 1 58.22 TCGGCTATTGATCCTGATCAACAATATACATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTTATCGAATCTAGTATACCCTTTTACTTTTACCCTGTAACGGGTATAAAAAGTTAGAATTGATTGCTTTA:1 + chr2L 21737999 5' - Cr1a 4257 1 72.60 AGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chrX 13651586 5' + 297 41 2 56.16 ACTAATTGCTAATGCCATTGCTAGGGGAATCTTTGCCCTCGAGGGCTATAAATCAGCTACGAACGATGGCACCCTGGAGATACATATATCAGTGGGTAATAAATGATACTTTAGTTTTCAGCCTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCG:1 + chrX 8248200 5' + invader1 3676 2 80.82 GTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAG:1 - chrX 10728900 5' + springer 7210 2 70.71 CGCAAGAACTGAGCCGCAGTGGTTGCTTATCCTTTCGCCGCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 20704101 5' - hobo 2911 1 66.44 ACACAGCATTTCCACGCAGTACCGCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr2L 18048224 5' + blood 7041 2 63.70 GTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCAACGGTCAAATTGCTGAACAAGCATT:1 - chrX 10728878 5' + springer 45 2 74.44 CTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTTTT:1 - chr2R 5900947 5' - Bari1 1666 1 58.90 GAGAGCCTAAAGCTGTCCGCGGATGTTCGAGCATCGTTCGCGTTTTTGTTGCATAATATTTTTGGGGCTCAGACAATATATATACGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr2L 5648523 5' + Burdock 33 2 63.01 CTTAAAAAAATATGTGTTTTGCTTAACGATTTAAAAAAAATATGTGTTGTTGTTGTATTTGCTGAGTGTAGACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTC:1 - chr3R 2631204 5' + 1360 3280 1 51.37 CCTTCCGCCATTAAGGGTGGTTGTTCCGCCACAGGCGGTTAGTTAGGCTTTGTTCCCTGCCCGCCGCCGAATGGACAAAGCATTTTATGTTCTGGAAGCGCTGTATGCGGTTGCGGTTTGAGACGCGGG:1 + chr3L 11403893 5' - G-element 3942 1 68.22 GGGGGCACTGCCACCCGCCGCCATAAACGTCGCGCCGGCCACATCGTCCGTGATGCCGAGCTTTTCAATGATTACGTCAAGGGAAGGCACGAAGAATTCATCACAGACAATGGCCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 9733288 5' - roo 346 2 79.45 ACATATTTACAAAACTTGTCTACAAGATGAAGTCAACTATTAATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chrX 10873755 5' + mdg3 5267 2 73.97 ACATATATGTACTAAATCGAACCTTATTTTAAATAACTAAATCGCACTTTTTTTCGTAACAAATAATTATTCCCGTTTTTACTCCTCAGCCAATTCTATATTTAATTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATG:1 - chr3L 8757217 5' + R2-element 3494 1 71.92 GGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGT:1 - chr2L 8772818 5' + Tabor 6908 2 63.01 AAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACGATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGT:1 + chr3L 20747059 5' + Burdock 27 2 65.75 CGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 16887303 5' + roo 56 2 56.85 CAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTCATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTCCAACAGCGAC:1 + chrX 14914376 5' - mdg3 5428 2 73.02 TAATTGTTTCTTGGGATCGGCTGTCGAAAGTGCAATCGGATTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATC:1 - chr3R 30731522 5' + gypsy6 7436 2 71.92 ATAAAATGCTTACTAGCTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 + chr2R 13574719 5' + diver 29 2 63.70 AAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3R 5245567 5' + 1360 59 1 59.59 AAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 + chr3R 5765338 5' - opus 429 2 69.18 GAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAAT:1 - chr3R 24228948 5' - opus 7424 2 79.86 CAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTG:1 + chrX 9955485 5' - accord 180 2 36.89 ATATGATATATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:2 - chr2R 9327040 5' - mdg3 5418 2 71.92 GCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chrX 13762613 5' + P-element 97 1 19.18 CTTGCAATATTAAAAACGTGAATGAAACTGAACGGTGCCGCTCAGTCTGCCAAAAATCAAAAAAACCAAGACACACACACACACACACACATAT:1 + chrX 4023788 5' + accord 183 4 75.53 ATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3R 23507552 5' - 412 455 2 58.90 CAACACGTTTGAGTGGTGGTATGTATGGAATGGGTGAGGAAAATTGCTGACTTGTCGCCACCTTTATGGGTGGGCCAGTTACAGATTTGCACTTGACTTGGTGTGGATTTTTACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTG:1 - chr2L 7486881 5' + transib2 387 1 70.55 AACTTCAATGTCAACTAGAAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr3R 25521943 5' + blood 7023 2 77.40 AAAAGAGGTATTCAGTTGGGTGAGTTCTAATCTTTTAATGTTGTAAATACTCTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 21924387 5' - roo 9046 1 67.36 TTTAAAGTCAAAAATTCCACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTCTTATT:1 + chr2R 12869195 5' + invader1 54 2 90.71 TATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 - chr3R 6103689 5' + Tirant 50 2 52.41 AGAATGCCTTGCATCTCGTTTTCCGTTGCATACCTTAAGGCTGCGAGTGTTAGTCTAGCGAAACAATTAATTTCGACATGTTGTTAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 - chrX 22824852 5' + jockey 4705 1 58.22 TTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 21421028 5' - roo 9015 2 58.22 ATGCTACGCATTTTATCTATCTCGTTTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACNNAGGCACAAATGTAATGATGANNTCCAATTAAGAACACAAGTNCGT:1 + chrX 983074 5' - 412 7532 2 73.97 ATATCAAGGTGCCACATAATTTTAATGCGGCCAACAAAAATGTGAGTATAAAACAAAATAAAAAGGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGTCATTAAACGGTGCTAACTGTGCTGCAA:1 - chr2L 18242371 5' + Stalker 477 1 55.48 AATATATTAGACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACGATAATGTG:1 - chr3R 8705857 5' - hopper 1396 1 72.60 CAATCAAATTGTTGTCAACATCGGCGCACGCAGCTAGCGATGAGTTGGATGTTGCCGCTAGCTGTCGCTAGGTGGCGTGTCGAACAAGGACAATGTCGCTGTCGTCGCCTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 - chr2R 19543803 5' + jockey 4769 1 76.39 AATATCATTGTGATATTAAATCAGCAATAATTTAAATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCT:1 - chr3R 21150682 5' + Burdock 30 2 62.33 TGGGATGATTTACGGTCTCAAATATTAAGTGGTTACTTCCCAAGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 16771301 5' - roo 9043 1 66.44 TATTCGAAAATAATTGCGGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTT:1 + chr3R 8542538 5' - roo 9052 2 67.12 CACAAAAAAAATGGTAGGAGAAAAAGGGAAATCCCTGGTTTGGCATAGGGCATGCGTATACTTATACTTATATATATCTCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCGGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chrX 9951497 5' - hobo 2923 1 73.97 AATAAAAGGAAATTCGTGGAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - chr3R 9289436 5' + HMS-Beagle 22 2 69.18 GGAACTGGCACTCTTTAAGACTCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr3L 9426802 5' + P-element 29 1 66.44 AAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 - chr2R 6559035 5' + mdg3 5299 2 56.85 GAGATCAAGTGGCTTGTGACTATCTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCTG:1 + chr3L 19279068 5' - opus 483 2 75.34 GCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTAT:1 - chr2R 16410080 5' + opus 206 2 81.51 GTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACA:1 + chr2L 16685347 5' + P-element 105 1 14.38 CACACTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTT:1 - chr2R 5900951 5' - Bari1 1670 1 61.64 GTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 - chr2R 6052679 5' - mdg1 351 2 60.96 GCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr3R 25443132 5' + 297 6644 2 67.81 CGTACTATACAAGGCCCGAACGTGCAGTTTGTTTTTGGCTTTTTCCGTAATTTGCTATTTTCCGAGATTCTATTCATTATGCGATAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATACATATTCTTGATCAGGATCAAT:1 + chrX 19402958 5' + INE-1 83 1 58.22 TACGTAACTACAATATTCATACAGAATACAGAATTGGGTAAGTTCAGACAGGCTCATCTAGCATTTTTACATATAATTTAGATCTTATTATTATATCTCAGACTGTTCCGCCATCGGCGAAAATCACGATCAGCTGAAACCCACTC:1 + chr2R 5260135 5' - Gypsy12A_LTR 194 1 33.56 GTCCCCTAATCGATGCTTGATTACCCATCCTATCGGAGGTGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCG:2 + chr3L 27413007 5' - hopper2 1307 2 72.41 GTAGCACCTGTACCGCTGACGCTACCAACGTTAGCGTTACCAACTATATAAACATTAGTGACAAAAATTAATTAGGCTGACACAACATACAATGCATGAGCATACGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGATCGGTTCGCTGT:1 + chr3L 4966280 5' - 1360 131 1 59.59 CTCCAGTGACCACTACTCCTGTAGCTCCATCCACTACTGAAGCTCCAGTGCCCACTACTCCTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 - chr2R 18051072 5' - mdg1 7401 2 58.22 CACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGC:1 + chr2R 5582158 5' + Cr1a 477 1 52.74 CCTTGAAGCATTTCCGACTTATATTTCCTTTATTTGTAATAGTAATTTTCCTTTTTTATTGTTAAGCGTATTTGAGGAAGTTTATATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAATTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 - chr3R 21373854 5' - 297 6942 2 54.79 ACCCTCTATCGACCCGCATCTGGCCGTGTGCGTGCACCGACCCCTCGATGTGGCGAACGCAGCTTTGTTAGCGATCGGGTGTCTGATAGCTCGACGTTCATACGG:1 + chrX 1317017 5' - INE-1 135 1 46.67 GGGGAGAAGTTTGTCACTCACTTTGCCCAGATATATAATGGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACACGGTACTCTAGGCACCCCCTTTTT:1 + chr2L 12355294 5' - hobo 2886 1 63.03 CACGCTCCCAGCCCGTCCGTTTGTCATGGTGTGTTAAAGAAGAAGGAGAAAGAGGAGATTAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTCGACAAATTTAATTGAAATTAATTGAATTTGTTTCAAACAAAGACCAAAAATTCTCTAGTC:1 - chr2R 19201451 5' + Tc1 337 1 59.59 GTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr2R 10367492 5' + 412 7134 2 71.23 AATATGAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chr3R 14088519 5' + 1360 25 1 69.18 CTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr3R 8402662 5' - mdg1 7433 2 63.64 AGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCATGTGTGAACAATAATAATCTTATTAATGCAGCTATTCAATTTACAATTTACCTTTTCGCCTCTGTTCTACTTGCCGTCTCTACAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATT:1 + chr3R 18849786 5' - roo 8731 2 52.86 CCGTTTGCTTTTGACTAAATATATTTAAATTGCATTTACGTGCTGCCGGCCCCAACCAATGGCATTCGGGGGATCTCTATATATATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chr2R 21922268 5' + mdg3 5287 2 50.00 CCACAAAGGGAAATCAGTTAAATTGATACTGGGAGGTGATGAATAATTAATTTGACTTAAAAAAGTAGAACTATTTTAAAGAAATTAAAATACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 12608198 5' + roo 8692 2 41.10 GAGCTGAACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 22255297 5' - roo 9036 1 62.33 AAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr3L 15058885 5' + blood 7095 2 72.60 TCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 - chr2L 8772833 5' + Tabor 6893 2 52.74 AAATTTTTTTGATTGCCTCATCAACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 53091 5' - roo 9025 2 53.42 AAGAAAGCACGTTATTGCCAATTTAACTTACATTGTGCATGTGTCTTTAAACAAAGATTTATGTACCCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 + chr3R 11553598 5' + hopper 16 1 75.34 AGTGGCGCACACTCACATGGTCGGTGGGGAAAAGTTGGGAATATGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 13073396 5' - accord 189 2 91.07 AGCCATCCGAATTTGAATCCAAAAATATATGCCAGAATTTCTGGACGACTGCTGCGAGTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr3R 9563591 5' + P-element 57 1 45.21 TCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 - chrX 19231833 5' + mdg3 67 2 63.45 TCTAAATCCGCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 16853426 5' - roo 9013 2 59.72 AATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 - chr3R 13494427 5' - opus 7449 2 63.70 GTGTGAAAATGAGTGGCAAAGTGGTCAAAGAGGGTTGTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 22481378 5' + roo 12 2 76.03 TCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAG:1 + chr3L 24153183 5' - Tabor 413 2 66.44 TTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1 + chr2R 5848983 5' - mdg1 7376 2 75.17 ACTCCGGAGTGGACTGCAGTGGTCCATTGTTTGTGTATGTATGTATATACATACAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATTAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCT:1 - chr2R 11064160 5' - Cr1a 4053 1 63.01 GCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 21897997 5' + 412 7091 2 56.25 GCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 + chr3L 18708616 5' + F-element 89 1 73.97 CGCACGTTGCTGCTGCTGCTGCTACTGTTGCTGCTGCTGTTGCGATCAGCGCAGCAACAACATCAAAAACAGAGAGCGAGCTCACTTTGCTACTCAGAATTTGAGGCGAGTGCTTTGGCTCTGTTTTTTTTTGCCTTTTTTTTTCG:1 - chrX 8399628 5' - Bari2 909 1 78.77 CAGGCAAGCAATTTGCCGACAAAAAAAAACAACAGCAATTGTGTCTCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAAA:1 - chr2R 5627694 5' - TLD2_LTR 96 1 78.77 AATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGC:1 - chr2R 23313061 5' + Tabor 6929 2 77.40 TACTGAAAACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGA:1 - chr3R 6842685 5' - mdg1 349 2 56.16 TGATATGGGAACTTTTGCGCATTTCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 9616547 5' + roo 8702 2 59.59 GGCTGTCGAAGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGGAATAACTAATAGCTCAGTGTA:1 + chr3R 16535254 5' - Stalker2 394 2 68.29 AACTGTACCGTGGTTATTCCATATTCCGTTGTGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACAT:1 - chr2R 11656163 5' + HMS-Beagle 6806 2 78.77 AGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCG:1 - chr3R 9289371 5' + HMS-Beagle 6883 2 78.08 ATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr3R 9163845 5' - hobo 2883 1 66.44 TATGTGGGCCGAATGGGTTGGGGTGAAACTATTGCTCGTGGGGGAGGGAGGTGTACAGATGGTACAGATATTGCTTAAATACATTTAAATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGC:1 - chr3L 10909931 5' + Bari1 361 1 52.05 ACATCAAGCAAGTTCGTAAAAAATTAAAGGGCTTAAATTCTGTGCGTTTCACTTATAAATCTGTGGAGGTTATATAGAAATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 + chr3R 18847227 5' + Stalker2 7 2 67.12 CAATATCAGCTCACAGAGCGTAATAATCAAGTCGATGAGGTACTTCCATATCTGTAGCTCCGTTTTATGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 + chr2R 16998239 5' + jockey 4762 1 54.11 GGCTAAAAGTTGGAGTCGGTGGCACGTAGTAAAATGACAAATGAATGCTCATCAGCCAGCAACAGAAACAAAAAAAGAAAAAGAAAAGGAAGGCAGGGCAGCAGACCCAGGAATGTACTGTAAGATTGGAAGAGTAGTTGATGT:1 + chr2L 2163455 5' - jockey2 50 1 77.78 GATGTAATAATTGTCAGCAGCAGTTTTGCGGTGCAAGTTAAACGCAGCCCACGCAAAAAAATTGTCAACCATCGGAATGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGGGGGCAAACTATAAATATGTTCTAATTATAGGCTGCAATA:1 - chr3L 22566697 5' + rooA 48 2 52.74 AGAACTATTTCAAAAGATCACATAGATTATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTTA:1 + chr3R 24479154 5' - 412 7504 2 53.79 CACAATCTGAAGAAAAAGATTTGTTTGCGATTATTGCAAAAATAAATGGACTTCATTAAAATTCAAATCGATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3L 4467904 5' - pogo 2052 1 53.42 TAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTG:1 + chr2L 19878142 5' - mdg3 201 2 51.37 ACTGACCAACATAAACATTCAATTTTTTATTTTCTTTCTGAATTTACAAGCACCTCATGAGTTCTTTCATTTTTGAGCTCCTGGGAGTTCTGCCCCGAAATAGAATCTCCAGCATGCGTATATATTCACACACACACACATACAT:1 + chr3L 8261101 5' + Quasimodo 37 2 45.52 AATATGCTACTAGATGGTGAAAAATAAATGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 21387451 5' - pogo 2033 1 78.23 GCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 11228573 5' - roo 327 2 71.92 GGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chr3R 25271202 5' + 412 90 2 77.40 CCCGTACTCGGTCCCGTACTGGTCCCCTACTTGGTCCCGTACTGGTCCGGTACTCGGCACCGTACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGATGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGGGAAGATATAGACGCGATATAAA:1 + chr3L 16047628 5' - Cr1a 4364 1 52.82 GGTGGTTGTTATTCGCACTCATGAGTCGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 16180828 5' - Transpac 5215 2 76.03 TCTACAAGATGAAGTCAACTATTAATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTA:1 + chrX 10873773 5' + mdg3 33 2 63.01 AGGAAAGTCAAACTAAACTGACTCAGCTGAAAGTTGTATACGTTGAGTGGCTAGCCTTGAACTTATCAACCCATTCAGGATCCCCACTGTTTTCACACCCATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chrX 12551659 5' - pogo 2084 1 73.97 CAACAAATGTTTATAAATAAGTCGAGCTACTTCCAGTTTATGTTGGAGTAGAATGTACATATATCTGCCACGTGCTCGGATCGATTTACAAAACTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATT:1 + chr3R 25737763 5' - Rt1b 4862 1 63.70 ACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 - chr3R 15649842 5' + blood 86 2 75.34 CCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr2L 535437 5' - roo 318 2 78.08 CTTTTAGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3L 6096571 5' + roo 80 2 78.17 TGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCCAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2L 1073899 5' + Tirant 8143 2 57.69 GGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chr3L 9430641 5' + P-element 84 1 28.08 AAGACTGCTTATTATAAATTAATTTATATGAGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATC:1 - chr2L 19372103 5' - Bari1 1620 1 77.40 GATATGGCGACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAG:2 - chr3R 11461882 5' - 17.6 7370 2 57.53 TTAAACAGATTTCAATCGGTTCACCGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAACATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTA:1 + chr2L 11158652 5' - Rt1b 5096 1 60.95 GCAGCCGCAGCCTTGACCTCACTGGGACACGTGTACACGGCTAGCGGGGATTACCCCAATGCCCTGGCCTCTCATAAATCCTCGCCGCTCAGGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTC:1 - chr3L 8479850 5' + roo 8917 2 61.79 GGGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr3L 3979532 5' - opus 7481 2 71.92 CTTTTGTGCGGCCCGTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 7424655 5' + 412 42 2 55.17 AAACCTACGGCAAATAAAGCAAATAGGTCACGTTCAAAGACAACATCGATTAACCATAAATTGCGAGTTAAGCAAAAGGAAGCAAGGACAACCTTAAAAGCCATCAGGACGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATAT:1 + chr3R 12816481 5' + Stalker4 7043 4 73.97 GTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2R 21380707 5' - roo 351 2 58.33 AAGCTATCACCAGAGCTGGCCGATTTCATTATCCATGAACATTAGCTTTAAAATTCCTCAACTGACGAAAGGCATCAATGTTTGAAAAACAGCTAAAATAATAAACCTTACATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAA:1 - chr2L 8087524 5' + Stalker 114 4 78.77 AATATCAAAATGCCGTAAGACGACTTAAAGCGCAATGAATAAAAGGTTGCCGCTCCAAGCTCACATATGGCAGTCGTATCGCATAAAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAAC:1 - chrX 18193840 5' + hopper 31 1 60.27 CCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACTACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAT:1 - chr3R 6053050 5' + Quasimodo 69 2 69.18 CAAAAATAAAATCACAAAAGCGTCCGGGAGGCGAACGCTTTGACTTTCGGAGGCAATAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 26399790 5' - roo 345 2 61.64 ATTCAACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGTCACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTTACGTGTCTCTTT:1 - chr3R 10778774 5' - mdg3 214 2 61.81 ATACGTCCCCGAAACTAAGTCTTAACCACTCTCGCAAAAAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chrX 17469310 5' + blood 7037 2 68.49 CGATGGCCGATCTACTCCGGAGAGCAATAAAGACCAATAGCAAATAGCATTAGGCACACTTTACACTTGGCTAAGATAAGCAGTATCCTGGCCAAAAGCGACAAGTGTCCGAACATCTCGGATCATCCAGACACGCAGAGCTGCCT:1 + chr3R 17014176 5' + Burdock 5975 1 79.45 AGATGCTTTTGTAAAGAGCAAATTTTATTTTAAAATTCCGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 8022241 5' - roo 9024 2 52.05 TGGGTTTCCACCAATTTTCTCTCTCGGAAAACCACACGCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACGTTTTTACCACTCG:1 - chr3L 13227754 5' + hobo 15 1 73.29 GCTTCCCATGACGGGAGAAAGCCATTTGGCCCTGAGAAATTTATCGAGAGACTTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTC:1 - chr3L 13313272 5' + roo 8697 2 60.27 TTGTAAACTAATATTACATTAATAGTTTTTGGCAATATATTCGAGTTCAGATATTTAAAATATTAATACAACCATATGTAAATTATATATATGTATATACAGATTTAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAG:1 - chr2L 21782057 5' - INE-1 562 1 69.18 ATAGCTAATATAGCATTTCTAATAAGCTGATCGCCACGGGCGCGATAGGTAAGATGCCCTACTGGCCTATGTCGTTTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCG:1 - chrX 20618038 5' - HMS-Beagle 53 2 66.67 TATGCACCCCGAGTATCATCTGCTTAATCACCAAAAATAGCCACCATATGGCACTCGCCCACAGAAAGCTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCGG:1 + chr2L 18894102 5' + 3S18 325 2 52.71 GATGACAGTTGGAATGAAGAGAAGAAAGCGGCTCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chrX 983262 5' + 412 7074 2 72.60 TTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 + chrX 21639590 5' - Tirant 366 2 62.76 GCGTGCCACCGCAATACCCTCTCAGGGGGTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 + chrX 22858799 5' + mdg3 5262 1 80.14 CCCATGAACAACTAGCCGATATTTACGCAAGTAAAGAAGTATGCGATATTCTATAGAGTTCCCCTAACCCTGATTGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3R 4884359 5' - pogo 2059 1 56.55 TCAATGGGCAGCAACATAAGTCAACACTAAAGCCGGGAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATG:1 - chr2L 9356950 5' + Stalker 21 4 69.18 AATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr2R 10991369 5' + jockey 90 1 71.92 CGGCATTCGTGTTTGTTTGCTCGCTTGTTTGGCTGAAATTCGCTGGCTTCGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2R 6585372 5' + pogo 18 1 73.29 TATGGCCTCCACCTTTTTAGCATCCGCCTTGATTCCGTCGATATTAAAATCAAATCTAAAAAATTGCATTTTTTACATAAATATTTTAATATTCAACACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - chr2R 5079328 5' + flea 4775 2 71.92 GCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGA:1 + chrX 18239371 5' + jockey 4531 1 52.53 CACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:2 + chr3R 25822982 5' - roo 332 2 71.92 CTCGAGACATGAAAAGCGAATTCAAGTCAAACTCAAACCGAAACTCCGGGCTCAAATCCGAAAAGCAAACGCACGTGCCGCACAAGCGAAACAACTTCATGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTC:1 - chr3L 3673116 5' + copia 4733 1 72.60 ACAAAAAACGCCGATGGAGACAAAAAGTTCTCGGCGATAAAGAGCAGATAATTTAAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCAGCGCTCACGGCAGAATGCTGACATTGCGCTTCACA:1 + chr3R 5647658 5' - gypsy4 6701 2 60.77 CACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCTATAGTTAGCTGCAACAGCGAGGTATCTGCGGTATTGTTCCATTTTTTAGTGTGAAT:1 + chr2L 13884617 5' + pogo 60 1 62.86 AGAAAGTTTAATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:2 - chr2L 1327617 5' + pogo 44 1 55.48 ACTAAAAGAAAAAAGAAAAAATCTAATAACGGCAAAATTTCAGGCAGTGCAAATGTTGTGGGCGTTAGAGTGGTCGTGCCAACATCGGTCAACAAACTTGTGTTGCGTATATGCCTCTCACAACCTTCTAGCTTTTAAAGTTTCTG:1 - chr4 349701 5' - INE-1 155 1 62.33 CCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr2R 20461149 5' + jockey 20 1 72.87 GCAGTTTGTTATTCGTTTTTTATTCATTGCTAATTGACAAACGAACAAGTACACCGACACCCCAGAAAATAATTGGTTGCGTGACCTTTGTGGGCAATGACAGCTGCGCATCGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTTTTGAGGAATT:1 + chr3L 4518367 5' - Tc1 1261 1 52.74 CGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 9938712 5' - roo 9031 1 56.94 TTCTTAGCCAAAGGTGTCGATGCGATCGTTGTGTAATCTAAGCTCTTAACTTGGCTGGCCAAGGCGTGCATATTTCGAATTAATTCGAACGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTTCTCATTTTCT:1 - chr2R 23223627 5' - jockey 397 1 58.22 ACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTT:1 + chr2L 17069566 5' + 412 72 2 70.37 CCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 - chr2R 23313084 5' + Tabor 6906 2 61.64 TTCTCAAAAACAGTTTCAGCCTGATTTAGCCAAAACGAAAGAAATTGGAAAGGAAAAGGGAGCCAGCCCAGCAGCAACAATGTTGACGTTAATAAATTATAAAATGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chrX 9710120 5' + pogo 13 1 75.34 GTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr2R 14562282 5' - Burdock 233 2 44.52 ATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATTTCCAACGTGCTTATATAAGTAATAGCCCTGCCATTGATTCTCTAATATCTTGTGGTTACACATAGTCT:1 - chr3R 9289411 5' + HMS-Beagle 6826 2 57.36 TTTCCCATGCTTTTTTAGTGGGTTGCTGATGGATAAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:1 + chr2L 12283890 5' + Quasimodo 20 2 71.23 TAAATAAATCAATTTAAACGTTCAATGCTATATCAAATTAACAAAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACAG:1 - chr3R 12363305 5' + jockey 27 1 72.41 TCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGG:1 - chr2R 20500109 5' + 412 92 2 81.51 GGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTT:1 + chr3R 10778670 5' + mdg3 5337 2 74.66 GTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:2 - chr3L 3540255 5' + mdg3 26 2 66.44 TAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACAT:1 + chrX 18239365 5' + jockey 4572 1 63.70 CAACCAGAAAAAGGCAAATGCCTAAAATAATAAATTTAATTTAAATAATAAACAAAGCAAAAAAAAACAATATAAATTGAATAATGTTAATTGAGTAAAAAAATTCTTCCCATACGAATTTTATGCATACAGAAAATGACCTGCGG:1 + chr2R 8069949 5' + hobo 2728 1 46.58 TACCAAAAAACATCTAGCTTTATGTAACTTATTGGAAAATATATATTAGTTTAAGAGCAGTATTTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTT:1 - chr2R 14552808 5' - mdg3 5211 1 56.16 ACACAAACAAATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 9616696 5' - roo 9036 1 60.96 CTCGGACCACTTTTATACTCTAAGCTGGCTTAAAAGAGCGGAATATTTAAGCATTAGCTATCATAAGCAAATATAAATTAAACTTATTGCGAAATATATAATAGATTGTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAA:1 - chr2R 10163684 5' + Juan 4093 1 73.97 GAGAGCTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chr3R 22846724 5' + 412 7135 2 73.29 CATTCTTGGTGTTTCCATAGTAGACCGACTCCCGGAAATAAACGTTTATCACGGCAATATTCTTTTATTTCCCAATTTCTATCGATATACCAGAAAAATTATGATATTTCTTATTCATGTACGTGGCATGACTATCCCTCTTTATT:1 - chr2R 22429135 5' - invader5 255 2 57.53 AATGGTAAATGTAGCTGCTACTCATGAGCTTTCAAAAACTTTTCCTTCCCCTAAGAGAAAATTTATAGTTTCTGTAATGTTGTATAATGCATATAATGCATTTTCCTTTGCAGAGTAGTTCCCCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTAC:1 - chr3R 9098925 5' - Osvaldo 17 2 63.70 CGGCAACGCCAAAGAGAGTTCTCTCGGGTGGCGCTCGTCTCCCATCGGTTTCGCTGCTCGAGCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3L 131717 5' - P-element 2830 1 46.58 TGGATTAGGTAGTGGTGCCTGATCCGGCACCCATAGATGTTCGGCGTCTCTCTTGTAAAACCGGGACATATGTCCATACTCCAGACACAAGCACTCAACAATCATTTCCTTATTA:1 + chr3R 3877473 5' - 1360 445 1 68.70 TGGTGTGGAACCCTTGCGCTGTTTTAGTTGGTGAACAGGAAGGGTCCCAGCGATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGA:1 - chrX 9755304 5' + invader4 120 2 64.38 GGCAGAACCCCAGTTCCCCCATTCTTCTGCCCCCACTTTACCCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATGT:1 - chr3L 16887435 5' - roo 9037 1 61.64 CTCCAAACCAATTTCCGTGATGTCAGAGAAGGAGAGATCGCTTGAGAAAACGTTGAAGGTGCTTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTA:1 + chr2L 20638345 5' + Doc 61 1 55.48 GCTGAGAACCAACAATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chrX 5222989 5' + 412 30 2 63.70 GAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr3R 15649860 5' + blood 68 2 68.49 ACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCAC:1 + chr2L 16107309 5' + Rt1b 175 1 70.55 GTGATTTTGATCATTGGGGGTTGAAACGGGTTATAAAATGACAAACACTTCAATTCGACGATCACTTTAATCAGTATGTATGTACAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCCATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3L 21387557 5' + pogo 30 1 65.07 ATTTCATACACACTCTAAACACTCTAAACCGAAATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 4722529 5' - roo 396 1 76.71 CCGAGGAAAGCTAAGTTTGCAAGAAAACAAACGAAAGCAAAGGCAGTTGATAATATTACTGGCGCGTTTGGTCGAGCAATGCATCGCGCCGCCACAAGCCGGCAAGCCGAACCAGCATTTCTTGCAGCGTGAAGCAACACT:1 + chr2L 21263054 5' - gypsy 7121 2 51.06 AGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACACTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chrX 18366020 5' + jockey 74 1 64.38 AAAGAGAAGGAAGTTTACCAAAACATCAGAGAGCCAAGAGGAACCAGGCGTGCGTGCAGTGAAACTTATTGATTTTTTGCCGTCATTATACCCGTTACTCGTAGAGCAAAACGGTATACTATTATAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 + chr2R 4407281 5' + INE-1 13 1 56.85 TCACACCAGACACAGTCTTGTAAGCTGTGGAAGAAGACGAGTTAAATGATTAGTTTTAGGTTTAAACTATAGAAAACAACAGATATGCGGATCCTTTCTTTATCAGCTCACTCGTCTTGACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCA:1 + chr3R 12626204 5' - R1A1-element 413 1 75.34 TAATTGCTGTAAGATGAAATTATTATGCGAAATGCACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:1 + chr2R 12085047 5' + Stalker2 88 2 76.71 AGGATATCCGATGGTGTCTATACTATAATTTTCCGACCCCCTACCTGCCGTCTAATTCTTCCGGTGTCCCCGCGTGAATGTGGATCCGCAACCCTTTTCATCTCCAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 + chr2R 6052543 5' + mdg1 7055 2 74.66 ATCAAGTGGCGCCAAGCCACAAATTGTTTCGGCTCGACTCGGCAAACTGCAAACTCCAAACTCTATATTATGAAAAAATATCCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAGTCTTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGAACAT:1 - chrX 4450297 5' - INE-1 123 1 57.53 GCCAGGTCGTAAAGTGCCCGCCACGAGTATTTACTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr3R 15514669 5' + 412 8 2 79.31 CGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 22429239 5' + roo 57 2 56.16 AAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGC:1 - chrX 19231840 5' + mdg3 5313 2 58.90 AAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAATATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACATTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2L 22746329 5' + 1360 54 1 63.41 GGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 17614391 5' - roo 332 2 69.86 CTTATATGCACTTGATAAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 - chr3L 19274926 5' - transib2 2799 1 67.81 GCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGC:1 - chr2L 17228686 5' - mdg3 5409 2 76.71 AAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1 + chr2R 11656017 5' - HMS-Beagle 178 2 65.75 AGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAG:1 - chr2R 24338425 5' + 1360 90 1 80.14 ATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCTC:1 + chr3L 3540141 5' - mdg3 5414 2 69.86 CTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGGTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 22481329 5' + roo 8724 2 59.31 CCGCCTATCGTTTTTGGCGCGCGCAAGCGTAAGCTCTCCCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chr2L 16685275 5' + P-element 33 1 63.70 GTTCTCTCCGCGGAATTCAAGTCTTTAGGTCTATAGATTTATTTCTCTTTAGAAAAGTACATCTTATATATTCTAAAATATGAACACTTTAAATGAAACCGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATACTGCGTTTCTCTCGAGCCCCC:1 - chr2R 21435299 5' + X-element 367 1 47.95 TCTACCTTATGAATTCAGAAAGTGCTTAGCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 - chr2R 9072985 5' + Burdock 6164 2 65.07 CATTTCAATTTCAATTTATATGAGCAAAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 - chr3L 13597898 5' - blood 7380 2 78.77 AGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr2R 21078412 5' + jockey 65 1 54.11 CACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr2L 19424660 5' + Tirant 46 2 57.85 ATATTTTAATTTTTGGATATGTTCTCCCTTATCTCGAAAATATTTATTAAATAGACATGAAATTAATTAACTTTAGTTAGCATCTTCGCACGCAATTGGTTAAGCGTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGAATCTT:1 - chr2L 12955621 5' + 1731 4574 2 72.60 CATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCA:1 + chr2R 5582160 5' + Cr1a 479 1 51.37 AGCTTTGCTGGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr2L 19878268 5' + mdg3 5304 2 52.74 AAATCTCTTAACTATATATTTCTATCAACTTTTTTAATCCCCGTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 12843666 5' - roo 8992 2 72.60 AAAGGTCTGAGAATCCAAGGCAATCAATATCGATAAGATAGGTTGAAACCGATTGCAAGTATTGCTTCTAATAAATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr2L 7991254 5' + 297 41 2 58.22 ACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr2L 17162774 5' + blood 7083 2 67.12 GACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3R 8705848 5' - hopper 1387 1 66.44 GATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 22255320 5' - roo 349 2 57.53 TTTACACTGCCGCTTCTTCTTCGCCTTTCTTCACCCTGCCTTTTATATCAGGCAACTTTTTTGCAAATTTATAATGTTACCAGTCCATGTCTCTGTCCATAATCTAAGCTTACTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAA:1 + chr2R 21250669 5' + HeT-A 5999 1 44.52 TTTTATTCTTATGAATATACCTTTTTTTTTGTAAGAACTATTTCAAAAGATCACATAGATTATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:1 + chr3R 24479122 5' - 412 7536 2 74.66 CACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3L 16887379 5' - roo 8981 2 76.03 TCACAACGTCATTGTGTTTTATCGTCTTTATCTCAATTACATCCAATGGTGCGTATAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCT:1 + chr3R 929327 5' - 1360 3323 1 62.33 CGCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2L 18048246 5' + blood 52 2 50.68 TTTGATTTTGTTTTGTTTTTTCGGATTACGGTTTTGTTTTCGGTTTTGGATTTGGAATTTTTGGTCTGCGTTTTTGGGGCTCACTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3L 15830993 5' - roo 9035 1 59.59 TCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr3R 10142924 5' + 412 7107 2 53.42 CATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTT:1 + chr2L 15142273 5' + BS 4791 1 78.26 CGTTCCCCGGGCACTTCAAAATAGGACGGCAGTGATCAGGTGGATATACGAATTGATAGTGTCATACTTGCTATTGGAGTTTGTGCAGATGTTTTGGAAGCCAGTGGATAATTATTATTTTTATTATTATTATGATAGATAGAAT:1 + chrX 5853987 5' - I-element 5347 1 74.48 AAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 + chr2R 11379739 5' + jockey 94 1 73.29 ATGGAAAAAAAGGTTTGAAATTTTAAGGGTTTTCCGGTTTCCAATTGGATATTGTTGCTACTATTCATAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 + chr3R 13056722 5' + jockey 4812 1 56.16 GTTGGGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:3 + chr3R 16194104 5' - mdg1 7415 2 54.79 ATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTA:1 + chr3R 23108066 5' + G-element 74 1 64.38 AAACTTATATATAAGTTTGTTAGTTTCAAAACGAGTAATGAGACTAATGATCAAATAACTCTATCTGTAATAGAGTTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - chr3R 20909029 5' - I-element 5301 1 52.05 TTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr3R 9163937 5' + hobo 72 1 69.86 GCAGAATTTGGGGCATAACAAATATTTTCAGAAGGATATTAAAAATCCTAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2R 9867098 5' + roo 8736 2 69.18 TTAGGCTCAAGTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTCGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chr2R 16409989 5' - opus 7463 2 59.03 CAGCAGCTTAGCCAACTATAACTGTATGCAAACACTGGAAAAAATGTAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGA:1 + chr2R 19903982 5' + Doc 4439 1 63.70 GGAAACAAACAAATGTTGGAAATGCCGGTGAGGAAGTTGAGTTCGTGGGGTTCGATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:2 - chr2R 8686686 5' + hobo 28 1 66.44 ATGAGCTATCTAGTATATTTGTCCCAAATTTCGGGCCACAATGCATAAAGTGCAGCTCTCAAATTTTTTTTATACACGCACATTAAAGCTCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 + chrX 21086067 5' + jockey 4704 1 54.79 CGAAAGTCGGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3L 9426659 5' - P-element 2841 1 52.08 TTTACCATTTAAATCAAGCGGGCATTGCCTCCATAACGATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chrX 16982241 5' - roo 8990 2 74.66 GTCACGTATGCAATCTGTGAAGCACGTCTCGGACAGTTTGTTGTAGGACATTAGGAAGTCGGAAAACTGAAAGTTAGAACCGAAAACATATCAAATGAAAACCACATTGTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCT:1 - chrX 13385544 5' - Doc 47 1 76.98 AAGAAAATAAAAAAAAATAAATAAAAAACAACAAACGTAA:1 + chr3L 1368818 5' + gypsy7 5018 1 82.50 CAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr2L 17228696 5' - mdg3 5419 2 69.86 CCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:1 + chr2R 14562130 5' + Burdock 80 2 76.71 GTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1 + chr2R 6984293 5' + HMS-Beagle2 6928 2 54.48 CTTGCACTCCCTGAACTTCCTGCCAACGCACGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3L 20290800 5' - roo 9037 1 60.96 CTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCA:1 + chr2R 6984327 5' - HMS-Beagle2 7097 4 45.21 AGCATTCGGATGATCAATGGGACTCGAAATGGGTTGGCCCTCTCCGGCCGGGGAGTCCAACTTCTAAGGAATTTCGGACCAGTTTACTATAATTGTCAGCTGAATCGTTTGCCATTAATACCATCCGGCAGCGGATGGTAATGTTT:1 - chr3R 6049764 5' - Quasimodo 6908 2 79.45 TATACATACATTTTAAAGAGTATATTGTCAATGTTACATAGGCCTTTCTGACGGACAACAACCGCATAACAAAGCGCTTCGATTATCTTTAACATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACG:1 - chr3R 12468172 5' + invader1 3638 2 65.75 CAATAAAAAAATTAGATTTTTCACAGTTTCGATTAGATCACCTAAATCAGGAGGAAACTTTCAGAGAACAATATTACACTTTACATACATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 - chrX 15211743 5' - 3S18 305 2 60.96 GAACTTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 31956367 5' - pogo 2075 1 64.39 TGTATGTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAA:1 + chrX 5439981 5' + accord 57 2 57.53 CTAACGGTACCAGCCCTCTAAACTGGGCCTAAATAACCATGCGTTTCATGAGGCCCATAAACCTGGCAAACGTTTTATTTGATTGTGTTGGGTTGGGATGGCCCCCTACGAAATCTGCGTTTTAATCTTCTTG:1 + chr2L 9610137 5' - Porto1 4520 1 82.71 TAGACTTCGCCCCAGACTGACAAGTGATCTTGGGGCTATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3R 4885276 5' + 1360 17 1 73.97 GTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr2L 9167532 5' + pogo 67 1 62.76 GTCGCGAGATGGCAACAATTTGGCTAAGTTTCAGCTATATTTCCAATATGGAAAATGAAAAACAAAGAGAGCATCAGTATACAAATAAGATTTCTTAAAATAATGTAGTTAAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCA:1 - chr3L 14571103 5' - HMS-Beagle2 7070 2 39.73 GTGAATACAACGTACCATAAATATTCAAGCGCGCCGCATGCTGCACTCGTCCAGCCCGATTCTCCGCGATCAAAATTACTTAAAAAAAATACCAATCCCAATGAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAAC:1 + chr3L 7175410 5' + I-element 264 1 52.05 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACCCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 4571527 5' + blood 52 2 62.60 TGATTATTTCACAAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 - chr3L 20925850 5' - Transpac 249 2 60.69 ATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAGGAGAATC:1 + chr3L 3762240 5' - roo 331 2 75.74 AATGAACTTTGGATGAAGCACAGATCATCACTAGTTATCATTGAGCGGTGTATCAGGGGTGGCGCCAAAACCGTGCAGAACACAAATAGTGAATTAGTTTTAAAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATG:1 - chr2R 328244 5' + Quasimodo 397 2 71.23 TAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr3R 21237852 5' + Doc 29 1 65.07 GGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 - chr3R 5765428 5' + opus 7068 4 65.75 ACTCCACTTCAAATTCGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3L 7434979 5' - pogo 2069 1 67.12 GAGGAAGTTTAAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACAT:1 + chr2R 544792 5' + HMS-Beagle 69 2 66.21 GAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 + chr2L 19424677 5' + Tirant 51 2 68.81 ACTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2L 20984256 5' + blood 7029 2 70.55 CAGTGTATCTATTAATTTATGAACAGCTGATATGGCTTAAATACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 - chr2L 2357425 5' + P-element 13 1 77.40 GGATACACGAAGTTTTAAATTTAAACACGAAAATTTTAATTACTTTTGTTTTCGACTGCATGGGATTTTCTTTTAAATTGTAATCAACACACCCTACACTACTCTGAATGTACCCAATAGATACATAAGACTGTCATATGATCCTC:1 - chr2R 2339856 5' + Idefix 6937 2 55.48 TTTCATTGTGCTTATTGTTTTGGGATAAAACAATTCAATATCATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chrX 10873882 5' - mdg3 5419 2 70.55 GTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3L 22481310 5' + roo 8733 2 70.37 CCCACAGTTTTCCTTGCCTTTTCTCCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGCGGGTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGC:1 + chr2L 17198027 5' + R1A1-element 5019 1 68.00 GCCAGTTGTTTGTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 15832961 5' - hobo 2909 1 63.01 ACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACG:1 - chrX 8626282 5' - Burdock 6311 2 76.71 CTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr3R 25271173 5' + 412 61 2 56.16 GTTGACTACTTAAGAAAATTGTTTGTTAACTTTGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 - chr2R 20362346 5' + diver 5904 2 74.66 GTCAACTTGACCCTGCCCTGCGAAAAGGGTCGTCGGACAATAAATAATACGACCTCTAATATGGTGGGTGGTGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGG:1 + chr3R 28410122 5' - blood 7045 2 54.11 GGCGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2L 12142558 5' + hobo 63 1 60.27 GTGCGACGTACGGTTGATGCTGCATGTTGCATGCACTCAACACATGTGCAACATGCGGCATCTGCGGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCATATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTAGCAGTACTGGGTAGACCG:1 + chr2R 9931851 5' + accord2 183 1 56.55 TGTGTACGGGCTGTCATCTTTTGTTCGTTGATCTTCATTGACTGACTCTTGGAATTTCGCAGATCTTTTGTCCATCGCATATATGGCATTGCCAAATAAATATACTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCGGTGTAATAGATATTG:1 - chrX 11850585 5' - Stalker2 384 2 69.18 CACATCGATCGATATGCTGAAAATTTAGTGAAAACATTTGCATGTTTGTTTCTCAACAAAACGAATTTGCAACAAGCAAGCAAAGATTATATGTCAATGCAAGTTAGCACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGA:1 + chr2R 2923348 5' + Gypsy6A_LTR 24 1 63.01 ATGAAATAAAACCAACACCAGATTCAGTCCCACTCCAGAGCACAAAACAAAGCTTAGCCCCATCCCATCTGATCCCAAACCATACCATACCATACTATACCAACCCATTCCCCAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATT:1 - chr2L 7862041 5' + 1360 3100 1 79.31 CACATCAGTAGAGTGTCCCTGCTTCGCTACCACCACCCATCATCTTAATCATCATCATCATCATCAGCATCATCGTTCGGAGTCTTCTTCTTGTGCCTTTGAATTGCTAATAAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr2R 12742019 5' - P-element 2841 1 76.03 CCTGCCATATATAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAAAA:1 - chr2R 13953763 5' + Doc2-element 253 4 80.00 AATGGTCGAGAGACTTGGAGTTGTTTGCACATTCCTTACTAATCTATATATTCTTCAAATTAAGCGAATTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCC:1 + chr3R 15289446 5' - F-element 4585 1 53.42 GAAAATAAATTAAAAAGAAAATCCACTAAAATCGTCACTGTTTGTTACGTGGGAAGTTGGGTAGTTAGGAGGAAAAGTAACCAATTGGATTCTAATCAATAGACCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAAAGGAGAGGG:1 + chr3R 26034021 5' + invader2 136 2 70.55 CGGATCATAATGTCAATGTTATTGCCGACTGTTGACAAGGACAATCGTTGGGATGGCTGCTCCACCGCGTGCTCTGCCAGAAGGATGGTCTGCATGGATGAGGTCATATCCGCTGATATTAAAGTGGGATCTGGGGGAGAAGTGGG:1 + chr2R 4878484 5' - G6 1720 1 65.75 ATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATT:1 - chr2L 15153347 5' - G6 1968 1 54.79 ATGGGGGGAATTTCTCTTCTGAATTTTCCAGCTACTTTGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 18846459 5' + roo 8685 2 71.92 GCCCTCCGTTTGGGTTGTTGTGGTCAAAGATTAAAACAACATAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCTGGTGTTCTGGTGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTCG:1 + chr3R 7142816 5' - HB 1354 1 78.77 ACACTGAAGGCCCCATACTCTCTGTCTCTCGGGTCTTGCTGGCCATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTTGG:1 + chr3L 13721991 5' - blood 343 2 61.64 ACATAATTAGTAAAGAATCTTTTTTGAGTGCGCTCATGCTTTGTGCAATAAAAAGGATACGATGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chr2L 17747395 5' - Tirant 8454 2 55.94 CAACATCAGCGACATTTGTCACAGTTTCTTAAAGAACATTTGAATATCCAAAGCATCATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 + chr3R 15974716 5' + P-element 61 1 39.26 GTTCAAAAACAAGCCAAGCGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3R 10140159 5' - P-element 2850 1 55.48 ACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATGTCTGCATTATTTTT:1 - chr3R 11526887 5' + pogo 42 1 56.94 TTTTAGCTTCAATCACATAGGCAGCAGCTGATGCAGCAGACCCAGATTTTTTTTTTTACTCACTGTTCACACATGAACCCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2R 16908582 5' + roo 41 2 55.20 ACTCGTTTAATGGAGAGCCGCTCGTTTTGGGCGAGATCTGTTAAGGGTGGTAGTGTGGTGCTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGCGATGAGTCTTGCTACCTT:1 + chr3R 6240233 5' - X-element 4305 1 72.12 CAATCCGATATACCCCACGATATCAGTTCGTACCTTGTATAATAACTGTCTTTGGTAGTCGTTCCTAATCCTAATCATTTTTGAACGCCTCACGAGGCGTCATAAATGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAG:1 + chr3R 18030739 5' - Doc 456 1 73.97 CAACATGTGCTAGCTGAGAACACACACTATCAGGATCTAGATTTCTTATCGAAGGAGTCGTCAGCATGGGGATTTAGTGATCATAAATTAGTTACGTGAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3L 19146732 5' - pogo 2085 1 73.29 ACCACACCAATGCCGTACAACTTTTAATATTATTAATGGGATATTTGTGGAGTCATATGGTATAAATGGCATTTATAACTTATATATAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 + chrX 15227363 5' - flea 4963 2 58.90 CTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGGGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3R 25271155 5' + 412 43 2 55.48 ATTTTTGTGACCTCTTTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chrX 21668665 5' - mdg1 411 2 67.12 AATGTATCTTTCGAATGCGTGCTGCTATCTGCAAGACTTTTGCTCGCCTAAAGTTTTATGAAATTACTTAAAAAATGGACTACTTTCCTGTTACAAGATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr3R 6827884 5' + flea 22 2 69.18 AATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3R 23664519 5' - pogo 2072 1 66.44 GTCTTTTTCGCTTTTTCTCAACGAGAGAGAGCTTTCGAAATGCTTGTTAAGCTTAGAGCTTGGTTAATATGGTTTTTGTCTCTACTTTCGTAATATATTGAAACCAATCTGGACCTATGTCTCACAGTTATGGGGCAATGTCAGCA:1 - chr3R 27657093 5' + F-element 4280 1 63.70 AATAAGAAAAGTCAATATAAAGTTATAAAAGATATAAGTCTTCGTCATATATTAATAATATAACATATATGTAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAGCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAG:1 + chr2R 2338910 5' + Quasimodo 53 2 60.96 GTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr2R 18722037 5' + 412 52 2 53.42 CATAAATGTGACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATT:1 + chr3R 20147861 5' + 1360 299 1 52.74 CAATTTGAATACTTTGTTGATATTTTTCCGAATAAATCTCTGCTGACTACCTATCGATATCACCGATAGTGTCATCTCTGTCCTAGAAGTTAAACCACAGATGCTCATCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTA:1 + chr3R 19644964 5' - Tirant 8057 1 71.92 GCTCCCGCCGTCTGGTTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGGGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr2R 17100113 5' + P-element 94 1 16.06 CTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGCACCCCACACTTATATTAATTTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCAT:1 - chrX 21907811 5' + accord 431 2 68.49 TAAAGAGTTTAAGTATAAACAACCTAACTACGCGTTTAACAGCTTAGGGAAATAGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr3L 11666022 5' + pogo 65 1 67.81 TCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr3L 13597832 5' - blood 7314 2 70.55 CCCTTACCGCCGTCAGTCTGCTTGGCTTTTGTGACCAGATGTCAAGAGGGCTTACCCCGCTCGTTTTCCATCTTTTATGTGTTTGTCTCTATATGCAATTCAATTTATTCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAAC:1 - chr3L 9917856 5' + INE-1 556 1 71.92 CCTAAGCGGGCGATCTCGCTCCCTAAATAATAAAAAAAAATGGCCCCTGTTTTAAACGGCTACCTATGTGGAAAACCAGCTTTTAACATTGAGGGTTGTTCCGGAGGTTTGTTCTCGGTCACCAGAGCCTCTGCTTAGGCACCAGC:1 + chr3L 25674205 5' - Rt1b 235 1 26.71 TTTTTCCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr3R 18665246 5' + 1360 58 1 63.01 ATACTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACGCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 24693543 5' - hobo 2899 1 59.03 AAGCTTTCCCTCTGGAGAAGATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTGTAGTCTAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTCCTTTGCACAATGCCT:1 - chr3L 15261400 5' - pogo 2078 1 69.18 AATGGAAAATTTTTTTTTAGAGGGCTCGGCCTAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGTCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCTATTTGATTTTGAAGAT:1 + chr2R 11655966 5' - HMS-Beagle 230 2 71.72 CTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTT:1 - chr2R 5900923 5' - Bari1 1651 1 61.31 ATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chr3R 20292432 5' - pogo 2031 1 70.83 GAGGATGCCATCGCTGGATATGTCCGAGATTACCTCATTGGCATTGTATCCGCGGGGCAGAAGGTACTTCCTCACAAAGTGCCGCTCCACCAGGCCATTGGAACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAAT:1 - chr3L 9375963 5' + mdg1 7059 2 71.23 GAGTAGTCAGCGCCTAACGCTCTTGACATTCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:3 + chr3R 15465433 5' + mdg3 17 2 73.29 AGGTATGGATTCATTCAAGTGCACAAACTGGGGGATACCATTACACAGTCAATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr2L 10832392 5' + Doc 15 1 78.08 GTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTATTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 + chr3R 25876887 5' + mdg3 5339 2 73.97 ATCTGGCGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGATGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3R 15649881 5' + blood 7031 2 63.87 ATTATCTTATCCGCTTTCTGTTATTTCATATTTGCGCTTTAATGAATTTTAATGCTTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 + chrX 13061662 5' + mdg3 18 2 72.60 GAAAAGAGAGAACTTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACGTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3R 31956358 5' - pogo 2070 1 64.38 ATAGGGATCTTCAGAGTTTTGGTTTTTGGCTCGGTTTACGCATTTTACTGGAATTTCGTCGGCACTTCGTTTATGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATC:1 - chr3L 14967852 5' - P-element 285 1 55.48 AATTGATAAAAGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGCGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr2L 15621993 5' + hobo 2 1 77.94 AAACTAAGGATTTGTGTAATTGATATATGTTTGATCACCATCTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGATTTTAGGAGAAATA:1 - chr3R 12787211 5' - 297 320 2 72.60 GATTGCCAACAGTATCAAGGATAGTGATAAGTGATAAGTATCTTTTTTTATTACCTCAAAATTATACACTTATACTAAATATTAAGTTATTATTTTGCATAGTATTCCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 18149939 5' + hobo 13 1 73.97 GAAGCGACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATTTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr3L 131824 5' + P-element 56 1 47.95 TGTGACCCGGCTGCATCAAAGCGCTCATCACGGCAAGAAGACTTCCGTGGGTTCGGAACTATCTGCCACTGTCGACGTGGCACCCGCCAACGGGGATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTGATTGT:1 + chr3R 12671535 5' - HMS-Beagle2 274 2 65.75 AGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 24693579 5' - hobo 2893 1 62.28 AATTGCCTAGGAAAACAAATAAACATTGATTGAAATATAATTTCAGCGAGGCGATGTGGCTTTTCTAGGGTGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chrX 9342432 5' + 1360 49 1 53.42 ATGACAGCATTGTTGTAAGGTAGGTGGGGGCATGCGATTTGGCTGAGGGTAATATAAGACTGACACAATTTAGTCAGCAAAGTGTTGTTAAGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 + chr3L 8067471 5' + copia 4898 2 65.75 GTACAGCAGCAGCTGGCAAACAATTCGGCCGGCAAAAACAAACATCGCATGCTCCATAAGCATTCATGTACATACGTCTCTATCTACATATGTATGTAAGTGCGTACCTAACATCGTACATATACTTCCTTAATGCAATTGGCCTA:1 - chr3R 17488761 5' - gypsy3 6806 2 75.34 GTTGGGCAGACAGATGGATACGGTTAGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 3322492 5' + 1360 55 1 75.24 CAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTT:1 + chr2R 13574779 5' + diver 88 2 77.93 AAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chr2L 6074102 5' + BS 43 1 53.42 ACTATGACTCCGAATGTCTATTAAAATTTATTCGAGCGTAAGTACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr3L 15371246 5' + Transpac 18 2 73.97 CGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 - chr2R 7223731 5' - blood 293 2 77.40 CTGCAACAAACTATCAACTGCACAACTCCATGCAAAACTCATGAGCTATGCTGTGCATAAGCTGCTGCTCATGCATATCCTAGTGGCATATTTCCCCTTTTTATTTTATTTTTATTCTGACTCATAGTTTAATTATTTAAGATAAC:1 + chr3R 12945519 5' - F-element 171 1 78.08 TTAAGCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2R 8305199 5' + blood 7063 2 54.11 GGTTGTAGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCCGCTTGCCTTCTGGTCCCATGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTATAATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATG:1 + chr2L 11867243 5' - BS 5071 1 65.75 GGGGTAAATACAAAAAATAAAAGGACAACAAAATCGTTTTGTTTGTGCTCATTAAACCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGG:1 - chr3R 9382490 5' + 412 479 2 61.64 ACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAGAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr2L 4416064 5' + jockey 88 1 69.66 CTTTCTCTTTCTCTCTTTTATCAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGTGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr2L 12142682 5' - hobo 2918 1 64.18 GCCTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 + chr3R 3527044 5' + Tabor 16 2 74.22 GGCAGGAGCAAATCTACGAAATAATTACATTTTCCATCTACACCTGAAGTGGTTCTCCTTTTGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTT:1 + chr3R 28203471 5' - accord 7213 2 58.22 GTTTTTCCGCTCTTCCGGTTTTTGTATGACTCAGAGTGGGTAAGCGCCATTCAACACGTAAGCGCGATCATAAGTGAAACAAACACCAGAGGAGCTTCGGCGCATCAAAAAAAAATTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGA:1 - chr3L 22870307 5' + Stalker 6782 2 72.60 GCTTCAGCCACAAATTTTGCGGCGGCAACAGCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGGGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGTTGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAG:1 - chr3R 31907414 5' - Tirant 8448 2 65.55 AAGTCTGGCGACTGGACAACAGCTGAAATAAAGCCCATGTTCAGTTGTTACGGACACAGTTCGCGTGTTATGTGCGTTGTTATACTTAAAATCGGTAAGATTTGCTTGAAATATTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAG:1 + chrX 15770461 5' + 1360 3299 1 78.62 GACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chrX 12558311 5' - Transpac 241 2 74.80 TTTATTGAATTCAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:2 + chr2L 1449561 5' + opus 7037 4 60.96 GGAAATCAGCTGATTATGACTATGAACAATAAAGTTTGTAAGTCAAACAACGATTTTTCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr2L 14359035 5' - pogo 2040 1 62.33 GTCAGCGAATGATGCACTGAATATCAATCAAAAATTTAATATATAAACGCGCCTTCTTAGCTATACGAATACTGAAAGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3L 18835266 5' - pogo 2083 1 69.92 GACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr3R 25876836 5' + mdg3 5267 2 72.80 CATAAAATTATAACATTTTATTTTGAGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 - chr3L 17667688 5' + F-element 12 1 71.23 TTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACACGGTACCTATAAGGACACAGCAACAC:1 - chrX 17469236 5' + blood 7044 2 64.56 ATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2R 21897991 5' + 412 46 2 51.37 ATATAAATGACACTCCTCGTGAAATCAACTGTTAGTTTCCATCATCCCATCAAGCAAGCTATGGGGCTTTCTATTGGCAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 20905527 5' - pogo 2084 1 73.97 AGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCC:1 + chr2R 19076556 5' + F-element 257 1 78.77 GTAAGTGGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3R 15030773 5' + jockey 64 1 54.79 GCAGAGCTCGAGGCAAAGTTTGTGTGGCTTGGTCGGCAAGACGGGTTGTTGGTTGGCCATAAAAATAAAGGAAATTGGACGATGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 + chr2R 18876566 5' - roo 315 2 56.16 AAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr2R 10453470 5' + mdg3 40 2 43.15 AAATATTCGCAAATTAAATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3R 22846656 5' + 412 14 2 76.71 CCATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGTGTTAGTGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr2L 17747549 5' + Tirant 8123 2 73.10 GGTGGGTGCATGGATAGCTGGGTGGTTTTTTGGTGCGCATGCACACGTATGTATTTGTAGTTTGACTAGAAAGCTACTACCTAAACATATGAGTCCATATGTAATACAGAAGGTATTGAAAAATGATAGGTTTTTAATCTAAGATG:1 - chr3L 12642433 5' + invader2 4626 1 55.48 CGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3R 23664482 5' - pogo 2035 1 63.01 CTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr2R 18123390 5' + 412 7084 2 58.90 CGATGATGAGGAGCGTGAGTCCAAATATGGACGTGTCTTCGCTGTCTCCGGTCCTGGTAAGCACCTAATGAGTGGCCGAAACAGCAAGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCACAATCACAACGAACATCTTTTGGTTCAAGCTTCAC:1 + chr2L 12975657 5' - hopper 482 1 49.66 ATTGGCCATTAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 - chrX 8200347 5' + flea 4764 1 80.82 TTATATTTGCCACTTGGTTTGGGGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 - chrX 12558356 5' - Transpac 267 2 56.16 TTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCC:1 + chr2L 18235431 5' - F-element 4585 1 80.14 CTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2L 12355377 5' + hobo 39 1 51.56 GAAAAATCTTAAAAATTGAAACCAAAATTGAGCGTTCTCGGAGGCGATGAAATCACAAAGCAAGACATGTACAAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAG:1 - chr3L 7280491 5' + mdg3 5070 1 54.11 ATAGTTTTGTCAAGACCGCAGAGCTGCGAAATCACTTGGGTCAGTAAGAAGTAGTTGTGGGAGAAATATCTCCAAAGAAATGCTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAA:1 - chr2R 17144217 5' - pogo 2066 1 60.27 GAGAAAAGAGAAAGTTTAATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:2 - chr2L 1327625 5' + pogo 36 1 60.96 ATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chr3R 10142946 5' + 412 7129 2 68.49 AATATGAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 14088519 5' + 1360 20 1 71.63 AACTGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:1 + chr3R 9289285 5' - HMS-Beagle 6996 2 52.48 AGTTTCGTTAACAGCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 - chr2R 14001076 5' - P-element 2788 1 15.00 TGAAGTTCCGAAAGAGCAGAGCTGCGGAAAAGGGGGCGGCGGAATGATAGCTGACCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 3967020 5' - hobo 2921 1 71.64 TAATACCAAATACGATTTGCATTTATACAAAACTAAAGGGTAGCAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACGTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAATCTTATACATT:1 + chr2R 9326986 5' + mdg3 70 2 68.53 GCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chr2R 7223652 5' + blood 59 2 58.90 CTAGGTGAACTGCTCGGCGATTCAAAGTCCGATCCTAAGGTCTCGTGGGTTTTTGAGAACTTGTGTGCAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr3R 29797435 5' + blood 55 2 56.85 GACATTTCGCAAGAACTGAGCCGCAGTGGTTGCTTATCCTTTCGCCGCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr2R 20704094 5' - hobo 2918 1 71.23 GTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATT:1 + chr2R 19076532 5' + F-element 233 1 62.33 ATAATATTAAGCCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATAC:1 + chr3R 20149649 5' + 1360 16 1 67.81 AAATTGTTCTATCTTGGCTATCACATACAATTGAAACTATTCGGAAAGGCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTTGAGAATGATGTTGAGAATCCCGACTTGATAAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTCACTATAAACTA:1 - chr2R 1927745 5' + Cr1a 4113 1 66.44 AACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr2R 9164845 5' - 412 7477 2 64.83 CAATTTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCGTTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2L 2464193 5' + pogo 50 1 54.11 TATAAGACTTTTCCCAGGACAGTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 + chr3L 1387077 5' + mdg3 5264 1 76.03 AGGCAATAGAACCGCAATTCACAAAGGCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTT:1 - chr2R 20382607 5' + Bari1 43 1 56.85 GAAATGACTAATATTATTATACATTTATGTATATATTTCACAATCACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 10498752 5' + 297 14 2 75.34 AATTTCAAGGAAATCGAAAATAGTGTAGCTAGTGGAAATTAAGAAAACAAAAATTGGACTGATAACCAGTTAAAATGATTAATTAGACAACCAGCAACAAACAAAAGAACAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr2L 14359189 5' + pogo 11 1 69.86 AAACAGGCACAAAGGGCTGTGTTGAAGCCAAAGAGCCCACCTGCTGATATTTCGGTTTATTGTTGATGTGGGTAGCGGCTGGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 10912166 5' + Doc 8 1 76.39 TGTACATTGCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGCCTGTTTGTGTGTGCGTGTGTTTGCCGTGCTGTGAGTCCGCATAATTACACGCAGTTGAGTCGCTTAAATGAAATCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCT:1 - chrX 22804758 5' + Doc 4237 1 80.82 AAAAAACAGGTAGGATGATGTATACGAGATATAAAAGGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2R 14705838 5' + roo 8747 2 76.03 TTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 - chr3R 15590049 5' - Transpac 5177 2 61.11 AATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGC:2 - chr2R 4122895 5' - rover 369 1 78.77 AAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chrX 4789107 5' + 297 6631 2 57.53 ACAATCTGATGAAGAATGGCAAGTACGTCAGCGAATGATGCACTGAATATCAATCAAAAATTTAATATATAAACGCGCCTTCTTAGCTATACGAATACTGAAAGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3L 18835240 5' - pogo 2086 1 76.71 AAAGGCGAATGGCGCCACTTACTTTAATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2R 10367437 5' + 412 26 2 66.44 ACGTATTTTAAAAAGGTTTCTACCTGCTATAAAAGGATTCCGCTAAGTTTTGGAACTCCTACAAGTGGTTCGTATCATACATTAGAAGCATGATATCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAA:1 - chr2L 6775682 5' + jockey 4596 1 63.70 ACGCGACTTGATTATAATTAGACGCTCCCACTTCCCCCCGTTCCCACCACATTTGTATTTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3R 9993357 5' - hobo 2933 1 69.23 AGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGGTCACATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 29708930 5' + blood 26 2 54.11 CTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACA:1 + chr3R 11461754 5' + 17.6 47 1 54.11 ATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCT:1 - chr2R 9327031 5' - mdg3 159 2 77.78 TTAGCATTGGGTTTCTTCGGTCCGCATTCTAATATTTTAGTGCCTTGTTTATTTGCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 25409604 5' + jockey 33 1 66.18 AGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3R 20292444 5' - pogo 2038 1 76.00 GGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGTGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chr3R 5087079 5' - P-element 2798 1 24.66 CGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2R 21078444 5' + jockey 25 1 53.33 CTTTTGTTACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3L 11665868 5' - pogo 2073 1 49.66 GCTTTAAAGTATTACATATTTGAAACGTTGTCGCATAACTCAAATCAAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 - chrX 6398865 5' + blood 70 2 63.70 ATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGCACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTTGTTTCCGAGCTCAGAACC:1 - chr3R 27845576 5' - Stalker4 7324 2 51.49 GCAGCATATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2L 17069507 5' + 412 24 2 69.86 AATGAGGTTAGTTTAATGGAAATTGAAAGTGTGTGCTAAAACCTAATAGCTTTGCATTAAAACGCTTTGGTAATAAGTAGCTTTCCTCGATGATGCTTGAAGATTTTATAGGGATGTTGCACATGGATTATCTCCGAAATAAATTA:1 + chr3R 30816796 5' - McClintock 362 2 19.18 CATAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTAT:1 - chr2R 16312133 5' + G6 1975 1 50.00 CAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr2L 2357372 5' + P-element 44 1 48.39 GGCGGGGGGGGGGAGCCCAAGGAAATGGGGAAAGGGTTTTTAGGGGCCTTTGTAATTTTTGTTTTTTGTATTATTTTTGTTTTTCTTTTGTTTTTTTTTATAA:1 + chr2R 10798067 5' - HMS-Beagle2 481 1 78.64 AATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2 + chr3R 21421045 5' - roo 8998 2 69.86 ATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGCCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr3L 13597769 5' + blood 85 2 75.34 CTAATCTGCACATTCTATTCGAAATCAGAAGTTTATATATATATTTGTTTGTATTTTCTCGTAATAGCTTGCTATGTTTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr2L 14008696 5' - pogo 2086 1 70.25 TTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGAGGCCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr2L 7215645 5' + 297 6619 2 57.53 AAACCGAAATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3R 4722504 5' - roo 9034 1 59.59 GTGTTGTATGTGTCTGTCTGCCCTGGCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 18882536 5' + roo 29 2 62.33 ACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACATAAGTCGCGGAGAAAACAAAAACTTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr2L 4416064 5' + jockey 68 1 61.60 GGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr2R 9164843 5' - 412 425 2 63.70 AATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr3L 13597735 5' + blood 7062 2 53.42 AAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCACGCCACA:1 - chr3R 3080556 5' - gypsy9 5165 2 85.62 GATTTGCTTAACAAGTTTCAGTCTGAGTTTGGCCTTCGTGTGGTACAGTACATGGTACAGTAAGCGCTCTCCGGATCTGCAGATCTCTTTGTGTCCTATAACATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATAT:1 - chr2L 7009905 5' - blood 7167 2 67.81 CAACTGCAATGTTTCAGCAGCAATAGCAGAAATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3R 5245708 5' - 1360 3373 1 73.76 AGCAATAATGCCGTTTAACTGCGCACAAAATTCATTCAGGCAGCGCAATTTATGTCGCAACAGGCGACATTTTTATAGCCGACCGTGAATTTTGTTTGTTAATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATT:2 - chr2L 9065019 5' - HMS-Beagle 350 1 52.05 CAACTGATCTTAGGTTCCGTGTCGAGGTATTCTAAAGTGAGTTATTTTGTTGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chrX 18149802 5' - hobo 2886 1 58.46 TGATATTATTGGCTGATAAGAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2R 18048927 5' + opus 152 4 63.01 CGATGATGGGTGATGGACGATGACGTCGGCTCGACTGAACCTTCTTCATCCATTTCATTCGATGTCGCCGCGTATGAAATACGGTGAGTCCATGACAAAACAACGACATGAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTA:1 + chr2L 11916954 5' + hopper 1183 1 72.60 CTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2R 13849642 5' - roo 334 2 69.18 GAAATGCTTGGCCCTGTTTTCGGTCCCTCTCGATTGCATATGCAGCTACTTTTATCGATTGGCTGAAGTTCGCACTCCTTGCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3L 12863653 5' + Transpac 4956 2 58.22 AAATTTTATTTTAAAATTCCGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 8022222 5' - roo 342 2 63.45 TAATGGTTGGGTTTTCCACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAG:1 - chr2R 24630221 5' - copia 5059 2 64.38 GTCACTTTTGCTAATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr2L 17228581 5' + mdg3 5282 2 65.75 CCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTC:1 + chr3R 27786571 5' - Tirant 8426 2 74.66 TAGCTAAATAATCAAAAGTCATAAAAATTAATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATTCACATTTTAGTTATAAATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 - chr2R 8305349 5' - blood 356 2 71.23 ATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:2 + chr2R 18123422 5' + 412 7116 2 60.27 CAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGATCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 22481312 5' + roo 8739 2 69.23 AAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:2 - chr3R 25521883 5' + blood 72 2 65.75 AACGATGAGGCAAGTGAAGCCTTTTGTGCACCTGCCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr3R 5765327 5' - opus 484 2 61.76 GGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTG:1 - chr2R 13574820 5' - diver 6020 2 79.45 TGATAAATTTATGAACATAATTAGTAAAGAATCTTTTTTGAGTGCGCTCATGCTTTGTGCAATAAAAAGGATACGATGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGCGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chr2L 17747381 5' - Tirant 358 2 57.53 ATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr2L 1327607 5' + pogo 53 1 56.55 AGCCGACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGTCAGCGCTG:1 + chr3L 12250942 5' + flea 4786 2 64.08 GAATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAA:1 + chr2L 17550607 5' - Transib-N1_DM 447 1 77.40 GGAAGGAACGGGGAGCAGGCCTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 + chr3R 3527026 5' + Tabor 6855 2 76.71 TTTGCCTCGCTATCCGCTCTTTCTGTGTCACTTGCCAATTCGCCGCGAATTTTCGCTTGTTTTTTTTTACACTTGTAATTATTCAGGAATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2R 8862527 5' + pogo 22 1 67.86 AAAGGAAAAGCTTGTCCGCCATCGTTAAGGTGACGTCATAATGTCTGCAATACAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCATA:1 + chr2R 16513080 5' + jockey 26 1 71.92 CTGCGGAAAAGGGGGCGGCGGAATGATAGCTGACCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 3967041 5' - hobo 2921 1 66.37 AGTGAACGTGTCTTAATCTAAGTCGAGCCACACAAACACACCTCCACACACTCGACACACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGAGGAGTGTAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTCTTTGTGTTAGTACGTAGGCATAA:1 - chr2L 11158744 5' + Rt1b 5041 1 60.27 GGACTTGGGCAGAAATTCAGATAAAAAGCTATACAATTTCATGCCTAGTTAAAATAAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr3R 20452331 5' + blood 7024 2 77.40 ATAGTCTGGCTCTCTATGAGCTGAATTTGCTATTTAAATTTTTAAAATGTTTAATATACTTATTTAGCCGCCGTTTACTGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAA:1 + chr2R 10453356 5' - mdg3 183 2 56.85 ATATTCCATTCGATGCAACATTCCAACAACATCCAATAAATCAAATGCCTTAGAATATAAGTCATAAATTCAAGTATCCCATAAGAACAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAACCATTAACATC:1 + chr3L 12782255 5' + Quasimodo 6899 2 72.60 TTTTTCTCTGTGCAGGTGGGAAACGGCCGAAAAACACTTAAAAATACATAAAAATACCAATGGGATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTT:1 - chr2R 19544840 5' - hobo 450 1 56.16 ACATGACGGCGTGTAATGCAGCTGCTGCTGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 - chr3L 5490940 5' - 412 7483 2 58.62 CCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATAT:1 + chr2L 5771437 5' + Juan 88 1 75.34 GGTTTGACATTATTTGCTTCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGAC:1 + chr2L 8959874 5' + Ivk 5122 1 56.16 ACGTTTCTGCACTTTTGCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 + chr3R 4464121 5' - 1360 3358 1 62.59 CGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 - chr3R 22810780 5' + flea 4783 2 58.65 GGTCGTGGGGATGGCGATTGAAGGAAAAGTGCCAAGCACACACGCACACACCGAGAGAAAAACTGATAGATAAATACAATGTTCATATCCCTTAAGCGTGTTTGGTTCACAACGATTCAGTGAATATTATTATTATTATTATTATT:1 + chrX 4693112 5' - mdg1 7075 10 75.34 ACTCGGGACTCCCGGATTCCGAGAGTCAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chrX 19498080 5' + P-element 45 1 48.00 GGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chrX 983224 5' + 412 7112 2 56.85 GAACCAGTTCCATTTTTAAAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2R 15079975 5' + roo 8690 2 66.44 GAGTACTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTG:2 - chr3R 20368109 5' + Max-element 35 2 61.64 GATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 9242066 5' - roo 323 2 74.66 GTTTTCAACAGTCCACCTGCATATCAGCCATCCGAATTTGAATCCAAAAATATATGCCAGAATTTCTGGACGACTGCTGCGAGTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr3R 9563566 5' + P-element 32 1 62.33 TAGTTACACGAAAGTCCCTTTACTACCAAAGATCAACTTAGTGAGTTTATAAATTTCGTATCTCTTCTAGCAAAACTAGCAAAACTAACTACTTTTAGGTAATAAAGATATACTGACATAAGTTACCATATTGGTGACCCCGCCAT:1 - chrX 16250489 5' + Chimpo 202 1 68.49 GTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 26399900 5' + roo 50 2 57.53 TTCTTTCCCAGAATCTTGACGGCTATTAAGGAGCAAATAGCAACGGCAAAAACAAAGCACAAAAAATTAGCGTCTATCACCAATTGAAGACGTTTTGGTACACACTATACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGACATATCCTTCCA:1 - chr3R 22158028 5' - Tc1-2 1277 1 54.79 GGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 22529772 5' - roo 8988 2 82.09 GGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:1 - chr3L 14043651 5' + Ivk 30 1 65.07 CTGGTCGTTGGGGCTTATTGATGTGTAATAAACCCAATTGCATTTGTTTTGAATATATAAATAAATCATAAAAAATAACAAAGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATC:1 + chr3L 7965950 5' - Quasimodo 7002 2 56.85 AATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCTTGGGAGATGTGTATTCGAGAGGACGTGTTCACAG:1 - chr2R 16891828 5' + jockey 27 1 45.95 AGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 + chr2L 12283925 5' + Quasimodo 59 2 59.59 TCTACGCAAAAAATATCTATATTTCTATAATAAATTGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAACATCATAGAATGCCTT:1 + chr3R 18469146 5' + Quasimodo 79 2 76.76 ATAGTATAATAAATTTTGAAATCATGACTAATAGTTAAACATGAAATCCTTTTCCTGCTCATTTCAGTTTTCTGGGTTACGTTTGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chrX 6937826 5' - hopper 1382 1 64.38 AACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr2L 15833096 5' + hobo 55 1 55.48 TTCCTGTTCCCGGACTGGCTATAAGTGACATAAAGGAGACCCATTGATCACCGTAATGAAGAGGCCGACGATTCCCTAAAGGCAGTAGCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr2R 3171037 5' - 1360 3355 1 54.11 AGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATA:2 - chr3R 11526847 5' + pogo 84 1 75.34 GGAATTAATACGATTTTTATTCATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 9938571 5' + roo 39 2 59.59 CCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAAACTTT:2 + chr2R 5900844 5' + Bari1 83 1 70.55 GTGAGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 + chr3L 3540080 5' - mdg3 224 2 70.55 TCGCTAGTCCTAATCATCGGACACAACCGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAG:1 - chr3R 30056543 5' - jockey 4899 1 80.14 ATTTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:2 + chrX 18034596 5' + Juan 44 1 42.47 CGAGACATCTTAAAGGGGTGCCGGCACTCACTCACACACACGCACACCCATACACACACTCGTTATCCTGGAACAGGAGTCAACCCATTCCCATAGAGCTTTCCCCGTTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2L 14139570 5' + Tirant 8120 2 76.71 AAGAATGTGGTCAAAGGAGCTTCGAAATTGAAATAAAGTGTATTCATCGCCGGGCATACAGTTCAAAAGGTAATTCCTGATCGAAACACAAAAGCTTGTATTTGCAAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCT:1 - chr2R 11038187 5' + micropia 5185 1 66.44 CACGAACAATTCCGTAATGAAAAGCTTCCACATTGTTGTTAATATTTTCCCTTCCCAACTCGCCCAAATGCGATTAAAATTGTTAGATTATATATTATATTATATACTTATTTTAAGAGAGTTGAGAGAGAATGCTATGTGTGCAC:1 + chr2L 1211353 5' - gypsy11 4199 2 57.53 GTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 + chr3R 22846700 5' + 412 58 2 56.85 GCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTC:1 - chrX 10728919 5' + springer 26 2 58.04 AATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 + chr2R 19900992 5' - mdg1 7381 2 70.55 AGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr3L 18708580 5' + F-element 53 1 56.85 CTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGC:1 + chr2L 15153284 5' + G-element 98 1 75.34 GTTTCGTAAGTGGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3R 15030778 5' + jockey 59 1 51.37 GAATTAACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3L 6751761 5' - pogo 2045 1 57.93 CATCAAGCAAGTTCGTAAAAAATTAAAGGGCTTAAATTCTGTGCGTTTCACTTATAAATCTGTGGAGGTTATATAGAAATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCT:1 + chr3R 18847228 5' + Stalker2 8 2 66.44 AACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3L 9241977 5' + roo 48 2 55.48 CCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAGAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 20149660 5' + 1360 26 1 59.31 GACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 + chr2L 16685333 5' + P-element 91 1 23.97 GAATTTTCTCTGGTTCAATGAGGCATTTTAGTACTTCGGTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATA:1 + chr3R 27845454 5' + Stalker 6894 4 48.61 AGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:2 + chr3L 18708618 5' + F-element 91 1 75.34 CTTTATTTCGTATGTTGCATGTACTACGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 + chr3R 31907287 5' + Tirant 8121 2 77.40 GCATTGCTTTAGCATGTGATTTAAGTTGAATTATTTATGCGATTTTATGCTATTTTTGCAGCAACAAAAACGCCACGAATTTATTATTGTTTTTTAAATACAATATTTAAATGACTCGGATTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAA:1 - chrX 8626033 5' + Cr1a 152 1 82.19 CTTATTGGTAAAACGAAATATTTGATTCACAAATGCATGTATGCTTATCAAAATTCTAATGCAGACTGATTTTGAAACACATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chr2R 7098064 5' - copia 5083 2 56.85 TATTGCCAGATAGCCAGATAGCCAGCTAGTTGTCCCATGTAGTCAGTCACTCAGTCAGGTCAGTTCGCGGTGTATCCATGGCAAGTGCATGGCGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAAATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 + chr3R 24175641 5' - Burdock 6364 2 67.12 TTTATTAGTTTTGTAAATTTTATTCGACGCTTTTAATTTTTTTCAACGCCTACAAACTGCCAAAAATTTGCACGCCCACACTTTTTCAAAATCTTTTCATATTTGTTTAGTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACT:1 + chr2L 8051819 5' - rover 232 2 72.60 GCAATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGTAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 29708909 5' + blood 6 2 73.29 ACTGTGTTGGTTTATATATGACAAATCGGAACATACATATGCAGGAAACACATTGAATAAGATTCGTCAAAATAAACTGATTGTTCACACATGAACGCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2R 7534705 5' + roo 8708 2 55.48 ACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 20292552 5' + pogo 34 1 62.33 GCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACG:1 - chr3R 17316118 5' - 3S18 6032 2 70.37 TGAGAGCCACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2R 16410143 5' + opus 19 2 70.37 ATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGATACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 9938689 5' - roo 344 2 60.42 GTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACT:1 + chr2L 19371296 5' + Bari1 80 1 71.23 GGAAATCAGAATTGGAATTGGAATCAGAATCCAATCCAACTGTGTCAGCTGCGACTTGCTTTGTTTACAAACAAATAAGGCAAAGAAGAGAAATGCAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 - chr3L 8067640 5' - copia 231 1 69.18 CGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGAC:1 - chr2R 23313077 5' + Tabor 6913 2 66.44 AATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 - chr3R 11096784 5' - copia 5070 2 55.48 CTATGAAGAATGCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 + chrX 14908384 5' - blood 306 2 65.75 ATAAGTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr3R 10140147 5' - P-element 2862 1 65.07 TTACTGCGTGTACCTTACCTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr3L 15371424 5' - Transpac 5201 2 66.44 GATGGGTGTATTGAATGCAATTGCATTTTATTTTGGTAAGTGGTAAGTTTAGTTTTAAAGAGTGAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGC:1 - chrX 19830148 5' - flea 120 1 56.16 GTAATGCGAAAGCTGTTCTGCATATTAAATAATATAGTAATACGATTTCTGCTTTATTATACTAGATTCGTTGAAAAGCATGTAATAGGCAGAAGGAAGGGTTTCTGAACTTATAAAGTACATATATTTTAGATCAGGATCAATA:1 + chr3R 18084363 5' + INE-1 84 1 74.48 AATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCATACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGA:2 + chr2R 7097965 5' + copia 4951 2 73.97 ATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr2R 24338464 5' + 1360 50 1 53.10 AGCGCAACAGCAGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 - chr3R 25876956 5' - mdg3 5430 2 61.64 GCCTTAATCATCAATTTGCCATGCATCATACCTTACATCTGAAATAGTAACCATGTCATATAAAAAGAAAAACGCAACAGTTTTGTATGAAGCTTTTTATTCAGATATATCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAA:1 + chr3R 30514431 5' - Copia1_DM 432 1 71.92 GCCTTTGTGTGGCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGC:1 - chrX 10728930 5' + springer 7186 2 52.05 GCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr2R 15062299 5' + blood 33 2 59.59 CACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:1 - chr2R 24630205 5' - copia 5043 2 75.34 GACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTGGCCAAAGCTCAGAGATCCGGCGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2R 9164949 5' + 412 27 2 59.68 GTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAT:1 - chr3L 17791949 5' + Stalker 85 4 74.66 GAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr2R 18882568 5' + roo 59 2 62.50 GAACTTTTCTTTGTAGCGGAACATCAACTAAAGGATATATATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACAT:1 + chrX 16325322 5' - mdg1 341 2 72.60 GTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 + chr3L 19397041 5' + F-element 89 1 71.23 ACGATCTCAATGAGAACTTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3R 23507707 5' + 412 7083 2 62.33 TTAAATGCAAAATTTAAATGGAAACCTAACAGGCCGTAAACGCTTTATATTCAATCCAAAAATTTTGTTTTAGTTTTGGAATTTATTACTTTATATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATT:1 - chr3R 12559782 5' + mdg3 29 2 66.44 TCTGATAATTATTTCTGAACAGTCAATGAGATTAAGTGCTTCTTTTATGCGACGAGCTAATTCTGATAATGTTGAATGTGCCCTTTCAACTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCT:1 + chr3L 25323157 5' + Max-element 8268 2 60.96 CTGTACCGTGGTTATTCCATATTCCGTTGTGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 - chr2R 11656161 5' + HMS-Beagle 6808 2 77.40 AAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGT:1 - chr3R 25521884 5' + blood 7082 2 65.07 ATTGCCAATTTAACTTACATTGTGCATGTGTCTTTAAACAAAGATTTATGTACCCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAA:1 + chr3R 11553611 5' - hopper 1386 1 66.44 CAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 4722409 5' + roo 8750 2 78.77 GTATTTGTAGTTTGTAAACTGTAATTTGTAACTTACCGATAGCCGTAACCGAACTAATATTTAATTTTGTAATTACCTAAGCTCATCATTCACAACAATCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGA:1 + chr3L 7052436 5' - Tirant 300 2 65.75 AATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGGACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr3R 28008208 5' + hobo 20 1 67.91 CAGAGTTTGCGCAACCCATTTTTCGTGGTATACACTTTTTAGCAGCAAGCACATGATATAAAATGGTTCATTTCTATTAAGACTGCTTATTATAAATTAATTTATATGAGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGC:1 - chr2L 19372181 5' - Bari1 1698 1 78.08 TGCTATGCGCATTTCCATTGTATCAATAATTGCCAATGTTTCGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr2L 8392987 5' - I-element 5277 1 70.55 ACTGATAGTTAGGTTTTAAATTTAGTTAGAACTTTTCTTTGTAGCGGAACATCAACTAAAGGATATATATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chrX 16325294 5' - mdg1 7407 2 56.16 GAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 12608067 5' - roo 328 2 72.60 CTGCATCCTACGCCCTTTATATAACTTTATGCACATTGTTGATCTAACAATCGCTGCCTCTTCTTGAAACTGGATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1 + chr2R 22664560 5' + Quasimodo 42 2 54.79 AAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 - chr3L 16180978 5' + Transpac 60 2 58.90 AGTCGTTGTGTCCGCCACACTGGAGGATGTCATGACACAGGTGGGTGCATTCCCGAGTAACTTGGTAGAATCTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTAT:1 - chr3R 10372759 5' - 412 7336 2 50.68 GTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAAAATACATACAGAGGGGGTCCAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 - chr2R 5900927 5' - Bari1 1662 1 52.31 CTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr2L 20984257 5' + blood 7030 2 69.86 TTTGGCCAGCTAATGATTGTTTGATAAGCTCTCCCCGGGCAACAGGGGATTGCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:2 - chr3R 25443183 5' + 297 12 2 76.71 CGTTGCGTCTTATTCCTGCTGCTTAGCAATTGAAACGGATTCTATTCAACTCGTTTTGCTCTGCTCTTTGATATTCGACGAAATTTCTATCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAA:1 - chr2R 14562528 5' + Burdock 6361 2 64.83 GTTGTAAGGTAGGTGGGGGCATGCGATTTGGCTGAGGGTAATATAAGACTGACACAATTTAGTCAGCAAAGTGTTGTTAAGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr3L 8067482 5' + copia 4909 2 58.22 TTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCGATGCAATACTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2R 10367464 5' + 412 47 2 50.00 ACGTATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACATGTACTATATAATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATGTAAAGT:1 + chr3R 19450143 5' - flea 4958 2 59.59 AAGTCGGAATTATGCGGAACACTGCAAATCAAATATGTTCATACTTAATTACCAAATTAATTTTGTAGTTATAATAAATTCTAAAAAAAAGTGTACCAATCTTATTATAAAACTTAAATTTCTAATTATTGTTTTTCTTGTTAAGT:1 + chr2L 16222967 5' - I-element 129 1 62.33 TCTCACTTCAACTTGAAGTCTAATTCATTTACTTTAATACCACATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTT:1 + chr2L 21582215 5' + INE-1 33 1 54.11 TGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr3R 19537468 5' - hopper2 1558 1 51.37 TGCATACTTTTCGACCGCTTTTGAGATACATATCTCAAGGATATTCATGTGATTTTCTTTCAGTGCACATGGCACCCGTCGCCATGTTTGTAATTTGAACTTAACTATATACATATTATGAAAGAGCATACATTAGGGACACCAAA:1 + chr3R 18155022 5' + transib3 87 1 53.42 TTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3R 31907320 5' + Tirant 38 2 58.39 CAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr2L 13877653 5' - Transpac 267 2 52.05 AGCGGTAATAGATGATAAACGACTAGCTTCTATATATTAATGACAACTGAAGTTGATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAAGCAGGTAAATTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr2R 16712958 5' - pogo 2049 1 56.93 GCGACAGTGTCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr3R 20137224 5' + Burdock 6172 2 59.59 GTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3R 5087134 5' - P-element 2856 1 63.64 GATCATTGGTTACAAGTACAAGACATTAAAGGAGGGCACACGAATCGAATTTGCTAACAATTGTTATTCCTATTTTCTCAGAGTGTTCAGATGGTTCAATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGA:1 - chrX 9185684 5' - F-element 4247 1 67.81 ATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:2 + chr2L 5771410 5' + Juan 61 1 56.85 AACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCATCTAACTTAATTTTT:1 - chr3L 6751756 5' - pogo 2039 1 58.90 ACTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr2L 1229700 5' + opus 55 4 63.01 ACGCAATGGCATTGGTGGACAGACTGGATGAAGCCATGGCTGAAGAGAAGATGCAGACAGAATCATACCAGACAGTATCGGACGCTTTGCCAATTCAATTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTAGG:1 - chrX 2117371 5' - I-element 61 1 65.75 GAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGGAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 22255307 5' - roo 9026 1 55.48 ATTCTTCTGCCCCCACTTTACCCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 16887415 5' - roo 9017 2 54.11 GAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr3R 15590055 5' - Transpac 5189 2 54.17 TAATCTGTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 4175258 5' - roo 9008 2 63.01 GGTGCGCCCAGCTGATAATAGTTGGGCATTTCTGGGTCCCGCTATAATTCAAGTGCTCTAAAATCATAAAAGATTTAGGAGTACGATCTGTGTGGGAAGGTAGTATTAAAGAAAAAAGTTCCTTGACTATCAGATTCCCGTTACTC:1 - chrX 19837147 5' - INE-1 549 1 67.81 CTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chrX 21639693 5' + Tirant 8143 2 68.82 TGAAGATATTTTATTTTTCGCTTTTCGATTCGATCAAGGGGGTCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 28008369 5' - hobo 2920 1 66.44 CAAGTGATTTTCATTTCCGCAATAAGACAAATAAAATACAGAATTATTAAGTGGCAAAGCTGGTCGCGTGGCAAAAAAACCAAAACGGCGTAGAGCAGATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTG:1 - chr2R 12093805 5' - 1360 156 1 65.07 GTTATAGAACAAGGTAATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 23507527 5' - 412 480 2 76.03 ACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:2 + chr3R 10498797 5' + 297 59 2 59.59 CGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr3L 3979708 5' + opus 141 4 66.44 ATAAAATTATAACATTTTATTTTGAGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 - chr3L 17667687 5' + F-element 11 1 71.53 TATTAAAATTTATATGGCCATTCTCAACTCGTTTCGATGGGTACTACACAAATGCAGGCTTTAAGAAGAACACTTCTTCAGTTCCCAGGAAGCATCTTCAGAAGAGAAGTATTATACCATATATATGTATGTATATTATATATATG:1 + chrX 13248365 5' - INE-1 60 1 74.66 CGAGATCAAACCGAGGAGTTCGATGGATAGGCTGTTTACGGGGGGCTAAACATTATCGACGATCATTGCTGAATCACAGTTAAGTCCATGTTGTCTCGGAGTAGTGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTTTGTTGGTG:1 - chr3R 24142594 5' - G-element 265 1 51.37 TCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 + chr2R 7404670 5' + blood 7069 2 54.79 AAAGAAATTAAAAATTGTATAACATTTTATATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3R 25271313 5' - 412 7524 2 68.49 CCGTTTCTCTCTCTTTCCATATAGCACCCGTCTATAACTTTTACCGCTGCCGCTCCCGCCGTCTGGTTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2R 17100164 5' + P-element 52 1 48.63 AAAAATTCCACTCGAAAACGATGGGCATATATGTACATATGTATTTTGATTGCAGTATAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr3L 18835393 5' + pogo 58 1 60.96 TAATCGCTTCCATTATATCTTAGGCTCGCTTCGCTACTATTTATCTATCCACTTTGATCTCGTGTTCATCATTTTCTATCGTCCCTTCTGCCATCTCCCCAAATTATTATTAGTTATTATAAATATTGTAATTAATTATTA:1 - chr3R 14011402 5' + Gypsy12A_LTR 1815 3 69.50 ACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:2 + chr3L 21097094 5' + mdg3 5292 2 58.22 AAAACGGGACAAAGGATCCTCGTTTCACACATTCAATGGGCTAAGAGGATCAATCCCAGCGAGGTAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATCAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAG:1 - chrX 20729685 5' - Stalker2 311 2 56.16 GCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAAAAATGAGGATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCCTGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTAT:1 + chr2L 20360645 5' + micropia 149 4 48.97 GATCTAAGGTTTTTTTTTTAATTTTTAACAAATAGAGAAAAAATGTGACGCTTTAAATAGTAACTTAAGCTTGTTCAACTTGCTATCTACGTTGAAGGTAAAATAAAATAACCCGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCG:1 + chr2R 14884203 5' - mdg3 237 2 79.45 TCTCACTGCACGACACTTTCACAGTTCGATCTTCACTCTGCACGTTTTCATTCACTGCCAGGCTGAAAACGAAGGGCGCGGGGTGGATGGGTGGAAGGAACAAGGAAGCTGCCTATGCGAGGAGACACCGGAGCGGAGGACCGCCG:1 - chr3R 2452273 5' + gypsy8 4588 1 64.38 CAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATGGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1 + chr3R 3527069 5' + Tabor 59 2 54.11 GTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGGTGAAGGTTGAACTC:1 - chr3L 14863911 5' - Transpac 5142 2 72.60 ACTTGTTGCTGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr3R 8367170 5' + Doc 82 1 69.18 ACCTTTTTTAAAACTAGAGCAACGCCAACGTAGACGTCTGACCAGTTTTTAATTTTTTACGGGCTTAGCGGCCATTGGCTTAACGTGTTTACCTAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAAC:1 + chrX 22691897 5' - HMS-Beagle2 2 2 64.38 ACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3R 23099103 5' - roo 8990 2 75.34 CAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:2 - chr3L 3540196 5' + mdg3 71 2 72.60 AAAATAAGTCATATTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATC:1 - chr2R 5022810 5' - Gypsy12A_LTR 113 1 74.66 TATTTCTGTAGAAACTTTGTGTGTGTAGACAAAACATAGTTTCGGCTTGTACCCAAATACGACAGCGATCGGCATTACAATGTCGTAGGTGAAGGCAGTATTGGCATAAAGCCAAACTTTTTGCCTCCTGTAATCGATCTTGAGGC:1 - chr2L 22215132 5' - G3 119 1 60.96 AAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTTCTATGTT:1 + chrX 3529733 5' + 412 59 2 56.94 GTTATCTCAGTGTTCCTGCTTCATTATACATATATAAGAAAAACTGATACCGAGTAAACCATTCCATTCAATAAAATGGCGTGCGTATACAAATGGACGTAAATGTTTCAATAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTA:1 + chr2L 1709365 5' - Doc 93 1 63.01 CTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 + chr2R 22255314 5' - roo 355 2 53.42 GGCGACCCAAAGCCAAACTTTCCTGAATATATATCGCTATATAAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3R 21570458 5' + mdg3 50 2 51.37 ATGGAAATGCAACAATTAAGCAGAGCTTATGGAGGCAGCCAATCAACTGGAAGCCAGCAAAGCCAAGAATTTGGTTGATTTGCATATCTAAGGTATTAGATAAATGACCGTTTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3L 20977501 5' + I-element 11 1 78.77 CGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCGACTGCGTTTTTCTGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTATTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:2 + chr3R 10541229 5' - hopper 1372 1 56.85 ACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 - chr2R 15062269 5' + blood 63 2 58.90 GCGCAGTCGCAAAGAGCGACTTTCTCTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTGCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAC:1 + chr2R 8686570 5' - hobo 2863 1 66.44 ACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 4869264 5' + roo 8714 2 54.11 TTAATAAAAATTGAATGGCTCTCCCTGCATCGTAGAGAAAACTTTCTGTTTGTGTTTGGTTATTTACTGAATGATTACAATATTTATTCTTGAGAAGAACACCGACCGATTATAATTAGGCCTCAAACTGAACTCTCATAATTACT:1 + chr2R 14539205 5' - Idefix 463 2 56.16 TCTGCCTTGTCTACAAATAGTACTTCATATATAATGAATTATTCAAGTGAAACTGCTGCGGCTGATGAATCATTGGGCTCCCAATGTGCTGCCCCGCAACGCTTTTAAAAAATCAAGCGAAAGTCTCGTGTTTCTCCAGAGACTG:1 - chr2R 3209537 5' + X-element 430 1 39.31 ACAATATTTAATGATTAACAATTAACATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr2R 20913227 5' - 1360 3345 1 55.48 ATGACTCTGTGCGATAGCTTAAGTTAATAATGTACCAAAGCAGGGGAGAAGTTTGTCACTCACTTTGCCCAGATATATAATGGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 12355252 5' - hobo 2921 1 69.05 AAGCCAGGTTAAGTGCTCGCACCTACGCACCTATAACAGTTTGAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:2 - chr3R 13358732 5' + mdg3 5272 2 72.60 CAGGCTAAACAAATGCAAAAAGATCATGAAATATACTTGAAAATATATTTTATATATTTTTAAGAGCATGCAATTTCACAAAAACAAAATATAAATGTTGGAGTATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 - chr3L 14546458 5' + copia 4899 2 65.75 CTCTGACTTTGGCGAAAAAAATACGAAAAAAAAGTGCAAAAACAAAGACAACTTTTTCACAGGGAACAGAAAAATATTTCAAAGCTATATCTTTGACCTTGGAGACTTTGAGGTGAAGAGCGGTAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAG:1 - chrX 14429849 5' - GATE 8279 2 64.83 GTAGCCTTGTTCCGAGTTGAAAGCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr3R 15514499 5' - 412 7502 2 52.05 TTCTATATTTTCATACGGACGGACATGGCCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACG:1 + chr4 33790 5' - 1360 3304 1 78.57 AGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTCTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 + chr2R 14553223 5' - mdg3 234 2 66.04 TAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 + chr3L 19397049 5' + F-element 97 1 76.71 GTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGC:1 + chr2R 7727083 5' + BS 4679 1 66.44 AAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:2 + chrX 10571331 5' + Doc 69 1 63.70 GTTTGTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTT:1 - chr2L 22684612 5' + transib3 59 1 51.37 GGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:1 - chrX 22858941 5' - mdg3 175 2 65.75 GTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTT:1 + chr2L 5771426 5' + Juan 77 1 67.81 CTTATGGAGTATGTAGTAGCTTTGTATCTTGATCCAAAGTGCATAATAAAATCTTGTACGGTTATCTAGAAGCTATGTTCTGTGGTTTTAAACGATATGTTTAAGGACTCTGGATAAGTTCATTGTATTAAAAAACTGGAATGTTT:1 + chr2R 22680526 5' - jockey2 3259 1 62.33 GAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCCATTCAGCTTCTGGAGACATAGACGGAGCGCAAGCCGCCCCAAAGCCGCCGAGCCGGTCACGCCCACATTTTTGAAAAATTTTAAAATTTTTTCTCATTT:1 - chr2L 22036462 5' + INE-1 470 1 40.77 ATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTTTGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr2R 21897965 5' + 412 7125 2 65.75 ATCATATGGTTAACAAATTAAAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 13849757 5' + roo 8699 2 58.90 TAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTG:1 - chr2R 16312131 5' + G6 1977 1 49.32 TTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTC:1 + chrX 23439057 5' - R1A1-element 5058 1 78.62 TAATACCTTTACATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTC:1 - chr3L 18920518 5' + Juan 30 1 65.07 CCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr3R 31120299 5' + opus 7038 4 60.00 TTAAGCTTAGCTGTTAGCGGATCGCAAATCGACCGCATTCAGAAGATTCACCGCAAAGACAACATGTTGCACTATATGGACGATATAAAGGACCTTATATAGTAACAAAGGTCCTCAACAACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTG:1 - chr2L 22244389 5' + Bica 4773 1 56.85 TCCTTCTTATAGTATAGTCCTTCTTATTTTATAATTTACACCAGCTTTTCATAAATGATAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTAATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACGAAA:1 + chr2R 4695788 5' + 1360 198 1 55.48 GTTGAGTAAGATAAGAGTGCAAAGGATTACTGGCTAGAGATATGGGCTATCGGAATTTACGCCAAGAGATGAGGTTTCCTCTTAAGTGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGAACTTAGTGTGGTCTACAGGCA:1 - chr2R 6566904 5' - mdg1 7330 2 62.33 AAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCGCTCTTGTAAT:1 - chr3R 28033657 5' + diver 5981 2 79.45 CCAAGCAAAGTAAAGATCCGTTTCATTAATCTGTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3L 4175232 5' - roo 9034 1 58.22 TATCAAAATAATATAAAACCGTGAAAATGGTCAAGAAATCTACAGAAACATTAAGAGTATAATGGAATGAAATGGAAGGATGATTACATTTTAATTGAATTATAACCTCATATAAAGATCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGG:1 + chr2R 9032150 5' + Tirant 8497 2 76.03 CGGGGCACGACTGATTGGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2R 24338307 5' - 1360 3368 1 70.55 TTCACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 9241963 5' + roo 34 2 62.33 ATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTG:1 - chr2L 6406555 5' - transib2 2746 1 76.03 ATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTATCCTCAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAGCGCTTAAACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAGTGCCGAGCATGCACCT:1 - chr2R 2745201 5' + Stalker3T 165 1 71.23 CTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3R 29708926 5' + blood 23 2 63.70 TGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 + chr3L 1387137 5' + mdg3 5264 1 61.63 AATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chrX 10101307 5' + mdg3 50 2 50.68 GAATTGAACTTTTGAATTTATTGATTGTTTCCTACGTATCTACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTACATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTATTCTAT:1 + chr2R 1533821 5' - 1360 332 1 71.92 GAAATTTTATATTTGCCACTTGGTTTGGGGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chrX 12558362 5' - Transpac 273 2 60.27 AAAGAAATGCCTTATAATAAATCGATATAACAATAACTAGTTTGCTCAGCTTGACTGTTCATAAACAATCTATTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTA:2 + chr2R 10163533 5' - Juan 4168 1 50.00 AAAACTGGAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 + chr2R 7097915 5' + copia 4901 2 63.70 AAATTAGTTTCACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr3R 5940413 5' - hobo 2935 1 77.88 GGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3R 6103649 5' + Tirant 8114 2 58.06 CTAAATGGAGCCACTCTCCGCTGCCTTGGTGGCCACCGCCATCTTGCCGCCAAGACAAATGATGATGTGTATCCAGATTCCTTTTCGACATTTCCCTTTTGTTTTACTCGCTGCGGTGTGCTACGTGGCTATGTGCCTGCCTAATG:1 + chrX 12069167 5' - Tom1 138 1 79.45 CCATTGTAAATTGTTTTCCTCACAATAGTTAATATGAAAATTTTACGATATTAAATATTATTAAAAATAACTATTTGTTAAAAAACTTATAATCCGATGCTCTAAGAGCGGCAGAGAGTTAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTC:1 - chr2R 5525039 5' - Cr1a 4215 1 67.81 AAATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3R 26782725 5' + hobo 65 1 75.40 AGTGTCCCCTATTCGTTCATCAACGGGGTGGCTTCAGACACGCTTCTGTATCACTAGTTCGGGTTCCTTGTCTCGTGGAGGATTCAAAAAATAAAAAAATCATTTAA:1 + chr3R 30480432 5' - Tc1 1393 1 41.12 CAGTATTTTAATTGCCAAGCATACCTCAATTAAATACATTTGCCTGTTGTTTAATTTTGCCATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 - chr3L 18468440 5' - jockey 4938 1 62.33 GGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 + chr3R 10778670 5' + mdg3 77 2 73.19 ACTTTGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 - chr2R 20362318 5' + diver 44 2 55.48 GCGCACCCATTCGCCAATGCAAATGTGGTCAATGCGCTCCAATTGGCAGCGAAGCGTGGCAGCGTTTGAGCCACACACGCCATGCGTCCAGTGGTGCAACAACTTTTATGCCCAATGTGTGCGCTGATGTTGGGCTCAGCTAACCC:1 - chr2L 1053212 5' - Stalker 7152 4 73.97 GAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:2 + chr3L 22481250 5' - roo 325 2 77.40 ATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr2L 17069540 5' + 412 7110 2 56.16 AAATGGAACATAAATCCTCTTGACTTTAGTTTAGACGTATAAAATATTCTGAAAGATGTAACCAATAATAGATTCATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTC:1 - chr2L 17026067 5' - hobo 2616 1 50.69 AGCAGCATGAGCGGACATCAACGTCGTGCCTCGCGAACCGACCAAGATTAGTTTATTGGCCCGAGGGGAGTGATAAGACGGGAGCGAGATAATATTTTCATATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2R 22227349 5' - Transpac 282 2 69.86 AATGAGTTGCTGGCGGGGATTCACCGTATGCAGCATATGCTCACCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACA:1 - chr2L 13877801 5' + Transpac 33 2 60.27 ATAAGCGGATTAACCGCATCGAAAGAAGGATACAAAACAGCACCAAACTTTAAGGACCTGTGCATTGTACAAGGGGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 4175371 5' + roo 46 2 55.48 AAACACGTATGCAGACAGATGAAAGACACCATCAACACGAATTAGATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGA:1 + chr2R 2948979 5' - 17.6 478 2 77.40 CCATAACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 + chr2R 5214913 5' + F-element 30 1 68.49 TAGGCAGTGTTACCTGTTGCCAGAGCGAGAGGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 26315846 5' - roo 393 1 74.66 CGGGCAAAATAACATCTCAACGGCGTAAGCCAGCAATGAAAATGGCGCGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTT:1 - chr3R 11121788 5' - copia 184 2 65.75 TTAATAGAAATCTAGATAAATATCTCGTCACAACTTTCTGATCAAAGGTCAGAAGGTAGCTAACTTAAAGTAAAGTAGCTGATAGATCGCAACAATGTAAAAATTCACTGAAGGGATCTGGTTACATGTCCCTTCTTCATCATATT:1 + chr3R 6344393 5' - invader4 2969 2 71.23 CCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAA:1 - chr2R 17182789 5' + jockey 4628 1 64.38 AGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr2R 21897975 5' + 412 7115 2 58.90 GGAGAAAGACAGCAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2R 15613880 5' - P-element 2855 1 63.70 GTATCATATTCGCAAGGTGGGTAACCTATTGACGATTTATAGCCCGTTCACATATGATTCGCCTGTGATTCGCCTGTGTCAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chrX 14173326 5' - 412 454 2 57.64 CCGATTCGACCCACCTCAACTGATTCAGCTGGCCACACTCCGCCCCATTTTTATATCCACAAATTCCTACGCTCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr3R 4659506 5' + P-element 46 1 54.11 AAACAAACATTTTGCTACTTCGTCGCAGGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTGGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGC:1 + chr2L 21237244 5' + P-element 82 1 25.36 ATACATATATGAGTGTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:2 + chr3L 21097074 5' + mdg3 20 2 71.92 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGC:1 - chrX 12649914 5' - blood 7173 2 75.93 ATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chr2R 18123509 5' + pogo 68 1 63.70 GTGTGTCCTTTTTCGTTCCATTCTCAGACTTCGTCCTGGAGCAATTTGCCAGCCGTTTTATTTGCGGTTGTCGTACATTTATGGCCAGGCTATTTCCTTCTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTT:1 + chr2L 12260495 5' - jockey 494 1 75.17 CTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 20076883 5' - roo 9031 1 58.90 CTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 4885322 5' + 1360 51 1 65.67 TACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chrX 14136561 5' - roo 9001 2 64.38 GCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTGGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr2R 24338453 5' + 1360 62 1 59.59 CATTATTGATTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr2R 969267 5' - mdg1 7434 2 70.55 ATTGAACTTTGTTTGGATATTCGTCTGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTATACCCCCACGCC:1 - chr2R 6187993 5' + Tirant 13 2 76.98 GATAACGCTAGAATTTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGACAATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATGAACAGAGGCAGTAGTCATACTCTATGCATAACATGTTCTAATACTTAATA:1 - chr2L 8777079 5' - G4 3723 1 65.75 CAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCC:1 + chr3R 10973209 5' + jockey 78 1 62.33 CTATGTATCATATTCGCAAGGTGGGTAACCTATTGACGATTTATAGCCCGTTCACATATGATTCGCCTGTGATTCGCCTGTGTCAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chrX 14173330 5' - 412 7509 2 59.59 AAATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 28008207 5' + hobo 31 1 64.38 ATACTCCATTTGGTGACCCCGTCGAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr2R 7223599 5' + blood 7017 2 80.14 GAAAAATACCCATTTAATGCGCAAGCGAGATGGCAGCACAAAAATACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 - chrX 8626327 5' - Burdock 219 2 60.96 AAATTAATTTTCAAATGTATAACATCTGATCACATTCTACTTACCCAGCTAATCTCTCTCTCCCGAATTATATTTTGTTGTATGAAATACTCAGATTGTGTTGAAAGATGTCTCTCATCATTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCG:1 - chr3R 6554206 5' - I-element 375 1 79.45 TATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTT:1 + chr2L 15153274 5' + G-element 36 1 54.84 ACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGTCATAAAACATATTGTAATAGA:1 + chr3R 11096701 5' + copia 4953 2 74.48 TAGGCAGTGTTACCTGTTGCCAGAGCGAGAGGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGGTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 26315846 5' - roo 393 1 73.29 TAAGGAGACAATAAAAGCAGACTACATACGTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3R 29350665 5' - 297 6941 2 62.33 TCGCATCAACAGCTGGGATAAACTTTCGCAATTCATTATTACGAACAGATCAGAAAGTTGATAGTTTTATTTAATGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCG:1 + chrX 8013554 5' - G6 1836 1 51.37 CAAGTAAAATTGAATTCAGCTGAAATCTCTTTGAGTTGCTCACACGTTCTTATTATTTCACGGAACAAACAGAAATCCCTTCCAGCTCAGAAAGATTTATCCTTCGCCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr2L 7667354 5' - copia 242 1 74.66 GGCAGAGAGAACATTATCAACTAAATGATTTGGTATTGATCAAGGGAACCCAACACGGAGCCAGACTAAGACTTTATGACGCAGAATGCGCACATTCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACA:1 - chr2R 547982 5' + Stalker4 6990 4 67.81 CTGCTTCAAAACTTGTTGACCTTTAAAGAGATAAAAGATACGATCTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr2R 15392856 5' + blood 7021 2 76.03 GAGAGCATGTTACAATAGATCAACTAGTAAACAACATATACATGTTCGAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3L 9242106 5' - roo 386 2 53.42 CTGTGAGGAAAAGCTGAAAAGGGAAAAATGGGTGAAATACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 + chr3L 10814486 5' - 297 348 2 60.27 GCAAATAAATGGCCACGCCCAACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3R 7424513 5' - 412 7525 2 66.67 AAACACATAAAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3R 27835720 5' + 412 7077 2 69.18 ACAGAAAAAAGCGGCGGCGTCGATTGGTGAATGCGGATATTTTGGCCAGAATAATCAAGGGATTTATTTTATTATTTTAGCTTTGCCGGGCATGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATGTGGTTTCC:1 + chr2L 4827804 5' - Stalker4 7336 2 48.95 AATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr2L 17162763 5' + blood 60 2 59.31 ATATCGCTATATAAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTTGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 + chr3R 21570488 5' + mdg3 51 2 63.25 ATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 + chrX 18366043 5' + jockey 97 1 77.40 CTTTTGGTATCGTCGGCGTCACGACCCCGGCCGCCCCGCCTCGTCCAGCAACCCAACGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATC:1 - chr3R 31071895 5' - opus 494 2 75.00 CGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chr3R 28008317 5' - hobo 2887 1 62.99 TCTGGAAATTGGCAAAGGCAAATCGGGGAGCGTGGAAATATGCACATATCTGCCCAAAATAAGCAGAACACTATGAGACGAGTACAACAAATGTATAGTTAAATATATAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTA:1 + chrX 16924768 5' - roo 8822 2 69.18 CCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr3L 19396997 5' + F-element 45 1 58.22 CTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTC:1 - chr2L 11867372 5' - BS 4967 1 58.90 ATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2R 9164929 5' + 412 7122 2 63.01 TGTTGCTATTACTGCCTCCGTTCAAGTTTTTCCTTTTGTGTAACTTTGACCTGCTCGGCTCCCAGAGCTTTTCTTTTTCCCGCCGGTTTATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAA:1 + chr2L 15965177 5' - blood 373 2 77.31 ATCTGGCCACAAATGCCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCT:1 - chr3R 24175798 5' + Burdock 40 2 58.22 GATGACTTTATATGGCCAAGCGCCGAGCGACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGAGTGAATAGTTGTGATGCCGCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAA:1 - chr2R 13574875 5' - diver 6075 2 57.53 GAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTC:1 - chr2R 16312129 5' + G6 1979 1 49.32 CTTGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAA:1 - chr3L 25232920 5' + GATE 8304 2 56.85 GCTACTGCTTCGGCGGTGAAAAGAGAGAAGTAGTGGGGAGTAGTCTACTACTACAAAGGTATTATGAACAGCCTAAAAGTTGTGATTTCGCTTAAGAAAGTAAATAAAAAAAGGATAACATGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTT:1 + chr3L 22956948 5' - HB 133 1 58.22 ATATACATAAGTTGTTATGTTTGCTGTTTGCCTAAAATTATTAACTGCTGCTTGAGATTAGAATCAATGGCTGTTGGGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3R 18665368 5' - 1360 3348 1 58.22 ATTTTGGAACGCAGATATGATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:2 - chr3R 24229023 5' - opus 489 2 79.45 TTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr3L 3979695 5' + opus 41 4 57.53 GGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr2L 2690571 5' + hobo 58 1 57.53 AGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTACATATATCGAGGTTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr3R 15649905 5' + blood 7034 2 69.86 CTCCCTGAACTTCCTGCCAACGCACGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 20290794 5' - roo 9031 1 56.85 TTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATC:1 - chr3L 17667607 5' + F-element 93 1 72.60 CGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chr3L 13204800 5' + jockey 69 1 60.96 CTGAACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 22255300 5' - roo 9033 1 60.27 AGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCT:1 + chr2L 1136320 5' - 1360 3312 1 69.18 AGACATAAGCACTCTCAGCTAAACTTTACACATCCTTAGCGAGCATAACAATGGGAAAAGCATTGCTATAATATCTCCAACTTCTCCAACTTGCACACCCCCAATCGAAGTATAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAA:1 - chr3R 3624061 5' + 1360 3108 1 76.71 ATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATA:2 - chr2R 5022791 5' - Gypsy12A_LTR 94 1 60.96 ATCAAACTCTTCGTATCTTCAACCAACTTCGACTAAAATGATTGTCTAAGCTTACAATTGTTCAGAAATTAAACTATTTTGAAGTGAAAAAGGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAT:1 - chr3R 9709731 5' - roo 72 2 63.70 GATTTGAAAGTATGCAGCGAAATGTTAAAATTTAAATTTTAACTTGTCCACCCCAATCACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr2L 1136436 5' + 1360 23 1 67.38 AATCAGTACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr2R 18123371 5' + 412 10 2 72.92 TATCTATCGCCTTTTGCACGGCCCATTAGTAATTAAATATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 - chr2R 14884392 5' + mdg3 5277 2 69.18 GGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3R 8542652 5' + roo 89 2 79.45 GCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2L 18048247 5' + blood 7064 2 51.37 AGAGTATACTAGATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 3322575 5' - 1360 3362 1 64.12 GTGCATCTGCAGCACCAGACGCTCTTGCCCGTCAAGATGGGTGAGCCACACGCATACACGAATCACACACACGTTACACACACACATCCACGCCCACAAAGCTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr2L 8103464 5' - pogo 2084 1 66.90 CATTGGTAAGTTGGGATGCTGGATTGGTGTATATTGTACGTAGGCCAGGATCTGCAAGACTGATGAAGAAAAATAAGTCTTAGCTCATTGTATAAAGTATCTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAAT:1 - chr3R 20827963 5' - pogo 58 1 66.44 ATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr2L 17162780 5' + blood 77 2 71.03 AGAATGAAGCGTTTGCGAACCAATAAAATGTATGTGTTGAATGTTGTTGTATGTTGTTGTTGTATGTATGTGTCTTATCAGTATAAATATATTTATACCCGATACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:1 + chr2R 5497753 5' + INE-1 11 1 75.34 GTGAGTGCCATAAAATGAAAGTTCACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 21420986 5' - roo 394 1 75.34 CAGCGCACTTAAATTGAAACCAGAAGACCAATAAGAAACGCTCAATAACATTTAAATAGCTCAAGATTCCTGCCCAAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTA:1 + chr2R 20856151 5' + Juan 4121 1 75.34 AAGTCGGATTATTTACATACATAAATATGTATCCATATTGCTGGTAGATAAATTCGATATTTGATCAGGATGACTAGCCGAGTCGAGCTGACCATGTCCTTCTGTCTGTCCATATGACGTTGAGATCTCGGAAACTATAAAAGCTA:1 + chr2L 22037429 5' + INE-1 151 1 56.85 TCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 25822973 5' - roo 341 2 65.75 AAATAAATAAATAAATAACTACTTGGGAAACAATGCATTAGACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr2L 16703574 5' + roo 79 2 72.60 TAGCCTGATATATGGATTATCACATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr2R 18123532 5' + pogo 45 1 53.42 AAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr3L 19397008 5' + F-element 56 1 50.68 AACCAAAATAACACAACGATAATAAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2L 10089871 5' + 297 27 2 67.81 GATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACCCGAGTTTCTCTAACATATCGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATAGAGAACACGTGTTTTACTTGCAGTTGTGTG:1 - chr3R 29709072 5' - blood 7353 2 51.18 CTTAAATGCCCAAAGTGTAGTAAATATCTTTTCAGAAGGGTAGGCCAGGAACAACGTAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGGGAGACCAAAC:1 - chr2L 12185445 5' + G5A 2570 1 73.12 GCGGGAGAACAGGTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:1 + chr3R 3527093 5' + Tabor 6922 2 71.92 TGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr3R 6103666 5' + Tirant 8169 2 64.93 GAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACA:1 + chr4 1301733 5' + 1731 4383 2 63.01 GAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:3 + chr3R 23507558 5' - 412 7502 2 54.79 GGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 + chr3L 17447420 5' - Tirant 8476 2 64.34 TCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGGGCTTATCTCA:1 - chr3R 15030738 5' + jockey 99 1 77.40 GGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAACCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3R 15514529 5' - 412 419 2 66.44 AGCCCGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATT:1 + chrX 18707440 5' + BS 4751 1 57.93 TTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGC:1 + chr3L 3540134 5' - mdg3 5421 2 64.38 GCATACGCTTGGTACACGCTCGTCAAAACATATACACATAACCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 - chr3L 20785533 5' + P-element 77 1 32.88 ATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCT:1 - chrX 19231816 5' + mdg3 5336 2 75.17 ACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 + chr3R 10778629 5' + mdg3 44 2 56.16 AATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 + chr3L 18468342 5' + jockey 4723 1 52.05 CCCAAAAATGCTCCCGAATTCCACACTTGTTGCTGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3R 8367146 5' + Doc 58 1 52.74 CCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 - chr2L 14969973 5' + Tirant 55 2 57.14 ATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 + chrX 10101330 5' + mdg3 71 2 63.89 TGGACCAAACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 - chrX 21639702 5' + Tirant 8179 2 72.46 AAAAAATCCCAAAACGATTCATGTTTTAATATGAACGTTAGTCTTAAGAGATGCCAGCATTAAATAAACCTACTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAA:1 - chr3R 24868420 5' + jockey 413 1 50.68 AACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 + chrX 19231706 5' - mdg3 218 2 66.44 AGCGTAAGCTCTCCCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACAGAAGGGGGTCCCGTC:1 + chr2L 16685300 5' + P-element 9 2 70.10 CATGCTCGCTCCATCCAAGCGTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:2 + chr2L 21936047 5' + INE-1 11 1 47.26 ATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATGGCATAAATAAATGTCT:1 + chr3L 13597778 5' + blood 60 2 75.89 CTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCGGTGGCTCTAGAGGTGTCTCCAGGCTTTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGA:1 - chr3R 9258739 5' + 1360 93 1 78.08 TGGTAACAGTACTCTACTGTCTCAATTATCTACCGGTAACATTTAACCACTTCAGTTAAACACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2L 21342358 5' + roo 60 2 67.81 AGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 + chr3L 12250961 5' + flea 4809 2 56.85 ATTTACCAATTTAAAGGGCAAATGGCCCAAATGCGTTATTTTTTTACCTATGAGGCCGTCATCCGTTATGCGTTCTGTAAATCCTTGCAAATGATAGAAAGACTCAGAGGCATCTGTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGA:1 - chr2L 21932844 5' + mdg1 153 2 73.61 GCACGAGGTCAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chrX 3452400 5' - Tirant 357 2 56.85 GCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAG:1 + chr3R 6103602 5' - Tirant 8418 2 76.03 AGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr3L 19396994 5' + F-element 42 1 60.27 CGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr2R 16908494 5' - roo 8999 2 67.12 GACTGCATTTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 + chr2R 21056681 5' + Tirant 65 2 62.33 CAGGATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 - chr3R 9958699 5' - opus 7426 2 76.71 CAATTTATTTTTATTAGCTCTTTGCCTTAATTGTGAGCCATAAATGATAATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 + chr3L 18468294 5' + jockey 4675 1 77.40 GAAAGTTCACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 21421002 5' - roo 9041 1 64.38 GGCAGAGCTGAACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTATTTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 22255293 5' - roo 9042 1 64.58 AGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chr3R 24229001 5' - opus 7470 2 64.38 ATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chrX 13651589 5' + 297 6618 2 58.62 CTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2R 8686595 5' - hobo 2922 1 64.52 CGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr2R 10367473 5' + 412 7099 2 55.38 ACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTGAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 21924332 5' - roo 325 2 74.66 AGCTATAAGTATTTGTGCTTGCTTGCTGGCTTAATCAAGCATGAAATAGTCCAAACGTTGTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 + chr2R 19353971 5' - 297 339 2 58.90 ATTAGCTACGCCTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3L 22529823 5' + roo 8740 2 69.86 GTGTGTGTGTGTGCAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTGTGGGTGTGAGCTGTGAGTTGTGAGTTGTAACTGCTGTCGGATCGTTTGTTGGTCATAAATTAAAATATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 + chr3R 15700808 5' - accord 183 2 59.12 GCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCA:1 - chr3R 11461855 5' - 17.6 416 2 76.03 TTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCAAGAAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCGGCACGAAGCTGGAGTG:1 - chr2L 15488476 5' + micropia 305 1 50.68 GACGCATTCCCCAAATGGTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chr2R 23313135 5' + Tabor 16 2 73.29 TACACTTCTTAAATTAGAAGACCGCCTCATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3R 12787095 5' + 297 6615 2 58.22 TGTAGATTAATATGGGATGGACTCACTATTTAGATACTTTTAACATTTAATTTAATCGTTTTTGTTGTGCAGTCTTTTGTGTGTCTTTGTGCAGGGTTGTGTTCCTTACTTACCATTCGCCTGGCGGTAATCGTCCTGGCGATTTT:1 + chr2L 9813878 5' - BS3 1376 1 56.85 CGGGCATTGTCTAGGCAAATCCCATTTTATTTAATAGTTTTTGTATTTTTTATTATTATCAGAATTAGTAATAAGACATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGC:1 - chr2R 20015185 5' + X-element 49 1 42.47 TACTAGAGCACATTCTCGCTTTTAGACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3L 4710678 5' + Doc 22 1 73.29 CACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCT:1 + chr3R 13358613 5' - mdg3 5413 2 73.97 ATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2L 535485 5' + roo 81 2 77.46 GAACTGCATCTTGAGGAACGTGACCGCGCACTTGCGATTGCACCAGATGGGCACCAGGATGCGAGGACGCAATATGCAAAGGCTTGGGCAAGGGAAGTGGTGCCAGCAGGAACAGTGCATGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCT:1 + chr2L 10073238 5' + Ivk 5164 1 41.78 TATTGATTCGGGCCAGATTCGGGCGTCAGCATCGTCATTTATATTTCACACATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chrX 8502168 5' - pogo 2077 1 57.94 ACCAAAAAACACTATGGCCACCACAACAACCATTTTTTAATTTTCCTCATTTTATTCGCCATAATCTATCGATATCCAAGAAAAAATATAAAATTTCGTGATCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGA:1 - chr3L 43515 5' + INE-1 554 1 64.83 ACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 + chr3R 5765356 5' - opus 434 2 78.05 ACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 - chr3R 29709051 5' - blood 302 2 68.49 CATTATTTACATCGCCAACAACCAGCAACAGTCGACCAGTGAAATTATGAACTCCGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:2 - chr3R 22810834 5' + flea 14 2 76.03 GGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 + chr3R 25271201 5' + 412 7142 2 76.71 CTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr3R 22289458 5' + 412 77 2 70.55 GATTTTCGAAAAAAATTTCCTACGCCCACTCTATCGCATTTAAACATAATCTTTCATACCTATGAATAATCTTTCATTCATATGAATACATAAGAGATCCTTTTTACGCTCTACATTATTATTAATTGGGTTTGTATGTGTACTGC:1 + chr3R 17021358 5' - baggins 5422 1 48.63 CACATATCGGTGCTGCACGTGGAGCAGGAGGTGGTTGGCGACGACACACCAGCAGTGGAGAGTGTGCTGGATTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGC:1 + chr3L 19587301 5' + 412 144 2 51.03 CTAGTATTCTAGTTTACGCTAACACCCAGTTATAGTTTGGAGATGATTACAGAAAATAAAATTAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATTATTATTAGCGCAAAAATTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAA:1 - chr3L 25255973 5' - INE-1 298 1 65.07 CTTCTAAGCACCGAAGTGGGTAATTCTCTTTACCTATTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTA:1 - chr2L 16942115 5' + mdg1 86 2 73.97 CGCAGAAAAAAGCAAAATCGATATGGCTTATTGCTAAAATGATTTTCTCAAAAAATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 8022096 5' + roo 8693 2 63.01 TCCGAGGACCAGGGACCACCCTCATTTTGGCTGGCTGACTAAAAATGCTTGGGATTCTCATGAATTTTCTATTTTCGATATGTACACACACACACACACAAACACACAGCCTA:1 - chr2R 20941107 5' + gypsy3 426 1 58.41 GGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 - chr3L 20747191 5' - Burdock 191 2 69.86 ACGGTCACTACTCCAGAGGCTCCAGTGTCCACTACTCCTGAGGCTCCAGTGACCACTACTCCTGTAGCTCCGTCCACTACTGAAGCTCCAGTGCCCACTACTCCTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chr2R 18051115 5' - mdg1 7444 2 70.55 AAAAGCAAATTTAAAAAGCTTTAAAAATATAATTTGTTTGCTTGTGTGAGTAAAA:1 + chr3L 20265020 5' - 1360 3252 1 58.18 GCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 10973168 5' + jockey 36 1 65.07 TTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGTT:1 - chr3L 14581470 5' + pogo 6 1 66.25 GGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 + chr3R 6103587 5' - Tirant 326 2 67.12 TTTTTGGGTACAAATACTCAATCACTCGGCCGGGTTTAGTGTGTCATTTTCCAGAGATACAGATACATTTACATATACTTACACACACAGAACGTGTTTAATACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATT:1 + chr2L 13094320 5' - mdg3 5212 1 67.81 ACTAAGACAATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 5245534 5' + 1360 26 1 68.49 AAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr2L 20984295 5' + blood 57 2 57.53 TATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 - chr3R 14165140 5' + Tabor 6884 2 54.17 TAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTG:1 + chr3R 10973219 5' + jockey 88 1 69.18 ACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 21093245 5' + Ivk 9 1 71.43 GTTGTCTACTTCAATAGGTTCTGGTGGTGGTTGAACTTGGGTGAGGCCTAGAAAACTTCGAAGCTCTCTAATGTTGTGTGGAATCGGATACTTGATAATTGTGGAAATTTTCTCAGGATCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAA:1 + chr2R 2897899 5' - TLD2_LTR 196 1 71.92 GCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAAT:1 - chr3R 27845572 5' - Stalker 352 4 54.11 CAATAGTTAGACGAACAGAAAACACAAAAGCAAACATATAGAAGCCAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCG:1 - chr2R 13584791 5' + Doc 4253 1 80.14 TGGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr2L 10937862 5' - mdg1 7374 2 75.86 CCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAA:1 + chr3R 27786577 5' - Tirant 8420 2 78.77 ACTGAAAAATATGATATATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 - chr2R 9327048 5' - mdg3 174 2 66.44 GTTTCTCCCGGATTTGTCAGTTTAATGAATGCTTTCCCAGCGAATCGACGTATTTGCTAAATGGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGGGCTGCGT:1 - chr3R 6052612 5' - Quasimodo 236 2 56.85 CTAGAAATTATGTTAGAAAATCGTGGCGAGAGGGCATCACACCTCATGTATCAACAACAAAAGAGATGCCGAAACCTGAATGCATTCCATTGTTTTCGAAAACGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTA:1 + chr3R 10590583 5' - roo 195 2 69.86 ACGCGCCTTCTTAGCTATACGAATACTGAAAGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTACAAATGCAGCTA:1 + chr3L 18835312 5' - pogo 2050 1 70.00 GAATTGTTTCGAAATATTCATTAATTCGACGTTGGCTAATATTTGCAAAGGTATCCATTCCATTCGCTGGCAACTCTTCATTTTCGCCATATACATACATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr2R 17945081 5' + 297 11 2 75.34 CAGAGCTGTAATCCTGCTCCCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGGCCGCAAATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr2L 20561341 5' - P-element 2872 1 71.23 GAAGTTGTTCGAATTCAGAAGAATATTTCTTAAAGTGCAATCATATTGAAGAATTAGACTAAAAAACAAGGCCAAGTAGCCCGGATTGATTTATTGGTTAATTTCAGACACTTAATATTAATTAATTCGACACCGATGCGTACGTT:1 + chr2R 20148002 5' - 3S18 6030 2 58.22 CTTGACTGTCCGCTGCCCTCTGTGTTTTTCCGTGCTTCGATTGTAAGCTGACCTCTCTCTCTGCCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCA:1 + chr3L 27413141 5' + invader1 3579 1 56.16 CTCATCATTTGGCGGTAAGAAATATATTTGTGCACACATTTTAGAAATTGTTGGTGTTTGTTTGAACATATCCTTCATACACCACTACACAGACACACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCTGTCCGTCCCATTCATGCCCATGCC:1 - chrX 13028341 5' - invader5 135 2 53.10 CCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr3L 11665901 5' - pogo 2039 1 63.01 GAGTGAGTGCAACAGGTAGACGGTGAGTGCAGCGGAAGGGCGGATGCGGTTTCGTTGGCCACAGTTCAATTTAGAGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCAT:1 + chr3R 4655082 5' + P-element 2885 2 53.79 AATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:2 - chr3R 15465600 5' - mdg3 5459 2 58.22 AGGAGGTGTATACACTGTTAACAGCCAGGGGTTTATTCATCGACGATAAATTGATCATTAGTGCAAAAGTGCCTCTGTTTAGCAGGCATCCATCCAAATTGTTCAGTGTTGTTGCCTCCCGAGTTATACCAGTAGTTAATATGGG:1 + chr3R 19449035 5' + transib2 2681 1 73.10 TGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTTCATT:1 - chr3R 25521911 5' + blood 44 2 55.48 ATTGCTTACTTTTCTTTAAAAACATCCCTTCAAATGGAGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 - chr3L 14320845 5' + Doc 86 1 74.66 GTCACATCTTCCCATGATCAAATCGAAAATCCAACGAATTTTCGATTTGATCATGGGAAGATGTGACATTGCTATTCATCATATTAAGTGCTTGACTTTCTTATTAAAAGTTACAGAAGACATGTTTTTAAATTTTTTCAATTTAT:1 + chr2L 22001492 5' - HB 318 1 52.05 GATTGCAGCGCAGCTTGAAAAGGACAGGATTGATTGGCATTTTATTCCCCCGGCAGGACCTCACTTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTCGTAAGAAACTGATT:1 + chr3R 19447503 5' - roo 9038 1 50.00 GTTCCGTTTTTATACCCTTTACACGTAAAGTAACGTTAAACAATTTTTTCTCATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 + chr3L 22737360 5' + mdg3 5321 2 64.38 TATTTCGTATGTTGCATGTACTACGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr3R 31907290 5' + Tirant 10 2 79.14 GAATACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 14088691 5' - 1360 3365 1 69.18 GCAGGTAAGAGAAGCAAACGAAAAGCCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 16771468 5' + roo 27 2 69.18 GCCTCCACGGCTCCCGACTCGCCCAGCCATCGACCATTGGCCATTGGCCATATGTTGACCCGGGACGGGACTATGCTGCTCCAGTTAATTACATGATTTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 26782838 5' - hobo 2930 1 76.69 AAGGGGGCTAGAAATATTTTCCAAAGCTTGTTGCATCTAATAAATGGGATCTTATGGTCATAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chrX 7293208 5' - 1360 3333 1 60.27 ATTTTACTTCTTACTCGTGAGATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - chr3L 21820067 5' + Juan 44 1 54.79 AAGAAATAAACTTTTATATTTTTTACTTTTCTAAGTACACAATAAATCTGTGCGAGTTTATTCATAAAAAATATAAATAGTTTAATTTAAATTCTGTTATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATTTATGTA:1 - chr2L 5771540 5' - Juan 4190 1 68.49 ACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 19700876 5' - roo 342 2 69.18 TTTAGAATATGGTAGCAATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCG:1 + chr3R 4913550 5' - 1360 135 1 49.32 ATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATT:1 - chr3R 14049405 5' - transib2 2735 1 77.40 GTATTGCCAGATAGCCAGATAGCCAGCTAGTTGTCCCATGTAGTCAGTCACTCAGTCAGGTCAGTTCGCGGTGTATCCATGGCAAGTGCATGGCGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAAATTTATTAGCGTAAGTTTA:1 + chr3R 24175640 5' - Burdock 229 2 67.81 TATTAAAGCAAAAAGACTGGTTAAACTAAATTATTGCTGTACTCTCCACTATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chrX 12551802 5' + pogo 66 1 65.75 GTAAATTTCGATTGTACATATTTAAAATGCTCTTGTGTATATATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 11526723 5' - pogo 2083 1 69.18 ATTATTGAATTAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCC:1 + chr2R 19633160 5' + jockey 4593 1 70.55 CCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr3R 10973197 5' + jockey 66 1 55.48 TGTGTCTGTCTGCCCTGGCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2R 18882544 5' + roo 8699 2 57.64 AATAGATCTGGTGATCTAGAAGGCACGTGCCTAAAATAGCCACACGCAGGCCAATGCTCTTAAACAAGAGGAAGCTCATATATATGAGCTATATATTCCATATATATCATATATGGAAATATGAGGGAATTGTGAAGTTTCCAGAG:1 + chr3R 3336554 5' - Q-element 20 2 54.79 TAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCA:1 - chr2L 19878248 5' + mdg3 72 2 65.07 ACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 + chr3L 5438732 5' - hopper 1353 1 58.90 ACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chr3L 19279100 5' - opus 7455 2 53.79 AGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chrX 5222872 5' - 412 7470 2 70.55 TAAGGGCATACAGGACCTGGTTTTCTGCACATCATTCAATTCATTATGGCACTGTGTATTCCAATTAATGGCATACTTTTTGGCTGGACGGGAAATTCGGCGGAACAATTGTTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTG:1 + chr2L 17213897 5' - Doc 462 1 76.71 GAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3L 9571664 5' + jockey 82 1 69.18 CGCGGATTACTCGGAACGTGGCTGCTAAGCGCCTCTAATGCCACTTGGCTGCCAGGAATGGGGCAACAAGGAGCTCACTTCCGCCTGGTTGGAGTGTAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGT:1 + chr2L 9356772 5' - Stalker4 384 1 71.23 CTAAACGTGAGAGCCACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr2R 16410150 5' + opus 23 2 69.86 TAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 23507555 5' - 412 7505 2 56.85 CAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGC:1 - chr3R 9983080 5' + HMS-Beagle 6877 2 73.29 CGGTCGTCTGGCATAGTAAAGTTGTTGGCAAGGCCGGAATGCAGTGGGTAGTTTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chrX 3524343 5' + roo 34 2 56.16 CTCTGCAATGCTTATATTATTTTTCCGCATCAAATCCTTTGAGAGAGATAAATATTTGCATAGATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 - chr3L 20053097 5' + blood 22 2 43.84 CACAGACTGCAATCATAAATAATAGATTTTTTTGGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGTGTGGTCAT:1 + chrX 21098579 5' - jockey 4770 1 73.97 AATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chrX 983196 5' + 412 7140 2 76.03 GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:2 - chr3L 27391422 5' - 1360 3365 1 64.38 GCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3R 19545319 5' + jockey 62 1 52.05 GTACAAGTGTCAATCAGCCACCTAAATACCCTAAATCTTAATCAACTTTTCTACTTTTGTGGCTATACGAAAAAAAATAAACGTCGGGGCCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCG:1 + chr2R 6565168 5' - diver2 4868 2 54.79 GCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr3R 15590077 5' - Transpac 5185 2 56.16 ACACTGAGAAAATAGGAAAAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 9938738 5' - roo 9055 2 74.66 TGTCCAGCCCGTTTCTGGAATGGAATGGAATTACTTATGAAATTTCAAGGAATGTGTACTGTTGAAATCGGCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTA:1 + chrX 12676034 5' - Tirant 370 2 48.63 GTGTAAACATATAAATATGATAATGAAGTTTGTTTTAATCTTAAATGTATAGTATCTATTTCTAAAATATTACTGCCAAGTAATGAGAATGCACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCTCCCCATTCCA:1 + chr3R 8393789 5' + Doc3-element 444 1 60.96 AGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAGCATGGGTCAACAAACTAGAGCTGCGTGTATGCGTGTCTCTAGAATCTGTATACTAAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGATCCTGAGATCTCGGCGTTCATGCGGACAGACGGACATGG:1 - chr3L 22511715 5' - INE-1 121 1 91.78 TTAAAAAAATATTTGTAGCCTACTTAGTGGGGCTGGGGAAAACTGCACTTTGTCAATTGCTCTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2L 11573641 5' + jockey 4718 1 55.30 GGAATACTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:2 + chr2L 20984251 5' + blood 13 2 73.97 CAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCC:1 - chrX 22913214 5' + gypsy7 47 2 64.38 TACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACAC:1 + chr2L 12283927 5' + Quasimodo 61 2 60.96 GACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGACCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chrX 17258330 5' + 297 6613 2 61.87 CACATCTGGCTGGTCAATGGTGTTAGTACATTGATCCCGATGTCCAGGAGTTGCCTTCTCTAATTTGACAAACTCTTTCTGCGCTACGTGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACACTTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2L 8397279 5' + roo 32 2 64.38 AGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chrX 9816448 5' + jockey 97 1 76.71 CTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr3R 10142925 5' + 412 7108 2 54.11 CCTGAGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr3R 20149816 5' - 1360 3352 1 60.27 ATTATCCCAGGGTCTCGAAAACTCGCCACCATTTGTACCACCGTCTCTGTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2R 21380755 5' - roo 398 1 77.40 AATATTCAGGAAATTAGTTGAGAAAAGAGAAAGTTTAATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2L 1327644 5' + pogo 17 1 73.97 GAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr4 1149951 5' + 297 47 2 58.62 AGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCG:1 - chr2R 22692446 5' + Ivk 48 1 51.37 AAGTATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chrX 15167774 5' - roo 9031 1 56.34 TGGTAGACGGACTCTTCATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGTTTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATAACGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chrX 14385114 5' + blood 7035 2 67.81 ATCAGATAAAACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:2 - chr2R 21898022 5' + 412 7068 2 72.60 TCTTAGGATGAACAAACTAAATGTTATTTACGCACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3L 5446225 5' + roo 8699 2 62.33 TTTCCGGCTCTGTTCTCTCTTCAATATTTTTTAATGAAACCATAAAGTTTATAATTACCATAAAATTTACTTGTTCGGTTCGTTTTTGTCCTGAGGTTTCTTCATGATGGGAGCAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAAACTTTAGTTT:1 + chr3L 5711372 5' + HMS-Beagle2 496 1 66.90 GTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chrX 3529821 5' - 412 419 2 66.44 AATTTCCAATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGAC:1 - chr3L 10076396 5' + X-element 67 1 54.79 GGGCAATTGGGCAACGCATTATGTCGTAGATTACGGCCTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 + chr3R 12537735 5' + Doc 83 1 72.60 TGTAGACGACAGCCAAGCCATGGAGGAGATGGCCTCAGATGGGAACGGGAATGGCAATGGATTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGAC:1 - chr2L 608891 5' - blood 7247 2 55.80 AATGTTAGTCTAAGATAAAATAATTAAACAATTTTTATTTCCAATTCAATTCCTTTTTCATATTATTAGTAATTTCTTATTTTTTATATTGTCTTTATATTGTCACTGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 + chr2L 22713312 5' + Ivk 26 1 67.12 GGTGGGTGGCTCAAGCTTTTGTTTGCCCAGATTTGTAATTCGATCCGGTTCTCTTTGCAGTTCATTATAAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGA:1 - chr3R 25658682 5' - Doc 4232 1 52.74 AAACTATGTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATAC:1 - chr3R 25753694 5' - hobo 2854 1 74.66 GTTCATGCCGAGGAAAAGCCCTCGTATTACAATGAAAATTGCAGCAAAGCCGGCATTCACCGTCTTTAATTTCAAGTACTTAACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTCACTATAAACTATATACCTCTTATCTTAAATAATTGTACAT:1 - chr3L 13953324 5' + Cr1a 4142 1 53.79 TTTGAAGCTTTAGTGGTAATGATTTAAAGGCTTTAAAGGACTTAAAGGACTTAAAATTAAAGACATCCCACTGTGCGGCGAGGACAGGCATGCTAACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCA:1 + chr2R 13192494 5' - mdg1 216 2 62.33 AACGGCATCACAAGGGCCACAACAACAACAACTCAGTAGTATATGGTATATTCATATGGATATGAATAAACACACATTATAAAATAAGCTCATACACATGTTACACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGTCAATAACATCTGGGC:1 - chr3R 3921811 5' + Circe 7216 2 73.29 AATACACTTAACATTTCTTTTCAATGTTGTTAATATTTTATTTTGACCGATTGTCTTGATTTATAAGAACAGAAACATACTAGACAACTAAGAAATAAAATCAAGTATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGATTTC:1 + chr3L 14396939 5' - F-element 4255 1 71.92 CAGATAGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 - chr3R 5940526 5' + hobo 69 1 63.45 GCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2L 1449605 5' + opus 40 4 62.96 TTTGGTCATCATACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3R 8542722 5' + roo 8679 2 69.18 TGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTT:1 - chr2R 5900945 5' - Bari1 1666 1 58.33 TTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGAC:1 + chr3R 23108078 5' + G-element 28 1 54.55 TGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 18846496 5' + roo 8722 2 56.85 GTTGCTGTTGGCAAAGTTCTGTATTTTTTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr2L 17069658 5' - 412 450 2 54.61 TATCCATCTATCATCATCATACTCCAGAAGAAGAAAGCTCTGCTACCTTCGAATGAGTTAGAATACTGCTAAGAATTATTGCTTATTTCAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2R 9814983 5' - pogo 2076 1 71.92 CAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 5446115 5' - roo 330 2 71.23 GACTCGGGACTCCCGGATTCCGAGAGTCAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chrX 19498079 5' - P-element 2828 1 43.57 ACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 12608074 5' - roo 8985 2 77.40 GGTAGCCCATTTAATTTCGTTTATTTGGCCTTTTGCCTGCTAATGACATACAAACAAATATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr2R 8862390 5' - pogo 2040 1 62.33 AAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:2 + chr2L 18048251 5' + blood 57 2 54.11 CACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTCTGACACCTTCTTTCGCAGTAACTAATTTTAAAAGAAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 + chrX 19231709 5' - mdg3 218 2 61.54 AATAGATGATAAACGACTAGCTTCTATATATTACTGACAACTGAAGTTGATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr2R 16712964 5' - pogo 2034 1 66.44 AATTGAAACAAATTGCCTAGGAAAACAAATAAACATTGATTGAAATATAATTTCAGCGAGGCGATGTGGCTTTTCTAGGGTGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chrX 9342422 5' + 1360 39 1 58.90 CGATTGTTCGCTGAGATCACAGCTGGGTAAATTGATTTTCAAACATCTCTGCAAAGGACTCGAACGAAATTCCTTTCGAGTGCAGGAGGGGAGATTTACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACA:1 - chr2R 17991274 5' - Circe 7346 2 63.01 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGAT:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 130 2 65.07 AGGAATAGTCCTTATTGGGTGGTATCCTATCTACTGTATATTTCCAACTAAAATAAAGGAAAATGTAACGTTTGAATGGTTATACTTTGCTCAACTAGTCAATTTGTAAATAAATTTAAATTAAAGAACATACAATAAAATAAAAT:1 + chr3L 16053596 5' - transib1 1900 1 76.03 AGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAA:1 + chr3R 14049357 5' + transib2 87 1 76.03 ATATATCGCTATATAAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 + chr3R 21570486 5' + mdg3 78 2 70.55 CTTTTGTTTCTTTCTGGAGGGTAACACCATTTCCGGTCAGATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:1 + chr2R 9332093 5' - roo 377 1 58.22 CATTGCTCATACGCACCGGAGGCCGCCATGAGAACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGC:1 + chrX 9525329 5' - hobo 2869 1 70.23 AACAACTTTGGTTTGCTTAAAGCGGTTCCCTCATTCTTACGCTGCCATTTTGTTGGTATTCACTATGCTGATTTATATCTGATGGACAGAACAGGGGGGGGCAGTGCCCCCGACCCCAACGACCCGTTTAGGAGGAGTGGTAGGCT:1 - chr2R 19205577 5' + Rt1a 483 1 51.37 GTAGAGAAGGAAAAGCGCTGGATGCGAGAAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACC:1 + chr2L 11158604 5' - Rt1b 5103 1 60.27 TCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr3L 13597827 5' - blood 7309 2 73.97 GCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAA:1 - chr2R 5022781 5' - Gypsy12A_LTR 85 1 55.17 AGATTGAGTAACAGCTTCTTGTTTTTAAGCTCTGATTCATTGTAATAATCATTTACCTTTTGGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr2L 10937802 5' - mdg1 395 2 63.70 ATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chrX 19162580 5' - pogo 2040 1 61.64 GTAGACATGCACATATTCAGATTTGCACATTTGAACAGAGCGGAGCGCATAAATGAATGAACGAGTTCAGGATGCTGTCAGCCATGGGGATCATGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chrX 20552917 5' + roo 3 2 79.03 AGGCCTCTGAGATCCAGAGCTAAAGAGCTCCACAGCTTCTGGGACTGTGCAGGCTGTGGAGGCTGCACAAATAAATAAATTTTAAAATACAAACAAGTAGCGCGCGCAAAAATAGGCGTTTTTTTCATTGAAAAAATAACTTTTAA:1 - chr2R 24366989 5' - S2 1365 1 76.71 AACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATCGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCG:1 - chr3R 9983079 5' + HMS-Beagle 6861 2 68.99 AAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAA:1 - chr3R 26900178 5' - baggins 5128 1 37.67 AGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCTATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr2R 15080036 5' + roo 8751 2 77.40 TTGCGTCCATTGGCCCGTCTTTGCTCCGCCGAATTGATACATAAGGTAATATATATATGGAGATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGAGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACA:1 + chrX 7329193 5' + Bari1 36 1 54.33 ACTTTAAATATGAAACATTATAGAAATATTGATAATATAAATTATATTGATAATATATGAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 + chrX 18953384 5' + opus 172 4 68.35 GTTGCATGTACTACGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr3R 31907300 5' + Tirant 26 2 68.97 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGAACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGCCA:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3375 1 57.29 GCCAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 4416009 5' + jockey 33 1 68.49 AAATTTCTGAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:3 - chr4 1149959 5' + 297 40 2 58.22 CCTTGTTTATTTGCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr3R 25409562 5' + jockey 82 1 68.31 TGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 - chrX 5222958 5' + 412 61 2 61.64 AATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr3L 10814640 5' + 297 20 2 71.23 AGCTTTGACCTTTTTGCCAAAACCAAAAGACTTCCGCGTCGATATGCACACATGCGTTTGATGATTTCGTAATTACAATCGGCACAAAAAATAGAAACAATTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAG:1 + chr3R 22782417 5' + gypsy5 368 2 67.12 ATAGGAAATGCCCAAATACACACGCAAACAAACGATTGCCGGCTAGATGTATGCCATGAGCGCCATCTAGCGGCCGGAATCCTTGCGAGATAGCAAATTGGGTGCAAGCAATTACAGAGGAATTTCTAAATTGTCGG:1 - chr3L 16407945 5' + Q-element 112 2 62.04 AATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTTGGGATTTTACACTACTTGTAACCGAGAAGTTAAGAGTCCCGTCTTGACTGGTCTGCTTAACTTCTCGGTTACAAGTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAA:1 + chr2R 13849650 5' - roo 410 1 48.23 AAATCTGAAATTTACATAACTCCATAAGCTCAATGATTTATTCGCTTTTGGAAAACCAAAGTTGTAAAACTATGAGTCAGAATAACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATG:1 - chr2L 3498071 5' + F-element 213 1 55.26 ATCGAAACTATGGCGCAGCTTCTCGATGAAGCCATCCTGCAAACATTAAATAGAAATTTTGGAATTGCAATTACATAAATATTATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCA:1 - chrX 7329332 5' - Bari1 1697 1 73.17 ATGGACGGTTTTGCTGCGTTTTGGAGTGGCTCGTGATGCAGTTAATATGCCACCGGGCAAAATAACATCTCAACGGCGTAAGCCAGCAATGAAAATGGCGCGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATTTTTCTTTTCTTAATAAATA:1 - chr3R 11121841 5' - copia 237 1 73.29 GTATCGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGA:1 + chr2L 8542746 5' + P-element 88 1 23.97 CATCGCTTTTGGACTGGAGAAGAAGGTAAGCCAATGTGCTATATGCAAATACATACTGAAATAATTATATTTAAAATCACGTAAACAAATTGTGTAAAAAACAGGTAATAACTATTAACTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAG:1 - chr3L 3470391 5' - X-element 4713 2 60.27 GTGGTGAAGAAGCAGCCTAAGTTTCCCACCCGCGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATAGATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 16887271 5' + roo 8688 2 68.49 CAGTTGTTTTCATGCCCTTGCCAAATGTATTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3R 11549785 5' + 297 41 2 58.90 TCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chr3R 15649884 5' + blood 7055 2 55.48 CAACACAATGCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAAT:1 - chr3R 28033693 5' + diver 57 2 54.79 CGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2R 15080032 5' + roo 8747 2 76.03 CAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAG:1 + chr2R 10478658 5' - invader4 3041 2 53.79 CTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 - chr3L 14969284 5' + P-element 79 1 28.77 ATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTT:1 + chrX 17735995 5' - mdg3 186 2 63.97 TGTATAAATTGTGTGTGAAATGAATTTAATCCAGCAGTTTTGCCGCCGGCGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGAGTCATTGTCTCTAGAATCTAAATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGACCTCGA:1 - chr2R 5150289 5' - INE-1 146 1 66.44 GGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCT:2 + chr3L 23146459 5' + 1360 49 1 52.05 TATTGATTTGTTAATACTCGTCTATGTATATATATATATTCAGATTTCATTTGGCCTTCTGTTCTGTCACAAACCCACTTACATTCACACACACACCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCG:1 - chr3R 11520045 5' + Rt1a 34 1 66.44 AAAAAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCG:1 - chr3R 27786647 5' + Tirant 64 2 62.86 AAGTGCATATAGTTGCGTTCCCGATTCCCGATTCCCCGCAAAAACCGATTCACCCCTGAAATTACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 20552776 5' - roo 350 2 54.79 AGTGATCGCCAGTCGTCTGATACAAGCACTTTAGACAAGCTCCCGTCTGCCGATCACAGTTTCCAGTGTCATAAAGATCGACATTATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAG:1 - chr2L 7818072 5' + Quasimodo 7173 2 58.22 GACGATGATCTTGCCAACCCCAAGCGGCGATCGCGATGGCAATGGCTGTGCGCTATTGCGATCGTATCGTATCGGATCGATCGGTTCGAGACTCGATTACAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 - chr3R 29207670 5' - copia 234 1 70.55 GCTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATA:1 + chr2R 20382502 5' - Bari1 1629 1 71.72 ATATGCAGGAAACACATTGAATAAGATTCGTCAAAATAAACTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr2R 7534669 5' + roo 8744 2 73.97 GCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr3L 5514203 5' + Doc 91 1 66.44 AAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 + chrX 18239368 5' + jockey 4575 1 65.75 ATATTTCGGTTTATTGTTGATGTGGGTAGCGGCTGGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr2L 10912212 5' + Doc 56 1 53.42 TGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 - chrX 14692942 5' - Transpac 249 2 62.07 GTAAATATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr3R 31621717 5' - blood 7309 2 70.55 AGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1 + chrX 6398806 5' - blood 299 2 70.55 AGGTGGACATGCGGAAGTGACTGGACTTAACAAAGCCCGGCGACTTGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCTGCTTATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGT:1 + chr3R 6371467 5' - 1731 90 1 68.49 TTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAA:1 - chr3L 14581445 5' - 1360 3167 1 65.07 ATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chr2L 19930154 5' + jockey 89 1 72.60 ACCTCGTTCGATCCTAAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:2 - chr3R 9983131 5' + HMS-Beagle 30 2 65.07 GTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 3524240 5' - roo 324 2 76.71 GGGTGGGGCACACAAGCACCTTGCACTTGAAAACCGAAGTGCGGGCAGCGCTGCTGCCGTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3R 30272939 5' - Tirant 8481 2 68.49 ACGGCGACCACTTGCAACTTTATTAGCTACGCCTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 22529844 5' + roo 14 2 65.71 AAACGAGATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chrX 14756633 5' - pogo 2067 1 62.33 CTGTTTTCGGAGCCATAACAGATGATGATGATTCCATTTGCGGTTTGAATAATTTTCATAATTTAAATAACAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGGGGCAGAATGGAATTCAA:1 - chr2R 23221116 5' - R2-element 3167 1 53.33 CATCAGTTACACGAAGAAATTTGCGCGCTTGGGCCCAGCGCACTTAACACATAAAACAAATTGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCGTATAAAAGCAGAGGTCTCAGCTAGAAGGTTGATATTCAGCATA:1 - chrX 2881439 5' + INE-1 171 1 59.70 TGCGATGTGATCTTCTGTACGTTTCATTGTACATTTCTCTAATAGATAGCAGGGTTTTTTTTCGGATTCGTTTATGATGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGG:1 - chrX 2670826 5' - HMS-Beagle 6926 2 52.05 AAATTATAACATTTTATTTTGAGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 - chr3L 17667684 5' + F-element 16 1 68.49 ACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACTTTGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 18849838 5' - roo 9003 2 68.28 TATTTAGTGTTTTTAAAATTTTTGTAAGAATTAAATAAATTAATGCACATGCAGATTTCGACTGGGCGATTTGAATGATGAGTGGCACCCGCACTCAAAATTGTTGAGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCACCCTTGCAGTTC:1 + chr2L 10118402 5' - hobo 5 1 46.58 TTTGTTGCTTAACAATCACCAAAACACACCTACTTCAGAAAGTGATTTTGAGATTTTAGGTATTTCTAAGTAATAAATTAAATTAAAAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:2 - chr3R 7649912 5' + Quasimodo 26 2 63.70 GCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAGGGAC:1 - chr2L 22684590 5' + transib3 81 1 63.70 AATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 4722497 5' - roo 9027 1 54.79 ATTGCCAAGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTC:1 - chr2L 8393098 5' + I-element 5144 1 67.12 CTAGTATCAACTTAATCGCTGTGAAGCACATGTGCATCGAAGAGGCGGCAATTAGTGGCAACATCCCAGTTTGAGTGCCAGGAAGAGGCAGCGAGGGCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCG:1 - chr2R 9033966 5' + F-element 4497 1 71.54 AATACTAAAAAGCTACAAAGAGTAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATTCCACGGCCACACCTACCGCCCCACCGACCGAGTGGCGCTGCCGTGTATCG:1 - chr2R 1949170 5' - Cr1a 4403 1 72.59 ACACAAATCAAACAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2L 17730564 5' + pogo 22 1 71.53 ACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chrX 10571352 5' + Doc 89 1 77.93 CTGAATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGAT:1 + chr2L 17550605 5' - Transib-N1_DM 449 1 79.45 ACTAAACGATGGAGTTTCTTGCTCTATCTCCCCAATGGCTACTTCTTTTACTTTTTTATTTACTTTTTTTTTTGCTGGCTCGGTTTCGGTTGTATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTG:1 + chrX 10103617 5' - mdg3 5319 2 68.75 AATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 - chrX 14908469 5' + blood 66 2 60.96 ATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr2L 7215648 5' + 297 35 2 59.59 ATGTATTAAGTGCAGCGAACAGCAATGTATTCATCCCAATTATATACTACAAAGTGATAACTTCCGTGATAAATTGGAGATCAATCATGAAACGCATTGTTGGGGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCTCGTCAATGGTTTG:1 - chr2L 17503536 5' - HMS-Beagle2 6769 1 60.00 GGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGGATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCA:1 + chr2L 15142249 5' + BS 4775 1 61.64 ATATAAGCTTACCTGCCTATAAGACTGATGGATACTGGGATCACTTTCATATTTCGAGAACCCATAATTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTATTGCATGCACATA:1 + chr3R 17219136 5' + Cr1a 256 1 54.11 CCTAAACACTAATCAATAATGATTAAATTAAATATATATTAAATATGTTTACATTAGACATTTATCAGTTAACAAATTAGTTCATTCCGCGCCTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTA:1 + chr2R 969268 5' + Cr1a 3973 1 60.27 TTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGGTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAA:1 + chr3R 10468012 5' - opus 444 2 59.84 GCTTGGCCCTGTTTTCGGTCCCTCTCGATTGCATATGCAGCTACTTTTATCGATTGGCTGAAGTTCGCACTCCTTGCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr3L 12863658 5' + Transpac 4960 2 55.17 GAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 + chr2R 5214949 5' + F-element 65 1 55.17 ATGCTTGCCGCATAAATGGATGCATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chrX 4789072 5' + 297 6596 2 76.03 CGCCGACGGCGGCCCCAAATAGCATCCGCAAAATGCAGCAGCAGCATCGTCGTTCGGTTGCCGCTGGATGTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTT:1 + chr3L 3400707 5' + copia 4975 2 51.37 GTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:3 - chr2L 15920168 5' + jockey 78 1 65.07 CGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3R 31120302 5' + opus 24 4 65.69 AACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3L 13597739 5' + blood 7064 2 55.56 GATTCTTCTCTCTCGCATGCCGCATTGCGTTTTTCAGATATTTTGAGTACCAGTTTTAAAACTTCTAAATGCACAAATATTTATTGCAAATATTGAATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTA:1 + chr3L 6842036 5' - jockey 252 1 66.44 AACGCTAGAATTTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGACAATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATGAACAGAGGCAGTAGTCATACTCTATGCATAACATGTTCTAATACTTAATACCT:1 - chr2L 8777076 5' - G4 3720 1 63.70 AAAAATTAAATTAAATACACTTACACAGCACTGTAACTTCTATTTGAAGAAATAATATTGTTCCGATTTTGTGGATTTTTGAAGTAGTACCCTACCCGATTGTAATTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGA:1 + chr3L 12100702 5' - Bica 453 1 71.92 CTCGCCGAAAAACTTTGACCCGCTCCTCTAGGTAAATGGCATTAGTATCCGTTTCTTCTTCGTTAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTCAAGCTAAGTCAGC:1 + chr3R 10243290 5' + blood 7121 2 56.16 ACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAA:1 - chr2R 6984407 5' - HMS-Beagle2 7131 2 63.70 GGTGAAGTAGTAAACTTTTAAAAGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr3R 9258811 5' + 1360 21 1 71.23 ATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3L 53051 5' - roo 8985 2 78.77 GCAGATCGACCTATAACATATCTGTACAACACCCTCCATTATTATGAGCGAATCTTACGAGACCGCCCTGCGCTAAAGAAGAAACTTGTAAGATTTGTTATGAATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2R 22892562 5' - pogo 2087 1 76.03 CTAGCGAATATCGTAAATCAGTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAAACAGCATCCGGCCGAA:1 - chr3L 13922349 5' + Tirant 76 2 79.67 GTGTGCAGTATAGAATGTGTGGTTCCTGTGATTATCTCGATATATTCGGGCCAGGAATTTGTAGTTGTCTTCGCCTGCCGCTGGTGTCAGTGTGTCAGTCTGTGTGGATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 1012464 5' - accord 7034 2 65.32 TGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chrX 9816455 5' + jockey 89 1 71.72 CGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr2L 19424687 5' + Tirant 8148 2 73.03 CAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGAC:1 - chr3R 22810777 5' + flea 4826 1 72.22 GATGAGCCAATTTTTAGTTAGCACACTTTGTTTATTGCATTGTAAAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGAC:1 + chr2L 3734470 5' - mdg3 176 2 64.83 CCTTTGAACGTTAAGTTTGTTGCTTAAGTCTTTTGTTTTCCCAAAAATTACATTAAAATTGGGAATAATCTCTATTTTCGTATTTTGTATTTTCCTTCTAAATATCACACAATTAAAGAGAAGTGTAGCATATTAGACTAATCTAC:1 + chr2L 16810931 5' + Stalker 2 4 76.71 ACACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 - chr3R 6103694 5' + Tirant 8153 2 55.48 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACAGGGGGTTCCTCTGTCAC:1 + chr3L 27396714 5' - springer 326 2 54.17 CGGACACGCCAGGGGCAGTGGCAACTTGTGTTTTTGGGGGGTCCTTTAATGGGCCTTTAACTCAAAGCTGCAACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 + chrX 20386636 5' - hopper 1369 1 53.79 AGTTTGTTGGGTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3L 14898821 5' + jockey 14 1 79.45 AGCAAGCAGAAAACGGTGCTTTCCATGCTTCTATCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCCCAGTTCCAGGGGATTTTTTTTAACGAAGTTAGAGATTAGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTG:1 - chrX 6279054 5' - Quasimodo 50 2 81.29 ACTAGTGTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 9481993 5' + roo 8708 2 56.16 ACTTACATATTTATTGCTGATTTAAAAAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 - chr3R 14331259 5' - Burdock 218 2 50.00 AACAAAGCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGA:1 - chr3R 27845598 5' - Stalker4 378 2 62.33 CGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr3R 16771427 5' + roo 8732 2 64.38 CCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 + chrX 19231708 5' - mdg3 5468 2 65.07 AAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:2 + chr3L 3979550 5' - opus 460 2 59.59 CCAGGCACATGCGAAGCCAGCAAGGCCATTGCCGTTTTCTCACACTACACTATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCT:1 + chr3R 14165038 5' - Tabor 378 2 65.75 ACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr2R 6984375 5' + Doc 23 1 70.55 AATTAGATCGTTCTAACAGTTGATGTCAGCAATATGTTTGACTAATGTGAACGCTTCGCCAAACATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGC:1 + chr2L 22696978 5' + X-element 4629 1 53.28 GCTACCCACCGCCCAGCACCGCCCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 + chr3R 19537441 5' - hopper 1392 1 69.86 GATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCATTAGGACAGATTTTAAATA:2 - chr2R 16312108 5' + G2 3040 2 63.70 ACTGGTTCCGCAGCCAGCAGCTTAGCCAACTATAACTGTATGCAAACACTGGAAAAAATGTAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGA:1 + chr2R 19903968 5' + Doc 4425 1 73.29 CCACTTTGCAAACATAATCGTATCGAACGCAATTACCAAAAATCATTTGACTTGAAACAGGAAACACTAGCTGGAAAAAATTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3L 11196468 5' + pogo 36 1 60.96 GTGCTTGCTTTCTCTTTCTCTCTGTTATCAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr2L 12142689 5' - hobo 2913 1 65.07 GCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTC:4 + chr3L 24153197 5' - Tabor 399 2 76.03 TGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTT:1 + chr2L 19371303 5' + Bari1 87 1 76.03 ATATGCCATTTGGCTAATGGTGGCACCCCACAAACTCACGTCGACCCCCTCGCAATTTTCGTGTTTTTCCGTGTGTGAAAAATATAAGACCCCATGACAATTGTAATGGCCTCCCCGTGGTGTTCCCTGGGTACCGATTATTACAC:1 - chr2L 19950469 5' + 1360 2916 1 54.11 ATCCGTTCTAATAGATACAATGGAAGTAGAATTTCACATGATTCAAGATCAGGATATGGGTTTCGAACCTATTTTATATTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTT:1 + chr2R 4192670 5' - roo 133 2 52.05 ATTGAACCGCAGGACGCGCCACGCATATGATATGAGCTTTCTAGCCAGGACACGTCGTTGAGCCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 + chr3R 8402509 5' + mdg1 30 2 65.75 AACACATTACTTGGTTACTTGATTTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 - chrX 19231892 5' + mdg3 5260 1 80.00 GAAGTGCGGGCAGCGCTGCTGCCGTCGACGCCGGCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCTCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAGGATATGATGTG:1 + chr3R 30272974 5' - Tirant 372 2 53.98 GTTATTAGCTACGTACGTTGAGAGAGGATAGACTGGTTCTAAAACCATTCATTGCTACTTGGCATTTGTGTATTTTTAGTATTAGTCAAAAAGTTAAAAGCAAAAAGGAGGAAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACA:1 - chr3L 22406518 5' - copia 97 2 71.23 CCTAAAACCCATAAGAATGTTTAGCTGAAGAACTAGATGGTATGATATGGGGCTGGTTTCTCCAAAAATATTAGAGAGTTTATTGAATACTTTGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTCG:1 - chr2L 8877471 5' + invader1 468 1 65.38 TTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGTTATGC:1 + chr3R 25271188 5' + 412 76 2 66.44 GTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chr2L 12355358 5' + hobo 64 1 67.16 GCCACTTGGAGGCGACTTAAAAGTCATGAAAATAACCAGATATGCAGATGAAGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 + chr3R 20883553 5' - I-element 5289 1 63.70 TCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chr3R 10140250 5' + P-element 68 1 32.03 CTAATGTTTTTGTTGGCTGGTATCTTATATATTTTTATTTCTTTTATTTTTGTCTTATTTTTGGTAATTGTAGATTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGGTCTTAATTGTAAGCATAATGAACA:1 - chrX 3522365 5' - Tirant 8292 2 45.89 ACTTATATAGCATGTACGTATGCGTTGTACATGCCAGCGTTCCGATATATATGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCAT:1 + chrX 18913267 5' + Quasimodo 57 2 69.18 CGCTTTGTTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr2R 13276491 5' + roo 85 2 78.08 GTTTGTTTGGACTGCATTTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 21056672 5' + Tirant 8122 2 67.62 ACACACACATACACACACACAATGAGAGACGACATTCGTATGGTGTCGGGCGTATGGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGC:1 - chrX 12633081 5' + Rt1a 19 1 41.05 GTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr3R 10140151 5' - P-element 2858 1 62.33 AAATGCGTCAAATAAAATTTAAGCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr2R 8305181 5' + blood 34 2 62.33 TTAAAGGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAAT:1 + chr2L 22641318 5' + HMS-Beagle2 55 2 56.16 AAAAGGAAATATTAAATGAAAATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 21192635 5' + roo 8680 2 76.03 GTTGAATGTGTAATGAAATTTTAAGGAGCAAATGCAATATTTTGCTATTAATTACCTAATTTAGACAAATTCTTCAAAAGAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr2R 20991325 5' - pogo 2064 1 57.53 TAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAT:1 + chr3L 13597772 5' + blood 88 2 78.77 GCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chrX 13762622 5' + P-element 44 1 36.27 CACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAA:1 - chr2R 6984398 5' - HMS-Beagle2 239 2 69.86 AGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 20292563 5' + pogo 23 1 69.86 GGCCCTCTTTCATGTGCACTTAATTGTCGCCTCCATTAGGCAAAGTCAGGCGCCCGAAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2R 10991441 5' + jockey 17 1 79.45 TCTTATTATTTCACGGAACAAACAGAAATCCCTTCCAGCTCAGAAAGATTTATCCTTCGCCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 + chr2L 7667401 5' - copia 229 1 56.85 CAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTATCTCAC:1 + chr3R 10973231 5' + jockey 100 1 77.40 AAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 - chrX 9816462 5' + jockey 83 1 67.12 CGCACTGGATTGATTTCTTTCAGTGCGCAAAGGGAAGTTAACACATTTCCTGCTGGCAAACGAAAAAGGCATTGGCCGCAGGAAGGTAAAAGGGCTAGTCAGAAAGTCATCTCGACTAGGACACATAAACATAACCCACCAACACT:1 - chr2R 6597693 5' + I-element 4962 1 78.77 AGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr2R 6984442 5' + Doc 88 1 73.61 CACTCAATCTGTGCGCATAAATTTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 - chrX 17012737 5' + Burdock 55 2 56.85 ATTTTTAAGAGCATGCAATTTCACAAAAACAAAATATAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAA:1 - chr3L 14546403 5' + copia 4954 2 75.34 AAAAAGACTAACGTCAGTTTTTAATAAATATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3R 23664354 5' + pogo 32 1 60.96 AAATGCCTATTTGGCATACAAGTTGTTATGCTAATGGCTAAAACCTTTAGTATTTAGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2R 6945723 5' + pogo 62 1 60.27 TCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCC:1 - chr2L 8772801 5' + Tabor 6924 2 74.48 AATAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAAT:1 - chr2L 15153371 5' - G2 3032 2 60.96 TTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACAAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCT:1 + chr3R 4464150 5' - 1360 3321 1 61.64 ACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3R 14088687 5' - 1360 3361 1 66.44 AACTGGGAGCCAGGACCTGGGCAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr3R 5765282 5' - opus 485 2 76.71 ATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr2L 1073948 5' + Tirant 53 2 77.55 ACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3R 20292533 5' + pogo 47 1 55.00 AAACTAAACGTGAGAGCCACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr2R 16410153 5' + opus 20 2 71.92 AAAACTCCGCCCAGCCGATAGGCATCCAAACACATCGTGTTTCGTTTGCTGCATAATTGAATTTAATTATAAATCATCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1 + chr2R 23312974 5' - Tabor 439 2 47.95 GGAAAAAGTATGTACATATGTTGATTTTGATCGGCGTATCTTTACCAATTTATGTACATTTATACATCCAGATATTTTATTTTTTTCCTTAACAAACATTCGGTTCGTTAAGTTGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATA:1 + chrX 19787928 5' + Stalker 241 6 49.32 AACCACCTGCAGGCAGTCGGCCTTCCTATTGGCTGGGTCCATCGATCGAGAGAACCGCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 14969205 5' - P-element 2837 1 42.54 GAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 21421032 5' - roo 9014 2 60.14 CGAAGCGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGGGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chrX 14962160 5' + jockey 27 1 68.97 AGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2L 19424654 5' + Tirant 8147 2 52.89 ACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr3R 6782733 5' + jockey 4725 1 67.59 TATTACATTTGTACAGAAATACGTAACATACCTGTTACAAAACTAATTTAATAGATTAAATAAATCGCTACATAAGCTTACGTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAG:1 + chr3R 21614273 5' + S-element 37 2 60.27 AATACTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr2L 20984253 5' + blood 15 2 72.60 TCCGTCTATCGATCACGTTTCGAACTGAAAGGCACGACCATGACGACCGAGAAGTCGCCAGTGCACAGTGGGGCTAGGAATGCGCTAAAAACATGGTTCATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 13843654 5' + roo 21 2 67.81 GTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3L 9242077 5' - roo 8998 2 67.12 TAACAATCACCAAAACACACCTACTTCAGAAAGTGATTTTGAGATTTTAGGTATTTCTAAGTAATAAATTAAATTAAAAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1 - chr3R 7649903 5' + Quasimodo 35 2 57.53 GCATATGTGCCACAAAGGGAAATCAGTTAAATTGATACTGGGAGGTGATGAATAATTAATTTGACTTAAAAAAGTAGAACTATTTTAAAGAAATTAAAATACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 12608207 5' + roo 19 2 42.47 ATATATATTGTTAACCAGTATAAATAGTAAAGTTGATCTGGACGTGCGCGTCTGTCTGTCTGTGTATCTGTCTGTCTAACAACAATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAA:1 + chr3R 4132435 5' - Quasimodo 7331 2 60.96 AAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chrX 13651584 5' + 297 6623 2 55.17 GCGACGTCCTTGGTGTCTACTATGCATCGGTATCTGTGATTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTA:1 - chr2R 2949171 5' + 17.6 6945 1 73.97 CACGACACTGGCTTTGCATGCAGACAAACTCAACTGAGCAGCGAATAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAG:1 + chr3R 27801681 5' - Rt1b 4988 1 54.46 ATTGCATACTGAAATTGGGAATAGCCGTGCGTATTACAGTACCAAAAAGAAAAAAGAAAACATGAAAAGTTACTTGTACATTTTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3L 5263494 5' - pogo 2069 1 60.96 TCGCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAG:1 + chr2R 19076480 5' + F-element 179 1 71.92 AATGAGTTTAGATGAGATTTTCGAATAAGCCAATGTACGCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chrX 16853284 5' + roo 20 2 71.92 ATATTGTTATGGTATTTAATTGGCACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3R 19545339 5' + jockey 62 1 60.32 CATAAGGAGAGTGACATACAACAATCGGCCACAACAGCGGGACTTAAATGCAAGCGCAAGCACTCAGGAAAGCACGCTTTGGTAGAGAACGCATATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCA:1 + chr3L 23436930 5' - Stalker4 227 4 64.14 GACTTTCAGGCCGTGACAATAACCAACAATGGTCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGAT:1 - chrX 16244839 5' - jockey 4897 1 78.08 GTTTGCCCAGTTCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 18722051 5' + 412 38 2 59.59 ATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGCTAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 21192600 5' + roo 8671 2 72.55 GGCATAAAAGAGCAGCGGCGTCAAGGCAAAGAAGGGGGTTTGTTTTAGTGAGCTGCTTCTTGGTTGTTATAGAGCGGGCTGTCGGTCCCTCTCCCGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCG:1 - chrX 5156777 5' - F-element 400 1 53.49 CAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr2R 7404647 5' + blood 35 2 58.22 TTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCATCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 - chr3L 3979679 5' + opus 170 4 57.53 GGGCTGCGGCGATCCGAACACGATCTCAATGAGAACTTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 - chr3R 23507726 5' + 412 11 2 75.34 CCTTCCCGCTTTCTCCCTTCCGCTGTTTGTGCAGCTGCAGCTGGCCAGCCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 4869113 5' - roo 9050 2 70.55 GTTGTACTAGCTCGAGCATTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 + chr2R 982279 5' + HMS-Beagle 23 2 69.86 CACTGCCCATCAGGACCGACTGAGCCTACCACTCCTTCATGAGCTGACTCTGAGGAACCTCCACCACAACCACGCCAAAACTGTTAGTTCGTTGACCTCTCTCCTTACCACATCAGCAGTCTACG:1 + chr2R 4342902 5' + gypsy5 74 2 54.40 AGTCCATTTCAAGTGTTTAATTACGGAATGCTGCTGAAAATAGCTTCGAGCTATATCGAGAAGCACGTTTGCTGGTCCGATCTGAAGATTGCTTATGGACCATCTTTTCTCTGTTCAGATCGTCTCGGCTATTGATCCTGATCCAG:1 - chr3L 20921009 5' - INE-1 89 1 78.08 TTTCTTCAGTGCAAACCTATCGTAAACTCTTCTCTATCCACTTCCTCTGTAACCAATCCCCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAAC:1 + chr3R 20963513 5' - R1A1-element 8 1 59.59 ATTCTCGCTTTTAGACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3L 4710689 5' + Doc 33 1 65.75 AGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3L 20076863 5' - roo 347 2 62.33 GTAGTAGTTTACCCCTATTTCGATAGGGATTTCCGGTGACAGTTGCACATTTTGCCCCAGTGTGCATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACA:1 + chr3R 8424162 5' - mdg1 7302 2 58.33 GAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2L 1073894 5' + Tirant 15 2 70.18 CAGTACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 - chr3R 26765200 5' - mdg3 214 2 55.38 AGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 - chrX 22517679 5' - 1360 3326 1 67.91 AAGAGTCTGCCAATTTGAGCACCCAGATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chrX 4566297 5' + Transpac 4936 2 74.66 GACAATGTGATTTATTATCGAGCAGAAGCTTTAAATGTCACTCTGAAGTGAGAAATGTCAATAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACC:1 + chr2L 4713410 5' - Stalker4 7003 4 58.22 TCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTGTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrY 311459 5' - 1360 3384 2 57.53 ACTGTACAAGTTGCTGGGCCGTCAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTTAAT:1 + chr2R 21897886 5' - 412 421 2 63.01 AACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:2 + chr2R 22255303 5' - roo 9030 1 58.22 TTAGTTTGTTGGGTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCTTCTTTTTGGCTTGATTGTGGATTTGTGTCTGTGTGCGTGCATTGTCCGCGTTGCCATTACATTCGCATGGGGGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 14898819 5' + jockey 12 1 73.97 TCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACA:1 - chr3L 10076374 5' + X-element 89 1 69.86 AAGCCAAATACATTCAGTACAATCGAGCTCGAAAAACTAGTGACCCACTAGTACATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 2873506 5' - roo 9061 1 78.77 AAAAAAGGAAATATTAAATGAAAATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 21192637 5' + roo 8677 2 77.93 AAGTTTACGAGCAAACGAGATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chrX 14756621 5' - pogo 2079 1 70.55 CAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr2R 4939195 5' - 1360 3363 1 34.25 GCGCCACTTACTTTAATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2R 10367448 5' + 412 7090 2 58.90 GTGGGGTTCGATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACACTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGTCACGCACA:1 - chr2R 8686642 5' + hobo 61 1 67.41 AAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAG:1 - chr2R 21897951 5' + 412 86 2 75.34 AGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chr2R 15062285 5' + blood 7058 2 50.00 CAACGCTCCACTTCCAATTTCGCCCACATCCACACATACTCCCCATTCCGCCGCGGGCATTCTTCGACATATTTGTGGAAAGCATTGGATAGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATTTCTGAACGTAAAACCTACGCTG:1 - chr3R 28730366 5' + Tc1 416 1 52.74 ATTACAAATAGCAAAGATTTCGAAAAAAAATTATCCAAAACATCACTTGACACAACCTTTTCCTAAAACAAAACAAAACTTCACTTAAAAATCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTT:1 + chr2R 3658058 5' - invader2 304 1 66.44 GCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3R 22659885 5' - 412 7511 2 60.69 GTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGTATAAATAAATGTCT:1 - chr3R 25521892 5' + blood 60 2 57.34 ACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 + chrX 3529759 5' + 412 84 2 76.22 ATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr3L 3979683 5' + opus 7154 4 54.96 AGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chrX 10979001 5' + roo 82 2 76.71 GGTGACGGTGAGATTTTATACTTCACCGGACCAGCGTGCACATTTCCCTGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAATGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTAACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 - chr2R 4830331 5' - 1360 3309 1 66.44 CCAGATTACAAATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3L 14043669 5' + Ivk 12 1 76.71 AATGCGGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATATTGGCGAACATTGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGGAGTGCGGTTGACCTCGAATGAAGAACACAAGTTGGCTTTAAGTTGAAGGCAGCAGTCG:1 + chr3L 22221105 5' - 412 457 2 59.29 GATAGCAATCCAAACCCGATCCTTAGTCTTTGATGTGAGCCAGGCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 - chr3L 1387269 5' - mdg3 5479 2 73.29 CCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGC:1 + chr3L 3540124 5' - mdg3 179 2 60.96 ACAGCACATTTGATGTCTTCTTAGACTTCTAGATACATATTTTGCAGTAATGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCG:1 - chr2L 7945951 5' - roo 260 2 65.07 GCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2R 21380695 5' - roo 337 2 67.12 GATATCCTTCTTGGCACTATGAACTTATTTCTTGCTTTTTATGACGGCTGTTCCCCGAGAAACTTTTCAATTTTGACAGAAAATAACGGAAGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - chr2L 7667531 5' + copia 4901 2 63.70 TGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 + chr3R 10778632 5' + mdg3 5299 2 54.11 GAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr2L 15965318 5' + blood 51 2 51.37 GATTGAAGGGCACATATATGGGATTCGTGAAGACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chr2R 6559079 5' + mdg3 5269 2 73.29 GCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:2 + chr3L 21630320 5' + Burdock 6201 2 63.70 TAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCCGTAG:1 + chrX 14692866 5' + Transpac 82 2 73.94 TATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr2L 15833073 5' + hobo 77 1 71.03 CGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCAGACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 27391423 5' - 1360 3368 1 64.58 GCGCAACTGACTGACTGAGAAATGGGGCGGGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3R 12794996 5' - mdg1 385 2 60.27 GAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:2 + chrX 19231755 5' - mdg3 169 2 69.18 ATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 + chr3R 24809886 5' + 1360 57 1 59.59 TTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chrX 14756641 5' - pogo 2059 1 56.85 AATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3L 14581383 5' - pogo 2034 1 65.75 GCGTAGGTCAATATCATTATATTGTTATCTATTTGTAGAGACGGCAAGTAGAACAGAGGCGAAAAGGTAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 18849702 5' + roo 8682 2 70.55 CGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:2 - chrX 4566266 5' + Transpac 48 2 54.79 TCGAGCCTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 + chr2R 5900787 5' + Bari1 20 1 71.43 TTGGGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATT:1 + chr3R 3617304 5' - micropia 179 2 78.77 CGTCAATGACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 + chr3R 25876829 5' + mdg3 29 2 67.12 AATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr3R 5940511 5' + hobo 85 1 73.97 GCAGGGAACGGCGACAGGGTCAGGTGTATAAATTGCACAAAAATACACATACATGCATATGACCATATATGCGCTCACATATCTCAACATATATCAAAATATATACATACATATAGGTATAGATATATGTACATATGTACATATAT:1 + chrX 13979912 5' + G3 4507 1 67.12 GGATTTCTTATAAAAAGGCACACAAAACAGGCTGCGCAGACGTAACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chrX 7293345 5' + 1360 28 1 66.44 CCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTTGTTCTGCACAGGTTTCCTTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGGCCGATAAGTTATCGTTTCTCATCTTATATTTCACCATCATTTTTGG:1 + chr2R 6984302 5' + HMS-Beagle2 34 2 51.20 GCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2R 22255324 5' - roo 9015 2 58.57 GGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr3L 3540227 5' + mdg3 5292 2 51.37 TTTTCAATAATTTATTAAATGTTTTTCGTTTTGATGTACACAAATAACTTAACAAGCTAAATGAATCAGTTTTTCCGTATAGTTAATAGTTATAGTTAATAGTTAATAGTTAGTTTAACGACCAAAGGTTCGTGTCTAACAATACG:1 - chr3L 3482803 5' + X-element 12 1 76.71 TGAAATGTTTGAAGCGTTTTTAACCAGAAATTTGATAAATAAAACAATAAATATGTATCATATTTATTAAATAAATAATATATTAAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 14663343 5' + pogo 33 1 64.38 TAACTGTCGGTAAAAGAATACCCACTGTTATAGTGTGTTATCAGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 21078370 5' + jockey 18 1 72.54 TTTCGAAAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCC:1 + chr2R 5070914 5' + Tirant 8 2 28.77 AAATAGCAGTTTTTTTTTTCCTGTGCACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3R 27971007 5' - mdg1 369 2 54.11 AAGCCGAGCGACTGCCGAATTGCGATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr2L 20561521 5' + P-element 28 1 65.75 ACAAAAATGTCCAACAAAACAGCGATGCCGGCAGCGCAGTAGCAGCGCAGCAACAGAGGCGGCAGCGTGGGAGTTTCGTTAACAGCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2R 14001147 5' - P-element 2876 1 73.17 CCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 + chr2L 1449589 5' + opus 7065 4 61.64 TGGCACTCGGAAACCTTCCAATTTCAACAGTTTAAACTGTCCTCGGCTATTTCGTGCAATTTTAGTTAGCACCAAAACAATATCAGACGAATAAATATGTTTTGGAGATTATTTTGAATAACAGATTTAAATTATAACATAATTTC:1 - chr3L 14912752 5' - Copia1_DM 5 1 68.49 AGGGTCAACCTGGATTTTCGTACTTGTATATTCTTGGCACACACACAAACTCAACTCTAAATCATCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGG:1 + chr3L 9164579 5' + Circe 7155 1 58.90 CCTGGCCCCAAGCGCTGCCATAAAAATCGCATCCTGAACGCATATTTACACGCCGCGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCT:1 + chr2L 10650314 5' + Doc 1 1 80.34 AAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATTGCATGCACGA:1 + chr3R 23346541 5' - Rt1a 5012 1 50.00 AAGATATTTTATTTTTCGCTTTTCGATTCGATCAAGGGGGTCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGGGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3R 28008367 5' - hobo 2918 1 65.07 AAAATTGAGCAAAACTTGTTTTTTTTTGAGTGTATAATAAGGGGGGTTAATGATGATTAAAAAAGTCCAAGAACAGTCCGCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chrX 5892199 5' + transib2 38 1 58.22 GACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGAC:1 + chr3R 443027 5' + gypsy2 6513 2 67.12 TTTGAAAACTGAAATGTACTCAAAATGTGCACGAATTTTCAAAAATACGTAAGCGGGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCT:1 + chr3R 10791646 5' + Idefix 19 2 66.44 TGCGATAAAAATATTTTATTTAAATATTGTCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 25822944 5' - roo 9034 1 58.22 ACTCAGCCAGCCAGAAAGATAGACATGGCCATTGAGTATTATTTGTTCCACCCTCTCCCCCGATTTCCACGAAAATCCTTATGAACCCGAGCCAGGCATGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACA:1 + chr3R 23828860 5' + blood 470 1 79.03 ATCCATCAATCATGCTGAAGATACACATGCTGGAGCAGGTCGTCAACACGGAAAATGTCTGCGAGAATGCCCAGGAGTCTCTGAGTGCATTTTTGCAGTTGCTGCTGTACTATTTGCCATTTGCTTTTTGTTATATTGCTTCTTT:1 - chr2L 7568808 5' - Bari1 1653 1 53.10 GTATCAGTGCGCATAGTAATTTCGAATTATTACTTTGTTCTTATCATCAAATAGGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chrX 12189685 5' + 297 6642 2 64.38 TTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAACTTTTTGAAAATGT:1 - chr3R 8049021 5' + Q-element 137 2 60.96 TGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 + chr3R 5765341 5' - opus 7429 2 71.23 AAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chrX 5222948 5' + 412 7124 2 68.49 TGGTAAAATATGTAAATCGAAATGATTTACTGCCGACCAACATCAAACCAATTTATTTTGAAGAGTTTCGATTATAATTGAAAAGAAACCGTATCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAA:1 - chrX 18365668 5' + jockey 172 1 65.75 GGTTCGTGCGTAGTTCGAAACATAGACTTCACACCTTGCCTTGCCGTAGTGGCAAATTATTCTGGGCTTTGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTG:1 + chr3R 28146968 5' - hobo 2607 1 52.74 CAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 23099069 5' - roo 9024 2 53.42 ATATATGCCATGTGTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGCGAAATGTAGTATGTGCATATATC:1 + chr3L 15058788 5' + blood 7009 1 57.14 GCGTTGAAAATGGCTTGAAATCCCTATAGCTTTTCCGATCCGATTTGAAACTCTTTCTCTCACTCGCTCGCGCCATGTGTTTTGCCTTTCTCTCGCATACATCCTGCAGTATTGGCATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTG:1 + chr3R 31729271 5' + F-element 4324 1 73.97 CTTATCCATTCAAAAAACAAAAAAAAAAACTT:1 + chr2R 18339538 5' + HMS-Beagle2 490 1 71.88 CTTACTAGAGCACATTCTCGCTTTTAGACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCAACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr3L 4710676 5' + Doc 20 1 74.66 CGGAGCGCATAAATGAATGAACGAGTTCAGGATGCTGTCAGCCATGGGGATCATGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chrX 20552877 5' + roo 8729 2 63.01 ATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATA:1 + chrX 18034611 5' + Juan 59 1 51.37 GTCGGTATGTATGTCTGCCTGTCTGGGCTCCCCAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr2R 15906318 5' + FB 54 1 70.27 AGGTGGTAACGAAAGGGGGTAGCGATTGATTGGAGTGAGAGTTTAGTATTCGTATAAATACAGGGTGCGGCAGGATAATTTCCTTTTTTCATAACGGAGCGCTAGTGGTCCCGTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGGTTTGTCCCG:1 - chr2R 2948758 5' + mariner2 93 1 65.52 AAAGTCCATGTCCAAATAAGTCCATGATGACAAGGAATAATTATTAAATAAAATCACGTACAAGTTTGAACACTTTACCCACATGATGGTCCTTTTAGCCTGCCCTTGAGCCGAATGTAGTTGTTGATACCGATAACACGCACGTA:1 + chr2L 15152251 5' - G-element 180 1 72.60 ATCGGGCTGATACTTTTCGTTGTAAATATACTCTGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTC:1 + chr2L 13244820 5' - hobo 2852 1 78.08 GTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATTTACGTGGCACTACTCT:1 + chr2L 15142246 5' + BS 4772 1 58.22 AACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chrX 3529734 5' + 412 54 2 57.25 AGTGATCTTGGGGCTATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTT:1 + chr3R 4885298 5' + 1360 23 1 66.15 GCAACGGCAAGTTGGAGAAGCAAATAAGTCTGCTGGACAGCGATAGGTAGGTATAAAACCCTCTGGTTTACCTAACCTAATGTTTTGTTTGAACGTGTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCAC:1 + chr2R 17109231 5' - P-element 381 1 69.18 CATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAACGCGGGGACT:1 - chr3R 9163920 5' + hobo 72 1 75.97 ATGTATTATTACTGATTTCGAGCGAACGGTTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 - chr2R 6052834 5' - mdg1 7435 2 37.67 GAACAAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTA:2 + chr2L 15153211 5' + G-element 19 1 65.75 AGGTAGTTGAGCATTTTGGGCTTATGCGGTGTACTTTTGGCATTTTTTTATGGCTCAAAAAAAAAATATATAGAACTAAGAAATTGTCTCTACATTATAAGACATTGTCTCGTCTATAGATGTAAAATTATTTATATGTTATATAT:1 - chr3R 11082011 5' - Tc1-2 1414 1 73.29 GGGATTATTTTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - chr3L 3979724 5' + opus 12 2 77.40 GACTGGAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 + chr2R 7097917 5' + copia 34 2 61.64 GCGGCGACTATCAGTTTTTTTTACGCATAAAGACTTGCACTTCCACTTGTACTCGTGAATAGCCAACAACTTTTGTTCGTGATATTTTGTACAACACAGCTAATTTGGATGCAGAAGTACAAGTCTTAAGTTTAGAGACAATCTC:1 - chr2R 4803433 5' - Bari2 294 1 53.10 TGGAGCCATAACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:2 + chr2R 5214908 5' + F-element 25 1 71.92 GCTTCCCTGTCTGAGGGTGCCCATTTCCTGCTCGATGACGTGAATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCGTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGGGATGGGAGTCAATAATGACTTT:1 - chr3R 13954772 5' - accord 7310 2 66.44 TTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chr3R 9163938 5' + hobo 58 1 66.17 GCATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAACGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr2R 24338473 5' + 1360 2 2 79.25 TGCAGCCCGAGGTTGCCAATTGAAATTGCCACAAGCCCAAGCACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATATATTC:1 - chr3R 18934854 5' + accord 7031 2 53.70 AGTTGCACTATAAATCGTAAGCAGCCGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2R 21380557 5' + roo 8677 2 75.17 TATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTC:2 + chr3L 27356087 5' - Tc3 1630 1 71.23 CAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCGACTTTCAGGCCGTGACAATAACCAACAATGGTCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chrX 16244915 5' - jockey 4973 1 70.55 CTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 4722478 5' - roo 344 2 61.64 CGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 + chr2R 6585421 5' + pogo 67 1 64.38 AAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3L 1387106 5' + mdg3 5293 2 56.16 ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTG:1 + chr3R 1875807 5' - Rt1b 4700 1 50.68 CAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr2L 10832339 5' + Doc 68 1 63.01 AATATATGCCATGTGTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3L 15058787 5' + blood 7014 2 55.48 ATTAACCTTAGTGATGTGTACCGACAAAAACTAGTTGCAATAACAGCCGGCGGCAATAAAAGATGATAACACGCTAAATGAATGCATATTGCATAGCCGAGTCAATCTATCTATGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTTGAGATCTCA:1 - chr3R 18574489 5' + INE-1 135 1 65.07 AAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGC:1 - chr2R 10478753 5' + invader4 84 2 71.23 GTAATTTGCACAATACTGTGATTCCTAGCAAGAAACAATGAGACACGATGAACAATTAACGATAAACGCTATTAATTATCGACTTTTGTGTGTTTGTGTGGTTTATAATTATTAAAGATTCCGTTCGCTTCGCTAGTGATTCTTT:1 + chrX 8554612 5' + Cr1a 130 1 71.72 GTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 6096516 5' - roo 324 2 72.60 TGCAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 23099067 5' - roo 9026 1 53.42 ATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 22255312 5' - roo 357 2 52.05 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGCGGGGATGCGGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGAGATCTTATA:1 - chrX 12649915 5' - blood 7106 2 89.47 GTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTT:1 + chr2L 5771418 5' + Juan 69 1 62.33 AAACGAGGGAAGCGGCGAGTTCGTGAGGCTGGCAAGCTGGCAGGCTGGTGGGAAGTAGGGAAGCTGGGAAGTTGAGTATGAGCCACTGCATTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTCTTTTGTTTATTGTTTTCACT:1 - chr3L 742311 5' - Porto1 184 1 61.64 TACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTA:1 + chr3R 3617315 5' - micropia 5123 2 71.23 AAAATCCAATCTCATGTGCTACCCACTTTTAGTGACCATCGTAAAATGGCACCCTCGTCGATAGTGAATGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2L 20295378 5' + Tirant 8115 2 63.55 GTTGGCTCGCCACAGAGATAGATATAGATATAGACTTTGGAACATGATGCTGTGCTTAAATAACAGCTAAGCTCTATCAAAGGTACATTTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAG:1 - chr2R 675740 5' - roo 445 1 63.01 AAACAAAAAATTCCCATGCATCACAATAAAAGAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCT:1 + chrX 10101256 5' + mdg3 5248 1 78.77 GTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAA:1 - chrX 22386785 5' + hobo 90 1 52.71 AGAGGGGGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCC:1 - chrX 21667998 5' + gypsy2 4 2 80.14 GTTCTCTTTAAATCGAATTCCTTCAAAAACCAATTGAGTATAAACAAAACGTTGCCGTTATAAGACTTCACACAATTTAACATAATGCTAGATTATATGTAGGACCAAAGACTAGAATGACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 - chr3R 12583888 5' + 1360 22 1 56.16 TTAAGCCAAGTCAGGGAAATGTCAGAATATTTGTAAAAATTTAAAATGCCTTTCACCAAATCGATCAGAATTGATTTCGGGCCGAAATCGTCTTCTAGCACAAGTACGCACACATATTCACGTTCTCGTCTCTTGT:1 + chr2R 2952978 5' + 1360 3230 1 55.88 GAGGTCCTCCTCCAGCTTTTCTCCCATCTGTCCCGTTGTTGAGGGGACGCTGCGCTTGGTTAATTAAGCCAGAATTTTTCATCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGTGCGGCCTGCCTCTCACACCTGT:1 + chr2L 12867880 5' - blood 492 1 47.55 GGTGTACAAATAGTGAGGCTGGCAACAAATACCAAATACAAAATGCAAAATGCATATGTACGAGCATAACTCATTAGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTA:1 - chr3R 27971132 5' + mdg1 7082 2 55.86 GGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAA:1 - chr3L 11596380 5' + gypsy6 40 2 57.93 GAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 + chr3R 28008249 5' + hobo 73 1 68.49 ATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGGTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 5446105 5' - roo 392 2 57.89 ATATATGGGATTCGTGAAGACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTC:1 - chr2R 6559066 5' + mdg3 5282 2 65.75 AAAAACATCAAAAAAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCTCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr3R 27786657 5' + Tirant 28 2 57.02 TCGAAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 22529723 5' - roo 361 2 53.42 AAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3L 15058810 5' + blood 26 2 41.10 GTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 + chr3R 23108084 5' + G-element 11 1 50.77 AGTCTAATCTGTGAATAGCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACACAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2L 1229524 5' - opus 491 2 77.40 AGACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3R 8705849 5' - hopper 1388 1 67.12 ATTTTTATGCTCTATGTTTAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 30568914 5' - roo 9023 2 51.37 TTTAGAGCGTTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 7534582 5' - roo 9017 2 55.17 AGTTGATTACTCATAAATCATAAGCGTAACATTTTTATAAAATAGAGCACATACTATATAGTAATTGAAAGTATAATACTGGGGGGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 + chr3L 16764779 5' + I-element 38 1 58.22 CCAGGTCCTGAGAACTGGAACCAAAGAACCGCAGGACGAAAGGCAAAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACGTCACCTTGCATTCCCTACCCTGTGGTCCGCACTCCAAGTTCCGTATACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTAT:1 - chr3R 6501917 5' - F-element 4654 1 78.08 GCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3R 21237837 5' + Doc 44 1 54.79 GTCAGCAGCAACAGCAGCAGATGTCCAGTGGCGGCGGGATGGTAAAGAACTCAGGAGGGCCACAGGTTTTTTCTTCATAATTGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACGAGCGGTTTCCTTTATCTTC:1 - chrX 15877464 5' - mdg1 480 1 51.72 TTTCAACCACCACCCCAACATCTTGACCGGTTTTTACCTTCACAACCCTTATATGCTATCCATCTATTCCTTGAGATTTTCCTTTTGTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGCCGTATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATA:1 + chr3L 11560570 5' + rover 7290 2 52.74 CCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr3R 10468096 5' + opus 25 4 55.77 CAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGCTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCTAAGCT:1 - chr2R 5022760 5' - Gypsy12A_LTR 63 1 58.90 AATTAAGGGGCCAAAAAGGAAAGGAATCGCCGCCAAACAAATGCCAACAATTAACTGCGGCAACAATAAGGCAGAAAGCGGAGTGCCGCAGGGTTACATAATAAAATAGCAATATGGACGAATGGAACAGAACTCTGGGGAACTGC:1 - chr3L 10004373 5' + Porto1 4279 1 65.07 TATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 - chr2R 14884355 5' + mdg3 48 2 56.85 GACCTAGTTTAAAAAGCCAATAAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAAC:1 + chrX 18239356 5' + jockey 4563 1 57.53 CGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 22481240 5' - roo 335 2 70.55 AATGATATGGCGACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACT:1 - chr3R 11461885 5' - 17.6 446 2 55.48 CTCGCAATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTTTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGTGGGTCACAATATATTGGAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3R 29708906 5' + blood 3 2 73.97 TAGCCGGCTATTTAAGCCGTTAGGTTAGGTTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3L 22676378 5' - 412 460 2 57.03 TCAGTCTTCTGCTGATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chrX 14692962 5' - Transpac 270 2 57.64 TAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAG:1 - chr2R 5924421 5' - jockey 4722 1 40.34 TTTGCTTGAATAAAACAGAATATTTTATTGAAAAATTTGTGTTGAATATTGATTATTTCACAAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:2 - chr3L 20925899 5' - Transpac 5216 2 76.71 GTTCCTAGGGGGTTTTCTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr3R 15649753 5' - blood 329 2 54.79 GCTTAGCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGC:1 - chr2R 9072962 5' + Burdock 51 2 54.11 TTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCCCCCGCACTCTACGGCCACCCGATAAA:1 + chr3R 5940465 5' - hobo 2914 1 52.44 AAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 - chr3L 3540200 5' + mdg3 67 2 69.86 CTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCTGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr3L 18708578 5' + F-element 51 1 58.22 ACAAAGTGCAAATTTCACTTTTTTCCCGCACATTTTGAAGTTCAACGAGCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAG:1 - chr3R 13723669 5' + FB 74 1 65.75 CGAACAATTTCTACTGTACGTAACTATTAAAAGATATAGTGTTTCTAATTTGATCGGCATGAAATAAACTAAAACCACTGATTCATTTGCTAGAAAACCCATATGAACCTTGGACTGTCCAAGTGCGAAGAGGTCGACCGGTAACG:1 + chr4 1007263 5' + gypsy8 4781 2 73.29 CAAAACGGTGAAAAGGAATTCTGGCGAGTCTTTGAAAGTCTGAGCACACTTGGCAGCATTTTCCTCTCATCTCCTCACGAAAAAATTCTTGGATATTTTTTCATCATTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGT:1 + chr2L 13583802 5' - I-element 5344 1 54.11 GCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3L 22529756 5' - roo 328 2 73.97 CCTGGGGAAAGTTATGTAAAACATTTAGGTGCGAAAATTTTTATAGATCTAAAATGGTTGTTATCCATACTATACATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 + chr3L 15890992 5' + mdg3 47 2 50.68 AAACTCGATTGGTAGTTAGCCCCACTTGTCTGGCAATTTCCCCCAAACTTCATGCGCTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGG:1 - chrX 5440081 5' - accord 7246 2 65.07 CTAAACAATATTTTCAAAGAAATGACTAAAACTAGTTATGTGCTCACATGGCAAAATGTTCACAAAGGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTAGACTTATGGCATACAGCTCTGTGGTACTGCCAGC:1 + chrX 19344303 5' + G4 3443 1 52.74 CATCGAATCCAATTAATGGGGGTGTGTCTGTCTCTTCTTCTTCTTCCCTTTTGAGGGACTGTGGTGTGAGGGGGGGGTGGTGGTGGTTTGTGGCGCCACCCCTTGGGGCATCCTTCCCAGGACAAACAAAACAGATGGAA:1 - chrX 16449592 5' + Penelope 531 1 77.86 AATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr2L 17162759 5' + blood 7068 2 56.85 GGAGGCATATTCATTAGCAATCGTACTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 21924245 5' + roo 8717 2 56.16 AACGCGGGCTAACGTGGCCAGTAAAATCCGGATATAATTAATTTCATAAATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr3R 26782678 5' + hobo 27 1 65.93 AATTAAAGGATATTACTTATGGAAATATTAAATATTTTAATCAAGTTTGACCCACCTCGGGCTCTGCATGTTGCACTTTTGATACACCCACTGTAACCCATTTAGGTTCGCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGA:1 - chr2R 17986413 5' - 297 6971 2 75.34 GTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chr3L 23146447 5' + 1360 37 1 60.27 GAGAACAAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCC:1 + chr2L 15153209 5' + G-element 17 1 67.12 CGAAAAAATAAAATTCAAAGCGAAGAAAAGGAAAACGCACACAATTTCCAGACCGCCCGCGGGGAAAAGCGAGAGAGGAAGCGAGAGCCAGAGCGAGATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTG:1 + chrX 20693841 5' + transib2 440 1 65.75 AAAAAATATACTTTTCCGCACTTACTCTGCTGTTTCCGAATTTCTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 + chr2R 22145501 5' + FB 78 1 69.86 CTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr2L 15920159 5' + jockey 86 1 71.03 CCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTA:1 - chr3L 15371371 5' - Transpac 240 2 72.59 ATTTACCATAAATTATGTATCACTGTCACAGATTAGATTAGTCATGTAACTTCACAATACTCAGGCTGAATTCTTGTCGAATCCGAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2L 3006055 5' - pogo 2085 1 67.69 GTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 8397158 5' - roo 9009 2 63.31 GCATTTGCATCTTTAAGATAGCCAAAATGTGCATCCACTCAGCGCGCAAAATGAAAGAGATGCTGAAGCATCTGCCGTAGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGCAA:1 - chr2R 24209208 5' + Juan 217 1 58.62 ATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:2 + chr2R 18807770 5' + jockey 73 1 58.22 CAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3L 17447538 5' + Tirant 63 2 70.15 ATGAAATTTACATAAATCATTTATTCGTCAAGGTGGGGAGGAAATGCGGAGAAGGGTATTTGTGTTGCGGTTGCGACTGCTGCTGACTGACATCCATTTTGACGGAAATACCAAAGACACTAGAATAGTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 - chr3R 4590493 5' - 1360 2 2 24.66 GCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chr2L 1449699 5' - opus 7453 2 52.74 AGCAGCCTAAGTTTCCCACCCGCGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 16887281 5' + roo 8698 2 61.64 CAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 + chr3R 25384179 5' + mdg3 59 2 58.90 GCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 + chr3L 3540112 5' - mdg3 191 2 52.74 GCACGACAACATCTATATAGGTTTGCCTAGGTATATAATATATATTTAGGTCTCTAGCTGGTATGTCTAACTTCTATATGTATGCATTCATAATTGACCAATGCTTAGTTCTGCATACCAGAGGTAAATATAGATGGCGCCACAAC:1 - chr3L 18751166 5' - Transib-N1_DM 372 1 56.85 GGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 + chrX 5222885 5' - 412 7459 2 79.17 CATCAAAAACTACAAGAAAAAGTGTTGAGTATCTGTAGCTGTATGTATTTCAGTCTGTGGGCTGAGCGATCCAGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAAC:1 - chrX 4767742 5' + jockey 131 1 51.37 TGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 23449249 5' - roo 9008 2 62.07 GAATGAAAGTGTTAAAATGTAGAGAACCAACGGAGACATTATAGAAAGAACACCGGAATTCTATGTTTCGATGCCTTACGCACTAAGCAATTATACAATTATGCAATGCATTGCCGCTAAAACAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 333450 5' - hopper 150 13 51.08 AAATTTCATTCGTTCTTGTTGTTGATGTTGTGTTCTCGGTTAGTTTTACCATATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTCGTATTGTCGGTTGTTCAAGTAAAATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTG:1 + chr3R 9203609 5' + Tc1 473 1 61.64 CTAATTGCGCCGCCTTGCTTCCTTTTTGCTCGGCACTCGACTTCACTTCACTTCACTTCCACTCCACACAACTCAACTGAGCTCAGCTCAACTCAACTCTCAACTCGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCC:1 + chr3R 27500547 5' - hobo 205 1 78.77 GGAAAGAAAACTGGAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 + chr2R 7097909 5' + copia 26 2 67.81 CAAAGCTAATGTAAATATGGGAGCTCTATTTGCCAAAAGCAACTGTGCGTCGAAATCTAAGCATATATGGAATTTCATAAAATACAAATGTATACTATACATAAATAATTTGTGATTCGATATGTAACTTATATTCATTACACTAT:1 - chr2L 15343146 5' - Doc2-element 4687 1 49.32 ACCGACTGACCGACCCGGCCATAACTTAATCTCCGCCTTTCCCCTTACTTTGTGGGAAAATTATGGAGGGAAATGCCGCACATAAATCAGCAAACGAAAACCTTTTGTGATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAA:1 - chr2L 16470554 5' - 1360 326 1 69.86 GCGGAGAGGGCGTGCACTAAACAATTTACTGTTAAATTGATGAAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAA:1 + chr3R 11002087 5' - flea 4938 1 73.29 TAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 9482000 5' + roo 8715 2 54.11 AAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 - chr3L 17667621 5' + F-element 79 1 64.38 ACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGTGATGGATTCCAGATAATAGCCAGTAATGTGCACACATATTGAATAAGCACTGTAT:1 + chr3R 3527072 5' + Tabor 13 2 63.92 ACGATTAATTAATCGGGCAGTAAATAGTGCCATGAATATATCTGAAAATATATGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 + chr3R 9258674 5' - 1360 3326 1 63.01 GTTTGGGCCTCTCTCTGTGATTTCAGTTTGCCTGTTGTGGAGATTGTTTTTTGTTCGCGTCCAATTTTTTTTTCATTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 - chr3R 12576959 5' - jockey 4960 1 55.24 GCAGAAAAAAGCAAAATCGATATGGCTTATTGCTAAAATGATTTTCTCAAAAAATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 8022097 5' + roo 8693 2 63.45 CGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1 - chr2R 15613846 5' - P-element 2821 1 40.41 TCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGTGTTAGTGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr2L 17747546 5' + Tirant 20 2 70.55 CTATATTTCTATAATAAATTGTATATAGTAGCATATGTGCCCTAGTATAAGACCACATAT:1 + chr3R 18469162 5' + Quasimodo 13 2 71.67 GAGTCACCCGGCGGCTCGGTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAGGCAACTAGCGCCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr3R 4885418 5' - 1360 3327 1 62.33 TGACTAAACCAGGACAATTTGTGCGGCACCTGGGGCTGAACTGTTGGCTTAAGGAAAAGCAGGGGCTTAAACCAAGACTGACTGGCTGACAGCTAGGGGATGTTCTGAGTTCATTTCAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACA:1 - chr2L 10937993 5' + mdg1 4 2 71.72 GAGAACCGAATTGTTTGCACTGGATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 31956540 5' + pogo 21 1 70.55 GAAATAATAAATAATACCTTTACATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAA:1 - chr3L 18920529 5' + Juan 17 1 73.61 GTACGGTCAGAGGGACAATAACTTTGATGATAATGGATCCGAGTTGGAGCCCAAGCAAGAGATTATCAACATCGACGACTTTGTGATGATGAACGAGGACAATAATTCGTACGCGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATT:1 - chr2L 13174980 5' + Bari1 1275 1 77.40 CTCGATGGCACTTCACACCACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr2L 1449729 5' - opus 480 2 71.92 AGCCCAGCCAGCAAATCTGTAGAGTCTCGACAAACAAGCTAGAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 + chr3R 11121641 5' + copia 4 2 78.77 ACCCGCTTTCCTCGAAACCCTCCGAACGGCGGTCAGTGCTGGCAAAGAGAGTCAAGATTACAGACAATAGAATAGGTCTATAGGTCTATTATAGACAGAACATAATTTTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGAGCTACAAT:1 - chr3R 1955142 5' - Cr1a 4155 1 67.81 GCGACCATGGTCAGGGATATGGGGAAAACGAGAAACGAGGTCAGCGGCTGGAACGAAGAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chrX 8357783 5' + FB 17 1 71.23 AGTATGCAGCGAAATGTTAAAATTTAAATTTTAACTTGTCCACCCCAATCACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 - chr2L 1136428 5' + 1360 36 1 59.59 ACCGAATGCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 15321956 5' - Transpac 5179 2 54.29 AGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr2R 21897984 5' + 412 7106 2 54.11 CTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACC:1 - chr3R 28008311 5' - hobo 2894 1 62.28 GAAACCGATTGCAAGTATTGCTTCTAATAAATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 + chr2L 7991298 5' + 297 6644 2 77.42 AATCATTTTCGACTGGACCTATGCAATTTATGTATGTATGTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGC:1 + chrX 5439947 5' + accord 23 2 68.49 GTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCAACAGATCATCGGACA:1 + chr2L 19424688 5' + Tirant 8140 2 66.25 TTTGTTGTGGCCTTAAGCCGGATTTATTCCTGTTTCGATTCGGTTTCGGGTTCTAGCTGTATTCTATTGACAATGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 30568786 5' + roo 46 2 52.74 GCAATTGAGTCCAATCCAACTCATACGAATTTGAATTCATTATAAAATACGCTGTGATGTATGTAAATAAATAAATTAGTAATGACTACACTACTACAAATTCTTTCAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCC:1 + chr2R 21079893 5' + jockey 4855 1 72.22 TACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCAATGTTTTTGACGATTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chr3R 24809887 5' - 1360 3327 1 61.64 AGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGCTCACAGAAGT:1 + chr2L 4416013 5' + jockey 31 1 68.57 CAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3R 31120285 5' + opus 7053 4 54.11 ACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chr3R 31956373 5' - pogo 2100 1 78.22 TTTTTAATTAATAAATCTCTGAATGTTACAAAATTACATTATGCTTTCAACGTTTGTTGTTTTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATA:1 - chr3R 21249741 5' - Doc 176 1 57.53 TGCCACATTTTCAAATAGGTTAGTTTCACATTTAAATATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGT:1 - chr3R 21518107 5' - 297 6899 2 76.71 CTTCTGACCACTAATTAAAAATCCACTTAAAATGGATTTCTAAACGCAACCCCTACGGTAATAAAATAGCACTTCAATTGAATATTGGGCAACTTTTAGTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCAC:1 - chr3L 7013440 5' - opus 7233 2 65.07 TGGAAGCCAAAGAAGCTCGAACGTGTTTGCAAGGAATAGGAAAAGCTAAGGAAAATACACAAGTTTTGCACCGTTTTTTTTTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCCTGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCG:1 - chr3R 6412898 5' - flea 4641 1 58.22 CTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 - chr2L 17730512 5' + pogo 76 1 69.86 AAAGTCAAATAACAAGCCAGACACCGAAGCCATCCTTCTGTCACGTCGTAATTCTGCATTTCTTGCCAAGAATTTGTATTGAAAAATCAATGCAACAAAGCTCGAATATCAGATACCCGTTACT:1 - chr2L 16936519 5' - INE-1 550 1 79.84 TTTGCACTGTTGTTGCTATTCTCCTCAGCTGCAACTGCCACCTCCTTATTGGCCTCCTCCTCTTTGGATTCCACGTTAGACTTGACAATTACAATTTGATCCCTCTTCTTTGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGT:1 + chr2R 18120289 5' - 412 7221 2 79.31 GTTGGGGAGACTATATTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTA:1 + chr2L 17638686 5' - blood 7331 1 56.16 TTCATGCTTTGCAGGTAAGAGAAGCAAACGAAAAGCCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 16771478 5' + roo 17 2 76.03 AAAGAAACACCCTTTACGGTAGATGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTA:1 + chr2L 5771364 5' + Juan 15 1 75.34 TTCGCATTCACATTCACTTCCTCGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr3R 10467968 5' - opus 471 2 66.67 GCTGGCCATTTCGACACACTTTTTAATAAGCCATTCGCAATGAGCAGATATTTTTGACATTTTAATTGCGCGCTTTCATTATTTATTTAGAAGCGATTAATCCATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATCAACATATA:1 + chr3R 5402054 5' - BS 5036 1 53.42 GCAGTTCATCGAATCAAACGCGGCCGCAAAATCTTGTTAGTCAGTATTGAATTCGATTTTCAAGAAAACATGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAA:1 - chr4 1053720 5' - hopper 27 1 52.05 ATACACTCCATCATTACACTTCTTAAATTAGAAGACCGCCTCATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3R 12787081 5' + 297 6601 2 69.86 GTGAACCAGTGTCATTAGCTGTTCGCACCTCAAGGACACTCTAGGCCATAAAGAGATTTAGGCCCAATCAATGCCTTTATTGTAGTGCCTTAAATGCCCATAATGAATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAG:1 - chr2L 5474097 5' - 17.6 7404 2 73.29 TCTTGGCTCTCTTTTGTCTCCCGCTCTCACTGTTTGTGCAACCACCTGCAGGCAGTCGGCCTTCCTATTGGCTGGGTCCATCGATCGAGAGAACCGCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3L 14969166 5' - P-element 2864 1 65.75 TTTAAATGAACTGGGTCGCCCGGCAATGAGGTTCTGCAGAAGAACTATGCACTCATATGAAAGTGTGCGGGATGCAAAAAGGCTGCGAATCTAGAAGGGTTGGGCGGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3R 31916236 5' - hopper 1405 2 78.32 TGAATATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chr3R 24809868 5' + 1360 39 1 59.59 GAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCGACTGCGTTTTTCTGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTATTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 + chr3R 10541235 5' - hopper 1366 1 52.74 CCACCTTTCCACTTTCCACTTTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 - chr3R 5765464 5' + opus 7032 4 65.75 TTGGTCGCGTGTTCGTAGATGATCTCGATGACTGGGACTTGGAAGACAAGTACTTTGAATGGAAAGACCTTCCGCAATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTAT:1 - chr2R 21052739 5' + Burdock 106 2 49.32 CGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr3R 25521893 5' + blood 62 2 58.90 AGGTATGCACATTTATATACCTAGCTGTGTTGGCCAATGAATACACATAAATTAAAGCAGGGTTTAAGCGTTGAATGAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACTATTTGCTATGTGTGCCA:1 + chr2R 16496095 5' - X-element 102 1 52.74 AAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTCATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATA:1 + chrX 14317416 5' + 1360 200 1 80.14 GTGTTGCCTACTTTTGGGCGGCGGACCCGTTTACGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2L 14006049 5' - hobo 2902 1 62.77 GCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGG:1 + chr2R 6984314 5' + HMS-Beagle2 67 2 63.70 GTGGCCTGTCGAAGTCCAGGGAACCAGAGGAGGAGCAATTGGATGTGACGGGCGGGGAGCCGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 - chr3L 9430702 5' + P-element 17 1 72.86 AGGTTTTAAATTTAGTTAGAACTTTTCTTTGTAGCGGAACATCAACTAAAGGATATATATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chrX 16325304 5' - mdg1 359 2 63.01 CAGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr2R 6984385 5' + Doc 33 1 62.33 GCAGAAATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3R 5245683 5' - 1360 3343 1 54.11 ACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCGGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCG:1 - chr3R 27845561 5' - Stalker4 7297 4 60.27 CCAGCCAGCAAATCTGTAGAGTCTCGACAAACAAGCTAGAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 + chr3R 11121644 5' + copia 7 2 76.71 GTGCTGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2L 18885839 5' + pogo 17 1 49.32 TCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr2L 22746338 5' + 1360 68 1 64.38 GGAGACCAAAAATCAACTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 24455334 5' + 297 6624 2 55.48 AATAAATGCGAGTCAAAGTAGCTACTTCCTGGCCAATCGGTTGCATTATATTATAGTTTAATTTGCGAATTTATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATT:1 - chrX 3917658 5' - 1360 253 1 53.42 TAGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:2 + chrX 7525040 5' - I-element 5304 1 52.05 ACAGTGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAAACACACACACACATA:1 - chr3R 6053087 5' + Quasimodo 34 2 63.01 CAAGTGTTTTATCCAATTATGTTCTTTGGTATTTTGTGATTGCACATTAATATGGCAGTGATGAGCCAATTTTTAGTTAGCACACTTTGTTTATTGCATTGTAAAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATAC:1 + chr2L 3734411 5' - mdg3 5484 2 73.97 ACGTTTTTGTGTCGAGTGCATAATTTGTTGTAATTAGAGTTCAACTGCAAATGCAAAAAGATTCCTATTACCTGTTAAATTCTTTTCAACGAATCTGGTATAACCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 10543079 5' - 1360 3375 1 58.22 ATCAATCGGCACTCGTCAGCCAAACCAATCATCCATTTATCCATCCATATCCATCCGGATCCTGGCCATCCAATCACACAATCACCCAATCGCTCAGGCGTTCCGCTTTACCCTGGCCGCCCTGCATCGCGGCTGTTGCTAGGCC:1 - chr2L 11288005 5' - gypsy8 4694 2 69.66 TTTCCTTTACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 4722360 5' + roo 41 2 56.16 TGCTCTTTCACTTGCGCAACATTGCACTATAGCCAATATATGGTACCTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 - chr3R 16535430 5' + Stalker2 7263 2 67.12 GCAGGAAACACATTGAATAAGATTCGTCAAAATAAACTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 7534665 5' + roo 28 2 62.22 ATTTAAATAGCCAACTGAATGCGAGAATTCACTGTGCTCCTCTCAGCTCAGTGAAGGTCAGCTAACTGTGGAGAAGAGATCACACTTTTCATTTCCCTTTTTTTTTT:1 - chrX 8889639 5' - Doc2-element 233 2 70.09 GTTTAGTTTGAGGCGTGCTCGGCCTTTTTATGGCCGCAATTGCCGGCTCGTCCAAAAGTGTGAGCCGCATTTAAATCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGA:1 - chr3L 17667220 5' - F-element 4334 1 59.29 AAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 3762219 5' - roo 9006 2 64.38 AAAATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 8022147 5' + roo 8744 2 77.40 GAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAGTAAAGTGCAGTTTG:1 - chr3L 13435601 5' + Doc 98 1 60.69 AATTATATTCATATACGTGAGTTATCTTTCAGTTGTATTGATATAAAAAGGAAGGCGATCTATTATCCCAATCAGTTCTGGTCTTGCCATCCATCGAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 + chr3R 12375647 5' - copia 231 1 68.49 ACTGGCTAAGCAAATATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATGGGTGACA:1 + chr3L 3762208 5' - roo 9003 2 63.01 TAATGCCACTTGGCTGCCAGGAATGGGGCAACAAGGAGCTCACTTCCGCCTGGTTGGAGTGTAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTG:1 + chr2L 9356807 5' - Stalker4 349 4 56.85 AAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chrX 983136 5' - 412 417 2 67.81 GGATATGAAAAATAGCCTGGATTCTTTGTTAAATAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTAGATCTGTACTCTAGCTTGGTTGAACAGCGACTGACTGCCGCGCT:1 + chr3R 12559673 5' - mdg3 5415 2 71.92 CAAAAACTGTTCGAGACATTTACAAAGATTTCTCTTACTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2L 1229736 5' + opus 19 2 72.60 AAATTAACAAAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr3R 12363271 5' + jockey 63 1 52.05 ATTCACACAGCGGGAGCAGGAACCCCATCTCCCAATCCCCCAATTCCCCCACCAATCTCTCCTCACCAGGAGTGTCCAATAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTAC:1 - chr3R 18124152 5' - Quasimodo 472 2 54.11 CCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTG:1 - chr3L 15371370 5' - Transpac 5147 2 74.66 AATAGTGGGGACTATATCTATCGCCGATACTGCTGCTGTATCTGTCTGTGAGAAGCTGAAATAGTAAGTTCAATAAATCATAGGGAGAATAAAATAATGCTAAAAGTAAACTTAAGGAGTGATTAATAATAAAAAACAAACAAAAA:1 - chrX 18906108 5' + Rt1a 5075 3 68.49 ATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 21380622 5' + roo 8742 2 71.72 TATTGGCAGTGAACTTTCCCATTTTCCAATTTTCCGATTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTAT:1 - chr3L 16535281 5' + copia 4826 1 74.66 CAAATCATGAAATAACGTTGAGCAAAGTGCTTAAAACTGGTAAATATTAAAATGATTTATAAACTGTTTAATGAGGTCGGTGAGTTTTTCTGGTATTATATTAAACACCATGGACAGAGGAACTTGCTGACGTATGCGGTTTTTCA:1 - chr3R 10801285 5' - 17.6 6974 1 62.33 ACAAATTAATCAAAATCATTTTCGAAATCAAAAATAATTATGAAAAATTAAGCGAAAGGCACAAAACAACCAAGTGAAAAACGATCGACGGATTTTTTGGCAAATATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAA:1 + chr3R 18095250 5' - hobo 2691 1 71.23 CAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chrX 17258286 5' + 297 6635 2 71.79 AACTAATTTCGAAGAAACTTAAATATTTATCAGCGGTAATAGATGATAAACGACTAGCTTCTATATATTACTGACAACTGAAGTTGATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2R 16712927 5' - pogo 2071 1 63.70 TGGCTAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 3762210 5' - roo 351 2 58.22 GGGGACAAACCAAAATAACACAACGATAATAAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2L 10089878 5' + 297 20 2 72.60 GAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:2 - chr3R 26399882 5' + roo 68 2 69.86 AAAATAAACTTCGAGTAGCAACATCCCTGGCCGGCAATCGATAAAGCGCCGATATGCTCGAGCGATATATCGAGTGCCCAGTAGTTATCAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr3R 9563727 5' - P-element 2860 1 68.49 GGCGGTGGATCCAAAGGGACTGTTTGGGTGGGTTAGGCTGGCTAGGGGCATCTTCATTGGTCATAAAAAGGGCGTTAAAAATTGCCATGTAAAGGTGGGGCCGGAAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 31956920 5' + pogo 11 1 73.97 AAAGTTAAAAGTGATTCTTTTGGAAATTCATAGCCCCGCTATGCCATGCCATGCCTCATCCACTGGCCGCGTAATTGTTGTGTTCTTAATTAACTATATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAA:1 + chrX 685277 5' - BS 5065 1 65.07 CGCTTTTCGATTCGATCAAGGGGGTCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3R 28008351 5' - hobo 2902 1 54.11 AGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTATTGGCAG:1 + chr3R 25271165 5' + 412 42 2 54.07 CTGGTACTCGTATAGTAAAAGAGTATCTAGTATCATTGAATCTAGTATCATTGAAATGTATTTAGCAGACATAAGGAAACGTTCCCCAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTG:1 + chr3L 26417925 5' - Quasimodo 6953 2 58.90 GCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCAC:1 - chr2L 8393077 5' + I-element 5165 1 52.74 GCTATTAATTATAAAATATATACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 22659862 5' - 412 480 2 76.03 CATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3R 25384171 5' + mdg3 50 2 53.10 TTTCCATTTGCCTGCACGGAGAACCAAACTAAGGATTTGTGTAATTGATATATGTTTGATCACCATCTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr3R 12787236 5' - 297 347 2 56.25 AATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTATTATGCGTGTTCCTATTTA:1 - chr2L 23295858 5' + micropia 5021 4 69.23 CTTGTAGGTTAGAAATTCTGAAGGCATAAGGTAGAGAACCAAGTTTCTAATATCTCCGACCACCACAACGTCACTATAGTTGCTTTTCGGTAGCACATACTCCTGTCGGAAGATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAG:1 + chr3R 10706441 5' + mdg3 5136 1 78.77 AGCAACAAGATCGCTTCGCAATTTTGCTTCGTACTTTGCGAGTGTATTAATTTGCACCCAATGCGAAGGCACAACAGAACATTTTTCCCAGGGGGATAAAAACAAGATGCGTATCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr2R 16689042 5' + 1360 38 1 71.53 TCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCG:1 - chr3L 25232910 5' + GATE 79 3 63.70 TTTGGCCACTTTGCGGTACAGTGAGCCCTGGGGGCATCAAACGAGAGAGACACCTGTTTCAATACATCATTATGCAACATAGCTTGGTACCCCGGATAAGGGGTGTCCAATTGCTGTTGCTGACCGTTCGTAGCGCAGAGCGCTG:1 - chr2R 11258887 5' - gtwin 88 2 52.41 ACGTGTCGTTTCGAATTGAGGATTCTGTCGGTACTCTCAAATTAGGTTATTTCCTCTTGAAAACTCACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr3R 6782667 5' + jockey 4697 1 69.18 TTTGTTAATTTTGGTACTTAGAGCGGAACATTATCGTTTACTTTGTGTACCCATGTGTACTCTAATGTCTGAGAGGGAGGGCTGCGTCCTATGTAAATAGATTATATGTAGGACCAAAGACTAGAATGACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr3R 26121958 5' + 1360 13 1 35.62 ATCGCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCA:1 + chr2R 19076479 5' + F-element 178 1 72.60 CATATAGATAACAAAAAAATTAAACACATTTTATAATATTCGTATGCATATATTTTACAATCGTATACATTAAAGTCATGAGCCGTTTAATTTGGGCCCTATCCATTCGCAAGGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr3L 11610544 5' - copia 247 1 75.34 CAGATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2R 9332130 5' - roo 340 2 65.75 ATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTA:1 - chr3L 25232911 5' + GATE 36 2 51.43 TCGATTTCTGTTCTTTGTCATATCCAATCACCAAGTAATAGCCATCCAGGAGATCGATAGACTGCCCCACAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 10099836 5' + pogo 48 1 54.11 GTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:2 + chr3L 13597724 5' + blood 40 2 58.90 AATTCACCAAAAATAAACTTGTTTTTTCTTGGTAACAGTACTCTACTGTCTCAATTATCTACCGGTAACATTTAACCACTTCAGTTAAACACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 21342387 5' + roo 8695 2 64.38 CCAGGTTGTGATTCGGTCCTCGATAGGCACTCCCCGCTTAGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTC:1 - chr3R 16618186 5' - G2 2793 1 72.60 AACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr3L 17447446 5' - Tirant 357 2 53.49 CGATGAAACCAACCGGAACCAATTCGCGTTCCCATCCACATCCATCCGCCGCCTCTGTCTTTGCTTATGTGTTTTGTCATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chrX 9709950 5' - pogo 2058 1 59.59 AGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr3R 9258789 5' + 1360 43 1 56.16 ATTGATATTATTGGCTGATAAGAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 18048929 5' + opus 7040 4 64.38 ACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACACCGGTGTTATAAGGTCGCAGCCGGGGGATTTTTTTGGGCTGAGATTGTCTTTGATTATTTTGGTTATTTCTTTAGGACGAAACACAATTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGG:1 - chr3L 24104301 5' - Stalker 121 4 60.96 TAAAATACAAGCTAAAAGTCTTACGATCACTATGGGAAAAATATATACAAAATACAAATACATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACA:1 + chrX 13460513 5' - Quasimodo 7310 2 65.07 TTTGGATATTCGTCTGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACACTCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - chr2R 6187982 5' + Tirant 8110 2 77.97 CAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr2R 15080004 5' + roo 55 2 56.85 ATCGACGAACGATTTGCATGCAGTAGCTCAAGGCATTCCATAATAATTCAAAAACGTTAACGTAGATTTCGCTCGGTTCCTCATGTCGGCGGATTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGT:1 + chrX 18521537 5' - Quasimodo 47 2 72.87 ACCGACCGCCAGTAACAAGCACCGCTTTGAAGCAAAAGCAGATCTCCCCACAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATGGGAGAATAAAATGAGAAAAAATTTTAAAATTGTTCCAAAGTGTGGGCGTGATCGTTTCG:1 + chr2R 6615196 5' - INE-1 244 1 59.85 AATTTCCATACATGCACTTTCCGTAGAATCCCTTCGTATGTGTCGCATTTTGCTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 18903397 5' - pogo 2034 1 65.75 TGTGGGCAACAGGTCCTGAATATTAAAGCATACTGACTCGTACTGAAACATCGTTGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 + chr2L 22746251 5' - 1360 3323 1 63.70 ATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACGGGGGTCC:1 + chrX 706056 5' + Juan 211 1 66.39 AGGCGGGGATTCACCGTATGCAGCATATGCTCACCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 - chr2L 13877791 5' + Transpac 43 2 52.74 AGAATTCTGGGCAGCGACTGAATGATAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chrX 18365979 5' + jockey 32 1 69.18 TGATAATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGACAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr3L 18468338 5' + jockey 4713 1 49.29 CAGCCATATCCTGTGGCAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATGCACTGAACGT:1 - chr2L 16685426 5' - P-element 2855 1 62.68 GTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:2 - chr3L 4869227 5' + roo 87 2 79.45 AAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:2 - chr3R 25271262 5' - 412 7473 2 69.18 GAGCCAATTTTTAGTTAGCACACTTTGTTTATTGCATTGTAAAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:2 + chr2L 3734473 5' - mdg3 5424 2 67.12 AGGTCGAGAACGTATCCAAATCAGAATCTGCAAAATGAGCTACTTGCGATCGATAGGTACATATACAATAAGTTTTATTGTCATTCTTTCCTCGCTCCGAGCAAATGCCAAAATATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3L 14626839 5' + roo 8725 2 72.60 ACTAGCTCGGTGAATATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3R 24809858 5' + 1360 29 1 65.75 GTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAAT:1 + chr3R 5087038 5' + P-element 90 1 24.66 GTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTGG:1 - chr2R 16410082 5' + opus 7204 2 78.32 GTAAGTAATTAAAATGCGACTTTATACATGATTTAATGTCCTTCTAGTATGAAAACCCTAGAAATCGTGTAACAACCATCATAACTTAATAATGCAACAGCAATCACAATAGACTCCAGATAATAAATAATAAATATTGTTATACA:1 - chr3L 18297069 5' + Juan 4063 1 76.03 ACGAGGTCAGCGGCTGGAACGAAGAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 - chrX 8357749 5' + FB 34 1 54.26 GGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chr3R 5765311 5' - opus 7459 2 56.85 CACACACACACACAGAAACAGGCGAGACACGCACACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chrX 2537522 5' + jockey 23 1 75.34 TTTGCTGGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1 - chr2L 19878265 5' + mdg3 55 2 54.79 CGGAGAATTCTGGGCAGCGACTGAATGATAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chrX 18365976 5' + jockey 29 1 71.23 CTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTT:1 - chr2R 12703859 5' - blood 7325 1 61.64 TCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 - chr2R 20704208 5' + hobo 84 1 75.34 AACTGAGCCGCAGTGGTTGCTTATCCTTTCGCCGCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2R 20704107 5' + hobo 34 1 62.33 GTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTATGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 22481342 5' + roo 48 2 50.68 TGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 + chrX 14385172 5' + blood 7093 2 71.92 TCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr3L 9426781 5' + P-element 50 1 52.05 AATGAATGAAATAAAATGGTATAACTTATGTGACATGGATAACTCAAATACTTTTTCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 14705703 5' - roo 404 1 78.08 AAATGCGGGCGCGTGCGTTGATGGCCAGAGAAAAAAGAGAGCACAGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chrX 4589375 5' + Burdock 19 2 72.60 GGGAGTCTCAACTACAAGTTACCCTGTGCTCTATTATCTATTAAAAATCTTGTCCAAGCAGTATCAAACAAGAAACTACTACCAACTACTCAGCTAGTGGAAATGCGAACGCGAACTTGCATACTTTTCCTGGAATATCGATAGAT:1 - chr3L 21732618 5' - INE-1 500 1 51.37 CGGGCCTAAGATGAATCTGTTCCCTCCCAGTAAATTTCGATAACTTTAGTTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTC:1 + chr2R 12688686 5' - Quasimodo 200 2 66.44 CTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTA:2 - chr2R 12703865 5' - blood 7331 1 57.53 GCTCCACTCGATTGGTCACACGATCCTTGTTGGTCTTGAATTTGGGATTCTGCGCCAAATGTTCCACTTTTAGGCGGCGACACATTCTCTTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAGCACTAACATATTCTTTAAG:1 + chr3R 20562982 5' + 17.6 284 2 57.53 AACAAACATTCTAAACTAGTGTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 9481979 5' + roo 8694 2 65.75 CACAAATAATACGTATCCGTTGCGGATTTCGCCCTACCCAGACAGAGCATCCTCGTGCTCAATCCCCTTTGTCATCGCCCTCGCCCTCGTCGTCGCCCCTTGGCAACTTCTTACGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTTAC:1 + chrX 21563381 5' + Rt1a 4711 1 77.40 TTCACTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTAT:1 - chr3R 15139853 5' - Tc1-2 1534 1 65.75 AATTAGTTACCGGAGTAGGAGTTATGCGTATCCTATTCTACTACCTCTACATACGTTTAACGGTTCAAAACAATAGAATTCTCAGTTATGATCACAATATTACACTAAAGTCATGTTGTTTTGGTTTGGACGGTTCACATAAGCAC:1 - chrX 8563105 5' - mariner2 624 1 78.08 CATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3L 4639073 5' - roo 341 2 65.75 TCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAGTTTAGTATTAA:1 - chr3R 8705817 5' - hopper 1356 1 53.42 TGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATA:1 - chr3R 16611516 5' + Stalker2 7499 2 70.55 GACTGTATACATAATACAACTAGAGGGAAATTTTGTTTCGTAAGTGGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3R 15030812 5' + jockey 22 1 73.61 ACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2L 535417 5' - roo 338 2 64.38 CGAGCCTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGGCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTG:1 + chr2R 5900788 5' + Bari1 21 1 69.29 ATTTAACTTTTAATGACTACACTGTATAGAAGAGAAATATCACACTAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:2 + chr2R 6558946 5' - mdg3 175 2 65.07 TCGAATGAATAAAAAAGCTATACAAGATAACATTGCACATTGGCAATTAAAAATTGCTTGAATATAGCTCTGAAATCAATATGTATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCT:1 + chr3R 30731347 5' - gypsy6 366 2 67.44 TAATTGACGATGATTTTTGACAGTTAGTTGGCTCATTATACGCTGGCAACGCGGCGTATGAGTGATGCGAACGCGTGATTTCAAGCCGAGAATTATCTATGAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAA:1 - chrX 8501532 5' + pogo 2070 1 67.12 CACCCATAAAGAATACTTATCTATGCGTGTATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 2661473 5' - Quasimodo 39 2 76.67 AAAAAATCTTGTCACTTGTTGCCAATTAAGAGGCAAAACAACGAGCATCCCGATGATCGTACCATCAAATGGTGATGGGGTCGGTATGTATGTCTGCCTGTCTGGGCTCCCCAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chr2R 15906397 5' + FB 10 1 78.77 AAGATGCGTATACATTTCGTTTTTGACGGCTGCTCTCGAGCTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3R 27502997 5' + hobo 11 1 73.98 GCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3R 22659891 5' - 412 7508 2 57.75 GCAACCTCTATCACGTTGCTGTAAAGCCTCTTGTGCGGATTTATTAGCTGAGCGATCGGATTTGTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3R 24479311 5' + 412 23 2 70.55 AGTAAACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGTAACTG:1 + chr3R 6068281 5' + jockey 4685 1 63.44 AGCTGACTGAGCATTTTCGGCTGCGGACTCGAGCGTTGACCGAAAAGCTTTTCATTCGGATCATGATGAAATAAAATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2L 18823499 5' - P-element 2876 1 64.52 ATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3L 15035231 5' + pogo 49 1 55.48 TTAAATTACATTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3L 6751631 5' + pogo 39 1 56.85 ACGAAACCGAAAATAAAATACAAGCTAAAAGTCTTACGATCACTATGGGAAAAATATATACAAAATACAAATACATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCG:1 + chrX 13460500 5' - Quasimodo 7323 2 56.16 TGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr3L 3979711 5' + opus 25 4 68.49 ACACATTATAGAGAAATTAGCAAAAGTTTTCGGGTTGCACATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATT:1 - chr2L 12284073 5' - Quasimodo 7346 2 71.92 TGTTGGTAACGAGCCATCAATGTGGTATCTTTCTATGTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 + chr3R 13358554 5' - mdg3 5474 2 67.59 CGCTCGACGCAAGTTTTCCGCCAAGGCCGACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr2L 6598404 5' + hobo 63 1 72.65 GCGGTCTATATAATTCCGTTGAGCACCAACAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAA:1 + chr2R 6187874 5' - Tirant 8419 2 76.71 GGTCTATAACAGCCTCTTAGGTGATTGCATTTATTTTCCACATCTTTATCGTTTAAATTCTTCTTTCTATCATACACAAAAAATTATCCTCCCTTAGCGTCTATCACCTTTTGCAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTG:1 + chr3L 26721102 5' - Tc1-2 1304 1 63.70 GTCCTAAGACTTTGCCCAGATATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAACGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTC:1 + chr3R 27835618 5' - 412 7452 2 81.38 TGCGGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr3R 8542552 5' - roo 9038 1 57.53 CGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 + chr3R 10079313 5' + P-element 81 1 30.14 GGGTCTTCAATCTACTGCACACATCATTTCGCCCTGCCGCACTCCTAAATCAACCCCCTCCATATACTTGCCTTTGTCTTGGACATTACTTCCCTGGAGTTAACCAGCAAGAGAAGGTTACCATCGCGAAGATTAGAGATGGATGT:1 + chr3R 26356780 5' - Ivk 429 1 56.16 AGGGAAATTATGAATGCGATTTCAGTTAATTAAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAA:1 - chrX 685373 5' + BS 5083 1 74.66 CCAACCCCTTCCCGCCTATCGTTTTTGGCGCGCGCAAGCGTAAGCTCTCCCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr2L 16685264 5' + P-element 22 1 71.23 TATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr2R 7223647 5' + blood 7065 2 55.48 AGAGAAGCAAACGAAAAGCCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 16771461 5' + roo 22 2 70.15 CGACAGTAAAATAGAATATCTGTTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr3L 5514164 5' + Doc 52 1 51.37 ATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTG:1 - chr3R 27845546 5' - Stalker 326 4 71.92 CAAACAAACGAACATATTTGTCTTTTACTCGGAAAATGGGGTTTACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 - chr3L 16264723 5' - Burdock 6351 2 57.93 GTCCCGTAATCGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTGGTCCCCTACTTGGTCCCGTACTGGTCCGGTACTCGGCACCGTACCTCCCGCCCAACCGAC:1 + chr3L 16047626 5' - Cr1a 4425 1 70.53 CTTGACCACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr3R 9345680 5' - pogo 2061 1 54.48 CTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2L 15833082 5' + hobo 68 1 64.83 GAAAACATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1 + chr3R 20452200 5' - blood 299 2 71.23 AAACGCATCACCACATCCTTGCGCAATAAACGCAGAGAAATCGTTTTCTTGGACATTGAATATCATTGAGTTAGCTAAAGTTAGAATAGATTTTGTAAAAAGAAGTGGACCAATATGGCTCCCTTGTGGGACACCGGATGTGACTC:1 - chrX 7166016 5' - Q-element 473 2 44.52 CTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 20076860 5' - roo 9009 2 64.14 AAATACACCCAAGACCACTTGGCACGCCCAGTGGCTGCAGTTGTCATATTTGTGGCTATTATCTTGGCCCACACAAAAACACCAGCTAAAAAACACCACACCTGACACCATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr3L 9317623 5' + blood 7026 2 58.90 TGTCAGCGTACGAAATGAAAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTCAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chrX 9951315 5' + hobo 22 1 69.18 ATGATAGGATATTTAACTTTTAATGACTACACTGTATAGAAGAGAAATATCACACTAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTC:1 + chr2R 6558936 5' - mdg3 185 2 58.22 GCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2L 1229541 5' - opus 7477 2 65.75 AATGAATTTATATGTGAATATATTTTATTCATATAAGCGTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2L 19930221 5' + jockey 21 1 75.34 GAAACGCGCCTTCCAGACGCGCGACAAGCGGATCATCATCTCCGCCCTCCAAGTCATCCAGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCA:1 + chr2L 19371229 5' + Bari1 13 1 73.29 TATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTATAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGA:1 + chr3L 25255411 5' + INE-1 299 1 67.12 AAAGCGATCTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 52920 5' + roo 8700 2 42.47 CGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 + chrX 14962229 5' + jockey 98 1 77.40 GGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAG:1 + chr3L 27356091 5' - Tc3 1632 1 72.86 GAGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3R 20149813 5' - 1360 3351 1 59.03 CGTCTGTTTGCTGCTTTTAAGTTTGCACTTTTTAGCTTTCAGCGGCTAGCAATTTTCTACTTTCCGTTTGTCATCTCGTCGTTTGTCATCTCTGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr3L 513729 5' - mdg1 7430 2 60.96 ATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:2 + chr2L 20984264 5' + blood 26 2 65.07 ATATTTTAATTGTCCAAAAACGAGAGGGAAATTCGTAAAATCACTGCAAGACTTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATATAG:1 + chr2L 14970135 5' - Tirant 271 2 60.96 AAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr2L 1073925 5' + Tirant 8114 2 65.33 AATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 8272439 5' - roo 8991 2 72.60 GTGTGCGTCTCGCTGGCTGCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 10973150 5' + jockey 18 1 77.40 GTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 + chrX 22858849 5' + mdg3 60 2 57.53 CGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr3R 14088576 5' + 1360 82 1 73.97 AGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGT:1 + chr3L 27356072 5' - Tc3 1645 1 60.96 TTCAGATATTACTACAGATTTGTATTAGCCTGATATATGGATTATCACATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:2 - chr2R 18123557 5' + pogo 20 1 70.55 CCAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr3L 12863785 5' - Transpac 269 2 55.30 TATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chr3L 10856806 5' + P-element 68 1 37.32 GTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3L 14898831 5' + jockey 11 1 79.70 GGAAGTTCCTGCATGCAATTCACGGGCGTTGGCCAGCGAGAAATGCGAGCCCCAACTGATCTGCAAACTTTCTCACATGAAACCACCGTGCACATGAAATGCAAACAAAGTGGAACATGAACCCACACACACACA:1 + chr3R 5213387 5' + accord 247 2 23.70 GAAAGCTCTTCTTGTAAATGTTAACGAAACTGACATTAATTTTATGTTACTGGCAAGCGAAATCAATTAATTATTCTTGTTGTCAATTGTGTTGTGTCGTGAAGGAGACAAGGTTAGAATGAAAATAAAAAAAATTTATGAATTTT:1 - chr2L 18376402 5' + S2 1633 1 71.92 CCCATTCTCCCGTGAACAGCATTTCTTCGCCTTCGTTTAGCAAGCGACCGCGTCTGCTGCCTAGCCGGGTCTAGGCCATCAGAGGAAATCACGTTCAGCTGAGAGTCGCTCTATTTATAATTATCACAAAACTTTCCGG:1 - chrX 9242599 5' - Gypsy12A_LTR 158 1 55.40 AAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGA:1 + chr3R 7739682 5' + blood 7078 2 60.96 ATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:2 + chrX 14385152 5' + blood 62 2 58.22 GACATTTCAAAAAAAGGAAAGGAAATAGCTGTTGCTTTTCTCACAGTGTGCTCCTCCTCCGTACTTCACTTGTTTTCCCCACTTGTGTACTGCGTTATTCTTATTTTCGATATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATG:1 - chr2R 8795658 5' - Stalker 54 4 73.97 TAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATTCACATTTTAGTTATAAATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 - chr2R 8305318 5' - blood 7337 1 59.59 GGTTTGTTGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGTAGAAGTGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCATACAGAAAAATGCGGTG:1 - chr3R 3953138 5' + invader1 174 2 58.22 GCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2R 15080015 5' + roo 66 2 64.38 CAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTT:1 - chr2L 8393085 5' + I-element 5139 1 66.41 ATTTGCTTAAAACTTGCCATGTTCAAGAGCCAAAAGTGGTGGGTGGGTTCGGGATTCTGGGAAAGTTTTCTGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAA:1 - chr3L 15375035 5' + Transpac 119 2 53.42 GCATTTCTACGTTAACAAACATTCTAAACTAGTGTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 9481966 5' + roo 17 2 74.66 GGCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 - chrX 13762623 5' + P-element 87 1 25.34 ATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAA:1 + chr3L 24153192 5' - Tabor 7243 2 72.60 GCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGT:1 + chr3R 6103583 5' - Tirant 330 2 64.38 GTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGCC:1 + chr2R 18807801 5' + jockey 17 1 53.33 AGGGGGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCA:1 - chrX 21667996 5' + gypsy2 6494 2 78.77 ATTAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAG:1 + chr2R 19633168 5' + jockey 4601 1 66.44 ACGGTGAGAAATACCATTTTCTCCACTTTGCAAACATAATCGTATCGAACGCAATTACCAAAAATCATTTGACTTGAAACAGGAAACACTAGCTGGAAAAAATTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3L 11196490 5' + pogo 14 1 76.03 AGCTACGGTGTCTTTCGAATTTTAATATAAACACAAAACTGCACAAATTCAGTTTTTCAAATTTATATGGTTGTAGGGATGTTTTAACAAATCACTTAATCTCCAATAATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACG:1 - chr4 654136 5' + 297 353 2 67.81 CAGATTCTTCCACTCCACGGTGTTGTGATCAAGTAGCTCTGGTTTCCATGCCACACCATCGATGATCTTAATGGTAGCAGCCAAATCGCAGTCGGCGGTACAATGACCCGGTTTTCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACG:1 + chr2R 17606572 5' + mdg3 299 1 77.93 GTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAAT:1 + chr3R 11461786 5' + 17.6 7006 2 74.66 TATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGA:1 + chr3R 18346616 5' - INE-1 532 1 53.42 GACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGGCTGG:1 - chr3R 30731456 5' + gypsy6 60 2 66.67 ATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2L 2519894 5' - roo 9001 2 67.81 CTTATAGTGCGTCCCTTCAAAAACTCAACTACTTAATGCCCAGCAAAGTATGCTATGCATTTTGGTTGCTGATGTGGCTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCAC:1 + chr3R 25508439 5' - hobo 2895 1 52.05 TTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr2L 1449582 5' + opus 7171 4 56.85 ACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 + chr3L 21097141 5' + mdg3 87 2 75.34 AGGCAGACTTTTGCAGCCCACAGTTTTCCTTGCCTTTTCTCCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGGGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCA:1 + chr2L 17198011 5' + R1A1-element 5024 1 69.18 CTGGGGCACCTCGCCCAGCACAATAACTATCAATCGCCGGCGACGATCTCTTAGCACCGACTGATGGGTTAAATTGTTAAATGTAAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCTACTGTCTAAAAGCCAAGAATAC:1 - chr3L 15239630 5' + HeT-A 5876 1 53.42 GTGATATCATGAAAATCCAATGGATCTATCACTAATGAAACGCACTGTTCAAGTGCATACATCAAGGGCTTCCCCGACTGCAAAGTGCAGTGCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCA:1 + chr3L 18271145 5' + F-element 4258 1 61.64 TCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chr2R 19900985 5' - mdg1 350 2 65.75 GGGCTATTCAACAGGATCGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 10978956 5' + roo 8701 2 58.90 AATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chr2L 17069573 5' + 412 7143 2 78.77 AGCTTGTCTGTCTCTCTGTTTTATTACAAGAAGAGCCAACAGCGAGCAGGGGCCACGAAAAAAAAATATCAAAAATTGGGCGTTGTTCGCAGGGCTGTATGCTGTTGTTTTTTGCATACACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACT:1 + chr3L 7824229 5' + Cr1a 278 1 45.89 CCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:1 + chr3R 3527087 5' + Tabor 6916 2 67.81 TCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:1 - chr3R 28033684 5' + diver 5954 2 60.96 GTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:2 + chr3L 1387100 5' + mdg3 5287 2 60.27 TGCCACAACTACCAGCAAAAGGTAGATACCCACCATAGCAATCAATGAATCAATCAATTCCCATAGCAGCCAAATATTTCTCAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTCACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTT:1 - chr3R 14806392 5' + Cr1a 383 1 56.85 GTCACTTTCACTTTGCTCGCTATGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACAACTCGACTCACAC:1 - chr3R 9163984 5' + hobo 23 1 69.44 ATTAATATGCTCAACGCACCGTCGTTTTGACATAGAGATGCCCAAAACTAGTAGACGGTTAACTCATTTAAATCGACGCCTTCATTCGGCGTAAAATATTGACTTGCATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTC:1 - chr3R 10186352 5' + F-element 113 1 72.60 GGAATTAAATGAATGAAATGCGGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3L 22221089 5' - 412 7520 2 71.92 TTTATAGAATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2L 17162752 5' + blood 7061 2 52.05 GAAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr2R 10991386 5' + jockey 73 1 60.27 GCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 + chr2L 15833009 5' - hobo 2877 1 67.69 CGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATCGGAATAGTGAGGAATAGTGCCTTTGCCGTTGAGTCCTACATTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCATTTCGAAATCGCTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTC:1 + chr2R 4802883 5' + mariner2 230 1 65.28 TGCGTTTGTCGAGCATATTTTAGACTTTTTATGGAGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 22481185 5' - roo 391 2 74.66 CGCGTAAGGGAGTGACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGA:1 + chr2L 16107237 5' + Rt1b 103 1 71.92 GTGCACGAAGCGACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATTTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr3L 131830 5' + P-element 50 1 52.05 GAGGAGCAATTGGATGTGACGGGCGGGGAGCCGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3L 9430673 5' + P-element 27 1 60.33 AAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chrX 14756645 5' - pogo 2055 1 54.11 GCGCACAAAAGTAGGCAACGTCGAATTTCTTGCTCGCTTTTAATGAGCTCATGTACGCACACACACACACGCTCTGACTGGAAAACCCCGCATGCCAACATGCACACACACACACACACA:1 + chrX 5548444 5' + accord 7026 2 55.00 AAAAACAAAACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:2 - chr3R 11526896 5' + pogo 35 1 62.33 AAGGCGTTGCTAGCTGAAACCAAAAAGTTTTGGCTGTTAGTGAAAAGTTACTGCACTATCGCCATCTTATACGGATGAAAATGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCCAAAGGCAGATCCGTGTTT:1 + chr2L 21687541 5' - mariner2 413 1 69.18 TTTTAACAGAAATGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAA:1 + chrX 21639572 5' - Tirant 8490 2 74.66 AAATATTTTATTGATTTGTTAATACTCGTCTATGTATATATATATATTCAGATTTCATTTGGCCTTCTGTTCTGTCACAAACCCACTTACATTCACACACACACCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGC:1 - chr3R 11520053 5' + Rt1a 26 1 71.92 AAACAATTGCGGCAGTAACAGCAATCACTAACAAGGAGCACCGTTCCTTTATGCGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCG:1 + chr3R 12540039 5' - flea 4940 1 61.64 CGCAAGAACTGAGCCGCAGTGGTTGCTTATCCTTTCGCCGCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2R 20704101 5' - hobo 2914 1 67.83 ATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCT:1 + chr3R 4913567 5' - 1360 118 1 60.96 GTGAAGTGCACAAATCAAATGGGTATATATCCGAGTTCAAGCGGTGCATAATGAGGTGAAATTCGCGGCCCAGAATCGTTGTGGTTTCGTCAAAAGAGGCGCTAATGAATTATCAGCGTTTGATGTACGGTCGCCTGTGAAGCAAT:1 - chr3R 8792442 5' + accord2 7223 1 74.66 CGTAACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3R 7739637 5' + blood 7033 2 70.55 AATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 + chr3L 16157187 5' + Juan 54 1 56.16 CTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1 - chr3L 13597825 5' - blood 296 2 75.34 CCGACACACTTACGTCAACATGTGCAACTATCCGGTGCGCTCTTACAAGGTTGCCCAGCGGCTTACCCTGCTGGAGCAGGGACTTAATCATATCTTATGGAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr2R 13134239 5' + roo 90 2 59.59 GCCCAGCACCGCCCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACACAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chr3R 19537451 5' - hopper 1382 1 63.01 ACTGGGCACTTACACAGCTGCAAGAGTAAACACACACACACACTCACAGGCACAATCAGCTCGAGCACCTTTCACAGAATGCACGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr3L 14863814 5' + Transpac 4959 2 58.90 ACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 - chr2L 14222342 5' - Transpac 243 2 67.81 ATTGAAATAATAAACTACAATATACAGATATTTTTCACTTTATTTATTATTTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAA:1 + chrX 18034548 5' + Juan 16 1 73.97 GCCATCATCGGAAAACGTTGCCCATTTTCCTGGGCATTTTTGCCATCGATTTTCTGTTGCATGTCAAGACTTCTTAAGATGAAAACGTTTCCGACCATAGACCTAGTATATATACTCTTGATCAGGATCAATAGCCGTATCGATCT:1 - chrX 18016493 5' + INE-1 97 1 54.79 CTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGC:1 + chr3R 20137270 5' + Burdock 6218 2 76.03 ATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chrX 21668713 5' - mdg1 7402 2 57.93 TGGTACTCCCACATATCTTGGCATTGCTACACATAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAG:1 - chr2R 16312164 5' + G6 1944 1 69.86 ATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 + chr3L 16264602 5' + Burdock 62 2 63.01 TTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chrX 19231852 5' + mdg3 5301 2 52.05 AGTTTTTGTTTTCTTAATCTTAATCTAGCTTTTAGAATATACATATATAGGAATATACACACATATATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:1 - chr3R 4132581 5' + Quasimodo 38 2 58.74 GGAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 - chr3R 9289419 5' + HMS-Beagle 39 2 58.90 AACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 - chr2R 10453465 5' + mdg3 5297 2 45.89 TTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGAC:1 + chrX 18239363 5' + jockey 4570 1 62.33 AAAGAGTCAGCTAATTTCCCTTTCCATTTGGGAATTATTCGTCTGAATTTCCGTTTGTTTTTGTTTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 - chr3L 5183801 5' - copia 5068 2 58.90 TGATAAAAACGTTGAGGTTGATCACCTGGTAACTTCTGTTTACATTCTAATTCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr2R 18807712 5' + jockey 16 1 78.08 TATTGGAAAGGTGGAATTTAAGGGGAAGTTTTAAATGCTTATAATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 - chr3R 11096826 5' - copia 243 1 77.40 GATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 23099075 5' - roo 354 2 57.53 TATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chr3R 25271284 5' - 412 7517 2 57.26 AGTGAGTGCCATAAAATGAAAGTTCACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 21420985 5' - roo 395 1 76.03 AATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTAATCAGTATATGGCTGCGGTGGTGGCACAAAACCGT:1 + chr2L 23299988 5' + invader4 400 1 71.23 AAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3L 10814604 5' + 297 6637 2 59.59 GCCTGGATTCTTTGTTAAATAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCTCAGAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACT:1 + chr3R 12559687 5' + mdg3 316 1 50.68 CAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 - chr3R 22810777 5' + flea 50 2 68.00 AACTAGAAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr3R 25521931 5' + blood 24 2 69.18 ATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3L 16887319 5' + roo 71 2 67.59 CAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr2R 18722002 5' + 412 87 2 77.40 ACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAA:1 - chr2R 17182790 5' + jockey 4627 1 63.70 GTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr2R 14385579 5' + jockey 85 1 69.86 CAAAGTTGGAAATTCTAATTTTTTACAAATCGGAGACTCTTCTTGAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGCGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACA:1 - chrX 11706186 5' + X-element 89 1 67.81 GAATTTAATAAATTTAAATAAGATTATCTTTTTATGCCAACTCTATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 21421118 5' + roo 8739 2 69.66 CACCATAGATTTACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACTTTGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 18849850 5' - roo 350 2 60.27 GTACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAA:1 + chr3R 907894 5' + gypsy11 357 2 35.62 ATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr2R 18882577 5' + roo 70 2 67.81 GGCACCCAAAAAAGGATGGAAAATAGAAGGAGCATAAAAACAAATGCAAATCACTTTAGCTGCTCCTTGGCGTTGTCACACATGCCGCAACGTTCGCGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATC:1 + chrX 723551 5' - INE-1 122 1 69.86 ACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3L 6751643 5' + pogo 51 1 54.79 GGCCCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGTTTGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGGGAAAACCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 - chr3L 9198635 5' + F-element 97 1 69.86 AAGTATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 15167774 5' - roo 9027 1 54.79 ACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACA:1 + chr2R 5284520 5' - Doc4-element 2611 1 58.22 GAAGAACAAAAGGTTATACTTTTACAAGTATAACAATCTAAATGCCTATTTGGCATACAAGTTGTTATGCTAATGGCTAAAACCTTTAGTATTTAGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2R 6945762 5' + pogo 23 1 69.86 TTCGCTTCGCATATACCCATCTCTTTCGCCGTCGTGGCACAGCGTGAGAAACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 - chr3L 10856863 5' + P-element 15 1 75.34 CACCTAGTACCCTGCTTATGCAAACAATTGTAATCTCCTCTATTCAACGCACACACAATTTACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr2L 12481421 5' + pogo 57 1 56.16 ACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:2 - chr2R 15062283 5' + blood 7060 2 50.00 TCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chrX 4789097 5' + 297 6620 2 59.31 CATCAGCAGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAAT:1 - chr2R 982422 5' - HMS-Beagle 6984 2 60.27 TTGAAAATAAATGTATATTTTTTATGTCCTCGTTATCCGAATATATTTGCTCACCTGGCTATTGTGAAAGATATCTTTTAAAGTATTAAGAAAACAAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTCAAAGACAAAAGTTAAA:1 + chr2L 7870055 5' - transib2 466 1 51.37 GAAGCAGCCTGCAAGTGAACCGCCTGTTGGACCAAATTCCGAGTCTATTTCCGGCGCGGGGTCATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAG:1 + chr3L 2852534 5' + invader4 2865 2 51.54 ATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTCCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr3R 4884476 5' + pogo 65 1 62.76 GTTATTTTGATCGATGAAGTTGATAGGCATTATCTTATGAGCGTACTTGGACTGTATCTTTGGGCTGGTTTTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGG:1 - chr2R 15261972 5' + invader1 3730 2 53.42 CCCAGACAGACCTAACCGATCTCGACAGATCATCTCGTCTTTGCTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCGAAACCCCCACGCC:1 + chr2L 19424604 5' + Tirant 8120 2 77.78 TTTGCTCGGTGGCATGTCTGCTGCCCGACTTTGTCATCAAGGTCGTTAATGATATGTACAGGAAAGTGCCACCCAAGAGCAATATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTG:1 - chrX 16399972 5' - 1360 272 1 49.32 GTTAAAGGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 + chr2L 22641317 5' + HMS-Beagle2 6937 2 55.48 ATTCATTCAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3R 4884494 5' + pogo 48 1 51.37 AAAGAGTTTAAGTATAAACAACCTAACTACGCGTTTAACAGCTTAGGGAAATAGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr3L 11666021 5' + pogo 62 1 67.61 CACTATGTTGCGCCCGAGATCTTAATCGGTTCGACAGGGTTACCCCGGGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 19700820 5' - roo 399 1 78.77 ACATTGGAATTTATTTGATAACAGTTATCCGCCGACCTGAAAATGCACTTCATCAGCAGAAATCCCCGTATTTGGCTTTAGTCAACAATTCCTGACTCAAAGTGGGTTTGCGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2L 9010373 5' + 1360 13 1 76.71 TATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 6096517 5' - roo 8987 2 73.29 GTCCTCAAAGCGGGTATTTTCAATTCCATTTACCACCCAACATACGGGCTATTCTCTTATATATTACGAGAATATATGACCTTTGACTTGGAGATCATATACCCTTTTTTTTTCCGTTACCGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCA:1 + chrX 23461075 5' - Bica 499 1 52.74 ATTAATGTGTATGTTTTAAAATAATTTGTTCTGAAATCAATCGGATTCCTCGCCACATATATCAATATACAGCTGGAGGACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTG:1 - chr2L 21403830 5' - G5 4694 1 64.83 CCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chrX 5222939 5' + 412 80 2 74.66 AGCGGCAACCAGAAATAAATCGGTGCAAAAAAAGGTCCTTTAACAAGGAGCAAATCCCTCTACCAACACATTTATTCTCCCTCCTTTAATAGCAGCCAATCTAGATCCTCAAGAACCCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCG:1 + chr3R 11149527 5' - Doc 4229 1 51.03 AAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr3R 29708951 5' + blood 40 2 49.28 CATACTCACAAGAAGCCAGAGCCAAAATATTAAAACAATCGATCAAACAATCAATGGCAGTGTGACGTGCAAGGTCTTTTCATCTAACGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATATCCATGAGGTTACGGTTTTGTGTTTCCA:1 - chr2R 22413707 5' - invader4 405 1 63.01 CGGAATGTGGAATGTGGTATTCATTGACAAAATCAGCTTTCAAAATGATCTCACTTGTATGAAAAACAGTCAAACCAAATCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCC:1 - chr3L 642290 5' - F-element 336 1 56.16 CCGTAAGCTCATATGCATCTGCATTACGCTCAAAATTTTCAAGCCAAATCTCCACTGGGATGCTGACGCCATCGAAGTCGGGTACATTATCTGGTAACTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTTTATATGTT:1 + chrX 22425771 5' - Idefix 59 2 58.90 CTAATTCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr2R 18807760 5' + jockey 63 1 51.37 CAATTCCCAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 - chr2L 15920181 5' + jockey 65 1 56.16 AAAAAATCAAACAAAACAGCATAGCCGCAATAGGCGAGCACGGTACGGGGTACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chrX 19498166 5' + P-element 68 1 39.73 GAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCAGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chr3R 13358690 5' + mdg3 5263 1 65.26 CATTTTTATTGAAATAATAAACTACAATATACAGATATTTTTCACTTTATTTATTATTTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:2 + chrX 18034541 5' + Juan 9 1 78.77 AGGAGATGGCTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr2R 17986238 5' + 297 24 2 64.80 CAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAATGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1 - chr3R 10140243 5' + P-element 93 1 23.29 AAACTCGAAAGCCTTTGGGCCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 20461130 5' + jockey 18 1 77.40 AAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 - chr2R 5237920 5' + Doc 58 1 50.68 CCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 17614378 5' - roo 9009 2 60.96 ACTACGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr3R 31907309 5' + Tirant 36 2 62.33 TGTTTGGTACGTTTCTGCACTTTTGCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr3R 4464113 5' - 1360 3359 1 65.07 TATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAA:1 - chr2L 589568 5' - Copia1_DM 92 1 75.34 AAGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACTACTCGACTCAC:1 - chr2L 15621984 5' + hobo 21 1 67.81 TGCTGATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 - chrX 14692953 5' - Transpac 259 2 56.16 AAGATGTTTCCGGTATTAGAGTTTATTTCATCCTTTCAATATCTGGTCCCTCTCTATTTATAAATAAAACCCGCCTGAAAACAACAACATTGATGAATTTTCGTGCAATGGCAAAATACAGAAAATAAAAATGAACGGAGCCATGC:1 + chrX 21032177 5' + gypsy11 4372 2 54.11 ACATTTACTCCCCTATGTATTTCCATAATTTTTCTCTGTGCTGAAAAAAAATTGCAGCGTAGAGAACGCAGCGGAGTACAAGTCAGAAATCTATACCGGAAAATTAAAAATTCCTAATAAAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAA:1 - chr2L 661122 5' + Transpac 158 2 78.77 CTAATCTAATCTAAAGCTTCGAAGAACGATACTAGGGGATGCGCTAAAATTTGGCAAATTCTGTTATGTTCGATACATTTCTATGTACCGGTGTATATAAGTCATCTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTT:1 - chr3L 21923796 5' - Cr1a 486 1 71.92 ACCATATTTACTGTTTTATTTGCAATTTTAATTATTGGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 14136490 5' + roo 12 2 45.21 GAGAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACATTGCCTCGATG:1 + chr2L 9167410 5' - pogo 2073 1 59.23 CGGAAAACTATGCTACGCTCGACGCAAGTTTTCCGCCAAGTTCGACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCTCTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTTTGGGTGCTACTCGTCATGCACATCGC:1 - chr2L 6598419 5' + hobo 65 1 57.46 GGCATAGGGCATGCGTATACTTATACTTATATATATCTCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGTCACCCCGTTTTTTTTG:1 - chrX 9951456 5' - hobo 2882 1 52.74 GTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chrX 15089493 5' - P-element 2827 1 43.75 GATAGTTATAAGAAGCTTTTTTATAGAGACTATCTGTGTTTTAATTAACATTCAAATTCAAGTGACAGCTGTATGATACAGTGGTGTGGTTCGGCTCGCTTCGACTAATATAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATA:1 + chrX 22868331 5' - mdg3 5251 1 78.77 ATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAA:1 + chr3R 11461758 5' + 17.6 51 1 55.48 CTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr2L 8772844 5' + Tabor 6882 2 56.16 CATTTCCACGCAGTACCGCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGCACACAG:1 + chr2L 18048230 5' + blood 7038 2 63.50 GCGCGGCAGCAAATAATATTGGGAATCCCCAATGAGTTTGGCAGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCG:1 - chr3L 11864413 5' - G2 2798 1 73.29 AATTGTAAGTTTTCTTTTAATTATTGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:2 - chr3R 23449345 5' + roo 8726 2 60.27 AATGGATGCTAGAAACTTCGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chrX 14692836 5' + Transpac 56 2 55.48 AAAGTTCTACACTGCGCTCTGTTACTCTTTTGAACTCCACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 - chr2R 544937 5' - HMS-Beagle 237 2 79.45 TCCGATGCGTTTTTTAAGCCGATCCGCAACGTCCAAGCACCCGGGAACTGGAACTCATACTGAGTGTTTACAAAACATCAGCCGCCGATCCCTGGAGAAGCTAGAAGGTTGCTAGTCAGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCTCTTG:1 + chr3R 16773126 5' + INE-1 578 1 67.12 GGTAGCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:2 + chr3R 10142910 5' + 412 7093 2 56.85 GCGTAAGGGAGTGACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGA:1 + chr2L 16107238 5' + Rt1b 103 1 72.41 GAAGGAAGCCGCACAAAAATGTCCAACAAAACAGCGATGCCGGCAGCGCAGTAGCAGCGCAGCAACAGAGGCGGCAGCGTGGGAGTTTCGTTAACAGCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTC:1 - chr2R 14001159 5' + P-element 9 2 76.69 GCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 + chr3L 14581375 5' - pogo 2042 1 60.27 GGGCGGAGATGCAAATTTTCTGAGGAAACGTTTACGGATTATAGTTTTCTAGAATTATGTTTATGATTTTATTTTATATCTATAAAGCTAGGATACTAAAAGTATATTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr3R 6828073 5' - flea 5002 2 75.34 GTCGTGTTTTTGGGTACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 + chr2R 14001065 5' + P-element 98 1 15.00 GTGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr2L 12261133 5' + jockey 24 1 68.00 AGCATTCATACATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr2L 2519807 5' + roo 8729 2 62.33 TTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3L 10814632 5' + 297 28 2 65.75 TGGTCACTCTAATCGCAGTCTGCAATTTACGTGTTTCCAACTTAACGCCCCCAAGTTAATAGCCGTAAAAAACGCCACGCTCAAACTTTTGAACAATTCTTCGAATTTTTTCAAAATTCTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 - chr3R 7086061 5' + INE-1 301 1 57.53 AATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCT:2 + chr3R 23108065 5' + G-element 73 1 63.70 ATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAAC:1 - chr2R 9072940 5' + Burdock 73 2 69.18 GCAATTGATCAAAAATTCCATACGATAAGTTAATGTTGCATAAATAATAGGTTTTTTAATACTTGCGGAATAATTAATTCATTTTTTATTGAATACAATGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATAC:1 + chr3R 22657156 5' + 412 201 2 32.88 AATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 - chr3L 14043659 5' + Ivk 22 1 70.55 ACATTTTATTTTGAGACCATTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr3L 17667676 5' + F-element 24 1 61.64 ATAAAGAAACTCATTTACAAACTTTTTATCAACTTTTGCATGTTTAAGTTTTGTCCTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr2R 9867183 5' - roo 343 2 60.27 GCCTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTG:2 + chrX 292383 5' - G3 4539 1 63.01 GAGATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chrX 14756637 5' - pogo 2063 1 59.59 TGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr2L 7215625 5' + 297 58 2 58.22 ATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 - chr3L 14043658 5' + Ivk 23 1 69.86 CGTCATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATA:1 - chr2R 3760476 5' + accord 75 2 69.93 ACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3L 13597706 5' + blood 22 2 71.23 GGGAGCCAGCCCAGCAGCAACAATGTTGACGTTAATAAATTATAAAATGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chrX 9710063 5' + pogo 57 1 66.92 GTTCGCTTGCATAACAAGTATATATGTATACATATATCTCTGCTTAACTACATCTACATATCTGCATTTGTATATTCAAATTTTTGTTCAACTTAATTAGTTCAAATTTGAATTTGAATTCGAATTTCGCGCCCAACGAGCGCGCG:1 - chrX 11139490 5' - Rt1a 290 1 51.37 GTGCAGAACGCAATAGGGTACAATCAATTAGAGGGCTGTTGTGGAAATTATTCATAGTAGCAGTATTATTTATTTATTAGTTAATTTAAGATTTAATATATTTTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCT:1 - chr3L 15382463 5' + 297 236 2 71.23 TTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTT:1 - chrX 10960285 5' - Transpac 5155 2 69.86 ATCATCATCAATTGAAGAGGAGCACACTGAAGGCCCCATACTCTCTGTCTCTCGGGTCTTGCTGGCCATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr3L 13721968 5' - blood 366 2 77.40 GAGGGTTGTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 22481349 5' + roo 41 2 54.79 TTGGGGTCTGAAATACGATACAGCATCTTTGTTATGGCCAAGCAAACAACCCTCTGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTAC:1 - chr3L 1385475 5' - mdg3 5254 1 63.01 AGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAA:1 + chr3L 19397022 5' + F-element 70 1 58.22 ACGAACTGGGTCCGAAAACTGAGCCACCGCTTGGAGTCGACTCAACATTGCCCATGTAGCGATACATTCCTAAAAAGGATTATCAAAGGCAAGGATTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr2L 2212023 5' + Doc 27 1 68.31 GAGCGGGGAATTATGTGCTTGCGTGCCGCGCTAAACTCTTAGCCACCTCCTTTTGGCCGAGTTCAAAACGTACTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 4659635 5' - P-element 2844 1 56.25 AATTAAGTTGCTGGCCAAGTCACTTTCGATTCGTTTGGTAATTCGTAGCTGAGAACGGTTCTTCCCTTATTTAGTTCTAAAGCGATTCTCTTTCTTGATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAA:1 - chr2L 675771 5' + HMS-Beagle2 444 1 67.12 AGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3L 13597745 5' + blood 7072 2 60.27 GCATGCGCGGCCAGGTTGGTACTCCACTAGATGTATATAGTAAAATTGTTATTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTT:1 - chr2L 7991350 5' - 297 6888 2 78.08 CAACAAATAGTGGCATTTATCAGTACTTAATGGCAATGGCACGCAACTCTCATTTGCACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr2R 18721898 5' - 412 461 2 60.27 AAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATA:1 + chr3L 19397029 5' + F-element 77 1 63.01 GAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr2L 20984273 5' + blood 7045 2 59.31 GTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATATATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTGTTTGTCTGAGCT:1 + chr3R 15589957 5' + Transpac 60 2 57.53 CGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAT:1 - chr2L 17730509 5' + pogo 79 1 71.92 AATCATTATGATTCCCAACATGTTCAAGCTCGTTCTAAATGATCGGGCTGATACTTTTCGTTGTAAATTTACTCTGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2L 13244779 5' - hobo 2893 1 54.11 ACGGTTTGTTGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGTAGAAGTGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCATACAGAAAAATGCGG:1 - chr3R 3953140 5' + invader1 3781 2 59.59 AATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1 - chrX 17469263 5' + blood 7084 2 66.44 CAATTAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2L 9167542 5' + pogo 58 1 56.16 ATTATCCGCACAATACCGATTAGTAACTTGATAAATTCACAGCTTTCATTACAGAGATGAACAGTGAGAATATTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGAT:1 - chr3L 546644 5' - 297 6841 2 52.74 AGCAGGAGGAGCAATTCAGTTGGATAAGAGAAACTTTCACCCATTTCATCGTGGGGCAGCCATCTCCAGACATTGTTGGGGCACGTGAATTGTTTAACCAATTCTGTCATCGATATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAG:1 - chr3R 10967157 5' - Porto1 4468 1 66.44 AAATAATTGCGATATATGATTAGGTTTTCGCTTAAGTTACCTTTGTATAATTATATCTAAAATGATCGTTACTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATA:1 - chrX 13460637 5' + Quasimodo 46 2 53.42 GTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGAC:1 + chr2L 15153220 5' + G-element 28 1 59.59 ATCCACAATAAAACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr2R 3009419 5' + pogo 52 1 58.22 ATGTCACATATTTACAAAACTTGTCTACAAGATGAAGTCAACTATTAATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCT:1 + chrX 10873750 5' + mdg3 5262 1 77.40 CGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTG:1 - chr2L 21403575 5' + G5 4425 1 52.05 ATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1 - chr2R 23313092 5' + Tabor 59 2 56.16 GGCAACGAAGAGGCAATGCCGGCAAAAAAGATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2R 20500163 5' + 412 37 2 58.90 GTGATTAAAGGAAATCGCTGGCTTTCATTTGGAGCAACCGCAGGTAAGCTGATCTGCGGCTGGAGTGTCAGTGAGTCCTGTTTCAGGGTCATTCTTCCGAAGTTCCTTCGCGTTTGTTTTATATATAAATTTTTTTTTTATGTTTT:1 + chr2L 12707093 5' + Tc3 86 1 72.60 CACACCAACACCATACCATAAAATAATAATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chrX 14908514 5' + blood 21 2 71.23 GAAAGTTGCGCCTAAAAGAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 - chr2R 24427637 5' + jockey 4720 1 53.42 CAAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTAT:1 - chr3R 20147559 5' - 1360 332 1 63.70 CAAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3R 25753595 5' + hobo 36 1 61.64 TTTCCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr3R 18665248 5' + 1360 60 1 64.38 AGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chrX 21213376 5' + Doc 50 1 58.97 CTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2L 15621974 5' + hobo 31 1 60.96 GGGGAAAATTGCAATTTGTACTTGGTTTCAGTTTACTGCCTTTAATTAAATTAAAAGAAGCGCAACAGCAGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 - chr3R 25877014 5' - mdg3 5489 2 76.71 ACGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGGAAACTGCTA:1 + chr2R 2666333 5' + Rt1a 67 1 57.86 TAAGTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr3R 10140148 5' - P-element 2861 1 64.38 AAAGAGAGTACGCGCAGGCGGCATACATGCAGCCCCACTGAGTTGACATATTTTCATTAAGATAACCGAAATCAATTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chrX 14385265 5' - blood 329 2 52.05 AGATGAACGGGCACATTCCAAAAAGGATAAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chr2R 9326922 5' + mdg3 23 2 69.86 GATTTAAACCAGGGCGCGGAACAACAGGTGACAATTCAAATGATGCCCGTAAGTAGGCTAAACATCCCTCGCGGGGAAAATAACACGAAGTAAGGGGGCATTCGATTGTTGTTTGTCGTACGCGTGATTCGCTGGTCCCTGTTTGG:1 - chr3L 19646517 5' - HMS-Beagle2 338 2 73.97 AATTCAATATTAAAAAATGTACATAGTATTTTAATGATCCGTACCCCATGAAGTAAAAAAATTTGTCTCCTCCAAAATTATAAAAGGCAACAAATAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTA:1 - chrX 346107 5' - 412 284 2 65.07 TTTGCTAATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 + chr2L 17228587 5' + mdg3 5288 2 61.64 TTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 + chrX 22858876 5' + mdg3 5339 2 76.03 AATTGTTTCTTGGGATCGGCTGTCGAAAGTGCAATCGGTTTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGGTAACTAAGTTAACCGAGCGACTGCTACGAC:1 - chr3R 30731521 5' + gypsy6 12 2 72.86 ACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGGCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGTTATGTTT:1 - chr3R 15514608 5' + 412 60 2 61.03 AAGCCAATGCGAAGCGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 14962151 5' + jockey 18 1 76.55 GACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAA:1 - chr2R 6559048 5' + mdg3 5286 2 53.42 TGGGGGGGGGGGAAAGAAAGAAAAGAAAAAAACGAAAAAAAAACAAAAAAAAACCT:1 - chrX 2976950 5' + HMS-Beagle2 489 5 58.93 CATTAGCCATGCCCGGCGGATCTTGTTCGTTTATTATTCATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCATGGTTACTT:1 - chr3R 19545385 5' - jockey 4910 1 75.00 AAACTAAAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:2 - chr3R 23664526 5' - pogo 2079 1 71.23 ACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAATTTTTGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chrX 14173223 5' + 412 59 2 63.49 TGGCAATCTGTCAAATTTTGCAAATTGGCTCGGTTTCCGTGGTTCACTGACAAAATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:1 - chr2R 21227484 5' - mdg3 5473 2 69.86 CAGCTGCTCACGGCGACGAGCAAGGAAAATCCAGCACCCGCTAATAGAAAATATCAAGCATACCTTTTAACTTATAAACACATTGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAAACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3L 11195543 5' + 1360 49 1 58.90 CGGTCGATTATATTACCTTACTATATGATGAATAGGTTAAGCTAAGTCGAGGCCAGGCAACCTTAATACATTTGCGGAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 + chr2L 14796836 5' - I-element 5310 1 53.42 AGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chr2L 18370357 5' + Doc 89 1 73.97 AGGTTATATTAAAATAAATGTGAAGGAATTAACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3L 6751786 5' - pogo 2069 1 63.70 CTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 + chr2R 13574735 5' + diver 5933 2 52.74 TTGGGTTTCGGAGTCTAGAAGTAGACAGATGTATATAGTTAAATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTCAAGTCGAACAAATGATCCGTATTT:1 + chrY 425005 5' - McClintock 6342 2 80.14 CGCTGCCACTGCCATTCGATTCATACGAGTCCCATTGCCATCACTTTCTTCGTTTATACACTTGTGAAACGCAAATTAGTTCTTAACTTAAAAATCACTGATGATCGCCTGTCCACAATTTTAGAAATGCAGCATCGTAATCTATT:1 - chr2L 3926986 5' + invader6 455 1 63.01 ACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2L 12261125 5' + jockey 37 1 64.38 AGAATATATATATATATATTTCTAATGAGTTTAAACAGCCGAGACGATTATAGTATTCCTTTCTCTACGCCAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGTGATAGTCGGGGAACTCGACTATA:1 + chr3R 18030717 5' + INE-1 565 1 69.18 GTGCCAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2L 4416007 5' + jockey 15 1 78.46 GCCAATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATACGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr2L 15965329 5' + blood 40 2 58.22 CTTGGGGGACATTTTATTGTTTGCACAATGCGGAGCCGGAGCCAAAAGTTGATGTAAGATTCGCCTGCCGCTCTCAGGGGTGTGTGTGGAATTTATGCATAGTTTCTTAATATATTTATATTATATCCAATTATACTAGTCTTTAA:1 + chr3R 16142172 5' + gypsy7 5082 1 65.07 ACTGTCGTAAGCATTTTCTTGCTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 + chr2R 20382482 5' - Bari1 1648 1 58.22 ATTTTATAAGGATATCACAGGATAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr3L 19396971 5' + F-element 19 1 76.03 CTTTTGGTGAAAAAGTTAGCTGCCTGCGTGTTGTCCTTTGATCAAGTTCCATTTTGATTTTCACCTGTCTGGCGGCCTGTAGCTGTTCTTTGTTGTCTTGGACGACAAGGTCTCTAAGGGACGAGGATATGCTGGGATG:1 + chr2R 11086489 5' - accord 6964 2 77.70 TTTCCCACTCCCTTGGCAGCTCAATTAGCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 + chr2L 14969859 5' - Tirant 380 2 66.94 GGGAGAAAGCCATTTGGCCCTGAGAAATTTATCGAGAGACTTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 13313260 5' + roo 45 2 52.05 TCGGGGCAATTCGCATCTTGTTCCGTTCTGGTTGGATTCGATTCGTTGGGATTCGCGGCGGTCCCGTGGGTAAATTGATATTCCTGTCACTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCC:1 + chr3R 15584198 5' - 1360 61 1 60.96 AAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 - chr2R 21897952 5' + 412 82 2 75.52 CGTTGAAGTGACAGTCAGCTCCAGTAAAGCTGACTTAACTCTGCCAAGGTTGTAGACCTTCGGCTAGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2R 18882713 5' - roo 397 1 75.35 TGCCGATTCTCATAGATACCGGATAAGCACAAAAAATTTCATGACAAATCGATGCTGCCGGAGAGAAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCAC:1 - chr2R 4848683 5' + HMS-Beagle2 6790 1 74.66 GCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGCGGTG:1 - chr2R 20382581 5' + Bari1 65 1 62.68 AAGTATCCAGTCCACTGTGGCGACTATTAGGCCTCGGGCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAAAGTGTGTACAAGTATGGAATGCGAGCAAGGGAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATT:1 - chrX 18179786 5' - hopper 1138 1 72.60 CCGGCGGCTCGGTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAGGCAACTAGCGCCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr3R 4885411 5' - 1360 3320 1 67.12 GTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 + chr3R 13358590 5' - mdg3 184 2 58.22 CTAGTAAGGGTCACTCGGCGATTTCCGATAGGTCGAGTATCCTCGCTGTTCTTCTTATTGGCATCCTCGTCCTGTTTCGCGCACTGTTTTGTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTAT:1 - chr3L 20246241 5' - R2-element 3124 1 71.65 CGAAGGCGTAGCCAAAACAGAACTAAAAAAACAGGGGCAAACAAATGAAAATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGA:1 + chr2L 5648398 5' - Burdock 190 2 65.75 AACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTCTCCATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAAATTGTCTCCAAATACTTTTTAATACTTTGTATGCAAAAACTAATAATTAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGTAAA:1 + chrX 22564590 5' + Transib5 329 1 60.27 TATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAAT:1 - chr3L 24153273 5' + Tabor 61 2 62.33 GAAGGTTAATGAGTGCAGTTTTACCATTTTAATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACA:1 + chr3L 176388 5' + Transpac 85 2 76.03 CTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 - chr2R 15062256 5' + blood 7087 2 67.81 ATGGGATAACTCTAGCTTAAAAATTTAAATTACCATAATTTGTTGCTACTTAATTAGTCATCTTTAACTGTTAAATTGGTAAAATTTAAACTACTTACATGAACTTACTAACGAACTTAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 + chr3R 13494274 5' + opus 111 3 63.70 AAAAAGGGCGCAACTGACTGACTGAGAAATGGGGCGGGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr3R 12794989 5' - mdg1 7430 2 65.07 AGATAATGAATCTTTTAATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATTTTTATTTTTTGTTTTTTTTTTTAA:1 - chr2L 7488947 5' - Doc 4702 7 78.77 GCTGCACTTTAAATGTCATTTGTTTGCCGTTTCGGTGCGGCTGCCTTTAAGTAAATTAGTGACCCCCTTTTCGGCGCCCCTGCATCGCCCATTGTGTTTATCTGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCG:1 + chrX 4852322 5' - mdg1 495 1 70.34 GAGATGAGTTGCATACTAATTCCCCCAAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 20076729 5' + roo 27 2 66.90 TAGAGGGCTCGGCCTAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGGTTAT:1 + chr2R 11655983 5' - HMS-Beagle 7009 2 62.76 AATGAAGAGAAGAAAGCGGCTCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGGTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATCTTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chrX 983250 5' + 412 7083 2 64.34 CGCATTCAGGCTGAAAACTACGAAACTAAAGAGTTCGTACAATTTGCAGCTTTGAGATTTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chrX 12623129 5' - jockey 4930 1 60.96 AGGGTGAGCACTTAAGCTTACTGAAAACCATAAGCCATACTGAGCATATTTGTCTTAAAAGCACACTTTGTAGGCTTTAAATATTAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGT:1 + chrX 18248894 5' - jockey 4725 1 60.96 CTGATTTAGCCAAAACGAAAGAAATTGGAAAGGAAAAGGGAGCCAGCCCAGCAGCAACAATGTTGACGTTAATAAATTATAAAATGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chrX 9710100 5' + pogo 33 1 61.64 AGTTAACATTTGCCAAATTGTCGAAAATTTCATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr2R 12703906 5' - blood 7372 2 71.92 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGC:2 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 344 1 66.90 GGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAAGCAGGTAACTTCAAAATGCAGCTAACTGTATTTTTTTT:1 + chr3L 14581388 5' - pogo 2036 1 61.87 ATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTT:1 + chr3L 23456271 5' - Gypsy6A_LTR 263 1 67.39 GCTGCGGCTCCAGAAAGAAAACATCGGCTAGTTAGAGTTGGTTAAGGCCCAAGGAAAGAAAGGGAATCGGAAACCACAGACCCAAAAAAGCTCCAGGGCATGATCTGCAACTCCACTATAAAGGCACTACCGAGATGTGCGATCC:1 + chr3R 31317348 5' + BS3 293 1 52.41 AGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 15621983 5' + hobo 6 1 75.38 AACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTTCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 - chr3L 14043622 5' + Ivk 58 1 55.86 AAAGTGGTCAAAGAGGGTTGTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 22481361 5' + roo 29 2 64.38 CCTATATAGCATATATAGTAATCGGTATAATCCTCACCTGTGGCGCCATTCCGATGTTGGCCGACGTGAGTCCGGCTGTCTGCTGCTCATTGTAGGCCCCCATGTTGGTTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATA:1 - chr3L 9592472 5' - Idefix 63 2 69.86 GGCTGTACGCTAATTGTTCATATTCTTTTTGTTCATTACCTGCGTTCTGGTCATTGCTACTAGTTGTAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTT:1 + chr3L 25190055 5' + 1360 126 1 75.69 CGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTC:2 + chr3L 3979579 5' - opus 7434 2 65.75 TTCGGCTTTTGCTCGCATTCAGGCTGAAAACTACGAAACTAAAGAGTTCGTACAATTTGCAGCTTTGAGATTTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 + chrX 12623116 5' - jockey 4943 1 52.05 TAAATATTTATTATATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 + chr3R 31204191 5' + 412 2 2 80.82 ACTTGTCTACAAGATGAAGTCAACTATTAATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 + chrX 10873768 5' + mdg3 5280 2 66.44 GAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGC:1 - chr3L 18920456 5' + Juan 92 1 76.71 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTGGGGGATCATGGGGTATTGGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTC:1 + chr3L 23112567 5' + R2-element 87 1 70.55 CGAAAGTGGTGAAGAAGCAGCCTAAGTTTCCCACCCGCGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTCAAAGGCTTACAAT:1 + chr3L 16887266 5' + roo 8683 2 71.92 CAAACAGAAATGGATAATTGAGCCCAATTGAATTCATGAAATGTGCAAGAGGGGTACCCAGCGCCAAACATGAGTAAAAGTTGTAAATTTGCTCAAGAACTTGAGCAAAATACCTTTGTATTTCTTAGTTTCCATCGCACTGCTAT:1 - chr2L 21709312 5' - HB 23 1 54.79 ATGGATCGATTTGTTTATCCTTCTACAAGGATACACACACATCGGTATTAACAATATTGGAATATATCTGTAGATAGTAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2R 22671343 5' + jockey 4711 1 53.79 TCTCGTGTCATAAAATTAAATACTTCACTGGAGAATTAAATGCAGTAAAAAGTGGGCGTGACCCCGTACAAAACACACCTCTCACGCCAGGTATTAGATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAA:1 + chr3R 28115308 5' - 1360 316 1 66.44 AGTATTTGTGCTTGCTTGCTGGCTTAATCAAGCATGAAATAGTCCAAACGTTGTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTT:1 + chr2R 19353978 5' - 297 332 2 63.70 TTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 - chr3L 14043653 5' + Ivk 28 1 66.44 ATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 20292428 5' - pogo 2033 1 68.49 GCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGATGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr3R 27786642 5' + Tirant 68 2 64.75 CTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 4722483 5' - roo 349 2 58.22 AAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr3R 18524213 5' - opus 7474 2 67.12 ATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:1 - chr3R 24228966 5' - opus 7435 2 68.49 CCAGATAGGCAATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 - chr3R 10288905 5' + copia 51 2 52.11 ATGTGTGCTCCTTTCTTTGCAAGTGTTGGAAATGTATGTATCTGTCACCTAATATAAATTAACAGACAACGATTTTGCGTATTGCGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAG:1 - chr3R 4353359 5' - gypsy4 196 2 65.07 GTTTGTGGCGAGATCAAATACCATAGCTCTATGTCTTTTCTAGTTGTCTTTGTATTGTATTCGTCTTTTCTTAAATACCCTGCAACTGGGAAACATACGATTGTTTGTTTTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr2L 16596342 5' + 412 10 2 76.03 CTCTCGCTTCATTAGCTGCACACTCCAAAGGCCAATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr2L 15965359 5' + blood 7021 2 78.77 GGTTGTGTACCGAGAGTGACTTTCTTCTTGTCCGTCAGTTGCCCAGTGGTTTGGTCCATGATAAAGTAATACATGGAACCGTCGCCCAAAGCGCAAAGCAGATAATGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATT:1 - chr3R 13054770 5' + jockey 4906 1 76.03 GTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2L 21192585 5' + roo 8730 2 67.12 CGGCTGCTCTCGAGCTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr3R 27503023 5' + hobo 60 1 60.27 CTCTAAGCCAGCCCCAAAAAGTAGGCTATAATGCATAAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 18846636 5' - roo 9046 1 63.70 TTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGT:1 - chr3L 24153265 5' + Tabor 69 2 67.12 CGATATGAGAGATGAACGTTGAAGGACTTGACGCGACTTGATTATAATTAGACGCTCCCACTTCCCCCCGTTCCCACCACATTTGTATTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3R 9993327 5' - hobo 2908 1 65.07 ATATGAGCAAAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr3L 13597881 5' - blood 7363 2 67.12 AAATCGTCCTTATATTTCCCACATCTGGCTGGTCAATGGTGTTAGTACATTGATCCCGATGTCCAGGAGTTGCCTTCTCTAATTTGACAAACTCTTTCTGCGCTACGTGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATT:1 - chr2L 8397298 5' + roo 13 2 77.40 GAGTGGAGTGGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrX 22517743 5' + 1360 9 2 69.44 GGCTCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chrX 983233 5' + 412 7103 2 52.74 TGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2R 15080100 5' - roo 388 2 56.84 AAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:2 + chr3R 29708951 5' + blood 48 2 52.05 ATTTTGTTTGATGTTTTTTTAATTTCAATATCTTTATCAATGTGTAAAATAGAATGTCAGAAGGATGCGTTCCCGACCATATGAAGTATGTATATATTCCGTCTGTCCGTATGAATGTCTCGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 - chr4 988266 5' + INE-1 153 1 60.27 CACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3R 9938603 5' + roo 8735 2 67.12 ACTAAAAAAATAACATTATAAAATGCTTACTAGCTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTT:1 + chr2R 13574702 5' + diver 5900 2 75.34 ATGATAGAAAGGATCACAAGAATTGATTAAAAATATGTTCAAGGAAAAGCTCTGGGTGTAATGAATTAGATGATAAAAATCCAGCCAGTGGAAACTGTGAACTGTAAATATGATTTCAAATTCTGATGAAATTGTAACATTGCGGT:1 + chr2L 3808764 5' + invader4 55 2 76.03 ATAGGAGTTGGTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr2R 8793864 5' + Transpac 42 2 56.85 AAGAACATATCTTAAACCAAAACTTATGTTACACAGAATGCGAGCAGCTAATACGGAACATGCTGGTGGTGGAGCCTGATCGGCGATATGTATCGCTTTTGCATTTCGACTATCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAATCT:1 + chr2R 18699983 5' + INE-1 557 1 60.69 AACTATTAAGTTTTCGGAAGTAAATAGTTCCTGTTCACACATGAACACGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGG:1 - chr2R 4551442 5' + roo 8929 2 67.81 GTTAGCGCTCCAAACCGCAGCAGCAACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2L 1136265 5' - 1360 3368 1 71.03 AATTCGAAATCAATCATTTTCGACTGGACCTATGCAATTTATGTATGTATGTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACA:1 + chrX 5439936 5' + accord 12 2 76.03 CAATCAAAGTCAACTTTATGTGGCCCGTCATTCGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCT:1 - chr3R 21986173 5' - gypsy4 403 1 77.40 CGGCATTAATTGTTTCTTGGGATCGGCTGTCGAAAGTGCAATCGGATTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGG:1 - chr3R 30731528 5' + gypsy6 5 2 79.29 ACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr2R 18807779 5' + jockey 82 1 64.38 ACGCTAAATCCAAGGCAAACGTTAGTCTTTGTATTAAAAACGTTTTGGAAAAACAGAAAATATATAGAGTACATTTCAATGTTTTTGCCAGAAGGAGAAGATTTAGCTGATACAAAAAAATACAGAGACGCTCTATGCGATGCAAG:1 + chr2L 7214102 5' + F-element 126 1 63.70 GGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:3 - chr3L 22221211 5' + 412 86 2 76.03 ACTCAGCGCATTTTCACGGCTCCGTCGGGTTAAAGTTATTGATTCCACTCTGACTTTGTACTAGACTCGTTGAAGAGTAAGTAACAGTCGTTTCCGAATGTATAGAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 + chr3R 25865384 5' + INE-1 96 1 57.53 ATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3R 9938593 5' + roo 61 2 60.27 GAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr2R 8305208 5' + blood 61 2 60.27 CCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 2519878 5' - roo 8986 2 78.62 CATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTC:1 - chr2R 982403 5' - HMS-Beagle 169 2 73.29 AATTTAATAAATGACTTGATTAAATTCCAATTCGCTGTGCCAAAACTATTTACGTTCGTGAAGCGCTTGACAAACTTTTAGAGCAACTTAACATAGACATGCATTTACATGAGGTGGCAAAAATAAAAAAAAAAAGGTGAAAAAAG:1 - chr2L 17610824 5' - FB 173 1 70.55 TTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3L 9375803 5' - mdg1 7417 2 54.79 ATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2L 20561497 5' + P-element 52 1 49.32 TTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 21192609 5' + roo 39 2 59.44 CGTGTATGTGTAATAAAAATACGCTAAAATGTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr2R 13628468 5' + jockey 94 1 74.66 GTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 20913113 5' + 1360 63 1 59.59 GCATATATATATCGCACGGATATGGGAATACGAGGGTTGAGCCACTACTTGTGGTCTAATTGAAATTAGCAAGGTAGTGGTATGTTAGCTGGGGAATTGGGCATTTAGCATGATAAGCGGCGTAAAACATATTTTTATTACTTACT:1 - chr2L 1386145 5' + Gypsy6A_LTR 229 1 73.97 GCTTGTTCAACTTGCTATCTACGTTGAAGGTAAAATAAAATAACCCGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 + chr2R 14884271 5' - mdg3 171 2 67.81 CCACACCAACACCATACCATAAAATAATAATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chrX 14908515 5' + blood 20 2 71.92 ATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCG:1 - chr2R 11656101 5' + HMS-Beagle 71 2 68.28 CACACATACACACACACAGAATTTGGTTTTGGTTTTTTGAGAGACAGATAGAGAGGATTACATTAAGGATTATATACTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCAGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATAATTAAT:1 - chr2L 15018011 5' - G4 3800 1 49.32 ATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 18581247 5' + roo 8702 2 58.22 AATGGAGTCATTCACAAATGGATTGTGAAAGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3R 20905342 5' + pogo 25 1 69.18 CAATTAGTTCCACATAATGATGCCTCATTATGGCCAGTAATTCATCAACACTGCTGGCACACCCTCTCATACTATCCTCGTTGTGGTTATACGATCTAACGCTTATGCATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCA:1 - chr2R 18072158 5' + Stalker 7040 4 60.96 ATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:2 + chr3R 8542600 5' - roo 326 2 71.23 AACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chr3R 25384160 5' + mdg3 5292 2 58.22 CTAATTAAGTAACCAATTTATTATATTCTACTTATCGACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr2L 1327446 5' - pogo 2090 1 73.97 ACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3R 20292423 5' - pogo 2038 1 65.07 CCTATGTTTTAATTGGCTTAGTAATCCATCAAAGCGATCTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3L 52890 5' + roo 8669 2 48.28 CATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1 + chr3R 443031 5' + gypsy2 29 2 64.38 TTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3R 7739651 5' + blood 7047 2 60.96 CAGAACCCACATATTTGTTGAATGAGTTGTGGCCAGAATATGCAAGAAATATTGAGGGCAATAAAACCGGTCAAGAGCATCGTAATAAAACTCAAACAAGAAGGCATTGGATGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr3L 16535112 5' - copia 245 1 76.71 GCGGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 + chr3L 17447418 5' - Tirant 8476 2 64.83 GTTGGGTGAGTTCTAATCTTTTAATGTTGTAAATACTCTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:2 - chr3R 21924373 5' - roo 9030 1 56.85 AATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 + chr3R 5245542 5' + 1360 34 1 63.01 AATGGAAATTAAATTTTTGGCCATATTTTGCAAATTTTGATGACCACCCTCCTTCCAATAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATTAATC:1 + chr3L 11142722 5' - Stalker2 7583 2 58.90 ACTGTAGTTGCCAAAGATTTTGCACGTATAAGTGTCTTTCGCCAAAAGGAAATATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATT:1 + chr2L 22696341 5' + X-element 30 1 65.28 GAATAGTAACAATTAGATAGTTGTATTTTCACCTGCTTTCGATTGATATTCTCTTGATGTTGTTGACAGGGAAAACTGTTTATAAAAAAACAGTGTCGTGTCATAGGTATCGTTTCCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr2L 20471885 5' + hopper 144 103 87.77 AGCAAAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGTACACGTGCTT:1 - chr3L 13597876 5' - blood 7369 2 68.89 CAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 4722392 5' + roo 73 2 69.86 CGATAAAGCGCCGATATGCTCGAGCGATATATCGAGTGCCCAGTAGTTATCAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGT:1 - chr3R 9563689 5' - P-element 2822 1 42.47 AGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr2R 16891843 5' + jockey 85 1 68.49 ATTGCGTAAGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGATCCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 24228836 5' + opus 27 4 66.90 TTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 + chr3R 10468019 5' - opus 419 2 71.03 TGGCTAGTATCCAATCCAGAAGGGACTCGCAGTGGGGACTCGCGCCTGGACATACCATTTAATATTAAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCTGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATGTTT:1 - chr2R 5992407 5' + pogo 50 1 52.74 GTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTATGCACCCC:1 - chr2L 12142637 5' - hobo 2892 1 57.39 CTGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAAC:1 + chr3R 9289287 5' - HMS-Beagle 193 2 55.48 AATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr2L 17162763 5' + blood 61 2 59.59 TTTGAATAAGAGGGTAAAGGAGGGGGGAAGGTTGGGTTTACATAGTCGCAGGGTAGTTGGCAATCATATCAGTTATATTTTTCGGGTATTTTGTGCTTAGTGGTCTACGAGTGTAAGTTCAAAATACAATTTACATAATTTTTTGA:1 - chrX 350064 5' - transib3 37 1 77.40 TATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 - chr3L 14043655 5' + Ivk 26 1 67.81 TGTGAGTTTTTGACATTGTCTCCGTACAAGTTCGTCTCCTACTTCGACTTTGGATTTGTCTTCGTTTTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTA:1 + chr2R 9403522 5' + jockey 168 1 52.46 CGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGTTATTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGAT:1 + chr2R 19633302 5' + jockey 4967 1 71.92 AAAAATGATTTGCGTAAAACGCAATTTTATTTTTTCATCGCCACAAAATGTGGGGAAAAAAAATAAAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 6443207 5' + G3 4583 1 54.48 TATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGGTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATCCTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chrX 21668703 5' - mdg1 7440 2 52.99 TCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chr3L 24153140 5' - Tabor 7295 2 65.07 CAAAATGTAGTTGGTGCAAATATTACTTAATTTTTTGTTATTTTTTTTTATTACCCAATTTGCAAGTATAAAAAAAAAACTAGTGTCGAAATCATAATGCAAATTATTTAATTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATA:1 + chrX 20645417 5' - Juan 4200 1 75.34 CAATAATTGCATTATCAATCGATAATCGTATCGTATCTTCGAGCGGTAGGTTTCGATAAAGGGTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chrX 22517548 5' + 1360 56 1 60.96 GTCTGGGGGGAGTGTGCTGTCGATTACCCACGGAAGGTGTTTTTTAGTGTTCTTAAAGGCCTTTGTTCGGAAGAAATTATTGGACGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3L 15663919 5' + 1360 59 1 76.24 TTTGTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr2L 15832969 5' - hobo 2901 1 57.53 TACATACATATATGAGTGTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr3L 21097071 5' + mdg3 5269 2 73.97 TTTTTTAGTGGGTTGCTGATGGATAAGTACATTCAATGGCGGGAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATA:1 + chr2L 12283900 5' + Quasimodo 30 2 64.38 AGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3R 20149812 5' - 1360 3348 1 57.53 GTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3L 22221258 5' + 412 39 2 58.90 ATTAGAACTTATTCACTTTCAATTGTTTTGTCGATCTTGAAGTAACTTTTAACGACCTGTGCTTGTAAACTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chr2L 8452229 5' + copia 4921 2 54.11 ATATATGTTTTGATATTTTTATTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATGTGCCATTAAACGTATTGCCACTCTCACTCGTACGCCTAAAATCCGCCCAATACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAA:1 + chr2L 19719413 5' + G4 3483 1 69.86 GAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATGTATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3R 23507596 5' - 412 419 2 69.57 AAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 - chr3R 8402646 5' - mdg1 7403 2 54.79 ATTTTTAAAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr2R 15079986 5' + roo 37 2 59.59 ATGGCCAAGCGCCGAGCGACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACA:1 - chr2R 13574864 5' - diver 6064 2 50.00 GCATTTGGCGCAGATTGGTCAAAGGGCATCAGCCACCGAGATCTCGGGTCCTAAGACATAAACGTGGACATGGACCTGATGGAGCTGCAGCTGAATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCT:1 - chrX 4395019 5' + roo 110 2 70.37 AGGAGAGATCGCTTGAGAAAACGTTGAAGGTGCTTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr2L 20638377 5' + Doc 84 1 74.29 AACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTC:1 + chrX 16244920 5' + jockey 4852 1 79.45 TTTACAACTATGATTATTATAATTTAAGACGCCTCTTTTACAATTTCCAACGAAAATTTCATATGCGGCAATGAATTTATAGACATCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAA:1 - chrX 7525200 5' + baggins 5178 1 58.90 GGCAGAAGACTGGCGGATGTCCCGGTTAACTCGTTAATGTTGTTAATGCAGGTCTACTAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr2R 6168342 5' - 1360 3333 1 59.71 ACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 21924332 5' - roo 325 2 72.60 CCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 + chr3L 3979582 5' - opus 7431 2 67.81 GGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCAC:1 - chr2L 9010497 5' - 1360 3305 1 75.34 AATAAACGATGATTTTTCTTTAAAAATTCATTATATTTCGCTATTCGAAATTACACGTTTCCTTTTGTGCACATCTACTTTCCAAGTTGTTCCGAGAATTGTATGATTAAGATAAGATAAGATAACAAACACATAGTCTTAAGCAC:1 - chr3R 20545630 5' + Stalker3T 224 1 70.55 TAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTGCTGGTTTTTTAACTTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACA:1 - chr2L 14025654 5' - TAHRE 10395 1 60.27 AGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr3L 9571676 5' + jockey 78 1 74.62 CATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2R 16383377 5' - roo 9015 2 58.90 ATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:2 - chr3R 9616683 5' - roo 359 2 52.05 TATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCATACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTATCCTTGCAGATGGGGTCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 - chr2R 12703847 5' - blood 7333 1 58.73 ATGGCTCCAGTTTATAAACATTTTGATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:2 - chr3R 8402693 5' - mdg1 7450 2 78.77 GAGTGTGCTAAAGTCTTGGGCAACCACTAAGAAATTGGAACTTTAACGCCGTTGTAAAGAAAGTTGTTAAGTAGTAATTTATTGGTGATTTTGATATTGAATAAAAAACAAATTAAACATTTCTATTATAACTGTAACGAACACAC:1 - chr2R 17232027 5' - Circe 228 1 82.19 TTGGGTACAACATTTATTTGAATTGTGAAAAGCTAAGTCTGAAAAGAATGTATGTATTTGAAGTTTACTACGAAGTAGGGAAAGAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - chr2R 22145606 5' + FB 36 1 58.22 TAAAAGCCGCATCACAGCCACTTTCAACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACAC:1 + chr3L 8254439 5' + jockey 4654 1 57.53 ATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTGTATGCACG:1 + chr2R 18123438 5' + 412 79 2 69.86 ACTAGCTCGAGCATTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 + chr2R 982284 5' + HMS-Beagle 28 2 66.44 GATTTTTTCGATTGTTTGGTACGTTTCTGCACTTTTGCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3R 4464101 5' - 1360 3371 1 73.29 TATCAAAATTCTAATGCAGACTGATTTTGAAACACATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAG:1 - chr2R 7098019 5' - copia 169 2 79.45 TTTGTACATAAATAAATGCATACGGAAAACGGAACGTGGAGTGCACAGAATGAGAGGATATATTCATTTCCTTGTTTCTGTTCTCTGTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCAAATCGAGCCGTACGGTTGGGCGGGAGGTGTGGC:1 + chrX 19839051 5' + Cr1a 4426 1 60.27 ATTATGGGACCCATCAGCGGGGAAATGAGCATGCTGGAGGCCAGGAAAATCGTGCTATTCTCTACCAGGCCAAAGCTCGCCAGAACTCTGTAACGCGGCTATGCTGGTGAACAGCGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCA:1 + chr2L 10509198 5' + Rt1b 4749 1 60.96 AATTAAGCGCGCACATTTTACATTTAAAACTGAATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3R 13494459 5' - opus 479 2 60.00 GTATTCAATCAGCGTCAACAAGAGCCGAAAAAAAGAGAAAGGAATCGAAAAATCACATGAAAAGTGAAGGCAAATCAAATAAACAAAAGTAATAATGTTAACTTAAATACCAATATTTGCATTCCTATCTTAATTATTTTTCCTTT:1 - chr3R 22501504 5' + Circe 6959 1 56.85 AGCAATTCAACGCTTTACAAGCAGCGTAACTCAAAGCAGTAGCGTCACCACAACAACGGTGACATTTACTAGTGCCAATAACAGCACCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAA:1 - chr2R 14855340 5' + Bari1 33 1 63.70 ACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTC:1 - chr2L 10032701 5' + hobo 51 1 78.12 CCTTTGGATACATTCTTATCCGCAAGATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 - chr3R 29709097 5' - blood 347 2 63.01 ACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr2R 16891832 5' + jockey 95 1 75.86 GTGAGTCTGTGTGTGTGTGCGTTCATCAAATTCAGGTATTTAGTGGGTGTCCCAAAAATGCTCCCGAATTCCACACTTGTTGCTGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTG:2 + chr3R 8367096 5' + Doc 8 1 73.97 CGGCTGCGGACTCGAGCGTTGACCGAAAAGCTTTTCATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATACACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr2L 18823516 5' - P-element 2847 1 41.90 ACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGT:1 - chr3R 10778769 5' - mdg3 5472 2 64.66 AGAGATGAACGTTGAAGGACTTGACGCGACTTGATTATAATTAGACGCTCCCACTTCCCCCCGTTCCCACCACATTTGTATTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 9993334 5' - hobo 2925 1 72.13 ATGTGCATTAAATACACTACACACTACTTGATTTTAATACCAAAAAGGTTGAAAAGTAGATAAAAACTAGAAATACGCGTTTAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3L 20711964 5' + 297 31 2 64.83 GCTTTCACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTAC:1 + chr2L 12142544 5' + hobo 49 1 52.05 CTGGATAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr3R 15649911 5' + blood 17 2 73.97 CGATCCTAAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 - chr3R 9983123 5' + HMS-Beagle 38 2 59.59 TTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTA:1 - chr2L 15153346 5' - G6 1967 1 55.48 ATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chrX 19162607 5' - pogo 2081 1 62.82 ATTACCAGACGGGTCTCTATGCTAATTCAATTAGCAATAGTAGCAGCTGGTCAGCTGCACGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGG:1 - chr2L 14998445 5' - G2 2763 1 48.25 ATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGAGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chr3R 24229004 5' - opus 496 2 79.17 AGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 + chr3L 20785469 5' - P-element 2808 1 31.51 CCATCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 + chrX 19231695 5' - mdg3 5481 2 73.97 ATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACGAAATCTAAAAACA:1 - chr2L 8393063 5' + I-element 5179 1 56.16 GAAAATATCAGCGCTTAGATTATTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGGAACGACTT:1 - chr3L 14863942 5' - Transpac 5173 2 51.37 CGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chr3L 16180875 5' - Transpac 249 2 60.27 TGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGCGTGTGTGCGGACGA:1 + chr3R 10079320 5' + P-element 88 1 25.34 GCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 5446120 5' - roo 8989 2 74.66 TGCACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGCAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr3L 14969315 5' + P-element 48 1 50.00 TATTCTTGCATATACACCACACGGCTACAAACCTAATTAAAGGCCGGCTAGGCCAGCAGAATCATAGATTACGAAATGGAACTTAGTACTTTAAATGGATTGAATTTTTGGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGG:1 + chr2L 1053263 5' - hobo 2666 1 76.03 CATACCGGTCGCATTGTTGCAATGGATGCGGTGCGCTTTGGTGCTTTAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr2R 10367595 5' - 412 454 2 56.85 TGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3L 14581379 5' - pogo 2038 1 63.01 GAGCATGTCACATATTTACAAAACTTGTCTACAAGATGAAGTCAACTATTAATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCT:1 + chrX 10873746 5' + mdg3 5258 1 80.14 GGAGCACTTGTGAATCCCGACTGCCCTGCATTCTAACTCACCCAAGTCACGTCCTGTTGCAACACCACACCTGACACCATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3L 9317443 5' + blood 7057 2 47.26 TGAGTATAATTACGCGTAGCAAGGAGCCTGATATTCGAAACATTTGATTTACTTTAAGTTGATAATTTGCAAGCTTTTAATTGGTAGAAGAGATTGATTTTACTATTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCC:1 - chr2R 10839420 5' + G2 3020 1 74.66 AATTTGATTTTAATTAGTTTAGCGCCTGAGAGTCTTTGGCAAGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAA:1 - chr3R 14957723 5' - HeT-A 5981 1 79.45 GCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATAT:1 + chrX 5440002 5' + accord 78 2 71.92 ATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATA:1 + chr2R 24630138 5' + copia 74 2 71.23 CACTTCATTTCATCATTCCATCAGCCAAACATTTCACCAGAGCAGCCGCAATGAAGACTTGTGTCAATATTGACGCTCGAAATCCTTTTATTTATCTAAAATCAGACCACTGCGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTGCAAGCGA:1 + chr2L 10591784 5' - Cr1a 378 1 61.64 GTCTTTGCTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 + chr2L 19424640 5' + Tirant 8158 2 52.05 TTTGTTTGGACTGCATTTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGG:1 + chr2R 21056673 5' + Tirant 57 2 56.85 AGCTACTGCCAAATTTCGAGATTGAACTGAATTAGTAATTCGATTAGATGGGGTTCTGGAAAAACCCGCTTTCCGGGATTATTCACGACCCATGAATCTTTTAAGGCTTGCGCCCTTGAAATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTC:1 - chr3R 21521478 5' - Bari1 1705 1 78.77 AGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTAAGACTTAGTTTCGGGGACGTATTAAAAATCTCTGCATTTTTTAATCACGCTCGATTCTTGGCCAAAAACCACACTGATGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAAC:1 + chrX 17469288 5' + blood 463 1 71.92 GCGGGATAACCATGGCTACTTTCAGACAAAAATAACTGTGCATAAACAAGGGCACGTTAATGAAAGCGGTTGCGAGCGGTAAAATGAACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGGAAA:1 - chr3R 27370410 5' - mdg3 5283 2 58.90 TTTTCGCTCACAGCATGAACGGTGTTTTGCGCTCGAATCCGATTCCACAACCGCTCTAGCGATCACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCTT:1 - chr2L 21237336 5' - P-element 2849 1 59.59 ATAGATTTGTAATAATACGTAATATATTTATGATATTGATTTTACTATTTTAGTCGTATTTTATAAATCATGTGGAATCACTTATAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGG:1 - chr2L 16984882 5' + Dm88 58 2 57.53 CCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTA:1 + chr2R 20382508 5' - Bari1 1622 1 76.03 AGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGTCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTAT:1 + chrX 18239348 5' + jockey 4555 1 50.68 GAGGCTAAGAAGGCGCGCATGGGCGAGAGAGCCAGAGAGAGCAAACACAGCTCTGCTCTCGCACGAATGAGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3L 20785400 5' + P-element 10 2 76.03 AACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr3R 25271195 5' + 412 7136 2 72.60 GAAATACAAATCTAAGCCATTTCTATCAGCGACTAGCAAAAGCGGAATTCAGTTTATTTCATCGCTTGCCTGCTGCCGATTAGTTTCCTCTTGATTGACCAAATTTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTGTTTGT:1 - chrX 22549584 5' - roo 9050 2 62.33 CAAGTCGAGATCAAGGCAGGCCTCATCATCATATTGCCAATAACGCAATGCAATAGATTTATTGAATTATTGCTTTGGCCGTGGCAGGTATATCCAAGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTCGGAGTATCGTGGTGGCTGTG:1 + chr2L 15347202 5' + R1A1-element 4993 1 61.64 CACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 18846524 5' + roo 86 2 76.03 ACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:2 - chrX 13651571 5' + 297 54 2 57.53 TTAAGCCAGGTGGGCTGTCTCACCCAGGATGTCCATGTCTGGCCGGATTTGCATGGCAATCGGTCGCCCGTCGCAGATCCCACGCTGCGAGGAGTGGTAAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3L 4023764 5' - pogo 2082 1 71.23 TTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2R 1277137 5' + Tirant 21 2 55.06 TATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATTC:1 + chr2L 17550621 5' - Transib-N1_DM 433 1 79.45 GCTACAATTTTTGCACTTGCGTTAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTTCTGTGAGTGTGTTTGCACACAGATACAGGCTTATGTGCTCGTGTTTTTTCCCCATTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chrX 3761401 5' + hopper 139 1 57.03 GAAAAAGCTTTCTCCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:2 + chr3L 15035080 5' - pogo 2076 1 68.28 AATTATCCATGGCGATGTGACAAGGCAGAAGCGTGGGAAGCAATTTATGTCGCTGCGAGAGCATTTATTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACCTATAGTCACCGATCGTGGCCACTACCTGG:1 - chrX 19386980 5' + Chouto 398 1 53.79 TAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr3R 25521890 5' + blood 64 2 60.69 TACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTATAATTTTTGGCTCTGTTCATATCTTATGTAATTGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTAT:1 - chr3L 4869236 5' + roo 78 2 66.44 ATCGAAGTGTGCATCATTCGGATAGCACTTGGAGTTCAATATATAGAAGTAAAGATGAAGTAGCTAAAAAATTGATTTCAAGTATATCCTGTATCCTGCATATAGTGGCCTACTTGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTT:1 - chr3R 13491437 5' - opus 100 2 76.03 CACACGGCCAAAGGTCGAACGATACACCGTCTTGCTGACCTTTGCTCAGGTCGGCTTATAGATGAAATAGGTAATACCTGAATGTGAGTTGCCATTGACGCACTAACTTCATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACG:1 - chr2R 6730349 5' + Stalker4 111 4 76.03 CTACTAACAAGTTCTACTGTCCTAAGTATACCGAAAAATAAACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr2L 14222208 5' + Transpac 21 2 71.53 TAAAGTGCCAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr2L 4416003 5' + jockey 27 1 72.60 ACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chrX 14173204 5' + 412 7113 2 58.22 ATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 - chr3L 3540202 5' + mdg3 65 2 68.49 GCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3R 12363248 5' + jockey 86 1 67.81 ATAATTGCGGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 8542547 5' - roo 9043 1 60.96 TTTGCCCGGCTTTTGTGCGGCCCGTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3R 7424664 5' + 412 7087 2 60.96 GAAAAGAAAACTCCGCCCAGCCGATAGGCATCCAAACACATCGTGTTTCGTTTGCTGCATAATTGAATTTAATTATAAATCATCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 + chr2R 23312968 5' - Tabor 7284 2 52.05 AAATACTACTAACTTTCATCTGAAACCAATAATTTATTACATAGAATTAAGTTCTTTTTTTTACATTTAATAGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chrX 11228667 5' + roo 8713 2 52.74 GCTGCAGGTCAAGGAGATGGCTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:2 + chr2R 17986227 5' + 297 6615 2 63.01 GTGTTCGTTCTGCTGGCAGCGACAGCAACCCCCAAGGCAGCATTATTGTGAAAGTTTCCGACTGCGCGAGAGTGTGTTTGACTTTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT:1 - chr3R 6419159 5' - accord 193 2 75.17 AACATTTACCTTTTGGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chr2L 10937849 5' - mdg1 7386 2 67.12 GAACGAGAGCGAGACAGTCGCGTCAAATGCAGTTTATGCCCCGGTCATAAATCAAAATTTCTGGTTTTCTGCTGTCAGGCGATGGCATAGCTCCATGGGCAGCAGCAAAAAACAACAAGACACACAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 13365354 5' + R2-element 3585 5 67.81 GAACATATTCTGAAAGAAATGAAACTGAGCTTCCAGCTCACCGAACAGCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2R 16102497 5' + blood 7040 2 39.57 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAACGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACACTGACGAAGATATT:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 127 2 64.38 AAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAGTT:1 - chr3R 8705826 5' - hopper 1365 1 51.37 GACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAAC:1 + chr3L 5514188 5' + Doc 76 1 56.16 AAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr2R 13849708 5' + roo 8748 2 76.71 ATTTGCCAACCCATGAACAACTAGCCGATATTTACGCAAGTAAAGAAGTATGCGATATTCTATAGAGTTCCCCTAACCCTGATTGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr3R 4884350 5' - pogo 2067 1 62.33 ATCCTACGTCAAAGTCGTATATTGATATGGGAACTTTTGCGCATTTCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 9616525 5' + roo 16 2 74.66 GGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chr2L 19930158 5' + jockey 84 1 71.03 TTGTATCTTCAGTACTTACAAGAGCTATACTTTGAATGCGGATAGCTTACAACCAATCGGTAGTTCCCCTAGTAAGTCAGGTGTATCTTTAACAACATATCGCTCTATTTATCCATTTATATGTTTTTTT:1 - chrX 3400395 5' + Circe 419 1 62.31 ACCTAACCGATCTCGACAGATCATCTCGTCTTTGCTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2L 19424613 5' + Tirant 8128 2 72.03 ATCCAACTAATTTTGCAAAGATCACGTCCACACCAAGCTCAGTGCCTTCATCCATTCAGATGCCACTGCCAATTCAGAATACCAAGATCCTAAAGTCCGAGAATTCGGATGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATA:1 - chr3L 8054910 5' - blood 14 2 74.66 AGGTTATAAGCAAATACCTCAATTAAATCGTTTTGTTTCAAATGGTATAATGAGTAAGTTATTTTTTATTAATTTTCTCTCCTATTTCTATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 - chr3L 15372843 5' + Transpac 4921 2 64.38 ACTTCTTTCATTTGTTGTTTTTATAGATTGTAAATAGAAATGGTTAATATCTAATTCCTGGATCAAATGGTATAAAATTTGAACTCCCCGCAACGGTATAATGCCTTCATTTATGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGA:1 + chr3R 6732307 5' + R2-element 3143 1 77.40 TAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGGACGTG:1 - chr3L 21630396 5' - Burdock 6309 2 74.66 CACTAAGCTTTGTGGCTAACTGGTCGTAACCGACTGAATGCGGTCTATATAATTCCGTTGAGCACCAACAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 + chr2R 6187835 5' - Tirant 355 2 54.23 GGCAAACATTTTCAATGTCATGGGTCTTCCATGTCTTATCCATTCAGGAAGTGCTGTTCAATATGCCAACGTCACCTTGATATTTCGCTAGCGACTTAGTTCCAGTTGCGCTGACGTTACTGCGGTCGCGTCCGGTCTTATCGTGG:1 + chr3L 17942978 5' - gypsy4 33 2 54.11 CGTAAAATTTGCTGAAATAGGTTCAATGAACTACGAAGTTCTCAGGTTTAACCCTTCACTTTTTCGCCAGATTGAGCTGTGAGTTGTATAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chr2L 7215484 5' - 297 369 2 71.23 ACTATACTTCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chrX 3529853 5' - 412 451 2 56.85 AGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATGAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr2L 18048272 5' + blood 78 2 67.12 TATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:2 - chr2R 10453457 5' + mdg3 5305 2 51.37 AGTGTGACCATATTTACTGTTTTATTTGCAATTTTAATTATTGGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chrX 14136484 5' + roo 8670 2 49.32 CGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr3R 31907380 5' + Tirant 10 2 77.55 CTAATAAAGCAGGTTCCATATCCAAGGCGTATGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCAT:2 + chr2L 22643322 5' + invader4 2761 2 55.48 ATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3L 22221265 5' + 412 7085 2 63.70 CAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACT:1 + chr3R 15465486 5' + mdg3 5322 2 65.07 TAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr2R 17986248 5' + 297 55 2 58.22 AATTAATTGAAATTGTTGAGATACCGCTAACTGTGAATTGGATACTACGCAAACACTCACCAGAGACTTCGATAATCTGGACAAATCATCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAAT:1 - chr3R 12060653 5' - Porto1 4223 1 60.27 TTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:1 - chr3L 14043657 5' + Ivk 24 1 69.18 CAAAAAAGGCAGTTAGTCGGCAAGCGATCGTAGAGGTGTTTTGTCAGAGCGAAGTTTTGATTGCAGTCAGCTAACTTTTTATTTAATGGATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chrX 6193106 5' + mdg3 5287 2 61.64 AAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATC:2 + chrX 18239366 5' + jockey 4573 1 64.38 AGCCCAGCAGAGTACACCCCCTAAGGCCGACACCACCCCCATCCACATCCCCATCCCCATCCCCATTCCCTGCGAATTTCCCCGGCACACGCACCTTTACACATTGTTCACACATCAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 22675938 5' + roo 14 2 74.10 AGACTTCAAAGCCCACACACTCGAACATATTCAAGGCAATAGAACCGCAATTCACAAAGGCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGT:1 - chr2R 20382640 5' + Bari1 10 1 78.08 TTAAGCTAATGGGAATGTTTTGAGTGAATATGTAAACATACAACGTTGGGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGAACATATATGTACAATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCA:1 - chr3R 1519343 5' + HMS-Beagle2 6890 2 80.69 TTTTGTATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 - chr2L 14222377 5' - Transpac 278 2 64.38 CTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:1 - chr3R 14097127 5' - transib2 2764 1 60.84 GTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chr3R 7424641 5' + 412 57 2 56.85 CCATATGATCGGGGCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 + chr2R 10478635 5' - invader4 304 2 69.18 AATCCTCATCCTACCTGATGAGCCATGAAGTACCATCGCCGGATTACCGGGAAACGTTCTATTGTGCCGCCAGTGGTGCCGATTACAACTCATACACCATGTTGTGGGGTCAGTATTATTTGGATTTTTTATTTATTTGACTTTGC:1 - chr3R 21760028 5' - F-element 4679 1 69.18 TAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr3L 24153291 5' + Tabor 6882 2 56.85 CATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2L 19930180 5' + jockey 63 1 56.16 AAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2L 10032732 5' + hobo 68 1 65.28 GAATAACAAAATCAACAAAGCGACACTAAATGAATGGAATTAAAATAATCAAATAAAAACAATGATAATTCCAATCATGCATTTCTGTTCTTACTCTAGTGTTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAAT:1 + chr3L 14043485 5' - Ivk 5362 1 72.60 GACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCG:1 - chr2R 4270289 5' + gypsy9 32 2 52.74 AGCACAACGATCCAGGTCTCTTTGATACCATTTGGCCAAAGCTGGTTAGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr2L 2357232 5' - P-element 2873 1 76.03 AATTGAAGTGCATTATCGACGAGTTTAATACCCCGCAGATTGCCTAGAATTGCCGCTGAGCTCATTACATGATCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGTCCCAGAGTTCAGTAGAGATTTTAGGT:1 + chrX 2509491 5' + R1A1-element 5101 1 50.00 TGGACCAGCGCGATCGAAGAAGGCACCTCTAATGGCGAAGACCTTGCAGTTTATGCGCGGACGTCTCAAACGATAGATGCGCTTACTCATTATAGCTACAATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 23254373 5' - pogo 2084 1 74.66 CATTAACAAACTAAACGAGTACTTTTAGGAGAAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGC:1 - chr2L 19417081 5' + BS 5050 1 78.08 AAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:2 + chr2L 18048285 5' + blood 7102 2 77.40 TAGTCAAGTTGCACTGTATTTCAGTGGAAATGGCTGGTAGCTATTTTCCAGTCAGTTTCGACGCACAATTGCGGGCTGCCTTCCAGTTAGCTGGAATTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCGGTTTTAAG:1 + chr3L 1349220 5' - X-element 4459 1 68.57 TAAGATGTACTAAACGTATTATACCATCTCGTATAAAATTTAATTGGATTGTAATGCTTTTTAAACGCATTTAACCTTAACCAATATAACCAATAAAAGTCAATGTAAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTA:1 - chr2L 15202191 5' + 1360 157 1 66.44 TGCAGCGACTGCTGCTGGATGCTGCGCACCAGGTCGGAGGAGCCGCGCGGAATGATCAGGTCGATGTATCCCAGCTGCGCAGGGGCGCACCACTCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCTC:1 - chr3L 21980723 5' + 297 152 2 45.89 CTAGTAATTAGCGCTTACTTATCAAGCATAAACTGGAATTTCGCTGATGGCCTAAAAGAAATATATTCATGAATTGATTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGA:1 + chr3R 29985054 5' - Q-element 75 2 51.37 CATCCACACTAGCAGATATCTGAAATCTGAATCGATCCCAAAATGACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGTGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGA:1 - chr2L 1074059 5' - Tirant 8491 2 71.92 ACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGAATAAATCACCTTGATATGACAACCAACATGC:1 + chr3R 5765328 5' - opus 439 2 58.22 TGCGAAGCGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chrX 14962158 5' + jockey 26 1 71.23 AACACGATCTCAATGAGAACTTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3R 23507710 5' + 412 27 2 64.38 TAGGCAACTACAGGTATAAGTAAGGGAAAACAATCTTCTTGTTAATCTTCTTGTTTGTATTTGAAAAATATATTTTCAGAAACTAGTACTACTCTTAAACCCTTTTGCTTTTTACTTTTTTTTTT:1 + chr2R 14552669 5' - Doc2-element 233 1 77.60 GACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chrX 983215 5' + 412 7121 2 63.01 GGGCGAAATCACGTCCGAGCGGGGAATTATGTGCTTGCGTGCCGCGCTAAACTCTTAGCCACCTCCTTTTGGCCGAGTTCAAAACGTACTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3R 4659651 5' - P-element 2858 1 66.44 ATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATCGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGAGCACCCGTCAG:1 - chr3L 13597851 5' - blood 7343 2 50.00 CTTGCAGTCGATCTGACCATGTTCGTCTTATCTTCTATTTTAAAAACGGGAAAGATCATATTTAAGATCACGGGAAACTACATAAAAGATTGGTTAAAATTCGTAAACTATACTTTCTATTTTGTACAGAGTTTCTTAAATTATAC:1 - chr2L 17068054 5' - mdg3 5028 1 69.18 GGGCAAGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chrX 21213422 5' + Doc 33 1 60.27 GACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACA:1 - chr2L 9356889 5' + Stalker4 7038 4 76.03 ATTCGTCTGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCCCTAAAC:1 - chr2R 6187975 5' + Tirant 20 2 69.53 TAATGAGCGGAGATGCAAATTTTCTGAGGAAACGTTTACGGATTATAGTTTTCTAGAATTATGTTTATGATTTTATTTTATATCTATAAAGCTAGGATACTAAAAGTATATTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr3R 6828077 5' - flea 5006 2 79.45 AAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr2L 12142580 5' + hobo 65 1 69.84 AAACGACAAAAAAAGATTCAGATGGCCCCCCCCCCCAACCAAAAAAATAAAAGGAGGATTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGTGCGAGTGACTTTAAACGGTGCTAACTGTGCTGCAAGTGATGTTCGCGCTGCCT:1 + chr3R 19444982 5' + Stalker 495 1 65.52 ATAGACCTCGCATATATAGACAGCAGTTTTCTCCGACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 + chr3R 9958598 5' + opus 53 4 60.96 GTTTTTGCTTTCATAACAGCTTTGCTGGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:2 - chr2L 19878285 5' + mdg3 35 2 62.33 GCCATACTTGTCACCTAGTACCCTGCTTATGCAAACAATTGTAATCTCCTCTATTCAACGCACACACAATTTACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2L 12481410 5' + pogo 46 1 51.37 GGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 28008226 5' + hobo 47 1 51.75 CTAGTGTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 9481994 5' + roo 8709 2 55.48 ATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 - chr3L 24153293 5' + Tabor 41 2 58.22 GCTCTTGAATATTGAAAATCAATGTTTTGCTTTAAAGTATTACATATTTGAAACGTTGTCGCATAACTCAAATCAAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chrX 6398893 5' + blood 7048 2 56.03 CGGCATCGTTATTTTCCGCCGCTTTTTATACCCGGTACTCATAGAATTATGGGTATACTAGTTTCGTTGAGAAGTATGTTACAGGCAGAAGAGAAGCGTTTCCGACCATATATAGTAAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGTC:1 - chrX 17554817 5' + INE-1 87 1 78.62 GTATCAGCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr2R 19900960 5' - mdg1 375 2 53.42 GGCTGACGAATAACTTTGGATAGCAATTGATGGAAAAAATGCACAAAATATATAGACAAACCAGACCAAGTTTCGTAAACAAAACGGGTTTCAAAAAATATTTATGAGAATCGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTA:1 - chrX 6203725 5' - roo 8961 2 71.23 TCAGCTAATAATTGGTAGACGGACTCTTCATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGGATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chrX 14385102 5' + blood 7023 2 77.40 TCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTGGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 + chrX 18366041 5' + jockey 94 1 74.48 AACAAACATTTTGCTACTTCGTCGCAGGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGATGTGTGCGGACGAATT:1 + chr2L 21237245 5' + P-element 91 1 23.29 GTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr3L 18708581 5' + F-element 54 1 56.16 ACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAACATCGGACCCTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 + chr2L 1073951 5' + Tirant 54 2 76.04 GAGATCGAAAGTGGTCTCCACTCATACATAATGGATGATTTGAGTGGAATATAATAAATGGGTACCGGAATACAAAATATAAAGAGCATAGACAAATTTAGGCAAAAGGCGCTACTAACATCAACTTAATTACAGTTTTGAGTAAA:1 - chrX 22906161 5' - transib3 461 1 56.85 AAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 4104110 5' + roo 8713 2 52.74 TGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGCG:1 + chr2L 15153285 5' + G-element 99 1 76.03 TATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2R 15062266 5' + blood 43 2 54.47 AGATTTACTCAAGCGCGTCATTCTATAGGTAAACTTTCAATTTGGCACGCCATTTGCATTTTTATGTATCGCAAATCATACTCTTGCTTCATAGTTCATCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATC:1 + chr3R 26165595 5' + Doc 198 1 63.01 ATAAATATACAAATATACAAAACATTTTTACATACATACATTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACCAAATAAAAAA:1 + chr3R 29534665 5' + F-element 91 1 70.55 GGCGGGAATGACCACAGACCACGTCCTACCAGCATTACCCATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 - chr2L 6406595 5' - transib2 2786 1 58.22 TACCATTGTTGGTTATTGTCACGGCCTGAAAGTCGGCAATTCAAAATATGAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCT:1 + chrX 16244827 5' + jockey 4759 1 79.45 TATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr3R 19545346 5' + jockey 89 1 70.55 CGCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr2R 20704139 5' - hobo 2898 1 56.20 GGGCGGTCATTAGGACGAAAAAAACGCCGAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3L 15035265 5' + pogo 14 1 73.29 TATGATAATTTGTATATGCCACATTTTCAAATAGGTTAGTTTCACATTTAAATATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 - chr3R 21518123 5' - 297 6915 2 65.75 ACGTGGCGCAGAGTGAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAG:1 + chrX 21474390 5' + 1731 55 2 80.14 AACCAATCATCGCATATATTTATCAACTGAAGAACCCACATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 - chr2R 17014157 5' - HMS-Beagle 222 2 68.53 TGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3L 20076851 5' - roo 8999 2 70.55 TATACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 22659880 5' - 412 7515 2 63.70 GGTGGTTGTTATTCGCACTCATGAGTCGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3L 16180828 5' - Transpac 5218 2 77.62 TTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:2 + chrX 15089509 5' - P-element 2809 1 32.19 GAAAGTATTTAAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAATTTTCAGCAGATAGTCGT:1 + chrX 3506061 5' - Tirant 333 2 65.28 CGATATATTTTAATTTCCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTGGTTGAGTTTT:1 - chr2R 15080152 5' - roo 390 2 73.10 ATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATT:1 + chr3L 16157177 5' + Juan 27 1 61.24 CGTCAAATAAAATTTAAGCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr2R 8305186 5' + blood 39 2 58.90 TCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTA:1 + chrX 7467960 5' - hopper2 1518 2 77.40 AATCAAGTTGATAAGAAGGAAGGCGAGTTTTCCAGCTGCCAGAAGGCATAGGCAAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTT:1 - chr3R 20147611 5' - 1360 384 1 75.86 CTCTCGCAAAAAAACTACAAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chrX 17469282 5' + blood 54 2 53.42 AAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGATCTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 15833001 5' - hobo 2922 1 55.91 ACATTGCTGAAAAAGCAGATGGTGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1 - chr2L 12283792 5' + Quasimodo 51 2 54.11 TAAACATAAATTGGTACTCCCACATATCTTGGCATTGCTACACATAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAG:1 - chr2R 16312175 5' + G6 1933 1 76.03 AAGGGGAAGTTTTAAATGCTTATAATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 - chr3R 11096807 5' - copia 224 1 64.38 TCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:1 + chr2L 19878168 5' - mdg3 5427 2 66.44 ATAATTGCGGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 8542547 5' - roo 9047 1 62.68 ATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTA:1 - chr3L 23583103 5' - looper1 99 1 56.85 AACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 14088545 5' + 1360 51 1 52.74 CGGGAGGCGAACGCTTTGACTTTCGGAGGCAATAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 26399814 5' - roo 8985 2 78.08 CGAGTTAAAGTCGGTGGCTGATAAGCTACGATTTTCCACTCGCTATATAACACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACAC:1 + chr3R 15984436 5' - P-element 215 1 39.73 GTTCCCCGAAAGCATTCCAATCTCTATATTAAACAGATATTGCAAATAGGCACCCAATGTTTTACATTCTTATAAAGAACGGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr3L 11953879 5' + jockey 4710 1 56.25 GCTCTTGGCCCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGTTTGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACACCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 - chr3L 9198641 5' + F-element 91 1 69.86 AAAACTCCACCAATCCATTCCCCTGGGTTCACAAAATTTAAATAATAGTTAATTGCATGCTATGGGTGATTTTACACATGATCGTTTTATTCAAATTATGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 6588334 5' - roo 9048 2 46.58 CATAGTGAACTATTAAGTTTTCGGAAGTAAATAGTTCCTGTTCACACATGAACACGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACCTCGATAA:1 - chr2R 4551449 5' + roo 8922 2 63.01 GGTCTTTATGGCCCAGTGACCTGCTCACGTTGTTCATGTTAAAATTCCAAATTACATTTTGCATTTTGATTAGAGCGTAAACACAGTGACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAA:1 - chrX 18031097 5' + Juan 370 1 65.07 GCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTT:1 - chr2L 11867401 5' - BS 4996 1 60.27 GTTTAACATGTGGTTTGAGATTAAATGATCAAATGAAAACACAATGTGTTTTACTGGATATATCATATAAACGGACTTGCGGATGTAATGGACTAAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAAT:1 + chr3L 4127794 5' - GATE 364 1 63.01 AAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 + chr2L 8772719 5' - Tabor 430 2 54.11 GGCTAGTTGGCTCTCTCGCATCGAACCTGTTTGCTGGTCGCCTTTAGATTGGAGCAGGCGGCTCAAAAGTCGGAATGTGGTATTTACAAGACTAATAAATTTGTTTTAAAATATCTTAAAAATTTTCAAA:1 + chr3L 14205328 5' + Ivk 5239 1 64.62 ATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr3L 19274866 5' - transib2 2739 1 76.71 ATTTTTGCGATTCCATTTGTTTGCACTTGCCCCCAGACAATCGCGGCAGCATAAAACACACATAGCTACGCCAGATCGTGATCGGACAGACATATATGTAGGATATAGGATCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATG:1 - chr3R 8396399 5' + roo 8611 1 72.60 GCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTGCATGAATAATAAGTAC:1 - chr3L 19339411 5' + Tc1 90 1 73.10 TAGGCAACTTGGGATGCCGGCTGATTCGCAATTCCCAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 15920209 5' + jockey 15 1 75.20 AAACAGTATTTTAATTGCCAAGCATACCTCAATTAAATACATTTGCCTGTTGTTTAATTTTGCCATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAT:1 - chr3L 18468443 5' - jockey 4941 1 60.27 AAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGG:1 + chr3L 22481328 5' - roo 8900 2 72.41 CGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 5087050 5' + P-element 98 1 16.90 AGGAAAGCGAGGGAGAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAGGGG:1 + chrX 7628722 5' - hopper 140 2 83.72 GAGCAAACAATTATATTCATATACGTGAGTTATCTTTCAGTTGTATTGATATAAAAAGGAAGGCGATCTATTATCCCAATCAGTTCTGGTCTTGCCATCCATCGAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:2 + chr3R 12375639 5' - copia 239 1 73.97 CTGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGCTTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 - chr3L 21630440 5' - Burdock 221 2 60.28 ACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 11228568 5' - roo 333 2 68.28 TTTACTGAGTTAATAATACAAATACTTGTATTTGATACCATATTGCTTATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 + chr3L 16264554 5' + Burdock 14 2 76.03 CAAAAATTTTCACTCGAAAACTTGTGCCTCTAATTTGACAGACGAGCGACCGCATTTTGGTGGCATTTTTCTGAAAACCCAACCATTTTTTAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAT:1 - chr3R 13996342 5' - 1360 3018 1 61.64 CATATGAAAATTTTTTAAAACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:2 - chr2L 8772864 5' + Tabor 23 2 69.86 GCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1 - chr2R 9072957 5' + Burdock 56 2 57.53 TCAGGGGTTGGGGGTCACGGCGTCCTACGTGAGCTTGAAACTTGTACTTGGTCACTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGA:1 - chr3L 15643998 5' + Ivk 342 1 63.01 CGATGCAGGAGTTTCAGGATTTGAGTATTATACAAGAGAGAATGCTATTTTCGAGGTCCCCGACTATCAGATACCCGTTTCTCTGCGATACCGATAGAAATTGGGGAGTACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:1 - chr3L 22737504 5' - mdg3 236 2 77.40 TATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 + chrX 21639591 5' - Tirant 364 2 61.64 GCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr2R 11379733 5' + jockey 88 1 69.18 CCGCTAATAAGGTGGAAACACAGATAGAGGTCACTATCGAAAACTGTGGTACCGAGTTTCGCTACAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCAAACGTATGCTCATGCATTG:1 - chr2R 630718 5' + 1360 184 1 67.81 CTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr2L 13547076 5' + P-element 48 1 52.74 TTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chrX 6398774 5' - blood 331 2 48.28 TTCATACTACAAATATATATATAATATATTCTGTGGATACTATCTGAATATCCAAACCAGGCGTGCAAAATATGAATTACACGATTCAAACGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3R 21373693 5' + 297 26 2 59.31 GAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chr3R 4913624 5' + 1360 84 1 75.34 AAGGATAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 18581225 5' + roo 16 2 73.29 AACTGATTAATCATCTGGTTAAATATTTGCTCAACTATAAGCAAGCAAAAATAAGTCAAATCGCATGAGAAAGAAAGAGACACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 3762338 5' + roo 38 2 57.53 GCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 + chr2R 14553262 5' - mdg3 167 2 79.10 CTCTGGACATGCTGATGCGCACTTTGTCGCAGGCACATCCCTACTTTATCCGTTGCATCAAACCCAATGAATACAAGGAACCTAAGGTGAGTGAAAGATTATTCAACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAA:1 + chr2L 7682543 5' - 297 280 2 73.57 AGATGAACCAAGGGAGAAAAGAGAGAACTTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 31956343 5' - pogo 2085 1 74.66 GATGCTCGTTAGTTTTATGTGGTGAAGGCCTCAAAAAAGAAGCTTGAAAATCTGTAAGGAAAAAGTGAGAAATTATCAGACTTAAATTCATTGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr3R 12367570 5' + copia 4900 2 65.75 AGAAGTATGTTAAATGATAGGATTATAATCAACATTTCTATCTAAGAGATCTCTATAGATATATATGCGTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGGAAGTAATAAAAATATGTTTTACGACGCTTAGTCGGAGTT:1 + chr2L 17712411 5' - Gypsy6A_LTR 209 1 51.37 CAAAGTTCTGTATTTTTTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr2L 17069647 5' - 412 7510 2 53.66 AGGGGAAGTTTTAAATGCTTATAATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 - chr3R 11096806 5' - copia 223 1 63.70 GAAGGGCCGTTTGAAGTCTGTGTTTAAAATGCAGATTATGTGCGTTGATTAAATATTGTATTTCCCAATATCTATCGATATTCCAGAAAAAATAATAAAATTTGGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGT:1 - chr2R 18946270 5' + INE-1 548 1 59.59 CTTACTATTTGATAGGTGTCATGGATACGGCATAGGGACTTGCATCTGCTTACTGTATCTGAAAGCACTTACAGCTGATCGCCTCATGAAGTTTTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTGGGC:1 + chr2R 3078951 5' - 1360 3361 1 56.85 CATCGAAAGAAGGATACAAAACAGCACCAAACTTTAAGGACCTGTGCATTGTACAAGGGGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3L 4175355 5' + roo 8726 2 64.38 CATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 - chr3L 15371384 5' - Transpac 5161 2 65.75 CAGCGAAGCAAATCGAATTTTAACATAAGACAAATTAAAAGCAACTTGTGAGATATCTTAATAAAAGTCTGCCAAGGAAATACTGCCAGAAGTAGATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACG:1 - chr3R 31634893 5' - micropia 5115 2 66.44 GGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCAT:1 + chr2R 5284512 5' - Doc4-element 2619 1 63.01 AACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCA:1 + chr2R 5582156 5' + Cr1a 475 1 54.11 AATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 + chr2L 10937865 5' - mdg1 332 2 78.08 ATACTAGTATTCTAGTTTACGCTAACACCCAGTTATAGTTTGGAGATGATTACAGAAAATAAAATTAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATTATTATTAGCGCAAAAATTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGAC:2 - chr3L 25255976 5' - INE-1 301 1 67.12 GAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:2 - chr3R 15514619 5' + 412 7112 2 56.85 AACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGC:2 + chr2R 982337 5' + HMS-Beagle 81 2 74.66 AATGCTTACTTTAAGACTATCCTCGCTTCCTCGCCATCGATCAGAATCTTCTGACCATTGAACATCAGCGTAATGCGAGGCGGGCATGTGCGCGCTGGGTGACCGCCGAAGGCACGGAACTCCAGACGGC:1 - chr2L 8516599 5' + gypsy10 181 2 49.23 CAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr3R 15514596 5' + 412 79 2 72.03 AATATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:2 - chr2R 14884357 5' + mdg3 5298 2 55.48 GTGGAGAGTCTATTAATTTCGTACGACCCCCCTTTTAAAATGGCAATGGTGGGGCTTTCCAGGGGGTGGAGCGTATTTGTTCTGTTGTTTGTTTGTTAATTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chr3L 21037818 5' + hopper 146 108 60.33 ATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCG:1 + chrX 18239387 5' + jockey 4580 1 76.52 AAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATT:1 + chr3L 24153190 5' - Tabor 7245 2 71.23 GAGGAGTTGTGCCAATTGCCGCTATTTACCACACACATTACACGATGCGAGCAAACCAAACAACGCCAATCTATATGGCCAACAGCACCACGGTGGGGCACCATGCATATGGATCTGCTCCAGCGCTGTCAGCGCAGAAGTGTGGC:1 + chrX 7566414 5' - invader4 499 1 59.59 AAAACATTGCACTACACAAAGAAAAATATATAATGGCTATGAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCG:1 - chrX 10101399 5' - mdg3 165 2 71.23 TATAAGGATAGCTAAACAAAATGTTGTTTATTATATGTAAATATACGTGTAAAAATATGGAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCAACCACATAAAGTATATATATTCTTGAATAGGATCTGGCCATGTCCGTCTATCCGTATGAACG:1 + chr2R 5780168 5' + INE-1 124 1 68.49 AAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr3R 24228853 5' + opus 7048 4 54.79 GATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGT:2 + chr3L 16157180 5' + Juan 47 1 52.05 TAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAA:1 + chrX 14692866 5' + Transpac 5005 2 76.03 ATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chr2R 1277143 5' + Tirant 69 2 67.13 GGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 + chr3R 6068303 5' + jockey 4760 1 82.19 ATTTAACTTCAAACAACCATCAACTAAAAGGGATGTTGACATTTCTTGATATTGTTACGTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGG:1 + chr3L 20925706 5' + Transpac 17 2 72.60 ATGCAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 + chr2L 13877650 5' - Transpac 284 2 59.85 ACCCGTAAAGTCACTGGAATAATATGAATGCGGTTTGAACGTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 + chr3L 13922299 5' - Tirant 8429 2 74.66 TAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:1 - chr3L 17667622 5' + F-element 78 1 63.70 GAGCTCCACTAATCGATCCAAATATTTACCATTTTTGCACGCTAATTGATAAACATTTCATCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAA:1 + chrX 5016424 5' + Tirant 214 2 61.11 GGCAGATAGGAGGACGAAGATCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGCCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr3R 10468121 5' + opus 150 4 58.87 CACCCGCTCCTTTGAGCCCCCACCCACTGGGGCGCTTCATGCACGAGTTGTTGTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCTTCA:1 - chr2L 1230489 5' - opus 267 2 69.39 TATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATA:1 + chr3L 16264601 5' + Burdock 61 2 62.33 GTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr3R 9482019 5' + roo 70 2 67.12 TAGATTATTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr3L 14863927 5' - Transpac 239 2 63.01 CAATTTTTATCCTCAAACTATTTTTGTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCCAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 3967149 5' + hobo 29 1 57.89 AGGTTAAACGAGGTGTTACTGTTGGGGAGACTATATTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr2L 17638666 5' - blood 358 2 72.44 GTTTGACAATATATTTTGCTTGGGAATTCCTTTTGTTCTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr3R 22289395 5' - 412 7480 2 70.54 GAAAAGTTCAAGGTGATGATGAATGGTTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTATGCGTGTGCGTGTGTGCTGGGGGATGCCCCTAATGCTAGACATACAAATACGGATACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr3R 9993503 5' + hobo 13 1 76.71 GATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTG:2 + chr3R 11461778 5' + 17.6 6998 2 69.18 CGCAGCGTCGAAGGGAGACGTTCGCAGTGGCGTAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 20292376 5' - pogo 2085 1 76.71 AAGGCTTGTGGTAAATGGCAGCGCAGTGGGCTTGGCAATCTTCAGCAGGCGTTCCACCTTTTGCTGCTCGCCCTTGAGTCGTTGCTGCTCCAACTAATTGGAAAGAAGCCATGGTCTTAAATCAATAATTTTGTTGTTTTTGTTT:1 - chr3R 18679478 5' - gypsy11 3935 1 69.66 TTACACGCCGCGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr2L 10650359 5' + Doc 75 1 67.81 ACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chrX 15167673 5' + roo 77 2 75.34 GGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACGTGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTT:1 - chr2L 3734598 5' + mdg3 32 2 45.21 ATGTGCCACAAAGGGAAATCAGTTAAATTGATACTGGGAGGTGATGAATAATTAATTTGACTTAAAAAAGTAGAACTATTTTAAAGAAATTAAAATACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 12608203 5' + roo 8687 2 39.73 TGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 - chr2R 14562274 5' - Burdock 6361 2 44.52 TAATGATTAACAATTAACATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr2R 20913219 5' - 1360 3337 1 54.11 AACTGTCCGCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 12355409 5' + hobo 25 1 67.12 CCATGACAAATCGCTCTCTTTTAAGCCTTTGTCTGTGTGTGTGTGCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATG:1 - chr3R 10541334 5' + hopper 75 1 67.81 AGGTTAGGTTCTCCTAAAGGAAAGAATATTCCTGTCAAATGATTGCGATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTTT:1 - chr3L 14603201 5' - jockey 4998 1 55.48 GCCGAATGGTGTTAACATTTCGAGTCAGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAA:1 + chrX 18239322 5' + jockey 4521 1 68.84 GAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chr3L 13597756 5' + blood 63 2 65.69 ATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACAG:1 + chr3R 27503050 5' + hobo 85 1 77.08 GTGTATAAATAAATAGAGATCTCTCGATGAATGTTACATAAGTAACCATTTGTACATAGTATGTGTTGAAGTTATAACTTTGCCTCAAGTCATCAAGGGCAAACACAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 7596381 5' - roo 393 1 67.81 GATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAA:1 - chr3L 14969292 5' + P-element 71 1 34.25 AAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 + chrX 10571327 5' + Doc 65 1 60.96 ACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGGCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACGCCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTCACAAACCCA:1 - chr2L 10032709 5' + hobo 82 1 72.59 AGCACCAAACTTTAAGGACCTGTGCATTGTACAAGGGGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 4175333 5' + roo 75 2 78.10 ATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 23507552 5' - 412 7514 2 61.43 TTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGTGA:1 - chrX 3452540 5' + Tirant 8151 2 56.85 CAATAAAAGCGGCTTTTATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr2L 9010519 5' - 1360 3327 1 63.01 ATCGTAGAATGTTCAGGAAACATTTGTGTAGCCTTAAGAAATAGTTGACAGATGAATGTGTTTGCCTTTTCTCAACTGACAAGACCTTGATTATTTCCTCGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCA:1 - chr3L 16830457 5' - R1A1-element 386 1 63.70 GAACGAGTAATGAGACTAATGATCAAATAACTCTATCTGTAATAGAGTTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 - chr3R 20909001 5' - I-element 5273 1 67.81 CACGAACACCATGTCCTTGAGCAGAGAGAAGTTCATCATTTCGGCGAATGTGTCGCGGGTCTCCTTGGAGCAAGTGATGCAGCCACAGCATTTGTTGACTTTTTGTTTAGATAAATTGAACATTTGTTCTTGATAACGTGTTACTA:1 - chrX 2204187 5' + Tc1-2 301 1 64.38 TACGAAATGAAAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chrX 9951323 5' + hobo 30 1 65.07 AGAGACCTTCGATGTTGTGCTTCTGTGAGTCGACAGACACTTCCGATGTTTCCCATTCTCCGAATTCTAAGAGTGACGATTATACTTTGAATATTAGAAGTGCACTGTATGTATTAAATATTAGTGTTACTAGGATCTAATTATGT:1 + chr2R 7329786 5' - Cr1a 4285 1 73.29 TGATCTGCTGTTGTTAGGTTTCTTATGCTGTGTGTTTTCATATTCGTTCTTTAAGACTTTTTGCACATACCCAGAATGCAATTTGCAATCAGTTTTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACAT:1 - chr3R 2216848 5' + invader2 4888 2 37.67 TAATAGATAACCAAATTCCAAGAAGTACTCACAATCTCAACATCTCCTAGCGGGTCTAGATATATTGCTGAGGTTTTATTTATTTTGTCTATAGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAAC:1 - chr3R 19448327 5' + blood 463 1 65.07 CGGCATTGTTTACGGCTCTGGATGTCGAAAATTGTTTGCCAACGAGGTGCCGCCTTAATTTGCCTGGGAAAACAATCTGAAAATTATTCTCCGCCGACCAATGTAACCGAGTAAGCCGCCCTCGCGGGGAGAGTGTAGTTGCACTT:1 + chr2L 6577986 5' - baggins 82 1 71.92 ATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr3R 22659927 5' - 412 7468 2 72.60 AAGGGAAATCAGTTAAATTGATACTGGGAGGTGATGAATAATTAATTTGACTTAAAAAAGTAGAACTATTTTAAAGAAATTAAAATACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 12608193 5' + roo 8697 2 44.52 CCTTCCCCCCTCCGCCCATGGGAATGCCTAATACGGGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCA:1 + chrX 3121992 5' - diver 138 2 74.66 AATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATA:1 + chr3R 14331167 5' + Burdock 61 2 66.44 CTGATAGCGGGAGCCGCACAAGAGACCTTCGATGTTGTGCTTCTGTGAGTCGACAGACACTTCCGATGTTTCCCATTCTCCGAATTCTAAGAGTGACGATTATACTTTATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTC:1 + chr2R 7329766 5' + Cr1a 4084 1 74.66 GTAGAGGATAAGCACTGACTTCGTGTTATTATTGCACTACGTGCCAGTAAATTCCCCGTGATCAGACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATG:1 - chr3L 24148697 5' + hopper 50 1 69.18 TTTATTATCTTATCCGCTTTCTGTTATTTCATATTTGCGCTTTAATGAATTTTAATGCTTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chrX 13061659 5' + mdg3 5267 2 74.66 GAAATTTTAAAATGAGAGGCTCTCTTCAATAAGCCCTCTCCTCTCACTATTTTCTTTTCGTTGACTGAAACTCCCCCTCAATATAATCGGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2L 8542846 5' - P-element 2855 1 60.27 ACCTTATTTAATTTTGGCATCAGATTTGGACTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 + chr3R 11461724 5' + 17.6 6943 1 75.17 ATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCA:1 - chr3R 934253 5' - Rt1b 4709 1 44.52 GGTCATATGTTGGCTGAAATCGCTGAAAAGTACAGCACTTGTGTTCCAGAAAATCCGAACTAAAATCGGTAATGTGAAACCAAGGACAATTCATTGTAATGTGCATGCCCATCTGTCTGTGTGAACGTCGAGATCTCAAGAACTAT:1 - chr3R 16793390 5' + INE-1 143 1 69.86 GATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 - chr2L 10832326 5' + Doc 81 1 71.92 ATTGGATTTGAATACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCAT:1 - chr3R 14088700 5' - 1360 3374 1 75.34 GTATCCGTTGAAAAGTTGTATCTTTAAGATAAGCTTAAGATAAGATAGGAGAAGAGAATATAAACTTCAAACAGGACATCATAGTTCAATAGAAAACATTATTTCATAAAACATTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGT:1 + chr3R 17776859 5' - jockey 4782 1 77.40 GATTGCATGATTTTACTTTTAGGTATTAACCAAATTCTTGTTAAGCAGGATTTAATGTAGGTCTTGTAAAAAATTTATTCAAACATGGGCAAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTTTTTAG:1 + chr3R 18767457 5' + Tc1-2 265 1 60.96 AGGTGGGATACAGGTGGACCGGCCACACTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGGTAAATATACATACAGAGGTGGGCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:1 - chr2R 5900974 5' - Bari1 1694 1 76.55 AATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 23099087 5' - roo 342 2 65.75 ACGGGCTCCATTTTCTTCTACTTTCAAATGTTGGGCTTAACATTTTTGTTGCAAAAAATGACTTAATTAACTATTATTTTTTTTCAGTGTCACGTTTTTCGTTTTAATTTTCTTTATCTTGCTATCATTATAAATATAAAAAAAAG:1 + chr2L 661164 5' + transib4 2575 1 61.64 CCTCGGGAAATCACCGTCTATGCAAGGGGAAAACCAGTTCGGTGATGACACTACTGACGCCACCATTGCACAATTCCACCAGTATCATCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCA:1 + chr3L 7893839 5' - P-element 84 1 58.90 AGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 + chr3L 13597752 5' + blood 64 2 64.08 AAATATTATTACTTGATCCCCACCGCCGAGCCACTCCAGTTTTTCCCCCATTCCCTCCCCGCCAGCTTTTTGAGTTGAAAGAGATTTCGGCAAATCTAACGGAATCGAAGGGCA:1 + chr3R 25645313 5' - diver 448 1 60.53 GGCATCGCACTGGCTGACTTCCTGCTATATCCATTTGTTGTCGTTACTAATATTGTTACTATTGTTGTTGCGCCTGTCAACACATGGCCAAAAGGATTAGCCCTCTCCCGGGGGAACCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAA:1 + chr2L 3609092 5' + 412 320 2 79.45 ATTTGTGGAGTCATATGGTATAAATGGCATTTATAACTTATATATAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAAC:1 + chrX 15227405 5' - flea 160 1 74.66 ACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACA:1 - chr3R 9289384 5' + HMS-Beagle 74 2 69.18 GTGCTGAATTGAGTCGCGAAATTCTTCAGGTGCACTGCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chrX 17469135 5' - blood 7367 2 69.86 CGCTAATGCGAGAAATAAGCGTTTAAAATCGTTTTCTGCTTCGAATATGTAAGTTGTTAATGACAATCAAAGGAATGGACATTTTCGAAATGTTGCGTAAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTT:1 - chr3L 14570156 5' - diver2 301 2 61.64 TGGGTAAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr2R 20913088 5' + 1360 38 1 59.59 TTAACTTGTAAACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr2R 14562071 5' + Burdock 6157 2 71.23 GCCGATTCTTGATGTGATAGTAAATGGCCAGTGAGACGCATTTGACCGTATTCTTAAGATTCGGCTGCGACACAGTGCTGTCGTCCAGATAGATCGTCGAGCATGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTG:1 + chr2L 11811837 5' - Stalker4 7282 4 72.03 CTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 - chr3L 14969271 5' - P-element 2795 1 19.86 GAGTTATATTCTGTGGGCCCGGTCTCTTTCACAGTCTTTCAGCCAGTTTCTGGCGCGCGATAATAATCTCAACTTGGTTTTGGTCGCGGACGGACAAATGGACAAATGGACAAGCGGACCGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTG:1 + chr3L 16489344 5' - 1360 3267 1 77.93 GCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr3L 3979548 5' - opus 7466 2 61.38 TGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACA:1 - chr3R 2689452 5' - diver2 4476 1 72.13 AAATATATATTGTATATAAATTCTTGGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAAACGTCTTCTAGCACAACTAGGCATATACGCATATACAACTACACATATACGCGTTCTCGTCTTATGTTGTCACTCACACAAGCAAGCAAATTCT:1 - chr3R 25873467 5' + 1360 3257 1 63.70 AATGCAAAGCACATGCACATGCATGGCGGGTTTTCATTTGAGAAAGTCACCCGAAAACGGAGACCTGAACTGCAGGGCACCTTCTCTCCATCGCTATAGAGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGGGGT:1 + chrX 15814466 5' + P-element 3 2 81.54 GGTAACCTATTGACGATTTATAGCCCGTTCACATATGATTCGCCTGTGATTCGCCTGTGTCAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chrX 14173307 5' - 412 433 2 58.90 AAATAATGTGTGAAATATTTGATTACAAATGCCAACCATATTTATATGCATAAACTTAATGAGGAATTGATTGCTAGTTTACATTTCACTTTTTATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 2873328 5' + roo 8688 2 56.85 ATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATACACCCATC:1 + chr2R 9326995 5' + mdg3 5334 2 80.14 CTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chr3R 10498798 5' + 297 60 2 60.27 ATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGC:1 - chrX 22824250 5' - Gypsy12A_LTR 2230 1 47.26 AGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:2 - chr3R 25876945 5' - mdg3 5419 2 69.18 TATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr2L 20984270 5' + blood 32 2 60.96 CGATCATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3R 22289470 5' + 412 7118 2 62.33 TATGGAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 4869286 5' + roo 28 2 64.38 GGGTTCCTAGTAAAATGCTTTCCTTTTTGCAGCCTCTATTTCCTTTTTTATATATGGATGTTGTTTGGTTATGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAG:1 + chr3L 20893442 5' - mdg1 291 2 54.11 ATTTCACAATCACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chr3R 10498786 5' + 297 6629 2 53.42 GAATCGTGCTAATTCAGATCAGTTGGGTAATTAGTTTCTCTTACCGATTAGATAATCATTACTAAAATATGCTACTAGATGGTGAAAAATAAATGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3L 21387386 5' - pogo 2076 1 68.49 GGTTCCATATCCAAGGCGTACGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTC:1 + chr2L 22643333 5' + invader4 2772 2 53.42 CACAGTCAATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 - chr2L 10832349 5' + Doc 58 1 56.16 TAGTCATTGCTGCAGAAGGGGTTAATAGTCGACCAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr3L 12863817 5' - Transpac 287 2 71.23 TATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 3762222 5' - roo 339 2 66.44 ATATTAATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTTAGAGGGTATACTAGATTCTTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTTCGACTATATAAAGTATATATTATATTCTGTCTGTCCATCTGTCCGTATGAACTTCGAG:1 + chrX 14317377 5' + INE-1 129 1 75.17 AACTAACACTCGGCGGGCGAACAGTTAAAACCATGATGAAATAACAAAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr2R 17100090 5' - P-element 2867 1 45.83 AAGTCCCAGAACTGAGTGCAGCAAAACGAACATCACTTGATTCTGATTAGCGTGCTGTCAAGCGTGAGAGCTGCATATACATATATCTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chr3R 31071711 5' + opus 7142 4 66.44 GGTCTTGAAAATGGGTTTTCAGGGAGGCATATTCATTAGCAATCGTACTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:2 + chr3R 21924223 5' + roo 8695 2 64.38 AGAGAAAAAAGAGAGCACAGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:1 + chrX 4589401 5' + Burdock 6180 2 55.17 GCATTGAAGAGTCTACACCGTTACCGAGGTGTAAAGGCGTCAAAGTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTC:1 - chr3L 25729986 5' - Quasimodo 7013 2 65.38 AGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATG:1 + chr3L 14854674 5' + rover 7011 2 63.70 CATTAGAACATTGAAAGATTTGAAAGTATGCAGCGAAATGTTAAAATTTAAATTTTAACTTGTCCACCCCAATCACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr2L 1136452 5' + 1360 12 1 76.03 GCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGGGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3R 15514597 5' + 412 43 2 62.04 TATATGTTTATGCACTGCGGAAAAACATTGGAAAATCATACAATCCATACAATATTTCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGATAAATA:1 + chrX 7794376 5' - Circe 6981 1 60.96 CGGAGACGCACTGTAGCGCATAATTAGCTCGATGAATAAAAACCAAAGAAAAACCAAAAACAAAAAAAAACAGCAAAATGAAGAAAACAATTGATAGAGCAAAGAAAAGAAAACCAAAACAAA:1 - chr2R 15075473 5' + mdg3 5104 1 75.61 AAACAAATTACATCATATTTTCTGGTTATATTTGCAAATACATATTTCGTTTTGTTTTATTGAATCGAATTGATATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTC:1 - chr2L 2274344 5' + 1360 3190 1 54.79 GAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 + chr3L 3540087 5' - mdg3 217 2 65.75 GGCGGCTCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2R 18250770 5' - hopper 149 105 86.67 GACTGGTTGACGACAAAACAGACAGCCACGTGTGGCCATAAAAAGTGGTGGTACACCGATTGTACGTTAGATGGTCGATTATATTCCGCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr2L 14796976 5' + I-element 30 1 63.70 CGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGAC:1 + chr2R 19076526 5' + F-element 225 1 56.85 AGTTTCCATCATCCCATCAAGCAAGCTATGGGGCTTTCTATTGGCAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 20905494 5' - pogo 2051 1 51.37 CAGATTCTCGACTCGCGATGCAGTGGCGTGTTTTTATTTTGGCTTATTTCTACAGTCATTTAGATAATTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chr3L 14546318 5' - copia 5072 2 54.79 GGCGGAAAAGGGGAGGCAGAGATAAACAGCATTTATATTCATGTACCAACAGCAAAACATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 14024184 5' + roo 8679 2 39.04 AGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:2 + chr3R 16194138 5' - mdg1 7381 2 69.86 GTAACTAATCAGCACAGGCAATGATATGGCGACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGG:1 - chr3R 11461904 5' - 17.6 7392 2 67.81 GTCAGACGTTGACCGCCTCTGCTCCTCCGAGGAACTGAAAAGCTGAAGAAGTGGAGAACTTGGGGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 + chr2R 15906246 5' + FB 58 1 57.53 AGACATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATC:2 - chrX 14815848 5' + INE-1 96 1 75.34 CATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 5446108 5' - roo 9008 2 64.75 AAAAAAAGGAGCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr2R 15062309 5' + blood 23 2 66.44 CATAGGCTGCCTTTGTGCTAACCTGTTTTTGTTTTGCCAACCAAAGTTGGCACATAAATAATGAAGCACGGGGCATCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGCAAAGTAGTTATAGTCGGATATGGTTT:1 - chr3L 13892602 5' - Ivk 364 1 55.88 CTCTGTGTAATTTGATTTTTATTTTTCTTAACAAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCA:1 + chr2R 5401680 5' - 1360 3306 1 76.71 TTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGCGTAC:1 - chr2R 969214 5' - mdg1 343 2 68.49 CAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chr3L 11669755 5' - Tabor 7287 2 56.16 AAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACT:1 + chr2R 10478687 5' - invader4 252 2 68.49 CCCTGCATTAGAAAGTTTTCTCGGATCTGTGGTGCATTCGGAATCACTTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCAT:1 + chr3R 28033602 5' - diver 6038 2 67.81 CCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2L 18581275 5' + roo 66 2 63.01 CAATGTCCAGCTAAAGTAATTTAAACTCGCCTGCCACATTTCTCGGTTTATTCTCCGCGGGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTAT:1 + chrX 18125117 5' + BS 5057 1 59.59 AAAATTATTGCCCCAGCTATGTGGGTGCTGCTGTGCGGCGGCTCTCTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTGTG:1 - chr3L 17298988 5' - gypsy3 417 1 79.31 GCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 + chr3R 3527090 5' + Tabor 80 2 69.86 GTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCA:1 - chr2R 6271494 5' + blood 209 2 78.42 TAGGATTTCCCTTTCACTTCTGCCAAAGTAAATACCTCATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:1 - chr3R 20137396 5' - Burdock 239 2 71.92 AGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCT:1 - chr2L 6074079 5' + BS 55 1 60.96 GCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 - chr3L 22221236 5' + 412 7114 2 58.90 AATCATTTCGATCACCATGCCTCTTATCATACCACAGCTCTGGTTTGAAGTGTGTGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCG:1 + chr2R 18058105 5' - mdg1 223 2 60.71 CATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chrX 2873453 5' - roo 9008 2 60.96 TAGCAATGTTCTGGCTGACTTTTCGTAGCAAAGGATCACCCTACTATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 + chr3R 27786522 5' - Tirant 8475 2 64.38 ACATAACCTACAAATCCGTGCCCAACTACAGGCACACCGACATTTGTACACCCGTCACTCGTAGAGGTAAAGGGTATACTAGACTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCG:1 - chr2R 5953897 5' + INE-1 30 1 64.41 AAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:2 - chr3L 17447548 5' + Tirant 56 2 63.50 GTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1 + chrX 22858864 5' + mdg3 5327 2 67.81 TATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chr3R 4913674 5' + 1360 34 1 62.33 AATTTGAAAATCTTATAAAATGTATTTTAATATAAAAAGGAATAGGAAACTATTTTTCAAATGAAGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 9669504 5' - roo 352 2 56.16 AGCGAAGACCACAGTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCC:1 - chr2R 14562301 5' - Burdock 6388 2 44.52 GGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 + chrX 10101315 5' + mdg3 5310 2 54.11 AGTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3L 14581344 5' - pogo 2073 1 66.44 AATGACGAGCGTGCTTATACGGTTCACCTGAGCTCGGGCATTGTCTAGGCAAATCCCATTTTATTTAATAGTTTTTGTATTTTTTATTATTATCAGAATTAGTAATAAGACATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCAC:1 - chr2R 20015219 5' + X-element 15 1 54.79 GCTTGCTTGCTCAGAAGGCAGCCGCAGACCTGTGGCACCTGCCACAAAGTACGAACCTCGTGCAGCAGCCTGCCCAAGACGTTAAACCGCTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTT:1 - chr3R 9519302 5' - transib2 2818 1 69.75 TTTATTGCTTTTTTCCGTTGAAACATATTTTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTAT:1 + chr2L 15142186 5' + BS 4711 1 78.77 GATTTCCCTTTCACTTCTGCCAAAGTAAATACCTCATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 - chr3R 20137393 5' - Burdock 6372 2 71.23 TTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCACATTGCTGACACAGCGTC:1 - chr3R 30731476 5' + gypsy6 7476 2 56.85 AGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chr3L 17447571 5' + Tirant 33 2 62.04 AAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chrX 13651593 5' + 297 6615 2 60.96 GCTGCAGATACGCCGCCAATTTCGCATGCAGCAAGGAGTTGCAGTTGTTCCATTTGCGTGGCGCATGTTGCACGTAGTCGTGTTGCCTGGAAAAGGATCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACGGA:1 + chr2R 15591281 5' - 1360 471 1 65.07 TTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chr3L 3979715 5' + opus 7024 2 71.23 AATGATTTTGTTGCTTAACAATCACCAAAACACACCTACTTCAGAAAGTGATTTTGAGATTTTAGGTATTTCTAAGTAATAAATTAAATTAAAAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:2 - chr3R 7649918 5' + Quasimodo 20 2 67.81 CATTGTATGTACTCTTTGCTCTTTGAAAAAAAAATTATAGGCCAAACACTTTCCCCACTGACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAA:1 + chr2L 14745730 5' - roo 8955 2 60.27 GTTGATTACTCATAAATCATAAGCGTAACATTTTTATAAAATAGAGCACATACTATATAGTAATTGAAAGTATAATACTGGGGGGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr3L 16764780 5' + I-element 39 1 57.53 GCCACGACTGTTCAAATTTGGACAACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 22429267 5' + roo 22 2 69.06 CTACTTGTCATGTAGACAAATACACATTCAGCGCTTTCTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGCGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chrX 7467906 5' - hopper 1379 1 60.96 CGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAAA:1 - chr3L 5498515 5' + Doc2-element 252 1 41.10 CAATTGCCAATTCAAATTCGTGCTAATGTGCTTTTGATATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGT:1 - chr3L 20747233 5' - Burdock 232 2 68.49 GTCGGTAAAAGAATACCCACTGTTATAGTGTGTTATCAGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGGTCACAG:1 + chr2R 21078375 5' + jockey 27 1 68.49 ATTTTGTTGGCATGGCTCTCCAATTTCTTTTAGTGCACCTCTCTTCGTTTTTGGGGCCATAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 15590560 5' - roo 9012 2 58.22 ATGGTAGCAATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCG:1 + chr3R 4913558 5' - 1360 127 1 54.79 ATTCTCTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 23623954 5' + roo 63 2 63.70 AATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 - chr3L 14043648 5' + Ivk 33 1 63.01 CGTTCCCACTCCCAAGTCCAAACCTGCGGATTTGTCACGCCTGATTATTTCATTAACTTTACGATCAAACTCCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr3R 21287331 5' + Doc 45 1 54.89 GAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1 - chr3R 29709048 5' - blood 7310 2 70.55 TGTGGGCTCAATCAATTGAAGATCCTCGCTATCCAAACGGATCAATATCAACATTGAAATTATTCAACTGGAAACCCCACACAAAAACAGAGAAGCGGCAAAGGAGTAGTTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACA:1 + chr3L 15807907 5' - pogo 1944 1 73.97 AAGAGAGCAGTTCCACATTCCTGCTGCAAACAACCAAGAACCCTTTTGCATCTCTAGCCCAAAATGGTTTCCGAATTTCAAATGCTGGTAACAACGAACACATGCCAAAATGGTATCCAATGATATTAAATATGAATGGAAGCCCG:1 + chr2L 1480248 5' + HB 477 1 69.86 TCTACCAAATATATATATATAAAAAAAAACAAAACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 11526920 5' + pogo 11 1 78.77 TGTGCCCATCGAGCTCCAGCAGGCGCAGATTGTCCGAATCCACGTCCGCCGAGGGAAAGTACAGAGCCTGGGTGAGTTGGGTCAACTGGCGCTCGTCCAGTTTCGCATGCTTCACATTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATT:1 - chr2R 20274915 5' + accord2 7300 1 78.08 AATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATATT:1 + chr3L 9242001 5' + roo 8736 2 70.55 AACATGCATTTTAATTGTAGACATTTAAGCTTGTAGATCGAAGTGCGAAAAACTGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGGACCATGGTGCCCCA:1 - chr2R 5360518 5' - Doc2-element 4455 1 63.70 TTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 - chr2R 22692462 5' + Ivk 32 1 62.33 GTGCGGGTGAAGAACGACCTCAAGGGCTTCCATCTGAACAACTTCGCGTATGTGGGCCCCATTGTCATGGGTTTCGGTGCACGATATGTATGAGATATGTGCAGATGGGTGGAGAGTTTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3L 868253 5' + P-element 2 2 52.74 GATTTGATTTATCCATTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATC:1 + chr3R 7884527 5' + jockey 4810 1 53.42 ACCTAACCAAATGCTAGTCGTCCTCTTCTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACAGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAACAC:1 - chr3R 4487455 5' - Tc1-2 420 1 47.95 GTGGAAGTGTTTGTGTGAATGTGTGTTTTACAAGATATGAAAGTATGCATTGGAATGGATAAGAGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTA:1 - chr3L 10506868 5' + S-element 34 2 45.89 ATGCCATGTGTGTGCCATGTCCACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 535395 5' - roo 9025 2 53.10 CTCCATTCCCAAGCAGGCGGCTGTCCTGAGCGAGGTCAAAACGCCCACTGTGAACGCCATGTAAGTTTATAGCACGAACTGGGGGGAATGGGTCTAACATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAAATAC:1 + chr3L 890116 5' - Circe 99 1 70.21 AATTCCGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 8022208 5' - roo 8992 2 73.10 CCTTCCTGCCTCCACCTCCATCGCCATCGCCATCTTCGCAAGAAACTCATCCATGTCCTTACCAGTATCCTGTCGTGACTGGTGTTGGTCCCCTGCTTTTCAAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCA:1 + chrX 6138832 5' - 412 7447 2 66.44 CGATCAGAAAAAGATAGTTTGAGAGAAGCATCGTCGAGTCGTGCGGAGCATCCAAATTAAACTGAATCGATAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCTAATTTTTATTCAATAATTTAAATGTATTTAAGCAAACA:1 - chrX 1046494 5' - Bari1 304 1 49.64 GGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr2L 12355373 5' + hobo 61 1 59.59 TATAAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGACAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGACTAAAATTAAATATCACTGTAAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCGGAGA:1 + chr2R 23638829 5' - Cr1a 4244 1 47.26 AAGCCACAACAGAAACGAATAAAACGCTGATCCGAAAACATAAATCGACCAATGGACGGTGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCAGTC:1 + chrX 10728773 5' - springer 366 2 71.92 GATAGCCAGATAGCCAGCTAGTTGTCCCATGTAGTCAGTCACTCAGTCAGGTCAGTTCGCGGTGTATCCATGGCAAGTGCATGGCGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAAATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr3R 24175649 5' - Burdock 6356 2 61.64 TTGGCTGGCGTTGTTTTGCATATGAAACAGCAAAATGAGTAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATACTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTA:1 - chrX 5892713 5' - transib2 418 1 71.23 CTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2L 12261158 5' + jockey 70 1 58.62 GTGCCCATTGCCCATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 15167647 5' + roo 51 2 57.53 AGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chrX 14692940 5' - Transpac 5165 2 65.07 CATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 21924331 5' - roo 324 2 76.71 AAAACATATATGTTTATTGATATGTAAACATTGTATTATCTTCATTATCTTTTGATTTCTTTACTCCCAACTGTCTTATACTTGAATGATCCTCACTTAACACATTTTAAACAATTTCCGCATCGTGTTGTTTGTTTTGGCTTCTT:1 - chr2R 11916714 5' + Rt1c 253 1 77.40 AAAATGCCAGGCCAAACTATTTAAATCAAAAACTTCTCAACGTCCAGCATCGGAAAAAGAGCTGTGGAATTTTCACACAGCGAGGGAAAAGCCAAGAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3L 14921342 5' + pogo 22 1 69.18 ACAATTTTTTTTTTTAATTATAAACTAATATGTGAGCCAACCACATTTATTAACAACTTATATTTCCACGTATCTGGTACTGAGTATATATATATATAGTAAAGTAACTATGCCTTTCTTATAATTCACTTATACAAAAGACCGAC:1 + chr3L 9938678 5' + Tom1 28 1 56.16 ATAAGGTGACTCAAGTGTGTGTTCCCCGTCAAAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGGCAGC:1 + chr2R 19168084 5' + opus 168 4 64.18 GTCCCAAAGCCTGCAATCCGCTGCCCGATTACTACACTGATTCCAAGCTACTGGCGTTGGCAGCGAAATACGGCAAGACACCAGCTCAAATCATCCTAAGATACTTGGTATAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chr3L 12500297 5' + FB 10 1 78.77 TGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr3R 8367179 5' + Doc 91 1 75.34 AGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chrX 3529742 5' + 412 70 2 65.07 TCTTACTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr2L 1229704 5' + opus 7166 4 58.62 TTATCAGCTCTGAGATGTGTACAAATCTCAGGGCCAACAGGGCAGCTGCACTGCTCAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGA:1 + chr3R 29538008 5' + mdg1 377 2 61.64 AATTCCATCCAGATAGGCAATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 - chr3R 10288913 5' + copia 47 2 50.68 AAGGATCGGGTGCCGGCACAAGAACAACATACGGCCGACAAAGTAACGACGCTCCGGCACGACACATGTACCCACGGCATATACACCCGTCTATCTAGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAA:1 + chr3R 11771650 5' - S-element 1694 1 70.55 AATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATGTTTAGATTTCGTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTCGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCA:2 - chr3L 14971176 5' + 1360 3343 1 78.77 GAGAGTCAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGT:1 + chrX 19498100 5' - P-element 2801 1 27.40 CTTCATTTCGAATTGGCACCGGAATAAGCCTGAACAATTTGGATGGATGCCTGCTAAACAGAGGCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAG:1 - chr3R 19449148 5' + roo 8895 2 56.16 ATGTTATGTGGTTTACTTTTTCTTTTATTCGTCGCCGAATTATGCAGCAACCGCTAGAGGCATTATGTGGACTTATGTTCATATATTTATATCATTTATGTTATACGTATATATGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAA:1 + chr2L 21703453 5' + mdg3 5057 1 76.03 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCACACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAATTTCAACGAAGATCGCCAATAC:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 146 2 59.23 CGCTGGGCACACGCGTCAATGACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTAGAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chr3R 25876816 5' + mdg3 16 2 74.66 CGATCTCACCGTTTCTCTCTCTTTCCATATAGCACCCGTCTATAACTTTTACCGCTGCCGCTCCCGCCGTCTGGTTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr2R 17100172 5' + P-element 44 1 54.11 AAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCT:1 + chr2R 19076554 5' + F-element 255 1 77.40 CTGAGTAAGTTTGTAGACTTGTGTTTTTAGCATAAATTTCTGTTTAAATAAGGAAAGCAACCTGTGACGTGTGGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr2L 19816705 5' - pogo 2054 1 52.05 TGTGTTGCCTACTTTTGGGCGGCGGACCCGTTTACGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 14006050 5' - hobo 2921 1 52.63 GCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 8397175 5' - roo 8985 2 76.71 CAATACTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAGCTACTCTTAAGCTTTCTAACCGAGCTGAATCCCGATATTTCCAATATGGAACAATAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTA:1 - chr2L 9788377 5' + hopper 426 1 54.11 GAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 + chrX 16244876 5' + jockey 4808 1 49.32 TATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 - chr3L 20747194 5' - Burdock 194 2 67.81 ATCAAAACATTTTCGTGTTATTTCTGTGTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTT:1 + chrX 10119536 5' - FB 23 1 68.52 GGTCGGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2L 2690567 5' + hobo 39 1 54.20 CGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chrX 10978973 5' + roo 54 2 57.53 AGGATGTCCATGTCTGGCCGGATTTGCATGGCAATCGGTCGCCCGTCGCAGATCCCACGCTGCGAGGAGTGGGAAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCTAGTACTTTGCGCAATGC:1 - chr3L 4023739 5' - pogo 2080 1 62.60 TAATTAATTCTTAAATTTCTTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3L 9571597 5' + jockey 16 1 77.40 CTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 - chrX 21213370 5' + Doc 85 1 71.23 AATGTGGCGTTGCCAAAAGGTGTTTATACTGATAGAAATTGACAAGATAAGTAACGCTCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGTTTAATTTGCTCTCTGTCCGCTTGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAA:1 - chr3L 24537016 5' - 1360 3289 1 71.92 CAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 + chr3L 21630317 5' + Burdock 6198 2 61.64 TCTTACTCGTGAGATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACA:2 - chr3L 21820059 5' + Juan 52 1 52.74 AGCAACGACAGGCGTCGGGACAGCAAGGATCGACTGGACTCGAGGTCTAGGGATGCGGAGAGAGCCGGACAGGAACGAAAGCGTTCTAGGGACAGTAACATGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAGGCTTGTTTACATTTAACA:1 + chr2L 19047483 5' - HeT-A 5826 1 63.70 ATAACTGATTGATGGATAGGTATTCATATACAGTATTTCATACATTTGGTAATGATTTCAAAAGCATGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCT:1 + chrX 6982455 5' + accord 7119 2 54.79 CCCCTTAATCGTATAGTAAAAGACTATACTAGATTCGATGAAAAGTATGTACCAGGTAGAAGGATGAGTGAGTATTCGGACTCTTGTTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 21754799 5' + roo 34 2 41.78 GGAGACCAAGCGCCATCGAACGCCCAGCAACAACTAACCCGTAAAGTCACTGGAATAATATGAATGCGGTTTGAACGTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chr3L 13922263 5' - Tirant 358 2 56.16 CTTTGCCTTAATTGTGAGCCATAAATGATAATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCGAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr3L 18468313 5' + jockey 4694 1 64.38 GCTCGGTGAATATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:2 + chr3R 24809862 5' + 1360 33 1 63.70 AAATTATACACTTATACTAAATATTAAGTTATTATTTTGCATAGTATTCCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 - chrX 18149882 5' + hobo 71 1 66.44 ATATACTTCGAATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTG:1 + chr3L 19146599 5' + pogo 93 1 58.22 AAAAAGGCCTAAAAGGGTTGCTCTTATTGTTATCGAAGCGAGTGGATGGTGTACGGCTCCATTGAATTATGTGCACAACATGAAAACATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1 - chr2R 14702058 5' - Quasimodo 6978 2 60.27 GAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 + chr3R 22659904 5' - 412 438 2 56.85 CCGACTTCGAGTCGGGCGTTTACATTGTTAACGAAAGGCACAACCAGCACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGTC:1 + chr3L 6630333 5' + jockey 4705 1 52.29 AATTTCTCCTAGACTGCAAATGACTGCGAGTTAATGGCAGGTGGGCATGCGATGGCTTCGGGGAAATTCCATTCTGACAGAAGTTAAAGGGTTCTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCT:1 - chr3R 31336880 5' + P-element 229 1 63.01 ATTGTTTGCCCAGCATTCCCATTCACACTTAATGTCAGTAATTATATTCGTGGCCCACGCATTGATTATTGCATTCCAATTAAAATAATTAAGATTTT:1 + chr2R 17983578 5' + TLD2_LTR 100 1 72.45 ATCTAAGCATATACAGAGACATATACAGATATACACAAAAATACAATTACAGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCA:1 + chr3R 14165542 5' - Tabor 398 2 64.83 AAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGTTTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGCCGTTTTTATCGTGCTCTG:1 + chr3L 19397008 5' + F-element 33 1 57.72 TACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 - chr3R 26765197 5' - mdg3 5447 2 54.11 ATATATGTATATATAAAGACATAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 23431798 5' + roo 75 2 71.23 GACGTGACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCATG:1 - chrX 7293307 5' + 1360 66 1 63.01 CTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2R 15080023 5' + roo 8738 2 69.86 CAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGT:1 + chr3L 16180894 5' - Transpac 5149 2 73.29 CGTCGATTGAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr3L 22635799 5' - hopper 1378 1 59.59 GCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2R 16383364 5' - roo 338 2 67.81 CATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTTT:1 + chrX 292430 5' - G3 4504 1 67.81 AGGGGTATCTGATAGTCACGACACTAATCTACATCGTGCTTTTTTGTTTATAATAGATAAAGATGGAAACCGTAGATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTA:1 - chrX 18105310 5' + Cr1a 497 1 63.01 ATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chrX 18366043 5' + jockey 78 1 74.02 AAAGTTATCTCTACACTATCCTACAGTTTGCTGCGGGTTTTCTCGCAAGATCACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2L 13884566 5' + pogo 50 1 53.42 CATATGTGGCATATTACATATTTTTCAGCGCTTATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 18581347 5' - roo 323 2 77.40 GATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 - chr3R 8402669 5' - mdg1 7449 2 73.98 AGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr2L 15621983 5' + hobo 22 1 67.12 AATTGTTAATAATAAATGCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3R 15590094 5' - Transpac 5202 2 67.81 CGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGT:1 + chr3R 24228893 5' + opus 198 2 78.08 GTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:1 - chr3L 16180976 5' + Transpac 62 2 60.27 AAGTGGGTGGTGGTTTTGGGTAGCTTGGGTGTTTGGTTGGCTGGGTGGTGCAGACCATACATGACGGCGTGTAATGCAGCTGCTGCTGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACAC:1 - chr3L 5490992 5' - 412 7540 2 72.60 GTCACCTGGTCTGGAAATTAAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr3R 12578099 5' + jockey 4693 1 67.14 AAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 18846598 5' - roo 9008 2 65.07 GCATTCCTCCGCTCGTCCTCGCCGTAGTCAATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCT:1 - chr2L 18163838 5' + HMS-Beagle 6875 2 73.79 AAATGAAAGTTCACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 21420998 5' - roo 9045 1 67.12 TTGGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAATGTATGTATGTAAAAATGTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTA:1 - chr3L 10714401 5' - Stalker4 7041 4 65.07 GAATCAGAATCCAATCCAACTGTGTCAGCTGCGACTTGCTTTGTTTACAAACAAATAAGGCAAAGAAGAGAAATGCAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 - chr3L 8067620 5' - copia 5080 2 55.48 AGGACATGATTTTCAGAGGAGCCATTTGAATGGGTAGCCTTGTTCCGAGTTGAAAGCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3R 15514466 5' - 412 482 2 74.66 CCAGTAATCTGAAAGCAATCATTTCCCATTTCAATAATAAAAAGAAGATCTATTTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr3L 4023620 5' + pogo 63 1 60.96 CTTAAGGTCTGAAGAGTACGTAATACTTTCAATTTGACTGTTGTTAGGAGGGCTGATTCACAATTTTCATCTTAATCTGGGCAGATTCGTTTTTATAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAAACAAAT:1 - chr3L 10676708 5' + Idefix 7255 2 65.07 CTGCTCCTCTGCCCCAAATGTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr2R 22867504 5' + hobo 65 1 65.25 GTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chrX 7293285 5' + 1360 81 1 78.42 AATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2R 15080006 5' + roo 57 2 58.22 TTCAAATGCTACGCATTTTATCTATCTCGTTTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chrX 983069 5' - 412 484 2 78.77 ATTCTGTACCAACTGCAATAGCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2R 9164812 5' - 412 456 2 59.59 GTAATGTATATAAACTAGATATTTACATACGCAAAATATTACTTTCCAAATGATAACTAGTAAATAAAATTAAACTTCAAGCATGCAAGCGATTCAAATGAGACAAATACATAACTATGAGGTATGTATGTACATATGTACACATA:1 - chr3R 25602328 5' + invader3 5087 1 79.45 TTTCGAGCTGGACTAATTAATATTACGTGCCTCAGTTCGGTGTGTAAAAGGGCCAATGCAAAGCGTGCTCTGAATAGAACTATTAATGTGTGCATACATACATATGTATTCTCGATATTGCGCATCCACTCAAGCCGTAACCAAAA:1 - chr3L 21097436 5' + Tom1 110 1 73.97 CGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3R 7424539 5' - 412 7484 2 60.42 ATATAACCGTTCTTATAAAAGATAGTTTAGTTTCCTGAAATAGTCTATTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr2R 9332215 5' + roo 69 2 66.44 ATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGA:1 + chr3R 27786567 5' - Tirant 8430 2 71.92 GCCAACAACCAGCAACAGTCGACCAGTGAAATTATGAACTCCGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 - chr3R 22810821 5' + flea 27 2 67.12 TTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGCCAGCAGGCGACTCGGG:1 - chr2R 18048899 5' + opus 7070 4 69.86 GCGGAAGAGGTGCATATGGGTGCGTTTTTATGGACAACAAGGCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 + chr2L 10089705 5' - 297 363 2 67.81 TATTCAAAATCCAGTCAATAATACGAAACTTACGCTGGGGGAGGCATGTAGACCC:1 - chrX 12558450 5' + Transpac 4912 1 49.09 GGTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3L 22221270 5' + 412 27 2 67.12 GTTAAAGGCAATGAATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr2R 9164974 5' + 412 7077 2 67.81 AGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:2 + chrX 12843609 5' + roo 86 2 78.77 TCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 - chr3R 25521874 5' + blood 7092 2 71.92 ACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 - chr2L 14969952 5' + Tirant 73 2 72.31 TTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 - chr2R 14884349 5' + mdg3 54 2 60.96 AAGGTTAGGTTCTCCTAAAGGAAAGAATATTCCTGTCAAATGATTGCGATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTT:1 - chr3L 14603202 5' - jockey 4999 1 56.16 TATGTCAGTTATTATATTAAAACATTATCATATGGTTAACAAATTAAAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 13849783 5' + roo 8673 2 75.34 ATTTAGTTAAGAAAAATAAAAGTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGG:1 + chr2R 7727062 5' + BS 4658 1 80.82 AATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGAT:1 + chr3L 19146609 5' + pogo 103 1 65.07 ATAGCCACGACGACGCACAAGATTAATCAGCTGGCTAACACACACACACACACACA:1 + chr2L 14303826 5' + Quasimodo 36 2 91.07 AAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATCTCGGCACTCGC:1 + chr3L 3979540 5' - opus 7479 2 69.29 TGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chr2R 10367481 5' + 412 7123 2 63.01 AAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr3R 4464171 5' - 1360 3337 1 69.09 TATTTATTTCGATGCCCGACTACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 13543976 5' + 1360 7 2 52.05 CTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAA:1 - chr2R 12703837 5' - blood 7303 2 76.71 AGCTGCCTCCGTTTTTATTGTCTCACTCGCGTGATAAACATCTGGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAGAGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr3R 29350816 5' + 297 39 2 54.11 TCGGGACATTATTCGTAAGTAAAACGCTAAGCATTAGCAGTGGTACAATAAACAACAATCAAACATTTCCCTAATCGATTTTGAGTCATTTTAGTAGGAAAGGGGTACTTGTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTC:1 + chr3R 17777692 5' - jockey 4746 1 72.60 CGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCC:1 + chr2L 13877698 5' - Transpac 222 2 77.40 TCAATATTTATATTAAAGCCTGTTTCAAAGCTTCCATCGTTCCGAATCAAAGCAATTGCACAGACTTCTGTCTGTGTTCTGTCTTCTGTCCACTCTGGTCACACTGCAACTGTTGCACGGCTGCAAATCGCAAAGCAAAATAAAAT:1 + chr2R 24037844 5' + HMS-Beagle2 382 1 45.21 ATTTACCTTTTGGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr2L 10937852 5' - mdg1 7383 2 69.18 GTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chrX 15089512 5' - P-element 2806 1 30.14 GAGAGACAGCAGCCCGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGA:1 + chrX 18707430 5' + BS 4742 1 64.38 ATATTCAAGGCAATAGAACCGCAATTCACAAAGGCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACA:1 - chr2R 20382614 5' + Bari1 36 1 61.64 ATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 17069523 5' + 412 40 2 58.90 AGGCCTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGGATCAAATCAGAACATTG:1 + chr3R 3527042 5' + Tabor 6867 2 68.31 TGCCTGGGGCAATTGGGCAACGCATTATGTCGTAGATTACGGCCTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 + chr3R 12537729 5' + Doc 77 1 68.49 GAGCTTGGCCATTAGCATAACGCTGAAAAGTATGCTACGTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3R 26399938 5' + roo 9 2 77.62 TGCGCTTTTTAATAGCTGATTAATCAATTTGCAAAAAAAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 - chrX 10960339 5' - Transpac 291 2 65.07 TGAGAGCCACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2R 16410143 5' + opus 30 4 65.07 AAAGAAAACTGGAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 + chr2R 7097911 5' + copia 28 2 66.44 AGTTCAAAGTCATTGATTCGCCCACGTTGTATAGCTTAGCTGGCGATCTCTCCAACATAACAACGTGCAGGTGAGTGAAATATATGGAATAATTTCAGGAATTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTT:1 - chr3R 19636088 5' - Rt1b 4904 1 72.54 GCAACGGCTTGTTGCAAGGACGACAGCCAGGATATTTGCACAGGCTCCTAGGTAACCCGGTTAACCCTTCTCGCTGCCGTTTGGCATATGTAAATTATGACAGTGCCAAGTCAGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr2R 15642712 5' - roo 9008 2 78.08 CATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTT:1 + chrX 18034628 5' + Juan 76 1 63.01 ATGCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTG:1 - chr3R 28033686 5' + diver 5952 2 59.59 TCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 - chr3L 3979651 5' + opus 68 4 75.19 AGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTT:1 - chr2L 3734598 5' + mdg3 5284 2 45.89 GGAAGTTCCGGAACAGATAACTTACTTGAATTGTAAGTTTTCTTTTAATTATTGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 23449373 5' + roo 34 2 62.33 AATTTAATATTTCAATAATACCGGATTACACTTGCCAAACATCAAGTTCAATTTCAGGCTAAAATAAATGGAAATGGAAGTGGAAGTCAGTGTGGAAACGGAATGAATTTTCTTCGGCCCCCTCGCACAAAGTATTCCCAAAGACA:1 - chr3L 9182889 5' + looper1 1390 1 58.90 GCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGT:1 - chr2L 11867373 5' - BS 4968 1 58.22 CTAGCAGATATCTGAAATCTGAATCGATCCCAAAATGACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 - chr2L 1074051 5' - Tirant 8483 2 67.81 ACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 25822991 5' - roo 323 2 78.08 CGTTTTGTTGCAAAAGTAAAGTACGGAAATATAAGCGCAAATAGTAATTGCGATAAATAGTGAATAGTGAATAGTGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAA:1 + chr2R 4582640 5' + 1360 3139 1 58.22 GCGGAGGAGCAACACCACCGAATCCCAGAACCCCACGGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATA:1 + chr3R 11094131 5' - copia 4930 2 80.14 ACGATGTAGAACACAGCTGGCTCCCTAAAGAACAATTATTTTGTTATTTCCTCCTTGGGGTTTCAAAGGAACACAACAAGATGGAATGCTATAGTCGAAATCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAC:1 + chr3R 4413757 5' - INE-1 530 1 54.11 CAACCAGCACCGATACTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 24693531 5' - hobo 2909 1 66.44 AAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 4722377 5' + roo 15 2 63.11 AAAAAGCTTTCTCCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATTCCTCGAT:1 + chr3L 15035081 5' - pogo 2074 1 67.12 AGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 + chr3L 20747108 5' + Burdock 6212 2 72.60 CCTCGTTCGATCCTAAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 - chr3R 9983130 5' + HMS-Beagle 6827 2 64.38 CTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 - chrX 12558332 5' - Transpac 5162 2 63.70 TGATATAAAAAGGAAGGCGATCTATTATCCCAATCAGTTCTGGTCTTGCCATCCATCGAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 + chr3R 12375685 5' - copia 194 2 59.31 GGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGA:1 - chr2R 10478749 5' + invader4 88 2 73.97 CCCCCCATGACCCCGGACCAGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr3L 17447590 5' + Tirant 20 2 72.73 ACATTCCCCACCCAAAAGCGATGGGGCAAGTCGAGAATATCCGAGAGCTGTTTGTGTCCTGTCGAGTTGAGTTGCGTTGTGTTCGACAAGAGAGAGATGACAATGGGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGA:1 - chr2R 13102533 5' + invader4 198 2 61.64 GTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAAC:1 + chr3R 25384208 5' + mdg3 88 2 77.40 CAATCAACGGACAAAAGTTGATTTCGCAATTCGCCATAGCCACAGCCATTCGCCATTTGCAATTCGCAGCTCGCATCTTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chrX 14448026 5' + HMS-Beagle 39 2 57.53 TCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 14705758 5' - roo 9013 2 60.00 ATTTTATTCCTGTTCATATTAGGTTAGATTGTTAGATACAAAATTTATATAAATGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 13843792 5' - roo 344 2 64.83 TAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr3L 13227696 5' + hobo 73 1 66.44 TTCCCATCCACATCCATCCGCCGCCTCTGTCTTTGCTTATGTGTTTTGTCATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 9709978 5' - pogo 2033 1 67.13 AGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chr3R 14088526 5' + 1360 32 1 64.38 GAGCGTTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2R 7534586 5' - roo 348 2 58.22 AATATTGAGGGCAATAAAACCGGTCAAGAGCATCGTAATAAAACTCAAACAAGAAGGCATTGGATGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 + chr3L 16535159 5' - copia 5067 2 58.22 GTGGATGGAGCTAGCGGAATAGCAGCGGCTGGAGGATCGGGCCTGAAGCCACCCAAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1 + chrX 11331662 5' - roo 8968 2 62.33 ATTGGCTTAGTAATCCATCAAAGCGATCTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 52901 5' + roo 8681 2 40.41 GGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGGTGAAGGGTGAACTCCTCAGTT:1 - chr3L 14863904 5' - Transpac 5135 2 76.03 ATATAGATAGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr3R 20292571 5' + pogo 13 1 76.39 ACAATATAGGCAACTTGGGATGCCGGCTGATTCGCAATTCCCAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 15920215 5' + jockey 30 1 68.49 GGATGCTATGGGGGCAGCGTGTATCGTCCACTAAGTTAAGGAAATGCTTTTCTTGCGACCATCTTTGCCGACCACTGACTCCACTGTTCCTTCTAACCACTCCAGTTTTAGGATTTTTGTTGACTTTTTCATCAATTTATTAGTCT:1 + chr3L 23536282 5' + INE-1 403 1 71.92 CAAAAATACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGT:1 - chrX 8626289 5' - Burdock 182 2 71.92 TATTGCAAACTGACTTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3L 14581484 5' + pogo 17 1 63.81 AAATTTATCAACTATACTTCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGTGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chrX 3529863 5' - 412 461 2 62.33 TTGCCTACTTTCGGGCGTCCCAAGGAAAGGGCCATCATTCTCACACTTTGCAATTAGTGTCAGTCCAGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTG:1 + chr2R 13078795 5' + BS 4713 1 53.79 CGGGCCGCAAATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGCTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1 + chr2L 20561405 5' - P-element 2810 1 34.25 CTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTATC:2 - chr3L 13204773 5' + jockey 96 1 78.08 AGCGAAACGAAAATGAGAGAAGGAAAGTAAATAAAAATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 26316003 5' + roo 50 2 52.74 TATGAGCTTTCTGAGAGAGCATGTTACAATAGATCAACTAGTAAACAACATATACATGTTCGAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 9242120 5' - roo 400 1 63.01 AGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:1 + chrX 21639611 5' - Tirant 8451 2 56.85 AGATCTAAGGACATTTGCACGTTTCACTGTACTTTGGCATTCCTGTACAACGATTGATATTAACTTCTTATCGAAGGCTATTATCGTGATTAAAATGTTGCAAGCTTTCATTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 18932178 5' - Doc 4596 1 71.92 CACTTGACGATGCAGTCGAAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 22529708 5' - roo 9041 1 64.14 AGTCATATTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGT:1 - chr2R 5022804 5' - Gypsy12A_LTR 107 1 70.55 GTCAATGTGCAGCAGCTCCGAGGCTGCATTGGCCGCCGGCATCAGTTCGTTGGTGAATCCATGCGCATTGGCGGTATGCATGTGATGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGCTCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCA:1 + chr3R 5490949 5' - Stalker4 300 4 58.22 TTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCT:1 - chr2R 18048891 5' + opus 75 4 76.71 CAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCTAAGCT:1 - chr2R 5022760 5' - Gypsy12A_LTR 63 1 60.27 GATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr2L 14969969 5' + Tirant 8150 2 54.70 GTTTTGGTTAAAACAAAAATTTTACGCCTCGCAATTTGAGGAATTTCGGGAAAGGGTCTCGCAACTCGTTCGCGGCTGGGCACCTGATGCAGGTATGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACAT:1 - chr3R 16865048 5' + Doc2-element 4348 1 65.07 AATTAGGAAATGCCTTGATATTAACAACAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chrX 10960175 5' + Transpac 4955 2 59.59 TGCTAGACATACAAATACGGATACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3R 9993419 5' + hobo 47 1 76.04 AAAAATGGTAATTTCGAGCACAGAATGAAATCCAGCCGCAACTGCCCAACTAAGAGTATATATAAATCCGAAATTGGTTAGAGGAAAAAATTAAAAAACAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3R 18903546 5' + pogo 10 1 78.77 CACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAATT:1 - chr2R 2879460 5' - Stalker 76 4 61.97 GTTCGACAGGGTTACCCCGGGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 19700848 5' - roo 9034 1 59.59 AAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chrX 13651564 5' + 297 61 2 62.33 TACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGA:1 - chrX 21667939 5' + gypsy2 6555 2 68.49 ATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACGGGAA:1 + chr3R 31907343 5' + Tirant 59 2 62.96 TTGGCTGTACGCTAATTGTTCATATTCTTTTTGTTCATTACCTGCGTTCTGGTCATTGCTACTAGTTGTAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTT:1 + chr3L 25190053 5' + 1360 126 1 76.03 AGTTGTGGCCAGAATATGCAAGAAATATTGAGGGCAATAAAACCGGTCAAGAGCATCGTAATAAAACTCAAACAAGAAGGCATTGGATGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr3L 16535136 5' - copia 221 1 60.27 AACTTAATGCTCATATGTACATACATATTTACATATTTAAAAAAAATGAATTCGTAATTATTATTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGTCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGA:1 - chr3R 21589088 5' + flea 53 2 57.93 CGCATCCTGAACGCATATTTACACGCCGCGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr2L 10650341 5' + Doc 57 1 56.85 GCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2R 18048779 5' - opus 461 2 58.90 GGGTGAAGTAGTAAACTTTTAAAAGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:2 - chr3R 9258812 5' + 1360 20 1 71.92 ATATCTCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 - chrX 9951424 5' - hobo 2883 1 69.03 TGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 22529732 5' - roo 352 2 57.53 AATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 - chr3R 5087124 5' + P-element 32 1 60.45 AATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2L 15965326 5' + blood 7054 2 56.16 TTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCTCATCGCG:1 - chr2L 15833074 5' + hobo 66 1 66.67 CAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATACCCTAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACTCTTAAATTCAGTGCACGTCTGTTTGT:1 - chr2L 2357339 5' + P-element 62 1 24.77 TTGTCTTAAATATAATGTCCTTCAAATTAACTATAAAAGCAAAAGTATGTACAAAGTTGAGATCCATTCAAAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 13313097 5' - roo 393 1 74.66 AAATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439060 5' - P-element 2495 1 60.27 GTGAGCATTGAACGGATTCCCGCCTTTGTGCTGCGGGGGGAATCCGTTCAATGCTCACCATAAATATTTACGTATAATTGAAAATTAAATTAAAATTAAA:1 - chr3R 23614161 5' - Rt1b 121 1 75.00 CATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAGCCATCACAAAC:1 + chrX 14962217 5' + jockey 72 1 64.39 TTTTTTTTTTTCATTAATGCCGGAATAAGTTTATTGCGTGGCTGGGAGGTCGTTGCGGGTCAGCCGGCTTGGACTGCATACTGGGTTTAGTTTTCTTGCGAGGGGTTT:1 - chr2L 15492975 5' - Doc 4499 1 81.48 GCCTTAAGTCCGAAAATCCCCTAATCAGCCGGATTACTCACCTTTCGTAGAGACATGCCGAGTCGGCACCAGCGCAAAATCAATAGATACGACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGC:1 + chr3R 5185328 5' + R2-element 3134 1 51.49 AGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAAC:1 + chrX 19231745 5' - mdg3 5434 2 61.54 CCTTTAAAAAAGTATAAAAACAATCCAAGGAATCAGACAAACAAATTAATGAGCCAGAGCAATTAATGATATCACCACAATTCTTGGCTGGCTGCGTATTTCGGGAGGGCCTCGCTCTTGGAATCTTAAGATTA:1 + chrX 13245400 5' - 297 6770 2 72.39 AAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 - chr3R 21150636 5' + Burdock 76 2 74.66 ACGAGATGTGTATGGTGATGACGCCTTAAAAGGAAGACAGTGTCCAAATTGGTTTCTCAAATTCCGTTCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGAGTGGGATCTGGGGGAGAAGTGGGTTTCGGCTAC:1 + chr2R 6491070 5' - G6 1710 1 53.42 CTGTATCTATCGTAGTTATAGCTAACTTGAATATTCTGATATATATAGAGCGGTAGGATATTGTTGATTAGATTAAATAACTCACAAAAATCGTTAACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAAC:1 + chr2R 6039756 5' + micropia 70 2 66.44 ATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:2 + chr3R 22846673 5' + 412 31 2 65.07 ATTGCAAACTGACTTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3L 14581483 5' + pogo 17 1 63.46 ACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr2L 4416058 5' + jockey 82 1 66.90 CCACAGTTTTCCTTGCCTTTTCTCCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGC:1 + chr2L 17198028 5' + R1A1-element 5027 1 63.64 AGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTGTGTTA:1 + chr3R 21924277 5' + roo 85 2 76.71 ACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 14898835 5' + jockey 28 1 69.86 AAAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 + chr3L 20747057 5' + Burdock 25 2 68.49 AATTACATATTTCGAGCAGCAAAAACAAAGTGTTTGCAGCGACAAAAAAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAAT:1 + chr3R 23346494 5' - Rt1a 5058 1 81.51 AGTGCATAGGGACAGAGGGCTGGGAATGAGATTGCAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGTTAAACACTCG:1 + chr2R 22867391 5' - hobo 2908 1 60.71 TATGGCAGGGAAGGGGCGCAGATAGAGTCAGATGCCGGAGAGACGAAGGCTTGGAGCTCTGATTGCCCAATGGGCCATATAACACACGACTATCTACTGTAGCTGCACCAGGGCAAAATATTGACACCATTCAGCGAGCACAATCA:1 + chr3L 3644341 5' + F-element 4315 1 78.08 GAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1 - chrX 13762611 5' + P-element 93 1 18.57 ACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr3R 24228994 5' - opus 7463 2 59.59 AGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTATGAGCAATACATTTTTACACTCTCAATTTAACGGTTCTTTTTGTTTTTAGGCACT:1 - chrX 16361573 5' + Tc1 160 1 47.26 GCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2R 19900966 5' - mdg1 369 2 52.74 CCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAGTAAAG:1 + chr3L 2037027 5' + Doc 89 1 75.34 CGTCTCGCTGGCTGCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 10973155 5' + jockey 23 1 73.97 CGAGTCATTTGAAATTTGCACAAATGAAAATTGTGGCAGTAAATTGAATACCGATCGAGAGATGTGTGTCAATCTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 13114195 5' + roo 8665 2 50.68 GTCGCAGTCGCCGTCGCTGCCGCAGTTCGAGTTGGAGTTGCAACAACCGCAACCGCGAAGGAGCGTGGATGAAAAGGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAAGCGAGAGTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chrX 9201861 5' + Tirant 8115 2 77.54 CGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCA:1 - chr3R 31071839 5' - opus 7419 2 76.71 TCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1 + chr3R 15465462 5' + mdg3 46 2 53.42 GCTGGTGATAGCGCCAACCTGGAACAACACAGTGTATTAGAAGAAGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2R 22892701 5' + pogo 51 1 66.13 ATGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGT:1 - chr3R 19449453 5' + roo 8646 1 57.53 TTTTGTTATTTTTTTTTATTACCCAATTTGCAAGTATAAAAAAAAAACTAGTGTCGAAATCATAATGCAAATTATTTAATTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 + chr3R 21191980 5' - Juan 4175 1 56.12 GATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCTGGTGCTACTCGC:1 - chr3L 13227675 5' + hobo 53 1 71.43 AGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 - chrX 21213417 5' + Doc 38 1 56.85 ATTCAAACATCATGTTGGCAAAACACTCCCCAAAGCTTGTTGGGCAACAGTGTTTTGTCTGCGGGCTTAACTACTGGCTGTAACTATTTTTATAACCTCCTATAATGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATT:1 - chr2L 7119200 5' - I-element 101 1 71.92 GGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr2L 12261159 5' + jockey 61 1 56.30 AGCTGAACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 22255298 5' - roo 9035 1 61.64 ACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCT:1 + chrX 18707472 5' + BS 4784 1 63.70 TGCTGGCTAATGGATATTGGCTTCGAACGCACTCGGAGAAAAGTCCCTTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACATAA:1 + chr3R 26765059 5' + mdg3 5286 2 60.27 ATAAATAAGAACCATATTAAATAATAAGAACACCACACTTACCCTCATTTCGAAGAATGGCCCCCGAATTTTTGGCTCCACTGTAACTCGTAAAGTAAAGGGGTATACTAGATTCCTTAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGG:1 + chr2R 3526654 5' + INE-1 29 1 68.49 AATGATAGTGCAAATAGGAATACCAATATCGTGTGTGCCAATAAAATGGCACTGTCTGTTTGTCAGAAGAATCCAAATTGAAAGCATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chrX 11814949 5' + flea 4787 2 64.58 TAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3L 4869244 5' + roo 8733 2 67.59 GTGCCTTTTTTGTGTTTTGGTTTTACTATATGACTTTTTATTTGCACCGAATGCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1 + chr3L 15321911 5' - Transpac 5220 2 79.86 AATTTGTTGCTACTTAATTAGTCATCTTTAACTGTTAAATTGGTAAAATTTAAACTACTTACATGAACTTACTAACGAACTTAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3R 13494310 5' + opus 7037 4 43.84 GAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chrX 14962166 5' + jockey 32 1 66.67 CATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTG:1 + chr3L 15321982 5' - Transpac 5147 2 73.97 AGAAGGAGAGATCGCTTGAGAAAACGTTGAAGGTGCTTCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1 + chr2L 20638374 5' + Doc 87 1 73.29 TCTTATGAATATACCTTTTTTTTTGTAAGAACTATTTCAAAAGATCACATAGATTATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3R 24479128 5' - 412 7530 2 70.55 GGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGAC:1 + chr3R 13358599 5' - mdg3 176 2 64.14 CCTAAATAGAACCATTCACATCATTTGAAACAAGGGCTTACCTACCATCGATGAGAAGCGCGGAGAGAGGCGCACTATGAACTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chrX 16456840 5' + P-element 38 1 58.22 AGGGGATTACATCAATTGTAAAATTGGTCAAACACCGCAATTGTTTCACTCCGCAAATCGGATATTCCACTGCCCCTGGATACGCGCTCACCCACACAGGCCCGTTCCCTATTTTTTTTCCTTTTTCCATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 1957699 5' - Doc2-element 231 1 77.86 CGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2R 21056719 5' + Tirant 13 2 69.64 GGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr3L 9426667 5' - P-element 2831 1 45.89 GAAATTTTCTTCGCGAGTGTTCGAAAATATCAAATCATATGGCAAAGTTTCGAAGTCAAGCCGAATTCGATGTTTGCATTTCATATACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 - chrX 17247834 5' + INE-1 28 1 80.14 CAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 27835678 5' + 412 66 2 60.27 CGCATATATTTATCAACTGAAGAACCCACATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 - chr2R 17014147 5' - HMS-Beagle 209 2 60.27 CACTATCCTACAGTTTGCTGCGGGTTTTCTCGCAAGATCACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr2L 13884579 5' + pogo 2 1 70.59 GCGCTTACCTTTAACCACTTAGACTTAGGAAAGCTACACATAGATAGGGTTGAAATATATCCTTTAAGTGCCCCCTTTCCTTGTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chr2L 6406444 5' + transib2 34 1 63.70 CCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACA:1 + chr3R 31907357 5' + Tirant 8191 2 76.71 TTCAGAAAGTGCTTAGCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 - chr2R 9072972 5' + Burdock 6177 2 56.16 GTGGTGCCGCGGCACAAACTTGTGCAGACCACGGTGAGTGGCCTCCAGCATCTCCAGCTGGCCAAAGGGCACGCCCCCAATGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAG:1 - chr3L 1197858 5' + R1A1-element 5090 1 59.26 AGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGA:1 + chr3R 23507591 5' - 412 7469 2 69.18 TATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chrX 21668691 5' - mdg1 7423 2 52.05 ACAGCAGTTAGCAATCCATAGTAAAAGTAAACAATTAAAGGCGGCAAGTAAGAGGAACTAGCAAAAGTTCGGGGCGATTGTCCACCGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGGTTTTCA:1 + chrX 2677964 5' + mdg3 483 1 54.11 CATTATTAATTAATTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 5381226 5' + jockey2 3405 1 88.00 AATCACTGCAAAAAAAAAGATGAGAGAATGGGGTGGAACAAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 4104149 5' + roo 10 2 79.45 AAATTCAGCCGCCAGCAGAGGTCTAATTAGAACTTATTCACTTTCAATTGTTTTGTCGATCTTGAAGTAACTTTTAACGACCTGTGCTTGTAAACTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 + chr2L 8452204 5' + copia 4896 2 67.12 CCGCTATTTATGAGCAGTTTAATGCATTAAATGAAATTTGCCTCAATCAGTCGACCCTTGAAAAGTTTAGTTCTACTAACTGGGATTACGGATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAG:1 + chr3L 10470738 5' - I-element 5070 1 55.48 TTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3L 14581470 5' + pogo 50 1 61.29 CATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr2L 4416065 5' + jockey 90 1 71.92 TACATACATTCTTACATATATCATAGTAATGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGG:1 + chr2L 19817818 5' - G4 3784 1 58.22 ACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 4710703 5' + Doc 47 1 56.16 CCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2L 2519878 5' - roo 8985 2 78.77 ATTAGCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:1 + chr2L 14969882 5' - Tirant 8440 2 62.76 CCATAAAATAATAATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chrX 14908499 5' + blood 36 2 60.96 GCCAGAAGATTATGCGACACAACCTTGCCACCGAAATGAAGTCAAATGGCGAGGACACACACACACACGTATGTTTGTATGTATGTATATTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr2R 20389749 5' + 412 72 2 67.19 ATGAAAAGCTGAAAATGCAGCACGAGGTCAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chrX 3452381 5' - Tirant 394 2 79.69 CGAATTTAATTAGAAAATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 28008193 5' + hobo 17 1 73.97 CCCTTAGCTTTTGATGATCATGTGGCCCGATTGTGTTTACGCATTCAGTTCGCACCTCGACGCGATGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTAT:1 - chr3R 19060418 5' + S-element 369 1 55.48 AATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chr2R 7223659 5' + blood 63 2 62.94 CTGTCACTGCTCAGTCAGTTGTTTTCATGCCCTTGCCAAATGTATTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3R 11549770 5' + 297 6607 2 68.49 TTTCGATCCTAATAATAAAACTCAACTGTTGCGCTGGGAGCCGTGCTAATACAGTTTACAGAAGACGACGAACTTAAAGTAATCACGTTTGCTAGTCTGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACATC:1 + chr2R 3914606 5' + G4 3426 1 66.44 AGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr3L 9430637 5' + P-element 69 1 29.13 AGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAG:1 + chrX 17469197 5' - blood 294 2 76.03 CTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGCAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 27391410 5' - 1360 3354 1 61.38 TATAAATAGTAAAGTTGATCTGGACGTGCGCGTCTGTCTGTCTGTGTATCTGTCTGTCTAACAACAATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAG:1 + chr3R 4132453 5' - Quasimodo 7313 2 54.79 CGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr3R 22659901 5' - 412 7494 2 54.79 AGCAACAAAAGTGCCGAATTATACCTCCAGAATGGATGGACATGGATATATTGGAGGAAATCAAGGAGGAGGAAAAGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 - chr2L 4386827 5' + Ivk 57 1 51.37 CTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGGAAAGGAATAG:1 - chr3R 5087104 5' - P-element 2823 1 41.78 GGGGGCAGGTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:2 - chr3L 22221277 5' + 412 7073 2 71.92 TTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3L 15058802 5' + blood 18 2 46.58 ATTTCGTAGGAATTTATTTCAGTTTAAGGGATATCTTTGTTTATATAAAACAAGGGTTTCACTTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAA:1 + chr2R 8231723 5' - Stalker4 394 1 43.84 GGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAA:1 - chr2R 4939191 5' + 1360 8 2 37.10 TTTGGGCCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2R 20461143 5' + jockey 31 1 68.49 TCGTGTGTGTTGCCCAATTGGCTATTTTCTGGTGTGATGTGTGTGGAGTATGGAAGATTATTAAACTTTTATGAAATTCTGTTATTCAAACCATAATCAACGGTTTGGCTTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 - chr3R 18847432 5' - Stalker2 392 2 73.29 TTACCGCTCTCTGTCCCATTGAATGTGTGTGTTCATTTAGTTTTTGTCTCGCCTTTAAGCGTTTCTTTGCTTTAAGCTCACTGTTTAATTAACGGTATGGATGCACAACAAATTATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAACTG:1 + chr3R 19852840 5' - rover 86 2 60.27 ATTTTATTGAAAAATTTGTGTTGAATATTGATTATTTCACAAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr3L 20925878 5' - Transpac 5195 2 62.33 ATTATTCTAATGAGGCCTACTGCTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTA:1 + chr2L 18370332 5' + Doc 61 1 57.34 AATTATTGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATGT:2 - chr3R 23449327 5' + roo 8744 2 71.23 TATGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr3R 9163964 5' + hobo 42 1 55.94 GTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTATAAA:1 - chr2R 22867485 5' + hobo 78 1 76.30 ATGTGCTAGCTGAGAACACACACTATCAGGATCTAGATTTCTTATCGAAGGAGTCGTCAGCATGGGGATTTAGTGATCATAAATTAGTTACGTGAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATA:2 - chr3L 19146728 5' - pogo 2081 1 70.55 AAGAGGTGCTTTGTAAATAAAGATTAAATACGTTTAGAACTTAAGCTTGGCGTTGCATCGTGTGACATCTCATGGGACGCAAATGTCAAATGTCATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr3L 21890275 5' + 1360 44 1 65.07 CGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:2 - chr3L 27391431 5' - 1360 3374 1 67.81 GTTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCACTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chrX 3452541 5' + Tirant 7 2 74.55 TTTGGTGGGACACACAAACTTTATGATCCAACCTCAACTTCTTTTCGAAAATCCTGTCAGTGAATAATCGATTTGGCCTTTGCTATTTAATAAACTTTTAGCTCAATGATGGAGCGGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACC:1 - chr3L 26834450 5' - invader4 2746 1 76.71 TATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGTGACCCACTAGTACATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 + chr3R 19450063 5' - roo 9069 1 51.37 CGTGCAGCTTTGCGGGCGGCAGATTGACTAACGAGTCTTCCCTTTCCTCATCCTTAACCGCCTGCTCTTCGGGGATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGGAATTGGCAAAAAC:1 - chr2R 17553846 5' + 1360 3120 1 52.05 AGAGTGGTAATTAAAAAAATATTTGTAGCCTACTTAGTGGGGCTGGGGAAAACTGCACTTTGTCAATTGCTCTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 + chr2L 11573631 5' + jockey 4722 1 52.74 GAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 9482099 5' - roo 8999 2 68.49 AAGAGGAGGAGCTAGAAGATGACGAGCAGCAGCCGGATGAAATTTCGGATACCGCAAAAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTAT:1 - chr2L 14353040 5' - F-element 91 1 60.27 CTTCATATCCTTCTTCTTTTGGATGCTCTGGATCTCCTTTAGGTTCCTTTTCCGGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAAGCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGC:1 + chrX 22426838 5' - hopper 397 1 63.01 GGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:2 - chr3L 5498516 5' + Doc2-element 251 2 42.47 TTTTAGATTAATATAACCGTTCTTATAAAAGATAGTTTAGTTTCCTGAAATAGTCTATTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr2R 9332225 5' + roo 59 2 59.59 GGGCAGCAACATAAGTCAACACTAAAGCCGGGAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGG:1 - chr2L 9356945 5' + Stalker 26 4 65.75 AGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr2R 14553223 5' - mdg3 194 2 54.11 TCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATTTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chrX 5222940 5' + 412 7132 2 72.60 CACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 16410136 5' + opus 150 4 60.27 GAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCG:1 - chrX 3452497 5' + Tirant 64 2 73.17 AATTTGGGGCATAACAAATATTTTCAGAAGGATATTAAAAATCCTAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2R 9867102 5' + roo 76 2 71.92 GGCGGTACCTGTTCCCCTGTTTTTCAGATCTTATCGTGGTCAGCGCGCTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCC:1 - chr3L 18330751 5' - roo 8776 2 67.81 GCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 - chrX 3452527 5' + Tirant 8116 2 71.43 CGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 25822992 5' - roo 8986 2 78.77 CACTTCGACTTTCTCTCAAATAGTATGGAACGCCACGAATTGAGTGGAGATTGGAAGAAGGACTCCCGATTTCTGGTGGACATTGTTAGGTATCATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGC:1 - chr3R 8510689 5' - R2-element 3354 1 65.07 CAAAAGTGGAGAAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTAT:2 - chr2L 6074113 5' + BS 32 1 58.90 CATTACAACTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTG:1 + chr3R 17316028 5' + 3S18 5812 2 53.10 TTCTCTCTGTTATCAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 12142674 5' - hobo 2920 1 64.52 TTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATT:1 + chrX 18034609 5' + Juan 54 1 48.95 ATATGCTTTGCCTACTTTTGTTACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3L 11665854 5' - pogo 2086 1 58.90 TATTTGTTACTAGGGAATATCAGTCAGCAAATACAATAACTTTTTGCGCATGTATTGGGGTTATTTTTGAAGAGTTACTTGGAAATCAGCACAGAAAAAGTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAA:1 + chr3L 10076270 5' - X-element 4693 1 67.81 TTAGCCCCCGCTCTTCTATCTTGGGGTTTATAAAAATATTTTTTATTACAATATTTTGATATTCGTTCGCGTGGTGTTTTGTGTTTTCTAAGTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chrX 10538088 5' + pogo 26 1 69.18 AGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 + chr3R 15589945 5' + Transpac 48 2 52.74 AATGTATGTAAATTATTCGAGCTTCTACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:2 + chr2L 20923002 5' + pogo 33 1 63.01 CAATGTCAACTAGAAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr3R 25521938 5' + blood 17 2 73.97 GCGATGCTCGTTAGTTTTATGTGGTGAAGGCCTCAAAAAAGAAGCTTGAAAATCTGTAAGGAAAAAGTGAGAAATTATCAGACTTAAATTCATTGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 - chr3R 12367572 5' + copia 29 2 67.12 ATCTAAAGGTGGCGTTCAGACGGATTCTACGGATTATCTCGGGTAAATGCAACTTCTTTCAAAAGGAGCTAAGGTATCTGTGACAGTAGTGGGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGGCGG:1 - chr2R 4027314 5' - Doc2-element 417 1 56.85 CAAAAACGACGACATGCCAAATGAAACGGCACAACTTTCGGCAGTCGCAAAACAAAAAGACGTCGGAAAATGGCCGGACGTGCTAGTATGCGTATGTATAGGGTAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGAC:1 + chr3L 21669471 5' + F-element 109 1 76.71 CATGCTGTCTTAGTTCGGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGT:1 - chr3L 21093282 5' + Ivk 13 1 76.71 GACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 - chr2L 3734602 5' + mdg3 5280 2 48.63 TGGCCCAAATGGAGAGACAGCAGCCCGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGT:1 + chrX 18707419 5' + BS 4731 1 71.92 CTTGGTGCGAATAAAAATTATACATTGCCATATAAGCGGGAATTCGCCGCCCGGCCTGGCCAGAAACACACAGAAAAGAGCAACAAATAATGAACCACCACGTCTCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTGT:1 + chr2R 14445058 5' - Quasimodo 27 2 64.34 ACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGAAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTC:1 - chr3L 25232915 5' + GATE 64 2 57.35 AAATGATTTTGATTTTGGTAGCTTATATTAAAGATAGATAGACTTGGAAGATAGGAGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 + chr2R 15374733 5' + 1360 42 1 47.95 AACAGTCGTTTGACCATAAACTTCGAGTGCTGATTGCACATGCAGGACTTGATCAGCTGCAGCACCACCAGCGGAGCAGCCTCTGTGTACAGCTGGACCACAAACAAGTAGTCTTATTTATTTACTTATTTGTGT:1 - chr2R 8827281 5' - Juan 4213 1 77.78 TTATTTTGTACAAAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 12261111 5' + jockey 23 1 73.97 GAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAG:1 + chrX 22858867 5' + mdg3 77 2 68.97 GTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAG:1 - chr3R 934249 5' - Rt1b 4705 1 47.26 GCCAGGTCGTAAAGTGCCCGCCACGAGTATTTACTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGCGTGAGCGGGGGCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr3R 15514669 5' + 412 9 2 76.03 ATTAATTCTTAAATTTCTTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 9571599 5' + jockey 18 1 76.03 ATGTACTTAAAAAACAATCATAACACAACTTTTCTAATAATCTAACTACTTTTAAAATAACTTCATAATATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACA:1 + chr2R 3202644 5' + gtwin 6933 2 73.97 TATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTT:1 - chr2R 11656096 5' + HMS-Beagle 77 2 71.92 GTCAATTAACTTGGAAATGAGCAGAGGCAGCGCCAAATGCCGCACAGCCATGCATAATTAAACAGCAATATTAAATGGCGGCGAGGAATGAATGGCCTAAATACATAAGAAATCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGC:1 - chr3L 8255158 5' - blood 7229 2 66.19 GCCAATGCGAAGCGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 14962153 5' + jockey 18 1 76.22 CATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGCGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chrX 14962217 5' + jockey 72 1 64.39 CGAGAAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTC:1 + chr2L 11158628 5' - Rt1b 5079 1 56.85 GCGACCAGTAAGGATGCCTATTCTGGTGGAATCGTGCGTCTCTACCACATTCATTCGGAGGGCTGGCGAAATATCTGCAATACGGACTGCTCCGATGACTGCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTC:1 - chr2R 23308952 5' + Tabor 7060 2 65.75 CATACCCCTTGTTGCTCCCTCCCTGTCTATCTGCTCCCTGCTTACTTATTTACTTTTGTCTTCTCTAGCCCCTTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTAT:1 + chr3L 409871 5' - Burdock 322 1 50.68 TACTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAG:1 - chrX 22824265 5' - Gypsy12A_LTR 2245 1 57.53 GCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGGCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCCACCCAGTACTGCAACTGAGA:1 + chr3L 25232769 5' - accord2 179 1 49.46 TTTGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATA:1 - chr2R 20362316 5' + diver 5934 2 54.11 ATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTC:1 - chr2R 11656095 5' + HMS-Beagle 6874 2 72.60 AAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 + chr2L 12261174 5' + jockey 87 1 69.86 GGGATTGGGATGCAGCACCCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACA:1 + chr2R 6984256 5' + HMS-Beagle2 6892 2 79.45 CAGTTAAGCTATTAAAAAATGCTTGTTCATATCGTTCATATGCACATTTAATTGGTCATTTACAATTGGTTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chrX 14914305 5' - mdg3 5479 2 71.92 GCTTTTTAATAGCTGATTAATCAATTTGCAAAAAAAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATGGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTCCCGAGCATAGACCGT:1 - chrX 10960336 5' - Transpac 289 2 64.14 AACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCT:1 - chr2R 6984389 5' - HMS-Beagle2 7113 2 76.03 GGAGAGCCTAGATTGGAGGGATACGATGAGTTAGATGGAAATAATGCGTCTCCTTAGCCTGCAATCGAATTCTGAGAAAACCGCGAGCCGGAAGAGATCTTTTAGTTTAGATCCATGTTTTTTTCTTTAACATAAGGGATTCCTAA:1 + chr3R 19921431 5' - G4 3564 1 74.66 ATTAGCGTGTGTACAAATGCATCCGTCTACGAGGCGAAGTCCTCTCTACCCACATACCCCATTCCCATATCTCAATTTGGGGTGGGCAGAAAGTAATTTTTTCGCTAGATAATTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGC:1 + chr3R 22663605 5' - BS 4895 1 54.11 CTGTAGTGAGTGGGAAAGGTTTCTGCACACTGCTTATAAAATAAAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 + chr2L 8772676 5' - Tabor 473 2 77.40 GGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGAATAACTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGT:1 - chr3L 21093221 5' + Ivk 31 1 54.37 AAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCT:1 - chr3R 10468087 5' + opus 7191 4 70.34 CACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGGGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr3L 16180878 5' - Transpac 292 2 61.00 TTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAGAATTGATCATAGAAAT:1 + chr3R 14049353 5' + transib2 83 1 71.92 TATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTA:1 - chrX 21772473 5' + 1360 3192 1 63.70 AACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTA:1 - chr3L 22635781 5' - hopper2 1553 1 52.05 TGCTTCCAAAAAACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 - chr3R 31120322 5' + opus 9 2 77.46 TATTATATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGAAATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3L 7774230 5' + 412 10 2 75.34 GTTTACCCACAGCTACGGCAATTTTGATAGTAGTTTTGTGTTTTATTCCGCATATGGCCAGTTAATAATCTAAGTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTACAGCCGTCAG:1 - chr2R 7404782 5' - blood 331 2 49.32 GATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 + chr3R 10562141 5' + I-element 57 1 66.12 GGGTTTGTGCATATGAATTTAATGGTGAAAGGATCAGGACTAGGAGTCGAGATCATCCATAGTGTCATCTGGGAAATCAACTTGTAATTTCTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGACTGGCAAGCGATTATCCCCCAAATTGA:1 - chr2R 1897948 5' - Ivk 208 1 51.37 TGGCCAGCCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 4869154 5' - roo 9021 2 55.97 AATCAATCATACGGAAATAGATCAACTCGTCGTTGGGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr3R 16194073 5' - mdg1 7447 2 76.55 GTTATTTGACAAAACAAGCGATTACTTATAGAAGTTATTACAAATATTACAAGTCAAACTGGTTGTAACATTTAAACAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTA:1 - chrX 18884335 5' + Doc 4243 1 56.16 GATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAAT:2 - chr2R 5022792 5' - Gypsy12A_LTR 95 1 61.64 GGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 - chr2L 19878259 5' + mdg3 59 2 58.33 TTTGATTTCCGTATGATGTTTTTGTTATGGCCACTCTTTTGCGTCACCTTCTCTCTCTTAAGTTCTTCTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTTCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTAT:1 + chr2L 13878097 5' - Transpac 467 1 60.27 GGAAGCGGTTGGGGCGGATGGAGCAATCAATATTAGAGTTGGTCCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1 - chr3L 11610679 5' + copia 78 2 67.81 CGCTTTATTAACACATCGGAGGTCGGACTCTGGTAAATATTATCATTCCCAGTGGGAGTGCACATCTATATGGCCCCCCTGTTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTG:1 + chr2R 9858031 5' - mdg3 5096 1 56.16 AGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:2 + chr2R 18048800 5' - opus 7443 2 59.59 GAAATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 4722499 5' - roo 9029 1 56.16 TGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr3R 15514533 5' - 412 7468 2 70.55 ACTGGTCATTTTAAAAAGTGGCTTGTAGGTTTCAGTGTTCAGGACTCTGCTTAAATAATCAGGATTAACTATGTAATATACATGTACACATTTTAAGCATCTAATAAAACCCAGGAGCCCCGATGGTGCATTGTTTAATTAACTTA:1 + chr2R 25189615 5' + hopper 1294 1 74.66 AGAACAAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCT:2 + chr2L 15153210 5' + G-element 18 1 66.44 TATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr2L 12355361 5' + hobo 65 1 65.94 ACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 12261125 5' + jockey 33 1 66.20 GATTGCGATTCAGTCATGGCTGGCAACTTCATCATCCATTAATGTCACTCAATCTGTGCGCATAAATTTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chrX 17012782 5' + Burdock 6146 2 78.77 TAAACATAATTTTGATTGTTGTAATAAAAGGGTAAGCTTAACTATAGCAATATGGTTTATTCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 + chr2R 20462779 5' - copia 194 2 63.70 GCTGGCCAAAAACGAGAAAAAGTTGCCGACTGGCATCGATTATGCAGGAACAGGAAGAGGCACGCTCGGCTCCTGATTATACAATATATACATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCA:1 + chr3L 4738339 5' - Idefix 7361 2 64.38 CCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3R 18665251 5' + 1360 63 1 66.44 AATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCTGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr3R 5940511 5' + hobo 85 1 72.60 GAGCGGTAGCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 10142906 5' + 412 7089 2 59.59 AAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr3R 25521900 5' + blood 36 2 55.12 TTAGCTCTTGACCACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3R 9345686 5' - pogo 2059 1 55.63 TTGAATTGTTGATAAACATTACAATTAGGATAAGCTTCACAGATTAAGCTTAAAAGAGCTTAAAATTCGATACTACTTTGCAGTCAAAGCAGTCATTGTCAAGATAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAA:1 - chr2R 6984666 5' + Doc 4499 1 71.92 TATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 - chr3R 14165136 5' + Tabor 6890 2 50.68 CCACCTTTTATTTGCTGCTGATTCAGAAAGTAAGCATCTCTGGCGTTGCTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTAGCATAAAGTCTAAAATTTTATGTCAATATAT:1 + chr2L 14771951 5' + transib2 38 1 56.85 GAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:2 + chrX 5222881 5' - 412 7461 2 76.71 ATTTGGACTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATAC:1 + chr3R 11461747 5' + 17.6 6967 2 58.90 CGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chrX 14385143 5' + blood 53 2 52.05 ATAAACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 - chr4 829135 5' - INE-1 156 1 72.60 TACATGACTGACAGTGAAAAGTTTTTAAGAATGATTTCTTCAAACTATTTCTTTTAAATTGTGTAATGAACCAATATATGCCTCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1 - chr2L 21596588 5' - blood 7326 1 56.16 AGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGGGGAAAGGTTGTGTGCGGACGGATTT:1 + chr2L 8542750 5' + P-element 92 1 20.55 AACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr2R 9164919 5' + 412 7132 2 69.86 ACTTCAATGTCAACTAGAAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr3R 25521942 5' + blood 13 2 76.71 CAACTAGCAACTTTTTGACAGCACATTGGCACTTGAACTCCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chrX 17614339 5' - roo 385 2 69.18 GAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 - chr2L 3734563 5' + mdg3 53 2 60.96 CTATCGCCTTTTGCACGGCCCATTAGTAATTAAATATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 - chr2R 14884389 5' + mdg3 28 2 67.12 ATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chrX 11228581 5' - roo 319 2 77.40 AAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 + chrX 19231725 5' - mdg3 5451 2 53.42 TTTGTACCAAAATTCCATTTGCAATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chrX 10979120 5' - roo 9029 1 51.37 GGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 9938595 5' + roo 8720 2 59.71 AATGCAATAAGAAAAACCAAGAGCGAAACGAAAATGAGAGAAGGAAAGTAAATAAAAATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 26316024 5' + roo 8693 2 65.75 ATAAAGAGCGCACAAAGCGGGAAAAAACAATAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTAAATAATTTAACATACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGG:1 + chr2R 10478425 5' + invader2 457 1 77.40 CTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGT:1 - chrX 22824256 5' - Gypsy12A_LTR 2236 1 51.37 GAAGCCATTGTAAAGTGGTTACAGTGGTTACAATACGACATGGTTTGGATTTGGAGCCTAATTGCACTCGGAATAGTTGTTGGCGCAACGGTAAGCGTGATCAATAAAAAAGAATGCGTAATTCTTTTCTCTAAATATATATGTAC:1 - chr3L 3484638 5' - gypsy11 3987 2 73.97 TAAAGCACATGGCATGTGGGTTAACTTATATAGCATGTACGTATGCGTTGTACATGCCAGCGTTCCGATATATATGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chrX 18913244 5' + Quasimodo 34 2 61.64 ATTACATAGAATTAAGTTCTTTTTTTTACATTTAATAGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chrX 11228632 5' + roo 8748 2 76.03 CCGAGGTTGAGTGGATTACGATTAAGATTTAGAAGATCAGACTGACTCGGGACGAGATCGTGAACAGCTTCAAATCAAAGATGCGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGC:1 - chr3L 26739215 5' - gypsy4 6765 2 56.16 ATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3R 20149809 5' - 1360 3345 1 55.48 GTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 + chr3R 16194135 5' - mdg1 7384 2 67.81 TCTGTGAATAGCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr2L 1229531 5' - opus 7487 2 72.60 AGGTAGGTGGGGGCATGCGATTTGGCTGAGGGTAATATAAGACTGACACAATTTAGTCAGCAAAGTGTTGTTAAGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chr3L 8067488 5' + copia 46 2 54.11 TCTTAGGAGATGGTTTTATATATGATATCGTTATCAATTAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr2L 9167576 5' + pogo 24 1 70.55 AGAATGATGGTCATATTTAAATATTTCAACAATGCAGCGTGGTATTCAGTTTAAAGCTTCATCTTAAAACCAAGTCTTCAATGCGATATAAGTACCAATTTAAAATATATATCTTAATTAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 - chrX 13023350 5' - 1360 20 1 52.74 CTACGGAAATTAAAATTATTAGGTATCAGCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr2R 19900938 5' - mdg1 7435 2 68.49 ATATTCATTAATTCGACGTTGGCTAATATTTGCAAAGGTATCCATTCCATTCGCTGGCAACTCTTCATTTTCGCCATATACATACATATATATATATATATATAGCGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr2R 17945094 5' + 297 6597 2 70.71 AGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 + chr2R 8305213 5' + blood 66 2 63.70 ATACCGAAAAATAAACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGTCGCTAAGCTTTT:1 + chr2L 14222235 5' + Transpac 4969 2 53.42 AATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCAC:1 - chr3L 23597293 5' + invader4 2 2 70.55 TTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chr3R 25521878 5' + blood 77 2 69.18 AAATTCTGTACCAACTGCAATAGCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr2R 9164810 5' - 412 7537 2 74.17 GTGGAAAGAAAACTGGAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 + chr2R 7097907 5' + copia 4893 2 69.18 GCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAG:1 + chr2R 10478663 5' - invader4 287 2 54.07 TTTAGAATTAGGTCATGAAGGGCACCCGGGTGAGTCGTCCAGGAAGCGTCGACTGAGAAGCAAGGTGTGCATTAGTATTGATGTATTTGGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTGTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr2R 2923272 5' - hopper 1384 1 56.85 TGAGCCACTTGACGATGCAGTCGAAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 22529703 5' - roo 9045 1 67.12 GCAAGCAGCAAAGCGAGTGATTTCCCTATCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTAT:1 + chr2R 6579527 5' - mdg1 330 2 80.14 ATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGT:1 - chr2R 20500134 5' + 412 7104 2 58.46 GCAACCTTTTGCTGGACCAAAGATTAAAAAGTTCTCTGAAATTGTTTGACAATATATTTTGCTTGGGAATTCCTTTTGTTCTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 22289352 5' - 412 453 2 57.53 GCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:2 + chr3L 22354444 5' + Doc 88 1 71.23 AGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:2 - chr2R 16891836 5' + jockey 92 1 73.29 TAAAAGCTAGAATGAAAAGCCCTAACAACGAGAAGTGACCATTGTCTTTGTCTTGTACTGCACCCGCTAACAAAATTGTCGCGCCCTGCTTGATTCCGGCTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGGCACACACTT:1 + chrX 20656343 5' + G3 497 1 53.57 CTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chr3L 24291994 5' + 1360 67 1 74.42 AAATCAAACAAAACAGCATAGCCGCAATAGGCGAGCACGGTACGGGGTACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chrX 19498163 5' + P-element 24 1 55.56 GTGGCAAGGAATAATATCAGCACATCCTTCAGCTGGCTGTGAAAACATGCAAAGCCCACAAGTGGTAATCCGCCTATATATTCCATATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 - chr3R 12540263 5' + flea 4786 2 65.75 CCCAAAAAAAACCCATAATTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3R 23449218 5' - roo 9038 1 60.96 TCTCAATCGCAATCTGCCAGCCGTCCCACCCACACTCACAAAAGAGGAGGTGAAGCAAGTGGAGCTGTATAAGGGATCAATAGCCGAGTCGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTA:1 + chrX 23098668 5' + INE-1 142 1 52.86 TAGCGCAGCACTGGCGCTCTGCCGCCAATTCGAACAGCTGAGCGCCAGCCGAAGAGAGAGAGCCGAAGAGTTCCGTCACCGTCGTGTCAGACGCCCGCGAGTGCCAAATCATACACGCGGTCAA:1 - chrX 19887343 5' + Doc3-element 330 1 57.26 ACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 - chrX 17469266 5' + blood 7081 2 64.38 TTAATGTTTTGCGCCATCAAATTGAAACAAATTGCCTAGGAAAACAAATAAACATTGATTGAAATATAATTTCAGCGAGGCGATGTGGCTTTTCTAGGGTGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chrX 9342403 5' + 1360 20 1 71.92 ACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 - chr3R 25521881 5' + blood 7085 2 67.12 TTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 13313219 5' + roo 8683 2 56.25 ACGCCAAGGAAAGTTAATTTGTCCGAATCTATATGCAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 + chr2L 13877618 5' - Transpac 5221 2 76.03 AATCAAAATTAGGAAATGCCTTGATATTAACAACAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chrX 10960169 5' + Transpac 4949 2 63.70 AGAATGCCTTTTTATGGAAAATTCTTGGCGCTCTTTTCACGTCCGCAGGAGTCAGATGTGTGCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTCTT:1 + chr2R 18316808 5' + FB 50 1 54.01 GGAAACATTGTTGTCTTTCGACGACTGTAACACAACTACTACATTGAGCACAACTGTACTTACAGCTTGTGTGCTTTTGTGACCTGCCTCCGTTAAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTCACAAA:1 + chr2L 20083352 5' - 1360 100 1 74.60 AGTATTTACTAGATTTACTTATGAAGAAGTATTTTACTCGATGCTTACGCCTAAAATGTATCTTTTAAGGTTTTGACAGTGAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTT:1 - chr3R 21169302 5' + 412 483 2 56.85 CAAAAAAGAAAATTAAAGGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCG:1 + chr3R 9163834 5' + hobo 2707 1 79.80 TAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:2 + chr3R 7739698 5' + blood 83 2 71.92 CTGGGATCCCCTGCCTTTTGGCCTTTTGTTCTTCGAGTTGCGCTTGTTAGGTAAATCAGCGCCAGTTTGCATGAGTGTGTTTTGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr3R 28144941 5' - hobo 2901 1 59.31 CCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr2R 15080136 5' - roo 9038 1 62.50 AGAGTAGGCAATTTGAGACTTATCGGCGCTTTTTTCTGCTCCAGCATGTGCAACAAAGAGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAAATGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTACATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGCAG:1 - chr3L 3263685 5' - accord 7027 2 78.77 ATCTTTCCATACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTA:1 + chr3L 24153127 5' - Tabor 7308 2 73.97 CTTAATTTTATTTACATTTTGCATTTTGCGCTCTAAAGTTTGCCCAAGCTCTTTGCTTTAGCTTTATGGAATACCATAGGATTGTCAACTGTAATATATTTTGTTTGTCGAAACATCATTTTAACACAAAAAAAAAGAAGAAAAAA:1 - chr2R 16066080 5' + gypsy7 5004 1 74.66 CGTGGTTCACTGACAAAATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:2 - chr2R 21227447 5' - mdg3 184 2 60.96 CCCGAACCGCCCCTAACCGCCTACCATACCAACCCCATCTTGGGGCTTCAACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACCAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACA:1 - chr2R 17182853 5' + jockey 4564 1 78.08 CTCTTCTTCTTTAGCAGTGTTACCATATGGAATAACACTGCTAATTCAATAAATAATCGATAAGTTTCACAAAAAATCGCGTTATTTAAACTGAACTATTTGCTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3R 14663165 5' - pogo 2086 1 75.34 ATACTATATTAGCGGCATCCACGACAGGCACAAGCTGAGCTACCAAATGATAAACACACACATCAGCAGCCGCAACAAGTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACG:1 + chr3L 6159794 5' - 412 307 2 65.83 GGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chr3L 16887339 5' + roo 8756 2 81.51 CTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTA:1 - chr3L 18920497 5' + Juan 50 1 51.03 AATCGAATTTAATTAGAAAATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3R 28008190 5' + hobo 14 1 76.03 AAAATTGAAAATTTCAGCATTTTTCATGAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGCAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCA:1 + chrX 21100573 5' + BS3 1421 1 63.89 AAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATC:1 - chr3L 25508750 5' + 1360 332 1 64.29 CGAAGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 + chr3R 16535260 5' - Stalker2 7613 2 53.42 GAAATGCAACAATTAAGCAGAGCTTATGGAGGCAGCCAATCAACTGGAAGCCAGCAAAGCCAAGAATTTGGTTGATTTGCATATCTAAGGTATTAGATAAATGACCGTTTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3L 20977498 5' + I-element 14 1 76.71 ATGATCTTGCCAACCCCAAGCGGCGATCGCGATGGCAATGGCTGTGCGCTATTGCGATCGTATCGTATCGGATCGATCGGTTCGAGACTCGATTACAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 - chr3R 29207666 5' - copia 231 1 68.28 ATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 4722458 5' - roo 324 2 75.34 AAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 + chr3R 20292416 5' - pogo 2045 1 60.27 CAGCTTAAGACTGAGATGAGTTGCATACTAATTCCCCCAAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 20076717 5' + roo 8680 2 74.66 ACGGTCTCAGTTTTGTGGGTCACACATGGCCAGAAGGATTTGTTGTGGCCTTAAGCCGGATTTATTCCTGTTTCGATTCGGTTTCGGGTTCTAGCTGTATTCTATTGACAATGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 30568748 5' + roo 8672 2 77.40 TAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1 - chr2R 5237885 5' + Doc 93 1 57.53 AAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAG:1 - chr3L 3979656 5' + opus 7080 4 74.13 GGGGAGGCTCAGGCTAGCACTCACCACGGCTGCGCAGTTAGTCGTCTGGTCGGTGTGGTGAGTTTTGGCCGATTTTTATGGCACCTCTATGAGGTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTATTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTT:1 + chrX 17346108 5' + transib2 351 1 78.77 GCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTT:2 - chr2R 5900941 5' - Bari1 1660 1 54.79 CATACCTATAACAAAGCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTT:1 - chr3R 27845607 5' - Stalker4 387 1 65.07 GTCTGCAATACAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2R 16513122 5' + jockey 69 1 59.59 TTATGTATTTTTTTTTAAGTGTAGAATCAGTTTCAGCTTCATTGAATGCGAATAACAAACGTATCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTTGCTACTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTA:1 - chr3R 10068674 5' - rooA 262 2 56.85 ATGGTATAGACATGCAAAGTTGAATTTTACGTAGTTCCTGATGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCAC:1 - chr2L 22513381 5' + Stalker2 79 2 71.23 CACTGCACCATCCGATTGTGGGACACATATCTCGCAGAGGTTGAGGAAAACCATCGGGGTTGCGGAACCCACCGCCAGCTCCAACGGCCGCGGCAGCCGCCTCCCTGCTGCTGATGATGCAGAACTCGTC:1 + chr3R 21104681 5' - Chimpo 4040 1 72.31 CGGCGTGGCTCCTTGCATGGTTATTGGCTTGGGATCGCATGGAGAGATCAGTGGTAAAATGGCACCGAAATTCTTACTTTTTGCCTTGCGGCGCTTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTT:1 - chr2L 7884099 5' + Cr1a 3971 1 62.33 GAGACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:2 - chr3L 16180990 5' + Transpac 48 2 52.74 AAAGTCATTTATTTCACTTAAATTCGCATTCCTCCGCTCGTCCTCGCCGTAGTCAATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 - chr2L 18163863 5' + HMS-Beagle 55 2 56.85 GCGAGAATGTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTAC:1 + chr3R 9983004 5' - HMS-Beagle 6975 2 63.01 CTGCACACTCCAAAGGCCAATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2L 15965344 5' + blood 7036 2 68.49 AAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1 - chr3R 6053059 5' + Quasimodo 60 2 64.38 CACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCACTAC:1 + chrX 18707457 5' + BS 4769 1 53.42 AATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAGG:1 - chr3R 7424611 5' + 412 7140 2 76.03 CGATATGACCATAAAAAATTGTCTCGTCGCACATAATAATTCTTCAGTAGTTTGATCGTTTATTTCGTGGGTTCCATGGGCCCATCATTTGCGTGCTCTATCTATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGG:1 - chr3L 10013887 5' + R2-element 3281 1 70.55 GTACCGAGTTCTTTACTTAACCCACATTGTTTTGCCCATGAGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCT:1 - chrX 16919802 5' - G2 2791 1 67.20 AATAATGGTTGGGTTTTCCACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 - chr2R 24630223 5' - copia 192 2 63.01 ACATAAATCAGACTTTTGTCTTGGACATAAACTTTTTCAAGTTAAGGCCCCGCTTTTGCGGTTGTTTTTCCTCGGTTTTCTGTAGTCGTTGGGCTGTCAGGAGCAGAGACGGAACCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATGTGACA:1 + chr2L 8572087 5' - GATE 426 1 63.01 CGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAGACTGATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAATTAG:1 + chr2L 8397152 5' - roo 9009 2 56.55 GACATATGGCCACTGGCCCACACTCACACCCCTTCCCCACCGTCGCCATGCGGAATTTTCCAACCCAACATCACCGCATCTGCAAAATGTTGTTGTCCTTTGGGTTGTTATTATTTTAAATTTCTGTTTTCAGCTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 7256538 5' - Porto1 172 1 76.71 AAATTGAAACAAATTGCCTAGGAAAACAAATAAACATTGATTGAAATATAATTTCAGCGAGGCGATGTGGCTTTTCTAGGGTGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chrX 9342421 5' + 1360 38 1 59.59 AAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATAC:1 + chr3R 21570500 5' + mdg3 5344 2 80.14 TATATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chrX 16243798 5' + 412 12 2 75.17 TAGGCAGGCGGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAT:1 + chr3L 17447411 5' - Tirant 375 2 68.49 ATTTACGCCGAAATTGCAGCGAAACCCGGGATTTACGGATGCCAAAGCTGACTAATTCGTAGAGGCGCCTTCAATTCGCACTGCTCATTATTGATGTTATGCCCAAACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAG:1 + chr2R 24401994 5' - R2-element 3350 1 60.00 ACGCATCCTCATTACCAAGCCACGTCCACGTCCTCCTCCACGTCTGCTTCCACTTCCAGTCACCATCAACATCATCTCCATCATTCCGTCCCCACTTCTTCCTCCTCTGTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCT:1 + chr3L 572821 5' + Doc2-element 354 1 77.40 TCTTACAGAAATGGGAAGAAAGGTTTGATGGAACAGTGGAAAGTTTATCGATAGAGGAATTTCTATACCAAGTGCAAATATTGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTC:1 - chr3R 1513552 5' + Doc3-element 4411 1 54.79 AATAATTTATAACTAACTATCTATATAAGATAAAAACAAAAAAATATTAAAGCAAAAAGACTGGTTAAACTAAATTATTGCTGTACTCTCCACTATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chrX 12551846 5' + pogo 22 1 70.55 ACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGC:1 - chr3L 16264679 5' - Burdock 6307 2 75.34 ATCAGACAACAATTGTTAATAATAAATGCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 - chr3R 15590104 5' - Transpac 5212 2 74.66 GCTGTGAAGCACATGTGCATCGAAGAGGCGGCAATTAGTGGCAACATCCCAGTTTGAGTGCCAGGAAGAGGCAGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAA:1 - chr2R 9033949 5' + F-element 4529 1 53.62 GAGAGAATCACACGTGTCGCATGTTTATGCAATTTGAATAAAAACTGTGGTTTAAGTGGCCAGAGGTTTTTCCACAGCAGCATGCACAAACATTTTACGATGGTAACTATGTAGATAGTCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGG:1 + chrX 20021628 5' + F-element 4269 1 78.77 CCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr3L 17447539 5' + Tirant 8150 2 64.35 TAATTCAGTACAATAATGTTTAAAGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 + chr3R 15589922 5' + Transpac 4944 2 68.49 TAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr3R 18849769 5' + roo 8749 2 78.08 AAGAATTTAATTGGAAACATTCTTAAAAAGTTCAGGGCATACTTTGAATACAAATACAATCTTTGAGATATCTTCGATATCAAGTTACAAGTATGTTTGCGCTATCAGAAAGCTTTTAAATATATATATTTTTTAAATTTAAATTT:1 - chr3R 14386333 5' + copia 4672 1 45.89 AACAATATAGGCAACTTGGGATGCCGGCTGATTCGCAATTCCCAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2L 15920216 5' + jockey 7 1 65.04 CACTCGTTTTGCGCGGTCTCTCAATGCACACAATTTATGCCATGACAACAGATTTATAGTTGCTTTAGATAAATTATTGTATAAAGGATACTTAAGGAATGATCAACGCACTGTTACCCATGCCGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 + chr2L 15884730 5' - jockey 4944 1 66.44 AATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGAGAAAGTTAAACAC:1 + chrX 10571340 5' + Doc 78 1 68.49 GACTATGGGGCGAATGGAAATTAGAAAATGCCCAGTGGAAAATGGCTGTAATTTTGATGATCCACATGCGTGGAAAACCAGATGTTGATCCTGAGTCGTATTGGCCTATAAGCCGCTTACCCTCCCTTTCTAAACTATGGGAGAGA:1 - chr2R 19694900 5' + Helena 210 1 78.08 TTAGCCCTCAGGTCAGCAGCATCAGACGCTAATTATTGAGGAGTTTGAACCCGACGTGTTCCGTCAACTGATCGAGTATATTCACACGGGCTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCCACGACCAGACTTCGTTC:1 + chr2R 16644742 5' - invader1 114 2 63.01 CAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chr3R 29708962 5' + blood 7070 2 59.59 TTTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACA:1 + chr3R 25508372 5' + Stalker2 63 2 60.27 AGTACTTCGGTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAA:1 + chr3R 27845483 5' + Stalker4 76 4 68.49 CTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:3 + chr2L 20984278 5' + blood 40 2 55.48 GAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATAAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCAC:1 - chr3L 10076377 5' + X-element 86 1 66.44 CATACACTGCAATAGGGATTTGGGAAACCCCATCCCTTCGAAAACATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr3R 20452161 5' - blood 337 2 57.53 GACTCTGAGACCTTCAATGCCGCTATTTTGGAAAGCTTTATAGAATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2L 17162716 5' + blood 7025 2 73.29 ATCCAGGTCTCTTTGATACCATTTGGCCAAAGCTGGTTAGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2L 2357241 5' - P-element 2864 1 69.86 CCGGATTTATTCCTGTTTCGATTCGGTTTCGGGTTCTAGCTGTATTCTATTGACAATGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 30568803 5' + roo 63 2 62.33 ATGCACTAAATAAATTAAAACTGAATGGATGTGTACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTT:1 + chrX 18709579 5' - BS 4965 1 76.03 CGGGCAGACATGAGTTCGTTTATTTATTTATACAGCCTGGAATATATCTTTGCCTTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAAT:1 - chrX 2873210 5' - roo 429 1 62.33 AAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACACAGGAACAGCCATACACAAAAT:1 - chr3R 6053053 5' + Quasimodo 66 2 67.12 ACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCTCTCT:1 + chr3L 3540144 5' - mdg3 159 2 71.92 AATGAGGAAAGATTTCTGGGTTAAGTGGAAAAGTGAATATTTGCATAAGCTCCAGCAAAGGAATAAATGGAAAAAGGAATACAATAAGAAAAATTGCAGAGAATGCTATAGTCGAATTTCCCGACTATCAGATACTCGTTACGCAG:1 + chr3R 19447845 5' - INE-1 547 1 54.11 CGTGAATTGCATTTGCGCTCGAAAAGCGAAAATGTAAAGGGAAAAAACAAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr3R 10079255 5' + P-element 22 1 70.34 AATCATCTCCGGAGCGAACTGAAGACGGAGAACGTTAAGGTGACAATCGGAAAGTTGGACAAAGATCCGGTGGACAATCGCCCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTT:1 - chrX 8468568 5' - mdg3 367 1 55.48 AAGTGGATGCACTATCCTCACAAAGTTTTCGTCCTGTGCAGCACAGCTTTCTTCTTCTCACTGCATGATGGATGGCCTAAGGTTACCTAGGCGAAGCACCAGCCTTAGAAAGGGGTTCCCACGTAGGCCACGGATTTCCCCCTGGC:1 + chr3R 25777104 5' - Rt1b 298 1 52.74 GAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1 - chr2R 20362309 5' + diver 5941 2 55.48 TCAGTGAAATAAATTTAGACAAAAGTTATAATAACATTAGGTAGCCTAAACCACCTCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGACGGCGG:1 - chr3L 12913741 5' + Rt1b 4834 1 62.33 GAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr2R 7404650 5' + blood 7049 2 56.16 ATTTCCCTAAAAACTTCAAAAGGTGATAGGGATAGTTGGTACTGATAATTAGCTGCTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTT:2 + chr3R 25870825 5' + 3S18 68 2 60.96 GGCGGCCTACTCAAGGTATATTATGGTTCACATATTGTGCGGCAACTTTAAGTTAAAGAACTTTTAAAGCCCAATAAATATAATTACAAGATCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACGT:1 - chr2R 22340570 5' - INE-1 123 1 56.16 TATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr2R 18807784 5' + jockey 82 1 66.67 AATTGTTTGGTGTCAACGCCTGGGGAATTGATGGCTATGAGTTGGCTACATTGGGAAAAAGGAAAGGAAAGTGATCTATCTGTATGAAATGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCA:1 - chr3R 30266598 5' + Tirant 8243 2 56.85 GCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAACTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 - chr2R 14562286 5' - Burdock 6373 2 44.52 TACGTGCTCAAAGTTTTGCATACACAACACCTACAGTACAAGCCATCAGCAGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr2R 982465 5' - HMS-Beagle 231 2 75.34 CACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr3R 24228993 5' - opus 459 2 58.90 CCCTGCGGCCATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGTGTTAGTGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGCGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 17747557 5' + Tirant 7 2 77.78 ACTTTTTTTCGGTTTTTTGGCTAGTTTAAGAATGAATTTTCCATCTAAATTTTGCTCATCTAAATAAAATATAGTATACATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 - chr2R 4564683 5' + flea 40 2 58.22 GGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGT:1 - chr2R 2949119 5' + 17.6 6997 2 67.12 CCTTATTTCCAGCAGTTCGTTTCGTTTGGTTTCGTTTCGTGCCCTGCTGTTTAGCTGTGTGTTTTTGCGGCAGAGGCTCTTAACTAGATGAAATGAGATGAGGACGAATGGGGCTGGGTGACTGGCATTTATTTTCCATATATTG:1 + chr3R 19717673 5' - transib2 265 1 52.41 GCAATCATAAATTGCTAAGGCCTACTCGCCGAGGATCCTGCAGGATTCGTTGGCAAGCACCAAAAGATGAGGGAACACGTTTTATTCTGGAAGAATTCAATGTTTCACAATTGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGT:1 + chr2L 19638117 5' - aurora-element 4210 1 50.68 TCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr2L 2464308 5' - pogo 2070 1 56.03 GAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATAAC:1 + chr2R 7223677 5' + blood 84 2 74.66 AGTGGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chrX 22517737 5' - 1360 3372 1 64.38 CTTGAACACCTTTTCTTCTGCTTCTTCCTCCTCTTGCTCGTTTTCTGTTGCTTACTGTTAATGCGTTTTACGTTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTAT:1 - chr3L 20357595 5' - Burdock 322 1 56.16 GATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTC:1 - chr2L 20561498 5' + P-element 45 1 52.14 CGCTAAATCAGTACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr2R 18123366 5' + 412 7 2 75.34 ACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr2R 18882641 5' - roo 8984 2 76.71 AAGGTGGGTCTCGACCAAATCGCGGATCGGGTGCAGTACCGCCTTCAGAAGGATGGGAAATGGGAATCCATGCACGTGTCCACCTAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 8272560 5' + roo 8679 2 70.71 CCTGGGAAGGATATCCGGTAATGTTCTCAGTTTTGCTCCTTGTTCAAATGCATTTCGCTGGCTCCTTGGGTATATTATCCTATTCACATACACCTTATTGTAAGTTAATGTGTTAATTAAAGCTGATATTTTTTATATTTAAAATT:2 + chr2L 17104609 5' - transib4 2576 1 27.40 GATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chrX 22517710 5' - 1360 3345 1 49.32 GTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGAT:1 + chr2R 14562096 5' + Burdock 6182 2 54.11 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGC:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5365 2 69.18 GAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 + chr3L 19397023 5' + F-element 71 1 58.90 TTGTAAAACAGCTTTTAATTGAAACTAACAATTCCCATCACTTCTTAATTTAATTATTATTAATAATATTTAGATCTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1 - chrX 14914463 5' + mdg3 46 2 52.74 TGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGCTACAAAAACCTG:1 + chr2R 2666337 5' + Rt1a 77 1 63.01 AATTAAATTATAGAAAACAAAATCCGTCCGGTTTCTTGTTCATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGG:1 + chr3R 21571666 5' - mdg3 5267 2 71.92 TTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAGAA:1 + chrX 10960228 5' + Transpac 5008 2 78.77 TATCACATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2R 18123515 5' + pogo 62 1 60.27 AATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTTTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2R 15080006 5' + roo 8721 2 55.48 CAAATTAATTTGCATGGACCAACCTTTTTTTTGTGTGCCAACAAATAAATCAAATAATAAATAGATGAGTAAATTTGCTAACTGAGACGAGGTTTAAAGAAATAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr2R 16713125 5' + pogo 14 1 34.25 CATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 9938680 5' - roo 333 2 69.86 AAACATACAAACACAGACAGGCGGACACACATTCTCCCAGTCACACACAGACACACACACACATACACACACACAATGAGAGACGACATTCGTATGGTGTCGGGCGTATGGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGC:1 - chr2L 4110068 5' + Rt1a 16 1 58.90 GAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTT:1 + chr2R 981617 5' + 1360 40 1 62.33 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:13 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 CAATGTTATAGAACAAGGTAATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr3R 23507523 5' - 412 484 2 78.77 CTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3L 9242071 5' - roo 328 2 71.23 AGCAATGTTCTGGCTGACTTTTCGTAGCAAAGGATCACCCTACTATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAA:1 + chr3R 27786523 5' - Tirant 383 2 71.54 AAAAGCTAAAGAAAATCCAATCTAACCTAAGAAAGAAGAGCAATGGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 + chr3R 8894880 5' + 1360 74 1 67.83 GGAAAGACTTGGTATTTAAACCATAACTAGATTAAATATAATATACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 - chr3L 15891084 5' - mdg3 171 2 71.23 GGGAAAGTATTGTAAGGGGTTTGCTTAGGTTTAGCTGGGCTTAGTGCCTTTTGTGGCCAACTTGTTTTCGAGGATGGTTCCTTTGTCTGAAATGTCCAGAATACGGAATTATTTCCACTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTT:1 - chr3R 20225484 5' - R2-element 3223 1 78.77 ATGCGGTGATGGTTGGGAATGGCAAAAGCAAATATTATATAATAAATTATATAGCACTGGCTAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAG:1 + chr3L 3762153 5' - roo 409 1 78.77 AAAATTACTCAACAAATAGTGGCATTTATCAGTACTTAATGGCAATGGCACGCAACTCTCATTTGCACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr2R 18721889 5' - 412 7524 2 66.21 AGGCGTAACTAATCAGCACAGGCAATGATATGGCGACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAA:1 - chr3R 11461908 5' - 17.6 7396 2 70.55 CTCTCGGAAAACCACACGCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3L 13227734 5' + hobo 35 1 61.64 ATTTAAATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTA:1 - chr3R 21150653 5' + Burdock 6195 2 63.01 GCATAACTTCATTCTTGTTTTATTTAGTGATGCTAACGTTGGGTTGGAAATCAGCTGATTATGACTATGAACAATAAAGTTTGTAAGTCAAACAACGATTTTTCGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2L 14358990 5' - pogo 2085 1 75.34 AGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1 + chr3R 10973232 5' + jockey 101 1 78.08 GGAAAACGCAAAAATAAAATCACAAAAGCGTCCGGGAGGCGAACGCTTTGACTTTCGGAGGCAATAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 26399782 5' - roo 353 2 56.16 TGGACCAAACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCT:1 - chrX 21639702 5' + Tirant 80 2 73.97 CTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAAC:1 - chr2R 5022780 5' - Gypsy12A_LTR 83 1 53.42 TTTCCATTTACGAGCCAAGGTGGCAAGGAACTCCAGCCCAACAACCATATGCCACATGGCACCTCCATTAGCCAAAGGGCAGTGTCCATGGGCTCTAAAATTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 + chr2L 8294711 5' + 17.6 6952 1 68.28 GCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chrX 3452525 5' + Tirant 8144 2 54.84 ACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3R 25271147 5' + 412 7088 2 62.33 GCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr3L 13722135 5' + blood 45 2 55.48 TTTGTGGCCGAAAAATCGTCCGGCGGTATATTAGTTTACTTATCTGCGAAAATTATTTTTTTTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTT:1 - chrX 18034677 5' - Juan 4146 1 63.70 AAAAACGCCGAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3L 15035247 5' + pogo 33 1 61.64 TTATAAGTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3R 10140145 5' - P-element 2867 1 67.83 AAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 + chr3L 3979575 5' - opus 7438 2 63.01 AAGCGCAGCAAGGCAAATAAATGGCCACGCCCAACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 7424501 5' - 412 467 2 67.12 GTTTGGTTCCATTTGTAATCGCTCATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATC:1 + chr3L 16157153 5' + Juan 20 1 70.55 TAATGCAATTTTAATTTCCTGGCTTATGTAGTACATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 9345539 5' + pogo 33 1 61.64 AATTTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2L 2464194 5' + pogo 51 1 54.79 CAGGCCAAAAGCCAGTTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTTTGTGCTTATTCAATATTAAGAACAATTAATTAAAAAAGCATATTAACTTATGGCAGCATTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chrX 3529741 5' + 412 69 2 54.79 TTCCACAGCTACATTTTTCCGGCTTCGTTGGCAGCGCAGAGCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAGTGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr2R 5848925 5' - mdg1 395 2 65.75 CAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr2R 15613868 5' - P-element 2843 1 55.48 TAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAG:1 + chr3R 17316053 5' + 3S18 5838 2 65.07 AGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:2 + chr3R 18846519 5' + roo 81 2 72.60 TTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAGATAAGATC:1 + chr2R 8305230 5' + blood 82 2 73.79 ACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 + chr3L 11665876 5' - pogo 2064 1 45.89 GCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTT:1 - chr3L 13597846 5' - blood 7328 1 60.96 TCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 - chr3R 10468101 5' + opus 7065 4 60.96 TTAGAAAGGCAACCGCAAAATGCGCGGTCCACATGTCCGTTTGGTTCACTTTTCATTTGGCGATCGCCCGCCCGCTTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGC:1 - chrX 9958193 5' + hobo 2676 1 56.16 CTTCCACTGTCCGCCGCCATTATTCCGTCCCGCATCGCCGTTGGTCTTTGTAAATTCCCAAATAAGAAGATTTTATTCGTGGAGTTTTTGTAAGTAATTGATTT:1 + chr2L 535424 5' - roo 9037 1 43.27 AAAAAAAACATCAAAAAAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGG:1 - chr3R 27786660 5' + Tirant 8164 2 55.48 GTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGCTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr3R 25384320 5' - mdg3 223 2 66.44 CTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGT:1 - chr3R 5765440 5' + opus 7054 4 56.94 CGCATAGAATGTACAATTTATTTATGGAAATAATATATCACAAGTAACCCATTAATTTACCATTTAAATCAAGCGGGCATTGCCTCCATAACGATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chrX 16982186 5' - roo 9045 1 61.64 TTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr3R 15030757 5' + jockey 80 1 65.75 CAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 + chr2R 7223682 5' + blood 89 2 79.45 ACTGCCAATGAATATTCAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2L 11668695 5' - mdg1 378 2 54.79 ATAAGGATATCACAGGATAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chr3L 19396976 5' + F-element 24 1 72.60 AATTCGATTAGATGGGGTTCTGGAAAAACCCGCTTTCCGGGATTATTCACGACCCATGAATCTTTTAAGGCTTGCGCCCTTGAAATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chr3R 21521442 5' - Bari1 1669 1 54.11 ACATTTGCCAAATTGTCGAAAATTTCATTTGGCCAGCTCATCCTGATGAAGAAATATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr2R 12703901 5' - blood 363 2 68.12 TAGCCATATATAGCTAATATACGCTGGCTGTTGCTGCTGCTGCTCCAATGATGAAGGCAGATTATGGAAGAGCAAGGCAAGAAATGCACACACACACAACGACACACACACACACACATATCCA:1 + chrX 10970254 5' + accord 186 2 49.19 CTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGGTGGTTG:1 + chr3L 16180906 5' - Transpac 228 2 75.00 CACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 21421009 5' - roo 390 2 68.50 CTGCCCTGGCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 18882553 5' + roo 45 2 52.41 CTTTTGCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr3R 4464132 5' - 1360 3340 1 52.05 CTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 21924336 5' - roo 329 2 73.29 GATATACACGAGATTCCTTGATGTTTGATTGGATCGTGCATAGACGATGCTCATCTTCTTAATTGTTTACCTATTCTCGCTTCTTAAAGAATTCTCCTTAAAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 3506199 5' + Tirant 8 2 73.88 TGGTTAGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr2L 2357274 5' - P-element 2835 1 48.59 GGTCGTCTGGCATAGTAAAGTTGTTGGCAAGGCCGGAATGCAGTGGGTAGTTTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chrX 3524342 5' + roo 8699 2 42.47 TACAGAAGCCCATCTATCATCTTTGTAGAACCAATCTGACAATGCTCACTCATCCGCCATGTGGCACATATATACATTTTTCCTCAAAGGCTTGTTGCATATCAATAAAGACAGCGTTGGAGTACTCGCAGTCGTCAAAAGCCTGT:1 + chrX 14804484 5' - Helena 354 1 56.85 CCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr3L 18708569 5' + F-element 42 1 64.38 TATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTGATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTATC:1 + chr3R 6368613 5' + Idefix 80 2 74.48 AAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chrX 14756765 5' + pogo 60 1 64.38 CCAATTTCCCGCCTCATCTGTCTGTCGGCCGTGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2R 20459987 5' + jockey 9 1 64.38 TCTGGTGTGTTGGATATTCCCCTGGAGGAAGTTGACGACTTTGGCAGTTGTGGCATTAAGATGCGATTAGATACAAGAATGTGTCTCTTCTGCAGAAAAAGTGGTGATTATTATACCGAGCTAAGCGGAGCTGTAGCGTCGGA:1 - chr3R 14271172 5' - gypsy2 6704 2 74.83 CGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGCCCAGCTCTGATCAGTATATGGCTGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 - chr2R 6460796 5' - copia 192 2 62.33 CCAGCCATAGATGATGGCAAATACGAACATGGCTCCCGACCCCATGAGCAGCTTAACCCGAGGTACTTGCATCTCTGGGCAATGTTTCGTGAAACTGTTACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCTGCTTATTTACTAATA:1 + chr3R 21168057 5' - 1731 4428 1 60.84 AAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr2R 21897951 5' + 412 86 2 76.71 AATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 + chr3R 29708959 5' + blood 56 2 57.53 CACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATA:1 - chr3L 13922320 5' - Tirant 314 2 71.92 AACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACAGAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr3R 8402657 5' - mdg1 376 2 52.74 GTTATTATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATG:1 + chr3R 6368608 5' + Idefix 76 2 73.29 GTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAGAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAAT:1 + chr3R 5087038 5' + P-element 90 1 24.66 ACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 25271141 5' + 412 7082 2 66.44 GTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chr2L 16685387 5' - P-element 2812 1 34.25 ATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr3R 10079317 5' + P-element 73 1 29.85 ACACACCACGCTTTATCTCCTCCTATGTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr3R 5087012 5' + P-element 64 1 41.10 GAATGCCTTTTTGCTATCGCTTCGCTCTTCTGTAACCGCCTTTCTCTCATCCTCCTCTTTTAACTTTATGGTGAGAACATCGAAAGAAGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 6340959 5' + roo 31 2 65.75 GTTATATGAATTCCGAAAGTGGTGCATTACTATCTGGAGTCTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCT:1 + chr3L 18296927 5' - Juan 4136 1 71.92 TCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 + chr3R 10778641 5' + mdg3 5308 2 54.79 CTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 - chr3L 22635774 5' - hopper2 1546 1 56.85 ACTCTGCTCTGGGGCAACCCTCTGACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chrX 17258353 5' + 297 6597 2 74.66 ACTAAAAAAATAACATTATAAAATGCTTACTAGCTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 + chr2R 13574702 5' + diver 5899 2 75.86 AGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGTTGGCTC:1 - chr2R 24338430 5' + 1360 62 1 70.73 GTCAGTAATTTTTGGCTTCAGAATACCTGGGCTTGAACCTTGGCTGGCGGTAGAGCTCTACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATT:1 - chr2L 22298991 5' + baggins 5160 1 67.12 CGGCATTCTCAATGTCTGCTTCTCGGTGGGCGTGCCGATCGGAATGGCCTTCAGTGGAGTGCTGCTCAGAAAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAATTTTCATATTTGCTT:1 - chrX 14759292 5' - TLD2_LTR 127 1 51.37 TCTCTGGCAAAACAAATGAGCTTCCTTTTCTTGTCTCTCTTTTTTGCGTGTCTGCTTTGGTTTTGGCGAACCTCGGAATCATTTTAATTGCCACAGTCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATG:1 + chr3L 20553335 5' + F-element 4253 1 65.75 GCTCCCGATAACTCCTATAAGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chrX 3529704 5' + 412 31 2 64.14 AATATTGATTATTTCACAAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr3L 20925855 5' - Transpac 5172 2 57.53 TTATAACTAACACTCGGCGGGCGAACAGTTAAAACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr2R 17100086 5' - P-element 2838 1 35.24 ATCCATGGGTATATATGGTTTAGTGTGCCGTGGTAATGGGTTTGGTGCCACGTCGTGCCCTGTCAGCAAGATTCCAACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGC:1 + chr3R 15918058 5' - HMS-Beagle2 184 2 56.20 ATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTC:1 - chr2R 6984392 5' - HMS-Beagle2 7116 2 73.97 ATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 - chr3R 9258750 5' + 1360 82 1 73.97 AATGAACAATAGAACTCTTTAGAAGTTACCCAATTGGGCGTCTCATCTTATCAATTTCTTATACATTAAGCCCTCACACGCATGCCAATGGCAATTTCGAAGTTTTTCGACTATCAAAAACCAGTTAGTCAGCTAGTGTGAGTGCG:1 - chr2R 21972678 5' - INE-1 533 1 67.81 GAAGGAATTAACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 - chr3L 6751765 5' - pogo 2048 1 55.48 CAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr2R 18123430 5' + 412 71 2 65.75 ATCATCGCAATGCCGCAGTCAAGTTCGGCAAGTAAACTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGTGAGTGAAAGGAATAGCATTCTGAGAGTCGT:1 - chr3R 15974783 5' - P-element 2808 1 30.56 CCAATTGGCTATTTTCTGGTGTGATGTGTGTGGAGTATGGAAGATTATTAAACTTTTATGAAATTCTGTTATTCAAACCATAATCAACGGTTTGGCTTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAG:1 - chr3R 18847419 5' - Stalker2 7627 2 65.75 GCACGCAGGCCGTGTCATTTGACACCACTCGGAAATCGTTGCGGTCATACAGACTGACAGACCAGATGCACTATGCTAGTGATAAAGCTCATCTTTATATGTATGTACAGCTGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAA:1 - chr2R 5741567 5' + HB 23 1 77.40 GACAGCTCGACCATCGCAACGCCGGCCGGTTTGGACGAGGACACGGGCTTTGTGAACGACACCAAAACGACGACAACCGGTGGCAATATTTTTTCCTTTTCTACTCAATAATTAAGAAATCACTTGGTCTCATATACATTTATACA:1 + chrX 13652949 5' + G5 4757 1 60.27 CAGACATGCGCAGACATGCGAGAATCCAACAAGTGCGGCATGGAAGTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chrX 15089448 5' - P-element 2870 1 73.97 CATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAA:1 + chr3L 20925775 5' + Transpac 5005 2 73.29 CATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 5446108 5' - roo 9001 2 66.44 CATATTGATTTTGCCAGCAACAATATTTAATGATTAACAATTAACATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr2R 20913246 5' - 1360 3364 1 68.49 ATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTT:1 + chr3L 16157202 5' + Juan 69 1 66.44 TTCAAACAAAAACACAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCATTTAATAATCAAAATAACTTCACTAGGTTACGTTATTTTTCAAAAGGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAAT:1 + chrX 6839186 5' - 412 202 2 73.29 CTCACTTCAACTTGAAGTCTAATTCATTTACTTTAATACCACATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTC:1 + chr2L 21582216 5' + INE-1 34 1 53.42 CAGTACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr2R 18123374 5' + 412 15 2 69.86 GTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 + chr3L 22221142 5' - 412 7474 2 63.31 TAGGGTTGAAATATATCCTTTAAGTGCCCCCTTTCCTTGTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:1 + chr2L 6406488 5' + transib2 78 1 68.49 GCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGAT:1 + chr3R 10973215 5' + jockey 84 1 66.44 GTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCGAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr3L 4710721 5' + Doc 63 1 54.86 ATCCTGTTCTGGCTCACCTTCCACTCTTACTTACTTGTAAGACTGCCGACAAGCGACTGACTAAATTCGGAGACTACATCCGAATCATGATGAAATAACATACGGTGGTCCCGTCGAAACAAAAGATAATTGGAAACTCCAAATTA:1 - chr2L 18823615 5' + P-element 2670 1 58.22 GTGCGAGCGGTAGCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 10142902 5' + 412 32 2 62.33 TTACTCAACGGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr3L 2036982 5' + Doc 44 1 57.53 TTTGGCGTTGGTTTTTGCTTTCATAACAGCTTTGCTGGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 - chr2L 19878295 5' + mdg3 5277 2 69.18 TCTTGAAATTCATTAGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTTCACAGTACGCATACAATGCATCGACAACAGAAGTGGGATCTCCCAAACCTCACAACT:1 - chr3R 14401947 5' + invader5 362 1 68.94 CAAGTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2R 16409996 5' - opus 459 2 56.52 GAAACAAGGAGGAGAAGACCCAGGTAAGTGGACGCCACATCAACACAATCATCCGCCTCACATTGCATGCTGCATGCGATAGTTAGTGCCGCCGCTCTGCATACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGG:1 - chr3R 8796706 5' + Quasimodo 381 2 64.38 AACGATCGCTGGATTGACTTCCTCAGCACAGCGCGCTCGTAGAGATCGGGATGAAGATACTCTTCTGTGCCGTATAGAGAAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCT:1 - chr2L 20676957 5' - hopper 1239 1 54.79 TGTGAACCGAGGCGAAACCACTTGAAAAATTATCTGCAACATGTAAATTCAATTTTCATTGTTCTTTATCTGTGATGGTCTCGCTCTCATTAAGTGTTGGCAAGTGAAAGTGTGGCGACTTTTGCTAGCTAGCGTCGCTTTTCTTT:1 + chr2L 7312231 5' + G5 160 1 59.59 GGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1 - chr3L 16180984 5' + Transpac 4973 2 54.79 ACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGC:1 + chr2L 14222249 5' + Transpac 64 2 64.38 TATCAAAAAGATAGATACAATAGATAAAAGAATACGAAAATAACTAAATTACAAACAATGAAAATTTCAATATCCAAGTTAGAGGCATTTTATGTATAGCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGC:1 - chr3L 24416607 5' - Quasimodo 7167 2 69.18 GGTTTAACAATGAGCACGGATCAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 8397119 5' - roo 394 1 70.77 CGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATC:1 - chr2R 5022773 5' - Gypsy12A_LTR 76 1 50.68 TAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chrX 12843608 5' + roo 84 2 77.93 ATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAGGCC:1 - chr3R 27835655 5' + 412 7142 2 74.66 TAAATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3R 22846670 5' + 412 28 2 67.12 GCAATCTGTCAAATTTTGCAAATTGGCTCGGTTTCCGTGGTTCACTGACAAAATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 - chr2R 21227482 5' - mdg3 5471 2 68.49 TATACATAATACAACTAGAGGGAAATTTTGTTTCGTAAGTGGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:2 - chr3R 15030807 5' + jockey 29 1 69.18 CCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTA:1 + chr3R 23108080 5' + G-element 78 1 72.06 GAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 + chr2R 6984290 5' + HMS-Beagle2 30 2 61.65 AACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3R 29708923 5' + blood 20 2 65.75 CATCGACCATTGGCCATTGGCCATATGTTGACCCGGGTCGGGACTATGCTGCTCCAGGTAATTACATGATTTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACTTCCACCCGATA:1 - chr3R 26782811 5' - hobo 2916 1 62.50 AGAAGGAAAAGCGCTGGATGCGAGAAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCC:1 + chr2L 11158608 5' - Rt1b 5099 1 57.53 ATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 - chrX 14692943 5' - Transpac 249 2 63.01 ATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 + chrX 10571333 5' + Doc 71 1 65.07 ATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2R 24338464 5' + 1360 51 1 53.42 AGTGCTAAATTGTGGATGGCGAGGATAAATATCGGTGGGCTGATATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr2L 12481559 5' - pogo 2077 1 66.91 TGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCA:1 + chr2L 15621874 5' - hobo 2865 1 79.70 TGCTGAGCCAGAAATGCAGCTTGACTATTTTTAATTACCGGGCAACATCTGCTCCATCTTCAGCTCCAGCTGCCAGCCAAAGTGGGGTGGCCAGTGGTCAGTGATGGACATAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3L 659041 5' - P-element 2828 1 77.62 AAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGTATAAATAAATGTCT:1 + chr3L 15058851 5' + blood 60 2 57.55 AGATGCTGCTACTTCGCCGTTGCCACAAGTTAAAGTTGCGTCCATTGGCCCGTCTTTGCTCCGCCGAATTGATACATAAGGTAATATATATAGGGAGATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 + chrX 7329158 5' + Bari1 20 1 71.23 TTTATACAAACACAAAATGAATTAGTGATTTTTATGCTCTATGTTTAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 30568941 5' - roo 9050 2 62.33 AATATTCCAATTGCCACAGAAATTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372609 5' - Doc2-element 232 1 83.65 CACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACACTATATTGTAGTATGTGAATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3R 29708919 5' + blood 7027 2 61.64 GGTCACATAAAAAACCAGACAAGAGCCACAAATAACGATTCCTAGGCTAAAGAACGATGGTTTAATTGTCATTACCTATACAAATTTGTAGCATCATTGCATGAATCTAAAAATAACCCTCTGGTGGGAGTCGTGAATGCGGCAGC:1 - chrX 498197 5' - Quasimodo 317 2 78.77 GGTGTTTGCCCGGCTTTTGTGCGGCCCGTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3R 7424668 5' + 412 7082 2 64.14 AGCACTCTTTGTTTAGCTTTAAGGGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCG:1 - chr3L 11596403 5' + gypsy6 7437 2 73.29 AACATTCCACTCGACTGAGACCGTCTACATGCCTCACCTTTGTTCCTGATCTAGGTTCGATTTCGTAGTCATAGTATTGTAAAAACATTGCCCACCTAGCTACTCGCAACAGCACACAATTCAAGAGCATCGATGGCTGTTTTGAG:1 + chr3L 25485227 5' + mariner2 492 1 76.71 ACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTA:1 + chr3R 15589971 5' + Transpac 74 2 69.18 AACAGTTTTTGCTAAGTAAATCACACAGCATTTCCACGCAGTACCGCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2L 18048202 5' + blood 7019 2 78.77 CTGGGATTTCCGTCTATGCTGTAGCGTATTGTAGCCGTTGATGGCGGATATGGTGGTTATGTTGTGACCTCCCTGGTTGGGCTGCTGTTGCCGTTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTTAGAGAGACAACATATGGTA:1 - chrX 11674194 5' - Tc1 109 1 67.15 TGGATAATTTTTATTAAAAATCCTTAACAACGCTTTCCATTACTACGACATTGAGCGTATGAGTACTAAAACCACTTTATAGCTTTTAAAGGACAAGTGTATGATTCGTGTAATGTACACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr2R 8862196 5' - pogo 2095 1 78.77 CGTCGAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr2R 7223618 5' + blood 25 2 67.12 CGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCG:1 - chr3R 22810780 5' + flea 4824 1 70.34 TCGGGGTGTAACACCATTAAAATTCCCAGAATATGGAATTTGGAGGATGGGACCTCAATGGTTAGCCAATCCCAATTATTATATTTCTAAAGCTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAAAAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACA:1 - chr2R 1638250 5' + hopper 218 1 51.37 AATAAGAGTGGTATGGGAAATTATTGCAATATTAAAACATTTCCATGTGTATCTACACATCTTTCGAAGATGCCTTTCGCTTCCTTGTAAATATTATCTAATGGCAGGTTACCTTTTTTTCCTATGTATCTACATATACATATGTA:1 - chr3L 19462747 5' - Stalker2 7501 2 62.33 ACATATACTAAACAAAATGCAAACCATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCACAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 23043104 5' + roo 44 2 54.11 TCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTC:1 + chr2L 1229545 5' - opus 7481 2 66.67 ATATGAAAAATAGCCTGGATTCTTTGTTAAATAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCT:1 + chr3R 12559675 5' - mdg3 161 2 76.03 GGTGGCAACGCTCGCTAACAGACCGAGAGCTCCACTAACAAAACAAACATTTTGCTACTTCGTCGCAGGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2L 21237204 5' + P-element 49 1 51.72 GCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACACTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 - chr3R 9163926 5' + hobo 83 1 76.03 GTGTCGTCATCGCCTTTAAGGATGTCACTCGTTTCTTATCTGTGGGGAGAAACGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr3R 9168938 5' - hobo 2894 1 54.11 GGCTTTCGACGAGCTGGTGCCGATTGCATCATCACCTACTACACACCCTTTCTGCTGGACATTATCGGAAAGGTCAAGTAATGGTCTACGTCCCATGTCCGATGTCTTGATACCATTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGG:1 - chr3L 12270351 5' + R1A1-element 5051 1 78.08 GCACATAAGGTACAATAACTAGACGACTATAATTATTTAATTGAAATATTGTATGTAGGAGATAAATATGAGAATTACATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCA:1 + chr2R 9247855 5' - Q-element 221 2 58.22 CCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGGGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAAC:1 + chr2R 14562134 5' + Burdock 73 2 76.30 GACTTCGCCCCAGACTGACAAGTGATCTTGGGGCTATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGGCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3R 4885278 5' + 1360 19 1 71.23 ATTTAGCTCTTATTACACACATTAAAATGAAGTCAGCTCCTTCATATATATGCATATATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr3R 21517996 5' + 297 6637 2 68.97 AAATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCA:1 - chr3L 23597294 5' + invader4 2760 2 70.55 AAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3R 10143043 5' - 412 7496 2 51.37 GCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGGGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1 + chr3R 16194139 5' - mdg1 342 2 68.49 CATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGAC:1 + chr3L 18468350 5' + jockey 4730 1 58.62 ATCGAAGGAGTCGTCAGCATGGGGATTTAGTGATCATAAATTAGTTACGTGAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATACCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3L 19146685 5' - pogo 2045 1 59.71 GCAGATGTGTCACTTGGAAGAGTAGAGAATGACCTGGTGAATGGATTCATTCAGACATTGTTCTTGGAACATTTATAAGATACGATCTCTTAAAGAAGTTACGATTCATTTTCACCTTTTAAATTACAAATATTAAAGACTATTAT:1 + chr3L 1320689 5' - gypsy7 5090 1 85.62 TATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATT:1 - chr3R 3527177 5' - Tabor 7267 2 53.42 ACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATA:1 + chrX 13061735 5' + mdg3 5343 2 76.71 CCGACTAAATTTCTGAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr4 1149965 5' + 297 34 2 62.33 GTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2L 18581252 5' + roo 43 2 54.79 TAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACCCCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGGGCTTTTCCCATCCATAGATC:1 + chr2R 14562139 5' + Burdock 47 2 70.19 AAAATAATATAGATTTTAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGATGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACCCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr2L 17256612 5' + blood 7042 2 61.11 GTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATG:1 + chr3R 11461776 5' + 17.6 6996 2 67.81 GTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 23099080 5' - roo 388 2 60.19 GAACCAGTGAGAATGGAAAAACACATACGCTCTCTCTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGAGAAAAATCGTGAGGAGAAGTGGGTTTCTGACAACAGGAGGATGT:1 + chr3R 25783136 5' - G5A 107 2 68.60 TAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 + chr3L 1387109 5' + mdg3 44 2 54.11 TTTTGGCCAGCTAATGATTGTTTGATAAGCTCTCCCCGGGCAACAGGGGATTGCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3R 25443184 5' + 297 6592 2 77.40 CACCCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 + chr2R 6984271 5' + HMS-Beagle2 20 2 71.13 GCGGTTTTGTTTACAAAAATCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3R 10140269 5' + P-element 64 1 41.96 GAGAATATTAAATCTTTGATTGCATTCCAAACTTAAAGCAAATACTCTGGGTCACATAGACATATATGACCCGCTCCAAATTTTTGTAACTTAGCCAACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2L 13576105 5' + 297 15 2 76.71 GGATAAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr2R 9326946 5' + mdg3 5285 2 53.42 ATTGTGAAAGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 20905363 5' + pogo 46 1 54.79 CACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1 - chr2L 8772822 5' + Tabor 6904 2 60.27 TAAATGGTTGTTTTGTCACTTTTGCTAATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chr2L 17228567 5' + mdg3 5268 2 75.34 GGAAAACGATCAGTACGTGTTTCTGGATTTGTTTATGTTTTGATTGTGCTAAGCGTAGCGGATAAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 10357738 5' + pogo 51 1 55.48 ACTAAGTCNTAACCACTCTCGCAAAAAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chrX 17469297 5' + blood 39 2 58.90 CCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2R 21380624 5' + roo 8745 2 73.29 GGGATTTCGGATTGACATCGATGTGCGACAATTTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr3L 9375771 5' - mdg1 7449 2 76.71 CGGCTAAATGCAATTGTGGCCACTTCTTGCACTCCCTGAACTTCCTGCCAACGCACGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3L 20290825 5' - roo 399 1 78.08 ACAAATGGAATTTATGTCCGACTGCGGTTATCCACAGCAGCAGCGGGGATATATGGATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGT:1 - chr2L 11668807 5' + mdg1 67 2 63.70 GGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCCCTAAACAAATCATC:1 + chr2R 21056695 5' + Tirant 8135 2 54.74 AATTCGTGCTAATGTGCTTTTGATATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 - chr3L 20747219 5' - Burdock 6354 2 58.90 GGTTACTTCCCAAGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:2 + chr3R 16771331 5' - roo 9013 2 55.48 TCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1 + chrX 18366048 5' + jockey 101 1 79.45 AAAGGCGAATGGCGCCACTTACTTTAATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGGATGTGGCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2R 10367437 5' + 412 26 2 66.44 CAAATGGATTCAACACAAGTCGACGGTGTAAAAATAACAACTCGTAAAAGCAAAACGAAAATCAACTTAATTTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chrX 10538242 5' - pogo 2055 1 54.11 TCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGCGACGAATAGCAAG:1 - chr3L 20747179 5' - Burdock 6315 2 75.34 GGATACAGCGCAGTCGCAAAGAGCGACTTTCTCTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2R 8686563 5' - hobo 2922 1 59.57 GTATCCAAAGCCGTTGCAAAATGAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2L 1073872 5' + Tirant 8128 2 71.83 ATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGGGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATTCAATATTAAGAACAATTAAATTAAATAGCATATTAA:1 - chr3L 22221265 5' + 412 32 2 62.33 GTGGAGGGGTTGACGATTCTAATAATGTCAGTAGTTCTGGAGTTTAAGATTGACGTATTTGTTTGTATTTCGTACATATCTACAGCTGTGTTAAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGTGTTTAAGATAAAAAATTCTTATGA:1 - chr3R 5367049 5' - HB 1585 1 71.92 ACTTGTATATGCCGGCCGGCAAATGGTAATTCAGAGCAGGACCACAAGCAAAGTGAGAATGTGATGAACGGCAGTGCAAAACAAATCGCTGATAGCCAGTTATCGGGGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAAGCAT:1 - chr3R 26988634 5' - invader1 3946 2 77.27 TTTCATAAATACTTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 11534543 5' + roo 8718 2 56.16 GATGCGGACATTGAACCTTGAAATAGACCTTAGAGTGATGGCGAAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTG:1 - chr3R 24958470 5' - F-element 4243 1 73.97 ACAATATCGAAAATTTATGGCGCATCAGCATCAGTAACTCGAAAAACAGTAGCCGCATCTGAATAAAAATCATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCA:1 + chr3R 31162149 5' - invader2 5036 2 51.37 TTTCAATCGGCCAATGGGAATTTTTTTAGAACAGTTTAAGATTTAATTGTGAAATGCCCCACCTTGGTTTAATGTAATTTAATCTTAATGACAACAAATACGTTGTACAAATATAACTATCTGTAGTACATATATACATATTGTAC:1 + chr3R 31953732 5' + gypsy11 4003 2 56.16 TTCCGAGCGAAAGCCCAACGATTTAGCCGTAGTGTTTTTGATCGACTTTTTTCCCTTATTTACTTTTCACTTTGATATCTAACCACAAAGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCACGAC:1 + chr3R 19764815 5' - micropia 2 2 60.96 TATAAGAACGTAGCTCTTCAATCCGATTGCCAGCATTCAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chrX 2872857 5' - roo 411 1 73.97 ACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAA:1 + chrX 5439999 5' + accord 64 2 67.41 CCAATACAAGTGGCCTTCCATCCGCCGTAGTTGCCGCTGGGATCCGACTGGTACAGTTGGTAGCCGTACTTGTTGTCCCATCCCATGTCCGGTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTTTT:1 - chr2R 20995709 5' + pogo 299 1 63.70 AAATAGAAAATAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGGTTTAAGTTGAAGG:1 + chr2R 9233312 5' - 412 466 2 66.44 GACCAAAAATACAGGAGCCAGCAATACATAGATGCCAAAATCTCTCCACGGTACATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAGTCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAAT:1 - chr2L 18867838 5' + G5A 2808 1 73.97 ACCGAGAGTAGGCAATTTGAGACTTATCGGCGCTTTTTTCTGCTCCAGCATGTGCAACAAAGTGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAAATGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTACATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 3263689 5' - accord 185 2 81.51 CTCTCTCGTTCGCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCACCGGCTG:1 + chr3L 17668110 5' + F-element 453 1 81.58 CTACTAAGTACGCCGCGTATAGTTGCCAAGTGGGCGGGGCGGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTT:1 + chr3L 22354381 5' + Doc 19 1 73.57 AGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTAT:1 + chrX 18239348 5' + jockey 4555 1 52.05 GAAATCCCCGTATTTGGCTTTAGTCAACAATTCCTGACTCAAAGTGGGTTTGCGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAAGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chr2L 9010431 5' + 1360 71 1 65.07 CTTCGTATACACACAAACAGACACAGATACATAATAATAAGAGATGCACGGAAAGAAACATTTGCTTATTGTGATCAAATTAGGTATATTCAGCTTATGGGGATTAAAGAAGAAATTAAAAACATTTTTAATAACATCTTTTTAAA:1 - chrX 16580333 5' + hopper 166 1 76.71 TATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTCGTTGCATT:1 + chrX 14385134 5' + blood 7055 2 55.48 ACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chrX 983214 5' + 412 7122 2 63.70 AGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chrX 2873436 5' - roo 327 2 72.60 CAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr3L 9571675 5' + jockey 91 1 75.00 ATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTA:1 - chr3R 15514605 5' + 412 7126 2 66.44 CAAAAGGCGAAATGCGCGCGAGACAACGAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chrX 8895307 5' + roo 8725 2 60.27 ACCTTCGAATGAGTTAGAATACTGCTAAGAATTATTGCTTATTTCAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr2R 9815027 5' - pogo 2033 1 68.28 ATAAGGATATCACAGGATAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTATATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chr3L 19396976 5' + F-element 24 1 71.23 CTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGCCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCC:1 - chrX 10728915 5' + springer 50 2 56.06 TGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATCTAACCACATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCT:1 - chr3R 2689452 5' - diver2 4473 1 70.40 TTCACTTCCTCGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr3R 10467980 5' - opus 457 2 57.53 CTTTTAACCCCCCATGACCCCGGACCAGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr3L 17447597 5' + Tirant 8123 2 76.03 CTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTT:1 + chr3R 15649769 5' - blood 7325 1 60.96 CGAACAGTGAGGAAAATTTGCATTTCCCTGGCCCCAAGCGCTGCCATAAAAATCGCATCCTGAACGCATATTTACACGCCGCGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 + chr2L 10650288 5' + Doc 4 1 81.51 GATAATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 + chr3L 18468339 5' + jockey 4720 1 51.37 ATTTTTTCGATTTGATGCTCAATTTAATGGAAAAGGGAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:1 - chr2L 17228739 5' - mdg3 5463 2 60.96 GATGATTTGCGGTCTAATGCCCCAGGGCAGGCGAGGCCTGGGCTTAATCAGAGATTGCAGATGAAAGCGACAAGAGCAAGGCAACCAAGGATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2L 497187 5' + roo 8722 2 60.96 ACACCTGAGGCAAATGATGTCAGGTCTTTTTAGATATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAA:1 - chr3R 27503101 5' - hobo 2857 1 75.34 TAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 + chr3R 10778652 5' + mdg3 67 2 62.33 AATTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 23449234 5' - roo 9022 2 52.05 GACGAGTTTCTGCAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 23099057 5' - roo 9036 1 60.27 CACCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTA:1 - chr2L 13877760 5' + Transpac 74 2 68.49 ACAACCTGGAGATTTTTTCAATTCAAGTATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 15167798 5' - roo 388 2 71.23 TGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr3L 15058830 5' + blood 7056 2 46.21 GTGTGGTGTGTGCTGTGTGGCGATTTTGCCTTTGTATTGGTGTCTTGGAATTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATAAGACTGACTTTCTTGAAATTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGT:1 + chr2L 14625034 5' - Tirant 8362 2 62.33 ATCATTGTGATATTAAATCAGCAATAATTTAAATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr3R 21150679 5' + Burdock 33 2 60.27 GATTGTTTTAACCCTAGCCGGCTATTTAAGCCGTTAGGTTAGGTTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3L 22676392 5' - 412 456 2 59.59 AGAGACACAGACGGTGCTGAGATTGGAGTTTGAAGTTTGTTTATCAACTGGGGCAGAGTGCTATATTTATTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chrX 21933001 5' + 1360 84 1 52.05 ATCTCGTCTTTGCTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCAGACACTCAACCGG:1 + chr2L 19424635 5' + Tirant 8149 2 57.04 ATTATTGTAATTGTACTGTGTATTATGATTTTGCTAACCAAAATCCCTTAGTATGAGATGCTCATCGATATTTCACCCCCATACACAAAATCAAATCAATTCGAACCAAATGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCA:1 - chr3L 16403881 5' + 3S18 81 2 75.34 GGGGAACTTTTCCGGATGGGATTAATTTGACAGCAAAGTGAATGTGTACTTTTGAGTATTTGGCCGAAACAGAAACTGTCAGCTCTCTGTGCTTTCGGACATAAAAAAAATACACTTTTGCTCCCCGGACTCCACGGAGCAGCCAG:1 - chr3L 18694228 5' + Gypsy6A_LTR 321 1 71.92 ATTGTCACTCCAGTCGAGCTGAAAAATTCCACTCGAAAACGATGGGCATATATGTACATATGTATTTTGATTGCAGTATAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3L 18835414 5' + pogo 37 1 60.27 ATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 20292434 5' - pogo 2033 1 71.43 GTTCTTTTTTTTTTTCTTCTTGTCTGCAACTTCCATCAGTCAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGGAATTGATTCTCTTACATGTTGTGGTTCCTCATAGTCTCCG:1 - chrX 8652907 5' + HMS-Beagle 6829 2 42.40 GAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAACGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3R 23099182 5' + roo 8726 2 60.96 CTCCCACACACCTTTCGCGATTGTTGCTGTTGGCAAAGTTCTGTATTTTTTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr2L 17069680 5' - 412 7520 2 67.81 ATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chr3R 9958695 5' - opus 419 2 79.45 AAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3R 27835711 5' + 412 7085 2 63.45 CTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3R 16771406 5' + roo 8753 2 78.77 CCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAA:1 + chr2L 16685313 5' + P-element 71 1 37.67 TTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr2L 20984284 5' + blood 7057 2 51.37 GAGATTTTCGAATAAGCCAATGTACGCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTT:1 + chrX 16853297 5' + roo 32 2 63.45 AGATGAGAGAATGGGGTGGAACAAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2L 4104132 5' + roo 8691 2 67.81 AATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 - chrX 14908454 5' + blood 7092 2 71.23 GAAATGTCCGCAAACAAAAGTTCAAATCACTCTGGCAATGTTTTTGACGATTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTC:1 - chr3R 24809981 5' - 1360 3320 1 65.07 ATCAAGTGGCTTGTGACTATCTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr3L 19279071 5' - opus 480 2 73.29 ATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 - chr2R 14884345 5' + mdg3 5310 2 63.70 CTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCATACCCT:1 - chr2L 15833082 5' + hobo 26 1 53.40 ATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2R 9332136 5' - roo 8998 2 69.86 AGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2R 13849719 5' + roo 8737 2 69.18 ACGAATGAATAAAAAAGCTATACAAGATAACATTGCACATTGGCAATTAAAAATTGCTTGAATATAGCTCTGAAATCAATATGTATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGTTCTCCGGCGTAGGTTGCAGG:1 + chr3R 30731347 5' - springer 348 4 58.90 GCAGCTGGCCAGCCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 4869149 5' - roo 350 2 56.16 CTGTGCTTTGCCTGGGCTGTTGGCTGTTGAAATAATATTTGCGATCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTAT:1 + chr2R 20362192 5' - diver 172 2 53.42 CGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1 + chr3L 22354443 5' + Doc 87 1 70.55 CGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 + chr2R 6984303 5' + HMS-Beagle2 56 2 56.16 TATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCTAAGCTCAAGCTTC:1 - chr2R 5022751 5' - Gypsy12A_LTR 55 1 65.52 GTCTTATCCGTCAAGCAGACAGGTGTGTTGCATACAAACCCACACGCACACACACACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 23623858 5' - roo 9011 2 56.94 GAGAATAGCTAAGACATCTAACGACGAGGAAGTTTAAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1 + chr2R 544767 5' + HMS-Beagle 45 2 54.79 AATTAGGAACCGATAAAGAAAAGATAGCATTATTAAAGTTTGACTAAACTTTCAATCTGCTCCTATCAATAGCTACCTCTTTTTGGAAAATCTGCGCTACATGCTCTACCCGTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTT:1 - chrX 19126514 5' - I-element 96 1 78.08 AGCAACTATAAAAACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGAGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 + chr2R 16908466 5' - roo 9066 1 72.90 AGTCCTTTAACATTTCGCTGGATGATTTGTGGTGCAATAAAGAATGCCATTTAATACCGGGCCCAGCTCTTTAATTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACT:1 - chrX 15404607 5' - blood 4 2 49.32 ATTCGTTGAAAAGCATGTAATAGGCAGAAGGAAGGGTTTCTGAACTTATAAAGTACATATATTTTAGATCAGGATCAATAGCCGAGTTGATCTGGCTATGTCCGTCTGTCTGTATTAACTTCGAGATCTCAGGAACCATAAAAGCT:1 + chr3L 18416453 5' + INE-1 150 1 75.34 CGCACGCACACCTGCAACTAACACCCACTCGCACACATACACATACGAGTATAGCGTACCTCTCACAACATATTTTAAAATTTCTCTGTTACCCGGCTATAGTTATAGTCTTATGATTGCTTTTTCACTAAAATTAATAAAATAAT:1 + chr3R 15131549 5' + HeT-A 43 1 52.05 GAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCACGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3L 2036992 5' + Doc 54 1 52.74 CTGATTTGTTTTCAAATGTCTGGCCGAAAATTATACTTTGAAATTGTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr2R 17144100 5' + pogo 65 1 69.34 GATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAACCCTGCAGGGAATGCCTCATATAATAAGAAAATAAATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 + chr4 1152031 5' + Transpac 57 2 58.22 TAAACGTGGGGGTCCTCAAAAATATATTTATACATATAGATTAAAAGATAGAGCCAAAAGCCGAACGAATAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3R 14062794 5' - blood 7372 2 52.74 CCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr3L 22354423 5' + Doc 61 1 55.00 TTGAGCAGCTTATTTCGTTATTTCGTTTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3L 20290667 5' + roo 8719 2 60.27 CTCTAGCTATCCATCAAGGGCTGCCAGCCACTGCATCGATTTCAAATGCAAATTTTGTCCGACTCCGGGATCGAGTTTGCCTGGAAGACTAACCCACTTAAGACTGTCATTATTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGG:1 - chr3L 14140177 5' - F-element 478 1 76.03 TAGATACTAGAAATGCAAGCGATATTCAGATATACAAGTAGGAAAGCAAATATGTCAGTGATTGTACACCTGATCCACATAGCGGCAGAGAGCCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACATAAAACTCTG:1 + chr4 864564 5' - Cr1a 4189 1 54.79 GGTGTTCGTTCTGCTGGCAGCGACAGCAACCCCCAAGGCAGCATTATTGTGAAAGTTTCCGACTGCGCGAGAGTGTGTTTGACTTTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT:1 - chr3R 6419160 5' - accord 193 2 75.34 CAATAACATTTAAATAGCTCAAGATTCCTGCCCAAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATG:1 + chr2R 20856193 5' + Juan 4163 1 56.16 CGGCCCGTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3R 7424647 5' + 412 7104 2 52.74 GCTTAGATATGTACGTACGAAAGGACAACATGCAACTAAATACATGCACAGACCGATGTCTAATTGTACATACACACACATTATCAAATTCCACATTGATGCAAGCAATTACAGACGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAA:1 - chr2R 8299529 5' + Q-element 123 2 65.52 AATGGCAAGTACGTCAGCGAATGATGCACTGAATATCAATCAAAAATTTAATATATAAACGCGCCTTCTTAGCTATACGAATACTGAAAGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3L 18835254 5' - pogo 2072 1 67.12 GTTCGTTAGCGCTCCAAACCGCAGCAGCAACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr2L 1136261 5' - 1360 3371 1 73.29 AGAAGGGGTTAATAGTCGACCAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr3L 12863804 5' - Transpac 5206 2 68.42 TGGCGCCACTTACTTTAATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2R 10367446 5' + 412 7088 2 60.27 GCAAAACAACGAGCATCCCGATGATCGTACCATCAAATGGTGATGGGGTCGGTATGTATGTCTGCCTGTCTGGGCTCCCCAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 - chr2R 15906365 5' + FB 42 1 56.85 AGCCAACACAAGCTCTCTTCAACTCCATTCTCATTCCTACTCTGATTTGCGGTTTTCATTGGGCGGACATAAATATGCATGAATTTGCGCTTTTGATGTGCTAGCGATAAAAAGTTTATATATTGGTTTATTACATG:1 + chr2L 19482778 5' + blood 379 1 81.02 CGGCGCCACTCAACAGACTACAGCCATATAAACACCAAGCAAACATCAATACGGTCGATTTTCTGTTACTTAAACTAAATTACATATATACAATTTTGTAAAATTACTTAAACATTGTTTATTACACAATAAAATAGAAAAATAAT:1 + chr3L 7810156 5' - pogo 55 1 34.93 TATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chrX 21668712 5' - mdg1 364 2 57.53 AGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3R 4884486 5' + pogo 56 1 56.16 ATTTTTTAATCCCCAAATTAAGTGCTTGTTGTAAGAGCAGTGCCCTTGTTCTCATATATATTTCAAGTTGGCGAGTCAATAACCTAATCATACTTCGCTTGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2R 19354123 5' + 297 6598 2 74.66 GTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 19545344 5' + jockey 74 1 66.17 TATACAAAATATCGTCCGTATTAGTTGTTGTCACTCTGTAATATTTAAATAAATTTATTACTATAGTAACTTTTGTAATAAAATGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTA:1 + chr2R 12619728 5' + HMS-Beagle2 132 2 56.16 GACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAAT:1 + chr3R 3527071 5' + Tabor 61 2 56.85 GCGTAGGTTTCCACTATAGTTTCCCAGCCATATCCTGTGGCAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:2 - chr2L 16685450 5' - P-element 2875 1 77.40 GGGGCATAACAAATATTTTCAGAAGGATATTAAAAATCCTAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2R 9867107 5' + roo 8745 2 75.34 CGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 - chr3R 9983110 5' + HMS-Beagle 46 2 52.48 TTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr3L 17447564 5' + Tirant 8156 2 54.79 AACAAAAAAAGCTCAGGAAACCAGAACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 8082358 5' + roo 50 2 52.74 TATAACTGGCGCAGTCGATAACCAGGAGCGGATTGCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACAC:1 - chr3L 27390974 5' + 1360 3207 1 76.03 CACACACACTTTTAGCCATTATTACTGCAACATTAAGACACCCAAATGGCTAGGCTTTTGTTGGTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAA:1 + chr3L 13102550 5' - X-element 4386 1 56.16 AGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCT:1 - chr2R 21227426 5' - mdg3 5415 2 75.34 TCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chr3R 10468005 5' - opus 446 2 57.58 AAAAAAAAAACACGCTGACATCACACCGGGGATCAAGATACACGATAGGAATTCTCTGAACGTGCACCTAAAACTGGATCCGATGCGCTCATATTAGGATATAAAGTTAAGGAGTAGATTTGGCATGATTATTTCTTTGTATTAAT:1 + chr2R 21433898 5' - transib3 2683 1 59.59 TTTGGGGCCGCGGAGGTACATCTTCCTGTTCTTGTCTGCAGTTTTCGGTATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCACAGCCATTTGCACCAAATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGG:1 - chr3R 5406008 5' + baggins 5200 1 66.44 ACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1 - chr2L 2338138 5' + blood 7098 2 78.77 GTTAATATGCCACCGGGCAAAATAACATCTCAACGGCGTAAGCCAGCAATGAAAATGGCGCGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:1 - chr3R 11121801 5' - copia 197 2 56.85 AAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTGTGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCTCGCAGTTAGGCCA:1 + chr3R 22846732 5' + 412 90 2 76.03 CTTGCAATTAAATTAAAATTGCCTTTGCCCCCCCGCACAGAGAAACACACTCACTACAGTAATTACCATTCCTAAAGGACGAAAACGATGTGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chrX 3345460 5' - hobo 2922 1 62.59 CAACCCTTCCGAAACCACCAGTTCCGTTTTTATACCCTTTACACGTAAAGTAACGTTAAACAATTTTTTCTCATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr3L 22737340 5' + mdg3 49 2 52.74 TCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1 + chr2R 8793898 5' + Transpac 76 2 70.55 CTATACTTATATACACTTACTACTACAGCTCCGCCATCCTGATAATTAGGATCTCCTGGTCCTCGCCGCTCTACTTCTCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAA:1 - chr3R 934373 5' + 412 7387 2 55.32 AGCTTCACTCACTTGGTTAGTCGTGATGATTTGTTAATACATGGACATATAAATATTATTGCACTTAAGGATTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAATAA:1 + chr3L 13019045 5' + hopper 1097 1 51.37 GGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTA:1 + chr3L 24153202 5' - Tabor 7233 2 79.45 ATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACC:1 - chr3R 27845588 5' - Stalker4 7324 2 55.48 CATCTGAAAAAAGGCAGTTGATTGAAAGGCATTTCCTATATACAAACATATACAAACACATACATATGCATTATGCAAAGCCACATGTACGACATGACACTAACACACTCAGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGAT:1 + chr2R 10462162 5' - mdg3 69 2 76.03 CACACCTTTCGCGATTGTTGCTGTTGGCAAAGTTCTGTATTTTTTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2L 17069674 5' - 412 7515 2 64.14 TTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 - chr2L 15621961 5' + hobo 44 1 52.05 GAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 - chr3R 15514624 5' + 412 7 2 70.71 AGGATTATAATGGGCTATTCAACAGGATCGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chrX 10978945 5' + roo 8690 2 66.44 CGCCGAGAAAGAGCTAAACAAGAAACAATCGGATGAGCTGACTGTGCTAAAGCAGCGCATGAATACATTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr2R 11857324 5' - opus 438 2 57.53 CATCTGCAGCACCAGACGCTCTTGCCCGTCAAGATGGGTGAGCCACACGCATACACGAATCACACACACGTTACACACACACATCCACGCCCACAAAGCTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2L 8103467 5' - pogo 2081 1 64.83 ATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr2R 20461183 5' + jockey 72 1 60.96 CAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGAGCGAG:1 - chr2L 16685410 5' - P-element 2835 1 50.00 GCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 10973195 5' + jockey 64 1 54.11 ATAAATCAATTTAAACGTTCAATGCTATATCAAATTAACAAAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3R 12363302 5' + jockey 31 1 69.86 ATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3R 10973170 5' + jockey 37 1 64.14 CGAAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAG:1 + chrX 693672 5' + INE-1 152 1 38.69 AAGTATTCACAATTTACAATCGTAAAAATGGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATT:1 - chr3L 18708120 5' - F-element 104 1 79.45 TACGCATTTTATCTATCTCGTTTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chrX 983078 5' - 412 475 2 72.60 CTGGTGTTTTTCCAAGAATTTTTTTTAACAGCTGCCCAGCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2L 17730405 5' - pogo 2058 1 54.79 CGTCGGCTTTCTTCGGTTCTCCGAACGGTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:2 + chr2R 15613783 5' + P-element 91 1 23.29 ACTACACACACTCGTACATGTGTAAGCCAAAGTCTGGTCTTTGGGTACACTGAGAGAATGCTTTGCTCTTTACAAAGTTTATAGTTTTATCTGTAAAAAATGTAACCATTGCGCGATGTATACGACTTTATAAAAAATGAAATAGT:2 - chr2R 16725257 5' + Tc1-2 381 1 74.66 GATCGGTGATAATAACTTATGGAAATGCTACAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGC:1 - chrX 21668170 5' - gypsy2 99 2 75.69 GGGCAGACAAAGCGGGGACTTGCTCAGTTACATCGACGTATCGATGACGAGCATCGAATTCGATGGGGCAGCTGCGAGCGCCTTGGGTGAGGTGCGTTATAAATCCTGGGGACTGGCGAGGTTCGAAGGCTGGAATGGCTCCGC:1 + chr3R 6241771 5' - BS3 101 1 72.92 GAGTTATTTGAGAAACTAAGCCAGTATGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr2L 17162884 5' - blood 336 2 55.48 CGCGTATAGTTGCCAAGTGGGCGGGGCGGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr3L 22354394 5' + Doc 37 1 62.07 AAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2R 15392823 5' + blood 43 2 56.16 CTTCAACTGTTTGAGGAACGTTGAATGTAACTAACTTCAATGGATGCTAGAAACTTCGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chrX 14692798 5' + Transpac 18 2 73.97 CATTCACGCAACAAGCAAATTGTGGCAATTATCGTGCTGGGGCACTGAGCAAAATAGTGGGTAAGTTTTGAAGACCATTTTCTATTATGTCCTGACATCATATAAGTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTG:1 - chr3L 16208802 5' - Tabor 6994 2 71.92 ATTACTAGCGAAGCTTTCACTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTA:1 - chr3R 15139868 5' - Tc1-2 1551 1 77.08 ATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 9616686 5' - roo 9026 1 54.11 TAGCTAGAACTTCCAAATATTGTAACTATACCCGTTACTCGCAGAGTAGATGTGTTGATCTCTTTTCACATTTTTATTAGTCTTTTAAGCAATTTTTAAATTTTTTATCATTTTTTTCCCAATTATCTATCGATATCTCAGAAAAA:1 - chr3L 22548340 5' + INE-1 500 1 56.16 AGAAATTTTATCATCTTAAAAAAATTTTTTGTATTAATTTTAAAAGTAGTTTCAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2L 21192494 5' - roo 9006 2 68.49 TAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATGTTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 - chr2R 10367549 5' - 412 408 2 72.60 TCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 16383378 5' - roo 9016 2 58.22 AATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 21380603 5' + roo 8724 2 58.90 ACATACATTGGTGTGCTACAGTGTAGCGGGCTCTTAATCAACAGGGATCTGAATGGGCCGAATTTGGCAGCAAAATAAACGCAAAACGGCGCACAAATAAAAATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr2R 6585566 5' - pogo 2087 1 76.03 AATATTTTTTCAAAAATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 14136580 5' - roo 356 2 51.37 CACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGA:1 + chr2R 5284538 5' - Doc4-element 2593 1 50.68 CTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTGACACTCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGTCACGCACATCGCGGG:1 - chr3R 9163940 5' + hobo 68 1 63.45 ATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr3R 24228905 5' + opus 36 4 76.47 TAATAAACATTTACCTTTTGGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1 + chr2L 10937844 5' - mdg1 353 2 63.70 ACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAGGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1 + chr3L 19397036 5' + F-element 84 1 66.44 CGCCCCACAATGCGCCATTCATAACGGGCATACGTCCTCGATACCGGGTCGGCGACATATTGCGAGGTAATTGCACATCGCGATGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAG:1 + chr2L 16078159 5' - jockey 4566 1 56.85 CAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGCGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 + chrX 18239373 5' + jockey 4575 1 66.67 CGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGT:1 - chrX 22386816 5' + hobo 69 1 61.87 AACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCAAATTTTTGTTAGAG:1 - chr2L 22746318 5' + 1360 88 1 76.71 GAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCGAACTTAATT:1 + chr2L 9167436 5' - pogo 2042 1 66.67 ACGACTTTGCCCACGGCGGATGCACAGCGAGGAGTACGAGCGATGTGCCCGCCAATGTTTTGATTTTAATGTCATAGTTCTCGGCTATCTCGCGATCCCTGCGTTTCTTTTGCTTTAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCG:1 - chrX 8526336 5' + Bari1 1558 1 40.41 GAGGGAAATTTTAAACTAATGCTATGAAGAATGCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:2 + chrX 14908363 5' - blood 7338 1 51.37 GTTTTTATTGTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 29350806 5' + 297 6630 2 58.90 CCCTACATATAGTACCCCTACACAAAAAACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTTTATATAATTTTATGCATCTGTGCGCAGTC:1 - chr3R 1977610 5' - micropia 5359 2 68.75 AATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr3R 5765304 5' - opus 463 2 61.64 CGATGCAATTGTGATATGCCAGCGAATTGGATTTTGCAAAGGAAAAAATTGGGGGAAAAATATGCCAAAGAAGGGGTAAACTATTGAATGACATGTCTATATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chrX 5265647 5' + flea 9 2 74.66 ATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2L 3967120 5' + hobo 41 1 68.04 AGTAAATGTAGTTGCCAAAGATTTTGCACGTATAAGTGTCTTTCGCCAAAAGGAAATATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGA:1 + chr2L 22696337 5' + X-element 28 1 68.49 AACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAGTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGA:1 + chr3L 2512211 5' - hopper 1327 1 73.29 TTTCTTCGAAATGATAGGAAAGACCTTTCTGAGTTGAGGGAACATTATAACTGATGCTTTTGGATTTAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGT:1 - chr2L 21329097 5' - roo 8958 2 57.72 GGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr3L 3979552 5' - opus 7467 2 60.71 AACCAACCCCACCCACCCATCCAGCCCATCAGCTTTCCCTTGGCAATTGTCCCACATACTGTGCACTTATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTG:1 - chr3R 10998770 5' - flea 4665 1 52.78 ATAAAAAGTGGTGGTACACCGATTGTACGTTAGATGGTCGATTATATTCCGCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 - chr2L 14796939 5' + I-element 67 1 63.70 AGACAATTATTTCAGTGGAAATACGATTATATAGTGCGGTCAATAATTTCGAGTAGCTAAAATACATCTATCTCCCATGTTTTTTAAAGTACAGTATAATTCGCTGAATTCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATT:1 - chr2L 20825038 5' - pogo 7 1 61.64 AATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAA:1 + chr2R 7727126 5' + BS 4716 1 63.57 GGCGCTCAGACGGAGACCAAAAATCAACTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 24455323 5' + 297 6609 2 64.79 AAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3R 25521925 5' + blood 7040 2 65.52 TCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chrX 18366031 5' + jockey 85 1 69.18 ATTAAAGATCCAAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr2L 2464325 5' - pogo 2057 1 56.16 CATTGTCTGTTAAGCAGATTTCGAGCTTACATTGTGTGCGTTGGTATTGGTGGTAAATTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 + chr3R 17765990 5' - mdg1 356 2 58.90 TAGCGGAAGGAAAATGAAAATGAAGGAAAATGTTTTTGTAAAACAGCTTTTAATTGAAACTAACAATTCCCATCACTTCTTAATTTAATTATTATTAATAATATTTAGATCTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chrX 14914498 5' + mdg3 5263 1 76.03 GAATCTTCTCTTGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGCCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCA:1 + chr2R 5284501 5' - Doc4-element 2632 1 70.83 CGACACTTGGCAAGTGAAATAATGAAATAAAAATAACAAAAAGTAGGGGAACAAATATACTTTATCTATTTTTGTACAATTCTCATTCTTACCTCACAACCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAGGCG:1 + chr2R 8736234 5' + Max-element 8259 2 76.03 CCAGAGCAGCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGGTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAATATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAA:1 - chr2R 21056768 5' - Tirant 325 2 69.18 CGATAAATCAAACTCCACTTCAAATTCGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAACGC:1 - chr3L 7434990 5' - pogo 2080 1 74.66 CACTTGATAAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chr3L 19274918 5' - transib2 2791 1 62.33 TTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr2R 7223655 5' + blood 7073 2 60.96 AACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 + chrX 6398783 5' - blood 7333 1 54.79 CTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr2L 14262960 5' + blood 7034 2 65.07 CCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 + chr2R 6984274 5' + HMS-Beagle2 26 2 67.59 AGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chr3R 10079333 5' - P-element 2786 1 16.44 AGAACTGTGGATCGTTTGTGGTCGATAACGGAGGACCTGAATATATTGTATAAGGAGAATTGGACGCGACTCGCCGCACAGGAGGTGCAGCTATTTCAGTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chrX 6484078 5' + mdg3 5291 2 67.81 GGACAGCTTAAGACTGAGATGAGTTGCATACTAATTCCCCCAAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 20076714 5' + roo 13 2 76.71 GACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3R 25521921 5' + blood 34 2 62.33 CTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACA:1 + chr2R 5900793 5' + Bari1 32 1 64.38 ACGGAACTGTGACCGCAATTTTGGAAATTTTGCTAGGCAGGTGTGCTGCGACTAAGGACATTTCAGGGGTTCAACCCAACTTGTTGTGGGAGTGGCTCACTAAAGAGTGCCGAGCATGCACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAA:1 - chr2R 9710032 5' + Stalker3T 188 1 69.18 ATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3R 18849772 5' + roo 88 2 80.14 TAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAA:1 + chr3L 24153172 5' - Tabor 7263 2 58.90 CTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 + chrX 14385179 5' + blood 7069 2 70.43 AACCTCTATCACGTTGCTGTAAAGCCTCTTGTGCGGATTTATTAGCTGAGCGATCGGATTTGTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3R 24479309 5' + 412 25 2 69.18 AATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATT:1 - chr3L 3540231 5' + mdg3 36 2 50.00 ATGAAACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2L 15833100 5' + hobo 51 1 52.74 CATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAAC:1 + chr3L 23456270 5' - Gypsy6A_LTR 273 1 64.34 AGTGCGTGATTTACAAGATGCAGAGAGAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAGTTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2L 9167386 5' - pogo 2081 1 67.81 ATCAGTGTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2R 18048769 5' - opus 7474 2 65.75 AGTTCCGGTCATGGTTCCAATGCGACTAATGGCGCCCGTATTGCTGCCACCCAGCGGATTTTGCTGTTGCGGGTCGAGAGATGCTGATTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACG:1 + chrX 18006800 5' - R1A1-element 13 1 59.31 TTCATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr2L 7215651 5' + 297 6612 2 62.07 GTGAGCCAGTTGAAGTCGATGCTGCTGCTTGCGCAAAATGCAATTATTAAAAGTTTTTCAAGTTGTCCGCTCCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 + chr2R 13657650 5' + flea 4793 2 58.70 TCTAAAGATTCAACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 - chr3R 10778781 5' - mdg3 219 2 67.12 TGTGGTCATAAAATTCCAGTTTGAAAATTTGAAATTTCGTTTTCCTTCTTTAAAATTTGTTTTCCTACTCAAAGATTATCTGTCGATGGGCATAAAAATATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAG:1 - chr3R 25947578 5' - R2-element 3381 1 68.49 TGATCAATTCCTCTTTAGTGGCATACCACCCTTGTATACCTTCTATTTTTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr2L 21400184 5' + pogo 52 1 62.79 ATTATGGAATTTTATACAAACACAAAATGAATTAGTGATTTTTATTCTCTATGTTTAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 30568951 5' - roo 397 1 66.44 CTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 + chr3R 14088538 5' + 1360 44 1 56.16 CCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTG:1 + chr3R 907897 5' + gypsy11 360 2 33.56 AGCAGGAATGATGGGAATTTTCCAGCGCGACAAGTTTGCAGGGGGGGTTTTTGAAAGTACGTACTTGGCAGCAGACTGACTGCGGATAACCTAGTCCCATTCATGCTGCAGGGTGATGCGGAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGC:1 + chr3R 11837256 5' + Rt1c 5228 1 58.22 AGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGACAAACACTCGGTACTC:1 + chr2R 22867448 5' - hobo 2902 1 68.54 GTCGTGGAACAGGGATACATGCAAAGTTATGACGGGGTATGAGGCACCCCTCATATGGTCAATTCACAACGCGCCATAATAATAAGAGCAGATAATTTCAGCTCTCGCGAGCACATACCACGCGGCTACAT:1 + chr2R 16475418 5' - hopper2 1431 1 32.06 GAACCACTATGAAGGAACCTAGATCAGATCAATCCCGAAGATACTCCCATGCCACCATGCCAAACTAGAGCAGTTCAATTACAACAGTCTTTAATCACGTTAAATAGTAATCTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTG:1 - chr2R 12930698 5' - HMS-Beagle2 6910 2 77.40 GGCGAGATTAGTATACTCAATTTGGGCACCGCAGGTAAAGAACTTGGTAAATATCCCGTTTTAGTGCGACAGGCGGAACAATTACGATAACGTAACTACTACAACAACCTTCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCTATAACCCATA:1 - chr2R 22746900 5' + F-element 309 1 76.71 GCATAATAAAATCATAAAAATCATGATGCAATCAAAATCGCGGCTTAAAAAATGTGATATTTGATATACTTGGATTGTAATATAAGTCAAGAAGGTGCAGTTCAATGACAAATTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCT:1 - chr2R 24016923 5' + copia 4999 2 58.90 GTTTATATTGCGGCATTTGTGCAGTTTGCCCAGTTCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 18722074 5' + 412 15 2 75.34 GCTGAACTGTTGGCTTAAGGAAAAGCAGGGGCTTAAACCAAGACTGACTGGCTGACAGCTAGGTGATGTGCTGATTTCATTTCAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAAT:3 - chr2L 10937959 5' + mdg1 7077 2 53.42 GATTTTCTAGAGCGTGCGCTTTGTTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr2R 13276475 5' + roo 69 2 67.12 ATGCCATTTGTACCAATAAATTCGAATGGCCTCGCGAATGGGGCCGCGTTTTCTGCCAACGACAACGACGGCCTTTGCGGTCAAGATTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATT:1 + chr3R 10473219 5' - Stalker 7141 4 58.90 GGGCAATTGTGGGGCATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr2R 24338486 5' + 1360 17 1 72.39 GCGAGCGAGTGTTAATTGAATCGAAGCGAATAAATTAACTAAAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAA:1 - chr2L 19894544 5' - Transpac 4949 2 71.23 ACTGGCGGCTCAATTATAACTGACAAATAGAACTTATTTTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTA:1 + chr3L 15099514 5' - G4 3808 1 73.97 TGATATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chrX 14756775 5' + pogo 50 1 57.53 GAATATAGGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 - chr3R 25384331 5' - mdg3 5492 2 75.71 ATCTGTGAGTGTCAGGTTGATGGGGAGCAACGAAGAAACAAACAACGCAACAACAACAACGACCACACATAATACTGCCTTAACACCTACACACACACACACACAC:1 + chrX 15182880 5' + accord 254 2 75.47 TGCGATAGGAATTTCCATATCGGACGTCGCCCCAAAAAAAAAAGGGCAGAATAATAAAGTAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 8582005 5' + BS3 1769 1 43.24 CCATCTTCCTGCTTTAAAACACTCATCGCTCACTTTTCATATATATTTTTTGTTGTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGC:1 - chrX 9526235 5' - hobo 403 1 56.55 TTTAGAGCGTTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 7534582 5' - roo 9016 2 55.48 CTCTTGCCCGTCAAGATGGGTGAGCCACACGCATACACGAATCACACACACGTTACACACACACATCCACGCCCACAAAGCTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr2L 8103485 5' - pogo 2062 1 52.05 TAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 - chr3R 9938700 5' - roo 9017 2 56.16 ACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chrX 4789111 5' + 297 54 2 60.27 GGAAAACGCAAAAATAAAATCACAAAAGCGTCCGGGAGGCGAACGCTTTGACTTTCGGAGGCAATAAAACTGTAAAATCCCAAATCAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 26399782 5' - roo 9063 2 70.00 ACATACAACGTTGGGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGAACATATATGTACAATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 - chr2L 23396009 5' + HMS-Beagle2 37 2 58.57 AGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGATAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chrX 11534516 5' + roo 81 2 73.29 TATTGTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3R 29350801 5' + 297 6635 2 62.33 CCATTGCCCATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 15167651 5' + roo 8701 2 54.69 GGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 7424631 5' + 412 66 2 63.45 GACTGCCTATTGAACACGATGAATTTATGGCTCAACATTTTAGCAGATGATTGATGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGGCGGCGTTCTGCATGCTCGCGCTGACGCTGGGC:1 + chr3L 18708480 5' - F-element 213 1 57.45 CAGATAGGCAATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 - chr3R 10288904 5' + copia 56 2 54.11 GTTTCCAATTCGAAATCAATCATTTTCGACTGGACCTATGCAATTTATGTATGTATGTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCC:1 + chrX 5439930 5' + accord 6 2 80.14 ACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCG:1 + chr3R 17316055 5' + 3S18 75 2 66.44 GGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr3R 4913656 5' + 1360 52 1 53.42 CGATTGACTCTTATTGACAGTTTTCTACCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr2L 19816820 5' + pogo 64 1 63.70 CATGCGAGAACAAAACCCAAACAAATAATTTAGGTTTTAGGTGCGAAGGGAAGTTTGAAAGATTTCAAACAGCGGGAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 - chr3L 3538234 5' - mdg3 5430 2 52.74 GCTGGGCGTTCGATGGCGCTTGGTCTCCGCGGTCTTGGCTTCTAAACCTCTGGAATGCCAACAATGTGTGCGCGTTCGGTTGTGGGTCATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGC:1 - chr3L 13922269 5' + Tirant 403 1 60.27 GGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATA:1 + chr3L 1387156 5' + mdg3 91 2 76.71 GGCAAGGAGCACTGCTCCTTGTGGCACTTTCAACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAAT:1 - chr3L 8253780 5' + jockey 4648 1 73.97 ACATTATTTGCTTCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAGGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATT:1 + chr2L 8959880 5' + Ivk 5128 1 47.26 ATTGGCAGCCCGAAGGGGAAATCCTTTGCAGCCACAGTCAAGATAAAAATAATTAAAAACGTCCGAAGTCGCACCACACTTCTGCTATTTCTGGCTTACAACGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 8244169 5' + hobo 42 1 77.69 GCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATATAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAG:1 - chr3R 27845592 5' - Stalker4 7328 2 58.22 GACTTATGGCGGCCCAATGATCGTAAAAGGAAACTATGTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr3R 25753724 5' - hobo 2905 1 56.80 GTAAAATAAAGAAATTAAAAATTGTATAACATTTTATATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTT:2 - chr3R 25271320 5' - 412 7531 2 73.29 AAGCAAATGGCGAGGAATTTCCTTCACCTGGACGCACAACCTCCAAGGTGGGCAATTCAATCAGTCTGCCGTTGCAGTTGATCTGCTCCGTTCCCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCG:1 - chr2R 11136012 5' + hobo 2727 1 63.01 ACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1 - chrX 21667919 5' + gypsy2 60 2 68.91 AAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTC:1 - chr3R 14088622 5' - 1360 3307 1 79.26 GCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAA:1 - chr2R 22692441 5' + Ivk 53 1 53.42 GCTACGTGCCTCTCGTGCTCGTCCTGTAAACTATTATCCTCGCCCAAAAAATTTATAACAAAAGTGAACGTTACATAAACAAACATTTCTCGATATTGCGCATCCACTCATGCTGTAACCAAAACCCAGTCACTAGGCAGACACAT:1 + chr2L 17054831 5' + Tom1 132 1 53.42 TGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCTGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 + chr3R 24228870 5' + opus 7065 4 60.96 ACCGAATGCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 + chr3L 15321956 5' - Transpac 254 2 56.16 GCAACTAATTGTCCAACTTAGTTGCTCATCAAATTGCCGCATCACTTTACGCAGATTTTTATCGCGCCAGCCCAGCCCCATCGTTGGGGCTCGGAATAGAGGGGAGTCCCTTGCTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1 + chr2R 7071743 5' - mdg1 335 2 78.77 GCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATCTTGT:1 - chr3R 22429213 5' + roo 83 2 71.23 AAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr2L 4416016 5' + jockey 34 1 66.43 TAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chrX 5222954 5' + 412 65 2 64.38 AAATTTGTATAGCTGTAGTACGTTGGCCATCAAAGTAGCAGACGGAAACTTTTAGTAATGAAAAAGTTGAAAATGCTGAACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCA:1 + chr2R 8270212 5' + G2 2911 1 54.79 GAGCCTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGGCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGT:1 + chr2R 5900789 5' + Bari1 28 1 67.12 AGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chrX 21668695 5' - mdg1 7419 2 49.32 AGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:2 - chr3R 25521924 5' + blood 31 2 64.38 TTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 - chr3R 9163939 5' + hobo 70 1 68.49 AGATTATCTATGTATCATATTCGCAAGGTGGGTAACCTATTGACGATTTATAGCCCGTTCACATATGATTCGCCTGTGATTCGCCTGTGTCAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chrX 14173337 5' - 412 7516 2 64.38 CGTGGACTGTGGAAAGGAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGGTAAGGTGATATTGGAACTGAAAGGTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr3L 22518975 5' - pogo 2051 1 52.74 GAGGCCAGCGATTGGGTATCATCGTTGGGCGCGATGGGCAGGGGTTTGTTATCGTAGTCACTGGTGGAATGCGACAATCCGCCAGCGCGAGCCGACTGTCCCGCATAGTCGGATCAATACGATGAGCGATATTTTCCACAGA:1 + chr3L 9713207 5' + transib2 2363 1 71.13 AAGGCAATCAATATCGATAAGATAGGTTGAAACCGATTGCAAGTATTGCTTCTAATAAATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:2 + chr2L 7991270 5' + 297 57 2 61.64 ATCAGCTAATATGACCAGACGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTTTGGTTCTCCAAATAATA:1 - chr2L 1449668 5' - opus 420 2 72.41 ATTCGTGCTAATGTGCTTTTGATATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr3L 20747218 5' - Burdock 6353 2 58.22 GATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 21380621 5' + roo 8742 2 69.86 CAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3L 3979549 5' - opus 468 2 63.31 AAAGCTTATATTTGTCAAGATCATAATCAAAGCTGTCGGCCATTAAATAAAATGCTCAACGAGAGAAAAGAAACCCATTAAAAACTGAGCGAATTAAATTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGG:1 - chrX 18720911 5' + invader4 2744 1 67.12 AAAATATTTTTTCAAAAATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 14136582 5' - roo 358 2 50.00 AATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCT:1 - chr3L 21093238 5' + Ivk 43 1 53.03 ACGAGAGTAGCAGGAATAGAAACGCCAAAGGATTCCGAGATACGTATATCGAATCGGTCGCGCCATATTTGTTGTGTTTTGGTGACGGTGGAAGGGGAGTAAAGGATGGTCAGGGTGGGGTTGTTAAATATATCTTGCTT:1 + chr2L 10603879 5' - I-element 5079 1 81.43 AAGCACCGCTCACATGGAGGTCAGGTCAGGTCAGGTCATTAGCCATGCCCGGCGGATCTTGTTCGTTTATTATTCATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 - chr3R 19545421 5' - jockey 4940 1 52.74 CGATTTTCACTGGCCTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTT:1 - chr3R 3179383 5' - S-element 1271 1 58.22 AAAATATTCGCAATTGAAAGCAAAAAGGATTTTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGT:1 + chrX 6398743 5' - blood 7373 2 62.33 AAGCCATTTGGCCCTGAGAAATTTATCGAGAGACTTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3L 13313254 5' + roo 51 2 52.74 GTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr3R 4885340 5' + 1360 81 1 80.82 ATGGAGTTCGGCTGCAGGTCAAGGAGATGGCTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr2R 17986217 5' + 297 6602 2 71.33 GCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 - chr3L 13722106 5' + blood 7085 2 68.49 AAAGCGAATTGCATTCGGAAAGTATTTCATTTGAAAATTACAAAGCCCAGACGAACAACTGCCAAGTCAAATGATGGAAAATTGTATAAAAATGCAATTTACTGTTTTCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 - chr2R 20700772 5' + mdg1 7052 2 76.03 GGTAGCCGCTGAAAAAGCACTGATTGAAAGTGAAAGTATTTAAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chrX 3506030 5' - Tirant 362 2 60.27 AACAATCACATGCCGACATTCTTTCATTCGTACAACGACCTCGACTTTGATTTGCAGTTTTGGCCAACAAAGAGAGCCGCTTCGGGCCAACACTGAGAGACCCGGCTCGCAATTGAAAGGTAGGCCTCAACGGCAAAGGCAAGCTC:1 + chr2R 15613622 5' - mariner2 152 1 76.71 CAATTTATGTGCATTAAATACACTACACACTACTTGATTTTAATACCAAAAAGGTTGAAAAGTAGATAAAAACTAGAAATACGCGTTTAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3L 20711958 5' + 297 26 2 68.49 TATGCCTCGTTGCTCCGCCATTCAGGGTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr3R 25443016 5' - 297 6933 2 54.48 TTAATGTTGTAAATACTCTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 21924353 5' - roo 347 2 61.38 GTAGGAAAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr2R 5067612 5' + F-element 62 1 61.64 ATCGAGTGCCCAGTAGTTATCAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr3R 9563659 5' - P-element 2792 1 21.92 ATAAAATAACATTGTCACTCCAGTCGAGCTGAAAAATTCCACTCGAAAACGATGGGCATATATGTACATATGTATTTTGATTGCAGTATAAAGATGTACATTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3L 18835424 5' + pogo 27 1 67.12 AAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATT:1 + chr2R 2949030 5' - 17.6 427 2 69.18 GACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr2R 9164949 5' + 412 7102 2 50.68 GAGAATTTAATGTGCCGTGCGTATTTGATAACTGACCGCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 19545282 5' + jockey 23 1 74.48 GATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 15833069 5' + hobo 14 1 55.13 ATATTCCGTTGTGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTT:1 - chr2R 11656143 5' + HMS-Beagle 19 2 70.37 AAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 19700869 5' - roo 9013 2 64.38 ATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTT:1 + chr2R 13574768 5' + diver 5964 2 71.53 TGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGGGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3L 22221228 5' + 412 31 2 51.85 GAGTTTGTTTTTTAGCTGGAAATCTGCAGGCGGTACTATAAGAACAATAGTTCAGCTTAGTGGCGGATTAAGAAGCAAACATTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGGCTGCCAACA:1 + chr3L 19896813 5' - R2-element 3539 1 58.52 CATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chr3R 15514531 5' - 412 7470 2 69.18 CTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2L 15920162 5' + jockey 63 1 64.00 AAATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGC:1 + chr3R 23108064 5' + G-element 72 1 63.01 ATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGTCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTAGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTT:1 - chrX 22517682 5' - 1360 3317 1 67.12 CATCATCTCGATTATTGGATACATTTGAAGAGCTTTGCTTGGAGTAAACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 + chr3R 6068239 5' + jockey 4696 1 69.18 AGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr2R 6052714 5' - mdg1 7424 2 60.96 CAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr2R 16513142 5' + jockey 89 1 73.29 GCTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr4 311161 5' - 1360 3360 1 65.07 TCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 + chr3L 1387104 5' + mdg3 5291 2 57.53 TAGACTTCCAGATTTTAGAGCGTTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr2R 7534569 5' - roo 9029 1 56.85 GTTTTCGGTGCAAGCATGCAATGATACAATGGATGGCTATCATGCACAACGAATTTTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTGCG:1 + chr3R 15285035 5' - X-element 401 1 55.28 TATCAACCCATTCAGGATCCCCACTGTTTTCACACCCATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 12551722 5' - pogo 2033 1 70.15 GTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 - chr3R 25521898 5' + blood 7068 2 55.48 GCGGAGAGAGGCGCACTATGAACTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGGTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chrX 16456781 5' + P-element 97 1 19.18 GGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr3L 22221214 5' + 412 7136 2 73.97 GCTGGTTTTCCGTAGATTTTGTATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr2L 14222393 5' - Transpac 5213 2 75.34 TTAGCCGCCGCAGCTCTTTAAATTGTCTGCCGCCGGTCGTCTGGCATAGTAAAGTTGTTGGCAAGGCCGGAATGCAGTGGGTAGTTTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chrX 3524376 5' + roo 1 2 78.77 GGATCACTTTTGCCGTGCTTCCATAGCCATAGTAACGATAACCATATCGTTTACCCACAGCTACGGCAATTTTGATAGTAGTTTTGTGTTTTATTCCGCATATGGCCAGTTAATAATCTAAGTTATTGTAATAAACCAATATATGC:1 - chr2R 7404830 5' - blood 379 1 78.77 ACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCA:1 + chr2R 19076512 5' + F-element 211 1 50.00 CAAATTAAAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 13849744 5' + roo 48 2 52.05 GAATATCTGGCCACAAATGCCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 - chr3R 24175802 5' + Burdock 6172 2 60.96 AGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGGGCAGGGAAACTTCCTATTAACTCATGGTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chrX 21213413 5' + Doc 11 1 56.52 TGGTAGCCACTATACAATGCTACGCGGAAATTGGTAGTATACACTTGGTATTCACGACTATTAGAAGTAGCTTTTAAATTTTCTTGTAATCATAGAATTCAGTTTAGAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3L 5263305 5' + pogo 9 1 76.03 GCTTATGTTAGGAGTTGGTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr2R 8793857 5' + Transpac 4954 2 62.33 GTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3R 9482024 5' + roo 75 2 70.55 GATTCAGCTGGCCACACTCCGCCCCATTTTTATATCCACAAATTCCTACGCTCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr3R 4659527 5' + P-element 66 1 40.00 ATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAACCCTGCAGGGAATGCCTCATATAATAAGAAAATAAATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1 + chr4 1152028 5' + Transpac 54 2 56.16 AATAAACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGC:1 + chr2L 14222244 5' + Transpac 4978 2 60.96 AATCTTGCGATTGCCAGAGTTGGATATCAAATAATAAGGATCATGACATTTCACTTAACACACTTTCATATAATTAATTTAATTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 + chr3L 21819948 5' - Juan 4167 1 51.37 AGACTACCGCTAATAGTCATGGAAATTCGTTATCAGACAGCCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGACTAGTATTCTGAGTGTCG:1 + chr3L 9430583 5' - P-element 2809 1 34.93 GAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGGGACGGGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGGATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAGTAAAGTGCAGTT:1 + chr2R 6984448 5' + Doc 96 1 72.60 AGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:2 + chrX 21668700 5' - mdg1 7414 2 49.32 CTTTCACCTACTGAGAATTATTCTGAAATAATTAGCCTTTATCAGTGCCGGTACTGAGCCTTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAACGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTTT:1 - chr3R 4167581 5' + 1360 156 1 58.22 CCTGCATGCCGCCTTTTTTTTTTTGGCCCTCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 - chr3L 16535232 5' + copia 4927 2 76.11 CAGTGGCGCACACTCACATGGTCGGTGGGGAAAAGTTGGGAATATGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 13073397 5' - accord 189 2 91.23 TGGATAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr3R 15649910 5' + blood 18 2 73.29 GGAATTAAAATAAAAAGGCATCAGCAATAATAGCTGGATGGCCTCTGGCCAAGGTGGATTTTCTCTAGCCCCCCAATCCCGAATGAATTTTCCAGCACCCCGCTGCCGCTTCCAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTT:1 - chrX 5474195 5' + roo 362 1 71.92 AGCAAATGCGCACAGCGAAAAAAATATTCCCATCAATTCTATGCTTTTTGTGTAATTTATGCAGTCAAAAAGTGATCATCAGTGAGAAGAAATGTCGTTACGTAGCCGGCAGACACAGCTTATTTGCATGGCCGCTACGAATATGA:1 - chr3L 11299947 5' + gypsy2 115 2 63.01 CTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chrX 21668715 5' - mdg1 361 2 59.59 GAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr2R 24427620 5' + jockey 4737 1 59.59 GGACATAGAGTCGCGAAATTANAACGTNAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2L 1073931 5' + Tirant 13 2 54.67 CAATCAAGCATTTACACCAATCACGCTTGTGAAACGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGGTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr3R 22846779 5' - 412 7494 2 68.75 TTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 23449271 5' - roo 8985 2 77.40 GAAGAACCCACATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTGTTGCAATTTATCATTCGAAACTA:1 - chr2R 17014129 5' - HMS-Beagle 191 2 53.42 GAAATGCCGGTGAGGAAGTTGAGTTCGTGGGGTTCGATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGACACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr2R 8686668 5' + hobo 45 1 54.48 ACGGATCAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 8397134 5' - roo 9026 1 52.74 CGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3L 53048 5' - roo 8982 2 80.82 GTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAGGCAACTAGCGCCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 4885400 5' - 1360 3365 1 58.89 AAGAATGAATAATAGCCCACTATAATCCCACTGTTTATGAGCCCATTTTGCAAATTTTCTACGTAACTATTTACTTAGCTTAAATGCCCTTTTTTATACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATAC:1 - chr2L 3165820 5' - P-element 51 1 67.12 GCCATGTTTCCTGAGGTCCATGTACGTGCTCAAGCTTATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 - chr3R 3527213 5' - Tabor 7303 2 69.86 AAATTACCATAATTTGTTGCTACTTAATTAGTCATCTTTAACTGTTAAATTGGTAAAATTTAAACTACTTACATGAACTTACTAACGAACTTAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3R 13494300 5' + opus 137 4 47.26 AAATATATAACAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACG:1 - chrX 22913224 5' + gypsy7 5272 2 57.53 CAGTCTAGCAAATCAGTAACTCAAGTAGCATATAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCA:1 + chrX 11534643 5' + roo 416 1 78.08 CGAAGGAGCTACCAGTACACTGGCCAAAATGGGAAATAATTCCACAATGCTTATTACTAAACATTTGAGGTTCCAAAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACATTCCGCCCCCCTTGCAATCACT:1 + chr3L 16829372 5' - GATE 8214 1 53.42 TACGGAAATTGTCTACACAAATTTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 + chr3L 5446053 5' - roo 393 1 74.66 AGAGCAGAGCTGCGGAAAAGGGGGCGGCGGAATGATAGCTGACCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr2L 3967032 5' - hobo 2897 1 57.53 ACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3R 8402656 5' - mdg1 7413 2 53.42 AGCTGAGTATCCTTCTTTTAATAGAAAATTGCTCTTTTGAAGAAAAATCTGTACTCGTCCAACTCATTGCGATTTACGTGATTCGAGCCGTTGCGCAGGCCCAGAAACTAATAAAGGGAGAAATATATATATACATATTTATACAT:1 + chr2L 10664964 5' - G3 4507 1 51.37 GAAAAATATTTTAGCAGATAAAAACATTTTTATTGAAATAATAAACTACAATATACAGATACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCC:1 + chrX 18034517 5' - blood 7291 2 58.90 AGCCAGTGCAAATACCCCAGTCAAGAAAACAAACGAGTTGGCAAGCAATGATTGCTGAGCATTGCTACTTGTTGTTAAATATGTTGCACAAACAAATGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCACTCTGCATACACATGTATAT:1 + chr3R 7768638 5' + Stalker2 7492 2 64.38 TAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 - chr2L 17228689 5' - mdg3 160 2 74.66 ACAGTGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACA:1 - chr3R 6053087 5' + Quasimodo 34 2 63.01 CAGCAAAACTTATTGTGATAAGTGTACATTTGTGTGTTTTGTTTAATTAAAAGATTGAAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 6096450 5' - roo 391 2 73.29 CATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 - chr3R 8402660 5' - mdg1 380 2 56.55 CATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:3 - chr2R 24338472 5' + 1360 43 1 56.85 GCGAAAAAACGTTTGTATGCAGGCGAATTATGTGAACGACTGAACTCAAAACTGGGAGAGTACGTCTCTCCAAACGCTCTGCTTAGATAAATAACAAATAAAAGAGCACAGGAACGAGGAAATTAATATAATGTAAAATAACTGTA:1 + chr2R 1950749 5' - Cr1a 4318 1 73.97 TAATATGAAACAGAATCGAGTTATGGGCCAAATGAAATAACTTGATGTATTTGGCTTCCATTGATGTCGTATTGTGGCGATGATCTACAGAAGAGCAAAATACGGACAAGGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 11534384 5' - roo 399 1 77.40 TTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGA:1 + chr3L 25232775 5' - accord2 7547 2 71.92 AACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTA:1 + chr3R 18665273 5' + 1360 85 1 81.51 ACTCGCTGTGTTTGTACCAAAATTCCATTTGCAATCGAAAAACTAGTGACCCACTAGTACATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 - chrX 10979130 5' - roo 9067 1 59.59 TCCATACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr3L 24153132 5' - Tabor 7303 2 70.55 AAATCCATGTCCATGTCCATGTCCAGCTGCTCCTTTGAGACGTTGGCCGTGTGGCCACCTGGTGTGACCAAATGTACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGAT:1 - chr2R 24267133 5' - accord 70 2 47.18 ATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAACCCGCCACTC:1 + chr3R 9163845 5' - hobo 2937 1 74.47 GGTCTCACACCAAGAAACAAAAGAAACCTCGAAGAGTGAAGAAAAAGATGAGAGTAATGAACTCAAAATAGTTAAGGAGCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACA:1 - chr3L 14508656 5' - R1A1-element 5268 1 51.37 ATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCT:1 - chr3L 21820046 5' + Juan 65 1 61.64 TACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr2R 6984370 5' + Doc 18 1 73.97 CGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chrX 14908484 5' + blood 7062 2 50.68 TACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 21421058 5' - roo 322 2 78.62 CATAGTGGCCGGGGCACGACTGATCGGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2R 24338298 5' - 1360 3377 1 75.34 CCGACCATCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chrX 19231691 5' - mdg3 233 2 76.71 AAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr3R 20292541 5' + pogo 45 1 54.79 GTCAGCATGTCAAATTAGAATCAGACGATTTGTCAAGTATCAAATATTATTCAATTATTATGGCAGGGAGGGAGCATATGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTT:1 - chr3R 30662654 5' + 1360 3233 1 52.05 GGAGGAGGATGCAGCTCAGCTCGAGTCGAGTGCAGGAAGTGAAACGTAGGAATCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATAC:1 - chr3R 16696369 5' - blood 7253 2 64.38 ATGTCTTTGATTTATCTACGAATTGTGGGCGACCGAGCGGGCGCCTTGAACCGTTGAAAATCTTGTCAATGTTCAGTGTCACTCAATTTCACGTACGCAACACTCTGACTACGGGCACCGCTTTAGCAATTATAAGAGGTAGCCGG:1 - chr2L 8263125 5' + gypsy7 5144 1 52.74 GTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:1 - chr3L 18920488 5' + Juan 60 1 54.79 TTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr3L 16180862 5' - Transpac 5186 2 54.61 AACAATTGTTAATAATAAATGCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 - chr3R 15590097 5' - Transpac 5205 2 69.86 CAATTTTCGTGTGTTGTATGTGTCTGTCTGCCCTGGCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 18882526 5' + roo 8683 2 69.18 ATTTATTCGAGCGTAAGTACTGGCAAGGGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGTTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 + chr3L 15371271 5' + Transpac 43 2 54.11 TACATTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTAAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 6751637 5' + pogo 43 1 52.08 GTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGACCCGCTACTCTATAACCGCT:1 + chr3R 23108084 5' + G-element 73 1 70.08 CTATCTTTACTCGGTTGTAGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCCGCTTGCCTTCTGGTCCCATGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTATAATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 + chr2L 11867231 5' - BS 5083 1 73.97 TTGGGCCCCACTTTGCATGATTGAACCGAGGTCTTGAGCTTTTGCATAACCTCCCGCCATCACCATTTCCATTCCTGTCGAACTCTTTTGATTTCTTTACATTCGCTGGCTTGGAGCTTTATGAATTCTTGAATACTTT:1 + chrX 7499623 5' - G4 291 1 86.33 AGGCAGGAGAAAGACAGCAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAATAG:1 - chr2R 15613885 5' - P-element 2870 1 72.06 AAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGGCTCACTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 9938720 5' - roo 9035 1 56.16 GAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 + chr3L 15371301 5' + Transpac 73 2 67.81 GGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chr2L 15965306 5' + blood 7067 2 57.55 ATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGT:2 - chr2L 6074052 5' + BS 82 1 79.45 CCTAATCGTTCACTTTTTAATTGATTTGATTTATCCATTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTGACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 + chr3R 7884505 5' + jockey 4788 1 65.07 ATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTTGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr2R 9326971 5' + mdg3 42 2 57.69 CAGATAAAACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr2R 21898020 5' + 412 7070 2 71.23 GAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3L 15035238 5' + pogo 11 1 70.43 CCATCGAGCAGGACTCCAATGTGATCGACACCTACGCTGTGGCAGAGGTCTGCACCAAGTTCGGCGTCAAGGAGACCGCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAG:1 + chrX 1377291 5' + hopper 369 1 56.52 TTCGCACTCATGAGTCGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3L 16180839 5' - Transpac 285 2 68.49 AGAGATCTAAAGAGTAAAGAGCTGTAGAGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chrX 5222825 5' - 412 7517 2 65.07 AAATACAATGGCAGTTTCGATCGGCGCGAGCGAGTTAAAAGCCAAAAACGAACAACAACAACAACAAAGTGGGCAAATACAAGTTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr2L 8103640 5' + pogo 33 1 61.38 AGTGCAGCCGAAAGTGGTGAAGAAGCAGCCTAAGTTTCCCACCCGCGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 16887258 5' + roo 11 2 77.40 TAAATAAAATAAGTCATATTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCC:4 - chr2R 5022815 5' - Gypsy12A_LTR 118 1 78.08 TTGGACTTATTTATGAATGCGCAAATTTCGCACGGTCTTCCAGTTTTTATTGCATTTTGTTTCATTTTTTCCAAACAGAAATGTGCAAACATTTACAAAGCATTAAGCATTAATGCAATATTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGT:1 - chr2L 7095775 5' - Doc 4379 1 80.14 CGATCCCCTTTTTTCTTCTCCAGCCAGCCTTTGTGTGGCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCG:1 - chrX 10728956 5' + springer 7160 2 69.86 CATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr2R 21898002 5' + 412 35 2 58.90 ATATAAACCCCCAACTGCTGCCATATTATAATAGTCGGTTTTAGTCTGCGTTGCCATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr2R 14246928 5' - pogo 2073 1 65.49 ATGGAAAATTCTTGGCGCTCTTTTCACGTCCGCAGGAGTCAGTTGTGTGCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1 + chr2R 18316821 5' + FB 72 1 67.12 TATATATAAAAAAAAACAAAACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 11526907 5' + pogo 23 1 70.34 TTTGGTGACCCCGTCGAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2R 7223607 5' + blood 7025 2 74.66 TTACAGATCTAAAGATTCAACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 - chr3R 10778788 5' - mdg3 5478 2 71.92 GATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGTAAATGCATGCGGAGTTGGTGTTGGAGGGGGGGTCAAATTATAATGTAGTTTGTGAATATATCGACGGTACACTG:1 + chr3R 29708933 5' + blood 7021 2 57.94 AAACACAAATCAAACAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2L 17730566 5' + pogo 22 1 71.92 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGGAACCGATTAGACGGCTTTAGGGCATTAGATTGTACGTGGGTATACAAGACTAATGAAATTATGAAAAAATATCTAAATATTGTTCAAAAATGTGGAAAAGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGAG:1 + chr2R 5722314 5' - INE-1 348 1 40.69 TTGAGCAATATTCCGATAGTGAGAGGTAGAAACCCGATAGACCTAATCGATTCAGCGAAACATTGATTCAGGACATGGAAGTTGCGCAGGATTCAATGCTATTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTT:1 + chrX 19381652 5' + roo 404 1 69.18 ATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 + chr3L 18708587 5' + F-element 60 1 54.11 TATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTTGATTAGTCCAATATGCTACAGAACAACACTATCAACTTTTGCTGGACAATTTCAGTTTTTACAACTGGAATCCGTAGGTCCTGGTGG:1 - chr2R 545173 5' - Doc4-element 2724 1 62.18 AATTTCTTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3L 9571610 5' + jockey 29 1 68.49 TACTAAACCTGAGTGTACGAGTACTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGT:1 - chr3R 20368127 5' + Max-element 8252 2 73.97 CCACTTGGTTTCGTTTTCTTGTAAATTTAAGATGAGTCTACGCTGAGCAAATCGATGACCATAGTGGCCGGTTCGCAGGCAGGACACTCAAAGAAATCCAACGGAGTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACA:1 - chr3R 17476285 5' + 412 7546 2 71.23 CGGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAT:1 + chr3L 17447419 5' - Tirant 8474 2 63.70 GTTAGAATTGATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGA:1 + chr3R 10562132 5' + I-element 73 1 65.75 AAATGAAAAAGGTGGCACAACATTTCTGCAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 + chr3R 10778599 5' + mdg3 5266 1 76.71 GCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 10142921 5' + 412 7103 2 51.03 GGGTTGAATGAAATGGTACAGAAAAAAAAAAGAGAAGGGATTAAGTAAAACAGAAAATAATTACTTGGATTAACGAAGCTTAGTGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGAT:1 + chr2L 11029699 5' - Porto1 233 1 62.33 CATCAATTTGTAGCGCAGCAGATTCCGGCAGATCTCCGGAATGGAGTCGTCGTCGCAGAGGGTGTTAAACTCCTGGTCCATCAGCTCCTCCAGGACCTCCACCATTTTCTTAACTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTA:1 - chr3R 26056999 5' - invader2 4717 1 71.23 CGGATACGCTGCACCTATACAAACTACTCTTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chr2R 1277180 5' + Tirant 34 2 63.45 GAGAAAATAACAAGTAAGCAATCAGAATAAATTACTTTAAATATTTGTGATTTAATTATTCCCCTTGCTTTAATCGGGTTTTTTGCTTGCAATGCAAAAGCTGGTAAGGTCGTTGACTGAATCGTTTGAGTTAAAGAGACTGTTGA:1 + chr3L 3774979 5' - Doc4-element 331 1 50.00 TGGGTGTTTATGGCATTTAAATCAATAATGTCGCATGACAGCGTCCCACTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACA:1 - chr2R 21234053 5' + mdg3 93 2 66.67 AGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAAAGTTGTAG:1 + chr3L 17447455 5' - Tirant 331 2 63.70 GAATAAACGTGGGCGGTAAAGAGCGCGTGCTCCATATGGTGTGATTTTTGGAGATTACAGGCTGCCACAAGTGTGGGCGGAGTAATCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2L 3006218 5' + pogo 25 1 65.71 ACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 20292557 5' + pogo 29 1 65.75 TTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACTTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAA:1 + chr3R 10468012 5' - opus 7428 2 65.07 GAAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCG:1 - chrX 11815054 5' - flea 157 1 79.45 CAGTCAGCTCCAGTAAAGCTGACTTAACTCTGCCAAGGTTGTAGACCTTCGGCTAGCGAATACCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2R 18882702 5' - roo 9034 1 50.00 ATCTATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACT:1 + chr2L 18370320 5' + Doc 52 1 53.42 GTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCT:1 - chr3L 11596327 5' + gypsy6 7477 2 80.91 AGGAAAAGCGCTGGATGCGAGAAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTAC:1 + chr2L 11158611 5' - Rt1b 5104 1 58.70 GAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 + chr3L 23146479 5' + 1360 69 1 65.07 AGATAGGAGGACGAAGATCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr3R 10468118 5' + opus 44 4 55.17 CGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr3R 20149676 5' + 1360 43 1 50.68 AGTTGAACCAGTTCCATTTTTAAAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2R 15079971 5' + roo 8686 2 69.18 CAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3R 28008220 5' + hobo 22 1 65.32 GCTGTTTTAGTTCAATATGTGCTGCTGCTACAACTGCACTTGGCCAAGTCATTAAGAGTACGTGCCGGCCTTTTCTGCTTCTCTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGTAGGGTGGGGTTTCGCACAAACC:1 - chr2L 17640524 5' - X-element 4336 1 49.66 AGTCTTGGGCAATTTTATGTCCCTCTAAGCTTGGAGCCTCTCTTTCGCACCGGATCATTTGTAAATGACGGACAAACGGACAATTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGAT:1 + chr2L 18722044 5' + Chouto 155 1 56.85 CTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTATGTTA:1 - chr3L 22529812 5' + roo 85 2 75.69 TGGGACTTCCTGAAGGTGGGTCTCGACCAAATCGCGGATCGGGTGCAGTACCGCCTTCAGAAGGATGGGAAATGGGAATCCATGCACGTGTCCACCTAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 8272572 5' + roo 9 2 76.03 GTTTTACGTTTACCTTGACGTACTTTCAGTTGCGTGTTATATCAATTTACAAAATATGTGACACCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAA:1 - chrX 5759279 5' + FB 956 3 56.85 ATGTAAACTTTATAAATTAAGTTATCATTCTAATAATAAAGAAAAAGAAGTGGAAGTGGAAGACGAATTTAATTGCCTTTATAATAAGAGGAGGCAGTTGAAGAATGACTTTTATCTCATAATAATGGTTTTTGCACCTTGTGTCC:1 + chr2R 6076828 5' + transib4 2320 1 74.66 ATATCACTTGGAACATTGCTTTAGCATATTCGGCCAAAATAAAAATGTATTGAATTTATGTACTCATTCGTTAGCCCGCAGTCTGAACTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 + chr3R 13418785 5' + Burdock 79 2 58.22 AAACAAAGATTTATGTACCCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATAT:1 + chr3R 11553646 5' - hopper2 1544 1 58.22 GAACGGGTTTCGGGAGTAGTGACCACCAACTGGACCAATGGTAGTGTGGATGGTATGTTCCGTGTGCAGTGAGTGAGCTAAGTGGATTTTCCGTGCTGCTGCGATCGAAATGCTTCTGAAAATACCAAAAAAAAAGGAAAAAAAAA:1 + chr2R 7850559 5' + gypsy7 5005 2 64.38 AGTTTATTTAATAAAGGGCAATCCCCCAGTATTATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 - chr3L 16764864 5' - I-element 5265 1 77.40 TTTCCCATTTTCCAATTTTCCGATTTTCCAACACTCCTGCATGCCGCCTTTTTTTTTTTGGCCCTCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 - chr3L 16535267 5' + copia 56 2 57.53 TCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGGGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 4722400 5' + roo 81 2 73.97 GGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3L 53047 5' - roo 317 2 81.51 CATACAATAGAATATGTAATAAATTGGTAAAGTTTTAACTACCCTCTTTTATTTTGCAAAAATACAGTCTAGTAATTTGTAATCATAAAAAAATAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAAAGTCTC:1 - chr3L 20893696 5' - mdg1 395 2 65.75 ACAGAAAATCTGGGAGTTTCGTAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 2519944 5' - roo 389 2 71.23 AGGAATGAGCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 - chrX 13762630 5' + P-element 73 1 30.94 AAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 - chr3R 14331233 5' - Burdock 6329 2 63.70 GCACCTGCAGGCGGGAACCCGGTTGCACCAGCCACCACCCACAACCCACCACCCACTCTGCTGCAAACAAAGTGTGCTGAAGATGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTA:1 - chr2R 8383871 5' - Stalker4 261 4 51.06 GCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTA:1 + chrX 17469171 5' - blood 7331 1 58.22 TGAAAGCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 + chr3R 15514516 5' - 412 432 2 58.90 GAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:3 - chr3R 25521915 5' + blood 7051 2 58.22 CCCAACCACCCCATCTCGGCCATATCCTAATATGGGCGGTATGGGTGGGCGTGGTCCGATTTACTTGAAATTTCATAATATGTAGTTAAGTTCAAAATACAATTTTATTTGACTTTATGTCAAAAATAAGGGAATCTGACCCAGTG:1 + chr2L 5751053 5' + transib3 2860 2 52.05 ACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCTCATCTATA:1 + chr2R 14562093 5' + Burdock 43 2 56.16 ATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 - chr3L 3540225 5' + mdg3 5294 2 52.74 AAAAACGGGCTAAGAAATCAGGTTGGGCTAATGAAATACAAAGCTTGCAAGGGCAAGAAGAAGAAGAAGACTGAGCACTTTCTTTTCGGCTGCATCGCTTACAACCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 16456673 5' - P-element 2872 1 77.40 GCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 11228573 5' - roo 8992 2 71.72 AAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAT:1 + chr2R 5067642 5' + F-element 92 1 79.45 CAAATTGTCGAAAATTTCATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:2 - chr2R 12703893 5' - blood 7359 2 63.01 TAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 + chr3R 24228861 5' + opus 7169 4 56.16 ATTGAGCTGCAAATTGGAAAGGGGACCGACAAATTGTTTTAGTCCCGTCTTTGATGGACAAATTGAATAAAATATGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATA:1 + chr3R 26305144 5' - F-element 4251 1 50.00 AGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACAT:1 - chr3L 3979647 5' + opus 7086 2 80.00 CCAGCTGCAGCGGAACGGGTCTGGTCAGCTCCTCGGTGATGCCCACCAGCCACAGCCAGCCGCTCTATGTGCCCGGCAAGTACTTGGTAAAAAGCCGGAAATTTTGGTATTAATGTAATTTTTTTGTGAGTGATATTTTAATGCTT:1 - chr3R 22315609 5' + transib4 48 1 61.64 AAGTTGGCCAGAATCCCGAACTGACATCTGATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2L 535515 5' + roo 8719 2 57.53 AAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3L 13597733 5' + blood 49 2 52.74 TTTATCCTTTTTGTCGAATTGTGATGAAAGTTGCGATTAGCTTTCGGCACTTGATCTGCGCCATGTACATGTACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 25354584 5' + 297 6630 2 56.85 GTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 - chrX 17469247 5' + blood 7100 2 77.40 GCTTCTAAGCACCGAAGTGGGTAATTCTCTTTACCTATTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAAC:1 - chr2L 16942116 5' + mdg1 83 2 72.92 TATGGACAACAAGGCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAG:1 + chr2L 10089733 5' - 297 335 2 67.12 GCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCT:1 + chr2R 5070924 5' + gypsy5 27 4 27.46 AGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACCCAACC:1 + chr3R 31907352 5' + Tirant 8147 2 61.68 CAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr3L 5183676 5' + copia 4910 2 57.53 GAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr3R 18524226 5' - opus 458 2 58.22 TCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATAAAGATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTAT:1 + chr3L 24796712 5' + Cr1a 443 1 50.00 TAGGAACAAAAACATTGTACATAAAGAAAATATCTTCTGTTGGATAAATATTATTTTGACTTAAGAAATTAAAAAATAAATATTAATTTATTCATTCGCCGTGTTTCGTTCTTTTCGACAAACAGCAGTACTTTGCGGATCATTTT:1 + chr3R 20516634 5' - Tc1 467 1 36.30 AATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCT:1 - chr2R 24427602 5' + jockey 4755 1 71.92 CCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGA:2 + chr2R 19900986 5' - mdg1 7387 2 66.44 AATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGTGAAGACGGCAACTGGA:1 - chr3R 6103682 5' + Tirant 58 2 55.48 CATAAGTTGTTATGTTTGCTGTTTGCCTAAAATTATTAACTGCTGCTTGAGATTAGAATCAATGGCTGTTGGGGTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 18665363 5' - 1360 3365 1 62.90 AGGAAATATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAAT:1 + chr2L 22696387 5' + X-element 78 1 63.01 AATTTTTTGTATTAATTTTAAAAGTAGTTTCAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2L 21192516 5' - roo 8984 2 82.88 ATAGGAGGGCCAATCAACTACGAAACGCGATTGTAATACTAACTAAATTGAGCATGATGCCGGGTTACGTTACTTTGATATAGGGGTGTGCTATAAGCTATCCTAGTTTATGTTCCAACATAACTAGTTTTTCATTGTATTTTACT:1 + chr2R 23785730 5' - Doc3-element 4497 1 74.66 CGCCGTCTTTTACAGGTACAGGTGTTCCCCAAGGAAGCGTACTCGGTCCGCTCCTATAGAACGCATACAAGGACGACTTGCCCGTACTGTTCTGGAATAGATTTTCTCAACTGGTGGT:1 - chr2R 3130102 5' - S-element 453 1 69.49 CGCAGTTGGCATAATAACTCACGCGTGATGCAGATATCGTATTCCAACAGCACTGGCAACAAAAACAAAGACATAAAGATGCCGAGGCATATAAATTCAGTTGTTATCTAAATTTATATTTATTTTATTTATATTTATTTATCTGG:1 + chr2L 14930997 5' - Tc1-2 478 1 76.03 GGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGAC:1 + chr3R 3617307 5' - micropia 5131 2 76.71 GAGCAATACATAATTGATTAGGTGAGAGCAATTGACGTTTACGATGATGTTGGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTG:1 - chr2L 11573706 5' - jockey 4922 1 69.86 GTATGTAGAACTTGGGTCTGCGGGAGCATCAAAAGGGCAGATTGCTGCTCCAGATGCAGCTGGAGATGCAACTGCTCTTGGCCCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGTTTGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 - chr3L 9198714 5' + F-element 19 1 76.03 ACTTATACTAAATATTAAGTTATTATTTTGCATAGTATTCCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chrX 18149873 5' + hobo 80 1 72.60 ATTGGGATGCAGCACCCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCT:2 + chr2R 6984259 5' + HMS-Beagle2 12 2 77.40 TGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTC:1 + chr3L 15371305 5' + Transpac 4996 2 70.55 CTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr3L 13204773 5' + jockey 75 1 76.00 GCGGTGCGCTTTGGTGCTTTAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATGTTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr2R 10367568 5' - 412 427 2 59.59 GCCACTCCATGTAATTCTTAAACAATTTCTTCTGCTATATTGCAGTTTCGTTAGCCGGAGCCGGTATAAAAATATAATAGCCGCTTCTCTGCCGCCTTCACCAGGCAGTGAAGGCGCACTTCATAGCCTAAGATGAATATTGTATT:1 - chr3R 29386615 5' + gypsy11 329 2 56.16 AGACTAGCGCACTATCAAAATTCATATTGCTAAATTATTTAAAGTGGTAATACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCATTGGCTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chrX 12771773 5' - 1360 3341 1 66.44 AAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACG:1 + chr2L 11158655 5' - Rt1b 5052 1 75.34 AATATTCGTACTCGAATGGCCGAACAGGGGCGTGGCACAAAAAAAGGGGGCTAGAAATATTTTCCAAAGCTTGTTGCATCTAATAAATGGGATCTTATGGTCATAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 + chrX 7293165 5' - 1360 3376 1 76.71 GCCTGAAATTGGCCATCACATGATTGTTAACCATTTCATGCCAAATTGGTTTCTCAAAGTTCTTTCAACTCTGATCATGTATTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr2R 17013995 5' + HMS-Beagle 6830 2 62.07 TCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 - chr3R 21237808 5' + Doc 73 1 63.01 CGTGCTAATGTGCTTTTGATATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chr3L 20747215 5' - Burdock 6350 2 56.16 CCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGGATGCAAGATAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAATGCTTTTCCCA:1 + chr2R 14562134 5' + Burdock 37 2 59.60 AGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTCTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 + chrX 19231752 5' - mdg3 172 2 67.12 AAATCTGAAGGATCCTCATATTTCGCACAGCCTACCAAAATAAATGGTGCAACCTGGTCATCTATCTCTTGGGATTGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCCGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr3R 23555832 5' + Tirant 8135 2 55.81 AGCTATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 + chr3R 10973207 5' + jockey 76 1 62.33 ATCGAAATGGCTCATCAACTAATTTAATGCCTAAACCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 9649199 5' + roo 8710 2 52.74 AAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGG:1 + chr2R 6984283 5' + HMS-Beagle2 6917 2 61.81 ATTTGCATGATCCATTTTTAAGCCTATGCTAATTTTAAGAGAATCTTATAAAATATGATGACATTTTTTTTTAAGACTATGAGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 + chr3R 6842570 5' + mdg1 7079 2 56.16 CAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr2R 14385585 5' + jockey 91 1 73.97 TCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 + chr3L 21097110 5' + mdg3 5308 2 54.11 TATCGAGATCAAGTGGCTTGTGACTATCTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 + chr3L 19279064 5' - opus 7490 2 78.08 AAAAACCTTAAAGCCATATACTTGTACATTTCTTAATCCTATACATCCGATCTTGTTAAGGATTAGGGATAGATAATTGTAAACTGCTTGATGGAATTCTTCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chr2R 4996680 5' - transib2 2806 1 73.29 TTTAGCTCTTGACCACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr3R 9345687 5' - pogo 2056 1 54.79 AGTTGGGAGCTTTATGCAAATGTACCTGGCCGACGCATCCAATTGGATGAAGGGCGTCGGCGAGTGCGAGTGCGAGTGCGAGGGGCGGCTAAGCATTGTGTTGCCGCAAGTAGGGGGTCAAAAAAAACGGGGGGCCTAGAGTACCG:1 - chr3R 9833615 5' + hobo 2888 1 65.07 CTTATTTAACTTCAAACAACCATCAACTAAAAGGGATGTTGACATTTCTTGATATTGTTACGTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 + chr3L 20925703 5' + Transpac 4933 2 74.66 AGCCGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr2R 21380579 5' + roo 36 2 59.59 TGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr3R 15649892 5' + blood 7047 2 60.96 GAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 + chrX 5222883 5' - 412 7459 2 78.08 GAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 23507662 5' + 412 75 2 68.49 AAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 20913123 5' + 1360 63 1 63.97 CCGAATTTTTAGCTTCAATCACATAGGCAGCAGCTGATGCAGCAGACCCAGATTTTTTTTTTTACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 16908588 5' + roo 8720 2 58.90 TGTGGGTAAGTGAAATGTTTTGTTCGAGCATAGTCGGGGAATACAACAACCGACATGCCATACAGACAGTGGACATGCCTTGTTCTTCACATGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGG:1 - chr3L 9569112 5' - jockey 473 1 62.33 ACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 53055 5' - roo 8989 2 76.03 GGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr2L 20984315 5' + blood 77 2 71.23 CTTAAATTGGATTGCATATAACCTAGTTACAACGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATTTGAATATTAGAATTCAAAATTTACAATGCATGAGCATAC:1 + chr3R 4577469 5' - 1360 190 1 75.00 TGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chr2R 14562104 5' + Burdock 54 2 58.90 GCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 - chr3R 28033684 5' + diver 5917 2 54.13 TGGCCAAACGCACAAAGAAAACTAATTAATTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr2R 13276537 5' - roo 8980 2 81.51 CAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATA:1 - chr3R 8402636 5' - mdg1 7393 2 60.96 GAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAATGAGCAGATAAG:1 - chr3L 23583081 5' - looper1 77 1 55.48 CGGCCACACACACACAAGATGGCAGGGAAATTATGAATGCGATTTCAGTTAATTAAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGA:1 - chrX 685396 5' + BS 5060 1 59.59 ACTTTATGGCATCCAGAACAGAGCCACCAAAATATCCGTCATATATAAAAAGCAAGGATATACACGTGCCGTTGTACATATCTGATAGTCGAGGCTGATAAATTTAAAAACTGTCGGTTTTGGTCGGTTTGTGGTCGTTAGAGTGG:1 - chr3L 22215139 5' - INE-1 220 1 55.48 CCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGTTATGCACGC:1 - chrX 5222939 5' + 412 80 2 73.29 ATCAAACAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr2L 17730558 5' + pogo 30 1 66.44 ATTTTATGCATATATATATATATAGGTACAGCGAATGTCTGCATAGGTGCGCTAAATGTATGTTCTAAAAGTAAGCCAAAATATTATAAACTGTGCAATATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGG:1 + chr2R 16855704 5' + Cr1a 494 1 66.44 GACCGATCCAAAAAGTCCATTCAGACGATGCTTTTATGTAGCTCATACCTGAGATGCTAATAATGCTAAATAATAAAAGCGAAGAGAGAGAGACATTCTCCATTAATCTTAAAGTCACTAGGAATCGTTCAGTTCCTTTTGAACTT:1 - chr2R 17146295 5' - G5A 2800 1 46.58 TTATGGTCGGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2L 2690563 5' + hobo 50 1 52.05 CAAAGTACCCTTTCGCGGCCATCAGGTGGTGGCCATGGCTGGCTCATGGGTTTGTCCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTG:1 + chr2L 7250358 5' + diver2 4715 2 63.01 TCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr3L 3540229 5' + mdg3 38 2 50.00 GTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTC:1 - chr2R 20362280 5' + diver 82 2 75.34 CTGGATTTGTTTATGTTTTGATTGTGCTAAGCGTAGCGGATAAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 10357760 5' + pogo 51 1 65.32 ACCGAAAACAAATTTCCATACATGCACTTTCCGTAGAATCCCTTCGTATGTGTCGCATTTTGCTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 + chr3R 18903387 5' - pogo 2044 1 58.90 AGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTT:1 - chr3R 25384291 5' - mdg3 196 2 50.69 AAAACATGGATTCAAAGTGAAAATGTAAAAGTTCTGGAATGGCCACCATACTCCCCAGACCTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 + chr2L 21400083 5' - pogo 2045 1 58.22 AATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAATG:1 + chr2R 4260433 5' + micropia 233 2 51.80 ATGAGAGGCTCTCTTCAATAAGCCCTCTCCTCTCACTATTTTCTTTTCGTTGACTGAAACTCCCCCTCAATATAATCGGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 8542835 5' - P-element 2844 1 52.74 TGGTAAACAAAAAGCATCTGAAATGCAATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAA:1 + chr3L 13227639 5' - hobo 2857 1 76.81 CCGAACACCTATTTACGCCGAAATTGCAGCGAAACCCGGGATTTACGGATGCCAAAGCTGACTAATTCGTAGAGGCGCCTTCAATTCGCACTGCTCAGCTCGTAATTCGTGACCTTTTCGTATTAAATAATATAATGATATTTTAC:1 + chr2R 24401984 5' - gtwin 7219 2 76.71 CAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAG:1 - chr2L 13877747 5' + Transpac 87 2 77.40 CCCAGGCTAAGTCCAGACCCTCAAAACCGTGTTGTTCTAGAAAACTTATCACACTTGCGACAAAGCGCCTCCTGGACTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 + chr2L 23000446 5' - copia 146 2 52.74 CATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2L 1449707 5' - opus 7463 2 57.64 TATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCTATTCTATGTACGTG:1 + chrX 18707450 5' + BS 4762 1 50.68 TCGAGAACCGAAAAAGCCCTCATTGTCTCCTGGCCCCACGAAAACTGAGATTAATACGCAGATTACAGCCAAGTTATAATTACTGGCATCCCGAAGCGAAAATGTGCGAGCAGATAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTC:1 - chr3L 18474722 5' + invader4 2615 1 76.71 AAATTACTCAACAAATAGTGGCATTTATCAGTACTTAATGGCAATGGCACGCAACTCTCATTTGCACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr2R 18721890 5' - 412 469 2 65.07 CGCAGCTCTTTAAATTGTCTGCCGCCGGTCGTCTGGCATAGTAAAGTTGTTGGCAAGGCCGGAATGCAGTGGGTAGTTTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 3524368 5' + roo 8673 2 73.29 GAAAAAATGGTAAATAAATCAATTAGTCCGGGGTACATTTTATGCGAAATATATAGGTCACTCTTATTTTATTTATTTATATTAATATCAATATACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2L 16596158 5' - 412 7518 2 56.16 AAGCAGACAGCTTTCAACAGGTTTGATGAGAATTTGAATATTGATTGTTGACTTTAGCTATACATAAATCACACCTCATGAGATCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCA:1 - chr2R 17118342 5' + gypsy2 6668 2 54.11 AGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2L 17730548 5' + pogo 40 1 59.59 TGGCAGCAGCTCAATTTCGGTTTATGTTATTTTAAACATTTGACGCTAGGCGCATAAAATATGAACTCAAGCTCTCGTTTTGCTTGCTCTTGGCTTTGCACTGTTTTTGTTGTTACTTTTTTT:1 - chr3R 11097367 5' - I-element 124 1 85.37 ATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACATTGTTTATGTAAGACTTT:1 - chr3L 24153256 5' + Tabor 6916 2 71.03 GGATGAACGGGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:3 + chr3L 3979524 5' - opus 486 2 77.40 CCAGACATTTCTAGACACTTATTTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr2R 7404618 5' + blood 6 2 76.71 CTATTACTGCCTCCGTTCAAGTTTTTCCTTTTGTGTAACTTTGACCTGCTCGGCTCCCAGAGCTTTTCTTTTTCCCGCTGGTTTATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr2L 15965182 5' - blood 7353 2 60.96 GCCGTGCGTATTTGATAACTGACCGCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3R 19545295 5' + jockey 37 1 65.07 TGGTGTGCTACAGTGTAGCGGGCTCTTAATCAACAGGGATCTGAATGGGCCGAATTTGGCAGCAAAATAAACGCAAAACGGCGCACAAATAAAAATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2R 6585558 5' - pogo 2079 1 70.55 GGGAGTGGCGATCATCCTCATCAGGAAGGGAGTCCACTCAACTTAACTCTCACACAAAAACCAAAACCAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAAA:1 - chr2L 3854043 5' + Doc2-element 251 7 80.00 GCCAAGTTTTCCCCCAAACAAATCGCTGCCAGCAACTATAAAAACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 16908436 5' - roo 9057 1 74.66 GGTTTAAAATATTGGGTGTAAAGCTCGGTAAGTTCCACACGTAGTAATGTTACAACATCTAGAAAAATAAGGTACACTACCACATGATACTATGATAATTTATTTCAAACAATTTAGTTCATGGGATAGCCTAACTAATTAGAATA:1 - chr3L 14958267 5' + GATE 108 2 61.64 ACAGCACAGGTCACTACACTACTGGAGAGGTGGTCCAAATCCGTAATTGTTGGAAACGGCCAGGTGGAGGTTTCTAGGTGCTGGCTCACCAAATTAACTAACAATCGTACCACGTTCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGAAAATT:1 + chr2L 23006639 5' - transib2 196 1 67.81 GCAAGCACAACATTGCTGAAGCGTTGCTCTCGTAACGAACAGTTTGCCAATTACCCAGGATGGCCTGCCCCCCCTTTTAGAGTCCACTGCCCCGCTTTGTCACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr2L 6404951 5' + Tirant 5 2 65.75 ATATTAGACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGATCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTTTTTCAATAATGTGTTT:1 - chr3R 8705854 5' - hopper 1393 1 69.18 CACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 5087117 5' - P-element 2837 1 51.03 GAAAATAGGAAAAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 9938731 5' - roo 9048 2 69.86 ACCCGTTTCTGGTGCTTAATAATCTATTAGAAATTTTTACTAATTCTTATGTTTTTTTGCCTGCTTTCCATTTTTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGG:1 + chr2L 18657087 5' + R1A1-element 4895 1 49.32 CTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAAC:1 + chr2R 5070925 5' + Tirant 8126 2 30.14 GCATGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCAAAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGTGGTGTGAAATGAGAATAATAATGAAT:1 - chr3L 25232859 5' + accord2 68 2 56.85 AAGGATTTTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chrX 6398767 5' - blood 337 2 45.89 GTTTAAAATAATTTTTTTTGTTTAAAGTAATTTTTTTTGGAAATAATTTTTATTTCGCGTTTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTG:1 + chr2R 2976546 5' + 1731 4604 2 68.49 CTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGGAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGAC:1 + chrX 18034623 5' + Juan 51 1 48.41 TAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:2 + chr3L 9242007 5' + roo 78 2 76.03 AGTATCAACTTAATCGCTGTGAAGCACATGTGCATCGAAGAGGCGGCAATTAGTGGCAACATCCCAGTTTGAGTGCCAGGAAGAGGCAGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACC:1 - chr2R 9033964 5' + F-element 4522 1 60.96 CGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:2 - chrX 13762607 5' + P-element 103 1 15.07 ATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCC:2 - chr2R 23313065 5' + Tabor 6925 2 74.66 ATTCCAGACATTTCTAGACACTTATTTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr2R 7404615 5' + blood 7014 2 78.77 GGCGGCCCATAAATCAAAATGACCCGAAATTCTCACGATAGAAAAATACACAAAAATATGTTGGACTTTTTTTATAAAAATTAAAGCTTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCACCGTCGATGCATTGCTTATAT:1 - chr2L 13446107 5' - invader2 313 1 60.42 TTTTCATGATCGATTCGAGCGGTAAGGTGCGAAAAGAAAACTCCGCCCAGCCGATAGGCATCCAAACACATCGTGTTTCGTTTGCTGCATAATTGAATTTAATTATAAATCATCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 + chr2R 23312938 5' - Tabor 475 2 72.60 CCTGCGGTTGTTGTTCCTTCGGCTTCATCCCTTTTTGTGTGGGGTGGCAGCACAAAATGGCATTAAATTAAATAAAGACCCGTGTACGGTTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 - chrX 3122085 5' + diver 5932 2 56.85 ATTTCGTTTTTGACGGCTGCTCTCGAGCTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 27503010 5' + hobo 47 1 53.42 GTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCGGAAGCCCGTG:1 - chr3L 11596338 5' + gypsy6 73 2 75.00 CGGACAAAATGCCACGTCCTTTTTAACTAAATAAAAAAAATACTACTAACTTTCATCTGAAACCAATAATTTATTACATAGAATTAAGTTCTTTTTTTTACATTTAATAGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chrX 11228705 5' + roo 12 2 77.40 CAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATAT:1 + chr2R 2666300 5' + Rt1a 40 1 54.11 GTGGGTTGCTGATGGATAAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACC:1 + chr2L 12283907 5' + Quasimodo 41 2 60.96 AAGTACTTTCGAATTTGTGGAGGAAATATCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:2 + chr3R 12566460 5' - mdg3 5412 2 80.82 ATTGGATTTGAATACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3R 14088700 5' - 1360 3375 1 75.86 ATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2L 2519818 5' + roo 76 2 69.86 AAAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:1 + chr2L 19878131 5' - mdg3 5464 2 58.90 AACACTGGCACAAAACGAAAGCTTTCACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 12142524 5' + hobo 29 1 65.75 TATGAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTCCATACGAT:1 + chr3R 14088521 5' + 1360 19 1 71.74 ATTGCATTATGCGCCGCAAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 25753579 5' + hobo 19 1 73.10 GGCGGGCGAACAGTTAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chr2R 17100101 5' - P-element 2786 1 15.49 CGCCAAAAGAACGAAACCCAAGGGCTGTCAGTAAGAATTATTGTGCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 - chr3R 9148099 5' - copia 178 2 70.55 AGGGCCAATAGTAGGGCGTTTGTACACGAGTGCAACGAAAATACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCATTGTGCCGGAAACCCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAAT:1 - chrX 18821747 5' + Gypsy6A_LTR 153 1 54.11 ATGTGCCAGGAGCCCTACGGGGATCCGTACAGTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTCCTTCAGCAGGACCTCTTACAGGAATCCTTGTCGTCGTCGTCGTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 + chr2L 16371538 5' + jockey 4800 1 66.44 TAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGAGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTA:1 - chr2R 11329665 5' - P-element 193 1 16.44 CGGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTG:1 + chr2L 22641322 5' + HMS-Beagle2 6942 2 58.90 TCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1 + chrX 13061719 5' + mdg3 5327 2 65.75 TATATGAGTGTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 + chr3L 21097079 5' + mdg3 25 2 68.49 GGAATGGCTACATTGCCAAGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCA:1 - chr2L 8393109 5' + I-element 5133 1 73.29 GCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr3L 13597858 5' - blood 7340 1 52.74 CCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 - chr2L 1449688 5' - opus 452 2 56.39 ATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr2R 18123402 5' + 412 7096 2 50.68 TTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGCCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCG:1 + chr2R 4447998 5' - invader1 3960 2 64.75 GAGCTCTACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCT:1 - chr2L 22298939 5' + baggins 5212 1 67.12 TTCACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3R 5940421 5' - hobo 2913 1 62.99 TAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGGTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGCGTCTCTTTTATTTTT:1 + chr2R 14553216 5' - mdg3 207 2 55.00 CCCTCCAACGTTGTTTCCCCTCCAACTAATCTCCGAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr2R 12704071 5' - blood 7309 2 71.23 CTTAGCTCGATTCATTTCATAAATACTTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 11534557 5' + roo 14 2 69.17 AAATTAGTAATTATCTTTTACAATTTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr2L 2464173 5' + pogo 30 1 69.18 ACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr3L 14581386 5' - pogo 2040 1 65.69 TTCTATTGAGCTGAGCATCGATTTGGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAA:1 + chrX 13652501 5' - 297 410 1 65.75 GGGCAGGAGAAAGACAGCAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr2R 15613885 5' - P-element 2860 1 66.44 ACACCAAATGCTTTGTACTTCAAAAGCAAGTCAATTTGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGG:1 - chr3R 20451947 5' - blood 152 2 62.00 GCCGGGCCACTTGGAGGCGACTTAAAAGTCATGAAAATAACCAGATATGCAGATGAAGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:2 + chr3R 20883548 5' - I-element 5294 1 60.27 GTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCT:1 - chr3R 10778764 5' - mdg3 5454 2 55.48 AGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCT:1 - chr3R 13358668 5' + mdg3 84 2 71.92 ATAGGAATACCAATATCGTGTGTGCCAATAAAATGGCACTGTCTGTTTGTCAGAAGAATCCAAATTGAAAGCATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGTCAGCGCGGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chrX 11814962 5' + flea 45 2 54.79 GATAGAGCTGTTGCTGAACGGGGCCACCTGCGCTTGTTGGTTAGGAAGGGAAAACTATATAATGAAAAG:1 - chrY 152056 5' + micropia 254 2 85.51 TATAGTTGTTTGGCCAGCATGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 - chr3L 21630458 5' - Burdock 6370 2 71.23 ATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr2L 17069540 5' + 412 56 2 55.86 CAAAGTAAACAAATTTGCACGTTTTTTGTGTGGCTAGGGAAAGGATACGAAATAATGGGGTGCGAGTGAAAGACTTATGAGGTAGAAATTCAGAATTTGAACAAAATTTTGCATACGATACAGATGCAAATGGCTGTGAAATTGGC:1 + chr2R 6091321 5' - baggins 5153 1 79.45 AGATTTTGTATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2L 14222380 5' - Transpac 281 2 66.44 TCATAAATGTTTGCACACTTTACTCAACGGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr3L 2036963 5' + Doc 24 1 71.03 CATAAGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGT:1 - chr2R 10478782 5' + invader4 2814 2 51.37 CTACGTTAACAAACATTCTAAACTAGTGTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 9481972 5' + roo 23 2 70.55 GTTGTATGTGTCTGTCTGCCCTGGCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 18882538 5' + roo 31 2 60.96 TGTTTGCCTAAAATTATTAACTGCTGCTTGAGATTAGAATCAATGGCTGTTGGGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTAC:1 - chr3R 18665344 5' - 1360 3324 1 62.33 ACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2R 15613865 5' - P-element 2841 1 53.79 ACATGCCTACTTTAATGCATCACAGGTTATTCCTTATCGCGATTGTGATTGTTCTTCACCGTAACAATATACATACGTATATATACATATATATATATGTATATATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 17614522 5' + roo 16 2 74.66 TTTTAGAGGGCTCGGCCTAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 + chr2R 11655980 5' - HMS-Beagle 7011 2 64.38 TTTAATTAAATTACATTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:2 + chr3L 6751626 5' + pogo 34 1 60.27 CCATACCATAAAATAATAATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chrX 14908504 5' + blood 7042 2 64.38 AGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTC:1 + chr3R 4913576 5' - 1360 109 1 67.12 CGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGTAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chrX 5222944 5' + 412 75 2 69.86 CGGTATGATATCGATGCGAATAGAAAAGAAAAAAAAATTTTAAAGGG:1 - chrX 22546145 5' - FB 877 1 70.21 ATTATGGCTGCTTGAGGTGAAACGAGAAGATGATGGAGGGGTTTGTTTACTCTTATCCGAGGCGGGCATCTAGTTATATTATGCACATTGCTTTTTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATG:1 - chr3L 13609845 5' + 1731 84 1 63.70 AGTTTCAGCGTGCGTTTGCAAAAGTCATAAAGAATGCTCCATCCTCACCCGATGTCCTTCTTGCAGGGAATCCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTT:1 + chr2L 9259425 5' - blood 7328 1 51.03 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTATGCGCATAT:1 - chrX 12649915 5' - blood 156 2 73.13 ACTTGAACATTTCTGCCTCATAAAGAAAGTAATTATTGCACCCATTTATTAGTGTAGGTTTATTAATTATAATAGGGCTTGCACTTAATGAGGCGAATTGTAAGTACGCGGCGATGACCGGCGCTTCTAAACTCCCAAAATCGACT:1 - chrX 17744593 5' - Burdock 137 2 70.55 GTGTTAGGAAGAACTCATACTTGGTGTACTTCTTAAGGTTTCCCACCACAAACGATTCTGCAGAGGCATCCATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGGACC:1 + chr2R 22696815 5' + mdg1 7129 2 51.37 AAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 - chr3R 14049413 5' - transib2 2743 1 71.92 ACGTGCCCATTGCCCATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 15167645 5' + roo 8713 2 56.16 TGTTAGTTTCCATCATCCCATCAAGCAAGCTATGGGGCTTTCTATTGGCAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 20905498 5' - pogo 2076 1 63.20 GTAAACATACAACGTTGGGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGAACATATATGTACAATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1 - chr2L 23396013 5' + HMS-Beagle2 6902 2 68.25 CACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3R 10973192 5' + jockey 61 1 52.05 AGGCAGGGACAAAATACTTCGTTTTTGTCATAATGGAGGGTGAACTGAACCCCCGTAAAACCCAAGTTTTATCTCTTCCGAAACCATCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCT:1 - chr3L 25515622 5' + Rt1b 4803 1 60.27 TGTATATTTGCGACGCGACAACACTATCTACCAGCAGACCATCTTCTATCGCGTCTACAAGATCATGCTGGAGGTGATCTTTAAACTGGTGCCCACTTTGGTGATCGCATAGCGGAGCACTAATGGCCCCGTTCAAGAGGGGCTAC:1 - chrX 18213776 5' + mariner2 76 1 73.29 AGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCC:1 + chr3R 15465495 5' + mdg3 5331 2 69.86 CAGCTCTGATTGTGCTGCAAAATCGGAGACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACTCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 - chr3L 16181015 5' + Transpac 23 2 69.86 ATTAAATAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAA:1 - chr2L 15153375 5' - G6 1996 2 63.70 GGTGGAATTTAAGGGGAAGTTTTAAATGCTTATAATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 - chr3R 11096817 5' - copia 234 1 71.23 TTAAAAATTATTTTAGATTTATGGAATCTCAACCTAGCTTTTATATCATTATTATGGCTTTATATCAACAAACACACTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTTGGACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 + chr3L 27285977 5' - 1360 3332 1 53.42 AACCATCAACTAAAAGGGATGTTGACATTTCTTGATATTGTTACGTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGAATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGA:1 + chr3L 20925720 5' + Transpac 4947 2 64.34 ATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chrX 21205069 5' + 1360 69 1 69.72 TAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 9616680 5' - roo 356 2 54.11 ATTTCAATCACTTAATTTCTCGCTCTGCACTTTATGTCTTCCTCCATTGGAAAGGTTCAATAGTTGGTAGGATCAACTTTATGGCCAACTTCTGATTTTTTAGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTG:1 + chr2R 11050621 5' - Doc 4563 1 54.79 ATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr2R 16410011 5' - opus 7445 2 62.86 ACTATAGCCTGAAAACAAAGATGCAGTCATCTTGGATTAGTTGGGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAATGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGG:1 + chr3R 11453813 5' - 17.6 7190 2 69.86 GAATTTAATGTGCCGTGCGTATTTGATAACTGACCGCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:2 + chr3R 19545284 5' + jockey 26 1 72.60 GTAAACATGTCAAAGTGAAAACAAACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 - chr3R 15465627 5' - mdg3 5486 2 76.71 GTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACAT:1 - chr3R 6103648 5' + Tirant 85 2 79.14 CGTTCTGTATTTATCGTCTTAATATATAGTTAGCGATATAACTTTCTATCGGGGAAAGCGAATGTTACTGATGTTGTGCGTTTTTGTGTGCGTAGCTTTCCCGGGCGAAAAGAGAGATAAATAAGTTACTATTGACAACTTGCATG:1 - chr2R 19139225 5' + Bari1 1510 1 45.21 CTGAAAAAAGTGGAAGTAAAAAAGTGGCCGTATCGGTGTGCGGCAGCTAGAAAGTGTGGCCAAAAGTGAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCA:1 + chr3L 13477742 5' - Stalker 333 4 53.42 AGCAAGATAAGCCTCTGCCAAAGACTATATTTTAAACAGTAGCTGCTTGGTGTGAGCCTTTAAAATCAAGTTATATGTTAACTTGATCATTGTGTATATGTTCAAATATTCAAATATATATTCAAAAAAATATTCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 9382856 5' + TART-A 13401 2 69.18 TTCAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTCGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chr3L 11669753 5' - Tabor 450 2 56.16 TAAACATACAACGTTGGGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGAACATATATGTACAATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:1 - chr2L 23396012 5' + HMS-Beagle2 40 2 58.22 CTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 52928 5' + roo 44 2 47.95 CAAAGAACAGCACCCTAACACATATCAGGAAAAGTGAAAATTCGAAACTAACTGACGAACATGAACACTGAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:1 + chrX 22591256 5' + copia 4922 2 52.05 CAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAAT:1 - chr2L 8393085 5' + I-element 5157 1 58.22 AAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTA:1 + chr2L 15142232 5' + BS 4758 1 51.37 TTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTCGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAA:1 + chrX 3506080 5' - Tirant 312 2 80.14 ACATGCAGTATTTGTGAGGACTTCTAATATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 9482160 5' - roo 397 1 78.08 GCCTGGGGCAATTGGGCAACGCATTATGTCGTAGATTACGGCCTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 + chr3R 12537730 5' + Doc 78 1 69.18 TGAGAAATACCATTTTCTCCACTTTGCAAACATAATCGTATCGAACGCAATTACCAAAAATCATTTGACTTGAAACAGGAAACACTAGCTGGAAAAAATTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3L 11196486 5' + pogo 18 1 73.29 TGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr3R 25384319 5' - mdg3 222 2 65.75 GAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr3R 14088524 5' + 1360 30 1 65.75 CCTGAGGTCCATGTACGTGCTCAAGCTTATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAATATTTATCGATATCCCAGAAAAATGATACATTTTGCGTTCGCATTCACATTATCTGAGTAACGGGTATCTGATA:1 - chr3R 3527204 5' + INE-1 546 1 54.79 GAGCGTTGACTACTTAAGAAAATTGTTTGTTAACTTTGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGTGCGGCGTCACCCGGTG:1 - chr2R 20362350 5' + diver 9 2 79.02 AGGGGCACAAGAGGGGGGCGTAACCCCTGACTTGGTTATTTTTAGTCAGTCCCGGCAATGTTGGTCGAAAATTTCTGTGTTGCTTCAGCATAATTTGTTTATTTATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACACTTACAGAGTT:1 + chrX 13024420 5' + Cr1a 4174 1 69.66 CTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 16771437 5' + roo 58 2 57.53 CTCGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 + chr3R 10467988 5' - opus 449 2 52.05 CAAAAATCAACTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3R 24455340 5' + 297 49 2 56.16 AAGTTGTGATGTGCTCTAGGCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 - chr3R 14049478 5' - transib2 2809 1 73.97 CCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 28008219 5' + hobo 43 1 56.16 CAATGGCAGATTTAAGTTTTACACACGAAATATTCTTCGACTGAAAAGTAAGGGAACAACTGTGTGTGTTTTTGTTTTATTCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTT:1 - chrX 7705127 5' - jockey 323 1 55.48 AATTTCAGTAATAGACAAACATTTTTACTCAACCTGCTTAAGAATGATATTAGCTTGTTTAACCAAAACTATATTACTGTGTTACTGTGGGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATT:1 - chr2R 8058144 5' - mdg3 5320 2 63.70 GCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCAT:1 - chr3R 27786629 5' + Tirant 8174 2 72.80 AAGAATTTTCACCATTGTAAATGAATTTTTACACGTTGTTTTAGAGAGCATTAACACTTCGTATTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCACTCCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGA:1 + chr3R 6828932 5' - flea 4827 1 56.16 TTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 - chr2R 24338451 5' + 1360 64 1 62.33 CAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3L 14898862 5' + jockey 56 1 52.74 AAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 - chr3L 17667636 5' + F-element 64 1 54.11 TGGTAGGAGAATCATCCCATTCAAATTCATCCATATTTGTGTCCTCATCGCTTTTCGAATCTTCATTATCCAGGGAGAGAATGAAGAATTTTGTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAA:1 + chr2L 115530 5' - mdg1 257 2 62.33 ACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATAC:1 - chr2R 6984402 5' - HMS-Beagle2 7126 2 67.12 CGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr3R 12578035 5' + jockey 4703 1 65.12 CGGTCAATAAATGAGCGTAATATTTGGACTTTGATTCCTCCGGCTAAACTGACGACGGTGAAGTATTTATCTGTAAATTAGCTTGTTGTTGTGGTGGTTGCTGCGGATGTTGTTGCTGCTGGTGGTG:1 - chr2R 14997042 5' - TART-B 149 2 48.03 TTCCCGCCTATCGTTTTTGGCGCGCGCAAGCGTAAGCTCTCCCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 16685272 5' + P-element 27 1 67.13 GAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr3L 13722098 5' + blood 13 2 57.14 AATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3L 9242019 5' + roo 90 2 84.25 GGTCCTACCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 + chr3L 18708562 5' + F-element 35 1 69.18 ACATCAAAAAAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCG:1 - chr3R 27786653 5' + Tirant 64 2 60.27 ATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAA:1 + chr2L 18370324 5' + Doc 56 1 51.37 ATACAGGATAGGCCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 20076896 5' - roo 9044 1 67.81 AAAAAAAATAGAATAAAAACCCACGCTGAAGGAAAAAATAAACTCACAAGAAAAAATTTAATACACCGGAATAAAAGTGTTGGAAAATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr3R 14064377 5' + flea 10 2 74.80 AACATAAAACCTTCGTGGATGTCGGGCACCTCAGATTGCGACACCCTTTTACCAAATACACTATAATAACAAGATGCGTAATGCTATGCGATTTTTTTGCATACGACTTTTTCGGCGTGACTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr2L 22630983 5' + 1360 62 1 71.85 TGCATGCCTGATGCGCTCCTTCCTGGCTTATCCTCGTCCTTTTGAGTCCTTGTCGTCCAGGACATCAAAGAAAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATT:1 - chr2R 11086628 5' + mdg3 215 2 50.68 GACGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3R 19545319 5' + jockey 62 1 52.05 CGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3L 7434964 5' - pogo 2054 1 56.85 CAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2L 12355333 5' + hobo 34 1 75.95 GTTAATACTCGTCTATGTATATATATATATTCAGATTTCATTTGGCCTTCTGTTCTGTCACAAACCCACTTACATTCACACACACACCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACG:1 - chr3R 11520036 5' + Rt1a 43 1 60.27 TGGGAATATAGGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 - chr3R 25384334 5' - mdg3 5489 2 74.66 AAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr2R 20461173 5' + jockey 62 1 54.11 AATTAAGGAAATAGGTACACGTTCTTAACAAAGTGCATGTGGTGTGTCAATTTATTTCAATAGGTACATAATAACGAAGAGAATAATAAAATATTGAGTTTGTTACGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGT:2 + chr2R 15392659 5' - blood 7373 2 73.29 TTGATGGATTGCAGATTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAGTTTGGGCTCCGGCCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 9482006 5' + roo 8720 2 53.79 GATATATGATTAGGTTTTCGCTTAAGTTACCTTTGTATAATTATATCTAAAATGATCGTTACTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCA:1 - chrX 13460627 5' + Quasimodo 56 2 57.53 GTAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2L 2519924 5' - roo 9032 1 57.53 TTACTCATCATAAAGCATAAATGAAGGCATAATGTGTTGACGGCCTGAATGTTCGCATAAATATGTATATGTGCAGACATTAATGTATACCTCCCCTGGATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGT:1 + chr2L 16647441 5' + Circe 7110 1 67.81 GCAAAGTAATTTGTTTAGCCTCCACCATCGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 + chr2R 14553183 5' - mdg3 234 2 73.97 ATCCTTTGCTATGAAATGGCACGTTCACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 9241940 5' + roo 8675 2 78.08 ATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 13849646 5' - roo 8994 2 71.92 AAAAGGAAAAGTAACTTATTCGTCATTTTTAATTATCGATACTGGCGAGCGGTTAAGTCCGTGGGCATGGCGTCTATGTATAATCTATGTCTATCTATAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGAT:1 - chr2R 4408191 5' - INE-1 151 1 58.22 TTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTA:1 - chr2R 17182771 5' + jockey 4646 1 76.71 TATGGCAAATTGAAAACATTAAAAAATATTAATAAATTTTTATCTAAAATTACTCAAACGATAAAATGCTTGAGCTCTTTTATTTGTTCACGCAAAATTGGAAAACACATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr2L 8543026 5' + P-element 69 1 78.08 AAGGGGGGGAAAACAATCGGGCAGTCAGTTAGTCAGAGCCTTTCTAACAGGAAATCCGCACGATCGGGGTCACCACCGCCCGGGGACCCACTAAATTAATATGAATTTTTTTATATTAATTTATTTTTTTAGGCATACGGGGAAGT:1 + chr2R 14122893 5' - X-element 4699 1 71.23 GCAAAAAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - chrX 17469277 5' + blood 59 2 56.85 CGAATTGTGATGAAAGTTGCGATTAGCTTTCGGCACTTGATCTGCGCCATGTACATGTACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 - chr3R 25354570 5' + 297 62 2 65.52 AATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3L 4710705 5' + Doc 49 1 54.79 TAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGC:1 - chr2R 10478765 5' + invader4 72 2 63.01 AAACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1 - chr3R 15465605 5' - mdg3 213 2 62.07 ATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 15621965 5' + hobo 40 1 54.79 AATAATAATAAAGAAACTCATTTACAAACTTTTTATCAACTTTTGCATGTTTAAGTTTTGTCCTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 9867190 5' - roo 350 2 55.48 CGAAAATCTTACTTATATGCACTTGATAAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 - chr3L 19274937 5' - transib2 2810 1 75.34 CTGAGAAAATACACTCCATCATTACACTTCTTAAATTAGAAGACCGCCTCATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 12787073 5' + 297 6593 2 75.34 GGCAACAACTTTGCCACGACTGTTCAAATTTGGACAACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 22429279 5' + roo 8681 2 72.60 AACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 + chr3L 20785478 5' - P-element 2799 1 25.34 GGAGTAGTTTTACCATATCTGTGAGCTTTTAGTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3R 16041064 5' + jockey 27 1 72.60 GGCTTCCACAGCTACATTTTTCCGGCTTCGTTGGCAGCGCAGAGCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chr2R 5848922 5' - mdg1 398 2 69.18 CACAAAAAGCACTGTGGAAAATGCGCAGGGGGAATATGTGGAAAAAGGGGGAAAAGGCAAGCAGTAACACTCTGGTAAATATTGGAAATGAGGCACTAAATACATTTTAAACATCTTTTTCGCTTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGC:1 + chrX 17296651 5' - Osvaldo 34 1 69.66 TGTTGGTACAAAAAATATAACAACACAAAGGGAAACTCTATCAGATACCCTTTAAGCAGATGGTATACCAATAAAAATTCGCAAGACACAATAAAACGAAGAAAAATCTAAACTTGTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAG:1 - chr3L 20503621 5' - INE-1 249 1 56.83 CTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:2 + chrX 21668697 5' - mdg1 7417 2 47.95 TTGCGGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 8542551 5' - roo 9039 1 58.22 TTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3L 13597711 5' + blood 7038 2 67.81 ATATATACAATTAAAATAATGGTTGGGTTTTCCACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 - chr2R 24630237 5' - copia 206 2 53.42 GGCGTGTATTCAATTTGCAGTAATTTGCATTTGAAAAATGTGTTTTGAGGACTAAACCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTTCTCTTCTGCCGCTG:1 + chrX 2844838 5' + blood 200 2 59.15 ATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 - chr2R 15392784 5' + blood 82 2 73.29 AATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 + chr2R 18048811 5' - opus 429 2 67.12 CGCCGCAAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 25753590 5' + hobo 31 1 65.07 TTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCTGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3R 5765306 5' - opus 7471 2 63.31 ATGCCCTCCATGCAGCGGGCTATGATTGGCGCCACCGATGACTCCACATCCGCCTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTC:1 + chr3L 4327290 5' + 412 7502 2 60.29 TATACGTGTTTTTTGTGTGAGTTAAGCTGTTTATAGTCCAGTTGTTGTTGTTGCGGAGAGGGCGTGCACTAAACAATTTACTGTTAAATTGATGAAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chr3R 11002035 5' - flea 4990 2 69.86 ATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3R 19545339 5' + jockey 82 1 65.75 GTGTTTAATTCGAAGAGGGGAAATATAAAATCTAGGTATTAAATTACAAACCTTTTTCCACTGTTCATTGACATAAGTTGTTCAATATACATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAGGTATTTT:1 - chr2R 22664721 5' - Quasimodo 7344 2 70.55 GCATATTTTAGACTTTTTATGGAGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3L 22481197 5' - roo 9042 1 66.44 ATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chr2L 21582258 5' + INE-1 88 1 75.34 AACAAGTGGAGTTTCGAATAAGGTTAAACGAGGTGTTACTGTTGGGGAGACTATATTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 + chr2L 17638646 5' - blood 7371 2 76.71 AAGGGAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 - chr2L 17228707 5' - mdg3 5430 2 62.33 ATAAAATTCATCTATCTATTTCATGAATGCATTCTGCTGCATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTATTAAGGTGACAAGACGATTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACACTCAATA:2 - chr2L 17551097 5' + Transib-N1_DM 231 1 53.42 CTCCTCTGCCCCAAATGTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr2R 22867501 5' + hobo 73 1 68.49 CTCAAGATTCCTGCCCAAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATA:1 + chr2R 20856210 5' + Juan 4180 1 67.81 AATTTCCACGCGAGTGTCCTCGAAGTCTTGCAAGCTCGGACATTACTAACCTCATTTGATGTGGAGCACATTTTAGATAGAATCCGATGGAATCTCAGCCTCCATCAAGTAATACGATCTAACGCTGATACATAAGCTGATCGCGG:1 - chr3L 13261888 5' + Stalker4 7124 6 71.92 CTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15261353 5' - pogo 2033 1 65.28 AAACGCCGAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3L 15035245 5' + pogo 35 1 60.27 GTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chrX 21213378 5' + Doc 44 1 55.75 GATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3L 14581351 5' - pogo 2066 1 61.64 TGTCGCTGTCAACTGCAATGTTTCAGCAGCAATAGCAGAAATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3R 5245717 5' - 1360 3377 1 77.40 ACCGGACATTTACCTTAAGCGTCAAACGGGACTCGCTCGGCTCTACGCAGCTGTGATCATTAGTCAAGGGCGCGATTGATGTACACATATACGGTCATCACACACAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCACA:1 + chr2R 8629682 5' + accord2 7163 1 51.03 AGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr2L 2357279 5' - P-element 2827 1 44.14 CAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chrX 22386790 5' + hobo 80 1 48.39 ATACCCCTTACTCAGCTAGTGGAAGCGTGAATGACAAATTTCAACTTTTTTCTATAATTTCGATAGAAATTGGGGGGAAAAATATAATAATATCATTAATTTTTGAAAATAGCATTTATAGTTATGAGATCTCGACGTTCATACGG:1 + chr3R 17733318 5' - INE-1 135 1 54.79 GAGAACAGTGCCTCCAAGAAGATCGTGGACAAGCTGAAGCACGACGTCAAGGGATTCCGCAACGTGCTGAAGATCCAGCAAACTACAAATGAGCTTTAAGGCTCTTTTAATCAAAGCCATACTTGCTCCAACGTGGAGTTATG:1 - chrX 15396772 5' + G5 4372 1 53.85 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAG:1 + chr3L 23112568 5' - R1A1-element 5215 1 78.08 GAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTC:1 - chrX 3452497 5' + Tirant 87 2 77.40 TGTGCGTTGTTTTAACTGCATTTAGTGCAGGCGTAATTAGCCAAATTGTTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCTACCAATTGAGAACAC:1 + chr3R 25521746 5' - blood 363 2 75.34 CAACTCCAAATTCACGCGGTTGTATATACGTTAAATGAGAAACACAGTAAACAAAAAAGAAAACTTAGTAACAGATTCTTAAAAACCCCCAATTCTAAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGAAAAAACATC:1 - chr3L 7245803 5' + Idefix 6992 2 56.85 AAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 - chr3R 10468080 5' + opus 7178 4 71.20 AAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAG:1 + chr2R 10478696 5' - invader4 3002 2 74.66 AAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGT:1 + chr3L 22221155 5' - 412 401 2 73.97 CTTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr2R 1277152 5' + Tirant 37 2 53.33 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATATATATATATATACGCTTCTCTTCTCCCGCTGT:1 + chrX 12649915 5' + blood 7212 2 64.86 CGAGTTGCGGGCAAGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chrX 21213430 5' + Doc 25 1 65.75 CAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr3R 31120267 5' + opus 168 4 63.16 AATCACTATAGTTTACCAAGAATTGATATTATTGGCTGATAAGAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 - chr2R 18048950 5' + opus 16 2 78.77 GGTTCCGCTGTCTGTGATTAACAATTCGACTGTTTTGTTTTCATCTAAACAATGACCTCCTGTTTCTGTTATCAACATTTTGAATTTTTTACAGGGTAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTT:1 - chr2R 15326735 5' + R1A1-element 191 1 67.12 TCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr2R 15062290 5' + blood 7053 2 53.42 CTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 + chr3R 10467998 5' - opus 440 2 56.55 ACTAATTGGCAGCTAAATAAAAAGCTAAAATAAAACTGCTCTTATCAACCATTTTCTTGGTAAGTTGCAGACCCCGTCCTAATGTTTTATTACACTTGAACTAAATGGCCAGAGATTACATCTTTACTACTGCCTGGCCAAATGCA:1 - chrX 23183583 5' + Helitron 221 1 74.66 CCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr3R 15649902 5' + blood 26 2 67.81 ATTTCCAAAAGTTGCATTTACCCTTTTGCCTTGGTTTAACAGGGTAGCAAAGCATGCAACCATTTTCTCCATTATTTTTTGCAAATTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACA:1 - chr3L 12030622 5' + I-element 5196 1 53.42 AGTTACCCCCTCCTATTGAGTCCTCTCCGCTAGCTCTGCGAATTTTACCGTTGCCGATCGCCGTTTGGACTCAAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTT:1 - chr3R 3355496 5' + baggins 5000 1 77.32 TGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3L 15371376 5' - Transpac 250 2 67.69 CAGAATCCACAATAAAACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2R 3009415 5' + pogo 48 1 55.48 AAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:2 + chr3L 9242012 5' + roo 83 2 79.45 AGAGAGGTAAAAGGAAAAGCTTGTCCGCCATCGTTAAGGTGACGTCATAATGTCTGCAATACAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2R 16513071 5' + jockey 17 1 76.71 ATTTGCAAGTAAGGCATAAAATATCATTCATTCAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3R 4884519 5' + pogo 23 1 68.49 TATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3R 23507551 5' - 412 7509 2 59.59 CAGGTGTATAAGCAATACGCCCCACCATTCCATTCCCATAAATCAGATTTCCCACACAAAACTAATTGTCTATGGACTACGCGTCGTATGAGCAATGCCCGTGAAAAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 + chr3R 8790306 5' + F-element 107 1 72.60 GTCTTTTATGCAGCCGCCACTGCCAATGAATATTCAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr2L 11668677 5' - mdg1 7434 2 65.75 CTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 - chr3L 13597838 5' - blood 7320 1 66.44 CGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2R 15613860 5' - P-element 2848 1 54.89 CACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACA:1 + chr3L 21097130 5' + mdg3 76 2 67.81 TAAACTTTTAAGATGGAGCTATTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 - chr3R 14097150 5' - transib2 2784 1 54.79 GATTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:3 - chr2R 969260 5' - mdg1 7427 2 65.75 GAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGGGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTG:1 - chrX 13762611 5' + P-element 99 1 17.81 GACACCATCAACACGAATTAGATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAA:1 + chr2R 2949003 5' - 17.6 454 2 60.96 CGGACTGGGTTTTCTACTCCGCACCATTGACAGCTTCCCGATTCCAATCCAGATCGCACTTAGCTGAGCGCAGGCGCAGAGGCCTTGACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATA:1 + chr2R 13551479 5' + 412 258 2 59.59 TTTTGGGAATTATGTCGGTTTACTTTGGACTTGACTGGCGGACCTCCCGTGCGATTGATGGTTTGCACACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGAC:1 + chr3R 8333547 5' + opus 315 2 54.11 CCCACGCTACCAACTGGGGGAGTATTTCAGGTCACACAGCCGCCGCCAGCAACTCATAATTCATTTGTTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTG:1 + chr4 907843 5' - 1360 3338 1 54.11 GCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 - chr3L 22221213 5' + 412 7137 2 74.66 AACTACGAAAATGTCAAGTAAATTTCTCGAAGGCAACGGAGGTTAAAATTAAGGAAACCAAGAGAGATGGAGAATCTCCTTTGGATGGTGACGATACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACA:1 - chrX 15658133 5' + R1A1-element 5229 1 63.01 CGTTGAATCTTCTTAACTCTCTTCTTCGTTAATTACGTGCCACACACCACGCTTTATCTCCTCCTATGTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 + chr3R 5086971 5' + P-element 23 1 69.18 AAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chr3R 27786617 5' + Tirant 31 2 71.43 ATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3R 9938713 5' - roo 9030 1 57.53 CTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 15167758 5' - roo 9011 2 60.27 AGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr2L 18370344 5' + Doc 74 1 65.97 AATCGATTGTTTTAACCCTAGCCGGCTATTTAAGCCGTTAGTTTAGGGTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCAGTTTTAAGTTGAA:1 - chr3L 22676396 5' - 412 468 2 63.04 TTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 20292429 5' - pogo 2033 1 68.97 CGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 - chr2L 2357350 5' - P-element 2814 1 25.34 CATCAAAATTCCCTATTCCCTATTTCCTTACTACCCCCCACCTACCCCTTTTCGCCTTCTGTTTGGTGGTTTGTTGTGTTCTTAGTCGGAAAAAATACTTCACTTCAATACTACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTT:1 + chr2R 7742861 5' - gypsy4 330 2 60.43 TTCTCAACGTCCAGCATCGGAAAAAGAGCTGTGGAATTTTCACACAGCGAGGGAAAAGCCAAGAAAAGTACAGTATAATTCGCGTAGCGGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3L 14921375 5' + pogo 34 1 54.40 CTGATCCTCTACCAAAATACAGTGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACT:1 - chr3R 6053105 5' + Quasimodo 16 2 75.34 GAAGATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr3L 15261384 5' - pogo 2062 1 58.90 GCACGCGCACACACACACACATACACAAAATTGTGAAAAACTGTGACGTTATGCACATGAGTGAGCAAATAGCAACAGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3L 9589644 5' + hobo 43 1 52.74 ATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCT:1 + chr2R 13574775 5' + diver 85 2 75.34 AAGCCACAAAATAATGTGCCATGAAATAGAAATTGTTTGCCTCCAAAGCTGCAACTTGGATTTCATCCCAGTACCGCACTGCCAACGAACGATTCCCTTATATGACCTTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTA:1 - chr3L 15462620 5' - Bica 4886 1 70.55 GAATACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCGTCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 14088691 5' - 1360 3365 1 67.81 GGATACAATTCAATGGCCCTGTGGTAGTGCTGAAAGGCTTTCGTATTGTTTCGCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAAT:1 - chr3R 15352753 5' + jockey 4536 1 63.70 AATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCATTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCAC:1 - chr2R 16312097 5' + G6 2011 1 71.23 GGTAACTGAAGTGTTTGCCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCT:1 + chr2L 18235389 5' - F-element 4627 1 51.37 GTTCTCGTTTCCCATTGGGGAAACATTTCTGTGGTGCATGGATGGGGAAGGGGCACTGTGCCTGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTTAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCA:1 + chr2R 22694148 5' + Ivk 5033 1 55.48 TTCATTTCGTTATGTCAGCACAATATAGGCACCTAAGCTAAGCAGATTAAGTTTGAGGAGTGCAGAAAGTTTAATCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chr3R 17840229 5' - mdg1 7456 2 51.37 TTTGCAAAAGGCACCTTTTTTGCAACGTGAATATACCAACCATTTGAGCAGTTCGGTCTTTTTTTCATAGGATAAGAGCGTAAGAAAAGGGGTATACAGTTTCTAGTGAATCTACGTCTCAACGTCCCCACGAATAAGCTTACAAA:1 + chr3R 4569804 5' - Cr1a 4047 1 54.79 AGTTTTACAACTACTAGGCTTGGTAACTAGAATTTCTATATTTCATAAATAATAACTGCTAATTATCAAATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr3L 19279229 5' + opus 161 4 56.85 GCCGCAACTGCCCAACTAAGAGTATATATAAATCCGAAATTGGTTAGAGGAAAAAATTAAAAAACAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 18903512 5' + pogo 38 1 57.86 ATCTTTGAAGACTGTTGCGATAAATTAACTATATTTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAC:1 - chr2R 22798693 5' - hobo 2863 1 72.99 AAATTTTGCATAAAATTAGTATTATTAAATGACAATAGGTATACAAAATGTTAAGGTTACATAACAAAAACCTTAAAAATGATTGATCAAAAGCAATTAAGCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTTTATAATATCA:1 - chr2R 4756132 5' - HB 1547 1 73.29 GCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACATTGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAG:1 - chr3R 27845592 5' - Stalker4 372 2 56.85 CCTTTAAGTTCGGTTATAATCCTTTATAGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:1 + chrX 7525014 5' - I-element 5330 1 67.81 GAACTGGGTCGCCCGGCAATGAGGTTCTGCAGAAGAACTATGCACTCATATGAAAGTGTGCGGGATGCAAAAAGGCTGCGAATCTAGAAGGGTTGGGCGGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:1 - chr3R 31916229 5' - hopper 1395 1 71.92 CTTTAAGTGCCCCCTTTCCTTGTTCCACCGCACTTTGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAAACAAAAA:1 + chr2L 6406505 5' + transib2 95 1 77.40 TATAGGAAATTTTCAATGATGTTAGTATATTTCAGAATTTCATTATACCTTTGTTTAGTGCTTTTAATGAGAATAATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTG:1 + chr2R 14810437 5' + accord2 7557 2 55.48 CTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGT:1 + chr3L 16157216 5' + Juan 83 1 76.03 CGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3R 7424628 5' + 412 70 2 65.75 CATCACCAACAATGTCTACACCCCCAAGACCCTGTACTCCGCACCTGCTCCAGTGATCACCAAGACCGTGTACTCTGTTGCTTTTATTGTTTTTTTTTTTGGCGATTATTCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3L 7469969 5' + pogo 10 1 42.47 AATCTTTGATTGCATTCCAAACTTAAAGCAAATACTCTGGGTCACATAGACATATATGACCCGCTCCAAATTTTTGTAACTTAGCCAACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2L 13576095 5' + 297 6606 2 69.86 CTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr2R 15392805 5' + blood 18 2 62.14 GACGGGCGGGGAGCCGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGATGTTATCATAATCCCGGCCATGAGAAAATAACATAAGGGGGTCCCGACGAAAG:1 - chr3L 9430656 5' + P-element 14 1 57.14 AATTTTGCTGCAGTTATTATAAAACCAGTTTTTCGTAGGATAAAATAGCAGAAGGAAGCGTCTTCGCCGATATAAAATATATACTTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGA:1 - chr3L 25514354 5' + INE-1 94 1 60.17 GTCGTATTATATATTTTAATTAAATTACATTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3L 6751612 5' + pogo 20 1 69.86 ACGGCAATTTTACTCGAGGTGTGCTAAATTGTGGATGGCGAGGATAAATATCGGTGGGCTGATATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2L 12481576 5' - pogo 2089 1 75.34 AGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chrX 21213406 5' + Doc 49 1 49.32 CAGGCCGTAAACGCTTTATATTCAATCCAAAAATTTTGTTTTAGTTTTGGAATTTATTACTTTATATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 - chr3R 12559753 5' + mdg3 5296 2 54.79 TTTGGACTGCATTTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 21056677 5' + Tirant 8115 2 70.97 TGATGGTGGGTTGGTTGGGTGATTAAATCGTGTTTTGTGTAGGAAGACATTAAGCAAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTATGCGCATAT:1 + chr3R 7100553 5' - blood 156 2 77.14 AAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 22529726 5' - roo 358 2 53.42 CTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2R 18807766 5' + jockey 69 1 55.48 ATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCGGA:1 - chr3R 30731468 5' + gypsy6 65 2 63.70 TTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 + chr2L 19903378 5' - Transpac 242 2 65.97 CCATATCCAAGGCGTATGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTC:3 + chr2L 22643337 5' + invader4 2776 2 56.16 CACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATTGAGAGCG:1 - chr3L 5446193 5' + roo 60 2 61.15 AATTTTTGTGACCTCTTTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chrX 21668664 5' - mdg1 7450 2 67.81 TTCTACTTATCGACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2L 1327471 5' - pogo 2069 1 58.45 CCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3R 25271178 5' + 412 7119 2 60.96 CGTTAACTTTGACTTTGGACGAGGGATTAAAGGTAAATCGGCTTACGTTATGCCGGTCATGAACAAAGGCACTGAAAGTTATGAGAAGGTAAGGAAGAGGATGAAGAGTGGGGAGCACACCATTCGCTAAGAAAGGGGAAAAGGCA:1 - chr2R 19909078 5' + Rt1b 174 1 73.97 CAGTCTTATGAATATGCAAGCAGTATAGTACGAGTAGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 + chrX 12893310 5' - Bari1 1676 1 64.14 AAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAGAGAT:1 + chrX 693674 5' + INE-1 163 1 37.67 GTCTGGGTTTCATTTCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2R 16383419 5' - roo 394 1 65.75 GGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGA:1 - chr3L 14969278 5' + P-element 85 1 24.66 TTACACTTCTTAAATTAGAAGACCGCCTCATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:2 + chr3R 12787094 5' + 297 33 2 60.96 CGGCCAATAAACTGTGTATGTATGATATGAAGGGAATTGATATAATTAATTGGGCATTTGTGGACCCGGGTTTGTGTTCTTGTTTTTTATTTTTTTCCTTAACAAACATTCGGTTCGTTAAGTTGCATGCCTTCTGCATACATATG:1 - chr3L 20366672 5' + Stalker2 7487 2 52.05 ATGGCTTCACTTAAAGTTAGGGCATTCAGTTGAGTTCTTCTTGATGGAACTCAACTCTGCTATCCTGGGCTTAATGATGCCGCGCATGCGCTCTTTTTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATAGTATAAAAGATATAGACAGACTAA:1 + chr3L 15066602 5' + G4 3606 1 66.21 GCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTT:1 + chr2L 17228636 5' + mdg3 85 2 74.66 TTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTCCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTT:1 - chrX 20678117 5' - Porto1 4517 1 81.51 ATTCCGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 8022207 5' - roo 8992 2 71.53 GGTTCCGTGTCGAGGTATTCTAAAGTGAGTTATTTTGTTGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAA:1 + chrX 18149814 5' - hobo 2858 1 71.23 AATTTGCAGACAGCCAGCCGACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 + chr3L 12250927 5' + flea 4775 2 72.60 GTCGGTGAGGAAGTTGAGTTCGTGGGGTTCGATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2R 8686663 5' + hobo 51 1 56.85 AAGAGTCAGCTAATTTCCCTTTCCATTTGGGAATTATTCGTCTGAATTTCCGTTTGTTTTTGTTTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 - chr3L 5183800 5' - copia 5067 2 59.59 GCGAGTGGAAGACTACCGCTAATAGTCATGGAAATTCGTTATCAGACAGCCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 + chr3L 9430574 5' - P-element 2818 1 41.10 CGATAAAAATATTTTATTTAAATATTGTCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 25822946 5' - roo 9032 1 56.85 AATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chr3L 15035218 5' + pogo 61 1 64.14 AGACACCCACATTTGTCAGCGGAGAATCATTCTGCCAGCCCTCCGGACTGTTCTTCCGACGAGGCAGCGTCTTCGGCATGTTTAAAAACCAAACCTCGCACTAAGCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTT:1 + chr3R 23990128 5' - BS 4977 1 62.77 GCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCGCGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chrX 15089576 5' + P-element 75 1 34.25 GTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr3R 5087134 5' - P-element 2855 1 63.19 TTGAAATAATAAATAATACCTTTACATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAA:1 - chr3L 18920531 5' + Juan 17 1 73.97 CAATTTATAAGGTAAATTTCGATTGTACATATTTAAAATGCTCTTGTGTATATATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr3R 11526712 5' - pogo 2094 1 76.71 GTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCA:1 - chr3R 4884460 5' + pogo 82 1 72.60 GGGTTTGCGGGTGCTTGTAGGTGTGTGGAAGAGGTCCTTGGTCTACGTTTATTGCGGGGATAATTTCTATATGGGACGTCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 - chr3R 14874254 5' - flea 217 2 60.96 GGCGAAAGGACCTAGCGAGCCCCACATAGAATTCGACGACATGGGCATCTTTAAAGATTGCAGTTGATTATTCCCGTTACTCCTAGAGGAAGAGGGTATACTAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATC:1 - chr2R 25107360 5' + INE-1 80 1 71.23 GGGGGAGAAAAGGAAAGCGCCAGATGTGCTGGGCCCAACAGAAAGAGAAAGGTGGCTGCCGTGCGAAAGAGAATCAATTATTATCATATGTTCATTATAATTAATTTAAATTAATAAAAATTGCAGCAATTTAACATTTCCTCACT:1 + chr3L 14716239 5' + Transib5 2619 1 50.00 TGCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACAC:1 + chr3L 14854671 5' + rover 57 2 61.64 ATGTGGGAGGTGGCGACGCTCAAAAATTTAATTACTTTCACTTGTGCGAACTGTTTGTCTGCCAGTCAGATGAGTGGACGAGACGGTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGGCGTGCTTAAGACTATGTGTTTGTTATCTTATCTT:1 + chr3R 24739627 5' - Stalker3T 213 1 58.90 GGCGAAAGCATCATGTTGGTACAATATTTGTTTCATTATATGGTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr2L 22446019 5' + 1360 73 1 70.63 GGCGACTGAAGAAGGAGAACAAGATGACGTGGGAGCCCAAGAATCGCACAGATGACGATGATGACGCCTTGGTGTCGGACGATGAGAAGGACAAGGAGGATCTGGAGCCGATATTATTGCACTGTTAGTGACTTGGGGGG:1 + chr3L 12594377 5' - X-element 124 1 79.29 GGGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCAC:1 - chrX 21667993 5' + gypsy2 6495 2 77.78 CATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGGTAACATAATCACAAAACTCCCGAAATATAGCCGTAA:1 - chr3R 24175755 5' + Burdock 18 2 51.85 GCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 - chr2R 14884336 5' + mdg3 5319 2 69.86 AGAAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr3L 15322075 5' + Transpac 4968 2 52.05 ATTTCATGTTCATTTTACTAGGCAGGAACGGTGTGCGGTGGAGGAGACCGAATATGGGAGTATATATTTCAAGTGAATCAATCTATAATATCTAAGCATATATATTGAGGTTTTTTACATTATATTCATTTCCTCGATTCTGTTCT:1 - chr2R 14945574 5' + Cr1a 4338 1 71.23 CACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr3L 17447568 5' + Tirant 45 2 56.16 GATTGTTAGAATTGATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATC:1 + chr3R 10562128 5' + I-element 69 1 63.01 GCATTAACAGTTTTTCCAGCAGTTCTGTGCTTTGCCTGGGCTGTTGGCTGTTGAAATAATATTTGCGATCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGG:1 + chr2R 20362168 5' - diver 6090 2 69.29 CTTGGGGCTATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chr3R 4885304 5' + 1360 45 1 56.16 CATATTGTATCTACACCTTTCGCGGCAACTGCTTTTAAAAGCAGAATAAGACTTGAAAAGGACTCAAGAATTCTTGACTTTATTTCGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATGATTAGTCATATACCATGG:1 - chr3R 7371876 5' - G3 4295 1 50.68 AGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:2 + chr3R 10973229 5' + jockey 98 1 76.03 ACGGGACATACGGCAAACACCCGGCAACTGGCAAACATGCAAACAAACAAACAAACAAACATGCTCACGACAATGTTTTGTTTCAACTGTAGTGTATCTACACTCACTATAACTCTACTCTACAGATATATAAGTAACGTACATAC:1 - chr2L 10784889 5' + Stalker2 38 2 60.96 AGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTC:2 - chr3R 10468089 5' + opus 7077 4 69.18 GTTTGGCTGTCGAAGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:2 + chr3R 16535250 5' - Stalker2 7623 2 60.27 AATCGACAGCGAGGCTGGGCAGGAATGGCACTTTACGGCCAGACAGCTGGGAAAATCGAATCTTTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGTTCTCTCGCTCTCTAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGAAACCTCTAGA:1 + chr2L 4433598 5' - 1360 70 1 56.16 TTCATACCTATAACAAAGCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGAT:2 - chr3R 27845609 5' - Stalker4 389 1 68.49 ATAGTAAAATAGAATTATGCATTTTAATTGAGTTCCATTTCCCACACTGATGTTCAGTCACTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAATCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 + chr2R 18812071 5' + jockey 4798 1 55.48 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACAAAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGT:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 43 1 67.61 TTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATACTTAATTCTAAATACTTAATTCTAAAATACTTAATTCTAAAATATATATCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTC:1 + chr3L 13727325 5' - P-element 311 1 17.12 CATTCATACATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2L 2519809 5' + roo 8724 2 61.87 AAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr2R 6984432 5' + Doc 80 1 65.75 ACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTA:1 - chr3R 14049432 5' - transib2 2763 1 58.90 ATCAGCTCGAGCACCTTTCACAGAATGCACGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCT:1 + chr3L 14863868 5' + Transpac 5013 2 79.45 TTAATAATTTAGTGAACGTGTCTTAATCTAAGTCGAGCCACACAAACACACCTCCACACACTCGACACACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGAGGAGTGTAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAG:1 - chr2L 11158754 5' + Rt1b 5015 1 75.38 TGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1 + chr3R 3527047 5' + Tabor 30 2 65.47 CTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chrX 3452534 5' + Tirant 41 2 56.20 GCACTATCACCCTTCCTTTTCCTCAGTGGAGGTCATTAAGTCAATCTGTGGACATAAATAACCCGCAGGACATTGCAAAATACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAATTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAA:1 + chr2L 4142762 5' - 1360 147 1 56.74 TTTTTTTTCCTGTGCACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 + chr3R 27971018 5' - mdg1 7396 2 61.64 CAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGG:1 - chr2L 22063440 5' - INE-1 127 1 60.27 AACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACGCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr3R 24228995 5' - opus 7464 2 60.27 ACAAGTGCGGCATGGAAGTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chrX 15089476 5' - P-element 2842 1 54.79 GCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:1 - chr3R 25384290 5' - mdg3 193 2 52.05 TTTATGATTTGCCAACAAAACGGCCGACAGCAGAGAGAATCTGGCAAGCTTCCAGGCTTACACTTAAATTTAAGGAGTTTTAATCATTTCTTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 + chr3L 10370848 5' + copia 24 2 67.14 CATCAGACATGGGTTATACTTTCGACAAGTTTTCTTATGAATTTCACACTTCGATTTGCTCGCCATTCGAATTTTTTAGTGAGAGGTTTGATTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTG:1 + chr3R 5520553 5' + BS 5059 1 51.37 ATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr3L 3979697 5' + opus 39 4 58.90 GAATTGGATTTTGCAAAGGAAAAAATTGGGGGAAAAATATGCCAAAGAAGGGGTAAACTATTGAATGACATGTCTATATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chrX 5265670 5' + flea 4789 2 58.90 CACACCACGCTTTATCTCCTCCTATGTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGA:1 + chr3R 5087013 5' + P-element 65 1 40.41 ATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2L 4104078 5' + roo 8745 2 73.29 ACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCACTA:1 + chrX 18707456 5' + BS 4768 1 52.74 GTTTTATTTTTCTACATTTTTTCATCTTGACTCGCTTTTTTCACAAACATTTGCGATGATAAATATACATACATCAAACTGAAACTTAAAAATGATTCTTATAGCTAACAAAGACTCGAAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGATTG:1 - chr3R 8176832 5' - Gypsy6A_LTR 101 1 52.74 AGGCAAAGTCGGGTCAACAGGTTGGCTTTGGTAGTTTACATGTGGCGTTAAAGAGTCTTCATAAAGTAATGCAAACTAAATTTAGTAATGACTTGGACTTAGATCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACAT:1 + chr2L 1317183 5' + hobo 62 1 71.92 TACCCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3L 16887397 5' - roo 335 2 65.07 TGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGC:1 + chr3L 3540154 5' - mdg3 5401 2 78.77 ATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTG:3 - chr3L 19339428 5' + Tc1 74 1 61.64 AATGGGATAACTCTAGCTTAAAAATTTAAATTACCATAATTTGTTGCTACTTAATTAGTCATCTTTAACTGTTAAATTGGTAAAATTTAAACTACTTACATGAACTTACTAACGAACTTAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCT:1 + chr3R 13494273 5' + opus 110 2 64.38 ACCTTCATCTGTATCTTAAGTGCTTAACATTGCATTCTAGCTTGGCCCATTCAAATTTGGTAGTTATTTATGTGTGAATAGGCTAGATCTTTCACTGAATCAAAGGTGTCAAGACGAGGCAGGCGTAG:1 - chr3L 19646918 5' + R1A1-element 437 1 77.34 AATTTGATTTTAATTAGTTTAGCGCCTGAGAGTCTTTGGCAAGCAAAGCGCGATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTAATTATTTTTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAAT:1 - chr3R 14957723 5' - TAHRE 10393 1 48.63 GTTGAAAAGGTTAGCCTGGGGAAAGTTATGTAAAACATTTAGGTGCGAAAATTTTTATAGATCTAAAATGGTTGTTATCCATACTTTACATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr3L 15890978 5' + mdg3 33 2 52.05 ATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTTTCCGCTCGC:1 + chr2L 23372624 5' - 1360 3309 1 70.55 ATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 + chr2L 17162766 5' + blood 64 2 61.64 TCATCATCCATTAATGTCACTCAATCTGTGCGCATAAATTTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chrX 17012754 5' + Burdock 38 2 59.59 ATTCCACTACTAGCAAATCATTTTCACACTCGATGCTTAAACACAAAGAACAGCACCCTAACACATATCAGGAAAAGTGAAAATTCGAAACTAACTGACGAACATGAACACTGAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAT:1 + chrX 22591213 5' + copia 10 2 79.45 CCCTTTAAAGTTCAGCACTTAGCACTTGGAACTCGACCGGGCCCAAGGCGAAATTAATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2R 11379660 5' + jockey 14 1 79.45 AACTTTGAATGTTATATTCTGTCGGATACGCTGCACCTATACAAACTACTCTTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2R 1277202 5' + Tirant 8120 2 78.08 TAGCAGGGGATTCAGAAATCAAGAATGACCAGGGAGGGGGTCCGTTCTTTGTGGAGATATCTCAATCTCCATATCCAATATGGAAATATAATAAAATACTACGATTTGCATCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 29260749 5' + roo 66 2 75.86 GGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAAAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 + chr3R 25753640 5' + hobo 81 1 71.92 CTCTTCTATCTTGGGGTTTATAAAAATATTTTTTATTACAATATTTTGATATTCGTTCGCGTGGTGTTTTGTGTTTTCTAAGTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chrX 10538098 5' + pogo 33 1 63.64 ATTAAAACTAGCGTCTGACGAGTACACAAGGTACACAGAAAAAAAACTAATGTGATACTAATGTTGGATACTTAAATAAATAAATAAATAACTACTTGGGAAACAATGCATTAGACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 9669660 5' + roo 8670 2 65.07 ATATTGAACAGACAAATTTCTGCGTACTTATTTTGTCCATAAGAAACGTCTCTTAATTAGTTTTTTTTATTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCCTT:1 - chr2L 22696465 5' - X-element 4654 1 57.53 ACAATTTCATTGTTTAAAAACTTAATTGCTTTCTACTTCAGCGTGCATATGTATGTACAAGCCAATGGACAATATGCACAATATGTTTCTACTTTGACTTATATATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAA:1 - chr2L 8960037 5' - Ivk 5357 1 63.70 TACGCTAGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr2R 6052720 5' - mdg1 7430 2 65.07 TTGCCCATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 15167654 5' + roo 8722 2 62.33 CTGGGGCAACCCTCTGACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chrX 17258345 5' + 297 24 2 69.18 ACGAACAACAACTCAAAAAGCTAGAAGAGCGAGGGTGGATCGATGGGTTCTAATAAATGGAGAAAATGTGACAAATAAGCCTTTTTATTATAAATATTTATTATTCATTAGTCACTGGGAATCGTTCAGTTTCTTCTGAACTTCAC:1 + chr2L 15203988 5' - G5A 2797 1 76.71 CACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCGCTAAACACATCATCGGAC:1 - chr3L 17447568 5' + Tirant 32 2 61.65 GAGCTGGGCCACAGCAATGGCGACATCATCTCACAGAATCAACAGAAGGGATGGTGGACCATCGGCCTGATCAACGGCCATTTTTTCTCTTTTTTTGAGTTGCCGGCAGACAGGAGTGGCAATGATTTGTGGCATTTTACAATTTT:1 + chrX 7982465 5' - TART-B 10543 2 54.79 CTTGGGATCGGCTGTCGAAAGTGCAATCGGATTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCC:1 - chr3R 30731513 5' + gypsy6 21 2 68.09 TTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 22846675 5' + 412 7086 2 63.70 AGTGTTACCTGTTGCCAGAGCGAGAGGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTT:1 + chr3R 26315851 5' - roo 389 2 71.72 CTACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 - chrX 9816477 5' + jockey 68 1 56.85 CAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATAC:1 - chr2L 15920174 5' + jockey 63 1 56.93 TGTGAATATATTTTATTCATATAAGCGTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2L 19930209 5' + jockey 33 1 67.12 GTCACTGATGATTAGGCCCCGCGGATCGCTGCAAAAGTTCGAAGTTGGCCAGAATCCCGAACTGACATCTGATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2L 535556 5' + roo 8678 2 76.03 ACGAATAAAACGCTGATCCGAAAACATAAATCGACCAATGGACGGGGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGGCGCAGTCTCCGGCGTAGGTTG:1 + chrX 10728787 5' - springer 7489 4 60.96 GCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGC:1 - chr3L 14043632 5' + Ivk 49 1 52.05 CCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr2L 12142641 5' - hobo 2895 1 57.76 TGTTACCTGTTGCCAGAGCGAGAGGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 26315853 5' - roo 389 2 71.33 TTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chr3R 13358606 5' - mdg3 168 2 69.18 ATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr3L 19397043 5' + F-element 91 1 72.60 ATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3R 12780917 5' + hopper 10 2 78.77 TAGCAACTCATGACTATGACACGGCGGAAGACAATCAGCTGGAGAAGCTGGTGGCCCTGATGGACAATGTATATATGGTTTTGTTGTGTATATTTTTGTTGTATATAGTGATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAA:1 - chr2L 3296660 5' + 17.6 6946 1 54.11 AATGGGGATGGCAGAATGATTCACGCGCAAAAGGTGAAGGACGCAGGATTCGGTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTT:1 - chr3L 4967361 5' - Doc 4669 1 64.63 CCAAGTAAATACCAATTGCCAATTCAAATTCGTGCTAATGTGCTTTTGATATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTT:1 - chr3L 20747245 5' - Burdock 6380 2 76.71 ATCGTGGATTCTTGTTTTCAAGTTTCTACTAATGTTAGTTTTAAGCTAAAAAAGATTTGATTCTTTAAAGCACTGACACTTAAAGTATTTAGAGATCGAAACTATTTAAATTCTAAATAAAGAAGGAGACTTAAAAGATTTCACGT:1 + chr2L 8776788 5' + G4 3682 1 68.49 GAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3R 23664499 5' - pogo 2052 1 52.74 ATGATCCTTGTTCTCCAGGGTCACATTACTGCCCAGCTCATCGTCATTATCATCATCATCATCAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGTGA:1 + chr3R 8865668 5' + jockey 4581 1 55.48 AGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:2 - chr2R 6187934 5' + Tirant 8147 2 60.75 CCGTGAAATATATATCCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCGACCATAACAGTCTCTTTATCCGCATCTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCGGATGTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTT:1 + chr2L 18419185 5' - Stalker2 349 2 74.66 AGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTAC:1 + chr3R 23108076 5' + G-element 75 1 69.34 GATGAACAAACTAAATGTTATTTACGCACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 5446219 5' + roo 8705 2 58.22 CGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:3 + chr3R 18524221 5' - opus 7466 2 61.64 CTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr3L 10814619 5' + 297 6622 2 56.85 AACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGC:1 - chr3L 3979667 5' + opus 182 4 67.12 TCAAGCATATTTATTTTCTTTTTTTTTTATGTCTACCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 12843542 5' + roo 17 2 71.03 CTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 - chr3L 3540262 5' + mdg3 5271 2 71.23 TTCAAATGTATCTAAGCATTTGCATCTGAATGCGCATCTGTGAAGTGCATGTCCCACTGTGGTTGTTGCTGTGATTTGGTGAATCGCGCGTAGCCGATTGTAATTATTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr3R 29207484 5' + copia 15 2 75.34 AATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr2L 12261149 5' + jockey 62 1 52.74 CGAGTCTGGTTGGTTAAGTGGATTGCGGGTGCCACTTGCATTGGTGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAG:1 + chr2L 19931121 5' - jockey 440 1 77.93 AACTCGCCACCATTTGTACCACCGTCTCTGTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2R 21380736 5' - roo 9042 1 64.38 AAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTC:1 - chr3R 17316122 5' - 3S18 260 2 69.86 CTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 8542607 5' - roo 321 2 74.31 CAGGGTTAAACGGTACCCGTTATTTGCTTTGGTTGTGGCCACACCTTTCAGCAAACCCTGCACCATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATACGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACC:1 - chr2R 22435836 5' + G2 97 1 72.60 GGGTTCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 + chr3R 6103579 5' - Tirant 334 2 61.64 GCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATTAACTACCTTGTTTATTTACACACGTACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAAATAATAGAAAAGAAGAACACAAAGGGGCTCCAAGATTTCC:1 - chr3R 16799801 5' + X-element 4683 1 58.90 AAGCAACAGTCAGAGTGACACGATGGGTAAGCGATACCGGGAGCAGGAGCAAACTATGTGAGCAAGCTATCAAAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 26501100 5' + roo 17 2 52.05 CGCTGATCCGAAAACATAAATCGACCAATGGACGGTGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCAGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGG:1 + chrX 10728797 5' - springer 342 2 55.48 GCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - chr3R 15514600 5' + 412 78 2 69.86 GAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3L 27391408 5' - 1360 3351 1 54.79 CAGCTAGTGGAAGTAAAAGAAAGAAATTTCAAAAATCATTTCAAAAAACAAGAGAGAATGCTTCAAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGAATGCGAACGCGTATTTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAAAT:1 - chr2L 21942387 5' - INE-1 500 1 60.96 CACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr3L 14969313 5' + P-element 49 1 48.97 AATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAA:1 - chr2L 6074066 5' + BS 68 1 69.86 AATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr2R 15080092 5' - roo 8992 2 71.92 GTCACCGTGATGCCAGCCATCAGGACATCCTGGGCAACCACAATCAGTGGGACAGGACCTCCAACACACAGACTGCTTTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTTTGTGTATATTCTCGTTCCGAATATACCATGGAGCTC:1 - chr3L 15747323 5' - Doc3-element 4415 1 50.68 GCCCGAAATTTCAGCAAATTATCTACCACAAGGCAGACACTCAAGAAGCGCAAATAAACATTATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCCACTTTTGTCCCAGATCCCATTTTAGCATTA:1 + chr3L 6112898 5' + G2 387 1 52.80 ATATAAAATGGGAATATTATATACTTCGAATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1 + chr3L 19146581 5' + pogo 75 1 45.89 CACGAAGCTTATCTGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689465 5' - diver2 4466 1 69.66 ATATATTACTGACAACTGAAGTTGATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCGCGATGCAG:1 + chr2R 16712989 5' - pogo 2070 1 69.41 GAATAAGGTTAAACGAGGTGTTACTGTTGGGGAGACTATATTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGAGTTTTCCTTGCAGGTG:1 + chr2L 17638661 5' - blood 345 2 66.90 TTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2R 16383367 5' - roo 9005 2 65.75 TATAAAAAGGAAGGCGATCTATTATCCCAATCAGTTCTGGTCTTGCCATCCATCGAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAG:1 + chr3R 12375688 5' - copia 5059 2 61.64 AATATACTTCTACTTATTGCGCCCATAAGTCGCTCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGA:1 - chr2R 19038443 5' + accord 6995 2 76.71 AATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr2L 2338170 5' + blood 7066 2 56.85 ACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACT:1 - chrX 21667963 5' + gypsy2 6527 2 58.90 ATGCCCGACTACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3R 13543987 5' - 1360 3371 1 44.52 GTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chrX 21213378 5' + Doc 77 1 65.75 GGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - chr3L 21093266 5' + Ivk 29 1 65.75 CCACGCCCATGCATTTTCCACTTGTCAGCCTCCTCTACCAACGTCCCAAATTAAGTAAAGTAAAGTAAGTAAACATGAAAATACGCACAAAAAAAGACAATATTGAATATTGAAGATATTAATTTTACGTAACTTAGTTAACTGAT:1 + chr2L 17338151 5' - Transib5 328 1 63.70 GATGCCCGACTACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3R 13543986 5' - 1360 3372 1 45.21 CAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 + chr3L 19279111 5' - opus 440 2 59.59 TATGTACATGCCTACTTTAATGCATCACAGGTTATTCCTTATCGCGATTGTGATTGTTCTTCACCGTAACAATATACATACGTATATATACATATATATATATGTATATATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chrX 17614527 5' + roo 11 2 78.08 GGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3L 2036991 5' + Doc 53 1 53.42 AGTTGCCAACTCCGAACTCCAGCAATGTCCAGCTAAAGTAATTTAAACTCGCCTGCCACATTTCTCGGTTTATTCTCCGCGGGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATCTG:1 + chrX 18125095 5' + BS 5020 1 62.60 AAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 12608068 5' - roo 8991 2 73.29 AAGCTTTCACTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAAATAGGTAG:1 - chr3R 15139858 5' - Tc1-2 1539 1 69.18 ATGCGGACTCGGGACTCCCGGATTCCGAGAGTCAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chrX 19498074 5' - P-element 2835 1 47.83 AATTATTAAGTCGACTTACACATTCTAGTGTATGCAAAACAATCTCAACTATATCTTTTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGC:1 - chr2L 19586350 5' + R2-element 3452 1 60.27 TCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 + chrX 10873807 5' + mdg3 53 2 60.96 AAATGTGACTGGGTTGTGAAAATTTGAACATAAGTCTTTGGCTTTATGGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chrX 16982310 5' + roo 72 2 67.12 ATATACTTACTTAACTCTTAACCAAGTTAATCCTGCCAGCTCAGCTGTATTGATCCCAATGCATTCACCTCTGTGAGGATTGGCCCATTATGACAACAATACAGCCGGGGTTGGGAGGTTCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTC:1 + chr2L 2926753 5' + Doc 328 1 67.12 ATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAA:1 + chr3R 443032 5' + gypsy2 19 2 68.89 AACTGGAAACAAACCTATGGCTGCCGCTGGAGCCACGAAACACCTCGGCGGGCCTGGGTTCTACTAGCGATCGGTTAATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 4316658 5' + roo 8715 2 57.81 TGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr3R 28008214 5' + hobo 38 1 59.59 ACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAGGTATGAAGGTTTTTAAGTTTC:1 + chr3L 17447440 5' - Tirant 346 2 53.42 CCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 9649164 5' + roo 81 2 75.34 AGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGTGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCGCGCAAGCACCGCT:1 - chr3R 20368045 5' + Max-element 8305 2 76.07 CGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 - chrX 4566256 5' + Transpac 58 2 61.64 ACAAAACAATGTTCATACTCAAAACACACTTTAAGTTTGATTTGGTTGTCATTTTGGTTTTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGAGCTTAGAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATC:1 + chr3L 15858166 5' - I-element 5264 1 59.59 TACATAAAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATGTATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCT:1 - chr2L 21570276 5' + Dm88 4411 2 53.42 GCCATGGCTGCTGTCAGTGGAGCAATTTTTCATTTTTATCCTTTTTGTCGAATTGTGATGAAAGTTGCGATTAGCTTTCGGCACTTGATCTGCGCCATGTACATGTACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 25354618 5' + 297 15 2 80.14 CAATCAACGGACAAAAGTTGATTTCGCAATTCGCCATAGCCACAGCCATTCGCCATTTGCAATTCGCGGCTCGCATCTTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 + chrX 14448026 5' + HMS-Beagle 6829 2 58.57 CTGCCTCGTATTTTTGCCACAATCATTTAAATGATGAGAACGGAGGCGGTAATTCGATGCCGTCATTATTATTATATTGTACCGCAACCAAGGCCATATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTC:1 + chr3L 88670 5' + R2-element 87 1 65.75 ACGTTGTACTAGCTCGAGCATTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACAT:1 + chr2R 982277 5' + HMS-Beagle 10 2 77.04 AAGGCAATGTGAGACATGAAAACAACCCTTGAAAATGGGCAACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 - chr3L 5182918 5' + copia 69 2 64.38 CCTATGTCAGTCAAAATGCAAATAAAGTTGGTAAATTGATTTTGCTTGTTCAGATGCTTGTCAAAATAAAAATGTGCCCTAATCAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATG:1 + chr2L 17733646 5' - pogo 1960 1 55.48 TATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 14756772 5' + pogo 52 1 59.31 GGCCCTACCCTGGCGACGCCCTTGCTAGTGGGATTTGGGTAAAGATCCAGAAACCAATCCCACATTCGGCCATTCTAACTAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGGCG:1 - chr3L 24157423 5' - Tabor 285 2 68.00 TGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTAT:1 + chr2L 12142583 5' + hobo 88 1 77.40 TAAATACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2L 2357388 5' + P-element 50 1 52.05 GCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr3R 25521910 5' + blood 7056 2 54.79 ATGAATATGCAAGCAGTATAGTACGAGTAGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTG:1 + chrX 12893317 5' - Bari1 1668 1 58.90 GTATTTTCTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chrX 19162544 5' - pogo 2076 1 66.44 GGCAGGAGATCCCACTATCACAATTACACACGCACATTTAATTGGACAAGATGTCAGGATCGTGGGTGGATCATAAAACCATTTTTACTCAAAACTCATTTGCATTTAAATTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTC:1 - chr3R 10396106 5' - 1360 136 1 75.34 CATTTTGATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 - chr3R 8402675 5' - mdg1 394 2 66.44 GAACCATTTATATTAATACATTTTCCAGGTATTCATAAGTAAATAAGTCAAGACATTTATATTAGATCTACACACTCGTAAAAACCATAAAACCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATTCAACTGCAACATT:1 - chr2R 22013104 5' + Doc4-element 2625 1 53.42 AGTTGGCTGGCCCAAATGGAGAGACAGCAGCCCGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGC:1 + chrX 18707412 5' + BS 4724 1 76.71 CGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTG:1 + chr2L 17198056 5' + R1A1-element 5069 1 62.33 AAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGATAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGATGTGTTCACAGCAGTCGC:1 + chr2L 4416016 5' + jockey 34 1 65.00 AACAGAAAATTGAATGCAATAAAGCACATGGCATGTGGGTTAACTTATATAGCATGTACGTATGCGTTGTACATGCCAGCGTTCCGATATATATGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATAC:1 + chrX 18913225 5' + Quasimodo 15 2 74.66 CCCCTCGAAAAAGTGGGCAGCTGCAAAAGGAGTGTCGAGTAATGCGAATCGAAGCACTCGCATGACAACTCGCAGACCAGACCCCTTCGGAATCCAGTGTTTCCCTTTTAAGCAGCGGCGTCAC:1 - chr3R 17830084 5' + gypsy4 6408 1 79.03 TGTTCTTAGTTCGAAATTTAATTTAGGCTGCAGAAATGGGACAAATTGAATTGTTTTTGGCCCTACTCTCAATGTTTGTGTAGTAGTAAGTAAGGTAATCAAGTACACGCTCTGTCACTCCAAGATCTATTGATATACCAGAAAAA:1 + chr3L 22982969 5' + INE-1 500 1 78.08 GGCCGTGTTTAATTAAAATAGCTGAGCCACCATGAGCTCTCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTAATTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCGCG:1 + chr2L 6606908 5' + G6 84 1 71.72 ATAATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3R 11096786 5' - copia 5073 2 53.79 AGGAGGGGTCTTTTTGGGGGGATCGGAGCAGGACTCTGCAACAACATGACGTGGGTTCCATTCGAATGCTGCCTGGCGGCGACAGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chr2L 14139748 5' - Tirant 385 2 72.00 CATATCATATGAATCGCTTATGTTAGGAGTTGGTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 + chr2R 8793842 5' + Transpac 20 2 72.60 ATTGTCTATTGCCGGGGATATACATACATAACATCTCAGGGGGCGGGGACAGGTGAAGGGGGTCAAAGACCATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGAAGCAAACGTC:1 - chr3R 6832011 5' + flea 4620 1 55.66 ATACAACCTGGAGATTTTTTCAATTCAAGTATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 - chrX 15167800 5' - roo 390 2 72.60 GCCCAGTTCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGGAATCACGGGGCAAGGCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGTCAG:1 - chr2R 18722047 5' + 412 7095 2 52.74 AGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 11228572 5' - roo 328 2 71.23 TGGCACGTTCACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 9241956 5' + roo 8691 2 67.12 CAGAAATACCATGCCCGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chrX 3524198 5' - roo 9030 1 56.85 GGCAAAGCAGCGCGCGAGCAATGCAACGGAACCTAATCCAGGAGTCAGCCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3L 5438681 5' + hopper 10 2 76.71 ACTTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:2 - chr3R 23507692 5' + 412 7098 2 52.05 AGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:2 + chrX 18366020 5' + jockey 74 1 61.64 TGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3R 15514613 5' + 412 65 2 60.96 GATGCGGTGCGCTTTGGTGCTTTAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATGTTTATTCAATTTCTT:1 - chr2R 10367571 5' - 412 7483 2 57.53 TTTTCCAAATTTCGGTTACCAAATAATCATTTATTTTGCCACAACATAAAAAATAATTGTCTGAATATGGAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTGGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTC:1 - chr3L 2563300 5' + Max-element 8285 2 51.37 CCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATGGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTG:1 - chr2R 5924442 5' - jockey 4717 1 41.38 AATTTCTGGTGTTTTTCCAAGAATTTTTTTTAACAGCTGCCCAGCTGGGGAGTTTAGAGGACTACGATTTTCCGCGAACAATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2L 17730400 5' - pogo 2063 1 58.22 CCTGACATTTTTATTATTATCTCAGGGAACCAGGAACCCAAAAACTCGACCAGCTGTCCCTTCAGTTCGTACCCCTCTCGCAGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCA:1 - chr3R 6915032 5' + G2 226 1 56.85 TTTTATTGCCATGTCATAAAAACAAAGACCGACTTTAAGCCAATTTTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 - chr3R 18357476 5' - jockey 4909 1 71.72 GTGTATATATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr3R 11526757 5' - pogo 2049 1 53.42 GAGAGGTTCGACGGCCGCCTGAAATTGGCCATCACATGATTGTTAACCATTTCATGCCAAATTGGTTTCTCAAAGTTCTTTCAACTCTGATCATGTATTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 + chr2R 17013979 5' + HMS-Beagle 6814 2 73.10 CGGCTGGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 + chr2L 10912241 5' + Doc 85 1 73.29 TTTAAAAGAAACACCCTTTACGGTAGATGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGA:1 + chr2L 5771360 5' + Juan 11 1 78.08 TAAACAAATAATTTTATAAAGCCTAATATAAGAAAATAGATTAAATTTCCAATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAG:1 - chr3L 10076439 5' + X-element 24 1 69.86 GCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGGACACAGCAACACTT:1 + chrX 14385146 5' + blood 35 2 55.20 CGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 - chr3R 8402640 5' - mdg1 359 2 58.90 TATTGGATATCCTGGCTCCCACTCCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 + chr3L 1387125 5' + mdg3 5312 2 55.48 AACAAATAAACATTGATTGAAATACAATTTCAGCGAGGCGATGTGGCTTTTCTAGGGTGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chrX 9342445 5' + 1360 62 1 62.33 CACGCCGACTTCATTAAAGTATAAAAACATTCCAAGTGTGCGTCAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGAGGGTATATCGCCTTTAGTGGTATTTGTCTTCTCACTTCTCGAGTGCATCAAATTTACACAACTCGCTGATGAAATCT:1 - chr3L 1075300 5' + G6 1762 1 75.34 CAATTTTTGTGACCTCTTTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chrX 21668663 5' - mdg1 413 2 67.81 AACATACAAACACAGACAGGCGGACACACATTCTCCCAGTCACACACAGACACACACACACATACACACACACAATGAGAGACGACATTCGTATGGTGTCGGGCGTATGGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTG:1 - chr2L 4110067 5' + Rt1a 15 1 59.03 TTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 + chr3R 10079335 5' + P-element 103 1 15.07 GGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAG:1 + chr3R 9983027 5' - HMS-Beagle 6952 2 78.77 GGAGGCGGGCAAGATGTCCGACCTGAAGCTCCAGTGGATGCAGTTGCTCAAGGAGCAGAGGTAAGTCTGCTAAGTAGGGGTCTGCAAAGTGCATTTAATATGGTATTTTCCATTTATGATCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCG:1 + chrX 6306234 5' - invader2 4666 1 80.14 TTTTTCGTTTTGATGTACACAAATAACTTAACAAGCTAAATGAATCAGTTTTTCCGTATAGTTAATAGTTATAGTTAATAGTTAATAGTTAGTTTAACGACCAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAG:1 - chr3L 3482782 5' + X-element 33 1 62.33 AATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 + chr3L 20925770 5' + Transpac 80 2 69.66 AAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 12261123 5' + jockey 35 1 65.75 GCTACGCATTTTATCTATCTCGTTTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chrX 983076 5' - 412 477 2 73.97 GTAAACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 + chr2R 14562078 5' + Burdock 26 2 67.36 GTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 + chr3R 25753641 5' + hobo 79 1 73.43 ACCTCCCATCTAAGTTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGCCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTATAAACCTGTCAGGGAGGTCTAGCACGTAAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGTT:1 + chr3R 7080679 5' - G4 3675 1 62.33 AAGAAATCCGAACGGTACCGAAGCCATCCCCATCTGCCAATGAGCTGTTAGACGGAGGAGCCCACGCAACAGGCTGCCGAGTGGGTGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTA:1 + chr3R 14096986 5' + transib2 19 1 67.81 TATTATATTCTACTTATCGACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:2 + chr2L 1327464 5' - pogo 2072 1 61.64 AAGCGGAAATTAGTTTCACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr3R 5940407 5' - hobo 2934 1 78.33 CTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCCCTC:1 - chr3R 4913637 5' + 1360 71 1 65.07 GGAAGAGGTGCATATGGGTGCGTTTTTATGGACAACAAGGCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:2 + chr2L 10089707 5' - 297 361 2 66.44 GGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 29708931 5' + blood 25 2 61.54 TCCAGCTATTTTCAATCCGAAAAGAGTGCGCACTCCTTCCGTGGCGGTCACCGGCGACTCCTCAACGAATGGATGCTGACGGGGCCCGAAAACACGA:1 + chr3R 20746841 5' - opus 167 4 71.13 GAGTTGAAAGCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAA:2 + chr3R 15514512 5' - 412 7489 2 56.16 GTGTCTAACGCGCTTCTAATAGACTGCATCCACTGAGTTCGGACTCACTTGTCGGTCTGGCTGGGTTTGGTTGGGTTTGGTTTGGTTGGGTCTCCATAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCT:1 - chrX 4743774 5' + R1A1-element 4913 1 67.38 CAGTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr2R 14562290 5' - Burdock 6377 2 44.52 TATGTCACGACACGTTTCATTCATGAGTCAGTCACACCTGAGGCAAATGATGTCAGGTCTTTTTAGATATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 27503134 5' - hobo 2893 1 51.75 GGCGAAGAAGCGATACACAGATCGTGATTAACGTTTTATTAAAATAACCTAAAATTTGTTGACCTGATTATGTACGACAAAAATAAAATCTTACAAGTAAACAGTTGTCAACAAAAAATATTAAAATTTTCTTATACATATTTAC:1 - chr3R 31976598 5' + TART-B 10183 1 75.86 GCTTTTTTCCGTTGAAACATATTTTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAA:2 + chr2L 15142192 5' + BS 4717 1 74.66 GTATAACATTTTATATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:3 - chr3R 25271297 5' - 412 7508 2 57.53 ATTATTATATTAAACGACTTTAAAATCCCTATAATATTATAATATATTTAATGACAGAAGGTAAACCATCTCACTTGTTTGATGTAACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr2R 12703743 5' + blood 35 2 43.84 AATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 8022149 5' + roo 8745 2 78.62 AGTTCAGTGGAGGCACACCTCGTTCGATCCTAAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:1 - chr3R 9983147 5' + HMS-Beagle 14 2 76.03 CTTGCTTTTCCACCCAACCACGCCCCCTTTTGGGGTTGGCAAGGCAACTGTCGTAAGCATTTTCTTGCTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGCATTTTCACAACGCAC:1 + chr2R 20382436 5' - Bari1 1696 1 77.78 ACATACATCAATTTGACGTGGCTGGATCACGGCTTTGCCAACGAGAATCCTCTTGAGGAAATTACCAGCATACACTTCGAACGTAAAGTCCAATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCT:1 + chrX 14754787 5' + roo 8835 2 61.64 GCAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 23099068 5' - roo 9025 2 52.74 CAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 + chr2L 14222250 5' + Transpac 65 2 65.07 GGCAGGTATGTATGTATGTATGTATATATATTTA:1 + chr2R 6649895 5' + 1731 100 1 73.53 TTCCTGCCAACGCACGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 20290784 5' - roo 9047 1 62.50 CCACCAACCGATTTGGATTGAGATGTAGGCTTGGAAAAGGGTTATATGAATTCCGAAAGTGGTGCATTACTATCTGGAGTCTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGC:1 + chr3L 18296887 5' - Juan 4176 1 56.16 ATTAATTGGATCCACTGGGAGTTAATCCTGCTCGCGGTCCAAATCATTTATTTTGAAATATGTATATAACTAAAATATGAAATTAGAATCGGTAAAAAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACT:1 - chr3L 19529836 5' + Juan 3885 1 68.49 CCTGGGGAAAGTTATGTAAAACATTTAGGTGCGAAAATTTTTATAGATCTAAAATGGTTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 + chr3L 15890992 5' + mdg3 18 2 60.96 AATACGAGTCATATGAAAATTTTTTAAAACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr2L 8772873 5' + Tabor 6853 2 76.03 AATGGATTACAATTTGTCATGTTGATGACAATTCTCAAGAGAAATTATACAATAGAAATAAGAAAGATAGATTGTTTTAGCATGTAGCAGAACTTATAGCAAACGGACATGGTCAGGTTGCCCCGGCTATTGAGCCTGATCAAGA:1 - chr3L 21484765 5' - INE-1 88 1 67.59 TCCTAAAGAACTTGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTAC:1 - chr3R 3905859 5' + GATE 37 2 58.40 CGAAGGACCAAAGTCATTGCCATTGCCATTGTCATTGCCTTATTGATCTTAGGTCTACTGTACATGCACTTCATTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGTGAGGTT:1 - chr3L 20391285 5' + jockey 228 1 50.00 CCGCCTAATAATGGGCATATTGCGAGTAACTATTATATCATATATAGATGTTATAAAATTGTAATACAAGTTTAATGCAAATAAATTAAAAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2R 9815159 5' + pogo 25 1 68.49 ACCGCAGGACGCGCCACGCATATGATATGAGCTTTCTAGCCAGGACACGTCGTTGAGCCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 + chr3R 8402514 5' + mdg1 7073 2 62.33 AAAGATTTCTCTTACTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr2L 1229713 5' + opus 7044 4 57.24 CGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAA:1 + chr2R 5582181 5' + Cr1a 483 1 52.71 GACTCGGTGAAGAAGGACAACATCAGCATAATGGACGGATTTGGCGGTTCCGGAGCGATAACGCCCACGGGCGTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTG:1 - chrX 22990225 5' + Doc 4269 1 50.00 AATATTTCACGGCTTGACACCTTATTCGGTTTCTGGTTACGCTCACAGCCTCATGGCGCCACTCGTAATTAGAACGCCCCAATAATAATATTTTTAATTCGTTCAATAAGCGTTATACTTACAATATAATAATAGTGATTAACAAA:1 + chrX 4592644 5' - Burdock 452 1 60.27 GAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGT:1 - chr3L 18920465 5' + Juan 83 1 70.55 GCAAACATTCTAAATACAATCAATTTTACGTTGTTGTGGCTAATCCATTCGTAGGCAATCTAAAAACCCTTTGAATTGGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATAC:1 - chr3R 27472182 5' + roo 8606 1 54.79 TGAAAAAGCACTGATTGAAAGTGAAAGTATTTAAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTT:1 + chrX 3506039 5' - Tirant 353 2 54.11 TCATATTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTAC:1 - chr2R 5022802 5' - Gypsy12A_LTR 105 1 68.49 TAATTGGTAATTTCAAAATTAGCAAGGCTTACCGCTCAGCTTACCAAAAACTTTTGACAGTCTGGAAAGACTTGGTATTTAAACCATAACTAGATTAAATATAATATACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 - chr3L 15891133 5' - mdg3 5486 2 58.22 ACCGTGGTTATTCCATATTCCGTTGTGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 - chr2R 11656157 5' + HMS-Beagle 6812 2 74.66 CACCAGGAGTTCAAGTAAGGTTGTTGAGCGATTCGAAATTACTTGTGAAATTGCATAACGCAATGATCAACAAGTCTGGCAACGCCACAGGTTCTCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chr3R 14874092 5' + flea 4769 2 75.56 CCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 5446114 5' - roo 331 2 70.55 TAAGGGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCG:1 - chr3L 11596384 5' + gypsy6 7441 2 67.18 GGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr2L 10912246 5' + Doc 88 1 73.61 GAGCGACTTTCTCTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 + chr2R 8686583 5' - hobo 2873 1 72.36 CACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 9241965 5' + roo 36 2 58.22 TGAACAGTGTCTAGTGCACATCGCTGGGGGAAAGAATGTGCCACAAGCCGAATACTCAATGACAAATATTTTAATATAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGGATATATGTACCTAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAT:1 - chr3R 26316610 5' - 1360 325 1 73.29 TCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chrX 14908451 5' + blood 7095 2 73.29 AAATTAAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 - chr3R 12578085 5' + jockey 4713 1 54.79 AAGGAGCACTGCTCCTTGTGGCACTTTCAACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTA:1 - chr3L 8253777 5' + jockey 4651 1 71.92 GGTTTAATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr2L 2338175 5' + blood 7061 2 53.42 ATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chr3R 15514532 5' - 412 7470 2 69.66 CATCATATTGTTAATAGCTACGAAAACAATTTGCTAATAATCCTTTTGATAGAGCAAAAAATTATGCTTCTAAGCACCGAAGTGGGTAATTCTCTTTACCTATTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 - chr2L 16942181 5' + mdg1 7058 2 72.60 TGCCAAATTTCGAGATTGAACTGAATTAGTAATTCGATTAGATGGGGTTCTGGAAAAACCCGCTTTCCGGGATTATTCACGACCCATGAATCTTTTAAGGCTTGCGCCCTTGAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1 - chr3R 21521472 5' - Bari1 1699 1 74.66 TTTGTCGAGCATATTTTAGACTTTTTATGGAGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 22481189 5' - roo 9050 2 71.92 AGTTCAGTGCTGTTTAGCAATCTAATGAAATTCGAAATATTCGAATAGGCGACAAAAAGATTCCTATAGCACGCACTGAATAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTG:1 - chr3L 13835012 5' + Tirant 8188 2 53.42 ATAAAACAACAAAGCAGCAGAGAAGCAGAAAGCGTAACGTAACATGTATATTTAGTAGTCGAATTAACTAAATTGTTGTAACATAAAGTGGAAATATGAGCGCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 - chr3R 21570611 5' - mdg3 5479 2 71.72 ACTTTACGAGTAACGGGTATAAAAAATCCGAAAATCTTTCAGGATTGAAGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTGAGGTTTTAAAAGTGGGAGTGGCTTACTAGCATTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGA:1 + chr4 700594 5' - INE-1 126 1 60.96 CCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chr3R 14049320 5' + transib2 50 1 52.05 AAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3R 31956387 5' - pogo 2041 1 59.59 TAGATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACG:1 + chr2R 2949021 5' - 17.6 7363 2 63.01 AAAGTAATACATGCATTTATTTTGTTTATTTTTCATCATATTTATACATAACATACCACAAATCAAATTTTAAATTTCGCGCCATGCGGTGCACGTTACAAATTCAATATGTGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTT:1 + chr2L 2193162 5' - invader1 3998 2 36.30 GTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTTG:1 + chr3L 21097088 5' + mdg3 5272 2 68.94 AACAAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTAC:1 + chr2L 15153212 5' + G-element 20 1 65.07 AAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTC:1 + chr2R 19076554 5' + F-element 254 1 77.24 GGAAAGTTTCTTTCTCCGCTCTAAATCCGCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 16853445 5' - roo 9030 1 57.53 ATATATTGTACAATCCATCTGGCATTCTGAATTCAATTACAGATTTTCCAACTACATTTCAATGGGAAAGCGAAAATAGCCGAAATTAATAATATAATTACGAAATGCAAAAGAATATAGGAGTTAGTAAAGAAAATCGGAGGAAG:1 - chrX 19807675 5' - Gypsy12A_LTR 2070 1 69.18 CATATCAGCCATCCGAATTTGAATCCAAAAATATATGCCAGAATTTCTGGACGACTGCTGCGAGTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr3R 9563585 5' + P-element 51 1 49.32 AGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTCACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 13227695 5' + hobo 29 1 50.50 AGTTGCAAAGGAGCTAAGATTTGCAGGTTGAAGTGCATTCGAAGAGGCATTCGATTGTGAGAGTCATCTAGTCCTTAAATACATTTTAGGTATTTTAAGGAGATATGTTATTCATATCTAAAAGTTTTAGAAGGTAATGCTTAACA:2 - chr3L 10252260 5' - Q-element 339 2 76.71 TTTAACGCAAATGCATTTGGCTTTTGGCCGGAATGCCTTCTGTGTCCCAAAATCTGTATTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGCACCGAAAAGAGGCTC:1 - chr3L 17722055 5' - R1A1-element 4927 1 60.82 CTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGGAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr2R 9164852 5' - 412 7473 2 65.49 TATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCT:1 + chr3L 3540140 5' - mdg3 163 2 69.18 GAAACACTATTCAGCAGGGGTTATCTGCCCGATAAGCCAGACGACACTTCCTGAGAGGGTATACACAAGGATATTGTCTCTCGAATTGGTGTCCGAGATTTGAGGATATTGCTTTGGTGGGTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAA:1 + chr3L 12057234 5' + hobo 2814 1 74.66 GTTAAGGTGACGTAATAATGTCTGGAATACAAATACATGCAATTATGTTTTGGGTGCGAAAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGCAGATGAGCAATCGAGTGGAGG:1 + chr2R 16513103 5' + jockey 18 1 64.35 GAAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTGTCGGTACTCGCTG:1 + chr3R 18524212 5' - opus 7477 2 68.75 GAGTGAGTGGTTCGGGGATTCTCTTCCATCGGAGGGTTGTTTTCTCTATTTCCGATTCGGCTTAGAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTTTTATTTTCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATACTAACGTTAAGGCACTGCAA:1 - chrX 1148291 5' - 1360 300 1 56.85 GTACGGACAAAGTCAATATCCTTGTATTTATTGAGTGGAGAGAAAAATATACCACTTCGATTTGGTGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr2R 20499998 5' - 412 473 2 69.86 CCACACTCACTCTAATCAAAACCAAAATGGAAACACACCGGCAATTGCGCAATGAGCATGTTTAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACTACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAA:1 - chr3L 2601561 5' + HMS-Beagle 6719 1 53.24 CCTTTCGTTCCTCGACTAGTTGCAATTTCCATGAGTGTGATAAGAACGCTGATAATATATGTATTAGATGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCG:1 - chr2L 11981565 5' + Rt1b 4990 1 52.45 CAATTTTGTTTTCATAGATGGCTGGAGGTACTGCGCAGCACAACCCAAACCCAGGACTTCAAGAACGTACACAGCCATGCTGTGTTGGGCAACTAAAAAGAGAAATGTGAGAAAGATTTTTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACT:1 + chr3R 4944958 5' - Tc3 2 1 67.12 GGTATTGAAATATTGCTTAGACATTAACGATGGCTGAAAAACTTTGCAGGAAAATATCATAATAGAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 + chr2L 16942034 5' - mdg1 365 2 55.48 AGTCGACCAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr3L 12863791 5' - Transpac 5180 2 55.48 GACGATCGACAGCGTTTTAAATTTCGCTCCAAGTGGAAGTTGTTGAGCCCGCACAAATAAATAAATTTATTATTTACACAAATTCTAAATTAATATATAATATGTATATGTTATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCAT:1 - chr2R 23231052 5' - Tc1 1638 1 41.10 AAAAGGAAGCAAATTTAGTTGTTAGTCTGTACGTTTAGCTGTTTGTAGAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chrX 8272378 5' - roo 389 2 70.55 AATAGCAGAAATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3R 5245687 5' - 1360 3347 1 56.85 ATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chrX 18034625 5' + Juan 73 1 60.96 CGTATATTGATATGGGAACTTTTGCGCATTTCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 9616540 5' + roo 31 2 64.38 GAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 + chrX 19231747 5' - mdg3 177 2 63.70 CCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr2R 18722019 5' + 412 70 2 65.75 CGACAATTTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3L 9375796 5' - mdg1 7424 2 59.59 GCGCTTGAGCCACTTGACGATGCAGTCGAAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 22529698 5' - roo 9050 2 70.55 GACTACGACTTTGAGATGAACTTCGCCAACCGATCAACCATAGGGGCCTTTCTTCACTTTGATGTGGTTGTAAGTCATGGATAACCCTGATGAAATGGACATTGTGGTGAACAGTGTTCCCTTGATCATTTTGGTCCTTCGAGCCG:1 - chr2L 882095 5' + GATE 269 1 69.86 ACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr2L 1327483 5' - pogo 2053 1 50.68 AATTGGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 - chr2L 3734615 5' + mdg3 5267 2 57.53 AATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGTACGTCTGTGTCTT:1 - chr3L 14043659 5' + Ivk 22 1 70.55 ACTCCGCCCCATTTTTATATCCACAAATTCCTACGCTCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGC:1 + chr3R 4659542 5' + P-element 82 1 29.45 GTGTAGGTCAATATCATTATATTGTTATCTATTTGTAGAGACGGCAAGTAGAACAGAGGCGAAAAGGTAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 18849702 5' + roo 18 2 69.18 AATATATAGTGCCCCCGTTTCGCGCAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chrX 6511281 5' + roo 8684 2 54.79 ATATAGATAGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:2 - chr3R 20292571 5' + pogo 15 1 75.34 AGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACCAG:1 + chr3L 14854681 5' + rover 67 2 68.49 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTATGCACTATGCAGCCCCACTTTTTTGGTGACAATCAAAATTGCCCTATGTCCGGCTCGCTTACGCTAAGAGCGGAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTG:1 - chr2R 1982172 5' - 1360 3261 1 82.19 ATTTATTTCGGATTTGCTGTCGTAATGGTGCTCTTTGTTTTCATATTGTGCTACATTTAAGTTTTATTATTTTTTACTCAAGCTTTATAGATATTCCAAAAAAATTTCTTCTTCGTCCCTGCTTCCTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 - chr3L 13427965 5' + INE-1 542 1 56.85 GATTATTCTATATGATTTATAATTAGTTCAGTTAAATAGCAGTTTTTTTTTTCCTGTGCACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3L 1324663 5' - mdg1 402 2 71.92 AATTGTCTGCCGCCGGTCGTCTGGCATAGTAAAGTTGTTGGCAAGGCCGGAATGCAGTGGGTAGTTTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 3524356 5' + roo 8685 2 65.07 AAGATGTTAAGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr3R 20905370 5' + pogo 53 1 58.22 GACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGACATGTACATGTTCTTATACTGCCAGACGCTATATTTTTTATACCGCCATTGTAAGCAGAGTAAGCAGTATTTAAAGGAACGGTATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr2R 4260433 5' + Max-element 7 2 26.71 TGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCG:1 + chr3R 4913573 5' - 1360 112 1 65.07 TCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGTCCGTCTGTTTGTCCGTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAGGAAC:1 + chrX 22651470 5' + INE-1 140 1 79.45 CACACCCAAAAGGTAGCCAACGACACTCCAGCTCCGGGCGATTACAGTCCGGAAAAGGTGCGTCTAGATCACACACCTGCCTATACTTTTGGAGGAAAGAACGATCCCAAATATCATCCTCTCACCGTTCTGGTGCTTAAGCAGAG:1 - chr2L 8248455 5' + Rt1b 231 1 73.97 CTTTTTTCCGTTGAAACATATTTTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAA:1 + chr2L 15142193 5' + BS 4718 1 73.97 TATAACATTTTATTTTGAGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr3L 17667680 5' + F-element 20 1 65.75 ATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr2R 21897986 5' + 412 51 2 52.74 TACCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:2 + chrX 12843574 5' + roo 8715 2 54.79 CCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGT:1 - chr2L 20841966 5' - G6 1942 1 69.18 CTAGCTTTTAATTTCACCAGACCAGCGTTCTACAGATCACCCCTCAATATGAACCCCATAAAAACCAGACTTTTTCATTGTCTTCTGTATTTCTTTGTTATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 31956728 5' - pogo 2084 1 73.79 TTTGAGCCCGCTGACCAAAAGTGGAGAAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:1 - chr2L 6074128 5' + BS 17 1 69.18 CTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr3R 7424548 5' - 412 471 2 53.68 CATGCCATGTGTGTGCCATGTCCACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 535394 5' - roo 9025 2 53.42 ACGACCCTTCCCTTTGCCCAATCGGATAATCCCTGGCTTACAACGTCCTGCGAATTGTAATGTGACTACAAATTGTGCTCACATCCGTAGCTGCATCTCAACACTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAA:1 - chr2L 793007 5' + 17.6 7282 2 69.18 ATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 14714575 5' + roo 8671 2 80.14 TCCGCGGAAAGTGGAAAACTCGATTGGTAGTTAGCCCCACTTGTCTGGCAATTTCCCCCAAACTTCATGCGCTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTTCTCTTAGTTAGT:1 - chrX 5440096 5' - accord 7350 2 54.69 ATTTGCCATTTTCCCGCGGTTCGCAACATCAGCGACATTTGTCACAGTTTCTTAAAGAACATTTGAATATCCAAAGCATCATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGACAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 15974693 5' + P-element 30 1 59.84 CAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCATTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 + chr2R 9326959 5' + mdg3 45 2 53.79 CATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATGGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 + chr2L 18048261 5' + blood 7078 2 59.59 AGGTTAGCCTGGGGAAAGTTATGTAAAACATTTAGGGGCGAAAATTTTTATAGATCTAAAATGGTTGTTATCCATACTATACATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chr3L 15890985 5' + mdg3 5290 2 46.53 GTTTCCATGCCATTTGATATAGACCTCGCATATATAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3R 9958580 5' + opus 34 4 62.33 AGTTTGCGCAACCCATTTTTCGTGGTATACACTTTTTAGCAGCAAGCACATGATATAAAATGGTTCATTTCTATTAAGACTGCTTATTATAAATTAATTTATATGAGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACA:1 - chr2L 19372178 5' - Bari1 1695 1 76.03 GAAAAACTGTGACGTTATGCACATGAGTGAGCAAATAGCAACAGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCCGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr3R 25508538 5' + hobo 56 1 66.40 CTTTAATACTTACATATTTATTGCTGATTTAAAAAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:2 - chr3R 14331266 5' - Burdock 225 2 41.10 GGCCTAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chr2R 11655993 5' - HMS-Beagle 202 2 55.48 CATTTAAATTTATGCCTTTATTTACTAACAAATAAAATGTTATGTTTTTATGACAAGCATATAATTGCTGAAAATATAATTTCATATTTATTATCTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTA:1 - chr3R 18469262 5' - Quasimodo 7342 2 69.18 TGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 - chr3R 26765193 5' - mdg3 5443 2 56.85 AAGCATTTTCTTGCTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGA:1 + chr2R 20382490 5' + Bari1 66 1 63.01 GGATTATAATGGGCTATTCAACAGGATCGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chrX 10978946 5' + roo 8690 2 66.21 GTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGCGGAAAGTAGTTACCAGAGAAATGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCAGTCGACTCACACCCTACAATCTTGGGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr2L 2690575 5' + hobo 62 1 52.05 GAAGTGTGACGCTCGCGTGGCACGGAAGTGACGTCGACGGCAGCTGTAGCTGTAGAACTATAACCAGAAACTGTTGATCCTTTCCTCCTTCCTCTAGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCC:1 - chr3L 3980278 5' - opus 238 2 71.23 ATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACC:1 - chrX 22824259 5' - Gypsy12A_LTR 2239 1 53.42 CTTTTAGGACATACAAAGCATCTGCAGTTTGTTGCCTCCGCCTTTGTTTCCCTCTTGTCGCTTCTGCTTGTACTAGGGGCTGGACTTTATTATATCCGTTACTCGTAGAATAATTGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAA:1 - chr3L 22962352 5' + INE-1 14 1 57.53 GTTAGAGTGGGCGTGGAAACATGGGGTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTTGACGCTCTTACGGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTAGGCTATTGGTCCTGATCAAG:1 - chr4 71479 5' - INE-1 89 1 69.18 TAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 - chr3R 6103687 5' + Tirant 8160 2 53.42 CACTTTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - chr3R 5765448 5' + opus 7161 4 54.79 AAATATGTTTATCTACCAACTAGTATATATATTAAAACTGGCAATGAACAATGAAAGCGAATCAAAATTGCTCAAATCATACACATAATATGTAGTCTTTATTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGATA:1 + chrX 20122901 5' - Stalker3T 81 1 68.49 GAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chr2R 5214978 5' + F-element 24 1 52.00 CCATTATGGTTTCTGGGGAAATAAAATGGGTTCCTCTACGAACTGTATTTTCATCTCAAATGTATTTTATCCGACTAGCTATATTCCGCAGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCC:1 - chr3R 4727524 5' + roo 346 2 63.70 AATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGT:1 + chr2R 7727126 5' + BS 4722 1 65.07 GCATGATGCTATAATTATGACAATTTTTTCATCCACGCCAAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATA:1 - chr3L 4738508 5' + Idefix 24 2 65.75 GGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 + chr3R 12795025 5' - mdg1 7394 2 60.96 CATTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr2R 982295 5' + HMS-Beagle 39 2 58.90 ATGTAAAATAACCTTTTCTTACATCGTGCACTCCAACATGATGGTCATTGATGATCATTGGCTATCTATGTCAACAAACTACATCAAGTTCGGATAAAACAAACCTGACACTTAGACGGAGCTACAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3L 16441716 5' + G2 3076 1 53.79 ATTGTGGGGCATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:2 - chr2R 24338481 5' + 1360 34 1 63.01 TGGAGTCTAGAATGCGCTTCAGCAGTTCTTCCATTAGAGGCTTCAAGTACTGGTCGTGCGGCTGGTTGACAACCCAATTGTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAG:1 - chr3L 6195669 5' - jockey 117 1 62.04 GTCCTTGGTGTCTACTATGCATCGGTATCTGTGATTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACAT:1 - chr2R 2949166 5' + 17.6 6950 1 70.55 CTTTTTCGCATTTGCCATTTTCCCGCGGTTCGCAACATCAGCGACATTTGTCACAGTTTCTTAAAGAACATTTGAATATCCAAAGCATCATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chr3R 15974684 5' + P-element 40 1 58.22 TTTCGTTGGTAAACAAAAAGCATCTGAAATGCAATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3L 13227633 5' - hobo 2922 1 54.43 TCAATATTCAAAACAGTTGGTCCCATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGAGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 15590666 5' + roo 8675 2 66.00 ACGGGCTGCGGCGATCCGAACACGATCTCAATGAGAACTTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGGTGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr3R 23507728 5' + 412 9 2 75.34 GTACAGTGAAATCCCATTTTTATGGATTTTTAAGACTAGTTTTTTTCCGAAGCGGGGTAATTTAATTGTTTCCGCTCCATTTTCTTTTGTTGTTCTTTTTTTT:1 + chr3L 21933431 5' - gypsy11 3933 2 80.58 AGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chr3L 9426700 5' - P-element 2798 1 23.29 GGGCAAGAGAGAGAGGCAGGAGAAAGACAGCAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2R 15613898 5' + P-element 10 2 78.17 AAATGTATATCGTCGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTAGTATTAATACA:1 - chr3L 5438789 5' - hopper 1352 1 80.82 AAACGCAAGTTATGCACGCGCAGCCGGCAGCCGCTAGATGGCGCCAGTCAAGGCGTCACTCAAGTGTCGCCCGCGCTCTTGGCTTAGGCGTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTG:1 + chr2R 23235126 5' - accord 273 2 62.33 AAAGGACGTGTCGTGCCAAAGGGACACCTCGGCTCCTTGTTTGTTTTTCCTCCGCCGTACGTCTCATATTTTCTTTTTATTTTTAATTTTTGTAAATTGAAAATATTTTGTCATATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 + chr3R 16756201 5' + INE-1 301 1 71.23 GTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTT:3 + chr3R 20137263 5' + Burdock 75 2 71.23 TTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3L 15058820 5' + blood 7047 2 39.73 ATCGGACTGATTTACCTGACGTGCGCTTGTGTTCGGTTTTTGCGCTGGGTATTGTTTATTATTAAAATTGTGTCGGTTGTTATTATATGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACA:1 - chr3R 3479490 5' - Stalker 7147 4 58.22 TATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:2 + chr2R 7404664 5' + blood 7063 2 50.68 CTTTCCCAGCGGCATCCATTCGCTCCCTCTTGTTATCCTCGATTTGCTCTCCCTCTAGAAATTTGATCTTTTTGCCGTGATAAGAAATCGAGGGATAAGAAGGCGCAAAGCATAATTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTT:1 - chr2R 14478819 5' - P-element 328 1 78.77 ATATCCATCTATCATCATCATACTCCAGAAGAAGAAAGCTCTGCTACCTTCGAATGAGTTAGAATACTGCTAAGAATTATTGCTTATTTCAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2R 9814982 5' - pogo 2077 1 72.60 TTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 4722473 5' - roo 9003 2 65.07 CTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 + chr2R 10367495 5' + 412 84 2 73.29 GCGTATTTGATAACTGACCGCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGCG:1 + chr3R 19545300 5' + jockey 20 1 72.58 AGGCTGCTCAGGTGAGTGTAGAGCCTGTAGGAGAAAAACATGTATTGTTGGCAAGACAGCTCATTAAAAAAATATGGAAAAGTTTGCTATAAAAATAAAATCCATCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGT:1 + chr2L 15148369 5' - Ivk 5172 1 71.23 ATGCCTCCGGTGGAAGGGCCCGGCTTTTGGTGCGTTGGGGGTTTTGCATTGGTTTTTTTATATTTTTTCTGGAATCCACAGTGCTTCTAAATTTGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTT:1 + chrX 21657095 5' - Tirant 8400 2 64.38 GTGTTTGCCCGGCTTTTGTGCGGCCCGTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:2 - chr3R 7424667 5' + 412 31 2 63.01 TTTCTGTAAAGGGTATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 4869299 5' + roo 8679 2 74.66 GAGGCCGTTCGTGAAGTACTTATTTATCACCAGACGCCGCTGGTGAAGCCCGCAAATATTTTAACCGCAAACAAAAGCAAAAGCCCGTCGGCAGCAGTTTAGCTTTATTGTTATTCTTATTTTTTTTTTTATTATT:1 + chrX 5688068 5' - Rt1b 5149 4 73.53 CGAAATTCACCAAAAATAAACTTGTTTTTTCTTGGTAACAGTACTCTACTGTCTCAATTATCTACCGGTAACATTTAACCACTTCAGTTAAACACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 21342390 5' + roo 28 2 66.44 GGACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr3R 11526868 5' + pogo 62 1 62.07 TTTTAACCAGTCGATCATACCTTGCATTTTTCAGTTAGGCCACGTTAGCGGCCAGCTGGAAATCAGTCCACCAGAGAGCCGAAGAGAGAGTATCTCTATCTTGAGGTTCCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGATACACGTTACA:1 - chr2R 14307661 5' + Gypsy12A_LTR 2259 1 69.18 TAACTGAAGTGTTTGCCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACATTAAGTTTAAAAATCTTAA:1 + chr2L 18235391 5' - F-element 4624 1 51.37 GGCGCGCGCAAGCGTAAGCTCTCCCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACTGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr2L 16685290 5' + P-element 47 1 53.79 AATCAACCATCAACTGACTAACGGAGGACTCTCGCGGTCATATTTCAAATCTGTTAATCGTAATCAACCACCAAAATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTTGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGT:1 + chr2R 4721999 5' + Tc1 1557 1 50.68 AACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chrX 9951355 5' + hobo 62 1 58.90 CTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGCCTC:1 - chr2L 11867388 5' - BS 4983 1 51.37 GACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 + chr3R 5765319 5' - opus 449 2 55.86 AGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 16771343 5' - roo 9001 2 63.70 GCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr3L 16180855 5' - Transpac 5192 2 59.15 CAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chrX 16853353 5' + roo 89 2 79.45 GTTAGCGCTCCAAACCGCAGCAGCAACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAACGGCCA:1 + chr2L 1136265 5' - 1360 3375 1 74.64 GTTGACATTGCGGACTTGTTGGAGTGGGCATTGTGTCCTCCGTTCCGTTCCGTTCCGCTCCTTCCTTACCACCATGTTCTCGAATCGGTGGATGATTTTGAGGTTGGATTTACAGGCCGTTCCCCATAGTTGGATGCCATACGTCC:1 + chr3R 28850437 5' - G7 856 1 51.37 TTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3L 9571616 5' + jockey 35 1 64.38 GGAATTTTTCATATATGTACATATGTATATGTGTGAAACTACATAGATAAAATGAATTTTCTTTCAAAATTGAAGTGTATAAACTCGGTGTTGATCTAGAAAGTACATGATTCATAAAGCGAGGCAGAAATAGTTTCTGTCAACGC:1 + chrX 18122959 5' + invader5 3794 2 75.34 CAATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr2L 15965327 5' + blood 42 2 56.85 GTCGCTTTTATAGATGCATAAAAACATTGCACTACACAAAGAAAAATATATAATGGCTATGAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTC:1 - chrX 10101419 5' - mdg3 185 2 57.53 CGTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGT:1 + chr3R 9983011 5' - HMS-Beagle 172 2 67.81 TTATTTAATTTTGGCATCAGATTTGGACTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAA:1 + chr3R 11461727 5' + 17.6 6947 1 72.60 TGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr3R 5245660 5' - 1360 3320 1 65.75 ATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 - chr2L 2338134 5' + blood 7101 2 81.38 ATAGTTGCCAAGTGGGCGGGGCGGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr3L 22354399 5' + Doc 11 1 74.56 CGATTATTGGATACATTTGAAGAGCTTTGCTTGGAGTAAACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr3R 6068247 5' + jockey 4691 1 69.92 AGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTATAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTCGCAAAAAA:1 + chr3L 25255422 5' + INE-1 310 1 67.12 CAGATGGAAGATCTGTAATTGTGGAATTCTTTGGCTTGTGCAATGGCACCCATATATGTGTATATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGG:1 - chrX 12893449 5' + Bari1 56 1 61.64 ATTTTCTCTGGTTCAATGAGGCATTTTAGTACTTCGGTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATT:1 + chr3R 27845456 5' + Stalker 6898 4 50.00 ATCCTTTATAGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:1 + chrX 7525032 5' - I-element 5312 1 55.48 CCAAAGATTTTGCACGTATAAGTGTCTTTCGCCAAAAGGAAATATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAG:1 + chr2L 22696351 5' + X-element 42 1 58.90 CCATGCTCGCTCCATCCAAGCGTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 + chr2L 21936046 5' + INE-1 10 1 47.95 TAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGCAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGTTATAAGATCACC:1 - chrX 17469251 5' + blood 7096 2 69.18 AAAATAGCAACAAAAAGTAGCAAGAGAAATAATGAAACGAAAACAGAACAAGAATTCACACACAAAGAGAGAAATCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCA:1 + chrX 12634564 5' - jockey 4578 1 55.97 CAAACAAATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 9616693 5' - roo 9033 1 58.90 GCGGTAAAAAATATTTGCCTTCATCACTCACTTCAATCATGTGTCCTAAATCCATGTATTCATTCATGAATTTAGTGTAGTCAACCTTAAGTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTGGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGG:1 - chr3R 19445188 5' - Idefix 19 2 63.01 GATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATC:1 + chr3R 17316051 5' + 3S18 5836 2 63.70 CTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr3L 13597729 5' + blood 7056 2 55.48 GAGCGGTCTCGAACTTCCCCCAGTTGTGTTGCCTCTAACCCAACTGAAACTGAGTGGAATCGAGGTTTTCTGGCGGCATAAAATTTGATAGCAATTAAGATCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCT:1 - chr2L 1075588 5' + FB 644 3 69.18 GCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 - chr3R 23507673 5' + 412 7117 2 60.96 AATATATTTAAATTGTAATATTTACTTAATGATTTCACCAAAATCTCGAAATCCGTTCAATAGCTTAGTTTTTTGGAAAAAATTTAATAAAATAATACAGAGAATTGGCTCTCATTATAGCCGTATGAACGACGAGATCACAGGAA:1 - chrX 19326710 5' + INE-1 139 1 74.66 ATAACATTTTATAACATTTTAATAAATACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAAAAAAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAATGATGTTATCCATATATTTTACCATATATTATACCTAATTTAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTA:1 - chr2R 9268324 5' + Tc1-2 1531 1 71.92 ACTAGGCAGAAACGCACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr2R 20461188 5' + jockey 77 1 64.38 GTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAG:1 + chr2R 10478689 5' - invader4 3021 2 67.16 ATTATGCCAAATCATTTTCATGTTTTTTGACAGCTTTAAAGAATAATTTCTTTACATTTGACGCAATTGTATTATAAATCATAAAATTATTATTTTTAAATATTATTGACCATGTAATTTTTATTTTATTTTTTAAATA:1 - chr3L 8226883 5' - TART-B 10632 1 61.87 CGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:2 - chr3L 13722126 5' + blood 54 2 54.79 TGGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAA:1 - chr3L 5498517 5' + Doc2-element 250 1 43.15 CAATTGATAGAGCATGAAATGAGTTTGTCAAAGATAAATCATCCTCACCAGATCGAGAAGAAAGGCCAGCGAAGAAAGAAATTCTCCTAGATTGGGAGATATGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGTCTGCCCTTAAGACTAGC:1 - chr3L 2393867 5' - springer 232 2 54.11 ATAGCTGCCAATGGCCTTTCCGCCAGTCCACCAGTGGGTTGTACAGCTGCCAAGGAGCTTTGCCAGCGAAAACCGAAGTGGGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGATCAACTGAGCGT:1 + chr2R 23473045 5' - Rt1a 4827 1 66.67 AATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACACCATACGATCTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 + chr3R 18665286 5' + 1360 42 1 80.00 TCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2R 16383405 5' - roo 9043 1 56.16 TGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 + chr3L 1387128 5' + mdg3 63 2 57.53 CTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr3R 23623949 5' + roo 68 2 67.12 CTCTTTCACTTGCGCAACATTGCACTATAGGCAATATATGGTACCTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:1 - chr3R 16535428 5' + Stalker2 17 2 68.49 GTGACGGAATTGGTAGCGAATCGGGAGAGCTCCGACGCCAACTGCAGTATGCCCAGTAGATAGTCGGAGCGCGACTCTTCGTACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCAT:1 + chr2R 10479320 5' + invader4 28 2 59.09 CACGCATATGATATGAGCTTTCTAGCCAGGACACGTCGTTGAGCCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 + chr3R 8402528 5' + mdg1 7087 2 52.74 AATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 9938714 5' - roo 9031 1 58.22 TGGCCAGTTGTTTGTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 15832959 5' - hobo 2911 1 64.38 CGACGATGGCATTCACGCGGCAGCATCAACTTCCAGTCTCGCCGAGTCCAAAACACCGAATGAAATCAGAAAACTTCGCGCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chr2L 10474287 5' + P-element 40 1 56.85 CGTCTCAAGCATCATTAGGGCCCTTCCATGACCATGACTTTCACAAATACCCGAGAATGCAGCCCAGACAACATGACGCTGCTCAACCTTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCT:1 - chr2L 8849540 5' - mdg3 5105 1 60.27 CATGTACGTGCTCAAGCTTATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGGGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 - chr3R 3527195 5' - Tabor 455 2 61.31 CAAAAACACAAATCAAACAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2L 17730569 5' + pogo 19 1 73.29 TGCTCTTTTGCGGGTGTTTCTGGCAAGCGCCTTAATGCTAAGCAATTTGCGTTAAATGCGAAAGAGATTAAAACAATGTTGCATTTCTAATTGTTTTAAAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2L 17033440 5' - blood 7335 1 66.44 AAAATATAAATACTTAATTTTCCAGCTCTTCTCGTACAAATATTTCTGGCATGGCATTCATAAGACTCACTTAAAACTAACATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAG:1 - chr3R 7510282 5' - Max-element 8344 2 58.90 CCATCTCCCCACAAAACATTGGGCTTCGAGCAGCAGCAGCTGGCAGCGGCCCATAAATGTGGTTAAATGTAAAAGTTTTTGCATCTTTTGGATATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTAC:1 + chr2R 19874235 5' + 1360 3137 1 63.70 ACTCGGCTTAATTGAAATGGCTACATTTAGGAAATGATTACTGGGAAATAAAAATGAAACGAACTTCCAAATGATGCAGAAAAAAAAGTTTGCTGAAAAAGTTTGCATTACAAGGACAGGAGAGGCTTAAAAATAAATATTAATAT:1 + chr2R 16729038 5' - NOF 3868 1 58.90 GCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3L 53049 5' - roo 319 2 80.14 GCGCCCGAAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr2R 10991392 5' + jockey 61 1 54.29 AGCTTCCCATCGATTCGCAGAATTAATTGCTCTGCTGATTCGCGGCTACAAATTCGCTTATGTGAGCGAGTGTACATTCAAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGACTACAGGCAGATCTCTTGTGA:1 - chr2R 20096854 5' - mdg1 7318 2 50.72 TTTACAATTCGCTAGTCCTAATCATCGGACACAACCGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAG:1 - chr3R 30056551 5' - jockey 4907 1 74.66 TAAGAAAATTGCATACTGAAATTGGGAATAGCCGTGCGTATTACAGTACCAAAAAGAAAAAAGAAAACATGAAAAGTTACTTGTACATTTTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3L 5263501 5' - pogo 2076 1 64.38 GCCCCAGATTTACTATTCCTTCAGCTGGAATGAGTGCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACG:1 - chrX 9342519 5' - 1360 3304 1 75.34 ATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr3R 5245677 5' - 1360 3337 1 54.11 ATCGAATGGTTAATCGGAAGTTGTTTGCCATTTGGGCAGAATTTACTATTCCATTCAGATGAGATCGGTCACGATTAGGAATATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 11461403 5' + jockey 10 1 54.79 AGGCCAAATTGATTGTGGATTGCTCAGCGTGGGTTTGGGATAATTAAAAGAGCAGAGCAATACATAATTGATTAGGTGAGAGCAATTGACGTTTACGATGATGTTGGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 - chr2L 11573760 5' - jockey 4976 1 61.64 TTTGTCCCACCATGATTTCATGACTGAATTCTGAAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAG:1 - chrX 11815086 5' - flea 4950 1 57.53 GCTGGCTTCGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr2R 6585413 5' + pogo 52 1 56.83 GAATTCCAGGGCACAACTTCCTTTGACTCGCTTCTATTTTTTTTTTCATCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAAT:1 - chr3R 20453447 5' - blood 456 1 77.40 AAAAGTCACGGAAAATCCCTTCTTTTGCTGATATGCGTATAACAGAAAAGTTTAAGGAATTTGCCCTGTGTGCGCTGAACAGAAGTTTTACAAACAAAAATAACCAAAGTGGTGCCAAATCAAAGATAATCTTAGCATCAACGACT:1 + chr2L 17873200 5' + diver 5629 1 70.55 ATGGAAGTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chrX 15089487 5' - P-element 2833 1 47.92 TCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:2 - chrX 983230 5' + 412 53 2 52.74 AATAGTTGTTGTTCCCTTCATTATATGGAATGCAAATTGGCAATCCGTGAAAGAACGAAACCACCCCATTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAAT:1 - chr2L 8557062 5' - jockey 4618 1 53.42 AAATGTGTAGACTTATTCCCACATTATTATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCCCCTCTTCTC:1 - chrX 21490508 5' + Max-element 8328 2 77.93 TGGAGAGCTGTGCATCAACATAAATGTAAGCCAGAAAGAAGTGGCAGCATATTCTACAATTTATTTAACAAACACACCAACACAAACAACAGCCGCAAACCAGTTGATCTCTCAATATCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTA:1 - chr2L 6889084 5' + blood 7181 2 47.59 GCAATGCAGGTATTTTATTTGAAACAAGTAGGCTACTTGGTATGAGTTATTTGTTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGTTCCTCTAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTAC:1 - chr2L 11234201 5' + R1A1-element 4922 1 63.01 AAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chrX 9951333 5' + hobo 39 1 58.62 GCTCGGTACCCAACACTGCGTATACGTAATGGCTCCAGTAGTCAGGGGCATTATTATTTGATATGGTCTAGATGAAAATGGGTAGAATAAAGTGATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATAT:1 - chr2R 18727918 5' + Circe 7062 1 65.07 GGGACCCAGGCATGGATAGCTGCGACTCCTGGTCCTGGTCCTTATCTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACATTAAGCCTTTCCATAT:1 + chr3R 18354213 5' - jockey 4653 1 64.96 ATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACAACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chrX 16243795 5' + 412 7069 2 71.23 TTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAAC:1 + chr2L 18370325 5' + Doc 57 1 52.05 ATCTCGGGCTTGCGAAACATGCCGGAGCTCGTGCTATCCTCAGTATAGATGATTTCACCCATTTGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTCGCAGCCACCTAAACCGCAGAGCCCTGCACCTGCAGCTCCAG:1 + chr3L 22876476 5' + Chimpo 4193 1 56.16 AAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3R 23664510 5' - pogo 2063 1 60.27 AACCAACAATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGCAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chrX 5222983 5' + 412 7089 2 60.96 GATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr2R 20500135 5' + 412 7119 2 63.70 GCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 20461181 5' + jockey 70 1 58.22 AATTGTTTGCACTGGATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3R 31956532 5' + pogo 28 1 65.52 AAGTGTGAATAGAGAAAATGGAAATAAGCAAATGAAAGCCGAAATGATTCCAATAGAACAGCAGACAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATG:1 - chr3R 29596246 5' - FB 65 1 54.79 AATGGAACAAACCACAGGTCTGAATGTCGCTAAAATATAATATAAGTTAACGCAAGGTCCACTTGCATCAGGGTTCCCGGCACTCGCCGCCGCATACCTAACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chr2R 19168161 5' - opus 7445 2 66.94 AAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chrX 18366006 5' + jockey 60 1 52.05 AGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:2 - chr3R 9616673 5' - roo 9013 2 58.90 GTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3L 19279115 5' - opus 7450 2 59.26 GACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2L 21192595 5' + roo 55 2 60.00 TTATCCGCTTTCTGTTATTTCATATTTGCGCTTTAATGAATTTTAATGCTTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGTCTGCTCCTTCTACCCTCTTTCTTTTCTCTTAGTCAT:1 + chrX 13061668 5' + mdg3 5276 2 68.49 GTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACA:2 + chr2R 19076542 5' + F-element 243 1 69.18 GGCCCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGTTTGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACACCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 - chr3L 9198635 5' + F-element 97 1 73.97 TGAGTCAACGGCTCTGGAACGTCCTTCGGCATTTCGAAATCCTCCAAATCATCGTCCTCATCACTTTCAACAGCTTTTATAAAGAGCAAGTATCTATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTA:1 + chr2L 3463862 5' + G4 3585 1 47.26 GTTTACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACG:1 - chr3L 16264683 5' - Burdock 6311 2 72.60 GTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 + chr2R 8793874 5' + Transpac 4970 2 53.79 CAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAG:1 + chrX 17469199 5' - blood 7305 2 77.08 CGGAAAACCACACGCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3L 13227730 5' + hobo 39 1 58.90 CAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr3R 29708955 5' + blood 52 2 54.79 CGAAAGAATATTCAAAATCTCTTAACTATATATTTCTATCAACTTTTTTAATCCCCGTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chrX 12843680 5' - roo 342 2 63.01 GGGTCTTGCTGGCCATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTT:1 + chr3L 13722021 5' - blood 7325 1 67.12 CCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATT:1 + chr2L 18235406 5' - F-element 4610 1 63.01 AATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 21192615 5' + roo 8699 2 62.76 AGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chr3R 4913672 5' + 1360 36 1 60.27 TCATCCATTAATGTCACTCAATCTGTGCGCATAAATTTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 - chrX 17012751 5' + Burdock 41 2 57.53 AACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAG:1 - chr3L 23597288 5' + invader4 7 2 70.55 GGCCGCATAGTGGCCGGGGCACGACTGATTGGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2R 24338293 5' + 1360 7 2 80.14 AATTTATTTTTATTAGCTCTTTGCCTTAATTGTGAGCCATAAATGATAATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 + chr3L 18468295 5' + jockey 4676 1 76.71 CACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTC:1 - chr2L 1449680 5' - opus 7434 2 65.75 GGGCATATCTTTTATTAAAGGGTTAAATGAAATATCGATGAAGTCGGCACCAGTTATGGCCGCCACGTGTTCCCGACCCACATTTCTCTATATGCTTCGAAAAAGGTTTCTGAAGCCAAACCCAATAATAACGATGATCTTTGGGG:1 + chr3R 22924687 5' + Tc1 1215 1 67.81 GGAATGGATGTGCTGCAGCAGTTGAAGGCGGTTATTGATAAACAGAACGCATGGTTTGAGTTAGCAAACATGAAACAGAAGATTCAGTTTGAGGCCTACAGACCATCAGAATTGTATACAATATGTAGTAGGCTAGAGGTACACAT:1 + chr2R 1323981 5' + invader2 2 2 77.40 AAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGGGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCGGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGGCATACATAACTAATTATACATA:1 + chr3R 25384180 5' + mdg3 43 2 49.61 AGCTAAAAAGCAACGGTTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCA:1 - chr3R 5086543 5' + P-element 2732 1 21.92 AAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCAA:1 - chr2L 22746331 5' + 1360 75 1 67.81 GTAAAACTTAAAATTTAAGCTCAACTTCAATATCTTAGGAATTTCCTTTTTGGCAATTGCCGAATTCTACGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAG:1 + chrX 12291961 5' - HMS-Beagle2 52 2 52.74 CGGTACCCCTGAACCAACTTTTTATAGCCATATCCCACATATTAAACCTTTAATTAAACTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGCAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr2L 13884682 5' - pogo 2047 1 55.00 TAAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGTAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:1 - chr3R 12578081 5' + jockey 4717 1 50.68 AGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr2L 14262971 5' + blood 7023 2 72.60 TTTAGAGGGCTCGGCCTAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 + chr2R 11655981 5' - HMS-Beagle 214 2 63.70 CATAAAATGATTTTTGAGGGAAATTTTAAACTAATGCTATGAAGAATGCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chrX 14908348 5' - blood 7353 2 60.27 CACCCATGAAATAAAAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3L 4639047 5' - roo 9031 1 57.53 ACCCGATCCTTAGTCTTTGATGTGAGCCAGGCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTT:1 - chr3L 1387256 5' - mdg3 5466 2 64.38 AACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCCCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCTA:1 + chr3L 20076778 5' + roo 70 2 67.63 ACAACTGGGAAAAATGCGTGAGAAAATGCCAAGGTAGCCGGCACCTGTACGTCGAACTGGAAAAGTGGAAAAGCGCTGGGAATCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTATTGCGCAACCAGCACCGCAACTCAAACGTCGA:1 - chrX 2959307 5' - R1A1-element 5049 1 56.16 CAAACAGTTCCAACACATATGCATGGGTGTACAATTCGCAGTGACAGCAGCATTGCACTGAAAGTAACGATTGCACCAGAATTGTTTGTTCGGTTTCAATTAAATTGAATAAGGTCAAGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAAAA:1 + chrX 1226364 5' - gypsy12 10058 2 71.92 GAGCATCGTTCGCGTTTTTGTTGCATAATATTTTTGGGGCTCAGACAATATATATACGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATA:2 - chr2L 5648495 5' + Burdock 61 2 65.75 CCTGTGCACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:2 + chr3R 27971026 5' - mdg1 7388 2 65.75 CGCCTACCATACCAACCCCATCTTGGGGCTTCAACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1 - chr2R 17182836 5' + jockey 4568 1 74.44 TTCAAGCATATTTATTTTCTTTTTTTTTTATGTCTACCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 12843541 5' + roo 8678 2 72.73 TATATGGATTATCACATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr2R 18123524 5' + pogo 53 1 54.11 CGGCTCAATTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGA:1 + chr3L 15099519 5' - G4 3803 1 71.92 TGGCTGTCCACTTGGGCTTTCATTACTTTTTATTGCCTACTTTCGGGCGTCCCAAGGAAAGGGCCATCATTCTCACACTTTGCAATTAGTGTCAGTCCAGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGC:1 + chr2R 13078763 5' + BS 4682 1 67.81 GCATGATTGGCTGGCCATCCGCAGTGGCCAGCTGAGGCTGAAGTTTCATCTGTACTTGGTATGTGGGGGGCAACTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAA:1 - chr3R 16343705 5' - 1360 56 1 52.63 ACATGGATAACTCAAATACTTTTTCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 14705735 5' - roo 9035 1 57.53 TAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3L 9242000 5' + roo 71 2 71.23 AAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr3R 21237811 5' + Doc 70 1 60.96 ATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2R 7404656 5' + blood 44 2 52.05 TTTTTGAACACTCTGCCAGTTATTTTATTTTAGCATACCTAATTATGTTTTAGATTAATATAACCGTTCTTATAAAAGATAGTTTAGTTTCCTGAAATAGTCTATTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2R 9332272 5' + roo 12 2 77.40 AATTTTCCATCTATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2L 18370312 5' + Doc 44 1 58.90 ATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr3L 8253729 5' + jockey 4699 1 60.96 AAACGAAAGCGCGAAATGCGTTAATTTCGCGGCCAATTGACGTGTTCGATGCTCGGGGGCAAGCCTTTGGGGTGTATGCACTGCAAGAAATATTTTAAACCGATATGTAAAAGGGATTATTAAAGATATTATTATTAATAATTATT:1 - chr2R 11534990 5' - gypsy9 298 2 59.59 GAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3R 23507563 5' - 412 7497 2 51.37 TGGCATCGTCATGCTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chrX 14173167 5' + 412 7076 2 69.86 ATAATTAGATTCTATTCTTTTTTTCTTTCTGTGCATAGGGACAGAGGGCTGGGAATGAGATTGCAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2R 22867361 5' - hobo 2931 1 76.71 CGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chrX 17258328 5' + 297 6622 2 57.53 AGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCCGCTTGCCTTCTGGTCCCATGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTATAATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAA:1 + chr2L 11867255 5' - BS 5059 1 57.53 AACATATCTGTACAACACCCTCCATTATTATGAGCGAATCTTACGAGACCGCCCTGCGCTAAAGAAGAAACTTGTAAGATTTGTTATGAATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr2R 22892576 5' - pogo 2073 1 66.44 AGGTGTGTGGAAGAGGTCCTTGGTCTACGTTTATTGCGGGGATAATTTCTATATGGGACGTCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGT:1 - chr3R 14874236 5' - flea 199 2 58.22 ACCCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3L 16887396 5' - roo 8998 2 67.12 GCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 + chr2L 20984306 5' + blood 7079 2 65.07 ATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:2 + chr3R 20137250 5' + Burdock 6198 2 62.33 CAATTACCCGAACATGAGAAATGGAAAATGCCCACACACGCCTGCAATCAGACAGCCACACATACATATACGCATTCGCTCCAGAATGGCTGGATCCGAGAACATCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr2R 5843701 5' - 412 7513 2 70.55 AAAGTTGCAAGCAGCAAAGCGAGTGATTTCCCTATCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr2R 6579521 5' - mdg1 336 2 76.03 AATCAGATAAAACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:2 - chr2R 21898023 5' + 412 14 2 73.29 ATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr3R 4913658 5' + 1360 50 1 52.05 TTACACTGAGAAAATAGGAAAAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 9938740 5' - roo 394 1 76.03 CCATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCGG:1 + chrX 22398527 5' - Gypsy6A_LTR 97 1 45.89 CCTGGTGCAGCTATGAGCTATCTAGTATATTTGTCCCAAATTTCGGGCCACAATGCATAAAGTGCAGCTCTCAAATTTTTTTTATACACGCACATTAAAGCTCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 + chrX 21086055 5' + jockey 4692 1 63.01 AGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGTA:1 - chr3R 973198 5' + Rt1a 59 1 52.74 AGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chr3R 4464141 5' - 1360 3331 1 57.53 GGTGGATGAGGGGGCTCCAATTTTAGCAGTGACCAAAACTCTGTGTCAGATTCAGTGGAGAAATAACAGAGTTGTCCTGCTAAAGCTACAAGTTACTCGACTTTCGATTTCAACTGCTCTGCTCTCTCGCTCTCTCGCTCTCCCGC:1 - chrX 19719956 5' + Cr1a 301 1 46.58 CACTCAACTTAACTCTCACACAAAAACCAAAACCAAAAAAAAAAGGGAAAAAGAAAA:1 - chr2L 3854009 5' + Doc2-element 233 1 70.18 TGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGGCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr2L 12261168 5' + jockey 81 1 64.38 AAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTT:1 + chr3L 1387150 5' + mdg3 85 2 72.60 ATATTGCGGCATTTGTGCAGTTTGCCCAGTTCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr2R 18722070 5' + 412 7072 2 72.60 ATATGCTGGCACTTGACTTGGACATGGACGCTTTTGAAGCCGAGCCGCCGCGCAAATTGCCTAGCCGAGGCATCAACTCCCGACCATGGGAACGACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAA:1 - chr2L 4616692 5' - roo 8764 2 63.01 ATGTTTAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 30568901 5' - roo 346 2 60.27 ATGTGCCGCAAACTGGCTTACATTTCACATTGCTCATACGCACCGGAGGCCGCCATGAGAACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGACAAACA:1 + chrX 9525302 5' - hobo 2912 1 60.00 AAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chrX 9816460 5' + jockey 85 1 68.49 TGAACGGGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3L 3979527 5' - opus 7486 2 75.34 ACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chrX 18366018 5' + jockey 72 1 60.27 TGATTGCCTATAAAAAAGAAATTCTAATTATAATTTAACGCAAATTCGTTGTCTGCGCCATCGACAATATCCTTTGCATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chr3R 10498925 5' - 297 6938 2 60.27 CTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 + chr3L 6751658 5' + pogo 66 1 65.07 CATGCACAGAGCGAAATCAGAGGGCGCAAACGTGAAACATGGGCAGTGCGGAAAAGAAGAATGATGACGGGACACGTTACCTTTGGTTCTGCCATAGCTGTCGGGTCAACGTGAAACATTGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTTC:1 - chr2L 14748090 5' + aurora-element 5 1 76.03 AATAACTATAAGCGAGGTGGGCGATTCAACAACCGCAACACCTACGACAAACCGCCGCGATTCCAGAAACAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAGATGCAACAGCAACATTCGATGGTTTAACGCAGTACCAGGTTGGCAGT:1 - chr2R 18176676 5' + Burdock 6012 1 70.55 TAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chr2R 11655997 5' - HMS-Beagle 6994 2 52.74 GTTTTAGGCAGCTCATAAAATTTCTTTTTTTTTAAAGATCTAAGTATTTCCGGTTGCACTGAGTCAATTTTAAATGGGGTAAACCAGAAGTTTGTTTATAAACTAGGGACTGCATAGCGCGTGCCAAAGACACTAAAATAACAAGA:1 - chrX 4209896 5' + 1360 1 2 68.49 AAATCGAAGTAATATCTTTGATAGGTATATTTTGTTGGTTAATTCTCTGTGTAATTTGATTTTTATTTTTCTATATCAAATAAACGGCACTCGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr2R 5401636 5' - 1360 3345 1 46.58 GGTTGAATTTAAATGCAAAATTTAAATGGAAACCTAACAGGCCGTAAACGCTTTATATTCAATCCAAAAATTTTGTTTTAGTTTTGGAATTTATTACTTTATATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGT:1 - chr3R 12559790 5' + mdg3 5273 2 71.92 AAGAGAGCACAGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chrX 4589409 5' + Burdock 53 2 58.90 AGCCGGAATGACCACAGAAACCGGAGCTGGACTAGAAGCAACTCTTAATGCGGGTAATGAAAGCAATACCAAATTGGAACCTTAAATAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTG:1 - chr3L 12849189 5' + P-element 188 1 61.38 CGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr2R 16891861 5' + jockey 66 1 55.86 GCACGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGGGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGATACTGATTTT:1 - chr3L 20290773 5' - roo 9036 1 51.67 GAATAAAGGATCGGGTGCCGGCACAAGAAAAACATACGGCCGACAAAGTAACGACGCTCCGGCACGACACATGTACCCACGGCATATACACCCGTCTATCTAGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAG:1 + chr3R 11771645 5' - S-element 1699 1 72.60 CATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACCCAGTATA:1 - chr3R 9163920 5' + hobo 89 1 78.77 CATAGATCGTTTCAATCTAAAATGGATGCAAATTTAACATTTGGGCATAGGAAAACGTATGGGTAGACAACGAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGA:1 + chr3R 10140418 5' + P-element 209 1 53.42 AAAGCACTACCAGTATTAATGTTAGTCTAAGATAAAATAATTAAACAATTTTTATTTCCAATTCAATTCCTTTTTCATATTATTAGTAATTTCTTATTTTTTATATTGTCTTTATATTGTCACTGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 + chr2L 22713295 5' + Ivk 9 1 78.77 ATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTAT:3 + chr2L 15153230 5' + G-element 38 1 52.74 ATTTGAATACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3R 14088695 5' - 1360 3371 1 72.92 GGGATCGGAATCGGAATCGAGCATCGAGTTTTAGGTTTCCAAAAGGTACACTGGTTGTGTAGGTCAAATAAATATACGTAAAAATAAAGTTAAGATTTAGCTAACAAACTCATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCG:1 - chr2L 2484484 5' - Chimpo 126 1 68.28 AGCCGTTGCAAAATGAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr2L 1073880 5' + Tirant 12 2 75.20 GCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chrX 16853327 5' + roo 63 2 61.64 ATAAATGCGCGGGAAAACGATCAGTACGTGTTTCTGGATTTGTTTATGTTTTGATTGTGCTAAGCGTAGCGGATAAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr3R 10357727 5' + pogo 40 1 60.96 CTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACA:1 + chr3R 25508370 5' + Stalker2 61 2 58.90 GAATAGCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr2L 1229536 5' - opus 7482 2 69.18 TAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 - chrX 14908482 5' + blood 7064 2 52.05 CCATGACGACCGAGAAGTCGCCAGCGCACAGTGGGGCTAGGAATGCGCTAAAAACAGGGTTCATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 13843691 5' + roo 8718 2 57.04 TAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGTGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGACGTG:1 - chr2R 1949148 5' - Cr1a 4371 1 68.28 ATCATTTCAGATGACTCTGTGCGATAGCTTAAGTTAATAATGTACCAAAGCAGGGGAGAAGTTTGTCACTCACTTTGCCCAGATATATAATGGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 12355242 5' - hobo 2911 1 65.07 TCCACGAGGTAATAATGGCCAACGGGTTATTGCCCTGCTCTTCGAGCTGCCCGAGTTACTTTTCCATCATGCTCAGTGTCTGGCTTTTGATAGAAAAAAAAAAAGTTAACCATGGCATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTT:1 - chr2L 4742098 5' - Quasimodo 7159 2 79.02 AATTTGATCCTGTTGGCAGTTCAATTGTAATCCTAGTTTTAAATCCACAATAAGCGTCTCCGTTTACGGTTGCATTAAATTTTTTCTTTACGAAAACTTTTTGGGGTTTTTTTTAAGCTTTTTCGTTTTTTTTTGTTCTTTTTCTT:1 + chr2R 6240082 5' - Doc2-element 220 1 65.07 TTGCTAAAGTATACATATTTTTCAAAAATCTACAGGGTGGGCAAACGTTGGCAAACAATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAATTGAAAAAAATTGAAACTAATTGGTAGGCAAACAATTAAAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATT:1 + chr3R 31746133 5' - FB 26 1 58.22 ACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAG:1 + chr2R 8793909 5' + Transpac 5006 2 78.08 ATTAAGTCACTTTATCATTAGTTTAAACTCCAAAACATCAGAAGCCCTTGAGTTTTATTTCAATCATAACAAGACTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTG:1 - chrX 15096100 5' - P-element 243 1 58.90 GGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCACAAT:1 + chr2R 6984313 5' + HMS-Beagle2 6938 2 58.52 ATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAG:1 - chr2R 4206653 5' + 1360 325 1 69.18 TCATTAGAAATTTCCAAGAATTCGAACGACAACGCACACATGCTCAGCGTTGAGACTAAAAAAGAGAATAGCGAGGTATGGCAAATCTGAAGATTCGTGTTACTTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTG:1 - chrX 10808891 5' - Tirant 8271 2 74.29 ATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATCT:1 - chr3R 26765191 5' - mdg3 5479 2 58.33 TCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 14581400 5' - pogo 2033 1 74.62 CTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGGGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAG:1 - chr2R 22692457 5' + Ivk 36 1 59.31 ATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr2L 14222353 5' - Transpac 254 2 60.27 GCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGTGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAA:1 + chr2R 19076482 5' + F-element 181 1 67.12 GAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr3R 29709069 5' - blood 7350 2 50.39 TGGAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr2R 7097920 5' + copia 4906 2 60.27 GAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 - chr3L 18920503 5' + Juan 45 1 54.79 CACTGCTCTGCGGTGACGGATTATCGGCAAAGCAAGTACTAAGTTGTGTTGCTTTTACCCTTCGCTCTGCGCCCTGCGCAAGCGGTAGGCTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGT:2 + chr3R 11411701 5' - Stalker2 369 2 63.70 ATAGTATAAAATATACTTTAAGTATAACTTTGAAATTTTATATTTCAGTTGTATTTTTTCACTAAGGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATTTCTTCG:1 - chrX 23043230 5' - roo 9019 2 52.74 TGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 + chr2L 5771387 5' + Juan 38 1 59.59 ACCAGCACCTGCTACATAGACTTCCTTCAGATCGGCATTGATAGCTATAGACCTACTGGCATCCTGGGTAAATTTCACTCTCTTGATGTAAAAAGGATCAAAGGATTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCC:1 - chr3R 27093537 5' - roo 285 2 71.23 ACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTG:1 + chr3L 23146456 5' + 1360 46 1 54.11 AGCTACGAAAACAATTTGCTAATAATCCTTTTGATAGAGCAAAAAATTATGCTTCTAAGCACCGAAGTGGGTAATTCTCTTTACCTATTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 - chr2L 16942166 5' + mdg1 7073 2 62.33 GGCAGAATGCCTTGCATCTCGTTTTCCGTTGCATACCTTAAGGCTGCGAGTGTTAGTCTAGCGAAACAATTAATTTCGACATGTTGTTAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chrX 22824855 5' + jockey 4694 1 63.77 CGGTGGATTATTTTTAATCTGGCTTATTTGGCTAAGCGGGTTCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGT:2 + chr3R 6103542 5' - Tirant 371 2 66.44 ATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACT:1 - chr2R 11656097 5' + HMS-Beagle 6872 2 71.23 TTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr2L 16685403 5' - P-element 2828 1 45.21 ATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACGGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3L 15058812 5' + blood 7038 2 40.00 AATGCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr3R 15590080 5' - Transpac 269 2 58.22 ATAAGAAGGAAGGCGAGTTTTCCAGCTGCCAGAAGGCATAGGCAAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATT:1 - chr3R 20147601 5' - 1360 373 1 68.49 CACCACCATGACTGCAACTTTTTAGTAGGGGTTTGGATTAGCTTTCGTTACATCTCCTGCATGTTCCACTCACATTTTGCATATAATAATCGGTTGAATTTGATTGGTTCAGTGAGTTGATATATAAATATTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 11958245 5' - gypsy11 3936 3 55.48 GGGCAAAGTAAAGCAAACAAATCGGTGCCAAGGTTGCCGCGGGACAAACAAATAGGGTCCAAAGCCATAATTAGATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAAT:1 + chrX 16868676 5' + Doc 4480 1 54.79 ATTATTACGGGAAAAATGTTTGGCGTCCGCGCTGACTGGCTACACACTGATGCCACACTTTAAACAACCGCCCACACCACCCACAAACTCTT:1 - chr3R 31881141 5' + Fw3 2774 1 75.00 CATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr3R 15590076 5' - Transpac 5184 2 55.48 TGCAGAGAGAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2L 9167404 5' - pogo 2063 1 56.16 CCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 9616666 5' - roo 342 2 63.70 TGTAAACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGT:1 + chr2R 14562077 5' + Burdock 27 2 67.12 GGCGTAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr3R 20292404 5' - pogo 2057 1 57.53 TATATCCCGCTCGCAACATACGTATGTATATATATTTATTCGGACTCGGTTTCGGGTTCGGTCTGTATGGCATAGATATAGATACGGTGCCTGCCAGAGCCTGTCCCTTTATCGGCCCTGGGGATCCAGTTATTTCCCCTTTTGCG:1 + chr2L 8479368 5' - gypsy8 311 1 71.23 CATATGTATGTACATCCCACACGCATGCGAGAACTGAGTCACCCGGCGGCTCGGTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAGGCAACTAGCGCCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 4885453 5' - 1360 3362 1 67.81 TATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 + chr3R 11084534 5' - blood 293 2 73.97 TAGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCCGCTTGCCTTCTGGTCCCATGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTATAATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATA:1 + chr2L 11867248 5' - BS 5066 1 62.33 AACAATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chrX 5222979 5' + 412 40 2 58.22 GGAGTATTATATACTTCGAATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 + chr3L 19146591 5' + pogo 85 1 52.74 GGGTGGGTTTTCCACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1 - chr2R 24630217 5' - copia 186 2 67.12 AGGATGGAGCTCGATCAATAAAAAACTAAGCTGGGTTAATATGTGCAGCTTTACTATTTATGTAAGCAATTTTAATAACCGAGAATATTTGTGCAAGTTAACACGAGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATA:1 + chr2R 9031512 5' + Gypsy6A_LTR 28 1 45.83 TAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chr2L 20561429 5' - P-element 2786 1 17.81 AACGATTTTTTTCTCCGTGCAGCAGGGAAAAATATCCGAAATATTTCTGCAGCTTAAGGTGGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 + chr2R 23225775 5' + Transpac 4976 2 57.53 TCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:1 - chr3L 24153261 5' + Tabor 6912 2 67.12 GCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTC:1 + chr2R 20382505 5' - Bari1 1625 1 73.97 ATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 8200314 5' + flea 4773 2 69.67 GCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 - chr2R 14562284 5' - Burdock 6371 2 44.52 CATATATGGCATTGCCAAATAAATATACTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCGGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGCATCGTTTTATTTGAATAAATCCTATGTTGCTGTATTTGGGTACAGCTAC:1 - chrX 11850508 5' - Stalker2 307 2 77.40 GCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 9241986 5' + roo 57 2 61.64 AGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chr3L 20785491 5' - P-element 2786 1 16.44 ATGGCCATCACCAGGGCAAGAAGAATGTTGTGTTTCAGAGAGCAGGAAAGCTGTACATTATCGATCCCTTGCAGCGCAAGCTTAATGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTG:1 - chr2L 8435440 5' - 297 6602 2 77.27 ACGTCAAACGTTTAAAAGATGATATTTTCTCGATGGGATTGATGATGTATTTGGCTAATAAATTACTCCTATCCAAATTTTGTGTGCAAACTAATTGCGATTTAACAACAAAATGTTCAAGTCTGTAGCTCATTTTCTAGACTTTA:1 - chr2R 10337178 5' + transib2 2792 1 51.37 AACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAAC:1 - chr2L 15153350 5' - G6 1971 1 52.74 GGATCAGTGTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:2 + chr2R 18048767 5' - opus 473 2 67.12 ATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:2 - chr2L 15920166 5' + jockey 80 1 66.44 TATCTTGAAAATATTGGAACTGGCACTCTTTAAGACTCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 - chr3L 9426817 5' + P-element 14 1 76.71 ACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3R 14088575 5' + 1360 56 1 67.77 AGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTAATCATAGAAATAAAA:1 + chr3R 14049357 5' + transib2 87 1 74.66 ACGGGTGAAGTAGTAAACTTTTAAAAGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3R 9258814 5' + 1360 18 1 73.29 ACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chrX 3529759 5' + 412 7140 2 76.71 CTAATCAGATAAAACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:2 - chr2R 21898025 5' + 412 12 2 74.66 CCTTGCCTTTTCTCCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGG:1 + chr2L 17198038 5' + R1A1-element 5051 1 50.68 AAAAATTTGCCAGTTTCATTCATTTTACGGGTCGGGCCTCGCATATTTATTGATAATTTCCGTGAATTTTGCAGCAGTCAAGCGAAAGCGGAATACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTG:1 + chr2L 8753976 5' + R1A1-element 5069 1 76.23 TGGAATGGCTATGGGATAAATGTAATCCCTGCCTGCAAATGTATTTGCAGAAATTTATAATTTAAAAAAAAACGTATAGCACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3L 5490821 5' + 412 39 2 52.41 ATCTAGCTCGGTGAATATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 24809857 5' + 1360 28 1 67.12 AATTTTGTTTTAGTTTTGGAATTTATTACTTTATATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATAC:1 - chr3R 12559722 5' + mdg3 5327 2 76.03 AAAAAGCACTCTTTGTTTAGCTTTAAGGGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCG:1 - chr3L 11596407 5' + gypsy6 14 2 76.03 GCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 - chr2R 14562272 5' - Burdock 223 2 44.52 GGAGAACAGGAGTTGAAGTGCACGGTCAAAAATTGTGCGGTTATTACTATCCAAAACTATCAATTGGAATATGATTTAAATCATTGATTTCATTTATATATTTTCAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chrX 8665898 5' + I-element 13 1 58.22 GGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 21421029 5' - roo 350 2 58.90 CAACGGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3L 2036987 5' + Doc 49 1 54.11 GCCCTCTGGACCAAACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 21639708 5' + Tirant 8 2 66.25 ATAACGGAGAATTCTGGGCAGCGACTGAATGATAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chrX 18365972 5' + jockey 25 1 72.60 CATATTATCTTGAATTACAGAAAAGGCAAAGAGATCGGGAGATGAACTACCCTAAGATTTGCTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 13849581 5' - roo 9059 1 72.60 ATTAAAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 13849741 5' + roo 8715 2 54.11 TTGTGGTGTTGATGCCTAGGTTATCATATTAATTTTCTTTTAACGCAATCATAAAAAAAAAGGCTTAAGTCTTACCTGTAGTCTTTTCGGTACTGGAAGTAGGGATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTC:1 - chr2L 4123531 5' - roo 31 2 73.97 GCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAG:1 - chr3R 8402633 5' - mdg1 7390 2 62.33 CGCCCCAGACGCGATGACTTTATATGGCCAAGCGCCGAGCGACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGGGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATTGTTGTGATGCCTCAC:1 - chr2R 13574887 5' - diver 225 1 78.33 GATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2R 20704261 5' + hobo 31 1 57.53 ACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATATAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chrX 23211093 5' + roo 85 2 82.19 GGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAACGC:1 + chr2L 1073931 5' + Tirant 79 2 70.92 GGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3L 10856802 5' + P-element 64 1 36.57 CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGG:1 + chr2R 2007458 5' + 1360 59 1 50.68 AGATGTCCACACCCTTGGTCCACTTTTGCACCCTGGCGTGTCGCTTCTGTGCTGCCGTCTGCTTCATGTCCGCTGGCCGCGTGAACGTTGTGAGTCTCTTGTAAAACAAGCACTCAACAATCATCGCCTTATTAATTTT:1 + chr3L 6745975 5' - 1360 440 1 73.38 GTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr2R 14385579 5' + jockey 59 1 63.33 GGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTGTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chr2R 5848986 5' - mdg1 334 2 76.03 CTCTCACTGTTTGTGCAACCACCTGCAGGCAGTCGGCCTTCCTATTGGCTGGGTCCATCGATCGAGAGAACCGCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3L 14969189 5' - P-element 2842 1 50.34 GTTGTTGTTGCGGAGAGGGCGTGCACTAAACAATTTACTGTTAAATTGATGAAATAAATGTAGGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 + chr3R 11002078 5' - flea 4947 1 65.75 AGATGTATCGTACACTAAAGAAACTCAACCACTCCGCCGTCAATGTCACGAAATTCCCGCGTCTGGATGAGGAACTAAACGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATG:1 + chr3L 20812724 5' - Quasimodo 189 2 54.86 TTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGCAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAG:1 - chrX 23108332 5' + BS3 1461 1 54.79 GCATTTTTTATTGGTTAATAAAATAACCTAAATCCCACTCCTCCTGCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAA:1 + chr3L 11816715 5' + G2 2960 1 68.49 TATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTGCCTAAAAACATTATTAAATGTTTATATT:1 - chr3L 19339444 5' + Tc1 58 1 50.00 AGTTTTCTGAAAAGTCAACACAGGAGCTCTGGTTTTTTGACCAGACCAAAATGCAATTTGCAGTGAAAAGAGTCACAAAAGTTACGCTGAATTATTCAGCGCATCATCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAA:1 + chrX 4331507 5' + jockey 380 1 71.23 GGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCC:1 + chr3L 16180902 5' - Transpac 222 2 78.77 AGCACATACTATATAGTAATTGAAAGTATAATACTGGGGGGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:1 + chr3L 16764824 5' + I-element 83 1 69.86 ATCTAGCCTATTTTTCAGTTTACAACTTAATCCTTAATAATCAATTAAAAATGATTAACAAATTGTGTAAAAAACAGGTAATAACTATTAACTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTT:1 + chr3L 3482632 5' - X-element 4686 1 63.70 ACAGGTTTTTCAAATAAAGTTCAGTCGAAGCTTAGGTAATTTTATTGCCGAACCAATTTTCAAGGCTGATCAAGTTTCTTTCAACGGACTGCATTATATAACTCCGTTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCTCCGAGCTATGGGG:1 + chr3R 21977798 5' + Doc3-element 4325 1 63.70 AAGTGCTTCAGCGTTCCTAGGGGGTTTTCTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr3R 15649741 5' - blood 341 2 63.01 CGTTCCTTTGAATCAGCTCTTCCACTTTGGAGCCAACAAACTTCGGCTCAGTCATGCTGATATTGGATTGATGCTGTTGCTGATGCTGCAGGATGAATGACTTTTGGGAACAGCTACCAGGACTTAGGTAGTCTAAGATTCTCCTC:1 - chr3L 287586 5' + baggins 5043 1 71.23 GGATTTCTCCAACCCCTTCCCGCCTATCGTTTTTGGCGCGCGCAAGCGTAAGCTCTCCCTGCTCTCGCGGCCTCTCCGACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chr2L 16685256 5' + P-element 14 1 76.71 CGAAGCTTTCACTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAAATAGGT:1 - chr3R 15139860 5' - Tc1-2 1541 1 70.55 ACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTAT:1 + chr3L 21630333 5' + Burdock 60 2 68.75 CGATTCCTAGCTCTTAACACGCTGTTCAAACAATCGAAGTAATTTACATTCGAGTCAAAATTCGGGCGATCCAATCTGTGTATATTATCGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCG:1 - chr3R 29303080 5' - Doc3-element 4381 1 49.32 ATGGTAGACAAATTAATGTGATTTACCTTACTTCTCCCATATTATTATTATTATATAATTTAAATACAGAGACACAATGCATTTCCACCAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 17826671 5' + G2 3077 5 61.82 GACTTTGGCTGCAGCATCATTAGCATTTGCATCAGGCTAACCCCGATTCTTTAGCAGCATTGCTCATCTGCATGCACCCAGCTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTT:1 - chr2L 8272792 5' + blood 371 2 57.94 GATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGCGT:1 - chr2R 969216 5' - mdg1 7383 2 69.18 AATAAATAGCTTTGTAAAAACCATTTAAATGCTTTCAATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTCTAAGAAACT:1 + chr3R 12608017 5' - roo 9042 1 65.75 AAGCTCGTTCTAAATGATCGGGCTGATACTTTTCGTTGTAAATTTACTCTGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGTCACCCTACTTGCG:1 + chr2L 13244804 5' - hobo 2868 1 65.75 CCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 - chr3R 24175783 5' + Burdock 6191 2 56.85 AGATAAATTTACTTTATTTTAAATAGATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2R 20704286 5' + hobo 6 1 74.66 AATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr3L 18468377 5' + jockey 4758 1 77.40 ACAAGCGATCCCCTTTTTTCTTCTCCAGCCAGCCTTTGTGTGGCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAG:1 - chrX 10728961 5' + springer 18 2 73.29 ACACAAAATGAATAATTTATATACAGATAGTTAGGATGGTAACTAAACGTTTACGAAGTGTATACAAGACAATAAAGGTATTTGGGTACAATGTAAGTAATGGGAGATGCTTTATAAGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCAC:1 + chr2L 20079490 5' + invader4 350 1 52.74 GTACAAAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 12261118 5' + jockey 30 1 69.18 AGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr2L 21192572 5' + roo 8743 2 76.03 AAAGGCGGTGGATTTTGGTGGTTTCGTGTTGGTGAACTTCAATTTAATTAATTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCT:1 + chr3L 22638782 5' - Juan 4142 1 69.86 TTAAATATTCATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGTTCCATACCAGCCACGTCCATTATTTCTA:1 - chr2L 7215658 5' + 297 6606 2 66.44 AATTATTGAATTAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1 + chr2R 19633159 5' + jockey 4592 1 71.23 ACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 - chr3R 27786621 5' + Tirant 8116 2 55.93 GCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 + chr2L 1073916 5' + Tirant 8176 2 63.01 CGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr3R 15589953 5' + Transpac 56 2 57.53 ATTTTCCATCTATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCTACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr2L 18370313 5' + Doc 45 1 58.22 ATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAA:1 - chr2R 2949103 5' + 17.6 7013 2 78.08 ATATATATAAAAGATGAAAGTAAGATTCTCTGATTTTGCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr2L 19903313 5' - Transpac 5211 2 47.26 ATTAAAAGTTAAAATTGTATTCCGGCCGCAAAGTTTGAACCGCGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCGAACAATAAATCAGTGAACTATTTGTGCAAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGC:1 - chr2R 8557307 5' + TAHRE 276 1 84.25 AAGCGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chrX 14962162 5' + jockey 30 1 68.49 CGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 8022203 5' - roo 322 2 76.71 CGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 + chr3R 5245549 5' + 1360 41 1 58.22 TTTCCAAAAAGGCAATATTAGATAAAAAAAGGCAAAGTAAAAATAATAGGCTCTCATGACTTAGTTTCAAAGATCCTAAGCTAGCTAGAAAATTGAAACTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAT:1 + chr3R 27519321 5' - X-element 4692 1 63.01 GATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 - chr2L 15833069 5' + hobo 82 1 73.97 ACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGATACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2L 1073896 5' + Tirant 36 2 58.65 AATCTGAGCTGCAAATGACTTATTTGTTGTATCGGCATAACAATGTTTTTAACAAAGTCACTGCAACCTTGTGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACT:1 + chr2L 21914588 5' - R1A1-element 4997 1 51.37 TAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATA:1 - chr3R 20147547 5' - 1360 320 1 71.92 GCGCCTAACGCTCTTGACATTCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 + chr3R 15465442 5' + mdg3 5278 2 67.12 GACTGGGTTGTGAAAATTTGAACATAAGTCTTTGGCTTTATGGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chrX 16982304 5' + roo 76 2 70.83 TTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAAC:1 - chr2L 8772829 5' + Tabor 6897 2 55.48 AACTGCATTTAGTGCAGGCGTAATTAGCCAAATTGTTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 + chr3R 25521759 5' - blood 351 2 66.90 GTAAGTACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 + chr3L 15371283 5' + Transpac 55 2 55.48 AGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 + chr3L 25272535 5' + 1360 84 1 51.85 GTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 5087119 5' - P-element 2844 1 54.29 CGTTATACGGCACATAATTTGAACTTAAAAGCTGCCTAACAACCGGTTGGAGGGATGGCCGCGGTTGCCTTTCGTAATTCAGCCCTTACAGGCGCGCCGGCTAACATGAGTTAGGTGTACAAAACAATAATACAAATATAACAGTT:1 - chr3R 5121344 5' - BS3 1649 1 49.32 AGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAG:1 - chr2R 9072950 5' + Burdock 6199 2 62.33 GTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCGGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATAC:1 - chr3R 25753682 5' - hobo 2854 1 78.36 AAATCACACTAATTTTATAGTTCGACGAGTATTTTGAATATTTAATTTATACAGACAAGCTTTATACTTTAATAATTTGAAAATTTCCTCCGTTGAAATTCGAAGGGATTTTACTTAAGGGACTACCAATATGTTTTCAAATCTTA:1 + chr2R 10349777 5' - Doc3-element 4667 1 63.01 GTCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 25822972 5' - roo 9006 2 65.07 TATAGATAACAAAAAAATTAAACACATTTTATAATATTCGTATGCATATATTTTACAATCGTATACATTAAAGTCATGAGCCGTTTAATTTGGGCCCTATCCATTCGCAAGGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr3L 11610546 5' - copia 245 1 73.97 AATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGT:1 + chr2L 11668726 5' - mdg1 347 2 67.12 GTATATCGGACAAGTGGGATTGTATTGACTACTTTGAATTTTTTAGAGTAAGGAATTCCTCTCTTCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2L 22746098 5' - 1360 3385 2 62.33 AAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr2L 2519883 5' - roo 8990 2 75.34 GATTAAGCCAAGGAGGAAATGCGAGACATAGAAGCCTTTATGACATTGCACTCAGTGGTGCGGATGCTGGAGTGGATGTTCTTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAA:1 - chr3R 19951607 5' - blood 477 1 54.79 AGCATAAAAAAATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTA:1 + chr3L 27356032 5' - Tc3 1685 1 78.77 AAAGCGAGCGCATAAAAAAATTATAACTAACACTCGGCGGGCGAACAGTTAAAACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr2R 17100066 5' - P-element 2860 1 55.34 AGAGTACTAAGACAATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAATGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATA:1 + chr3R 5245529 5' + 1360 15 1 75.00 TGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTT:1 + chr3L 27356068 5' - Tc3 1649 1 58.22 CTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGA:1 - chrX 22824263 5' - Gypsy12A_LTR 2243 1 56.16 TTCCCCTGATTCGCTTTTAATTATCCTCATTTGTAAAATGTGACTGGGTTGTGAAAATTTGAACATAAGTCTTTGGCTTTATGGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chrX 16982345 5' + roo 37 2 58.90 AAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chr3L 19397028 5' + F-element 72 1 61.27 GCTTCCGAAAGAGCTATGTTTATATGGGTTTATTATCACATGCTCTGAAGCAGATGTTAACGATTTTGCATTTAAATAATTATATTTGAAAATGTTATCACTCCTCACCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGT:1 - chr2R 10356257 5' + Q-element 186 2 58.16 GCCCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGC:1 + chr3R 19537461 5' - hopper2 1565 1 56.16 TATTAGCTGATTCTACGCAAAAAATATCTATATTTCTATAATAAATTGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:1 + chr3R 18469135 5' + Quasimodo 72 2 71.23 CCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 - chrX 10960296 5' - Transpac 5166 2 62.33 TAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGATCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 - chr2R 10453462 5' + mdg3 5299 2 47.59 CAAAGATAAATGAGCCCGCTAATGACCCCGAAAAACACTGGATAAACTTTGCAGCTGAAAAACTTTAGATTAATGGACGGTGCAAGTTCGTTCAGCTCGGGTGGCAACAATGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATC:1 + chr2L 9384228 5' + jockey 481 1 73.29 CACTCTTCCATCCCTCTGGCGTTAATTGCGATTCGAGTTGTTTACCCAACTTACCTCCTGTTTAGTTGAATATATTGATGGCACAGGCGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAGTT:1 + chr2L 18245971 5' + accord2 7224 1 54.11 ATATCTATCGCCTTTTGCACGGCCCATTAGTAATTAAATATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 - chr2R 14884393 5' + mdg3 24 2 69.86 ATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 + chr3L 13722035 5' - blood 7314 2 74.13 ATTCTTATCCGCAAGATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr3R 29709086 5' - blood 7348 2 55.48 CTATTGTAGATTAGTTGAAAAGAACGACTAAGTATGTAGGTATACCTTCTACCGAGATCTTTTAGATCCCAATTAGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:1 - chr2R 6579613 5' + mdg1 46 2 50.68 GTTGTTGGATTTTATATAAAGTGGTTAGTGGTTATGTAAATTAACAGACAAGGCTTTTGGGTATTGAGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAATGTTGATGATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTT:1 - chr3L 27874134 5' - gypsy4 6369 1 73.29 GTCGTGGCACAGCGTGAGAAACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3L 10856833 5' + P-element 27 1 62.50 CTTAGATTATTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr3L 14863929 5' - Transpac 5160 2 61.64 TAAGACCAGTTTCCGCACTGACCTTGGAGTACGGAGAGGTCATGATGTTGTTAATGACTCTGGGCTCTAATCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATGTTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr2L 19185310 5' - 412 7461 2 50.68 GTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTG:1 + chr3L 11474689 5' + gypsy 7128 2 69.23 AGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr2R 20500130 5' + 412 7124 2 67.12 TTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 - chr2R 18722025 5' + 412 7117 2 61.64 AAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chrX 14385150 5' + blood 7071 2 56.85 TAGAAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 - chr3L 15322076 5' + Transpac 48 2 52.05 CGAAAAAACGCCGAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3L 15035250 5' + pogo 30 1 63.70 TTTCCATACTTTTGAAGACTTTCTCTAGCGAGGCATAGGTAACTTTGATTTTTTGTTGGGAAATTGTTACCCCTATAGCCTGACATTCTAAATAACAGTGGTTCTATTATCTCATAAATATACAAGAAAATATACAACAAATTCCA:1 + chr3R 24301241 5' - S-element 1544 1 73.97 GTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 21192576 5' + roo 75 2 73.29 ATATTTTTTCCTTTACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 4722354 5' + roo 8699 2 60.27 AATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 - chr3R 15590061 5' - Transpac 251 2 57.93 GTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr3R 6103648 5' + Tirant 8168 2 74.78 TTCAAGCTTTTATACTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGACACTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCT:1 - chr4 260888 5' + Tc3 320 1 53.42 AGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chr3L 17667663 5' + F-element 37 1 54.11 AAATTAGAATTGCCTGCTTTTCCAAAAGCCCAGAGCTCACCTCAACCCAAAACCCATAAAAAGCCCCTTTTTTTTTTGCGTTCGCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr2L 9287120 5' - jockey 4954 1 48.63 ATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 + chr3R 20452206 5' - blood 293 2 75.34 GGTTAAGTGAGCTTACCAAAGCAGCTTAACTTTAAAGCTTGTAGAGCTTTTAGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 6096617 5' + roo 8702 2 59.59 GATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCA:1 + chr2L 12283934 5' + Quasimodo 68 2 65.75 AAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chr2L 17069562 5' + 412 7129 2 70.63 GCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTT:1 - chr3R 25271242 5' - 412 400 2 82.88 GCGATAATAATAATAAATGAGTAAATGAGTCTATTGAAAATTTTAATTAAATTAATAAGCTAGAAAAAACACTGTCTAAACAAAGACCCTAGAATAACTAATATAATAATAGAATAACTAATAATATAATAATATTCTAGTGTCTT:1 - chr3R 7541576 5' + Tc3 308 1 53.42 CAACTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr2R 14385556 5' + jockey 62 1 54.11 AATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGAC:2 + chr2L 15153217 5' + G-element 24 1 62.07 GCGCGTTTTCCCAGCGATTTTTGCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 19162687 5' + pogo 52 1 57.86 TTTATTTCCAAATTATTAAATAGTATTACTGAAAAGATTTAGCTCTTATTACACACATTAAAATGAAGTCAGCTCCTTCATATATATGCATATATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 21517960 5' + 297 21 2 69.18 ACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr2R 3009431 5' + pogo 64 1 66.44 ACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAAATTAAAATTAAACCGTTGAATTTTACTTTAATTTTAATTTTGATTCTGGGTACTGGGAGCGTACAAGCCTTTAAGAAAGGGGAA:1 + chr2L 16107309 5' + Rt1b 168 1 61.87 TTTTGAGGTTTAATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2L 2338181 5' + blood 43 2 56.55 GGCAGTGTTACCTGTTGCCAGAGCGAGAGGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 26315848 5' - roo 9054 2 73.29 TCTTGACATTCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr3R 15465453 5' + mdg3 5289 2 59.59 TAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTC:1 + chr2R 19076502 5' + F-element 201 1 56.85 ACAACTAAACCATTTAAGTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3L 14581328 5' - pogo 2089 1 77.40 GAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2L 1449598 5' + opus 162 4 62.10 ATTTAACGCAAATTCGTTGTCTGCGCCATCGACAATATCCTTTGCATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAG:1 - chr3R 10498893 5' - 297 325 2 69.18 GAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr3R 11526868 5' + pogo 63 1 62.33 GTATACTAGATTCGTTGAAAAAAGCACACAGACATAGACCCAGCGCCAGTTTGTTGACCCATGTTGTCAAGCCCACTATAACGCCCTAAAATCGCCCAAAACTTCCATCTATTTTTTGTATATTTTTTCATAATAATTTCTATTGA:1 - chr2L 21794174 5' - invader2 434 1 53.42 AGCCGCAGGTAAGGGCGAAGAAAAGTGTTTGGGCATTAATTATACCTGGACTTGGAGCTCTCAGGCAAATGCAACCGATGCGAATTAATGAATCTGCCAATGAATTATTTTTCAAACTAATTCCTAAATAAATAAAATAAAATAAA:1 - chr3L 14335010 5' + HeT-A 1 1 60.27 CATGCTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chrX 14173176 5' + 412 7085 2 63.70 TATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGATTGCGCGGTCTGCACTTA:1 - chr3L 20747196 5' - Burdock 6332 2 65.07 GTAAGATACCACACCAATGCCGTACAACTTTTAATATTATTAATGGGATATTTGTGGAGTCATATGGTATAAATGGCATTTATAACTTATATATAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 + chrX 15227356 5' - flea 211 2 63.70 ATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCTACT:1 - chr3R 5245661 5' - 1360 3347 1 55.83 ATAAAGTATTTTCAATATTTTAAAATTCTTTCAATGCGTTTGAATGTTTTAAACTAAAAAAGTTCATTTCAATGGCAATAAATGTCCACATTATTTGTTTAATCTTAAATAAGAGTAAGGATGTATTCTGGCTGGGGCTTGTTGTG:1 - chr3L 15871017 5' - TAHRE 10028 1 74.66 TAATTAAATAATTCTTTAATATATTTATCACCTTTTAGGGGCTGTATGCGTTCATATCCTTCAAATTGCCTTATTTAAATGTATTATTTATGAAATAATAAAAGAATTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:2 + chr2L 21596441 5' + blood 13 2 77.40 ATCTCAATATTAAATTCAGCCGCCAGCAGAGGTCTAATTAGAACTTATTCACTTTCAATTGTTTTGTCGATCTTGAAGTAACTTTTAACGACCTGTGCTTGTAAACTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr2L 8452193 5' + copia 15 2 75.17 GGTTGGTACATATATCTGAAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:1 - chr2R 22692483 5' + Ivk 11 1 76.71 CAAATTCCGTTCCTGTCACGCTGACATCTCTGCCCCAAACCCACTCAAATTTGTTTGTCCCAGCCGCAGTCGTCTGTACGTGATTCCATCAAACATAAAAAGAGAGAATTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATG:1 + chr3L 15185839 5' + roo 308 2 69.86 ATAGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 20292565 5' + pogo 21 1 71.23 GGGGCGGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3L 22354416 5' + Doc 32 1 57.63 CGTGATTTACAAGATGCAGAGAGAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2L 9167390 5' - pogo 2077 1 65.07 GTGCGTTTTTGACCGAAGCTCTGGTTGTCCTCTGCCACAGGCAGATACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2L 14970026 5' + Tirant 15 2 76.71 GAAGTTGTTAGCCACACAAATTTGTTTTTTATTTTTTTTAACACACTTATACGCCCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCAT:1 + chrX 4858350 5' + BS 5065 1 61.64 TTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:2 - chr2L 1229693 5' + opus 7065 4 67.81 GTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGT:1 - chr3R 24228970 5' - opus 436 2 65.75 TCAACAACCGGCCACTGCCCCGACCCAACTGAACCGAACGGAACTTCCCTTTTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTT:1 - chr3R 22288014 5' - 412 274 2 65.73 AATGCCACAGAAAACTGGGAACTGGAAGTTGGGAATTATGGACCAAGTTGCATTCAAGTCCTCTCCGTCTTCCGCCCCAGCATACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGCTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTC:1 + chr3R 19689056 5' - R1A1-element 36 1 57.93 CACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr2L 4416061 5' + jockey 85 1 68.97 GTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1 - chrX 15089555 5' + P-element 96 1 19.86 ATTGAAGTTTAGAGAAAAAATTAATTGTAGGGTCGATTAAAGCAATGGGAATAGTAGGAGCAACACCTATGGATATTCACCTTATATTACAAACTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAAAAAGCCAGCAATTAGTTAGGAAAT:1 - chr3L 23847958 5' + I-element 5223 1 68.49 CGATAATAAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr2L 10089855 5' + 297 6617 2 59.71 GAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr3R 24228889 5' + opus 168 4 70.00 GAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chrX 8895280 5' + roo 88 2 78.77 TCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCCCG:1 - chrX 9951419 5' - hobo 2891 1 68.00 TTACAATTCTTTTTTTTTATTTGCATTATTATTAATTTTTCCGCAATTAATATCGATATGACAGCATTTTTCCTTCGCACTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTA:1 + chrX 7874194 5' + INE-1 539 1 32.04 TTTAAAAAAAAATCATAAGAGTCGTAAAATGTGGTATTCTAGAAAACGAATTTCCGGATGATGCAGCCTAAGTAGCCACAAATTTCTCATTATTCACACTACCAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGA:1 + chr2R 3334171 5' - Quasimodo 6971 2 72.60 CAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chr3R 25271275 5' - 412 433 2 60.27 CCCTAACCGCCTACCATACCAACCCCATCTTGGGGCTTCAACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCG:1 - chr2R 17182843 5' + jockey 4574 1 72.60 GATTTGGAATAGGTCCATGATCATGGACCATGACCAACCTATATGGAAATTTGGATTGAAAACATGATTTTTCTTTCGAATAAATATTCTTAATGTTTTTATGCTCTCTTTGAACCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAA:1 + chr3R 17339415 5' + 297 191 2 47.26 CCTCGTTCAATGGCAACGGTTTAAGTGCAATCAATCATGAAAGTGAATATGCTTGAAATGCTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTATCTTAAAAATGCAGC:1 + chr3L 11196334 5' - pogo 2052 1 55.40 CGCGATTTTCACTGGCCTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTC:1 - chr3R 3179385 5' - S-element 1273 1 56.85 GTGGTTGTTATTCGCACTCATGAGTCGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 16180829 5' - Transpac 296 2 75.86 TTCTGTTTATGTTTTGCAATTGTGCCGCTCTATATATGTGAATATGTGGAATGAGTTTCTGTCCGTTTTTGACAGTTATGATGGAGAATATTGTATTTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCCG:1 + chr3R 9182910 5' - accord 7023 2 78.77 TGGGGGGGTGTTGGAGCCAGGCCCAGTTGGCGATATGGATGGCGTCCTTATGGAAGCGGTGGGGGGGGATTGAGCAATCAATATTAGAGTTGGTCCTTGTTGGAATATTCTATTCAATCTA:1 - chr3L 11610730 5' + copia 4872 2 65.29 TGTTACGTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 + chr3L 20925758 5' + Transpac 4988 2 61.64 CCAGCCATATCCTGTGGCAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2L 16685427 5' - P-element 2852 1 61.64 GGTGTTAACATTTCGAGTCAGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAAT:1 + chrX 18239329 5' + jockey 4536 1 60.27 AGTCATGTAACTTCACAATACTCAGGCTGAATTCTTGTCGAATCCGAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTCATTTTTTTT:1 + chr2L 3006094 5' - pogo 2036 1 64.29 ATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACT:2 - chr3L 17667619 5' + F-element 81 1 65.75 GACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGGCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATATCAAGTTCTTAAAACTACAACAGTATAGGGAAAGATA:1 + chr3L 2037011 5' + Doc 73 1 58.90 TTTTTCAAAAATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 14136575 5' - roo 351 2 54.79 CAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATA:1 - chr3R 6842654 5' - mdg1 318 2 77.40 GTTAGCTTCTTGTTTTTCCTTCTTTGATTTGCTGCGCAAAGTGCTGGAGAACAATAGAGAGACACAAAAAACACAAGCGGAAATACAAAAAAAACCCAGTGAAAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAGCTCTCTATCCCAGGGTTCA:1 + chr3R 23297151 5' + X-element 259 1 71.23 GACATTGCGTTGGAGGTGGTACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr3L 12863774 5' - Transpac 244 2 67.12 GCACCCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGGATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 + chr2R 6984270 5' + HMS-Beagle2 6906 2 67.12 GTAGCTCAAAGGATTAATATAATTAACTTTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGGG:1 - chr2L 18046594 5' + blood 477 1 77.44 ACCAAGAATTGATATTATTGGCTGATAAGAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2R 18048936 5' + opus 143 4 69.18 TTTCACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGTGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 5940420 5' - hobo 2916 1 63.20 ATCACTGTATATTCATTGTATGACTAGGTGGCAACTCTGTTGAGAACAGCTGTTCGGCAGAAGCAATTGGAATTTTCTTAAAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAG:1 - chr3R 9400063 5' + Ivk 5299 1 62.69 GTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTATTTTGTTA:1 + chrX 15167681 5' + roo 85 2 78.08 TCCCATGCATCACAATAAAAGAGAAGAAGAAAAAACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 + chrX 10101267 5' + mdg3 5262 1 78.08 GATACTGGGAGGTGATGAATAATTAATTTGACTTAAAAAAGTAGAACTATTTTAAAGAAATTAAAATACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 12608174 5' + roo 8716 2 57.53 TCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3R 5245555 5' + 1360 46 1 54.48 AGAAAATTGCATTCAAGCATATTTATTTTCTTTTTTTTTTATGTCTACCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chrX 12843530 5' + roo 8670 2 78.77 TAAGCGGCTCCTCTGTGATTCGTACTCCCTACTATAACTAGTTTCTCCCGCTCCCACAAAGAGTGCATTGTATTTTCATAAACGAGTCCCATGGAAATTATCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCC:1 - chr2R 8905010 5' + roo 8880 2 69.18 AATGTTTTGAAAAATACCCATTTAATGCGCAAGCGAGATGGCAGCACAAAAATACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 - chrX 8626335 5' - Burdock 227 2 66.44 GGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chr2L 10937863 5' - mdg1 334 2 76.71 TACTTATCGACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr2L 1327474 5' - pogo 2062 1 54.79 TGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACAC:1 + chr2R 19076488 5' + F-element 187 1 66.44 GGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTANATATAAGTTAACACAATCACANNACACCCGAAATATAG:1 + chrX 4589426 5' + Burdock 6148 2 61.36 GCCGTTTCGCAGGAGTATGGCAATGAAAACTATGACACGATAATAATATATACATATATATAGAAGATGTAAAAATTAAACCTTAAACAACTCAATAAAAAATTTCATATTACACAGAAAACAAGAGAGAATGCAAAAGTCGAGTT:1 + chrX 23189485 5' - INE-1 575 1 54.11 ATTAGTCACTGCTAAGCATCATCATATACACTTAATTATATTTTCTGGAATCTGGGTCACAAATTCCAGTTTAAAGAAAGACAGCTTAGATCATAAATAACTATCCCCTGCAGAATGCAAACGATAGCAGTCTTGCTCACCAATGC:1 + chr3L 8324974 5' + Doc3-element 380 1 68.49 TGCATTTTATCGTTAGGCCTCGTTATATATGTATATATATATATTTTCAACTGAAACAAAAACCATAAATCATATTCGGCACGGCGCGGCGTAAGTTTTTCATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3R 10099996 5' - pogo 2085 1 74.31 ACTTACTTTAATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2R 10367453 5' + 412 42 2 55.48 TCTCGCAAAAAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chrX 17469281 5' + blood 55 2 54.11 CGGTAGCGAAGCAGTGCAGCAATTCAATAAAAGAACCAACAATTCGAATTCAAAACAATCTGTTTTCCGTTGTGGGTTTATTGAAAAGAAAACTCCTTAGGCTATAGAGCTTTATTCCAGTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGA:1 - chr2R 22855717 5' + Chouto 234 1 75.34 AGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTATGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1 + chr3R 10973232 5' + jockey 101 1 76.71 ATAATAACCAAATTAGTAATTATCTTTTACAATTTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr2L 2464164 5' + pogo 21 1 75.34 GCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 28008237 5' + hobo 35 1 53.33 GCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3L 15058831 5' + blood 43 2 45.77 CAACCACGCCCCCTTTTGGGGTTGGCAAGGCAACTGTCGTAAGCATTTTCTTGCTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTC:1 + chr2R 20382450 5' - Bari1 1680 1 67.12 TTTGAAACGTTGTCGCATAACTCAAATCAAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAT:1 - chrX 6398847 5' + blood 88 2 76.03 GTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 - chr2R 6559041 5' + mdg3 41 2 52.74 CAATGTTTCAGCAGCAATAGCAGAAATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3R 5245702 5' - 1360 3363 1 67.59 TACTTCGGTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAAT:1 + chr3R 27845485 5' + Stalker4 7033 4 69.66 ATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chrX 15167728 5' - roo 8981 2 80.82 AAAGATTTATAGTTTAAGTAGTCTGATTGAATTTGAACTATGATAATTTGTATATGCCACATTTTCAAATAGGTTAGTTTCACATTTAAATATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 - chr3R 21518161 5' - 297 6953 2 55.48 AGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 23449247 5' - roo 345 2 60.96 TTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2R 1277151 5' + Tirant 8115 2 70.00 TTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - chr2R 20704217 5' + hobo 75 1 69.18 GGGGTTGTTTGCGTTTTACAATCATTATGATTCCCAACATGTTCAAGCTCGTTCTAAATGATCGGGCTGATACTTTTCGTTGTAAATTTACTCTGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr2L 13244760 5' - hobo 2933 1 78.40 GTAAAATCCGGATATAATTAATTTCATAAATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 26782698 5' + hobo 58 1 60.27 CCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2R 20704159 5' - hobo 2909 1 63.33 CTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chrX 18193688 5' - hopper 1375 1 58.90 ATAACTTAACAAGCTAAATGAATCAGTTTTTCCGTATAGTTAATAGTTATAGTTAATAGTTAATAGTTAGTTTAACGACCAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAT:1 - chr3L 3482760 5' + X-element 55 1 54.79 CTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 - chr2R 18048900 5' + opus 7182 4 70.55 TTTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACGGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr2R 7404639 5' + blood 27 2 63.70 CAAAAACTTCTCAACGTCCAGCATCGGAAAAAGAGCTGTGGAATTTTCACACAGCGAGGGAAAAGCCAAGAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:2 + chr3L 14921368 5' + pogo 48 1 51.37 GTATGATATATTGCAGATTGCAGGCGGGCAAACAAGTCAAGTGAAGGGCCAATAAATCTACCATATGAACGAAATACGTAGTATATGTAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:2 + chr3R 25354446 5' - 297 6938 2 59.59 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTATGCGCATA:1 - chrX 12649914 5' - blood 7168 2 80.00 CAGGCTTTAAGGAGATGCCGATGCCATTTAACCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 + chr3L 14299865 5' + mdg3 5300 2 50.00 TCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 + chr2L 14262854 5' - blood 7317 2 65.07 TAATTCGATTAGATGGGGTTCTGGAAAAACCCGCTTTCCGGGATTATTCACGACCCATGAATCTTTTAAGGCTTGCGCCCTTGAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTT:1 - chr3R 21521443 5' - Bari1 1670 1 54.79 GCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3L 5446176 5' + roo 84 2 76.03 ATTTATATGCATAAACTTAATGAGGAATTGATTGCTAGTTTACATTTCACTTTTTATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chrX 2873357 5' + roo 63 2 63.70 ATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 23099076 5' - roo 9017 2 58.22 CTGCATAATTCATTACAACTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACAT:1 + chr3R 17316018 5' + 3S18 38 2 59.59 AACTGAGTCACCCGGCGGCTCGGTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAGGCAACTAGCGCCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3R 4885422 5' - 1360 3343 1 55.97 GCTGGATAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2 - chr3R 15649912 5' + blood 7027 2 74.66 AAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGCGTGCTTATC:1 - chrX 9816449 5' + jockey 96 1 74.66 TGCATTTGTGCGGAGTTTTAACACCTCAAAACTTGTTCACACTTTTCAACGATACTATTTTCGTTTACCATTTAACTTGACGAGTAACGGCTATAAAAGAATGATTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTACTC:1 - chrX 21183934 5' - gypsy 6984 1 71.23 ATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr2L 7459573 5' + BS 5078 1 72.60 CAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr2L 14969979 5' + Tirant 62 2 56.85 GGTATAAAGATAGCCATTGTTTGGGTAATGGCCATGATGGTATCCAGTTCAATAACCGTTCTTGGTAAGATACAGAACGGATGAATTGAAACGTGGCTACAGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCT:1 + chr3R 4627134 5' + accord2 7410 1 69.18 ACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr3R 22846728 5' + 412 86 2 76.03 GGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGACCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 - chr3R 25384324 5' - mdg3 227 2 67.81 CATCAAAGAGAAAGATGGAGCATATAATTAACTATGAGTAGCAAATGGCGCAAGCCATTCGCACAAAAATAACGAATGAATGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGGTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATC:1 - chr2R 12089195 5' - 412 7310 2 54.79 ATGAGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 + chr3L 20785466 5' - P-element 2811 1 33.56 GCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGC:2 + chr2L 15142238 5' + BS 4764 1 55.48 AATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 - chr3R 25521888 5' + blood 7078 2 62.33 CTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr2R 21380705 5' - roo 9011 2 60.27 AGAAGAAGGGGGCGTGGCGCCTCCACCGCTTTTTAGTGCGAAAATAATTGTAAAATGTGCAAATGCAAAAAAATTACGCGCAGCTCGAAAGGGCAAGAGTTAGCTTTGGGCCCCAAATAATAATAATAATAATAACAACAATAATA:1 + chr3R 29708651 5' + mdg1 25 2 52.05 GCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACA:1 + chr3L 14854672 5' + rover 7009 2 62.33 GTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCG:1 + chr3L 25272557 5' + 1360 115 1 69.44 CAAGGCGTAACTAATCAGCACAGGCAATGATATGGCGACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATT:1 - chr3R 11461910 5' - 17.6 471 2 71.92 GCTGGGATTTCATACCTATAACAAAGCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATG:1 - chr3R 27845617 5' - Stalker4 397 1 73.97 GAGTTAAGTTTACTTAAAGATAAAAAACGAAAATCCAGACATTCCAGGAAATCGAATGAATCTTTATTGTGCATAATAATTGATCTTAGCCTAAATACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAG:1 + chr3R 805150 5' - blood 205 2 65.07 GCCAAGGATACACACCTGCAATACACATATTCTTCTAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 + chr2R 21227329 5' + mdg3 5295 2 54.79 GGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 - chrX 12558334 5' - Transpac 5171 2 60.43 AAATTGTGTTGTGTTGCCTACTTTTGGGCGGCGGACCCGTTTACGCCAGAGAACTTCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 14006059 5' - hobo 2921 1 56.47 CGCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGT:1 + chr2L 21580875 5' + INE-1 538 1 51.08 TCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr3R 28008327 5' - hobo 2895 1 55.81 GGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:2 - chr2L 17730534 5' + pogo 54 1 56.85 GGATTATTTTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chr3L 3979723 5' + opus 13 2 76.71 GTGGATGGCGAGGATAAATATCGGTGGGCTGATATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr2L 12481548 5' - pogo 2059 1 56.85 TTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1 - chrX 4566242 5' + Transpac 4991 2 71.23 TGGCGAGACTGGAAGTTGATGCTGCCGCGTGAATGCCATCGTCGGTCAGGTATTAAAACGTGACACTTCTAATTCGCGTGTGATTCCCCCGAGTTTGCAGTCAATTTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTC:1 - chr2L 10474309 5' + P-element 253 1 74.66 ACTTGACCCAATTAGCGCCGAAATTCCGAAATTCAGCCCCAGCAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2R 23225913 5' - Transpac 5200 2 66.44 GAGCAGCATTCCGCATTCCACATTCACTTGATTCACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTAC:1 - chr2L 10032791 5' + hobo 9 1 77.78 AGATTTGGACTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCAT:1 + chr3R 11461745 5' + 17.6 38 2 60.27 ATTATTGATTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2R 969266 5' - mdg1 395 2 69.86 CGATGGTGTACGATAAGGCCGAAAAGAAAAACAATATTTTCGCTATAAACGTGTTTTCCTGTGTCGCCGACCGGAAACGCATTCGCCGACATAATTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCATAGCCGCTGGTTT:1 + chr3L 12710879 5' - Burdock 351 1 69.70 CTTGTCTCTTGCAGCACACAAAGTTCGTAGCGTTTAATCGAACTAGAGAATTGCGAAAGTGAAATATGGTCACAGGGTGTCCCGATATATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 - chr3R 10026343 5' + FB 32 1 63.19 TGTTACCATATGGAATAACACTGCTAATTCAATAAATAATCGATAAGTTTCACAAAAAATCGCGTTATTTAAACTGAACTATTTGCTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 14663182 5' - pogo 2069 1 63.70 TTTTCAACCAAGCAAAGTAAAGATCCGTTTCATTAATCTGTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3L 4175225 5' - roo 9041 1 63.01 AATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr2R 11379715 5' + jockey 22 1 63.64 AGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr3R 10140175 5' - P-element 2835 1 46.21 AACTCTCATTTGCACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chr2R 18721942 5' - 412 417 2 70.55 CTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:1 + chr3R 20137240 5' + Burdock 6188 2 55.48 TTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 22846674 5' + 412 31 2 64.83 CCTAACGCTCTTGACATTCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 + chr3R 15465445 5' + mdg3 5281 2 65.07 AGCTATCATAAGCAAATATAAATTAAACTTATTGCGAAATATATAATAGATTGTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATA:1 - chr2R 10163629 5' + Juan 4148 1 69.86 ATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAAC:1 - chr2L 8393042 5' + I-element 5200 1 71.92 CGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 21421031 5' - roo 350 2 59.72 GTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr2R 16383388 5' - roo 9027 1 51.03 ATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 - chr3L 13597851 5' - blood 7333 1 57.53 ATTATCTTTGGACGCATGCTTATGGCACTCACGGGTGCGCTTACTGCAGCCCGAGGTTGCCAATTGAAATTGCCACAAGCCCAAGCACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATAT:1 - chr3R 18934898 5' + accord 7031 2 58.22 ATTAAATAAAAAACAAAACAAAAAAAACAGAAAAATTCAGCTTATAGTGCGTCCCTTCAAAAACTCAACTACTTAATGCCCAGCAAAGTATGCTATGCATTTTGGTTGCTGATGTGGCTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3R 7279634 5' - hobo 2935 1 69.18 AAAATGTGTCCTTATAGTTAGTCATTATCTCTAAAATTGTACGGTGATTAAAAGGCATTGGGTGCATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr3R 17932684 5' + hobo 56 1 56.16 GGCGGTTTAGGAGCCATCGCCTAACCAAATCGAGCCGTGTGTCTGCTGCGGTCGCCGGCAGCAACGCGTTGTCGGCGCTGCGTTTTCTATATACATGTTTCTATTGCTTATCTTTATTTTTTTT:1 - chr3L 1080340 5' - invader2 302 1 76.61 AATGACATCAATTGGATTCCCCTATTGTCCAGGAACGAATGGCCAGCGTTTCGCTGTCATGGTAAGAAACTACAATGTTATTTTTTTTTTATTTTTATTATTTTGTTTATTTTTTTTT:1 + chr2R 19361279 5' - gypsy11 3934 3 56.78 GTTTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAATA:1 + chr2L 4104018 5' - roo 318 2 76.71 GTTTTCGGTTTTGGATTTGGAATTTTTGGTCTGCGTTTTTGGGGCTCACTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr2L 7744899 5' - roo 336 2 69.18 CTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 25753617 5' + hobo 58 1 57.53 TAAGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3R 24228842 5' + opus 34 4 62.33 CCTAATCCCGAGTAAATCCGATCATGGGCGTAGGGGAATGCCTGGGATATCTATCCAAATCGAAGTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACCCACACAAGCAAGCA:1 + chr3R 20849171 5' + 1360 3251 1 56.85 CAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACA:1 - chr2L 8393076 5' + I-element 5166 1 52.05 CAAGTGGAAGAGTTTTCAATGTTCTATAAGAGTGTTTTGTGTTGAATATTTAAAAGTTCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCT:1 - chr3L 27423 5' + pogo 1840 1 63.01 AACACTGGAAAAAATGTAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCA:1 + chr2R 19904012 5' + Doc 4469 1 53.42 CAAGAGGCCTGAGTGGGAAAGAGGCTTTTGGGCTAAGTTTCTATAAAATACTGAAAACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3R 6842733 5' - mdg1 7440 2 72.60 GCGCTTACTAGAGCACATTCTCGCTTTTAGACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr3L 4710673 5' + Doc 17 1 76.71 ATTACCTGCGTTCTGGTCATTGCTACTAGTTGTAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTCATAGCAGACAACTGTATGTG:1 + chr3L 25190089 5' + 1360 161 1 55.17 GAGCAAACGAGATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chrX 14756629 5' - pogo 2072 1 65.52 ATTTATGCCGAAATATGTCTATTCTTTTTTCCGGCTTGTCAAAATCTGGGTCCCACTTTGCCATGGGGATATAAATACAATTTGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGCTGATCAAATAATAAAAACATCATCG:1 - chr2R 10993826 5' + jockey 4988 1 58.22 GCATTTCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 9616565 5' + roo 56 2 60.27 AACCAGCACCGATACTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAACCGATAAACACTCG:1 + chr3R 24693532 5' - hobo 2908 1 65.75 ACAATAATGTTTAAAGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr3R 15589931 5' + Transpac 4953 2 62.33 GTGTCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 + chr3R 20137230 5' + Burdock 42 2 55.48 GACTCCGAATGTCTATTAAAATTTATTCGAGCGTAAGTACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 + chr3L 15371251 5' + Transpac 23 2 70.55 TTCACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGGGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAGCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 12142547 5' + hobo 29 1 56.10 CAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAATTGATGGCAGACGAGCCACAATTGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGCAATAGATTTGGTT:1 + chr3R 178120 5' - Stalker4 383 1 52.80 AATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTTCTG:1 + chrX 18034618 5' + Juan 66 1 56.16 AACAGCAAGGAGCAGCGGCGACCCAAAGCCAAACTTTCCTGAATATATATCGCTATATAAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAA:1 + chr3R 21570442 5' + mdg3 5286 2 62.33 GACGGACTCTTCATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chrX 14385119 5' + blood 29 2 65.75 GAAAACTCGCCACCATTTGTACCACCGTCTCTGTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2R 21380739 5' - roo 394 1 72.39 GTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATCTCCA:2 + chr3R 30272997 5' - Tirant 8424 2 77.24 GCCTGAAATCCCCATCCCCCAATGCTCCTCCCACAACGCTCCCATCGACTCGAAGCAATTTGTTGATATTCTGGTAGCTATTAAGGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 + chr2R 19985667 5' - copia 219 2 60.27 TTTCAGGCGTGCCATCAGCTTTTCCTTCGGCTGGGCTTCCATTGTTTGCACATTGTTTGACTGGCATTTATTTATTAACCATGTCCCCCGGGCACTCAATTTGTGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGTCCCAAAGCTA:1 - chr2L 1528963 5' + Ivk 237 1 52.74 AAATATGAATTCATGAACAGAATCGTATATTATTGTGGTTGTATTCAGTGTGTTTTTAATTTTCCATTTCGGGGTTTATTTGCACAGTGCGGCGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAGCCGAATTAATCGCGA:1 - chr3R 23532298 5' + mdg3 380 1 64.38 GGATATTTTTCTCGTGTTTTTTTATGTCTGCTCGATTCTTTTGAACCCCTTCTCCTGCCGGCAAGCAAAAATAGGCGGCTGACGTCAAAATGCAAGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAG:1 - chr3L 16179499 5' - Transpac 4933 2 69.72 ATAGAAGATTAACACATATTTATATGTATGTAGGTGGTAGTTGTTTGCTATGAGCCAGTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAACCCTGCACAAAGACCTCAAACTAGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTC:1 + chrX 17266270 5' + X-element 4387 1 60.27 AGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr2L 1073926 5' + Tirant 12 2 60.76 CCGAATGAAATCAGAAAACTTGGCGCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 + chr2L 10474342 5' + P-element 95 1 20.55 CAACTTTAATTAGATCTGCATATGCAATGAGGACTCGAGGGTTCGTTCCGGTAAACAGGTTAACGAACTGCCGGAACGGACAAGTGGCCAACATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 - chr3L 11236032 5' + Transpac 4972 2 74.40 CAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 + chr3L 18708626 5' + F-element 58 1 73.33 TTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 + chrX 18034598 5' + Juan 45 1 43.45 GAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3L 9242082 5' - roo 9003 2 63.70 ATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGATC:1 - chr2R 15392780 5' + blood 7080 2 71.32 CGCTTAATAACTCAATAGATTTTTAGTAAACCGATTATGTGACATTTCACATCGATTTTTACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTA:1 + chr2R 12107046 5' - R2-element 3125 1 58.90 GGCCCCAAGCGCTGCCATAAAAATCGCATCCTGAACGCATATTTACACGCCGCGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr2L 10650317 5' + Doc 33 1 63.01 ACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr2L 12142552 5' + hobo 54 1 55.24 GTTTGGGGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chrX 12558340 5' - Transpac 299 2 67.35 CTCTCGTGTGCTTGCTTTCTCTTTCTCTCTGTTATCAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 12142696 5' - hobo 2920 1 69.86 ATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chrX 15089567 5' + P-element 84 1 28.08 GAGATTTTCATGAGCTTTGGGGCGGAGGACCTCAATTCTCGCCAATCGGGGGGTGCTGAGAAAAGAGATGACGATGACCGTGACGATGATGAGGAAAATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACA:1 - chr3L 17794992 5' - Bica 4861 1 70.50 TCCATTCAAAGCTGCCCAGAGCGATTTCATAAACTGCAGCACTTATCTAAAAAATACCGGCATTTTGGCCGCCTTCGTATTTTTCCTTTATTTTGTACTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTAAACAA:1 + chr2L 17645096 5' + Circe 7014 1 53.47 ACAAGTTTTGGTACTTTTATGGTCGGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 2690547 5' + hobo 34 1 62.33 TTATAAAGTGTACAAAATAGGATGAGTAGAAAGTGAAAATAAGATAATCAAATTAGAATAATCACAAAAGCAGAATGGTAAATTAGAAACAAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAA:1 - chr2L 9117092 5' + Porto1 4420 1 63.01 GTACACGATTCAACGGTTCAATAGTTGATTGGGCAACGGCTTATGAACTTGCCCCGACACATGCATATATATATATGTATATACATATATAAGTTAATAATTACAGATATAGATTTGATTTT:1 - chrX 14448177 5' - HMS-Beagle 7032 2 68.85 GGCGGAAAAAGCGGCGTGTAAATTTTCCAACTAAGCCACAGCGAGCAGAGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATC:1 + chr3R 18524604 5' + opus 436 2 69.86 CAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr2R 15062277 5' + blood 55 2 54.11 ATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr3L 23871299 5' + Doc 75 1 77.50 CCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTAT:1 + chr3L 9375852 5' - mdg1 7368 2 78.77 TAAAGTTGTAACCACTTCCCAGCGGCATCACCTATTAATGCACTACTTCATTCATTCCAGATCGATCAACTGCCGACGAGATTCTGAACTTAATGTCTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGAGTATACAT:1 - chr3R 5587490 5' - G5A 2740 1 55.48 TTATGCAAACACGGCTGGAGGAAATCTTTTTGGATTTTGCTTCAAAACGAGATAGTTCAGATATCTTTACTAAACGGTGGGTGCTTATACATACATATTTCAGTCAGGTTTTTAAAATCAGTTTTTTTTAAATATAACAATAAGTA:1 - chr3L 17724230 5' - Porto1 4637 1 76.71 AAGTAAATCACACAGCATTTCCACGCAGTACCGCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr2L 18048215 5' + blood 21 2 69.86 GTCCGATGTTTGGATTGGAGGCTGGTTGCCGTTAGAAGTGCGCAAAAGTGCTGAATTGAGTCGCGAAATTCTTCAGGTGCACTGCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTAT:1 - chrX 17469030 5' - Bica 184 1 76.03 ATGCAAATATTGCCTACTTGTCATGTAGACAAATACACATTCAGCGCTTTCTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAAAAATGTGTTTT:1 + chrX 7467893 5' - hopper 1392 1 69.86 CAGGTCCATACCGGCAGTCATCAAACTTTGGTCACACTGCCGAGCACAGCGTTTTGTTGCCGGCGATTTGTAAAAAAGTTTGGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATTCGTGTGCACACATAAAGTTGTC:1 - chr3R 18663542 5' - 1360 169 1 54.79 AAGCAGTTAAGGACATGGATCGGCTGTAGTACTTCTACTAGAGAAGGCGGCATTTTTAAATACCTTTCAAACTCATCCCACTGTTAGGAGTCCATATTGCCGCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 12180331 5' - accord 185 2 70.40 ACAGAAATCCCTTCCAGCTCAGAAAGATTCATCCTTCGCCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 + chr2L 7667422 5' - copia 5077 2 71.23 CCTCATTACTTTCATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 + chr3R 14049294 5' + transib2 24 1 69.18 GTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 24809915 5' + 1360 55 1 73.91 AACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 + chr2R 14553249 5' - mdg3 5429 2 70.07 TGTTGAACTACCTTTGTTTAGTACTAATTCCTTTGGGTTGTTGGCAAGGTATCCAACGTATCTTTAGTGTGAGCCCAGCAACTGCTTAGCAACTATTTTTTTTTTACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 7835769 5' + roo 14 2 65.07 GGACGCTTTACAGCAGAGATTTGGCTTAAAATAACTGCCCAAATCCACGGCACTAACACAGTCGCACTTGGCCGCTCACAGATGCGCACCCACACATACATACATACACACCCTATATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTGCT:1 - chr3R 8621925 5' + Cr1a 4333 1 78.77 GCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 - chr3R 15514588 5' + 412 90 2 78.08 AGATTCTTAGTTCCTCGCTGGAAAGGGAGGGCCTGCTTTAGAGCAAGCAAGAGATAGCGAGAGAGAAAAAGTGCGAGAGAGTGGGAAATGCAGTTTGTGAATTGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3R 10079435 5' - P-element 2870 1 72.60 GCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGGGACTGCTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGA:1 - chr2L 12142622 5' - hobo 2881 1 72.07 GATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr2R 7404698 5' + blood 85 2 73.79 ATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGTGGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAA:1 + chr2R 5530007 5' - 1360 3238 1 71.20 ATATCGTTATCAATTAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr2L 9167552 5' + pogo 48 1 54.11 GTTTATAAAAATATTTTTTATTACAATATTTTGATATTCGTTCGCGTGGTGTTTTGTGTTTTCTAAGTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chrX 10538113 5' + pogo 51 1 55.48 CAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chrX 3529753 5' + 412 71 2 70.59 AGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 + chr3L 15058852 5' + blood 68 2 61.64 GAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 + chr2R 18048799 5' - opus 441 2 58.90 CGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr2R 7223630 5' + blood 35 2 59.72 CACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 - chr3R 6103693 5' + Tirant 8154 2 54.79 CTAGAAGCGAATCCCGAAATCAGTATGCATTTCTCGTTGCATAAGTCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACC:1 - chr2R 21050346 5' + Tirant 437 1 68.49 CTTTTGATTTATTTGTTTATTTCGTTTTGGACGGAAGTTGTTAGCCACACAAATTTGTTTTTTATTTTTTTTAACACACTTATACGCCCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 - chrX 9007865 5' + BS 5032 1 59.59 CGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 535435 5' - roo 8985 2 76.55 GTTCCCACTTTGAATTTTGGCTTATTTTCTAATTTGCTTTTGTGAAAACAGTATTTTAATTGCCAAGCATACCTCAATTAAATACATTTGCCTGTTGTTTAATTTTGCCATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr3L 18468488 5' - jockey 4986 1 71.92 TGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3L 20076835 5' - roo 8983 2 81.51 CGGCCTAGTCCAAACACATAAAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr3R 27835731 5' + 412 13 2 76.71 TGCATGTGTCTTTAAACAAAGATTTATGTACCCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 + chr3R 11553633 5' - hopper2 1557 1 51.37 ATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:2 - chr4 1149947 5' + 297 6633 2 61.64 TATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr2L 15920167 5' + jockey 79 1 65.75 CCACCGCAATACCCTCTCAGGGGGTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chrX 22858804 5' + mdg3 15 2 76.71 GTAGGAATATTATATATAGTACAGTTTAAAAGCTATGACTGACCTATGTATGTATGTGTATCAATGGACATAGATTACTTGTTTAAACTATATCCGTATGATTACGTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAG:1 + chrX 16479548 5' - gypsy4 181 2 71.23 CAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCAAAAAAATATAGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTA:1 + chr2L 15142228 5' + BS 4754 1 52.05 CAATGAAAATAGTCCTTATTAAACGATCAAAACAATCATTCCTGTTAATCTTATATTTATTAAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCCGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr2R 6945615 5' - pogo 2053 1 57.97 AACTTGTGTAAACTTTCTGTTTCGCACGCTCCTTGCAACTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr2R 14420374 5' + jockey 26 1 54.79 GTCTCTTTCGCTTCGCATATACCCATCTCTTTCGCCGTCGTGGCACAGCGTGAGAAACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3L 10856869 5' + P-element 9 2 79.45 TAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTCGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAG:1 + chrX 3506081 5' - Tirant 8418 2 80.82 TGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATGTTGTTAT:2 - chr3R 23449321 5' + roo 8750 2 75.34 TTTATCGTCACTCAAAGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACATGAGAGAATGCTATAGTCAAG:1 + chr3R 23020769 5' - INE-1 577 1 69.18 CTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTGTTTTTT:1 + chr2R 20704160 5' - hobo 2883 1 64.35 ATGCGAAGCCAGCAAGGCCATTGCCGTTTTCTCACACTACACTATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACG:1 + chr3R 14165046 5' - Tabor 7209 2 71.23 AACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr3R 24228891 5' + opus 7052 4 69.64 CGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 20149661 5' + 1360 28 1 59.59 GTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chrX 14136555 5' - roo 331 2 68.49 GTCCTATATGTAAGGATATATATAAAAGATGAAAGTAAGATTCTCTGATTTTGCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 + chr2L 19903298 5' - Transpac 307 2 47.26 ACTACTCTTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1 - chr2R 1277158 5' + Tirant 8163 2 57.24 GCTCACCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 - chr2L 13877763 5' + Transpac 71 2 66.44 TATGCACCCGAACCATACAACCGACAGTCTGTTCGGCACTTTACACTGTCGCTGACTTTTTGCAAACTTTTTCCGCATTACCTTATTCACACTTGTTTTAGCACCCCACTATCGTTTTGTCGCACTTGCAGTTTGCCTGAATGTAG:1 - chr2L 21685638 5' - mariner2 288 1 74.66 CTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr3L 15035213 5' + pogo 67 1 67.81 ATGAAGAATGCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 + chrX 14908386 5' - blood 7315 2 67.12 GCCGACTTCGAGTCGGGCGTTTACATTGTTAACGAAAGGCACAACCAGCACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:1 + chr3L 6630332 5' + jockey 4741 1 65.07 AACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr2L 1073895 5' + Tirant 8153 2 54.86 CAGGATGAAACGGACACCGGGGTTTCCACCAACCTGGTGGAGCAGCCAGACATGGGAGTGGTGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCTCCCTTTTGCTCC:1 + chr3R 19048294 5' - R1A1-element 4904 1 52.27 TTGTAAACAAAAATTACTTTGGTTTAACGACATTTGTTTATCAAAACACTTTATTCTTTCCGTTGAAAACAAACTGGCGATGGTATATAGTGTACACAATATTTATGTATATATATATATTTATATATATTCCTATATATAATTAT:1 + chrX 4077576 5' - Tc3 285 1 59.59 AAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr3L 17447424 5' - Tirant 362 2 60.27 TCTATAGTTACTAATGATGTCTCTAATATCGGTACCCCTGAACCAACTTTTTATAGCCATATCCCACATATTAAACCTTTAATTAAACTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr2L 13884711 5' - pogo 2070 1 60.96 TAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chr3R 31120247 5' + opus 46 4 72.12 GGAATAGCAACAATAAATTCCATCCAGATAGGCAATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - chr3R 10288928 5' + copia 32 2 60.96 GCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr2R 5848965 5' - mdg1 7393 2 63.01 GGAGCGATAGGAGCGCATGTAATTAATGAGAAACAACTGATAATTTGACAGACGGCCGAGCCACTTGAGGCACGCGATTAACTTGACCAACAATAAATTGCCTTTACGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chrX 3444029 5' - pogo 2090 1 75.34 ATCATAAATATAAACAGCTGCGCTTAAAAAAATAGTTCCAATTGCTTTATATAAATTTACATACAATTTTATTAAATTATGTGTCTGTTATTATTTAATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAA:1 + chr2R 17917583 5' + F-element 98 1 67.12 ATGACGATGTGAAATTAGAAAGCCTGCGATAAAATTGAATGTAAATTGTTTGGCAACAAAAAAAAACAGGTAGGATGATGTATACGAGATATAAAAGGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 14705904 5' + roo 8687 2 67.81 TCGTAAGGAATTATGTAAATAATTGAATTCTCCTTTTTTATTTATATTGCAGTTAATGGGGTTAGTTTGGGACGCTCGTTCATCACGATCACATTAATAACCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATTAGCCGAGAACTTG:1 - chr2R 1984451 5' - Quasimodo 244 2 69.18 ACATCAATACGTTCATGTCTTATAACACAGGCTATTTTATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAACAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCTACTGGAAC:1 - chr2L 21272357 5' - Cr1a 3975 1 66.67 ATAGATAGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr3R 20292569 5' + pogo 17 1 73.97 GATTGGGCCCGCATAGAATGTACAATTTATTTATGGAAATAATATATCACAAGTAACCCATTAATTTACCATTTAAATCAAGCGGGCATTGCCTCCATAACGATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 16982177 5' - roo 9054 2 67.81 AACCTTAGAAATTGAGTTGCCACCCGGAACTAAATTCATCTACGTAGAAATCCTCTAGCAAAGCAGCCGATTTGTAACGTGTAACAAAATAAAGGGATGGAAGACGAGAGTACCTGTACTTGCTGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGC:1 - chr2R 1219012 5' - gypsy12 10145 2 50.68 AACAAGGTAATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAG:1 + chr3R 23507534 5' - 412 7526 2 71.23 AACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3L 10856814 5' + P-element 64 1 41.78 CGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCC:1 + chr3R 443026 5' + gypsy2 6493 2 77.95 AAAGTACAGCCCGCAAACAGGATACGAATGCGAGAATGTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1 + chr3R 9982975 5' - HMS-Beagle 7004 2 56.85 GGGGAGTGAGTGGGGAGTTCTCTTTTCCTCTCGAATTTATATGCATGCAAGAGGAAAAGAGAACTCCACACTCACTCCCCTTCCACCCGACCCTCCCCCTAACACTCTCTCCACTTCGCCCCACAAACAACAACACACACACACAC:1 + chr2R 20998164 5' + gypsy3 418 1 72.60 AAATGTTATCAATTGATACAGTTTTGAACGACGAGTTGTTTATATTCTACAATATATGACTTGTTTTCAATACACTTTAGATACTAGATATTATCATACTTGTCATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACC:1 + chr3L 19216553 5' + Quasimodo 196 2 71.92 AAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2R 16383382 5' - roo 9020 2 55.48 GTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 23449248 5' - roo 344 2 61.64 GCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:2 - chr2L 16685405 5' - P-element 2830 1 46.58 TAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGA:1 - chr2R 18048905 5' + opus 174 4 67.12 ATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGC:1 + chr3R 17316046 5' + 3S18 5831 2 60.27 TCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr2R 14385561 5' + jockey 67 1 57.53 GAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCGCATCGCGGGTACTTA:1 + chr2L 12142569 5' + hobo 74 1 65.07 CCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 + chr3L 18708577 5' + F-element 50 1 58.90 AGTTCCAATATCTTTATGATTTGTAGAAAATAATCATTGTCGCGATTATTGATTAAGTGGCTGAAGTTTAGGCGATAGATTAAAGATCCCTGAAGTCCAATGCACTCTATAAATGCCAGAATTTAATTGGGGTTCACGGCTGCAAT:1 + chr4 265394 5' - baggins 5317 1 40.41 GAAGAGCTCGGCTAAATTAAAGACGTGTCCTTCAGTTCTCTTTTGTTTCTTTCTGGAGGGTAGAGAATCTTTGGGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGCGGCGAGCTTT:1 + chr2R 9332054 5' - Doc2-element 4554 1 55.86 TTTTAGAAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chr3R 18524207 5' - opus 477 2 71.23 TTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGC:1 - chr2L 3734555 5' + mdg3 61 2 66.44 GAGTCCCCATACTAATGCCCCCCATTTCCCAACTTAGACATCGCCTTCGATCCCAAGGGGATGCTGCTAAGGTTGGGGGAAATGTGTCTCGAAATAAAGCAGAACCGTGAGGAAAGCGCAAACAAAAAGAAAAAGAGAGAAAAAAC:1 - chr2L 14147493 5' + transib2 2426 1 60.96 ACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGGTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 22659883 5' - 412 460 2 62.07 GTGTAGCATACTTTTGGGATCTCATTAACAAACTAAACGAGTACTTTTAGGAGAAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 - chr2L 19417103 5' + BS 5028 1 63.01 TTGTGAGCCATAAATGATAATTGGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCACC:1 + chr3L 18468324 5' + jockey 4689 1 63.85 ATACTCTGGGTCACATAGACATATATGACCCGCTCCAAATTTTTGTAACTTAGCCAACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr2L 13576064 5' + 297 6636 2 62.07 GTAGACGGACTCTTCATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chrX 14385116 5' + blood 7037 2 67.81 GCTCCCGCCGTCTGGTTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 - chr2R 17100113 5' + P-element 103 1 15.07 AGACGAGCAGGAATATGATTTGCCCACATTTATTGGTATATTTAAGTGGTGATTCACTTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTG:1 + chr2L 10039888 5' - hobo 244 1 60.69 ATTGTTTTGATAACTGAAAATGGCGCAAGCATAAGGATGAGAATTTCGGCCGAAATTGTACTCAATTATTTTGCATTGATTATTGGCTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr3R 9993003 5' + hobo 54 1 61.64 ACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2R 10367472 5' + 412 45 2 54.62 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAG:1 - chrY 311346 5' + 1360 53 1 62.07 GCGTAAGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3R 24228839 5' + opus 7147 4 64.38 GTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chr2R 10367480 5' + 412 7122 2 63.70 CGACTTTCAATAGCTGTAACTAACTTCGTTATTGCCTCAGCATTGTATTGCATCACATCAAAGGAGCTGTATTTAATTCAACTTTATAATATCGAAGAACGCTACATGATTCTACACTTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGC:1 - chr2R 14717952 5' + Max-element 8234 1 84.29 ATAGAACTGAATATGGCTCTTAATTCCTAAATGCAAAAATAGTAATAATAATAAAGAAACTCATTTACAAACTTTTTATCAACTTTTGCATGTTTAAGTTTTGTCCTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2R 9867233 5' - roo 393 1 73.29 AATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 + chr2L 11668730 5' - mdg1 7381 2 69.86 GGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr3R 16771427 5' + roo 8732 2 64.38 CTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATG:1 - chr2L 22063435 5' - INE-1 122 1 61.64 CGAATTAACTAAATTGTTGTAACATAAAGTGGAAATATGAGCGCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 - chr3R 21570552 5' - mdg3 166 2 69.86 TCTGTTATTTCATATTTGCGCTTTAATGAATTTTAATGCTTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAA:1 + chrX 13061678 5' + mdg3 5286 2 61.64 GTGTAGAGAAGGAAAAGCGCTGGATGCGAGAAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTA:1 + chr2L 11158602 5' - Rt1b 5105 1 61.64 GGATATAGAAGGACACGGAATGGGGATGGGATGAGTTGGATAGCTCCCAGCGTTGGCCAGAATGGAATAGATGGTGTCCGAGTCGAGGCGGTACAAACCTCCAGCCGTAAAAGCCAGGGGGAAATCCGTGGCCTACGTGGGAACCC:1 + chr2R 20049330 5' + Rt1b 310 1 50.00 TCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 + chrX 10101320 5' + mdg3 5315 2 57.53 GATTGCTCCGTCAAGTGCATTTCTGCAGGACACAGAGTGTGGTGGCAGAAACTGGGGCTCTCGTTCGAAGGGCTGGCGGGAAATTGAGGGACATGTGAAGCACACCTCCGTTCATAATAATACAATATGTAAACATGTATATATTT:1 - chr3R 10746383 5' + G3 4507 1 76.03 CACCTTATCAGCTGTAGGGTCTTGTTCTAGCGATAGCGCACAAAAGTCCGATGAGTAATTGACTTCCTTGCCCACCTCTTCCTTGTTTCTACTCACCTTGCTCGAAAATGCTATGTACAAGCTGGGAAAGTAAAATAGAAAAAAAA:1 - chr3R 27679505 5' + F-element 4679 1 72.60 AGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3L 20076782 5' + roo 81 2 74.66 ATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACAGCATAAAGTATACATATTCTTGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCCCATAAACGCCTAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGATTCA:1 + chrX 124082 5' + INE-1 166 1 69.66 ACATAAAAATCATGCTGTGATGCCCGACAACTGGCAGGGTAGGATTTTCAGAACAAGAACTCGAATCGGAGGAAGCACAATTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGG:1 - chr3R 21923335 5' - roo 301 2 64.03 CATTCGGTGGGACAAGTTTGCCAACGTAAAGCCATCGGCATCGCCATCGTCATCGCCGCTAGACAAGGCCGTTGTTCAAAGTTGTTTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGA:1 - chr3R 26538693 5' - mdg1 429 1 58.90 GGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTGATAAATGCAATTAAATTACATGTGTTTGGGCAATGCACCCAGGTCGCCTTAGATAACGAATTCCTAAATATAATTT:1 - chr3R 19450199 5' - roo 8748 2 40.41 GCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 + chr3L 15371310 5' + Transpac 5001 2 73.97 CGGCGGTTAAGTTAAGGAGACAATAAAAGCAGACTACATACGTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr3R 29350653 5' - 297 374 2 71.53 ATTGGAACTGGCACTCTTTAAGACTCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3L 9426805 5' + P-element 26 1 68.49 CAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGGGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGGTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCG:1 - chr3L 829958 5' + G6 82 1 67.81 AACAGATCAGAGTCAACCTAAACCGTACTATTCTAGTCAATATTCTTAACAACATTTTAGGTGTGTACACCCCAAGCACAGAAAACCAAGAGAGGATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTACCAAATACCCGATACTCAGCTAGTGG:1 + chr2R 5246345 5' - INE-1 540 1 53.42 GAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 - chr2R 20913198 5' - 1360 3316 1 65.75 CAACGCCAAGGAAAGTTAATTTGTCCGAATCTATATGCAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:1 + chr2L 13877616 5' - Transpac 5223 2 77.40 AAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAA:1 + chr2L 11158632 5' - Rt1b 5075 1 59.59 ATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:2 - chrX 17469245 5' + blood 7102 2 78.77 CCCACCCACATGACTGGCGAGCACCCATAAATATGCTTTAAAGAGTTGAGCCCAGGAACGGAAAAAAAGTGACACCACCCTCAAGACCTCCCTAACCTGGATTTGATCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 + chr3L 22527313 5' + jockey 4812 1 47.95 TGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chr3R 15030740 5' + jockey 97 1 77.40 GCAACTGACTGACTGAGAAATGGGGCGGGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr3R 12794998 5' - mdg1 7421 2 58.90 GCACGAAAAAAAAACAAATCTCATAATTTGAAAATCTTATAAAATGTATTTTAATATAAAAAGGAATAGGAAACTATTTTTCAAATGAAGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr2R 17309126 5' - roo 9040 1 58.22 TCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chrX 21668714 5' - mdg1 7400 2 58.90 ACTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGGGGGCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGT:1 - chr2R 5900948 5' - Bari1 1667 1 59.59 AAACGGATATGAAAAATAGCCTGGATTCTTTGTTAAATAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 + chr3R 12559669 5' - mdg3 167 2 71.92 TCGTACGCTAGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2R 6052723 5' - mdg1 395 2 67.12 CGTAGGTCCGGGAGTTTGAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAA:1 + chr2R 5039322 5' - gypsy11 324 2 71.23 GCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 + chr3R 13358603 5' - mdg3 172 2 66.90 AATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCATTAGGACAGATTTT:1 - chr2R 16312113 5' + G2 3035 2 60.27 ATGCAGTATTTGTGAGGACTTCTAATATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 9482158 5' - roo 395 1 76.71 ATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCATGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTC:1 - chr3R 29709034 5' - blood 285 2 78.77 CTAGGGGGTTTTCTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr3R 15649757 5' - blood 7357 2 60.32 GATAATTTGTATATGCCACATTTTCAAATAGGTTAGTTTCACATTTAAATATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 - chr3R 21518120 5' - 297 6912 2 67.81 ACAAACATGACCTGATTTATTTACCATAAATTATGTATCACTGTCACAGATTAGATTAGTCATGTAACTTCACAATACTCAGGCTGAATTCTTGTCGAATCCGAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr2L 3006037 5' - pogo 2088 1 71.72 GGCAAGTGAACGAAGGAAAAGTAGAGAATAGCTAAGACATCTAACGACGAGGAAGTTTAAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 + chr2R 544744 5' + HMS-Beagle 21 2 71.03 CTACTTTTGTTACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3L 11665865 5' - pogo 2076 1 51.72 TTCATAACTTCAGCTTTTCTGAGCTTCTGAGCTATACCTAGGCCATAAAAAATACCAAGGAAAATTTATGTGCTGCACATGCCACGCCTGAAACTAAAGGGTTTTCCCTTAAATTTTGCATGATTTTTTTTTCTTTTTGTATTTT:1 + chr3R 25511280 5' - F-element 4686 3 77.24 ATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:2 - chr3R 9258748 5' + 1360 84 1 75.34 ACATACATTTTTATAATTATTCAATAATTAATAATTTTCAATAAGCTACATTATCGAGCATATTTTCAAATCAAAGGATTCAAGCTGCGAACTTAATATTATGAATAGAAATGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTC:1 + chrX 9467120 5' - R1A1-element 390 1 76.71 AGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 + chr3L 3979555 5' - opus 7458 2 56.16 GTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 9938686 5' - roo 9003 2 65.75 GAGAAATCAAGCTGGGCTCACACAACGAATGTCATGTGATGTGATCATTTGTGAGGCGAGCACTTTGTGGAGCCACCTCAACTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 + chrX 13548288 5' + jockey 4800 1 58.90 CAGGGATTTGCCTGGGTGCCCAGTTCCAGCGGTGGAGTGCCACCGAATGCGGTGATCTCAAAAATCTTTTTCGCATGTTTTCATAAGCTCTATTAGATGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGT:1 - chr2R 12951116 5' + Transib5 2950 1 63.01 CAATTTCAATTTATATGAGCAAAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3L 13597893 5' - blood 7375 2 75.34 ACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 20292560 5' + pogo 26 1 67.81 CTAGACACTTATTTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr2R 7404628 5' + blood 7026 2 70.34 ATGCACAGAGAAGAAAATTAAAAACCTAGTCTTTTAACAACAACTAACTAACTATATAGTTCAACAAAAGAAATCATAAGGGATTTAAATAAAAATCAAATGCATTACCCTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 14005501 5' + hobo 13 1 72.60 TAACTGCTCGACTGCGTTTTTCTGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTATTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACGTTGGAAATACGTT:1 + chr3R 10541262 5' - hopper 1339 1 67.12 CCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chr2R 9164910 5' + 412 7141 2 76.03 CAATGGCAACGGTTTAAGTGCAATCAATCATGAAAGTGAATATGCTTGAAATGCTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3L 11196341 5' - pogo 2038 1 63.70 CACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 535416 5' - roo 9009 2 62.14 ACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chrX 14385138 5' + blood 42 2 55.00 CACATCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAAGGGGAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTAGTCAGGACT:1 + chr2L 1449585 5' + opus 16 2 53.85 TGAGCACCCAGATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:2 - chrX 4566282 5' + Transpac 32 2 64.38 CCACCGTTCGCTTGTGTTTCGGCTGGCACCAGTTGGCCAGAACTCACCTGGTCCACGTAGTTGTTGCCCGAGAACTGCTTGGTGATCTCCATGTAGTGCTCCGAGTCCATCCGTTTTCATATAGTCTTGATTAGGATCAATAGCCG:1 - chrX 17279693 5' + INE-1 88 1 77.40 AGTTTTTAATAAATATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3R 23664369 5' + pogo 47 1 50.68 ATCCAAGGCGTATGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTG:1 + chr2L 22643341 5' + invader4 2780 2 58.90 TCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr2R 18722040 5' + 412 7102 2 52.05 TCACGCTGGGCACACGCGTCAATGACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chr3R 25876813 5' + mdg3 5265 1 78.08 ATACGTATAATAGCATACATAAATAGATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGATATAAAAATAGCGGAAACAGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr3R 19446685 5' + copia 4889 2 72.60 CACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chrX 5222934 5' + 412 7138 2 78.08 GCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACG:1 + chr2R 19076517 5' + F-element 216 1 50.68 TAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGT:1 - chr3L 15371387 5' - Transpac 245 2 63.70 CGTTTAGCTGTTTGTAGAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 8272409 5' - roo 357 2 52.74 TAAGTTTAATTGCCATTATATATAACTAGGGATCGTGGTTGGAAACCCCGTACTTTATATGAGAATGGAATTTGTTTTTTATTTTCTTGTATATTTCACATTTTTAATTTGTTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTA:1 + chr3L 3810325 5' + S-element 1602 2 55.48 GTAAATAAGAGTTAAACAAATAATTTTATAAAGCCTAATATAAGAAAATAGATTAAATTTCCAATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACG:1 - chr3L 10076451 5' + X-element 12 1 76.71 ACGCAGCATGGGACAAGAAAGGGCCAAGAAATTGTGAGAATAATACCTTATAGAATGGGCAGAAAATCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCACACTGAAGGGATTACAACCACGTCACC:1 + chr3R 19323843 5' - R1A1-element 5281 1 45.89 ATGAGGAAAGTCAAACTAAACTGACTCAGCTGAAAGTTGTATACGTTGAGTGGCTAGCCTTGAACTTATCAACCCATTCAGGATCCCCACTGTTTTCACACCCATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chrX 12551656 5' - pogo 2087 1 76.03 CATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr3L 9375846 5' - mdg1 336 2 74.66 GACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGA:1 - chr2L 1074015 5' - Tirant 8447 2 57.53 TAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr3R 20452265 5' + blood 79 2 71.92 TTGCCAATAGATAAAGTTCTATCTATATATGCGAAAAAGAAGAAGACGTTTTCCTAGAAATACTACCATCTGAGCAAAGACACTAGAATATAAAGATGCGTAAATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTC:1 - chr3R 3620689 5' - hobo 469 1 70.55 GTAATTTATTTCTTAGTCGATCTAAGCTTCAGATTATTCTATATCCTATGCGCAATACATACATATATATATATACATATATATATGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCT:1 + chr2R 13748010 5' + hobo 2611 1 57.53 AGTCGAATTAACTAAATTGTTGTAACATAAAGTGGAAATATGAGCGCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr3R 21570555 5' - mdg3 5421 2 67.81 GGTTCATACTAACACTTATTTTCTCTAAAAAAAATCTTTATTTACTGCTTAAAATGTTCAATTTTTCATTGCTTTTGTAACTTTCTTTATAAAAAAAACATAGTTTTATAATATATGTATGACAACCATATTGGGAAGATCCTAAT:1 - chr3L 10270539 5' - 1731 4585 1 32.19 TAGGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATATAAT:1 - chr3R 25384326 5' - mdg3 5481 2 70.55 GCAAAGTTTAGTTTAGACAACTTGCTAATATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chrX 21205112 5' + 1360 29 1 62.76 CCCACACACATAAACACACAAACACTCGGAAGAAACAAAACAAAACAAAACTCATTTCAACACTAAGAAATTTTTGTGGTCGTAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 5898074 5' - pogo 2069 1 67.12 ACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATATAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chrX 23283043 5' + roo 8726 2 66.44 GTCTGCTGCCTTACTTGATTATCCTCCAAACTAAGGGCTGGAGCTCGTTACCACCGCTGTTGATCGATATTTTAATTTTATTAAAATCTCGACGTTCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTGATC:1 + chr2R 25240146 5' - INE-1 92 1 53.42 AAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chr2L 13547049 5' + P-element 75 1 34.25 TCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 - chrX 19231845 5' + mdg3 56 2 55.48 TAACTAAATTAATTATTTTAAGTATCGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr2L 8542725 5' + P-element 66 1 38.62 AACATCACTTGATTCTGATTAGCGTGCTGTCAAGCGTGAGAGCTGCATATACATATATCTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 + chr3R 31071739 5' + opus 7049 4 62.32 TATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 18846586 5' - roo 8996 2 73.29 TGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 + chr3L 15321973 5' - Transpac 237 2 67.81 CGTGGTTATTCCATATTCCGTTGTGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:2 - chr2R 11656155 5' + HMS-Beagle 18 2 73.29 CACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr3L 14043631 5' + Ivk 50 1 51.37 AGAGTGCCAGAATGTATGTAAATTATTCGAGCTTCTACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2L 20922992 5' + pogo 23 1 69.86 ATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 - chr3L 22635767 5' - hopper2 1539 1 61.64 ATTAAATAAAAAACAAAACAAAAAAAACAGAAAAATTCAGCTTATAGTGCGTCCCTTCAAAAACTCAACTACTTAATGCCCAGCAAAGTATGCTATGCATTTTGGTTGCTGATGTGGCTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACCCGC:1 - chr3R 7279634 5' - hobo 2935 1 69.18 AAGTGCCCGCCACGAGTATTTACTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 15514658 5' + 412 7073 2 71.23 AACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 - chr2L 8772846 5' + Tabor 6858 2 67.74 GAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr3L 9430634 5' + P-element 91 1 23.29 AGAACATTTATAAAAGAAAACTGATTAATCATCTGGTTAAATATTTGCTCAACTATAAGCAAGCAAAAATAAGTCAAATCGCATGAGAAAGAAAGAGACACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 3762356 5' + roo 20 2 69.86 ATTTTGCTAATACATCTGATGAAATGGAATATCTATGCCGTACTTTGGGGAGCTGCTTCATGTTGTTGAATGAATTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCAT:1 - chr2L 12145489 5' - hobo 463 1 52.05 AGCAGCATTCCGCATTCCACATTCACTTGATTCACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr2L 10032790 5' + hobo 12 1 76.03 GTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACTTTATATTTAGG:1 + chr3L 9242006 5' + roo 8740 2 72.41 CATGCTTCCTGCTCCCCTGCCGACTTGCCTCCACCTAAACCCTCTCTCCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGTTGATGCCCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGAT:1 + chrX 19889464 5' - rover 6849 1 67.12 GCAAATGCTAATGATGCTAGCAAGAGCTCGGAAAATATGACAAAGTTTGATTGATTAAATATATTTCTTTTAAATATTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGC:1 + chrX 19819626 5' - flea 215 2 55.48 GTTCGATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr2R 8686637 5' + hobo 77 1 76.03 TTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chrX 983099 5' - 412 7507 2 58.22 TGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACTTTTACTTTTGCCTTTTGATTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGATTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCC:1 - chr3R 934250 5' - Rt1b 4730 1 37.70 CGAAATGGCTCATCAACTAATTTAATGCCTAAACCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 9649197 5' + roo 8707 2 53.19 CGACTGCAAATTACAAGTTATTATTAATGTTAACAAGCGAAATCTCCGTGTACTTATGTGTTTATATATGACCGGTCGTATTCATATATATATATATAGATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 23426328 5' - pogo 2084 1 73.97 TCCAGACGCGCGACAAGCGGATCATCATCTCCGCCCTCCAAGTCATCCAGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1 + chr2L 19371240 5' + Bari1 24 1 67.12 GAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCGGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr2R 7223622 5' + blood 7040 2 63.01 GAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:2 - chr3L 22221239 5' + 412 58 2 56.85 TATTAAATAAGACGCACATGCACATAATAATACACATACAGTTTGTCAATAAACTGTTTACACACGGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACATTAAAGGTAAGAAAATATCAAATGTATACAGTCACCGACTATCTCTCTTCAAGTGC:1 + chr3L 27262785 5' + Ivk 7 1 67.12 AACTTTTCCCCTGCATATTTTTCTAACCGCACCGCAACCATAAATCAGCACTAAAGTTTGTTGCCATCGACTGGCGGCAGAATCAATGGGAATCTCCCCGTGATGCACACACGGCGTATAAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGG:1 - chr3R 10753079 5' - opus 67 4 79.45 TAATAAAATTGCTAATAAATAAACGAGAATGGCGTAAGCGCAAAAAAGAGACACACGAAGCGAAAACAAAGCAGGCGAAGAGGAAGCACAGAACACAGTAGGCAGCGCAGCAGAGAAAATGTATAATTTACATTAATTTAATTACA:1 + chr3R 29325078 5' - X-element 4598 1 54.79 ATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGCGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 - chr3L 14043658 5' + Ivk 23 1 69.86 TATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chrX 14962208 5' + jockey 77 1 63.01 AAGATTTGCTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2R 13849634 5' - roo 9006 2 63.70 ATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:1 - chr2R 21227421 5' - mdg3 5427 2 75.97 CAGCGATTTTTGCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAG:1 - chrX 19162676 5' + pogo 69 1 67.12 AGGTGGAAACGTGGCCAGCAGCCAAAACAAACAGTTTTTCGCTCCTCCCGCTTTTCGACCAGCCTTGGCAATTAGTTTGTGTCAAGGAAATACACTACAAATACACAATACAAATATAATTGCAGGGCAATAACTCCTCCCCTC:1 - chrX 5485164 5' - HMS-Beagle 6788 1 68.75 ATCATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 - chr3R 22289468 5' + 412 7120 2 63.70 AGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr2R 24338442 5' + 1360 73 1 68.49 AAAGGATTTTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 + chrX 6398766 5' - blood 7350 2 46.58 GGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGTTCTAGAGGT:1 - chr2R 24338454 5' + 1360 57 1 57.75 CCTACATTAGTTGATTACTCATAAATCATAAGCGTAACATTTTTATAAAATAGAGCACATACTATATAGTAATTGAAAGTATAATACTGGGGGGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3L 16764771 5' + I-element 30 1 63.70 ACAATAATGGCAATGTTGCAGCTGCTGGGGAATTGAATTTTGATTTGATTTGTTACCGTTCAAGATACAAAAACTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTA:1 + chr2R 20015097 5' - X-element 4666 1 51.37 CTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chrX 14136559 5' - roo 335 2 65.75 CTGATGAGCAGACGGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACCTACATGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAGGATCAAGGTTATACGGTATTTTTGTAGTTGATATAATAGAC:1 - chr3R 2270610 5' - Stalker3T 324 1 72.60 TAGGGTAAGTAGCGCAAAAAAAAAAAGACTGAGGAGAGTATAAATATTGTTCATCTTAAGGGCAATTAATTATAATTAGTTTGCTTTTATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAACACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTA:1 + chr2L 16151953 5' + I-element 482 1 58.22 ATTTTTATTGAAATAATAAACTACAATATACAGATATTTTTCACTTTATTTATTATTTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGG:1 + chrX 18034542 5' + Juan 10 1 78.08 ACCGCAGGTCCTGGCCAGTTGTTTGTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAATTGCAGCCCGCCACTCGCACTCAACGTCCAC:1 + chr2L 15832948 5' - hobo 2922 1 71.92 ATGGGGTTTACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAG:1 - chr3L 16264688 5' - Burdock 6319 2 68.53 CCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTG:1 - chr3L 13204779 5' + jockey 90 1 73.97 AGCGATTGTGATAGCGCAACGGAAAGCCCATTCAACTTTAACCGCAACTTTAACATAGTTGATGAGTGAAGAAAAAACAAGCATCTTGGCAGGCGGGCCAGCAAAGTTTTTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGA:1 - chr3R 15718199 5' + Doc 205 1 74.66 AAGGAGTTGTTAGCGCGTTGAAGTCGTCATTATAGATCATCGTGGATGGATAAGATAAGTGCACGTTGCTGCGATAGGATGTAAGTTTATGGAATAATAATCAATGTCTGCGTGGCGACGACCGACGCGTTCGATGATCCAATTT:1 - chr3R 21340918 5' - gypsy7 117 2 54.48 CCCCCCATTCGCAATCACATTCACTTCCTCGTTACTGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCATCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3R 10467961 5' - opus 7486 2 68.35 GAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:1 + chr3L 16157193 5' + Juan 60 1 60.27 AGCCAGGACCTGGGCAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGTTTCTCGGCACTC:1 + chr3R 5765289 5' - opus 7481 2 71.92 GCTGGATGAAATTACCCTGCACCGTAGAATAGCCAGGAGCCTGGATTTCCTGGGCTCGGCACTTTTGAATCAAAACTAACGAAGCAGCCCTAATAGAGGCAAACAATAGGCAGGTATCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACT:1 + chr3L 26501722 5' - Idefix 7107 2 78.08 ACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATACGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTCACGATTT:1 + chr2R 4193299 5' + 1360 36 1 78.08 GAAAACAACATGTGAGAGGCGGCTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:2 - chr2L 13547098 5' + P-element 26 1 67.81 AGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 + chrX 22858851 5' + mdg3 62 2 58.90 TGCGCCGTGTATGTGTAATAAAAATACGCTAAAATGTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chr2R 13628473 5' + jockey 89 1 71.23 TACCAAGACCCTTAAAATACACATTTTCTACAAGTGCGCACAGATATCAAAGTTAACCATGAGCTACAGCATCGAACAAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAATCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCC:1 - chr3R 5953083 5' - Dm88 406 1 51.37 GTTATTAAGCTCTGAGCGTTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr2L 6583304 5' - hobo 2933 1 71.58 TCGCAACGTCATCGGCGTGGCTTCAATGGATTTCGATGGGAAGCATTATCAATGGATCTTAGGGCAATGATTTCCAATGCGGTTACGCATCTCCGGGTGGAACAAAAGGTGAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAA:1 + chr2L 18653729 5' - Bari1 1401 1 73.10 ATTAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 - chrX 8200340 5' + flea 14 2 76.03 TAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr3R 9258776 5' + 1360 56 1 56.16 AAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATA:1 - chr3L 10076384 5' + X-element 79 1 63.01 GGACTCTGAGACCTTCAATGCCGCTATTTTGGAAAGCTTTATAGAATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGTGTACACTGTAC:1 + chr2L 17162715 5' + blood 13 2 73.97 TAATTCTTAAATTTCTTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 9571601 5' + jockey 20 1 74.66 GCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATA:1 + chr3R 11461765 5' + 17.6 50 1 57.97 TCTGTACCAACTGCAATAGCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr2R 9164814 5' - 412 7507 2 58.22 TATGCAATACCCAATTTGAGCAGCTTATTTCGTTATTTCGTTTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 20290652 5' + roo 39 2 58.62 AAGCCACAACAGAAACGAATAAAACGCTGATCCGAAAACATAAATCAACCAATGGACGGTGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCAGTC:1 + chrX 10728773 5' - springer 366 2 70.55 GTTACCAACTGTTCGACTTTAATGCAATTTTAATTTCCTGGCTTATGTAGTACATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3R 9345520 5' + pogo 12 1 75.69 TGACAACCAACAATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chrX 5222987 5' + 412 7085 2 63.70 ACTGCTAACCTGTTCCATTAACGATCAAGTCCCCCAACCCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCGTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACCATCATTGTCTTATTAATTTTTCACACGC:1 + chr2R 2843294 5' - 1360 432 1 68.49 AAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3L 10814622 5' + 297 6619 2 58.90 AAATAAAATAGATGCTTTTGTAAAGAGCAAATTTTATTTTAAAATTCCGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATT:2 - chr3R 8022250 5' - roo 369 1 58.22 AACGGTGCGCCATAACTTGCCATCAACTTATTAGCAGGCAGTGCAGCTCCTCCTGCTTGCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr2R 7223799 5' - blood 7372 2 73.29 TGCAACTCGTAGCAGAACGAAGAAAAACAGTTCGTTACAGCGTGTGGTATAGCCATATATTTGCTGATTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTAT:1 + chr2R 3107809 5' + Dm88 4242 1 54.11 AACTATGGCGCAGCTTCTCGATGAAGCCATCCTGCAAACATTAAATAGAAATTTTGGAATTGCAATTACATAAATATTATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chrX 7329327 5' - Bari1 1669 1 58.22 GCGCTACTTTTCCATTATCTAACAAGAGTTGAGATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTA:1 + chr3R 6097143 5' + Tirant 399 1 77.40 ATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 11228576 5' - roo 8988 2 73.97 TAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCAG:1 + chrX 19231747 5' - mdg3 177 2 62.33 CTTCCACTCTTACTTACTTGTAAGACTGCCGACAAGCGACTGACTAAATTCGGAGACTACATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTA:1 - chr2L 18823598 5' + P-element 2687 1 46.58 GACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr2L 19424680 5' + Tirant 8169 2 73.50 GTCAATGGGCAGCAACATAAGTCAACACTAAAGCCGGGAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGAT:1 - chr2L 9356951 5' + Stalker4 20 4 69.86 GCCCAGGAGTCCCAGCTCTCCCCAGCTGATTCCCAAGCTGGAACAGCCCGCTACGCCGCCCTCGGAGCCAGAAGCCTTAGATAACAAAATACTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAA:1 + chr2L 536294 5' - roo 8706 2 50.00 ATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 - chr3R 4722464 5' - roo 8994 2 71.23 AAAGTAAACTATAAAATACAGGATAGGCCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 20076911 5' - roo 397 1 77.40 ATTACTTGGTTACTTGATTTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:2 - chrX 19231887 5' + mdg3 5266 1 76.03 CGGCTCAGACAGTCGTGCCACATATTTTACACATTTCATTTTCACTGCTGCACGAATTTATTTGGCAATAATACAAAGCCATACTAAACTTATACCAGCAATTCAAATATTTAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAATACTAAG:1 - chr3R 22186094 5' + G4 3490 1 47.95 ATGTGGTAAACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCCTTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:2 - chr2L 17638777 5' + blood 68 2 61.64 CTAGGGCGTACTGTAATGTTAGGTATTATATTGTAGTAGATATAAGGTGTATGTGCGTTCCATCCATCCGCTTTGACAGCCACGCCCCAAAGAGCACGCACTCGTTTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTA:1 + chrX 8941640 5' + Doc 167 1 71.23 ATGAGCTGAACTCGGAGCAGGAAGAGTGGACGCATGGAAGCCGTGAAGGGAAAGTCTGGGGCAAGTGGAACAGAACATTAAAATTCTTTTGTTGAAGCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAG:1 - chr2L 20259457 5' - hopper 380 1 52.74 AAAGTGCTGCATAAAAACGCTGGAGGCACTCCTCGCCTGGAGGGGATGCGGTTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCAC:1 + chr3L 9013208 5' - P-element 424 1 34.93 CAGACAGAACATGACAAGAAGAACTATTCATCGCTCCATCTCAAAAGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAG:1 - chr2R 2527457 5' + roo 8739 2 52.74 GCCATATTATAATAGTCGGTTTTAGTCTGCGTTGCCATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCGCAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr2R 14246947 5' - pogo 2051 1 53.10 GTGTGTATGTGTGTGTGGGTGCTTGTGAATTTCGCCGTGTAGAGAGTGGCGCCAACGCGCAGTGTGTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chrX 16491282 5' - accord 184 2 52.22 GTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2R 16891855 5' + jockey 70 1 59.44 GTCCCGACTGTGTCTCTGTGTGGGTAAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr2R 20913068 5' + 1360 18 1 73.29 GCAAATACCGTCATAATAGCGGTAGCAAGAAAATCCGACAGCTGGATTGAGCCTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATAT:1 + chr3L 5886157 5' - jockey 4575 1 63.70 CAAGTGCATGTGCAACGGTACAATTACAAAAACACAAACGGGCGCGGCGGGAGCGGCAGAGCGCAAAGACGAGAGTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGG:1 + chrX 17651830 5' - roo 193 2 51.72 ATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACAAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTA:1 + chr3R 29534665 5' - HMS-Beagle 204 2 56.85 TTCAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGCATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 4884489 5' + pogo 50 1 53.15 TCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chrX 18366034 5' + jockey 88 1 71.23 GTATTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:1 - chr3R 4658884 5' + Burdock 6213 2 72.60 ATAGCTGTTTTAGCCACTTGCACGTGATCAACAATTAATTGGCAATATCTTTTTCAGGTTCGTCAAATCAAGCGGATCTCTCCAGCCAAAATAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTC:1 - chr3L 19232608 5' - hobo 2510 1 64.38 TGATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:2 - chr3R 8402670 5' - mdg1 389 2 63.01 TATTAGATCTTTCCATACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTT:1 + chr3L 24153121 5' - Tabor 7314 2 78.08 GGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 + chr3L 18708615 5' + F-element 87 1 73.10 GCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 - chr3L 15322071 5' + Transpac 4972 2 54.79 GTGTGTGCGTTCATCAAATTCAGGTATTTAGTGGGTGTCCCAAAAATGCTCCCGAATTCCACACTTGTTGCTGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr3R 8367108 5' + Doc 20 1 65.75 GCTGATTAATCAATTTGCAAAAAAAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chrX 10960325 5' - Transpac 5196 2 58.90 AAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr3R 11526874 5' + pogo 57 1 58.22 GTAAATATAAAATATTTATTGCCAGATTGCACACGCATCCCACAGCAGCAGTTGGTTTTATTCACCAGCACCTTCCTGCACAGTAAGGAACCGGTTACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGCAATA:1 - chr3L 2036725 5' + Doc 4432 1 69.86 GGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3L 22221110 5' - 412 452 2 60.00 GCCTAGTCCAAACACATAAAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3R 27835729 5' + 412 7068 2 75.34 TTATAGCAACAGTACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTT:1 - chr3R 26765209 5' - mdg3 5459 2 55.48 ATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr3R 12363253 5' + jockey 81 1 64.38 AGCAGCAATTTGAATATATTATCATCTCGTTCGTCCGTCGCCATTTTGTTTGTCAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAG:1 - chr2L 5717 5' + G6 29 1 59.59 AATAGGCCGCCAGCGATGGTACATCAGAGATCTCGTTTTCATCTGGACCGGCTTCGATCAGCAGTACTTTCCATTTCCTCACCTCGCTCAAATGGGTGATCTTATATCACGCTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTA:1 + chrX 14865683 5' - blood 42 2 63.01 GGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3L 16887326 5' + roo 8743 2 72.60 TTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTA:1 - chr3L 22638873 5' + Juan 4142 1 52.74 CAGCTTCTCGGCTGTTGGCCTATCTGCTGTCTCGGCCCAGACATTCTCTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 23623996 5' + roo 8685 2 73.29 CGCACACAGATAATATTCTTGAATGGATTTTGGCGTTCGAAAAGGTAGGTGTTACGTTTTCTTATTAGAAGGTACTGATTAACAGAGTCAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr2L 22629738 5' - 1360 3357 1 62.33 TTGAATGCAATAAAGCACATGGCATGTGGGTTAACTTATATAGCATGTACGTATGCGTTGTACATGCCAGCGTTCCGATATATATGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACA:1 + chrX 18913234 5' + Quasimodo 24 2 68.49 GTTAAGGCGTACTTTCCCCTGATTCGCTTTTAATTATTCTCATTTGTAAAATGTGACTGGGTTGTGAAAATTTGAACATAAGTCTTTGGCTTTATGGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chrX 16982358 5' + roo 8688 2 66.44 AGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chr2L 15832990 5' - hobo 2919 1 58.88 ATGCAGCACCCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr2R 6984265 5' + HMS-Beagle2 6901 2 73.29 TAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1 + chrX 18239385 5' + jockey 4592 1 77.40 ACACTTATTTCCGATTGTATTGTTCAGCTTGCACGTTTATTAAACTCTGAAAACGATTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATTTCAAATCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTTGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTTAAT:1 + chr3L 17427104 5' - invader2 338 1 61.64 TCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr3R 23664483 5' - pogo 2036 1 62.33 GCAACGGTTTAAGTGCAATCAATCATGAAAGTGAATATGCTTGAAATGCTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 11196346 5' - pogo 2033 1 67.12 GCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3R 10142914 5' + 412 7097 2 54.11 ATACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr3L 24153135 5' - Tabor 7300 2 68.49 CAACGAAGAGGCAATGCCGGCAAAAAAGATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:2 - chr2R 20500161 5' + 412 7092 2 57.53 GTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 + chr2R 7404677 5' + blood 7076 2 59.59 CCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCT:1 - chr2R 5900936 5' - Bari1 1655 1 53.42 ACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3L 6751742 5' - pogo 2035 1 69.12 GCAGACAGATGAAAGACACCATCAACACGAATTAGATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAA:1 + chr2R 2948989 5' - 17.6 7395 2 70.55 AATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 23664516 5' - pogo 2069 1 64.38 GTAATAGATGATAAACGACTAGCTTCTATATATTACTGACAACTGAAGTTGATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr2R 16712962 5' - pogo 2036 1 65.07 GAATGACCACAGACCACGTCCTACCAGCATTACCCATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 - chr2L 6406590 5' - transib2 2785 1 56.34 ACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCCTTGCATAAATAAATGACTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chr2L 17638768 5' + blood 7088 2 69.18 GAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 - chr3L 13722098 5' + blood 82 2 73.97 CAGAGAGCAAAATGCACTGCGAGAAAATGGGTAAGCGGCAAGGGTAGTGAACTTGTTAGAAACTCCAACTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 - chr2R 10932054 5' + blood 91 2 53.42 ATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 + chr2R 8305227 5' + blood 80 2 73.29 AAGAATTGATATTATTGGCTGATAAGAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 - chr2R 18048933 5' + opus 7036 4 67.12 GTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1 + chr3L 5438751 5' - hopper 1332 1 73.29 AAGGGCCAACAGCTTGAGCATGACTCTTGCAATTTGCGGCTGATTTATGGTCTGCAATCTGCAATGGAGGGAAACTGCTCGGCGTTATCTAAAGAGCATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCAGCA:1 + chr2R 13291004 5' - HMS-Beagle2 198 2 68.49 AGACATATAGTTTGGTTCCATTTGTAATCGCTCATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr3L 16157144 5' + Juan 9 1 77.78 ACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:2 + chr3R 16041127 5' + jockey 91 1 75.34 GTCAGATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2R 9332128 5' - roo 342 2 64.38 TTCTGGCTGACTTTTCGTAGCAAAGGATCACCCTACTATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr3R 27786530 5' - Tirant 8469 2 59.72 AAATTGAGTTTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr2L 4104011 5' - roo 325 2 73.29 GGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 + chr3R 14049309 5' + transib2 39 1 58.90 AACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr3R 14088536 5' + 1360 42 1 57.53 TTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATC:1 + chr3L 9571670 5' + jockey 62 1 64.17 TTGGTAACGAGCCATCAATGTGGTATCTTTCTATGTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAACACAATTTCACGTGTC:1 + chr3R 13358556 5' - mdg3 5471 2 65.75 ATTTTTTTTGAATAACTAAATTAATTATTTTAAGTATCGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2L 8542713 5' + P-element 49 1 48.57 GATGTCCAGGAGTTGCCTTCTCTAATTTGACAAACTCTTTCTGCGCTACGTGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr2L 8397241 5' + roo 69 2 66.21 GCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 10973187 5' + jockey 35 1 60.32 GCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr3R 15514597 5' + 412 7134 2 71.92 TAATTAAGTTGGGAGGCACTTAAAACAATATGCACTGTTCTAATTAGCATAAAAGAACTTTAATCAGAATGTTATAGCACCATCTGCTTAAATTAAATTATAGTATGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCC:1 - chr2R 18440839 5' + Doc2-element 4338 1 68.49 TACTTAAGAAAATTGTTTGTTAACTTTGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 - chr2R 20362340 5' + diver 22 2 70.55 ATATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:2 - chrX 14756773 5' + pogo 52 1 58.90 TGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 30568889 5' - roo 334 2 68.49 ATTGGACAGGAAAATTGTTCAAACTCCTTGGTTCTCGACTGCTTTTCATGTACTTGCTGTGTGTTCGCAGCATATTTAATGAGCCACACATGTTGATGGCTCTGACAGTCTGTAAGTCGTTCTTTTTTTTTCGTATTTTTTGTT:1 + chr2L 12120425 5' - gypsy7 5004 1 82.64 ATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 - chr3L 14043654 5' + Ivk 26 1 67.59 AATACGGGTGGCCTTATGTTGTGATTGCGCATAGTCTTATTCATTTAAGCAGCTTAAGTTCGACTTAAATTACTCGGTTATATTTTTCCCGCTCTCTCACACTTCCATTCCATCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTG:1 + chr3L 24035198 5' + R1A1-element 4984 1 76.71 CCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 2519876 5' - roo 8986 2 79.72 TATCAGTTATCAGTTATCAGTTACCAGTGCTGCGGTGCAGGAGGAGGAAGCTGGGGGAGATTGGTCTAGCCGATATGTTGATATATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAA:1 + chr3R 24702352 5' + 1360 3325 1 57.64 TGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr2L 4104082 5' + roo 77 2 70.55 AAAAAAAGGAAAACATTTGCCTAGCGTCTGTCGTGACGTGTCCGATTTTTTTTTAAATTTTATTTCACTTTTTGTTTGGCTGCCCACGAAAAAAAAGAGGCAAAATCGATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGCAA:1 + chr3L 9432099 5' + R1A1-element 480 1 73.29 TTGCTGCTGCTCCTGCAGATCACGCTCCAGTTTGTCAGCTATTTCTTTGGCCACTCGCTTGTCATGCTCCTCCCTGTTGAGAAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCA:1 + chr2L 18476436 5' + hopper 1400 1 56.16 CACGTTCTTATTATTTCACGGAACAAACAGAAATCCCTTCCAGCTCAGAAAGATTTATCCTTCGCCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr2L 7667396 5' - copia 234 1 53.42 GTATGCTACGTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 26399909 5' + roo 41 2 57.53 ATTCAGGAAATTAGTTGAGAAAAGAGAAAGTTTAATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 1327641 5' + pogo 20 1 71.92 CCAATAAAATATTTATTGACTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 11228515 5' - roo 386 2 70.55 CATTCCCCAAATGGTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chr2R 23313131 5' + Tabor 6859 2 70.55 AATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3R 20292544 5' + pogo 42 1 56.85 TCGCTGGCAAATGGAAAATCATTAACATGCGAACCTATGTACATAGTGCTCCGCTTACCCCCTGACTATGCAAATTTTCTTCACTGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTCCTCGGCTTTTCGGAAAGGTATCGTCA:1 + chr2L 7592502 5' - gypsy4 6519 1 57.53 TTTACACAACTAATAAAATTATGAAAAATATACAAAAATATTTATATGGCAGTTTTTAGCGGTTTCGCGATGACGTCAGCAAAGTGATTGGTTGCATCGGCAAGTCCA:1 + chr2R 1268579 5' - BS3 183 1 58.33 AATGAACATATTTCATCAGGTATTTACCACAGGACTCGAGGACGGCAAAGTGCGTGCCCTGCACAGCAAGAGCATAGTATGCACCATTCTTTCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAAT:1 + chr3L 2230230 5' - Cr1a 469 1 50.68 ATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCC:1 - chr3R 934253 5' - Rt1b 4710 1 44.14 TCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 - chr2R 10453476 5' + mdg3 5284 2 47.92 ATTGGATTTGTTATACAAATTTAAACGTAATTAATTTGTAATCAGAAATGGAAAAACAAATATGAACTAATTAATCAAGTAACAACTTAATAAATTAATTTGTCTATAAATTATTAAAAATGCATGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3L 4639203 5' + roo 8665 2 66.44 AGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTC:1 + chr2R 6984323 5' + HMS-Beagle2 6959 2 69.86 ATATTAAAACATTATCATATGGTTAACAAATTAAAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 13849770 5' + roo 22 2 67.81 AAAGAAATGTGCATTTATGATTTTGCACTTTACGTATAATTGTTATAATCAACCTTCCTGAATTAAACACCTTGAACTACTACCAGAAAATTACGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTC:1 + chr3R 26086234 5' + Bica 4656 1 54.79 GGCAATTGTGGGGCATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:2 - chr2R 24338485 5' + 1360 30 1 65.75 CAAATAGAAAATCTCATTTTTCTTTTAACGATCCGTTTTATTGAATATATAAAACCACAAAATGGGATGGTTTAGCGATTCTAGCGAGGCAAACGATAATACTGTCAAATACTGTCTCAGTTTGAGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chr2R 2705332 5' + F-element 17 1 65.75 GTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTC:1 + chr2R 10478689 5' - invader4 3009 2 69.86 AAACAGAAATACAGAGGTTGATAAATGTTATTGTTTAGTTCCAACACCGCAGAACTTTTGCAGGTTCTCACGGTATTAGCAACGTTTGCATAAATAATAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCG:1 + chr3R 11817428 5' + 3S18 324 2 66.44 AAGGCCAATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 15965332 5' + blood 7048 2 60.27 CATTTGTCTTCGCTGACAGTAAAATAGAATATCTGTTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3L 5514151 5' + Doc 39 1 60.96 CTTTTGTCCCGATTGTTCGGACAGGCGGAGTCAATCAACGGACAAAAGTTGATTTCGCAATTCGCCATAGCCACAGCCATTCGCCATTTGCAATTCGCAGCTCGCATCTTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 + chrX 14447995 5' + HMS-Beagle 6804 2 78.77 GCTCGGTTGTGATTTTCCATACAAATTCGTATGCAAATTCAAAGGGATATATAGCCAATAGTCGGGGCAACAACGCGCTCGCAAGGGAAGCACTTGAGCCTTTGTAGTATGTGTCTATGCAAGATTAAGCACAATTAA:1 + chr3R 14844409 5' + 412 15 2 72.46 AGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3L 9242013 5' + roo 8748 2 80.14 AGCCGAAAGTAAACACACCCTTGTTCAAATTGCAGGGATTGCAATCTGACCCGCCCTCTGAAAATATGGGTGTCAAATCCCTATAAGGGATAACGTGGAAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTT:1 + chr3L 8083085 5' - R1A1-element 5311 1 64.38 ATACTGAAATTGGGAATAGCCGTGCGTATTACAGTACCAAAAAGAAAAAAGAAAACATGAAAAGTTACTTGTACATTTTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr3L 5263489 5' - pogo 2064 1 57.53 ACCACCCATACAAATACAACCCCTCATCCCGACCCCTTTGCGAGTGGGTATCTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 + chr3R 16714180 5' - accord 7028 2 51.25 GGTTGTTGCTGTGATTTGGTGAATCGCGCGTAGCCGATTGTAATTATTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 + chr3R 29207544 5' + copia 75 2 69.86 ATAATCTCACAAATCAAACTTATATATAAGTTTGTTAGTTTCAAAACGAGTAATGAGACTAATGATCAAATAACTCTATCTGTAATAGAGTTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr3R 20909044 5' - I-element 5316 1 62.33 TTCTCTTACTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr2L 1229707 5' + opus 7164 4 58.22 AAATTGCCTTTTTATTGTATCACAAAAAAAGGCTCAAACTAAATTTTAATTAACAGCACTTGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3R 26399100 5' + roo 81 2 58.22 TTAAAATCTAATCAAAATTGGTTCTGAACAGGTTCATGAAGCTTATCCTCACATGCTTAGTTCAAGGTTTGGTTTTATTATTTCCTTGTTAATTGCGCTGTTATGGTACTATTACTGCATTGTATGGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 - chr3L 27422604 5' + BS 5078 1 67.81 GTCTTAACGGTACCTGGAGCAAACGAGAGCGATGGAGCGTCATTGTTTGGGGGGAAGGAGGAAGAGTGGGGGCGTGCGAGGTTTAGATTTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGC:1 - chr2L 9497547 5' + 1360 3331 1 56.25 ATAAATATTTTAAAATTCACTTTCAAGCAAATTCCGAAATAGGAATTTTTACACACATTGCAGTATGTATTTTCTTTTTTTTTGAGAGAGCCTAGTTAATTTCATTTAAAGATGAAGCAACAAGTGATAAATTGTTAAATTTTTT:1 - chr3L 16988326 5' - NOF 4124 2 73.79 CCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCT:1 - chr2L 21403545 5' + G5 4455 1 68.49 ACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 + chr2R 18048806 5' - opus 435 2 63.45 GTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 18581258 5' + roo 48 2 51.03 ATTGGCATTTTTGTGTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 + chr2R 5900759 5' - Bari1 1676 1 57.53 AATATCATTATATTGTTATCTATTTGTAGAGACGGCAAGTAGAACAGAGGCGAAAAGGTAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 18849711 5' + roo 8691 2 64.38 AAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAGGTGTGCACAGAAGTCGCG:1 - chr2R 10991385 5' + jockey 35 1 55.56 GATGATGTGGCCACGTCAACGTCATCAATCACAAGCATTGGAAGTGGAAGTAACAGTGGATTCATACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCTCAGAAGT:1 - chr2L 10068970 5' + mdg3 257 1 56.16 GTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 + chr3R 20137236 5' + Burdock 48 2 52.74 AACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCA:1 + chr2L 8772741 5' - Tabor 408 2 69.18 ATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 - chrX 5222937 5' + 412 7135 2 76.03 GGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:2 - chr3L 22221210 5' + 412 7140 2 76.71 GCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 + chr3L 20747094 5' + Burdock 62 2 63.01 AAGCCGTTAGGTTAGGTTATACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:1 - chr3L 22676365 5' - 412 429 2 60.27 GAGAAGCGATGGAAAATGCAGGAAAACGGGAAAAACAGAAGTGGAAAACACACACATATTTTTGGAAGACACGCACATGGGACGTGCAATTGCTGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTATGACT:1 + chr2R 19266388 5' - Doc 4532 1 73.08 AGATCTGTGCATCCTTTGGATACATTCTTATCCGCAAGATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 - chr3R 29709109 5' - blood 359 2 71.23 AGTCATATGGTATAAATGGCATTTATAACTTATATATAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCCACCGA:1 + chrX 15227413 5' - flea 152 1 76.03 CTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGGGCAGCAAGTGGGG:1 + chr2R 5900824 5' + Bari1 58 1 55.32 GCTACAGTGTAGCGGGCTCTTAATCAACAGGGATCTGAATGGGCCGAATTTGGCAGCAAAATAAACGCAAAACGGCGCACAAATAAAAATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr2R 6585552 5' - pogo 2073 1 66.44 GATTCCACATACTTAGCTCCACTACCCTGACAGCACCGACTGGGTTGTGGCAGCACGTTCTGCTTTGTTTAAATGCAAAATGTGAGAATATATAAAATAAACTTAATAGAATCTAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCG:1 + chr3R 17970512 5' + Cr1a 342 1 71.92 GCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3L 22221123 5' - 412 444 2 52.59 AAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCAGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr3R 11526864 5' + pogo 67 1 63.70 CATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr3R 31907338 5' + Tirant 8149 2 55.28 GCGTGCTAAGAGCGCGAGAGTCCTTTCACCGATGAGAGAGAAAGTGCCTGCAACATCAGCGGCTCTCGAGCCAAATCTAGGGGATGAGTCCTGCGCAGTCTTCGGCGTTGCTCAC:1 + chr3R 11483555 5' - G7 1024 1 50.43 ATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - chr3R 12363257 5' + jockey 77 1 61.64 GGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 7424560 5' - 412 478 2 52.63 CCGTTCGTCCTGGGTCGTGTAATTTTATGACTAATTAGTCAGATAGGACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGGGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGTTGCT:1 - chr3R 7424643 5' + 412 54 2 52.41 CCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGC:1 + chr2L 19371298 5' + Bari1 71 1 70.37 CTCCCCTAGCTAGGGAGTAGGAAATTTTTTTGATTGCCTCATCAACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 53112 5' - roo 9046 1 67.81 TGTTGATAGCCTCAAAACGCGAACTTTCAAGAAACTTCATGATTTATAAATTAAATTTAAATGATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 1516581 5' + Transpac 4956 2 51.20 ATGCAATAACCCAATACAAATACGTTGATAACTGTTTAGTAACCAGTGGATTATTATTTTATATAAAGTTTTCCGCTTAAATATTCAAATGTATTCTTTCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCT:1 + chr2L 18789580 5' - G2 408 1 67.81 AAGAAAATTGGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCT:1 - chr2L 3734620 5' + mdg3 5262 1 60.96 ATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 + chr2L 19903380 5' - Transpac 5157 2 67.81 CTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chr3L 19279095 5' - opus 456 2 56.85 GGGCGGAAATAACAATCTGTGTGCTTTATTACAAGCAAAAAGTGTCGATGATGAGATTGCTTTTGTGGTCCATTTGGGGCAACACTCTATGTGTGTATGCGTGTTGGGGAAGGGTGGGCAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 10441298 5' - hopper 149 108 71.72 TATGTGGTTTATAAAAACTAAAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr3R 23664540 5' - pogo 2093 1 79.45 AATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:2 - chr2L 3734570 5' + mdg3 46 2 56.16 CTGAAGGATTTTTTAATCCCCAAATTAAGTGCTTGTTGTAAGAGCAGTGCCCTTGTTCTCATATATATTTCAAGTTGGCGAGTCAATAACCTAATCATACTTCGCTTGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:2 - chr2R 19354130 5' + 297 10 2 79.45 GGCGAAATTTATGTTTATCACCAGAGCACGCACACAACAAATTCAATTGCTAGAAAAATATGGATGGTTAGCAACCAGTTTTCTTTTCGGGCATACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAA:1 + chrX 17733244 5' - R1A1-element 4936 1 66.43 AGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACT:1 - chr3R 5765430 5' + opus 7066 4 64.38 AAAAAATAAAATATAAATATAGCAATAAAGGCATGGCTATAAAATATTCTGAAGTATCAATTAAAAAGGTGTTTTAAGCCTGATTTAAAAATGAAATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 + chr3R 31988203 5' - copia 230 1 67.81 CATGCGGACGAGTGAAAGATAAAAGTGAACGAAAATATCAGCCAGAGCAGCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGTTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr2R 21056809 5' - Tirant 8473 2 61.64 TTTTGTTACTTAACATTTTGTCTTTACCATTGTGCCCTTTGGCCAACAATTATTATTAATTATTATTATTAAACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCCAGTGGT:1 - chrX 22759999 5' + Stalker 7058 4 50.00 TGCCCCCTCGCCAATTTGCATGGCTCGTCACTTTGGCGATGCGAAATCTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAA:1 - chr3R 12795109 5' + mdg1 7112 2 65.75 GGTGAGAAATACCATTTTCTCCACTTTGCAAACATAATCGTATCGAACGCAATTACCAAAAATCATTTGACTTGAAACAGGAAACACTAGCTGGAAAAAATTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3L 11196488 5' + pogo 16 1 74.66 AGCAGAGCTGTAATCCTGCTCCCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGGCCGCAAATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2L 20561339 5' - P-element 2874 1 73.29 TAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3L 9242069 5' - roo 8990 2 72.60 AATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr3R 5765410 5' + opus 7058 4 72.88 CATTTTAATATTTTGCAGGTGTTGACTACGAAATAAAGAGCACTCCACTCATCTTACACTTCATTCATATCCCATAAAAAGATTAATGATTTGACCATCACTATCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAA:1 - chr3L 15219670 5' + 297 6789 2 67.12 GCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACAGCGGC:1 - chrX 21667961 5' + gypsy2 6522 2 60.43 AGTAACTTAAGCTTGTTCAACTTGCTATCTACGTTGAAGGTAAAATAAAATAACCCGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACA:1 + chr2R 14884261 5' - mdg3 5433 2 60.96 AAATTTAATTTAGGCTGCAGAAATGGGACAAATTGAATTGTTTTTGGCCCTACTCTCAATGTTTGTGTAGTAGTAAGTAAGGTAATCAAGTACACGCTCTGTCACTCCAAGATCTATTGATATACCAGAAAAATTATGAAATTTCG:1 + chr3L 22982982 5' + INE-1 513 1 69.86 CCTTGCCCCTTTTTGTCGCTGGTGTATTACAACAATTTGCCAATTAAAAGCTCTTGACCTCTCACTCTTACAAATAGATCGTAGTGCGTTACACATGCTACCCCTGCTCCTTTTTCTTAACCCTTTTCCCACTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7203859 5' - gypsy2 406 1 71.23 TGTCATCTTTTGTTCGTTGATCTTCATTGACTGACTCTTGGAATTTCGCAGATCTTTTGTCCATCGCATATATGGCATTGCCAAATAAATATACTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCGGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGA:1 - chrX 11850574 5' - Stalker2 7621 2 61.64 GTAGTAATGCCCCAAAAAGTGTGCTATGGTATAAACTTTTAAGATGGAGCTATTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGC:2 - chr3R 14097181 5' - transib2 2815 1 76.03 ACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chrX 11534528 5' + roo 69 2 66.44 TCCTTCGTGCGCTGAGGTCACCACCACCCGCTTGAGGTCACCAATGGTAATAGTGAGTGTAACTTTCAAAAAATCCTTGAATGTCAAAATGCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACTGTGGTAC:1 - chr2L 3850456 5' + HB 490 1 56.16 TGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr3L 15371395 5' - Transpac 5172 2 58.22 CACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 13597705 5' + blood 7031 2 72.41 GGGTTAGTTAAGGGGTATTGGAATGCATTCTTTTGGAAAGGCAGCACCTTGTGCCTGAAGAATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 + chr3R 14331107 5' + Burdock 1 2 66.44 TTTGAAAGTTTGAAAATATATATTTGAAAAGCAAAGTTTATTCTCGTTGAAAGAAAATATGTCTGGCGTCTTTTGTATACATACAAGGTGTCCCGCCGGCAGCACACGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATT:1 - chr3R 20067576 5' - R1A1-element 5295 1 72.60 TTAAATGGGAATTAAATGAATGAAATGCGGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chr3L 22221082 5' - 412 7527 2 76.71 ATCGCCAACAACCAGCAACAGTCGACCAGTGAAATTATGAACTCCGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chr3R 22810824 5' + flea 16 2 73.19 GACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTG:1 - chr3R 27845543 5' - Stalker4 7279 4 73.97 AACAGCACCCCGTGTGACTTAAATACAAATTTGTGCTTCCTTTTCTCACATTATAGCTTAATTGATTTTCGCTTTATTGTAAATTTCTATCGATTTGTCAAAAAAACTTTTTGCCATCCCCACACTTACGCCCTAAAACCGCCCAA:1 - chr3R 1515401 5' + INE-1 342 1 54.79 TAGTTTCCCAGCCATATCCTGTGGCAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2L 16685434 5' - P-element 2876 1 75.19 CGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGT:1 - chr2L 8772824 5' + Tabor 63 2 58.90 TTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTCTG:1 + chr3R 5765349 5' - opus 435 2 72.09 AAGGGGGCGGCGGAATGATAGCTGACCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACCCGGCAC:1 + chr2L 3967049 5' - hobo 2904 1 54.92 ATTTGGAGCTTTATACAGTATACAGAAGATTTTATTTCACCACCTATCATAATTCAAATTAAAATTGTTTTTGAAATAGTAAAGCGGTAAATTAAAAACTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATT:1 + chr3L 23287021 5' - Quasimodo 7346 2 71.23 CAAGGGGGCTTTTAAAAGCTGATGCAGTGAAATGTTGCTTTAAGCAGGATATACATACATTTTATATAAAAAGTGCTGACCCCAGCATCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAG:1 + chr2R 8244138 5' + Gypsy6A_LTR 111 1 52.74 GCCTTGGAAAGAATTATGTTTCCCAATCGCAGAAGCCCGCCAGCAGCAAAGGATCAGCTGCATATGCTGTAACGAACTACGCGTCGATCCTCTATATCTGTGGATTTACGTATGGAATGTTCTCGCAGAACATTCAATGGTTTTTT:1 + chrX 19586328 5' - HB 436 1 48.63 GGGCAACGCAAAACAAAAACAAACAAAAAATAAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTT:1 - chr3R 9249777 5' - 1360 3097 1 78.08 CTTCCAGAAAGTCCGACGCGAGTTGCCATGGCAACGGATCTCGCACAACGACATGAAGCTCTTATTTATGTTTATTGAAACAATAAAAATATTACAGTAATAATACGAATTAAAGTAAAAAATGAAAAAAAAAAACAATAAAATAA:1 + chr3R 9678465 5' + gypsy11 3933 1 51.37 GTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 + chr3R 20137263 5' + Burdock 74 2 71.03 AGCTGTCGCTAGGTGGCGTGTCGAACAAGGACAATGTCGCTGTCGTCGCCTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:1 - chr2R 19543744 5' + jockey 4830 1 65.75 ATAAGATAAAGTCGATGAAGTTAAACACTACATAATAGCTTTTAACTGAAACTCATATCCTGAAATATGTTTGTATGAGTCGTAAGTTTTTTGAAGGGTATGCATTTTAGTTAACAATTTTTATTTTTAACAAATATTTATGGAAT:1 - chr3L 10429617 5' + transib4 462 1 56.16 GCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAG:1 + chr3R 6103602 5' - Tirant 311 2 77.40 TCTCAGTGCTCTTCGTCACAACGTGTGTGTTCATCATTAAGTAAGAAAATATAACTGACGGACTTTTATGTTTTTATAATAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAT:1 + chr4 479874 5' + roo 9006 2 52.74 ATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 20292432 5' - pogo 2033 1 70.42 TAACGGAGAATTCTGGGCAGCGACTGAATGATAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chrX 18365973 5' + jockey 26 1 72.60 GCTGGTTCCGTAAAATTTGTTTGGCTGTCGAAGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAA:1 + chr3R 16535232 5' - Stalker2 393 2 72.60 ATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr3L 10814636 5' + 297 6605 2 68.49 GGTGGCTGTTCAAAAATGGGAACATCGATGATATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chrX 14756803 5' + pogo 22 1 73.29 GTTTTCTATTTGGATACTGCTTTGTCACATTATATGCCACAAAGAAATTAAATTCTCGGAGATTTCTGTTAAAATGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAA:1 - chr2R 8690097 5' - hobo 485 1 52.74 TTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCAT:1 - chr2R 5022797 5' - Gypsy12A_LTR 100 1 65.07 AACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:2 - chr3L 6751756 5' - pogo 2039 1 61.64 GCTCGCCGCATTTTGGCTTCGAGTGAAAATTGCATTGCCATCGATGGACGGTTATAAAATGTCATGATTTTCGAATCTTCCATACCCGGAAAATACAATGACTGTACAGAGTTTTGATCGGATCGAAGTGAGTCGTGAG:1 - chrX 1125918 5' - rover 7142 2 70.50 GACAGGAATAGCAACAATAAATTCCATCCAGATAGGCAATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chr3R 10288932 5' + copia 4897 2 63.70 TTGCAATTAATTTAAGTTGGTAGCTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCG:1 - chr3L 14854781 5' - rover 292 2 61.81 CGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3R 10467990 5' - opus 447 2 51.37 CTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 - chr3L 15322061 5' + Transpac 4982 2 61.64 GAGAAACGAGGTCAGCGGCTGGAACGAAGAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:2 - chrX 8357754 5' + FB 46 1 51.37 GCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr3R 4885327 5' + 1360 36 1 65.79 ATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 17614389 5' - roo 8998 2 68.49 TGGATGGTTTCCGATACCCTTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGGCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCCA:1 - chr3R 3322559 5' - 1360 3331 1 55.48 AACGGGGGGCTTCGTTTCCAGCTCCTCGCAGCATGTTTATTGGCCTGCAGCGGTGTTAACTTTGCCACATTCCCCGAAGACCAAATTTGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGTTTTCGGCCCAAAAATCGTCTTCTAGGACAA:1 - chr2R 22440508 5' + 1360 3198 1 54.79 AAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 - chr2L 14262894 5' + blood 89 2 78.08 GCTGATAAACCACATTATTGCTCCTTAAGTATGCCCATGTATGCTACCTCCCAATACGTGATGAGTGCAACTACCTTATATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATC:1 - chr2L 4360970 5' - blood 7265 2 53.42 ATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 + chr3L 13597778 5' + blood 7077 2 78.81 ACCCTCTGACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCGCTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGAGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chrX 17258337 5' + 297 6592 2 72.80 CGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAA:1 - chr3R 24228949 5' - opus 7418 2 80.14 ACTAGTCTTGTAAATTTCTATAAATATGCCAAAAACCTTTTTGCCACGCTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGCCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTA:1 - chr2L 23066895 5' + INE-1 532 1 40.41 GTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:2 - chr3R 24175759 5' + Burdock 79 2 73.29 CGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr2R 6052698 5' - mdg1 7408 2 50.00 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGACAGGACCAAGCAAACAAACCACACTTGCACAAACACACACTCATGCACACACTAACTTAAGTAGCCACACTCATATTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chrX 7978949 5' + jockey 27 1 71.23 ATTTACTTGGATTAAATTTTCCTCTGCCATACTTGTCACCTAGTACCCTGCTTATGCAAACAATTGTAATCTCCTCTATTCAACGCACACACAATTTACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr2L 12481385 5' + pogo 21 1 68.49 CCGCCGGAAAACCACCTGCCGGTCGGTATGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGCATTTTTGTTAGAGAGCG:1 + chr2L 23189404 5' + 1360 92 1 93.10 TATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 + chr3R 5245583 5' + 1360 75 1 70.55 GTTTAAAGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr3R 15589939 5' + Transpac 4961 2 56.85 TCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTATCCTCAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAGCGCTTAAACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAGTGCCGAGCATGCACCTAGG:1 - chr2R 2745198 5' + Stalker3T 168 1 72.60 CTTCATGGCTGCCGCTCACAACGAATAACAAAGAATATTGTTGCCTACTTCCAGGCGCCTCGCGGAAGGCAGCCAAAGTTTTTTAGCCGCCGCTCGCTGGAGCTCAATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 + chr3R 15030635 5' - jockey 4976 1 67.81 GTTTGCCGCTGCCTGGGGCAATTGGGCAACGCATTATGTCGTAGATTACGGCCTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr3R 12537720 5' + Doc 68 1 62.33 ATGGTGAATGGTGGCTACTGAATGCCCTTTTTAGAGCTTTTAAAATTCATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAA:1 + chr3R 20001584 5' - FB 69 1 73.97 TATTTACTTTAAATCTACACACAGCTTTTGAAATACTAATACCAGAATTATATATGATAAATATTTTTGAGTTTGGGAAGACTCTTACCATTATATTATATTATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3L 15261211 5' + pogo 14 1 71.23 AGCTAAGGCTGAGAAACAATTACAAATTCTTATTTTGTTTTTTATACAACACGCCATCGCGGCCCCAGGAATTTTCTGCGTCTCATCCAGTTCTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTC:1 - chr2R 17093535 5' + R2-element 3465 1 62.33 ATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTA:2 - chr2R 5022794 5' - Gypsy12A_LTR 97 1 63.70 TGATTTTGAGATTTTAGGTATTTCTAAGTAATAAATTAAATTAAAAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCA:1 - chr3R 7649870 5' + Quasimodo 68 2 70.55 GTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 - chr3L 3540213 5' + mdg3 5306 2 60.96 AGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3R 31120295 5' + opus 24 4 63.85 ATCCAAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr2L 2464318 5' - pogo 2086 1 68.18 GTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 + chr2R 14553212 5' - mdg3 206 2 55.86 ATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3L 22529742 5' - roo 9007 2 64.14 AGCTGGATTTCCATCTGGGCCTTAAACTCCAGCAAGCTACTTGCTATGCGCATTTCCATTGTATCAATAATTGCCAATGTTTCGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr2L 8392946 5' - I-element 5318 1 60.27 GAAATTATCAACTCAACGCCTTTGGCAAAAAAGGGAAAAACGGATGAAAGGTAATTTCCAGGAAAACGATTAGAAATTCCTGTCGGTATTCGAGTAAATAAAAGAAAACCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACA:1 + chr2L 16866191 5' - P-element 216 1 72.60 ATTATACCCGGACCTCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAGCAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAAA:1 - chr3L 27670265 5' - I-element 5337 1 55.48 CCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2R 15080136 5' - roo 9036 1 61.64 GGTGGAACAAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 4104118 5' + roo 34 2 61.15 AACCACCACACTGCTCCTCTGCCCCAAATGTTATGCTTCAAAGGCTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 22867514 5' + hobo 34 1 50.83 AAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3L 10814602 5' + 297 6639 2 60.96 ACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGGGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAGCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1 - chr2R 544859 5' - HMS-Beagle 6974 2 70.87 CCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 - chr2L 1449675 5' - opus 426 2 69.18 GATTTTCACTGGCCTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTT:1 - chr3R 3179382 5' - S-element 1270 1 58.90 CAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 - chr3L 24153287 5' + Tabor 47 2 54.11 CGTATCTAAACGCGACAATTGCGCTATATTTGCTTTCTGCTTTTTAGCCGCTTCACTTGTGCCCCCATAGCTCTCAGCCACAGTTACTAAACAAAAGTACAGGAAGGTGCATGCTAAATCTCAACATTCTAACTTTTATAGTTCC:1 - chrX 22478827 5' - INE-1 157 1 70.34 TGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr2R 1277149 5' + Tirant 8173 2 63.70 AAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGT:1 + chr3R 18346608 5' - INE-1 540 1 50.00 GTTTTTTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTTATATTTAATTTTTTAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1 - chrX 11150079 5' + pogo 75 1 69.86 TTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr2R 18123403 5' + 412 7097 2 50.00 AATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr2R 24630109 5' + copia 45 2 52.05 GAGTACTTTGGGGATCTCGAATTTCAGGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACCGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCC:1 - chrX 15089990 5' - P-element 238 1 16.44 CGACATCCTATACACCCAGCGTCCCGGCCGAGGGCACAGAAACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCATCGTAACTCAAACATCGATCACCACGATACTTCCCCCGGGTGCTTACCATAATGAGCCGTCTTGGCTAGCTGATCAACCCGT:1 + chr3L 23054443 5' - R1A1-element 4945 1 56.16 GCTGATGGATAAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGG:1 + chr2L 12283914 5' + Quasimodo 48 2 56.16 CGTCTCCTGCGACTGTGTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGGGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3R 5087150 5' - P-element 2875 1 75.00 AAATCATAATTAAAAGATTTTCAATTTTTTAAAATACTTACCTAAATCGCTGAATATAAGCAATGCCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATACATATACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGCAAATA:1 + chr3L 25303804 5' + 1731 106 1 65.75 ATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 + chr3L 13597764 5' + blood 80 2 73.29 ATGCTTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 + chrX 13061713 5' + mdg3 5270 2 57.89 ATGGGCAAAGTAGGTGCCAGCTAGCATGTTGTCTTGCATGTCGAAATCAGCTCCTATCCTACAGGCTGCTCCATGCTGCTCCTTTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGG:1 + chr3L 20954554 5' - Bari1 1373 1 63.78 ATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGGGATTACTGGGATTAAAGTTTTTGAGATTTCGACGTTTATACGG:1 + chr2L 18177043 5' - INE-1 135 1 78.08 TATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTTACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr3L 13227713 5' + hobo 56 1 53.42 ATAACAAAGCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCC:1 - chr3R 27845600 5' - Stalker4 380 2 63.70 ATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr3R 7424617 5' + 412 7134 2 73.29 ACGAGTGCTTAAGTTATATTAAAACTGTTGATCAAATGGCTGTTTCATTTTCTGGATATAAGATAAAATAGAAAAAAAAAAACAA:1 - chr2R 21487598 5' + gypsy7 5009 2 67.06 CAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTTAATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTT:1 + chr2R 21897908 5' - 412 400 2 78.08 TAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGGTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 - chr2R 5900909 5' - Bari1 1648 1 67.46 AAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr3R 19545323 5' + jockey 66 1 54.79 GTAGAGCACTACGTAGAAGAATATTATATTTTATACAGATGGCATCGTTGTTTGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCT:1 + chr3R 10140685 5' + P-element 2809 1 43.84 TAATGTAGCTCCCCATGGAACCACAGGGATTGCCCTTTGGACAGAATAACACGGGTTGGTGATCTTGGTGTTCTTCTGGACCCTAAACTAAGATTTACCTCTTTTTTCTAGTAGACTACTTTTAATT:1 - chr3L 25725772 5' + Cr1a 3976 1 76.38 GGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 + chr3R 20149718 5' + 1360 86 1 73.97 TATTTATCTTTTTTCACCCGATTTTCCCTTTTTTCCATTAACAAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 - chr3L 10346854 5' + Doc2-element 228 1 90.00 GCCCGAGATCTTAATCGGTTCGACAGGGTTACCCCGGGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 19700831 5' - roo 388 2 71.23 TGACTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chrX 11228531 5' - roo 9033 1 59.59 GGTTTTCCTGCTGCACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chr3L 14969326 5' + P-element 20 1 65.12 CTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2L 17730525 5' + pogo 63 1 63.01 CCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3R 18846509 5' + roo 71 2 65.75 ATACCGGTCGCATTGTTGCAATGGATGCGGTGCGCTTTGGTGCTTTAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - chr2R 10367594 5' - 412 453 2 56.16 GTTGCTCCTTAGCCGATGGGCCTCGTCCACGACCAGCGCCGCCCAATCGATGCACCCGAGAAAGGCTGCGTCCACAGAGATAAACTCGTAGCTGGTCATGTATTAGAAAAGATTATTATATCATCCACATAAA:1 - chr3L 19448478 5' - TLD2_LTR 41 1 73.68 GACAGGCGGAGTCAATCAACGGACAAAAGTTGATTTCGCAATTCGCCATAGCCACAGCCATTCGCCATTTGCAATTCGCAGCTCGCATGTTGCATATAAGGTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 + chrX 14448014 5' + HMS-Beagle 5 2 75.81 CCTAGCGAATATCGTAAATCAGTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 - chr3L 13922350 5' + Tirant 65 2 80.53 GTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:3 - chr2R 21227425 5' - mdg3 162 2 76.03 GTTGAGATTTGACGATTTGTTAATCGTGTAAATAATGCGCTTTCACAATCACTATTGATTTTCCGTGAACACGAACGGATTGCCTTCTTTTCGATCTGAACAGTCAACGCGTCAAGTTGCGAAAGTGCGTCGAAAAATTTTAACTT:1 + chr3L 16046545 5' + gypsy12 292 2 54.11 GAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - chr2R 20362313 5' + diver 5937 2 52.74 GATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chrY 311344 5' + 1360 55 1 56.16 ATAATCCAAAGCAAGGATATATATGTATGTACATCGAATCCCCAAGAGATCCATCTTGTCTGGACACTTTCTGTGTGCCATGCATATACATTTTGATTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTT:1 - chr3R 10775893 5' - Doc 4669 1 74.60 ATAGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr3R 5940523 5' + hobo 73 1 65.75 TGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chrX 3452484 5' + Tirant 8147 2 74.42 CCATTTTTCCATCGAATGCCTATCAACGAGCCCGTCAATTCATGGCAAAATATTGCACAAATGTTAAGAGACAGGGCTGCGGGAATGTGGAAGGGGGGACATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATA:1 - chrX 13357072 5' + jockey 4914 1 65.07 TGGAGGACTGTGCACTCGACTGATTACTGCATAAATGTGACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAA:1 + chr3R 20147832 5' + 1360 271 1 64.38 GGTGTGCGTTTTTGACCGAAGCTCTGGTTGTCCTCTGCCACAGGCAGATACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCCACGC:1 - chr2L 14970029 5' + Tirant 8119 2 78.77 ACACAAACACATGGACAGGCACACGCATACATTAGCTCCACATGGCTCTCTGTCTCTGTGTGTGTATGTATGTATGTTTGTGAATGGGATTTTCTTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTAT:1 - chr2R 10685116 5' - mdg1 17 2 63.01 AAAGGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGC:2 + chr2L 22641320 5' + HMS-Beagle2 6940 2 57.53 CATTCAGCGCTTTCTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGT:2 + chrX 7467930 5' - hopper2 1548 1 56.85 CCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCTC:1 + chr3L 23146453 5' + 1360 42 1 56.55 ATCTCTAAGATAGTTTCGCTTGTCGCCGTGCCGCCTGTGGCATACAGCGTACATTTATAATAGCAGCAGCAACAAGTTGCCCACGAAGCGTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGAC:1 - chr3L 615459 5' + F-element 382 1 75.63 AAACAAACCCTTGGCACAGGTAGTTCGTTTCACTTCCATACGCACACACCTACATATACATAGTGTGCATTGTTTTATTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATA:1 - chrX 5052832 5' - jockey 132 1 53.42 AGGTCGGTGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAGTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 5446133 5' - roo 325 2 78.95 TACGCATCTTGTTATTCTAGTTGACCATTGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCCTACTATTTTTTGTCACATTTACAATGCATGAG:1 + chr2R 1982172 5' - 1360 195 1 57.58 GACTCAGAGATGAGGCGCATAGTCGGGCAACTCGAGTACTTGGTACAGGGAGCCACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACCAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACG:1 - chr3L 21238944 5' - Rt1a 4794 1 62.14 CTGGTACCCTAAGTCTTGATTTAAAAAATAGGATTTGGAATAGGTCCATGATCATGGACCATGACCAACCTATATGGAAATTTGGATTGAAAACATGATTTTTCTTTCGAATAAATATTCTTAATGTTTTTATTTGCTCATTGTTT:1 + chr3R 17339384 5' + looper1 73 1 68.49 TCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chr3R 25521874 5' + blood 77 2 71.13 TGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 9938673 5' - roo 326 2 74.66 ATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGATAGCGGAGAGCGCT:1 + chr3L 25272573 5' + 1360 109 1 76.23 CACACACACAGCGCCGACGGGCGCACGCACACAACGATAGCAAGCGGTTGTATAAATAACCGGCACTTTCGTGCAACCGGCGTCAGTTGAATTCAAAAAGCCAAAGCGAAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCA:1 + chr3L 9381805 5' - Doc2-element 397 1 71.92 TATAACCCACCGCTACCCACCGCCCAGCACCGCCCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr3R 19537430 5' - hopper 1403 2 77.40 GTTATGCTATATAAGAGTGGGTGCAGTGTTTGACAGGAACTGCTTAAGGAAGCCGCACACTTAAGTCGCATTTAATCGCTGAATCCTCAGCAAGGGCAAGCACTCCTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGG:1 - chr2L 8924989 5' + R1A1-element 5166 1 58.16 GATAAAACATGACATTTTAACAAGATCTAAGTAGTCATACTACAAATTACTTCACTGTGCAAAAACGACTTATTCAAACCGTTTTTTACAATAAAGTAAGGTAATAAATCACTAAAAAATTGGCATAGTGCCAAACCAATGTATGG:1 - chr2R 7099743 5' + 1360 3356 1 71.92 ACTTAACTTGTAAACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chr2R 14562069 5' + Burdock 19 2 72.60 TAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 52995 5' + roo 80 2 72.60 AAAATATTCGCAAATTAAATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr3R 22846655 5' + 412 13 2 77.40 GGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 19700867 5' - roo 351 2 63.01 GTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr2R 7223654 5' + blood 7065 2 58.27 ATTTCCATATGCTTCACATACTGGCCATTTTCCATGTTTTAACCGCCTGTTTGTTTGCATTTGCATAGTGCGTGTTTTTTGTTTGCTTTTTTTTTTTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCC:1 - chr2R 20092953 5' + X-element 4426 1 70.80 TTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3R 23507690 5' + 412 7100 2 50.68 CTTATCTACTAACAAGTTCTACTGTCCTAAGTATACCGAAAAATAAACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr2L 14222203 5' + Transpac 18 2 73.97 TCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chrX 3529845 5' - 412 7496 2 51.37 CCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 16887387 5' - roo 325 2 73.29 AGAATGTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAA:1 + chr3R 9983007 5' - HMS-Beagle 176 2 65.07 CTTCTTCAGACCCTGAATTCCCAGTCCCAGAGGATCTCAAAGGAACCACCCGCTGGTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTA:1 + chrX 7545647 5' + 412 398 2 60.56 CAGCGTGTTTTTCTTTTGTACCAGAATGCGCTTATGTGCGTGTGTATGGGTGTGTGTGTGTTCGTGATGATGACCGTCAGGGCGTATAATGCAGCGCTTGTTAGACGCCGCTGTCTGCGTTG:1 - chr3L 3223649 5' - rooA 7459 2 68.85 AGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTGCATGAATAA:1 - chr3L 19339419 5' + Tc1 83 1 67.81 AAGTCTACTTATGTCACGACACGTTTCATTCATGAGTCAGTCACACCTGAGGCAAATGATGTCAGGTCTTTTTAGATATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chr3R 27503143 5' - hobo 2899 1 56.85 GACAAAAAAATCTGCCAAGAAAATTATTAAAGACAGTAAGGAAGAGTCAGGTGAAGACCAGGAACACCAAGAGCTAAATATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCA:1 + chr3L 4314498 5' + roo 151 2 46.58 ACAGATTAGATTAGTCATGTAACTTCACAATACTCAGGCTGAATTCTTGTCGAATCCGAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2L 3006082 5' - pogo 2087 1 60.40 GATATGTTAAGCATTGAAATCGTGTCCTGTGTTCCTTTGACTAGTACACGTACACTGCGCGTCATCAGATTAGCGCCTCCCTGTATGCCACCGTTTCATCTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCT:1 + chr2R 5354898 5' - I-element 271 1 73.29 TCACAAAAATTGGGTTATTCATTGTTGCATAGATAAAATATTTTTATTTAAGGTTTCTCTTTTTCAAATAATTATATTTTTGCGTGGGAAAAGTTGTCCAGACAAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCT:1 - chr2L 8001375 5' + R1A1-element 5114 1 71.23 TAAACCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3L 9649168 5' + roo 74 2 72.03 AAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTG:1 - chr2R 4939193 5' - 1360 3368 1 32.37 AAAAAAAAGATGAGAGAATGGGGTGGAACAAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2L 4104139 5' + roo 20 2 72.60 GTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 + chrX 4589421 5' + Burdock 65 2 67.12 GATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAAT:1 + chr3L 19397051 5' + F-element 85 1 75.76 GCCGATATGCTCGAGCGATATATCGAGTGCCCAGTAGTTATCAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGCATTCTGAG:1 - chr3R 9563680 5' - P-element 2814 1 36.55 GACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 + chr3L 22354439 5' + Doc 83 1 67.81 CTCAAAGAGGAGATGATTGCCTATAAAAAAGAAATTCTAATTATAATTTAACGCAAATTCGTTGTCTGCGCCATCGACAATATCCTTTGCATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 - chr3R 10498938 5' - 297 6951 2 69.18 GATATGAGAGATGAACGTTGAAGGACTTGACGCGACTTGATTATAATTAGACGCTCCCACTTCCCCCCGTTCCCACCACATTTGTATTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 9993328 5' - hobo 2911 1 66.20 AGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAAC:1 + chrX 18239370 5' + jockey 4577 1 67.12 GTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAA:1 - chr2R 17182783 5' + jockey 4617 1 64.34 CATAAATGACGTCATGATTTAATACAAATAGCATTCTAATAATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCAACGACCAGCC:1 - chrY 64271 5' + gypsy10 18 2 71.92 GCCCACCTTTCCACTTTCCACTTTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTGGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3R 5765466 5' + opus 140 4 67.12 TTCAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2L 11668709 5' - mdg1 7402 2 56.16 GCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1 - chr3R 24175756 5' + Burdock 6217 2 75.17 TATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 + chr2R 14385570 5' + jockey 76 1 62.33 GCCTAATATAAGAAAATAGATTAAATTTCCAATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTT:1 - chr3L 10076419 5' + X-element 44 1 56.16 AAGAGAAAACAAATTTTGAACAACTTTATCTATATATTTGTTTGTATTTAATCTATTTCGAGTCATCTATGATAACTAAAATATTCCTTAAATAATGTAAAATAACTATATTAAATGTTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATATAAT:1 + chr3R 23304049 5' - Cr1a 4282 1 56.85 ACGGAGAGGCATCTGCAGGGACCCGGGGACTCGTTTCTCAGCGATGTCTATGAGGAGAGTATTTCCACCAAAACACAGGGATTGATTGTCCTGCCCAAAGTCATAACTTATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTGAATAATTTTAG:1 + chr2L 16902694 5' - Tc1-2 1550 1 70.55 CTTGCTGTCGACCTTCTTTTACTGCGTGTACCTTACCTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 - chr3L 15371442 5' - Transpac 5219 2 78.77 TGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chr2L 14262937 5' + blood 7057 2 49.32 CTTTGCTCTGCTTCCGCCTTTCGTGTGGCAAATGTGAGGGGGGCTACACTGTGAAAAAAGTGCACATTTTCAAACAAGCAAATGAGGGAAATAATCCGCATATCTTCTTTAATTATCATATATCTGAAACATAATTATTAAAGATC:1 - chrX 4983541 5' + Cr1a 106 1 69.86 CATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAG:1 - chr2L 11867356 5' - BS 4951 1 69.86 TCTGAATCGATCCCAAAATGACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 - chr2L 1074034 5' - Tirant 8466 2 57.53 GGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr2L 2519891 5' - roo 8998 2 69.86 CAAACAAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chrX 10571322 5' + Doc 60 1 57.53 AGTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 + chr3L 1387097 5' + mdg3 5284 2 62.33 ACAAAACTGTTCACGATGGATTTCGTTTTTTATTTTTTGTTATTTTTTTATTCTTTGCTTTTGCTGTTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGACGGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCG:1 + chr3L 18185478 5' + blood 441 1 52.74 AAGGATGATACGAACATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCTTATGCATATGTGATCTATTTTGCTTTCTTATTGCTTTATTATTGCAATTT:1 - chr2L 6074080 5' + BS 53 1 55.86 ATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGCTCGATTCGTGAGA:1 - chr3L 23940541 5' - Cr1a 4384 1 60.96 GAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGTCACTATGCAG:1 - chr3L 27391408 5' - 1360 3352 1 55.17 CGTTGTCCATGAGCTTCTTGATCAACACTATTGCGGCTACCACGAAGGCAATTTTGGACAGGATCAGAGCCTTGAGATGTATTAACCGAACATCCGCTTAAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAAGG:1 + chr3R 6220230 5' - mariner2 159 1 62.10 TGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTTCTATG:1 + chr2R 10367468 5' + 412 57 2 55.48 GGTAGACGGACTCTTCATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chrX 14385115 5' + blood 25 2 68.49 TTCACAAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr3L 20925843 5' - Transpac 241 2 65.75 AAAATGGGGAGTTGACCAGGATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAGATGACAACTAACA:1 - chr3R 9958715 5' - opus 442 2 60.84 GGAGGTGCAGGTGGCACGGTGAACAGCACCAACGAAATCGTCTCTATGTGGGCAACCTGACCAATGACATCACCGACGATCAGCTGCGCGAGATGTTCAAGCCATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2R 4730846 5' + roo 8682 2 50.00 GCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAGGCAGAAATGGTT:1 + chr3R 7424568 5' - 412 7453 2 79.45 AGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGT:2 - chr2R 9072943 5' + Burdock 70 2 67.12 ATTCATTGTGTCCTGGCTGAAAATCATTTAACAAAATAATATGCGTTTGGGTAATACATTACAGAACAGAAAGTAGTTCGAACTTATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATT:1 + chrX 13865851 5' + Doc 170 1 59.59 TGTATAGTTGTTTGGCCAGCATGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 - chr3L 21630460 5' - Burdock 6372 2 72.60 CTGAATACTGACCACTGTTGAAAGCAAATTGCTGCAACATACAAGACATTGTGTTCCAACTAAAGATTTTTGGTGCAACATCGCGACATAAATTTGAAATTAAGTTTATAAGACCTTTTATCCATAATCAATTAAATAAATTAATT:1 - chr2L 15118203 5' + jockey2 3377 1 78.08 CGCTTCCATTCATATCCAACGCATTTGTCGCAATTTTTGCTTTTAACGAGGCAAATTGTCTGGTCCAAAAGTTTAGCTCGTTTTCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCG:1 - chrX 6411923 5' + R1A1-element 93 1 59.59 GATTTATCCAAAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chr3L 20747048 5' + Burdock 6146 2 77.86 GGATCACCCTACTATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr3R 27786554 5' - Tirant 336 2 63.01 ACTGCGGATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGT:1 - chr2R 10453499 5' + mdg3 5263 1 63.01 TATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr3R 19545332 5' + jockey 75 1 60.96 GGAGGCACACCTCGTTCGATCCTAAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - chr3R 9983139 5' + HMS-Beagle 22 2 70.55 ACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 + chrX 3529735 5' + 412 63 2 60.27 AATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 15030749 5' + jockey 62 1 65.00 GGTAGTATTCTGGTTTTCCTGCTGCACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3L 14969337 5' + P-element 26 1 65.07 GAAAAGTGAATAGCTTGCTGTGACTAGAAGTATTATTTATTGGATACAAAAATATATTAAATTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTGACCACTTGAG:1 + chr2L 7069520 5' - Stalker2 7458 2 58.22 CCTAAAGAAACTTTTTTCCAATTAATGTTAATGCTTTGTAATGTAATATAGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTG:1 - chr2R 22366496 5' - BS 4700 1 65.75 CTTCGGCATAGAGTTTTTACCTTACGTAGCAATGACTCTTTCGGGGTCATCTAATTATATAATGCAGCGATTGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATAACCG:1 - chr3L 23454762 5' - rooA 173 2 68.49 GTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 - chrX 14908477 5' + blood 58 2 55.48 CGAAAAACTTATCAAAAACTTTCACGTTCATCATTTGCAAATATTATGAGTTTCCATGCGAGACACACATTCGCAAATATAGGAATTTCCGCGCATAAGGAAGTTTTGGGCGGTTTGTGGACGTTAGAGTGGACAT:1 - chr3L 6636653 5' - INE-1 216 1 74.26 AGACCACAGTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATA:1 - chr2R 14562296 5' - Burdock 6383 2 44.52 ATCGTTCACTTTTTAATTGATTTGATTTATCCATTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 + chr3R 7884509 5' + jockey 4792 1 62.33 CAGGCAGATACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chr2L 14969989 5' + Tirant 8158 2 51.72 GTTATTACTTTGATAAGTACTTTCAAAGTGATGCGCACTAACCTAATTATTGTATTGCTATTCCTTTCAACCCTTGAGTGTTTTTTATCTTTTGCTGAATCACAAACAATTTACATCACTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTG:1 - chr3R 14708608 5' + 17.6 7267 2 77.40 TTCAAGTATTATCTGAGAGTTTTGTGTTGCGATACCTATTGAATTTAATAAATTTAAATAAGATTATCTTTTTATGCCAACTCTATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 21421158 5' + roo 8700 2 60.27 AGACTAATTGATTTTTATTGGTAAAATGCTCTGTATTTGGTATTGAAATATTGCTTAGACATTAACGATGGCTGAAAAACTTTGCAGGAAAATATCATAATAGAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2L 16941996 5' - mdg1 7441 2 72.60 CAATTAACATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr2R 20913209 5' - 1360 3327 1 59.59 GGCAAGTGCAGGCGTATAACGTGAATCTAAAACATTTCCTGAACGAGCGAGCGAGACGGCGGTAATTAACAGACAACAATTTTAATTATTGAGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAA:1 - chr3L 18044561 5' - gypsy4 6773 2 56.85 GTAACGGTTGAATTTAAATGCAAAATTTAAATGGAAACCTAACAGGCCGTAAACGCTTTATATTCAATCCAAAAATTTTGTTTTAGTTTTGGAATTTATTACTTTATATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:2 - chr3R 12559795 5' + mdg3 5268 2 75.34 GAGAGCGAAAGAAAATAAATATTCCCAAGTCATAAACAAGGGCGTTTGAATATCGACAAAAAAAAAGGAAAAAGAGG:1 + chr3L 14805216 5' + Bica 341 1 75.32 GAAAGTTTCTGTGGCCTGAGTGTCGTGAGGAAAAGGGAGGGAAAAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGTGCAGTGTTTATAAATATAACCGCCTGTGTTACTGTTAATTTTCATT:1 - chr3R 17316165 5' - 3S18 320 2 67.44 AGCACTACCAGTATTAATGTTAGTCTAAGATAAAATAATTAAACAATTTTTATTTCCAATTCAATTCCTTTTTCATATTATTAGTAATTTCTTATTTTTTATATTGTCTTTATATTGTCACTGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:1 + chr2L 22713297 5' + Ivk 11 1 77.40 AATTGCCAAGCATACCTCAATTAAATACATTTGCCTGTTGTTTAATTTTGCCATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTA:1 - chr3L 18468431 5' - jockey 4929 1 68.49 CCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3R 8542609 5' - roo 8981 2 77.40 GTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAACATATACACATAACCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGA:1 + chr3L 20785538 5' + P-element 65 1 31.51 TAATGGATATTGGCTTCGAACGCACTCGGAGAAAAGTCCCTTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3R 26765066 5' + mdg3 41 2 55.48 ATAGTCCATCAACCACATTCTCCTCCTATTCTTTTCAATCCCAAAGTGATCTTTGTGCTCGCCGTCGTGGTAGCCATGGCCGGAAATCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATATATACACATGAACTGTATGT:1 - chr3R 18726284 5' + 1731 85 1 57.53 ATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTG:1 - chr3R 14088627 5' - 1360 3301 1 78.77 CAATTTAGTGTGTGCGTACGTAAAAGTTTGAACTGCCATAACTCAAATTTCTGCATTACACAAAATTAGGTTTAACATTCCTAAATAATTTATAATCCTGTTATATTTTTGAGTCGAACTGATGTCCCGTCAGTTGACTAAGAACA:1 - chr3R 9642233 5' - 297 356 2 67.12 TAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTG:1 + chr2R 19904028 5' + Doc 4465 1 58.73 CCATCTTATTGAGCATACAGCATAGGTTTAGAGCACGGAGAAGATGAACGAATTTCTTTGTGTCCTTTCACTTTAGTGCTGACTGATTCAAAGTGAGTCCTGGCTATAAATTTGATTTGCATTTAGTTCGTAAGATACCAGAATTC:1 + chr3R 9164305 5' + gypsy10 285 2 71.23 CCTGGCAGGCAGCTGCTCCTCTGCTGGGAAGCTGGGAGCGGGCCGAGAAGTATGCCAGAGATTACTTGCTTAACATTAAGCTGGGCTTCCATGGCTGGATTGACTGGAACATCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGC:1 + chr3R 23702036 5' + X-element 385 1 79.43 CATAAATTTGCAGACAGCCAGCCGACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr3L 12250923 5' + flea 4771 2 75.34 GCTGTGGCAAGGAATAATATCAGCACATCCTTCAGCTGGCTGTGAAAACATGCAAAGCCCACAAGTGGTAATCCGCCTATATATTCCATATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 - chr3R 12540266 5' + flea 4783 2 66.44 GGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3L 22221211 5' + 412 74 2 72.39 ACCAAAGATCTTTGAAGACTGTTGCGATAAATTAACTATATTTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACGTGCGGCAACAC:1 - chr2R 22798700 5' - hobo 2861 1 68.49 ATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2L 8397173 5' - roo 8987 2 75.34 CACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCATTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAA:1 - chr2R 16312090 5' + G6 2018 1 73.29 TGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAG:1 - chr2L 22684606 5' + transib3 65 1 52.74 CCTGAATAATAAGAAACATACATGGATACAATAAACAGAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCT:1 - chr3R 3916372 5' + 1360 3225 1 73.97 AAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr2L 4416031 5' + jockey 56 1 53.42 GAAAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chrX 13651595 5' + 297 32 2 62.33 AATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:2 + chr3L 20747076 5' + Burdock 44 2 55.48 CAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGC:1 + chr2R 2949039 5' - 17.6 7345 2 73.97 TTTCGTAGCAAAGGATCACCCTACTATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGGATGAAGGTTTTTAAGTT:1 + chr3R 27786542 5' - Tirant 348 2 53.42 TCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr3R 29708918 5' + blood 15 2 69.18 ATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr2R 1277147 5' + Tirant 8175 2 65.07 TCCACAAGAGTGCTCTTTCCTTTTCCATTGCATTTTAGTTTTGCCGTTGGGAAATTCTTCTAATTGGCAAAAACCAGGAGTTTGAGCGATTCAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chrX 22591395 5' - copia 225 1 67.12 TCCTGAAGCTTCGTGCTCTGCGCCCAGCAAAAGAACCCGATGGTTTCAGTTCGCCAGGAGCTCCAAAAATCGAAGGAAACGATTGCACTGTGATGAAGATGAGGATGTTAATAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGCGCCGC:1 - chr3R 12077285 5' - 17.6 7114 2 75.69 AGGATCGGCATTGAACTGATTGATGGAACTGAGGAGCAAGCAAAAGTGTACGTCTCATTTGGATTTGATCGTCTTCTATATGATATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACT:1 - chrX 6235872 5' + 412 7169 2 57.53 TTTGTAGACCAGCGCTGCGAGAAGGTGGAGCGCGAATTGGAGTACGTTACCTTCTCTAATCAGCGGCTATTGGCTAAAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTCCCGAATCAGTTATTCCCACCAGAG:1 + chr2L 18710791 5' + Quasimodo 200 2 53.85 ATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 - chr3R 5087073 5' - P-element 2796 1 21.13 ACCCCCATCCACATCCCCATCCCCATCCCCATTCCCTGCGAATTTCCCCGGCACACGCACCTTTACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr2L 16919534 5' + roo 8719 2 56.16 GTGAGATTTTAATCTGTTCAACGACGTGTACATACAATAAATAAAATAGATGCTTTTGTAAAGAGCAAATTTTATTTTAAAATTCCGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 8022288 5' - roo 407 1 81.51 CAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr3R 10778627 5' + mdg3 5294 2 57.53 CGTTGTCTGCGCCATCGACAATATCCTTTGCATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:1 - chr3R 10498879 5' - 297 311 2 78.77 ATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr2L 17162844 5' - blood 7309 2 71.72 CTCGTTACGCACTTTTTGTCCATCGAAACAAAAAGTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16750164 5' + Doc2-element 219 2 93.62 GTTAGTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 23146439 5' + 1360 29 1 65.75 TTTGCACATCTATGTATATCTAACTCTTTGACTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGTGGAACTCTACTATACCTTTTTTGACCTGCTAAATATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3L 22519122 5' + pogo 29 1 65.75 TTTCAATATTCAAAACAGTTGGTCCCATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 15590668 5' + roo 55 2 56.85 GGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:2 + chr3L 9426691 5' - P-element 2808 1 29.66 TTAGCCGGTTTTCAACAGTCCACCTGCATATCAGCCATCCGAATTTGAATCCAAAAATATATGCCAGAATTTCTGGACGACTGCTGCGAGTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3R 9563559 5' + P-element 25 1 67.12 TCGCTAAAGTAACTACTTGGCGCATTATCGGTTGTGGTACTAATTTTTATTTGTTTGTCTGTTCTGGTTTTGATTTTGGTTTTGTGTGGCTGTGGCAGGTGGGTTTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr3R 24693705 5' + hobo 16 1 73.29 CATTAGAGCATAAATCCCAAACGAATGAGTAAAGTTATTAATTTTCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGG:1 - chr3R 29443723 5' - Doc 448 1 63.41 GTCTACACAAATTTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 5446063 5' - roo 9046 1 67.81 AAAATCAAATCTAAAAAATTGCATTTTTTACATAAATATTTTAATATTCAACACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTT:1 - chr2R 5079283 5' + flea 4820 1 61.64 ATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr3R 6103667 5' + Tirant 8169 2 64.44 GCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 4464137 5' - 1360 3362 1 58.47 ATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCCGGGAGACGGCAAC:1 - chr2L 14969962 5' + Tirant 54 2 59.50 GTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGGGCTTATC:1 + chr2R 16513149 5' + jockey 96 1 76.71 GCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:2 - chrX 2873433 5' - roo 324 2 74.66 GCAATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 29708909 5' + blood 7017 2 75.34 CAAGTTAGCTTCTTTAAGAACACACAGATATTAAATTCGTCGAGATAACTTCACCATTTAGCACATCTATCAAACTGTTGCTTCTGCGCTAACTTTTCGTTCATTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTT:1 + chr3L 3496207 5' - R1A1-element 106 1 71.03 CGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATC:1 - chr3R 10778765 5' - mdg3 203 2 56.16 AGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGA:1 + chr3R 10973214 5' + jockey 83 1 65.75 AAATAATTCTTTAATATATTTATCACCTTTTAGGGGCTGTATGCGTTCATATCCTTCAAATTGCCTTATTTAAATGTATTATTTATGAAATAATAAAAGAATTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2L 21596446 5' + blood 18 2 73.97 AAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 - chrX 22517698 5' - 1360 3333 1 57.53 TTTACCTTGTGCGGTTTTTTTCACGTGGCGCAGAGTGAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATG:1 + chrX 21474368 5' + 1731 33 2 80.14 AGGCGAGCAAAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAGCACAAACTTGGCCAATAACTTAACTTGGCTCAAATGCTCCCCCCTGCCACCATGCACCCCCTACACACACACACACACACACACACATATCA:1 + chr2L 7094201 5' + accord 7031 2 69.60 TGGAAATTAAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr3R 12578088 5' + jockey 4710 1 56.85 GGTTATTCCATATTCCGTTGTGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1 - chr2R 11656152 5' + HMS-Beagle 20 2 71.72 ATTCCACATTCACTTGATTCACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 10032777 5' + hobo 25 1 67.12 TACACATATAAATCGTTTTTGACAAATTTCCTCTTTAAAGTGCGGACACACGCACTCAACAATCATTGCCTTCATTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTAGAGAGA:1 - chr3L 23318647 5' - 1360 89 1 74.66 GTATGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTT:3 - chr2L 17162861 5' - blood 7325 1 60.27 GTTACTTTTATTTACATAAAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATGTATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCA:1 - chr2L 21570288 5' + Dm88 39 2 61.64 TCCAAGTAGATGGAGCGATGAATTTTGCCAGCGCAAAATGCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:1 + chr3L 14854633 5' + rover 6970 2 73.29 TACTTTTATTTTTAACGTCAGAGTGACCAACTGGTCTTTCCTAAAAATAATTACACTGACATGTTAAATAATAGCCTATTTCCAAGTAGGTTCACCAGAAACGATATACCCCTTATTTTAAATCATTCTAGATCTAACTATGAGTT:1 - chr3L 27279332 5' + Cr1a 4155 1 57.53 ATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 - chr3R 12578072 5' + jockey 4726 1 54.11 GAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTC:1 - chr2R 20362284 5' + diver 78 2 72.60 AGTTGTGTAAATCGCAAAATAACGAGCGCACTCATTAGGGAATTGTTTCTTTTAGTTTGTGTATTCTTATTCAGAAACCACTTATTGGTTGCTCTGGCCGTACATTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAAGATGGAAACCG:1 + chr2R 8496591 5' + Cr1a 423 1 71.23 GCTGGCATTTTGTGATTTCATTATATTGTATTTTACGGCGCCTTAAAGCCCCATTTTACGAGCCTTATCTATGGTGAGCATATCGCAAAAGACCACCAACACTTACATGAAATCTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAGCGCTTAAA:1 + chr3R 17207521 5' + Stalker3T 123 1 59.59 GTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr2R 15062292 5' + blood 7051 2 54.79 CATTCAAGTGCACAAACTGGGGGATACCATTACACAGTCAATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr2L 10832381 5' + Doc 26 1 70.55 ACGGTGGTTGTTATTCGCACTCATGAGTCGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr3L 16180826 5' - Transpac 298 2 77.40 CAGTCACGGTCACTACTCCAGAGGCTCCAGTGTCCACTACTCCTGAGGCTCCAGTGACCACTACTCCTGTAGCTCCATCCACTACTGAAGCTCCAGTGCCCACTACTCCTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 - chr2R 18051120 5' - mdg1 7449 2 75.34 ATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAAT:1 - chr3L 10856788 5' + P-element 90 1 23.97 GAACGCAGATATGATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3R 24229017 5' - opus 7486 2 75.34 CGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAA:1 + chr3R 20147891 5' + 1360 329 1 73.29 ATATTTGCATCAGTTTTCATTGGCATTTATACCCAGTAGCCCATTCAAAAAACATCCGTGATTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAG:1 + chr2L 19370448 5' - Bari1 1628 1 57.53 AGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr3R 15649905 5' + blood 7034 2 69.86 AACGGTATAATTAAATGTGATTTATGTAGCTCAAATTTCCCCGCCACAGAGACAAGTGAATTTTTCGGGTTAGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCA:1 - chr2R 12789206 5' + baggins 5068 1 50.68 CGCCAACGACGGCGATGGAGGACCGTGGCGAATAAGGTAAACGGAAAAGTTGAAGGTAGTATCCGCTCCTTTACAGAGAGAAGAGCTTCTGCTCCGATTTGGGTTCTTTATTTTAACGCCCAATGTGTGCTGATGTTGGGTTCAGC:1 - chr3R 13569371 5' - Stalker 309 4 52.74 CCAGCAGTTCTGTGCTTTGCCTGGGCTGTTGGCTGTTGAAATAATATTTGCGATCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATAT:1 + chr2R 20362183 5' - diver 181 2 56.16 ACGAGAATTTAATGTGCCGTGCGTATTTGATAACTGACCGCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 19545280 5' + jockey 22 1 75.34 AAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:2 - chrX 9816463 5' + jockey 82 1 66.44 ATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTGTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGGATAGTGAAAGT:1 - chr2L 10832336 5' + Doc 71 1 62.33 CGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 + chr3L 16180872 5' - Transpac 252 2 58.22 GATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 + chrX 14385173 5' + blood 81 2 72.22 CAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAAC:1 - chr3R 24175771 5' + Burdock 6203 2 65.07 AATTTGTAGTCCAACATTTTACCTCAATAAAAGCGGCTTTTATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr2L 9010543 5' - 1360 3351 1 60.27 TCGCCTCTCGTTAAAGGCAATGAATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 9164983 5' + 412 7068 2 73.97 CGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGGAGAGACCGTTGGGTCCAAAAGATCGTTG:1 + chr3L 16180854 5' - Transpac 5189 2 58.22 TTTGTTACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3L 11665870 5' - pogo 2070 1 47.95 TTTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr3L 3979716 5' + opus 7023 2 71.92 GGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 28008227 5' + hobo 51 1 53.42 TGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGT:1 + chr2R 10478662 5' - invader4 277 2 51.37 TTATAATACTCGTAGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr3L 21630291 5' + Burdock 36 2 60.96 GATACATACGTATGTGGGTGTTTGTGGGTAAGTGAAATGTTTTGTTCGAGCATAGTCGGGGAATACAACAACCGACATGCCATACAGACAGTGGACATGCCTTGTTCTTCACATGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGT:1 - chr3L 9569134 5' - jockey 495 1 77.40 CCTCAAGAACATCGAGCAGGTGGAGATCGCCTTCCACATGGGCACGCCCTTTCTGCCATTCCAGCAGGTGAGCTGAGCACATTTAGTTAGCACCGATAGCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTC:1 - chrX 19490252 5' - P-element 48 1 71.23 GCTCTGATTGTGCTGCAAAATCGGAGACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 - chr3L 16181013 5' + Transpac 25 2 68.49 AGTTGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1 + chrX 12893342 5' - Bari1 1643 1 61.64 ATGTGACCGCCGCTAGATGGCGCGTATGCGCAATCTTTGAATCTATCGATTTTCTACTTATGTAAGTATGTAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chrX 21605788 5' + P-element 52 1 50.00 CATTCTCTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3R 23623955 5' + roo 59 2 62.24 CTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 22481223 5' - roo 9016 2 58.90 ATCAATTGAAGAGGAGCACACTGAAGGCCCCATACTCTCTGTCTCTCGGGTCTTGCTGGCCATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr3L 13721974 5' - blood 360 2 73.29 CAGTGTTACCATATGGAATAACACTGCTAATTCAATAAATAATCGATAAGTTTCACAAAAAATCGCGTTATTTAAACTGAACTATTTGCTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 14663179 5' - pogo 2072 1 65.75 GTCTCGACAAACAAGCTAGAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:3 + chr3R 11121664 5' + copia 27 2 64.38 CATAGATAGGGTTGAAATATATCCTTTAAGTGCCCCCTTTCCTTGTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTG:1 + chr2L 6406482 5' + transib2 72 1 64.38 ATGCAAGCAGTATAGTACGAGTAGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chrX 12893323 5' - Bari1 1662 1 54.79 ATGGATGAACGGGACGCAGCAGGTCTTCCCATCCATTTGTTGGCATTCCACTACTCCAGCTCTTACCGGGCCGTATTAGGGCCAAAAGAATGCACTCGGTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAG:1 + chr3R 10283631 5' - Doc 458 1 62.07 CCGCTTTGTATTGGCGACAGCGCAACTGGGCCCCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr2R 11493940 5' + accord2 223 1 81.54 GTCAAGTGTTAAATCAAAGTGACTAACGACTATGTTTATAGATTTTGCCCTCCGACTTTTCGCAAAATATCCCCAGGTATTCGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2R 5992267 5' - pogo 2089 1 72.95 AAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chrX 10571330 5' + Doc 68 1 63.01 ACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:2 + chr2R 6984380 5' + Doc 28 1 67.12 AGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:2 - chr3R 8402645 5' - mdg1 7402 2 55.48 AAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 - chr3R 14049457 5' - transib2 2788 1 59.59 TACACATTAATCTGCTGGCTAATGGATATTGGCTTCGAACGCACTCGGAGAAAAGTCCCTTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr3R 26765047 5' + mdg3 17 2 70.92 AACATAAATTGGTACTCCCACATATCTTGGCATTGCTACACATAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTA:1 - chr2R 16312173 5' + G6 1935 1 74.66 GACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTA:1 - chr2R 13574847 5' - diver 6047 2 60.96 GAGCCAGTTCGTCTAATAGTTTCGCATGGTACTCATAACCCGCCTGAGTTTTAAGGTAATTGGCACAGGATTTAAGGCAGCCCAGAAAGTAATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGG:1 + chr3R 25788801 5' - 297 171 2 54.11 AAAAACAGAAGACAGGGTTTAAGGATTTCTGAAATGCATTCTTCTTCGGCGTAGATGTTCCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr3L 21942404 5' + hobo 61 1 58.22 AAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 9938715 5' - roo 9032 1 58.90 TCGGTCCGCATTCTAATATTTTAGTGCCTTGTTTATTTGCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3R 25409588 5' + jockey 60 1 51.37 AATGCAGCACGAGGTCAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chrX 3452394 5' - Tirant 8470 2 60.96 ATCGAAACTATGGCGCAGCTTCTCGATGAAGCCATCCTGCAAACATTAAATAGAAATTTTGGAATTGCAATTACATAAATATTATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTT:1 - chrX 7329332 5' - Bari1 1675 1 62.07 TTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2L 16685403 5' - P-element 2829 1 45.52 CTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr2L 12261158 5' + jockey 71 1 58.90 ACAGCTGATGCTAAAATCGTCACTTAGAAATGATGTGGTAAACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr2L 17638809 5' + blood 36 2 56.16 GAATACTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2L 20984252 5' + blood 7025 2 73.29 TATCAGGGGGTGGCGGGGGGACTTTCCCCTCAAAACTCTGGGCCTTTCCTCCGGGGAAAAATTTTCACAAAAGAAAAAAAAAAAGGAA:1 + chrX 13332009 5' + Doc2-element 244 2 72.73 ATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAA:1 + chr2L 12283930 5' + Quasimodo 64 2 63.01 TGCTATGAAATGGCACGTTCACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 9241946 5' + roo 17 2 73.97 GATTCAAAGTGAAAATGTAAAAGTTCTGGAATGGCCACCATACTCCCCAGACCTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 + chr2L 21400091 5' - pogo 2037 1 63.70 CTATCTATTAAAAACTGTCCGCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 12355421 5' + hobo 13 1 75.34 GTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGGATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 + chr2R 8305214 5' + blood 7075 2 62.24 TTAAGACTGAGATGAGTTGCATACTAATTCCCCCAAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3L 20076721 5' + roo 20 2 71.92 TACGGGTCACACGATGTGCCAGGAGCTCTACGGGGATCCGTACAGTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTCCTTCAGCAGGACCTCTTACAGGAATCCTTGTCGTCGTCGTCGTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAG:1 + chr2L 16371525 5' + jockey 4787 1 76.71 AGTGAGTGGGAAAGGTTTCTGCACACTGCTTATAAAATAAAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:1 + chr2L 8772680 5' - Tabor 7308 2 74.66 GAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 - chr3R 5940513 5' + hobo 83 1 72.60 GACCTATAACATATCTGTACAACACCCTCCATTATTATGAGCGAATCTTACGAGACCGCCCTGCGCTAAAGAAGAAACTTGTAAGATTTGTTATGAATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGC:1 + chr2R 22892569 5' - pogo 2080 1 71.23 TCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGAGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 + chr2R 14562098 5' + Burdock 6183 2 53.10 GAAAAATACTTTTGTAGTTTGACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 + chr3L 5183651 5' + copia 16 2 74.66 ATATAGTATACTCTTCATACATTTTTCCATAATTACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr2R 8793963 5' - Transpac 5169 2 73.17 ACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr2R 14562091 5' + Burdock 41 2 57.53 ATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCT:1 + chr3L 23456271 5' - Gypsy6A_LTR 279 1 63.11 GTTGCCGGTATTTGGTAAGATTGTGTGCGGAAGAGGGACTTAAAGCGGCCGGCATTTGACTTGACTCCTTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGA:1 - chr2L 14189410 5' + Transpac 5143 2 52.74 GGATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTA:1 - chr2R 10453494 5' + mdg3 5265 1 60.84 TGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCACGCCACTCGCACTCTACGTTCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3R 24693555 5' - hobo 2900 1 55.73 ATTTAAAATGCTCTTGTGTATATATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 + chr3R 11526742 5' - pogo 2064 1 56.16 ACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 - chr3R 25521894 5' + blood 61 2 58.22 GCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 - chr3R 9163926 5' + hobo 83 1 77.40 TGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr2R 18123439 5' + 412 7132 2 71.72 CGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCG:1 - chr3L 21093233 5' + Ivk 62 1 60.96 GCCTGGGCGTAGAGAGGCATTTGTATTTGCGTTTCTGCTTAAATATGCCGCTGAAATCATTTTTCAGACGAGTGTGAGGTGTGGTAAATAGTTTTGGGCGGTTTAAGGGCGTTAGATTGACGGACATGGCTAGATCGACTCGG:1 - chr3L 23289814 5' - INE-1 107 1 67.83 TGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTATTATGCGTGTTCCTATTTATG:1 - chr2L 23295870 5' + micropia 67 2 63.19 TATAGCAGAGCCACAAAAAAATTCCAACTGATCTTAGGTTCCGTGTCGAGGTATTCTAAAGTGAGTTATTTTGTTGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCGAGGCACC:1 + chr2L 5635060 5' - hobo 2894 1 47.26 ACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 8542710 5' + roo 8691 2 60.96 GTCTCCTCCCAATCGAAAGCCAAACAAATCGGAAATCGATCGCCCTCTGCCTTTTGTTTTTCCAAGTTTTACATGCCCGCGCTAACGAATTTATCAATCAGCGAAACAACAACAAGCATTTGTTTTTATTTTTTTCTTTTTTT:1 - chr3R 31418635 5' - Rt1a 5087 5 76.92 TAGCACATATACATCATAAGAGCGGAACTAGATAGTCTACAATGATGCAAGAGACCGGCAATCAAATGGTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACCAACACTTACATGAAATC:1 - chr2R 11142949 5' + Stalker3T 91 1 52.74 TTCTGTGGCATACTTTTTTGGTTATTAATGTTAAAGTTTTTGTTGCTGTTTATGTTCGGTTGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACT:1 - chr2R 9668079 5' + jockey 4731 1 58.22 CTCACTTTTAATTTCTTCAATTTTATTTCATTTCCATTACCTATGCCATCACGTATTATTTTAATGTCTTTAGAATCTGTAAGCTTAAACTTAACCTTCTATCTATTATAGTTCTTGAGATATCGCTATTGGTCCTGATCAAGAAT:1 + chrX 20915530 5' - INE-1 86 1 62.33 CCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 - chr3R 12363247 5' + jockey 87 1 68.49 TGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr3R 5940519 5' + hobo 77 1 68.49 CGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 - chr2L 16685358 5' - P-element 2783 1 14.38 AAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGG:1 - chr3R 6103683 5' + Tirant 8164 2 56.16 TAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr3L 19396993 5' + F-element 41 1 60.96 AGCCACAAAATTGCCCAGCAATTTCCTTTATTATCCTGTAGATCCCACCATGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 - chr3L 13678990 5' - hopper 1343 1 65.07 TGTAAAGGGTATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 4869295 5' + roo 19 2 71.92 CATCAAAGGAGCTGTATTTAATTCAACTTTATAATATCGAAGAACGCTACATGATTCTACACTTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr2R 14717897 5' + Max-element 8288 2 55.40 CTACCATCGATGAGAAGCGCGGAGAGAGGCGCACTATGAACTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGTAAGGTTGTG:1 - chrX 16456799 5' + P-element 79 1 31.51 GCCCAGTTCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2R 18722047 5' + 412 7095 2 56.85 TGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chr2R 18048788 5' - opus 452 2 52.74 GTAGTGTCTCCACTCATCAGCGCTGTTGTTCTTCAGCCTCGGCTTTAGCTTCTGGCCAGGTTCTCATCCTCATCCTCATCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chr3R 13491833 5' - opus 456 2 58.22 GCCGCAAAAGTGCTTAATTGAGTCGCGAAATTCTTCAGGTGCACTGCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCGATTGAGAACA:1 + chrX 17469126 5' - blood 364 2 74.66 GAAAAGTTGTGATGTGCTCTAGGCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGCATTCGATTTTTTTGGCATA:1 - chr3R 14049481 5' - transib2 2812 1 76.03 CGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 21380582 5' + roo 8703 2 58.22 AAGGTCATTCAATAACTAAGTATGAATTATGTAATGAAATATGAGCTGGTTTATCTTTGTGTTTTGTATATGTATACGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACAAAAAATGCAAAATACTTTATATATTTGT:1 - chr2R 20935995 5' - Cr1a 173 1 49.32 GAAGCGTGGCAACCACTTAATGTAACTTTGATGTTTTTCTGGCTACGCACCAAAGAAGTATTGTAGTTTCACCTGCTGCGAATATTCAGGCAGCAAGGAAACGATAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGA:1 - chr2R 19548112 5' - jockey 4740 1 71.23 AATTCGATTAGATGGGGTTCTGGAAAAACCCGCTTTCCGGGATTATTCACGACCCATGAATCTTTTAAGGCTTGCGCCCTTGAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chr3R 21521442 5' - Bari1 1669 1 54.11 AAAGCTTTATAGAATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2L 17162747 5' + blood 45 2 54.79 ATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATA:1 + chr3R 11096690 5' + copia 4943 2 69.86 GTGCACGAATTTTCAAAAATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATA:1 + chr3R 10791672 5' + Idefix 45 2 51.37 CCTTCTCGCCTTCCCGCTTTCTCCCTTCCGCTGTTTGTGCAGCTGCAGCTGGCCAGCCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 4869105 5' - roo 397 1 77.08 CGCGCCATCCGTCGTCCGTCCGGTGAACCAAGTGACCTCTTCATTACCTCACGGCGATAATCTTAGCGGGGCTGTTTTATGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCTCAACTTGGGACTCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGT:1 - chrX 15693528 5' - INE-1 160 1 65.07 TGGCGGCATTCGTGTTTGTTTGCTCGCTTGTTTGGCTGAAATTCGCTGGCTTCGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGGTA:1 + chr2R 6585369 5' + pogo 11 1 77.46 TTTATAGCCCGTTCACATATGATTCGCCTGTGATTCGCCTGTGTCAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chrX 14173291 5' - 412 417 2 69.86 TCTGGCCTATTGCCACAGCGAAAATTCTGGAAAACGTGATATCTGCAAAGTGGGCGTATAAATAAGATATAGCCGCAGATATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAA:1 + chr3R 20547157 5' + roo 116 2 54.11 GAAATGAGGTGGAGCATTCACGATATTAGGGGACTTTTTTGGACCGAGTTAAAATTACGATTTTTAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 - chr2L 19903482 5' + Transpac 53 2 53.42 GCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr2L 17162850 5' - blood 7314 2 67.81 ACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACAC:1 + chr3R 10791692 5' + Idefix 65 2 65.07 TTCCTTCAACTTATCGAAAGGCAGTCGATCGATACAACAATTGCTTTGCCTCACAGTTCCAACACTCATCGATGGCGACACCCGCTGCACGAGGCTAAACAATATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTT:1 + chrX 1110764 5' + 1360 279 1 69.86 AAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAT:1 - chr2R 15062244 5' + blood 7099 2 76.03 TGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr3L 10814631 5' + 297 21 2 68.84 TTTCGGAACTCCTACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAGTCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chrX 9816488 5' + jockey 57 1 52.74 AATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3R 16041116 5' + jockey 80 1 67.81 CGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAAT:1 + chr3R 11461775 5' + 17.6 68 2 67.12 ATATATCACAAGTAACCCATTAATTTACCATTTAAATCAAGCGGGCATTGCCTCCATAACGATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chrX 16982218 5' - roo 349 2 58.90 CATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chrX 14962217 5' + jockey 86 1 69.18 AGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chrX 3452516 5' + Tirant 34 2 53.57 GCTGAAAAATATTCGCAATTGAAAGCAAAAAGGATTTTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chrX 6398738 5' - blood 366 2 65.75 CCAATGCTCCAATGCTCCGCTTCACTTAAGAATTAAGAGATATCTGGCAATGAGTTGGCAGCCGACGCTCGGATCGGTTTTTGAAATACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGCATGGAAT:1 - chr3R 29359651 5' - R2-element 3171 1 63.85 AATTAATAATAAAAAATAAAAAAACAACAATGGAACAACCACATCAACAAGTGCAACTAATCTCCGAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr3L 24505512 5' - blood 7340 1 52.74 TTTGGAATTTCTTTTAAGCAAACAACGAAATCAACTTTGAACCCGAAGAAGACTCTAGTCGCGTACGATTGTCTGATTCACAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTT:1 + chr3R 332141 5' - Doc 88 1 55.48 GGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAGTTTTGTTAGAGAGCGA:1 + chrX 14317412 5' + 1360 93 1 77.40 AATGTGCCCCAGCGTCGCTCCGGACATCTGGTTCCCCATGTACGTATGGATGTATCTACGTACTTACGTATTTCCCAGATCCATTCACAACGCCCGTGAGTGCGATGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAA:1 + chr3R 12904202 5' - Doc 273 1 71.92 CCTAGTCCAAACACATAAAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 27835728 5' + 412 16 2 74.66 GTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCTGGTAC:1 - chr3R 5940508 5' + hobo 71 1 71.32 GGTCTTTCCGGTTCCGGCTGGACCGGCTGGAGCACCCCCCATTACCAGGGGGAGGGACTGGGGCAGTGGAATGTAACAACGATCTGTTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATAAAGGGTTTCAAAAATAATCTCCAAACAGATTTCAT:1 + chr3R 21035064 5' + Q-element 287 2 55.48 ATATCTGTTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chr3L 5514179 5' + Doc 67 1 50.00 TGGATCCACTGGGAGTTAATCCTGCTCGCGGTCCAAATCATTTATTTTGAAATATGTATATAACTAAAATATGAAATTAGAATCGGTAAAAAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTT:1 - chr3L 19529830 5' + Juan 3891 1 64.38 GGAGGCGGGGTGGAACTGTTAGCTGGCATAATTGAAATGTAAATTCTCGGCTAGAGTTTTCAGATGCAGACAAGTGAGGTGGCTCGAGTGAAATTAATATTTTGTTTGCCATCTATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGT:1 + chr2L 13080623 5' + 17.6 186 2 76.03 TGATTTATCCAAAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 + chr3L 20747047 5' + Burdock 15 2 75.34 GTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3L 3979710 5' + opus 7142 4 67.81 CTTATAAAATAAAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGA:2 + chr2L 8772708 5' - Tabor 441 2 55.48 TATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAAC:1 + chr3R 13358592 5' - mdg3 5434 2 59.59 GTCGGTTAATTGGCGATCCGACATTGGTTACCAAAGAGAGTGGGATCCTACTTTCCTATACACATGATGGTGTTGTGCACTTTGCTCGCTCCAAAGAAATGTCCGTTCGACACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCT:1 - chr2L 20319844 5' - opus 297 2 69.78 TTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 23507545 5' - 412 7515 2 63.70 GCAGCAAAACGAACATCACTTGATTCTGATTAGCGTGCTGTCAAGCGTGAGAGCTGCATATACATATATCTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 31071728 5' + opus 7156 4 55.94 TTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATC:1 + chrX 19231721 5' - mdg3 5455 2 56.16 CAAATGCCCTCGGGCTAATCATTGTTGTACTAAATGAATTTATGCGTCGATGATTTTCGTATGAATAATGGGGAAATATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACA:1 - chr2R 19077013 5' + flea 403 1 52.05 ACGTACCACATCTCCTTTGTCCCACCATGATTTCATGACTGAATTCTGAAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 - chrX 11815101 5' - flea 206 2 59.59 TTTCCGTTGAAACATATTTTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGT:1 + chr2L 15142197 5' + BS 4722 1 71.23 CATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 9938702 5' - roo 9019 2 54.79 GATCCATTCAAAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3L 13313157 5' - roo 332 2 73.29 ATACGTGCTCAAAGTTTTGCATACACAACACCTACAGTACAAGCCATCAGCAGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 - chr2R 982466 5' - HMS-Beagle 7028 2 76.03 TATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chrX 5222970 5' + 412 7100 2 52.78 GAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr3L 3979706 5' + opus 143 4 65.07 TACCATACCAACCCCATCTTGGGGCTTCAACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTC:1 - chr2R 17182832 5' + jockey 4585 1 65.07 AAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr2L 2357355 5' + P-element 83 1 29.45 ACTCTCGACCCCTGCCCTTTCCGAACTTCCCCCTTCCCCCCTCCGCCCATGGGAATGCCTAATACGGGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTA:1 + chrX 3121961 5' - diver 6057 2 53.42 GGAATGAAGAGAAGAAAGCGGCTCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chrX 983252 5' + 412 7084 2 65.75 AGGGAAAAAACAAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr3R 10079292 5' + P-element 56 1 45.77 AAGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 - chr3R 9258790 5' + 1360 42 1 56.85 GTCGTACTGCGTTGTTTATAATTGCTTCTCGCTGCTCTAGAAAAACAATTTGAATCTGAATAAAGAAACTTAAGATATACACATCGACTTGTGATCGACTGAATAATGCTGGAGAGAGAGACTGCTATAGTCGAGTTCCCCGACT:1 + chrX 4636348 5' - INE-1 567 1 76.55 ATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACAGTA:1 + chr3R 26782727 5' + hobo 87 1 78.77 ATTTGGTCATCATACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 8542723 5' + roo 8678 2 69.86 AAATGTGCTCTGGGATCAGGAAGCTGGAGTTCCGTAGGCTCTCCATACACGTATAGGATTATATTGCTGGCATCTACCAGGGAATCAGGTGGTGGCATATTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGG:1 - chr3R 18171209 5' - Gypsy6A_LTR 259 1 78.74 ACTCCTATAAGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 3529714 5' + 412 7095 2 56.85 CGTATGAGTGATTATACCCGTAACTCGTGGAGTCCAATTAGGCAGAAGGAAACGTTTCCGACTGTATAAGGTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATC:1 - chrX 665748 5' + INE-1 132 1 74.66 CGTTGGTGCTGCTACCTTCCTCGCTTCTTCCCCCCGTAGCCACACTAATTGATTGAATCGTAGGAGGTAATGTTTAGATAATTGTGGGTATATATATATTGAAAATTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTG:1 + chrX 3401331 5' + S-element 1514 1 72.66 TATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATTCACATTTTAGTTATAAATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 - chr2R 8305304 5' - blood 7323 1 69.18 GCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGTGTCAGGGGGATGGTGTAGTATGTGCCTGTGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3R 15514630 5' + 412 7080 2 59.20 TTCATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 - chr2R 12703878 5' - blood 332 2 52.74 GCCCTGCGGGCTCGTACGCTAGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTT:1 - chr2R 6052734 5' - mdg1 7444 2 74.66 ACAGGTAATCAGTTTCCCGGCCTCACTTTCACCTCAATGTATGTATTGATGGTTTCGCCTGACTTTCTTGAGTTTAATTAGTTTGTTGCAGTGCCTTTTATTGTCTTTCTCTGCGCTGACAGGATTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTG:1 + chr3L 20050122 5' - gypsy7 5006 1 68.49 ACCGCCGCTCCGCTCGTAAACACCCAACTAACCGTGTTTTGATTATCGCCCACGGTTCCAAATTCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTC:1 - chr3R 12110516 5' + Quasimodo 223 2 53.85 ACCGCATCTGCTCCTGCTCCTCCTTGGCCGCAGGACATTCGCTTGTAATTATAATATTTCATCCCAAAAGTAGCTCCCAGGCATCAGTTAAGATTAAGATTAAGTAACATAAGTAACAGTAAGGAGGGCAAATCCAGGACCCCC:1 + chr2R 21580140 5' - Rt1c 5356 1 61.11 CTCATGTAACACGTGACCATCTCAACAGAATCATGAATTCTGAAAAAAACTAGTGAATTTCATGCTGTTTGGCGTTATTTTTGGTAGGCACATAAAGTGCACTGTGCACCCATTTTCTCGGTCTCCCACACAAAATCTAAAGTTCT:1 + chr3R 9055216 5' + Cr1a 318 1 57.53 TCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3L 2037004 5' + Doc 66 1 62.33 TCGAATTGAGGATTCTGTCGGTACTCTCAAATTAGGTTATTTCCTCTTGAAAACTCACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr3R 6782677 5' + jockey 4707 1 62.33 GAGATTATGAAACTGAATACATATTTTGTACGTGTTTTTATTGTTTTGAATTAGGTGTATGCTTGAATGCTTGAACTTCGAGCATGGGACTTTTTTCGGAAAAGAGAATAGAGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 - chrX 4842936 5' - accord 7030 2 70.37 TAAATATACAAATATACAAAACATTTTTACATACATACATTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACCAAATAAAAAAT:1 - chr3L 3421022 5' + F-element 92 1 71.23 GCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2L 15621975 5' + hobo 30 1 61.64 AATGCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAAC:1 - chr3R 28033687 5' + diver 62 2 58.62 GAGATCCATTCAAAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 13313155 5' - roo 334 2 71.92 CAGGAATGGGAATATAGGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAA:1 - chr3R 25384340 5' - mdg3 5495 2 78.77 GAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGG:1 + chr2R 22867432 5' - hobo 2867 1 70.00 TTTTACTACTTGTCAAAATTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 20746980 5' - HMS-Beagle2 493 1 74.29 GAAGCGCTGAAGCAAGTTTAATGGGGTAATGTAACAGAGAAACACCAGTTAAAAGTGGTATTATCTACTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAATCTCTGTGTATATTCTCGTTTCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAAT:1 - chr2L 395724 5' - Doc3-element 4408 1 60.27 GGAGTAGCAAGAACAAGCTGCGTCGCATATCTGCAAGCTACTTAAGCGACAAAGCAGCAACCAGGGAGAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATG:1 + chr2R 6743445 5' + copia 4743 1 52.78 ACGGTAAAGTTGGGACTTTGGATACAGCGCAGTCGCAAAGAGCGACTTTCTCTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chr2R 8686544 5' - hobo 2910 1 60.00 ATAAATTGAAAAGTTGAAATATTTTGTAAGTAACAAACCATATAGTATACATATATATTACGTTTTTCAAAATGACTTGCGCTGGTACTTTTAAATGTGTTCTGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTC:1 + chr3L 23556024 5' + mdg3 5282 2 73.29 TTGCTATTGCCAACATTTAGAAGTCGTTTTGTATATAGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1 - chr2L 8452314 5' - copia 170 2 76.71 ACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATAC:1 - chrX 21667963 5' + gypsy2 6526 2 59.31 AAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 13313167 5' - roo 322 2 80.14 CTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACAGTAT:1 - chr3L 13227678 5' + hobo 88 1 76.92 TAGTAACTTAAGCTTGTTCAACTTGCTATCTACGTTGAAGGTAAAATAAAATAACCCGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAAC:1 + chr2R 14884260 5' - mdg3 182 2 60.27 CAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1 + chr2R 21056715 5' + Tirant 56 2 79.61 GAACATCACTTGATTCTGATTAGCGTGCTGTCAAGCGTGAGAGCTGCATATACATATATCTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 + chr3R 31071738 5' + opus 7056 4 63.70 CCAGTGGCGTGTCAAGTGTCAACTGTCTGACATTCGATGTGGCGCCCAGGACTCGAAATGCTAATGAACTAGGGTATTACAAGTTTCCCGGTCGCCTTAGCCTTTCATCATTTGTTTTTGCTGTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTCT:1 + chrX 4809215 5' - gypsy7 5015 2 54.79 ACCACACCAACAACGACAACGAGACGGATGAGGGTGAGTCTTTAGGCAGTCACATTGTGTGATTCGTTTTCATTTTTCATTTTCTGTGCAGGTCAATCTCATTCGACCAACGAGAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCA:1 - chrX 6243165 5' + HMS-Beagle 6599 1 79.86 TGAACAAACTAAATGTTATTTACGCACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 5446217 5' + roo 8707 2 56.85 GTGTGGATATTGCGCGAAAGTCGGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3L 9426645 5' - P-element 2853 1 60.96 ATGAGCTTATTTGGTCGACTTTTATTAGTATTAGTTTGTGGAATATTTACGCTATTATGGTCTTGCTTGTACAGATACCTCTTCGTTACATAATGAATAAGATCAAGAAATTGACCATGCTTACAAGAACAACAAAAGGAAGGAGC:1 + chr2R 14679778 5' - gypsy12 10046 2 59.59 GGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 2036991 5' + Doc 47 1 53.57 GTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACATATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAATTGAGCGTGATATA:1 + chrX 14385167 5' + blood 77 2 65.75 TGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chr3L 17447531 5' + Tirant 8176 2 75.19 CTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 - chr3L 18920497 5' + Juan 51 1 50.68 ATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCAGAGTCGATCTG:1 - chrX 14815844 5' + INE-1 98 1 73.61 CGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCGGAAGCC:1 - chr3R 30731464 5' + gypsy6 69 2 66.44 AGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAAC:1 + chr3L 24153173 5' - Tabor 423 2 59.59 AATGGATATTTATCTGACTGCAGAATTGGATTTATTTTTCTGCCGCAGTAATTAAACGCAAATTTTGCCAACTGTTAATCAGTTTAAGAAACTGGCAGCTGCTGGGAATTTATCGCTTTATCTCGCTCGGCTCTGTATGCGAGGTG:1 + chr3L 14603738 5' - G6 420 1 76.71 GACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chrX 17258321 5' + 297 6629 2 53.42 ATTGCAATGAAAAAACAAAATGCAAACCATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chrX 23085989 5' + roo 25 2 55.38 ATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 - chr3R 8402668 5' - mdg1 7426 2 62.07 GCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3L 3979543 5' - opus 7471 2 64.83 TTTCAAATATTTATTTCGATGCCCGACTACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTCCACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chr3R 13543969 5' - Tc3 312 1 57.24 ATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGGAAGTTATTTTCGTGCTC:1 + chr3R 23108091 5' + G-element 48 1 69.47 ATTTCACCTCATAAGCCAAAAATAACGAAAA:1 + chrX 20917731 5' - S-element 285 1 87.10 TTTGGTTTCCAAATAGGCTTAGAGCGCGATAAGCATGACTTACGCAAATTATAGATTACAGAGCAAGTTACTTTGTAGAATTACGAAATTTAATAGATGTGATATCATTCAAATTAGCTTTTTGAAAAAAAGGAAAAAGAAAATGA:1 + chr3R 26979405 5' + Doc2-element 236 1 65.07 TATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 9482133 5' - roo 9033 1 59.59 TAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGTTAACT:1 + chr2L 9167425 5' - pogo 2064 1 54.84 CGAATCTGAAGCTGTGGCGAACTAAAATCACTAAGAAAAGCAGTCATAGATAAACAGGGAAACATGATGAATGTGAATATGATGAAGCGTGAAACTTGCTAAAGATATAGATATAAAATTGCTTATCTATTATTTTAACCGCAGCT:1 - chr3L 17151617 5' - Tc1 4 1 76.71 TTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACGGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 - chr3R 15649846 5' + blood 7093 2 71.23 AGCTGCTTTCGAAACTGAACTCAAGTAGCCACACCAGCATCAACAATTGTGGTCTGTCCAGGTATTTATGATGTTTCTCCGGACGTAGAGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGCAG:1 - chr2R 20650380 5' + Gypsy12A_LTR 1948 3 53.42 TTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3R 18846504 5' + roo 66 2 62.33 AAACTCGTCAAAGGGCCATTGAAGCTGGGACAATGAGTGGATAGCTTGCAGATGGGCTGATGGGCTTTGTCTAGCCCATAAAAATGCATGGCCCGCATTGCATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1 + chr3R 26606458 5' + Quasimodo 18 2 68.49 AATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAA:1 + chr3R 18847305 5' + Stalker2 7333 2 75.34 AGCAAAGTTAACATTTGCCAAATTGTCGAAAATTTCATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr2R 12703911 5' - blood 365 2 75.34 CTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGA:1 + chr2R 19904035 5' + Doc 4492 1 69.18 AACAGCTACATTTTTCCGGCTTCGTTGGCAGCGCAGAGCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr2R 5848928 5' - mdg1 392 2 64.38 CCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGC:1 - chrX 21667927 5' + gypsy2 6567 2 69.86 AGCTATCTTAATCGAGACCAAGTTGCGGGTTTTAATGCAGTTGCAAACGCCAGAACGAGTTAGCTTTGGTCAGCTTGAGGGAAGTGCACTCAAAGAAAAGACTATATAATCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTA:1 + chr3L 12636859 5' + 297 6942 2 71.03 GTATAATAAACTAAACTAAAGCCAAGTGAAACAAAGCAAAGTACAAAACTTTTTCTCGCAGCTAAAATGTATGTTGCTTTCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGC:1 - chr3R 12535831 5' + Doc 4488 1 56.85 GCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTA:1 - chrY 2720336 5' - gypsy 7375 2 69.18 GTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3R 23664492 5' - pogo 2045 1 56.16 ACCCTCAGTATTGGAATGCATAGCAATGAGACTGAATGCTCATAAAGGGAAATTTTCGAAAAGAAGACGATAAAATGCTGACCATCATCGTTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGC:1 - chr2R 21046472 5' - jockey 201 1 58.90 CTGGACCAACTCTTCGTTGAGCGTCTTCACCTTCTTTTCGGCCGCACTGGACGATGTTCCGAGACTGAGAAGCGAGGACTTGCTGCCACTGGATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGA:1 + chr2L 6936375 5' - Doc 4665 1 77.78 CTTACAAAATAGACTCTTGTTTTTCTTTCGTGTCTTTTTTAGTCCTAGTAGCAGCTAGTAATCGACCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 - chr4 520297 5' + P-element 73 1 48.15 TCTTACTTATATGCACTTGATAAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTCTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr3L 19274931 5' - transib2 2804 1 71.23 GTAATAGTAACCAATCAAATAACCGAAATACGTTCAAGTGTGTTTTAATTGAGTCGAAAGCGGCGGAAATTCAACAATTTCAATTCAATTAACCGATGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 + chrX 9007929 5' - blood 7380 2 72.31 ATAAACCTTAACTTTTCCACAACCATGTGGGCAAGGGAAGAACCCTGCTGTCTTTTTGGCCAACTAAATGGGCATGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACAT:1 + chrX 1753498 5' - Stalker4 7212 4 50.68 TATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 + chr2L 1073911 5' + Tirant 27 2 57.80 GCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 + chr2R 19900972 5' - mdg1 363 2 56.85 AAGGGGGCGGCGGAATGATAGCTGACCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr2L 3967049 5' - hobo 2934 1 72.83 GATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACA:1 - chr3L 4738467 5' + Idefix 32 2 56.64 ATATTGGAACTGGCACTCTTTAAGACTCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTA:1 - chr3L 9426807 5' + P-element 24 1 69.86 CGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATA:1 + chr3L 24153194 5' - Tabor 7241 2 73.97 ATGGGGACTTAAATTGCTCGTAGAACGCATGGAAAAATAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCC:1 - chr3L 11669855 5' + Tabor 6924 2 73.29 CCCGTACTCGGTCCCGTACTGGTCCCCTACTCGGTCCTGTACTGGTCCGGTACTCGGCACCGTACCTCCCGCCCAACCGAC:1 + chr3L 16047628 5' - Cr1a 4425 1 67.90 TCGCATTCAGGCTGAAAACTACGAAACTAAAGAGTTCGTACAATTTGCAGCTTTGAGATTTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1 + chrX 12623128 5' - jockey 4931 1 60.27 ACTTGTTGAGTAAACAATTTGTCGCATGCCAAAAATGTAAATTAATGAAGTAACGGAACTAAAAATTGTTGAAGCACCAAGAATTGATGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACA:1 + chr2L 13411819 5' - hobo 347 1 59.59 GCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTG:2 - chr3R 6842661 5' - mdg1 7363 2 72.60 CTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chrX 14173180 5' + 412 36 2 60.96 CTTTCTGTGCATAGGGACAGAGGGCTGGGAATGAGATTGCAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2R 22867386 5' - hobo 2922 1 69.47 ATCAGGTTTTCTAGAAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr3L 15322087 5' + Transpac 37 2 59.59 GTTCGGCTGCAGGTCAAGGAGATGGCTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2R 17986222 5' + 297 13 2 74.62 GCATAACGAGAGAAATTCACAATTTTGATGTAATTGACAGCCAAGGAAGGCTGCACGGTTCATGGGGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGACTCGATTT:1 + chr2R 9628179 5' + INE-1 97 1 54.84 CAATAATGTTTAAAGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr3R 15589932 5' + Transpac 4954 2 61.64 ATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCGCGG:1 + chr2L 12261133 5' + jockey 36 1 62.77 TGGGGAATTGAATTTTGATTTGATTTGTTACCGTTCAAGATACAAAAACTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGC:1 + chr2R 20015122 5' - X-element 4641 1 65.07 CATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCT:1 + chr3L 19274788 5' + transib2 60 1 58.90 TTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAG:1 + chr3R 25521817 5' - blood 294 2 76.55 CGCAAAAGTGCTGAATTGAGTCGCGAAATTCTTCAGGTGCACTGCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 + chrX 17469128 5' - blood 362 2 74.66 AATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAAATATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGTCTCTCAATTCAGCGCAACAA:1 + chr2R 19076559 5' + F-element 244 1 75.38 ACAATTATTAGTTGGAAACCAACTGTTTTTCCAACACAATGCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 - chr3R 28033724 5' + diver 26 2 66.44 AGCTGATCTAACTAGGCTAAGTATTGCTTGATCTGATTGGCACTCTAGGCTACATTAAAGATGATATTCTTATATAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAATTA:1 - chr3R 19754170 5' - 1360 323 1 56.85 TCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 + chr3R 10778648 5' + mdg3 63 2 59.59 ATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chr2R 24630110 5' + copia 4915 2 52.05 GCTTGCTGTGGATATGTGTCGAATGGCACTGCGTCTTAGGTATGCTTCATACTCCCAGCGACGTGGCTCCAGTTGCTCGATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACG:1 + chr3R 24913858 5' + Doc 204 1 57.25 AATGAGCAAAGTCCAAACTAGCAAAAGCTTTTTGTAATTTCCTTGTGGTTATGTACGCAAAAAATAGCATAGTAAAAAATATATTGACAGACTAAGAACATATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGCAAATAATAATAACAACG:1 - chr2L 21925652 5' + G4 3657 1 59.59 TATCTATGTATACTCGACGTGAAGTGTACCCAGTGTCAATGACACCGCCAGCAACAAAGTTGTGGCAACAAATGTTGCTGGCTTTAAGAAATATATAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACATACA:1 - chr3R 18916023 5' + Quasimodo 24 2 58.22 TCGACATTTAATATGCAAATCAGCGTACTGTGATGGGGATGGGATGGGCTTAGTGTCGCTCGTCCGCATTTCTAATGCTGCTCTTTCGACTTGCGCGCATAATTTTCTAATGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGA:1 + chr2R 10930873 5' + R2-element 425 1 76.03 CCAAAATCGCATAAAATTCATCTATCTATTTCATGAATGCATTCTGCTGCATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTATTAAGGTGACAAGACGATTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACC:1 - chr2L 17551107 5' + Transib-N1_DM 221 1 47.95 TCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 9241969 5' + roo 40 2 58.22 ACATTGTGCATGTGTCTTTAAACAAAGATTTATGTACCCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:1 + chr3R 11553627 5' - hopper2 1563 1 55.48 AGACCACAGTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCGTAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATAT:1 - chr2R 14562296 5' - Burdock 6384 2 43.45 TCCAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr3R 25384157 5' + mdg3 5289 2 60.27 TCCACTCAGGCAACAACTTTGCCACGACTGTTCAAATTTGGACAACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGCCACCCAAAGCGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3R 22429287 5' + roo 8671 2 76.39 GTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1 + chrX 10101312 5' + mdg3 5307 2 52.05 CAGTCAATGAGATTAAGTGCTTCTTTTATGCAACGAGCTAATTCTGATAATGTTGAATGTGCCCTTTCAACTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGGTCCTCCA:1 + chr3L 25323176 5' + Max-element 52 2 49.32 GCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2R 24338328 5' - 1360 3352 1 58.16 ACTGCAATTTAATTACATTCAGATGAACATCACAAAACAGCTAAAAGTAAATTACGTAAAGTCATTACTAATAATACTGTTAAAAAAGACATCGCGTAAGTACGAAACAATAGAGAATGTTATAGTCGAGATCCCCGACTATCAGA:1 - chr3R 17336257 5' - INE-1 561 1 56.16 ACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr2L 12142550 5' + hobo 55 1 53.42 ACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2R 15080094 5' - roo 330 2 70.55 AATATCATATCATTACTATGATTATTGCAATTGTACAATGTTTTGCTTCAATATTAATTGGTGGTTCAAGTTAGAAAATCATATCTCAACTATTTTAACTAACTATATTAAATCTCTTGGTCAAGATCAATAGCCTAGTCGATCTA:1 - chr3R 28836795 5' + INE-1 98 1 75.34 GCTATAGACAGCAGGAGCTGCTGAAAGTCTCCGTCTACCTTCAGGTCACCATTCCTGAAATGCTCGAGCAGGACTTTTTCCATATCACCGCCATAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGAGCACATCTGCC:1 + chr2L 12039467 5' - roo 248 2 65.97 ATACTCGTAGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr3L 21630296 5' + Burdock 41 2 57.53 AATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr2L 10832342 5' + Doc 53 1 55.97 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATT:2 + chr3L 25232768 5' - accord2 7554 2 67.12 AAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:2 - chr2R 9072936 5' + Burdock 77 2 71.92 CCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 + chr2R 6984274 5' + HMS-Beagle2 6910 2 67.12 TTCGTCCTTCGAGTGGGTGGTGTTTGTTTTGTGCCCCGTTAAGTGGGCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGG:1 + chr3R 10963465 5' - Doc 4388 1 69.86 AAGATGCTGCTACTTCGCCGTTGCCACAAGTTAAAGTTGCGTCCATTGGCCCGTCTTTGCTCCGCCGAATTGATACATAAGGTAATATATATAGGTAGATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTG:1 + chrX 7329157 5' + Bari1 19 1 73.29 AGTGTGCTACGGAAATTAAAATTATTAGGTATCAGCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2R 19900932 5' - mdg1 7441 2 72.60 CATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTGCAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 + chr2R 21056692 5' + Tirant 65 2 68.89 CACGCATTTTTTTTTCAAATCGTTTTTGGCATGGCATTCTAATGGATTTGATTTGATTTTCCTTATATTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAAT:1 - chrX 9481677 5' - R2-element 3147 1 54.11 AGTCCTGTGCACATACTTTTAGCACGTACTGTGCGCTCAGACGACACACCGCGAGAAAAGTGGGGCGTATAAGTTTTTTTCACGAGTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAG:2 - chrX 4858446 5' - BS 5051 1 50.68 CTTATATCTTATTATAGATTTAATAGTGAGGGGCTTTATATTTCATTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACC:1 + chr3R 20367998 5' - Max-element 224 2 67.12 GATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGATTAGCAGA:1 - chr2L 17162840 5' - blood 7304 2 73.29 GCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2L 18581287 5' + roo 78 2 71.23 CATGACCACGACGAGTTTCTGCAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 23099048 5' - roo 9045 1 66.44 GAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAG:1 - chrX 8357726 5' + FB 74 1 69.18 GGGAAACAATCAAATTATAATACTCGTAGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCT:1 + chr3L 21630277 5' + Burdock 22 2 70.55 GTATTTGATCTCCCATAGGCTTACTGATTCATGTATTTAATTCATTGTAATTTATTTCATCATCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCTATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAACAGCA:1 + chr3R 25998431 5' + R2-element 376 1 57.53 GGGAAGAAAAAGTGTATAATGAACTCATTATACATGCAACAGATTCGGAGTCACAATTAAAAGTCAAAATACTTGATATGTTGCTCAGTCGCATTACTTCATCTATCTAATAAATTGATAAATGTTTTTTTCTATTTCTAACATTT:1 + chr3L 7618849 5' + Tc1-2 1405 1 72.60 GCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 - chr3R 24228960 5' - opus 7429 2 72.60 TATTAACAATATTGGAATATATCTGTAGATAGTAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGGTCAATGCTG:1 + chr2R 22671388 5' + jockey 4703 1 63.04 ATATCCTTGTATTTATTGAGTGGAGAGAAAAATATACCACTTCGATTTGGTGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr2R 20500013 5' - 412 458 2 59.59 TATACAAGATAACATTGCACATTGGCAATTAAAAATTGCTTGAATATAGCTCTGAAATGAATATGTATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTATCCGGGAGGCAGGGCG:1 + chr3R 30731365 5' - gypsy6 331 2 57.53 CTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 16908480 5' - roo 9013 2 57.53 AACAGACGCATTCCCCAAATGGTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAC:1 - chr2R 23313139 5' + Tabor 8 2 78.17 AAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAGAT:1 + chr2R 7223683 5' + blood 7101 2 78.08 GACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGAATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr2L 9167522 5' + pogo 57 1 63.20 TTCACACCACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr2L 1449718 5' - opus 7473 2 64.83 AGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAA:1 - chr3R 28008304 5' - hobo 2858 1 76.22 GGCAGGCAACCTTTTGCTGGACCAAAGATTAAAAAGTTCTCTGAAATTGTTTGACAATATATTTTGCTTGGGAATTCCTTTTGTTCTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCTGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3R 22289347 5' - 412 7511 2 60.96 AATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTTAATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTC:1 + chr2R 21897909 5' - 412 7452 2 78.77 TTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACA:1 + chr2L 15142214 5' + BS 4740 1 60.27 GTTTACTGATAAATTTATGAACATAATTAGTAAAGAATCTTTTTTGAGTGCGCTCATGCTTTGTGCAATAAAAAGGATACGATGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 + chr2L 17747375 5' - Tirant 364 2 61.64 AAATTCGTTGCATGCTTTTGGGGATGATCATATTAATTTCAATCACTGTTAGAAAAATCAAAGGGTTAGATATTTACCGCTCTGTTACCTGCTATAAATTCGTGTAATAACTAAGGAACTTGTGCATAAATATTAAAAATTAAAAA:1 + chr3R 20840220 5' + Doc 4687 1 51.37 CCGACCTTCGGAACACTGGCGAACGTTTATCCGTGTTGGTTCTTCCTTCCAAATTCCACAAAAATTGTGAAAAGTGTGGAGAAGGCGAATATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTT:1 + chrX 15477051 5' - roo 197 2 63.57 GAGTAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 + chr3R 28008249 5' + hobo 73 1 68.49 GGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 53059 5' - roo 329 2 73.29 GATCATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGGTT:1 - chr3R 22289469 5' + 412 66 2 61.64 AATGTGGGCGAAACAATTTTGTGTGCTTTCCGGACGTAACAATCTTCTGAATCAAACCGGTCACGCTCATGCTTTTGAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTCCCAAACATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATT:1 - chr2R 6160883 5' + INE-1 510 1 64.38 CAGCAAGGCAAATAAATGGCCACGCCCAACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 7424506 5' - 412 462 2 63.70 ACGTAAGATTCCTTAAAGTAAAAATGTAGTATTTGCAAATCAAATACATGTGTGAGCTGTTTAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAG:1 + chr2R 5069641 5' - F-element 4238 1 59.59 CGTGGCGCAGAGTGAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGTCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGGGCATATGTAATTCTGTATGAGA:1 + chrX 21474391 5' + 1731 56 2 78.77 GGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGA:1 - chr3R 6842649 5' - mdg1 7351 2 80.82 AGGAGACAATAAAAGCAGACTACATACGTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 + chr3R 29350667 5' - 297 6939 2 60.96 ATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 - chr3R 21150633 5' + Burdock 79 2 76.71 AGATATAGATAGTAAGGGGCTTGCAGAGGTGGAATAATAATACTGCGCATAAACCATAAAATGCCATTAAGTGCGTCATTTCAATTTGATTTCGATGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATAC:1 + chr3L 22210584 5' + Idefix 31 2 63.70 AAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATGGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 7534604 5' - roo 8994 2 69.18 ATGCAGAAAAAAGCAAAATCGATATGGCTTATTGCTAAAATGATTTTCTCAAAAAATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 8022095 5' + roo 8692 2 64.38 GAGATAAAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2R 15392829 5' + blood 7048 2 60.27 GGATTTGTACGAGTGTGTCTTGGGTCTCGGCGTAATGTCCATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTAT:1 + chr3L 22353646 5' - Doc 141 1 73.29 GCAAAATAAACGCAAAACGGCGCACAAATAAAAATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGCAC:1 - chr2R 6585497 5' - pogo 2085 1 55.70 GCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 21668696 5' - mdg1 7418 2 48.63 TTGCACTATAAATCGTAAGCAGCCGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2R 21380559 5' + roo 8680 2 73.29 AAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3R 21237833 5' + Doc 48 1 52.05 GTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 + chr2R 11379721 5' + jockey 76 1 60.96 CAAAATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 - chr2R 21227434 5' - mdg3 5423 2 69.86 GAAATTTTCTATTGTACTTGAAGATCGCTGTACCTCCGATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chrX 8895184 5' - roo 9028 1 51.37 CATCACGAGATGATGCAGTTCTTGTCCTTGTCAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCT:1 - chr2R 7222800 5' - blood 258 2 77.62 CATTTTTTGAACATTAGAAAATATTAGAAAATATACAGACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chrX 13651611 5' + 297 6597 2 71.92 GAGCAATAAAAATCGGTTATAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr3R 10472964 5' + opus 7166 4 67.54 ACAGACAAATTTCTGCGTACTTATTTTGTCCATAAGAAACGTCTCTTAATTAGTTTTTTTTATTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCCTTTGGGCTC:1 - chr2L 22696458 5' - X-element 4647 1 62.33 TCCATTAAAAATGAAATTAAATTTCAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chr3L 11669731 5' - Tabor 7311 2 72.60 CGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 4722462 5' - roo 8992 2 72.60 ATTTATCACCTTTTAGGGGCTGTATGCGTTCATATCCTTCAAATTGCCTTATTTAAATGTATTATTTATGAAATAATAAAAGAATTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:2 + chr2L 21596463 5' + blood 7046 2 62.33 GAAATCACGTCCGAGCGGGGAATTATGTGCTTGCGTGCCGCGCTAAACTCTTAACCACCTCCTTTTGGCCGAGTTCAAAACGTACTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr3R 4659647 5' - P-element 2854 1 62.33 ATGTAAAGGGAAAAAACAAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr3R 10079286 5' + P-element 54 1 48.63 CTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 22255410 5' + roo 74 2 68.49 AAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr2L 12261176 5' + jockey 89 1 71.23 TGGGTTAGCTAAGTGCACTAAACAAAATAAATGTTACAGAAAGAAAAGTGATGTACCTCATTTGAAGAAAATGTGCACACACCTGATTGGTCATAAATTGATCATGAGCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGATGAGCGGC:1 - chr3L 15320530 5' + Max-element 8249 2 76.71 TGCAGCTATGAGCTATCTAGTATATTTGTCCCAAATTTCGGGCCACAATGCATAAAGTGCAGCTCTCAAATTTTTTTTATACACGCACATTAAAGCTCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 + chrX 21086060 5' + jockey 4696 1 60.00 TTCCAGCTACTTTGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 18846484 5' + roo 8710 2 54.79 GGGGCAACCCTCTGACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTAGTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chrX 17258343 5' + 297 26 2 67.81 AAAATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 + chr2L 20561412 5' - P-element 2809 1 30.00 TAGAGCATTAGTATTAATTGACATTTAATTGCGGCAATAAAACAATGTGTGTGTGGGAAAAATAAAAGATACTACTACTACTTTTGGCTCATGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTT:1 + chrX 16736766 5' - I-element 85 1 62.33 TAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTCTGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chrX 14173232 5' + 412 7140 2 75.86 ACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3R 5765320 5' - opus 7450 2 56.85 AACTCTGTTACGACTATTTCCGTTTTACCCTTTTGTGGCGTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACCTCGCGGGTACCT:1 + chr2L 14005998 5' + hobo 73 1 69.78 CGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:2 - chr3L 9430642 5' + P-element 83 1 28.77 ATTTTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 - chr3L 3979718 5' + opus 18 2 73.29 GAACCACTAATTCAACCTCAACCGTTACGGAGTCGAAGAAATGGGAGGAAGGTGCATTAGATAGTGGCAGAGAGAAGCATATGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGAATATTATTGTTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCGTT:1 + chr3R 23193858 5' + invader3 106 2 58.90 GCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 21192611 5' + roo 8704 2 59.59 AAGAGATAAAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr2R 15392831 5' + blood 7046 2 61.64 CCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGA:1 + chr2R 5848971 5' - mdg1 7387 2 67.12 TCTTTCCATACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCACAAGATGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTAC:1 + chr3L 24153128 5' - Tabor 468 2 68.49 CGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTAT:1 + chr3R 17316050 5' + 3S18 5835 2 63.01 CCGCCATCGCCACCTCAAAACTTGAGGGCCCCAGATGTCACTAGCCGAAGTGTTACATTGGATTGGGAGGTCCCAGCTCGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAG:1 - chr3L 2041474 5' + Doc 4364 1 54.79 GGCCAGCAGACGGAGCGTGTCGCCCGGCATTGAAAGTGGAGGAGCACCCAGTTGTGTGCTGCCACTTAAGTTGCCGTTTTGGGCAAATCGCGGATGCAAACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTAT:1 + chr3R 18691161 5' - invader2 4798 1 69.86 CAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAG:1 + chr3R 23108072 5' + G-element 80 1 67.12 AAAAAGGAATAAAGCCGGGAGAGTGGGGAAAAGTTTTTCGGCTTTTGCTCGCATTCAGGCTGAAAACTACGAAACTAAAGAGTTCGTACAATTTGCAGCTTTGAGATTTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chrX 12623080 5' - jockey 4979 1 71.23 AGTTAGAAGGTTAATGAGTGCAGTTTTACCATTTTAATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 + chr3L 176383 5' + Transpac 80 2 72.60 GGGTTAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGA:1 + chr3R 23020785 5' - INE-1 561 1 64.38 CCCCAGAGCCGGAGCAGTGAAGGAGTCCCGGACTCGCCGGCGGAGGAATGAAAGGGAAGTGGAAAAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr2R 22675790 5' - roo 9034 1 53.85 GAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 + chr3L 15058884 5' + blood 7093 2 71.72 GTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATTAATGGCCACACCT:1 + chr2R 24630120 5' + copia 4925 2 57.53 AGAAAAATACTTTTGTAGTTTGACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr3L 5183650 5' + copia 15 2 75.34 TTTGAAATTATCTTCAACGCCTGGCTCTCGTCAAGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCT:1 - chr3R 9147657 5' - BS3 1572 1 71.19 AATAAATTCATTAGTAATTTAAGTAAAGACCTTTGTCTACCCGAACTTTTAAATGGAAAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAG:1 - chr3L 7761537 5' - HMS-Beagle2 7017 2 60.27 AATACAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr2R 16513128 5' + jockey 75 1 63.70 ATGAAATTTAACGGTTAAGTGAGCTTACCAAAGCAGCTTAACTTTAAAGCTTGTAGAGCTTTTAGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 6096629 5' + roo 25 2 68.28 TGAACAGAGTCTGTCCAAGTGTCAGGTTATTTCCTCCAATGTATATCCATAACGTGGATTCAGTGACGACCTTAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 + chr2R 1277033 5' - Tirant 355 2 57.53 TGATTATTTGTTTCTTACAGGCGAATCCATAAGCCGAGCAGAAGATGATGTTTAACGGCAATGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGACACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGACAATATTGAAAACTAAGTTTACCCTCGAGC:1 + chr3R 2307265 5' - gypsy 7185 2 69.86 TATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:1 + chr3R 24809872 5' + 1360 43 1 56.85 CGGGTGAAATGGGACTTCGTCCACCTGGAGGATCCAGATCCAGTTCGAGAACCGGTGATATATCATCTATGTCGATGTCATCGATGTCCTTCTGCTGACGCTCCTCACAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATT:1 + chr3L 9747706 5' + R1A1-element 5156 1 73.29 CACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2L 1449585 5' + opus 7024 2 59.63 GAACGGTACCGAAGCCATCCCCATCTGCCAATGAGCTGTTAGACGGAGGAGCCCACGCAACAGGCTGCCGAGTGGGTGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGGCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 + chr3R 14096995 5' + transib2 28 1 61.64 CCAGGACATTGATGGTTATGTCAGGCGAGCATGCAGGCCATAAGACTCACGTCATGCCAGCCACATTATGCAAATAGATTTGGCCGGTTCAGCGCTCTGTGTGTGTTTTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGT:1 - chr3R 27655896 5' + R2-element 3342 1 72.60 GTTTGTTATCCTTTTTTGGTTATGGGTGCGCTTACTGGCTAAAATAAGACTACAACTGCAATCGAAAAAGTGGCAATAGAAATATTACGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTCCGCTTATTTTTACCTTATT:1 - chr3R 22960870 5' + Q-element 509 2 56.85 GGCGGAGAATCGCCGAGGAATCACGATAGAACCGGCAGCGAAATGTCCAAGTTCTTTGTGAATGTTGCCCACCGCCGAACCAGAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACCACAACAACAGCAGCAACAACAGCAGAG:1 - chr3R 21626518 5' + TART-B 153 4 52.08 CAGAGGCGGGTGTGCAAAGGGCTGAGCGTAAATATGAGCAGATGAAGTCCAGGAAATTGACGGCAACAACGGCAAACAACATTTCCATTTGAACACATAAATTTATTCGACTTACGGTAGAAAAATTAAAATCTTTTAAAGATACC:1 + chr3L 13747795 5' - Rt1b 5110 1 71.23 CTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGTGTTAGTGTGTGCGGGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chr2L 17747542 5' + Tirant 18 2 69.29 CTCTAGATCCCGGGAGCGGAAGAGGTGCATATGGGTGCGTTTTTATGGACAACAAGGCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr2L 10089690 5' - 297 6959 2 78.08 ATCGGAGACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr3L 16180994 5' + Transpac 4960 2 56.64 AGAATCGTTATCTCATAAACTACTCACTGGACACTCCTGATTTAATAGAACCCCATCCGGAGAAAAATTTTTTTTTATTTGTACTTTATTAAGGCTTATGGGGTAACTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTCTCTATTAATTCAG:1 - chr3L 9091471 5' - BS3 1714 1 56.55 CCAAGGCAATCAATATCGATAAGATAGGTTGAAACCGATTGCAAGTATTGCTTCTAATAAATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:2 + chr2L 7991268 5' + 297 55 2 60.27 TTTGTAGTTTGACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chr3L 5183661 5' + copia 4894 2 68.28 CGGTGTGAGATCGAAATTTGTTGGAATGCAAATCAAATTAGACACACATACACATACACACACACACA:1 + chrX 6914031 5' + Quasimodo 30 2 76.47 GTTCTCCGGGAAAACGTGAATAAGAAAAATGGGGAGTTGACCAGGATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:2 - chr3R 9958740 5' - opus 7467 2 62.33 TTTCATTACATAGGTAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTATGTCGATTCGTCTTTTAATACTGATCAAGAACTATACTAACTAATGTGAAGCAATCAGATTTGATATGCATATGAAGACATATACATACATATGTATATGTACATAC:1 - chrX 3681043 5' + Stalker2 7500 2 55.48 CGAACGCTTTGACTTTCGGAGGCAATAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTGTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTACAGTAAATG:1 + chr3R 26399821 5' - roo 8978 2 80.14 TGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2R 6984388 5' + Doc 36 1 61.64 CATGGACATATTTGCAACGACACACTTTACCAAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chr3R 10143074 5' - 412 7527 2 71.92 CATTGCTCACCAGATACTCAATGATTTTGGTCAGGCGCTTCTCGTAGAGAGCCAACCGAATCCACAGATACCTATGCGAAGATATAACAAAAAAAAACAAACAAA:1 - chrX 20461700 5' + gypsy7 5002 1 79.05 TGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr2R 6187968 5' + Tirant 8145 2 58.99 TAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAATTGAGCGTGATATAAGA:1 + chr2L 17162782 5' + blood 80 2 71.23 ATTAAGGCGAGCGCCCCAACCAACCCATAACCCCCTTTTGGAGGGGGGGGGGGTATGTCAAGCATAATGAGGCATTATGAAAAAATGATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTTT:1 - chr2L 11227492 5' - Porto1 4231 1 73.04 CACTCATTTGCCATGTCCGTTTCCGCCCCACAGCCCCCAGACCTTCCCACCAACAGACCCTTCCGCCACGCCTCCGCCTCCCCTTGGCCAGTTAATGCACCTATCTAATTTCTATTCAATAATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAA:1 + chrX 22661005 5' - Bari1 302 1 68.49 CAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr2R 9164945 5' + 412 53 2 52.05 GATGGATAATGAAAGGGGGCTAATGAAATTTTAGTCTGTGTCGATCCATAACTGTAGTTATTAATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 + chr3R 2474281 5' - Juan 4155 1 59.59 GGTTGGCCTTTCGTCTATAGGATTTGTTTTTTTCGTAGATTTATCTCCAGTCCAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATT:1 + chrX 8622002 5' - Burdock 6163 2 63.70 ATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:3 - chr2L 14262948 5' + blood 35 2 56.85 GTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTCCAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 12142561 5' + hobo 45 1 54.40 GACCGCCGCTAGATGGCGCGTATGCGCAATCTTTGAATCTATCGATTTTCTACTTATGTAAGTATGTAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chrX 21605784 5' + P-element 55 1 47.59 CATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCC:1 - chr3R 1446143 5' - 1360 3376 1 27.40 GAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 22221121 5' - 412 473 2 67.59 AATCGACTCGAATTTGTTTTCCTTTCGTCCTAAGACTTTGCCCAGATATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAACGTTGAAGGCAGCCGCCGGCCTGACATACATTTATTCACTTTCTGCTTTTG:1 + chr3R 27835592 5' - 412 7477 2 56.85 ATAAGCGTCCATATTGTCGTTGTACTCCGACAGCCACGGATGCTCGTTCTCGTCGGCCAGCTTCTGCCACTCGTCTTGCACAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chrX 1867977 5' - roo 400 1 54.79 GATTTGGTGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr2R 20500056 5' - 412 415 2 73.29 CAAGCAGTATAGTACGAGTAGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTC:1 + chrX 12893326 5' - Bari1 1659 1 52.74 CATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3R 12787122 5' + 297 6642 2 63.01 AATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr3L 3540231 5' + mdg3 5287 2 50.34 TGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2R 16908488 5' - roo 341 2 63.01 GAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCTATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAA:1 - chr3L 15099663 5' + G4 3832 1 43.15 CAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chrX 15167674 5' + roo 78 2 76.03 ATTTTGTATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr2L 14222378 5' - Transpac 5198 2 65.07 AATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACAGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCG:1 - chrX 21667913 5' + gypsy2 6565 2 74.62 TAATGGGTTCTGAGAACTACTTACGATACAGCTTAATTGTGCCGTCCGTGTCGCCCAGGGAATTCTTGGCCACGCAACGATAGGATCTGTTCCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAG:1 + chr2L 5604692 5' - baggins 5284 1 72.50 CATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGC:1 - chr2R 5022766 5' - Gypsy12A_LTR 69 1 56.16 AGATTATAGTGCGCCGATATGGCAGCGGATTTGCTGAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAATGTGATAGACGCTAATATTTTTTTTTAATTTGTCAT:1 - chr2R 12329768 5' + Tc1-2 1365 1 73.79 GAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:2 - chr3R 25521908 5' + blood 47 2 53.42 GCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTTTTGACACCCTACT:1 + chr2R 20704140 5' - hobo 2872 1 61.64 GAACATGACAAGAAGAACTATTCATCGCTCCATCTCAAAAGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGATTT:1 - chr2R 2527451 5' + roo 8744 2 51.03 ACTCGTGGCCGACTGGCAAGCAGCAAAATGCAAATGCAGATGCAGATGCAAATGCCACTGCCAATGTGTATGTGAATGTGAAATCGGAACAAAATGAAAAGTGCACGCCAAATACAAAAAACCGAGCAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 12350716 5' + R2-element 3581 1 61.81 AGCGTTAGAGTGGGCGTGGAAACATGGGGTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTTGACGCTCTTACGGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTAGGCTATTGGTCCTGATC:1 - chr4 71482 5' - INE-1 92 1 65.75 TTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCNGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3R 3322536 5' - 1360 3339 1 65.22 TGACAAGAGAAAAACTTTATCACAATTGTAACGGTCAAAAGATTTATATTGAAAATTATTTTTGTTATTAAGTGGATTTGTATGTGTATATTGTACTAACCCTTCGTGACTCAAAGATGCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAA:1 + chr2R 3351707 5' - baggins 5351 1 62.07 TATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCA:1 - chr2R 6559010 5' + mdg3 72 2 73.97 AAAGGAATCTGAAAATGAAGTACTCTTTTGGCTAATTACAACATGTTGGATGCAACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTC:1 - chr2L 15995504 5' + 412 276 2 60.87 GTCGATTGGTTCGTTTTGGGTCGTTTTTGGCTGAGCTTTTTCGGTGGTCTGTGATTAATTGGCCATCACACATCGAGCGGTCAATAACCGATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTAGCAACAAATCAAGAA:1 + chr3L 3276345 5' + F-element 344 1 48.44 GATAAGCTCCCGATAACTCCTATAAGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chrX 3529699 5' + 412 7080 2 67.12 TCAGCCGCCCGTCGCCCTTTTCGTTTCCATTTTGGAGGTCATCTCAACTTCGGCGACTATCAGCTACCAAAGAAAATAGAGCGGCGCAGCTAGATCAACATCTCAATAGCATGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3R 8819030 5' + 297 6610 2 76.03 TTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTA:1 - chrX 22824255 5' - Gypsy12A_LTR 2235 1 50.68 CTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCG:1 + chr3R 25271207 5' + 412 7148 2 78.08 AAATCTAAAAAAATCTAAGAAACAATCGATATTTAGCCCTAAAAACAAATAATATATAGTGATAGTGTTTGTGATTAATACTCTAATAAGTTTAATTCTAGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGTATACTCG:1 + chr2R 2787884 5' - Doc 4523 1 60.69 ACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACCTGCTGTGGGTC:1 + chr2L 1229586 5' - opus 7434 2 65.28 TTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3L 13597721 5' + blood 37 2 60.96 CAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCA:1 + chrX 16244879 5' + jockey 4811 1 51.37 TTCCCTGCACGAAATGAAAAATAATTCCCAACTTTTCCGAACCTAAGAGTTTTTCCTTTGCCTCACCTGGTCATGATTTCGATTTTTTGCAGCTTTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAA:1 - chrX 17470233 5' - blood 394 1 69.18 GAGGTGGAAGACCTTGGTTCTATGGTACTTGCAGGGACCCGTATGTGTCGGGGTCCGGTTTATCTGGACCCGTTTTCTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGA:1 - chr2R 5856241 5' - flea 4943 1 53.42 GTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAAC:1 - chr2L 23295869 5' + micropia 70 2 64.38 CCAAACACATAAAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 27835722 5' + 412 7073 2 71.53 CTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 + chr3L 23146476 5' + 1360 66 1 63.01 TTTGATGCTTAGTTTGGATCTCTATGTTCACGGGCTTATCTGCGGTTGTGTGGTTCAGCGTTCCTAGAATCATAACTTATTCAACATGAAAAGCCAACATTAAAGTAAGCATTTCTATGGAATAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 + chr2R 14717718 5' + Max-element 8247 2 79.45 AATGGGCTCATGGTTTTGCCGAATAGAAAACTGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCGACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1 + chr3R 9289257 5' - HMS-Beagle 7019 2 68.49 GTTTGTGTTTGATCTGTTTTTGTTGCCCCCAGACAGGATGGACATGGCGGCAAGGGGGGCAGGCACACGGATATGGACAATGGGGTGGGGTATCGCTACTGTTTCCCCCTTTCCAATTTAATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGA:1 + chr3L 16215900 5' + roo 433 1 71.23 GTTTAGCTTTAAGGGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACT:1 - chr3L 11596393 5' + gypsy6 7447 2 66.44 ATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chrX 14385131 5' + blood 35 2 60.00 AATTAACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAGGCAGGAAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chr3L 6751760 5' - pogo 2043 1 56.16 TCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATAC:1 + chr2L 15142270 5' + BS 4796 1 77.40 TTGTGAAAAACTGTGACGTTATGCACATGAGTGAGCAAATAGCAACAGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr3R 25508542 5' + hobo 73 1 69.86 CGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGAATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGT:1 + chr3L 4710751 5' + Doc 95 1 76.03 ACACGAGATTCCTTGATGTTTGATTGGATCGTGCATAGACGATGCTCATCTTCTTAATTGTTTACCTATTCTCGCTTCTTAAAGAATTCTCCTTAAAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chrX 3506194 5' + Tirant 8113 2 74.02 CGGTGCGCCACTGACTTCCTGTCCTTGAACCTGGACGTCCTGAATCATTTGGGATTGCGGCAGCTTAGCGGTGGGTGGACCCATGTTAACCAAGTTAGCATAGCCTTCAGCAGGATTCGTAAGGACACAACTTATTCACTGCCCGC:1 + chr3R 2925849 5' - diver2 4459 1 78.08 TTAATGCTGTAAAAGATACTGTTACCAGTACCCTGTTGAAATTTTGCAACGAAATTGATGAAAACTCCAAGTGTGTATATTTGATTCTTAGATAAAAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCATCTAGCACAACACGCACACATATA:1 + chr3L 23085011 5' + 1360 3212 1 44.52 GGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAG:1 + chr2R 19076498 5' + F-element 197 1 59.59 GTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCG:1 + chr3L 3540136 5' - mdg3 167 2 64.38 TGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCTTGCTTGAGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCA:1 + chr2R 4284688 5' - invader1 250 2 69.86 ATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:2 + chrX 14962206 5' + jockey 75 1 61.64 CGTTGACTACTTAAGAAAATTGTTTGTTAACTTTGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTC:1 - chr2R 20362347 5' + diver 5901 2 76.39 CTTTTACCGACATCTGCGGCGTCGCTGATAGTTACTTCAAGAAAATAAGTAATCAACACAAATTTTTTACAAGTTTCTTATAAAAGAATGCCTCTCCCACTCACTATTGCCCTCAAACCTTTTAAAACTGTCACGCCCACACATTT:2 - chrX 22663963 5' + INE-1 246 1 69.86 GTATAATAAGGGGGGTTAATGATGATTAAAAAAGTCCAAGAACAGTCCGCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAA:1 - chrX 5892167 5' + transib2 69 1 65.75 GAGTGCTGCGTATAATGAAATTCGTATTCAAAATTCGTCGTCATTCAGTTGCTGCCGCTGAATCAGAATCTGACTAAATGTTTGTCGAGCTATGGGACTGTTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAATTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1 + chr3R 11855464 5' - TAHRE 10434 1 73.97 GGTAGATCACACTTTAACCAGGCATATGAATTCGATCTAAGATTGTTTACCTCTGCAGCGATCAAATTGAGTGGAACCAAATTTCGAACAACGTGAATGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAA:1 - chr2R 7329492 5' + copia 4954 2 66.44 CCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chrX 19162553 5' - pogo 2074 1 63.31 AAAAACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chrX 10101297 5' + mdg3 5292 2 57.53 GTCGATCTTGAAGTAACTTTTAACGACCTGTGCTTGTAAACTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAG:1 + chr2L 8452258 5' + copia 81 2 72.60 CGAATTTTTAGCTTCAATCACATAGGCAGCAGCTGATGCAGCAGACCCAGATTTTTTTTTTTACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 16908587 5' + roo 56 2 59.31 CTCCAAACCGCAGCAGCAACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGCTTGGCA:1 + chr2L 1136272 5' - 1360 3360 1 65.75 GCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr3R 5765308 5' - opus 7462 2 58.90 AGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 - chr3R 25384257 5' - mdg3 160 2 74.66 GCGTTATCTTATCTACATTTATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACCACTCCCCAACCACACCCATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTATG:1 - chr3R 3389457 5' + Rt1a 4778 1 54.79 GATATAATAATGACTCAAAATTCTCGGAATAAACAGCCTGATAAGACCGATTTGTTGAGCTTATTAAAAAGAAATGCACTTCCGATTGATACACAGTAGCGTAATGGATTCAGTTGTAATTGTGCACCATATGCTCACTTGTGGG:1 - chr2L 14775057 5' + R1A1-element 5252 1 73.10 ACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 - chr2L 15965293 5' + blood 7087 2 67.81 GCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr2R 7223644 5' + blood 51 2 53.42 AGGTTTTATGATGATCAGCACTTTGTGTTTTTCCAGATGCATTAAATGCCCTAGGCATAGGGATTCGAAGGCGGCCTTCGATCATAATCCCATGGTCGTTGACCTTTCCATTCCTTCAACTTTAACCCAAGAGACGTGACGAACAA:1 - chr3R 17667731 5' + Bica 4493 1 78.77 TTTGGCTAAGAAGATTACCCACTGTACAAGTTGCTGGGCCGTCAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATT:1 + chr2R 21897866 5' - 412 443 2 51.39 TATTTTAAGTATCGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 + chr2L 8542738 5' + P-element 79 1 29.66 TACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGC:1 + chr2L 15153287 5' + G-element 98 1 76.92 CCCTCTTGGTGGAAGAGTTTCGGGAATTTCTTACAGAGGGTTTTTAATGCTGTAAACTCTTCAGCATTTAAATGGTCTGTGTTTAATTTACAAAGAAGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCA:1 - chr2L 23050449 5' - Tirant 120 2 66.44 CGTTTTGGGAAATGATCTTCGGTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 19604520 5' - blood 7180 2 64.56 GCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGA:1 - chrX 13762622 5' + P-element 88 1 25.34 GCATCGCCAGCGGAATTTACCTCTTCCGCAACTGGATCGATATGTTTACACGCATGCGCGGCCAGGTTGGTACTCCACTAGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chr2L 7991401 5' - 297 6939 2 61.64 CCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAA:1 - chr3L 9198632 5' + F-element 104 1 81.51 CTTTTTTGTGTTTTGGTTTTACTATATGACTTTTTATTTGCACCGAATGCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3L 15321915 5' - Transpac 299 2 78.17 CTAAATCAGTACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr2R 18123368 5' + 412 9 2 73.97 TTTTTAAAACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chr2L 8772853 5' + Tabor 6873 2 62.33 ATTGATGGGTCTTCAGATGGAAGATCTGTAATTGTGGAATTCTTTGGCTTGTGCAATGGCACCCATATATGTGTATATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTT:1 - chrX 12893462 5' + Bari1 43 1 53.42 CGAGAGTATCAAATGTACCTTACACTATGTTCTGACCCCCAAGAAATACATTAAAATATCAATTTATCCCATGTGTAAACTTCGGTAGGCAAAAGGCGTTACTAACATCAATTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGGTTTT:1 - chrX 20805458 5' - transib3 448 1 58.22 GAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTAT:2 + chr3R 20147897 5' + 1360 335 1 77.40 ACGACTTTGAGATGAACTTCGCCAACCGATCAACCATAGGGGCCTTTCTTCACTTTGATGTGGTTGTAAGTCATGGATAACCCTGATGAAATGGACATTGTGGTGAACAGTGTTCCCTTGATCATTTTGGTCCTTCGAGCCGAATG:1 - chr2L 882091 5' + GATE 273 1 76.71 TTCAACGGACGGAAAGTTTCTTTCTCCGCTCTAAATCCGCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chrX 16853455 5' - roo 402 1 77.69 CAATGTTAAGTTATCACCCATCTGACAGGAGTTACATAGCTACAAAGCATCTGCTATAAGGTAAACGAGTAAATTCAGTTAGCTCTCGAAAATGATTCTGCACTTATCTTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGC:1 + chr3L 2671054 5' - R2-element 3380 1 74.66 TTTATAAATCGACTCGAATTTGTTTTCCTTTCGTCCTAAGACTTTGCCCAGATATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAACGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 + chr3R 27835586 5' - 412 7483 2 59.59 AAAAACAAAGTGTTTGCAGCGACAAAAAAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCA:1 + chr3R 23346514 5' - Rt1b 5109 1 67.81 GTTTCTCTCTCTTTCCATATAGCACCCGTCTATAACTTTTACCGCTGCCGCTCCCGCCGTCTGGTTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chr2R 17100162 5' + P-element 54 1 48.63 ACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCA:1 - chr2R 17182803 5' + jockey 4614 1 54.79 AAATTGCTTTGCCGTGGCAAGGAATAATATCAGCACATCCTTCAGCTGGCTGTGAAAACATGCAAAGCCCACAAGTGGTAATCCGCCTATATATTCCATATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chr3R 12540276 5' + flea 4773 2 74.66 ATGCTGACAACCAACAATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chrX 5222991 5' + 412 7081 2 66.44 CAGTACAATAATGTTTAAAGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAAATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr3R 15589927 5' + Transpac 30 2 65.07 TAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGTTTCAATGTTTAAGTCATTATCTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGGTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGG:1 - chr3L 14257254 5' - Porto1 4300 1 75.86 ACTGCATAAACAAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3L 13722150 5' + blood 30 2 65.75 GCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGT:1 - chr3R 31120250 5' + opus 85 2 78.08 AACAAAATTTTGTAGTAGTAGTAGTAATTGTATTGTATATATGTATGTAAGTATAGTACTATAAGCACCATTGCAATATTAAAATGTAAGAACTAATTATAAGAGTCGCGAATGTAAATAGTAGAGAACTGAAAGGGTGGCATTTT:1 + chr2R 14551122 5' + hobo 4 1 71.92 AAGGCATAGGCAAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATT:1 - chr3R 20147569 5' - 1360 342 1 56.85 GTTTTTGCTGCACAGAAATCATGAATATTTTATTGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2L 15621841 5' - hobo 2905 1 54.76 CAGGACACGAGCTTTCAGATCTTCCCTGGTGCAGCTATGAGCTATCTAGTATATTTGTCCCAAATTTCGGGCCACAATGCATAAAGTGCAGCTCTCAAATTTTTTTTATACACGCACATTAAAGCTCTACACCCCAACAGCCTAGC:1 + chrX 21086031 5' + jockey 4668 1 79.45 ATCCTCTATTACATATAGTACATATATCGTGTATATTTTGCAGCGCTCGATTGCTATGTGTGCACCTATTTGTCTCAAGTGACTGATTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGAT:1 + chr2R 19332665 5' - roo 106 2 50.68 AAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 + chr3R 10079329 5' + P-element 61 1 25.45 ATACGATTCTGCATATGTCGAATGGGGAGTTATACAGCTTTACCTCATTTAAGGCCCTGAATCTTATAAAATGGCTCATGAATTAAATCAATGCAATGTTGTTCAATTGTATTAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATG:1 + chr2L 22538574 5' - TLD2_LTR 37 1 53.42 AAATAGATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2R 20704266 5' + hobo 26 1 60.96 GGCAATGAGGTTCTGCAGAAGAACTATGCACTCATATGAAAGTGTGCGGGATGCAAAAAGGCTGCGAATCTAGAAGGGTTGGGCGGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 - chr3R 31916215 5' - hopper 1381 1 62.33 TTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr2L 19424650 5' + Tirant 8168 2 58.22 ACATCGACATGGACATCGGCTGACAACAATCAATGTGCGATGACATTTCTCTTTCTCGACTTTTTTGTTCGGTCGGTCAGATGGGAAAGTCAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCG:1 + chrX 8212627 5' + flea 435 1 65.07 GCCCGTCTTATCGAGGGAACCAAGGCTCGCCTCGCCTCGCCAAGGGCAGGCACGTCGGCACTTAAGCCTTTTAAAATTTATGAGAGAACAAGTCGGAAAACTTGTCATGTTTATATGGATGATATAATAATCTTTTCTAATACAAT:1 - chr2L 13740285 5' + TLD2_LTR 56 1 54.79 CTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chr3R 10140184 5' - P-element 2825 1 39.73 ACATGCCCAGACATGCGCAGACATGCGAGAATCCAACAAGTGCGGCATGGAAGTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 15089441 5' - P-element 2877 2 78.77 CACGTTTCGAACTGAAAGGCACGACCATGACGACCGAGAAGTCGCCAGTGCACAGTGGGGCTAGGAATGCGCTAAAAACATGGTTCATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 13843667 5' + roo 8698 2 58.90 GCAGTGCAGCTCCTCCTGCTTGCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2R 7223762 5' - blood 7335 1 56.16 TGGTTAGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 + chr2L 2357274 5' - P-element 2832 1 47.59 GCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGTTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTGTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCA:1 - chr2R 21056760 5' - Tirant 8424 2 74.66 TTTAAAAGTTAAAAAACAAAAACGGCGTAGCTTAAGCTGTTTAGAAAACTATGTGATTTCAGGAATCTAAAACGAAAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAG:1 + chr3R 4526273 5' - Rt1a 4855 1 55.48 AACGTGACAGGCATGTGTCAGGCCAGGCCGCAATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATGGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAG:1 + chr3R 27971572 5' + mdg1 462 1 77.78 AAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 - chr3R 10468087 5' + opus 177 4 67.91 ATCTTGTGCTCCTGGTGTGCAGAGCTGTGAAAGTCCGGATACTTGTAGTGCCCCATGTCGTTGATATCGGTGTAGATTATGTTGTCCGTTTCAGTTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGAACTTGCATCGCATAGAGCG:1 - chr3R 4927378 5' - F-element 130 1 66.44 GTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chrX 5222886 5' - 412 7456 2 80.14 GTAGGCCTGGGAGTTGCAGAGGCAGGTAGCCGAAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGAT:2 + chrX 693642 5' + INE-1 131 1 47.26 TGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGTCCTGTTGCCCGCTAGAGAAATTCGGTGGCCATATAGTTATGAGGAGGGTTGTTAGGGCCTTGCGAGCAGAGAGCGTTGTG:1 + chr3L 16180865 5' - Transpac 285 2 56.67 TAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGG:1 + chrX 19231736 5' - mdg3 5440 2 56.16 GGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTG:1 - chr2R 5237880 5' + Doc 98 1 60.96 TGGGAATACTAATGGCTAGTATCCAATCCAGAAAGGACTCGCAGTGGGGACTCGCGCCTGGACATACCATTTAATATTAAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2R 5992419 5' + pogo 38 1 58.22 ATACGCTGTGTTTTCGATGAAAATTCCCCAGAAAAAAAATAACAAAAATCAAGCGCAAGGAATATACGCTTAGTTTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 - chrX 8354775 5' - blood 7386 2 50.68 GTTGGTACATATATCTGAAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr2R 22692482 5' + Ivk 12 1 76.03 CAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 + chr3L 18708603 5' + F-element 74 1 64.58 ATGGCTTTGTTCTGTACATTCTCAGATATAACAATTTTTATAAGGTAACTCGCGATTACAAATAGACTTACTACATTTATGCGGGATAGGTTTCTTACGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGACAGCAATTGTGGCCGTCACCAA:1 + chr3L 19410488 5' + 1360 3322 1 58.90 AGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:2 + chr3L 22529749 5' - roo 335 2 69.18 AATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr2R 5848975 5' - mdg1 7383 2 69.86 CACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCT:1 + chrX 17469184 5' - blood 7318 2 67.12 AATTTAATCAAATTATACATATTTTTATAGACAGATTTTCATAGACATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1 - chr3L 23287149 5' + Quasimodo 73 2 68.49 ATGGAATTTTATACAAACACAAAATGAATTAGTGATTTTTATGCTCTATGTTTAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 30568948 5' - roo 394 1 66.44 ACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr3L 7434949 5' - pogo 2039 1 61.64 CGTTCATATGCACATTTAATTGGTCATTTACAATTGGTTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 + chrX 14914337 5' - mdg3 5447 2 52.74 CTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3R 27503037 5' + hobo 52 1 64.52 AAGTAAGTTTTTTCTGCATAAGTTTTATTCTGTACTGTGCAAAAAAATATCCAATAGAATAGCTAATTTAGAAGATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAGGTTACAATCGATTG:1 - chr3L 21483552 5' - Cr1a 4262 1 50.00 ATTGAATTTTCCGATGAAAAGCTGAAAATGCAGCACGAGGTCAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 + chrX 3452368 5' - Tirant 389 2 78.77 ATTGACAATTTCCTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:3 - chr3L 3540274 5' + mdg3 5259 1 79.45 ATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chrX 10960300 5' - Transpac 5172 2 57.64 CAACTAAACCATTTAAGTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3L 14581329 5' - pogo 2089 1 77.24 TATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTA:1 - chr3R 5765417 5' + opus 189 4 73.29 CACTACTAGCAAATCATTTTCACACTCGATGCTTAAACACAAAGAACAGCACCCTAACACATATCAGGAAAAGTGAAAATTCGAAACTAACTGACGAACATGAACACTGAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 + chrX 22591217 5' + copia 4883 2 76.71 GCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:2 + chr3R 25271160 5' + 412 48 2 53.42 AAAAGTCCTTAAAGTTGAAAAGTACTATTTTCCATCACTTTATTTTATTGAAGCATAAAAGGTGATAGGAACAAACCATTCAAAAATTTGTTCAATAGTTTCGATAATATAGATTAAAGCAACATAAAAGGCAGAAATTCTGGTGT:1 - chr4 279680 5' - HB 1444 1 58.90 TTAAGCCAGGTTAAGTGCTCGCACCTACGCACCTATAACAGTTTGAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCAGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chr3R 13358734 5' + mdg3 5263 1 77.70 GGGTGCCACGAAAGCGCTAATGATAATTTCAAGTGCATAATGTGTATACTTCTGTTCGAGCTTATGCTAGTTTGTATCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATAT:1 - chr3R 12371738 5' + 412 252 2 52.74 GAGAGGTAAAAGGAAAAGCTTGTCCGCCATCGTTAAGGTGACGTCATAATGTCTGCAATACAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 16513072 5' + jockey 18 1 76.03 CGTCAGTTTTTAATAAATATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3R 23664365 5' + pogo 43 1 53.42 CTGAAATTAGGGCGTGCTGGGGAAAAAAAGTCTCCATTCGCGTCCCTAATAAAGTCGTACACAAAGAGAAATTGTGTTTGGGTTTCTATATAATTTTGTTTTTATTTTAATAATCGCCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGACTCACG:1 + chrX 8728090 5' + BS3 137 1 71.23 GACACGAATTAGATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTA:1 + chr2R 2949012 5' - 17.6 7372 2 56.85 TGTCCCCTTCTGCTGGGCATACATACAATTCGTTTTTCCATTTGCCTGCACGGAGAACCAAACTAAGGATTTGTGTAATTGATATATGTTTGATCACCATCTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr3R 12787270 5' - 297 6960 2 73.29 TCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr2R 9326955 5' + mdg3 42 2 52.74 GATAGCTGCTCAATTTGTAGTCCAACATTTTACCTCAATAAAAGCGGCTTTTATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2L 9010554 5' - 1360 3362 1 67.81 AGGCAAATAAATGGCCACGCCCAACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTA:1 + chr3R 7424511 5' - 412 469 2 65.67 CAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 - chr2L 14222336 5' - Transpac 5156 2 71.92 GTAATTATCTTTTACAATTTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr2L 2464179 5' + pogo 36 1 65.07 GAGTGGAAGACTACCGCTAATAGTCATGGAAATTCGTTATCAGACAGCCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr3L 9430576 5' - P-element 2816 1 39.73 TCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCGACGACCGATCGTCCGATGACTCGCTCCGGCCAAAT:1 - chr3R 30731447 5' + gypsy6 7461 2 64.71 AAACTCATGGAATTTACTATTGTAGATTAGTTGAAAAGAACGACTAAGTATGTAGGTATACCTTCTACCGAGATCTTTTAGATCCCAATTAGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 - chr2R 6579629 5' + mdg1 7068 2 62.33 ATGTAGGTAGCAATAGTCAACATTGTCAATTATTTTCGCAATTTGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTCATGCTATAA:1 - chr3R 7549731 5' + copia 68 2 68.38 TCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr3L 18708608 5' + F-element 64 1 64.34 CAATGGGCTCATGGTTTTGCCGAATAGAAAACTGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:1 + chr3R 9289256 5' - HMS-Beagle 224 2 70.55 AAGTACAAGCTGAAAAATACAAAAATTTTAGACGACATCGTCGACATTCTAAAAAGCCGCAGTACACTCCAAAAAAGCCGATAATAAGAACATGACGAGAATCAGAAAATAAAATAAAATAACA:1 + chr3L 16182409 5' - transib1 1901 1 79.03 AAATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAATCTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCGAACACTTAAAACACTATAGCAGTCACCGACTATCTCTCTCAGAGTGCGGACGTCTGTGTCT:1 - chr3L 14043660 5' + Ivk 21 1 63.70 TTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACC:2 - chr2L 6074055 5' + BS 79 1 77.40 ATATTATATAATAAATTATATAGCACTGGCTAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 3762184 5' - roo 9041 1 58.90 ACGAGTATTTACTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGGGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3R 15514647 5' + 412 7084 2 62.33 GCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGGGTGAATAG:1 - chrX 19162665 5' + pogo 62 1 69.53 GAATGAATTTATATGTGAATATATTTTATTCATATAAGCGTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 19930222 5' + jockey 20 1 76.03 CATGGTCAGGGATATGGGGAAAACGAGAAACGAGGTCAGCGGCTGGAACGAAGAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chrX 8357778 5' + FB 21 1 68.28 AAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr3L 13722139 5' + blood 7052 2 58.22 CGAAAAACTTTTGCCCCAAAACGCGCACAATCAGTCAAGCATCATCTCCTTGTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTAGCGTTTTTTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTATGATACTCTTGTTCATCTCA:1 + chr3R 28205993 5' + Circe 7335 2 64.38 AATGGCATTAAAAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 + chr2L 19878121 5' - mdg3 222 2 65.75 GGGTTTCATTTCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGACTATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 16383415 5' - roo 403 1 57.14 ATATATTTTACAATCGTATACATTAAAGTCATGAGCCGTTTAATTTGGGCCCTATCCATTCGCAAGGACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:1 + chr3L 11610591 5' - copia 200 2 56.16 AAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATGACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGGATGCAAAAGTGATCTATT:1 - chr2L 6074097 5' + BS 33 1 51.91 CTTCTCGGCTGTTGGCCTATCTGCTGTCTCGGCCCAGACATTCTCTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 23623993 5' + roo 24 2 71.23 TATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 + chr2R 18048821 5' - opus 7422 2 73.97 TATAATTATGACAATTTTTTCATCCACGCCAAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACAC:1 - chr3L 4738499 5' + Idefix 33 2 59.59 GGAGCTTAGCTCGATTCATTTCATAAATACTTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chrX 11534561 5' + roo 36 2 59.59 CACATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGC:1 - chr2R 17014121 5' - HMS-Beagle 183 2 60.27 AGAGAATTTATTGGTAAAATGTATCATTAGGCAATCGCTGGTTATCCTATGGCTGTATTACTACACATTTTATATAAATTTTACAACACAATTTAATTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCC:1 - chr2L 13317597 5' - X-element 4690 1 52.74 TTTCAAAAATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 14136573 5' - roo 9013 2 56.16 TCACACACAAAGGGCTTGCTTGTCTGCGTTACTACGCATCCCTGAGATACTTTTCTTTTCACACTCATCGACTATTAGAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATT:1 - chr3L 10516931 5' - S-element 1253 1 62.33 GCTCCTTTGTGGTGCACTGTTTGGTGTAGTTATTGTACGGAGTGCTCGTACTGCCGGGATATCGGCACTGAAAGTGATCCTCCCAGAATTCTGAAATCAATTATTATTTAAAAATAGAATAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAT:1 + chr2R 8482938 5' + 1360 343 1 67.81 GCATTTAGTGCAGGCGTAATTAGCCAAATTGTTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCCCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCGTG:1 + chr3R 25521763 5' - blood 7363 2 65.96 GTGTGTGCGTCTCGCTGGCTGCATAAAAACCCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 10973148 5' + jockey 14 1 78.47 AGGTCGAAGGATACACATTAATCTGCTGGCTAATGGATATTGGCTTCGAACGCACTCGGAGAAAAGTCCCTTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 + chr3R 26765036 5' + mdg3 5263 1 76.03 TTCGTAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr2L 2519927 5' - roo 9035 1 59.59 GGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 + chr2R 5848969 5' - mdg1 7389 2 65.75 CATGGCTGCCCCATGGTAGAGGGGGCAGGATCGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2L 17730247 5' + pogo 6 1 60.96 ATTTTTTTAATTTAATTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTT:1 + chr2L 3976571 5' - P-element 17 1 14.38 AATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chrX 10979098 5' - roo 9007 2 64.38 AATACATTTAAAATGGCAATCAGACGTCAGTTGTCCATTGCATTGATATTTAATCAATAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTA:1 - chr3L 10840576 5' + mdg1 7211 2 57.78 TTTTGATAGTAGTTTTGTGTTTTATTCCGCATATGGCCAGTTAATAATCTAAGTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1 - chr2R 7404761 5' - blood 7322 1 65.07 AATAGCTGATTTGTTTTCAAATGTCTGGCCGAAAATTATACTTTGAAATTGTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAG:1 + chr2R 17144095 5' + pogo 69 1 67.81 AAACGGCCTTTGGAGTCACATTGCTATACTGTCTGATAGTTAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGTAAAGCTCTATTAACATCTAAGGTAGTAAATGAAGGACAGCCCTAAAAAAAAAATTGAAAGAAGTGAAATTTTTGATTTTCGG:1 - chrX 21976898 5' - FB 154 1 67.12 TCGTCCTTATATTTCCCACATCTGGCTGGTCAATGGTGTTAGTACATTGATCCCGATGTCCAGGAGTTGCCTTCTCTAATTTGACAAACTCTTTCTGCGCTACGTGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTAC:1 - chr2L 8397295 5' + roo 16 2 75.34 CGGGCTACTTTATGCTAATGGCATGTGACGACTTCTCCCAAGGCAAACAAAAACCTCGAAATGTTTGAGTAAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCA:1 - chr2R 14573233 5' + R1A1-element 268 1 51.37 TCTCTTATTTAGTTGCCATTTCTGACATTGATTTAATGTGGCTTCCGTCATTATGTGATAGGAATCTATCTCAAAATTATCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAA:1 - chr3R 19449270 5' + Quasimodo 7357 2 55.56 TCCGTTACATCGAGAAGAGAGATAGGTGATCATCGAGAGGATCATCTTGGCCTCATCTCATAATAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAG:1 - chr3R 18048330 5' - flea 4950 1 56.85 CCAATAATTTATTACATAGAATTAAGTTCTTTTTTTTACATTTAATAGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chrX 11228642 5' + roo 8738 2 69.18 TTGCTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2R 13849639 5' - roo 337 2 67.12 TTTTTTTTTTGGCCGACTTCGAGTCGGGCGTTTACATTGTTAACGAAAGGCACAACCAGCACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGAC:1 + chr3L 6630321 5' + jockey 4730 1 57.53 TAAGTAGGGTTTTTTGAGCGAAATGAGGTGGAGCATTCACGATATTAGGGGACTTTTTTGGACCGAGTTAAAATTACGATTTTTAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 - chr2L 19903501 5' + Transpac 4953 2 57.53 TCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCG:1 + chr3L 20756368 5' + INE-1 559 1 60.96 GTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr2R 21897983 5' + 412 54 2 54.79 GAGGTTAATGGTTGCGCATTGGATGCGTTTTTCAGCATTATTAATTGCATTTTAATGCTATTTATATCGGAGCAAGGGTATACAAGATTGTATGTACAATGCTTGTGTAAGCGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTTCCCTCC:1 + chr3L 4312615 5' - rover 6945 1 56.16 GTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:2 - chr2L 8772817 5' + Tabor 6909 2 63.70 ATTTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATATAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chrX 23283049 5' + roo 8720 2 62.33 TAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAAT:1 + chr3R 11461756 5' + 17.6 49 1 54.11 TAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 - chr3L 13722102 5' + blood 7089 2 71.23 GATATCCGCCAGGCGATCGGAGACCGTTACTGCCAAGGAATCGGTCAAATTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGA:1 + chr2R 22692352 5' - Ivk 5308 1 67.12 AGTAACCGCACCGCCATGGCCATGGCCACTTCATTCCATCGGACAGACGGACCATGGACTACGAACTTGGGAGTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGATCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGC:1 + chr2L 2629381 5' + R1A1-element 4950 1 48.63 GAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr2R 7404667 5' + blood 7066 2 52.74 AAAACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr2R 3009428 5' + pogo 61 1 64.38 CTCAACCCAAAACCCATAAAAAGCCCCTTTTTTTTTTGCGTTCGCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1 - chr2L 9287080 5' - jockey 4919 1 75.18 GCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCA:1 + chrX 14908395 5' - blood 7306 2 73.29 GGAAACTATACATCGAATTCAAGTTATAAAAGATCAATTTATAAAACACTTCGAACGTTGGTGCATTAAAAACATGATCTCTGAATGTAAAACCTACGCTGAAATTGGTCGAATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCACAATG:1 + chr3R 14389387 5' + Tc1 461 1 54.79 GTTAAACATCCAATCATTTTAGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 19446958 5' - roo 9023 2 52.74 ATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGCGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr2R 7223660 5' + blood 7046 2 52.63 AAATCAAATGCCATCACACGACAACTTTATTGAATTCAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 + chr2L 1449536 5' + opus 9 2 78.08 AAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 13849737 5' + roo 8719 2 56.85 CGGCACTAGTGCGCTGCCTTTCCCACTGCCACTTTCCCCGGTTTTCCCGCCGCTTTTCCGCGCCCGTTTTACCCTCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATAT:1 + chr2L 4104840 5' - roo 20 2 52.05 TAGCGCTCCAAACCGCAGCAGCAACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2L 1136267 5' - 1360 3365 1 69.18 GTGTGGGGGAAAAAATATCATTGCAACAGCAGGATCTCAGCCTGCTCCAAGTTAGGAGTATGAGAAGGAATGGCTCTTTATTGTGCATAATAATTGATCTTAGCCTAAATACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAG:1 + chr4 868189 5' - blood 219 2 50.68 CAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 + chrX 10960202 5' + Transpac 63 2 60.96 ACTTGGTTTCAGTTTACTGCCTTTAATTAAATTAAAAGAAGCGCAACAGCAGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 - chr3R 25876995 5' - mdg3 218 2 65.07 CAGCAGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTA:1 - chr2R 982419 5' - HMS-Beagle 6981 2 62.33 GTGGGTCGTTCGAAGAGTTTTCCGCGCCTGGCGGATGAAGGTCACCTTCCATTATTATAATTTATTCATACTGAGTGCCCCAGCCCCCATCGAGCCAACATGCACATTTGTACATTGTTTTGCATTGCCTTCACGTTATTATTATT:1 - chr3L 12275330 5' + 1360 305 1 76.03 CACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 + chrX 17469172 5' - blood 7330 1 58.90 CAAATATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGGGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr3R 14165144 5' + Tabor 43 2 54.11 TTCAAATATTTATTTCGATGCCCGACTACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 13543970 5' - 1360 3388 2 56.16 TATACTGTTATAACGGAGAATTCTGGGCAGCGACTGAATGATAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chrX 18365963 5' + jockey 15 1 79.31 GAATGGAAGTGGCAACAAGTGGATGGCCAGGGGAGTAGAGCTCTTCGAGTTTGGTTCGAGCGGGGGCGCTGGGTGATCGTCGAAGGCATGTAACTCCAGACGGCACGAG:1 - chr2L 442226 5' + gypsy10 5828 2 52.29 CACATTTACTTGCGAAAGTAAGCGTTTGCAAGTGTTTTGCCAGAATGGAATTTGAGTGAGAGCCAAACAAGTTTGTCCCCCAACTGACTATCCTGCCCGTGCGACTCATTATAATCAACGGCGCTGCCAACCGTGTTGTTGCCAGC:1 + chr3L 11757025 5' - flea 23 2 78.08 GCGCCACACGCTGATTTCGCTTTCTTCGCCTTTTGCTCGTTTTTTGTTTCGCTTTGGCTTGTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGC:1 + chr2L 16645668 5' - Ivk 5321 1 57.53 TATTGTTAACGCTGCGCTTTTTAATAGCTGATTAATCAATTTGCAAAAAAAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chrX 10960351 5' - Transpac 303 2 75.34 AGCTATTTCCCACTTGATGAGCCCCCGCCCCAGATTTACTATTCCTTCAGCTGGAATGAGTGCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chrX 9342545 5' - 1360 3330 1 59.59 CAAGCACGTAACTCATACACACGGCCTTAAAAAAGACACTGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCA:1 + chr3L 13343065 5' - F-element 4367 1 72.60 ACCACCTATGAAGTATGCAATATAAACTGTGCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATA:1 + chrX 19184731 5' + invader4 418 1 76.52 ATGCCAGTTTCCTTTTTAATCTTTCTCCTGCATTTTGGTAAGATAAGTTTCGGCGTCCCATTTGCTGGGGTATATTGGAGTTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr3R 8329825 5' + copia 40 2 58.22 ATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3L 14581349 5' - pogo 2069 1 63.45 AAACTATGAATTGAATTCTCTTTAATTTTCATTGACTATTTAGGAAGTCCCATTTTGGATTGGCACAGGGAATAGAAACTTCAAAAATAAAGTTCTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr3L 7416740 5' + blood 32 2 65.75 GCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACT:1 + chr2R 982341 5' + HMS-Beagle 6872 2 75.91 TTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAA:1 + chr2R 19633175 5' + jockey 4608 1 61.64 ACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTACTTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 + chr3L 21097131 5' + mdg3 77 2 67.12 GCAACAGGCTGCCGAGTGGGTGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCATCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 + chr3R 14097051 5' + transib2 84 1 74.66 TGGGGTATCTGCGACGCGACACATTTGCGCAGCCTTTCCTGTTTTTAGCCCCGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTTT:1 + chr3L 22925715 5' - Doc 4697 1 66.25 AGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 9938615 5' + roo 83 2 75.34 CATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGAATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2R 7223666 5' + blood 7064 2 61.90 AAATTAAATTGATAAAAGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 15621999 5' + hobo 6 1 78.08 ATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chrX 14962218 5' + jockey 84 1 69.23 ACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCGATCACAAACATGTGCGCAGATCGAGTGCT:1 + chr2L 4416081 5' + jockey 92 1 75.00 CCTTCCAGACGCGCGACAAGCGGATCATCATCTCCGCCCTCCAAGTCATCCAGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTG:1 + chr2L 19371237 5' + Bari1 21 1 69.18 CCACAATTTAATTTTCTTCGAGCCGATTTCGCCGACGTATGGCATTGTTGAGCTTCATATTGAGGATGTCTATTATAGACAGAACATAATTTTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGAGCTACAATGATTTAAGATAAGGGG:1 - chr2L 233951 5' - Cr1a 4139 1 54.11 CCTGAAAATTACCCAGATGCCTTCTTTATAACAAATCAATCTCTGCTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTGTGCGTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTTTGGATGTTGAGAGTCCTGACTTGAT:1 + chr3L 25457356 5' + Cr1a 4068 1 69.18 TTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 - chr2L 3734574 5' + mdg3 5293 2 53.10 ATAAAGTTTTAGAAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3R 18524201 5' - opus 483 2 75.34 GGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 - chr2L 3734607 5' + mdg3 23 2 52.05 CTTGGGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACAT:1 + chr3R 3617303 5' - micropia 180 2 79.45 TTCGTTTCGTTATGTCAGCACAATATAGGCACCTAAGCTAAGCAGATTAAGTTTGAGGAGTGCAGAAAGTTTAATCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chr3R 17840229 5' - mdg1 7456 2 50.00 AATTAATCTCCAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTATGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATA:1 + chr3R 25384149 5' + mdg3 5281 2 65.75 GTATGTAGGTATACCTTCTACCGAGATCTTTTAGATCCCAATTAGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAA:1 - chr2R 6579582 5' + mdg1 7115 2 71.92 TATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr3R 11121691 5' + copia 4923 2 54.79 GTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCAC:1 - chr2R 2949130 5' + 17.6 59 1 59.59 AAGTTGTTATGTTTGCTGTTTGCCTAAAATTATTAACTGCTGCTTGAGATTAGAATCAATGGCTGTTGGGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3R 18665360 5' - 1360 3340 1 52.74 TATACCACAACTTTTATCAAATGTTTTAAATAACGATATTGCATAAAATTCGGTTTAAAGTCTTCCTATACTGTATAAATTTAAATATTTATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chrX 18950650 5' + opus 22 2 70.55 TATAAAAAAAAACAAAACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3R 11526903 5' + pogo 28 1 67.12 TGGCAAATGTACAAAACTCATTAGATGAGTTAGATGAGTTCAATGACCGACACACGCGCTTTGGAATAGAAAACTCTGTTACGACTATTTCCGTTTTACCCTTTTGTGGCGTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2L 14005927 5' + hobo 9 1 79.45 GCAAAGTAAAGAGTCCTTTTTCCCAGGGAGCCTTTTTAGTAGCGAGATGCAGGGCACATGGACCTTTACTTCATCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAA:1 + chr3L 15395829 5' - Doc 4436 1 57.26 CTATTCTAAGGCCTTGTCCGCCGCCTTGAGCCACAACAGCAGCAATAACAACAACAACAACAGTAGCAGCAACAACAGTGATTGGCTCAGCCGGCGAACATTACAGTATCGCTACCACT:1 + chr2L 11236315 5' + G-element 145 1 62.18 AAGTTGCAAGCAGCAAAGCGAGTGATTTCCCTATCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1 + chr2R 6579522 5' - mdg1 7373 2 76.71 ATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 11228539 5' - roo 361 2 54.11 CGCATTCCTCCGCTCGTCCTCGCCGTAGTCAATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCT:1 - chr2L 18163839 5' + HMS-Beagle 6875 2 73.29 TGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTTAATTTCTTCTTTTGATTTTAGA:1 + chr3R 15514533 5' - 412 7469 2 68.97 TGCTCATTTGCATGCCACATGACAAAAAGCTCGTAGCAAATGCAAATTGAATCCAACTTAAATGCCCGACCATCGGGTATTTTAAATTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTC:1 + chrX 10698691 5' - Bica 448 1 59.59 CATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 + chr3R 9345572 5' + pogo 66 1 66.44 CTGATAGTCAAGCAGACATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGGCTGGATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGATTCCTGGGCATGT:1 + chr2R 4330779 5' + baggins 5275 1 52.74 ACACCACGCGAAATTTGCGGTTAAGCTAAGCAAACCATAGCATACTTCTAAGCGCCCCGGGTGTATCTGTATCTGAAAATGCATCTGCTGCTGTGTGTGTGTGAGAGTCCTGGATGCGCCATCATGTGTGTGTGTATGTTTATGTG:1 + chr2L 11785181 5' - Quasimodo 28 2 66.44 CTGTCTCTTTTCACTGCTCCCCCCCCCCTTTTTTTTTAATTTTTTTAAATTTT:1 + chrX 5363753 5' - TART-C 11096 2 62.26 CTGTGAATAGCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr2L 1229532 5' - opus 484 2 72.41 GCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAAC:1 - chr3R 24175765 5' + Burdock 6209 2 69.18 AATTCACTAATGGCTATTAAATGCGATAAATGCAAAGACTGTGATAAGATAAGGTGACTCAAGTGTGTGTTCCCCGTCAAAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGTCTCAC:1 + chr2R 19168036 5' + opus 7022 2 71.23 GTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATAACGAGGGTACACT:1 - chr3R 15649828 5' + blood 7020 2 60.00 GCAATGCATCAATGATAAGAAACTGATGTAAATCGCAATAAGTATTAAGAATATCCAGGTCGCAGTATATTTATCTCACATAAGAACCAAAAGGACATTATTAATTAATTATTAATTAGTTATTAGTTTTTTGTATAACAATATTT:2 - chr2L 17841149 5' - Juan 4070 1 67.12 AAATGCGATAAATGCAAAGACTGTGATAAGATAAGGTGACTCAAGTGTGTGTTCCCCGTCATAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr2R 19168054 5' + opus 7030 4 61.76 AATAGGGATTTGGGAAACCCCATCCCTTCGAAAACATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCAA:1 + chr3R 20452171 5' - blood 7339 2 50.68 TAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAG:1 - chr3L 24153246 5' + Tabor 6927 2 79.45 AGGCCTCATCGATGCCTCGTTATCCATCCCGTCGTGCCATCGACATTCTCGGCGGTTTTTCTTTTTTGATTTTACTTACCTTTTTTTTTTCCTTTTT:1 - chr2L 3598436 5' - Doc2-element 245 1 77.32 CCATTTTTATATCCACAAATTCCTACGCTCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGATGTGTGCGGACGAAT:1 + chr3R 4659550 5' + P-element 90 1 23.97 GGATTTTTGCACTCGACTCGCTGAGTTTTGGCAAGCTTTCGATTTCTCGGCTGCTGCGGAGGCTGCAAACAACTTTGGGCGGAATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTTCCCCTTTTTTGTTTTT:1 - chr3R 25753091 5' + hobo 375 1 60.96 ACTTCATCAGCAGAAATCCCCGTATTTGGCTTTAGTCAACAATTCCTGACTCAAAGTGGGTTTGCGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAAGTGG:1 + chr2L 9010419 5' + 1360 59 1 56.85 AAATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 9616688 5' - roo 9028 1 55.48 ACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3L 5446128 5' - roo 8981 2 80.14 GGAGACCAAAAATCAACTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 24455334 5' + 297 6624 2 55.48 GTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCGCACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr3R 9938663 5' - roo 316 2 80.14 TTTTAATTATTGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 23449331 5' + roo 76 2 69.86 CCGAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr3R 8402650 5' - mdg1 369 2 52.05 TCGATAGCAATCCAAACCCGATCCTTAGTCTTTGATGTGAGCCAGGCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr3L 1387271 5' - mdg3 229 2 74.66 GAATTCATGTAATTGGCCTAAAGACGTAGCCCTCACTTGATATATAAAAATATTTATTATTATATAGTATACTCTTCATACATTTTTCCATAATTACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr2R 8794024 5' - Transpac 5207 2 68.49 AGTGGGGCTGGGGAAAACTGCACTTTGTCAATTGCTCTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chr2L 11573666 5' + jockey 4757 1 76.71 GAACTTTAGACAAAATAAAATACACAAACACCATTTGCATTTTAGACGTAGAAATACAACGAAAATACTTTAATCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCT:1 - chr3R 7212736 5' + 1360 3227 1 50.68 TAGATTTTCCACGGCAATTTTCCAGGGCAGACAAATTAATGAACTCTACATTGACTGCAGCTGGGCCAGTTTATCAATAGCAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTAC:1 - chr3R 10187758 5' + Ivk 128 1 64.38 TGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGG:1 - chr2L 6074075 5' + BS 59 1 63.70 CGAAAATGTAAAGGGAAAAAACAAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr3R 10079281 5' + P-element 46 1 53.15 GAAATATATAGGTCACTCTTATTTTATTTATTTATATTAATATCAATATACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr2L 16596202 5' - 412 420 2 65.75 GTATACATAATACAACTAGAGGGAAATTTTGTTTCGTAAGTGGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3R 15030808 5' + jockey 28 1 69.86 AAGCTCCCGATAACTCCTATAAGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chrX 3529702 5' + 412 7082 2 65.52 AACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGC:1 - chr3L 14043644 5' + Ivk 37 1 60.27 CCGCGAATATCTGGCCACAAATGCCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTAT:1 - chr3R 24175806 5' + Burdock 32 2 63.70 ATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:2 - chr2L 1449686 5' - opus 7440 2 61.64 AAACTGAAGCAGCTTTGCTCTAAATGGGATGAGTTTGACACAATCATTGAGGAGCTAGACAACTGGATGAAGAATGTCGAGGCGGTGGTTAAGAACCAAAACCTCAAGATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTT:1 + chr2L 5131159 5' + 1360 279 1 70.55 AATGCCTTTTTGCTATCGCTTCGCTCTTCTGTAACCGCCTTTCTCTCATCCTCCTCTTTTAACTTTATGGTGAGAACATCGAAAGAAGGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 6340960 5' + roo 32 2 65.07 GCCACGACTGTTCAAATTTGGACAACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 22429267 5' + roo 8693 2 65.75 ATTATTTGCTTCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCT:1 + chr2L 8959882 5' + Ivk 5130 1 50.68 ATCACGCTGGGCACACGCGTCAATGACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 + chr3R 25876812 5' + mdg3 5264 1 78.08 GTAGAAGAAGAAGACTGAGCACTTTCTTTTCGGCTGCATCGCTTACAACCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chrX 16456729 5' - P-element 2816 1 37.67 AACAACTAGCCGATATTTACGCAAGTAAAGAAGTATGCGATATTCTATAGAGTTCCCCTAACCCTGATTGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATTCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr3R 4884365 5' - pogo 2054 1 52.78 GTGCGACAATTTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACG:2 + chr3L 9375793 5' - mdg1 389 2 61.64 CCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGCGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chr3L 5438729 5' - hopper 1380 1 50.82 AGACTAAATGATAGTGACAAAAATCTTTCTTCCCCTTTTCCATTTTCCTTGCTCTTTTATATACTGCTTCAACACTACCCCTCCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 + chr3R 3788279 5' + 1360 42 1 58.90 AGCGATGATATGAAAATTATTTTTAATGAATGCTCTCGGTAAGGACACCTTGTTAATTTGTGTTTCCTTTAGCAGTACCGACACCATTAATGGTAGTTCGGGTGTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2R 15062124 5' - blood 360 2 73.29 ATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCA:1 + chr2L 22696394 5' + X-element 85 1 67.81 GGTCGAGTGGGGGCATCATTATTATGCCATGCACAGTTATGTGCCTGACCCGAACGGAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGAGTGGCCATTCATATC:1 - chr3R 11097642 5' - copia 59 2 59.59 AGTGCCGGTGGAAGACTGGCCGTTCCGAGTGGCCGCGGAAGACGGGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGGCGGTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGGGGACCACGATG:1 - chr3R 2894719 5' - Q-element 502 2 54.78 CAGTATTAATGTTAGTCTAAGATAAAATAATTAAACAATTTTTATTTCCAATTCAATTCCTTTTTCATATTATTAGTAATTTCTTATTTTTTATATTGTCTTTATATTGTCACTGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGT:1 + chr2L 22713305 5' + Ivk 19 1 71.92 AATTGCACCACTCAAACTCACAAAATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chr2R 24630086 5' + copia 4891 2 67.81 CGATGTGTGCTTTTCGCGATTAGCCGAGCGCCAAATGAGCTGGACGCGACGGATGGAGGAGCACGTCCCCGATTGAGGCCCGCGACGCTCCCCCGACAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAGAATTTGTACAT:1 + chrX 20387579 5' - hopper 1080 1 63.38 AATATTATATACTTCGAATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGT:1 + chr3L 19146593 5' + pogo 87 1 54.11 TTGCATCTCGTTGCATTCAATTTAGCCTGAACTACTTAGTATTGTTGCTATCACTCTCTCACTCGCTCTCTATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATATCCTACCTATTAATAAT:1 - chr3L 13876172 5' + Tirant 433 1 51.37 TTTGCGTTTACAGCTATCAATATAAATAACTCAAGGCCAATGGGGTTTTATAGCAGCATTCACAAAATAACATTCACAATTCATGCATTGCTCGAGGGTAAACTTAGTTTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGTC:1 - chr3R 20999759 5' + gypsy 7220 2 57.53 AACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chrX 10571351 5' + Doc 89 1 77.40 CATCCATGAGATACTCAGATACAATTGAAATCGAATATAATTTCTCAATTGAATTGAGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAG:1 + chr2L 12544199 5' + R1A1-element 76 1 60.96 GGCTATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3R 4885309 5' + 1360 50 1 59.59 ACGCGTGTAATGTGCAAAAACGGCGTTTAATGCCTCACTAATCCCTCAACTACAATGCTGCCAATTTACGCAAGTGGTTATTATAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTT:1 + chr3R 28383598 5' + Cr1a 4257 1 52.74 GTATTCTAAAGTGAGTTATTTTGTTGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 + chrX 18149828 5' - hobo 2876 1 75.44 AAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATGTTTCCATTTTTT:1 - chr2L 17730537 5' + pogo 51 1 53.42 GGAGCACTGCTCCTTGTGGCACTTTCAACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACA:1 - chr3L 8253775 5' + jockey 4653 1 70.55 CATAAAGCAAACCAAAACGGGGATATACAATCAAGAGTACAATGTATTAACAGCAGTTTCAAACTTTTCAAATTACACATTTCAATTTCTTTCGAAAATGTAACTAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAG:1 + chrX 7960825 5' - FB 695 2 73.29 ATATGTTATACGTGTCGTTTCGAATTGAGGATTCTGTCGGTACTCTCAAATTAGGTTATTTCCTCTTGAAAACTCACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr3R 6782658 5' + jockey 4688 1 75.34 GGAGCAGCAAAAGTTGAAAACTTTTCCGTTGGCAGCGACATCTTTGGCGTCCTTGTATTGTATAAATTTCATTAAAAACTTTCCGGGTGCAGCTTATAAGGGCTGCACCTCGTCTAGTATATTACCGATGCATGATACTGCATTT:1 - chr3R 13115404 5' - Gypsy12A_LTR 98 1 53.79 TATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 4869286 5' + roo 28 2 65.75 GTGGGGGTAAAATATTTTTTCAAAAATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 14136590 5' - roo 9035 1 42.55 GATGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACCCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr3R 4571531 5' + blood 7095 2 53.42 GTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 + chr2L 20561424 5' - P-element 2791 1 21.23 ATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr2R 11379716 5' + jockey 71 1 57.53 CGTTCCTAGAATCATAACTTATTCAACATGAAAAGCCAACATTAAAGTAAGCATTTCTATGGAATAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 + chr2R 14717776 5' + Max-element 8293 2 51.49 ATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATT:1 + chrX 22726196 5' - Helena 1230 1 56.85 CTCCAAAAATCACACCATATGGAGCACGCGCTCTTTACCGCCCACGTTTATTCAAAATTTTTGGGTATTGTGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2L 3006187 5' - pogo 2069 1 57.69 CTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 - chr2L 3734575 5' + mdg3 5293 2 52.74 CAGTCGATGAAACCAACCGGAACCAATTCGCGTTCCCATCCACATCCATCCGCCGCCTCTGTCTTTGCTTATGTGTTTTGTCATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chrX 9709946 5' - pogo 2062 1 62.33 ATATTGTTGCTCTTACTTCTAAGAAATCATTGATGGAACCAAACACTCACCTATACCCTGATTCCTATTCAATTTAATATGTTGAACCTTTAAAAAACTGGAAGTATGGGTATGTAATTGTAGTAAAATTACTGTAAACTTGAAAA:1 - chr3L 19669892 5' + X-element 4604 1 64.38 CTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 - chr2R 5237894 5' + Doc 84 1 51.37 CAGAGCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr2R 5848961 5' - mdg1 359 2 60.27 GCTCAATAACATTTAAATAGCTCAAGATTCCTGCCCAAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTA:1 + chr2R 20856190 5' + Juan 4160 1 54.11 TTTGGAAAAATGTCACTGATGGTTTGGGGCTGTATCACCAGCCGTGGAGTTGTAAACGAAAGAACCATTTCTAATGAGTGTAAACATAGCACAATCAAACCATTTTCACTGCAAACCTAACGGTACCTTCTAAAAATAGAACTA:1 - chr2R 4659351 5' + Transib5 130 1 68.06 AGAGACTTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr3L 13313225 5' + roo 79 2 71.92 AGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 - chr3L 16180985 5' + Transpac 4972 2 54.11 GGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chr2R 5237901 5' + Doc 77 1 46.58 AAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chrX 14962204 5' + jockey 73 1 60.27 AAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 - chr3L 13597872 5' - blood 342 2 60.96 GTTTGCACACACATTTAGTTCTTTGTCATTGTGTCTTTGCGACTCCCAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAA:1 + chr3R 8865821 5' + jockey 4916 1 67.81 GTGTGGTCGCTTTTATAGATGCATAAAAACATTGCACTACACAAAGAAAAATATATAATGGCTATGAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 - chrX 10101424 5' - mdg3 5442 2 54.11 AGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 - chr2R 18048895 5' + opus 70 4 73.79 TTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 + chr2L 17638701 5' - blood 305 2 66.44 AGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGA:1 + chr3L 21630304 5' + Burdock 6185 2 52.74 TTTCGAATAAGCCAATGTACGCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 16853302 5' + roo 38 2 59.59 AAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:2 - chrX 13651565 5' + 297 6641 2 61.64 TTTTGCACAGCCGAGCGTTCAACGATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGC:1 + chr3R 4464133 5' - 1360 3339 1 51.37 TTGTGTGGCCGACCTTATAAAGTGCACATAATCTCCATATACTTTGGGGATACAGGAAACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTCCAAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGCCAATCTCTTTCCAGG:1 + chr3R 4686621 5' - S-element 407 1 68.49 GTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 9482125 5' - roo 361 2 54.11 TTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2R 18882581 5' + roo 74 2 71.92 GGGCCTATTGGCAGGGTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGGCTTTCCAATTGTGT:1 - chr3L 21093220 5' + Ivk 33 1 57.69 CGCTTAGTTGTTTTAAAACATTGTTACTTTAACCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTTTACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGAT:1 + chr2R 16193766 5' + INE-1 545 1 51.37 TCGTTATGCATATAGCGTATTACATTGTTAAATTATTATACATAATTGTTTTGTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTAT:1 + chr3R 21570885 5' - mdg3 5030 1 63.70 ATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3L 15035103 5' - pogo 2052 1 57.53 GATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1 - chrX 21667934 5' + gypsy2 60 2 67.16 TTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 22846674 5' + 412 7085 2 64.38 ATTAGGCAATCGCTGGTTATCCTATGGCTGTATTACTACACATTTTATATAAATTTTACAACACAATTTAATTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAA:1 - chr2L 13317572 5' - X-element 4665 1 51.37 GCACATATTTTCCTGGAAACCGATTAATGGTTTCGCCAGCAAATGTACGCATATACATTTTAGAACGGCTTATCTTCATAAATGATACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTTGCAGGGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCGTGCACATAA:1 - chr3R 29769645 5' + Cr1a 257 1 58.22 TTCCAAAAAGTAACTTTCGTAATGTTGTAGTAATATTTCTAAGATAATGTTTTAACTTGTTTATTCACTCTAGCATTTTTGAATAGCTTGCAAACTATTCAATTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCA:1 + chr2L 15388432 5' - INE-1 533 1 69.86 GATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTA:3 - chr2L 22684595 5' + transib3 76 1 60.27 AAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - chr2R 22692465 5' + Ivk 29 1 64.38 GTGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 - chr3R 4913673 5' + 1360 35 1 60.96 AAATTCTCAGTTACGCTCTCACGTACTGGGCACTTACACAGCTGCAAGAGTAAACACACACACACACTCACAGGCACAATCAGCTCGAGCACCTTTCACAGAATGCACGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr3L 14863790 5' + Transpac 16 2 75.34 GAATACCCACTGTTATAGTGTGTTATCAGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGCTGAGCAATCGAGTGGACGTGTGCACAGAAGTCGC:1 + chr2R 21078385 5' + jockey 34 1 62.94 TATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTC:1 - chr3L 25232912 5' + GATE 77 3 62.33 TTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCTAG:1 + chr3R 26765106 5' + mdg3 5333 2 70.55 GCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 10973187 5' + jockey 56 1 52.05 GATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 5446117 5' - roo 8997 2 70.21 GAAATTAGTTGCGTATTAGGAAAACATAAATTAGGCGACGCTGCGGTATAAATTAAATTTATTTTATTTTATAATGGTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTAGTATGT:1 - chr3R 30778821 5' + blood 7000 1 58.22 AAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 - chr3R 27786644 5' + Tirant 8180 2 66.44 AAATTAAATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3R 22846666 5' + 412 24 2 69.86 ATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3L 22221223 5' + 412 74 2 67.81 GTTTTTTCCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3R 18665244 5' + 1360 56 1 61.64 GAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 16908501 5' - roo 328 2 71.92 ATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr3R 22289452 5' + 412 7136 2 74.66 CAGGAAACCAGAACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chrX 8082371 5' + roo 8727 2 61.64 GAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGCCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGG:1 + chr3L 22221154 5' - 412 402 2 71.92 ACAAGCGTAATTAAATTTTATTTTACTCTTACATGCAAATTCTATGGGAGTTCTTTTTTAGTCACGTCGCTTTGTCTTCTGCCCGGGCTTGATTTGATTTTCCGTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTG:1 + chr3L 19217816 5' + 1360 282 1 71.23 GCCTTCCAGACGCGCGACAAGCGGATCATCATCTCCGCCCTCCAAGTCATCCAGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 + chr2L 19371236 5' + Bari1 20 1 69.86 ACTATATTTTGCCGCTGTAAAATCTGAAGTTTCTGGCTAAGAGTTCTCATAAAGAGTGATAGTCCGTGTTTAAACTAAACTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGAT:1 - chr3R 28192603 5' + 17.6 324 2 47.26 AACTTGTGAAATGCAAAGATGGGGAAAAAGAGGAATGGCTATGGGATAAATGTAATCCCTGCCTGCAAATGTATTTGCAGAAATTTATAATTTAAAAAAAAACGTATAGCACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3L 5490792 5' + 412 10 2 71.92 TTTGCAATATAACCGGGTCCATAGAGCCGCAGTGCATCTACTAGAAAGACCACAAATTTCGACTCCGATTTGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCT:1 - chrX 10623923 5' - X-element 4678 1 53.28 CTTTTTGTCGAATTGTGATGAAAGTTGCGATTAGCTTTCGGCACTTGATCTGCGTCATGTACATGTACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr3R 25354578 5' + 297 6636 2 60.27 CAATGTCTTCGAGGAGATGCCAATGCGTTTACTGATTTTTTGAGTGCGATACGTGCAAAGATTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTT:1 - chr2R 13627253 5' - jockey 4585 1 55.40 AAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chrX 14756768 5' + pogo 57 1 62.33 CTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCA:1 - chrX 3529811 5' - 412 7462 2 73.29 AGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGTCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chr3R 23507604 5' - 412 7456 2 76.71 AAATAGTAAAATCGCAATAAAAGAAAAATAATACAAATGTTACAGCTGTGGAAAAGAGTGAAAAACAAATCAATATCAAAATATTGTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTAGATATATTACGTAATTT:1 - chr3L 27414133 5' + Stalker2 7212 3 54.79 ATGTATGAGATATGTGCAGATGGGTGGAGAGTTTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 - chrX 15814580 5' - P-element 2800 1 26.03 ACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2L 17730530 5' + pogo 58 1 59.59 AGGGTATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 4869290 5' + roo 8688 2 68.49 ACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - chrX 22386796 5' + hobo 78 1 51.56 ATCAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTTCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTATTTGTTGAGTTTT:1 + chr2L 8397138 5' - roo 9053 2 63.48 ATGCATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chrX 4789091 5' + 297 31 2 64.34 TGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3L 13597709 5' + blood 25 2 69.18 ACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chrX 21213409 5' + Doc 46 1 51.37 GGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr2R 9326962 5' + mdg3 49 2 57.53 ACTGGGAAACATACGATTGTTTGTTTTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTTAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGTTATGGTTTTGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr2L 16596258 5' + 412 7136 2 73.33 ATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAATACGAATATATTTACAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 22429230 5' + roo 8686 2 59.80 GTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr3L 19397004 5' + F-element 52 1 53.42 GCCAGAATGTATGTAAATTATTCGAGCTTCTACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr2L 20922997 5' + pogo 28 1 66.44 ATCTGGGAAAATTGAGCAAAACTTGTTTTTTTTTGAGGGTATAATAAGGGGGGTTAATGATGATTAAAAAAGTCCAAGAACAGTCCGCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 - chrX 5892206 5' + transib2 25 1 63.57 ATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCCG:1 - chr2L 14969954 5' + Tirant 71 2 69.23 TGGACCTGGCGGTGGAGAAGTATATCGGCAGACGGGCCCATTAATTGGGTGTGCTCCCGCAGGATTTGGGGTAGTCACTTGGGTACAAACAGGGTTGGCTTCGCCAAATTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGT:1 - chr2R 18832155 5' + blood 7212 2 71.72 AATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3R 14088532 5' + 1360 38 1 60.27 GGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACAT:1 + chr2R 6984287 5' + HMS-Beagle2 25 2 64.89 ACATTGGCGCGGAATTAATACGATTTTTATTCATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 9938561 5' + roo 29 2 66.44 GCTCCAAGCTCACATATGGCAGTCGTATCGCATAAAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAG:1 - chrX 18193789 5' + hopper 82 1 73.29 AAAAAGCATCTGAAATGCAATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACC:1 + chr3L 13227647 5' - hobo 2894 1 74.19 GTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGATGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2R 16891865 5' + jockey 35 1 59.66 GCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAAAG:1 - chr3L 5498514 5' + Doc2-element 253 1 41.10 AAGAAAACATGAAAAGTTACTTGTACATTTTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3L 5263441 5' - pogo 2035 1 74.80 AATAATCCCCCCTCCCCCCCAGAAATACCATGCCCGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 3524179 5' - roo 9050 2 68.97 AAACTATAAACACTTAGTTTTTTCTTCATTTAACAATCTTGATAAATTTGCAAGTGAAAAGCCTGTTAATAGCATACGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATC:1 - chr3R 13276795 5' + BS 4789 1 49.32 CTCTAATGGCGAAGACCTTGCAGTTTATGCGCGGACGTCTCAAACGATAGATGCGCTTACTCATTATAGCTACAATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3R 23254399 5' - pogo 2058 1 56.85 GCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 16853322 5' + roo 58 2 58.22 TGTGTATTAAAAAGAAATGCACGGCTCGCGTTCTTTTAGTTTTATTGAATTATGAACCCAAAATAGAAAGCAATAGGTTTCCGATCAGTCTGTTTACAGTATTGTAGCTGTGAAACTCTTGTTCATCTCA:1 - chr3R 8040902 5' + Circe 124 2 66.15 TGAAATGCGGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGGGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGCCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3L 22221102 5' - 412 7520 2 67.67 GGGCATTTAAAGCTAGCTATTTTTAATAGTACTATCCATATATGTATGTATGTAAGTAGTGTGTTGTTCTAACTGTAATATCCCCATATTTTAGTCCAGCATAGTAACTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 2690719 5' - hobo 2928 1 77.62 CCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACATACAATTTT:1 - chr3R 16771443 5' + roo 8686 2 65.52 AAATGTTTTGATATTTTCATTTTCATTCTATTAACACCACACCTACTCTAACGCGAACTTCGCTGTTAGTCGCTTTCTTTTTATACCCGTTAGAGTAACAGGGTATACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1 + chr3L 24163240 5' + INE-1 29 1 46.58 GTTTTTCGTTTTGATGTACACAAATAACTTAACAAGCTAAATGAATCAGTTTTTCCGTATAGTTAATAGTTATAGTTAATAGTTAATAGTTAGTTTAACGACCAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAA:1 - chr3L 3482783 5' + X-element 32 1 63.01 ATATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 17069512 5' + 412 7082 2 66.44 CACACACATGGTTGGGGGAATTACAATTGTATTGCAGTCAACATTTCCATTTTTGGTGGAGGAGGAGGCGGGGGAGGAGGAGGATGTGCCAGGACACGCCGTAACAGTAAATAGCAAACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAT:1 - chr2L 1244210 5' + gypsy7 5010 1 69.66 AAAATATTTGCTTTTTTTGTGAGTAAAATTATTGCCAAACAAAATTTCATAAAAAACTAACATTTAAATACCACATCAACAACACAATTATGAAAGTTAATAAAATTATTTGCACACTGTACCCTCTAATAAATCGTAAATCTAAA:2 - chrX 20645552 5' + Juan 3737 1 67.12 CAATCGTTTCCATATAAATTTGTTTGGTTGTATATTTTCTCAATAACTGGATATATTTTTACTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGTGCTATGGGTTAT:1 + chr2L 18420488 5' - F-element 321 1 56.85 AAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGACTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTCTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr3R 5245666 5' - 1360 3329 1 58.74 GATTGTCGTGCTTCTTTTGGGGCTGCTGACTTAACCCCAAAGAGACCGTTGCACTTCAACGGGCGATTGTCACACCACTTGCTGCCCAGCAAGTACACTGCACTGATGATTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGCCTAATCTCAATT:1 + chr3L 19674336 5' + mariner2 523 1 68.49 CTTAGTGGGGCTGGGGAAAACTGCACTTTGTCAATTGCTCTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 + chr2L 11573663 5' + jockey 4754 1 74.66 AAAACAGCATAGCCGCAATAGGCGAGCACGGTACGGGGTACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 - chrX 19498154 5' + P-element 73 1 33.09 GCTCCGACAGGACGCCCCTCGTTGTCCTCGCAAGATAAATGTCACTCATTGGAGAATCCCGTGGCCGAGAGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGTTGTTAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTGTTACAAAT:1 + chr2R 9248358 5' + accord2 82 2 57.53 GTTGGTTGGTTGTCTGCTTTCAATATTCAAAACAGTTGGTCCCATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 15590685 5' + roo 38 2 59.59 CAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3L 3979549 5' - opus 7464 2 60.27 TCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr2L 19930153 5' + jockey 90 1 74.66 ATTGCAAGCTAAACACTATGTGTATATATCTTTAGCCCTATTTTCTTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAA:1 - chr3L 22638918 5' + Juan 4097 1 76.03 GACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chrX 3452432 5' - Tirant 8479 2 55.56 CTTTCTATGTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr3R 13358582 5' - mdg3 194 2 52.08 GAAATTCAGCCCCAGCAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr2R 23225886 5' - Transpac 254 2 57.53 CACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATA:1 + chr3R 15465490 5' + mdg3 5326 2 66.44 CGGCTTTAATACTTACATATTTATTGCTGATTTAAAAAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chr3R 14331269 5' - Burdock 6364 2 39.04 TTTTGAGATTTTAGGTATTTCTAAGTAATAAATTAAATTAAAAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAG:2 - chr3R 7649867 5' + Quasimodo 71 2 72.60 TGCGATGGGATGGCGAATTGAGATTACGATTTCGACGGCTATAAGATTAGTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCA:1 - chr2L 15142321 5' - BS 5023 1 71.92 TATCACGTTGCTGTAAAGCCTCTTGTGCGGATTTATTAGCTGAGCGATCGGATTTGTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3R 24479303 5' + 412 31 2 65.07 CTGGGGTATGGCAATAGCCCGGAAAGTGGCATCAACAGCGCCTCTTAAGGCCATGGAGATGTGATTCTGCTGCTGCTGCTGGGCGCCCAGCGAAAGTTGGGATCCGGGAACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAATC:1 - chrX 22533340 5' + springer 267 2 75.52 CGAGTGGAGTGGGTGTTTAATGTGTAAACAAGGCGGGATTTTGTTTGGCCGACTTATTCAGAGCACTTTAAAGTGCTCTTGAGTAAATATTTGAATACCATTTCTTTCAATAAAACTGACCACATCAAAAAATACTTGTTATAGTT:1 - chr3L 2266169 5' + F-element 4604 1 77.40 TATAAGTATTTGTGCTTGCTTGCTGGCTTAATCAAGCATGAAATAGTCCAAACGTTGTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 + chr2R 19353974 5' - 297 6924 2 58.99 CATCCAATTCGAAATCAATGTCGAGCGGTTGCAGTTATGATTATTGCAGTTGTCAAAAGTTTTCAGAGGATTGGTGCTGCTCGGTGATAATGGGCTGGGCAAACAGAGATTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTT:1 + chr3R 30652160 5' - Bica 482 1 73.29 AAAAACACTTTGGCCACGTCCAGCCAGCCAAAATCGTCTTTATTACTCGTTATCTGATAGTCGGGGAACTCGATCTTGTTTTGTATTTTTTAATATACCTGTTACTCGTAGAATAATATCCCAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 + chr3L 23747101 5' + INE-1 16 1 64.38 AGCATGTTACAATAGATCAACTAGTAAACAACATATACATGTTCGAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 9242103 5' - roo 9046 1 51.37 CTTCGGCCCTCGTCCCTCTCACTCCCACCCACTTGCCATTTGCATAAAGTTTTGCATTTGCTTACATCAACTTAATGTTCATTGTTTCTATGCATTTGTGCTGCACTGGACGGTGGAGAAGTTCAAGTGCGTTTCGGCGAGTTGCT:1 + chr2L 19373662 5' - Chouto 486 1 74.66 CCAGAAATACCATGCCCGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTTTTTG:1 + chrX 3524197 5' - roo 9031 1 57.53 AATGCAGCTGCTGCTGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr3L 5490926 5' - 412 7468 2 68.49 CTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3L 6096523 5' - roo 317 2 77.40 GTAATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAG:1 + chr3R 23507540 5' - 412 7520 2 67.12 AGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 + chrX 21639631 5' - Tirant 8431 2 70.55 GAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 24228894 5' + opus 153 4 69.00 AATTGATTTTTATGTTCTATAATGCATTTAACTAGTTGCCCTAGTTTTAATGTTGTCAGCATGTTAATTAAAGGCAAATTATTTGCTAAACTCTTCGTCTTTTCGCTTTTTTTTT:1 + chr3R 9237832 5' - Bica 343 1 55.65 GGCACAACATTTCTGCAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chr3R 10778612 5' + mdg3 27 2 67.81 TCGTGAGATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAAT:1 - chr3L 21820053 5' + Juan 58 1 56.85 GTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCCGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCA:1 - chr3L 14863907 5' - Transpac 5138 2 75.34 ACAAGTGCTGAATTCGGTGAGATGAAAATCTTGCGATTGCCAGAGTTGGATATCAAATAATAAGGATCATGACATTTCACTTAACACACTTTCATATAATTAATTTAATTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 + chr3L 21819922 5' - Juan 4193 1 69.18 CTAATCCCATATTTATCTCACAAATGAAAAAGAAATTGTCTATGAGCTGGTAATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chr3R 11096638 5' + copia 4891 2 70.55 TTTCCAGCTACTTTGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTTACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 18846483 5' + roo 20 2 64.46 ACGGTTTTGCTGCGTTTTGGAGTGGCTCGTGATGCAGTTAATATGCCACCGGGCAAAATAACATCTCAACGGCGTAAGCCAGCAATGAAAATGGCGCGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 11121837 5' - copia 233 1 70.55 AAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3R 25521925 5' + blood 7041 2 65.07 AAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1 - chr3L 13204768 5' + jockey 101 1 81.51 ACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 + chr2L 12261185 5' + jockey 98 1 77.40 TGTTCAGATTGCTCTAAAGGTAATTAATCTATTGAGTTAATAGAACAGAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAGGTCGAGGACAGACCAAATATCATCCTCTCACCGTGCTGGTGCCTAAGCAGAGGCTCTGGTGCCCGAGTCGAGGCGG:1 + chr3L 12925240 5' + Rt1b 255 1 65.75 AATTTTAATTTCCTGGCTTATGTAGTACATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:2 + chr3R 9345545 5' + pogo 39 1 57.53 GTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr3L 15371402 5' - Transpac 260 2 53.42 AGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 - chr3R 25384291 5' - mdg3 5446 2 51.37 GTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGC:1 + chrX 5439986 5' + accord 36 2 52.50 ATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 8542587 5' - roo 339 2 62.33 GCCTCACAACATCTAAAGTAATAACTTAGGTTTCTCATATATGGGTTCTACATTTTTAGATACGCTACGACAATATTGAGAAGGGCGTTATTTTCTGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAAT:1 - chr3R 7044472 5' - invader2 469 1 61.64 CCCCGAACCGCCCCACCATTTCGACCACAACAAAGGGAAATCCCAGGCGTGTGTGGCATTTGCTATCGTTTTCAAATACAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCGCCGCACAAAATCGGCTGTTT:1 - chr3R 9376982 5' + F-element 50 1 51.80 CAGATAAAAAGCTATACAATTTCATGCCTAGTTAAAATAAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3R 20452314 5' + blood 7041 2 65.75 ATATTTGTGGAGTCATATGGTATAAATGGCATTTATAACTTATATATAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGA:1 + chrX 15227403 5' - flea 162 1 73.29 AAACGAAAGAATATTCAAAATCTCTTAACTATATATTTCTATCAACTTTTTTAATCCCCGTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 12843683 5' - roo 345 2 60.96 AGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chrX 21668689 5' - mdg1 7425 2 53.42 TTCACTTTTTAATTGATTTGATTTATCCATTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAAT:1 + chr3R 7884513 5' + jockey 4796 1 59.59 TGTCACATGGACAGCCATTGGAAATGAGCTTATGCGGTTGTGGTTGTGGCTGCGGATCCTGCGACTGTCGCGCGGCAACTCTAATAAATGCCACAGCTTAGCTGATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 + chr3L 7211433 5' - 412 7457 2 71.92 ACTTTATAAGTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3R 10140142 5' - P-element 2867 1 68.49 GGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:2 + chrX 14136526 5' + roo 48 2 53.42 ACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGCTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCA:1 + chr2R 5582138 5' + Cr1a 457 1 66.44 AAGATACGAACATTGTTTTAAAACCTCTGAAACAGCTGATGCTAAAATCGTCACTTAGAAATGATGTGGTAAACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chr2L 17638840 5' + blood 7016 2 77.40 AATTCATTGCATTTTATCAAGATTTTCCCCACTGCATTTTTGTGCAATTTTTATCCTCAAACTATTTTTGTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTCTTACCACTCGAC:1 - chr2L 3967193 5' + hobo 17 1 75.34 TTTCTGAGAGAGCATGTTACAATAGATCAACTAGTAAACAACATATACATGTTCGAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATATGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 9242113 5' - roo 393 1 58.22 ACAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 + chr3L 19274784 5' + transib2 56 1 56.16 AATAAAAGTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGG:1 + chr2R 7727076 5' + BS 4672 1 71.23 TAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr3L 8253712 5' + jockey 4699 1 68.99 ATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3L 3762235 5' - roo 8990 2 75.34 GTAGTCACTGCGGATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 - chr2R 10453505 5' + mdg3 5257 1 67.12 AGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGC:1 - chr2R 10478762 5' + invader4 2834 2 65.07 AATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3R 15590061 5' - Transpac 250 2 58.22 AAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chrX 8272427 5' - roo 9003 2 65.07 ACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 15080122 5' - roo 358 2 52.05 GAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr3R 25271248 5' - 412 7459 2 78.77 TTAACGCAGTATTCAAAATTTTTACTAATAACAAAATAATGTTTTTTTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATG:1 - chr3L 24535857 5' - rooA 7161 1 41.38 TATGACCTTTGGTATGGTTCCCAGATGCTTCGACGTGCCATCAGCACCGCCCTCCAATCGCACCGACTCGATGGACGAGGACATAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCC:1 - chr3R 29902411 5' + 17.6 259 2 56.85 CAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr2R 16891831 5' + jockey 94 1 76.22 CCTTTTCCATTGCATTTTAGTTTTGCCGTTGGGAAATTCTTCTAATTGGCAAAAACCAGGAGTTTGAGCGATTCAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 - chrX 22591377 5' - copia 207 2 54.79 ACACTCCAAAGGCCAATGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACAAACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATAGATCGAGGG:1 - chr2L 15965340 5' + blood 7014 2 78.33 CATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGG:1 - chrX 14815845 5' + INE-1 99 1 75.34 TATTTGGCGAAATAAAAATAAAGGTATAATACTCAATAATATTGTCGCTGGTCGTTGCCCGCCTTCGTTCTATTGGGAGCCTATGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACT:1 - chr2L 19694409 5' + 297 315 2 55.48 TAATACGACACAAAATGAGTAATACACTGAGAAAACAATATAAGATGGAAAAATTTAAGTACAAAGAAAAAGTAGTCACAAGGGTGTAAAAAATTAAAGGGTTATTATAGTAATTGTTAATTTGCTCGACTATCAGATACCCGATA:1 - chr2R 8201709 5' - INE-1 552 1 60.96 TATACAGTAAGTCCTCCTATGTCATGACCTGATCGGGGCAGTAAAGAGGGTGGAGTCGTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGNNCCTAGCTTCCTTGC:1 + chrX 21156664 5' - jockey 4688 1 73.04 GCAAACGAAATAATTTACTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTCGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTT:1 - chrX 10442246 5' + FB 358 1 78.08 GCTACGGTTCTGCTCTTGGCCACCATTCTTGGGGCCCAGGCTGTGGACTGGAATTCGGTCAAGAACCTGAACATCGAGACCCCGATGCCCAAGGTCCATGGCGATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAA:1 - chr3L 6062857 5' - pogo 1900 1 71.23 AATAACACCATGGCTAAACCCAATGGGGTGCGACAAGTGTAATAAGCATGAAATGTGTCTCTCGGGTTGACCCTGAAAGGATGTTTAACTTGGTTTGATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAA:1 + chr4 827434 5' - INE-1 153 1 69.18 AAAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr2R 5237933 5' + Doc 45 1 59.59 TAATCTCGGCTTTAATACTTACATATTTATTGCTGATTTAAAAAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 - chr3R 14331275 5' - Burdock 6370 2 43.15 GAGCAGATGCCTGTAAATGGTATAAATTACCAATGAATGACATACGATTTAATTGCCTCGACTAAGTAGCAACCGCTAGCAACCAGCAACTGAATTAGCTGTATGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGT:1 + chr3L 11007435 5' - Porto1 4272 1 62.33 TTGCACAATAAAATGGGCAAATTAACAAACACACACGCGAGCAGCCCACATACATATACATATATGTACTTACATACAAACGCGTACATATGTGCACATACATACGTATTTGTAATGGCTTTAAGTCTTGTTTTCCTTTTTTTATT:1 + chrX 4157884 5' + HB 155 1 55.48 GGCCAAATGAAATAACTTGATGTATTTGGCTTCCATTGATGTCGTATTGTGGCGATGATCTACAGAAGAGCAAAATACGGACAAGGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chrX 11534409 5' - roo 9037 1 60.27 TGAAACGTGATTATCGTATAAATTATAAAAAATTCAGTATATGTAAAGTTAAAAAAAAGTTTTACACATAATATAAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chrX 11710392 5' + pogo 40 1 61.64 AAAGCGCTAAGCAATTTATATAAAATGGGAATATTATATACTTCGAATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr3L 19146564 5' + pogo 58 1 55.48 CGTCTTCCGCTTCAGCCACAAATTTTGCGGCGGCAACAGCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 - chr3R 31907422 5' - Tirant 8429 2 69.18 AGTCCACCGGTCTGGCAGCACTAAACTGTCCCAAGACACAGACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCGTCACAGCTGTTCAGAAAAGCTTACCCGTGCTTACACGTGCTGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGCGAAT:1 + chrY 2468610 5' - R1A1-element 143 1 50.00 AAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGT:1 + chr2R 5848973 5' - mdg1 7385 2 68.49 GAAGACATGTCGACGGCAGTGGCAGCCCCGCCCCTCTTGGGTCTCCGCCTCTTTGTCTGTCTGCGGGACTCACTCACACTCATAACACCCACATTCACACACACACATATACATA:1 + chr2R 18482048 5' + Quasimodo 38 2 58.26 ACCAGATAATTATATGCTAATTATGCAGCACACACAGATCCTGAGAATGCGACGTTCGACTCGGCTATTGATCCTGATAGTGAATATATACACTTTATGTAATCGGAAACGCATCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATC:1 + chr2R 3097210 5' - INE-1 15 1 75.34 TGCGTCATATCGATATGAGAAAGTGTACATCAATCCGGTAGTTTGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr4 311635 5' + 1360 28 1 66.44 GGCACACAATTTCGTCAGGTGTACCTGTACAACATCCGTGCTCCGGTCCAGTAGAGCCAGTTCTTTTCGAATCGTTCGTGGACTTAGGCTAATCCGCGGAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCA:1 - chr2R 12297342 5' - 412 7354 2 62.90 GAGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGTGGATCCACATCCAGCAGCTCTATTACATTGGACACCAGGTAGGGCAGTGTCTTGTTGACCTAATGGGGAAGTCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCT:1 - chr3R 23753349 5' + 412 397 2 65.75 AGTATAACTTTGAAATTTTATATTTCAGTTGTATTTTTTCACTAAGGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chrX 23043210 5' - roo 8999 2 67.81 GTGTACTTATGTGTTTATATATGACCGGTCGTATTCATATATATATATAGATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 23426375 5' - pogo 2035 1 73.29 AATCGATGAATCGATTGTTTTAACCCTAGCCGGCTATTTAAGCCGTTAGGTTAGGTTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3L 22676404 5' - 412 469 2 68.28 CTTTATAACCGTAAAAGCCAAACACTTGGATTGATAGATGGCTTTATTGTTACCCATACCGGCAAGAAAACTTATTTGAGTATGAGACAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACA:1 + chrX 21067788 5' + Doc3-element 4604 1 67.12 ATTATTAATAATATCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTAAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 + chr2L 14262841 5' - blood 7330 1 56.16 ATAGAACGGCTATGTATGGAAAACAACCAGGAGCTATTCAATTGGGGTAACAAAAAAGTAGTTGATTATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTGAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACA:1 - chr3R 15109910 5' + roo 201 2 52.74 CTCCTATGTTTTAATTGGCTTAGTAATCCATCAAAGCGATCTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 52888 5' + roo 8668 2 49.32 AACTGAAGTGTTTGCCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTTTTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAACCTTAA:1 + chr2L 18235392 5' - F-element 4624 1 50.68 GAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATA:1 - chr3R 24228954 5' - opus 7423 2 76.71 GGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chr2L 19930146 5' + jockey 97 1 79.45 GTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 8542578 5' - roo 9012 2 54.79 ATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 25521903 5' + blood 7063 2 52.05 ACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTT:1 + chr3L 15321981 5' - Transpac 229 2 73.29 AGGAAGCAGGAACAACCCAAACACGGCGAAGGCGTAGCCAAAACAGAACTAAAAAAACAGGGGCAAACAAATGAAAATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 + chr2L 5648372 5' - Burdock 6351 2 58.22 GACTAACGTCAGTTTTTAATAAATATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr3R 23664359 5' + pogo 37 1 57.53 GATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 - chrX 10960301 5' - Transpac 252 2 58.90 ACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTT:2 + chr3R 10973224 5' + jockey 93 1 72.60 CTCTTCATCGAAACTATGGCGCAGCTTCTCGATGAAGCCATCCTGCAAACATTAAATAGAAATTTTGGAATTGCAATTACATAAATATTATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAATTT:1 - chrX 7329338 5' - Bari1 1681 1 66.21 GTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr3R 5940430 5' - hobo 2914 1 60.68 GCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr3R 10142932 5' + 412 62 2 58.90 CAGACGACACACCGCGAGAAAAGTGGGGCGTATAAGTTTTTTTCACGAGTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCA:1 - chrX 4858409 5' - BS 5014 1 71.23 ATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACTCACATCG:1 + chr2L 2690603 5' + hobo 64 1 73.33 ATTAAGTTTTCGGAAGTAAATAGTTCCTGTTCACACATGAACACGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTA:2 - chr2R 4551438 5' + roo 269 2 70.55 ATTCAATTATAGCAACAGTACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1 - chr3R 26765215 5' - mdg3 5465 2 58.90 CAACCTCGATCCACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 25271129 5' + 412 16 2 75.17 TAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr3L 3979676 5' + opus 173 4 60.96 GATTTACGGTCTCAAATATTAAGTGGTTACTTCCCAAGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 16771307 5' - roo 9037 1 62.33 GTTATCTCTACACTATCCTACAGTTTGCTGCGGGTTTTCTCGCAAGATCACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr2L 13884569 5' + pogo 53 1 55.48 TAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chrX 9816452 5' + jockey 93 1 73.97 GAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:2 - chr3L 3979669 5' + opus 7180 4 65.03 AAATTAATTTAATCAAATTATACATATTTTTATAGACAGATTTTCATAGACATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACGCACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCA:1 - chr3L 23287154 5' + Quasimodo 68 2 63.70 CCAAGACTTTGGGCACACTTGACCCAATTAGCGCCGAAATTCCGAAATTCAGCCCCAGCAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCTCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 - chr2R 23225929 5' - Transpac 298 2 75.34 GACTCTGAAGCTCCTCCGTGCGAGCGGTAGCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3R 10142885 5' + 412 7068 2 73.97 CGCTTTGAGGACAGCGGGTTCAAAAACTACTATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCGCATTGTTCGAAATATATATTTCGTATATCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGC:1 - chrX 23461065 5' + blood 120 2 56.16 ATAAAAACTAATAACTAATATAATTTATCCAGACTTTTATTCTTATATCTTATTATAGATTTAATAGTGAGGGGCTTTATATTTCATTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1 + chr3R 20367957 5' - Max-element 8509 2 64.96 CAAAATGAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr2L 1073888 5' + Tirant 41 2 58.90 CAATACTTTTTTTAACTTTTATATTTTGCAAGAGTATATTTATTGCAATTATTTTTATATAGACAAAGTATGGATATGATACTAGATATGTCCGATTTGATCGAAAATCGCGACCAAAGTGCAATATATTTTTAATAATATATTTT:1 - chr2L 9089603 5' + hopper 162 1 63.01 GGAATGACCACAGACCACGTCCTACCAGCATTACCCATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr2L 6406591 5' - transib2 2782 1 55.48 AATGTTTGCCTTTTGATATTTTTATATTCCCTCATCGTTCACAGCGCTCCATGCTTATTTCACTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGG:1 + chr2R 1685617 5' + 17.6 72 2 56.85 CTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 24338446 5' + 1360 63 1 64.29 AATTCCCAACTCGATTGGGTTTCCACCAATTTTCTCTCTTTCTTTCCCACGACCAAGCTCATTTTCCCCTTTGGTTCGACAAATACTATAGCTGGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3L 13227769 5' + hobo 26 1 45.52 TTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr2R 8305225 5' + blood 78 2 71.92 AGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGCGCTTATCTC:1 + chr3R 10973229 5' + jockey 98 1 74.66 TACATCGCCTCGTTTCCAGTCGGACTTCCGATTCTCGGATTACGTCCCTGAAATGTGATCGATTTCAATAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGCTATTACTTATTACTTATGAGCTATTACTTATTACTTATTA:1 + chrX 4583820 5' + Stalker2 7649 2 46.90 AAAGGGTATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 4869292 5' + roo 8686 2 69.86 TTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAAC:1 + chr3L 25272564 5' + 1360 118 1 74.29 TGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr2L 3734581 5' + mdg3 35 2 48.63 AAGGCAATTCGGAGCGTGGCAGCCGGACACCTGATTAGGCACGATTCGGAATGATGGACAATCTAGCAATCTCTCCAAGCAACCAGTTTAGAATATGAAACAAAAAAACATGGCTCAAGGCCTTCGTCATCTCGCTCCCAGCCTGC:1 + chr3R 23127791 5' + G3 267 1 74.66 TACGAGTATTGGAAATGCAAATTAAATACATATATGCTTATTTAAATATATCTATATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 - chrX 5265796 5' - flea 4953 1 67.81 ATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - chr3R 9163934 5' + hobo 75 1 71.92 ATTGCGAGTAACTATTATATCATATATAGATGTTATAAAATTGTAATACAAGTTTAATGCAAATAAATTAAAAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr2R 9815141 5' + pogo 24 1 64.57 TAGGCCGACTCCTCCGTCGACCCTTTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGCGAAAGAG:1 + chrX 5466514 5' - Cr1a 306 1 78.08 CATGGTCAGGGATATGGGGAAAACGAGAAACGAGGTCAGCGGCTGGAACGAAGAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chrX 8357778 5' + FB 22 1 67.81 ATCCAATTGAACGCGCACAAAGCATCAGTTTTTACAATATGTTTATTCTGGAATCAAACGTAGTCATATTTATATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAG:1 - chr3R 17318993 5' + 3S18 5880 2 54.11 CTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:2 - chr2R 24338452 5' + 1360 63 1 61.64 CAGCTCAATTGGCCCGGAACGAGTCAAAGAGATCCGCAAATCCAGTTCGACATACAAGTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:2 - chr2R 20856295 5' - Juan 4156 1 58.22 TATTCTGTCGGATACGCTGCACCTATACAAACTACTCTTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2R 1277188 5' + Tirant 8134 2 68.49 TTGGCCATCAAGAATAGATTGATCACAAGTATGAACAATTAGCACTGCAGAAATATTAGCAAACATAAAACAAGTGGATGCGTCAGACAAAATGTCAAGAATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATCTTAACAAACGAATTT:1 - chr3R 6676157 5' + 1360 2999 1 67.81 TTAGACCATTTCAATTTTGAAATTCCCCAGTTATTTGGTTAAGTTAAGTTACCGAATCATCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTG:1 - chrX 15926271 5' + blood 357 2 59.59 AACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 - chr3L 3540199 5' + mdg3 5320 2 70.55 TTATCAACTGAAGAACCCACATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:1 - chr2R 17014138 5' - HMS-Beagle 200 2 54.11 ACACGCCTGAGCAATGGCCGCGAAGAGAGCGCCGTCGGCTTTCTTCGGTTCTCCGAACGGGAGGCCCATGATGAAATTACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2R 15613751 5' + P-element 6 2 64.52 ATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGCCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGCTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr3R 5765305 5' - opus 7473 2 63.04 TCCGTGCGAGCGGTAGCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 10142899 5' + 412 29 2 64.38 GGTCATCATACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 8542719 5' + roo 8682 2 67.12 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAATCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 TTTGGGGCACTTTGACAGACGCCGAATGTCATATTTTTTCAAGAAATTAAGCTCTAACAATCTGATTCAGCCAATAATATACTACATTCAGCTAAATATATTAAATATATATATAAATATATATATATTAAAAACAACACATAAAA:1 + chr2L 13117237 5' + hopper 1120 1 65.07 TCGTTAATTACGTGCCACACACCACGCTTTATCTCCTCCTATGTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTCAG:1 + chr3R 5086996 5' + P-element 47 1 52.41 AGTCATGGCTGGCAACTTCATCATCCATTAATGTCACTCAATCTGTGCGCATAAATTTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 - chrX 17012771 5' + Burdock 6157 2 71.23 AGCGAAAATGTAAAGGGAAAAAACAAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCACGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chr3R 10079279 5' + P-element 40 1 56.12 TTTTAGCCGCCCCACTGGTAGATGAAAATTCTTTCCAGTTCAACCCTTTAGTGAGTTCTGCGATTTATCCTTTGCTTATATCAATACAACCGGTAGGACCGTGAGTCGAGTCAAAAACAAAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 + chr3L 22980577 5' - INE-1 571 1 64.38 CTTCAACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAA:1 - chr2R 17182808 5' + jockey 4596 1 53.38 GATCTCGAACAATGGGTAATCTTCTGTTTCAAACAATACGCCTAAATAAATCGTAACAGACAAAAAGAACCAACTATATAAAGTAGATATATTCTTGATGAGAATCAATAGCAGAGTCGATCTAGCCATGCCCGTCTGTCCGTATG:1 - chr3R 25718262 5' + INE-1 120 1 64.38 TTCCGACTAAATTTCTGAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr4 1149967 5' + 297 6613 2 63.70 GCTGTTCCCCGAGAAACTTTTCAATTTTGACAGAAAATAACGGAAGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1 - chr2L 7667485 5' + copia 4947 2 72.60 TCTTGCATAAATTTGCAGACAGCCAGCCGACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 + chr3L 12250918 5' + flea 4760 1 82.14 CACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTATGTCCACCCGAGAAACACTCG:1 + chr3R 5940423 5' - hobo 2908 1 60.00 TTAACTTCTTTGACATAACAAAGGCGGTGGATTTTGGTGGTTTCGTGTTGGTGAACTTCAATTTAATTAATTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 + chr3L 22638763 5' - Juan 4161 1 56.85 GAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3L 9571654 5' + jockey 72 1 62.33 CCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCC:1 - chr2R 982399 5' - HMS-Beagle 6964 2 75.52 TTTGTAAAAACCATTTAAATGCTTTCAATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 12608027 5' - roo 9033 1 59.31 TATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:5 - chrX 16243796 5' + 412 7068 2 73.29 GTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1 + chr3R 20137244 5' + Burdock 6192 2 58.22 ATTTAATCATTATTGATTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr2R 969274 5' - mdg1 403 2 75.34 ACTATGTATTTTCCATAATTTTCAAAATATTCTTGATTTTTTTTGAATAACTAAATTAATTATTTTAAGTATCGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAG:1 + chr2L 8542678 5' + P-element 20 1 70.55 GCAGTGGCGTAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3R 20292399 5' - pogo 2062 1 60.96 ATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chr3R 19545352 5' + jockey 95 1 74.66 CCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chr2R 5237896 5' + Doc 82 1 50.00 TGTTGCAATGGATGCGGTGCGCTTTGGTGCTTTAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGACGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr2R 10367581 5' - 412 452 2 52.99 CACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATT:1 + chr3L 16157214 5' + Juan 81 1 74.66 TTTGACATTCAAAATAAAATACACCCAACGTAATATCGGAGCAGTGGAATATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATT:1 + chr2L 168615 5' - accord 7020 2 69.18 ACAGTCCCAGAGAATCATATCCAGCTCGACGAGAAGCCAGAGCCTGCAGTCCAGCACGATTGTGGGCGAGGCCACTACCATTACGAGCGGAGCTGCCCAAATCCTAAAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGA:1 + chrX 3280343 5' - R1A1-element 303 1 69.18 AATTATAGCAACAGTACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTT:1 - chr3R 26765211 5' - mdg3 5461 2 56.85 ATTACAATCGCAAGCTCTGCAAACGTTGTTTAGATTCTGACTTATGTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAT:1 - chr3R 23448054 5' + roo 8843 2 68.49 TATGTGTGGTTATTAAAGATCCAAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2L 2464336 5' - pogo 2069 1 64.14 AAGGGAAAAATGGGTGAAATACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 + chr3L 10814504 5' - 297 331 2 72.41 AATCCCCGTATTTGGCTTTAGTCAACAATTCCTGACTCAAAGTGGGTTTGCGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAAGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr2L 9010433 5' + 1360 73 1 66.44 GACATAATCAAAGTGCTGCTGATCGATAGGTGCGAAAACGGACGTATTGTTCGAATGATGATCGATAGCCATAAACTCAGCTGCAGGGGCTGTCCGTGCCTCTGCCGCAGAGCTCGACAGATTTTTACCGCAATATTACAATTTCA:1 + chr2R 16162279 5' - invader4 2816 2 49.32 ACATTTTACATTTAAAACTGAATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chr3R 13494447 5' - opus 7469 2 51.37 CCTGTCGGCAAGGATCTATTTGTCCTCACTGCTATATACTGCTCCCCTGATAAGGGTCACCAAATGAACTAGGACTACGGCCACAATTATCAAGCCCTTGTAGCAGCAAAGACACTATTCTATTATTCTAGTGTCTTTGG:1 + chr3L 17885418 5' - Tc3 242 1 74.29 CCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr2L 3967074 5' - hobo 2897 1 65.38 ATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTT:2 + chr3L 3540132 5' - mdg3 171 2 64.38 GTTACTTTTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTCGCCGTCTCTTGTTCGCTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTTAGGATAAATGGTGATGTCCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTT:1 + chr3L 17956674 5' - I-element 268 1 71.92 CGAAGGAAGCCGCACAAAAATGTCCAACAAAACAGCGATGCCGGCAGCGCAGTAGCAGCGCAGCAACAGAGGCGGCAGCGTGGGAGTTTCGTTAACAGCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr2R 14001160 5' - P-element 2867 1 71.03 GGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTT:1 + chr3R 3527074 5' + Tabor 64 2 58.90 GTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chrX 16853325 5' + roo 8725 2 60.27 ACAAACTCTAATCCCATATTTATCTCACAAATGAAAAAGAAATTGTCTATGAGCTGGTAATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:2 + chr3R 11096631 5' + copia 15 2 75.34 ATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 + chr2L 1449580 5' + opus 7056 4 55.48 GTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chr3R 31071838 5' - opus 7422 2 76.76 AACGCTTACACAACTTAAAAATGAAAGATTGAATTAACTGCAAATAGAAAATTGTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGA:1 + chr3R 7608891 5' - HeT-A 5730 1 61.11 AGCACGTATGGCAAAAACGGTTAAATGGCAAAGAAACACGCTTCCTATCGATTTTCAAATAAATAATTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 - chrX 14955260 5' + mdg3 89 2 54.79 AAATAAATAAATAACTACTTGGGAAACAATGCATTAGACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2L 9669589 5' + roo 83 2 75.34 ATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 + chr3R 31907361 5' + Tirant 8173 2 75.81 CTGGTAGGTTGGGGGAAAATGTGGAAAACGAAAAGCTAATTTGGGTGCTACGCTCTGCATTCGCCATTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAAATATATAAGTTCATGCGCC:1 + chr2R 14718307 5' + Max-element 478 1 57.53 CGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr3R 22846703 5' + 412 7114 2 58.90 GTATTTGCCCCGAAAATTGCGTATACGACATGGGGAGCGGCGCACGCGAAGAGGGATTAAGAATGTCATTAATCAATTTCACTGCGACGTATATAATTTTCTTCCTGTTTGGATGTTTTGCATAAGATTGGCATTGCAGACAGTGA:1 + chr3L 3244618 5' + baggins 5177 1 77.40 GTCTCTTTTTCCTTCTTTCAAGCACACCAATTTCCATGATTTTGGTCATTTTCATCGGATGGACTTAAAATCGGTTGGTGTATTGTAGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTATAATGTACCATTCGG:1 + chr2R 16464991 5' - Porto1 4366 1 54.79 CTTGCATTAAACTCCATTACAGACAATTGCAATTTTAGTTTGTTTTTTCCGACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3R 18665204 5' + 1360 15 1 74.66 GTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACA:1 + chr3R 19537511 5' - hopper2 1516 1 77.93 CGGAATTAATACGATTTTTATTCATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACAAATGAACAAGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 9938570 5' + roo 8701 2 60.69 CTTTGGGCCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGCGTTCACATAAG:1 + chr2R 20461142 5' + jockey 30 1 69.18 ACTAGATTATAAGACTTTTCCCAGGACAGTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 + chr3L 1387070 5' + mdg3 5257 1 80.82 ATTTTATTTAAAAAATGCGCAAAAACTCATATATATTTTCGTAGTGAAAACAATAAATATAGAATCATTAAGTTGTACACGCATTTAAATTTAGACTCCCAACATAATAGCTTTAATTTTCGTTATCAGAATCAATAGCCAAGTCG:1 + chrX 13275583 5' + INE-1 93 1 69.86 GGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr3R 15030767 5' + jockey 70 1 58.90 TTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGGTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTC:1 + chr2L 17198058 5' + R1A1-element 5064 1 60.43 GAAGCAGCCTAAGTTTCCCACCCGCGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 16887279 5' + roo 19 2 69.17 CACGGACTTAAATGAAAAGTGACACATATGCCGGGGCTAGGCGACGACAGCCGACGTAGCTTTAGGAAAGTGCAACCCAGTCTAGAAAACTGGGATCCCCTTCATCAGGAACGTTGAACTCAGATCCTTTAAAAAAATTTTTTTTT:2 - chr3R 20191703 5' + FB 405 1 74.66 AAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAAT:1 + chr2R 2949029 5' - 17.6 7355 2 68.49 AAATAAAAAGGAAATAGAAGACACTGAAGAGCTTGAGGAACCTGTGGTGATCGAAGGTGAAGAAACAGAAGATCCCCAAAAGAAAGTCCAAAAAGAATTTGTGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAG:1 - chr2R 10804213 5' + invader4 200 2 69.18 CGTGGCGCGGGGTGGGGCACACAAGCACCTTGCACTTGAAAACCGAAGTGCGGGCAGCGCTGCTGCCGTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTT:1 + chr3R 30272930 5' - Tirant 390 2 78.42 GGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3R 28008217 5' + hobo 41 1 57.53 AAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 9938720 5' - roo 9037 1 62.33 GACATGCCAGACCGCAGTGAAGAAACCGTACGATGGCCTCGCCATATTCACCATGTAAGTAAAGATCATAATCATAGAGAGATGATGCATGCGATGGTCTAAGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATG:1 - chrX 19589363 5' + jockey 4950 1 65.75 CACTGACAAAATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 - chr2R 21227440 5' - mdg3 5429 2 65.75 GAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr3L 13597756 5' + blood 72 2 67.81 GTTTTCCTTGCCTTTTCTCCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGG:1 + chr2L 17198033 5' + R1A1-element 5045 1 54.48 CTACTGTCCCTATCTACTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGACTAATACAGGTTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTAC:1 - chr3R 9201034 5' + R1A1-element 4922 1 86.30 AATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCCAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 + chr2R 21056716 5' + Tirant 8170 2 79.82 AGTGGGGTTACAGTGGGAGTGGGAGTCGAAAGAAATTGTTGGGGAATTATGAGAATGGCCAAAGGAAAGGTGAAAAGAGGCAACTTGGCTTAGACGATGATGATGACTGTTTCTTCTGTTTGTGTACGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 3855872 5' - Quasimodo 38 2 67.81 GGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr3L 15058841 5' + blood 57 2 54.11 AACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 - chrX 17469270 5' + blood 66 2 61.64 ACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 + chrX 10101301 5' + mdg3 44 2 54.79 ATAAATTTAAATAAGATTATCTTTTTATGCCAACTCTATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 21421111 5' + roo 8747 2 74.66 CCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTA:1 + chrX 7525061 5' - I-element 5283 1 66.44 AAAGGCAACAAATAAAGCCAAAATGTATTTAACAAAGTGACAAAAAATTCGGGGAAATCCCCCTCTCCCCCCTCCCCCTTACCACTCTACTCTCTCTCTCTCCCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCC:1 + chrX 19093918 5' + blood 7207 2 63.57 ACCATGTTCACAGCCCGCTGGCCTTCTTTATTACCACAACACTTTGGAAAAAAGAGCAGGAAAAATCTGTAGCGCTGGATACAATAACTATCGATGCAGCTACGCGA:1 - chr3R 17160831 5' - pogo 10 1 76.64 CGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chr2R 24338342 5' - 1360 3333 1 60.27 CGCGAACAGTGCGTTTTGGCCAACATTCAGATCGTAATCAAAAAATAGGAATATTTAACACTTGAAAATTTGTCAATTTGTCAACGTTTTTGTTGTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 8275547 5' + roo 48 2 73.91 ATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAAGCCT:1 + chr2L 23020629 5' - Transib5 2941 1 49.32 AATAGCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 + chr2R 9164828 5' - 412 7516 2 57.72 ACTAAGGGTCATCCGAAGATTAAGTACGGACCACCACCGCCCCACATTCGCTACTCGAAACCATCATTCCCTGCCCATACCCATATCGAGGAGCCAAGCTTCTCCCTCGATGACTTTCACAAAATTTTTCAATAATTTTGTTTTTT:1 - chr3L 4203028 5' + Tc3 79 1 81.51 AAGGAGCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr2R 15062304 5' + blood 27 2 63.45 AGATTACTCTCTAAAATGAAGATACGAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 23099207 5' + roo 8699 2 63.89 TTTGACATTGAATACACAAAATTTGCAACGAACACAAAAGGCGAAATGCGCGCGAGACAACGAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chrX 8895341 5' + roo 8691 2 67.81 ATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTT:1 - chrX 22517682 5' - 1360 3317 1 67.12 CACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3L 9571619 5' + jockey 32 1 65.00 GTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr3L 5514194 5' + Doc 82 1 60.27 ACAGCACTCAAAAGCGCTGAATCACATTGAACTTTCGACGAGCTCTTGACCTCCCAGGTCGGTCTGGGCCAAAACACATGTGGATCCATGGCCCGGATCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTC:1 - chr2L 17939701 5' + Max-element 8364 1 65.07 AACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 + chr3L 3979584 5' - opus 426 2 69.18 TAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGCACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr3L 13597712 5' + blood 28 2 67.12 GTGCTGCCATCTATTTTTTTTTTCTTGCATATTTTGCTTGGGGCCAAGACTTTGGCCATAGTTCGTCCATTAGGCATAAGTTTGGGATCACCACATGCAATGTTAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAA:1 + chrX 10136131 5' + TAHRE 10350 1 57.53 CCCTTAAAAACAAAAGAAAGGGGAAAAACCAAACCTCTTGACTGTTAAGTACAAATCGAGCTGCCGGTCAGGCCATAAAGGTGTATAAAACATTTCAGATAAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCG:1 - chr2R 12541419 5' + roo 94 2 68.49 CTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:2 - chrX 17469258 5' + blood 78 2 69.86 GGTGGACGACACGTTTGCGGTGTGTAATATCTGCAAGGCGAAGCTCTCTTACAAGACGACCACCACGAATCTAAGCAATTTATTATTTATTGAATCTTTCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAAC:1 - chr3R 17043000 5' - Doc 4632 1 53.42 TGGTTTATCGAACTTTATTTGACACCGAAACCGTTTGTATGCAGGCGGAGTATGTGGACGGCTGAGCTCAAAATTAAGAGACCTTGTCTCTCCAAACGCTGTGTACAAAGATGTTTTACGACCTTATTTTGGATAGCCTGGATCCT:1 + chr3L 24352709 5' - X-element 4284 1 78.08 GTTGTTGTTGTAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAAAAAACTTGATACCGTTTGGAATGGGGATGGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGGCCGGGA:1 + chr3R 25400123 5' - Doc3-element 380 1 67.59 GTACTCAATCAGCACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACTTGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGAATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3L 13597693 5' + blood 7020 2 78.77 AACCGAAATTCAGACACCAACAATGCTTTACCTTTGTTCAAGTAAGATATTAGGCACTACTTCTTCAGTAGAAGATTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATT:1 - chr3L 14364316 5' + Burdock 6259 2 50.00 CTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACC:1 + chr3R 24693546 5' - hobo 2894 1 56.16 CATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 3762230 5' - roo 8995 2 71.92 TATAAAATAGAGCACATACTATATAGTAATTGAAAGTATAATACTGGGGGGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 + chr3L 16764814 5' + I-element 70 1 62.24 CAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 20076868 5' - roo 9017 2 58.22 AATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chrX 18366029 5' + jockey 83 1 67.81 GAATTGGGAATAGCCGTGCGTATTACAGTACCAAAAAGAAAAAAGAAAACATGAAAAGTTACTTGTACATTTTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCCCAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3L 5263483 5' - pogo 2058 1 52.74 TCTATGTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACTATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 + chr3R 13358585 5' - mdg3 189 2 53.42 CGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACTTGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chrX 10978996 5' + roo 77 2 71.92 TAGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 20292564 5' + pogo 21 1 71.03 AATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGC:1 + chr3R 23507542 5' - 412 7518 2 65.75 AGAGTCCGGATCAGCTGGTTGACGTACGCAGCGAAGTGCTGATCCACTTTCCGATGAGATCGCTGCGCGAAAACTGCCTCTGGCTGGTAGTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGT:1 + chr2R 11280179 5' - Tabor 6978 2 60.27 AAAGAAATAACATGTATTTTCTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chrX 19162531 5' - pogo 2089 1 73.97 GTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:2 + chrX 14173225 5' + 412 81 2 72.60 CTGTTGTTTTCTCGTCTTCGTTATTTTTGTCGTATTTTTTGAGTGAATAGAAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAAT:1 + chr3L 15037162 5' + pogo 2093 1 79.45 TAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGGGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3R 15030751 5' + jockey 30 1 51.65 GTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:2 - chrX 19231830 5' + mdg3 71 2 65.75 ACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3L 16887337 5' + roo 90 2 80.14 CGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chr2L 1073930 5' + Tirant 43 2 62.26 TTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAT:1 - chr3R 25521867 5' + blood 88 2 76.71 ATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAGTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr2L 18048256 5' + blood 62 2 56.16 ACAACGAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chrX 8895285 5' + roo 8747 2 75.34 AGCTGATTAATCAATTTGCAAAAAAAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chrX 10960326 5' - Transpac 284 2 62.14 CGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGCTACAAAAAC:1 + chr2R 2666334 5' + Rt1a 74 1 60.96 AATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGT:1 - chrX 8200292 5' + flea 4819 1 63.70 GAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:1 - chr3L 22635791 5' - hopper2 1563 1 54.11 TTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3R 9163912 5' + hobo 54 1 79.61 AATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAAGTAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chr2R 5260086 5' - blood 7368 2 70.55 ATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 5446122 5' - roo 8987 2 76.03 AAATTGTTTGACAATATATTTTGCTTGGGAATTCCTTTTGTTCTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr3R 22289390 5' - 412 415 2 70.55 GCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGA:1 + chr3L 12250968 5' + flea 4816 1 61.64 ATTGCAAAGTGCATCTAGTGCTGAGCTCAGACATGAAGGGCTTCTAAATACCTTCACCTTCAGCTATATTACACGTGCCTCATAGTTACTTGCTTAAATCTCATATATTTCGGATAAGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTC:1 + chr3R 12738936 5' + Stalker 202 4 71.23 GGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAAA:1 - chr3L 5498515 5' + Doc2-element 252 1 41.78 GACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGGGCAG:1 + chr3L 12250946 5' + flea 37 2 59.59 ACGTCTATTCTCCCGAAAGGAGAGGTGTTCTTCCGTTAATAGAGGAGCTCCCGAAAAATAGGAGTATCCTGAATTCTGAGACGATTGTTGTATAGTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATAT:1 - chr3R 2999886 5' + McClintock 24 2 69.86 ATACGAGATAAATTTACTTTATTTTAAATAGATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - chr2R 20704291 5' + hobo 1 1 78.08 CAATTGAATTGCCACAACGAGAGGAATATTTCGGAACTCCTACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chrX 9816516 5' + jockey 28 1 71.92 CATGTCCACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 535410 5' - roo 9009 2 59.59 GATTAACGTTTTAACGATTTGCGCAAACAATTGCGGCAGTAACAGCAATCACTAACAAGGAGCACCGTTCCTTTATGCGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATA:1 + chr3R 12540015 5' - flea 4964 2 58.22 TTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr3L 5514186 5' + Doc 74 1 54.79 AGGCGTATGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTGA:1 + chr2L 22643346 5' + invader4 26 2 62.33 TGTTTAAACTAATTTATTGTATTTAAACGACCTTTCTCGGCCACACACACGGACAATGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTCTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr2R 16880918 5' + 1360 62 1 61.64 CACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCG:1 + chr3R 5940423 5' + hobo 2707 1 82.11 GCCACGACTGTTCAAATTTGGACAACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 22429267 5' + roo 8682 2 71.11 AGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGC:1 + chr3R 15589956 5' + Transpac 4978 2 59.59 GGCTATCAATTTCGTTAGTTTGCCGACCATAATTTCCTGTAGAAACATCTCGTAGAATGCGGGCTGTAATCGGCATGCTCGTCATATATCATATAGTATATACATATATATATA:1 + chrX 16921894 5' + INE-1 65 1 57.02 AACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCG:1 + chr2L 15142252 5' + BS 4778 1 65.07 TACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 + chr2L 1229585 5' - opus 430 2 67.81 TCATTCTTTTTGTCACCTCATCCCCGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3R 31903539 5' + Tirant 8122 2 60.00 GATCACCTGGTAACTTCTGTTTACATTCTAATTCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2R 18807731 5' + jockey 35 1 66.44 GCACAAGGATAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:2 + chr2L 18581221 5' + roo 12 2 76.03 AAAAGCGATTGGGGAAAAAAAAGGGAAAGCCAGCTAGCCAGGAAAGCGAATCCTTTTTTTCCCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTCCGCTC:1 - chr2L 4111963 5' - Rt1a 4958 1 58.22 ATTTCATTGATTAATATTCTACACATTTTGAAAATAATTGCGATATATGATTAGGTTTTCGCTTAAGTTACCTTTGTATAATTATATCTAAAATGATCGTTACTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:1 - chrX 13460669 5' + Quasimodo 11 2 72.60 GTTATCAGTACAGCTACAAACCCGAGATATGCAATAATAACCAGTTCGTTTCCGATGAATCTGATTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACA:1 - chr3R 4876894 5' + Transpac 5148 2 56.16 GGAAAGAGGCTTTTGGGCTAAGTTTCTATAAAATACTGAAAACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 - chr3R 6842718 5' - mdg1 7425 2 62.33 AAATTACACTGAAATATGCGAACGAATATCCTATAATTTAAGTTTTTACAATGTTTTTATGATATAATCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAAC:1 + chr3R 31966294 5' - Circe 7347 2 54.11 CGCATCATTGAACTTTGTTTGGATATTCGTCTGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr2R 6187999 5' + Tirant 8121 2 77.40 GGGTGATGGAAGCTACCGATCGAGAGATGTGTGTCAATCTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2R 22255448 5' + roo 8700 2 59.59 CTATAGTTTCCCAGCCATATCCTGTGGCAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2L 16685437 5' - P-element 2862 1 68.49 TTAATGAATGCTCTCGGTAAGGACACCTTGTTAATTTGTGTTTCCTTTAGCAGTACCGACACCATTAATGGTAGTTCGGGTGTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 + chr2R 15062146 5' - blood 7351 2 58.62 AAAATACTTTTGATAATATTAAGCCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chr3R 20149637 5' + 1360 3 2 76.03 AATAATAATAAAAAAAGAGAAATTGAAAACGAAGAAATTGAATAGGAACAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAAT:1 - chrX 2987863 5' + mdg3 5182 1 66.44 AATGAAACTGAAATAAACTCGCAAACAAACGAACATATTTGTCTTTTACTCGGAAAATGGGGTTTACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 - chr3L 16264744 5' - Burdock 6371 2 71.92 TATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3R 27835681 5' + 412 7115 2 57.93 AGATTCTTAGTTCCTCGCTGGAAAGGGAGGGCCTGCTTTAGAGCAAGCAAGAGATAGCGAGAGAGAAAAAGTGCGAGAGAGTGGGAAATGCAGTTTGTGAATTGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCACGAG:1 - chr3R 10079435 5' - P-element 2870 1 72.60 ATTTTTTGAACATTAGAAAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCACTGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chrX 13651610 5' + 297 17 2 71.23 CAATAAGAGCTGTGTTGTGTGATACTCTCTGGGACTCGGATTGATAAGTTGATCAAGTGCAAACAGAACATGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGC:1 - chr2L 7589265 5' + F-element 495 1 48.06 AGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGA:1 + chr2L 13877693 5' - Transpac 227 2 73.97 ATTAAACGGTCAGCAGAAAAAAAAATTTGTTATTATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACAC:2 + chr3R 6368580 5' + Idefix 48 2 54.11 GAAGCTAATGCCAGCGAAGGGGAAACTGTGGCATCTAAATTGTTGCAAAAATATTTTATTGCAATTCTTAAGCCCCAGCTAGCAGAGGCTCTGAGCTCCAAAACCAAATCTATTACATATACTACATCTATACCTGTTACATTTTA:1 + chr2L 17671434 5' + Stalker4 397 1 54.79 AAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:2 - chrX 15167762 5' - roo 351 2 57.53 ATCTTTGAAAAATTTATGACTTGGTATTAAAAATCAAACGAAAGAATATTCAAAATCTCTTAACTATATATTTCTATCAACTTTTTTAATCCCCGTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 12843718 5' - roo 9044 1 63.70 GAGGTGCAAATAATGAATCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGCCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTCCT:1 + chrX 5222883 5' - 412 428 2 70.97 ACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 - chr2L 19878237 5' + mdg3 83 2 72.60 ACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTT:1 - chr2R 982404 5' - HMS-Beagle 6966 2 72.60 CTGGCTCTGCTCTTTGGTTAGCCCCGTTGTATTTCGAACATTTGCGATGCGATTCCATTCGATTCGATTCGATTTCTGTTTTGTTTTGTTTCTGCGGCAAGGATGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGG:1 - chr3L 12661184 5' - accord 35 2 68.97 AGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 + chr3R 10467996 5' - opus 7444 2 55.48 GAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3L 2036992 5' + Doc 54 1 54.11 GGCATAGGATTAGTGATAAAAACTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 7694648 5' + Doc 4693 1 65.71 CTTGAAGATCGCTGTACCTCCGATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chrX 8895200 5' - roo 348 2 58.90 CAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 8397140 5' - roo 9020 2 52.74 GTTGACTGACTGCTGCGGCAAAAGGGCTACAAAATGGCAATTAATTGAAACATGAATTATTAACGCCATGATAGCAGACAACTTTGTGTGTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTA:1 + chr3L 18282961 5' + 1360 214 1 52.45 TGGACATATTTGCAACGACACACTTTACCAAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3R 10143072 5' - 412 7525 2 70.55 AAGAAAAATACTTTTGTAGTTTGACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 + chr3L 5183649 5' + copia 4883 2 76.03 ATAAATAATAACCTTGCCAAATCGTTTGACTTCGTTTCGCTGCTTGGCAACATATACTAAACACTAATGCTGAAAATCCGAAAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACT:1 + chrX 9983027 5' - pogo 1660 1 57.53 GCTTCATTATTTTAATTTGGTCTAACATACCAGCATTGTCTCCGCAAACAGCAATTTTACAATTGTTTCCCGTGGGACTTGATGGTAAGCGCCATTCAATCGCATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGC:1 + chr2R 3398867 5' - baggins 5213 1 56.12 ATAAAACTCAGCTCAAGCCAGCAAATGTCATCATTGGTATTGTGGCCATCGAACAGGTGAGAGATGCCCCGACCAATCTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCCCCACCCAAACATGTAATTATTGTCCAGATGGACAG:1 - chrX 5798055 5' + G-element 4281 1 52.05 AACAAAAGGCGCTCAGACGGAGACCAAAAATCAACTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGGATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3R 24455316 5' + 297 6600 2 69.29 AGAACAAGGTAATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTT:1 + chr3R 23507532 5' - 412 475 2 72.60 ACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr2R 6559047 5' + mdg3 5287 2 52.74 ATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 + chrX 14962218 5' + jockey 87 1 69.86 CCGCCGAATTGATACATAAGGTAATATATATAGGTAGATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACT:1 + chrX 7329218 5' + Bari1 80 1 78.08 AACAACAGCGAGAAGAGAGCGAAAGTAGTTGAAGTGAGTATAAATCGGCAATCGAATACAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATTCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTAAAAAATATATAGACAGACTAAGAACACA:1 - chrX 14986436 5' + G4 3613 1 58.90 CAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:2 + chr2L 18048281 5' + blood 87 2 74.66 GGACGGAAAGTTTCTTTCTCCGCTCTAAATCCGCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 16853449 5' - roo 9034 1 60.27 AATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAG:1 - chr3R 27845540 5' - Stalker4 7276 4 76.03 AAGGGCGGTTCTAATGGGCTTTAATTACATTAATTAAATACTTTCTTAATTGAGCTCCATTTTTTTTTCTTTTCTGTGCATGGATGTCTTTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1 + chrX 13934591 5' - Transpac 301 2 53.10 GGATGGGAAATGGGAATCCATGCACGTGTCCACCTAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chrX 8272510 5' + roo 71 2 67.81 CATCATAACTTAATAATGCAACAGCAATCACAATAGACTCCAGATAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATA:1 - chr3L 18296993 5' + Juan 4138 1 69.18 TTTTGAGGTTTAATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chr2L 2338181 5' + blood 44 2 56.16 CTGTGGGAAAGATATATTCGAAAATAATTGCGGCCCACCAACAACAGGGGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 8542524 5' - roo 403 1 76.71 TGCCAAAAAACTTTTTGCCACGCCCAAATTTGTAAAAATTTTTAATAGTGCAAGACAAATGATAATAACAATAACTACAATTATTATTTGCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACGTAAGTTTTCAAATCTTATTC:1 - chr3L 24075580 5' - Doc3-element 4664 1 77.40 ATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 12142654 5' - hobo 2893 1 52.67 GTCCGCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 12355405 5' + hobo 29 1 64.38 AGGACCTCAGGCCTGTTAATCTGCTCGCTGAAATATTGCAAACTGACTTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTTGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3L 14581517 5' + pogo 21 1 74.65 CATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 + chr2L 14969888 5' - Tirant 8433 2 67.12 GTGTGTATTTGTGTTACAGTTTATTGTTCGTCGAAGGGTGGGTCCACGTTTATTTTATTTAATAAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGG:1 - chr3L 13195639 5' - Burdock 342 1 58.06 CTTTGCGTGCTGCAGATTGGCGTGGAAATTCTTCACGCTACCATTATCTCGGCATCGACAAGTTTACAGCTCAATTGGCGTTAGTTCGTTTCCCGGATAGTTTAGCCATGCACTGGAAAAAATATAATTAATATTAATATTAATAT:1 + chr3R 15654808 5' - mdg1 44 2 76.03 AACACTCTAAACCGAAATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 4722512 5' - roo 9043 1 65.52 CAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2L 1073952 5' + Tirant 8143 2 76.62 TTTTAAGAAAATTGGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCT:1 - chr2L 3734624 5' + mdg3 5258 1 63.70 AGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACCTGCGGCAACACAA:1 + chr2L 15833011 5' - hobo 2859 1 71.23 GCTGGACAATTTACTAACTGTTGTTATGTCAAACCTAGCTAATTGCATCTAGAGTCTGTCTGGGAGTTTTTAATAATTACATTTTTTACTGTATTTTTCATTGCGTTTATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr3L 26816019 5' - opus 488 2 78.77 AAAAGCTTTAGTGCAGGATGTCAATGTTGCCCGTTTGTATACATGAACTGCATTGCTTTAAAGTCTTGTGTGGTATTTGTTGCTCACTGTTGTCTGTCTGATTTGTTTTTCCTCCTGGCCGCCAGCGATGTTTATGTTTATGTTTG:1 + chr3R 12518468 5' + 412 7126 2 45.89 TGAGCGATCGGATTTGTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAGCAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACATATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr3R 24479263 5' + 412 71 2 64.38 CATGTCAAAAGTTAACTATAACTAACCACCATCCACTATCTAGTCAACTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGACACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCG:1 - chr3L 19282229 5' - opus 302 2 67.12 CCCAAGTCCAAACCTGCGGATTTGTCACGCCTGATTATTTCATTAACTTTACGATCAAACTCCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr3R 21287321 5' + Doc 68 1 62.33 GAGTCAGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTT:1 + chrX 18239343 5' + jockey 4550 1 50.68 ACAGCTTCAACGATTAATTATGCTAATTGTACTCAGCATTTTGGTTATGTTCTTTTTCGGCTGTTTTTTTTTTAGAGTGTATTTCAGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTT:1 - chrX 2573675 5' - jockey 4860 1 56.94 CCGGATATTAACTTCTTTGACATAACAAAGGCGGTGGATTTTGGTGGTTTCGTGTTGGTGAACTTCAATTTAATTAATTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTA:1 + chr3L 22638756 5' - Juan 4168 1 52.05 TGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 - chr3R 20149790 5' - 1360 3326 1 62.33 ATCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chrX 19231697 5' - mdg3 227 2 72.60 AGAATGGAGTGGAGTGGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 22517749 5' + 1360 5 2 72.60 GCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGAC:1 - chr2R 5022787 5' - Gypsy12A_LTR 90 1 58.22 GTTTCGAAATATTCATTAATTCGACGTTGGCTAATATTTGCAAAGGTATCCATTCCATTCGCTGGCAACTCTTCATTTTCGCCATATACATACATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2R 17945086 5' + 297 6595 2 73.29 AATTCGTACAAATATTTGAGTGCTAAATGGTAAATGGTTAATTCGCTGCTTACATTGTAAGTACGACATATAAATTGTCATTGAAAAAGTTTTCTAAAGTAGGTTTTTGTCAAGAGGATGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTG:1 - chr3L 7025516 5' + Bica 17 1 62.76 TTTACAAACTTTTTATCAACTTTTGCATGTTTAAGTTTTGTCCTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2R 9867170 5' - roo 9001 2 67.63 GGGCACATTCCAAAAAGGATAAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCT:1 + chr2R 9326930 5' + mdg3 5283 2 64.38 TTTATAGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 + chrX 7525036 5' - I-element 5314 1 55.00 GTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:2 - chr2R 14562288 5' - Burdock 239 2 44.52 CTTATCGATAGGTAGTTGCACGTCTTATTCGAATTCAAATGGCAGACGACACTCGGCCAAAAAGCAATTTTTGTTTTCGCTTTGTTTTGCTCTTCTTTTGTGTGTGAACTCAATGATTAACAGAATCAAATGCTTTACTAATATCA:1 - chr2R 9836893 5' - Q-element 315 2 77.40 ATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAGTTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGT:1 - chr3R 27845539 5' - Stalker4 319 4 75.34 TACTACACCCGAGGCAGACTTTTGCAGCCCACAGTTTTCCTTGCCTTTTCTCCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGG:1 + chr2L 17198000 5' + R1A1-element 5013 1 76.71 CAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 4416011 5' + jockey 35 1 67.12 TGTCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 25822971 5' - roo 9008 2 64.14 CACCGGTCTGGCAGCACTAAACTGTCCCAAGACACAGACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCGTCACAGCTGTTCAGAAAAGCTTACCCGTGCTTACACGTGCTGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGCGAATTACT:1 + chrY 2468614 5' - R1A1-element 139 1 50.00 TTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTG:1 + chr3R 24228886 5' + opus 72 4 72.14 AAAAAACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr3R 31120315 5' + opus 19 2 71.03 TGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr2R 18807782 5' + jockey 85 1 66.44 TAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGT:1 + chr3L 24153179 5' - Tabor 7256 2 63.70 ATCGAGAGATGTGTGTCAATCTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2R 22255430 5' + roo 8718 2 54.79 AATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 + chr2L 2357310 5' - P-element 2795 1 22.60 TCGTATGTTGCATGTACTACGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3R 31907294 5' + Tirant 8114 2 80.30 GTCGAAGGGAGACGTTCGCAGTGGCGTAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3R 20292382 5' - pogo 2079 1 72.60 ACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chrX 14908456 5' + blood 7090 2 69.86 GGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2R 21898009 5' + 412 7081 2 63.70 AGATCTGAATCGATCCCAAAATGACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 - chr2L 1074037 5' - Tirant 362 2 58.22 CCACACCAGATCTGAGCCCCAAGCTGTAGGAGTTGTTATAATTTACGAACAACACGTAGAGAAACATTTTGTAGAATATACGAACATAATAAAAATAAGAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAT:1 + chr3L 20893555 5' + mdg1 54 2 52.08 GCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 + chr3R 25876877 5' + mdg3 77 2 68.49 AAGGGTATACTAGATTCGTTAAAAAGAATGTAACAGACAAAACGTTTTCGACCATATAAAGTATATTATTTATTTATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGAATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGGATTATTTTT:1 + chr3R 14437794 5' + pogo 42 1 57.93 TCATACGCACCGGAGGCCGCCATGAGAACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCGCTCGCACTCTA:1 + chrX 9525335 5' - hobo 2929 1 55.38 GTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:2 + chr3R 13544015 5' - 1360 3343 1 50.00 ATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATA:1 + chr2L 12283953 5' + Quasimodo 87 2 78.77 AAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2R 16383383 5' - roo 357 2 54.79 ATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3R 21924330 5' - roo 323 2 77.40 CAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3L 3762244 5' - roo 317 2 81.51 CTTTTGCTAATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr2L 17228585 5' + mdg3 5285 2 63.45 AGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAA:1 - chr2L 8393091 5' + I-element 5151 1 62.33 ATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 - chr2L 10832336 5' + Doc 71 1 65.07 TAATATGTAAAGTTGCCAACTCCGAACTCCAGCAATGTCCAGCTAAAGTAATTTAAACTCGCCTGCCACATTTCTCGGTTTATTCTCCGCGGGGTAAGTCCTCACATGATTAGGGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1 + chrX 18125085 5' + BS 5025 1 63.01 CGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr2L 10032728 5' + hobo 72 1 68.06 AATTAAGTGCTTGTTGTAAGAGCAGTGCCCTTATTCTCATATATATTTCAAGTTGGCGAGTCAATAACCTAATCATACTTCGCTTGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr2R 19354108 5' + 297 32 2 63.01 ATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr2L 12355360 5' + hobo 73 1 68.28 GCTCGATGCTGGTGTGGTGCTACACTGGAAATAATTGTATTGAAAAGAGATCTATACACCCATGTGATGCGCATATTTCCGGATTTACATTGAACTTTTCTTGTAAATATTACACATTTGAAACCTTAAAATTATAATAAATAAAA:1 + chr3R 13135772 5' - INE-1 424 1 73.29 AAGCAAACGAAAAGCCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 16771457 5' + roo 38 2 61.64 CTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 - chr2L 8772800 5' + Tabor 87 2 75.34 ACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:1 + chrX 19231731 5' - mdg3 193 2 52.74 AGGTCCTGTGGGGTGTTGCCTGCCAGCCAGAGCTCCAGCTGCTGTGATGACACTGACAACAATGACAACGCTGACATGACATGCCGGGACAAGAAAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGAGAAGTGTTGATGTCGCGCTTAA:1 + chrX 14410961 5' - HMS-Beagle 78 2 65.07 ACGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3R 9163963 5' + hobo 46 1 52.74 AGTGCAGCTCCTCCTGCTTGCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:2 - chr2R 7223760 5' - blood 7333 1 57.53 CCAGAATCGTTTCGGCTGTGGAAGGAATATTTCCAAGAACAAGAAATGGATAAAACTCGGGGGCCTCGCCATGGGGTTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCT:1 - chr3R 22478073 5' - invader2 4991 2 54.48 CTTAAATATAATGTCCTTCAAATTAACTATAAAAGCAAAAGTATGTACAAAGTTGAGATCCATTCAAAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 + chr3L 13313101 5' - roo 389 2 71.92 GCGGAATATATGCCATGTGTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCG:1 + chr3L 15058783 5' + blood 7010 1 58.22 GGAAATTTTTTTGATTGCCTCATCAACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 53093 5' - roo 9027 1 54.79 AAACTCCAGCAAGCTACTTGCTATGCGCATTTCCATTGTATCAATAATTGCCAATGTTTCGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chr2L 8392969 5' - I-element 5295 1 58.22 AATTTGAATATATTATCATCTCGTTCGTCCGTCGCCATTTTGTTTGTCAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGC:1 - chr2L 5711 5' + G6 30 1 57.45 CTGTTACGGAGAGTGCCAGAATGTATGTAAATTATTCGAGCTTCTACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr2L 20922983 5' + pogo 14 1 76.03 TGATTAATCATCTGGTTAAATATTTGCTCAACTATAAGCAAGCAAAAATAAGTCAAATCGCATGAGAAAGAAAGAGACACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 3762335 5' + roo 8705 2 55.48 TAAGTCAAAAGTTTTTTTAGGTTTAGGTGACAGGTAAAAAAATAAGCTATTTGGAATCAATATTGAAAACTGGTTAATTTAGCAAGGGCACTTTTATTCATAGGCAAAGGTAGCTCATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTG:1 + chr3L 14398892 5' - 1360 3259 1 76.03 TTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 - chr3L 13597837 5' - blood 7320 1 66.90 CATGGAGACGCAATCCGTACGTGGAAAGACTAGACAACGAGAAATCGGTGACAAAAGTACAAAAAGCTGAGTATTATTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGCAATATGTATTTGGTCGGCGTG:1 - chr2R 17495819 5' - 412 7260 2 52.41 AGTGCAAGAAAACCCTTCGCGGCAGTAGTTCAATGACCACGAAGGGATCGCTGAAGCCATTCGGATCCACTTGGATCTATCGCTCCCTAAGCGTATCTTTTTTCGTTGTTTATTTATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAA:1 + chr3L 7269707 5' - I-element 5338 1 51.72 CTGTGGTACCCTGGCAAAATCGGATAACAAAGGCTGGTAATTACAAAAGATGTAAATTAACACTCGGAAAATGAAATGGATAAAACTATAGTAAAAATGAAAAAAAAAAATAAAA:1 + chr3R 6533895 5' - INE-1 471 5 69.57 TACAATTCGCTAGTCCTAATCATCGGACACAACCGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAATTTAATTTGATCTGCTTGAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGG:1 - chr3R 30056549 5' - jockey 4916 1 71.11 AGTTATGACCAGGCGAGAATTTCTATTTTACTGTGAAATCTGTAATTTTCCCCGACAGCAAGGCAAAACTTTATGAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTC:1 - chr3R 14232776 5' + Tirant 375 2 63.33 ATTTGCAAATAGTTAAGTTGAATCGCAGAGGAGGTTGGTAGGCAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGGGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGTAGA:1 + chr2R 11682170 5' - Tirant 323 2 70.55 GCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAATCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr2R 7223741 5' - blood 7314 2 69.18 GTCCTCTTGATATTTAAAACGAACAATAAACACCTTAATTGCTAATCGAAAATTTCCACAGCTTTAAGGTAAATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCGCAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGG:1 - chr3L 3441197 5' - flea 4661 1 50.00 GTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTT:1 + chrX 18034614 5' + Juan 62 1 53.42 ATTAGGCAAAGTCAGGCGCCCGAAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2R 10991407 5' + jockey 9 1 78.85 CAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr3R 5765303 5' - opus 7467 2 62.33 CATCGAGAAGCCCACGGATTTGCAAGTAAGGCATAAAATATCATTCATTCAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr3R 4884536 5' + pogo 6 1 78.77 AATAAATAAAATAGATGCTTTTGTAAAGAGCAAATTTTATTTTAAAATTCAGATATCGGTTGTTAAGCTTCGATATGCTTTCAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTT:1 - chr3R 8022253 5' - roo 372 1 58.90 AGTATGCGTAATGGTCGCTGCTATTTTCGTGTGCAAGTATTTTAATCTCGCCAAGTTTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 - chr3L 293963 5' + FB 65 1 62.33 AGACCGAGAGCTCCACTAACAAAACAAACATTTTGCTACTTCGTCGCAGGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr2L 21237223 5' + P-element 69 1 38.36 AGCCCATACCCACCGCAATGCCCCTGCTCGAGCGCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTGAC:1 - chrX 15089609 5' + P-element 25 1 64.34 CGAACATCAAACAAAAAAAGGCGGCGCTGAAAAAATGTGAAATAAAGAGCCGCATACAAAGGCTTTTAGCCCATGATGATAACAAGAATTGGCATTTGCAAATTTCAACTCTCTCCATTCCATCCACACACACACACATATACACA:1 + chrX 5591783 5' + accord 188 2 52.05 ACAAAAGATTATTTTAGACTCATTAGAGTGTTCCTCTCCACGGAAATCTTTAGTAAAAGGCGAAAGATTTATTCGACAATTGAAGAGAAACCAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 13244924 5' + hobo 29 1 65.75 GACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr2L 1327482 5' - pogo 2054 1 50.00 AGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr2R 24338430 5' + 1360 68 1 73.64 GATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCT:1 - chr2R 20913184 5' - 1360 3302 1 74.66 CGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr2L 17069527 5' + 412 44 2 56.16 TTGGATGCAACTATATGCAGTTCGCCTTTTCTTCGTTTCCACCCCCCCCCCCGGGCGACCACAGATAAGTTCCTC:1 - chrX 5009269 5' + roo 213 2 66.67 AAGAAAAGTTCTCAAACTGTAAAACGTTTATCAAAACGTATAGCTGCCCCGTTTTCGTTTCGCCCAAATGCCACCCACATAATTGGCCCAAAGGATGCCGCCTCATCTTACATCCTCAGTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAAT:1 - chr3L 11361693 5' + flea 225 2 78.77 CTGATAAGCTCCCGATAACTCCTATAAGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chrX 3529697 5' + 412 7077 2 68.97 AATTGTGAAGGGGGTTCGGGGGGTTCAGGCCCCCTTTTGCAGCCTCTGAACGCTTGACTTCCCTAGGCTCTGACTCCGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGTAGCTGCTCTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCT:1 + chr2L 15152819 5' - G-element 370 1 58.82 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTATGCGAGCTTAACGGATTTTGCTCTGTTCTACATAGCCTCGGTTCGACGATGCGTTAGAATGAGACAAATGCTCGTCCTGT:1 + chrX 14768478 5' + invader6 195 2 75.34 TCTGAGGAAACGTTTACGGATTATAGTTTTCTAGAATTATGTTTATGATTTTATTTTATATCTATAAAGCTAGGATACTAAAAGTATATTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:1 - chr3R 6828055 5' - flea 4984 2 64.38 AGGATGGGAAATGGGAATCCATGCACGTGTCCACCTAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chrX 8272511 5' + roo 70 2 67.12 GGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 20290737 5' - roo 9028 1 77.17 ACTGGTAACGAATGTGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCC:1 + chr3R 1418271 5' + BS3 226 1 56.30 AGAACCGACGTAATAAGAAACCCAAACCATAACAAATGATAAAATCAAAAGGCGTCATTAAATAAATAAAACATTTATTACACAACGAACTTTAAAAGTGTGTCAATATTCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGT:1 + chr2R 12948289 5' + Bari1 1657 1 71.92 CTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGAGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2L 19424647 5' + Tirant 8141 2 54.92 TTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGT:1 + chr3L 16157182 5' + Juan 49 1 52.74 ATTTCATAAATACTTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chrX 11534544 5' + roo 53 2 55.48 AAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGAGTCCAAAAGTTCGTTG:1 + chr2L 19903372 5' - Transpac 270 2 51.64 AATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCG:1 + chr3R 23108065 5' + G-element 71 1 63.19 ATTGTCAAAGGTCTGAATGTTTCACATGTGTCGCTTTTTGCTGTGTGTGTTGACTCCCAAGTTGACATCATAATTCGGGCAAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAACAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAA:1 - chr2L 17101738 5' + TART-A 13225 1 55.48 TGTTCCCCGTCAAAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTT:1 + chr2R 19168103 5' + opus 7202 2 77.40 AAAAAGGACGCAAAAAAAGACAACCAAAATGCCGAATTTTTAGCTTCAATCACATAGGCAGCAGCTGATGCAGCAGACCCAGATTTTTTTTTTTACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 16908619 5' + roo 21 2 68.31 ACACCCCCCTCCCCCCTTTCACCGTACAAACACCACCCACTTTTTCGTTGGTAAACAAAAAGCATCTGAAATGCAATTCGCACCAGAGAACTGCAGGCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr3L 13227591 5' - hobo 2918 1 66.40 TGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3L 9241993 5' + roo 8728 2 66.44 AGTTGGGGTTACTTTGACTAAGGAAAAAATGGTAAATAAATCAATTAGTCCGGGGTACATTTTATGCGAAATATATAGGTCACTCTTATTTTATTTATTTATATTAATATCAATATACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACAC:1 + chr2L 16596136 5' - 412 487 2 71.23 CCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAA:1 - chr2L 17069618 5' - 412 7458 2 79.45 GCTTTCTAGCCAGGACACGTCGTTGAGCCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAA:1 + chr3R 8402544 5' + mdg1 65 2 60.96 GCAACGACACACTTTACCAAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3R 10143061 5' - 412 7514 2 63.01 GCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3L 13227717 5' + hobo 52 1 52.05 CCAGAATCCCGAACTGACATCTGATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2L 535508 5' + roo 62 2 62.33 TATGTAGTCACTGCGGATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACC:1 - chr2R 10453508 5' + mdg3 5254 1 69.18 GTTACGATCTTTAACCGATTCTTAAACATTAGCCCGCTGAAATGGAGCACAATCCGCTTGGTCAACTACGATTCATCTCGCCAGCACCTCCAGCATTTCCTTCACTAAGACCCAGCATTAAACACAATGTTTTTACATTTATTTTT:1 + chr3L 3390397 5' - looper1 1811 1 41.78 GCAGCCGAAAGTGGTGAAGAAGCAGCCTAAGTTTCCCACCCGCGAACGCCACATGGCCATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 16887261 5' + roo 8678 2 75.34 GGGGGCTAGAAATATTTTCCAAAGCTTGTTGCATCTAATAAATGGGATCTTATGGTCATAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chrX 7293210 5' - 1360 3331 1 61.64 TGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAG:1 - chr3R 24175751 5' + Burdock 87 2 78.77 ACACATTGGCAAAAGTTAAGCAAGGAAACGTATTAGATTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 3526365 5' + roo 8706 2 49.64 ATAAAAAAAAACAAAACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 11526902 5' + pogo 29 1 66.44 AAACACTATGTGTATATATCTTTAGCCCTATTTTCTTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTC:1 - chr3L 22638908 5' + Juan 4107 1 70.55 GAAATAGTACCTATGTAGATCTGTCCAAATTGTAAATTTTAAACAGTTTGAATTTAGAATATTGAGTTTAAATATATCACTTGAAGCGCGAGTATGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTG:1 + chr3R 19838619 5' + G2 2720 1 64.38 ACACGCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3L 13227721 5' + hobo 47 1 53.10 CGATCTGGACCGGTGGGAAGGGAGAGCCCGACGAGAAGATCACGCGAGCCTGTGCATTTCAATCATCTCATTAGTTGGTCATTACAATATCCAATGAAAATAACTTACAAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATT:1 - chr3R 27155805 5' + P-element 2723 1 74.66 GGTAACGCTTTGTAGATCTGAGATGGAGCCCGCGTAGTCGCCGCTTTCGCGATCATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 22289519 5' + 412 16 2 74.66 CTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2L 15920171 5' + jockey 75 1 63.01 TCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCT:1 - chr3R 3527168 5' - Tabor 419 2 59.59 TATAGGAGTCAACCACGGACCAGTGGACCCCATCCGGTCCATTTGGGGCGACAATTGCTGATGCTGGTCCGCTTTGATGTCCAAAAGTAATTACACATGCATGTTTCTCATAATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCT:1 + chr2R 13965600 5' - Quasimodo 7191 2 75.34 CTTTCATTACTTTTTATTGCCTACTTTCGGGCGTCCCAAGGAAAGGGCCATCATTCTCACACTTTGCAATTAGTGTCAGTCCAGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAAC:1 + chr2R 13078779 5' + BS 4698 1 56.85 TTGCTGCACAGAAATCATGAATATTTTATTGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACGCGCACTCTACGTCCACCCGATAACCACTCGGT:1 + chr2L 15621845 5' - hobo 2906 1 53.72 CGACATCGCCGTTCTTAACGGTCATCGTGTATATATAACTCAAGGGCTAATATCAATATCAATATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2R 14247073 5' + pogo 51 1 57.53 GAATAATTAATATAGGCATACATGAAATACCCCTGGGTAACATTTGGCAAATCTACAATGGGCAAAACGTGATGTTTGGGGTCACCGAAAGTGTAATTAATTTCAATACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAA:1 + chr2R 14525841 5' - roo 8768 2 72.60 GAGTAGTGGTGAGAAATCTACATGGCTATAAACATAAGATTCAACACTTTTAGGAGCCATGCCGCACCACTCCAACGCCCATCCTGAACGCGCCCACCAAGTCATTTGCTTTGAATGGGCTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTA:1 + chr2L 6884967 5' + hobo 2480 1 78.77 AAAAATAAACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr2L 14222241 5' + Transpac 56 2 58.90 GCATTAAAAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 + chr2L 19878125 5' - mdg3 5470 2 63.01 CTAGGGGGTTTTCTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr3R 15649757 5' - blood 7337 1 52.74 AATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr3R 7424611 5' + 412 87 2 77.40 TTTGCACTGGATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 31956527 5' + pogo 34 1 61.64 AAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chr2R 18123446 5' + 412 7140 2 76.71 ATAGGGATTTGGGAAACCCCATCCCTTCGAAAACATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAAGTGTTTTCCTT:1 + chr3R 20452172 5' - blood 352 2 60.83 TAATGTCACTGGTATTACATTTTTGCTTGTGAATAACAATCAGAAATACAAAAATTGTTGATATTTCGCGTTCGCTTTCACACTAGCTGAGCAACGGGTATCTGTTAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTGATAT:1 + chrX 22906393 5' + INE-1 585 1 65.75 TAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3L 14581357 5' - pogo 2060 1 57.53 CAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 - chr3R 25384292 5' - mdg3 195 2 50.68 AGGTCAAGGAGATGGCTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr2R 17986232 5' + 297 6620 2 59.59 ACCAAGTCAGTCACCCACCATGTGCAATGTTTATGTTTTGTCTTCGATTTGTTTCTAGCCTCCCACAGTACGTGCTATCTTGTATTCTCCGAGTTACATGCAGTGTCCCACAAGAAAGCCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCCTT:1 - chr2L 14678379 5' + Q-element 506 2 51.03 TTAATTGTGCGTTGTTTTAACTGCATTTAGTGCAGGCGTAATTAGCCAAATTGTTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 + chr3R 25521741 5' - blood 368 2 78.77 TGTTTCTTTGGAGTTGCACCTTCGATTTCTGTTCTTTGTCATATCCAATCACCAAGTAATAGCCATCCAGGAGATCGATAGACTGCCCCACAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr3R 10099815 5' + pogo 27 1 68.49 AATTTCTTCCATGAAACACAGTGCTAACAACATTTTTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTAC:1 + chrX 22824764 5' - jockey 4912 1 77.40 GGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 + chr3L 2037029 5' + Doc 85 1 78.57 TATATGTATATATATATATTTTCAACTGAAACAAAAACCATAAATCATATTCGGCACGGCGCGGCGTAAGTTTTTCATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr3R 24991140 5' - pogo 2081 1 66.67 CCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 12843576 5' + roo 53 2 56.16 AGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chrX 9816473 5' + jockey 71 1 59.31 GTGTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3R 5087134 5' - P-element 2869 1 70.00 GCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 11228550 5' - roo 9014 2 56.16 CAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1 + chr3L 15371294 5' + Transpac 66 2 63.01 ACGGCTATGGAGTAAGTGCCATTTAAATGAATGCTTAATTAAACGAAGAGCATGCAGACTCACATTTGTGTGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTAGAATGATTTAAAATAAGGGGTATATC:1 + chr3R 7904341 5' - Cr1a 4133 1 51.37 CATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTA:1 + chr2R 19076549 5' + F-element 250 1 73.97 TATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 11228575 5' - roo 8989 2 73.29 ATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGA:1 + chr2L 14969904 5' - Tirant 8417 2 78.08 CATTGCAGTCGCATTCGATTTTAATATTTCATTATTTAATGTGGCCCTGGGAGCCGAGGGAGTAGAGCAGGGATCAGGGGCATATGCATAATGAATAACTCATTTGGTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTG:1 - chr2L 581708 5' - G5 4557 1 73.79 ATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 5940464 5' - hobo 2915 1 58.54 ATCAGCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 19900962 5' - mdg1 7411 2 52.05 AATTCGAAATATTTTATTGATTTGTTAATACTCGTCTATGTATATATATATATTCAGATTTCATTTGGCCTTCTGTTCTGTCACAAACCCACTTACATTCACACACACACCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCG:1 - chr3R 11520059 5' + Rt1a 20 1 76.03 CACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGC:1 + chr2R 19076511 5' + F-element 210 1 50.68 TTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGTAACACC:1 + chr2R 21056689 5' + Tirant 63 2 63.97 TGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTGGACATGAG:1 + chr3L 22481240 5' - roo 335 2 67.81 ATACCTAATTATGTTTTAGATTAATATAACCGTTCTTATAAAAGATAGTTTAGTTTCCTGAAATAGTCTATTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 9332238 5' + roo 46 2 54.11 CTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:3 - chr3L 13204797 5' + jockey 72 1 63.01 AAGTAGTTTGCTGCTGCTCTTCTGCTTGGCTCCACTCTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTT:1 - chr3L 12864561 5' + Transpac 5177 2 74.66 AAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2 - chr3R 9482098 5' - roo 334 2 69.18 ATCAATCAGAAATTGAAAATAAAAGAAATGATACGTGGATCTATCTAGTAAACGATCCTAAACGAGTAACATACACATACATTAAAATCACAGCGGGTTGGCGTCTGGCGCGATCGGGGAAATCGAAAAAGAAAAAAAATGAAAAA:1 + chr3R 11562627 5' + Doc2-element 228 1 56.16 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACGCGCATGAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATAC:2 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 47 1 68.49 AAGGTTTCTTTGCGACAACTTGAACTCTGCTTTGTGTGCGTTTGCTGGCAGTTTTAGGTTTCTCTATTTATATTTCCGTTTTCAAATGGATCTCATGTTTCCATCTATTTTAAAAGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAG:1 - chr3L 12501684 5' - FB 407 1 74.66 CCTAATCAGATAAAACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACCTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATGAAGAACAA:1 - chr2R 21898026 5' + 412 11 2 73.97 TTTATCTCCTCCTATGTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 + chr3R 5087023 5' + P-element 75 1 34.93 GTCTGGCATTCTTGGGCGTACATAATGCATATATATATATATATATATATATGTTAACGCAAGTTCCTCTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3R 31120181 5' - opus 476 2 65.96 TCAATTAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr2L 9167543 5' + pogo 57 1 55.48 AGAAACGGATATGAAAAATAGCCTGGATTCTTTGTTAAATAATATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTG:1 + chr3R 12559667 5' - mdg3 170 2 70.34 AATTACGCGCTCACCTGCAGCTCCCCGCTTTTTTGCACCCACTTTCACTGCCCCACCAGACCGGCCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAAAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGG:1 + chr3R 11122257 5' - copia 75 2 53.79 AAACGCGCAATCGAAAAGACCCCACAAACAATAAAAACAAAACAAAAAAAAAACAAAAAATGATACAAAAAATAAAAAGGAAATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chrX 21422202 5' + copia 4876 2 55.48 GTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGTCTCCA:1 - chr2R 24338424 5' + 1360 64 1 74.79 GGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chrX 17614383 5' - roo 9004 2 64.38 CAACTGTTCGACTTTAATGCAATTTTAATTTCCTGGCTTATGTAGTACATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr3R 9345525 5' + pogo 19 1 71.23 GACTGGTGTAAAAGGGACAGGCACAAGTATCCCCGGCAAGGATGTCGACGACGACAATGACGAGTGCAATTATACAAAAACTACTTAGGCGTTCGAACATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTCAGATTTATTGTCACATCTAACGG:1 - chr2L 1264106 5' + GATE 419 1 60.96 AAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 23449238 5' - roo 9018 2 53.42 AGATGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCT:1 + chr2L 5771384 5' + Juan 33 1 62.50 GCATCAGTGAACGGACTGTCTGTGTTGCGGTCTCGCCTCCTGGCCATTCCTCAACTTTTGGCCAAGAAGTACACTCGGTTTCCCTTTTTCGAGTGGGTCAGTGCAAAGACCCTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTT:1 - chr3R 30262993 5' + Tc3 308 1 69.18 GCATGATTTATGCCATAAATTGGTTCAAATATTTATCCACATTTATGACGATTTTCTAGAGCGTGCGCTTTGTTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2R 13276426 5' + roo 20 2 72.60 TTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAG:1 + chr2R 19633182 5' + jockey 4615 1 56.85 TTCATACATATATATATCGGCCTGTATCTCTATGTGATATAATTAAAATCTTGGCTCTTAATTGTTGTCGAATGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCGC:1 - chrX 16921632 5' - Doc 425 1 52.45 AAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 21897999 5' + 412 7091 2 56.85 AGCTGGCCAGCCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 4869151 5' - roo 348 2 56.16 TCCATAAAATTATAACATTTTATTTTGAGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr3L 17667690 5' + F-element 10 1 72.60 GCTGGCTGATGGACGTTGTGCCCAACCAGAGTCGACGTCATGTGATAAGCGGTCTGAAGCCCTACACACAGTATGCGTATTTCGTGAAGACCCTCACCAGAACCGAATAAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCA:1 + chr3R 14920771 5' + accord 7222 2 74.66 ACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr3R 5765441 5' + opus 52 4 56.85 AAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chr3R 24228953 5' - opus 7422 2 77.40 AATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGGCGCGAAATTTCTTCGCGCACC:1 + chr2L 15153290 5' + G-element 103 1 77.93 ATACATTTTACACTTCGAAAAATGTATGCATGTCTACATTGTAAATTAATTGTAATTCTGAACTGAAATGTAAGCGGTAAGCATTAGGAACTCAAGAGAACTAATACATTATGCCACTTTGTATGTATGTACGTATGTAATATGTA:1 - chr3L 16643256 5' - 412 220 2 78.77 TATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 - chr2R 15062266 5' + blood 66 2 60.96 CAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3R 29708965 5' + blood 62 2 61.64 AGTTAATTTGTCCGAATCTATATGCAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr2L 13877629 5' - Transpac 291 2 68.49 TTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr3L 3979546 5' - opus 7467 2 62.33 GACGGCCGCCTGAAATTGGCCATCACATGATTGTTAACCACTTCATGCCAAATTGGTTTCTCAAAGTTCTTTCAACTCTGATCATGTATTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 + chr2R 17013988 5' + HMS-Beagle 6824 2 65.07 GAATAACACTGCTAATTCAATAAATAATCGATAAGTTTCACAAAAAATCGCGTTATTTAAACTGAACTATTTGCTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr3R 14663194 5' - pogo 2057 1 55.48 GCCAGCGCAAAATGCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCAC:1 + chr3L 14854659 5' + rover 6996 2 55.48 CACGAATGCTGACAACCAACAATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chrX 5222996 5' + 412 23 2 69.86 CGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 22481258 5' - roo 324 2 82.01 AGCTCGAAAACAAGCTTATACAAACTCCACACTCCGCTATTTACGAGGTAACAAGAGTTTATCACTGATTTGGTTCTTATTTCCCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 18915274 5' - Doc2-element 252 1 82.11 ATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 - chrX 8200335 5' + flea 4776 2 72.60 AGGCTGAAACTCGTTTGATAATGCCGACACCAACAGGAATTTTTACTTTCTCCTAATGTTAAATATTTCGAAAATATTTGTACCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGA:1 + chr3R 15160504 5' - opus 7027 4 50.00 TAGATTAAATTTCCAATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACT:1 - chr3L 10076403 5' + X-element 60 1 50.00 CATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 + chr3R 31907338 5' + Tirant 65 2 63.70 AGATAGCAGCATCGCATCCACCGCTGCATTCGCTCGCTGACACTGATAATTCAGTTGGCGATGTAACACCTCCACCACCTTTTTATCCTTCTCCTTTTCCTTTTTGCTCTTTCTTTGCTTCTCTTTTTCTTTTTCTTGTTCCTTTT:1 - chr2L 7676007 5' - Doc2-element 239 1 54.11 CTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 + chr3R 7739704 5' + blood 7100 2 76.03 GCCGATACATCAATTAAATTTGCATTTTAATTTGACGTTTCGTTTTGTTTGGCTCGGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGG:1 + chr2R 24863741 5' - F-element 325 1 58.90 AAACAAAAAAAGCTCAGGAAACCAGAACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 8082357 5' + roo 49 2 52.05 AAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 + chr2L 15153215 5' + G-element 23 1 63.01 AATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATGGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 11379715 5' + jockey 70 1 55.48 GTTTTCCACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1 - chr2R 24630211 5' - copia 196 2 67.69 TTATATTATTTATTGTTTTCCTTTTTCTGGTGGGGTACTTCTATTCTATTCCCGGTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGT:1 - chr2L 11556833 5' + invader4 2741 1 62.33 ATAAGGGCATTGCATTATGCGCCGCAAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 25753571 5' + hobo 12 1 78.08 GATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2R 20704144 5' - hobo 2937 1 70.13 CCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCT:1 + chr3L 18708621 5' + F-element 94 1 76.71 AACAGAAAGTCAGAATGACTAGCAGATTGGTTTCACTCAACAATTTTGAGTGCGGTTGCCACTCACCACTCACATCGCGGGTAGTTACAAACACCCAGTAAAAAACCTGCATGTGCAGGCAAGCACCCGGTTGTGCGCGCACCCGA:1 + chr2L 16857360 5' + hobo 133 1 77.40 ACACACCTGCAATACACATATTCTTCTAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 + chr2R 21227338 5' + mdg3 5304 2 52.74 TGAGATTTTCGAATAAGCCAATGTACGCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGG:1 + chrX 16853296 5' + roo 24 2 67.39 TAAATTAAATATCATTGTGATATTAAATCAGCAATAATTTAAATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCCTAAGCCTC:1 - chr3R 21150689 5' + Burdock 23 2 67.12 ATGTCCTTCTAGTATGAAAACCCTAGAAATCGTGTAACAACCATCATAACTTAATAATGCAACAGCAATCACAATAGACTCCAGATAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAA:1 - chr3L 18297034 5' + Juan 4097 1 52.05 GCTAGAAATATTTTCCAAAGCTTGTTGCATCTAATAAATGGGATCTTATGGTCATAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chrX 7293214 5' - 1360 3327 1 64.38 GTAATCTCCTCTATTCAACGCACACACAATTTACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr2L 12481450 5' + pogo 62 1 71.31 ATATTTTAATTAAATTACATTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3L 6751622 5' + pogo 30 1 63.01 AAATTTATGCATAATTTCTATGACAAATGCCACAAAACGGCGGCGAGAGAGCATGGAAAGTGTGAAAACCAGACCACAAGGCTGACAGTTAAAAGAGAAGTGTTCCTCTCTACGCAAATAATAATCATCTGCTCACCGGACTCCCC:1 - chrX 17236268 5' + Gypsy6A_LTR 310 1 50.68 GATGATATTCATGCAGATAGTTTAAAACAGATTAAAGAACTAAATACGAGAAAATCTCTTATCTGGTGTAAGCTAAATATCAGTTTAGCACATAAGCAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCA:1 + chr3R 11663626 5' + P-element 2774 1 67.81 AACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGC:1 - chr3L 14043639 5' + Ivk 42 1 56.85 GGTGCCATATCCAGGATCTTTTTCAGCTTCAGCGGCTGGGGGCCCAGATTTTGAATAGGCTGGGATGATGTGAATAATACTATGGGGCTGCTGCTAATGCCCTCGATTAGACGCTTGGCATAGCACAACACGCACACATATACGCG:1 - chr3L 16094931 5' + 1360 3216 1 80.14 ATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:2 + chr3L 18708611 5' + F-element 84 1 70.55 AGCCGCAGGTTTGTCAAACTTGGCCCGACTGCAGTGCAGCAGGCCGTTGCAAGTCCAACTGCAGCTCAGCAGTTTGTCAGCCAGTCAGTGCGACTATACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCCTAAGTCCAGATAGG:1 - chr2R 18924050 5' - Doc 4283 1 66.90 GCAACATAAGTCAACACTAAAGCCGGGAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATA:1 - chr2L 9356940 5' + Stalker4 31 4 62.33 CCCAGCACGAGGTGGATCACCTTAATGGAACTATCTACATGGATAGGATGGATCTCTCCACCTTCAACTGCATCCTCTGGGAGCAAATCAAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCG:1 - chr3R 10708696 5' - Stalker 7036 4 75.83 AGCCAGTATGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 - chr2L 17162866 5' - blood 7330 1 56.85 GTTCATCAAATTCAGGTATTTAGTGGGTGTCCCAAAAATGCTCCCGAATTCCACACTTGTTGCTGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr3R 8367116 5' + Doc 28 1 60.27 ATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chrX 11228583 5' - roo 317 2 78.77 GCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 + chrX 14385146 5' + blood 7067 2 54.11 GATCAATAGATAGATTTTTAGAGTAAGGAATTCCTCTCTTCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr2L 22746153 5' + 1360 29 1 56.16 AAATTATAGAAAAAACTGTGTGCACAAAGTGCCAAGAAAACCAGTGGGTGGCACAGTACATATAAGTCAACACTTGAATGATTAATTTTCGTTATCAGAATCAATAGCCAAGTCGTCCGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCA:1 - chrX 2781154 5' + INE-1 135 1 55.48 AATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr3L 3979560 5' - opus 7453 2 52.74 ACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr3L 3979568 5' - opus 442 2 58.22 ACAGCCAACTAACAAAATTCACGTCAATCCGGCCATTCATGTTAATCCGGATTTCTTAAAACCGGTAAGTGCCCCATATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTA:1 - chr2R 14868670 5' - hobo 47 1 54.29 GTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 + chr2L 18370353 5' + Doc 83 1 72.22 GCAAGTCGGATTATTTACATACATAAATATGTATCCATATTGCTGGTAGATAAATTCGATATTTGATCAGGATGACTAGCCGAGTCGAGCTGACCATGTCCTTCTGTCTGTCCATATGACGTTGAGATCTCGGAAACTATAAAAGC:1 + chr2L 22037427 5' + INE-1 149 1 55.48 TCTAACTGCAGTTCCAATGGAGCAGAGCGAAAGCAGCCAAGGTGATGGAGACTTCTGGGCGTTAAAACTCATTGCCCGAGCGATCCGATCGCACAGTTGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACTGCCAC:1 + chr2L 10032604 5' - hobo 2922 1 70.92 CTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAG:1 + chrX 18239359 5' + jockey 4566 1 59.59 GTGCGGTTGTCTTTTCGAGCCTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGGAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGC:1 + chr2R 5900773 5' + Bari1 12 1 76.71 ATTACTTTATAAGTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:2 + chr3R 10140139 5' - P-element 2870 1 70.55 ACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTT:1 + chr3R 17316055 5' + 3S18 5822 2 61.72 TAATATGCTTTGCCTACTTTTGTTACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3L 11665852 5' - pogo 2088 1 60.27 TTACAATTCGCTAGTCCTAATCATCGGACACAACCGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1 - chr3R 30056550 5' - jockey 4906 1 75.34 GAAACACAAAACACGAAACGCAAAAATTCAAAATCAAATTCAAATCAAATCATGTCGAGTAAATAATTAAAGCTAAGGTGTGCAAAAAGGGTGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAT:1 - chr2L 4311992 5' - roo 55 2 64.38 GGATATATATAAAAGATGAAAGTAAGATTCTCTGATTTTGCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr2L 19903311 5' - Transpac 294 2 47.26 CGACAGGGTTACCCCGGGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 19700851 5' - roo 9039 1 60.87 AATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2R 10367462 5' + 412 7094 2 52.94 AGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2R 20500128 5' + 412 42 2 60.00 GCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1 + chr2L 19903363 5' - Transpac 5174 2 56.16 GCTTACCTTTAACCACTTAGACTTAGGAAAGCTACACATAGATAGGGTTGAAATATATCCTTTAAGTGCCCCCTTTCCTTGTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chr2L 6406446 5' + transib2 36 1 62.33 ATACTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr2L 20984254 5' + blood 16 2 71.92 ATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr2L 19903368 5' - Transpac 5180 2 56.30 GGCGAGTTGAGAAGTTGAAGGAAGAGCGGCACGGCACCGGCGGCAACAACCTATACAGGATTATATTGCATTAAAACAAAGAAAGTGCTGAGATACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACAT:1 + chr3R 9576658 5' + Stalker2 7559 2 63.70 GGTCAAGAGCATCGTAATAAAACTCAAACAAGAAGGCATTGGATGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGC:1 + chr3L 16535180 5' - copia 5046 2 72.60 ATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 20704157 5' - hobo 2907 1 58.51 AAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTC:1 + chr3L 3979593 5' - opus 417 2 75.34 CACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3L 9375811 5' - mdg1 371 2 50.68 ATTGTTATCTATTTATACATTACATAACCGTTCTTTTAATCCTCCCGAATCTGACTGATCTTCAAATTCTGAATCCTAATCCAATCAACCTTTTCTTTGACAGCCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCA:1 - chr3R 3932553 5' + Circe 326 1 59.59 CACGATAAACACCTGATAAGCTCCCGATAACTCCTATAAGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chrX 3529685 5' + 412 13 2 76.03 CATTTCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 9616566 5' + roo 57 2 60.96 TAATACCAGTTCATGTGGAATAGTAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 - chr3R 21237875 5' + Doc 6 1 80.82 GCTCCATAATATGGAGGACTGTGCACTCGACTGATTACTGCATAAATGTGACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCAC:1 + chr3R 20147821 5' + 1360 260 1 70.55 GTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTAC:1 + chr2L 15153286 5' + G-element 75 1 75.00 AAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr3L 13597734 5' + blood 50 2 52.74 TTACTAGGGAATATCAGTCAGCAAATACAATAACTTTTTGCGCATGTATTGGGGTTATTTTTGAAGAGTTACTTGGAAATCAGCACAGAAAAAGTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCT:1 + chr3L 10076276 5' - X-element 4687 1 63.70 CTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 - chr2R 5900934 5' - Bari1 1654 1 55.86 GTTCTCGGGTTCGTTTTCGTGCAATTATGAAATATCTTATGTTATGCCTAGAATTTATTATGTTTTAACTTCAGATACTTTTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAA:1 + chr2R 16624775 5' - I-element 497 1 59.59 ACGAACAAGCTAGTGTCTATCTCTTGGGACTTACAGCAGATGACATGAGTCATCGAAATAATGGCAAGCCAATACATATTTTGATTGTCGTCGTGCATCCAGGGAGTTGCCTTAAACGGCTACCCCACACATTGGTTCCCGAAAGA:1 + chr3L 695443 5' - aurora-element 52 1 56.16 AGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 - chr2L 16685366 5' - P-element 2791 1 19.86 GCAGTGCAATTCAGTGAATTGTGTATTCTTGTTTTTGAAATATGTTAGCTTTGCCTGCGGTTAATTGAATTTCGATTCTAACTACATTTGTACACACTTGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGA:1 + chr3L 5528452 5' - Doc 4287 1 65.07 ATTGGCCAATTGCCAATTTCAGTTATTGCGCACCGACTTCCCCATACAAAAGCCAACAATTTGTTTATAATTGAGGGCCTTACCAATCCGAAAGGAACACTCCCCGCATGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGT:1 - chrX 11923986 5' - R2-element 241 1 73.97 GTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 9482117 5' - roo 9017 2 56.16 AAAAACAAAAAAAGCTCAGGAAACCAGAACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 8082355 5' + roo 47 2 52.05 ACAGGATAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:2 + chr3L 19396987 5' + F-element 35 1 65.07 AACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 20292561 5' + pogo 25 1 68.49 GACAATAACAACTGAAAGCATGGAAGATACACATTTCGTTTTGGGGCTAATAATAGAAGTGCAGCCGCGAAAGAGTAAAGACTTGTGGTACAAAGTGGTAATGGAGATTGTTTTACGGGGCGTGTTCCACACTG:1 + chr3L 16642542 5' - R1A1-element 5303 1 78.36 ATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr2L 19878149 5' - mdg3 194 2 53.42 GAGCTTCTGGAGCCATAACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 + chr2R 5214901 5' + F-element 18 1 76.71 AGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr2R 18123431 5' + 412 7125 2 66.44 TCCGAACGTATATTCACAACTTTGCACCCAGATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 - chr3L 15322131 5' + Transpac 12 2 62.33 GCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chrX 12558333 5' - Transpac 244 2 63.01 CTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCGG:1 - chr3R 30731454 5' + gypsy6 7483 2 70.23 ATGCAATTTATGTATGTATGTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAG:1 + chrX 5439967 5' + accord 43 2 54.79 AATCCATTATTGGCCAACGAACCTGTTGCATTATCAGCTTTAGTTAACTGATAAGAAACTATTTTGAAATTCATTATCATCTCATACATGTGTTTAACAAGCGCTCTGTTAATTAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 + chr3R 31196656 5' + jockey 4768 1 80.82 AGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCATCTTGATATGACAACC:1 + chr3L 19279105 5' - opus 7449 2 54.11 GTTTATTTGCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr3R 25409558 5' + jockey 90 1 71.92 ATATTTATCTCACAAATGAAAAAGAAATTGTCTATGAGCTGGTAATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 + chr3R 11096646 5' + copia 4899 2 65.07 CAATCATCCACTTGAGCAGTTGCATAGATTGAAGTTATCTAGATATGTAAATCATATTTTTTCAAGCATTCATACATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 2519733 5' + roo 1 2 82.88 AATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr3L 15035218 5' + pogo 62 1 64.38 GGTCAGCGGAGCGGAAGTCGCCGCACCAACAACAACATCCGCAGCGTGCTGATCAACAAGCGGCACACGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGA:1 - chr3L 18923990 5' + HMS-Beagle2 7096 4 54.11 AATCGATAAGCCTAACAGCGGGGCTGTCCACTTGCTGACAGCTGTTAACTGTAGCTGTAAGCTAGCGGCGAGTGCTTGAAGGTAAAAGGTTAATGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAA:1 - chr3L 11765911 5' - 297 458 1 65.75 AAATTGGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 - chr2L 3734616 5' + mdg3 5266 1 58.22 ACAGAAAATCTGGGAGTTTCGTAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2L 2519944 5' - roo 401 1 77.61 ATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCA:1 + chr2R 9326985 5' + mdg3 72 2 73.29 GGGGGCAGGTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAGAATTAAATAAA:1 - chr3L 22221277 5' + 412 20 2 69.86 TTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chr2L 19930172 5' + jockey 71 1 61.64 GCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 4722493 5' - roo 359 2 52.05 GTGTGGGTCCAAGCACGGCGATAAAAAACTTGGATTTGGTTTCGTTTTTTAATAAATAAAATAAAATATATTATTCGTAAAAAATTGTTATAATTGGCAATGTAATAGAAAGTGTTGGTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGC:1 + chr3L 12660112 5' - opus 497 2 76.71 GTTCCCCCATTCTTCTGCCCCCACTTTACCCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 16887423 5' - roo 9033 1 56.52 GCTATACAATTTCATGCCTAGTTAAAATAAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3R 20452304 5' + blood 7051 2 58.90 CACACTCCGCCCCATTTTTATATCCACAAATTCCTACGCTCGGCAGTATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 + chr3R 4659539 5' + P-element 79 1 32.88 GGATTGACATCGATGTGCGACAATTTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAAT:1 + chr3L 9375779 5' - mdg1 7441 2 71.23 GATGTAACTTAACATCTGTCGACACTTGCGTGCCACTTGATAAATCGGATCTAACTAAGTTGAACCCCCTGCCCAGCCCAATCACCAAACATCCGGATGGTCCCGGGTATTTTTCTCTTCATGATCAAAACCCTAAAGTCTAAAGT:1 - chrX 15366057 5' + Idefix 393 2 73.29 CACTTCAACCATAACAAGTTTCGAGGAAATCAGTGCCAATGAAAATAGTCCTTATTAAACGATCAAAACAATCATTCCTGTTAATCTTATATTTATTAAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2R 6945579 5' - pogo 2081 1 71.92 AACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2R 21078442 5' + jockey 73 1 70.16 AGAAGGATTTGTTGTGGCCTTAAGCCGGATTTATTCCTGTTTCGATTCGGTTTCGGGTTCTAGCTGTATTCTATTGACAATGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:2 + chr3R 30568779 5' + roo 39 2 57.53 GCACCTTCGATTTCTGTTCTTTGTCATATCCAATCACCAAGTAATAGCCATCCAGGAGATCGATAGACTGCCCCACAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 10099830 5' + pogo 42 1 58.22 ATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3L 5446098 5' - roo 9011 2 59.59 AATTGAATGTCTACAAATTTCTGAAAACCGTTTCTGCAACCATTATTCACTGATGTTTCGAGTATTTAGCAGCTGCAGGCAACATTAAGGCCATTAGCAATTGCTGAACGCTGTGTGCATAGGATTAATATATAGGTAGAATAATT:1 - chrX 7981380 5' - TAHRE 10345 1 58.22 TTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATGGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 7534611 5' - roo 323 2 73.97 AAAAAACATCAAAAAAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGCACACTCAACCGGGAA:1 - chr3R 27786658 5' + Tirant 8152 2 50.76 TAATGCATAAAAGCACCGCTCACATGGAGGTCAGGTCAGGTCAGGTCATTAGCCATGCCCGGCGGATCTTGTTCGTTTATTATTCATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr3R 19545431 5' - jockey 4950 1 54.79 CATATTTCATATTCCTTTCATAAATATTTGACCTTAAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGACGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGG:1 + chr2R 5217481 5' - F-element 4450 1 73.97 CGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 + chr2L 10650369 5' + Doc 85 1 76.03 ATTGGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chrX 14136523 5' + roo 8709 2 51.37 CACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr2R 15080095 5' - roo 8995 2 69.86 ATATGTAAACATACAACGTTGGGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGAACATATATGTACAATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 - chr2L 23396017 5' + HMS-Beagle2 6916 2 62.50 AAGCCGAAGATTTATGGCCAGTTGCCAAAGCCCACAAAATTAATGTACTTCACAGTTGAGTTTAGCAGCTGTATGTTTTTCTTTGCGGTTGTCCATTTGTTGTGCGCTTCTGCCTTTGTTTAACTTTTTTCTTTTTCAGTTTTTTT:1 + chr2R 24645454 5' - Doc2-element 235 1 58.90 CCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 - chr2L 12142635 5' - hobo 2876 1 66.67 GGATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTC:1 - chr2R 10453494 5' + mdg3 16 2 59.59 ACACTCGACACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGAGGAGTGTAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTCTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGG:1 + chr2R 15158587 5' + Rt1b 5090 1 67.12 GTAGGAATGTCAAATTAAATAAAGTTGCACTTTTAACCGGATATTAACTTCTTTGACATAACAAAGGCGGTGGATTTTGGTGGTTTCGTGTTGGTGAACTTCAATTTAATTAATTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 + chr3L 22638720 5' - Juan 4204 1 74.66 TGGTTACGTTTAAAACGTATATCATCACAGCAAAAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGA:1 - chr2L 1448697 5' + opus 7468 2 76.71 TTCGCACGCGGCATCTGGCCACACTGCCTGCAACGCTAGCTCGCCTTCGCAACGCGAATCCGCTCATTTCAAATTTTCACTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGG:1 - chr3L 16411828 5' + R1A1-element 5012 1 63.71 ACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 16908479 5' - roo 9014 2 56.85 AATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCTTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 - chrX 19231820 5' + mdg3 78 2 70.63 AAATTGACAATTTCCTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 - chr3L 3540276 5' + mdg3 5257 1 80.82 CAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGACGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGAGCGTGTGCTTATCTCACAAA:1 + chr3R 10973234 5' + jockey 103 1 76.71 CCAGCTCACTATCTCATCATTGTGCACTGAGAGAAACTACTCTGGATTACTCAACTAAAACTTAGAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGA:1 + chr2L 19684724 5' + Tirant 82 2 55.48 TATAATATATTCTGTGGATACTATCTGAATATCCAAACCAGGCGGGCAAAATATGAATTACACGATTCAAACGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr3R 21373712 5' + 297 46 2 50.00 AGCATTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 + chr2R 982293 5' + HMS-Beagle 37 2 60.27 ACCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr3L 18708568 5' + F-element 41 1 65.07 GGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTG:1 + chr2R 5900831 5' - Bari1 1638 1 57.53 CCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 - chr2R 24338440 5' + 1360 75 1 69.86 GGGGAGCCGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 - chr3L 9430649 5' + P-element 20 1 54.44 ATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 4639065 5' - roo 9013 2 60.27 CGCTGACAAAAAAAAAAGAAAAACGACGTGGTGCCGCCTCGTGCTGTTATCCCTCCTTTTCCGGCTCATGGCAAGCTCTGCAGTGGAAAAGCGCCGTCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACTGCTCGCAAGCACCGCTGCTC:1 - chrX 11148155 5' + Max-element 8309 2 74.66 AGTCGCCGCTTTCGCGATCATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 22289484 5' + 412 42 2 54.01 TAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 - chr3R 15649906 5' + blood 7033 2 70.55 AATACGAGCATATAATTGAAATCGAGTGTAAGTAAGTGCACAGAGAGGTGTCCGTGTGTGTTCGCGTGTGTGTATAGTGCTTAGCGAATACAAACCTCCATCCGTAAAAGCCAGGGGGAAATCCGTGGCCTACGTGGGAACCCCTT:1 - chr2R 16403648 5' + Rt1b 313 1 57.53 GGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCC:1 - chr2R 5022772 5' - Gypsy12A_LTR 75 1 51.37 GACAAATGAAAATCTCTGACTCTCTCCTTGAAGACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAG:1 + chr2L 10784771 5' + Stalker2 194 2 39.04 ATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 - chr2R 16410107 5' + opus 66 4 63.70 ATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTC:1 + chr2R 5284530 5' - Doc4-element 2601 1 51.37 ACGTAAGTATATATATATTTATTTGTAAGCTTATTTGTGGTGATGTTTAGAGTCCCGACTTGATAAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAATTATATGCCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTAT:1 + chr2R 10775434 5' + Cr1a 4150 1 81.51 ACACTTTTCTTTTTAATAACGTTTATGACCCCGATAACCATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 - chrX 17161899 5' + FB 84 1 74.66 GATTACGATAATGTCCCTCTTCAATGGGATTCGAAGGTGTTGAGTGAATTAACACACACATCCACCGACAGATGGCAATTTTCGGTATTTTTTCAGGCTTATGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCC:1 + chr3R 7671320 5' + R1A1-element 5297 1 69.18 CTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 9482081 5' - roo 8982 2 80.69 CATTAATTCGACGTTGGCTAATATTTGCAAAGGTATCCATTCCATTCGCTGGCAACTCTTCATTTTCGCCATATACATACATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr2R 17945099 5' + 297 6587 2 75.20 AGCAAAACTTATTGTGATAAGTGTACATTTGTGTGTTTTGTTTAATTAAAAGATTGAAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 6096451 5' - roo 390 2 72.60 GATAAAAAGTTTACGAGCAAACGAGATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:2 + chrX 14756615 5' - pogo 2085 1 74.66 AACTGAACTGAAAAACAACAAATCTGAAGAGTAAGCGCAAAATTTTCTTATTAATAATTTACCGAAAAAAAAAAATGAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTG:1 - chrX 13061820 5' - mdg3 5453 2 50.00 CCGCTCTAGCGATCACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGGCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 - chr2L 21237286 5' - P-element 2800 1 25.52 CCGTTTGCCGCTGCCTGGGGCAATTGGGCAACGCATTATGTCGTAGATTACGGCCTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3R 12537718 5' + Doc 66 1 60.96 CATAAGTTCAACTAGCTACAAAGCAAACTTAAAATGCGAGGTAAACACGGAAATGCCGAGGATAAATCAAACAAAACCATATACATGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAAC:1 + chrX 8354088 5' - R1A1-element 5290 1 73.04 ATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3R 29708912 5' + blood 9 2 73.29 GAAGACAATACCCATCTTGGCACTCATTAAGCATACATACACCAAGCATGCCCAACTCTTTCAGCTTCTCTACTCTCCACTGTCTGATATTGACTTATGGCATTTTTACCCACCAGAGGAGTCGGTAACCCGACCCATGGTGACG:1 - chrX 7560809 5' + Rt1b 473 1 72.41 ACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGCGCAC:1 + chr2L 15153288 5' + G-element 102 1 78.08 AAAGCTGAAAATGCAGCACGTGGTTAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 + chrX 3452385 5' - Tirant 400 1 79.66 ACTTGGTTACTTGATTTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAGCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chrX 19231884 5' + mdg3 17 2 73.97 ACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTCTCCATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAAATTGTCTCCAAATACTTTTTAATACTTTGTATGCAAAAACTAATAATTAACTAATCAGTTAA:1 + chrX 22564576 5' + Transib5 315 1 69.86 CGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATTTTTATGTT:1 - chr2R 18722016 5' + 412 7124 2 65.97 ACTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 - chr3R 20368105 5' + Max-element 39 2 58.90 TGGGCCCGCATAGAATGTACAATTTATTTATGGAAATAATATATCACAAGTAACCCATTAATTTACCATTTAAATCAAGCGGGCATTGCCTCCATAACGATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 16982180 5' - roo 9051 2 65.75 CCAGCAGCTCAGGTGCGGGCAGGTGGCAAATGGTTGGAAAAATGGGTGGAAAATGCCCGTGTGCCGGGCGAAACACAAATATTAAATAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCC:1 + chrX 6438127 5' - Tirant 420 1 72.41 CTTTTAATGTTGTAAATACTCTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 21924356 5' - roo 9014 2 59.31 ACTATGGGAATATTACATATATATAGTAATTTTTAATTTTGAAAAAATGTCTGCCCAGGAAGTCTGAACAATTTAGAATTGGTAAAATCTGCATGCTGAATCTCAATCTTCTAGCTAGTCCTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCA:1 - chr2L 21711931 5' - INE-1 140 1 60.27 AAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGA:1 + chr3R 20149727 5' + 1360 95 1 80.14 GAGGGGAAACCACCTGGAGGTGGTAACATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCC:1 + chr2L 18163783 5' - HMS-Beagle 160 2 79.31 AGTGGTCAAAGAGGGTTGTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGT:1 - chr3L 22481359 5' + roo 31 2 63.01 AATATTGTATTAAGTAACTGGTGGGCGTCACCACCAAAAAACGAGGAAGACTGCCAAAGTTCCGACCTCGCTGTGGAGGGTTGTGCTACTTTTAATTAATTAACCTTCCCTAGATAACCATATAACGATGCTTGGAACAGTCTTTA:1 + chr2L 3682762 5' + Cr1a 4025 1 58.22 CTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGAGAGGGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATCTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 16908480 5' - roo 9013 2 53.42 TATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAAT:1 + chr2R 5582166 5' + Cr1a 484 1 47.59 AAACTAAACTGACTCAGCTGAAAGTTGTATACGTTGAGTGGCTAGCCTTGAACTTATCAACCCATTCAGGATCCCCACTGTTTTCACACCCATTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chrX 12551668 5' - pogo 2075 1 67.81 GAAGAGAAGAAAGCGGCTCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chrX 983247 5' + 412 7083 2 65.00 TCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCGTCTTTTGATTTTAG:1 - chr2L 17069630 5' - 412 7470 2 69.86 TGCAAAAAAAAAGATGAGAGAATGGGGTGGAACAAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 4104143 5' + roo 16 2 75.34 ATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGATTATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 + chr2L 17228594 5' + mdg3 5295 2 55.48 AAAAACTAAAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr3R 23664528 5' - pogo 2081 1 72.60 GTTTGTTGGGTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3L 14898822 5' + jockey 15 1 78.77 AGGTAGATGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCT:1 + chr2L 5771380 5' + Juan 31 1 63.70 TTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACACAATCGGTTGTTGTGAGTGAAGTG:1 - chr3L 17667623 5' + F-element 61 1 55.38 GTACTAAGACAATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr3R 5245532 5' + 1360 24 1 69.86 TATTAAATATGACCCGTCTAGTGAGAATTGTTTATATTATTATTTCCATTTATTAGAATGGCACCTTCTTGAATGATATCTATATTGCATTGAGAGGGAGTGTTGAAAATATGTATATAATAAAGTCAATGCAGTGTGTCTCCCTC:1 - chr2R 543945 5' + Dm88 52 2 58.90 TTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGC:1 - chr3R 934271 5' - Rt1b 4727 1 47.26 GCGGGGACAAACCAAAATAACACAACGATAATAAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2L 10089880 5' + 297 6596 2 75.52 GGACTGAAATCCTAATGATTAAATTAGTTTTCATTTTTCAGCATGATATCCGTTATATCTATTACAGTTATCCGCCCATCCAGTGCTGCCAAGTAACTGAGTAAACAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCA:1 + chr3R 8250278 5' + roo 8815 2 70.55 ACTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr2R 14385558 5' + jockey 64 1 55.48 TTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr2L 15833074 5' + hobo 77 1 70.55 GTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 + chr2L 19424649 5' + Tirant 8167 2 57.53 GTGGTCATCACACCCAGCAGGGCCAGAAAAATCGCTCCAAGATTAAGTTGCATCTTAGTTCGGTGGCGGGAATTGATTGATGCTTAGATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATAC:1 - chr2R 15408907 5' + R1A1-element 5333 1 55.48 TAAATAATTCTTTAATATATTTATCACCTTTTAGGGGCTGTATGCGTTCATATCCTTCAAATTGCCTTATTTAAATGTATTATTTATGAAATAATAAAAGAATTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr2L 21596445 5' + blood 17 2 74.66 CAACGTAAATGCAGGCTGAATTCAATATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGAC:1 + chr2L 8959845 5' + Ivk 5084 1 76.03 ACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAAGAACTTTACAATTTTGAGGTAAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chrX 21204948 5' - 1360 3356 1 56.16 AGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGGGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAG:1 + chr2L 17198070 5' + R1A1-element 5080 1 69.93 GTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2L 19930183 5' + jockey 60 1 54.11 CAACCTCTATCACGTTGCTGTAAAGCCTCTTGTGCGGATTTATTAGCTGAGCGATCGGATTTGTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3R 24479310 5' + 412 24 2 69.86 AGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 22481219 5' - roo 9037 1 58.14 ATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr3L 15058839 5' + blood 7066 2 52.74 AAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chr2L 10089848 5' + 297 50 2 59.59 AAGATGATACATGCTGAATACATTTAAACTGAACTAAAAACTATTCATTGCATTTACTGATCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAG:1 - chr3R 26862613 5' - opus 7086 2 52.38 AAGCTGATAAATAAAGGAGGGATGTGGGAACCGGAGCGAGAGGGACTGGAGAGGCACTCTCTCCCAAACACTCAAAAAGGCAAACGCTCACTCTCTGAGATAGAGCCGGAGAGCAGTATGCCCCTATGGGGCATTTGTCCTGTTTT:1 + chr2R 3292697 5' - hopper 1411 2 58.90 CGTTGTACTAGCTCGAGCATTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 + chr2R 982278 5' + HMS-Beagle 6818 2 70.55 GATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3L 10814630 5' + 297 6608 2 65.73 GTATATGCTAATATAGATAGTCAGAGGTAGAAAGATGTATATCCTTGAAAGATTTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGCTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATGG:1 - chrX 10824912 5' + R1A1-element 215 1 62.07 ATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3L 15058828 5' + blood 43 2 44.83 TGCGCATAAATTTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATAACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAA:1 - chrX 17012726 5' + Burdock 6202 2 63.01 TTGAATTGCATTAAATAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCT:1 - chr2L 15153384 5' - G6 2005 1 69.86 CAGGGTAGCAAAGCATGCAACCATTTTCTCCATTATTTTTTGCAAATTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACT:1 - chr3L 12030583 5' + I-element 5235 1 67.81 AACTCTCATTTGCACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chr2R 18721942 5' - 412 7470 2 69.18 TGGCTATTGGCAGTGAACTTTCCCATTTTCCAATTTTCCGATTTTCCAACACTCCTGCATGCCGCCTTTTTTTTTTTGGCCCCCATCTGTTGGACTATACTATTCCACCTCCAAAAATAACGTTAAACCACACTCCTTTATATTTG:1 - chr3L 16535285 5' + copia 38 2 55.48 GTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACG:1 - chr2L 9010496 5' - 1360 3304 1 76.03 ATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 - chr2L 16685381 5' - P-element 2806 1 30.14 GCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 - chr3R 13358687 5' + mdg3 65 2 58.90 AGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATA:2 - chr2R 14884337 5' + mdg3 5318 2 69.18 TGTTCGAGTAGTCAGCGCCTAACGCTCTTGACATTCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 + chr3R 15465428 5' + mdg3 5264 1 76.71 ACGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTC:1 + chr3L 24153197 5' - Tabor 7238 2 76.03 ATATATAGTATACATTCTTCGAAGTGAAATCGGATAGGCGCTCTAGTTTTACCCTAATGACCTTTCCACACTCAGATACATTCACACGTACATTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTCAGTGTGTGTACGTGTGTGTGCGA:1 - chrX 12811895 5' + Stalker 446 1 53.42 AGTGACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTT:1 + chr2L 16107247 5' + Rt1b 113 1 65.75 CGCAACTGACTGACTGAGAAATGGGGCGGGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr3R 12794997 5' - mdg1 384 2 59.59 CATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGCCATAAGCTTATA:1 + chr3R 15465482 5' + mdg3 5318 2 60.96 AACTTTTACCGCTGCCGCTCCCGCCGTCTGGTTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr2R 17100129 5' + P-element 56 1 33.04 AAGGGTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATTTATGTGTGTAACATGTTCAGGATCAATACCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGAATGAATGAAATCTCGCGTTCGCTTTCGCACTAGCTGAGTAGCGGGTATCTGTTAG:1 + chr3R 14437794 5' + INE-1 547 1 68.49 ATCGTATTTCTTTCGAATTGAGGTTTTATGCTCGCCTGTCAAATGGATTCAACACAAGTCGACGGTGTAAAAATAACAACTCGTAAAAGCAAAACGAAAATCAACTTAATTTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chrX 10538281 5' - pogo 2094 1 79.45 CATGGGATTATTTTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 - chr3L 3979727 5' + opus 9 2 79.45 GCAACCTCAAGAACGAGTTATTTGAGAAACTAAGCCAGTATGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr2L 17162898 5' - blood 7374 2 70.90 ATCAATATATTAGACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3R 8705860 5' + hopper 2 2 82.58 GGTTAAATATTTGCTCAACTATAAGCAAGCAAAAATAAGTCAAATCGCATGAGAAAGAAAGAGACACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 3762322 5' + roo 8718 2 55.48 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCACAAGGAGGAGCCAC:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 347 1 68.53 TGCCCTTGTGAGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 + chr3L 3540073 5' - mdg3 5483 2 75.34 ACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTC:1 + chr2L 10784804 5' + Stalker2 227 2 54.11 GACTATGCTGCTCCAGTTAATTACATGATTTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAACATACTCGCG:1 - chr3R 26782770 5' - hobo 2849 1 76.71 AACGTAAATCAGGTGAGGTACAGTGTCGATGTAAAGCGACCAAAGATGGGGCATAGCGGGTCAAAGTTCATTTTTAAGCTAGGAATATGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2L 13879695 5' + Transpac 30 2 64.38 GTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGGGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCA:1 + chr2R 19076538 5' + F-element 211 1 56.78 TAGGCTCTTCTAGGAACATAACCTTTTTTCTTGTATAAACTTTCCTGGTTCCCGTCACAACAACAACACAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGGAATTTTTGCCCATGCATC:1 - chr3L 5249490 5' - HB 1243 1 53.42 AAACATAGCCGCAACATCGCTGATATCCTTCTTGGCACTATGAACTTATTTCTTGCTTTTTATGACGGCTGTTCCCCGAGAAACTTTTCAATTTTGACAGAAAATAACGGAAGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr2L 7667552 5' + copia 11 2 78.08 AAGGGAGTGACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTT:1 + chr2L 16107242 5' + Rt1b 108 1 69.18 GTGTCGTTTCGAATTGAGGATTCTGTCGGTACTCTCAAATTAGGTTATTTCCTCTTGAAAACTCACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 + chr3R 6782669 5' + jockey 4699 1 67.81 GTGCGGGGTGGGGCACACAAGCACCTTGCACTTGAAAACCGAAGTGCGGGCAGCGCTGCTGCCGTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGGTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chr3R 30272934 5' - Tirant 8501 2 77.10 CATGCATCACAATAAAAGAGAAGAAGAAAAAACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chrX 10101270 5' + mdg3 5265 1 76.03 CGGGAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGAC:2 - chr2L 9356917 5' + Stalker4 54 4 56.85 GGGGTGGCGCCATAAAACCCATTTGGCGCACAGCCGTTAACGTGTTTTGTTGTTTGGCAAAAGAGTTGGGGTTGGGTTTGGTGTTGGTGTTGGGGTTGAGTCTGGGGAATCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATC:1 - chr2R 14071885 5' + HMS-Beagle 7007 4 76.71 ACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr2L 10089844 5' + 297 6635 2 62.33 ATATTCAATGTTTATTTTGCTATCGCACTTTCAACAACCTTTGAACTGCAAGCTGCACATTTCGTTTGACAAGCTCGTGCGATTTTCCATGTAAACAGCCTGTGGGCCATTATTTCGATAGGGTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 6910102 5' - Doc2-element 234 8 79.45 GGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3L 22221267 5' + 412 7083 2 65.07 ATGCTAGAAACTTCGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 + chrX 14692841 5' + Transpac 61 2 58.90 GCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGT:2 - chr2L 14222329 5' - Transpac 230 2 76.03 ATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr2L 12355369 5' + hobo 65 1 62.33 TTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 - chr3R 20452254 5' + blood 7101 2 79.45 TTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3L 10814633 5' + 297 6608 2 66.44 ACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 + chr3L 15371289 5' + Transpac 4980 2 59.59 AGTCTTAAAGCTCTTTAAAAGTATATTAGATTATTTGTATTAAAAGTTTATAATTCCATCTTTTCTCATTCCCAGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr2R 19263411 5' + Doc 55 1 48.63 AAGCCGCAAACCGAAAACAAATTTCCATACATGCACTTTCCGTAGAATCCCTTCGTATGTGTCGCATTTTGCTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3R 18903378 5' - pogo 2053 1 52.74 AAAATTATGGTGCGCAGCGAAAACTGTTTTCGTATACTTAATTATTTTATAGTTTGAATTTTTTAACCCTCCCCTCCAGCACTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCT:1 + chr2L 14224883 5' + Transpac 5082 2 54.79 ACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAA:1 - chr2R 6984397 5' - HMS-Beagle2 239 2 70.34 GAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 9482107 5' - roo 9007 2 63.01 AACTATATATTTGCCACAAAATGATTGTGTACTTAAGAGCAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAA:1 - chr2L 18365396 5' + Doc 4259 1 73.29 AAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 25822985 5' - roo 8994 2 73.79 AAAGTCAATATCCTTGTATTTATTGAGTGGAGAGAAAAATATACCACTTCGATTTGGTGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2R 20500006 5' - 412 7518 2 64.38 CAATCTAAATGCCTATTTGGCATACAAGTTGTTATGCTAATGGCTAAAACCTTTAGTATTTAGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr2R 6945729 5' + pogo 56 1 56.16 TTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr2L 19930151 5' + jockey 92 1 76.03 ACGCATTTTATCTATCTCGTTTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:2 + chrX 983079 5' - 412 7527 2 71.92 AGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3R 15514595 5' + 412 45 2 63.89 ATAATTAATAAAATTATGTAACCAAATTCTTTGTTGCTTACGGGTTGCAGCGTGCCAGCTTTGCGTGGCAAAAATCTTGCACTGCGTCTATGTCTCTGGAAGCTGCATGCGTAATCTAAACATTTTATAGTTCCTGAGATCGAGAC:1 + chr2L 23313288 5' - INE-1 145 1 65.07 AGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr3R 24809922 5' + 1360 36 1 74.16 AATTGTTTCTTGGGATCGGCTGGCGAAAGTGCAATCGGATTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGG:1 - chr3R 30731521 5' + gypsy6 7424 2 76.69 ATCCAATGTGTGCCATTTGTCAAGGAGGAAAACTTCGAGGCAGCGCAGCACTTATTAAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGA:1 - chr2R 20408296 5' - mdg1 7304 2 63.70 GGTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chr2R 23313119 5' + Tabor 32 2 62.33 TTTTAATAACCATTGACAATAACAATAATGGCAATGTTGCAGCTGCTGGGGAATTGAATTTTGATTTGATTTGTTACCGTTCAAGATACAAAAACTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCT:1 + chr2R 20015076 5' - X-element 4687 1 65.75 ACATACAATTACATATACTAAACAAAATGCAAACCATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCA:1 + chrX 23043094 5' + roo 34 2 62.33 CAATACGGAAAATTCGATTTTTTCGAAGCACTCGAAACGCGTTCCACTGTATCTCCCTAGCGAATATCGTAAATCAGTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr3L 13922405 5' + Tirant 35 2 50.72 CTCTCACGTACTGGGCACTTACACAGCTGCAAGAGTAAACACACACACACACTCACAGGCACAATCAGCTCGAGCACCTTTCACAGAATGCACGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 + chr3L 14863805 5' + Transpac 31 2 65.07 CTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 + chrX 19231719 5' - mdg3 206 2 57.93 GGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAG:1 - chr3R 30731439 5' + gypsy6 7472 2 77.14 CCTAGTGTGGTTAGAAGGGACAGTGGAGTCATTCGAGCCGGCACGGGGTACGTTGTCAAGGACAACGCGGAACAACGAAGGAAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTCGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTTGTAAGGGAGAGC:1 + chr3R 892822 5' - Doc2-element 463 1 58.22 GTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chrX 16243793 5' + 412 18 2 71.92 ATTGAAGGGTACATATATGGGATTCGTGAAGACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 - chr2R 6559078 5' + mdg3 5270 2 73.97 GTTAAAGTGCCAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 4416001 5' + jockey 18 1 77.70 AAACAATTTATTTTAATATCTTACTTATTTTGTCTTATTTTAGGAAGTGGTAATAGCTAGTTCATTATCTGTAACCAGCGGAATGCTCAACCTTATGAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAGGCAAGATCGCTTA:1 - chr2R 5212489 5' + F-element 134 1 69.86 ATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 23043132 5' + roo 8736 2 71.23 GAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 - chr2R 22692460 5' + Ivk 34 1 60.96 GGGAAAACGATCAGTACGTGTTTCTGGATTTGTTTATGTTTTGATTGTGCTAAGCGTAGCGGATAAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:2 + chr3R 10357737 5' + pogo 50 1 54.79 CATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTC:1 + chr2L 5771413 5' + Juan 64 1 58.90 AAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGGACGCCGTCTCTCAATTCA:1 + chr2R 19076555 5' + F-element 235 1 71.20 TACCATAGTATATGGTATATACATAGGTTCCTACAGAGAACAGGCCTTATCAGCACCACATCCAGAGGCCGGCTAACTAAGCCTATGCGTAAGAAATGCATAATTGGCTTTTTCAAGTAACGGTAAATAAATAAATAAATTGATAG:1 + chr3R 30013941 5' + Doc3-element 85 1 48.63 ACTAAAAGCGCCTTATTTACGACGTTTACATGCAATATTTACACGAAATCTCTTACAATAACAGTTATGCCTGCCAATGAGCATGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAA:1 - chr3L 15398752 5' + Tabor 71 2 56.85 CTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3R 20149804 5' - 1360 3340 1 52.74 GCAAATCCATCATTTTTGGCGAATTAAGGTGCCACCCGGTGGCAGACACCGCCCGAGGCACCTGTCATTGGCTCCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr2L 1070200 5' + Tirant 17 2 72.81 ACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTATAGCTAAGATACAAAATATTTCTCT:1 - chr2R 6984376 5' - HMS-Beagle2 230 2 80.45 ATGTTGAACATGGGAGAGCGCTGCAGATGAAGAAATGCAAGCTTCTGGGATGCTGGTACATATAACAGCTACCAGTGAAACCGCAACACATATCGTTTCGGATCCATGTTCATAGCGGCCACGCAAAAATGCTGAGTTTG:1 + chr2L 22726855 5' - Gypsy6A_LTR 101 1 52.86 CCTCTTGAAAACTCACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACA:1 + chr3R 6782719 5' + jockey 4740 1 64.23 TGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr2R 20913132 5' + 1360 82 1 71.92 TAAATAGTTACCAATTAAGCTTTGTGCGCTCAACAATTTCCGAAAATGTTTTTAAAAATTTTCCAAAACCATTAGATTCATGCTCTTAAATTCGCTATTTCCTTCATTTTAATTTTCCATCCATCAACATTTGTAACAAATTGTTG:1 + chr3L 7956421 5' + INE-1 375 1 68.49 CGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:1 - chr3R 15590034 5' - Transpac 223 2 76.71 ATTAATAAAGCGCTTCCCATGACGGGAGAAAGCCATTTGGCCCTGAGAAATTTATCGAGAGACTTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 13313283 5' + roo 8686 2 67.81 ATGAAGAATTGCATTTAAATTGCAATTTGGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTG:1 - chr2L 18368589 5' + Doc 338 1 77.17 CACGCCCAACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3R 7424526 5' - 412 446 2 51.41 GTAAAAAAGGAGGGCTTGGAGGGCTGCAACTTAAAGATACCCAGCATTCTGAAATGATAGGATATTTAACTTTTAATGACTACACTGTATAGAAGAGAAATATCACACTAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGA:1 + chr2R 6558883 5' - mdg3 5488 2 78.08 ACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr3L 15035214 5' + pogo 60 1 65.71 TTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 - chr2R 15392786 5' + blood 80 2 71.92 GCAGAATCTGTAAGCTGGCAGAGCTGAACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2R 22255277 5' - roo 393 1 76.03 AATCAAAAATAAAAAAAATGTTTACGTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAATTTTTTGCAGCTGAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACAT:1 + chr3L 3846446 5' + rover 33 2 63.70 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGGTCAACGAAGATCGCCAATACTAACTCTGACGAAGAT:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 130 2 62.33 ACAAAATGCCACGTCCTTTTTAACTAAATAAAAAAAATACTACTAACTTTCATCTGAAACCAATAATTTATTACATAGAATTAAGTTCTTTTTTTTACATTTAATAGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 11228702 5' + roo 8679 2 75.34 CCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:2 + chr3L 19397019 5' + F-element 67 1 56.16 AGCCTGATATATGGATTATCACATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr2R 18123531 5' + pogo 46 1 52.74 GTATGGCTGGGGATGGTGGGGTGATGCGTTAGCTGATTGTTAGAATTGATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr3R 10562094 5' + I-element 35 1 60.27 ATTGAAACAATAAAAAGGGCGCAACTGACTGACTGAGAAATGGGGCGGGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr3R 12794978 5' - mdg1 7441 2 72.60 CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGA:1 + chr3L 25232764 5' - accord2 131 2 64.38 GAAATGGAAATGTAAAACTCGGAAATGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGGGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACCGC:1 + chr2R 16410528 5' + opus 7333 2 80.69 GCTTTAAAACAAAGCTTAAGCGTTGTCACAATACCTTACAAAAAAGCTCTGATCTGCATCAACAAGCATGTAAAAGATATTTTAAACATACATACATTAACCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGT:1 + chr4 227821 5' - accord2 166 2 68.49 CTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr3R 31907326 5' + Tirant 8160 2 55.48 AAAGATAAGTCATGTGTGCTAACTGGGAGTGGCTAATCACCCAGGCTACTTAGCGGGATCAAGTGTCAAATCAATAATTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAG:1 + chr3R 7984955 5' - Doc 4293 1 52.74 AAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCAAATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 11526771 5' - pogo 2035 1 63.01 CCTCCACCAGAATGGTGTCTCCTTGCCTCTCTTTCCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:4 - chr3L 13204845 5' + jockey 23 1 74.66 CACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr2L 1136379 5' + 1360 73 1 76.12 AGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chrX 7525041 5' - I-element 5303 1 52.74 CAGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 - chr3R 25876946 5' - mdg3 5420 2 68.49 AACAAACTAAATGTTATTTACGCACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr3L 5446215 5' + roo 8709 2 55.48 GTGAGAGGCCCGTGCAAATGGTGAAAGCACTTGGAACGCGTAAAGCAATTAACACGCAATTACCATTTCCACTTTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGC:1 - chr2R 19076294 5' - F-element 4324 1 51.72 TTTACAAGTATAACAATCTAAATGCCTATTTGGCATACAAGTTGTTATGCTAATGGCTAAAACCTTTAGTATTTAGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2R 6945742 5' + pogo 43 1 56.16 ATGCCCAGACATGCGCAGACATGCGAGAATCCAACAAGTGCGGCATGGAAGTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 15089443 5' - P-element 2875 1 77.40 GATTTACGCGCGTCGAAAGTTGCACTCTTAAACTGATTTTTAATGTTGGTCATTTGAATTCCTACCATCAAACTTGATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr3L 4467767 5' + pogo 40 1 59.59 ATTTATTATATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCTATATTAAGA:1 - chr3L 4286928 5' + 412 7 2 78.77 CAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATATTTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCC:1 - chr2R 6984390 5' - HMS-Beagle2 231 2 73.97 ACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACTACTCGACTGACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr2L 10032742 5' + hobo 45 1 51.15 GCCGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr3L 9430644 5' + P-element 69 1 32.84 GTAAATTTAAATCCAATCTCATGGCAACGAAGAGGCAATGCCGGCAAAAAAGATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 20500185 5' + 412 7068 2 73.97 TTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 + chr2L 19903365 5' - Transpac 253 2 57.53 TAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTC:1 + chr2L 15153234 5' + G-element 42 1 50.00 AAACTGCGAGCAGGAATTACTTTCCTCCCAGCTAGTTCCGAAAAATCGTTGCGAGTGCAAGAAATGTTGCACTCATTGAATCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGC:1 - chr2R 5857009 5' - Doc 4508 1 61.54 GACAGCAGGAAAATGGGAGCAGGAACAACCCAAACACGGCGAAGGCGTAGCCAAAACAGAACTAAAAAAACAGGGGCAAACAAATGAAAATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chr2L 5648000 5' - Burdock 228 2 55.48 AAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTT:1 - chr3L 20925838 5' - Transpac 5155 2 69.18 CTGTGTGGGTAAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:1 + chr2R 20913083 5' + 1360 33 1 63.01 GCGATCGAAGAAGGCACCTCTAATGGCGAAGACCTTGCAGTTTATGCGCGGACGTCTCAAACGATAGATGCGCTTACTCATTATAGCTACAATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 23254382 5' - pogo 2075 1 68.49 CCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:2 + chr3R 7739702 5' + blood 87 2 74.66 ATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGT:1 - chr3R 9289400 5' + HMS-Beagle 57 2 57.93 CTTTGCGAATGTCTAGCTGCCTTTTGTGCACGAAAAAAAAACAAATCTCATAATTTGAAAATCTTATAAAATGTATTTTAATATAAAAAGGAATAGGAAACTATTTTTCAAATGAAGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 9669451 5' - roo 404 1 76.71 CCTCCGTGCGAGCGGTAGCCGGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3R 10142897 5' + 412 26 2 66.21 AGAACAATTATTAGATGGAAACCAACTGTTTTTCCAACACAATGCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 - chr3R 28033727 5' + diver 23 2 69.86 ATATATTAAAGAGTATACTAGATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3R 3322584 5' - 1360 3357 1 64.14 ACAACCGCTCTAGCGATCACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGA:1 - chr2L 21237290 5' - P-element 2803 1 28.08 CAGAAAGTGCTTAGCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 - chr2R 9072970 5' + Burdock 6179 2 54.79 AATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr2L 12261166 5' + jockey 79 1 64.38 AATAAATGGCCACGCCCAACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 7424516 5' - 412 7505 2 56.85 GTAACAAATTTGGTTCTTCTTCGTTCTCTTGGCGTTCCTTATTCGAAAAGCTCTTCATATAAACACATGCATGTACTTAAACTCCAAAGTAACCAAAGTCCACAGAGGACGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTA:1 - chr3R 19572347 5' + 1360 3016 1 74.66 TAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGATAT:1 + chrX 5222893 5' - 412 448 2 74.47 ACACTCGAACATATTCAAGGCAATAGAACCGCAATTCACAAAGGCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGG:1 - chr2R 20382624 5' + Bari1 26 1 68.49 AAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAA:1 - chr2L 9356905 5' + Stalker4 66 4 65.07 AGATCATGAAATATACTTGAAAATATATTTTATATATTTTTAAGAGCATGCAATTTCACAAAAACAAAATATAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 - chr3L 14546438 5' + copia 4919 2 52.74 GTAACATGGTTCCATTTTAATGCATGATCTGGGAAAATTGAGCAAAACTTGTTTTTTTTTGAGTGTATAATAAGGGGGGTTAATGATGATTAAAAAAGTCCAAGAACAGTCCGCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTT:1 - chrX 5892232 5' + transib2 5 1 78.77 GGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAAT:1 - chr2L 3967118 5' + hobo 92 1 80.14 AGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGACCACACCAGCCACTTCC:1 - chrX 13651562 5' + 297 15 2 62.24 TGGCAAAGGTCAGCTTCTCCACCAGCTGATCGTAGCTCTTGTACGGCGGCAGGTCCAATCGATTGAAGCCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGGGTAAGCGGC:1 - chr2L 2043130 5' - BS 4892 1 60.53 GACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGACACTATTGTTCATG:1 - chr2L 15153322 5' - G6 1943 1 69.18 CGTCAGTAAAAATTGCGTAAAATACAAATATTGTGCCAGACTCATACCAACAATTTTTTTTTTTAACCTCCCCCCTCCTTTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 21910218 5' - Bica 341 1 57.14 ATAATCACAAGAATTTCACTTTTCACGCAACGACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCGGCAACAACATCATCATTGGCAACGTCTTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAA:1 + chr3R 14508870 5' + Doc 4343 1 60.96 ATCGAGAGTGTGTAACTTATTGCAAATATATTTGTTATAAGGTGTTATCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCC:1 + chr2R 10934681 5' - R1A1-element 267 1 67.81 TGTACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACA:1 + chr3R 907893 5' + gypsy11 4332 2 36.30 ATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chrX 21205069 5' + 1360 73 1 70.55 TAGATGATCTTAGCCAGAATACTGAACATGGTCTCTGGAACAATTTGCAGAACGCGGCGCAGGATCTAATCTATTTTCAAACAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTTGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAA:1 - chr3L 16124271 5' - 1360 261 1 56.16 TCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3L 19396999 5' + F-element 43 1 58.45 TGTTGCATAATATTTTTGGGGCTCAGACAATATATATACGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 - chr2L 5648477 5' + Burdock 79 2 78.08 CTGGGAAATAAAAAATATATATGTGTATGTCAGGATGTGTACAAGTGCAGAGCGGACGCAGTTAGACCCGTTAAAGGGGTGGGGGGATTTGTAAATGCGGAAAATATCTTCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGT:1 - chr2L 17086124 5' + Circe 7110 1 71.23 AAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAG:1 + chr3L 21630318 5' + Burdock 6199 2 62.33 TGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAA:1 + chr2R 19633184 5' + jockey 4617 1 55.48 AATCATATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr3R 4913679 5' + 1360 29 1 65.75 GCCACTGGGATTTGATGCCCCGAAAAAGTATATTTTTGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTG:1 - chr2L 10783103 5' + Stalker2 229 2 55.48 GAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAA:1 + chr2L 16685344 5' + P-element 102 1 16.44 CAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr2R 23225871 5' - Transpac 241 2 66.44 ATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 + chr2L 4416066 5' + jockey 91 1 72.60 AAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 + chr2R 18048814 5' - opus 428 2 68.75 GCATTTATTGCATACTATATAGGAATCAAGTATTTGCCCGCTATGCAAGAATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 10357846 5' - pogo 2034 1 65.75 CCAGAAATCTGAATGGCCCTTTGATGTCTGCCCCAAATAAATTCGCGTTGCTAATGGTTTATGCCAGTCGTGATAAGACTACATGACTCCCTCTCCGTTTCCGATCTGTCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTG:1 + chr3R 5092663 5' - invader2 106 2 57.86 GCCATCTTTTGCGACAGCTTACGACCTTATGAAATATTATATTCTTTGTGCCCAGCCAGCAATAACAAATGAAACACATGGCCCGGCAGGCGGCCAGTTTAGTTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGA:1 + chr2L 2515304 5' - gypsy4 6779 2 70.14 TACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr3R 25521895 5' + blood 7071 2 57.53 GGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr3R 15649877 5' + blood 51 2 56.85 GAGTGTCAGAGTGCATGGGATTGGCCATAAAAAAACAATTGAATTTAATTTCAATTGAATGCACACTCAAATCGAAATTGAAGCAATATTTTATACTATCCTCCGGTTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCGTCTTCAGCCTTCGA:1 - chr3R 12027626 5' - G5 4632 1 59.31 TCGTGGCACAGCGTGAGAAACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr3L 10856832 5' + P-element 46 1 54.11 CTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTT:2 - chr2R 5900904 5' - Bari1 1623 1 76.71 CAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr3R 22429209 5' + roo 8751 2 76.71 AGGCAAAGAAAAAGAGCCTAAATACAAACTATTGAACAAACTAAAAAAAACCCACCCAAATCGAAGTTCAAAATGCCAAAATTGTGTGTGATATAGATAGATAGAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCT:1 - chr3L 16640542 5' + mdg3 230 2 71.92 GCATAATATTTTTGGGGCTCAGACAATATATATACGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCT:1 - chr2L 5648473 5' + Burdock 6219 2 80.82 TTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATT:1 + chr3R 7884542 5' + jockey 4825 1 63.70 AATTGCCGTGTGGAAATATTTCTTAATTAATGACTGACTCTTGACTTGCTAAGGGTGTAAGCTCAGTAAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 - chr3L 18834991 5' - 1360 3336 1 80.14 GGCGTACAATAACCGAAATTATATTATATTTAAATTATACATTAACAGCTACGTTCATTGTTACGTGGTGAATGGATCAGTTTTGTCGTTGATTAAGAGCTGCAAAGCCAACCAGTGTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGT:1 + chr3L 3186915 5' - 1360 3009 1 71.23 AATACACAGCCATAGAGTACAATTACTCTTTGTTTTCATTTCCCCAATTTCAACGACGCGACCTGCACCCTCCTCTTCCTCATTTGATTTTCCCTTTTTTTTTT:1 + chrX 2980373 5' - Doc2-element 251 1 52.88 CTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 4722369 5' + roo 8714 2 52.74 ATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439058 5' - P-element 2495 1 60.69 CATTTGCTGATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:1 - chrX 14979306 5' - accord 7026 2 27.62 GAGTGGAGAGAAAAATATACCACTTCGATTTGGTGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr2R 20500030 5' - 412 7494 2 55.48 GGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACAGAAGGCGCG:1 + chrX 14962197 5' + jockey 35 1 54.31 GCCAGAGAAAAAAGAGAGCACAGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 + chrX 4589398 5' + Burdock 6140 2 76.85 ATTCCCATCACTTCTTAATTTAATTATTATTAATAATATTTAGATCTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACA:1 - chrX 14914433 5' + mdg3 76 2 68.49 TGATGGATAAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAA:1 + chr2L 12283916 5' + Quasimodo 50 2 54.79 GCTGCCGCTGACGGATATGATAAAGCTTCGATTATTCCATCGCCTCTATGGGAATGTGCATACATACATATGAACATGTGGGGAAAAGGGCGACCAGGCGGACAACAATTTGTTATACAAATATGTATAATAAATGTATCTCCCAA:1 + chr2L 5664960 5' + accord2 106 1 77.40 TGACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 + chr3L 5183670 5' + copia 4904 2 61.64 CTCAATAAAACGTAATGAATTCCAAATGGAGGTGTCTTAAAATAAAGGATCCTAGCAAGTTTTAAAAAGCTTTGCACAAATCCCAGAGGTGATAATCTTTCATCGCATCTGCGTCACCCGAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAAC:1 - chr3R 13488897 5' + opus 380 2 65.07 TTCCATTTGTAATCGCTCATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTAT:1 + chr3L 16157159 5' + Juan 26 1 66.44 CAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGAACGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGATTTGAGTGAAGCGAACGCCAAACAAAATAAACTAAAAAAAAAATCTGAAAGCGA:1 + chr3L 18708633 5' + F-element 102 1 77.46 AAGCTATGGTTCTAAAGTAAATCCATAGAGGAAAAAGGTGACTTCGAACTAAATACCGCACAAAATATCAATGGGAATTATTTCTTTTATGTTGCAACTTTGGATCGCAAAGCTTCCCGGGTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCG:1 + chr3L 18935899 5' - ZAM 8012 2 56.85 ACTCTGGCAATGTTTTTGACGATTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCT:1 - chr3R 24809953 5' - 1360 3308 1 82.31 TCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGTTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr2L 15621964 5' + hobo 21 1 62.70 TAGTGCTTCCAAAAAACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chr3R 31120325 5' + opus 10 2 77.40 GCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCC:1 + chr3R 10973215 5' + jockey 78 1 65.00 TGTACATACATACATATGTATTTATGTATATACTAGTATACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2L 22125284 5' - P-element 2835 1 50.00 ACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr3R 9163917 5' + hobo 67 1 80.17 AAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chrX 17469272 5' + blood 64 2 60.27 GCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1 - chr2L 2357345 5' + P-element 93 1 22.60 CAGAACATGACAAGAAGAACTATTCATCGCTCCATCTCAAAAGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGATT:1 - chr2R 2527453 5' + roo 79 2 50.00 ATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCCCTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr2R 20704155 5' - hobo 2904 1 58.59 CTCCACTTCAAATTCGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3L 7434978 5' - pogo 2069 1 66.90 CCCCGTAGTCATTGCTGCAGAAGGGGTTAATAGTCGACCAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3L 12863822 5' - Transpac 5211 2 71.23 ACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr2L 7215635 5' + 297 6629 2 51.37 CCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACCGTAATTAAATCTGTAAAATCCTAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 20290753 5' - roo 9050 2 70.73 GAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chrX 15167686 5' + roo 84 2 83.57 GTGACCCCGTCGAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2R 7223611 5' + blood 18 2 71.92 CCAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTC:1 + chr2L 17198051 5' + R1A1-element 5064 1 58.90 GCCCGAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAG:1 + chr2R 20856222 5' + Juan 4192 1 76.03 TCTAAACCGAAATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 4722507 5' - roo 9037 1 61.64 CCCCAAAAAGTAGGCTATAATGCATAAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3R 18846625 5' - roo 9035 1 57.53 AGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAGCGTAAGCTCTCTTCAATAAAAAAAAACGCGTATTTCT:1 + chr2R 5532367 5' + Doc4-element 58 1 59.59 GTCAAGTGTTAAATCAAAGTGACTAACGACTATGTTTATAGATTTTGCCCTCCGACTTTTCGCAAAATATCCCCAGGTATTCGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2R 5992267 5' - pogo 2065 1 60.96 ATAGAAGACATTGCACGCATCCACCAGCAATTGCACCTTGTGCAGTTTCTTCAGGCTGAAATATATATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3R 28725033 5' + pogo 51 1 55.48 TAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGCATAGCCAGTTCTAAAAACTACAACGGTATAGTGAAAGTT:1 + chrX 10571339 5' + Doc 72 1 63.83 AATGCTAGACATACAAATACGGATACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3R 9993421 5' + hobo 52 1 75.73 AATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 11379715 5' + jockey 70 1 56.85 AGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 15514618 5' + 412 54 2 55.71 TGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 27503038 5' + hobo 35 1 59.43 AAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2R 10991385 5' + jockey 8 1 74.07 ATTTGTTCTCCTTTCGTCCTAAGACTTTGCCCAGATATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAACGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chr3R 27835603 5' - 412 417 2 70.42 CCAATTTGAGCACCCAGATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 - chrX 4566288 5' + Transpac 26 2 68.49 ATTATTTGCTTCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCGGTGAGGAGCTCACCGTAGACCATATTCT:1 + chr2L 8959882 5' + Ivk 5130 1 50.68 CAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACC:1 + chr2L 15142251 5' + BS 4777 1 64.38 AATTGTGCGTTGTTTTAACTGCATTTAGTGCAGGCGTAATTAGCCAAATTGTTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr3R 25521743 5' - blood 366 2 77.40 TTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:2 - chrX 2873440 5' - roo 8995 2 69.86 AATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 27391407 5' - 1360 3368 1 61.72 GGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGAGTGAATAGAAACTTT:1 - chr3R 11526862 5' + pogo 69 1 62.33 TAATAATTAATAATAATATTTACACTAAAAAAAGGAATTCAAATACTAAAGCTAATTATAATAAAAGAAAGAAATGCTATAGAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chrX 17879460 5' + opus 7038 4 61.64 CTGAGTGTACGAGTACTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 - chr3R 20368119 5' + Max-element 12 2 75.19 AAGCTGACTCATTTGGCCGAAGCCTTTGTGCGAAAACCCATATAAACCGTAGTTATTATAGTTTACGTAAATTATTATTATATTCACGTTGGGCTTGCGCTTTGCTATGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCA:1 + chrX 12429834 5' - R1A1-element 386 1 73.29 TAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTT:1 + chr2R 2949036 5' - 17.6 421 2 71.92 CAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 + chr2L 1073917 5' + Tirant 66 2 62.68 ATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2L 21192614 5' + roo 37 2 61.64 GAGCAGTGACTAATGGAATCTTCTTTGGGTCACCATCATCGTAATCACAGGCTGAGTCTGAGTCTCCAAATCCCACGACTCCCACGGTTCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATAC:1 - chr2R 23685804 5' - Stalker 7144 4 58.90 CTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chr3R 10140186 5' - P-element 2823 1 38.36 CTTAAACTCCAGCAAGCTACTTGCTATGCGCATTTCCATTGTATCAATAATTGCCAATGTTTCGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 + chr2L 8392966 5' - I-element 5298 1 56.16 ATATCCTGGTGCTATAAGTCGTAGTAGATTTCCCTTTCTGCCACTGTCTGTCCTCTGTGTTTCAACTGCCACGCCAATTACCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCGTTGTCGGCCCTAGC:1 + chr3L 18083290 5' + diver2 4793 2 57.53 TACTATCCCCGTATACGTGAGTCGCATGCCTTTTCGCCATTAGACTTTTAGTGTTTTATGGTTTCGCCCCAGTCCCCTGCGTAAGCCTAAGTCAAAATATATTAAAAACTGTACAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGAC:1 + chrX 12098131 5' + 412 7429 2 57.53 ACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr2R 21898012 5' + 412 25 2 65.75 GCAGACATATAGTTTGGTTCCATTTGTAATCGCTCATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr3L 16157142 5' + Juan 9 1 78.08 AATCGTAAGCAGCCGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:2 + chr2R 21380569 5' + roo 8690 2 66.44 GAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACTTCTTATATTTCACTATCATGTCTGGGTAAACACAAG:1 + chr2R 6984298 5' + HMS-Beagle2 6928 2 52.86 GGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3R 29708931 5' + blood 27 2 60.69 GTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:3 - chr2L 14222340 5' - Transpac 241 2 69.18 AAATCAAACAAAACAGCATAGCCGCAATAGGCGAGCACGGTACGGGGTACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 - chrX 19498163 5' + P-element 62 1 40.15 TATATAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 9958610 5' + opus 7143 4 57.80 CATGGGTAATAAAAATCAGACGAATCAGCCCAAAAAAAGCGGAGAAGGCGAAAGCTAAGCTAGTTTGAAATTGTTTTGATTCAATTATAACGTTATAACGTAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr3R 7569553 5' + Doc 24 1 45.21 CAATCCCGTTAGGTATTCTGTATGTACTCTTCAATATGTAGACCCTTTCTAATTTTCTTTGACAACTTCTATTCGTAACTAAATTCACTCGTAATTCGTAATGATGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCC:1 + chr3R 10081505 5' + Doc 340 1 68.49 CTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGT:1 + chr2R 20382503 5' - Bari1 1627 1 72.60 ACCCGAGTCTGAGCCACCAGCTATGCAAAAAAAAAAAGCTCTTTAACAAG:1 + chr3R 22706389 5' - copia 366 1 84.00 TCTATAAAGTACAGCCCGCAAACAGGATACGAATGCGAGAATGTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr3R 9982970 5' - HMS-Beagle 7009 2 60.27 AATGTATCATTAGGCAATCGCTGGTTATCCTATGGCTGTATTACTACACATTTTATATAAATTTTACAACACAATTTAATTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTA:1 - chr2L 13317580 5' - X-element 4673 1 45.89 GAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr3R 11121682 5' + copia 45 2 52.74 CCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 - chr3R 25384274 5' - mdg3 178 2 62.76 GTTCCTTTGTTTAGTGTTTAATTCGAAGAGGGGAAATATAAAATCTAGGTATTAAATTACAAACCTTTTTCCACTGTTCATTGACATAAGTTGTTCAATATACATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAA:1 - chr2R 22664734 5' - Quasimodo 7357 2 78.77 GGCAGATAGGAGGACGAAGATCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr3R 10468121 5' + opus 35 4 59.71 GCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 16685407 5' - P-element 2844 1 52.24 TCCACTTTGCAAACATAATCGTATCGAACGCAATTACCAAAAATCATTTGACTTGAAACAGGAAACACTAGCTGGAAAAAATTTTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3L 11196469 5' + pogo 35 1 61.64 ACTGGACTGCGAACGAATCGATCGATGGCCGGCTACTGTTTAATTTGTTTCGTTTTTTTGCCCAAGCTGAGCTCGCATTACTGTAATTACGCACAGAGGCAACAAAATTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3L 1128783 5' + roo 77 2 72.60 AATTTTGTTTTTTCGCAAGTAACTTCCAAAAGAACATAGAACAGATATTATAAAAAATGTATCTGCAAGATAATTGTAAATGTCTTGCGCTTTAATATACCACGGCCACACCTCCCACCCAACCGGCTCGATTCACGAGAAGATAG:1 - chrX 13314572 5' - Cr1a 4378 1 67.81 ATTTTTTAAAACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chr2L 8772855 5' + Tabor 32 2 63.70 GAACACGATCTCAATGAGAACTTCATCAAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3R 23507711 5' + 412 7079 2 65.07 AAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3R 12608078 5' - roo 8981 2 80.14 AGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAG:1 - chrX 4566227 5' + Transpac 87 2 78.77 ACATTACACTAAACTATTTATTGGAAATAATTAACTTTTTTTGAACACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAG:1 - chr2R 23309758 5' - Tabor 7131 2 68.49 AGTACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2R 18123375 5' + 412 16 2 69.18 GCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACT:1 + chr2R 19076489 5' + F-element 188 1 65.75 AATAGTATTACTGAAAAGATTTAGCTCTTATTACACACATTAAAATGAAGTCAGCTCCTTCATATATATGCATATATTATATATATAGTGACGTATTCGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 21517978 5' + 297 39 2 56.85 CAAGTGCCTTCCTGGGTGGCAGGGTGATCTTTGCCAGGTGCCTATGTGTCGAAGGAGCTGTGACCCTTCAGTTTTAAGAGTTGGCAAACGAAAAAAACTAATTTTAAAGGGTGGGCAAATGAAAAAAATTATTTTTAAAGGGTGGG:1 - chrX 10966262 5' - FB 689 2 54.79 GAATTTTGCCAGCGCAAAATGCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAAT:1 + chr3L 14854652 5' + rover 6989 2 60.27 CTGAGCAGCAGCAAGCAGAAGGGCACAAAAAAAACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCAAAGGAAAA:1 - chrX 5162742 5' + Doc2-element 227 1 79.10 GTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGGTACGAATAGCAAGTT:1 + chr2R 6984408 5' + Doc 43 1 52.63 TAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTG:1 - chr2L 6074098 5' + BS 47 1 56.16 TTTTAAATAGATATTTATAAGCTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTGACGAC:1 - chr2R 20704270 5' + hobo 12 1 66.91 TGAATCGATTGTTTTAACCCTAGCCGGCTATTTAAGCCGTTAGGTTAGGTTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3L 22676398 5' - 412 471 2 67.88 CTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAAAATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTT:1 - chr2R 5900947 5' - Bari1 1666 1 55.48 ATAGTGGCCGGGGCACGACTGATTGGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 + chr2R 24338299 5' - 1360 3376 1 76.03 TACCAAAATTCCATTTGCAATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 10979116 5' - roo 361 2 52.05 AACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr2R 14385575 5' + jockey 63 1 62.50 GGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGCATAGT:1 + chr3L 22354421 5' + Doc 65 1 54.11 GTATAGTCGAACATTTAAATATTCATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2L 7215672 5' + 297 6592 2 76.03 ACATGCAAAGTTGAATTTTACGTAGTTCCTGATGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:1 - chr2L 22513372 5' + Stalker2 7336 2 77.40 CATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTT:1 + chr3L 23456281 5' - Gypsy6A_LTR 277 1 69.30 ATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 15080009 5' + roo 8724 2 60.27 GACTACGGGGGCAGGTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr3L 22221283 5' + 412 8 2 79.29 TTAGGTCCCTTACCGTGTGCCCGCTTCCTTGTACCACATTCATAATTTGGGGCCACCTGCCCACTCGGATTTGGGCCATTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAG:1 + chr3L 20249845 5' - 297 173 2 53.42 AACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 + chr3R 24228891 5' + opus 65 4 73.44 ACTGCCTAACAGGTACATATAGCAAGCACTATATGCTGTCTTACAAAACGATTATATGATATTTTCCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTT:1 - chr3R 6760223 5' + Doc 363 1 54.79 GTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 + chrX 19231758 5' - mdg3 5418 2 71.23 TTTGCAGCCAAGTGTAAAAAAGCCATCAGGTTTTCTAGAAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:1 - chr3L 15322111 5' + Transpac 4932 2 74.66 GCCACCCAACCAGTCACCACAACAAGCACCGACCAACACACAACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCATCATCAAGTTTTTCTATTTGGTTTATTGATGAACTCATTTTCACTTCAATAAGTTTTTCGTATTAAATCCCTGAATCACA:1 + chrX 10859619 5' - Dm88 275 1 69.86 AGTGCAGGCGTAATTAGCCAAATTGTTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr3R 25521769 5' - blood 340 2 59.59 AGAACTTATTCACTTTCAATTGTTTTGTCGATCTTGAAGTAACTTTTAACGACCTGTGCTTGTAAACTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 + chr2L 8452232 5' + copia 55 2 56.16 GCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGGTCTTGGTAGGTAAGATGGTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTAGTTGAGTTTTTGGAAGAAATTGATTTTATTTGGAAATATTTTCGGTT:1 + chr3L 5446096 5' - roo 352 2 50.35 ACTAGGTTTATATCTCTCTCTGTGAGTACCGGAAATGACGTTCTGTTTTATTTATTTTTTGTTTCATTGGGTGGGTGTGCGTATTCGTGTGTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGT:1 - chr2R 19176961 5' + opus 253 2 69.86 CAGAGATTCAGTTCCTCGCGTCATGTCCAGTCCAGTAATCTGAAAGCAATCATTTCCCATTTCAATAATAAAAAGAAGATCTATTTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3L 4023589 5' + pogo 32 1 63.70 GCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGACGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3L 17447544 5' + Tirant 8170 2 65.71 CAATCCTATTTTGCATCTGAGCCAAGCCGACCAAGAAGACCCCAACAAAGTAGTGCATCGAATTCCGCTGTACAAGGAGGAATTCAAACAGATATATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAAA:1 + chr2R 5672531 5' - S-element 1552 2 73.29 AATTTGTGTGCATCGATGGAAGAGGAATGAGCTACGCTGCCAAGGATACACACCTGCAATACACATATTCTTCTAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 + chr2R 21227291 5' + mdg3 5257 1 80.82 ACAAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chrX 10571325 5' + Doc 63 1 59.59 GGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chrX 22517734 5' - 1360 3369 1 62.33 AATGAAGTTAAAATCTTAATACCGCGTGAATCTGAACTTCGGCAAAAAGTTACCATTTTTTCTCCGATTTGCCCATACGGCTGGCCTTTAAGTTCTGATTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAA:1 + chr2L 17909256 5' - INE-1 537 1 69.57 AGCAACAAAGTCTGAATATTATAAGCGCCACACTCCAGCTGCAGTTCAGTTCCAGTTCCAGTTCCTCAAAACGAGCTCATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTCCTCTGGGGAACCAGCCCATCGGAAAAGTTTTGCC:1 + chr3R 29414170 5' - R2-element 188 1 54.11 GATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTT:1 - chr3R 27845577 5' - Stalker4 7313 4 50.68 GCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAA:1 - chr2R 5022781 5' - Gypsy12A_LTR 84 1 54.11 GGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr3L 9571653 5' + jockey 71 1 61.64 ATGCCTAACAATATCTAACAATATCTTAGTAGGCGATATCGATTTCAGACAAACTGATTAGTAGTCTGCTGCTTTATAAGAGGCATTTGAATTTAAAATTTAAAATGCTATTTCTGACATTGCAAACACAAATAAACATAATTCAC:1 - chr2R 22708606 5' + Stalker2 79 2 77.40 AGATAAAGTAAGAAATAAAACATCGCAAACTATAACAAACAACAGGATGCAGTCAGCCAGCGGCGAGGCAGCCAACTGGTCTGTGTTTTAATTTTGGTATAGTGTATACAAATGTACCGTGCAGAGATTATACTATCTTACGTGTA:1 - chr2L 18721856 5' - G5A 2712 1 67.12 CCCAAAAGTTTTGCAATTCTTGGCTAATAAATATCTGTCTATAAATTCAACTCTTTCAGAGTCAACCGTTGCCGGCTGAGATGTGCGTCCAATTTGTGGCGAAATTAATTATATAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAAT:1 + chr2R 22904013 5' + mdg3 220 2 80.14 CATTCATACGCCAGTATTTTTATGCCATTCGATAAGTGGCTCCCGATTGCTTACTTTTCTTTAAAAACATCCCTTCAAATGGAGTACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr3L 14320890 5' + Doc 41 1 60.27 GTAGAAATCAACGTAATTTCTTCCATGAAACACAGTGCTAACAACATTTTTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 + chrX 22824750 5' - jockey 4927 1 67.59 CTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 9242071 5' - roo 329 2 71.03 AAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGTTTTTGACCGCGATCATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGTCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 - chr3R 9289417 5' + HMS-Beagle 18 2 65.04 ATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr3L 19397038 5' + F-element 86 1 69.18 AGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTT:1 + chr3L 24153180 5' - Tabor 416 2 64.38 GGTGGCATGATGCTATAATTATGACAATTTTTTCATCCACGCTAAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTA:1 - chr3L 4738512 5' + Idefix 20 2 67.12 GCCTTGTTTATTTGCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr3R 25409563 5' + jockey 85 1 68.49 AGTGTGCTATGGTATAAACTTTTAAGATGGAGCTATTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 - chr3R 14097164 5' - transib2 2798 1 64.38 GTTCGAAAGCCGGCGATCAGAATGGAACAAACCACAGGTCTGAATGTCGCTAAAAATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr2R 19168181 5' - opus 7483 2 56.73 GGATCGCTTCACTCCTTATGACTTCGCCACGACAGAACAAATAAGAGAGACTCACCAGTACCTACAAATGCTATTGCAGATGTCTTGGCCTAAATAACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATGTGCCATGCCACGC:1 - chrX 22727594 5' + Helena 16 1 63.01 AGTTGCGGGCAAGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 - chrX 21213428 5' + Doc 27 1 64.38 ATTAAAAAAATATTTGTAGCCTACTTAGTGGGGCTGGGGAAAACTGCACTTTGTCAATTGCTCTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACT:1 + chr2L 11573640 5' + jockey 4731 1 58.90 ACCAACGACAAATGAAAATCTCTGACTCTCTCCTTGAAGACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAG:1 + chr2L 10784765 5' + Stalker2 7436 2 43.15 CCTTGGCAGCTCAATTAGCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCA:1 + chr2L 14969869 5' - Tirant 8452 2 54.11 GAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGC:1 + chr2R 19633177 5' + jockey 4610 1 60.27 CATAAACAAGGCGAAACCTGTTTAGCCGAGTGTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr2L 15333687 5' + Doc 37 1 42.47 CATTCCGCAAATGTTCCGTGATAAACAAGATTGTAAAGATTTCCTTCCGGAAATTCATAAATTTGGAATGCCTACATATACATATACATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCA:1 - chr3R 10791820 5' - Idefix 7361 2 65.75 ACGCGCACACACACACACATACACAAAATTGTGAAAAACTGTGACGTTATGCACATGAGTGAGCAAATAGCAACAGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 245864 5' + hobo 45 1 51.37 AGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTC:1 + chr3R 24693588 5' - hobo 2852 1 75.34 GAGAGTAGGCAATTTGAGACTTATCGGCGCTTTTTTCTGCTCCAGCATGTGCAACAAAGTGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAAATGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTACATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 - chr3L 3263686 5' - accord 7029 2 80.00 TTTTTTTTTAGAGGGCTCGGCCTAGGCACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAT:1 + chr2R 11655975 5' - HMS-Beagle 7016 2 67.81 TGCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1 + chrX 14908394 5' - blood 296 2 72.60 CCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 9938682 5' - roo 8999 2 68.49 TTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 + chr3R 23507579 5' - 412 7481 2 60.96 AGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:2 + chr2R 14553255 5' - mdg3 5414 2 76.03 GTTTTATTCTTATGAATATACCTTTTTTTTTGTAAGAACTATTTCAAAAGATCACATAGATTATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 + chr3R 24479121 5' - 412 7538 2 75.86 TAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 30568896 5' - roo 9005 2 63.70 AGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:3 + chr3R 10973207 5' + jockey 76 1 62.33 GAAGATACGAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 23099190 5' + roo 8708 2 55.15 ACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAA:1 + chrX 14908398 5' - blood 7303 2 75.34 AAACTTATTTCAAAGAGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGGTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAGTT:1 - chr3R 8705826 5' - hopper 1365 1 50.00 ACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr3L 16180987 5' + Transpac 4970 2 52.74 CGGGGGAGAGATCTCGCTTTTGCCTATTAATCAACAAGTGTGACATGTCCAGGCAGGCGCGGCTCACACTTTATGAATCGACGGCATTGTGAGTAATTTATATCAAGTGGAAGCATAAGCTACCCTTTTAAAGGG:1 + chr2L 14241227 5' + rover 6925 1 76.30 ATTGTGATAAGTGTACATTTGTGTGTTTTGTTTAATTAAAAGATTGAAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 6096461 5' - roo 385 2 68.09 GACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 8397150 5' - roo 9010 2 59.59 CCTGCATAGGAATAGCCAAGCGATGCGGACTCGGGACTCCCGGATTCCGAGAGTCAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chrX 19498052 5' - P-element 2871 1 70.97 TACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTTGAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACCAGAAAAATTATGAAATTTCGCAAATGATGAATTTCGCATTAACACTAACTGACTAAGGGGTATCTGATAGTCGG:1 - chr3L 25245596 5' + INE-1 551 1 68.49 TGCACTTATCCGCATTCACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACTCCTCCTTCAAGTTGCGCATGTGTTCCCGCAGCGCCCGTCCGATCACTATCATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCG:1 - chr3L 25232918 5' + accord2 3 2 78.77 AATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAG:1 + chrX 18239374 5' + jockey 4560 1 64.80 ACTCCTAGTCATTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCAC:1 + chr2R 1571529 5' - 1731 267 2 52.74 ACGAATTTTCAAAAATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACC:1 + chr3R 10791676 5' + Idefix 49 2 54.11 ATATATAATATATTCTGTGGATACTATCTGAATATCCAAACCAGGCGTGCAAAATATGAATTACACGATTCAAACGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 21373709 5' + 297 6624 2 47.95 GATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:2 + chr3L 22221130 5' - 412 426 2 56.85 GCAAGCGTGAGTTCAGCTTTCTCTTTTCTTCAGTCTTCTGCTGATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:2 - chrX 14692991 5' - Transpac 297 2 76.71 ACGCCATGCCAAGCCCATACCCACCGCAATGCCCCTGCTCGAGCGCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 - chrX 15089620 5' + P-element 23 1 68.12 TTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3L 9242075 5' - roo 332 2 68.49 CAATACCCTCTCAGGGGGTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 + chrX 22858810 5' + mdg3 5260 1 79.70 ATAAATGTACTTAAAAAACAATCATAACACAACTTTTCTAATAATCTAACTACTTTTAAAATAACTTCATAATATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCA:2 + chr2R 3202640 5' + gtwin 6929 2 76.71 CACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 - chr2L 10032758 5' + hobo 44 1 54.11 TGAGTGGCGCCAGCCGGTCAAAAAGTATCTGAATCCTGCGCAGCATCAGCCGGAAGGAGAGGGTGGCGGAGGTGGCTAAGCACGGCCAGCAATCATCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCTGTGTATATTC:1 - chr3L 8559846 5' - Doc3-element 4440 1 67.12 CAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGT:1 - chr2R 982406 5' - HMS-Beagle 6968 2 71.23 CGAGGAGCGGAACACAGCGGCCGATGTCCTCGTTAAGTATCACTATGGACCGCGCGGTATCACCAAGAGGAATTAAAGACAATGTCGGAAAGGTTGCAACCATAGACCCGAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr3R 7525244 5' + 1360 25 1 47.26 CCATTAGCATAACGCTGAAAAGTATGCTACGTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 26399930 5' + roo 8684 2 71.92 GTTTTGGTTGGTACATATATCTGAAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 - chr2R 22692488 5' + Ivk 6 1 80.14 CCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3R 19545320 5' + jockey 63 1 52.74 CAATTGGTTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCG:1 + chrX 14914367 5' - mdg3 5417 2 71.92 GCACCCATGAAATAAAAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3L 4639046 5' - roo 9032 1 58.22 ATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATAT:1 + chrX 18239350 5' + jockey 4557 1 53.42 TTTTATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 - chr3L 24153297 5' + Tabor 6875 2 61.38 GGGTAGCGGCTGGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 + chr2L 10912235 5' + Doc 79 1 69.18 AAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATGTATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTG:1 - chr2L 21570270 5' + Dm88 4417 2 55.48 GCAGAAAGTTCTTCAGAAGGGAAGGCAAGAACGTGGCGTGTTAGTAAGGATCAGTGGAGAAGTGCTGATGATCGCACTTTAAGCGTTCGTTGACGTTGATGGCTGCGGAAACTTTGCAGCCTTCTGGTCAGCATTTTGGGCACTTG:1 + chr2L 22407111 5' - HMS-Beagle2 63 2 60.96 TTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr2R 14385560 5' + jockey 64 1 56.25 AAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATC:1 + chrX 18707477 5' + BS 4789 1 67.12 ATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 7739668 5' + blood 7064 2 52.74 CGCTGTGTTTGTACCAAAATTCCATTTGCAATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 10979127 5' - roo 9036 1 56.16 AAGGATCATGGCGATTATGAAATTGTACGACGTGTCATGCTCAATCGAGCTTAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGC:1 - chr2R 11624625 5' + mdg3 5244 1 64.38 GAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 - chr2L 15965300 5' + blood 7080 2 63.01 AAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr2L 15833090 5' + hobo 61 1 59.59 CATTCATATCATATGAATCGCTTATGTTAGGAGTTGGTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr2R 8793838 5' + Transpac 16 2 75.34 AGTTGTTTGGCCAGCATGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 - chr3L 21630455 5' - Burdock 6367 2 69.18 AGTGGTGCGTTGGGTTTATGCCACTCAAAGTTGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAA:1 - chr2L 20842006 5' - G2 3029 2 58.99 AAATGACTTCACTTTTTTTCGGTTTTTTGGCTAGTTTAAGAATGAATTTTCCATCTAAATTTTGCTCATCTAAATAAAATATAGTATACATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 - chr2R 4564693 5' + flea 4786 2 65.52 GATCAAGTGGCTTGTGACTATCTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3L 19279070 5' - opus 482 2 74.48 AGTTTGTTGGGTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 + chr3L 14898821 5' + jockey 13 1 80.00 CTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2R 21380586 5' + roo 8707 2 56.16 TCCGAATCTATATGCAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGTCCA:1 + chr2L 13877639 5' - Transpac 281 2 61.64 CCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGG:1 + chrX 18034601 5' + Juan 49 1 45.21 CAATCTGCCTTCAACTGTTCGAAGGAACTCCAGTTTGACAGCAGCTGAGACATCAGAAGTTGAAGCTCTTCATCATGTCGTAATTTTACCTAGATTCATATTCCACGTTACAGGTATATATTAGGTTTAATGTATTTAATTTATTT:1 + chrX 449316 5' - HeT-A 2 1 54.79 GTTACGGATTGACTTTGAAGTGAGTCCTCATTTCTAATGAGTTCTTGTGGTGATATGAAGTAGGGAAGGTAATTAATTCACTAAACCACAATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTA:1 - chr2L 10963272 5' - Doc 4634 1 60.96 TTCGAGAGGATGTAAAGAAACAGGCAAAGAACTCACTGTCGCACTCATCCATGTGATGATGGTAATTGAGCAAAAACTCCAAGACGGCCAACTCATTTATGTGTTACACATATTTTTTTTTTAAATATTATATTTCTAAAGTTTAT:1 + chr3R 22442886 5' + hopper 172 1 65.07 AAATAGTGCTTTGAACCATAAAAAAAAAACATAAGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCT:1 - chr2R 10478811 5' + invader4 2777 2 68.84 CGGGGGCCGAAAGCTCACGCAAACGACTATTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 15824599 5' - hobo 2893 1 53.44 AAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTC:1 + chr2R 19076555 5' + F-element 256 1 78.08 ATTACCCACTGTACAAGTTGCTGGGCCGTCAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCT:1 + chr2R 21897879 5' - 412 7481 2 60.96 AAATAGTCTGGCTCTCTATGAGCTGAATTTGCTATTTAAATTTTTAAAATGTTTAATATACTTATTTAGCCGCCGTTTACTGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTC:1 + chr2R 10453354 5' - mdg3 185 2 55.48 AGAAAAAGAACCAGAATTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2R 18882638 5' - roo 324 2 73.97 TAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3R 21237841 5' + Doc 40 1 57.53 GTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chrX 14961151 5' + hobo 67 1 69.57 TTTTGTTTGCGTTAAATAATTACTATCACGAGAAACGCATTTGCTAAGCCAAACAAATACGATGAGTTCTTTAAATATTAACGCGTGACAAATTCCGATTTTTAAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGACATGATTGATG:1 - chr3R 26196174 5' - I-element 179 1 65.75 TTACGCATGTGAGTTCTGGAAGTTCCGGAACAGATAACTTACTTGAATTGTAAGTTTTCTTTTAATTATTGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 23449390 5' + roo 8681 2 73.97 ATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3R 24103361 5' + 297 48 2 53.42 TTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATA:1 + chr2L 22696400 5' + X-element 91 1 71.92 GAGGAGGACCCCTGTTCGCTTTTTGTTTGGCGCAAAATTTTAATTGCCTTGCAACGGGGCAACCGGCAACTGCAAACTGCAAACTGCAAACTGGCATACTCGGGTACAAGGCCCACATATTGTGCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTT:1 + chrX 14145518 5' - gypsy8 4817 2 50.68 CTTATCTAAAATATTTTTCCAAAACCAAATCCATAATTGCTGTTTTTGATGTTTCCATGAGAATGAAGGCAATAACCCTGTCAGAATGTTGCATAGAGGCCAGCAAAGTGGAAATCAGATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAAC:1 + chr3L 23611426 5' + Bica 4572 1 74.48 CGACTGCTGTTGTTGCTGCTGGGCGCGGCTGTTGCACTTGGCGCAGTTGTGGTGCTTGGAGGATTTGCGCCATCCAGCCAATTTCAGTAATTCCATGAACAATAAAGCACTTAAGCACTTACTGTATGCCATCTGCTCAGTATGCG:1 + chrX 10715074 5' + 17.6 141 2 57.53 ACGTAAAAAAAATTACTTATCTGAGAAATGCAACCCTTCCGAAACCACCAGTTCCGTTTTTATACCCTTTACACGTAAAGTAACGTTAAACAATTTTTTCTCATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chr3L 22737310 5' + mdg3 19 2 73.29 AAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 + chrX 10960212 5' + Transpac 4992 2 67.81 CAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3R 10140243 5' + P-element 64 1 29.06 ACAATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3R 11526887 5' + pogo 44 1 56.16 ACAGAAATTATTGCTCGTTTTTTTACCCTTCCCTTTTGGGGGCCAAGACAAATAGCCCAGGAATGCGAACTGTTTGTTGTTTTTTTCCATTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 2832586 5' + hopper 141 1 55.56 GATTATGTACTTTTTATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 - chr3L 24153308 5' + Tabor 6865 2 68.49 GTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3R 25753687 5' - hobo 2916 1 61.04 GTGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGTGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr2R 17986257 5' + 297 4 2 68.60 GAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACT:1 - chr2L 9356914 5' + Stalker 6906 4 58.90 AGGAAATGAGAAAAAGGAAAAAAAGGATTTTTGGCTCAACTGCCTAAGCTTAATATGCATTTACAGATAAAATAGCTCCTTTCGCTTCCATTATTATGTGTTGAAATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATT:1 - chrX 13648192 5' - hopper 1087 1 61.64 AACTATACTTCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chrX 3529854 5' - 412 7505 2 57.53 AAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 4639062 5' - roo 9016 2 58.22 ATAAAAATTGCATTGCAAATACTAATTTAAGCATACATGCTATATAACCGATAAGATGGGCGAGCGTCAAGGCAAAAATAGTTGACCGTATTAATATAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTATTTCGCAACATCGG:1 + chr2L 18081074 5' + invader2 4951 2 65.75 TCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:1 + chr2R 14562102 5' + Burdock 6188 2 57.53 ATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chrX 3524221 5' - roo 343 2 63.70 CGAAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 22529724 5' - roo 9024 2 52.74 TTATAATTATACATAATATACGATACTAAATATATGAATATGTATGCATATGTACATACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCACAAGCACATTTCGAGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTAC:1 - chr2R 5412764 5' - Tc1 1577 1 63.01 TTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGT:1 + chr3R 5765349 5' - opus 7421 2 76.71 ATCGGCCGTATATATATTGATATTAATGCAGTGGCACTTGTATATGGACACCGAGTGCCCGCTGCCCGATAACCGCTAGCTGGCGGAGCAACAAAGAGCATCAATAAACTTCGCCTTGTGTAGTTTTCTCTAACACACTATTTATG:1 + chrX 11312074 5' - invader4 147 2 64.38 GATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr2R 20704144 5' - hobo 2933 1 66.67 GCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 - chr3R 24228975 5' - opus 441 2 62.33 ATTAATTAAGGAAATAGGTACACGTTCTTAACAAAGTGCATGTGGTGTGTCAATTTATTTCAATAGGTACATAATAACGAAGAGAATAATAAAATATTGAGTTTGTTACGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 + chr2R 15392656 5' - blood 7376 2 73.97 GTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACACGAACACAAACACATGCACAATCGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:2 - chr3L 15035233 5' + pogo 47 1 54.11 ATTTTTAATTGCTGCGATGCACAGAATGCTGCCGCTGCTGCATTCAGCAGCACTGAGGCAGCTTTGCAGAGGAGCAAAAATTATTTCCATAATAAATGGATGAATAACTTTGTGGAATTTTACGTTATTTAGAGTTAATAGGGGAC:1 + chr2L 21012941 5' - Doc4-element 2378 1 61.64 TGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3L 9242064 5' - roo 321 2 76.03 CTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTT:1 - chr3R 3179369 5' - S-element 1271 1 64.39 AACCTGGGGAATATGTTTTAATCGGGGAATATATTTTAAAGTTTTATTTAGTGCGTTACAAAGTTTTGATTTAAATCATTACTCATTTCATATTTATTTCCTTTCAATTTCTTTCAAAAACAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTT:1 + chr3L 24734295 5' - INE-1 574 1 72.60 ATTAGTGGGATATGGTCAAAGCGCTGACAGAGCAGCTTAACTCACGATATTGCAATTAAGTATCGAATATATCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTCT:1 + chr3R 10026209 5' + FB 50 1 51.03 ATAATGGCTGATACATCACTCAGTTGGAATTTTTTTGTGCTGCCTCCGAGAATTTAACATAAAATATTTTTATGTGTGTGTGTGTGTGGGT:1 + chr3R 22821054 5' - Quasimodo 39 2 80.22 GATTTCTCATACACCTTAACACAAAGTATCTAAACTATATTAATGATTATGAAATAAGTAAGAAATCCTTAAAAATAGATTTACATTTTTTACTTAAGACTAACAGGTTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTT:1 - chr3L 15442601 5' - jockey 4860 1 61.64 AAGCTTATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 - chr3R 3527182 5' - Tabor 433 2 50.00 ATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 - chr2L 15833068 5' + hobo 83 1 74.66 TAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chrX 18366004 5' + jockey 57 1 52.41 GAAGCCAATACTGCCAAGCGATTAGCAAGGCTGATTGGTTTTCCTTACTCATTAGTTTGAGGCACGAATTGCCATCAGCTTGCAACTGGAAACTCATGTCCATGCAACCATAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATG:1 - chr3L 16653812 5' - Tirant 170 2 73.97 TGCACGGTGCTTCATTCAAAAACGAACTATTCGTTTCGCACAGCTGTTTGCTACACTAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 22548905 5' + 1360 63 1 63.01 GTAAATTCATTCCGGAATAGAAAAGGGTATGGCTGGGGATGGTGGGGTGATGCGTTAGCTGATTGTTAGAATTGATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 + chr3R 10562068 5' + I-element 9 1 78.08 TACTGTAGTTTTTCCAGCGAACTAGGGCTTGCTAAGGTGGCAGGTTGTGGCTTATCTATAAATAAGTGGCGATCAAGTGGGAAAGCTCCAGTCTTGCCAAGCCTGTCTAGCATTTTAGCCAATATTTACTAACATGTGACTGCCCC:1 + chr2L 11840592 5' - Gypsy12A_LTR 435 1 78.77 CTTTTCGATTCGATCAAGGGGGTCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr3R 28008349 5' - hobo 2900 1 52.74 TAGGGAATAAAATAAGAAAAAATTTAAAAATTGTTTTGTGCGGTTTGCGGGTGTGGCAACTTGTACTGCGTCTATGTCTCTGGAATCTGTATGCAAAATCTTAACCTTCTAGGTTTTATAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACG:1 + chr3L 6435802 5' - INE-1 136 1 54.11 AATGCAATTGAGTATGCAAATATTGCCTACTTGTCATGTAGACAAATACACATTCAGCGCTTTCTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:2 + chrX 7467880 5' + hopper 10 2 78.77 AATATTCTTCCCCGCACTCGCCATCCACCGCAATTGAAAATCACGGTTTTTGTCTACACTGAGGGAAATACCTTAATTGTCAAATAAACTTGCATGACACAATGAAACTACAGGAAGTTGGAGTAGGCGGTCCCACTTCTGATGTC:1 + chr3R 12837026 5' - invader4 343 3 64.38 AACAAGCGATCCCCTTTTTTCTTCTCCAGCCAGCCTTTGTGTGGCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCA:1 - chrX 10728962 5' + springer 17 2 73.97 TTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 - chrX 4566258 5' + Transpac 56 2 60.27 TATAAGTTTGTTAGTTTCAAAACGAGTAATGAGACTAATGATCAAATAACTCTATCTGTAATAGAGTTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAG:1 - chr3R 20909020 5' - I-element 5292 1 54.79 AAAACTTAAAAAAAAAAACTGATTACATTTGAATTCGGTTATATTGAAGCCAAAAAAACCAAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCACCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACACGGTCTTGCTCTACAA:1 + chr3R 26020358 5' + F-element 4224 1 68.49 AGATCCGTTTCATTAATCTGTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 4175245 5' - roo 9021 2 54.11 GGCGACGTCCTTGGTGTCTACTATGCATCGGTATCTGTGATTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGT:1 - chr2R 2949172 5' + 17.6 6944 1 74.66 TAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 + chr2L 1073914 5' + Tirant 8172 2 61.11 TGAAACTCCCCCTCAATATAATCGGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 - chr2L 8542781 5' - P-element 2790 1 17.12 CTGGGGAAATTACGGGTAAAATTATAGAATTCGAAACGACAAGAGGACATGTCAATAAAAAAAAAGTGAATTAAAACGCTGCCCCGGCAGTCTTGAAGAGTCTTAAACTTGTTTTTGGTTTT:1 - chr2R 17398594 5' - mdg3 5112 1 70.49 AAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAAGATAGACGTAAGCCTCAAGTG:1 + chr3L 20747060 5' + Burdock 6164 2 66.44 ACGAGCGTGCTTATACGGTTCACCTGAGCTCGGGCATTGTCTAGGCAAATCCCATTTTATTTAATAGTTTTTGTATTTTTTATTATTATCAGAATTAGTAATAAGACATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGA:1 - chr2R 20015215 5' + X-element 19 1 52.05 CATGCACGTTAGCTGCACACGTGTAATCCGCATTGAGAAATAAATCAAACATGTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTA:1 + chrX 12526357 5' - roo 8941 2 63.70 CTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 + chr2R 5214952 5' + F-element 69 1 57.53 TAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACATTAATTA:1 - chr2L 15153369 5' - G2 3030 2 59.59 TAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATGGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 7534602 5' - roo 8996 2 67.81 ACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3R 25822983 5' - roo 331 2 72.60 GTTTTACAATCATTATGATTCCCAACATGTTCAAGCTCGTTCTAAATGATCGGGCTGATACTTTTCGTTGTAAATTTACTCTGGTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr2L 13244772 5' - hobo 2900 1 58.90 AGCTGATGCAGCAGACCCAGATTTTTTTTTTTACTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr2R 16908557 5' + roo 8751 2 80.14 ATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAT:1 - chr3R 10288894 5' + copia 66 2 60.96 CGCTGGCTGCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 10973160 5' + jockey 28 1 70.55 GCATTCGGACACAAATTGCCCATCGATAATTGATGGGTCTTCAGATGGAAGATCTGTAATTGTGGAATTCTTTGGCTTGTGCAATGGCACCCATATATGTGTATATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATT:1 - chrX 12893490 5' + Bari1 15 1 74.66 ACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 - chr3R 15465603 5' - mdg3 5462 2 60.27 CAGGACTCAGACTCCCCCAACTCCAAAGTATCCCCAATATTTTGCCATGTTTATGCAGTGTCCAAGTTGTTGTTGGCTATTTGTTTAGCATTTTGCCCAGACAGTTTTATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGA:1 - chr2R 13602697 5' + Stalker4 292 4 78.77 AAAACTAAAAAAAAAATACAGATAGAAAACGAACGAAACGATCGTTCTAAAATGAGCCAACGAATTGCGCGCTCGGCGGCGAAAA:1 - chr3L 19891231 5' + Doc3-element 235 1 68.24 AATATTAAGCCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATAC:1 + chr3R 20149651 5' + 1360 16 1 67.36 CGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACA:1 + chr3R 15465492 5' + mdg3 5328 2 67.81 TTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:2 + chr3L 13597770 5' + blood 86 2 77.40 TTCTAAGTCTATATTTTTAATAATAATAGTTTACTAATCTTCTAATTGTTCACAAAATTGGTCCAAATAAGGTATTTAATATAATAAAGGAACCAGGTATTAAGTGCCAAACATTAAAACTGTGAGGAGTCTTAAAACTCCCCACA:1 + chr2R 2015715 5' + gypsy8 3 2 59.59 TTTAATAAAATAATTAAAAAATTTAGAATTAAACTTCGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAATATGTGCAAACTTGGAATTTGGTGTTTATTTTCTTGTATACCAGCGCAAAAACCCCAGTGCTCGAAGC:1 + chrX 12958049 5' + G6 200 1 80.82 CATGACCCCGGACCAGCCACTTTGAGGAGGTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGCGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTGGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr3L 17447585 5' + Tirant 21 2 66.91 GTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAA:1 - chr2R 544870 5' - HMS-Beagle 176 2 67.86 GAGGTCCAATACCAGACTTTGAATTTTTTAGAGTAAGGAATTCCTCTCTTCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr2L 22746387 5' + 1360 19 1 72.60 GGCCCTGCTTATAATTATTGCTGCCGTTTGCTACGAAACTTTATTAGCTGATTCTACGCAAAAAATATCTATATTTCTATAATAAATTGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1 + chr3R 18469094 5' + Quasimodo 31 2 65.75 GTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:3 + chr3R 21421027 5' - roo 352 2 57.53 CGATACATATGGGAACTGATCTATTAAGGGCTAAAAGCACCTCCTTATGGGAGGAATCCAACAAATGCAGCAACATGGAATTATTGGTGTTCGAGTTTACATTCATACACCCATCCTTATATACATACATACAAATATTATCGAGA:1 + chr2L 21773988 5' + mdg3 106 2 66.44 GCGTAACTAATCAGCACAGGCAATGATATGGCGACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAAT:1 - chr3R 11461906 5' - 17.6 7394 2 69.18 CGATTACAACCAACTCTGCGGCTTTATTTGAAGTCTCTGATTATGTTTTGAGAGTGAGCCGCAAATTACGGTAAACACAAACAATAAGCCAAGGATTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGC:1 - chr3R 27875469 5' - Quasimodo 320 2 56.16 CTATGCATCGGTATCTGTGATTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:2 - chr2R 2949152 5' + 17.6 6964 2 60.96 GGAAAACTATCTGTCGATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 + chr2R 8793904 5' + Transpac 82 2 74.66 GCATAACCGACAATACCATAATCTGCTGGCCGCCGTTTGCAATATAACCGGGTCCATAGAGCCGCAGTGCATCTACTAGAAAGACCACAAATTTCGACTCCGATTTGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGG:1 - chrX 10623958 5' - X-element 4704 1 73.97 ATTTCGTATGTTGCATGTACTACGCCTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr3R 31907291 5' + Tirant 8124 2 75.17 AAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 + chr3R 25384180 5' + mdg3 5312 2 59.59 GGTGGATGGTGTGTGCTTGATGGGTGATGGATGACCTCAATCTCAAAATCTATTAGGAGCCTGAACCGAAATCCTAGGCTTCTAGCTATACTGGAAGTATTTATGGCGGCTG:1 - chr2L 8430763 5' + Transib5 2956 1 64.29 TACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr2R 6984379 5' + Doc 27 1 67.81 AAAACAAACAAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTG:1 + chrX 10571318 5' - Doc 211 1 53.42 TCTACCAAAATACAGTGAATGCTTGTGTGTGGTGAAAGAAAACGTAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTTCTGAATACATTAAAATGTAAAATATATATAGTAGCTTATGTGCCATAGTAT:1 - chr3R 6053098 5' + Quasimodo 1 2 73.39 AATATTGTCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 25822966 5' - roo 348 2 60.96 AAACTAATAACTTTTCCGTTGTCCCTCCATCGAGCGATTTTCCTTTTTCCTCCGGCTTTTCTTTTACACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGC:1 + chr2L 20586218 5' + roo 8893 2 54.79 ATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAATATAT:1 + chr3R 10791690 5' + Idefix 44 2 54.33 GAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAGCGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAG:1 + chr3R 17316068 5' + 3S18 5853 2 73.97 AGTAGGATGGGGAACACCAAAAGGCTGTTGCAGGCGCCAACGCATAAGACCACCAGCAGAAGCCAGCAGATTTTTTATGTTTTCGCATAGATAGAGAACATACAAAACAAGAGATATTGCTATAGTCGAGTTTCCCTACTATCAGA:1 - chr2R 8663762 5' - INE-1 561 1 47.95 ATAAGCATTTGTATAATTACACAATGTCGCGGGAAATAAAAATTCACACAAGCCAAAAGCTTTAAATAAATAAATCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTT:1 - chr2R 14639366 5' + invader2 4940 2 49.32 GATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCT:1 + chr3R 11461772 5' + 17.6 65 2 65.07 AAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTGTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chr3R 4464167 5' - 1360 3327 1 68.55 CTTGGCTCACCAAATTGTTTTTTTTTGTTATTCCATAAATATACAAGAGAAAAACCGATAAAAAAAAATTGTACACCGAGACTCCAAAACCACGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCA:1 - chr2R 5550334 5' + I-element 4957 1 66.44 TAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGA:1 - chr2R 6984444 5' - HMS-Beagle2 285 2 67.12 CATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 + chr2L 19878169 5' - mdg3 174 2 67.12 GTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr3L 15058801 5' + blood 7028 2 46.58 AGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGG:1 - chr2L 11867374 5' - BS 4969 1 57.53 CAGATATGATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr3R 24229012 5' - opus 7481 2 71.92 GATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1 + chr3L 22354449 5' + Doc 93 1 74.66 ACATAATTGATTAGGTGAGAGCAATTGACGTTTACGATGATGTTGGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGT:1 - chr2L 11573699 5' - jockey 4915 1 74.66 CATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2L 1229556 5' - opus 7462 2 55.48 GTACTACTAAGTACGCCGCGTATAGTTGCCAAGTGGGCGGGGCGGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3L 22354378 5' + Doc 21 1 73.10 ACCTTGAGGAAAAAGTCACAAAATTAACGTTCAGTGCAAATGTATCTAGGCACTTAATAATTAAAACACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGC:1 + chrX 7546472 5' + R2-element 326 1 57.63 CTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 - chr3R 10140249 5' + P-element 87 1 27.40 TCGGCTTTCTTCGGTTCTCCGAACGGTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 + chr2R 15613785 5' - P-element 2817 1 22.07 AAATCAGAAAACTTGGCGCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAA:1 + chr2L 10474349 5' + P-element 102 1 15.75 CCCGATTGTTCGGACAGGCGGAGTCAATCAACGGACAAAAGTTGATTTCGCAATTCGCCATAGCCACAGCCATTCGCCATTTGCAATTCGCAGCTCGCATCTTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 + chrX 14448002 5' + HMS-Beagle 12 2 75.52 GGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:1 - chr3L 5498515 5' + Doc2-element 251 2 42.07 ACGCTTTTCGTAGATACACAGTCAGGGGTTTTTAATATTTATTTTGGGGGGTGGACAAAGACAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAA:1 - chr3L 4430772 5' - blood 7127 2 61.87 TTAACAATGAGCACGGATCAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 8397122 5' - roo 387 2 66.42 ATAAATTCCATCCAGATAGGCAATGTAAATATGCAAATGAGAATGTTTTTCTGGGTCAAGTCAAGTGCGACATTTTGTCCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr3R 10288916 5' + copia 44 2 52.74 TTTTAAACGTAATAGTTTCCTCCTTTTTTGTGTTTAACGTAAACTTTTTCAAATTTATTAAGGTTACGTTTATACTAATACACTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTA:1 + chrY 312134 5' - Tc1-2 1579 1 47.95 AAACTCCTCGAGCAGTATGCCTGATCCACCTGCTGCTCCCGATGATCCTAGTCCCGAGGAAGAGGACCCTTGCTGCGGTCTCACATTCTCATCCTCAAGTCATTTGACTTAATGTAAATGTAAAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCA:1 - chr2R 15357345 5' + 1360 3318 1 66.44 TAGGTACATAATAACGAAGAGAATAATAAAATATTGAGTTTGTTACGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 + chr2R 15392719 5' - blood 7313 2 71.92 CGAATTTGATGTCAATGAAACCAACGTAGAAGCTCTGAAGATTTGAGTGTTATGTGGTCAAGATCATGGACAGCTATACGTAGGTAGGAATATATAACTAAAATAGTACAAGGGAAAGTTATCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 - chr2R 25168614 5' + HMS-Beagle2 6937 2 76.03 TTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGGTTATGTAA:1 - chr3L 24153254 5' + Tabor 71 2 70.80 ACATGTCAAAGTGAAAACAAACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAA:1 - chr3R 15465623 5' - mdg3 5482 2 73.97 AATCATTTTCACACTCGATGCTTAAACACAAAGAACAGCACCCTAACACATATCAGGAAAAGTGAAAATTCGAAACTAACTGACGAACATGAACACTGAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chrX 22591228 5' + copia 4894 2 69.18 CATGCCTACTTTAATGCATCACAGGTTATTCCTTATCGCGATTGTGATTGTTCTTCACCGTAACAATATACATACGTATATATACATATATATATATGTATATATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 17614521 5' + roo 8681 2 73.97 CAATGAATATTCAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2L 11668700 5' - mdg1 7411 2 51.37 ACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGC:1 + chr3L 27356055 5' - Tc3 1662 1 63.01 CTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCA:1 - chr2L 1229699 5' + opus 169 4 63.70 ATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 + chr2L 11668727 5' - mdg1 7384 2 67.81 GAAGAAGGCACCTCTAATGGCGAAGACCTTGCAGTTTATGCGCGGACGTCTCAAACGATAGATGCGCTTACTCATTATAGCTACAATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 23254388 5' - pogo 2069 1 64.38 GCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGTCCGAATGCTGACA:1 - chr2R 6187923 5' + Tirant 84 2 76.43 GTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTC:1 - chr3L 3979662 5' + opus 7077 4 70.55 ACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGCACTACC:1 + chrX 18707458 5' + BS 4770 1 54.11 GAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr2L 9167412 5' - pogo 2055 1 54.11 ATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 + chr3R 5765331 5' - opus 7444 2 63.12 TCGGTTAATTGTTAAGTGCTTGCCTGTTTTCTTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 + chrX 13651480 5' - 297 6894 2 78.77 TATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chrX 983101 5' - 412 7505 2 56.85 CTATCACCCTGTCACGCACCCATCGCCAGCGGCCACACACACACAAGATGGCAGGGAAATTATGAATGCGATTTCAGTTAATTAAGAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCACTTATATGTTAATTGCGCT:1 - chrX 685425 5' + BS 5031 1 59.59 CGCATTTTATCTATCTCGTTTTATGAAGGAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chrX 983080 5' - 412 473 2 71.23 GACTCATTTTGAATTGCATTAAATAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAA:1 - chr2L 15153392 5' - G6 2014 1 75.86 CTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr3R 9938600 5' + roo 68 2 65.07 AACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 - chrX 17469260 5' + blood 76 2 68.49 AAAAACGTTAATAAAATATGATTTAGTGTAACAAGGCATTTAGCAATAGGTTTAATAATGGCGCCAATTTGAGAAATTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGTAAACAATTCTCAAAGTAAACAGTATCGTAAAATAA:1 - chr2R 7024370 5' + diver2 302 2 50.68 AACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2L 1136289 5' - 1360 3343 1 54.11 AATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCT:1 + chr3L 3540131 5' - mdg3 5424 2 64.38 ATGCTGTCTTAGTTCGGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTC:1 - chr3L 21093281 5' + Ivk 14 1 76.03 CGATGCCCGACTACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr3R 13543985 5' - 1360 3373 1 45.89 GCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTC:1 + chr3R 5765336 5' - opus 7434 2 67.81 GATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTA:1 - chr3L 19274889 5' - transib2 2762 1 60.96 ATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:2 + chr3L 18468364 5' + jockey 4745 1 68.49 GCAGCATTCCGCATTCCACATTCACTTGATTCACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 10032789 5' + hobo 13 1 75.34 GTGAGTATAATTACGCGTAGCAAGGAGCCTGATATTCGAAACATTTGATTTACTTTAAGTTGATAATTTGCAAGCTTTTAATTGGTAGAAGAGATTGATTTTACTATTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTC:1 - chr2R 10839421 5' + G2 3019 1 75.34 ACAAAAGACTTGAGCGACAAACCTGATGATTAAAGTTAAAAAACAGCTAAAAGATACCCTATTTATGGAAAATGAAAATAATGTATCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chr3L 5574918 5' + roo 92 2 41.78 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTATCTATCTATCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTG:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 38 1 63.70 AAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTAC:1 + chr2R 11656016 5' - HMS-Beagle 179 2 65.07 CCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr2R 16410119 5' + opus 7170 4 58.22 TTTATTTCGATTGGTCCTGCTTTAGTTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGAACCACTCCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr2R 2009391 5' + I-element 8 1 80.00 ACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr2R 21897977 5' + 412 7113 2 58.90 CTTACAGATCTAAAGATTCAACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 - chr3R 10778789 5' - mdg3 5479 2 72.60 CTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 52936 5' + roo 8716 2 53.42 AAAACATAAGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTG:1 - chr2R 10478786 5' + invader4 2810 2 49.32 AAACCAGTCGACGTCAGCAACCAACAACACACAAAAAAAAAAACAACGAGCACGTAGTGAGTGATTTATAAGATACCGGTCAAGAGGATTAACTAAAGAAAACAAACGCTCCTGACAACAGACATATGGGATCTGGGGGAGAAGTG:1 + chr2L 5545995 5' - G6 1722 1 80.14 TTGGCAGGTCGTCGACGACAGGTTGCAATGCCCCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGTAGCAGCAATGCCAACACTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACCACATACACCACTCCG:1 - chr3L 14872568 5' + Idefix 72 2 49.32 AAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr3R 12363260 5' + jockey 74 1 59.59 CGGATCGTTTTGCCATTCCCGTCGCTCGGGGCAATATGATTTCAATTCAGCTGACCTTGTCAAGGGTTTGGCATCGCATTTGAGTTCGAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACT:1 - chr3R 18643667 5' + pogo 1702 1 57.53 ATTACAGCGCACTTAAATTGAAACCAGAAGACCAATAAGAAACGCTCAATAACATTTAAATAGCTCAAGATTCCTGCCCAAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGC:1 + chr2R 20856147 5' + Juan 4117 1 78.08 CGAAGAGAAATTTGTACATTATATATGAACATATATACTATATACACACTCACATTTTGAAGCGAATAAAATTGTGGATAATTGGAAATCAAATAAAACTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTG:1 - chr3L 5566982 5' + invader4 2867 2 67.59 ACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr2R 16410135 5' + opus 38 4 59.59 ACATTGAAACTTTGGAGACCTTAGAGGGAATAAACTATAGCTACACGTGTGTTTGTGTATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGT:1 + chr3R 14805570 5' - 17.6 210 2 60.27 CCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAA:1 + chr3L 18708602 5' + F-element 75 1 64.38 TCGGCGCGAGCGAGTTAAAAGCCAAAAACGAACAACAACAACAACAAAGTGGGCAAATACAAGTTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr2L 8103620 5' + pogo 52 1 59.03 AGCCAAACACCTCGTCATTAACTACTATAATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCTCATATTGTTCAAAACGTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTA:2 + chrX 23431006 5' + invader4 2804 2 53.42 AGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 - chr3R 9345661 5' - pogo 2031 1 68.28 CGAAGAAGGGTACCGGCGGAGGAGGACCTGCATGCGGCACATGCTATCCTGTATGTGTCCGTTCGACACTGGGCC:1 + chr3L 3986874 5' - opus 7321 2 68.00 CAATTCGCTAGTCCTAATCATCGGACACAACCGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:1 - chr3R 30056547 5' - jockey 4903 1 77.40 CTGTTATCGCCATCTTTATCATTCAGTCGCTGCCCAGAATTCTCCGATGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGT:1 - chrX 18366000 5' - jockey 446 1 66.90 GGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 12608065 5' - roo 330 2 71.23 ACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr2L 18581296 5' + roo 8751 2 77.40 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGGGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGAGCGAAGAACTTTG:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 25 1 66.09 ACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCGGAAAT:1 + chr2R 18721955 5' - 412 7457 2 78.08 CTCTTTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chrX 21668676 5' - mdg1 401 2 61.38 CAAAGTTTACAGTGGGCAACTTTAAACAAATATATATGTGGGTGTGCTACTTTTGGCTAAGAAGATTACCCACTGTACAAGTTGCTGGGCCGTCAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr2R 21897815 5' - 412 7545 2 77.40 AAAAGGAAATTCGTGGAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:2 - chr3R 9289433 5' + HMS-Beagle 6821 2 67.12 ATTTTCATGCTTTGCAGGTAAGAGAAGCAAACGAAAAGCATTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 16771481 5' + roo 8678 2 76.71 AAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:2 + chr3L 15371308 5' + Transpac 4999 2 72.60 ACACCTTTCGCGATTGTTGCTGTTGGCAAAGTTCTGTATTTTTTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr2L 17069673 5' - 412 460 2 63.01 TCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr3L 8253702 5' + jockey 4703 1 75.61 GTCGAGGTATTCTAAAGTGAGTTATTTTGTTGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCA:1 + chrX 18149822 5' - hobo 2865 1 74.05 AACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTA:1 - chrX 23182957 5' + Idefix 8 2 66.43 GAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTG:1 + chr3R 11461761 5' + 17.6 54 1 57.53 GCAACTAAAAATTAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:2 - chr2L 15833135 5' + hobo 15 1 73.79 ACTCAAACTCACAAAATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 + chr2R 24630095 5' + copia 4900 2 61.64 CTTTCCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 13204815 5' + jockey 33 1 62.70 CATTGCACATTGGCAATTAAAAATTGCTTGAATATAGCTCTGAAATCAATATGTATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTATCCGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGAC:1 + chr3R 30731377 5' - springer 300 4 65.75 AAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3L 4639061 5' - roo 9017 2 57.53 ATGCTGTGACCGCTTTTAATAATTTCGGTTACAGCATCGGATGAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGC:1 - chr2L 20983516 5' + blood 392 1 70.55 CTATGTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAA:1 - chr3R 25753691 5' - hobo 2859 1 75.36 CGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr2R 6984415 5' + Doc 62 1 55.17 GGATATCGAGAAAGAGAGTACGCGCAGGCGGCATACATGCAGCCCCACTGAGTTGACATATTTTCATTAAGATAACCGAAATCAATTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chrX 14385275 5' - blood 340 2 59.31 TGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 + chr3L 18708598 5' + F-element 71 1 61.64 TCGAATTTAATTAGAAAATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chr3R 28008192 5' + hobo 16 1 74.66 GTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3L 20076840 5' - roo 8988 2 78.08 CAGGCCTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 + chr3R 3527041 5' + Tabor 31 2 67.12 TAACTTTTACATACTTTTTACTCTCTTTTTTTTTTTGTTTATGTATGGGGAATGTTTGATGCCACGTAGAGGTTTTGGTGATGTTAGATAGATATTTTTGTTCGCCCGGGTCCCACGGCCACACCTTCCGCCCAACCGACCGAGGG:1 + chr2R 5633396 5' - Cr1a 4419 1 71.92 GCACCTACGCACCTATAACAGTTTGAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr3R 13358714 5' + mdg3 38 2 60.27 GTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chr3R 12363245 5' + jockey 89 1 69.86 AGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGC:1 + chr3L 20747061 5' + Burdock 6165 2 65.75 CAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 14962177 5' + jockey 12 1 73.45 ATATTGTCATATCATTTCTTAATATCTCTGTCCAGAATTAGGTATTTCCAGCGAAATTCAATCACCATTTCTGGCATCCTGATTAGACCTGGTACTTAAACAATATTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3R 13157862 5' + Doc 57 1 68.49 ATTCATTCATTTTCTTTGCAATTCGAATGCAAAATTTATTCACAAAAAACCCAGAAAACACCCAAACTATATGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACA:1 - chrX 10559630 5' + Doc 232 1 51.37 GGCTTCTCCTGCATTCGATAAGGCCTGTGTAGCACCATGTATCCCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGCCGCTCGAATTAGCTAC:1 + chr4 904823 5' - 1360 2984 1 69.86 GAAGGAAGTGCATATAGTTGCGTTCCCGATTCCCGATTCCCCGCAAAAACCGATTCACCCCTGAAATTACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATTTTCG:1 + chrX 20552771 5' - roo 355 2 51.37 AATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2R 10991365 5' + jockey 75 1 69.29 CAGCTTTCTTTTGACTACGAATTGCAGTTAAGTTGTCCGTGATTTGTGTTTTTTAAAGTAATCAAGGCAAACAAAACTAAGAAACGATAAAAAAAAAAGAATCCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCG:1 - chr3L 3151539 5' + G2 2817 1 69.86 TAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr3R 7739665 5' + blood 7061 2 51.37 AATATATGTTTATGCACTGCGGAAAAACATTGGAAAATCATACAATCCATACAATATTCCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGATAAA:1 + chrX 7794374 5' - Circe 6983 1 60.96 AACAATATTTAATTTACAATTTCAGATATAAGCGATACCATTGTTTTCCACAGAATAATGAATTTTTGGGTGCTGTTCTTGTCTAGTGCAAGTGCCTTGAATACTTTGGGTTGTACGGATGGAGGTTTGTACCGCCTCGACTCGGA:1 - chr2L 7715047 5' - Rt1b 262 1 77.40 GTACATACATTGGTGTGCTACAGTGTAGCGGGCTCTTAATCAACAGGGATCTGAATGGGCCGAATTTGGCAGCAAAATAAACGCAAAACGGCGCACAAATAAAAATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2R 6585568 5' - pogo 2091 1 78.47 AACGAAAATATCAGCCAGAGCAGCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGTTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAT:1 - chr2R 21056782 5' - Tirant 8446 2 60.96 AATCGCTTAACTCAACGATTCAACTACCAAATAATTAAACGGTCAGCAGAAAAAAAAATTTGTTATTATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATAT:1 + chr3R 6368547 5' + Idefix 15 2 75.34 CATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 - chrX 3452506 5' + Tirant 8126 2 54.02 GGCAACAGGGGATTGCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 25443146 5' + 297 49 2 58.22 ATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACT:1 - chr3L 23597292 5' + invader4 3 2 70.55 GATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr3R 15649891 5' + blood 33 2 61.97 CTAGGTGGCGTGTCGAACAAGGACAATGTCGCTGTCGTCGCCTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1 - chr2R 19543736 5' + jockey 4838 1 71.23 AAACGAAAGCTTTCACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 12142536 5' + hobo 41 1 57.53 CGAGGTTTAACAATGAGCACGGATCAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 8397116 5' - roo 9044 1 65.07 AAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGGGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 7739711 5' + blood 53 2 70.87 TATCACCTTTTAGGGGCTGTATGCGTTCATATCCTTCAAATTGCCTTATTTAAATGTATTATTTATGAAATAATAAAAGAATTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr2L 21596466 5' + blood 38 2 60.27 TTCTGGGCAGCCCCGGAGGTCCATCACGTCGGTCTACTTTCGGTTCGCTTTCATCGAGAGCACAAGTCGTGGAGCGAAGATACTGCCTCTCCTACCCCG:1 + chrX 11456173 5' + Doc 431 1 58.59 TGCGGCGCATGGCAAGAGCAGAAGCTTTCTGGAACAGCCAAACAGGATATCCAGGCAAATCAGTGGGGAAAATTTCATAAATTCTCCATAAATTCATTCGCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTAT:1 - chr3L 2424841 5' + Doc3-element 22 2 54.79 GACAGGCCAAATTGATTGTGGATTGCTCAGCGTGGGTTTGGGATAATTAAAAGAGCAGAGCAATACATAATTGATTAGGTGAGAGCAATTGACGTTTACGATGATGTTGGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 - chr2L 11573763 5' - jockey 4979 1 63.70 ATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr3R 25521905 5' + blood 50 2 51.37 AGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 + chrX 19231752 5' - mdg3 5424 2 67.12 ATATCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 + chr2L 14262851 5' - blood 7320 1 63.01 CTAGTGCACACAAAACAGGACTCGCCGAGTCCTTATTTATATTTCTCCGCTCTGGGCCAAAAACTCGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTT:1 + chr2R 14388645 5' - jockey 4747 1 71.15 CATCATTGAACTTTGTTTGGATATTCGTCTGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCCAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2R 6187997 5' + Tirant 15 2 76.55 CTTTTTCATTTCCCACTCCCTTGGCAGCTCAATTAGCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chr2L 14969851 5' - Tirant 8470 2 60.96 CTTTCAATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 12608048 5' - roo 347 2 59.59 TTATATAATATAATTCAAATCTGGGGTTACACAGTGGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTT:1 + chr3L 25272488 5' + 1360 23 1 72.60 ATGGGGTTCTGGAAAAACCCGCTTTCCGGGATTATTCACGACCCATGAATCTTTTAAGGCTTGCGCCCTTGAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCT:1 - chr3R 21521431 5' - Bari1 1658 1 51.37 AAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr3R 20292421 5' - pogo 2040 1 63.70 TGATCCTCTACCAAAATACAGTGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 - chr3R 6053104 5' + Quasimodo 17 2 74.66 TTTTTATTTAGGGAGTCATTTAAATTTTTATACTCCATATTTTGTATCGTTTCTGAATTTCTATATATATTTTTTTACATTCATAATACACATACGTAATCAAAACCCATCCACTAGGCAGGCACATAGCCACGTAGCACATAAGA:1 - chr2L 17066899 5' + Tom1 151 1 63.70 GCGAACAATGTACGGCGAGAACTTGGCACAAATCCATTAACATTAACACTCACCATTTTCGAGTCGCATGCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 27332139 5' - roo 9026 1 54.11 AATACATTTTCGTTTGTTTTCTTGCATATACTAAACATAATTTTGATTGTTGTAATAAAAGGGTAAGCTTAACTATAGCAATATGGTTTATTCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chr2R 20462748 5' - copia 225 1 64.38 AGTAGTTTTACCATATCTGTGAGCTTTTAGTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 16041066 5' + jockey 29 1 71.23 GGACTTAAATGAAAAGTGACACATATGTCGGGGCTAGGCGACGACAGCCGACGTAGCTTTAGGAAAGTGCAACCCAGTCTAGAAAACTGGGATCCCCTTCATCAGGAACGTTGAACTCAGATCCTTTAAAAAAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 20191700 5' + FB 406 1 72.92 TTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3R 9482020 5' + roo 71 2 67.81 TTCGCAGTATCTTCGAGATACTTCTGCGAAATGTGCAACAATGTGCCAGCATCGATTTTCTATTAGCCACGAGACACTTGAGCCACAAAACTAAATGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGG:1 + chr2L 4792962 5' + jockey 139 1 63.01 GATTTAAGGTGTGCAGAAATCGCTGTGCGTTCGCTTCCCCAATGGTTAATTGCAAAAATAAACAGACGAAAAAGCGTACTCAAATTTACAATGCATGAGCATTCGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGA:1 + chr3R 18642690 5' - 1360 148 1 58.90 TAGAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr3R 11121680 5' + copia 4911 2 53.79 CCAGGAGGAGGTCTGCAAAATGCGTCGGAAGAAGTGAGTGATCCAAGCCAATGGGCTGATGAAAAGTGTGACAGTCAGAAAGCTGGCGCGTGCTTCTTGCTCGGGGTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTG:1 - chr3R 18739308 5' - gypsy4 311 1 49.32 CATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAG:1 + chr2L 14222269 5' + Transpac 5001 2 76.39 ATTTTGTCTTAAATATAATGTCCTTCAAATTAACTATAAAAGCAAAAGTATGTACAAAGTTGAGATCCATTCAAAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 13313094 5' - roo 396 1 76.71 AGGTGTTTCCACAAATAGATAATTCTCTTAAATGTTATATTATAATGACTCTATCTGCTCTAGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3R 19700974 5' + roo 59 2 60.27 GTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chrX 14962169 5' + jockey 15 1 75.00 ATTGAAGAGGAGCACACTGAAGGCCCCATACTCTCTGTCTCTCGGGTCTTGCTGGCCATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chr3L 13721978 5' - blood 356 2 70.55 CTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chr3R 10140249 5' - P-element 2830 1 25.34 GCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCAACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 - chr2L 19930156 5' + jockey 87 1 72.60 TGGGCACAAGGATAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2L 18581218 5' + roo 8673 2 77.40 CATTTTTCCAATTTGTTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCGCTAAACAAATCATCG:1 - chrX 3452555 5' + Tirant 8136 2 67.12 GAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 9482107 5' - roo 9050 2 59.22 AAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chr3L 24153290 5' + Tabor 44 2 56.16 TTTGATTAACTACGAACTAAAAATAAAAGATCTACATAGGCAAATGTATTTTATACAAAATCGAACTTTGTAACTCTTCTGTGAAATAAATAAATAATTAAATAATTATAATTAATTATTTAATTTAATAATATAATTAAATTAA:1 - chr2R 7604853 5' + NOF 3956 1 54.48 AAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chrX 16853347 5' + roo 83 2 75.34 GAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1 + chr2R 18048804 5' - opus 7440 2 62.07 CAACTCGCACAATTTGCACAGAGAAACTCGCTGTGTTTGTACCAAAATTCCATTTGCAATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGTGGGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chrX 10979155 5' - roo 404 1 76.92 CATAATAATTAGACTAAGCTATTACACGTCGATCCGCTTAATGAGTTGTCCTTCAAGGAGCTGGAAGAACCTTTTTGCCACCCACCTGTCATTCCATTAATTTTTTCTCATTTTATTGACCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAA:1 + chr2L 17853987 5' + INE-1 500 1 65.75 CATTGCTCTGCAGTTGGAGTGCTCCCCTCGGCGGAAAACGCCATCGACGCTCAATGCCCAGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTT:1 + chr2L 19424548 5' - Tirant 416 1 76.19 CCCATGCATCACAATAAAAGAGAAGAAGAAAAAACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 + chrX 10101268 5' + mdg3 5263 1 77.40 ACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr2L 2357374 5' + P-element 64 1 42.47 TTTGATAGTAGCGTTTTACCTAATCGGGCGCTGGCCAAAATGATTGACACCTCCTATACTAAGGGCTCTTGAACTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCCCTCTCGC:1 - chrX 16439371 5' - 1360 111 1 57.36 CAGACGCGCGACAAGCGGATCATCATCTCCGCCCTCCAAGTCATCCAGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGG:1 + chr2L 19371242 5' + Bari1 26 1 65.75 CCATTAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTATTGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 - chrX 8200342 5' + flea 4769 2 76.03 GCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr2L 20984268 5' + blood 7035 2 65.00 AGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTAT:1 + chrX 18193734 5' - hopper 1329 1 78.08 ACCTATAACATATCTGTACAACACCCTCCATTATTATGAGCGAATCTTACGAGACCGCCCTGCGCTAAAGAAGAAACTTGTAAGATTTGTTATGAATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr2R 22892570 5' - pogo 2079 1 70.55 ATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTT:1 + chr3R 18717468 5' + Cr1a 228 1 80.14 TTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chr2R 13276498 5' + roo 92 2 82.88 AGTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr2R 14562289 5' - Burdock 240 2 44.52 AAAAAATTAGTGTATTATTTCAAAGTGCAAAAGTAGACGTTAAAAGGCAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAA:1 + chr3R 7549661 5' - copia 5050 2 68.49 GGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr2L 8542755 5' + P-element 97 1 17.81 GCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACACCG:1 - chr2L 10032736 5' + hobo 64 1 61.11 ACACATGGGGTCGTTTGCCCATGGGTCTCTTCTGGGGACACACCATCAGCATGGGTCAGTACGAGGAGTGCGTAGCAGCTAGCTCTACCCACACCACAGAGATTATGCGCTCCATTCAGTTAGTTGATGTCATATCGGAGCGA:1 - chrX 9661397 5' + mariner2 50 1 72.73 GAACTTTTGCGCATTTCTCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 9616555 5' + roo 46 2 54.11 TTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2L 21192579 5' + roo 8719 2 67.44 ATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACCTACCTAATTATACATA:1 + chr3L 1387108 5' + mdg3 5295 2 54.79 AATGTTTCCTAGCTCTATTGCCCCCTTTAGCAATAAAGCTATAGCTTTACGTTTGTGGTGGTTTATTTGTGGTCCGTTATTGGTAACTGTTGTGAATGGAATCGCGGAGTGGGTTTATCAAAGACACTTTAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2L 22254551 5' + 1360 7 2 60.96 CAGATTTGCACATTTGAACAGAGCGGAGCGCATAAATGAATGAACGAGTTCAGGATGCTGTCAGCCATGGGGATCATGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 20552900 5' + roo 8706 2 55.48 CTTAATTATGTTAGTCTTCTGACACACAAAGTTACAAAAAAATTAAGGAAAATCATGTTTTCGATGCGCATAGGAATATTATAAATGCGATTCCACCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTCAAACTTTCCTCCCATTCTAGAACT:1 + chrX 13745869 5' + gypsy12 9976 2 59.59 GGGGGAGACACGCCAGAGCTTGGATTGGAAAACGGGGGTGGAGTCTTCCTGGTGCTGGGTCTCGGCTTGCTTGCAGCAATGGTTTTGGGATGCACGGAATTTCTATGGAACGTGAAATCGGGATTAGATTTCTTACGGTCTCAGCG:1 + chr2L 21210944 5' + 1360 3284 1 78.77 ACCCCCAGCACTGATGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCCCACCTATATACAGAGAAAAGCTCGAATACTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTCGAAAATACAACTTCCGCATAATACCCCAAAAAAAGGACAGCATCC:1 + chr3L 25552471 5' + Fw3 71 1 75.34 TTTATGATCCAACTTCAACTTCTTTTCGAAAATCCTGTCAGTGAATAATCGATTTGGCCTTTGCTATTTAATAAACTTTTAGCTCAATGATGGAGCGGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACATGTCCTCGTGTG:1 - chr3L 26834431 5' - invader1 3577 1 62.33 ACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1 - chr2R 16891832 5' + jockey 96 1 76.03 AGCAGCTGAGGAAATGTGCGGGAAAGCGGAGAAAGCGCAGAAAGCGCAGAAAGCGGGAGAAGCGGGAAAAGCAAAGGGGGAAAGCGGACAAGAAAGCGTAGTGTGTAGTAAGTGATGCTGTTGAGAATGGTGGCCACCAGCTGTGT:1 - chr3L 956605 5' - G6 1570 1 39.73 ACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 - chrX 22858950 5' - mdg3 5436 2 59.59 CATATAATTGCTGAAAATATAATTTCATATTTATTATCTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGT:1 - chr3R 18469205 5' - Quasimodo 7285 2 80.82 CCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2L 535427 5' - roo 8993 2 71.03 TGCCAACCCCATTGTGTTCGGATAAACCATGATAACCAAACTCTAAATGCGAAACCAAATTAAAAATAAGTATTTGCATAAACATTTGAAGATTGTCCGCTTCCTCTTTCATGAGTCGATTTACTGCACTAAAATCAAGTGATTTT:1 + chr2R 24079899 5' - Doc3-element 44 1 63.01 CAAGTGATCTTGGGGCTATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chr3R 4885296 5' + 1360 37 1 60.27 AGTGGATAAGAAGCCACCACACAAATGATGCCCAAACGAACTATCAATGTCAGTGAATTGGCAAAAAATTTAAACTCAATTTGTATGCAGGCCTGCGGAGCTTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAA:1 - chr3L 21448613 5' + opus 7196 2 70.34 GTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAG:1 + chr2L 22641331 5' + HMS-Beagle2 6949 2 64.58 GTTGAGGTTGATCACCTGGTAACTTCTGTTTACATTCTAATTCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr2R 18807722 5' + jockey 26 1 72.60 AAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3L 17447549 5' + Tirant 63 2 64.83 GGTGCACTTGTACTCTTGGCCATGTGGAGGCCGACTTAATCAATGGAAACGCTGGCAGGGAATGGGAATGTATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr3L 4185630 5' + blood 68 2 52.05 AACCGTAGGTAAACACACTTAACGCTTTTCCATTTACCGGGTTCTTTAGGCCATTACCCATTGCCTGTTTAGGTATTCAGGGGGCATCTCCATTAAGAAAGCCAACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTG:1 + chr3L 3098554 5' + G5A 2638 1 66.44 TAATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATTCACATTTTAGTTATAAATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr2R 8305321 5' - blood 7342 2 56.94 TGCAATACCCAATTTGAGCAGCTTATTTCGTTATTTCGTTTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 20290654 5' + roo 42 2 56.85 ATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGT:1 + chr2R 8747030 5' - R1A1-element 5096 1 73.97 ATGGATGCATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chrX 4789087 5' + 297 30 2 65.75 CTCCGGCGGAAAAGTTCGATCTTACAGGCAGTTAGCCAAGGAATCGAGTGGATTTACTATTACTTATGGACTTATGCACCCTATAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAA:1 - chr2R 9164088 5' + 412 7433 2 55.48 CCGACTCGTTGAGGATCACTACATCTCGAACATGTTTTTTCGATTTGACCAGGTCGAATGCTTTTTCCACACGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTG:1 + chr2R 17455988 5' - roo 8671 2 51.37 TAATGAGATAACAAATTCTCTCAAATCTGATGGTGCATTGTAAACACTCCATTTCAGCAGTGCACTGAGTTGTTTCAGAGTTTTCCTGTTCTTTTTCCTTACGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGG:1 - chr2L 6197947 5' + roo 260 2 69.18 ATGCGCATTTCCATTGTATCAATAATTGCCAATGTTTCGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 + chr2L 8392991 5' - I-element 5273 1 73.29 CCCATGACCCCGGACCAGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr3L 17447587 5' + Tirant 8121 2 75.37 GTACTTTCCCTGCAACATGATTGCCTTTACTCTCTTTGTGTGTGTATATAAAATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAA:1 + chr2R 20388378 5' + Bari1 1488 1 69.86 ACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGTATAGCAAGTTCTA:1 + chr2L 18370350 5' + Doc 46 1 59.09 AAATCGCAAATTAGACTTCCAGATTTTAGAGCGTTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2 + chr2R 7534558 5' - roo 9040 1 64.38 TTTGGACTGCATTTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr2R 21056677 5' + Tirant 8168 2 59.59 GCCAGACATGCCCTTATTTGCGCTGCCAGCCAAAACGTCCAGTGCATAAATTATATATGCCAACAACACAAATTTTTCGCTAAATACCCTTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3L 6774276 5' + pogo 30 1 63.70 TGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr2R 9164848 5' - 412 420 2 67.12 AGTACAAAAACCCACGCACTCAAACAGACTTCAAAGCCCACACACTCGAACATATTCAAGGCAATAGAACCGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACCCACAATATTTGCAAAC:1 - chr2R 20382665 5' - Bari1 1683 1 51.37 ACTTATATATATCTCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAA:1 - chrX 9951432 5' - hobo 2858 1 70.55 GGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2R 24338323 5' - 1360 3352 1 59.59 GTCATGGTGAACATGTTCAGACCAATGAATAACATAATGATTATATCGAATTTCTTATCGGTTACTATTTCAAAGACTATTGCTTGTGGTCGCCACTGGAATGGTAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAG:1 + chrX 16471390 5' + P-element 426 1 77.40 GCTCATCTCAAGTTTCGGTGCCTCGAAGATGTAATATGAGAAATTAAATGGCGCGTGCTCTCCAAATGAAACGCAAATACAAGTGTGTTTGGCTGATGTAAATTCTGATGTATACATATCATACTACATACATATTTACATGTTTT:1 - chr2R 9389333 5' - G3 4504 1 77.40 TTTTCAACTGCTTTTATTGCCATGTCATAAAAACAAAGACCGACTTTAAGCCAATTTTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1 - chr3R 18357487 5' - jockey 4919 1 64.38 AGAATGAAATCCAGCCGCAACTGCCCAACTAAGAGTATATATAAATCCGAAATTGGTTAGAGGAAAAAATTAAAAAACAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 18903525 5' + pogo 31 1 64.38 GCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 12355401 5' + hobo 33 1 61.64 ATATGAGTGTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATAC:1 + chr3L 21097080 5' + mdg3 5278 2 67.81 AAATGGGCTCAAATCAACGTCTGAGCTGGCTTAAAACAGCAGTCAGATCTGACGACTGGCAAAGGAAATCAAGGGTTTTTAGACTACAAGCCTATTATTTATGCCCAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAG:1 + chr2L 7668140 5' - copia 4882 2 63.70 CCGGAGCTACGTGAGTTTCCCGCTTTGATTTTGTTTTGTTTTTTCGGATTACGGTTTTGTTTTCGGTTTTGGATTTGGAATTTTTGGTCTGCGTTTTTGGGGCTCACTTTGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 22429085 5' - roo 395 1 75.34 ACTTGTCCACCCCAATCACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2L 1136395 5' + 1360 53 1 63.85 AATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAA:1 + chr2R 7727095 5' + BS 4691 1 58.22 ATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 - chr3R 21150647 5' + Burdock 65 2 67.12 TAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3R 20292408 5' - pogo 2053 1 54.79 GCGGCCATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGGGTGTTAGGGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 17747553 5' + Tirant 13 2 72.60 CTGCTGATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chrX 14692954 5' - Transpac 260 2 55.48 TTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3R 4913626 5' + 1360 81 1 73.79 GAATATTAAATCTTTGATTGCATTCCAAACTTAAAGCAAATACTCTGGGTCACATAGACATATATGACCCGCTCCAAATTTTTGTAACTTAGCCAACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2L 13576103 5' + 297 6598 2 75.34 TCTATATGCTTATGTACGTTGCATGTGTATCACAGAGCCATCAAATTTTTGCATAACAAATCAATGTGATTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGG:1 - chr2L 20950123 5' - flea 4551 1 52.74 GACTTTGGGCACACTTGACCCAATTAGCGCCGAAATTCCGAAATTCAGCCCCAGCAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 - chr2R 23225925 5' - Transpac 293 2 73.29 TCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAA:1 + chr2R 5900813 5' + Bari1 52 1 50.68 GCAAAACGGACGATAGCATTATAGATTGGGATAACTTTAAATACAATTTTATGACACAAGAATGCTCGTTCTAAAAAGTAGAGTACATTCTTTGATTCTAGAAACAGATGTACACAACTTTTCATATTATTATATATACTTATATA:1 - chr2L 5460074 5' + Tc3 284 3 65.75 GTTTTGATGTACACAAATAACTTAACAAGCTAAATGAATCAGTTTTTCCGTATAGTTAATAGTTATAGTTAATAGTTAATAGTTAGTTTAACGACCAAAGGGTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAG:1 - chr3L 3482776 5' + X-element 33 1 60.71 ACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 - chr3L 22635780 5' - hopper2 1552 1 52.74 GAACTGAGGAAGAAAGAGGAATTCTCAGAATCCGTTCCCATTCATACCTATGAGCTTTTGACAGCCCGCGAGGATTTGCTTGGATATGGTCTGACTCATAGTTATATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTT:1 - chr2L 12707421 5' - F-element 145 1 59.59 GTGTGCTATGGTATAAACTTTTAAGATGGAGCTATTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 - chr3R 14097163 5' - transib2 2797 1 63.70 AATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:4 - chr3R 5245665 5' - 1360 3325 1 62.33 TATCCTCAAACTATTTTTGTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2L 3967142 5' + hobo 68 1 63.70 TAAAATTTAAATTTTAACTTGTCCACCCCAATCACATGCTTCCTTCCCCTTTTCTGGGCACCTGCCCTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2L 1136411 5' + 1360 53 1 56.85 AGAGGCAAAACAACGAGCATCCCGATGATCGTACCATCAAATGGTGATGGGGTCGGTATGTATGTCTGCCTGTCTGGGCTCCCCAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr2R 15906369 5' + FB 1 1 79.82 TGATTGCATTCCAAACTTAAAGCAAATACTCTGGGTCACATAGACATATATGACCCGCTCCAAATTTTTGTAACTTAGCCAACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr2L 13576089 5' + 297 6612 2 65.75 GACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chr3L 12250964 5' + flea 37 2 53.91 GACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr3L 13204799 5' + jockey 70 1 61.64 CAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:2 - chrX 14908455 5' + blood 80 2 70.55 GAAAAATAGGAGTATCCTGAATTCTGAGACGATTGTTGTATAGTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTC:1 - chr3R 2999834 5' + McClintock 6028 2 71.92 TTTCTGGATAATGAATATTTGTAAGATCATTTCCAAAAGTTGCATTTACCCTTTTGCCTTGGTTTAACAGGGTAGCAAAGCATGCAACCATTTTCTCCATTATTTTTTGCAAATTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAA:1 - chr3L 12030650 5' + I-element 5168 1 68.49 ATTTTTTGAACATTAGAAAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chrX 13651610 5' + 297 17 2 72.60 GGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 + chr2L 13877687 5' - Transpac 235 2 69.44 CCTTAAATCACTACAAAAAACGTGCTATTTCCACAAATTAAATGAATGCAGTTTTTAAAATGCTTAAAATGAAAAATGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGGCCACTCCAACGGGTAGTGTTTGCCGGCTATGCA:1 - chr3R 13068688 5' - gypsy6 7512 2 50.68 GATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCT:1 - chr2R 10453493 5' + mdg3 5269 2 58.90 CTAAGGCAGTTAATACTTTTTTAAATAAGGCTGTAGTAAGAACTAAACTGTCTGCGAACAGCAGCACATAAACAAAAACCAGGCTAAATGTTTGTTTAGTCGACTTTCTTCTAGGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAA:1 + chr2L 15078066 5' + R1A1-element 103 1 40.41 GGGCAAATTGCCAAATGCAGGCGCAGAAGTAAAAATGGGAAAAACGACATCCGGAAATTTATGTGCTGGATACTGGCACGCGCATGATTCACATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTA:1 + chr2L 18067847 5' - invader4 161 2 63.01 AGTAAGAGCCGTAACCGTCCGTCCGTTTCAACGCAAACTGGTTCAATTACTGGTTAATTATCAAGTAAACAAGTATTCGGAGAATATATCATTTAAGATTTGAAAACCAACATCCAAGAAGAAATTGCCATCATAACACCTGCAAT:1 - chr4 1084169 5' + mariner2 684 1 69.86 ATCCAACAAGTGCGGCATGGAAGTGCTATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chrX 15089471 5' - P-element 2863 1 65.38 CAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTC:1 - chr4 829120 5' - INE-1 141 1 34.93 ATAATTCACATAATTTTCAATGAGCAGCGGAAGCAGTTCCTCCTGATTTCGTTTGTCATTAGGTGGCTCTGGGAAAGTCCCTGAGGAAATTGATGCTCTGGCATATTCATTATGTTTATGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAT:1 + chr2L 11080354 5' + Cr1a 480 1 73.29 CTCCTCATCCACGTCACAGCAGGCCGGCGAGCAGGATGACGACGCCGAGGAGGTGGAGGGAGAGGATGCGGGCGGCGACTGGGACGCCTCCACGTCGGACGGGCATTTCGACTACCTTCTGCATAGAGCA:1 - chrX 14241843 5' + Bari1 1590 1 76.92 GCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 - chr2R 14562286 5' - Burdock 237 2 44.52 ACTTTTTATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chr3L 24153300 5' + Tabor 6873 2 63.01 ACGAAGAATATTTTTTCCTTTACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 4722347 5' + roo 28 2 65.07 TAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3L 17667656 5' + F-element 44 1 49.32 ACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 + chr2R 3009431 5' - pogo 2037 1 62.33 TAGTGTCAACTGCGTGGTTCCCAAAGGTGACTTGCCACTAGATATCTATTGGACACTAAACTCGGCTCTCATTGTAAACGGTGAAATGGGATTCACATTAGTGCGTCTACATAAAACATGTTCAGTGGCGTTT:1 - chr2R 7345269 5' - G4 498 1 77.44 GTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATG:1 + chr3R 907900 5' + gypsy11 363 2 31.51 AATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGAGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTC:1 - chr2R 11329662 5' - P-element 190 1 14.38 CAGAGGCAGGTAGCCGAAAGTAAAAGATAATACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAA:1 + chrX 693658 5' + INE-1 147 1 36.30 AATATAAATATACAAATATACAAAACATTTTTACATACATACATTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACCAAATAAA:1 - chr2L 21750457 5' + F-element 88 1 68.49 CAATCAGCACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3L 13597698 5' + blood 7025 2 76.71 ACGGGAAAACGCAAAAATAAAATCACAAAAGCGTCCGGGAGGCGAACGCTTTGACTTTCGGAGGCAATAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 26399779 5' - roo 356 2 54.11 TACTGCGAAAAACATCACAGAGGCAACCGACCTAAGCAGGTGTGGTTTGAGTAGGCACAAAAGTTGGCTTGTGCGTTTGGAATTAAATAAATAGCAACCAGCTGGCAAATATAATTCTCTTTCCCACTTCTTTTTTTATTTTTTTT:1 + chr3R 19981389 5' - gypsy2 401 1 54.79 ACACAGAGCCGCTTGAGCAGTGGCAACAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 + chr3L 19274759 5' + transib2 31 1 64.38 CACATACGCACCTTATCGCCACCGACAACCCGAACATTTCCCACACACATCCATAACTATCGAATTTATATATATGTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 28724913 5' - pogo 2085 1 65.00 AAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTATGATCCATCACAAACA:1 + chr3L 9571655 5' + jockey 73 1 61.64 GTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 20076827 5' - roo 323 2 84.33 ATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chrX 21639592 5' - Tirant 363 2 60.96 CTCGAAAGCCTTTGGGCCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2R 20461133 5' + jockey 15 1 78.57 CGAATTGTGATGAAAGTTGCGATTAGCTTTCGGCACTTGATCTGCGCCATGTACATGTACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAGGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - chr3R 25354570 5' + 297 6641 2 63.64 GTCCTTCATCAAGTCCATTTTCTCCCCTTTTCCACCGCCTTTATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAG:1 + chr3R 25443042 5' - 297 6906 2 72.60 CATTCATGAATTTTAAATTAAGCGCGCACATTTTACATTTAAAACTGAATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 - chr3R 13494474 5' - opus 7496 2 68.49 GACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 - chrX 19231838 5' + mdg3 58 2 58.87 GCACAGAAAGGTGCAATGCGACCAATACCGATGGGCAGAATAATCAGAGCGCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTATTGCATAATTAGATCTTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTGGT:1 + chr2R 5271273 5' + Cr1a 4329 1 62.33 GAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATA:1 + chrX 21474404 5' + 1731 4381 2 80.14 CGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 9482118 5' - roo 354 2 55.48 AAGGCACATTCTCTATTTCAAGAATATTTCTAGAATCATTGGTTTACCTTATTGGCCCAATCAATAGTATGTAGATTTCTACGGCCAATTTGTATAGCAATTAACCCTCCAATTCCTCCACCTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTT:1 + chr3L 20249576 5' - invader3 470 1 71.23 GGGACCGATTACGGGACCGATTACGGGACCGAGTACGGGACTGAGTATGGGACCGAGTACGGGACCGAGTACGGGACCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTG:1 + chr3R 16535298 5' + Gypsy6A_LTR 19 1 69.86 AGCCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 4869159 5' - roo 340 2 63.01 ATGACTGACAGTGAAAAGTTTTTAAGAATGATTTCTTCAAACTATTTCTTTTAAATTGTGTAATGAACCAATATATGCCTCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 - chr2L 21596585 5' - blood 7323 1 58.22 GGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 - chr3L 3540211 5' + mdg3 56 2 62.33 CTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGAT:1 - chr3R 31071835 5' - opus 412 2 79.45 GTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 22481229 5' - roo 9010 2 63.01 ATGTGGAATAGTAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 - chr3R 21237863 5' + Doc 18 1 72.60 CTAATAAATCCAAAAGAATATACATAATTTCCCAGACATAGGCACTCGGATCTGCCCACATGTGCCACAGTTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAA:1 + chr3R 15459453 5' - mdg3 5482 2 50.00 ATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACCCTCAA:1 + chr2L 1073948 5' + Tirant 8145 2 71.08 ATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 + chr3R 24228884 5' + opus 7067 4 69.40 AAAAGAACGAAACCCAAGGGCTGTCAGTAAGAATTATTGTGCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:1 - chr3R 9148095 5' - copia 174 2 73.29 AACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 - chr2R 22692459 5' + Ivk 35 1 60.27 ACTGTCTGCATTTTCGATCATATGCATAGTACTTATCATGATGTTTACAAGAAGAAGCACCACCATTATCACCCCGGTGGAACTTCCCTTAAATTACGTTCCGGCCATTCCAATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTAGGCTCGC:1 + chr2R 962722 5' + mdg1 331 2 76.71 GCCTCCGTTTTTATTGTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3R 29350812 5' + 297 43 2 54.79 ATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr3R 4884476 5' + pogo 64 1 62.50 AGAGAACAAAAAGTTCTGCCAAAACACCTCAAGAATCGTAGGGATGGGTTGAACTTTCCACTGAACTGAATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAG:1 - chr2L 18018935 5' + blood 249 2 52.74 TGTGGAATTCTTTGGCTTGTGCAATGGCACCCATATATGTGTATATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAA:1 - chrX 12893430 5' + Bari1 74 1 74.48 ATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTA:1 + chr3R 5245593 5' + 1360 85 1 77.40 TTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 + chr3R 25521806 5' - blood 7315 2 69.18 TAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 + chrX 10101346 5' + mdg3 5341 2 75.34 AATGAGAGAAGGAAAGTAAATAAAAATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 26315992 5' + roo 8725 2 60.27 ACGAGGATGCGATTTAAATATTGTAACATTGCCAAAAGCAAAGAAGAAGCAGCAGCAAGAGGCCAATGTGGAGCGAAAACTTTTGCACATGTTTTAATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAA:1 + chrX 12273517 5' + accord 130 2 67.81 AAAACAACAAAGCAGCAGAGAAGCAGAAAGCGTAACGTAACATGTATATTTAGTAGTCGAATTAACTAAATTGTTGTAACATAAAGTGGAAATATGAGCGCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 - chr3R 21570609 5' - mdg3 224 2 69.86 TCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 + chr3R 10778672 5' + mdg3 87 2 76.03 GCAGCAGCGCGTGATCCGTGTCCAAACGGAGCAGGCCCACGAGATCTCGCGCCTGGTGCGCCAGTATATCACCATGGCGCAGATCAGTCAGTATTCAACAATTTTCCTTGAGTTGAGTAAACAATGAGTTAAAAACAAATATATTG:1 + chrX 10963353 5' + Tc1-2 1586 1 62.33 CAACAGGATCGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 10978964 5' + roo 8709 2 53.42 GGATTGCGTATTTTACATCGAGAAGAGCTCACCAAATGTCTGTCGACTGCGGATTCAGTTCAAGTTCTTTGATTTCGTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGG:1 - chr2L 7776831 5' - Rt1a 4891 1 53.10 TTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGGCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGCGTTTTCGGGCTCCGTC:1 - chr3R 5765439 5' + opus 7055 4 53.47 GGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372577 5' - Doc2-element 232 1 26.92 GTTCTCTTGGGTTTTAATATCTCTTTAAGTTTTCGTCCAATTGTTTCTTCGTCGAAATTATTTTCTCTCCAAGTTATTCTCAACTTATTCCTGCAGACATCTACCTTCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAA:1 + chr3L 27397744 5' - invader1 107 2 63.01 ATGCATAAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 18846606 5' - roo 9016 2 59.59 CCAGACGGAGAGCATTGATAAGGCATCCAAGGGGCTCACCCCAGACACGCTTATGGATCTGGGGCGGTATGGTGGGATCTGCCGGTAACTGAACCCGCCTTCTCACTCATCTTATTTATACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCC:1 + chr2L 9338690 5' - Chimpo 4009 1 74.66 ATATTTTTTTATTCAAAGGTATATTTTACATACATTCTTACATATATCATAGTAATGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTT:1 + chr2L 19817792 5' - G4 3809 1 69.18 GAGGGGGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCC:2 - chrX 21667997 5' + gypsy2 5 2 79.45 TTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 + chr3L 16180891 5' - Transpac 5156 2 70.42 AGAAAGACAGCAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr2R 15613878 5' - P-element 2854 1 62.76 CGACCCTCCGCAACTTCCAAAGAACCTACTTATCACAACTAGCGCAACCCACTAACCTAGACTAAACCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGTACACT:1 - chr3L 27391730 5' + roo 137 2 52.74 GCCAGCCATGGCAACAAATGTCCTGCCCCTTCCATTCCATTCCACTCCACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCC:1 + chr3L 12252400 5' - flea 41 2 71.94 GGTTCATTGACGATGCTAATTAAATTACATTAATAATTCGGTTAACTCTGCATATGGCAAAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAA:1 + chr3L 18468346 5' + jockey 4727 1 56.16 CCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr3R 24228997 5' - opus 7466 2 61.64 ATGAGATTTTCGAATAAGCCAATGTACGCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGT:2 + chrX 16853295 5' + roo 31 2 64.38 TGGTCCTGCCACATTCACATCCCCATCCACGCACCTGGCCAAAAGGGCTGAGCCTGAGCCGTGGTTCGTAATGAACGATGCCTGGCATTTTCTTGTTATTTTCTCGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAG:1 - chr3L 5008502 5' + 17.6 6941 1 69.86 ACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGCTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr3R 25753616 5' + hobo 57 1 54.11 GCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:2 + chr3L 16887324 5' + roo 8741 2 71.23 GCGCATGCGTGTTGCGCGCGACTTGGCAGCGATTCGGGCGCGTTTTCCCAGCGATTTTTGCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chrX 19162724 5' + pogo 21 1 71.23 CTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr2R 17986247 5' + 297 6635 2 57.53 CTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr3R 16041125 5' + jockey 89 1 73.97 GGGGCAACCCTCTGACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGGATAGGAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chrX 17258343 5' + 297 6598 2 69.34 TCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAAAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr3R 4464158 5' - 1360 3359 1 53.47 ATAAAACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 + chr2R 3009426 5' + pogo 59 1 63.01 GGGCTAAGAAATCAGGTTGGGCTAATGAAATACAAAGCTTGCAAGGGCAAGAAGAAGAAGAAGACTGAGCACTTTCTTTTCGGCTGCATCGCTTACAACCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 16456679 5' - P-element 2867 1 73.79 AATGGCTACATTGCCAAGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCAT:1 - chr2L 8393107 5' + I-element 5134 1 72.41 GAGAGTGGATTAACTTCAATGTCAACTAGAAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACTTTTATCCGTTTTTTCACTGCGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCGATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr3R 25521954 5' + blood 1 2 78.77 ATTCTGAAGTATCAATTAAAAAGGTGTTTTAAGCCTGATTTAAAAATGAAATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 - chr3L 10370970 5' - copia 185 2 65.75 CCTTTTGTCCCGATTGTTCGGACAGGCGGAGTCAATCAACGGACAAAAGTTGATTTCGCAATTCGCCATAGCCACAGCCATTCGCCATTTGCAATTCGCAGCTCGCATCTTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAA:1 + chrX 14447994 5' + HMS-Beagle 7 2 79.45 AATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTAATATATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACT:1 + chr3R 25384190 5' + mdg3 5322 2 63.70 AACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 25822990 5' - roo 8988 2 77.40 AATCCTTACGAAGAATATTTTTTCCTTTACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTT:1 + chr3R 4722340 5' + roo 8685 2 69.86 AAACTCATATGCGTTATGTGTGCGGCATGCTGGCTAACCGAAATAAACCACTAAATGCGGCCGGAGTAATCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCGAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTT:1 + chr3R 24409934 5' - Transpac 470 1 49.29 GATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAAC:1 - chr3R 27845589 5' - Stalker4 7325 2 56.16 AGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr2L 17069625 5' - 412 7465 2 74.66 AATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGGGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 + chr2R 4561103 5' + Stalker2 7323 2 67.12 GCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAG:1 - chr2R 5022767 5' - Gypsy12A_LTR 70 1 55.48 GTCTCGACTCGGCATCTCGATCGTTTCGCCCTTCTCCACTTCCCATCTTCTGTTGCCGTATGCTCTCTGTCACTGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTAGATTGGGGGATATGGGGGGAGAACGTCTCTCCGTTG:1 - chr2R 979533 5' - gypsy6 270 4 53.42 TGGGGCAATTGGGCAACGCATTATGTCGTAGATTACGGCCTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 + chr3R 12537733 5' + Doc 81 1 71.23 ATACCCACTGTTATAGTGTGTTATCAGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr2R 21078387 5' + jockey 27 1 65.67 AGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAAAAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTGCATGAATAA:1 - chr3L 19339419 5' + Tc1 83 1 66.44 CCGACGATCAGCTGCGCGAGATGTTCAAGCCATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAT:1 + chrX 16363941 5' + roo 90 2 78.77 CATTATACCCCACTGTTTTCTCTATGTACACTTGCAAAAAGAAAAAATGGTTCTTTTCTAAGGATTTCTGTTCTGTAAACTACACTTCATGTTATTAAGGATTTATCGAAGATATATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGAAAG:1 - chrX 13795586 5' + 412 79 2 73.29 GCCAGGACCTGGGCAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr3R 5765290 5' - opus 478 2 71.72 TGGGTTAGTTAAGGGGTATTGGAATGCATTCTTTTGGAAAGGCAGCACCTTGTGCCTGAAGAATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACA:2 + chr3R 14331106 5' + Burdock 6136 1 67.12 AGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr3R 4913650 5' + 1360 58 1 57.53 AAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 14088555 5' + 1360 55 1 57.86 TTCTACAAGGATACACACACATCGGTATTAACAATATTGGAATATATCTGTAGATAGTAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 + chr2R 22671363 5' + jockey 4716 1 56.15 AAAGTCTTAAAGCTCTTTAAAAGTATATTAGATTATTTGTATTAAAAGTTTATAATTCCATCTTTTCTCATTCCCAGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr2R 19263409 5' + Doc 53 1 47.26 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACGAGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGG:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 4884 1 61.65 TAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACGCAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCACTTAC:1 - chr2R 4122888 5' - rover 362 1 80.82 GCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2L 15621967 5' + hobo 37 1 56.55 AAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGA:1 - chrX 11815053 5' - flea 156 1 80.14 GCAATGCCCCTGCTCGAGCGCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chrX 15089595 5' + P-element 53 1 48.25 ATGTACTTTTTATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1 - chr3L 24153304 5' + Tabor 6869 2 65.75 CACCTATAACAGTTTGAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTGCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 - chr3R 13358705 5' + mdg3 47 2 54.11 TAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2L 18581235 5' + roo 26 2 66.44 GAAAACTGAAATGTACTCAAAATGTGCACGAATTTTCAAAAATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACA:1 + chr3R 10791649 5' + Idefix 22 2 70.55 GAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAGAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTCGCACAACTA:1 + chr3L 5514218 5' + Doc 106 1 73.97 GCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGA:1 - chr3R 27786642 5' + Tirant 8182 2 67.81 TTCATACATAAAAATTTATTTCGCTTAAATTGGATTGCATATAACCTAGTTACAACGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATACGAATATTAGAATTCAAAATTTACAATGCATGAGCATA:1 + chr3R 4577446 5' - 1360 191 1 75.34 TACCTGGTGGCAAGTGCAAGATTATGCATGCACACGCACACGAAAGCAGTGGCAGATACCTGATACTGCTGAAGTGTACTTTGACCTCTTTTAGTATATATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGATCTGGCCATGTCCGTCT:1 + chr2R 16611426 5' + INE-1 111 1 63.01 ACTCTACAAAAATCACCCAAAACCCAAATAAAAAAACTACACATTTATAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATATGAATCTAAGAGCACTCTAAGAGCAGATGCACTTGAATCCAACAGAAACGGAAAGCTTTTTCTC:1 + chrX 5920638 5' + Idefix 7181 2 67.12 CCCAGTTCCCCCATTCTTCTGCCCCCACTTTACCCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3L 16887427 5' - roo 9036 1 58.99 CCTAACCGCCTACCATACCAACCCCATTTTGGGGCTTCAACGTATTTCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGGTTCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1 - chr2R 17182842 5' + jockey 4568 1 72.66 CCTTAACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 - chrX 22858955 5' - mdg3 5441 2 56.16 GTTGCAAAATGAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 + chr2L 1073884 5' + Tirant 14 2 73.17 TTTGATGCCGATTACTCAGATCCAGAAGGGGGATGTATGGCGTCTATCATTCCGTGGGTTCGAAATGCATCTGCAGATACGGAAATATCTGTCCCACTGAAAGCTAAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCT:1 + chr3R 6992222 5' + P-element 2772 1 77.94 TATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGCGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGCATAAA:1 - chr2R 22867483 5' + hobo 91 1 74.66 CGGAAATATTTAATTGAAATATATTTAATGATAAAACATATTGGGATATTTAGCCTAATCTCGTTTATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 25823075 5' + roo 8717 2 55.86 TGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chr2R 13574777 5' + diver 87 2 74.66 GTGTGATTTTCAACACGGAACTTCAAAAAATAAATAATAAGAAAGGGGCACGGCATGCATAAAGTGTACGGAGCTTAAAGCCAACAACTTACACTGGATCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTC:1 + chr2L 19855229 5' + F-element 4213 1 55.40 TCGCACGAGACTTTTGCGACTTATGGCGGCCCAATGATCGTAAAAGGAAACTATGTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3R 25753741 5' - hobo 2902 1 60.69 TGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAA:2 + chr2R 16410032 5' - opus 7418 2 78.77 CTAGTGTGACCATATTTACTGTTTTATTTGCAATTTTAATTATTGGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 14136482 5' + roo 4 2 50.68 GATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCATTTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAAT:1 + chr2L 13877665 5' - Transpac 255 2 54.79 GTGGTATGCACTTCCTTCCGCCTTGCGGTTGCACTTTAATTGTTTCTTTGCTTCTGCAAAAGAGTGAGCGACAGGACGACAGGACGACGACGCGATTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTT:1 + chr3R 15917901 5' - invader2 4707 1 59.59 ATAACTTACTTGAATTGTAAGTTTTCTTTTAATTATTGTGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 23449357 5' + roo 8714 2 52.05 TGAAATTAAATTTCAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr3L 11669742 5' - Tabor 461 2 65.07 AACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 + chr3R 6068285 5' + jockey 4742 1 69.86 CTCGCATAATTCGCACACAATGGGATGACGGAGCTCGAGCACGGTGGCACTGGCACCGGCGGGACTGGGATTACGACTACAAAGAGTAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTA:1 - chr3L 21451646 5' - jockey 4796 1 41.10 GTGGTAGCCACTATACAATGCTACGCGGAAATTGGTAGTATACACTTGGTATTCACGACTATTAGAAGTAGCTTTTAAATTTTCTTGTAATCATAGAATTCAGTTTAGAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chr3L 5263304 5' + pogo 8 1 76.71 TTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chrX 14756757 5' + pogo 68 1 69.86 AACAACATGTGAGAGGCGGCTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr2L 13547095 5' + P-element 28 1 66.21 TGTATGTATGTAGTTCAGTTCAACTGCTCTTTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAG:1 + chrX 5439977 5' + accord 53 2 54.79 ACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCTGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3R 20149778 5' - 1360 3339 1 62.81 CTTTGCCGTGCTTCCATAGCCATAGTAACGATAACCATATCGTTTACCCACAGCTACGGCAATTTTGATAGTAGTTTTGTGTTTTATTCCGCATATGGCCAGTTAATAATCTAAGTTATTGTAATAAACCAATATACGCCACCAA:1 - chr2R 7404823 5' - blood 7385 2 75.17 TGGTAAACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCTCAGTTCATATGGAAGGTCAGACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3L 22016851 5' - Tc3 316 1 71.23 ACTTAAACTAACTATGCAAAAAATCGATACGGATTCTCGAATTATATGAAACAAATACTGCGGTTTAGGTAATTGATTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAG:1 + chrX 5075319 5' - invader2 4688 1 52.05 ACAGTACAAGCCATCAGCAGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr2R 982433 5' - HMS-Beagle 6995 2 53.42 CCTCTTTCACCTAAGATCAGCTCTAAAGTGTAATCAACTCTATTGTTTGTAATTCGCATAATATTTTTTTTTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTTAGAAATTACAAGATGATTTCCCAGACCTCCCAGAAACGCAGT:1 - chr3R 22569051 5' + Ivk 297 1 51.37 AGGCATTGATGATTGCATTGCAATTAAAATAATTAAGATTTTCCAGACGGTGTGAGCGTGGCAAAAGGTTGCCGCGGCAGTGAACTCTGACCTCCCAGCACCCAGCAACCACCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTT:1 + chr2R 17983614 5' + hobo 395 1 76.03 GTCCCTCAAGCTGCCCTCGCTGACGTCGAGTCATGTGCATGGAATGAGTTGCAGTTGATGCAGAATATGAAAAAAAATCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTTTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACG:1 + chrX 7257765 5' - blood 7300 2 52.74 ATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 + chr3R 5245543 5' + 1360 35 1 62.33 AAGCTAAGCACCCATTTATTCTTCCTGATAAAATTAGTACACTAAGTTCTAATATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCAC:1 + chr3R 7649778 5' - Quasimodo 7303 2 64.38 AAAAACTTTGAAAACACACACACACACACA:1 - chrX 6030565 5' + accord 7028 2 80.00 GGTCCTCGTTCTTGTGGTTGAGTAGTTTAATGTAGAGGTTAATCTGCTCCAGATAACTCTTGGGTGTAGTATAGTTGTAGCGCCTCTCATTCTGTAGGTACACCTTACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTC:1 + chr3R 21030848 5' + hopper2 1211 1 71.23 TATGAAGTTGTTCTTTTGTTCTTTTGAAACCTTAAGTACTTTTTTTTTTAGAACAATGAATCATGCCCATGTACTCTTTTGAGCTTAAACAAACATATTTCTTAAAAATCGACTAACTCAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAA:1 + chr3L 16263434 5' - Burdock 6241 2 76.03 TTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr2R 20704215 5' + hobo 77 1 70.55 TCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - chr2L 16685394 5' - P-element 2820 1 39.31 TGTATGTGTCTGTCTGCCCTGGCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2R 18882540 5' + roo 33 2 59.59 TAGGCTTGGAAAAGGGTTATATGAATTCCGAAAGTGGTGCATTACTATCTGGAGTCTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 + chr3L 18296912 5' - Juan 4151 1 61.64 TTATTTATTGCTTTTTTCCGTTGAAACATATTTTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGG:1 + chr2L 15142183 5' + BS 4708 1 80.82 AGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAGAA:1 - chrX 4566225 5' + Transpac 89 2 80.14 AAAACCATTTAAATGCTTTCAATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 12608033 5' - roo 9033 1 57.55 GGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 29708932 5' + blood 29 2 59.59 AACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 + chr2R 10478650 5' - invader4 3060 2 64.18 ACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTCTCCATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAAATTGTCTCCAAATACTTTTTAATACTTTGTATGCAAAAACTAATAATTAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGTAAAA:1 + chrX 22564591 5' + Transib5 330 1 59.59 GAAAAGCGAATATAATTATTTAAGCAAGCAAATACAATTGTAAATCATTTCGGGAGTAGGCCCTATCATGTATCAAACCCCAAAGCCACCAATGCTTGTAGTAATACATTTAAATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTC:1 + chr3R 9505706 5' + Bari1 336 1 71.92 CCTTGTCCCGACTGTGTCTCTGTGTGGGTAAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2R 20913064 5' + 1360 13 1 76.55 TGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCA:1 - chr2L 6074054 5' + BS 80 1 78.08 GTTTACGGTCACCCGTCGTCCCAACGTGACCTGTCCTCGGCGAAAGTATTGTTTAATTTATGGTTAATGGTTCCCACGAGTTGCAGAGAAATAAACGGTCTACCCGGGCAGAGATCCGCAGTACCCGGGTAAGGCTAACCAGAC:1 + chr3L 11894656 5' - baggins 322 1 59.72 TCTCACTGTTTGTGCAACCACCTGCAGGCAGTCGGCCTTCCTATTGGCTGGGTCCATCGATCGAGAGAACCGCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr3L 14969190 5' - P-element 2840 1 49.32 GTGAAAATTGAATGGTCACTGGACTTTTTGGGTACAACATTTATTTGAATTGTGAAAAGCTAAGTCTGAAAAGAATGTATGTATTTGAAGTTTACTACGAAGTAGGGAAAGAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 - chr2R 22145633 5' + FB 9 1 73.97 TAAATGCAACACAAAATGGCCGCTGGAAAAAAGGCGTGCCCTTATTACTATGGCGATCAAAAATATAGTGTCTGGAAGTGTAAGGAAATGTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTTACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGC:1 + chr2L 20175212 5' - invader2 4995 2 62.33 ATCTCAGCTTCACTCAACAAAAATTAATCCCATGTGTATAAATGTTTCGCGCTGCGATAAAAAAAATGGACTTTCGCTTTCGCCCCAATATAACCTGTAAAATGAATTCCCATACGCTTTAAAAATAAAAATAATAATAAAAATAT:1 - chrX 13137294 5' + mdg1 32 2 73.29 GGGTTACCCCGGGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 19700856 5' - roo 9026 1 55.48 ATACTATAACGAACTAGCGCAATTATTTTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGTTCCGTTCATATCTTTTGTAAATTAATCGAGAGCGATTCATTATATTTAG:1 + chrX 23043141 5' + roo 75 2 67.14 GTGCAACGGTATAAAAATAACATTATTACATTTACATTAACATTTACATTATAAGAAATATGAGATCACATCTCAGACAAATAGTCTAACCCTACGAGGCACGTAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATG:1 + chr3L 23286184 5' + Quasimodo 7125 2 76.71 GCCATGCCAAGCCCATACCCACCGCAATGCCCCTGCTCGAGCGCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGGGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chrX 15089618 5' + P-element 12 1 72.00 CAGAAATACCATGCCCGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 3524198 5' - roo 9031 1 57.24 GATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGATATAAAAATAGCGGAAACAGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr3R 19446710 5' + copia 4914 2 55.48 GAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATT:2 - chr2R 6984394 5' - HMS-Beagle2 235 2 72.60 AATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3R 22846672 5' + 412 7083 2 65.75 GGGTCTTCAGATGGAAGATCTGTAATTGTGGAATTCTTTGGCTTGTGCAATGGCACCCATATATGTGTATATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 - chrX 12893456 5' + Bari1 49 1 56.85 GTATAAGTTGTTATAAGATTACAACGATTTTTTAAACAAGAAATAATTATTTCATGAATAAATGAAATAGCTATTCTTTTTTTGTATGTGCCAAGGAAAATTCACAATTAGACAGTGTGATTATATAACTTATATTAATTACAATA:1 + chr3L 13068595 5' - Doc2-element 4688 1 76.71 AACTTTTAATGACTACACTGTATAGAAGAGAAATATCACACTAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 + chr2R 6558950 5' - mdg3 5423 2 67.81 TATTGTAGAAATCCCTAGTTAATTCCCTTTCGGTTCTCAAAACAGACACACTAAGCAACAGACAAAATGTACAAAATGTGGGCGCAGTTTTATATCTAACAATATTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATT:1 + chr3L 9495525 5' - Stalker4 7019 4 71.23 AACTGAAGGCAAAATCACAATCGTTAGTCAGATAACTACTTTAAAGTCTAAACTCATGGCATCGCTCGTCCTTGGTTACCATGCTCCTCTCCCCGCCTTACTGACTATTTAATCCATCTGAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chrX 18810008 5' + pogo 6 1 54.79 TCTAAAGAGTAAAGAGCTGTAGAGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chrX 5222830 5' - 412 7512 2 61.64 AAATCAGCAATAATTTAAATTACCTATGCAAGATCACGTAGTGCAAATGTAGTTAATTGTAGTGATAAACTGTGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 - chr3R 21150665 5' + Burdock 47 2 54.79 GAAGAGTCTGCCAATTTGAGCACCCAGATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 - chrX 4566298 5' + Transpac 4935 2 75.34 TGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAA:1 - chr3L 19274864 5' - transib2 2738 1 77.93 GAAATTTTTTTGATTGCCTCATCAACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 53092 5' - roo 9026 1 54.11 AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr2R 2007459 5' + 1360 60 1 51.37 AAGCGATCCCCTTTTTTCTTCTCCAGCCAGCCTTTGTGTGGCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCA:1 - chrX 10728959 5' + springer 20 2 71.92 TTGGCATCGTCATGCTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chrX 14173166 5' + 412 22 2 70.55 ACTAAGCCAGCGCCATGGGCAACAGACACAAACAGAAGGGTTTGCCATGTGCGACACGACACACTGGGAATACTCTGCAATTGAATATTCGATTTTCTGCAAGTGCAGAACACAGCACCCTACCTCTGGTACATATCCTGTAATTT:1 - chr2L 6294971 5' - G5A 450 1 58.90 GCAGGGGTACACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr3R 6103702 5' + Tirant 38 2 60.96 AATGCTAAAGATATAGTTTTCGTAGGGTCATTATATCCCTTACTCAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAATCGTTTCCGATTTTTTAAAGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2L 17362150 5' + 297 6593 2 77.40 ATGCATGGCGGGTTTTCATTTGAGAAAGTCACCCGAAAACGGAGACCTGAACTGCAGGGCACCTTCTCTCCATCGCTATAGAGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chrX 15814484 5' + P-element 29 1 63.77 GCTCGCAATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:2 + chr3R 29708905 5' + blood 7013 2 78.08 TTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3L 20290693 5' + roo 81 2 78.08 CTTGTAGTGCTATAAACATTTACATGGCATTTATTTGAAAGATTCCTTTAGAATATGGTAGCAATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACA:1 + chr3R 4913504 5' - 1360 181 1 73.97 AAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1 - chrX 10960303 5' - Transpac 255 2 57.24 AGAAGAAGAAAGCTCTGCTACCTTCGAATGAGTTAGAATACTGCTAAGAATTATTGCTTATTTCAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr2R 9815008 5' - pogo 2051 1 55.48 AAATGCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAA:1 + chr3L 14854668 5' + rover 54 2 59.59 TCATACTTGTCTTGCTCAAGCTCTGCCCAAAATGTTATATTTTAAATCATATAAAATGTTCGTTAATAATTTAAAACTTTCGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGT:1 - chr3R 10981711 5' + R2-element 125 1 56.16 AGTCTACAGAGTTGCTTGCTGCGGTGCAGACCTCGTTCGGATTTAAGCGCTTCGTACATAAAATACGAAATCCGATTCGTGGCAACCTAACTAAAAACAAACTCTTATCATTGAATATAAAATATGCACACACACACACACACACA:1 + chr3L 160806 5' + accord 7028 2 69.18 AATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACA:1 - chr3R 31120253 5' + opus 82 2 76.03 AAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr2L 13547071 5' + P-element 53 1 49.32 ATTACATAGAATTAAGTTCTTTTTTTTACATTTAATAGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chrX 11228632 5' + roo 83 2 75.86 AGACGTCATGGGGCCAGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAATATGAATATAAATAGAATACAAAACGAAAAATGGGTTTCAACTACAGTTATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAG:1 - chr3R 2474408 5' + Juan 3993 1 69.86 GCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTTATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3R 14088673 5' - 1360 3347 1 55.48 AATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 2519889 5' - roo 8996 2 71.23 TGACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATGTTGTTATCT:1 - chr3R 23449319 5' + roo 8752 2 76.71 CTTAGCCATTATTATACTCTGTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chrX 21668715 5' - mdg1 361 2 59.59 TTAATTCCTAAATGCAAAAATAGTAATAATAATAAAGAAACTCATTTACAAACTTTTTATCAACTTTTGCATGTTTAAGTTTTGTCCTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGGTT:1 - chr2R 9867214 5' - roo 374 1 61.64 GGCCAGTAAAATCCGGATATAATTAATTTCATAAATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3R 26782693 5' + hobo 53 1 56.85 TACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGGC:1 + chrX 18707452 5' + BS 4764 1 50.00 GTGGCCCGACACACAGAAACAGCAAAATTCCCAATCTAAACAAAATTCAAGGGAACCAACCACTTGCTGAGTGTTCACTCTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGC:1 + chr2R 3921263 5' - rooA 312 2 59.59 TTAATCGCGGCCCAACCAGAAACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGG:1 - chrX 19505388 5' - P-element 131 1 19.18 AAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAAT:1 - chr2L 1449670 5' - opus 421 2 72.60 GAAGAGGCAATGCCGGCAAAAAAGATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2R 20500157 5' + 412 7096 2 54.79 GTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAGATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 22481252 5' - roo 8987 2 77.40 CAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATTATCT:1 - chr3L 21093209 5' + Ivk 98 1 73.97 AAATCTAACAATTTTTTCTTTTAAAATTTATAATTCATTTTGAACAGATTAACAATGTAACAGTAAGGATGGCAAATCCAGGACCCCCAGCTGCATTGCTTCGCGAGGACGATCAGGATTTGCTTACTCGTAGACCCTCCTGGCTC:1 - chr2L 22562022 5' - Rt1c 5285 1 69.18 GTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3L 9242080 5' - roo 9001 2 65.07 AAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTCTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTGCTTGAATGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAATATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTT:1 - chr2L 2436615 5' + Cr1a 439 1 55.48 CGGGTGGTTGGGGGTTGGTGGTTGAGGGAGTTTATTATGTGAGCCAGTTGAAGTCGATGCTGCTGCTTGCGCAAAATGCAATTATTAAAAGTTTTTCAAGTTGTCCGCTCCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 + chr2R 13657612 5' + flea 4763 1 80.82 CGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 + chr3L 21097117 5' + mdg3 5315 2 58.90 TTTGTTTGGACTGCATTTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2R 21056673 5' + Tirant 8120 2 68.63 CTGGTAGACATGCACATATTCAGATTTGCACATTTGAACAGAGCGGAGCGCATAAATGAATGAACGAGTTCAGGATGCTGTCAGCCATGGGGATCATGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 20552920 5' + roo 8686 2 69.18 TTAAAACTGCATTTTAGGCTCAAGTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2R 16409976 5' - opus 7474 2 67.12 GATTCGAGCGGTAAGGTGCGAAAAGAAAACTCCGCCCAGCCGATAGGCATCCAAACACATCGTGTTTCGTTTGCTGCATAATTGAATTTAATTATAAATCATCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr2R 23312949 5' - Tabor 7303 2 65.07 TAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr3R 24479247 5' + 412 7140 2 76.71 TATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 18846595 5' - roo 341 2 67.12 TGGCATACCGACGCATTAAATATGTAGTACAAGTGTTGGTATGACAGATTTGTACGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGTCGCAGCGTCTATGTCTCTGGAAACTGTATGTTTAATCTCAACTTCTTAGCTTCTTTAGTTCCTGAGATC:1 + chr4 632800 5' - INE-1 150 1 60.27 CGTATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3R 4913676 5' + 1360 32 1 62.33 GAATGCTGCTTCAAAACTTGTTGACCTTTAAAGAGATAAAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chr2R 15392861 5' + blood 7016 2 79.45 GAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:2 + chrX 17614386 5' - roo 9001 2 66.44 AGTATACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 + chrX 13762576 5' - P-element 2802 1 26.90 CGACAACAAGCTGCAGCAGATACGTATCCAAACGAGATTTGCTGACAGTCTGCTGGACGAGAGACCTCATCGATTTGACTTTTTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAGTTGCACACC:1 - chrX 13040080 5' - Rt1a 4875 1 57.53 CCTTCGAATGAGTTAGAATACTGCTAAGAATTATTGCTTATTTCAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr2R 9815028 5' - pogo 2033 1 68.75 CCTTTTTGTCGAATTGTGATGAAAGTTGCGATTAGCTTTCGGCACTTGATCTGCGCCATGTACATGTACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3R 25354579 5' + 297 54 2 59.59 ATAGAATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2L 17162755 5' + blood 53 2 54.11 AGCCGAGCGACTGCCGAATTGCGATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr2L 20561520 5' + P-element 29 1 65.07 ATCGACATTGGCGCGGAATTAATACGATTTTTATTCATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 9938557 5' + roo 23 2 70.14 CCCCCATTCGCATTCACATTCACTTCCTCGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr3R 10467962 5' - opus 475 2 69.86 GAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3R 25271158 5' + 412 46 2 54.79 GGGTATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 4869289 5' + roo 25 2 67.81 ACTGAAAACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 - chr3R 6842684 5' - mdg1 7386 2 56.85 AACTTTATTAGCTACGCCTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3L 22529829 5' + roo 8734 2 65.75 AACATAATTTTGATTGTTGTAATAAAAGGGTAAGCTTAACTATAGCAATATGGTTTATTCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 + chr2R 20462781 5' - copia 192 2 65.07 CTGCAGCACCAGACGCTCTTGCCCGTCAAGATGGGTGAGCCACACGCATACACGAATCACACACACGTTACACACACACATCCACGCCCACAAAGCTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCCGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2L 8103470 5' - pogo 2077 1 62.33 GGATAACTCAAATACTTTTTCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2R 14705739 5' - roo 9031 1 54.79 GATATCGTTTAATTAAATGGTTAAAAGATATGGGCTTATACCTACCATAAAGCAAACGCCACATTCTAAATAATCGAAATGAAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACAT:1 - chr2L 4789117 5' + Porto1 4208 1 59.59 GTTATTTTACCCTACTGGCTAAATAGCCAGTGATTACATCAGATCTCTTGGCCTCTGTTCCCGAATTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGC:1 + chr3R 6279462 5' + Cr1a 227 1 54.79 AAAATAAAAGGAAATTCGTGGAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATC:1 - chr3R 9289438 5' + HMS-Beagle 11 2 75.18 TTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 - chr3L 3979677 5' + opus 172 4 60.27 TACCAACTGCAATAGCTGACGCACCGGAACAGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCCGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTATTGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTCTAAGT:1 + chr2R 9164818 5' - 412 7525 2 62.10 ATGTGGCAACGCTTTGTCGTCGCTATTGGTCGAGTTTCATAAAAGCCAGCTTTGTACGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCA:1 - chr3L 12336422 5' - mdg3 5477 2 39.73 ATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 + chr2L 19878165 5' - mdg3 178 2 64.38 AGAGATTCAGTTCCTCGCGTCATGTCCAGTCCAGTAATCTGAAAGCAATCATTTCCCATTTCAATAATAAAAAGAAGATCTATTTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3L 4023590 5' + pogo 33 1 63.01 CAACAGATATGACAGCATTGTTGTAAGGTAGGTGGGGGCATGCGATTTGGCTGAGGGTAATATAAGACTGACACAATTTAGTCAGCAAAGTGTTGTTAAGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr3L 8067463 5' + copia 21 2 69.86 AAAAAATGCTTGTTCATATCGTTCATATGCACATTTAATTGGTCATTTACAATTGGTTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 + chrX 14914318 5' - mdg3 5466 2 63.01 AGCGTACGAAATGAAAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 9951319 5' + hobo 25 1 68.28 GCAGGATGGCTGGCTAGCAGAAGTTGGGGCAGTTGCGCCAAGGCGACAGAGATGGAATCGAACGGGGAGCAGCAGCAGCAGCTCGTTCTCAATTGGGGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCC:1 + chr3L 13723354 5' + blood 399 1 65.00 CAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCA:1 - chrX 19231821 5' + mdg3 80 2 71.92 CGACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATTTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr3L 131820 5' + P-element 60 1 45.21 CAAACAAACGAACATATTTGTCTTTTACTCGGAAAATGGGGTTTACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chr3L 16264723 5' - Burdock 214 2 57.53 CATCATGGACTGCATAGGCAACCGAGTCGTTGTTATCCTGGATCTGCTCCTTCACATAACTTACATCCGCATCAATGGATATGTAACCTTCAATAACCTTCGTTAATGTACAGGTCGTTATGAAAGTTAGAGATTTTATTAAGTAA:1 + chr3L 17817346 5' - gypsy7 415 1 57.53 TTTCAGCCTAAAAAACGTTTTAGATCGACCTTAAGTCGGCTTATCACCAGCTGCCAGATAAAATAATACGTTATACAATTAAGTCGCTACGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATTCTGAATCTCAATCTTATAGCTTTTATAGTTCC:1 - chrX 126967 5' - INE-1 157 1 61.64 TGGCGGCATTCGTGTTTGTTTGCTCGCTTGTTTGGCTGAAATTCGCTGGCTTCGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2R 6585369 5' + pogo 15 1 75.34 ATATCCTCATATATATTCAATTCAATCATATCCTGTCGGTTTTCACCAGGAAACTGGCTCTTTTGCCATTGAGCAAACAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCT:1 + chr3L 10269287 5' + Tirant 8298 2 50.00 TAGGGAATATCAGTCAGCAAATACAATAACTTTTTGCGCATGTATTGGGGTTATTTTTGAAGAGTTACTTGGAAATCAGCACAGAAAAAGTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCTTTGT:1 + chr3L 10076280 5' - X-element 4683 1 60.96 ATGTGCCGTGCGTATTTGATAACTGACCGCCGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3R 19545291 5' + jockey 33 1 67.81 CTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 + chr3R 4885335 5' + 1360 75 1 77.24 CACATTTCATACACACTCTAAACACTCTAAACCGAAATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 4722532 5' - roo 402 1 80.42 CAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chrX 14385149 5' + blood 59 2 56.16 TACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 9616600 5' + roo 74 2 82.17 CACTTTCCACTTTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr3R 5765455 5' + opus 7038 4 60.84 CTTAATACTGGAATAGATTACGCAGGTCCTTATTATGTTAATTTTTATAAGAATAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACACACACATACATTGCTTATA:1 + chr3R 19447213 5' - Stalker4 7241 4 76.71 ACTGGAAAGATGCATAGTCGAGAAAATAATTACTCAATTAAGCAGGAAGCCGCTGGCTCCAACGGGCGCACAATGCCGTCAACTGTCCCCCGTTCCAAGCTGGCATTTTTTTTGTGCACGAAACGAGTATGTATGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 21998909 5' - Quasimodo 41 4 73.29 ATAATTGATGGGTCTTCAGATGGAAGATCTGTAATTGTGGAATTCTTTGGCTTGTGCAATGGCACCCATATATGTGTATATACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:1 - chrX 12893465 5' + Bari1 40 1 53.42 GTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 24479248 5' + 412 7139 2 76.03 TCTATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTA:1 + chr2L 18370321 5' + Doc 53 1 52.74 TCAAGGACACATCTAACTGTCGGTAAAAGAATACCCACTGTTATAGTGTGTTATCAGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr2R 21078357 5' + jockey 9 1 79.45 CATATTCAGATTTGCACATTTGAACAGAGCGGAGCGCATAAATGAATGAACGAGTTCAGGATGCTGTCAGCCATGGGGATCATGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chrX 20552906 5' + roo 36 2 59.59 CCACCCGCTGGACACCGAAAAGTATGCAGTGCGAAAGTGTTCGTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 + chr2L 15920105 5' - jockey 4920 1 70.55 GTGTGGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCT:1 - chr3L 14863909 5' - Transpac 221 2 75.34 ACTACGCTAAATTCATGAATGAATACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGAAGGCAAATATTTTTTACCGCACCAGGCAGTGATTAGAGATTCAAGCCTTACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATG:1 + chr3R 19445129 5' + 1360 3351 1 77.78 TAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGCAAAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATGTATGCCCAGCTACAACCACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACG:1 + chr3R 22516037 5' + R1A1-element 5206 1 68.49 CATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGCAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 9938592 5' + roo 8724 2 58.22 GGGAATGACCACAGACCACGTCCTACCAGCATTACCCATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 - chr2L 6406592 5' - transib2 2783 1 56.16 TATCTGAAGGTCTGAAGGTTTGAAGGCCTTTCATGCCATCAGCAGCGGCGAAAAGCAGGACAGGGGCGGATTGTGTGCACCTGATGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGG:1 - chrX 562639 5' + Dm88 416 1 60.96 CATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 9241988 5' + roo 8723 2 63.01 AATGGAAAAAAAGGTTTGAAATTTTAAGGGTTTTCCGGTTTCCAATTGGATATTGTTGCTACTATTCATAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCA:1 + chr3R 13056721 5' + jockey 4811 1 55.48 GGAAAGTAAATAAAAATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3R 26315982 5' + roo 8735 2 67.12 TCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1 - chr2R 6187937 5' + Tirant 8163 2 64.29 ATAGTATTTAACCAAAATAGTTTACGACACTGAAATCAAGGCAAGATCTTTGGTTACAGATTAAATACCATAATCAATCTTCAGGTTTGTATTATGTGTTCCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACTATTTG:1 + chr3L 17882981 5' - hopper2 1289 1 54.11 GCCCACGGGCCGCCAAAGATGTTTACTCTACTATATATTCTGTAAACTTGCCGCCGGGTGTTTTTGGCCTGTTATTGTCAGCGTGCCAGGCAAATGAGTTTACGAGCATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATAT:1 + chr2R 18512967 5' + accord 428 2 73.97 GACTAATTCCCGGCCAAAGGGATTGAGCTAATGCAAATCACATTTAAAACACTGCACCTAAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTG:1 - chr3R 17598732 5' - Tirant 8235 2 52.00 CCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGAAATAAA:1 - chr2L 18689236 5' - Gypsy6A_LTR 238 1 72.60 AATTATCCAATAAAATATTTATTGACTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 11228509 5' - roo 9055 2 74.66 TCACTGGCCTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTA:1 - chr3R 3179377 5' - S-element 1265 1 63.70 AACGATCGACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 + chr3R 7424533 5' - 412 7488 2 56.85 CAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCATCA:1 + chr2R 14385598 5' + jockey 67 1 75.23 GTTGTATAAAATTGCTATTCAGCGCTCAAAATCGATCTTGGAAACAAACAATGCAGCCAGCCGTAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr3L 6774132 5' - pogo 2049 1 54.79 TTGCACGCATCCACCAGCAATTGCACCTTGTGCAGTTTCTTCAGGCTGAAATATATATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chr3R 28725023 5' + pogo 61 1 61.64 TCCGTGTGGCTGCTCGGGCGCCAAGTGCATTGGAATGTGTGGCAGCTGCAATTGTGCGGCAATAAATTATTGTGCAACACGCAGACATCACAAGATTATAAGCACACTACGCATTAAAATGCTCCATACGTCGTAATTGTCGTCGC:1 + chr2L 1246486 5' - Copia1_DM 360 1 65.07 GTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAGTGCGTGAGCATGGGAGAATGAGTGAATCAGAGAAATGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACACACAC:1 + chrX 14961151 5' + hobo 23 1 39.36 AGGTCAGGTCCATTAGGTCGGTTTAAAATAGTATGCCGTTTAAGTCTGATCAAAATGGGTTGAGCAACTCCTTCGAAGTTGCAAAAACTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGGATCGAGAGCG:1 + chr2R 3393411 5' + roo 8724 2 60.27 CTCAAAGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACT:1 + chr3R 23020779 5' - INE-1 567 1 64.38 CTTTGCTGGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 - chr2L 19878266 5' + mdg3 5306 2 54.11 TACTAGTATTCTAGTTTACGCTAACACCCAGTTATAGTTTGGAGATGATTACAGAAAATAAAATTAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATTATTATTAGCGCAAAAATTTTTTGGCAAATCGATAGAAAT:1 - chr3L 25255975 5' - INE-1 310 1 71.32 CTACCGTCGATTGAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 - chr3L 22635803 5' - hopper 1382 1 62.33 TCTGTACGTTTAGCTGTTTGTAGAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 8272403 5' - roo 9027 1 53.42 AATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:2 + chrX 14385151 5' + blood 7072 2 57.53 AAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTA:1 - chrX 983210 5' + 412 73 2 66.44 AGACTGAGATGAGTTGCATACTAATTCCCCCAAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 20076724 5' + roo 8687 2 69.86 GCCTGTGGTTATTGTGAAATTTATAAATTGTATATGTATGAATGTTGGGTGCATTCGCGCTTTATTTTCCATCTTTCACTTATAAATGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCAACGACCCGCCGAAGTGCCATCCAAGA:1 - chr4 174671 5' + gypsy10 34 2 57.45 ACGGAAGCACATGAGAGCATTTGCTGCTTATTCTAAGTTTGATTCAGTGTCGTCGCAACAGCTCAAGGCTGTTTGGTCCTGGCCAAAACTACAACCAAAACCAGAATCAGAATCAAAAAGCTGAGCCTTAGACGTCGGGGAGTTCT:1 - chr3R 28359378 5' - HB 1199 1 58.22 AAGGAAATCAATCATACGGAAATAGATCAACTCGTCGTTGGGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:2 + chr3R 16194068 5' - mdg1 7452 2 80.00 CTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chrX 3524216 5' - roo 348 2 60.27 GTTTAATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2L 1327612 5' + pogo 49 1 53.42 AAATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:2 - chr2L 21192616 5' + roo 8699 2 63.01 AGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCA:1 + chr3L 24153198 5' - Tabor 7237 2 76.71 TAACTGAAGTGTTTGCCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTTTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTA:1 + chr2L 18235391 5' - F-element 4625 1 51.37 CCATGTACGTGCTCAAGCTTATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 - chr3R 3527196 5' - Tabor 7286 2 58.22 GTTCTGATATCTATATTATTCTCAGTGTCGACCAGTATTTAATATTTAATTTATTTAATGTTTATGATAAGGACTTTAAACACTACAAATAGCTTAATACTAGTTTTAATATACAGGATCAGCTTCAACAAGAGAGAACGCTATAG:1 + chr3L 19529590 5' - INE-1 582 1 54.79 AATAAACAAAAAGGAGTAAGGAACAGGAATAACAATGCAAGGGGACACATGTCGTAGTGTGCGTGTGCAATTTCATTTAATTAGATTGCGTTTTAATAATGCCACAAACAAAAGCACAAACACACACACACACACACAGATACACA:1 - chrX 7973447 5' + accord 7034 2 69.18 ACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 15167739 5' - roo 8992 2 73.29 AAGCCAAAAGAAATAACGAATCGATCCCGATGTGATACTAACCACATTTTTAGGTATGTGTGAATCTAAGACGGTTGACCTCGTCCGTTTTTAATTTAATTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGC:1 + chr2R 25128599 5' + Rt1b 146 1 68.99 GATAACTCAAATACTTTTTCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2R 14705740 5' - roo 9030 1 54.11 ATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGAC:1 + chrX 18239375 5' + jockey 4582 1 70.55 TGAAGATACGAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 23099191 5' + roo 53 2 56.16 AGGAAATTCGTGGAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 - chr3R 9289430 5' + HMS-Beagle 28 2 65.07 AGATGACTTTGAAGATAACACAGTAACGATTAAAACAAAGTTCCGAAAAATGGAAAATGTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCAGCCCAACCGACTGAGAGGCGCTGCCGTG:1 + chr3R 2471367 5' - Cr1a 4408 1 90.24 ATGTTCTGACCAATGAATTTGTTCTATTTGAACTCCAACATGGTCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTAGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGAGAGCGAGAGAGCGAAG:1 - chr3L 26569839 5' + 1360 103 1 71.23 CGAATAGAAAACTGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTA:1 + chr3R 9289276 5' - HMS-Beagle 204 2 56.85 ATAAAAGTTTTTGTCTGCTTGCCAGAGGGAATGCTAAATGTACGACAACACTTTCGTGAATGTGTGCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAG:1 + chr3R 21800922 5' + blood 420 1 54.79 GGACATATTTGCAACGACACACTTTACCAAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3R 10143071 5' - 412 471 2 69.86 GCTCTTGACATTCAAATTATGAAAGTTTGGTCATCCAATCACGTAGCCTTGTAGTCCGGATCCGCCCCGCCGAACTTATTACATATATACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chr3R 15465451 5' + mdg3 5287 2 60.96 TATACGAATTGATAGTGTCATACTTGCTATTGGAGTTTGTGCAGATGTTTTGGAAGCCAGTGGATAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 + chrX 5854031 5' - I-element 5302 1 54.11 TTCACAAACCAAAAATGTATCTCTCAATGTGAATGTTTGTGTAAAACATCTGTTTGTCGTAACAATTGCAACAACTACAACAACAACAACCACACTGAACACTCAACGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCAC:1 + chr3R 15296312 5' - Stalker 193 4 74.66 TAGATGGTATAGACATGCAAAGTTGAATTTTACGTAGTTCCTGATGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATT:1 - chr2L 22513384 5' + Stalker2 7324 2 69.18 CACTACTTGATTTTAATACCAAAAAGGTTGAAAAGTAGATAAAAACTAGAAATACGCGTTTAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3L 20711985 5' + 297 53 2 58.22 ATCTAACTGCAGTTCCAATGGAGCAGAGCGAAAGCAGCCAAGGTGATGGAGACTTCTGGGCGTTAAAACTCATTGCCCGAGCGATCCGATCGCACAGTTGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr2L 10032603 5' - hobo 2924 1 72.14 CACAGGAATGGGAATATAGGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTT:1 - chr3R 25384342 5' - mdg3 5497 2 80.14 GCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCG:1 + chr3L 22529756 5' - roo 330 2 72.22 AAAAACATCAAAAAAGCACAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTC:1 - chr3R 27786657 5' + Tirant 8194 2 76.03 CATGCCATGCAGGACGTTTTTCCCATTAAGAGTCATTTCGTTTTCATTTTTCACTTCCTTTTGCAAGGAAAAAAAAAATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3R 14527100 5' + 297 32 2 61.64 CCCTGTCCATGGGACCCAAAAATGTTCACTGATGTCTACCGAAATGTACGAAAATGCGCAAAAATGGCTACTGGCTACTGATTCCCAATAGAGTTGTAGATTGCATTTAATTAAGCAGAAA:1 - chrX 14629382 5' - S-element 74 1 56.20 CGAGCAGAGCGAGTGAAGGAAAGGGCCCAGGCCGAGGCGAAACGTAATAAGCACACATTTCTGGGGGTTCCGAAAGTGAACTTGAATTGTAATTAAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCAT:1 + chr3R 29965184 5' - Transpac 451 1 60.27 AATCTCGGCTTTAATACTTACATATTTATTGCTGATTTAAAAAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 14331274 5' - Burdock 233 2 42.47 CTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCACC:1 + chr3L 14898872 5' + jockey 66 1 58.22 ATTGAATTTTGATTTGATTTGTTACCGTTCAAGATACAAAAACTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGC:1 + chr2R 20015128 5' - X-element 4641 1 67.86 CAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr2R 4939195 5' - 1360 3366 1 32.87 ATGCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chr3L 15321961 5' - Transpac 249 2 59.59 GTCCTTTGCCGGCATTAATTGTTTCTTGGGATCGGCTGTCGAAAGTGCAATCGGATTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGA:1 - chr3R 30731537 5' + gypsy6 2 2 82.19 AGCATTTTTCCAATTTGTTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chrX 3452557 5' + Tirant 13 2 75.76 CCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:1 - chr3L 20925824 5' - Transpac 5142 2 78.62 TACGAATATGCAAGCGGTAGATAAAAGTCTGCAGTTTTTTGCGAGTTTTTCAGAATAATTCTAGCTTGCTCCCCGCATATTTGAGCATATCTTATTAATTATTGAGTATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAAT:1 - chr3R 12850183 5' - Quasimodo 7172 2 72.60 TGCCAAGTGCTCGTTAATTTGATTGATCTCTCTTCTCTCTAGTGTCTCACGCTCTCTTGCGGGTAGACTTGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAGAATTATTCTAGGGTCTTTGTATGTACCATGTAAATTCGTTT:1 - chr3R 4567341 5' + 1360 3152 1 61.64 CACAATCACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTACTT:1 + chr3R 10498790 5' + 297 52 2 53.42 CCTCCACGGCTCCCGACTCGCCCAGCCATCGACCATTGGCCATTGGCCATATGTTGACCCGGGTCGGGACTATGCTGCTCCAGTTAATTACATGATTTATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3R 26782837 5' - hobo 2916 1 70.55 TATTAGAGACACGAGGACCATATTACGTTTGTTTGAGAGATCGTAAACATAATCATTTATGTATGTAAACAACAACAATAACACAATACTACACTTAGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCCGAGCTGGATTA:1 - chr3R 20535835 5' - F-element 4494 1 67.12 CTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCGCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGCACTTACAAACACACCGTATAAAT:1 - chrX 22386762 5' + hobo 92 1 62.96 CGGTTTTCTGTGCATGCTTGCATGATATTAAATACAACACATTTTAACGTTTTCTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACA:1 + chr2R 24696033 5' - Tabor 389 2 63.01 GAAAATCTCTGACTCTCTCCTTGAAGACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGCAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGTGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTC:1 + chr2L 10784778 5' + Stalker2 7439 2 36.76 GCTGACAAAATATAATAAAATATTACCATTTTACTTATTACTTATTACTTCTCTGTGACATCCAGTTGAAATGTTGATATGATATGGTTATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGCAATTTGCAAGCTGGA:1 + chrX 17161797 5' + FB 33 1 63.01 CAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 5446084 5' - roo 361 2 53.42 AATCGGAGACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 - chr3L 16180995 5' + Transpac 43 2 56.16 CATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGGACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1 + chr3R 24479191 5' - 412 7466 2 72.60 TGGCTGTCGAAGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAG:1 + chr3R 16535253 5' - Stalker2 372 2 58.22 GAGGATTGCTCACAGACTGAGAAGCTTGATTAATCTTAAATTTGGCTTAGCACTATTTAATGTTATAATCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATT:1 + chr3R 11276819 5' - mdg3 68 2 53.42 AGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr3R 24228844 5' + opus 142 4 64.03 AAGGGAAAAAACAAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr3R 10079291 5' + P-element 59 1 45.21 CATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr2R 21056692 5' + Tirant 62 2 66.67 TAATAAATGTATTATAATTAAAGTTTAATCAAGAGTGTTATGCTAATACAATAGATACATATATGAAAACGTTCCCGACCGTATATATATATATATTCTTGAATATATTTATATATATTCTATATATTCTTGATAAGGATCAATAA:1 - chr3R 4183685 5' + INE-1 85 1 57.53 GAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 + chr2R 20461205 5' + jockey 94 1 76.03 TGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTC:1 + chr2R 10478675 5' - invader4 264 2 60.27 CATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTTTCTGAGAACAT:1 - chr3L 18920507 5' + Juan 41 1 57.53 ACAGTCCACCTGCATATCAGCCATCCGAATTTGAATCCAAAAATATATGCCAGAATTTCTGGACGACTGCTGCGAGTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr3R 9563573 5' + P-element 39 1 57.53 ATGGGAAGGAAGAATGTGCACTCATCGTTGAGCTCCTTGAGAAAAATAAATCAATTTCAGAATTTAATTGCTTGTATGCAGATAGGTAAAGAAATTCATGTATAAATTAACTAAAGATAAATCGCACCGTCTTGCGATACTGTTGT:1 + chr3L 11596218 5' - Gypsy6A_LTR 379 1 71.23 ATTAATTAAAAGTAGTCTAGTTTTTTTTTTTAAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGGAGCCCCTTAGTGTCCTTCTTTTCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAG:1 + chr3R 12100171 5' - X-element 4618 1 79.45 AAAAAGCACAAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 - chr3R 27786647 5' + Tirant 8166 2 61.48 CGCTGAGTTTTACGTTTTATTTATTTACTTTCGCTCCGCTTTGCTTTGCGTTCGATTGCTGGCACCGGAAAAAAAAGATTCATTGCCTTATTATTTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAA:1 + chrX 18354937 5' - 1360 392 1 54.11 AAAATAGTCCTTATTAAACGATCAAAACAATCATTCCTGTTAATCTTATATTTATTAAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAATTTAATTTT:1 + chr2R 6945620 5' - pogo 2040 1 63.70 ATTTGGGAATTGTTTGCATAACCTCTTGAATACATTTATTTCTTCTGTGTTTAAGTGTTCTAGTCTTAGCTTACTGTTTCCTTCTTTTTCCTTGTCCGAACATACCGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 - chrX 17355118 5' - roo 393 1 74.66 TTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAA:1 - chr3L 19274881 5' - transib2 2754 1 66.44 AACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 + chrX 5222856 5' - 412 433 2 60.27 CGGCAGCGATTTTTTTTCACGTGCAACACACAATGCCAAATAAATCTAAAATATCGCACTAACTCTTCTAAAATTTTGACAAAGCAAATATAGTTTCGAAAACTCTGAAGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTAT:1 - chrX 8160088 5' + Rt1a 4777 1 74.66 CGTTACCCAAGTGAGCTTTGGGTATCGAGTACTGAGGGCCTTGTGCAAGGATTTTCTGCGTGCTGGAGAACTCTCCATCCATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCTATTTTAACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAA:1 - chr2L 4098572 5' + 1360 3011 1 57.53 TGGGGTTTTCTGTGGGGAGGGAGGGGGGTGGGGTCTGCAACTGCATGCCACTGCAATTTGCAATTACCACAAACACGCGGCGCAGAAAACCATAGGCTCGGTGGGCCTCGCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGAGGAACC:1 + chrX 9743407 5' - R1A1-element 4882 1 63.89 ATTGGAATGTGCTATAGTCTCTATCCATCTACCTTTCTAGTCAAAGTAATTTACACTAAATTACATGCGAACAAGCAAAATGAGAAAAGCCTACAAAGCTCTCGCTTATGTGTGTGCGTACTCTTATTTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 5245747 5' - Quasimodo 38 2 76.71 AGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 - chr3R 24228955 5' - opus 7426 2 75.69 TTTTCGGGGGATCCCCCACTCACACACTCACACACACACACATCGACAATAACTGTAATAGTTTAACAGCGTACGCCGAAAAGTATGCTGCGACATTTGGGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCA:1 - chrX 14961162 5' + jockey 122 1 63.89 GTAGAGTAAAAGGGTATGCTAGATTTGTTGAAAAGTATGTAATAGGTAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAG:1 - chr3R 2473817 5' - 1731 4553 1 67.59 AAAAAAGACATGTTTTTCTCGGTCGTAGTCATTTTATTGAGCTTAAACTGGCTTAGTCAAGGTCAATCTCGTCTGTCGAAACTAAATCAATTGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATT:1 - chr2R 6049852 5' - mdg1 7292 2 65.07 GGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGAT:1 + chr2L 5771435 5' + Juan 86 1 73.97 AACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 - chr2R 10453465 5' + mdg3 5296 2 45.52 TTGAGCGATTCGAAATTACTTGTGAAATTGCATAACGCAATGATCAACAAGTCTGGCAACGCCACAGGTTCTCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 + chr3R 14874115 5' + flea 46 2 54.11 GAGAAAAAAAATGTACAAATCGCCCCTCCCCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr2R 14744266 5' + accord2 223 1 56.82 AAGAGCGAGAAGAAGCTAACGATCGCTAGGAAACTTTTGACTGTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 + chr3R 17777451 5' - Cr1a 293 1 76.47 CTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTGGGCGTAGATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGAT:1 - chr3L 18920461 5' + Juan 86 1 68.97 TCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACCTACCTAA:1 - chr2R 10453476 5' + mdg3 34 2 47.26 ATATATAAATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr3L 10814647 5' + 297 13 2 76.03 TAGAAAGCATAAATAATTCAATTATAGCAACAGTACGTGATATCAATATTTCCAGCGCATATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr3R 26765230 5' - mdg3 5480 2 68.49 CGGTAGCCAAGGGATCCTGCAACCGAAACGGCAGGAAGCCCCAAGGAAAAGAGGGCGAACATCATGATGAGGAATGTGCTGGCCGCACGTCTTTTGCTAATAACCATCATCACGGGGTCGGGGATGTCGCGGATCGATTATTGT:1 - chr2L 8856772 5' + aurora-element 4044 1 76.39 AAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCA:1 + chr2L 22641326 5' + HMS-Beagle2 6946 2 61.64 CGTGTGTGTTGCCCAATTGGCTATTTTCTGGTGTGATGTGTGTGGAGTATGGAAGATTATTAAACTTTTATGAAATTCTGTTATTCAAACCATAATCAACGGTTTGGCTTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATA:1 - chr3R 18847431 5' - Stalker2 391 2 72.60 ATATATTGACTTTAACTATAGTTGACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAAGTCATGGAAAATGTAAATAGTTTGAAGTTTTGATATGTAAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAA:1 - chr3L 27391456 5' + invader4 2622 1 66.44 CGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr3L 15371403 5' - Transpac 261 2 52.74 TTTATTATCATCAAAGTGCAGAGCGATATTTGTATGCATGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTCAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAA:1 + chr3L 21635269 5' - Burdock 6241 2 72.60 AAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTC:2 + chr2R 19076553 5' + F-element 254 1 76.71 TAACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chrX 7293303 5' + 1360 70 1 67.12 TTCAAGAGATCTAAAGAGTAAAGAGCTGTAGAGTAAACAAGGGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chrX 5222821 5' - 412 7523 2 67.36 GATGCATGGATTATATCGTTTGGAAACTGAACAACCATTGCAACTGTTACTAATTTTGTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTAAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAA:1 - chr3R 5162228 5' + Tc1 1602 1 70.55 AATAAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTATAGTTGAAATCGATTGTTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTTTTATAGTCAGAATATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAG:1 - chr3L 17846747 5' - Cr1a 4168 1 81.51 ATAGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGTGAACTGCGAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr3R 5940523 5' + hobo 45 1 54.24 GCTCGATTCATTTCATAAATACTTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 11534553 5' + roo 44 2 54.11 CGGGGCGGTGGATCCAAAGGGACTGTTTGGGTGGGTTAGGCTGGCTAGGGGCATCTTCATTGGTCATAAAAAGGGCGTTAAAAATTGCCATGTAAAGGTGGGGCCGGAAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3R 31956923 5' + pogo 8 1 76.03 GCAGACGCGGGTACAGGTCCTACCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chr3L 18708547 5' + F-element 20 1 79.45 CCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTGTC:1 - chr2R 17014101 5' - HMS-Beagle 6965 2 71.43 CAGAGACTCCAGCTGCATTCTTTTGGTTTTTTGCTCAAGTAAAACACAAAATAAAATGTAAGCCTAAGAGTTTGAGTTTGTTTACGCCAGTGTGATTCGAGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTGTAGATTTTGTG:1 - chrX 8390589 5' - I-element 5184 1 69.86 CCGGCAGAATGCCTTGCATCTCGTTTTCCGTTGCATACCTTAAGGCTGCGAGTGTTAGTCTAGCGAAACAATTAATTTCGACATGTTGTTAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 - chrX 22824857 5' + jockey 4700 1 61.64 CGCCTGCTTCCATGGTTCCTGCTGCCACAGAAGCCGCAGCAAAAAGTGGCAGCCAACATTGCTACCAATTATGCGATAAGCGAGAGGAGCATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATGGGAA:1 + chr3R 22135884 5' + Quasimodo 50 2 63.64 CCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCG:1 + chr2R 19076547 5' + F-element 248 1 72.60 AAATGCATTTAAGAGCTTTAAGGGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 21380692 5' - roo 9044 1 57.00 GCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 + chr3L 15321963 5' - Transpac 247 2 60.96 AATCCTTACGAAGAATATTTTTTCCTTTACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 4722340 5' + roo 21 2 69.86 TGATTTGAGCTCAATTTTGTTTTCTTCAAAACGGAATTACTGGTTGATAATCTCACGATTACAGCAATCAGGGTAATCTGCGTTTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCAT:1 + chr2R 6831358 5' - jockey 4719 1 60.27 ATCAATCAAAAATTTAATATATAAACGCGCCTTCTTAGCTATACGAATACTGAAAGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3L 18835288 5' - pogo 2038 1 62.33 AAAATGGTTGTAATGGATTTATCGTATGCAATCTTAAAACGAATTCATTCATATTTTTTCCATTTTTTTCTCAAATTATTTAATTTTTTTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATTTATTTATTTACATTTCATTAAAGCTA:1 + chr3L 18920371 5' - Juan 4174 1 55.48 ATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGT:2 + chr2L 1229582 5' - opus 433 2 65.75 GGAGACAATAAAAGCAGACTACATACGTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 + chr3R 29350668 5' - 297 6938 2 60.27 ATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chr2L 1327506 5' - pogo 2031 1 66.21 AGTTCCATTTTTAAAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 15079980 5' + roo 31 2 63.01 AGCGTTTATCAGAACAACAACAATCACATTAGCAGCAACAATGCGTGTCGCGGTTTTGTTTACAAAAATCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGAAAGC:1 - chr3R 10140318 5' + P-element 15 1 76.22 CTCACAAATGAAAAAGAAATTGTCTATGAGCTGGTAATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 + chr3R 11096654 5' + copia 4907 2 59.59 CTTTTGGCTATCTGGGAGTTTTTCCCATATGCCATGGCATTTCGTTTTCAGCTTTTATTTGTTTATTTTATTTAAAGAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACTTGAGTCAGTCACTTGAG:1 - chr3R 9940300 5' + roo 157 2 58.22 TACCTCCCATCTAAGTTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGCCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTATAAACCTGTCAGGGAGGTCTAGCACGTAAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGT:1 + chr3R 7080678 5' - G4 3676 1 63.01 ATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGA:1 - chr2L 23295860 5' + micropia 5035 2 70.55 ATTGCACGAAGCTATTAAATATGTCGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAAATTG:1 + chrX 11228563 5' - roo 9009 2 60.14 TTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chrX 11534531 5' + roo 8730 2 64.38 CGGGAGTTGGGAGTTGGAAAATGGCTGGCAGTTTGTGTAATTTGACAAGTTCCACCTCGCCGGGAATCCGGATTATAGCGCCTGCCGAACCGTGCTCCTCTGCCTTTCGTTGATTTCTTGGACTACATTGAAGGAAGGGAGTGCGA:1 + chr3L 4867563 5' + Rt1b 4933 1 78.08 AATTTTTTGTTTTGTATTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGTGCGTTTTCGTTTTATATGTTACATATAAACCGGCCGTGGTTTTTGTTTTTCACTCGCCTAGTGCAGTTGCACTAGGGTTTTTTATTTTTTGTTTTTCCTTGTTGT:1 + chrY 36806 5' - gypsy9 464 1 66.43 GATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr3R 31956518 5' + pogo 43 1 55.48 CTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 - chr3L 13597848 5' - blood 7330 1 59.59 GTTAATCTGCTCGCTGAAATATTGCAAACTGACTTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3L 14581503 5' + pogo 30 1 62.77 AGAATCTGTAAGCTGGCAGAGCTGAACTGAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 22255279 5' - roo 391 2 74.66 CTAGAATTATGTTTATGATTTTATTTTATATCTATAAAGCTAGGATACTAAAAGTATATTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTC:1 - chr3R 6828025 5' - flea 4954 1 60.96 CACACAGATGTAATGGCTTACTGTGCGAGTGCCATATAATAATTCAAGTACAAGTGTGCGGGTCTGCGCTTGTATTGTTGTTGATGTGATAAACGCGTCTGGAATTATATCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAG:2 + chr3R 13173201 5' + jockey 377 1 74.66 GATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGA:1 + chr3R 1418286 5' + BS3 195 1 54.79 ATCCAATCACAATGCCCAAAAAAAACCCATAATTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 23449203 5' - roo 389 2 71.23 TTGGATACATTCTTATCCGCAAGATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr3R 29709094 5' - blood 7356 2 60.96 AGAGAGCACAGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chrX 4589410 5' + Burdock 54 2 59.59 TAACAAACTTTTCGCTTCGTAATTTTTTCGATTTGATGCTCAATTTAATGGAAAAGGGAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 - chr2L 17228760 5' - mdg3 5484 2 75.34 ACTGTGCAGCGGAAAATTCACCACGACGGCGAACGGCAACCCAAGTTTGTTATGTTTGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chr2L 10474403 5' - P-element 2823 1 43.15 AGCAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr3R 20905379 5' + pogo 62 1 64.38 TATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 + chr3L 1387125 5' + mdg3 5312 2 55.48 GAGGGAAGATCTTGAAGGAGCGGGACGGGACACAACCACACACACACACATATGAAGTAAAACCAACAGCTTAGGGACTAACCCACACACACACACTTCGTCTGTCCGTATGAACCCCGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAA:1 - chrX 14959854 5' + INE-1 154 1 65.75 GGTTCGAGGAGAGGTCACTAGCGGGTTATATGATATGGGTGATATATTTCCAGCTGCCTCATCAATTGTTCTATCGGTTCCAAAGCTGGAGAATCCCACTAAAGTGGCATTAAAATCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATA:1 + chr3R 11127702 5' + Juan 59 1 77.40 GCAGCAATTGAATTGCCACAACGAGAGGAATATTTCGGAACTCCTACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chrX 9816520 5' + jockey 24 1 74.66 AAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 + chr3R 20149664 5' - 1360 3358 1 58.90 ATAATAAATTGCATAAACTGTACAAAATAGAAAGGAAAATTTAAGAA:1 + chr3R 25935259 5' + mdg3 5020 1 55.32 CTGAAGGATTTTTTAATCCCCAAATTAAGTGCTTGTTGTAAGAGCAGTGCCCTTGTTCTCATATATATTTCAAGTTGGCGAGTCAATAACCTAATCATACTTCGCTTGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCGAAACCAGCCA:1 - chr2R 19354130 5' + 297 10 2 79.45 TCGCGTGTATATACATTAAAACAGCAAGGAGCAGCGGCGACCCAAAGCCAAACTTTCCTGAATATATATCGCTATATAAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr3R 21570423 5' + mdg3 5267 2 75.34 GTACCACCGTCTCTGTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr2R 21380721 5' - roo 9027 1 54.11 CAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:2 - chr3R 20292551 5' + pogo 35 1 61.64 TTGTGAACTCGAATTGCAGAATGCCCAGCAACAGCGGCGATAATACCAACAACTATGGGCTTTAGTTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chrX 17258198 5' - 297 341 2 55.48 CATACAACTTGAGTGTTTTCTTAACTTTAGAAACATTGGTTTTGCAATATGCAGCCATTGTTCTGAAGTTGCTGAGAGCGGAAGAGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGAGAGAGTTGAGAGTGTGTTT:1 - chr4 872551 5' - Porto1 465 1 58.62 TCCTACAGTTTGCTGCGGGTTTTCTCGCAAGATCACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 + chr2L 13884584 5' + pogo 68 1 65.75 GTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTC:1 - chr3R 28033672 5' + diver 78 2 69.18 AATAAAATGGAATGACGCCAGTAAGTATGCTACAATAATCGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCGACTGCGTTTTTCTGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:2 + chr3R 10541190 5' + hopper 4 2 83.56 GTGGCATTGAAATCAATCCGTTTGTCAATCAAGCATTTACACCAATCACGCTTGTGAAACGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 - chr3R 22846804 5' - 412 432 2 60.27 AATAAAACGAATAAAAATAAAAACTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTTATAAATAAATGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATA:1 - chr2L 2283725 5' - blood 155 2 54.96 GAAGGATCATGATCAGTTGGCCAAGGATTCCTACGTGCAACAAGAAAGGGACGGCGCTTGTGAAGCGTGTGAGTGGGACGGAGCATAGTTGGATGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTA:1 - chrX 15674865 5' - Idefix 21 2 63.70 CTGCCAGGAATGGGGCAACAAGGAGCTCACTTCCGCCTGGTTGGAGTGTAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGA:1 + chr2L 9356820 5' - Stalker4 336 4 65.75 AGTGGCGCAGAGTGAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGA:1 + chrX 21474391 5' + 1731 56 2 79.45 CTCGGTGAATATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr3R 24809863 5' + 1360 34 1 63.01 GACAGCTTTGGGTTAAGGTGAAACCTCAGGACCTTGCCTTAGTTACATTTTAATGGCTTTATAAACACTTTATAAAGAATGTTAAGCTTCGAAAGTGATACAACAAGAAACCACGGCCGCTCTCACGCACAAAAACCGCCCAAAAC:1 - chr2R 21873650 5' + INE-1 345 1 67.12 CGCATTGATTTAATAAAAAAAAAATTAAATGGAAAAAAAGGTTTGAAATTTTAAGGGTTTTCCGGTTTCCAATTGGATATTGTTGCTACTATTCATAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGGCT:1 + chr3R 13056694 5' + jockey 4784 1 64.38 AATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr2R 16513143 5' + jockey 90 1 73.97 ATTCTAATATTTTAGTGCCTTGTTTATTTGCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chr3R 25409579 5' + jockey 69 1 57.53 GTTGGTTATATTCTTGTAATCAAAATTAGGAAATGCCTTGATATTAACAACAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:2 + chrX 10960152 5' + Transpac 4932 2 75.34 GCGTGCTGTCAAGCGTGAGAGCTGCATATACATATATCTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCT:1 + chr3R 31071760 5' + opus 75 4 78.77 GATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr3L 3979557 5' - opus 470 2 62.02 AGCAGTTTTTTTTTTCCTGTGCACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 + chr3R 27971011 5' - mdg1 365 2 56.85 CATGTACCAAGGGGCGAAATCACGTCCGAGCGGGGAATTATGTGCTTGCGTGCCGCGCTAAACTCTTAGCCACCTCCTTTTGGCCGAGTTCAAAACGTACTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3R 4659662 5' - P-element 2869 1 73.97 GACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGCCCAGCTCTGATCAGTATATGGCTGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTCTATGATTTATATTTTAA:1 - chr2R 6460795 5' - copia 191 2 61.64 AATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTA:1 + chr3L 24153191 5' - Tabor 7244 2 71.92 CTTTTAGCTCCCCCACATCCTTCCATTCAGATTGAGAGCGTTAAAAGTCGTTAACGACCAGATGAATCCGGTATGAGGAGATTTTGGAGGACAGGAAGTCCAGCAGTTCGTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTG:1 - chrX 9756670 5' - jockey 4859 1 75.34 GAAATAGGTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATA:1 + chr2L 11158631 5' - Rt1b 5076 1 58.90 GGGCGTGTACTTTTTAATTAACAAAACAGCAAAAGCCACAGGAGTGAGTGATGTGTGGCGGCATCTGAAATGGAAATCGGATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTTCA:1 - chr2L 7657881 5' - copia 4659 1 54.11 ATTGGTAGTTAGCCCCACTTGTCTGGCAATTTCCCCCAAACTTCATGCGCTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGCTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTG:1 - chrX 5440074 5' - accord 7239 2 68.49 AAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAAAACAAAAAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACA:1 + chr3R 8963755 5' + 1360 195 1 70.55 CGGTTGTCTTTTCGAGCCTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATT:1 + chr2R 5900776 5' + Bari1 15 1 76.03 TCGAACATAAATTCCTTTAAGTTCGGTTATAATCCTTTATAGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 + chrX 7525001 5' - I-element 5343 1 76.71 AGACGTGTCCTTCAGTTCTCTTTTGTTTCTTTCTGGAGGGTAACACCATTTCCGGTCAGATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 9332074 5' - roo 396 1 71.23 GTAACATGTATATTTAGTAGTCGAATTAACTAAATTGTTGTAACATAAAGTGGAAATATGAGCGCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGT:1 - chr3R 21570573 5' - mdg3 5439 2 55.48 AATTATCTCCCTACTGGAGAATGATCAGAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGCGAATATGATGAAGAAGGGCCATGTAAGACGATC:1 - chr3L 17832337 5' + invader4 2979 2 71.67 AAATACAGTGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 - chr3R 6053091 5' + Quasimodo 30 2 65.75 AAGAGAAAAAAAAAAATGAATTTAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTTAAAGGAT:1 + chr2L 1689346 5' + invader2 327 1 92.73 CGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr3L 9649163 5' + roo 8746 2 76.03 GCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:2 + chr3R 29708964 5' + blood 7072 2 60.96 CCCTTTTTGTGTGGGGTGGCAGCACAAAATGGCATTAAATTAAATAAAGACCCGTGTACGGTTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTAT:1 - chrX 3122057 5' + diver 5960 2 63.01 ATGGAGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 22481215 5' - roo 9024 2 54.11 CAAATAATAATTATTATTCTTTTTTAAGTGCATCAGAATACGACTGACCACTTTTGAGTTCTGTTTAAAACTAAGGTACAATTTCATATTCAGATATTTATAGCGGCACTTCTGCCACTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGAC:1 - chr3R 3080547 5' - gypsy9 165 2 79.45 GATACCATATTGCTTATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 + chr3L 16264587 5' + Burdock 47 2 53.42 GACACTGCAGATAGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr3R 5940533 5' + hobo 63 1 58.90 GGTCGGCTTAAATAGCCGGCAAAGTGTTTTCGTTGTCAGCTCAATTGGCCCGGAACGAGTCAAAGAGATCCGCAAATCCAGTTCGACATACAAGTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 - chr2R 20856331 5' - Juan 4192 1 68.49 TCTATATACAATAATCTTTTGAAATTACCAAAATTGAATGCATGTATTGCATTATATTCAAATACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACA:1 - chrX 19599383 5' + 1360 3206 1 59.59 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chr3L 5685501 5' - pogo 2068 1 68.49 AGCAGCAGATGGAAGCTGGAGGAAGACCGCGAGGAGTTTGGCGGTGTTGCCGAAAATTAATGAGTGGAAGGAGGAGAAGGAGAAGGAGAGGAGGACGGAGAAGGGTATGTGAAGGG:1 - chr2R 4948467 5' + gypsy8 4482 1 61.21 ATACGATAACAAATACAATGGCAGTTTCGATCGGCGCGAGCGAGTTAAAAGCCAAAAACGAACAACAACAACAACAAAGTGGGCAAATACAAGTTGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:2 - chr2L 8103650 5' + pogo 24 1 67.81 TAGTGCGTGATTTACAAGATGCAGAGAGAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2L 9167385 5' - pogo 2098 1 76.92 CACGAATGAGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr3L 20785461 5' - P-element 2816 1 36.99 CCGTCATGCACTACTATCCAGTTCACCAGGCTAAAGTCGGCTCCTATTCAGCAGATCCTTCCGAGGTTAAATACACCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 6754120 5' - roo 349 2 51.37 GGAGTAAGGCTGGCAGGGCAACCCGATCAAAACGAAAAATCAAAGTGTGGGTATCATTGTGTATTTCGTAAATTAGAAGGCCAATTTGGTGGCAATTCCTGTTTGTGATACAATGTTGGAAAAAAGAGCAGATTTTCCGGAAGAGG:1 + chr3R 8590774 5' + HMS-Beagle 443 1 78.08 CGGCCATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGGGTTAGTGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTTTGTGCGCGCGAGTTACCACTCTACCCCCTAAAC:1 - chr2L 17747552 5' + Tirant 8111 2 75.00 CAATTAATATATTTATTTTAATTAAACATGGGCCAGTTTACAAGAGCAATTGTGAAGTGTCATAATGCGCAAAATGAAAATGTTACAGAAATAGCGTGTTTATTCTATCATAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACA:1 + chrX 15197417 5' + 1360 119 1 75.34 TCCTAATTAATTCTTAAATTTCTTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:2 + chr3L 9571594 5' + jockey 13 1 79.45 GCGGCTACTAACTTACTAAAATGTTTTAAAACAAATTAATTAACTTTCCTGACAGCATAAATTTGTAGATATAACTATTCTTCACTTTGGAAATAATTAATTTTAGGAATAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTA:1 + chr3L 13455534 5' + Dm88 146 2 73.29 AATTATTTGGAATGATTACCTCCCATCTAAGTTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGCCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTATAAACCTGTCAGGGAGGTCTAGCACGTAAAATCTT:1 + chr3R 7080662 5' - G4 3692 1 73.97 GGGGACCTACCGAACCGATTGTGTCTAAACGTGGAAAAGGACTTAAATAAAGTCCTTTGATCGTTTCGAGGTGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGC:1 + chr2L 12293745 5' - Quasimodo 194 2 52.05 GCAGATATGATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3R 24229013 5' - opus 7482 2 72.60 ATCGAATGTAAATTATATATATCACCATATTTATGCATGGTAATAAACTAGAGGTTGTTTACATATGTTTATTTTGATTGGCAGCCTATAAAGATTAGTGAAGTAAATAGTTAATAACGTAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGA:1 + chr3R 23437735 5' + Doc3-element 88 1 65.07 AAAGGGGAAACAATCAAATTATAATACTCGTAGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAA:1 + chr3L 21630273 5' + Burdock 6154 2 73.29 AAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAAT:2 - chr3L 3540232 5' + mdg3 5287 2 50.68 GGCAAACAGGACGAAATAATGGCAAAGGATGAGCGAGCTTATGATTGGTACGAGCCAGTGCGATCGATCAAGTTACAGACGTGTTTTATAAAGTAAAACTAAAAAAAA:1 + chr2L 11163967 5' + Doc3-element 168 1 64.81 TGTGGCCGTAGCCGTGACGTGTGGATATTGCGCGAAAGTCGGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAATGTGGTC:1 + chr3L 9426627 5' - P-element 2883 2 79.85 CCTGAGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 20149816 5' - 1360 3369 1 68.22 GCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 + chr2L 11668733 5' - mdg1 7378 2 71.92 TTTGATAAATATTCCGAAATAAACTTTGACAAAGTTGGGACAAGCATAATGCTTGAAGTATGAAGAATGCCATTGCAACAAGTAAATTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTTCCTCTCCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCG:1 - chr3R 17628015 5' - invader2 77 2 58.90 CAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chr3R 4884487 5' + pogo 55 1 55.48 GCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGA:1 - chr3L 4738446 5' + Idefix 74 2 79.10 AAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - chr3R 12578080 5' + jockey 4718 1 51.37 TGCAACGCCATCATCGTCGCCATCAAGAGCACCAACCCGGTCTTAATTGCACGAATTTCATTTTGTTTAAATGTACAGCAATTTGGATTGGAGGTCACCGTCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATAGATGGGTTTATT:1 - chr2R 8304743 5' + blood 7386 2 69.18 ACGGCAAGTAGAACAGAGGCGAAAAGGTAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 18849742 5' + roo 58 2 59.59 CTGTCGGTACTCTCAAATTAGGTTATTTCCTCTTGAAAACTCACTTTACGCAAAATTGGACTAGCAGCATAGTCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr3R 6782691 5' + jockey 4721 1 52.74 ATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3L 20076842 5' - roo 8990 2 76.71 GCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr2L 19424665 5' + Tirant 8169 2 65.15 AAATGTTGCGATAGTTGTAACACTTTGATTACATGTAGATTTCCACTGATTATTATTTTTTCATTCAGTCCTCTTGTTCTGCAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACGTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAA:1 - chrX 4845524 5' + baggins 5049 1 56.85 ACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGGTTTT:1 + chr2L 535417 5' - roo 389 2 57.29 GTGTTTTGCGAACAGATATCAAGATCGTACATCAATGAATGGCAGCTGACAACAAAGCCGTCTCGAAGAAGAAATATGCATACAAAAATAAATCGCAAATTCATTTCTTTTTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGA:1 - chr3L 7991928 5' + 1731 4431 1 76.03 AAGGCAACTGTCGTAAGCATTTTCTTGCTGCTCCCTCCGCTTGCAATTTTCCTTGTTGCCCGCTCTAAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:2 + chr2R 20382476 5' - Bari1 1654 1 54.11 AATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGTCATATATTTATTCAATTT:1 - chrX 3529835 5' - 412 433 2 55.48 AGAGCCTCCAGCACGAAGAAATCCGAACGGTACCGAAGCCATCCCCATCTGCCAATGAGCTGTTAGACGGAGGAGCCCACGCAACAGGCTGCCGAGTGGGTGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTT:1 + chr3R 14096971 5' + transib2 4 1 78.08 TCCAAGAACCTTTTGGACATTTAGCACCTTCATGGATTATAGAACTCGAGAGTCAATGCTCAAATGTTGGTTGTTTGCCATATTGGCTCATGCCAAATCGAGTACTGGACCACAGTGCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGA:1 - chr3R 5618213 5' + G5A 2684 1 60.27 CAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:2 + chr2R 18123413 5' + 412 54 2 54.11 GATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGA:1 + chr2R 19633172 5' + jockey 4605 1 63.70 GCACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 13597704 5' + blood 7031 2 72.60 ATGCCACACAGATATTTCACTCCTTTTGAGTGCCATTAAATATTAATACAAATTTCAATTCATTTACATATTAGCGAATGAGTAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATA:1 - chr2L 9677161 5' + jockey 4976 1 53.42 ATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chrX 983112 5' - 412 7494 2 51.37 AAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr2R 21897989 5' + 412 7101 2 50.68 AGTTGACCAGCTTAACTGCTTGACTAGCTTAAAATCTTCCCAAAATGTTTGTATAAATATACATTGTTTTCATATATCTCAAAGTCCCTCTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr2R 6168215 5' + 1360 31 1 64.38 GATGAAAATCTTGCGATTGCCAGAGTTGGATATCAAATAATAAGGATCATGACATTTCACTTAACACACTTTCATATAATTAATTTAATTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 + chr3L 21819942 5' - Juan 4174 1 55.86 AAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 + chr3R 16535267 5' - Stalker2 7606 2 48.63 ACTGACCCTTACGATTCGCCACATCCTTCTCCTACTGGTAACGCTCCGACGCACTATCTCCTTCCACGCGCGATCTTGCTGTCTCACTGACTGCCCCGCATCCGTGCTCGCGCCTACCTTTTATAGGCCGCATGGATCCCGTTATT:1 - chr2R 4876692 5' - gypsy8 323 1 73.29 GATGTTAGACAAGTTTTCTGCTACAATTAGACGCACTCAACTTTGTTTTGCCGCCTATCATTACAGATTGATCCAAAATTTATATTATTAAAGACTTCGAAGCTGTGTTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTAC:1 - chr2R 11248867 5' + gypsy11 10 2 73.29 AGAGGACTTAGGTATAAGAAGCCATCCAGAATTTCCAGAAGAGAGCGCCGAATAGGATTCCCAGACCCATGTCTATTAGAGGGATTGAAATTTGCGAAGAAGTTAGTGGAAGACGAGAGTACCTGTACTTGCTGGTGCACGCTTTA:1 + chr2R 5265484 5' - gypsy12 10154 2 71.92 ATTTTTAGATTTAACTTCTATAATGAAAGGACCTTGTAATTTAACATTATATACACATGACTTATTAAATTTATATAGACAAAGTATTAGTACTGCCCCCAAATACACACAAACACGCACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chr3L 10706656 5' + accord 185 2 62.33 AGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTATAAAGTGCAGT:1 + chr2R 6984447 5' + Doc 95 1 76.03 ATTACCCTCGTGCAGAGGGTTGATTTCCCAGTCCCGCGACTCGTTATAATTCCCATTTCCATTTACATTTTAGAGTCCACATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGC:1 + chr3L 17443649 5' + Tirant 8063 1 59.26 GTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chr3L 9426685 5' - P-element 2814 1 33.79 GGGCAGGAGGGTGCACCCAGTTCCAGGAGAAACGCCAGCTTCCTCAGACCCGCCACAGGACCTTCGACATCGGTTAAGGCCATGTTGTGCAATGTGACCGGATCTATTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTT:1 - chr2L 13107952 5' - Juan 291 1 72.60 GGCATTTGCAAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCT:1 - chr2L 11867421 5' - BS 5016 1 73.97 AATAAGGCGTAATGGTGGTAAATGATAGTGCAAATAGGAATACCAATATCGTGTGTGCCAATAAAATGGCACTGTCTGTTTGTCAGAAGAATCCAAATTGAAAGCATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chrX 11814929 5' + flea 12 2 77.40 AAATGTACCATCCGACATCAGTGGGCGTATAGCCTCCTTTTGCCAAATATGACACACTGAAATATATGGTCGCGATTTACGGCACATACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTT:1 - chr3L 18936154 5' - Stalker4 95 4 57.53 GAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATC:1 - chr2R 5900900 5' - Bari1 1620 1 79.31 GAAACAAATAATAATATAAGATAGAAATTAAGTAAACAAAAGTAGGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTATACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTG:1 - chr3R 17583388 5' - accord2 7552 2 69.86 CGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr3R 9163948 5' + hobo 45 1 57.69 AAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGGGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 25753596 5' + hobo 33 1 61.27 TATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 + chr3R 11526764 5' - pogo 2042 1 58.22 AAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 - chrX 19231857 5' + mdg3 5296 2 55.48 ATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2L 22746336 5' + 1360 70 1 65.75 AAATACATTCAGTACAATCGAGCTCGAAAAACTAGTGACCCACTAGTACATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 - chrX 2873501 5' - roo 9056 1 75.34 TATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 - chr2R 6052662 5' - mdg1 334 2 73.97 GCCACCATATTTTCCCAGAAATCTGTAGCGGGAGGTCTCGCCCTGTCCCTTGCTCAGCACTAAAAGATACATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTT:1 - chr3R 30082217 5' - 297 222 2 52.05 TATATGCCATGTGTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr3L 15058789 5' + blood 7016 2 54.11 ACTCGCAAACAAACGAACATATTTGTCTTTTACTCGGAAAATGGGGTTTACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 - chr3L 16264728 5' - Burdock 219 2 60.96 GGAATATTTTTGCTGTGTGTAGGCAAAACTGAAGAAGCAGTATTAGGTCTCGCAGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATT:1 + chr3R 11556840 5' + hopper2 1349 1 63.01 CGCAAATTAAATTTCGTCCCGAAAATCTTCTCCTTCCGTTCGAGTTTCGATAACATTATTTGAGAACTGAAAATACAATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 22846663 5' + 412 7074 2 71.92 TGAGAAATGCAACCCTTCCGAAACCACCAGTTCCGTTTTTATACCCTTTACACGTAAAGCAACGTTAAACAATTTTTTCTCATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chr3L 22737331 5' + mdg3 19 2 67.20 CTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:3 - chr3R 6053049 5' + Quasimodo 70 2 71.23 CGTTGAATGTAACTAACTTCAATGGATGCTAGAAACTTCGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chrX 14692816 5' + Transpac 4955 2 61.64 ATAAGCTTTCCCTCTGGAGAAGATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATCTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3L 15261402 5' - pogo 2080 1 69.86 TACTAGATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3R 3322569 5' - 1360 3341 1 53.42 GAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAG:1 + chr2L 22641329 5' + HMS-Beagle2 6949 2 63.70 AGAGAAAAGATACTGACTGCTTAAAGAAACATAAGGGGAAAGTAGTGGCAGATAAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGC:1 + chr2R 3031743 5' - X-element 4456 1 58.46 TGTAATTCAGCTGTATGATTTATATACCATCAAAATCAACAGTACCCGATCCATCGGAATCAATTTCCTCAATCATCATGTCCAGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTT:1 + chr2R 5066501 5' - F-element 179 1 62.33 AGCGAAGAGGATCAATTGCGCATTCTTAGCCAATTGGATGAGGAGACCATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGAGTGGTAGCACAGACTTCAAATTTTGTGT:1 - chr3R 19401518 5' + transib2 2723 1 61.48 GAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAG:1 - chr2L 21403568 5' + G5 4415 1 53.49 ATGCTGTCTTAGTTCGGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 21093281 5' + Ivk 9 1 78.72 ATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 + chr3L 5183719 5' + copia 4953 2 73.97 AGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCG:1 + chr2R 19076556 5' + F-element 238 1 75.59 ATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCAC:1 + chr2R 7404659 5' + blood 23 2 59.84 TACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTG:1 + chr3L 21630324 5' + Burdock 69 2 66.44 AATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 - chr2R 18048907 5' + opus 172 4 65.75 GGATCTCCCTAAATAGCCCCCATTCCACAACCTTTGCATACGCAACTGGACATTATTCACATGCATACTCGCGGAATACACTGTGAAAATATATAGGTGACTTAACAATGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 17179617 5' - roo 351 2 73.97 GACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 + chrX 10571347 5' + Doc 85 1 74.66 ATCGACTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2L 1327479 5' - pogo 2057 1 51.37 ACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAA:1 + chr3L 3979585 5' - opus 7428 2 69.86 GTGTGCTGAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3R 5087132 5' - P-element 2851 1 60.96 TAGGCGCGACTTGGTGTCTGCCTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCG:1 + chrX 292364 5' - G3 4558 1 76.03 AAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 - chr2L 2464314 5' - pogo 2046 1 58.22 TTAGTTTACTGGTTAAAAATAATTGAGATATATGAATGATTTCATTTTTGTATTGAATTTCTTACTAACATTTTTTCTTCTTTTATAAGCAGTAGTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATC:1 - chr3L 14576259 5' + HMS-Beagle2 1 2 65.07 ATATTGTTTTGGATGATAAATGTTTACTGAAAATAGTGTATTTGAGAAAACTTAGATAAATTATGTATGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTA:1 - chr2R 673578 5' - 17.6 169 2 53.42 GAGCGAGTGAGAGAGGGTTGCACGGAGAGACGGAGAAATCAACCACCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAA:1 + chrX 2135575 5' + flea 4740 1 69.18 ATTGTCACAGCCATTTGATTCTCGATTCTGTCGGAGATTCAGATTCAGATTCAGAGAGCACCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAG:1 + chr3L 20834310 5' - Doc 343 1 58.22 AGGTCCAATACCAGACTTTGAATTTTTTAGAGTAAGGAATTCCTCTCTTCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr2L 22746386 5' + 1360 20 1 71.92 ATTTGCATGGCAATCGGTCGCCCGTCGCAGATCCCACGCTGCGAGGAGTGGTAAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr3L 4023718 5' - pogo 2036 1 63.70 GGTAGTTATGATCTGTCTGAAAAGTTATCTCTACACTATCCTACAGTTTGCTGCGGGTTTTCTCGCAAGATCACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr2L 13884546 5' + pogo 24 1 66.43 TTTTGATTTATTTGTTTATTTCGTTTTGGACGGAAGTTGTTAGCCACACAAATTTGTTTTTTATTTTTTTTAACACACTTATACGCCCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGT:1 - chrX 9007864 5' + BS 5033 1 58.90 CAAATGAAACGTGATTATCGTATAAATTATAAAAAATTCAGTATATGTAAAGTTAAAAAAAAGTTTTACACATAATATAAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chrX 11710388 5' + pogo 36 1 64.38 CTCCACTAACAAAACAAACATTTTGCTACTTCGTCGCAGGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr2L 21237233 5' + P-element 73 1 32.86 ACTCCAGCTCCACCCTTTATAAAAGTTAAAAAACAAAAAGCGTAAACGCAGAGGCTAATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGG:1 + chr2L 12351709 5' + hobo 401 1 60.96 ATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chr2L 14222371 5' - Transpac 272 2 60.27 GGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr2L 2519822 5' + roo 80 2 72.60 GAATATGTAATAAATTGGTAAAGTTTTAACTACCCTCTTTTATTTTGCAAAAATACAGTCTAGTAATTTGTAATCATAAAAAAATAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3L 20893687 5' - mdg1 7424 2 59.59 GGCAGATAGGAGGACGAAGATCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTCCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chr3R 10468121 5' + opus 7158 4 56.85 TACTAGAGCACATTCTCGCTTTTAGACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3L 4710678 5' + Doc 21 1 73.79 TGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3L 22221259 5' + 412 38 2 59.59 TGGCGCATTATCGGTTGTGGTACTAATTTTTATTTGTTTGTCTGTTCTGGTTTTGATTTTGGTTTTGTGTGGCTGTGGCAGGTGGTTTTTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3R 24693688 5' + hobo 33 1 63.01 TTATGGAAAATTCTTGGCGCTCTTTTCACGTCCGCAGGAGTCAGTTGTGTGCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAA:1 + chr2R 18316819 5' + FB 70 1 65.75 CAATTGTTAATAATAAATGCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chr3R 15590095 5' - Transpac 5203 2 68.49 GATGTGTGTGGAGTATGGAAGATTATTAAACTTTTATGAAATTCTGTTATTCAAACCATAATCAACGGTTTGGCTTATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1 - chr3R 18847397 5' - Stalker2 7605 2 50.68 GGTGAGATGAAAATCTTGCGATTGCCAGAGTTGGATATCAAATAATAAGGATCATGACATTTCACTTAACACACTTTCATATAATTAATTTAATTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAA:1 + chr3L 21819937 5' - Juan 4178 1 58.90 ACGCTTAGTTGTTTTAAAACATTGTTACTTTAACCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTTTACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGA:1 + chr2R 16193765 5' + INE-1 544 1 50.68 AATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGA:1 - chr3R 6103682 5' + Tirant 8165 2 56.85 ATATATGCCAGAATTTCTGGACGACTGCTGCGAGTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 + chr3R 9563615 5' + P-element 81 1 28.77 ATCAACTCTGTTATGGGTGTGTTATTCAAAAAAGAATGGTTGCGCAGGCTGTGGAATGAGATATAGTTTTCCGGATTGGCAATACCCGCCTCCTGCAGGCGGGTCATTGGGGATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTC:1 - chr2R 6253709 5' + Stalker4 7018 4 72.60 TCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTT:1 + chrX 292429 5' - G3 4505 1 67.12 TAAAGAACCTACCTTGCTGTTTCAATACTATTTGGAAACTATTTCGAGAGTGAATTAGTACACTACGAAACCAATGTGCTTTGTGTGCCGGTGATAGCCGATGATTTCAAAATGCATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGC:1 + chrX 715500 5' - invader4 119 2 73.29 GCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAA:1 + chr2L 10089746 5' - 297 322 2 76.03 AATGGTTACCCCAACGCGGGCTAACGTGGCCAGTAAAATCCGGATATAATTAATTTCATAAATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3R 26782666 5' + hobo 26 1 69.18 TTAACTTAATTATTTTCGGCTTTTTACGCACAGTTTGCTACGCAAATGGCTGTGAATTATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 + chr3R 25521794 5' - blood 7329 1 60.42 GTTATCTGCCTTTTGGTATCGTCGGCGTCACGACCCCGGCCGCCCCGCCTCGTCCAGCAACCCAACGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGAC:1 - chr3R 31071904 5' - opus 7485 2 70.34 TCGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGA:1 + chr2R 4260423 5' + micropia 5215 1 47.26 TTTGCAAACGCCATTGTCTTTTACAGCAAAAATAATATTGATAATTAATTTATTTTTAATTTAAATGCTAATAATAATAGAATATAATTTTTAACAATTCTTTTTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3L 15059009 5' - blood 360 2 69.18 TTTAACGATGTAAACTAAAATAATAACGAATTAAAGGAACTCAATTTCTACTGTATGTATCGATAAGCGGCATTTATTGATTACCCACTATGCCTGACACTAAATGGAATCAATTCTCAGTGCCCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAA:1 + chr4 215687 5' + invader3 359 1 54.79 CATTTAAATGAGCTTGTCAAGTTGGATTTCAGCACATTAATCACCACGCACATCCAGAAGATACATATATATATATATATATATCTCTATATATATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 - chr2R 14553363 5' + mdg3 25 2 55.48 ACCAAAGCAGCTTGGTTGCCTTGTTTGGCGTCTGATCAGGTCCTGGTACCTTTATGGCTTTAAGGCTCCTCGCAGCCCATAGGATGTCGGGCTTATGGGACGATAAAAAGCGAGATTGGTCTCA:1 + chr2R 4932707 5' - G7 264 1 72.58 CACGTGTGGCCATAAAAAGTGGTGGTACACCGATTGTACGTTAGATGGTCGATTATATTCCGCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr2L 14796950 5' + I-element 56 1 56.16 GTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 23449270 5' - roo 8986 2 76.71 ATTTACTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 15514641 5' + 412 7090 2 59.59 CATTTAAACATGCAGAAGCTGGGCGTTTGTGCATGTGGCGATGCAACTTGGTCAGCCGCACACACATAAATATGTACGTACATATATGTATGTACTATGTGTATGTATGTATGTATGCATGTATGTATGTATGTATGTAGTATGTA:1 + chrX 14443270 5' - 412 7273 2 80.82 GATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:2 + chrX 14385160 5' + blood 70 2 63.70 CATGCAGCGCATGATTTATGCCATAAATTGGTTCAAATATTTATCCACATTTATGACGATTTTCTAGAGCGTGCGCTTTGTTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 13276418 5' + roo 11 2 78.62 CGCCTATTACACAATCCGAATAGAGGAAATTTCACGCAAAAAATGCGATTACCACCAATAAAAATATCACACACAAAAAAACACTCCTTAATACTACATCTATACCTGTTACATTTTAAAACTATTACATGGCGACCGTGACTCGG:1 - chr3R 8686710 5' + Stalker 403 1 60.27 ACTGAAAGGCACGACCATGACGACCGAGAAGTCGCCAGTGCACAGTGGGGCTAGGAATGCGCTAAAAACATGGTTCATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 13843677 5' + roo 44 2 52.05 GCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chr3R 13494421 5' - opus 440 2 67.81 ACAACCGATTTTTGTTGCCAGCTTTATCTCCTAATGGCGGCCTTCATTATGCGCTATTTGGCAACGCATTGTGGGTCAGTTTACCTTGGGCCACCATCCTTCCACCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 + chr3R 23570384 5' + jockey 4754 1 73.29 CATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 + chr3R 5245596 5' + 1360 61 1 74.79 CTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCACATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGAC:1 - chr3L 16180945 5' + Transpac 84 2 78.10 GCCCAACGTGCCGGTCCCCAAGTTTGTTGTCGCTCTTATTATTTTAGTTGGGTAGTTCTCGCTAGTTTCTCCTGTTTGCCACAGCACAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAAC:1 - chr2L 16371475 5' + jockey 4956 1 61.64 GATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2R 18123427 5' + 412 7121 2 63.70 TGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCC:1 - chr3L 14863910 5' - Transpac 222 2 74.66 GAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 8542678 5' + roo 8727 2 61.64 ACCACGACGAGTTTCTGCAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 23099052 5' - roo 9041 1 63.70 AATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 12608053 5' - roo 9006 2 63.01 GGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCTCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 + chr3L 13722048 5' - blood 7313 2 80.15 AATTTAAAACATTTTGTAAAAATGTTTTTTTGGCCTATCAGAACAAATATCCTTGGTATCCTATGTCACCTACTCTATTCACAAGGTGTTAGCAAAGACACTAGATACATTGGTTTGGCATTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 + chr3L 22964267 5' - 1360 3334 1 59.59 GGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr3L 3979547 5' - opus 7468 2 61.81 TGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3L 10814617 5' + 297 6624 2 55.48 TTTTTAGAGCTTTTAAAATTCATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAAAGTGGGCAAAAGATTCCAGTTTTCAAA:1 + chr3R 20001611 5' - FB 42 1 55.48 AGGAGAGGTAGATAAAGGCGAAGCAAAGATATGGATAAATGAGATGAAAAAGAAAACTTAAACAAAGTAAAAAACCTGTTACATTTTTTTGATATATTATTAATGATATTAATAATATAAAATATATTAATAATTAAAAAAAAAA:1 + chr2L 4032083 5' + Doc 4692 1 72.41 GCATGCGCAGCCATCTAACTGCAGTTCCAATGGAGCAGAGCGAAAGCAGCCAAGGTGATGGAGACTTCTGGGCGTTAAAACTCATTGCCCGAGCGATCCGATCGCACAGTTGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr2L 10032591 5' - hobo 2930 1 77.40 AAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCG:1 + chr3R 31907347 5' + Tirant 8181 2 69.86 GCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 + chrX 21639633 5' - Tirant 8429 2 71.92 GCAAAGTAATTTGTTTAGCCTCCACCATCGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 + chr2R 14553183 5' - mdg3 237 2 75.52 CGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGC:1 + chr3R 11461771 5' + 17.6 64 1 64.38 CTACACAAATTTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 5446065 5' - roo 9044 1 66.44 GTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 19450047 5' + roo 8744 2 73.97 CACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGT:1 + chrX 12893358 5' - Bari1 1627 1 72.60 CGATGTGCGATTCCCAGTTTGCGACAGTGTCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGT:1 + chr3R 20137204 5' + Burdock 6152 2 73.29 ACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 - chr3R 25384279 5' - mdg3 184 2 59.03 TGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr2L 14262898 5' + blood 7096 2 75.34 TGCCATTGCAGTTGGGAAATCTTGTTGGCCGGCAAGCAGCCCGTGCACCACCGCTCTATATCCTGCACGGTGAAAAAGGAAGCGAGGGGACTTAAGGCCTTGAATCTTTTATGGTTACATTCACGGAGGAGAATCTTAGACCGCCA:1 - chr3L 3973919 5' - baggins 5044 1 55.48 CAGACGCTCTTGCCCGTCAAGATGGGTGAGCCACACGCATACACGAATCACACACACGTTACACACACACATCCACGCCCACAAAGCTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr2L 8103479 5' - pogo 2068 1 56.16 AATGCAATGGCAATGGATCGAATGTTTTTCCCATTCGAAAAAAAAAACGCTAGCAGAAAAACCTAAAAAAAAGAAAGGGTTAAGGAAAACGTACACTTAGGGGCTTTTGCACTCAGGGAAAGGCTTGATGTACAACCCAACAG:1 - chrX 12306395 5' + jockey 4662 1 77.62 TTCTCAACCTCGATCCACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGGAAGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr3R 25271125 5' + 412 13 2 75.34 AGTGAACGAAGGAAAAGAAGAGAATAGCTAAGACATCTAACGACGAGGAAGTTTAGGGCGAAGACTTGAGGTTGAGGCGCATAAGGTAAGGCTTGCTCAAGTTATTGCCCTGCAGTTGATTCTGTAACATCTTG:1 + chr2R 544748 5' + HMS-Beagle 14 2 64.93 CCGGAGCAGTGAAGGAGTCCCGGACTCGCCGGCGGAGGAATGAAAGGGAAGTGGAAAAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 22675798 5' - roo 9017 2 58.99 GAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACA:1 - chr2L 10032726 5' + hobo 76 1 68.49 AACATAAGGAGTAATTTTTTAAGATTATCTATGTATCATATTCGCAAGGTGGGTAACCTATTGACGATTTATAGCCCGTTCACATATGATTCGCCTGTGATTCGCCTGTGTCAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chrX 14173358 5' - 412 7537 2 77.40 AGGCGCCCGAAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTTGCATGGGTGATGAGCAATAGAGTGGACGGGTTCACTGAAGACGCGGAAACAACAAAAACGTAAGTGTGATCC:1 - chr2R 10991394 5' + jockey 63 1 47.92 ATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 + chr2L 18370341 5' + Doc 73 1 64.38 ACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chrX 14136560 5' - roo 336 2 65.07 CAGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTA:1 + chrX 18239347 5' + jockey 4554 1 51.37 AGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAA:1 + chr3L 20747098 5' + Burdock 66 2 65.75 TAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2R 24338466 5' + 1360 6 2 74.76 AAAGATATTTGCTACCACAATCCTATCCTACGAGGTAATAATCCGGCCGGAGTTGTACGCAAGAAAAATTGGAATGTGGGGTCTGGTGGTTAAGAGCTTTGCAGATGTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCA:1 - chr3R 21844426 5' + 1360 266 1 73.97 CAACAACAATCACATTAGCAGCAACAATGCGTGTCGCGGTTTTGTTTACAAAAATCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:3 - chr3R 10140304 5' + P-element 32 1 65.07 TCCATACGCTACGAAGGGCATTCCATTATCGCTACTGATTATTATTTGGTGGCAAGTCGGCGAAAATGATTTCACAAATCCGACAGATGCAACGAACAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 18041766 5' + R2-element 3581 2 68.42 ATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2R 18722023 5' + 412 41 2 54.17 ATCGAGAAGCCCACAGATTTGCAAGTAAGGCATAAAATATCATTCATTCAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3R 4884535 5' + pogo 7 1 79.45 ACTAGATTCGATGAAAAGTATGTACCAGGTAGAAGGATGAGTGAGTATTCGGACTCTTGTTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2L 22211545 5' + roo 60 2 60.00 CGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTA:2 + chrX 14692854 5' + Transpac 4993 2 67.81 TATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr2L 17069513 5' + 412 7083 2 65.75 TTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr2L 2464200 5' + pogo 57 1 58.90 GAATAAAACTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 - chr2R 18048908 5' + opus 58 4 65.07 AAATACTTTTGTAGTTTGACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chr3L 5183654 5' + copia 4888 2 72.60 TTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGC:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10402 1 65.22 TATTTCAAATAACAAGCATTTCTATTGCATTTATTGCATACTATATAGGAATCAAGTATTTGCCCGCTATGCAAGAATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3R 10357872 5' - pogo 2060 1 57.53 ACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 + chrX 17469173 5' - blood 7329 1 59.59 GCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATA:2 - chr2R 2949109 5' + 17.6 80 2 73.97 TGAACTTCGCCAACCGATCAACCATAGGGGCCTTTCTTCACTTTGATGTGGTTGTAAGTCATGGATAACCCTGATGAAATGGACATTGTGGTGAACAGTGTTCCCTTGATCATTTTGGTCCTTCGAGCCGAATG:1 - chr2L 882079 5' + GATE 273 1 74.63 TCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr2R 10315296 5' + Doc 84 1 72.38 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 30 1 55.48 GGAAGTACGTCTTACACACCGCGTTGTCCATGAGAACCACGTCCACTTGATATATGTGCACCGCCAAAGGTCCGCCCTGGAATCATAGAAGCATAGATTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCT:1 - chr2R 22764511 5' + G6 1872 1 69.01 AAATACATTGAATATTTAGAATCGAACGATAGATAGAAAACTTGTAGTCTAAAGTTGATTGTTGGATCTGATATTTTGTAATGCTTTGCATGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGG:1 - chr2L 18779698 5' - roo 8977 2 62.33 ATATTTTTTATTACAATATTTTGATATTCGTTCGCGTGGTGTTTTGTGTTTTCTAAGTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chrX 10538123 5' + pogo 61 1 62.33 ATACGGTTCACCTGAGCTCGGGCATTGTCTAGGCAAATCCCATTTTATTTAATAGTTTTTGTATTTTTTATTATTATCAGAATTAGTAATAAGACATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTA:1 - chr2R 20015203 5' + X-element 31 1 43.84 TAATTAAAATTGTAATTTTTATTTTATGCACAATGTTAGGAAGCCATACTCGATTCACATTGCTGCGGATAGAAAAGACGATAAAATCTGTCAAAACATTAATTTGTCGGCAATGCCCCGCAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGGACG:1 - chr2R 5451429 5' - baggins 5118 1 73.97 TGATGCCAATTCACTTCCTATGGAATGAGTTGCTGGCGGGGATTCACCGTATGCAGCATATGCTCACCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 - chr2L 13877824 5' + Transpac 10 2 76.03 AAGGAAAGTAAATAAAAATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3R 26315984 5' + roo 8733 2 65.75 GAAGAACCGGTACCGTTAAGGGATAATCGCCGTCGCGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTAC:1 + chr2L 8544647 5' - P-element 376 1 27.40 ATACAAAAAAAGTTGAATTTTATTTAACTTCATTACCAATTGGCAATATTTACTTTTTAATTTCATTTAGTGAAATTTTCTTCTAATTAAATTACAACATATTGTTGTAATTTAATTAGAAGAAAATTTCACTAAATGAAATTAGA:1 - chr3R 12261875 5' + Tc3 1351 1 72.60 TTGAAGTCAAATAATTTATAACTAACTATCTATATAAGATAAAAACAAAAAAATATTAAAGCAAAAAGACTGGTTAAACTAAATTATTGCTGTACTCTCCACTATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chrX 12551855 5' + pogo 13 1 76.71 TATATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:3 - chrX 16243798 5' + 412 13 2 74.66 AATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr2L 7215627 5' + 297 6637 2 56.85 GAAATTCAGCCCCAGCAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 - chr2R 23225886 5' - Transpac 263 2 54.74 AGCTGAGAGCAGCAACTGATTGAACGTTGACCGCCCGAAGCACTACAGCTCTATGCCTACTCCACAAAAGGCCGGAAACTTTCAATTCTGCAGCATTGTGTAAATAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCT:1 + chr3R 14089339 5' + mdg1 7175 2 71.23 TGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chr2R 18048778 5' - opus 462 2 59.59 CAAACATGTTTTTAATCTCTTTTAAGCGATTTATTTTGTTTACTTTTCAACTGCTTTTATTGCCATGTCATAAAAACAAAGACCGACTTTAAGCCAATTTTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr3R 18357529 5' - jockey 4962 1 63.70 AGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chrX 5222852 5' - 412 437 2 57.53 AGAAGACATTAAGTTAAATGAAAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATTTATTGGTGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAATTTTATTTCTTGATTCTGCTGCCACTTCTCCAAA:1 - chr2R 5237953 5' + hopper2 305 1 59.59 AAGTTCAAGGTGATGATGAATGGTTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTATGCGTGTGCGTGTGTGCTGGGGGATGCCCCTAATGCTAGACATACAAATACGGATACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr3R 9993500 5' + hobo 16 1 74.66 ATGTGACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTAT:1 + chr3R 20147866 5' + 1360 304 1 56.16 CCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAAC:1 + chr3R 443030 5' + gypsy2 28 2 65.07 ACAATTTAGTTTTGCCTTGTATCGCAGCTCAGCTAGTTTTTCTAATTGTATAGCTTTTGCTTTTCGCGTTGGCGTTTTGCTTTTATTGTTTTTTTTTTTGGCGATTATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr3L 7434795 5' + pogo 11 1 77.40 CATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chrX 14173185 5' + 412 41 2 57.53 TTGTACAAAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr2L 12261116 5' + jockey 28 1 70.55 AGAAATTCAGATAAAAAGCTATACAATTTCATGCCTAGTTAAAATAAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr3R 20452321 5' + blood 7034 2 70.55 GCAATCGCTACGGGGGGGAAATCAAGTCGTACGATACGATATCGCTGTGATAAGCGAGCTATTCATAGTCCACAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTCACGGCAGAACGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGG:1 + chr3L 1739805 5' - gypsy4 6692 2 54.07 CAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 19700881 5' - roo 337 2 72.60 ATTGTTGCAATATGTTAATAAACACCTTTAGCCCAACCATATGTGTGTGTGTGTGGCTCAAAACGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCAGAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAA:1 - chrX 6545289 5' - micropia 155 2 56.85 AAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3L 15058810 5' + blood 7035 2 41.67 AGTTGCCTCCCACCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATAC:2 - chr3R 8049040 5' + Q-element 118 2 66.44 AAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr3R 20452276 5' + blood 7079 2 64.38 ATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATA:2 + chr2L 17550609 5' - Transib-N1_DM 445 1 79.45 ACTCCCTCTCTTAATGTAATTACTCAATACAACATCATTATATATAATTGAATATAATTGAATTATTGCGCTTAAGCATTGCTCTTTATTCTTTGAATATCCAAAACGAACTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAAAACATCATA:1 - chr3R 5899605 5' - springer 121 2 54.86 ACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGT:1 - chr3R 31120262 5' + opus 7076 4 69.86 GATATTGTTTTGAGGTTTAATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 2338188 5' + blood 37 2 60.96 AGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAA:1 + chr3R 20147891 5' + 1360 329 1 73.29 GGATATTGAAGTACATACATACATACATATATACAGCAAGTAACCAAATAACCAAAAAGCTGAAAACTGAGAACTGAAGCGAAAGAGTGATACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGC:1 - chr2R 23572502 5' - Tirant 162 2 55.48 CGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGG:1 + chr3R 3617317 5' - micropia 166 2 69.86 TTTCTCGCGCTTGTTTTAAATGAAATATTTGCACTACTTAAACCACAGACGCTACAAAAAACATTAATAATACCTAGAAACAAAAGCAGCAATAAGAACGACAATCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAA:1 - chr3R 8112292 5' + Doc 410 1 71.23 TATGGCCCAAAGGGTGGACGTGGTCAAAATAATTTTGGTTTACCGATAAAAAATGGCAAAATACATTCTCAAATAAGAAATAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGT:1 + chr4 872944 5' - 1360 3219 1 55.48 AATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chrX 17614388 5' - roo 9006 2 66.19 AACTAAGTCTTGACCACTCTCGCAAAAAAACTACTAATAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chrX 17469298 5' + blood 38 2 58.90 GCAAACGAAAAGCCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 16771455 5' + roo 8704 2 60.27 AATATTACTTCGTCCTACACAGAAGTTGGAATTGGAATCCCTTTGAACGAAAAGGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chrX 14136566 5' - roo 342 2 60.96 CCGGCTTTAGGTAATCGCACTCAGCCATCGGCGTCGTCATCATGATCTTCACTGTCATCTCAGTTGACTGCCCAACAAGGCGTGAATATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTG:1 + chr3L 4506246 5' - F-element 483 1 67.19 TGATAAGTATCTTTTTTTATTACCTCAAAATTATACACTTATACTAAATATTAAGTTATTATTTTGCATAGTATTCCCAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTAACCACTCGACTCACACCCTACAATTCTGCGTGCG:1 - chrX 18149908 5' + hobo 41 1 53.85 GCCCCGACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678167 5' + Osvaldo 18 1 62.83 AGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAG:1 + chrX 4589419 5' + Burdock 63 2 65.75 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTAATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 58.90 ATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 15167770 5' - roo 359 2 55.48 AGCAAATATAAATTAAACTTATTGCGAAATATATAATAGATTGTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTT:1 - chr2R 10163619 5' + Juan 4158 1 76.71 TATAACTAGCTGTCGGGCGGCAGTTATTGAGTTGGTGAACGCAGAACGTGTAACGAACTAAATTGATTGAGGGTGCACGCTTTAGAGACCGGCTCTAGCTGATGGCGTTGGGTGTAGTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTCTTCGT:1 - chr3L 24240833 5' - Gypsy12A_LTR 2153 1 54.79 GTAATGCAGCTGCTGCTGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3L 5490928 5' - 412 7470 2 67.12 GCATGGCTCTCCAATTTCTTTTAGTGCACCTCTCTTCGTTTTTGGGGCCATAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 15590569 5' - roo 9003 2 64.38 CGAGCCGAAGTAGCGCATTTGTTACCACGGACATGTTGTCACACACACACATGGCCAGGGGGTTTTCCCAAAACCCTGCATCACTTGATTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 + chrX 22779327 5' + Transpac 63 2 60.27 AAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCTTT:1 + chr2L 16107290 5' + Rt1b 156 1 57.53 TATTCAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr2L 11668707 5' - mdg1 7404 2 54.79 CTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2R 15080133 5' - roo 9033 1 59.59 ATCGCACATACCTACATATATACACTGAAAGCGCATGCGTTTTTGTTGTTTTTTGGCGCTCCACGCCTGTTCCGCTTCTTCAAGAAATCTGCCAAGATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAAT:1 - chr2R 11633487 5' - F-element 4641 1 65.07 CGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2R 20704230 5' + hobo 18 1 55.88 CCATTTGTACCACCGTCTCTGTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2R 21380727 5' - roo 9033 1 58.22 CTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 - chr3R 9163925 5' + hobo 84 1 78.08 TAAAAGGAAATTCGTGGAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1 - chr3R 9289434 5' + HMS-Beagle 20 2 69.72 ATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr2R 18807785 5' + jockey 88 1 68.49 AATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3R 4722497 5' - roo 9038 1 59.26 CTTACCATCATAAACATAAGCTTTTTGTTTAAAGAGTTTAAGTATAAACAACCTAACTACGCGTTTAACAGCTTAGGGAAATAGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3L 11666051 5' + pogo 36 1 56.16 GTTTTGAGGTTTAATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2L 2338182 5' + blood 43 2 56.85 CCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1 - chr2L 13877758 5' + Transpac 76 2 69.86 GTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 - chr3L 15322069 5' + Transpac 4938 2 64.55 ATAGCCGGCAAAGTGTTTTCGTTGTCAGCTCAATTGGCCCGGAACGAGTCAAAGAGATCCGCAAATCCAGTTCGACATACAAGTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 - chr2R 20856320 5' - Juan 4181 1 60.96 AATTTGCTAATTAACTGTGCCCGCACTTTCGTTATTTTCACTGTTCTCTCGCTTGTGTGGCTTATTTGACCGTTATTCCGTTAATCGTGCCAAAAGTCAACCGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 6226089 5' + roo 8683 2 72.60 AAGGATCTTTTGCCAAGGACTTTTTGAAAAAGAACTACATACACGGCATCGAATTGCTGGGCACAGAAAGGACCGAGCTCTGCTTTCTGTGCCAATACATGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTGTTAAGTTTCAGCA:1 + chr3R 29608724 5' - Tirant 8449 2 65.75 AACAAAACAGCATAGCCGCAATAGGCGAGCACGGTACGGGATACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAGGAATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 - chrX 19498157 5' + P-element 77 1 32.19 TGGCATTCGACTGCTGCATTTGGCTCTGCTCAGTGTACTCGGGGGCACCCTATTCACAAAAAAACACACAAACACGCTTTGTAGACAGTGGCTCGATTGATAGAAATATTAATATAATAATTTTTTTTGTTAATATTCAAACTTAC:1 - chr2L 2407498 5' - P-element 443 1 74.66 GGTATAATGGAACATTGATTATTATTTTGATACCACCACTCAAAAGTCTTGCAAATTAAGTACGCATTTATCTCAAGTAATTTGGGTTCAAATTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAAC:1 - chr3L 14157245 5' - 1360 297 1 63.70 AGATAAGCCTCTGCCAAAGACTATATTTTAAACAGTAGCTGCTTGGTGTGAGCCTTTAAAATCAAGTTATATGTTAACTTGATCATTGTGTATATGTTCAAATATTCAAATATATATTCAAAAAAATATTCAAAAAAAAAAACC:1 - chrX 9382852 5' + TART-A 13403 1 79.17 GAAAGGAAAAGGGAGCCAGCCCAGCAGCAACAATGTTGACGTTAATAAATTATAAAATGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chrX 9710073 5' + pogo 56 1 61.97 GGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2R 20461180 5' + jockey 69 1 58.90 AGCAGCAACTAAGGCCAAAAGTAGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr2L 1136283 5' - 1360 3349 1 58.22 AGTGTATCTATTAATTTATGAACAGCTGATATGGCTTAAATACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chr2L 2357424 5' + P-element 14 1 76.71 GTTTAATTTATTTTATTTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGGACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCTCATCCACAATT:1 - chr3R 18052450 5' - TAHRE 10392 1 63.01 AATTGAAATATATTTAATGATAAAACATATTGGGATATTTAGCCTAATCTCGTTTATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chr3R 25823064 5' + roo 65 2 63.70 ACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCAC:1 - chr2L 22298932 5' + baggins 5218 1 71.72 AACATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGGG:1 + chr2L 18177001 5' - INE-1 539 1 78.08 CTTGTTGACAAGCAGAAAAAAAAAAACGGAAAACGAA:1 - chr3R 10987656 5' + Doc2-element 231 1 62.16 ATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGAGCTTTCGGGCTCCGTCAGCAGGCGAATC:1 - chr3R 10468070 5' + opus 64 4 70.94 AAGTCGAAGAGTCATTTATTTTTTTTGTTTTTGCTTTCGACTCCGCTTGAAAAAGATGAAGATTGCCTTTGGCAAGGTCGTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACTAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCA:1 - chr2R 7770450 5' - micropia 5206 1 56.16 CAGCGGAATTTACCTCTTCCGCAACTGGATCGATATGTTTACACGCATGCGCGGCCAGGTTGGTACTCCACTAGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGTACAACGCC:1 - chr2L 7991394 5' - 297 6932 2 56.85 ATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGC:1 + chr2L 19878170 5' - mdg3 179 2 66.43 AACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAATTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 7424572 5' - 412 467 2 65.33 AAATATTAAAATAGTTATTGAAAAAAATACTGCAATATTAGACATTGAAAATACGGTACCACAATTATACCCTTGAGGCCAAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGG:1 - chr3R 4159510 5' - Idefix 201 2 56.55 CATTTTTATATCCACAAATTCCTACGCTCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGACTT:1 + chr3R 4659551 5' + P-element 91 1 23.29 GATTGGCCAAACGCACAAAGAAAACTAATTAATTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr2R 13276540 5' - roo 320 2 79.31 ATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr2L 17069514 5' + 412 7084 2 65.07 GAAAACCACACGCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTGTTACCACTCGACTCA:1 - chr3L 13227728 5' + hobo 20 1 67.20 ATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCTAAGCTCAAGCT:1 - chr2R 5022754 5' - Gypsy12A_LTR 57 1 63.70 CGGAAAAACAGTGCTCTCCCCTCTGCTAGCAAAAAAAAACAGGTAGGATGATGTATACGAGATATAAAAGGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2R 14708583 5' + roo 8714 2 53.42 ATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr3R 4913669 5' + 1360 39 1 58.90 GGTCGGAAATCAGTTAATTTGGAAGCGCACAAAAGTAGGCAACGTCGAATTTCTTGCTCGCTTTTAATGAGCTCATGTACGCACACACACACACGCTCTGACTGGAAAACCCCGCATGCCAACATGCACACACACACACACACACA:1 + chrX 5548420 5' + accord 182 2 60.96 GGTAGGGGTGGCCTAGTGGAACAAGCCGAGAGAGAAGAGAAGGAGCAAATGACGGAAGAGTCATCTGTAGTACCTAGCCTCGATCTAGCCATGTCCGTCCGTCCGTATGAACTTGAAGATCTCAGGAACTATAAA:1 + chr3R 4547298 5' + INE-1 146 1 50.37 AGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCG:1 + chr3R 10973229 5' + jockey 79 1 72.44 GGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chrX 22386800 5' + hobo 73 1 55.12 AAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTCGTAGTGTGAAGATT:3 + chrX 3506071 5' - Tirant 321 2 73.97 TACCCTGCAACTGGGAAACATACGATTGTTTGTTTTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr2L 16596267 5' + 412 7138 2 74.66 GAGAATTCTGGGCAGCGACTGAATGATAAAGATGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chrX 18365978 5' + jockey 31 1 69.86 AACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 + chr2R 21056698 5' + Tirant 3 2 67.16 GTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:1 - chr3R 14165114 5' + Tabor 6912 2 65.75 GTGTGAGAAGTCGATAGAGAGCGACGGTGGGCGTTAAATCACAATGGCAAACAGGAAGTCATTTTGTTTTGGGCAGCCTGAATGCGACGAATTTAACTGTCGCAAGCCAAGCCCCGAATCTGACAACCATACCTCCATATTGGCGC:1 - chr2L 4125515 5' - BS3 1295 1 58.90 ATTTTAATTTCCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 15080146 5' - roo 9046 1 68.49 CATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chrX 23043131 5' + roo 8735 2 70.55 TAAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2L 10089849 5' + 297 49 2 58.90 AATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 + chr2R 4561103 5' + Stalker2 7323 2 68.49 CTGTTACAGTGCGCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGA:1 + chr2L 19424647 5' + Tirant 58 2 56.16 AGATAATTCTATCTGTAGGTTTTTTTCCACCAACCGATTTGGATTGAGATGTAGGCTTGGAAAAGGGTTATATGAATTCCGAAAGTGGTGCATTACTATCTGGAGTCTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chr3L 18296861 5' - Juan 4202 1 73.97 GAGAGAGCCAGAGAGAGCAAACACAGCTCTGCTCTCGCACGAATGAGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3L 20785424 5' - P-element 2853 1 60.96 AATCGTAAACAGTCACGTTGTGAAAGTGTAGCATACTTTTGGGATCTCATTAACAAACTAAACGAGTACTTTTAGGAGAAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTG:1 - chr2L 19417128 5' + BS 5003 1 54.79 CAAAGCAATGGCAAAATGTTGACACTATGAATTCCTTGTTTCTGATACTGCATACCAAATAATATTCCTGGTACCAAACCTTTTTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGAAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTC:1 + chr2L 16375565 5' + Burdock 6099 1 58.22 AAAATCATATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chr3R 4913681 5' + 1360 27 1 67.12 GGTTTGCCCCACTGTGCAGCGGAAAATTCACCACGACGGCGAACGGCAACCCAAGTTTGTTATGTTTGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGTGAGTG:1 - chr2L 10474413 5' - P-element 2833 1 50.00 CAGTGCAGCTCCTCCTGCTTGCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr2R 7223761 5' - blood 7334 1 56.85 ATCGTGATAACTGATTCCTTTCGGCCTGAGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 20149840 5' - 1360 3378 1 77.78 GCGCGACTTGGCAGCGATTCGGGCGCGTTTTCCCAGCGATTTTTGCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chrX 19162709 5' + pogo 36 1 60.96 GTCGTGGCACAGCGTGAGAAACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3L 10856833 5' + P-element 45 1 54.79 AGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr2R 18882648 5' - roo 8991 2 71.92 AGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTTATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 + chr3R 11121709 5' + copia 4936 2 64.54 ATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 + chr2R 7223667 5' + blood 7085 2 69.18 GTTGGTCCCATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3R 15590651 5' + roo 8736 2 68.49 TGTGGTTTATAAAAACTAAAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3R 23664538 5' - pogo 2091 1 78.08 TGGGAGCTGACCTCCCAGATGAAGGACTACAAGGCGACCAAGCGGATCAAGCAAATATCGCAGCCCGTCGTCCGGGATAATGTCCACATCAACGAGAATCCGGAGAAGGTCTCGTGCCAGGTTATAAAACTTGAGCAGCCAAAAAT:1 + chr3R 22015625 5' + Cr1a 484 1 75.34 CAATTCATTTTATTTTCGACGCAATCATTTACTTTTCGTTCCGGTCTTGTTTGGAGGGGCGTGGCCAAATTGTTTTTAGTATACCGATTGAAATTCAAACAATATAACTGAGAAAAATCAAAACACTTTTCAAAAGTGTGAGCGTG:1 + chr2L 21719158 5' - INE-1 253 1 64.38 TAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAAAGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 - chrX 22386810 5' + hobo 82 1 53.42 TTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:2 - chr2L 8772842 5' + Tabor 6884 2 54.79 CATGTTCCGCTCCTTGCAACTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr2R 14385540 5' + jockey 27 1 67.97 GGAACATACATATGCAGGAAACACATTGAATAAGATTCGTCAAAATAAACTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 7534678 5' + roo 8717 2 63.28 GGTGGGATACAGGTGGACCGGCCACACTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATA:1 - chr2R 5900973 5' - Bari1 1692 1 76.71 AGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 19700896 5' - roo 8986 2 82.88 ACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chr3L 5514201 5' + Doc 89 1 65.07 AGGAAACCAGAACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chrX 8082372 5' + roo 63 2 62.07 ATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATT:1 + chr2R 4561104 5' + Stalker2 76 2 69.18 AGCAATTTTTTCCATGCTTCTGCCGATGTTCTCCTTGACTTTATGAGCATTAACTGCGTGGGCTTAACATTCAATATTTGACTAGATAATCGCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACA:1 - chr2L 21151406 5' + 1360 3206 1 67.81 GCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chrX 15167667 5' + roo 71 2 71.23 TGGGGTAGATTAAAACTGCATTTTAGGCTCAAGTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr2R 16409967 5' - opus 7483 2 73.29 ATCAGCACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3L 13597700 5' + blood 7027 2 75.34 GAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCC:1 + chrX 12893349 5' - Bari1 1636 1 66.44 TTTGTAAAACAGCTTTTAATTGAAACTAACAATTCCCATCACTTCTTAATTTAATTATTATTAATAATATTTAGATCTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 - chrX 14914464 5' + mdg3 45 2 53.42 GGGGAAACGAAACACTCGCAGCAAGCGACGAGAGCGAAATGCAGCGTGCAAGAGCGAGACTGCACCACAGTCAGCTTTTACGACCTCCACGCTCATTCTTCGGCTCATTTCCTGCAGTGGTTGTCTTGAAAGTGCGTCGGCTACGA:1 - chr3R 31812629 5' - Osvaldo 234 1 54.11 AAATAAACTTCGAGTAGCAACATCCCTGGCCGGCAATCGATAAAGCGCCGATATGCTCGAGCGATATATCGAGTGCCCAGTAGTTATCAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCTGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3R 9563726 5' - P-element 2859 1 67.81 GTCTGTCCAAGTGTCAGGTTATTTCCTCCAATGTATATCCATAACGTGGATTCAGTGACGACCTTAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chr2R 1277041 5' - Tirant 8454 2 52.74 ATTTACTGTTTTATTTGCAATTTTAATTATTGGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 14136495 5' + roo 8681 2 41.78 GCTTGGTACACGCTCGTCAAAACATATACACATAACCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr3L 20785527 5' + P-element 83 1 28.77 CGAGTCATATGAAAATTTTTTAAAACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:2 - chr2L 8772869 5' + Tabor 6857 2 73.29 GTCCCAAGGAAAGGGCCATCATTCTCACACTTTGCAATTAGTGTCAGTCCAGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCG:1 + chr2R 13078811 5' + BS 4730 1 65.07 GAACTCGAAATTCCAGGCACATGCGAAGCCAGCAAGGCCATTGCCGTTTTCTCACACTACACTATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGAC:1 + chr3R 14165026 5' - Tabor 7229 2 57.53 CTCTTTCCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCGTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 13204817 5' + jockey 33 1 61.72 CAGCTTCTGCAGAAGGACCTCTGCTTCGGCATTGAAAATGGGCAGGAAGTTGCTGAGAATCTGGCGACCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCT:1 + chr3R 8644851 5' - hobo 129 1 54.11 TAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr2L 19930177 5' + jockey 66 1 58.22 GCGGATCGCTGCAAAAGTTCGAAGTTGGCCAGAATCCCGAACTGACATCTGATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 535536 5' + roo 8698 2 62.33 AGTTATACTTTATAGCTAGAGCTAAGTTTAAGCCTGTTTGTTTGCATGCACTAAACTTGCATTCCATTTTTTTGTCCTTTTGTTTTTTTTCGTTTTTTCTGTTTCTTTTGTATTCATAAAGGGAGACAGAAATAGTTCCTGTCAAC:1 + chr2R 16625992 5' + invader5 106 2 70.55 CGATACTTATCAAATGAGCGACCCAATTCGATGTCAGACCACTCTAACTTGCTGTGGCTGTTGCGGTGTGACCGCAGGACTTAGCCTCAGTCTTTATTGTCAATTACTTCCAAACCGCTAGTTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGC:1 + chr3R 10736250 5' - R1A1-element 102 1 64.14 TTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr2R 6984295 5' + HMS-Beagle2 48 2 52.74 AAGTGTACATCAATCCGGTAGTTTGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr4 311615 5' + 1360 47 1 53.10 CTCGGTTGTTTCCTGAAATTTTCTATTGTACTTGAAGATCGCTGTACCTCCGATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 + chrX 8895170 5' - roo 9042 1 59.59 ACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3R 25271268 5' - 412 426 2 65.07 CTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGCGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2L 14222365 5' - Transpac 266 2 54.79 TATTTCCACAGCGATGTGGGTTTCCCCGGTTAATAGAATTGAAAATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr3R 26765171 5' - mdg3 5421 2 71.92 TTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 + chr3R 10079336 5' + P-element 104 1 14.38 ATGCGTTTGTCGAGCATATTTTAGACTTTTTATGGAGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 22481184 5' - roo 392 2 75.34 ATCTATGTACAATCCATCAAGAATGAATAGTATGATCGTGATCGTAGCTGAGAATGTATAACTAATTTTACAAATAGAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATA:1 - chr2L 22108220 5' + Transib-N1_DM 40 1 50.68 AGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTT:1 - chr3L 21093208 5' + Ivk 99 1 75.34 CTAAATTTCTGAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr4 1149961 5' + 297 6619 2 59.59 TAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3L 13597722 5' + blood 38 2 60.27 TAAATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 8200338 5' + flea 4773 2 74.66 GACTGGGCCACGTTTAATTGAATGTGTTGCCAGTATGATTTTGGCCATCTGACGCATACAAAATTTCTATAAATATGTACGTTATCGTGCCCTGATATCGATCGCCTGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACT:1 - chr3R 28149307 5' + hobo 266 1 78.08 ACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3R 15514608 5' + 412 7123 2 64.38 ATTTTTCAAAAATAGAACGTTTAATCCTTACTACCAACTCCCTATTACTCACTCGCTTAATCCTTCAATCCCCGCAGGAGTATTGCCAATGATTAGCAATCAAACGCCAAACTGCATTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTTTTTT:1 + chr2L 18169166 5' - I-element 5167 1 79.45 CACCTCCACCAGAATGGTGTCTCCTTGCCTCTCTTTCCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3L 13204847 5' + jockey 21 1 76.03 AATTTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 5446072 5' - roo 9037 1 61.64 GTGTTTCGTTTGCTGCATAATTGAATTTAATTATAAATCATCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAAT:2 + chr2R 23313010 5' - Tabor 7242 2 71.23 CCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 + chrX 15089507 5' - P-element 2811 1 33.56 ATCCACACTAGCAGATATCTGAAATCTGAATCGATCCCAAAATGACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGA:1 - chr2L 1074058 5' - Tirant 8491 2 73.10 TTTCATGGCAACCGCTCAATAATTATCAATCGAATCGAACTCGTACAGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 + chr2R 21056689 5' + Tirant 49 2 61.48 TTGTAGACCTTCGGCTAGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr2R 18882664 5' - roo 9007 2 60.96 TTGCATAAATTTGCAGACAGCCAGCCGACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:3 + chr3L 12250920 5' + flea 11 2 77.40 AAAAATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAA:1 + chr3R 23108062 5' + G-element 68 1 61.11 AAAAAAAAACATAAGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAA:1 - chr2R 10478791 5' + invader4 2805 2 51.37 CTTAGTTCGGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 - chr3L 21093274 5' + Ivk 20 1 71.72 ATTTTCTATCGATATTTGACCATCGATTAACTGATAGTTAGGTTTTAAATTTAGTTAGAACTTTTCTTTGTAGCGGAACATCAACTAAAGGATATATATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chrX 16325265 5' - mdg1 398 2 69.18 CACGAGGTCAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 + chrX 3452401 5' - Tirant 356 2 56.16 TTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr3R 9958693 5' - opus 7462 2 73.08 ATTAACAAAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:2 - chr3R 12363269 5' + jockey 65 1 53.42 GGCAATTCACTTTATTTTGGTCTTATAAATAACAATTCGACTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTTGATC:1 + chr2L 19363053 5' - Bari1 1607 1 71.92 GTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr3L 3540215 5' + mdg3 52 2 59.59 CTGTTGAAATAATATTTGCGATCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATA:1 + chr2R 20362215 5' - diver 149 2 67.81 AAAAAAAGTTTAAATACACCAAACATACTTCACCATCACTTCGGTAGTCTATCTATCTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 - chr3L 59619 5' - I-element 5291 1 60.96 TTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGGCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 - chr2L 15965277 5' + blood 86 2 75.00 ATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 20076877 5' - roo 361 2 54.79 CGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr2R 7223653 5' + blood 7071 2 59.59 AAGTTTACAGTGGGCAACTTTAAACAAATATATATGTGGGTGTGCTACTTTTGGCTAAGAAGATTACCCACTGTACAAGTTGCTGGGCCGTCAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 + chr2R 21897817 5' - 412 493 2 77.62 TTCGTAAAGTGGCAGTGTGCAGCAACAGCTCGCAGAAAGGTGGCAACGCTCGCTAACAGACCGAGAGCTCCACTAACAAAACAAACATTTTGCTACTTCGTCGCAGGCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAT:1 + chr2L 21237166 5' + P-element 12 1 77.40 ACCATCCACACCAACCAGCACCGATACTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3R 24693520 5' - hobo 2920 1 73.97 TCTGAAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr2R 22692469 5' + Ivk 25 1 67.12 AACACTCGCAGAGAAAAGAAAAAGTGTAACAAATTGTGTGAAAAATAAATTGCAATTTTCTCTAATTTGCACCCCATGCTAATTTTCTTTATAAAATAGATTTTGGTGTGGCTTTTTTTCTTGTTTTTTCTTGTTTTTTTGAAGGT:1 + chr3L 3772958 5' - Doc2-element 212 1 79.45 TGTAAGTTTAACGAGTGTTTTTTTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGG:1 - chr3R 23021033 5' + INE-1 552 1 60.00 TACTGCCGGAAAATATGTTGATGTTGGTACTGGCAACTTTGTCACACAAATTTATGCAAACTTTCACACTTTACTGCACTGGCGGTCAACAACGAAAGGAGTCATCAGCCTGTGTATTTAATTTTCATTTTTTTGTTGAAGTACTT:1 + chr3R 28718269 5' - P-element 2626 1 76.71 GCGGTGGGATTACACAGAAAATCTGGGAGTTTCGTAGTTAGGGGGCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2L 2519957 5' - roo 402 1 77.40 GATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 + chr3L 24153156 5' - Tabor 7279 2 54.11 GACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCG:1 - chr3R 30731463 5' + gypsy6 63 2 65.47 GAGCAGGAAAGCCAATCTCTTTTTAAGCTGTTCAACAAAAAAAAAACTTTCACTTTGTTGCCCAGGACGATCAACGCTAGAAGTTTTGTCCTTCGGGAGGTGGGGGATTACCTTATCTCTGGAAACTTCACAATTCCCTCATATTT:1 + chr3L 6346083 5' + Q-element 28 2 69.86 GTTGGCCTATCTGCTGTCTCGGCCCAGACATTCTCTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 23623983 5' + roo 33 2 64.83 CAACTGTTTTTCCAACACAATGCCGGGGGCGGGGGCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 - chr3R 28033705 5' + diver 5933 2 53.42 GCCCGTTGGACATTCAAATATAAACCCCCAACTGCTGCCATATTATAATAGTCGGTTTTAGTCTGCGTTGCCATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr2R 14246911 5' - pogo 2086 1 75.34 GCGTATAGAGAGTAACCTCCGCCAGCATTATAAATTCAATTTGGCCAAAATCAACAGCAGTGCAAAGAAGGAAGGGCCCTCTGCTACCCGTGGCATTCCAA:1 + chr3L 2321572 5' - G-element 4046 1 70.30 CAAAGCGAAGATGGTGGAAATGTAACGTTCGAGTGTAGATGCGTTGGAGATCCCACGCCAACAGTCACATGGTAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTGAAGTCCCTCGACCCGTTAGATCACCTGAGAACATTGAAGCAG:1 + chr4 728744 5' + mariner2 350 1 51.03 AGTCGAGGTAAACGGTTAAAAGGAAAACCAGGCCAAGAAAGAAACTAGTGAAATTCATTTTCCCGACCCAGAGACAGACGATAGACCACCACGATGCTCAGACAGCATAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCGGAGAGA:1 - chr2R 14368067 5' + 412 355 2 72.41 GCATACTAATTCCCCCAAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 20076739 5' + roo 26 2 64.93 TTATGCTCCAAGCAACTGAACCAAGTGCATATACCCTCTGATAGGGCGTGGCCGGCAGTGACGTTTCGCTGGCTTTTCTCCGCCGTCGTCGGGGACGTGGTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1 - chr2L 19764227 5' - copia 5039 2 65.75 GCTTTTCGATTCGATCAAGGGGGTCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr3R 28008350 5' - hobo 2901 1 53.42 AAACTCTTTTATATTAAAAGAGCCAAGGTCACAAATGTCTTATCTGGATTTTTGAACAATTTGTTTATGGCTTACGGGTTAGTCGACCTGCTAGTAGTTTTATAGAAAAATAAGTTGGGAAAAGTTCTTTCAGATATGACATTAAA:1 - chr3L 13987604 5' - Helena 483 1 78.77 CTTGGCCCTGTTTTCGGTCCCTCTCGATTGCATATGCAGCTACTTTTATCGATTGGCTGAAGTTCGCACTCCTTGCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:2 + chr3L 12863659 5' + Transpac 4962 2 54.11 AATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:2 + chr3L 9241991 5' + roo 8726 2 65.07 ATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTT:2 - chr3L 13204776 5' + jockey 93 1 76.03 AACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAA:1 + chr3R 5765323 5' - opus 444 2 58.90 CATTTCCCACTCCCTTGGCAGCTCAATTAGCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr2L 14969857 5' - Tirant 357 2 56.85 ATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chrX 14756640 5' - pogo 2060 1 57.53 GGAAAAACTAAAAGATAAATAGCGGGTATTAGTTCAAGACTGAAATAATTCCTAAAAATGTTATAAGTTCTTATAGTCAAAATTATATGAGAATTGAGTATTGTATAAAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAA:1 + chr3R 12332518 5' - GATE 442 1 73.97 TTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr2R 10367475 5' + 412 64 2 60.27 AGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3R 14088550 5' + 1360 56 1 56.16 CTATACTTCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chrX 3529852 5' - 412 7503 2 56.16 TATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCGGAAGCCCGTG:1 - chr3R 30731460 5' + gypsy6 7492 2 69.18 ATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCAC:1 - chr3L 23597292 5' + invader4 2 2 71.03 GTACGCTAGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGGCTCAA:1 - chr2R 6052721 5' - mdg1 393 2 65.75 GCTCCCTTTTTGCTCAGTGCACACACTCACAAACACACACACTCACAAACACACACACACACTGGCAAATTTCTGTTGTAACGCTGACGTTTAAGTATTTATCACAATGACAAATGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTG:1 - chr2R 8230769 5' - 1360 18 1 78.08 AACATAATTCGCTTTATGGTTTATGTCCGCGCATTGTGTAATCATGACCATAATTTAAAATAAAGGGATTTATATTTTGTTAATTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAG:1 + chr2R 17477429 5' + Rt1b 179 1 54.11 GCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATT:1 - chr3L 21093232 5' + Ivk 55 1 59.42 GCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr3R 29708916 5' + blood 13 2 70.55 TTTTATGACTAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr3R 7424621 5' + 412 77 2 70.55 CCTTTAACCAAATGATATGTGCTGTGTCCAAAAGGACCATTGAGACGCCTCTGCAATTGGCTGCACTTGGAAAAAGTTCAGGTATCATATACTAGTCTTTATACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGACAACACTCAAAA:1 + chr3R 8472498 5' + Porto1 4196 1 73.97 GCATGACAACACTGGCACAAAACGAAAGCTTTCACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr2L 12142517 5' + hobo 22 1 70.55 ACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3R 9163957 5' + hobo 52 1 56.16 AATATGCAGATATTTTCTAACAATATCGTGAAGTATGAGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 22846739 5' + 412 7085 2 59.26 ATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 - chrX 14908468 5' + blood 7078 2 61.64 GATCTTGGTCATCCCGTTTTCGGAGCGGTCAACATGCGTATTACAATTTGATCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACG:1 + chrX 4568463 5' + Transpac 498 1 65.07 TAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAAT:1 - chr2L 15153366 5' - G2 3027 2 57.53 TCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAA:1 - chr3R 15590035 5' - Transpac 226 2 75.69 CCTTCATTGGCGTGTGTCACTTTCACTTTGCTCGCTATGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3R 9163999 5' + hobo 10 1 78.77 ATTGGTATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chrX 5222975 5' + 412 7096 2 55.86 CATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACT:1 + chr2L 15142241 5' + BS 4767 1 57.53 AACAATAAGCATGAAATAACCATCAAAAATGTTGGCGAAAAGACAGTGACCTACAAGGCAATAAATACATATATTCTAATATATACTAATATTCACGCATATTATCTTCCGATTTGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCA:1 - chr3L 10558841 5' - Rt1a 4735 1 71.23 CTTACTATATGATGAATAGGTTAAGCTAAGTCGAGGCCAGGCAACCTTAATACATTTGCGGAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 + chr2L 14796852 5' - I-element 5294 1 56.85 GATTGCCAAGCGACTGCGGATTGCAGTTGAGCGACGGCAAAATCAATGCCGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAGTGAACATAAAACATT:1 + chr2L 14922550 5' + I-element 458 1 71.23 GGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTA:1 - chr3R 28033679 5' + diver 71 2 64.38 CCCAATGTTTTTCTCTCTCTGCAGGCAATGCAATGCCAGGTGCTCGTACATGTGATCATCTGCGTTATAAAACATGCAACTAGCAATCCCTGTGAGCGAACAAGGACTGAAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCA:1 - chr2R 14339968 5' + Rt1b 5038 1 58.22 AATTTCCTAAATGGCATCATTTCAGATGACTCTGTGCGATAGCTTAAGTTAATAATGTACCAAAGCAGGGGAGAAGTTTGTCACTCACTTTGCCCAGATATATAATGGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2L 12355227 5' - hobo 2926 1 75.34 ACATTTGAAATTAAGAATGCATTGCACATTGGAAGGCGTGATCATATTTTAGAACATTTTAAGGCGAATTCCCAATGTTAGCACCTTTTTGAAACATCAAGCCAAATCACCCGGTCTCCACGGAGCAGCCAGAGAAGGAAGCCCTT:1 + chr2L 8193848 5' + Gypsy6A_LTR 335 1 74.66 TTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:2 + chr3R 7739658 5' + blood 7054 2 56.16 CCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGTTTGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACACCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGC:1 - chr3L 9198632 5' + F-element 100 1 76.03 GAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:3 + chr2L 20984262 5' + blood 24 2 66.44 TTGCCAATTTGACAATTTTATTGATGGCCAGCAGTTACGTGCCCATTGCCCATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 15167609 5' + roo 13 2 76.71 CTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:1 - chr3R 14049442 5' - transib2 2773 1 52.74 GAGTGGTGCGTTGGGTTTATGCCACTCAAAGTTGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTT:2 - chr2L 20842007 5' - G6 1983 1 56.85 CTTATTTGCGCTGCCAGCCAAAACGTCCAGTGCATAAATTATATATGCCAACAACACAAATTTTTCGCTAAATACCCTTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 6774264 5' + pogo 42 1 55.48 AATACACCCAAGACCACTTGGCACGCCCAGTGGCTGCAGTTGTCATATTTGTGGCTATTATCTTGGCCCACACAAAAACACCAGCTAAAAAACACCACACCTGACACCATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2 - chr3L 9317622 5' + blood 16 2 58.22 AGAGCAGCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGTTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGAGTGAAGA:1 - chr2R 21056766 5' - Tirant 8430 2 70.55 CCCCTTGAAAATTCGAACTTTTTCCCTCTACTTCTTTGTTTTTTTGGCAGCCAAGCGGCAGACATCAAAACACACCCCCGGCTTTTCGCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATTACTTTGAGGGT:1 - chr3L 3965486 5' - Porto1 329 1 64.66 AATCCACCATATGATCGGGGCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATT:1 + chr2R 10478629 5' - invader4 3069 2 73.29 CCACCACTTCTAGCAGGTGTCCCTTAGTGGCCAGACAATCCATGGAATCCTTCATATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAA:1 + chr3L 20738911 5' - R2-element 3306 1 63.01 GTATACTTATACTTATATATATCTCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chrX 9951442 5' - hobo 2894 1 55.83 GTAAACTTTTAAAAGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3R 9258802 5' + 1360 30 1 65.07 CCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3L 27391420 5' - 1360 3363 1 63.01 AGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 25271180 5' + 412 7113 2 60.14 GGTATATACATAAGTTGTTATGTTTGCTGTTTGCCTAAAATTATTAACTGCTGCTTGAGATTAGAATCAATGGCTGTTGGGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3R 18665371 5' - 1360 3351 1 60.27 CAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chr3R 20292525 5' + pogo 61 1 62.33 TAAAGCGTAACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:2 + chr3R 7739632 5' + blood 7028 2 73.97 TGGGAAATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTAC:1 + chr2L 23020623 5' - Transib5 2947 1 52.05 CTAATGCTTACAGATTCAGGCTACACGGAAAATTCATATTTGTAATTTACTATTTTATGCAAAAACTGTCTTATCTGATGCAGCTGATCTGATTACTTGGCAATTTACTGGATCACTCGTGAAATCCGAAACAACACCGTGACGCT:1 - chr2R 22368194 5' - Rt1a 131 1 55.48 GATATTAACAACAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 + chrX 10960191 5' + Transpac 4971 2 53.42 CATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 9482033 5' + roo 84 2 76.71 GCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGTAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chrX 13762613 5' + P-element 97 1 19.18 GTGCCTTTTTTGTGTTTTGGTTTTACTATATGACTTTTTATTTGCACCGAATGCTGTTTTTATGGCTTATACATAGAAAAGGAATTTTGTTAAAGTTCTGATAAAGACTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3L 15321911 5' - Transpac 5218 2 78.77 ATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 22255321 5' - roo 349 2 57.93 CAGCCATATCCTGTGGCAGGCGCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2L 16685426 5' - P-element 2851 1 60.96 ACAACGATAATAAACACCTACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr2L 10089859 5' + 297 39 2 59.59 AGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chrX 22858935 5' - mdg3 169 2 69.86 AGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATC:1 - chr2R 6984452 5' - HMS-Beagle2 7176 2 72.60 GAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 - chr3R 13358665 5' + mdg3 5339 2 73.97 ATTTTTTAATTATACCCGGACCTCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAG:1 - chr3L 27670273 5' - I-element 5345 1 56.85 GACATCTTTAATGTCGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCA:1 - chr2L 21403589 5' + G5 4411 1 61.64 ATTCGGCGGAAAAAGTCCACGGCCATGGTCACGACCACGTCGGAAAACACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3L 16887319 5' + roo 8736 2 67.81 AACAATGCCAAAAAGTGTTTTTCAATTTTTTTATTTTTTCCAATACGTTTTTAAAGTTTTTTTTTTTACTTTCCTTTGTTGCCATCTTTTGTTTTTGGTTTAACTATTTATAAAACATTTCATTTTAGAATCTTAACAACATATAT:1 + chr3L 12121258 5' - BS4 679 1 58.90 CATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTA:1 - chr2R 22692406 5' + Ivk 100 1 75.34 AAGCTAGCTATTTTTAATAGTACTATCCATATATGTATGTATGTAAGTAGTGTGTTGTTCTAACTGTAATATCCCCATATTTTAGTCCAGCATAGTAACTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2L 2690710 5' - hobo 2922 1 72.86 CTTCGCTGACAGTAAAATAGAATATCTGTTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 5514158 5' + Doc 46 1 56.16 ATGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3R 9163963 5' + hobo 46 1 54.11 TGTTTCGAGAGCTGAAAAGTGGGCGTTAAGTTGGCTAATGAAAATTGCCAGGCAACGTTGAAAAGCATGTGAGTTTGTTTTGCCTGCTTGATTATAAATAATAGGAGTACAGAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATT:1 - chrX 9795316 5' - Transpac 4811 1 66.44 CACAATTTAAAATGCAAAACACAGGCGAGGATGTCTGGGCCCTGGGAATAGATAGCATTGTATCTGGGATAGGATGGAATATCGGGGGACTTTGACAAATGCCTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATA:1 - chr3L 19031870 5' + Cr1a 410 1 72.26 ATGAATTACACCCGCCCTCAAACTGCTGCAATCTAAAATATTACGAGTTTCGCGAAAAGCACAAACTGTCTCTCAAACTCTGTAATATTGTAA:1 - chr2R 14072931 5' + diver2 42 2 87.10 CCTCATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3R 12787119 5' + 297 6639 2 60.96 GGGCACAGTGGATGCCAAAAGTATGTCTACCTATCTACCTATCAGTGCACTACTGTACACAATGGTGCACCTATAGATTGCAGATAGTTTCTTTAAGGGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 30796961 5' + roo 23 2 67.12 AATGGGAATATAGGCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGGCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATT:1 - chr3R 25384336 5' - mdg3 5491 2 74.66 TACACCGGAATAAAAGTGTTGGAAAATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTTGCAGCGCTGTTGTGCAGTAACATGATTG:1 - chr3R 11002140 5' + flea 48 2 69.00 ATGCATATTTATTTTCAATAATTGCATTATCAATCGATAATCGTATCGTATCTTCGAGCGGTAGGTTTCGATAAAGGGTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 - chr3R 25793752 5' + 1360 41 1 45.89 GAACCGCGGGACATCAAATCTAATTATGCCATATAAAGAAACACATAAGATAGTGCAAAAGGAGCATTTTACACTCGAAAAACGTAGCGAATTTTTAACTATTTTTAAACCAGGGTGCAGTTCGACGACTCGGCCTATAGTC:1 + chr3L 18340095 5' - diver 5691 1 75.35 ACCCTTTGCCATATATGCAAATGTGCCGCAAACTGGCTTACATTTCACATTGCTCATACGCACCGGAGGCCGCCATGAGAACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chrX 9525282 5' - hobo 2901 1 60.96 AATCAAGGCGGATGCTAAAAAGGTGGAGGCCATAGTCGAGATGAAATTTCCAATTCAAGGAACTGAGAAGTTTCCTTGGTTTTACCTCGTACGAAACTACGCAAAGACTTTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 + chr2R 5079316 5' - flea 197 2 56.85 GAATCTTTTTTGAGTGCGCTCATGCTTTGTGCAATAAAAAGGATACGATGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAG:1 + chr2L 17747409 5' - Tirant 8438 2 66.21 ACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr3R 25521920 5' + blood 7046 2 61.64 GTGTGGGGTGGCAGCACAAAATGGCATTAAATTAAATAAAGACCCGTGTACGGTTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTT:1 - chrX 3122049 5' + diver 80 2 68.49 GTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr2L 1229573 5' - opus 442 2 59.59 GTCGTCATTTGCCGCAGATCAAGGTGTTATCTCGCTGCGAAGACGTGGAACTGGAATTGTTTGACGAGAGCTCAAAGATTTCGAATCCATTGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCA:1 - chr3L 8961803 5' - R1A1-element 329 1 58.22 GCAGAGTTTGCGCAACCCATTTTTCGTGGTATACACTTTTTAGCAGCAAGCACATGATATAAAATGGTTCATTTCTATTAAGACTGCTTATTATAAATTAATTTATATGAGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1 - chr2L 19372182 5' - Bari1 1699 1 78.77 AAACAGTGCAACAAAATAGATAACTGCTCTGTTGTTTTTTGCTCTGTGCTCGTAAAGCAGCTGCATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCG:1 - chr3R 10539059 5' - Quasimodo 330 2 56.16 TATCCTGTCAGGGACCCTTTCTTCAAAATGCTTAACCGCTCGGTAGCGACATTTATGAACGCAGTCCACCTAAAAAGACTCTGTCTACTTTTTTGACCAGCATGTTCAGGGAAAATGGAAATGGGTTTTGTGTTAAGATGAACCAG:1 + chr2R 5092319 5' - Circe 7344 2 58.22 TAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr3L 15035101 5' - pogo 2054 1 56.16 ATTAAAAATTGTATAACATTTTATATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3R 25271307 5' - 412 7518 2 64.38 ATCCTTACGAAGAATATTTTTTCCTTTACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 4722341 5' + roo 22 2 69.18 ATACTGCAAATAACTGCAAACTATTTGAAAGCCAAGCGCAATGGATTTAGTAAATATTGATGTATCTTAAATTCTAAATAGATACCCTTTTTGGTCTATCAAGAGATCTATCTACCATCAGTAATTTTTTTTTTTCATAACTGCCG:2 - chrX 4067148 5' - HMS-Beagle2 475 1 81.51 AAGTGCACAAACTGGGGGATACCATTACACAGTCAATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr2L 10832376 5' + Doc 31 1 67.12 CACGACAACTTTATTGAATTCAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr2L 1449552 5' + opus 7028 4 67.12 AGTCACTTCCTGACACACAAAATGCATTTAGAGTTAGTGGATCGAACAAAGGCCACTCGAAATTGGCGTACTTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAA:1 - chr2R 12476305 5' + R1A1-element 5059 1 50.68 CAAATTTCAGCATTTTTCCAATTTGTTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chrX 3452565 5' + Tirant 8120 2 77.14 GCGATGAGTTGGATGTTGCCGCTAGCTGTCGCTAGGTGGCGTGTCGAACAAGGACAATGTCGCTGTCGTCGCCTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chr2R 19543767 5' + jockey 4807 1 50.68 ATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTATCCA:1 + chr3R 6368614 5' + Idefix 82 2 76.71 ATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTGTTTAAGTTTCAG:1 + chrX 3452414 5' - Tirant 8451 2 55.86 AGCCAAGTGTAAAAAAGCCATCAGGTTTTCTAGAAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chr3L 15322106 5' + Transpac 4936 2 71.72 ATGCATGCATAATAGAGAAGAGGAAGGGAAACCAAACGAGTCGGCCGCAATGAAAGCGCAACACGTAATTGTTGTTCGCATCTAATGGGTGTTCGACTATATAAAGTATTGTATATGAATTCTTGATGAGGATCAATAGTCGAGTC:1 + chrX 22808451 5' + INE-1 92 1 65.75 GAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTTACGTTATTCTTATTT:1 + chr3R 20147874 5' + 1360 306 1 57.14 CCCGTTTCCATGCCATTTGATATAGACCTCGCATATATAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3R 9958577 5' + opus 7147 4 64.38 CACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAGACACT:1 - chrX 21667920 5' + gypsy2 86 2 73.97 CCGATGGCGTGGAGTACACAGAGGAGGAGCGCGTCCAGTTGGCCGAGCGGAAGCAGAGCATCCAACACAATGCCACCAGGCTGCCCGATGAGGCAAAGCATCGCGAAATGGACATATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTG:1 + chrX 8462461 5' - Stalker 142 4 76.71 GGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGA:1 - chr3R 24175750 5' + Burdock 6224 2 79.45 AGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3L 5446116 5' - roo 8993 2 71.92 CTACCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:2 + chr3L 18708566 5' + F-element 39 1 66.44 GGTTATAAGAATATTGTCAACATTCACAAACCAAAATCGTTAAGATATTTGTGATTAAAATATATATGTTTATTTGTAATCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCC:1 - chr2R 11449684 5' + R1A1-element 5135 1 55.48 TTTTAAATCTTTTTTAAAGAGTGAATGCTAACTCTTGCTATACCCGTTACACATAAAGGAAAAGGGTATTCTAGTTTTGTTTCAAAGTATGTAACAGGTAGAATGAAACGTCCCCATAAATCTCGAGTAGGGGAGTGGCC:1 + chrY 252390 5' + gypsy8 25 2 76.43 GATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGGATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 22221261 5' + 412 7089 2 59.59 CTGACATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3L 9241984 5' + roo 55 2 60.27 CGCCAAAAACGAGGTGTGTGACCTTTTTCCGCGCTTTTGGCGTTGCTGTAACTCGACTTTTCTTCGTCGTTTTCAGTTTTTTTGAATCTTTCCTTTTACTTAAAAGACTAACAATAAGTTTTAAAATCTTATTCTAAACTAACTAA:1 + chr2L 1069758 5' - Doc3-element 4652 1 54.79 GGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 10973205 5' + jockey 74 1 60.96 TTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 + chrX 13061717 5' + mdg3 5325 2 64.38 TTCGAAAACATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 + chr3R 20452197 5' - blood 7313 2 69.18 ATGTTGCGCCCGAGATCTTAATCGGTTCGACAGGGTTACCCCGGGAAAACAAACTGACAGCGACGTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 19700824 5' - roo 395 1 76.03 ACAATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTTTTTCAAGCTAC:1 + chr3L 4710703 5' + Doc 31 1 63.08 ATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:3 - chrX 16243795 5' + 412 7069 2 72.60 GGAGGAAAAAGAAACTAAGTTGCATACTTTTAATTTCATTATTTAAAAGTATGCAACTTAGTTTCTTTTTCCTCCTTTTTTTTT:1 + chr3R 19314844 5' - Doc2-element 231 1 63.10 GTACATACCTTTATAATTTACACAAGCATCGAAAAGTTTCCAAAAACAAATGAAGTTTTTATTAACATAACAAACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGTAAATGA:1 + chrX 5115103 5' - X-element 4513 1 54.79 ATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 10032754 5' + hobo 42 1 53.57 AAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:3 - chrX 9816449 5' + jockey 96 1 76.03 CAAATAACAAGCATTTCTATTGCATTTATTGCATACTATATAGGAATCAAGTATTTGCCCGCTATGCAAGAATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr3R 10357867 5' - pogo 2055 1 54.11 AATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATNC:1 - chr3R 16611513 5' + Stalker2 7471 2 64.35 CAGAACAAAATAAATAATAAGTAGGAATGCATATGATTATTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATC:1 - chrX 4443478 5' - F-element 4339 1 73.97 TATAATACATAATAAATCTTGTGTAAGTCCTAAACTATCATAAAATATATCAGGTAAATCCAACAACTAAATAGGTAAGTAAATAATTGCCTTTTTGTTTGTCTGGATCGGTTTTGCTTAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTA:1 - chrX 15927078 5' - I-element 5093 1 59.59 AATCTCCAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr3R 25384153 5' + mdg3 5285 2 63.01 GACAGCGCAGTCACAATCCGAAGGATATATGTATATATATATATATCCCTATCCCCAATACATATGTATAATTTGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 + chrX 12558220 5' + Transpac 45 2 54.79 CTCAAAACGGACAAATAAAAAATGCAAATAAATAAGCGCAGCGAACTGTCGAACAATTGAATCTAATACAATAACAACATTACACTGATGTAATACAAATAATTAATATTTTACAAAGAGCAAATATGAAAATTTCTCTAGAAAAA:1 + chr3R 18558801 5' + TLD2_LTR 134 1 56.85 ATCTGCAGCACCAGACGCTCTTGCCCGTCAAGATGGGTGAGCCACACGCATACACGAATCACACACACGTTACACACACACATCCACGCCCACAAAGCTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr2L 8103468 5' - pogo 2079 1 63.70 TTTGTCTAGACCAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr2L 5373474 5' + gypsy7 5004 3 70.00 TAGCCACACAAATTTGTTTTTTATTTTTTTTAACACACTTATACGCCCAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1 + chrX 4858358 5' + BS 5073 1 67.12 ATTTTCAAAAATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAA:1 + chr3R 10791680 5' + Idefix 53 2 56.85 TCAGTCACATGGCTGTTCATCATCTCGATTATTGGATACATTTGAAGAGCTTTGCTTGGAGTAAACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr3R 6068222 5' + jockey 4679 1 80.82 GCTAATGTGCTTTTGATATATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 - chr3L 20747212 5' - Burdock 6348 2 55.17 CGGCACTGTCAGTGCTCCAACGTCATCCAGGTGCCGGCCAACCAGCAGGTGGAGTTCGTCATCTCCAGCCTGTCGCAGACGCCGCATCCCATCCACCTGCACGGCTACAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGAC:1 - chrX 17853421 5' + 412 194 2 73.29 CGCTAGGCCGTGGACTGTGGAAAGGAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGGTAAGGTGATATTGGAACTGAAAGGTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr3L 22518967 5' - pogo 2059 1 56.85 AAATATTTATGCACACAAACAAATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTATTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 9616708 5' - roo 385 2 69.18 CTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCAT:1 - chrX 14815841 5' + INE-1 103 1 75.34 TCCATCATGTGCCGATACTTCCTGTATTTTTCCCCATCATCGACACTCTCAAGAGCCGACTTGTAATCGAATCGCCTCTTCCCTAAGCTCTTCTCTTTCACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAAACA:1 - chr2R 5266389 5' - invader2 4685 1 65.07 GCCTACCGTCGATTGAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGT:1 - chr3L 22635805 5' - hopper 1384 1 63.70 AACATTGCACTACACAAAGAAAAATATATAATGGCTATGAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCT:1 - chrX 10101397 5' - mdg3 163 2 72.60 AGGATAAATATCGGTGGGCTGATATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr2L 12481538 5' - pogo 2050 1 53.79 GATGGAGAACAGGAGTTGAAGTGCACGGTCAAAAATTGTGCGGTTATTACTATCCAAAACTATCAATTGGAATATGATTTAAATCATTGATTTCATTTATATATTTTCAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chrX 8665901 5' + I-element 10 1 60.27 CGAAATGAAAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chrX 9951325 5' + hobo 32 1 63.70 GGGAAATCGCCAAAAGAACGAAACCCAAGGGCTGTCAGTAAGAATTATTGTGCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 - chr3R 9148106 5' - copia 5054 2 65.75 GAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTT:1 - chr2R 5900932 5' - Bari1 1651 1 57.53 CACACCTCGTTCGATCCTAAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 - chr3R 9983134 5' + HMS-Beagle 6823 2 67.12 CCTTTGCCGGCATTAATTGTTTCTTGGGATCGGCTGTCGAAAGTGCAATCGGATTGCTGATATCCCGACTATTGACTATTCGTCGAGAATGGCAATTGGTTTATTTCGGGACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACG:1 - chr3R 30731535 5' + gypsy6 7423 2 80.82 TAGAGTGGGCGTGGAAACATGGGGTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTTGACGCTCTTACGGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTAGGCTATTGGTCCTGATCAAGAA:1 - chr4 71477 5' - INE-1 87 1 69.18 GAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 + chr3L 9571658 5' + jockey 76 1 65.07 AAAGAGCAACGATTGAAATAGGCGCTAGAAAATCACGTGCCCAGTAATGGAGCAGCTAAAGGAATACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGT:1 - chr3R 4203815 5' - Juan 292 1 56.16 ACATTTTGATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr3R 8402676 5' - mdg1 395 2 67.12 TCCAGGAGTCAGCCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:1 + chr3L 5438717 5' - hopper 1368 1 52.05 ATAATGAAATTTAACGGTTAAGTGAGCTTACCAAAGCAGCTTAACTTTAAAGCTTGTAGAGCTTTTAGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3L 6096632 5' + roo 8687 2 69.86 ACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACT:1 + chr3R 907896 5' + gypsy11 359 2 34.25 CAAGTCGACGGTGTAAAAATAACAACTCGTAAAAGCAAAACGAAAATCAACTTAATTTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCGCGGTGCAGGTAAC:1 - chrX 10538227 5' - pogo 2065 1 52.89 CCATTTGTCTTCGCTGACAGTAAAATAGAATATCTGTTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3L 5514150 5' + Doc 36 1 62.50 CACATTTTTGACAACAAAGCAATTTAAAACATTTGCCGGCCAGAGGCTAACGCAAAAGTCGAAATAGTGACGAATGATCATTGTACTTGGAGCAATTATAAACATTGGGAAATTTATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAA:1 + chr3L 16888062 5' + roo 9035 1 76.71 GACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTG:1 + chr2L 19371300 5' + Bari1 84 1 73.97 AAAAAACAAAAAAAGCTCAGGAAACCAGAACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 8082354 5' + roo 46 2 52.74 CTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATC:1 - chr3L 14043620 5' + Ivk 61 1 58.90 GTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAA:1 - chr3R 14049430 5' - transib2 2761 1 59.59 CCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 22429220 5' + roo 75 2 68.97 TTTCATTGCGTAAGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3R 24228832 5' + opus 24 4 69.18 GAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chrX 22517731 5' - 1360 3366 1 60.27 ATAATTTAGTGAACGTGTCTTAATCTAAGTCGAGCCACACAAACACACCTCCACACACTCGACACACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGAGGAGTGTAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTCTTTGTTTTAGTACGTA:1 - chr2L 11158751 5' + Rt1b 5034 1 65.07 CCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAATCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATAC:1 - chr2L 8393079 5' + I-element 5162 1 54.48 CAGGCATGGCCAATGGACCACCAATGGAAGCCACACAGCAGCGGGAAAGGGAACGGGAACGAGATAGGGAGCGGGAACGGGAACGTGAAAGATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chrX 8266065 5' + roo 8744 2 58.90 CCATGTGTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3L 15058795 5' + blood 11 2 50.00 ATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAG:1 + chr2L 17198081 5' + R1A1-element 5082 1 77.61 ATGGCATAACCGACAATACCATAATCTGCTGGCCGCCGTTTGCAATATAACCGGGTCCATAGAGCCGCAGTGCATCTACTAGAAAGACCACAAATTTCGACTCCGATTTGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATAC:1 - chrX 10623961 5' - X-element 4707 1 76.03 AATCGATCCCAAAATGACACCCAATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 - chr2L 1074030 5' - Tirant 357 2 55.56 AGTGGAGATTAAGTTAATTACAATTTCGCGCTGCTCTGGCAAAGTCAGCCAAGCTGGCCAAGCTGTACACGCTGGCAACCTGTAACGTGCAACTTGCAATAAGCAACATGCAACATTTGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCTTACTT:1 + chr3R 19077942 5' - Stalker3T 77 1 77.40 GTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTA:1 + chr2L 8959911 5' + Ivk 5159 1 59.59 GACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 + chr3R 25876836 5' + mdg3 5288 2 62.33 TTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chrX 5222964 5' + 412 7108 2 57.53 AGCCGAAGGACCTTCTCGGCACACCGACACACACATGCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAGTCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAA:1 + chr3L 15336198 5' + Quasimodo 167 2 82.88 AAATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3L 10814641 5' + 297 19 2 71.92 GCATCGTCATGCTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chrX 14173169 5' + 412 7078 2 68.49 AATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATA:1 - chr2R 4206654 5' + 1360 324 1 69.86 ACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAATAATACACTTAAATTCAG:1 - chr2L 2357370 5' + P-element 47 1 46.40 AAAAAAAAACAAGACCCAAATTGAAACTGCAGGTTCGGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 + chr2R 17957565 5' + copia 84 2 73.97 GGTAGGAAAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr2R 5067611 5' + F-element 61 1 58.22 TATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:2 + chr3R 19545340 5' + jockey 79 1 65.49 CATGGCCATGGCTGTCACTGCTCAGTCAGTTGTTTTCATGCCCTTGCCAAATGTATTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3R 11549759 5' + 297 15 2 76.03 AATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGT:1 + chr2L 20561414 5' - P-element 2801 1 28.08 GCACGAATTTTCAAAAATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACA:1 + chr3R 10791674 5' + Idefix 47 2 53.42 TTCCGCTCCTGGTTGTCGGCAGTTTATGTGTCTTTTAAGTAGTTGGAAACGCTTTTTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAG:1 - chr2R 6111402 5' + R1A1-element 4936 1 61.64 ATTATTTCCAAATTGAACAGAGTCTGTCCAAGTGTCAGGTTATTTCCTCCAATGTATATCCATAACGTGGATTCAGTGACGACCTTAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 + chr2R 1277020 5' - Tirant 368 2 66.44 CTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTT:1 - chr2R 5900947 5' - Bari1 1666 1 58.90 GCAATTCCCAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2L 15920182 5' + jockey 63 1 55.17 AAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chrX 9816465 5' + jockey 80 1 65.07 AAACAATTTTCATAAATTAAGATATGAAATTCTACCAAAATATTTTGTCCAACGTTGGCTCACCTGACTGTTTTTTGGGACTGCGGATCGTCTGTCCGTATGAACCCCGAGATCGCAGGTACTATAACAGCTAGAAGGTTGAGATT:1 + chr3L 17784127 5' + INE-1 164 1 54.11 ACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr3R 24479245 5' + 412 89 2 76.71 ACCTATTGCTCTGACAAACACCCTCCTTCTGTAAAAAAAAAGGAAGCCTAAAACGGTAACGTTATAACGGTACGCTTGTCCTTTGTGGCGAATATTTTTTACAGCTGACAAGATTTGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCCCAGATGC:1 - chr3L 16401430 5' - G5 4471 1 76.71 CGGAGCACAACGATCCAGGTCTCTTTGATACCATTTGGCCAAAGCTGGTTAGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGG:1 + chr2L 2357229 5' - P-element 2876 1 78.08 TACATCCTTGTATGTCTCGATGTTGCCGATGAACTCCTCGACCACGTCGCAAATTTTTTACTCATTTTATTCCCCAATATCTATCTATGTATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTTGCGTTCGCATTCACACTAGCGGAGTAACGG:1 + chr2R 14359979 5' + INE-1 536 1 66.44 CGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGG:1 - chr3L 23678155 5' + Osvaldo 21 1 71.15 CTTCCGCTTCAGCCACAAATTTTGCGGCGGCAACAGCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGGTTTTAAGTTTCAGCAG:1 - chr3R 31907419 5' - Tirant 8448 2 64.52 AGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGC:1 - chrX 10728902 5' + springer 77 2 70.55 CACTTATTTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr2R 7404633 5' + blood 21 2 64.38 AGAAAAGGTCCTTTAGCTGCTATTTACTTTGTCTATTCGCCGGAATTACCAGCAGTGCGTCTGATTGTTAGACTGGATTAAATGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCAT:1 - chr2L 12260432 5' + Quasimodo 7124 2 57.53 GACATCCTATACACCCAGCGTCCCGGCCGAGGGCACAGAAACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCATCGTAACTCAAACATCGATCACCACGATACTTCCCCCGGGTGCTTACCATAATGAGCCGTCTTGGCTAGCTGATCAACCCGTG:1 + chr3L 23054444 5' - R1A1-element 4944 1 55.48 ATAATAAATAATACCTTTACATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTT:2 - chr3L 18920526 5' + Juan 22 1 70.55 ATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCA:1 - chr2R 6984449 5' - HMS-Beagle2 7173 2 70.55 CGTGGAATAAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTGGG:1 + chrX 11631158 5' + P-element 232 1 19.49 GATCATCGTAAAAAAAAAAACAAGAGAGATCTTGACGTTTATACGGTCTATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 + chr3R 4464156 5' - 1360 3316 1 66.44 CAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2R 18123385 5' + 412 26 2 62.33 CTGGTATTTAATTAAGCGTAATTTTAATGACAAAGAATGCAGTTGCTCAGCAGTGTGTGGAATGAGGTAAATGTACACGGAAATAAATGTGGAGGATATCTATGATAAGTTTGTTCTTTGTTTTTACTCACACTAGCAAGCAATTT:1 + chr3L 8381444 5' + 1360 3255 1 67.81 CTCATCTCAAGTTTCGGTGCCTCGAAGATGTAATATGAGAAATTAAATGGCGCGTGCTCTCCAAATGAAACGCAAATACAAGTGTGTTTGGCTGATGTAAATTCTGATGTATACATATCATACTACATACATATTTACATGTTTTT:1 - chr2R 9389332 5' - G3 4503 1 76.71 CACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 9241965 5' + roo 36 2 60.96 GGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGG:1 + chr2R 5900819 5' + Bari1 58 1 54.79 AGTACGCCGCGTATAGTTGCCAAGTGGGCGGGGCGGCCAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGATTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 22354387 5' + Doc 8 1 77.24 AACTTGGGAAAATTTACGACATCTACGAAAAAGCTGCAGTTATGGAGAACAAAATCGGTAAAATGGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACAC:1 + chr3R 3617301 5' - micropia 5137 2 76.71 TTAGGAAAATTGCATACTGAAATTGGGAATAGCCGTGCGTATTACAGTACCAAAAAGAAAAAAGAAAACATGAAAAGTTACTTGTACATTTTTAAGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3L 5263502 5' - pogo 2077 1 66.44 CCGTAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 9241987 5' + roo 58 2 62.33 CTTCAATGTCAACTAGAAGTGACAGTGAGTTGCGAAATATTAAGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:2 - chr3R 25521941 5' + blood 7025 2 76.03 GCATTCACATTCACTTCCTCGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 10467971 5' - opus 473 2 66.91 ATGAACATGCATCTAATCTTTTTCCAGACAAGCAGAGTTAGGGTTTTACAAATCTAAATAAACAAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2R 14215413 5' - 412 462 2 45.21 CCTAGGTCAGAAATTCATTTACTTTTCCTCGAGTAGAGTATTAGAAAGTGTGTGACCACAAGACTAATCTCCACACAATTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGGCCCGCCCGGGTACAAGGTCCACATA:1 - chr3R 11943346 5' - gypsy8 4932 2 54.79 ATCTGCGCTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr2R 7223648 5' + blood 55 2 56.16 AACCAAGTTAATCACAAATATTTATGGTACATTCCCACTTCAACTTCCTCAACAGCCCACCCTACGAATTCTCATCTATTACTCATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAGATCG:1 - chr2L 3593113 5' + Doc 4482 1 59.59 TCAAACACTGCAACTGCATAAACAAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr3L 13722162 5' + blood 18 2 73.97 AGGTAAAATGATTCGCCCACGCTTATTTTGCAGCACTTTTTCATCTCAGCTGTCTTTTTTTTTTATCGTTACCCTTGCTGCGGTCGTTGCAACGAGAATTTTGCCACATAGCTGACTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAA:1 - chrX 10119702 5' + FB 3 1 79.45 AGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3L 20076855 5' - roo 339 2 67.81 TAGAAAACGTACCACATCTCCTTTGTCCCACCATGATTTCATGACTGAATTCTGAAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 - chrX 11815107 5' - flea 213 2 64.14 GAGCAGCTAAATGTATCACATGCCAGCCACATACGCCTAATCATCTTGTAAGCACTAGTGTAAAAAGGACATGCTTGGTGATCGCGAATCTGCTGACCCATAAGATTTGGGGAATGTCTCCGACTTGCTGAGCTGTTTCCGCCGAC:1 - chr3R 29379079 5' - gypsy5 167 2 51.37 AGTACTCTACTGTCTCAATTATCTACCGGTAACATTTAACCACTTCAGTTAAACACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr2L 21342351 5' + roo 67 2 72.60 AAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:2 + chr3L 20785489 5' - P-element 2788 1 17.81 GTTGCATTTACCCTTTTGCCTTGGTTTAACAGGGTAGCAAAGCATGCAACCATTTTCTCCATTATTTTTTGCAAATTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCA:1 - chr3L 12030612 5' + I-element 5206 1 47.95 GTGAGGACTTCTAATATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 9482147 5' - roo 9047 1 69.18 ATGCGGTCACTTGGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3L 22221106 5' - 412 452 2 61.11 AACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCATTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3L 20076778 5' + roo 8739 2 72.22 ACCCTCTCTTTTGCTCTCTCTTCCTCGCTTCCTATTCCTAGCCGGTTCGCATTTTCTTATCTTCCATTCCGTCCCCGTTCGCGACACGGACTCACACACACACTAGTGCTTTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAG:1 - chr3L 11789284 5' + diver 371 2 76.71 TGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAGGTGAACGCCAAATAAAATA:1 + chr2R 5214960 5' + F-element 77 1 61.64 GCATGTTACAATAGATCAACTAGTAAACAACATATACATGTTCGAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 9242102 5' - roo 9045 1 50.68 GCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTTACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3L 9571674 5' + jockey 81 1 72.59 TTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAAGTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr3L 19274905 5' - transib2 2779 1 53.79 TGCACCTCTCTTCGTTTTTGGGGCCATAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 + chr3R 15590593 5' - roo 8979 2 80.82 TTGGTTACTTGATTTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 - chrX 19231882 5' + mdg3 5270 2 73.10 ATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAA:1 + chrX 18034608 5' + Juan 56 1 49.32 GGAGATATAATAAATCCAAATGATATTTTATAAAATTAAATGCCACGTGACATGCTTAATTTATTCGCCGAGGTTAATGCCTTAAATTCGCCTTAAAAATGCAAAATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGATATCTGC:1 + chr3L 2806883 5' + hopper 377 1 67.81 ATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2R 9332133 5' - roo 337 2 67.81 GAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATATTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAATCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAGAAA:1 + chr3R 15589987 5' + Transpac 5009 2 76.03 GGCAGGCGGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3L 17447413 5' - Tirant 374 2 68.28 TTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chrX 8082396 5' + roo 8752 2 78.77 AGTTGGTAGTATTCTGGTTTTCCTGCTGCACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chr3L 14969341 5' + P-element 22 1 67.81 TACCTGCCGTCTAATTCTTCCGGTGTCCCCGCGTGAATGTGGATCCGCAACCCTTTTCATCTCCAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATA:1 + chr2R 6052584 5' + mdg1 58 2 58.22 AAAATAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATTGAAATGATGACCTCCAATTAAGAACACAAGCCCGTTTTAAGTT:1 - chr2R 15108888 5' - 412 471 2 68.15 AAATCAAACAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2L 17730560 5' + pogo 28 1 67.81 AATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 + chr2L 1327489 5' - pogo 2047 1 54.79 GAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr3L 13597744 5' + blood 7071 2 59.59 GAAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 - chr2L 6074103 5' + BS 42 1 52.74 AAGTATCCCAAGTTTTTGGGGCGAAAGTCTTTTGTCTGTCGGTCTGTCTGTCGGCGACTTGTCTTATCCGTCAAGCAGACAGGTGTGTTGCATACAAACCCACACGCACACACACACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 23623798 5' - roo 405 1 78.77 AAAAAAAACAATTGCGCGCCATTCCCTCAATCAATTGACACATATAATTTGATGCTGTCATTGATACGGATTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTGACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATTCACA:1 + chrX 10940477 5' + Transpac 35 2 51.08 CACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2R 1857480 5' + 1360 14 1 58.62 ATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGA:1 + chr2L 19878170 5' - mdg3 173 2 67.81 GCAAAACTTATTGTGATAAGTGTACATTTGTGTGTTTTGTTTAATTAAAAGATTGAAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 6096452 5' - roo 9052 2 71.92 TCATCACTTGCTGATCGAACAGGGGCTTGCTTTTCCAGTCGGAGAAAACCCGAGTTCCTGTCAAAACTGCATCCGCTGCATACATAGCTCGACCACCACGTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATG:1 - chr2L 722639 5' + frogger 11 2 56.16 AAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAA:1 + chr2R 6984285 5' + HMS-Beagle2 38 2 59.59 TCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2R 13849722 5' + roo 8734 2 67.12 CACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chrX 14385137 5' + blood 7058 2 53.42 AGAAATGCCTTATAATAAATCGATATAACAATAACTAGTTTGCTCAGCTTGACTGTTCATAAACAATCTATTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 + chr2R 10163535 5' - Juan 4166 1 51.37 ACTCATATGAAAGTGTGCGGGATGCAAAAAGGCTGCGAATCTAGAAGGGTTGGGCGGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chr3R 31916186 5' - hopper 1352 1 59.59 AATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 - chr2R 21227431 5' - mdg3 168 2 71.92 AGTTGCTTTTCGCCGGTGGGTGAAAGAACGGTTCTTGCGTGCAACACACGTGGCAGTTCCCACCTCTCCACTAATTTATTTGCTCTGGAATCTGTTGGCCGTGTATGTGTGTATTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAA:1 + chrX 7217557 5' - S-element 390 1 77.40 CTAACACCCAGTTATAGTTTGGAGATGATTACAGAAAATAAAATTAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATTATTATTAGCGCAAAAATTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTATGAAAAATAT:1 - chr3L 25255955 5' - INE-1 400 1 52.74 ACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 29708954 5' + blood 49 2 52.08 GGACGCGGCACACGTGCTTAAATTTTTCCCAAATTGTCGTTTTTTAGCCCTGCCACGGACGCTATTATTGTTTCTGCTGCGCGTTGTCCACTTTATAATTATAGACGTCAATATGTATTCGAGCGATGATGCATCGCACAGAGCGT:1 - chr2L 20288216 5' - Doc2-element 121 1 72.60 CAAGGCCTACCTCAACCTCGGGCTCAGCGGTGTGTGATGGCATCGCTGGTTACAACAAAACTTAATACGGCAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr2L 12277882 5' - 1360 3366 1 51.37 ATTACTCGGAACGTGGCTGCTAAGCGCCTCTAATGCCACTTGGCTGCCAGGAATGGGGCAACAAGGAGCTCACTTCCGCCTGGTTGGAGTGTAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGGATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCG:1 + chr2L 9356777 5' - Stalker4 379 2 67.81 TATCAATATGGAAAACTTGGGCCTCAGGTGGTTTGGATTTTTAAGTATCTGCTAAAGAACATTTAATATTGCCACATAATTAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3L 11669280 5' - pogo 2088 1 54.79 TTGGAGAAAAACAATGAAATTCGTAGACTTATATTTTTAAATATTTTTTTTTCTTTAGCCCTTATAACCATTTTTTTTGTCTTTAAAGCTAACAAAGACTCCGGCCCAATGCTGGCTCAGCACTTTGATATTATGTTTCATACACT:1 - chr2L 18684524 5' - Gypsy6A_LTR 37 1 56.16 CGCCAATATCGATATCTCTTTGTTTGGTCAAGACTGACGACTGACTCATAGCTATATTTTGAATATTTTTCAGAGGTTTTTCGAATTTCGATATTTATCATTTTTTTTTTGTATGTTTATAAAGAAAACCGCCAGTGTTACTGTTT:1 - chr3R 28812058 5' - 3S18 6094 2 72.60 GATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 + chr3L 24153181 5' - Tabor 7254 2 65.07 CGTTCATCAAATTCAGGTATTTAGTGGGTGTCCCAAAAATGCTCCCGAATTCCACACTTGTTGCTGGTACTTTTCAGATTCATGATTACTATTCATGATACATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3R 8367115 5' + Doc 27 1 60.96 CGACTCGCGATGCAGTGGCGTGTTTTTATTTTGGCTTATTTCTACAGTCATTTAGATAATTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 + chr3L 14546326 5' - copia 5064 2 60.27 AATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr3R 29708911 5' + blood 8 2 73.97 GAACGGGGGATGTCCATTAAAATGGGGGTGTCTAAGTTCATCTGTTCAGTTTGTTTTCATTTTTATTTTAAAGAGGTTGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAA:1 + chr3R 13720136 5' - FB 398 1 60.27 TTGTCGTTTTGATAAATTTATTTTCACAGATTTCAGACTCGATATCATCTTTTTCTTCTTCTTCCACTTCCCAGTAGCGATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGT:1 - chr3R 19444969 5' + roo 102 2 56.85 CTTGGCAAGGAGCACTGCTCCTTGTGGCACTTTCAACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTT:1 - chr3L 8253783 5' + jockey 4645 1 76.03 AAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAAAGTGGGCAAAAGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTAGATTTTTC:1 + chr3R 20001666 5' - FB 22 1 69.37 CAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 12261126 5' + jockey 35 1 65.03 GTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr3L 1387098 5' + mdg3 5285 2 61.64 GTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCGCGGCACTCGCTGC:1 + chr2R 16409999 5' - opus 7476 2 61.98 GCTTGAACCTTGGCTGGCGGTAGAGCTCTACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTGGCATTGCAGACAG:1 - chr2L 22298961 5' + baggins 5174 1 52.31 AAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr3R 4913642 5' + 1360 66 1 63.01 CAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr2L 11668711 5' - mdg1 362 2 57.53 CAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGATT:1 + chr2R 5284540 5' - Doc4-element 2591 1 52.05 GCGGCATATAATTGCATAATTCATGCTAGTGGAATTAAACTAGTTCCGCATGGCTTACTATTTGGCTTTCGCAAATATCAATGATAAATATTGTCCGCCATCATAGCGGCAACCAGGCCTCTAGGGCTGAGAGG:1 - chr3L 16884894 5' - Rt1a 4654 1 67.16 AAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAG:1 - chr2L 11867378 5' - BS 4973 1 54.79 CATCTGCCAATGAGCTGTTAGACGGAGGAGCCCACGCAACAGGCTGCCGAGTGGGTGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr3R 14097016 5' + transib2 42 1 51.08 CGCAATGCCCCTGCTCGAGCGCTAGTGCAATGTGCGTGGTGGTGTTGAAATTCCTCTGCTCTGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chrX 15089596 5' + P-element 55 1 47.95 TGCAGCTCTCTTCTGAACTCTGCGTCGACAATTAATGCATAGCCAACCTGTACTGAATTGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTCTTTCATGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGTTATGGGTTATTGGCCGCTCGGTGT:1 - chr3R 3610961 5' - F-element 307 1 62.33 TTCACCTCAGCATAGAGCGAAGTAGATGGCATTTTTTTGCGAATAGACTGGACCGGCTTTAAAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAG:1 + chr3L 12632508 5' - HMS-Beagle2 176 2 56.34 CGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAC:1 - chr2L 11867399 5' - BS 4994 1 58.90 TTTTAATTTCCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 15080145 5' - roo 9045 1 67.81 TTGCATAAAGCGAAATCCAATTTACTTTAACCATTATATGTGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:1 - chrX 17012715 5' + Burdock 77 2 71.92 ATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCCCACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1 - chr3L 19274868 5' - transib2 2741 1 75.34 AAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:2 - chr3R 12363262 5' + jockey 72 1 58.22 AATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTA:1 - chr2L 16685382 5' - P-element 2807 1 30.82 GAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATA:2 - chr2L 9356906 5' + Stalker 6914 4 64.38 TGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 - chr3L 21093254 5' + Ivk 41 1 57.53 CTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chr3R 5087104 5' - P-element 2823 1 41.78 CTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr2R 11379724 5' + jockey 77 1 62.50 AGGTCTTATCGCTATGTCAGCATTATGAGGCGGGTACAGTCAAAATTGGTAAAAAGAAACTCTGTTTTAGCTGTAAATTGTATTGTTGCCTTTGTATTCATTTTGTCCGGGAATTCGTTTAATAACAATAACACACACACACACAC:1 + chr3L 3339733 5' + gypsy3 420 1 72.60 ATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr3R 27503050 5' + hobo 67 1 75.40 GCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCT:1 - chr3R 6842661 5' - mdg1 7364 2 72.41 CTCAGTTATAGACAATTTAAAGTCATTTGCAATTCGTTACATTTTCCTTTACGTAATACACCTCACTAAAGGTCATGCCCCCCACTGCGCTGTCCATCAACTGACGGAGGGCCTAAGGATACCTACGCGACGCACCAGCCTTAGAA:1 - chr3R 9085540 5' - Rt1b 334 1 51.37 CGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr3L 14969269 5' + P-element 94 1 18.49 ATGTTTTAGATTAATATAACCGTTCTTATAAAAGATAGTTTAGTTTCCTGAAATAGTCTATTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 9332228 5' + roo 56 2 57.53 CAATCGATGATTGTTTTTTGGCCTTTGTTTATGGTTCCTTGCGGACTGCACATATTCGTATTTTTTGGGAACGTTAAAGGCGTGCAAAACATGGTTCATTCATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATT:1 - chrX 18697042 5' + R1A1-element 12 1 69.86 GGTGACTCAAGTGTGTGTTCCCCGTCAAAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr2R 19168088 5' + opus 7166 4 68.80 CAGCAAATACAATAACTTTTTGCGCATGTATTGGGGTTATTTTTGAAGAGTTACTTGGAAATCAGCACAGAAAAAGTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTA:1 + chr3L 10076294 5' - X-element 4669 1 51.37 TGCTCGCTATGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 9163971 5' + hobo 37 1 60.00 CCATTTTTAAAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2R 15079984 5' + roo 35 2 60.27 TTTATCGATTGCCACACGGCGTAACTATCTATGCACACTTTTTGCCTCCACCTCCGTCAAGCCGCCGATTCCCCAGTTCATCCCCTACGACCCCCACTCACCCCCTACCATCTAATGTCCTTGGAGGGCATGCACGATTCATAACC:1 - chr3R 11524157 5' - Rt1a 5003 1 76.03 AAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3R 23664520 5' - pogo 2073 1 67.12 ATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chrX 983127 5' - 412 426 2 61.64 ACCAAAATTACAAAGTTAATAAACAAAATAGATAAGACTTTCCTATTGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGCCGAGCTCTGATCAGTATATGGCTGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr2L 20252566 5' - copia 245 1 78.17 ACTTACGCACATTTTATCACAGCCAAACTGGAGACACCGCTGTGTGAGCCTCCTCCTCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGAGCGGCCACAAGCTCTCAACAATCATTGTCT:1 + chr2R 24338792 5' - 1360 450 1 54.79 GCTCGGAGCTCTCATAGAAGCGCTTGGTTCGGGTCTTCTCCACGAAATCGATGAGAAGGATCAGGGGAGTGTAGTTCTGGAGGTGCATCATTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGG:1 - chrX 5753295 5' + Doc3-element 4686 1 61.64 CACATTACTTGGTTACTTGATTTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chrX 19231890 5' + mdg3 5263 1 78.08 GCTTTCGCGATCATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3R 22289477 5' + 412 7111 2 57.53 CTTTCTGTGCATAGGGACAGAGGGCTGGGAATGAGATTGCAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 22867386 5' - hobo 2907 1 62.33 TAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTC:2 + chr3R 23346544 5' - Rt1a 5009 1 53.42 TAACTTATAAAATTAAAAATAAAGACAACAACAATTGTTAAGCTTCAACAGCAGAAAAGAACAACACATTCGACAGCAACCAATGAAAAGTAAGCCAACAGACAGCATAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTC:1 - chrX 10814688 5' - roo 8950 2 73.29 AAACTTTTAAAAGGATTTGCTTCTTAATTTTACTTATATGTATTTGTAATATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3R 9258800 5' + 1360 32 1 63.70 AAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 8397141 5' - roo 355 2 53.42 AAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGAGTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chrX 14756646 5' - pogo 2060 1 54.29 TAATAGCATACATAAATAGATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGAGATAAGAATAGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAAGGTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGT:1 + chr3R 19446692 5' - INE-1 554 1 75.86 GAAATATATGTATATATAAAGACATAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 23431795 5' + roo 72 2 69.18 TGAGGCGGCAAAAAATGTTTTGCGCTAACTTGGCCCAGGGCCACGCCCCCGCCCCGCCCCCGCTGGCAGACCCACTCCGCAACCAGTTTCTAATTACAAAATCTTTTTTTGTTGTTGCAAGCACGCT:1 - chr3R 26761919 5' + gypsy12 10057 2 79.53 CATCATTAGCTACATCCATAAGCTCCAGCGGAGGCCGATGTCGATGTCGTTTAGCATGTCGGCTTTATGTCAATTAATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAG:1 + chr3L 719385 5' + 412 7189 2 54.79 GGCCGTAGCCGTGACGTGTGGATATTGCGCGAAAGTCGGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 + chr3L 9426630 5' + P-element 19 1 71.23 TAATAATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chrX 14908491 5' + blood 7055 2 55.48 GTCTTATAAATTATAAATGGTTCGATTTTGTCTAATCTGAAAGTGTTAGTCGTTTGTGAATGGGGGATGGGCGGGGACAGCCTTAGGAGTCATATATGAGGGAATTGTGAAGATTCCAGAGATAAGGTGA:1 + chr2R 22246542 5' - Q-element 11 1 70.77 GACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chrX 17258330 5' + 297 6620 2 58.90 AATCGCCGCACAAAAAAAGCTGAGCTCTCAACTCTGTCAGTCCTATACAGAGTTTTAGAATTTCTCGCCTCCTGCTAAACGTAGTTACTCTGCATTTAAAAATTGGCCCCCTTAAGATACCAGCATGGAATTCAATAGGGGCCTCC:1 - chrX 22718577 5' + G5A 39 1 63.70 AGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chrX 15167680 5' + roo 8748 2 80.14 TCATCATACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 8542717 5' + roo 8684 2 65.75 AATCTATATATTGAAGGGACTTTCTATAACATTGAAAAACTTACGTTTTAGCCAGGTAAGACTGTAATTGCGGACGGCATTTATTAAAAAATTGTCAGATGAAAGACAAAGAAAAACACACGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATT:1 + chr2L 18570557 5' + 1360 2998 1 56.85 TTTACACCTGCTAGCAGGCTTGAAATATTTTTCATAAATATTTGCTCATGTATATACAATATTTATGTTAAAAATAGGCCGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTT:1 + chr3R 28953462 5' + S-element 217 1 53.42 TAACTAACTTCGTTATTGCCTCAGCATTGTATTGCATCACATCAAAGGAGCTGTATTTAATTCAACTTTATAATATCGAAGAACGCTACATGATTCTACACTTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGCGTA:1 - chr2R 14717936 5' + Max-element 20 2 70.34 TATTGCTTTAGGAAGTGGCAAACCCCTAATAGAGATCGAAGCTTGCATCACAGCTGCGAATAGTTCGATGTGATCTTCTGCTCCGAGTCAATTAAAATTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCG:1 + chrX 11685306 5' + 412 118 2 67.81 CAAATCAAACAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2L 17730561 5' + pogo 27 1 68.49 TCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr2R 23313108 5' + Tabor 6882 2 54.79 AGTCTGTACGTTTAGCTGTTTGTAGAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chrX 8272401 5' - roo 9029 1 54.79 TTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chrX 21213400 5' + Doc 55 1 50.68 TCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTA:1 - chr3L 15322043 5' + Transpac 81 2 73.97 CGAGGTGTTACTGTTGGGGAGACTATATTTTAAAAAAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAG:1 + chr2L 17638674 5' - blood 331 2 57.53 GAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAATCTCAAC:1 - chr3L 17447562 5' + Tirant 8146 2 56.72 GCGTATGCTCAACATGCGTTTGCATAAATTCACGCTTAATTAGCTCTCGCTTCCTCACGCCTAGCTCTCTCTCTCTCTCCCGCGCTCACCAACGCTCTCACTCAGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAG:1 - chr3R 25378510 5' - mdg3 5323 2 74.63 AAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGC:1 + chr3L 3540130 5' - mdg3 173 2 64.38 GCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3R 14088673 5' - 1360 3347 1 56.85 TCCATCGCATATATGGCATTGCCAAATAAATATACTGTAATATGTAATAAGTAATAGCTCGGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGCATCGTTTTATTTGAATAAATCCTATGTTGCTGTATTTGGGTA:1 - chrX 11850515 5' - Stalker2 314 2 72.60 CCTTCTGATTTTAGTTTCTGTTCTTCCTCCTAACTTTATAACTACAATAGTTTATAATTGACAAAAGCTAAAGCTAAATTATACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACA:1 - chr2L 20687159 5' - Ivk 392 1 54.11 GTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:2 - chr3R 9938711 5' - roo 9028 1 56.16 GTATGCAGTGGCACGTTGGCGCTTCTGGCCGGGTCATAACTGATTGGTCATTTGCTAGTGTGTGTATGTTTGCATGTGCTTGGATGGCCTCGTCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr2R 10341735 5' - Transpac 5211 2 64.08 GACAAATAATTCCAATGATAAGTACTTATCTTCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATGTTGTTATCT:1 - chr3R 23449318 5' + roo 8752 2 77.24 GTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATACAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAAT:1 + chr2R 19076532 5' + F-element 232 1 60.69 AGCAGGGAAAACTTGTGAAAAGAAAATAAATACATGAAAATGTCCACTCGAACTGGGGCTTTTGCATCCAACCTAAAAGCTACATAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCAC:1 + chrX 4337602 5' - R1A1-element 5003 1 55.17 ATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATAT:2 + chrX 292427 5' - G3 4507 1 65.75 ATATAGCACTGGCTAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 3762201 5' - roo 9024 2 52.05 GCTTTAAGTGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chrX 18193687 5' - hopper 1376 1 58.22 TTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCT:1 - chr3R 3322540 5' - 1360 3312 1 69.18 TACATTGCCAAGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 - chr2L 8393101 5' + I-element 5141 1 69.18 TATCATCGTTATATATAATAAACAATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTACGCTGTAGCGCTCTGCGCTCTCTCGCTCTCTAAAAAAAATTCGAGAGAGCCTGTAGCCA:1 - chr2L 22633059 5' - 1360 78 1 77.78 TATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 - chr2L 17162855 5' - blood 7320 1 64.14 GGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCC:1 + chr2R 10478665 5' - invader4 3033 2 53.42 CTGGCAAGCTTCCAGGCTTACACTTAAATTTAAGGAGTTTTAATCATTTCTTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAA:1 + chr3L 10370888 5' + copia 4939 2 69.18 CGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGGAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTTCG:1 - chr2R 10478750 5' + invader4 2835 2 68.15 TTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCCCAAGTGA:1 + chr2L 17162769 5' + blood 67 2 62.33 CCTATGCAAGCTCCACCTCAGCATACGGATCGGCATGGATACTACATGCGACACGCCAGGCGAATGAACTCTTGCGACGAGGACTACGAGTAAGTCCACTTATTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTT:1 + chr3L 16720928 5' + FB 401 1 69.18 GGATATTCGTCTGCCAATAGGCAGCTAAGATACAAAAACCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2R 6187979 5' + Tirant 8120 2 74.40 ACATGCTGCATAGTAAAAGAAAATTGTTAAACCCTAAAGGCCATCATCAAATAAAGATGAATATTGTGCGAAAATCCAATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAA:1 + chr3R 26296501 5' + GATE 444 1 53.42 GAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 + chrX 10960210 5' + Transpac 71 2 66.44 TATTTTAATTTCCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 15080147 5' - roo 9047 1 69.18 CAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 15167767 5' - roo 9020 2 55.48 GACATTCGCCGGTCATCGCCCACATAAGTCGCAATGGGACGGCAGAATAAACAAACAAAATGCGAGGACCTAACACAGCCATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCA:1 - chr3L 11859159 5' - G2 2808 1 58.22 ATACCAGTTCATGTGGAATAGTAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr3R 21237873 5' + Doc 8 1 79.45 TGGCTTCGATATGGACTACACCTTGGCAGGTGGGACACAGATACTAACCACACATCCATATACCACATATCCGTATAATGTTGACCATCTCTATTTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATCTTGCG:1 - chrX 18392844 5' + invader4 53 2 63.70 ATTCACTTGATTCACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 10032770 5' + hobo 14 1 71.09 AAATGTAACGTTCGTATTGGAATACAGTAGATTCGTCTTTATTGAATTTGATTTTTCTGTTCAGTTTTACATGCTATATATTTTCCTTCTATAACTTTTTTACGATAGACGCATCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7678853 5' + hopper 144 105 56.12 ATATTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTG:1 - chr2R 5022800 5' - Gypsy12A_LTR 103 1 67.81 CGTGCATAGACGATGCTCATCTTCTTAATTGTTTACCTATTCTCGCTTCTTAAAGAATTCTCCTTAAAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chrX 3506165 5' + Tirant 8161 2 54.11 GACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 22529736 5' - roo 348 2 60.27 CATCTACGTAGAAATCCTCTAGCAAAGCAGCCGATTTGTAACGTGTAACAAAATAAAGGGATGGAAGACGAGAGTACCTGTACTTGCTGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAGCTCATAGCGTTGGGTGTGGTGGTCTTGTTTG:2 + chr2R 1530579 5' - Gypsy12A_LTR 2170 1 72.60 AGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAA:1 - chr2L 9356902 5' + Stalker 69 4 67.12 CCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3R 25271148 5' + 412 51 2 50.00 AAACAAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chrX 10571323 5' + Doc 59 1 57.64 TGCCACAAGTTAAAGTTGCGTCCATTGGCCCGTCTTTGCTCCGCCGAATTGATACATAAGGTAATATATATAGGTAGATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:1 + chrX 7329178 5' + Bari1 40 1 58.90 TTGCATGTACCATCACGTTGATTTGATAATTTGATTGATAATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAA:1 - chr3L 24916723 5' + Porto1 150 1 38.36 AACTGATTCCTTTCGGCCTGAGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 20149832 5' - 1360 3368 1 71.23 TCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr2L 17069619 5' - 412 7459 2 78.77 CAGCAGTCGATGAAACCAACCGGAACCAATTCGCGTTCCCATCCACATCCATCCGCCGCCTCTGTCTTTGCTTATGTGTTTTGTCATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chrX 9709943 5' - pogo 2065 1 64.38 ACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTTTTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTTGCATGGGTGTTGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 9571618 5' + jockey 20 1 69.77 AATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 9616679 5' - roo 355 2 53.42 AACTACGTAAAAAGAGTGGCAAAAAGGGGTGCTGGAAATCGGAAGTGGTGCACAGTGTTGGTGGTGGTGTGGCTGTTCGATGTGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAG:1 + chr2R 18459746 5' - blood 7126 2 64.62 ATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr3L 10814627 5' + 297 6614 2 62.33 AATGAAAAGACAAAATGTCGAATTGGAATATTACGGCGAAAGAGAGAGGCAGTGAGCAGAGACCGCCCCTAAAATATTTATATAGAGATAGAGCTCAAGATAATAAAAAGAAATAATCACGCCAAATCTACTCCTTAACTTTATAT:1 + chr2L 1954849 5' + transib3 2709 1 68.49 ACAAATCGCTGCCAGCAACTATAAAAACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2R 16908453 5' - roo 9040 1 63.01 AGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr2R 15062296 5' + blood 36 2 57.53 AAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCT:1 - chr2R 6984409 5' - HMS-Beagle2 7133 2 62.33 AGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 21421036 5' - roo 343 2 63.70 AAAAAAATCGTATTATTAAATATTTTAGGTTTTTTTTTTATTAATATTTTATTCTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr2L 14008817 5' + pogo 65 1 69.18 GCATCGAAAGAAGGATACAAAACAGCACCAAACTTTAAGGACCTGTGCATTGTACAAGGGGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3L 4175356 5' + roo 61 2 63.70 AAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chrX 9816459 5' + jockey 86 1 69.18 CTTATAAAAAGGCACACAAAACAGGCTGCGCAGACGTAACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chrX 7293339 5' + 1360 34 1 62.33 ATTTTATATTTCAGTTGTATTTTTTCACTAAGGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chrX 23043196 5' - roo 321 2 77.40 CAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chr2R 7404671 5' + blood 59 2 55.48 GATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGC:1 + chr2R 2666327 5' + Rt1a 65 1 58.62 AGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3L 13597723 5' + blood 39 2 59.59 GGTGTGGAAAATGTCTTCACACAGCACACTCCTCTCCTGAAGGAAACTTTGGAGGACGTGTTTAAGGGCCGCGAGCTGGATCCCCTCTTCCCTCAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAA:1 + chr3R 9565520 5' + P-element 2744 1 66.44 TGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr3R 20149723 5' + 1360 81 1 77.21 TTTTATTTTGTACAAAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr2L 12261109 5' + jockey 21 1 75.34 GCCTTCTTTCTCTCTGCCTCTCCATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAAATTGTCTCCAAATACTTTTTAATACTTTGTATGCAAAAACTAATAATTAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGTAAAACTA:1 + chrX 22564594 5' + Transib5 333 1 57.53 CAAGTTTTCCCCCAAACAAATCGCTGCCAGCAACTATAAAAACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 16908438 5' - roo 392 2 73.29 TTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATGGGT:1 + chr2R 7534591 5' - roo 9007 2 60.27 GTGCATCGATGGAAGAGGAATGAGCTACGCTGCCAAGGATACACACCTGCAATACACATATTCTTCTAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 + chr2R 21227298 5' + mdg3 5264 1 76.03 AGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 23507671 5' + 412 7119 2 62.33 TACTGGTTCAAAGAAGCATTCTTTTCAAGACTGTCCCTATCGCAGCTTATATTCGCCCGAGCTTGTTCGAACATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 4722367 5' + roo 46 2 52.08 GTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3L 4869247 5' + roo 8731 2 65.75 TTAAAAACAACAAGGACTGAGTGTAAGGTATAAATCAGCAAGCTTTATATAAATTAATAAATATATTAATCATACCTTAGCCTTTATGTTCCATTTTATTTGTAAATATTCGGACAAGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACATAAT:1 - chr2L 22250909 5' - transib3 219 1 58.22 CAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAA:1 + chr3R 3985687 5' - invader4 2664 1 68.49 CTTGTTGTTAATTTGTCGAAAAAAAAGGAGCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGT:1 - chr2R 15062327 5' + blood 4 2 78.08 TTTGATAAATAAATATTATGCAATACCCAATTTGAGCAGCTTATTTCGTTATTTCGTTTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 20290636 5' + roo 8688 2 69.18 AGCACCTTCAGCGTGCTGTCGCGCAGCTCCTTGTTGTCGTTGAACAGGTTCGACAGGTCAAAGTGTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGG:1 + chrX 2693029 5' + 1360 315 1 56.85 GGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGACAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAAGCAGTGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:1 - chr3L 5498516 5' + Doc2-element 251 2 41.10 CTCAGCGAATAAAATAACATTGTCACTCCAGTCGAGCTGAAAAATTCCACTCGAAAACGATGGGCATATATGTACATATGTATTTTGATTGCAGTATAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3L 18835432 5' + pogo 19 1 72.60 AGCGTACACTAACCGGCAAACGGCATCAGTGACTCTAAATGGTCACCCTAAATTGGTAAATAGCAGTGTGCTTCAGAAATTATTACTTGGACTTGACTTAACATTATATTTGATAAATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAA:1 - chr2L 8197185 5' - Cr1a 3973 1 75.69 ATTGATGGGCCGAATGAGCCATTCAAAGTAAGAGCCATCGTCGATTTACTTGGTATATTTCGCGGAACTGTGTGCAATAAAAACACAAACGCAGGAGTTTGCCTCTTTGGTTTATTTGGTACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTC:1 + chr3R 4956960 5' - invader2 166 2 55.48 TGTATAGTTGTTTGGCCAGCATGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTAT:1 - chr3L 21630460 5' - Burdock 242 2 75.71 GTTTTTAAATTTTAAATAATTATAGTAATTCTTACAAATGAAAAATTAATTTAATCAAATTATACATATTTTTATAGACAGATTTTCATAGACATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:1 - chr3L 23287196 5' + Quasimodo 26 2 67.12 AAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr2L 8397178 5' - roo 318 2 78.77 TATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGTGTATTTGTGGCGAGTACTTACAACCACGGCACCCTATATA:1 - chrX 23280906 5' - R1A1-element 5274 1 48.63 GCCAGGTCGCCCGGAGAAGCTGGCAATTCACACTTCCGCGATTGGTCCACAGTTTACTGATGCTGCTGTTTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAG:1 + chr2R 7165596 5' + mdg3 381 1 54.76 GCAAAAAGGATTTTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 + chrX 6398762 5' - blood 7355 2 49.66 CGCTTATTTTGCAGCACTTTTTCATCTCAGCTGTCTTTTTTTTTTATCGTTACCCTTGCTGCGGTCGTTGCAACGAGAATTTTGCCACATAGCTGACTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chrX 10119683 5' + FB 22 1 66.44 GGCGAAATGCGCGCGAGACAACGAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chrX 8895302 5' + roo 8730 2 63.70 CAATGCACTGTAAATTCACCACTGGGTTTAAATGCAAACAGCTGATTGCAGGCAACAAGTATATCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTC:1 + chr2L 13640576 5' + R1A1-element 305 1 51.54 GTGGCGCGGGGTGGGGCACACAAGCACCTTGCACTTGAAAACCGAAGTGCGGGCAGCGCTGCTGCCGTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 + chr3R 30272931 5' - Tirant 8489 2 73.97 GACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCC:1 + chrX 22726191 5' - Helena 1235 1 53.42 GATGATGTGGTAAACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCCTTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr2L 17638781 5' + blood 7075 2 58.90 GGGAGTTTATTATGTGAGCCAGTTGAAGTCGATGCTGCTGCTTGCGCAAAATGCAATTATTAAAAGTTTTTCAAGTTGTCCGCTCCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 + chr2R 13657637 5' + flea 31 2 64.38 CAGAAGAACTATGCACTCATATGAAAGTGTGCGGGATGCAAAAAGGCTGCGAATCTAGAAGGGTTGGGCGGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chr3R 31916200 5' - hopper 1366 1 52.05 TGTGACCTCTTTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chrX 21668670 5' - mdg1 7444 2 60.27 TGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTA:1 - chr3L 23597291 5' + invader4 4 2 70.55 TATCCATTAAAAATGAAATTAAATTTCAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 + chr3L 11669729 5' - Tabor 7313 2 73.97 GACATGGACATCTATATGGCCCGCAATCCGACGACGCGCAACGGTTTAGTGCCATTATGAGGGCGACTTATCGGATTGTAAGTCTAAATGGCACGAAGTGTCCTTGTACTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTA:1 + chr2L 1606460 5' - Q-element 569 2 52.74 GTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTTTAATACAATT:1 + chrX 19231729 5' - mdg3 228 2 65.49 ATGCGCAGGTGTTTGCTCCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGGAGGCGCAGTATTT:1 - chr2R 12700715 5' + blood 7237 2 80.00 TTCATTTCCCACTCCCTTGGCAGCTCAATTAGCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 + chr2L 14969855 5' - Tirant 359 2 58.22 CCCTCAATTAATCTCCAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 + chr3R 25384144 5' + mdg3 24 2 69.18 CACGGAATCAATTAAATGTTTAGCGACTCGCGTGCTGTTGATCCGCCCCCTTCGCCATCCCCCTTCACCAACCCCTTAACCAACGAAAATTGATACTCCGCGGCCATATAGTCGAGTTTCACGACTATCAGAT:1 - chrX 8686488 5' - INE-1 560 1 79.70 GATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr2R 9332135 5' - roo 8999 2 69.18 GCTCTTTAGAAAATATCAGCGCTTAGATTATTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 - chr3L 14863950 5' - Transpac 5181 2 52.74 ATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 + chr3L 1387133 5' + mdg3 5320 2 60.96 CTTCTTAACTTTGGTGGTGAATAGTTTTTGTCACATCTCTGTACTGTTTTTCTAGCTGAATTCAGGCATATTTTCTCGCATGGACTCAGAAGACAGGTCTTCTAGAATCTGTATGCTGAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCGGAGA:1 - chr2L 22079827 5' - INE-1 152 1 69.18 ATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 + chr2L 17069550 5' + 412 67 2 63.01 TATAAAAAATAATTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTATTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTAA:1 - chr3R 18245514 5' - Gypsy6A_LTR 164 1 72.60 GCAGACGGCCGCCAGGCTAAACAAATGCAAAAAGATCATGAAATATACTTGAAAATATATTTTATATATTTTTAAGAGCATGCAATTTCACAAAAACAAAATATAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 - chr3L 14546470 5' + copia 18 2 73.97 GGCGGTGCGCATACGCTTGGTACACGCTCGTCAAAACATATACACATAACCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGACGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATTCACTCAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr3L 20785541 5' + P-element 69 1 38.36 ATGCGTGGCAAAGTTTTCAGTTTCGGCTTTGAGTCATTGAATAATTACCCACACTTAATGGAGCTTGCAACGTACTATAAATCGAACCAACTTTCGGTTTATTAAATAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGGCTCTT:1 - chr2R 9466448 5' - invader2 5063 2 73.10 GCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3R 4913671 5' + 1360 37 1 60.27 ATGATATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chrX 14756776 5' + pogo 49 1 56.85 ATGATCTATAGGGTTAGCATTATCCTCCTCGGTTGTTTCCTGAAATTTTCTATTGTACTTGAAGATCGCTGTACCTCCGATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chrX 8895143 5' - roo 406 1 76.71 CAGCAACAACAACAACACTACTTCCACAGCGAGTGGAAGACTACCGCTAATAGTCATGGAAATTCGTTATCAGACAGCCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 25662092 5' - P-element 2846 1 60.27 ATTTATTGCTTTTTTCCGTTGAAACATATTTTTTAGGCCAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTA:2 + chr2L 15142185 5' + BS 4710 1 79.45 AAATTTTAGCTCTTGACCACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAA:1 - chr3R 9345691 5' - pogo 2060 1 57.53 GGGTACATATATGGGATTCGTGAAGACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 - chr2R 6559072 5' + mdg3 5276 2 69.86 TCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chr3L 27670251 5' - I-element 5323 1 67.12 ATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 16853401 5' - roo 322 2 77.40 AGGATCCTGCAAAACTATCCTAAGTAGTGTTTAACTATTAGGGACTTTTGCCGACATTTGGTTTCAACTGTGCAGAAAATGTTACCAAACATCATTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAA:1 + chr3L 19484068 5' + Stalker3T 287 1 63.01 TTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 16771429 5' + roo 66 2 63.01 ATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr3L 8253706 5' + jockey 4710 1 74.63 GGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3L 22221118 5' - 412 7529 2 70.37 TATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATA:1 + chr3R 28008265 5' + hobo 89 1 79.45 GATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr2R 18048789 5' - opus 7454 2 52.05 TCAGCAAATACAATAACTTTTTGCGCATGTATTGGGGTTATTTTTGAAGAGTTACTTGGAAATCAGCACAGAAAAAGTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGCAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCT:1 + chr3L 10076293 5' - X-element 4670 1 52.05 TATGATTGCAAGGCATGTAATTCGTATGCTAATTGATAAGTATCGCGAAATACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTTATATATATCTGTGAACAAGATAAACAAAAAAAGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGCGCA:1 + chr3R 23464470 5' + Porto1 198 1 65.07 AAAAGGGAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAG:1 - chr2L 17228709 5' - mdg3 180 2 60.96 AAATGAACATGGGACTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACCCAA:1 + chr2L 1073890 5' + Tirant 8145 2 58.16 AAGAAAGTTTCTGTGGCCTGAGTGTCGTGAGGAAAAGGGAGGGAAAAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTA:1 - chr3R 17316167 5' - 3S18 6076 2 65.00 CGACTTGGTGTCTGCCTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAA:1 + chrX 292370 5' - G3 4552 1 71.92 TGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3L 15058821 5' + blood 37 2 40.41 CTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 + chr2R 18048797 5' - opus 7446 2 57.53 GATGGGTGCGGTACGGTTCGATGGCGTATAAACTAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACAGATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAAT:1 - chr3R 11543674 5' - pogo 1877 1 78.77 AACAATTAAGCAGAGCTTATGGAGGCAGCCAATCAACTGGAAGCCAGCAAAGCCAAGAATTTGGTTGATTTGCATATCTAAGGTATTAGATAAATGACCGTTTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:2 - chr3L 20977491 5' + I-element 21 1 71.92 CACGCTGAAGGAAAAAATAAACTCACAAGAAAAAATTTAATACACCGGAATAAAAGTGTTGGAAAATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 - chr3R 11002180 5' + flea 54 2 55.48 ACTTAACTAATTTATAACTTATGACTGCACGGCCATGGACAATTTTCCATGCCACTACAAAGGAGAGCAAAAGCCAAAATTTGACATGAGTAGCGGTCGTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCA:1 - chr3L 18295064 5' - flea 4740 1 67.81 TCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCT:1 - chr3R 20368074 5' + Max-element 70 2 63.70 GACATGTATAGTTCGTAGAAAAAGGGGCACTGTTTAATCCCAACAGAAAAGCGTAGTGAAAACACAAGCCAAATATGCAAATTTCCATAAGGTTATGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTG:1 - chrX 7150075 5' - R1A1-element 440 1 66.21 TTTTACCTAGTAGCAATTCATCACACGATTGTAGTTTCTTTTTATTTTTACTAGTTTCTGCAACAGTCAGGCCATATAGACACATACTTTCCCACTTAGAATTATTTGTATGTAACACACATACATATGTACATATGTATATATAT:1 + chr3L 18913581 5' + G3 4507 1 58.22 TTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3R 23449266 5' - roo 8990 2 73.97 TAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAG:1 + chr2L 15153226 5' + G-element 34 1 55.48 ACCTAACTCGGCTAATTTTGTTTTTCAACCACGTCCACACACATCAATACTAATACTACTAATACTAATACTACTCTGTACGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACCTTCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGGTCAG:1 + chr3L 23665631 5' - invader1 3721 2 73.10 GAAATCTGTATTATGCTTTATTTTGACATCAAATATCATAAAATATTGGCTAAAGAAATTCAATTATTGGATAATATCTCTGCGTGTACGTCAGTTAACATTATCATATAAATGCCGACCGCGAATTTTTTATTAACTCACGGGAG:1 - chr3R 10380937 5' - HMS-Beagle2 446 1 78.08 AGCTCCGTCTTGGCCAAGTCCCTATTTGCTCCGAAAAGGACCGCGATGTCAACCATATACTTGTAGTATGCCGTCACCAGCATAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGAA:1 + chr3R 4723241 5' - 297 102 2 63.20 CAGGATGGTTATGATTGTAGTAAACAGCCAATTACCATACCCTCTCTTTGAGATTTCCCCCCGAACTCAGGATTCAATCTTTACGAGAAGTCAAGTCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTACAAAT:1 - chr2L 22730925 5' - Cr1a 4046 1 63.01 CCGGCAACATCATCATCGTTGTTAATGGCCATCGTTTAAACACGCCTGATTGATGTGTTTTTTATGAGTGTCAAGCTACTCGAGTCGATTGACTGATGCGAATTGCGCCAAACGACCGTCCCGGGGAACTGTAACACTGCAATAAC:1 - chrX 10569546 5' + Doc 484 1 73.29 ATAGTTTGGTTCCATTTGTAATCGCTCATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAA:1 + chr3L 16157150 5' + Juan 17 1 72.60 GGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAAC:1 + chr3L 1387154 5' + mdg3 88 2 75.17 ATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 + chr2R 9326971 5' + mdg3 5310 2 63.70 AGCGCCGTCGGCTTTCTTCGGTTCTCCGAACGGTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 + chr2R 15613778 5' + P-element 86 1 26.71 GGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 + chrX 11228548 5' - roo 352 2 54.79 ATGGATTGAGGTTTTCTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 - chr3L 20747193 5' - Burdock 193 2 68.49 TGTATGAGCTTTCTGAGAGAGCATGTTACAATAGATCAACTAGTAAACAACATATACATGTTCGAGTTGTTTTGCTTAAGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 9242122 5' - roo 402 1 64.38 ACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAA:1 + chr2R 10478685 5' - invader4 255 2 66.90 TGATAAGATAAGGTGACTCAAGTGTGTGTTCCCCGTCAAAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2R 19168077 5' + opus 173 4 65.75 CCATTTAAGTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3L 14581337 5' - pogo 2080 1 71.23 GGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTAT:1 - chr3R 28033678 5' + diver 72 2 65.07 CCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr3R 9163946 5' + hobo 63 1 63.70 CAATCGAACATAAATTCCTTTAAGTTCGGTTATAATCCTTTATAGTTTCTTGAAAATCATACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 + chrX 7524998 5' - I-element 5346 1 77.40 AGGTGACTGGTGGGCCGCATTACGGCCTTAATTTTCCAAAAGAAGCTTTGATTTAAAGGCAAAACACGGCGACCAAAGGGCGATGAATTTATTGTCAAGCGTATAAAATGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chrX 5206182 5' + 412 7141 2 77.40 CATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTGTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr3R 4913670 5' + 1360 38 1 59.59 GTTTTCAGGGAGGCATATTCATTAGCAATCGTACTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 21924237 5' + roo 8709 2 54.79 CTCTGCTCTGGGGCAACCCTCTGACGGCGTCGACGTCGACGTCGCTTCACTCGGCTGAGCACGCGTCAGCAACAACAGAAACAACAACACTGGCATGCATAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chrX 17258352 5' + 297 6598 2 73.97 TGGGGGCATATCGGACAGTAGATTCCCCATTGGGAGGTTCTCATGGCTGCCAACTAGATGGAAATCGCTGGAGCGGTCTGCAAAACAAAAAAATTTGTACATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATGTAGATTTAAAGTCTAAGAAC:1 - chr3R 13908598 5' - 1360 239 1 54.79 GATTTTAGCAGTCAATTGAGAAGAACGCAATCGTTTAAAAATAGTCTGGCTCTCTATGAGCTGAATTTGCTATTTAAATTTTTAAAATGTTTAATATACTTATTTAGCCGCCGTTTACTGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 + chr2R 10453316 5' - mdg3 224 2 58.22 ACATTCACTTGATTCACCATTCATCGTACTACACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGGGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2L 10032772 5' + hobo 30 1 62.33 ACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAAT:2 + chr3R 17316059 5' + 3S18 5844 2 69.18 TTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3R 31956371 5' - pogo 2062 1 57.45 TCCAGCACGAAGAAATCCGAACGGTACCGAAGCCATCCCCATCTGCCAATGAGCTGTTAGACGGAGGAGCCCACGCAACAGGCTGCCGAGTGGGGGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCA:1 + chr3R 14096977 5' + transib2 10 1 72.60 AGCTTCTCCGCTGTGCTGGTGGAGCCAGCGGTCAAGTGAGCCGACTTTTTGACCGGATCATGCATTGCCTTAGGGCTGGAATTTAATTATAAGTCAAAATATATTAAAAACTGTACAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGC:1 + chr3R 15361513 5' + 412 7425 2 62.50 AGCAGGCCTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 + chr3R 3527039 5' + Tabor 6868 2 68.49 TTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3L 14898844 5' + jockey 37 1 63.70 AACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3L 53069 5' - roo 9003 2 66.44 AAGGAACTACGTAGGTGTGTACGAAATGCGTCGTTTAGAGCAGCAGCTGAGGGAGTCTCAACAGTTGGAGGAGTCTCTACGCAAAATCTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAA:1 - chr3R 5087702 5' + P-element 2653 1 21.23 ACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3L 5446124 5' - roo 8985 2 77.40 AGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACA:1 + chrX 9951374 5' + hobo 80 1 68.97 TTTAAAAGTTATTTAATTTAATCGAAAAGGAATGACTTAATCTGAATCCTTGTTCTTTCCGTGTTCTGTAGAAATATAGAAAACATTTATTATTTTTATAATGTAGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATATTGTTTTGAAGATG:1 + chr4 658444 5' - mariner2 784 1 67.81 TACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAAC:1 - chrX 12558314 5' - Transpac 5144 2 76.03 GCGGCGTGTAATGCAGCTGCTGCTGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr3L 5490935 5' - 412 478 2 60.87 TCCTTTGTCCCACCATGATTTCATGACTGAATTCTGAAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 - chrX 11815089 5' - flea 4953 1 55.48 ACTTCGGTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATAT:1 + chr3R 27845486 5' + Stalker 79 4 70.55 CAGATAGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr3R 5940526 5' + hobo 68 1 61.81 TCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGTTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGAGCTCCACTACGAACTCTGACGAAGAT:1 + chr3L 25232766 5' - accord2 7557 2 60.00 TTCTCTTTCTCTCTGTTATCAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - chr2L 12142680 5' - hobo 2938 1 76.79 GTGCTGGGGATTAAACGAGTTTAGGCTCACTCAAATTTCAATGTTATTTTGCTTAAATCGTCCGTACACGTGTAGCCGTTTTGTCTGTTTTATTTCATATTGGCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTT:1 + chrX 14970649 5' - Bica 200 1 76.71 CAAAGATTTTGCACGTATAAGTGTCTTTCGCCAAAAGGAAATATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGT:1 + chr2L 22696352 5' + X-element 43 1 58.22 ATTGCATTTATTGCATACTATATAGGAATCAAGTATTTGCCCGCTATGCAAGAATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr3R 10357849 5' - pogo 2037 1 63.70 AAGTGGCTTGTGACTATCTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:2 + chr3L 19279074 5' - opus 477 2 71.23 AAGGCGTGAAAGAAATCATAGGGTGGTTCTTCGTTGCCCATAATCAAAAAGAGTTTGTTATCAGCACCTAAATTATATTCAACTTGTGTGAAATTCAGTGATTCAATTGAGGTAATGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATC:1 + chr2R 11702124 5' - Ivk 291 1 74.66 TTAAACTGGCAACTCAGTTGCAAGGGATGGGAACAAGAAATAGAGGTAGTACGAGCAGCATGTTGTCGACAGTATGTAACTGTCAGAAGGAAGCGATTAAGACTATATAAAGTATATGTTCTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCG:1 - chr2L 21328853 5' + INE-1 93 1 52.74 ACGCTGAAAAGTATGCTACGTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 26399919 5' + roo 8695 2 64.38 TTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr3R 9163929 5' + hobo 80 1 75.34 TTTCGAACTTCTCTGGCCAGCTACTTTCGATTTTTTGTCTTGTATGGCTTTATTTAGAGAACACAAAACACAAAATCTCCACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 3006325 5' + pogo 39 1 57.24 TAACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3R 7739639 5' + blood 24 2 69.18 ATGCACGACTTCACCGACAAGGTCATCAGCGAGCGGCGAGAAACCGTGCGGCGGGCTAAGGCCGACGGCACCTACCGACCGCTGAGTGGGTGCACTGACTCAGCAAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCAAATC:1 - chr3L 2477248 5' - Burdock 6085 1 70.55 AGGCTTGGTAACTAGAATTTCTATATTTCATAAATAATAACTGCTAATTATCAAATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACT:1 - chr3L 19279214 5' + opus 7066 4 67.12 CACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:1 + chrX 19231732 5' - mdg3 5445 2 53.10 GCTTTGACGCACATTGCATTCCAGGTCGTTGTACCGCATCTTGAGGTCGAACTCCAATGAGTTGTTTACATTCACAGCACAAGATTTGGGTGCTCCCTTGTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAAC:1 - chr3R 31504542 5' - roo 182 2 68.49 GCGGGGAGCAGGCCTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGGGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3R 3527033 5' + Tabor 6846 2 80.77 TGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 18581257 5' + roo 8712 2 51.37 CCGCAGTGGTTGCTTATCCTTTCGCCGCTGGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2R 20704114 5' - hobo 2931 1 74.34 ACTTAAATAAATAAATAAATAACTACTTGGGAAACAATGCATTAGACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 17158911 5' + roo 8739 2 77.40 CTTTTCCGCTTTTCCGCCTCCCCCGCCTCTTCCGCGGAAAGTGGAAAACTCGATTGGTAGTTAGCCCCACTTGTCTGGCAATTTCCCCCAAACTTCATGCGCTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGAGCGGGGGTCCTCCTTTCTCT:1 - chrX 5440140 5' - accord 7363 2 48.28 TGATTTTCCGTCTGGGTTTCATTTCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 16383428 5' - roo 403 1 71.92 ATTAGCAAGGCTTACCGCTCAGCTTACCAAAAACTTTTGACAGTCTGGAAAGACTTGGTATTTAAACCATAACTAGATTAAATATAATATACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 - chr3L 15891116 5' - mdg3 5469 2 46.58 TAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 + chr3L 20747075 5' + Burdock 43 2 56.16 GGGGTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chrX 22858824 5' + mdg3 5287 2 63.01 AGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAG:1 + chr3R 23020784 5' - INE-1 562 1 64.38 AAGAAACAAAACAAAACAAAACTCATTTCAACACTAAGAAATTTTTGTGGTCGTAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chrX 13846168 5' - pogo 2040 1 64.38 CTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGC:1 - chr3R 9983077 5' + HMS-Beagle 83 2 75.17 AAAGCAGCGCGCGAGCAATGCAACGGAACCTAATCCAGGAGTCAGCCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr3L 5438684 5' + hopper 12 2 75.17 GCACGTTCACTTCCATTAAAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTTATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 9241958 5' + roo 29 2 64.38 AATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3R 6103668 5' + Tirant 6 2 68.75 AACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAA:1 - chr2L 8772827 5' + Tabor 6899 2 56.85 GGCCGCCCCGCCTCGTCCAGCAACCCAACGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAA:1 - chr3R 31071867 5' - opus 444 2 57.53 GTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 + chr2R 10367474 5' + 412 63 2 59.59 AGAAAATTCATGCTCTCGGAGTTTTGTTCAGTAGTTTTCTGTTCAGTTTGTAGTACCAGCCGTCGCTCGGATTGGTGGCGCTTGCTCGGAAGCTATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACA:1 + chrX 2443775 5' + Stalker2 7319 2 63.01 CTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 - chr3L 17447542 5' + Tirant 65 2 68.57 TTTATGAAAGTTACAAATTTACAATAATTTTCGCCGTAATTATGCTTGGCATATGCGCGCATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAA:1 + chr3R 22156635 5' - 1360 319 1 58.90 GCTCTTGTGTATATATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr3R 11526751 5' - pogo 2055 1 50.00 TTCGCTTGTGTTTCGGCTGGCACCAGTTGGCCAGAACTCACCTGGTCCACGTAGTTGTTGCCCGAGAACTGCTTGGTGATCTCCATGTAGTGCTCCGAGTCCATCCGTTTTCATATAGTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 - chrX 17279687 5' + INE-1 94 1 73.29 GAAAACAAATTTCCATACATGCACTTTCCGTAGAATCCCTTCGTATGTGTCGCATTTTGCTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr3R 18903390 5' - pogo 2081 1 61.32 ACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:1 + chr3L 24153137 5' - Tabor 459 2 67.12 ATTTTCTCTTGCATAAATTTGCAGACAGCCAGCCGACGAATTCAGTTAAAGCGACTGCATTAATGTGAAATGAAGTTGTGCACTTTGCCTTGTCAGTCCGTCAGTTGGATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 + chr3L 12250912 5' + flea 4760 1 82.88 GAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 15080027 5' + roo 78 2 72.60 TTGGTGACCCCGTCGAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr2R 7223608 5' + blood 7026 2 73.97 GACACAACCATCAGGCTTGCTATCCATTTGCTTCCAAAGAAGTCCAAGATTTGGTCACCCTCGATCATTTCTGCGTTGAATTATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTG:1 + chr3R 23534333 5' + 1360 453 1 55.17 AAAACGTTGAGGTTGATCACCTGGTAACTTCTGTTTACATTCTAATTCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr2R 18807717 5' + jockey 21 1 74.66 GGGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chrX 12558335 5' - Transpac 5165 2 61.64 ATTAGAAAATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 28008201 5' + hobo 25 1 68.49 CATTGCATTATGCGCCGCAAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 25753578 5' + hobo 19 1 73.29 GCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCGACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 - chr2R 12703838 5' - blood 293 2 73.29 TAAGCGCGCACATTTTACATTTAAAACTGAATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3R 13494456 5' - opus 476 2 57.93 GTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAAC:1 + chr3L 13722045 5' - blood 7301 2 81.51 TCTGTTTGCCAGATAAACGAACTTTAAATACTATATCCGCAGTAATTAGGAAAAAACCAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 9616572 5' + roo 8727 2 65.07 GCTTTCAATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 12608047 5' - roo 348 2 58.90 GTGTGCAGATGGGTGGAGAGTTTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACA:1 - chrX 15814569 5' - P-element 2789 1 17.81 AGTGTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 + chr3L 21097085 5' + mdg3 5283 2 64.38 CCATGACCCCGGACCAGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr3L 17447586 5' + Tirant 10 2 77.52 TCCGCCGAATTGATACATAAGGTAATATATATAGGTAGATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAAC:1 + chrX 7329217 5' + Bari1 79 1 77.40 CCAAACCCGATCCTTAGTCTTTGATGTGAGCCAGGCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACT:1 - chr3L 1387260 5' - mdg3 218 2 67.12 TTTTATATTTTCCCTTATATTTGGAAGTTTGGGTTTGGGTTGTGTTAGTATTGTAATTAATTTGTGATTTTTACGTACAGTACCTGTTGCAAAGATTCCTATTTCCTTCAACGAAATCAGAAGGCTTACAGACGTAAACCAATTAT:1 + chr3L 25912695 5' - looper1 1433 1 51.37 CAATAATTTAAAAGATATTTGAATAGAGTTCAGGTGCTCCAACATTCAATTGAACAATAGAATCCAGATAGACAATTTTCACCTGTCGTCTTAATTGAACAATTAGTTTTGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGAT:1 - chr3L 14871441 5' - R2-element 3359 1 69.86 CTGCAATCGCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATG:1 + chr2R 19076474 5' + F-element 173 1 76.03 GTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGT:1 + chrX 18707449 5' + BS 4761 1 51.37 CGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr2L 18048278 5' + blood 84 2 72.60 CCTTGCAACTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2R 14385551 5' + jockey 35 1 60.80 AGCTAATGATTGTTTGATAAGCTCTCCCCGGGCAACAGGGGATTGCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr3R 25443176 5' + 297 6599 2 72.41 AAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCTTGCCGCGCTCTCTGCAGAG:1 + chr3L 3540150 5' - mdg3 153 2 76.03 GATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTTTCCGCTCGCTCACG:2 + chr2L 23372629 5' - 1360 3304 1 76.03 TAAATAGATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 20704267 5' + hobo 25 1 61.64 AATATATTTTAAACTTGTTATTCAATGCTCACTTTACTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCA:1 - chrX 6937935 5' + hopper 81 1 71.92 GTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTA:1 - chr2R 5022778 5' - Gypsy12A_LTR 81 1 52.05 CAAGTTTAGATGAAGATTTGTTTATTTTGGTATTTATGCACAAGTTTGAAATAGTTCCTTATATACCTTACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr2R 16409996 5' - opus 7454 2 54.11 CTTAGCTCTTTAGAAAATATCAGCGCTTAGATTATTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr3L 14863954 5' - Transpac 5185 2 55.48 ATCGCCTCTCCCGATCTCACCGTTTCTCTCTCTTTCCATATAGCACCCGTCTATAACTTTTACCGCTGCCGCTCCCGCCGTCTGGCTTTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chr2R 17100183 5' + P-element 22 1 65.19 CACCATTAATCAACTGCGAGCAGCGGCGAAAACTATTGTCTCCAGGATTTAATCTGTGTCAGTTGCAGCATGATCACCACCGCAGTTGATACACAAATAATTG:1 - chr3L 24974845 5' - jockey2 438 1 45.63 AATCTATTTAAGTGAAAACAGAAAATATTCTTTCCATTTAAATATATACGAAATGGTTATGTGTAGTAGAAGTGGGTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGG:1 - chr3R 22655103 5' - 412 7350 2 58.70 AAAGGACAATGTCGCTGTCGTCGCCTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATAACTATGATATATCAACAATTATAATACTCC:1 - chr2R 19543719 5' + jockey 4855 1 77.40 GTTTATGATAAGGACTTTAAACATAACGGTGTAAGAGCGTAATGCGCAAGAAATGATATTATAAACTATAAAATTTTAGATATTACTAACAAATGTATTTCTGTGTTTTTTTCTCTAAGTAAGTAAAGGTAAGTTCATTATTAATT:2 + chr3L 19529649 5' - Juan 3892 1 77.40 ATTCGGCAGCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chrX 15089498 5' - P-element 2827 1 41.73 TTTTTTATATGGTGTATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr2L 17069544 5' + 412 7114 2 58.90 ATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAG:1 - chr3L 10076388 5' + X-element 75 1 60.27 AGTTACGTGCCCATTGCCCATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 15167641 5' + roo 8709 2 54.79 ATCCAGTGAGAGCCTAAAGCTGTCCGCGGATGTTCGAGCATCGTTCGCGTTTTTGTTGCATAATATTTTTGGGGCTCAGACAATATATATACGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 - chr2L 5648530 5' + Burdock 6162 2 67.81 ATTTACAAGATGCAGAGAGAAATCCCTTCGATAAGTTAACCTGAGGTTAGTGATATCCATCGGAAAATACATATGTACATACATATGTATTTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr2L 9167394 5' - pogo 2073 1 62.33 GAAAAGAGCGACAGGAGTAAAAGAAAAAGAGCAAAAAGTGTCGATGATGAGATTGCTTTTGTGGTCCATTTGGGGCAACACTCTATGTGTGTATGCGTGTTGGGGAAGGGTGGGCAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAA:1 - chrX 10433454 5' - hopper 144 111 76.26 AAGTGTAGATACAAATATATCAGCCCAAGACTACGAATACGAAAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTAGACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2R 15079993 5' + roo 8666 2 75.96 GCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATC:1 + chrX 10101339 5' + mdg3 5334 2 70.55 GAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 - chr3R 11526872 5' + pogo 59 1 59.59 GGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACAT:1 + chr3L 1387155 5' + mdg3 5342 2 76.03 CATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 14088670 5' - 1360 3344 1 54.79 GCGAAATTTTATATTTGCCACTTGGTTTGGGGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chrX 12558364 5' - Transpac 5209 2 68.70 AAGCTGATAAATAAAGGAGGGATGTGGGAACCGGAGCGAGAGGGACTGGAGAGGCACTCTCTCCCAAACACTCAAAAAGGCATACGCTCACTCTCTGAGATAGAGCCTGAGAGCAGTATGCCCCTATGGGGCATTTGTCCTGTTTT:1 + chr2R 3292697 5' + hopper 4 2 43.84 CTTGCCAGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCTATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTT:1 - chr3L 15099673 5' + G4 3813 1 53.68 CTTGGTCCTGCAGTTGCCACACTGTTGGCACCTATAAGCCTATGCAAACACATACACTCATGCAGGCGGCGCGTTCTGCAATTGAAAATCACTGCGCCTTAGTTAATGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACAT:1 + chr2R 22265464 5' - micropia 140 4 71.23 CACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3R 5245674 5' - 1360 3334 1 56.16 ATTAGATAAAATATATATATATTCTTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTC:1 + chr2R 15097643 5' + INE-1 571 1 67.81 CATTTGCACGGGATTTTGTCAATATTTAGGCCGGAGTTAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 + chr2R 18721948 5' - 412 7464 2 74.66 AATTAAAAGTAAACACGAAACCACAAAACAAAAAAGAAAATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 9163806 5' - hobo 2924 1 74.66 GTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACG:1 + chr2L 1073902 5' + Tirant 55 2 52.74 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chrY 311346 5' - 1360 3362 1 43.15 CGGGCATCACGCATACGCTCCGTGTCCAGGCATCTATGGCCATTCTAATTTAAGCTAACTTATTTCCAAAAGATCAAGAAATTGACCATGCTTACAAGAACAACAAAAGGAAGGAGCTAATATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTA:1 - chr2R 9065414 5' - Gypsy12A_LTR 2063 1 51.37 TGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr3R 24228858 5' + opus 163 4 54.11 GTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3L 17447557 5' + Tirant 8120 2 68.93 ATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1 - chr2L 19930147 5' + jockey 96 1 78.77 AGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTTTATT:2 - chr3L 24368824 5' - invader2 196 2 63.70 GTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr2R 18123419 5' + 412 60 2 58.22 GGTCTGACTGATATATGAGCACTCGCACACAGGCAAAGAACTTTTGTACGGTCTATGCAAATCTCGGGCAGAAAGGGACAAAGTTTTTAACACACCGTGCAAAGCCCGGGCTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGC:1 - chr3L 22142832 5' + Cr1a 4034 1 76.71 ATGTTTGATTGGATCGTGCATAGACGATGCTCATCTTCTTAATTGTTTACCTATTCTCGCTTCTTAAAGAATTCTCCTTAAAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTAT:1 - chrX 3506179 5' + Tirant 8123 2 66.39 GCAGGAGGACCGAAACATCATCACCCTCTATCAGTGTGACAGTTCGCTGAGCGCGTGGACACAGCGCTGCATGCGACAGGCTGACGTTATCCTGATTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATCTGACAATAAATCTGACACCAAATTGAA:1 - chrX 7962103 5' - GATE 404 1 65.75 ACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGGC:1 - chr3R 5765441 5' + opus 52 4 55.48 TTTGTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGGCAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 + chr2R 982297 5' + HMS-Beagle 41 2 56.16 AGGCTTCCAGCTACGTCTTCCGCTTCAGCCACAAATTTTGCGGCGGCAACAGCAGCGCGTGGGTTAAGGCCGTGGTCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGTTGTGGAAATGTATGAAGGGTTTTA:1 - chr3R 31907435 5' - Tirant 352 2 47.29 AGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATA:2 + chr3R 25384186 5' + mdg3 66 2 63.70 ACGAAATATTTTAAATATACTAATAATGAGAAATTGTCCTATAATCTGAAATTATTTTGGGTGGGGCAGCATGGGTCAACAAACTTTCGCTGCGTCTTTGTCTTTAGATTCTGTACGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGT:1 + chr2L 180119 5' - INE-1 160 1 56.16 CCTTGATTTTCCGTCTGGGTTTCATTTCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2R 16383431 5' - roo 406 1 73.97 CCACACTTGTGGCAACCTGTAATCTCCAAAAATCACACCATATGGAGCACGCGCTCTTTACCGCCCACGTTTATTCAAAATTTTTGGGTATTGTGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2L 3006164 5' - pogo 2076 1 67.12 GGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCA:2 + chr3L 24153199 5' - Tabor 398 2 77.24 AGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3L 27391418 5' - 1360 3361 1 61.64 CGGCGGCTAGAGATGAGGCGCAAAATTTGTCATTCTTTGTGGCAGAGAAGAGAGCAATTAAACTCAATTGTTTTTGATAGCAGCAGCAGCAGCATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGCATGC:1 - chr3R 18129086 5' - Stalker4 242 4 64.38 AGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGG:1 + chr2L 22641330 5' + HMS-Beagle2 67 2 64.38 AAGTGTTGTGATTTTTATTGGGGCTTTATTTAGGGCTTTCGGTAATTACAGGAACGATCGGTTAATTGTTAAGTGCTTGCCTGTTTTCTTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 + chrX 13651423 5' - 297 370 2 68.49 AAGTGCATATAGTTGCGTTCCCGATTCCCGATTCCCCGCAAAAACCGATTCACCCCTGAAATTACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 20552776 5' - roo 350 2 56.16 ATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1 + chr3R 24479182 5' - 412 7475 2 67.81 CGTAAAGTGCAGTGTGAACTGCAGTGGTTGAGTGGAGGCTATGGCACCATCATCATCACGGCACCTGGAACCATGAATCAAAGAAAATATTTAGATGTCCTTAATAATCATGCATTCCCCTCCGCGATAGTCTACCTATTTACTAA:1 - chr3R 15139981 5' + Tc1-2 1532 1 49.32 ATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chrX 21668722 5' - mdg1 354 2 64.38 AAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3R 4913653 5' + 1360 55 1 55.48 ATCCTTTCCAGGATAATGAAATTTAACGGTTAAGTGAGCTTACCAAAGCAGCTTAACTTTAAAGCTTGTAGAGCTTTTAGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 6096644 5' + roo 8675 2 78.08 AATTTATGAACAGCTGATATGGCTTAAATACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr2L 2357412 5' + P-element 26 1 68.49 TTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGG:2 + chr2L 17198058 5' + R1A1-element 5045 1 55.83 AAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAAT:1 - chr3L 23583099 5' - looper1 95 1 54.11 ACAGATTACAAATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3L 14043669 5' + Ivk 12 1 77.40 ACAATATATCTGTTTTTGAAGAAAAAAAACAATGCAATATATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAATCGATCTGACCTTGTCCGTATGTCCGTGTGTCCGTCTGACAGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAC:1 - chr4 1078920 5' + INE-1 140 1 75.34 ACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr3R 20292533 5' + pogo 53 1 56.85 ATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGT:1 - chr4 829122 5' - INE-1 143 1 63.70 AATAAAAGAGAAGAAGAAAAAACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chrX 10101280 5' + mdg3 5275 2 69.18 ACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGTGTTAGTGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 - chr2L 17747543 5' + Tirant 8130 2 68.49 CACCACTCAAACTCACAAAATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 + chr2R 24630091 5' + copia 4896 2 64.38 GTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATA:1 + chr3R 10468017 5' - opus 420 2 69.86 CAGCAGCTTAGAAATTAGAATTGCCTGCTTTTCCAAAAGCCCAGAGCTCACCTCAACCCAAAACCCATAAAAAGCCCCTTTTTTTTTTGCGTTCGCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1 - chr2L 9287131 5' - jockey 4969 1 54.93 TCAGCACTTGTTAGAACTTTTTAGTGTGCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr3L 13597701 5' + blood 17 2 74.66 TTCATTACAACTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 + chr3R 17316026 5' + 3S18 46 2 54.11 TAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAG:1 + chrX 19231744 5' - mdg3 5432 2 61.64 TGGACTGGTGCCTGTTTGGAGAGCACAGTGAGATTACTAAGCAACAGTTTGGAGTTGTGCGGTGGTTTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGGAATTTTGGCCGTCACCAAAAA:1 - chr3L 14008298 5' + 1360 3325 1 50.72 GACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAAT:1 + chr2L 16107250 5' + Rt1b 116 1 63.70 GCTAATTGTTCATATTCTTTTTGTTCATTACCTGCGTTCTGGTCATTGCTACTAGTTGTAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACA:1 + chr3L 25190063 5' + 1360 136 1 69.18 CCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTA:1 + chr2L 18235406 5' - F-element 4612 1 62.50 CAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 + chr3L 20785487 5' - P-element 2790 1 19.18 GGCTAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 3762211 5' - roo 350 2 58.90 AATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr2L 18048252 5' + blood 7068 2 54.48 ATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 + chrX 10101344 5' + mdg3 5339 2 73.97 GCAATCAATATCGATAAGATAGGTTGAAACCGATTGCAAGTATTGCTTCTAATAAATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chr2L 7991273 5' + 297 6641 2 63.70 TCAAATAATTGAATGTCAGTCAGTCATGACCACTACATCGGGTATTGTAAAATCTTATTTTTACAAAAAATCATGACTTAGGAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAA:1 + chr2L 8389990 5' + I-element 5347 1 54.79 AAGTAGATGTGATCAAATGTCTAACAAGATGCGTATACATTTCGTTTTTGACGGCTGCTCTCGAGCTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTAC:1 + chr3R 27502972 5' + hobo 9 1 79.45 GTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGATGCTGCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGC:1 + chrX 9788831 5' + HMS-Beagle2 6955 2 67.12 TAAGTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3L 14581342 5' - pogo 2075 1 67.81 AGACTTTCATTTTTGTGAGTGTTGCAGAAACGAACTCCAAATAATTCGCGAGGGTGGTTTGACCTTAACAAAGGTCATAGTTGATCTGCGGCTTTGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTC:1 - chr2R 6741554 5' - R2-element 3121 1 64.80 ATGGCCATGGCTGTCACTGCTCAGTCAGTTGTTTTCATGCCCTTGCCAAATGTATTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr3R 11549760 5' + 297 16 2 75.34 ACAAAAAAGAAAATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr3R 9163833 5' - hobo 2935 1 74.55 GTACATACACATACGCACCTTATCGCCACCGACAACCCGAACATTTCCCACACACATCCATAACTATCGAATTTATATATATGTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3R 28724906 5' - pogo 2066 1 58.22 CGTGGCCTATGGCCCTCAATTAATCTCCAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 + chr3R 25384132 5' + mdg3 5264 1 77.40 GAACGGGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3L 3979528 5' - opus 482 2 74.66 AAGAAACACCCTTTACGGTAGATGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAA:1 + chr2L 5771365 5' + Juan 16 1 74.66 AAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chrX 9816451 5' + jockey 76 1 71.09 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACGAGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCA:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 4888 1 64.66 GATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 - chr2R 8686633 5' + hobo 81 1 78.77 ATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTATTTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTTCGCACGT:1 + chrX 23406393 5' + R1A1-element 160 1 68.49 CCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTC:1 + chr3R 19537484 5' - hopper2 1542 1 60.27 CAGTCTTTAGGACAAACAAGGGCTTTATATCGTCACTGCATTGTTTGAAAACAAAGTTCATTTGCTGCTTGGCTTTGTCTGCAAATGGTCCTCCACAGCCCCAATAACCCTGGTCATCATCTTTCTTATCTACCGTTTGAAAGCCA:1 - chr2L 4679162 5' + gypsy10 5569 1 60.27 TTTCCCTAGAGGTTTTTAATTTTTTTTTTTGTTGTTTTTT:1 + chr3R 18966818 5' + hopper 143 7 85.00 GCACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2L 19424659 5' + Tirant 39 2 54.78 GAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCGGACATTC:1 - chr2R 6187926 5' + Tirant 8194 2 75.34 GCCACTGCCAATGAATATTCAAATAACAAACTTTAATCAATGCAATTTTTATCCAACTCTCTCAGATACAAATGAATATATCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2L 11668692 5' - mdg1 7419 2 56.85 GTCTGCCACACGCTGTGCGCAAAAAGTCTTGCGACTTCCAAGCGACCGAATCGACAAAATGTCATATCATCCACAAATGATTGTGAAATTCCTCCTCCTCAGAAAGGGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chrX 3444233 5' + pogo 8 1 78.32 CAAATAAAGGGTTTCCCCAAGGGAACGAAAAATTGATTGAATTGTAATAATATACAATGGTCAATGCTAATTAGATTAAGGTTGAAGGACTTCTTGGCCTCCAGATATTTTATTCTTAATATGAATAAAAATAATATTAATATTAA:1 + chr3L 3889069 5' + mdg1 41 2 70.55 GGCTTGTGACTATCTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACTATTCAAGATTACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3L 19279078 5' - opus 473 2 68.49 GAAATTATGAACTCCGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 - chr3R 22810794 5' + flea 54 2 60.96 CATTTTGGTATTATTTTTTTTTGCCCCAGCAACGTGTGAAATTCAATTATACAGCAGATTTATATGTCGAGCATGGAGCTGGGTGCATGAGCAGCTCTTCGTTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACT:1 + chr3L 2621276 5' + R1A1-element 5150 1 70.55 ATTTTGGTTCCTGGGCCCCTGCATTAGAAAGTTTTCTCGGATCTGTGGTGCATTCGGAATCACTTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACT:1 + chr3R 28033586 5' - diver 166 2 56.85 ATTTCTCATTTAACTTGTATGTATATTTATGTATATAAATGGAGTTAAGATTTCGAACCGCTAATAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGA:1 + chr3R 28289270 5' - 17.6 250 2 55.48 GATACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGA:1 - chr2L 14969983 5' + Tirant 8165 2 54.11 GATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCT:1 - chr3R 6103639 5' + Tirant 8107 1 57.78 GCCATTTGCTGCTATGTTTGCTTATCGCTTCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGTTTATCT:1 - chr3R 25409550 5' + jockey 97 1 75.86 TGACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 27391434 5' - 1360 3377 1 77.40 TGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTACATGTATGTTTCTTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCAT:1 - chrX 17678734 5' - Rt1a 5018 1 49.32 TGGGGAGTTGACCAGGATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 - chr3R 9958711 5' - opus 7438 2 68.49 TTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 + chr3L 9426703 5' - P-element 2796 1 22.76 GGGCACGCACACACAGAGCCGCTTGAGCAGTGGCAACAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 + chr3L 19274749 5' + transib2 21 2 71.23 ATTGCTGCAGAAGGGGTTAATAGTCGACCAGGGACAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr3L 12863812 5' - Transpac 282 2 67.81 CTAACCGCCTACCATACCAACCCCATCTTGGGGCTTCAACGTATTCCGGCTACCCGGCGTTGCCACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAA:1 - chr2R 17182841 5' + jockey 4576 1 71.23 CCCGCTTAATCCGCCACATAAAAGAGGGGCAATCTGGGGACTTGGGGCCAAGGGCGGCCCACCCACATAATGCAAATTGCTATTATAATTTGCACAGCAGCGGCGCCATTCATATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGG:1 - chr2L 1372048 5' - F-element 4543 1 76.03 GAAGTAAGCTGGCATACGTGGTCGGCAAGTGACCTTCGTGCCTACTCAAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTAT:1 + chr3R 25522153 5' + blood 7385 2 69.29 TTTTGACCGAAGCTCTGGTTGTCCTCTGCCACAGGCAGATACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2L 14970020 5' + Tirant 21 2 72.60 ATCGACTCGATTAAAATGCTGCAAACTTAATTGGGGCCCAGTTTGTCGCACATTCTGGGTGGCCCGGGTACAGTGGTCGCCAATTAAAGGAATCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGGGC:1 - chr3L 7546417 5' + Doc 490 1 62.07 CAAACACAGACAGGCGGACACACATTCTCCCAGTCACACACAGACACACACACACATACACACACACAATGAGAGACGACATTCGTATGGTGTCGGGCGTATGGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGC:1 - chr2L 4110061 5' + Rt1a 21 1 54.86 ATTAATTATTTAGATTATTTATTAGCGCGGTCATAGACCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCGTCTTACAAGCGCTGCATTACAAATTAAATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGG:1 - chr2R 7068764 5' + rooA 7515 2 67.69 GCTGCGTTGGACTACAAGTGCCGAATGCCTCTCTAGCAGAAGGCAAGGGTGGAAAAAAAACAGGAGGAGTGTATAAAAAACACACACACAATGGATGATATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTTTGTAGTGGACGAAA:1 - chrX 18032692 5' - Juan 251 1 65.07 GTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTA:2 - chr2R 6271494 5' + Stalker 7125 4 76.03 GCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAA:1 - chr3R 8402633 5' - mdg1 7391 2 62.07 ACTGCCAGACGCTATATTTTTTATACCGCCATTGTAAGCAGAGTAAGCAGTATTTAAAGGAACGGTATTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGAGGCAGT:1 + chr2R 2959620 5' + Max-element 17 2 39.25 TTAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATT:1 + chrX 5440007 5' + accord 6929 2 75.34 TGTTAATTTGTCGAAAAAAAAGGAGCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr2R 15062322 5' + blood 7020 2 74.66 CTTCTCCAGCCAGCCTTTGTGTGGCCCCTAGCGGTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGAC:1 - chrX 10728942 5' + springer 7174 2 60.27 AGTGCGTCCCTTCAAAAACTCAACTACTTAATGCCCAGCAAAGTATGCTATGCATTTTGGTTGCTGATGTGGCTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 25508444 5' - hobo 2916 1 59.17 GAATTGCATTAAATAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCT:1 - chr2L 15153382 5' - G6 2005 1 69.44 ACATTAGCAGCAACAATGCGTGTCGCGGTTTTGTTTACAAAAATCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGCAGTATACACTTAAAT:1 - chr3R 10140293 5' + P-element 43 1 57.53 TACTTATACTTATATATATCTCAGTGGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chrX 9951439 5' - hobo 2887 1 59.68 AATAGGAAAAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 9938728 5' - roo 9045 1 67.81 GAAATCAACTGTTAGTTTCCATCATCCCATCAAGCAAGCTATGGGGCTTTCTATTGGCAGCTTGCTAATATGCGTGTTCTTAGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 20905507 5' - pogo 2069 1 62.41 AAAGGCAAGGAAAATAAACCGAATGAAAATTGTGCCTCAATATTTTTCACCGACTCCCAGAGCGAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATCCAGC:1 + chrX 14589976 5' - pogo 2052 1 53.15 TTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 15621973 5' + hobo 32 1 60.27 ACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 - chr2L 21237272 5' - P-element 2785 1 15.75 ACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAG:1 + chr2R 10478657 5' - invader4 3041 2 54.11 TACATGTACGATATGTATGAGATATGTGCAGATGGGTGGAGAGTTTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chrX 15814592 5' - P-element 2812 1 34.25 ATAATACTTTTGCGTGTTCATCTTGTGGTTTGTTTTAATTAAAGCACAAAGAAAACAATCGAAAAGGGATCGAAAAAAGCAGAGCACGTTAAATATGCAAGGGAACGGAGCTCTCTGGAAACCGTACTTGGCAGCAGACTGACTGT:1 - chr3L 21423413 5' + Rt1c 5165 1 50.68 CCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr2L 17069537 5' + 412 7107 2 54.11 ATAAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCA:1 + chr2L 12283922 5' + Quasimodo 56 2 57.53 CTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCA:2 - chr3L 3979680 5' + opus 169 4 58.22 TTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr3R 27835659 5' + 412 85 2 73.29 CCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3L 20076884 5' - roo 9032 1 59.59 TACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr2R 21897978 5' + 412 7112 2 58.22 ATTCGTACTCGAATGGCCGAACAGGGGCGTGGCACAAAAAAAGGGGGCTAGAAATATTTTCCAAAGCTTGTTGCATCTAATAAATGGGATCTTATGGTCATAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chrX 7293168 5' - 1360 3373 1 74.66 TAACAACAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 + chrX 10960196 5' + Transpac 55 2 56.25 TTACTCGTGAGATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 - chr3L 21820057 5' + Juan 54 1 54.11 TACTATGTCTGTCGCTCATTTGACTTCTTTTTTATCGTCCATATGCAATCGGCTATCTCAGTGGCTCAATCCATGCTTAAATAATGGTATTCATAGCTGGTTGGAATCTTCATAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTG:1 + chr3R 13884922 5' + Bica 96 1 45.89 CGACTTATGGCGGCCCAATGATCGTAAAAGGAAACTATGTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3R 25753725 5' - hobo 2931 1 72.00 ACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTAT:1 - chr2L 8393082 5' + I-element 5160 1 56.16 ATATATATAATATATTCTGTGGATACTATCTGAATATCCAAACCAGGCGTGCAAAATATGAATTACACGATTCAAACGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3R 21373707 5' + 297 6622 2 49.32 ATAAAACAGAATATTTTATTGAAAAATTTGTGTTGAATATTGATTATTTCACAAATGTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr3L 20925890 5' - Transpac 288 2 70.55 GTAAATCGCAATAAGTATTAAGAATATCCAGGTCGCAGTATATTTATCTCACATAAGAACCAAAAGGACATTATTAATTAATTATTAATTAGTTATTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGA:1 - chr2L 17841122 5' - Juan 4043 1 48.63 CTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 + chr2R 14562083 5' + Burdock 33 2 63.01 CGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr3L 22354427 5' + Doc 63 1 55.80 ATTACATATACTAAACAAAATGCAAACCATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 23043101 5' + roo 8705 2 57.53 AGACGGCAAGTAGAACAGAGGCGAAAAGGTAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 18849740 5' + roo 56 2 58.22 GAATGGCAGTCAACGTAATGACGAAGCGCACCAGGAGAGTGCAAAAGTGACTACTATATTTTCTGATCTTAAGGAATGATACCAAAATTTACAAGACTACTAAAAATGTGAAAAAATATCAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGCAGT:1 + chrX 153391 5' - INE-1 254 1 57.53 ATACATTAAAACAGCAAGGAGCAGCGGCGACCCAAAGCCAAACTTTCCTGAATATATATCGCTATATAAGTAGTTGATATTTGGCGTTGTCGCGAAAGCGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 + chr3R 21570433 5' + mdg3 5277 2 68.49 AATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 26315968 5' + roo 85 2 76.71 GCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAA:1 - chr3L 1387226 5' - mdg3 183 2 58.90 CAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 - chr2R 10991361 5' + jockey 98 1 77.40 ACATAAATAGGAGGAGATAATGGTGAAATTTCTAGGAGAATGTCAACAAAAAGTACAATACAGTTAAATGACACAGCTGTAAAAGTCTTTAACGAACTTAAAGATAATTTAATCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCG:1 - chr3R 2649479 5' + X-element 4501 1 77.40 GAGATATATTGCTTGTAGCTTGTTGCATGTTGGGAAAAATGAGTTTTACATGGACTTCGTTAAAGAATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAA:1 + chr2L 18587071 5' - F-element 70 1 54.79 AATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3L 9241998 5' + roo 8733 2 69.86 CACAGTGGAAAAAATAAAGTGCAACACCAGGCGGAGAAATGAAATACCTTATTTCCTCACAGCCGCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAA:2 + chr2R 11656001 5' - HMS-Beagle 194 2 54.79 GTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 - chr3R 5940520 5' + hobo 76 1 67.81 CTACTGTCCCTATCTACTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGACTAATACAGGTTCCTCTAACCCTGCTTGCCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCT:1 - chr3R 9201034 5' + R1A1-element 4911 1 83.70 AATTTATTCGAGCGTAAGTACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr3L 15371270 5' + Transpac 4961 2 57.53 ATACGTGCTCAAAGTTTTGCATACACAACACCTACAGTACAAGCCATCAGCAGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTACATATGTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:1 - chr2R 982466 5' - HMS-Beagle 234 2 77.08 TATAAACATTTTGATTAAACTCATAACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3R 8402681 5' - mdg1 7438 2 70.55 GCAGGCCAAGATCAACCGCGATGCCCTTCGCATGGTCATATCCTAGGCAACCAGATAAAACATGCAGTCATAAGCTGTTGTTTCAGGGCCCTTTTTGCCACCTTCTTTTTGAAGTAGGTCCACAAATTTT:1 + chr2R 14245949 5' - S-element 1251 1 51.54 AAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTG:1 + chr3R 7739689 5' + blood 72 2 65.28 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGGGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTAT:1 + chr2L 20360644 5' + micropia 149 4 52.74 GATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAACAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr2L 14222322 5' - Transpac 5173 2 74.78 AGCGTGTGAAAATGAGTGGCAAAGTGGTCAAAGAGGGTTGTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 22481381 5' + roo 8673 2 78.08 TTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 - chr3R 5765444 5' + opus 7165 4 54.79 CGCTATGGTCGATTTCGACTCTACTTAGCCAGAAAAAAGCTTCGTAGATATTTTATCTTTTCGTGGGCAGCGTTTGCGACTATATAAGGTATATATATTCTTGATCTGGATCAATAACCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTC:1 + chr4 641294 5' + INE-1 114 1 56.16 AATGTATATGTTGTAATTTAATTTACTAATATGTAGATTATATATATATATACAAAATAATAATTTTTTAAA:1 + chr2L 7023039 5' + gypsy11 3945 1 79.17 CTGGAAATTAAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3R 12578089 5' + jockey 4709 1 57.53 TCCAGCTACTTTGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 18846485 5' + roo 8710 2 54.48 AAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chrX 14908458 5' + blood 7088 2 68.49 CAAATAATTCCTGTGTTCCTCATAACTTGAACTGTTTGTGTTAGCAGTTGCAAAAGGAACTACGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr3R 20905381 5' + pogo 64 1 65.75 TAGCCAAAACAGAACTAAAAAAACAGGGGCAAGTGCATGGCGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAAATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAG:1 + chr2L 5648406 5' - Burdock 6315 2 69.44 TGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr3L 5514187 5' + Doc 75 1 55.48 ATATTTTAATTTCCCCTCAATATCTGACTACGATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 15080148 5' - roo 390 2 72.34 CTTAACATCACAGGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGGCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTG:1 + chrX 22726174 5' - Helena 1254 1 48.94 CAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr2L 17730540 5' + pogo 48 1 54.11 ATATAAATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3L 10814645 5' + 297 15 2 74.66 GAAGCATTTCCGACTTATATTTCCTTTATTTGTAATAGTAATTTTCCTTTTTTATTGTTAAGCGTATTTGAGGAAGTTTATATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAATTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chr3R 21373850 5' - 297 357 2 52.05 CCCATGCTTTTTTAGTGGGTTGCTGATGGATAAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAC:1 + chr2L 12283893 5' + Quasimodo 23 2 70.55 AAACAGTTGGTCCCATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3R 15590656 5' + roo 67 2 65.07 ATGTGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTA:1 - chr2R 5022791 5' - Gypsy12A_LTR 97 1 61.54 AATGGCCATGAAACAGGGTATTTGTTACTAGGGAATATCAGTCAGCAAATACAATAACTTTTTGCGCATGTATTGGGGTTATTTTTGAAGAGTTACTTGGAAATCAGCACAGAAAAAGTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGC:1 + chr3L 10076252 5' - X-element 4711 1 80.14 TAGGGAAATCTGTATTAATCTAGCTCGGTGAATATATTACTTATTGATACTGATATGTGTACATGATTCAATTTAGTGTCAAAGTCTGGCATTTTAAGCGTTTCAGGGTCTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3R 24809840 5' + 1360 11 1 78.77 TTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr3R 18846506 5' + roo 68 2 63.70 CAGTAATTTGACGCCCATTTGGTCGAATAATTCAATTAAAAATTAAATGCAGCCAAAAGCAATATACAGATGCATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAA:1 - chr3L 11913257 5' + roo 113 2 51.37 GGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr3R 8542555 5' - roo 9035 1 55.48 CTGGCTTATTTGGCTAAGCGGGTTCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTT:1 + chr3R 6103560 5' - Tirant 353 2 54.11 ATGCAAGCGACAAAACCTGTCAACGGGAGGGTGTAATATAGGGTATAACGTAGCTAAAAGTTGGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTT:1 + chr3R 17913968 5' + Tirant 8400 2 54.11 GGTAAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTCTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr2R 20913090 5' + 1360 40 1 56.85 ACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr3R 31120281 5' + opus 167 4 56.85 AATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGCCTTTAGGGT:1 - chr2L 11867363 5' - BS 4959 1 63.45 GATACGAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 23099187 5' + roo 8721 2 58.90 CTTCGATCTCAGTGGAGACGAGCGCTCCAGGTCGGACTACGAGCGATCCCGCTCCCGCACTCCAGATGGTTATACTAGGGCCTACGATTCATTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATAGCCGTCACGCTTCCACCC:1 + chr3R 26584716 5' + hobo 2661 1 59.59 AAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTGAGTCCATCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr3L 15322073 5' + Transpac 4970 2 53.42 GTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 11526882 5' + pogo 49 1 52.74 TTTCACTTTCGTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr3R 5940420 5' - hobo 2938 1 78.64 CGCTGACCAAAAGTGGAGAAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 - chr2L 6074120 5' + BS 25 1 63.70 CACGCCTGATTATTTCATTAACTTTACGATCAAACTCCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1 - chr3R 21287296 5' + Doc 93 1 79.45 AGATTTACACACCATAGATTTACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACTTTGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 18849859 5' - roo 359 2 54.11 GAAAATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 21192618 5' + roo 33 2 64.38 AAATATATTTTATATATTTTTAAGAGCATGCAATTTCACAAAAACAAAATATAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAA:1 - chr3L 14546418 5' + copia 4939 2 66.44 TTTCCTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 - chr3L 3540266 5' + mdg3 5267 2 73.97 AAAATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTC:1 + chr3R 23108063 5' + G-element 63 1 60.14 AAAGGAAAAGGGAGCCAGCCCAGCAGCAACAATGTTGACGTTAATAAATTATAAAATGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chrX 9710072 5' + pogo 61 1 63.70 GAAAGGGCTTAAAAACAGCTAAGCACTTCGGCACTCGGGCTGGCGGGCAAAGAGCGTCGACTTAAGCAGATTTAGGGATTAACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACT:1 + chr2R 5849381 5' + mdg1 388 2 60.96 GACAGCAGCCCGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGC:1 + chrX 18707434 5' + BS 4746 1 61.64 GTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCG:1 + chr2R 6984329 5' + HMS-Beagle2 6965 2 73.97 GAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 9938698 5' - roo 9015 2 57.53 TTTTTCATTATTTTTATGTTACTTGTTATTGGCGTTTTTTGTACTTTTGTTTGCCAAGAGCTTATCACGCCGTCATTAAAAATTGTTTGCTTTTCCTTTGTGCTCAACAACTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTTTC:1 - chr3L 10118384 5' + diver2 212 2 75.34 CAAAAGTAGGCAACGTCGAATTTCTTGCTCGCTTTTAATGAGCTCATGTACGCACACACACACACGCTCTGACTGGAAAACCCCGCATGCCACCATGCACACAAACACACACACA:1 + chrX 5548449 5' + accord 180 2 53.04 ACTTTGTATGGCAACACATTCAGGAAATTGTGCCCAACCTGGTGCAACAGGTTGAACAGGAGCTCATGGAGAAACCGGGAGAGGTAGCTAAAATTGAGGCAGAATGAAGCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATG:1 - chr2L 6765468 5' - hopper 392 1 73.29 AATGAAAAAGGGGGCACAACATTTCTGCAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr3R 10778600 5' + mdg3 15 2 74.66 ACTCCGGATCAGATCATTTACACATATAACATTTCACATGCCAGATCAAGGAGCTGGAGCCACGCCAAAGCGCTTCACATATCTGCGAAAGCAACCGTGTCCACTGACCAGCTGCGTTAGATGGAACGTTATCTCGCCATGCTTCC:1 + chrX 20187588 5' - Rt1c 4970 1 53.42 TACGGGGGCAGGTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGACGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr3L 22221280 5' + 412 10 2 76.26 CACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 + chrX 10101304 5' + mdg3 5299 2 52.74 ATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:1 - chr3R 20368068 5' + Max-element 45 2 59.13 ACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 16908479 5' - roo 9019 2 55.32 AAGCTACAAAGAGTAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGGATCGTACGGCTCG:1 - chr2R 1949161 5' - Cr1a 4394 1 67.41 TTTACCCACTGAGAGAACCGAATTGTTTGCACTGGATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr3R 31956552 5' + pogo 9 1 78.77 GTTTGCACTGGATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 31956528 5' + pogo 33 1 62.33 CATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr3R 4913670 5' + 1360 38 1 59.59 AAGGATATATATAAAAGATGAAAGTAAGATTCTCTGATTTTGCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:2 + chr2L 19903309 5' - Transpac 5215 2 47.26 ACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 7739641 5' + blood 7037 2 67.81 ATGAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGCAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAA:1 - chrX 23108345 5' + BS3 1448 1 48.63 ACTCGGTTGTAGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCCGCTTGCCTTCTGGTCCCATGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTATAATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATAC:1 + chr2L 11867239 5' - BS 5075 1 68.49 AATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2R 16891853 5' + jockey 75 1 61.64 GCACATTTGTCACACATTTTAATCTAATTAGGGCTCCCCTTGGAACTCGCCACCTTTTTTTTTCAATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAATAGACTAAAAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACT:1 + chr3L 5202531 5' - Doc3-element 4658 1 58.57 AGCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2L 1229540 5' - opus 476 2 66.90 ACTATAATTTTCCGACCCCCTACCTGCCGTCTAATTCTTCCGGTGTCCCCGCGTGAATGTGGATCCGCAACCCTTTTCATCTCCAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 + chr2R 6052564 5' + mdg1 38 2 60.27 AACTGCATCTGGCGATATTAGGGGGTTGGGTTTTTAATTTCCCCACAGTTTATCTGGCTGCCATTCAATGCCATTTCATTTACTTCCGTTTCATTGGAACTGCCCACCATCTTTCTCTCTTTCGCACTCTCTCTCTCTTTCTCTCT:1 + chr3L 10324984 5' + Cr1a 296 1 77.40 CAATTAAAAATAAAAATTTATCAACTATACTTCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chrX 3529876 5' - 412 7528 2 73.10 TCAATTAAAAAGCAGCATATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr2L 17069496 5' + 412 13 2 77.40 GCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr3L 15371385 5' - Transpac 244 2 64.83 TAAGAATGATTTCTTCAAACTATTTCTTTTAAATTGTGTAATGAACCAATATATGCCTCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAAC:1 - chr2L 21596563 5' - blood 290 2 73.29 CGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGA:2 + chr2R 19076518 5' + F-element 217 1 51.37 AGGCAACACATTTTAATCGAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATT:1 + chr2L 7459553 5' + BS 5058 1 58.90 GGACCAGCGCGATCGAAGAAGGCACCTCTAATGGCGAAGACCTTGCAGTTTATGCGCGGACGTCTCAAACGATAGATGCGCTTACTCATTATAGCTACAATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 23254374 5' - pogo 2083 1 73.97 GGTTTATAAAAACTAAAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr3R 23664535 5' - pogo 2088 1 77.40 AAATGGCCATAAATTGTTGATTGGATCGATTCAATTGAGAACGAGGACGATTCGGTTAGGGAACCTACGTGCCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTAT:1 + chr3L 18843494 5' - Stalker2 144 6 51.37 TAAATAGCAGTTTTTTTTTTCCTGTGCACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr3R 27971006 5' - mdg1 7408 2 53.42 TTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 - chr2L 15833075 5' + hobo 76 1 69.86 GCATATATAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 9958607 5' + opus 153 4 60.80 CGCGATTTATTGGCTGCTCGTTAGCCTTTGAACTGATGCTGATGGATAATGTATAAATTAAAAGGGACACTAGGTTAATCGTAGAGTAAAATCTGACCGTGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGTCGGTATCTCAGGAACTATAA:1 + chr3R 31957302 5' + INE-1 145 1 60.96 ATATGGTAGCAATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAG:1 + chr3R 4913556 5' - 1360 129 1 53.42 CTTAAGTTTTGTAATCCTGCTGTATTGGTTCCTTGCCATTTTAAATTTGGGCAGTGCTACATATTGTAAGCATAACGCTTCTGAACTTTTCTTCATATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACTCCCATCCTTA:1 - chr2R 17867826 5' + mdg3 86 2 63.70 TAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2L 9167538 5' + pogo 62 1 58.90 ATATTAAATATTTTAATCAAGTTTGACCCACCTCGGGCTCTGCATGTTGCACTTTTGATACACCCACTGTAACCCATTTAGGTTCGCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAATTAATGTCCCGTCAGTTG:1 - chr2R 17986389 5' - 297 6947 2 58.90 ACGACACGTTTCATTCATGAGTCAGTCACACCTGAGGCAAATGATGTCAGGTCTTTTTAGATATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr3R 27503128 5' - hobo 2925 1 64.76 CTGCTGTTGGGACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCGGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTGTTCTTTTGATTTGAGAG:1 - chr3R 25271244 5' - 412 415 2 72.18 AGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTA:1 + chr3R 25876886 5' + mdg3 5338 2 74.66 AAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 - chrX 3529827 5' - 412 425 2 62.33 AATTTATATGAGCAAAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 - chr3L 13597886 5' - blood 356 2 70.55 AAAGGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCGGGGTAAACAC:1 + chr2L 22641320 5' + HMS-Beagle2 42 2 51.91 CGCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chrX 16853418 5' - roo 348 2 63.50 GTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr3R 22429205 5' + roo 91 2 79.45 ATGCCACTCAAAGTTGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAG:1 - chr2L 20841989 5' - G6 1966 1 53.10 TTTGTCCCAAATTTCGGGCCACAATGCATAAAGTGCAGCTCTCAAATTTTTTTTATACACGCACATTAAAGCTCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chrX 21086084 5' + jockey 4721 1 49.32 TCCATTTTTTATTTGCGAGTGCAATTGTTGCATAAATCAAGACGACTTTCACGCATATAAACAGTGCAAAGTGTGCGTAACGAGCGTTTCAATTTAAGATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGTGTGCTCTAC:1 - chr2L 16121647 5' - Rt1b 5022 1 67.81 AAGCAAAGTTTAGTTTAGACAACTTGCTAATATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 - chrX 21205114 5' + 1360 3 2 71.07 TGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr2R 18722035 5' + 412 54 2 54.79 CTTAATTGTAGACCAAGCGTTTTATACCGGTGATCAATTCCTCTTTAGTGGCATACCACCCTTGTATACCTTCTATTTTTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 21400214 5' + pogo 39 1 58.90 GTTCGGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGGTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 - chr3L 21093270 5' + Ivk 23 1 68.06 ATATATATGTGGGTGTGCTACTTTTGGCTAAGAAGATTACCCACTGTACAAGTTGCTGGGCCGTCAATTGTAATGAAATGAATGTAGGTTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 + chr2R 21897844 5' - 412 7516 2 58.90 AAAAAAAAAAATCAAATTTTTTGGATTCTTGAGTCATACCAGTAGTTAGTATGG:1 + chr2L 11000737 5' + transib2 2680 1 85.19 CAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1 - chr2R 14562224 5' - Burdock 6333 2 61.64 CAAAATCTCTTAACTATATATTTCTATCAACTTTTTTAATCCCCGTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chrX 12843668 5' - roo 8994 2 71.23 TAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:1 - chr2L 8772814 5' + Tabor 73 2 65.75 TGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGTAGACAAGCTCCAGAA:1 + chr2R 19633184 5' + jockey 4617 1 55.48 GTTTTTAATAAATATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 23664370 5' + pogo 48 1 51.37 AACAGTAAGTGCGGTGTAGATTGTGTTAAATTAGGCATTTTCTGTTGAGCTAAATTACTTTTATGCCAGAAAGGAGCATTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGC:1 + chr3R 31657767 5' - roo 459 1 53.42 TACCAAGCTTTGAATTTATACCCAAGACTCGAACCACACAAAAGCTAACCGACTGTTATACGGGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCT:1 + chr2R 8519037 5' - Doc 4584 1 56.25 TTGGCAGCCAGAGGAGGGGAACCCACCTGGAGGGGGAAACATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAAGTACATCTAGCGTACAAAATGT:1 + chr2L 18163770 5' - HMS-Beagle 172 2 67.81 AGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3R 25271165 5' + 412 52 2 51.72 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATAT:1 - chrX 12649915 5' - blood 156 2 81.36 TAATTTTCCATCTATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr2L 18370311 5' + Doc 43 1 59.59 ATTTTCTAGTGATTTTACGGCTAACAATTTGCCTGCCATTTGCCATTTGAACTTTTTAATTTTGTCGTTTTTGAAATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGATGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCT:1 - chr2L 7271302 5' - G5 4614 1 50.68 ATAGTAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr3R 21237856 5' + Doc 25 1 67.81 ACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chrX 983204 5' + 412 79 2 70.55 TTAAGCTGCTAAAGCAAACAATTCCTCATGCAGCTACAAAGCGTCCTTAATGTGCACCTGTATGTGTCTGGGTGCTGGGTGCGGTTCAATGTAATTTAATGGATGGCCAACAGACACACACACACACACACACACACACATACATA:1 - chr2L 12844714 5' + Quasimodo 38 2 70.55 GGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 22481233 5' - roo 9006 2 65.75 CAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGCGGTGCCCCGCGTCCAAGCGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 + chr3R 25384179 5' + mdg3 5311 2 58.90 AGTTTTCCCCCAAACAAATCGCTGCCAGCAACTATAAAAACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 16908440 5' - roo 390 2 71.92 TACTGAGTTAATAATACAAATACTTGTATTTGATACCATATTGCTTATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGT:1 + chr3L 16264556 5' + Burdock 16 2 74.66 ATGTTACAATACAATACAGTTGAATATATACTAGTTAAATGTACATATGTTTTATAACAGCTCATTGGCTGTGTTTTAATGGTTTATAAATGTAATCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACA:1 - chr3R 18913345 5' + 1360 3197 1 65.07 GTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAA:1 + chr3R 9289304 5' - HMS-Beagle 176 2 67.12 AAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 6096507 5' - roo 8997 2 66.44 AGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCC:1 - chrX 22386787 5' + hobo 54 1 60.00 TTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACAGCAATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr2R 981768 5' - 1360 3356 1 58.62 ACTTCGAATTAAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATC:1 + chr3L 19146603 5' + pogo 97 1 60.96 ATGAAGCAGGAACAACCCAAACACGGCGAAGGCGTAGCCAAAACAGAACTAAAAAAACAGGGGCAAACAAATGAAAATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 + chr2L 5648372 5' - Burdock 215 2 56.85 CTGCTCGTTGTAGTTGCTTTAGGTATGCTTTTGTTATCCTGTCAGGATTCGCTGATGGGGAATAGAGACCCGGGTCAGCCGAAAAGGTTAACGAAAGAAGTTTGCCCGGCAATCAAGCGTTGTGTGTTATTTTCTGTTTGCCAAAC:1 + chr2L 18622803 5' + Cr1a 43 1 66.44 TGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 23099100 5' - roo 335 2 73.57 TATGCGTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAAATTGAAAGTTGAAAATGTTTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAA:1 - chr4 829457 5' + INE-1 155 1 51.03 ATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATTCA:1 + chr2L 17550622 5' - Transib-N1_DM 432 1 79.45 GAAATGCCGACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAAC:1 + chr3L 24272047 5' + gypsy11 60 2 66.44 AGTATACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGT:1 + chrX 13762576 5' - P-element 2801 1 26.71 ATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr2L 12481515 5' - pogo 2097 1 66.67 AAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAA:1 + chr2R 5582148 5' + Cr1a 467 1 59.59 GGTGCGCGTTTTGTGTGGCCATTTCAATCTTTAATTCCAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr2R 14562289 5' - Burdock 6376 2 44.52 ATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr3R 8705830 5' - hopper 1369 1 54.11 GGTTGGAGTACCAGTTCCAGCGACATTTTTGGGAATGGAAATTTGAGTATGTGAGTTTTCACGGCTTTTGAAAATAAATGATCCAGATTTTGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAAC:1 - chr2L 18740414 5' + flea 4741 1 61.64 AGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 + chr3R 28008253 5' + hobo 75 1 70.83 TGGAATGAAGAGAAGAAAGCGGCTCGTAAGGGAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chrX 983253 5' + 412 30 2 63.70 ACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:2 + chr3R 10140200 5' - P-element 2809 1 28.77 AGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:2 - chr3R 9482091 5' - roo 8991 2 73.97 CTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr3L 15371406 5' - Transpac 264 2 54.11 GGAGGGGAAACCACCTGGAGGTGGTAACATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCC:2 + chr2L 18163782 5' - HMS-Beagle 6956 2 78.77 AAAACTCATTTTTTGAACATTAGAAAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chrX 13651617 5' + 297 6591 2 77.40 TAAATGGCTTGCGCTCCGATTTCCACTGCAAAAGGTGTAAGAAACAATATCAACGGGGAGGAAAAACAAAAAAAATGGCAACAACACGCGACTAACAAGCATTGAAGTTTAATAAATAGAAAGGGGTTCCCACGTAGGCCACGGAT:1 + chr3L 9215927 5' - Rt1b 309 1 79.45 TACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATT:1 - chr2R 5924444 5' - jockey 4718 1 43.84 ACGCACCTATAACAGTTTGAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr3R 13358708 5' + mdg3 43 2 56.55 GCCAAGCGTTGCCGAAACGGGTGGGACGCAAGCCAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGAT:1 - chr3R 9479804 5' + roo 225 2 76.71 CAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAA:2 - chrX 10728904 5' + springer 7212 2 69.18 AAGCAAGTTACGTGTGGGACACCTAAGCGTGCAGTTTTGAACAATGGACACACGTTACCTTTTTCAAAAGTGTGGGCTTTGCATTTTTGGGCGGTTTGATGATATGTATGCTAAATCTATTTTTATAGTGCCTGAGATCTCGACGT:1 - chr2R 5802820 5' - INE-1 143 1 59.59 TTTACCGGGCTGCTAATAATGTAATTGTAATGAATGAATTAGTGGGGAACTCCAAGGGAGAGCTATACTTCGTTGGAAATTAAGGCATTTAGACAATAAAGACTTATTTAGATAACCTGGTAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTC:1 - chr2R 21672427 5' + jockey 488 1 75.34 CTGGGCTCCACTCGTAAATTACAGCCAGCTGGCCCGAAGGAGGGCGTGGAACTTTGGTTTGGGGAGCCAAACGAAAATAAAAATAATTTTTAAATGAACACTTTAAATGAAACCGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATACTGCGTT:1 + chr3L 19049683 5' + X-element 353 1 64.38 CAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGC:1 + chrX 9955485 5' - accord 7025 2 39.22 TAATTTTCCGGCCGGATATCTGGTTCATATAATTATAAATATTCAATATGTGTATCAAATATAATGTTTTTGTTGAACATTCCGATGTGGGTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3L 22676238 5' + 412 32 2 63.70 ACGAAGCGACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATTTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3L 131826 5' - P-element 2856 1 58.54 AATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 - chr2L 19878251 5' + mdg3 69 2 64.38 GAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 23099107 5' - roo 8986 2 79.45 AGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2L 1229554 5' - opus 7464 2 56.85 CCAAAGGCAAAACTTGGCCGAAACACAGGCATGTCATTTGGTTTTGTCTGTTTCCGATTTGGTACTCAATGGAATGGCAAATGGAATTCTGTGTCTCGTGTTTTAAACCCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr2L 19868693 5' + mdg3 5282 2 78.77 CATCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chrX 19231696 5' - mdg3 228 2 73.29 GTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGTAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTTACCTTGATATGACCACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTC:1 + chr2R 18048825 5' - opus 417 2 72.92 ATGGCTATTAAATGCGATAAATGCAAAGACTGTGATAAGATAAGGTGACTCAAGTGTGTGTTCCCCGTCAAAGTTTTCGGATTTGAGTCATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr2R 19168045 5' + opus 28 4 65.07 AAACAGGATAACCCAATCATTTATGATTATCTATCCCTTACATATCCTCCATTGTTGACAATCCTGATGTCAATCTGGCCACTGCCATCGCTTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGA:1 + chr3R 8772207 5' + Doc 188 1 63.01 GAGCTTCGGCGAATAAAGAGCAAAAAGCAGCCGCAAAAATATTTATAGAAATTCGAAACAACAAAAAACGTGGCCAGAGGAAAGAAATTGAAAGCTCAAAACGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCG:1 + chr2L 11682404 5' + Tirant 8267 2 71.23 TTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3R 29708939 5' + blood 36 2 54.79 GTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATTTCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTT:1 + chr3R 9983012 5' - HMS-Beagle 6967 2 68.49 AGACAAACGGATCCATTCATTGCACCCGTATGACTCAACCCGAGTCAATTCAACTCCTGGGGCTGTGATACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGATTACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCC:1 + chr3R 15631820 5' - Stalker4 7151 4 53.42 AGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAG:1 - chr3L 21630402 5' - Burdock 6315 2 71.92 GAGCATTTCTAATCGGGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATACCAGTACACTTACAACTCAGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:1 + chr2R 982292 5' + HMS-Beagle 36 2 59.59 ACAATAATCGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCGACTGCGTTTTTCTGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTATTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chr3R 10541221 5' - hopper 1391 1 67.41 TGATTCATGACCAAAAGCCACAGAAATGCCAAAAATAAAAGCAAAACTTTGAAAAAAGAAGAATAACTCGAACAAAAAATCAAATGGAAGGCAGAAAAAGTTGCTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTGTTGTTGT:1 + chr2R 19902500 5' - mdg1 29 3 71.23 AGGTGGCACAACATTTCTGCAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTTTTCCTTTACTCTTAGT:1 + chr3R 10778608 5' + mdg3 5273 2 71.53 GAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGGTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 - chrX 13762615 5' + P-element 95 1 20.55 AGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr3R 15514618 5' + 412 60 2 57.53 GCGGGGCACGTCATTTTAGAAGGTGGAGAGTTATCTAACCCACAAATATAGCAATCTGCCCCAAGCTATAAAACACTTCCTTTGCTCATTACCTATTCGGTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATA:1 + chr3R 4068968 5' + diver2 4888 2 59.59 GAGAAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTT:1 - chr2L 6074105 5' + BS 40 1 53.42 AACCACACGCGTTATCTGGCTCTCTTTCATAGTTCGCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGTGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 - chr3L 13227725 5' + hobo 44 1 55.48 ACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr3R 20292413 5' - pogo 2048 1 58.22 GTTAAAGGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAA:1 + chr2L 22641317 5' + HMS-Beagle2 53 2 55.17 AATGGTTCATTTCTATTAAGACTGCTTATTATAAATTAATTTATATGAGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGC:1 - chr2L 19372120 5' - Bari1 1637 1 65.75 CCTTTTAGTTTTTGCAGTTAGTTGGGCTAGATTTGCATTTTATTTTCCAGTGTATCTGCTGACTCAATTGTGTGAGTATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGGTACTGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAA:1 + chrX 8196579 5' - McClintock 6158 2 46.58 CATTAAGTTAAATGAAAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr2R 5237947 5' + Doc 31 1 69.18 AGGAAAGGGCCATCATTCTCACACTTTGCAATTAGTGTCAGTCCAGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAAT:1 + chr2R 13078817 5' + BS 4736 1 69.18 CTGAGGGACACGTGGAAGAGCTGGTGCTTGGTCTTTTGTTGGTCGAATCGGGAAACCATGATTAAATGCAGATAAATACAATTTTGGTAAATCTTAAACTTGGACAATATATAGGCAACCTAAGAACACATGAAAATAACTTAGCC:1 - chr3L 19612588 5' + G4 3629 1 75.34 TTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAG:1 + chr3R 10468025 5' - opus 7417 2 75.00 AGGAGAGGAAACACATAACTTATACGCGTTCTTGTCTCTTGTTTTTACTCACAAGCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:2 + chr3R 1271932 5' + roo 65 2 63.01 GAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 9482107 5' - roo 9008 2 62.76 ATTACTTATGGAAATATTAAATATTTTAATCAAGTTTGACCCACCTCGGGCTCTGCATGTTGCACTTTTGATACACCCACTGTAACCCATTTAGGTTCGCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAATTAAT:1 - chr2R 17986402 5' - 297 379 2 67.81 TTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr2R 15392812 5' + blood 7065 2 54.11 GTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGT:1 + chr2L 8397158 5' - roo 353 2 58.02 CGAACAACTCAATCAACCTTTTTTCGCTGTCTAAATATGAACTCGAGTAAAAGTGGACTTATATACAATTTGGCGTTTCCTTCTTACCACTGCTAATCTATTTTACCACTGGTTGGGCGCCAATTAGGAAAAGGGTTGGCCGGCGG:1 - chrX 1185403 5' - gypsy2 329 2 71.23 ACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACA:1 + chr2L 12283928 5' + Quasimodo 62 2 61.64 GAAAGGCACTAGAGGAAACAAGTTGCACATTCTGTCCGGAAGTTCAGTATTTGTGCTCTATTTGTTAGACCAAGGGGCACTGATAAATATGGTTTAATGCACTTGTTTGATCTATTCCTGATTCATAACTGAACTTGGTGTGGTCT:1 + chr2L 18262861 5' - mdg1 299 2 72.60 ATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTTCGCAGATCGT:1 - chr2L 19930154 5' + jockey 87 1 72.22 GGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACA:1 - chr2R 2949106 5' + 17.6 7010 2 76.03 GCAGATACCCAAACCTACCGAGCATCGAGCCCCCAGCTCCCAGGTTTCCCAGGTCGTACGAGCTTTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGG:1 + chr3R 21797006 5' - opus 7322 2 51.16 GCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 8397148 5' - roo 398 1 62.89 CGTAATGGTGGTAAATGATAGTGCAAATAGGAATACCAATATCGTGTGTGCCAATAAAATGGCACTGTCTGTTTGTCAGAAGAATCCAAATTGAAAGCATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chrX 11814936 5' + flea 19 2 72.60 CACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTT:1 + chrX 4589440 5' + Burdock 84 2 80.14 CTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 28008326 5' - hobo 2920 1 52.43 ACATGGCTGTTCATCATCTCGATTATTGGATACATTTGAAGAGCTTTGCTTGGAGTAAACCATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr3R 6068228 5' + jockey 4685 1 76.71 CAATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCG:2 + chr2L 17198052 5' + R1A1-element 5065 1 59.59 AAATTAGATGAACAAGTGTTTTATCCAATTATGTTCTTTGGTATTTTGTGATTGCACATTAATATGGCAGTGATGAGCCAATTTTTAGTTAGCACACTTTGTTTATTGCATTGTAAAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 + chr2L 3734399 5' - mdg3 244 2 82.19 GCCTCTAATGCCACTTGGCTGCCAGGAATGGGGCAACAAGGAGCTCACTTCCGCCTGGTTGGAGTGTAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGA:1 + chr2L 9356802 5' - Stalker 7203 4 53.42 GACTTTATATGGCCAAGCGCCGAGCGACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 - chr2R 13574872 5' - diver 6072 2 55.48 TAATATCAAAATGCCGTAAGACGACTTAAAGCGCAATGAATAAAAGGTTGCCGCTCCAAGCTCACATATGGCAGTCGTATCGCATAAAAGGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAACATTAATACCTCCTAAA:1 - chrX 18193841 5' + hopper 30 1 60.96 ATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chrX 21668728 5' - mdg1 7386 2 68.49 GTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGC:1 - chr2R 2949121 5' + 17.6 64 1 64.79 AAATTAGTAGATTTTTCATGCTTATAAATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACA:1 + chr3L 19146613 5' + pogo 107 1 67.81 TGAATATATTTTATTCATATAAGCGTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 19930207 5' + jockey 35 1 65.75 ATCGCGATTCTTGTCCAAGAAACCGTCCACACAGTACCACACCTGACCCGCATAGTGGGTCACCCCAAACTCCTGGGCACCGACACAATAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGGCTTGTTGCATATCTATAAAGAC:1 - chrX 10943267 5' - Helena 388 1 59.71 ATCCGGGGCAAACAGGGCGAAACTTTCGATATGTGTGTGTGTGCTGGATGGCTTTCGCCTCTTGCCACTCTCATTCTCCAAAGGGCCAAAAGGTGTCAAAGTGCGTGTGCTCAAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCA:1 - chr3L 9227631 5' + G2 83 1 77.40 ACCATATGATCGGGGCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1 + chr2R 10478634 5' - invader4 305 2 69.86 CCCGTCGAGAGTGTGGAGGCCACAAGCGACCTGTGTAGATACACATGCACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAAAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chr2R 6187941 5' + Tirant 41 2 55.65 CTTATAATTTGTTAATTTGTTAATGCTAAGCTTAATCTACCTAGTTATCAAATAAAAAATGTCACTCTACTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr2L 1327484 5' - pogo 2052 1 51.37 ACCCGGCTAAGGCAAAACTGCTAACCGAGGTGCAGCGAGGCAAAAATCTCGAGTTGTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTA:1 + chr3R 17615872 5' - Doc 4425 1 62.76 ACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr2R 14385576 5' + jockey 82 1 67.81 TTTGCAAGTTTCTGCCAACCGAAGGCCGTCCAGGCAAAGTCGCCAGACGAGACGAGCCAAGACGAGACACACACCGCATTTCGACGTTCAACGTTGCGTATGGAAAATGTGAAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAA:1 + chr3L 6138944 5' + Quasimodo 498 2 79.45 ATCCAAAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:3 + chr3L 20747053 5' + Burdock 21 2 71.23 AAATCAATCATACGGAAATAGATCAACTCGTCGTTGGGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr3R 16194072 5' - mdg1 7449 2 77.78 CATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3L 9426778 5' + P-element 53 1 50.00 CGGGCTATCGATAGGCGACTGTCGTGGCCAGCTTGGCAAGGCAAGCAGATCGTCATGGTGGCCACTATTTCACTTGCCATATATTTAGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAG:1 - chrX 4473241 5' + 412 7174 2 57.53 TCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGCAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 + chrX 19231698 5' - mdg3 5481 2 72.03 TTTCATCCACGCCAAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCC:1 - chr3L 4738482 5' + Idefix 50 2 56.16 AAATTCTCAACTTTTGATACCGCTTTCTCAGATAATGAGAGTGCATGGTAAATTATAATATAAAACAAGAGGGAACGCTATATCAACACATTTTTTAAAAGTGTGGGCCTGACAGTTTTCTGCGGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGGC:1 + chr2L 21284557 5' - INE-1 218 1 54.11 GTGGATCCAAAGGGACTGTTTGGGTGGGTTAGGCTGGCTAGGGGCATCTTCATTGGTCATAAAAAGGGCGTTAAAAATTGCCATGTAAAGGTGGGGCCGGAAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3R 31956916 5' + pogo 15 1 71.23 CGAAGACCATGTCCACGTCGATGAACAGAATGATGTCCTCCTGACGAATGTACGAGGATCTGGCGGCCACGTCCAGGGCAACGCCACGGGAAAATTGTTGCTACAGAGCCGATGTAGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCG:1 + chrX 15586605 5' - invader2 77 2 63.01 TCTCTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr2R 8686592 5' - hobo 2892 1 73.68 AAAGTCCCAGACGAGCCGAGTGGTTAGCTTAGACATTTTGTAAAAGCGGGCGACAGGTGAGAATCGTGACTCGCATGTGAAGCAAACAGTGCATGTAATAATTACCGCGCAACACCCACTTGGCTTCGAGCTCCGGATAAAATCAC:1 + chr3L 13823245 5' + Doc3-element 30 1 63.01 GTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr2R 20913109 5' + 1360 59 1 56.85 CTAAGACCATTTACTTGCATCTCTATAAAAGAATTAGAGTAAATTGCACTCAGAAGGATATATGCTTATTTCATACTTACTGTCCAACCACTTGGAGTCGTATTTCATACATTGTGACACTTAGTTGCAAACACAAATAAACATA:1 - chr2R 16529299 5' + Stalker2 73 2 72.41 TGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCG:1 + chr3R 4913583 5' - 1360 127 1 66.12 GCTAGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2R 18882651 5' - roo 8994 2 69.86 TATTGAATTAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCA:1 + chr2R 19633162 5' + jockey 4595 1 70.55 GTGGCTAACCTGGCATATAAAGGCTGCCTCAACAAGCCAATTAAGTGCCAAATAAATCTGGCTAACTAGCTTCTGCTTCTGCTAGATTCATAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATT:1 - chr3L 19704387 5' - 1360 96 1 61.64 GGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGAT:3 - chrX 4566230 5' + Transpac 5003 2 77.40 CATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chr2R 24630112 5' + copia 48 2 53.42 AAGGAATCGAATCGATCAAACAATTTCCGAGCTGCTCGTCTGCCGAAAATACACAGCGAGAAACCAAAACGTTAAAAAATGTGGGCACAACTTGGAATGCCAACAACAAAAGTAACTGCCATTTGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 8154458 5' - accord 7103 2 56.85 GATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr2R 18123442 5' + 412 7136 2 73.97 ATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 + chr3L 21097092 5' + mdg3 5283 2 62.59 TCTGAGGTGTGAATTTTTAACCGGATATGAGTGAAACGCATCTTCCAGGACAACCCAGACGACGGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAAC:1 - chr2R 18222953 5' - 412 7156 2 56.16 GGGGCAGTCAACAGTCGCAACATCACTAACTTCTTAAGTGCAGTGCAACTTTTTGACACTTGAAATTGAGTTTTGCGGTGTAATTGCATTTTAATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCA:1 + chr2L 749120 5' + 1360 391 1 63.70 GTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3L 20076783 5' + roo 82 2 76.71 GACTTTTTATGGAGCTCTGGTAGTAAGGGAAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 22481207 5' - roo 9047 1 66.41 CTCTTGACCACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 9345682 5' - pogo 2051 1 54.11 TGGGAGCCAGGACCTGGGCAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3R 5765285 5' - opus 7485 2 74.66 AATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATA:1 + chr3R 11461757 5' + 17.6 50 1 54.79 CTATCTCCTTTATCGCCGTCTATTGATTTTCCTATCAATATTTCCATTCCATTTTACTCTCCCTTATCCTGTCTTTTGCACGTACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGC:1 + chr2L 13537521 5' - Stalker 7040 4 56.16 CTTCTGCTGATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chrX 14692957 5' - Transpac 5191 2 56.93 TATCAGTCCGCAATTATTGAATTAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTAATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATTAGAACAAGAGACATCGAACGCGA:1 + chr2R 19633148 5' + jockey 4581 1 77.40 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGGTTTCCGT:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 33 1 66.67 TCTGTCTCTCGGGTCTTGCTGGCCATGTTTTGTCGTCGGACTAAGATGGCTATCAGCAAATGGCAACAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr3L 13722011 5' - blood 7341 2 58.57 AAAGTTTTAGAAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3R 18524203 5' - opus 483 2 75.00 GAGCCCGCGAGAGCAATCTAAATAATAAAAAAGCGAGCGCATAAAAAAATTATAACTAACACTCGGCGGGCGAACAGTTAAAACCATGATGAAATAACATAAGGGTGTCCCGTCGGCA:1 + chr2R 17100037 5' - P-element 2874 1 72.88 GTCTTGCGTTGATTTTTGCCAGACATGGTCCTAATCCGTTTATACTATCCCAAGGATGGGTGGCTCCTTGCCCGGGTTCATTGCTCTGACATATATGCGTTGTGACACTCAATTATTGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACT:1 - chr2R 17830536 5' - baggins 5048 1 76.71 CTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1 - chr2R 5900923 5' - Bari1 1643 1 63.45 ATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGAGAAAGTTAAACACA:1 - chr3R 21237802 5' + Doc 79 1 65.75 AATTTCAACAACCATACTTTTGGGATTATTATTATTATTATAACCATTTAGTAGTAGTTAGAAGGTTAATGAGTGCAGTTTTACCATTTTAATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:2 + chr3L 176328 5' + Transpac 4944 2 69.18 CAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr3R 15030737 5' + jockey 75 1 75.21 CTTCTATGCACACACTTGATTATGTGCATTTACAGTGAAATTAATTTCTACTTTACAGTTGCTGGCAAACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAA:1 - chr3R 20130679 5' - Doc 171 1 53.42 AAGTAAAGATCCGTTTCATTAATCTGTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 4175239 5' - roo 9027 1 53.42 TTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAT:1 + chr2R 7404700 5' + blood 7099 2 75.34 TATATACTTATAGTACTATATACTTATAGACTTCTTGCGGTGTGTTTCGTCTCTACATGGAAAACAAATGTTGTCGAGAAAAGTGAAACCCAGATGCCGACCGATAGATTTGCATTGTGACCTCTTGCCGCTTCTGCCATTATTGT:1 - chr3R 24695222 5' - hobo 457 1 80.82 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTGGGGGATCATGGGGTATTGGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGT:1 + chr3L 23112566 5' + R2-element 86 1 69.86 CACAAACAAATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 9616695 5' - roo 9036 1 60.69 CAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 - chr2R 15392776 5' + blood 7101 2 78.77 AATTTATTTGATAACAGTTATCCGCCGACCTGAAAATGCACTTCATCAGCAGAAATCCCCGTATTTGGCTTTAGTCAACAATTCCTGACTCAAAGTGGGTTTGCGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr2L 9010380 5' + 1360 20 1 71.92 AAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 8272442 5' - roo 8988 2 75.34 TCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 + chr2L 20984313 5' + blood 7086 2 69.86 TATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chr2L 14222372 5' - Transpac 5192 2 60.96 ACTGCAACTGCATAAACAAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr3L 13722156 5' + blood 7035 2 69.86 TTTGCATAAGCCCGCAGAGCGTAGAATTTGGGCGCCAGGACATTGGGAAACATGCGTAACGGTATTTGTTTAGGCCATGTTAGGGTTTTTAATCATATTCCAAACAGACCAAAACTGAGAACCATCACTGGGGCACCGCGGTACGA:1 - chr3R 14833459 5' + F-element 4353 1 78.08 ACTACACTGTATAGAAGAGAAATATCACACTAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 + chr2R 6558961 5' - mdg3 5412 2 75.34 CGCGTTGATCTGGCCATTAAAAACAAAGCAATGCAGCGTTTAACACGGGAGTTGGATGAATGCATAAAGACCATACGGAAGCTGCAGCGGGACAAGGCGGGGATTTTTATGTCCAGATCACTCTCTT:1 + chrX 5785998 5' + Tabor 205 2 71.65 GTAGCGGCTGGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 + chr2L 10912237 5' + Doc 81 1 70.55 GGGCGAGTGTCTGGCTGCCAGCGGCATTGGTATGCGTGTGTATCTGTGAGTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCATCTAAAATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2L 13546940 5' - P-element 2851 1 61.64 TAATAAGGACTCTTATTCGGTAGCCCATTTAATTTCGTTTATTTGGCCTTTTGCCTGCTAATGACATACAAACAAATATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:2 + chr2R 8862372 5' - pogo 2058 1 54.11 AGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 4869164 5' - roo 335 2 66.44 GCCACGCAATTGTGAGAATGTGTCTGGGAACCGAACTGAAAACAGAACAGACTCTTTGTTGTGCTTTTGAGTTCAGTAAATTGAAAAAAAAAAAGAACGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCT:1 - chr3L 7108319 5' - Q-element 84 2 62.33 TAAAGATCCAAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr2L 2464323 5' - pogo 2056 1 55.17 TTGTACTTGGTTTCAGTTTACTGCCTTTAATTAAATTAAAAGAAGCGCAACAGCAGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr3R 25876999 5' - mdg3 5474 2 67.81 AAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chr3R 12578075 5' + jockey 4723 1 52.05 AAACAGAGTCTGTCAGTCGGTCCGTCCCCTTCTCATCCTGGATGCTCCTCTGTCACCATCTTTCCGTCTAACTCGGTGTCATTGTAGCGTTCCAGTGATTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAT:1 + chr3R 18804337 5' + 297 372 2 65.75 AAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACT:2 - chr3L 24153259 5' + Tabor 75 2 70.55 TCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATTTGTG:1 + chrX 22726200 5' - Helena 1226 1 59.59 GAACTTAATTTGTTTACTGATAAATTTATGAACATAATTAGTAAAGAATCTTTTTTGAGTGCGCTCATGCTTTGTGCAATAAAAAGGATACGATGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAT:1 + chr2L 17747364 5' - Tirant 8482 2 69.18 TGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 - chr3R 15649875 5' + blood 53 2 54.11 TGACCGAACCTTTTGTTGAACGCGCCACCAAATTATTTTAAAGCCCGCGTGTATTTCATGCATCAGTTTCTGATATTCGGAACTGACATTTAATTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr2L 18048391 5' - blood 351 2 67.12 GGAGGTTATATAGAAATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACA:1 + chr2R 5604199 5' + Stalker2 71 2 65.75 AATGAAATAACTTGATGTATTTGGCTTCCATTGATGTCGTATTGTGGCGATGATCTACAGAAGAGCAAAATACGGACAAGGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chrX 11534414 5' - roo 9032 1 56.85 GTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chr3R 23507649 5' + 412 7141 2 77.40 CTGCGGTCAAAACAATAGGGACCACTTGAAATCCGAGCAACTTGGGAATAGGTGTTGTTATTATATTCATAATTATAAACCGATATATATGCTTTACATATTTGCTTTTAAGACCAATAAGTTTTTATGCTCTCATTTGCCACTCA:1 - chr2L 1953132 5' - frogger 117 2 77.40 TTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr3R 14088678 5' - 1360 3352 1 60.27 GACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3L 4710743 5' + Doc 56 1 64.35 ATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 - chr2L 1449673 5' - opus 430 2 69.29 CAACTCGGCCGCAGACTGCGGACTTTGTGTGAGGTATCAAAGAATTTACTTATCAAAATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 + chr3R 29708842 5' + blood 7075 2 59.59 TGAGAATATTAAATCTTTGATTGCATTCCAAACTTAAAGCAAATACTCTGGGTCACATAGACATATATGACCCGCTCCAAATTTTTGTAACTTAGCCAACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr2L 13576106 5' + 297 6595 2 77.40 AACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACC:1 - chr2R 6984442 5' - HMS-Beagle2 7166 2 65.75 TATATTTATCACCTTTTAGGGGCTGTATGCGTTCATATCCTTCAAATTGCCTTATTTAAATGTATTATTTATGAAATAATAAAAGAATTCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr2L 21596460 5' + blood 7039 2 66.20 TAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGT:1 + chr2L 13877690 5' - Transpac 5149 2 71.92 CTCGATCCACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGGCCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGCAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr3R 25271133 5' + 412 7070 2 71.13 ATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 11228576 5' - roo 345 2 69.60 CAATAGATAGATTTTTAGTGTCATAATTTTTTGCTAATCTCGATACCCCATCTCTCAAACCAGGATACTGTTTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGACACTTT:1 + chr2L 22746156 5' - 1360 3345 1 78.72 ATAACATCCTCTATTTCGGGGCATTATTGGAGCAGATAGAGAGGAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCG:1 - chr3R 19588562 5' + G2 333 1 69.86 CTTTATTGAATTCAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2L 1449560 5' + opus 7036 4 61.64 GGAATGAGCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 - chrX 13762629 5' + P-element 81 1 28.77 GGAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGT:1 + chr3R 10079314 5' + P-element 82 1 28.08 GGCACACGAGCGCCGCCTGCCGGCCGAACCGGCAGTCTGCCCAGTGGGAGATACAAAGATACCCAGATACATTTACATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGGAACGGAAGAGGGTAGAAGGAG:1 - chr3R 16882853 5' - mdg3 5265 1 63.41 ATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 16887376 5' - roo 8989 2 79.26 TATTTGGGTGCAAGTGCGGGTGCGTGGGCGCTGATTTCTTTTGGCCATAAACATTTCCGGGCCGAGGTGGGATGCATACTGTTTAGTTTATTTTGTTGGCTAATTTCAGACGCTTGAAATGATTATGTCGACACCGATGCGTATG:1 - chr3L 4751562 5' - 3S18 6032 2 52.41 ATTTCATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 - chr2R 12703880 5' - blood 334 2 54.11 AATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1 - chr3R 4884474 5' + pogo 68 1 63.70 TTTCCTGCTGCACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr3L 14969323 5' + P-element 40 1 55.48 CTGCATAGGAATAGCCAAGCGATGCGGACTCGGGACTCCCGGATTCCGAGAGTCAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chrX 19498053 5' - P-element 2851 1 60.84 AACCGCAGGTCCTGGCCAGTTGTTTGTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr2L 15832947 5' - hobo 2923 1 72.60 AATCACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3R 10498793 5' + 297 55 2 56.85 AAGGTAACTGCATGACTACGAGAAGTTAATTATACTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr2R 15080035 5' + roo 86 2 78.08 GTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 16887385 5' - roo 8987 2 74.66 GAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 + chr2L 8542753 5' + P-element 95 1 19.18 GATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGGAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 8895222 5' - roo 8993 2 71.53 ATATTTGTAAGATCATTTCCAAAAGTTGCATTTACCCTTTTGCCTTGGTTTAACAGGGTAGCAAAGCATGCAACCATTTTCTCCATTATTTTTTGCAAATTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAA:1 - chr3L 12030636 5' + I-element 5182 1 63.01 CAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr3R 10142953 5' + 412 7136 2 73.29 GACGCTCCCACTTCCCCCCGTTCCCACCACATTTGTATTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTACGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAA:1 + chr3R 9993377 5' - hobo 2858 1 73.29 AGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3R 28008250 5' + hobo 63 1 66.67 ATGACGTATTACAAAAATATCCTTGTAGTTGTTGTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCTGAAAGCGAAA:1 + chr2R 2078227 5' + F-element 104 1 71.67 TGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTT:1 - chr3R 11461860 5' - 17.6 421 2 72.60 CTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr2L 1327605 5' + pogo 56 1 58.22 ATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 25753608 5' + hobo 49 1 52.74 ATTAAAAAGTTGGCAGCGGCATTTGTGCATTAATAAATTATTTGAGCCGGGCCACTTGGAGGCGACTTAAAAGTCATGAAAATAACCAGATATGCAGATGAAGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 + chr3R 20883503 5' - I-element 5339 1 73.97 TAAGAAGTATATTTTAAAATATAAACAAGAGATTACAAATTGAGTTTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 4103975 5' - roo 9025 2 48.63 AAATCAAACTCCACTTCAAATTCGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr3L 7434986 5' - pogo 2074 1 69.86 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGACTCGATGC:1 - chr3L 5685501 5' - pogo 2072 1 70.42 ATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chrX 5222864 5' - 412 7479 2 65.52 ATTTGCTGAAATAGGTTCAATGAACTACGAAGTTCTCAGGTTTAACCCTTCACTTTTTCGCCAGATTGAGCTGTGAGTTGTATAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 + chr2L 7215490 5' - 297 6944 2 67.12 CTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr3R 25271173 5' + 412 7114 2 57.53 AGTTGAAGTGACAGTCAGCTCCAGTAAAGCTGACTTAACTCTGCCAAGGTTGTAGACCTTCGGCTAGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2R 18882713 5' - roo 397 1 76.06 TATTTACCATTTAATTATCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTT:1 + chrX 18034595 5' + Juan 43 1 41.78 GCTGATTAATCAATTTGCAAAAAAAGATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chrX 10960325 5' - Transpac 5202 2 61.43 GCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr3R 15514521 5' - 412 427 2 62.33 CATGCCTAGTTAAAATAAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 20452292 5' + blood 7063 2 53.42 TCAATAACATTTAAATAGCTCAAGATTCCTGCCCAAAGTTTTGCTGGTATTCTTTGGTTTCATTTAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAAT:2 + chr2R 20856192 5' + Juan 4162 1 55.48 CAAGTTCTAATAGTTGACCAGCTTAACTGCTTGACTAGCTTAAAATCTTCCCAAAATGTTTGTATAAATATACATTGTTTTCATATATCTCAAAGTCCCTCTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr2R 6168204 5' + 1360 20 1 71.92 TATATAAAAGATGAAAGTAAGATTCTCTGATTTTGCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr2L 19903316 5' - Transpac 5208 2 47.26 ATGCCTATTTGGCATACAAGTTGTTATGCTAATGGCTAAAACCTTTAGTATTTAGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr2R 6945721 5' + pogo 64 1 61.64 ACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 + chr2R 14562082 5' + Burdock 32 2 63.70 AGTCCAAACACATAAAATCAATCATCTTTCTTCTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGGCTTTCATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr3R 27835725 5' + 412 19 2 72.60 TAACACAGAATGTGTAATAACACCAAATTATTTAGCGATTCACGAAGACGAAATGTCTTATTATAAGGAAAAATATCAGTAAGACCGTCCAAATCACCTTTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAG:1 - chrX 22118668 5' + Stalker3T 58 1 54.79 AGAATTAATAATATAAAATATACTTATAAGAAGGAATATCTATTGCGAGTTGTTTAGGTTTTTGTAATAGGAATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGA:1 - chr3R 26813647 5' - hobo 256 1 51.37 AAACATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGG:1 + chr2L 18177000 5' - INE-1 540 1 78.08 GCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATC:1 + chr3R 25876882 5' + mdg3 82 2 71.92 AGAAGAGGTGTTAAATAAATCGACAGTATTGTAGCGAACAATTTCTTTGAGAACCAAAGATTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCTATGCTGACGCATCTGC:1 + chr2R 5434621 5' + Juan 147 1 56.16 CACACGCAACACGAACAGAAGACATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACTGCA:1 + chr2L 19424660 5' + Tirant 8159 2 58.27 TGAGCATGTCACATATTTACAAAACTTGTCTACAAGATGAAGTCAACTATTAATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATCATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTC:1 + chrX 10873745 5' + mdg3 5257 1 78.77 TGCCAACTGTCGAATCCCGTGCATGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGT:1 - chr2R 13686194 5' - accord 7039 2 76.00 ATCGTTTACCCACAGCTACGGCAATTTTGATAGTAGTTTTGTGTTTTATTCCGCATATGGCCAGTTAATAATCTAAGTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2R 7404785 5' - blood 7347 2 49.66 AATTGGTTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGC:2 + chrX 14914368 5' - mdg3 164 2 72.60 GCACTGCGAAAAAATCGGTGTCTTAAATAAATCAATTAAATGGAAACTATGAACAGTTTGCTAAGCTGGAGTAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 + chr3L 11868273 5' + mdg3 5264 1 50.68 TTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chrX 18193689 5' - hopper2 1567 2 58.22 CAACAGATAAATGAGGATTGCAAACTGAATACGAATACATGAAGTAGTCTAGTCATCCCAATTTAAGAATAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTCGCCCGGCAAGCAAGTACT:1 - chr2R 9304849 5' + R1A1-element 5150 1 56.30 CGGGCGCGTGCGTTGATGGCCAGAGAAAAAAGAGAGCACAGGTTCAGGTATTGCCATAAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chrX 4589380 5' + Burdock 20 2 71.13 GAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATG:1 - chr2R 5022789 5' - Gypsy12A_LTR 92 1 60.27 GGCCAAGCGCCGAGCGACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATAT:1 - chr2R 13574862 5' - diver 6069 2 51.08 AAAACTAAACGTGAGAGCCACACAAAGTGTGGGGGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2R 16410154 5' + opus 7022 2 71.23 TGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2R 981616 5' + 1360 39 1 62.33 GACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGT:2 + chr3L 23146455 5' + 1360 45 1 54.79 CGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATG:1 + chrX 18707444 5' + BS 4756 1 54.79 TTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCA:1 + chr2R 7727119 5' + BS 4715 1 60.27 TGGATCGATATGTTTACACGCATGCGCGGCCAGGTTGGTACTCCACTAGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGA:1 - chr2L 7991369 5' - 297 326 2 66.44 CATTCACCTGTTTGAGCCCGCTGACCAAAAGTGGAGAAATTAAGGTATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTG:1 - chr2L 6074138 5' + BS 7 1 76.03 AAAGAATCTTTTTTGAGTGCGCTCATGCTTTGTGCAATAAAAAGGATACGATGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 + chr2L 17747406 5' - Tirant 8457 2 58.14 ATGTTGGGTTGGCAGTTATATTTTTGCGCTTTTAATGCATTTTCACACAAGATGGTTCATATTGTAAATGTATTTGGGAATTACCATTGATATATTCAAAGTTTATCGACTTCGCATTTGCATAAGATTGGCATTGCAGACAGTGA:1 + chr3R 20179619 5' + baggins 5177 1 66.44 TAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:2 - chr2L 3734554 5' + mdg3 62 2 67.12 AGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGTATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 - chr3L 13722097 5' + blood 81 2 72.92 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGGGGGGGGGCTGACTTAGCTTAAAGCATATATGTGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAAT:1 - chrX 12649915 5' - blood 7074 2 89.04 AAATTTGTTTATTTTATCATTTGACTTTCCAATTTCCAACGCCATCCAGACGCCCAAAACCTGCTCTACTGAAAAAGTTGTCGATTAATTTTTTTGTCTTTCATTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAA:1 + chr3L 26223451 5' - G4 3813 1 69.18 GTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr2R 6984408 5' + Doc 56 1 50.68 ATTGATTACTAGCGAAGCTTTCACTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTT:1 - chr3R 15139872 5' - Tc1-2 1553 1 78.77 AACTAAATTGCCCTTTACTCATTTGTAATTTGTTTTCCGAAACAATAATACAAATCGTAGCTAACCGTAGAACTATGCATGGAACAGTCTTTATTTGTAAGTCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCT:1 - chr3R 13779393 5' + Cr1a 4077 1 63.01 ATGCAATTGAGTATGCAAATATTGCCTACTTGTCATGTAGACAAATACACATTCAGCGCTTTCTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chrX 7467881 5' + hopper 11 2 78.08 CCAAAGTAAATACCTCATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCCAGCCATAATACGTATACGCCAAACATTGAATCAGGTGTGTGCGTGTGTAGGTGTGTGTATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTAT:1 - chr3R 20137374 5' - Burdock 6378 2 44.52 CTGGAGTTACAAACTACAAAATATATAACAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCA:1 + chr2L 21109027 5' + gypsy7 5254 2 53.42 GCCTGAAGAATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chr3R 14331159 5' + Burdock 53 2 60.96 ATGTCACGACACGTTTCATTCATGAGTCAGTCACACCTGAGGCAAATGATGTCAGGTCTTTTTAGATATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3R 27503133 5' - hobo 2908 1 57.48 CGGTGGTCGGAGCGCGTGTGTGCAGCTATGTGTAAAAAGTCAGGGGGATCTCTCGCACTGCTGCGCATCGCTGAAAACGCTTTAGTTTCACCATTTGGCTGGGTTTACCAGGATGATGTTAAAACTTTGCATAATT:1 + chr3R 8596438 5' + transib1 1864 1 77.21 ATTCCCCAAATGGTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chr2R 23313130 5' + Tabor 20 2 70.34 AATGAAAATTGTGCCTCAATATTTTTCACCGACTCCCAGAGCGAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 + chrX 14589997 5' - pogo 2044 1 66.15 GTATCGGGAAAATATCTTGAGTCTTAGGTTTCTTTTTATTTTTTTTTGGTTTTTA:1 - chr2R 7528915 5' - mdg1 357 2 81.82 AGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 - chr2R 9072935 5' + Burdock 76 2 72.22 ACACTTGACCCAATTAGCGCCGAAATTCCGAAATTCAGCCCCAGCAACGAAAGCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr2R 23225915 5' - Transpac 283 2 67.81 GCTCAAACACTGCAACTGCATAAACAAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr3L 13722164 5' + blood 16 2 75.34 ACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr2R 20461201 5' + jockey 74 1 70.00 GAGTTTCATGGTGGCTGTGGTTGCTTAAGCTAGAAGGATCTCCTTCACCAAAGGGGGTGTGTTACCCGACAAGTGTGCAACCGAATTGGTACCTCTGAGTTTACTCGGGGGCGCGGAGCGTGAGAATGGTGAGCATGCACTT:1 - chr3L 24163423 5' + Stalker2 7431 2 78.17 GTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 8542604 5' - roo 8986 2 73.97 GTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chrX 22858827 5' + mdg3 38 2 60.96 TGAGGTGTCTTAGATCTCCGCTGAGTAGCGTTTTTGTTTTCACTCGAAGTGCTCTCAAACTGTAGCTTCAGCTTTTGACTTTGATGTCGTCATCGCTTTTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATT:1 - chr3L 441743 5' + I-element 5012 1 65.75 AATGGATTCACTCACAAACCATTTGATTGATCGTTGAATTCTCAATTGAGTTGTTCCCAGTTTTATGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chrX 10873796 5' + mdg3 5294 2 53.42 GATTTGGAGTTAATTAATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 - chr2R 15080117 5' - roo 9017 2 54.79 TATGTTAACACTGAACATAGATTTACACACCATAGATTTACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACTTTGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 18849891 5' - roo 9041 1 44.52 ATCTAAAGAGTAAAGAGCTGTAGAGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chrX 5222829 5' - 412 460 2 62.33 AAAATCTTAATTTTAGATAGTTGAGATATAGACAATCAAACGGATAGGCGGACTCGACCAGGTCGATTCGCCTATTGATCCTGATCCTGATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATTT:1 - chr2R 5497124 5' - INE-1 28 1 48.92 AGACTTAAGATAGACAACAACGGAGGCGCTTGGTGTCCCAAGCACATGGTATCTCGTGGTAAAAACCAAAAAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAT:1 + chr2L 6289763 5' + mdg1 422 1 58.22 GCGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chr2L 4416070 5' + jockey 95 1 75.34 GGGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 23507651 5' + 412 86 2 76.03 CGCTGTCCTCAAAGCGGGTATTTTCAATTCCATTTACCACCCAACATACGGGCTATTCTCTTATATATTACGAGAATATATGAACACTTCATTTTCCATTATTCATATATATTTTTCCATTTGCTTGGCTATTTCATCTCTGACCG:1 + chrX 23461071 5' - Fw2 3696 1 74.66 CATCGCACGCACTAACAAACGAGTGAAGAAAAAACCGAGCGCAAAACTTTCATTTTGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTTAATGAATCGAG:1 + chrX 15167659 5' + roo 8720 2 62.59 AGAGCGAAAGCAGCCAAGGTGATGGAGACTTCTGGGCGTTAAAACTCATTGCCCGAGCGATCCGATCGCACAGTTGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 10032627 5' - hobo 2922 1 65.25 GTTGTTGTTTGTAAAAGAGAGCAAAAGCGTGAAACAGGAAGAGCGGTGGGAGAGAGCTAACGGGACCTTGAGACCTGGCCACAGCCAACACACACACACTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTC:1 - chrX 13763349 5' - P-element 267 1 69.18 AAATATTTTATTTAAATATTGTCATGTGCACACAAAAAAACGATTTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 25822952 5' - roo 9026 1 52.74 AGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3L 8253740 5' + jockey 4688 1 53.42 ATTATAAAATATATACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3R 22659869 5' - 412 473 2 71.23 AGCACCCAGATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 - chrX 4566280 5' + Transpac 34 2 63.01 AAATATTCATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2L 7215656 5' + 297 6608 2 65.07 ATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 + chrX 10101330 5' + mdg3 5325 2 64.38 CATATATGTAACTGATATAACTTAATGCTCATATGTACATACATATTTACATATTTAAAAAAAATGAATTCGTAATTATTATTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 - chr3R 21589106 5' + flea 34 2 61.81 GCGAGAGCGAACTTCGCAAACAATTATGGGCAGAACTGAGGGAATATTCGTATAAATCCAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAGTCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGGTAAAGTCTATTATAGT:1 - chr3L 8199842 5' - Cr1a 4206 1 62.33 GAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 + chrX 5222877 5' - 412 412 2 73.97 AGAGTACTAAGACAATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3R 5245529 5' + 1360 21 1 71.92 CATACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 8542713 5' + roo 24 2 63.01 TATATATAAAAGATGAAAGTAAGATTCTCTGATTTTGCTTTATTGAAATCATTATGTTTCAGGTTTAAGAAACAAAGCTAAAGTGACTTCTTTGCTGGTTTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr2L 19903314 5' - Transpac 5210 2 47.26 AACAAGCACCCATGAAATAAAAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 4639041 5' - roo 9037 1 61.64 CTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr2L 20984287 5' + blood 49 2 52.05 TGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3L 22221228 5' + 412 62 2 62.59 TTAGGAGTTGGTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr2R 8793864 5' + Transpac 4961 2 57.53 TACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 25271282 5' - 412 440 2 55.48 CCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:1 + chr2R 6984275 5' + HMS-Beagle2 6911 2 66.44 GCTGTTGAAATAATATTTGCGAGCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCTAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCAT:1 + chr2R 20362214 5' - diver 150 2 65.75 AGCAGCAGCGGCGGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGC:1 - chrX 13870531 5' + TART-B 155 2 85.71 CAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3R 5245605 5' + 1360 63 1 81.25 CATGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 22289466 5' + 412 69 2 65.07 GACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 + chr3R 13544000 5' - 1360 3358 1 39.73 GTAGTCGTCCGTCTATCGATCACGTTTCGAACTGAAAGGCACGACCATGACGACCGAGAAGTCGCCAGTGCACAGTGGGGCTAGGAATGCGCTAAAAACATGGTTCATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 13843647 5' + roo 8678 2 72.60 AAGTCGAAGTTTAATCCTTTATTTTCGTTTCCTACTATTTTCGTATTAGTGTAAAATTCCGATGTCAAATTAGGAACTATATTAGATGGTATTAAATATATTTAATATCCAAAAGCGAATGCACTTGAATTCAAGAGAAATGCAAA:1 - chr2L 18543238 5' + Idefix 354 2 62.33 CTACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chrX 9816477 5' + jockey 9 1 75.00 TAGTCTGCGTTCGTGTAGTCGTTAAGTTTCACTGTCGCGTCCGTCCTAACAGTCATACGTATAAAAACTTATGTGGGAGAGCGAAAGAGTTAGAGCTAAAAGTGTAGCTGATGTGCATGCCTAAAACAGCACCAAACAGCATTGCG:1 - chr2R 4341650 5' - Cr1a 241 1 53.42 AAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chrX 983109 5' - 412 7497 2 51.37 GGCAGGCAGGCAGGCTCCCCAGGCTCCCCAGGCTCCCCACCTCAGGCCCCTCTTCGGATTTCCCTGGAAAATGAAAAATCAAATTAAAAGACTGAAACCAAATGAAATGTGACCATTTAAAAATGCTAAAAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 23175065 5' + G-element 4325 1 54.11 GAGCAGTGAAGCGGTTATTAGTGGATTCAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGATGTTTAGTCTATCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCAT:1 + chr3R 1685395 5' - Idefix 6963 2 79.45 GTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGTATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chrX 14962226 5' + jockey 95 1 73.97 CATCAAAATTTGTTGCTTCGCTTGTTTTTTGCTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 27835656 5' + 412 7133 2 73.91 GTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr2L 19930163 5' + jockey 80 1 67.81 GAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCATATACACTCATACACCCATCCTTAA:1 - chr3R 13358665 5' + mdg3 87 2 72.60 CCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGCTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATC:1 + chr3L 27356052 5' - Tc3 1672 1 62.59 AAAATTGCGGTTGGCTCTAAGGGAGGCTATATTTTTAATAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 + chr2L 17638709 5' - blood 7308 2 71.92 CCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 20292530 5' + pogo 50 1 57.14 GGCGGCTCGGTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAGGCAACTAGCGCCGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1 - chr3R 4885409 5' - 1360 3318 1 68.49 CGGTCGCCCGTCGCAGATCCCACGCTGCGAGGAGTGGTAAGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 4023704 5' - pogo 2033 1 71.11 TAGTAAATGTAGTTGCCAAAGATTTTGCACGTATAAGTGTCTTTCGCCAAAAGGAAATATTGATTTTTAAGGAATATTGATTTCGTCGACACTAATTAAGAAGTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGG:1 + chr2L 22696336 5' + X-element 27 1 69.18 AAGAGTGAGAGCTGCGATAAAAATATTTTATTTAAATATTGTCATGTGCACACAAAAAAACGAATTCTGTACCTACATATTTTTGTAATATTGTAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 25822932 5' - roo 9046 1 65.07 AGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1 - chr3L 13722107 5' + blood 73 2 67.81 ATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTA:1 - chr2R 17014118 5' - HMS-Beagle 6976 2 62.33 AGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 14088558 5' + 1360 53 1 57.04 GTCTCAGGAATCGAGAAAGAGGGTTTTATTTTGGTCTCCAGAACAGAGCTGTAATGAACGTGCTCATGATCCTTGTACCGCTCTCTGGCGAGCAGCCACGCCCTCTGCCGAAAGTCGTTCGTCTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 18158483 5' - accord 7031 2 78.08 TACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAAAG:1 + chr3L 17447449 5' - Tirant 8444 2 59.59 AAAAAACATAAGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATAT:1 - chr2R 10478788 5' + invader4 2808 2 50.68 GTTGTTGTTGTAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAAAAAACTTGATACCGTTTGGAATGGGGATGGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGGCCGTGAT:2 + chr3R 25400123 5' - Doc3-element 379 1 67.12 AAGGATGATGAATCTTCTAATGGAGGGTTGAGTGACATATACGCAAAGACACCAAACCCAGTCAACTACGTGTATATGTTGTAACATGTCCACATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGCCGGATCTATTGTA:1 - chr3R 1939270 5' - baggins 5401 1 59.59 ATTGTTTGCACTGGATTTATAGTATAAACAAGTATAAGCATTTCCTTCTGTTATGCTTAAATCAAAATACCAAATACTTTCTTGAAAGTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 31956531 5' + pogo 30 1 64.38 AAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTTTTTTCTATTT:1 + chr3L 15035135 5' - Doc2-element 238 4 78.08 ATGGCACAAAGCTGGCGGTTGGTGATGATTACGCTGCGTGTGAAAGTCTGTCGCATTCCAGCAAGTTTCTTGAACTCTAGCTGTTAAAGTTAGGTTGGAAAAACAGACGTTTCAAGCTATTTTCTGCGTTATCTACGTGTCGATCG:1 + chr2R 18142622 5' + McClintock 6101 2 76.03 ATATCTGGCCACAAATGCCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:1 - chr3R 24175800 5' + Burdock 6167 2 62.59 TCATTCAGCGAAATGAAAAAAGAGTCAGCTAATTTCCCTTTCCATTTGGGAATTATTCGTCTGAATTTCCGTTTGTTTTTGTTTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 - chr3L 5183819 5' - copia 217 2 58.22 GAGCGTGCGCTTTGTTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 13276484 5' + roo 78 2 73.29 GTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr2L 3967124 5' + hobo 85 1 75.86 AGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3R 7739662 5' + blood 7057 2 53.79 ATTTAGTAGCAAGTAATAATTTATAGCGAATCACATGCACTTATTATTTATATTGCATATGTCATTAATAGTTACATCTAGAAGGCGTTGCGTCTTTGTCTCTAGAATATGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 + chr2L 21687460 5' - INE-1 158 1 60.27 CTGAGTGATGCGACGAAAGGTAAACAAGAGTCAAAAAGACTCCATCCCCCACGAAATTCCATTAAAGTTTTTACTAGTACATGTAGTACTAGTACATTTAATATATTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTG:1 - chr3R 26458997 5' + INE-1 98 1 55.48 AATCTAGTTTCCTAGGCTTGTTTTCACATCTAAATTATCGCTCACAAACATTCAATTCTCGTTTGAGAAAACAAAATATGCATTCTAAAGAAACATTTCATTTTATATATACATACATTTCATTTATATATATGTATATTTATAT:1 - chrX 4526682 5' - Stalker4 7047 4 78.62 GAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTCCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATT:1 - chr2R 6984394 5' - HMS-Beagle2 7118 2 71.23 ATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1 - chr3R 20137353 5' - Burdock 6333 2 63.70 GAGTCCGCTGGCTGCGATGTTTCACTTGATTTACATATGAATCCGCATAAAGCACGGCAGTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGG:1 + chr2L 1990478 5' - G2 395 1 58.90 AATTAAAAACCTTGGTCTCTAAAACTATTTACCACTGGTCGCTTGGAGAGATAATTCTTTATATTATCGATCCGCGACATTAGTTAAAAACAAGAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCC:1 + chr3R 10191342 5' - INE-1 556 1 48.87 TTGTTTAAAAATGAGCATTCTTCAAAGGTTTAAGCTGAAAATAATCAGTAAAGCCAAGCGAATGACTATTTTATGTAGTTAACAAGCTCAGCTAACGATTCTTATCAATTTCTAAGTTATACGAAAAACTTATTTTTTTACAAATT:1 + chr3R 26058304 5' - Tc1-2 1459 1 15.75 ATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTC:1 - chr3L 18920477 5' + Juan 71 1 62.33 CTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 + chr2R 7404695 5' + blood 83 2 71.92 GATAATTTTATAAGGATATCACAGGATAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr3L 19396967 5' + F-element 15 1 78.77 CTGCCACCCCTTTTTTCGGCTGGCTGGAATTAAGCCACCCACTGAGCCGGGCACTCACACTGCAATCAGCTAAAACAGCACACATCCCACTAGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTC:1 - chr3L 7177039 5' + INE-1 575 1 58.74 GAAAAAAAAAAACATGTGCTTACATATTTACATGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 8449928 5' - Transib5 27 1 53.33 GAAATTAAAAAACAATCAACTTGGCATTCCAAATTCGAAAAAAATAACGCATCGCGTGCCAAAGTATTCTCAATGGGATCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCC:1 - chr2L 10197610 5' - Transpac 428 1 53.79 CAACCAGCGTGCTCTCTTAATATGCACTTTTATAATTTTAAAGTTGATTCGTGTTATTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTGTAGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAA:1 - chr2R 5945828 5' - I-element 5018 1 61.64 AACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 - chr3R 6842678 5' - mdg1 7381 2 60.69 TGCAGGAGCTTTGTTTTGAATTTTTATTCGACATTTAATGGAATTGCTGGCATGTTCCGGCTCTGCTTTATGCGATTTATTGCTTGTCACATCTGAAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCG:1 - chr3L 2203460 5' + Tirant 93 2 65.07 TTAACCCTACACACACACTTTTTGTGGGTTCATGGCTGTTCTGTGTGTCAGACGGGGGGCTTTCCATGTCACCGTCGGTCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACTATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGA:1 - chr3R 23653516 5' + 1360 3163 1 52.05 TAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1 - chr2L 23295899 5' + micropia 4996 4 55.48 AGGAATTCCTCTCTTCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2L 22746352 5' + 1360 54 1 56.16 TGATTAATAAAAATATTTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCAAAGTTATAATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAAA:1 + chr3L 19590768 5' + 297 6609 2 55.56 ATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATATAATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chr3L 20785483 5' - P-element 2794 1 21.92 TATCTGGTTATTTTCATGACTTTTAAGTCGCCTCCAAGTGGCCCGGCTCAAATAATTTATTAATGCACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCT:1 - chr3R 20883573 5' - I-element 5135 1 54.79 ACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 5446086 5' - roo 9025 2 52.78 TCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 + chr3R 4885345 5' + 1360 86 1 84.25 AAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 - chr3L 14043635 5' + Ivk 46 1 54.11 AGTTTACTGCCTTTAATTAAATTAAAAGAAGCGCAACAGCAGTTGCTATGTATATAGTCTGCGTCCAACTAAGCTGACATCATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1 - chr3R 25876985 5' - mdg3 208 2 58.90 AAAAAATAATTTTGGACACGGAATACTACTACTACTACTACAAATACCTTTTTGGAAAGGGTATACTAGAATCGTTGAAAAGTATGTAACAGTCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 + chr2L 21689110 5' + INE-1 91 1 62.33 GGGCTCGTACGCTAGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr2R 6052727 5' - mdg1 7439 2 70.83 GGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr3R 21237823 5' + Doc 49 1 49.64 TGGCTAGTATCCAATCCAGAAGGGACTCGCAGTGGGGACTCGCGCCTGGACATACCATTTAATATTAAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr2R 5992407 5' + pogo 50 1 55.48 TTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 - chr3L 13597869 5' - blood 7351 2 58.90 GAATTACAGAAAAGGCAAAGAGATCGGGAGATGAACTACCCTAAGATTTGCTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 13849592 5' - roo 386 2 65.52 ACTTCAGCTTTCCTCGTTTTCCAACACATCTGCGCGTAGAGAAGAAGAAGAACCTTCACGTCCGAGCCGTAAGAGGTGAATTATCCTTACTTGACTAAAACCTTGTTTATTTCGTTAGTCCGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAA:1 + chr2R 10099664 5' + Cr1a 4016 1 56.85 ACTACTCCACTTGATTGGGCTTGTAAAGTGCATTCTCGCCATTTTTCCCAAACACAAAACTCCTACTTTACGCTCAAACCAAATCTGATTCTATTTGTGTGGGCATTTTTAAATGATTATTCGTGGGTATGTTGAGAGTCCCGACT:1 + chr3L 17271045 5' + Cr1a 4064 1 75.34 GAATACGTCACGGAACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 5087125 5' - P-element 2844 1 56.16 AGCCGCGAATAGAATTGTGAACTCGAATTGCAGAATGCCCAGCAACAGCGGCGATAATACCAACAACTATGGGCTTTAGTTAATATATGAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTAGAACTAATGTCCCGTAGGTTGACTAAGGA:1 + chrX 17258184 5' - 297 6939 2 55.94 TGAGATCTGAAAATATGGTAATTATCAGCAAATGAATAATCTAACAATCTGTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:2 - chr3R 22289464 5' + 412 7124 2 66.44 GGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2R 24338332 5' - 1360 3343 1 53.42 CTCTGAGCGTTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr2L 6583313 5' - hobo 2894 1 53.60 ATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGATGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr3R 25271283 5' - 412 7494 2 54.79 TTGGATCAGTGTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2R 18048765 5' - opus 475 2 68.49 AACTATAAGCAAGCAAAAATAAGTCAAATCGCATGAGAAAGAAAGAGACACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3L 3762306 5' + roo 70 2 66.44 TAAGGATGCACAGCTCCGACTTCCCTGTGAACACGCGGCAAATTGAATTTGTCTTGAGTAGCTATACATACATACTCACATACAAGTTGGGGGTTTATGAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 10980360 5' - roo 9043 1 74.66 CAGTAAAATCCGGATATAATTAATTTCATAAATCATGCTCACTGCATGCGTATATTTATGGGTATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr3R 26782696 5' + hobo 56 1 58.90 ATTCCACTGCCTGCCACTTGCAGCAGCAGAGAGGACAAGTCGACAAAAAAGCGTCCAAGTCTCGAGGATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTA:1 + chr3L 1388753 5' - mdg3 39 2 56.85 AATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 + chr3L 21097097 5' + mdg3 5295 2 56.16 GTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:2 + chrX 14962226 5' + jockey 95 1 75.34 AACTGAAAAATATGATATATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:2 - chr2R 9327049 5' - mdg3 175 2 65.75 GTTGGGCTCAGGTGGTTTTCATCTGTTAATGGAGGTAAAATTGCTCGCCTTTTTGTGGACATGGCCTGTTTTGTCGACTTAGTAGTATTGATCCTAAACCAGAATATTTTTTTGGTTCGAGACGCTTCCTTCTTCCTGTTACATAC:1 - chrX 159955 5' - INE-1 28 1 63.01 TTAACATTTCGAGTCAGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCG:1 + chrX 18239333 5' + jockey 4540 1 57.53 CGACGCTTTTAAATGCCGAACATCTCTTTTTCTTTACGGCCCATATAGACATTGCCCAGTTTGCAGTGTGAGTACACTGGGAGAAATAACGAATGTAGGAGTTTACAATCTTTTTTTCTCTATCTACACATTCCATTTAACAAGA:1 - chr3R 24886829 5' - HB 103 1 71.72 CGCGATAAATCAAACTCCACTTCAAATTCGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3L 7434992 5' - pogo 2082 1 76.03 TTATTGGGGCTTTATTTAGGGCTTTCGGTAATTACAGGAACGATCGGTTAATTGTTAAGTGCTTGCCTGTTTTCTTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 + chrX 13651437 5' - 297 356 2 58.90 CAAATGGTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGAACTGTATCAAATCA:1 - chr2R 23313124 5' + Tabor 6859 2 69.06 AAAGATTGTTTTCTTTGCAAAGAAACTAGTTTTAATCATTCAGAAGCACTATATGTTTTGAAATCAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3L 20076755 5' + roo 8718 2 57.53 ACATGTATTTTCTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chrX 19162540 5' - pogo 2080 1 67.81 CAACCAAGCAAAGTAAAGATCCGTTTCATTAATCTGTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3L 4175229 5' - roo 9037 1 60.27 TTTTAATGTTGTAAATACTCTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3R 21924355 5' - roo 348 2 60.27 TTAATCTGCTCGCTGAAATATTGCAAACTGACTTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATTGTTAGTTAGCTGCATC:1 - chr3L 14581502 5' + pogo 19 1 68.00 TTTGTATTCTAGATAGGTTTTTCTAAAAAGACTAACGTCAGTTTTTAATAAATATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chr3R 23664330 5' + pogo 8 1 77.40 AAGGGTGTGTTTAAGTGTCAAGGGCAGGAAGGAGAAAATATGCAGAGTTCACCCGCATATATTATGTGTAGCTTGACCACTTGAGTTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGC:1 - chr2R 18079353 5' - Stalker4 7142 4 60.83 GCTCGCTTGTTTGGCTGAAATTCGCTGGCTTCGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2R 6585390 5' + pogo 15 1 71.20 ATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 23099158 5' + roo 86 2 78.77 CTTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTG:1 + chr2R 5582135 5' + Cr1a 454 1 68.49 ATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGT:1 - chr2L 11867355 5' - BS 4950 1 70.55 TATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGAACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTC:1 - chr3R 24228965 5' - opus 431 2 66.44 TATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2L 15833116 5' + hobo 35 1 60.27 AAGGAGGAGACCCTAGTCCAAACAGCTGTTCCTCGAAAGCGCAGAGGTAGTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCATTAGGAATCGTCCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTTATGTGTAGCTT:1 - chr3L 19597406 5' - G5A 2783 1 60.32 TACCAAATAACATGTTCATAAATTATAGTTATTCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3L 19279135 5' - opus 473 2 60.67 CGTCGAGACAAACTGATGGATCACATCAAATCATCACAGGCTGCCTTGGAGGAACAGAACCGGATCAAGGACGAGCTCCGGCGAGATGTTGGCACATGTACACATATACTGATTAGACATACCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAG:1 + chr3R 24059940 5' + rover 187 2 66.44 TAACAATCTTCGCTCTGCATGGAGGCATATCGATCACAATCCACACAATTAAATCGTGCGAAGCCCCCAACAAGCCAACCAAACACAACATTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATT:1 - chr3R 4682129 5' - invader1 276 2 61.64 AAATAGCAAACGCGATACGCTCACGCGCTTGTTATGCACGCTCAGCAGCGTCTAAAAGTGTTGGTAAAGGGGGGTATTGCGGGGAATTCGGGGGCTAAGGTAAGATCGACTGTAATTTTTCGGGAGGGTAGATTGTTCCAATATGC:1 - chr2L 2166081 5' - Stalker 6854 4 68.49 TAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3L 3762214 5' - roo 9011 2 60.96 GATGTTGCATAGATATACATAGATTTCACTTGGCTTTCGGGAGTCCAAGATCTAAGGTCCGAGTTCGAGAACGCGGAGAATCTTCTCCTGTTCTAGAACTGTCCTCTTCCGAAGGTATTAATTTGCTTCCTCCAATTTTGTATACT:1 + chr3R 13466013 5' + Gypsy12A_LTR 2069 1 52.05 CACGTATGCAGACAGATGAAAGACACCATCAACACGAATTAGATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTC:1 + chr2R 2948982 5' - 17.6 475 2 75.34 CCTATGCGGAGATTCAATTTCATCACGCTACGGGCCAATTACAAATAACTCCGGTAATCATGACTCTCCGGATCGAGAAACCATCAAATATCGTTTAGGGCATATAATATATTTATTATTGATTAGCTGACTAACGGGTATCTGAT:1 + chr2L 12444591 5' + INE-1 545 1 73.29 GAAGGATGGGAAATGGGAATCCATGCACGTGTCCACCTAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chrX 8272513 5' + roo 68 2 65.75 CAATTGGATTTTGTCATGGGTAATAAAAATCAGACGAATCAGCCCAAAAAAAGCGGAGAAGGCGAAAGCTAAGCTAGTTTGAAATTGTTTTGATTCAATTATAACGTTATAACGTAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr3R 7569539 5' + Doc 10 1 54.79 AACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:1 - chr2L 8772804 5' + Tabor 83 2 72.60 CGTTTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGACTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr3L 20290690 5' + roo 8742 2 74.66 CAATCGATTCGATCTGCTCTGAAGCCATCAGAGAGCCGCTTCCCAAACTGGACCACATGGCCTGGCCAGCTCATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCAT:1 - chrX 19503593 5' - BS 5006 1 50.34 ATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTG:1 - chrX 23280905 5' - R1A1-element 5303 1 37.67 GAGTGTACGAGTACTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCC:1 - chr3R 20368117 5' + Max-element 27 2 67.12 ATGACTTTCAGTAGGGCCAAGTTCCCCAAGCAACTGTGCATTCTGCCGCACTTCAACTCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 - chr3R 10327556 5' + jockey 4700 1 60.27 TAGGTTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3L 22676353 5' - 412 7470 2 69.86 TTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr3R 25521870 5' + blood 85 2 74.66 AAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:2 - chr3R 10140242 5' + P-element 94 1 22.60 CCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1 - chr2R 23313071 5' + Tabor 6918 2 70.34 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTACATGTATGTTTCTTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCATG:1 + chr3R 29487012 5' - Rt1a 5017 1 50.00 ACGCTGTTGTAACAACTATCTTGATTGTTAATATAGGAACATGACAAATATTTACCCTTGTAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTGTTG:1 + chr2L 65075 5' - X-element 4490 1 58.90 AAAAGAAAATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGAC:1 + chr3R 9163837 5' - hobo 2904 1 57.78 GATGGCACTTCACACCACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2L 1449726 5' - opus 7480 2 69.86 CTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 + chr3R 21421011 5' - roo 9032 1 58.22 TATATCTAATTTCGCGTTGGCAAAGAATAACGGAACTTAGTTACGATTGAAACATATGTACGTAGATGCAAAGCGTTGTATCTATCAGTGTGTTGATACGAATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 - chr3R 3257603 5' - Burdock 6374 2 73.97 CAAAGCATGGCAAAAGTGGAGAGCAGTGGAACCTGTTGTTGAAAGACCATCACGCCTGTTGGAACCGACGGAGCCTTGGAACCAATAGGTTCTGGGATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCC:1 + chr2R 7351732 5' - 297 465 1 66.44 GAGGTTTAATTATTTTTTGCCAGCCGCAATGAGCTTTTAACCTATTTCACCGAGGACTAATTGTTTCAACTTTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr2L 2338177 5' + blood 48 2 53.42 TTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr2R 7404640 5' + blood 7039 2 63.01 ACTATTAGAAGTAGCTTTTAAATTTTCTTGTAATCATAGAATTCAGTTTAGAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr3L 5263365 5' + pogo 65 1 67.81 GTTTGTATAAATATACATTGTTTTCATATATCTCAAAGTCCCTCTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1 + chr2R 6168261 5' + 1360 77 1 69.86 GCTGTAAAATAAACATGAGTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3L 13597728 5' + blood 7055 2 56.16 TGGCTAGCTTTTAATTTCACCAGACCAGCGTTCTACAGATCACCCCTCAATATGAACCCCATAAAAACCAGACTTTTTCATTGTCTTCTGTATTTCTTTGTTATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:2 + chr3R 31956725 5' - pogo 2086 1 75.34 CTAGGGAGTAGGAAATTTTTTTGATTGCCTCATCAACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTT:1 - chr3L 53103 5' - roo 9037 1 61.64 AGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1 - chr3R 5940521 5' + hobo 59 1 63.08 ACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 - chr3R 9345673 5' - pogo 2042 1 60.27 TAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 + chr2L 18370339 5' + Doc 71 1 63.01 GTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAAT:1 + chr2R 7727091 5' + BS 4687 1 60.96 TTCCACCAGCCATCAGCCACCCAATGCCAATCCCATCCAGCCATCCATCCATCCATCCATCCCCACCCGTTCATCTACGCTCTTTATTCTGGTTAATGAAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAAGACTC:1 + chr3R 18050901 5' - Gypsy6A_LTR 130 1 52.74 CGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCT:1 + chr3R 4913579 5' - 1360 106 1 69.18 GAGACCATTATAAAAAACCTAATTATATATCCGTCTATTTGTTACAGATTCTTACCCTCATCGTTCGGGATGATTTTCCGGGAAATTATGAATTTAACGATACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 2755039 5' - roo 9022 2 68.49 TCACGCCTGATTATTTCATTAACTTTACGATCAAACTCCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAGTAAAGTGC:1 - chr3R 21287297 5' + Doc 92 1 77.40 GTGGGCGTGAGGCGGCTTAATGCATTTAATGGCCTATTTTTATTTGTTCGCATTGCCCACCGTCGATTGAGGTAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAATGCCAAGCCCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACAGCTGAA:1 + chr3R 7489323 5' + rooA 7559 2 50.34 GATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr3R 29708933 5' + blood 5 2 72.13 CTTATAATTTGCTCCTTTAGCATTTTATCGATTTTATAACGAAATGTGTAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAA:1 - chr2R 4915880 5' - S-element 129 2 71.92 TTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTACGTGCTCAAAGTCCCGCTATTCTAAAACCGCTAC:1 + chr3R 23108085 5' + G-element 75 1 71.09 GGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr2L 15621982 5' + hobo 23 1 66.44 GGTTTCTGCACACTGCTTATAAAATAAAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chr2L 8772693 5' - Tabor 456 2 65.75 ATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 + chr2L 19878149 5' - mdg3 195 2 53.10 ACACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr2L 10089840 5' + 297 6639 2 65.07 CACCTCCTTTTGGCCGAGTTCAAAACGTACTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 - chr3R 4659592 5' - P-element 2800 1 26.21 AAACGCAAAAAATTGCATTTAATGCACACAGAAAGTGGAGAAGGGCAAGGATTTTCGGGAAATTCCAACATCGGCGTCGGCATCGGCAGCACTTCGATTAAGTAGCTTTGTAATAGTCTTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 19455358 5' + 1360 1 2 77.40 GTAATAGTTTTCCGTCCTTCCTTTGTAGCCACTGCAGGTAATAAACCAGTGCTAAGAAACATGAAGGAGCCAGTTTCTTTTTACTTACGGTGCTATCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAAT:1 + chr3R 16653169 5' - Tirant 8297 2 65.75 CCGAGAAAAAGCTATCCTTAAAGATATTAAAGAAATGCCTTATAATAAATCGATATAACAATAACTAGTTTGCTCAGCTTGACTGTTCATAAACAATCTATTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 + chr2R 10163514 5' - Juan 4196 1 56.85 AGGATAGGCCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 20076892 5' - roo 9041 1 65.52 ATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3R 16041105 5' + jockey 69 1 60.27 TGCTAAACATCTAACAAAACTGCCTACCGTCGATTGAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTAC:1 - chr3L 22635826 5' + hopper 9 2 78.08 CCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAT:1 - chr3R 6053050 5' + Quasimodo 69 2 70.55 GTCGAGTGTCGCGACGATTAGATACCCTCACCCAGTAAATAAAGTTGCAAGCAGCAAAGCGAGTGATTTCCCTATCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chrX 10825464 5' - mdg1 7414 2 53.42 AGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 + chr2R 6984421 5' + Doc 69 1 59.59 GTGCTTTGCCTGGGCTGTTGGCTGTTGAAATAATATTTGCGATCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTT:1 + chr2R 20362194 5' - diver 6058 2 54.79 TGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 + chr3R 25384209 5' + mdg3 5341 2 78.08 ATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 9482132 5' - roo 9032 1 58.90 TGGGATTTCATACCTATAACAAAGCGGATTATGATTTCGATAGGCTCGTAATAAACGTATCAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTA:1 - chr3R 27845615 5' - Stalker4 395 1 72.60 AAATTAGCGTTTATCAGAACAACAACAATCACATTAGCAGCAACAATGCGTGTCGCGGTTTTGTTTACAAAAATCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 - chr3R 10140323 5' + P-element 12 1 78.62 TGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3L 10814631 5' + 297 6610 2 65.07 ACTTAACTATAGGCATTACGATTAAGTTCTTTATAATCAGCAATAACTGAAGTCTGTCTGAATAATAATATACAAATATTATATATACAATTAAAAATACGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGT:1 + chrX 13984692 5' - mdg3 256 1 63.01 GCATCGATGGAAGAGGAATGAGCTACGCTGCCAAGGATACACACCTGCAATACACATATTCTTCTAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:2 + chr2R 21227300 5' + mdg3 5266 1 74.66 GACGACATCGTTTTATGAAGGATAGACCTTGGGCTGCATCTTGCAACCCTTTAGGAATGCCTGAACCCATTCCATGTCATGCCATATATCCTGTGTATAATTTCAACTTTCTAGCTTGTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATA:1 + chr3R 22139898 5' - INE-1 138 1 66.44 AAAGAACTATCGAAAGAACAGGACCAAATTAATAAATTTTAATACATAAATAGATTAATATATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAA:1 - chrX 21668829 5' + mdg1 62 2 60.27 ATTGCCAGATAGCCAGATAGCCAGCTAGTTGTCCCATGTAGTCAGTCACTCAGTCAGGTCAGTTCGCGGTGTATCCATGGCAAGTGCATGGCGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAAATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 + chr3R 24175642 5' - Burdock 227 2 66.44 CTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGT:1 - chr2L 16685397 5' - P-element 2822 1 41.10 TTTGGGCGGCGGACCCGTTTACGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACCCCGGTTTTTTTGACACCC:1 - chr2L 14006037 5' - hobo 2876 1 75.00 CACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chr2R 5848966 5' - mdg1 7392 2 63.70 AAGCATACTGACTCCTACTGAAACATCGTTGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGA:1 + chr2L 22746276 5' - 1360 3298 1 79.45 CATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 - chr2R 14884335 5' + mdg3 5320 2 70.55 GTTTATCAGAACAACAACAATCACATTAGCAGCAACAATGCGTGTCGCGGTTTTGTTTACAAAAATCTTCTTCAAAAGAGAGCGCCAGGCCCCACGGTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGC:1 - chr3R 10140315 5' + P-element 21 1 72.60 AAGCCAAGATGAACGGGCACATTCCAAAAAGGATAAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr2R 9326916 5' + mdg3 17 2 73.97 GTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGCAA:1 - chr3L 9242060 5' - roo 8981 2 77.40 ATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3R 15590642 5' + roo 81 2 74.66 ACATCGATGTGCGACAATTTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTC:1 + chr3L 9375785 5' - mdg1 397 2 67.12 TAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr2L 2519923 5' - roo 9031 1 56.85 TTAATTATAAAATATATACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGGGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3R 22659866 5' - 412 7530 2 72.41 AGCTTTCTCCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCTTCGAGTACTTT:1 + chr3L 15035085 5' - pogo 2089 1 74.02 AAACATGTCAAAGTGAAAACAAACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 - chr3R 15465625 5' - mdg3 5484 2 75.34 GCAGAGCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGGGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chr2R 5848960 5' - mdg1 7398 2 59.59 AAATCCACAGTCTGGCATTCTTGGGCGTACATAATGCATATATATATATATATATATAAGATAACGCAAGCTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTC:1 + chr3R 31120172 5' - opus 431 2 73.29 GCAGCTGCAGCTGGCCAGCCGAGCTCTTTCCCATGGCCTCCCGGCCAAAATCTAGACCCTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTCTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 4869143 5' - roo 356 2 47.95 CCACGCTTTATCTCCTCCTATGTCCGCACGAATCGAGCTCTTTGAAGCGACTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chr3R 5087017 5' + P-element 40 1 48.72 ATTTGCAATGATTTTTATTCTAAGCTTAAAGAATAAGTTCCCGTTAGGGCCATGAGAGAAATTGATATATAAGTATACAACGAATTTTATAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGT:1 + chr3R 18164494 5' + Stalker4 7007 4 60.96 CGAGACGGCTGCTCGCTTTTGCATATGCACTTCAATCAGAGATGACCAATTGGATTGAATTAATATTAATCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAG:1 - chr3L 16752023 5' - P-element 272 1 45.89 GTAAGCTAACAAGCTGCGCAATGATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr3R 5940430 5' - hobo 2929 1 69.61 ATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 5446091 5' - roo 9019 2 54.48 GAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATAT:1 - chr2L 16685357 5' - P-element 2782 1 13.70 GAGCCTTTAAAGCTTACAATCTTTTAAATGGTAAATTCAATAATATTTTATCAAATTCTTATATGTTTATATCACTAATATTTCTTTATAGTTTTAAGGTTGTAATGGTGTAATTGCTATTTATTTTTTTTTTTAATTAACTTATT:1 + chrX 18256416 5' - jockey2 3405 1 56.16 GAACATGGCCTCGGTGGCGCAGTTGGCAGCGCGTAAGTCTCATAATCTTAAGGTCGTGATAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2R 11660621 5' + Tirant 10 2 40.69 ATAAAATAATAATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:4 - chrX 14908497 5' + blood 38 2 59.59 GAAAATTCCGTCCGATACACTTTATTTTCAGGAAATCTATTCTTGTGCATCCACGTCCTCGCTTTTGTTTTGGACGTGTTTACAGATTTGTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15823457 5' + hopper 143 8 80.37 GGTTGCTGCTTAACAGCCATTCCATCCAATATACATAGATAGACTAAATACCGCTATGCCGGGGCCATCACACGGTATAATAATTTGATTTGTGATCTTTGATAGCGACATAGATAATAAATGTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 - chr2L 21850166 5' - accord 7030 2 73.97 CGGTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1 + chr2L 12283939 5' + Quasimodo 73 2 69.18 ATAAGAAATGATATTCAGAATATATGGTCTGTATGGTGTGTGTGTATGGTAAGTTCCATTCATCATTATGATAATTTTAAGCTAATTTAATCGTAAAATATAGAATATTTCACGAAAGTCGTTCTATCAGATACCAGTTACTCAGC:1 + chrX 5711883 5' - INE-1 546 1 17.81 AATGGGATGTAGTAATGACCAAGTGTTTAATTTATTTAAGCGCCTTGACGTAGGCAACACATTTTAATCGAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTT:1 + chr2L 7459502 5' + BS 5007 1 71.23 AATTAAAATTATTAGGTATCAGCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr2R 19900945 5' - mdg1 7428 2 63.70 AAAACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr3R 31120313 5' + opus 7025 2 69.18 GGAAGCCAGGTGAAAGGCATCCGTTTGTGCCTCGTTTGTGCTTGATAATGTGCGTGTGGAGGAGCGACCTTGAGCGGAGCGTACCACCTACACATGGACAGACCGACATTGTAGTAGATACGAACATAATAACAATAAT:1 - chr2R 5849106 5' + mdg1 9 2 76.98 CGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATC:1 - chr2R 5900901 5' - Bari1 1620 1 78.77 GTCTATTGAAATAATGTGTGAAATATTTGATTACAAATGCCAACCATATTTATATGCATAAACTTAATGAGGAATTGATTGCTAGTTTACATTTCACTTTTTATATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 2873320 5' + roo 8680 2 62.33 TACACAAATAACTTAACAAGCTAAATGAATCAGTTTTTCCGTATAGTTAATAGTTATAGTTAATAGTTAATAGTTAGTTTAACGACCAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCG:1 - chr3L 3482767 5' + X-element 48 1 52.05 TATATGAACGCCCTTCAATATAGTCTATTTTTTAAAGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3R 9258751 5' + 1360 81 1 73.29 CAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 + chrX 19498106 5' - P-element 2795 1 23.29 ATCGTAAGCAGCCGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCT:1 + chr2R 21380570 5' + roo 8691 2 65.75 TATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 + chr3R 27786566 5' - Tirant 324 2 71.23 TTTTAGGTCTTACAATTTTTCCAAATTAGGGGGGCTTTGGTCATTGTTGATCATATTGCTCAAAACAATTGAGAAAAATGCTAATATAACTTATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTA:1 - chr2R 3065449 5' - Quasimodo 7342 2 67.81 ACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 + chr3L 21097094 5' + mdg3 5284 2 61.59 CATTGCGTAAGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 24228835 5' + opus 140 4 67.12 CAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGGATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chrX 8082385 5' + roo 77 2 69.86 CCTCTACCAAAATACAGGGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGAATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chr3R 6053100 5' + Quasimodo 21 2 70.55 ACATTTTCGTTTGTTTTCTTGCATATACTAAACATAATTTTGATTGTTGTAATAAAAGGGTAAGCTTAACTATAGCAATATGGTTTATTCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chr2R 20462751 5' - copia 222 1 62.33 GTACTAAACCTGAGTGTACGAGTACTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:2 - chr3R 20368128 5' + Max-element 16 2 74.66 GGTGACGGATTGGAATTTATACCAAATTTTTGTATATTCAGCAACGATGATATGAAACGATGATGATATTACTAAGCAAGCAGCCGATATTTTTCCAACTGTTCTATTATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAG:1 - chr3L 5144307 5' - F-element 4535 1 59.59 CTTTGTTTTTAAACGTTTGCTTTAATGCCAAGCATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr2R 13276493 5' + roo 8750 2 79.31 GAAGACTACCGCTAATAGTCATGGAAATTCGTTATCAGACAGCCGGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 + chr3L 9430581 5' - P-element 2811 1 36.30 ATGGCAGCACAAAAATACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 - chrX 8626298 5' - Burdock 6327 2 65.75 AGTCTGAAAAGAATGTATGTATTTGAAGTTTACTACGAAGTAGGGAAAGAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 - chr2R 22145571 5' + FB 71 1 65.75 ACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAA:1 - chr3L 19339437 5' + Tc1 65 1 56.16 AGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chrX 9951334 5' + hobo 41 1 57.53 TATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chrX 11228582 5' - roo 318 2 78.08 ACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTAC:1 + chr3L 25272551 5' + 1360 111 1 66.44 TCTTGAAGTAACTTTTAACGACCTGTGCTTGTAAACTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAAT:1 + chr2L 8452263 5' + copia 4955 2 76.03 GGATAGACAAAATTAGTTGTCTCTTGCAGCACACAAAGTTCGTAGCGTTTAATCGAACTAGAGAATTGCGAAAGTGAAATATGGTCACAGGGTGTCCCGATATATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chr3R 10026358 5' + FB 17 1 72.22 ACCTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr3L 15371408 5' - Transpac 5185 2 55.48 GCAAGTGAAAGTAGTGCAAAAGAGCAACAAACGAAATTGATTTAATAGCCCAACATTACGGCGCTAAATACATACATGCTGTCCCACCTTCCCACATGTACATGCATATGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAA:1 + chr2R 5801436 5' + Bari1 7 1 76.26 CGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr2L 15965285 5' + blood 84 2 73.29 CACGAAACCACAAAACAAAAAAGAAAATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGTCGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3R 9163819 5' - hobo 2933 1 77.42 GAAAAAGGTGGCACAACATTTCTGCAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 + chr3R 10778603 5' + mdg3 5270 2 73.97 GTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGA:1 + chr3R 10468024 5' - opus 7416 2 74.66 CGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 - chr2L 2357365 5' + P-element 73 1 36.30 GTGGGTAAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 + chr2R 20913087 5' + 1360 37 1 60.27 ATGGTATAAATGGCATTTATAACTTATATATAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCCACCGACTGCAA:1 + chrX 15227419 5' - flea 146 1 81.51 GCTTCAAATCACACAAAACTGACAACTCACTCTTTCTCTTCATTTGGTCAGATGCATTAAAAGTTTTCCCATTGGCAGACTAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTATCGCCCACCCGAACACGTTGGCG:1 + chrX 17177167 5' + G5A 2628 1 60.84 GTTCGAAAAAGCTTTCTCCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCC:1 + chr3L 15035076 5' - pogo 2079 1 70.55 AATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3R 30568895 5' - roo 340 2 64.38 GGTGGGGGGATTGGGATGCAGCACCCCTCCTGAAAAAGGGGAAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGATCCCCTCGGGAAAGTGTATAAGTTATTTCCCTATAAGTTATCGT:1 + chr2R 6984250 5' + HMS-Beagle2 3 2 77.40 CATTTCTGCGCAACATATTTGCAGGCTTTGGCAAGCGAAAATCCCTGAATAGGGGAAAAAATATATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 29440846 5' + BS4 730 2 82.05 ACCAGGAAGCAGGAGCTCCACACTCGAAAAAACAAGACACTCGAAATAGGTGCTATTGCGAACACTTTATCTATTCACTAGATAGAAATGAGTTCACCATATGTGGCGCCAGCGTACATTTTGTCGCGCGAAATATTGAAAATACG:1 + chr3R 21345107 5' + gypsy12 337 2 76.71 ATGCAGGCTGAATTCAATATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGGTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGC:1 + chr2L 8959853 5' + Ivk 5092 1 70.55 GAAATATCTAAACAAAAATGATTCACAAGTTATTAGTGTAAGTTCATATATAAATAAATCCCTAGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAG:1 + chr3L 60886 5' - I-element 5008 1 52.59 ATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3R 14088667 5' - 1360 3341 1 52.74 AGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACT:1 - chr2R 16410098 5' + opus 7066 4 70.15 TACTGTTCAGGAAGTGGAAAGAGGAAGCTGCTAGTAAAATGAGTCGAAAACTAAAATAAAACAGAACTCAAAGGGGTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCCGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACG:1 - chr3L 21051185 5' + R1A1-element 471 1 50.77 TTCATTTTGTGTAGTGCGATAAACATCTGACTAACTTAAGAAATAAGACTAAGGATTATGGAAACATCTCTTGGTTGCATTTTATCAGATTGGCCCAACTTTTTACCGTTTCGTGATACGCCACATTTAATAAAAATTCCTTTTTT:1 + chr3L 3822278 5' - Tc1-2 1466 1 55.48 GTAATGAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:1 + chr2L 12283941 5' + Quasimodo 75 2 70.55 ACTATCAGATACCCGTTTCTCTGCGATACCGATAGAAATTGGGGAGTACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 - chr3L 18043932 5' - mdg3 174 2 67.81 TCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr3R 9163952 5' + hobo 57 1 59.59 AATGGAGTGGAGTGGTGAGTGTAACCGTCCCGACTATGATTATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chrX 22517747 5' + 1360 7 2 71.23 ATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3L 9242062 5' - roo 319 2 77.40 AACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chrX 14136530 5' + roo 8716 2 56.16 GAACTGAAAGTGAATAGAAATGTCAAAAGAAATTAGCAAGAAACCAAAGGCAATCAAAGCTATTATAAGCATTACAAATAAGTTGTCTCAATCTTCGCATAGTATTGCGGTTATCTCTTACAATGGCAATCGCATCGGCAACAACA:1 - chr3L 12004813 5' + Doc4-element 303 1 71.23 ATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 + chrX 6398799 5' - blood 306 2 65.75 CAACGCATTAGATGCTGTACTCAAGATGGCAACGCCGATATCCAATCCGCTGCCAAAACCGTCCCTATGGTTGCCATATAATGTGCGACCAGCGGCATCGATGTTATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATATCT:1 - chrX 15685679 5' + G4 3758 1 70.55 AGCACTCTTCAAACGGATCAGGCCAAAAGCCAGCTCACTGACCAGATCTGAATTTTTTTTTAATGTAATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chrX 3529723 5' + 412 51 2 52.05 GTATGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr2L 17162861 5' - blood 7334 1 57.66 GTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTAGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 + chr3R 14049317 5' + transib2 47 1 57.53 AGGGCGGGATGCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr3R 12795019 5' - mdg1 7400 2 56.85 ATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGAC:2 - chr3R 10778738 5' - mdg3 5428 2 65.75 GTCAGATTTTCGACCTAGTTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGG:1 + chrX 18239345 5' + jockey 4552 1 50.00 TAGAAATTCTTTTGAAGTCGTCCAGTGCTAATTCCACGTCAAATTAACAACTGTCAAGTTGGCCACTGTACGAGTGCCGGACAAAGTTTTGAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGGCGCTTGTCAAAGGAGATC:1 - chr3R 22070281 5' - X-element 4522 1 65.00 GTAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 + chr3L 20785486 5' - P-element 2791 1 18.49 ACAAGCAATTGCACCACTCAAACTCACAAAATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 + chr2R 24630080 5' + copia 4885 2 71.92 GGGTATTTACATTTTAAACTATGATTTTTCTTTATTGCTGGAAATTTGCCTGACTGAAATTAATAAAAATTGCAACAATTTAATTTCCTCAATTTGTTTATATTTGTTTCTGGTTATGGTGGAGTTTGGGGTTTCCCTGGGGGACG:1 - chr3L 12426621 5' + Transib5 2672 1 56.85 AAAGGGAGAAAAGAGAGAACTTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 31956351 5' - pogo 2077 1 68.49 GACTAGTGGGGATTTTTGCTATAATTGTACTGTGGCGTACAATCGATTGAATGGGGCATATTGCCACATGGCCAATTACCGCTTTATGAGGGTGGATCAGCAGTATCTCAGCGGGATACCACAGATAATAGTCTTTAATATTTGTA:1 - chr3L 1320956 5' + gypsy7 5090 1 76.03 AAAAAGATTTATAGTTTAAGTAGTCTGATTGAATTTGAACTATGATAATTTGTATATGCCACATTTTCAAATAGGTTAGTTTCACATTTAAATATGAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chr3R 21518163 5' - 297 374 2 56.85 TTTGTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGCGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTT:1 - chr2L 22684611 5' + transib3 60 1 49.32 GCATCGATAGCAATCCAAACCCGATCCTTAGTCTTTGATGTGAGCCAGGCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1 - chr3L 1387274 5' - mdg3 232 2 76.71 TTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1 + chrX 14692856 5' + Transpac 4995 2 69.18 AAACCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3L 9649167 5' + roo 8742 2 73.29 TTCTTATCCGCAAGATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr3R 29709085 5' - blood 7347 2 54.79 AGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3L 53003 5' + roo 88 2 78.08 GGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 - chr2R 16410116 5' + opus 170 4 60.27 CGTGAAGGAATTAACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3L 6751768 5' - pogo 2051 1 53.42 GGTGGTTGTTATTCGCACTCATGAGTCGCATGAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGAGAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 16180828 5' - Transpac 296 2 76.03 ACTTATTCAATGTTTACAATGCTGTCAGCCGTTCCTTTCAATTCGACTCGGATTCGGTTTGGTTCGCATTGGTTTGGTTTGCCTCGTTTTTGGCATGCAAGTTTTGCACTTTCCTTTTTACCTCAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 20707317 5' - HMS-Beagle2 489 1 54.11 ACATACAAAAAGCAAATCCACGGCCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chr3R 10776098 5' - P-element 2792 1 20.55 GGAGAGCAGTTTTCTGCGAACGCTAACCATCGCCATCATCCTGGCCAGAACTGGGCAATGGCTACTTGGCGCGGAGCTAACCTAAGCCGGACCACCAAAATGGCAGATGGCACCCCATATAATAATTACTATGTTATATCAACTAT:1 + chr3R 23578901 5' + jockey 4844 1 76.71 ATCGCCGGAGTTGAAGTGACAGTCAGCTCCAGTAAAGCTGACTTAACTCTGCCAAGGTTGTAGACCTTCGGCTAGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2R 18882721 5' - roo 401 1 79.45 TTTGAGGGAAATTTTAAACTAATGCTATGAAGAATGCTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:2 + chrX 14908360 5' - blood 329 2 52.05 AAATCGAAGACAATTTCGTACACTCCATAACTACCACTTTCTTCGCACGACCAACTACCAATCTACGTATGAGTATCTAAAGAAGTTAGCGCGAATAAAAATTTACAATGCCTGAGCATTTGTTGTTGTCTGCTATCTCTGTATGC:1 + chr3R 14044622 5' - 1360 153 1 67.12 AAATGAGAATGAAACTCATTCGCTTTAATAAAAGCCGAGCTAATTGGGTAATGACCATGAAAGGAACAAGGAAGTTTCTCGAACTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAGCTT:1 + chr2R 8208848 5' + X-element 243 1 51.37 TGGCACTTCACACCACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACT:1 - chr2L 1449724 5' - opus 479 2 70.42 ACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 + chr3L 15058849 5' + blood 7076 2 59.59 GTCCCCACGCCAATGTGCTGGCTTTGATCCAGACATCGCAGCTCAAATATTTGGGACCAGCTTTTGTGAGCTCATTAAATTTCGTCAATGTAAATATGTGTGCCGCTGCAAAACAACCAGAGTTCCCAGTGCTTGGTGAAAAATTA:1 - chrX 21444222 5' + Dm88 4083 1 76.71 CATCGCATATATTTATCAACTGAAGAACCCACATATGCATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1 - chr2R 17014150 5' - HMS-Beagle2 276 4 62.33 GACTATGCAAATTCGCCACCAAATTAAAATAGTTTGCAGCTGAAGCCAAAGTCAGGCCAAATACCCACTGAATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACC:1 - chr2L 20318101 5' + 412 7165 2 64.86 GTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGCCGCTGTTTACTTCTTCT:1 - chr2L 23295910 5' + micropia 29 2 63.01 AAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chrX 14908481 5' + blood 54 2 52.74 AAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 9482105 5' - roo 9005 2 64.38 AGACTTATCGCGCTCAGGTCTCCGAGGACGAAGATTAGACATATTCATTTGTTGCTACATTTGTACCAATTTTCTAAATAAATCGCATACTATATACGTACATACTGCACTTCATATATTCCTTATCAGAATCAATAGCCGAGGCG:1 - chrX 14316207 5' + INE-1 93 1 81.51 AGGCAGTGCAGCTCCTCCTGCTTGCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 - chr2R 7223764 5' - blood 7337 1 54.79 GCGATTTTCACTGGCCTTTGGAAAATGCTTTACACTAATTTTGCCTTTTGCACACGACTCACTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTC:1 - chr3R 3179384 5' - S-element 1273 1 57.24 TCCGGTGATCAATTCCTCTTTAGTGGCATACCACCCTTGTATACCTTCTATTTTTCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr2L 21400189 5' + pogo 60 1 62.68 AGTCGATCTAGCATTATTATATTAAACGACTTTAAAATCCCTATAATATTATAATATATTTAATGACAGAAGGTAAACCATCTCACTTGTTTGATGTAACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr2R 12703731 5' + blood 23 2 35.62 CTCCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 + chr3L 15035091 5' - pogo 2064 1 60.27 CAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 - chr3R 10778753 5' - mdg3 191 2 55.48 CAGAGCCAAAAGTGCTGGGATTCCATGTTATCCCATCCTTAAAGTGCACTCGAAGCAGGATTTAATCATGTATAAATGTAAGTAATAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTG:1 + chr2R 23479237 5' + Stalker4 313 4 52.74 AAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2L 2519897 5' - roo 9009 2 64.54 TAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 - chr3L 23456273 5' - 1360 3331 1 59.59 GGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 26315876 5' - roo 9032 1 56.43 TGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTG:1 + chr3L 16157217 5' + Juan 84 1 76.71 ATAAAATTATAACACCATAATCGCTCCGTCTTTCATTGCGACGTTAAACGGTAACTATAGTTACTCAATTACACAAGTAACTTATTAATTTATGTAAGCTCGGCCGCGCTCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAAGTGTGGCCGCGGG:1 - chr3L 25810198 5' + Cr1a 4432 1 72.22 AGATTTTAGACAAATCAATTGAAGAACATTGTAAGTATTTAACGTTTGTTTATCTCTCATTTGATATTCATTTGTTTTATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTT:1 - chr3R 11705023 5' - Tirant 471 1 52.05 GTAATAAGCTTTCCCTCTGGAGAAGATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr3L 15261405 5' - pogo 2083 1 73.29 ATAAAATAAGTCATATTTATGATGAGCTGCTGCTGTCTGCGGTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGA:1 - chr2R 5022812 5' - Gypsy12A_LTR 115 1 76.03 GTGTGGGTGTTGATTTGGACGACGAAAGCCAAGGAGCAGGTAAGCAGCTAAGATGATCCGATAACTGCGGCTTGAGTATACACCCTTGCAACAAAACACTCTAACCGAGTGGTCTTTTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAG:1 - chrX 11712786 5' + Stalker3T 147 3 79.45 ACATTGTTGGACAGGTTGACGACAAAACAGACAGCCACGTGTGGCCATAAAAAGTGGTGGTACACCGATTGTACGTTAGATGGTCGATTATATTCCGCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr2L 14796985 5' + I-element 21 1 71.23 TACCAACTGCAATAGCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr2R 9164818 5' - 412 452 2 56.25 GAACGGGCACATTCCAAAAAGGATAAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chr2R 9326926 5' + mdg3 5279 2 67.12 CAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr2R 22867425 5' - hobo 2883 1 62.60 ATACCCAAAAATTTTGAATAAACGTGGGCGGTAAAGAGCGCGTGCTCCATATGGTGTGATTTTTGGAGATTACAGGTTGCCACAAGTGTGGGCGGAGTAATCAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr2L 3006233 5' + pogo 15 1 75.17 GGATGGCGAGGATAAATATCGGTGGGCTGATATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2L 12481546 5' - pogo 2078 1 64.80 ACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2L 12142552 5' + hobo 57 1 56.16 GCACATGGCCATGGCTGTCACTGCTCAGTCAGTTGTTTTCATGCCCTTGCCAAATGTATTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 11549756 5' + 297 6593 2 78.08 GAGTGGGAAAGGTTTCTGCACACTGCTTATAAAATAAAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr2L 8772683 5' - Tabor 7305 2 72.60 AATAAAATATCTAATATTCCAATTGCCACAGAAATTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372621 5' - Doc2-element 232 1 85.34 TTCTGTGCATAGGGACAGAGGGCTGGGAATGAGATTGCAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2R 22867388 5' - hobo 2905 1 60.96 GCCGTGTATGTGTAATAAAAATACGCTAAAATGTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr2R 13628470 5' + jockey 92 1 73.29 CAGCAGGTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGAATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr2L 17730552 5' + pogo 36 1 62.33 TATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr3L 3979714 5' + opus 7025 2 70.55 AAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGC:1 + chr3R 12795034 5' - mdg1 7385 2 66.44 AAATTGAAATATATATCTCAAATCGCTCTTGCATATCCCCATTATCGTGCTCTCTCCTTTTCTCTCTCTTCAATACGTACACTTTCTTGTCTGGTTCTTAACCATTTGGTTATCGTTTTGCATCTATCGTATTTCTGTCTACAGTA:1 + chr3R 9432954 5' + Circe 95 1 54.79 AAAGCACTCTTTGTTTAGCTTTAAGGGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGA:1 - chr3L 11596405 5' + gypsy6 15 2 75.17 AAGCAGAGTTTCAAACTGAAGACCACGAATGTTGGATGCACTTTCATAAAAATGGTGCGTTTAAATGTGGACTTCATATCCCTCATATATACATACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTT:1 - chr3R 30632566 5' + Q-element 608 2 52.74 ATTTAATCTCTAGGGGCATGCACCACAACGCCCCCCATAAGATTAGGCAAACTATTCGCTCTTTAATGTAGATAGATAATAGTTAAAAACTGCAAATGATTTGCTCCTTTTACTTTTGCACAAATGTAAGTTATCTGGATTAGGTT:1 + chr2L 7719140 5' - I-element 5125 1 72.60 GACGCCCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3R 7424540 5' - 412 7495 2 57.58 GCTGCAATCGCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTAT:1 + chr2R 19076473 5' + F-element 172 1 76.71 AAATGCAACAATTAAGCAGAGCTTATGGAGGCAGCCAATCAACTGGAAGCCAGCAAAGCCAAGAATTTGGTTGATTTGCATATCTAAGGTATTAGATAAATGACCGTTTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr3L 20977497 5' + I-element 15 1 76.03 AAAATTTTACCATTTTATATCATTGAATTGATAGCATAAATATTGTATGGTATGCTGGCCATTTAGATTATTCTGAACTCTGCCCTTTATTGAAACACAATAAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCAACCAGGACTTTG:1 - chr3L 5181764 5' + baggins 5024 1 70.34 TCCCGATTCCCGATTCCCCGCAAAAACCGATTCACCCCTGAAATTACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 20552794 5' - roo 332 2 68.49 GCAATTGCAGGGGTACACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 - chr3R 6103708 5' + Tirant 22 2 69.85 AACAAACTGTATTTATTTAGTCGATTGCAAATTTATTTTTCGTCTCTAAAATAAATCTCTGCTGTTTTGCAAGTCACTGTGCAAATGACACTAGGTTTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 - chr3R 16619871 5' - P-element 2802 1 67.81 AATTAATTTGTGTATCTCTTGTTTTGATTCGATAGTAATATTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGTGGATATAAAAGCA:1 + chrX 21668601 5' + opus 279 2 65.04 GCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGGGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 25271172 5' + 412 7113 2 56.85 ATACACATTAATCTGCTGGCTAATGGATATTGGCTTCGAACGCACTCGGAGAAAAGTCCCTTGTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 + chr3R 26765046 5' + mdg3 5260 1 75.94 CCTTATGAATTCAGAAAGTGCTTAGCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 - chr2R 9072981 5' + Burdock 32 2 62.33 ATGGAATTTATGTCCGACTGCGGTTATCCACAGCAGCAGCGGGGATATATGGATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGAC:1 - chr2L 11668803 5' + mdg1 7109 2 66.44 CAGGGATATTTTGTTTGGTTGTGCTTTTCGCTTTGAACGTGGGATTGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGTATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCAT:1 - chrX 6141208 5' - Idefix 147 2 77.40 GGGTGTGACAGGCCAAATTGATTGTGGATTGCTCAGCGTGGGTTTGGGATAATTAAAAGAGCAGAGCAATACATAATTGATTAGGTGAGAGCAATTGACGTTTACGATGATGTTGGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr2L 11573769 5' - jockey 4985 1 67.81 AGAGCCGCTTGAGCAGTGGCAACAACATGAGGCACTGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1 + chr3L 19274763 5' + transib2 35 1 61.64 AATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTTAAAATATATACATCTCCTACTGTCAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTATTGTACGAAACTAATTTTATTTGGGAATA:1 - chr3R 30568895 5' - roo 361 2 51.20 CATCTGATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2L 535491 5' + roo 76 2 73.43 AGATTACATTTTGAACTTGTATGTTTAATCCCATGTGATTGCATTGACCGGCTGGATTTCATCGCTAAATTATAAGCAAATCTCGCACCCAAATAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGA:1 + chr3L 17852339 5' + accord2 144 2 65.75 AAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 + chr3R 10142954 5' + 412 84 2 73.97 GACTTTTCCCAGGACAGTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCT:1 + chr3L 1387082 5' + mdg3 5269 2 72.60 GCACCTTAGCTGGGCTTAGTTTCGTTATCTAAGCAATCCTCCCTAGTACTCTTGCACCTACACCTTTGGCTTTACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATTTACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGA:1 - chr2L 22178586 5' + Cr1a 4152 1 54.11 AGTGACTAACGACTATGTTTATAGATTTTGCCCTCCGACTTTTCGCAAAATATCCCCAGGTATTCGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2R 5992284 5' - pogo 2048 1 56.16 GCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAATGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1 + chr2L 8542751 5' + P-element 93 1 20.55 TGGCAGCGATTCGGGCGCGTTTTCCCAGCGATTTTTGCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGTCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chrX 19162701 5' + pogo 43 1 55.86 CACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chr2L 1449711 5' - opus 462 2 59.59 TTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAAT:1 + chr3R 14049353 5' + transib2 83 1 73.29 AAAGAGTTTAAGTATAAACAACCTAACTACGCGTTTAACAGCTTAGGGAAATAGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr3L 11666021 5' + pogo 66 1 68.49 TAAGCATATCATTTTCCCAATAAAAATCGCTTCAGTTCTGAAATGAGTCATTAAATTCAAAGCTATGCCGTTTTCCATACGCGGGTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGTATCGTGCATGCTAGG:1 - chr3L 11047124 5' + R2-element 3499 1 58.22 AGAGAGGTTCGACGGCCGCCTGAAATTGGCCATCACATGATTGTTAACCATTTCATGCCAAATTGGTTTCTCAAAGTTCTTTCAACTCTGATCATGTATTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 + chr2R 17013978 5' + HMS-Beagle 18 2 73.29 ACACTGAGAAAATAGGAAAAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 9938738 5' - roo 393 1 75.17 TAGTTTGTATTTATTTATGTACTTCTTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACGATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATACTGAACTCGTCTGATGTTTC:1 - chr3L 26265112 5' + Gypsy12A_LTR 1879 1 80.14 AATCGTAAAAACTTGTTTGATGACGTAGCTGCAAGCCAAGCTTGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGTTTCTCTCTTATGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGT:1 + chr3R 13976225 5' - Bica 460 1 52.05 GCCACAGGCAGATACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chr2L 14969993 5' + Tirant 48 2 54.11 TAATGATGATTAAAAAAGTCCAAGAACAGTCCGCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAA:1 - chrX 5892151 5' + transib2 85 1 76.03 GTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3R 4913655 5' + 1360 53 1 54.11 GAAAGTCCCAGGGAGATTGTCATGGTGATGGAGTAGTGAGTATTAATACATATATATCTTTAGAGAATCATCCTGATGGAAAGCGCAATGCATATAATATGTGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAACGCCAATCTTGTGCA:1 - chr2R 15949619 5' - baggins 5171 1 52.05 AGCAAATATCACTGGCGAGTGAAATGCATTAATGGGTCAGCGAAAGGGGAACAATTGCAGCTTAACAAATATACATAAAAAAAAACAACAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTG:1 - chr2R 20361484 5' - INE-1 539 1 91.78 GCCAAGCATCGTGTATGTAGTTGTCGCGTGGACCGTGGTTCCCCATCGTATTTTGTTGATCTGTATTTTGAATTTGAGATCCTCCATCCTTAACTCATAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGC:1 + chr3L 27414946 5' + hopper 300 1 65.75 GAGGAACGGTGCGCCATAACTTGCCATCAACTTATTAGCAGGCAGTGCAGCTCCTCCTGCTTGCCTCATTTTCGATTTTAATTTCCATGTTGCGACCGCTGGTGGATGGCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 - chr2R 7223803 5' - blood 7376 2 76.03 GAAAGTCGGCAATTCAAAATATGAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGGTTTGACCTAGAAAGTCTTA:1 + chrX 16244854 5' + jockey 4786 1 62.33 GCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 16410120 5' + opus 150 4 55.38 CACAACGAAAGACTCTAGAAACGAACTGCCAAGCGAAGAAGAGGAAGAAACGGAAGTCTAGACTACTACAGTGGCGAACTGATGAATACACACACACACACACA:1 - chr2R 21372812 5' + accord 182 2 78.85 AGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 + chr3R 24228876 5' + opus 68 4 66.44 GGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:1 + chr3R 5765335 5' - opus 7435 2 67.12 CGGTGCCCATCGTCTATGGGCGCATCGCACCTACAAGGCCAAGTGGCCCCTGCGCCTGCTCCTGGTCATCTTCAATACGATCGCCTTTCATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCT:1 + chr3R 12436774 5' + roo 174 2 61.64 GAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAA:2 + chr2R 5582147 5' + Cr1a 466 1 60.27 ATTTGTGAGGACTTCTAATATTAGAAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 9482151 5' - roo 388 2 70.55 GATTTGTGGCCGTAGCCGTGACGTGTGGATATTGCGCGAAAGTCGGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGGCG:1 + chr3L 9426623 5' + P-element 10 2 77.08 AAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 4939194 5' - 1360 3362 1 34.93 AACTCTGTTAGGTAATAGCAACTTACACACACACGCTCACAGAACGTATAAACGGCACTATGTGTATGTGGTTGTGTGCTCAATATAAAAGTATTCAAATAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATC:1 - chrX 5227583 5' + Idefix 7251 2 67.12 AGAACGAACCTTTAAATCTAGCGAATATCGTAAATCAGTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 13923091 5' + Tirant 8169 2 69.84 GCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr3R 14049459 5' - transib2 2790 1 60.96 AGTATACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chrX 13762576 5' - P-element 2833 1 34.21 GCATGTCAACTTGTGCGTATTCAATTGTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 + chr3R 23970507 5' + jockey 4812 1 68.24 GGGCATCAAAAAACCGACCATTAAATCGGCTAAGCCTAATTGGTTTTCATTGTGCATAGGAATTTAAGCCTAAGTAAATGCATAAATTTATTGACGAGGAGGAGTTAATGCCTAACATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chrX 12990298 5' + 297 48 2 72.60 TAATTAGTCAGATAGTACGTCAAGTTGGTAACTACATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 7424612 5' + 412 86 2 76.71 TCTTTCGCTATCAAGATCATCAATATGAGAATGGTATGTATGCGCTTGTGTGGTGGATGGTGTGTGCTTGATGGGTGATGGATGTGTTTTCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATT:1 - chr2L 8430814 5' + Stalker2 7211 3 61.64 GCGGGTACAGGTCCTACCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 + chr3L 18708553 5' + F-element 26 1 75.34 AGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr3R 23507660 5' + 412 77 2 69.86 GGGGGTGGTAAAAAGAGAAGAGCCAGAAAAGAGGAAGGAGTAGAGGCGGATGAAGAGGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGTAACTGGAACACC:1 - chr3R 30274136 5' + Tirant 8170 2 58.90 CAATTGTGGGGCATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 - chr2R 24338483 5' + 1360 32 1 64.38 GCTCACATGGAGGTCAGGTCAGGTCAGGTCATTAGCCATGCCCGGCGGATCTTGTTCGTTTATTATTCATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 - chr3R 19545414 5' - jockey 4933 1 57.53 AACATTCTTGCATCTTAAGTTAATACAATAAATTATGACTGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:2 + chr3R 20452203 5' - blood 7307 2 73.29 CGATGGGATTACACAGAAAATCTGGGAGTTTCGTAGTTAGGGGTCTGCAAAAGGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCGTGTAAAATCCCATATAAGAAG:1 - chr2L 2519956 5' - roo 409 1 81.16 GATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - chr2L 14969969 5' + Tirant 8110 2 71.43 CTTGTGCCCCTATCATTAGTCCATGTTTTGGATTCAGCCGAAGGCAGAGGAATAGGGCTCCCCGAACAATTGATTTTGCCTGCTTGATAATTTGACATCCATGGTATCTTCGGAACGTGAATGTACACAGAGACTTACAAATAAAA:1 - chr2L 19897639 5' + Doc3-element 4446 1 65.07 CAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGTTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAA:1 + chr3R 23108072 5' + G-element 68 1 64.18 AACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGG:2 - chr2L 20841954 5' - G6 1930 1 77.40 ATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr3R 4913613 5' + 1360 73 1 79.84 GGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATT:1 - chr3L 18920466 5' + Juan 81 1 69.66 AGCCAGCCCCAAAAAGTAGGCTATAATGCATAAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3R 18846631 5' - roo 9041 1 60.27 GGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAAT:1 + chr2L 16107256 5' + Rt1b 116 1 62.14 ATTTTTGGGCAACCTTTTCCACACACGGTGTACCTAGCACACTGGTATCTCACGCCCGCTCGGGTACAGGGTCAAACCTATTTACCGTTAGATCACGGAGCGTCCTCTTAGGGCGTCTTCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACC:1 - chr2L 22524684 5' - gypsy8 225 4 58.90 CCTATCTCCATTCATCTGCGCCACAATATTTTTAATGTATTTAATATCGAAAAAGCACCAAATAGCTGTGACATAGGATCAAATATAAACGTATATATATCAGAAAAGTCAACAATCATTGCCTGATTAATTTTTCACACGCCGCA:1 - chrX 19338780 5' - 1360 428 1 75.34 TTTGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCATCACTTTGAGGGTGCAAGCTTTGATAATTTT:1 + chr2L 12460698 5' - Porto1 311 1 64.62 CCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACT:1 - chr3R 12578067 5' + jockey 4731 1 57.53 CGAATCGAAATGATGATGATGGAATATGTGGGCTCCTGCAAACTTGAGCTTCTGGGTGGCGACGCATAACATGGGCCCACTCACGCCACCGAATGCCGCG:1 + chr2R 24238126 5' - invader3 198 2 77.00 CAGTCACCCAGCCAAAGCCGCCGGAACTCCACCAGCTCGACGGCAACCAGCAGCAGGCAGCGCGAACATCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAATGACCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGA:1 + chr2R 18138973 5' - Stalker 432 1 64.75 AGTTCACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3R 21421005 5' - roo 9038 1 62.33 AAATGGTAATTTCGAGCACAGAATGAAATCCAGCCGCAACTGCCCAACTAAGAGTATATATAAATCCGAAATTGGTTAGAGGAAAAAATTAAAAAACAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 18903544 5' + pogo 12 1 77.40 AATTACAGAAAAGGCAAAGAGATCGGGAGATGAACTACCCTAAGATTTGCTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 13849593 5' - roo 9047 1 64.38 ATTAAATTACATTACAACAACAATGCACCTAGATAAAGAAAACGTTAACTTGTCAAACTTTGCACTGTATGTAGCATAATTAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr3L 6751630 5' + pogo 7 1 73.04 CCACTTCTACGTGAAGAGTTTTACATTAGTTAGCTGCAGTGTAATAAGCTCATATCATTCTTTTTAGCACCGATTGCAATAAATTATTCACTTTTAGACGGCAGTTCTACAAATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGG:1 + chr2L 10968014 5' + R1A1-element 5289 1 76.71 CTCTGCCCCAAATGTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr2R 22867498 5' + hobo 60 1 66.92 AGCATGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 - chr3L 21630443 5' - Burdock 219 2 60.96 AGGGATTGCATACTTTAAGGATGATACGAAAATTATTACGATTGATATCATTTTTTAATTGGCTTGAGAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGC:1 - chr2L 6074096 5' + BS 48 1 57.24 AAATGAGCTACATCGACGCCGTAAAATGTCAAAATTAATGGAGAACCGTAATTGTAAAAGAGTATATTGGCATAGTTTATTACTTTTAATTAACTTTATGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACGGTCTTTATTTGTA:2 + chrX 22503097 5' + Cr1a 4031 1 45.21 GACGCTCTCTGGAAGTTTCGAGTTTCTTTCGAGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTCTACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGCTGTGTGCGGACGAATT:1 + chr2L 16685333 5' + P-element 91 1 23.97 GGCCGGAGGGAAAATCCATTAAACCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGATTTGCATTGCCTTAACGTTATTCTTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTC:1 + chr3R 20147892 5' + 1360 327 1 70.63 GTTCTGGCTCACCTTCCACTCTTACTTACTTGTAAGACTGCCGACAAGCGACTGACTAAATTCGGAGACTACATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAA:1 - chr2L 18823610 5' + P-element 2675 1 54.79 ATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTAT:1 + chr2R 7404704 5' + blood 92 2 78.08 TCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAACG:1 - chr2R 15080081 5' - roo 8984 2 77.62 ATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:2 - chr2R 15392789 5' + blood 77 2 69.86 TATTTTTGCTATATTATTGCTCAACTCGGACAGGCAGGCGCTCATCGCACCTACTTTCCGTAGCCCCGATAATTGTGCATAATTCAAGGGGTTTATGCCGACTGGAGCTGTCAGTACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAA:1 + chr2L 5504280 5' + Stalker4 7031 4 76.03 TTTACTCAACGGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 2036981 5' + Doc 42 1 58.62 ACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTATTTATTTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATTTAAAAGGCAGAGCGAAGCGTTTCCAACCATTTAAAAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCTGAGT:1 + chr2L 20413506 5' + INE-1 91 1 50.68 ACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATTTTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3R 25271268 5' - 412 426 2 63.70 TGACATGGATAACTCAAATACTTTTTCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2R 14705733 5' - roo 9037 1 58.90 GCCCACACTTTTGAACCATTTTGAAGTTTAATATAATGTAATCCCCCAATATTTCGCGTTTGCATTCCCAATTGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGG:1 - chr2R 5722313 5' + INE-1 553 1 69.61 ATTATTGATTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAAATCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2R 969266 5' - mdg1 395 2 69.86 AGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATC:1 + chr3R 16535272 5' - Stalker2 353 2 49.32 AACATTATCATATGGTTAACAAATTAAAATTATTCCTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2R 13849763 5' + roo 8693 2 63.01 CAATACTTTTTACTAAAGCCGTTGATCTGCCTTTGTTGATCCGGCTCGAAGCACCAATGTCTGTCGAACTTCCTTGCTTAGTACTTAAACCTTTTTCGAAAAAAACCTTATCCCTTATTTCTATTATTTTTTTTTTGCAGATGATT:1 - chrX 20491533 5' - gypsy5 499 1 56.16 AGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACG:2 + chrX 18707448 5' + BS 4760 1 52.05 CGTATCATTATCCAGCCCTTAACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 - chrX 22858971 5' - mdg3 5476 2 63.78 TGCTCAACAACAATTTTTGTCTTCGATATTCAGACAAATTAAAGGCATATCTTCTATTAACATTGAAAAATAACGTCTTTGGTCTTTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAA:1 + chr4 905663 5' - 1360 3253 1 56.16 CAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACC:1 + chr2L 22641325 5' + HMS-Beagle2 6945 2 60.96 AATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 + chr3R 20292418 5' - pogo 2043 1 61.64 GATAAAAGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr2L 15621989 5' + hobo 15 1 71.72 TATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr2L 17162765 5' + blood 7072 2 60.42 GGTTCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:2 + chr3R 6103580 5' - Tirant 8440 2 62.33 ATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGGGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTA:1 + chr3R 9983024 5' - HMS-Beagle 180 2 72.00 GACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:2 - chrX 10960298 5' - Transpac 249 2 60.96 TGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3R 15514620 5' + 412 58 2 56.16 ATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr2L 15833115 5' + hobo 36 1 59.59 ATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 7739664 5' + blood 49 2 52.05 TAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2L 1073936 5' + Tirant 38 2 64.21 GAAAACTCGCCACCATTTGTACCACCGTCTCTGTCTCATAATCTGCCAAATGCATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 21380739 5' - roo 9045 1 66.44 CTTGAATTACAGAAAAGGCAAAGAGATCGGGAGATGAACTACCCTAAGATTTGCTAAATTAAATGATACTATATGGTTATCTTAGAAGCAAAAATTAATCATTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 13849589 5' - roo 9051 2 67.12 GCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGG:1 + chr2L 15142238 5' + BS 4763 1 55.17 AAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chrX 4789115 5' + 297 6639 2 63.01 TACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAGTGTCGCGAAATTTCTTCGCGCA:1 + chr2L 15153287 5' + G-element 101 1 77.40 CAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 19162588 5' - pogo 2033 1 65.52 CAAGCAAGTTCGTAAAAAATTAAAGGGCTTAAATTCTGTGCGTTTCACTTATAAATCTGTGGAGGTTATATAGAAATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 + chr3R 18847231 5' + Stalker2 11 2 64.38 AGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1 + chr3L 15371300 5' + Transpac 72 2 67.12 TTACCCTAGAACATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 - chr3L 23871333 5' + Doc 67 1 58.22 ATATGTAGCTACGGTTTTATTGTTGGGTTGAGTGTGTTGGTTATGGATGAAGATTGATGACGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACC:1 - chr4 810611 5' - Doc3-element 384 1 58.90 CTGTGATTGTCGCTCCTCGATGGGGAAAAGTGGGGGATAGCTGCCGTAATGGATCAGCACGTTGCCAGGTTCGCTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGCTGATTGGCTGTAATCACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAA:1 + chr3L 20593078 5' - 3S18 5952 2 69.86 CAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr2R 14562087 5' + Burdock 36 2 60.69 ATGAACTTACCCGAATACAAAAGAATATATTTTTCCCATACCTTTATTTATTTCAGCTGTCATCCTTGTAGTGTTGATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCCAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAGTCGATTGCTTTA:1 - chr2R 22832703 5' - Cr1a 4257 1 53.42 GTAACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3R 7739638 5' + blood 7034 2 69.86 AAATAATACCTTTACATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATT:1 - chr3L 18920521 5' + Juan 27 1 67.12 ATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGGAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chrX 21668728 5' - mdg1 348 2 67.12 TATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAA:1 - chr2R 2949104 5' + 17.6 85 2 77.40 GGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3L 20290767 5' - roo 340 2 65.07 TGGCTTCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 + chr3L 19274798 5' + transib2 70 1 65.75 CTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 + chrX 14385164 5' + blood 74 2 66.44 CAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr2R 16513132 5' + jockey 79 1 66.44 ACAAAGGGAAGTGTTTCGTAATTTGTGAGTGGGCGTGGTAGCATGGGTTAACAAATTTGCGCTGCATCTTTATCTCTTAAATCTGTATGCTTCATCTTCTAGCTCTTATTGTTCCAGAGATCTCGACGTTCATACGGACAA:1 + chr3L 22783277 5' - INE-1 131 1 78.72 GGACTTGCGAATTGTCCGGATTCCGACATTCCGCCGGAATTGGACACCTGTCCGCAAAAGTGTGCAATGGTATTTTTGTGCAACAGTTTGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCG:1 - chrX 3229987 5' + X-element 4501 1 62.50 GTACAAAAAACCTTAAAGCCATATACTTGTACATTTCTTAATCCTATACATCCGATCTTGTTAAGGATTAGGGATAGATAATTGTAAACTGCTTGATGGAATTCTTCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAA:2 - chr2R 4996685 5' - transib2 2811 1 76.71 TAGTTGGCAGACGTGACTGACAATATCAGGATTACTAGCCGAATAAAGCATTTTCTTCTCCTGACTAAAGACTTTGTGTCAGAGTGGCAAGGAAAGTCCGCCCCTTTAATCATTTTTTAAGCCAAGCCCACACTTTTGAAAAATGT:1 + chrX 303946 5' + INE-1 255 1 68.49 CTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 - chrX 22858932 5' - mdg3 5418 2 71.92 ATTTTGTATTTTTCCAAGACCTCGTGTCTTTTCCGCTGCGCCATAATAATTTCATGCTGGGATGGACTTAACCAGAAGCACGCCGATATATTTAATGTGGGAGTGGAGGGCATTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTG:1 + chr3R 7685360 5' - Quasimodo 421 2 76.71 AGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCTAA:1 - chr2R 5022763 5' - Gypsy12A_LTR 66 1 57.53 GTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTA:1 - chr3L 21093206 5' + Ivk 100 1 76.55 TCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 + chr3R 11121693 5' + copia 56 2 56.16 TAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3R 15649906 5' + blood 19 2 72.03 TACAAAATCAAAGTCGGGCAAATATGCCAGCTATGTGAGGACGACAAAAGACGAAAGGCAAATGTAAGGACACTCAAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCG:1 - chrX 11014944 5' + F-element 392 1 59.69 CCCGAAAGTATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTA:1 + chrX 18707442 5' + BS 4754 1 56.16 GGCCCAAGTGTCGTGCCATTTAAATGAGCTTGTCAAGTTGGATTTCAGCACATTAATCACCACGCACATCCAGAAGATACATATATATATATATATATATCTCTATATATATATAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chr2R 14553379 5' + mdg3 5261 1 66.44 GATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 21380621 5' + roo 78 2 71.23 TGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr2R 21898010 5' + 412 7074 2 67.14 ATAACGCTGAAAAGTATGCTACGTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 26399922 5' + roo 28 2 66.44 AAATCAGTACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr2R 18123370 5' + 412 11 2 72.60 CAAATGATTTATCCAAAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 + chr3L 20747043 5' + Burdock 6147 2 78.08 TATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:3 + chr2R 8305220 5' + blood 73 2 68.49 TTGAAATCTACCTATTTGCACAATAAGATTGAACAACTAAATGTTCAATATTTTGTAGGAAAATAGCTTTTAATTTATACACAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCA:1 + chr3R 11012722 5' + flea 4642 1 63.01 TAGGCGCTACCACTCTTTTTCGCTCACAGCATGAACGGTGTTTTGCGCTCGAATCCGATTCCACAACCGCTCTAGCGATCACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2L 21237352 5' - P-element 2865 1 70.55 ATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACTCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr2R 8686632 5' + hobo 50 1 71.93 GCTTCTATTTTAGTTCTCCAGCTCCATCACTGCCTTTCACGACAAGGACAGCCTAGAGCCACGTCCTGGTAATCGACAAAGAGGGCAAAGTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGC:1 + chr3L 6615885 5' + gtwin 408 2 51.37 CCAAACCGCGATTGCGACTCGTTCAGGGACAGTCCCACAGTTCCACAGCTGTGCCCATTTCTTAGCTCATTTTATTGGCCAAAATCTATTGATATCCTAGAAAAAGTATGAAATTTCGCGATCGCATTTTCACTAGCTGAGTAACG:1 - chr3R 4826639 5' + INE-1 535 1 53.42 TAAACGTCCCATCGATGGTCAAGTGCTGTATTAGTGGACAAATCACTGTCTGTCCAAATAATGATAACATAAGCGCATGTCGCAAGAAGAAGAAAGTCAGCTGTCGTCAGTGTGGTCATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGT:1 + chr2R 14854948 5' - invader1 377 2 79.45 TGGGTTTCATTTCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 16383416 5' - roo 391 2 63.70 AAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chrX 3529808 5' - 412 7459 2 75.34 TCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr3L 14969303 5' + P-element 60 1 41.78 AAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 11526771 5' - pogo 2035 1 63.01 ACCATGCGGATCCATGACCACGACGAGTTTCTGCAGGCTGATGTGTATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 23099036 5' - roo 394 1 74.66 TGCATTAAAAGGTTTTAATGTGGGCAACAGGTCCTGAATATTAAAGCATACTGACTCCTACTGAAACATCGTTGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2L 22746233 5' - 1360 3341 1 52.74 CTACGGAAATTGTCTACACAAATTTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 5446052 5' - roo 394 1 75.34 AGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATT:1 + chrX 12893345 5' - Bari1 1640 1 63.70 CATCCGTTTGTGCCTCGTTTGTGCTTGATAATGTGCGTGTGGAGGAGCGACCTTGAGCGGAGCGTACCACCTACACATGGACAGACCGACATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATT:1 - chr2R 5849089 5' + mdg1 7071 2 61.64 AATAGTTTGTCACTTGGACAGCAAGGTCCAACTTTGCACAAGTCTTGTGCTTACAATGTAATACTTTTAGACCAATCCCCGCTCATCCGTTTCCACACGAAACCCCTGAATTAGTGGAAATGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAG:1 + chr3R 30749732 5' - F-element 380 1 80.00 CAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr2L 12142661 5' - hobo 2904 1 52.76 ATTATATGTGGGAATACAATGTATGACTAATAAAGAACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATGA:1 - chr3R 21614378 5' + S-element 84 2 76.03 GGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:2 + chrX 21668695 5' - mdg1 381 2 48.63 TGAGCACGGCTGTTTGTCGACCGTATAAGCGATGTGATCTCGGAACTTTAAAAGCTTGAAAGTTAGGACTAAGCATGCATATTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGT:1 - chr3L 22955632 5' - mdg3 152 2 57.53 GTTAGTTGTTGTAAACGTTGTATAAATGCGCTGAGTAGAATTTAAATTCAGTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3L 4175264 5' - roo 338 2 67.12 GGCGGTGGTAACAACCGCAAGGGTCGCAATCGATCTCCTCGCCACGAACGGGACAACAACAGCGGCAGCACAAATACCAGAGAGGGCCGTGGTGATCGTGGCAATTCCAAAAAGTTTGGGCGTGGAAGTTTTGGGCGGTTTAAGGG:1 - chr3L 17037483 5' - INE-1 348 1 75.34 GCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr2L 3734576 5' + mdg3 5292 2 52.05 ATCGAATTTACGACTTTTTTATGAGGCTTTATGTGCGCCCTGCCACACAAACAACAATAAAAAGTTTTACACGCACTGTATTTGCACCGGCAACCAAACTGCTTACTCACAATAGCAATGGTGTGTGTGTGTTTATGCACAAAGTC:1 - chr3R 26273907 5' - G3 36 1 57.53 AAAGGCAAATTATGGCCCAGAGGCATGGAATGTATAAGCTTAAACGCAAAAAACAACCAGCAGGATTTCCCAGAATCTCCCTCAACTATAATTCTAAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCATTGCTAATTTGTAAGAAAGTGAT:1 - chr2L 9753971 5' + Tc1-2 1455 1 60.96 GTGTCGGAATTGTTAAGACTGGCTCTTCGATTAGTTAAACTCAATCACGAGTTTCAGTTTAACAACTAACAAAAATAAAATGAAATATTCGGCAAACAATAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCA:1 - chr3L 7847508 5' - 1360 199 1 66.44 GAATCAGCCCAAAAAAAGCGGAGAAGGCGAAAGCTAAGCTAGTTTGAAATTGTTTTGATTCAATTATAACGTTATAACGTAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3R 7569574 5' + Doc 45 1 45.21 AGTGGAGGAATATATACATACATATCATTGTATGTATGACGTATATCATACATATCATAATTCAATTGTGATATCTCTGAGTTTTTCTTATTTTATATTTGGTATGGCCACCCTTGTTTTTAATTACCTCAAACATACGGTTTGGA:1 + chr3R 4359489 5' - Tc3 1390 1 68.49 TACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr2L 2357384 5' + P-element 46 1 52.17 AGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2R 9164944 5' + 412 50 2 51.41 TGCAGGTATACATTTGACTTTGGTTTATTTTTGTTATTTGCCCAGTTTGTAGTTGACAAACAAACCGACTGACCATGACAGGAGGGCCTGGTTGGCTGGGTTT:1 - chrX 19129062 5' - G7 749 1 62.14 AACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTCTTATTTGAAAATAGATTAG:1 - chr2R 4206659 5' + 1360 319 1 73.29 GAGATAAATTTACTTTATTTTAAATAGATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2R 20704287 5' + hobo 5 1 75.34 CCATGAGGCATCTGTTCCTGAACCGACGACACCTGCGTGTGGAACTCCAACGACCGCAGACATTGGAGTTGGCCGAGCAGCTCGTGGTAGTTCTTGAACCTATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTG:1 - chr2R 12242873 5' + Stalker 425 1 62.33 TGGCGATAACAGATAGCACAATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCA:1 + chrX 18366010 5' + jockey 64 1 53.42 CGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGATGCATTGCATAAATA:1 + chrX 14385143 5' + blood 7064 2 50.68 AAGTCAATGGGCAGCAACATAAGTCAACACTAAAGCCGGGAAATAATGAAAAGAAATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAG:1 - chr2L 9356953 5' + Stalker4 18 4 69.86 AGAGCTGTAGAGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chrX 5222842 5' - 412 447 2 53.42 CGCAAGAAGCTGAACAAATTCGGAGCGTAGGTAAAAAGTTTTGTTTTTCGAAAGGCAGCAGCAGCCGAAGAAGAAGAAGTACATCCATTTGCTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCATTTCTCTTCATCACTCCATCT:1 - chr2R 12783750 5' - R2-element 478 1 54.11 CTCAATTTGTAGTCCAACATTTTACCTCAATAAAAGCGGCTTTTATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr2L 9010546 5' - 1360 3376 1 73.39 GGCCTAACGGATTTGCCCGACCTCGGTCTGGTCCCCTCCTTCATAATTGTTACGGCTTTGGCTTTAAAACTGACAAGATGGTAAGATTGTAGGATCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAA:1 - chr3L 22190542 5' + R2-element 3203 1 65.07 ATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAGCTATTAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTGAAGTGAGTGTGATATA:1 - chr2R 15392789 5' + blood 7088 2 64.38 GATATGATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3R 24229010 5' - opus 476 2 70.55 TTTTGGGGGGTCCTTTAATGGGCCTTTAACTCAAAGCTGCAACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 + chrX 20386667 5' - hopper 1337 1 71.23 GAGCTGGATAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr3R 15649914 5' + blood 7025 2 76.03 GCTAAAGAGAACAAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 + chr2L 15153203 5' + G-element 11 1 71.23 AAACGGGTGTGGGACCTGCATAGCCAGAATATTGCTGGACATCCGGCGCGAGCGAGGATATGGCCTTGGTGTGCAGCAACTCCGACTGTTGCTGCGGCTTTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTAAGATCA:1 - chr2R 13757190 5' + 297 6859 2 63.01 CATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1 - chr2R 11656110 5' + HMS-Beagle 6859 2 62.33 CCGGCAGTATACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTC:1 + chr3L 25232687 5' - accord2 208 1 83.56 AACTCTGATTAGTTAGTCTTTTCTTAAAAGATTTCTTCTCTCTCTTCTTTTCTATTGATTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTTTACAATAATAATACAGTAAATAACAAACACATATAACAA:1 - chr3R 3520281 5' - X-element 4573 1 70.55 CCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1 - chr2L 15965296 5' + blood 73 2 65.75 TAATCCCCCCGTTTCTTGACCATAGAGTGTGGTTGCCATGGCATTCGGCTGAAGGCCCCTCCCCATCCTCCTCATCAAGTTTTCTTGCAATATTTATCATTTATAAAACTAAGAAGAATTTCTGAAATTACTAAATAACTAAAATT:1 + chr2L 7200042 5' + HeT-A 32 1 56.85 ACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:2 - chr3R 6842677 5' - mdg1 7379 2 61.64 CACATTCACTTCCTCGATACAGCTGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3R 10467976 5' - opus 7464 2 60.27 TATGGGGATGTTACCACAAATTGTTGATATAAAATTACCTTTAAACAGTTGGAATTCAACATTTAAGCCGTTAATATATAGAATTTATTCAATGTTTGGTCGACAATAAGATCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGC:1 - chr2R 9263157 5' - 297 6794 2 76.03 ACGTGAGAGCCACACAAAGTGTGGGTGCCTGGCATTCGCATAGCTGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:2 - chr2R 16410146 5' + opus 27 4 67.12 AATGCATAAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 18846607 5' - roo 353 2 58.90 GAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGACTTT:1 + chr3R 10142918 5' + 412 7101 2 51.37 CTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCT:1 - chr2R 2949124 5' + 17.6 6992 2 63.70 TAACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 - chrX 17469261 5' + blood 75 2 67.81 TAGGTCAATCCAACTCTCGCCAGTTAATTTGTTTCTTTCCAACAGCTGAGCAGCGTTGTATCCCCCGTCCTCAGTGGTGTACGTCACAGCCCAAGGGCGATTCCTTCTTACTGTTACATACTTTTCAACGAAT:1 - chr3L 12191793 5' - INE-1 16 1 72.93 CACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTATTTATTTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATTTAAAAGGCAGAGCGAAGCGTTTCCAACCATTTAAAAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCTGAG:1 + chr2L 20413505 5' + INE-1 90 1 50.00 AAACACGTGTACATATATATAGACGACCACATATAGTACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:1 + chrX 4589437 5' + Burdock 80 2 77.93 CCTTTGAGCAAATGCAAAACGCTTGGAATATTTTTAGGCGCGCACAATAAACAATATATTAATTACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTT:1 - chr3R 31914316 5' + hopper 1189 1 73.97 TGTTATATTCTGTCGGATACGCTGCACCTATACAAACTACTCTTTGATTAATTTTGTTAGTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 - chr2R 1277193 5' + Tirant 8129 2 71.92 ATATTAAGCCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGAT:1 + chr3R 20149652 5' + 1360 19 1 65.75 CAGCAGCAACAGCAGCAGCAACGGCAGCACACTACCAACGGCGGCAATGCCGAAAGGATGTTCGTGGCAGGACGAAAATGACTGCCGCTCTTTTTTTCTGATAAATACAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTATAACTAA:1 - chr3L 14125928 5' - Gypsy6A_LTR 139 1 55.48 GGAAACAAACAAACTCCCACACACCTTTCGCGATTGTTGCTGTTGGCAAAGTTCTGTATTTTTTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2L 17069693 5' - 412 7533 2 76.71 AAACAGTAGGTAGATTGGCAGCCAGAGGAGGGGAAACCACCTGGAGGTGGTAACATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCT:1 + chr2L 18163756 5' - HMS-Beagle 186 2 60.96 GGCAGTATACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTC:1 + chr3L 25232689 5' - accord2 206 1 82.19 TGTATACATAATACAACTAGAGGGAAATTTTGTTTCGTAAGTGGAATTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3R 15030809 5' + jockey 27 1 70.55 CATTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAA:1 + chr3R 7884540 5' + jockey 4823 1 62.33 ATTTAAAGGGGCTCATAGGTTTGTTAAAAATTCACCATTTTTGAGTTCAAGAGATAATAGGGTCGTAAAATGTGATTCTTGTGCGTGCAACAGCTGTTTTCAACAGCTGATTTCTTTGTTGTGGCGCCATCTATATTTACCTCTGG:1 - chr3L 8084640 5' + Transib-N1_DM 379 1 49.32 ATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chrX 14692948 5' - Transpac 254 2 59.59 GGCTACCATTTTGGGGTTGCATGCGGGCTTGTGCGGCCTCGAGACACGCACCACCAAAAATGGCTTGTGATTTTTTCCCGAATACATCATTGGCAACTGGATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACA:1 + chr2R 19625001 5' - Stalker4 7250 4 69.18 GTCCTTCAGTTCTCTTTTGTTTCTTTCTGGAGGGTAACACCATTTCCGGTCAGATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 9332080 5' - roo 9053 2 67.12 ATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATA:1 + chr3R 10778651 5' + mdg3 66 2 61.64 AACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAA:1 + chr2R 19633214 5' + jockey 4647 1 65.07 ATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr2R 16891852 5' + jockey 72 1 61.27 CTTACCATGAATAATCCTTGTCTGCTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTC:1 - chr3R 20368104 5' + Max-element 40 2 58.22 CCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr3L 13204811 5' + jockey 58 1 53.42 TTTCCCAGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 - chrX 19231869 5' + mdg3 32 2 63.70 TCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 - chr2L 1073997 5' - Tirant 8429 2 69.86 AACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3L 6751756 5' - pogo 2084 1 62.38 GCACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3L 5446194 5' + roo 63 2 62.94 AGCAATTGCACCACTCAAACTCACAAAATCATGCGGGGTTGTACTTCTCAAAAGGATTCTGCTCCACTTGGAAGAGTGTTTTAAATTTTGAATTTTGATTTGTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chr2R 24630083 5' + copia 4888 2 69.86 ATTTTCTTCAAACAGCAGGTTTTGAATTGACAAAGTGGTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTTACTCTCGCTCATTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCATACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTT:1 + chr2R 3393978 5' + Cr1a 350 1 72.60 ATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:2 - chr3L 22481322 5' + roo 68 2 64.38 ATATACTTTAAGTATAACTTTGAAATTTTATATTTCAGTTGTATTTTTTCACTAAGGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 23043220 5' - roo 345 2 60.96 CTGCGGTGATTGAACTTCAGATTGCTGAATTATTTACAGCTGGCAAAGCGATAATTAGTTGGGCCGCTGACGAAGCTGATGCTGTGGCAGTTGCCAGGGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTAAAGTTACCCGGG:1 - chr2L 10641610 5' - Doc 479 1 77.14 TTTTAAACAACAAATTTAGAGCACTTGCGCGCAGCTAAAAAAAAATTGGCCACGTTTAAGTTCAGGGATTAAGCTGCTCGTATATTAATAAATCATTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATT:1 + chr3R 20305458 5' - F-element 111 1 65.96 ATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 + chrX 6398789 5' - blood 346 2 47.83 AATGTGGTGGTGGTTGAGCTGCTCGTTTCACCGCGCAGATTCTGTTGCTGCTTGTTGCTCAGGTCGGAAAGACTGATGTTGTTCTTTATGATTAATCTGTTCTCTAACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 16502784 5' + 1360 17 1 58.90 GAAATATTTTATTGATTTGTTAATACTCGTCTATGTATATATATATATTCAGATTTCATTTGGCCTTCTGTTCTGTCACAAACCCACTTACATTCACACACACACCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTG:1 - chr3R 11520054 5' + Rt1a 23 1 73.61 GGTCGTAAAGTGCCCGCCACGAGTATTTACTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGGGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr3R 15514665 5' + 412 13 2 76.03 ATCTATAGGGTTAGCATTATCCTCCTCGGTTGTTTCCTGAAATTTTCTATTGTACTTGAAGATCGCTGTACCTCCGATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chrX 8895146 5' - roo 403 1 76.03 AGGCAGGCGGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3L 17447412 5' - Tirant 374 2 68.49 CATTTGCCAAATTGTCGAAAATTTCATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 - chr2R 12703900 5' - blood 354 2 67.81 TTTGCTCGCTTGTTTGGCTGAAATTCGCTGGCTTCGTCGAAGAGCTCGGCGGGATTCTGCCACGGTTGAACGCATATTGACGCTTATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2R 6585387 5' + pogo 33 1 63.01 ATAGTTATTAAGCTCTGAGCGTTAAAATTCTTTCCTGCATACTTTTAAGCGCATTAAAAATAGATGCCAGCCAGAGAACTGCAGTCCGCCACGCGCACTCTAC:1 + chr2L 6583301 5' - hobo 2928 1 68.93 AATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr2L 17228593 5' + mdg3 5294 2 57.53 TAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGAGATAAGAGCACCCATTTAT:1 + chr3R 7739707 5' + blood 7103 2 75.34 ATCTTTCTATGTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr3R 13358580 5' - mdg3 194 2 51.37 CACAAAAAGCACTCTTTGTTTAGCTTTAAGGGCGGTCTTCAAATCACTGCGTTTGATTCGTTTTTTTGATGGGTATGGTATGTGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGA:1 - chr3L 11596410 5' + gypsy6 11 2 78.08 ACTTTTAAGATGGAGCTATTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr3R 14097147 5' - transib2 2782 1 53.10 TCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 + chr3R 10140185 5' - P-element 2824 1 39.04 AAATCAATAAAAAATTACATAATAGAAAACGTGAAACGTTTTTTGCCTAGCTCTAGCTTGCAAAATGTTATTTGAAAGTGTTTTGAATCATACATGCCAAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGT:1 - chr2L 9247012 5' + blood 6993 1 68.49 CAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGC:1 + chr3R 10468001 5' - opus 497 2 74.12 TGTTGCTCATAAATTAAATTGTTAAATTGTTGTTAAAAAAAAACGCTTACACTGTATTTGCCCTTTCTCTGCTGAGTGAATAAATCAAACATACTGAATATTTATTCACTCTGTTATCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAA:1 + chrX 10133018 5' - rooA 115 2 78.08 CTTTTGCTCGCATTCAGGCTGAAAACTACGAAACTAAAGAGTTCGTACATTTTGCAGCTTTGAGATTTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 + chrX 12623121 5' - jockey 4938 1 56.85 CCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:2 + chr3L 18708601 5' + F-element 74 1 63.70 CTACAATAATTTGTATGCAAATTTAAATGCAGTAACATCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAG:1 + chrX 14908396 5' - blood 294 2 73.97 ATTTTCACATTTTCAAGGGGTTGCAGTCGGAAAAGTCAGTGACAGGGGGTTGGAGCGAGATGAATTCCAGTTGACATTGATTTATTCTAACAATTACAATGCAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGAAATTTATTTTGTTATGA:1 - chr2L 1438357 5' - 1360 364 1 71.23 AATTTGTTTAGCCTCCACCATCGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACGATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 + chr2R 14553190 5' - mdg3 228 2 68.28 AAATGCACTTCATCAGCAGAAATCCCCGTATTTGGCTTTAGTCAACAATTCCTGACTCAAAGTGGGTTTGCGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2L 9010413 5' + 1360 53 1 54.11 TCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 - chr2L 14262977 5' + blood 7017 2 76.71 TGGAGCTCAAACACTGCAACTGCATAAACAAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr3L 13722168 5' + blood 7023 2 78.08 GGGTAGCCGCTGAAAAAGCACTGATTGAAAGTGAAAGTATTTAAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chrX 3506029 5' - Tirant 8470 2 60.27 ATGCTCGCTCCATCCAAGCGTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGT:1 + chr2L 21936048 5' + INE-1 12 1 46.58 AGGCTGGGCACATTTTTCTTCTGCGGCGGCAGATCGTACAAATACATAACGATCTCCTTCAGTCCAAAAAGCTCGTGGTGCGTAAGATGGGTATGCGGACGGGCAAAAAGTCTTTTAACACATGCTGGTTTGGATGAATTTTTATG:1 - chr3R 9059301 5' - frogger 2009 1 70.55 GTATCAGTCCGCAATTATTGAATTAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCG:1 + chr2R 19633147 5' + jockey 4580 1 79.45 TTTCCAGCTACTTTGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 18846483 5' + roo 8709 2 55.48 AGCAGTGTGTGTCTTACCAATAAATCTAGCTGGATTTGCACAAAGTTGGCTAAGCTCCTTGGAAGCTTTCACTTGGGAATTTCGGTAATACACTTGAGATAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGC:1 - chrX 16214024 5' + X-element 4273 1 69.18 TTGTTATTCTGGATTTCCCCCCCGTCCTGACCAAATGAAATCGAACCGGCCCATTCCATTTCGCTCACTTGGGGGGCGAAAAAGTTTCCCTTTTGCAGCACGCAAACTGCAGTCGATTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAAT:1 - chr3R 10488676 5' - 1360 209 1 79.45 TTTGCTTGGCATCGTCATGCTTGACATTTCCTGCCTTTTTTACACTTGAAGATAATTCATCAACGTGATCATAAATGAAATCGATATAAAAATGGATTTTAATTATTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chrX 14173161 5' + 412 17 2 73.97 AAAAGTTGTGATGTGCTCTAGGCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAA:1 - chr3R 14049480 5' - transib2 2811 1 75.34 ATACTCTAAGCTGGCTTAAAAGAGCGGAATATTTAAGCATTAGCTATCATAAGCAAATATAAATTAAACTTATTGCGAAATATATAATAGATTGTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTC:1 - chr2R 10163670 5' + Juan 4107 1 64.38 AACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 - chr3R 24175770 5' + Burdock 6204 2 65.75 TGTTAAACTTTAGTAAGGATGATATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCTCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCTGGAATCCCGTGCAT:1 - chr3L 11596328 5' + gypsy6 7495 2 75.97 GAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3L 9571627 5' + jockey 25 1 66.40 TTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAAC:1 - chr2L 1229674 5' + opus 194 2 79.45 AATAAATCAATTTAAACGTTCAATGCTATATCAAATTAACAAAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3R 12363303 5' + jockey 30 1 70.55 TAAAGCCATATACTTGTACATTTCTTAATCCTATACATCCGATCTTGTTAAGGATTAGGGATAGATAATTGTAAACTGCTTGATGGAATTCTTCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 - chr2R 4996672 5' - transib2 2798 1 67.81 GGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 23099106 5' - roo 325 2 78.47 CAAGTTATTTAAGTTATTTGACCTATATTTTGACGAACTTTGTTCTCAAATTAAATTGATATAAAATTGATTTTAAAGTATTTATAATTTTGTGATGGTCTTGGAAAACCCATTTTATCCAACCCTATTATTTTGACCACAGCTGT:1 + chr3L 13476329 5' - Tc1 2 2 86.99 TTTGCATGATTCGGGAGAGCTGTACCTACTGTCGGGCCATTTGTTCTCGCAACGATTGCCGAAGTATTCGGTTGGGCACCTGATTTTTCGTTTGCCACCACACTCTGTTGACCATCTCGTCTGATCGGACTCGTTTCATCATATTA:1 + chr3L 5816622 5' - Rt1b 4772 1 56.85 GGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2R 16383386 5' - roo 360 2 52.74 ACATACCGGAAATTGAAAAATTGAAATGTCCGCAAACAAAAGTTCAAATCACTCTGGCAATGTTTTTGACGATTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3R 24810003 5' - 1360 3342 1 54.11 CAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:2 + chr3R 29708921 5' + blood 7029 2 67.12 CCGCTCTCACTGTTTGTGCAACCACCTGCAGGCAGTCGGCCTTCCTATTGGCTGGGTCCATCGATCGAGAGAACCGCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr3L 14969186 5' - P-element 2844 1 52.05 GCTTGAAGTTATTTATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 + chr3R 12795029 5' - mdg1 7390 2 63.01 TTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2R 18123397 5' + 412 7091 2 54.11 AATCGCAAATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTC:2 + chr2R 19076478 5' + F-element 177 1 73.29 GCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 12608058 5' - roo 337 2 66.44 GATTATAATGAAGCGGCAATTGCAGGGGTACACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr3R 6103723 5' + Tirant 8124 2 73.97 CAAAAAAAACCCATAATTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 23449220 5' - roo 9036 1 60.27 ATACATAATATTATTTTAAGCATACATACCGGAAATTGAAAAATTGAAATGTCCGCAAACAAAAGTTCAAATCACTCTGGCAATGTTTTTGACGATTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 24810026 5' - 1360 3365 1 69.86 GTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr3L 18708589 5' + F-element 62 1 55.48 CCTTAAGCTCGTTCACATATGTATGTAGGTAGCAATAGTCAACATTGTCAATTATTTTCGCAATTTGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr3R 7549753 5' + copia 4888 2 64.22 ATAAAAGGGATAAAATTGAAAACCAGACAGCGCAGTCACAATCCGAAGGATATATGTATATATATATATATCCCTATCCCCAATACATATGTATAATTTGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 + chrX 12558195 5' + Transpac 4939 2 71.92 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGGAATTGGCAAAAACTGCCCTAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACAGGGGGTTCCTCTGTCAC:1 - chr3L 14971177 5' - springer 7463 2 57.53 GATTTGTATTAGCCTGATATATGGATTATCACATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr2R 18123541 5' + pogo 36 1 59.59 GAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGC:1 - chr2L 23295862 5' + micropia 5033 2 69.18 TTTGTTCCTTTAAGCACACGCTGTCTTTGAATATCATTAACATAATTTAAAACGTATAATATTATTTGTGTACCAACCTATTTTACATTTTATTTAGTTTTATAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACT:1 + chrX 17326683 5' - Doc 84 1 65.75 TAAAGATCTTACAGATCTAAAGATTCAACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 - chr3R 10778796 5' - mdg3 5486 2 77.40 AGAAAGTGATTTTGAGATTTTAGGTATTTCTAAGTAATAAATTAAATTAAAAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACA:1 - chr3R 7649876 5' + Quasimodo 62 2 66.44 CTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3R 29708917 5' + blood 14 2 69.86 AGAAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 18524211 5' - opus 473 2 68.49 TATGCTCTATGTTTAATTGTTGGCCAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 30568909 5' - roo 354 2 54.79 GGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr2L 17730532 5' + pogo 56 1 58.22 TTTGTTCCGCCCAACTCCGATTGCATGATGCAGGCAAGAACGGCATCGGCGTACACATCATTCACATGCGTCGCTTGCCACTCCATCACAATGATTTTCTGCTCCACAGTTACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGGGTGCCAA:1 + chr3R 18661484 5' - 1360 44 1 76.71 ACTTCTTGTAGTGCTATAAACATTTACATGGCATTTATTTGAAAGATTCCTTTAGAATATGGTAGCAATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTG:1 + chr3R 4913500 5' - 1360 185 1 76.71 GCACGACGACCAACAATGCCGGATTCGATCGGGGGATCTGGGGATCCAGTTTGCTATGGTGTGGTGTGCTATGGTATGGTATGGTGCCTATATGGCCTCGCTCCGTCCCGTTCCCACTTGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCA:1 + chr2R 21899154 5' + blood 169 2 78.08 GGGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAA:1 - chr3L 5498517 5' + Doc2-element 250 1 42.47 AGTTTACGGGTCACACGATGTGCCAGGAGCTCTACGGGGATCCGTACAGTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTCCTTCAGCAGGACCTCTTACAGGAATCCTTGTCGTCGTCGTCGTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTC:1 + chr2L 16371521 5' + jockey 4783 1 79.45 ATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACC:1 + chr2L 15142244 5' + BS 4770 1 59.59 GAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr2R 18048804 5' - opus 7441 2 61.81 GTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTG:1 + chr3R 18346610 5' - INE-1 539 1 48.97 GTTCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:1 + chr3R 6103581 5' - Tirant 333 2 62.76 ACAATTCCCATCACTTCTTAATTTAATTATTATTAATAATATTTAGATCTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 - chrX 14914436 5' + mdg3 5325 2 66.44 ACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 + chr2R 5214918 5' + F-element 35 1 65.07 AAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2L 1073925 5' + Tirant 42 2 59.09 AAGTATATAACACCCACCTGAATCAAATCATCAGTTTCCAGATCCACAGCGGCAGTGGCTTCGTCCAGCACCAGGACCTTTGCTGTGCTTGCCGGCTGCGCACGGGGTTCCGCTCAATGCTGGGTCAGCACATTG:1 - chr2L 12739184 5' - Gypsy6A_LTR 56 1 59.26 GCCATTAAGCTTTTCGAAATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGT:1 + chr2L 14969886 5' - Tirant 328 2 65.75 TCTTTTACTGCGTGTACCTTACCTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr3L 15371428 5' - Transpac 296 2 74.26 CGTGTCCTGGCGGTGTACAAATAGTGAGGCTGGCAACAAATACCAAATACAAAATGCAAAATGCATATGTACGAGCATAACTCATTAGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 - chr3R 27971143 5' + mdg1 7072 2 63.01 AATACAGATTACAAATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 14043672 5' + Ivk 9 1 79.45 AGAAAATTGCATTCAAGCATATTTATTTTCTTTTTTTTTTATGTCTACCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 12843530 5' + roo 5 2 79.31 TGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - chr3R 5087101 5' - P-element 2820 1 39.73 GGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGTCCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTCGATATGACAA:1 - chr2L 1449696 5' - opus 7451 2 54.48 CTCGGAATGTGTATTAAAGTGTTCTTTCTTCGCTTTCTTTTTGTTTACACCGTCACTAGTTTAGGCCACTTTTTGTTTTACTGCCGCAACGATACTGATTTCTTAAAGCACCGCTGAATTACATATTAACTCTACTCTACATATTG:1 + chr3R 17774289 5' - Stalker3T 51 1 76.71 CAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr2L 2357344 5' + P-element 94 1 21.92 TTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGC:1 + chr3R 13358610 5' - mdg3 5416 2 71.92 ATTCCTACATTGCTACCCTAATAATGTAAACTAATTTCATAACATTCCGTTTGAAGGGCTTAACTATTTTGATCTGCTCTCGAATTTGTAATTGGGATGTTAAAACAATAATGAATCGAACTGCATAATAAATTTGAACTGAATTT:1 - chr2L 16036114 5' - transib3 2657 1 54.79 TTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAACATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 + chr3L 18708596 5' + F-element 69 1 58.90 CAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 17614399 5' - roo 8988 2 75.34 AAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1 + chr3L 24153189 5' - Tabor 7246 2 70.55 GTGCTTCAGCGTTCCTAGGGGGTTTTCTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr3R 15649743 5' - blood 340 2 62.07 GATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 - chr3R 3322564 5' - 1360 3336 1 54.11 CTTTAGACATTGAGCTATAAGTATTTGTGCTTGCTTGCTGGCTTAATCAAGCATGAAATAGTCCAAACGTTGTGGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 + chr2R 19353959 5' - 297 6932 2 56.85 TGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAG:1 + chr3L 27356085 5' - Tc3 1632 1 69.86 AGAGTGGCTCACCTCAACTCTATAATCATGGGTAGAGCACCGTGGATCCGAACACGCACCGCTTCTCTCCACTCATATCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATC:1 + chrX 14140569 5' + G2 91 1 60.96 ATGGACATATTTGCAACGACACACTTTACCAAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 10143073 5' - 412 7526 2 71.23 ACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTT:1 + chr2R 14553227 5' - mdg3 5442 2 56.85 TTGGGACTTTGGATACAGCGCAGTCGCAAAGAGCGACTTTCTCTCTGAGAGAAAAGCTCTTGATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr2R 8686553 5' - hobo 2904 1 54.10 CCAGGCCCCCGACTTTTCCGCTTTTCCGCCTCCCCCGCCTCTTCCGCGGAAAGTGGAAAACTCGATTGGTAGTTAGCCCCACTTGTCTGGCAATTTCCCCCAAACTTCATGCGCTAGTTACGGGTGGCTCCGTTGGATCGGGGGTC:1 - chrX 5440152 5' - accord 7374 2 47.95 AGTGGTGGTCGAGCGAAAGGATTATAATGGGCTATTCAACAGGATCGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chrX 10978928 5' + roo 8673 2 78.08 TGTACAAAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr2L 12261117 5' + jockey 29 1 69.86 CCGTCAGTCTGTCTGTCCTTTCGTATGATTCAGGAACCACAAGAGTGGAAGTTATAAACAAAATCGAAATCGCTTTACTTGCATTGCAGTGCATTTCTTCAACTTCACTGCACTTCCATCTAGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGT:1 - chr2L 20935325 5' + INE-1 548 1 53.42 TGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1 - chr2L 17162858 5' - blood 7322 1 62.33 AGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 - chr2L 19878247 5' + mdg3 73 2 65.75 ATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGCTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCT:1 - chr2R 5022765 5' - Gypsy12A_LTR 68 1 54.79 CGGCTGACAAGCTAGGGACTCCTTCGTTCGGACTGCCCAAGATTATTGGTTTCAAGGGTAAAATTATGATATGAAGTGGAAAATTAAGTGTATGATTGTGCCAAGTGGCAACTGCTGGCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr3L 13661854 5' - INE-1 541 1 78.77 ATTTTCTTTTTCCGACTAAATTTCTGAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr4 1149976 5' + 297 23 2 69.86 GATGTGCCAGGAGCTCTACGGGGATCCGTACAGTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTCCTTCAGCAGGACCTCTTACAGGAATCCTTGTCGTCGTCGTCGTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 + chr2L 16371537 5' + jockey 4799 1 68.49 TATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 + chr3R 19545351 5' + jockey 93 1 73.79 ACCAAATGCACTCAATATTATCTCAGCTACTTACTCGTTTGCATTTCAGTGCATAGAAATGCGAAGATCAGCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAA:1 - chrX 5955887 5' + roo 8609 1 51.37 AAGAAGACATAATTTCATTAATATTTAAGATGGTGGGCTTCACAGAACGCAACGAGCACTAAATCAAATGTTTGTGGTGGTCACGATCTGCCCCATTCCAACAAAAAATAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTC:1 + chr4 489955 5' + 297 6926 2 78.77 GAAACGAATGCAAAAAGCCACCACATGTAGCCGGTGTGTGTTATACACACACACACACACACACACACACATATATGC:1 - chrX 6945872 5' + accord 185 2 70.51 ATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 + chr2R 18048818 5' - opus 7427 2 70.14 ATCAGCTGCAAAAGGAGGCGCTGGAGAAGCAGACACCCATGCCGGTGACCGGAACACTGGCCTCCTGGATGACCCTGCGACTGTTTCGCCTGCGACACATGCATTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTA:1 + chrX 11768400 5' - hobo 486 1 70.55 ATAAATTATTTAAGTGGGATTAGAATTTGCAAATTGCATGATTATAAGCGGTCCGAATTGTATCAAGTTTTCGTTTGCATCTATAATTGCTATAAGAAATTTTAGTCGTGTTTAGATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATA:1 + chr2L 20637029 5' + Quasimodo 2 2 36.99 CAGACGTAACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 - chrX 7293309 5' + 1360 44 1 57.14 GTATCGGTTTGAGATTAAAGAGATTTCAATCGGTTCACAGTCAATTGAGAGTGTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTA:1 + chr2L 11158638 5' - Rt1b 5069 1 63.70 CACTTCCTCTTGGCTCTGCACTCTTGTTTCATTTATTTCTTCAATGTGCAAACTCAAACATTATTAATAATATCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCA:1 + chr2L 14262782 5' - blood 377 2 67.81 AAACGCAAATCGATTTTTGCCTCTCTCGTTGCAGCGGATATAATACAGGATTTGGCAAATTAAACTAATTGCCAGTTGAGAGACAACAAGAACAAGAAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGT:1 - chr2L 3905600 5' + mdg1 109 2 65.07 AGCGCTCTTAAATAAGCATACATTTTTTATAATGTGTGATATATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2L 1229540 5' - opus 7478 2 66.44 CCGGAGAGGACGATCTGGTCGTGGGACTCATTCTGCGCCTGGAGCTTTGCCTCCAATGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGAAAG:1 + chrX 13089676 5' + R1A1-element 76 1 60.27 TAGGTCCGGGAGTTTGAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAAGT:1 + chr2R 5039324 5' - gypsy11 322 2 69.86 GGCAAGGAGTGTATTCTGAATTAAATCTCTATACCCAAACAGCGACTTATCAGAAACTGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGA:2 + chr2L 22641323 5' + HMS-Beagle2 6943 2 59.59 GTTCGCTCCCGAGACGCGACCCTGTACCTCCTACGCTGCGTCTTCTTAATGGGCGTAAGAGTGGAGATAGGAAATCGATAGAAAGTGACAGTTCAAAATATTATAAAGAACAAGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATC:1 - chr2R 5792888 5' - INE-1 564 1 65.75 TGCAGATGATGAACCAATATATACAAAACTTGCTTAGTTAGGCATGCACCATCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTA:1 + chr3R 17656562 5' - invader4 2671 1 64.14 ACGGAATGGCTACATTGCCAAGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACT:1 - chr2L 8393111 5' + I-element 5131 1 74.66 TTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:2 + chr3R 25508374 5' + Stalker2 65 2 61.64 ATGAAAAAGAAATTGTCTATGAGCTGGTAATAACTGAAGGACATGGACGACTTTTAGATGACCTGCAATAGGAGACTTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 + chr3R 11096661 5' + copia 44 2 55.17 GTGGTGGAGGAGGGGCAGCAGGCGGGCAGCTTGACATCAGCATTCATACGTCACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGG:1 - chr2R 13338028 5' + R1A1-element 5124 1 64.38 TTGCAACTAAAAATTAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 15833137 5' + hobo 14 1 74.66 ATGGATAATTTTTATTAAAAATCCTTAACAACGCTTTCCATTACTACGACATTGAGCGTATGAGTACTAAAACCACTTTATAGCTTTTAAAGGACAAGTGTATGATTCGTGTAATGTACACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCAA:1 - chr2R 8862197 5' - pogo 2096 1 79.45 CTCCGCCAGAAGCTTACGCACAACATCACGCAATGCGTGCTTGGTTTCCGTGCTGTACCAGAACTGACTCAATTGCTGCAAGCGAAGATGTGAAAATTGACAGAAAGAGTTAAACAAATTGCAGCGCAAACATTGTCTTCATAGCA:1 + chr2L 6070318 5' + transib4 226 1 60.27 ATACCCTCTCAGGGGGTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chrX 22858812 5' + mdg3 5275 2 71.23 CATTTCTATTGCATTTATTGCATACTATATAGGAATCAAGTATTTGCCCGCTATGCAAGAATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 - chr3R 10357856 5' - pogo 2044 1 58.90 ATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chrX 4789095 5' + 297 21 2 68.22 AGGTTAGGTTAGACATCAAATAGTCCACAAAAATTTTATAATTTAGATGACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr3L 22676357 5' - 412 421 2 65.75 GCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 + chrX 10101325 5' + mdg3 5320 2 60.96 CCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 - chr2L 14222366 5' - Transpac 5186 2 56.85 GCAATGAAAGAATGGAGTGCTGCTCCAAGGAACAGAATGCGGCAGATTATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 - chr3R 25443132 5' + 297 62 2 67.59 AAAAAAAAATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAA:2 + chr3R 23108058 5' + G-element 66 1 58.90 AAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr3L 3979554 5' - opus 479 2 67.48 TATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGGGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr3L 15058845 5' + blood 7021 2 37.89 CTGGGCAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr3R 5765298 5' - opus 7472 2 65.75 AAATCAGAAAACTTGGCGCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 + chr2L 10474349 5' - P-element 2785 1 15.75 GACCATCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 + chrX 19231693 5' - mdg3 5483 2 75.34 GACGCTTTTCAAATTCCACTTAATTCCCGGGGTGCAATATGTATGGTTACATTGTGAAAAATCAGTTATCTATATATATACGGCATAGTAAACCCCATAACTGTGAGCCATAGATCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGC:1 + chr2R 16392484 5' - F-element 4237 1 63.01 TCCAAAGCCGTTGCAAAATGAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr2L 1073875 5' + Tirant 28 2 67.81 ATACGAACATTGTTTTAAAACCTCTGAAACAGCTGATGCTAAAATCGTCACTTAGAAATGATGTGGTAAACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr2L 17638837 5' + blood 7019 2 75.34 GACTCAATTTAAATCAATAAAGGGCAGGCACTTTCGCAAAGGTACGTGGTGACCCCGAATGCTGTGGCAACTGAGGCATACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCA:1 - chr3L 7597493 5' + Doc2-element 4377 1 52.74 CAAGAGCATCGTAATAAAACTCAAACAAGAAGGCATTGGATGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:1 + chr3L 16535183 5' - copia 5043 2 74.66 ACAGATGGGCAGACAGATGGATACGGTTAGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 + chr3R 3322489 5' + 1360 66 1 75.63 TTTGTAACTAACTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr3R 24479251 5' + 412 83 2 73.97 CCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3L 15035093 5' - pogo 2062 1 58.90 CAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTG:1 + chr2L 5771397 5' + Juan 48 1 52.74 GAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:1 + chr2L 7459571 5' + BS 5076 1 71.23 CGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 - chr2R 15613812 5' + P-element 104 1 17.12 CTTTAATGGAAAAGATATGATTTCTTTTAAATTTTGTGTCATATTTTTGGTTGCTTTGTATATGTTTTATATAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCAT:1 - chr3L 11203850 5' - Idefix 7165 2 53.42 GTCCTTGAAAACGTTGGTTATTAAAGTTTGGGTTCTCGTCAAAAGTTTTGCGATTGAATTGTGCATTCGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGAT:1 + chr2L 12717055 5' + roo 8823 2 53.42 GAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:2 - chr3R 9616664 5' - roo 9004 2 65.07 CTTCTTACAGCAATACTAAAAAGCTACAAAGAGTAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGTGGCGCTGCCGTGTATCG:1 - chr2R 1949181 5' - Cr1a 4403 1 76.03 AGCCATTGTCATACATTTACTGGGCGACTCTGGGACTCGGAGACGGAAATCGTGATTGCCCAGGGCTACTTGCCAGGACGTCCCTTCTTGTTTTATCGTATTGAAGGGGACTTAAAAGGTGTCCCATTGGGGTACCAAATAAACTT:1 - chr3R 9641462 5' + G5A 2576 1 67.12 GGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCTATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAA:1 - chr3L 15099666 5' + G4 3829 1 45.21 AGATGATGTAAGGAAAATCTTACAGCAGTATGTAGTTTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3L 9242067 5' - roo 8988 2 73.97 CATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAAATGACAACC:1 - chr2L 1449687 5' - opus 7449 2 57.25 TTTTAATTTTTTTAAATTAATTTTGTCAGTGCATGACTTTTGCGTGCGCTCCAGCGAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr3R 15030763 5' + jockey 74 1 61.64 GAGGAAAATTATACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTT:1 + chr2L 12283946 5' + Quasimodo 79 2 73.79 CAATTTCCTGCGCAGTGAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 - chr3L 3540269 5' + mdg3 5264 1 76.03 CTTCAGTCTTCTGCTGATTGAATGAGAGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chrX 14692964 5' - Transpac 5189 2 58.22 TTTAACGTGTATTTATTTCGTTTTTTTTTTCGCCCACCTACAACTTAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTAT:1 - chr2R 6047913 5' + mdg1 447 1 66.44 GCACGACCGACTCCTTATATACGATTTGCTCTCTTTGGTTTCTCTCGGCGGGGGAGAATTCTCGCACAGAGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr3L 14969314 5' + P-element 49 1 49.32 CAATTATTTAGATTTAAATGGCATTAAAAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 + chr2L 19878105 5' - mdg3 5490 2 76.71 CCGTGGTTATTCCATATTCCGTTGGGCCCCAACTCAATCAAATTGCCATACTGATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTACCATCTTGTGG:1 - chr2R 11656156 5' + HMS-Beagle 17 2 72.60 ATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2L 17730526 5' + pogo 62 1 62.33 GCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGT:1 + chr2L 5771432 5' + Juan 83 1 71.92 AGGTGTTGAATGTGTAATGAAATTTTAAGGAGCAAATGCAATATTTTGCTATTAATTACCTAATTTAGACAAATTCTTCAAAAGAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chr2R 20991329 5' - pogo 2068 1 60.27 TTGTCACCTAGTACCCTGCTTATGCAAACAATTGTAATCTCCTCTATTCAACGCACACACAATTTACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr2L 12481417 5' + pogo 53 1 53.42 TTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chrX 21668726 5' - mdg1 7388 2 67.12 ATTTCGTATCTGTAACTATAATAATAATTGTTTTAATTGCTATTGCCAACATTTAGAAGTCGTTTTGTATATAGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 - chr2L 8452350 5' - copia 206 2 52.05 TATTATCCGGGCTTATAGATGACTCGACTCCGATTGCCACATATTTCTTTCTGTGTAGTGACCACCTTGAGGATGTGACTCGCCTGCAAAGTTCTCAGCGATCGGCAGTACTTGGATTCTTATCTCTAATTATATAATGCATCGCT:1 + chr2R 24588166 5' - rooA 248 2 72.60 TGTCATACTTTTTGTGTGGCCGAAAAAAAAAAACAAGCCCAAAAAAAAAACAAAACCCTTTTTTGTAAATTTTTTTTAAAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 13975592 5' + FB 173 5 34.78 CAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 + chr3R 24455353 5' + 297 6643 2 65.07 CGCTTGTATGCCTATACTGTTTGTATGAAATACCGCTTGTATATTCACACCGCTTGCAGACAAATACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chr3R 3257449 5' + Burdock 53 2 56.16 CGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 + chr3R 10142933 5' + 412 63 2 59.59 TCGATATTAAAATCAAATCTAAAAAATTGCATTTTTTACATAAATATTTTAATATTCAACACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAA:1 - chr2R 5079291 5' + flea 55 2 56.16 CAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chr3R 11121685 5' + copia 4917 2 51.37 ATGATTTGGCAACTTTTTGTGGCTTTTCATTTCTGAGTGGTATCCGAGTGTGTGGCGTGTGTTATGGGATGATAAATGATAGTTATGGACAAGTATAGATGTACTGGGTCGTTTACTTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTTAT:1 + chr2L 5418919 5' - Tom1 201 1 64.38 AAGCCTCTTGTGCGGATTTATTAGCTGAGCGATCGGATTTGTAACTAATTTCGAATAGAGAATTTCGAACAATAAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr3R 24479288 5' + 412 46 2 54.79 AGTATACGTTAAATCAAAACCTTTATCCGTTTTTTCACTGAGCCCACTGTAAGACCCTTAGATGTCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chr3R 25521899 5' + blood 7067 2 54.79 GGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 + chr3L 14581388 5' - pogo 2047 1 64.84 GGGGGGAATTTCTCTTCTGAATTTTCCAGCTACTTTGTTACGTTTTTGCCCCACAAACAGGCACACATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:2 + chr3R 18846461 5' + roo 8687 2 70.55 ATGTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2R 15080101 5' - roo 9001 2 65.75 GGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3R 16041109 5' + jockey 73 1 63.01 GAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chrX 983228 5' + 412 7092 2 55.38 ACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAGACACTG:2 - chrX 21667919 5' + gypsy2 6575 2 74.66 CGTAAGGGAGTGACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAAT:1 + chr2L 16107239 5' + Rt1b 105 1 71.23 CGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAGTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr2L 17069527 5' + 412 7097 2 56.16 CTAATCTGCACATTCTATTCGAAATCAGAAGTTTATATATATATTTGTTTGTATTTTCTCGTAATAGCTTGCTATGTTTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr2L 14008696 5' - pogo 2061 1 58.22 TATGCGGAATATGCAACTGAAACAACAGCCAATGGCAGCAGTGTCGAAAGGAAGTCGAAAGCGAACCGAGTTGGGAGGAGCAGTAGAAATAGCAGTTTTTCATCCACCATATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGAC:1 + chr3R 16947271 5' - 412 7249 2 76.03 GCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chrX 14385144 5' + blood 54 2 52.74 ATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1 - chr3L 24153256 5' + Tabor 78 2 72.60 TACACGTAAAGTAACGTTAAACAATTTTTTCTCATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAAC:1 + chr3L 22737379 5' + mdg3 5340 2 77.40 AGTCCATTCAAATGGGTCATACGCACGACAGGCTGTCGGCAAAAGATGTGGAGCAGATGTGACTGCGGTCGCAACAGATGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAA:1 - chrX 11448627 5' + mdg3 5073 1 60.27 GCACACAACACCTCCCCCTTTGCCACCTGAAGATGAGACGCACTAACCGCTATAGGTTTACCGTTGCCGCTTCCTCTTGGACGCCCTTCTTCAAATGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAAC:1 - chr3R 6913788 5' + G2 101 1 67.81 GAAACCCATTGAATTTAGATTGAAATTACTGGCCACATCTTAGCCGTAGGCTTTTGACCGCGAACATGTCCAACGAGCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 - chr3R 9289418 5' + HMS-Beagle 6836 2 58.22 GAAGGAAAAGTAGAGAATAGCTAAGACATCTAACGACGAGGAAGTTTAAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr2R 544755 5' + HMS-Beagle 31 2 63.89 ATAGATCACAGGAGCATTAGGTCTTGAAAATGGGTTTTCAGGGAGGCATATTCATTAGCAATCGTACTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3R 21924204 5' + roo 12 2 77.40 GAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 - chr2L 17228703 5' - mdg3 5426 2 65.07 TGGAATTCTTAGGAAAATAAATGCGCGGGAAAACGATCAGTACGTGTTTCTGGATTTGTTTATGTTTTGATTGTGCTAAGCGTAGCGGATAAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 10357711 5' + pogo 24 1 71.92 CACCCCCTGCACACTAACACTTACGCAGATTAAGAATCACACATGGTCGGAAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGG:1 + chr3R 6068400 5' - Quasimodo 75 2 65.07 GAGCACCTGCTCGAAGCCTCGTGAGCACCAGAATCGCTTCATGCTCACTACCATCATGGTAGTGCTCCTCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCT:1 - chr2R 9163770 5' + 412 7445 2 52.74 ACATTACTACGCTCCTCTTCATCGAAACTATGGCGCAGCTTCTCGATGAAGCCATCCTGCAAACATTAAATAGAAATTTTGGAATTGCAATTACATAAATATTATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:1 - chrX 7329352 5' - Bari1 1694 1 75.34 ACAATGCCGGGGGCGGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAA:1 - chr3R 28033689 5' + diver 61 2 57.53 AGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAG:1 + chr4 1301734 5' + 1731 100 1 65.07 TACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chrX 9816476 5' + jockey 69 1 57.53 TTGCTGTTTGCCTAAAATTATTAACTGCTGCTTGAGATTAGAATCAATGGCTGTTGGGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 - chr3R 18665348 5' - 1360 3328 1 59.59 TCCTTTAGCAGTACCGACACCATTAATGGTAGTTCGGGTGTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 + chr2R 15062188 5' - blood 297 2 73.97 GCCATTTGATATAGACCTCGCATATATAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr3R 9958588 5' + opus 151 4 58.45 TGATGAGCTATCATTTTATTCCTGTTCATATTAGGTTAGATTGTTAGATACAAAATTTATATAAATGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 13843804 5' - roo 356 2 57.53 CAAATTTCAGCATTTTTCCAATTTGTTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 - chrX 3452565 5' + Tirant 8126 2 73.97 AGACGCATGGACATATTTGCAACGACACACTTTACCAAATTGCTGCTGACTTGAACACGTTCGTCTTTTATAGCTCCACAAGCTATATAAATGACATAGTTAGCCTATTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3R 10143079 5' - 412 7532 2 75.34 CTTCAAATTCGCATCTCTCTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3L 7434973 5' - pogo 2063 1 63.01 CTCCGGGAAAACGTGAATAAGAAAAATGGGGAGTTGACCAGGATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATTTATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACGTGC:1 - chr3R 9958737 5' - opus 497 2 78.18 ATTCATACATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2L 2519810 5' + roo 8731 2 64.14 GGCTTAAATACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr2L 2357392 5' + P-element 46 1 54.79 ACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTTCT:1 + chr2R 6984380 5' + Doc 21 1 70.50 CCTGGGCAATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr3R 5765297 5' - opus 470 2 66.44 ATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGA:1 + chr2R 5582167 5' + Cr1a 486 1 48.63 AGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr3L 15371386 5' - Transpac 5163 2 64.38 AACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTTTTATC:1 + chrX 292434 5' - G3 4500 1 70.55 TTTTCAACATCTCGGGAGAACCTTTGCAGTAAACATTAAATAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACATAGCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTACGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAAT:1 - chr4 140777 5' + I-element 5017 1 74.66 TACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGT:1 - chr3L 11361866 5' + springer 7162 2 68.49 GGGAACGGCAATGGCAGTGGGTATGCAGAAATGACTGCAGGTCGTCCTGCCGGGTTCTGCGAAACTCCTCTCTCCAAAAAGCGGGGGCTGCCGTGTAAATGGAGAATGTAACCATTAGACAAAGATAGACGCGAGTTCTTTTCTCT:1 - chrX 12340097 5' + frogger 2155 1 76.71 GTGATCGCATTGTGTGTGACGAGTAGAGATATTTCTAATGAAATCAATAATCGAAACAATGTTTAATCATTACCGCTTTCGCTAATACATTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATTTATGCTTTTCGGATCCCTCC:1 - chr3L 8755922 5' - R1A1-element 5334 1 63.64 AAAACAAACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 - chr3R 15465610 5' - mdg3 5471 2 65.97 AAAATATGTTACAGATTTACATGACTGACAGTGAAAAGTTTTTAAGAATGATTTCTTCAAACTATTTCTTTTAAATTGTGTAATGAACCAATATATGCCTCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr2L 21596605 5' - blood 331 2 53.42 AATACGCGCATTTGTTTGTATTTATGTTTTGGCTGCTGGTTTGGTGCCCATTTTTTCTTCGAACACATGTTTTTACTTAACTTTTCAGTGCTTATTTATAGAGACGACTGCGCCCCATTTGTCACATATATGTATATACAATATAT:1 + chr2L 10499306 5' - INE-1 61 1 76.71 CCACTTTTCCGTAATGGACTTAAGCTAAACGGAGTCGTCGCTTCGGTTTTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGA:1 + chr3R 7424545 5' - 412 7476 2 65.07 CACACACTCGTACATGTGTAAGCCAAAGTCTGGTCTTTGGGTACACTGAGAGAATGCTTTGCTCTTTACAAAGTTTATAGTTTTATCTGTAAAAAATGTAACCATTGCGCGATGTATACGACTTTATAAAAAATGAAATA:1 - chr2R 16725253 5' + Tc1-2 379 1 75.00 ACGAAAATTGCTTTGCCGTGGCAAGGAATAATATCAGCACATCCTTCAGCTGGCTGTGAAAACATGCAAAGCCCACAAGTGGTAATCCGCCTATATATTCCATATACATATATGTAACATGTAGTAAGGCTGAAGTCTGGCAACAA:1 - chr3R 12540280 5' + flea 12 2 77.40 CCTTATGCGCCCATATTGTGCAATCCCTGGCCTGATAAATGCCCCACTTGACCCTTGTGCCAGTCGAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTA:1 - chr3L 14897072 5' + jockey 258 1 54.79 CAAACTCTTGGTTTGCCACCAGCTTGGGTTTCTCGGGGGTCTCTTTACACAGCGCAACTAACATTTAATTAGAGTAGTTTTTGGAATTATGACTACTTATGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGT:1 - chr2L 2030390 5' + R1A1-element 5255 1 64.38 AAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 + chr3L 5438734 5' - hopper 1351 1 60.27 CACCGGGCAAAATAACATCTCAACGGCGTAAGCCAGCAATGAAAATGGCGCGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTA:1 - chr3R 11121791 5' - copia 187 2 63.70 TGATTTAAATAAAAATTTGAAAAAAGTAAAATTTTTGATTTTCGAACATTTTTAAACTTTATTTGAAATTTCATATCTCAAAATTTGGACGTGCGCAAAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACT:1 + chr3R 19418483 5' - FB 57 1 79.45 ATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACA:1 - chr3R 14097108 5' - transib2 2742 1 74.66 GGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr3R 23507652 5' + 412 7138 2 75.34 CTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTT:1 + chr3L 16157196 5' + Juan 63 1 62.33 AACATTGTTTTAAAACCTCTGAAACAGCTGATGCTAAAATCGTCACTTAGAAATGATGTGGTAAACATTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGTTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr2L 17638832 5' + blood 7024 2 71.92 ATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAA:1 - chr3R 6053080 5' + Quasimodo 39 2 58.22 AAACGTATTGAAATGTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAA:1 + chrX 7480735 5' + Doc2-element 227 1 71.77 GATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chrX 14756639 5' - pogo 2061 1 58.22 TATCAACTTTTGCATGTTTAAGTTTTGTCCTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr2R 9867157 5' - roo 8981 2 78.08 GCACACAAACAAATTATTTAATTAAAGTGCCCCCGAGGCAACATCGTGTGTGTTTTGCGTCTTTGGGGTGAAAGTTAAGCTCTTCGGATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 9616698 5' - roo 9038 1 62.33 GATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACA:1 - chr2L 15833069 5' + hobo 82 1 72.60 CCGCGGTTCGCAACATCAGCGACATTTGTCACAGTTTCTTAAAGAACATTTGAATATCCAAAGCATCATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 + chr3R 15974706 5' + P-element 62 1 43.15 CCCGAAAGGAGAGGTGTTCTTCCGTTAATAGAGGAGCTCCCGAAAAATAGGAGTATCCTGAATTCTGAGACGATTGTTGTATAGTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCC:1 - chr3R 2999875 5' + McClintock 5987 2 62.33 GGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr2L 15833066 5' + hobo 85 1 76.03 AGCTGCCACAATATGCATTATATTGCTCATGACCCTTAGGGCGGTCCGGGGATAAGATAAATGAAATTAAGCTTCAGTTCATTGATGTGCTTGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTG:1 - chr3L 6294244 5' - G2 2639 1 55.48 GACATCTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGC:1 - chr3R 11461874 5' - 17.6 435 2 63.01 GGTGGTCATGGAATCAAGTTAAGTGATTCGCTACGTGATGCTCTTTTGGGGCCAAGCATCGTAAAAAGGTTCCAGCAGTAAGTGGAAGTGGACAAAAAATAATCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATAT:1 + chrX 7486941 5' + 1360 3261 1 69.86 GCCTAAAGGTGGCAAAATCATATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3R 4913694 5' + 1360 14 1 76.03 TCGCCCCGGTTTTCACTGGCTCATGACTAAAAATGTGTAATAAATTGTCAAATGATTCATTCTAACAAATGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTTGGACAACTTAGTG:1 - chrX 12576744 5' + R1A1-element 258 1 49.66 TGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 + chr2R 10367496 5' + 412 77 2 73.19 GTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGTTGCTAATTGAACTGAA:1 + chr2R 13574756 5' + diver 66 2 62.33 CGATGAGTCCTACAACGATCATATATTCTACGACGAACTTCAGGAGGACGGAGAGTTCCACAACCTCGGCAATGAAAAATTGAATACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACT:1 + chr3R 21044695 5' + jockey 476 1 58.22 GTAGATTTTGTATACCCCTTTGCTTATCAATTAAACATTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:2 - chr2L 14222382 5' - Transpac 283 2 67.81 ATGGGATAAATGTAATCCCTGCCTGCAAATGTATTTGCAGAAATTTATAATTTAAAAAAAAACGTATAGCACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3L 5490831 5' + 412 50 2 56.85 CAGATAGCCAGATAGCCAGCTAGTTGTCCCATGTAGTCAGTCACTCAGTCAGGTCAGTTCGCGGTGTATCCATGGCAAGTGCATGGCGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAAATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 + chr3R 24175647 5' - Burdock 6358 2 63.01 TTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 - chr3L 17667647 5' + F-element 53 1 46.58 GAGAGGGAAAATGGACCTTAAGTCATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATTTT:1 + chr3R 26315872 5' - roo 9036 1 59.29 ATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr2R 15062272 5' + blood 7071 2 56.85 GGCTGGCATATGTTAGCAAATGCAATCCCTCTCACAAAACCCACTGATATGTAAGAGCATACTTTAAAATTAAAAAGAAAATCTATATCTTCCTTGAACATCAATCCATATATCAATCTTAAATTTTTGAAATATTTTTTTTTTTA:1 - chr3R 21238131 5' + FB 176 1 52.05 GAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCACCACTTAGTTGCACTGCATAAATAAATGTC:1 - chr3R 15649869 5' + blood 59 2 59.59 GTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3L 14581345 5' - pogo 2072 1 65.75 CTATTTTTGTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr2L 3967132 5' + hobo 77 1 68.97 GGACTTTGGGCTGTTCAGCTCCACCAAGCTGCTCTACTGTGATATGGGCCTAGGAGTGCCCCACAACTGGTTGTGCTACCTGGCGCCGGAGCTAATCCGAGCATTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTT:1 - chr3R 5481169 5' + Doc 213 1 71.92 CTTACAGCAATACTAAAAAGCTACAAAGAGTAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGTGGCGCTGCCGTGTATCGTAC:1 - chr2R 1949178 5' - Cr1a 4400 1 73.97 AATGGCCAGAGACTGCTAACTGGTCCAAGTCGAAAACAAAAGGACCAACCTACTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATA:1 - chr2L 9356899 5' + Stalker4 7028 4 69.18 AGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 15514592 5' + 412 86 2 75.34 GAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:2 + chr3L 20785492 5' - P-element 2785 1 15.75 AAAGTGACCATGGTCAGGGATATGGGGAAAACGAGAAACGAGGTCAGCGGCTGGAACGAAGAAATGCACTGAAAAAATAGTGCACCAATTTGACCAGAAAGTACAAATGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATC:1 - chrX 8357786 5' + FB 8 1 72.14 CTTTTGATAATATTAAGCCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGGGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACG:1 + chr3R 20149643 5' + 1360 10 2 70.55 AAACCTTACTGCCATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 9241976 5' + roo 8711 2 53.42 ATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:2 - chr2R 23313074 5' + Tabor 77 2 68.49 GGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2L 12261156 5' + jockey 69 1 57.53 GCAAAAACACCGAAATCACAGCAATACCAGCCGCAATCATCCATATGTACTGTCCTGGGATTTCATCAGCGAGCCGAATGAATGGCGTCTCTTATTGATTAGCGGCAATGATGCACCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 + chr3L 3137719 5' + FB 7 1 79.45 CCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACG:1 + chr3R 443025 5' + gypsy2 23 2 68.49 GAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2R 20500118 5' + 412 32 2 62.11 CCAAGGGGCGAAATCACGTCCGAGCGGGGAATTATGTGCTTGCGTGCCGCGCTAAACTCTTAGCCACCTCCTTTTGGCCGAGTTCAAAACGTACTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 4659656 5' - P-element 2865 1 70.83 CGGGTTTTTGTTAAAGTTTCGCGGACCGACAAATCGGTTCGTTTTAATTTCAAACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGC:1 - chr3L 19801748 5' - mdg3 5333 2 63.70 GTGTGATGTTTTAAAGGAGGTCGTGACACTTGGATCCCCATTTTTTTCCATTATATCTGAGCTCTCATTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGAGGTGGACAACGATCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTT:1 - chr2L 21366350 5' + Circe 223 1 52.74 GTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGCCGCGGATAAAACAAACACGAAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3L 13204770 5' + jockey 73 1 72.50 AGCCATTTGGCCCTGAGAAATTTATCGAGAGACTTAACAATTCGCGATCGATTCTATCTGATGACTATCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 13313253 5' + roo 52 2 53.42 TAAGATTTTAGGAATGATTTATCTAACAAAGAATATATTAGACTTTTAAACACACTTAGAATGAAATATTTTGCAGGAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAA:1 - chr2R 12703586 5' + blood 7363 2 54.79 CCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 - chr3L 16180969 5' + Transpac 4988 2 65.07 GGTAAGGTGCTCTGAAGCTGGACTGTAGAACTCAGCGATACCTCAAAAGTGTTTTTTTTTTAGAATATTTCGAAAATGTTTCGGTATTTGACTTTATTTTGTTGTTTTTTTGTT:1 + chr2R 9561768 5' - gypsy11 3934 2 78.07 GCTAGCTGAGAACACACACTATCAGGATCTAGATTTCTTATCGAAGGAGTCGTCAGCATGGGGATTTAGTGATCATAAATTAGTTACGTGAAAACCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATACCTC:1 - chr3L 19146724 5' - pogo 2077 1 67.81 AATGCCATACTTTTCGCAACTGGCCGTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGC:1 - chr3R 24175787 5' + Burdock 6187 2 54.11 TCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 - chrX 19231847 5' + mdg3 50 2 52.82 ATCTTACAGATCTAAAGATTCAACATCGTCAGGGTCGCCAGACAATGACCTCCATATATCACCTCATATTAAAATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAA:1 - chr3R 10778791 5' - mdg3 230 2 74.48 GAAAAATAACCCATCCACCTTCTACCCTTGTAAGTTAAGTGCCCATCTTTTGCTTTTCCTTCCTCAGCTTCACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTAGGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTAAT:1 + chr3L 8269343 5' - G4 3506 1 51.37 AAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCA:1 - chrX 22858923 5' - mdg3 156 2 77.40 CAGTGGCGTGTTTTTATTTTGGCTTATTTCTACAGTCATTTAGATAATTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTC:1 + chr3L 14546338 5' - copia 5052 2 68.49 TGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chrX 16243794 5' + 412 7070 2 71.92 AGAATGAAGCGTTTGCGAACCAATAAAATGTATGTGTTGTATGTTGTTGTATGTTGTTGTTGTATGTATGTGTCTTATCAGTATAAATATATTTATACCCGATACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:1 + chr2R 5497753 5' + INE-1 11 1 75.34 ACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACTTTGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 18849838 5' - roo 9002 2 67.12 ACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3R 10973191 5' + jockey 60 1 51.37 TTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 + chrX 18193667 5' - hopper 1396 1 71.92 AGCAGCGCGCGAGCAATGCAACGGAACCTAATCCAGGAGTCAGCCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAA:1 + chr3L 5438686 5' - hopper 1400 1 73.29 TTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAG:1 + chr3L 21630342 5' + Burdock 87 2 78.77 TAAGACAATTTCGCGACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 5245536 5' + 1360 28 1 67.12 GAAAACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 - chr3R 6842681 5' - mdg1 345 2 58.90 CGAGTAGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTC:1 + chrX 12893340 5' - Bari1 1645 1 60.27 ACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGCTATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 - chr3R 24228944 5' - opus 7433 2 79.37 GTTTACATGTACGATATGTATGAGATATGTGCAGATGGGTGGAGAGTTTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 - chrX 15814595 5' - P-element 2815 1 36.30 ACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chrX 9816475 5' + jockey 70 1 58.22 CTCTGTACGCGATTGCTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGTGAGCAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3L 7434955 5' - pogo 2045 1 57.53 GGTGGTAGGCGATGCAGCTGTAGACTCTTGGCGCTTTTAGAACTCTACTTCACATGTATTTATTTGGTTCCATTTATCTCAAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTG:1 + chr3R 6056041 5' - Quasimodo 7018 2 55.48 TTTTATTGTCGGAACATGTTATTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr3L 3979717 5' + opus 7022 2 72.60 AAACACCGAGCGAAATGTGCCAAAGCAAAAAGTTTGAACGCACACAGGCGCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACGGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3R 10079303 5' + P-element 69 1 37.50 AAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:1 + chr2L 19878132 5' - mdg3 211 2 58.22 AATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCC:1 + chrX 18239386 5' + jockey 4593 1 78.08 AAATATATAAGTTACACATAGTATTTGAATATTTCGGTAATTAAAAAAGACAAATATAACAAATCAGCTTAAGACTGACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGT:1 + chr2L 17813806 5' - rover 7113 2 56.85 TATCCATTAAAAATGAAATTAAATTACAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 + chr3L 11669729 5' - Tabor 474 2 72.60 CTGCAATACACATATTCTTCTAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1 + chr2R 21227344 5' + mdg3 5310 2 56.85 AAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATAC:1 - chr3L 4738469 5' + Idefix 63 2 65.07 CTCTGCCTGCATTAATTGCAAATACCTAACGGTTCCAAGCACGTTAATGGCGGATGGTTAGACCGGTTTAGGCCATGGCTTATTCTTCCTGGCATCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACG:1 - chr3L 4422658 5' + 412 7323 2 69.63 ATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr3L 18708629 5' + F-element 39 1 69.88 GAAAATCGATGTTGGATGGAAAGAAAATTTTAGCTCTTGACCACAAGGTGAGCCAGTTGTTGTTGGTGGCTTTTATCTCTTCTCTTTGCGGTTCGATTCAACGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 9345715 5' - pogo 2084 1 73.97 CAGTTCCGTTGATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATTTTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2R 18722044 5' + 412 45 2 53.42 CGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCC:1 + chr2R 6984303 5' + HMS-Beagle2 6932 2 53.96 GAATTGTGAGTTTTATTTGGTCCAAGGCATTCACTTCAATGTGAAGGGGAAATAATTAAACCGAAATGATTAGTGTGCTATCTATAATGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGTTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAA:1 - chr3R 25420039 5' - blood 391 1 60.27 TCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chrX 983133 5' - 412 7473 2 65.75 CAAAAGCACCATCCACACCAACCAGCACCGATACTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGGAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr3R 24693513 5' - hobo 2927 1 77.40 CTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 11228534 5' - roo 9030 1 57.53 GTAAAAGAATACCCACTGTTATAGTGTGTTATCAGTTACCCACGCTGGCTTATCAATCAGAAAAACGAGCCCCTCCTTCGATTGCCCTTATCGCGTATTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2R 21078379 5' + jockey 30 1 66.21 TAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 15167763 5' - roo 352 2 56.85 GGGGCGTGGAAAACAAACTGCTGCCGGGAGGGAACTTGACTGGAACGTCAAAGGAGGCGGTTTTCAGGGAACGGGAAAACACGGCAAGATTAGTCTCAAGTGAGCGTGATATAATATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGC:1 + chrX 20752189 5' + blood 7121 2 59.59 CGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 20290770 5' - roo 9017 2 60.29 GGGCCGAGATATCAGGAAACACATTTCCTCTCTAGTTTCTCCCTCAAATGAACTATATTTGTGTACCTGTTACTCGTAGTGAAAATGGGTGTACTAGTTAGGTATAGTTCGTTGAATATATATATATTCTTGATCAGGATATATAG:1 - chr2R 5191123 5' + INE-1 85 1 78.08 AGAAAATTGGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGCATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chr2L 3734619 5' + mdg3 5263 1 60.27 GAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 + chr3L 16180883 5' - Transpac 241 2 65.75 AATTTGGAGCTTTATACAGTATACAGAAGATTTTATTTCACCACCTATCATAATTCAAATTAAAATTGTTTTTGAAATAGTAAAGCGGTAAATTAAAAACTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTAT:1 + chr3L 23287020 5' - Quasimodo 7347 2 71.92 GATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr3R 10142928 5' + 412 57 2 55.86 ACTCGAAGCAATTTGTTGATATTCTGGTAGCTATTAAGGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 + chr2R 19985714 5' - copia 172 2 76.03 ACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 + chrX 13762581 5' - P-element 2796 1 23.29 AGCTATGTTGTTTGGGAATCTTGTAATGCCCGAAACTGCAAACTATCATGACCCTCTTTAAAATAAACAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACAATCAGATACCCGTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACA:1 + chrX 20344044 5' - INE-1 132 1 76.71 GCCGTGGCAAGGAATAATATCAGCACATCCTTCAGCTGGCTGTGAAAACATGCAAAGCCCACAAGTGGTAATCCGCCTATATATTCCATATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - chr3R 12540266 5' + flea 18 2 71.74 CAATGCAAAAAATATGAAAAACTCCCCGCCGCGAAAGAGCCATCAAAAATTAATTAAATAAAATGCATTAAAGGAAAACCAAAGCGATATATATTTGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 + chr3L 9814088 5' - opus 7484 2 69.18 GCTGCACCCATTGGAATTGATTCCATTTTGACTTTGGTGCTGCAACAGTTTCTAGTTAAACCACACTGTTACTCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATA:1 - chr2L 14946553 5' + Bica 4864 1 59.59 TTTTTGGATGTTGTATTTATGGAATTGAATGTATATGGCTCTTTGGATTAGGGCCTTATCCTGGTAAAGATAGGTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCC:1 - chr2L 8124218 5' + R1A1-element 4902 1 49.32 GTTCCTAGAATCATAACTTATTCAACATGAAAAGCCAACATTAAAGTAAGCATTTCTATGGAATAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAG:1 + chr2R 14717777 5' + Max-element 63 2 53.62 CATTTGGAATTGATAATAAATTTTTGTAATTTTTTCGCAATTTTTGCGTTATTTATTGGTTCTTTTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTAGTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATT:1 - chr2R 3550647 5' - Doc2-element 4673 1 69.23 AAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCGAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAG:1 + chr2R 5214983 5' + F-element 99 1 76.55 CAGTGCAGTTCACATAAGGCATAAGACTCGATGTACTGTAGCAGTCTGTGAACAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAAT:1 + chr2R 2947628 5' + 17.6 353 2 64.38 ATGTTTCGATTTCAGTACTTGTATCTGTATCTGTATCTGTTGGCTATAATGTCTTCTATATATTCCATGCCTCATGGAAATCAAGACGAGGCAGGCGTAAAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCG:1 + chr2R 17273290 5' + R1A1-element 477 1 49.29 ATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 + chr2R 8305221 5' + blood 7085 2 69.18 CTTGCCCTCTGGACCAAACTGGATCTATTTCCTGGACACAGGACCAAAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 21639711 5' + Tirant 32 2 56.07 GATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGTAACAC:1 - chr2L 14969955 5' + Tirant 62 2 66.39 GTTAAGCTATTAAAAAATGCTTGTTCATATCGTTCATATGCACATTTAATTGGTCATTTACAATTGGGTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCA:1 + chrX 14914307 5' - mdg3 225 2 69.18 GAATTCGGTGAGATGAAAATCTTGCGATTGCCAGAGTTGGATATCAAATAATAAGGATCATGACATTTCACTTAACACACTTTCATATAATTAATTTAATTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 + chr3L 21819931 5' - Juan 4184 1 63.01 CAGAGGAGCCATTTGAATGGGTAGCCTTGTTCCGAGTTGAAAGCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3R 15514479 5' - 412 469 2 65.75 ACCAACACACACACACACACACCGACACTCGAGCGGAGACGGAGACGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCCGCGCTGCGCGAATTTCGTCATAT:1 + chrX 7978948 5' + Rt1a 40 1 60.00 AAATATATACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:2 + chr3R 22659875 5' - 412 7520 2 67.12 GTCAGCCGCCATATTGATTTTGCCAGCAACAATATTTAATGATTAACAATTAACATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr2R 20913255 5' - 1360 3373 1 74.66 CATTCATTCAGAATACGACATAATGCGATTTCATCGTCTGTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:2 - chr3R 4884495 5' + pogo 47 1 52.05 GAAATACTAATACCAGAATTATATATGATAAATATTTTTGAGTTTGGGAAGACTCTTACCATTATATTATATTATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 15261240 5' + pogo 43 1 52.74 TCTATAATCCTATATCCTTGTTGCAAGGATTTTTTGGTGCATCTTTTTGTAGAAATCAACGTAATTTCTTCCATGAAACACAGTGCTAACAACATTTTTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chrX 22824702 5' - jockey 4974 1 65.07 CCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2R 24338456 5' + 1360 53 1 57.14 CGAAAGAGCAGAGCTGCGGAAAAGGGGGCGGCGGAATGATAGCTGACCCATCTAGGCCTTTTTCAAAAAATTTTGCTTGAAAAATGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTTAACACTCGGTACTCT:1 + chr2L 3967028 5' - hobo 2901 1 60.27 GTCGTCGCATGTGGGCAGTTGGTTTTCGAACTCCAGCTGGACATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 - chr3R 24175762 5' + Burdock 6212 2 71.23 GCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTG:1 + chr2L 13877672 5' - Transpac 249 2 59.31 TGGATCAGTGTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2R 18048766 5' - opus 7477 2 67.81 AATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr2R 20704172 5' - hobo 2892 1 76.60 AAAATACCCATTTAATGCGCAAGCGAGATGGCAGCACAAAAATACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chrX 8626325 5' - Burdock 217 2 59.59 GCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:2 - chr2L 16685370 5' - P-element 2795 1 22.60 CAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr3R 29708965 5' + blood 50 2 58.21 CACCAGAAAAAAGAACTCCAGTTTTTGGTAGTATGAAGACATTTAATCAGCCAACTCGACATTCTCACGTTTTCATACATGCATACCTGTGGCTACAGGGTATGCTCACATATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCA:1 - chr2L 19677412 5' + opus 437 2 73.29 CCGTGAAAAGACCTGGCTTATTATTCAACTGGTTTCTTGGTATGTGAAGTGTGGAGCTGGGGTTTGGTTTACCTGCTCGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 + chr3R 13723567 5' + FB 43 1 56.85 AAATTGGCTCGGTTTCCGTGGTTCACTGACAAAATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGT:1 - chr2R 21227463 5' - mdg3 200 2 55.48 ATGGAATTGGCTGCTGTGCCATCTGGTAAAGTTCCTTTCCGAAGGAAGTGTCCTGATCTTCGTGACTAAAAAAGTAGATGCTGAAACGGTGTCAAACAATCTTTTAAATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTAC:1 - chr3L 10877425 5' + Stalker 110 4 69.18 CTACTGTCCTAAGTATACCGAAAAATAAACAATTGTAAAATTACCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2L 14222221 5' + Transpac 36 2 61.64 CAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCCCAGAAGTCGC:1 + chrX 14962191 5' + jockey 34 1 57.02 CTGACCTTATTTAATTTTGGCATCAGATTTGGACTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAG:1 + chr3R 11461721 5' + 17.6 6941 1 76.71 ACAAATGCCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr2L 14969980 5' + Tirant 8152 2 50.77 ATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGG:1 + chr3L 3540115 5' - mdg3 188 2 54.79 AAACGGCTCTAAGCCAGCCCCAAAAAGTAGGCTATAATGCATAAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 18846642 5' - roo 389 2 67.81 TTAAAATATAAACAAGAGATTACAAATTGAGTTTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2L 4103988 5' - roo 348 2 57.53 GGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATCTCGGCACTC:1 + chr3L 3979533 5' - opus 7481 2 71.72 AAAGGAAACTATGTGAGGTCGTTTGCTCTGCTTGCGGTTGTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACGTGCGGCAACACA:1 - chr3R 25753699 5' - hobo 2860 1 69.66 ATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCTACAATATGTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGCATTGAGTC:1 + chr2L 20561415 5' - P-element 2800 1 27.40 CCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 - chr3R 25271267 5' - 412 7478 2 65.75 ACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGGACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr2R 6559039 5' + mdg3 43 2 54.11 CATTTGCAAGACCTGGCAACATTCTCCACCACCTGTGCCATCAATTGCACCCGCAAAATGGCCAAACAATCAACAAGCAGCGCGACGGGTGTTGGGCCTGATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGT:1 + chr2L 18291954 5' - hobo 76 1 67.81 TTTACAGGAATTATAATTACTCATCTAGAAATATACTGAGTAAGGTTTGTTCTTGAATTTTAATGGTGTAGTGTAGTTTATTAGTGTAGTGAGGTAAGTATGTATGTATATATTTTCATAACCAATTATTGAATACATTTAAGTAC:1 - chr2R 10264712 5' + Tc3 1244 1 71.23 AAAATATAAATATTATATGAAATAGAATTGATTAAAATTGTAATTAATCGATCAACGATATTGAATTTTTAATAATTATTTTTTTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTT:1 - chr3L 25996571 5' + 1360 3152 1 57.53 CGGAGCCGCCTCCGAGCAGTGCTCCGGTGAGCATGGCCAGCTCGGGTGGCGGTGGTCCTCCGTCGGGCGGTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGCCAGCAGGCGACTCGG:1 - chr3R 28584516 5' + opus 66 4 50.34 TTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr2L 20984323 5' + blood 7096 2 76.71 GTTACGGAGAGTGCCAGAATGTATGTAAATTATTCGAGCTTCTACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 20922985 5' + pogo 16 1 74.66 CACTCCCTGAACTTCCTGCCAACGCACGTGGCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATATGAAGACTTTACGCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 20290796 5' - roo 9041 1 61.59 GCTGTGTTGCCATTAATTAAACTTCGGCCTAAGAAATCATTGAAAAAAAGTTACACTTTGGTCTATTGAGTAGGTTACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTG:1 - chrX 18009370 5' + P-element 154 1 51.37 CAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 - chr3R 15649871 5' + blood 7068 2 60.96 GAATCAAAAATGGAAAGGTCCTGGGCTTACTTTCGCTCATCAATAAGCTCCATTACGTATACGCCGGGTTGGTTTCGCCCATTGCTCAGCCGACAAACAAACTCAGATGATAGCATTGCCAACCTTTCGCAGTCGACGAGCTGGTA:1 - chr2L 5661523 5' + Rt1a 228 1 73.29 ACTCGTCTATGTATATATATATATTCAGATTTCATTTGGCCTTCTGTTCTGTCGCAAACCCACTTACATTCACACACACACCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCATTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCG:1 - chr3R 11520030 5' + Rt1a 49 1 54.79 ATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr2R 21897965 5' + 412 66 2 65.71 CATTTTGAATTGCATTAAATAGTAGCATGCTGTTTGTAAACATTCTGGAATGCATAATTTCTATTTGACAACGACTTCAAGAGATTTCCATCGCACAGCATTATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATC:1 - chr2L 15153388 5' - G6 2011 1 73.61 CGGGCAATTGTGGGGCATTTTTAATTTGTGCCCGGCTTTGACTTTTGCCTGGAAATCAGAGCAGTGGTCGGAGTCGCCTGGAAGCGGACTGTGCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr2R 24338487 5' + 1360 28 1 67.12 GTAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2R 15080099 5' - roo 8999 2 67.12 ATTAGACGATGCGTAATCCCCCAGCACTTTGTCTCCAGTCTCGATTTAATTAAGCTCCTTTCTCGACGGTGTTTTTCAACCCTCACTGCCTTACAGGCTCACAGAACTGCAATTTATCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTG:1 + chr2R 17951569 5' - F-element 4504 1 80.14 AAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr2R 18123447 5' + 412 7141 2 77.40 TATAAGCGTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 19930190 5' + jockey 15 1 72.48 GCTCAGCGAATAAAATAACATTGTCACTCCAGTCGAGCTGAAAAATTCCACTCGAAAACGATGGGCATATATGTACATATGTATTTTGATTGCAGTATAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3L 18835433 5' + pogo 18 1 73.29 AAACTGTTCGAGACATTTACAAAGATTTCTCTTACTTGTCTTGTCATTTAGTGTTCATCTTGCATACTTTCGGGGGTTTTCATTTAAGTTTTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr2L 1229733 5' + opus 22 2 70.55 AGATGTGTGTCAATCTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2R 22255424 5' + roo 60 2 58.90 ATTGCCCGCTTTTTGGGGCCGCTCACTTGCTGTTTGCTTGGTGTCATAATTCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr3R 6068289 5' + jockey 4725 1 68.00 GAAAAAGCGCCTTTTCTACCCCATAAAGATCAGATTGAAAAAAAAAAATAATTTTGGACACGGAATACTACTACTACTACTACAAATACCTTTTTGGAAAGGGTATACTAGAATCGTTGAAAAGTATGTAACAGTCAGAAGGAAGC:1 + chr2L 21689069 5' + INE-1 29 1 41.78 ATTCACATGGTAGCTATATGATATCGTATCATTATCCAGCCCTTAACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGTAGTTAATATTCTAATACATT:1 - chrX 22858995 5' - mdg3 5481 2 68.49 CGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr2L 1073930 5' + Tirant 8168 2 67.74 TTTTCAACATCTCGGGAGAACCTTTGCAGGAAACATTAAATAAAAATAATACGACTTTGATTAGGACACACAAACATAGCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTATGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAAT:1 - chr4 140777 5' + I-element 5017 1 71.92 ATGTTTAAACCATATTCAAACTTAACGCTCTTAAGCCTCCAAAAACTACCCTAATATGTCCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCAGAACACGCACTCATATACGCGTTCTCGT:1 - chr3L 23491562 5' + 1360 3223 1 73.29 GAGGACTTCTAATATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 9482145 5' - roo 9045 1 67.81 TCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAAC:1 - chr2L 14222324 5' - Transpac 5144 2 75.34 TTGATTGTTGTAATAAAAGGGTAAGCTTAACTATAGCAATATGGTTTATTCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTC:1 + chr2R 20462790 5' - copia 5052 2 71.23 ATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chrX 9816456 5' + jockey 89 1 71.23 AACCACATACACATATCATTGGCTTAAATAGAAAAACATTATGTATGCCAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCA:1 + chr3R 13547261 5' + 1360 181 1 66.44 ATGCATTTTTTCCGAGTGCATCCATACCACCATGGACTATGAATAATTCTGTTTGCTGTTGTCCTGTCCGACCACTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTA:1 - chr2R 10164247 5' + Cr1a 3991 1 50.68 CGTTCATTAGTTTTTTTCCGTGTATCGGGCATCTTAAATGGGATATGACGGAAGGCGACTTGGCGGAAAAGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2L 19930184 5' + jockey 59 1 53.42 ATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTTGCC:1 - chr3R 934274 5' - Rt1b 4730 1 49.32 GTTCGTGGGGTTCGATATGTTTTGATTAAAATTAGTTGCACTTTCAGAACTATCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2R 8686646 5' + hobo 68 1 69.86 AGAAACGGAGAAAGAGAGTGCCCAAGCGGACGAGTGAAAGATAAAAGTGAACGAAAATATCAGCCAGAGCAGCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGTTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 - chr2R 21056831 5' - Tirant 388 2 78.08 AACACAATCCCGACGAGGATTGGCTGGACAACATCGTTTGGGTGTTCAAGGCCTTTGTCATGCTGCTCATCATCATTGCGGCCATCTGCGCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACG:1 - chr3R 12560515 5' - accord 7193 2 61.64 GAAAACAACATGTGAGAGGCGGCTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr2L 13547098 5' + P-element 12 1 75.00 ATATTAAAGAGTATACTAGATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3R 3322582 5' - 1360 3354 1 62.33 GCATGTTGCACTTTTGATACACCCACTGTAACCCATTTAGGTTCGCATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAATTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAG:1 - chr2R 17986348 5' - 297 6906 2 67.12 ATCGAATTTAATTAGAAAATTGTTGTGGCCAAGCTTGGCGAGGACTGCAGTTGAAGGCGAGCAGGATATGCACGTATCACAGGATGTGTTGCGGTATTGGCCGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3R 28008191 5' + hobo 15 1 75.34 ATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTTATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGTGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAAATTCAC:1 + chr2R 10478708 5' - invader4 248 2 75.97 TATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTC:1 + chr3R 31907360 5' + Tirant 87 2 78.77 GCGCCAGTTACCAGTTACCAGTTACCAGCTCCCAGCTCCCAGTTCCCAGTCCACTCCAAACCTCGGATATCGAGGACCCCGTCCGGGTGTCCGGAGCCATACCGGAGGAAATGTTATGCTTTTATATGTTTTTTTTCTATCAGTTC:1 - chr2R 15577710 5' + Circe 432 1 63.01 TCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr3R 20452251 5' + blood 60 2 76.11 TACCCTCTTTTATTTTGCAAAAATACAGTCTAGTAATTTGTAATCATAAAAAAATAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 - chr3L 20893657 5' - mdg1 7394 2 61.64 ATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 + chrX 21668725 5' - mdg1 351 2 66.44 GGCTCCTCATAACTTAACCCTGGCAACCCTGGTTTTCAGCGTGTGCACTTGCATTTGCCTGTGCATCTGCGAGATACTCGTGCTTGGGTGTGTGTATCTTATGGATTTCAGTTCGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTG:1 - chrX 19053465 5' - jockey 4615 1 79.45 TAAGGGTTTCAGCGGGTTAAGGCGTACTTTCCCCTGATTCGCTTTTAATTATCCTCATTTGTAAAATGTGACTGGGTTGTGAAAATTTGAACATAAGTCTTTGGCTTTATGGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chrX 16982373 5' + roo 8672 2 78.62 GTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3R 22429216 5' + roo 8744 2 71.92 ATATTGATTTTACTTCTTACTCGTGAGATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 - chr3L 21820073 5' + Juan 38 1 58.90 CAGGGGCAGTGGCAACTTGTGTTTTTGGGGGGTCCTTTAATGGGCCTTTAACTCAAAGCTGCAACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAACTATTTTAGTAT:1 + chrX 20386645 5' - hopper 1359 1 54.79 ATGCCCGGGAACGCTGCGATTGTTGTTGAAAAATTGTCGGACATGTTCAATAATGTTTATCAAATGGCATCTCCTTGTGTGGATTGGGATATGGCCCCACCCTATTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAG:1 + chrX 17002286 5' - F-element 4399 1 69.86 CAGTGGGCAAAAGTCATTAATGATTTACATGTTAATGTTGTATGAGTGTCTTATAAAAAGAAAGACATGAAGTATGAACGAAAATTCTAATAATGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACTCATATACGCGTT:1 - chr3R 7184054 5' + 1360 3218 1 63.70 GCACGTACTTCGAACAGGAGTACAAGTCTTCAGCACCACCAGATACGCCGGATATAGTGAAATCATCGCTGCCCAAGGAGGATTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACA:1 + chrX 6582381 5' + roo 8799 2 56.85 ATTAACACGCAGCGGACTGCTAACCGACCAAAACTGAGATGATCGGGTAGGATTCAATGGAGCTTTGTGCGGAAAAAATGGTATAGATACCCGTACGTCTACGTATGGAGATCTGCTCTTTCACTGTATGAAGATTCAGATCACGG:1 + chr2L 13800523 5' - BS 4797 1 72.60 ACTGGCGAGTGAAATGCATTAATGGGTCAGCGAAAGGGGAACAATTGCAGCTTAACAAATATACATAAAAAAAAACAACAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACC:1 - chr2R 20361474 5' - INE-1 529 1 91.78 CAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1 + chr3L 11669791 5' - Tabor 412 2 68.49 CTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGC:2 - chr3L 13204778 5' + jockey 91 1 74.66 GTCTTAAATATAATGTCCTTCAAATTAACTATAAAAGCAAAAGTATGTACAAAGTTGAGATCCATTCAAAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTTAGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 13313099 5' - roo 391 2 73.29 AAATGGGAGAAGAAGGGCGGAAAAACACAAACTGCAGGAGTCTTAGAACTTGGCTTAAACGCACGACTGACTGCCAACGGGGACACCATGTCCTTGTCATAATAAATATAAATATACAGATATACAAAAAGACCACCAAAAACTA:1 + chr3R 19431948 5' + Stalker 6958 4 64.83 AGAAATACCATGCCCGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 3524199 5' - roo 9029 1 56.16 ATCACATAGATTATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:1 + chr3R 24479170 5' - 412 434 2 59.59 CGTTACTCGTATAGTAAAATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCA:1 - chr3L 21858919 5' + invader1 38 2 60.27 GGATGTGTAATATGCTTTGCCTACTTTTGTTACTGGCTTTTTGGGCCTTTGATGCTCCTTCATCCATCAAAATGTTTGCAGACACACAAAATATGCTGTGTTTTAATATTTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 11665845 5' - pogo 2095 1 65.07 TCTAATGTCAACAAAATGTATACAAAAGAGTAGTACGTACAATTCGTTTAATAAATAGGCTAGACAGATCTTTTAGGGGAAAATACTTAAAGTGCACAATCTTAGATCATTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTA:1 + chr3R 21053347 5' + X-element 4275 1 75.34 TTTCAAGCATTCATACATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAACGCATTGTTCACACATGCACACGAATATATTTAAAGACTTACAATATTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2L 2519802 5' + roo 60 2 59.59 GCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3R 5765308 5' - opus 7469 2 61.87 TTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3L 20076859 5' - roo 9007 2 65.07 CCGTGCATTTATACAACGAAATAAATTCAGTAGAAATATCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAG:1 + chr2L 14222264 5' + Transpac 4998 2 73.29 CCATAATTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 23449230 5' - roo 9026 1 54.11 GGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:2 + chr2L 8397147 5' - roo 9013 2 57.53 CAATGACATTGCGTTGGAGGTGGAACCAAAAGCTGGCAGGACGAGGCCTAAATATATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chr3L 12863778 5' - Transpac 248 2 64.38 AGATATTGGAGAATATAATGACAAAAATGGGAGGCTTGTGGGTGCGAAGTGGCAAATTTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCATGTTGTGTTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCA:1 - chr3R 4194003 5' - 1360 3187 1 59.31 AGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3R 10973204 5' + jockey 73 1 60.27 GCTGGTGGTGGTGCGGATGCGAGATCGGATGCGAGTGCGAGATCTGGTGTGTGTGGGCGATCTGGTGTGTGTGCGAGATCGGGTGTTCACAATTCGCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGC:1 - chr3R 17966989 5' + Q-element 69 2 58.22 AGGTCGGAAATATTTAATTGAAATATATTTAATGATAAAACATATTGGGATATTTAGCCTAATCTCGTTTATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 25823079 5' + roo 50 2 53.42 CAATATGAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3R 14088518 5' + 1360 22 1 70.83 AATCCAATCACAATGCCCAAAAAAAACCCATAATTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 23449202 5' - roo 9054 2 72.41 AGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3R 27786637 5' + Tirant 8119 2 57.69 GTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 25271162 5' + 412 7103 2 52.05 GCCGAAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAG:1 + chrX 693670 5' + INE-1 159 1 37.67 ACTGACGGAGTAGTTTTACCATATCTGTGAGCTTTTAGTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 16041058 5' + jockey 21 1 76.71 AGGAGGGGAAACCACCTGGAGGTGGTAACATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTC:2 + chr2L 18163781 5' - HMS-Beagle 161 2 78.08 GAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr2R 7223677 5' + blood 84 2 76.03 AACCAACAACTAGCAACTTTTTGACAGCACATTGGCACTTGAACTCCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 17614333 5' - roo 391 2 73.29 GGAGAGCCAGAGGATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 + chr3L 22221118 5' - 412 438 2 52.05 ACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:2 + chr3L 52997 5' + roo 8746 2 73.97 ATAGTTGCAACGTTTAGTTGATTAATAGCCACAGAGCAATGTGGAAAAAGCCGGGGGAATCCCCGAAAAAAAGTGGGCATTGGCCACACATACACATACGGGCATCTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr2L 10606647 5' - 412 478 2 68.49 AACTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 + chr3R 17316034 5' + 3S18 48 2 50.71 ACATTATCTTAACTTCAAAGCTTTTAAAGTTTTCGAGGTGACAGCCCCCTTACGGACAGACAGACTTTACCATATCAATTCGGCTAGTGATCCCTTATACAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCGTGTTACATTCCTT:1 - chrX 23102785 5' - INE-1 25 1 68.38 CCATTATCTGTAGTTACCGGGGTGCCAGCGTGCTCTGCCTTAACAATAAATAAAAACTATTTAATTTTTATAAATCATTCTATTTATTTTGGGTCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATA:1 - chr3R 13109977 5' - G5 4773 1 58.90 TTTTCATTGTGCTTATTGTTTTGGGATAAAACAATTCAATATCATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 - chrX 10873883 5' - mdg3 5420 2 69.86 TGCAGCAGTCGGCCTAATAAAAATGCAATTTTTATGGTTAAGATAATAGTGCGCGAACGCCGTTGTGTTGCACATTGGATGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACT:1 + chr3R 26229708 5' + Dm88 41 2 55.07 CACCTCCTCCTTAACCTTCTCGCCCACTTTAACGGCCAGCAAAAAGGCAGACAGAGCATAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTA:1 + chr3R 11114909 5' + mdg1 7157 2 60.00 GATCCACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGGGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3R 25271136 5' + 412 24 2 69.18 GCTGGGGAAAACTGCACTTTGTCAATTGCTCTCACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 + chr2L 11573672 5' + jockey 4690 1 61.64 AAGTAGAACTGTTCAAAAACAAGCCAAGTGAGCTCCTCTGTTTCCCCAAGTACTCTCACGCTCTTTTTTTGCTCTCTCCAGTTGGTGATGACCATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3R 10140149 5' - P-element 2860 1 63.70 ATGCAACGAAGCGAAACAACTAAAATGCAAAATGCGCGAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGCCTACATTCC:1 + chr3R 12795043 5' - mdg1 7376 2 72.60 GAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr2L 14262897 5' + blood 85 2 75.86 CTAAGCAAATATTTTATCATAAATTGTATATCAGGTTTACTCAACAAACATTGTATCATTATATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 3762213 5' - roo 9012 2 60.27 TTAACCCCCCATGACCCCGGACCAGCCACTTTGAGGAGTTAAGCAAAAATGCCTGCCAGGATGTGCGCATTTCTCTTCAGTATCTTTGTGGGCTTGTGTGTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3L 17447594 5' + Tirant 8114 2 80.60 CGAAATCGTTGCGGTCATACAGACTGACAGACCAGATGCACTATGCTAGTGATAAAGCTCATCTTTATATGTATATATAGCTGAGTTCATAAAAATATCAGGGCTTGGGACCTGTGAGTTTAAGAAAAAATCCTTTGATTTACAGT:1 + chr2R 5739023 5' - HB 1577 1 49.32 CATGTACGTGCTCAAGCTTATCGCACTTCGTGACGCTTCTTTGTTCACTACTTTCTTCGCCAGTCTTCCTACTCTTTACAATGGCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 - chr3R 3527195 5' - Tabor 446 2 57.53 GAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGGGC:1 - chr2L 20561462 5' + P-element 50 1 35.45 TAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 9482092 5' - roo 328 2 73.29 TTTCATATATCTAATTTCGCGTTGGCAAAGAATAACGGAACTTAGTTACGATTGAAACATATGTACGTAGATGCAAAGCGTTGTATCTATCAGTGTGTTGATACGAATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTA:1 - chr3R 3257608 5' - Burdock 243 2 77.40 ATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:2 + chrX 13061721 5' + mdg3 77 2 67.12 ATACACATTCAGCGCTTTCTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCCTCAACGTCGACTGTCTCATTCACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTA:3 + chrX 7467925 5' - hopper2 1553 1 53.42 ACACCCATTTTATGAACTCATAAAACACTCCGATGGAATCGGAATCGTATATTTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - chr2L 10089838 5' + 297 6641 2 66.44 AGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 - chr3L 15371379 5' - Transpac 237 2 69.18 AGCTAAGTCGAGGCCAGGCAACCTTAATACATTTGCGGAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTA:1 + chr2L 14796875 5' - I-element 5271 1 72.60 AATGCATAAAAGCACCGCTCACATGGAGGTCAGGTCAGGTCAGGTCATTAGCCATGCCCGGCGGATCTTGTTCGTTTATTATTCATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 - chr3R 19545430 5' - jockey 4949 1 54.11 GGAACCAGCTGAAAACTGTGAGAGCCGCCTTATATTCCCAACTGGCCTTAATTAATTTCTCACCCATCCACTGTATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACGTGGAGCATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACG:1 - chr2L 16431604 5' + 1731 494 1 52.05 GAAGAGAAGAAAGCGGCTCGAAAGGAAATTATGACAGAAAGAAACCAAAGAAATGCAATTAAATCGGTTAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chrX 983247 5' + 412 36 2 62.33 ATACAACACTTTGCTGAATGAACCTGAAGTAAGTTGTCGTTTTATTTTATTCGATTTGATTGCATCGTATTTAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATTCTATGTACGTGG:1 + chrX 18707451 5' + BS 4763 1 50.00 CTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:1 + chr3R 17316036 5' + 3S18 56 2 53.42 ACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr3R 14049448 5' - transib2 2779 1 53.42 AAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3L 20076847 5' - roo 337 2 72.14 TAGTTGTTTGGCCAGCATGTGGCATGTAGAAAACCATGGCGTACTGGTTCACCAAGTTTATAGTGTCTACAGTATTGCTGGATTTATAAGAATGTGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:1 - chr3L 21630456 5' - Burdock 239 2 73.38 ATACGACCTGTGGTGCGGCCCATTTCCCCAAACACTTACAATTGTGTAAATTGCACTTGTTATGGCCAAACCCCCAGCTGCATTGCTTCGCGAGGACGATCAGGATTTGCTTACTCGTAGACCCTCCTGGCTCTCTCGGCTCTTCT:1 + chr3L 18932719 5' - Rt1c 5272 1 47.95 TGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAA:1 + chr3L 20747104 5' + Burdock 6208 2 69.86 CTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3L 4869231 5' + roo 8747 2 75.34 GAGCCCTCTTCCAGGCCAGGTCCATTGGAAGCCTTTTTCTCGGCTTCCACTGTGTCCATCTGGATGTATAAAATGCACCATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 - chrX 4589543 5' - Burdock 6354 2 60.27 TATTTATTGACTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chrX 11228524 5' - roo 9040 1 64.38 CAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 - chr2R 9072951 5' + Burdock 6198 2 61.64 GAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr2L 12142639 5' - hobo 2884 1 62.40 AAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2R 21897994 5' + 412 43 2 53.42 GCCATGTCATAAAAACAAAGACCGACTTTAAGCCAATTTTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAAC:1 - chr3R 18357469 5' - jockey 4901 1 76.71 GATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2R 15080088 5' - roo 324 2 74.66 CTTTGTCATATTTCGTCTATTGAGTGATACAGTCATTTGTCCATAAGTATGTCTTTACCTATTCGATTGCAGAGAGAACAATATGTAGATACTTATCCTGTATTGGTGTTTTGTTTGGCGATAACGTCAGCAATCTCTCTGGGCGT:1 - chr3L 2699669 5' - BS3 206 1 67.81 AGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chrX 21213417 5' + Doc 32 1 59.29 GATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 8542573 5' - roo 9017 2 52.74 TTTAAAAACTAATCAGTAATAGCTTCTTGTTTGCAAGTCAGTAATTAAGCCACTAATAACTTGGTGAAACCGATAAGAACGAAAGTCGTTATTCTAAAATGAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAAGATGAG:1 - chr2R 14262408 5' + Doc3-element 247 1 61.64 GCCCACGGACATCGCACCTGCCACGTGGAAATCGTCAGCAAGGTGCAAGGTATCTGCCAGCCGATGCCCATTGGCAGTAAGCATTATGCCGGATGTCGAT:1 + chr3L 18985344 5' + gypsy2 6556 2 77.00 ATCGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAA:1 + chr3L 24153182 5' - Tabor 7253 2 65.75 CAAACTGCGACGCTTATCCGGCGACTCCATCTGCATGCCATGTGTGTGCCATGTCCACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 535361 5' - roo 395 1 76.03 AATAGAAAAGGGTATGGCTGGGGATGGTGGGGTGATGCGTTAGCTGATTGTTAGAATTGATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr3R 10562083 5' + I-element 8 1 76.15 ACCTTCTTTTACTGCGTGTACCTTACCTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3L 15371432 5' - Transpac 5209 2 71.92 CGAAAGTATGCTATGAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 19545321 5' + jockey 64 1 53.42 TAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr3R 9958614 5' + opus 7033 4 61.11 ATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr2L 1327595 5' + pogo 65 1 64.83 GAGTTATGACTCACGGCGGCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATGGTTGCCTCC:1 + chr3L 16180859 5' - Transpac 5184 2 54.79 ATTGTATAACATTTTATATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGATCACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3R 25271300 5' - 412 462 2 61.27 ATGCCCCTCCGTATGCCTGCCACCGTATCCTGGCGCTTTGTGCTCCTGTCTGCCTTCTGCCATTGCACAATAAACAGGGAAAACTAAAAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGG:1 + chr3L 9314703 5' - blood 135 2 71.01 CAGCTTATAGTGCGTCCCTTCAAAAACTCAACTACTTAATGCCCAGCAAAGTATGCTATGCATTTTGGTTGCTGATGTGGCTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3R 25508436 5' - hobo 2905 1 56.83 CTGCTTCAAAACTTGTTGACCTTTAAAGAGATAAAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr2R 15392856 5' + blood 7021 2 77.40 ACTGGGAGCTGAAGAGGAACTTCGAAATTCCATTTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTG:1 - chr3L 16264679 5' - Burdock 6309 2 75.00 CTCATATCTCCTATTTCAAAACTTCATAAGGATAAAGTTGTTGAATTTGATGTAAGCAATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAG:1 - chr3R 20368080 5' + Max-element 63 2 59.31 AAGCTTTCCCTCTGGAGAAGATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr3L 15261400 5' - pogo 2078 1 69.86 TAGTATAGTCGAACATTTAAATATTCATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr2L 7215674 5' + 297 8 2 77.93 ATGGGATTCGTGAAGACGGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGCCATACAT:1 - chr2R 6559062 5' + mdg3 5280 2 65.71 TGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 21421012 5' - roo 9031 1 57.53 AAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCTAACGCTGTATATATATATAT:1 + chrX 5440009 5' + accord 82 2 74.83 CCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr2L 20984300 5' + blood 7073 2 60.96 GCTCCAAAAGGAGAACGGCAGATAGGAGGACGAAGATCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3R 10468137 5' + opus 7142 4 67.81 ATCGCATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 4722496 5' - roo 9026 1 54.11 TAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:2 + chr2L 18581239 5' + roo 8694 2 63.70 AACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr3R 7739693 5' + blood 78 2 68.49 TGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 + chr3L 2037010 5' + Doc 72 1 66.44 TGTTGGGTAAACTATTACTTTCGCCGTCCACTGCAGTCAATGTGTTTCTTTCCCTCTTTTTGGCTTGATTGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 14898825 5' + jockey 18 1 76.71 TGGGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTG:1 + chr3R 3617305 5' - micropia 5133 2 78.08 AGCGGCTGGATTTAAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 + chr2L 10912239 5' + Doc 81 1 71.53 CAGTGAATGCTAGTGTTTGTTGAAAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACAT:1 - chr3R 6053086 5' + Quasimodo 35 2 62.33 GACTAGAACCACTTGGCATCATTAGCCCCGCCCCGAAATCTAAGAGGCGGTAGGTCCTCCCACGCACAAACAAAAAAAAA:1 + chr3L 7040706 5' + gypsy2 394 1 62.50 AAAAAAGTAAAATCTATACATAATTTATCCTTAAATCTGGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGG:1 + chr3L 23324449 5' - Quasimodo 216 2 73.29 GTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr3R 11526767 5' - pogo 2039 1 60.27 CGCGGTCACATGACACGAGTTACACACACATACACACATGCAGGCAAGTACAGCACACATACAAGTGAAAAATTTGTTGAGGCAGCGCAGGACAAGCACACACACACACATACCAACACAGCGTTTTTTTTTTCTTTTAAATTGT:1 - chrX 12633102 5' - TART-C 11096 1 78.62 CGGAGGTGCAGGTGGCACGGTGAACAGCACCAACGAAATCGTCTCTATGTGGGCAACCTGACCAATGACATCACCGACGATCAGCTGCGCGAGATGTTCAAGCCATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 4730847 5' + roo 17 2 50.00 GAGGATATCTGTTTGTGCGGCCGCTTCCGCCGACCTCCGCTCCACCCGCTGCCGCTCCCGATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTAGTTTAGCCGCCGGTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 - chr3R 9643645 5' - mdg3 5478 2 41.10 TGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGGT:1 - chr3R 15514613 5' + 412 7118 2 59.59 TACTAACCCTGGACTGAAGGCAATCCAACTCGATGGCTTTTCAATTTTCAAATACTCATATTCTCGTTATATGTGTATTCGCTGTTCTTTATTATGTTTTTCAATTTCTTCATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 8197615 5' + hopper 145 105 50.00 ATACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chrX 13762579 5' - P-element 2798 1 24.66 TACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 - chr3L 14043627 5' + Ivk 54 1 54.11 GTATTGAAATGTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAAGAATA:1 + chrX 7480739 5' + Bica 342 2 68.00 ATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTG:1 + chr3L 6620573 5' - accord 192 2 62.50 AGTCTTCATAAATATTTAAACTCGAATTCATATTGAAAGTTTTAACCTTTTTCTTTACTGTAATGTATCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAA:1 - chr3R 27530528 5' - X-element 4603 1 54.11 TTGTACAAAACAAATGTATGTGATATTTTCATGAATATTTGGCTGTTGAATATGGAGGAAAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGTCGTGTTCACAGA:1 + chr2L 12261116 5' + jockey 28 1 70.55 ATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGCTCACAGAAG:1 - chr2R 16891852 5' + jockey 30 1 57.43 TAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGG:1 + chrX 292386 5' - G3 4536 1 60.96 ACTTAATTAGAAAAGTTTTGGCGCGCCACGAGACAAAAGCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAA:1 - chr2R 17182777 5' + jockey 4639 1 72.41 TTAATGTAGTTATCTGTGACCCAAAGCAATATTTTATTCTCTAGGAATAAATATCTTTGTTAAACACGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGG:1 - chr4 952593 5' + invader2 4993 2 54.79 AATCGTTGCACATTACAAGTGTAATAAAATGTGAGAGGATATTATTGTCCACACAGGCATCGTGGAGGCTGTGGTTGGTACCCATAAC:1 + chr2L 17198053 5' + R1A1-element 5008 1 67.05 TCCCAGCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr2L 15920177 5' + jockey 66 1 58.04 GGGGTCAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCT:1 - chr3R 28033675 5' + diver 5963 2 67.12 GATCGGGGCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1 + chr2R 10478641 5' - invader4 3057 2 65.07 CACGACTGATTGGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:2 + chr2R 24338312 5' - 1360 3363 1 67.12 GAACAATCTAACTGATTGCTTACAAATGAATCTCAATTAAAATTAATTCAAAACATGAACCGAGTATTATTTACCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAATCTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 22255307 5' - roo 9026 1 55.48 ATTTACTTTATTTTAAATAGATATTTATAAGTTCGCGCAGTTAGGCTCAACGAAAGCAGATATTTTTTCAAATCTAAACTATTTCATTGCTACGATGTCCTTTGCTTGCATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr2R 20704280 5' + hobo 12 1 70.55 CATAACACATAAACACAAGTACATACACAACTCTGGAGTACTTTTTAAAGGAAAACGAACTTATTCTAACTTGCTCTTTATTTTAATAGCATTTAATGCTGACCGTTCGTAGCGCAGAGCGCTGAACTCCGTTGGGGCGCGTCAGC:1 + chr2R 8311783 5' - gtwin 6982 2 67.12 ATTTATGTTAGTGTAGTTCATTTTTTTTTCTTGGGCCGACGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTTAAAA:1 + chr3L 4710706 5' + Doc 50 1 54.11 GCACAAGGATAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGGGTTGATACAAACCAATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGCCGAATAAGCCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTTACACATGAACACGAAT:1 + chr2L 18581221 5' + roo 8664 1 76.87 AGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 + chr2L 19371288 5' + Bari1 57 1 61.83 GAGGAAATCATAAGGTACATTACGAAAGATTCCTCAAACTGAAGTGAATTGAAGGAGAAGTCTTGCATATAAATGGGGTGTGTAAAGCACATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTG:1 + chr3L 19702540 5' - F-element 4354 1 63.89 CTGCTGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAA:1 - chr3L 5490916 5' - 412 405 2 75.34 ATTTATTTCAATAGGTACATAATAACGAAGAGAATAATAAAATATTGAGTTTGTTACGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTCCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr2R 15392708 5' - blood 7337 1 59.40 CTTTGTGGCTAACTGGTCGTAACCGACTGAATGCGGTCTATATAATTCCGTTGAGCACCAACAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:1 + chr2R 6187842 5' - Tirant 344 2 54.79 GCGACTTGGTGTCTGCCTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTCATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGA:1 + chrX 292369 5' - G3 4553 1 72.60 GAGCGAAAGGATTATAATGGGCTATTCAACAGGATCGCAGGATAGCTCCTAGAACAAGCGGCAAGTCATGGATGATCCATTAGATTGAGCAATAGCATTATGGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 10978938 5' + roo 19 2 71.23 AACAGTTTTTCCAGCAGTTCTGTGCTTTGCCTGGGCTGTTGGCTGTTGAAATAATATTTGCGATCATAATGGATTTTGGCAATTTGAATATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 + chr2R 20362173 5' - diver 191 2 63.01 CCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 - chr2L 15965297 5' + blood 65 2 63.31 CGAAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAGAG:1 + chrX 693672 5' + INE-1 161 1 37.67 AGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2R 10453461 5' + mdg3 49 2 48.63 TCCCTTTCGTCGGGGAAAATTTACAATAACAACGCCGGGTAAGAGGATGGAAAGCCCGCCAAGGATCAAAACGCAATCGGTCATATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTACATTCCTGATCTATTCCTGATTCATAA:1 - chr3R 19957381 5' - mdg1 317 2 57.53 ATTATATATACAATTAAAATAATGGTTGGGTTTTCCACTGCACTGCTTACATTGGTTTTACGCGGAAGGATCGCTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 - chr2R 24630240 5' - copia 209 2 53.42 CTATCATCCTCATGATGATGAACTGGCTTTCCCCGATGATCATCCGCAACTCTTTGGTTGCCCCGCCCATGGGTCATACAGTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCACCTCTCCTACCCCGCT:1 + chrX 11235781 5' + Doc 433 1 56.16 AAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3L 10814623 5' + 297 6618 2 59.59 CAGGCATTTATGGACAATGCTAAAATATTGTACATGAACTGGTACTATTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGAT:1 - chr3R 27845555 5' - Stalker 7184 4 65.75 TAAGCTTGTTCAACTTGCTATCTACGTTGAAGGTAAAATAAAATAACCCGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 + chr2R 14884268 5' - mdg3 5426 2 65.75 CTTTGGACGCATGCTTATGGCACTCACGGGTGCGCTTACTGCAGCCCGAGGTTGCCAATTGAAATTGCCACAAGCCCAAGCACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 - chr3R 18934893 5' + accord 7029 4 75.89 GAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr3R 24228894 5' + opus 7048 4 70.48 ACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chr2L 20984297 5' + blood 7070 2 58.90 CAGCAGCCACGCAGCCGCTTACCCTCGATCGTGGATGAGCAGCCCTCGTCCGCGGCCGGCTTAACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGC:1 - chr3L 368445 5' + R2-element 409 1 52.94 GATGGCTGAAAAACTTTGCAGGAAAATATCATAATAGAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 + chr2L 16942062 5' - mdg1 7384 2 72.99 ATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAAATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chr3R 10142946 5' + 412 7129 2 67.12 CGTGCTAATTGCTAATCAAGGCGGATAAGCGGCGGGAATGACCACAGACCACGTCCTACCAGCATTACCCATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 - chr2L 6406625 5' - transib2 2817 1 79.31 TGGCGTCCAGGACCTTGACCGTGCTTCCGTTGTCAAAAAGCAAAAGGACATTTAATTGCGGATGGTAGACGACGTTGCGCATCTCGAATGGTCGAGATGGAGCGCTATTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGT:1 + chr3R 10331010 5' + INE-1 548 1 74.66 TTTCTGGCATTTGCAAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAA:1 - chr2L 11867426 5' - BS 5021 1 77.40 CAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 - chr3L 13722105 5' + blood 75 2 69.18 GGGGGCGGTTCCCAGTGGCGACCAAGTAGAAATTGTGGAGGATTTCAACGAGGAGTCTCACAACAAGTGGTTGGCGGAGCACATTCCTTTTTTTTTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTA:1 + chr2R 24566068 5' - Bica 287 1 56.85 TACGAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 23099185 5' + roo 8722 2 60.00 GCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr3L 18708605 5' + F-element 53 1 59.50 GATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTC:1 - chr3L 21820047 5' + Juan 64 1 60.96 GATTAATATTCTACACATTTTGAAAATAATTGCGATATATGATTAGGTTTTCGCTTAAGTTACCTTTGTATAATTATATCTAAAATGATCGTTACTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chrX 13460661 5' + Quasimodo 19 2 67.12 GATTTTCTATCGATATTTGACCATCGATTAACTGATAGTTAGGTTTTAAATTTAGTTAGAACTTTTCTTTGTAGCGGAACATCAACTAAAGGATATATATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chrX 16325264 5' - mdg1 7441 2 71.83 ATGCTCTTGTGTATATATGTACAAATATGGCCTCCAATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chr3R 11526749 5' - pogo 2100 1 72.82 AATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3R 4722451 5' - roo 317 2 80.14 GAAGGACACCGAGATGATGGGGCAAAAAGGGGGCGGCCAAATGTGGGCGTGAGTGGGCGCTCAAAGGCGTTCACATGGCAAACATATAAGTTGATCTGACCATGTTTGACTGCCGTTCTATCTGTCCGTATCAACGTCGAGATCTC:1 + chr2L 13054962 5' + INE-1 134 1 58.90 AGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGTACT:1 - chr3R 15514589 5' + 412 46 2 66.02 CCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGACATTTGACCTGTTTTTTTTACATAAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chr3R 19537463 5' - hopper 1385 1 61.07 CTGGCAAAGCAGCGCGCGAGCAATGCAACGGAACCTAATCCAGGAGTCAGCCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3L 5438679 5' - hopper 1407 2 78.08 TTTAATTTCCTGGCTTATGTAGTACATGTGTATGTGTACTTATGAGGAAACCACAAAAACGAATAAAAACAAGAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 9345548 5' + pogo 42 1 55.48 ATTATATCAATATAAAAACGACAGTCCTGATGGGAAAGACCAATTGAGGTAGAATTATGATGACCCTGGGAAGTTGACTTAAAAAAAATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGTTATTAT:1 + chrX 7833850 5' - Tc1 17 1 50.68 ACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr3R 25271167 5' + 412 7107 2 53.10 ATGTGATAAAGGTTCATTTTCCCACCGCCACCTGGGGGGCAGGTGAAAAAATTGGCTGGGCGCATTTGCAACGTTCCGGTTATTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAAA:1 - chrX 8359164 5' - FB 419 1 60.96 AGGTTAAGTGCTCGCACCTACGCACCTATAACAGTTTGAGGCACAAATTGAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 - chr3R 13358727 5' + mdg3 25 2 69.18 AGTTGCAACAATCTGAGTGGTTAGTATACCTTACGATTTTTGAATTGTGAAACTCATAAACGAATCGCTTGGTTATTATGAACCAAACCCATCTGTGGTGTTGGTCACAACAGAGTAC:1 + chr3L 21364218 5' + baggins 4957 1 69.49 CGTACTGGGCACTTACACAGCTGCAAGAGTAAACACACACACACACTCACAGGCACAATCAGCTCGAGCACCTTTCACAGAATGCACGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3L 14863811 5' + Transpac 4956 2 60.96 AACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 + chr2L 1229591 5' - opus 424 2 71.92 TTTTGATATCTATCGCCTTTTGCACGGCCCATTAGTAATTAAATATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 - chr2R 14884398 5' + mdg3 19 2 73.29 AATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3L 9571628 5' + jockey 14 1 72.57 GAAGCCGAGCGACTGCCGAATTGCGATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2L 20561522 5' + P-element 27 1 66.44 TCTGGGTTTCATTTCCTTCTTTTTCTCTTTGTGGGAAAATTCATATTGTTTTTTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGTGAATATACATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTCTACTCGTTGAGT:1 - chr2R 16383418 5' - roo 393 1 65.07 ACTGGCACAAAACGAAAGCTTTCACACTACAGGTGTCTTTGCGAGCGAGCGACAAGTGTGGTGAATTTTGCGAACATCCTTGAGCACGCAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2L 12142527 5' + hobo 32 1 63.70 GACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 - chr3L 16180956 5' + Transpac 82 2 73.97 TAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 8272441 5' - roo 325 2 74.66 ATACAATTTATTTCCATACCAGTTACACCTTGTTGGGTAACCGATCATATACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAA:1 + chr3R 5167389 5' - Tc1 1570 1 67.81 CTCATCGATTAGCTCTAACCGCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCAT:1 - chr2L 22684601 5' + transib3 70 1 56.16 CTTTCTGGCTCTCTCGTGCTGTGCTCGTTTGTGTTTTGAAAATTTAATCTCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr3L 10856729 5' - P-element 2816 1 36.99 GAAAAAAGCGATGATCCGAATTTGGGACTGCCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAACATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACGCA:1 + chr3R 3625674 5' + 1360 3208 1 75.00 TTTGAACATTAGAAAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACATCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chrX 13651606 5' + 297 6602 2 68.49 TCGCTGAAATATTGCAAACTGACTTTGAAACGGGGCTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr3L 14581493 5' + pogo 9 1 71.70 GCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 - chr2R 6052693 5' - mdg1 365 2 52.74 TCCTTGTTGTTTGGATCGTGGTTTCCCACTGTAATTTGTTGATCTGCATTTTTGTTTCCATATCCTGATGAAGAATATGTATATGTCGCAGATCATTTAATCGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGC:1 + chr2L 23177340 5' + invader1 32 2 56.85 ATGTTATAGAACAAGGTAATTTCATATATTTAAGAATGGAAAAGAGCCAAAAAGTTGATTAATTTCAGAAAGAGTTGGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3R 23507525 5' - 412 7535 2 77.40 CTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTCCTTCAGCAGGACCTCTTACAGGAATCCTTGTCGTCGTCGTCGTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTAT:1 + chrX 9023559 5' + jockey 4835 1 55.48 GGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 10032727 5' + hobo 18 1 53.93 TAGTAAGCCCCAAATGGGGGATTGTGGTAGGGGGTGGAATGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTA:1 + chr3R 24142869 5' - Doc 229 1 73.97 AAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGA:1 + chr3L 17447425 5' - Tirant 361 2 59.59 AGGGCATTGCATTATGCGCCGCAAAAATCCCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3R 25753574 5' + hobo 15 1 76.03 ATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTAT:1 + chr2R 5582179 5' + Cr1a 498 1 56.85 TATGAAAAATGTTTTGAAAAATACCCATTTAATGCGCAAGCGAGATGGCAGCACAAAAATACGATGATTCCGAATACGTTTGGCTGCTATTTAGTACATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 - chrX 8626342 5' - Burdock 6371 2 71.72 TGAACGAAAAATTTGACTGCCTGCCCTTGCGAAAGTCCCTGTATGTAATCCCCTATGTGTGCGTGTGTAATAATATTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATC:1 - chr2R 20362314 5' + diver 5936 2 52.74 TTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTC:1 + chrX 10960216 5' + Transpac 4996 2 70.55 AAGGAAGCAAATTTAGTTGTTAGTCTGTACGTTTAGCTGTTTGTAGAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 8272380 5' - roo 387 2 69.18 GTGCCCCAAGGATAGCTGCCAAAAGTAGTAATGTCAAATATTATCCTTGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 19700888 5' - roo 345 2 71.76 TGAATGCCCTTTTTAGAGCTTTTAAAATTCATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGGCAAAAAGTGGGCAAAAGATTCCA:1 + chr3R 20001602 5' - FB 51 1 61.64 CCAGCCCTTAACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTTTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGTAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTT:1 - chrX 22858960 5' - mdg3 5448 2 50.69 AATATATTAAAGAGTATACTAGATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3R 3322585 5' - 1360 3357 1 64.38 TTATTAAAGTCTTAAAGCTCTTTAAAAGTATATTAGATTATTTGTATTAAAAGTTTATAATTCCATCTTTTCTCATTCCCAGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCCACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr2R 19263404 5' + Doc 48 1 47.26 TATTTTAAGTATCGCGAGGGAGAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGT:1 + chr2L 8542738 5' + P-element 80 1 29.45 CGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 - chr3L 22635759 5' - hopper2 1531 1 67.12 CATAAATAGAGTGCAGTGTATATGCCAAAAGAGCATAAATGCCGAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGC:1 + chr2L 20725835 5' - roo 8913 2 69.86 GAAGAATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACC:1 + chr3R 14331163 5' + Burdock 6193 2 63.70 GAGGACTGCTTTCTGAGGTTCAAGAATCAAAAACCGGAACCGGAAGAGGAAACCGAGGCAACCAAAGCCTTGTTCGCAAAATATTCCGACTTCTTTAACTTAAAATATCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCAT:1 - chr2L 18739619 5' - Cr1a 4028 1 72.60 AAACAATTATATTCATATACGTGAGTTATCTTTCAGTTGTATTGATATAAAAAGGAAGGCGATCTATTATCCCAATCAGTTCTGGTCTTGCCATCCATCGAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr3R 12375643 5' - copia 235 1 71.23 TATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 9482003 5' + roo 54 2 56.16 TTTTAACTTTAAGATCCTTTTAGAAAAGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3L 3979696 5' + opus 153 4 58.22 GCGCCGGCTATAATTTTGAGAGCACGACAAAAGCGGTGAAGAAAAAAGATAAAATAATTTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 - chr2R 13657771 5' - flea 4956 2 59.59 GGATGAACGGGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCATGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr3L 3979524 5' - opus 486 2 77.40 AATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr2L 7215640 5' + 297 43 2 54.11 TATGTGACATGGATAACTCAAATACTTTTTCACCGAAAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 14705729 5' - roo 9041 1 61.64 ATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chrX 23043129 5' + roo 69 2 69.18 CATAGATTTACACACCATAGATTTACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACTTTGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATT:1 - chr3R 18849862 5' - roo 9026 1 50.00 TATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chrX 11228575 5' - roo 9004 2 70.23 CGATTAAATAATACTCCACAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGA:1 + chr3L 131962 5' + P-element 431 1 17.12 AAGTTTATATCTCAAATAAAAGTATTTGGAATACAACGATGACTTTCACAACTACAACTTTCGCATTTAGAATACATTCTTTGACTTACTAACCAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACA:1 + chr2L 14227199 5' - Transpac 4962 2 66.44 AAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr2R 20500131 5' + 412 7123 2 66.44 TAATACGATTTTTATTCATGGCAACTGCACGGGGAAAAAAGATTTCAAAAGTTGCTTTAGTCCTTTTATGATGAAATGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 9938576 5' + roo 8708 2 56.16 TTTGTGACCTCTTTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 + chrX 21668668 5' - mdg1 408 2 65.07 CACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr2L 14262923 5' + blood 60 2 58.22 AGACTTGTGTTTTTAGCATAAATTTCTGTTTAAATAAGGAAAGCAACCTGTGACGTGTGGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTACTTTT:1 + chr2L 19816719 5' - pogo 2040 1 56.85 CTTTAATGGCAAAGGCAAATAAAACGATTTAAGTGCTTCCGACATAGGGTTTAGGTACTTCTAGAGAACTAGGAGTAGAAAGCGTATCTGAATGAATCTCACCCTTCTAGCTTTATGTAGTTCCTGAGATCTCGGCGTTCATGCGG:1 + chr3R 21014754 5' - INE-1 135 1 65.75 GTTTGCTCTCTTTGGCGCCATCATCAGTTTTCATTCATAAAGTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 3452541 5' + Tirant 8146 2 59.15 AGTTAATCCTGTTATGGGGACTTAAATTGCTCGTAGAACGCATGGAAAAATAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1 - chr3L 11669868 5' + Tabor 6911 2 64.38 AGCCGGTGGAGTCGAGCCAAAAGGCAAAGCCAACTGAAATGGTTTTGCAGCCAAGATGAAGAAAATGTTATGAACAAGTTCGGCGTGCTTAAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACG:1 + chr3L 20981041 5' - R2-element 3139 1 62.33 GAATGCCTTTTTATGGAAAATTCTTGGCGCTCTTTTCACGTCCGCAGGAGTCAGTTGTGTGCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chr2R 18316809 5' + FB 60 1 58.90 CGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGCATAGTGCAAGTTAAACACAA:1 + chr3L 2037028 5' + Doc 80 1 74.26 TAAATAGCGACGAAAATGGCGGTCTTGCAACTAATTGAGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTCTGAAGCCCGCCCGG:1 + chrX 5440008 5' + accord 40 2 63.73 GCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chrX 16853417 5' - roo 338 2 66.44 CGGCGTCACGACCCCGGCCGCCCCGCCTCGTCCAGCAACCCAACGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr3R 31071882 5' - opus 459 2 54.79 AACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr3R 11526867 5' + pogo 64 1 63.01 GTTTATAAACAGGCATAGATAATGAGATGCAAACGTTTTAATTTCAATGATCCTTATTTAGAATTTCTTTACCATTTTTGTTTGATCAATTGTTTGAATGTCCTTCATATTCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTAC:1 - chr3L 10076734 5' - X-element 4593 1 71.92 AACTATAACTGTATGCAAACACTGGAAAAAATGTAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTA:1 + chr2R 19903995 5' + Doc 4452 1 54.79 TATACGGTTCACCTGAGCTCGGGCATTGTCTAGGCAAATCCCATTTTATTTAATAGTTTTTGTATTTTTTATTATTATCAGAATTAGTAATAAGACATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATT:2 - chr2R 20015204 5' + X-element 30 1 44.52 AAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chrX 13070824 5' - 412 467 2 67.12 TGGGCTAAGTTTCTATAAAATACTGAAAACAGCTCTCTTAGCTTGCCTGTTCAACAGGTATTCCTATTCTGTTGCTCTGTAGTCAATTATTATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATCTTT:1 - chr3R 6842705 5' - mdg1 374 2 53.42 AAAGCCACAACAGAAACGAATAAAACGCTGATCCGAAAACATAAATCGACCAATGGACGGTGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGAGCAGGTCCCTCG:1 + chrX 10728772 5' - springer 7511 2 76.26 CATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 9482094 5' - roo 8994 2 71.92 ATGTAAACATACAACGTTGGGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTATAATGAACAACGAACATATATGTACAATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 - chr2L 23396015 5' + HMS-Beagle2 37 2 60.27 GGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAA:2 + chr3R 16535284 5' - Stalker2 341 2 57.53 ATGTTACTCGCATGGAACAAGGCACTGATAATTATATGTGGGAATACAATGTATGACTAATAAAGAACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTAAGGGTTT:1 - chr3R 21614408 5' - S-element 1662 1 55.48 CTGAGTGAGTGCGGCTCATATACGCGTCCACTTCTAGTGAGTGTCAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2R 22255410 5' + roo 8737 2 68.28 TGGGAGTTGCAGAGGCAGGTAGCCGAAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATC:1 + chrX 693649 5' + INE-1 132 1 44.29 GTAACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr3R 7739638 5' + blood 7024 2 75.00 GGCGCGTTGCAAAAATGATAAAGTGCATAAGGCAAAACAACACTCGACAACATGGCATCTCGAACATATGGAAACGGGTTCTCTGTCTCTGTCTTTTTTTCTTTTTATTTAATCTACGCGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGTG:1 - chrX 7364234 5' - accord 7026 2 80.82 ATAATGGGTTGGCTGATGAATTGATCCATATTTGACATCATCATGTGATGGAAAGTATAGTTACATATTCTGAAACATTTACTAATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCGTCACTTCGAACTGGG:1 + chr3R 23172568 5' + Tirant 8080 1 58.22 AAAGAGATAGAGTGAAAGGGAGATAGGGTGAGGTAGAGCAAAATGAAAGCAAAAAATAGTTAAAGAGTTGGTGCTTTTAACCCAAATACACAGAGAATAATAATTTCAATCAAGTTGACATTGAAGAAATAATTGTTAAATATGTT:1 + chr2L 3105887 5' - frogger 327 1 76.03 AGTAACTATTATATCATATATAGATGTTATAAAATTGTAATACAAGTTTAATGCAAATAAATTAAAAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2R 9815135 5' + pogo 49 1 58.22 GCGAACAAGCGCAGAGATACACTACACCCCCCCCACATTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGACGCCTGTAG:1 - chr2R 23225863 5' - Transpac 5158 2 64.49 TGAGTGGCAAAGTGGTCAAAGAGGGTTGTGCAATGAATGGCTCCACCATCTACATGGCAGTTTCCATTAAATTAGTTTGCAGAGCGTTCAAAGGCATCAGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3L 22481369 5' + roo 8685 2 69.86 GTAATTCTCTTGGTAAGGGAGCCACGACTAATCCATAGCCAAACAAAGCAGTCGTGAAGTAAAAGAGTATATAAGAGTGGTAAAAAGTAAGAAACATGGAGAGGGGGGCGTTACGCTTCTTGTTATTCTATTGTCT:1 + chr2L 23314329 5' + 1360 3385 2 73.53 ACTCGCAGAAATCGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 - chr2L 10032740 5' + hobo 62 1 60.27 AGGGAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGA:1 - chr2L 17228706 5' - mdg3 5429 2 63.01 TGTCGCCAATTGTGCAACGGTAGCTCGAGCGATCGGATCGTTGGATCGAAAGCGGAACGATATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCAC:1 + chrX 2667247 5' - BS 5013 1 58.90 CCGAGGTTTAACAATGAGCACGGATCAAGGATGGCGACGGAGTGTCCTTGCTGTGGCCATGCCAAGTCATTGAACCCGGAGGAACCTCTAAGAGTCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 8397115 5' - roo 9048 2 67.13 AACGCTGAAAAGTATGCTACGTTATGTATAATTTAAACGAAACACCGCATCGTCATTTATCAAAACGGCTCGCAAAATGTTAATTATTATGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 26399920 5' + roo 8694 2 65.07 TAAAAGCACTGACATTTACTTAAGTTACTCCCATGATGCAGCCGTAAAGCGAGGCAGTTATCATAACAATTATGTAGCATAGACAATGGCAATCCGAAGTCCGAGTCCTTCTCAATTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAA:1 - chr3L 13341360 5' - G2 2725 1 78.77 TCACTTAAATTCGCATTCCTCCGCTCGTCCTCGCCGTAGTCAATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACA:1 - chr2L 18163850 5' + HMS-Beagle 68 2 65.75 AAGAGAGAACTTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATGATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr3R 31956361 5' - pogo 2067 1 62.33 GCTGAAGGAATCGCTTGAAGCTTTAGCCGTTAGCCTAATAAAGACTAAGCTTAAAGGTCATGTCAAGAATCTAATATAAAACGAGAATTCAGTCCAAGAAATAATAATCAAATTTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTGGAGTTCC:1 - chr2R 332538 5' - INE-1 573 1 26.03 GCGCATCACCCGATGGCACTTCACACCACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 - chr2L 1449737 5' - opus 7491 2 76.03 GGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 + chr3R 18665256 5' + 1360 68 1 69.86 TCTGGTATTCGTAATGATATCCATAAAGATTGGCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACA:1 - chr3L 15322039 5' + Transpac 5004 2 76.71 CTGCAATAGGCGAGCACGGTACGGGGTACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTT:1 - chrX 19498142 5' + P-element 92 1 21.92 CTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATTTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 - chr3L 131794 5' + P-element 86 1 27.40 AAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAACGCGTAGATCGCCAACAACAGTTACAGTAAGCACACACTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTTGTTTTTTGCAT:1 - chr3R 4357545 5' + Cr1a 249 1 69.18 ATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGT:1 + chr2R 18048822 5' - opus 418 2 74.66 CCTCTTCCAGGCCAGGTCCATTGGAAGCCTTTTTCTCGGCTTCCACTGTGTCCATCTGGATGTATAAAATGCACCATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chrX 4589539 5' - Burdock 6350 2 57.53 TCTTCAAGGTAACTGAAGTGTTTGCCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTT:1 + chr2L 18235382 5' - F-element 4675 1 74.29 ACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 17614396 5' - roo 8991 2 73.29 CATAAACAAGTGCAAGACTCCGATTAAATTGACAATAATAGCAGTAGCGAGAGGGTTGGGCATCAGCCATCCGTTTACCCGTCGAATGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 13722146 5' + blood 34 2 63.01 TAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 + chr3R 14088572 5' + 1360 78 1 71.23 TCGATTGAAATACTTTAACTGAACTTTAAAATTGATTTCGAAGATCCCCAAGTGATTTTTACACATTGTGTTGAAGTACGTACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTCCAAAAATGTGTTTTTCACAAGCATGCAAA:1 - chr3L 22635797 5' - hopper 1377 1 58.62 AGTATTTGTGAGGACTTCTAATATTAGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 9482154 5' - roo 9054 2 73.97 GAGGGGGTTTATTATGTGAGCCAGTTGAAGTCGATGCTGCTGCTTGCGCAAAATGCAATTATTAAAAGTTTTTCAAGTTGTCCGCTCCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTTGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr2R 13657635 5' + flea 23 2 67.14 GCGTTAGTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 + chr3L 23146437 5' + 1360 27 1 67.12 ACGGAAATCGGTTGATCCTGATGACACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 2036989 5' + Doc 51 1 52.74 CCAAAATGGATGCACTCATTTCGATTGCTCAGTTTTCGGTGGCTGGCACTAGTTGGATGGTTAAAGTTGGGAGATAAACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 25753603 5' + hobo 35 1 59.85 TATCTTTACTCGGTTGTAGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCCGCTTGCCTTCTGGTCCCATGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTATAATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAA:1 + chr2L 11867232 5' - BS 5082 1 73.29 GCGACCACTTGCAACTTTATTAGCTACGCCTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:2 - chr3L 22529841 5' + roo 8722 2 57.53 GAGTGGAACACTTTGTGCTTTGTTTGAGGCCGCGGAAAACTTTTCCACGCGTTCACTTGGTCAACCGTCAGTCCACCTCCCACCACATGTCAGTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCA:1 - chrX 15092224 5' - P-element 255 1 69.18 CGCGCATGGGCGAGAGAGCCAGAGAGAGCAAACACAGCTCTGCTCTCGCACGAATGAGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3L 20785413 5' - P-element 2867 1 68.53 TTACCCTAGAACATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr3L 23871333 5' + Doc 59 1 55.80 AGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACAGTATAA:1 - chr3R 5940506 5' + hobo 90 1 76.03 ACGGAAACAAGCCTTCAAATTAACATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2R 18123378 5' + 412 19 2 67.12 CAAGTATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chrX 15167775 5' - roo 9028 1 55.48 CAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr2R 14385574 5' + jockey 80 1 66.44 CAAGCAAAGTTTTCTGCAAAACAACAACGACAAGGACACGAAATAAATCCAAGTTATTCACGTGACGAGTACCAAAATGGAAATAATATAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTTTACCTTTAAAGTCAAAA:1 - chr2R 14281386 5' + S-element 1671 1 60.69 CGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCC:1 + chr3L 20747068 5' + Burdock 6171 2 61.38 GAAACGAAAATGAGAGAAGGAAAGTAAATAAAAATTATGAATGTCGTTTGCCCAGATTTAAGAGAGAGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 26316000 5' + roo 53 2 54.79 CTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chr3L 15035130 5' - pogo 2031 1 75.00 GCGAAGGGGATTTCTTATAAAAAGGCACACAAAACAGGCTGCGCAGACGTAACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chrX 7293352 5' + 1360 21 1 71.23 TAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGA:1 + chrX 18193736 5' - hopper 1327 1 79.45 ATAGACATGCAAAGTTGAATTTTACGTAGTTCCTGATGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAA:2 - chr2L 22513376 5' + Stalker2 84 2 74.66 CATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTA:1 + chr2R 13574782 5' + diver 91 2 80.00 GCCTAAGCGCGGCTAGATGGCGCCAATGGGCTGCCGAAGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr3L 13227690 5' + hobo 42 1 60.55 AAAGTTTTATGAAGTGCATGTCATGCTGCCTGTCGCTTTGCTCTGCTCCTGTTTCACAACCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGGACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGTG:1 - chr3L 13597873 5' - blood 343 2 59.59 AGTTGAAAGTGTTTTCTCTCTGTAAGACATTCTGTAACTTTTCAATCATATTCCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTACTTAT:1 - chrX 19231863 5' + mdg3 38 2 59.59 AAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 - chr2L 3734605 5' + mdg3 22 2 51.75 CTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr2L 17069533 5' + 412 7103 2 52.05 ACCAGCAACAGTCGACCAGTGAAATTATGAACTCCGACAATATTGCAGCGCAATGAGCTGAACTTCGGGCGCAATATGCACACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 - chr3R 22810814 5' + flea 4791 2 62.33 AGGCCGCCATGAGAACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chrX 9525348 5' - hobo 2886 1 76.84 GTGCTGCTAATGAGCTTAGACTTTTGGAGTGGGAGTGACCGAAAATGAACGGAAGTAATTATAATGGCTGCTGACATGATTTTTGGCATTCTAATTGAATCGAGCGTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATG:1 + chrX 6509002 5' + R1A1-element 5231 1 72.60 ACCATAACAAGTTTCGAGGAAATCAGTGCCAATGAAAATAGTCCTTATTAAACGATCAAAACAATCATTCCTGTTAATCTTATATTTATTAAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr2R 6945586 5' - pogo 2074 1 67.12 AGATGAGATTTTCGAATAAGCCAATGTACGCTGTGCTCTAGTTAATAGTAAATCAAAGAACAATAGAAGTAGCGAAGCAAGTCGAATGACAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCC:3 + chrX 16853293 5' + roo 29 2 65.75 GAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATA:1 + chr3R 7739672 5' + blood 7068 2 54.79 AAACTTTATGATCCAACCTCAACTTCTTTTCGAAAATCCTGTCAGTGAATAATCGATTTGGCCTTTGCTATTTAATAAACTTTTAGCTCAATGATGGAGCGGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACATGTCCTCG:1 - chr3L 26834435 5' - invader1 3581 1 66.44 GGTAGCTATATGATATCGTATCATTATCCAGCCCTTAACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:1 - chrX 22858987 5' - mdg3 5473 2 66.44 ACAGGATAGGCCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 20076894 5' - roo 9042 1 66.44 GCCAGTCACGGTCACTACTCCAGAGGCTCCAGTGTCCACTACTCCTGAGGCTCCAGTGACCACTACTCCTGTAGCTCCATCCACTACTGAAGCTCCAGTGCCCACTACTCCTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 - chr2R 18051122 5' - mdg1 7451 2 76.71 ATTTCGTTATTTCGTTTGATAATTAAAGCGACAATTATCGCACTCATACTTAAAGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3L 20290678 5' + roo 66 2 67.81 CTAAAAGGAGGCTGTTCTCCGGGAAAACGTGAATAAGAAAAATGGGGAGTTGACCAGGATTTAGCTCTGGCTTTTCGACACAGATAGATATATATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr3R 9958753 5' - opus 477 2 71.23 ATATTCTTAGGAGATGGTTTTATATATGATATCGTTATCAATTAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 9167580 5' + pogo 20 1 73.29 GGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 + chr3R 23507601 5' - 412 406 2 76.03 GGTGCTGCATAATTCATTACAACTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 + chr3R 17316014 5' + 3S18 5799 2 61.64 AGATACGAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 23099188 5' + roo 8694 2 60.83 GAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATT:1 - chr3R 2520352 5' - Tc1-2 1610 1 62.33 AGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTATGATGAAAACTTACATATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr2L 14262969 5' + blood 14 2 71.23 ATTTAAAAATTTGAGTTACTTTTATTTACATAAAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATGTATAATAATATGTA:1 - chr2L 21570302 5' + Dm88 25 2 71.23 ACTTCATTTAGAGTATGTTGGGATTACGAAATTAGCATTTAAATGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1 - chrX 17469259 5' + blood 7084 2 68.31 TAGGAAAAGAAAAATGTGTATGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 9938726 5' - roo 9043 1 66.44 TATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACG:1 - chr4 829123 5' - INE-1 144 1 64.38 ATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr2R 18807774 5' + jockey 77 1 60.96 CTCCAACAACCGGGACCGGGATGATTCGCGTAGGAATAACGATCGTGACAGGGATCGCAATGACGGACAGTATGGGGGCAATCAGCTGCTGGGTAGTAAGGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGGTCGTCATGCTC:1 + chr2R 12921144 5' - Doc2-element 318 2 69.66 GCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAA:1 - chr2R 6984399 5' - HMS-Beagle2 7123 2 69.18 GTTGACCTTTAAAGAGATAAAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr2R 15392842 5' + blood 24 2 67.81 ATTGCGTTTGTCGGCATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGAC:2 + chr2R 19076486 5' + F-element 185 1 67.81 CAATTGAAATTCGCTTCAAAACATGAAATGAAATATTTCTCTGTGCAGGATATATGAAAAATCAACAGAACGGTTTCCCAATAGTATTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTT:1 + chr3R 20206393 5' + 297 329 2 59.59 CACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGCCAGGCC:1 - chr3R 29709057 5' - blood 7340 1 56.80 ATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCT:1 - chr2R 20913201 5' - 1360 3319 1 63.70 CCAGGGCCGAAGCGCTGATGGGAATAGCCTGAACGCAATATGCGGAGTCTGGGTAATCCTTCTGACCACTGTCGTTGCCATTGGCATCTGGAATTGTGATATCTACATCATTTATTCATGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTT:1 + chr2R 7386652 5' - rooA 199 2 66.90 GGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr3L 22354431 5' + Doc 75 1 62.33 TATGATTAGTACCAACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr3R 24229008 5' - opus 7477 2 69.18 GCTGTCGTAAACTTCCAAGGCAATTATGTATGTATGTATGTGTACAAATGTGCATTTTCTGGAATTTAAACTATTCAAGAAAATTTGACATTTACATACGTCGACGAGGTGTCTCACGGCGGACTTATTAAGCCGTCCGAAAAATT:1 - chr3L 128747 5' + P-element 2435 1 52.05 TATTATTAATAAATTGATGCACTCGGAGGGGAGATGCCAAAAGGGAGGACGGCAGTTCAATACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATA:1 - chr3R 11692855 5' + hobo 2711 1 58.90 AGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTGTATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr2R 6559043 5' + mdg3 39 2 51.37 AGTCGCCGCATGCTACTTAATATTGCATTGGCCGCGAAGGAAGTGCATATAGTTGCGTTCCCGATTCCCGATTCCCCGCAAAAACCGATTCACCCCTGAAATTACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGT:1 + chrX 20552736 5' - roo 391 2 71.92 CGCACAGACAGATTTTGTCGCCTGCAGTCCTTTTGGCCAGAACATTTTCTTTAAGCCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 5446195 5' + roo 60 2 61.70 AGAGGCGGCTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr2L 13547084 5' + P-element 40 1 58.22 GAAATCCCCATCCCCCAATGCTCCTCCCACAACGCTCCCATCGACTCGAAGAAATTTGTTGATATTCTGGTAGCTATTAAGGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCACGTTTACGTT:1 + chr2R 19985671 5' - copia 215 2 56.16 AAGAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr3R 27786638 5' + Tirant 37 2 58.65 AAACTATCAACACGCAGTCACATTCGGAGGAGTCGAGCCCTCCAACTTCAATCAGGCTCATCACAGTCGTGTTTTTGATATCCTTTTCCCATAACTGTCATCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGT:1 - chr2L 7537604 5' - BS 4718 1 69.86 GTTGCGATACCTATTGAATTTAATAAATTTAAATAAGATTATCTTTTTATGCCAACTCTATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 21421133 5' + roo 8725 2 59.59 AAGGCGAATGGCGCCACTTACTTTAATTGCTGCCACGTTGCCGTGGTCCTCCGCGTCCTGCGTCCTGGCGGCCAAATACACAAAGGAGCCAGAGCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2R 10367438 5' + 412 26 2 66.21 AGAGATCAGAATCCACAATAAAACTAGATGCAAGGACAAAAACATTAGTAGAAATAGCAGTAACAGAAACGGAACGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGTTATCTGCATTATTTTT:1 + chr2R 3009409 5' + pogo 42 1 55.48 AACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 - chr3L 3540199 5' + mdg3 5319 2 70.34 GCAACCGTCGTGGACGTGCGAGTTGACTTAAAAGCACAAATGTGCAAGTTATCCAACCCGTAAATATAGCACTCTGACCCAGTTGATAAACAAATTATAACACCTTGAGGTAATTTTAAGCTTTCAGTGCTGCTCGGTTGTTTGCT:1 + chr2R 2964757 5' - S2 1293 1 65.75 AACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 - chr3R 8705844 5' - hopper 1383 1 63.70 GCAAACACTGGAAAAAATGTAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGA:1 + chr2R 19904009 5' + Doc 4466 1 51.37 ATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr2R 15392787 5' + blood 7090 2 71.23 GCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chr3L 18708593 5' + F-element 20 1 70.00 CATATTGCGAGTAACTATTATATCATATATAGATGTTATAAAATTGTAATACAAGTTTAATGCAAATAAATTAAAAGATTATATACAGTATAATACGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2R 9815144 5' + pogo 40 1 58.22 ACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAA:1 + chr2R 10478685 5' - invader4 3013 2 67.12 AATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr2R 21897966 5' + 412 71 2 66.44 CGCTATTAATTATAAAATATATACGCCTTTGCGTATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3R 22659861 5' - 412 481 2 76.71 CATATAATGACGCCGCATCCGGTGTTCAGAAATTGTTATTCATGGTCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAAAA:1 - chr2R 17014113 5' - HMS-Beagle 175 2 65.75 TAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2L 15833123 5' + hobo 28 1 65.07 ATTTAATGCGGCCAGGCATGTCAACAACGTATGCGATATCGAATTGAAGCCAAAATCGAGCAGAGGAAAAAATTCATCTGCAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chr2L 2122765 5' - HMS-Beagle 6994 2 52.05 ATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATGTTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 - chr2R 10367547 5' - 412 407 2 73.79 CTGAGTAGATAAAGCTGGCGGCTCAGACGGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGTTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 + chr3R 3527046 5' + Tabor 36 2 63.01 GTGATCGAATTCTACATGGACCACCTATCCTTGCCCCCGCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 - chr2R 23313118 5' + Tabor 6860 2 67.16 ATTTGGCCAGCTCATCCTGCTGAAGGACTATTTGTTTGCTTTTGCAAGGCAGACATATAAACAAAAGCATATCAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr2R 12703875 5' - blood 7341 2 50.68 TTTAAAAAGCCAATTAAATTGTTAATAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGG:1 + chrX 18239363 5' + jockey 4544 1 54.17 TTAACAGAAATGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGGCAAACGGGTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 + chrX 21639574 5' - Tirant 8488 2 73.29 ACTAAAAAAAAACGTATAAAAACAGAGATTGGTATTAGCCAAAATAAACTTTTATTGTATTTGAGTTTGGAATAATTTTTTTTTAAAGAAATTCCTTTATTTTTTTTTTTACATTTT:1 + chrX 1964023 5' - TART-C 11096 1 76.92 AACAAGGAGCTCACTTCCGCCTGGTTGGAGTGTAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAG:1 + chr2L 9356836 5' - Stalker4 320 4 76.71 ATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:2 + chr3R 15649772 5' - blood 7322 1 63.01 ATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGC:3 - chr2R 5237886 5' + Doc 92 1 56.85 TGGGAACGTGTCTGTAGCCATAATAATTATGATCTTGACCAGATGGATTTGTCTGCTTCAAAAAATTCATTAAGTTGATACTATTATCACGACAGAGCTAAGTCCCGTTGCCCTTCGATTCCGTTAGATTTGCCGGAATCTCTGCC:1 + chr3L 16197286 5' + diver 464 1 58.90 AGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 + chr3R 15589968 5' + Transpac 71 2 67.81 ATCTTACATTGGATCATCTCCTTCAAGATAACGTTAAAAATGAATTTT:1 + chr3R 23966812 5' - FB 976 2 89.58 AAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 25271145 5' + 412 33 2 63.70 ATTTCTACAAGTTTCCACAAAACTGGAGTTGATTTTCTTTCCGATGACGCAGAGCACGTAAAATATTAAAATATTATATGGATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGA:1 + chr2L 529276 5' + Bari1 1499 1 56.16 GTAGTGCTATAAACATTTACATGGCATTTATTTGAAAGATTCCTTTAGAATATGGTAGCAATCCTCTGTAGGAGAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACAT:1 + chr3R 4913507 5' - 1360 178 1 71.92 GGCTGGTCAGATACAGTTACATATCCTACAGCGTGGGAGGGAAATACACCACACCCCATACACCTGTGGCCCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCG:1 + chr3R 7678576 5' - R1A1-element 18 1 56.25 AAATTTATTTTAAATTTATTAAATATCTTTATTCACTTTATTAGTTCTTAACCCGTTACTCGTAGACTAAAAGGGTATACTAGATCCGTTAAAAAGTATTTATGTGTGTAACATGTTCAGGATCAATACCCGAGTCGATCTAGCCA:1 - chr3L 20055834 5' + INE-1 102 1 76.03 GTATATTTAACGATTAATTAATCGGGCAGTAAATAGTGCCATGAATATATCTGAAAATATATGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr3R 9258665 5' - 1360 3335 1 56.85 CGTTTGTCCGTCGTAGGAGGCACCTGGTACTCTGGATTGTAGACTCCCTCCAGGTAGTTCTGCAAAACTACTACCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGGGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAG:1 + chr3L 21340365 5' + R1A1-element 369 1 50.00 AATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCT:1 + chr2L 15142223 5' - BS 4934 1 55.48 CATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chr3R 15649882 5' + blood 46 2 54.11 ATCTCGACTATGGCCTCCACCTTTTTAGCATCCGCCTTGATTCCGTCGATATTAAAATCAAATCTAAAAAATTGCATTTTTTACATAAATATTTTAATATTCAACACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr2R 5079336 5' + flea 10 2 76.03 CTCATATAACCCACCGCTACCCACCGCCCAGCACCGCCCCCTTGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 19537426 5' + hopper 8 2 80.14 ATGTATAAATATATTTGTAAATCATGGACAGAATGAACTGACTTCGACGCAGATTACGTATATTATCGGCGTGGAGTAGAAGGTGGAACATGAAGGTCAATCCTTTAAAAACATTCAATCCATGTTTCACACTTTAAAGGCTTGCT:1 + chr3L 5272927 5' + BS4 330 1 57.53 AAGAAGCCCACGCCCGAGGACTCGGAGAAGGCCAGGAAGATTGCCGAGTTGCAGGCGCAAGAAACACCAGAAAATTATTAAATTTCACGTTCGCATTGCCACTAGCTGAGTAAGCTGGGTATCTGATAGTCGCGGAACTCGACTAT:1 + chr3L 19910820 5' + INE-1 564 1 59.59 ATATTTCAGTTGTTTAATTGCGTTTTTTACCTTAAGCTCGTTCACATATGTATGTAGGTAGCAATAGTCAACATTGTCAATTATTTTCGCAATTTGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 - chr3R 7549782 5' + copia 4896 2 67.81 ATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 9938689 5' - roo 9006 2 63.70 GTGTTATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTTAACAAATCATCGGACAC:1 - chr2R 1277134 5' + Tirant 8141 2 59.60 ATATCACTAAGCGAAGTTTTCGCACATAAAATAAATATGAAGTTACGATATATAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATA:1 - chr3L 17666791 5' - F-element 4309 1 67.12 TCTCACTCTGGCATTAACCAGAACTCTGAAAAAAGGAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGGATGCCTTAATAAATAA:1 + chr3L 3498207 5' + X-element 4703 1 73.97 GAAGTGTTTGCCGTCGGTCGTGTGTAGACATTAGTTTCACCATTGCACACTGGACTTACGCAGCTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTTAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAA:1 + chr2L 18235396 5' - F-element 4624 1 53.52 GGAGTTTCAGGATTTGAGTATTATACAAGAGAGAATGCTATTTTCGAGGTCCCCGACTATCAGATACCCGTTTCTCTGCGATACCGATAGAAATTGGGGAGTACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr3L 22737497 5' - mdg3 229 2 73.29 CGATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1 + chr3L 24153184 5' - Tabor 412 2 67.12 TATTTTTATTTGTTACTATGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr3R 23664382 5' + pogo 60 1 59.59 TCTTTCGATCTTTGGATCAGTGTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr2R 18048754 5' - opus 486 2 76.03 ACCCCAAAACAATGCGAAAATCTATAGAAAAACACGTCTTGCGGGGGGCCACAAAGAAGAGCGACAATTTTTGCGCGTGCACTGAACTCATAAAAAATAATTAGAAGACACAATTAAACAATAATAATAATATAATAA:1 - chr3L 8665025 5' + invader3 5045 1 73.91 ATGACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chrX 10960300 5' - Transpac 292 2 59.05 TACGACCACGACGACAACTATAATAAATGGACCTACGACACAGCCGCAGGTAGTGTCCATTCCAGCGGATCGTTATATCAGGCTGGCTGAGTCACTATTGGATCAACTATTTCATTATTAGGAATTTTATTCTTTTTTTTTATTAT:1 + chr2L 9516706 5' - gypsy7 5002 4 63.70 GTTACGACTATTTCCGTTTTACCCTTTTGTGGCGTAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGT:1 + chr2L 14006004 5' + hobo 86 1 78.08 CTTGTCACCTAGTACCCTGCTTATGCAAACAATTGTAATCTCCTCTATTCAACGCACACACAATTTACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr2L 12481416 5' + pogo 52 1 52.74 GAGGGGAAAAGGAACCGCGGAACGTTATCATCTCCATTTAAAGTTGGGATTATATTTGTTCATATATGTTAAATATAGTTATGATTTCTTATTACAGAATCTGCATTACTGTTTTTGTCTAATGTTGTGTAATCCGTGAGCAGGCT:2 - chr2L 4142223 5' - 3S18 5681 1 87.67 CATGGCAAGATTTTCCTAAGTTCAACGTTACGAAATTCGAGGCGGGGCAAGGGATCATGACAACAACTTCCACTCTTGGCTAATTAGCCAAACCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGAGCACG:1 + chr2L 13552728 5' - baggins 5118 1 73.17 AAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2L 2519881 5' - roo 324 2 76.71 CATCCACTTTCAGGTGCGATTGACTGCCCGAGGACTGAATCTTGGGTGCCTGCTCCACCAGTTTGCATTTCTTGGCTTCGCCGGTGGGGATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCT:1 + chr3R 17104512 5' - roo 8775 2 59.57 CAATCGAAACCTAGTCCAAGGCAATTCTGTCTCCGTTTACCATCTTGTACACCAGCGGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 10979099 5' - roo 9011 2 61.54 AAATCTCAAACTGAAAAATATGATATATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATGCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCA:1 - chr2R 9327057 5' - mdg3 5436 2 58.62 ACAAGGATAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 18581223 5' + roo 14 2 74.66 ATTGATATGGGCAATTTGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATATCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr2R 18123402 5' + 412 7096 2 49.32 AAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chrX 10571327 5' + Doc 64 1 60.69 CCAAGTTTGTTATGTTTGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 - chr2L 10474363 5' - P-element 2783 1 15.75 CAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr2R 19900968 5' - mdg1 7405 2 54.11 TAGGTAAATGTGTTGTCGAGATACAAGCTAGGTATAGAGCAAACTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 + chr2R 21227364 5' + mdg3 78 2 70.55 TTCACTTTGCTCGCTATGTTTACCTTTCTTCGCCCTGGCTTTTCATAATTTTGCTTTGCATACTTTTTGCGGTTGGGTAGCTTGTGGTGCTGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3R 9163978 5' + hobo 31 1 64.38 ATAAAATGAAAGTTCACTGCCGATGGCCGTTCGTTGCGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 21420995 5' - roo 9048 2 69.18 AAACAAAATCCTATAATTATAAGTTAATGGCCAACCAAATATACGATTATAATAACGCTCATTAGCGACACTTTTCTTTTTAATAACGTTTATGACCCCGATAACCATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chrX 17161966 5' + FB 17 1 74.66 TAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAG:1 - chr2R 5900909 5' - Bari1 1628 1 73.29 ATCTCCCAGGGGCTTGGACCCTCGTTTGTCCAGATCTGGCGGCACCTCGTGATCGATCCAACTGGACTGACAAATGCATAAATCACGTGCCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAA:1 + chr3R 31125891 5' + P-element 456 1 65.07 ATCACGGAATAGTGGCGAACAATGAAGATGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGCGGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:2 + chr3L 22221131 5' - 412 425 2 57.53 TAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 18581230 5' + roo 21 2 69.86 CCGTTTTTTCTTCGTTCTGTTTCTCTTCTTCCCCGTTAACCATAAATATTCGGTTTTTTGAAAGCAATTACAAAAAAATTAGAAATGGCAAAAGGATGAAAAAAAAGGAAGAAAAAAAAA:1 - chrX 9716310 5' + Doc2-element 254 4 40.83 GGTATTTTTGATGGGTGAGAATCCCAAAGCTGGAATGCCCTGAGCTCGAATGTTCCTGCTGTCGGTGGCACCGGGGCAGACAATGGGGTAGATCTTAAGGCCACTATATTCTGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTG:1 - chr3R 23096990 5' - invader2 485 1 72.60 TCGTTAAATTCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATAT:1 + chrX 18034612 5' + Juan 60 1 52.05 AAAAGGGTCTCATCCCACCAGGTGATACTATTGTCATCATGAGAACTCTCATGCTGTTAATCTTATATTTATTAAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr2R 6945427 5' - pogo 2057 1 53.42 GACAACTTTATTGAATTCAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr2L 1449555 5' + opus 7031 4 65.07 CAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 + chr3L 9375831 5' - mdg1 351 2 64.38 TTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr2L 18370336 5' + Doc 68 1 59.59 TGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACT:1 + chr3R 9289288 5' - HMS-Beagle 192 2 56.16 GGCAATAAAACCGGTCAAGAGCATCGTAATAAAACTCAAACAAGAAGGCATTGGATGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGT:1 + chr3L 16535168 5' - copia 189 2 64.38 AACCAGCAATGAGGCGGGACAGCAAGAAGCGGCTGCTAGTGAGAACTCACCGGAGGTATCAACGCCGCCTTTGAAGGCTGAGCAGAACAAGGACATTGTAGTCTCCGTAATGTCCAATCATTATGCTTACAATAAAGAACCTATGT:1 - chr3L 8090657 5' + Tirant 8302 2 80.14 TGGTTCAAAAGCAGACTAGACTTTAACCTTTACTCCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:1 + chrX 14914371 5' - mdg3 5414 2 74.48 ATCATCTACTGTCATTCCTCCCTACTTGCCATTCTTACGCTCTCTCAGCATTCGCATGGGAGATGTGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAGGGAATTGTGAT:1 + chrX 18366030 5' + jockey 61 1 57.72 AAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr2R 9326950 5' + mdg3 37 2 50.68 GTGCGGGTATGTGCCACTTAAATGGCGGGCGATCAACGGAGTCCCGTTGCCACAAGTGGCGCACAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGC:1 - chrX 2190082 5' + Doc 385 1 55.86 GTTCGTTCAAGTCCCGGAAATCGGTGAAGCTTTATCACCACACTTTATTTTCGCTCTATAACCTGTTGTGCGTTTCGGACTCCGTTTACGTTTTACAAAAACGTAGAGATCCATACCAGTCTGCATGACCGAATTTGGGCGTCCAC:1 - chr2L 12017632 5' - Doc4-element 446 1 75.34 AAACGTAAAAGGTATTTACAATTTTATTGAATTTATTCTTTTTATTAGTTTAGTTAGTTATACGTATATTGCAGTATTTCTTAAGTACAAATTCTTTAAATGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAA:1 + chr3R 11002772 5' + flea 392 1 70.55 ATATCCAAGGCGTATGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTG:1 + chr2L 22643339 5' + invader4 19 2 57.53 CAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 - chr3R 21237806 5' + Doc 74 1 64.14 ACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr3R 29708924 5' + blood 21 2 65.07 TGTAACTAACTTCAATGGATGCTAGAACTTCGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATTTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chrX 14692823 5' + Transpac 4963 2 55.48 GAAGTGTAATTCCAGTATGTCGACGAACCCTGCCTACGCCGGATTCCCGTGGATGACCGAATAAAATAATACTATTCTGTGAAAAGAATATTTTGTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCA:1 + chr2L 21909410 5' - pogo 1624 1 68.84 CGCTCGATCAAGAGATACCCTACACACAGATGCCTCAAAAAGGTTCATCCATGGGTCTTAGAATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAA:1 - chr3R 5090169 5' + X-element 4585 1 57.53 ACTCACCAACATAACTCAACTCCTATACTTATACACGTCCGAAATATGCTCTGAAATAAACTGAATGAATTTCCTGGTCAAAATATACGAAGAAAAAAATCAAGCTTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chrX 991128 5' + 412 16 2 54.79 AAAGCCTTTGGGCCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2R 20461137 5' + jockey 23 1 73.61 GAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 - chr2L 2357376 5' + P-element 62 1 43.84 GGACAGACGGACATGTCTATATCGACTCGGCTATTATTGAGCAGCTTCTTTAGAGCAAAAGTACAGACAATATTCCTTGCTTAGTCTACCCTACGCGACAATGCATTGCGCCACCCAGACATGAGCGGCAAGCCGACTCAGCATTC:1 + chr2R 5879016 5' - gtwin 162 4 69.18 AACATCAGCTGTGCCGAACAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chr3R 5087112 5' - P-element 2831 1 47.26 GCAATTGTTTGGGATAAATGCAGATGCAGATACACAAACAAACACAGATACTCAATGCCCAAACATTCACATACATATCAGCCAGATCGTTTATATGGCAGCTATATGAAAGTTGACCAAATCACTTGAAACTTTGTGAATCACCT:1 - chr3R 21009753 5' + transib1 2052 1 50.68 GAAAGCCTTTGGGCCGAGCCATAAATGTTTAATTCATAAATTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:2 + chr2R 20461136 5' + jockey 24 1 73.29 GTAATGAGGAAAATTATGCTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:1 + chr2L 12283941 5' + Quasimodo 75 2 70.55 ACTAGCTAATTAGAATTTCAGTGAGCGCTCGCCAAATGAAATGCAACAACAACAATGTGGCATTTTTATTTTAGTTTTCAATTATTAGGCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAG:1 - chrX 5890438 5' - transib2 478 1 66.90 CCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 + chr3L 18708569 5' + F-element 34 1 68.12 AAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTGATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTGGTCTGAGCTTAGCTT:1 + chrX 10960205 5' + Transpac 66 2 60.27 GCCGGGCAGCCACGCTCAAGTGAATTGTCATATTCTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 13391165 5' - gypsy3 428 1 90.00 CTAGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr2R 13849728 5' + roo 64 2 63.01 ATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 23099111 5' - roo 8988 2 81.43 GTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 11228546 5' - roo 354 2 53.42 TTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr3R 25271256 5' - 412 421 2 71.94 CAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCA:1 + chrX 22726193 5' - Helena 1233 1 54.79 CTACCCATGACTTTAGATGAATTTCATATTTTATTTAGTTACATAAATAAAATCTCATAACAAATTCAATAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTTTGTAAATGA:1 + chrX 12843573 5' + roo 50 2 52.74 CAAGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 16771341 5' - roo 9003 2 62.33 ATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAATGAG:1 - chr3L 23583089 5' - looper1 85 1 50.00 TAAGTGTCAGCTTTAATAATTTAGTGAACGTGTCTTAATCTAAGTCGAGCCACACAAACACACCTCCACACACTCGACACACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGAGGAGTGTAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTCT:1 - chr2L 11158766 5' + Rt1b 5019 1 75.34 TTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2L 2519820 5' + roo 78 2 71.23 TAGCACAATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr2R 15080098 5' - roo 8998 2 67.81 CGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCCCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chrX 3452498 5' + Tirant 8151 2 65.38 AAACAAACAAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chrX 10571319 5' + Doc 57 1 55.48 ATAACATGTATTTTCTCCCGGTGCATGTCTTTTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chrX 19162537 5' - pogo 2085 1 70.83 AACATTTTACCTCAATAAAAGCGGCTTTTATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr2L 9010531 5' - 1360 3339 1 54.79 TAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 + chrX 14385155 5' + blood 7076 2 60.27 GTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3L 22221269 5' + 412 7081 2 66.44 GCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCA:1 - chr2R 10453487 5' + mdg3 5275 2 54.79 AGTTTTTGCTGCACAGAAATCATGAATATTTTATTGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chr2L 15621840 5' + hobo 2708 1 77.78 GATTGCGCAATTTTCAACGGACGGAAAGTTTCTTTCTCCGCTCTAAATCCGCAGCACGAATTTAATATTTTTGATTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 - chrX 16853467 5' - roo 9052 2 72.60 CGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTCCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2L 15621968 5' + hobo 37 1 56.85 ACAAACAAAAAAATGTACTAATTTTTGACCAACTGAAATTTCTCAGCTTTATTTTCCACTACACACATTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:2 + chrX 10571321 5' + Doc 59 1 56.85 CAATATGGTATCAAACATCAAACCAAAATCATCTTAACAGCTACATTTTTTTTAACTATAAAAAAATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAGT:1 + chrX 22518943 5' - INE-1 550 1 73.29 ACAACACACACCTTTGTCTGCTTAGCTGGTACATGCAGTTAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCCATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:2 + chr3R 27971033 5' - mdg1 7381 2 70.55 ACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGC:2 + chr3R 1875805 5' - Rt1b 4702 1 49.32 GATAGGCTTGGGCTCCACTTTCAGTTCGTCGGCACCCTTGCTCCCCTAAACTCCACACTTTATGGCAGTAGGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACA:1 - chr2R 16811724 5' + ZAM 8053 2 54.62 AGTTCTGGGATGATTTACGGTCTCAAATATTAAGTGGTTACTTCCCAAGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 16771296 5' - roo 385 2 69.86 ACTGGCTTTGCATAAGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr2R 21898012 5' + 412 7077 2 66.21 GTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 + chrX 13762592 5' - P-element 2785 1 15.75 CTGGGAGGTGATGAATAATTAATTTGACTTAAAAAAGTAGAACTATTTTAAAGAAATTAAAATACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 12608170 5' + roo 8720 2 60.27 TAGCCATCGAAGTGGGGAACGCATGTCAGGTGAGCAGTCGAGCAGCCAAGCGGAAGTGCTTAACACCAACACCAGTGCACAAGCACGTGCACTATGTGGCCATGATATGAGTTTGTGTGGCCCTAATAATTATCGTCGGGTTGGCA:1 + chr2L 10539580 5' - Fw2 3819 1 70.55 CAATATTCAAAACAGTTGGTCCCATATGCAAATGTTTGGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:2 - chr3R 15590665 5' + roo 8722 2 58.90 AGTGCTGAATTGAGTCGCGAAATTCTTCAGGTGCACTGCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chrX 17469134 5' - blood 7368 2 70.55 AGTAGTGTCAACGTTGAAGATCGAAAATAGGAAATCATAGAGAGGCATCTCAAGGGCTTATGAAATTGTACTTTAAAATGAATGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3R 9482129 5' - roo 9029 1 56.85 TTAACACTTGAGTTAATTTTCCATCTATTGTGGGATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2L 18370298 5' + Doc 30 1 68.49 ATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr3R 6103672 5' + Tirant 8117 2 67.05 CGGCATACATGCAGCCCCACTGAGTTGACATATTTTCATTAAGATAACCGAAATCAATTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 - chrX 14385247 5' - blood 7323 1 63.01 GTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chrX 21668690 5' - mdg1 7424 2 52.74 GGCCTGAGGATGGCCTCAATTTCATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3R 20149818 5' - 1360 3376 1 72.58 AACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGGGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTACGTTGATATCTTA:1 - chr3R 22429244 5' + roo 41 2 52.59 CCGAGCTCTTTCCCTTGGCATCCCGGCCAAAATCTAGACACTGGGGAAAAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 4869161 5' - roo 9014 2 61.19 GTGTGTGTGTTGTTTTTGAATTAATTACACAGTTGATAGCCATGGCGATAGGTAATAGTAGGGCTATAAAGCCAATGGTACAGTGAAAAAATGAGTTGTAATGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAA:1 - chr2L 4081152 5' - G2 287 1 65.75 GTATCTTTAAATTTTACCTTTCCTTTAAGATACTATTTTTTGACCTCGTTCAATGGCAACGGTTTAAGTGCAATCAATCATGAAAGTGAATATGCTTGAAATGCTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3L 11196291 5' - pogo 2088 1 76.71 ATGGCTTATTGCTAAAATGATTTTCTCAAAAAATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 8022118 5' + roo 8715 2 57.53 TTCCATTGATGTCGTATTGTGGCGATGATCTACAGAAGAGCAAAATACGGACAAGGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chrX 11534439 5' - roo 9007 2 60.96 GAAAAATGTTGGATATCATTCTCTATTACATTAAAATACATTAAAATTATACCAGGCAGAAGATGCTATGTCCATTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTGTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACTGTAAATAA:1 + chr2R 2009251 5' - I-element 497 1 55.48 ATGAAGAATGATATGTTGGCATCGCCGCAGCCGCAGAAGCCGCAATTTTCCACACCCCCAACCGCCCACATCAACATATACGAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr3L 13600483 5' - blood 340 2 45.21 GAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTGAGCTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - chr3R 15649869 5' + blood 59 2 59.59 TTGTAGAGCAAAACTTTTTACACAATCCATGGGAAAAAAGGACATAAAAATTGATTAACTACCGGGCGACCACAAAAAACATGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAA:1 + chr3R 11344040 5' - Stalker 6928 4 55.48 AATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chrX 14908480 5' + blood 55 2 53.42 ATTTATTAAATATCTTTATTCACTTTATTAGTTCTTAACCCGTTACTCGTAGACTAAAAGGGTATACTAGATCCGTTAAAAAGTATTTATGTGTGTAACATGTTCAGGATCAATACCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCC:1 - chrY 538723 5' + INE-1 115 1 67.12 CGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGTCCGTGATTTATCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 3524213 5' - roo 351 2 58.22 GCTATTCAGCGCTCAAAATCGATCTTGGAAACAAACAATGCAGCCAGCCGTAACCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr3L 6774145 5' - pogo 2036 1 63.70 GGTGTGGCAACAGTAAAGGATATGAGGCAACGCACGCAGACGAGGATTTATTTTAATCAACGTGGACGTTAGTCCAAATAGTGACGAAGGACAACGAGGAAATGAGTGGGCATGGCAAAAAGGTTGTTGGCAAATCGATAGAAA:1 - chr3R 14212919 5' - INE-1 446 1 68.06 GTATAGAGCTGAAATGAAATGAAATTTAATAAATGCAGTGCGCCAGTGGGCGAAGGAACGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3L 13597746 5' + blood 7073 2 60.96 TATATTATTCCGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGAGCTACCCGCCACGCACATCGCG:1 - chrX 22386826 5' + hobo 66 1 65.75 ATGATATCGTTATCAATTAGCACGTCTTATTTTGACAATCAATCAATTTATGAAATCGCAGACCTGCCACAACTGGCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr2L 9167555 5' + pogo 45 1 56.16 AGTCTCCACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATTAAGGCGGCCATGTGGACAGGCGGGTAGACAGCCGGACGAAGATGGCTAAGTCGACGTGTTGACCCATCTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGC:1 + chr3R 757415 5' + INE-1 348 1 36.99 GCCAATGCGAAGCGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chrX 14962153 5' + jockey 21 1 74.66 CTCGCTGTAAACGCACTTGATCTTCCTTGTACTGAACCAACATATCGCTATTGCCGCAGAAGAACTGGCCAACATTTAGGAAGAATATCTGCTCCGGTGGCACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 - chr2L 16490014 5' - hobo 2861 1 69.86 GGTAATTTCAAAATTAGCAAGGCTTACCGCTCAGCTTACCAAAAACTTTTGACAGTCTGGAAAGACTTGGTATTTAAACCATAACTAGATTAAATATAATATACATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr3L 15891128 5' - mdg3 229 2 54.79 AAGTTTTAAAGACCATTTCACCAATTAGTTGGCAGGATATCAAGTTCGCGATAGGTTAGTAAACTATATAAGGCACAGTGAAGAATTACAATTTATCCATTAAATTTTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGC:1 - chr2L 17068883 5' - 412 200 2 71.43 ATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 + chr3L 21097137 5' + mdg3 83 2 72.60 GGGAGACGTTCGCAGTGGCGTAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3R 20292388 5' - pogo 2089 1 76.92 CGCCTGCATCTCGACAGGATGGCCGAACCTATATTTAAGGATCCGGAATTGCAACGTAACGTAATCAGACCCGAAAAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACA:1 + chr2L 7014487 5' - pogo 1711 1 50.68 AAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1 - chr3R 6053060 5' + Quasimodo 32 2 57.26 ATTCAAAGTCAAATAAAAAACATTAATTCGCTCTATACAATATAGATATTTCAAATAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 + chrX 12230493 5' + FB 65 1 61.64 ATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCC:1 + chr2R 19633180 5' + jockey 4613 1 58.22 AAATCATAAGCGTAACATTTTTATAAAATAGAGCACATACTATATAGTAATTGAAAGTATAATACTGGGGGGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAA:1 + chr3L 16764793 5' + I-element 52 1 48.63 ACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 - chr3L 17667644 5' + F-element 56 1 48.63 CAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAA:1 + chr3R 23108072 5' + G-element 79 1 67.59 GTCGGCAAGGTTTTTTCCCCACCCAATAAGTGTACACTTTACATTTTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGG:1 - chrX 10728909 5' + springer 7207 2 65.75 GTTCTAATTAAATGACTTCACTTTTTTTCGGTTTTTTGGCTAGTTTAAGAATGAATTTTCCATCTAAATTTTGCTCATCTAAATAAAATATAGTATACATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 - chr2R 4564702 5' + flea 21 2 71.23 AAATGGCATTAAAAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 + chr2L 19878120 5' - mdg3 5475 2 66.44 TTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3R 8542657 5' + roo 84 2 76.03 ATCAATATATTAGACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGCTTTTTTTACAATA:1 - chr3R 8705860 5' - hopper 1401 1 75.69 GGTTAGCCTGGGGAAAGTTATGTAAAACATTTAGGTGCGAAAATTTTTATAGATCTAAAATGGTTGTTATCCATACTATACATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3L 15890986 5' + mdg3 5293 2 46.58 AAATTCAGTATATGTAAAGTTAAAAAAAAGTTTTACACATAATATAAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chrX 11710421 5' + pogo 57 1 65.67 GATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 18123421 5' + 412 7101 2 55.30 AATTTACTATTGTAGATTAGTTGAAAAGAACGACTAAGTATGTAGGTATACCTTCTACCGAGATCTTTTAGATCCCAATTAGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATA:1 - chr2R 6579619 5' + mdg1 7078 2 55.48 ATATTAATAATGATAGCAATGTTCTGGCTGACTTTTCGTAGCAAAGGATCACCCTACTATATCCCAATCCCTCCATTTTCGCCCAGCTCTTCTCGCCTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 + chr3R 27786509 5' - Tirant 381 2 73.29 TCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr2L 1073941 5' + Tirant 18 2 58.57 CACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTCGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATAC:1 + chr2L 15142226 5' + BS 4752 1 53.42 ACGGTAGGAAAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2R 5067609 5' + F-element 59 1 55.48 GACCATCTTTTAAAATAAAATATTCTTAGGCCATATCATTTATATTCATAGCTCGCAAATTCTGTCTTAACGTTCAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 + chr3R 5245550 5' + 1360 42 1 57.53 TAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGC:1 + chr2R 5582155 5' + Cr1a 474 1 54.79 ATTATTTAGATTTAAATGGCATTAAAAATGAAGCCTAGCTCAATCATAAATAAATATGATTTCATTGACATTACTTTTTGTGCATGCAAACAAAGAAGAGGCAGAACAAATATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:1 + chr2L 19878107 5' - mdg3 236 2 75.34 TGTGCGTAAGGGAGTGACATAGGTAGAGGTAGATAGGTAGTCAGTTTTTGCTCACAAAGCCATAAAATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGT:1 + chr2L 16107235 5' + Rt1b 100 1 74.48 TTTGGTTGGTACATATATCTGAAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:1 - chr2R 22692486 5' + Ivk 8 1 78.77 AAACAAAAAAGAAAATTAAAAGAAAATTCTCTATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGATTTAATCAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 9163831 5' - hobo 2909 1 61.76 AATCGAGAGAAGAAGCTGCTCGAAAAGCAAATTTCGGTTAGAAGGTTACATTTATGTGTAGTGAAATGTGTACATTTTGTAATTTTTAGACCGTCGTCTACCTGGTGATATATTCTTGATCAGGGGATCAATAGCCGACTCGATCT:1 - chr2L 2517665 5' + INE-1 97 1 74.66 TAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 - chrX 8200330 5' + flea 24 2 69.18 CAAAATGTTTAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGG:1 + chr2L 15153214 5' + G-element 22 1 63.70 AAGCCAATATATGTACATTTTCTATCCCCAATTTTTCAGCACTTGTTTTTATACTAGATTCTTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAAGACTATTCCGACTATACGAAGTAAATATATTCTTGATCAGGATCAAGAGCCGAGTCGAT:1 + chr2L 21911704 5' + INE-1 95 1 66.44 CAGTAGTCACTTTTCATTGCATTGCGCCCACGCCCAACCACCCACAGTCCCCTTATCATTTCAATTCAGTTGCGTTGGCGCGCGCGCTGCAAAATGTTGGGGATTCCCTTACGTAATAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATT:1 + chr2R 11175423 5' - P-element 196 1 78.77 CAGCATTTCCACGCAGTACCGCGCAAATGATAGCCATAATTTTAAAGCCGACGCCAATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAATAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGAACACAGCAACAC:1 + chr2L 18048227 5' + blood 33 2 56.85 TTATAAGGATATCACAGGATAGACCTCAATGTACAAATTGTTTTCCCAAGAACAAAAGGAACACATTGTATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr3L 19396974 5' + F-element 22 1 73.97 AGTTTAGTTTAGACAACTTGCTAATATGTGTAAATAATTATTAACAAACTTTAATTAAAAAGTGCTTATACGATTTGTAAGAAGTGTTCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chrX 21205108 5' + 1360 34 1 60.96 CACGTGTCGGAGAAAAATAACGAAATTAATTGCATGCTTCGTGCTAAAATTCTTTCATTCCAACAACAAACTTCGTCTCAAAAAGGGAACATTAAATGCAGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGATGT:1 + chr3L 7793581 5' - 1360 170 1 67.81 CAGCGACATCGGTGGAATCGACGGGGTCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGAGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 + chrX 19498106 5' - P-element 2795 1 23.29 TAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCA:1 + chrX 18239388 5' + jockey 4595 1 79.45 ATTATTCTAATGAGGCCTACTGTTCAGCCGAAGCCTTTAATCAAATTTTCAAATTTTCAAACAAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAG:1 + chr2L 18370332 5' + Doc 64 1 58.22 ATAAGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 - chr2R 10478781 5' + invader4 2815 2 52.05 GTACTCGGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCC:1 + chr3R 26765108 5' + mdg3 5335 2 73.97 ATTTGTTTAGCCTCCACCATCGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 + chr2R 14553191 5' - mdg3 5478 2 68.49 ATAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATT:1 - chr2R 16312132 5' + G6 1976 1 49.32 CATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:2 + chrX 21668721 5' - mdg1 7393 2 63.70 ATAAATCTTTGTGACAAAACAGACGAAAGCGAGAGGCAGATGAGGAGAATGAAGGACAGACACTCAGAAACACATTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGAT:1 - chr2L 1266444 5' + 1360 3159 1 50.68 AGTTTGTGCAACATAAAGGTAATTAAAATGGCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAACTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATT:1 - chr2R 10478778 5' + invader4 2801 2 49.61 AAAACTTCTCAACGTCCAGCATCGGAAAAAGAGCTGTGGAATTTTCACACAGCGAGGGAAAAGCCAAGAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3L 14921370 5' + pogo 50 1 52.05 GTGACAAAGTCCTGCAAAGAACTTTGATGGCAGTTAAGTAATAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 - chr3L 20925834 5' - Transpac 232 2 71.92 GCAGTCAAGTTCGGCAAGTAAACTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr3R 15974769 5' - P-element 2792 1 20.55 CGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGGGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATG:1 - chr3L 16047628 5' + Cr1a 499 1 43.84 CTTCTTACACGGCATCCTGGCAAAGAGTATCAAATAAAAACTAACAATCTGTTATAATTGCTAGTATTTATATTACATACGCCTGCCTCGTCTTGACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCT:1 - chr3L 20600070 5' - R1A1-element 389 1 53.42 ACATATATGTAACTGATATAACTTAATGCTCATATGTACATACATATTTACATATTTAAAAAAAATGAATTCGTAATTATTATTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 - chr3R 21589107 5' + flea 4792 2 61.64 ACTGTAGGCGCTACCACTCTTTTTCGCTCACAGCATGAACGGTGTTTTGCGCTCGAATCCGATTCCACAACCGCTCTAGCGATCACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr2L 21237356 5' - P-element 2869 1 73.29 GATGTCGAAAGTTCAAAGTTGTAAGCAAGTATGCTCGAAGTGGTGGCGGAGAGTGCCGTGGAACCTCCCAGAGTCGAAAGAATAGCTTTGTGGGATCAAAATCAAAGGAAAAAAATCTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCAC:1 - chr3L 14361397 5' + Idefix 7050 2 82.19 GACCATATTTACTGTTTTATTTGCAATTTTAATTATTGGTTAACTTAATCCCATGTCGATTAAACGATTTCTTAAGTAAATGCCTATATTTACAGTTCATTTATCCTTGATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 14136489 5' + roo 11 2 45.89 ACACTGCAAATTGGCCAGCAAATTAAGGATAAAAATTAAAAGTTATTTGTTAATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATTTTTTAGCAAAATTTTGATTTTGCTCCGCGACTTAGAATTTTGTCTTTCG:1 - chr2L 18166011 5' - HMS-Beagle 301 1 69.18 TGTAGAACTTGGGTCTGCGGGAGCATCAAAAGGGCAGATTGCTGCTCCAGATGCAGCTGGAGATGCAACTGCTCTTGGCCCTCTTATTCATTTTTTTTTTTGCTATTTGTTTGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 - chr3L 9198711 5' + F-element 22 1 73.97 AAATAGTTCAAAAGTTCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 + chr3R 23108064 5' + G-element 51 1 56.80 GAGTGTTCAATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCT:1 + chr3R 4913580 5' - 1360 106 1 69.66 ATTTGTAAAGAACTATCGAAAGAACAGGACCAAATTAATAAATTTTAATACATAAATAGATTAATATATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCA:1 - chrX 21668835 5' + mdg1 56 2 56.16 TCTTGTCTATGCAAATGTGTTCAGCACAAAGGAAAGTCTTTCATTCATTTTGTTCGTTATTTATATAGTCGACTACCCCAAGGAGTTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTA:1 + chr3L 4506555 5' - flea 198 2 56.85 GGATCGGGTTAGCTTTCGGCTGATGGGATGGGTGGATGGTTGGGTGGTGCCAGGGGTTCGGTTCGCTTGGATTGGTCTGGGTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chr3L 3137893 5' + FB 38 1 60.27 TAGCATTGCATAATTATATTAAATAACAATAATATATTTACTAGAAATATTTCTGTCATAATCAATGGAACAGAATATGGCTGACTTGCCAATAGTATAAAATCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGT:1 - chr3L 16876727 5' - Doc 4577 1 70.55 TATGCATTTATTTGATTAGTTCAAGTCGACTCCATTCACTGCATTACATTCATATAAAGCTCATGTTTGATTTCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chrX 5222970 5' + 412 7102 2 53.42 ATTTGCATTTATAGCCGCGGTAATCACGGGTCAAGTCGCAAATTATATTCAACTCCAATTGCTGACCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chr2R 18722033 5' + 412 56 2 56.16 GCGTCTGCTTTGATGACGATGATGAGCGTCAAACTTGATGGCGAAGTCACACTGCCCGTGAGGAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAGTAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGG:1 + chr2L 16395785 5' - F-element 351 1 53.12 ATAGTATAGTCGAACATTTAAATATTCATATTTGAAATTGACTCTAAAAATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr2L 7215675 5' + 297 8 2 78.08 TGCCACGACTGTTCAAATTTGGACAACAACGCGGGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 22429268 5' + roo 8683 2 70.80 AACTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr3R 8402657 5' - mdg1 396 2 62.70 AATCCGTTGCTTTACATAGATAGCGGAAATGCTTGGCCCTGTTTTCGGTCCCTCTCGATTGCATATGCAGCTACTTTTATCGATTGGCTGAAGTTCGCACTCCTTGCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr3L 12863628 5' + Transpac 4931 2 75.34 GGACATGTGAATAAAAAACAGGTAAGGCAAGGTTTTCCTACTATTCTTTTTGTAAGAGATACTTTTTTAGCAACATGTGTTTGTTTTGTGCCCTTTGAAAATAATTGGTAAGACAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACA:1 - chr3R 8686402 5' - Tc1 1454 1 68.49 TTTAGTATGCGTTTGATTTCTATGTTAGGCCCATTATGAGTAAGCTAAGTATGAATATTATCATAAAATAGAAGCAACTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAATG:1 - chr3L 16001544 5' - roo 444 1 52.94 GCTTACTGAGGAAGAGATCCAGGAGAAGGAGAATCTACGCTCACAGGGTTTCACTGCCTGGACCAAGCGCGATTTCAACCAGTTCATCAAGGCCAACGAAAAGTATTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGATAATCCGCGTA:1 + chr2R 12639473 5' - 412 7378 2 67.81 GGATAGACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:4 - chr3R 15649909 5' + blood 19 2 72.60 GGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2L 17069528 5' + 412 45 2 55.48 CATTTCTAGACACTTATTTGATATCAAGAAAGAATAATAAGTATGAATCAATGCGTAACAATCTATAACTTACTCGATTCAATTGACTATTACTACGATTCCATTTCTGGATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr2R 7404623 5' + blood 11 2 73.29 GTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 + chr2R 8305214 5' + blood 7078 2 64.38 CTGCACAGAAATCATGAATATTTTATTGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr2L 15621848 5' - hobo 2886 1 61.59 CATTTGCAACTCGCTTTTCTATGGTTTTTCCTTTTCACTTTTCGCTTTTCCTTTCCTTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:2 + chr3R 26315895 5' - roo 343 2 60.96 ACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr2L 15965290 5' + blood 7090 2 69.86 CCGAATTGCGATGCTGTCCTTCGGACTTCCGTCGTGGCGTACACGAGTTCCTGGCCACGAACAAAGCGCAACTTGCTCCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr2L 20561507 5' + P-element 40 1 56.94 GAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 + chr2L 17228599 5' + mdg3 48 2 53.42 TAGAACTTACAATATTCTAGCACCTGGAGAACCATCTTCTCTTGCGCTAACTGAGAAAATCCTTTTCTGGCCACAATATCTGTTTTAATTACATTTTGAGAAACAATATAACAAAGAAATTCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAG:1 - chr2L 18970028 5' - TLD2_LTR 157 1 53.79 AGGTGGAAATGATTCGAAGGAAAAATTCGGTTTTCATGACCTGGTTTTGTGTTTGAAAATATCTCGAAATAAACTCGAGCCTAACAAATGGATTTAATTTTATTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAAT:1 + chr3L 4957126 5' - Ivk 211 1 69.18 AAGATAAAGTTCATTCAGCGAAATGAAAAAAGAGTCAGCTAATTTCCCTTTCCATTTGGGAATTATTCGTCTGAATTTCCGTTTGTTTTTGTTTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 - chr3L 5183829 5' - copia 227 1 65.07 ATAGTTTAGATATTAAATTACATGGTTAAATGTGGGATTATAAAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGTCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr3L 19397043 5' + F-element 86 1 68.79 TGTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 - chr2L 3967125 5' + hobo 79 1 74.29 GTCTGTTTGCTGCTTTTAAGTTTGCACTTTTTAGCTTTCAGCGGCTAGCAATTTTCTACTTTCCGTTTGTCATCTCGTCGTTTGTCATCTCTGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 513730 5' - mdg1 7429 2 60.27 CAACAGGCTGCCGAGTGGGTGATGTTTAGTGGGCACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 + chr3R 14097052 5' - transib2 2739 1 73.97 CCTAATGGTTTTTGTGGGATGTTTTAGTTTGTATAACTTTCAATTTTTAATTGGGGAATATAATAAAGAAATAATATCTTCGCTAGGAATTGTCACTGAGCCTTTGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAGATCCCGACGTTCATACGG:1 - chr3L 316696 5' - INE-1 135 1 63.01 TGTCAGCGTACGAAATGAAAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chrX 9951315 5' + hobo 22 1 70.55 AGTGCTTCCAAAAAACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chr3R 31120324 5' + opus 10 2 77.24 CCATGATTATATGTCGGTCAGCCGGCACCGCCCACTTGTATGGCCTCTCCGAGGACATGAAAGTAAGCCCGAATAAATTGGGTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCC:1 - chrX 10590743 5' + invader4 3080 2 58.39 TATGTTTTAATTGGCTTAGTAATCCATCAAAGCGATCTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 52892 5' + roo 8 2 46.58 CAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACT:4 + chr2L 8772727 5' - Tabor 422 2 59.59 ATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1 - chrX 21667933 5' + gypsy2 60 2 66.92 CCATTTGGCCAAAGCTGGTTAGCTACAACTAACTTTTCGAACTTCGATTTCAATCGCAAGTTGTTTTTGATTCGCGATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:2 + chr2L 2357259 5' - P-element 2846 1 57.53 AAGACTCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3L 9426786 5' + P-element 45 1 55.48 ATGAATAAAAAAGCTATACAAGATAACATTGCACATTGGCAATTAAAAATTGCTTGAATATAGCTCTGAAATCAATATGTATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTATC:1 + chr3R 30731351 5' - gypsy6 345 2 56.85 ATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCA:1 - chr3R 6103667 5' + Tirant 8125 2 59.34 ATTAAGCGCGCACATTTTACATTTAAAACTGAATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr3R 13494458 5' - opus 480 2 60.14 ATTTTTCCATTGCACGTAAATCTATCAATGTTATTATTTTTTGTTCACTGATATTCCCTCTCTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGT:1 + chr3L 23270434 5' - invader2 125 2 58.22 CACAAATGCATGTATGCTTATCAAAATTCTAATGCAGACTGATTTTGAAACACATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTA:1 - chr2R 7098037 5' - copia 187 2 67.12 CGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGA:1 - chr3R 10468066 5' + opus 61 4 80.00 CCTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3L 22529813 5' + roo 8750 2 76.71 GAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chrX 13651585 5' + 297 6623 2 55.48 AGGAGCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2R 15062303 5' + blood 29 2 62.33 CGCATAAAAAAATTATAACTAACACTCGGCGGGCGAACAGTTAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGGGAAAGG:1 + chr2R 17100074 5' - P-element 2828 1 38.58 CGATATTAAAATCAAATCTAAAAAATTGCATTTTTTACATAAATATTTTAATATTCAACACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAAT:1 - chr2R 5079290 5' + flea 4813 2 56.85 CAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGAGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:2 - chrX 9816466 5' + jockey 79 1 64.38 ATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGG:1 + chr3R 11461779 5' + 17.6 72 2 69.86 GGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCA:1 + chrX 16244907 5' + jockey 4839 1 70.55 GTGTATGTGTAATAAAAATACGCTAAAATGTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr2R 13628467 5' + jockey 95 1 75.34 AATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr3R 24228856 5' + opus 7164 4 52.74 TATCTACAAAAACAATTTTTACATTCATATTGCATACACTTTACTTGTACATACATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 + chr2L 1229581 5' - opus 434 2 65.07 GCTTTATAGAATTAATATTTTTATACCAAAATTAATTACCTTTAGGAAAATATAAATTTAAATAAAAATTAACATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr2L 17162750 5' + blood 48 2 52.74 TATAAGTTTGTTAGTTTCAAAACGAGTAATGAGACTAATGATCAAATAACTCTATCTGTAATAGAGTTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGTGCTTACAG:1 - chr3R 20909020 5' - I-element 5292 1 53.42 AGTTCGTGCTGGACACTATGGAGCTCTTGGAGCAGATCGAACAGCCGCTGGATGGCACTTACAACCTGCAAATGTCTGAACAGCACAGGCATCCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGG:1 + chr3L 13969815 5' + G-element 3915 1 62.33 GCACGGAAGTTGACCATGGCTAAAAAAATGAAGCAATTTAAGCCATCGACATCAAGCTAAACAGAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTGTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCTTCGGCTCACAA:1 + chr3R 22048479 5' + Doc 397 1 52.17 ATACGGCGTTTACGGTGCCAGGAAAGGGATTGTTCCAATGGAAAGTGATGCCATTCGGACTACACTCAGCGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTC:1 + chr3L 25232695 5' - accord2 204 1 80.28 AAAGCAGCGCGCGAGCAATGCAACGGAACCTAATCCAGGAGTCAGCCAACAAAGGATCTTATTGTTTGTGTGTGTGTGCGTGCAGTCGCATGTGTGTTGGTTCGCTCTATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 + chr3L 5438684 5' - hopper 1402 1 73.29 AATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1 + chr3R 11121715 5' + copia 4947 2 71.23 CCGAGATACAAATGTAGAGATACAAGTGCGTAGGCTGAATTTTTGATTGGCTATGCTGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr2L 14969973 5' + Tirant 8175 2 60.96 AGACAACGCAATGACCAGTTACAAGCGACCATATATTCATATGGTATTCTGGGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chrX 14692938 5' - Transpac 5163 2 66.44 GAAGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:1 + chr3R 16535261 5' - Stalker2 375 2 57.04 GCTTGTATTTCTCCTTTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2L 15920172 5' + jockey 74 1 62.33 GCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCCGTTGGTCATTTTAT:1 + chr3L 9375810 5' - mdg1 373 2 51.03 ACCTACGTGAACAAGGTGCTTGACTGGAAGGTTAAATACGACGAGTCCGAGAACCCTGTTATTCGTGCCTCCCGCCTGCTGACCGATAAAGTGTCTGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGCCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGC:1 - chr3R 19155714 5' + roo 169 2 65.07 GCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGA:1 - chr2R 5900914 5' - Bari1 1633 1 69.86 GCGTTCTCCAGTCCCCGTGGTTCTGGTTCATGTGGCATTCCGTACGGAGAGTGTTGTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTG:1 - chr3L 4286356 5' - I-element 5099 1 61.64 AACAAGATGCGTATACATTTCGTTTTTGACGGCTGCTCTCGAGCTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 27502994 5' + hobo 31 1 64.38 CCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 + chr3L 20747100 5' + Burdock 68 2 67.12 GCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTA:1 + chr3L 21097118 5' + mdg3 64 2 59.59 ACCTACTGACAAAATCGAAATGGCTCATCAACTAATTTAATGCCTAAACCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 9649212 5' + roo 33 2 61.64 AAACATTTAGGTGCGAAAATTTTTATAGATCTAAAATGGTTGTTATCCATACTATACATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATATATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 + chr3L 15891010 5' + mdg3 5317 2 61.64 GGTAACACCATTTCCGGTCAGATGATTCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 9332112 5' - roo 9022 2 53.42 AGTGAACTATTAAGTTTTCGGAAGTAAATAGTTCCTGTTCACACATGAACACGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGG:1 - chr2R 4551446 5' + roo 248 2 61.65 CAAATGTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 - chr2R 22867490 5' + hobo 84 1 76.03 CGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 - chr3R 25271249 5' - 412 407 2 79.45 CGAAAATTGTTTCATTAGCATGAGAAAGAAACAACAACCGAGCTGAAAATCCATCAAGTTTCCGCTTCGAAGGAGGATAAAAGACAGACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACA:1 + chr2R 14524469 5' + Doc 191 1 58.90 ACGATTTTTTTCTCCGTGCAGCAGGGAAAAATATCCGAAATATTTCTGCAGCTTAAGGTGGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 + chr2R 23225776 5' + Transpac 4977 2 58.22 GTCCCTGACTTCTTGGCAGCAATGCAATGCCACTGCAGACTGCAGTTGCAGATACATTGCACGATAAAGGGATTCATGTTAGCTTATAGTCAGTTTGATTTTGTATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTCAATCAACTCCAGC:1 + chr3R 6774791 5' + springer 7321 2 52.78 GTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 25271153 5' + 412 41 2 58.22 TAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3R 18524224 5' - opus 461 2 60.00 AAAGTCCACTAACAGCTCAAAATTATCACCATTACACTTATATATTTCCTCTTTTCTGTGTTCTTTTCTATATCGTGTCTATCCTCTCGCTAATCGAGCCCCTCGGTCGGTTGGGAGAGAG:1 - chr3R 3625244 5' + Cr1a 4419 1 69.42 CCACTTTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr3R 5765449 5' + opus 7153 4 58.27 CTGCACCTAGTTCTTTCAAATAATCATTGCCCCAAATTGCATTAAAAGGTTTTAATGTGGGCAACAGGTCCTGAATATTAAAGCATACTGACTCCTACTGAAACATCGTTGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2L 22746196 5' + 1360 10 2 78.62 GACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCGGCCTCGAGTACTTCGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 15035122 5' - pogo 2033 1 67.81 ATGATTTATCCAAAAAGGCAACCGAATGCTAATAAAATCATCACAGACGCCTTGCCGTTGATAGTCACAATTGAGTCTGGCCAGGGATCTATTTGAATGCATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 + chr3L 20747046 5' + Burdock 6150 2 76.03 GACATTAATTATATGCAACTTAGGTATAATACTTAATTAATTTACGTTAATTCCCATTTTGGGGGACATTGAATAATATTAGGATTGCAATTGAAACTTGAATTGAAAGCCAACTTGATTATAACAAATTATAACACCTTGAGGTA:1 + chr3R 27259812 5' - S2 1444 1 73.97 GAGAAATGCCAAAGAACTGAAGAGAAACCCAAAATGACATGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3R 27786636 5' + Tirant 8120 2 56.41 AAATTATTAAATGTTTTTTTTTTTAGGCAGGTTGGATGGATTATTAGGACCATATGGGGTCTCTCTTAGCAATAAATTTTTACTCTCTCAACGGAACGGGTCTTTTTGTTTTTTGGCACTT:1 + chrX 16125728 5' + Tc1 161 1 78.51 GGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 - chr2L 17730503 5' + pogo 85 1 76.03 GGCTGCAATTTCTGATGTTGTTTCATTTCTTTTTCCCCCTTCTTTCAATGTCAGTTAATGGGAAATCATTTATCATGTGCGTGTCCCTCTAAGAAAATAAAGAAAAGAAGAGAAAAACCCGCGGTTCTGAGCGTCACGGGGTTGTT:1 - chr3L 8037829 5' + Rt1a 126 1 76.71 CCGTTTCCCGTTTTTCACATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3L 16887394 5' - roo 8996 2 68.49 TGGCCTTTTGGGCTGACAAACTGCAGCGGCGCATGGAGGCCGTACTCCTATTTCTATTTTCAAATGCCATTTTAGCGGTGGATCCAAGCGTACCTTCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGT:1 + chr2R 19981863 5' - invader1 96 2 60.27 TATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAATATTAAGTAC:1 + chrY 680457 5' + invader2 4908 2 77.40 CGAATCAATCCAAAAATATGTTTCGATGAATGCAAATAATAAAAAAAAGAAATGCTCAGAATAATCACAAAAACCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAAACATTCAACGAAACTATTTAAAA:1 - chrX 11961101 5' + Porto1 4417 1 72.60 AAATAAATTGAAGATATTTTATTTTTCGCTTTTCGATTCGATCAAGGGGGTCTACGATTTTGGTGGCTGATAAAGGGAGGTAGGGGTGTGTATAAATTGGAAATGTGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3R 28008377 5' - hobo 2928 1 71.92 ATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCAATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3L 15261380 5' - pogo 2058 1 56.16 GATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 - chrX 8200307 5' + flea 4804 2 53.42 GTAAAGCCACAACAGAAACGAATAAAACGCTGATCCGAAAACATAAATCGACCAATGGACGGTGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGAGCAGGTCCCTCGCCGCA:1 + chrX 10728770 5' - springer 7506 2 73.97 TCTTAATGATTTATTTGATTTAAAAGATTACAGATAATAGAAGTGTAAGGGCGATTCAGTAATGATGCTAAAAATATAACAAGTATTTTTCAACGTTGATACAATTTAATTAAAACGAAACACATTGTTGCGGTTTCATATTCGTA:1 - chr2R 4749677 5' - gypsy2 126 2 76.71 GGGGAGCCGGAAAGCGAATTGCGCGACGAGTTGGTATCATAATCCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chr3L 9430649 5' + P-element 75 1 33.79 AACTGCAAGCCGGAAGATAGCGGAGTAAACGCCAGCAGCACGTACAGTTCTAATAAGCTGGAGATATTGTATTTGGTAAGATTAACAATGTAACAGAAATGAGGGCAAATCCAGGACCCCCCGCGGTATGGCCGTGAAGCATTGCT:1 + chr2L 15529117 5' - Rt1c 5331 1 52.05 CTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAGCTCAAAACTCTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr2R 14385559 5' + jockey 65 1 56.16 GCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGGTT:1 - chr3R 23507670 5' + 412 66 2 61.38 TCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3L 9242004 5' + roo 8739 2 73.97 GAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 - chr3L 21093261 5' + Ivk 34 1 62.33 GAAACGGGACATCACAAAGCAGATGGATGCCTCAACGCTGGAGAAACTGAATAAAAAGCTCAGTCAGATCGAAAGCGATTCAGCAACCAGTTCGCGAACCGAGAGCACGAATCATAATATTACAAAATAAATTTCAAAAATGACTA:1 + chr3R 4930310 5' + 1360 372 1 73.29 CTGCCAAAGTAAATACCTCATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:2 - chr3R 20137377 5' - Burdock 220 2 60.27 AAAAGCAGCATATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2L 17069503 5' + 412 20 2 72.60 GCGCATGGGCGAGAGAGCCAGAGAGAGCAAACACAGCTCTGCTCTCGCACGAATGAGAAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr3L 20785414 5' - P-element 2863 1 66.44 GACAGTGTCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 + chr3R 20137226 5' + Burdock 38 2 58.22 CAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr3R 15649871 5' + blood 15 2 65.38 ATTAGCTAGTATTGCTAGTATCAACTTAATCGCTGTGAAGCACATGTGCATCGAAGATGCGGCAATTAGTGGCAACATCCCAGTTTGAGTGCCAGGAAGAGGCAGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCG:1 - chr2R 9033980 5' + F-element 4506 1 69.18 TGAGACCTTTAATTGTGCTTAACAAGCCAAAGATATATTTCATTAAATACCATTATTTTTAAAGTTTTATGTTCATAAATTAATATGTTCATAAATTTGGTTAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 - chr3L 17667665 5' + F-element 35 1 55.48 GAGTCTGTTTGGCTGTACGCTAATTGTTCATATTCTTTTTGTTCATTACCTGCGTTCTGGTCATTGCTACTAGTTGTAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAAC:1 + chr3L 25190045 5' + 1360 118 1 81.51 AATATCGTTTGTATAGCGTGCTACCAAAGACACTAGACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACTGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAAT:1 + chr3R 4913588 5' - 1360 97 1 75.34 CGTCACGACCCCGGCCGCCCCGCCTCGTCCAGCAACCCAACGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 - chr3R 31071879 5' - opus 7459 2 52.74 AAGCGTTAAAATCTATATTTAATTTCTTGACGTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTC:1 - chr3L 15322073 5' - Transpac 337 1 71.01 TTAAAAGGATTTTGTCCATTACCGCTATCCCCCGGCACAGGCTTCCAGCTACGTCTTCCGCTTCAGCCACAAATTTTGCGGCGGCAACAGCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGGAGATATGAT:1 - chr3R 31907473 5' - Tirant 375 2 68.75 AAAAAAGTTGACCACTGAACAAACTATTTTTTGTTGGTGTCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATATGCGC:1 + chr2L 12261175 5' + jockey 80 1 67.39 ATTTGTTACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCC:1 - chr2R 5924457 5' - jockey 4731 1 52.74 CTCGATCCACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 25271133 5' + 412 7073 2 72.41 GGTGGTGGCGATAGTGCCGCGTCTATAAGCAATTTCGCGAACAATGACTAAATTTCGGGAAAAGCGAGCGACTTTTGTTGCTGTTGTTGTTCCACTGCTGTTGCATCTGAACGATGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAG:1 - chr2L 11496263 5' + transib2 133 1 75.34 AGCATCACCAGACAAATCGCAAATTAGACTTCCAGATTTTAGAGCGTTTGCTGGATCTAAAGATTATTTTTTACGTGTTTATTCGTTATTTATTCAACATGATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 7534545 5' - roo 9053 2 73.29 CAACTGATTGGCCAAACGCACAAAGAAAACTAATTAATTATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2R 13276545 5' - roo 8988 2 76.03 GGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2R 7223643 5' + blood 7061 2 52.74 ATTTTATCTCAGTCGTACTCACCATCATTATAGTTATCTTCGATAAAAGTTGATATTAAGCTACTATGGATTTGGAGACATGGTACCGATAGAGGGTACAGTAAATCAAACAGGATACCTCCATATCTTAAATGAGCACGCATTGA:1 + chr2L 21586378 5' + Bari2 863 1 60.96 GGGCGTTTACATTGTTAACGAAAGGCACAACCAGCACCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCT:1 + chr3L 6630346 5' + jockey 4755 1 74.66 AGTGTGAGTGCGCATAAAACATTTCGCAGACAGGCCATAAAACGGCATTCGGCACGCCTGCATTTTAAAAATATCGTTTCGATTGGCCATCTTGTCCTTACGAACACTCTTCATAATGGTGACGATGATCACGGTAGCCCCAT:1 + chrX 5241924 5' - Rt1a 4708 1 50.35 TAGATCATATCGTCTAATATGCAGAAAAGTCGAAAATCAAACGGATGAAAGTACATATGTATGTACACATACCTCAATTATATCCTGTACTGCATATGCACCAACAATTGTGAAGCATTGAAGCATACATAATACATACATATATT:1 - chrX 19890681 5' - Dm88 4366 2 65.07 GACGATGGCCATCAGCCAGAAGGGCAACAGGTTCTGAAAACAGACTCAAAGCAACAAGTTGACTTGGCCAAACAATCCACTTTCAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCC:1 + chr2L 11903227 5' + Quasimodo 107 2 58.90 CAAGCGCGCTACTCGTGTTTTTTGCTGCTCCCCCAAGGAATTCCGGAACCGAAGAGATCGGCGACGGCGCGAACTCACTAAACTGAAGTACATATTTTTTTGTGAACACCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTG:1 - chr3R 14724200 5' - 1360 158 1 76.03 AGGTGAATCATTCTACTCCGTATTAAATCCACAATTTTTCGGAATATTTCCTCATCTAATCTAGTTTTAATAGTTTAAAAGTGTATTAGAAACAAATTAACTTGGGGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGC:1 + chr3L 21094252 5' - Ivk 319 1 70.55 TTCAGCAGTTTTTCCTGGCATTTATGCACTTGCTTCTAGCTAAGAAGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 - chr2L 17069631 5' - 412 7473 2 70.14 ATATTGTTACGTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 + chr3L 20925754 5' + Transpac 4984 2 58.90 CTTCGTAATTTTTTCGATTTGATGCTCAATTTAATGGAAAAGGGAAAATACAAAAATTAAGCTAATAATGCAATGGGACTTAGCTCCTATAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 - chr2L 17228746 5' - mdg3 218 2 65.75 AATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chrX 14908487 5' + blood 7059 2 52.74 AACTTTACAAAATTCAATTAACCGCACGGGTTTAACCCAATTAACTCTGAGGTTTTACTTTAGAAGTTAGTGGAGTATTACCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 - chr2L 8772846 5' + Tabor 6880 2 57.53 GTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGC:1 + chr2R 19076538 5' + F-element 239 1 66.44 GTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAAAAGCCATTTTAGTGAATGGATATAGTAGTGTAAGCTAGCTGTTTTACGACAGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chrX 16243793 5' + 412 16 2 72.92 ATTTGGGGCATAACAAATATTTTCAGAAGGATATTAAAAATCCTAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr2R 9867103 5' + roo 8741 2 72.60 AGATTACAAATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTC:1 - chr3L 14043667 5' + Ivk 14 1 76.03 TATATCAAATTAACAAAAAAATAAATAATGCCGTTGTCCACTTATCAAAATCGTTTCGAATCTTTTATTATAATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 12363277 5' + jockey 57 1 52.74 TAGTTATTTTTAGCGAGTAGCACATAAAATGCGTCAAATAAAATTTAAGCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2R 8305155 5' + blood 7019 2 78.77 GAAGTTGAACTGGAGGTTTTAGGATGCCTTTGCTTTATCCTAAGTGCACACTTATTTTCGCATTTCCTGGTACCACTTCAGTTTTTATTTGACCGATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 - chr2R 22692466 5' + Ivk 28 1 65.07 AGTTTCACTCATAAATCAGTTAAAGCTCGAGGGTAAATATTTTCTGGAAAGAGCTTGACAAATTGGATAGTCGTTTACTAGCTGATTATGACATTTACATTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAGTCACTCGCGAAGCGAACGG:1 + chr2L 18613807 5' - Cr1a 127 1 66.44 CCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr2R 4939196 5' - 1360 3364 1 33.56 AGACGCGGGTACGGGTCCTACCATCCCACCTAGTTTCAATGTGTGCCTTTGCCCCAGCCTCTATCTGGCAGTCCATGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr3L 18708549 5' + F-element 22 1 76.71 TTTGTCACGCCTGATTATTTCATTAACTTTACGATCAAACTCCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr3R 21287301 5' + Doc 88 1 76.03 ACTGTATGCAAACACTGGAAAAAATGTAGCTTACTCACACATTTTCATTTATGAGGTAAAGAAATTTTAACTAATTTTTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAA:1 + chr2R 19904002 5' + Doc 4459 1 50.00 CATCACAATAAAAGAGAAGAAGAAAAAACACACAATCTGTGGGAGATCAGTGCAATATCAGGTTTGCTTAATTAATTATTAAATCAAAACATTTTTATAACTTATTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chrX 10101274 5' + mdg3 5269 2 73.29 GCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 + chr3R 31907356 5' + Tirant 69 2 73.48 GGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTT:1 + chr3L 27356091 5' - Tc3 1626 1 72.60 ACTTAATACGGAAGAGTATAACGAATTAAAGAAACTTTGTTCAAAACTTTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCCGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGT:1 - chr2L 23388748 5' - 1360 3262 1 65.07 TTGTAGTCACAGTCTGTTAACAGATGTTTACATTACGCTGGCGGCAATACAAAAAGTAGCCTCTGGACATCAATTAATGGATCTTAAATTAGACAGAAGAAGCAAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATG:1 + chrX 11447466 5' + Tirant 8185 2 73.97 GAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr3R 29708950 5' + blood 47 2 51.37 AGGGAGCCAGCCCAGCAGCAACAATGTTGACGTTAATAAATTATAAAATGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAG:1 - chrX 9710064 5' + pogo 69 1 69.18 AAATATAACAGAAAATGCTTAAAATATATAATCAGAAAAATTTTTTTTAATTGTACCCAAAATTTAGGGAATAAATGTGACCATATTACAAGTTGACTTTGTCATAATATCATCCAGTGATGGGAAAAAAAAATTTTTTTAAAAG:1 - chr2L 11856364 5' - FB 406 1 87.59 ACATTGGCACTTGAACTCCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAATGGTTTTATT:1 + chrX 17614361 5' - roo 9033 1 56.83 GAGTGCCCTTTTTATTGATATTGATATGAAATAAATAAATTATACTATATATCTTATCAATTTTCAAAACATATCATTCTAAGCACCTGCTATCAGACTGCTGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAA:1 - chrX 3187276 5' + Tc1 488 1 68.57 TAATCAGTCGGAGTTTTTCAACTTTTTGCGTGCACTCATTAAAATCCCCTTTAGAGAGTGAATAGAGTGAATATATGAAATCACATATATCACACGTATTGTTTCAGTCTATTCTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTCGATTT:1 + chr2L 7700947 5' + 1360 3261 1 50.00 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGGGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCAC:1 - chrX 12649915 5' - blood 7102 2 91.67 TGGCATGGCTCTCCAATTTCTTTTAGTGCACCTCTCTTCGTTTTTGGGGCCATAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 15590567 5' - roo 9006 2 62.76 GGAACGTTGAATGTAACTAACTTCAATGGATGCTAGAAACTTCGTTTCTTTTTTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chrX 14692812 5' + Transpac 4951 2 64.38 CATTGCTCAGACTTGTTTTCAAAAAAGAGTGTCCATAAACATTAAGAGCATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr2R 18123510 5' + pogo 67 1 63.70 AGTTTTTTAATATCTAAGCAAAAATTATCCAGATTGCAAATATGTACATACATACATATGTATTTATGTATATACTAGTATACTTTTTATGAGTCTGGCGATTTTGCGGTGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 13762500 5' + P-element 10 2 78.77 ATAAACTTTTAAGATGGAGCTATTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 - chr3R 14097151 5' - transib2 2788 1 56.64 AAATATTCTTGATTTTTATTGCGTTCGCTCGCAAGTGAAATTGCTTCAAATGTATTTGAGTTTTGCTTTCTTTTTTCAATTTTTCCCCCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 + chr3R 22228075 5' - mdg3 160 2 63.70 ATATCGATATTTAAATGATAACTGCCTCCGATCCGGTAAATTGATTGATTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATC:1 - chr2R 11656103 5' + HMS-Beagle 70 2 67.12 AACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTC:1 + chrX 3452445 5' - Tirant 8426 2 76.26 AATAGCAGGTAGGCGTCGGCAGAATGGAGCGAAGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 - chr3R 5087096 5' - P-element 2817 1 35.42 ATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2L 20984282 5' + blood 44 2 52.74 AAAACGAGAAATGCGAGTTAAAAAAAATGCGTTAAACTTTATTGCAAAACTATTGCCAGACAAGTGGCATCAAAGGTTGGGGGAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGCATATGCCTATATACTAATACACTTACAACATATACAC:1 - chr3R 19186886 5' + Idefix 48 2 52.05 TCGTAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2L 2519926 5' - roo 9034 1 58.90 ATACTAGAACCTAATCGTTCACTTTTTAATTGATTTGATTTATCCATTTATATAACAAGAGTGTTTCCACTGAAAACCAAGTGTCGGAATCGCATCTCCTACAATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 + chr3R 7884496 5' + jockey 4779 1 71.23 CTGTACGAAAAGTTTATAATGTGTGTGTTTGCCTATCGAGACGAACACCTTTTTTTCCCAAATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTT:1 + chr2L 10034080 5' - hobo 2624 1 58.22 ATAGGTATTAGATCTTTCCATACTTCTACATTGCAGCCCTGATTAAAATGCAACCCTAGACCCTAGATCGATAAAAATGGAGCGGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGAAATGCATTATTGTG:1 + chr3L 24153116 5' - Tabor 481 2 80.82 GCCCACTCGACTGCCTTCAATTGCCAGACGGGGCGTATACGCAATTTAAAGAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3L 20290766 5' - roo 9003 2 65.75 GGATCTAGGCGATATGAGAGATGAACGTTGAAGGACTTGACGCGACTTGATTATAATTAGACGCTCCCACTTCCCCCCGTTCCCACCACATTTGTATTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr3R 9993318 5' - hobo 2928 1 77.04 AAATAAAGTTGCAAGCAGCAAAGCGAGTGATTTCCCTATCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 + chr2R 6579517 5' - mdg1 340 2 73.29 ACAGAGTCTGTCCAAGTGTCAGGTTATTTCCTCCAATGTATATCCATAACGTGGATTCAGTGACGACCTTAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 + chr2R 1277036 5' - Tirant 8459 2 55.48 TTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chr2L 2464197 5' + pogo 54 1 56.85 TGCCATGCAGGACGTTTTTCCCATTAAGAGTCATTTCGTTTTCATTTTTCACTTCCTTTTGCAAGGAAAAAAAAAATAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr3R 14527098 5' + 297 34 2 60.27 TAATAAAGCAGGTTCCATATCCAAGGCGTATGTTGTTTTTGAACTGAATCCAGAATCCTGGACTGTTTGCTTATTAACAGTCTGGTATGAACTGCAATGCACGCATCTTATACATACATATATGTCTGAGTGCGACTCTTCGCATT:1 + chr2L 22643323 5' + invader4 3 2 54.79 AAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr3L 5183677 5' + copia 4911 2 56.85 GAAAATATAATTTTGTGGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:2 + chrX 983108 5' - 412 7498 2 52.05 ATATGAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 14088520 5' + 1360 26 1 68.49 AGGGGAGTTTAAAGTTATTCTCGTGTTAAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:2 + chr3L 3540083 5' - mdg3 221 2 68.49 TCAGCATTAACCACCCTTAAGCTTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 + chrX 19231698 5' - mdg3 5478 2 71.92 CCCCGATCCAGATTGATTTCAACATATTAACCAACTTTGGAACGCTGAAGGCCACGAAATACTCGACAACTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATAGTAAGGATGGGTGTATGAATGTA:1 - chrX 4826953 5' - mdg3 86 2 52.74 AATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCATGCCTCTAAACAAATC:1 - chr3R 6103668 5' + Tirant 25 2 55.56 TTAACGAATGCAATTGCATAATGCCGCGCGCACCGAGCAAATCATAATCATAATCATTACGCATACGCAATGGTGTCACTTTACTGCTCAACATTTCAATTTCTTGACTAGCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTC:1 + chr3R 9901494 5' - R1A1-element 205 1 68.49 CCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 + chr3R 20292424 5' - pogo 2037 1 65.75 CAATTCATCCGCCTAATAATGGGCATATTGCGAGTAACTATTATATCATATATAGATGTTATAAAATTGTAATACAAGTTTAATGCAAATAAATTAAAAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2R 9815167 5' + pogo 17 1 73.97 ATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATTAACATAGGAACTATTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 - chr2R 969221 5' - mdg1 7388 2 67.12 GGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGCCTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 22481241 5' - roo 8998 2 71.23 TTATTAAAGATCCAAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr2L 2464327 5' - pogo 2059 1 57.53 TATAAAAAGGCACACAAAACAGGCTGCGCAGACGTAACATTTTCCCAAGAAAGTATGCAGTACTTTATAAAATGTGAGCAACGTAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTGTGGCACACGATTT:1 - chrX 7293337 5' + 1360 36 1 60.96 ATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 4869271 5' + roo 8707 2 55.48 ATAAGAAACTAATTTCGAAGAAACTTAAATATTTATCAGCGGTAATAGATGATAAACGACTAGCTTCTATATATTACTGACAACTGAAGTTGATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr2R 16712921 5' - pogo 2084 1 71.22 GTGCGGTGGTGATGGTGATGGTGTTGTTGTGCTCATAATTTCTGTTTCGATTTATGTGCCAAGTGTCAGGCTGTCAGTGCAAATAGCAAAAATGAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGC:1 - chr2R 17328393 5' - 297 6871 2 64.38 GGCTGAGTAACGGGTATCTGTTAGTCTGGGAATTCGACTTTAGCATTCACTTTTGTTATACCCCTTACTCTACGAGTAATATGCTCTACGAGTAACGGTATAACAAAATTATGAAACTTTGCGTTCGTATTCCCACTAGCTGAGTA:1 + chr2L 16936422 5' + INE-1 532 1 68.49 AGCACGAGGTCAGTAATGGGAACGAAAACGAAAGACTTTGGCCACAAACTCGAATTCAGCGATGCGTTAAACTAGCAGCGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTTTGTGGAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 + chrX 3452399 5' - Tirant 359 2 57.93 AAGGCTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr2L 15833086 5' + hobo 65 1 62.33 GTTTCCTTTAGCAGTACCGACACCATTAATGGTAGTTCGGGTGTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1 + chr2R 15062185 5' - blood 7326 1 68.70 AATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 + chr2R 18123448 5' + 412 7142 2 78.08 AAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGAGAGAGAGCGGAAAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTCATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAAT:2 + chrX 14317415 5' + 1360 199 1 80.14 GTACTTCGGTTTAGAATTTTTTTTTGCTTTGTTATAAACTTGGCGAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAAT:1 + chr3R 27845484 5' + Stalker4 77 4 69.18 GTTTCTCCTATGTTTTAATTGGCTTAGTAATCCATCAAAGCGATCTTTAAAACTATCCCTAAAATAATAACGAAAACAGTTAACAGAAAGTCACTCCCTTCACTCCGCTGGCATTGCACGATAATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3L 52884 5' + roo 8664 1 52.05 AATTATCAATATATTAGACCAACTAACTTCTTTTATATAAACTTATTTCAAAGTGTATCTTCATCGCCGACTCACAAACACACAAACACACAAGTAAATACGTTCACCCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 - chr3R 8705864 5' + hopper 12 2 77.40 CAAGTGGGCGTCCAAAGACAACCAGACGATTCCCAGGATTCAAGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTT:1 - chr3R 28033670 5' + diver 80 2 70.55 CTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 + chr3L 5183673 5' + copia 38 2 59.59 GATGCATTGGACACCTTGAAACATCAGTCAGCTCCAGCAATCCAGTTCAGCAACATGCATCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGCGCATTGCTCAAAAACA:1 + chr2R 14747337 5' + roo 8782 2 58.22 AAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2L 4104087 5' + roo 8736 2 67.12 TTATAAACAGAAGCTCAAAGATAAAATCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTACGAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGT:1 - chr3R 2916526 5' - BS 4884 1 87.67 CGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGGGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATC:1 - chr2R 5900901 5' - Bari1 1620 1 77.40 GGAGGCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACGGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 10142917 5' + 412 7100 2 50.68 AGGGGGTTTTCTCATGCGCAGTACGGATTTTCCGGATTGATTTATCAATAGGCTTAATGTAATAATTTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 + chr3R 15649759 5' - blood 7335 1 54.11 ACCTTTCCTTTAAGATACTATTTTTTGACCTCGTTCAATGGCAACGGTTTAAGTGCAATCAATCATGAAAGTGAATATGCTTGAAATGCTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3L 11196306 5' - pogo 2073 1 66.44 ACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGATATTATTATTTGAAAATAGATTAGA:1 - chr2R 4206658 5' + 1360 320 1 72.60 GTGCTTAGCATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 - chr2R 9072964 5' + Burdock 48 2 52.41 GAATAAGAGTTTAAAGCGACCGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 + chr2L 8542759 5' + P-element 101 1 15.07 TAAGGTTTTTTTTTTAATTTTTAACAAATAGAGAAAAAATGTGACGCTTTAAATAGTAACTTAAGCTTGTTCAACTTGCTATCTACGTTGAAGGTAAAATAAAATAACCCGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATA:1 + chr2R 14884207 5' - mdg3 5485 2 76.71 AGGTATTTGCTATGCCAATATTTTTTTGCCCCTGAGCTACTAATTGGTACATAATGTGATAGTTTCGTTCCCCTTCACTTTGAAATTATTTCTCGTTCGTTTCTACGGAAACCTCCAAGCCCTCCAAAGACCAGAGAGCGCACTCG:1 - chr3R 1025234 5' + Doc4-element 111 1 56.16 ATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTTTGCGAGTGTGTTAGTGTGTGCGTGTGTGAGTGCGAGGGTGTGTGCCTGGGATATTTATGTGTGTGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr2L 17747547 5' + Tirant 8124 2 72.22 ATTGGGTCCGCAAAGTAATTTGTTTAGCCTCCACCGTCGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCTGCCGTTTACAGAAGTTAA:1 + chr2R 14553174 5' - mdg3 5495 2 78.77 CTTTAGCTTAAAGGATATAGAAAACGTACCACATCTCCTTTGTCCCACCATGATTTCATGACTGAATTCTGAAAGAAGGATCACATTAATGTTGATAGGCACATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGT:1 - chrX 11815124 5' - flea 4988 2 75.34 GTAGATTGCGAAAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATA:1 + chrX 21639641 5' - Tirant 314 2 77.40 CTTTTACAATTTCTTCCATTATTTAGCCCCAACTCCTTAAGCTTTTATTACTCATTTAAAAATAAATTTGCCAGTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 2464187 5' + pogo 44 1 59.59 TATGAACCGCGAACAATACGCGGAGCCAATCGAATCACACTTGTTAAATTGTGGTTTAATTTGTGTTTTGTTAAGCCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 + chr3R 22659894 5' - 412 7501 2 54.11 AAAATACGTAAGCGTGTTACGTATGCTCGCTTTTGGCCATTTAAAAACAATGGCAAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACA:1 + chr3R 10791687 5' + Idefix 60 2 61.64 TGCCAAGAGGTGAAAAAAGGAAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr2L 15965324 5' + blood 7056 2 54.79 AGCTGTTGCCGCATATGACGCCAATGAGCAAGGCGTAGTCACAAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3R 20294575 5' - pogo 2088 1 57.53 ATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGT:1 - chrX 14815844 5' + INE-1 100 1 75.34 AATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAATTCCAGCCGATGCACGATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - chr3R 12780918 5' + hopper 5 2 80.28 ATGCGCAGCCATCTAACTGCAGTTCCAATGGAGCAGAGCGAAAGCAGCCAAGGTGATGGAGACTTCTGGGCGTTAAAACTCATTGCCCGAGCGATCCGATCGCACAGTTGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:2 + chr2L 10032593 5' - hobo 2928 1 76.03 TCAGACGAATCAGCCCAAAAAAAGCGGAGAAGGCGAAAGCTAAGCTAGTTTGAAATTGTTTTGATTCAATTATAACGTTATAACGTAACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCGTT:1 + chr3R 7569568 5' + Doc 23 1 39.23 AAAAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:3 + chr3L 4639059 5' - roo 9019 2 56.16 ATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1 - chr3L 24153275 5' + Tabor 6898 2 60.96 ATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr2L 18581277 5' + roo 68 2 64.38 ATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCACTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr2R 15392795 5' + blood 7075 2 62.59 AAGTGGGTTTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTAAGTGTGTTTGCAGCTAATGAATTTTAATTGCTTTTATTAAGGCACAAAGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:1 + chr2R 20913093 5' + 1360 43 1 56.16 TAAGTAATTAAAATGCGACTTTATACATGATTTAATGTCCTTCTAGTATGAAAACCCTAGAAATCGTGTAACAACCATCATAACTTAATAATGCAACAGCAATCACAATAGACTCCAGATAATAAATAATAAATATTGTTATACAA:1 - chr3L 18297068 5' + Juan 4064 1 75.34 CACCATATGATCGGGGCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACT:1 + chr2R 10478633 5' - invader4 3065 2 70.55 ACGTCAATCGCATTTTTCCATTTCCATTTTCTATGTCCAAAGCTGTTCATCAAGTATTTTTGTTTTGCTTTTTTTATACACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr3R 8112068 5' - 297 6935 2 58.22 GTGTGCCAAAAAGGGGACAGATTGGGGAAATGTCCTGCGGATTGGCCGTGTTCAGTGGCCATTTTGTTTTCACATTGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2L 17730546 5' + pogo 42 1 58.22 CAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2L 1073920 5' + Tirant 34 2 53.27 TATATTTCCCACATCTGGCTGGTCAATGGTGTTAGTACATTGATCCCGATGTCCAGGAGTTGCCTTCTCTAATTTGACAAACTCTTTCTGCGCTACGTGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTG:1 - chr2L 8397288 5' + roo 23 2 70.55 CATTCTTATCCGCAAGATGAACCTTTTTTCCACTCGACTGAATCGCCTGCGAAATGAAAAACCACTCGAGTTTCTCTAACATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 - chr3R 29709087 5' - blood 7349 2 56.16 CAAAACGGTCGAACTGGAACTGCAAGGATATACAAATGTGTTGCATCATAAAAAATAAACAATTTTCTTCCGAATAAGGGAACATTTTTAAATTCAGTAAAGTAACCAAATTGTCTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAAC:1 + chr3R 10852541 5' + Transib5 85 1 66.44 TTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTA:1 - chr2R 10453491 5' + mdg3 5271 2 57.53 GAACAGGGCTCTAGGGATCTACGCATATGTAAACTTCCATATTCAAATTCGTTTCGCCTTTGCCTCTCATTTCGTTCAATGCGATCTGCAGTACTTTGTTATTGAGTCCGAGCATTTGTGTAATATGTGGACTTAGAACAATGAAT:1 - chrX 772903 5' + Doc 197 1 78.08 ATGCATGCGTGCGAGTGTCAACCTCGCCCTCATCGTCATGCACTTGCGATATCAGCACATGTATCTTTGTATCTATGTATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTG:1 + chr2L 15139455 5' - BS 4785 1 60.27 ATGTACATACATATATGAGTGTATATACGAATATATCTCCCTTCCTCAACGCGAAGCGCCGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 + chr3L 21097068 5' + mdg3 5266 1 76.03 TAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chrX 21668699 5' - mdg1 377 2 48.63 AACTGATCTTAGGTTCCGTGTCGAGGTATTCTAAAGTGAGTTATTTTGTTGGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTACACCCTACTTGCG:1 + chrX 18149803 5' - hobo 2868 1 63.01 AGCGATGAGTTGGATGTTGCCGCTAGCTGTCGCTAGGTGGCGTGTCGAACAAGGACAATGTCGATGTCGTCGCCTTGTCACAACCCTCATGACCTCCCTAACCGGGTTTTGACCTAGATAGTCTTAGT:1 - chr2R 19543768 5' + jockey 4788 1 57.03 ATGCGGGGCGGTGGATCCAAAGGGACTGTTTGGGTGGGTTAGGCTGGCTAGGGGCATCTTCATTGGTCATAAAAAGGGCGTTAAAAATTGCCATGTAAAGGTGGGGCCGGAAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr3R 31956926 5' + pogo 5 1 78.08 GTGAGCCAGCGAAAATTTTGTTTGCCGTGATTTTTAGCCATGTAAAAGAGATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCA:1 + chr2R 14708389 5' - roo 8930 2 65.75 GCCCCAAAGAGGAGCAGTCGGCAAAGCAACACAACAAACAAATCAAAATAAGGCACACAAAAAAGCGCAGGCAAAATCAAATAAAATCGCCGCAGCGATAACCACCGAGCTCAGGAGAGCGGAGAGAGCCAGGAGGGGC:1 - chr2L 9180802 5' + Rt1c 5277 1 62.59 AATGGCGTTGATGAGCACAATTTTATTTGAAGGTCGGAAATATTTAATTGAAATATATTTAATGATAAAACATATTGGGATATTTAGCCTAATCTCGTTTATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 25823109 5' + roo 20 2 71.92 AAAGATTTAGCTCTTATTACACACATTAAAATGAAGTCAGCTCCTTCATATATATGCATATATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3R 21517992 5' + 297 6634 2 66.44 AATGATGCACATGAGTTTCATCTCGTTTCACCTTTTGATATGATTTTCCTAACCTATCAAGCTCAGCCAAAAGCTAGATGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGG:1 + chr2L 3524900 5' - Doc 268 1 52.05 GATGATATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chrX 14756777 5' + pogo 48 1 56.16 GGCCTTATTAGCCTTCTCTCACTGGTTTTCGACAAAGTTCTCTCCGGCCGCATGTTTGTTTGTTTGGCTTTGGCAGCACAAATTATGACTGGATAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATAT:1 + chr3L 22003756 5' + pogo 1923 1 63.70 TGTAGAACCGTCAACTTCTGGTTCTCTGTCATTACTGAGATCGTTCCTGCTTCTTAATTTCCAGATATTCCCCATATTATTATGGCCATAAGCAGAGCCAGTCTGCTACTACATATAGTATGTACAAAGACACTAGAATAATAATA:1 + chr3L 14480134 5' - Tc3 310 1 60.27 AATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr2L 1327608 5' + pogo 53 1 56.16 ATGTGTGGCATACAATGACAATGTACTTATATATTCACACATTCATATGTGAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAAGTATT:1 - chr2L 21676487 5' - HB 1538 1 65.07 TTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 + chr2R 13574741 5' + diver 5939 2 53.42 TATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGA:1 - chrX 22517665 5' - 1360 3300 1 78.77 AGAAACTAAGCCAGTATGGTATTTGCTTTTATTAGATTTACAATAGAATTATTTCGATGCAATACTTTCAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chr2L 17162874 5' - blood 353 2 59.66 CGGAACTCACCAAACTCGTACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 - chr2L 10032728 5' + hobo 74 1 68.49 GAAAAACTGTGACGTTATGCACATGAGTGAGCAAATAGCAACAGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chr3R 25508538 5' + hobo 77 1 72.60 AAGCCATTCAGTTCCCCTATAAATTTGTTATATTACATTCAAATTGTAATTACTTTTGAACCCTTTAGTTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr3L 3540110 5' - mdg3 194 2 51.03 CGTTGGCGTTTTGCTTTTATTGTTTTTTTTTTTGGCGATTATACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTT:1 + chr3L 7434861 5' + pogo 53 1 68.85 AATATCTGGGCGACAAAGAGCCTTTTCCACGGCTCGGGGGCTTATTAAGAATTTTCCAGCGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 23624053 5' + roo 48 2 54.11 ATGCGATCTCGACGGCTCCGCGTTGAGCGAATTTCTGCGTGTCACCACCATCATCATTATTCATTTCGGTCCACTTTTGCCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - chr3R 19555996 5' + jockey 4780 1 55.48 TACACAAATTTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 5446066 5' - roo 9043 1 65.75 AACAGTTATCCTTGACTGAAAGTGGTGCTGCATAATTCATTACAACTATGTGGAAATTTCGATAACTCACAAGTTTGGAAATTTGTGCGCAAATTAAATTAAGCTGTCACTGCCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAA:1 + chr3R 17315991 5' + 3S18 11 2 75.34 GCAAAATGAACATGGGTCTTGATTTATTAGCAACAGACAAGGACGGACATAGAGTCGCGAAATTACAACGTAAGACGATGGCGCACTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2L 1073887 5' + Tirant 8147 2 59.59 GAGTTCAGAGGTTGCAGTTGCAATTTGGGTCAAGCCAACAAGATAATGCGGTTCGCGGCTTCTATCCACTTTTTCCTGCCCGCCGCTCAAAGTTTTGTTTGCATCTTCCACTCGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTTCTGAGGAAT:1 - chr2L 19588507 5' - Tc1 1262 1 76.71 GGGGCAGGTGGATGGGATGTTTGGTCAGCTGCAGTCGGAAGCTGATGTTGGGCATTGTCGATGGCGGGTTAATGGTGCAAATTGCAGCGTGCGCGAGAACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3L 22221276 5' + 412 7074 2 71.23 TACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 - chr3R 3322545 5' - 1360 3317 1 65.75 CGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 + chr2R 8305217 5' + blood 70 2 66.44 AATCAACTTCAAAAAAGGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3R 24455344 5' + 297 6634 2 58.90 TGGTGGTCACTGATGATTAGGCCCCGCGGATCGCTGCAAAAGTTCGAAGTTGGCCAGAATCCCGAACTGACATCTGATTTGTTTCTGTTTTGGCCACGGCGAAATATTATAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 535561 5' + roo 8673 2 79.45 CATATATATAAATATATATATGTTCGGAAACGCTTCCTTGTCTTTGTTAATAAACCCTCTTACTCTACGAGTGACGGTTATAAAAAAGGGAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATA:1 - chr3R 25929381 5' + Bica 253 2 60.96 CGCTGATCCGAAAACATAAATCGACCAATGGACGGTGGACGGTGGTCGGTGGGCAGTGGGTGGCGGGGCGATGTACACATGTAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGGCTCTCGCCGCAGTCTCCGGCGTTGGTT:1 + chrX 10728797 5' - gypsy6 354 4 60.00 CTGGAGGCATCGATGCGAAAGAAATCACTTGTGGTTGTTATGGTCGCCCGATGCTGATGCAATTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 - chr2R 18969151 5' + HMS-Beagle2 6939 2 58.39 AAGAAAACGAAAGCCTTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCA:2 - chr3R 6053063 5' + Quasimodo 56 2 61.64 TTGAAGACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGT:1 + chr2L 10784798 5' + Stalker2 7467 2 49.31 CCGCATCAGCTTCCAGGACTCCGGTATGGGCGTAAAGAACCCTAATATGCTTTACCCCTCGGATTACAAAGGCCAGCTCATCGCCAACAGCGGGTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCT:1 + chr2R 24905841 5' + Cr1a 228 1 63.70 GGTTCTAAGCCAAGATGAACGGGCACATTCCAAAAAGGATAAAAGTCAACAAGGATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTT:1 + chr2R 9326910 5' + mdg3 5263 1 78.08 ATTAGCCTTTTGGCGTTGGTTTTTGCTTTCATAACAGCTTTGCTGGTTATTTAATTAGTAAAAGGAACATCAGCGCTTATAGCTGTAAAAAACCGTTCAATAAATATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chr2L 19878303 5' + mdg3 17 2 74.66 CTTGCCAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chr3L 14581458 5' + pogo 61 1 70.73 ATTTATTGGCTGCTCGTTAGCCTTTGAACTGATGCTGATGGATAATGTATAAATTAAAAGGGACACTAGGTTAATCGTAGAGTAAAATCTGACCGTGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGTCGGTATCTCAGGAACTATAAAAGC:1 + chr3R 31957306 5' + INE-1 149 1 58.22 CTCTGTAGTGAGTGGGAAAGGTTTCTGCACACTGCTTATAAAATAAAAGTAATCAACAGTCATAAGTAACTTGAATTATATGAGGCCGTAACTGTTAATTCCATATAAACATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 + chr2L 8772674 5' - Tabor 475 2 78.77 AAAGTGCACAAGTTTTGGTACTTTTATGGTCGGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2L 2690540 5' + hobo 27 1 67.12 AATTCGACTTTCCCGAAATGTTGGAGCTACATACTATCAACATTTCGTGGACGAATCTCTCGTACATCTCATCGCGAACCTTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTA:1 - chr2R 17692256 5' + roo 8967 2 62.41 GAGGCATATTCATTAGCAATCGTACTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTTCAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 21924246 5' + roo 37 2 55.04 CATCATTTCTCTTAAAAACGAAAACCTAAAATGTTCGACAATCTGCAGCTCGCCACTCTGTGCATGTCCTGTAAAAACTGCAGTCTGCTGTATTCTGATATCTAATGCTAATATTATCGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCC:1 - chrX 7800374 5' - G-element 4297 1 74.66 CTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTCTCCATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAAATTGTCTCCAAATACTTTTTAATACTTTGTATGCAAAAACTAATAATTAACTAA:1 + chrX 22564568 5' + Transib5 307 1 75.34 GTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCAT:1 - chr2R 2949127 5' + 17.6 62 1 61.64 CTCATATTAAATACAAGATATAGAGGCTTGGGTGGTGGGTAGGTGGGTGGGGGGAGTGGTTTTGGGGATGGAGGCAGCTAGTTTGAGTTGGTATCTTGTGTGTGTGCGTTTGTGTGTGTGGTTGTG:1 - chr2R 18337153 5' - gypsy3 419 1 74.60 GACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:2 + chr3L 9375814 5' - mdg1 368 2 52.74 TAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chrX 2873438 5' - roo 8993 2 71.23 AATTCTACTTGTTTTACCAATATAACAAGAAGATCATACAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chrX 23283151 5' - roo 326 2 73.97 AATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACT:1 + chr2R 5582169 5' + Cr1a 488 1 50.00 AAATGGCTCATCAACTAATTTAATGCCTAAACCGACTTTAAAACTTAATACACAATCTGTTCAGAAAAATGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 9649195 5' + roo 49 2 53.79 AAATCAAAACAAATTGCAAAAGAATAGAGATTTTCTGCCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chr3L 20785471 5' - P-element 2806 1 30.14 TGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGA:1 + chrX 18034637 5' + Juan 85 1 69.18 GGGATGTAATCTGCCCATCTAATTACAATAGCATGCTTTTAGGCTGCTTATAAATTATCCCAGAGTTCTTCGAACCATATTTATGGCGGCGTCCACATATAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr2R 22798579 5' + hobo 21 1 69.86 ACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATT:1 - chr3L 14043626 5' + Ivk 55 1 54.79 TCCCAGTTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGCCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAAG:1 + chr3R 23108079 5' + G-element 80 1 70.50 AGACATGCAAAGTTGAATTTTACGTAGTTCCTGATGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAG:1 - chr2L 22513374 5' + Stalker2 7334 2 76.03 GAAAAGGTAAATTGTAAATTGAATAGCTGCATTAATAAGATTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr3R 18849762 5' + roo 8742 2 73.29 AGTCCAACTGTGTGAAGTTCGAATAAACAGTTATATACTTCCACTGTTATTCACATTAAAGAACGAGTAGATGACACTTTGTACATTTTATCTGCTCCAATTATGCTCCTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGAC:1 + chr2L 22697559 5' - roo 9070 1 18.49 TTGTGGCATATCACTAGGCAGAAACACACAAATCGGCCTGAAAACTTGGCTCCCTCGGGCGAGGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2R 20461176 5' + jockey 35 1 57.26 GAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 5446100 5' - roo 9009 2 60.96 ATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATGAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3L 15058818 5' + blood 34 2 38.36 CGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGAGCAGATCGTG:1 - chr2R 16891834 5' + jockey 88 1 72.14 GAAAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGC:1 + chr2R 5070918 5' + gypsy5 25 2 26.03 AAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGGGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCT:1 + chr2R 19076554 5' + F-element 255 1 76.03 AACAAACGGATTTTGCTTTTAAAGATAGATTTGAAATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 7739640 5' + blood 25 2 68.49 AACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGG:1 + chr2L 16107306 5' + Rt1b 172 1 68.49 AGCCAAAATAAGATAGTTTTTACAGTGGTTGCAATGGGCAATACCTAAAACCAACTTGTTGTACTTAAAAACCTAGCCAGCTAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr2R 21897998 5' + 412 39 2 56.16 GGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTC:1 + chr2R 19076533 5' + F-element 234 1 63.01 AAGGTGGGTCTCGACCAAATCGCGGATCGGGTGCAGTACCGCCTTCAGAAGGATGGGAAATGGGAATCCATGCACGTGTCCACCTAATTGTGGTATACCCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 8272560 5' + roo 8685 2 67.81 GAGGAGACGGTAAGCTGCCCATATAGGCTGGATAATGCAGTTTGAAATGGGGTTAGTAGCGCAACTTGATACCAATTTATTTAGAAGCGATGAATCAGTACGATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGAT:1 - chr3L 12140744 5' - BS 5030 1 50.00 ATTTCATGCCTAGTTAAAATAAAAAATGGATTAATTTATGTTTTTTCATTATGTGCCAAGATTTAACTAAAAGTCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr3R 20452296 5' + blood 7059 2 53.42 CAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAA:1 + chr3R 14049356 5' + transib2 86 1 75.34 AAGGAATTAACGATGTCCTCATACTGAGACGCAAAAATATAACCTTAAAGAGTACACAAAATGTTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr3L 6751764 5' - pogo 2047 1 56.16 GTCAAGGAGATGGCTAGGGGAATATGGTAGGAAAAGCCATGGAGAGGACCAAGTCAACTGAAAGTCGTCGGGAGACATATATATAGTGACGGATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr2R 17986234 5' + 297 7 2 75.89 AAATACACTTATGAAATAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3R 5245679 5' - 1360 3341 1 52.08 GTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGA:2 + chr2R 10478671 5' - invader4 3027 2 57.53 GATGCTATAATTATGACAATTTTTTCATCCACGCCAAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAA:1 - chr3L 4738504 5' + Idefix 28 2 63.01 GTTTTAAGAAAATTGGGCGGAAAGACAAGCGGAAAATATGTCCATGTTGGCTTGTAATGAATGAGCTTACTTAAAAAATTAAAAGAAAATTTCAGAACACATGTAAGTCCAAAGTATTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTC:1 - chr2L 3734625 5' + mdg3 5257 1 64.38 ACAACGAAACCGAAAATAAAATACAAGCTAAAAGTCTTACGATCACTATGGGAAAAATATATACAAAATACAAATACATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAA:1 + chrX 13460497 5' - Quasimodo 7326 2 57.53 ATAAATTGGTACTCCCACATATCTTGGCATTGCTACACATAGAAAACATTTACCCAGAATACGATATTCTGAAAATCCATCACAGATCATTTTGCCGTGAGTCATTCTACTGGTTACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCC:1 - chr2R 16312170 5' + G6 1938 1 72.60 GTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCC:1 + chr2R 19633191 5' + jockey 4624 1 50.68 ATGTATTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTT:1 - chr3R 4658886 5' + Burdock 6211 2 71.23 GAAAATTTCTATGGAGTGCCCGCAACTGGACGTAAGTCCATATCTCCCGCCACCAAAAAGGAGGAAATATTCCTGAACAAGTCCGGATGGGTGCAGGTCAACACGACGCGTGGGGTCAACAATCTCCTTCTCTTTTCTCGCTCTCC:1 + chr3L 287274 5' + Max-element 8337 2 80.82 GCTGAATTCGGTGAGATGAAAATCTTGCGATTGCCAGAGTTGGATATCAAATAATAAGGATCATGACATTTCACTTAACACACTTTCATATAATTAATTTAATTATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:1 + chr3L 21819928 5' - Juan 4187 1 65.07 CTATGGAATTCTTAGGAAAATAAATGCGCGGGAAAACGATCAGTACGTGTTTCTGGATTTGTTTATGTTTTGATTGTGCTAAGCGTAGCGGATAAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr3R 10357708 5' + pogo 21 1 73.97 ACTGCAAGTCGCTCCGGAAGTTGTCCGTTTTTTATTTTATTTTATTTCTTTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAAC:2 + chr3L 2037014 5' + Doc 76 1 69.18 TTCTGCCTGGGCCAAGGTTTCCTGGCCCGATGGCATGACTTGGACTTCAGATAAGCCCGGCTAGGTTTATGCCACTCCAGCTCAAGAGTCTTTGAGCCATATACATGAGCCAGCCCAGTAACGCATTTCGCTTTAGCGAAAGCGAT:1 - chr3L 4394255 5' + gypsy10 5748 2 69.18 AAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chr2L 1449670 5' - opus 7443 2 68.50 CCTCAAACCCGCTTCCAACTAACAGTACTTCATGTTGTTGTGTGGTAATTGAATATGATCAACTGATGCTAAACTGGTCTAAATCGTGCTATATTTATATCCCTTGGCTGAGGTATCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAA:1 + chr3L 11589994 5' - pogo 68 1 60.27 AAGCTTAAATAAATATAGCTTTTCCTCTCACCTTTTCCGGTACATAAACCTGGGATGTAGCATATTAAAAACACAGCACAGACCTTCATCGGAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAG:1 - chrX 3570390 5' + pogo 2071 1 63.01 AAACAAGAGATTACAAATTGAGTTTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:2 + chr2L 4103997 5' - roo 9003 2 63.70 TCATATGTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chr3R 12787121 5' + 297 60 2 62.33 TACATAAATGTACTTAAAAAACAATCATAACACAACTTTTCTAATAATCTAACTACTTTTAAAATAACTTCATAATATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGA:1 + chr2R 3202637 5' + gtwin 6926 2 78.77 TCCCTAGCGAATATCGTAAATCAGTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr3L 13922352 5' + Tirant 8175 2 79.66 GTCTGCTGTTCGGTAAGCGAGGTATGAAATGCGCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:1 - chr3R 4884456 5' + pogo 86 1 75.34 GAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCAGACACTTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 16771358 5' - roo 322 2 73.97 TTGATCTAACAATCGCTGCCTCTTCTTGAAACTGGATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTA:1 + chr2R 22664598 5' + Quasimodo 80 2 77.40 ATAGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGT:1 + chr2R 19076501 5' + F-element 200 1 57.53 CGCTAAATTTCAAGGAAATCGAAAATAGTGTAGCTAGTGGAAATTAAGAAAACAAAAATTGGACTGATAACCAGTTAAAATGATTAATTAGACAACCAGCAACAAACAAAAGAACAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr2L 14359194 5' + pogo 6 1 73.29 CTTTTCCCAGGACAGTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATTGGATATCCTGGCTCCCACTTCAAACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTA:1 + chr3L 1387084 5' + mdg3 5271 2 71.23 ATTTCCTCCAATGTATATCCATAACGTGGATTCAGTGACGACCTTAGCAAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTG:1 + chr2R 1277061 5' - Tirant 327 2 66.44 TTAACTGAAACAGGAAATAGGCTTTTGAAAAAACAGATGGACGTTTCGTCTCGTCTGTTCATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 - chrX 22858953 5' - mdg3 195 2 55.07 AAACTAATTGCCTGAGCACATCCGACAGCTGCGCGAATCTGTATCTATATCTGTATTTAAATCTTATTCGATCTGCTCCACATATAGTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTA:1 - chr3R 15465605 5' - mdg3 212 2 61.64 TACCATATCTGTGAGCTTTTAGTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3R 16041074 5' + jockey 37 1 65.75 AAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3R 19545337 5' + jockey 80 1 64.38 AGCGAGCCGAATGAATGGCGTCTCTTATTGATTAGCGGCAATGATGCACCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAG:1 + chr3L 3137786 5' + FB 74 1 66.44 AAGAACTGGGTGCAGCTGGGATGAAGTGGTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3R 23507684 5' + 412 7106 2 53.42 CCAGTTAAATAAAACTATTCCAACCAAATCAGGGCATCTCGCACACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 - chr2R 18316889 5' + FB 79 1 69.86 GTCGAGTCGCACTCGGTGTGCGAAAGAGATAGCAGGAGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 3452500 5' + Tirant 8150 2 65.71 TTTAATTTTATATAATAAATATGAATATGAAATGGGTTAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCCTTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr2L 17638765 5' + blood 79 2 69.66 CTTAAGAATTTTCCACGAAGCGCAGCATTAACTTTGCCGCAGTTTCAAGCCAATGATGACTCAGTAATGATCTATTTGCATCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCACAACAATCACGATA:1 - chr3R 15048156 5' + Doc3-element 487 1 55.48 ATACAGATTACAAATTTATTGGTAATGAACCAAACCAAAGCACATACAAAACTTTCGGTTCATTGATACTAAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 - chr3L 14043671 5' + Ivk 9 1 79.31 AGTCGCCCAACTATGACTCCGAATGTCTATTAAAATTTATTCGAGCGTAAGTACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3L 15371237 5' + Transpac 4928 2 80.14 TTGGTTATATTCTTGTAATCAAAATTAGGAAATGCCTTGATATTAACAACAAAAACAGAAAAGTTTATTTCTTTTTTGCATTATTTTTTATCAGTGTTTTAGCTCAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 + chrX 10960153 5' + Transpac 4933 2 74.66 CATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCC:1 - chr3R 934284 5' - Rt1b 4740 1 56.16 TGGGATTACACAGAAAATCTGGGAGTTTCGTAGTTAGGGGTCTGCAAAATGAAATTCAAAATAGGAATTATAAAAACCCCTTCCTGGTTGACTTGCACATGCAAGCAGTATGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 2519953 5' - roo 398 1 77.40 AAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1 - chr2R 6052670 5' - mdg1 342 2 68.49 CGACAACTGAAACTTGACACTTTGCAAAGAAAGTTTCTGTGGCCTGAGTGTCGTGAGGAAAAGGGAGGGAAAAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGGGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGATACTGT:1 - chr3R 17316193 5' - 3S18 6096 2 78.77 AATTGCGGCAGTAACAGCAATCACTAACAAGGAGCACCGTTCCTTTATGCGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACG:1 + chr3R 12540043 5' - flea 4936 1 64.38 AGTTAGCCCCACTTGTCTGGCAATTTCCCCCAAACTTCATGCGCTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGA:1 - chrX 5440068 5' - accord 387 2 73.97 CAGTTGGGTGAGTTCTAATCTTTTAATGTTGTAAATACTCTTTACATTCGAGTGCATTTCGTTTCGTTTCAAAATTAAGTGTACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3R 21924375 5' - roo 9032 1 58.22 ATAGAAACAATTTATCATCGCTTCGAAAGGTTTTATCTAGGGAATTGGCCAGCAACAACATTGCCGGCAAATAGATGAGCACGTCAGCAGACACAATTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCG:1 - chr2L 10380563 5' + hopper 1214 1 60.27 GTTGAAAGGCAGGCAACCTTTTGCTGGACCAAAGATTAAAAAGTTCTCTGAAATTGTTTGACAATATATTTTGCTTGGGAATTCCTTTTGTTCTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 22289340 5' - 412 7518 2 65.75 CTTTTTTGTGAAAAGTATTTTTCCACAAATATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 - chr3R 14165169 5' + Tabor 6857 2 73.29 CACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chrX 15167740 5' - roo 8993 2 72.60 AAATTCCTTTAAGTTCGGTTATAATCCTTTATAGTTTCTTGAAAATCGTACTCCCTCCGTATATTTGGTCACGACTTTCCATTGAGCTCAACTAACATGGATTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAAC:1 + chrX 7525009 5' - I-element 5335 1 71.23 AGAATCAAGAATTAATCAAAGGACTATCATAAGATATACAGATCTTATGACTTTCCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2R 13849726 5' + roo 66 2 64.38 TTAAACTAATATTACATATTACTACTAATCGATTTTATATAGGTGGCGGAAAAAACGAAAAGAAAAAGTCTAAAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAATTGGGTTC:1 - chr3L 10630182 5' - Stalker 312 4 50.34 CCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:1 + chr2L 13877697 5' - Transpac 5142 2 76.71 ACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAA:1 - chr2R 544889 5' - HMS-Beagle 189 2 56.16 GAAAAACTGTTTTTCAGGAGGTATTGGTCGCAGCAAGTTATCAGTATCACTTGGTATTCGGATGAAACTATTGGCTGCAATTCCCCAAATCTGGATCCCGTATAACCACATCGGTACGATACAGTGCGCATACAC:1 - chr3L 22906472 5' - Helena 1042 1 52.59 GTAGCCACTATACAATGCTACGCGGAAATTGGTAGTATACACTTGGTATTCACGACTATTAGAAGTAGCTTTTAAATTTTCTTGTAATCATAGAATTCAGTTTAGAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:2 + chr3L 5263307 5' + pogo 11 1 74.66 GACGGCATTAATTAGTAAGTAAAAGTCATTTATTTCACTTAAATTCGCATTCCTCCGCTCGTCCTCGCCGTAGTCAATATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTAGTGGTTCCACATAG:1 - chr2L 18163884 5' + HMS-Beagle 27 2 65.47 ATGTCAACACGCGCCAAAATGTTGCAAGCGACTGAGCAAAAAAGCGGAAAGCCAGAGGAAAAGCAGCGCCCACGCTTAAATAAAATTAATTGATTTATTAAATAAGTTTAATTTATTGTGTTATTTAATTTTGCTTTTATTTTATT:1 + chrX 17047789 5' - HeT-A 323 1 52.05 GGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1 + chr2R 8793901 5' + Transpac 4998 2 72.60 CTGGCGACGTCCTTGGTGTCTACTATGCATCGGTATCTGTGATTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGA:1 - chr2R 2949174 5' + 17.6 6942 1 76.03 CAAATATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 - chr3R 14165144 5' + Tabor 40 2 57.34 CAGTACAATAATGTTTAAAGTAATTCCGCAGTTATTTGTTAAGCACCCGCCATATTAATAGAATCATTCCCATTCCAATACACTCACTCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr3R 15589927 5' + Transpac 4949 2 65.07 GAAATGAACTTCTCACTGCAGATCGACTGACTGCCAGATTCCCCTGGCTAAACACCAAGGGCATCGCTTTGGGCTGTCTTGGCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCA:1 - chr2L 19050781 5' - R2-element 3456 1 56.16 CGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATCAGATCAC:1 - chr3R 15649844 5' + blood 84 2 71.23 AATGTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGT:1 - chr2R 22867488 5' + hobo 86 1 77.40 AACAATACTACTAATAAAAATTAAAAAGAAATTGTAGAAAAAAGAGACGAAATGATTCACGGGTATATGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAATCTCCACTGAAGGGATCTTCTTACACGTCCCTTCTTCA:1 + chr3L 15880063 5' - invader4 217 2 52.41 CGCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGAATGTGCATATATCGATGTTACACTGAACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGTATAAATATATGTCTCA:1 - chrX 14908450 5' + blood 62 2 59.35 AATTAAATTAAGATTCGCCAGTTTGCTTGTTGGCAAAGCGTCAGCATGTCGTCGAGTCCTCTTCCTTTTGGCCAAATATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 - chr3R 12578084 5' + jockey 4682 1 69.30 TAGTAAATTAACAAACCCAAATGGCTTCGAATAAATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3L 6096567 5' + roo 88 2 81.51 ATAAAAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr3L 4639057 5' - roo 9021 2 54.79 CTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3R 18524223 5' - opus 461 2 60.27 CTCAGGGCCCTGGAGTTGAGTAATGATGACCATGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 15514636 5' + 412 42 2 56.16 AATCGACCGGCAGCTGTCCACCCATGGCAGCTGCTCACTTCGTCTGCAAACTTTGGCAAAGCCAAACCACTTTTTTCACCACTCCCGCAAATTTGCAGTATTTTAGTATTAATATATTGGAAATACTCTAAACTGTTATGTTTCAG:1 - chr2R 9887502 5' - hopper2 1515 1 59.59 CTCATTACCAATTTTTGGAACATACATATATGTTTCCTAACATCTCGCCCTTATTTCGAGAATAGCTCATCTCAAAGTTTCGTTACCCACAAGAGTATTACTATTATAATTAATAAACCTACACTAATAAATATATTGAAAATGTA:1 - chr2L 18752796 5' + Burdock 6376 2 68.49 ATAATAACCGCCATCAATTTCCGTTATAATCACCAGGCAGCCAACCGAACATTGAGGGCCACTTATTCCATTGTCACCTTATGCCACATGGTAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCA:1 - chr3L 5244560 5' + hobo 293 1 64.38 AGCTGGATCACGTTGCGTATGAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCATCAAAAGCAATTGATTTTTCAGTCATGTTGAGGAGGGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCA:1 + chr2R 19076503 5' + F-element 202 1 56.16 CGGGCAATCAGACAACAATTGTTAATAATAAATGCATAATTTGCAATTGAATTTGGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr3R 15590110 5' - Transpac 5218 2 78.77 ATTGACTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:2 + chrX 11228529 5' - roo 9035 1 60.96 CTTGTGTTTCGGCTGGCACCAGTTGGCCAGAACTCACCTGGTCCACGTAGTTGTTGCCCGAGAACTGCTTGGTGATCTCCATGTAGTGCTCCGAGTCCATCCGTTTTCATATAGTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGGCGATCTG:1 - chrX 17279683 5' + INE-1 98 1 70.55 TTTTTCAATTCAAGTATTCAATTAAAACTTGTTTGCAGTACTTACCACACAATCTTTATGTTCAGACTTCTCTTCATTAAATTATCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 15167785 5' - roo 9038 1 62.33 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTATTAAGGTATTAAAGGTTTTAATTGAATTTTTCCCAAACGAAGACCAAAAATTCCCTAGTTATGGGTCGCGGCAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAA:1 - chr3R 4571525 5' + Tc1 386 1 78.08 GTCCTAAGACTTTGCCCAGATATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAACGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCT:1 + chr3R 27835618 5' - 412 7451 2 81.51 AAATTACTTATCTGAGAAATGCAACCCTTCCGAAACCACCAGTTCCGTTTTTATACCCTTTACACGTAAAGTAACGTTAAACAATTTTTTCTCATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTTGTCATACAT:1 + chr3L 22737319 5' + mdg3 5280 2 67.12 CTCCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chrX 17614376 5' - roo 9011 2 59.59 TAAATAGCTATCATTTTTTTCCTCTTGGCGGCCAAATAATCAGTGAAAATTTTTTGGGTTAACTTATTAGGGTTATTAGGGTTAACTTATATAGTGACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 - chr3L 25078468 5' + Transpac 23 2 68.49 ATTCCGAGGTACAGACTTCCAGCCAACGATGGATCCAAGTAGAGACGAATGGTTCTAGTTTCCCCTTTATAGGTCACCTCTATAGGACTACAAAGAATATATTGGCTTTTCCGTCACTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGA:1 + chr3L 25264316 5' + R2-element 3187 1 79.45 TATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTA:1 + chr2R 5582143 5' + Cr1a 462 1 63.01 GGAGGTACTAAAGGACCTACACTTTTGGAAATCTATATCTCTTTGGTTAGCTGTACAATTTTGGAGAATCTTATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 - chr2R 6559045 5' + mdg3 5289 2 51.37 GTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 9481999 5' + roo 8714 2 53.42 CGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 - chr3L 16180982 5' + Transpac 4975 2 56.16 GCGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACTTTCGAGATCCCCCACCAGA:1 - chrX 12173677 5' + Rt1b 445 1 60.94 GTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTAT:1 - chr2R 5900944 5' - Bari1 1664 1 57.24 AAAAGATTATTTTAGACTCATTAGAGTGTTCCTCTCCACGGAAATCTTTAGTAAAAGGCGAAAGATTTATTCGACAATTGAAGAGAAACCAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2L 13244922 5' + hobo 31 1 64.38 AAATATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chr3R 14165143 5' + Tabor 6883 2 55.48 ATATGGAAATCAATTGTTAAACCACCTAAAACGAAAAATAGTGAAATTTGTTAAATACTCTAAACGTGCATTTAATACATAAATAACCATACGAAATACGTAAATTCAGCTCTACAAATAATAATCCGGGCAGGGAGATCAGTGGG:1 - chr2L 7249275 5' - G5 4654 1 78.77 AGTATTGGAAATGCAAATTAAATACATATATGCTTATTTAAATATATCTATATATATATATGTGAGTTTGTTTATTATTATTGTTTATTTTTAATTTTATTATTAGTTTTTTTCTAAATGCGGTAATTATATAGAGTATT:1 - chrX 5265792 5' - flea 196 2 59.29 GGGCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGA:1 - chrX 13762624 5' + P-element 85 1 25.52 ATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 - chrX 3529816 5' - 412 7467 2 69.86 ATGGAATAGACTCCTAAAGTTTCTCAAGTTGAGACATTTCAATCATAGATCTTTTTTCACTGATTTTACGTTGTTCAGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATAT:1 + chr3R 20280084 5' + R2-element 3248 1 52.74 ATTTTGGCATCAGATTTGGACTTAATGGAGTGCTTTTCGATCGTGATAGTAAGTGATACATTAATTTTCTCTGCGTGCACATTCATTTAGATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTG:1 + chr3R 11461734 5' + 17.6 6954 1 67.81 GTGCAGCAAAACGAACATCACTTGATTCTGATTAGCGTGCTGTCAAGCGTGAGAGCTGCATATACATATATCTGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chr3R 31071726 5' + opus 41 4 56.16 GGGTAATGCCAAGTGCCAAGTGGCAACAACGTGACTGCCACACAAAAATCCTGGGCACCCAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 22429235 5' + roo 61 2 58.90 AAAATTTGTTATTATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACT:1 + chr3R 6368601 5' + Idefix 69 2 68.49 CCTTTGATTAAGCAGATCTTTATAAACCCTTATAATAGTTCTGTAAACGAACCTTGTTGTTTGCCCACCTTAAAACTTATTTATATTAGTGGAGCACGTATTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAG:1 - chr2L 1271751 5' + pogo 2083 1 68.49 ACAAGAGATTACAAATTGAGTTTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTCTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2L 4103999 5' - roo 9001 2 63.70 GATTTGTTTATCCTTCTACAAGGATACACACACATCGGTATTAACAATATTGGAATATATCTGTAGATAGTAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGT:1 + chr2R 22671350 5' + jockey 4719 1 52.05 GTAGCGCACTTACACTGCTGTCGTAGGCCGTGAACAATAATTTACGCCTTAAAGCTGCACCGAAATCGGTCCGCTGTCATAATTATTCTCACTTTAACTTGCATGCATATTTTCTTTTGCTTTAAGCTTTGTACTATGAACCGTTA:1 - chr2R 5916374 5' + Bari1 1551 1 67.12 TATAAAAACATCAAGCAAGTTCGTAAAAAATTAAAGGGCTTAAATTCTGTGCGTTTCACTTATAAATCTGTGGAGGTTATATAGAAATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACT:1 + chr3R 18847220 5' + Stalker2 7248 1 71.92 TATTAAACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 - chr3L 24153294 5' + Tabor 6865 2 65.15 ACAGTGTTTAACTCATTTAAGGGTTGTGATTTGAAATTAAATATAATACCTAAGAGAAAGCTTCGCTACGGTTATAGTAAATCATTTGTTTGATTTTTTTATATATTTGATGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCT:1 - chr2L 7204514 5' + 297 6909 2 73.97 GGAGGGACATGCCCCTTTATGACGTCGTGTTGGGCAAGGTCAGGCAAAATGGCAGAAAGAAAACCAGTTCTCTTGTAGCCATGGTCTTGGCTTTGGAATATTCATATCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGA:1 - chr2L 19454155 5' - Tabor 132 2 73.29 CAAATCGCTGCCAGCAACTATAAAAACTTTCAACTGAAACCGGAATTGAATATGAATCCTGATCATCGTCGCTGTCAAAGGGAAAAAGTGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2R 16908454 5' - roo 9039 1 62.33 GGATTTGAATACTTTGCGGTTGTGGCTCATATTCAATATCCATGGGCTCAATTGGTGGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3R 14088697 5' - 1360 3371 1 73.29 AAAAACTGGGTTTATTAGAAAAAAGAGCACTGATTATCCCAGATTATCTCAGATTTCTTCGAAAGAGTCAATTCCTTTCTGTTCCACTTCTAAGTTGAATAAATTATGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCCTTATAAGCA:1 + chr3R 19438302 5' - Bica 4728 1 74.31 GATTTTACTTCTTACTCGTGAGATCTACGATGCTAAATTAAGCCTTAGTTCAATGCTCTATGACAGAAATTATATGAAAGTGTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTT:1 - chr3L 21820068 5' + Juan 43 1 55.48 AGTAAAATAGAATATCTGTTGACAAAGTTTTTCACGCACAGCCAGCAGGGGAAAAAGTTTACGAGTTTATTCAGTCAGGCGTGGACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3L 5514168 5' + Doc 56 1 49.32 GAATTTAATAAATTTAAATAAGATTATCTTTTTATGCCAACTCTATTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 21421118 5' + roo 76 2 69.86 ATGGGGCAATCAGGATATGGCGATGGGATGGCGAATTGAGATTACGATTTCGACGGCTATAAGACTAGTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAAC:1 - chr2L 15142339 5' - BS 5041 1 53.42 GGTACTTTTATGGTCGGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 2690556 5' + hobo 40 1 57.34 AACAGAGAGATAGTTATTGTTCAAATTCTCAACTTTTGATACCGCTTTCTCAGATAATGAGAGTGCATGGTAAATTATAATATAAAACAAGAGGGAACGCTATATCAACACATTTTTTAAAAGTGTGGGCCTGACAGTTT:1 + chr2L 21284535 5' - INE-1 246 1 72.14 ATAAGGGTTAGAATGTTGATTAAGCATACGGATTGCAATAACGCTAAATCTGTGCAAGTTTTGTAATTTTTCCATGCTTCTGCCGAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 - chr2R 2843234 5' + 1360 42 1 54.79 ATTGGAGATAGCAGCAGTACTAAAAGATGTGGCTTTCAGCACAATGTCTGCTTAAAGGGGCGACGGTATCGACATCTTGTGTTGTGTATTTTTTAATAATCTTGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACATGTG:1 + chr2R 698831 5' + Bica 44 1 71.92 ATGGAAAATTCTTGGCGCTCTTTTCACGTCCGCAGGAGTCAGTTGTGTGCGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr2R 18316821 5' + FB 28 1 52.94 TGGGACTTCAATGCAATTTGTTGGTAACGAGCCATCAATGTGGTATCTTTCTATGTTATACTCGGACGCTTTTATTGCACGGAAATGTCCTTGTCTGACTGTGCATATCGAAATTGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATT:1 + chr3R 13358536 5' - mdg3 239 2 79.45 AAAATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATTTGGCACCATCGTGTATGTAACTAGTTCCTAAGCTATAAAGAGAGAATGCTATAGCCG:1 - chr3L 27875018 5' - INE-1 579 1 76.03 CCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr3R 15649902 5' + blood 26 2 67.81 TGGGGCTGGCGTGAAGTTACAATTACGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chrX 12558337 5' - Transpac 5167 2 60.27 GCACTTGAATTGAATTTCAATTGCCGGACCTGTTGCCCGCTAGATAAATACGGTGGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 + chr3L 16180877 5' - Transpac 5166 2 61.64 CTGCCGCTTTTGTTCTTGTTGCTGGCCCGTGGCTGGGGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3L 5490916 5' - 412 456 2 61.05 AAAATATCCTCTGTAATAAAAAATAAAATTTAATTAAACTAATTGGAATACTTTGGACTTTTTAATTTTAATTATATAATTGGAGAAAAGATTTATTTGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 21388432 5' + roo 8702 2 75.34 GTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 - chr2L 16685400 5' - P-element 2825 1 43.15 TCCATCTGCATGCCATGTGTGTGCCATGTCCACGTCCACTTCCACTGTCCGCCGCCATAATCTCGGCCAGCATCGCCGTTGGTCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGGTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 535386 5' - roo 9033 1 58.90 TGTGGTGGAGCTGTGCAAGTCCGCCTTTGATTACCTAATAAATGGACCCAATCCCAGCCGTTACGAGATTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTC:1 - chr3R 18225588 5' - 1360 169 1 53.42 TACTGATACTCTGAAGTGAAGAAGGACCGACCAGGCGACAGAAATGCAGCAGGCACATAAATCAGGACAAAGCAAAGACAAGGGAGCAGGAAAAGCATACCAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAA:1 - chrX 13350609 5' + roo 8609 1 70.55 ACTCATCTCTACTCTGTGCATATCAACGAACGCGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3L 23456044 5' + 1360 54 1 54.79 ATTGCCCCATGTTAGCCAACATAATTTGCCCATTCCTTTAAAATGTCACATAAAATGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGC:1 - chr3L 13231613 5' - hobo 466 1 78.08 TGCGAAGGGGAAAAACAAAGTCAAGCATTTTCCCCAGAAGAGTGCCTTGCCATTTGGCGACCGGTGACCCACTCACCTCTTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr3L 20848247 5' + pogo 58 1 57.53 TGAGCCAACAAAAGCAAATGCTCCGACTGGAGTTGAGACGACACCTCCTCCATTACCATCCATCCATCCATCCTTTCCATTCTGTTCCATCCACAATAAAGTCCAAGAACTTCTCAGGTGAGGGGCATATTTTGTCAACTTTACA:1 - chr2R 10657059 5' - 1360 204 1 60.69 TCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chr3L 24291977 5' + 1360 67 1 65.75 ACAAATCCACCATATGATCGGGGCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTT:1 + chr2R 10478626 5' - invader4 313 2 75.34 ATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATATAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 + chr3R 18665267 5' + 1360 79 1 77.40 TCCAAGACTTCTGCTATATGCACGGTATTAAGTATTAACAGCAGGGTGACCAAGAACAATGTTCATTATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr2L 2464317 5' - pogo 2049 1 56.16 AAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAACAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr3R 21237811 5' + Doc 70 1 59.59 AGAAACATGTTATTAAACATCTGAGATAACAGTTTATTCTTTAAGCTCAAATTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 - chr3L 3979670 5' + opus 179 4 65.07 TATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 - chr3R 21237827 5' + Doc 54 1 50.00 TTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3L 9571668 5' + jockey 86 1 71.92 ATAAAAAAGAAAAAAATAAACGTATAAGAGCCATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 + chr2L 18048283 5' + blood 7100 2 76.03 AACAGAAACAGCCGCAGCATCTGACGTACCTGACGCATCTGGAGGATCTGGAGGAACTGGAGGAACTGAGGGATCTGGAGGATTAGGAGGATCAGGAGAGCTGGATTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCT:1 - chrX 15244091 5' + invader6 42 2 63.64 AAAATTGTTTTTGAAATAGTAAAGCGGTAAATTAAAAACTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAG:1 + chr3L 23287081 5' - Quasimodo 7286 2 78.77 GACGCTTGTCTGGTGCTAAATAAATTCACGTTGCGCGTCGCCAGTGAATAAGATTTGGAATTTCGAAATATATGTGCCAGCACCCACATACTAAAAAGACGAGCGCCGAATCTATCTCTTCGAAGCGGAACAATGCGTACTTCACC:1 + chr3R 7794094 5' + Doc3-element 286 1 63.70 GTAAGAACTATTTCAAAAGATCACATAGATTATCACCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 24479151 5' - 412 7507 2 55.86 TTGGAAATCAATTCTAGATAGTACATAACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAATAAA:1 + chr2L 4104020 5' - roo 8980 2 78.08 CAATCACATTAAAACATATATTTGGTGAGACGAGCACACATTTCTGAGTTGTCGCTCCTAATCGTAGCCATCAGAACATAGAGATGGCTGCTTGTGGTCCATTTTTTTTTATTTTTTGACTT:1 - chr2L 22998371 5' - Rt1b 5143 1 76.23 AGCGGAAAATTCACCACGACGGCGAACGGCAACCCAAGTTTGTTATGTTTGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCATGAGACATCC:1 - chr2L 10474396 5' - P-element 2864 1 57.14 CGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr2R 14553211 5' - mdg3 5485 2 68.91 GGTCTTTGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 + chr3R 26765114 5' + mdg3 5341 2 78.08 TCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 + chr3R 20137233 5' + Burdock 34 2 57.78 ATGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGGGCGTGCACAAA:1 - chr2R 2994286 5' + gypsy8 4794 2 65.09 AATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAG:1 + chr3L 15371315 5' + Transpac 5006 2 76.71 CCATCCATCCAGGCGAACCTTTCGTCCTTCTGCCCGACCATTCAAGTCATCCATCTCGGCTTTGGCAGCTTTCGCATTAACAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1 - chr2L 8803119 5' - Quasimodo 6920 2 52.05 ACACTACTTGATTTTAATACCAAAAAGGTTGAAAAGTAGATAAAAACTAGAAATACGCGTTTAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3L 20711984 5' + 297 6633 2 57.53 GATCATCATCTCCGCCCTCCAAGTCATCCAGCTGATGGTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTT:1 + chr2L 19371259 5' + Bari1 43 1 54.11 ATATATTTTGCCATACAGGGCTGTATGGTATAACCAAAGACATTAGTCTAACAAGATGCGTCACGCCAGACGATTTTTTGGCGCA:1 - chr2R 1394532 5' + 1360 30 1 83.53 CCCAAATTAAGTGCTTGTTGTAAGAGCAGTGCCCTTGTTCTCATATATATTTCAAGTTGGCGAGTCAATAACCTAATCATACTTCGCTTGCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr2R 19354112 5' + 297 6609 2 67.12 CACAAAAAATGCGTAACAATGCCACCGACTTTAAATGTCAGCCCGAAAGTATGCAGGCCTAAATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAAT:1 - chr3R 11118038 5' + copia 354 2 56.85 ATGGAATACTATTGAATTAGCTATGAGGACTTTATTTTCTCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr2L 20984249 5' + blood 7021 2 75.86 CAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr3R 5765309 5' - opus 7461 2 58.22 ATGCTGAAAAATATTCGCAATTGAAAGCAAAAAGGATTTTGTGCATCAACTAAATAAAGGTTGATCCTTCAGCTTATTTATTACGTCTTTACTCATACTGATGAAATAGGTAAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 + chrX 6398736 5' - blood 368 2 67.12 GCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 + chr2L 15833009 5' - hobo 2861 1 71.23 CAACAAATCACAAGCCTAACTCCAAGTGTAATGCACAAAATCATTGTGATCACCTCATTTCAATCATACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGCGTCTAGAATTTTAAAATATTTGGGA:1 - chr2R 5415965 5' + springer 488 1 54.11 GGGGTGAGGACGGGTTCCTTGTATCAAGTAGAGCAGAAACTCTTCTTACACATTTGCACCCTGCAAATGGCTGTCTGTTTGTGCCACAGTCGCTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGCGTTGGTAGGGCTTAATCTTACTTAGTTAACTT:1 - chr2L 17542774 5' - Doc 4621 1 73.29 TAATAATATGTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGC:2 + chr2L 15153223 5' + G-element 31 1 57.53 ATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 - chr2L 2357379 5' + P-element 59 1 45.89 GTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chrX 14385154 5' + blood 52 2 55.97 AAATTTTCATGGAAAGAATCAAAGGATGTGTTAAAGACCCCCTCAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:1 - chr3L 17443409 5' + Burdock 85 2 69.86 AAAGGAAAAGCTTGTCCGCCATCGTTAAGGTGACGTCATAATGTCTGCAATACAAATACATGCAATTATGTTTTGTGTGCGATAACTTGTCATTATGCAAAATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr2R 16513080 5' + jockey 26 1 71.92 GTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCTGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr3R 1965562 5' - 412 7510 2 50.68 ACTCAGGCACCGGTGCCGATCTCTATTACAAACGCACAGTATAAATCTGCACATGCAGACAGCACCCCGTTGTGCGAGCACCCGAATCAATACGGTACTCTACGTCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr2L 20205317 5' + Tirant 8123 2 75.34 CATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2L 2519817 5' + roo 75 2 69.18 GCCGTATCACCGCTGCGCTTGGAAGGATCTAATTTGGGAGATGATTATTAATCCAAACGAGCGAGTTAAGTGAACCGATACTATCATGTTTGTCAATTCGATCGCCAACGAGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr3R 13378757 5' + F-element 39 1 58.74 GAGGGCTGGGAATGAGATTGCAAGCCCGAGAGAAACCAAGAAACGTCGACATACGGTTAGAAAAACATTCGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr2R 22867405 5' - hobo 2895 1 51.80 GATAGCTGTTTTCATGGCACTGATGACCATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2R 18048128 5' - opus 457 2 48.28 TAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTT:1 - chr2R 6984426 5' - HMS-Beagle2 267 2 54.79 GAAAGCGACCTGATCCGTAGGACAGGTTTATGTCTGACAGGCTTGGATTACCCGGAGGAGAGGGGGCGGACTATGCTGTCGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCAC:1 - chr3R 4639950 5' + Tabor 119 2 54.11 CAATCGAGCTCGAAAAACTAGTGACCCACTAGTACATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chrX 2873487 5' - roo 9042 1 65.75 GATTTGTTTCTAAGTCGTCTGCATATGCCTCAGATAATTTGCAATAATATGATTTGCTTCGAATATTTTCTATATTTAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3L 15261381 5' - pogo 2059 1 56.85 ACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGGGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTG:1 + chr3R 30273001 5' - Tirant 8434 2 77.86 AATCGATATGGCTTATTGCTAAAATGATTTTCTCAAAAAATCAAAGGCAATTGTTGAAAAATTAACAACAAATACGCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 8022111 5' + roo 44 2 53.42 AAATTCTTCAGGTGCACTGCACAAAAATACACACGAATAAGGTCAGCAGGTCTTGAATTAATTTTCCACTTAGAAATGTATTTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chrX 17469153 5' - blood 7349 2 57.53 GCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 + chr3R 19537483 5' - hopper2 1543 1 60.27 CCCTCTTCATCACCATTCGCATTCGCACTCGACGATCTTGGCCAGGAACACCTACCGCATCTGTGATGATGATCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCA:1 + chr3R 12641945 5' - Burdock 6089 1 50.68 AATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chrX 13651592 5' + 297 21 2 66.67 TTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:2 - chrX 4566243 5' + Transpac 71 2 70.55 ACATCCACATCACATCTTTATGTATGTAGTCTGTGTATCTTTGGGTCTGTTATGTAGCCTCTTAAAGTTGCTTGCACGCAACTTAAACATAAATCCATCATACGCCATGTGGCACACATATACACACACACACACACAGATACACA:1 - chr3R 17961977 5' + accord 7034 2 56.16 GGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr3R 16194108 5' - mdg1 373 2 52.05 GTAAACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 + chr2R 14562078 5' + Burdock 6164 2 66.44 ACATACAATTACATATACTAAACAAAATGCAAACCATCATAAATATGATACTATAACGAACTAGCGCAATTATATTTTATTTCTCCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chrX 23043094 5' + roo 34 2 62.33 GACCAACGTAGGAACCTTTATGTGTCTCTTTATCGTTTCCTATTTCAACAAAACTGCTCTGTACTTCAGTACTTACGTTCCCAGCAATCTTTAAAAATACATATGTTGCATAAATGCTGAGTCGGCTTGCCGACCATGGGCTTATG:1 + chr2L 3716693 5' + gtwin 175 2 67.81 AAAATGAAATTAAATTTCAGCACTGCCAACTTTTGATGCCAAAATTTACGAGTCAACAAACTCGGGAAAACTTCTCTCCTAGCTGAATTTGTATTTTTTTTTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 + chr3L 11669738 5' - Tabor 7304 2 67.81 CAACAGTACCTACTTCTAGCTTTTTTAAAAATATATACATCTCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 - chr3R 30568885 5' - roo 330 2 71.23 TTAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAATAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCT:2 - chr3L 23597299 5' + invader4 2755 1 70.55 GGAATAGTAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 - chr3R 21237859 5' + Doc 22 1 69.86 AAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAAAACAAAAAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAA:1 + chr3L 19590776 5' + 1360 196 1 71.23 CATGCAAACTATACGGCTCCATATACTTTTGATGCCACTTGCTGATTTCACAGTTGAAGTGCTGCTAGAAAGCTGGCTGAAATTAAATGGCAACCAGCGCAAAATCAATAGATACGACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTC:1 - chr3L 22110761 5' + R2-element 3121 1 61.64 CATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCGGC:1 + chrX 22398528 5' - Gypsy6A_LTR 96 1 45.21 ACAGAACATGACAAGAAGAACTATTCATCGCTCCATCTCAAAAGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGAT:1 - chr2R 2527454 5' + roo 78 2 50.68 TCTACATGTATTCTACATGTATATGCAGCTTACACTGTACAAGATTTCTCCACAACGATCTCTACTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr2R 18807765 5' + jockey 68 1 54.79 AAAAGGGGGACTGAATACTTACTACAAACAACAAGAACACAAGAATAATAAAAATCAGACTCAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACATATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCA:1 - chr3L 25841086 5' + Idefix 6956 2 56.85 ATATACCCATCTCTTTCGCCGTCGTGGCACAGCGTGAGAAACTCTCGTATCGGGTGTTCATCTCAATGAAATTGTAGCATATTTGTTGCCATATCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3L 10856853 5' + P-element 25 1 68.49 ATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTC:1 - chr3R 14088633 5' - 1360 3307 1 74.66 GTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 - chr2R 16891860 5' + jockey 68 1 56.85 TTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3L 22529743 5' - roo 341 2 65.07 TTCTTAAAGAATTCTCCTTAAAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 - chrX 3506119 5' + Tirant 59 2 80.00 GTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAATCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr3R 25384320 5' - mdg3 5475 2 65.07 ATAAAGAAATTAAAAATTGTATAACATTTTATATACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:2 - chr3R 25271315 5' - 412 7526 2 69.86 CATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chrX 4789112 5' + 297 6637 2 60.27 TGCCAAGTCCACAAACGCCGCAAAATACAATCGATCAGATTGGTATTAACCAGAATTATTGGTTTACATACAACGCGCTTAAACAAAACGAAACATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAA:1 - chr2L 8393096 5' + I-element 5146 1 65.75 AATTTAAATTACCATAATTTGTTGCTACTTAATTAGTCATCTTTAACTGTTAAATTGGTAAAATTTAAACTACTTACATGAACTTACTAACGAACTTAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3R 13494295 5' + opus 19 2 50.68 GAGGTAAATAATCTTATACTTACAAAAAAGTGTTTAATTCTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAA:1 + chr2R 4917858 5' + S-element 314 1 72.60 AGGCGGTAAGGCAGGCGGAAAAAATCAAATAAAATAACATCAAACTACCTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTTTGAG:1 + chr3L 17447404 5' - Tirant 385 2 75.52 AAAAACTGTCCGCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACGGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 12355412 5' + hobo 13 1 73.72 TCTGTATTTGGTATTGAAATATTGCTTAGACATTAACGATGGCTGAAAAACTTTGCAGGAAAATATCATAATAGAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATTTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr2L 16942025 5' - mdg1 374 2 52.74 ATCGATGATATAAAAAAAACAATTTTTCAAATATGATTCAAAATCTTCAAGTGGATATATTCTGAACATAATAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chrX 14756780 5' + pogo 44 1 57.93 TATCATTTGTGTTGAAAGGCAGGCAACCTTTTGCTGGACCAAAGATTAAAAAGTTCTCTGAAATTGTTTGACAATATATTTTGCTTGGGAATTCCTTTTGTTCTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3R 22289330 5' - 412 7528 2 72.60 TGCCGCTTCGCTGAAATTTCTCCGCGGCTTGTAAGTGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGGTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTTGGTGCTTATTGG:1 + chr3R 18469961 5' - Quasimodo 127 2 73.76 GAGGAGCTCCACTGTTAATTATTCTATATTTACATACATTCACATTTTGTTGGCATGGCTCTCCAATTTCTTTTAGTGCACCTCTCTTCGTTTTTGGGGCCATAGCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 15590517 5' - roo 392 2 69.86 ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCTCCTAGGGCTG:1 + chr3R 1875807 5' - Rt1b 4700 1 47.95 TCAAACCGAAACTTAAACTAAAACAAAAAACACATAAAGTATCCTCAGTTTCAAATTTTGATATATGTAGTTTCCTTTATAAACGTGTAAATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAGAACAATTCTGATGACACCCAGCT:1 - chrX 9581164 5' + BS 351 1 50.68 GGATCATCATCATAATCATAAATCGTCATTACCCACATCCATGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCC:1 - chr3R 14088641 5' - 1360 3315 1 69.18 CAAACGAGATTTTAAAAGAAAATTTCTAGAACTAATTGTTTACGAGATCTCGATAATTTCTCAGAAGAGTGGATTTGTTCGTATACTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chrX 14756632 5' - pogo 2068 1 63.01 TTTTTTTTTTTAAAAAAAGGGGGTATTTTGTTGTTTTAAAAAAAATCGCC:1 - chr2R 14728785 5' - transib2 2601 1 80.00 ATTTACATGACTGACAGTGAAAAGTTTTTAAGAATGATTTCTTCAAACTATTTCTTTTAAATTGTGTAATGAACCAATATATGCCTCCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 - chr2L 21596591 5' - blood 7329 1 54.11 GAGCAGAGCAATACATAATTGATTAGGTGAGAGCAATTGACGTTTACGATGATGTTGGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 - chr2L 11573711 5' - jockey 4927 1 66.44 ATAGGCCTTTAAATCCTTAATCAAGCAGTCTTAAAGTATGGAAAAAAATGTGTATGCCACGAGTTACTTACTTTTCAACATATTTCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3L 20076889 5' - roo 9037 1 63.01 AAAATGTTTTCTTTTCGGCCATCGAACATGCCAAAAGGGGAATATCACCGTTAAACGCCTTACGAACAAGGACTAATACAAACTTAAGATACTAATAGCTATGTAGTATCTTTCAAGTTTACAGTAATTTTACAACAATTACATAA:1 + chr3R 23049791 5' - X-element 4589 1 74.66 AACACTTGATTTGGCGAATGGCGAAGGACAGCATTTATTTCCCTGCCCTATTCAGAAATATAATGGAGCTTATAAATAAATGCATTTGGTCTAAAAATGCCTTCTTATGCAATTATATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTT:1 + chrX 20460395 5' - Doc 4407 1 74.66 TCCTCCTCGGTTGTTTCCTGAAATTTTCTATTGTACTTGAAGATCGCTGTACCTCCGATGGCAATTCGGTCTGTGCCCTTCTGTTTTCGTGAATAGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 8895165 5' - roo 9047 1 63.01 CAATCACAATAAGAGCGCTCATATGTAGGCAACATATTATATTCTTTTTCTCATTTCACTTGCCTGCGGTACTAATCTTATAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCC:1 + chr2L 15142222 5' + BS 4748 1 54.79 TAGTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 16041093 5' + jockey 57 1 52.74 GCATGGGCAAATTAACATGCGGGACGTGGCATTGAAATCAATCCGTTTGTCAATCAAGCATTTACACCAATCACGCTTGTGAAACGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr3R 22846829 5' - 412 457 2 60.27 AGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGCACCCCACACTTATATTAATTTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATAT:1 - chrX 21907816 5' + accord 426 2 65.07 AACTTATATGAAAATGACGAAAAAAAAGGAAAATAAGAGGAAACAACAAAAAGGAAAGAATGAAGGTGGAAGGAAGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTA:1 - chr2R 2307664 5' + hopper2 1357 2 54.79 AAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 - chr3R 14165100 5' + Tabor 6926 2 75.34 GGCGGATAAGCGGCGGGAATGACCACAGACCACGTCCTACCAGCATTACCCATTATGAGGCCGTGTAAAAATCATTCTGTTTATATTGCCTTGCGGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 - chr2L 6406606 5' - transib2 2797 1 65.75 AGAAAAGGGTATGGCTGGGGATGGTGGGGTGATGCGTTAGCTGATTGTTAGAATTGATTACAAATTGGTTATAAATGTCGCTTTAAATTGACACGCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3R 10562086 5' + I-element 27 1 65.75 TCCTATGCATTTGAATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTTCTGTTT:1 + chrX 18034621 5' + Juan 69 1 58.22 TAATGTGGTTTCACAGCTGCCACTAAGTCCATTAAGCTCTAAGCTACATAGGGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 - chr3R 5245663 5' - 1360 3323 1 63.70 ATTGGCCACGCTCTTTCTCACTCTCTCTTTGTGGAAATCATAATTGAAAGTCTCGAAAAGTGTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAG:1 - chr3R 21154327 5' + jockey 4728 1 54.29 TTTCCAATGAAAAGCACGAGTCTTAGGAATTTACTCTTCCGTTTCACTTTTTCTGTGATTTTCTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAA:1 - chr3L 10076394 5' + X-element 69 1 56.16 TTAAGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 23449236 5' - roo 356 2 53.42 AAACAAGTCAAGTGAAGGGCCAATAAATCTACCATATGAACGAAATACGTAGTATATGTAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:1 + chr3R 25354475 5' - 297 6909 2 67.12 AGTCCAGTTGTTGTTGTTGCGGAGAGGGCGTGCACTAAACAATTTACTGTTAAATTGATGAAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 + chr3R 11002069 5' - flea 4956 2 60.96 ATAATGAATGAATTATGTCAGACACGAATACTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 - chr3R 10778718 5' - mdg3 184 2 74.58 GAGAAGCAAACGAAAAGCCTTTTCTTTCGTGTTGGTCGTTGTCGTTCGAGATTCCTTTGCGGAATCCATACCCATAGCTTGGATATCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 16771460 5' + roo 8694 2 65.96 ATGATCCCGTTGAGCGCACTCGTCCACATCGTCCTGGCAGAATCTGCCCGTGAAGTTCGGTGGACAGCGGCAGGTGTAGATCACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTAGGGGTCAGGG:1 - chrX 3163627 5' - baggins 5324 1 52.74 AACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 - chr3L 21093246 5' + Ivk 2 1 76.77 GGAGAGACTGTGAATTAACGGTACCGCGCTGGACCTTGGACTCGAGTTGGCCAAGGGCGCAGAGGACGACCGGTAACGGTACATGCACAAAGAGGACGCACCTTGAACTAACGGTACAATATTTGGGCCTTGTACCCGAGCGGGC:1 + chr2L 22601692 5' + gypsy8 285 1 81.38 GGATACGAATGCGAGAATGTCGGGGTGTGTATAGGTTGGCGTACCTAACGCATATATCTAGGTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAA:1 + chr3R 9982994 5' - HMS-Beagle 6985 2 56.16 GTTGAAAACCAATGCGCTAGAATGTGTTAGTCGAACATAAAGTATGTGGATCCGTCCTAACGAGACGTGCCATAAATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGTAAATGTTTTTAAATATCGTTTTGGTGCCCCTAATGTATGC:1 + chrX 20104578 5' - transib3 88 1 49.32 GACTTTGAATTTTTTAGAGTAAGGAATTCCTCTCTTCATGGCAAAAACTATGTCCAACCGAAATTAGTTGATAACCCAATACACCATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 - chr2L 22746373 5' + 1360 32 1 63.45 GCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr3R 9958632 5' + opus 142 4 73.03 GGTTGTCTTTTCGAGCCTCTTTGTTTGCTTCCCCATTCATCAGGTAACTCGATTGGATGGGGCTCCTCCGTCTTCAAGGGGTTTTGTCGTTGGCCCTTGTTTGTAGTGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTT:1 + chr2R 5900777 5' + Bari1 16 1 75.34 TTTCCTGCCTAGCTAGTTGCTGTGCGCATTATCTACAAGATACAGATACAGAACACAATATATAGAGACGGGTCTGCCTCGATATCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTT:1 - chrX 6577299 5' + Cr1a 243 1 57.53 AGCATGGGCAAATTAACATGCGGGACGTGGCATTGAAATCAATCTGTTTGTCAATCAAGCATTTACACCAATCACGCTTGTGAAACGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr3R 22846830 5' - 412 469 2 64.44 ACAACTCTTGAGTGCACAGACAGGAGAGGCGAAGGCAGTTAGGACTGCCCAGTACTGTTCTGGATACTCGGGCCATCGAAGTGGGAGTCTTGATTAGTAACAATTTGATTGTACTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGAAG:1 + chr3R 19723154 5' - baggins 5368 1 73.97 CAGAAACCGCGTGGACAACGATCGCCGTTGATGATGATGGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTT:1 + chrX 18701981 5' - BS 4711 1 71.92 AAAAATTTAAAAATTGTTCAAAAGTAGTTAGTGGACGTTAGGATGGGCGTGGCGAAATTGGTCAACAAACTTGGGCTGCGTCTATGTGTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTTAATGCCTTTATACAGGATGCGGCAGTATAACTTC:1 + chr2L 22211205 5' + mariner2 1 1 43.15 GGCAGGAGAAAGACAGCAGACAACCGGCACAGGCGAGACGCGCAGCACGAATGAATGGAGTTTCGCAGCCAGCGAGCGAGCAAAGCTATGGCCGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr2R 15613884 5' - P-element 2859 1 66.44 TTGCAAAGAAAGTTTCTGTGGCCTGAGTGTCGTGAGGAAAAGGGAGGGAAAAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTA:1 - chr3R 17316172 5' - 3S18 6076 2 66.21 GAATTTCGTATCTGTAACTATAATAATAATTGTTTTAATTGCTATTGCCAACATTTAGAAGTCGTTTTGTATATAGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 - chr2L 8452352 5' - copia 5077 2 50.68 CCAGAATGGTCAATTATATAAGTAGACCTCGATTCGAACATGTTAAGAAACACCCTGGTATTTGACCAGATGGGGTAAAGCGACAAAAATGTAGCATTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCT:1 + chr2R 932777 5' + Circe 89 1 66.44 AACAACTAGCAACTTTTTGACAGCACATTGGCACTTGAACTCCTCCGGCGAAATGGAAAACGCAGACCATATCCCACTCGCCACTTGATTTGCCTATGGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGT:1 + chrX 17614337 5' - roo 387 2 70.55 TGGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr3L 25272522 5' + 1360 82 1 50.00 CAGCTTGACCGCAGTTGTACGTGCATATGCAATGGAAATGATTAATTAACCCAGACCCAGACCTCTAAAATGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGATCGCCGG:1 - chrX 10717989 5' + Doc 245 1 52.05 GCACTATAAATCGTAAGCAGCCGTTCTTTCCCACAATGAATGAATGAATCCATTCATTATGATCCCCAAAGCCGACGTGACTGCAATCCGAATTGTGTCTTATGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2R 21380561 5' + roo 8682 2 71.92 TAATACTCGTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATGCTAGATTTGTTGAAAAGTATGTAATAGGTAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGC:1 + chr4 25108 5' - 1731 4566 1 58.22 ACGTGCGCACGCGTCTACGTCTCGGTCTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr2L 10032709 5' + hobo 67 1 75.83 CGGACAGTACACGAGTCGAGTTGCGGGCAAGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAATGGTGCTCGTAGACTACTGCAGACTATGTGCAGGAAAACTTCCTATTAACTCATGTTTTTCATGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGG:1 - chrX 21213446 5' + Doc 9 1 76.71 AAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATT:2 - chr3R 20147558 5' - 1360 331 1 64.38 ATCGTAAAAGGATGGAAAATTCAATTGAAAAGCGCCTGGCGGGCACATATTTTCCTCAAGCACGTCAGCTGCTTCATCTCGGGAAAAATGAATGAATCAGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:1 - chr2R 19901115 5' + mdg1 22 2 71.23 AGTGTCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr3R 20137229 5' + Burdock 6172 2 58.16 AATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATACTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 - chr2L 23295918 5' + micropia 19 2 68.06 GTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTC:1 - chr3L 3540251 5' + mdg3 30 2 63.70 TTAGCTGCTCACGAAGCTTATCTGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689474 5' - diver2 4474 1 75.34 GTTGTTTTGTCACTTTTGCTAATGGTGAGCTTTTTTATAATGCACATTTTGCTTTCCACTTGCGCTTTTTATATGGAACTATACTCTATTCTGAATATTTTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:2 + chr2L 17228573 5' + mdg3 5274 2 71.23 GGAATATGTTCGAAAGCAAAAACTTGTTTGCTTTTTGCCGTGTATCTACAAAGGCACAAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:1 + chrX 983124 5' - 412 7482 2 59.59 GATTTAGCGATAAGTTAGTAGTTATCCGCCCGTGGGAGGAGCACATCCGGATACCGGCTAGAGCCGGGCTGGACAAGGAGCAGAGCAGCCGGAACGAAAGGGAATGAATGGTTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGT:1 - chrX 18688976 5' + Chimpo 151 1 64.38 AATCATGAATATTTTATTGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTTCGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2L 15621857 5' - hobo 2905 1 58.18 TACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 + chr2R 8305215 5' + blood 7079 2 65.07 CTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAA:1 + chr2R 5582164 5' + Cr1a 482 1 48.63 AATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATATACATATTTACATATTTTTATCTATTT:1 + chrX 292442 5' - G3 4495 1 75.52 CGTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATCTCCA:2 + chr3R 30272996 5' - Tirant 317 2 76.71 GATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTG:2 + chr2R 6984306 5' + HMS-Beagle2 6942 2 58.22 CTCAGGGGGTATATTGATTTCAGTCAGTCAGTAGTTGGCAACGAAGTGGAGGAGATATTTGCGACCATTTGAAGTATTTATATTCATAATGAGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chrX 22858819 5' + mdg3 5282 2 66.44 GGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2L 18581237 5' + roo 8692 2 65.07 TGCAGATAGTGCCCCGAAATGTAGGCAACGTTTTCGGGGGCTAAAAGAAGTGAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGC:1 - chr3R 5940528 5' + hobo 46 1 54.03 TTCCCTGCACGAAATGAAAAATAATTCCCAACTTTTCCGAACCTAAGAGTTTTTCCTTTGCCTCACCTGGTCATGATTTCGATTTTTTGCAGCTTTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCCGCCTCACGGTCGCCATGTAA:1 - chrX 17470233 5' - blood 394 1 69.18 AAATAGTAAAGTTGATCTGGACGTGCGCGTCTGTCTGTCTGTGTATCTGTCTGTCTAACAACAATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACA:1 + chr3R 4132456 5' - Quasimodo 7310 2 56.85 AGATAACAAGTGTTATTACTGCAAAACTTATGTTTGCTAAAGTGTTAGTCGTGATTTATGTGTATATAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGACATATCTTCG:1 + chr3R 23449239 5' - roo 9019 2 53.47 CCACAAATATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:2 - chr3R 14165147 5' + Tabor 40 2 58.22 AATTTAGTATACCCTAATATCTAGGACTATCTACCAACATCGAAAATAATTACTAATTGACTTTATAAGTTCTAAACATTCTTGCCATTGAATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACT:1 + chr2L 20941945 5' - Rt1b 4814 1 66.44 AAGGCAATAGAACCGCAATTCACAAAGGCAAACACATACGAATGTAAAAAATACAACAAGCCAGTTACACGATAATAAAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCT:1 - chr2R 20382608 5' + Bari1 42 1 57.53 AACAAATTCTCAGTTACGCTCTCACGTACTGGGCACTTACACAGCTGCAAGAGTAAACACACACACACACTCACAGGCACAATCAGCTCGAGCACCTTTCACAGAATGCACGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:1 + chr3L 14863787 5' + Transpac 13 2 77.40 CAAAAGGTTATACTTTTACAAGTATAACAATCTAAATGCCTATTTGGCATACAAGTTGTTATGCTAATGGCTAAAACCTTTAGTATTTAGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2R 6945756 5' + pogo 29 1 65.75 GGAATTATCCATAGAAGATAAAAATTATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACTACGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTC:1 + chr3R 19446009 5' + 1360 3219 1 80.82 CGAACAAATATTCGAGGAGATACAAATACTGACAATGATAGGGCATTTAATAGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGATGTGGCTCCAGGC:1 + chr4 294587 5' + 1360 67 1 63.01 CATATTCATTAGCAATCGTACTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 21924250 5' + roo 56 2 59.03 TCTATCGCCTTTTGCACGGCCCATTAGTAATTAAATATTGTTTGCATAATGATAGCATTGATATATGTATTTTCAGCCTAGGCAACGTAATTGACGGGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 - chr2R 14884390 5' + mdg3 27 2 67.81 CTTGTGGCACTTTCAACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCT:1 - chr3L 8253763 5' + jockey 4665 1 62.33 GTGCAGTTAGATGCAACTGCGATGCTAAATGGCTGAAAGCCATATCCAATTTTACCATAGATCATATCATACACACATCGTCACATCCACTCAATCGTGGTATACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACA:1 - chrX 16109390 5' - F-element 4643 1 69.86 ATAAATAGCTTTGTAAAAACCATTTAAATGCTTTCAATGTGCTTAATGGGAAAAATACAGAAGACCCCTTTGGTTCTTTATTTGTAATAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 12608018 5' - roo 9041 1 65.07 CACACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGAGGAGTGTAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTCTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTT:1 + chr3R 11083443 5' + Rt1b 5096 1 71.23 ACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATATATATAGGTACAGTGATAAACCGATATGTGTGCATACTACAACAATTTTGCCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCA:1 - chr3R 3181094 5' - Cr1a 4176 1 54.79 GCCGCTGTATTCACAATTCCCATTAGAATGCTAGCGTGATTTTTCGATAGATCAATTGTGTTTAGAACACTGCCAATGGTTTGAGCACTATTCACGCCCACACTGATGGTCATCAAAGCATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 - chr2R 22838913 5' + copia 4927 2 79.45 CTTAGGCTTTATAAAAATCCCAGTCGAAACACAAGCAGCACTCGCACACCCACACACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAAAGTTG:1 + chr3L 17447452 5' - Tirant 8441 2 61.64 AGAGGTTTCTGTAAAGGGTATGCAGTAACAAACATTTCTAACTTAATTAGCTCTGTTGTGTAATTTTATACACCTTTGTGGTTCAATTTAAAGCCCTAGAGATTGTATATCGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 4869304 5' + roo 10 2 78.08 CTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGA:1 - chr2R 6984419 5' - HMS-Beagle2 7143 2 55.48 ATGCTCGAAACTTTAAATAACTTTAAGCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACT:1 + chr3R 7739675 5' + blood 7071 2 56.16 TCCAAACCCGATCCTTAGTCTTTGATGTGAGCCAGGCTCAGTTCCCGGCAGGAACCTCTCCACTCCTTTGGCATTGGCATAAGATAAATGTTGGGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGAC:1 - chr3L 1387261 5' - mdg3 219 2 67.81 CCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAA:1 + chr2R 20704159 5' - hobo 2864 1 75.56 TACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:2 - chr3R 24228982 5' - opus 7451 2 57.53 CATGCTCACCGTTGTTCCGGACACTTGGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 - chr3L 16887377 5' - roo 8979 2 80.14 GAAATCCCCATCCCCCAATGCTCCTCCCACAACGCTCCCATCGACTCGAAGCAATTTGTTGATATTCTGGTAGCTATTAAGGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr2R 19985671 5' - copia 5084 2 57.53 GTAAAGTTGTTGGCAAGGCCGGAATGCAGTGGGTAGTTTTGGGTGGTTAGCTGGTGAACTGGTGGGTAAAAGGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 3524328 5' + roo 8713 2 52.05 GCCCTTTTTTTCGGGCTGCCAACACGCACACAGAGTTACATATGTGCGTTTGGGTGTTAAAACGCCACAAGTGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAG:1 - chr3R 23568172 5' + jockey 4641 1 53.42 TACTACGCAAACTTACCATAAAAACCTTTGGTCCGAAACTGCTGTTGGAACTCAAATAAACTCGGAACCTTTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACACATATTTAT:1 - chr3R 25271282 5' - 412 7493 2 54.11 ATAGATTGCTTCCCAAACAGGAAGCCAATTAGGAAGTGTCTCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr2R 15080091 5' - roo 327 2 72.60 TATACGATCCCTTTCGCATTGTCCTGCTGTCCATCCTGGCCCAAACAACCATTCATTTTTAGAGGGTCCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACGCGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 4885312 5' + 1360 53 1 60.27 ACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chr3R 6103692 5' + Tirant 48 2 54.11 ACGTTGCAATTGTGAAATCAGAAGCGTTTCAATGTTTAAATGAGACAATTTGTAGCCGCTTAAATGGTCACAATAGGTTGCAATGGAAAAATGTTGTAGATAATATTAAACAATTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCG:1 + chr3R 16424684 5' + blood 7081 2 76.03 ATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr2R 5237928 5' + Doc 50 1 56.16 CTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 - chr3R 15649837 5' + blood 91 2 78.77 AACCAATTTAAACTCTGTTTCACCAGGCAAGCCACTTCTGCCCAAGTCATCTTTGAAAACATGACGTCACGCGCTTCGATCATCTTCCTCTTCCATGGTTTTGACCCCGTCTTCCTCCACGGTTATTATAGTTGTTATTATTGTTA:1 - chr3R 3596790 5' - mdg1 21 4 66.44 ACAATTCCCTTCTTCTTATTCCTTCTTATAGTATAGTCCTTCTTATTTTATAATTTACACCAGCTTTTCATAAATGATAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTAATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATTCACAT:1 + chr2R 4695769 5' + 1360 178 1 53.79 AGAATGGTGTCTCCTTGCCTCTCTTTCCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3L 13204837 5' + jockey 14 1 78.29 GAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 + chr3R 25876865 5' + mdg3 5317 2 61.64 ACAACGGTAGAAGTTTGTGCCATCTAAGGATGCATTTGAAAATGATTATTAATTGCAATACTTATGCGGTGCCATCTTTTGTTAATTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTTCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCA:1 + chr3L 22380516 5' - Doc 4368 1 58.22 GATGACGGGCTCATTGAACCCCAGTCTCCTTCGGCGGGGCACTTCTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr3R 5940452 5' - hobo 2914 1 51.58 AAAAGTGTGGGCGGGGCAGTTTTCTGCGGTTTGTAGGCGTTATTGAGGGTGTGGCCACATGGGTCAACAAACTTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATCCTGAATCTTAACCTTCTCGCTTTTACAGTTCCTGAGATCTCGACAT:1 + chr3L 23331451 5' - INE-1 143 1 71.23 AGTACGCGGGTAAAACAAGTTTTTTCTTTACTTAAAATACCATAGTTATTAAAAAGTTCGTTCTTAAAATAAGAACGTATTTAATGCACTTAATGAGGCGAATTGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAAACTCCCAAAAT:1 - chr2R 977527 5' - Burdock 142 2 57.53 TTTTAATGAACTCGAAATTCCAGGCACATGCGAAGCCAGCAAGGCCATTGCCGTTTTCTCACACTACACTATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAA:1 + chr3R 14165019 5' - Tabor 397 2 52.74 GACCCACTAGTACATATGATTTATATTTAAGAGCTGAGCTAAAGGAATCCCCAGATACCTCAATATGAAATATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 2873465 5' - roo 356 2 52.74 CTAAGACCATTTACTTGCATCTCTATAAAAGTATTAGAGTAAATTGCACTCAGAAGGATATATGCTTATTTCATACTTACTGTCCAACCACTTGGAGTCGTATTTCATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAA:1 - chr2R 16529299 5' + Stalker2 7322 2 73.29 CCTTCCATCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 + chr3R 24479186 5' - 412 418 2 70.55 CTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chrX 19162600 5' - pogo 2034 1 72.73 CTTAAACCAAATCAGGCTGGAATCCTAGGATCGGGCAGTGGATCCAACGGACTCAGAGTCCATCAGGGCGTCATCAGATTTATTGGTTAATTTCAGACTCTTAATATTAATAAGTTCGACACCGATGCG:1 + chrX 17740663 5' - 3S18 6036 2 55.81 AATGGGTAGCCGCTGAAAAAGCACTGATTGAAAGTGAAAGTATTTAAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 + chrX 3506026 5' - Tirant 8473 2 63.01 GCCTTTTGTTCTTCGAGTTGCGCTTGTTAGGTAAATCAGCGCCAGTTTGCATGAGTGTGTTTTGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chr3R 28144921 5' - hobo 2929 1 68.04 AGTGTACATTTGTGTGTTTTGTTTAATTAAAAGATTGAAGATTTTTGTATTTGCTTTGTTTTATTTGGGAAAGAACCTTAAGGATTTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 6096470 5' - roo 9034 1 59.59 AGGAGCCATTTGAATGGGTAGCCTTGTTCCGAGTTGAAAGCATCTCCGGCATGTGTTGTTCATATTTGCATAAGCGTCAGCCCCGAGCATATTACATTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3R 15514482 5' - 412 470 2 65.49 AAAGATATATTCGAAAATAATTGCGGCCCACCAACAACAGGTGATGGGTTGGAATTATCCGGCTTTGGCATTAGTTCTCCGTTATGGTCACAATTATTGTCTGAATGCCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 8542531 5' - roo 396 1 71.92 GCCTTTATAGTGCTTCCAAAAAACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 - chr3R 31120332 5' + opus 3 2 82.19 CCCCTCATTACTTTCATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAT:1 + chr3R 14049292 5' + transib2 22 1 70.55 ATTGCGTGTCGAGTGGGCGATGAAGTGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2L 19424683 5' + Tirant 8144 2 68.54 GTTTTCTTTTTTGTGAAAAGTATTTTTCCACAAATATATATCGGCACGTCACTGCCGATTGTTTCACTTTTTTGAAGCTGTGAGTGGGTGAATGGCTGGTTTGGGGTGGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 - chr3R 14165174 5' + Tabor 6852 2 76.71 CTATAATTATGACAATTTTTTCATCCACGCCAAGATGGATTTGTTCGTTAACACGCCGAGAAGTTGATGTGCCAACTGTCTGACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACA:1 - chr3L 4738500 5' + Idefix 32 2 60.27 TAAATAATACCTTTACATCGAAACACTTTGATTTGTTTTTAAAACATCTGCAACAAGGAAACTTTTGAGAAAAAACTGGAGAAATAAATAATTTGAGAAAATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTAT:1 - chr3L 18920522 5' + Juan 26 1 67.81 GCAAGTTTTTGCTGCACAGAAATCATGAATATTTTATTGCATATTTCCAGGCGCCTCCAACACCCACATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2L 15621837 5' - hobo 2902 1 54.89 ATGCATCAGCTTCTGAATAAAATTCGCGTGCAACGATATCTTCAAAAAGTTCACCACCGGTTACACTGCAAATGTATGTAGGCATAGTCAAATTTTGCGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAA:1 + chr4 1048084 5' + Transpac 5096 2 67.81 AGCGGGGCTTTGGTCAGATGTCAGTTGCCAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr2L 1136305 5' + 1360 54 1 52.74 AAATTAAGCGCGCACATTTTACATTTAAAACTGAATTCTGCTGCTTAAGTGGTAGCCACGAATTTTGGTAGTCCTTGCAATAATATAATCTATAATATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3R 13494460 5' - opus 479 2 60.27 GGAGATGGAGTTATTTTCAAGTTTGTCCCGAGTTCCCTATGAGTGGGATCTGGGGGAGAAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTT:1 + chr2R 6493579 5' - G6 1683 1 70.59 GTGGATATTGCGCGAAAGTCGGTTAGTAACTGAACATCGTTTGCGGCGAGCACAGATTTTTGGGGGTGAAGTTTTCTTTGGAGCCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr3L 9426647 5' - P-element 2851 1 59.59 AACGAAGTGCAGATACTCTGTTTTTTTAACCAATTATTCAATTTACATCTACGAAAATGAAAAATATCAACATAAGACACATACACAATCACATTTTGGCATTGATTTTTTGTAGCCTTTTATTTCTTATTTAAAATCTGTCCT:1 - chr3R 26970023 5' - G2 3045 1 73.61 GTTATTAATATATAATTACGATGATTTACCAATAAGATAAAAGCAGAGAAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 12787127 5' + 297 6609 2 55.56 ATTGAATGTAAATTGTTTGGCAACAAAAAAAAACAGGTAGGATGATGTATACGAGATATAAAAGGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 14705871 5' + roo 56 2 57.53 ATGAGATATGTGCAGATGGGTGGAGAGTTTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGTGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 - chrX 15814576 5' - P-element 2796 1 23.29 ATACTTATTTACAAACAATCGAATAACAATGGATTAAAGAACTACATGACTGGAAACCCTTTAACCTTTGTTTTTAGCACAGGTGGCAGTGTGCACGGCTTCAGCCCATAAAAATTCATAAAAGCCAGCATGTATTAAAAGACTTT:1 + chr3L 15598860 5' + frogger 2027 1 52.05 GTAGAACACAGTTCAGATTAAAAGTATAATAATAATAAGTCCTAATGAAATGGAAAATATGTGACTTTACTGATGCAATGTCTTTTTTGTAGCGCTCTCCGCTCTGTAACAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCC:1 + chr3R 8929601 5' - 1360 67 1 59.59 CAAAGCCATCGTGAGTGTTGAAGACGCAGATTGGACAAGGAACATAAGGATAACCTTTAGGATTTCCTAATCAATTGTTTTTTTTTACTGAATGTGTAACTAATAAAGGAACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAG:1 - chr2R 7135297 5' + I-element 223 1 74.66 CGAGAAAGTTTAATCTTGGCTTTAATATGCCTTATTTAATGGGCATAATTGGGGACTTAATCTCGATTTTTCCAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2L 1327619 5' + pogo 42 1 56.16 AGCAGCAGCAGCAAAGGATCGGGGTGAGCGGGGTCAGGGGGATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 15514598 5' + 412 7133 2 71.23 AGGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr2R 18123438 5' + 412 79 2 71.23 TTTGCGCTCGAAAAGCGAAAATGTAAAGGGAAAAAGTGCGAGAGAGTGGGAAATGCAGTTTGTGAATTGCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr3R 10079266 5' - P-element 2835 1 30.14 TGGAATGCATTCTTTTGGAAAGGCAGCACCTTGAGCCTGAAGAATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chr3R 14331125 5' + Burdock 19 2 53.42 GGCTACACAAGAGCCAGCAGCGGGAGAACAGGTGAGTTGCGATGGATTCCAGATAATAGCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAAC:1 + chr3R 3527074 5' + Tabor 58 2 57.14 GAAATTGCTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCA:1 + chr3R 18847303 5' + Stalker2 83 2 73.97 TTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3R 23664477 5' - pogo 2035 1 65.25 GGGGGGTGAAAGTGGGTTTAGGGGGGGGAACTGGTCTTATGTGGCCGGTGACCACCTCCTCCTCCTGCGACTGATTACGCCTTCTTGAACATGATCAGTAAACGAGTCGATCTGGCCTTATCCGTATGAACGTCGAGATCTCGGG:1 + chrX 8055638 5' + INE-1 137 1 58.62 AAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGTGGCCTGTCTAGGAACAT:1 - chr3R 10468080 5' + opus 196 2 73.29 ATAAAATAGGTAAACATTATTATGTAAATGTAGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 18581229 5' + roo 20 2 70.55 GGCAGGAGGTCGTGATGCGAAATCTGGCATAATGCCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 + chr3R 23507601 5' - 412 412 2 75.00 AGCTTGGCCAAAAGTCTCGCCCAGGCGCAAACAGCCGAACTTTGCTCGAACACTAGCACACCGAGACACATAGAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr3R 8402657 5' - mdg1 7414 2 52.74 GAATAAATTAGATGAACAAGTGTTTTATCCAATTATGTTCTTTGGTATTTTGTGATTGCACATTAATATGGCAGTGATGAGCCAATTTTTAGTTAGCACACTTTGTTTATTGCATTGTAAAAATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAA:1 + chr2L 3734395 5' - mdg3 248 1 84.93 ATTGGCCATCACATGATTGTTAACCATTTCATGCCAAATTGGTTTCTCAAAGTTCTTTCAACTCTGATCATGTATTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 + chr2R 17014002 5' + HMS-Beagle 6837 2 57.24 GCTCCGCCTACCGCTTCCAGGCGAGACGACTCCTAGCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCGTGTGTGCGTGGGAGAGGATTCGCATTACGCTGCTGTATGGGTGTTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCT:1 + chr3R 18699187 5' + Tirant 324 2 74.13 GACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTG:1 + chr3R 20147870 5' + 1360 307 1 58.62 TCGAAGGCTGCGATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr2R 7223620 5' + blood 26 2 66.21 TATCAATTTGATTTGATTTCGAGCCGAGTCCTCGCACAATCTGCCTTCGCTTGCGCTTGCAAGGGTGACTGCGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr2L 12142664 5' - hobo 2910 1 56.45 CGCCAGCGGAATTTACCTCTTCCGCAACTGGATCGATATGTTTACACGCATGCGCGGCCAGGTTGGTACTCCACTAGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr2L 7991397 5' - 297 354 2 58.90 TAAAAACTGTCCGCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr2L 12355413 5' + hobo 21 1 69.86 GAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTATATCG:1 - chr2R 6984451 5' - HMS-Beagle2 292 2 71.92 CTTTTGTGAAAACAGTATTTTAATTGCCAAGCATACCTCAATTAAATACATTTGCCTGTTGTTTAATTTTGCCATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr3L 18468452 5' - jockey 4950 1 54.11 AACTATGACTCCGAATGTCTATTAAAATTTATTCGAGCGTAAGTACTGGCAAGCGAGAACTGAAAGCTGAAATCATGTTTAGCTCACTCGTACAGAAATGGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 + chr3L 15371245 5' + Transpac 17 2 74.66 ATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chr3L 3979558 5' - opus 452 2 54.11 GATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2L 21192581 5' + roo 8734 2 69.86 GCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAATTCGTTGT:1 + chr2L 13877672 5' - Transpac 248 2 59.59 CTATTGCATTTATTGCATACTATATAGGAATCAAGTATTTGCCCGCTATGCAAGAATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr3R 10357851 5' - pogo 2039 1 62.33 ACTCATATTTGGTCAAGTGTTAAATCAAAGTGACTAACGACTATGTTTATAGATTTTGCCCTCCGACTTTTCGCAAAATATCCCCAGGTATTCGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2R 5992256 5' - pogo 2076 1 68.49 ATGTAATATCCCCATATTTTAGTCCAGCATAGTAACTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACCCCGAT:1 - chr2L 2690647 5' - hobo 2889 1 63.64 GTTTGTTGTTTTATAAGAGAAGGTCTCATAATATTTGCAGATATTGCTTATATGATACATTGCCGTTATAAAATTAATGATAATTACCTCACACTTTTTTTATGAACCTTGATATTTAAAAGACACGAAGTTTTCACAACTTGACT:1 - chr3R 16982803 5' - Gypsy12A_LTR 285 1 75.34 GGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAGTTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTA:1 - chr3L 21093207 5' + Ivk 100 1 74.66 ACCCAATCCCGTGTGGGGAGCGAGAAGCTAACCCCATACCCAGCGTTGCGTAAATGTTTCACATCGAGGCGTCAATGTGGCTCACATAAATCCATTATGCTTTCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGTCTGCTATCATCTCAT:1 - chr2R 8190426 5' - 1731 4199 1 57.53 CTGCTGACCCTTTGGTTTGGTGGGAACAAAGAAAGAAATCCGCAAGTAGGTCTAAGAAGAGAGCGAACTGCTGATACAACGACGACTTAGAATTTCCGCTACCATCCAATTATGGTAGGTGTTATTATTATTTACGAAACTTAAGG:1 + chr2R 4782357 5' - G4 3649 1 78.77 AAAAGAACAACACTTAATTGAACCGCAGGACGCGCCACGCATATGATATGAGCTTTCTAGCCAGGACACGTCGTTGAGCCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr3R 8402493 5' + mdg1 7052 2 76.71 GTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 - chr3R 5765434 5' + opus 172 4 61.64 CGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr3L 3979572 5' - opus 491 2 69.89 AACAAAGCAGCAGAGAAGCAGAAAGCGTAACGTAACATGTATATTTAGTAGTCGAATTAACTAAATTGTTGTAACATAAAGTGGAAATATGAGCGCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 - chr3R 21570604 5' - mdg3 5471 2 66.44 CTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGCG:1 - chr3R 15139849 5' - Tc1-2 1530 1 67.12 GGTTTTATGCTCGCCTGTCAAATGGATTCAACACAAGTCGACGGTGTAAAAATAACAACTCGTAAAAGCAAAACGAAAATCAACTTAATTTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chrX 10538260 5' - pogo 2073 1 66.44 ACGAACACAAAAGGCGAAATGCGCGCGAGACAACGAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATAT:1 - chrX 8895314 5' + roo 8701 2 55.81 CCTGGGCTCGGCCTACTACGCCATCCAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr2R 6950528 5' - pogo 2033 1 78.07 GTAATATCCCCATATTTTAGTCCAGCATAGTAACTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 - chr2L 2690645 5' - hobo 2883 1 70.18 GTTTGTCAGCAAATCAGGAGTGGACTTCACCCTTGGCTAGAATAGCACGTGTTAATGGCTGGTGGTCTCCCCCTCAGGGACTATTTTAGGAGGCGG:1 - chr2L 2549034 5' - roo 8851 2 64.58 GCACTTAGCACTTGGAACTCGACCGGGCCCAAGGCGAAATTAATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGAGGACTGTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr2R 11379674 5' + jockey 28 1 71.23 AAAATATTGTATATATCTATATTACCCAAGACGGATAACTCAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTC:1 + chr2R 16998615 5' - HMS-Beagle 6882 2 73.97 AGTCAAATGAGGTTAAAATACGGATACCATACTACGGGACCGACGACGGGACCGATTGAAGATATGGCCCAGTGTAACCCAATTGTAATAAGTAATAACTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCC:1 + chr3R 16535263 5' - Stalker2 362 2 51.37 CAATTCGGTTTGTTTGTGTTCCCGGCATGTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chr3L 14581453 5' + pogo 68 1 75.20 CCATTCGAACCGATTCAAACATCAATCACCAGTTTCTTATATCCCATAAAACACATCCTTTGAACTAGTTCACAGCGACCCAACACGCTTGCAATCACCCAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTC:1 + chr2L 6896080 5' + invader2 190 2 71.72 CGGTCATAGAGATTTTAATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 9938706 5' - roo 359 2 52.05 ATATGAAGGCGAAATCAACTCTGCGAACCCAGCTCAAAAGCTTACTCCCAAATAAACGGCTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr3R 14088520 5' + 1360 24 1 69.44 CTCAATCAAATTAAATTCAGAAGTGCTGAGTAAGTTTGTAGACTTGTGTTTTTAGCATAAATTTCTGTTTAAATAAGGAAAGCAACCTGTGACGTGTGGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr2L 19816680 5' - pogo 2080 1 69.66 CAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 + chr3R 25384159 5' + mdg3 39 2 58.90 AGCGAAATACGGCAAGACACCAGCTCAAATCATCCTAAGATACTTGGTATAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 - chr3L 12500236 5' + FB 71 1 65.75 TTTGGATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chrX 21668680 5' - mdg1 396 2 59.59 ACAGTCATTCCGCAAATGTTCCGTGATAAACAAGATTGTAAAGATTTCCTTCCGGAAATTCATAAATTTGGAATGCCTACATATACATATACATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTA:1 - chr3R 10791825 5' - Idefix 7366 2 69.18 GTTAACAAACATTCTAAACTAGTGTAGTATTTGATGGATTGCAGTTTTGTTTGCGTTCATTACTTGCCTAGAATTTCCGCTTTTGTAGCTAAATTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 9481976 5' + roo 27 2 67.81 ACCGAATGAAAATTGTGCCTCAATATTTTTCACCGACTCCCAGAGCGAAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTC:1 + chrX 14589993 5' - pogo 2032 1 67.12 ACTTGGTTAACATTTAGATCTGTTCAATGATTCAATGATTACTGATTTCGAAATGTGCTTTAAAAATCTCAAACTGAAAAATATGATATATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 - chr2R 9327130 5' - mdg3 244 2 81.51 GTTGAAATTTGCATATCTAAGCAGTCGAGCCAACATAGAATAAGGGGTTGAAAGGCTTTCTGGGGTGGCAGCAAAGTATCTTATTACAGCTGTCATAACGGATTAACATTCTATGTGTCGATGCCAATTGAACTCAACTGTATTCT:1 + chr3R 12293563 5' + diver 5963 2 57.53 TAGCCTCCACCATCGTGCTAATAGCAGCCACGCCCCATCCTTTTGGCCATTAACCGGAGTCTCGGCCCCGCCCACTATAAACTTCTTACACACCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTC:1 + chr2R 14553198 5' - mdg3 219 2 63.70 TAGCTGACAAAAAGTTGGTCCGCCATTTCAATGCCATTTAAACTTTACCCAGCAGCTGCTGCTTTTTCAGCTTCCTAGCTGATGCAAATTAATAAGCCATACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGTAAAAGCAC:1 - chr2L 18416716 5' - Burdock 6183 2 68.28 TTGTCGCCTCTCGTTAAAGGCAATGAATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr2R 9164986 5' + 412 12 2 76.03 GCTGGGCACACGCGTCAATGACGCCATCTGGCGGCAAGGCGGCAATTAAAGTGGGAGACTGCCCCGCCCAGTTTCGCCTTGCTTTAAACTTCTATAGTTTCATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr3R 25876817 5' + mdg3 5269 2 75.34 CTGCACCAAGAGCTATGCCTTCAGAAAATTTCCCGAGAAGATTAAGATCTCCAAGAGCTATGCGGTAAAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCG:1 - chr3L 19591860 5' + G6 79 1 53.10 GCCAAGGAAAGTTAATTTGTCCGAATCTATATGCAATTTACACCTGATTGGCGCATATTATTGGTATGGTTAAAGCGCCGCAATTGCTTGATTTACGCCTTGTGCATTCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 + chr2L 13877620 5' - Transpac 5219 2 74.66 ATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3R 21421046 5' - roo 8997 2 70.55 CCGCAACTTGACAATTTGCTTGCAGCCAAAAACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGAACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAA:1 - chr2L 15154074 5' + G2 3038 2 77.40 GCTGTGCGCGTTTTGATTAAATCATAACTAAGTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAA:1 - chr2R 10478748 5' + invader4 2848 2 73.29 GTGATGGTATCATTTTGCAGTCTTATGAATATGCAAGCAGTATAGTACGAGTAGAGGAAACCAATCACTAACTAATACCAGTCCTGAGTATCCAGAGCAGCAATTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATA:2 + chrX 12893293 5' - Bari1 1692 1 75.34 CTGGCGAGTCCTGGCACATCCCACACAGCCCTGCACTCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGT:1 - chr2L 20574778 5' - P-element 2757 1 28.08 AAAACTTTAGGACTAAAATGGGAACCTCAAAAGGATTTATTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 19445803 5' - roo 9021 2 53.42 TGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCCTTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chrX 18193676 5' - hopper 1403 2 73.85 ATTCCATCAATTCATTTGGAAATCAAATTGAAAACCAATTTGCAGCCATGGGAAAACGCTAATGATACGAGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTGGGCGCCAATTAACAGA:1 - chr2R 14551002 5' - gypsy4 273 1 52.05 AGTCGAGGCCTGACCTTGATAATCCCCAGCTCAGATTTTCGTAAGCACCACATCAAGTATTTAAAAAGGTCAGAGATTTTTGTTTTTATCCCACAGCCAGCGAATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTATCACAACA:1 + chr3L 5212436 5' + 1360 3200 1 71.23 GGATTCATTCAAGTGCACAAACTGGGGGATACCATTACACAGTCAATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr2L 10832386 5' + Doc 21 1 73.97 AGCTGATATGGCTTAAATACCTATCGAACCAACAGCCGCCCAAAGCAAACGAGTTGGCAGCCCAGTTAAAATCAGTGTTTATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chr2L 2357401 5' + P-element 37 1 60.96 GGGCGCGAATGCGTCTGCTGACGGATTTCCTCGAATCTGGACGCCAATCTAGTGGAAAGCGACTTTTCCGCGCGCTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTATCATATTGTATGGTATGTTTACAATTTACAATTGACATGAT:1 + chr3R 16734222 5' - TAHRE 10180 1 50.68 TTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTA:2 - chr2L 13877753 5' + Transpac 81 2 73.29 GCCAAGGTTGTAGACCTTCGGCTAGCGAATACCAGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 18882671 5' - roo 350 2 56.16 AAACTATGCTACGCTCGACGCAAGTTTTCCGCCAAGGTCGACGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 - chr2L 6598415 5' + hobo 81 1 70.55 TTCTAATGCAAGTTCTAATAAAACTTTTCACTTCCTCGGGAATCCTTTCTATTGTACAATTATTCTTTTTTATTTTTTATTCAATTTGCACTCGATGTACCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 21342215 5' - roo 389 2 70.55 GTAGATTGGCAGCCAGAGGAGGGGAAACCACCTGGAGGTGGTAACATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTCGAAACTAAATCTAGCGTACAA:1 + chr2L 18163765 5' - HMS-Beagle 177 2 67.12 CTCGTTTTATCTTATGTTATTTCATAAATGTAAGACAGCTGCCGTATAACGAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCCAAACCC:1 + chr3R 31907316 5' + Tirant 8113 2 77.06 TTGGTATCGTCGGCGTCACGACCCCGGCCGCCCCGCCTCGTCCAGCAACCCAACGTCCTCCCCCGATTCAAAAGTAGCTGCGCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGTTCTCGACACTC:1 - chr3R 31071892 5' - opus 7481 2 65.69 TTCAACATTTTTTTTTTTGTTTTTACTTTTCATTTTTTTTTTTAAACTTTTTTGATAAGAAATAACAATAAGTTTAAAAATCTT:1 + chr2R 9395305 5' - F-element 4626 1 67.86 AACTGAAACACGCACACATGGACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGAGAAAACAAAAACGAAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2L 4416049 5' + jockey 73 1 57.93 GGTATTCTTGTTGTTTCTTAATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTCTTGTTTTCATCTACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 19446793 5' + roo 8706 2 73.29 ACCCGCATCCGTTTCCGCAGTCCCAAACAAGGATATATGTATGGTAAACGAGGTCCATGAATGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTT:1 + chr3R 4886926 5' + pogo 1715 1 57.14 ACATTGATTGAAATATAATTTCAGCGAGGCGATGTGGCTTTTCTAGGGTGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chrX 9342454 5' + 1360 71 1 68.49 GAGGCAGGTAGCCGAAAGTAAAAGATAGTACGTTCCGAACGACATACCAAAAGTCAAAGTACTCGTCTATGGAGTTCTTTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTCTGTCGGTATGAACGACGAG:1 + chrX 693660 5' + INE-1 129 1 42.06 ATTACAACACCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGA:1 + chr2L 16107301 5' + Rt1b 167 1 65.07 AATAAAAAAATTAAAATCATTTAATTATTGAAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 4639056 5' - roo 9022 2 54.11 GCAACATTCATTTCAGTTGTTTAGATTTTATGCTTTGCAGTTTTATTTATCGCAGACTCCTCGCCAACTTCCAACTTTAGGCATAATAAGTGTTTGGTTTTTGGTTTGGGAATCGTACAATGTTCCAATTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 13306978 5' + hopper 141 2 52.74 CTGTTATTTCATATTTGCGCTTTAATGAATTTTAATGCTTTCATTTGTTTTAACGGACTACGCTTATTTTTGCTTTTCCCATTATTTTCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chrX 13061679 5' + mdg3 35 2 60.96 ATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTACGCCGGATGTCGATACG:1 - chrX 21667912 5' + gypsy2 6559 2 73.98 CATAATGTCCAATAATTCGTAATTAAGATATAATGCATTAAAGGTAATCATTAATTAATCTGGAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 9241988 5' + roo 57 2 62.50 GTTAGGATTTCCCTTTCACTTCTGCCAAAGTAAATACCTCATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr3R 20137398 5' - Burdock 6377 2 73.29 TTTTAAACAAAAATACTTTTTCCCGATTTGCGATAAAAGGGCGTAGTAACATCAACTGCAAACATGGACATAGATTTGGCTATTTCTATTCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGG:1 + chr2L 22551283 5' - 1360 281 1 54.11 GGTTACAAAGGCATTGCAAGGAAGGATAATAATTGACCACGGAAGCCGTCCAACTTATTTAAAGTAACAGACTTCAATCATGTTCAAGTATGGAAAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chr3L 3979533 5' - opus 7480 2 71.23 GAAATAGATCAACTCGTCGTTGGGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr3R 16194086 5' - mdg1 395 2 67.12 TTTTGAAAAACACGTTGAACAATTTAAATATTGCTAATGCTGTTTAAATTTCTAACACATGATCTTCATTTGAAGTAGGACAGTTTTGAGCAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTTCGAAGGTACCACGGCGCTC:1 + chr2L 10656464 5' - Doc 4383 1 67.81 ATTTTCGAGTGAAAAGCCGTGGAAAACTGTGTGTAAGAAAGGCTACCAGCAAGAAGGCTCAAGGAGCAGAAGAAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGGTCGAAACACCACCCTGCACAG:1 - chrX 10619976 5' + X-element 4342 1 52.74 GGAGACATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTTATATATATATTGGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 - chrX 14815850 5' + INE-1 94 1 73.97 GTGACTTAGCATGTAGCTATGGGGGTAAGTAGCAACTTCGCTCTTACCTTCACATTGAATGGGACACCGACAACATTGTTGGGTTAGTTGCCCCACCGCTGTCAAGATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGAT:1 - chr2L 17452416 5' + 1360 3169 1 72.60 TGCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 10973167 5' + jockey 35 1 65.75 ATCCATAGATTTATGCATTCGGTTTTCATTTCAAGTTCTCCTAGCTCGGATGAAAAATGTTTTTCGGGGACTGTTGGCTGGGAATCGAGGTTATTACTAAGGGTAGGCCTTTAATAAATAAGGTAAAAGGAATCGGAC:1 + chr2L 5972197 5' - Q-element 509 2 60.14 AGACATTTTTCTGTGACTTTCTGTTGTTCTTCGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTGTTCTGGGTCGCATGACCGTTTATTTTGTCCGCCAGCCTTGTTTTCCGCTCACAAAAACAATCCTTGAAAATAAAGTGAAAAATGTATTTATA:1 + chrX 13774418 5' - transib4 2470 1 65.07 TCATTAGAAACTCCTATGGCAAAATTCGGAATAGTTTTTCCTCCAAAAACAGGTGAAATCAAACTTTAGACAATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2L 20984288 5' + blood 50 2 52.74 CTAGCTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTT:1 + chr2R 13574731 5' + diver 41 2 55.48 GAGGCAAATGATGTCAGGTCTTTTTAGATATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 27503095 5' - hobo 2922 1 60.00 GTATGCCAGCGGGAGTGTGGGTGTCCGCTTTTTTTTTCATTATTTCGGTTCGCTTTTTTGCGGAAAGAAAGTTAGCTGACAAAAAACGATTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACA:1 - chrX 17445753 5' + 1360 112 1 56.16 TATTGATAAACAGTCACTTGGTATGTGAACTGGTGGGATCTGTTTTTCTCCACGGAGCATTTGGCATCGAACGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAAT:1 + chr3R 21394999 5' - 412 7278 2 51.37 GCTCATGTTGGCGTACCCATGATCGTGCTGCATGCACTGCAGCATATGCCATCGCGTTTCTGACGGTGGCTTTCGTGGAGTATTACTTATTTTCTGACAATTTCTGACAGAAAATAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGT:1 + chr2L 8435256 5' + transib2 456 1 52.05 TAAAAGGAGCTGGCTTACACGCATCATTGACTTTTCCTTTCCTCTTTTTCCGTGTCAGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGAATGCGTGAGCATGTGAGAATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 15621987 5' + hobo 18 1 69.86 ACATCGTTTTCTCCATACCGCTACGGCTTTCTATTATCCGAAAAAAGGCAAACTGAAAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATG:1 + chrX 3560890 5' + Stalker 7080 4 60.96 TGCGCATCACTCGATGGCACTTCACACCACTCATCTTTCGCTGGTTCTGGCCATCAAACACGTCCATAAAATCAGCTAATATGACCAGATGCATTTGCGTGGCTCATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2L 1449738 5' - opus 7492 2 78.08 GATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACG:1 + chr2L 15153279 5' + G-element 76 1 71.09 GAAACGGTATAGAAAGTAGCCAGAAAATAATATGACATGTGCGCGTATGAGCTCCAATTCCGAATAACTATAGCATCTCAGTTAAGTTATTTTTTGTTCAGTGCACGCCAAGTTTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAG:1 + chr3R 28232032 5' + Ivk 318 1 75.34 ATGAGCGGAGAGAGCGAGGCGTTCCGAAAATGAGTATCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chrX 13762626 5' + P-element 84 1 28.08 CCATCTGTAGGCGACCGGCAGAATGCCTTGCATCTCGTTTTCCGTTGCATACCTTAAGGCTGCGAGTGTTAGTCTAGCGAAACAATTAATTTCGACATGTTGTTAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chrX 22824871 5' + jockey 4686 1 71.23 AAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 + chr3L 21630310 5' + Burdock 55 2 56.85 CGTTTCTCTGACGACAGCTTCGGCATCGTCTAAGATTGACAAATGTCTTCCTCGATGCGAGTTGACTTAATGCCCATTTGCACTGCACCGCAGCATCGGCATTTGGATGTGAGGCTAGTGTTTCATTGTATTTTACATTTTTC:1 + chr2L 11503631 5' - Doc3-element 4491 1 70.63 GGTTACAGATCCATAAAGTGCACAAGTTTTGGTACTTTTATGGTCGGGTGTCGGCCTGAATGCGGATTGAAGTACTCATTTTCCTCCGCCTCCAAAGGAGGAAAGTAGTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2L 2690526 5' + hobo 13 1 76.71 GCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAGATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:1 + chrX 16244896 5' + jockey 4828 1 63.01 ATCGTAAATGTAATTATAATGATGGAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chrX 14908486 5' + blood 7060 2 52.05 ACCTGCGACTAAGTCTAATTAGAACCGGAGACATAAAAACGGCTACCCGCCAAAAGGTTCGCATTCGCATGCCGGCATGACGACATTTGGATGGAGGATAGGTGATTATAGTTTGCCTACTTATTATGTCTAAACACATATTTAGA:1 + chr3R 12584130 5' - rooA 7238 2 72.60 TGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTGTTTAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCGGGGCCGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGC:1 + chr2L 8959898 5' + Ivk 5140 1 47.14 AGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 + chr2L 18581301 5' + roo 8755 2 80.69 AAAACCCACAAAGGCAAAGAGCTGCGAAAGAACACTTCACTCACTTAAGTAAACTTGGCTTAATTACTTTTCGCTCGGCTTTTCCATCTTACCAAACGAATAATAAACATCATCGACCTCGCTGAGGTGCAAAAGAGCTGTGCTTG:1 + chrX 8363664 5' + Helena 1027 1 76.71 AAAGAACGAAACCCAAGGGCTGTCAGTAAGAATTATTGTGCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACA:2 - chr3R 9148094 5' - copia 5042 2 73.97 ATGAAGTGCATAGCTTAAAGTTTTTTAAATGATTCCGAAATTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr2R 21227430 5' - mdg3 5419 2 72.60 AATTTTTTCTATAAAAAAAATAGGAAAATTGGCTCTTGAATATTGAAAATCAATGTTTTGCTTTAAAGTATTACATATTTGAAACGTTGTCGCATAACTCAAATCAAATTGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3R 12347054 5' + blood 7022 2 52.74 GCACATACCATATTGTTATACATTCCCAACATGTTAGACTTCGCATAATATTATTTAAACGCACCTTGAAATACACAATAACATTTTCTTCAAAGTAAGTACTTCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGAC:1 + chr2R 22296861 5' - blood 7232 2 76.69 AGTCTACCTGCGGTTTTTTGTCGCTTCCAGAAGTCTCCAACTTCTCTAAAAGCTGCGAATCCTGCTCGGAAGGGCATCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGAC:1 + chr2R 5951311 5' - Doc 19 1 52.05 AGGCGGCTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr2L 13547082 5' + P-element 42 1 56.85 CTCGTTAAAGGCAATGAATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:2 - chr2R 9164977 5' + 412 7074 2 69.86 CAGCACCGATACTCGCCAGCTGTTGAAATGTGTGCCGTAGATCCAGATGACCCAGAAAGCGTAGGACCTATACCCCAAAAACTATAAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCC:1 + chr3R 24693535 5' - hobo 2920 1 70.99 TTTATAAAAACTAAAATAATAATAAGCGAGCTTGGAGCTTTGTTTGTTTTTCGTGATTGTCAATCACTTATTGATAACACAGTTTAAGTAAGGCAGTCATAATCACAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3R 23664533 5' - pogo 2086 1 76.03 GGTTGCTTTGTGGGTAGTTATGATCTGTCTGAAAAGTTATCTCTACACTATCCTACAGTTTGCTGCGGGTTTTCTCGCAAGATCACAATCGTAACAGTCATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 13884534 5' + pogo 18 1 71.92 CAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3R 13544002 5' - 1360 3356 1 41.10 ACACACATCTTCAATCTCCTAAGTCCCACACACTCCCATCGATCTACCTTATTAAACGTATATGTGTATAATTTATCTGTACAATATCTATATCTTCTTTTTCCATGGATATTTTTTGCCACGCCCACTCTTACGCCCACAAACAG:1 + chr2R 15465137 5' + INE-1 220 1 76.03 TCCTACGCCCTTTATATAACTTTATGCACATTGTTGATCTAACAATCGCTGCCTCTTCTTGAAACTGGATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAG:1 + chr2R 22664565 5' + Quasimodo 47 2 54.79 CCAGGGAATCCATTACGTTGCCTGGCACTCATGAAAAATGCAAATTGCCATCGCAGCTCAACACATTCAACGAGCTACAAAAGATCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGAAGCTGACGCTTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCG:1 - chr3R 19752071 5' + Chimpo 4135 1 57.53 CGTTAAAGGCAATGAATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 - chr2R 9164975 5' + 412 23 2 68.49 AGACGCGATGACTTTATATGGCCAAGCGCCGAGCGACGCGCCGTCGAAAGTGCGAACCTGCGGAGGAGGTGCACTGAGAGAAAATAAATAGTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTAGCAAA:1 - chr2R 13574881 5' - diver 193 2 61.64 CATTCCGATTATAATGAAGCGGCAATTGCAGGGGTACACATATAAAAAATAGGCATAATTAAATGGAAGCCGTTCTAACGGGTTGTGAGCGATTCAAAAGATTCCAGTCACGAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACG:1 - chr3R 6103729 5' + Tirant 11 2 78.08 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 337 1 66.18 TGTGGAATAGTAAAATCCGAATAGTGCGGAAATAATATAGGCTGTGCACTTAAATCCAACATTTGCTTCAGAATTTTAAATATTTACATACCTTAATAAACTTTACCTTAATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr3R 21237862 5' + Doc 19 1 71.92 CTGTTGCTATTCAAGTAATTTGAAGATATTTATAATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCA:1 + chr3R 18847310 5' + Stalker2 90 2 78.77 CGAGGAGAAGGCCTTTGTATTTGGTTTATTTGTCTGGTTTTTTGTGTACAGGTTTTCTTTTATTCATTATTTTTTTTAACATCTAGCGTAGATACGGCCCAGCATATGAGCATAAGAGCATTGGGCACAAACACACACACACACAC:1 + chr3L 3389249 5' + accord 7025 2 53.42 CAGCACATCCTTCAGCTGGCTGTGAAAACATGCAAAGCCCACAAGTGGTAATCCGCCTATATATTCCATATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 - chr3R 12540246 5' + flea 4803 2 56.85 GAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr3R 20292562 5' + pogo 24 1 69.18 GGCTTTAATACTTACATATTTATTGCTGATTTAAAAAAAAATATTGTAATTCGTATTTCATTTAATCGGAACTAGTAATTAAAAAATGATATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:2 - chr3R 14331268 5' - Burdock 6363 2 39.73 GGCAAATGCCAAACTTCGGTGGAAGGAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAATTGAATCGAGAGTGCTAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 15590628 5' + roo 86 2 78.83 GAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 - chr2L 15965302 5' + blood 67 2 61.64 TTTAATTAGTTTTACAACTACTAGGCTTGGTAACTAGAATTTCTATATTTCATAAATAATAACTGCTAATTATCAAATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr3L 19279236 5' + opus 7044 4 57.53 GAAAGTGTAGCATACTTTTGGGATCTCATTAACAAACTAAACGAGTACTTTTAGGAGAAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAA:1 - chr2L 19417107 5' + BS 5024 1 60.27 TCGTCGTTGGGTTCTTTTTTGGCCTTTGTTTTTATTGTTAGCTACGGCGCTTACTGTTGTTGCTCTGCTGACCTGCGTTGAGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr3R 16194099 5' - mdg1 382 2 58.22 GGTTAAGTTCCAAATGCACTTAGCTCTTTAGAAAATATCAGCGCTTAGATTGTTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chr3L 14863972 5' - Transpac 284 2 66.44 GAGTAGGAAATTTTTTTGATTGCCTCATCAACTTCAAATGGGGACTAATGCGGGTGTATCGGCTTTCGTATTAGGTTTTGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTT:1 - chr3L 53098 5' - roo 9032 1 58.22 CTAGTGTGGGGCTCCTTTTATGATTCGGACTTTTGTGCCTGGTTCCTTGTGCTGCTGTGACTTCATTTTTATAAATTCCCATCACCAATTTTTCATATAAAATGGTTGCTGCTCTTATCGTCCTTAATTGTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 9927624 5' - gypsy11 3936 1 55.48 AGCTAACATCTTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAA:1 + chr2R 5582126 5' + Cr1a 445 1 74.66 AGGACAACAACAAAGGATATTTTCCAATGACTTATAAATATTTATTTTATACAAAGCAGGTGATCTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGG:1 + chr2R 11750689 5' + flea 4576 1 67.12 ATGGTATAAACTTTTAAGATGGAGCTGTTCTTTGGGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTAATCCCACACTATGCCATATTGCCACCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr3R 14097156 5' - transib2 2790 1 57.53 CCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAACTTTTT:1 - chr3R 8049028 5' + Q-element 129 2 60.00 ACCGCCAATGTTTTACACAGAAATAACTTTCAAACTCAATTGCAAGATGGCATGTTCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chrX 10960297 5' - Transpac 248 2 61.64 AGATAGAACCACAATACAACTTGAATAAATCGAAACACCAATCAAACTTATTAGTACTCTGCGAATTTACAAACCATTAAAAACTATAACTGACCAATATACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3R 20292567 5' + pogo 19 1 72.60 GCTGAAATTTCTCCGCGGCTTGTAAGTGACTTAGCGAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGGTCTTATTGG:1 + chr3R 18469970 5' - Quasimodo 127 2 73.79 GGAGAGCTTTTGTCTTTTTGGGGCTACTGAGGCAATTAACTTTTATGGCATTCCCCTCAGCGCTGTTTGTCGCCTGTTGCTCCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 - chr2R 19985812 5' + copia 4910 2 58.22 CGCAGTTACAGGAAGCAGGAACAACCCAAACACGGCGAAGGCGTAGCCAAAACAGAACTAAAAAAACAGGGGCAAACAAATGAAAATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 + chr2L 5648363 5' - Burdock 6360 2 64.38 ATTTCTTCCATGAAACACAGTGCTAACAACATTTTTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACT:1 + chrX 22824765 5' - jockey 4911 1 78.08 TATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGGGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGGT:1 + chr3R 6103590 5' - Tirant 8455 2 59.50 ATCTGATTGCTAGTCAATGGGCTGCATTTGCAGACAAAGGTTCAAATGTCAAAGTATTTAAGTCACACGAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACC:1 - chrX 22520189 5' + 1360 3320 1 58.90 CGTGACCGGCATGATTAATGAACGCCGTTATGCTTTTATGCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chr3L 4710745 5' + Doc 89 1 73.29 GGAGAAGTTGGAAAAATGCCACTTGGCTACCAGCTGAGAGGCAGAAAAAGACATTTGACTCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 21421031 5' - roo 9012 2 60.27 TTGACACTTTGCAAAGAAAGTTTCTGTGGCCTGAGTGTCGTGAGGAAAAGGGAGGGAAAAGCGCCAGGGATGGGGGGTGGGGAAAGTGTGTGGCATGGGCAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGGTAATTTTCATTTA:1 - chr3R 17316180 5' - 3S18 6083 2 71.23 ATGTGTTGGCTTTAAATTATTATTTGTTGATATTGCAGGTTCATGGTTTATGACAAGATAAAAGATAGATAAAGTCACACGCTTATGCCGGGGACAATATTATGAAGTGAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr3L 15058797 5' + blood 13 2 46.58 CCGCGTCCTTGTTGTTAATTTGTCGAAAAAAAAGGAGCAAGGAGTTCAGTAGACTGTACAATAATCACTTATAAGTTAGCTATTTTTAAGTAAGAATATCTTATACAAGTATATTATTTCTGCTGAACTGTAGTATGTGCATATAT:1 - chr2R 15062334 5' + blood 7008 1 81.51 GGTGGAGTAAGAACAAGAAGTACAACACGATGCCATGTTCCGAGCTACGCGCTGGCCGACTTGTCGATGGCCAACAAAGGATAATCCATTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAA:1 + chr3L 1390996 5' - R2-element 3351 1 56.16 GTGCCAAGCAAAGAAGTATAATGAAAGCGCCACAAAGTATGCAACTGAAACACGCACACATGCACGGGAAATAAACGTCGCTTGAGTTAACAATTACTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2L 4416007 5' + jockey 31 1 69.86 TTTGGATCAGTGTCTGCAGCAAAATGATACACACTGAGTTGAACATTAATAAATATTTATTGTACTTCCATGTATAATAGAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2R 18048764 5' - opus 476 2 69.18 GATCTAAAGAGTAAAGAGCTGTAGAGTAAACAAGTGATTTCAAAAGTTGTAGGGAGAGGTGCAAATAATGATTCAATACGTTGAATAGGGGATGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chrX 5222828 5' - 412 462 2 63.45 GCAACAACAACAACTGCGGCCCAGTGGTGGTGGCTAAACAAGTTTCAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCG:1 + chr2R 10478648 5' - invader4 291 2 60.27 ACCATTTAAGTGTATGATTTTTAAGATCTCTAATCTTATGCAATGCCAATACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr3L 14581336 5' - pogo 2081 1 71.92 GTGGAACTCTGGCCAGCAGCTAGAATGCCCACACCCCAAATGTACATGGCGACAGCTCCAAATGTGCAGCCAAGGAATAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTG:1 + chr3R 21056225 5' + invader2 53 2 52.74 AATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATTCACATTTTAGTTATAAATGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2R 8305320 5' - blood 7339 1 58.22 GCGTGGGGAAGAAGGGGAAGTTGAAGTGGCAACAGCTGAACGAACGAACAAACGTCCAAAGCGGCAGCTGCACTGGAATCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGG:1 + chrX 7978403 5' - G2 2768 1 74.29 GCAGTGGGTGGATGAGACTCCTCCTTTTCAGCAGCGGCAGATTCACCGGCCAGATTCGATGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACCATTTC:1 - chr3R 25384323 5' - mdg3 226 2 68.49 TAATTGAAAATCCCTACCCCTCCATCCCATGTTCCCATTTCCTAACCCTTTCAAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATATATTCACTTT:1 - chr3R 24478086 5' - 412 7486 2 59.15 ATTTATAACAAATACAAACGAAAGTTAACATAAAGACCAGACTTTGATAAATTATAATTAGCTCATATACATAACTTTTTATAAAACCTAAATATTGTAGGTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGTGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3L 176509 5' - Transpac 292 2 76.03 ATGGTTAGCTAGAAGTCAAGCAAAATCAAGCATAACGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2R 1277129 5' + Tirant 8146 2 66.67 GCCCGAATCCCGGAAATGCAATCCAAGAAAGAGAAAAGCCAGCGAGGATGGATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAA:1 - chr2R 23313080 5' + Tabor 6910 2 64.38 CGCCATGAAACATTTTAATATCGAGGGATTATCTTTAATGCCATTTGATGCCATTGGAGTTCCTGAGTCCTTAGTACGTACCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAG:1 + chr2R 15365076 5' - roo 8644 1 54.11 GCACAGCCTGATGCGGCTGTGACGTCATTGTCGCCTCTTTTCTAGATGCCGCCGTTGTCGATGAGTCGGTGCTCTGCTGCAGCGACCTATGCTATTCAGACCAGAAGTGCAGAGTCAGCATAATTAGCATGCGCGACTGCTCGATC:1 + chrX 17955588 5' + Tabor 7022 2 61.64 AGACGACGTTTCGAGTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGGCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr3R 5087064 5' - P-element 2794 1 15.56 TACACACCATAGATTTACATAGACTATATTTGAATATGCTGAATGTAATGTCATGTAATTACAATGATATCTAGGACTCTAAAGGATAGAGAGCTTAGTTTCGCAACAAACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 18849854 5' - roo 396 1 37.67 TACTGACAGACGCCAGGCAGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 13543996 5' - 1360 3362 1 38.36 TTAACCCAAAGGTCTGAGAATCCAAGGCAATCAATATCGATAAGATAGGTTGAAACCGATTGCAAGTATTGCTTCTAATAAATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr2L 7991247 5' + 297 34 2 63.01 CTTGTTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr3R 21924270 5' + roo 8742 2 73.29 GCGGAGGGGAGGGGTAAGGAAGTGACGGAGTGTGTGTGCATTACGTTTGGCTTATTCAGTTTGGGGTTTTGGTTGGCTTGGATTGGTGTGTATGTGTGTATGTGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTGTGGATATGT:1 - chr2R 23219112 5' - Idefix 4 2 68.49 ATTTGAACGCTAGGCCGTGGACTGTGGAAAGGAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGGTAAGGTGATATTGGAACTGAAAGGTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3L 22518960 5' - pogo 2066 1 61.64 TTTCTATCCATTTAGTCATTTTATGTACAACTGACCAAGGCAAATAAATATTTGAAAACGGCCCATTTAAGTTGCTTAAGTTGCGGTTGTTAATGAATAAGATCAGGAATTGACCGTGCTTGCAACAAAAGAAGAGAGGAGCTAG:1 - chr3L 14734728 5' - Gypsy12A_LTR 2089 1 61.38 CAAGAAAAATAATAAAATGTCAAAAATCTCAATGCTCCAGCTTTTATCGTTAAAAAATAACAAAATAAAAATAACTCCCGACTATCCGTATGAAGATCTGGCCCTGTCCGTCCGTATGAACGGCGAGATTTCAGGAACTAT:1 - chr2L 21335782 5' + INE-1 143 1 55.32 AGCTGCTCGCAGTTTAGGCCGCAACTTTGATGATGAGACAGCCGCAGCCGTGTCAGCTGCTAATAAGCATCGCTCTAAGTGACTGACTCTTGACTTGCTAAGGGTGTAAGCTCAGTAAAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 20720013 5' - 1360 3385 2 54.11 CAAAAGGGTTAAGCCATCAAACTTCTGCACTTGTCTATATGTATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTG:1 + chr2R 10478693 5' - invader4 246 2 72.60 GCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 + chr3L 18708625 5' + F-element 98 1 78.77 TTAAAAACTGTCCGCGTTGCTCTTGTTCATCTAAGATCTTTGGATATATATTTTATGTAAAGAAATATCATTGCATACTTTCAGGCTGGCAATCGAAGTTGCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTATCACTCGACTCA:1 - chr2L 12355414 5' + hobo 20 1 70.55 AACCTGTTAGCTGGAAGATATGCTACAAATATTATTCAAATGGTTTTTCGTTTCGAGGAAACCGTTGAATGTATACCAAATCATAAAATTATTTTCGCTCATCATTCTGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTAT:1 + chr3L 16292532 5' + Cr1a 4125 1 71.23 TTGAACATTAGAAAATATTAGAAAATATACAAACAAAAAAAAGAAATGCGCTTCTTGTAGAAAACCTCTGCTAGTTGTATGTCAATGTCGATGATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chrX 13651605 5' + 297 6603 2 69.18 AGGGACTGTTTGGGTGGGTTAGGCTGGCTAGGGGCATCTTCATTGGTCATAAAAAGGGCGTTAAAAATTGCCATGTAAAGGTGGGGCCGGAAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 31956906 5' - pogo 2076 1 64.38 GTTAAATTTAAATTGCACATATGTCTTTTTTGTTCTTTTTGTTCTTTTTTATACGATTTCTGTACAATAACAAAAAATTAAGTCATGCTGTGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTT:1 + chr2L 15153232 5' + G-element 40 1 51.37 AAGGGGTATTGGAATGCATTCTTTTGGAAAGGCAGCACCTTGTGCCTGAAGAATTCGCGAAGTTGTAACGTATGTATATATTCTAGCAAATTTTTTATGTATAAATACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chr3R 14331116 5' + Burdock 6146 2 60.27 TGGTTGTAGACCACTTAACGTCTTACATGTATGCTCATAAGTACTTTAACAATAGGAACTATACATATATATATAGATATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chr3L 17444109 5' + Burdock 38 2 58.22 GTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAAT:1 - chr2R 5237867 5' + Doc 111 1 69.86 CACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3R 25271140 5' + 412 7081 2 67.12 ATTGCTCGCAATTTGCTCACAAACCTCAAGGGATTTCTTTCTTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCG:2 + chr3R 29708902 5' + blood 7010 1 80.14 GAGCTTAATGCGCTCGAACAGCTGCTGCGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAATACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 + chr3R 31907366 5' + Tirant 72 2 78.40 AGGGCTTGGGGGTTGTTTATGGTTAGTTAAAGGTAAGGGTATGGGATATAGATTACTATTCTTAGATGAACTCGTATGATGTTGGAGTCTTGGAGGGAGTTTATTCTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTGTGCA:1 - chr2R 4580180 5' - Chouto 309 1 74.66 TATGTGTAATAAAAATACGCTAAAATGTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGACGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 - chr2R 13628464 5' + jockey 98 1 76.03 GAATATGTCGGAATTCTTGTTCCCGGAACTCACACCCATGCAACAACAGCAGGACACATCCTTCACTGTCGAGTGTCACTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATCAGCCTAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTTACCCTTTG:1 + chr3R 26373684 5' - Quasimodo 217 2 53.42 GGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 22529753 5' - roo 331 2 71.92 CTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAA:1 - chr3R 11096764 5' - copia 5050 2 69.18 CCCAAGCGGACGAGTGAAAGATAAAAGTGAACGAAAATATCAGCCAGAGCAGCTGCACCGAAATCGGAATAAGTCAGTTAACAATCAGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 - chr2R 21056811 5' - Tirant 8475 2 64.38 ATTATTCTAGTGTCTTTACTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAGTGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chrX 23087723 5' + blood 7088 2 71.23 CGATAGAAGTGCTCGAAATCGAGGGCGACATGTTCGAGGGTCAAGGTTCGCCCCAGCAGATTGGTAGTAATGGTGCCCAGAACTGGTTGCATCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAATAACTCAAC:1 - chr3R 9363582 5' + roo 9041 1 64.80 TAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCATTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAG:1 - chr2R 10453490 5' + mdg3 20 2 56.85 CGCTCATTGATTCAGAATTCCGAACTCACAATGCCGAGTTTCCACTGCACGTGTGCGTTTCCATTGCGATTCCATATCGATTCGCATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAAC:1 + chr3L 16157172 5' + Juan 39 1 57.53 GTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr2R 6052706 5' - mdg1 7416 2 55.48 TTAGAAATAGTTCGCTAGAATATCCTGTAAAGATAGAAAATCACCTATTTTTACATAAATTTAATGCATACATACATTTGATATACATCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr3R 18524209 5' - opus 7478 2 69.86 ATGCTACTCTTCGCTCCTTTTTTTTTAGATCGGTATATCGGAATCGGTCTTTAGAACTCATAGTTTTAAGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 4722491 5' - roo 358 2 52.05 AGTGTTGATACAAACCCATGACTATGCGCATAAATCACAAAAGTCGAATAAGTCGAAACGAGGGAAACGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 18581260 5' + roo 50 2 52.41 CTGATTCATTGTAATAAACATTTACCTTTTGGAATCTATTAACTAACAACCAAGAAATAAATCTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2L 10937833 5' - mdg1 7402 2 56.16 ATCCAATAAAATATTTATTGACTACCATGTTCAGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 11228513 5' - roo 9051 2 71.92 ACGCTTAAAATGAGCAATTGATCGACTTCCTGAAAATGGTCATTTGTTTTCAGTGTGTATGTGTCACACACTGCGACGTTTTTAGATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGT:1 + chr3R 21521291 5' + Bari1 38 1 58.90 GACCGAACCTTTTGTTGAACGCGCCACCAAATTATTTTAAAGCCCGCGTGTATTTCATGCATCAGTTTCTGATATTCGGAACTGACATTTAATTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 - chr2L 18048390 5' - blood 350 2 66.44 CTTATTGGAAAGGTGGAATTTAAGGGGAAGTTTTAAATGCTTATAATAATTAAATCTTTTTGAACTTTTTTCAGTTTTGAACATTAAATTATATCTAAATTATTTTATCGAAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr3R 11096828 5' - copia 245 1 78.77 AATGTAGAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:2 - chr3R 11526885 5' + pogo 46 1 54.79 AGCAACAAGCAGAGTGAAAACAGGGGAGCGAAAGCGGGTGGAAATCTTGAAAGAGCTTCCCTCGCCATTGTGGCAATTATTGGTTTATTACATG:1 - chr2L 17159329 5' + blood 379 1 50.00 TGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1 - chr3L 3540212 5' + mdg3 55 2 61.64 AGTTGCATGATATCATCCCTGCTGGTAAATGATAGCTCAATATCCAACTGGGTGAACTCCGGCTGACGATCTGGACGCGTCGCTTCATCCCTGTAGCAACGGCATATGCGTCACTAAATTGAACAGTCGCGATCGAACACTCAACG:1 - chr2L 16829997 5' + G-element 3 1 69.86 CGGCACCTCAATCTACATAATTCACACTTCATTGAGCTTGGAAATTTACAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 + chr3L 21097127 5' + mdg3 5325 2 65.75 AATTGTATCCCATTTCGTGTGTCAAATGTCATCAGTTACTGAAATGGGACTCACACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 9938690 5' - roo 343 2 63.01 TTTAGTTTAGGAAGTGGTCATTCCTGAATACATCAAAATGTAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAG:1 - chr3R 6053048 5' + Quasimodo 71 2 71.92 ATGGCGTTATTCAAAGGTTTGAGAATTCATAAGTTTGAAAGTCATTGCTGGCCTTATGCTAGAAAATTGAGCCGTGATAACAGAATTTCGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGA:2 + chr2L 5771386 5' + Juan 37 1 60.27 ATGGTTGCCAATTAAGACTATATCTTATATGAATACCTCTTAATAATTTAGCCTTCTATAATCTATAGATTTTAAGTACTTTAAGTAAAATATTTCAAAATAAACACGTGTACAGGAGGAGTTTTAGGTTTTCCCTAAGTTTGGAC:1 + chr3R 26095691 5' - G-element 3853 1 74.66 GCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGCTAAAC:1 + chr2L 15833005 5' - hobo 2913 1 48.98 AAAGAATAAGTTTAATATTTAGCTTTGTATATTTAACGATTAATTAATCGGGCAGTAAATAGTGCCATGAATATATCTGAAAATATATGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr3R 9258639 5' - 1360 3361 1 64.38 GAAAATATTGTTATGGTATTTAATTGACACAAAAATAATTCCACGAACAAGATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr3R 19545335 5' + jockey 78 1 63.01 CAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAG:1 + chr2R 5582139 5' + Cr1a 458 1 65.75 ATTGCAGGGATACTGACGAACTAACGATGAGGCAAGTGTAGCCTTTTGTGCACCTGTCCGTCCATCAGAGTGTTCAAATATAGTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chr3R 5765305 5' - opus 462 2 60.96 TAAATATTTTCACTAGCCATCAACTGAAATAAACTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr2L 17069571 5' + 412 88 2 77.40 CCAAACGACAGTTAACCACCATACTCTCTATATATACGAATATCAATATATACCACTCAGTTATACAAATAACAACAGAAAAAAGATAAACACCATAAATTACAATCTGTTTTTTTTAAACAATATGTAATTGGTTGACTAGATG:1 + chr3R 19759850 5' - Porto1 4621 1 52.41 AGTTCCATTTATTTAAGTTACTTGTAGTTGGTTCACGGATTTATTTTGCGTTTTACAAACAATTGTTTCTTTGGCCAGAAGCACCATAAGGTTTGAGTAAATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGAAGTTTCAGTGTGTCCA:1 - chr3L 3701354 5' - Chimpo 100 1 65.75 TGATTGGGATGCCTGGTGAAGCGACGTGCGCAGAATTGACATTTTGTGTGTGCATTTGTGCATTTGCGCACAGTGGGCGCGATAAGGTCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr2R 24338318 5' - 1360 3357 1 63.01 CGCAAAAAAAAAAGTGCCCAACTTGCTGGCGGCACGGGAACGGGATAGAAATATGGTTGCGTGACCTATGCTGGTAATGACAGCTGGACATCGTCTTGGCATGGACTCCACCAAGTCCTGGCACTGTTTTTGAGGAATTTTGCT:1 + chrX 3373576 5' - Tc1 1256 1 63.19 AGAAAAAGAACCAGAATTGCCGAGGAAGAGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr2R 18882638 5' - roo 8981 2 78.77 TTAAATATTCAACAGGATATTGCATGAAATATACATGAGCCAGATGCATACACACAAAAGGTCGGAGGTTCTTGGTAGGTAAGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 5446075 5' - roo 9034 1 59.59 AAATAATTAAACGGTCAGCAGAAAAAAAAATTTGTTATTATCATACACGTTTATTTTTCCAACAAAAGAAGAGATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATA:1 + chr3R 6368575 5' + Idefix 43 2 56.16 TCCCTTTTGGAAAATGCGGAATTTGAAGTTAACATTTTTGTGCACAAAGGGCAAACAGTGGCTGGTGATGATGATGATGACTACATGATGGCATGACCTCAAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCG:1 + chrX 8533336 5' - 412 313 2 80.49 CGCTGTTGTTCGTCGCTCATTGTGCTCGTGCCTCCTCCATGGGCATAGAATGTTTATCCATTGTTATGTAATACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCATATCCTACTCA:1 + chr2L 16125284 5' + Rt1b 4954 1 62.61 TCTCATAAAAAGTATCCCATTGTAAGAGCAAAGTATTACTTTGTATTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 9332138 5' - roo 332 2 71.23 ACTTCGTTCTGTTTGCCAATGTTATTTGTGTGTGTGAGCATGAGCTTTGGATGTTTTTAATACATATATCTCTACTATATTTCTACTATCTACCAGTATGGAGCCAACTGCTCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCT:1 - chr2R 10332871 5' - roo 8962 2 36.99 GAGCTGCCTCCGTTTTTATTGTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 29350817 5' + 297 38 2 57.53 ACATATTGCATCGGCGTGCACGAAGACACCAGCAACAGCGAATATAAGCATGGAGAGGAGAGTCGACACGTGTGCGGTAATTCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCG:1 + chr2R 3022064 5' - HMS-Beagle2 145 2 68.22 ACAACTCGGCATGGCATTGTTGGGCCAGGAAATGTTTTCCCAAATGCAAATCAAAGCAGGCCACTCCACCTGCTCGAGATTCCCTGCTGAAGAGCCAATGACACTGGCCGTCACATAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAA:1 - chr3L 6648826 5' + Doc 4449 1 79.45 CGGTTCGCAACATCAGCGACATTTGTCACAGTTTCTTAAAGAACATTTGAATATCCAAAGCATCATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr3R 15974709 5' + P-element 64 1 41.38 ATGAGGTTAGTTTAATGGAAATTGAAAGTGTGTGCTAAAACCTAATAGCTTTGCATTAAAACGCTTTGGTAATAAGTAGCTTTCCTCGATGATGCTTGAAGATTTTATAGGGATGTTGCACATGGATTATCTCCGAAATAAATTAA:1 + chr3R 30816797 5' - McClintock 6313 2 18.49 AATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2R 9164961 5' + 412 7076 2 65.15 GTTGCATAGATTGAAGTTATCTAGATATGTAAATCATATTTTTTCAAGCATTCATACATTTGGAGCATGACAATGGACATGATTGCCGAAAAGCGTAGAAAAGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:2 + chr2L 2519751 5' + roo 8683 2 70.55 CTATTTGCATACCATTTATCGCATTTGATATCTGGTCATATATGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCA:1 + chrX 11850459 5' + Stalker2 78 2 69.86 TTTAGAATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGAC:1 + chrX 14692864 5' + Transpac 84 2 74.66 AAAGGCGACTGCAGGGCAACTTTGGCTTGACTTTTTCCATGCAATTACCTCCGGAGTCCAGACCGGAGAAGAGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACA:1 + chr3R 30672776 5' + 1360 3138 1 54.79 GGAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTGTGTGTCGTTTGAAAGGCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2R 20500132 5' + 412 7122 2 65.75 CATCATTTGTATAATAAAGCATCTACCAGCTTTCGAACTCTTTGACTTTTGTAAATAACACACTTAACCACAAATAGATTTAGGCCTAATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTGGACTTTAAAT:1 - chr2R 9668382 5' + 1360 234 1 60.27 TTCTTGTGAAAACAGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr3R 29708943 5' + blood 40 2 52.05 GTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 - chrX 4566253 5' + Transpac 61 2 63.70 TGCAAGTCACACACGTCTAAGTGCACTGAAACACAAAAAGATAATGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGC:1 - chr2R 16410102 5' + opus 182 4 69.44 AGGTGGCACAACATTTCTGCAACATGTTGATTTTCATAAATCTATAAAGAGGTATTACTTTAGGTCTGCAACTTGAAAAGGTTTACTAATTGTCCATAAAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1 + chr3R 10778608 5' + mdg3 5275 2 70.55 ATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGGATAAAGAGGAACATAAAACAT:1 + chr3L 15322031 5' + Transpac 466 1 73.29 AATCAACTGGAAGCCAGCAAAGCCAAGAATTTGGTTGATTTGCATATCTAAGGTATTAGATAAATGACCGTTTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chr3L 20977461 5' + I-element 51 1 51.37 CGAAGTTGCATGCAAGAAAAGCCATGCAAAGCGGGCCAAAAATTATGTGTTGCATACTTACGTGCGCCGCACTGACCTTGCGTGCGGTGGAAAGGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTGCACAGAAGTCG:1 + chrX 14962165 5' + jockey 33 1 66.44 GCCCACCTTTCCACTTTCCACTTTCACTTTGTGTTGAGGGCGTGCCATTTATTGGCAATTTCATTATTTATAAGCGTTTTCCATGGCATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3R 5765466 5' + opus 27 4 67.12 CTTTGGTAATATCCACTTATACATACGTGTTCTTACAAATTCAAGTACAGTGAACGCACGAGAACAAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGA:1 + chr2L 7434765 5' - F-element 4263 1 54.79 GTTGGGTATTATGTGGCAAGCGGGATTTATTCGAATTGCCTTCAATCAAGATCGAGAATTTTGACGAAAATTCTCAGATAATTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCA:1 - chr3R 21969867 5' - hobo 477 1 49.32 AAATCTGTAGAGTCTCGACAAACAAGCTAGAACAAGCGTATCGTAATAATCTGTAGAGATATAATCCACTACAGGTACTGAAGAGATACGCAGATACTCGAGTAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr3R 11121653 5' + copia 4884 2 71.03 ACAGCAATACCAGCCGCAATCATCCATATGTACTGTCCTGGGATTTCATCAGCGAGCCGAATGAATGGCGTCTCTTATTGATTAGCGGCAATGATGCACCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr3L 3137736 5' + FB 23 1 69.66 CTCAAGCGATCTCCTCCTTTACGAGTTGAACTTGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr3R 14088579 5' + 1360 82 1 75.52 AAGCGTTTTTATATCCCACGATAGCTTAATGCATAATTGAAAAGCACGCAAAGTGAAACAATAGACCAAGCTCTTCGACTTCGTTTCATTTTCAGTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAA:1 + chr3L 10069048 5' + 17.6 7291 2 67.12 ATTAAAAGTGTAGTGTAGTAATTGTATATAAGTATAGTATTGCAATATTAGAATGTAAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATCAAAGAGTATGAGATTAGTCTATTGC:1 - chr2R 3157576 5' - diver2 29 2 60.96 GCCCTATAGGAAAATTAACTATCAAAGCGAACTACCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:2 + chr3R 7739701 5' + blood 86 2 73.97 CTGGGATTTCATCAGCGAGCCGAATGAATGGCGTCTCTTATTGATTAGCGGCAATGATGCACCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr3L 3137773 5' + FB 61 1 57.53 GCTTCGTCCTGTCTGAGAGTTGAAATCAAACTGCCGCCTAGGTTCGCCGAACCGAGAAAGCCTCGAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr2L 16685405 5' - P-element 2837 1 48.92 ACACTTGTTGCGGTCCCTGAGCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGGGGTCAAAAGAATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 - chr2R 5900950 5' - Bari1 1669 1 60.96 CCTTATCGAGAAAACGAAACTTAAGTGCTGGTGTTTAATTCTAAAAACTCCACCAATCCATTCCCCTGGGTTCACAAAATTTAAATAATAGTTAATTGCATGCTATGGGTGATTTTACACAGAGAAAACTAATAATATTTTTAATT:1 + chr3L 6588291 5' - Burdock 499 1 69.86 ACCGTTCTTATAAAAGATAGTTTAGTTTCCTGAAATAGTCTATTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 9332210 5' + roo 8738 2 69.86 ATCCATTTCAAGACTCAGTTGAGTTACAGAGATGAACGAAGAACATCACGCCCACGAAAATTTGGTTGCCAAAGCTCAGAGATCCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 9164960 5' + 412 7091 2 58.22 ATGCCTTTGAAGCAAATCCGTCATAAATTTAGCTTTTCGCCACCCTTCGGGCAAACAATATTTGGAAATTCAATCACATGTCTATTATTTTGACTTTAAAGGGCTATTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr3R 10742244 5' + mdg3 17 2 52.05 GAGTTAATAATACAAATACTTGTATTTGATACCATATTGCTTATTATGCATTATTGGATATGACTTCTCTTCAAGTATAGTATAATATGCATAGTAAACTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chr3L 16264560 5' + Burdock 20 2 71.92 ATTGATGAATAATTTTCGCAGATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGGACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGT:2 + chrX 18034635 5' + Juan 83 1 67.81 TTGCACTTCATCCACAATGATTTTGGTTCCTGGGCCCCTGCATTAGAAAGTTTTCTCGGATCTGTGGTGCATTCGGAATCACTTGTGAATAGCTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGG:1 + chr3R 28033567 5' - diver 6090 2 65.89 ACGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGAAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3L 14581386 5' - pogo 2035 1 65.49 GTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3R 25271181 5' + 412 7122 2 63.01 TAATCGTCAGCCGCCATATTGATTTTGCCAGCAACAATATTTAATGATTAACAATTAACATTGAACAGGGATTTTTGATGCAGGCACTGCAGTCATGCCACGTCAACCTCTTTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr2R 20913260 5' - 1360 3378 1 78.08 GCCGAAATTGGTGCAGTTAGATTTGAACGCTAGGCCGTGGACTGTGGAAAGGAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGGTAAGGTGATATTGGAACTGAAAGGTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3L 22518940 5' - pogo 2086 1 75.34 CACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 + chr2L 1449585 5' + opus 7174 4 58.90 ATGATAAATATTTTTGAGTTTGGGAAGACTCTTACCATTATATTATATTATTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 + chr3L 15261264 5' + pogo 67 1 67.12 TGCAATTCGCAGTTTGCTGTTTTCCGTTTTCAGGAGAGCCCGCGCAGCCAACTAGCGATGATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr3R 10467999 5' - opus 438 2 57.53 GTCACTAACCGGTTTCAACTTGACCAAAATCCAGCAACGACACCGATACCGACCCTCAGACGCCTGCAGAGGAAACATCCCCTAGATCCCCCCACCAATGAACACTCCAACCCATCTACATCTGTGTAATCTCTTAAGTTAATGTC:1 + chr3R 27153181 5' + G-element 4242 1 65.07 AACACACCAATTTTACTGAGGCCATGTTGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr3R 24228995 5' - opus 461 2 60.27 AGCCGCGACCAAGAGCCTGGCCAGAAAACTGAAACAGATCAGCAACGCACAGAACTCGTTTCGCTGTCTGTCTCCTCTTTTTCATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCG:1 - chr2L 7910238 5' - roo 188 2 59.15 GTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr2L 13547055 5' + P-element 69 1 38.36 GTCCGACTGGGTGAGTTTATTTAAGAATTAAACTTTCAGAACTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGGGAAATGCAAAAAAACT:1 + chr2L 19371296 5' + Bari1 80 1 69.86 TTAAAAATAAAAATTTATCAACTATACTTCAGTATAAAAATCTGTTAAACTTGTTCAATCAGCTGAAAACTTAATTTTTGGTGCTGCGTAATGCAACCAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chrX 3529873 5' - 412 471 2 70.55 TATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGGTTGCTTTAAGAGCGACAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGAATAAAATTAAATATCACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAG:1 - chr3R 25598583 5' - Cr1a 4275 1 65.75 GATAGGAGGACGAAGATCGGACCTGGCCAGAAATTGTAAAAGCTGAAATTACGCTAAATGCTGATTAAGTGAACATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chr3R 10468117 5' + opus 7162 4 54.11 GATCGCAGGGGCCGGTCAATTTTTCCTTTCACAAGAGAGAGTTATGATTCGTTGTCCTAATTTCAGACAATGCTGAGCATTAAAATGGTTGCTGAATGTGTGTTGCGACACGTTGCTGCTCACAACAC:1 - chr2L 18379660 5' - Chouto 333 1 67.97 GAATAAACAATTCTCATAAAAGGAGGTAATAGAGTTACCAAAATCAATTGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1 - chrX 14908462 5' + blood 7084 2 65.75 AAATACCATGCCCGCCTCCCATGTTGCGTCTGCCAAAAAGGCCGTGATTTTTCGCTTTTAAATGTGCCCCGTAACCAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGGAGACT:1 + chrX 3524201 5' - roo 406 1 73.08 ACATGTCGAAAAGGAAGCAAATTTAGTTGTTAGTCTGTACGTTTAGCTGTTTGTAGAAAGATATTGTTGAATAAAATGAAATCGTCCAAAATCAAGATAATGGTTTTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 8272370 5' - roo 397 1 76.03 GATGGCGAGGATAAATATCGGTGGGCTGATATCATAAGCATACATAAATATTTATCGGTTGAGTGGCTACTCTAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr2L 12481545 5' - pogo 2056 1 54.79 ATGCAGCTATAAGCTAACTTAAAATGTTGCAAAGCTTGAATGACCTTTAAAAAAATTTCCAGCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 - chr2L 7215626 5' + 297 6638 2 57.53 TTAAAGCAAAAAGACTGGTTAAACTAAATTATTGCTGTACTCTCCACTATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chrX 12551800 5' + pogo 68 1 67.12 ATGTAATTGGCCTAAAGACGTAGCCCTCACTTGATATATAAAAATATTTATTATTATATAGTATACTCTTCATACATTTTTCCATAATTACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2R 8794018 5' - Transpac 282 2 64.38 GGGCGTTAAAACTCATTGCCCGAGCGATCCGATCGCACAGTTGAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACGCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTTCGGCAACAC:1 + chr2L 10032660 5' - hobo 2861 1 69.18 GTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCA:1 - chr3L 14863907 5' - Transpac 219 2 76.71 ACTTCTTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCA:2 + chr2L 12283958 5' + Quasimodo 92 2 82.19 CGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTACTACATGCTCTA:1 + chr2L 19817853 5' - G4 3749 1 78.08 AATCACCACCGTACTTGGAACCGGATTTTCACGGGGGAAGTTTTCGATTTCTGAGGAAGAGAACACCTGGATGCTAATCGGCGGGGTCTAAGGGGCATTTTAGTTCTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCTGGTCTGGCATCACG:1 + chr2L 15432202 5' + Chimpo 15 1 64.08 GCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 - chr3R 15590040 5' - Transpac 5154 2 71.43 GCCGTTGCTAATTGGCGCACTTAGAGCTTCGAGTGCACACTCTCTCGAGGCGGGTTAAATATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGT:1 - chr2R 5900930 5' - Bari1 1649 1 58.90 CATATATTTCAGTTGTTTAATTGCGTTTTTTACCTTAAGCTCGTTCACATATGTATGTAGGTAGCAATAGTCAACATTGTCAATTATTTTCGCAATTTGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 - chr3R 7549785 5' + copia 24 2 69.86 TGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCA:1 - chr2L 11867358 5' - BS 4953 1 68.49 TATAGTTCTTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGACATGGCTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCC:1 + chr4 649083 5' - 1360 3315 1 67.81 CATTTCCCTGGCCCCAAGCGCTGCCATAAAAATCGCATCCTGAACGCATATTTACACGCCGCGAGGCCAAGTTTTCAAATTAAGTTTGCAATCGAAATGAGGCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr2L 10650308 5' + Doc 24 1 67.81 ATTATTAATAATATCATTCCTGTAAATATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 + chr2L 14262841 5' - blood 7330 1 56.16 AATATTAAATGAAAATTGCTTTTAATCAATAACGACAATTTGTGTCTGATTGGTGGAGAAACCCCCTTTGTATCATCATATAGGAAAAGAGATAAACCATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 21192628 5' + roo 8687 2 71.23 AATATTTATAATTTGGTCATCATACGAATACATCCTTTTTAATTCAGTGGGTACGGACTGAGCAGAACCAGACTTCACCATTTGTGGCTCATCTTTTTTGTGCTGGTCGAGTAATCACCGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 8542733 5' + roo 8668 2 76.71 GATTCTAATAATGTCAGTAGTTCTGGAGTTTAAGATTGACGTATTTGTTTGTATTTCGTACATATGTACAGCTGTGTTAAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGTGTTTAAGATAAAAAATTCTTATGATTTACAGTTTTAAT:1 - chr3R 5367035 5' - HB 1571 1 60.96 GTGTTAGTACATTGATCCCGATGTCCAGGAGTTGCCTTCTCTAATTTGACAAACTCTTTCTGCGCTACGTGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2L 8397260 5' + roo 8715 2 52.05 GGCGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 - chr3L 16180956 5' + Transpac 5001 2 73.97 TTTACGTTGCAGACACGCACCTCGATAAGGTGGAGATGGAATTAGGTTTACATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chr2L 14222345 5' - Transpac 246 2 65.75 ACATGTGAGAGGCGGCTCAAAAAGTTAATTTAGCCAGTCGAAAAGATGGCCGCCAGGATGTGCAGCATCGCTTCCATCGTCATCATCTAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2L 13547091 5' + P-element 27 1 65.71 ACACTATGTGTATATATCTTTAGCCCTATTTTCTTTGTAGAGAAGATGTTATTTGTTTTCAAACACAAAGAAACATTTTCCCTAACTGCAATTCAAATTTTCAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAG:1 - chr3L 22638906 5' + Juan 4109 1 69.18 ACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTC:1 - chr2L 23372629 5' - Gypsy6A_LTR 280 1 52.05 GCATGTGGTAATGTTGGAAAAAAAAAAATGAACTTG:1 + chrX 18426985 5' + TART-A 60 2 83.33 ACACTACACACTACTTGATTTTAATACCAAAAAGGTTGAAAAGTAGATAAAAACTAGAAATACGCGTTTAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr3L 20711977 5' + 297 45 2 55.48 CTAGGCTTGGTAACTAGAATTTCTATATTTCATAAATAATAACTGCTAATTATCAAATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGTCGA:1 - chr3L 19279216 5' + opus 7064 4 64.38 AACCGGATATTAACTTCTTTGACATAACAAAGGCGGTGGATTTTGGTGGTTTCGTGTTGGTGAACTTCAATTTAATTAATTAATTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGG:1 + chr3L 22638754 5' - Juan 4170 1 51.37 TTCTGGTTAAGTTCCAAATGCACTTAGCTCTTTAGAAAATATCAGCGCTTAGATTATTTTTCTCAGTGTGTAGGGGGTCTAGATTTGTTGAAATTGGTTCGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr3L 14863976 5' - Transpac 5207 2 70.55 AAGAGAGCCCTACTACATACGTATATTTTCGGAAAGAAGCTGCTACTACTTGCAGACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr2L 15965304 5' + blood 64 2 60.00 GTATTTTCTATAAGTATATATAGGTTTGAAAATTTCCAGACATGATATTTTAACACTGGAAGTCGCATCAACAGTTTTTTTTTATAAATGTCAACTGCGAATTTTTTTATTAACTAACGGGAGTTTCTTCGGCACTAATTTAACCA:1 + chr3L 26282315 5' - HMS-Beagle2 423 1 54.11 CTGTGGGAGTGGGGCTCGAAATTCGCCTGCGTTGTGCGTGAAGATATGCAGGGAATAGAATGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGTCAAGCAAGTTCTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTA:1 + chr2R 6690185 5' + R1A1-element 5175 1 51.67 AAATATATATATAATATATTCTGTGGATACTATCTGAATATCCAAACCAGGCGTGCAAAATATGAATTACACGATTCAAACGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3R 21373703 5' + 297 6618 2 52.05 TGATTGTGTAATTAAATGCAATAATTCTTATGTCTAACTTATGTCACCCGTGTTTAAGCCAAAAGCATATATTTTTTTATTATAATACATTTACTACATGATTTATAGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGTC:1 - chrX 8088091 5' + blood 170 2 59.31 TAGTTCGAAAAAGCTTTCTCCAGCTTTTAATGGTGTGCGTGTGTATGCGACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr3L 15035074 5' - pogo 2081 1 71.92 GTATGGGTCCGTATCCCTGTCTGTGTGATAAGCCTTTGCTAACTAGCTGCCAGCTCACAGATTTGTAGCAGTTACTAAAAGTTCACTTACGGCAAGAAGTCTCAGCCGGGAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTATGGAATTG:1 + chr2L 4174793 5' + 1360 3112 1 74.66 CTAATTAATTCTTAAATTTCTTACACATGTCGAATTAGTGGCGAAAGAGATTCGGGGAAAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3L 9571596 5' + jockey 15 1 78.08 AACTTGTAAACTGCCAGCACACCGTTCCCTCTGTCCGACTCCAAAAGCACCTAATTCCCGCCCAACTAAGCCACCGACCCCTGTGGACAATATATGTATGTAAGTTAACACAATCGCAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTC:1 + chr2R 14562073 5' + Burdock 23 2 69.86 CCACAGCTCCATTATGTCCTGTGTCCTTTGGTTCCTTCTTTTTTCGGTGTATGGTTCCTGGCTGGTAGGGGATGATTGATCAAAAGCTTCACTAAAGCTTTTTATGAACTTTTAGGGGTGCAGTGTTAAACAGCTGATTGAGAGAA:1 + chr3L 17253812 5' + transib2 171 1 51.37 GGGTGGGGGAAAGGCCAGGGGATCTGAGGAAATGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGAT:1 - chr3L 19034318 5' + flea 406 1 78.08 GCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 11228566 5' - roo 8998 2 67.12 AACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGTCCCCGTC:1 - chr3R 31120282 5' + opus 7055 4 54.48 GATAAAAATGGAGCGGGGGTAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTATTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGAC:1 + chr3L 24153185 5' - Tabor 411 2 67.81 AAAATACTTTTGATAATATTAAGCCGCAAATTTTAATTACGTGTTCGACTCGTGCGAAAAAAAAAATGTGAGTGACCTATTTGGATTTGGAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGA:2 + chr3R 20149637 5' + 1360 4 2 76.03 CATTATAAAATGCTTACTAGCTTATTTTGTATCTCAAAACTGTTTAGTCGCTTATTATTTATTGCAACATATGTTAGAATGTAATTTTCGTCTTGCACTATGAACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 + chr2R 13574715 5' + diver 25 2 66.44 ACTTTAGGATTGAACGATGGGCATAAATGCGTGTGCAGTTTAATTCTAATGCGAATACTTACAAGAACATTTTTGTCTTTATCAGTTTTAAGTTTTTAAGTGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2R 5434148 5' + 1360 15 1 69.18 GCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 + chrX 18193662 5' - hopper 1401 1 75.34 ACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCC:1 + chr2R 5582159 5' + Cr1a 478 1 52.05 ATGATTAACATTATAATGCAAATATGTTGATTTTAAATATTTTAATGAGAGAACTTGCCAACTTAATTGCAGCGAATTCTTGCGGAGCGAACACACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 - chrX 8200335 5' + flea 4770 2 75.71 GCTGGCTGCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 10973161 5' + jockey 29 1 69.86 GGCCCTGCGGGCTCGTACGCTAGCGATTTGTGGGCGTCGTGCGCCGTTTCAATTTTGTTAACCGCAAAACTTTTATGGCACCGAAAGGTGATGTTAGGAAAGAGGAATTGTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGT:1 - chr2R 6052735 5' - mdg1 407 2 75.34 CTTTTAGGATTTGTTAATTGCCAGATCCATCTTAGATATATTAAGTCAGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr2R 18048900 5' + opus 48 4 66.41 TCAGTTGTCAGTGGCGACACCACTGCCTGTCGGAGCCACACAATCATTGCCAGTCACATCGGAGCGTGTGACTCGACTGGAGTCACCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGG:1 - chr3L 2033968 5' - Doc 449 1 68.33 CGTCCCGTTTCCATGCCATTTGATATAGACCTCGCATATATAGACAGCAGTTTTCTCCGCACGTCCAGCTGCCCTGCAGGTCATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr3R 9958574 5' + opus 141 4 66.44 CATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:2 - chrX 11534527 5' + roo 8734 2 67.12 ATCTTAATGGCATTAATGTGTACAAGAAGATTATTCGCAATCTGGCTGAAGTCTAAACAAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 23099082 5' - roo 9011 2 62.33 CTAACATCCGTCAGCAAGCATACATACATACACTTAATCTGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGT:1 - chr3L 20747178 5' - Burdock 6314 2 78.77 ATGAGAGAATGGGGTGGAACAAAGGCAGCAAAATGCTGGCCTAAAACTTGGCATTAGGCATGCACTGAAAGAAATGCATTTCTTGTGTAATGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2L 4104130 5' + roo 29 2 66.44 CTTATGTTAGGAGTTGGTGGGCATTTGTCATACTTTTTTGTCAGGCGGAAAACTATCTGTCAATAATGCCATGACTGATCACCGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2R 8793858 5' + Transpac 4955 2 61.64 ACCAGAATGGTGTCTCCTTGCCTCTCTTTCCCACGTCGAGCGACTGTCTCTTTTTCCCTTCCCTATGCTTGTAAATTAAAGCAAATATTTTGCTTATTTATTTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3L 13204840 5' + jockey 28 1 71.23 CAAGCTTAAAGAGAAATTTTAAAATGAGAGGCTCTCTTCAATAAGCCCTCTCCTCTCACTATTTTCTTTTCGTTGACTGAAACTCCCCCTCAATATAATCGGTCGCATGATGAAATAACATAAGGCGGT:1 - chr2L 8542858 5' - P-element 2884 2 75.97 ATAGCTTCGTTGGCGTATCTGCGTTATAATTATGCATCAGATAATGAATACAAATTACGCTCATGTTGAGCATTTGCATGCTGGCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr2R 7223632 5' + blood 7050 2 57.53 GAAGATCTTTTAAAGAAAATTATTTAAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 + chr2R 7097922 5' + copia 4908 2 58.90 ATATGATATATATATAGGCATTTTGCCATTTAATTCTGCTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr2R 9327040 5' - mdg3 167 2 71.72 CCAGGCAAGCAATTTGCCGACAAAAAAAAACAACAGCAATTGTGTCTCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAA:1 - chr2R 5627695 5' - TLD2_LTR 97 1 79.45 ACAGAATGAAATCCAGCCGCAACTGCCCAACTAAGAGTATATATAAATCCGAAATTGGTTAGAGGAAAAAATTAAAAAACAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 18903527 5' + pogo 29 1 65.75 AGAAATCAGCAAGGTAAACAAGCAAATGAAAATGCAAGCGGAGTTGGAGTTGGAGGGGGGGTCACAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr3R 29708956 5' + blood 7024 2 59.43 GAAAGGAGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGGGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGG:1 - chr2R 2994313 5' + gypsy8 131 2 47.11 AGTGGCATTGAGTGTTCCCCTTAAAACAACAATAAAATCAACAATACGATGTTGGGCACTCGTTCTGCTTTTATTATTGTTCTTTTCTGTTTCGATTTTTATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 + chr3R 14526929 5' - 297 6964 2 77.40 GAGAGCATTTACGTTTACAGTGCCTTCATGGATAATAAGTTCCTGGAAGCAGTCACTGCGTTGTCCTACATTGGCTTCGTAACCGTATGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3R 8511187 5' + 412 7100 2 59.59 GTCTTGAAGCCTGAGGATTGCCTGGAAATTCTGTACCAACTGCAATAGCTGACGCACCGGAACTGCGCTGCTTCTCGCTAGCTGTGCTGGCAACTTCCGGATCCGCATCGCCGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:1 + chr2R 9164785 5' - 412 483 2 78.08 TATTTATTTTGTTTATTTTGTTTTCTTTGTTTTGTTGGGTATCTAATATTGGTTGTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 - chr3L 12679098 5' - hopper 1353 1 59.31 GGCAAAATCATATGCATGGAGAAGAAATGGTAAAAGTTCTTCAAATCCTGGTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATTATCTTGTATAGGAAAATTGAGTAGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 4913684 5' + 1360 23 1 69.66 GGATTGGCCCAATCCGGCAGTTGGGGTTGCTTCGACGAGTTCAATCGCATTGAACTTCCGGTCTTATCCGTGGCTGCCCAACAAGTGGCCGTCGTCCTGACCGCCAAAAAGGATCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTG:1 - chr3R 9664517 5' - jockey 125 1 77.40 GAGGCACACTTTAGTAATTAGCCCATCTTTATTATAGCCACGATCCATGTAGTTCAAACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3R 23099182 5' + roo 8726 2 62.33 GCAACTGACCCCCAGGGAATCCCAACTTTATCAATGACAGTTCCAGCTTGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCG:1 - chr3R 13486801 5' + opus 7494 2 62.18 ACTCTTCATATATCACTGGCGCGCCCAAATGTAGTTGATTCTTGTAAATGATTGCCTGCCCGCATAAGTATATGGAGGAGTTCCTCAATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chrX 14385124 5' + blood 7045 2 62.33 GAAAAAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAG:1 + chr3R 20149725 5' + 1360 88 1 77.30 AGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCTTAT:2 + chr3R 10973226 5' + jockey 95 1 73.97 AAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 - chr3R 15649859 5' + blood 7080 2 68.49 TTAATCTCCAACAAGAATGCCATTAGCTCAAATCAAGGAAATGGCCTTTCCTATGTCGTGGTGCCCCGCGTCCAAGTGGGTTTCAATGTTCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACC:1 + chr3R 25384151 5' + mdg3 5283 2 64.38 GACGGCTGCTCTCGAGCTGAATATTCTCAATGACCCTGAATATAATTAAATAAACGGCTGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 27503021 5' + hobo 58 1 58.90 CGATTCCACAACCGCTCTAGCGATCACACGACGCAACACAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1 - chr2L 21237297 5' - P-element 2810 1 32.88 CATTACACAGTCAATCAAATAACTAAAGGATAAAGGATTATTCTTAAGTAGTATTAATAGTGTGTTATTAAAGTTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr2L 10832354 5' + Doc 53 1 52.74 GACTCTCTCCTTGAAGACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATA:1 + chr2L 10784788 5' + Stalker2 7459 2 44.52 CTAGAAATATTTTCCAAAGCTTGTTGCATCTAATAAATGGGATCTTATGGTCATAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 + chrX 7293215 5' - 1360 3326 1 65.07 AACGAAAGCGCCTGACGTCATGGTTGCGTCTGTTTATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chrX 8895283 5' + roo 8749 2 76.71 GGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chrY 311345 5' + 1360 55 1 62.33 TTCTGAGTTGTTGGATTTTATATAAAGTGGTTAGTGGTTATGTAAATTAACAGACAAGGCTTTTGGGTATTGAGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAATGTTGATGATGATGTCAGATTTCAGACTACCAA:1 - chr3L 27874140 5' - gypsy4 6375 1 77.40 ATAAAATAAACAACACGTATAAATTACAACACCAACAACAATACGTCATGTGTGTTTATGAATAAAACAAAAACCCAAGAAAAGAATAGGTGACAGTCGACAACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCT:1 + chrX 12824103 5' + 1360 206 1 58.90 CGAAGAAGGATAAATAAAAATAAAAAACAATAACAGGCAGCAACATGTAAATAAATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGT:1 - chr3R 31904283 5' - Tirant 288 2 63.01 GGAATGTTTTTGTTTCGCATTTCGATGCAAGAGAATTGATTAACGACTCGATTGAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr3R 15590056 5' - Transpac 287 2 58.65 CAAAAGCCAGCGGCAACCACATCAAAATGTAAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAG:1 + chr2L 1136333 5' - 1360 3299 1 78.08 AGCCCAGTGTCCAGTGGAATGCATGCTATTCGATTGGCTTGGCACACTTGCTAATGATAATTTCTTGCCTGCGCGGACTCTTTTAATCAGGTCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGTATGATCTCTCAGCAACTATAGAAGCTAGA:1 + chrX 1790248 5' + INE-1 153 1 58.22 CGACCAGGGAATACCGCTAGCAGTTAACGCACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTC:1 - chrX 12558312 5' - Transpac 5142 2 77.40 CAAAAATCGAAGGAAGCCGCACAAAAATGTCCAACAAAACAGCGATGCCGGCAGCGCAGTAGCAGCGCAGCAACAGAGGCGGCAGCGTGGGAGTTTCGTTAACAGCTGTACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2R 14001167 5' - P-element 2874 1 75.86 CCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1 - chr2R 10991362 5' + jockey 96 1 76.55 CGGAATGAGGGACGAAATGGGCTCAACTGCTTATTATTATGCCGCACGAACGGCTGCTGAGATGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCGTGCTATGGTATTT:1 - chr2L 19851218 5' - F-element 4445 1 56.78 AGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGC:1 - chr3R 9983097 5' + HMS-Beagle 64 2 61.64 TAGGCAAAGTCAGGCGCCCGAAAGTATGCAACCGGCAATAAATCCAATGCGCAAAATTATTACCTGTAATTGCGGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGGTCACAG:1 - chr2R 10991405 5' + jockey 27 1 66.67 TTAGCATTTAGCATTTAATTTGGTGGCCTATTGTAAAGTCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTTAAGTAAATG:1 - chrX 16853393 5' - roo 314 2 76.03 TCTTCTTTTCCTATAAAACATTTAATACTTACGTATTTCACCATTTACATTTATTCTGAAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCG:1 - chr3R 9730327 5' - blood 226 2 54.26 CAATCACTCTCAATTTCATCTTAAAGAACTTACAATTTTCTTGCAGTGCACAAGTGTTTCAGCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:2 + chr3R 10498792 5' + 297 6635 2 56.16 GTTTTGCCGAATAGAAAACTGTGGCCAAAGCGTCCGTTCGAAAGTTCTCGCCCCGATTTAATGACGTAGGCTCAACTGGCTGGATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 + chr3R 9289269 5' - HMS-Beagle 211 4 61.64 ATGTCGGTTATAAAGATTAGATTATGTTATCACTAGGCCCGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTC:1 - chr2L 9010502 5' - 1360 3311 1 73.10 CCTGCGTACATTTGATTATTTAGCATTTAGTTGATTCCCCAGTACCCTCTCACCCCTTTTCCAACTGTTTTTGCATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr3L 15371407 5' - Transpac 5184 2 54.79 AAGTTACGCATCCAAGCCCAGATCCTGTCATAGACCCAACTATATCGCTGCCAGCAAGCCGAGCGCTATATAAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 - chr3R 9983116 5' + HMS-Beagle 6840 2 55.17 GATTTCCGTTCTGATGCGGCCCCTTTGCACTTTACATTTTATGCGCCGTCTGCTGCTGTTTTCCTTCTTCAGCCATTGCTGCTGGTTTTTATATGTTATTTCTTTCTAAACACCATCTTTAAACCCATTTTTTTTTTTGTGTTTT:1 + chr2R 21445952 5' + hopper 140 1 68.28 TTGGAAGTATGCGTAATGGTCGCTGCTATTTTCGTGTGCAAGTATTTTAATCTCGCCAAGTTTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 - chr3L 293968 5' + FB 60 1 58.90 ATTCTAGCTAACCCCAGATGTGGTGGCATTCGTACTTCCAAACAGCAGGTATAATCCTTTTGTAGATTGTTACTTAATTTAAATGAATGTGCATAATCGAATAAGTTTTCTTGCAAGGGGATTTGGACGTGAGGTTAGTTTTTCAT:1 - chr3R 13960547 5' - Doc3-element 4508 1 60.27 TTCATTGCGTAAGCCTTGTAAAAAATGTTAACGAATTTGATTCAGTTTTAAATTTTGAAACGAACCCATTCGATGCGGCCTTGAATACCAGTCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr3R 24228833 5' + opus 7141 4 68.49 CAAGATTTTCCCCACTGCATTTTTGTGCAATTTTTATCCTCAAACTATTTTTGTTTATGGCATGTCAACGCCTAATGACGCCGCCATTTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCCACAATTTT:1 - chr2L 3967176 5' + hobo 34 1 63.70 AGCACCATCTGTGGGATCTGGAACCGGGCATGCAAACACTGCGGGCTTAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGTACCTATAAGAACACAGCACCACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chrX 12564496 5' + blood 7088 2 48.92 TTCCATTTGGAAGTATGCGTAATGGTCGCTGCTATTTTCGTGTGCAAGTATTTTAATCTCGCCAAGTTTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr3L 293974 5' + FB 54 1 54.79 GATGCCAATTCACTTCCTATGGAATGAGTTGCTGGCGGGGATTCACCGTATGCAGCATATGCTCACCGTATTTTATCAGGCATAATAATTTGTCGATTGTTTTTTATGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 - chr2L 13877823 5' + Transpac 4930 2 75.34 AAGCGGAATTCAGAGGGCAAAAAAGAAAAAAAAAACAAAGCA:1 - chr2R 12774739 5' + Doc2-element 224 1 57.14 ATGTAGTCACTGCGGATTAAGCGTGAAATCTTCACTCAAACAAACTAGTTTATGTGATGTTTTCAGCATTTGAATATTATGCCTGATACTTCAGTTCTACCCTAGACCGTTTAACATTTAAGTGTAGTAGGCTTCTCCTTCTACCC:1 - chr2R 10453507 5' + mdg3 5255 1 67.12 CTGCTGCCGTCGACGCCGTCGATGCATTTGTTGTTGTTCTAATGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 + chr3R 30272989 5' - Tirant 8431 2 73.29 TAAAGAGATAAAAGATACGATTTTTGACCTTTCAAGAGATTAAAATATTATACATTTCAGTGCCGAATCATTAAATACGCTAATAGAATCGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr2R 15392833 5' + blood 7044 2 63.01 GGCAAAGTGTTTTCGTTGTCGGCTCAATTGGCCCGGAACGAGTCAAAGAGATCCGCAAATCCAGTTCGACATACAAGTTAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 - chr2R 20856314 5' - Juan 4175 1 55.48 AGGAGAACGCCGTGTACGATGACATGAACCTGTACATCGCACCGCAGAGCTTCATCATCGAGCCGAATGGCTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGATGAATACTCTAATGAGAAATATTCTTATATAAAG:1 + chr3L 1248304 5' - 1360 391 1 52.05 CACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTCCGCAGATCGTGTGCT:3 + chr3R 10973223 5' + jockey 92 1 71.92 TTAGGTATCAGCCAGAGCCTTAATCAATCTCCTGCGAATATTAAGTGTGCGACATGTTGCCAGCGGTATTCATTTAAATCACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr2R 19900956 5' - mdg1 7417 2 56.16 GTTCCTAATAACATTGAGAAGCGCAGAGGGGGGTACTGTACATGTGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACTTGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 + chr3L 20925764 5' + Transpac 69 2 62.86 CGTTTCATCGGATCAAATATCGATGGCAGTGTTACAAGCTGATACGTGCACTCAGAAAAAAAAAACAAATCCGTGCAAAAAAAAAACAGTGATAGGTATATTCTTGAGAAGAACACCGACCGATTATAATTAGGCCTCAAACTGAA:1 + chr3R 6127132 5' - Idefix 477 2 67.12 GACTTAATGTTGCATGTAATCTAAGTGCTGCATTTTAAACTAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTC:1 + chr3R 23583710 5' - jockey 4701 1 77.40 AAAATGATTTTGATTTTGGTAGCTTATATTAAAGATAGATAGACTTGGAAGATAGGAGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 + chr2R 15374732 5' + 1360 41 1 47.26 CTGATGAATTGTTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAA:1 - chr3R 11461869 5' - 17.6 430 2 66.44 GTGAGGTGTTGCCTTTGCTAACAATGTTATCGATATATGTGATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 23507656 5' + 412 80 2 72.41 CGAAAATCCGCATCTGAATCACCACATTCTGCTTAAGGAACACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCC:1 + chr3R 9992634 5' + hobo 163 1 72.60 TGCAAATGCCAAATGCTAATGAATTCATTCAACATACAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 + chr3L 18708624 5' + F-element 97 1 78.08 GCGGAGTCGTCGCTTTCGAACATAAATCCTGTTCTGGCTCACCTTCCACTCTTACTTACTTGTAAGACTGCCGACAAGCGACTGACTAAATTCGGAGACTACATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAACA:1 - chr2L 18823640 5' + P-element 15 1 75.34 CTTGTATTGACCTATTGAGCCTAACAGTCTTTTTCATTAATAACTAGATTGCGCATTCTTCTTTTTTTCCAGTGCATACACACCAACATCACTAGAAACTATATACCCCTTATCCTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCA:1 - chr3R 22236892 5' + Cr1a 4158 1 60.96 AAATGTTGACAGCTTCTCGGCTGTTGGCCTATCTGCTGTCTCGGCCCAGACATTCTCTGGCAACTGTTAATTGAAAAAGTTTTGCATTCTCACCCGGCAAACATGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3R 23624005 5' + roo 12 2 79.45 GAGAGGAATATTTCGGAACTCCTACAGCACTACAAAAAAAAAATGTTAAAAGATAAAAGACATGAAAGGGCAATGCACACAGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chrX 9816498 5' + jockey 20 1 70.83 GATGTATTTGGCTTCCATTGATGTCGTATTGTGGCGATGATCTACAGAAGAGCAAAATACGGACAAGGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 11534427 5' - roo 9019 2 52.74 GCGTCTAGATTGCGCTGCAAAAGGAATGGGATCAAGGTGTTACAGTCGCATCTGAGTAAGCATCACTAATGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3R 10142921 5' + 412 51 2 51.37 GAATGGGCCGAATTTGGCAGCAAAATAAACGCAAAACGGCGCACAAATAAAAATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2R 6585516 5' - pogo 2069 1 54.39 AACCAATGTACAATTTACGCCAATGAGAGGTATTATTTGGTTCAAAGATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chrX 8082382 5' + roo 8738 2 69.18 AAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATGCAAATAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATT:1 - chr2L 11867383 5' - BS 4978 1 51.37 GTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3R 16041095 5' + jockey 59 1 53.42 GCCTTTGGAATACTTTATCATTTCGTTTTTTGTTCTTCCTACTCCTCCATCTGCTCCAAAAACAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 18882561 5' + roo 8716 2 57.64 GTCATGTAACTTCACAATACTCAGGCTGAATTCTTGTCGAATCCGAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr2L 3006095 5' - pogo 2035 1 66.43 AAAGCGTATTAAAATGAAGTTAATCAATTTATAGTGGATTAACCAGTGCTTTTAATTGTCCGAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCAT:1 + chrX 11046297 5' + 1360 392 1 58.22 AAATAAAGGTTGAAGGGAACCTTTGCTAATATTTCGTGTAATTTCATTTAGTGTGCTTTATTTTAAAATCCAGTTTTTGCGAGTGTATCTCGCATCCGATTTTTCAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTG:1 - chrX 3046135 5' - 412 321 2 67.81 GCTTGAGCCACTTGACGATGCAGTCGAAGAGATGCTGACTGCATTTTTAAGCAGGAGCTTTCGAGGCAATACGGACGAAACTAATAAGCCCATTGAGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:2 + chr3L 22529700 5' - roo 9048 2 69.18 AAAAATAAACCTTATTTATATTGTTATGTAGTACTAGAGGCAGAAACATGAATGTTTAGTGAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr3R 20292415 5' - pogo 2046 1 59.59 CTGCCGCCCAGCAAAAGCCAGTGCATATCCGTGGGCACAAAGTCATCCGGAAGCTTGGCATCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAG:1 + chr2L 20835291 5' - roo 272 2 58.90 AAAAATATGCGCATTATCATGCGGGTTTGCCAGTTGCTAAATTTGAATTTCTTTGGAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAGTATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 18846600 5' - roo 9010 2 62.33 GAAAGCTCCAAGCGAACTGGGTGCAAATCAACCGGGACAAACAATTACCAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATA:1 - chr3R 13358678 5' + mdg3 5326 2 65.07 AAAAAATTCTCAACAGAAAAATTCAATTCAATCATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2L 10912252 5' + Doc 32 1 65.85 ATACTAGATGCTGGATGGTTTCCGATACCATTTATTTTATATATTCATGATCCGGATTACTTGTCGGGTCGATCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3R 3322570 5' - 1360 3342 1 54.11 TGTGATTAGGATCAGTTGATATGCGATAAAAATGTCCTGCGTAAGGGAAAGGTAATTACAGTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chr2R 18123418 5' + 412 59 2 57.53 AGTGGGCTGAGCTCTTTGATTGCACGAAGCTATTAAATATGACGTTTTTGCCATAGGAAATGTTATTATTGCTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 11228545 5' - roo 355 2 52.74 AAACAATTTCTTTCACAAACAATCCCAAAAATTAAAACACTAGAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTA:1 - chr3L 14043601 5' + Ivk 92 1 71.92 ATTTATTTATGGAAATAATATATCACAAGTAACCCATTAATTTACCATTTAAATCAAGCGGGCATTGCCTCCATAACGATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chrX 16982201 5' - roo 9030 1 52.74 TTTAAGACTCCCATCCCTAACCAATCGATTGACCGGTTAGCTGCATGCCATCTCTATGTGGCAAGCCAAAGCTTCGCCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr3L 9426789 5' + P-element 42 1 57.53 CATATGCAGCTACTTTTATCGATTGGCTGAAGTTCGCACTCCTTGCCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCGAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGTTGTATTTTT:1 + chr3L 12863689 5' + Transpac 4992 2 63.70 CAGCGGTGGGCACGTGACGCGCCACGATTGGTCAGCTCCTTTCTGAGTCATCTTGTCCGTAGTCGGCATTCCACAGTCCTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr3L 22354424 5' + Doc 68 1 54.79 CTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGC:1 + chrX 19231760 5' - mdg3 164 2 72.60 TTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGCTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATTTGTGC:1 + chrX 22726202 5' - Helena 1225 1 60.69 CGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTG:1 + chr2R 981623 5' + 1360 46 1 62.33 TTATAGTGCGCTATACTGACAAAAAATAGGCTGAAATTCGCATGAACAAGCATATTGTGGTAAGACAAAATGAAATCAGAACTTCCCAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACG:1 - chrX 5421113 5' + Doc 259 1 60.96 GCAACTTTATTAGCTACGCCTTATACCTTTATAATGCTCCGGGGCGGGAAGGACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:3 - chr3L 22529831 5' + roo 68 2 64.38 TGTTACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAG:1 - chr2R 5924454 5' - jockey 4728 1 50.68 GAGTTTCAGCGGAGTGAGTTTAAATCGGATTTAAATGTGTGTGGGAAATGTATAAACCAATTAAAGGCATCGCATTGGACTACAAAGTATACATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 - chr3L 3540253 5' + mdg3 5280 2 65.07 GTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCTCATCTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr2R 6984443 5' + Doc 91 1 74.66 AGTCGTGCTTAATGTGGATAAAAATCGTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAATCACCAAATGTACCCAACATACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 16041094 5' + jockey 57 1 52.41 TTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGTTATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAA:1 + chr3R 25508373 5' + Stalker2 64 2 60.96 TACTAGCGAAGCTTTCACTCAATTTCGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTCAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAA:1 - chr3R 15139866 5' - Tc1-2 1547 1 74.66 TATATCTTTCAATACACCATATCCCTAATATGGGAGCTTAGCTCGATTCATTTCATAAATACTTCACATAATGCTACAGTTTATGGTAGCAAAAGATACATCTTAGAAAACATATCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 11534593 5' + roo 8668 2 78.77 GGATTTTCGTTGATATCCTGCAGCCAGACAATGGGTTAGTGGTGGGTATATGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTA:1 + chr2R 20704143 5' - hobo 2900 1 53.91 ATGCACACTGAAAAGCTTCTATCCATGTTGGTCTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr3R 18846527 5' + roo 8753 2 78.08 AAAAGTTTCGTGATGTGAAGTATGTGCAGTTTAGCTAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3L 10814603 5' + 297 54 2 59.44 TTGGTAAAATGCTCTGTATTTGGTATTGAAATATTGCTTAGACATTAACGATGGCTGAAAAACTTTGCAGGAAAATATCATAATAGAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr2L 16942013 5' - mdg1 386 2 60.96 GGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAA:1 + chr3R 6103588 5' - Tirant 325 2 67.81 AGCTACATTTTTCCGGCTTCGTTGGCAGCGCAGAGCACGGCCAAAATATTATTTTGGCAGTGAATGGCAGGCGGCTCAGCAAACATATATGTTGTAGTTAATTAGCATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr2R 5848931 5' - mdg1 7427 2 63.01 TATAATCAGCAGCTCTGATTGTGCTGCAAAATCGGAGACAGGCGGAAAGTTTGCCCCCATCCACGGCCGACGGCGATATCTCTCCCCTAATTAGCTGGCCATTAGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 - chr3L 16181024 5' + Transpac 14 2 76.03 GTCTGCATAGCCAAACAATTTATTGTTTCCGCAAATTTCCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCCCGATCCATAGTACTGCATTTAATATGACCCTAAACTAGAATCCC:1 - chr2R 5022771 5' - Gypsy12A_LTR 74 1 52.74 ATGTAAATTATTCGAGCTTCTACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:2 + chr2L 20923007 5' + pogo 38 1 59.59 TAGATTTGAAATTTTGAAAGTGTATAGTTATTTATTGACAGTCAAACGAACTGTGTCTTACTTTTGCAAATTCTTCGAGCTTCCTTAATATTTGTTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGA:1 + chr2R 19633170 5' + jockey 4603 1 65.07 AACGATATTAAGAGGGCTGCGAGTGTAATACGAGTATGCCGAATAGAGCATATCCTTGGCTACAGCACTAAGGATCTAAGACGAACTTAAAGGAAGCAACAACTAAGCCTAATCTCTGTGTATGTTTTCGTTTCGAAGGTACCACG:1 + chr2R 11075144 5' - Doc 4389 1 74.66 GATCGGTGGATTATTTTTAATCTGGCTTATTTGGCTAAGCGGGTTCTTGGGTATTTGGCAAGTGCATTTGTGAAACGGTAATTTGTCGTCGAGTCGCGTTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3R 6103539 5' - Tirant 8481 2 68.49 ACCATCGGAATTGATCTCTTCCATCTGGTGGCCAGAAGCACTCGAAAAATCCCAGATTTCGACTACCTGCCTTCTGTTAAAAACCACATATTAGAAACAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr3R 15649903 5' + blood 25 2 68.49 AAGCAATAGATTGAGTAAAACCTAAACGTACATCAAAATAAAGTCGATAAACAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2R 14705765 5' - roo 9005 2 65.07 ATGTATCATACGCTTAAAATGAGCAATTGATCGACTTCCTGAAAATGGTCATTTGTTTTCAGTGTGTATGTGTCACACACTGCGACGTTTTTAGATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCTTTTTTGTGCAT:1 + chr3R 21521282 5' + Bari1 24 1 67.38 GGGTGCTCGGCATCGAATTTAGATTCGGATCGGGTTAGCTTTCGGCTGATGGGATGGGTGGATGGTTGGGTGGTGCCAGGGGTTCGGTTCGCTTGGATTGGTCTGGGTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr3L 3137919 5' + FB 12 1 78.08 GCTCGAATGAATAAAAAAGCTATACAAGATAACATTGCACATTGGCAATTAAAAATTGCTTGAATATAGCTCTGACATCAATATGTATAAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCG:1 + chr3R 30731345 5' - gypsy6 7791 2 69.60 TACAAACTTTTTTATTTTATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr2L 20923027 5' + pogo 58 1 60.96 ACACCTTTCGTCCCTAGAAGAACACCAAAACTCAAGAGATGCCCAGACACGTTCCATAATGCCTAGAGAACAATGCGCCCAAGGGTTATCCCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACAAGCGC:1 - chr3R 31120310 5' + opus 25 4 67.12 AATTGTCAAAAATGTTTTAAGGGGGACAGTACGCCAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAG:1 + chr2L 14969903 5' - Tirant 311 2 77.40 ACAGCAGCAGCCGCAAAGTATGCAACACTAAATTTGTAAGCAATTTTCAGCCCCAGCAACGCCGCACTAGAGCAATTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1 - chr3L 8253748 5' + jockey 4680 1 52.05 CATTTCAGTAAAGAGCATTTAAGTAAACTTTTTTATCTCATCAATATTGTGCGTAAACTACGCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACC:1 - chr2R 9072956 5' + Burdock 6193 2 58.22 ACAATTTCATCCGCACGACATTGTGGTCAAAACCAATGACGACTATGTCATCGTCCAGGGAAATCACAATCGTCGCGACGAGGGTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:2 + chr3L 9375798 5' - mdg1 384 2 58.22 TAGTTCAATTGCTGGCATTATTTAATTAGTACCACCATTTGATAACTCGCTGCACTTGACTTTAGCGGGTAAAGTCAACCAAGTCAGCGAATAAAATTTGTTTCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3R 23676748 5' + pogo 15 1 43.15 TAATACTCGTAGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 + chr3L 21630294 5' + Burdock 39 2 58.90 AAACTTTAAGCTAAAAGATCGTTACTTGAAACTTCTGTTTTGAATCTTAAAATAGCTAAGTTTTAAAATTAAAACATGTACTTTAATTGGTAAATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAG:1 - chr3L 15827435 5' - accord 7163 2 65.73 AAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCTGC:1 - chrX 22386783 5' + hobo 96 1 55.64 AATTTCACTGTTCTGTGAATGAATACGGTTTTTTTATCACGTGTATGTGGGTGCGAGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:1 - chr2L 1074008 5' - Tirant 8440 2 62.33 CTCGATCCACGAAAACCTTCGTCTGGAGCGTCAGACCGAGCTGGTCCAGTTCTACTTCTATAAACTAGTGGTGGCTCTAGAAAGGGTGAAATATTCGGGTAAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 25271133 5' + 412 21 2 71.92 CCCTCTGCATCCTTTTAGTTGTCGATCCAGTGGAAAACCGCTTTCAAAATTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACA:1 + chr2L 16107310 5' + Rt1b 176 1 71.23 GGGGATTAGTCATCCGGGATCGGGAAAGTTCTCAAACAATCGTGACAAACAATATCGATCCATGAATCACTAGCGTGATAAGCAAATACTATGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAA:1 - chr3R 9344192 5' + accord 7010 2 71.32 ATGCAGTTGACAGCCATCCAACGTAAAAACGGCGACACTTCATCGAAAAAAGAAAATATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACA:1 + chr3L 14854670 5' + rover 56 2 60.96 GTCTCGCTGGCTGCATAAAAACTCGCTTAATGCCAACACGCCCTCTACAGGAGCAATAAGCAATAAGCACAGCAGCAGCAACAACTCCATTTCCTCCTAACCCCTGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:2 + chr3R 10973156 5' + jockey 24 1 73.29 CCGCATAAATGGATGCATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chrX 4789079 5' + 297 22 2 71.23 AAAAACCAAACTTAAAATAATTACTTTTATAAGCTAGTAAGGGTATTATATTTATTAATGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCATACCGTTTATGCC:1 + chr2R 7097947 5' + copia 4933 2 60.27 CCTGGATGTTTAAAAAAGGAATTTTACAATAGTCTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTA:1 - chrX 19231811 5' - mdg3 304 1 52.05 GCCGCAAAATGACGAAACGAAGCGTGAAGGGGAGCAGGCGGCAACAAGGAAGAAGGAGCAAGGAACAAGGAAAGCCATCGCAATTTGCCTCTGCCGCACAAATAACATCATTATATATTCTTCATCAGGATCAACAGCGGAGTCGA:1 - chr2R 10996937 5' + INE-1 94 1 75.34 CTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATTTAATACCATTACGTTAAAGTGCTGACCCCAGCATCGGGCCGGAAACC:1 - chr3L 16047628 5' + Gypsy6A_LTR 66 1 78.40 CTGACTCTCTCCTTGAAGACGTTTGCCATTCCTACGCAGTTGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCATAAGTAATAAGTAATAGCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACA:2 + chr2L 10784786 5' + Stalker2 7457 2 43.15 GATTGCTTATTGCCTTGTTATAATAATACCAAATACCATTTGCATTTATACAAAACTAAAGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr2R 9326963 5' + mdg3 50 2 58.22 GTCCTAATCCAAACTATATACTTGTTGTATATAAGTCCTTCAAAATGAAATACAATTTCATTTTACCAATATGGTTTGTATTAATCTTGGGGTAAAATAAAACCAAAAAATTAAAAAAATTATT:1 + chrX 14679295 5' - Tc1 1396 1 29.84 TCACACGACAACTTTATTGAATTCAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2L 1449549 5' + opus 22 2 69.18 ACGGGGCAACCCTCTGGGTTCTCCCCCTCTGCGTTCTGGCGCGTTTCCTGCCGGCACACGCCGCTGCCGAAGCTTGAGCCTTCAGGTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACT:1 + chr2L 8788355 5' + 297 6950 2 67.72 CGGTTTAGCATTCTCTTAGTGGCCGAAAACAATAAAGCAATTAATCAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chr3L 14581387 5' - pogo 2031 1 68.28 ATCTAGTATTAGCTTAGGTATTATTTTTATCTTAGCCATTATTATACTCTCTGATAGATCATTTGAATGGTTTCCAAGCCGATCTATATTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:2 + chrX 21668685 5' - mdg1 7429 2 56.16 GAAACAATCAAATTATAATACTCGTAGAGTCAAGATGCCAAGCACTACTAATTTACACATTATTTACTGATGTTCTTAACAAAGCTTAAAAGTCATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 + chr3L 21630279 5' + Burdock 6160 2 69.18 CTGCTCCTCTGCCCCAAATGTTATGCTTCAAATGTTGGCATTTTTATGTGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr2R 22867504 5' + hobo 63 1 64.75 TTGAGTGGAGAGAAAAATATACCACTTCGATTTGGTGAATTGTCAATGCAGCAACAATTGAAAATCATTTGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 + chr2R 20500028 5' - 412 443 2 54.11 CTGATTGAAAGTGAAAGTATTTAAAATATGATTAGAAAATTTGCTTATCAGGACCGAGGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 + chrX 3506049 5' - Tirant 8462 2 56.72 TTTGCTTCGACTTGGCTAATTGCTTAATTCACGAACACTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2L 15920157 5' + jockey 74 1 69.47 GTTCCTTCGGCTTCATCCCTTTTTGTGTGGGGTGGCAGCACAAAATGGCATTAAATTAAATAAAGACCCGTGTACGGTTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAA:1 - chrX 3122073 5' + diver 5944 2 52.05 ATCTCCGTTTAACTTCGAGTAGTATTTGTTTAGCTTTAGATGGAAGAGAGTACTTGGATATCGGTGCAAAAAAAGAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 - chrX 4566271 5' + Transpac 4962 2 56.85 TCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 + chr2R 5214966 5' + F-element 83 1 67.12 GAACTTAACTATGGAAGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCTCCGCCGCATACCTCACCTTGATATGACATCCAACATGCTGTGTTTCT:1 + chr2R 18048843 5' - opus 430 2 78.76 AGTACTTTGCGTGCAATCAAACGATGTTGGCAGCCTCACTCTCATTTTAAAACAGAAACCAGTTTCTGTGCTTTTCAATTAAATCCTTTCCTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTTAATTGTGTAAGACGTGAATTTG:1 - chr3R 19052873 5' + Quasimodo 7290 2 62.33 TGGCAGCAGATTTAGACCAGGCCAATTGAAACCCGATTGTCCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGCTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr3R 25384264 5' - mdg3 169 2 68.06 AACAAGTATTACAAATTATTTATGTTCTTCAAGATTTCACATTTAATTATTTAGACTTACGAACAACCGCTCTTGGCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chr3L 24153289 5' + Tabor 6883 2 55.86 AAAAATACACCCAAGACCACTTGGCACGCCCAGTGGCTGCAGTTGTCATATTTGTGGCTATTATCTTGGCCCACACAAAAACACCAGCTAAAAAACACCACACCTGACACCATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr3L 9317625 5' + blood 7024 2 60.27 GTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 + chrX 19231746 5' - mdg3 5430 2 63.01 TTTTTATGTCAGCGTACGAAATGAAAGAGATAGCAAAATGTGGCCAAACAAAAGAAAGTTAAAGAAGGTCAGCAGGCTGGCCGACAAATTGAAATATTTAGCCTAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACCCGA:1 + chrX 9951309 5' + hobo 16 1 74.66 GGTGCTTTAATTACTCGAGGAGCTCCAGTTCAGGTCCTGGGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATGTTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:2 - chr2R 10367556 5' - 412 7468 2 67.81 CATCTGAATGCGCATCTGTGAAGTGCATGTCCCACTGTGGTTGTTGCTGTGATTTGGTGAATCGCGCGTAGCCGATTGTAATTATTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr3R 29207506 5' + copia 37 2 60.27 TTGAGGTAAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 + chrX 21204987 5' - 1360 3317 1 65.75 AATTTCTTCCAGACAATTTCAACTCGAAATGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chrX 14692869 5' + Transpac 4960 2 67.35 AGCCAGTACAAAAACATGGCACTTTGGGCCAGCAAGAAGAACAAAAACCCAATTGGCTTTTGGTGGGGAATGAAAGTGAGCCGGAAGAAGGGAAAGCCAAAGTCCAAACACAAGATGACATATATTTATTTAATTTCTTCTTTTGA:1 - chr3R 22493869 5' - 412 423 2 79.45 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAGCAAACAA:1 - chr2R 6585384 3' - pogo 29 1 65.52 TTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAATCATCAATTTTGGCCCAGACTAATTAAGATTGTGTTGGAGCTGGCTGCTCCTTGGGGTTTTAC:1 + chr3L 6509261 3' + roo 8809 2 56.85 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATTCGTGTGTATTTTTGTGCAGTGCACCTGA:1 - chrX 17469160 3' + blood 330 2 52.74 GTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATGATGATCCGCTTGTCG:1 - chr2L 19371250 3' - Bari1 31 1 61.54 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCACAGCGTACATTGGCTTATTCGAAAATCTCATCTAAACTCATTT:2 - chrX 16853283 3' - roo 19 2 72.60 GAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACC:1 + chr3L 21093242 3' - Ivk 1 1 76.60 TATGTCCAACTCCCAAACTCACCACATGCAATGTTAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTAGGTCCTTGCCATCCCATGGAGTCGATGGGTTTGAAAAGTAATAG:1 - chr3L 2739818 3' + TAHRE 10295 1 69.18 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAATTCCGCG:1 - chr3R 9938568 3' - roo 8700 2 61.64 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGC:1 - chr3R 16194145 3' + mdg1 7374 2 74.66 GGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTTTTTCTTAAGATTTCTTCGTCTACCCATTGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTGTGGTGAAGTATTAGCGTTCTATATTATTTTCATTCTTTAGTTTT:1 + chrX 1538316 3' - G2 2847 1 62.41 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTT:1 - chr3L 1387150 3' - mdg3 5331 2 71.43 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGGCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAAATTTCATCACAATTCGACAAAAAGGATAAAA:1 + chr3R 25354585 3' - 297 6629 2 56.16 GCAGAATTTTGGCAGTGTGACGTGCAAGGACTTTTCATTTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGTGATTAATATCCCTGCCACACGTCGATTGAATTGAATTCGCATTTCGATTACTGGAAAT:1 + chr3L 18012373 3' - invader4 490 1 59.59 GCAACCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCTCCGATCGAGGCCACCACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGTAGCTTTAAGTAAAAACGCTGTGTCTTTAAAAGGTTGTAAAAGT:1 + chrX 21500717 3' + Chouto 369 1 67.61 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATATAATGATACAATGTTTGTTGAGTAAACCTGATATACAATTTATGATAAAATATTTGCTT:1 - chr3L 3762215 3' + roo 9064 1 59.78 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAACGGGGATTAAAAAAGTTGATAGAAATATATAGTTAAGAGATTTTGAATATTCTTTCGTTTGATTTTTAATACCAAGTCATAAA:1 + chrX 12843706 3' + roo 9032 1 55.48 CTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACATAGACGAGTATTA:1 + chr3R 11520034 3' - Rt1a 45 1 58.90 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTA:1 - chr3L 9242011 3' - roo 8745 2 78.62 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACATTTACGATTATTATTTTATG:2 + chrX 14908498 3' - blood 7048 2 60.27 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTACGGCATT:1 + chr3R 24175787 3' - Burdock 30 2 57.60 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTTCCGCTATCTATGTAAAGCAACGG:1 - chr3L 12863631 3' - Transpac 15 2 73.29 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAA:1 + chr3R 21237800 3' - Doc 81 1 68.49 AATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCATGACTTAGCAAAATAAACAAATAGATGGCCGAATTGTTAAT:1 - chr2R 6913154 3' - Burdock 6075 1 71.92 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTTGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAAC:1 - chr3R 9482024 3' - roo 54 2 64.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTTCAA:1 - chr3R 10079250 3' - P-element 9 2 78.10 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCAT:1 + chrX 22824849 3' - jockey 4708 1 56.16 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAAATAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGTTGATGGCAAGTTATGGCGC:1 + chr2R 7223793 3' + blood 7366 2 67.81 TGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAACACTAGAGTAAGAACAGAAATGCATGATTGGAATTATCATTGTTTTTATTTGATTATTTTAATTCCATTCATTTAGTGTCGCTTTGTTGATTTTGTTATTCAA:1 - chr3L 14043483 3' + Ivk 5364 1 73.97 TCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTTTTCAGTTTGAGATTTTTAAAGCACATTTCGAAATCAGTAATCATTGAATCATTGAACAGATCTAAATGTTAACCAAGTGTTG:1 + chr2R 9327134 3' + mdg3 249 1 84.83 TTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACA:1 - chr3R 20137253 3' - Burdock 6201 2 64.38 GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTT:1 - chr3L 11669804 3' + Tabor 7238 2 77.40 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACA:1 - chr2R 18807771 3' - jockey 74 1 58.90 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTTCATTAAGTAATACATATGTAATTGTTGAAACCGAACGAATCCAAAGGCAGGCGTAACCTACTTTCC:1 + chr2R 21049276 3' - Transpac 4939 2 69.18 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCA:1 - chr3L 5183690 3' - copia 55 2 54.79 AATATTTTCAATGCCTTTCGGTGCGCTTTGCATGAATGTTATGATGTTTGCACGCGTGAAACGTCAACAATCAACGCACCAGCGAATAAGTGATACTTCCGTTAGAAAGAGATGGCCGCAGTAAAAGAACAACAAAGAGCG:1 - chrX 11528213 3' - TART-B 10614 2 65.96 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATATCAGTATCAATAAGTAATATATTCACCGAGCTAGATTAATACAG:1 - chr3R 24809849 3' - 1360 16 1 74.65 TAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGGGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGAC:1 - chr2R 4745228 3' - blood 7109 2 53.42 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAG:1 - chr2R 6585391 3' - pogo 26 1 65.19 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCAT:1 + chr3L 13597865 3' + blood 7347 2 56.16 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATAT:1 + chr3R 9482134 3' + roo 9034 1 60.27 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTG:1 + chr3R 15974764 3' + P-element 2838 1 26.32 TAAGCAAAAAACCTTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGCTGAACGTAATGTTTGAATTCAAATAATAATTCTAAGATTGAAATAAAGCCAAATGA:1 - chrX 21123435 3' - S-element 62 1 60.27 TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCCACCTTAAGCTGCAGAAATATTTCGGATATTTTTCCCTGCTGCACGGAGAAAAAAATCGTTGAAATCTGAGGGT:1 - chr2R 23225762 3' - Transpac 44 2 56.16 AAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTCGAATATATATATACATAGATTACAATGTGCTCAGATACGCATACGCATTGGCAGTGCTAGAATAATCTTTGTTGTTATTTATTTTTGCAATAATATTACTGGAGGGGTGG:1 + chrX 14874248 3' + gypsy11 3966 1 68.49 AAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCTCCAGAAAGAAACA:1 - chr2R 9332097 3' + roo 373 1 55.48 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCG:1 + chr3L 27391412 3' + 1360 3355 1 57.53 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACGAGCAGGTAAACCAAACCCCAGCTCCACACTTCACATACCAAGAAA:1 - chr3R 13723599 3' - FB 75 1 70.55 AATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACC:1 - chr2R 20382469 3' + Bari1 1661 1 54.11 GTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGAGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAA:1 - chr2R 20382463 3' + Bari1 1700 1 73.45 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGA:1 + chr3L 16180965 3' - Transpac 72 2 67.59 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTATGT:1 + chr3L 11196457 3' - pogo 47 1 53.42 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAGTTTATTTTGACGAATCTTATTCAATGTGTTTCCTGCATATGTATGTTCCG:1 + chr2R 7534679 3' - roo 8734 2 67.12 AAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCATTACGATTAAATATAAATGGTATTTTCAAAATTATTAACGAAACCACTATCACCTAACA:1 + chr3L 23288812 3' + P-element 91 1 37.67 TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGG:1 + chr2L 9287092 3' + jockey 4926 1 67.81 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGCAAACCCACTTTGAGTCAGGAATTGTTGACTAAAGCCAAATACGGGGATTTCTGCTGATGAAGTGCATTTTCAGGTCGGCGGATAACTGTTATCAAATAAATT:1 - chr2L 9010380 3' - 1360 20 1 71.92 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGTC:1 + chr2R 15613873 3' + P-element 2848 1 58.90 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACAGGTGAATGG:1 + chr2L 6074139 3' - BS 6 1 76.71 TTATAAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATCGTTAATAGGCAAATTGATGGTCACACAAGAGATATGCTTT:1 + chr2L 18498441 3' - mdg1 7376 2 71.92 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATC:1 + chr2L 8397241 3' - roo 8734 2 66.44 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAG:1 - chr3R 15465498 3' - mdg3 5334 2 71.92 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGGTACAGAAT:1 - chr2R 9164812 3' + 412 490 2 77.68 GGGATACAGAAAACATTTCTACTAATTCTGGAATAGATTTTCCCAACTGGTGGTGTTATATCTCTTTTTAAGATTCCTGGAGCTGGATCCGCCAGCGGATGGCAATGCAAACAGTACCACCACCCAGTCACAAGCGACGGGCTCCC:1 - chrX 2381433 3' - S-element 485 1 58.22 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTT:1 - chr3L 23146498 3' - 1360 88 1 78.08 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGTAA:1 + chr2L 3734559 3' - mdg3 57 2 63.70 AAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATTGCTAAGTTAATCTTGCAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGACTCTTATTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAATTGCAACTGATATGACAGGCGATGGACACAAAGC:1 + chr3L 6664977 3' + roo 494 1 75.34 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAGGGAATGTGTGTAAGTCGGTCAAATTTCGAGCCAAAGAACTTTCTCTATGTCAAAT:1 - chrX 6341475 3' + I-element 5293 1 59.59 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGCAACTTCGATTGCCAGCCTGAAAGTATGCAATGATATTTCTTTACATAAAATATATATCCAAAGATCTTAGATGAAC:1 + chr2L 12355390 3' - hobo 44 1 54.11 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTAC:1 - chr2R 11379748 3' - jockey 82 1 76.00 CAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACAATTTTGGTGTGCTTAACGATATAATTAGATTGTTTTGTGGATGGTTTTTTTTCGTATTTTTTCCCCGTCTGCTCACCGACTGTGATTTTCAATATGCCAGGCAGGC:1 + chr2R 17186014 3' + jockey 4689 1 76.55 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATACATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTT:1 + chr2L 1449683 3' + opus 7437 2 65.07 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTATGTCGACCGCAACATTACTGACACCTCCAGAAGGCCAACAGCCGACAAGGTGGGCTAAGTATGCTGTGGCTTTTCAG:1 + chr3R 31432681 3' - Juan 60 1 54.11 GGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCGACAGAATATAACATACAAA:1 + chr2R 1277199 3' - Tirant 10 2 75.71 AGGGTAGGGCAATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTGTCTCAAGCTTTCTTTCGAATATAATAATTGGCTTCCTCCGATTATATCGATCTTATTCATTAATGTCTGTAGACCAACACACTCAATGCCAA:1 - chr2R 5580501 3' + Gypsy12A_LTR 1963 1 79.45 TATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCT:1 + chr2R 10552438 3' - S-element 83 2 73.97 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATC:1 + chr3R 29709072 3' + blood 7334 1 54.11 TTATCAACATCGACGTTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACCGGATTACGCAAGAC:1 - chr3L 9428363 3' - P-element 2558 1 17.12 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAA:1 - chr3L 22529746 3' + roo 338 2 67.12 CCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTACATACATA:1 - chrX 5439979 3' - accord 44 2 52.59 ATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAG:1 + chrX 21667937 3' - gypsy2 6556 2 69.66 AGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGC:1 + chr4 829127 3' + INE-1 149 1 67.59 CGGCTATATATCCTGATCAAGAATATATATATATTCAACGAACTATACCTAACTAGTACACCCATTTTCACTACGAGTAACAGGTACACAAATATAGTTCATTTGAGGGAGAAACTAGAGAGGAAATGTGTTTCCTGATATCTC:1 + chr2R 5191118 3' - INE-1 88 1 75.69 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGGGGTAACCATTTTGTTGCAAGG:1 - chr3R 26782655 3' - hobo 15 1 76.71 GAGTAACGGGCATCAGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTGACTGAATCATTATACCCCCCGTAAGAGCACGCAAAAGCTTAGTATTAGGAGCATATGAG:1 - chrX 20381365 3' + INE-1 549 1 78.47 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCTCCAGAAAGAAACAAAAGAGA:1 - chr2R 9332090 3' + roo 393 1 66.17 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCACTATATAAGTTAACCCTAATAACCCTAATAAGTTAACCCAA:1 + chr3L 25078415 3' - Transpac 76 2 72.60 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGTACTGGGGAATCAACTAAATGCTAAATAATCAAATGTACGCAGGTAAGGTACATGCAGTAA:1 + chr3L 15371424 3' + Transpac 282 2 65.07 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATA:1 + chr3R 26399898 3' - roo 8716 2 58.90 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTT:1 - chrX 15167675 3' - roo 67 2 74.63 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAATCAGCA:1 + chrX 14692953 3' + Transpac 259 2 56.16 GCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGGTGTAATTTCGCGACT:1 - chr2L 1073939 3' - Tirant 8198 2 77.24 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGAGAGTTTTCCTTTTCATCTGAACACACTCCTCCCGTGGTGGCAGGACCATCTGA:1 + chr3L 11952638 3' - jockey 4804 1 60.96 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACCTGATGGCTTTTTTACACTTGGCTGC:1 + chr3L 15322108 3' - Transpac 4935 2 72.60 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAAACATTGGCGGTCATCTTTTTTTGCAAATTGATTAATCAGCTATTAAAAAGCGCAGCG:1 + chrX 10960342 3' + Transpac 5213 2 69.18 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTGCATTATAAAAAAGCTCAC:1 - chr2L 17228597 3' - mdg3 46 2 54.79 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATGAATGATATT:1 + chr3R 4884500 3' - pogo 36 1 57.86 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTA:1 - chrX 14692829 3' - Transpac 4968 2 52.74 GTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTCTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATTAAATAATGTTTGCTTCGTGTCTGGCTTCTGGCTGCTGTCGTTTCCGGAGGACCTGAGAGTC:1 + chrX 7428170 3' + jockey 4852 1 61.64 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACT:1 - chr3R 23099061 3' + roo 9032 1 57.53 TATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCCAACTTAGGCGACATATTGAGAAATCATTTTGCTATCAATCGTGGGGGGAAAAGCAAGG:1 - chrX 1081149 3' - F-element 4555 1 59.59 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGCCCCAAGATCACTTGTCAGTCTGGGGCGAAGTCTA:1 - chr3R 4885276 3' - 1360 17 1 73.97 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTACAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCAATTTCTTTCGTTTTGGCTAAAT:1 + chrX 9710097 3' - pogo 36 1 58.22 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGCACATATCTCATACATATCGTACACCGAAACCCATGACAATGGGGC:1 - chr3L 868308 3' + P-element 2844 1 34.85 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTG:1 + chr2R 1277161 3' - Tirant 54 2 55.48 TTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGGAAGCTTCAGGAGACGTTGCAGGTGAGTATTTGTTGATTTTTGGCATCCTGCACTTGGTTGCTCAGTGGACCCTGGAC:1 + chr3R 5502324 3' - HeT-A 5744 1 73.55 ATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTATGATGG:1 + chr3L 18296994 3' - Juan 4137 1 68.49 TTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATTACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTATCATTTATGAAAAGCTGGTGTAAATTATAAAATAAGAAGGACTATACTATAAGAAGGAATAAGAAGAA:1 - chr2R 4695778 3' - 1360 188 1 51.37 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCACTTCTA:1 + chr3R 25521928 3' - blood 7038 2 67.12 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTA:1 + chr2R 6945724 3' - pogo 61 1 59.59 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTTTCAACTCGGAACAAGGCTACCCATTCAAATGGCTCCTCTGAAAAT:1 - chr3R 15514474 3' + 412 474 2 69.18 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGAAATC:1 + chr3L 19146693 3' + pogo 2046 1 56.16 TTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCAGTGTTTGCATACAGTTATAGTTGGCTAAGCTGCT:1 - chr2R 19903983 3' - Doc 4440 1 63.01 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGA:1 - chr2L 16685328 3' - P-element 86 1 27.40 CGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAATTTAGCAACTTCTCTTGATTTTCATTTGTGTGGTGTTAATTAGTTCCTGAAGAAGCAATATGGATCGGGCTACCGATTGGTAAGTGGAGTTCAGAATTTATTTTATGGTAGATGTACC:1 - chrX 21296811 3' + INE-1 555 1 51.37 CATATGTGGCGACAACATAAGTTCTCATCATATTGCGAAGAATCCAGTACACCATAAACGCACTAAGCACATAGATATTAAGTATCATTTTGCCAGCCAAGTTAATTGCCAATTAATCGTTTAATATGCATTTTCACTCCTTTGGC:1 - chr3R 10113950 3' + Copia1_DM 4063 1 63.01 GATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCG:1 + chr3R 18846591 3' + roo 337 2 69.18 AGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCAACGACCAGCTACAGCGGAAAGAATGCAGACCTCTGGTCAGCATTTTGGGCACCGAAGCTTTTTGCAATATTTATGGGCAGAGACACCTTTCACACAGTGATTAAGTGATCATAATTTTTGG:1 + chr2R 21674107 3' - HMS-Beagle2 7002 2 52.74 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTT:1 - chrX 18366005 3' - jockey 59 1 51.37 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCATTTACAGAACAAATAATTACACAGCCAAAGTA:1 + chr2R 3009551 3' + pogo 2057 1 55.48 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATAAACAGACGCAACCATGACGTCAGGCGCTTTCGTTGTCTCGCGCGCATTTCGCCTTTTGTGTTCGTTGCAAATTTTGTGTATTCAATGTCAAAATC:1 + chrX 8895344 3' - roo 24 2 69.86 TACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAAGTAGAAAGCAATTAAGTTTTTAAACAATGAAATTGTCCCATTCCAGG:1 + chr2L 8960048 3' + Ivk 5368 1 70.55 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAAGAG:1 + chr3L 13227704 3' - hobo 65 1 60.96 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAA:1 - chrX 10571345 3' - Doc 83 1 73.29 AACGTGGAGCATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACGCATGTTTGTGGAAGGCGGTTTTTCCAGCTGCCAATGTCAGGGGGTTGCACTTGATTTATGTATTCTTTCCTTGAGAGACCCGAAAGTGCTCT:1 - chr3L 5978717 3' + 1731 478 1 65.38 CGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATG:1 + chr4 829126 3' + INE-1 147 1 66.44 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATC:1 + chr2R 18123518 3' - pogo 59 1 58.22 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATT:1 + chrX 18193840 3' - hopper 25 1 62.86 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGAGTCTTTCTTGCCCGCAACT:1 + chrX 21213428 3' - Doc 27 1 63.01 ATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGAGGGGGGAAATCTATGCCAAATTATCGGCAAGGCAACCGCAAAACTTAAACGCTGCGTTTCACTTTCCCGTCCTGCTGCCCGGCGAAACTTTGCCAGCCGTTAT:1 + chr3L 22628419 3' + hopper 94 1 78.36 GATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTGTTGGATAACATTTGCATGACTGAAATCGGAATTGGAAATTAGTGTATGACTAATTAATGCACAGAAATGAAG:1 - chr2R 16835412 3' - Quasimodo 183 2 54.11 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAAT:1 - chrX 19162546 3' + pogo 2074 1 65.07 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATATTATAGATTATATTATTGCAAGGACTACCAAAATTCGTGGCTACCACTTAAGCAGCAGAATTCAGTTTTA:1 + chr3R 13494435 3' + opus 465 2 54.81 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATTTGTGTAGACAATTTCC:1 - chr3L 5446056 3' + roo 390 2 72.60 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAG:1 + chr2R 15080125 3' + roo 9025 2 54.11 AGGATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTTATCCCACTTTTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAACCGCCAGTTTCATGATGCTCCTGGATCTGTCGGATCGCTTGGGGATGGGTCG:1 - chr2R 18266120 3' - mdg3 294 1 55.00 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTT:1 - chr2R 5067648 3' - F-element 98 1 80.14 CGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAATGTTATTAGAGCACATTTTTCATCGTAATTTCTTTCACGCGAAATAGAAAAAAATAAAGATATCT:1 + chrX 16170481 3' + opus 7305 2 55.48 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTC:1 - chr3R 31956365 3' + pogo 2063 1 59.59 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTTGTCAGCATTCGTGTCA:1 + chrX 5222999 3' - 412 20 2 71.92 GGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGCGGATGTAATAACAGAAAGGTAGATAAAGAGATTATAAACGTTTATCTGATTAAACAGCGTGCAGTGTTTCGATTTTAGTTATATCGTAGTCTATATAGTAATTCTGCTCATCTTCTTTACCT:1 - chr3R 9560030 3' - accord 180 2 87.59 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCG:1 - chrX 15089466 3' + P-element 2852 1 61.64 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAGCGTGAGAGTACTTGGGGAAACAGAGGAGCTCACTTGGCTTGTTTTTGAACAGTTCTACTTATAAA:1 - chr3R 10140144 3' + P-element 2865 1 67.12 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGT:2 + chr2L 19878237 3' - mdg3 83 2 72.60 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTCGATAAAATAATTTAGATATAATTTAATGTTCAAAACTGAAAAAAGTTCAAAAAGATTTAATTATTATAAGCATTTAAAACTTCCCCTTAAATTCCA:1 + chr3R 11096815 3' + copia 232 1 69.86 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAGGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGACTGTACGGATCCCCGTAGAGCTCCTGGCACATCGTGTGAC:2 - chr2L 16371530 3' - jockey 4792 1 73.29 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATT:1 + chr3R 9938714 3' + roo 9031 1 58.22 CTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCA:1 - chr2L 14222267 3' - Transpac 5001 2 75.34 AAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTT:2 + chr2L 6074110 3' - BS 35 1 56.85 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGC:2 - chr2L 18581287 3' - roo 8742 2 71.23 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGCAGTTTTCAGCCTGAATGC:1 - chrX 12623130 3' + jockey 4945 1 56.92 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACA:1 + chr3L 3540218 3' - mdg3 5301 2 57.53 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCG:1 - chr3L 1387153 3' - mdg3 88 2 74.66 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCCTCATTTCGATTGCAAACTTAATTTGAAAACTTGGCCT:1 - chr2L 10650371 3' - Doc 87 1 77.40 TAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAATAAACAATCTTACATATATACGCATAAAGGAACGGTGCTCCTTGTTAGTGATTGCTGTTACTGCCGCAATTGTTTGCGCAAATC:1 - chr3R 12540030 3' + flea 4951 1 54.86 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACGAGCAGGTAAACCAAACCCCAGCTCCACACTTCACATACCAAGAAACCAGTTGAATAATAAGCCAGGTCTTTTCACGGGGAAATTGCAAATTACCGCCTCA:1 - chr3R 13723544 3' - FB 19 1 73.10 TGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGTGCTCT:1 - chr3L 16764822 3' - I-element 64 1 64.34 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTAC:1 - chr3R 5765342 3' + opus 440 2 68.70 TTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAACACTAGAGTAAGAACAGAAATGCATGATTGGAATTATCATTGTTTTTATTTGATTATTTTAATTCCATTCATTTAGTGTCGCTTT:1 - chr3L 14043501 3' + Ivk 5346 1 61.64 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCACTGA:1 - chr2R 6945608 3' + pogo 2052 1 56.85 ATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTCAGACAGTTGGCACATCAACTTCTCGGCGTGTTAACGAA:1 + chr3L 4738457 3' - Idefix 75 2 73.29 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGGGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAA:1 + chr2R 9164900 3' - 412 70 2 77.12 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCAT:1 + chr3R 15514602 3' - 412 76 2 68.49 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCATTATCTTTTTGTGTTTCAGTGCACTTAGACGTGTGTGACTTGCAGCTATGCGAATGCCAGGCACCCACACTTTGTG:1 + chr2R 16410134 3' - opus 7042 4 58.90 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTA:1 + chrX 14908476 3' - blood 7070 2 56.16 GAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGTATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAAA:1 - chr2L 1136313 3' + 1360 3320 1 64.14 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACG:1 + chr2L 16685401 3' + P-element 2829 1 44.76 TAAAAAAAAAACAACAACCAAATACGAAATGCACTTT:1 - chr3L 14586885 3' - Circe 70 1 75.68 GCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTGCAGTGGAGTTCAAA:1 + chr2R 544909 3' + HMS-Beagle 210 2 60.69 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGG:1 + chr2L 13547042 3' - P-element 82 1 29.45 TGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAATTTATTCATGCAACGTTGTAAAGTTAAGCCCGCTGACAGTTAGCTAGTTTGGACCCGGCGCTTTATTTTTTTGTAATTTTCCCA:1 - chr2R 19851661 3' + copia 396 1 57.53 GAGGAGAATCTTAGACTGCCAAAGTCCTGGTTGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTATTGACTAAAAAAGCCCAGTAAACGAGGGGCTTGATGTGGACGCGGATTAGGTGGCNGGATAGAAG:1 + chr3L 22502904 3' - baggins 5043 1 66.17 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAACTCTATTACAGATAGAGTTATTTGATCATTAGTCTCATTACTCGTTTTGAAACTAACAAACTTATATATAAGTTTGATT:1 + chr3R 20909033 3' + I-element 5305 1 54.79 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAG:1 + chr2R 7223750 3' + blood 7323 1 64.38 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATTGAGCTCCAGCGAGCGGCGGCTAAAAAACTTTGGCTGCCTTCCGCGAGGCGCCTGGAAGTAGGCAACAATATTCTTTGTTATTCGTTGTGAGCGGCAGCCAT:1 - chr3R 15030639 3' + jockey 4972 1 65.07 GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAATTAACTTTGGTCGTTAACAGCAGACGCCAAACGAATGTCTGGTTTTTC:1 - chr2R 14537616 3' + roo 8972 2 67.12 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTA:1 - chr2R 7534569 3' + roo 9029 1 56.85 ATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTAAATTTTGGCATCAAAAGTTGGCAGTGCTGAAATTTAATTT:1 - chr3L 11669744 3' + Tabor 7310 2 69.40 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGGCGACGTCG:1 + chrX 17258322 3' - 297 22 2 62.81 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTCAGCAGAAATAATATACTTGTATAAGATATTCTTACTTAAAAATAGCTAACTTATAAGTGATTATTGTACAGTCTACTGAA:1 + chr2R 15062291 3' - blood 18 2 64.23 AATTCGTTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGACCGAAAATCGTGTTCTAGCACAACAATTCAATAGGAAACCGCGACCGGCAGGCGGGGGAATGCATAAGTTGCTTGAGAGCAAGAGGTTGGACTGGGCGAAACACGC:1 - chr3R 3877786 3' + 1360 3165 1 57.25 ATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGTAATCTAGATCCTGATAGTGTGTGTTCTCAGCT:1 + chr3L 19146721 3' + pogo 2074 1 64.38 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTGGTTGCATTACGCAGCACCAAAAATTAAGTTTTCAGCT:1 + chrX 3529813 3' + 412 411 2 71.92 AGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTGCCCATGCCACACACTTTCCCCACCCCCCCTCCCTGGCCCTTTTCCCTCCCTT:1 + chr3R 17316133 3' + 3S18 6064 2 53.39 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCAC:2 + chr3L 4869227 3' - roo 8751 2 79.45 GAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGGCTTAGTTCTCATGGCGGCCGCCGGTGCGT:1 - chrX 9525339 3' + hobo 2937 1 56.60 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCATTGCGGTGGGTAT:1 + chrX 15089604 3' - P-element 30 1 60.47 AAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAGATATAGGTGCATTAACCAATACGATTCTGCAGTGACCTTTGGAAACTCTATAATGTACAATAACACTGT:1 + chr3R 3396097 3' - Cr1a 267 1 53.42 AGCGTCAGCTTTCCGCTGCCGGACGTTCTTTGCGCAGAGCGCTGAACTTACTTCTGGCGTGTCAGCACTCTTCATAACTTACATAGGTGTAAAAGCAGTAAAGCAACGCTTAATTTGATTTTGAAACCGAAGCACCCTGTATACGC:1 + chr2L 14054569 3' - gypsy 102 2 50.00 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATT:1 + chrX 18193855 3' - hopper 13 1 72.03 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCAGATTTTCTG:1 + chr2L 2519943 3' + roo 9051 2 70.55 CATAGTATATAAACATGAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAATATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGAGCGCAAACGGAGACTTGCGATCATCTAGACGAAAAGTTAGTTACAATGAG:1 - chr2R 16111475 3' + invader2 4907 2 72.73 CTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGTCCTCACAAATACTGCA:1 + chr3R 9482157 3' + roo 394 1 76.03 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGC:1 + chr2R 5900914 3' + Bari1 1655 1 64.52 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGCCCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAA:1 + chr3L 20785556 3' - P-element 37 1 55.04 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAGAAAACAATCTTTGGGGGAATTAGTATGCAACTCATCTCAGT:1 - chr3L 20076726 3' - roo 8689 2 68.49 TTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGCATCTAATTATGTATACATTTGTGTAAATTGTACTTGGCTCACTTGCTACATATATGCAGTGCACCGTGCTTGGCCAAAATCCATCAATTCGTCCGGAT:1 - chrX 15318750 3' + S-element 1694 1 70.55 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCACG:1 + chr3L 131831 3' - P-element 22 1 64.71 CCATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACG:1 - chr2R 7534589 3' + roo 345 2 58.90 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTC:1 - chr2L 17730449 3' + pogo 2046 1 71.05 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGCTTTCGCGACAACGCCAAATATCAACTACTTATATAGCGATATATATTCAGGAAAGTTTGGCTTTGGGTCGCCGCTGCTCCTTGCTGTTTTAA:1 - chr3R 21570438 3' - mdg3 30 2 65.07 ACCGTTTACATATTTATATTTATGTTCATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACAATTGTACCCTCGGGTAATTTAAATTAAGCATCTGACGCACACCTCT:1 - chr3L 12714764 3' - 1360 2964 1 71.22 CGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTTTATGGGAGAGCTAATGCAGGCGGATGCTCCGGGCGCCGTATCGCTGTCCGGTCTGTATCGCATACC:1 + chrX 5837480 3' + 1360 189 1 56.85 ATGGCTGTGAAGCCGGCAATGTCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCACACGGTGTTTGACTTCAGTAAGCCCTGCACTCTGTGGTGACCAACACCACAGACCTCCTCCGGCTGGTTCTCGCAATCCTCGCCACCGAGCGC:1 - chr2R 22879158 3' - baggins 5148 1 71.63 CACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATACTAGACTCCCTTCTAGCCTTTGCCATCTAGCCATGAAAATGGCAGAGTGTAACTAAATGTGAGATTGT:1 + chr2L 16688163 3' - P-element 198 1 54.79 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGAC:1 - chr3L 9375823 3' + mdg1 359 2 58.90 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGGGAATCTGCCGCTGCTG:1 + chr3R 25384295 3' + mdg3 198 2 50.68 ATTAAAAAGACGATCTAAACTGGAGGATAAATTACAAATTAAAAGCCAGGGTATTTACACCTTACAGGCAGAGAATGCGAATGGCCGCAAGGTTCACAGGCCATAGATGAAAAGTGTGG:1 + chrX 962943 3' + TAHRE 358 1 44.54 CTTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACA:1 - chr3R 24809895 3' - 1360 66 1 64.38 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTG:1 - chrX 15089477 3' + P-element 2841 1 54.11 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCT:1 - chr2L 7991263 3' - 297 47 2 55.94 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGGGA:1 - chr3L 4869126 3' + roo 9037 1 61.64 AAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGAGGTCGCGCATCTACTTAATTATCAAATAGTTTGGCATGTGGGGAATGTTTCTGGGG:1 - chr3R 15616129 3' + hobo 260 1 60.96 GTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATCCATCAGCAACCCACT:1 - chr2L 12283906 3' - Quasimodo 40 2 61.64 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTTTTTGTTTTTTTTTTGC:1 - chrX 8082348 3' - roo 8704 2 56.85 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTT:1 + chrX 4566261 3' - Transpac 4972 2 58.22 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGTTGAACGCTCGG:1 - chr3R 4464143 3' + 1360 3336 1 56.83 CGGGTATCTGATAGTCGGGGATCCCGACTATAACATTCTCTATTGTTTCGTACTTACGCGATGTCTTTAAATCACTAGAAAACATATTGTAGCTCAGTTTTTTCCTCACCAAATTACAACGAAAAAGCGACAGAAAAA:1 - chrX 20677351 3' + INE-1 555 1 66.67 GTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCACTGGCACAATTTTTAATTAAAACGCAC:1 + chr3R 17182293 3' - Doc 4534 1 72.45 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCC:1 - chr3L 13722031 3' + blood 337 2 63.39 AGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCA:1 + chr3R 18357479 3' + jockey 4911 1 69.86 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAA:1 - chr3R 9482022 3' - roo 8737 2 69.18 CCAATGTATGACCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCACCAGGCATCCCAATCAGTCGTGCCCC:1 - chr2R 24338308 3' + 1360 3367 1 69.86 GAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAATCGTCAAAAACATTGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATAT:1 - chr3R 24809892 3' + 1360 3322 1 63.70 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGC:1 + chr2L 16685360 3' + P-element 2796 1 17.04 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGC:1 - chr3R 20452169 3' + blood 7341 2 52.05 CCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCCACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATAAAGAAATACAAAAAAAAAAGAAGCTGAAAGAACCAGGGAGAACTTGAAATTTTTTACGAGTGTCGAGTAGAAGATT:1 + chr2L 12377865 3' + mdg3 5247 1 52.05 ATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAATGTTTGAACTTGCAAATCGAATACTGCGTTATGTATACAAAGGGTACTTAAAATTCGACTCGTTCTGAGGTGTGTTATTCATCGCTTTTCTAGTT:1 + chr2L 15846645 3' + R2-element 423 1 60.96 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTGCACTTTCTTTTTTCTACTGTGCCTAGGCC:1 - chr2R 11655993 3' + HMS-Beagle 7009 2 57.04 CGGCAAAATATACCTCTCGCGTGGAACTTTAATTGCACTCCTTTTTATCATCAATACTTTACTACCCCCCACCATACATTTCAGCGCACAACACACATTTCCCTCCGGTTTTAGCCACCAGCTTCGCT:1 + chr2R 12011216 3' - Tc1-2 123 1 48.44 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTGCTG:1 - chr2L 8103473 3' + pogo 2074 1 60.27 TCTATCGTTATCCCAGAAAAATGATATTTCACGTTTGCATTCACACTAGCTGAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTCTCTTTAGTTAAATTGTTACATTTGGGTAATACAATTTAGATTGAGATTTGT:1 - chr4 192594 3' + INE-1 501 1 67.12 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATT:1 - chr2R 5848975 3' + mdg1 7383 2 69.86 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCACCAATCAGACACAAATTGTCGTTATTGATTAAAAGCAATTTTCATTTAATATTTCCTTTT:1 + chr2L 21192635 3' - roo 16 2 76.03 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGGATTATATCTCTACAGATTATTA:1 - chr3R 11121696 3' - copia 59 2 58.22 GGCGGCTGGAAACAGGCTCTTAGTTAGGTCATGCCTCTGCTAAGGGTGCTGGATTCTAAACCTTTTACTTCATAAAATTGATGTTTTGTTTCAAATATTGTTAATATATGGTAATATTTTATAATTGAGTATCCAAGAACTGTAAA:1 - chr2L 22299960 3' + baggins 108 1 64.38 TTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTCCAATGGGTTCAGAATTAAATGAGCTTTCGTTATCGCAATAAATTGTTCGTATTTTTGGAAAAAAATTTCCTATGTGTAATGAACTGCTAATTTTTATGCAGTTTAC:1 - chr3R 13120223 3' - Stalker 18 4 76.22 CCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCAATGTCACGGCTTCCCCAGATTGAGTTAGGAAGCTCTGACAGCAACAACTATGCGGCTTTTAGTTCAACAACTGACGGCCAAA:1 - chr3R 14558720 3' + R2-element 302 1 67.91 GATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAAACTTGGCGAGATTAAAATACTTGCACACGAAAATAGCAGCGACCATTAC:1 + chr3L 293956 3' - FB 72 1 66.44 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTT:1 - chr3R 8367151 3' - Doc 63 1 56.16 CTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTGCCGGGAAAATTTAGCTTTTCATTGTCGTGTAAGAGTTGGAGGACACACTGCGGTGATGTAACTACCCCGAAAAAATAGGGTCAACACTTGCCATTCAAGGCGGTAAGCTGACAG:1 - chr3R 10664415 3' + aurora-element 4134 1 60.27 TGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTTATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGG:1 + chr3R 10778743 3' + mdg3 181 2 62.33 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCAATTAAAAAGTGAACGATTAGGTTCTAGTA:1 - chr3R 7884497 3' - jockey 4780 1 70.55 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGAGCCATGCCAACAAAATGTGAATGTATGTAAATATAGAATAATTAACAGTGGAGCTCCTCA:1 - chr3R 15590516 3' + roo 393 1 70.55 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCT:1 + chr3R 15514595 3' - 412 83 2 73.29 TATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAACTAGTTTGTTTGAGTGAAGATT:1 + chr2R 10453481 3' - mdg3 5281 2 50.68 ACGAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAATTCATTTGGCTGATGGAGAACTTTATTATTTTTTTCACATGACCTTTTTTTGTTCTCTGAGTTGTTTGAATCGGAATTAACATC:1 - chr3L 25111131 3' - rover 7081 2 57.53 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAG:1 - chr2R 13276493 3' - roo 8751 2 79.45 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTATGCAGCAC:1 - chr3R 17316015 3' - 3S18 5800 2 61.64 GATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTG:1 - chr3R 10973216 3' - jockey 85 1 67.12 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGAGAGCTTACGCTTGCGCGCGCCAAAAACGATAGGCGGGAAGGGG:1 - chr2L 16685268 3' - P-element 24 1 69.44 CTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTATGCAAAGGATATTGTCGATGGCGCAGACAACGAATTTGCGTTAAAT:1 + chr3R 10498893 3' + 297 6906 2 69.18 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCG:1 - chr3R 26765113 3' - mdg3 88 2 77.40 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATTTTTCAAGCAAAATTTTTTGAAAAAGGCCTAGA:1 - chr2L 3967078 3' + hobo 2851 1 78.08 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAATATATGCATATATATGAAGGAGCTGACTTCATTTTAATGTGTGTAATAAGAGCTAAATCTTTTCAGTTATACTATTTAATAATTTGGAAATAAAC:1 - chr3R 21517959 3' - 297 20 2 68.49 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAG:1 - chr2L 12481408 3' - pogo 38 1 55.00 AGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTC:1 - chr3L 24153174 3' + Tabor 422 2 60.27 TTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTATTATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGGGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAAATATATAGACTATGGTGACCCCGATTTGTTACTATTCCGCAAGCT:1 + chrX 18868065 3' - Idefix 432 2 68.49 TGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTCAGACAGTTGGCACATCAACTTCTCGGCGTGTTAACGAACAAATCCAT:1 + chr3L 4738466 3' - Idefix 66 2 66.44 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTATTCTGAACTTCTCTACGGGAGGCAGAT:1 - chr3L 26002605 3' + pogo 2038 1 63.01 GCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACA:1 - chr2R 19633190 3' - jockey 4623 1 51.37 TAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAGATGGTGATCAAACATATATCAATTACACAAATCCTTAGTTTGGTTCTCCG:1 + chr3R 12787220 3' + 297 6910 2 67.81 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAAAGAAGGCCCAGAAGAAAGATGATTGATTTTATGTGTTTGG:1 + chr3R 27835722 3' - 412 9 2 77.44 GACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGATAAACTGTATGTTCTTTATTAGTCATACATTGTATTCCCACATATAATTATCAGTGCCTTGTTCCATGCGAGTAACATGGCTAATCACGGAC:1 + chr3R 21614422 3' + S-element 1676 1 56.85 AGAATACCACTCTTTTTATTCCTTTTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCCTGTTGCCATTTTGTTTGTTGTTTTCCATAGCTATATTTCTTGGCTGCTAAACTTTGTTGAATTGCTCATTTTGTTGACATGTTGTTTCCAAGCGCCT:1 - chr3L 10373927 3' + copia 103 2 73.29 CTGGAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAATGAATTTTAAAAGCTCTAAAAAGGGCATTC:1 - chr3R 20001603 3' + FB 50 1 60.96 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATGTCTAAAGTTGTATTCTGCCAACGGCTTTGGCAAATGGA:1 - chr2R 19353928 3' + 297 6963 2 78.08 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTG:1 - chr2R 20382475 3' + Bari1 1655 1 53.42 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGAATTGCGGTGGCACG:1 - chrX 22858800 3' - mdg3 5263 1 78.08 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCATTGCGGTGGGTGTGGGCTTGGCATGGCG:1 + chrX 15089619 3' - P-element 26 1 65.00 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTTCCGCTATCTATGTAAA:1 - chr3L 12863638 3' - Transpac 4941 2 68.49 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCG:1 + chr3L 9430623 3' - P-element 102 1 15.75 CCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7218 2 73.08 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATGGTGG:1 - chr2R 14553204 3' + mdg3 213 2 59.59 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATGATGCTTTGGATATTCAAATGTTCTTTAAGAAACTGTGACAAATGTCGCTGATGTTGCGAACCGCGGGAAAATGGCAAATGCGAAAAAGCTGA:1 - chr3R 15974680 3' - P-element 30 1 63.57 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTAC:1 + chr3R 9482128 3' + roo 9028 1 56.16 CGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAAC:1 + chr3R 30731517 3' - gypsy6 7441 2 68.49 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAGGCAAATATCTCCCCGACCCA:2 + chr3R 12795164 3' - mdg1 19 2 72.60 CATACGTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGTAACTATTATACAAAAATACATTATGTTAATTTCACATTATTAAATATTTACTTAAGTGGATTCCGAGAAACACAAAAGTAGTAGTTGTTACCCATAC:1 - chr3L 9341392 3' - INE-1 11 1 65.07 CAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGAATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAATTGGGATGACAAAATGTTTCATCATTTTTTTTTAGCA:1 + chrX 12366684 3' + 17.6 67 2 73.29 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGGAAAAATCGAGATTAAGTCCCCAATTATGCCCATTAAATAAGGCATATTAAAGCCAAGATTAAACTTT:1 + chr2L 1327615 3' - pogo 46 1 54.11 CTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTT:1 - chr3L 27356080 3' + Tc3 1637 1 66.44 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACCCAACAGCCATTGATTCTAATCTCAAGCAGCAGTTAATAATTTTAGGCAAACAGCAAACATAACAACTTATGTATATACCAAAAAGAAACCCAAAAC:1 + chr3R 18665388 3' + 1360 3368 1 71.92 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATGGTGCATTTTATACATCCAGATGGACACAGTGGAAGCCGAGAAAAAGGCTTCCAATGGACCTGGCCTGGAAGAGGGCTCAT:1 + chrX 4589545 3' + Burdock 221 2 62.07 GCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTTCTACTCCGATTTAATGAGTTTTCCTTATTTCGGTGTGAAGTCCTGCGGCGCTCCTCCAGTCAAATTCCTGCTGCGCCTAATGGCA:1 + chr3L 15330081 3' + aurora-element 4222 1 56.16 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACCA:1 + chr2L 14970005 3' - Tirant 8122 2 72.80 ACGTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGACTTCTCATTTGGGCTTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGACG:1 + chr2R 15080083 3' + roo 319 2 71.23 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGGTGTCTAATCATTTTTTTGTGGGGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTT:1 - chr3R 31956387 3' + pogo 2052 1 56.30 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGG:1 - chr2L 7991251 3' - 297 6603 2 67.69 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCTATTTCCCTAAGCTGTTAAACGCGTAGTTAGGTTGTTTATACTTAAACTCTTTAAACAAAAAGCTTATGTTTATGATGGTAAGTTATT:1 + chr3L 11666056 3' - pogo 31 1 58.90 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACATAAAAATGCCAACATTTGAAGCATAACATTT:1 + chr2R 22867489 3' - hobo 54 1 70.43 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACTGGGAATGAGAAAAGATGGAATTATAAACTTTTAATACAAATAATCTAATATACTTTTAAAGAGCTTTAAGACTTTAATAAGTATTTATCCT:1 - chr2R 19263393 3' - Doc 37 1 54.79 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTG:1 - chr3L 4869150 3' + roo 355 2 55.00 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGAGGGAACGG:1 - chr2R 14562094 3' - Burdock 6179 2 55.86 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGGTGTCTTACATTTAT:1 - chr3R 31907339 3' - Tirant 8119 2 64.13 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATCGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGGGAAAATCAAGTAACCAAGTAAT:1 + chrX 19231887 3' - mdg3 5266 1 74.66 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTACCCCCCCCCACCCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCC:1 + chr2L 19903495 3' - Transpac 39 2 44.14 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGTAAAAAAAAAAATCTGGGTCTGCTGCATCAGCTGCTGCCTTTGTGATTGAAGCTAAAAATTCGGCATTTTGGTTGTCTTTTT:1 + chr2R 16908606 3' - roo 38 2 58.90 CCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGATAACGAAATCAATCATCATCATCGTGTCGGCATGGCACCTGACATACAGAGAAAAATACT:1 - chrX 21217222 3' - Rt1b 4886 1 58.90 CGAATCGAGCCGTACGATAAACGGCAGCGCCACTCGGTCGGTTGGACAGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGACAAAAAACAAACGTATTTTATCCGGTAGGCGCACAATTTTCGCGCCTGATCAAAAGACAGCC:1 - chrX 17365859 3' + Cr1a 4389 1 67.88 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGAC:1 + chrX 14136555 3' + roo 331 2 68.49 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGCGAACCTAAATGGGTTACAGTGGGTGTATCAAAAGTGCAACATGCAGAGCCCGAGGTGGGTCAAACTTGATTAAAATATTTAATATTTCCATAAGTAATATCCTTTAA:1 + chr2R 17986411 3' + 297 6969 2 73.97 AATTATTCTACCTATATATTAATCCTATGCACACAGCGTTCAGCAATTGCTAATGGCCTTAATGTTGCCTGCAGCTGCTAAATACTCGAAACATCAGTGAATAATGGTTGCAGAAACGGTTTTCAGAAATTTGTAGACATTCAATT:1 + chrX 7981380 3' + TAHRE 10345 1 58.22 GAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTTTCACAATGTAATAAAGAGATCGAATCTACATTTATTATTAATAGTTACAAAATGTATCTCTTTTATATTTCTAAAAACTACCTGCTTTTAAAT:1 + chr2L 18580651 3' + TLD2_LTR 150 1 56.16 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTAATTAACAGAGCGCTTGTTAAACACATGTATGAGATGATAATGAATTTCAAAATAGTTTCTTATCAGTTAACTAAAGCTGATAATGCAACAGGT:1 - chr3R 31196676 3' - jockey 4788 1 67.12 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAAACAATAAGATCCTTTGTTGGCTGAC:1 - chr3L 5438724 3' + hopper 1361 1 53.42 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCT:1 - chr2R 20500038 3' + 412 7486 2 60.96 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAACGACGAGTTGATC:1 - chr3R 16194092 3' + mdg1 389 2 63.01 ATTTATTTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGGATTTTCAGAAT:1 + chr2R 16312105 3' - G6 2003 1 65.75 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGTGGCAAAGGCAC:1 - chr3L 18708591 3' - F-element 64 1 56.85 GTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGA:1 - chr3R 9289301 3' + HMS-Beagle 179 2 65.07 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATA:1 + chr2R 6052662 3' + mdg1 336 2 73.61 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGGGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCA:1 + chr2L 20561501 3' - P-element 10 2 68.52 CTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGT:1 - chr3R 7739694 3' - blood 7090 2 69.18 ATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGAACTTTTAAATATTCAACACAAAACACTCTTATAGAACATTGAAAACTCTTCCACTTAGAGGAACATC:1 + chr3L 27433 3' - pogo 1830 1 56.16 TGGATCTGTCATCATTGTTGGTTTAGGGCTTAAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTCTTCGCTAAGGCTATATGGCCGCCGTTGTACATTCTTTTGATGATCTATTTATCTAATTTC:1 - chr3R 1546699 3' - I-element 177 1 56.85 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATG:1 + chr3R 5087110 3' + P-element 2829 1 45.89 CACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAAACGTCAATAAAAAATGTATGCGCACACGGGAAACGGAAAAACTGAAAGAAAAATTAACATGAATGGAGAAGGCAAACAAAAGCCCAAGAATCAAAGGAGAAATTCTCGC:1 - chr2R 15393605 3' - blood 479 1 71.92 GCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGAAGCAGCCAGTTCATCAATAGCTGTAGTGGCGATGCA:1 - chr2L 8121345 3' - roo 8768 2 74.66 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTT:1 + chrX 983241 3' - 412 7095 2 58.22 AACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCACCCAAAAACCAACTTAAACATTTCAGCGAGTAACCATTAATTTTTAAGCAATCATGAAACTCCATGCGATTGCCATCAATAACG:1 - chr3R 14105153 3' + transib2 2455 1 59.59 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAAAAATGGGGCGGAGTGTGGCCAGCTGAATCAGTTGAGGTGG:1 - chr3R 4659516 3' - P-element 54 1 47.92 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGATTAATTGAGGGCCATAGGCCACGGGA:1 - chr3R 25384129 3' - mdg3 5261 1 79.45 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAA:1 - chr3R 24228873 3' - opus 7181 4 64.38 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATTCTTGCATAGCGGGCAAATACTTGATTCCTATATAGTATGCAATAAATGCAATAGAAATGCTTGTTATTTGAAAT:1 + chr3R 10357871 3' + pogo 2064 1 58.87 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGCATCT:1 + chr3R 18846648 3' + roo 395 1 71.92 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGCACAAA:1 + chr2R 18722059 3' - 412 30 2 65.07 ATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCTTCTTTTTCTAGATAATATTTTCAAGCCTTTGCCATGGCT:1 + chr3L 5480002 3' - 412 2 2 54.79 AGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAG:1 - chr2R 982333 3' - HMS-Beagle 76 2 71.72 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGGTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGGTTACCTTTGTCGCG:1 + chrX 22386795 3' - hobo 79 1 49.22 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGGAATTTCAGCTTT:1 + chr3R 10468079 3' - opus 55 4 70.09 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTA:1 - chr3L 5446076 3' + roo 9033 1 58.90 AGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAGTAAACAAGACCACGCTGTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCG:1 - chr2L 20360643 3' + R1A1-element 38 1 60.47 TTCTGCCTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGT:1 - chr3R 7424562 3' + 412 7459 2 75.34 ACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGT:1 + chr2L 11867353 3' + BS 4948 1 71.92 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGA:1 - chr3R 27503032 3' - hobo 69 1 63.70 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAGCATCTAAATAAATGGTCTATTTACTTCAGTGTACTCGATCGGCGTTTTTCTCTGGGGGATTATCATTGCGGTTTTCTTTCGGTAAACTTCCATTGTGTGGGGGATTTTC:1 + chr2R 14385415 3' - jockey 4836 1 75.34 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGGAAATTAAAATAT:1 + chr2R 15080148 3' + roo 385 2 69.86 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGTGTAAAAAAGTGCCACCCTTTCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTATCTCCCGAAAACGCTGCCTACATTT:1 + chr3R 5940512 3' - hobo 69 1 65.65 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGA:1 - chr3R 18903366 3' + pogo 2065 1 60.96 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATATCAGTATCAATAAGTAATATATTCACCGA:1 - chr3R 24809864 3' - 1360 35 1 62.33 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGG:1 - chr3L 18708621 3' - F-element 89 1 76.60 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCT:1 - chr3R 8402519 3' - mdg1 7071 2 61.87 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGCTAATTAAGTTAGAAATGTTTGT:1 + chr3L 4869277 3' - roo 37 2 59.59 AAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATTGTGGTTCTATCTATATATGA:1 + chr3R 20292575 3' + pogo 2090 1 78.08 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAAACAATAAGATCCTTTGTTGGCTG:1 - chr3L 5438726 3' + hopper 1359 1 54.79 CTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTT:1 - chr2R 10478696 3' + invader4 3002 2 74.66 GATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGA:2 + chr3R 22810782 3' - flea 4823 1 69.18 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCC:1 - chr3R 30272981 3' + Tirant 333 2 67.59 CTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATAATAATAATTACGAATTCATTTTTTTTAAATATGT:1 + chr3R 21589058 3' - flea 4841 2 80.14 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGT:1 - chr2R 15080003 3' - roo 54 2 56.16 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACAATCAGAGC:1 + chr3L 16181013 3' - Transpac 25 2 68.49 GCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCATAACTTTCTGTTAAATCAACTGATGAAGTGGAAACGGTTTCATTAGTTTTAA:1 - chrX 451639 3' - HMS-Beagle2 7114 2 64.38 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGCTGTGAAAAAGTCCACAA:1 - chr3L 22635665 3' - hopper 53 1 50.00 ACGCACACACACACACACACATGGGTTCAAGGTGGCAAGTACAGAGGGAACCATTTGGGTTAGAACAAGCAACTCTTTCAGAAAAGAATTATCTAAGACTATTTTCTATAAATATTATA:1 - chr2L 4140428 3' + accord 7027 2 79.83 TCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATATTGTACTGAATATTTACCTTGCATCGGAAATTGTACAACGAACGCGAGTAAAGTATTTTAATTAAATGAAGAGCAC:1 + chr3L 18708091 3' - F-element 108 1 54.11 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTGCTGCAGAG:1 - chr2L 8103468 3' + pogo 2079 1 63.01 GCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATG:2 + chrX 8200327 3' - flea 27 2 67.12 GGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTG:1 + chrX 19231821 3' - mdg3 5332 2 71.23 TTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCTAGCAATTACAGAAGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTCACTCTCTTCCCCTCTACTTCGCTCTTTCTGGCTCTCCATTCAATGGAATTTTGTTGTTT:1 - chrX 9584349 3' + Q-element 62 2 58.90 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTA:1 + chr3R 10143009 3' + 412 409 2 73.29 GGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTA:1 + chr2R 10163637 3' - Juan 4140 1 64.38 ACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGGAATGCAAACACGAAATAACATAATTTTATTTGTAGCACATGGGAAATGGGACAGCTCAAAAAAAATTTAAGATATATGGGCGTGGGAGTTTTGTGTACCTTAAGGGTCTTAGAGT:1 + chr2L 21924951 3' - INE-1 548 1 62.33 ATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAATAAAAATAAAAAACGGAGAAACTACTTCCCTTCAAATATTCAAAATGGAAGT:1 + chrX 12726953 3' - 1731 4571 2 64.38 CGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTA:1 + chr2L 5648516 3' - Burdock 6176 2 58.22 TTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTCTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATT:1 + chr3R 19449442 3' - roo 8657 1 56.85 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAGTTCTCATGGCGGCCTCCGGGGCGTATGAGCAATGTGAAATGTAAGCCAGTTTGCGGCACATT:1 - chrX 9525301 3' + hobo 2894 1 50.75 GTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTTATATTGCAAACGGCGG:1 + chrX 10623929 3' + X-element 4707 1 69.30 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGA:3 + chrX 19231818 3' - mdg3 83 2 73.97 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCAACTCCGGCGA:1 + chr2R 18882720 3' + roo 401 1 79.31 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACAGATTAAGTGTATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAGAAAACCTCAAT:2 + chr3L 20747189 3' + Burdock 6325 2 71.23 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGA:1 + chr2L 10032752 3' - hobo 50 1 52.05 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATC:1 - chr3R 9938582 3' - roo 38 2 56.72 AGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATCCCATATTGTTCCGGTAAAGCGCTCGAATTTTGCCGCTGAAAAGGAATCACTGCTGAC:1 + chrX 10660153 3' + Doc 84 1 69.86 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAG:1 + chr3R 20292521 3' - pogo 65 1 65.07 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCC:1 + chr3R 24479254 3' - 412 80 2 71.92 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTGATTAAATCTGCACACACACACACACACACACACACACACACAGCCATAGAGAATTTTCTTTTTATTTTCTTTTTTGTTTTGTGGTTTCGTGTTT:1 - chr3R 9163816 3' + hobo 2937 1 78.86 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATGAGGACATCGTTAATTCCTTCACATTTATTTTAATATAACCTCGGTA:1 + chr3L 6751791 3' + pogo 2074 1 67.12 AGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAAAATACTTATTAATTATTCTAGACAGTAAATT:1 - chr3R 9083567 3' + flea 4698 1 78.08 ACAAAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAACTGAAAATGAAAATGGAAAAAATCTAAGCCGAAAGAGATGATTGCGTCCTTTTTTGTTTTTGGGGTGCAAAGTTTGGCGCGAAAATTTTTGAACGTTTCTGCATAATAAATTTTGAA:1 + chr2L 9471630 3' + G2 3076 7 77.40 AAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:1 + chr2L 14147250 3' - transib2 2592 1 69.86 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTG:1 - chr2R 24630131 3' - copia 4936 2 66.44 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACCTCAAAACAATA:1 + chr2L 2338186 3' - blood 39 2 59.59 GATAGTGACTTGGGGGGTCACTATTTACGATATGTACCAGTATTCTGGACTTGTCCACAAGATTTTACCCCGAAAACTAATTTCACTTTTTCCACTTTTTCATCGAGTGTGTGCGGCCAAGTATTTAGGCAAATGTCGCCAGCTCA:1 + chrX 18418741 3' - X-element 119 1 69.86 AAATCGTGAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGT:1 - chr2R 4193299 3' - 1360 36 1 78.08 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATC:2 - chr2L 2357304 3' + P-element 2801 1 26.71 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGCCACAAC:1 + chr3R 14088679 3' + 1360 3353 1 60.96 TACGCATACAGTGATAGCAAACAACTGTATGTGTTCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTATACTGGATGACAGCCATGCGATCAAGTATCGTCATATTTTCCA:1 - chr2R 17495621 3' + 1360 150 1 70.55 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGCTTATGCAAAGCCAGTTTTATCTGATTAGGCCTA:3 + chr2R 21898030 3' - 412 7 2 78.08 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAG:1 - chr2R 21380586 3' - roo 8668 2 76.64 ACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTA:1 - chr3L 25232696 3' + accord2 7628 2 78.47 CGACTCGGATTCGTATCACGATGATCCATTTTCTATGCATTTGAACGTAGAAAATTTTGATGGTAAGCTTATAGTTTTTCCTTCAGTGTACTCCTCCATCTCCAGCATGATAGTTTGTTTTCATTTGGCGCAGTCACGTTCACAGT:1 - chr3R 29717569 3' + transib3 2550 1 58.90 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATATCGGGACACCCTGTGACCATATTTCACTTTCGCAATTCTCTAGTT:1 + chr3R 10026303 3' - FB 68 1 67.14 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAGAGCCA:1 - chr3L 14969169 3' + P-element 2872 1 68.89 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATTTTTCAAGCAAAATTTTTTGAAAAAGGCCTAGATGGGTCAGCTATCATTCCGCC:1 - chr2L 3967057 3' + hobo 2872 1 63.70 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGTCG:1 + chrX 17258316 3' - 297 6607 2 60.50 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:31 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAAAACAAACAATCGTATGTTTCCCAGTTGCAGG:1 + chr2L 16596264 3' - 412 88 2 76.71 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGC:1 + chr3R 7424648 3' - 412 50 2 52.05 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAATTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTG:1 - chr3R 28008270 3' - hobo 27 1 65.82 AGTATTAGAACATGTTATGCATAGAGTATGACTACTGCCTCTGTTCATTTAAGATTAATTATAAAATATACTTATTGTCATACTTTTTTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAAAATAAATTCTAGCGTTATCTAGGC:1 + chr2L 8777084 3' + G4 3728 1 69.18 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCATATATTTTCAGATATATTCATGGCACTATTTACTGCCCGATTAATTAATCGTTAAATATACAAAGCTAAAT:1 - chr3R 9258655 3' + 1360 3345 1 53.42 GCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTT:1 + chr2L 17228693 3' + mdg3 164 2 71.92 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTATTAC:1 - chr3R 7569558 3' - Doc 27 1 42.36 TAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTGCCCATGCCACACACTTTCCCC:1 + chr3R 17316102 3' + 3S18 291 2 74.74 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCT:1 + chr3R 21237824 3' - Doc 57 1 52.05 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATC:1 - chrX 18366021 3' - jockey 75 1 62.33 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGATAATTTATAAGCAGCCTAAAAGCATGCTA:1 - chr2R 22798607 3' - hobo 49 1 52.74 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGGAATAACCACGGTACAGT:2 + chr2R 11656162 3' - HMS-Beagle 11 2 78.08 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGC:1 + chrX 11534521 3' - roo 8740 2 71.23 GTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCCAGTCTTCCACCGGCACTTCCTTCCACCGCTGATCGTCCAGCGACGCCTGGCA:1 + chr3L 23300755 3' + Q-element 506 2 45.21 ATTAAGCAAAACACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTACGCATGTATCTGGAGCCAGTAACGCTGTGCTGGTGTGTAGGCAGCCACACTTT:1 + chr3R 11771790 3' - S-element 64 1 63.01 ACGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGGCTGGTTAACTTGCCCTTTTTAATGATCGATAACTGGGAACTTTTGAAC:1 - chr3R 23108069 3' - G-element 77 1 66.44 GTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGGTACTCATCTTGTTGTTCGAGGGTCTTTGGGATGGGTTTAGGATGTTATGGGGG:1 + chr2L 23191354 3' + 1360 3348 1 83.91 ATTCGCAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCAGCACGTGTAAGCACGGGTAAGCCTTTTTGAACAGCTGTGACAAAGCTTTTTGATGGCAGTGACTAGCTAAGGCCTGTGTCTTGGGACAGTTTAGTGCTGCCAGACCGGTGGAC:1 - chrY 2468611 3' + R1A1-element 143 1 30.14 GTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTTCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCACTGCCAC:1 - chr2R 8822637 3' + R1A1-element 91 1 52.05 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAGATACACAATTATTGCAATGCTCTTATCCATTCCAATGCATACTTTCATATCTTGTAAAACACACATTCACACAAACACTTCCACATAAAAAAAACTTCGCGGTACCGATCGCGA:1 + chr3L 10506900 3' + S-element 1712 2 52.05 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTTTATG:1 + chr3L 13722146 3' - blood 7045 2 63.01 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTTTGGGGGAAAACTTGGCAAT:1 - chr2R 16908433 3' + roo 9060 1 76.71 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGG:1 - chr3R 8367146 3' - Doc 58 1 52.74 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAACGGGGATTAAAAAAGTTGATAGAAATATATAGTTAAGAGATTTTGAATAT:1 + chrX 12843673 3' + roo 335 2 67.81 TCGATATCCCAAAAAAATTATGAAATTTCGCTTTCGTTCTACTGGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCCTCCTTGATTTTAATCAATTTCAAGATGACTTGTCTTCGATTTAAGTAAATAAACGTTATAGATATACGTAAGGTG:1 + chrX 15900576 3' + INE-1 505 1 51.03 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTG:1 + chr3L 17447572 3' - Tirant 8148 2 58.90 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTT:1 + chr3R 20905476 3' + pogo 2033 1 63.01 GAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAAATTT:1 - chr3R 6368602 3' - Idefix 70 2 69.18 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTAC:2 - chr2R 15079997 3' - roo 48 2 52.74 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTTTAAATATGTACAATCGAAATTTACCTTATAAATTGCACT:1 - chr3R 11526708 3' + pogo 2098 1 79.45 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCAATGTCATTGTCCCTGGTCGACTATTAACCCCTTCTGCAGCAATGACTACGGGGCAAGTAC:1 + chr3L 12863829 3' + Transpac 299 2 78.08 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATAAACAAATCTTCATCTAAACTTGAGCCTAAAATGCAGTTTTAATCTACCC:1 - chr2R 16409969 3' + opus 478 2 71.92 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGCCCCAAGATCACTTGTCAGTCTGGGGCGAAGTCTAAGT:1 - chr3R 4885273 3' - 1360 14 1 76.03 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGA:1 + chrX 11534530 3' - roo 67 2 65.07 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGGGATATAGTTGGG:1 + chr3R 9983082 3' - HMS-Beagle 62 2 68.22 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACAGATTAAGTGTATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAGAAAACCTCAATCCATATATCAAAAGCACATTAGCACGAATTTGAATTGG:1 + chr3L 20747227 3' + Burdock 226 2 64.38 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCAATCGCTTATTTGCCTATGCAAATTGTTGTGCATTAAG:1 - chrX 6938159 3' + hopper 1336 1 70.55 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:1 - chr2R 20461151 3' - jockey 25 1 69.70 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCA:1 - chr2R 13276446 3' - roo 40 2 58.90 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAACCGGTCAATCGATTGGTTAGGGATG:1 + chr3L 9426778 3' - P-element 53 1 50.00 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGC:1 - chr3R 4885310 3' - 1360 51 1 60.27 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACA:1 + chr3L 3540214 3' - mdg3 5305 2 60.27 TATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 46 1 69.18 TGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCATCAGGAACTACGTAAAATTCAACTTTGCATGTCTATACCA:1 + chr2L 22513380 3' - Stalker2 7328 2 71.92 AAAACATGGGTGTTTGCAAAAATACTCGGGTAGACCACCCGATAGTCTAGTTCAGTCTAGATAGTGTGCGGATTGTTAGGCGTTACAGGGATTCGATTTTACCACGTTATAAAGCCAATACTAAATGTATTTAAACTGAAAGCACT:1 - chr3R 22458081 3' + hobo 242 1 58.22 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTTAAAAATGTACAAGTAACTTTTCATGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAATACGCACGG:1 + chr3L 5263470 3' + pogo 2045 1 58.22 AATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACAAAAAATTGCAATGTAAACTTTCA:1 + chr2R 10552475 3' + S-element 1670 1 52.74 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGTGAATCTGCCGCTGCTGAAAAGGAGGAGTCTCATCCACCCACTCAGTTAAGTGCAATATTTCC:1 - chr3R 25385619 3' + mdg3 5496 2 67.12 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTT:1 + chr3R 15649858 3' - blood 7081 2 68.49 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTACTCCCCAATTTCTATCGGTATCGCAGAGAAACGGGTATCTGATAGTCGGGGACCTCGAAAATAGCATTCTCTCTTGTATAATACTCAAATCCTGAAACT:1 + chr3L 22737495 3' + mdg3 227 2 71.92 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCATTTACAGAACAAATAATTACACAGCCAAAGTATAAATCATAAACGAAACT:1 + chr2R 3009569 3' - pogo 26 1 67.81 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTAAGCAAATAATTGTATATTTACCACGAATCAAGAGTTCATACTTCCCGTTTTGCAACCATTTGTGTTTCTTTTCTGCTACTTTGTAACTTTTTTCCGCAGCTGTTGA:1 + chrX 4106542 3' - 1360 14 1 72.60 TTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTACCAAAGTTTGTTTCTCAGATTAAGAATTCAACTCTCCATCTTAATTATTTTCTGAGAGTGTATACATTGACTGAGGCATCTGATTGA:1 - chr3R 6925484 3' - Bari1 1371 1 50.68 TACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTCACCGACACTGTCGCAAACTGGGAATCGCACATC:1 - chr3R 20137205 3' - Burdock 6153 2 72.60 GGAAAAATCTAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAAT:1 - chr3R 20001632 3' + FB 21 1 53.42 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAA:1 - chrX 15089519 3' + P-element 2799 1 25.34 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACA:2 + chr3R 7424626 3' - 412 72 2 67.12 AATAATAATAATGATATTAATTGATTGAATTATGGAGCGTGCACCGAGTTGCGCAAAATCACCGCCAGGGGGCGACACACACACACACATACACACACTACCACAGCGTACCTCAAAAGCCAATGCAATTTACACTGAATCAAAGC:1 + chr3L 6649549 3' + mdg1 7075 2 73.29 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTATATTATATTTAATCTAGTTATGGTTTAAATACCAAGTCTTTCCAGACTGTCAAAAGTTTTTGGTAAGCTGAGCGGTAAGCCTTGCTAATTTTGAA:1 + chr3L 15891122 3' + mdg3 223 2 50.68 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACA:1 - chr3R 16194134 3' + mdg1 347 2 67.12 ACATTGTTGCAAAAGGGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTATTTTTCCATGCGTTCTACGAGCAATTTAAGTCCCCATAACAGGATTAACTTTGACCTTT:1 + chr3L 11669877 3' - Tabor 6902 2 58.22 GGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAGCAGCTCATCATAAATATGACTTATTTTATTT:1 + chr2R 5022814 3' + Gypsy12A_LTR 118 1 77.93 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCGAGAAGCTGCGCCATAGTTTCGATGAAGAGGAGCGTAG:1 + chrX 7329346 3' + Bari1 1693 1 73.76 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAA:1 - chr2L 14222261 3' - Transpac 76 2 72.60 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGGGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTCGGAGGTGGCAACTTTACATATT:1 - chrX 18125086 3' - BS 5026 1 59.59 GTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCAGTTTTGCT:1 + chr3L 17447553 3' - Tirant 8167 2 62.33 CAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTGCTTGCATATTCAT:1 - chrX 12893317 3' + Bari1 1668 1 58.90 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCC:1 - chr3L 9430580 3' + P-element 2865 1 58.06 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAAACTTGGCGAGATTAAAATACTTGCACACGAAAATAGCAGCGACCATTACGCATACTTCC:1 + chr3L 293966 3' - FB 62 1 60.27 GTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAG:1 - chr3R 20452209 3' + blood 290 2 77.40 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGAAACTAACAGTTGATTTCACGAGGAGTG:1 + chr3R 20905517 3' + pogo 2074 1 67.12 TACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAATTTAATTGGCTTTTTAAACTAGGTCGAAAATCTG:1 - chrX 18239347 3' - jockey 4554 1 51.37 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGTAAAATAATTTTTACTTAAGATAATGTTTTCGATTTCGATTCTGGATTGTTTTACTGTAATAATTTTGTTTTCCTTTATTTTGACA:1 - chr3L 12034351 3' + 1360 3379 2 73.29 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAGTGCGTGCGATGGGCAATGGGC:1 - chrX 15167649 3' - roo 53 2 58.90 GTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATGTATTTGTATTTTGTATATATTTTTCCCATAGTGATCGTAAGACTTTTAGCTTGTATTTTATTTTCGGTTTCGTTGTTACT:1 - chrX 13460493 3' + Quasimodo 7330 2 60.27 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCNCTNGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGTCATCTGAAATGATGCCATTTAGGAAATTA:1 - chr2L 12355226 3' + hobo 2928 1 76.55 ATATTAAATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAGCAGCTCA:1 + chr2R 5022790 3' + Gypsy12A_LTR 93 1 60.27 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGATTGTTATACTTGTAAAAGTATAACCTTTTGTTCTTCTTGAATTCA:1 + chr2R 6945771 3' - pogo 14 1 76.03 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATATTTCAGCCTGAAGAAACTGCACAAGGTGCAATTGCTGGTGGATGCGTGCAATGTCTTCTATCAGCCCA:1 + chr3R 28725040 3' - pogo 44 1 50.68 CCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGCGCTTCGAGTCACATCCTCCATCGACGCCTCCTGGCATTCTCGCCCGCTGTGCGTCTGCGATCCACAGTTG:1 - chr2L 19057319 3' - opus 179 4 51.03 CTTGACCGCGCGTTCTCACTCCCGATCTCCTTCCTTTAACGCTTCGACTCCTATCTTCTTCCATCTGTGCTTGCGCCGACGCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTTTCCCCCTTTTTGC:1 + chr3R 14499106 3' - gypsy8 445 1 46.67 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACAATATTTAAATAAAATATTTTTATCG:1 - chr3R 25822946 3' + roo 9032 1 56.85 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGGTTGGTGGAAAAA:1 - chr3L 18296882 3' + Juan 4181 1 59.59 AGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTGGAGTCTGGTCCAATTTGGATGGGATTTCGAATTAGTGCCTCTTATCTCAATTGGCAGCAAAACACTAAATCAAAACAACAAATATGTATAAATATATTTCTGGAACTTTTTGAATTAACA:1 - chr3L 1964781 3' - I-element 4930 1 60.96 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTTGCCAAGTTATGAGTTTAATCAAAATGTTTATAAA:1 + chr3R 8402683 3' + mdg1 402 2 70.55 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAA:1 + chrX 15167785 3' + roo 9038 1 62.33 TTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGTGCTCTATTTTATAAAAATGTTACGCTTATGATTTA:1 - chr3L 16764792 3' - I-element 51 1 49.32 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGG:1 - chr2R 14553230 3' + mdg3 217 2 54.31 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTAT:1 - chr3L 15058854 3' - blood 70 2 63.01 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTACTGTCAGCGAA:1 - chr3L 5514159 3' - Doc 47 1 55.48 CATTTTATAACGATCGATTTGTTCGTTATCTATTTGTTTTTTAGTTTTACTTAATTATTCCACACACAGAAAATTTTATAGTATAGCAATTTACGTTTAGTATTCAAATGGTCGACAATAGACTGCAATTTGCAGTAATAGTAATA:1 - chr3R 25549505 3' - Doc3-element 202 1 63.70 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGCAACTTCGATTGCCAGCCTGAAAGTATGCAATGATATTTCTTTACATAAAATATATATCCAAAGATCTTAGATGAACA:1 + chr2L 12355391 3' - hobo 43 1 54.79 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATGGGAATTCTAATTAACTACAGTATTAACTGCATGTACCAGCTAAGCAGACAAAGGTGTGTGTTGTGCACAGGA:1 - chr3R 27971025 3' + mdg1 351 2 65.07 GCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAATATATGAA:1 - chr3R 23507545 3' + 412 7515 2 63.70 TCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAACTACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGGTGTACGTATTTACTTGTGTGTTTGTGTGTT:1 - chr3L 2512211 3' + hopper 1327 1 73.29 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTATGTTC:1 - chr3R 31956367 3' + pogo 2073 1 59.70 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACA:1 + chr3R 10140262 3' - P-element 74 1 36.30 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTA:2 - chr2R 9332114 3' + roo 356 2 54.79 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACAC:1 + chr3R 9938674 3' + roo 327 2 73.97 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTAATAATATATAGAATTATACTAAAAATGTTCTTCGTTGCCTATTCGGTCACAG:1 - chr2L 21724024 3' + pogo 2037 1 67.12 ATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATGTAGTCTCCGAATTTAGTCAGTCGCTTGTCGGCAGTCTTACAAGTAAGTAAGAG:1 + chr2L 18823592 3' - P-element 2692 1 42.76 GAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGC:1 - chr2L 17228636 3' - mdg3 5337 2 73.97 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGTTGGCATTAAGCGAGTTTTTATGC:1 - chr3R 10973168 3' - jockey 36 1 65.07 AAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCATTGGTACGGCGTTACCACACTGGTACGATGTTACTACACTGTGTTCTGTTAAT:1 - chr3L 25492623 3' + Porto1 206 1 62.41 TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAA:2 - chr3L 15371272 3' - Transpac 44 2 56.16 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCCATACCTGAAC:1 - chrX 4589421 3' - Burdock 51 2 63.64 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAAT:1 + chr2R 18123517 3' - pogo 60 1 58.90 GCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCAAAATATATTAAAAACAGCAACAAGCGAAACAGCTTCATTTAAATGGCACGCAAGGGCGCCACTTGAGTCCTGGACATGCTCCAAAACCCCCCAGCTCCAACTCCTCCATATTTCCCTC:1 + chr2R 21894486 3' + 412 318 2 78.77 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCA:1 + chr3L 5438818 3' - hopper 73 1 68.97 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGCGAAGTATGATTAGGTTATTGACTCGCCAACTTGAAATATATATGAGAACAA:1 + chr2R 19354078 3' - 297 62 2 63.01 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTCT:1 - chrX 17258194 3' + 297 6926 2 52.74 AGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAGTAGATAGGGACAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 5063 1 58.90 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTAGTTACATCCAACGTTCCTCAAACAGTTGA:1 - chrX 14692800 3' - Transpac 4939 2 71.23 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAACACCCGAACTACCATTAATGGTGTCGGTACTGCTAAAGGAAACACAAATTAACAAGGTGTCCTTACCG:1 - chr2R 15062160 3' + blood 7336 1 54.79 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATACGTTGATGGCAAGTTATG:1 + chr2R 7223789 3' + blood 7362 2 65.07 AATTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGAT:1 - chr3L 23456282 3' + Gypsy6A_LTR 244 1 76.71 AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTGGTAGGACGTGGTCTGTGGTCATTCCCGCCGCTTATCCGCCTTGATTAGCAATTAGCACGCGT:1 + chr2L 6406628 3' + transib2 2819 1 80.82 CAGCGGATGTTTATGTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAAAATTGGGGTTCTTATGGAATACTTGAATTTATGACTTATATTTTAAAGTATTATTTCGAGTGCCTAAAAGGCCTATGGAAAAGTGGATGAGTC:1 - chr3R 12735884 3' - Quasimodo 6904 2 64.38 AGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTGGAG:1 + chr3L 1387204 3' + mdg3 5413 2 73.97 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAAAAAATCCTTGCAACAAGGATAT:1 - chrX 22824713 3' + jockey 4963 1 57.53 AAATTAAATTTGTATTATTAAATTATTCTTATGTATGCCATATTCATTTAAAAATATAATTATTTGCTTACCGAAAGAATGCCAAATCGATTAATGTTTGGCGAATTAAATAAGTTGCCATACTGATGAAGCCAAACCACCCAGAA:1 + chr3R 23591741 3' + invader2 4727 1 38.36 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCG:1 + chrX 16853418 3' + roo 340 2 65.52 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGGGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTTGATTT:1 - chrX 13548291 3' - jockey 4803 1 56.85 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCCAAAGGCCAGGGCAGACAGACAC:1 - chr2R 18882545 3' - roo 38 2 56.16 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGG:1 + chr3L 16180958 3' - Transpac 4941 2 54.55 AGCAGATACCCGTTATTCAGCTAATTTCAGTTTCTCATTCAACTGAAATTAGCTGAATAACGGGTATCTGCTATTTCGAACTCAACTAAAAGCAATCTCCTTTGATTTTGATTGAAATGTTCGGTT:1 + chr2L 21275149 3' - INE-1 545 1 76.98 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAAAGCCG:1 + chr3R 14331269 3' + Burdock 6364 2 39.04 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGAGAAGATTTTCGGGAC:1 - chr3R 22846678 3' - 412 36 2 61.64 GGTCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAA:1 + chr3L 23456274 3' + 1360 3332 1 58.90 GGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGGGTTGTGCGTCGAATAAGGATTACTGCGCTGCGTGTCCCGGAACGAAACTATAATTTTATGCCGTCTC:1 - chr2R 21272486 3' + hobo 87 1 58.90 CGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATA:1 - chr2L 13877647 3' + Transpac 5192 2 56.16 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAG:1 + chr3R 5087144 3' + P-element 2863 1 69.18 GAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGATGATGACTAGGCGGTGAGGCCGGACAGCGACTGACAGCCGGAGCAGGCGGCGGACCCGGAGACACCGAG:1 + chr2R 11828686 3' - F-element 4584 1 55.22 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGAGAAGATTTTCGGGACGAAATTTAATTT:2 - chr3R 22846666 3' - 412 7077 2 69.86 GGGAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTG:1 - chrX 10873764 3' - mdg3 5261 1 75.57 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTTTCCCTCTCGCTCTGGCAACAGGTAACACTGCC:1 - chr3R 26315848 3' + roo 9054 2 73.29 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAATTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAA:1 - chr2L 13877689 3' + Transpac 231 2 71.23 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCAAATAATTCGTTCTTGAGGTTGCATTAATCATCTTAATGAAATTAAAT:1 + chr2L 17162923 3' + blood 7387 2 80.82 TAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAATGTCTCAACCACTTCTAGTTCTATCTCGATTTCAGCTGCTGTTAAACACACATTTTATTCATAC:1 - chr2R 12411686 3' - HMS-Beagle2 99 2 56.16 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAATTAAATGTCAGTTCCGAATATCAGAAACTGATGCATGAAATACACGCGGGCTTTAAAATAATTTGGTGGCGCGTTCAACAAAAGGTTCG:1 + chr2L 18048387 3' + blood 7359 2 64.38 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACT:1 - chr3R 15465474 3' - mdg3 5310 2 56.85 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATT:1 + chr2R 21897992 3' - 412 45 2 52.05 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGAT:1 - chr2L 7991266 3' - 297 53 2 58.90 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTGGTCACTGGAGCCTCAG:1 + chr2R 18051078 3' + mdg1 7407 2 54.11 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGCTTTTCAATCGAAGACTGCAGAAATATGTTTTAATATCACATAAATATATATTTTACACGAATTTAAATTTG:1 + chrX 10948877 3' - Transpac 46 2 53.42 AGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTATGTACTGATTACATATTATAACCGGATATCCGCTGCCACCTATAATGTATGGTTGATTAATTCACTGGAGCGATCA:1 + chr3L 3482480 3' - X-element 4541 1 51.05 TCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATGTTCCCTTTGGCATTCCCACTAGCTGAGTAATATAAACCGAAAAACGTTCACTTACATTAATTTTTAACAGGAGCACCAGCCACAGGGCAAGCAGTTGGCAGAACCACAGAAAACAGTGG:1 - chrX 20475470 3' + INE-1 505 1 60.27 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAA:1 - chr3L 4710731 3' - Doc 56 1 58.27 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAG:1 + chr3L 22519113 3' - pogo 38 1 59.59 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTC:1 + chr3L 3540253 3' - mdg3 5280 2 65.07 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTATAATAT:1 - chr2R 14246950 3' + pogo 2047 1 56.85 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATT:1 - chr2R 15080028 3' - roo 79 2 73.29 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACG:1 + chr2R 18722038 3' - 412 50 2 52.41 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATGAATTTAAGTCTGATAATTTCTCACTTTTTCCTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTTTTGAGGCCTTCACCACAT:1 + chr3R 12367554 3' - copia 38 2 58.39 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGATTG:1 + chr2L 19417129 3' - BS 5002 1 55.48 TGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCCCCT:1 + chrX 21667996 3' - gypsy2 6 2 78.77 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATAAACAGACGCAACCATGACGTCAGGCGCTTTCGTTGGCTCGCGCGCATTTCGCCTTTTGTGTTCGTT:1 + chrX 8895315 3' - roo 42 2 52.59 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAAC:1 + chr3L 21093241 3' - Ivk 54 1 55.48 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCTTCCATACTCCACACACATCACACC:1 + chr3R 18847402 3' + Stalker2 362 2 54.11 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCA:1 - chr2L 8397146 3' + roo 9014 2 56.85 CTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAATGTTATACAATTTTTAATTTCTTTATTTTACTCAGC:1 + chr3R 25271325 3' + 412 7537 2 77.24 AATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTTATATGTAATAACGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGGGTTACGCATCTTATTATAATTTGAAACTGTTCACGATCTCGTCCCGATTAAGACTGATCTTTTAA:1 + chr3L 23382464 3' - 1360 393 1 67.12 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTGCTGCAGATGCACCTGATGCCCCTGGCCAC:1 - chr2L 8103447 3' + pogo 2100 1 78.08 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCATGTCATTTTGGGTTTCTCTTCAGTTCTTTGGCATTTCTCTTGTGCTTTTTTGATGTTTTTTTT:1 + chr3R 27786660 3' - Tirant 57 2 55.48 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAAGGACGT:1 + chr2R 2949168 3' - 17.6 6948 1 71.92 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTA:1 + chr3L 8253712 3' - jockey 4716 1 72.60 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACCCTTAATATTC:1 - chr2R 19900991 3' + mdg1 7403 2 64.80 AGCGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTGGTTGCATTACGCAGCACCAAAAATTAAGTTTTCAGCTGATTGAACAAGTTTAACAGATTTTTATACTGAAGTATAGTTGATAAATTTTTATTTTTAATTGATGC:1 + chrX 3529880 3' + 412 478 2 75.34 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGAGTGATTAAAATCGCTGCCGCCACTCGAGGAGGGGGATGGGATGG:1 - chr2R 8790980 3' + Transpac 5178 2 63.64 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGTGAATAGACTATTTCAGGAAACTAAACTATCTTTTTCTCTTTATATATTTTTTTCATTTACTTTACGGTGGAAAGTCTTAAGATTTCCGA:1 - chr2R 9334701 3' - roo 30 2 41.78 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAGGCTAATACAAATCTGTAGTAATAT:2 + chr2R 18123552 3' - pogo 25 1 67.12 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTC:1 - chr3R 10778656 3' - mdg3 5323 2 65.07 GTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7193 2 78.46 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCAC:1 - chr2R 20913113 3' - 1360 63 1 59.59 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAG:2 + chr3L 20290752 3' + roo 8989 2 75.34 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAGCTCAACGAGACTTTGACTTGGGAAGTAACCACTTAATATTTGAGACCGTAAATCATCCCAGAACTGGTTAACGA:1 - chr3R 16771287 3' + roo 394 1 76.03 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTATAGTATCATATTTATGATGGTTTGCATTT:1 - chrX 23043118 3' - roo 8721 2 61.38 GGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATACTAAAACACTCGCTTCAGGAGAGTTGGCTCGTATACGGCCTCTCCTCCGC:1 - chr3R 30361919 3' + invader4 2746 1 65.07 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCTACCCACATCAACAATAAACCGAAATATCAGCAGGTGGGCTCTTTGGCTTCAACACAGCCCTTTGTGCC:1 - chr2L 10912171 3' - Doc 15 1 72.60 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGC:1 - chr3L 22354426 3' - Doc 70 1 58.90 CCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCATAATTTCCAGCTAATGCATGAACGTCACACGAACGAACGTCTACATTCCCCGCTGCCCAC:1 + chr3L 5655115 3' - X-element 4406 1 58.90 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTTCAAACGAGAGTTGCGTGCCATTGCCATTAAGTACTGATAAATGCCAGTATTT:1 - chr2R 18721902 3' + 412 465 2 54.35 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCATTTCATTCATTTAATTCCCATTT:1 - chr3L 22221084 3' + 412 473 2 75.86 CCTCGATGAAAACAAATGAATTCAAGGTCGAACTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACTATTACCACGATGCTATCCTTGTTGCCTTTGGCTTGGATAAGAAAATCAAGGAAAGGATGCAGTTTGAGTAAAATAA:1 + chr3R 20193062 3' + Chouto 5937 1 50.34 AAGACGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTATTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGATTTCATTCGCACACAAGCTGGCATAGGGAAGCGATAATTGTCTT:1 + chr2R 17899641 3' - 1360 3370 1 64.38 ACGAAGAAGCATACGATCATATCATATTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAATCACACGACTAGCTCTCGTTTGAATGTTGGCTAACCAAGCTGGCCCAAACCACATCCCCT:1 + chr2R 21772642 3' + invader3 50 2 58.90 TTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATATAAAATAAGCAAACAGATGAAATTAATCTTAATTAGTAATTAGTAAGTCTGCCCAATGCCTCTCA:1 + chr2L 7917182 3' + roo 8810 2 55.48 GAGCAAGACCGTGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTATGTCATTGACCGGGTGATTTGGCACTCGCGGGCGTCAGACACGTTTATATATATTATATTTATTTGGCGCTTAGGTTATGTTGCGCATTTGCTGCACGTGCACTTTAAA:1 + chr4 614942 3' - Doc3-element 372 1 54.79 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAG:1 - chr2L 20923026 3' - pogo 57 1 60.27 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGGCATAACTCATGCGAC:1 - chr3L 16180852 3' + Transpac 272 2 58.22 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTGGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTCTGTGCGTAAATAACATTTAGTTTGTTCATCCTAA:1 + chr3L 5446223 3' - roo 37 2 60.96 CCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7240 2 79.03 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCAGTTGAAAAGTAAACAAAATAAATCGCTTAAAAGAGATTAAAAACATGTTTGTATTAAAAA:1 + chr3R 18357538 3' + jockey 4971 1 69.86 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTATCTGGCAAACAGAGAAA:1 - chr3R 9616568 3' - roo 59 2 62.33 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAAAAATGGGGCGGAGTGTGGCCAGCTGAATCAGTTG:1 - chr3R 4659522 3' - P-element 62 1 43.15 TAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGACAATATTCCCATTTTACCATTTTCCATTTGCCAACTTGCCTTGCCTTGCGCGTTTTCT:1 + chrX 6500681 3' - transib2 2478 1 63.70 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATG:1 - chr2L 21237251 3' - P-element 97 1 19.18 AGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATTTCTTTTCATTATTT:1 + chr2L 9356913 3' - Stalker4 7013 4 59.31 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAGATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGAAGAGTATGGCAGCGGAAAATTTAATC:1 - chr2L 12481394 3' - pogo 26 1 58.45 TTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATGAGTGGCTAAAGTCAATAATCAATAATCCTATAGCAATGTTACCTCGATGTTCCGTGAATCTGCGAGCTACTCTGACTGGAATGAGTGCC:1 + chr3L 11960479 3' + jockey 4790 1 65.75 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTACTCCCCAATTTCTATCGGTATCGCAGAGAAACGGGTATCTGATAGTCGGGGACCTCGAAAATAGCATTCTCTCTTGTATAATACTCAAATCCTGAAACTCCTGCAT:1 + chr3L 22737502 3' + mdg3 5486 2 76.71 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGTTGGAATTTTTTTGTGGCTCTGCTATATGTTTATTTTTACCCTTGCAGCGATTTCCATATTTTC:1 - chrX 18149741 3' + hobo 2931 1 77.40 ATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTAAATGAAACCAAAGAATACCAGCAAAACTTTGGGCAGGAATCTTGAGCTATTTAAATGTTATTGAGCGTTTCTTATTGGT:1 - chr2R 20856177 3' - Juan 4147 1 57.53 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGG:1 + chr2L 17747536 3' - Tirant 8137 2 63.70 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACCAGAGTAAATTTACAACGAAAAGTATCAGCCCGATCATTTAGAACGAGCTTGAACATGTTGGGAATCATAATGATTGGAAAACGC:1 - chr2L 13244770 3' + hobo 2902 1 58.90 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAAGTGCAAGGAAACGCTGATGGAGAAGTGCTCGAAGGAAG:1 + chr2R 9668120 3' - jockey 4684 1 74.29 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACA:1 - chr3R 10541242 3' + hopper 1359 1 54.79 ACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAA:1 + chr3L 21093229 3' - Ivk 66 1 62.33 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAG:1 + chr2R 6585518 3' + pogo 2039 1 63.01 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCT:1 - chr3R 10467996 3' + opus 7478 2 60.71 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGCA:1 + chr3R 7424662 3' - 412 28 2 63.04 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTA:1 + chr2R 15080090 3' + roo 326 2 73.29 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCCTTGTCCGTATTTTGCTCTTCTGTAGATCATCGCCACAATACGACATCAATGGAAGCCAAATACAT:1 - chrX 11534428 3' + roo 354 2 53.42 ATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCATCTTTAACTCCGAGCTACATTGGTTATTAATGGGGGGTCATCGGTGAAAGTGCAGTTCAAAC:1 + chrX 17744533 3' + 1360 3185 1 58.22 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAGTGACGGGTGGCAGTTAGGCATTTAACATATTCTATGGAAATCCGCTGGCAAACCATTCAAATGCTCGTGCACAGTACGTAATGCTTTA:1 - chrX 14958348 3' + jockey 4945 1 67.81 GTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 182 2 66.23 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTTTT:1 + chr2L 15833089 3' - hobo 62 1 60.27 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCG:1 + chr3L 13227691 3' - hobo 78 1 69.86 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGA:3 + chr3L 21093234 3' - Ivk 61 1 60.27 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCAC:1 - chrX 19231753 3' + mdg3 5423 2 67.81 ATTTTGATTTTATTTTAATTTTTTTAGTTGTAATGCCAAAACATTTTAACGCCCACAAACAACATTAAGCGCACGATTTCGAAATAAAGCGGTCAGCATAGCAATATCTCTTTTACGTTATTTAAAATGATTAAAATTGTTGAAC:1 + chr2L 16146367 3' + Rt1b 125 2 55.86 TATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACATCGATGTCAATC:1 - chr3L 9375780 3' + mdg1 7440 2 70.55 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGCGCCGGTTGTCTGCTGTCTTTCTCCTGCCACTCTCTCTTGCC:1 + chr2R 15613897 3' + P-element 2872 1 72.60 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGCG:1 + chr3R 9345674 3' + pogo 2048 1 58.16 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTACCATTTAAATATCGTTATCAGTATGGCAATTTGA:1 + chr2R 11656119 3' - HMS-Beagle 45 2 53.28 AGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGAGCTAAGACAG:1 - chr2L 20638336 3' - Doc 52 1 50.68 GAAATAATTGTTGAATATGTTAACACTCAGAATAATGTCGCAGATATACTCACCAAAGGTTTAAGTAAGCAAAAGCATTGTGGCATTTTGAAATCACTTGGTAAACCTGTTGGTCATTAAGAATTTACAATAGACTGACAAACTTT:1 - chr3L 10267774 3' - frogger 326 1 69.18 AAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTA:1 + chr3L 14043602 3' - Ivk 91 1 71.23 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCG:1 - chr3R 13056756 3' - jockey 4846 1 79.45 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGG:1 - chr3L 18708574 3' - F-element 47 1 60.96 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGT:1 - chr2R 21897882 3' + 412 425 2 63.01 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCGTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGC:1 + chr3R 13358706 3' - mdg3 5298 2 53.42 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATATCGGATGTTTTGACCGCCATTAAAACACTGCCAAAATG:1 - chr3R 23968560 3' + jockey 4953 1 48.63 CAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGC:1 + chr2L 19372133 3' + Bari1 1650 1 56.85 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATACACTT:1 - chr3L 14581343 3' + pogo 2074 1 67.12 GATCGACTCACCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAG:1 - chr3R 7539434 3' + mdg3 140 2 56.94 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGTTGGCTAAGTTACAAAAATTTGGAGCGGGGCATATATGTCTATGTGACCCAGAGTATTTGCTTTAAGTTTGGAATGCA:1 + chr2L 13576085 3' - 297 6616 2 61.64 AGACTTTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAATGCAAGAAATAATCCTAATTACAAACTATTAGTA:1 - chr2L 3575810 3' - Burdock 6086 1 76.71 CGCCGGTACGAACGGGTCGCAGCCAGCGACAAGGAGACGCAAGAAGCGTCATTTGTGGAGACCGCAGCCAGCGGTCAGAAGGCGCAAGGAGCGCCAATGACTTAGAATCCAATGAATATGGGAGATATGTATGTATATT:1 + chr2R 18642809 3' + aurora-element 312 1 74.10 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGGATTATATCTCTACAGATTATTACGATACGCTTGTTCTAGCTTGTTTGTCGAGACTCTACAGATTTGCTG:1 - chr3R 11121649 3' - copia 12 2 73.29 ACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAGGCATCCTAAAACCTCCAGTTCAACTTC:1 + chr2R 22692466 3' - Ivk 19 1 69.34 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCA:1 - chr2R 20500060 3' + 412 7464 2 76.03 ATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACACATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAACTGTGCAAACAAATTATAAGTGCAAAGCGAATTATAGAATGACCAACAGTTGTCAACGGTGGCGGCCGCTTGGATTTTCTTCTTCTGCCGAAAA:1 - chr3L 15389718 3' + gypsy4 315 2 62.33 AATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAATAATACAGTAACACATATTATATTTTTTTACGGCAAGGCCGCTGGAAT:1 + chr3L 12971281 3' + 297 304 2 67.12 CCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTTTATTTATATCAATTTGAATGGTATACAAATTT:1 + chr3R 19675979 3' + hobo 2769 1 77.08 CAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACA:1 - chr2R 6984332 3' - HMS-Beagle2 6968 2 76.03 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAAAGAAACTTTCCGTCCGTTGAAAATTGC:1 + chrX 16853461 3' + roo 9046 1 68.49 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAA:2 - chr2R 24630127 3' - copia 63 2 63.70 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTAATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCA:1 - chr2R 19904017 3' - Doc 4474 1 55.48 AACATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTAGGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAAAAAAAAAAACAAAACAAACAATATTCGCACTCCACGCGGATTGGGCATTATCGTCGA:1 + chr3L 26350093 3' - G4 3584 1 60.96 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACG:1 - chr3L 9430610 3' + P-element 2782 1 16.44 GTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGGAGCA:1 + chr2R 15080085 3' + roo 321 2 76.03 GCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAG:1 + chr3L 13204783 3' - jockey 80 1 70.00 GCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATAAAATAAAACGACAACTTACTTCAGGTTCATTCAGCAAAGTGTTGTATACTTTCGGGCTGCTGTCTCTCCATTTGGGCCAGC:1 - chrX 18707417 3' - BS 4729 1 73.29 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTAGT:1 - chrX 14692827 3' - Transpac 47 2 54.11 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCATTCGGT:1 - chr3L 15321956 3' + Transpac 254 2 56.16 TGGGATTTTTCTACTGACGAAGAAAGTGGTGATGAGATGGAAGACATTTCTACGATACTGGAGAAGAATTTGGAAGGAATTCTTGAGAGGGGAGAAAGTATATGTACTGGTGTATAGGAGAGTAAGTGTGGTTGTATG:1 + chr3R 27839408 3' + looper1 469 1 73.19 ATCGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTC:1 - chr2L 5771447 3' - Juan 95 1 79.72 CTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGGGCAGCGGATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATGTGTAAACAAATCACCTGCAATTGATCTTGTGTATGCAAATCGCAGAGCGAGGAG:1 + chrX 7559144 3' - blood 7221 2 56.59 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATATTCTTCGTAAGGATTGCTAGCC:1 - chr3R 4722333 3' - roo 8678 2 74.66 CCTTTGTGCCTTTTCCCCTTTCTTAAAGACTTGTGCGCTCCCAGTAACCAGAATCAAAATTAAAATTAAATTAAAATTCAACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAAAAGGATGCAG:1 - chr2L 16107314 3' - Rt1b 180 1 73.97 TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTATAATGTGTTG:1 - chr2L 7459556 3' - BS 5046 1 58.02 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCATCTACTCGTACTATACT:1 - chrX 12893331 3' + Bari1 1654 1 54.11 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTAT:1 + chr3L 4869237 3' - roo 36 2 61.90 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATATTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACG:1 - chr3R 20292406 3' + pogo 2055 1 52.74 TGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCA:1 + chr3R 23507647 3' - 412 90 2 78.77 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATTTATAACTAAAATGTGAATTTTTAATCATTTAATCATGAAATATGTATAATAAATATATATGTTTATTAATTTTTATGACTTTTG:1 + chr2R 8305337 3' + blood 344 2 63.01 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCCGATCGCTCAGCTAATAAATCCGCACAAGAGGCTTTACAGCA:1 + chr3R 24479295 3' - 412 17 2 70.16 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGGGTTATTTTATTTTACCTTCAACGTAGATAGCAAGTTGAACA:1 - chr2R 14884274 3' + mdg3 168 2 69.86 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAACTGGCAAATTTATTTTTAAATGAGTAATAAAAGCTTAAGGAGTTGGGGCTAAATAATGGAAGA:1 - chr2L 2464198 3' - pogo 55 1 57.53 AAAAAATAAAAAAAATAAAAAATACAGCATAAAAGCACAAACGAGAACAACAGAAATTGAGCTTAACAATTGGTTTTTTTTTTGTTTCTTTAACCATTTTTGCAGACCACACACGCAGCCCGCTCGGCATGTTATTTACAGTTAAT:1 - chr2R 11802395 3' - hopper 146 108 52.05 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATT:1 - chr3L 9241991 3' - roo 8726 2 65.07 AGTTAGGAATTGAACACACAAATTTAAACAAATTGTTGTAGCTCTATTTAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTTTCAGGTGAGTTGCGTTTACAACGATCACTCTCTTTACATCTGGG:1 + chr2L 1934979 3' + hopper 954 1 69.18 TCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGTGCTATATGGAAA:1 + chr2R 17100151 3' - P-element 65 1 41.10 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGC:2 - chrX 15089465 3' + P-element 2853 1 62.33 GAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCCAAAAGTTCCGAAAATCAAAAATTTCACTTCTTTCAATTTTTTTTTAGGGCTGTCCTTCATTTACTACCTTAGATGTTAATAGAGCTTTACTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTAACTATCAG:1 - chr2R 4330779 3' + FB 121 1 50.00 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACA:1 - chr3L 13597725 3' - blood 7052 2 58.22 TGGCGACCGTGACAGGACAGGTCTCTGCCACTGAGTATATATACTCAGTTGCAAATAATTTGTGTAACTTTAACAACTTTAATATGGGAAACGGAGCGGCCAATTAAACGTCGTTGGCCTGCACTTTTGTTCAGCCATTTTGGTAA:1 + chr3R 23824832 3' + gypsy11 453 1 43.15 CATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAGTTCGTTAATGTTTTTTCCAGAAGCCGTTGGAAAAGTTTAAACGAAATCGAAGAAAAGTGGGTGAGCAAAAAATGCTATACACATTATAGCAGTTTTTCGTTGGGTAAACTT:1 - chr3R 7568273 3' + mdg1 7054 2 75.34 ATAACTTCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGAGCAAGAGAAGCTTGCTCTCTGAGAGAGTAATAAAGTTGCCAGACAGAGACAGAGACGCCGTAGTACAGAAAGCGATAGAAACTCACAAAGCGCCGCCGCAAC:1 - chrX 2508777 3' + frogger 89 2 62.33 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTACACTTATCACAATAAGTTTT:1 - chr3L 6096454 3' + roo 387 2 70.55 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAATGATTTTA:1 - chr3L 4639067 3' + roo 9011 2 61.64 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCACCAATCAGACACAAATTGTCGTTATTGATTAA:1 + chr2L 21192607 3' - roo 44 2 56.85 TAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACACATTCTTATAAATCCAGCAATACTGTAGACACTATAAACTTGGTGAACCAGTACGCC:1 + chr3L 21630419 3' + Burdock 6332 2 60.27 AGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATGTCTATGAAAATCTGTCTATAAAAATATGTATAATTTGATTAAATTAATTTTTCATTTGTAAGAATTACTATAAT:1 + chr3L 23287178 3' - Quasimodo 44 2 54.79 CTAACAAAAATTTGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAATGGTGTATTGGGTTATCAACTAATTTCGGTTG:1 + chr2L 22746319 3' - 1360 86 1 75.86 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTG:1 + chr3R 5087077 3' + P-element 2805 1 24.82 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAAGCATTTTTTAATAG:1 - chrX 14914313 3' + mdg3 5471 2 66.44 GGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAATGTCCAGCTCCTGCAGACCATCGATATTGGTAGTGGATTCCAGAATTAGACTTTCGGATTGCAGCTCATTGAAG:1 - chr3L 8389039 3' - FB 857 2 51.03 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCT:1 - chr2L 18048258 3' - blood 64 2 58.90 CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGCGGCCGTCGAACCTCTCTA:1 - chr2R 17013977 3' - HMS-Beagle 17 2 73.97 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATTGCCATTAAGTACTGATAAATGCCACTATT:1 - chr2R 18721903 3' + 412 7509 2 57.53 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTTTTAATTTATTTGCATTAAACTTGTATTACAATTTTATAACATCTATATATGATATAATAGTTACTCGCAATATGCCCATTA:1 + chr2R 9815151 3' - pogo 33 1 63.01 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATTGAGCTCCAGCGAGCGGCGGCTAAAAAACTTTGG:1 - chr3R 15030707 3' + jockey 4916 1 78.36 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCAGATTAAAAATAATCCACCGA:1 - chr3R 6103541 3' + Tirant 373 2 67.59 GTGATCTTATATCACGCTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGGGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCATC:1 + chr3R 4571531 3' - blood 84 2 53.42 TTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCATTTTTACGTTGGATGGCTGTCA:1 - chr3L 14854677 3' - rover 63 2 65.75 CGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAA:1 - chr3L 4710726 3' - Doc 4 1 73.75 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAATCATATGTACTAGTGGGTCACTAGT:1 + chrX 2873471 3' + roo 9026 1 54.79 GCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGGTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGTCGTTTAC:1 + chrX 22386785 3' - hobo 65 1 50.96 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCT:1 + chrX 21213376 3' - Doc 78 1 66.90 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATTGGTTCCGGTTGGTTTCA:1 - chrX 9709953 3' + pogo 2081 1 70.00 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACATTGTCAATAGAATACAGCTAGAACCCGAAACCGAATCGAAACA:1 - chr3R 30568816 3' - roo 76 2 71.23 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAAGT:1 + chr3L 20290786 3' + roo 9023 2 52.74 CATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAATTTGCGATTGCAG:2 - chr2R 19076474 3' - F-element 173 1 76.03 CAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATGATGATCCGC:1 - chr2L 19371256 3' - Bari1 40 1 56.16 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAAT:2 + chr2R 18722027 3' - 412 7115 2 60.27 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACACTTAGAAAACACAAAACACCACGCGAACGAATATCAAAATATTGTAATAAAAAATA:1 - chrX 10538124 3' - pogo 62 1 63.01 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTTTCCGTACTGAT:1 - chr2R 18123372 3' - 412 13 2 71.23 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCTTTAAAAAATAGACTATATTGAAGGGCGTTCATATATTACAAATACATATAAGTAAAATTAAGAA:1 + chr3R 9258780 3' - 1360 52 1 53.42 ATTTTTATTTCTTACTCTGCCAGACCATCACGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATG:1 + chrX 7701626 3' + Gypsy6A_LTR 235 1 72.60 ATTCAAGTATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAGTTCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCCACCAAAGGTCAACCAAAACTTCTGTCAAAGCTGGAGGAAAAAATGAAA:1 - chr3R 14335222 3' + Quasimodo 117 2 75.34 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGG:1 + chr3R 10143004 3' + 412 7457 2 76.71 ACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGA:1 + chr2R 10367542 3' + 412 401 2 77.40 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAGCTGGGAATTGCGAATC:1 + chr2L 15920187 3' - jockey 58 1 51.72 TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGA:2 + chrX 19231812 3' - mdg3 89 2 78.08 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGTGCTCGCCAGTGATATATGAAGAG:1 - chrX 14385125 3' - blood 7025 2 68.80 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGCGTTATGCTAATGGCC:1 + chr3R 26399932 3' - roo 8 2 78.68 ATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGAATCTTTTTGAACTCGTGGCCCAACCCACATTATGTCGTTCAAACTTTTGTTATTCGTAGTTTTTGCTGAAGCATCAA:1 - chr3R 19445261 3' - X-element 4614 1 52.74 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAAATTTTTTTTAACAAATTTATTCCTGATCTGCTCACCTGCGCTGCAGCTTCTCCTGCAGCAGCTCCACCTGC:1 - chr3R 27520980 3' + Juan 4181 1 54.14 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCA:1 + chr3L 12863769 3' + Transpac 239 2 70.55 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGC:1 - chr3R 18903363 3' + pogo 2068 1 63.01 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTGAAAAAGTATTTGAGTTATCCATGTCACATAAGTTA:1 - chr2R 14705724 3' + roo 9046 1 65.07 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGAACAAAAGGAATTCCCAAGCAAAATATATTGTCAAACAATTTCAGAGAACTTTTTAATCTTTGTTCCAGCAA:1 - chr3R 22289360 3' + 412 7510 2 55.22 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAA:1 - chr2L 8397122 3' + roo 9038 1 60.96 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCT:1 - chr3R 16194138 3' + mdg1 343 2 69.86 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTGAAGTTGCAGGAAG:1 - chr3L 19279091 3' + opus 7463 2 59.59 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGTGCAGCAGGAAAACCAGAATACTACCA:1 + chr3L 14969338 3' - P-element 22 1 67.13 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCG:1 - chrX 17614385 3' + roo 338 2 65.75 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTTGCTTAGATGATAAGGTGTCCCACTTATTTGCGAAAAACA:1 - chr3R 21150526 3' - S-element 75 1 71.23 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCGTAACAAACTCAATATTTTATTATTCTCTTCGTTATTATGTACCTAT:1 - chr2R 15392718 3' + blood 303 2 71.23 TTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGAGT:1 - chr3R 23346580 3' + Rt1a 4974 1 78.08 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTA:1 - chr3R 11526768 3' + pogo 2038 1 60.96 GAGCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGACACAAAAACAAAAAAAATAAACCAAAACAATTGCATGCGAAATTTTAAATGAAATTAATTAAAT:1 - chr2L 16745591 3' + R2-element 3582 1 81.52 AGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGG:1 + chr2R 10991374 3' - jockey 79 1 66.43 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACAGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAACACAAGAGATATACACAAATATTATAATTCTTGAAGTGTCGCGAATA:1 - chr2L 17925088 3' + pogo 2075 1 52.74 GAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGCCCGCCCGCCTGCCTGCCCCTCCATTTATCCATCCGCCGAGCGATAGTGAAAAGTTTGGCAAGCTTATGGCATTGC:1 + chr3R 18433246 3' + R1A1-element 5335 1 53.42 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGGTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACA:1 - chr3L 18708588 3' - F-element 45 1 56.15 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGAAATTCGGAAACAGCAGAGTAAGTGCGGAAAAGTATATTTTTTTTCCTGCTCTGTGGCCGAAAATCTCA:1 - chr2R 22145477 3' - FB 51 1 52.41 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAAGATTCTCCAAAATTGTACAGCTAACCAAAGAGATATAGATTTC:1 + chr2R 6559018 3' - mdg3 64 2 68.49 TATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 177 2 82.14 AAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAATGTTATACAATTTTTAATTTCTTTATTTT:1 + chr3R 25271318 3' + 412 7529 2 71.92 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATT:1 - chr3R 25876833 3' - mdg3 5282 2 65.73 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACTATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTG:1 - chr2R 21380627 3' - roo 8748 2 75.34 CTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAGTTGAAAGGGCACATTCAACATTATCAGAATTAGCTCGTTGCATAAAAGAAGCACTTAATCTCATTGACTGTTCAGAAATAATTATCAGAGCCGC:1 - chr3L 25323152 3' - Max-element 8240 2 78.05 TAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTTGAAGCATTTCGGTTGGATCCTAAAGCTTTAAAAGTTGGCCCCGTAAAATGTTTTGCGCTGCGTTGCGTCTTTAAGTAAACACAATATTCTTGATGCTTTCTATTC:1 - chrX 725167 3' + INE-1 544 1 67.38 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTATGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGCATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCTACTGTTCAAGTAGATGGTA:1 + chr2L 23400860 3' + S-element 1683 2 64.38 ACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTTGCTGTAGCGCTCTCAGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGATAGAGCCTGGAGCATTCGCTTTAATTGCATATTAATGCGAAAATGTGTGAAATGCGCCCCCAGGGAATCGACGGCAG:1 + chr2R 21583435 3' - 1360 140 1 56.85 GCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAG:1 - chr2R 19904031 3' - Doc 4488 1 66.44 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTCCGATGACAGTGTGCCCTGCGCTATAGTTTCACAGTTAGCAAAATCATCGATAGATGACGCGACGGC:1 + chr3L 14854539 3' - rover 35 2 46.58 TAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTTCTTTATTAGTCATACATTGTATTCCCACATATAATTATCAGTGCCTTGTTCCATGCGAGTAACATGGCTAATCACGGACAACTAG:1 + chr3R 21614428 3' + S-element 1682 2 60.96 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTAT:1 - chr3L 15058854 3' - blood 69 2 62.76 GCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGAAAAAACCTTGCCGAACGCTAGGGGCCACACAAAGGCTGGCT:1 + chrX 10728935 3' - springer 7170 2 58.52 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGAGATATATTCGTATATACACTCATATATGTA:1 - chr3L 21097075 3' - mdg3 5273 2 71.23 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTC:1 + chr2L 19417107 3' - BS 5024 1 60.27 GTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACATTAGCGGTGCACACACATTGGACAAGTTGAAGATGAGTCAGTCTATTTAGATGGGATAATGGAGCACACGA:1 - chr2L 2012321 3' - Transpac 435 1 60.66 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATAATATAATATAATGGTAAGAGTCTTCCCAAACTCAAAAATATTTATCATATATAATTCTGGTATTAGTATTTCAAAAG:1 - chr3L 15261235 3' - pogo 37 1 56.55 AAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCAATGTACTAACACCATTGACCAGCCAGATGTGGGAAATATAAGGACGATT:1 + chr2L 8397297 3' - roo 8678 2 76.71 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACAC:1 - chr2L 1449594 3' - opus 67 4 65.07 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAG:2 - chr3L 1387136 3' - mdg3 71 2 63.01 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAACAGCCAA:1 - chr2L 12261154 3' - jockey 67 1 56.16 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTTTTTTAAAATATAGTCTCCCCAACAGTAACACCTCGTTT:1 - chr2L 17638671 3' + blood 7367 2 69.60 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTACATTTGCGCTTTCTCAGGGATACGAAACAGGACACCAAGCGAAGATCATATGAGTG:1 - chr3R 15485366 3' + mdg3 5460 2 44.52 ATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGATTGTTAAATCATACTTTGTACCAGACTCACTCATCAATTAGCATGCTAAAAA:1 + chr3L 17032959 3' - copia 4814 1 64.38 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATTTGGCAAATGTTAAC:1 + chr2R 12703905 3' + blood 7371 2 71.23 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGA:1 + chr3R 8542663 3' - roo 8742 2 71.92 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATA:1 - chr3R 6103566 3' + Tirant 350 2 51.75 AAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAATCCTTGTTGACTTTTATCCTTTTTGGAATGTGCCCGTTCATCTTGGCTTAGAAC:1 - chr2R 9326911 3' - mdg3 5264 1 77.40 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTG:1 + chr2L 10032721 3' - hobo 79 1 72.92 GCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGTAATAACAATTTATTTAACCAACTCAAATATCTTTCTCTGTTACATTTATTAACTTATA:1 + chr3L 23597305 3' - invader4 2749 1 64.38 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTA:1 + chr2L 13884688 3' + pogo 2047 1 54.11 AGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAA:1 + chr2L 1229680 3' - opus 75 4 76.71 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCA:1 - chr3L 13597760 3' - blood 7087 2 70.55 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGATTATTCATGGTAAGTACTCGTACACTCAGGTTTAGTACAA:1 + chr3R 20368130 3' - Max-element 14 2 76.03 GAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTT:1 - chr2R 19076555 3' - F-element 256 1 78.08 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTCCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCTGCCGTTC:1 + chr3R 10468125 3' - opus 151 4 58.22 GACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTT:1 - chr2R 10478694 3' + invader4 257 2 70.90 CCTAGCAATATGATAAAATAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTGGTTGAGCACTTTTGCCGGCAGACGCAGCTGCTCAAGCTGGTCCAGGTCTCCTCTGGCCGCTTTGTGGCG:1 - chrX 17142620 3' - 1360 3106 1 51.72 CTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGGGCGGGAGACCTAGAGACGGTGCTGCACGGATTTAGTTACATAAAATTTACTTT:1 + chr3R 27380937 3' + blood 434 1 75.34 TATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTGAACGTTTGATTGTATTGTTCTTCTGCCACCACACCTTCGAATGCAGTTGCAATGTCATTTACAAGCTTTTCTCTTTTTTTGAC:1 + chr3L 14908648 3' - Juan 176 1 52.74 ATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 7557 2 65.97 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTATCC:1 + chr2L 12481537 3' + pogo 2048 1 56.16 GATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCTTTTTGTCAGTGAACCACG:1 + chr2R 21227447 3' + mdg3 5455 2 55.12 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGG:1 - chr2L 17228628 3' - mdg3 5329 2 69.18 AGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTGGAGAGGTTCCTGCCGGGAACTGAGCCTGGCTCACATCAAAGACTAAGGATCGGGTTTGG:1 + chr3L 1387260 3' + mdg3 5470 2 67.12 AGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTT:1 + chr2R 6984389 3' + HMS-Beagle2 7113 2 76.03 TTAATACCTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAG:1 - chr2L 8776813 3' - G4 3707 1 67.81 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGAGTTTATTTCAGTTGATGGCTAGTGAAAATATTTACACGTATTTAATGCACCATATAAAAAAT:1 - chr2L 17069543 3' - 412 7113 2 58.22 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGTGAATAGACTATTTCAGGAAACTAAACTATCTTTTATAAGAACGGTTATATTAATCTAAAACATAAT:1 + chr2R 9332231 3' - roo 53 2 55.48 ACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATCTCGAGAAGTAATGGTGACGCCGAGAAGCTGGAGAAAAGAAAGATCTGAGAAGAACGAATTCGTCATATT:1 - chr3R 2999731 3' + McClintock 434 2 55.48 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCGGCCGTT:1 - chr3L 10370866 3' - copia 4917 2 54.11 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCA:1 - chrX 18366010 3' - jockey 64 1 54.79 GGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGCACAATAATTCTTACTGACAGCCCTTGGGTTT:1 + chr3R 9148086 3' + copia 165 2 79.45 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAAACGCGCACTGTGGTCT:1 + chr2R 14562296 3' + Burdock 247 2 44.52 AGGCCACTCCCCTACACGAGATTTATGGGGAGTTTTAACTCCTCACAAGTTTATTCAAAGTGGTTAGAAGAACACCTGGTCCTGAAGGTAAAAGAGAAAAATGAAAAGGAAAGGAAACTAGCTG:1 - chrX 2550483 3' - gypsy8 4677 2 56.45 AAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTACGCAAATGGTCAAAGAGAACTAGTAATTCGGAAGAACCGCA:1 + chr2R 5701574 3' - S-element 78 1 73.97 AAAAAGGACAAAGTTAACAAAAGTTAGCAATATCAGGATAATATAACAGTCTACAAGATGACAAACATATATTGACTTTTTATTTAAATTACATTTACTTATCTATTAAGTGTTCTTATTGCCATAACTATAGATTTCAACTTAAA:1 + chr3R 17550499 3' - frogger 350 1 58.90 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTCAGCAGAAATAATATACTTGTATAAGATATTCTTACTTAAAAATAGCTAACTTATAAGTGA:1 + chr2R 15062271 3' - blood 61 2 57.53 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTTATAGTTGAGCAAATATTTAACCAGATGATTAA:1 + chr3L 3762332 3' - roo 8708 2 53.42 TAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGA:1 + chr3L 3540248 3' - mdg3 33 2 61.64 CGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1 - chr3L 25232769 3' + accord2 145 2 62.99 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCCAGCGAGGAACTAAGAATCTCAAGGTTACCG:2 + chr3R 10079446 3' - P-element 6 2 80.14 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATCGTTATGGAGGCAATGCCCGCTTGATTTAAATGGTAAATTAATGGGTTACTTGTGATATATTATTTCCATAAATAAATTGTACATTCTATG:1 - chrX 16982188 3' + roo 9043 1 60.27 CGTGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCTCGTGTTAACTTGTACATAAATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCTCACCGTGTCGACCTAAGACAATTTGGTAACTGGGCAGTCGGCTCGTACTCCACATCCATTGGA:1 + chr2R 3822002 3' - Gypsy6A_LTR 23 1 60.96 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATATAATGATACAATGTTTGTTGAGTAAACCTGATATACAATTTATGATAAAATATTTGCTTAGCCAGTGCTATATAATTTATTATATAATATTTGCTTTTGCCATTCCCAACCAT:1 - chr3L 3762161 3' + roo 9064 1 73.29 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGGTATCAACGAAAA:1 - chr2R 20704146 3' + hobo 2889 1 60.98 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAA:1 + chr3R 15030741 3' - jockey 96 1 76.71 CATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACT:2 - chr3L 14854674 3' - rover 7011 2 63.70 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAG:1 + chr2R 22255436 3' - roo 43 2 53.19 ATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGGGTGTTCGCTCCGCAAGAGTTCGCTGCAATTAAGTTGGCA:1 + chrX 8200280 3' - flea 4829 1 71.53 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGAGTTTATTTCAGTTGATGGCTAGTGAAAATATTTACACGTATTTAATGCACCATATAAAAAATCATGGGAAAGCAACCGAAATCTGCCAAATATGCTGCTTTT:1 - chr2L 17069503 3' - 412 7073 2 72.60 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAA:1 + chr3L 3540266 3' - mdg3 15 2 73.97 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGATTACTCCGCCCACACTTGTGGCAACCTGTAATCTCCAAAAATCACACCATATGGAGCACGCGCTCTTTACCGCCCACGTTTATTCAAAATT:1 + chr2L 3006224 3' - pogo 25 1 68.49 TCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAATCCACTGGCTCCGGTGGCCAGTATTCTCTATCTTTGGCTTCGTCCGCAAGCCATTATATCCCATC:1 + chrX 7987342 3' - 297 6876 2 55.48 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTGCCTGCATCAAAAATCCCTGTTCAATGTTAATTGTTAATCATTAAATATTGTTGCTGGCAAAATCAATATG:1 + chr2R 20913246 3' + 1360 3364 1 68.49 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGCATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACTATTAAGAAGATGAGCATTGTCTATGCACGATCCAATCAA:1 + chrX 3506175 3' - Tirant 8135 2 54.62 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATT:1 - chr3L 13597768 3' - blood 84 2 76.03 TGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGC:1 - chr3R 14097058 3' - transib2 76 1 78.63 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTGAATGTGTATTTGTCTACATGACAAGTAGGCAATATTTGCATACTCAATTGCA:1 - chrX 7467882 3' - hopper 12 2 77.40 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAAATATGAAATA:1 - chrX 13061683 3' - mdg3 5291 2 58.22 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAAATTTAATCCAAGTAAATTA:1 - chr2L 12481383 3' - pogo 19 1 69.86 AGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAATGTATGAAACTAAAAACAAAAAGTGCAGTTACAAATACAAATATTACTGTCAC:1 + chrX 5381268 3' + jockey 4745 1 63.70 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATC:1 - chr2R 9332135 3' + roo 335 2 69.18 TTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTATCCACGGCGTATTCTAGCTTCTTACAACTGCTGCTTCTCTCGCGATTTCTAACTCTCGACA:1 + chr2R 5372734 3' - 17.6 7074 2 57.64 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCGCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTC:1 + chr2R 15613836 3' - P-element 87 1 34.81 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAATGTATCCAAAG:1 + chr3R 29709096 3' + blood 7368 2 66.91 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGT:2 - chr3R 6782729 3' - jockey 4759 1 73.29 ATGTATATTCTTGATCAGGCTCAATAGCCGGGGCAACCTGACCATGTCCGTTTGCTATAAGTTCTGCTACATGCTAAAACAATCTATCTTTCTTATTTCTATTGTATAATTTCTCTTGAGAATTGTCATCAACATGACAAATTGTA:2 + chr3L 21484758 3' + INE-1 80 1 62.33 CGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCT:1 - chr3R 10778657 3' - mdg3 5324 2 65.07 ATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGGACAGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGAGTTGGGCTTGATGGTGTTGCTGGTAA:1 - chrX 6554571 3' + 412 496 1 38.64 ATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTAGTTATTACTTATTACAATTGGGTTACACTGGGCCATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGTATCCGTATTTTAACCTC:1 - chr3R 16535271 3' + Stalker2 7602 2 48.63 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATT:1 - chr2R 16908502 3' + roo 327 2 72.60 AAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTGCGTATCATCC:1 + chr2L 6074078 3' - BS 56 1 61.64 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACT:1 + chr3R 25521918 3' - blood 7048 2 60.27 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCACATTTTTCGTTCAAAGTTAACAAACAATTTTCTTA:1 + chr2R 20362336 3' - diver 5914 2 66.44 CGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCATAGGTTAATGTTCTTGCAACTGTCTAATGCACTCAATCAAAGTCATAAAATCGCTAGATAC:1 - chr3L 8619716 3' - Max-element 8326 2 57.53 ATGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGT:1 - chrX 3529763 3' - 412 91 2 78.77 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAA:1 - chrX 3524248 3' + roo 9002 2 79.03 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCG:1 - chr3L 5263327 3' - pogo 31 1 60.96 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAGGATCAACCTTTATTTAGTTGATGCACAAAATCCTTTTTGCTTTCAATTGCGAATATTTT:1 - chrX 6398743 3' + blood 362 2 62.76 AACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAA:1 - chr2R 20382465 3' + Bari1 1666 1 57.24 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTT:1 - chr3L 9426715 3' + P-element 2783 1 14.38 AAAAAAAAAAACAACTGAACACTATTCCAAAGGAATCGCACAACGCATC:1 - chrX 18692488 3' + Porto1 171 1 85.71 GAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGCTTAGCAGCCACGTTCCGA:1 - chr2L 9356782 3' + Stalker4 7330 2 64.38 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCAC:1 + chr3L 13722137 3' - blood 41 2 57.64 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGGCCCGCACTC:1 - chr2L 20561400 3' + P-element 2815 1 37.67 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTT:3 - chrX 983105 3' + 412 7501 2 54.11 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAACATAC:1 - chr3R 31907296 3' - Tirant 8118 2 77.61 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAA:1 + chr3L 20290784 3' + roo 9021 2 53.42 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACAC:1 + chr2R 14562277 3' + Burdock 234 2 46.43 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATGATGCTTTGGATATTCAAATGTTCTTTAAGAAACTGTGACAAATGTCGCTGATGTTGCGAACCGCGGGAAAATGGCAAATGCGAAAAAGCTGAAAAGGCCGACCGCCGCCGTTTGAAACT:1 - chr3R 15974653 3' + P-element 2878 2 79.45 GGACTCCACGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGCTCAATCATTAGAATAATTTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTT:1 - chr2R 5617529 3' + Gypsy6A_LTR 323 1 96.77 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTTTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAATAATTACAATCGGCTACGCGTG:1 - chr3R 29207568 3' - copia 35 2 73.17 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAATGTTATACA:2 + chr3R 25271298 3' + 412 456 2 58.22 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGTCCGAAAG:1 + chr3R 20149823 3' + 1360 3370 1 68.89 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACA:1 - chr2L 1229574 3' + opus 7444 2 60.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATTTGTGTAGACAATTTC:1 - chr3L 5446057 3' + roo 9052 2 71.92 ATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATGTCTTATTACTAATTCTGATAATAATAAAAAATACAAAAACTATTAAATAAAATGGGATTTGCCTAGACAATGCCCGAGCTCAGGTGAACCGTATAA:1 + chr2R 20015205 3' - X-element 29 1 45.21 AAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATTGAAAAAAAAACAAATTACCCTCACCCTAACGGGTGTGTGGAAAGAGGACTGCATATTAATGTGTTTTGGAAGAGGTAACCCAACAGGTCATAAATGACAATTTTGTCTA:1 + chr3R 1588651 3' + Doc3-element 4697 1 54.11 CTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAAAAAAATGAAATGCAAAATATATCAACACATAAGTATCGGCAACATGAATGGGGTATTAATTATATTTTGGCCATTATTGCACGATTAAGCCTAGTTTACATCGAAAGATTCAAC:2 + chr3R 27521137 3' - Juan 4087 1 73.97 ATAAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGGAAACAACCCACTAACCCAGTACATCTAAGATTTTTTCACACCATTTGTTTCAGTCTTAAGCTGACCAAATCCCTCCTACTCCTACCAGTGAATAATTAATGACAAGGACAATGG:1 + chr3R 28216143 3' + Tom1 201 1 66.44 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGC:1 - chrX 17614384 3' + roo 9003 2 63.70 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATAAGCGCTGAAAAATATGTAATATGCCACATATGAAAAGTG:1 + chr2L 18581354 3' + roo 8994 2 72.60 ACTGTCCTCTACCCACTAAAATATAATTTTTTTTTAAATTTTTTGACCTTTTAAATACACGAACTTAACCAAACTCACTTTTTAGAAAATATTGATGCACGTACAACAAAGCTCCTCTTAAAAAGATAATCTGTTACAGCCTTATT:1 - chr2L 22110345 3' - HB 345 1 65.75 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACACTTAGAAAACACAAAACACCACGCGAACGAATATCAAAATATTGTAATAAAAAATATTTTTAT:1 - chrX 10538117 3' - pogo 55 1 58.22 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTT:1 - chr3R 10142954 3' - 412 84 2 73.97 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAAATATAGTTAATTTATCGCAACAGTCTTCCAAGATCCTTGGTATTATCAGATGACCTGATTCCCTTGGTATTTCAA:1 + chr2R 22798734 3' + hobo 2895 1 48.63 TTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGCAACACCAATCCCAACAGCAACATCAGGTCCAGCAACAAAATCAGGCACAACAACAACACCTATCCCAACA:1 + chr2L 195970 3' + F-element 4341 1 53.42 GCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAAATTGTAAGAAAACGTGATAGACCTGCCCGAGGAGGAAGCTGAAGAAGCAATTATAGCAACGGAAACGCCTCATGTAGAGGAACCTGCATCAGTGCCCGCTAG:1 + chr3L 8123496 3' + Cr1a 291 1 65.07 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCT:1 - chr3R 7739700 3' - blood 7096 2 73.29 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAA:1 + chrX 17469253 3' - blood 83 2 73.29 GTTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCCATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTG:1 - chr2L 19424660 3' - Tirant 11 2 62.79 ACATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAG:1 + chr3L 14581505 3' - pogo 37 1 60.27 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGG:1 + chr3R 7424659 3' - 412 38 2 57.93 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATG:1 - chr2L 8397172 3' + roo 8988 2 74.66 GTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCTACTCAATTTTCCTATACAAGATAATTTTCTTTTTTCAAAATAAAACCAGGATTTGAAGAACTTTTACCATTTCTTCTCCATGCATATGATTTTGCCACCTTTAGGC:1 + chr3R 4913694 3' - 1360 14 1 76.03 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTATCTGCCTCTAGTACTACATAACAATAT:1 - chr3R 20292432 3' + pogo 2035 1 67.14 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCA:1 + chr3R 3527165 3' + Tabor 416 2 61.64 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGG:1 + chr3L 20785549 3' - P-element 61 1 43.84 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGCTCCATCGACTACTGAGGCTCCAGTGTCCACTACTCCTGAGGCTCCAGTGTCCACTACTCCTGTAGCTCC:1 - chr2R 18050958 3' - mdg1 51 2 52.05 TTTTTTTGTTTTTTTATTATTATTGTTTGTATTGTCGTCAATGTCCTCACTGCTGTTTCTCGCTCATTTTCGTCCGGGGCACGAATAGGTGAGAAAGACGAGCCCCATTCCCGACAAGATGCCAGTGATCACCAGCACTAGCTTGT:1 - chrX 14258148 3' - Rt1a 5074 1 52.05 TTTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATTAGAATATTGTGATAAGGAATTTCCTCCCAAAAGTGAGAACAATACCATGAAAAGTTGAACCGAGTGC:1 + chr3L 26043522 3' + 1360 321 1 59.59 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCG:1 + chr3L 22221241 3' - 412 56 2 55.48 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATC:1 - chr3L 22529716 3' + roo 9032 1 58.22 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTACACTGTAG:1 + chr2R 6585551 3' + pogo 2072 1 65.75 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGAC:1 + chr3R 7424637 3' - 412 61 2 59.59 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGGACACGATATTTA:1 + chr3R 27971150 3' - mdg1 27 2 67.81 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGTAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCAGTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCT:1 - chr3L 22221126 3' + 412 7484 2 53.79 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAAGCAAACCTG:1 - chrX 10101332 3' - mdg3 5327 2 65.75 AGGATGGGTGTATGAGTGGATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGAATGACTAAGAGTAGAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAACTTGCCAAGCTCAATGCAGTGTGAATTATGTAG:1 - chr3L 21097139 3' - mdg3 5336 2 69.66 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCCAGCCCTCTGTCCCTATGCACAGAAAGAAAAAAAGAATAGAATCTAATT:1 - chr2R 22867363 3' + hobo 2935 1 78.57 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTT:1 + chr2L 1136396 3' - 1360 51 1 62.79 TGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGC:1 - chr3L 13722028 3' + blood 7318 2 71.23 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTTGATTTAAATGAATAAAGTACATTTAGTACAATATACCAAAAACGTAGCAGCAA:1 + chr2R 9665535 3' - jockey 4988 1 63.01 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGA:1 - chr2L 2357295 3' + P-element 2810 1 32.88 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAGCAATTAAAGTAAGTGGCGCCATTCGCCTTTCACG:1 - chr2R 10367433 3' - 412 7075 2 69.18 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAACTAGGCATGAAATTGTATAGCTTTTTATCT:1 + chr3R 20452313 3' - blood 31 2 65.07 CTTGTCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCCT:1 + chr3L 14581517 3' - pogo 25 1 68.49 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGGACACG:1 + chr3R 27971143 3' - mdg1 7072 2 63.01 AACAAAAAAAAAATGGGAAAAAAATGAAAACAGCAACCGACGAGCGACGAACAACAACACGAATGCCGAACGAAAGGGAGAGAGCACAGAAACGAAAAAAAATAACCGAACACACACGCACATACACATACCAGCG:1 + chrX 6862934 3' + Tc3 137 1 76.47 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATGCTGCCCGTTGTTTGTCATTCAGCTCCATTAA:1 + chr3R 15974818 3' + P-element 2847 1 56.43 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGC:1 - chr3L 4869156 3' + roo 9007 2 60.96 GGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACAT:1 - chr2R 19904025 3' - Doc 4482 1 62.33 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAACAA:1 - chr3L 19397011 3' - F-element 59 1 50.68 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGTTGTAAGCGATGCAGCCGAAAAGAAAGTGCTCAGTCTTCTTCTTCTTCTTGCCCTTGCAAGCT:1 - chrX 16456714 3' + P-element 2831 1 49.32 CACAATATGTGGACCTTGTACCCGGGCGGAAGATCACTACAAGCGAGTAGAGATCCTGGGAGTGGAGGAGAAGGACCTGGCGTGTTTGAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCA:1 + chr2R 2016838 3' + gypsy8 276 2 63.01 GCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTC:2 + chr3R 11461874 3' + 17.6 435 2 63.01 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTC:1 - chr2L 17730449 3' - pogo 73 1 63.01 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTCTG:1 + chr3L 5446191 3' - roo 68 2 65.52 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTT:1 + chr3R 23507710 3' - 412 27 2 64.38 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAG:1 - chr3L 13597729 3' - blood 45 2 55.48 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTTACTTTAGCGA:1 + chr3R 24693705 3' - hobo 16 1 74.66 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATATTTTGTTTTTGTGAAATTGCATGCTCTTAAAAATATATAAAATATATTTTCAAGTAT:1 + chr3L 14546426 3' - copia 4931 2 60.96 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACAGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGATAAGACT:1 - chr2R 5214964 3' - F-element 51 1 57.76 TCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAAACAATAAGATC:1 - chr3L 5438738 3' + hopper 1347 1 63.01 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTG:1 - chr3L 1387144 3' - mdg3 79 2 68.49 CACATTAGGTGAAGTTCAGAAGAAACTGAACGATTCCCAGTGACTAATGAATAATAAATATTTATATTCCAGGCGATTATCAAAAATCTAATTTCCGCTTTTAAAACACCAAAGGATATGTAAGCTGGATATTGGTCACCATCCAT:1 - chr2L 10173901 3' + G5A 2789 1 52.05 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCCCCTTGTACAATGCACAGGTCCTTAAAGTTTGGTGCTGTTTTGTATCCTTCTTTCGATG:1 + chr3L 4175355 3' - roo 62 2 64.38 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGTCATGGGTTTGTATCAACACTACATTTACATAATA:1 - chr2L 18581246 3' - roo 8701 2 58.90 ATGAGATTTATTTATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGAAACTATGCCGCGTAGGCGACGGGGCAATGGCATCTGCCCTTTCCCTGGATTTTGCGCAT:1 + chr2L 1615541 3' - G3 346 1 63.70 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCATTTC:1 - chr3L 22221103 3' + 412 453 2 62.33 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAATGACTCCATTAAGGAGAAAAA:1 - chr3R 20905331 3' - pogo 14 1 76.71 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCTTGCGAATGGATAGGGCCCAAATTAAACGGCTCATGACTTTAATGTATACGATTGTAAAATATATGCATACGAATATTATAAAATGTGTTTAATTTTTTTGTTATCTATAT:1 - chr3L 11610545 3' + copia 246 1 74.66 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTT:1 - chrX 3529748 3' - 412 7129 2 69.18 GGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGGGAGGCAA:1 + chr3R 8049038 3' - Q-element 119 2 66.90 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGGCAGTAAGGTTTTAATGGAAGTGAACGTGCCATTTCATAGCAAA:1 - chr3L 9241944 3' - roo 8679 2 75.34 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAA:1 + chrX 19231824 3' - mdg3 77 2 69.86 GCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGCCGGCAAA:1 + chr3R 30731533 3' - gypsy6 7425 2 79.45 TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAA:1 - chrX 10873802 3' - mdg3 5300 2 57.53 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTTAAACG:1 + chrX 4566266 3' - Transpac 47 2 54.48 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTTTTCAGGAGGGGTGCTGCATCC:1 - chr2R 6984263 3' - HMS-Beagle2 6898 2 75.17 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTT:1 + chrX 13651584 3' - 297 6623 2 55.17 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATG:1 - chr3R 26782740 3' - hobo 19 1 75.38 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGCTGGCCGCC:1 - chr3L 22354418 3' - Doc 62 1 53.42 GTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTAT:2 - chr2R 9326988 3' - mdg3 75 2 75.34 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTAT:1 - chr2R 21227349 3' - mdg3 63 2 60.27 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAA:1 - chr3R 8367175 3' - Doc 87 1 72.60 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTCTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGACTC:1 - chr3L 21630305 3' - Burdock 6186 2 53.42 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGG:1 + chr3R 10143045 3' + 412 445 2 52.05 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGGTGCATTGTT:1 - chr3L 6751648 3' - pogo 56 1 58.22 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAA:1 - chrX 22824746 3' + jockey 4930 1 65.07 ATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGAAACTGAAAATGAAACGAAGTCGAAGAGCTTGGTCTATTGTTTCACTTTGCGTGCTTTTCAATTATGCATTAAGCTATCGTGGGATATAAAAACGCT:1 - chr3L 10069049 3' - 17.6 7292 2 66.44 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAACCTGGCTTA:1 + chr3R 13358733 3' - mdg3 19 2 73.29 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTT:1 + chr3L 3540200 3' - mdg3 5319 2 69.86 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCT:1 + chrX 21213366 3' - Doc 89 1 73.97 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTGTTTTTTT:2 + chrX 14756768 3' - pogo 57 1 62.33 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATGAACCATGTTTTTAGCGCATTCCTAGCCCCACTGTGCACTGGCGACTTCTCGGTCGTCATGGTCGTGCCTTTCAGTTCGAAACGTGATCGATAGACGGACGACTACCACT:1 - chr3R 13843643 3' - roo 8674 2 75.34 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGC:1 - chrX 10978995 3' - roo 76 2 72.60 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTGGAGAGGTTCCTGC:2 + chr3L 1387214 3' + mdg3 171 2 67.12 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATC:1 + chr3R 15649891 3' - blood 37 2 60.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAAAGTTGCTAGTTGTT:1 - chrX 17614337 3' + roo 9050 2 70.55 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAA:1 + chr3R 9163924 3' - hobo 85 1 78.77 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAG:1 - chr3L 24153138 3' + Tabor 7297 2 66.44 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAG:1 - chr3L 18708613 3' - F-element 86 1 71.92 TTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATGTAGTCTCCGAATTTAGTCAGTCGCTTGTCGGCAGTCTTACAAGTAAGTAAGAGTGG:1 + chr2L 18823595 3' - P-element 2667 1 52.85 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAG:1 - chr3R 25384177 3' - mdg3 5309 2 57.53 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGCGAATGGTTTTCTAACCGTATGTCGACGGTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAAT:1 - chr2R 22867421 3' + hobo 2872 1 62.33 ACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAAAGGAGCAAATAGAGAATGTCACAGTGTTCAGATTACCGGGAGAACGTCTCGGTTTTGGC:1 - chr3L 14512940 3' + hobo 69 1 58.22 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATGAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATAGATTCGGACA:1 - chr2L 13877637 3' + Transpac 283 2 63.01 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACGTTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTA:1 - chr2R 7404693 3' - blood 81 2 69.18 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTTATTTAAGTATCCAACATTAGTATCACATTAGTTTTTTTTCTGTGTACCTTGTGTACTCGTCAGACGC:1 + chr2L 9669650 3' - roo 8680 2 58.22 CTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAGCGGCAAAAG:1 + chr2L 11867406 3' + BS 5001 1 62.33 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGACAGTGGAAGTGGACGTGGACATGGCACACACATG:1 - chr2L 535399 3' + roo 9031 1 54.07 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGATTATTCATGGTAAGTACTCGTACACTCAGGTTTAGTACAAGT:1 + chr3R 20368132 3' - Max-element 11 2 77.93 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAA:1 + chr3L 13722123 3' - blood 57 2 56.85 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGTTTTATATATACTCTTAGTTGGGCAGTTGCGGCTG:1 + chr3R 18903514 3' - pogo 39 1 56.64 ATTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATG:1 - chr2R 22671382 3' - jockey 4751 1 72.60 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTAGAG:1 + chr2L 13884691 3' + pogo 2050 1 52.05 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCTATTTCCCTAAGCTGTTAAACGCGTAGTTAGGTTGTTTATACTTAAACTCTTTAAACAAAAAGCTTATGTTTATGATGGT:1 + chr3L 11666048 3' - pogo 39 1 54.79 GTATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGACGACTACATCCGCATCTGAGCGGATTTTCCCGCTGCGAGGCTAAATTGCTTGTTAGCAATGAATGAGAATAGAGCTGGAGCCGCAGAAGATGGTGAGGCAGCAGC:1 + chr3R 6472067 3' - Quasimodo 39 3 76.03 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGA:4 - chr3R 25384199 3' - mdg3 5331 2 71.23 AGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATTCCATTAGGCATACGCTTCCCTCTTGGACAACACGAGGAGGCTTTATGTTTGCCGG:1 - chr2L 16660738 3' - pogo 2050 1 61.64 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGT:1 - chrX 15814522 3' - P-element 75 1 34.25 ACAGCGAACCGCTCTTTTCTACGCATACAGTGAGAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTCGAGAACTGTACACATTTGAATTAGATGTATAAATAGTTAAT:1 + chr2R 24331877 3' + 1360 131 1 69.86 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCT:1 + chr2R 18882686 3' + roo 9029 1 55.48 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTTTATGCAGTTGC:1 + chr3L 13722153 3' - blood 7036 2 68.75 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAAC:1 + chr3L 22221209 3' - 412 88 2 77.40 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTT:2 + chr3R 6053060 3' - Quasimodo 59 2 63.70 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAAATTGCATTGAAG:1 - chr3R 13358541 3' + mdg3 234 2 76.03 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAATATTTAAGTTTCTTC:1 - chr2R 16712937 3' + pogo 2061 1 56.85 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCTC:1 - chr3R 20292390 3' + pogo 2091 1 77.78 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACCTCAAAATTGTAAAGTTCTTTAACAATTTGTAAGTTTAATG:1 - chrX 21204951 3' + 1360 3354 1 54.48 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGG:1 - chr3R 10468038 3' + opus 435 2 79.09 AACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTGCCGAGGGTGTCAAGTAATTGCAGTTATCCAC:1 + chr2R 5001911 3' + copia 4901 2 78.08 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGGTGCATTGTTGTTGTAATGTAATTTAATTAAAATATATAATACG:1 - chr3L 6751614 3' - pogo 22 1 68.49 GGAGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAAGAACGTCTAACTACTGCAATAGCCTCCAATATTATTGAAAGCCAGCCGTGCTTCTGCAT:1 + chrX 20111284 3' + Bica 25 1 59.59 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAA:1 + chr3L 4023717 3' + pogo 2035 1 64.38 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATG:1 + chrX 11534545 3' - roo 8716 2 54.79 TTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATATATATATATATAAATTCTGCTCATATATCCGTTTTTAATAAATTAGTT:1 - chr3R 22810694 3' + flea 4960 2 70.40 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAATAAACAATCTTACATATATACGCATAAAGGAACGGTGCTCCTTGTTAGTGATTGCTGTTACTGCCGCAATTGTTTGCGCAA:1 - chr3R 12540033 3' + flea 4947 1 57.24 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCT:1 - chr2R 15079999 3' - roo 50 2 53.42 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACAGATTAAGTGTATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAGAAAACCTCAATCCATATATCAAAAGCACATTAGCACGAATTTGAATTGGCAATTGGTATT:2 + chr3L 20747238 3' + Burdock 6373 2 71.92 GGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCGGCTAAAAG:1 - chr3L 22980576 3' + INE-1 572 1 63.70 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCATGTCCGTCCTGCATCTTTCCCAAATATTTTCAGAAATTTAGTCGGAAAAAGAAAATTAAGAGAGAACAC:1 + chr4 1149989 3' - 297 6590 2 79.31 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAAGCATTTTTTAATAGCTTAACTGCGAA:1 - chrX 14914301 3' + mdg3 232 2 75.17 ATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGTTAGGACAACAAATTTTT:1 - chr3L 27356039 3' + Tc3 1678 1 67.12 TATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGCTTGCTAATAGCCACACGCCATTTTCATGTTGCATCCTGCCAT:1 - chrX 12837008 3' + Quasimodo 409 2 74.66 TCTGTAGCTCATATTGGAGATATTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGTGTGGCCGGTCTGGATTGATAGCCTCCATCTTCCGCATTCCCTTGCTGTCCACCACATACACCTCAAAGTTCCGCTGGTTGATGATCAG:1 - chr2L 2656038 3' - G2 51 1 50.00 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTA:1 - chrX 18913274 3' - Quasimodo 64 2 73.97 TTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTTTTTTTTCAGAAACATGCATGTATCTACAAGATGCTCTCATAAAAGTTGAACGA:1 - chr3L 5396440 3' - F-element 168 1 65.07 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGACATATATATAAATTCGATAGTTATGGATGTGTGTGGGAAATGTTCGGGTTGT:1 - chr3R 28724937 3' + pogo 2035 1 68.49 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATG:1 + chr2R 10367584 3' + 412 7509 2 55.64 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGCTTAAATTTTATTTGACGCATTTTA:1 - chr2R 8305179 3' - blood 32 2 63.70 GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGATTGTATTTTGCGGCGTTTGTGGACTTGGCAATGTA:1 + chr2L 8393101 3' - I-element 5141 1 69.18 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAG:1 + chr3L 9649160 3' - roo 8749 2 78.08 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATG:1 - chr2R 19353966 3' + 297 6925 2 55.48 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGACTTGTTTATTCCAT:1 + chrX 14908465 3' - blood 7081 2 63.70 AAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGATTCTCGAGGGACTTTGAAATGCGTTTTTACACCGATTCCATGCGGGTTCAATGGATGGTGGTACCCGCTTGTGTCTCTCAGCCTTCA:1 - chr3L 10196926 3' + blood 443 1 58.90 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCT:1 + chr3R 8542674 3' - roo 67 2 64.38 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATCACGTTGATTT:1 - chrX 22824754 3' + jockey 4922 1 70.55 AACAAAAACAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATCAAACAAACCTAATCTATACACATTACTGACCTGACCTTACCTGTATTAGTGATAAGAAAGCCGGCCGAACCGGTTCTCTTTAGTAAATGCTTTAAGAGAGTATAAAGA:1 - chr3R 13051506 3' + Porto1 262 1 71.23 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAACCTGGCTTAA:1 + chr3R 13358734 3' - mdg3 18 2 73.97 CCATTTGCAGCTTCAATACGGCATTTGGATCTGTAAAGAACCGCAATATCATCGGCGTAAGTCGCAATGATAGCCTTAGAGGGTAACTTTGGAGGCAAAAACACAACAATCAGGACATCGGATTACACATTTTAGCCAGCATTAGT:1 - chr2R 16251499 3' - BS4 224 1 56.85 GTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 182 2 80.95 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:1 - chr2R 20461151 3' - jockey 32 1 66.19 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAG:1 + chr2R 18882673 3' + roo 352 2 54.79 AAAATAAATGTAAAAACATTGTGTTTAATGCTGGGTCTTAGTGAAGGAAATGCTGGAGGTGCTGGCGAGATGAATCGTAGTTGACCAAGCGGATTGTGCTCCATTTCAGCGGGCTAATGTTTAAGAATCGGTTAAAGATCGTAACT:1 - chr3L 3390396 3' + looper1 1812 1 41.78 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGG:1 + chr2R 5900936 3' + Bari1 1655 1 54.79 AGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGT:1 - chr2R 5582151 3' - Cr1a 470 1 57.53 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATTAAATAAATTAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGC:1 - chr3R 31907303 3' - Tirant 16 2 68.94 ATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTGTGATTGGCCTAAAAAATATGTTTCAACGGAAAAAA:1 - chr2L 15142194 3' - BS 4719 1 73.29 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACCTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGCATGTAGTTTTCGCAATCTACCAGATAGCCTAACTCTATTCAGACTTCACCTGACTCAGCATACGTTTAAAATTCCCATTTCT:1 - chrX 21639579 3' + Tirant 378 2 58.33 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCAAACAATTCGGTTCTCTCAGTG:1 + chr3R 31956546 3' - pogo 11 1 76.76 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTT:1 + chrX 13651566 3' - 297 6640 2 60.96 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGG:1 + chr2R 18051055 3' + mdg1 7400 2 66.15 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCCTTTTTCAAGCAAAATTTTTTGAAAAAGGCCTAGATGGGTCAGCTATCATTCCGCCG:1 - chr2L 3967056 3' + hobo 2874 1 62.76 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACCGAATAGGTCGCCATATGTCGCCTGGGCGTCCCCCGTATCAAGGGTGAGGCCCAGATTAAG:1 - chr3L 9430840 3' - P-element 98 1 57.52 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCA:1 + chr3L 53078 3' + roo 351 2 59.44 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGT:1 + chr3R 8402656 3' + mdg1 375 2 53.42 TATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGGAAATAACTGAAATAAAACAGCAAATAGTAATTGCCCGTCGAGGGGGAAATGG:1 - chr3L 16137301 3' - Juan 4092 1 59.59 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTATAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCCATTTCTTTCG:1 + chrX 9710085 3' - pogo 48 1 54.79 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAGCGTGAGAGTACTTGGGGAAACAGAGGAGCTCACTTGGCTTGTTTTTGAACAGTTCTACTTA:1 - chr3R 10140148 3' + P-element 2861 1 64.38 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAA:1 - chr3R 16194105 3' + mdg1 7441 2 66.39 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATACACTTAAATGGTTTAGTTGTTG:1 - chr3L 14581326 3' + pogo 2091 1 78.77 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGT:1 + chr3R 23507680 3' - 412 51 2 54.29 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGATCGGTCTTCTATTGGTGACTGAGTGCACCGTCTTACGAAAGTGGGTGGCGGAGTGGGCAAATGCGGGCTCGCATTCGAGTTGATGAAATTGGAATACATCCAAAATGAAA:1 + chr2R 11003752 3' + 1360 3379 2 52.05 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCT:1 + chr3L 9426751 3' - P-element 80 1 31.51 CACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTT:1 + chr2R 20382585 3' - Bari1 65 1 62.33 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATCATTTAAATTTAATTTATAAATCATGAAGTTACTTGAAAGTTCACGTTTTGAGGCTATCAACA:1 - chr2R 1516581 3' - Transpac 4977 2 57.53 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCA:1 + chr2L 16685392 3' + P-element 2823 1 39.29 TTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCATACCAAACTTACAGACACCTAAGGCCTCACAGTAT:1 - chr3R 8364140 3' + Doc 272 1 75.34 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGTGGTCCATGTAGAATTCGATCACCATTTGGGGAATGCGTCTGTTG:1 + chr2R 23313140 3' - Tabor 11 2 76.71 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGTAACTTCACGCCAGCTCCAAACCAAGTGGCAAATATAAAATTTCGCTGCAT:1 + chrX 12558369 3' + Transpac 280 2 63.70 ATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGGAATAACCACGGTACAGTT:1 + chr2R 11656163 3' - HMS-Beagle 6806 2 78.77 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACG:1 - chr2R 10367491 3' - 412 80 2 70.55 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATC:1 + chr2R 19543765 3' - jockey 4809 1 51.37 GAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACAAAAGACACACCGCCCGCATCTCGCCTCCGAC:1 - chr3R 15125720 3' - hobo 405 1 76.47 CTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATGTATAAGAAGGCTGATATGTGGATATTGATACTGATACTGATATATGTGATATTCATCACCGCGATATTCGAACCAGAGGCTGGGTAGATCG:1 - chr3L 27392326 3' + 1360 391 1 68.49 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATC:1 + chr3L 22635755 3' + hopper2 1527 1 69.86 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAA:1 + chrX 15167753 3' + roo 342 2 63.70 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAATGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACCCGACTTTC:1 - chr2R 5674610 3' - S-element 34 2 62.33 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTT:1 + chrX 13651584 3' - 297 43 2 54.79 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCTACCCACATCAACAATAAACCGAAATATCAGCAGGTGGGCTCTTTGGCTTCAACACAGCCCTTTGT:1 - chr2L 10912174 3' - Doc 18 1 71.23 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTTGTATCTTAGCTGCCTATTGGCAGACGAATATCCAA:1 + chr2R 6187981 3' - Tirant 10 2 76.61 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAACATACGAAA:1 - chr3R 31907292 3' - Tirant 8126 2 73.97 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGT:1 + chr2R 5992412 3' - pogo 44 1 55.17 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTTCAAGGCC:1 - chr3R 10079246 3' - P-element 14 1 76.03 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATAAACGAGATTAGGCTAAATATCCCAATATGTTTTATCATTAAATATA:1 + chr3R 25823056 3' - roo 8737 2 69.18 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTT:1 + chr2R 9327042 3' + mdg3 168 2 70.55 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTAGAGACATCATTAGTAACTATAGAGGTTT:1 + chr2L 13884716 3' + pogo 2075 1 64.38 AATGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGAGGAGGGAAAGAATACGTGCGCACGATTGAGATGGGAGGCCCGT:1 + chr2R 675083 3' + 17.6 6956 1 63.87 CAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTGTCTCTCTAAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGAAATGATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTTCGA:1 + chrX 14206113 3' + Tc1 89 1 67.81 CAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTT:1 + chr3L 18920482 3' - Juan 66 1 58.90 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAG:1 - chr3R 16194112 3' + mdg1 369 2 52.05 CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTC:1 + chr2L 8772798 3' - Tabor 6928 2 76.71 AATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGCTTCGTTCACATGCTTTGTCTTTGGCACTTGCCTTCTGATTCCCGGCCCTTCTG:1 + chr2L 6359159 3' - hobo 2670 1 63.01 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAA:1 + chr2R 15080114 3' + roo 350 2 56.85 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAG:1 + chr3R 21237821 3' - Doc 60 1 54.11 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCGTTTGCTTTGGGCGGCTGTTGGTTCGATAGGTATTTAAGCCA:1 + chr2L 2357393 3' - P-element 45 1 55.48 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCCCCCTTCATCGCCCACTC:1 - chr2L 19424693 3' - Tirant 8155 2 77.78 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTTATTCT:1 + chr2R 18048909 3' - opus 170 4 64.38 AAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTAAGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTTTCAGTTCATCCGTCAATGAAATAGGAACCA:1 + chrX 2338762 3' - invader1 265 2 78.77 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTT:1 + chr3R 21237805 3' - Doc 76 1 65.07 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACACAGTTTATCACTACAATTAACTACATTTGCACTACGTGATCTTGCATAGGTAATTTAAATTATTGCTGATT:1 + chr3R 21150664 3' - Burdock 48 2 55.48 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATAAAGGCGGTGGAAAAGGGGAGAAAATGGACTTGATGAAGGACCCTGAATGGCGGAGCAACGAGGCATAAATAAATAAAA:1 - chr3R 25443005 3' + 297 362 2 60.96 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTGAATG:1 - chrX 7467930 3' + hopper2 1548 1 56.85 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTAACCAGCTTTGGCCAAATGGTATCAAAGAGACCTGGATCGTTGT:1 - chr2L 2357235 3' - P-element 17 1 73.97 TGTGCAAGTTTGGATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATCTATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTGACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTT:1 - chr3L 14854668 3' - rover 6997 2 53.62 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGATTTCCAGCGGAGACGC:1 - chr2L 23189398 3' - 1360 45 1 67.31 ACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGTAAATGCATAAATCTCAGATTACATTTGCCTCCATTTTAGGATCTGCTTAAGTAGC:1 - chr3R 19232888 3' + P-element 2776 1 36.30 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGA:1 - chr2R 7404684 3' - blood 7083 2 64.38 GCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTA:1 + chr2R 11656085 3' - HMS-Beagle 88 2 79.45 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCC:1 - chrX 13548301 3' - jockey 4813 1 51.37 TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGAT:1 + chr3R 25521875 3' - blood 80 2 71.23 GGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAATTTCCTTCAAAACGAAACTTTTCAAGTTGTCTAAAAATGGAGAA:1 - chr2L 9658256 3' - F-element 257 1 69.86 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCTGCTAATGTGATTGTTGTTGTTCTGATAAACGCTAAT:1 + chr3R 10140321 3' - P-element 15 1 76.71 AGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAAA:1 - chr2L 9778710 3' + F-element 4581 1 65.75 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCC:2 - chr3L 22529764 3' + roo 320 2 79.45 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATATAATGATACAATGTTTGTTGAGTAAACCTGATATACAATTTATGA:1 - chr3L 3762229 3' + roo 332 2 71.23 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAGTCGGTTT:1 + chr3L 9649167 3' - roo 8742 2 73.29 TTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAATAACGAATAAGACTGCGGATGTTTATGTTAAATTGTTTACATCGGACGAATTTGTTATTGTCA:1 + chrX 21999988 3' - S-element 359 1 59.59 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTG:1 + chrX 15167738 3' + roo 8991 2 73.97 ATTATATTTTATACAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACACTTCATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAATCATAATATGAATAAATGTACTATAGTTTT:1 + chrX 15077377 3' - S-element 92 2 95.89 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGGTTTGAGACTTTTTTAACTACATCGGAAGACTTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTG:1 - chr3R 12795046 3' + mdg1 359 2 62.30 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGTTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGGGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTTAGGCCGATTTGT:1 - chr2R 20461203 3' - jockey 92 1 71.92 AGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTATGTATATAGTAGTGGAATGCAAAGATCTGGAGCGGAATGATCATTTGGGCATTAAGATGAATGTAGAGCACTGGTACACGGAAATTTACTAGCAAACTTTCCATGACTTAGCC:1 + chr2L 18180888 3' - mdg3 118 2 72.60 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATGTATGCTTATTT:1 - chr2L 1229549 3' + opus 7469 2 60.27 ATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCAAAGTGTTTCGATGTAAAGGTATTATTTATTATTTC:1 + chr3L 18920529 3' - Juan 19 1 72.60 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGA:1 + chr3R 20368090 3' - Max-element 8289 2 52.74 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAGTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTTTACTTTGCTTGGTTGAAAAAGGATAATCACACATATATA:1 - chr3L 4175205 3' + roo 398 1 73.97 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTTAAACGGAGATCTGGGTGCTCAAAT:1 + chrX 4566285 3' - Transpac 29 2 66.44 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTGCAAACATTTATGAAA:1 - chr3L 2036961 3' - Doc 22 1 72.41 CAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGTGTGTGTGTGGCCGC:1 + chrX 685397 3' - BS 5059 1 58.90 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATC:1 + chr3R 4722465 3' + roo 8995 2 70.55 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCAAATAACTCGTTCTTGAGGTTGCAT:1 + chr2L 17162900 3' + blood 353 2 66.90 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGCACGGAGGAGCTTCAGAGTCCG:1 - chr3R 10142883 3' - 412 13 2 75.34 CCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATGATGATCCGCTTGTCGCGCGTCT:1 - chr2L 19371243 3' - Bari1 26 1 65.52 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAACTTT:1 + chr3L 13597873 3' + blood 7355 2 61.64 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTCGAATA:1 - chr2L 20923015 3' - pogo 46 1 54.11 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAACGGCTT:1 + chrX 18193864 3' + hopper 1408 2 76.71 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTATCGAGG:1 - chr3R 10467987 3' + opus 478 2 65.25 GCGAGCAAAGACTGAAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATACCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTATACACCGCATATGACGGCACATACATA:1 - chr2L 11443776 3' + Rt1b 5009 1 78.08 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCC:1 - chrX 17614383 3' + roo 340 2 64.38 AGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCATTTCAGCAGCCGTTCGGGCGGCATAATAATAAGCAGTTGAGCCCATTTCGTCCC:1 + chr2L 19851210 3' + F-element 4440 1 62.61 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAAT:1 + chr3L 14581483 3' - pogo 59 1 58.22 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTGCCTGCATCAAAAATCCCTGTTCA:1 + chr2R 20913199 3' + 1360 3317 1 65.07 GTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCC:1 - chr3R 6068303 3' - jockey 4760 1 80.82 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTTCCGTGGTCAATTATTATCCTTCCT:1 - chr3L 3979551 3' + opus 7462 2 58.90 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTCCAATGGCCTGGTGGAGCGGCACTTTGTGAGGAAGTACCTTCTGCCCCGCGGATACAATGCCAATGAGGTAATCTCGGACA:1 + chr3L 9375943 3' - mdg1 41 2 57.53 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAA:1 - chr2L 1073905 3' - Tirant 56 2 54.86 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTC:1 + chr3L 13722096 3' - blood 7095 2 75.34 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCATAAAACGAGATAGATAAAATGCGTAGC:1 - chrX 983076 3' + 412 477 2 73.97 TCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCATTCGGT:1 - chr3L 15321956 3' + Transpac 5176 2 55.24 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTA:1 - chr2L 4416078 3' - jockey 85 1 78.12 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGG:1 + chr3R 9163945 3' - hobo 64 1 64.38 ACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATATGCCCCTCGCCGGGTGCCATCAATACATTCACTTATGTTGAAATCTTTACAGCAAATGATCACCGCCATG:1 - chr2L 2162429 3' + Stalker 6826 2 52.05 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCC:1 + chr3R 9993432 3' - hobo 84 1 75.34 TATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAAGTACCAAATGAAACTCAAACAAGTCCCAGAAGAAAAGGCGTTTGTAAAGCACGTCCTCTGCAAAATTCA:1 - chr2L 17749566 3' + Tirant 496 1 64.18 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAA:1 - chr2L 10089731 3' + 297 337 2 65.75 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAATTGGTGTGTTGGTACTA:1 + chr3R 24229002 3' + opus 7475 2 66.90 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCT:1 - chr3R 10079292 3' - P-element 60 1 44.52 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATACAAGGATATTGAC:1 - chr2R 20500009 3' + 412 462 2 62.33 GCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGAGTTCATAATTTCACTGGTCGACTGTTGCTGGTTGTTGG:1 + chr3R 22810820 3' - flea 4784 2 66.90 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAATAATTAAAATCCATTTTTATATCGATTTCATTTATGATCACG:1 - chrX 14173224 3' - 412 80 2 71.92 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCATACATGCATTTGTGAATC:2 + chr2R 7098041 3' + copia 5060 2 64.38 ATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATCTTGTAACAGGAAAGTAGTCCATTTTTTAGGTAATTTCAT:1 - chr3R 6827941 3' - flea 4836 1 73.29 ATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAA:1 + chr2R 22692410 3' - Ivk 96 1 72.60 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATC:1 + chrY 311344 3' + 1360 3360 1 43.15 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGG:1 + chrX 3506204 3' - Tirant 7 2 75.36 GTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTATTTAATTTTATTGATACGAAAATTGGTTTACACCAAAGGAAGTCGGCTTGGCAGATGTCTTCCAGGGGAACACCTACA:1 - chr2R 25203308 3' + invader1 3812 2 53.42 ACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAG:1 - chr3L 18296916 3' + Juan 4148 1 64.14 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTTCAATA:1 - chr2L 16942036 3' + mdg1 363 2 56.85 AGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGTTAAAATAACATATTGAACTTAACACGACATTATTTTTACCATTTTGTGTTACAATACAAATTTAGTAAAATA:1 - chr3L 10804111 3' - Idefix 302 2 50.00 ATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTACTCCC:1 + chr3L 53100 3' + roo 9034 1 59.59 CAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGCAGCGTTGTTCCTGTTGATTTTTGTATGTCGCTGGCTTTGGTTTTTCGCCAGGTTTCACTGGTCTTTTTTCGGGTTTTCTTGGTTTTTCGCGGTGTT:1 + chrX 22691283 3' + mariner2 45 1 72.86 ATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGT:1 + chr2R 6984397 3' + HMS-Beagle2 238 2 70.55 GCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGTTGTAGGGGATGCTGTCCTGAAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACACACTAACCACCGGAGTGCTGGCGCCACTGCCACTGGGTCCGTTGTTGTTTATGGGAGTCCGCGAACGCTGGGGCG:1 - chr3R 24040587 3' - GATE 267 1 52.74 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTATATATAAGTTATAAATGCCATTTATACCATATGACTCCACAAATATCCCATTAATAATATTAAAAGTTGTACGGCATTGGTGTG:1 - chrX 15227365 3' + flea 202 2 58.90 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACTTAACAACACTTTGCTGACTAAATTGTGTCAGTCTTATATTACCCTCAGCCAAATCGCATGCCCCCACCTACCTTACAACAATGCTGTCATATCTGT:1 - chr3L 8067465 3' - copia 4892 2 65.75 ATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAAAGCTGGTGAAAACAAAGGAACAAAGGAACACTGGACTGGAAGAAGACTTGCACGTTGTTGTCCAAATAGCCATGAAATATCTTAA:1 + chr3L 649892 3' + 412 496 1 74.66 TATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGCTATTACTTATTACTTATGAGCTATTACTTATTACTTATTACACA:1 + chr3R 16611518 3' - Stalker2 249 2 69.18 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGT:2 + chr2R 7223774 3' + blood 7347 2 56.16 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACTGTACGAGTTCGATTCGATTGATAATTATTGAGCGGTTGCCATGAAAATGCAGTCCAAACAAACGGTACACTGAGAGAAA:1 - chr2R 21056656 3' - Tirant 40 2 59.59 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCGAAAGGAATCAGTTATCACGAT:1 + chr3R 20149840 3' + 1360 3376 1 76.71 TTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTT:1 + chr2L 6074068 3' - BS 66 1 68.49 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGCACAT:1 + chrX 15814569 3' + P-element 2790 1 18.62 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCG:1 - chr3R 18903382 3' + pogo 2049 1 55.48 AAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGCTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTCTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTACCTTTGATATATCTTGCTTTCCGAGTATTAAATTGGCTTAGCAGCAA:1 - chr3L 3722636 3' + Cr1a 446 1 67.12 CCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACAC:2 - chr2L 18046730 3' - Tirant 8178 2 80.14 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGNT:1 + chrX 23291031 3' + P-element 2495 1 76.52 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCA:1 - chr2L 16942047 3' + mdg1 7390 2 64.38 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTAC:1 + chr4 311598 3' - 1360 65 1 61.64 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAACTTTGCT:1 + chr3L 13597876 3' + blood 7358 2 63.70 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGTGAATAGACTATTTCAGGAAACTAAACTATCTTTTATAAGAACGGTTATATTAATCTAAAACATAATTAGGTATGCTAAAATAAAATAACTGG:1 + chr2R 9332257 3' - roo 27 2 67.12 GCCGTTGAGGCATACTTTTCAAACGGATGTTCGGTTATCAAGAGCGGGTTAATGTTTTTGTTCACAGACTGCTACAGTACATCGAGTCTTATGCCTTATGTGAACTGCACTGTGCACTTTGATATTTTATTTTATACCTTATTAGC:1 - chr2R 2947594 3' + mariner2 164 1 71.92 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGAGAGC:1 - chr2L 16685307 3' - P-element 53 1 45.52 AGATGAATGGGTGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTTATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGAATCCGGAGGTGTCTTTCCTGGGGGATTGGCGTGAGGACACAAGGGTTTCAATGCTATTTCAAGCGCCCGTCTAAGCATCCAGCTCGCAT:1 - chr2R 5462898 3' - transib4 2423 1 65.07 ACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTTTCGGCACTATTCAACACGCGCGGCTTTTGAATGTCAGTTCAAATTAAAGCAATTGCACACGC:1 + chr3R 20510708 3' + Tirant 8316 2 55.48 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGC:1 + chr3L 4869255 3' - roo 8716 2 58.27 AAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTCAGTGTTCATGTTCGTCAGTTAGTTTCGAATTTTCACTTTTCCTGATATGTGTTAGGGTGCTGTT:1 - chrX 22591261 3' - copia 4927 2 55.48 GAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAATGCAAATTATTATTTTACAATAAATATTTTACGATTATTAAGTGATGTTTGTTTGTGGCTGT:1 - chr3R 15259841 3' - 412 449 2 57.24 GTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTAAACAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACACCTAGAAGCAAA:1 - chr2L 8959886 3' - Ivk 5134 1 47.95 ATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCA:1 + chr2R 2949107 3' - 17.6 7001 2 73.91 GAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTTGTTGGATGAACTGCAGGCTGTCTTTTTATTGTTCTGC:1 + chr3L 19597092 3' + blood 7098 2 72.92 AATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATGTATTTGTATTTTGTATATATTTTTCCCATAGTGATCGTAAGACTTTTAGCTTGTAT:1 - chrX 13460517 3' + Quasimodo 7306 2 67.81 TACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCTCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTG:1 + chr2L 20841965 3' + G6 1941 1 68.49 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGC:1 + chr3R 18846644 3' + roo 393 1 70.14 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATATAGTAGGGGGATCCTTTGCT:1 - chr3R 27786548 3' + Tirant 380 2 61.11 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCATTGTATAG:1 - chr3L 5263314 3' - pogo 18 1 69.86 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCC:1 + chr2L 14262944 3' - blood 7050 2 54.11 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAAC:1 + chr3R 10143021 3' + 412 7474 2 65.07 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAA:1 - chr2L 1229562 3' + opus 453 2 52.05 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCAT:1 - chr2R 18721933 3' + 412 426 2 64.38 ACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCAGTGGACTCCCAAAGACCGCCCCAGCA:1 + chr2L 7815015 3' - F-element 4395 1 67.12 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGATATCCAAGCTATGGGTATGGATTCCGCAAAGGAATCTCGAACGACAACGACCAACACGAAAGAAA:1 + chr3R 16771440 3' - roo 8717 2 54.86 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACG:1 + chr3R 25521872 3' - blood 7090 2 72.54 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGGGAA:1 + chrX 19231868 3' - mdg3 5285 2 63.01 TAAAAAAAAAAACTTCAAAATAAGTTGGAAATGGAAGCAGAAATATGAAATCTATCCACCTTAAAGGTACACTTACAAGATGTATCTTCTTATTTTTATTATCTTATCTAAGTACCAGCCTATTATAAGGTTTTCACTAAAAGTAA:1 - chrX 2556725 3' + gypsy11 3932 1 78.08 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGAATGGTGAATCAAGTGAA:1 + chr2L 10032769 3' - hobo 33 1 61.64 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAG:2 - chr2R 16908480 3' + roo 349 2 57.53 AAATTTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACGCCATGCACTTGCCATGGATACACCGCGAACTGACCTGACTGAGTGACTGACTACATGGGACAACTAGCTGGCTATCTGGCTATCTGGCAATACGATTGCGA:1 - chr3R 24175632 3' + Burdock 6380 2 76.98 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCA:1 - chr3R 23507580 3' + 412 428 2 61.38 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCTGTACCCGCGT:1 - chr3L 18708551 3' - F-element 24 1 76.71 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCT:1 - chr2L 7991271 3' - 297 26 2 59.65 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCTGAGTAAATACTCGTGG:1 + chr3R 15514649 3' - 412 29 2 65.07 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTTGTGG:1 - chr3R 18846511 3' - roo 8737 2 67.12 GTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGAAATCTAGATCCTGATAGTGTGTGTTCTCAGCTAGCACA:1 + chr3L 19146727 3' + pogo 2080 1 69.86 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCT:1 + chr3L 22481350 3' - roo 8704 2 56.85 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAAGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGGGGAACTTGCGTTAACTTGTATAATATACAAACTATTTCTAAGATGGCTGAATG:1 - chr2L 8687266 3' + opus 7435 2 75.00 CTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCCCACTCGGTTTGAGTCCCCATTTCCATCTGCATCGCTGTCTCCATCTCTAGATTCAGCTTCAGACCGTAATTCAGAGCAGAACTCTTT:1 + chr3R 20452570 3' + blood 141 2 65.41 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACATTTA:1 + chrX 14908482 3' - blood 53 2 52.05 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCA:1 + chr2R 9164941 3' - 412 57 2 54.79 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGGGTGTTGGAGGCGCCTGGAAATATGCAATAAAATATTCATGATTTCTGTGCAGCAAAAACTTGCAGAAA:1 - chr2L 15621832 3' + hobo 2917 1 63.41 CAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACCATACGCCCGACACCATACGAATGTCGTCTCTCATTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGACTGGGAGAATGTGTGTCCGCCTGTCTGTGTTTGTATGTTTA:1 + chr2L 4110069 3' - Rt1a 15 1 59.59 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACATTTTTTACAAGGCTTACGCAAT:1 - chr3R 24228836 3' - opus 141 4 66.44 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAACACCCGAACTACCATTAATGGTGTCGGTACTGCTAAAGGAAACACAAATTAACAAGGTGTCCTTACCGAGAGCATTCATTAAAAATAATT:1 - chr2R 15062138 3' + blood 346 2 63.70 GGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCT:1 - chr2R 19076556 3' - F-element 257 1 78.77 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGAGCAACAGGCGACAAACAGCGCTGAGGGGAATGCCATAAAAGTTAATTGCCTCAGTAGCCCCAAAAAGACAAAAGCTCTCCGGCATAGTGTGACTTC:1 + chr2R 19985828 3' - copia 25 2 67.81 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGACCAACTCTAATATTGATTGCTCCATCCGCCCCAACCGCTTCCATAAGGACGCCATCCATAT:1 + chr3L 11610698 3' - copia 4915 2 50.38 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTT:1 + chrX 18034665 3' + Juan 4136 1 72.60 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAA:2 + chrX 11534543 3' - roo 8718 2 56.16 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGAATTCTTTTATTATTTCATAAATCCGCGGTCATGACTTGGCCACTTCCCG:1 + chr2L 10614625 3' - blood 7082 2 67.12 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAACTCTCGCTTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCCTTTTCATCCACGCTCCTTCGCGGTTGCG:1 + chr3R 30273077 3' - Tirant 8170 2 60.96 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGAT:1 + chr2L 10832341 3' - Doc 66 1 61.64 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGAATCGAGCTAAGCTCC:1 + chrX 11534561 3' - roo 36 2 59.59 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGCTAATTAAGTTAGAAATGTTT:1 + chr3L 4869275 3' - roo 39 2 58.22 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCAATGTAC:1 + chr2L 8397254 3' - roo 57 2 57.53 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACATTTTTTACAAGGCTTACGCAATGAAAAAGA:1 - chr3R 24228828 3' - opus 20 2 71.92 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTACACTTTAAAA:1 - chr2R 15079988 3' - roo 39 2 58.90 TCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCGGCAGCGCTCGACAGTCGTGGGTTGCGATTTCAGTGG:1 + chr3L 15120404 3' - invader4 2879 2 70.37 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTG:1 + chr2R 16891837 3' - jockey 91 1 72.60 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAATCGATCCATGACACATGATCA:1 - chr2R 22671331 3' - jockey 4700 1 61.64 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCAAAACACACTCATGCAAACGGGCGCTGATTTACCTAACAAGCGCAA:1 + chr3R 28144904 3' + hobo 2887 1 63.93 GTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACATACTATGGAAAAAATGTTTTTATCTGGCTAGGCATGTCAACGAACCAGCAGCCAAATGAATATGG:1 - chr3R 17587908 3' + flea 345 1 54.86 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTACCCTTTCTATAAAATGAAATCGAAATGGGTTCGTATTTGTATTCCATTTCCT:1 - chr2L 14005360 3' + hobo 2869 1 63.70 TTTTATTTAAAAATAAATAAAACCCCATAGGTAGCGCACCACCTACAATGGAAATGCCCAAAACTCGATGATTTTCAGTCGCGGCCACCGAAAA:1 + chrX 17787146 3' + transib2 2633 1 71.28 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGC:1 + chr3L 9430644 3' - P-element 81 1 30.14 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATATCGGATGTTTTGACCGCCATT:1 - chr3R 23968577 3' + jockey 4936 1 60.27 TAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCGCAAAAAGTTATTGTATTTGCTGACTGATATTCCCTAGTAACAAATACCCTGTTTCATGGCCAT:1 - chr3L 10076253 3' + flea 231 2 82.27 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCATCCAATGCCTTCTTGTTTGAGTTTTATTACGATGCTCTTGACCGGTTTTATTGCCCTCAATATTTCTTGCATATT:1 - chr3L 16535148 3' + copia 209 2 52.05 ATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAAAGACACTGTACCACCTTGCTATTAGTTTATTTTCTCAAAATAACTTAATCAACTGGATCA:1 + chr2R 12306686 3' + 1360 424 1 64.38 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATT:1 + chr2R 21056776 3' + Tirant 8440 2 65.07 AGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCTGCCGTTCTCCTTTTGGAGCAAAAGCCACT:1 + chr3R 10468147 3' - opus 16 2 74.66 AGAATGATAGGTGGGGGCTTAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATTTCCAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGCAAAGTTATTTTTTGGCCTGCTGTTTGTTGGGGGTTTAAGAGTCTATTGGCC:1 + chr2L 12542648 3' - G4 159 1 73.97 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATA:1 - chr3R 9563616 3' - P-element 82 1 28.08 CCTGTTACATACTTTTCAACGATTTTATAAATATCAAAAAAATATTTTGCAGAAATGCTGTCGTGACAGTTTATAAAGGTTTGTTGGCGTTAGATAATCGAGAGTTAAATAGATTAACAAAGACGTAGGCCAATAAAGCAGGGAAT:1 - chr2R 15855332 3' - INE-1 18 1 64.38 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATCGGAAG:1 - chr3L 14969226 3' + P-element 2804 1 26.03 ATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAATTATAAAAGCTAGATGATTGAGAAACAATTTTCTCTGGCCGAAAATTGTTCGTATGAGAGGGGTCATTCGACGCAATGAACTGTCTCTTCCGTGCACTTAATACATAT:1 - chr2L 17897443 3' + INE-1 123 1 56.85 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAA:1 - chr2R 7223661 3' - blood 68 2 65.07 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAA:1 - chr3L 2036981 3' - Doc 43 1 58.22 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCACCAAT:1 + chr2L 21192580 3' - roo 71 2 70.55 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTATGAATATAAATGATATGGCCTAAGAATATTTTATTTTAAAAGATGGTCGCGAAATTGTCTTAGTACTCTCTTGCTT:1 - chr3R 5245522 3' - 1360 14 1 76.71 TAGCTGAGTAACTGGTATCTGATAGAACGACTTTCGTGAAATATTCTATATTTTACGATTAAATTAGCTTAAAATTATCATAATGATGAATGGAACTTACCATACACACACACCATACAGACCATATATTCTGAATATCATTTCTT:2 - chrX 5711885 3' + INE-1 544 1 17.81 CCTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAGAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAAAAGGTACGTATACTGCGATGCGTCTACGTT:1 - chrX 20384803 3' - hopper 1150 2 77.40 TATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCCCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTTAGCGAGCG:1 - chr2L 21237212 3' - P-element 13 1 64.36 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACA:2 - chrX 18193708 3' + hopper 1355 1 60.27 TAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACATTGAAGCACCTCGTTCAGTTTGCTCTCATCGTGTGCCACCTTCTCTAGCTCTGCGAAGATCTCATCCTCGAGCGACTG:1 + chr3R 16080386 3' + R1A1-element 82 1 53.42 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACGTAAATCACGACTAACACTTTAGCAAACATAAGTTTTGCAGTAATAACACTTGTTATCTTAATTATGGGTTTTTTTTT:1 - chr3R 23449220 3' + roo 9036 1 59.59 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTGTTTTTTTTATATCATCGATGTTCCCATTTTTGAA:1 + chrX 14756795 3' - pogo 30 1 67.81 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCATACATGCATTTGTGAAT:1 + chr2R 7098040 3' + copia 190 2 65.07 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAG:2 + chr3R 24693693 3' - hobo 28 1 66.44 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGTGTGGGTGTGCGAGTGCTGCTTGTGTTTCGACTGGGATTTTTATAAAGCCTAAGGTAGTTTGATGTTATTTTATTTGATTTTTTCCG:1 - chr3L 17447419 3' + Tirant 8496 2 75.00 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAGTAGA:1 + chr2L 21342346 3' - roo 72 2 76.03 AATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGTAGTTGCTGGCCATATGTAATACGAGTATTTCAATTATAAAAGCAATTTACTGGAGGATGGGCACGTTTCGATTACAATAAGCGTATTAGCTTACCAATTACCATG:1 - chr2R 22773853 3' + jockey 4667 1 76.71 TTTTTCTTTTTTTTGTAATTTTGTTCGTTCAGTGATAAGAAACTCCAAAAAACAATAACCTACAAAACCATACAGATATCTTAACATGATTCACTGTCAATATTATATTGAACCCATAATTTACACATAAAAGGGCTATGGCTATA:1 + chrX 7831667 3' - Doc 4698 1 58.90 CATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCCAAGAGGAAGTGGCA:1 - chr2L 14262779 3' + blood 380 1 69.86 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGA:1 + chr3R 20149797 3' + 1360 3333 1 57.53 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGAT:1 + chr3R 5087109 3' + P-element 2835 1 47.48 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGGAGTACGATTTT:1 - chrX 7525050 3' + I-element 5294 1 58.90 GTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGGACACCCCAACAGCCTAGCAGGAAGTTTTCCACAATGTTATTCTAGTTACCTTTGCATAATCATGG:1 - chr2R 22778990 3' + jockey 4619 1 61.86 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGGACGTTGAGAAGTTTTTGAT:1 - chr3L 14921366 3' - pogo 46 1 52.74 CTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTT:1 + chrX 21667925 3' - gypsy2 81 2 70.55 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAATATATGAAATTACCTTGTTCTAT:1 - chr3R 23507530 3' + 412 477 2 73.97 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCGCGTTCGTTGATATGCACAGAGTAGAGATGAGTT:1 - chr3L 23456043 3' - 1360 53 1 54.79 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATA:1 + chr2L 2338135 3' - blood 90 2 80.82 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGATGTATTCGTATGATGACCAAAT:1 + chr3R 8542723 3' - roo 8678 2 69.86 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATTGTTGTTAGACAGACAGATACACAGACAGACAGACGCGCACGTCCAGATCAACTTTACTATTTATACTGGTTAACAATATATATATTGTATCACTTAA:1 - chr3R 4132421 3' + Quasimodo 7361 2 79.84 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCC:2 - chr3L 5446089 3' + roo 9020 2 53.42 CCGACCGAGGGGCGCGGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGAGACGCGATATAACAAAGAGAACAAGGGACAACTTCATGTTGGATGCTTCGATCGAGAACTGATATGCTTTCTGCTGGCAAAATACAACTTT:1 - chr3R 14516999 3' - Cr1a 4408 1 53.42 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAAC:1 + chr3R 23623940 3' - roo 77 2 73.29 GTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACA:1 - chr2R 19076541 3' - F-element 242 1 68.49 ACAGTAGCCGATATGCCGGCAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTTGCGAATTTTCTTGTCGACCCTATTTCCTTCCGACGTTTGAAGAGAATACATCCCCATTAATCGTTTACTGCCGCTACATAAACTATGATAAAACTCTGT:1 + chrX 4969664 3' + G5A 2600 1 73.29 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGT:1 - chr3R 16194142 3' + mdg1 7378 2 72.41 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGCTCGGCCGTCTG:1 - chrX 3444077 3' + pogo 2043 1 58.62 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTT:1 + chr3R 5087112 3' + P-element 2831 1 47.26 GAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTTTGAAATACACGCAGGCACACTGGGATTCAGATACTCCCCGCATGCCTAGATACATTTGCTCGGGTGTGTGGTTGTGACAGGC:1 + chr3L 13598569 3' - blood 162 2 65.22 GCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTG:1 - chrX 14317414 3' - 1360 164 1 68.49 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTG:1 - chr2R 16908454 3' + roo 9063 1 74.59 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCA:1 + chrX 15089585 3' - P-element 66 1 40.41 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTA:1 - chr2R 20913138 3' + 1360 3319 1 53.33 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCAC:1 - chrX 19498117 3' + P-element 2830 1 23.00 CATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACACCAAGTCGCG:1 - chrX 292368 3' + G3 4554 1 73.29 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAATTTACACAAAAGGAAAAACTTGAACGGAGGCAGTAATAG:1 - chr2L 15965182 3' + blood 7357 2 61.27 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTTGCAAGGGCATGAAAAC:1 - chr3R 11549790 3' - 297 46 2 62.33 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAA:1 - chr2L 20984322 3' - blood 7095 2 76.03 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTCAACGTTTTTAT:1 - chr2R 18807714 3' - jockey 18 1 73.97 AGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAAAAAACAATATATGGGGGCTCATACACCTTATCAGGCTAGAAATGTCGCCGCGTTGACAACTCG:1 + chrX 4446141 3' - McClintock 70 2 56.55 ACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTGTATATCTTGGGTATATCCTTTTTATCGAACATTTTGATTTAAGTACCAGGTATAAAGGTTCACTTTATTTATATCCTAACATATAAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCA:1 - chr3L 23583082 3' + S-element 1698 1 57.53 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAA:1 - chr2R 22671363 3' - jockey 4732 1 60.96 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATCACCGCAAAATCGCCAGACTCATAAAAAGTATACTAGTATATACATAAATACATATGTATGTATGTACA:1 + chr2L 22125284 3' + P-element 2835 1 50.00 CCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCAT:1 - chrX 14914344 3' + mdg3 5440 2 57.53 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGAGGAGATCGCTTGAGCCGTTTATTTGGGAGTAAGCTTTTGAGCTGGGTTCGCAGAGTTGATTTCGCCTTCATATTGAAGGGG:1 - chr3R 14088512 3' - 1360 17 1 74.48 CCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGG:1 - chrX 693671 3' - INE-1 137 1 43.09 ACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAAATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTAT:1 - chr2R 19076501 3' - F-element 200 1 57.53 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCACCCCATCCGCGGTAGAGAAACGCAACCTGACCAACCTGAAGAAGAGCCAACATCGCTGGATAGATGGACGGGTTGGTGGGCGGGCCCACACAGATACACATACCAGATACTT:1 + chrX 4588875 3' - Burdock 6146 2 77.40 AGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATCTAAATGAATGTGCACGCAGAGAAAATTAATGTATCACTTACTATCACGATC:1 - chr3R 11461772 3' - 17.6 65 2 65.07 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAATTTCAAATATGAATATTTAAATGTT:1 + chr2L 7215663 3' - 297 20 2 69.86 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATGAGAAAAAATTGTTTAACGTTACTTTACGTGTAAAGGG:1 - chr3L 22737374 3' - mdg3 83 2 74.66 ATATGTATATATATAAATGTATACATTCATTTGACTCATCTCAGGGACGTCTTACAGACAAACCCTGCTGAACCCTGCCTATGTTCTGCCGCAAATCCACTCTGAAACTAAACCTTCGCCAACATCATTTCGGCCGTACGAGAACA:1 - chr2R 4706940 3' + Stalker4 248 4 68.49 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATATATATCCTTTAGTTGATGTTCCGCTACAAAGAAAAGTTCTAACTAAATTTAAAACCTAACTATCAGTTAATCGATGGTCAAATATCGATAGAAAATCTAGAAAT:1 - chrX 16325257 3' + mdg1 406 2 74.66 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATGAGGACATCGTTAATTCCTT:1 + chr3L 6751764 3' + pogo 2047 1 56.16 TTTGGCCATTTCCACAATTGTGCGGTTTGCACGTTCAGCAATTCCTAAATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCT:1 - chr2L 22319304 3' + frogger 2047 1 74.66 TGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACACTTTCAAA:1 - chr2R 19633182 3' - jockey 4614 1 57.24 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAAGAAAACAGGCAAGCACTTAACAATTAACCGATCGTTCCTGTAATTACCGA:1 - chrX 13651461 3' + 297 6913 2 65.75 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTGGCCAGGACCTGCGGTTGC:1 - chr2L 15832945 3' + hobo 2925 1 73.97 GTTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTGTTAAACCAAGGCAAAAGGGTAAATGCAACTTTTGGAAATGATCTTACAAATATTCATTATCCAGAAAAG:1 + chr3L 12030652 3' - I-element 5166 1 72.60 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTTATCATTCAGTCGCTGCCCAG:1 - chrX 18365985 3' - jockey 36 1 65.97 ATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTG:1 + chr2L 11867379 3' + BS 4979 1 52.48 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTATATACAAAACGACTTCTAAATGTTGGCAATAGCAATTAAAACAATTATTATTATAGTTACAGATACGAAATTCGGCGGTTG:1 + chr2L 8452360 3' + copia 242 1 66.67 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTCAATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTT:1 - chrX 8082364 3' - roo 48 2 51.45 TAAGATAAGATAAGATTAGATAAGAGAAGAAGAAGAGAAGAAGAAGAGAAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGATTACCTTTCCTCTTTTTTTTTCCATTGCCTTTGCTTCCAATTCAAACTTCTCACTCTCGCTCTATTTTGTCCATT:1 + chrX 6884504 3' + Stalker3T 202 1 50.68 AGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGGCCCTATTTTGGCGAGTACTTCCTTAAGTTGGGCTGAGGTCTTCTTGACCCTAATGGTTCTAAAATTTTGAAATGCGTTTGCACAGTTATT:1 + chr3L 20581027 3' - gypsy3 6542 1 67.26 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTGCCTCTTAAAGGACTTATATACTTATATTTGTGTATGTAATGGGTGTCGGATGGCTTATACTTTTATTAGCAAAGAACAACTAATAGTTG:1 + chrX 20386806 3' - hopper 28 1 43.15 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATACGGTATAACATGTATGTTTAATAAATGAATTCAAGGAGTTATATGCCAGTTTCGATTT:1 + chrX 4789231 3' + 297 6927 2 60.96 GTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTTTGATTCTAGAGGTTGTTCCATTTCTGGATTTGTATATCAGAGAGTGCATCTAGTTAGTTGGTGAGACTTGTCTTAGTTTGAATTATAGAGT:1 + chr3R 27598007 3' - Quasimodo 318 2 67.81 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATAAGCGCTGAAAAATATGTAATATGCCACATATGA:1 + chr2L 18581348 3' + roo 8988 2 79.45 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACTA:1 - chr3L 13597722 3' - blood 38 2 60.27 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTCGGAGTTGGCAACTTTACATATTATGAACTTTC:1 - chrX 18125076 3' - BS 5016 1 69.18 AAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCCAGTCGTGCAGAGCGCAAATAACTAACAGACAGATATTGGCCAGCTTTTCACATTTTTAGCGAAAGCTAAT:1 - chrX 16246260 3' + jockey 4894 1 51.37 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTG:1 + chr2R 24338431 3' - 1360 80 1 75.35 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGA:1 + chr3R 15649862 3' - blood 7077 2 61.64 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCA:1 - chr3L 13597743 3' - blood 7070 2 58.90 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATG:1 + chr3R 15974787 3' + P-element 2810 1 32.88 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGAACTGA:1 - chr3L 4023596 3' - pogo 38 1 59.31 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATCTTACTATATATATTCATATTTAAATGTGAAACTAACCTATTTGAAAATGTGGCATATACAAATTATCATAGTTCAAATTCAATCAGACTACTTAAACTATAAATCTT:1 + chr3R 21518160 3' + 297 371 2 54.79 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGCTTATGCAAAGCCAGTTTTATC:1 + chr2R 21898018 3' - 412 7072 2 69.86 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTGGTTGCATTACGCAGCACCAAAAATTAAGTTTTCAGCTGATTGAACAAGTTTAACAGATTTTTATACTGAAGTATAGTTGATAAA:1 + chrX 3529860 3' + 412 458 2 61.64 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTA:1 - chrX 21668694 3' + mdg1 7420 2 50.00 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCA:1 - chr2L 1073886 3' - Tirant 8146 2 60.27 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTT:1 + chr2R 18882688 3' + roo 9031 1 56.85 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATGTCT:1 - chr2R 19353963 3' + 297 6929 2 54.48 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCGCTTTGCATGGCTTTTCTTGCATGCAACTTCGCTTCGCATTG:1 - chrX 14962155 3' - jockey 23 1 73.29 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAAAGCCCCGCTACTTTTGGC:1 - chr2L 1136296 3' + 1360 3336 1 55.48 CGCAAAAAACAATTAAAAAAGCTGTATGTAAATAATTTTGGGAAAAGCTGCTGCAGCAGTGCAATCAGCAACGCAAGCAGTCAATCAAAGTGCGTCGTCAGTGGCATCAGTCGTTGCACAAAAGCCAACAATCGTACCGAGAACGA:1 - chr4 899565 3' + Bari2 920 1 77.40 ATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGGGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAATGTTTTTTTTCAGTGCATAAACTGATAGTCGCGCAGTGACATACAGTCAT:1 + chr2R 20754514 3' - 1360 301 1 67.12 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGG:1 + chr3R 29709078 3' + blood 345 2 56.59 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTATACTATATTTTATTTAGATGAGCAAAATTTAGATGGAAAATTCATTCTTAAACTAGCCAAAAAACCGAAAAAAAGTGAAGTCATTTAATTAGAA:1 + chr2R 4564701 3' - flea 22 2 70.55 GCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATG:1 + chrX 22517673 3' + 1360 3324 1 70.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTTAAAT:1 - chr3R 12608039 3' + roo 356 2 53.42 GGATCCATGGAGCAAAATTCCTTAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAGGACGATGCGTGGCTGTCATTGCCAACAAAACTTTTCATCATAATTGTCGTTGGGGTTTGGTGCGATTTGGTGCGGAAAAGGCCGGAG:1 + chr2R 13752566 3' + Tc1 1246 1 59.59 ATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCTTTTAATT:1 + chr3R 6103673 3' - Tirant 67 2 63.01 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCGAGAGCAATTGACAAAGTGCAGTTTTCCCCAGCCCCACTACGTAGG:1 - chr2L 11573659 3' - jockey 4750 1 71.23 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTA:1 + chr2L 15833108 3' - hobo 43 1 54.79 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCGAGTGTCTTTGGTTTGCGGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTATAACCGACATATAAG:1 + chr2L 9010507 3' + 1360 3319 1 67.61 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCAAAGTGT:1 + chr3L 18920500 3' - Juan 48 1 52.74 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATATCGGGACACCCTGTGACCATATTTCACTTTCGCAATTCTCTAGTTCGATTAAACGCTACGAACTTTGTGTGCTGCAAGAGACAAGTAATTTTGTCTATCCTTT:1 + chr3R 10026361 3' - FB 16 1 74.66 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTG:1 - chr3R 4722375 3' - roo 29 2 56.30 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTGGTAGGACGTGGTCTGTGGT:1 + chr2L 6406585 3' + transib2 2776 1 55.48 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTAC:1 + chr2R 6585544 3' + pogo 2065 1 60.96 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTTCCGTGGTCAATTATTATCCTTCCTTGCAATGCCTTTGTAACCCGTTCAT:2 - chr3L 3979526 3' + opus 7487 2 76.03 AAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAACAGCAAAAAACACACCAACAAAACAGAAACATAATGGCACAGCCCGAACAACTAGCCGAAATCGTTCGTCAGATTCTGGCCGAACAACTCCCAACTCTCTTGCATCAAAGTCAAAGT:1 - chr3L 25507472 3' + Porto1 4414 1 75.34 GTAAAGAAATAAAATAAAATATCACTGCACTACCAATAAAAAAAAAGCAGTATAACAAGCTCAATCTTGCGAATCCCAAAACACGACGGCTGGCTGTTGAAAGTTTCACAAAGTATTTATTTATTTTGCACGCAGCAATTCCGTTT:1 - chr3R 28421438 3' + G7 1147 1 52.74 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTGGAATCGAGTCTCGAACCGATCGATCCTATACGATACGATCGCAATAGCGCACAGCCATTGCCATCGCGATCGCCGCTTGGGGTTGGCAAGATCATCGTCTTCGG:1 + chr3R 29207675 3' + copia 250 1 77.04 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGGTACAGAATTTCCAG:1 - chr2R 9164806 3' + 412 462 2 63.70 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAGAGCAATTGACAAAGTGCAGTTTTCCCCAGCCCCACTAAGTAGGCTACAAATATTTTTTTAATTACCACTCTGCAGAGAT:1 - chr2L 11573623 3' - jockey 4714 1 57.53 ACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATAT:1 + chr2L 6074052 3' - BS 82 1 79.45 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTCTCTTTTCTCCCTTGGTTCA:1 - chr3R 31956346 3' + pogo 2082 1 72.60 TTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTGAAGTGAAGAAAAATTGCAGTCAATATGT:1 - chr2L 17840982 3' - Juan 4047 1 60.27 ACAAATACATGAACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGT:1 + chr2L 15153315 3' + G6 1936 1 75.34 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCCGGACGCTTTTGTGATTTTATTTTTGCGTTTTCCCGTGATTTAGCCGGACAGTTTGAAATATGCTGCCGGCA:1 - chr3R 26399744 3' + roo 9055 2 73.97 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATTTTCCAACACTTTTATTCCGGTGTATTAAATTTTTTCTTGTGAGTTTATTTTTTCCTTCAGCG:1 + chr3R 11002178 3' - flea 4806 2 54.68 TAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTACCCTTTCTATAAAATGAAATCGAAATGGTTTCGTATTTGTATTCCATTTCCTTG:1 - chr2L 14005358 3' + hobo 2871 1 61.64 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAAAAAAATTAAAATTCCACTTACGAAACAAAATTTCCCTCTAGTTGTATTATGTATACAGTCAAGCAACTTT:1 + chr3R 15030822 3' - jockey 14 1 79.45 CGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACTAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACTTTGGCTAAAGCAAATTATGAGCTTCATTTGCATATTCGCATATCCAACAAAGGGCTGAAATTGAAAACGC:1 - chr3R 25567394 3' + Doc3-element 4555 1 51.37 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTC:1 - chr3R 10079314 3' - P-element 82 1 29.45 GCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTA:1 + chrX 22517671 3' + 1360 3313 1 73.38 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACTTT:1 - chr2L 4416040 3' - jockey 65 1 54.79 ATTTCGAATTTCTGCCAAAAAAAAAACACATAAAAAACCACAGTGCACAAAGTAAATTTTTGTAAGTAAGGTAAAATACTAATAAATTAATAAAAGAATTCATTAATTCATTTAAAGGAGGGATAAAAGTGTTGTTTGTAAGTAAG:1 - chr3L 24737520 3' + transib1 2124 1 53.42 ACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGAGGAGATCGCTTGAGCCGTTTATTTGGGAGTAAGCTTTTGAGCTGGGTTCGCAGA:1 - chr3R 14088539 3' - 1360 45 1 55.48 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACTGATTCATTCATTTTTCCCGAGATGAAGCAGCTGACGTGCTTGAGGAAAATATGTGCCCGCCAGGCGCTTTTCAATTGAATTTTCCATCCTTTTACGATGGTGT:1 + chr2R 19901120 3' - mdg1 7055 2 74.66 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTGTTGGTGGGCCGCAA:1 - chr3R 8542551 3' + roo 9039 1 58.22 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGAGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGGTTGGCGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGAATGGTGAATCAAGTGAATGTGGAA:1 + chr2L 10032776 3' - hobo 26 1 63.70 GGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCAGTG:1 - chr2R 19904014 3' - Doc 4471 1 54.79 GTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCCTCTGCAACTCC:1 - chrX 693651 3' - INE-1 140 1 41.10 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATT:1 - chr3L 14581377 3' + pogo 2040 1 61.64 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTAT:1 + chr3R 9482093 3' + roo 8993 2 72.60 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAACATACGAAATAAAGATGA:1 - chr3R 31907283 3' - Tirant 8117 2 80.14 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAAGCATT:1 - chrX 14914322 3' + mdg3 210 2 60.27 TACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATAGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCTGGCAAGTTGATGATAGCTACAA:1 + chr3L 15099689 3' - G4 3807 1 60.96 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATC:1 - chr3R 23099075 3' + roo 9018 2 57.53 TTTCGGCCCGCAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCACAATGTTTTTTTTTCGAGTGTTCACTCGAATAAATAGTTTCTGGCAAAATGAGTTCAACGTTT:1 - chr3R 28203180 3' + 1360 3190 1 56.16 GTATGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGTGTGTGTGTTGGCCCTTTCACTTGGCTTGACTCGAGTCTCGGGCTCCTGGTTTTGCGGTTCGGATTGTGACTTAAGTTTCAGTAGTTTTTTTTCGTAAATTTCCTTTAGCTAACTAGCCTG:1 + chrX 16995596 3' - Quasimodo 35 2 63.70 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCATTTTCGTTTCGCTCTTGGTTTTTCTTATTGCATTTTT:1 + chr3R 26316027 3' - roo 8673 2 76.74 GAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATA:1 + chr2R 9327034 3' + mdg3 5412 2 76.03 CCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATATAGTTGGGTCTATGACAGGATCTGGGCTTGG:1 + chr3R 9983105 3' - HMS-Beagle 6852 2 56.16 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTTTTTTAAAATATAGTCTCCCCAA:1 - chr2L 17638687 3' + blood 7330 1 56.85 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGT:1 - chr2L 2357290 3' + P-element 2834 1 41.73 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAAT:1 - chr3R 17316025 3' - 3S18 5810 2 54.79 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACATCCTGGGTGAGACAGCCCACCTGGCTTAACCCTCGAGCT:1 + chr3L 4023774 3' + pogo 2092 1 76.71 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCA:1 + chr3R 14049440 3' + transib2 2771 1 54.11 CAACTTGATTGCTTCTATTAAAATTCTGGTTTTTACTAAATTACTAATGAATTTATATCTACATATTTTTAGACCATGTTTCTCGATATCGGGATCAATTAGGAGTAAGTTGATTAAAACCGTGCCAGGCAGCGCGTTTTCGAAAA:1 - chr3L 20018645 3' - HMS-Beagle 6596 1 52.74 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCT:1 - chr3L 4869151 3' + roo 9045 1 57.52 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTGCATAAATAACTTCAAGCATCCCGCCCCATTTCTCAG:1 - chr3R 12795010 3' + mdg1 7409 2 50.68 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTAT:1 + chr3R 12608173 3' - roo 53 2 58.22 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCATTCGGTGTTTTGGACTCGG:1 - chr2L 10474328 3' - P-element 80 1 30.34 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTG:1 + chrX 16853416 3' + roo 337 2 67.12 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTCTCTTCATTCCAACTGTCATCTTCATTTT:1 + chrX 983270 3' - 412 13 2 78.08 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGCTCACGCACTAATACAAATTCTGCCCACACACACACACACATTCAAGCAATCGCGTACAGAGAG:2 + chr3L 7434957 3' + pogo 2047 1 56.16 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAAAAACAGT:1 + chr3R 28033703 3' - diver 47 2 53.42 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAATATATGCATATATATGAAGGAGCTGACTTCATTTTAATGTGTGTAATAAGAGCTAAATCTTTTCAGTAATACTATTT:1 - chr3R 21517977 3' - 297 38 2 57.53 AGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAGAGCAATTGACAAAGTGCAGTTTTCCCCAGCCCCACTAAGTAGGCTACAAATATTTTTTTAAT:1 - chr2L 11573640 3' - jockey 4731 1 58.90 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGG:1 + chr3L 21093248 3' - Ivk 46 1 53.79 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATA:3 + chr2R 2949151 3' - 17.6 6965 2 60.27 AAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGTCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAAGGTCTACACACGACCGACG:1 - chr2L 18235407 3' + F-element 4609 1 63.70 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCT:2 + chr3R 15514589 3' - 412 7142 2 77.40 GGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTATTCCCTTCATTTTGGCATATTCTCTGGCATTTCCCGTATCTTTTTGCTGCTCTATGACATTTCCCTGTTTTTAT:1 + chr2L 1634466 3' - roo 453 1 50.68 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCG:1 - chr3L 2036997 3' - Doc 54 1 56.03 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTC:2 + chr3L 3540271 3' - mdg3 5262 1 77.40 GGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGATATGAGTGGAGAGAAGCGGTGCGTGTTCGGATCCACGGTGCTCTACCCATGATTATAGAGTTGAG:1 - chrX 14140581 3' - G2 103 1 55.48 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGGGAGAAAGCGGGAAGGCGAG:1 - chr3L 4869109 3' + roo 9055 2 73.79 CATGGCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACAAATATAAGCGCTGAAACATATGTAATAT:1 + chr2L 18581337 3' + roo 337 2 75.41 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAACGTGTGAGCAACTCAAAG:1 - chr2L 7667382 3' + copia 248 1 55.48 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCG:1 - chr3L 15035121 3' + pogo 2034 1 69.86 CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCAGACCCCTCTGACTCACTGATTGCGATCGGGAGCGGAAGGTGCGTGAACAATGGAAACAATCGAACATAATTAGGCTAATTCCCATTTCCACATCCTGTCGGGCCGGAATCGTCAGCATACCAGA:1 - chrX 12835157 3' + blood 7180 2 67.12 CCTGCCTCCCAGTGACAGAGGAACCCCCTGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCATATATTTAATAATGTCTGGAAAGTTTATTTCACTTGCCAAATCAGTCCAACTCGTTAATCATTCAGATAAC:1 - chr3R 15779630 3' + springer 315 2 56.85 TGTTATTTTTTTTAAATGGAATTAAGATGAGTACACTTGGTTGCTGCATTGTTATTCTTTGTGGAATTCTGATTTTTGTTGTTGCAGTTGCAACAACAGTTGCAGTGGCTGAAAACAATAAGTTTCAGGATGAAAGGGATGAACAT:1 - chr3R 13608289 3' + HB 97 1 78.08 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACACAGTTTATCACTACAATTAACTACATTTGCACTACGTGATCTTGCATAGGTAATTT:1 + chr3R 21150649 3' - Burdock 6199 2 65.75 GACATGTTCACACTATAAACTTTTGCGTACACTTAATGAGTTGAATTCCGGTGTTTGAATCCAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTAAACGACATTTTAACATTATTTACTGTGGTTAATACTTAAA:1 - chr2L 21287087 3' - rooA 369 1 69.86 AAGGCTGTCCACAGACTTTTTTCAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTATGAGCCAAAACGTGGGCACAGATTGCTAGCCAAAAATATTTGCAGCAGCAAGTACACAGAGCAAAATGGCGAGTTAGTTACACATG:1 + chrX 15399360 3' - Burdock 6098 1 59.59 CTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAACACTAGAGTAAGAACAGAAATGCATGATTGGAATTATCATTGTTTTTATTTGATTATTTTAATTCCATTCATTTAGTGTCGCTTTGTTGATTTTGTTATTCAAATATAT:1 - chr3L 14043477 3' + Ivk 5370 1 78.08 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGAAAATGCTAACGCGAAATTTCGTAATTTTTCTGGCTTATAGATGTAAATAAAATTAAAAAAAGCATGGGCAAGGCCTTTTTAAAAGCTTTTGCATGATATTTTGTACTTAA:1 + chr3L 23024399 3' - INE-1 557 1 65.07 GTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTGTGATTGGCCTA:1 - chr2L 15142217 3' - BS 4743 1 58.22 TCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTC:1 - chr3L 9571664 3' - jockey 83 1 69.86 ATATTACGTCATTTCTCTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAATTTACCATGAAATGTATTCGAATGCATGCTAAAAAGTT:1 - chr2L 13080852 3' + Stalker2 7220 1 73.97 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATTAAGTTG:1 + chr2R 9033959 3' - F-element 4526 1 57.93 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGGTTTCGAGACC:1 + chr2R 21380745 3' + roo 9051 2 69.18 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGCAAACCCACTTTGAGTCAGGAATTGTTGACTAAAGCCAAATACGGGGATTTCTGCTGATGAAGTGCATTTTCAGGTCGGCGGATAACTGTTATC:1 - chr2L 9010389 3' - 1360 29 1 65.75 GATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTACATACATACATA:1 - chrX 5439975 3' - accord 51 2 53.42 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATC:1 + chr3R 20149810 3' + 1360 3346 1 56.16 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGGAC:1 - chr3L 14921383 3' - pogo 63 1 60.96 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGCGGACTGTTCTTGGACTTTTTTAATCATCATTAACCCCCCTTATTATACACTCAAAAAAAAACAAGTTTTGCTCAATTTT:1 + chrX 5892199 3' - transib2 38 1 58.22 AAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCAAGCAGTTTCTTTGCATTAACATTTAATTATGGTATATT:1 - chr2L 12257066 3' - roo 329 2 73.29 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAAA:1 + chr3R 29350805 3' - 297 18 2 64.04 ACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAATTAAATTGTGTTGTAAAATTTATATAAAATGTGTAGTAATACAGCCATAGGATAACCAGCGATTGCCTAATGATACATTTTACCAAT:1 + chr2L 13317588 3' + X-element 4681 1 47.95 ATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTT:1 + chr3L 8253734 3' - jockey 4648 1 62.00 ATCAGGATAAATAGCCGAGTGGATCTGACCCTGTTTGTCTGTCCGCCCGTCTACATACAGAGACATAGATGAAGCGCAAGTTTGTTGAACGCCAGCTGGACCAGCTGACTAACGGTAGTCGGTGAACTCAAGTATAGCGTTCTCTT:1 - chr2R 15689436 3' + INE-1 93 1 63.70 AAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTTTTTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATACATTCATGCGCGTAGATAGGGACAAT:1 - chrX 23406393 3' - R1A1-element 146 1 75.34 ACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCACTAAGAGATGTTATGGCTCCAGAA:1 - chr2R 5214905 3' - F-element 18 1 76.06 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATACTTCAAAAAAAAACGTTTCATTGAATACGTCCTGGTGGAACTCGGAGCGGTGCTGGCTGATCGCTTTGGAGACGGCTAATGCCGGCTTGAGCATCAGCC:1 + chr2R 11903369 3' + opus 7487 2 50.35 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAATATGAGTGTGGCTACTTAAGTTAGTGTGTGCATGAGTGGGTGGTTGTGCAAGTGTGGTTTGTTTGCTTGGTCCTGTCCAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' - jockey 27 1 68.49 GGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAATCCTTGTTGACTTTTATCCTTTTTGGAATGTGCCCGTTCATCTTGGCTTAGAACCAA:1 - chr2R 9326908 3' - mdg3 5261 1 78.77 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTGTGTATCATTTTGCTGCAGACACTGATCCAAAGATCGAAAGATTGTA:1 - chr2R 18048749 3' + opus 491 2 79.45 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCA:2 - chr2L 17228633 3' - mdg3 5334 2 72.60 TTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGGGTG:1 - chr2R 20382446 3' + Bari1 1684 1 69.86 GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGG:1 - chr2R 22671361 3' - jockey 4730 1 59.59 ACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGCGCGAAATGAGGTGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTGTTGAATAAAATTAATAGGAGTGATTGAGAATGACCTGGCCTACTATCGGACATATTCGCGTAAG:1 + chrX 16807542 3' + Tc1 157 1 72.60 TAGATTATCGCTTTTATAGGTAAAACCTTTAGCGTGGCATGGCACATCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGTTAATATATGCCTTGGCTTTGAAATCAACGCATTGATGGACTTGTGTTCCGTGATCATGGATTTAAATT:1 - chr3R 7897060 3' - Helena 47 1 50.00 AGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGACTCTTGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGATCGTCTCGCTGAAAGGTCACCACGACGCCACGGTGGATTCTCAGATCTATGCCGTGCCAAA:1 - chr2R 15219972 3' + roo 490 1 58.22 CGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGC:1 - chr2R 19076517 3' - F-element 216 1 50.68 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTTTGGGGGAAAACT:1 - chr2R 16908440 3' + roo 391 2 72.41 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCAC:1 + chrX 15089565 3' - P-element 86 1 26.71 GCTGAGACTGGCAAAGCGATTATTCCCCAAATTGAGTGGCCCGCTGGCAATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGATTCCTCTGGATATATTTACTCTCCGTCGAGCTTACCA:1 - chr3L 8902379 3' - Ivk 221 1 75.34 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGA:1 + chr2R 6585529 3' + pogo 2050 1 55.48 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAGTTTGTGCACT:1 + chr2L 10832375 3' - Doc 32 1 66.44 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCG:2 - chr2L 7459570 3' - BS 5075 1 70.55 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATTCCTGTATAATTACAAGTGCAAAAAAAAACAAGCGAAAATTCGCGGCGAAGTGGCAAGTGACACAGAACGAGCGGAG:1 + chr2R 8862516 3' - pogo 36 1 54.55 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGC:1 + chrX 19162709 3' - pogo 32 1 62.68 TTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAAATTATTACATTAAGCCTATTGATAAATCAATCCG:2 - chr3R 15649791 3' + blood 292 2 76.03 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTT:1 - chr3L 5514192 3' - Doc 69 1 55.56 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAAC:1 + chr3L 16887392 3' + roo 8994 2 69.86 GGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGATTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAGAAGAACAAAAAAGACATATTTGCACTTTAAATTCAACATATTATTAAACATT:1 - chr2L 15153217 3' - G-element 17 1 59.42 AATTGAATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATT:1 + chr2R 10367575 3' + 412 7487 2 54.79 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTA:1 + chr3L 14581501 3' - pogo 41 1 57.53 AGATCACCTGATCTTGTCGAAATTCCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTCTACTTTCTTGTCTAGTTTTTTGTTTCTTATTTTTAGCAATTTTCCATGCTACCTGTGCGAATTTTTTGCGCGACGGTGTGCGGAGATGCGCTCG:1 + chr3R 16810932 3' - invader2 4816 1 67.81 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCA:1 + chr3R 14088645 3' + 1360 3319 1 66.44 AAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTC:1 - chr3L 15371301 3' - Transpac 4992 2 67.81 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATT:1 - chr3L 18468342 3' - jockey 4723 1 52.05 TGCGAAGAGTCGCACTCAGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGTTCATACCAGACTGTTAATAAGCAAACAGTCCAGGATTCTGGATTCAGTTCAAAAACAACATACGCCTTGGATATGGAACCTGCTTTATTAGA:1 - chr2L 22643321 3' - invader4 2760 2 56.16 GCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAG:1 + chr3R 20368080 3' - Max-element 64 2 59.59 TATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTG:1 - chrX 7525078 3' + I-element 5266 1 78.08 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGC:1 - chr2L 10089746 3' + 297 322 2 76.03 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAA:1 - chr3R 31907322 3' - Tirant 8156 2 53.42 TTGCTGTGAGTAGGTCGTGTTGCTTGATAGTGCAGCACTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAAACTACCACGTCGTTGCCGGAGAAGAAGCACTGGTTCACATCCAGGACGATCTTGGTCATAAGCCGACGGGTGCTGTGGATTA:1 - chr2L 810880 3' + copia 147 2 53.42 CTTGCCGATGCAGCTTACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAGCAAACAAACATG:1 - chr2R 6585379 3' - pogo 25 1 67.12 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAA:1 - chr3R 10778667 3' - mdg3 82 2 72.60 GGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTGGCCCACTGCTTCATCCATTCCTTCTCCGACTGCTCGATCACAGTCACATAGGTGTTGCCCAGCATGGCAATCAACATGTTGAGCAACAGGATGGGTACGAAGATCATAA:1 - chrX 6816523 3' - G2 225 1 77.40 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATAC:1 + chr2R 20362274 3' - diver 5976 2 78.08 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTTGTATCTTAGCTGC:1 + chr2R 6187959 3' - Tirant 8147 2 55.30 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCG:1 + chr2R 17014100 3' + HMS-Beagle 6996 2 67.59 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGC:1 - chr3R 3527090 3' - Tabor 74 2 68.57 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATCGTCAAGTGGCTCA:1 - chr3L 22529703 3' + roo 9045 1 67.12 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACCA:1 + chr2L 14970005 3' - Tirant 35 2 62.76 TGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGAGAGAGCATACAGATTCTAGACCCAAAGCCGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTAGTGGCTTAGATACAACGCGATGCTGGTAGTAGCCGTATATCTGCTTGGGGTCCTGGGCG:1 + chr3R 20583414 3' + INE-1 140 1 65.07 AGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATT:1 + chrX 3506139 3' - Tirant 80 2 71.92 TTAAATAATTGAAAATAGATTTGTGTCATTTTTTCTCTCCGTGTATGTTCAGATTCAGGCGGCCGCTAAGCGCAAAACGCTCAAAATTACAGCAACAAACAAAATTTGCAGTAAACTGCGTGCTT:1 - chr3R 29651510 3' + Transib5 259 1 77.60 AATGGATTTTGAGTTATCTACAAATTGTAAACTCTGCCGGTTTTAATTGCTGTCGCATTTCGAACATTTACTGCTTCAAATGGGCTGAGGCGTCGAGATTTATGGCGCACATATACACTCGAGGTCGTCATTGATGTATT:1 - chrX 22706381 3' + invader5 3623 1 70.00 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGTTACCCTTTCTATAAAATGAAATCGAAATGGTTTCGTATTTGTATTCCATTTCCTTGGGCTGTTTTATGGCGG:1 - chr2L 14005342 3' + hobo 2913 1 59.17 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTAAAA:1 - chr3L 4710697 3' - Doc 41 1 60.27 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCG:1 + chr3L 131825 3' - P-element 18 1 65.14 AAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCGTGCTTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTTGTTGCCGCTGCTGCTGTTGCTGGATTTTTCCCAGGCCGAAAAAAAAGA:1 + chrX 13895376 3' + 1360 440 1 63.70 CTTATGGTCCACCCGAACCGACTGGCAAATATCCTTGTTAATCCCATCTCCCTTCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCAGCGATCTCCGTACCCGGCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTAACTAAACATGGAGAA:1 - chr2L 15004779 3' + G5 4579 1 63.01 TGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTAC:1 - chr2L 17198073 3' - R1A1-element 5086 1 73.97 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGC:1 - chr3R 31907314 3' - Tirant 8141 2 61.87 AAAATCGTGAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGG:1 - chr2R 4193300 3' - 1360 37 1 78.08 CCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCGATTGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGTTAAACATCCAATCATTTT:1 + chr3R 19446956 3' + roo 8882 2 66.44 GGGCCACAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACAACATATCCCGCGCGACAGAACAGAACAGAGTAGAGTGGA:1 - chr3L 21554485 3' + 412 7194 2 63.30 TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTT:1 - chr2R 6984432 3' - Doc 80 1 67.12 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTG:1 + chr3R 15649865 3' - blood 63 2 59.59 CTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGATTTCGTAATGCCGCAGTAGTTGGCTTAATCCGGCGGTGGCAGCTG:1 + chr2R 23150958 3' + Stalker4 139 4 59.82 TAGAATTCCCAAATCAACTCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAATTCCACTGATTGTAGTAGTCATCGTTGTAGTAGTTTATGTACGCCCACCAGGCGT:1 + chr3L 12159200 3' - blood 460 1 60.96 GCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCAAGATGATGCCCACCAGCAGCAGCAGCTCTCTCGCCTCGCGCTTCTC:1 - chr3R 11372143 3' + opus 7250 2 60.83 ATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGGTCAAGGGTTGCCTTGTTGGGCCCATTCATAAATTGGCAGTCGCC:1 + chrX 19113099 3' - Rt1a 5053 1 65.38 AGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAACAGCCCAGGCAAA:1 - chr2R 20362198 3' + diver 6054 2 57.53 ATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTCTCTCATATGCCTTGAATGTGAATATGCTTGGGGTTCA:1 + chr2R 24379326 3' - mdg3 101 2 73.29 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTT:1 + chr3R 18846642 3' + roo 389 2 67.81 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAAGAAGAGAGTTAAGA:1 - chr3R 5086981 3' - P-element 33 1 62.33 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATTTGGCAAATGTTAACTTTG:1 + chr2R 12703909 3' + blood 7375 2 73.97 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGCCGGGCACAAATTAAAAATGCCCCACAATTGCCCGCGAGTTTGAGATCGGGTA:1 + chr2R 24338505 3' + 1360 3379 2 78.08 AAAATATTTTTTAAATATACTAAATAACATTTATTTTCAATAACTCATTATTGCATTCGAGATAATGAGCAGTCATAAATATCTCCCGATTTAGCAGGTGCTCAAGGACCCCGACTTATCGGGCCTACAGGGCATTGGCTTACTCG:1 + chr2R 22964383 3' - Transib5 2723 1 56.16 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTCGACCTTGGCGGAAAACTTGCGTCGAGCGTAGCATAGTTTTCCGCGCTTTT:1 + chr2L 6598426 3' - hobo 64 1 61.43 GGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGATTTTGGAATCCTTAGAACAGCCATTGGTTCGATTAGCCATCTTACACACCTGAAGTTTAGAGCAGTCTAGAGGA:1 - chr2L 43068 3' - I-element 4965 1 51.37 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACCTGATGGCTTTTTTACACTTGGCTGCAAAGTTG:1 + chr3L 15322115 3' - Transpac 4928 2 77.40 ACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGGGTGATCCACTCAAGAAGGCCCCCGCCGACAGACACGAAACTGGTAGTAACTCATAACTCGGCTCATGCACTTGGGGTATCTACAAAATGCACTGATTATGAACGGGGTCT:1 - chr3R 12287546 3' + Quasimodo 6964 2 63.70 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGC:1 + chr2R 12703866 3' + blood 7332 1 56.85 GGGTGTCAAAAAAAACGGGTTGCCTAGAGACCCGGGGGTTTATCGGGTGGCCGTAGAGGGGGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTTTGGTACAGACATTGAAGTTTTTTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACCCGCTTGA:1 - chr2L 15832999 3' + hobo 2876 1 50.35 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGTTCTCTGTTACCCTTTCTATAAAATGAAATCGAAATGG:1 - chr2L 14005384 3' + hobo 2887 1 70.19 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTAT:1 + chr3L 11196455 3' - pogo 49 1 54.11 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTATGGAAGC:1 + chr2R 7404814 3' + blood 7375 2 69.18 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAAT:2 + chr3R 25271290 3' + 412 7501 2 52.74 GAAGTCGGGTTCAGCTAGATAGCCGTGTTAAAAATCTCTCAAGCCAGTTCAGATGGGCACGTAGCTTGTTGCGATTTGATTATTATCAACCTTTCGATTTAAAACCCCTGCCTTGTGTGAATCAAGTCTTACCTTTCAGCACTTAA:1 + chr2R 23291564 3' - Fw2 3785 1 51.37 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAG:1 - chr3R 25271190 3' - 412 78 2 69.18 AGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGG:1 - chr2R 20382460 3' + Bari1 1676 1 62.86 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTGCCTGCATCAAAAATCCCTGTTCAATGTTAATTGTTAATCATTAAATATTGTTGC:1 + chr2R 20913230 3' + 1360 3348 1 57.53 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCA:1 - chr3R 8542580 3' + roo 346 2 57.53 GTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTACAAGATAAGAACGATTTGTTAATGATTGCTCATGTGTTGCAAAATGGTGTAAACT:1 + chr3L 14749910 3' - Doc 4334 1 62.33 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAGTTATTACCAGCTCATA:1 - chr3R 11096678 3' - copia 4931 2 61.64 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAA:1 + chr3R 21237813 3' - Doc 66 1 59.03 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGTACTGGGGAATCAACTAAATGCTAAATAATCAAATG:2 + chr3L 15371399 3' + Transpac 5177 2 55.17 AACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGGGGCCATTTATTTG:1 - chr3R 7424514 3' + 412 7531 2 68.03 AAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTTGTTGATATTTAGCTTCGGGAAGTGACGAGTTCAGGA:1 + chr2R 19294709 3' - hobo 2637 1 72.60 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAA:1 - chrX 7467956 3' + hopper2 1522 2 74.66 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGGAAAAATCGAGATTAAGTCCCCAATTATGCCCATTAAATAAGGCATATTAAAGCCAAGATTAAACTTTCTCTTTTCTCAACTA:2 + chr2L 1327630 3' - pogo 31 1 64.38 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCC:1 + chr3R 13358688 3' - mdg3 5316 2 58.22 CTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAATTCGGCAGTCGCTCGGCTTC:1 + chr2L 20561522 3' - P-element 20 1 69.78 TCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAAAAACAAAATTAGCCGAGTTAGGTGGAGTGCGTTCACAAAATCACGATAAAGGGTGATCAAGCAGTCAAGAGATCAACGCCAAAGTCGACGAACTGCTATTACAAAAATACATCATAC:1 - chr3L 23665500 3' - Stalker3T 297 1 49.32 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCT:1 - chr2R 18807791 3' - jockey 94 1 72.60 TTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAAGGTGGCTGCGAACAGCAGGCGGCAAAGTGTCATGCGCAGGGATATTTATGCGCTATAACGGCGAGCG:1 + chr3R 6864245 3' - 1360 3003 1 50.37 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACAAAGGCAAATATCTCCCCGACCCA:1 + chr3R 12795164 3' - mdg1 7041 2 80.00 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATCAATCGGACTGGTATATAACAAAATAGA:1 - chrX 18824091 3' - roo 8756 2 82.19 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTTTTCCACTTCCCTTTCATTCCTCCGCCGGCGAGTCCGGGACTCCTTCACTGCTCCGGCTCTGGGGCCAAATGAAAAATTGCACACGCGGGAATTTGATTT:1 - chr2R 22675755 3' + roo 390 2 71.92 TCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAG:1 - chr3R 6782722 3' - jockey 4752 1 68.49 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTAAAATTTAAATTTTAAC:1 + chr2L 1136413 3' - 1360 51 1 55.48 ATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACT:1 + chrX 21907816 3' - accord 426 2 65.07 GTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAGTGCCATCTGTAAACATATCGTTATTTATCCATTTACCCCGTTCCACGTGACAGACGCCCTAGGAGCAGGGACACGGTGCGGGGCT:1 + chr2L 10785218 3' + Stalker2 7508 2 60.27 TACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAAATATT:1 + chr2R 10163643 3' - Juan 4134 1 60.27 GAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCT:1 - chr2R 10478704 3' + invader4 2994 2 80.14 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTG:1 + chr3R 10140256 3' - P-element 80 1 32.19 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTGGAAGCCTGTGCCGGGGGATAGCGGGAATGGACAAAATCCTTTTAAAAAA:1 + chr3R 31907477 3' + Tirant 377 2 69.18 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATACCTCTTTTATAACATTTC:1 + chr3R 21924397 3' + roo 9054 2 73.29 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGGGGGCTT:1 - chr3R 15589967 3' - Transpac 61 2 64.96 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTATCTGGCAATCAGAGAAATGCGCAAAAGTTCCCATATCAATATACGACTGTGACGTA:1 - chr3R 9616529 3' - roo 5 2 77.10 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAAAGGTAAACATAGCGAGCAAAGTGAAAGTGACACACGCCAAT:1 + chr3R 9163994 3' - hobo 15 1 75.34 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTAAACGTAC:1 - chrX 8272406 3' + roo 9024 2 51.37 AAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTTATATTGCAAACGGCGG:1 + chrX 10623929 3' + X-element 4686 1 58.52 GTAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCGTATTAGGCATTCCCATGGGCGGAGGGGGGAAGGGGGAAGTTCGGAAAGGGCAGGGGTCGAGAGTTGA:1 - chrX 3121958 3' + diver 172 2 50.68 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAA:1 + chr2R 5900943 3' + Bari1 1662 1 56.16 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAG:1 - chr2R 9326976 3' - mdg3 5315 2 67.12 ATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCACGTGAAAAAAACCGCACAAGGTAAAC:2 - chrX 21474367 3' - 1731 32 2 77.40 ATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATGCTGCAGTTGGTTTGATGTTCAAAATGAAGACATTTGAATTTGCGGTTCGGGCTTGAGCACCGTAGGCTATAGATT:1 - chr2R 8376156 3' - G2 466 1 52.74 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGAAAAATCGTTGTTTGACTTACAAACTTTATTGTTCATAGTCATAATCAGCTGATTTCCAACCCAACGTTAGCATCACTAAA:1 - chr2L 14359012 3' + pogo 2063 1 60.27 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTG:1 + chr3R 23507708 3' - 412 29 2 63.01 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCTACGGC:1 - chr2R 15613781 3' - P-element 60 1 29.06 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCGATTAAGATCTCGGGCGCAACATAGT:1 - chr3R 19700821 3' + roo 398 1 78.08 AAATAAAATAAAATAATTAAAATAACAATTTTATTTGTAATGCAATAACCACACTTAATATAAAATTATTATTACTTATATGTGAAATAACAAACGCCAATAGACTCCGGAAACGCACT:1 - chr2L 17038351 3' + F-element 89 1 68.07 TTTATAGTTCCTGAGATACCGACGTTTATACGGACAGACAGACGGACACGGTCAGATTTTACTCTACGATTAACCTAGTGTCCCTTTTAATTTATACATTATCCATCAGCATCAGTTCAAAGGCTAACGAGCAGCCAATAAATCGC:1 - chr3R 31957303 3' - INE-1 146 1 60.27 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGGGGTAACCATTTTGTTGCAAGGT:1 - chr3R 26782654 3' - hobo 14 1 77.40 GCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTAT:1 + chr2L 14969968 3' - Tirant 8179 2 62.76 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCCAAGTTCTCCACTTCTTCAGCTTTTCAGTTCCTCGGAGGAGCAGAGGCGGTCAACGTC:1 - chr2R 15906250 3' - FB 16 1 63.00 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACAT:1 - chr3R 24228857 3' - opus 7165 4 53.42 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCTTTAGTTTTTAACTGAAA:1 + chr3R 19545453 3' + jockey 4972 1 69.86 GGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTGGTCGTTAAACTAACTATTAACTATTAACTATAACTATTAACTATACGGAAAAACTGATTCATTTAGCTTGTTAAGTTATTTGTGTACATCAAAACGAAAAACATTTAATAAATTATTG:1 + chr3L 3482799 3' - X-element 16 1 73.97 GGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCAACTTGGACGCGGGGCACCACGACA:1 - chr3R 25384204 3' - mdg3 5336 2 73.97 ATCGTCTCGGCTATTGATCCTGATCGAGAATATATATACTTGGGGGTGGCCGGATTATGACACGTTGCTGGTGCATAAATTAATGGCAGACTCTTCGGTTGGCACTGGGCTGTCACCTCACGGCAACCTCAAGTCATCTG:1 + chrX 663247 3' - INE-1 95 1 70.00 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTC:1 - chr3R 25271166 3' - 412 54 2 52.74 GATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATTAGAGCGTAAACCCGTTTTCGTTCGATTTGGCTGAGGAATCATGGTGTCTCTGCCTTTGCCATCATTTTGG:1 + chr2R 17096049 3' - Transpac 5090 2 51.37 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTACACTGT:1 + chr2R 6585549 3' + pogo 2070 1 64.38 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTACCATTGAACGAATCGGTAAATATTATGGGTGCAAACATTGTCCGGAATCGCGTACATAATTAGGCACAATTCT:1 - chr2L 11426502 3' - hobo 21 1 52.74 CTAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' - 1360 225 1 69.18 ACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAAGAAACTTGTGTACTCAAACACTCAAGTATCCTTCGAGCAACGGATAATTCCTTTTTGAGTGTTTTCGCTACTAAACGGC:1 - chr2L 23395867 3' + HMS-Beagle2 7157 2 53.79 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATAT:1 - chr2R 15080007 3' - roo 58 2 58.90 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCACTCGATATATCGCTCGAGCATATCGGCGCTTTATCGATTGCCGGCCAGGGATGTTGCTAC:1 + chr3R 9563713 3' + P-element 2853 1 61.87 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCTCTGCGCTGCCAACGAAGCC:1 - chr2R 5848945 3' + mdg1 375 2 53.42 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATA:2 - chr2R 18807773 3' - jockey 76 1 60.27 TTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACT:1 - chr2R 19633195 3' - jockey 4628 1 52.05 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAG:1 + chrX 5222941 3' - 412 78 2 73.29 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGAGTTTATTTCAGTTGATGGCTAGTGAAAATATTTACACGTATTTAATGC:1 - chr2L 17069557 3' - 412 74 2 67.81 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAAGAGAGCCAGATAACGCGTG:1 + chr3L 13227720 3' - hobo 49 1 52.05 CACGGTGGCTGGGCGCATGAACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAAATGGCGAATGCAGAGCGTAGCACCCAAATTAGCTTTTCGTTTTCCACATTTTCCCC:1 - chr2R 14718318 3' - Max-element 489 1 65.07 AAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAAT:1 + chr2R 5900920 3' + Bari1 1639 1 65.75 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATG:1 + chr3R 19545426 3' + jockey 4945 1 51.37 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAAAA:1 + chr3L 3979679 3' - opus 7173 4 58.90 CTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGACTGACTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGAGTACCTTTTTTTCATATTTGGTAGTTATTTTGAATTTT:1 - chrX 16490824 3' + R2-element 3483 1 68.97 TGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCAAAGCCCAGAATAATTTGCCACTACGGCAAGGCAA:1 - chr3R 28147003 3' + hobo 2572 1 76.71 CGTACTAAAACAAAGACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTACACTCCTCAATTGAGAGTGTAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTCGAGTGTGTGGAGGTGTGTTTGTGTGGCTCGACTTAGATTAAGACACGTTCACTAAATTATTA:1 + chr2L 11158753 3' - Rt1b 5032 1 66.44 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAAAAGCCGAAAAACTTTTCCCCAC:1 - chrX 12623102 3' + jockey 4957 1 56.16 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCATTTACAGAACAAATAATTACACAGCCAAAGTATAAATCATAAACGAAA:1 + chr2R 3009567 3' + pogo 2073 1 66.44 TTAATAATAATTTTTAATTTTTTTTATAATTTTTCAGCTGGCGCTGAGAAGTATGCTACAGTTTCGTCTTAGCCAAGTTCAGTGCGCTTGTGTGTGTGTATTTCTGTGCGCGCGCGCTTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 12980362 3' - BS 315 1 76.92 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCATTTACAGA:1 + chr2R 3009527 3' + pogo 2033 1 68.49 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGCGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCTACTTTCAGGCCGTGACAATAACCA:1 - chrX 16244836 3' - jockey 4761 1 75.54 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTATGACCATAAGATCCCATTTATTAGATGCAACAAGCTTTGGAAAATATTTCTAGCCCCCTTTTTTTGTGCCACGCCCCTGTTCGGCCATTCGAGTAC:1 - chrX 7293172 3' + 1360 3369 1 71.92 CCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCTAATCACTAAACCAACTCATTTGCCTAATGGCATCTTACCCTCTAATTTTAAACTTTTTT:1 + chr3R 7804158 3' + Transpac 13 2 58.90 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGGTCCTGATAAGCAAATTTTCTAATCATATTTTAAATACTTTCACTTTCAATCAGTGCTTTTTCAGCGGCTACCCATTTT:1 - chrX 3506024 3' + Tirant 368 2 64.38 GTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTTGGAATATGTACAAAAGTTTTTAGTTTTTAGTTTTAAGTCCGGTTTACGGAGAGTAAAAAGGTAGTT:1 + chr3L 15860293 3' + I-element 5015 1 54.11 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCTGCGGTTCAATTAAGTGTT:1 - chr3R 8402501 3' - mdg1 7059 2 71.72 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATA:1 + chr3L 17667630 3' - F-element 70 1 58.22 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATGTTTATATGGAATTAACAGTTACGGCCTCATATAATTCAAGTTACTTATGACTGTTGATTACTTTTATTTTAT:1 - chr2L 8772711 3' + Tabor 438 2 53.42 ATTCTAGTGTCTTTGGTCTGACCTTCCATATGAACTGAGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTTTACCAC:1 + chr3L 22016852 3' + Tc3 317 2 71.23 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAACCTGGCTT:2 + chr3R 13358732 3' - mdg3 20 2 72.60 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTAATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCT:1 - chr2R 19904029 3' - Doc 4486 1 63.70 CAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTTCGAATTGAAATGATAATGAATTGTGTGGAATGATTATTAAAATTCTCTGACATTTCACGTTTGATTTGTC:1 + chrX 10023922 3' + Idefix 7156 2 51.85 AATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTA:1 + chr3L 16973460 3' - S-element 65 1 65.75 GCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGCTAGGTGGGCATTATACCTTAAGACTTTGATTATCAAATAGAACATCGCTCAGGGACGAGAATGAGACATGTTGATGCG:1 - chr3L 25399716 3' - Stalker2 56 2 59.59 TTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACACTTTCATATAATTTCTGTCATAGAGCATTGAACTAAGGCTTAATTTAGCATCGTAGATCTCACGAGTAAGAAGTAAAATCAATATTATGAAAATAAATATATATATA:1 - chrX 20499721 3' - Juan 16 1 73.97 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGATATCAAATAAGTGTCTAGAAATG:2 - chr2R 7404623 3' - blood 11 2 73.29 GTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGAT:1 - chr2R 19076550 3' - F-element 251 1 74.66 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAAGTTCAGGGAGTGCAAGAAGTGGCCAC:1 + chr3L 20290810 3' + roo 9047 1 67.81 TTAGATCTCAATTATTTGGTACACATATTCTTTCGAATTCTTTAGGCTTATTATATAAAACAATTAACCCAATTATTTATTGTACTTGACAATTGGAGAACAAAATTAAAACTGAAACTTAGGGCAAGCTTGCTTACGCACATAAG:1 - chr3L 24870660 3' + Ivk 5178 1 50.68 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTAGCTAAACTGCACATACTTCACATCACGAAACTTTTTCTGGTTACGCTCAAGTTTTGAATATCAAATATTA:1 + chr3L 10814638 3' - 297 22 2 69.86 CAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACA:1 + chr3R 15590046 3' + Transpac 5154 2 68.49 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGCA:1 + chr2R 18722055 3' - 412 34 2 60.27 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATTATTGCAAATCAAAAGCCGCAGTTTGATTTTTTTT:1 - chr3L 12030533 3' + I-element 5287 1 71.77 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCT:1 + chr3R 18846627 3' + roo 9050 2 63.16 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATATCCACACGTCACGGCTACGGCCACAAATC:1 - chr3L 9426623 3' + P-element 2875 1 76.03 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAG:1 - chr3R 10467998 3' + opus 461 2 53.23 CGCCCACACTTTTTTAAAATGTATTGAATTTTTTTCCTGCCTACAATTAGTTTAACTAACAGCAGAGAGTTGTGAAGATCCGAAACGTGAAAATTCTGTTTCCACAGTGTGGTTTCTGTTTGTTCTGTTCTGTTTCTCGAAGACAT:1 + chr3R 4971347 3' + INE-1 255 1 60.96 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTGGTCACTGGAGCCTCAGGAGTAG:1 + chr2R 18051084 3' + mdg1 7422 2 55.47 TATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCC:2 - chr2R 19904018 3' - Doc 4475 1 57.53 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCACAGTCTTTGCATTTATCGCATTTAATAGCCATTAGTGA:1 - chr2R 19168039 3' - opus 7025 2 69.18 AATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAAGTGATTCCGAATGCACCACAGATCCGAGAAAACTTTCTAATGCAGGGGCCCAGG:1 - chr3R 28033595 3' + diver 157 2 63.01 ATATGGTATTTATTATTCATGCAATCTGACTTTAAAAAAAATAAACATTCAATATTTTTTTTTTTGGACACTGTTGACATTTTCGAGAAATACGGTGAGAAGAAGAGCCAAACAAAGCAAAGTTA:1 + chrX 17743775 3' - Tc1 95 1 54.40 CCATCTCCCTTTAAAACAGCTTTCATTTGTATATAAATAAATTTATGTATTGTATATGGCAGGTGGAAGAGATAAACTGCCAATGAATCAGATTCGATTTCGCTGGACCAGGTGTTCG:1 - chrX 6750212 3' + transib4 2439 1 66.10 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAA:1 - chr2L 2357294 3' + P-element 2811 1 33.56 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGGACACGA:1 + chr3R 27971144 3' - mdg1 7071 2 63.70 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACTAAAA:1 - chr3L 13597719 3' - blood 7046 2 62.33 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTGGCT:2 + chr3L 17667641 3' - F-element 59 1 50.68 GTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATTTGCCATTGTTTTTAAATGGCCAAAAGCGAGCATACGTAACACGCTTACGT:1 - chr3R 10791692 3' - Idefix 65 2 65.07 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTTAAATGGTTTTTACAAAGCTATTTATTATTATAGATCGTTATGTAC:1 - chr3R 12607998 3' + roo 398 1 78.77 TACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTTAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCT:1 + chr3R 9938699 3' + roo 352 2 53.42 AATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGTCTAGGAACAAATTTTTATATGAAGAGGTTCTGGATCTTTATCCCACCCCAATCTTCCCCTTTAATTTATCGCCC:1 + chr2L 177314 3' + Tirant 449 1 60.96 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAGTTCTCATGGCGGCCTCCGGTGCGTATGAGCAATGTGAAATGTAAGCCAGTTTGCGGCACATTTGCATATATGGCAAAGGGGTTTTCCAGCGCG:1 - chrX 9525270 3' + hobo 2913 1 67.81 GATCGAAGCGCAATTTCAATGCAGCCGCATTTCTTCAGATAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATGTTGATATAATGACTGGAGGAAGTCAACCACGTCACGAGTGTCAATTGTTGTTAAAAAAAACAAATAGCA:1 + chr3R 2785356 3' + Chimpo 395 1 61.64 AAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGAC:1 - chrX 10873772 3' - mdg3 32 2 63.70 GATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGATGAAAAATCACGGCATCAAAGAAAATAAACAAGGTGTGAAAATGCAGTCAAAGCATCAACATGAG:1 + chrX 5377919 3' + opus 7292 2 55.48 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAGTTGTTTTTTGTAGTTATATAAGTTATAAATAAAAGCATTTTGTCCACCCCCCACTCTAACGCCCTTAGACCGTCTAAAACTGCCACGCCCACACTTTTG:1 - chr3R 4322608 3' - F-element 36 1 32.64 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAA:2 + chr3R 4722469 3' + roo 8999 2 67.81 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAATATACATGTTACGTTACGCTTTCTGCTTCTCTGCTGCTTTG:1 + chr3R 21570602 3' + mdg3 5469 2 65.07 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTT:1 + chrX 12551806 3' - pogo 62 1 63.01 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTT:1 + chrX 21213415 3' - Doc 28 1 60.45 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTCTTTTTATAAAAAAAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTATCCAATGCGTCCTGCTGCGTTGCCAGTTGATTAAAATGCCTC:1 - chr2R 6903027 3' + copia 5066 2 63.01 AGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAATATTGGCTCCATTATGCGACGTTTTCTTTCCTTTCCCATTTGTTTTTGTTTTTGGGTTTTGTGCCCA:1 - chr3R 24027035 3' - Copia1_DM 98 1 54.11 TTTATCGTTGATAAGCAAAATTGATGTATACTCTCTTACACTCTTACACTTACACTGACTTTATATAGAAGATGAATGAAAGAAAAGAAATATTGTATGGATTGTATGATTTTCCAATGTTTTTCCGCAGTGCATAAACATATATT:1 - chrX 7794374 3' + Circe 6983 1 62.33 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGC:1 + chr3R 10541340 3' - hopper 32 1 51.38 GGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATAC:2 - chr2R 19633191 3' - jockey 4624 1 50.68 CTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTG:1 - chr2R 19168095 3' - opus 7080 4 77.93 TTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGA:1 + chr2L 8393066 3' - I-element 5176 1 55.48 TTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTGATTGATTTATTTTGTATCCCATGGAGGGGCCCCCGCGCTGTTGCAACCGCAACAGTTGGGAGGGGGGGTCTCACGACGCCCGGCTAATT:1 + chr2L 19204951 3' - Doc 4700 1 39.82 TCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTACATATTTCTCCTTTTTCATTAAGCCGATGGAACA:1 - chr3L 19580813 3' - F-element 4235 1 71.77 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGTGCGTGTGTCCGTGCGTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATATGCACCTCTTCCGCTCCCGGGATCT:1 - chr2L 10089694 3' + 297 374 2 73.97 AACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGCTTGCTGCTAAAAAGTG:1 + chr2L 19372149 3' + Bari1 1666 1 56.16 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTATAGTATCATATTTATGAT:1 - chrX 23043129 3' - roo 8733 2 69.18 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGTCTGATTCGTCTGATTTTTAT:1 - chr3R 7569561 3' - Doc 32 1 38.36 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAGAGCCAAGAGAAAGCGGGCTCGGAATCAGG:1 - chr3L 14969145 3' + P-element 2885 2 78.77 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAATTAAATTAATTATATGAAAGTGTGTTAAGTGAAATGTCATGATCCTTATTATTTGATATCCAACTCTGGCAATC:1 - chr3L 21819956 3' + Juan 4159 1 56.85 ACCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCA:1 - chr2L 18046733 3' - Tirant 8179 2 78.47 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTGCTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATA:1 - chr3L 15891004 3' - mdg3 5311 2 57.53 GCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATATCATCCTTACTAAAGTTTAACACATACCATACCCATCAAAAAAAACGAATCAAACGCAGTGATTTGAAGACCGCCCTT:1 + chr3L 11596383 3' - gypsy6 37 2 58.90 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGTGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATATTTCTTTT:1 + chr3R 9938722 3' + roo 9039 1 60.96 TAACATAACAGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGC:1 - chr3R 19537508 3' + hopper 1325 2 76.03 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGTACGAATGAAACAAGGGGCTTCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTG:1 - chr3L 22221133 3' + 412 7488 2 55.22 ATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATAT:1 + chr2R 14884330 3' - mdg3 73 2 73.97 GGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAGTTAATAGTTATTACCTGTTTTTTACACAATTTGTTAATCATTTTTAATTGATTATTAAGGATTAAGTTGTAAACTGAAAAATAG:1 - chr3L 3482639 3' + X-element 4679 1 58.90 CTCAAAGTAGTGAATCATGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTTCTTATAAAGCATTCACCCTAATCACATGTCATTGTCTCAATCATTTAAACATATCTAACCCTCGGTGGCCTAAAATATTTGAGGATACATTAAAATAGT:1 + chr2L 8707606 3' - frogger 99 2 63.70 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAG:1 + chr3L 13597825 3' + blood 297 2 75.17 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTG:1 - chr3R 25822980 3' + roo 334 2 70.55 AGGCCAAGTTAGGCAGATTATCGCTGAACTACAGACGGCCGAGGGCGGCCTTAATTCTGAGGGGGGACTAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGATCATACTTAGCCACAGGATGCAGCTTATGC:1 - chr2R 17976024 3' + gypsy6 7353 1 79.45 GTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGATTCTCAGTTGTTTTTATTTCAG:1 - chr3R 2995053 3' + P-element 265 1 17.81 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAA:1 - chr3L 21097109 3' - mdg3 5307 2 53.42 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTCAGTAGCCAAAGAGGTTCTTGCGTCGCGTC:1 + chr3R 16194263 3' - mdg1 7058 2 72.60 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAAC:1 + chr3L 16887423 3' + roo 9025 2 53.42 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAGAGTAGCCAAAGACCTCGTCATCAATTTAGTGACGCGTATGATATTGTCCCTATCATATAATTAATATATAAAGAATTTAA:1 - chr3R 10406598 3' + blood 7349 2 52.05 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGGGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACA:1 - chr2R 6984395 3' - Doc 25 1 64.84 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTACTCAAGCGATCTCTCTTTCTCGGACATCACGGAAATTGGTTTGGAGCTAAGACAGGATCCG:1 - chr2L 20638330 3' - Doc 21 1 61.16 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATA:1 - chrX 16244904 3' - jockey 4836 1 68.49 GTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCATCATGTAAACAAAACTTGGCTGGCCC:1 - chr2R 21884882 3' + P-element 2768 1 18.49 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGT:1 - chr2L 8103477 3' + pogo 2070 1 57.53 TAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAA:1 + chr2R 9033896 3' - F-element 4549 1 80.95 ACAGGATGGGTTACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCATTAATCGAGGTGGTACCATTATACTGGTGAGATAGGCTCATTTTGGATTGGCACCTTCTCGAACATTT:1 - chr3R 31687120 3' - Ivk 5215 1 52.05 GTTAGATAGAACGTTATTTCGCCATACTTCCGTTCTATCCACGGCTTGAGATTGGGGATCAGCTTGTCTAGCTTAGGGTAGTTAATCTTAAATACAATTCAGCTTGAATCTACAGAATCTACAGCCTCCTCTTGCTAACGTTAAAA:1 - chr3R 30923263 3' - Rt1c 4979 1 54.79 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTATTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTT:1 + chr2L 2519880 3' + roo 323 2 76.03 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTG:1 + chr3L 8253747 3' - jockey 4674 1 53.96 CCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCA:2 - chrX 18193715 3' + hopper 1348 1 65.07 GACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGAAAAAACCTTGCCGACCGCTAGGGGCCACACAAAGGCTGGCTGGAGAAGAAAAAAGGGG:1 + chrX 10728952 3' - springer 7163 2 67.59 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGAGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCAT:1 - chr3L 5263321 3' - pogo 16 1 67.88 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATG:1 - chr3L 9430600 3' + P-element 2792 1 23.29 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGTGCCTGGC:1 + chr3R 10140232 3' - P-element 104 1 13.01 CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAAT:2 - chr2L 7459562 3' - BS 5067 1 65.07 GAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGC:2 - chr3R 13358612 3' + mdg3 162 2 73.29 GATAGCGACTCGGATTCGGATCACGATGTTCCATTTTCTATGCATTTCGACGTAGAAAATTTTGATTAATATAATAGTATATCTACGTCATCCATAGGGAAGACGTCAAGGCCAAGGGCGGGTTAAGTATAGCTTCAGAGCG:1 + chr4 904986 3' + transib3 2545 1 57.75 AAATGCTTGGTCAGCAATTTCACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTATTCCCTCCTCAAGATTAAGGCCGCCCTCGGCTGACCCTATTTGGGCGAGTACATTTCAAGTTAAAATTAATTGTGTAA:1 - chr3R 21631761 3' - springer 46 2 78.77 TAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTGCCCATGCCACACACTTTCCCCACCCCCCATCCCCGGCGCTTTTCCCTCCCTTTTCCTCACGACACTCCGGCCACAGAAACTTT:1 + chr3R 17316164 3' + 3S18 329 2 70.59 AAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAAT:1 + chr2R 10367583 3' + 412 7495 2 50.00 GGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTAACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCATGAACTGTGTTCGAGTGATTAATTCATATATTTCATGTGTGAATAAATATCTTTAGCC:1 - chr3R 29578432 3' - opus 7473 2 55.22 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTT:1 - chr3L 16157194 3' - Juan 61 1 60.96 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAA:1 - chr3R 15465461 3' - mdg3 45 2 54.11 GTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTATATACACATATATGGGTGCCATTGCACAAGCCAAAGAATTC:1 + chrX 12893426 3' - Bari1 79 1 77.40 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCGATTTGAATTTTAATGAAGTCCATTTATTTTTGCAATAATCGCAAACA:1 + chr3L 4467883 3' + pogo 2031 1 67.81 GTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAG:1 - chr2L 18370322 3' - Doc 54 1 52.05 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCA:2 + chr3R 7424633 3' - 412 7118 2 62.33 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGTCATGGGTTTGTATCAACACTACATTTACATAATAATGTTTACCTATTTTATCC:1 - chr2L 18581227 3' - roo 8682 2 71.92 GTCTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAATCCTTGTTGACTTTTATCCTTTTTGGAATGTG:1 - chr2R 9326933 3' - mdg3 22 2 67.91 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAGTGATACATAATTTATGGTAAATAAATCAGG:1 - chr2L 3006047 3' + pogo 2077 1 65.75 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTGCATAAATAACTTCAAGCA:1 - chr3R 12795028 3' + mdg1 353 2 62.33 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTT:1 + chrX 21639696 3' - Tirant 35 2 66.32 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTTATGATTGA:1 - chr2L 19878146 3' + mdg3 5449 2 51.37 CGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATTTGAAAACATCGAAAAATTTATCAAAAGTGTGGGAATGGCAGTTTTGTGCGGTTTTTTGGCGTTAGAGTGGACGTGGCCAAGACAACAGGCAATAGATTGTGTGTTTGTTGTGGGGT:1 - chr3L 18084654 3' - INE-1 298 1 73.29 ATACCCGTTACTCAGCTAGTGCGAGCGAGATGGCGATGTGCACACATATATTCTAGTTAAAATTTGTGGGCAATGGAAGGGGTTAGGGTTAATATACCCATTCAAACGCTAAACAATCAATGTTAATCATCCGTTTTTAGTTGACA:1 - chrX 12601011 3' - INE-1 540 1 54.11 AAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAA:1 + chr2L 11867351 3' + BS 4946 1 73.29 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAAAGAAACTTTC:1 + chrX 16853444 3' + roo 9029 1 56.85 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGG:1 + chr2L 13884676 3' + pogo 2035 1 62.33 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATTCATCTAAAGTCATGGGTAGACATAAAAAAAAAAGAAAATAAATATGCTT:1 - chrX 12843544 3' - roo 8684 2 69.18 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGC:1 - chrX 14962216 3' - jockey 85 1 68.49 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCAGCTGACCAAACATCCCATCC:1 + chr3L 22221267 3' - 412 7083 2 65.07 ACTGAGCTATTAGTTATTACTTATTACAATTGGGTTACACTGGGCCATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGTATCCGTATTTTAACCTCATTTGACTTCGACAGCCAAACAAATTTTACGGAACCAGCAAAA:2 - chr3R 16535228 3' + Stalker2 397 2 75.34 CGCGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 24 2 26.71 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAATCAGCAGAAGACTGAAGAAA:1 + chrX 14692967 3' + Transpac 296 2 71.54 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGCTTCGTGCGGACA:1 - chr3R 5087037 3' - P-element 89 1 23.97 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAAC:1 + chr3R 13358694 3' - mdg3 5261 1 70.10 AGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGAAAAAACCTTGCCGACCGCTAGGTGCCACACAAAGGCTGGCTGGAGAA:1 + chrX 10728941 3' - springer 7171 2 59.86 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAAC:1 + chrX 3506177 3' - Tirant 42 2 54.11 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCTTGCGAATGGATAGGGCCCAAATTAAACGGCTCATGACTTTAATGTATACGATTGTAAAATATATGCATACGAATATTATAAAATGTGTTTAATTTTTTTGTTATCTATATGAA:1 - chr3L 11610542 3' + copia 249 1 76.71 GAACAAGAAAAACAAAAAAAAAAATGCAGGAACCCAACCGTGGAGTTCCCCCTGAAAGCGAGAGCATTT:1 + chr3L 12352105 3' + Porto1 156 1 85.51 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGG:1 + chr3L 17447573 3' - Tirant 8117 2 75.00 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGG:1 - chr3L 18296894 3' + Juan 4169 1 51.37 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAA:1 + chr3L 22221222 3' - 412 75 2 68.49 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGTTAACCCTGTCGAACCGATTAAGATCTCGGGCGCAACATAGTG:1 - chr3R 19700820 3' + roo 399 1 77.40 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGA:1 - chr3L 13722011 3' + blood 7341 2 58.57 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAAC:1 - chr2R 6984408 3' - Doc 56 1 50.68 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCA:1 + chr3L 9426748 3' - P-element 83 1 29.45 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATATTCGCGGTCCATTACCATA:1 + chr3R 24175818 3' - Burdock 6156 2 71.92 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACA:1 - chr2R 8793883 3' - Transpac 61 2 60.27 AGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCG:1 + chrX 17258310 3' - 297 6593 2 66.67 ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTAGTATACCCTCTTCCTCTAGGAGTAACGGGAATAATCAACTGCAATCTTTAAAGATGCCCATGTCGTCGAATTCTATGTGGGGCTCGCTAGGTCCTT:1 + chr2R 25107355 3' - INE-1 83 1 68.75 GCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGGTTATGTATGTGTTGAGTCGGTGCAGTCACGTTTG:1 + chr2R 6984410 3' + HMS-Beagle2 251 2 61.64 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATAC:1 - chr3R 11526759 3' + pogo 2047 1 54.79 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATAC:1 + chr3R 9938709 3' + roo 9026 1 54.79 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTAT:1 - chr2R 18048812 3' + opus 428 2 67.81 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGG:1 - chrX 18149818 3' + hobo 2880 1 68.33 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCATC:1 - chr2R 17986242 3' - 297 49 2 54.11 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTGTATAACTGTGTAGAACTA:1 - chr2R 8862022 3' - pogo 47 1 52.74 TAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAACACTCTCAATTGACTGTGAACCGATTGAAATCTCTTTA:1 - chr2L 11158653 3' + Rt1b 5054 1 73.97 CTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAATTCGTGTT:1 - chr2R 2949012 3' + 17.6 7370 2 52.74 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATAT:1 + chr2L 12481531 3' + pogo 2042 1 60.27 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTTCC:1 + chr3L 20977453 3' - I-element 59 1 54.11 CGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGGAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAGGAACGGCGTCATATTAGACCCAAGATCACCAAGCAGAGACT:1 + chr4 692519 3' - HMS-Beagle2 7064 2 69.86 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTAACCAGCTTTGGCCAAATGGTATCAAAGAGA:1 - chr2L 2357248 3' + P-element 2857 1 65.07 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCT:1 - chrX 11228554 3' + roo 346 2 58.90 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTATCCCCCGAAAACGTTGCC:1 + chr3R 5940505 3' - hobo 75 1 75.38 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTTCCGCCAAGTCGCCTTCCGTCATATCCCATTTAAGATGCCCGATACACGGAAAAAAACTAATGAACGCTT:1 + chr2L 19930187 3' - jockey 56 1 52.05 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGACATATATATAAATTCGATAGTTATGGATGTGTGTGGGAAATGTTCGGGTTGTCGGTGGC:1 - chr3R 28724930 3' + pogo 2042 1 63.70 GGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCT:1 - chr2R 19168087 3' - opus 7186 4 72.60 ACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCC:1 - chr2R 20382478 3' + Bari1 1652 1 55.48 TTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCACTCAGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGTTCATACCAGACTGTTAATAAGCAAACAGTCCAGGATTCTGGATTCAGTTCAAAAACAACATACGCCTTGGATATGGAACCTGC:1 - chr2L 22643330 3' - invader4 2769 2 51.37 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAA:1 + chr2L 535484 3' - roo 86 2 78.77 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTATGCAGCACCACTTTCAGTCAAGGATAACTGTTGCCAA:1 - chr3R 17315986 3' - 3S18 6 2 78.77 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAACATACGAAATAAAGATG:1 - chr3R 31907284 3' - Tirant 11 2 79.45 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAAGCAAA:1 - chrX 10101336 3' - mdg3 79 2 68.49 TAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATTTATTTATTTATTTATCTTGCAATTATCCCACTATCAAAG:1 - chr3L 14461767 3' + mdg1 117 2 72.60 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGTTTTCGAGACCCTGGGA:1 + chr2R 21380751 3' + roo 394 1 74.66 AGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 185 2 67.50 AGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATATTGACTACGGCGAGGACGAGCGGAGGAATGCGAAT:1 + chr2L 18163842 3' - HMS-Beagle 6872 2 71.23 ACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCATATTTTGGAATTTTTCGAGATATTTCACGATTTTTTGAATTACTTTCTGCATATTTGG:1 + chr3L 972452 3' + Doc 447 1 60.27 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCGCTTT:1 - chrX 14962192 3' - jockey 61 1 52.05 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATACTATACAGGCAGCGCCATCGTCTTGTTGTTTCGCAAATATTTGCCTTTT:1 - chr3R 24455356 3' - 297 39 2 60.00 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGG:1 - chr3R 21421049 3' + roo 8995 2 72.41 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTT:1 - chr3L 21097121 3' - mdg3 67 2 61.64 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAATTGGAAAAATGCTGAAATTTGCT:1 + chrX 3452567 3' - Tirant 17 2 75.34 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCAAACAATTCGGTTCTCT:1 + chr3R 31956541 3' - pogo 19 1 71.72 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGAGGGCCAAAAAAAAAAAGGCGGCATGCAGGAGTGTTGGAAAATCGGAAAATTGGAAAATG:1 + chr3L 16535262 3' - copia 61 2 60.96 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTAATCATACACATATACCGTCGGAAAAAACAAACTAAAATTGCAATTGTCTGTAATGGAGTTTAATGCAAGC:2 - chr3R 18665203 3' - 1360 14 1 75.34 ATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCCGCTAGTGTGAATTCGAAGTCGAAATTTCATCATTCTTCTTCTGGGATATCGATTAAGTGAGCAACAAATAAAGAACAAAATGTGTATTAAAACTGCAGCTTTTGTGCTTA:1 - chr2R 23162990 3' - INE-1 562 1 60.96 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACAT:1 + chr3L 20076842 3' + roo 8990 2 76.71 TCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGC:1 + chr3R 5087078 3' + P-element 2797 1 23.97 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAA:1 + chr3L 17667610 3' - F-element 90 1 71.92 ATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTTTATTACGAGC:1 + chr3R 27845572 3' + Stalker4 7308 4 54.11 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAAC:1 + chr3L 21093270 3' - Ivk 24 1 68.97 GTTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGAAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGAACA:1 - chr3R 26765107 3' - mdg3 5334 2 70.55 ATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAG:1 + chrX 8200282 3' - flea 4829 1 70.55 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTG:1 + chr3R 15514590 3' - 412 88 2 76.71 GAAGTCACTGGAGGGGGAGTAGATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAACTTGAGCGCACGGAGCAGCAGCAGCAGGAGCCGACGGAGCCGTCCAATGGCAATCTGGAGGAGCAAGTCCGCAAGCTCAGGG:1 + chr2L 16291423 3' + Chimpo 4244 1 58.22 AATGCACTGTATAAATGTCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACGTGCCCAGGATTCAGATTTTCAGGTAATACTTTTCCCCGAAAAGGCGAGGCGTTGGTTTATGTTTTTTTACCGTTT:1 + chr3R 23818895 3' - baggins 5343 1 54.79 CTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTG:1 - chr2R 19633208 3' - jockey 4641 1 60.96 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCCCATGCTGTTCGACACTTGATTAAAGCCTGT:1 + chr3R 22846854 3' + 412 482 2 77.40 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAAGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACGCGCCATTTTCATTGCTGGCTTACGCCGTTGAGATGTTATTTTGCCCGGCGGCATATTA:1 + chr3R 11121799 3' + copia 5065 2 57.93 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTT:1 - chr3L 5183677 3' - copia 42 2 56.85 GGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACGTAGGCCTCTGCGTAGTCACGGATGAGTCTGCTCCCCCACAACTGACCATTAGCTATGCCTGCAAGTTCTGTCTGCGCCCGCAGGAGAGCTACCAGCTG:1 + chr3R 9583882 3' + roo 8931 2 63.28 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCTGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCAC:1 + chr3R 4659613 3' + P-element 2821 1 39.31 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTGGAAGCCTGTGCCGGGGGGTAG:1 + chr3R 31907449 3' + Tirant 8457 2 51.72 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGATATCCAAGCTATGGGTATGGATTCCGCAAAGGAATCTCGAACGACAACGACCAACACGAAAGAAAAGGCTTTTCGTTTGCTT:1 + chr3R 16771457 3' - roo 14 2 73.77 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAAAGCACAAGGCGTAAATCACGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATCTGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATAG:1 - chr2L 13877646 3' + Transpac 274 2 52.74 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAGACGACTTAGAAA:1 + chr3L 15261375 3' + pogo 2053 1 52.74 GACACGCCCGTGAAGTATGCATTGTTCCGCTGCAAAGAGAGTTGGCGCTCGTTGTCTATTTGTTTTTTAGTTTTACTTTATTGTTCCACACACAACAAATTTCTTGTATTGCGACAACCCTCTTGCCATTTTTTGGTACATTTGCT:1 + chr3L 23937211 3' - Doc3-element 294 1 69.86 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTAT:1 - chr2L 6406487 3' - transib2 77 1 67.81 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGA:1 - chr2L 16685311 3' - P-element 48 1 45.60 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTATAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCAATTTCTTTCGTTTTGGCTAAATCAGG:1 + chrX 9710101 3' - pogo 31 1 62.76 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCG:1 - chr3L 22221146 3' + 412 410 2 67.81 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGT:1 - chrX 8082391 3' - roo 8747 2 75.34 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTTTCCCTCTCGCTCTGGCAACAGGTAACACTGCCTAG:1 - chr3R 26315845 3' + roo 394 1 75.34 GAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGTAAACGGATTTCAGGGGGGTACTGCAGTCGACGAGGGTGTGGAAAAGTCAGAAGGACTTTCCG:1 + chr3R 11499173 3' + P-element 229 1 42.07 GCTTTCGCAGTCGACGAGTTGGAGCTGCGCAAGAACCACCAAGAGCTGCGCTTGCTGCGGCGGTATATCTTGATGCGTTTCACATTGCTTGTGGATGAGCTGG:1 - chrX 1684299 3' + Rt1a 226 1 60.19 GCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGAACGCAAGGCAGGAGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAATACGAAGTGTTAATGCTCTCTAAAACAACGTGTAAAAATTCATTTACAATG:1 - chr3R 6828944 3' + flea 4815 1 63.01 AACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCGGCTAAAAGTAA:1 - chr3L 22980573 3' + INE-1 575 1 61.64 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCAATTCTAATTTCTAAGCTGCTGGATCTAAGCGTAATG:1 + chr2L 9287146 3' + jockey 4980 1 62.33 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGA:1 - chr3R 29708944 3' - blood 7052 2 51.37 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAAGACAAGTAAGAGAAATCTTT:2 + chr2L 1229713 3' - opus 155 4 56.85 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACT:1 - chr2R 7404662 3' - blood 7060 2 48.97 GATCGCCCACCAAGAAGGCTCCACAGGAGACAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTTCCCCTTGACGAGAGCCAGGACATGATGATGATCTCGAATTGATATACTCGAAATCAAAATTCTTTTGAGAACTATTCGATGTTTGGGGCG:1 - chr3L 18994387 3' + BS3 1541 1 68.49 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTA:1 - chr3R 9616585 3' - roo 76 2 73.97 AACACATCAGGTTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATGGTTATAGCTAAGACCTATTGGCCGCCTAGAAGAGCGTCTGCACCACGAGGCGGATACGTATTATG:1 + chr3L 13420349 3' - transib3 441 1 67.12 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGA:1 + chr2R 16891862 3' - jockey 66 1 55.48 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGTCATAACTCATGCG:1 - chr3L 16180854 3' + Transpac 5190 2 58.62 TGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAATT:1 - chrX 18239379 3' - jockey 4586 1 73.29 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGGGAAAATCAAGTAACC:1 + chrX 19231880 3' - mdg3 5273 2 71.23 CAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATTTGTCTGCAAGCGGCGTGAATATACAAGCGGTATTTCATACAAACA:1 - chr3R 3257466 3' - Burdock 6205 2 67.59 GCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGGGGTGGGGGAAAAAAACCCAGAAATGGAGAGCCGGGAAAA:1 + chr3R 11463477 3' - 17.6 7137 2 72.22 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTC:1 + chr2R 18882709 3' + roo 389 2 71.23 TAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAATCCTCAGTGTACCAGACTAAAGTAAAGTAAAGGCAACCAAAGTTTCAGGCTGCAACTTGTCAAA:1 - chr3L 2162070 3' - invader4 2638 1 56.16 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCA:1 - chr2R 22255319 3' + roo 9014 2 56.85 AAACGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCCTTATACGTACATTGTATAGAATAATCAATTTACCTTATAAGAGTTCCTTAAGAGTTAACTTAAAATGAAA:1 - chr2R 5780103 3' - INE-1 33 1 67.12 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATCTTATTAATGCAGCTATTCAATTTACAATTTACCTTTTCGCCTCTGTTCTACTTGCCGTCTCTACAAATAGATAACAA:1 - chr3R 18849723 3' - roo 39 2 56.16 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCA:2 + chr3R 23507697 3' - 412 7093 2 55.48 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGAGCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTCACAGACAC:1 - chr3R 20137230 3' - Burdock 42 2 50.00 CACTAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGGAGCTCGACTATTGCATTCTCTCTTGTTTGTATTGTAGTTGCCATTGCTTGTGTATAATCTAATGAATTATTTTTGTTGATTTGTGACCTTGCGGCGATACCAATATTTCCAT:1 - chr3L 25007896 3' + INE-1 541 1 76.71 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACCAACTC:1 - chr2R 8793868 3' - Transpac 4965 2 54.79 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCGTTCCGTTTCTGTTACTGCTATTTCTACTAATGTTTTTGTCCTTGCATCTAGTTTT:1 - chr2R 3009428 3' - pogo 61 1 64.38 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACAATACCCAAAAATTTTGAATAAACGTGGGCGGGAAAGAGCGCGTGCTCCATATGG:1 - chr2L 3006201 3' + pogo 2059 1 58.73 CGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTTTTCTCGAAGGATCCAGGGACATGCAAAAATGCATTAGCATCGATTTATGGCA:1 - chr3R 22894873 3' - Doc 297 1 64.38 GGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTG:1 - chr2L 16371597 3' - jockey 4855 1 72.14 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGAC:1 + chr2L 1449677 3' + opus 428 2 67.81 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATTGCGCATACGCGCCATCTAGCGGCGGGCACATTAATAGTTTATAAATCTT:1 + chrX 21605806 3' + P-element 2877 2 71.31 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAACGTGTGAGCAACTCAAAGAGATTTC:1 - chr2L 7667375 3' + copia 255 1 60.27 TCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGAGATTAAATTTTCAAAACACAAACGAGCACA:2 - chr3L 10856748 3' + P-element 2797 1 23.97 AGCTGAGTAACGCTTATCTGATAATCTCTCTCGTTTTTATTCTTAAATAATCATATATTATAAACTGTCAATCTTTACTTTATAATTACTTAATAATATCTGGTGATATTTTAAAAGTTTTAATAATGCGCTCGCTTGAAAAATTC:1 + chrX 21130788 3' + INE-1 545 1 72.60 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTG:1 + chr2R 9164914 3' - 412 84 2 73.29 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTTA:1 - chr3R 12608042 3' + roo 9017 2 55.48 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTTCCTGTTTCAGTTAAGGACTGGATAATGATACGATATCATATAGCTACCATGTGAATAAACTT:1 + chrX 22859001 3' + mdg3 5487 2 73.29 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTA:1 + chr3L 20076880 3' + roo 9028 1 56.85 TCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAACTTCATAATGTAATCCTTATCATACCCTTAGGCTCCCGTTCA:1 + chr3L 9090457 3' + Tirant 376 2 71.23 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAGCCGCCAGC:1 - chr3R 3527059 3' - Tabor 6880 2 57.25 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGACATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCACTTGGG:1 - chrX 8502157 3' + pogo 2049 1 54.79 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCCTTGTCCGTATTTTGCTCTTCTGTAGATCATCGCCACAATACGACATCAATGGAAGCCAAATACATCAAGTTATTTCATTTGGCCCATAACTCGATTCTG:1 - chrX 11534394 3' + roo 389 2 70.55 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCG:1 + chr3L 16180961 3' - Transpac 4985 2 68.15 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGAACAAAAGGAATTCCCAAGCAAAATATATTGTCAAACAATTTCAGAGAACTTTTTAATCTTTGGTCCAGCAAAAGGTTGCCTGCC:1 - chr3R 22289347 3' + 412 458 2 60.96 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAA:1 - chr3R 16194105 3' + mdg1 7414 2 54.11 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGATCTGTCGAGATCGGTTAGGTCTGTCTGG:1 - chr2L 19424605 3' - Tirant 8123 2 76.03 CTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGTCCTGGAAATCTGGGTGTGGCTCTTTACAAGAAGAAAGGAGTAA:1 - chr2R 10074792 3' - transib2 436 1 69.86 AATTTAGGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATGCTTGGCAATTAAAATACTGTT:1 + chr3L 18468442 3' + jockey 4940 1 59.59 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAAAGGTGTGTGGGAGGTTGTTTGT:1 + chr2L 17069689 3' + 412 480 2 74.65 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAA:1 + chr3R 21570561 3' + mdg3 175 2 63.70 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGAAAAGCTTAATGGCTAATTGAGCTGCCAAGG:1 - chr2L 14969869 3' + Tirant 345 2 54.11 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACTCGAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGC:1 + chr2R 1277173 3' - Tirant 42 2 55.48 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTGTACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCATTTACAGAACAAATAATTACACAGCCAAAGTATAAATCATAAAC:1 + chr2R 3009563 3' + pogo 2069 1 63.70 GCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAAA:1 + chr3R 28033697 3' - diver 53 2 52.05 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGTGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGTGTAAGTGCCCAGTA:1 - chr3L 14863813 3' - Transpac 39 2 59.59 GGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCATTTTATTATGCCTATTTTTT:1 + chr3R 6103686 3' - Tirant 8107 1 77.17 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAAT:1 - chr2R 22671351 3' - jockey 4719 1 52.41 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGATACTCATTTTCGGAACGCCTCGCTCTCTCCGCTCATTCC:1 + chrX 13762629 3' - P-element 62 1 33.07 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTT:1 - chr2R 18123383 3' - 412 24 2 63.70 ACTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAGGAAACTATTACGTTTAAA:1 - chrY 312135 3' - Tc1-2 46 1 47.26 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATATCAGTATCA:1 - chr3R 24809884 3' - 1360 55 1 58.22 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATATCGGAATTTTAAAATAAAATTTGCTCTTTACA:2 + chr3R 8022232 3' + roo 9015 2 56.85 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAAT:1 - chrX 14962206 3' - jockey 75 1 61.64 ATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAAAATGGTTGAAGATGACCGACTTGCTGGCACCCATCGCCAGGACGCA:1 - chrX 19723703 3' + 297 305 2 68.49 ACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATCTACCTATATATATTACCTTATGTATCAATTCGGCGGAGCAAAGACGGGCCAATGGACGCAACTTTAACTTGTGGCAACGGCGAAGTAG:1 - chrX 7329166 3' - Bari1 28 1 67.12 ATAAGAAGAAATAAAAAGGGGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCTATTGGTGTCAGGTATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGAGGTTTTTCATTTCGCAGGCGAT:1 + chr3R 29709046 3' + blood 7320 1 63.43 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGG:1 - chr3L 18708573 3' - F-element 46 1 61.64 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGAATTCAAATTCG:1 - chr3R 9563598 3' - P-element 64 1 39.04 TATTTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGTATTACATCAGTGTAATGTTGTTATTGTATTAGAAAAGATTATTATATCATCCATATGTATAGGGCCGCGTCTTTCTCTATGAAAACCTTCTCTTGGGACCGCCACGTCTCCGG:1 + chr2L 12399815 3' - TLD2_LTR 114 1 60.69 CAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTTCACTTATATGCGCCTGGGTCATCAAGCTGTTTTTTTCTTTTAGCGATTTTCCGAGGAAAAGTGTCAAGTCAACAG:1 - chrX 9709605 3' + Tirant 8408 2 52.05 ACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATGCTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCG:1 - chr3R 7739680 3' - blood 7076 2 58.22 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAATCGTCAAAAACATTGCCAGAGTGATTTGAACTTTTGTTTGCGGACATTTCAATTTTTCAATTTCCGGTATGTATGCT:1 + chr3R 24810008 3' + 1360 3347 1 57.53 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCTTACTACCAGAGCTCCATAAAAAGTCTAAAATATGCTCGACAAACGCA:1 - chr3L 22481185 3' + roo 391 2 74.66 GCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCATTTAATGGCCAAT:1 + chrX 8200347 3' - flea 4764 1 80.82 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATCACCGCAAAATCGCCAGACTCATAAAAAGTATACTAGTATATACATAAATACATATGTATGTATGTACATATTTGCAATCTGGATAATTTTTGCTTAGATATTAAAAAACT:1 - chrX 13762500 3' + P-element 2877 2 78.77 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTT:1 + chr3R 26399846 3' - roo 48 2 85.56 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCC:1 + chr3L 4023724 3' + pogo 2042 1 59.59 TTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCTAATGCTGTCGAAGATGCGATCTTTGGTTCGGACCACGCCCTCGGGATCGATGAGAAGCAGATGCTTGGGCGTCT:1 - chr3L 9428226 3' - P-element 12 1 56.55 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTA:1 + chrX 17469235 3' - blood 53 2 78.57 CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCTGTCGCCGCCAGGCAGCATTCGAATGGAACCCACGTCATGTTGTTGC:1 + chr2L 14139711 3' + Tirant 8434 2 67.81 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATCCATCAGCAACCCA:1 - chr2L 12283908 3' - Quasimodo 42 2 60.27 TGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAA:1 - chr3L 1387159 3' - mdg3 5346 2 78.77 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATAAACGATTTTTCACTTTGTGCTTGTGTGTTTAATGACGGAAAATTGCAAATAGATCGCTGAATATGGCCAAGAA:1 + chr2R 17536454 3' - roo 46 2 50.68 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCGTTCTTTATAAGAATGTAAAACATTGGGTGCCTATTTGCAATATCTGTTTAATATAGAGATTGGAATGCTTTCGGGGAACTT:1 + chr3L 11953881 3' - jockey 4710 1 56.85 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTT:1 - chr3R 10079284 3' - P-element 52 1 50.00 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTGCAGTGGAGTTC:1 + chr2R 544906 3' + HMS-Beagle 206 2 58.22 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCC:1 + chr3R 22429214 3' - roo 8746 2 73.29 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATGCTTGGCAATTAAAA:1 + chr3L 18468435 3' + jockey 4933 1 65.75 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATGTCTAAAGTTGTATTCT:1 - chr2R 19353950 3' + 297 6941 2 63.01 AGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGT:1 - chr3L 25232697 3' + accord2 199 1 77.24 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGTAACTTCACGCCAGCCCCAAACCAAGTGGCAAATATAAAATTTCGCTGCATAAAAACGCGTGGAGCATCTCGT:1 + chrX 12558391 3' + Transpac 5221 2 80.14 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGGAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGGCTTTCTTGCCCGCAA:1 + chrX 21213426 3' - Doc 27 1 61.11 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAAAAAAATTAAAATTCCAC:1 + chr3R 15030769 3' - jockey 68 1 57.53 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTA:1 - chr3R 21924276 3' - roo 84 2 77.40 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTA:2 + chr2L 19878245 3' - mdg3 75 2 65.75 AAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAAATATTCCGCTCTTTTAAGCCAGCTTAGAGTATA:1 + chr2R 10163671 3' - Juan 4106 1 65.07 AGAGCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAGGTGTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTTTAAAAAGTCATGTAAACCAGGTCATTAAAATAACTAAAATGAAGAAAAAGGC:1 - chr3R 21503769 3' + R1A1-element 389 1 63.70 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCA:1 + chr3L 22221247 3' - 412 7096 2 53.96 TTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTAAATCAGCAAAACCGCAAACGCGCAAGCAAACACAAACACGGGCGCAAACAAGTGCACAGGAAATAACAATTAAAATAATTATATTTGCATTAGCTTACATT:1 - chr3L 6635445 3' + jockey 4902 1 74.31 GTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTGGTCGTTAAACTAACTATTAACTATTAACTATAACTATTAACTATACGGAAAAACTGATTCATTTAG:1 + chr3L 3482747 3' - X-element 67 1 63.45 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAAGAGAGCCAGATAACGCGTGTGGTTTTCCGAGAGAGAAAATTGGTG:1 + chr3L 13227746 3' - hobo 23 1 69.86 CTGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACA:1 - chr2R 6984332 3' - HMS-Beagle2 6968 2 74.66 AGTCCAATGCTTTGTATAAATGTCAGAATTTTATTTTGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAATCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCATCCAGAGGTTAAAAACGGTTACGTGTTCAGGCCG:1 + chr2R 5217073 3' - baggins 5348 1 77.40 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAAC:1 + chr3R 22429258 3' - roo 8702 2 59.59 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACA:1 + chr2R 8686629 3' - hobo 85 1 81.51 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAAATAACCAGCAAAGCTGTTATGAAAGCAAAAA:2 + chr2L 19878284 3' - mdg3 36 2 61.64 ACTAATACAATTACTTCATATTGTAATTAATAAAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTGATAATGTAATTTATTGATGTACTGTAAAAGTTAAG:1 - chr2L 14861618 3' + Doc2-element 4670 1 76.71 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTA:1 - chrX 8272413 3' + roo 353 2 55.48 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAACCACAGAGCACAGCCCACATGGACTGACCTATCTGTGAACTTTGCTGGCAAAGTCAGCGTG:1 - chr3L 12030356 3' - roo 8749 2 57.53 ATTATAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAAATATTTTTATTAATCAACGGGGGCAGTGTCCCAGTATCGGATCGCAAACTATCCCACTACCCAAAACTCATCTCGGACATTGTGCGCTAATTGATTTT:1 + chrX 17542540 3' - Quasimodo 7365 2 58.09 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATC:1 + chr2L 17730527 3' - pogo 61 1 61.64 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTACGTTGCTCACATTTTATAAAGTACTGCATACTTTCTTGGGAAAATGTTACGTCTGCGCAGCCTGTTTTG:1 + chrX 7293323 3' - 1360 50 1 53.42 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCAGCCATATACTGATCAGAGCTGGGCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCAATAGGAAAGTCTTATCTATTTTGTTTATTAACTTTGTAATTTTGGTGC:1 - chr2L 20252564 3' + copia 243 1 78.77 CATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAATCTTACATACCAAATTTTCACCAAAATTGTCGCAAGTAG:1 - chrX 21442566 3' - Cr1a 4151 1 77.14 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATGTCTTATTACTAATTCTGATAATAATAAAAAATACAAAAACTATTAAATAAAATGGGATTTGCCTAGACAATGC:1 + chr2R 20015182 3' - X-element 52 1 44.52 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGG:2 + chr2L 15965297 3' - blood 72 2 65.07 CGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATAC:1 - chr2R 19076519 3' - F-element 216 1 51.39 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGC:1 - chr3R 19700890 3' + roo 328 2 73.97 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTA:1 + chr3R 15030746 3' - jockey 91 1 73.29 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCATTCGGTGTTTTGGACTCGGCGAGACTGGAAGTTGATGCTGCCGCGTGAA:1 - chr2L 10474298 3' - P-element 50 1 51.03 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACAC:1 - chr2R 6984394 3' - Doc 42 1 57.53 GTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATC:1 - chr3R 15465509 3' - mdg3 5344 2 79.31 TAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTAGATATGTCTAGATAAATGCATGGGAAAGAGCCTCATCCGTAAAAGTAAGCGTTTTCGAGTAATAGGCTCTCTAGTG:1 - chrX 15088243 3' - P-element 204 1 60.27 GAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAAT:1 + chr2L 17162844 3' + blood 7324 1 68.46 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGTAGCTGACTGTCACTTCAACTCCG:1 + chr2R 18882716 3' + roo 396 1 74.66 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCGAAGAGCTTAACTTTCACCCCAAAGACGCAAAACACACACGATGTTGCCTCGGGGGCACTTTAATTAAATAATT:1 + chr3R 9616687 3' + roo 9027 1 54.79 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCGTTTGCTTTGGGCGGCTGTTGGT:1 + chr2L 2357374 3' - P-element 64 1 42.47 GGTCATGAGGGTGGCGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCGAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCA:1 - chr3R 6782724 3' - jockey 4754 1 67.12 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTTTCCGTA:1 - chr2R 18123377 3' - 412 7071 2 67.81 GGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTCAAGAATGGCGGAACCTGCTTCAACACCGGCGAGGGATTGTACACATGCAA:1 - chr3R 19306377 3' - F-element 4518 1 63.70 TATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGAGAAGTGTTCGGCTTCTTCTAGTGTTATTTTCATGTGCAGTCTGCGTGCCAGATTTTGGA:1 + chr2R 14880620 3' + blood 7047 2 58.90 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAA:1 + chr2L 7215638 3' - 297 6626 2 52.74 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCACCCAGACCAATCCAAGCGAACCGAACCCCTGGCACCA:1 + chr3L 3137849 3' - FB 82 1 72.60 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGC:1 - chr3R 7424543 3' + 412 7478 2 63.70 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTTAGATCTCTTGA:1 - chrX 5222822 3' + 412 467 2 67.12 CGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7214 2 72.73 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTC:1 + chr2L 16685357 3' + P-element 2819 1 18.35 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACAATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCACAATTTCAAAGTATAATTTTCGGCCAGACATTTGAAAACAAATCAGCTATTGCATTCTCGTT:1 - chr2R 17144084 3' - pogo 46 1 55.22 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGATTGTTATACTTGTAAAAGTATAACCTTTTGTTCTTCTTGA:1 + chr2R 6945766 3' - pogo 19 1 72.60 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCC:1 + chr3L 22221214 3' - 412 83 2 73.97 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCAGA:1 - chr2L 13546949 3' + P-element 2843 1 57.24 GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACCAGAGTAAATTTACAACGAAAAGTATCAGCCCGATCATTTAGAACGAGCTTGAACATGT:1 - chr2L 13244796 3' + hobo 2876 1 61.64 TCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAGCTTTATTCGACTTTGGAAATCCTTGGAGTTGAACAGAGGGAACAGGATTGATAGTGTAAGCCTCATACCCGGCAATAGCTATTTCAAAATTAACTAACCATGGAGTTTTCCTCGACT:1 + chr2L 3872135 3' - Ivk 4923 1 65.07 TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCACTATATAAGTTAACCCTAATAACCCTAATAAGTTGACCCAAAAAATTTTCACTGATTATTTGGCCGCCAAGAGGAAAAAAATGATAGCTATTTAAC:1 + chr3L 25078470 3' - Transpac 4940 2 68.49 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTT:1 - chr2R 7404648 3' - blood 7047 2 57.53 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGG:1 - chrX 19162576 3' + pogo 2044 1 58.90 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAATCCTTGTTGACTTTTATCCTTTTTGGAATGTGCCCGTTCATCTTGGC:1 - chr2R 9326918 3' - mdg3 5271 2 72.60 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGG:1 + chr2R 11656145 3' - HMS-Beagle 6824 2 66.44 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCT:1 - chrX 15814539 3' - P-element 92 1 22.60 TAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTT:1 - chr2R 19633214 3' - jockey 4646 1 64.83 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGATAATTTATAAGCAGCCTAAAAGCATGCTATT:1 - chr2R 22798605 3' - hobo 47 1 53.42 TGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCCAAGTTTTAGGCCAGCATTTTGCTGCCTTTGTTCCACCCCATTCTCTCA:1 + chr2L 4104129 3' - roo 30 2 65.75 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTTGAATCTTTAGA:2 + chr3R 10778781 3' + mdg3 5471 2 67.12 CTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATT:1 - chrX 19231737 3' + mdg3 193 2 55.00 CTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCA:2 + chr3L 16973476 3' + S-element 1667 1 54.79 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAA:1 + chr2R 15080104 3' + roo 340 2 63.70 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCAACTGAGTCTTGAAATGGAT:1 + chr2R 9164960 3' - 412 38 2 58.22 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTA:1 - chr2R 22255327 3' + roo 9006 2 62.33 GTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTCCGGGATCTCGGCTTCATAGCTGGGCATATAGAACTGCGGTGCTCGTTTGCCGCCCACGATTGAAAGTCGCTCCTCGGGAG:1 + chr2L 17720735 3' - pogo 1701 1 67.94 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATATCGGAATTTTAAAATAAAATTTGCTCTTT:1 + chr3R 8022229 3' + roo 9012 2 58.90 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATCCAACTGACGGACTGACAAGGCAAAGTGCACAACTTCATTTCACATTAATGCAGTCGCTTTAACTGAATTCGTCGGCTGGCTGTCTGCAAA:1 - chr3L 12250929 3' - flea 20 2 71.23 AATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATT:1 + chr2L 19417141 3' - BS 4990 1 63.70 CTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCCCTTTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAAAAAGACATCAATACCCCATTGTAACCATAATGGCAAAATCAATCGTATACCTTCTCACGCTCC:1 + chr2R 7967617 3' - blood 1 2 52.90 TGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATATATTATATACATATAATATATTATTAAATGTATATATATAAAATTATGTGTGAATAGATATGGTTACTATACTGGCAGGAGATGGCACTACA:1 - chr2R 3066284 3' - 17.6 6949 1 71.23 AGGGACGGTAAAATAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGGGAGAATAGAAGTTCTACGAATATTTAATACACAATTGGACACAATTGCCGCCTGTTTCCTATTAATAACCTTATGCTATTAAGCATAGAATGTTTTTTATTG:1 + chr2R 3899664 3' - Cr1a 3990 1 74.66 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGTAGAGTGACATTTTTTATTTGATAACTAGGTAGATTAAGCTTAGCATTAACAAATTAACAAATTAT:1 - chr2L 1327487 3' + pogo 2049 1 53.42 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAAGGGATTTCTCTCTGCATCTTGTAA:1 - chr2L 9167396 3' + pogo 2072 1 61.38 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGTACTTGCCATTC:2 - chr3L 18835253 3' + pogo 2073 1 67.81 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCGGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTATAACCGACATAAAAGCCGCTTTTATTGAGGTAAAATGTTGGACTACAAATTGAGCAGCTATCGGCTACACTT:1 + chr2L 9010564 3' + 1360 3372 1 74.66 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCACGACGCCCACAAATCGC:1 + chr2R 6052713 3' + mdg1 386 2 60.69 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTGTAGCTTTCCTAAGTCTAAGTGGTTAAAG:1 - chr2L 6406452 3' - transib2 41 1 58.62 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGAACTGAATCTCTGGCCATCA:1 - chr3L 4023582 3' - pogo 25 1 68.49 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAA:1 - chrX 21668711 3' + mdg1 7403 2 56.85 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGAGGGAACGGTGTGCTGGCAGTTTACAAGTTAAGTT:1 - chr2R 14562068 3' - Burdock 18 2 73.29 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGCTTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAAAAGC:1 - chr3L 15035096 3' + pogo 2063 1 55.63 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGT:1 - chr2R 18123400 3' - 412 7094 2 52.05 CACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTAAGACA:1 + chr3L 21093277 3' - Ivk 18 1 73.29 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGG:1 + chr3R 15649852 3' - blood 7085 2 68.06 AGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGC:1 - chr2R 20382457 3' + Bari1 1673 1 62.33 GACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAATCACTATTTAATGAGAAGGAATTAACTGATATTAGCAGCGTTTTAATTAAACACA:1 + chr3L 18351390 3' + accord 226 2 62.33 CCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 210 2 76.70 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGAAATAATTTTGCGCATT:1 + chr2R 10991360 3' - jockey 87 1 76.12 ATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTCCAGAAAGTGGGCATATTCCGAACAAGGCAACTTGTTGACGAATGCATTTAGACCCGGACAAGTGTAAGAATCCAAACGAT:1 + chr2L 10469935 3' + P-element 233 1 55.86 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCA:1 - chr3L 18835278 3' + pogo 2048 1 55.48 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTT:1 + chr3R 26399881 3' - roo 8726 2 69.06 CTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGATTATTCATGG:1 + chr3R 20368100 3' - Max-element 44 2 55.48 CCGCCTCAACACACTCTGTCTACTCTTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATATCACGGAGACCTCAGCCACCTCGCGAGTCACCCAGCTACAGATGC:1 - chr3L 451354 3' - Circe 192 2 67.36 TTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGT:2 + chr2R 6984407 3' + HMS-Beagle2 248 2 63.70 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTC:1 - chr3R 29708983 3' - blood 7090 2 73.79 CACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATACACCAAGGAGCAGAAGTTGCAAGAAACTCACATAATGATCACAGCTGAGTGCGTGTGTGCCAAAATTGTTGACCACAAATAAGATGCCCAAAAAGAAAATGCCAATTGA:1 + chrX 4351900 3' - jockey 4591 1 75.34 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCATGCC:1 - chr3R 25876849 3' - mdg3 5297 2 53.52 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACAATCAGAGCTGCTGATTAT:1 + chr3L 16181023 3' - Transpac 4934 2 75.34 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAG:1 - chr2R 10367495 3' - 412 84 2 73.29 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTG:1 - chr3R 6782732 3' - jockey 4760 1 74.31 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTC:1 + chr3L 9242106 3' + roo 386 2 53.42 ATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATTTCTTTTCA:1 + chr2L 9356907 3' - Stalker 6913 4 63.70 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAAA:2 - chr3R 13358552 3' + mdg3 5475 2 68.49 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTT:1 + chr3L 8253749 3' - jockey 4679 1 52.74 GAAGCGGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTGAATGACTTTTACGATCCGTATCTGTATCTGGCATCAGTATCTTCTTTTTAATTCGGAGCGACATTAATTGGCTCG:1 - chr3L 12691185 3' - Porto1 4587 1 52.74 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCTCGTTGAACTTCAAAATGTGCGGGAAAAAAGTGAAATTTGCACTTTGTGGCCAAGTTAATGATCTGCGCGAAAATCTCGACAGGAAG:1 + chr3R 13723708 3' - FB 35 1 60.27 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTATTTTTCCATGCGTTCTACGAGCAATTTAAGTCCCCATAACAGGA:1 + chr3L 11669862 3' - Tabor 78 2 68.49 TTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCT:1 + chrX 685373 3' - BS 5083 1 74.66 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGACAACAATT:1 + chr2R 19543797 3' - jockey 4777 1 71.23 TTCCTGATCTATTCCTGATTCATAACTGAACTTGGTGTGGTCTACAGGCAGATAGCTCGTGACAGTCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTAAGTTAAGAATGAGGCGGCAAAACGCAAAGCCAAGCAAATATAAACA:1 - chr2L 6829763 3' - mdg1 320 2 68.49 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAAGCAAACCTGATATTGCACTGATCTCCCACAGAT:2 - chrX 10101308 3' - mdg3 51 2 50.00 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCAAACAATTCGGTTCTCTCAGTGGGTAAAAGTGA:1 + chr3R 31956557 3' - pogo 4 1 82.19 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGAATGGTGAATCAAGTGAATGTGGAATGCGGAATGCTGCT:1 + chr2L 10032790 3' - hobo 9 1 77.62 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTATTCAGGGCTG:1 - chr3L 24153149 3' + Tabor 451 2 59.15 GAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATATATGCATTATGTACGCCCAAGAATGCCAGACTGTGGAT:1 - chr3R 31120174 3' + opus 429 2 77.40 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACTTTTTAGAAAGGAACACTTGGCATAACTTGGATTCTCCTCGACAACTTGGGACTCT:1 + chr2R 7717298 3' - S-element 62 1 64.38 AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTATAGCCGTCGAAATCGTAATCTCAATTCGCCATCCCATCGCCATATCCTGATTGCCCCATCT:1 + chr2L 15142341 3' + BS 5044 1 57.93 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAAATAACTAGCAAAGCTGTTATGAAAG:1 + chr2L 19878278 3' - mdg3 5294 2 56.16 TGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTAT:1 - chr2R 9326985 3' - mdg3 5324 2 73.29 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTT:1 + chrX 14908458 3' - blood 7088 2 68.49 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAA:1 + chr3R 4722474 3' + roo 340 2 64.38 GAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAACAAAACCAAAGAAAACACTCGAAATGCTAATGGGTTAAAAATATCTTGAATTCGAGCAGGGAATCCCCGTCAGTGGCGTTGATTGGTGGCGTTGAGCTG:1 + chr3R 13039393 3' + invader2 462 1 77.40 CTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGACAACAAAATTGAAGAAGTAATTAAATAAAGACGAAAACTGAATCGATCAGCATAATTGAATTTCACAATGCAGTAGTAATTTCAGAATAAAGCTTTTATCGATAGTTGA:2 - chr2R 3502426 3' - 297 6943 2 78.77 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCT:1 - chr3R 31956761 3' + pogo 2050 1 57.53 ATAATAATAATATATTTAATTATAATGCCACGTAAATTGCGAGGTTTCTGATCCGAAAGATATAATTACAACACCAAAGAGTGTGGCAAGTGTACATATGTGTCGCAAAGAATTCCGGGGAAAAACACGTTTCTTCTCAGTTTATA:1 + chr3L 9445326 3' - Burdock 498 1 64.38 TTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCTGCTAATGTGATTGTTGTTGTTCTG:1 + chr3R 10140309 3' - P-element 13 1 75.76 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAG:1 - chr2L 10912244 3' - Doc 88 1 75.34 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGCTTGGCTATGTATCATTAGGTATTTATGCCTAAGAGGAAAGGACGAGGTTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAAT:1 - chr3L 21097157 3' - mdg3 74 2 70.94 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAA:1 + chrX 10979102 3' + roo 9011 2 61.64 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAATATAC:1 + chr3R 21570566 3' + mdg3 180 2 60.27 ACCCTCGATATATGCACATACTACACTTGATAAAATTCTTTATATTAATTATATGATAGGGACAATATCATATGCGTCACTAAATTGATGACGAGGTGTTTGGCTACTCTTGATAATCCTTATTGATAGTGCTTCACACATTTTAC:1 - chr3L 1266690 3' - blood 7015 2 63.01 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAA:1 + chr3R 9163950 3' - hobo 59 1 60.96 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAATATTTAAGTTTCTTCG:2 - chr2R 16712936 3' + pogo 2062 1 57.53 AACGGGTATCTGATAGTCGGGAAAATCTGTTGTTTTTTATTGCAGAAAATCCGGAGAAATAGAAGGGAATGCGCGAAAATTTACATTCGCGCTTTTTAGCTTTTCTTTGGTCCCTCGTGAGTTGCTGAATTCCTTGCTGTTCCCTT:1 + chrX 4630137 3' + INE-1 553 1 58.90 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATTTAGTAGTTCGCATTCGTGCATCTTTTGCTTGGCTTATTTATAAACGATGACCCTAGAAAGAGCACGATATCGTGCCAGTTGCGTGTTTAATTTGAAGGCATTATCCA:1 - chr3R 24100142 3' + jockey 4967 1 71.92 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATCACCGCAAAATCGCCAGACTCATAAAAAG:1 - chrX 13762582 3' + P-element 2795 1 22.60 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACCGATTATATTGAGGGGGAGTTTCAGTCAACGAAAAGAAAATAGTGAGAGGAGAGGGCTT:1 + chr2L 8542816 3' + P-element 2825 1 39.73 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTTCGGTTTAGAGTGTTTAGAGTGTGTATGAA:1 + chr3R 4722527 3' + roo 394 1 75.34 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAACGAAAAAGTGGGGGGTGTTTGTACGGCGAAAGGGG:1 - chr3L 13227603 3' + hobo 2904 1 52.76 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGGGAGAAAGCGGGAAG:1 - chr3L 4869114 3' + roo 397 1 75.56 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGTACTTGCCATTCTTCATCA:1 - chr3L 18835246 3' + pogo 2080 1 72.60 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTCCTCAAGTTGAAAGGCACTTAAGACCGCCACCGACCCGCCCCGCCCACTTTAGCCGACTCCCGGCGAACTAATCCACTTTC:1 + chr2R 17014912 3' - HMS-Beagle 6807 2 72.57 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCAATTCTAATTTC:2 + chr2L 9287121 3' + jockey 4955 1 47.95 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTTTAGTTTCGCACTAATAACGTTTCTGCAATTTTATTTAAGCGTAACATAGTCAAATCTATATTAGTGTTTATTTTAATCGTACATT:1 - chr2R 969105 3' - mdg1 35 2 61.64 AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCA:1 + chr2R 6052660 3' + mdg1 7370 2 75.34 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATCACGCGTGAATTTACCCAGCATTTAAAAGCATTTTTAAAGAGAT:1 + chr3L 5822048 3' - blood 7049 2 44.52 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATTAGCATTCGGTT:1 - chr3L 20747065 3' - Burdock 6169 2 63.01 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTC:1 - chr2R 15080021 3' - roo 72 2 68.49 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCT:1 + chr2R 9072945 3' - Burdock 68 2 65.75 ACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGATGTCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCACTCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAAT:1 + chr3R 15590038 3' + Transpac 5167 2 66.40 CATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTT:1 - chr3L 27356071 3' + Tc3 1646 1 60.27 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGT:1 - chr3R 11553662 3' + hopper2 1528 1 69.18 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCT:1 - chr3R 10142913 3' - 412 7096 2 54.79 CCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAAC:1 + chr2R 2949117 3' - 17.6 6999 2 68.49 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCCAAGTTTTAGGCCAGCATTTTGCTGCCTTTGTTCCACCCCATTCTCT:1 + chr2L 4104127 3' - roo 32 2 64.38 GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTT:1 - chr2R 10478683 3' + invader4 264 2 63.77 TTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAGATATACAACGTACTGACTCGGATAGAATTGCAGCACAGTGGTGTCCGCTAG:1 - chr3R 8732975 3' + Stalker 6859 4 69.18 CCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATAATGATTTCAATAAAGCAAAATCAGAGAATCTTACTTTCATCTTTTATATATATCCTTACATATAGGACT:1 - chr2L 19903297 3' + Transpac 308 2 47.26 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAATCATTTAAACCTTGCGTCTCCCTCTGTTTTAGGTGTCTGCCTTAAAGTGCGCCATAAACTAAAA:1 + chr2L 3545084 3' + Juan 4139 1 55.56 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGGAAAAATCGAGATTAAGTCCCCAATTATGCCCATTAAATAAGGCATATTAAAG:1 + chr2L 1327600 3' - pogo 61 1 61.64 AGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGGAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGGATTTTCAGAATATCGTATTCTGGGTAAATGTTTTCTATGTGTAGCAATGCCAAGATATGTGGGAGTACCAAT:1 + chr2R 16312166 3' - G6 1940 1 71.53 ATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGT:1 + chr3L 18920462 3' - Juan 86 1 72.60 TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATTTGTCTGCAAGCGGTGTGAATATACAAGCGGTATTTCATACAAACAGTATAGGCATACAAGCGGCGGGGAT:1 - chr3R 3257441 3' - Burdock 6181 2 54.79 GATGGGTGTGTGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTG:1 + chr3R 13358670 3' - mdg3 82 2 69.18 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCC:1 + chr3R 21237823 3' - Doc 57 1 52.41 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTGGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATGTCGGTTGGAACTGTTCTACTAACGGCGCTGCTGGTGCTTGTTGGTTACCTGCTGATGAA:1 - chr2R 14886804 3' - mdg3 15 2 41.78 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTATATACAAAACGACTTCTAAATGTTGGCAATAGCAATTAAAACAATTATTATTATAGTTACAGATACGAAATTCGGCGGTTGAAGCTCGGAATTGATGTCAAA:1 + chr2L 8452381 3' + copia 237 1 69.18 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTTGCGCGGTACTGCGTGGAAATGCTGTG:1 - chr2L 18048225 3' - blood 7042 2 63.01 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAAT:1 + chr2R 18722033 3' - 412 56 2 56.16 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGATTACTCCGCCCACACTTGTGGCAACCTGTAATCTCCAAAAATCACACCATATGGAGCACGCGCTCTTTA:1 + chr2L 3006202 3' - pogo 47 1 55.48 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCT:1 - chr3R 10541248 3' + hopper 1353 1 58.90 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATA:1 + chr2R 12703847 3' + blood 7313 2 69.86 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGCGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACTGCTCAAGC:1 - chr3L 19274769 3' - transib2 41 1 56.16 AGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATATATGTACATTGGTGATTTTGCCTTGAAGAAAATGAATTTCTTTTAACTATTACTTAACTATTTATTCAGCAT:1 + chrX 19231396 3' + mdg3 5250 1 56.85 GTATGAACGTCGAGATATCAGAAACTATAGAAGTTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCGCAAGTTTGTTAACCCTTGTTGATATGCCTACACAAGTAACATATATAGCGTGATAGTTGAG:1 + chr2R 1726352 3' + INE-1 137 1 77.94 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAAC:1 + chr3L 13597823 3' + blood 295 2 76.55 TCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATAT:1 - chr2L 15142255 3' - BS 4781 1 67.12 CCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATATTGCATGCCGCGCAGTGATTTGTGATTTGTGTGTTGA:1 + chr3R 10557199 3' - blood 7134 2 74.66 TCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGACGAGGCATTTGGCTACCTTAAGAGAGTCATAGTTACTCCTGCAGCCGGGGGCAACGAACCGGTGACCACGGAT:1 - chr2L 6964953 3' - R1A1-element 16 1 76.71 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTCACCGACACTGTCGCAAAC:1 - chr3R 20137220 3' - Burdock 32 2 62.33 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAA:1 - chr2L 10937861 3' + mdg1 336 2 75.34 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGC:1 + chrX 15167751 3' + roo 340 2 65.07 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTAT:1 - chrX 983114 3' + 412 7492 2 52.74 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTTCTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGATTAATTGAGGGCCATAGGCCACG:1 - chr3R 25384132 3' - mdg3 5262 1 78.47 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGCCGGGCACAAATTAAAAATGCCCCACAATTGCCCGCGAGTTTGAGA:1 + chr2R 24338498 3' - 1360 17 1 74.66 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATTCGTGTGTAT:1 - chrX 17469179 3' + blood 7326 1 62.94 TACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGGTTTATATTTTTTCCTCCCCATAAGGACTTAAAATGTCAACAACAA:1 + chr2L 20831469 3' - G6 1935 1 45.21 TACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTAATAAAGAAAATATTAAAAAGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTAGAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTATCATTGCCAGCATCCGCTATCGATTAGGTATTCG:1 + chrX 12569254 3' - S-element 1387 1 64.38 TAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGATTGGAAAAAACATCTCATGAGCAGAGCAGCATCCTATAGTCGAG:1 + chr3R 5765125 3' - opus 400 2 65.65 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATT:1 + chr2R 15392790 3' - blood 76 2 69.18 AGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTTGGTAAAAATAATGCTAGAAATTGCAT:1 + chr2R 8689363 3' + hobo 420 1 78.89 GGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTT:1 + chr3R 13358676 3' - mdg3 5328 2 65.75 GCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATATAGTTGGGTCTATGACAGGATCTGGGCTTGGATGCGTAACTTAGGATCG:1 + chr3R 9983123 3' - HMS-Beagle 37 2 60.00 GGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTAAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGA:1 - chr2R 14385561 3' - jockey 204 1 52.74 CGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAAAATAGACGTTGACGCTGAACCTAATGAATGAAAATATGCAGGCAACGTGATTCCGCCACAGCTAACGGGGCGCCCAGCC:1 + chr2R 19780770 3' - invader1 108 2 55.64 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATGAATTTAAGTCTGATAATTTCTCACTTTTTCCTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTTTTGAGGCCTTCACCACATAAAACTAACGAGCATCGCG:1 + chr3R 12367573 3' - copia 4897 2 67.81 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCAATTTATGGCATAAATCA:1 - chr2R 13276429 3' - roo 8687 2 70.55 AGCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTGGAGAGGTTCCTGCCGGGAACTGAGCCTGGCTCACATCAAAGACTAAGGA:1 + chr3L 1387250 3' + mdg3 221 2 66.17 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAA:1 + chr3R 10140265 3' - P-element 71 1 38.36 AAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCAAGATGACTCCCTTGTTTAACACCGGATGTGACTCGGAGAATACAAGATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTTGTAGCTTGAAATCGGGGTGTTGGGGTATATCAAGTAGTGGGCAAGAGGGGG:1 + chr2R 10056005 3' - Q-element 510 1 73.97 TGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTT:1 - chr2R 9326993 3' - mdg3 80 2 78.77 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCAACGATGTTTCAGTAGGAGTCAGTATGCTTTAATATTCAGGACCTGTTGCCCACATTAAAACCTTTTAATGCAATTTGGGGCAATGATTATTTGAAAGA:1 - chr2L 22746207 3' + 1360 3367 1 70.55 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCT:1 - chr3R 20452174 3' + blood 7336 1 53.42 TGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCAAAATATATTAAAAACTGTATTCCCTTCGAATGGCGCATGCATATTAGATATCTGGTAACAGATTCGAGCCACCACACAAATCCGCACATGCTTCTTGTTGGCC:1 - chr3L 9759705 3' + 412 7357 2 57.93 ATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAATTTCTCCTATCTTATTGCACTAAATGCTTCCATTTAAGCCTCTCATAACGCAATTGATAGAAAATCTAC:1 + chr2R 502636 3' + Bica 141 1 52.74 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATATCTGCTTTCGTTGAGCCTAACTGCGCGAACTTATAAATATCTAT:1 + chr2R 20704264 3' - hobo 28 1 59.59 TTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCCAC:1 + chr2R 5900961 3' + Bari1 1685 1 70.92 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGGCTTGACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGA:1 - chr2R 19168112 3' - opus 185 4 77.24 TTTGCTAACATATATGCATACAATTTATGTGAAATTTTTCAATCAATCCACCACATCTACATTTCTTTCAGCTAGCTTTCCATTTGAATAGAGCTACCAAGTTTAGTATAAACTACGGTAAGCCTACTGCTCCAGCCCTTAACTGT:1 + chrX 19278930 3' - 1731 104 1 79.45 CCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAACAACAACAGAACCCTGAACTCAAGTGAAGTGCAGTGCTGTGAGTGTGGCCAGCGTTTCGGTGGGTCGCTTG:1 + chr2R 13623545 3' + S-element 1666 1 51.37 ATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7189 2 79.66 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGGTGGGAACGCGAATTGGTTCCGG:1 - chrX 9709962 3' + pogo 2046 1 58.22 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGA:1 + chr3R 26399868 3' - roo 8746 2 79.45 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCATTTGACAGGCGAGCATAAAACCTCAA:2 + chrX 10538264 3' + pogo 2077 1 69.18 CTTCTTGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATAAGCCTCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAAATGCATGATCCTTACAGAGCTGGCAGTCCCAAGTCCATGCACTACATCCTGCTGGTGGCCGGGGGAAGAACGA:1 + chr2R 24280097 3' + Cr1a 4102 1 61.64 GGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCTAGGCGTCGCAATATAAATTTGTAAACCGCTTTTAATTGCTTGTTGCAAAAAATTTGGCAATTCGGACATTGCTTAGTGTGAAAATGGGGAAAACGTGTGCTCT:1 - chr2R 6188293 3' + Rt1a 4951 1 73.97 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTT:1 - chr3L 23146496 3' - 1360 65 1 72.80 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTG:1 + chr3R 22846822 3' + 412 7503 2 55.48 ATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATACTTAATTCTAAATACTTAATTCTAAAATACTTAATTCTAAAATATATCCTGCGTCGTTCCAGCATGATGA:1 - chrX 16441982 3' - P-element 2668 1 20.55 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGAGGTCCATGTAGAATTCGATCACCATTTGGGG:1 + chr2R 23313127 3' - Tabor 9 2 74.05 AGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCG:1 + chr3R 9983071 3' - HMS-Beagle 79 2 77.78 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAATGCA:1 + chr2R 20700763 3' - mdg1 7061 2 69.86 AAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCACATTTATGCAGTAATCAGTCGAGTGCACAGTC:1 - chr3R 20147837 3' - 1360 276 1 60.96 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGCCTATCCTGTATTTTATAGTTT:1 + chr3L 20076906 3' + roo 9054 2 74.66 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGG:1 + chr2R 17100115 3' - P-element 85 1 18.46 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAA:1 + chr2L 17162846 3' + blood 299 2 70.55 GTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAAATCTTTG:1 - chr3R 11553649 3' - hopper2 1325 1 41.10 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAG:1 + chr3L 14581512 3' - pogo 28 1 65.97 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAA:1 + chr3R 20452262 3' - blood 82 2 73.97 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGCGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTC:1 + chr3L 15035249 3' - pogo 31 1 61.64 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACATCCTGGGTGAGACAGCCCACCTGGCTT:1 + chr3L 4023762 3' + pogo 2080 1 69.86 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGAT:1 + chr3R 25271260 3' + 412 7474 2 69.93 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTTCAATACCAAATACAGAGCATTTTACCAATAAAAATCAATTAGTC:1 - chr2L 16941997 3' + mdg1 402 2 71.92 CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATCCATCAGC:1 - chr2L 12283914 3' - Quasimodo 48 2 56.16 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAATACTGGGGGATTGCCCTTTATTAAATAAACTGCAACAACGTGTTTTTCTCATAACTGTGGATGAATCATTCTGTTGATTTGCGTATCGCTCAAAATAAATGCATTTAAA:2 + chr3L 16764944 3' + I-element 5343 1 73.97 CGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAGCGAAATGGGGAGAAGAGAGCAGTAAAGTGAAACTTGAAATTGAATAAAGCCCACAG:1 - chr2L 17209395 3' + mdg3 5219 1 60.96 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTC:1 - chr3L 16157186 3' - Juan 53 1 55.48 AACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGAAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTATTGTTTTTCCATTGCTACCAGCTTCCAGCTACCCAATAACAAATTGTATCGAATGGTCGGAGTGGTCTGAGGACGCTGAAAAA:1 - chr2R 20402837 3' - Circe 7396 2 56.16 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTA:2 + chr2R 18051059 3' + mdg1 7388 2 67.12 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTTGAATATTGAAAGC:1 + chr3R 15590670 3' - roo 53 2 55.48 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATTAATTT:1 - chr2L 17162778 3' - blood 7087 2 69.86 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCAT:1 - chrX 18193683 3' + hopper 1380 1 62.33 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAACCACTGAGGCTCAGTTCTTGCG:1 - chr2R 20704101 3' + hobo 2937 1 79.17 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGA:2 + chr3R 9482138 3' + roo 9038 1 63.01 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACT:1 + chr2R 21056786 3' + Tirant 343 2 58.22 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCAT:1 - chrX 21639583 3' + Tirant 8479 2 67.12 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGTGTGCAGCTAATGAA:1 + chr2L 15965352 3' - blood 7026 2 75.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCA:1 + chr3R 26399915 3' - roo 8699 2 61.64 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTTCAAGG:1 - chr3R 10079248 3' - P-element 16 1 74.66 ACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTATCTGTTTGCCATTCAATATTGGCGCCATTGTAGCCCCTCTCCGCGACTCCTTG:1 - chr3L 3619082 3' - R1A1-element 43 1 63.19 AAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGC:1 - chr2R 14246975 3' - 297 6884 2 67.59 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACT:1 + chr3R 8402645 3' + mdg1 364 2 55.48 CACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCAT:1 + chr3R 27845546 3' + Stalker4 7282 4 71.92 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATATTTTGCATAATGACAAGTTATCGCACACAAA:1 - chr2R 16513151 3' - jockey 88 1 77.94 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATTGACG:1 - chr3R 25876829 3' - mdg3 28 2 67.59 AAAAAATGGCTGCATAGTGCGAAACCGTTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGACTTCACCATCCAGCTCGAAATGCACAATTCTGGGCCAATTGATTGAACGCATTCATTCATGAGGACATGGGCACTTTGTGCAACTTTCC:1 + chr2L 22350301 3' + 1360 3343 1 64.38 CTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCATAAAACGAGATAG:1 - chrX 983090 3' + 412 463 2 64.38 ATATGTGCACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTATGCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATGCTTGTGTAATATCTATGTATCTGCCCACCCAACTTCAGTC:1 - chr3R 30526173 3' - rover 148 2 77.40 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCTGAGCCATCAAGACGATTTCAATAAGTGCGGAACTACAACTAAAGACAGGCGAACTTCGCCCGACTCTGGGGACTTC:1 - chr3L 20276980 3' - BS 5002 1 54.11 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCA:1 - chrX 14962215 3' - jockey 84 1 67.81 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTAT:1 - chr3L 15321979 3' + Transpac 5150 2 71.92 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAAC:1 - chr3L 15058842 3' - blood 7069 2 54.79 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCA:1 - chr2R 16908513 3' + roo 8980 2 80.14 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTATTTATTTTTT:1 + chr3R 12363262 3' - jockey 72 1 58.22 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTGTTTGTTT:2 - chrX 10571319 3' - Doc 57 1 55.48 ACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTAATCACACAAGCAAGCACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAAGCGAAGGAATTAATACTGAATTCCGAACAAACCTTTCTTTTCACTGCTTAT:1 + chr2R 18130967 3' + 1360 3227 1 63.70 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAATATATGAAATTACCTTGTTCTATA:1 - chr3R 23507529 3' + 412 7531 2 74.66 ACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGAAATGGGGACCATGAAGTCTTCCAAAATACAATAGTTTTATAAAAATCTATAT:1 + chr3L 19667735 3' - R1A1-element 5267 1 64.93 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATA:1 - chr2R 20500045 3' + 412 7479 2 65.75 TATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAATACAAAAAACAGAAACTAAATAACTCTCCGTTTTGATGTTATTAATTTTGGCCAC:1 - chr3R 25508376 3' - Stalker2 67 2 63.01 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATATAATAGCT:1 - chrX 11228572 3' + roo 336 2 68.12 GCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCGGCGTCATTATATGCATATGTGGGTTCTTCAGTTGATAAATATATGCGATGATTGGTTTATTAAAC:1 + chr2R 17014165 3' + HMS-Beagle 7023 2 72.60 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTT:1 + chr3L 3540221 3' - mdg3 5298 2 55.48 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCGCCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGGCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAACTTTCATCACAATTCGACAAAAAGGATAAAAATGAAAAATTGCTCCACTGACAGCAGCC:1 + chr3R 25354613 3' - 297 6601 2 76.71 CAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTG:1 + chr2R 5900949 3' + Bari1 1668 1 60.27 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTGCTTGCATATTCA:1 - chrX 12893318 3' + Bari1 1667 1 58.22 GAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGAT:1 + chr3R 14088633 3' + 1360 3307 1 74.66 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGAAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGGAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAAC:1 + chr3R 5940499 3' - hobo 81 1 76.92 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTC:1 + chr3L 9430656 3' - P-element 32 1 51.38 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAATAAAACTTCACC:1 - chr3L 9426711 3' + P-element 2787 1 15.07 TCTATTCGCACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTG:1 - chr3R 20905381 3' - pogo 63 1 64.14 AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATTTCTTTTCATTATT:1 + chr2L 9356912 3' - Stalker 6908 4 60.27 CTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAAAAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAAAATGAAATGCAAAATGCAGAAAGCAA:1 - chr2R 18315143 3' + FB 407 1 82.19 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCAGACACTCGCACACCAATACCAATGCCA:1 - chr2L 13546924 3' + P-element 2867 1 73.97 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCC:1 - chr3R 9938608 3' - roo 8740 2 70.55 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCATGATCCCCATGGCTGACAGCATCCTGAACTCGTTCATTCATTTATGCGCTCCGCTCTGTTCAAATGTGCAAATCTGAATATGTGCATGTCTACCAGTGGGTGTG:1 + chrX 20552928 3' - roo 8678 2 74.66 GAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATC:1 + chr3R 20147555 3' + 1360 328 1 66.44 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAG:1 + chrX 18193817 3' - hopper 54 1 54.11 GTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCA:2 - chrX 21474393 3' - 1731 58 2 80.14 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGATCTAAATATTATTAATAATAATTAAATTAAGAAGTGATGGGAATTGTTAGTTTCAATTAAAAGCTGT:1 + chrX 14914456 3' - mdg3 5305 2 52.74 ATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCAAATAGAA:1 + chr2L 15153330 3' + G6 1951 1 66.44 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTTATCCGCTACGCTTAGCACAATCAAAACATAAACAAATCCAGAAACACGTACTGATCGTTTTCCCGCGCATTTATTT:3 - chr3R 10357725 3' - pogo 38 1 62.33 TTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGG:1 - chr2R 14553236 3' + mdg3 5435 2 62.50 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACC:1 + chr3L 131815 3' - P-element 59 1 43.57 GGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAACCTGTATTAGTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTAACCACACGGCAAAGTAGATAGGGACAGTA:1 + chr3R 9201033 3' - R1A1-element 4923 1 86.99 TGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGGGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACA:1 - chr2R 19076529 3' - F-element 230 1 58.90 AGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCA:1 + chrX 21907822 3' - accord 420 2 60.96 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAATTGGTGTGTTGGTACTAATCATATCTG:1 + chr3R 24229012 3' + opus 7481 2 71.92 ATTATTTTAGTAGATTTTACATTTCCAATTAAGTGCTTTGTCTTGCAATAATAAGCCGGAAAAATAGTTCTACCGATAATTCCGATATTTCGATAATTCGTAAAAATGCTTAGATATCGAATTTCGCCAAGAAATAATAATATTTC:1 - chrX 3309333 3' - Burdock 6386 2 71.92 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGG:1 - chr3R 12787116 3' - 297 6636 2 58.90 TAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGAATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTAGAGCCGTCGAAATCGTAAACTCAAATCTCCATCCCATCGCCATATCCTG:1 + chr2L 15142329 3' + BS 5043 1 58.21 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTCGAATAATTTACATA:2 - chr2L 20923006 3' - pogo 37 1 60.27 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTA:1 - chrX 13061701 3' - mdg3 57 2 53.42 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATAT:1 - chrX 4789117 3' - 297 6641 2 64.38 CGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGACGTCCCATATAGAAATTATCCCCGCAATAAACGTAGACCAAG:1 + chr3R 14874218 3' + flea 4940 1 70.55 ATTCTTTATCAGGATCAATAGCCATGTCATGACCGTATGAACGTTAAGATCTCAGGAACATTGAGGTCCAGTAAGACGCCTGGCTACACAACTAATTGATACCAGACACTGGCGTTAGCCCGGCGAGTCCGTTAATGTATGAACAG:1 + chr2R 4430969 3' + INE-1 86 1 63.70 ATGTTTAGTACGTAGGCATAATTTTCTAGCTGAGAGTTATGAATCGTGCATGCCATCTACGGACGGTGGCGCCATCTAGATTTTTTCACCCTTATAAAAATTGAAGTTAGTTAGTTGTGCCACAGGGCATAACTCAAGAATTCATA:1 - chrX 6277077 3' + Rt1a 4970 1 54.11 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAGTTTATTTTGACGAATCTTATTCAATGTGTTTCCTGCATATGTATGTTC:1 + chr2R 7534677 3' - roo 8736 2 68.49 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTAC:1 - chr3L 15371283 3' - Transpac 55 2 55.48 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCG:1 + chr2L 12481527 3' + pogo 2038 1 63.01 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAAT:1 - chr2R 18123396 3' - 412 37 2 54.79 GCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATCTTGTAACAGGAAAGCAGTCCATTTTTTAGGTAATTTCATAAAACTTTAGGCGAGCAAAAGTCTTG:1 - chr3R 6827915 3' - flea 53 2 54.79 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCT:1 - chr3L 20747090 3' - Burdock 6194 2 60.27 CAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7202 2 79.73 ATGGGCCCAGCGCCCTAGGAGCTGCCTAAAGGAGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTTGTAATGATGAACTCCATGAATTAAATGAACTTTTGCATTTCA:1 + chr2L 14910855 3' + 1731 342 1 70.34 TAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGAATAACGCCATCTACCGTACAGG:1 - chr2L 5771374 3' - Juan 25 1 67.12 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCGTTCTTTATAAGAATGTAAAACATTGGGTGCCTATTTGCAATATCTGTTTAATATAGAGATTGGAATGCTTTCGGGGAACTTAATTGTTGT:1 + chr3L 11953890 3' - jockey 4701 1 63.01 ACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGACCAATCATACCAATCAAACCAACATATAGCCAAGCGATCTGGAAAACGGGGAGAACTCTGTTACGGTTACGTTACGTGTGCTAGTCGAAGAGTTA:1 - chr2L 2784143 3' + R1A1-element 281 1 65.75 ACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAACATTCTACTGTCAATGTCAGCATGCTGCCGTGAGCGCTGCTTATCCATTCATGTGTTAATTCTTCCCTTTCCGTGCGTGTCAACCCCTCATCTCTGACATGGTGACTATGTGAA:1 + chr2L 15243006 3' + gypsy4 118 2 51.03 AAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAACCGTACACGGGTCTTTATTTAATTGAATGCCATTTTGTGCTGCCACCCCACAC:1 + chrX 3122049 3' - diver 5968 2 68.49 ATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACATAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGA:1 - chr2L 14969899 3' + Tirant 8422 2 73.29 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATGACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTTTCCGCTCTCTCTCGCATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTACAACTAGTAGCAATGACCAGAA:2 - chr3L 25190099 3' - 1360 172 1 62.33 CTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAAAGCAAAAAAAAACCGCCCTCTTTTATGTGTTTAAAAAACGAATTAAGAAACCTTTGAAGAGGACATAAATGTTAAATTTAGCATATGGCTTAAACGGCA:1 - chr2R 14550301 3' - mdg3 5207 1 58.90 CATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAAGCCTGAGGTTCCAGAACTGTGGCATCTGCATCTCTTTTTTAGCCACATGTTGTTGCAGCTTTAATAAAGACATCAGCCGCGCATAAT:1 + chr2L 3852223 3' - pogo 1691 1 60.27 ATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAAGCCACAGATGGAGAAAAAAGGGGTTCGGAAAATGTAAGGAGAAAACTTTTCTGTTTATAGTGAAAAAAAGAGAAATGTTAAAACATCAGCGCA:1 - chrX 15140945 3' + jockey 4864 1 66.44 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAACTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCCTAAGACAA:1 + chr3L 14581524 3' - pogo 18 1 71.92 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATGTATGCCGCCTGCGCGTACTCTCTTTCTCGATATCCACC:1 + chrX 14385278 3' + blood 7354 2 60.96 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATTAATTTTGGTATAAAAATATTAAT:1 - chr2L 17162760 3' - blood 58 2 57.53 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACA:1 + chr2R 14562276 3' + Burdock 227 2 44.52 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGAAGCGATAAGCAAACATAGCAGCAAATGGCAAATAAACAAGGCACTAAAATAT:1 + chr3R 25409573 3' - jockey 75 1 61.64 TTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAGTAGGTGACGTGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGATAAAGATAATTTTAGAACAAACTTATGCATACAGAAACTCCAGGTAGTTTGATCAAAA:1 - chr2L 19648355 3' - roo 9033 1 57.53 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATG:1 - chr3L 4023610 3' - pogo 53 1 54.11 ACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCA:1 + chr3L 5490912 3' + 412 401 2 78.08 GTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATCTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACCCAGCGGTCCCTCCAGCGTCCACTTGCACTTGCTC:1 + chr2L 6984491 3' - I-element 5324 1 73.29 ATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCC:1 - chr3L 24153194 3' + Tabor 7242 2 73.79 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACCAAAGAGAGCCAAGAGA:1 - chr3L 14969164 3' + P-element 2884 2 75.00 GCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGTTAGCTTTTTATGATTTTCCCATCGCCAATT:1 + chr3R 11803513 3' - accord 6968 2 76.81 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGAAATCTAGATCCTGAT:1 + chr3L 19146704 3' + pogo 2057 1 54.11 CTCGACGTTCATACGGACATATAAATCTGGATATATACTTGATATGATCGGAAACGTTTTCGTCTACCTGTTACATACTTTGTAACGAATCTGGATTAACTGGATTAATAACAAACATTTCACTCATTTGGTTGATTGGTTGTTGC:1 - chr2L 9207052 3' - INE-1 129 1 80.14 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCG:1 - chr2L 13884599 3' - pogo 64 1 72.44 GAGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTA:1 - chr2R 20913092 3' - 1360 42 1 56.85 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCAATTAAAAAGTGAACGATTAGGTTCTAGTATGTTAGAAATAAAC:1 - chr3R 7884483 3' - jockey 4766 1 78.77 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTT:1 + chr2L 17069646 3' + 412 433 2 60.27 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAAC:1 + chrX 19231862 3' - mdg3 39 2 58.90 CGCTACCTTTTGCCTGTTACATAATTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTATTTTACGGGTAACAGGTATAATTACTATTTATTTGGCGAAAGATACACAAGTAATGAGGTTAAGTGCAATCGCATTTAACTTGGTTTAATTTAC:1 + chr2R 25240344 3' - INE-1 30 1 41.10 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGG:1 + chr3R 20292530 3' - pogo 56 1 58.90 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCTTGCGAATGGATAGGGCCCAAATTAAACGGCTCATGACTTTAATGTATACGATTGTAAAATATATGCATACGAATATTAT:1 - chr3L 11610576 3' + copia 5084 2 56.16 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCCAAGA:1 - chr2L 14262789 3' + blood 370 2 63.01 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTTAGATCTCTTGAAACTAT:1 - chrX 5222816 3' + 412 7526 2 71.23 TATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCC:1 + chr2R 9033910 3' - F-element 4575 1 76.55 TGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTATA:1 - chrX 18913272 3' - Quasimodo 62 2 72.60 ACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACAGATTAAGTGTATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAG:1 + chr3L 20747178 3' + Burdock 6314 2 78.77 ATGTTCCCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCAAAGTGTTTCGATG:1 + chr3L 18920507 3' - Juan 41 1 57.53 TAAATTTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACGCCATGCACTTGCCATGGATACACCGCGAACTGACCTGACTGAGTGACTGACTACATGGGACAACTAGCTGGCTATCTGGCTATCTGGCAATACGATTGCGACAGCCG:1 - chr3R 24175626 3' + Burdock 6379 2 77.40 CAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCGTCGCTCGGCGCTTGGCCATATAAAGTCATCGCGTCTGGGGCGGCTCAATGGC:1 + chr2R 13574897 3' + diver 209 1 72.60 TTAATTTGAGTAATTGATTCTTAGGAATTATAGTTCTGATTTAAGGTCGGTTCTGTACCAGGATTTCATAAAATGGCTTAGTGGATATTGTCACTTCATTTACTTATAAGGACTTCCTGCATCATAAATTTGCAATCAACGCCCAT:1 - chr2L 9145548 3' + Circe 492 1 55.48 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATT:1 - chr2R 18807762 3' - jockey 65 1 52.74 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGAATGGTGAATCAAGTGAATGTGGAATGCGGAATGCTGCTCTT:1 + chr2L 10032793 3' - hobo 9 1 78.08 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAATGTATCCAAAGG:1 + chr3R 29709097 3' + blood 354 2 66.19 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAGAGCCAAGAGAAAGCGGTCTCGGA:2 - chr3L 14969151 3' + P-element 2883 2 78.17 AAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACA:1 - chr2R 21227372 3' - mdg3 86 2 75.34 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAA:1 + chrX 14136576 3' + roo 352 2 54.11 AGTGGTAGCAGTTGCGATGCACATAGTGCAAACCGCTGTTCTCTCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGTAAGTTGAGAGCACATCTACAGATTCCTACGAAGA:1 + chrX 21051879 3' + diver2 76 2 76.03 CGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGGAACTAGTGGGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCG:1 - chr2L 1073942 3' - Tirant 89 2 74.29 AAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATGATGATCCGCTTGTCGCGCGTCTGGAAGGCGCG:1 - chr2L 19371233 3' - Bari1 17 1 70.55 ATAGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCCTC:1 - chrX 693660 3' - INE-1 143 1 37.86 TCAGTGTGGCTTGTATTATGTGTTTGTGACTGTGAAAACTAACAAAAAATCGTGTTGTCCCCTTAATACCGTAAAAATGTTAGCGCTAGTGTGGGTGCTTTCGGTGCACCGCGGTCCTGTGTGTGCATGTACTTTACAAGTGTGT:1 - chrX 22918497 3' - Transib-N1_DM 228 1 57.24 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGCTTAAATTT:1 - chr2R 8305195 3' - blood 7059 2 52.74 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCA:1 - chr3R 25753628 3' - hobo 69 1 65.07 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATT:1 - chrX 12843592 3' - roo 69 2 67.12 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACG:1 - chr3R 8367115 3' - Doc 27 1 60.96 GTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAA:1 - chr3R 26765106 3' - mdg3 5333 2 71.92 TTTTTTTTTTATATAATTTATTAATATAATAATTATGAATGTGTGTATCAGGAATTTTAACAAAAGGATTTTCTTTTATATTTTAATGGATACTTTCGCGGATTATAGAGAGTCAATAAAGACTTACACTTAATGTCACACTCATA:1 - chr3R 17477195 3' - BS 5095 4 67.12 ATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATACCCCACCAATTGCACTGTCTACTGTGGCGGCATCAACGGAGCCCTCTC:1 + chr3R 28235333 3' - R1A1-element 5237 1 57.14 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAG:1 - chr3R 25876844 3' - mdg3 5280 2 63.85 TCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGA:1 + chr3R 27845556 3' + Stalker4 336 4 65.07 CAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATC:1 + chr2L 6074077 3' - BS 57 1 62.33 TTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGGACACCACCCACATCTACTGCACCTTCAGTTTTATCTGGGAAAGT:1 + chr3R 11094190 3' + copia 4691 1 77.40 GCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTTATACATATTGATTTCAGAGCTATATTCAAGCAATTTTTAATTGCCAATGTGCAATGTTATCTTGTATAGCTTTTTTATTCATTCGAGCCATTCATTAT:1 - chr3R 30731335 3' + gypsy6 361 2 66.44 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTAGAGCAC:1 + chr3R 14049468 3' + transib2 2799 1 67.12 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGC:1 + chr2L 20561500 3' - P-element 49 1 51.37 ACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCCGAGCGTGAGAATGCTGAGCATACACTTAGCAGCTCAAGTTTACATTTGGATTCGTTGGTTGGTTTCAGCAAGCGTACTT:1 - chr3L 19347020 3' + Stalker3T 93 1 69.86 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAATGACTCCATTAAGGAGAAAA:1 - chr3R 20905332 3' - pogo 15 1 76.03 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATGTTTTTCTGGCCATCGGCATACTGATCACATTGGG:1 - chr3R 25876587 3' + blood 7328 1 76.03 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGG:2 + chr3R 6053050 3' - Quasimodo 69 2 70.55 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGCGCAACACGCATGCGCAG:1 + chrX 19162726 3' - pogo 19 1 72.60 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTTATAGTTGAGCAA:1 + chr3L 3762312 3' - roo 64 2 62.33 CTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGTGAAATAAAATAAATTTTTGCAATTTCGTAAGTTTTATGCGCAC:1 - chr3R 18955880 3' + F-element 278 1 69.86 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACATCGATGTCAATCCGAAATCCCTTC:1 - chr3L 9375768 3' + mdg1 7452 2 78.77 GAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAAAAATAAAAAACAAATTTGTGTGGCTAACAACTTCCG:1 - chrX 4858348 3' - BS 5063 1 60.27 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTTTCATAAACCATGAACCTGCAATATCAA:1 - chr3L 15058823 3' - blood 7050 2 41.78 TCTCTATCCCAGGGTTCAAGTTTTGGCTAGAACCCTGGTGATTTGGTGCACACTTCAATATGAACACTTCAAAGTGTTCGTTCTGTGCTGCCATGTCGTTAAATAGATACCATTGCTTATTTAACGTTTGAGTCCAATTATGAGCC:1 + chr2L 22696088 3' + X-element 263 1 50.68 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCCTTGTCCGTATTTTGCTCTTCTGTAGATCATCGCCA:1 - chrX 11534458 3' + roo 324 2 73.97 TATGTGTTTAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTTTATTTACGAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTACATTATATTCCTTCCTAGTCATCAAAATCTGCACCACCTATCATGTTATTGCTA:1 - chr2R 4869692 3' + rooA 7244 2 65.93 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGATCTGT:1 - chr2L 19424628 3' - Tirant 8146 2 60.27 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCGAGCCAATTTGCAAAATTTGACAGAT:1 + chr2R 21227479 3' + mdg3 5468 2 66.44 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTT:2 + chr3L 5183800 3' + copia 198 2 59.59 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGGGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAAGAGGTCACAAAAATTGAA:1 - chrX 21668661 3' + mdg1 416 2 67.59 GCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTC:1 - chr3L 19146608 3' - pogo 99 1 63.64 GTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAACACTCTCAATTGACTGTGAACCGATTGAAATCTCTTTAATCTCAAACCGATACCTATTTCTCGCATCC:2 - chr2L 11158623 3' + Rt1b 5084 1 53.42 GTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATTTCGTACTGGGAATAGAGTTTGTTTGTTTAGAGCTGGCACAGTTCTCTGGCGACGTTTAAACGAAATTTA:1 - chr3L 9690218 3' + jockey 291 1 52.05 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTA:1 - chr2R 8305212 3' - blood 7076 2 63.01 CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATG:1 + chr3L 22676344 3' + 412 7461 2 76.03 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTGGG:1 - chr3R 19537435 3' - hopper 17 2 73.97 ATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACGAGATGAATCTATGATATAATATACTTGTTGTTGTGTCCACAATCTATAGGATTAGCCTACCCGAAATCAGATCG:1 + chr3R 9993616 3' + hobo 2551 1 56.85 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTGCCACAGGATATGGCTGGG:1 + chr2L 16685428 3' + P-element 2859 1 65.00 ATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACGTTTAAGAAAGTTCTGTTCTCAGGTTCATAAAAGTCAATGTCGAAAATGGTAAAAAAAATTCGAGAACCACCTCCTATATACCAAATCAACCGATACGGCATC:1 - chr3R 19254480 3' + Tc3 317 1 77.60 CCTTCTTGTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTTTCCCGCACTTCCAACTAAACAAAATGCTAATAAAAAAGCATATTTGCACACCTGCAAAACAAAAGCGTATATTAAAACTTAGTTCAATAAAGAGTAAATTCATA:2 + chr3L 18930182 3' + F-element 341 1 43.84 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGTTTTCG:1 + chr2R 21380740 3' + roo 9046 1 67.12 GAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGGGAAGTATGATTAGGTTATT:1 + chr2R 19354046 3' - 297 14 2 62.12 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTAACTGATTT:1 + chr3R 12608188 3' - roo 8702 2 47.95 ATATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTACTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATGCAGGAAAACCAATGGCCAC:2 - chrX 19817459 3' - invader3 5088 1 74.66 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGAATCGAGCTAAGCTCCCATATTAGGGATATGGTGTATTGAAAGATATA:1 + chrX 11534593 3' - roo 8668 2 78.77 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGT:2 - chr2L 18370350 3' - Doc 82 1 70.55 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCGGCCGTTTTGTTGGCAAATCATAAAAA:1 - chr3L 10370846 3' - copia 28 2 65.75 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAAC:1 + chr3L 9242080 3' + roo 9001 2 65.07 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAAT:1 - chr3L 13597769 3' - blood 85 2 76.71 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTGTTGAATATTAAAATATTTATGTAAAAAATGCAATTTTTTAGATTTGATTTTAATATCGACGGAATCAAGGCGGATG:1 + chr2R 5079308 3' - flea 4795 2 58.22 GCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAA:1 - chr2L 22696402 3' - X-element 93 1 72.60 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATAT:1 + chr3R 20368077 3' - Max-element 8302 2 61.64 AGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGGTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTTCTGGGGCATCTGGATCTACGGCACACATTTCAACAGC:1 - chr3R 24693553 3' + hobo 2891 1 50.00 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGAGTACGAAACGACACCA:1 + chr2R 16891867 3' - jockey 59 1 51.39 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGGAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTGGCCAACTTCGAACTTTT:1 + chr2L 535524 3' - roo 8695 2 58.78 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGAT:1 + chr3L 19274885 3' + transib2 2758 1 63.70 CTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTTTAGTTTCGCACTAATAACGTTTCTGCAATTTTA:1 - chr2R 969157 3' - mdg1 87 2 75.34 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCA:4 + chrX 22824811 3' - jockey 4746 1 70.55 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGGTGAACTTATCGGCGCCATAGCCACTGTTGTCGATAACTTTGTACTG:1 + chr2L 17661673 3' - jockey 4746 1 70.55 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGCGGCCGTCGAACCTCTCT:1 - chr2R 17013978 3' - HMS-Beagle 18 2 73.29 TGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGTATGTATATATTATATTATTAAATAAAATCTCTGTATGGTAAATACATCAAGTGATAATTAGAT:1 - chr3L 14143083 3' - X-element 4662 1 68.49 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTTTTCAGTTTGAGATTTTTAAAGCACATTTCGAAACGCGACAGGTAAACTTTGGTTGCCAACGACAGACAAGGTAAGTACT:1 + chr2R 16939832 3' + mdg3 245 2 52.74 TCTCAATCAGCTGTTCAACACTTCACCTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTTAGAAAATTATTGCCATCACTAAGAAAATTAATTTCCTTGAATGCCAACTATTTTGATAAATTAGTTTGATGAA:1 + chrX 15260827 3' - transib2 168 1 60.27 GTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGTCGCTCAAGATATCCTTTCCAAATCCTTTGTAATCAAAACAAATACCTCCGAGTCAAACCCCTTATGCTTGCTGATGTCCTAAATGAAAGGT:1 - chr2R 6224221 3' + roo 8846 2 54.11 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAAAGAAACTTTCCGTCCGTTGAAAATTGCGCAA:1 + chrX 16853465 3' + roo 9050 2 71.23 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTC:1 + chr2L 21596573 3' + blood 7311 2 66.44 CTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCCAGCTTTTGGGCTTGGGATCAAAGGCGAGCTTAAGAAAGAAGAGCAGCTGACTATATCTTTCATAGAAAAATCTGTAATTTGAACAAAATGGGGCGTTCAGCGTAGATTCTTGACTACTCGTC:1 + chr3L 12778652 3' + gypsy7 5280 2 52.05 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGT:1 - chr2R 16908470 3' + roo 9023 2 51.37 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAACCCGCCATGCATGTGCATGTGCTTTG:1 - chrX 15814470 3' + P-element 2882 2 79.69 AATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATGAACAGAGGCAGTAGTCATACTCTATGCATAACATGTTCTAATACTTAATACCTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGT:1 - chr2L 8776853 3' - G4 3801 1 63.70 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACCAGAGC:1 + chr2L 14970009 3' - Tirant 32 2 65.07 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACTGCCATTGTATTTGTTATCGTATCAAAACTACAGCTTTG:1 + chr2L 8103666 3' - pogo 7 1 79.31 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACCAACTCCTAACATAAGCGATTCA:1 - chr2R 8793851 3' - Transpac 28 2 66.90 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGC:1 - chr3L 4869143 3' + roo 356 2 52.05 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTT:1 - chrX 16853347 3' - roo 8747 2 75.34 ACTGAAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATCCCATTAGGGTTTATGAATCGTGCATGCCCCCTAAGGAAAGCATGAACATCCCCAGCCGCACGCTGCGTGTCCTCTGCTCTATGACATGGAGCACTGTCTG:1 - chr2R 7038775 3' + Rt1b 5019 1 56.85 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAG:1 + chrX 15089583 3' - P-element 62 1 40.71 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATATGAAGATCTCTTACAAGAACTCACTCACGCTTACTTTTTTCGCTT:1 - chrX 23036382 3' - pogo 71 1 69.18 GTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTTGCATTTATGAGTCGGAATGAAATGTTGTTTCCCGCTTGTTCACGCGTTTCGAGCGTGATAACGCTCAACTGGCCA:1 - chr2L 21308173 3' - jockey 475 1 47.59 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTTATTCGAAGCCATTTGGGTTTGTTAATTTACTAAAAGCTCTACAAGCTTTAAAGTTAAGCTGCTTTGGTAAGCTCACTTAACCGTTAAATTTCATTATCCTGGAAA:1 + chr3L 6096640 3' - roo 8679 2 75.34 TTAGTCTTGGACATTTCTATCGCTTTCTTAAACAAAATTTTCTAATATCTTTCGATACCCGAGAAAACTGATGAGTAACAGGGGAACTCGACTATAGCACTCTCTCTTGACTTAATTTGGACCACTGTAAAAATAAAACAAAACCA:1 + chr2R 5529367 3' + INE-1 298 1 50.68 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCACTGATTTC:1 - chr2R 6945604 3' + pogo 2056 1 54.79 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGCTCGGTGGACATGTTCGCGGTCAAAAGCCTACGGC:1 + chr3R 9289376 3' - HMS-Beagle 62 2 70.63 TATCTAGGTTCTGTAGCCGAAGGGTTTTCCCCTTGTTTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGACCGCATTAACACATATTTGACGAAACGCCGTT:1 + chr3L 16545722 3' - X-element 497 1 77.40 GTAGGGCAATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTGTCTCAAGCTTTCTTTCGAATATAATAATTGGCTTCCTCCGATTATATCGATCTTATTCATTAATGTCTGTAGACCAACACACTCAATGCCAACG:1 - chr2R 5580499 3' + Gypsy12A_LTR 1966 1 77.93 ATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGGGCTTATTGC:1 - chr3R 10973215 3' - jockey 84 1 66.44 GAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:1 - chr3L 25232766 3' + accord2 7567 2 62.96 ATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAATAAAGAGATTTTACGATCGAATAGGATAAGCTGAGGGATGCCCAACCGGACACCAATATCATAAATG:1 - chr3L 14326075 3' + opus 136 2 54.11 ACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGAATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCT:1 - chr3L 12863696 3' - Transpac 4999 2 72.60 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATACATATGTAGATAAGCTGAGGGAGCATCATGGCTCCCGAACTCTTGCAGATCGCCCTGCAATTAAGTCTCC:1 - chr3L 27269469 3' + S-element 1671 1 53.42 TTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACAC:1 - chr2R 19076540 3' - F-element 241 1 67.81 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGACGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGGCACATCCAATTGCTCCTCCTCTG:1 + chr3L 9430678 3' - P-element 16 1 64.35 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTTGAA:1 + chr3R 15590660 3' - roo 63 2 62.33 AAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATACTTACTGGCGGCATTCCATTT:1 - chr3R 10541194 3' + hopper 1407 2 79.45 CTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGGCAACATTTACGGTTTCCATGTTTACTGAAATCAGACCACTGTCCACGAAATCCACCGCCGACAGCATGTCTGACAACGGACCCGAGTTCGCCCAGGTCTTCGTAATCGTCTGGATAGGTG:1 - chr2L 4393305 3' - Cr1a 458 1 51.37 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCGATTAAG:1 - chr3R 19700840 3' + roo 9043 1 65.52 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGAATGCAAGATG:1 + chr2L 1229678 3' - opus 7074 4 77.14 GAACCCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGAGAACGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTTATACATATTGATTTCAGAGCTATATTCAAGCAATTTTTAATTGCCAATGTGCAATGTTATCTTGTATAGCTTT:1 - chr3R 30731360 3' + springer 7472 2 49.32 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGG:1 - chr2R 10367478 3' - 412 7078 2 53.85 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGAGAACCTGTGGCGTTGCCAGACTTGTTGATCATTGCGTTATTCAATTTCACAAGTAATTTCGAATCGCTCA:1 - chr3R 14874116 3' - flea 4798 2 54.29 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGGAATACTATGCAAAATAATAACTTAATATTTAGTATAAGTGTATAATTTTGAGGTAATAAAAAAAGATACTTATCACTTATCACTAT:1 + chrX 18149919 3' - hobo 33 1 60.27 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAATAATTACAATCGGCTACGCGCGATTCACCAAATCACAGCAACAACCACAGTGGGACATGCAC:1 - chr3R 29207528 3' - copia 4928 2 58.90 GTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGCTTACACTCGAG:1 + chr2L 21400825 3' + Doc3-element 4686 1 35.42 CCCAATAAAATTCTGGTATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGCATCTTTGAGTCACGAAGGGTTAGTACAATATACACATACAAATCCACTTAATAACAAAAATAATTTTCAATATAAATCTTTTGACCGTTACAATTGTGAT:1 - chr2R 3351725 3' + baggins 5332 1 74.66 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAA:2 - chr3L 18708597 3' - F-element 70 1 60.96 GGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCCCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTCAAATTTTTTAAATAATGCCACAACATTTGTCTGCTCTTGTGTGCGGGTTAAGCTAAC:1 + chrX 11064947 3' + hopper 470 1 70.55 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCACTTGGGCCTGTCGTTG:1 - chrX 8502147 3' + pogo 2059 1 56.85 GAAAAAAAAACAGGAAAAAAAAAACCATTTTCCCATTTTCGCGCTAGAAAACAACCAAAAAGGCAATAAACGCCAGCT:1 + chr3R 26570142 3' + Doc2-element 250 1 83.33 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTATAATATGG:1 - chr2R 14246948 3' + pogo 2051 1 54.86 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTTAAAAATGTACAAGTAACTTTTCATGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAATACGCACGGCTATT:1 + chr3L 5263475 3' + pogo 2050 1 54.79 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAAT:1 - chr2L 5771410 3' - Juan 61 1 56.85 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAG:1 + chr2L 1229675 3' - opus 27 4 65.59 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGA:2 - chr2R 7404646 3' - blood 7045 2 58.90 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAAC:1 - chrX 14385157 3' - blood 7078 2 61.64 ATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGGTATTTATACAGAAAA:1 + chr3L 21093205 3' - Ivk 101 1 77.24 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGGATTCCAAAGGCCAGGGCAGACAGACACATACAACACACGAAAATTGACGAAACTTATTCGC:1 - chr2R 18882511 3' - roo 8664 1 78.87 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGGAATACTATGCAAAATAATAACTTAATATTTAGTATAAGTGTATAATTTTGAGGTAATAAAAAAAGATACTTATCACTTATCACTATCCTTGATACTGTTGGCA:1 + chrX 18149936 3' - hobo 16 1 71.92 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGGGCCGGG:1 + chr3L 17447579 3' - Tirant 8141 2 62.33 GTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCCCC:2 + chrX 21667995 3' - gypsy2 7 2 78.08 GGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGA:1 - chr2R 6984320 3' - HMS-Beagle2 6934 2 61.29 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTGTTGAATATTAAAATATTTATGTAAAAAATGCAATTTTTTAGATTTGATTTTAATATCGACGGAATCAAGGCGGATGCTA:1 + chr2R 5079311 3' - flea 35 2 60.27 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAG:1 - chr2R 18807760 3' - jockey 63 1 51.37 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTTGAAAG:1 + chr2R 15392805 3' - blood 61 2 58.90 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCA:1 - chr2R 16908462 3' + roo 9032 1 57.24 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACAT:2 - chr3R 24809894 3' - 1360 65 1 65.07 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTCTATTCTCGGCTAATTGACGGCATCGGGCCATTGGCATTG:2 - chrX 17258156 3' + 297 6964 2 75.34 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCAAATAACT:1 + chr2L 17162883 3' + blood 337 2 55.56 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAACGAAAAAGTGGGTGGGGGTTGTACGGTGAAAGGGGGGAGGGGGGTGTCGGCAAA:1 - chr3L 13227584 3' + hobo 2919 1 65.65 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAA:1 + chrX 19231851 3' - mdg3 5301 2 51.72 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTTCGCTTTCGTTGCTGGG:1 + chr2R 23225876 3' + Transpac 244 2 64.38 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATCAATT:1 + chr3R 15649895 3' - blood 33 2 63.01 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTCATTACCAATAAA:1 + chr3L 14043657 3' - Ivk 24 1 69.18 GTTGCTCTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCAATTTCTAACAATTTGTACTCTTAGCAAGTGGTGTCCACATGTAGCTGTTTGAAAAAAATTTCAACTTTGAAGAGAGCTACAACATTCCGCCGACTCTTTTGCTGGCCAACTA:1 - chr3L 13563726 3' - hopper2 1316 2 75.34 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGTGATTTTCTATCTTTACAGGATATTCTAGCGAACT:1 - chr3R 18524217 3' + opus 7471 2 64.83 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCT:1 + chr2L 13547028 3' + P-element 2806 1 19.86 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGA:1 - chr3L 18708620 3' - F-element 93 1 76.71 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATA:1 - chrX 11228528 3' + roo 9036 1 61.64 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTTGATTCTCGCATGTCTGC:1 - chrX 15089457 3' + P-element 2861 1 66.44 TAGCTTAATTAATTAGAATAAGAATTATTTTCGTGGCGGAGACTGAATTAAATATTTCTTAAGATACAAATGTACTAACATTATTTCGGATACGATATCTTGCAATTAGTTTTCTGTCTAGTTAAAATTCAGAAGGAAATAGAAAA:1 + chr2R 16642759 3' + GATE 110 2 66.44 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATTCATAACAAATCTTACAAGTTTCTTCTTTAGCGCAGGGCGGTCTCGTAAGATTCGCTCATAATAATGGAGGGTGTTGTACAGATATGTTATAGGTCGA:1 - chr2R 22892567 3' + pogo 2082 1 72.60 GGTATGTTAAGGATGGGTGGATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGGAGTGTGA:1 - chr3L 21097148 3' - mdg3 5345 2 77.93 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACAC:1 - chr3L 4710716 3' - Doc 60 1 53.42 TAACTTACTGATTTAGAACTATGTGTTCCATCCTGTAATTGTTGTTGTCTTTGTTTAGGTCTTAGCTATAACCATCTAATCAAAGAGAGGATAACACCAAGGGAACCTGTTCCCGTGGTGAAATATGTTAGACAAGATATATATGT:1 + chr4 904674 3' + transib3 308 1 56.85 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCAT:1 - chr2R 16908505 3' + roo 8988 2 74.66 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAACAAAAAATTCAAATATTTCGACACTCCTCTCATGTTCTACCAAGAACAAAAAATCCAAATATATATGTATGAGTTCTGTCAAT:1 - chr3L 14906588 3' + jockey 4959 1 57.53 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTG:1 + chr2L 14969985 3' - Tirant 8163 2 51.37 AGAATTCATTATCATTATCATTTCACAACTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACGCAGTTGAGAGCATAGCTCCTGTGCCGTCCTAGAAGACAAACACAATCAAAAGGACTTGG:1 + chr2L 10625748 3' - accord2 7502 2 56.16 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGC:1 + chrX 19162696 3' - pogo 48 1 53.10 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATACCTCTTTTATA:1 + chr3R 21924390 3' + roo 9047 1 68.49 GAGAGATCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGTCACTCGCTGAGTAATCGCCGCGACAGTAATGAAAATGACTTCCATTCCACTCTGAAC:1 - chr2L 4263834 3' + 1360 113 1 60.27 TTTTATTTATTTCGGCGTTGATTATTTATTCGACTCATTTATTCGAATTCGGTGTTCTTCGAATGAGTTTCTTTCTGTGCACGTTTACAGGGAGGGGGCAGTCGAACTTGTTTCGCCTCGACAAGTATTTCCCTAATCAACTCGAC:1 + chr3R 21239986 3' + Tom1 337 1 47.26 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACAATAT:1 - chr3R 25822967 3' + roo 9011 2 61.64 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAA:1 - chr2L 5771403 3' - Juan 54 1 52.05 AGTTGAACTCAAAACTTTTATTATCTTAAAACTATGCTCTGCATTTTTGAGGAACACAACTAAAAGTTTAAGTAAACATGAAAATACGCACAAAAAGATAACATCCAAGACAGTGATGGCAACTTTTGCGACTGTGTTATCCCGGT:1 + chr3R 11895801 3' - Transib5 460 1 65.75 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATGATTAAGTTCGTTAGTAAGTTCATGTAAGTAGTTTAAATTTTACCAATTTAACAGTTAAAGATGACTAATTAAGTAGCAACAAATTATGGTAATTTAA:1 - chr3R 13494298 3' - opus 7025 2 47.26 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATCAATTCCGATGGTCTAT:3 + chr3R 15649907 3' - blood 7032 2 71.23 GGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAA:1 + chr2L 23295900 3' - micropia 126 4 56.16 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACCTCAAAACAATATC:1 + chr2L 2338188 3' - blood 7048 2 60.96 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTC:1 + chr3R 3527164 3' + Tabor 415 2 62.33 GATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGA:2 + chr3R 12540235 3' - flea 57 2 64.38 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATATCAGTATCAATAAGTAATATATTCACC:1 - chr3R 24809866 3' - 1360 37 1 60.96 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTTGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGATGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATT:1 + chr3R 10140279 3' - P-element 57 1 46.58 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGAAGGATGTGCTGATATTATTCCTTGCCACGGCAAAG:1 + chr3R 12540270 3' - flea 4772 2 74.10 GGAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTGAATTATTAAGATTTGATTTATGTCAAGTGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTTTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTT:1 - chr2R 6526153 3' - jockey2 3239 1 71.23 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGGTCCGGGGGCATGGGGG:1 + chr3L 17447589 3' - Tirant 8119 2 75.37 GCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 184 2 79.10 CTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAATTAAATTAATTATATGAAAGTGTGTTAAGTGAAATGTCATGATCCTTATTATTTGATATCCAACTCTGGCAATCG:1 - chr3L 21819955 3' + Juan 4161 1 55.86 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAG:1 + chr3L 16887409 3' + roo 9039 1 54.24 AGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACATTTTATTTTTAAAATCCCAGACAGGAGCCAGTGCCACTGCTCAGCCAACTGAAG:1 + chr2L 4336904 3' + invader2 175 2 71.23 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGG:1 + chr3R 19545416 3' + jockey 4935 1 56.16 ATGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCT:1 - chr3R 3527098 3' - Tabor 6927 2 74.66 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACTTTGTGGCGCTTTCATTATACTTCTTTGCTTGGCACTTTAACGCCG:1 - chr2L 4415997 3' - jockey 21 1 76.71 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTTTTGTATTTTCCCTTTTCCATTAAATTGAGCATCAAATCGAAAA:1 + chr2L 17228736 3' + mdg3 208 2 58.90 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCAGTCCTCGCCAAGCTTGGCCACAACAATT:1 - chr3R 28008208 3' - hobo 32 1 63.70 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGGGTGTTGGAGGCGCCTGGAAATATGCAATAAAATATTCATGATTTCTGTGCAGCAAAAACT:1 - chr2L 15621840 3' + hobo 2886 1 58.22 ACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAAGTACCCAATTAATAAACTGGTGGTTAGGAAAAGGCATGGTGAAATTATTTAAAGATTGAGTACATATATTCATTTTTCGGCGTCC:1 - chr3L 24283394 3' + S-element 371 1 63.70 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAA:1 - chrX 22824735 3' + jockey 4941 1 57.53 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGCGTATTTGTTGTTAATTTTTCAACAATTGCCTTTGATTTTT:1 - chr3R 8022146 3' - roo 8743 2 76.71 CCATAATTAAGGAACAGAATCCATAATGTCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAAGTATAGAAGGAAGTGAACGATTCCTACTGACTAATGAATAATAATAAATGATTTGAGCGATTGCCTTGCGGCAAAGCCACACAGAGCTTAACG:1 + chr2R 25060601 3' + G5A 2749 1 70.55 ATTTTATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTTCACCTACGCAGACTCGATTACAAATAAAGGCTTAACATTCATATGC:1 + chr2L 18438345 3' - mdg3 5147 1 67.81 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCACTTCGCGGCCATTGCTCAGG:1 - chr2R 15613756 3' - P-element 22 1 56.73 TGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGT:1 - chr3R 6068286 3' - jockey 4743 1 70.55 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGCTCGGCCGTCTGTCAAATTATCAGTTGTTTCTCATTAATTACATGCGCTCCTATC:1 - chrX 3444034 3' + pogo 2085 1 71.92 CAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGATGACAGACGCGCTTCTAGTCGCCACACACACACACACGTACAGACTCTTTACACACACCGCGCCGTGCACACACATCCTAATT:1 + chr2L 5491616 3' - Doc 4269 1 55.48 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATTCGTATCAACACACTGATAGATACAACGCTTTGCATCTACGTACATATGTTTCAATCGTAACTAAGTTCCGTTATTCTTTGCCAACGCGAAATTAGATATAT:1 + chr3R 3257604 3' + Burdock 6375 2 74.66 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:2 - chr2R 20461151 3' - jockey 33 1 65.71 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATCATTTATG:1 - chr3L 18468332 3' - jockey 4713 1 51.37 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTT:2 - chr3L 24153189 3' + Tabor 7246 2 70.55 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATAC:1 + chr3L 15035233 3' - pogo 47 1 54.11 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTACTACGCTAATTCGCTTGGCAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAACTTAAGCGACTAAAAAAATTATGGAAAAATACTCAACAATTTTGAAA:1 + chr2R 16604999 3' - INE-1 557 1 51.67 GATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTAT:1 - chr2R 9326995 3' - mdg3 82 2 80.14 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGAGATTTTGTGTTTTGTGTTCTCTAAATAAAGCCATACAAGACAAAAAATCGAAAGTAGCTGGCCAGAGAAGTTCGAAAAGAATTTCAGCAGCC:1 + chr2L 3006340 3' - pogo 25 1 67.12 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTA:1 - chr3L 18468366 3' - jockey 4747 1 69.86 AAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCGAGCCA:1 + chr2R 21227459 3' + mdg3 196 2 52.74 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAAACGGA:1 + chr3R 29350809 3' - 297 20 2 63.33 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCA:1 - chr2R 5214929 3' - F-element 46 1 57.53 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGTGAGTTTGAGT:1 - chr2R 24630095 3' - copia 4900 2 61.64 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTACAGCCACCCGCACATGACGCGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGT:1 - chr2R 8562343 3' - 1360 39 1 61.64 CATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTACTCGCCGTGGTCTCGGTCGCTTTTCCG:1 - chr2R 11442778 3' + jockey 93 1 78.23 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTACTTA:1 + chr2L 19903501 3' - Transpac 34 2 57.53 GGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATCTCGAGAAGTAATGGTGACGCCGAGAAGCTGGAGAAAAGAAAGATCTGAGAAGAACGAATTCGTCATATTGGGACCAGAATTGGTGAGACAGCGGGAC:1 - chr3R 2999703 3' + McClintock 6415 2 75.17 AATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTCGCCTGCTG:1 - chr3R 11076983 3' + mdg1 7066 3 35.48 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTTGAATCTTTAGATCTGTAAGATCTTT:1 + chr3R 10778795 3' + mdg3 233 2 76.71 CCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACACTATTGAAATCGAAAATCAAATGCGAAGCGAACAAGCGGAGGCGGCAGATAAAACGAA:1 - chr2R 18582067 3' + copia 5000 2 60.27 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATT:1 + chrX 21668836 3' - mdg1 55 2 55.48 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACTGGGAATGAGAAAAGATGGAATTATAAACTTTTAATACAAATAATCTAATATACTTTTAAAGAGCTTTAAGACTTTAATAAGTATTTATCCTATA:1 - chr2R 19263390 3' - Doc 34 1 56.85 AATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTCGAAGTATATAATATTCCCATTT:1 - chr3L 19146586 3' - pogo 80 1 49.32 CGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAACTAGTGACAATCGAGTTACTTTTTAAACTTCTAGTATTTGCAATCGCTTGCAACCCTGACTTGCGATCTATC:1 + chr3L 3225642 3' - 1360 100 1 49.28 CTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAAGCGGGGCTCAGCAGGCGTGAAATTAATCACAATAAAGACTGCAAAAAAAAAAACAGGGGGAAATCCAGCAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCTCGAAT:1 - chr3R 22431066 3' + roo 487 1 72.86 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATGCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGGATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACC:1 + chr3L 15322036 3' - Transpac 5000 2 74.82 GTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGCATATAATTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTTATCAAGTCGGGACTCTAAACATCACCACAAATAAGCTTACAAATAAATATATATATACTTACGTATT:1 + chr2R 3146324 3' - Cr1a 4147 1 79.45 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACACATTCTTATAAATCCAGCAATACTGTAGACACTATAAACTTGGTGAACCAGTACGCCATGGTTTTCTACATGCCACATGCTGGCCAAACA:1 + chr3L 21630452 3' + Burdock 228 2 67.12 GGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTT:2 + chr3R 20368061 3' - Max-element 8318 2 72.60 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTTCTTACAAATTTAGTGTT:1 + chr3L 8253725 3' - jockey 4702 1 63.45 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGGGGGGGTTGCACAGATACTCTACGCTT:1 - chr3R 8687280 3' - accord 184 2 81.82 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGG:1 + chr3R 15514607 3' - 412 7124 2 65.07 TGTGGACCTACTTAAAGGAGAAGGTGGCAAAAAGGGACCTAAAACACAACAACAGCTTATGACTGTAATAGTCGAAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAGTGAGTCGTGTGCAAAAGGCAAAATTAGTGTAAAGCATTTTCCAAAG:1 + chr3R 3179369 3' + S-element 1257 1 67.81 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTC:1 - chr3L 2036992 3' - Doc 54 1 54.11 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTTGTGGGGC:1 - chr3R 18846508 3' - roo 8734 2 65.07 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTGGGATTTTTGCGGCGCATAATGCAATGCCCTTATGTA:1 - chr3R 25753568 3' - hobo 9 1 80.14 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAATTAGTTTGTTTTCACTTTGACAT:1 + chr3R 15465621 3' + mdg3 5481 2 73.10 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAG:1 + chr3L 17447566 3' - Tirant 8111 2 77.67 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAAACATAGCAAGCTATTACGAGAAAATACAAACAAATATATATATAAACTTCTGATTTCGAATAGAATGTGCAGATTAGCCTTCATTCGC:1 - chr2L 14008685 3' + pogo 2072 1 65.75 CAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAGCGAAGCTGGAGATAGCAACGAAGACGGCGATGACCAACTAACTACAGGCAGCATGAGAGTGTTGGAAAAAACGC:1 - chr3R 7348662 3' + invader2 485 1 71.92 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGC:1 + chr3R 10140284 3' - P-element 52 1 51.37 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTT:1 + chr3R 25753694 3' + hobo 2897 1 64.08 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCT:1 + chrX 17469250 3' - blood 7085 2 73.13 ATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACACTT:1 - chr2R 19633187 3' - jockey 4620 1 53.42 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGCTTATGCA:1 + chr2R 21898004 3' - 412 7086 2 60.27 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTG:1 - chr2R 9332117 3' + roo 353 2 56.85 AGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTATAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAACAATTCGTCAACAGTTTTAATAAATATTTGGGTGTTGGTGTCTTG:1 - chr2R 5451057 3' + baggins 5357 1 78.77 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAAGTTCAGGGAGTGCAAGA:1 + chr3L 20290801 3' + roo 9038 1 61.64 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGAT:1 - chr2R 16908509 3' + roo 8984 2 77.40 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTG:1 + chr2R 18882698 3' + roo 9041 1 63.70 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACACTTTTCGAGACTTTCAATTATGATTTCCACAAAG:1 + chr3R 21154301 3' - jockey 4759 1 73.10 GGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTGCGATCTGTATCTTAATTCGTTTGTTTTTAAGTAATTAAAAAAGGCACAAGTAAGATTCAATTTGAGAAGTACAAATATTTGCGGTTGTTCCTGTTCACTGCACTACTCCAGCTCAAAACACCCA:1 - chr2L 14430764 3' - mdg3 5096 1 71.92 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCA:1 + chr2L 535494 3' - roo 8740 2 71.92 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATGTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGTAGCGGCAGCGGT:1 + chr2R 17100122 3' - P-element 48 1 29.00 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCA:1 - chr2R 6945612 3' + pogo 2048 1 59.59 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTATTTCTTTAAACCTCGTCTCAGTTAGCAAATTTACTCATCTATTTATTATTTGATTT:1 + chr2R 16713053 3' - pogo 60 1 62.33 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAAC:1 + chr2L 2519929 3' + roo 9037 1 60.96 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACG:1 - chr2R 24338342 3' + 1360 3333 1 60.27 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGTTATAATTT:1 - chr2R 17100083 3' + P-element 2800 1 27.40 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTGCACTAAATG:1 - chr3R 25521764 3' + blood 361 2 70.77 CCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGATTATTCATGGTAAGTACTCGTACACTCAGGTTTAGTACAAG:1 + chr3R 20368131 3' - Max-element 8248 2 76.71 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAACTTTGCTCATATAAATTGAA:2 + chr3L 13597889 3' + blood 359 2 72.60 GAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGATTTGTTATCTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chrX 23065112 3' + F-element 82 1 66.44 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAA:1 + chr3L 3540265 3' - mdg3 16 2 73.29 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAAC:1 + chr2L 21596568 3' + blood 7306 2 69.86 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCAC:1 + chr3R 25521923 3' - blood 32 2 63.70 GGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCAGGAGCTCCTCCAGATAGGTCTGGCACAGCCGGCGGTC:1 + chr3R 27295849 3' - R1A1-element 5078 1 71.43 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCGTGTCAATTTAAAGCGACATTTATAACCAATTTGTAATCAATTCTAACAA:1 - chr3R 10562130 3' - I-element 65 1 62.86 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTT:1 - chr3R 6782726 3' - jockey 4756 1 71.23 ACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAATGAATTTTAAAAGCTCTAAAAAGGGCATTCAGTAGCCACCATTCAC:1 - chr3R 20001587 3' + FB 66 1 71.92 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTT:1 - chr2R 13276452 3' - roo 46 2 54.79 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTTATTCTTATCAGCCAATAATATCAATTCTTGGTAAACTAT:1 + chr2R 18048943 3' - opus 7026 2 73.97 CAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGGAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGATAAACTAGGGCCGTGCGTCAGTACGCGACTTTTCAATA:1 - chr3L 17437882 3' - jockey 447 1 72.41 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTA:1 + chr3L 21093272 3' - Ivk 23 1 69.86 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTGTA:1 - chr2R 21227337 3' - mdg3 5303 2 52.05 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGTAAGTTCTTTAAGATGAAATTGAGAGTGATTGTGAAATATATA:1 - chr3R 10498781 3' - 297 42 2 57.24 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATCAATTCCGATGGTCT:1 + chr3R 15649905 3' - blood 23 2 69.86 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAGTTTACAAGCACAGGTCGTTAAAAGTTACTTCAAGATCGACAAAACAATTGAAAGTGAATAAGTTCTAATTAGACCTCTGCTGGCGGCTGAATTTAATATTGAGAT:1 - chr2L 8452193 3' - copia 4885 2 74.66 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTG:1 - chrX 16244900 3' - jockey 4832 1 65.75 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTT:1 - chr3R 31907347 3' - Tirant 32 2 57.69 GATAAGAAGAAATAAAAAGTTGGCCTGTCGGTTTCACCCAACTGCAAGGTAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATGTAATGGATTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGG:1 + chr3L 13597806 3' + blood 7319 2 71.30 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATA:1 + chrX 21605745 3' - P-element 95 1 20.55 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTATACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCG:1 - chr3L 15371298 3' - Transpac 70 2 65.75 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAATATCGGCTAGTTGTTCATG:1 - chr3R 4884361 3' + pogo 2056 1 54.79 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGCTGGCCGCC:1 - chr3L 22354418 3' - Doc 41 1 52.80 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCC:1 - chr3R 20905361 3' - pogo 44 1 56.16 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATATAAAAAGTGAAATGTAAACTAGCAATCAATTCCTCATTAAGTTTATGCATATAAATATGGTTGGCATTTGTAATCAAATATTTCACACATTATTTCAATAGAC:1 - chrX 2873320 3' - roo 8680 2 62.33 TGTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATGTAGTCTCCGAATTTAGTCAGTCGCTTGTCGGCAGTCTTACAAGTAAGTAAGAGTGGAAGGTGAGCCAGAACAGGATTTATGTTCGAAAGCGACGACTCCGC:1 + chr2L 18823640 3' - P-element 15 1 75.34 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAATTGGAAAAATGCTGAAATTTGCTA:1 + chrX 3452568 3' - Tirant 16 2 76.03 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTTGAATATTGAAAGCAGACAACCAACCAACTGCAGGGGATGGGGCAGCTGGGGG:1 + chr3R 15590709 3' - roo 14 2 76.03 GATTTTTATTAAAAAATATATATTCCTTTGATATTCGTACATTTCATTTGTATAATTATATATTTCTGAATAGAACTTCAGCTTCTATCAAAATATAACTTTATTCAGCCAAAAATAGTTTATTCAACGCTCATTGGAGAAAAAAT:1 - chr3R 6646542 3' - TART-B 10450 2 53.42 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATTGAGCTCCAGCGAGCGGCGGCTAAAAAACTTTGGCTGCCTTCCGCGAGGC:1 - chr3R 15030691 3' + jockey 4933 1 66.17 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTTCATTTAA:1 + chr2R 5237940 3' - Doc 38 1 64.38 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCT:1 + chr2R 23225851 3' + Transpac 265 2 73.00 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTG:2 - chr2R 5214938 3' - F-element 55 1 51.37 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTT:1 - chr2L 18048251 3' - blood 39 2 51.56 AATGACGGTTTAGACGGCCAGCTAGAGAGTTGCCGGAGCTGGAGTGACGGTTTAGACGGCCAGCGAGGAGGATTTGTGTGAGCGCAGCCAGCTACGTATGGGATGATGAGAGTCCTGTGCCTTGGCACATGTATTTGGCAAATCAA:1 - chr3R 13477345 3' + aurora-element 161 1 66.44 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCA:1 - chr3L 5263322 3' - pogo 26 1 64.38 GGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCCAAGAGGAAG:1 - chr2L 14262784 3' + blood 7387 2 66.44 AAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGA:1 - chr3R 14049326 3' - transib2 56 1 54.79 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATTGTGGTT:1 + chr3R 20292561 3' - pogo 25 1 68.49 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGCGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGG:1 - chr3R 5087019 3' - P-element 71 1 35.62 GGTCATAAATAGTATGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATTCGGATGGTTTGGGGGAGAAACAGAGAGAAAGACAAGCGGGAATTAGCA:1 + chr2R 18437648 3' + invader4 144 2 66.44 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGCGAAGTATGATTAGGTTATTGACTCGCCAACTTGAAATATATATGAGAACAAGGGCACTGCTCTTACAACAAGCACTTAATTT:1 + chr2R 19354109 3' - 297 6594 2 74.22 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATG:1 + chrX 11228628 3' - roo 88 2 78.77 AAACATTTCTACTAATTCTGGAACAGATTTTCTCAACTGGAGATTATAGTATATTAATTGGGTAATCCCTTTTTTCCTCTTAGAGCTCAAAATTCCCATTAACATTGGTCAGATTGCCAGGAAAGTCATTAAACTTCATTAGGAGC:1 - chrX 20130505 3' - S-element 475 1 54.79 GGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGATGAAAAGGGGTCAGCAAAGTAAGATGTTGTGGGAAAAATGCGAAATTTCATTGATAAGGGTTCTGGGAGGTTTTAAACCTAAGATAGCGTGTGAAATGTAAGCTTTTAA:1 + chr3L 7876868 3' - blood 168 2 76.55 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAATTCCGCGCCAATGTCGATTCTGTTTCAG:1 - chr3R 9938547 3' - roo 15 2 76.03 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTA:1 + chr3L 22676348 3' + 412 7465 2 71.92 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTATTAATAATGTTTGAGTTTGCACATTGAAGAAATAAATGAAACAAGAGTGCAGAGCCAAGAG:1 - chr2L 14262788 3' + blood 7383 2 63.70 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAAATATAGTTAATTTATCGCAACAGTCTTCAAAGATCTTTGGTATTATCAGATGACCTGATTCCCTTGGTATTTCAAAATAA:1 + chr2R 22798739 3' + hobo 2908 1 57.97 TTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGAGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTTTTTGTCGCTGCAAACACTTTGTTTTTGCTGCTCGAAATATGT:1 - chr3R 23346498 3' + Rt1a 5054 1 78.77 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCG:1 + chr2R 1277180 3' - Tirant 33 2 63.89 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATA:1 - chr2L 19903379 3' + Transpac 5158 2 67.12 AGTTAATGTGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTTATGTAGTTTGTACAACTTCGTTATCATACTCGCACATAGCAGTACTACTATTATTATGATTTATGATGATAAGTGCTTAATACGGC:1 + chrX 3795779 3' - 412 7087 2 42.47 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACT:1 - chr3L 15371286 3' - Transpac 58 2 57.53 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGCATCTAATTATGTATACATTTGTGTAAATTGTACTTGGCTCACTTG:1 - chrX 15318803 3' - S-element 75 1 70.55 AATCACAAAAGCAGAATGGTAAATTAGAAACAAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAAAAGCAGCAAAATACACACAAATAAACTACTTATAATGTAAAACAAAATATTTTTTTGTT:1 - chr2L 17879195 3' + Porto1 4355 1 78.08 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGT:1 + chr2R 6984435 3' + HMS-Beagle 7008 4 60.96 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAACGAAAAAGTGG:1 - chr3L 13227627 3' + hobo 2870 1 69.34 AACATAAACATAGCAACAAAGAGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCCTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTA:1 - chr2R 18123424 3' - 412 65 2 60.27 TCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTGGA:1 - chr3L 10370898 3' - copia 80 2 74.66 TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGC:1 + chr3R 5087084 3' + P-element 2803 1 28.08 TTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTTGCAAATGTAAACTCCTATGACTTGCATCGATATTAGTGTTAAGCTT:1 - chr2L 5341237 3' - S-element 68 1 69.86 GAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTATATTTACAGATAAAACAGGTACTCTCACAGAGAAC:1 + chr2L 9516331 3' + hobo 309 1 75.34 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAA:1 - chr3L 24153139 3' + Tabor 7296 2 65.75 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATAACCCGTTTCAACCCCCAATGATCAAA:1 + chr3L 21387552 3' - pogo 35 1 61.64 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGCTTAAATTTTATTTGACGCATTTTATGTGCTACTCGCTAAAAATA:1 - chr2R 8305159 3' - blood 7023 2 76.03 CAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAGATAATAAATATGAAATTATATTTTCAGCAATTATATGCTTG:1 + chr3R 18469209 3' + Quasimodo 7289 2 78.08 CCCCCCCCCCCACCCCCCCCCACGAAAAAATTTGAAAAAATT:1 + chrX 16146616 3' + accord2 225 1 54.76 CGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCCC:3 + chrX 21667994 3' - gypsy2 6496 2 77.40 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAACCTG:1 + chr3R 13358728 3' - mdg3 24 2 69.86 AAAAAGAAAGAGAAAAAGGAAAGGGGAAAGAAAAAGAAGTTAACAAGGAACATGAAACATTTATTATTAAAAAGTATAGAATAATTTCAAAAATTTATCAATTTTAGGAATGAATATTTTTATTGGCTAACAATTTCCATAGATTT:1 + chr2L 19266630 3' + Doc2-element 245 1 60.27 CACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTAT:2 + chr2L 6074073 3' - BS 61 1 65.07 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGGCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGTCATAACTCATGCGACTCATGAGTGCGA:1 - chr3L 16180840 3' + Transpac 5203 2 66.44 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACACTTTCATATAATTTCTGTCATAGAGCATTGAACTAAGGCTTAATTTAGCATCGT:2 + chr3L 21820042 3' - Juan 69 1 64.38 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATAAGTCGCCA:1 + chr3R 25753728 3' + hobo 2921 1 64.60 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATAC:3 + chr3L 3540204 3' - mdg3 63 2 67.12 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGGAAATTAAAATATATCGTAACG:1 + chr2R 15080157 3' + roo 394 1 76.03 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAA:1 - chr3L 12863686 3' - Transpac 4989 2 69.86 TGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGAT:1 + chr2L 22684598 3' - transib3 73 1 58.22 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAACAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCG:1 + chr3R 4659609 3' + P-element 2816 1 36.30 CGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCGTTCTTTC:1 + chrX 11815054 3' + flea 157 1 79.45 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGATGCGAGGAACTGAATCTCTGGCCATC:1 - chr3L 4023583 3' - pogo 13 1 72.93 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACTTTTATCTTTCA:1 + chr2R 21056797 3' + Tirant 8461 2 54.79 CAGATTGGTTTCCATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAATATAGATGTGCCGCGGTGCTCCGATGTTACTCCGAAATCGGTTTCGCCTGGGCGCATCCAACT:1 - chrX 1483045 3' - F-element 4245 1 55.48 CTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7268 2 92.65 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCAT:1 - chrX 4789119 3' - 297 6643 2 65.75 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCATGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAACCTTTTTCAATTAACAGTTTCCAGAGAA:1 + chr3R 23623953 3' - roo 59 2 61.70 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATTTTTGTAGGTGAGCGGCAAATGTGGTGGCTCTGTTTTTAATTAGCTGCCATCGGGCCAGGTAGTAGCGGTAAGGATATACACTCAATGGAG:1 - chrX 3984533 3' - Doc 37 1 39.73 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTC:2 + chr3L 9242104 3' + roo 9047 1 52.05 GGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGCGAATCCGCCGTAGGCATAGTGGTTGCCTGACACCCTTC:1 + chr2L 22695038 3' - X-element 73 1 60.00 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTGGTAGAATATTT:1 + chr3L 19274910 3' + transib2 2783 1 56.85 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTT:1 + chr3L 20977442 3' - I-element 70 1 61.64 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCC:1 + chr3L 16180981 3' - Transpac 4970 2 55.00 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTAATCATACACATATACCGTCG:1 - chr3R 18665252 3' - 1360 64 1 67.12 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCATAAAACGAGATAGATAAAATGCGTAGCATTTGA:1 - chrX 983070 3' + 412 7536 2 78.08 CCAACACTGAACGCATCTGGATGCTCCACGTTTCATAGGATCCATCCTCCAGCTTATCGATCTGATACAGGTTACTCATTCCGGCAATCTTGAGTAGACTCCAATTGAACATTGCCAGTCATTTGTCAACAGATGTGAGCACACAG:1 - chr3R 30661265 3' - 1731 488 1 71.23 TCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTAT:1 - chr3R 19537487 3' + hopper2 1540 1 61.38 AAATTCAAAATTAAAAACAAAAAAATTTTTTTTTCATAGTTCTTGGTGTCCTTTTCTTTACTCGAACATAGTAAAAACTCTATTGACCCAGGATACTTTTATATATCATGATTATATGCGTATAGACAGTCCGCTTTCCACATCCT:1 + chrX 2365677 3' + P-element 2648 1 81.51 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCC:1 - chrX 19498093 3' + P-element 2876 1 60.26 GACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGT:1 + chr3L 3979654 3' - opus 187 4 74.64 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAATATACATGTTACGTTACGCTTTCTGCTTCTCTGCTGCTTTGTTG:1 + chr3R 21570605 3' + mdg3 220 2 67.12 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATT:1 + chr2L 15965326 3' - blood 43 2 56.16 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAG:1 - chrX 15167670 3' - roo 74 2 73.29 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGACGCAACATGGGAGGCGGGCATGGGATTTCTGGGGG:1 - chrX 3524194 3' + roo 393 1 68.55 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCGCAGCCTTCGACGGGGTCACCAAATGGAG:1 - chr2R 7223602 3' - blood 7020 2 78.08 TACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAAGGACGTCGCCAGGG:1 + chr2R 2949176 3' - 17.6 6940 1 77.40 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAA:2 + chr2R 21380684 3' + roo 326 2 74.66 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTAAC:1 - chr2L 2357276 3' + P-element 2829 1 45.89 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGTTGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATAAAAATCACTAATTCATTT:1 + chr3R 30568927 3' + roo 9041 1 53.19 CACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATTTTAATGCGCGTAATTAGGAAAATTGCCAAAGTAGCTTAATAAATTTTTACATTTTAATTGCATT:1 + chrX 9890019 3' - jockey 399 1 55.48 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAAATCAAATTGATAAC:1 + chr2L 12142666 3' + hobo 2925 1 64.86 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTT:1 + chr3R 23507684 3' - 412 53 2 53.42 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGA:1 - chr3R 27835594 3' + 412 422 2 65.07 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAA:1 + chr2R 12703879 3' + blood 333 2 53.42 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTT:1 - chrX 14962202 3' - jockey 18 1 63.83 AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTC:1 - chrX 14692847 3' - Transpac 67 2 63.01 CAAGCTTTTATACTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGACACTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTAC:1 - chr3L 21484235 3' - INE-1 152 1 54.79 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAAAACACCGTTCATGCTGTGAGCGAAAAAGAGTGG:1 + chr2L 21237343 3' + P-element 2857 1 64.83 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAATATTTAA:2 - chr2R 16712945 3' + pogo 2053 1 53.42 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGAAAAGCTTAATGGCTAATTGA:1 - chr2L 14969879 3' + Tirant 8442 2 60.96 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATGGTGCATTTTATACATCCAGATGGACACAGTGGAAGCCGAGAAAAAGGCTTCCAATGGACCTGGCCTGGAAGAGGGCTC:1 + chrX 4589543 3' + Burdock 6354 2 60.27 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACAC:1 + chr2R 22255420 3' - roo 64 2 61.64 AATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAGTTAATAGTTATTACCTGTTTTTTACACAATTTGTTAATCATTTTTAATTGATTATTAAGGATTAAGTT:1 - chr3L 3482655 3' + X-element 4663 1 52.74 AATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCATCAGGAACTACGTAAAATTCAACTTTGCATGTCTATACCATCTA:1 + chr2L 22513384 3' - Stalker2 7324 2 69.18 TCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTT:1 + chrX 22858939 3' + mdg3 5425 2 67.12 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTT:1 + chrX 5222983 3' - 412 7089 2 60.96 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAG:1 + chrX 19231848 3' - mdg3 5305 2 53.42 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCG:1 - chrX 20552797 3' + roo 8993 2 70.55 GACGGGCAACCCATCCTCAATTTTTAGGAACCCCGGTTGGATCAAATTGGCATATACATCTGATCCCATAAATTTTAAAATAAATTAAAAAGTATTCTAAGACATTCTATTGTTAAGTGAATTCCGATTAGATACATCTCCTTTTA:1 - chr3R 10505369 3' - Max-element 8101 1 53.42 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAA:1 - chr2L 19424644 3' - Tirant 8162 2 54.11 GACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAA:1 - chr2R 10478691 3' + invader4 289 2 60.00 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGAGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTCAGGCACAAGGTGCTGCCTTTCCAAAAGAATG:1 - chr3R 14331132 3' - Burdock 6162 2 50.68 CAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAAC:1 + chr2R 21227452 3' + mdg3 5441 2 57.53 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAA:1 + chr2L 17069667 3' + 412 7507 2 58.90 GAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATGCAAACAATATTTAATTACTAATGGGCCG:1 + chr2R 14884374 3' - mdg3 30 2 62.41 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAAAAAATCCTTGCAACAAGG:1 - chrX 22824717 3' + jockey 4959 1 54.79 CACACACACACATGCTCACACACGTGCACAAACACCCGCACAACCCGCACACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTGTTTGTACACAGTTTGACTTTTATTATTTTATTTAAACTTCTTTTCCGCAGC:1 - chrX 9955438 3' + accord 190 2 61.36 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGCAAACCCACTTTGAGTCAGGAATTGTTGACTAAAGCCAAATACGGGGATTTCTGCTGATGAAGTGCATTT:1 - chr2L 9010413 3' - 1360 53 1 54.11 TCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGGCACTCTTTTTGCCATTGCCCAAGTACACGTCTGCAGCTACAGTTTCTGAAATTGATGAAGCCAGATTTATATTTTTTTTTGTTTTTTGTGTACTGAACAAATGTCAGACATACAT:1 + chrX 21381256 3' + G3 479 1 68.49 GTTACATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCAAAGTCCTGGTTGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTATTGATAAAACAAGAGAAAAAAACTACAAAGACGGCAGCAGGCAGTCGACTTTACCAATAAATCGAC:1 - chr2R 21044385 3' - baggins 5055 1 60.27 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGTGTTCCGAT:1 + chr2L 10032730 3' - hobo 72 1 67.12 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGG:1 - chr3L 4869132 3' + roo 390 2 67.74 AGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAA:1 - chr3L 21630338 3' - Burdock 83 2 76.03 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAAAAGCCGAAAAACTTTTCCCCGCTC:1 - chrX 12623100 3' + jockey 4959 1 56.16 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAA:1 + chr3L 14969281 3' - P-element 82 1 26.71 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGA:1 + chr3L 14969285 3' - P-element 78 1 29.45 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTAT:1 - chr3R 10467992 3' + opus 452 2 51.80 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTATACTATATTTTATTTAGATGAGCAAAATTTAGATGGAAAATTCATTCTTAAACTAGCCAAAAAACCGAAAAAAAGTGAAGTCATTTAATT:1 + chr2R 4564697 3' - flea 26 2 67.81 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAA:1 - chr3L 4710722 3' - Doc 66 1 57.53 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCAACTCC:1 + chr2R 18882715 3' + roo 395 1 75.34 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGTGCTCTATTTTATAAAAATGTTACGCTTATGATTTATGAGTAATCAACTAATGTAGGAGATATGT:2 - chr3L 16764763 3' - I-element 22 1 69.18 TAAATTAGTTCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAATTCGCGGTCGGCATTTATATCCTTCTCCGGCCGGGATGTCGCCACATTATCGTTTAGTATAAC:1 - chr3L 9342439 3' + HMS-Beagle2 427 1 55.34 ACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTT:1 + chr3R 20137334 3' + Burdock 6314 2 76.71 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGG:1 + chr2L 14222366 3' + Transpac 267 2 56.85 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGG:1 - chrX 7467950 3' + hopper2 1528 1 70.55 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGATGTATTCGT:1 + chr3R 8542710 3' - roo 8691 2 60.96 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGTAAGTTCTTTA:1 - chr3R 10498813 3' - 297 6635 2 65.60 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAAATTATTACATTAAGCCTATTGATAAATCAATCCGGAAAATCCGTACTGCGCATGAGAAAACCCCCTAGGAACGCTGAAGCACT:1 - chr3R 15649742 3' + blood 340 2 62.33 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTGGAGATGAAAAGGGTTGCGGATCCACATTCACGCGGGGACACCGGAAGAATTAGACGGCAGGTAGGGGGTCGGAAAATTATAGTATAGACACCATCGGATATCCTCCGC:1 - chr2R 6052539 3' - mdg1 7047 2 79.58 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGA:1 + chr2R 22255411 3' - roo 8737 2 67.81 CAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGT:1 + chrX 21667919 3' - gypsy2 87 2 74.66 CTTTAAGAACAGCAGAGAGTCAAGATTACAGAGACATAGGATAGAGTAGAATTAAGTCAATCATAGTCAGAACATAATGCTCTGTAGGGGCCATGCAATTTGGGTTTTTAATTAAAAAAATTTCGGTGTTTCATTTTGTTTTGAAC:1 + chr3L 14579502 3' - Cr1a 4240 1 67.12 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGCTCGAGCAGCGAAACCGAGG:1 - chr3L 131759 3' + P-element 2796 1 17.39 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGGGAAGCGACGTC:1 + chrX 17258315 3' - 297 47 2 55.40 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTCATTTGGGATTTTACACATATAATGATACAATGTTTGTTGAGTAAACCTGATATACAATTTATGATAAAATATTTGCTTAGCC:1 - chr3L 3762211 3' + roo 350 2 57.53 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATAACCCGTTTCAACCCCCAATGATCAAAATCACT:1 + chr3L 21387558 3' - pogo 29 1 65.75 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTCAGTGT:1 + chr3R 9938738 3' + roo 9055 2 74.66 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACA:1 - chr2R 20913102 3' - 1360 49 1 51.05 GACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAA:1 + chrX 8200304 3' - flea 4807 2 55.48 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAA:1 + chr2R 21897981 3' - 412 7108 2 55.86 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCC:1 - chrX 18193677 3' - hopper 23 1 65.71 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGTTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGAC:1 + chr3L 13597854 3' + blood 7336 1 54.11 TAAAAACGTATTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTACAGTTGATAATTGAATACATCGCTTAAAAAGTGGTCGCACGTTAGATAAGGATTTTTATGTTTTGGGTTTTTCAGCTAATTAAACCAAATTATTAAATATGAACG:1 + chr2L 17451516 3' - F-element 23 1 78.77 GACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACAGGTGAA:2 + chr2L 6074136 3' - BS 9 1 74.66 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATT:1 - chr2R 15080006 3' - roo 56 2 57.93 GAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGATTAGTTACCTGCAGTTTATTGCGCATATCGTAGACGAACT:1 - chr3L 14042328 3' - Ivk 5188 1 71.92 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCCCAGCACACACGCACACGCATACACACCCACACA:1 + chrX 14575491 3' - hobo 50 1 52.05 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGG:1 - chr3R 14049323 3' - transib2 53 1 54.11 AGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCG:1 + chr2L 6074058 3' - BS 75 1 75.17 AACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTATGATGGTTGTTACACGATTTCTAGGGTTTTCATACTAGAAGGACATTAAATCATGTATAAAGTCGCATTTTAATTACTTACGCTAA:1 + chr3L 18297074 3' - Juan 4058 1 78.08 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTAAACATTAAATGCTAAGTACTTTTTTATGTTTTTGAATGGATCTCAACTTTGTACATACTT:3 - chr3L 13313139 3' + roo 9014 2 60.96 TTTCACTAAATGATTACAATCTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTTTCTTCTTTCCATATATTGTCTGAACGCTCTTTGTATTATTAGAGCTGCATTTGACTTTTCTACGAGATCATCCTTTA:1 + chr3R 10796253 3' - Idefix 7344 2 58.22 ACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTACAAAGGAAAAATGTA:1 + chr2R 5924451 3' + jockey 4725 1 47.26 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATGTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTG:1 + chr2L 6406566 3' + transib2 2758 1 68.28 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACGTTTGAATCGTGTAATTCATATTTTGCACGCCTGGTTTGGATATTCAGATAGTATCCACAGAATATATTA:1 - chr3R 21373714 3' - 297 47 2 51.03 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTTGATTTGAGTTATGCGACAACGTTTCAAATATGTAATACTTTAAAGCAAAACATTGATTTTCAATATTCAAGAGCCAA:1 + chrX 6398896 3' - blood 7050 2 56.16 GGAGCAGCCACCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACAACAGTATCGCAAGACGGTGCGATTTATCTTTAGTTAATTTATATGTATATGTATATGTATGTATGTATACAAATTAACAGACAACAATTTTATG:1 - chr2L 21635746 3' + Gypsy6A_LTR 332 1 64.58 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATAACTTTCCCCAGGCTAACCTTTTCAACCAATTGATTATCGGCTAAAAAC:1 - chr3L 15890956 3' - mdg3 5263 1 65.75 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATG:1 + chr3R 21237803 3' - Doc 78 1 66.44 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATTGCGCATACGCGCCATCTAGCGGCGG:1 + chrX 21605782 3' - P-element 52 1 47.86 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCAAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATT:1 + chr3L 13722120 3' - blood 7071 2 58.90 CCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCAAATAGAAATTATGCATTCCAGAATGTTTACAAACAGCATGC:1 + chr2L 15153364 3' + G6 1985 1 56.16 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAGTTATTACCAGCTCATAG:1 - chr3R 11096677 3' - copia 61 2 60.96 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATC:2 + chr2R 18123526 3' - pogo 51 1 52.74 TTTGAAGGACCACCTTTTTTTCTCTCCGGCAGCACCGATTTGTCACGAAGATCAGGACAGCAATCATCATTATGAGACAATATATGTCCACTGTGCTGCCGTGTGTTTGATTACACGGCACGCATAATTGAGGTGCTC:1 + chr3L 2923427 3' - HMS-Beagle2 6730 1 52.17 TGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGA:1 + chr3L 15322039 3' - Transpac 5004 2 76.71 TAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCGGTATGAATTTTGAGATAGGAATTTGAATTTGAAGAGCGGAAACTGAAGTGGAAGCGTCAACGGAAACGGAAACATCGACGGAAGCGGAAGTGCAAGTAAA:1 + chrX 13062652 3' - mdg3 5134 1 74.66 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCCCTCCTCTGGCTGCCAACCTACCTAC:1 - chr2L 18163761 3' + HMS-Beagle 6999 2 59.68 TCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAAACATTGGCGGTCATCTTTTTTT:1 + chrX 10960308 3' + Transpac 5181 2 53.15 AGTACAGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCTCAACTGGGCGATCGGATCGCTCGGGCAATGAGTTTTAACGCCC:1 - chr2L 10032660 3' + hobo 2903 1 53.85 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAG:1 - chr2R 22255325 3' + roo 344 2 60.96 ACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAA:1 - chr3L 15321969 3' + Transpac 5164 2 64.08 GCAAATGGCTGTGAAGTCAACAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTAAAAATGCGCACCGTGTTTTTTGGTTGTGTAAATTTGAAATTTGTCAGCGTCCATGGTTAAGCCAAAGCCCTGGCCTAAAATTTCACGACCAATTAGTACGTC:1 + chr3R 1166837 3' - baggins 5152 1 56.85 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGG:1 + chr2R 7404777 3' + blood 334 2 51.45 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGGACACGATATTTAT:1 + chr3R 27971151 3' - mdg1 7064 2 68.49 CAAAGCGAACGGTCGTTTTTTTTTTGCTCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAATCAGCCGTAGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTACTGCCGTCTCCTATTTTCTCCCTTTCTCTCTCTCTTATTCGTTCCCTCTGTATGTGT:1 + chr3R 14098788 3' + Cr1a 9 1 56.16 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAG:1 + chr2R 5237908 3' - Doc 70 1 42.47 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAAT:1 - chr3R 9938574 3' - roo 32 2 64.71 TTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATCTAAAAACGTCGCAGTGTGTGACACATACACACTGAAAACAAATGACCAT:1 - chr3R 21521326 3' - Bari1 73 1 67.81 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATATCTGCTTTCGTTGAGCCTAACTGCGCGAACTTATAAATATCTATTTAAAATAAAGTAA:1 + chr2R 20704278 3' - hobo 14 1 69.18 TCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACATTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTTATCCTTATATCTAACATCAATTCAAAATGAAATCGGAACCATGTCAGGC:1 + chrX 2493994 3' + 17.6 7159 2 65.28 AAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAATGAAGAAATAATATGGATGAGATGAGATTTTTTTTTAGATGAGAATAGACTTTGGTA:1 + chr3R 5509260 3' + invader4 219 2 76.03 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGGAGTACGATTTTCAAGAAAC:1 - chrX 7525042 3' + I-element 5302 1 53.42 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATT:1 - chrX 19231726 3' + mdg3 198 2 52.74 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTGTTCTTTTGTTTGTTGCTGGTTGTCTAATTAATCATTTTAACTGGTTATCAGTCCAATTTTTGTTTTCTTAATTTCCACTAGCTACACTATTTTCGATTTCCTT:1 + chr2L 14359183 3' - pogo 17 1 65.75 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGAACAAAAGGAATTCCCAAGCAAAATATATTGTCAAACAATTTCAGAGAACTTTTTA:1 - chr3R 22289376 3' + 412 7482 2 60.96 ATGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTA:1 + chr3R 20368054 3' - Max-element 90 2 76.03 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAATCATATGTACTAGTGGGT:1 + chrX 2873464 3' + roo 9020 2 53.10 TAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGTTAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTG:1 + chr3L 8253741 3' - jockey 4666 1 52.00 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAA:1 + chr2L 13547020 3' - P-element 99 1 14.89 TACAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATT:1 - chrX 292442 3' + G3 4492 1 76.03 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAAAAATGGGGCGGAGTGTGGCCAGCTGAATC:1 - chr3R 4659527 3' - P-element 66 1 40.00 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAGTCTAGAGGGGTTTTTTGCCTTTACAAAGAGCCATATTAAAAGCATAAATAAATTTGA:1 - chr3R 13544030 3' + 1360 3328 1 60.27 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCATCTCCTT:1 - chr2R 17986237 3' - 297 22 2 66.13 ATTTTTGATCAGGATCAATAGCTAATTCGATCTTGTCATGTCCGTATGCCTGTATGAACGTCGAGATCTTCGGAACTACATAAGCTACGCTGCGCATGTTTGTTGGCCCATGTTTCCACAGCGTTTTTAGTGATCTCGCTGGTACC:1 + chr3L 24790825 3' + INE-1 86 1 80.14 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTTTTCGGCCACAAATAATTAATGGGTTAATGGGC:1 + chrX 18034697 3' + Juan 4168 1 51.37 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCG:1 - chr2R 9164837 3' + 412 7484 2 59.59 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAAACCTCGGAGGTG:1 - chr2L 8397110 3' + roo 389 2 70.14 GCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTG:1 + chrX 8272488 3' - roo 8757 2 82.88 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGCGTATTTGTTGTTAATTTTTCAACAATTGCCTTTGATTTTTTGAGAAAATCAT:1 - chr3R 8022134 3' - roo 8731 2 68.49 GTTACGGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAACTTCCTCGTTGGAAAAAGATCTCTTCAAATTGAAAGGGGGAGCTC:1 + chrX 15571941 3' - McClintock 6165 2 67.81 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATGTATGCCGCCTGCGCGTACTCTCTTTCTCG:1 + chrX 14385269 3' + blood 333 2 54.79 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATTTGATAATTAGCAGTTATTATTTATGAAATATAGAAATTCTAGTTACC:1 + chr3L 19279208 3' - opus 176 4 70.00 CACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTAATTACATATGTATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTAT:1 - chr3L 23456275 3' + Gypsy6A_LTR 260 1 70.80 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCACAGCGTA:1 - chrX 16853319 3' - roo 55 2 56.16 GACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTGCAGGTTTACTGGAGCGTTTTAAGGGACGTAGGGCT:1 - chr3L 6905519 3' + 1360 213 1 74.66 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCAATTTATGGCATAAATC:1 - chr2R 13276430 3' - roo 24 2 69.86 AAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGGATTCTGAGAATTATCACTGGAGACCATACGCTTGCTCGAACCGTCAAATGCCACTTATTAAAAGGCTATGAACTTGCTGATTAATCGATTCGGTAACAAAGTTT:1 - chr2R 4942101 3' + Doc 4327 1 63.83 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAACAATTTGTACATTGAGGTCTATCCTGT:1 - chr3L 19396987 3' - F-element 35 1 65.07 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTC:2 - chr3L 9430604 3' + P-element 2788 1 20.55 CTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCGTAACAAACTCAATATTTTATTATTCTCTTCGTTATTA:1 - chr2R 15392727 3' + blood 7305 2 77.40 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTGGGATTTTTGCG:1 - chr3R 25753593 3' - hobo 31 1 64.34 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCCTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTTTAACTTTCTTTTGTTTGGCCACATTT:1 - chrX 9951344 3' - hobo 50 1 51.03 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGTATGTTCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAAA:1 - chrX 23283146 3' + roo 8997 2 70.14 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACATTTACGA:1 + chrX 14908485 3' - blood 50 2 51.37 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGCATCTGTATTAGGCA:1 + chr3R 18846658 3' + roo 405 1 78.77 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAA:1 + chr3R 13358724 3' - mdg3 5280 2 67.12 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAATATTTTATTGGAT:1 - chrX 11228513 3' + roo 388 2 71.92 AAATTTGTAATTGCAAAACACGCAAATGCAAACCAGGGAATATAAATCAACCCACTCCACCGCCAACCACAGATCCATTCAAGGTTGTTGGAGTTAGGGTGCTTATGGCGCTGCTACTGCCAAGTGGCTGCGGTGAGCTGTTCTTC:1 - chr3L 8093133 3' - frogger 228 1 66.44 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCA:1 + chr3L 18920494 3' - Juan 54 1 50.68 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCG:1 + chr2L 17069665 3' + 412 7511 2 60.00 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATTGAGCTCCAGCGAGCGGCGGCTAAAAAACTTTGGCTGCCTTCCGCGAGGCGCCTGGAAGTA:1 - chr3R 15030680 3' + jockey 4931 1 61.64 CCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATCTAAAAACGTCGCAGTGTGTGACACATACACACTGAAAACAAATGACCATTTTCAGGAAGTCGATCAATTGCTCATTTTAAGCGTATGATACATCCA:2 - chr3R 21521279 3' - Bari1 26 1 67.12 CTCGACGTTCATACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGAATATCAAGAACATACAGCTGTGATCATAAAAATAGCAGTGCTTGGGACCTGCAAGTTTAAGATCACAGCTGTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTC:1 + chr2L 22036462 3' - INE-1 129 1 76.71 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCTCGAGCT:1 - chr2R 982287 3' - HMS-Beagle 31 2 64.38 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAG:1 + chr3L 15261363 3' + pogo 2041 1 60.27 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATGCGCAT:1 - chr2L 8392991 3' + I-element 5273 1 73.29 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATA:1 + chrX 21213362 3' - Doc 92 1 76.55 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTAT:1 + chr2L 10832358 3' - Doc 49 1 54.79 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCCCATACATATGCAATAGCCGAGATGCATATGCATGTGTGTGCGTGT:1 + chrX 7468021 3' - hopper 72 1 67.81 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCA:1 - chr3L 9430602 3' + P-element 2790 1 21.92 CAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCAATCGCTTATTTGCCTATGCAAATTGTTGTGCATT:1 - chrX 6938162 3' + hopper 1333 1 72.60 GCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGCCGGCAA:1 + chr3R 30731532 3' - gypsy6 6 2 79.31 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAAGTTGCAAGGAGCGGAACA:1 - chr2R 14385542 3' - jockey 36 1 62.96 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAGTTCTCATGGCGGCCCCCGGTGCGTATGAGCAATGTGAAATGTAAGCCAGTTTGCGGCACATTTG:1 - chrX 9525299 3' + hobo 2921 1 64.22 TATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAATCAATTAACTTTCGAGTCTTTTCGAGGAGGCTATGTGTGTCCCCTTGACAAGTTGTGGAGCATACTTTACG:1 - chr2R 6983242 3' - Juan 3918 1 52.74 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATAAATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATAACAGAATTTAAATTAAACTATTTATATTTTTTATGA:1 + chr2L 5771479 3' + Juan 4129 1 76.03 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATTGCGCATACGCGCCATCTAGCGGCG:1 + chrX 21605781 3' - P-element 59 1 45.21 CCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGACATCCGACTGTGCGCCCTGCCGCCCTCCAACTGCCGCCCTCCGCCTGCCTGGCAAATTACCATCAAAAGCTGAATGCG:1 - chr3R 25082997 3' + G2 245 1 53.42 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTGGTAGGACGTGGTCTG:1 + chr2L 6406581 3' + transib2 2778 1 56.43 CATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCACACAGGCAAGGGAAAGCCAAGACCTTCACTAG:1 + chr2L 17198114 3' + R1A1-element 5249 1 77.40 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCGGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTATAACCGACATAAAAGCCGCTTTTATTGAGGTAAAATGTTGGACTACAAATTGAGCAGC:1 + chr2L 9010550 3' + 1360 3358 1 65.07 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCA:1 + chr2R 18882710 3' + roo 390 2 71.92 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTGCATTATAAAAAAGCTCACCATTAGCAAAAGTGACAAAACAACCA:1 - chr2L 17228571 3' - mdg3 20 2 72.60 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGAAATCTAGAT:1 + chr3L 19146698 3' + pogo 2051 1 51.37 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTATAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCATTGTAT:1 - chr3L 5263316 3' - pogo 20 1 67.12 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCC:1 + chr2L 4104081 3' - roo 8742 2 71.23 CCGAATGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTTTATTTTATTTTTGAAGCGCAAGGTTATGCCCACTTGGAAGACAATGGACTTGG:1 - chr2R 9239572 3' + Circe 7183 1 60.27 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATC:1 + chr3R 15649849 3' - blood 79 2 70.55 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCTAAATCGTCAGGGTCAGCGGTTAGCGGGCAAAGTGGACGTGAGTTCAAACATTTGCATATTTTTTCAACGTTCACGGAAAACGTAAATCCACCAATCGTGC:1 + chr2R 6714776 3' - pogo 18 1 39.04 TGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCC:1 - chr3R 27503024 3' - hobo 61 1 60.96 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAA:1 + chr2R 24338450 3' - 1360 65 1 63.01 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCACGATGCTTTGGATATTCAAATGTTCTTTAAGAAACTGTGACAAATGTCGCTGATGTTGCGAACCGC:1 - chr3R 15974708 3' - P-element 64 1 41.78 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAAT:1 - chr3R 26315896 3' + roo 342 2 61.64 CTCTTCGCTCTCTCGCTCTCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCTAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACCATGTTGGAGTTCAAATAGAACAAATTCATTGGTCAGAAC:1 + chr3L 26569837 3' - 1360 105 1 72.60 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCAC:1 - chrX 3524244 3' + roo 8984 2 79.45 CTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTG:1 + chr3L 12030575 3' - I-element 5243 1 73.29 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTGTATAACTGTATAGAACTATAGAGATTTACAGG:1 - chr2R 8862008 3' - pogo 33 1 60.27 TTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGTGGCGACGAAAAAGTTACGCCGGCGGGAGTTCATTTTATGG:1 + chrX 6938244 3' - hopper 29 1 50.86 GTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAAC:1 - chr2L 15153220 3' - G-element 28 1 59.59 AAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAAGATCTAATA:1 - chr3L 24153121 3' + Tabor 7314 2 78.08 ATGCAAATCATGGTTAGATCTACAATGATTTAAGATTAGGGGTATGTAATTTCAAGTGAATCTGCTTTAGTATAGCATTTTACTCTACGAATAAATGATATAAGAAGGACAACACAGAACACTATCCAAGACCCCGGTCGAGCCAC:1 - chr3R 4484118 3' - Cr1a 4159 1 56.16 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCTTACTACCAGAGCTCCATAAAAAGTCTAAAATATGCTCGACAAACGCATTGCC:1 - chr3L 22481180 3' + roo 396 1 78.08 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCTCATTGGCAGATGGGGATGGCTTCGGTACCG:1 - chr3R 14096998 3' - transib2 31 1 59.59 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAA:2 + chr3L 9242074 3' + roo 331 2 69.18 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTA:1 - chr3L 4710719 3' - Doc 63 1 55.48 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACATTGTCAATAGAATACAGCTAGAACCCGAAACCGAATCGAAACAGGAATAAATCCGGCTTAAGGCCACAACAAATC:1 - chr3R 30568784 3' - roo 35 2 55.47 ATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGATTCTTGGCCGTGATCTTCACGATGCTAGCCAGCGGGCGACGCACCATTATCTGCGCC:1 - chr2L 1131743 3' - roo 340 2 60.96 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACC:2 - chr2R 8793873 3' - Transpac 51 2 53.42 GGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTCTTTTAATTTAATTTATTACTTAGAAATACCTAAAATCTCAAAATCACTTTCTGAAGTAGGTGTGTTTTGGTGATTGTTAAGCAA:1 + chr3R 7649908 3' - Quasimodo 30 2 60.96 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCA:1 + chr3L 13597859 3' + blood 329 2 52.05 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGGCCCGCACTCACTCACACACACATACACACACACACACACACAAAAGGGAGCAGGATTACAGCTCTGCTTTTGCCC:1 - chr2L 20561332 3' + P-element 2884 2 79.72 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTGCTGCAGATGCACCTGATGCCCCTGGC:1 - chr2L 8103450 3' + pogo 2097 1 76.03 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACTACAAAAGTAT:1 - chr3L 5183656 3' - copia 4890 2 71.23 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAG:1 + chr2R 5900934 3' + Bari1 1657 1 54.93 GCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACAACTACAAACAAACAACTGGCAGAATAATAATATAGA:1 + chr2L 15834175 3' - hobo 2708 1 60.77 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATACAAG:1 - chr2R 20500018 3' + 412 7506 2 56.16 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGGGCAAGAGCGCAGATGTGGCTTTTTTGCTTTGCAGACATAATAATCCTGGCAAGACCCGTTCTTTGTAAGCATCACTCCATCCTTCTTGCCAGCACACATTTTGTCAAGGGT:1 + chr3L 11952839 3' - jockey 4746 1 71.23 CAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAA:1 - chr2R 14553239 3' + mdg3 5441 2 62.22 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTGCATGGATTCCCATTTCCCATCCTTCTGA:1 + chrX 8272516 3' - roo 65 2 63.70 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACAGCCACATCAGCAACCAAAATGCATAGCATACTTTGCTGGGCATTAAGTAGTTGAGTTTTTGAAGGGACGCACTATAAGCTG:1 - chr3R 25508436 3' + hobo 2900 1 54.86 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTACTGTCAGCGAAGACAAATG:1 - chr3L 5514151 3' - Doc 39 1 60.96 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCGTTGGCTTGCCACATAGAGATG:1 + chr3L 9426741 3' - P-element 63 1 28.57 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGAAAAGCGTAATGGCTAATTGAGCTG:1 - chr2L 14969875 3' + Tirant 355 2 53.08 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCACACTGTAACAGCAAAGACGAGATGA:1 - chr2L 19424633 3' - Tirant 8150 2 55.86 GACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCA:1 - chr2R 5848985 3' + mdg1 7435 2 59.52 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGTGAATAGACTATTTCAGGAAACTAAACTATCTTT:1 + chr2R 9332198 3' - roo 86 2 78.08 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTC:1 + chrX 983242 3' - 412 41 2 58.90 GGTCATGTTGTTAGAAACATAAGTAATATTAAAAGCCGTGCGACCAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGAACCTAACATATACATATATATTATAAGTTTGATTATATTTATTTGATCTTATCCATAACAGTGATG:1 - chr3L 21275756 3' + G4 452 1 58.90 TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAATTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTT:1 - chr3L 3979593 3' + opus 7423 2 73.43 AAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTGTGTGTGTATATGTGTGGGGCAGCTGAGCGTGTGTGCGTGCAAGTGTGCGAGAGTTTAAGCTTAAAGCTATTGTACACTTGGTG:1 - chr2R 22676848 3' + roo 29 2 58.22 TTATTATTAATTATAATTATTATTATTAATTTGTAGTAGATCAACGGATACTGTATACAGCTCAATCCAATTTCATTTTAAATTTCAAAGAGTTTCAAGTTTATCAACAGTAAATAATAATGCTACGGTAAGATTTAGGATTGTCC:1 - chr3R 31611832 3' - gypsy9 5310 2 75.34 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGCTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTT:1 - chr2R 20500080 3' + 412 443 2 79.79 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGACGCAACATG:1 - chrX 3524220 3' + roo 386 2 58.10 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTAGGCTCTCACTGGATTCTAG:1 + chr2L 5648535 3' - Burdock 14 2 73.38 GCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGGAAAACTGTGGGCTGCAAAAGTCTGCCTCGGGTGTAGTAATA:1 - chr2L 17197997 3' - R1A1-element 5010 1 78.77 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCG:1 + chr3L 14581492 3' - pogo 16 1 66.96 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAAGAAGAGAGTTAAGAAGATTCAACGTCG:1 - chr3R 5086968 3' - P-element 19 1 71.72 CAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCC:1 - chr3R 6068303 3' - jockey 4760 1 81.51 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCGTCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGGATGGCTGATA:1 - chr3R 9563587 3' - P-element 53 1 47.95 TAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCCCATACATATGCAATAGCCGAGATGCATATGCATGTGTGTGCGTGTGTT:1 - chr3R 13536116 3' - hopper 69 1 65.75 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAA:1 - chr3L 15371273 3' - Transpac 45 2 55.48 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAG:1 + chr2L 15920171 3' - jockey 75 1 63.01 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGTTAAGTTTCGCAAGCCG:2 - chr2L 7991234 3' - 297 6602 2 71.92 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTAAAAACGGAAAGAGATAGCTACATGTCTGGGGAGTGAG:1 - chrX 9407700 3' - Tirant 39 2 72.59 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCAACTGAGTCTTGAAATGGATTCATTGCCTTTAACGAGAGGCGACAA:1 + chr2R 9164986 3' - 412 12 2 76.03 TGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCATAACATTTATTTAGTAATTAAAGCTATTCTTCCCCATCATCGTAATCGC:1 - chr3R 14899558 3' + flea 4782 2 66.44 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGTTGGAATTTTTTTGTGGCTCTGCTATATGTTTATTTTTACCC:1 - chrX 18149763 3' + hobo 2909 1 62.33 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAAT:1 + chr2L 17162854 3' + blood 307 2 65.07 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAAT:1 - chr3L 5263368 3' - pogo 53 1 66.41 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGACGATCAATGCAAGTGAAAAACGGAGCAACGCAGAGATCATCGAGGCATTGGAACACAAGGACCTGGCGTGGTCATTTTCCATGCCGTTTACTTTCATACCTGCCGCATTGATTCCATTAAC:1 + chr3R 22826126 3' - roo 8664 1 67.81 ACTATCTGTATCTATATATATTTACAAAAAAAAAAAGTTATTTCTTTTCTTTATTATCAACTATAAGTCTATAGTTATTTTGCTCAGTGCTCTTTAAAAGACGTGGTAACTACTGTGACAAGAAAGCCGCCTGGGGCCAAAGAACT:1 - chr2R 12698880 3' + 1731 4410 1 52.74 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATATAGTAGGGTGATCCTTTGCTACGAA:1 - chr3R 27786543 3' + Tirant 8454 2 55.48 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGC:1 + chr3R 9163941 3' - hobo 66 1 66.67 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGG:1 + chr3L 16973488 3' + S-element 1679 2 60.96 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAATATAAAGAACGGGGTTTATTGTTCGTTAGGTGTTACCTACTTTTAGG:1 - chr3L 11953784 3' + jockey 4921 1 69.86 TCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATCTTGTAACAGGAAAGTAGTCCATTTTTTAGGTAATTTCATAAAACTTTAGGCGAGCAAA:1 - chr3R 6827922 3' - flea 4816 1 60.00 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACT:2 - chr3R 9345568 3' - pogo 62 1 63.70 GTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTTTTGCTTACGATATTTGACAATAATTTTCTTAGGTATATTTTTA:1 - chr3L 23697995 3' + Idefix 7230 2 69.86 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCC:1 - chr3R 26399815 3' + roo 8984 2 78.77 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTAATTGCGTTAATCCAGCTATCTAGTAACCGGTTATCTAACATCCCTTGGCACATCCTCTCTTCACTCCCTTGGTATAACCATATCAGTATCT:1 - chr2L 18237060 3' - F-element 4462 1 63.70 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTG:1 + chrX 19231821 3' - mdg3 5332 2 71.92 GTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACA:1 + chr2L 5648500 3' - Burdock 6192 2 62.33 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTC:1 - chrX 17258195 3' + 297 344 2 53.42 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAAAGTTGCT:1 - chrX 17614344 3' + roo 9044 1 66.21 ATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCATGTACAAAACCGCCCCATAAAATGAGACCCTGTTACAACGCCTC:1 - chrX 3675693 3' - R2-element 3248 1 63.64 CCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCATTTAATTTGGCTTAAAAATGCATACTATTAAAAAGCGTTTGCT:1 - chr4 1186250 3' + G2 388 1 70.55 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGCAATTAATTT:1 - chr2R 11379710 3' - jockey 65 1 53.42 TGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCA:1 + chr3R 10778746 3' + mdg3 184 2 60.27 GTGAAGTATACTTTGTTCCGCTGCGAAGAGGGTTTGCGCTCATCTTGGTCTTTTCGCCGCCGAGCGCGCAATTCGTTGGCTCATTTTAGAACGATCGATTCGTTCGTTGTCTATCTGTATTTTTTTTTTAGTTTTACTTTATTAT:1 - chr3R 836741 3' - Doc3-element 285 1 80.00 TGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGG:1 - chr2R 14553264 3' + mdg3 5433 2 77.97 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCCAGCGAGGAACTA:1 + chr3R 10079428 3' + P-element 2864 1 68.28 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTAT:1 - chrX 22858812 3' - mdg3 22 2 71.72 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTAGCAAGTTGTCTAAACTAAAC:1 + chrX 21205107 3' - 1360 35 1 60.27 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACAAAAAATTGCAATGTAAACTTTCATCTTCATAAACCAACATTTAATCACAGCTAATTTGT:1 + chr2R 10552511 3' + S-element 1706 1 67.81 AATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAA:1 - chrX 292428 3' + G3 4506 1 66.44 AGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGTAATAACATTTTATTTAACCAACTCAAATATCTTTCTCTGTTACAT:1 + chr3L 23597292 3' - invader4 3 2 68.49 AAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCAAAGTGTTTCG:1 + chr3L 18920504 3' - Juan 44 1 55.48 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAAGCA:1 - chrX 8502171 3' + pogo 2035 1 65.75 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGCGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGATCTG:1 - chr2L 19424629 3' - Tirant 8122 2 70.25 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACACTTAGAAAACACAAAACACCACGCGAACGAATATCAAAATATTGTAATAAAAAATATTTTTATAAACCCCAAGATAGAAGAGCGGGGG:1 - chrX 10538092 3' - pogo 30 1 66.44 TTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTGTGATTGGCCTAAAAAATATGTTTCAACGGAAAAAAGC:2 - chr2L 15142192 3' - BS 4717 1 74.66 AGCCTTTAATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAATAGTAAAATCAATCTCTTCTACCAATTAAAAGCTTGCAAATTATCAACTTAAAGTAAATCAAATGTTTCGA:1 + chr2R 10839386 3' - G2 3054 1 51.37 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAAATTATAATTGAATTCAATAAA:1 - chr2L 1449561 3' - opus 145 4 61.81 GTAAAACGCCAGTTAGCCAGCCAATTCTTCACAACAGTTAGGTGACCTGCCAGGTGCACTGATGCTTGCAGAGGTACATATATTGTTTGACAATCTTCTACCAAGGTGTATGTTAAATTTCTCAATGTTTCCATACAAATTTAGCG:1 + chrX 13712609 3' - Doc4-element 2303 1 50.68 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTA:1 - chr3R 9482036 3' - roo 8751 2 78.77 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAGTTCCTATGTTAATATATAAATACAAAAAAAGTAATGAAATCAAAATAAGAAAATGTTTACAACTTAATTTCCCTAAACACTAATCAATAATGA:1 + chr2R 969268 3' + mdg1 397 2 71.23 AAAAACAAAACCGAATTGATTTTCTTAATTGACTGAACAGTTTCAACAGAAGCCAGACCCCAAAGCCAGCCAAAGCAAAAATCCAAACTCCAAGATAAAGTCATTTAAAAAGGGGCATTTAAAATAAATGGTCTTTTATT:1 + chr3R 30870947 3' + McClintock 6286 2 64.29 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAACCGGTCAATCGATTGGTTAGGGATGGGAGTCTTAAAGAGTGCCAGTTCCAATAT:1 + chr3L 9426807 3' - P-element 24 1 69.86 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCCTTAATAGCTACCAGAATATCAACAAATTGCTTCGAGTCGATGGGAGCGTTGTGGGAGGAGCATTGGGGGATGGGGATTTCAGGCAGGGCGCAATGAATAATCATCGAGCGAC:1 - chr2R 19985639 3' + copia 250 1 81.12 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCC:1 + chr2R 6585512 3' + pogo 2033 1 67.12 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCA:1 + chr3L 16887408 3' + roo 9031 1 52.00 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGC:1 - chr3L 4639088 3' + roo 326 2 76.03 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACAC:1 + chr3L 3540217 3' - mdg3 5301 2 57.93 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTG:1 - chr2R 21227339 3' - mdg3 53 2 53.42 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGA:1 + chr3R 20292538 3' - pogo 48 1 53.42 ATGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACATTAATAAATATAATACCCTTACTAGCTTATAAAAGTAATTATTTTAAGTTTGGTTTTTAAATAATTTTCT:1 - chr2R 7097935 3' - copia 52 2 54.11 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGATGTTACTGCATTTAAATTTGCATACAAATTATTGTAGCATTCTTCATAGCATTA:1 - chrX 14908379 3' + blood 7322 1 62.33 AATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGAGCT:1 + chr2R 14793535 3' + Dm88 8 2 84.93 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAA:1 - chr2R 5214959 3' - F-element 76 1 62.33 GGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAA:3 + chr3L 3540250 3' - mdg3 31 2 63.01 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATG:2 - chr2L 7459561 3' - BS 5066 1 64.38 TGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTATAGCCGTCGAAATCGTAATCTCAATTCGTC:1 + chr2L 15142310 3' + BS 5023 1 77.78 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCACGCAAGCACATAATTCCCCGCTCGGACGTGATT:1 + chr3R 4659645 3' + P-element 2853 1 62.76 AGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 243 2 80.00 TATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATTATTATTACTATTTTTGC:1 + chr2R 9867201 3' + roo 9025 2 52.74 ATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCATGAAGAATGCATCTGTTGAATTGCAGCTCCACCTGCTCCTGCCAGCCGTTCTATCCTGCCTGCT:1 - chr3R 5549725 3' - Rt1b 5048 1 56.94 GTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCG:1 - chr2L 17638716 3' + blood 7301 2 76.71 GAGAGTAAACAAAACATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACAATATGGTCATTTAATAGTAATGTGTTATATTAATAATTTCTTTTAGTA:1 - chr3L 24791844 3' - Cr1a 203 1 41.78 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAAGAGAGCCAGATAACGCGTGTGGTTTTCCGAGAG:1 + chr3L 13227734 3' - hobo 28 1 64.75 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGCACGCCCTCAACACAAAGTGAAAGTGGAAA:1 + chr3R 5765452 3' - opus 7157 4 57.53 CATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGACACTTCTGCCCGGAATACATTTTTCCGTCTTAATCGCTGAGTTCTTTGAGGAATCGATAATTCCAGCTGAGATTTCTTA:1 - chr3R 17678939 3' - Doc 4277 1 54.11 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACACATTTCCAATTTATACACACCCCTACCTCCCTTTATCAGCCACCAAAATCGTAGACCCCCTTGATCGAATCGAAAAGCGAAAAATAAAATATCTTC:1 + chr3R 28008368 3' + hobo 2919 1 65.75 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTT:1 + chr2R 6984436 3' + HMS-Beagle2 7160 2 61.64 AATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTGAAAAAAAAAGATGGTTGCTCTGAATGCCCGCTAAAACTTCCTTTTGGTTGTGATAAGGAAGCAGACTCTCGGTTCTTAATCATACGTTGAT:1 - chr2R 5149035 3' + Doc2-element 4726 1 71.92 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCCCGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCAATCTA:1 - chr3R 10288782 3' + copia 5080 2 53.42 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTGGAGATGAAAAGGGTTGCGGATCCACATTCACGCGGGGACACCGGAAGAATTAGACGGCAGGTAGGGGGTCGGAAAATTATAGTATAGACACC:1 - chr2R 6052555 3' - mdg1 29 2 66.44 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATT:3 + chrX 19231820 3' - mdg3 5333 2 72.60 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCG:1 - chr2L 16685332 3' - P-element 90 1 24.66 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATG:1 + chr3L 21093227 3' - Ivk 65 1 63.64 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGG:2 - chr3R 19537445 3' + hopper 1388 1 67.12 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGCATCTAATTATGTATACATTTGTGTAAATTGTACTTGGCTCACTT:1 - chrX 15318804 3' - S-element 76 1 71.23 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGTTATAATTTTTTTATGCGCTCGCTTTTTTATTA:1 - chr2R 17100059 3' + P-element 2824 1 43.84 TGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAGCCGCCAGCTTTATCTACTCAGGC:1 - chr3R 3527044 3' - Tabor 34 2 65.07 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATTAATTTTGGTATAAAAATA:1 - chr2L 17162765 3' - blood 63 2 60.96 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAGTGTGCTCCTCTT:1 - chr3L 13721982 3' + blood 7364 2 67.81 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTT:1 + chrX 13651583 3' - 297 44 2 54.11 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTGAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAGTGATACATAATTTATGGTAAATAAAT:1 - chr2L 3006051 3' + pogo 2073 1 61.64 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGC:1 + chr2R 9164911 3' - 412 7140 2 75.34 TTGGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAATGTATGTATGTAAAAATGTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTA:1 - chr2L 23069854 3' - F-element 83 1 65.07 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAGG:1 + chr3R 12795145 3' - mdg1 14 2 71.31 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCCTGTTCGCTTTCGTTGCTGGGGC:1 + chr2R 23225878 3' + Transpac 5166 2 62.76 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCCCTCCTCTGGCTGCCAATCTACCTACTGTTTTTTAAGTTATTAATTGATTATATTTA:1 - chr2L 18163730 3' + HMS-Beagle2 276 4 62.33 AGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACA:1 - chr2R 19076529 3' - F-element 199 1 49.57 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGGTGGCAATATGGCATAGTGTGGGATTAACAGTTGCATAGTAAG:2 + chr3R 14097114 3' + transib2 2748 1 70.55 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCACAGTCTTTGCATTTATCGCATTTAATAGCCATTAGTGAATTGGCA:1 - chr2R 19168032 3' - opus 15 2 73.97 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTT:1 - chr2L 9167426 3' + pogo 2041 1 63.70 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATG:1 - chr3L 9241988 3' - roo 8721 2 62.50 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAA:1 - chr3L 21630330 3' - Burdock 6211 2 70.55 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTG:1 - chr3L 4023616 3' - pogo 59 1 58.22 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCCG:1 + chr3R 23426458 3' - pogo 37 1 65.38 GGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGCCACTATTTGGTAGAATCAAAAAAATCGATTATTACACTATCCTTAAAGGTAATGCCAATTCTCTGATATCTGTCCCTCTCCACG:1 + chrX 7514863 3' - I-element 4956 1 60.69 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGT:1 + chr3L 16887378 3' + roo 316 2 79.45 CAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTCTTGATCAGAGAACAGAGAAATATAAGTATCCGCTTAATAGAACAGGGTTCATTTTAAAAGTGTTCACACATGTACTGTAATAATTGATT:1 + chrX 17217528 3' - rover 6979 2 56.85 AGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCACCCCAGTGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAACCATTAGACCTGCTATTATGGCCAT:1 - chr3L 22747046 3' + Doc3-element 4564 1 76.60 ATTTTTGAAAATTGTTTTATTTCATCATATTCCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATTAACCTTGATCACCGGCACTTTCGGGTGACTCCAAACGGCCCTGGTAGTACGATCCGT:1 + chr3L 1505085 3' + 1360 3091 1 60.27 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGTTAGCTTACGAAAGTGAAA:1 - chr3R 5940420 3' + hobo 2903 1 58.70 TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAA:1 - chr3L 15480092 3' + hopper 1337 1 71.72 ACGTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCGCGTCACCAGCAGATGTGCCAGCACGAGCAGCAGAAGCAGGACTTTGCCCGTCAGAGGTACCATGTGACCCAACACCCCTACTCCATCTTGCCACTCGCCA:1 + chr2R 8793617 3' - Transpac 355 1 71.22 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCTTTAAAAAATAGACTATATTGAAGGGCGTTCATATATTACAAATACATATAAGTAAAATTAAGAAGCAAATCCTTTTAAAAGTT:1 + chr3R 9258799 3' - 1360 33 1 63.01 CAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATTAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAAGAAACTTGTGTACTCAAACACTCAAGTTGCCTGCGAGCAACGGTTAATTCCTTTTTGAGTGTTTTCGCTACTAAA:1 - chr2L 23395871 3' + HMS-Beagle2 7152 2 56.16 AAAGTGTGGGCGTGTTAGTTTTGAACTTTAGAACCTGAATGCCTAATCTCAACCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGGTCGAGACGTTCATACGGAGAGACGGACATGATCCATCCACCAACTGGATAATTCTATAATATTTTCTC:1 + chr3R 12242101 3' - INE-1 245 1 71.92 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCAAATTGCGAAAATAATTGACAATGTTGACTATTGCTACCTACATACATATGTGAACGAGCTTAAGGTAAAA:1 + chr3R 7549758 3' - copia 51 2 54.79 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTATCTGGCAAACAGAGAAATGCGCAAAAGTTCCC:2 - chr3R 9616553 3' - roo 8708 2 55.48 TGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAAGCTGACTTTATGAAAAATATAATCCTAAGTTCAAGTGGCATATTTATGTTGGTTTCTTTTGGTTTAAAGGAAGAAGAACGA:1 + chr3L 15328970 3' + Transpac 491 1 57.53 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGGTAAAGTGTGTCGTTGCAAATATGTCCATGCGTCTG:1 + chr3R 10143080 3' + 412 7533 2 76.03 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCACTTCTAGTTGACATTGAAGTTAAT:1 + chr3R 25521946 3' - blood 9 2 79.45 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTGTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTG:1 - chr2R 14705759 3' + roo 9011 2 59.59 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGGAATAACCACG:1 + chr2R 11656155 3' - HMS-Beagle 15 2 74.83 AGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACTGCTGCTTTCCGGCTTGTAGGCTGACCGCCCAGTCAAGCG:1 + chr2L 5958928 3' + F-element 4327 1 72.41 GACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:2 - chrX 12649915 3' - blood 7228 2 87.76 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATAC:2 - chr2R 20500021 3' + 412 450 2 54.11 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACCGATTATATTGAGGGGGAGTTTCAGTCAACGAAAAGAAAATAGTGAGAGGAGAGGGCTTATTGAAGAGAGCCTCTCATTTTAAAATTTCTCTTTAAGC:1 + chr2L 8542855 3' + P-element 2864 1 66.44 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTT:1 - chr3L 4175244 3' + roo 358 2 53.42 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCC:1 - chr2R 8793876 3' - Transpac 4973 2 55.48 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTCTCTGTGGAAG:1 - chr3L 9430566 3' + P-element 2833 1 47.48 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAATATTTTATTGGATAATT:2 - chrX 11228509 3' + roo 9055 2 74.66 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGCATCGCGAGTCGAGAATCTGTATCTCGTATATCTGAGATAAAAAATCTC:1 - chr3L 14546289 3' + copia 232 1 69.18 TAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATATTTGGGGGCGTTGGGCGTGCCCTGGAATACAATTAACATT:1 - chrX 14617155 3' - transib2 452 1 72.60 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAATAACTCTATCAAAACATATAATATTTGTATTCATTCCTAAAATATCTTATTTTTATTAAGACAAACTGGCTTAAGTTTAGAAAGATTGATCCAT:1 + chrX 12230620 3' - FB 27 1 67.81 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGT:1 + chr3L 13722130 3' - blood 50 2 52.05 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATCGTTATGGAGGCAATGCCCGCTTGATTTAAATGGTAAATTAATGGGTTACTTGTGATATATTATTTCCATAAATAAATTGTACATTCTATGCGGGCCCAA:1 - chrX 16982179 3' + roo 9052 2 66.44 GAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAA:1 - chr2L 5771420 3' - Juan 71 1 63.70 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAATAAAGT:1 - chr2L 20984277 3' - blood 7050 2 56.16 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTT:1 + chr3L 131800 3' - P-element 80 1 31.51 CGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTGCTTTTCATTGGAAATTTAATCTATTTTCTTATA:1 + chr3L 10076413 3' - X-element 50 1 52.05 TTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAATTAGTACAAATATACTTTACGACGTTCAGTCGGAGTAATAAGATTGACGAGCAGCCGCTCTTTATTAATGTCAAAAATCACAATTGTCAGCTGTTTTGGAATTTGAATCAC:1 + chrX 654217 3' - Gypsy6A_LTR 258 1 74.48 AAAACTCAAAATAAATAAAAAATAATTCCTGGGATCTCGACGAGACTAACATTATGTTTTCTGTTTTTGTTTTGTGAGTTGGCAGCACCTACGTGAGCCGCTAACCGGTTTCAAGTCTCAAAGGTAACTTGAATAACATTTAAACT:1 - chr2L 171820 3' + Copia1_DM 284 1 74.66 GCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATA:1 + chr2R 22692431 3' - Ivk 63 1 58.22 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCG:1 - chr2L 8103483 3' + pogo 2077 1 47.33 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACAC:1 - chr2L 20561426 3' + P-element 2789 1 19.86 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACAT:1 - chrX 13548326 3' - jockey 4837 1 66.90 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACAGCCACATCAGCAACCAAAATGCATAGCATACTTT:1 - chr3R 25508483 3' + hobo 2851 1 78.77 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGG:1 + chr3R 5765422 3' - opus 7074 4 69.86 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATTAATTTTGGTATAAAAATATTAATTCTATA:1 - chr2L 17162754 3' - blood 7063 2 53.42 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTAAATTTTGGCA:1 - chr3L 11669774 3' + Tabor 7268 2 56.85 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTA:2 + chr3R 18846601 3' + roo 9011 2 63.01 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTACTTAACTGCCATCAAAGTTCTTTGCAGGACTTTGTCACATTTGTGAAATAATCAAT:2 + chr3L 20925852 3' + Transpac 250 2 59.59 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCTCCCTTCGACG:1 - chr3R 20292381 3' + pogo 2081 1 73.79 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATTAACCAAATTCTTGGCTTT:1 + chr3L 20977443 3' - I-element 57 1 57.46 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAG:1 + chr2L 2338136 3' - blood 89 2 80.14 GCGGAGGCTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCCGGGGGTGATGAAGCGGGCAAGCCATCCAAGGACGTCAGATGGCATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGAATATAATAAAACCTCCTCATACCCGTTATTGGT:1 - chr2L 23181928 3' + Rt1a 4960 1 81.51 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATCCATTAGCCAGCAGATTAATGTGTATCCTTCGACCT:1 - chr3R 26765036 3' - mdg3 5263 1 76.03 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATATATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGTCTATTTTCATTGG:1 - chr2R 6945614 3' + pogo 2068 1 54.03 TTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATATAGTTGGGTCTATGACAGGATCTGGGCTTGGATGCGTAACTTAG:1 + chr3R 9983118 3' - HMS-Beagle 6839 2 56.16 TAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACATTTAGA:1 + chr2L 22684619 3' - transib3 52 1 57.53 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTCAAAGAAAAAAATTATAATTAAAGAAAATCATAAATTAATACAAAATTAAG:1 - chr3R 12363193 3' + jockey 4917 1 69.86 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAA:1 + chr2R 7223734 3' + blood 296 2 75.34 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAG:1 + chrX 22858932 3' + mdg3 166 2 71.92 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTACTTATGTAGGC:1 + chr2L 19903508 3' - Transpac 27 2 62.33 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCCAAAGGCCAGGGCAGACAGACACATACAACACACGAAAATTGAC:1 - chr2R 18882524 3' - roo 17 2 70.55 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATATTATAGATTATATTATTGCAAGGACTACCAAAATTCGTGGCTACCACTTAAGCAGCAGAATTCAGTTTTAAATGTAAAATGTGCGCGCTTA:1 + chr3R 13494456 3' + opus 475 2 57.53 TAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCCCTTTAAGCTGTTGACAGGTTTTGTGTGCAGATCCCGATACAAATGAATTTTTAAGCTAGCATTTTTCAAATATGTATATTCAGTAGATAACAAAGTACACATTTCAATGTGTTTGTTTTTT:1 - chrX 3630572 3' - accord 7032 2 69.18 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTTGTGGGGCAAAAACGTAACAAAGTA:2 - chr3R 18846491 3' - roo 8717 2 53.42 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGAATGCA:1 + chr3R 9163922 3' - hobo 62 1 76.03 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTCGCGATTTGAAGCTATAATTAGATGAGGTATTTACTTTGGCAGAAGTGAA:1 + chr3R 20137384 3' + Burdock 227 2 65.07 TTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTAT:1 - chr3L 19397043 3' - F-element 91 1 72.60 TAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAAGATCTAAT:1 - chr3L 24153122 3' + Tabor 7313 2 77.40 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCA:1 - chr3R 10468013 3' + opus 424 2 67.12 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCCTATTTATGTGTTTCACCTGCTGAATGCATCCATTTATGCGGCAAG:1 - chrX 4789075 3' - 297 9 2 77.37 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGT:1 - chr3R 5765328 3' + opus 7442 2 62.33 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAG:1 + chr3L 10856792 3' - P-element 86 1 26.71 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTAAAGGTGCGTGTGCCGGGGAAATTCGCAGGGAATGGGGATGGGGATGGGGATGTGGATGGGGGTGGTGTCGGCCTTAGGGGGTGTACTCTGCTGGGCTGC:1 + chr2R 22675940 3' - roo 8683 2 71.92 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCTCAACTGTGCGATCGGATCGCTCGGGCAATGAGTTTTAACGCCCAGAAGTCTCCATCACCTTGGCTGCTTTCGCTCTGCTCC:1 - chr2L 10032622 3' + hobo 2922 1 65.85 GTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATCCAGTTTCAAGAAGAGGCAGCGATTGTTAGATCAACAATGTGCATAAAGTTATATAAAGGGCGTAGGATGCAGAACCTCAGATAAG:1 - chr2R 22664547 3' - Quasimodo 29 2 63.01 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGT:1 + chr3L 17447567 3' - Tirant 8153 2 55.48 CTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 233 2 79.69 CTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATA:1 + chr2R 7098019 3' + copia 5038 2 79.45 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAG:1 - chr3L 9430586 3' + P-element 2824 1 37.50 GTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATTGCGCATACGCGCCATCTAGCGGCGG:1 + chrX 21605782 3' - P-element 25 1 59.29 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTG:1 - chr2R 21227341 3' - mdg3 5307 2 54.79 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTGTTGGTGCTCAACGGAATTATATAGACCGCATTCAGTCGGTTACGACCAGTTAGCCACAAAGCTTAGTGCGCCGCTTCGATTGCACTTTGGCC:1 - chr2R 6187811 3' + Tirant 375 2 69.18 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTA:1 - chr3L 11669784 3' + Tabor 7258 2 63.70 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTGTTGAATATTAAAATATTTATGTAAAAAATGCAATTTTTTAGATTTGATTTTAATATCGACGGAATCA:2 + chr2R 5079299 3' - flea 4804 2 52.05 GCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGCTTTCAATTTGGATTCTTCTGACAAACAGACAGTGCCATTTTATTGGCACACACGATATTGGTATTCCTATTTGCACTATCATTTACCA:1 - chrX 11814944 3' - flea 27 2 67.12 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGACCATTGTTGGTTATTGTCACGGCCTGAAAGTCGGCAATTCAAAATATGAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTAT:1 + chrX 16244885 3' + jockey 4943 1 46.58 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACAAAAAATTGCAATGTAAACTTTCATCTTCATAAACCAACATTTAATCACAGCTAA:1 + chr2R 10552506 3' + S-element 1701 1 64.38 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATAAATCATGTAATTAACTGGAGCAGCATAGTCCCGACCCGGGTCAACATATGGCCAATGGCCAATGGGCG:1 + chr3R 26782808 3' + hobo 2903 1 55.38 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATTGACGCGTGTGCCC:1 - chr3R 25876820 3' - mdg3 18 2 74.31 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTG:1 - chr3L 4869150 3' + roo 9024 2 53.33 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGT:1 + chr3R 5087111 3' + P-element 2830 1 46.58 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTACACTGTAGCACACCAATGTAT:1 + chr2R 6585564 3' + pogo 2085 1 74.66 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAATAACTCTATCAAAACATATAATATTTGTATTCATTCCTAAAATATCTTATTTTTATTAAGACAAACTGGCTTAAGTTTAGAAAGATTGATC:1 + chrX 12230617 3' - FB 30 1 65.75 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACG:1 - chr2R 15613783 3' - P-element 48 1 33.01 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCGCTTGGC:1 - chrX 19498066 3' + P-element 2838 1 51.75 GCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGATGCCTTTCCGTCTGCCTGCGGATATCCAGATCCTGACCCGTACTATATATTTGCATGGAAAAGCCTTCGTCTGCCCA:1 - chr3R 28772133 3' - R1A1-element 5019 1 52.74 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTTATCCACATTAA:2 - chr3R 16041102 3' - jockey 66 1 58.22 AGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGTAAATTTATTTGGTTACTCTCTTACTAGATCGGCATTCTCCAAT:1 - chr3R 4152039 3' + R1A1-element 5123 1 69.86 CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAA:1 + chr3R 6053071 3' - Quasimodo 48 2 56.16 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAAT:1 + chrX 14908474 3' - blood 61 2 57.53 CACAGAAACAGTACAACTACACATATATTAACTACATACGTTAAAAACAACATACCTTGGAATTGCATTCTCTCAATTTAACATAGCACGGTAAGTGGAAATGGTGTGATCAAGTTTATGCCCAGTCATCGCATTATGTATTTTAT:1 - chrX 21422022 3' - transib2 323 1 52.74 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGCACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTC:1 - chr3L 14921408 3' - pogo 23 1 58.02 AACAGGCCAAAGGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTTGCCCACTTAAACAAAAC:1 - chr3R 8705691 3' + hopper 1413 2 77.27 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTT:1 + chrX 17469287 3' - blood 7060 2 52.74 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTGCATTTCTCTTCTTTGCCTTATTTGTTTGTAAACAAAGCAAGTCGCAGCTGACACAGTTGGATTGGATTCTGATTCCAATTCCAATTCTGATTTCCAGGGCAGGAG:1 + chr3L 8067650 3' + copia 241 1 76.03 CTAGCAACAGCCGCGATGCAGGGCGGCCAGGGCAAAGCAGAGAGACCGTTAATTAACGGAACCCCGTTAGGCCTTGGACTCGATTTGATGTATTTTCTCTAGATTT:1 - chr3L 19622751 3' + gypsy8 4697 2 76.42 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATCGTCAAGTGGCTCAAGCGCTGCT:1 - chr3L 22529694 3' + roo 391 2 73.29 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGGAAAAATCGAGATTAAGTCCCCAATTATGCCCATTAAATAAGGCATATTAAAGCCA:1 + chr2L 1327603 3' - pogo 58 1 59.59 GGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATCAGCGTTTTATTCGTTT:1 - chrX 10728785 3' + springer 377 2 75.61 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAACATACGAAATA:1 - chr3R 31907290 3' - Tirant 8124 2 75.34 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTAAGTCGGCGCACTACTTTGTTTAACAAGTGTG:1 - chrX 10571286 3' - Doc 14 1 60.84 ATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGAAGGATACAAGGATACAAAAGATGCTGAGTGGCTTACGAATATCATATTAATTAAGTGCAGATCACACTC:1 + chr3R 29355504 3' + 297 6877 2 56.16 CTAATCTTAAGATTCCAAGAGCGAAATACAAGTATTGTTCAAAAACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATGTACATAATACTCGTAGGGGGTAGGCGAGG:1 + chr3R 32014261 3' + 297 6769 2 71.15 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTTATGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAAACTCGAAGATAGCGTGGTGTTAACGGGTTTCAAGAGGATCTCCATTTGAGTGGCGCTTTTTAAATGGA:1 - chr3R 19996066 3' + transib2 2752 1 51.37 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCGCC:1 - chr3R 20292389 3' + pogo 2072 1 66.44 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGTTACTATGCTGGACTAAAATATGGGGATATTACAGTTAGAACAACACACTACTTATATACATACATATATGGATAGTACTATTAAAAATAGCTAGCTT:1 + chr2L 2690710 3' + hobo 2938 1 79.03 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTT:1 + chr2L 14969978 3' - Tirant 8170 2 61.64 TATCAGTCTGTCCGTATGAACGACGAAATCTTGCCACGGACTCATTACTCGAAAGCTGGGGGTTACATGCTCATTAACTGTTTTCCCCCTTGTTATTTTTTTAAATAAATATTGTATATTATGAAAAAACCATATTTTAGATAAAG:1 - chr3R 7060272 3' + INE-1 124 1 74.66 AGTGGCCGTCCGAATTCGGTCATGCAGACTGGTATGGATCGTACGTTTTTGTAAGACGTAAATGGAGTCTGCAACACACAACAGTTAACAGAGCCAAAATAAATTGTGGTAAAACTACTACTATAAAAACAATAATAAAACAATAA:1 - chrX 11294326 3' + Doc4-element 445 1 70.55 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATAACCCGTTTCAACCCCCAATGATCA:1 + chr3L 21387550 3' - pogo 37 1 60.27 AATTCGCAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCAGCACGTGTAAGCACGGGTAAGCCTTTTTGAACAGCTGTGACAAAGCTTTTTGATGGCAGTGACTAGCTAAGGTCTGTGTCTTGGGACAGTTTAGTGCTGCCAGACCGGTGGA:1 - chrY 2468612 3' + R1A1-element 142 1 30.82 ATATATATATAATATGTATGTATATGTGTGTGTATTTCCAATACTAAAATAACAACAACAAACAATAATAATAATAATAATAATAATCATACGAGTAATATAAATAAAATAATGCAAGTCGAGCGAGAGACAGCGACAAGATAGCA:1 - chr2R 13953408 3' + Dm88 4369 2 73.97 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTT:1 + chr3L 13722142 3' - blood 7049 2 60.27 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGCTAATTACTAAAGTGTGCCTCGTATCTTCATTTTAGAGAGTAATCTTATC:1 + chr3R 23099211 3' - roo 8697 2 65.75 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGA:1 - chr3R 19537495 3' + hopper 1381 1 55.34 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAGGAGTTCCGA:1 + chrX 9816486 3' - jockey 59 1 51.37 TCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGGAGGAGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTGAATGCGGATAA:1 + chr3L 25232913 3' - accord2 8 2 78.08 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCTCTGCGCTG:1 - chr2R 5848956 3' + mdg1 364 2 56.85 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTAATACCCAAATTCAAAGCTTCAGTGTATTTCCGAAAATTGATATGGTAATCCCACAGAATGTAGTATGTAATATTGGCAAGATCCAAAC:1 + chr2L 21724158 3' - pogo 28 1 66.44 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAAATCTTTGTTTAAAGACACATGCACAATGTAAGTTAAATTGG:1 - chr3R 11553615 3' + hopper 1382 1 63.70 ACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATGTTACAATTTCATCAGAATCATGTGGAACCATTAAGCAATTATAACGTCTCATTAG:1 - chr3L 18217524 3' - invader4 137 2 74.66 CTCGGTTATTGATCCTGATCAAGAATATGTAACTTCCATGGTCGGAAACATAAAAAAGGTGTGTGAATCCATGAAACAAAAATTGTCAAAAAATTGAGCTATTCGATAAAGTTAAATGCTACGTTAAATGGAATTTATATGTTTGG:1 + chr3L 23011224 3' - INE-1 90 1 73.29 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAAG:1 - chrX 10101340 3' - mdg3 83 2 71.23 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGGCAGTAAGGTTTTAATGGAA:1 - chr3L 9241968 3' - roo 8703 2 58.90 AAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGATAATCCGTATAAGAGCTAGAAAAGATTAGTTTAAGATGGTATTAAGCATTTAGATTCTCTATTTGATAATAGCCGTCTGCTTCTGCATGCAATT:1 - chrX 21312926 3' + INE-1 84 1 64.23 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTG:1 + chr2R 10367576 3' + 412 446 2 51.85 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATAT:1 + chr3L 21093226 3' - Ivk 54 1 61.83 ACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTATGCTAATGCGACTTTATTGTTATGGATGTGACGCTACTCTTTCGCTTTTTCTTTTGCA:1 - chr2L 17140113 3' - flea 292 1 60.27 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATT:1 - chr2L 8397127 3' + roo 9033 1 57.53 TTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGTCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAATGTCTACACACGACCGACGGCAAACACTTCAGTTACCTTGAA:1 - chr2L 18235384 3' + F-element 4632 1 52.05 AGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTTATTTATGCAATGCATTTGCCCAAAGCGACCCAAAACCGGCGATGCCCTGTGCAA:1 - chr2R 9098318 3' - blood 151 2 65.71 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTTAGCGAGCGTTGCCACCTTTCTGCGAGCTGTTGCTG:1 - chr2L 21237185 3' - P-element 31 1 64.38 TAGGGCCCAGGGTTCTTTTCAGGCTTTCCAGGTTTGTGAATCATGGAAATAATACCGAGCTTCCACTGTGGAAGGAAGTATTGCAGTCTCACAATAGCCTTGAATTCTTTAAAAATGTATAGAGAAACGTATAGTAGCGTTTTTAT:1 - chr2L 13712273 3' - BS3 414 1 71.92 ACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGATCGAGGAGTTGCGAGACATCTGCGAGTGGTTG:1 + chr2R 7853452 3' + Burdock 6040 1 78.74 CCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCGTGAAAAGTGTATTAGAGGTTGACGTGGGGCGACGATGATGACGAAGTCGTCTGGGAGAACTGTGGGAACAATCCAGTGTGCTGCAGT:1 + chr3L 21093568 3' + Ivk 199 1 65.07 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAG:1 - chr3R 25876875 3' - mdg3 75 2 65.75 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCTTACTAC:1 - chr3L 22481226 3' + roo 354 2 59.57 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTAAACGTACAGACTAACAACTA:1 - chrX 8272393 3' + roo 9037 1 60.27 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCA:1 + chr3R 22429249 3' - roo 47 2 53.42 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATA:1 - chr2R 5848980 3' + mdg1 340 2 73.29 CGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTCCCTGTTGGCCTGGTTGTTGGCCGCAGGTGCCTTCCAA:1 - chr3L 13221482 3' - Bica 441 1 76.71 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGGCCCGCACTCACTCACACACACATACACACACACACACACACAAAAG:1 + chrX 2141923 3' + P-element 2852 1 59.59 TGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAACTGCTGAAAAGAGAGTCGATAAAGAGTAAAATGGAAATGGAAGTCCAAGACCGGTTCAGTTTTACCGCCTTATTGTAGGAAGCCTTAAAGTGCCAGCGAAA:1 + chr2L 12480977 3' - pogo 2082 1 71.92 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGT:1 - chr3L 18835264 3' + pogo 2062 1 60.27 GACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGT:1 - chr3L 25232697 3' + accord2 200 1 77.78 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCA:1 - chr3R 12608057 3' + roo 338 2 65.75 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGTG:1 - chr3R 7424526 3' + 412 442 2 52.05 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGC:1 - chr3R 10079271 3' - P-element 39 1 58.90 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCC:1 + chr3R 7424646 3' - 412 7105 2 53.42 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTCGCTGTGG:1 - chr3L 9430569 3' + P-element 2824 1 44.83 AGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGTATGTATATATTATATT:1 - chr3L 14143130 3' - X-element 4693 1 59.23 GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGGACTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATTTCTTTTTATTATT:1 + chr2L 9356912 3' - Stalker 6887 4 53.60 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACA:1 - chr3R 25822971 3' + roo 9007 2 64.38 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTAAACGAATCGGAATCGCCAAAGGTTCAGTTGTTCGACGACATCG:1 - chr3R 9502560 3' - P-element 78 1 32.19 AAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTTTTAACAGATCACTTCATGCTGTTGCCAGTCGTCTTTCTTGTTGTTATTGTTGTT:1 + chr2R 9320979 3' + invader4 2788 2 62.07 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACATCCTGGGTGAGA:1 + chr3L 4023747 3' + pogo 2065 1 59.59 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAAC:1 - chr2L 18370309 3' - Doc 41 1 60.96 TCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGTGAGATTATTGTTGAGCGTCAACTTGGACAGCACATATAA:1 - chr2R 19828225 3' + blood 478 1 57.53 TCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCCTCTGGTGTTTGGAAAAACGGTAGAAAGGATTGCCATAGCTCCTAATTGCAACTTTAGTTGTCAATTGTCAGGACTCACGTGCGATGCTTCTGGGGACAACATCAATAC:1 - chr2L 2658970 3' + G2 437 1 74.66 CAGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTTGTTCGCGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGGAAAAAAGAA:1 + chr2R 2868553 3' + Rt1b 4687 1 59.59 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTACCCACACAGAGACACA:1 - chr2R 20913076 3' - 1360 20 1 70.71 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTACAATTGTTTATTTTTCGGTATACTTAGGACAGTAGAACTTGTTAGTAGATAA:1 - chr2L 14222204 3' - Transpac 19 2 73.29 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTGAATGTGTATTTGTCTACATGACAAGTAGGCA:1 - chrX 7467903 3' + hopper 1382 1 63.01 GGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGTTTCAGTACGCCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTC:1 - chr3R 7539437 3' + 1731 204 2 51.37 AAACGCTTCCTTGTGCCTGTTACATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTTT:1 - chr3R 21923951 3' - INE-1 33 1 77.60 CTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCAC:1 - chr2L 18370327 3' - Doc 59 1 54.79 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGGAAATTAAAATATA:1 + chr2R 15080149 3' + roo 386 2 70.55 AAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGTCTGCTCAAGATTCTCCTCCAGGGGAATGGCCATGGCCATGGCTCCG:1 - chr2R 20793050 3' + R1A1-element 354 1 58.04 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTA:1 - chr3R 3527077 3' - Tabor 67 2 60.96 ACGGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACA:1 + chr3R 11520021 3' - Rt1a 58 1 53.42 ATATAAATATGTATATATATGTATAATAATACACGAGCACGTAAACTTGACATTGCGACTTGTTAAATATTTTCCAGCAAATTCACTTTACGAAAATGTTGTAGATTCCAAAAGATAAACACGGTAATTGTCGGCAAATAGAAAAT:1 + chr3R 14728636 3' + G3 4509 1 73.97 AGTGGAAAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGGGTTGCCTTGTATCTGTTTGAATGTTGGGTCGGTTGGCCACAATT:1 - chr2R 8858160 3' + micropia 5323 2 55.70 GCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7206 2 82.05 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGAATTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTTCTCAAAGCCAGCTTGATTTT:1 - chr3L 19274828 3' - transib2 49 1 75.79 GCTTCCGGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGGTAACTTAGTTAACTTATACATATATCATCCTTACTAAAGTTTAACACATACCATACCCATCAAAAAAACGA:1 + chr3L 11596353 3' - gypsy6 68 2 66.44 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCCTTAATAGCTACCAGAATATCAACAAATTGCTTCGAGTCGATGGGAGC:1 - chr2R 19985704 3' + copia 5052 2 68.97 GGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAACATTTTGTTCTC:1 - chr2L 15153209 3' - G-element 17 1 67.12 AGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTATGAACTCCAACTGCTGCTCCATGGATAGTGACAGTGTAGGAGT:1 + chr3L 12272309 3' + FB 94 1 70.55 GTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGGCTGTTTAACTTGCCCTTTTTAATGATCGATAACTGGGAACTTTT:1 - chr3R 23108073 3' - G-element 75 1 67.86 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGGCGTAATTGTAACTTCACGTCAGCCCCAAA:1 + chrX 12558339 3' + Transpac 5205 2 55.45 ATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAATCCATGGGGAGGGCTGTCGAAAATAATAAATCAAAGAGACACATTGAGAATGCAAAGGCCCGGGCTACGTCCCCCTATT:1 + chr3R 17456067 3' + Bari1 325 1 53.42 GTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTGAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGAATATTCAGCTAACCATTTCGTGTGTGTTAACAACAATTGAAAGTGACATCAGCTTCGAAA:1 - chr3R 8845250 3' - accord 7017 2 57.53 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAAT:1 - chr2L 16942045 3' + mdg1 354 2 63.01 ATTGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCC:1 - chr2R 19904018 3' - Doc 4475 1 56.16 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGA:1 - chr3L 2036996 3' - Doc 58 1 56.85 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATT:1 + chr3R 10140252 3' - P-element 84 1 29.45 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGCGTTATGC:1 + chr3R 26399924 3' - roo 8690 2 67.81 CTGTGCTGCAAGCGATGTTCGCGCTGCCTGATGCATTTTCTAATAAAATGCGTTTGAGTAAAACAAGATAATATTTTGGCTGCCACAGGTGGATTTCGATACTGATCGCTGGCGTACAAATTCTGAGGTATCGCAGAG:1 - chrX 7327054 3' + Stalker 488 1 51.45 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCAAGTG:1 - chr2L 18370302 3' - Doc 34 1 65.75 TTTTTATTTTCCTTTTTCTTTTGCTTCTTACGGCCATTGGTTGCGTTATCAGAAGATTTATCATCGGCGATTTCGTTTTTGGTAACACTGAGAGCCTTTGGCTCAGAAGAAACAGTTCCCTTCTCATCGCTTTTATTTTCTCCGCC:1 + chr3L 5498515 3' - Doc2-element 252 1 40.41 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTTCGCTTTCGTTGCTGGGGCTGAATTTCGGAATTTCGGCGCTAATTGGGTCAAGTGTGCCCAAAGT:1 + chr2R 23225924 3' + Transpac 5211 2 72.60 ATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAA:1 - chr2R 21897867 3' + 412 7493 2 52.74 CACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGCTATTACTTATTACTTATGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAACTGCGTAGGAATGGCAAACGTCTTCAAGGAGAGAGTCAGAGATTTTCATTTG:1 - chr2L 10784773 3' - Stalker2 7444 2 37.67 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTA:1 - chr2L 12283927 3' - Quasimodo 61 2 60.96 TTTTTGTTCGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACATCTGCTCACTCTGCGCGTGCACATTTTGTCCTATAAATTGGCGGCGCTGACTACTATCTAACATTTGTGCGCT:1 - chr3R 19835230 3' + 1360 98 1 51.11 CGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTA:1 + chrX 22824797 3' - jockey 4760 1 78.77 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACAATATTTAAATAAAATATTTTTATCGCAGCTCTCACTCTTCTT:1 - chr3R 25822929 3' + roo 9049 2 68.49 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGATTGTTATACTTGTAAAAGTATAACCTTTTGTTC:1 + chr2R 6945759 3' - pogo 26 1 67.81 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGG:1 - chrX 16244886 3' - jockey 4818 1 56.16 ATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCTGCTGGTTGAATATGTAAACCCTCCCCTTCTAAGAAGAAGGCTGTCCACAGACTTCTTGAGCCAGATAACTCCGACTTGACTGCCAATCCGTTCCAAGACGATCCGC:1 - chrX 8685330 3' - gypsy7 39 2 68.49 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTG:1 + chr3R 20292529 3' - pogo 57 1 59.59 AGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTTTATTACGAGCCTATCGAA:1 + chr3R 27845580 3' + Stalker 360 4 50.00 AGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTG:1 + chr3L 12030583 3' - I-element 5235 1 67.81 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGG:1 + chr2L 14222366 3' + Transpac 5187 2 57.24 GGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATCAGCGTTTTACTCGTTTCTGTTGTGGCTT:1 - chrX 10728773 3' + springer 7509 2 73.57 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAA:1 - chr3L 9571686 3' - jockey 22 1 64.62 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTATCTTTGCTCAAACCTTCCACACGAATCGTTCCAAATAGTATAGGCGGCTTAATTTCTAGGTAGTTATAGTCTCCTTCGCGTCTACCTTCAGG:1 + chr3L 23090639 3' + 1360 3350 1 53.42 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGCGTATTTGTTGTTAATTTTTCAACAATTGCCTTTGATTTTTT:1 - chr3R 8022145 3' - roo 8742 2 76.03 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGC:1 + chr2R 15613843 3' + P-element 2818 1 38.36 GCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGATTAGCGCGGCCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTTATAGAATAGCTTAGATAAAGAATGTACCTACGTGTTACGTGTACCCAGACTATAGCTAGTCGAA:1 + chr3R 15190360 3' + rooA 130 2 55.48 CGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGAGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTT:1 - chr3R 23346540 3' + Rt1a 5013 1 50.68 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGTCTTTCTCCTGCCTCTCTCTC:1 + chr2R 15613892 3' + P-element 2867 1 71.92 ACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTGAAAAATTGAAACACCTTAAATCACAAATTCTGTTAAATTTTCGGTTTAAAACACATTACTATTAC:1 - chr2R 14550414 3' - mdg3 5231 1 54.79 ACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCCATCCAATCGAGTTACCTGATGAATGGGGA:1 - chr2R 5900806 3' - Bari1 45 1 55.48 GAACAAGCTGTGTCTGCTTCGTCCGAAATCTTGACTTTTAACGGGAGGACCATGTCGGACCACGTAGCCGGCAGCATTAAGCAAGACCAAATGTAATAGTTAATGTAGTTTGTCTTGCGGATCTTACAGAT:1 - chr3R 18107837 3' + diver2 4468 1 19.85 CGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATG:1 - chr2R 17014031 3' - HMS-Beagle 71 2 68.49 TATGAATCGTGCATGCCATATAAGGACGATAGATATCTTAAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGAATATAATAATATATCCATTCAATCAAATGCGAAACGCACACACACGCACACACACAATCTCAGCCGCACATTCTCTCCGGATG:1 + chr3L 5690091 3' + Rt1a 5006 2 44.52 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCATTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTAGGCATCTCGTTTGCCGTCTTCT:1 - chr2L 1119826 3' - Doc 4474 1 57.14 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTA:1 - chr3L 19279116 3' + opus 435 2 63.01 TAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCA:1 - chr2R 5070923 3' - Tirant 8124 2 27.40 ACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTTATCAACTACCAAATTTTTTATTATTAATTAAAAAGACAAAAAGTCATCTTAAGCAACAAAAGAGCCTATTTATAT:1 + chr2L 8620152 3' + Stalker 327 4 57.53 GTATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAATAAATTAATCCATGCCATGTAAGTCCAGTAGTGTCAATGGCGGAGTATGTCACAGCCAAATCCTTGCGTCTTAAAGCAGCCACCACCTTTGTACCGATAA:1 + chr2R 9174843 3' - blood 436 1 53.42 AAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAA:1 - chr2R 21897865 3' + 412 442 2 51.37 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGACCAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTG:1 + chr3R 4884487 3' - pogo 39 1 50.77 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTT:1 - chrX 15089478 3' + P-element 2840 1 53.42 AAACTATTGAACAAATAAAACTGAAACATTTGTTGAATTGTTTGAAATTAAATACCAAAGGATATTATAAAAAAAAAAGTTGGCACACTATTTTGAACTAAACGGGCTTTTTTCGCGGCTAACTGGTTTATGTAATAAGGCAACAC:1 + chrX 22675817 3' + HB 1488 1 53.42 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAA:1 - chr2R 9326980 3' - mdg3 5319 2 69.86 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAAAT:1 + chr2L 12142654 3' + hobo 2924 1 60.00 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCA:1 - chr3L 18296918 3' + Juan 4145 1 65.75 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCATTTAAT:1 + chr3R 6103672 3' - Tirant 8156 2 58.27 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAA:1 + chr3R 22429251 3' - roo 8709 2 54.79 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGGGAACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGT:1 - chr3L 19274805 3' - transib2 54 1 59.35 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAG:1 + chrX 9816477 3' - jockey 65 1 55.94 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAATGGTGTATTGGGTTATCAACTAATTTCGGTTGGACATAGTTTTTGCC:1 + chr2L 22746334 3' - 1360 72 1 67.12 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAG:1 - chrX 3529756 3' - 412 7132 2 73.76 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATANGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCT:1 - chr3R 22846725 3' - 412 7129 2 71.94 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACAC:1 - chr3R 10541243 3' + hopper 1358 1 55.48 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTGTAATCGAGTCTCGAACCGATCGATCCGATACGATACGATCGCAATAGCGCACAGCCATTGCCATCGCGATCGCCGCTTGGGGTTGGCAAGATCAT:1 + chr3R 29207666 3' + copia 230 1 67.81 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATTCGTGTGTATTTTTGTGCAGTGCACCTGAAGAATTTCGCGACTCAAT:1 - chrX 17469142 3' + blood 7360 2 65.07 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAG:1 - chr3L 11665902 3' + pogo 2038 1 63.70 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAACGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGAC:1 + chr2L 17730515 3' - pogo 73 1 66.44 AAATAAAGTCAAATGCTGAGCGATACATAAGTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCAAATAATGCTAAAACATTGCCTTT:1 + chr3L 27358532 3' + G3 4356 1 73.29 TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACAT:1 + chr2L 5648501 3' - Burdock 55 2 61.64 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTCTTTT:1 - chr2R 21078381 3' - jockey 31 1 65.28 GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATTTTTCAAGCAAAATTTTTTGAAAAAGGCCTAGATGGGTCAGCTATCATTCCGCCGCCC:1 - chr2L 3967053 3' + hobo 2876 1 60.96 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCT:1 - chr3L 18708561 3' - F-element 34 1 69.86 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAAT:1 - chr3L 4639074 3' + roo 9004 2 66.44 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTGAAAAAGTATTTGAGTTATCCATGTCAC:3 - chr2R 14705732 3' + roo 9038 1 59.59 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTG:1 + chr3R 14088664 3' + 1360 3338 1 54.11 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTTATCCGCTACGCTTAGCACAATCAAAACATAAACAAATCCAGAAACACGTACTGATCGTTTTCCCGCGCATTTATTTTCC:1 - chr3R 10357722 3' - pogo 35 1 64.38 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAG:1 - chr3R 20292425 3' + pogo 2036 1 66.44 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGCTTGTTTTAATTAAATTTAAAGTGCAGTTTTCGTTTTGGCTTAGACGCAAAAAACAGCAAAATACGTCATTCGCTGGATAATGAAAA:1 - chr2L 2363250 3' - P-element 22 1 63.70 GTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCGTAACAAACTCAATATTTTATTATTCTCTTCGTTATTATGTACCTATTGAAATAAATTGACACACCACATGCACTTTGTTAAGAACGTGTACCTATTTCCTTAATTAATAAAGGTTTA:1 - chr2R 15392647 3' + blood 7385 2 80.14 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTCAAT:1 + chr3L 3540274 3' - mdg3 5259 1 79.45 AATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTA:1 + chr2R 4206661 3' - 1360 317 1 74.66 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCTTCCATACTCCACACACATCACA:1 + chr3R 18847400 3' + Stalker2 362 2 53.47 AATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGGATGGGATGCGATAGTTGCCAGGTTGCCAAGTTCTCCGGATGGGGAAATCGCGTCTGACAAGGGGGTGGTCACAGGTCTACTTTGAACTA:1 - chrX 1144398 3' + INE-1 102 1 58.22 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAA:1 - chr3R 31907321 3' - Tirant 48 2 54.11 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGTAAGTTCTTTAAGATGAAATTGAGAGTGATTGTGAAAT:1 - chr3R 10498786 3' - 297 48 2 53.42 AGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACACACAGCACTTGAACG:1 - chr2R 6984317 3' - HMS-Beagle2 6953 2 65.75 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCAGCTATAGAATTTGTCGAACCAAAGGGGAAAATGTGCTTGGTCGTG:1 + chr2L 6583393 3' - hobo 69 1 66.67 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTGTAAATAT:1 - chrX 10873757 3' - mdg3 17 2 72.60 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGATGTATTCG:2 + chr3R 8542709 3' - roo 8692 2 60.27 AGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTG:1 - chrX 12893330 3' + Bari1 1655 1 53.42 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGT:1 + chr3R 3527149 3' + Tabor 7239 2 72.60 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTG:1 + chr2R 15613864 3' + P-element 2878 2 71.96 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCAC:1 + chr3R 9563654 3' + P-element 2787 1 18.49 TTGGTGCATTTGACATTTAAAATACGTACGTGAAATTTCAAATAAATCGGATATTTATATATTTTATAATAATATATTTATATTATATTTATAATATAATTTAATTCGCTTGATCACGCTTCTATGCTAATAATTCTTCGGCCTTG:1 + chr3L 14545449 3' - transib3 2789 1 71.92 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGGAATAACCACGGTACAG:2 + chr2R 11656161 3' - HMS-Beagle 6808 2 77.40 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGCTATGTGTATATGTTT:1 + chr3L 20785508 3' - P-element 102 1 11.64 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTTAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCACAACTTATTTAAGGCTGAAATTATTTACCTTATTCATAAGCTTAAACAGAGAGATAGTTATTGTT:1 + chr2L 21284534 3' + opus 419 2 57.53 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCGTCCTAATG:1 + chr3L 15035258 3' - pogo 21 1 69.66 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCAC:1 - chr2R 19168076 3' - opus 172 4 65.07 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTAATCATACACATATACCGTCGGAAAAAACAAACTA:1 - chr3R 18665238 3' - 1360 50 1 57.53 TTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACAAAAAATTGCAATGTAAACTTTCATCT:2 + chr2R 10552478 3' + S-element 1673 1 48.63 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATG:1 - chr2R 23313006 3' + Tabor 7246 2 68.49 CAAAAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAAGGAACATGGAGAAAAAGTAAATAGCGAATTATGAAATTCCCATTGGCAGATCGCAATTATTTCCTCAGTGCACTTATGGTATGCTCATGTTTTCGTATCTTCTAATGATGAGCACA:1 - chr3R 9483162 3' - micropia 155 2 58.22 TGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGTTGAACGTATTATAGCCCCGATATGACATCATAGCCAAGTTAACTTCTGT:1 - chr3R 12369047 3' + roo 305 2 65.52 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTTGCGCGGTACTGCGTGGAAATGCTGTGTGATTTA:1 - chr2L 18048218 3' - blood 7035 2 67.81 TTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAACACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTATAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTACGCATGTATCTGGAGCCAGTAACGCTGCGCTG:1 + chr3R 11771769 3' + S-element 1631 2 76.03 AAATAATAACAATATGTAATTGGACTTTAGTTTAATTATGACTTTAGGGTACTTTGATATTCCCGCTCTGAATGGCCTGGTGGCTGAAGTTCTCAAGTTCTCAGTTCTCAGGTTCTCTAACGAAGTCCCTTAACGACAACGACTGC:1 - chr2L 16455676 3' - Porto1 4633 1 54.11 CCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCGCAGCCGTTCTTGTAATTTCGCTCGTTTCTCTTGCCTGCAGATTTGCAAGATG:1 + chr2R 23025659 3' + 297 29 2 74.48 CTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCGCTCCTTTTCCCTACCCACCTCCCCTCTTCCACTTC:1 - chr2L 8463503 3' + copia 22 2 77.40 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACAACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGCGCCTGTGGGTGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTGGCTCGGTGTTTGTTTTTT:1 - chr3R 10079296 3' - P-element 63 1 36.55 CAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTTTT:1 + chr2R 9327044 3' + mdg3 5422 2 69.18 TAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTTGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAATTCTAATCACCTTCCGCAGGCGGTGGCAAATCCCCGCCCCCTTAAAGCCATCTCAATGCCAACGGCTTA:1 - chr3R 9889916 3' - 1360 303 1 55.48 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCC:1 + chr3R 25384276 3' + mdg3 5431 2 61.64 AACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTC:2 + chr2R 5900907 3' + Bari1 1626 1 74.66 ATGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGTAAGCTCATTCATTACAAGCCAACATGGACATATTTTCCGCTTGTCTTTCCGCCCAATTTTCT:1 + chr2L 3734619 3' - mdg3 5263 1 60.27 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATTAGCAGTGTT:1 - chr3R 14663198 3' + pogo 2053 1 52.74 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTG:1 - chr2R 5848972 3' + mdg1 7386 2 67.81 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATCACTTTCCCCAGGCTAACCTGTTCAACCAATTGATTAT:1 - chr3L 15890967 3' - mdg3 5274 2 56.85 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCG:1 - chr2R 19900990 3' + mdg1 345 2 69.18 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGCATCTGT:1 + chr3R 18846650 3' + roo 397 1 73.29 GAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGAACATTCAGCAGGTTGAAGCAGGTCGACGAGGTGGGCAGTCGGTTGAGTGGATCCTTCTTACGTATGGCGAAGAAACCGCG:1 - chr3L 9001968 3' - X-element 4387 1 51.37 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATGTTGGGATCGATTCAGATTTC:1 + chr2L 1074038 3' + Tirant 363 2 58.90 ACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCATCCTGCATGGCCTTCAGCTCCTGTTCGCTGCGCCCGGAGATGTCCACCGCCAGCAGCTCTCGGTTTTCATTCTT:1 + chr3R 18225167 3' + 1360 313 1 50.68 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACT:1 + chr3R 22429224 3' - roo 72 2 66.44 AATCTTTTATGTTCACTTGCTGTAACACCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTATTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTT:1 + chrX 23280951 3' - I-element 458 1 50.00 ACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGG:2 - chr2R 19076548 3' - F-element 249 1 73.29 TGGGAAAAAATTCAATTAAAAGCAACAGCACGTAACTGAAACTTTTCTTTTTCGCTCTCGTTTTTCCAATTTGTTGCTGTCCTGTGTCCTTCCCAATTGTCAGATGACGAAGCTCCGTGTGTGAAGTTCCTGTGTCTTGTTTTGTC:1 - chr2R 12861647 3' - Tc1 313 1 52.74 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGAAAACATAATGTTCCTCTTGTTTTTGTCAAAT:1 - chr2R 11753527 3' - jockey 4792 1 75.97 GCAGACAACATTTATTGTTTCCCTGTTTGTCTAAAATCAAATCAAGCTTCATTGCGAAGCTTTTCTCAGTCTTGGCTTTCATATCTCAGTTTGGACTAGTACAAATTTATATTTATACACATAATATTGTGAGGCATTGTTCCAGC:1 + chr2L 22687892 3' - Cr1a 437 1 62.33 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGGAGG:1 + chr2L 17747539 3' - Tirant 8134 2 65.75 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACT:1 + chr2L 8103628 3' - pogo 46 1 54.11 TATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' + R1A1-element 5195 1 69.18 TGGCAGGACACAACAAGTCCTCTTTAAACATTCTTTATCTTCTATTCTCTGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGATGGAGTATTTAGTTCGAGTGCAATCAATAGTTATCCCTAAGAAAACAGCGAGTCGGTTATTCCTATGTA:1 - chr2R 8855056 3' + Q-element 423 2 52.74 AAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAA:1 - chr3L 16973383 3' - S-element 1601 2 67.12 AAATTATTTGCACAATGGAAATTAGTTTCGGTTTTT:1 + chrX 4757953 3' - S2 1702 2 91.67 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATC:1 + chr3L 17667634 3' - F-element 66 1 55.48 TACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATTCGGATGTTACTTGTGTCATAGCTACATAGCTCAATGCCTTTGTGACATCATTT:1 - chr2R 1727070 3' - Stalker4 113 4 63.01 GTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCC:1 - chr3R 3617307 3' + micropia 5131 2 76.71 AATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACAGAAAAGTCGGAGAGCATAAAGACTTGACTGCCTGCGACAACGTCTCCTTCGAATGATTGCC:1 - chr3L 22265018 3' + invader2 436 1 73.79 TCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTTAAATAAGTCTCGATGGAGCAAACTTGATTTATG:1 + chr3L 2385210 3' + transib2 2535 1 78.42 AAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCGGGATGTTGATCCTTGACAGCGGACCCCGTGCCGGCTCGAATGGGTTTAGGATATTATGGGGGGCAACGGATTAAGCCAAAGCTTCTCC:1 + chr3L 23933148 3' + rooA 7422 2 75.00 TCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCA:1 + chrX 15089551 3' - P-element 88 1 18.66 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGACAGAATCCTCAATTCGAAACGA:1 - chr3R 6782672 3' - jockey 4702 1 65.75 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTGACCACTTTGCCACTCATTTTC:1 + chr3L 22481374 3' - roo 16 2 73.29 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTA:2 + chr3R 9938700 3' + roo 9017 2 56.16 ATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAATACAAAAAACAGAAACTAAATAACTCTCCGTTTTGATGTTATTAATT:1 - chr2R 4561103 3' - Stalker2 7323 2 68.49 AGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGATGTTGTTGCCCCGATCATATGGTG:1 - chr2R 10478633 3' + invader4 306 2 69.18 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCT:1 + chr2R 6187925 3' - Tirant 8185 2 75.74 GGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATATTCGCGATATTTGTGCGAGTATTCCTTTAAAAAAGGGTGAGGATTTCTGCTCGGAG:1 + chrX 7577549 3' - R2-element 296 1 61.64 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATA:1 - chrX 18193705 3' + hopper 1358 1 58.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGTGGTCATGGATC:1 - chr3R 23099044 3' + roo 386 2 69.18 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCCAGCG:2 + chr3R 10079420 3' + P-element 2855 1 62.33 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTA:2 + chr3L 9242069 3' + roo 8990 2 72.60 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGTAGAGTGACATTTTTTATTTGATAACTAGGTAGATTAAGCTTAGCATTAACAAATTAACAAATTATAAGTCG:1 - chr2L 1327481 3' + pogo 2055 1 50.00 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAAT:1 - chr2R 18123422 3' - 412 63 2 60.27 TACAAACACACTTAATAATAATAATAACAAGAATCTGCACGCTAAATACTAAAGTTTGTTTTGGTATTTGCAGAGATTTTGACGCATAACTTAAGAATATTCTTTATCGAAGCACTCAGGCGATCTAGCTATTGATGACTGTCCGT:1 - chr2R 4330705 3' + baggins 5432 1 67.81 AGGAAAACATGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTGCACTAAATGCAGTTAAA:1 - chr3R 25521756 3' + blood 7365 2 68.49 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAAC:1 + chr3L 16180976 3' - Transpac 39 2 52.85 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCTTTTACCCACCAGTTCACCAGCTAACCACCCAAAACTACCCACTGCATTCCGGCCTTGCCAACAACTTTACTATGCCAGACGACCGGCGTCAGACAATTT:1 + chrX 3524357 3' - roo 8677 2 46.76 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAACGTCAAAGCGATCGCCTCCCGGACGCTTTTGTGATTT:1 - chr3R 26399798 3' + roo 9007 2 65.71 TACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGAAATCTAGATCCTGATAGTGTGTGTT:1 + chr3L 19146714 3' + pogo 2067 1 60.96 CATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTAGCGGATACTTATCACATATGTGTGTTCGGTGTGGGCCGCAAGAATTTATAGCCTACTTTATGGCTTACTAATGAACTTTCA:1 - chr3L 12874047 3' - Transpac 4801 1 55.48 CAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAA:1 + chr2R 5900919 3' + Bari1 1638 1 66.44 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTTGAATATTGAAAGCAGACAACCAACCAACT:1 + chr3R 15590686 3' - roo 37 2 60.27 TTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAAC:1 - chr3R 4913584 3' + 1360 101 1 72.60 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGT:1 - chr2L 4416064 3' - jockey 89 1 71.23 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATT:1 + chr3R 5087124 3' + P-element 2843 1 55.48 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTAT:1 + chr3L 17667619 3' - F-element 81 1 65.75 TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAGTTTACTATGCATATTATACTATACTTGAAGAGAAGTCATATCCAATAATGCATAATA:1 - chr3L 16264601 3' - Burdock 61 2 62.33 GCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTATGCAGCCAGTCGAGGGGGGAGGGGGCAAGCGGTGGCTCTTCGGACGGGAACGGAACGAAAGCGGGTGTGGCGG:1 + chr2R 8299197 3' - blood 7371 2 58.21 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACA:2 + chr2L 14262937 3' - blood 46 2 49.32 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAA:1 + chrX 21213426 3' - Doc 29 1 63.01 ATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAGATAGATATTTATTTGGGAACAAAATGAGAAAAACAAAAACGCAAAGCAAAAGCGAAACGTATATGTTACCAATACCTTCTACTACCTATGTAT:1 - chrX 20805562 3' - INE-1 569 1 58.22 ACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTAT:1 - chr2R 19076501 3' - F-element 200 1 57.53 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAAT:1 + chr3R 9482132 3' + roo 9032 1 58.90 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGCATGTC:1 - chrX 15089450 3' + P-element 2868 1 72.60 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGAATTAATTTATGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACAT:1 - chr2L 1245610 3' - hopper 51 1 70.71 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTTACTTTAGCGAA:1 + chr3R 24693706 3' - hobo 15 1 75.34 TGCACATATTATATGTGATTGCGTGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGCACCCCAATTTGAAAGTATTCCGTACTCTTATCACCGAAAACAATGCCTTCA:1 + chrX 20090166 3' + baggins 5235 1 69.18 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGATTTCTCATTCGTGCGAGAGCAGAGCTGTGTTTGCTCTCTCTGGCTCTCTCGCCCATGC:1 - chr3L 20785416 3' + P-element 2861 1 65.07 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGGTACAGAATTTCCA:1 - chr2R 9164807 3' + 412 461 2 63.01 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGAGAGCTTACGCTTGCGCGCGCCAAAAACGATAGGCGGGAAGGGGTTG:1 - chr2L 16685265 3' - P-element 23 1 70.55 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACT:1 - chr2L 9167427 3' + pogo 2040 1 64.38 CACTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTT:1 - chr3R 5940468 3' + hobo 2847 1 78.08 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCAGCTATAGTATTTGTCGAACCAAAGGGGAAAATGAGCTTGGTCGTGGGAAAGAAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGAAAGGCGGAGGGGCGTGGCCACCTGCC:1 + chr2L 6583456 3' - hobo 19 1 67.12 TAATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACGGCTTAGCCCATTATGCTCATACTCTATTTTTATATTTTTTTTTAGCATTATCCAATGCAGGATACTACAAAATCTTAAGACAAATTTGAATTGATTCTGGTTAT:1 + chrX 7325378 3' - Bari1 307 1 73.29 GTTCCAAGCATCGTTCTACTGTTATCTAGGGAAGGTAAATTAATTGAAAGCAGTCTACTGGAATAAGGAATTGAGTGACAAATAAAAAAGATATACGGAAAACATCTGTTGTCCTTCAAGTAGCAAGAAGCAAACGCTACTATACA:1 - chr3L 5407480 3' - Cr1a 4017 1 52.74 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGGAGGAAGCGGATGGCCGCAG:1 + chr2L 17747555 3' - Tirant 8118 2 75.34 CGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTTC:1 + chr2R 20362313 3' - diver 49 2 52.74 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTA:1 - chr3R 4722367 3' - roo 48 2 52.74 AAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACTGGGAATGAGAAAAGATGGAATTATAAACTTT:1 - chr2R 19263453 3' - Doc 97 1 77.40 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTC:1 + chr3L 11196444 3' - pogo 60 1 61.64 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATAAT:1 + chr3R 24175801 3' - Burdock 6167 2 61.43 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCAT:1 - chr2R 8305233 3' - blood 7097 2 77.40 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTA:2 - chr3R 5765315 3' + opus 452 2 54.11 TATACTGTGTGTTTGTAAGTACTCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCCGCACACAAAATTGTTGGATGTGAGTCTAGTGGCAAAAATGGCCCACTGGCCATAAAGCCTGTCAAACAAACAAGAGATGCGTCTGTCCCATTGACC:1 - chr3R 16939780 3' - hobo 89 1 60.00 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCA:1 - chr3R 9482007 3' - roo 8722 2 58.90 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACA:1 - chrX 5222847 3' + 412 7495 2 54.11 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGG:1 + chr2R 23313079 3' - Tabor 6911 2 65.07 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGC:1 - chr3R 25384176 3' - mdg3 55 2 56.55 GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTGCCTGCATCAAAAATCCCTGTTCAATG:1 + chr2R 20913202 3' + 1360 3320 1 63.01 AACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAAAGTTTTCGGCCATGTTTCGCCTC:1 + chr2R 9030820 3' + P-element 12 1 16.20 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTCGACTTTGACCCTGAATATTTATAAGCAATTTCCAGCGGG:1 - chr3R 19088878 3' - FB 75 1 70.14 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGATTATGACTGCCTTACTTAAACTGTGTTATCAATAAGTGATTGACAATCACGAAAAACAAACAAAGCTCCAAGCTCGCTTATTATTATTTTAGTT:1 + chr3R 23664525 3' + pogo 2078 1 70.55 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAATCGATCCATGACA:1 - chr2R 22671339 3' - jockey 4708 1 56.16 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTAAACGCGTATTTCTAGTTTTTATCTACTTTTCAACCTTTTTGGTATTAAAATCAAGTAGTGTGTAGTGTATTTAATGCACA:1 - chr3L 20711965 3' - 297 33 2 63.70 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTTGTATCTTAGCTGCCTATTG:1 + chr2R 6187965 3' - Tirant 8138 2 61.24 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAAGGGTCCGTTTCGGTTGTCTGAATCGTGACCCGGGACCTCCTCGCCCAAACCCCCAAAAAGC:1 - chr3L 22633452 3' + hopper 1412 2 45.39 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCATAAAAAACAATCGACAAATTATTATGCCTGATAAAATACGGTGAGCATATGCTGCATACGGTGAATCCCCGCCAG:1 + chr2L 13877792 3' - Transpac 42 2 54.11 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACGGCAGCTGACCAAACATCCCATCCACC:1 + chr3L 22221270 3' - 412 27 2 65.75 ACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTT:1 - chr2L 5771398 3' - Juan 49 1 52.05 AGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGCCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAATGTCTACACACGACCGACGGCAAACACT:1 - chr2L 18235398 3' + F-element 4622 1 56.03 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATT:2 - chr2R 16908456 3' + roo 9037 1 60.96 CTTCAAGCTTTTATACTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGACACTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACT:1 - chr3L 21484239 3' - INE-1 155 1 52.41 AGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAAATATAACATGGTACAAATTCCTAACAAATAAATGCAAAATGCAGGCAAAATGAAAACATACAAAAA:1 + chr2R 953979 3' + transib2 2499 1 48.63 TTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACATGCCTAAACACTTGCAGTATTTGAGAATCGTGAGAAAATGGTGCTAGTCATGGAATTTGCCGCTG:1 + chr3R 10291863 3' + Circe 117 1 55.48 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCAATGTCATTGTCCCTGTTCGACTATTAA:1 + chr3L 12863796 3' + Transpac 5185 2 55.48 ATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCATATATTTGGGGGCGCGATTTTCGGGGGCTGAGCTCCTTTCGCTGTGTTGGTGAGGTCAGGTGCTCGGGCAATAACTCGCT:1 + chr3R 11553784 3' - hopper 20 1 71.23 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCCGCATTTCGGTTTTCAAGTG:1 - chr3R 30272962 3' + Tirant 353 2 54.17 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGG:1 + chr3R 15649852 3' - blood 75 2 68.28 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATGTAATAAATTATTGGTTTCAGATGAAAGTTAGTAGTATTTTTTTTATTTAGTTAAAAAGGACGTGGCAT:1 + chrX 11228697 3' - roo 8684 2 71.92 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCAT:1 - chr3R 26315882 3' + roo 356 2 52.05 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAGGG:1 + chrX 21639707 3' - Tirant 70 2 69.50 AGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTGCTTTTCATTGGAAATTTAATCTA:1 + chr3L 10076403 3' - X-element 60 1 50.00 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGGCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCATGTCATTTTGGGTTTCTCTTCAGTTCTTTGGCATTTCTCTTGTGCTTTTTT:1 + chr3R 27786648 3' - Tirant 69 2 62.33 AGGAACCCCGGTTGGATCAAATTGGCATATACATCTGATCCCAACACGAGGGAGATGGAGGCCGGCCGTCAAAAACTCGCCCCATTCATTGAGGTGATCCGATCTTTCCGCAGAAATCTTTCTGCACGATTGCATGCAACACCAAG:1 + chr2R 13919742 3' - Max-element 8076 1 53.42 CCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACATAGTTCGTTTG:1 - chr2R 19633212 3' - jockey 4642 1 62.94 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCTCGAGCTAGTACAA:1 - chr2R 982280 3' - HMS-Beagle 6820 2 69.18 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAATGGATCCAAAGGATGC:1 + chr3R 29709101 3' + blood 351 2 64.38 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACTAAAAAGT:1 - chr3L 13597716 3' - blood 7043 2 64.38 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTTTATGCA:1 + chr3L 13722148 3' - blood 32 2 64.38 TTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAGTAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTAGTAATTATTCGTTGATCTTTTGAAACAAGAAACATTTCGCCAAAACAAA:1 - chrX 5892950 3' - Tc1 1569 1 69.18 AAATAAAATAAAATCAAATCAATTCAATTCATTTTAATTAATGGTAATTGAGATGACCTGATATGACCGGCGATCCATAATATTTCGCCGAAATCTTATCTTTAAAGAAAAACATAGGAGCGTACTCATAAGCTTAATTACTAAAT:1 - chrX 16674790 3' - transib1 1897 2 63.01 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTTTTAATTTATTTGCATTAAACTTGTATTACAATTTTATAACATCTATATATGATATAATAGTTACTCGCAATATGCCCATTATTAGGCGGA:1 + chr2R 9815160 3' - pogo 24 1 69.18 AGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCAGTGACAATATAAAGACAATATAAAAAATAAGAAATTACTAATAATATGAAAAAGGAATTGAATTGGAAATAAAAATTGTTTAATTATTTTATCTTAGACTAACATTAATAC:1 - chr2L 22713307 3' - Ivk 21 1 70.55 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTC:1 + chrX 21213365 3' - Doc 90 1 74.66 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAGGATC:1 - chrX 6398798 3' + blood 7318 2 65.07 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAA:2 + chr3R 29709085 3' + blood 7347 2 54.79 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGCGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTT:1 - chrX 15814521 3' - P-element 74 1 33.56 ACTCCTTATCTATCGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTTCGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATCACGTGAATATTTGTCTTGTTTTTGGCATTTACTGAATGGGAATAGGAAATGGTTGTCTGATCAATTAGGAGCACATC:1 + chr2R 19000483 3' - Rt1a 4767 1 51.37 GCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATCGTGGCAGCCAGCATTGCAGAGGATGCCGCCATGCTCTGCTGC:1 - chr3L 9827684 3' + 412 200 2 62.61 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAGAGCGTTAGGCGCTGACTACTCGAACAGAT:1 - chr3R 15465425 3' - mdg3 5261 1 78.77 CCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAGTTTCAATTTTCTAGCTAGCTTAGGATCTTTGAAACTAAGTCATGAGAG:3 - chr3R 27519371 3' + X-element 4642 1 69.18 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAATTGTCAA:1 + chr3L 3540273 3' - mdg3 5260 1 78.77 ATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAA:1 - chr3R 14049353 3' - transib2 83 1 73.29 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGAGCTAAAACACTGATAAAAAATAATGCAAAAAAGAAATAAACTTTTCTGTTTTTGTTGTTAATATCAAGGCATTTCCTAATTTTGATTACAAGAA:1 - chrX 10960162 3' - Transpac 23 2 68.49 ATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTGTTGGTGCTCAACGGAATTATATAGACCGCATTCAGTCGGTTACGACCAGTTAGCCA:1 - chr2R 6187847 3' + Tirant 8446 2 58.22 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATG:1 - chr2R 18882579 3' - roo 72 2 70.55 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAATTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGCGAACCTAAATGGGTTACAGTGGGTGTATCAAAAGTGCAA:1 + chr2R 17986343 3' + 297 320 2 70.55 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGGTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGGGACAAAC:1 - chr2L 12355302 3' + hobo 2851 1 76.71 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCTCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATCTCCAAACTTTTGAGTTATCGAAATTTCCACAT:1 - chr3R 17316038 3' - 3S18 5806 2 48.06 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAGTGAT:1 - chrX 14385135 3' - blood 45 2 54.79 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTATGTTTGCAAAGTG:1 + chr3L 11196467 3' - pogo 37 1 60.27 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCA:1 + chr2R 9164928 3' - 412 7123 2 63.70 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAACGG:1 + chrX 18193861 3' - hopper 10 2 74.66 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAATATATGAAATTACCTTGTTCTA:2 - chr3R 23507531 3' + 412 7529 2 73.29 GATTCCTCGTTAATTAAGCAAACATTTCTCTATATTGCGCATCCATAACCCAGCCACTACGCAGGCACATAGCCACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGAACATTAAGTCACCAAAACATTTGTAAAATAAAACTGT:1 - chrX 8434422 3' + Tom1 69 1 45.89 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGCATTTTGAG:1 - chr3L 1387163 3' - mdg3 5322 2 77.12 AAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTATATTGGAAATTCTTCGTAAAGCTTTAAATCCACATACCTGGACTGCGAAACTCGTACTTGTCCGCATCCA:1 + chrX 2348956 3' + Cr1a 175 1 51.37 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGC:1 + chr3L 16181002 3' - Transpac 36 2 60.96 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAA:1 + chr2R 12703844 3' + blood 7310 2 71.92 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAAGA:1 - chr3R 10099847 3' - pogo 59 1 58.22 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCC:1 + chr3L 22221240 3' - 412 22 2 61.26 CACGATTGTTTCGCCGTGGCTCCAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGAGAGAGCAGCGCACATATTAAATAATAACAGAAAATAGCTGCTGATAACTAAAATTTCGATGTTTAAT:1 + chr4 437122 3' + 1360 50 1 52.74 ACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAA:1 - chr2R 16410029 3' + opus 418 2 76.71 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGG:1 - chr3L 4869157 3' + roo 346 2 60.56 CTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATC:1 + chr2L 6074053 3' - BS 81 1 78.77 ACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGCCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAATCACAACGAGTTACAAGTTATGTTCATTTCGCCGCAGAAGTCTAAACATGTATATATGTAGTCGT:1 - chr2R 19653014 3' + transib2 2672 1 52.82 ACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGC:1 + chr2L 7667485 3' - copia 78 2 72.60 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCGACCCAATTTGCAAAATTTGACAGATTGC:1 + chr2R 21227482 3' + mdg3 5471 2 67.12 AGCTTTTATAGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTA:1 - chrX 693668 3' - INE-1 150 1 38.13 CTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTG:1 - chr3L 12863695 3' - Transpac 4998 2 73.29 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAAAAAATCCTTGCAACAAGGATATAGGATTATA:1 - chrX 22824704 3' + jockey 4987 1 70.99 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCG:1 - chr3R 25271169 3' - 412 57 2 54.79 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATTTGTCTGCAAGCGGTGTGAATATACAAGCGGTATTTCATACAAACAGTATAGGCATACAAGCGGCGGGGATATAGA:1 - chr3R 3257436 3' - Burdock 6176 2 58.22 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTTTCCCTCTCGCTCTGGCAACAGGTAACAC:1 - chr3R 26315852 3' + roo 9050 2 70.55 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATATACTACGTATTTCGTTCATATGGTAGATTTATTGGCCCTTCACTTGACTTGTTTGCCCGCCTTCAATCTGCAATATAT:1 - chr3R 25354451 3' + 297 6933 2 54.79 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATAACCCGTTTCAACCCCCAA:1 + chr3L 21387544 3' - pogo 43 1 56.16 GTGTGTGTGTGTGTGTTGCTGCGCCTGTCCGTGTGTTTGTGCCTCAAGTGGCAGTCATAAATTTGAGATTTATGTTCATCTCTTTTTTCGATTTTGTTGTTTGCGGCGATTGGAAAATTAAAAACGTTTTAACAGCGATTTTGCTG:1 + chr3L 10357727 3' - accord 7025 2 52.05 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATCACGTTGGGTTTC:1 + chr3L 23871317 3' - Doc 83 1 69.18 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTGGAAATATTGATATCACGTACTGTTGCTATAAT:2 + chr3R 26765210 3' + mdg3 208 2 56.16 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAATTTCAAATATGAATATTT:1 + chr2L 7215656 3' - 297 6608 2 65.07 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAATTCGGCAGTCGCTCGGCTTCGTCCTGAACAC:1 + chr2L 20561533 3' + P-element 2872 1 73.79 AAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTTTATCTTCGAATCTAAGTTCTCAGCACTTTTCAACCAATATGGTACACCCATTTCAATTCGAGGAGTA:1 + chr3L 21482948 3' - hobo 461 1 53.42 ACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATGATGA:1 - chr2L 19371261 3' - Bari1 45 1 52.74 TAAGCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTCGTCGGCTTAACTTCTCTGTTACAACATTAGGGATATACAGGATGAAAATAAAAAAGCATTTGATTTAAAAAGAAAACAACAGAAACAGTATAATATTAATGATTT:1 - chr3R 1224889 3' + Cr1a 4051 1 58.90 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACATAACGTACCGCTGTGTAAAATGCTCTTCTCGACACCCAAGCAACATATGCCCGAAAAATACAGAAAGCGGTGCAGATTGTGCCCTACACGC:1 - chr3L 17044919 3' + 1360 3382 2 78.69 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCG:1 + chr2R 16891834 3' - jockey 88 1 73.57 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACA:1 + chr3L 14581504 3' - pogo 38 1 59.59 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATGCTTGG:1 + chr3L 18468426 3' + jockey 4924 1 71.92 CAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGCTTGAATATCAGTATTTAAGTACGTGAATCACTGACGAA:1 + chr3R 21239044 3' + invader2 320 1 77.24 CTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTAAGTTCGTTAGTAAGTTCATGTAAGTAGTTTAAATTTTACCAATTTAACAGTTAAAGATGACTAATTAAGTAGCAACAAATTATGGTAATTTAAATTTTTAAGC:2 - chr3R 13494288 3' - opus 12 2 55.48 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGA:1 - chr2L 12481420 3' - pogo 56 1 55.48 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGC:1 - chr2L 17730443 3' + pogo 2037 1 69.77 AAATGTGTGGGCGTGACAGTTTTAAAAGGTTTGAGGGCAATAGTGAGTGGGAGAGGCATTCTTTTATAAGAAACTTGTAAAAAATTTGTGTTGATTACTTATTTTCTTGAAGTAACTATCAGCGACGCCGCA:1 + chrX 22663949 3' - INE-1 246 1 66.67 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGAGGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGC:1 - chr3R 20452160 3' + blood 7350 2 56.85 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTGTAATCGAGTCTCGAACCGATCGATCCGATACGATACGATCGCAATAGCGCATAGCCATTGCCATCGCGATCGCCGCTTGGGGTTGGCAAGATCAT:1 + chr3R 29207666 3' + copia 244 1 73.48 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATATTTTGCATAATGACAAGTTATCGCACACAAAACATAATTGCATGTATTTGTATTGCAGACATTATGACGTCACCTTAACGATGGCGGACAAG:1 - chr2R 16513090 3' - jockey 36 1 65.07 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTAT:1 + chr2R 7404802 3' + blood 7373 2 65.44 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGC:1 + chr3R 7424661 3' - 412 37 2 58.90 AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATCTAGATAGACGGGTGTATATGCCGTGGGTACAT:1 - chr3R 11771715 3' + S-element 1636 2 76.98 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGGTACATCGAGTGCAAATTGAATAAAAAATAAAAAAGAATAATTGTACAATAGAAAGGATTCCCGAGGAAGTGAAAAGTTTTATTAGAA:2 - chr2L 21342227 3' + roo 9040 1 62.33 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTATGTTTGCAAAGTGGAGAA:1 + chr3L 11196472 3' - pogo 32 1 63.70 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTC:1 - chrX 8272438 3' + roo 8992 2 72.60 AGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGATTTCTTTACCACATAGATTGAACTCGACGAAAACATGAAGTTTGACGAAATGATCTTGGAGGCTGCCAAGGGCATAATGGGAGCATCCGCTGCCTTAGTG:1 + chr3L 8572080 3' + R1A1-element 375 1 68.49 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGC:1 + chr3L 22481313 3' - roo 8741 2 70.55 TCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGAAAAAGCGCAATCAAGGCGTATGGATTTTAATTAATTTTCCCTGCTG:1 - chrX 10984135 3' + roo 233 2 68.49 AATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCACGTGAAAAAAAC:1 - chrX 21474381 3' - 1731 4358 2 80.14 TTTTAGAGAAGCAAATAGTTAATAACATAAAATAAATAAATAAATGGAAAGCGTAAAAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATATTTATTTCATTTACCCCTTTCCAGATGAACATAAATTGAACTCCGGCTCATGGGAGGAC:1 - chrX 17464914 3' + Doc3-element 56 1 59.59 GAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTGTGTGTAGTTTGATATGTGGGTCTCTCTTGAGGGTGTTAGCTTTGATAATTTTGTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGGATGGGTTGGGGATG:1 + chr3R 11855563 3' - Porto1 313 1 49.57 AAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACATTTGTACTTTCTGGTCAAATTGGTGCACTATTTTTTCAGTGC:1 + chrX 8357721 3' - FB 79 1 72.60 CCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACATGAAATCCTCAATCTTCATAATCTCTTGGGCAGCCGACGACAGCTGTGATTCCGTTTCTGA:1 - chr2R 21002161 3' - hobo 2921 1 51.20 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTTAATACTAGCATGTGACGTATCGCCATATG:3 + chr2R 4551494 3' - roo 8877 2 67.81 TATATTCTTGATCAGGCTCAATAGCCGGGGCAACCTGACCATGTCCGTTTGCTATAAGTTCTGCTACATGCTAAAACAATCTATCTTTCTTATTTCTATTGTATAATTTCTCTTGAGAATTGTCATCAACATGACAAATTGTAATC:1 + chr3L 21484761 3' + INE-1 83 1 64.38 TACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAA:1 - chrX 5439995 3' - accord 71 2 67.12 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGCTAATTAAGTTAGAAATGTTTGTTA:1 + chr3L 4869279 3' - roo 35 2 60.96 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAAGAGGTCACAAAAATTGAA:1 - chrX 21668661 3' + mdg1 415 2 68.49 GCACTGAAAAAATTGAAAAAAAATTCTATAAATTTCGTATCTATTTTATATAAAGTTTTTATATTCTGCCACATGTTATATATAAACTGCCGGTGGGGGTGAACGAACGACTAGATTCTACTATTTTTGCATGCGATTCCTCGCAG:1 - chr3L 1405786 3' + TART-B 10501 2 57.53 GTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACACCAATTGGGTTAACAAACGCCCCTATTATAAATTCTGAATCGAAAGAGTAATATTGTTTTAGTATTTACATGTTGGGGAATGTTAATTTGAAT:1 - chrX 11799660 3' - Copia1_DM 32 1 53.42 GCCAGATCAACTCGGCTATTGATCCTGATCTAAAATATATGTACTTTATAAGTTCAGAAACCCTTCCTTCTGCCTATTACATGCTTTTCAACGAATCTAGTATAATAAAGCAGAAATCGTATTACTATATTATTTAATATGCAGAA:1 - chr3R 18084378 3' - INE-1 100 1 55.48 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCCT:1 - chr3L 5490821 3' - 412 7072 2 61.60 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTTATGATTGAGC:1 - chr2L 19878144 3' + mdg3 5451 2 50.00 AAATAAATAAATAAATGGCAAGAACGTTTGAGCTTTGAGCTGTTTACTGGGACAGCTTAGCAACTTTTGGAGTGCAAATTTGTGAGAATTTTCCGTGTTTGGTTTGGTTGGTTTATTTTACTTTCCTTCTTGGCATCTGTATCATT:1 + chr3L 18577548 3' + Doc3-element 85 1 64.38 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAGTTTAATCAAAATGTTTATAAACTGGAGCC:1 + chr3R 8402691 3' + mdg1 410 2 77.40 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGAGATTAAATTTTCAAAACACAAACGAGCACAGCACGAGAGAGCC:1 - chr3L 10856735 3' + P-element 2810 1 32.88 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCTTCTAATTTAAGAAGTGTAATGATGGAGTGTATTTT:1 - chr3R 12787078 3' - 297 6598 2 71.92 ACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATATTTATTTTTTGACAGAAGTTCTCAATCGTGTAGACGGCGCAAAAAGGACAACAATCTCA:1 - chr3L 12682752 3' + hobo 149 1 59.59 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGGTGAGGAAG:1 - chr3L 21097108 3' - mdg3 30 2 56.56 CTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATTTAGTATAAATGCAGTTAATTTTGTTTCGAATTCAACGAGTTATTGCAGATATTTGTTTGTTGCTTC:1 - chr2L 14612828 3' + 1360 3297 1 54.11 GTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACAAGGAGCA:2 + chr3L 8253768 3' - jockey 4660 1 65.75 GAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTGCCCATGCCACACACTTTCCCCACCCCCCATCCCTGGCGCTTTTCCCTCCCTTTTCCTC:1 + chr3R 17316139 3' + 3S18 323 2 63.00 CCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCCGAAATGGTTAAAATCGGAAGAATA:1 + chrX 22386824 3' - hobo 68 1 63.01 CAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGT:1 - chrX 17614356 3' + roo 9031 1 57.53 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTTTAATTAGGTATGTATGACTAGAGTAAAGGAAGAGGAGAAGGAGAAGGAGATAGCTTTTGCTATAGGTCAAAATTTACTGGGTTTCCCCCTGCTTCGTAACCTTC:1 + chr2R 21630635 3' - mdg3 5331 2 55.48 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGT:1 - chr3L 5183698 3' - copia 4932 2 60.27 GCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTGTAAATAAGAACAATTGTGTTTAACGGCAGTGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGTCACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGACATCTCGGCGAGAACTTTCAATGGCTGCGAAGGCAG:1 + chr3L 2626382 3' - gypsy 316 2 76.71 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGCACGGAGGAGCTTCAGA:1 - chr3R 10142888 3' - 412 18 2 71.92 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCG:1 - chrX 17614397 3' + roo 8990 2 73.97 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGC:1 - chrX 14385142 3' - blood 52 2 51.37 CTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAACCGAAAAGCTGTTTTCGCTTTTGTGGCCAACAATTATATACCGCTTGGTCAATGGAACTCGAACTCGCTGCTCAAAAACATGGGTGCAG:1 - chr3R 14813292 3' + Stalker4 7177 4 61.38 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAGAAAACAATCTTTG:1 - chr3L 20076754 3' - roo 8715 2 56.25 GGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCGTCTAGAGGCCGTTGCGAGCCGGGTCTCTCAG:1 - chr2R 15613714 3' + P-element 2877 2 76.87 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACACACA:1 - chr3R 8367107 3' - Doc 19 1 66.44 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGCATCTAATTATGTATACATTTGTGTAAATTGTACTTGGC:2 - chrX 15318810 3' + S-element 1634 2 75.34 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATTTTGAGCGCTGAATAGCAATTTTATACAACACATTTATTCTATTA:1 - chr3L 6774117 3' + pogo 2065 1 60.69 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTATGAATATAAATGATATGGCCTAAGAATATTTTATTTTAAAAGATGGTCGCGAAATTGTCTTAGTA:1 - chr3R 5245533 3' - 1360 24 1 69.66 GTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATGACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTTTCCGCTCTCTCTCGCATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTACAACTAGTAGCAATGACCAGAACGCA:1 - chr3L 25190095 3' - 1360 168 1 59.59 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTCGAAGTAAATAATATTCCCA:1 - chr3L 19146589 3' - pogo 83 1 51.37 GATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGTGCTCTATTTTATAAAAATGTTACGCT:1 - chr3L 16764801 3' - I-element 60 1 54.11 CTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCG:1 + chr2R 9033929 3' - F-element 4556 1 63.45 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGG:1 + chr3L 22481324 3' - roo 66 2 63.01 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAGATGAACACCCGATACGAGAGTTTCTCACGCTGT:1 + chr3L 10856825 3' - P-element 53 1 49.32 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTTGTCAGC:1 + chrX 5222989 3' - 412 30 2 65.07 TCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGG:1 - chr3R 5087017 3' - P-element 67 1 39.58 CGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACT:2 - chr3L 25232692 3' + accord2 203 1 80.14 CCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATCTAATGGATGCGTCACAGCGACAAGAACAACGGAATGGGAACAACGGATGGTAATGGTATCTTATG:1 + chr2R 11228855 3' + Stalker2 14 2 54.79 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTT:1 - chrX 8082366 3' - roo 58 2 58.22 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCG:1 - chr3R 22659924 3' + 412 7472 2 70.34 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAAATTATAATTGAATTCAATAAAGTTGTCGTGTGATGGCATTTGATTTTTT:1 - chr2L 1449533 3' - opus 6 2 79.45 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTT:1 + chr3R 25521907 3' - blood 7059 2 52.74 CTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTCGTTTTCCTGTTGGCTCAAACCAGTTGTTACTTCTGCTCCTGTTGGTTGAGGATTGAAGAAAGGAATAGGCGTTGAGGATATTGTTGGTGCAGCGAAG:1 + chr2L 8138752 3' - G2 2633 1 70.55 TTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACA:1 - chrX 983148 3' + 412 7458 2 76.03 AACAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTGATGATTGATCTACAAAAGTGTTGCAAATGAGGAGTGATAATCCCGCCCAGTGAAATGGCTCAATTCGGTATTCTTTGGGAC:1 - chr3R 30082381 3' - Q-element 243 2 71.92 GTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGACGTTCGCATGTGGCCCTTCAATCATAACCTGACACATGCATTTAGCATTCAGATCTTGATATTTCCCAAATATTTCATAAA:1 + chr2R 12686546 3' + jockey 4573 1 56.16 CGGAAGGAGACAGTTCTAGCAGAGAAAGAAAAGCTTGAGAATTTGTTCCCTGCGAAACACCGGTGTAATCGTGTTGGCGGATTCTGAACCAAAAGCTCATAGTTGTCACTGTTGGTCAACCTGTGCAGCTTATCCAATCCGATAAA:1 + chrX 9964005 3' - Gypsy12A_LTR 2034 1 56.85 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACCTGATGGCTTTTTTACACTTGGCTGCAAAGTT:1 + chr3L 15322114 3' - Transpac 10 2 76.71 CTTTTGTCGCAAGCACGCTCAATTCTCGATCTTAGAGACAACTTAAAGACCCCCAACACACCTGAAGAAAGTCTCCGACATCTGCTTTAATATCTGGAAAAAGTCAACATAATCAATTTGCTATAAACACAGTTTCGTAATACGAA:1 + chrX 19821426 3' + Gypsy12A_LTR 2103 1 73.97 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGATCTAAATATTATTAATAATAATTAAATTAAGAAGTGA:1 + chrX 14914426 3' - mdg3 5335 2 73.29 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCT:1 + chr2L 14969984 3' - Tirant 8151 2 52.63 AGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTAAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAGGAAAGGATTTAATTGAAAAGCACAGAAACTGGTTTCTGTTTTAAAATGAGAGTGAGGCTGCCAACATCGTTTGAT:1 + chr3R 19052858 3' - Quasimodo 7305 2 52.05 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGC:1 - chr3L 14546337 3' + copia 5053 2 67.81 CCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAAGTACCAAATGAAATAGTCTTTGGATTAATTCACTAAGCAGGTGAGC:1 - chr3R 19446271 3' + Tirant 461 1 77.40 CCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTTTATTTCCTACCAAGCCAAGTGGTGAGGTTTCGAGCTTATCAAACGCTTTAACTCTTTAT:1 - chr3L 9211327 3' + Ivk 190 1 58.90 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGGCTGCTTACG:1 - chr2R 21380572 3' - roo 8693 2 64.38 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTATAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCAATTTCTTTCGTTTTGGCTAA:1 + chrX 9710095 3' - pogo 38 1 58.22 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTTCAATACCAAATACAGAGCATTTTACCAATAAAA:1 - chr2L 16942008 3' + mdg1 7429 2 64.38 AAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGCGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATCAATTCCTTCAAAT:1 - chr3L 10506744 3' + S-element 1637 2 73.97 ATAAGTGTGGGCGTGACAGTTTGGGACGGTTTCTAGACAGACAGACGGACATGCTCAGATCGACTCGGCTAGTAATCCTAATCAAGAATATACATACATATATCGTAGATTAACAAAATTTTTACCGATTAAAGATTTAATTTTTA:1 + chr3L 21943296 3' - INE-1 246 1 69.86 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACT:1 + chrX 22824801 3' - jockey 4756 1 77.40 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTCGCTGTGGAAGTAGTGTTGTTGGTGTTGCTGGTG:1 + chrX 13728329 3' + P-element 2870 1 71.20 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGG:3 + chrX 5222981 3' - 412 38 2 59.59 TGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATATAATATGGTGTCCATTACAATCTGTCACATTTTGTTACCCTTGTT:1 - chr3R 27029933 3' + invader1 230 2 69.18 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTAATTAAAAAAAATGAT:1 - chr2R 5067624 3' - F-element 74 1 67.12 GGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTG:1 - chr2L 15142251 3' - BS 4777 1 64.38 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAA:1 + chr2L 5648481 3' - Burdock 75 2 75.34 GCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCACGCCTCCTGCACCTGCCACGCCCACAGCAGTCGAACCCGC:1 - chr3L 9944765 3' + HMS-Beagle2 103 2 81.51 TGCAGTTGAAATAACTTAAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCC:1 - chr3R 10288818 3' + copia 176 2 72.60 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTT:2 - chr3R 25271146 3' - 412 34 2 63.01 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATATCGGATGTTTTGACCGCCATTAA:1 - chr3R 23968575 3' + jockey 4938 1 58.90 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGT:1 + chrX 21213374 3' - Doc 81 1 68.49 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTCAAAAACAAATCAAAGTGTTTCGATG:1 + chr3L 18920507 3' - Juan 41 1 56.16 TGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAACGCCCTGCTGCCGGAGGGACTGAACGTGGCCGAGGACGAGATGATCAACCTGTCGGTGCCCAGCTTCTTCGAGGACCTTGGCAAGCTGCTGGCCAAGACGCCG:1 - chr3R 4722938 3' + roo 8787 2 77.40 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCACTCGATATATCGCTCGAGCATATCGGCGCT:1 + chr3R 9563683 3' + P-element 2816 1 38.36 AATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAAAGCCGAGATTAATATTGCCAACGGTTGTTTCCA:1 + chr3R 14331297 3' + Burdock 256 1 58.22 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAACCATGAACCTGCAATATCAACAA:1 - chr3L 15058820 3' - blood 35 2 39.31 GGGCTTAGTTTTCGCTTTATTTGTATGTATCGATCTATACCAGTCTGTATGGTCGATAGAGCCATGCACGAGTAACGGGTATGAAAACAGTAGCCTTTATAATACCAACACGGCCATAGATCTCTGGCTAACGGGTATCAAATGGA:1 + chrX 16430446 3' - Fw2 36 1 60.27 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGTGCCTTCTTCGATCGCG:1 - chr3R 23254381 3' + pogo 2076 1 69.18 GCAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCAGCACGTGTAAGCACGGGTAAGCCTTTTTGAACAGCTGTGACAAAGCTTTTTGATGGCAGTGACTAGCTAAGGTCTGTGTCTTGGGACAGTTTAGTGCTGCCAGACCGGTGGACTGTT:1 - chrY 2468607 3' + R1A1-element 147 1 34.25 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATT:1 - chr3R 7470959 3' - Doc 38 1 61.54 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTGCAATTGCCCAGGTCCTGGCTCCCAGTTC:1 - chr3R 5765281 3' + opus 7489 2 77.40 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATGGCAACGAGGACAATGCACACACACAGACACATATACACAATCAAGCCAAAAAGAGGGAAAGA:1 - chr3L 14898871 3' - jockey 64 1 58.62 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGA:3 + chrX 19231822 3' - mdg3 79 2 71.23 GGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTTGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAAAAACTGAGAGAAAGAAGGAAAATACGTCGCCATACTGGCCGCATATTCAAATGCAAATCACGCCATCAATATGCAGCACACACTGACATAGAC:1 - chr2L 18229272 3' - F-element 4544 1 66.44 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAACTTCCTCACCGGCATTTCCAACATTTGTTTGTTTCCATT:1 + chr2R 8686689 3' - hobo 25 1 68.49 GCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Cr1a 477 1 56.72 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATT:1 + chrX 18193803 3' - hopper 68 1 63.70 TATTAATAATAATTCAATAATTTGTCGTCTTTTTTGTTAACTTTACTGATGTTGTTGTAAGGAACGTTGTTTTATCAGCGAAAAAAGCAGCGAGGAGGAGAAAAATGTGACAGAGGCGGGAGATACCGAGATACTGAGAGAGAGCA:1 - chr3R 28563834 3' + gypsy9 5320 2 52.05 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTTTTAATTATCCCAAACCCA:1 + chr2L 11573731 3' + jockey 4947 1 52.74 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGC:1 - chr3R 10142904 3' - 412 34 2 60.96 CATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTATCCAACAGATACCAGAAAGATGATGCTTGGCCATTTAATTAAGCGTAATCCGCAGTCAAAGTTGCAGTTAAAGTTGCC:1 - chr3L 2006636 3' + Idefix 32 2 60.27 CATTCAGTTAGTTGATGTCATAGAGAAGCGCTAGTGGTCCCGTTCAACGCTGAACCGCGTCTTCTACGACGAGCGCTGGTCGAAGAACCGCTGCATCACCAGCATGGACTGGTCCACCCACTTCCCCAAGCTGGTGGTGGGCTCGT:1 - chrX 20214225 3' + mariner2 41 1 67.81 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACAATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATC:1 - chrX 10873800 3' - mdg3 46 2 56.16 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCAAAAAACAATATGAATTTTCCCACAAAGAGAAAAAGAAGGAAATGAAACCCAG:1 + chr2R 16383417 3' + roo 392 2 64.38 TCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGGCCAGCTCGATTCCAAGGTCCAGCGCGGTAACGTTAGTTCACGGTCTCCTCGCTTTGCCAGGGTCCAGGTCCAAGGTCCATTGATTACCGT:1 - chr2L 22524523 3' - gypsy8 137 4 79.20 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCG:1 + chrX 18193810 3' - hopper 61 1 58.90 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTTATTTCTACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTG:1 + chr2L 16685410 3' + P-element 2863 1 58.47 ACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTAACATTTGCGCGGTACTGCGTTGAAATGCTGTGTGATTTACTTAGCAAAAACTGTTG:1 - chr2L 18048201 3' - blood 4 2 78.32 TATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTTTACCACGATACTATGTTCAAATGGTGGACCACTTGTTGGAATATTA:1 + chr3L 22016892 3' + INE-1 150 1 67.12 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGGTTGGTGGAAAAAAACCTACAGATAGAATTA:1 - chr3L 18296864 3' + Juan 4199 1 71.92 GTTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTT:1 + chr2L 19878238 3' - mdg3 82 2 70.55 GAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGATAACTGGGGATGTTGTAACGATTTTGTCGGTGTTTTGCATACTCTTTACGG:1 + chr3R 25201477 3' - Tirant 8332 2 63.70 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCAGCTATAGTATTTGTCGAACCAAAGGGGGA:1 + chr2L 6583377 3' - hobo 28 1 63.10 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTCACCGACACTGTCGCAA:1 - chr3R 20137222 3' - Burdock 6164 2 63.57 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAG:1 + chr3L 9426749 3' - P-element 82 1 30.14 TTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTT:1 - chr2R 6984291 3' - HMS-Beagle2 6927 2 55.48 CGTTGCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGACCTTCTACGTCCCTTTTTTTTAACCCGTTTAGGCTTGAGGTTAGCGTTATTGTTCTTTAGTTTCAATCTCAGACCCATTTCCATAACACTGTGCGTGAGTTAAAAATAA:1 + chrX 18129308 3' + 1360 3379 2 78.08 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAGAGAGACAATCTCGATATTATAAATAAATGTTTCTTTGTCCA:2 - chr3L 16725513 3' + 297 6901 2 74.66 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAGGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGACTGTACGGATCCCCGTAGAGCTCCTGGCACATCGTGTGACCCGTAAACT:1 - chr2L 16371521 3' - jockey 4783 1 79.45 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATTAGAACTTAGTGTACTAATTTTATCAGGAAGAATAAATGGGTGCTTAGCTTCACCCGCTATCTTAATAGCTCGAAAAGTAACTCGACTTGGAGCCCACA:1 - chr3R 7649730 3' + Quasimodo 7359 2 78.26 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACG:1 - chr2R 23313009 3' + Tabor 445 2 59.05 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTT:1 + chr2L 14969964 3' - Tirant 8184 2 65.75 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAA:1 - chr2L 1136314 3' + 1360 3379 2 63.53 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCATTCTGCCGGTCGCCTACAGATGGCGCGTG:1 + chrX 22824877 3' - jockey 4679 1 75.86 ATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGAACTTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAA:1 + chr2R 10367579 3' + 412 440 2 51.39 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGA:1 + chr3R 8542701 3' - roo 8700 2 54.79 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAA:1 - chr3R 20292426 3' + pogo 2035 1 67.12 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTACTAAATT:1 - chr3L 13597768 3' - blood 84 2 76.03 CTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATCCATTATCGCCTCGTAGGCCATGCTTCGTGCAGGCTCGTCCTGGTAG:1 + chr2R 7515466 3' + mdg1 7195 2 64.66 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAAGTGCAAGGAAACGCTGATGGAGAAGTGCTCGAAGGA:1 + chr2R 9668118 3' - jockey 4692 1 69.86 GACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATAAGTCAGAACGACACTCGCGCTCATGCAACAAACTGAACCAAAAGAAGCACACAACACGATGCGATTATTACTGGCAGTT:1 - chr3L 9879287 3' + F-element 128 1 60.27 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTGCATAAATAACTTC:2 - chr3R 12795033 3' + mdg1 7386 2 65.75 AATTAAAAATATTATTAGTTTTCTCTGTGTAAAATCACCCATAGTATGCAATTAACTATTATTTAAATTTTGTGAACCCAGGGGTATGGATTGGTGGAGTTTTTAGAATTAAACACTAGCACTTAAGTTTCGTTTTTTCGAT:1 - chr3L 6588295 3' + Burdock 499 1 64.08 TTTCACAGTGTGTATGTGTGTGTAAGTGCTGCTTGAAAGTTCATGCACCGTGTGCCAGTGCAGCTGTGTGGGTGTGCACTGTGTGTCCTTAGTGCATATATAAATTTACGCGTTTTTAGAATTTTACAATTTGGGTTTACATTTTA:1 + chr3L 465832 3' - accord 7107 2 69.86 GCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAATAATTACAATCGGCTACGCGCGATTCACCAAATCACAGCAACAACCACAGTGGGACATGCACTTCACAGA:1 - chr3R 29207520 3' - copia 49 2 52.78 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGACAATAAATAACACAATATGTGTAGACTGTTCGAAGGACAAACAGGTTAAATGCATAATTG:1 - chr2R 14554180 3' - mdg3 5260 1 58.22 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGGTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATTAGCAGTGTTATTCCATATGGTAACACTGCTAAAGAAGA:1 - chr3R 14663169 3' + pogo 2082 1 71.23 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAG:2 + chrX 21213373 3' - Doc 82 1 69.18 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGG:1 + chr3L 16887394 3' + roo 332 2 68.49 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTC:1 + chr3R 23507654 3' - 412 7136 2 73.97 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACG:1 + chrX 15089562 3' - P-element 87 1 25.00 CATTAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAATTTGCCGGTAAAACAACAACAACAACAGAGACCAACAACTCTTATTGAATTAACTTAATTTGTCT:1 - chrX 3389617 3' - hopper 153 5 75.53 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTAAGC:1 + chr2L 15833111 3' - hobo 40 1 56.85 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCAC:2 + chr3L 22481342 3' - roo 8712 2 51.37 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGAT:1 + chr2R 6585520 3' + pogo 2041 1 61.64 ACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAA:1 + chrX 10960286 3' + Transpac 237 2 69.18 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCAAC:1 + chr2R 18882712 3' + roo 392 2 73.29 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCGGGAACGCAACTATATGCACTTCCTTCGCGGCCAATGCAATATTAAGTAGCATGCGGCGACTT:1 - chrX 20552735 3' + roo 392 2 72.60 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTG:1 - chr2L 13884579 3' - pogo 61 1 61.81 GAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAACACTCTCCTACAG:1 - chr3R 4913572 3' + 1360 113 1 64.38 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATATATACATATATATATATGTATATATACGTATGTATATTGTTACGGTGAAGAACAATCACAATCGCGATAAG:1 + chrX 17614490 3' - roo 8712 2 50.68 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTGTAGCTTTCCTAAGTCTAAGTGGTTA:1 - chr2L 6406455 3' - transib2 45 1 56.16 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGAT:1 - chr3R 8542587 3' + roo 339 2 62.33 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGAGAGCTTACGCTTGCGCGCGCCAAAAACGA:1 - chr2L 16685282 3' - P-element 40 1 58.90 TTTTTTTTTTTGTTTTTTATTCATTCATT:1 - chr2R 21246744 3' - Osvaldo 1522 1 86.21 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTGGAAGCCTGTGCCGGGGG:1 + chr3R 31907445 3' + Tirant 8464 2 52.99 TTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTT:1 + chr2R 13574827 3' + diver 141 2 74.31 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGG:1 - chrX 9710001 3' + pogo 2074 1 72.15 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTG:1 - chr2R 18123413 3' - 412 54 2 54.11 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTG:1 - chr3R 25876885 3' - mdg3 5337 2 73.97 GAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTAAGTCGGCGCACTACTTTGTTTAACAAGTGTGGTAACTTAAAGTAC:1 - chrX 10571272 3' - Doc 3 1 67.81 CTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGACATTCTGTTTTCATTTTTTTCTCTTTTTCCCCACTTGGCTTTTATGGCG:1 - chr2L 7936199 3' - mdg3 5429 2 57.02 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAA:1 + chr3L 16973455 3' - S-element 70 1 69.18 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGC:1 - chr2R 11379719 3' - jockey 56 1 53.91 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTC:1 - chr3R 25271143 3' - 412 7084 2 65.07 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATATTTCAGCCTGAAGAAACTGCACAAGGTGCAATTGCTGGTGGATGCGTGCAATGTCTTCTA:1 + chr3R 28725032 3' - pogo 52 1 56.16 GGATCAATAGCCGAGTCGAACGTCGCATTCTCAGGATCTGTGTGTGCTGCATAATTAGCATATAATTATCTGGTA:1 - chr2R 3097209 3' + INE-1 97 1 50.67 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAACTAGTTTGTTTGAGTG:1 + chr2R 10453475 3' - mdg3 5287 2 46.58 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTTCCGGCCCCACCTTTACATGGCAATTTTTAACGCCCTTTTTATGACCAATGA:1 + chr3R 31956872 3' - pogo 63 1 64.14 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTTGCTTAGATGATAAGGTGTCCCACTTATTTGCG:1 - chr3R 21150533 3' + S-element 1634 2 75.34 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTTATTCTTATCAGCCAATAATATCAATTCTTGGTAAACTATAGT:1 + chr2R 18048946 3' - opus 7023 2 76.03 GATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAACGGCAAAAGGAACTTG:1 + chr2L 11867413 3' + BS 5008 1 68.49 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTG:1 + chrX 15167740 3' + roo 329 2 72.60 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATATATACATATATATATATGTATATATACGTATGT:2 + chr3L 16731389 3' - roo 86 2 76.71 CTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCGGAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAGCGGAGTTACTTTGTACTTCAGACTTAGGGGAGAGCGTGCAAATCTCACCTTAACCGAGAGTAATCGAACTATTTGTGATACGCTCCA:1 + chr3R 31260207 3' - Doc3-element 4337 1 63.31 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGATT:1 + chr2L 19417128 3' - BS 5003 1 54.79 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGGATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCG:1 - chr2L 2357303 3' + P-element 2832 1 32.76 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACC:1 - chr3L 22354428 3' - Doc 42 1 50.00 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCAT:1 - chr2R 21380596 3' - roo 50 2 53.15 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAGTGTGCTCCTCTTCAATTGATGATGA:1 - chr3L 13721969 3' + blood 365 2 76.71 CGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTATTATATATTTACGATTAGCTTTAAGATTATAATTATATCTTGAT:1 - chr2L 21791718 3' + Ivk 328 1 69.86 TATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATTTGCCATTGTTTTTAAATGGCCAAAAGCGAGCATACGTAACACGCTTACGTATTTTTGAAAATTCGTGCACAT:1 - chr3R 10791670 3' - Idefix 43 2 51.37 TGGGCGATGGTAATTACGCGATATGCAAAGCGCACACAATTGGAAAGACATAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGCAATAAATATAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAA:1 + chr3L 21093230 3' - Ivk 66 1 69.86 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACAC:1 + chr2R 10552451 3' - S-element 70 1 67.12 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAAATTGCATTGAAGTCCCA:3 - chr3R 13358536 3' + mdg3 239 2 79.45 CATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATG:1 - chr2L 19371265 3' - Bari1 25 1 59.84 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGG:1 + chr3L 5438842 3' - hopper 50 1 52.74 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGT:1 + chr3L 13722141 3' - blood 7050 2 59.59 TGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTT:1 + chr2R 24427624 3' - jockey 4733 1 56.85 GGTGCGTCCTCCTTGCTCACGCACCGTCACCGTTCGACCTGCCCTCCCTTGGCCCGCTGGAGTCCAAGGTCCACAGCGGTACCGTTAATTCACGGCACAGTGCAGTCTGTGGAGGTAGGGTACTGGCTTAAATCCATCTA:1 - chr2L 3373958 3' - gypsy8 4893 2 67.86 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATTGATATTGATATTAGCCCTTGAGTTATATATACACGATGACTGTTAAGAACGGCGATG:1 + chr2R 14247070 3' - pogo 32 1 55.65 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGG:1 - chr3R 22846698 3' - 412 7109 2 55.48 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGATCCAATATCACCTTACCA:1 - chr3L 22519017 3' + pogo 2051 1 74.04 AAACACGAGAGCCGAGCGCCGGTGAGTCCTGACCAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCATTATCTTTTTGTGTTTCAGTGCACTTAGACGTGTGTGACTTGCAGCTATGCGAATGCCA:1 + chr2R 16410117 3' - opus 7043 4 53.08 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCCACCCTAGAAAAGCCACATCGCCTCGCTGAAATTATATTTCAATCAATGTTTATTTGTTTTCCTAGGCAATTTGTTTCAATTTGATGGCGCAAAACATTAATTGA:1 - chrX 9342399 3' - 1360 16 1 74.66 TTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAACAACAACAGAACCCTGAACTCAAGTGAAGTGCAGTGCTGTGAGTGTGGCCAGCGTTTCGGTGGGTCGCTTGTTGTGC:1 + chr2R 13623551 3' + S-element 1672 1 55.48 GTACGTGTAGAACTCACAGTTATGTTCCTTGAGTTGGTTACAAGCTGCATAAGGTGCAATATTCAAAGCTGTTCTTTGTTTAGAAATAAATATATATATGCCCCCTTTGGTTTTTCTCTTTTTGCTTTAAAATATTTTCTTAATTC:1 + chr2L 16379368 3' - Juan 496 1 65.75 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAAAGAAGGCCCAGAAGAAAGATGATTGATTTTATG:1 + chr3R 27835715 3' - 412 7082 2 65.75 TCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGTTATTTAGAATCAAGGGTGCGGTACATATAATTATACCC:1 + chr3R 4926536 3' + gypsy4 32 2 73.29 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGA:1 - chrX 19498097 3' - P-element 83 1 29.45 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATGGTGTCAGGTGTGGTGTTTTTTAGCTGGTGTTTTTGTGTGGGCCAAGATAATAGCCACAAATATGACAACTGCAGCCACTGGGCGTGCCA:1 + chr3L 9317604 3' - blood 33 2 46.21 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTACTCCCTAGCTAGGGGAGAGACAAGAA:1 + chr3L 53121 3' + roo 9055 2 73.97 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGG:1 + chr2L 14262976 3' - blood 7 2 76.03 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTTCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGTACAATCAGAGCTGCT:1 + chr3L 16181017 3' - Transpac 4935 2 70.92 AAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCA:1 - chr2L 17747419 3' + Tirant 320 2 73.29 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTGCATTATAAAAAAGCTCACCAT:1 - chr2L 17228594 3' - mdg3 43 2 56.85 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGGGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGTCTTTCTCCTGCCTCTC:1 + chr2R 15613888 3' + P-element 2875 1 73.88 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATG:1 + chr2R 14884346 3' - mdg3 5309 2 63.01 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCTAACTAACACACATGCGACTGCAC:1 - chr3L 5438761 3' + hopper 1366 1 79.41 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGTGGTCCATGTAGAATTCGATCACCATTTGG:1 + chr2R 23313125 3' - Tabor 6865 2 66.44 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGGGCGTGTCTGCAACGTAAATGGTTAATTGATAAGCAA:1 + chr2L 14222363 3' + Transpac 264 2 53.42 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATTTTCATTTGTTTGCCCCTGTTTTTTTAGTTCTGTTTTGGCTACGCCTTCGCCGTGTTTGGGTTGTTCCTGCTTCCTGTAACTGC:1 - chr2L 5648364 3' + Burdock 6359 2 63.70 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGGAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCA:1 + chr3R 14088645 3' + 1360 3319 1 66.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATTCACGAAAACAGAAGGGCACAGACCGAATTGCCATCGGAGGTACAGCGATCTTCAAGTACAATAGAAAATTTCAGGAAACAACCGAGGAGGATAATGCTAACCCTATA:1 - chrX 8895149 3' + roo 400 1 73.97 GACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACTACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCCGCACCCGCTCACGTATATTACACCAATATTACACACGCGATTTATCAGAAAGTTTTTTAATTAAATCAATTAC:1 + chr2L 17270357 3' + F-element 401 1 56.16 TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCTTTACTGAAATGCTAAGCACTTTC:1 + chr2R 9072968 3' - Burdock 45 2 53.42 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGA:1 - chr2L 15832999 3' + hobo 2871 1 64.38 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCT:1 - chr3L 22529729 3' + roo 355 2 55.48 TAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAACGCAAGAATCAAGGAAACTACAGTCGTGAAAGTC:1 - chr3L 24362862 3' - micropia 5299 1 77.10 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGAC:1 - chr3R 25271162 3' - 412 50 2 52.05 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATTTTGAGCGCTGAATAGCAATTTTATACAACACAT:1 - chr3L 6774128 3' + pogo 2053 1 52.74 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCT:1 - chr2R 5214954 3' - F-element 71 1 58.90 AATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATATGAAGAGGTTCTGGATCTTTATCCCACCCCAATCTTCCCCTTTAATTTATCGCCC:1 + chr2L 177314 3' + Tirant 449 1 62.33 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGA:1 + chr3L 27391421 3' + 1360 3364 1 63.70 GGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATAAGATACTTTCGAGATAAATTCCTAAGCCAAACAATTTACTTTGGCCTTAAGATACTTTCGAGCTTCAAGATAAATTCATTAACC:2 - chrX 13016528 3' - jockey 4657 1 58.90 AACTTGAAATTAAAAATTAAAACAGGGCTATGCATATTAACAGTTACATTTAAAATGTGCTGAACCATTAAGTTAAAACTATTTACTAAAATCTGTTTGGATGTATAACTGTGAAGCCAAGAAAAGTCCAATTAAGAACACATTCA:1 - chrX 5073325 3' + P-element 2642 1 65.07 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGG:1 - chr3L 22221124 3' + 412 449 2 54.26 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCAATACCTGAACCTGTGCTCTCTTTTTTCTCTGGCCAT:1 - chrX 4589395 3' - Burdock 39 2 58.90 TATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAATGGCAAAAGGAAAAGAAATGGCTA:1 - chr3L 22346531 3' + Doc 176 1 66.20 CAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCC:1 + chrX 21639701 3' - Tirant 81 2 74.66 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGGATGCAAAGCAAAATTAT:1 + chr3R 9163934 3' - hobo 75 1 71.92 CATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTG:1 - chr2R 11656022 3' + HMS-Beagle 6969 2 69.18 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGT:1 + chr3R 22429210 3' - roo 86 2 76.03 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAAAACACCGTTCATGCTGTGAGCGAAAAAGAGTG:1 + chr2L 21237342 3' + P-element 2875 1 73.81 CGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAGGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAATGGTTTGTGGCTAAAGAGGGTGGCCAAACAGATGGCTTTCAGCTGGCCGC:1 - chr2L 14574664 3' - diver2 4720 2 68.49 AAACAGGCGAGTGAGATGGTAAAAGTGATGGACACTGCTTGCGATCGGTCTCGACAATACTGACTTGGCTTTTAAGCTACCTTCAAGCTCAGCTCATGGAGGTAGTCGGAGGAAATGGAAATCGTTAAATCTGCCATAAAAAGTTA:1 + chr3R 23238646 3' - gypsy9 4887 1 71.92 TATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7184 2 83.93 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAACTTCTTCAGCGACAACTTAAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACCTCGATCTATTAGGCATTCACGGTGGGATTACCTTCCAACTTTATTGGCAA:1 + chr3R 23254555 3' - pogo 27 1 67.12 CTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCGATTCAATTGTATTGTATGTCGAGCGGCAAAGTGAAAA:1 + chrX 3837470 3' + blood 7305 2 78.77 AGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTTAATACTAGCATGTGACGTATCGC:1 + chr2R 4551488 3' - roo 8883 2 63.70 AGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCG:2 - chr3L 25232688 3' + accord2 207 1 82.88 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCG:1 - chr2R 5992293 3' + pogo 2039 1 62.33 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAG:1 + chr2L 8397205 3' - roo 8716 2 81.52 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGTT:1 - chr3R 4464153 3' + 1360 3319 1 64.38 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTC:1 - chr3L 22221119 3' + 412 7490 2 51.37 TATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:1 - chr3L 25232766 3' + accord2 7556 2 65.75 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCA:1 + chr3R 26399906 3' - roo 44 2 55.48 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCAGCTTTGAGTTAAAGGCCCATTAAAGGACCCCCCAAAAACACAAGTTGCCACT:1 - chrX 20386652 3' + hopper 1358 1 59.29 CTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAAT:1 - chr2L 14222260 3' - Transpac 4994 2 71.92 CTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTAAACGCGCTATTAGTTTCCCCATCGAAAGGGATGGACTGAAGTG:1 + chr3R 20846291 3' - Stalker4 7209 4 70.55 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAATG:1 - chr3L 4639073 3' + roo 9006 2 65.52 TCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCACG:2 - chrX 21474391 3' - 1731 4368 2 80.14 TTTTTAGAACTTGCTATTTGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAAT:1 + chr2R 5237928 3' - Doc 50 1 56.16 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCAATGTCATTGTCCCTG:1 + chr3L 12863784 3' + Transpac 254 2 60.27 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGGG:1 + chr2R 17100140 3' - P-element 40 1 42.73 CCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGCTGCCAGTGCCGCCTTCATTTCCTCGATTCTGGCTCCTTTCTTGTGGGGAAAAAAAAAATCGATAGCCTGACTTTCAACGGCGAAAAGCAAACAAA:1 + chr3R 9088814 3' - roo 263 2 66.67 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAAC:1 - chr3R 31907300 3' - Tirant 8 2 78.74 GTGGAGATCCCAATATTGACGCTCTCACTGCTTTAATGTTCTCAGGAGATCTAACGGGTCGAGGGACTCCAGCTCTTCGTTTTTTCGCACTTGCAGTTTTATCCGGTTCGTTTTCGTCCCTCAGCATACGATGGATACTCTGGTAG:1 + chr3R 13132141 3' - mariner2 377 1 67.81 CATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCATGAATGTACATATGTATTGTACGACTTCGGCATATGCTTACATTTCAAGATAAGAAATAAAAGTTGAG:1 - chr2R 13805650 3' + Stalker4 279 4 53.42 GACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCATAATTGATGGAGTGTGAAGCAACAATAAACCAACCAAAAAACCTAACACAAATTGCAGTTCGG:1 + chr3R 15958739 3' - R2-element 3223 1 56.85 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACT:1 - chrX 22858840 3' - mdg3 5303 2 52.05 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAGTCGGTTTAGGCATTAA:1 + chr3L 9649176 3' - roo 8733 2 67.12 ACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACATGCATGTATCCACTTAGCTGGACATGTGTGGCACAAACATGTTGCTGCTGCTACTG:1 + chr3L 7826671 3' + Bari1 1592 1 51.72 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGT:1 + chr3R 4884478 3' - pogo 62 1 61.11 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATTTTGAGCGCTGAATAGCAATTTTATACAACA:1 - chr3L 6774131 3' + pogo 2050 1 54.11 TTTTTTTTCTCTCTTTCTTTTTTTGGGAGGTGGGGGGGGGGGTAGGTAGGTTTTGTATATTTTGTTGTTGCCTTTACCGCTTGTTTAATTT:1 + chr2R 18573815 3' - transib2 2425 1 74.73 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTT:1 + chr3R 29350781 3' - 297 39 2 68.47 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTATTTATTTTTTTGTTAATTTGATATAGCATTGAACGTTTAAATTGATTTATTTAAGGATATTAT:1 + chr3R 12363315 3' - jockey 18 1 78.77 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCAAAAAACAATATGAATTTTCCCACAAAGAGAAAAAGAAGGAAATGAAACCC:1 + chr2R 16383415 3' + roo 9053 2 63.01 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTATGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGCATAGATGATTTATTTATGCG:3 + chr2L 23400824 3' - S-element 69 1 65.07 CATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTTCGATAGGGGAAAATTAAGTGGGGTGATTTCTGGTGACCCTGGTTGAATAGATTATCTAAGCAGGAAGCGTGAGATCTTCGCCAG:1 + chr3R 25759355 3' - hobo 228 1 62.33 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATAATGATTTCAATAAAGCAAAATCAGAGAATCTTACTTTCATCTTTTATATATATCCTTACATATAG:1 - chr2L 19903301 3' + Transpac 5223 2 47.26 TTTCTCAAAAAAACCAAATTATACGAAAAAATCTGAAAACAAAACAGGTAATTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAGAATAGGACCGCCAATGTCCACATCAGCCCGAACCTGATGGCCCCATACGGAGCGATCAACAGCTAC:1 + chr2R 24106717 3' + I-element 5160 1 54.79 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTGAAATAAGCAATAATTCTTAGCAGTATTCTAACTCATTCGAAGGTAGCAGAGCTTTCTTCTTCTGGAGTATG:2 - chr2R 9815000 3' + pogo 2059 1 60.27 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGT:1 + chr2R 21897977 3' - 412 7111 2 58.33 CTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTACTGGTAGTCAGATAGTTTTCTGCATGATTTTGGAGGATGCGTGCCACCTGAAGCTCCTTCTTCTCCACAGAAGCTGGCCACAGGGGCCCATAC:1 + chr2L 16836001 3' - baggins 5070 1 57.53 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTC:1 + chr2L 6074105 3' - BS 40 1 53.42 ACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGTACTTGCCACACAAACACACTCCCGCAGTGCCGTATATGTACGACATTTGTATGCAAATACTGAGTCGATGATTTTGCATATGTTTG:1 - chr3R 20201097 3' + Cr1a 4402 1 59.59 GTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCG:1 + chr3L 16180954 3' - Transpac 84 2 75.34 TTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAAT:1 - chr3R 14331168 3' - Burdock 6198 2 67.12 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGGCTTTCATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATG:1 - chr3R 31907304 3' - Tirant 16 2 70.23 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATT:1 - chr3R 9563614 3' - P-element 80 1 29.45 GAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAATTATCCGCTACCGTTTAATTGCGCGCTTGGCGATTCTGTGGGCTGCTGCTGGCTGATTT:1 - chr2R 24800396 3' + R2-element 3504 1 59.59 CTACACATTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTATTGACGTATGACTAATAATAAATGATAAACTCTAATAAAAAAAAAGGTAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTGTTTGTTTCAAACAAACATGTTCACGATTAGC:1 - chr3L 6132436 3' + G5A 2786 1 77.40 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCG:1 + chr3R 10140268 3' - P-element 36 1 51.75 GGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACCATACGCCCGACACCATACGAATGTCGTCTCTCATTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTG:1 + chrX 10730490 3' - Rt1a 56 1 52.41 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTGACCACTTTGCCACTCAT:1 + chr3L 22481370 3' - roo 8684 2 70.55 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTTCCGCTATCTAT:1 - chr3L 12863643 3' - Transpac 4946 2 65.07 GATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGG:1 + chr3L 13204784 3' - jockey 85 1 70.55 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAA:1 + chr3R 9163953 3' - hobo 56 1 58.90 AATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTTTGGACCCGGTTATATTGCAAACGGCGGC:1 + chrX 10623930 3' + X-element 4716 1 73.58 AACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGGGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGGCTT:1 - chr2R 544808 3' - HMS-Beagle 58 2 70.34 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATGAGAAAAAATTGTTTAACGTTACTTTACGTGTAAAGGGTA:1 - chr3L 22737372 3' - mdg3 81 2 72.60 CAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAACTAAATCAGTGCTGGCATTGCATTATCTTTTTGGGGCGTGGCGCCAT:1 - chr3R 25435490 3' - hopper 406 1 67.81 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGGCAGTAA:1 - chr3L 9241981 3' - roo 8716 2 58.22 ATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATATATTAATGTTAGTACGGCTTGAGAAGATTGGCATTGAGGCAAGAAATATGAAACTTATGGGATTCTTAAGTAAATTGTGTAATAACAAACTTTAAAGGCAAA:1 - chrX 13030003 3' - INE-1 103 1 67.81 AATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGT:1 + chr3L 18296986 3' - Juan 4145 1 73.97 ACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACAAAGACAGCCACCTAAATAGAAAAAATATCGAATTAA:1 + chr2L 5541340 3' + F-element 4279 1 76.03 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGTGTAAGTTTCGCAAGCCGGCAAATTGG:1 - chr2L 7991225 3' - 297 6592 2 75.86 GCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTGGCGAAATATCTGCAATACGGACTGCTCCGATCTCCATGACTCGTATTGCGCATCTGGGTGTCCGGGGAACGAGAAGGATGTAGGAAACG:1 - chr2R 23308820 3' - Gypsy6A_LTR 380 1 63.01 TATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATTATACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCATGGGACCAGAAGGCAAGCGGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGCGATACCTTGCTCTACAACCGAGTA:1 - chr2L 11867238 3' + BS 5076 1 69.18 ATGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAACTGCGTAGGAATGGCAAACGTCTTCAAGGAGAGAGTCAGAGATTTTCATTTGTCGTTGGTGTTTTTTTTTCGGGACTTTGTCTTAAAGCTTTAAGCAAATTCTTAGCCATACTTGA:1 - chr2L 10784708 3' + Stalker2 7646 2 79.45 ATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTC:1 - chr3R 20147874 3' - 1360 312 1 61.64 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTC:1 + chr3L 20076849 3' + roo 333 2 71.92 TGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCATTAAGTAAA:1 + chrX 22824267 3' + Gypsy12A_LTR 2247 1 58.90 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAAATGGCGGCGTCATTAGGCGTTGACATGCCATAAACAAAAATAGTTTGAGGATAAAAATTGCACAAAAATGCAGTGGGGAAAATC:1 + chr2L 3967173 3' - hobo 37 1 61.64 ATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAACTGCATGCTCAGCATTCCCATGATTCACTCGAATGGCGTTCATGAATATCACATTTTTGTCACCAATTTAAA:1 + chr2L 11886419 3' - Stalker4 7222 4 64.38 TTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGGGCTAAAGATATATACACA:1 + chr3L 22638900 3' - Juan 4115 1 65.07 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGC:1 - chr3R 20452160 3' + blood 338 2 58.22 AGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGT:1 + chr2L 6074115 3' - BS 30 1 60.27 AATTCAATGATAACAGCAGTAGCTGGAGTTGATTGAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTGAATACAAAATCAAACTGACTATAAGCTAACAATATTTTTCATATATTTATATTTATATATATTCGACCATTTTCTCGAAGTGCAGCTA:1 + chr2L 15354095 3' - springer 205 2 61.64 CGTATGGTACTTATTATTCATGCAAACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAA:1 + chr3L 19339406 3' - Tc1 96 1 75.34 GGATCAATAGCCGAGTCGATCTGACCCTTTCCGTCTGTCGAGATTACCATTCCAGAGACAAAGACGCAGCGCGAGTTTGTTGACCCATGCTTCCACGCCCACTCCAAAGCCCACAAACCGAAGAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1 - chr3R 4322609 3' + INE-1 97 1 64.38 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTA:1 - chr3R 25384174 3' - mdg3 5306 2 55.48 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATT:1 - chr3R 23507559 3' + 412 448 2 54.11 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTGCA:1 - chr3L 2036974 3' - Doc 36 1 63.01 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCATATTTAAATGTGAAACTAACCTATTTGAAAATGTGGCATATACAAATTATCATAGTTCAAATTCAATCAGACTACTTAAACTATAAATCTTTT:1 + chr3R 21518162 3' + 297 373 2 56.16 TTTGCATGGCCGCTACGAATATGAAACAGCAACAATGTGTTTCGCTTTCAGTCAAGTACGCCGCAAAACATATTTTCAACGAAGATTTAAAAACAGAGTTGGAATTCAAACAGCTCAAAAACCGCGACTTTAGAGAAATTATACTT:1 + chr2R 4132260 3' + gypsy2 6601 2 63.70 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGGTCCTGATAAGCAAATTTTCTAATCATATTTTAAATACTTTCACTTT:1 - chrX 3506056 3' + Tirant 336 2 65.07 TGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAGTGAAATATGTAAGCTCAACCACATAAGATATATCTACAACATATACCAGCCACTTTATATATTCTTTTACTTAGCAACAATAGAAAA:1 - chrX 22000069 3' - Quasimodo 30 2 65.75 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAA:1 + chr3L 23456275 3' + 1360 3334 1 57.24 AATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGC:2 - chr2L 7459543 3' - BS 5048 1 52.05 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATTGACGCGTGTGCCCAGCGTG:1 - chr3R 25876814 3' - mdg3 5266 1 77.40 AGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATTAAAGATTCTAAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAGAGTTTGCTGGTGGGACGCCCCCGAATAATCTAA:1 + chr3L 25326219 3' + F-element 4281 1 73.97 AAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTTGAAATTGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTTGTATAATGACAGAATAATACATAAATTACATTTTCTTTACAAT:1 - chr3R 15297502 3' - Stalker 6813 3 53.42 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCG:1 - chr3R 25753624 3' - hobo 65 1 62.33 AGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATGACGCAACCAGAGCGCTGTACCCACATCCTTGAGCCAAATCCAGATAC:1 + chr2R 22406476 3' + roo 8694 2 67.12 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTA:1 - chr3R 7569562 3' - Doc 33 1 39.04 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGG:1 + chr3L 17447539 3' - Tirant 40 2 63.39 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGCTTGCTGCTAAAA:1 + chr2L 19372145 3' + Bari1 1662 1 53.42 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAA:1 - chr3R 4659556 3' - P-element 96 1 19.86 ATTTATTATTATATTTAAATTTAAATTTCTGCATTCCAGGACAGTCCTCCTTCATAGTAACTGCAGGTGCACGGGGTATGGGTTATTATGGGAAATTTCAACCACTTGTCTGTTCGGGAGTACCAAACCAAACCGGGCACTTTGAT:1 + chr2L 7340175 3' - HeT-A 337 1 63.70 GTAAATTCGTTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGACCGAAAATCGTGTTCTATGGAGAACTCTCGCACACACATGCATCCCTTCACGCACACCAGCTAGAAAAAGTAGGCGTGACACGGTCGAAAAACTTCAGCCACGTTGAACTT:1 - chr3R 12944188 3' + 1360 3162 1 64.38 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTA:1 - chr2L 18370349 3' - Doc 81 1 69.86 GCACTTTGTGAAAATAATTTCGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTTGTGAATTGCGGTTCTATTGCCTTGAATATGTTCGAGTGTGTGGGCTT:1 + chr2R 20382632 3' - Bari1 12 1 77.14 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACTCAAAACTA:1 + chr2R 7404752 3' + blood 302 2 71.23 CCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCA:1 - chrX 5222887 3' + 412 7455 2 80.82 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAG:1 + chr3L 14581475 3' - pogo 67 1 63.70 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGGGTCAGCTGTTTATGAGTTAT:1 + chr3L 16887457 3' + roo 396 1 76.71 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTATTGGTCCTGATGAAGTAATATGTTCTTTATCGAGTCAGAAAAGAACATA:1 + chr3R 4464233 3' - 1360 71 1 65.75 TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGG:1 - chr3L 18708602 3' - F-element 75 1 64.38 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACC:1 + chrX 5222972 3' - 412 7100 2 53.42 GATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATACCTAAACAC:1 + chr3L 23940561 3' + Cr1a 4404 1 74.66 GGTGTGGACTACCGACCGGCAACGGTAACTGAACCACTTGATATAGATCCGCCCGGTCTGCTCAAGGACGTTCGTCGCCTTTCCGTCCGCTGTTCTTACTTTTGAGGCGATTTGACGAAAACTTGGCATGTGTTCACATTCTAACG:1 - chr2R 3340378 3' - R1-2 470 1 55.48 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACT:1 - chr2L 4416042 3' - jockey 67 1 56.16 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTATTTATTTTTTTGTTAATTTGATATAGCATTGAACGTTTAAATTGAT:1 + chr3R 12363298 3' - jockey 35 1 67.12 TAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGA:1 + chr3R 29709059 3' + blood 7321 1 63.01 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTCGAAGTATATAATATTCCCATTTTATATAAATTGCTTAGCGCTTTTA:1 - chr3L 19146562 3' - pogo 56 1 56.85 TTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAATTTAATTGGCTTTTTAAACTAGGTCGAAAATCTGACTCGAAATGTTAACACCATTC:1 - chrX 18239325 3' - jockey 4532 1 63.01 ATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAATTG:1 + chr2L 5712 3' - G6 34 1 56.16 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTCGGGGCACTATCTGCA:1 + chr3R 5940528 3' - hobo 63 1 60.99 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCG:1 + chr3L 9430654 3' - P-element 71 1 36.99 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTCCAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGTGTGCAGCTAATGAAGCGAG:1 + chr2L 15965357 3' - blood 7022 2 77.93 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTAAATGTTTATTACAATGAAT:1 - chr2L 10937836 3' + mdg1 361 2 58.22 ACATATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTATGAGTAAAGTCATTTTCTTGTTTACTTCGTTGTAAAATTCTGTAATGGTCATACGTCCCT:1 + chr3R 908380 3' + TLD2_LTR 131 1 60.96 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTTTCCGTACTGATTTAG:2 - chr2R 18123368 3' - 412 9 2 73.97 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGG:1 - chrX 18193727 3' + hopper 1336 1 73.29 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGG:1 + chr3L 4023722 3' + pogo 2040 1 60.96 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATAC:2 + chr2L 17069638 3' + 412 425 2 65.75 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTGAATGTGTATTTGTCTACATGACAAGTAGGCAATATTTGCATACTCAATT:1 - chrX 7467885 3' - hopper 15 1 75.34 CGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTTGTGCACTTTTTTTTTCACACACAAACTCGAAACAGAAAATGCCATTAATGATAC:1 + chr3L 13925087 3' + Tirant 8282 2 60.71 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGAAGATAAGTACTTATCATTGGAATTATTTGTCACAATAATTAAAAGAAAACTTACAATTCAAGTAAGTTATCTGTTCCGGAACTTCCAGAACTCACAT:1 + chr3R 23449384 3' - roo 23 2 69.86 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGATTACTCCCCCCACACTTGTGGCAACCTGTAATCTCCAAAAATCACAC:1 + chr2L 3006180 3' - pogo 36 1 63.72 TGAGGAGATTGAGTGAACCTCATCGTCAGAAAATAGGTGGTCGGACGTGGACATAATTATAAAATGAAGATTAGGATATAGCACACTTAAACTTCCGATTTTTCGAGTAAACCTATACCATGAGTTCAAACAGGTCAGCAACGCTA:1 + chr3L 23228566 3' - TAHRE 485 1 64.38 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGTGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGTGTAAGTGCCCAGTACGTGAGAGCG:2 - chr3L 14863803 3' - Transpac 4948 2 66.44 CTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGAGGAGATCGC:1 - chr3R 14088584 3' - 1360 90 1 79.45 ATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCC:1 + chr3L 21093211 3' - Ivk 96 1 73.29 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGA:1 - chrX 15089529 3' + P-element 2789 1 18.49 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACC:1 + chr3L 22221210 3' - 412 7140 2 76.71 CGTTTAAATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCTAAGAAGTACGCTGGTCAATTAAATAATTTCGTTTACGGCACTTAATTTAAAGAAACAAAAAATTTCTTTCGGTAAAGTAAATAAATGATCACAGTTCCTCGAAAATGTGTAT:1 + chr4 625920 3' + jockey2 3324 1 59.59 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAA:1 + chr2L 12142652 3' + hobo 2911 1 52.25 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGG:1 - chr3R 7424530 3' + 412 7492 2 54.48 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCCAGCCCTCTGTCCCTATGCACAGAAAGAAA:1 - chr2R 22867383 3' + hobo 2910 1 64.38 CCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGGTTTATTGCGATTGGAAATTGAGCTTGACAACGCGGCAGCGGGCAACGCTTGGCTA:1 + chr3R 6914894 3' - G2 167 1 54.47 TTTATTTTATTTATTTAGGAATTAGTTTGAAAAATAATTCATTGGCAGATTCATTAATTCGCATCGGTTGCATTTGCCTGAGAGCTCCAAGTCCAGGTATAATTAATGCCCAAACACTTTTCTTCGCCCTTACCTGCGGCTCATGA:1 + chr3L 14335015 3' - G7 1143 1 63.70 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGC:2 - chr3R 29708977 3' - blood 7085 2 69.86 GCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCAGTGTTTGCATACAGTTATAGTTGGCTAAGCTGCTGGCTG:1 - chr2R 19903978 3' - Doc 4434 1 66.90 GTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTGTTATTACTTTGCATTGCTGCTCCATTTATCCACACTTTG:1 + chr2R 24471984 3' + hobo 253 1 72.60 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGAGTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTNACGCTCG:1 - chr3L 15371278 3' - Transpac 4964 2 51.77 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACT:1 - chr3R 20292444 3' + pogo 2035 1 76.56 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATT:1 - chr3L 18468368 3' - jockey 4749 1 71.23 GTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCATGCCTATCTTTAACCAATAATCCCTTTAAACTCCTTAACTTTCAGTACATGGGCTATGCAGCGGGAATA:1 + chrX 16679987 3' + Quasimodo 262 2 52.74 GAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATATTGACTACGGCGAGGACGAGCGGAGGAATGCGAATTTAAGTGAAATAAATGACTTTTACTTACTAATTAATGCCGTCGTAGCCGGCGCCCA:1 + chr2L 18163898 3' - HMS-Beagle 6816 2 71.92 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGCCGGGCACAAATTAAAAATGCCCCACAATTGCCCGCGAGCTT:1 + chr2R 24338494 3' - 1360 20 1 71.03 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCA:1 + chr3R 29709049 3' + blood 7311 2 69.86 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGAAGAGTGCTTATAGGAG:1 - chrX 3529715 3' - 412 7081 2 62.60 GCTAGATTTAGTTTCGAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCGGCGTCATTATATGCATATGTG:1 + chr2R 17014121 3' + HMS-Beagle 6979 2 60.27 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCATCACCCTTCTACTACATAAGATGGATGGAATG:2 + chr2R 22255474 3' - roo 8674 2 76.03 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTAAAATTTAAATTTTAACATTTCGCTGCATACTTTCAAA:1 + chr2L 1136434 3' - 1360 30 1 63.70 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATTGCGCATACGCGCCATCTAGCGGCG:1 + chrX 21605781 3' + P-element 2879 2 69.47 ATTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGGGCAAGAGAAGCGTGCTCTCTGAGAAAGTAATAAAGTTGCCAGACAGATGATATCCAATCTTATATTTCCAACACTTTTGCTTAAGATCATGATATGCAGGGTAAACGCATTTGGATAGC:1 - chr2L 14725979 3' + frogger 106 2 78.08 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATGTGTTTGGATGCCTATCGGCTGGGCGGAGTTTTCTTTTCGCACCTTACCGCTCGAATCGATCATGACAA:1 - chr2R 23312938 3' + Tabor 7314 2 71.23 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATAATATAATATAATGGTAAGAGTCTTCCCAAACTCAAAAATATTTATCA:1 - chr3L 15261265 3' - pogo 68 1 67.81 TTTCTCTTTTTAATTTTTCATTTTCATAGAAGGCATTCAAATAATTTTTTCTATTTATCAAAGGTTTTTTTCTATTGTGCCCATTATTTATCATCCGATATTGATCTCCCTTTCTTTACTTTCGAGGACACTTCCCCTTCACTTTC:1 + chr3L 12605873 3' + Tc3 43 1 58.90 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTC:1 - chr2L 2357297 3' + P-element 2808 1 31.51 TATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGATCAAAGAGGCTATATATGCATGTAATTTATCGTGTTATAAGGTATGGTACTAGTGTACGTTAGCTCGATG:1 + chr2L 6678487 3' + R1A1-element 301 1 51.72 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCA:1 + chr3L 5438840 3' - hopper 52 1 54.11 GACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGACCTAAAACACAACAACAGCTTATGACTGTAATAGTCGAAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAGTGAGTCGTGTGCAAAAGGCAAAATTAGTGTAAAGCATTTTCCAAAGGC:1 + chr3R 3179371 3' + S-element 1261 1 65.97 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGA:1 - chr2R 15080012 3' - roo 63 2 62.33 AATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTCATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGGACAGATATCAGTTGTTAGCCCATTCACGAC:1 - chr2L 18610299 3' + R2-element 3215 1 77.40 TGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGA:1 - chrX 18366045 3' - jockey 99 1 78.77 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTTCCATCCA:1 + chr3R 9345703 3' + pogo 2072 1 65.75 TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCACTATATAAGTTAACCCTAATAACCCTAATAAGTTAACCCAAAAAATTTTCACTGATTATTTGGCCGCCAAGAGGAAAAAAATGATAGCTATTTAAC:1 + chr3L 25078470 3' - Transpac 21 2 69.86 ACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCA:1 - chr3L 22354438 3' + Doc 308 1 65.75 ACGGAGTTCAGCGCTCTGCGCTACGAACGGTCAGCAACAGCAATTGGACACCCCTTATCCGGGGTACCTATACAGTTCTGTGTGTTTTGGTATCAAAAGATACGGGAAAAATATTCGTTTTTATTCTTCTAACAGCTATTTAAAA:1 + chr3L 24074283 3' + gtwin 80 2 53.10 ACTTCTAAGGTGAAGGGCATATCTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCCCACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAATAATGTAATGGTAATAATGTTTTTTTACTTTCTGGCCAGGTTTTGCGGGT:1 + chrX 22992252 3' - 1360 219 1 65.75 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATT:1 - chr2R 21380603 3' - roo 53 2 56.83 CGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATG:1 + chr2R 2949147 3' - 17.6 41 2 57.93 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCTTTACTGAAATGCTAAGCACTTTCTGAATT:2 + chr2R 9072974 3' - Burdock 6175 2 57.53 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAA:1 + chrX 10310336 3' - hobo 65 1 63.01 TCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATCTATTTCGTCACTAATTTGGTAAGCTAAGCTGAGCCCACACTTTTTTCTCTCTGTGC:1 - chrX 19044806 3' - P-element 2798 1 39.73 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGTGAGTTTGAG:1 - chr2R 24630096 3' - copia 32 2 60.96 TGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTG:1 + chr3L 19274871 3' + transib2 2744 1 73.29 TATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGA:1 + chr2R 2949139 3' - 17.6 50 1 53.42 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGCGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGGTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTT:1 - chr3R 26782701 3' - hobo 47 1 55.30 GACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTAAATGTAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTATAGATAACAAACCTGAGCCAACTGATCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTAACTTGTAT:1 - chr2R 3097970 3' - Gypsy6A_LTR 204 1 67.41 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGA:1 + chr2L 17069630 3' + 412 418 2 71.03 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGAGAGCTTACGCTTGCGCGCGCCAAAAACGATAGGCGGG:1 - chr2L 16685274 3' - P-element 30 1 65.28 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCACGACGCCCACAAATCGCTAGCGTACGAG:1 + chr2R 6052724 3' + mdg1 7434 2 67.81 AGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCATTGGTACGGAGTTACCACACTGGTACGAGG:1 - chr3L 25492646 3' + Porto1 184 1 78.57 CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATATAGTA:1 - chr3R 27786563 3' + Tirant 327 2 69.18 TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTC:1 - chr2L 20984316 3' - blood 7089 2 71.92 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTG:2 - chr3R 6782732 3' - jockey 4762 1 75.34 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAGTTTACAAGCACAGGTCGTTAAAAGTTACTTCAAGATCGACAAAACAATTGAAAGTGAATAAGTTCTAATTAGAC:1 - chr2L 8452224 3' - copia 46 2 53.79 ACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTTTGGGCAGTTGAATGTGGGCAAAAGCCAGGCCAGTGGCAAACTCTTCGAAAAGAGCCCTTATCTGTGGCGAAAAGCACTG:1 + chr3R 28831409 3' + Chouto 414 1 49.32 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTTACTTTAGCGAACT:1 + chr3R 24693708 3' - hobo 13 1 76.71 CAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCATATGCATATATGGTTTTGTCTACCTAAAACACCTAAAAAAAAG:1 - chr2L 10397806 3' + roo 8905 2 70.55 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCATCGGATTTATTGCCGCTCATT:1 + chr3R 20704931 3' + HMS-Beagle 213 2 72.94 ATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAATACT:1 - chr3R 3922954 3' - Cr1a 81 1 71.22 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTTGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTGTATGTAAAGCTAATTTCATCTCCACCTTATCGAGGTGCG:1 + chr2L 14222330 3' + Transpac 274 2 62.14 TTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTTTTTTCCCCCCTTTTTGTTTTTATTTTCCATTCAAGCGCAAATTGCGTG:1 - chrX 7526814 3' - I-element 4910 1 66.44 GTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCATTCACTGTATTTT:2 + chr3R 6053092 3' - Quasimodo 29 2 66.44 AAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAGCTAGTAAGCATTTTATAATGTTATTTTTTTAGT:1 - chr2R 13574702 3' - diver 12 2 75.34 GTTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTC:1 - chr2R 5070918 3' - gypsy5 24 2 26.21 ACACGAGTTCTCAATTGGTTGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCGTGACACGCACTTCATAAAACTCTGCTCATA:1 + chr3L 13597880 3' + blood 359 2 66.42 GCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGAGAGGTTTATTGTACGACAATCGTCGTTGCATGGATGATGCTGCCTGGCTTGAGAACCCAA:1 + chr4 954687 3' + 1360 468 1 54.20 AGTTAAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAGCAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGATACTTTCATGTGCCCATTGGCAATATGCCGCCGG:1 + chr3R 23353300 3' + invader2 349 1 72.60 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGAGGGCCAAAAAAAAAAAGGCGGCATGCAGGAGTGTTGGAAAATCGGAAAATTGGAAAATGGGAAAGTT:1 + chr3L 16535270 3' - copia 4914 2 52.90 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGT:1 + chr3R 9482141 3' + roo 9041 1 65.07 CAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAATGACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTAATGACAAGGGATGACCTAGCAAAGGGTAAAGCTCGAAGGTCACAATATTGGACTCCTGGTGAAAACG:1 + chr3L 9827648 3' + Cr1a 477 1 73.10 GAATTCATTATTATTCTCATTTCACACCACAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACA:1 + chr3L 25232856 3' - accord2 70 2 58.62 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGAAGGGG:1 - chr3R 9993384 3' + hobo 2863 1 77.61 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCAT:1 + chr2R 21897965 3' - 412 7125 2 67.12 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATGAGTGGTGTGAAGTGCCATCGAGTGATG:1 + chr2L 1449734 3' + opus 485 2 75.34 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGACAGTGGAAGTGGACGTGGACATGGCACACACATGGCATGCAGATG:1 - chr2L 535388 3' + roo 9031 1 57.53 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCA:1 + chr3R 13358679 3' - mdg3 66 2 62.59 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGAACTGAATCTCTGGCCATCAAATACTTGGCG:1 - chr3L 4023571 3' - pogo 14 1 76.03 AATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAAACGCGCACTGTGGTCTTCGCTTTAA:1 + chr2R 14562305 3' + Burdock 256 1 44.52 AACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAATATTATTCGTGTTTCCATTTACTAACCTAGCAGGGAAAACTCCATTGGGGGGATTCGCGACTATGATAGACTA:1 - chr3L 22304676 3' + Transpac 483 1 50.68 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTGTGTATCATTTTGCTGCAGACACTGATCCAA:1 - chr2R 18048765 3' + opus 475 2 68.49 CTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCATGTTGACCCATGTTGCCACAAATGCCGAATAGAAGCGGGCCGCACATGCGGAAATAGGCTA:1 + chr2R 24021483 3' + INE-1 131 1 73.29 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTAT:1 - chr2L 14262848 3' + blood 7323 1 60.96 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGAAGGATGTGCTGATATTATTCCTTGCC:1 + chr3R 12540261 3' - flea 31 2 64.38 GAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGTGCTCTTTAAAGATTTAAAATGAAAGACATAAGCGTA:1 - chr2R 15118519 3' - Transpac 5126 2 74.66 CTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGT:1 - chr2R 8793909 3' - Transpac 5006 2 78.08 TTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTC:1 - chr2R 5582147 3' - Cr1a 466 1 60.27 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAAG:1 - chrX 20552806 3' + roo 8984 2 76.71 TATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTCTGTCTTATTTGTGTGACAAATGCACTTAGCACACGAACACTTTTCACAAACTTCTGTCAAACTTCATAGCCCACGGTAACATCACGGCAATTGC:1 - chrX 13540472 3' + Transib5 2952 1 64.38 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGAT:1 - chr3R 25384154 3' - mdg3 34 2 62.33 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGGAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTATCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTC:1 + chr3R 5940513 3' - hobo 74 1 69.34 AAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAG:2 + chr3L 21093256 3' - Ivk 39 1 58.90 CCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCTCGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 4896 1 64.38 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTTCGGATCGCCTCAGCCCGTTC:1 + chr3R 23507730 3' - 412 7 2 76.71 TGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAATTGGTGGGTTGGTACT:1 + chr3R 24229001 3' + opus 7472 2 63.89 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAAGGTCGCTCCTCCACACGCACATTATCAAGCACAAACGAGG:1 + chr2R 5849077 3' - mdg1 19 2 65.00 CCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATACTCAGTAAATAATTTGCTAACGCTCTGCGCGTATAGTACCAGAAACAAACGGATATCCAACGATTCCCTATCA:1 + chr3L 23245693 3' + HMS-Beagle2 207 2 57.53 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACAAAAACATTCCAAATTCAATTGCAAATTATGCATTTATTATTAACAATTGT:2 + chr3R 15590096 3' + Transpac 285 2 69.18 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAAGTGCACATGAAAG:1 + chr2R 10991435 3' - jockey 23 1 75.34 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCTTTAGTTTTTAACTGAAATTTAAACCAA:2 + chr3R 19545463 3' + jockey 4982 1 76.71 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATTGGTTCCGGTTG:1 - chrX 9709959 3' + pogo 2055 1 55.71 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATG:1 - chr2L 1229560 3' + opus 455 2 52.74 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGCCCCAAGAT:1 - chr3R 4885302 3' - 1360 43 1 56.16 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGCATGTCTGGGCATGTCCC:1 - chrX 15089438 3' - P-element 7 2 80.82 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAATTCCGCGCCAATGTCGATTCTGTT:1 - chr3R 9938551 3' - roo 8683 2 73.29 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGC:1 - chr2R 9164826 3' + 412 450 2 52.90 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTTTTTTAAAATATAGTCTCCC:1 - chr2L 17638690 3' + blood 7327 1 58.90 TTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAATGGGAAGTCAGGTTGTTGACATTGTTGCAGTTCAGTTTTAAC:1 + chr3L 18012532 3' + pogo 1939 1 71.92 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGCAGCAGCTGCATTA:1 + chr3L 5490927 3' + 412 424 2 65.94 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTTGTATAGGTTTCGATTTCTTTAGCGGATAT:1 + chr3R 24228966 3' + opus 441 2 66.42 AGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTAAGTAGATTTACGCATTCTTACAATTTATTT:1 + chrX 13358730 3' + Bari1 192 1 50.68 GAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAAAGAATCATCAGGGGATTGTAGTAGCAGAAAAAACTAACTAACTAATTTTAAGTTATTGTGTCAATAATATAAATATTGTA:1 - chr3L 4518107 3' + Doc 4406 1 55.48 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGA:1 - chrX 19162582 3' + pogo 2049 1 60.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTG:1 + chrX 10979099 3' + roo 9015 2 61.87 CGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACAGGTGA:2 + chr2L 6074135 3' - BS 10 1 73.97 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAG:1 + chr3L 20290781 3' + roo 354 2 55.48 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATC:1 - chr3R 5765313 3' + opus 7458 2 55.86 TTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAGATACACAATTATTGCAATGCTCTTATCCATTCCAA:1 + chr3L 10506808 3' - S-element 84 2 76.03 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAG:1 + chr2R 22692439 3' - Ivk 55 1 54.79 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATAACT:1 - chr3L 15891001 3' - mdg3 50 2 55.00 ATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGTCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACATCACACATTTTCAATGTGTCTCCTTTCGACATCACTCATATCATATTCACCACAACCCCCATTGCATTTTATCCTGCTCGA:1 + chrX 10346751 3' - diver2 292 2 55.48 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGA:1 - chr3L 1387148 3' - mdg3 82 2 71.03 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAGTGAGCTCCTCTT:1 - chr3L 13721982 3' + blood 352 2 66.44 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAGATATATGTATATGCAGCTCTCACGCTTGACAGCACGCTAATCAGAATCAAGTGATGTTCGTTTTGCTGCACTCAGTTCTGGGACTTGGGAGGT:1 - chr3R 31071704 3' - opus 7022 2 71.23 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGGTGCATTGTTGTTGTAATGTAATTTAATTAAAATATAT:1 - chr3L 6751620 3' - pogo 28 1 64.38 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTCTTT:1 - chr2R 21078382 3' - jockey 34 1 63.70 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTA:1 - chrX 18913281 3' - Quasimodo 71 2 78.77 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGTGTGGGTGTGCGAGTGCTGCTTGTGTTTCGACTGGGATTTTTATAAAGCCTAAGGTAGTTTGATGTTATTT:1 - chr3L 17447435 3' + Tirant 8458 2 52.74 TGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATATT:1 + chr3R 24175801 3' - Burdock 37 2 60.27 GCTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACG:1 + chr3R 22846786 3' + 412 7467 2 71.92 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGGCCATCTTTTCGACTGGCTAAATTAACTTTTTGAGCCGCCTCTCACATGTTGTTTT:1 + chr2L 13547097 3' - P-element 20 1 70.50 CGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAATCGATGATATAGGTTCTCAGACATACATACACTGAAAGTAAAACATAA:1 - chr3L 16080848 3' + Stalker4 7148 4 67.81 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTAAATTTTGGCATCAAAAGTTG:1 - chr3L 11669764 3' + Tabor 7278 2 51.37 GAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGGTCTTAACAAATGAACCATAAAATCCAAACGTGCCGAGGAAAACAGAGCGGATAGCGCTCCGT:1 - chr3R 30357947 3' - Tirant 8378 2 62.33 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGC:1 - chrX 22858856 3' - mdg3 67 2 62.33 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATATGCAC:1 - chr2L 10089714 3' + 297 354 2 61.64 AAAAAAAAAATAATGGGAAAAAACTGTGTAGCCCATTGTGTTGTTTTTGTTATTTATGCGCAAGCACTATATGTGAGCAAAGTTTAATTTTCTTTTTTTT:1 - chr3L 6271025 3' + Tc3 137 1 69.00 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTATGCAGCACCACTTTCAGTCAAGGATAACTGTTGC:1 - chr3R 17315989 3' - 3S18 9 2 76.71 AGAGGCTACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCATTAACGTGCCACGTTGACATCCCCTTGCAACAACGGTGTAGGCGGAGGCAAAAATCCAACGATTGCGTTACACAT:1 + chr3R 3353738 3' + Chouto 454 2 77.40 TCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGAC:1 - chr3L 13722042 3' + blood 293 2 79.45 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCCAAGTTTTAGGCCAGCATTTTGCTGCCTTTGTTCCACCCCATTCTCTCATCTTTTTTTTTGC:1 + chr2L 4104142 3' - roo 17 2 74.66 AGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAAAGCGTCCCAATTTTAAGGGAAAACAGATTCCACCCGTTGATCGTACATTTCGCACCAAGCTCATAAACTTTGGACCCGCGCATCCGGCGGCACAC:1 + chr3R 25358792 3' + 297 420 1 72.60 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTC:1 + chr2L 6074116 3' - BS 6 1 72.36 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAACTAGTTTGT:1 + chr2R 10453468 3' - mdg3 42 2 43.84 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGCTTGCTGCTAAAAAGTGT:1 + chr2L 19372150 3' + Bari1 1667 1 56.85 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGT:1 - chr2R 22671377 3' - jockey 4746 1 70.55 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGGTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAG:1 - chr2R 9164847 3' + 412 442 2 60.80 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCAGATTAAA:1 - chr3R 6103554 3' + Tirant 8466 2 58.22 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAAATTCGTATTGAA:1 - chr2L 17730391 3' + pogo 2072 1 64.38 TATATATATATATGTACATACAAGTACAAGTAGTGTCTAGAATTCTGGAACTGAAACCGAAACTT:1 - chr3R 30301780 3' - invader3 5087 1 67.69 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAAAGTAC:1 - chr2L 2690557 3' - hobo 28 1 62.31 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAACTTGTATGTCGAACTGGATTTGCGGATCTCTTTGACTCGTTCCGGGCCAATTGAGCTGACAACGAAAACACTTTGCCGGCTATTTAAGCCGACCGACGGACGAA:1 + chr2R 20856341 3' + Juan 4202 1 75.34 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTGCCACAGGATATGGCTGGG:1 + chr2L 16685428 3' + P-element 2856 1 63.64 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTG:1 + chr3R 20292525 3' - pogo 61 1 62.33 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATG:2 - chrX 18366042 3' - jockey 96 1 76.71 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACT:1 + chr2L 19417118 3' - BS 5013 1 52.74 GTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAA:1 - chr3R 15589981 3' - Transpac 5003 2 75.34 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGGTCTCTGGTACAGAAATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTTAAAAATAATTT:1 - chr2L 15833014 3' + hobo 2877 1 67.20 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACT:1 + chr2R 16891843 3' - jockey 85 1 68.49 GCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACA:1 + chr2R 10552450 3' - S-element 71 1 67.81 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGACTCTACGAGTATTATAAT:1 - chr3L 21630290 3' - Burdock 35 2 61.64 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACCGATTATATTGAGGGGGAGTTTCAGTCAACGAAAAGAAAAT:1 + chr2L 8542798 3' + P-element 2807 1 25.34 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGTTTTCGAGACCCTGGGAT:1 + chr2R 21380752 3' + roo 395 1 75.34 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAA:1 + chr2L 16685403 3' + P-element 2830 1 45.83 TAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAA:1 - chr2L 5771404 3' - Juan 55 1 52.74 TTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTAAACAGAACGTAGGGTAAAGGGTATTTTATAAATTAATCATTATACCTACTCTTAAATATTAATTAGTTGCCTATTTGGGGTTTTATTTTTCACAATGTTGCATATGAGTTATGTTCTGGAGCTT:1 - chrX 787886 3' + hopper 150 11 82.88 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGCTTCTTAT:1 + chr3L 131802 3' + P-element 2815 1 32.86 GGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGCTTTTGTCTCGTGGCGCGCCAAAACTTTTCTCATTAAGTGGCAACGCCGGGTAG:1 + chr2R 17182792 3' - jockey 4625 1 62.33 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCGTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATACATACTGACTTAATATAGCTAAGATGGATCTGGCAATTAAC:1 + chr2R 18048888 3' - opus 185 4 70.00 GCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACC:1 + chr2L 19903475 3' - Transpac 59 2 57.93 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTG:1 + chr3L 8253726 3' - jockey 4702 1 63.01 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTC:1 - chr3R 19700852 3' + roo 9030 1 56.85 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAAGAACAGAAATCGAAGGTGCAACTCCAAAGAA:1 - chr3R 10099818 3' - pogo 30 1 66.44 GTAAGTAATAAGAATATATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTATTTTTTACTTGACCAGATGATGTCAACGGTAAAATCTTTGAGTGAGGAG:1 - chr4 830607 3' - Gypsy6A_LTR 228 1 66.44 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAA:1 - chr2R 18882587 3' - roo 8717 2 70.59 ATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCAAAGTGTTTCGATGTAAAGGTATTATTTA:1 + chr3L 18920522 3' - Juan 26 1 67.81 CACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAG:1 + chr2L 7667484 3' - copia 4948 2 71.23 AATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACAC:1 + chrX 22824806 3' - jockey 4751 1 73.29 GCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGG:1 + chrX 21667965 3' - gypsy2 6499 2 73.33 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGC:1 + chr2R 21897968 3' - 412 7121 2 64.83 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCACTTCTAGTTGACATTG:1 + chr3R 25521938 3' - blood 7028 2 73.97 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGATTTATA:1 - chr3R 27835588 3' + 412 7481 2 60.96 AGTTAGATTTAAGCACCCGAATTGAACTCATTAAGTTTATAGTGTGAACAACATGTAATATTCGTAATATTCGGTACTCAAAGAACACCACGGTTGGAATGACGACGGGGTGTCCTGGCAACAGCAAACCCCACTAAAGCAGTAAA:1 - chr3L 20637006 3' + rooA 7560 2 63.70 TACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATA:1 - chrX 18193712 3' + hopper 1368 1 58.14 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAG:1 + chr3L 15322048 3' - Transpac 4995 2 70.55 AAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 226 2 89.62 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAATAAAGTCCTCATAGCTAATTCAATAGTATT:1 - chr2L 20984253 3' - blood 15 2 72.60 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGCCTATTGCGGCTATGCTGTTTTGTTTGATTTTT:1 + chrX 19498165 3' - P-element 61 1 41.30 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAAAACACCGTTCATGCT:1 + chr2L 21237325 3' + P-element 2838 1 52.05 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTTAAAAATGTACAAGTAACTTTTCATGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAATACGCACGGC:1 + chr3L 5263471 3' + pogo 2046 1 57.53 ATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATA:1 - chr3L 9430613 3' + P-element 2779 1 14.38 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATATTATAGATTATATTATTGCAAGGACTACCAAAATTCGTGG:1 + chr3R 13494405 3' + opus 446 2 75.00 GCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCCTGTCTCGCCGACATATGTATATTTAAGTCTGTATGTCTGTACAGTAGTATAAATAGAAGTAAATTAGTGTTTTGAATTAGTTGAAATAAATAGTTA:1 + chrX 610648 3' + invader4 3043 2 73.97 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGGTTGTTATTGAAGTGTAATTAGAGGTTATAAGAAAGTAAATAAACTTTATGCGATTATAGGAAATGGATTTAAAATTTATGTTCTTTAAAGCTT:1 - chr3R 25866305 3' + mdg3 5486 2 65.07 GCTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAAT:1 + chr2R 5237918 3' - Doc 60 1 49.32 GGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTC:1 - chr2R 19076523 3' - F-element 222 1 54.79 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGTTGGCATTAAGCGAGTTTTTATGCAGCCAGCGAGACGCA:1 - chr3R 10973153 3' - jockey 21 1 75.34 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTT:1 - chrX 15089533 3' + P-element 2785 1 15.75 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATAT:1 - chrX 22858829 3' - mdg3 5292 2 59.59 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCCATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTGTGTTTTCC:1 - chr3R 19700867 3' + roo 9015 2 60.27 AAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAAGTAATCAGGAAGGAAGTCAACTAGGGGTTATCAGAATTGGGAACAGAATCTTACCTGACACGCAATCCCTGCGGTAAACTCGAAAAAGTCTTTCTTAAAAAAAGCATCCGT:1 - chr3L 22725486 3' + mdg3 5447 2 78.08 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGGTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATATATATACATGTAGGAAGTTTCTATTATGTGTT:1 + chr2R 3824669 3' - 297 6627 2 71.15 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTCTTTATAGATTTATGAAAATCAACATGTTGCAGAAATGTTGTGCCACCTTTTTC:1 - chr3R 10778603 3' - mdg3 5270 2 73.97 ACTCGACTATAGTATTCTCTATTGTTGTATTGTAGTGAATTTGGTTTCGCCGAGCCCATTGTCTGTGTTACGAAGGAATGGGGATGGAGTTGCAATTGGAATTGCCGGAGGAGGCGGAGGAGCTGGCTGCACTCATCGAGTTTAAG:1 + chr3R 11594018 3' + INE-1 576 1 53.42 CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGCTCGTTGGACATGTTCGCGGTCAAAAGCCTACGGC:1 + chr3R 9289376 3' - HMS-Beagle 82 2 74.66 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATAATCGCCAAAAAAAAAAACAATAAAAGCAAAACGCCAACGCGAAAAGCAAAAGCTATACAATTAGAAAAA:1 - chr3L 7434831 3' - pogo 36 1 57.04 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCC:1 + chr2L 2357346 3' - P-element 92 1 23.29 TAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTTCGCAACGAAATTCGGGGGAATCGAACGGAAAATGCTTGGCATGATTAAAAGCTAACAGTTATAATTAC:1 + chr3R 13225652 3' - Quasimodo 449 2 53.10 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTTCCGTGGTCAATTATTATCCTTCCTTGCAATGCCTTTGTAACCC:1 - chr3L 3979532 3' + opus 7481 2 71.92 GACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 202 2 70.30 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGTGAATAGACTATTTCAGGAAACTAAACTATCTTTTATAAGAACGGTTATATTAATCTAAAACATAATTAGGTATGCTAAAATAAAATAACTG:1 + chr2R 9332256 3' - roo 8692 2 66.44 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATG:1 + chrX 14908448 3' - blood 7098 2 75.34 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGAGGGAACGGTGTGCTGGCAGTTTACAAGTTAAGTTGCGC:1 - chr2R 14562064 3' - Burdock 14 2 76.03 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCATCTACT:2 - chr3L 14854637 3' - rover 6974 2 70.55 AAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAATCACAGTGTTTATATTTAATTTAATGGGTAGTGTCCAAATT:1 + chr3R 26325158 3' + mdg3 5107 1 71.92 AATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAGACCCGGTTCCTTGTTTATCCCGACGTGGAAAGGAAAGTGCCTG:1 - chr3L 22267954 3' + copia 7 2 70.55 GGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGATGGTGCATATTTAAAGCGCTTTAAAAAGTCTGTTGTGCAAAAACAATAGAG:1 + chr2L 16251957 3' - Doc 4282 1 65.07 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAGTTTTCGGG:1 + chr3R 10541354 3' - hopper 55 1 54.11 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAAACCTCGGAGGTGGTAT:1 - chr2L 8397106 3' + roo 9054 2 71.92 GTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATATTAAATAACTCTTGATCTAATTTTCTTGCAGC:1 - chr3R 19447450 3' + micropia 5139 2 78.08 TGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAGCTGGATGACTTGGAGGGCGGAGATGATGATCCGCTTGTCGCG:1 - chr2L 19371248 3' - Bari1 23 1 65.69 GAGCGTCTGTTACGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATATGACGGTAAACGATAACGGATATATATAGAAA:1 + chr3L 7144646 3' - Stalker2 7601 2 76.71 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCT:1 - chr2R 16712967 3' + pogo 2031 1 68.49 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACGAAATGTATACGCATCT:1 - chr3R 27502998 3' - hobo 24 1 66.67 ATTCATCTGCGCGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAAAGACGCTGAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTAGGCACTATGCATTCCTCAGTACCTGGCACATGGAGTGGGAGATGTAAAAATATACTAAATA:1 + chrX 20335484 3' + Porto1 422 1 65.75 GTTGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGGAT:1 - chr2R 9326995 3' - mdg3 5334 2 78.77 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAAAGAAACTTTCCGTCCGTTGAAAATTGCGCAATC:1 + chrX 16853467 3' + roo 9052 2 72.60 GATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAAAAGCCGAAAAACTTTTCCCCACTCTCCCGGCTTTATTCCTTTTTT:1 - chrX 12623079 3' + jockey 4986 1 75.00 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGA:1 + chr3R 4722484 3' + roo 350 2 57.53 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGTTAAGTTTCGCAAGCCGGCA:1 - chr2L 7991231 3' - 297 18 2 73.97 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCA:1 + chr2L 17162851 3' + blood 304 2 67.12 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTTCTGGGTCATCTGGATCTACGGCACACATTT:1 - chr3R 24693560 3' + hobo 2894 1 53.03 CAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTG:1 - chr2R 20382480 3' + Bari1 1650 1 56.85 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGGGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGACTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTTATATAGATAGTTAGTTATAAATTATTTGACTTCAAAATCAA:1 + chrX 12551861 3' - pogo 7 1 78.08 ATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAACT:1 - chr3R 6368604 3' - Idefix 61 2 68.15 GCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATTATACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCATGGGACCAGAAGGCAAGCGGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAATT:1 - chr2L 11867264 3' + BS 5050 1 51.37 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAGAGCGTTAGGCGC:1 - chr3R 15465442 3' - mdg3 26 2 67.12 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGGAAATAACTGAAATAAAACAGCAAATAGTAATTGCCCGTCGAGGGGGAAATGGGGGAGAACAGGTACAAGGCAAG:1 - chr3L 16137279 3' - Juan 4070 1 52.74 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACT:1 + chr3L 3540256 3' - mdg3 25 2 67.12 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGTCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCT:1 - chrX 11228554 3' + roo 9011 2 58.62 AAGACACTCAAAACTAGAATTAGAATATACAGGGCGATAATAAAAACACAAACAGTAAGCGTTTGAGGGTGATCTATTAAAATAATTATCGATGCAGTTGGCCTGCAATCATTTTCTATGGCTTCTCATTTTGCATTTCGCAGAAA:1 - chrX 9483341 3' + Porto1 4205 1 73.97 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATAAGCTTGAGC:1 + chr3R 3527186 3' + Tabor 437 2 51.37 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTGCAA:1 - chr3R 5765306 3' + opus 461 2 60.27 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACC:1 - chr2L 6406491 3' - transib2 81 1 70.55 ATATTAGTGTTAGTAGGATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTATAGATAATAGGATAAAGATTATTATAGTCAGAACATTTATACGTCACCCGTAAATATTTTACTTCACAAATTAGGATGAGCATAATTTAGTTG:1 - chr3R 24510473 3' - Cr1a 4292 1 59.59 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTGGAGATGAAAAGGGTTGCGGATCCACATTCACGCGGGGACACCGGAAGAATTAGACGG:1 - chr2R 6052590 3' - mdg1 64 2 62.33 TTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACAGTAGTCTCTCGAGAGCGAGAGAGAGATATTCCCGTTAAGAATGGGACTAGCAAGGAATTGGCAAAAATGCCATAATGTGTGTTGG:1 - chr2L 22497731 3' + Stalker4 7326 2 58.22 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCT:1 - chr3L 22481232 3' + roo 350 2 63.31 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTTGAATCTTTAG:1 + chr3R 10778780 3' + mdg3 218 2 66.44 ATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATAACCGTCCTTTCGCTCCGCCGTCGCCGTCAACTGA:1 - chr2L 19954609 3' - opus 7086 2 76.03 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAG:1 - chr3R 6068271 3' - jockey 4728 1 60.27 AATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGTAGTCTAGTATTGTGTCTTGATTGAGTGAGCCCGGCGAAGAGAATAAGAAT:1 + chr2L 14681332 3' - F-element 4233 1 65.07 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGAGATTAAATTTTCAAAACACAAACGAGCACAGCACGAGAGAGCCAGAAAGAGAGGGCGCTATGCGGCGCGAAAGA:1 - chr3L 10856704 3' + P-element 2841 1 54.11 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATGGGTGTGAAAACAGTGGGGATCCTGAATGGGTTGATAAGTTCAAGGCTAGCCACTCAACGTATA:1 - chrX 12551695 3' + pogo 2048 1 54.11 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAG:1 + chr3R 22289476 3' - 412 59 2 58.22 GATGATGGAGAAAATGTTCTCGCAAATTACGCAGCTTCTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAACCAGACTGACATTGGCCTAGCCCACGGAGTAGTTCGAGGCGATACGGGGGCATTCAGCAGACGGACTCGATTCTCACGAGCACTG:1 - chrX 1306213 3' + G2 201 1 58.22 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTTGTCAGCATTCGTGTCAAGT:1 + chrX 5223002 3' - 412 17 2 73.97 GAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAGTTGAAAGGGCACATTCAACATTATCAGAATTAGCTCGTTGCATAAAAGAAGCACTTAATCTCAT:1 - chr3L 25323182 3' - Max-element 8293 2 54.79 GACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTCCAAACAGGGGTCGTAGCGAATATGCGTTCAGGTGTTGTCCAGGTGCAAGCGACGCGC:1 + chr3R 13156294 3' - roo 8814 2 60.27 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCAACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGACAA:1 + chr2R 19543792 3' - jockey 4780 1 67.36 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTC:1 - chr3R 29708983 3' - blood 7055 2 65.45 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAATTAAAATTGCATTAAA:1 - chr3R 9345537 3' - pogo 31 1 63.01 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTTTTCGGCCACAAATAATTAATGGGTTAATGGGCT:1 + chrX 18034698 3' + Juan 4169 1 52.05 AATTAAAATTAAATTAAAATTCAACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAAAAGGATGCAGAGGGTGTTGTAATTTTATGGCTTTGTGAGCAAAAACTGACTACCTATCTACCTCTAC:1 - chr2L 16107257 3' - Rt1b 123 1 58.90 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGTCACAGTTTTTCACAATTTTGTGTATGTGTGTGT:1 - chrX 9555004 3' - hobo 49 1 55.71 ACTCCGATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATTTGTTATTAATTTGAAGCGATCAACTGGTCAGCCTCAGTGAGAAATCAGAAATCAGAAGTCACCTCCATT:1 - chr3L 1812360 3' + Tc1-2 1528 1 49.32 ATAAAAGGGGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGCAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTG:1 - chr3L 10370900 3' - copia 61 2 70.40 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCCCATGCTGTTC:1 + chr3R 22846834 3' + 412 7515 2 63.70 GGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCCCCTCT:1 + chrX 21667998 3' - gypsy2 4 2 80.14 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGC:1 - chr2R 13574778 3' - diver 88 2 77.40 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGC:1 + chr2L 7991374 3' + 297 6912 2 63.01 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTATGG:1 + chr2R 7404810 3' + blood 359 2 66.44 AGGCCTACTAGATATCACCAGCAACCGAAGGCGACTAAAAAGGTTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATTTACAAATAGATAATCAGCATTTGATCAGAGTCCTAGCAACGCGCCTCAATTACGCCACCGAAATAAATCAATGG:1 - chr2L 12905853 3' + G3 4420 1 56.85 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTACACTTT:1 - chr2R 15079992 3' - roo 8707 2 56.16 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCAAAAAACAATATGAATTTTCCCACAAAGAGAAAAAGAAGGAAATG:1 + chr2R 16383409 3' + roo 9047 1 58.90 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAA:1 - chrX 14385158 3' - blood 7079 2 62.33 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTCAATGAGCCCGTCATCATTGCG:1 - chr3R 5940446 3' + hobo 2869 1 64.83 AAAGCTAAAAGGTTAAGATTCAGCAAACAGATTCTAGAGACGTTGGCGTTTATTGACCCATGTTGCCACACCCAATATAAAGCTATAAAACCACCCAAATGAAAATATAACAAGTAATGTTATAACATAAGAAATGGCATTACTGC:1 - chr2L 7526055 3' + INE-1 166 1 67.81 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAA:1 + chr2R 21897970 3' - 412 67 2 63.70 TGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATTGAATATAAAGCGTTTACGGCCTGTTAGGTTTCCATTTAAATTTTGCATTTAAAT:1 + chr3R 12559784 3' - mdg3 27 2 67.81 CTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCAAACAAAAATGAAAATGAAAATGGAAAAAGGGAGGAAGGGAGTGGGAGTGGAGGTGGATGTGGAGGTGGAAAACACCAGTTCAATATTGCCTCTGCCAATACTCTGAACGC:1 - chrX 5266133 3' - flea 4751 1 73.97 AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGATTCAGGAGGTTGCAATATATTTTCATTATTTTATTAAAACATCTTTTTAA:1 + chr3L 6053610 3' - Stalker 59 4 65.75 GCGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTTCTCTTCAATTGTCGAATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCCGTGGAGAGGAACACTCTAATGAGTCTAAAATAATCTTTTGTAGTGCC:1 + chr2L 13244930 3' - hobo 23 1 69.86 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGTGCTATATGGAAAGAGAGAGAAACG:1 + chr2R 17100163 3' - P-element 49 1 50.00 TTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGGTGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGGTGGCCACGCAGTAGCCTGCACAGCTGAGCGTGAACTCGTTGATGGCTTTGT:1 + chr3R 20630448 3' + 1360 3254 1 65.75 AGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7201 2 69.41 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGTAACACAGGAATTATTTGCT:1 - chr3R 20905379 3' - pogo 62 1 64.38 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGGGAAAAAGAGACAGTCGCTCGAC:1 + chr3L 13204806 3' - jockey 57 1 55.00 TAAGACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACGACCACACCCACGCTGCCAATGCCAATGGCGACCCCAAAGAGCCACCAGCCCAAG:1 - chrX 6754696 3' + transib4 2371 1 55.24 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAAT:1 + chr3R 21237790 3' - Doc 91 1 75.34 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATAAACAGACGCAACCATGACGTCAGGCGCTTTCGTTGTCT:1 + chrX 8895287 3' - roo 81 2 73.97 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGGTTCTCAAATAACTCGT:1 + chr2L 17162886 3' + blood 338 2 55.48 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCGTGGCAAAGTTGTTG:1 + chr3R 22429277 3' - roo 8683 2 69.18 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATTAGCA:1 - chr3L 20747072 3' - Burdock 40 2 58.22 ATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTATTTAACAAAGAATCCAGGCTATTTTTCATATCCGTTTCTATCCAGAACTTATCAATTTCTTGCTGCGACCTTGTTTTGCTAATGATGGGCGGAGTTTTT:1 - chr3R 12559607 3' + mdg3 5486 2 74.10 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTTTGGGGGAAAACTTGG:1 - chr2R 16908437 3' + roo 9056 1 73.97 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTAT:1 + chrX 11534526 3' - roo 71 2 67.81 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTACAATTGTTTATTTTTCGGTATAC:1 - chr2L 14222233 3' - Transpac 4967 2 53.42 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAAATATAGTTAATTTATCGCAACAGTCTTCAAAGATCTTTGGTATTATCAGATGACCTGATTCCCTTGGTATTTCAAAATA:1 + chr2R 22798738 3' + hobo 2899 1 54.11 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAGTAG:1 + chr2L 21342345 3' - roo 8737 2 76.71 AGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACAAGGAGCAGTGCTCCATGCCAAGT:1 + chr3L 8253784 3' - jockey 4644 1 75.34 CATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTTTTTTTATCTCGGACGAGATTAGACTCCTCTTCTCTTCTGCATCGGCCATGGAATTCTGCGGAATTAAAGCTGT:1 - chr2L 12126448 3' - hobo 2520 1 49.32 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGC:1 - chr3R 25876882 3' - mdg3 5334 2 71.92 AAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGACAAGCGTCAATTAAGAGGGGACGCTCTCGCTCTCGCGGACAGCGACGCCGCCGGCG:1 + chrX 4617494 3' + HMS-Beagle 6703 1 72.44 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGATTTGTCTGGTGATGCTG:1 - chr2R 7534544 3' + roo 9054 2 73.97 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTA:1 - chr3L 9430593 3' + P-element 2799 1 28.08 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGTTGGCATTAAGCGAGTTTTTATGCAGCCAGCGAGACGCACACACA:1 - chr3R 10973147 3' - jockey 15 1 79.45 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACA:1 - chr2R 6984395 3' - Doc 34 1 60.58 CAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAGGCATCCTAAAACCTCCAGTTCAACTTCAGATATATGTAC:1 + chr2R 22692478 3' - Ivk 16 1 73.29 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGCAACTTCGATTGCCAGCCTGAAAGTATGCAATGATATTTCTTTACATAAAATATATATCCAAAGATCTTAGATGAACAAGAGCAACGCG:1 + chr2L 12355402 3' - hobo 32 1 62.33 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATGCTGCCCGTTGTT:1 + chr3R 15974799 3' + P-element 2822 1 41.10 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGATCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGGGTGGAAA:1 - chr2R 20382442 3' + Bari1 1689 1 73.10 AGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCGAGAAGCTGCGCCCTAGTTTCGATGA:1 + chrX 7329334 3' + Bari1 1676 1 61.64 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTTGAAAGGGTTAGGAAATGGGAACATGGGATGGAGATGGAAGGTG:1 - chr3R 24479184 3' + 412 420 2 69.18 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAGCAAACAAACACGAATGCCGCCAG:1 - chr2R 6585368 3' - pogo 14 1 76.03 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTTGCAGACGCAACATGGGAGGCGGGCATG:1 - chrX 3524207 3' + roo 357 2 54.11 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTACAATTGTTTATTTTTCGGTATACTTAGGACAGTAGAACTTGTTAGTAG:1 - chr2L 14222208 3' - Transpac 4942 2 70.55 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTGATTAAATCTGCACACACACACACACACACACACACACACACAGCCATAGAGAATTTTCTTTTTATTTTTTTTTTTGTTTTGTGGTTTCGTGTTTACTTTTAATTT:1 - chr3R 9163805 3' + hobo 2927 1 73.61 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTGGCTCCGCGTATTGTTCGCGGTTCATACGCAAAGGCGTATATATTTTAT:1 - chr3R 22659872 3' + 412 7523 2 69.18 AATGTACATAAATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATAACAGAATTTAAATTAAACTATTTATATTTTTTATGAATAAACTCGCACAGATTTATTGTGTACTTAGAAAAGTAAAAAATATAAAAGTTTATT:1 + chr2L 5771536 3' + Juan 4186 1 65.75 AAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGTACCGCTCTGGACCTTGGACTCAAGTTGTTTAAGGGCACAGGGGTCGACGATACACCCTGCCCCATACATCCTAAGCCCGTTCCAGCCGGCAGGAGGACCTTGGGAAGGGAAGATAAGGAT:1 + chr3R 1432528 3' + gypsy8 4902 4 51.37 GCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATT:1 + chr2R 9033953 3' - F-element 4505 1 66.10 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCCTCTTTTTCCCCATCTTTGCATTTC:1 - chr3L 5490799 3' - 412 7070 2 67.12 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATGATGCTTTGGATATTCAAATGTTCTTTAAGAAACTGTGACAAATGTCGCTG:1 - chr3R 15974722 3' - P-element 78 1 32.19 GAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATCAAATAAAACGACA:1 - chrX 18707485 3' - BS 4792 1 71.63 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCC:1 - chr2R 9164843 3' + 412 476 2 58.95 TTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAATGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGTGTTGAAGTTACTCGCACCGT:1 - chr3L 2350172 3' + hopper2 1398 1 76.71 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAAAG:1 - chr2L 2690560 3' - hobo 46 1 53.79 GCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGAAGAAAAAGTGATCACAAAGTTGAATCTTTGCTAATGGAATATTTTTATATATTAGCCAACTCACTGACCTGCTCCAAGTGCACATCGCCGTCTGGAT:1 + chr2L 9010799 3' - 1360 3283 1 70.55 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAG:1 + chr2R 12703837 3' + blood 308 2 73.85 CCGGTATTAAAGGGACAACACGATTTTTTTTTGGTAGTTTGGCAGTCACAAACACATAATACAAGCCACACTATGTGTTGTGTTTTGTGTTTTGAGGTTCGTTCACACGTATTTTCACTCAACCGCAACTCGCTGTACAATCGCAC:1 - chrX 2088077 3' + Transib-N1_DM 176 1 51.37 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTG:1 + chr3R 21237794 3' - Doc 87 1 72.60 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTATTGGTCCTGATGAAGTAATATGTTCTTTATCG:1 + chr3R 4464216 3' - 1360 88 1 77.40 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGGCGTGG:1 + chr3L 5438847 3' - hopper 4 2 74.29 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTGAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGT:1 + chr2L 14262922 3' - blood 61 2 58.90 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTGTAGCTTTCCTAAGTCTAA:1 - chr2L 6406462 3' - transib2 52 1 51.37 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAGCGTGAGAGTACTTGGGGAAACAGAGGAGCTCACTTGGCTTGTTTTTGAACAGTTCTACTTATAAAGTAATTATAC:1 - chr3R 10140134 3' + P-element 2875 1 73.97 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGT:1 + chr2L 3734557 3' - mdg3 5311 2 65.07 CCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTGCCGCCACTGCCCCAAGCTGCGCTGTGGCTTCTGCG:1 - chr2R 7668831 3' - blood 7367 2 64.71 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTATGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTT:1 + chr3R 21237811 3' - Doc 70 1 60.96 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCA:1 - chrX 14962227 3' - jockey 96 1 76.03 TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAAT:1 - chr2R 5848978 3' + mdg1 7380 2 71.92 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCAGATTAAAAATAATCC:1 - chr3R 6103546 3' + Tirant 8474 2 63.70 CGGCTATATATCCTGATCAAGAATATATATATATTCAACGAACTATACCTAACTAGTACACCCATTTTCACTACGAGTAACAGGTACACAAATATAGTTCATTTGAGGGAGAAACTAGAGAGGAAATGTGTTTCCTGATATCTCGG:1 + chr2R 5191120 3' - INE-1 88 1 76.03 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGGTATGTTCGGACAAGGAAAAAGAAGGAAACAGTAAG:1 - chr3L 15149382 3' + roo 8987 2 77.40 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCCGGACGCTTTTGTGATTTTATTTTTGCGTTTTCCCGTGATTTAGCCGGACAGTT:1 - chr3R 26399762 3' + roo 9037 1 61.64 AACTCTTTCGAAAGAATTTCACCCTTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCATTCCATAAATGCAAATCAGTTTGTTTACTGCACCCCGCCCCGAAACACC:1 - chr2L 1300932 3' + I-element 283 1 65.07 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCTTCTCATCGATGGTAGGTAAGCCCTTGTTTCAAATGATGTGAATGGTTCTATTTAGGAGTTTGTCTGTCTGTGTCTGTATTGTGTC:1 + chrX 16456869 3' + P-element 2878 2 78.08 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTCCAATGGCCTGGTGGAGCGGCACTTTGTGAGGAAGTACCTTCTGCCCCGCGGATACAATGCCAATGAGGTAATCTCGGACATATCCAGCG:1 + chr3L 9375952 3' - mdg1 7070 2 63.70 CCATTTCGCATCACCCTGCAGCATGAATGGGACTAGGTTATCCGCAGTCAGTCTGCTGCCAAGTACGGTTTCCAGAGAGCTCCGTTCCCTTGCATATTTAACCCGCGAGTGATTCGTCCGAAATATACATTGCTTTTGTGTATTTA:1 + chr3R 24459842 3' - Rt1c 5208 1 73.29 TTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTATATAAGTTAACCCA:1 - chrX 18913260 3' - Quasimodo 50 2 64.38 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTAC:1 + chr3R 25753702 3' + hobo 2890 1 61.86 CACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTTGCGTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAATACAGGCGGCACAAAAAAATGATTATATTTACATTAAGAACCTATGTACACTTAAAACCAAAAGCACT:1 + chr2R 5070983 3' + Tirant 81 2 39.04 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAG:1 - chr2R 18123390 3' - 412 30 2 59.31 CCGTGTGTTACGAAAGAAGTTAGCTTCAAGAGGGTAGTGGTTGTTGATCTTCGTTTCATAAAACCGTGCCCTTTGAAAGCTAATAGACGATAGATAGATGATCGTGTCCATTGTTGTTTCTTCTTTTT:1 + chr3R 15553807 3' - Q-element 257 2 78.12 TATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCG:1 + chr2R 13574837 3' + diver 149 2 67.81 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGCATGTCTGGGCATGTC:1 - chrX 15089440 3' + P-element 2878 2 79.45 GCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAACGTAATATGAGAAGCATCATCGTCGCAGCAGTCGGATTTGATTACTATTACACTACTGCCGCTGCTGCTGGATGTCTTGGTG:1 + chr2R 17433476 3' - rover 108 2 52.03 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTTCCG:2 - chr3L 3979572 3' + opus 7441 2 60.96 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCA:1 + chr2R 6585517 3' + pogo 2038 1 63.70 TTTTGCATAATTTGATTTTGCTGTTTTTGCATGATTTCAAAATAAACATGGAGAATTCGACGGCATCGCATCTTGCTGGCAGCCAAAAGGGAGGCATCGAAGCAGGGAAATGCCTTTCGAGCGGAGGATGGTTC:1 + chr3R 29243270 3' - HMS-Beagle2 391 1 69.40 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTCTCGTTAACAATGTAAACGCCCGACTCG:1 - chr3L 6630340 3' - jockey 4710 1 59.81 CGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTTTCGGAAAAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTTTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATAAACATGTGTGCAGGAGGGTACTCCACGGCCACTGCCTCAATTCGCATC:1 - chr2L 18189384 3' + diver2 208 2 69.86 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAAT:1 + chrX 15167765 3' + roo 354 2 56.16 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATGCAGTCGAGTGGAAAA:1 + chr3R 29709062 3' + blood 7325 1 60.69 ATCACAAAAAAAATTACATAAATACCAAAATTTTCTGCTTTTTGCCTATAGTGCGCTGGCTAACAAGGTTAAAAGGCAAAGAAAATTAGCAAAGACCACAAATGAATCGAGGCAAAAAGGGCGATAGCACAAACAAGATTACCG:1 - chr2L 13888049 3' - transib4 32 1 49.31 GATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAATAAAATCTCAATTGATTTTGCATAAATTCCTGACGAAAATAGCCCAAATTTATTCACGTTCTGAACAGTATT:1 - chr3R 14578542 3' - Dm88 150 2 50.68 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTATAAATCATGTAATTAACTGGAGCAGCATAGTCCCGACCCGGGTCAAC:1 + chr3R 26782785 3' + hobo 2871 1 66.19 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTTATAGTTGAGCAAATATTTAACCAGATGAT:1 + chr3L 3762329 3' - roo 8711 2 51.37 CAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTGTGATTGGCCTAAAAAATATGTTTCAACGGAAAAAAGCAATA:1 - chr2L 15142188 3' - BS 4713 1 77.40 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATA:1 - chr3R 23968604 3' + jockey 4910 1 78.62 CGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATCGAACTGTGTGTGGTGAAAGTGCCACACCGCTTTTCGCAT:1 - chrX 823757 3' - roo 432 1 73.97 AACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCG:1 + chrX 7329309 3' + Bari1 1651 1 59.59 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTG:1 + chr2L 1449680 3' + opus 436 2 64.54 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGG:2 - chrX 14385148 3' - blood 7069 2 55.48 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGG:1 + chr2R 18051055 3' + mdg1 7384 2 69.18 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGGATTATATCTCTACAGATTATTACGATACGCTTGTTCTAGCTTGTTTGTCGAGACT:1 - chr3R 11121663 3' - copia 26 2 65.07 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAA:1 - chrX 10101341 3' - mdg3 84 2 71.92 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTTACATCAAACAAGTGAGATGGTTTACCTTCTGTCATTAAATATATTATAATATTATAGGGATTTTAAAGTCGTTTAATATAAT:1 - chr2R 12703746 3' - blood 38 2 45.89 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTC:1 - chr3R 25271158 3' - 412 46 2 54.79 TGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGATATGGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGGAGTACGAGTGGTGCGAACTTATATTGTAACACATCTTCTCTGGCTAGATAACGAAGTGCCATAAAGTTCAACTATGTCTTTAAAGTT:1 + chr3L 24768044 3' - 1360 3241 1 66.90 GTGTGGGCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAGAACAGACCGACATGGCCAGATCCATTTGCCCGGTGATCCTTATCAAGAACATTTATACTTTATTCACGCTCAATTTCAACCAAATGCTGCTCCATCATGTCGTCCGATTTTCCCA:1 - chr3R 17663642 3' + Cr1a 4441 1 35.62 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTTCCGCCAAGTCGCCTTCCGTCATATCCCATTTAAGATGCCCGATACACGGAAAAAAACTA:1 + chr2L 19930177 3' - jockey 66 1 58.22 ATATTACTTATGTTTCTAACAACATGACCTTTTGACTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCTGTTGCGCATTTTTACAAAAAATAGCAGAAAGATTAAGTATAGAGAACAAAATATC:1 + chr2R 4781457 3' - G4 459 1 65.75 GCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGCTGTTGTTGTTG:1 - chr2R 10478649 3' + invader4 3061 2 63.43 TATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTA:1 - chr3L 27356099 3' + Tc3 1618 1 78.08 ACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGGGACCCAACAATTACTCTCAGCACTATTTTATTCTTTATTTTAATGAAATCGTCGTGATCTGGAGTTCCAGCTAACCGTTTCCAAAC:1 + chrX 22933880 3' + Porto1 327 1 51.85 GTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGCTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTAT:1 - chr2L 23299985 3' - invader4 397 1 73.29 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATT:1 - chr3L 21097136 3' - mdg3 82 2 71.92 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCTGAGTA:1 + chr3R 15514638 3' - 412 7093 2 57.53 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGCGACA:1 - chr3L 13722013 3' + blood 7333 1 61.64 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAGGCCGTAATCTACGACATAATGCGTTGCCCAATTGCCCCAGGCAGCGGCAAACG:1 - chr3R 12537719 3' - Doc 66 1 61.38 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGTCGACGTCGACGCCGTCAGAGGGGTGCCCC:1 + chrX 17258343 3' - 297 23 2 67.83 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGCGGACTGTTCTTGGACTTTTTTAATCATCATTAACCCCCCTTATTATACACTCAAAAAAAAACAAGTTTTGCTCAATTTTCCCAGATCATGCATTAAAATGGAACCATGTTA:1 + chrX 5892231 3' - transib2 6 1 78.08 ACAAAGACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTACACTCCTCAATTGAGAGTGTAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTCGAGTGTGTGGAGGTGTGTTTGTGTGGCTCGACTTAGATTAAGACACGTTCACTAAATTATTAAAGCTGACA:1 + chr2L 11158762 3' - Rt1b 5023 1 72.60 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAA:1 + chrX 16853397 3' + roo 8984 2 79.86 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTG:1 - chr2L 1449585 3' - opus 7061 4 58.90 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACTTAACAACACTTTGCTGACTAAATTGTGTCAGTCTTATATTACCCTCAGCCAAATCGCATGCCCCCACCTACCTTACAACAATGCTGTCATATCTGTTGGGTATAT:1 - chr3L 8067456 3' - copia 14 2 74.66 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCC:1 - chr2L 16685324 3' - P-element 69 1 31.58 GCACACACACACACACACACATTAAGATGCTACGCACAATGCCGATTTTGGTAAACTTTTTGGTACCATTTCTAAGGGAACTTGTGTATCTATAACGTGCGATTGATTGACTATATCGGTAGACGTTAAAGTGGCTAATAATGTAG:1 + chr3L 2071265 3' + accord 7029 2 55.48 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTT:1 - chr3R 5765323 3' + opus 463 2 55.91 AGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAATTGGTGTGGTGGTACTAATCATAT:1 + chr3R 24229009 3' + opus 475 2 68.49 ATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAGCAGCTCATCATAAATATGACTTAT:1 + chr2R 5022807 3' + Gypsy12A_LTR 110 1 71.92 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAG:1 - chr3L 16157174 3' - Juan 41 1 56.16 CAAGAGCTTCCAACCACTTCTTTAGTTGGGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATATTTTGACTATTAATTTTTTATTAATTACTGTTTTTATTAGCTATTTTTGCGCAATGAAAATACGAGTTTTATGTATCGATT:1 - chr2R 1994914 3' - invader3 366 1 55.48 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGAGATTTTGTGTTTTGTGTTCTCTAAATAAAGCCATACAAGACAAAAAATCGAAAGTAGCTGGCCAGAGA:2 + chr2L 3006316 3' - pogo 49 1 51.37 ATTTCTGGTATGCAGAACTAAACATTAGTCAATTATAAATGCATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTTTCAATACACATTAGCATTACTAAATCGGTAGAAATAATCTGTAAATCTGTAAAA:1 + chrX 2078416 3' + Transib-N1_DM 393 1 58.62 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGTCCTCA:2 + chr3R 9482146 3' + roo 9046 1 68.49 ATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACATTTAG:1 + chr2L 22684618 3' - transib3 53 1 56.85 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACAAACGTAACCCAGAAAACTGAAATGAGCAGGAAAAGGATTTCATGTTTAACTATTAGTCATGATTTCAAAATTTATTATA:1 - chrX 6937830 3' + hopper 1378 1 61.64 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTCGATGGATGGCAAGACCAGAACTGATTGGGATAATAGATCGCCTTCCTTTTTATATCAATACAACTGAAA:1 - chr3R 12375673 3' + copia 5074 2 51.37 TATTAATTATAATTATTATTATTAATTTGTAGTAGATCAACGGATACTGTATACAGCTCAATCCAATTTCATTTTAAATTTCAAAGAGTTTCAAGTTTATCAACATGAAATAATAATGCTACGGTAAGATTTAGGATTGTCCACAA:1 - chr3R 31611828 3' - gypsy9 5306 2 75.34 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAAC:1 - chr3L 4175251 3' + roo 9015 2 58.22 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAA:1 + chrX 2873440 3' + roo 331 2 69.86 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGCACTCATTCCAGCTGAAGGAATAGTAAATCTGGGGCGGG:1 + chrX 9342522 3' + 1360 3333 1 70.00 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTG:1 + chr2R 21897967 3' - 412 70 2 65.75 GTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAA:1 + chr3R 12559720 3' - mdg3 77 2 77.40 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCAC:1 + chr2R 6052697 3' + mdg1 7407 2 50.00 TTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCTAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTGGG:1 - chr3R 19537435 3' - hopper 14 1 74.13 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAA:1 - chr3R 10079335 3' - P-element 103 1 15.07 TAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATTTACATCCGTTGCTTTGGGTGATTTCTTGATGGCCAGACAAGGTTGGAACTTAATTAATTAT:1 - chrX 17049081 3' - invader4 2651 1 61.64 AAAATTAAAATTAAATTAATATTAATGCAATTAAATTTAATTGCAATATTGAAACAAGATATTAAAGCAAGCAAACTAAACTAACAAAACAGTAGTTCCCAGTAGGAAATGAAACACCTGCTTTTATCCCTTGTAGGCAAATAGTT:1 - chr3L 9546660 3' - Rt1b 125 1 74.66 ATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGTCGTTGACTAGCTCACTGTCGGACTGACTGGTGCGTGAATGAATGAATAAGACACGAAA:1 + chr3R 5193297 3' + R2-element 254 1 59.59 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTT:1 + chr2L 10832323 3' - Doc 84 1 73.97 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCAGATT:1 + chr2L 2519938 3' + roo 9046 1 67.12 CTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATACAAAAAAAGTCATGAAATCAAAATAAGAAAATGTTTACAACTTAATTTCCCTAAACAGAATACAAATTATGATTAAATTTTTTTTTTCTCTATTAAAATACTTATGTTTAC:2 - chr3L 27383325 3' + BS 5068 1 79.45 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGAATCGAGCTAAGCTCCCATAT:1 + chrX 11534566 3' - roo 30 2 62.07 AGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCAACTCACTGTGATGAGTGTGAGTAAAAAGGGTGGAAAGTCTGGGATGCAAGTGCAGAATCTGCCACCATTGCCGCCACTAAGGACATACATCT:1 + chrX 10122617 3' + FB 8 1 62.33 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTTGCCCGCTTTGCATGGCTTTTCTTGCATGCAACTTCGCT:1 - chrX 14962163 3' - jockey 31 1 66.44 TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAGTGCGAAGGAAAAATGCTGTCATATCGATATTAATTGCGGAAAAATTAATAATAATGCAAATAAAAAAAAAGAATTGTAAAAACTTTCGAAAGGACGTGGCAGTTTTGGGCGGCTT:1 + chr2R 20706625 3' - INE-1 546 1 30.82 TTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTTCCGTGGTCA:1 - chr3L 3979566 3' + opus 444 2 56.85 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTT:1 + chrX 9816464 3' - jockey 70 1 62.96 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTCTCAGAAAGCTCATA:1 + chr3L 9242120 3' + roo 400 1 63.01 ATTATAATATTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTAATTAACAGAGCGCTTGTTAAACACATGTATG:1 - chr3R 31196738 3' - jockey 4850 1 78.77 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCAGTAAACGGCGGCTAAATAAGTATATTAAACATTTTAAAAATTTAAATAGCAAATTCAGCTCATAGA:1 - chr2R 10453368 3' + mdg3 171 2 65.07 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAA:2 - chrX 11228530 3' + roo 9034 1 60.27 CCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGAAGGA:1 + chr3R 12540239 3' - flea 4809 2 61.38 CGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7220 2 75.00 AGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTA:1 + chrX 22824822 3' - jockey 4731 1 61.97 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGTGCAGCAGGAAAACCAGAATACTACC:1 + chr3L 14969337 3' - P-element 26 1 65.07 CGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTC:1 - chr3L 16180883 3' + Transpac 5165 2 64.54 ATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAG:1 + chr3R 12795103 3' - mdg1 7113 2 68.79 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATT:1 + chr2R 10367575 3' + 412 7505 2 50.78 CCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTTCCAGTTGATTGGCTGCCTCCATAAGCTCTGCTTAATTG:1 + chr3L 20977489 3' - I-element 23 1 70.55 CACGGAGCAGCCACCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACAACAGTATCGCAAGACGGTGCGATTTATCTTTAGCTAATTTATATGTATATGTATATGTATGTATGTATACAAATTAACAGACAACAATTTTAT:1 - chr2L 21635747 3' + Gypsy6A_LTR 329 1 64.38 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTCGGGGCACTATCTGCAG:1 + chr3R 5940529 3' - hobo 38 1 52.14 CAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACAAAAGGTTGTAATTTCTGTTGCATACTTGCGGGCGGCTACTGAAAATGGCAACCACACA:1 + chrX 12273100 3' + copia 4713 1 59.59 GTAAAAACATGTAAATATGTATGTAGTATGATATGTATACATCAGAATTTACATCAGCCAAACACACTTGTATTTGCGTTTCATTTGGAGAGCACGCGCCATTTAATTTCTCATATTACATCTTCGAGGCACCGAAACTTGAGATG:3 + chr2R 9389330 3' + G3 4501 1 75.34 GAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATAC:1 - chr3L 25232693 3' + accord2 204 1 80.56 AAACATAAACATAGCAACAAATTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGC:1 + chr3R 15514594 3' - 412 7119 2 68.75 CCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGACACCTTTGATTTGTGCATAATTGAGATGAGACTCATTTGATTTTGTGCGTTCGACTAGCCTTCAATGTCTGTCGGCCTAATCATGTATGATAATTTTTAT:1 - chr2L 19784568 3' - R1A1-element 463 1 63.70 ACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAAACATTGGCGGTCAT:1 + chrX 10960300 3' + Transpac 251 2 59.59 GAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAACCATAAAGGTCGTTTCTTTCCAATCGCGCAGATGGAACTGGA:1 - chr2L 18712574 3' + Bica 4569 1 67.69 AAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACAACTTTGAGTGGC:1 + chr2L 20841987 3' + G6 1963 1 54.79 AAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAG:1 + chr2R 5900947 3' + Bari1 1707 1 81.90 GTTACCTGCATCGAGGCATCGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTATCCTCGCCATCCACAATTTA:1 + chr2L 12481554 3' + pogo 2065 1 60.96 CGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAA:1 + chr2R 5900903 3' + Bari1 1643 1 73.60 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCTAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTCTCTT:1 - chr2R 11379739 3' - jockey 92 1 70.14 GTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACTTGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTATCCGTCACCGTGAAGCGAATGCACTGCAGGAATTCGTTCAGTAGCTCATAGT:1 + chr2L 6655977 3' + roo 103 2 63.01 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACAAAAACATTCCAAATTCAATTGCAAATTATGCATTTATTATTAACAATTGTTGTCTG:1 + chr3R 15590102 3' + Transpac 292 2 73.79 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTGCTTGCATATTCATAAGACTGCAAAATGATACCATCACA:1 - chrX 12893292 3' + Bari1 1693 1 76.03 AGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCACACTTGCTGAATAGCGGGTATCTGTTAGTCGGGGAAATTCATTCAAATTTTTTATGATTCGCAAGCTAATTACG:1 - chr2L 21383305 3' + INE-1 515 1 59.00 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAA:1 - chr3R 7739658 3' - blood 7054 2 56.16 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCA:3 + chr3L 14969279 3' - P-element 84 1 25.34 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGA:1 - chr3L 15371277 3' - Transpac 4968 2 52.74 ATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGAGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTTTTTGTCGCTGCAAACACTTTGTTTTTGCTGCTCGAAATATG:1 - chr3R 23346499 3' + Rt1a 5053 1 78.08 CAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTCCAGAACCCCATCTAATCGAAT:1 + chr3R 21521441 3' + Bari1 1668 1 53.42 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATAT:1 - chr3L 9242015 3' - roo 8750 2 81.51 AAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCTACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACACACACACAGACTCACGCATT:1 - chr3R 8367091 3' - Doc 2 1 76.55 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGT:1 - chrX 19231765 3' + mdg3 5411 2 76.03 TCGCATTCACACTAGCTGAGTTACAACGGGTATCTGATAGTCCTGATAGTCGGGGAACTCGATTATATGTGTATTTCAAGGAAATAAAGAGTAAAGCATATAACAGTGCATCAGATCCAATAATGAATCAGATGAACAGAACATCC:1 - chr2L 5942735 3' + INE-1 532 1 45.89 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCATCTCCTTGACCT:1 - chr2R 17986232 3' - 297 6618 2 60.42 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTAAAGATGAAGATAAATATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTAAATGTTGCTGATTTCATGGCGATTGCATAACTCGATTCTCTGCCCCCTTGTGCGTTCTTTTTTCTACAT:1 + chr3R 11526884 3' - pogo 47 1 51.37 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGTTGATGGCAAGTTAT:1 + chr2R 7223788 3' + blood 7364 2 67.13 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAGCAATTAAAGTAAGTGGCGCCATTCGCCTTT:1 - chr2R 10367437 3' - 412 20 2 69.29 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTTTCAACTCGGAACAAGGCTACCCATTCAAA:1 - chr3R 15514490 3' + 412 7511 2 58.22 TGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGCACTCATTCCAGCTGAAGGAATAGTAAATCTGGGGCGGGGGCTCATCAAGTGGGAAATAGCTC:1 + chrX 9342546 3' + 1360 3331 1 58.90 ATGCTGACATTACACAAAAGCCGCACTGCAACAGAAATACTAAAATTCATATATAGTAAAGTTTAACATCAATATAGGCGCAATTCGTCGATCAACATAGTTTTTAGCAAACA:1 + chr2R 1277377 3' + Tirant 8223 2 74.34 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACAT:1 - chrX 8082387 3' - roo 79 2 72.60 GCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTACATATATTTTTCATAACATTTGGGCTATTCCAGCCAGCTTGTGTA:1 + chr3R 29489413 3' - S-element 71 1 68.49 TAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTG:1 - chr3L 21630334 3' - Burdock 6215 2 73.29 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTG:1 + chr3R 5087107 3' + P-element 2828 1 44.44 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAACAATTTGTACATTGAGGTCTATCCTGTGATATCCTTATAAAATTATCT:1 - chr3L 19396966 3' - F-element 14 1 79.45 AAACTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATG:1 - chr3L 14854684 3' - rover 7021 2 70.55 GGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTGTAAATATGTGACATG:1 - chrX 10873749 3' - mdg3 5261 1 78.08 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCTC:1 - chr3R 20292390 3' + pogo 2071 1 67.12 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTAGAGGGACTTTGAGATATATGAAAACAATGTATATTTATACAAACATTTTGGGAAGATTTTAAGCTAGTCAAGCAGTTAAGCTGGTCAACTATT:1 - chr2R 6168212 3' - 1360 28 1 66.44 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAG:1 - chr3L 13721994 3' + blood 7354 2 60.42 ACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCA:1 + chr3R 12540230 3' - flea 4819 1 67.81 TCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTATT:1 + chr2R 4206663 3' - 1360 315 1 76.03 CAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCATGAGATCTGAACAAAATCAATTCGGTGCAACTAGATTTGCAAAACCCACAACCTAATTTTAATAGGAATCCATTTCCACAAACGCAACAAAATA:1 - chrY 520277 3' + Quasimodo 6972 2 68.49 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCGTGCAATGCCAGCGGAGTGAAGGGAGTGACTTTCTGTTAACTGTTTTCGTTATTATTTTAGGGATAGTTTTAAAGAT:1 - chr3L 52926 3' - roo 8706 2 46.58 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAG:1 - chr3L 9571667 3' - jockey 85 1 71.23 AGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCCTC:1 - chrX 693660 3' - INE-1 141 1 38.41 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATTTG:1 - chr3L 5446070 3' + roo 9039 1 63.01 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCACTTCTAGTTGACATTGAAGTTA:1 + chr3R 25521944 3' - blood 7022 2 78.08 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATCTATATATATATATATGAATACGACCGGTCATATATAAACACATAAGTACACGGAGA:1 - chr3R 23426370 3' + pogo 2042 1 67.81 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACTGCCATTGTAT:1 + chr2L 8103638 3' - pogo 36 1 60.27 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGCGGTGGCAC:3 - chrX 22858801 3' - mdg3 5264 1 78.77 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGC:1 - chr3R 10142937 3' - 412 67 2 62.33 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCTCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTT:1 + chr2R 21897989 3' - 412 7101 2 50.68 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTA:1 + chr2R 7404807 3' + blood 7380 2 70.15 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCT:1 - chr2R 11379740 3' - jockey 95 1 73.97 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTG:1 - chr2L 17730441 3' + pogo 2041 1 67.72 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTAA:1 - chr3L 19279128 3' + opus 424 2 71.03 GGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTTACCGAAGTCATACCTTGATTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGATCATTTGCGACGCGACTGCGGTCAAAGTTCAATGAAGCAAGCGCTTTCAACAGC:1 - chrX 9435665 3' + Rt1b 4928 1 63.01 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTT:1 + chr3R 20292524 3' - pogo 60 1 62.50 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTT:1 + chr2L 9669589 3' - roo 83 2 75.34 AACACGTTTTTCAAAAGTGTGGGAGTGACAGTTTTGTGCGGTATGTAGGCGTTAGCGTAGCAGTTATGGGCGGTTTTACGGCGTTAGAGTAGACGTGGCAAAAAGTTTTTTTGCAAATTGATAAAAAATGAAATGTAAAAAAATAT:1 + chr3L 9260909 3' - INE-1 258 1 65.75 GAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACT:1 + chr3R 28033668 3' - diver 82 2 71.92 GTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGA:1 - chr2R 6984337 3' - HMS-Beagle2 6973 2 79.45 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATTTTGAGCGCTGAATAGCAATTTTATA:1 - chr3L 6774136 3' + pogo 2046 1 57.24 TTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATATTATCCACTCTCCGGGTGCTACTCGTTATATTATC:1 + chr3L 7036737 3' - micropia 5216 1 76.03 AAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTG:2 + chr2R 5900951 3' + Bari1 1670 1 61.64 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAA:1 + chrX 4566258 3' - Transpac 4975 2 60.27 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGCTAA:2 + chr3L 4869258 3' - roo 8720 2 58.22 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGAC:1 + chr3R 5087082 3' + P-element 2802 1 26.90 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTTGCCCACTTAAACAA:1 - chr3R 8705694 3' - hopper 41 1 56.16 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAAACATTGGCGGTCATCTTTTTTTGCAAATTGATTAATCAGCTATTAAAAAGCGCAGCGTTAACAAT:2 + chrX 10960350 3' + Transpac 302 2 74.66 CGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTG:1 - chr2R 22671378 3' - jockey 4747 1 70.55 CGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGC:1 - chr2R 19904030 3' - Doc 4487 1 65.75 TGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAACATTTGTGGCTGAAGCGGA:1 + chr3R 31907417 3' + Tirant 317 2 73.97 GTGAAAGTTAACTAAGCTAGATTAAGATTTGAATACTTAATGCTTTTAATACTAAAACAAAGGGAAGATTCAACACCTTTCAATAATGAAATGCACATGACCAATTGGTGGCAACAGTCGAGGAGTCAAGTTAGCCAGCCCAAAAC:1 - chrX 7593437 3' + Doc 4617 1 50.00 CGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTTGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAAGTGGAGCTCTATTCTCGATAGCTTGCTGTTTATTTAAGGACAGG:1 + chrX 18777912 3' + R1A1-element 192 1 77.40 TGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATATATATCCTTTAGTTGATGTTCCGCTACAAAGAAAA:1 - chrX 16325326 3' + mdg1 7375 2 75.34 GTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTAAATTAGTGCGGCTTCTAACCAACCTTTTTATTATCAAGTACCGCAACCATGCAAAGAGTTGCCAGAATGTTAATTTCGAACATTTACGTTACAAGTTGAA:1 - chr2R 17098548 3' - P-element 116 1 76.71 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCTGCCG:1 + chr3R 10468122 3' - opus 154 4 57.53 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGCGAAAAAGTATTTGAGCTATCCATGTCACATAAGTTATACCATTTTAT:1 - chr2R 14705713 3' + roo 394 1 69.86 AGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTGCTTTTCATTGGAAATTTAATCTATTTTCTTATATTAGGCTTTATAAAATTATTTGTTTAACTCTTA:1 + chr3L 10076446 3' - X-element 17 1 73.29 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAAAAATGGGGCGGAG:1 - chr3R 4659543 3' - P-element 83 1 28.77 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACATTCTCATTTGCATATTTACATTG:1 + chr3R 10288896 3' - copia 4933 2 59.59 ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAA:1 - chr3L 5183708 3' - copia 73 2 67.12 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCA:1 - chrX 11228565 3' + roo 9021 2 60.48 ATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTACCGTGGGACTACATACGTGCCCAGGAGTGTGTTCCCCCTGATGGAAAACGTCTAAGTAGGTCCTTTTCATAGTTTTAATTTTAATTTTTTTGTGAGCTCTTATTTT:1 - chr3R 16818366 3' - baggins 5329 1 60.27 AACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGC:1 - chr2L 9356800 3' + Stalker4 7313 4 52.41 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCTAATTGGGATCTAAAAGATCTCGGTAGAAGGTATACCTACATACTTAGTCGTTCTTTTCAACTAATCTACAATAGTAAATTCCATGAGTTTTTTTTTCCTCATATCTCTAATAA:1 + chr2R 6579651 3' - mdg1 7 2 76.71 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGGAGCGGACAACTTGAAAAACTTTTAATAATTGCATTTTGCGCAAGCAGCAGCATCGACTTCAACTGGCTCACATAATAAAC:1 - chr2R 13657641 3' - flea 31 2 63.38 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGCATTTATCTAGCGGGC:1 - chr3L 16180911 3' + Transpac 265 2 76.60 GTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTATCAAGTAATTGAGTTGGTATCCGCGTTTGGCCCTC:1 - chr3L 12373217 3' + Tabor 7199 2 76.03 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTTATTTAAGTATCCAACATTAGTATCACATTAGTTTTTTTTCTGTGTACCTTGTGTACTCGTCAGACGCTAGTTTTAATGC:1 + chr2L 9669662 3' - roo 4 2 66.44 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAGTTTAATCAAAATGTTTA:1 + chr3R 8402679 3' + mdg1 398 2 69.18 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTCTGGTGAAATTAAAAGCTA:1 - chr3R 31956729 3' + pogo 2082 1 72.60 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACATAAATCACGACTAACACTTTAGCAAACATAAGTTTTGCA:1 - chr3R 23449258 3' + roo 8998 2 68.49 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTCAACGTTTT:1 - chr2R 18807717 3' - jockey 21 1 74.66 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGTTGTTGCTGGGCGTTCGATGGCGCTTGGTCTCCGCGGTCTT:1 - chr3L 13922255 3' + Tirant 8479 2 64.29 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGAAGATAAGTACTTATCATTGGAATTATTTGTCACAATAATTAAAAGAAAACTTACAA:1 + chr3R 23449343 3' - roo 64 2 61.64 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTT:1 - chr3R 31956390 3' + pogo 2038 1 61.64 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGT:1 + chr3L 5438838 3' - hopper 54 1 55.48 CGGATCATTTGTTCGACTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATCTCGAGAAGTAATGGTGACGCCGAGAAGCTGG:1 - chr3R 2999769 3' + McClintock 395 2 78.77 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCT:1 - chr3L 13597750 3' - blood 7077 2 63.70 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAG:1 - chr2R 6585418 3' - pogo 64 1 62.33 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATACTTAAAGATTATCTTTACACCTGGTAGAATATTTATCAAGTGCATATAAGTAAGATTT:1 + chr3L 19274934 3' + transib2 2807 1 73.29 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCG:1 - chr2L 2357303 3' + P-element 2802 1 27.40 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTGAATGTGTATTTGTCTA:1 - chrX 7467918 3' + hopper2 1560 1 52.74 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAAGAACAGAAATCGAAGGTGCAACTCCAAAGAAACAAAAGAG:1 - chr3R 10099809 3' - pogo 21 1 72.60 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGAC:1 - chr3R 4885332 3' - 1360 73 1 75.34 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCT:1 + chr3R 6103662 3' - Tirant 8155 2 62.93 AAGTTACTGCGAACAACTCAGCAGCAGCCACGTGCAGTGGTTGGGAATACGACCAACTGTACCCAGC:1 + chrY 1425615 3' + G-element 219 1 61.19 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATT:1 - chr2L 18048282 3' - blood 39 2 62.89 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTC:1 - chrX 5222851 3' + 412 7499 2 54.35 CTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTCTAAGATAAGTACATTTTCAAAAAGTGCCAACAAAAAAAAAGCAAATCTAATCACAAAACGAACACTATTATCGGTGGCGTCGTCTTTTTCACTTTACTAG:1 + chr2R 1343950 3' - Max-element 8257 2 53.42 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACTGGGAATGAGAAAAGATGGAATTATAAACTTTTAATACAAATAATCTAATATACTTTTAAAGAGCTTTA:2 - chr2R 19263416 3' - Doc 60 1 52.05 GTATGCTCACTGACACGGTCTAGTTGCTATGGTGGTAGTGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGATACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAATAATTATGCGAAATTGACATTGACCATTATGACAGGT:1 + chrX 14145250 3' - R1A1-element 316 1 70.55 TGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCGATTTTG:1 + chr2L 17551106 3' - Transib-N1_DM 222 1 48.63 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATC:2 + chr3L 9242066 3' + roo 323 2 74.66 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATT:1 - chr3L 5446072 3' + roo 9037 1 61.64 ATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTACTGAATAAAATTAATAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTTTCGACAAATTTTGAGTTGCTCTTCTATACAATTTCATTGTAGTTTATGATCTTTCATTT:1 + chr3L 19342334 3' + Tc1 201 1 61.64 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCT:1 + chr2L 17162866 3' + blood 7330 1 56.85 GAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCA:1 + chr2R 14884332 3' - mdg3 71 2 72.60 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGGTTTCGAGACCCTGGGATAAT:1 + chr2R 21380755 3' + roo 398 1 76.03 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATG:1 + chr3L 18468421 3' + jockey 4919 1 75.34 GATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTAAAGATCTTCTAATGTACAATAAATTCCTACCGTTGTGCTTGGTGGTAGATAAGATCTTAATATTCCTACTAAA:1 - chr3R 4068128 3' - mdg1 7240 2 54.11 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTG:1 + chr3R 21924375 3' + roo 9032 1 58.22 GGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACA:1 + chr2R 14884325 3' - mdg3 78 2 77.40 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAA:1 - chr3R 8542595 3' + roo 8995 2 67.81 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGA:1 - chr3L 4710734 3' - Doc 78 1 65.75 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGAAACTAACAGT:2 + chr3R 20905500 3' + pogo 2057 1 55.48 AATTAATCAAAAATATTATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGATGAAGAAGGGCATATTTGCATATGTGCATACGTGTGCACACATACTGTTGCCGCCTATTTGCTGTATGAACGTCCAGGCCTCGTTCCACCAAAAGCTAGG:1 - chrX 22921476 3' - 1360 255 1 73.29 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGGCGT:1 + chr3L 5438845 3' - hopper 47 1 52.05 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTT:2 + chr2L 15965332 3' - blood 37 2 60.27 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGGGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGA:1 - chrX 13548305 3' - jockey 4806 1 50.37 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAAAAGCCGAAAAACTTTTCCCCACTCT:1 - chrX 12623099 3' + jockey 4960 1 58.22 AAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCATTCTGGGTTTCCAGTTTCTTACACCAGCTAAAATGCTAATTGGAGAATGTTTATCGCTAACTCACCTTTCATTTCCAGTT:1 + chr3R 25299289 3' + roo 278 2 53.42 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACCAACTCCTAACATAAGCGATTCATATGATATG:1 - chr2R 8793842 3' - Transpac 20 2 72.60 AGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGCAGGGGATCAAAAGCGGACCAAATGAGCTGTGGCAAATGTGATTAGAGAGCGCCTATTAATTGCCTGTTTAATTG:1 - chr3R 15458386 3' + mdg3 5156 1 53.42 AATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGAT:1 - chr3R 27786569 3' + Tirant 321 2 73.29 GACAAGTCCAGAATACTGGCACATATCGTAAATAGTGACCCCCAAGTCACTACCAGTGAAATAATAGGGAAAAAAGACACATTTAATTTAATGTGTAAAAAGTTGTCATTGTCTGCGGCTGGCAGAGTGTGCGAGGAAAGAATTT:1 - chr3R 7877961 3' + X-element 86 1 62.07 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATATAGTAGGGTGATCCTTTGCTACGAAAAG:1 - chr3R 27786540 3' + Tirant 350 2 53.42 CGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAA:1 + chr3L 53085 3' + roo 355 2 55.48 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAGCTCTTCAAATGTATCCAATAATCGAGATGATGAACAGC:1 - chr3R 6068233 3' - jockey 4680 1 78.68 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGAAA:1 - chr3L 9571612 3' - jockey 31 1 67.12 AAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACACAGCGATAAACCATATCTCATCCATTGTGCCGACAGACCCTACAGTACACTACACTTTCTGGGAGTCCGTGTGTATAAAATAAATATTTATCTAGCCCGAATTATTCC:1 + chr2L 11618977 3' - HMS-Beagle2 6896 2 77.40 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAA:1 - chr3R 13358556 3' + mdg3 5471 2 65.75 GACCGCAATATTACAATTCCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCACCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCGCCAAATGTTTCCTTTCTTAGGCACGA:1 - chr3R 14791655 3' - invader4 56 2 80.14 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTG:1 + chr2R 23225839 3' + Transpac 5184 2 82.95 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACTTAACAACACTTTGCTGACTAAATTGTGTCAGTCTTATATTACCCTCAGCCAAATCGCATGCCCCCACCTACCTACCAACAATGCTGTCATATCTGTTGGGTA:1 - chr3L 8067459 3' - copia 4879 2 73.38 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATGTATGCTTATTTAAGAGCGCTA:1 - chr2L 1229539 3' + opus 7479 2 67.12 GCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGCTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7579 2 61.21 ATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACACAAGAAAAGAAAAACTCAAAGCGATAACTTTTTAAATTGCATATTAATTTTTTATGGCGCAAATTTTCCACCCCTCCACCGCGGAGGGGCCT:1 - chr3L 19367731 3' - Bari1 1588 1 63.01 CGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGCTTGCTGCTAAAAAGTGTATACCACGAAAAATGGGTTGCGCAAACTCT:1 + chr2L 19372180 3' + Bari1 1697 1 77.40 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACATTGTCAATAGAATACAGCTAGAACCCGAAACC:1 - chr3R 30568827 3' - roo 8751 2 78.77 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACAATACCCAAAAATTTTGAATAAACGTGGGCGGTAAAGAGCGCGTGCTCCATATGGTGTGATTTTTGGAGATTACAGGTTGCCACAAGTGTGGG:1 - chr2L 3006163 3' + pogo 2077 1 67.81 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTAGGCTCTCACTGGATTCTAGGCACAATCT:1 + chr2L 5648544 3' - Burdock 6148 2 76.03 TTGGCAATTTTATCTCCGTTGTCGGCTTCGTCCAGATAAATCAACTTGCCTACGTTTTCTATCGCGCATAAATATAAAAGAACTAAAAGACATGCAAAATAAAGTCCTGAAAGTCACTACCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCG:1 + chr3L 16047622 3' + diver 308 1 58.90 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACT:1 + chrX 10979087 3' + roo 8996 2 71.92 TTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGAGCTA:1 - chr2L 20638342 3' - Doc 56 1 52.78 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCATCCAATGCCTTCTTGTTTGAGTTTTATTACGATGCTCTTGACCGGTTTTATTGCCCTCAATATTTCTTGCATATTCTGGCCACAACTCATTCAACAAATA:1 - chr3L 16535123 3' + copia 234 1 69.18 GTTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATGCCACTCTTAATCACCGAAGCGAACGTAACGCGGAAATTGTCATTTA:1 + chr3R 24172058 3' + Burdock 273 1 67.12 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCC:1 - chrX 10978997 3' - roo 8742 2 73.97 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTG:1 - chr3R 29708978 3' - blood 7086 2 70.55 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGAGAATTTATAAG:1 - chr2R 22798625 3' - hobo 67 1 65.07 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGTTAGCTTACGAAAGTGAAACTAATTTCCGCTTTTACGTGGATACAACTTGC:1 - chr3R 5940388 3' + hobo 2927 1 77.40 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCTGTCGCCGCCAGGCCGCATTCGAATGGAACCC:1 + chr2L 14139696 3' + Tirant 347 2 72.97 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTCATAGTCTTAAAAAAAAATGTCATCATATTTTATAAGATTCTCTTAAAATTAGCATAGGCTTAAAAATGGATCATGCAAATAAAT:1 - chr3R 6842566 3' - mdg1 37 2 58.90 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTGGTTGCATTACGCAGCACCAAAAATTAAGTTTTCAGCTGATTGAACAAGTTTAACAGATTTTTATACTG:1 + chrX 3529844 3' + 412 450 2 53.62 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCAC:1 + chr2R 14562275 3' + Burdock 6362 2 44.52 GATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATAAAATAAAACGACAACTTACTTCAGGTTCATTCAGCAAAGTGTTGTATACTTTCGGGCTGCT:1 - chrX 18707437 3' - BS 4720 1 74.36 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGAT:1 + chr2L 21192557 3' - roo 15 2 70.15 CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAG:1 - chr2R 24630141 3' - copia 77 2 73.29 TCGCGAAGCAAAATAAAATTTTGCAAAAAAAAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAATTCGTGAAAGGAAATGGTTATTAATTATTGTTCGCTGGATGATTATGGTGCCTCTTACAAGGAA:1 - chrX 18102697 3' + HMS-Beagle2 385 1 58.90 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTACACTTATCACAATAAG:1 - chr3L 6096458 3' + roo 9046 1 67.81 GGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTATGGAAGCACGGCAAAAGTGATC:1 + chr2R 7404829 3' + blood 378 1 78.08 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGTAGAGTGACATTTTTTATTTGATAACTAGGTAGATTAAGCTTAGCATTA:1 - chr2L 1327504 3' + pogo 2032 1 65.07 GGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGG:1 - chr3R 25876880 3' - mdg3 5332 2 69.86 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGG:1 - chr2R 9164820 3' + 412 7523 2 63.71 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAAT:1 - chr2L 21237252 3' - P-element 98 1 18.49 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCGTGCAATGCCAGCGGAGTGAAGGGAGTGACTTTCTGTTAACTGTTTTCGTTATTATTTTAGGGATA:1 - chr3L 52937 3' - roo 53 2 54.11 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTG:1 - chr3L 2036976 3' - Doc 38 1 61.64 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACAC:1 - chr2R 6984394 3' - Doc 41 1 57.93 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCC:1 + chr3R 26315982 3' - roo 8735 2 67.12 CCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCACCAAACTGACCACAGGACCCGTTCGCACCAGG:1 + chr3R 5181142 3' + hobo 45 1 78.08 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACG:2 - chr3L 5183706 3' - copia 4940 2 65.75 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTGTTTTTTTTAT:1 + chrX 14756771 3' - pogo 54 1 60.27 CGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTG:1 + chr3R 13358696 3' - mdg3 5308 2 52.05 GTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTAAAAAAAAGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGT:1 + chr3R 20147542 3' + 1360 315 1 75.34 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCA:1 - chr3R 7884526 3' - jockey 4809 1 52.74 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAAAGTGAGCATTGAATAACAAGTTTAAAATATATTATTGCT:1 + chrX 6937941 3' - hopper 75 1 67.81 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGAT:1 + chr3R 15649890 3' - blood 7049 2 59.59 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACATCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGC:1 - chr3R 8367177 3' - Doc 89 1 72.60 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATT:1 + chrX 14908475 3' - blood 7071 2 56.85 TAATAAACTTACGCTAATAAATTTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACGCCATGCACTTGCCATGGATACACCGCGAACTGACCTGACTGAGTGACTGACTACATGGGACAACTAGCTGGCTATCTGGCTATCTGGCAA:1 - chr3R 24175643 3' + Burdock 6362 2 65.75 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATGAATGATATTTTATGCCTT:2 + chr3R 4884509 3' - pogo 33 1 61.64 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTAC:1 + chr3R 31621717 3' + blood 7309 2 70.55 TTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTTAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAATCAGGTGGGTAAAGTGGAGTAGCAACTGAATTAACGCTTAATTAGAAAATCCGAAA:1 + chr3R 22658493 3' - Quasimodo 7308 2 60.27 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGA:1 + chr2L 15920161 3' - jockey 85 1 69.86 CGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGTAGTGGGAGCGTCTAAT:1 - chr3R 9993373 3' + hobo 2868 1 70.71 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGGGATGAACACCCGATACGAGAGTTCCTCACGCTGTGCCACG:1 + chr3L 10856831 3' - P-element 25 1 59.68 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCA:1 + chr3R 7424649 3' - 412 7102 2 51.37 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTGTATCCTTGGCAGCGTAG:1 - chr2R 21227322 3' - mdg3 5288 2 59.59 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGCAAACACCCAAGGAGGAG:1 + chr3R 7424678 3' - 412 7073 2 69.18 CATTTGCATATTTGTGAAAAAATATTTTAGCATGCGATTTACAAATGTAACTAACTCAGCTTTCGTCG:1 - chrX 5570835 3' + hopper2 1568 1 50.00 AGGGACGGTAAAACAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGGGAGAATAGAAGTTCTACGAATATTTAATACACAATTGGACACAATTGCCGCCTGTTTCCTATTAATAACCTTATGCTATTAAGCATAGAATGTTTTTTATT:1 + chr2R 3899663 3' - Cr1a 3990 1 74.48 GCCGTGGTTTTTCATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACAGAATTATTAAATATCACATCGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACATCGCCTTGCTGAGATGCCGGTGCCCTGTGAGCCATA:1 + chr2L 16020666 3' + Cr1a 67 1 76.03 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAAGACAAGTAAGAGAAATCTTTGTAAATGT:1 + chr2L 1229721 3' - opus 7150 4 62.33 CCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCT:1 - chr2R 10478697 3' + invader4 242 2 75.34 CGCAGACTGCGGCGTCTTACAATCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAATATGAAAATATAAAGGATAACACAAACTAAACGAAAAGCAAAAAATAAGATGAATGATATACAACAGAACACTG:1 + chr3L 23455794 3' + rooA 227 2 56.16 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTC:1 + chrX 19498131 3' - P-element 103 1 15.75 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGGGGTAACCATTTTGTTGC:1 - chr3R 26782659 3' - hobo 19 1 73.97 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGC:1 - chr2L 12355262 3' + hobo 2891 1 52.74 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTGGAGTCTTTGGTTCAACCTTGATGGACTGGATGGTTATAATAACTACTTCCTCGATAAGTGAATTATCGATTACTTATTCCATATGTAGGCAAACAA:1 - chr2L 23173961 3' - 1360 38 1 71.92 TTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCACGACGCCCACAAATCGCTAGCGTACGAGCCCG:1 + chr2R 6052728 3' + mdg1 400 2 70.55 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATTTATAACTAAAATGTGAATTTTTAATCATTTAATCATGAAATATGTATAATAAATATATATGTTTATTAATT:1 + chr2R 8305324 3' + blood 331 2 55.48 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGA:1 + chr3R 21237795 3' - Doc 86 1 71.92 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAAAAGCTGGAGAAAGCTTTTTCGAAC:1 - chr3L 15035076 3' + pogo 2082 1 72.03 TGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCGATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATCAAATAGTTTCGAATAATTATATGCTAGAAGGAGCGCACACAAATACAGAAGATTTTTTAGCCATTTTGGAGTT:1 - chr2R 903722 3' + Stalker2 7440 2 50.68 TTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAATTCGTGT:1 - chr2R 2949013 3' + 17.6 444 2 57.53 AGGCGGGAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGGTTGCTAAAACTAACCAAAAAAAAATAAAGAAGGAGGCCAACTTCATTCCACCCAACTATACCAGTTGGCTTGAGAA:1 - chr3R 4831013 3' + Tc1 204 2 52.73 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATCTATATATATATATATGAATACGACCGGTCATATATAAACACATAAGTACACGGAGATTTCGCTTGCTAACATTA:1 - chr3R 23426352 3' + pogo 2060 1 56.16 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTCTGTGCGTAAATAACATTTAGTTTGTTCATCCTAAGAATTATTTTGACAGC:1 + chr3L 5446239 3' - roo 21 2 71.92 TGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATA:1 + chrX 21213362 3' - Doc 93 1 76.71 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTTCGGATC:1 + chr3R 23507716 3' - 412 7074 2 68.49 GGGAGGTCGTTGCGGCGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTCCGAAGTGTGTGGGATAAAAGAGCGATATGTTGTTAACATTTAACATTTTTGGGTTACGACGAAACCAAACAGACTATTGATAATATATTACT:1 - chr2R 17623426 3' - Doc 4542 1 57.53 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAAGCCACTCAACATGCTGACAATGGCATGAGCCCCATAAATTGCCAC:1 - chr2L 6166281 3' - 1360 61 1 67.44 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAGG:1 - chr3L 11665901 3' + pogo 2039 1 63.01 CTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCA:1 + chr3R 24175751 3' - Burdock 6223 2 78.77 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACT:1 - chr3R 10099869 3' - pogo 65 1 70.00 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTTGAAAGGTCAAAAATCGTAT:1 + chr2R 15392819 3' - blood 7058 2 53.42 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTTTTTTAAAATATAGTCTCCCCAACAGTAACACCTCGTTTAA:1 - chr2L 17638669 3' + blood 336 2 60.96 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAAACGG:1 + chr3R 29350808 3' - 297 6628 2 57.53 GCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGAAAA:1 - chr2L 8776802 3' - G4 3696 1 67.81 TCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGTATAAGTATACATATGTACGTCGCATTTTTAGCTGAGTAACGAG:1 - chrX 22959184 3' + 297 6905 2 76.03 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATAAGTCGCAAAAGTCTCGTGCGAGGCGAGATGATAAA:1 + chr3R 25753755 3' + hobo 2922 1 73.38 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAAT:1 + chr2R 21380725 3' + roo 9031 1 56.85 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTTATGTACTATCTAGAATTGATTTCCAAACTCA:1 - chr2L 4104015 3' + roo 321 2 76.03 AGTTTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGGGGCGACGAAAAAGTTACGCCGGCGG:1 + chrX 6938229 3' - hopper 32 1 52.38 GTACCCCCTTCAGCCTTCGGAGGGAGAAGGGATTAGCTAGCATATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGAACGCGTGCCCCAGAAATCGATGCAAATAAATCGGCAAAATCGGTAATGAGCAGATGCGGGGCATATTATGTCGTA:1 + chr2L 5933932 3' - G5 4630 1 53.90 CACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACT:1 - chr3R 18346609 3' + INE-1 539 1 49.32 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGACAGAATCCTCAATTC:1 - chr3R 6782679 3' - jockey 4709 1 60.96 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATTCTTGCATAGCGGGCAAATACTTGATTCCTATATAGTATGCAATAAATGCAATAGAAATGCTTGTTATTTG:1 + chr3R 10357867 3' + pogo 2055 1 54.11 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTT:1 + chrX 3444177 3' - pogo 67 1 63.70 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAA:1 + chr2L 8397229 3' - roo 8746 2 74.66 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGAT:1 + chr3R 14088660 3' + 1360 3334 1 56.85 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAAAAAA:1 - chrX 4858380 3' - BS 5008 1 55.93 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCACTGATTTCCTCGAAACTTGTTATGGT:1 - chr2R 6945586 3' + pogo 2074 1 67.12 TCTGCCTACTCTAAAATTAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCC:1 - chr2R 21897901 3' + 412 407 2 73.29 TGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATGAAGTTAATTTCATGGCCGTCGAATTGCTTTGTGAGCTA:1 - chr4 328529 3' - roo 147 2 73.29 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAAATT:1 - chr3R 13358550 3' + mdg3 225 2 69.86 GAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCGCGTGATCTTGTAAATCAAATAAATTTGTGTTTTTTGGACTTCATGCTCGGCTGCCTCGAGTCTCG:1 + chr3R 9609040 3' + G6 23 1 63.01 TGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACATGGTGTCTGTCTGTGTGGGCTCAATCTCAATTGATTGGGTTAATTGGTAGGGT:1 - chrX 10091771 3' - Bari1 1627 1 63.70 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCGATTAAC:1 - chr3R 19700840 3' + roo 9042 1 64.38 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTCAAACTCACTGCGCAGGAA:1 + chr3L 3540265 3' - mdg3 16 2 71.92 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTTGATTTGAGTTATGCGACAACGTTTCAAATATGTAATACTTTAAAGCAAAACATTGATTTTCAATATTCAA:1 + chrX 6398889 3' - blood 46 2 51.37 CACCGTGTCAGCAAGGTTTTATGAAACGAAGCTCAACAACCACTAACCTCTTGGAGCTTTCCCAGAGTGCTTCTTGGGATTAATGTACGACTTCAAGATTCCATTTATGTACATAAACACGGTGGGATTCTACACAGGCAGTATCT:1 + chr2R 5547775 3' + Q-element 200 2 65.07 ATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7189 2 80.95 TCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGGAAATAACTGAAATAAAACAGCAAATAGTAAT:1 - chr3L 16137322 3' - Juan 4113 1 73.97 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCCCAGCACACACGCACACGCATACACACCCACACACACACACACAACCATTCATCATCACCTTGAACTTTT:1 + chr3R 9993502 3' - hobo 14 1 76.03 GCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAATGTATCTGTGTTCTTTGCCTTTTACCTTTTTGCGCAT:1 - chr2R 17324424 3' - 1360 412 1 74.66 CTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACAACTTTGAGTGGCATA:1 + chr2L 20841990 3' + G6 1966 1 52.74 AAGCACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCT:1 - chr3R 10973226 3' - jockey 93 1 73.61 AAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTCAATAAAGTCTCATCGGCTGTGCGGAGGATGTGATACC:1 + chrX 2705811 3' - mdg1 495 1 79.45 GAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACATTTCTCTCTGTGTTTCTTCTGCATCTGAGCTCG:1 + chrX 14849437 3' - 412 471 2 81.51 ATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATTTACATTGGAGCACGTCATGGAGACTCGCAGTTGGTGCGCTTGAATTCGGAGGCCATCG:1 + chr3R 13053763 3' + Dm88 42 2 56.30 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTCACTGTCAGTCATG:1 + chr2L 21596586 3' + blood 7328 1 56.34 CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTGCTTTTTCGGCAGGCACCTGCACCTGGCCGCCCTCGTTTCTCGTATTCCTGCTACTTCGTT:1 - chr2R 21059184 3' + Tirant 8434 2 63.81 CACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCAAGAATCCAATAACCAAGCCCAGTAACAAATTACCCAAACCAAATTATCGACAACCACCTGTGATGGTAACCAGCGGACCCATCGATCTTGTA:1 - chrX 17086815 3' + G6 1689 1 67.15 GCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATA:1 + chr3R 25876935 3' + mdg3 157 2 76.03 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTT:1 + chr2L 17228688 3' + mdg3 5411 2 75.34 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACCCTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTC:1 - chr3R 10778656 3' - mdg3 5323 2 62.33 ATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGATATTTATTTATTCCTTTAAAAATGGACTCAAATTGTT:1 + chr3R 17221698 3' - copia 5079 2 73.10 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGGAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGGGATTGGATGACCA:1 - chr3R 15465478 3' - mdg3 62 2 58.22 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTTCATCT:1 + chr2R 20500136 3' - 412 7118 2 63.01 CATTGCTTAAGCCTCAGCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAATCCACCAAATTCATTCTGCAACTTTGTTGTGGGACTAACAAATGGCAACTAACCTCT:1 + chr3L 18092311 3' + Idefix 7036 2 60.69 GCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGTTTACTGCATTATTTAATTCACTGTATGTTTCATAATCAATTTAA:1 - chr2R 15527549 3' - HMS-Beagle 88 2 69.18 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTTCGGTTTAGAGTGTTTAGAGTGTGTATGAAA:1 + chr3R 4722528 3' + roo 395 1 76.03 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGG:1 + chr3R 7424635 3' - 412 7115 2 60.69 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATC:1 + chr3L 9242063 3' + roo 8985 2 76.55 AAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTGGGTTATATGAGT:1 - chr3R 19537425 3' - hopper 7 2 80.82 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGG:1 - chrX 15814515 3' - P-element 68 1 39.04 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAAAAGCCGAAAAACTTTTCCCCACTCTCCCGGCT:1 - chrX 12623092 3' + jockey 4967 1 63.01 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTTATAGTTGAGCAAATATTTA:1 + chr3L 3762319 3' - roo 57 2 57.53 ATTGCCTATTTTTTGTTTTTTAGACATTTTCCAGCTCTTGGCCAGCTGTTTGGCCTTCACCTTATTCCGCTTTAATCGACCAAGCCCCACATTCAGTTCATTTTTGTCCAAAGTATACGCACATATATCATTAAGTTAGGACGTAA:1 - chr3R 17756003 3' + hobo 377 1 60.96 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAGGATCAACCTTTATTTAGTTGATGCACAAAATCCTTTTTGCTTTCAATT:1 - chrX 6398754 3' + blood 350 2 54.79 CTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATATGGATGAGAATGCCGGGCCAAACACTTTGGTTACCACTGTGGTAGCCTCCGACAAGGACGGTGATAACGTGCGGTTTGGA:1 - chr2L 17719246 3' + Stalker 7062 4 54.79 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATA:1 - chr3R 22846719 3' - 412 77 2 69.86 GTATGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACATTAATAAATATAATACCCTTACTAGCTTATAAAAGTAATTATTTTAAGTTTGGTTTTTAAATAATTTT:1 - chr2R 7097937 3' - copia 4923 2 54.79 ATCGGCGTTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGACGACGAATTGTCTAAATTATCACACACAAAGGGTACAAAAACATGGCAAACAACAGACAGCA:1 - chr3L 20664198 3' - R1A1-element 365 1 57.53 CTAATTTGTTAAAAAGTTATTTCAGTTATTTGATTACTCATTTTATTAATATTTTTTGTTTCTTGAAAAGTTTGCGGTATTCTTTTGTCTTGAGCAAAGAATTTACAAGTGGATTTAAGCGACAACTTTGGTCTTTATAACCTACA:2 + chr2R 21720185 3' + Tc1-2 1457 1 80.82 CAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGC:1 - chrX 21474415 3' - 1731 80 1 80.14 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACA:1 - chr2R 21078395 3' - jockey 36 1 59.26 GTTGCACAAACTTCGAACGTACTCAACTCAAGAAGAGAGCCTCTGAAAATAAAACTTCACTCTGTATGGAGTTGCCAGACTGTTCGCTTCTCCTAATGTTAACCAGCCTCTGCTGCTAAGTTTACAGACATGTAAATAACACGAA:1 - chrX 7015313 3' + HMS-Beagle 6638 1 53.10 AGGGCAATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTGTCTCAAGCTTTCTTTCGAATATAATAATTGGCTTCCTCCGATTATATCGATCTTATTCATTAATGTCTGTAGACCAACACACTCAATGCCAACGAGC:1 - chr2R 5580496 3' + Gypsy12A_LTR 1968 1 76.03 TGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATCGCTTTTGATGGGCGCAC:1 - chr2R 19076542 3' - F-element 243 1 69.18 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGTACTTGCCATTCTTCATCAG:1 - chr3L 18835245 3' + pogo 2081 1 73.29 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAA:1 - chrX 12623124 3' + jockey 4935 1 57.53 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGTACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAGTTTTCGGG:1 + chr3R 10541354 3' - hopper 23 1 57.89 AATACTTCTGACAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCCGTTTTTAGCCAGTACGTGAAGTTCCCGCCTTCACT:1 + chr2L 19370801 3' - Bari1 199 1 75.34 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAA:1 - chrX 15089523 3' + P-element 2801 1 23.57 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAGCATTTCAAGCATATTCACTTTCATGATTGATTGCACTTAAACCGTTGCCATTGAACGA:1 - chr3L 11196336 3' + pogo 2043 1 60.27 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTGACAGTTACGTTTGAAATTGCCGTTTGGAAAGAGAATGGAAA:1 - chrX 5892089 3' + transib2 2748 1 69.86 AGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAACGGCAAAAGGAACTTGCAAATG:1 + chr2L 11867419 3' + BS 5016 1 73.61 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCCAAGTTCTCCACTTCTTCAGCTTTTCAGTTCCTCGGAGGAGCAGAGGCGGTCAAC:1 - chr2R 15906253 3' - FB 55 1 59.56 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACACTTGATATCCAAGCTATGGGTATGGATTCCGCAAAGGAATCTCGAACGACAACGACCAACACGAAAGA:1 + chr3R 16771438 3' - roo 8721 2 55.48 ATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGTGACTTTCCAGTGTGTTTGGTATCGGCTTGCTT:1 - chr3R 15323319 3' - flea 4956 2 61.18 GAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCC:1 - chr3R 3527095 3' - Tabor 84 2 73.10 CACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTGTTGGTGCTCAACGGAATTATATAGACCGCATTCAGTCGGTTACGAC:1 - chr2R 6187857 3' + Tirant 329 2 65.07 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACAATGAGTGTGAGTACGAGTACGTGCACGACAAACAATTAGAGCTGCGGTGGACATTGCGGCAATGCATTTTCCT:1 - chr3R 13806441 3' + roo 9021 2 51.03 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGAGGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATG:1 - chr3L 18468373 3' - jockey 4735 1 67.72 AGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCCACCT:1 + chr2R 5900963 3' + Bari1 1682 1 69.86 GTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 7573 2 62.20 ACGCAGAAAAACAACCACTAACCGTTTGGACCGTCATTTTCTTCGTAATACAGGGCTTCAAAAATAATCTTCAGCATATAATCTGCGTCCTCTGCACGCCAGATGGCGCTATCGCCTGGATGTACTGGCC:1 - chr3R 31181977 3' + Q-element 225 2 62.31 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCA:1 + chr3R 25443133 3' - 297 6643 2 67.12 ATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCCCTCTTACTGCTCTCCATATAGTTAAAATTTTTCCCTAACATACTTT:1 + chr2L 16688990 3' - P-element 344 1 41.10 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGA:1 - chr2R 14562102 3' - Burdock 52 2 57.53 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTATCTGGCAAAC:1 - chr3R 9616575 3' - roo 66 2 67.12 CTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGCTTACACT:1 + chr2L 21400821 3' + Doc3-element 4680 1 39.04 TCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATCCAGTTTCAAGAAGAGGCAGCGATTGTTAGATCAACAAT:1 - chr2R 22664594 3' - Quasimodo 72 2 73.94 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTTCAATAC:1 - chr2L 16942035 3' + mdg1 7402 2 56.16 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTT:1 - chr3R 12608043 3' + roo 9016 2 56.16 CGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGGTTTCGTATCAGCGTTTTATTCGTTTCTGTGGTGGCTTT:1 - chrX 10728772 3' + springer 371 2 70.42 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGGCCATCTTTTCGACTGGCTAAATTAACTTTTTGAGCCGCCTCTCAC:1 + chr2L 13547087 3' - P-element 37 1 60.27 TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTA:1 - chr2L 10937855 3' + mdg1 342 2 71.23 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACTACAAAAGTATTTTTCTT:1 - chr3L 5183649 3' - copia 4883 2 76.03 CAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAGTTTCAATTTTCTAGCTAGCTTAGGATCTTTGAAACTAAGTCATGAGAGCCTATTATTTTTACTTTGCCTTTTTTTATCTAATATTGCCTTTTTGGAAAACA:1 - chr3R 27519318 3' + X-element 4695 1 65.07 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATATTCTTAATCCTCATTCAAGTCGATTTGGGCTTATCCGTTGGTGCGCAAAC:1 + chr3L 20712096 3' + 297 6915 2 65.75 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATTATTATTAC:1 + chr2R 9867192 3' + roo 352 2 54.11 CATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGTCGACGGAGATGTGCCTCGCCATTCAACACCCATTACCGATGGAAGGCTCATGATGCCCGCGATGAGGTTGAGGATGAGGATGTCCCCAT:1 - chr2L 18758033 3' + blood 6978 1 61.64 TTATTCTCATTTCACACCACAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTTGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTT:1 + chr3L 25232866 3' - accord2 60 2 51.37 CTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGTAAGCTTTTAAAGATCTAGACAATGTGTTCGAGTGTCGA:1 + chr3L 1626866 3' - G2 3002 1 71.63 TATTATTATTATTATTATTATTAAGACATGACAGAGATAGACAGATAGATAAAGAGGGAGACATTAAGAAAAGTAAAGTCTACAAGTTGGACGATCACATCTTAAATTTTCTGAAACACTGAAAATGATACAATCAAAATTCTCTA:1 - chrX 13999224 3' - mdg1 7069 10 56.85 TTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTCAGGCACAAGGTGCTGCCTTTCCAAAAGAATGC:1 - chr3R 14331131 3' - Burdock 25 2 51.37 TTATATAAATAAATTAAAATATGCAAATATGCACATAAAGCCGACGAGGCGGACGAAAAGGAAAGGAAAACCCTAATTCGGGGCTGTTTTCCCGCCAGTCCTTCTGATTAAGGACTCGCAGACTTCTTCTTATCTCACCTCGATTT:1 + chr3L 1055177 3' + G7 1147 1 73.29 AGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCA:1 + chr3R 30731511 3' - gypsy6 28 2 64.38 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCATGTCATTTTGGGTTTGACTTAAGTTGTTGCCTACACCAATTGGTCAGAGCTACGGCACAGCTGCTCCCCAAAGTTGCCGCCTAGGGAAAAGCTAATAGAAATTAGATA:1 + chr3R 27783822 3' - Tirant 8117 2 67.36 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAA:1 - chr3L 24153146 3' + Tabor 450 2 60.96 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGGCGTGGGG:1 + chr3L 5438849 3' - hopper 26 1 61.54 GTTATTTAAAAAAAAAATTAAAACACTTTAAGAAATCGAATTTATGCTGTGCTTTTGCCTCTTGGTTTCGAAAATAAATTGACATTTAAAGTGCTATTTCTTTGACCGCAACTGTGTGGGTGTGCGAACACAATTACATTTCGGCC:1 + chr3L 8924793 3' + NOF 3952 1 67.81 GAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGAGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCG:1 + chr2R 5900940 3' + Bari1 1659 1 52.74 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTTCAAAGTTAACAAACAATT:2 + chr2R 20362330 3' - diver 5920 2 63.70 CACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGGAGTCAAGGTAAG:1 + chrX 21907839 3' - accord 403 2 51.37 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAAACCAGCGGCGAAAGGATA:1 - chr2R 20704128 3' + hobo 2935 1 71.58 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGAGGGGGCAG:1 + chr3L 16887409 3' + roo 9011 2 58.22 GGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATTAAGTTGATACTAGCA:1 + chr2R 9033968 3' - F-element 4518 1 62.33 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCATGATCCCCATGGCTGACAGCATCCTGAACTCGTTCATTCATTTATGCGCTCCGCTCTGTTCAAATGTGCAAATCTGAATATGTGCATG:1 + chrX 20552912 3' - roo 8694 2 63.70 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGCGGAAGAGGTAAATTCCGCTG:1 + chr2L 7991394 3' + 297 6953 2 66.40 CGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGCATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTG:1 + chr3L 13597817 3' + blood 289 2 81.38 GAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGAAATCTAGATCCTGATAGTGTGTGTTCTCAGCTAG:1 + chr3L 19146723 3' + pogo 2077 1 67.59 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTTGCCCACTTAAACAAAACAAAGGGGAAGCAAGGAAAACAAAA:1 - chr3R 8705667 3' - hopper 14 1 74.66 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGGACATTGGCGCCATCTATCCGCGCTTA:1 + chr3L 13227687 3' - hobo 71 1 70.37 GCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTAGAAGTTGTTTTTCCTTCACTTTGTATAGCATTGCAGAGCTTCCTTATCGCATTATGCAAATATTCAATTATT:1 + chr3R 17308463 3' + 412 392 2 50.00 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGTGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTTATCATTCAGTCGCTGCCCAGAATTCTCCGTTATAA:1 - chrX 18365970 3' - jockey 23 1 72.60 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTG:1 - chr3R 10468008 3' + opus 435 2 62.14 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGTCCTCACAAATACT:1 + chr3R 9482154 3' + roo 9054 2 73.97 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACT:1 - chr2R 20913094 3' - 1360 23 1 64.80 ATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGTTTTTCATTAATCGTGCATAAATTGAGGACAGGTAGAAGGTAGAGTTTCTCGAACGGGAAGTCTAACCTACATCTAACTAGGGAAG:1 + chrX 15608453 3' - I-element 5211 1 55.86 TTGGCGTTGACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTTAATGAATTCATTAGCATTTTGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGG:1 - chr3L 18708602 3' - F-element 69 1 60.00 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGTCATAACACATGCGACTC:1 - chr3L 16180850 3' + Transpac 5193 2 59.59 AATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAG:1 - chrX 14385139 3' - blood 7060 2 52.05 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGATCGGTCTTCTATTGGTGACTGAGTGCACCGTCTTTTAAAAATAAATGAAAGGCAAGCCTTCGAGACACTTTAAAGCATACAC:1 + chr3R 10831659 3' + 1360 3351 1 67.12 ATTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAAAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGAAATATGATGAAATTAAAACTTCAATACAACCACAAATATGCAATGAAAACACCCTTCTTGGAAATG:1 - chr4 52167 3' - 1360 3182 1 65.75 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGAAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGG:1 - chr3R 25876879 3' - mdg3 5331 2 68.49 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGAATCGCTCAAACTCCTGGTTTTTGCCAATTAGAAGAATTTCCCAACGGCAAAACTAAAATGCAATGGAAAAGGAAAGAGCACTCTTGTGGAGTGGG:1 + chrX 22591400 3' + copia 230 1 70.55 TTTTTTTTTTTGGGGTTTTTTGTCGGAAGAGAACGTGAGGTCGCCGACTGCGGGT:1 + chrX 19617853 3' + mariner2 595 1 34.55 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCCTAAG:2 + chr3L 14581520 3' - pogo 22 1 70.55 AGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGGACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCA:1 - chr2L 17198059 3' - R1A1-element 5071 1 62.76 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATT:1 - chr3L 20785493 3' + P-element 2784 1 15.07 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGGAATTATATAGATAATAAATATGAAATTATATTTTCAGCAATTATATGCTTGTCATAAAAACATAACATTTTATTTGTTAGTAAATAAAGGCATAAATTT:1 + chr3R 18469257 3' + Quasimodo 7337 2 65.75 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCACGCAAGCACATAATTCCCC:1 + chr3R 4659631 3' + P-element 2838 1 52.74 GATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCACTGGGGGATGATACCCGGTGCGACTTAGATGGGTCACTGCTGCCTGTCCCAAAATAGTACGAGAAATAA:1 + chr2L 41306 3' - HMS-Beagle2 7109 2 49.23 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCC:1 + chr3L 53057 3' + roo 8991 2 74.66 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTT:1 + chr3R 6053060 3' - Quasimodo 61 2 65.75 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATAC:1 - chrX 15089512 3' + P-element 2808 1 30.56 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGG:1 - chr3L 21097111 3' - mdg3 5309 2 54.79 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCCTTGTCCGTATTTTGCTCTTCTGTAGATCATCGCCACAATACGACATCAATGGAAGCCAAATACATC:1 - chrX 11534427 3' + roo 9019 2 52.74 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAATGATATTATTAAT:1 - chr2L 14262844 3' + blood 7327 1 58.22 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAG:1 - chrX 6398802 3' + blood 303 2 67.81 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATGAGTGGTGTGAAGT:1 + chr2L 1449720 3' + opus 7480 2 68.57 AGTGGCAGAAGAGCAGCGTATATAAATATGTATAAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 199 2 64.52 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATGGGGGAGGC:1 - chr2R 14553200 3' + mdg3 5469 2 62.33 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGGTACATCGAGTGCAAATTGAATAAAAAATAAAAAAGAATAATTGTACAATAGAAAGGATTCCCGAGGAAGTGAAAAGTTTT:1 - chr2L 21342234 3' + roo 9033 1 57.53 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAAATCAAATT:1 + chr2L 12142660 3' + hobo 2886 1 52.78 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAATCGATCCATGAC:1 - chr2R 22671340 3' - jockey 4709 1 55.48 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATTG:1 - chrX 9709969 3' + pogo 2040 1 62.76 TACGACTTCTACCAGGACACACAAACATAATCCACCAACACTACCTAAATCCAAGTTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAATGATACCATGGTTGTAATTTCCTTGTTCGTGGCTGCCTTTCATGTGTCAGGCATTTGTCCCAT:1 - chr3R 29183717 3' + I-element 4942 1 59.59 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATGAACT:1 + chr3L 5183822 3' + copia 220 1 60.27 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCTAATTGGGATCTAAAAGATCTCGGTAGAAGGTATACCTACATACTTAGTCGTTCTTTTCAACTAATCTACAATAGTAAATTCCATGAGTTTTTTTTTCCTCATATCTCTAAT:2 + chr2R 6579649 3' - mdg1 7047 2 75.34 ATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCAATCAACATCCCTTCTGCATTACGTTTGGTAATGGTTTATTGCCAGCTTACAATGAAAGCCAAATTGAATGTCAACACCTCTATT:1 + chr2L 17730036 3' - pogo 1822 1 56.85 GATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATATGTATAAATGTTAAAAGCTGTATTTTAAAGTGATAAACGTGCACAAAAGGTGAGTTTGACACTGAAAATCA:1 - chr2L 5542161 3' + Stalker 182 4 60.27 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCC:1 + chr2R 6585538 3' + pogo 2059 1 56.85 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTCTATTCTC:1 - chrX 17258188 3' + 297 6932 2 53.42 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCA:1 - chr3L 13597755 3' - blood 71 2 67.12 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGAAGTGGGAGCGTCTAATTATAATCAAGTCGCGTCAAGTCCTTCAACGTTCATCTCTCATATCGCCTAGATCCTAGTAAA:1 - chr3R 9993311 3' + hobo 2924 1 76.03 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAA:1 + chr2R 10552445 3' - S-element 76 1 71.23 TATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTG:2 + chr2L 9356893 3' - Stalker 6927 4 73.29 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTA:1 + chr2L 14222370 3' + Transpac 271 2 59.59 AAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATACCTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAATTCCTATATAATCATTAAAATGCAGTTTCCGCCGCAGAAGTG:1 + chr3R 5785425 3' + Stalker 6842 2 71.23 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTCGCCATATCATTGCCTGTGCTGATTAGTTACGCCTTGCTGGTTGGT:1 + chr3R 11461919 3' + 17.6 7407 2 78.08 CAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACGTATATTTATTAAATCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAAAAGTGTTTCAAAACTGTAACTCGCTCAATTGAATAGACAAAGGGGGGGCATTTCGATGCGGCGCCCCT:1 + chr2L 2260601 3' + 1360 453 1 62.33 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGTTACTTGGCACACTCAACAAAGTATCTATCAATATT:1 + chr2R 13614925 3' - jockey 4784 1 63.89 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGA:1 - chr3L 2037026 3' - Doc 88 1 77.40 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCTAGGGTAATAGTACACCAGTTCATCAAGTTCTTTTATAAAGA:1 + chr3L 23871367 3' - Doc 33 1 63.70 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGGGATAACCCTTGGGCGCATTGTTCTCTAGGCATTATGGAACGTGTCTGGGCATCTCTTGAGTTTTGGTGTTCTTCTAGGGACGAAAGGTGTTTTTT:1 + chr3R 31120315 3' - opus 7023 2 70.55 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCT:1 - chr3R 31956366 3' + pogo 2063 1 59.31 AAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATCCCTGGATGATCCACGGGCCACATCCGAAAGTCGATGCGGGCGTTCAAACTTT:1 - chr2R 24055661 3' - pogo 1913 1 63.70 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCA:1 + chr2R 5237911 3' - Doc 67 1 44.52 GCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTT:1 + chr3L 15322065 3' - Transpac 4978 2 58.90 CTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCGCAAAAAGTTATTG:1 - chr3L 10076303 3' + X-element 4660 1 55.48 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTT:1 - chr2R 5214939 3' - F-element 56 1 50.68 CAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGGGTCTTTGCCGCGACTGTGTCAACCAAATGCGTTCCAGGAATATCTTAGAGATACAGCACCGGCCATTCAATATGATGATTCTGGTCAATGACGGGG:1 - chr3R 29292362 3' - 1360 3388 3 68.70 GTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTCCAGAACCCCATCTAATCGAATTACTAATTCAGTTCAATCTCGAAATTTGGCAG:1 + chr3R 21521473 3' + Bari1 1700 1 75.34 GCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGT:1 - chr2R 981625 3' - 1360 48 1 62.33 CTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAAGGACGTCGCCA:1 + chr2R 2949173 3' - 17.6 6943 1 75.34 GCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGAGCAACATCCTCGTTAAGGCGACTTCGGTTTTTTTT:1 + chr2R 1985633 3' - Idefix 7026 2 75.34 ACTAATGTTTAGTTCTGCATACCAGAAATAAGTATAGATGGCGCCACAAGCGGATAAGGGGGCAAGCTGGGCGGGAGAGGAAGTATAAGTGGGGGGAGGTTGATGGTTCCCAGGACAGGGACTGGAACAATGGAGCGA:1 - chrX 2084228 3' - Transib-N1_DM 400 1 69.57 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGC:1 - chr3R 10142921 3' - 412 51 2 51.37 GATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAAATAAGAAGAGAGAGAAAAAAAATATATATATGTA:1 - chrX 13958420 3' + G4 3722 1 77.40 GACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTATTAGATATGACATGACGAAAGGAAGAGTTCGGAAA:1 - chr2L 8530372 3' + I-element 277 1 76.03 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTGGCAAGGG:1 - chr3R 11549799 3' - 297 6636 2 68.49 ATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATGTGTTTGGATGCCTATCGGCTGGGCGGAGTTTTCTTTTCGCACCTTACCG:1 - chr2R 23312957 3' + Tabor 456 2 59.59 ACAATGCATGAGCATACGTGTGTTGTCGACTGTCACCTAAGCGTAGAAAAGAGCTGCTCGCTGTAGAGCTCTCCGCTCTCTCACTCTTGAACGTTATTATTTTGATTAATTAGCCAAGATTTGGCTAGTTCAAACTGCA:1 + chr2L 15416827 3' - 1360 185 1 66.91 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTAAAATTTAAATTTTAACATTTCGCTGCATACTTTCAAATCTTTCAATGTTCTAATGTAAGTT:1 + chr2L 1136458 3' + 1360 3383 2 80.14 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTAC:1 + chr3L 21093265 3' - Ivk 30 1 65.07 CAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTG:1 - chr2L 21580873 3' - INE-1 543 1 52.05 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTATAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCAATTTCTTT:1 + chrX 9710083 3' - pogo 49 1 55.86 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCAC:1 - chr2L 19424695 3' - Tirant 8125 2 68.97 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGGCAGTAAGGTT:1 - chr3L 9241977 3' - roo 48 2 55.48 GAGCAGAATTTGTGTTGTTGGCCACTGCCGTGATCAGTATTTAAAATAAATCAGGATCTTGGGTTCCTTGTCGCGCTTTGCTTGACTCCGGCTCGCAACTACATGTCCACATCTGAGGCCAGCACATTCACAATCA:1 - chr3R 14638279 3' + G3 406 1 75.74 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGTCTTTCTCCTGCC:1 + chr2R 15613884 3' + P-element 2859 1 66.44 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCC:2 + chr3R 7424632 3' - 412 7119 2 63.01 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGT:1 - chr2L 2357283 3' + P-element 2822 1 41.10 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCG:1 - chr3L 22221109 3' + 412 7500 2 58.22 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGTCATCTGAAATGATGCCATTTAGGAAATT:1 - chr2L 12355227 3' + hobo 2926 1 75.34 AGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGC:1 - chr2R 20382474 3' + Bari1 1682 1 61.67 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGG:1 + chr3L 16887437 3' + roo 397 1 73.60 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTT:1 + chr3R 12540221 3' - flea 4794 2 66.07 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACTTTGCCTACATTTCGGGGCA:1 + chr3R 5940519 3' - hobo 75 1 68.06 GTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAATATGGAAACCGTAAATACAGGATTCACGCGTTTTTAACGACTTGTTTGTTCGCCTGGGGAGCGAGACGAGGGATTGGCAATGATGGCTCGGTCCCATCAT:1 - chr3L 11867838 3' + Cr1a 388 1 55.48 CAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAGGTCGGCACACACAGTCACATTGCCACACCACACTGACACACTGACACACACACACACAGTCGCACTTTAACGCGCCGCAGCTTACATTGTAATCTGTAGAACGGA:1 + chr2L 10933444 3' + mdg1 7027 1 75.34 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATGGGTGTGAAAACAGTGGGGATCCTGAATGGGTTGATAAGTTCAAGGCTAGCC:1 - chrX 12551707 3' + pogo 2036 1 62.33 TAAATAAATAATTAAATAATTATAATTAATTATTTAATTTAATAATATAATTAAATTAAATAATTATTTTTTTAATAGTAATACCCTATTTTTCTTCCTGTGCACTGTAAACATATGTGTGGCCATTGTACCTGGCTGTGTTTGTG:1 - chr2R 7604653 3' + HeT-A 27 1 62.33 ACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAG:1 - chr3R 11096694 3' - copia 78 2 72.60 TGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTAGCTGAACCCAACTTTATTAATATGAAATCATGTGTGGGAATACCCTAGAGCTAGTTATAATTGCTAGTTTTG:1 - chrX 10564332 3' + Stalker 234 6 59.59 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTAC:1 - chr3R 7424555 3' + 412 7473 2 70.50 ATTAAATTAAATTAATTCAATTAATTCAACTTGGTGCTTTACAGGACTTTTTTCAATATCAAACTAGTTGAAAAAACCATCAAAATCATAAGACTGTTACCAAATTGCGCTCAGTGCAGTGAGTGCAGGGGGGTGGGACATGGACA:2 - chr2R 22397494 3' + HeT-A 379 1 70.55 GTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAAGTGAAATGAATAAATTCCACAATTTTTGCATTAGTCTCAC:1 - chr2L 1089386 3' - roo 117 2 71.92 TCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGGAGGAGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGGACCTGAAAGTGAATGCGGATAA:1 + chr3L 25232913 3' - accord2 8 2 76.71 GTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAAT:1 - chr2R 19076486 3' - F-element 185 1 67.81 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTCGCGATTTGAAGCTATAATTAGATGAGGTATTTACTTTGGCAGA:1 + chr3R 20137378 3' + Burdock 221 2 60.96 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGCACACCTGCTGTTTGAT:1 + chr2L 17730558 3' - pogo 30 1 66.44 ATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAAGCCTCTAGATTTATAATTAGATGTGAAGAATACATTATTATTTAATTAAAATGCGAAGTACATAGACTAATATTTTAAAGTTAATAGCTGTC:1 - chr3R 29024165 3' - S-element 1604 2 67.12 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAAC:3 - chr2L 18370353 3' - Doc 85 1 72.60 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTTCATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACA:1 - chrX 13061724 3' - mdg3 80 2 67.12 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTGAAATAAGCAATAATTCTTAGCAGTATTCTAACTCATTCGAAGGTAGCAGAGCTTTCTTCT:2 - chr2R 9815011 3' + pogo 2048 1 57.53 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTAC:1 - chr3L 5514169 3' - Doc 55 1 49.31 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAAGAACAGAAATCGAAGGTGCAACTCCAAAGAAACAA:1 - chr3R 10099814 3' - pogo 26 1 69.18 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGAGCTAAAACACTGATAAAAAATAATGCAAAAAAGAAATAAACTTTTCTGTTTTTGTTGTTAATATCAAGGCATTTCCTAATTTTGAT:1 - chrX 10960170 3' - Transpac 4950 2 63.01 TTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTG:1 + chr2L 14222332 3' + Transpac 233 2 74.66 CTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGACTCCAACAACAAGGGCCTGCTGACCATCATGATATCGAATAATTTCGTGGAGCTCAAGGGATCCGTGT:1 - chr3R 18162936 3' + F-element 4248 1 52.74 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATCATTT:1 - chr3L 18468335 3' - jockey 4715 1 49.66 CACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTG:1 - chr3R 19537437 3' + hopper 1396 1 72.60 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCCTAAGACA:2 + chr3L 14581523 3' - pogo 19 1 72.60 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAATACAAAAAACAGAAACTAAATAACTCTCCGTTTTGATGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATATATTGCCTATAGTGCAATGTTGCGCAAGTGAAAGAG:2 + chr3R 16535428 3' - Stalker2 17 2 68.49 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGT:3 + chr3R 21237815 3' - Doc 66 1 58.22 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAA:1 + chr2L 2519920 3' + roo 9028 1 54.79 TTTTTTTGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAA:1 + chr3L 25232869 3' - accord2 7456 2 58.04 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAG:1 - chr3L 14969183 3' + P-element 2882 2 71.17 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTATATAAGTTAACCCACATGCCATGTGCTTTATTGCATTCAATTTTC:1 - chrX 18913229 3' - Quasimodo 19 2 71.92 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTCATTTACCTTTCCTATATTTTTGATAGCGATTTTCCAGCAGTTTTCCCATAGATTTC:1 - chrX 5261723 3' - 297 6635 2 60.96 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGC:1 - chr3L 21097125 3' - mdg3 5323 2 64.38 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGG:1 - chr3R 26765103 3' - mdg3 78 2 70.55 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCT:1 - chr3R 16041134 3' - jockey 77 1 76.80 ATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATTGAGGTGCCATACTGTCCGTTGGATGCCTTGATGTTGCCGCGCGG:1 + chr3L 16788710 3' + Ivk 13 1 68.53 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCC:1 - chr2R 8793877 3' - Transpac 4974 2 56.16 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGG:1 + chr3R 7424659 3' - 412 39 2 57.53 GGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTTGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCATGTTTAATGCATTTCCAGGATGAGGAGTGGTCATGTTCTTTCCTTGGCTGCGGGTTAT:1 + chr2R 21600921 3' - G2 299 1 56.83 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGGGAGGAAAATGCAAAAGGACATTTGACTGCAGGAAC:1 + chr2R 16891277 3' - jockey 4822 1 73.29 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGT:1 - chr3R 25271196 3' - 412 7137 2 73.29 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTAGCTAAAATGCACATACTTCACATCACGAAACCTTTTCTGTTTTCGCTCAAGTTTTGAATACCAAATATTATTT:1 + chr3L 10814641 3' - 297 6599 2 65.52 CACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCAAATAGAAATTATGCATTCCAGAATGTTTACAAACAGCATGCTACTATTTAATGCAAT:1 + chr2L 15153380 3' + G2 3041 2 67.12 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAAT:1 - chr2R 7534580 3' + roo 9018 2 54.11 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGG:1 + chr2R 21897948 3' - 412 89 2 78.77 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAGAGTTAATTGGGTTAAACCCGTGCGGTTAATTGAATTTTGTAAAGTTTT:1 + chr2L 8772848 3' - Tabor 39 2 58.90 GCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACAGG:1 + chr2L 6074132 3' - BS 13 1 71.92 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCCCAGCACACACGCACACGCATACAC:1 + chr2R 19630951 3' - hobo 46 1 54.14 TCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCACAGTCTTTGCATTTATCGCATTTAATAGCCATTAGTGAATTG:1 - chr2R 19168035 3' - opus 14 2 73.94 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACC:1 - chr3R 8367130 3' - Doc 42 1 50.68 CACTCCTATTAATTTTATTCAGTAAATAAGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTAGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAATGTGGCGCTGCTGTGCGACTTATCGGCGGT:1 + chr3R 20735578 3' - Tc1 239 1 76.00 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATACCATAACAATATTTTCATAGCATACTTTCGT:1 - chr3R 19545320 3' - jockey 63 1 52.74 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCACGCGGCGTTCGACTACGCACACACACACACCCATAGCGCGC:1 + chr3L 131870 3' + P-element 2878 2 80.00 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAAC:1 + chr3L 21093253 3' - Ivk 42 1 56.85 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTT:1 - chr3R 26315880 3' + roo 358 2 51.37 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACTTTTTAGAAAGGAACACTTGGCATAACTTGGATTCTCCTCGACAACTTGGGACTCTCTTGAGTAATATTTCGTTTTTGAATTTTC:1 + chr2R 7717327 3' + S-element 1683 2 60.27 TATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAACTAGTTTGTTTGAGTGAAGATTTCAC:1 + chr2R 10453485 3' - mdg3 25 2 53.42 CTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTTCTATGGACAACGGACTACGGAGGCTCAATCTGTCCTGCTCGCTT:1 - chr2L 2629141 3' + INE-1 89 1 68.75 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCCACGATGTAGACTCTAATA:1 + chr2R 5992436 3' - pogo 21 1 71.23 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTACGTTGCTCACATTTTATAAAGTACTGCATACTTTCTTGGGAAAATGTTACGT:1 + chrX 7293306 3' - 1360 51 1 60.77 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGGTTATCGGGGTCATAAACGTTATTAAAAAGAAAAGTGTCGCTAATGAGCGTTATTATAATCGTATATTTG:1 + chrX 17161931 3' - FB 51 1 52.41 GTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTTGGCAGTGCTAGAGGAAATATGCTTTCTGTGGTGCTGCGCCAAATGAATGAATGAAATAAAACATTAAGGCCGCAAAATTAATG:1 - chrX 19117434 3' + Rt1a 4728 1 60.96 AAAGACAACAACAATTACAACATGTGTTCCATGTCCATAATTCTAAATCAGTAAGTTATACCTACATTAAGCATCTTCGCTCCTTTCTCATTTCTTTGCTCTCGGCAGCGGAACAACAATAATAACAATAAGATTGCTTTGGTGGC:1 - chr3R 18002953 3' - transib3 338 1 50.68 GAGAAGTTAAGGCGACTAATCAAGTCGGGACTCTAAACATCCCCACAAATAAACTTACAAATAAAGATTGTTCCAAGCGTTGTTCTACGGTTAACCCGCTTCAATAACATTTGTTTTGGTATTGAGCTGCGCCCGTCCCTTGTGTA:1 + chr2R 9173097 3' - Cr1a 4086 1 62.33 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTATAGCCGTCGAAATCGTAATCTCAATTCGCCATCCCATCGCCATATCCTGATTGCCC:1 + chr2L 15142336 3' + BS 5045 1 59.71 ATATGTATTCTTGATCAGGATCCCTATTCGACTAACTGTCCGTTCGTATGAACGCTGAGAATATGCAAGCAGATTTCAGAGACATAGACGCAGAGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACA:1 + chr3L 22511715 3' + INE-1 80 1 74.82 ACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTTTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGGGTGGAAAAAAAAAGAAGAAATGTGTGCGGGTGGACAGGAA:1 - chr3R 11120501 3' + copia 4941 2 68.84 TGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACA:1 + chr2R 20382566 3' - Bari1 72 1 73.13 TAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGC:1 + chr3R 10541340 3' - hopper 69 1 63.70 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGTACTGGGGAATTAACTAAATGCTAAATAATCAAATGTATGCAGG:1 + chr3L 15371407 3' + Transpac 271 2 54.29 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATT:1 + chr2R 5992409 3' - pogo 41 1 55.40 TATGTTTAAATCATTATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTTGTGATTATTCTGAACATTTTTAATTTCGTTCGTCTTTGGTAAATTACTCGCATTTTAAGCCATGACTTTTTGTAGTGCACGAAAAAGGATTCCT:1 + chr2L 20614304 3' - Porto1 4391 1 57.53 ATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGTGAGATTCATGTAATTTATGGAATGCGGTACACTGGAGGAGATTTCGAGCCAGGTCCATACGAACAAATCAGCGA:1 - chr2L 15811807 3' + 1360 34 1 50.00 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGAAGTGGGAGCGTCTAATTATAATCAAGTCGCGTCAAGTCCTTCAACGTTCATCTCTCATATCGCCTAGATCCT:1 - chr3R 9993317 3' + hobo 2928 1 77.21 ATAAAATTAGGTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGAGTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGA:1 + chrX 15167781 3' + roo 9034 1 58.22 ATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAATAGAACTATTTTCAATTGATCTATTGTCGATTATAAG:1 - chrX 15889199 3' - 1360 263 1 74.66 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGC:1 - chr3L 5514203 3' - Doc 91 1 66.44 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGC:1 + chrX 19162685 3' - pogo 60 1 60.96 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCATTCGGCGTTTTGGACTCGGCGAGA:1 - chr2L 10474323 3' - P-element 76 1 32.19 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGGAGAAGGAGCAGCCTACTACACCTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGAC:1 - chr3R 25384205 3' - mdg3 5337 2 71.92 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCTTCATTTGAAAAATAGTTTCCTATTCCTTTTTATATTAAAATACATTTTATAAGATTTTCAAATTATGAGATTTGTTTTTTTTTCGTGCACAAAA:1 - chr2L 9669472 3' + roo 9046 1 62.33 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGAT:1 + chrX 3452519 3' - Tirant 63 2 61.81 GGACTTATTGAACTTTACGGTATAACTTTCAACTTAAGACTAATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGTCAAGCATTCATTTAAATACCTTTAGCCCGAAGATGTGAATAAATAAAAAGTCTTTTGTCGCTAATGAGGATTCT:1 - chr3L 10237284 3' - McClintock 295 2 50.00 AGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGGCCGTATGAACGTCGAGATGTCAGGAATTTAAAATCTAGAAGGTTGATATTAAGCATGGGGATGCAGGACAGTCAGCAGGAGGAAGAAAGGAAACATATCA:1 + chr2L 11488345 3' + INE-1 105 1 66.92 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAAAAGGATCTTAAAGTTAAAATAACATGTTCCGACAATAA:1 + chr3L 3979715 3' - opus 7024 2 71.23 GTGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGTATAAACGACCTTAGAATTGTAAAGTGATAAAGATATTTATTGGCTAAAAATCTACAGATCGATAT:1 - chr3L 12500145 3' - FB 57 1 55.48 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTC:1 - chr3L 16157193 3' - Juan 60 1 60.27 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTCTTTATAGATTTATGAAA:1 - chr3R 10778639 3' - mdg3 54 2 53.42 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGA:3 + chr3L 53065 3' + roo 335 2 69.18 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTT:1 - chr3L 5514171 3' - Doc 59 1 47.26 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCAT:1 + chr2R 15613834 3' + P-element 2823 1 35.61 ACGACTTATCTCTGCGCAGGTTGAAGAGGAACTTATCAGGACCACTAGTCGAGATGCTTTATAGAAAATTTCTATAGCTATGACAAACATAATTGCACTGTAACCGTCACAAGGTTGAGCGAGCGAGCTATCACGGAAAGGCTCCG:1 + chr3R 2136291 3' - I-element 13 1 78.77 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTGTTGAATATTAAAATATTTATGTAAAAAATGCAATTTTTTAGATTTGATTTTAATATCGACGGA:1 + chr2R 5079295 3' - flea 4808 2 53.42 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTCAGTTCAGCTCTGCCAGCTTAC:1 - chr2R 22255286 3' + roo 9047 1 69.86 AATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAAGATC:1 - chr3L 24153126 3' + Tabor 7309 2 74.66 ATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGC:1 - chr2R 20362214 3' + diver 150 2 67.12 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAATCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTC:1 + chrX 983215 3' - 412 68 2 63.01 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTGTGTATCATTTTGC:1 - chr2R 18048782 3' + opus 7461 2 56.85 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAGAC:1 + chr3L 15261365 3' + pogo 2043 1 58.90 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACGTTTGAATCGTGTAATTCATATTTTGCACGCCTGGTTTGGATATTCAGATAGTATCCACAGAATATATTATATATATATTTGT:1 - chr3R 21373701 3' - 297 6609 2 56.12 CAACTGACGGGACATTAATTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGCGAACCTAAATGGGTTA:1 + chr2R 17986320 3' + 297 366 2 74.03 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCAATACCTGAACCTGTGCTCTCTTTTTTCTC:2 - chrX 4589402 3' - Burdock 46 2 54.11 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGAAGAATTCCATCAAGCAGTTTACAATTATCTATCCCTAATCCTTAACAAGATCGGATGTATAGGATTAAGAAATGTACAAGTATATGGCTTTAAGGTTTTT:1 + chr2R 4996680 3' + transib2 2806 1 73.29 CAAACGACTGCGGCGCGGGAACAAACTAACTGCAACGCCGGCCGGACCTATTTGTTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCATGCAACATAGCTCCAGCCCAAGTACACCAAGCCACAGCTTTTACCTATTATTAATTCATCT:1 - chr3R 16089954 3' + HeT-A 5586 1 73.57 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGGTCACAATACCCAAAAACTTTGAATAAACGAGGGCGGTAAA:1 - chr2L 3006220 3' + pogo 2047 1 69.75 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAAATTCGTATTGAAAGTGGGGTAACAGAAGGAAA:1 - chr2L 17730371 3' + pogo 2092 1 78.08 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCC:1 + chr3R 30568888 3' + roo 8999 2 68.75 GGAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTATTTAGGGTATTCGCTTCAAACTACCACATAGATATATAG:1 + chr2L 525292 3' - gypsy2 211 2 73.29 ACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGAAGGATGGGCTGATATTATTCCTTGCCACGGCAAAGCAA:1 + chr3R 12540273 3' - flea 18 2 71.72 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 18126079 3' - Doc 49 1 50.00 AATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTATACATGCCCTCAATGTTTTTGTTGCCCTCGCCTTCCTTGGAGGGACTT:1 - chr3R 9795465 3' + P-element 200 1 32.88 GTGGGAGAGCGAAAGAGCGAGAAAGTGAGATCGAAAAGTGCAGTTTATGTGAATGCAAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGGACAAATTTTTAGAAACATTCGCTCAGACAAATTTCCATTGTTTGCTTTTACCACA:1 + chr2R 7556741 3' - Cr1a 301 1 65.75 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTA:1 + chr3L 22635771 3' + hopper2 1543 1 58.90 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTACCCACACAGAGACACAGTCGGGAGAAG:1 - chr2R 20913065 3' - 1360 15 1 73.97 GGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTTTTGGGCTATGGGTTATAGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGAAGGTTGTTGTAGTAGTTACGTTATCGTAATTGTTCCGCCTGTCGCACTAAAACGG:1 + chr2R 22746845 3' - F-element 364 1 61.64 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCC:1 - chr2L 2690589 3' - hobo 76 1 68.49 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCG:1 + chrX 18193820 3' - hopper 51 1 52.05 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAG:1 - chr3R 6782720 3' - jockey 4750 1 67.12 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGCTTTGGAT:2 - chr2L 1073874 3' - Tirant 8134 2 68.49 TACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGA:1 - chrX 21668732 3' + mdg1 7382 2 71.23 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTT:1 + chr3L 20785507 3' - P-element 103 1 15.07 ACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGCTGAACGTAATGTTTGAATTCAAATAATAATTCTAAGATTGAAATAAAGCCAAATGAAGAATATTCTTTAATGGAATGTTTGTATTCGTAGAAAGTCGCTG:1 - chrX 21123391 3' + S-element 1698 1 73.97 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGC:1 - chr3L 4869152 3' + roo 9037 1 53.33 ACATATTATATGTGACTGCATGGCGATTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTTCCACGGGAAATAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGTACACACCCCGTCTCTGTACATAAACTGGATATTGAT:1 + chr3R 26841964 3' + baggins 5238 1 74.66 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGATTTATAAAGCATTTAAGTTGCTTTTG:2 - chr3R 27835568 3' + 412 7501 2 52.74 AACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTAC:1 - chr3L 22980594 3' + INE-1 575 1 72.00 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTTCTCGCAACGAACG:1 - chr3R 21421022 3' + roo 357 2 54.11 TATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTATGTCTTGTACAGGCGGCGCACCTCTGG:1 - chr3R 23794739 3' + mdg3 5207 1 71.28 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTTAGGGGAGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAAGCGGGAACGCAACTATATGCACTTCCTTCGCGGCCAATGCAA:1 - chrX 20552758 3' + roo 9032 1 52.74 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACGAACACTTTCGCACTGCATACTTTTCGGTGTCCAGCGGGTGG:2 - chr2L 15920105 3' + jockey 4914 1 72.60 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAA:3 + chrX 19231823 3' - mdg3 78 2 70.55 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAG:2 + chr3L 21093231 3' - Ivk 64 1 62.33 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATG:1 + chr3L 9426746 3' - P-element 84 1 28.28 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCT:1 - chr2L 1449599 3' - opus 185 4 68.49 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACAATACCCAAAAATTTTGAATAAACGTGGGCGGTAAAGAGCGCGTGCTCCATATGGTGTGATTTTTGGAGATTACAGGTTGC:1 - chr2L 3006175 3' + pogo 2065 1 59.59 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGGTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCCAGCCCTCTGTCC:1 - chr2R 22867400 3' + hobo 2893 1 51.37 GATCGTGGCCACCACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTCTATATATTTCTGTTACATATGAACATGACTGG:1 + chr2R 4577055 3' + Chouto 401 1 77.24 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCTTGCGAATAT:1 + chrX 14173321 3' + 412 456 2 56.93 CGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATGTATTTGTATTTTGTATATATTTTTCCCATAGTGATCGTAAGACTTTTAGCTTGTATTTTATTTTCGGTTTCGT:1 - chrX 13460500 3' + Quasimodo 7323 2 56.16 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATC:3 - chrX 22858872 3' - mdg3 5335 2 73.29 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACG:1 + chrX 14136556 3' + roo 8996 2 67.81 TAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTG:1 + chr2R 10163617 3' - Juan 4160 1 78.08 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATTATTATTA:1 + chr2R 9867191 3' + roo 351 2 54.79 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAAAGAAGGCCCAGAAGAAAGA:1 + chr3R 27835701 3' - 412 7096 2 56.16 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAGTTTGTGCACTTGA:1 + chr2L 10832378 3' - Doc 29 1 68.49 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCG:1 + chrX 983234 3' - 412 7101 2 53.79 GTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAAGGACAAAACTAATATTATTATTATTATTATTGTTACTTTTCATTGTCCACTCTTTGAACGGCTTCTACACTGCG:1 - chrX 16910930 3' + Cr1a 210 1 56.94 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCG:1 - chr2R 5848968 3' + mdg1 7390 2 65.07 CCCCCCCCTCAAGACGGAGACCGCCCTCGGCCGACCTTAACTCCGCAATCGCCACGTTCAGTTGTCTTGCGGATAACAAAATTGCCGTGCTGATGCGAAACTTTCGCAGTGCTACGAAAATTGTCTGCATTCCATGTGTCCAGTCT:1 - chr3R 18207940 3' - gypsy2 6458 1 48.63 CTCGACGTTCATACGGACAGACGAACGGACAGACAAACTAGTTCCAGAATTTATGCATATCCTTTATAGGAAAATTTTAATCAAAATGCTATGTAGCTCATATTAAGATTGGATGCCATGGCCAAAAGTTTTAATTATGAATAAAA:1 + chr3R 19701490 3' - INE-1 129 1 69.18 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCTTTTCTACGCTTTTCGGCAATCATGTCCATTGTCATGCTCCAAA:1 - chr2L 2519819 3' - roo 8741 2 70.55 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGCG:1 + chr2L 7991375 3' + 297 6913 2 62.33 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATACCATTTTCCTCTTTAAATAGGTATTTCACCCATTTTTCCCTTTTCAGCTTTTCCTCACAG:1 - chr3L 10814486 3' + 297 348 2 59.59 AAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAGTTCAGTTTATATATATATTGTTCGTCGATCCTTACCTGCAACAAAATAGAGAAATGAAATTGAAGTTAGTCAGGATCTG:1 + chr3R 31921697 3' - hopper 1358 1 56.85 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACA:1 + chrX 15167756 3' + roo 9020 2 60.00 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCTACTCAATTTTCCTATACAAGATAATTTTCTTTTTTCAAAATAAAACCAGGATTTGAAGAACT:1 + chr3R 4913650 3' - 1360 58 1 57.53 CGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGACGTTTTCATCGCTGGAGTGCCTGTAAATAGAAAGGTCAAGTGGTCAAGTACTGGGTGGGTATATATAGCTA:1 + chr2L 6381155 3' + R1A1-element 482 1 63.01 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCTTAGTGAAAAAATACAACTGAAATATAAAATTTCAAAGT:1 + chrX 23043204 3' + roo 329 2 71.92 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGTGCAGCAGGAAAACCAGAATA:1 + chr3L 14969332 3' - P-element 20 1 66.67 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGCTCGGCC:1 - chrX 3444082 3' + pogo 2055 1 57.03 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCCACTCGTAAAGGAGGAGATCGCTTGAGCCGTTTAT:1 - chr3R 14088571 3' - 1360 67 1 66.91 TAAGCTTACGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTG:1 - chr2L 17228615 3' - mdg3 5316 2 58.90 ACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGAACAATCCATAATCGTTGCCAGTTACGATGGCA:1 + chr3R 6890572 3' + mdg3 87 2 78.08 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTGGTTCCATTACGCAGCACCAAAAATTAAGTTTTCAGCTGATTGAACAAGTTTAACAGATTTT:1 + chrX 3529837 3' + 412 7488 2 57.53 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCA:1 + chr3L 22519120 3' - pogo 31 1 64.38 AGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAACCACTGCGGCGCAGTTCTTGCGAAATGTCG:1 - chr2R 20704093 3' + hobo 2919 1 70.55 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAAT:1 - chr2R 16908498 3' + roo 8995 2 69.86 GGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGCGCATGAAGTTTGGGGGAAATTGCCAGACAAGTGGGGCTAACAACCAATCGAGTTTTCCACTTTCCGCG:1 + chrX 5440094 3' + accord 7373 2 65.05 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGATTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTC:1 + chr2L 19878239 3' - mdg3 81 2 71.23 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATATTTCAGCCTGAAGAAACTGCACAAGGTGCAATTGCTGGTGGATGCGTGCAATGTCTTCTATCAGCCCAATCTGGAGCGGCAGC:1 + chr3R 28725055 3' - pogo 29 1 60.27 AAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACA:1 + chr2L 22684609 3' - transib3 60 1 50.00 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCG:1 - chr2L 2690570 3' - hobo 56 1 56.55 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCATTCGGTGCAAATAAAAAGTCATATAG:1 - chr3L 15321936 3' + Transpac 5193 2 61.64 TTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCTAAACGAACGACCGCCAACAGACGTAGGCGCTTAGATTTATGAGTAAGCAAATAAATAAA:1 + chr3L 18153586 3' - Max-element 8444 2 56.20 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTT:1 - chr3L 2037019 3' - Doc 81 1 72.60 TTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCACGACGCCCACAAATCGCTAGCGTACGAGCCCGCAGG:1 + chr2R 6052732 3' + mdg1 7442 2 73.29 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGAGATTTTGTGTTTTGTGTTCTCTAAATAAAGCCATACAAGACAAAAAATCGAA:1 + chr2L 3006300 3' - pogo 65 1 60.96 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAAATTATTACATTAAGCCTATTGATAAATCAATCCGGAAAA:1 - chr3R 15649786 3' + blood 7308 2 72.60 CTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTAC:1 - chrX 21639641 3' + Tirant 8431 2 75.74 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGC:1 - chr3L 2037017 3' - Doc 79 1 71.23 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATATTATAGATTATATTATTGCAAGGACTACCAAAATTCGTGGCTACCAC:1 + chr3R 13494412 3' + opus 7456 2 69.35 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCG:2 - chr2L 18370360 3' - Doc 92 1 77.40 CAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACACTCGGCTATTGGGGCCACACACACACACACACACACACACACAACATTACCAACACACCCACACCCAGGCAGGAATAA:1 + chrX 18235137 3' + jockey 4634 1 57.48 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTATCGAGGAAGTGAATGTGAATGCGAATGGGGGG:1 - chr3R 10467961 3' + opus 7481 2 71.53 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGAACAAAAGGAATTCCCAAGCAAAATATATTGTCAAACAATTTCAGAGAACTTTTTAATCT:1 - chr3R 22289372 3' + 412 7486 2 58.22 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTA:1 - chr3L 18708579 3' - F-element 46 1 60.00 GTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTCCTTCTTCTT:1 + chr3L 21531440 3' - G2 3076 7 97.06 CATTAGTCAGTAGGAACCGTTCAGTTCCTTCTCAACTTAACCTAATGTGTATCTTTAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACAAATGTACCGTGGATGACATTAGCAAGGTAGAGCTCCCGGTACTCGCTCT:1 - chr3R 4202158 3' - G5A 2816 1 75.34 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATCATTTATTTTTCACCATCTAGTAGCATATTTTAGTAATGATTATCTAATCGGTAAGAGAAACTAATTACCC:2 - chr3L 21387410 3' + pogo 2052 1 53.42 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCATCTCCTTGACCTGCAGCC:1 - chr2R 17986226 3' - 297 6597 2 72.09 ATGTAGGCTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTGCATAAA:1 - chr3R 12795040 3' + mdg1 7379 2 70.55 TCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGTACTTACCATCTTCCGGGGTGGGTTCCACATTATCTTGCTTCTCTGTTTCGACTGCATATCGCTCCCTCATTACAAGA:1 + chr3R 12031687 3' - mdg1 7434 2 53.42 AAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACATCGCAATCATTTGACAGGAATATTCTTTCCTTTAGGAGAACCTAACCT:1 + chr3L 14603201 3' + jockey 4999 1 55.86 ACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCCAATACCCCATGATCCCCCACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R2-element 86 1 69.86 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATG:1 - chrX 15089486 3' + P-element 2832 1 47.95 AACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATTTTAAATCAAAGAAAATCAGCTTGCAGCCTTTGTACCTCATCATATATGAAGCA:1 + chr3R 14866789 3' - flea 4820 1 64.38 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTGGC:1 - chr2L 15832961 3' + hobo 2928 1 72.44 AAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCCGCTCCATCATTGAGCTAAAAGTTTATTAAATAGCAAAGGCCAAATCGATTATTCACTGACAGGATTTTCGAAAAGAAGTTGAGGTTGGATCATAAAGTTTGTGTGTCCCACCA:1 + chr3L 26834448 3' + invader4 2744 1 75.34 AAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTTTGGCAGAGGACAACCAGAGCT:1 + chr2L 14970010 3' - Tirant 15 2 72.31 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGATACTCATTTTCGGAACGCCTCGCTCTCTCCGCTCATT:1 + chrX 13762627 3' - P-element 83 1 28.77 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAA:1 + chr2R 17100125 3' + P-element 2813 1 26.15 GGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTGTTGTTTTGTATTGTTTTCAGCTGCACATGGCCTTTGTCTATGGGGCGAAGGGATATAAATTACCAATAAATCTTATATTGGAAATTAATCATTCTCTTGAGTAAGAAACGCATTAAAACA:1 + chr3R 17866366 3' + INE-1 571 1 54.11 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTG:1 - chr2R 18123393 3' - 412 7082 2 58.87 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGT:1 - chr3L 2037014 3' - Doc 76 1 69.18 GAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATGGATTTATGAAAATGTTAAATTTGTTTTAATTTTTGTAAACATGTTGGCATTGAGGAATTGGCGTAGGACTTGCGACGCCGACCCTTTTTGCTG:1 + chr3L 18225477 3' + 1731 4201 1 75.17 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATAATATAATATAATGGTAAGAGTCTTCCCAAACTCAAAAATATTTATCATATATAATTCTGGTATTAGTATTTCAAAAG:1 - chr3L 15261235 3' - pogo 38 1 56.16 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATGCTTGGCAATTAAAATACTGTTTTCACA:1 + chr3L 18468448 3' + jockey 4946 1 56.85 TATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATT:1 + chr2L 9356899 3' - Stalker4 72 4 69.18 ACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCCATCCAATCGAGTTACCTGATGAATGGGGAAGCAAAC:1 - chr2R 5900799 3' - Bari1 38 1 60.27 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGT:1 - chr3L 22221114 3' + 412 442 2 54.79 GTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCG:1 - chr3R 13358598 3' + mdg3 5428 2 63.70 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGGCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTT:1 + chr3L 20977451 3' - I-element 35 1 52.50 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCATTTCATTCAT:1 - chr3L 22221097 3' + 412 7512 2 66.44 AAAGAAAAAAAAAAAGGGAAAGGAAATCCC:1 - chr3R 27949296 3' + Doc2-element 247 1 93.33 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACGAAATG:1 - chr3R 27503009 3' - hobo 46 1 54.11 GTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGG:1 - chr3R 15465485 3' - mdg3 69 2 64.38 AAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTTATGATT:1 - chr2L 19878148 3' + mdg3 195 2 52.74 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAGGGAATGTGTGTAAGTCGGTCAAATTTCGAGCCAAAGAACTTTCTCTATGGCAAATGGAATTAACACCTGAACTTTTTCCTTCAGCCAAATA:1 - chrX 6341439 3' + I-element 5329 1 64.38 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTCTCAGAAAGCTCATACATTT:1 + chr3L 9242125 3' + roo 405 1 66.44 GAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGTTCAGTCCCATCCGAACCCACCCACACCTCACGCCATC:1 + chr2R 12276224 3' + jockey 350 1 73.97 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTG:1 - chr3R 10079323 3' - P-element 91 1 23.29 GTAAACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAACTGGGCAGAAATAATGGAAAAGAAGGACACAAAGGCGGTCCAAGATTTCCCCGAATGCCTTACATACATTATGGTAATTAAAGAATGTGTTCCTTACTAATATA:1 + chr3R 6284377 3' + X-element 4613 1 71.23 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTA:1 + chrX 13651546 3' - 297 42 2 66.06 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATGTAACAGGCACAAGGAAGCGTTTCCGCGCATATTAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTGGCCATGTCCG:1 - chr2L 21256470 3' + pogo 2074 1 66.90 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGC:1 + chr2L 15965329 3' - blood 40 2 58.22 GAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACA:1 - chr2R 6984328 3' - HMS-Beagle2 76 2 72.34 AGAAGAAATTGAATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCA:2 + chr2R 10367569 3' + 412 428 2 58.90 TCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGTATCTGAAGTTAAAACATAATAAATTCTAGGCATAACATAAGATATTTCATAATTGCACGAAAACGA:1 - chr2R 16624785 3' + I-element 487 1 66.44 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGA:1 + chr3R 4659599 3' + P-element 2806 1 30.82 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTCTCA:1 + chr3L 9242109 3' + roo 389 2 55.48 ATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTAAATAAAGTTTCACTTAATTTCACCTTTTAAC:1 + chrX 21123510 3' - S-element 89 2 80.82 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCCTC:1 - chr3L 5490820 3' - 412 39 2 53.42 TGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAATTATAGAGGCTCAACTAAAGCTTGATAACAGCAATGG:1 - chr3L 19486466 3' - hobo 481 1 74.66 CGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATATAGTTGGGTCTATGACAGGATCTGGGCTTGG:1 + chr3R 9983105 3' - HMS-Beagle 6851 2 55.86 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTCACCGACACTGTCGCAAACTGGGAATCGCACATCGCAG:1 - chr3R 20137201 3' - Burdock 13 2 75.34 AGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAGAATTTTACAATTATACCATATATATTTTGATGTGTGAACACGGTTAATAAAATTACTCCGCACTCTTTTAAC:1 + chr3R 26064422 3' - 1360 3332 1 53.42 TATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTG:1 - chr3R 11121724 3' - copia 4956 2 76.03 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCT:1 - chr2L 10912239 3' - Doc 82 1 71.72 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCA:1 - chr2R 14385572 3' - jockey 78 1 65.07 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAAAGGTGTGTGGGAGTTT:1 + chr2L 17069683 3' + 412 470 2 69.86 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAG:1 + chr3L 14969271 3' - P-element 71 1 23.20 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTA:1 - chr3R 29708970 3' - blood 67 2 65.07 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAG:1 + chr2R 18051057 3' + mdg1 7387 2 68.28 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATTCTCACATGCTCACGCATTCCCACACTCACACACACACACTGACACGGAAAAAGAGGAAAGGAAAAGTCAATGATGCGTGTAAGCCAGCTCCTTTTA:1 + chr2L 15621987 3' - hobo 18 1 69.86 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGACGTAGAGTACCGTATTGATTCGGGTGCTCGCACAACGGGGTGCTGTCTGCATGTGCAGATTTATACTGTGCGTTTGTAATAGAGATCGGCACCGGTGCCTGAGTTG:1 + chr2L 20205319 3' - Tirant 8120 2 77.24 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTT:1 + chrX 983201 3' - 412 7135 2 72.60 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCCCTCAC:1 - chr3L 3540080 3' + mdg3 224 2 70.55 AGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAACACTAGAGTAAGAACAGAAATGCATGATTG:1 - chr3L 14043556 3' + Ivk 5291 1 78.08 TCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGTCCTCACAAATACTGCAT:1 + chr3R 9482158 3' + roo 395 1 76.71 CGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGC:1 - chr3L 10076317 3' + X-element 4646 1 65.07 AGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATATATAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGAAAGAAAGAATCACTCACTTACCAATCCCTTAAG:1 - chr3L 20895260 3' - invader3 5317 2 50.00 TATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATA:1 + chr2R 14884329 3' - mdg3 74 2 74.66 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGG:1 + chr3L 15035240 3' - pogo 40 1 56.85 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTCGAAAAATTGTTTTTTTTATATCATCGATGTTCCCATTTTTGAACAGCCAC:1 + chrX 14756802 3' - pogo 15 1 75.36 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATG:1 + chr3R 15649882 3' - blood 7036 2 63.20 GGTGCGGGAGCATAACTTCTTTTTTCTACAGCTTCCAGTTACAGCTAAGTTTTGTTACGGTTCAGTCGCCTTCATGCGTTGTAATAGTGAGGATCGTGCGGGAGATATAATGATAAATGAATTACGTCGACAGACTGTATGTTTTC:1 + chr2R 3287382 3' + mariner2 4 1 71.92 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAATAAACCATATTGCTATAGTTAAGCTTACCCTTTTATTACAACAATCAAAATTATGTTTAGTATAT:1 - chr2R 20462773 3' + copia 200 2 59.59 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGAATGCAAGATGAACACT:1 + chr2L 1229684 3' - opus 71 4 73.97 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGACGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTC:1 + chr2R 16891833 3' - jockey 95 1 73.97 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTCAG:1 + chr3R 9938735 3' + roo 389 2 72.60 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCT:2 + chrX 18193783 3' - hopper 88 1 77.40 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATCTGATTAACCGAGTTCTCCAGCGTGCCCTCGCCCGAATCCAAAGTAATTGACTCCTCC:1 + chrX 17646805 3' + roo 9006 2 63.70 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAAAGTGAGCATTGAATAACAAGTTTAAAATATATTATTGCTG:1 + chrX 6937942 3' - hopper 74 1 67.12 CTGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACGAACACTTTCGCACTGCATACTTTTCGGTGTCCAGCGGGTGGTTTGCTCAGCAGTTTCCCACCCAGTTTTTTAACTATTTTGCGCCAAAAAAGTTGCCCGACTGC:1 - chr2L 15920042 3' + jockey 4977 1 73.29 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTATGGA:1 + chr2R 7404811 3' + blood 7372 2 67.12 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAACCGGTCAAT:1 + chr3L 9426762 3' - P-element 69 1 39.04 TACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7242 2 80.65 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACACCACACTAAA:1 - chr3L 13597720 3' - blood 7046 2 60.69 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTC:1 - chr3L 13597744 3' - blood 7071 2 59.59 TATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGGAAAAACCTTGCCGACCGCTA:1 + chrX 10728914 3' - springer 65 2 62.33 TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCC:1 - chr3R 16194144 3' + mdg1 7375 2 73.97 ACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCAGTGTTTGCATACAGTTATAGTTGGCTAAGCTGCTGGCTGCGGAACCAGTTGCTTT:1 - chr2R 19903962 3' - Doc 4419 1 77.40 ATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 23244251 3' + Cr1a 4312 1 79.85 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGTCAA:1 - chr3R 8542595 3' + roo 331 2 67.81 ATTGTTTTTTTTTTCTTTTAATTTGCATTTATTTTTCGCTTTTATGCGTTTCATTTTTGAGGTTCTTCTCTGTTGCGGGGCTAGATCGAAAGATCGAGGGCTAGCCCTAGGTTATTGAGTTTTTGTTGCAATCTTTGATATTCGCT:1 - chrX 19728413 3' - transib2 2638 1 58.22 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGATAGTCATCAGATAGAATCGATCGCGAATTGTTAAGTCTCTCGATAAATTTCTCAGGGCCAAATGGCTTTCTCCCGTCATGGGAAGCGCTTTATTAATTGTC:1 + chr3L 13313287 3' - roo 18 2 70.55 AGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCG:1 + chrX 21667962 3' - gypsy2 39 2 58.62 TCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTG:1 - chr3R 5765355 3' + opus 413 2 80.69 GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGTATATACATATATATATATGCATGTGTCGGGGCAAGTTCATAAGCCGTTGCCCAATCAACTATT:1 + chrX 14448158 3' + HMS-Beagle 193 2 65.07 GCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 208 2 81.05 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTT:1 - chr2R 21078439 3' - jockey 28 1 51.81 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCGAAGAGCTTAACTTTCACCCCAAAGACGCAAAACACACACGATGTTGCCTCGGGGGCACTTTAATTAAATAATTTGTTTGTGTG:1 + chr3R 9616697 3' + roo 9043 1 64.29 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCCGG:1 + chr3R 25443149 3' - 297 39 2 56.12 TACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGGTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATT:1 - chrX 5440010 3' - accord 71 2 71.76 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTACTGTCAGCGAAGCCAAATGGGATT:1 - chr3L 5514146 3' - Doc 34 1 63.01 AACCATTTCTGCCTACTCTAAAATTAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATT:1 - chr2R 21897909 3' + 412 400 2 78.62 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCGGGGCGGTGGGTAGCGGTGGG:1 - chr3R 19537435 3' - hopper 16 1 73.10 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATATTTCAGCCTGAAGAAACTGCACAAGGTGCAATTGCTGGTGGATGCGTGCAATGTCTTCTATCAGCCCAATCTGGAGCGGCAGCTGGCCTAC:1 + chr3R 28725063 3' - pogo 21 1 65.75 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAACGGGGATTAAAAAAGTTGATAGAAATATATAGTTAAGAGATT:1 + chrX 12843665 3' + roo 8991 2 73.29 CGCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAAATTATAATTGAATTCAAT:1 - chr2L 1449564 3' - opus 7040 4 58.90 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTG:1 - chr3L 9426697 3' + P-element 2801 1 25.34 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAACCATGAACCTGCAATATCAACAAATAATAATTTAAAGCCAACACAT:1 - chr3L 15058797 3' - blood 7024 2 48.63 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGACGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAACAGTAGAAACACACACCACTCTAGGTGTGCAGATAACTTAAACCC:1 - chr2R 7399538 3' + blood 345 2 67.81 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGAAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGACACCCACTTGGACGCGGGGCACCAC:1 - chr3R 25384208 3' - mdg3 5323 2 73.64 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCT:1 - chr2L 18370344 3' - Doc 76 1 65.07 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTGCACT:1 - chr3R 25521769 3' + blood 7352 2 59.59 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTGTT:1 + chrX 14756763 3' - pogo 62 1 65.75 ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGA:1 - chr2L 12283932 3' - Quasimodo 66 2 64.38 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCATCACCCTTCTACTACATAAG:1 + chr2R 22255462 3' - roo 5 2 76.74 GGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAATTGAATACTTCAGATAAGTAATACTCAAATCCACTATATCC:1 + chr3R 14031185 3' + R1A1-element 5222 1 71.72 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGC:1 + chr2R 24338453 3' - 1360 62 1 60.96 ACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCATTCACTTAAATAACAGTTGAAAATAGGAATTAATGTTTGGAATAGCTGTTCACAGGTAGGGTAGGTTTTACTGC:1 + chr3R 8251587 3' + roo 156 2 53.24 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGGTGCATTGTTGTTGTAATGTA:1 - chr3L 6751637 3' - pogo 45 1 52.74 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGCGTATTTGTTGTTAATTTTTCAACAATTGCCTT:1 - chr3R 8022154 3' - roo 87 2 82.19 TAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTCATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCTTGCGAATGGATAGGGCCCAAATTAAACGGCTCATGACTTTAATGTATACGATTGTAAAATATA:1 - chr3L 11610592 3' + copia 199 2 55.48 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAG:1 + chr3L 22481329 3' - roo 8725 2 59.59 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATATACTACGTATTTCGTTCATATGGTAGATTTATTGGCCCTTCACTTGACTTGTTTGCCCGCCTGCAA:1 - chr3R 25354463 3' + 297 341 2 58.62 GTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACATCCTTGCCACAGTTGTGTGCTTCCTTCGTAGACCGTGTTCTCAGTGTACCTCATACTTTTCCGAG:1 - chr3R 13949187 3' - 412 439 2 55.48 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATAT:1 - chr3L 5446091 3' + roo 9018 2 54.79 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAATGGTGTATTGGGTTATCAACTAATTTCGGTTGGACATAGTTTTTGCCATGAAGAGAGGAATTC:1 + chr2L 22746350 3' - 1360 56 1 56.16 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATTTTTTTTTTCCTTGCAAAAGGAAGAGAAAAATGAAAACGA:1 + chr3R 14527063 3' - 297 53 2 70.00 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCGGCGCTAGTTGCCTGTCAAATTAGTTCGGTTTCACGGGGACCGAGCCGCC:1 + chr3R 4885409 3' + 1360 3319 1 66.90 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGGGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTC:1 + chr3L 19274863 3' + transib2 2736 1 78.77 TTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGGCAAAACCATGAGCCCATTGATTTTCCAA:1 - chr3R 9289247 3' + HMS-Beagle 7029 2 76.71 AGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTGGGTGTGCCACCCTCGTCGAGTGTGCGTGTGTGAGTAATTTGCGGGCTGCTCGTCAACTTCCTTTGCATATCTCACAGCTGTCAGAGACCGAAAAGTGTTGGCTTAGTTTTTGAT:1 - chr2L 20519961 3' - I-element 5095 1 78.77 TTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTT:1 - chr3R 5765323 3' + opus 7447 2 58.90 ATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAGCGATGAATAGTTCTTCTTGTCATGTTCTGTCTGACTTAACCAA:1 + chr2R 2527467 3' - roo 65 2 59.59 AAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCCACC:1 + chr2R 5900962 3' + Bari1 1681 1 69.18 TTTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGATTATACACTGTTCTTCTATTAAAGAAATATGTTTCTTCATATACCTAAAAA:1 - chr4 411237 3' - Rt1a 5066 1 65.07 ATGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCT:1 + chr3R 19545399 3' + jockey 4918 1 66.44 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGCTTGTTCAGTGGGCAACTTTTTTT:1 - chr2L 12261174 3' - jockey 87 1 69.86 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCCGCACTTCGGTTTTCAAGTGCAAGGTGCCTGTGTG:1 - chr3R 30272947 3' + Tirant 8473 2 61.64 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGTACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATG:1 + chr2L 4104079 3' - roo 8744 2 70.55 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCCGATCGCTCAGCTAATAAATCCGCACAAGAGGCTTTACAGCAACGTGATAGAGGTTGCAG:1 + chr3R 24479313 3' - 412 21 2 71.92 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGCTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACAAAAACATTCCAAATTCAA:1 + chr3R 15590064 3' + Transpac 253 2 56.16 TAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATGCCACGATCAAAGACACGAATAACAAGATGCGTAACGGCATACGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTAGAATTTTTGTTAGAGAGCGAAAGATTCGATATTATGTCAACATATCGATCGGCTGG:1 + chr3R 27414681 3' - Rt1b 5117 1 78.08 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGA:1 + chr2R 10367587 3' + 412 446 2 52.74 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTTTAACTTTCTTTTGTTTGGCCACATTTTGCTATCTCTTTCATTTCGTACGCT:1 - chrX 9951319 3' - hobo 26 1 67.81 CAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAGTCATTTATTGTATTGGTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACATTATGAAATACTCCTGGATACTTTTTATATTGCTTGAAGGAGGCTTGGAGTGGAAAGAAATGAGC:1 + chr2R 2176415 3' - Stalker 60 4 73.97 CCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACC:2 + chrX 21667992 3' - gypsy2 10 2 76.03 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTATACAACTCACAGCTCAATCTGGCGAAAAAGTGAAGGGTTAAACCTGAGAACTTCGTAGTTCATTGAACCTATTTCAGCAAA:1 - chr2L 7215491 3' + 297 362 2 66.44 ACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCG:1 - chr3L 23456268 3' + Gypsy6A_LTR 261 1 66.43 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGT:1 - chr3L 9430585 3' + P-element 2815 1 35.51 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTTCATCTTTTTTGCCGGCATTGCCTCTTCGTTGCCATGAGATTGGATTTAAATTT:1 + chr2R 20500183 3' - 412 7070 2 72.60 TCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCACCCAAAAAAAAACAACAACAACAACAACAAACCACAAAAACAGTGTATTATAAGACAAGAAATAAACACAACACAAGAACAACAACAGCCACATCAAG:1 - chr2R 19568407 3' + 297 43 2 71.23 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGGGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGGGGCTGCTATTAGCACGATGGTGGAGGCTAAACAAATTACTTTG:1 - chr2R 14553184 3' + mdg3 5485 2 69.18 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAGTAACGATCATCTTAGATATAATTATACAAAGGTAACTTAAGCGAAAACCTAATCATATATCGCAATTATTTTCAAAATGTGTAGAATATTAATCAATGAAAT:1 + chrX 13460669 3' - Quasimodo 11 2 71.23 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAA:1 - chr3R 11553656 3' + hopper2 1534 1 65.07 ATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATGACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTTTCCGCTCTCTCGCATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTG:1 - chrX 14317414 3' - 1360 199 1 81.38 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATTAACATATAAGTAAAGATTAAAATATCTTACGTATCCTCAAGTGCTGGCCCGTTGAGGGATCCTTTA:1 - chr3R 15188141 3' + 412 442 2 52.05 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGAGTTCATAATTTCACTGGTCGACTGTTGCTGGTT:1 + chr3R 22810815 3' - flea 4785 2 65.25 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCCCGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCA:1 - chr3R 10288787 3' + copia 5075 2 52.74 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCGTTCCGTTTCTGTTACTGCTATTTCTACTAATGTTTTTGTCCTTGCATCTAGTTTTATTGTGGATTC:1 - chr2R 3009417 3' - pogo 50 1 56.85 GGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCC:1 + chr2L 19878240 3' - mdg3 80 2 69.86 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAA:1 + chr3R 10143040 3' + 412 7493 2 53.42 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTG:1 - chrX 10571326 3' - Doc 64 1 60.27 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTT:1 + chr3R 25521883 3' - blood 72 2 65.75 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATATCCACACG:1 - chr3L 9426644 3' + P-element 2854 1 61.64 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTNACNCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGGAA:1 + chrX 3506206 3' - Tirant 8120 2 72.60 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCCACCCTAGAAAAGCCACATCGCCTCGCTGAAATTATATTTCAATCAATG:1 - chrX 9342455 3' - 1360 72 1 69.18 TTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATCTAAACACGACTAAAATTTCTTATAGCAATTATAGATGCAAACGAAAACTTGATACAATTCGGACCGCTTATAATCATGCAATTTGCAAATTCTAATCCCACTTAAATAATTTA:1 - chr2L 20637030 3' - Quasimodo 3 2 36.30 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAA:2 + chrX 2873446 3' + roo 337 2 65.75 TTATCATAATTATATTGGTCATTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCCGTACACTCAAGGGAATGCCTTAATATGTGTTTAGATATGATAATACATTAAACATTAAATTTCTATAGAATCGCAAAATTC:1 + chr2R 11424371 3' + rooA 7157 1 73.97 ATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTCTTTTACCGACAGTTAGATGTGTCCTTG:1 - chr2R 21078358 3' - jockey 8 1 79.86 GTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAATATAAAGAACGGGGTTTATTGTTCGTTAGGT:1 - chr3L 11953800 3' + jockey 4905 1 80.82 GTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAGTTCTCATGGCGGCCTCCGGTGCGTATGAGCAATG:1 - chrX 9525329 3' + hobo 2854 1 73.29 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAATATATGCATATATATGAAGGAGCTGACTTCATTTTAATGTGTGTAATAAGAGCTAAATCTTTTCAGTAATAC:1 - chr3R 21517982 3' - 297 43 2 59.59 GAAATGACTTAATATATGTATTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAATTTTTTTTTGAAATTGATTTTACGACTTTAAGAACGTCAATTAGAAGGTACAGTGCGAGCAGTTGGTATCGCCGG:1 + chr3R 29593963 3' - Stalker 6814 3 59.42 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGT:1 + chrX 3506131 3' - Tirant 8119 2 52.86 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGC:2 + chr3L 13597846 3' + blood 7328 1 60.96 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGGTAAGGTTCGCAAGCCGGCAAATTGGC:1 - chr2L 7991224 3' - 297 11 2 76.03 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAAATATCTAAAAAGACCTGACATCATTTGCCTCCGAATTTGTTTCCTTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGGTCGTACTTTCGAGTACACTCTTATG:1 - chr3R 27499965 3' + hobo 2924 1 51.05 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCTTTTCTACGCTTTTCGGCAATCATGTCCATTGTCATGCTCCAAATGTATGAATG:1 - chr2L 2519809 3' - roo 67 2 63.70 ACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAATTTGCGATTG:2 - chr2R 19076477 3' - F-element 176 1 73.97 AATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAACATGGAGGGATTGGGAT:1 - chr3R 27786569 3' + Tirant 321 2 73.29 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCA:1 - chr3L 14581374 3' + pogo 2043 1 59.59 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAATTCAAAGTGTAGTTAAGCTTTCAAGGTCGTCATTCTCAAGGATCTGCGACAAGTCCTTCGCAGGCTTAGCTTCGATCATAAAGAGTCATAAAGAG:1 - chrX 8014644 3' - 1360 88 1 62.33 AAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAACAAATAACACTCACATCGGACCATCCGTAGCCCACCAGGGATGGTGCCACGACCTCAAAAGCGTAATCCGTGATGTTTGAGTGC:1 + chr2R 18861309 3' + Bari1 95 1 62.33 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCGACAGA:1 + chr2R 1277185 3' - Tirant 8136 2 66.90 TCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCCAACCCCACCTGAAGCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGATTAAAAGTTCGGGGTCGCGGAATCGGGTCCTCAATTCCGATGGCTGTCTGAGGCG:1 - chr3L 22655556 3' + G2 99 1 62.33 CTTGATCAGGCTCAATAGCCGGGGCAACCTGACCATGTCCGTTTGCTATAAGTTCTGCTACATGCTAAAACAATCTATCTTTCTTATTTCTATTGTATAATTTCTCTTGAGAATTGTCATCAACATGACAAATTGTA:1 + chr3L 21484758 3' + INE-1 89 1 66.42 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGAT:1 - chr3L 4175247 3' + roo 9019 2 55.48 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAG:1 + chr3R 7424655 3' - 412 43 2 54.79 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAAT:2 - chr3R 20292428 3' + pogo 2033 1 68.49 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAAT:1 - chr2R 9326964 3' - mdg3 51 2 58.90 AAAAATATGAGCAGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCATGGCTTCCCATGACAGCGACAGTCCACAAAATATTGGTCGCTCTCTAACTGCACTTTTTAATCCGATCCCAAATCGCAGATCGCAGATGC:1 - chr3R 11645770 3' - hopper2 437 1 64.38 ATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGCATCTAATTATGTATACATTTGTGTAAATTGTACTTGGCTCACTTGCTACATATATGCAGTGCACCGTGCTTGGCCAAAATCCATCAATTCGTCCGGATTTATCTTA:1 - chrX 15318742 3' + S-element 1702 1 76.03 AGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTTTTGGATT:1 + chr2R 4103368 3' + invader1 396 2 67.81 TATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATATAGTTAATTAAGAACACAACAATTACGCGGCCAGTGGATGAGGCATGGCATGGCATAGCGGGGCTATGAATTTCCAAAAGAATCAC:1 - chrX 685287 3' + BS 5055 1 58.22 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCCTAA:2 + chr3L 14581519 3' - pogo 23 1 69.86 TATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGGTTGGTGGAAAAAAACCTACAGATAGAA:1 - chr3L 18296867 3' + Juan 4196 1 69.86 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTTTTAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTTCTGGGTCATCTGGATCTACGGCACACATTTCAACAGC:1 - chr3R 24693553 3' + hobo 2906 1 57.48 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTGGCTCC:1 - chr3R 22659915 3' + 412 427 2 64.38 AATCGATAGAAATTTACAAGACAAATAAAAATATATAAAAAGTTTTAGTTTTGGGCGGCTTGTCGGCGTAAGAGGGATCGTTCAGAATGTGTAAGGTTGATCTAGATGTGCAGTACTTCAATTTACAAGATCATCACAAATTATTT:1 + chrX 16089319 3' - INE-1 301 1 72.60 TGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAAGTCGACTACTAAAT:1 + chr3R 21570562 3' + mdg3 184 2 60.87 ACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATAATTAGATGATAAAAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCACCCTCCATATCCATCCGCCTTTGTCTGCCTGTGCCCCCTT:1 + chr3R 27780982 3' + rooA 226 2 70.37 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTGCTCTATTGGAGTCATATATTGGTTTATTACAGAGATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATTCGTGTGTATTTTTGTGCAGTGCACCTGAAGAATT:1 - chrX 17469154 3' + blood 7348 2 54.79 CCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCATTAAGT:1 + chrX 22824264 3' + Gypsy12A_LTR 2244 1 56.85 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAG:1 + chr2L 9287080 3' + jockey 4914 1 76.03 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGT:1 + chrX 9816467 3' - jockey 66 1 60.45 GGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAAATGTTTTTGTCATGTTTGCCTCAAATTAAAAT:1 - chr2R 19862968 3' - micropia 5385 2 45.89 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCAAAACACACTCATGCAAACTGGCGCTGATTTACCTAACAAGCGCAACTCGAAGAACAAAAGGCCAAAAGGCAGGGGATCCCAGTTGTT:1 + chr3R 28144946 3' + hobo 2909 1 64.08 CTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACTCGTGAAAAAAACTTATACGCCCCACTTTTCTCGCGGTGTGTCGTCTGAGCGCACAGTACGTGCTA:1 + chrX 4858427 3' + BS 5032 1 58.90 ATAGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCCTCTGCA:1 - chrX 693656 3' - INE-1 143 1 38.19 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCATTTTCGTTTCGCTCTTGGTTTTTCTTATTGCATTTTTATGCCCGCTCCCT:1 + chr3R 26316040 3' - roo 8677 2 76.71 ATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGATGATTCTTTCAAGCTTGCAGCTCTGCATTCAACAGCTGCGTCGAAGTCAGCGATTCAGAGACT:1 - chr3L 1456065 3' + invader4 2653 1 56.85 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGG:1 - chrX 16244902 3' - jockey 4834 1 67.12 GCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCCCTCCTCTGGCTGCCAATCTACCTACTGTTTTTTAAGTTATTAATTGATTATATTTAAGGACGAGGACTTAA:1 - chr2L 18163715 3' + HMS-Beagle 227 2 72.60 TTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAATCACATCGGTGGCCCACTTACCGCGTTCAAGGCGTAGATAGGCACCATCCACAATATGCGGATTATGTGCTTCTGCAGTATGGGCTTGGTAAAATG:1 + chr2L 9963146 3' - R1A1-element 86 1 65.75 GCCGACAATGTTGCAACATGAGAGTGCGACGAACTAGCAGCTCTGGTGTGAGGGTTTTTGGGAGACGGCGGAGAAGACGTAGACTGCTGATGTGGTAAGAATATTTATCATTTCAGTGAATGTCATTTAGAATGCCCCACATCCAT:1 + chr2R 16687184 3' - gypsy5 151 2 69.18 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATC:1 - chr3R 20452177 3' + blood 7333 1 55.48 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTATAATATGGCAGCAGTTGGGGGTTTATATTTGAAT:1 - chr2R 14246922 3' + pogo 2076 1 68.28 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCC:1 + chr3R 10079352 3' + P-element 2787 1 17.12 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAAC:1 + chr2R 10367580 3' + 412 7534 2 67.31 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAACTCGGCAG:1 + chr2L 20561510 3' - P-element 39 1 56.85 GTATTATATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGATAAATTTTTCCTTCTGTACTTCATAATTAAGAAACCACTTGTCCTCTTCGGATAACGTAATTTGTTGGCTCCTCTAAAAGCGGGCTTTGGCACAAATTGATTTGCGAGT:1 - chr3L 18522291 3' + G5 4681 1 53.42 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCAAAAAAGATTCTTTACTAATTATGTTCATAAATTTATCAGTAAACAAATCAATGATTTTTTCGTTAGCTGATGTGC:1 - chr3R 14916800 3' + Tirant 395 2 64.38 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCAGTTGAAAAGTAAACAAAATAA:1 + chr3R 18357500 3' + jockey 4932 1 55.48 ATTATGCCAAATCATTTTCATGTTTTTTGACAGCTTTAAAGAATAATTTCTTTACATTTGACGCAATTGTATTATAAATCATAAAATTATTATTTTTAAATATTATTGACCATGTAATTTTTATTTTATTTTTTAAATA:1 - chr3L 8226727 3' + Transib5 2697 1 61.87 CAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTCGCCATATCATTGCCTGTGCTGATTAGTTACGCCTTGCTGGTTG:1 + chr3R 11461917 3' + 17.6 7406 2 77.24 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGTGGCCATTTATTTGCCTTGCTGCGCTTTTAATT:1 - chr3R 7424495 3' + 412 473 2 71.23 GCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCCTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTT:1 + chr2R 11329664 3' + P-element 315 1 16.44 GATAAGCACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTGACAAG:1 + chr3L 13204773 3' - jockey 96 1 78.08 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGGTTGGATGACCAAACTTT:1 - chr3R 15465472 3' - mdg3 46 2 52.21 GTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCACATTTATGCAGTAATCAGTCGAGTGCACAGTCCTCCATATTATGGAGC:1 - chr3R 20147821 3' - 1360 260 1 70.55 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAG:1 + chr2L 16685393 3' + P-element 2818 1 38.36 AAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTTATGATTGAGCTAGGCTTCAT:1 - chr2L 19878134 3' + mdg3 5461 2 56.85 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACTTTGTGGCGCTTTCATTATACTTCTTTGCTTGGC:1 - chr2L 4416009 3' - jockey 33 1 68.49 AATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAGAAAAGGAATTTGCTTATTTATTTTAGAATGCTCCTTTTCAATTTTATTCATAACTTTATTTTCGAGATCTTTTATTTGATTTGA:1 - chr3R 3348764 3' + TLD2_LTR 169 1 58.22 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAGTTTTCGGGGGGTTTGCATTTTCCCCAGA:1 + chr3R 10541374 3' - hopper 35 1 58.90 AGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTC:1 - chr3R 5765319 3' + opus 7452 2 55.17 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGT:1 - chr2R 9164836 3' + 412 7485 2 58.90 ATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATACTGCGTGTGTGCAGGATGGGTAGTCGCCTCATTATCCATCGCCATGTCGTCGTCAATTATTCTTGTTCTGCAGCCAGCCTGCAAGAACTTTGC:1 + chr2L 2587523 3' - roo 8654 1 63.70 GCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATCCAGTTTCAAGAAGAGGCAGCGATTGTTAGATCAACAAT:1 - chr2R 22664594 3' - Quasimodo 76 2 74.66 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCGGCCGTTTTGTTGGCAAATCATAAAAATATTT:1 - chr3L 10370841 3' - copia 4892 2 69.18 ACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCACTATAGGGTCTTGGGTTCTTATAAGCTAGGATTCATTACATTTTTCTCTTCAGAGCTAATAGGTACCC:1 - chr3L 437383 3' + 412 7293 2 53.42 TAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAACCAAATAGCAAATGTCAAGCCGAAGCTTTTTCATCGGCATCCAGTTC:1 - chr3R 8505825 3' + FB 237 1 67.81 CCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATGTTTGCTTTTCTGTTAGACGATCCCCCCTCGAATGCAGCGCCCGACTTGCGGTTGCAACTG:1 + chr2L 2201761 3' + 1360 3196 1 58.90 GCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGATTTTTTTGACACCCTTCTTTTCAGCACTCACCCTAATCGAGTTATTGGTCTCACACAATCCAACTAATACAC:1 - chr2L 12362964 3' - hobo 2929 1 55.64 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATAC:1 + chr3L 20076854 3' + roo 9002 2 68.49 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTCAGTTCAG:1 - chr2R 22255300 3' + roo 9033 1 60.27 GATGATGGAGAAGATGTTCTCGGTGTAGGCTTGGGTTTGTCCTGAGGTTTGGTGGCAGCAGGTCCAGGTTCTCCGTCTGGGAAGCCTTGTTCGTCGTCGTCATCATCATC:1 - chr3R 13781126 3' + G2 201 1 75.45 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTA:1 - chr3L 15371267 3' - Transpac 38 2 60.00 AGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAG:1 + chr2L 12481520 3' + pogo 2032 1 66.21 GAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCCTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGCGCGTGGAAAACCAAGAGCTGAAGAGGGACCTAGAGACGAAAATCGA:1 - chr2R 24786363 3' - F-element 227 1 67.81 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTTTTAATTATCCCAAACCCACGCTGAGCAATCCACAATCAATTTGGCCTGTCACACCCG:1 + chr2L 11573770 3' + jockey 4986 1 68.49 ATTTCTACTGTTAGTGTTAAGGTAGTTGTAATTTACCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCACCCCGTGCCTTATGTTTTAGCCAGTCGATCGCGTTTGAGAATTCGCCATTAAATACAGATCTTAAACTGTGTAGG:1 - chr2L 9777496 3' + Max-element 8400 2 52.05 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTT:1 + chr3R 8542672 3' - roo 69 2 65.75 TTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATCTAAAAACGTCGCAGTGTGTGACACATACACACTGAAAACAAATGACCA:1 - chr3R 21521327 3' - Bari1 74 1 68.49 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTCTGTGCGTAAATAACATTTAGTTTGTTCATCCTAAGAATTAT:1 + chr3L 5446230 3' - roo 30 2 65.75 GAAGTATAAAAGCTTGAAGGTTTTTGGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCATCGCACGTTTGTTGACCCATGTTGGCAAGCCAACTCTAACGCCCAAAATCGCACAAAACTGCATCGCCCACACTTTTTAACCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 8481993 3' + INE-1 158 1 62.33 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCTCCAGAAAGAAACAAAAG:1 - chr2R 9332093 3' + roo 377 1 58.22 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACAGGTG:1 + chr2L 6074134 3' - BS 11 1 73.29 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAA:1 - chr3R 25521806 3' + blood 304 2 69.18 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATA:1 - chr2L 20984302 3' - blood 7075 2 62.33 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCT:1 + chr2R 18048895 3' - opus 184 4 73.97 ACACACACACACTCACACATTCCTGGCAAGAGGTAATGGCGTTTGCCCAGGAATATGGACCGTGCTCCTCGTGCATTCCAGTCCGAACTCAGCGACGGACCCCCGTGGAACGCTGACAATCACGCAC:1 + chr2L 19224613 3' + accord 7031 2 85.83 GGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCG:1 - chr3L 10076316 3' + X-element 4657 1 61.76 CGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATGTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATT:1 + chr3R 9938714 3' + roo 399 1 72.17 TAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAGTAGCACACCCACATATATATTTGTTTAAAGTTG:1 - chr2R 21897831 3' + 412 7529 2 67.81 CCCCCCCTGTTCTGTACATCTGATCTGTGGCGCCCAGACTAAAGCCCGGTCTGGGATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCATCAGACTGGACACACTGAAACTTCAGCT:1 - chr2R 22372743 3' - Rt1a 438 1 79.45 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCA:1 + chr3R 21924367 3' + roo 360 2 52.74 CTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTACCTAGCTCAAGAGATTCTTTCAGATTTAATTTAATAAAACCGGTAGCTTAGGATTATAAAATTAACTTTGACTTTATTTAATGTCCCTCC:1 - chr2L 3712931 3' + roo 295 2 63.70 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCT:1 + chrX 21213413 3' - Doc 42 1 54.11 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGCTGGAGATTAATTGAGGGCCA:1 - chr3R 25384141 3' - mdg3 20 2 70.34 CTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACA:1 + chr2R 18048889 3' - opus 7193 4 78.08 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCGGCGCTAGTTGCCTGTCAAATTAGTTCGGGTTCACGGTGACCGAGCCGCCGGG:1 + chr3R 4885412 3' + 1360 3321 1 66.44 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTACTT:1 + chr2L 19903500 3' - Transpac 35 2 56.85 GTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGGTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTATGGGCATACGTTCACTGTGCCTAACATCGCCCACGCCCCTTGTGCGCCACGCCTCTGTGATATTTTCGATGCACTCGTAATCCCG:1 - chrX 7326967 3' + Bari1 74 1 63.70 TTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTAAATATAAAAAAAATACGGACTAGTGTAATTCAAAGGAATCTAGCGTTTGGACCAAAAGCATTGGCTGCAATCTCAGACAGCCAAATAATAAACTACCATTTTTTATG:1 + chr3L 15656277 3' - gypsy12 9750 2 53.42 CACGAACACATACACACACACACATGGACATACACGCCCAAAAAAAAAAGCGACGAAAAAGTTCATCTATTTTGTTGTTGCTCATGTATTTTTTCGCTAATTCGAGGCGGAAGGCCAAGCGGAGCAGCCT:1 - chrX 1506377 3' + accord 7026 2 74.62 TTTTTTTTCATATTCTTTTGAAAGCTTCTAAAGGATAATGAAAATGATCCAAAAGGGTAAGTTATAAAAACCCAAGTTATCTCAAAACGAGAGGTGAAAGCTCTGGCTAGTGTGCTTCCTTGAGTCTGCCTTTGAATTT:1 + chr3R 21727679 3' - Doc2-element 215 2 58.99 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGACTTTTTC:1 - chr3L 16887327 3' - roo 80 2 73.29 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTT:1 + chr2L 10032732 3' - hobo 44 1 58.33 ATTTAAATGATTTTACCAAAAAGATACGTTTCAGACGCCTGCAATGCACTTAAAATTACGAATGTATTGTATATTCAAATAAGCATAAATATATTAAAAATTGCTTCATTTACCTAAAGCTTTTGTGTGGCTTTCATGTTTTCAAT:1 + chrX 9973681 3' - HeT-A 5804 1 47.95 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGACGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGA:1 - chr2R 5992280 3' + pogo 2052 1 53.42 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTA:2 + chr3R 25271269 3' + 412 7480 2 64.38 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAAC:1 - chr3L 13722037 3' + blood 298 2 76.03 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCGCTTGGCTATTCCTATGCAGGAATTACGAAAGGTTG:1 - chrX 19498037 3' + P-element 2864 1 70.55 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCCGCAGTTCTCTGGTTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTTCTGGGTCATCTGGATCTACGGCACACATTTCAACAGCTGGC:1 - chr3R 24693549 3' + hobo 2913 1 63.71 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGGGCTTTTGGAGTCG:1 - chr2R 14562108 3' - Burdock 50 2 59.42 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCC:1 + chr3R 23507677 3' - 412 60 2 58.22 AAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATCGTGCTCCTCGGACTCGCCGATGATGAAGTCCTGGTGCTGGTGGTGCATCTGGTCCAGGTGGTGCAGCTCCCCC:1 + chr2L 5651683 3' + Burdock 350 1 61.24 GTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAA:1 + chr3R 10288869 3' - copia 4960 2 77.40 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCTACT:1 - chr2R 544763 3' - HMS-Beagle 41 2 57.53 AATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATATTAATTTAGAATTTGTGTAAATAATAAATTTATTTACCGAATACAATTTTAAATTCCTTTTATATATTTAAGCGGATGTGTTAA:1 - chr3L 19339287 3' + Tc1 1629 1 69.86 AATTTCATTCAGCATTCGATTGGTCGTCTTGCAGCAAACCCAATTTGTCTCGTAACTCCACAAATCTCGCAGTCGTGTAGCAATCAATGAATAAATAATCAAGGGTAGACAGTCCGTTGGATTACGAAGTGGAATTAAATGGAGTA:1 - chr3L 10747253 3' - copia 4644 1 49.32 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCATTGCGGTGGGTATGGG:1 + chrX 15089607 3' - P-element 44 1 55.48 AATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGC:1 - chrX 18125145 3' - BS 5053 1 71.05 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATGTAATAAATTATTGGTTTCAGATGAAAGTTAGTAGT:1 + chrX 11228663 3' - roo 53 2 54.79 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGCAATTAATTTCGCCTTGGGCCCGGTCGAGTTCCAAGTGCTAAGT:1 - chr2R 11379676 3' - jockey 30 1 69.86 GCCTTATCGAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGCGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACT:1 + chr2R 4551446 3' - roo 8925 2 65.07 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATTGATATTGATATTAGCCCTTGAGTTATATATACACGATGACCGTTA:1 + chr2R 14247058 3' - pogo 66 1 67.81 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTTTCAACTCGGAACAAGGCTACCCATTCAAATGGCT:1 - chr3R 15514485 3' + 412 463 2 61.64 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTTCCGGTTG:1 + chr2R 15613864 3' + P-element 2839 1 51.37 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCAGAT:1 - chr3R 6103558 3' + Tirant 355 2 55.48 AGATCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTAGTTGTTGATATGGTCTATAATGATAATTATTATCACTTCGCGATACCAATACGTTAT:1 - chr3R 2682380 3' - F-element 4220 1 58.90 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTTTTCGGCCACAAATAATTAATGGGTTAATGGGCTGGGAAAAAGGAAATTCAGACAGTCT:1 + chrX 18034723 3' + Juan 4194 1 69.18 CGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGG:1 + chr3R 22810781 3' - flea 4824 1 69.86 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACT:1 - chr2L 12481426 3' - pogo 62 1 59.59 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACAATTTATTATAGAAATATAGATATTTTTTGCGTAGAATCAGCTAATAAAGTTTCGTAGCAAACGGCAGCAATAATTATAAGCAGGG:1 - chr3R 18469096 3' - Quasimodo 33 2 64.38 AAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTGAAGATAAAAAACAAATGATATTTTGGCTCGCCGGCAGATTTGCAAACGTAAGCGTGCGTGAGAAGAGAAAAGAAAACAAAAC:1 - chr2R 21077403 3' + jockey 4690 1 60.96 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTATCCT:1 + chr2L 12481538 3' + pogo 2049 1 55.48 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGTGAGTTTGAGTGGTGCAATTGCTT:1 - chr2R 24630082 3' - copia 4887 2 70.55 TCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCA:1 + chr2R 20362297 3' - diver 5953 2 63.70 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTATG:1 - chr3R 17316021 3' - 3S18 41 2 57.53 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACCTCAAAATTGTAAAGTTCTTTAACAATTTGTAAGTTTAATGGGTCACATATCACTAATTCAATGC:1 - chrX 21204927 3' + 1360 3377 1 69.18 CTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTGAATCTACGAGTAACGGGTAAAGCACCATTGAGGACCATTTGCCGCTGCACACACAACAAACACAGATACACACATTTACGTGCAATCGTGCATATGT:1 + chr3L 9447774 3' - INE-1 28 1 63.01 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAGACGACTTAGAAACA:1 + chr3L 15261377 3' + pogo 2055 1 54.11 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCAT:2 + chrX 11534511 3' - roo 8750 2 78.08 TCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACTGTACGAGTTCGATTCGATTGATAATTATTGAGCGG:1 - chr2R 21056700 3' - Tirant 82 2 75.00 AATAAGGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAAAAATAGAAGGTATACAAGGGAGGTATGCCACTAAAGAGGAATTGATCACCGGTATAAAACGCTTGGTCTACAATTAAG:1 + chr2L 21400214 3' - pogo 39 1 57.53 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACAT:1 + chr3L 3979664 3' - opus 7075 4 69.18 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAACGGGGATTAAAAAAGTTGATAGAAATATATAGTTAAGAGATTTTGAATATTC:1 + chrX 12843675 3' + roo 9001 2 66.44 CAGGTTAGGGCGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCG:1 - chr3L 18468384 3' - jockey 4765 1 79.45 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGC:2 + chrX 15089590 3' - P-element 61 1 43.84 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATAAGTCGCAAAAGTCTCGTGCGAG:1 + chr3R 25753742 3' + hobo 2916 1 67.42 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTG:1 + chr3L 17667638 3' - F-element 26 1 49.09 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAAAGATTACGTTTTTTGTTCGTTTATTTTTTTGAATATG:1 + chrX 6700760 3' - P-element 82 1 29.45 AATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAG:1 + chr2L 21400806 3' + Doc3-element 4665 1 49.32 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATG:1 + chr2R 18123510 3' - pogo 67 1 63.70 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCT:1 + chr2L 17162874 3' + blood 7338 1 51.37 TGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGTAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTTTGATAAAAAACTGTGTTGCAAAGGA:1 - chrX 10119515 3' + FB 14 1 65.94 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGTC:1 + chrX 17258315 3' - 297 6635 2 57.53 AAAACATGTAAATATGTATGTAGTATGATATGTATACATCAGAATTTACATCAGCCAAACACACTTGTATTTGCGTTTCATTTGGAGAGCACGCGCCATTTAATTTCTCATATTACATCTTCGAGGCACCGAAACTTGAGATGAGC:1 + chr2R 9389333 3' + G3 4504 1 77.40 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTGGGATTTTTGCGGCGCATAATGCAATGCC:1 - chr3R 25753576 3' - hobo 17 1 74.66 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGC:1 + chr3R 20149806 3' + 1360 3342 1 53.42 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAATATACAAAATAATTTGCTGCA:1 + chr3L 20785579 3' - P-element 26 1 66.67 GTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTACAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGACTGTCTGTTTTGGTACCGGAGAAGGACGAGAA:1 + chrX 7371558 3' + invader2 4723 1 77.93 CACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGATATAAGAAATATCGATTCCCCGAAAGTTTCGATATTCGAAAGCGTCATTCGTTGGCAT:1 + chrX 4373583 3' + mdg3 151 2 60.27 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGATTTATATATACTCTTAGTTGGGCAGTTG:1 + chr3R 18903508 3' - pogo 29 1 60.63 TTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGGTCTCTGGGTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGGCCTACGCTTTCTGGGTCATCTGG:1 - chr3R 24693577 3' + hobo 2864 1 66.90 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTT:1 + chrX 5222948 3' - 412 71 2 68.49 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGG:1 - chr2R 21380610 3' - roo 67 2 63.70 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCT:2 + chr3R 15514633 3' - 412 45 2 54.11 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGCGAAGAGAAGGGGATATTGGAATAACAACAGCCGCTGGAATCGGAACTTTACTGATCCAACCAGGGTTCAATCAAACTCACATTGTATGTTTTCCAGTGGCCC:1 - chr2R 11381023 3' - jockey 4755 1 69.86 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAG:1 + chr2R 15080121 3' + roo 357 2 52.05 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATA:1 - chr3R 9563618 3' - P-element 84 1 26.71 GTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGTTTAAACTATTTAATAAGCCATTTTGACGTTTTGAGTTAATAATAATCCTTGCTGTACTCGCAT:1 + chr2L 5535939 3' - gypsy4 6663 2 54.79 ATTACGGTACCGCTACCACTACCAACGCACTCGTACGTGCGTGTTATCGGTATCAACAACTACATTCGGCTCAAGTTACTGCGAACAACTCAGCAGCAGCCACGTCGATTGCCAGATCAATTGGCCAAATGAAACGAAGCGCGGTA:1 - chr2L 15151676 3' + G-element 147 1 64.38 GTCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTGGTCAAATGTGTGCTGTGCGATTTAGGGACATTGATGTGTTGTTGTTGGTCATGGTCGGGATTAGAAAAAAAACACTTTTACTTGATCAAGTATACGACA:1 + chr2L 13458117 3' - I-element 144 1 70.55 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCT:2 + chr3R 9938699 3' + roo 9016 2 56.85 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATGAATGATATTTT:1 + chr3R 4884502 3' - pogo 40 1 56.85 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACATAGGAATTAT:1 - chr3R 20905384 3' - pogo 65 1 67.36 CCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGAACGATTATGTCATGTTAGTACATCCTCTTTAAATCT:1 + chrX 11813180 3' - flea 436 1 74.66 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATGAGGACATCGTTAATTCCTTCACATTTATTTTAATATAACCTCGGTAAGGAA:1 + chr3L 6751796 3' + pogo 2079 1 70.55 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAG:1 - chr2L 16371594 3' - jockey 4858 1 71.23 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCAGTTGAAAAG:1 + chr3R 18357488 3' + jockey 4920 1 63.70 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAACGACGAGTTGATCTATTTCCGTATGATTGATTTCCTTG:1 - chr3R 16194067 3' + mdg1 414 2 80.14 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCTACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATATTCGCGGTCCA:1 + chr3R 24175810 3' - Burdock 28 2 65.07 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGA:2 - chr2R 5070916 3' - gypsy5 6962 4 27.40 CGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTCGGAGTTGGCAACTTTACAT:1 - chrX 18125089 3' - BS 5029 1 60.27 TATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTGAAGTGAAGAAAAAT:1 - chr2L 17840996 3' - Juan 4061 1 60.27 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATTGACGCGTGTGCCCAGCGTG:1 - chr3R 25876814 3' - mdg3 5263 1 79.02 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAAGTTGCAAGGAGCGGAACATGTGTCTGCCA:1 - chr2R 14385531 3' - jockey 36 1 64.38 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCG:2 - chr3R 10142916 3' - 412 7099 2 52.74 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGCCGACAAAACATGGCCAGCAAG:1 - chr3L 13722025 3' + blood 7334 1 66.92 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATACACTTAAA:3 - chr3L 14581340 3' + pogo 2077 1 69.18 CGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGGGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGGAAAACTGTGGGCTGCAAA:1 - chr2L 17198020 3' - R1A1-element 5009 1 73.77 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTTCG:1 + chr3R 4722500 3' + roo 9030 1 56.85 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCC:1 + chr2R 6585511 3' + pogo 2032 1 67.81 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGCTTTCGCGCCAACGCCAAATATCAACTACTTATATAGCGATATATATTCAGGAAAGTTTGGCTTTGGGTCGCCGCTGCTCCTTGCTGTTTTAATGTATATAC:1 - chr3R 21570429 3' - mdg3 5273 2 69.86 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAA:1 - chr2R 9332137 3' + roo 338 2 69.50 TATTAATATTTATTTTTAAGCCTCTCCTGTCCTTGTAATGCAAACTTTTTCAGCAAACTTTTTTTTCTGCATCATTTGGAAGTTCGTTTCATTTTTATTTCCCAGTAATCATTTCCTAAATGTAGCCATTTCAATTAAGCCGAGTC:1 - chr2R 16729037 3' + NOF 3869 1 59.59 GAAAATAATTAAAAAAAAAAACCAAACAATCCATC:1 + chrX 5252413 3' + TART-B 10506 2 97.14 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAACAGCCCAGGCAAAGCACAG:1 - chr2R 20362192 3' + diver 172 2 53.42 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCT:1 + chrX 685380 3' - BS 5076 1 70.55 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTATGAATATAAATGATATGGCCTAAGAAT:1 - chr3R 5245571 3' - 1360 63 1 62.33 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCA:1 - chr3L 22221117 3' + 412 439 2 52.74 TATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTATTTAACTTTAAACCAATGCAATAGGACCTACACTTAACCACTTCTTTTTTAAATTGGCT:1 + chr3R 8500799 3' - 412 7272 2 59.59 GTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAACTACATTGTAGGCCATTGTCGGTTTATATCCGAACACTTAAGACGGCAAGAGGGCTGCGAGA:1 - chr3L 3447041 3' + Idefix 199 1 57.53 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGGAATGAGGGG:1 - chr3R 14049292 3' - transib2 21 2 69.66 CTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCAAAATCGAAAACCACTATGGCGAGGCTGTAGAGGATCAGCAGACGCTACTTCGCTATGTGCGATA:1 - chrX 14917159 3' + mdg3 19 2 55.48 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATA:1 - chr3L 18835287 3' + pogo 2039 1 61.64 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCTTGCGAATATGATACATAGATAATCTTAAAA:1 + chrX 14173342 3' + 412 468 2 67.81 AATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGCTGCACAGTCAGCGGATGAAGGCGGAG:1 + chr3L 21426399 3' + FB 198 1 77.87 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTAC:1 + chr2L 19903498 3' - Transpac 4956 2 56.85 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGT:3 - chr2L 1073896 3' - Tirant 49 2 53.42 AAAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATCAACACGTTTTTCGAAAATGCTTCCTTCTGCCTGTTACATATTTTTCAACGAATCTAATATACCTTTTTACTCTTCAAAATATAGGAGATGTACAAAAAAATGAAAATTTTGTGTTA:1 + chrX 3741385 3' - INE-1 286 1 39.73 TTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCC:1 - chr3R 9289291 3' + HMS-Beagle 190 2 57.93 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCTTCTTCTAATACACTGTGTTGTTCCAGGTTGGCGCTATCACCAGCGCCTTTAG:1 + chr2R 22892709 3' - pogo 63 1 65.28 GGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTG:1 - chr2R 19076552 3' - F-element 194 1 59.77 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGCGAGTTGGGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCACAACTTTAACCATCCAACTAGCGCCAGCCACCGAAAACTGAG:1 - chr3R 25753630 3' - hobo 54 1 52.71 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATATCGGATGTTTTGACCGCCATTAAAACAC:1 - chr3R 23968570 3' + jockey 4944 1 55.17 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGT:1 + chrX 17469266 3' - blood 7081 2 64.38 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGACACTTTCATATAATTTCTGTCATAGAGCATTGAACTAAGGCTTAATTTAGCATCGTAGATCTCACGAGTAAGAAGTAAAATCA:1 + chr3L 21820069 3' - Juan 42 1 56.16 GTTGCCGCAAGTAGGGGGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCCGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCATAGCAAAC:1 + chr3R 25753679 3' + hobo 2863 1 78.69 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCT:1 + chr3R 15514592 3' - 412 74 2 73.13 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACC:1 + chr3R 19545398 3' + jockey 4922 1 67.38 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTCTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAGAAAACAATCT:1 - chr3L 20076757 3' - roo 56 2 57.53 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACACTC:1 + chr3L 16181008 3' - Transpac 30 2 63.70 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGTCATGGGTTTGTATCAACACTACATTTACATAATAATGTT:1 - chr2L 18581241 3' - roo 32 2 62.33 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGC:1 + chr2R 18722054 3' - 412 35 2 61.64 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCA:2 - chrX 8502163 3' + pogo 2043 1 60.27 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATT:1 + chr3L 20977434 3' - I-element 78 1 67.12 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGG:1 - chr2L 7459520 3' - BS 5025 1 63.01 CTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAATTAAAACAAAACTCTCCCTACCCGCCGTAGTCTATAACTATTTATTGCGTGCCACAAGAAGCAGCGTTTATACAAGCATAAGAAAAAATCGGAGTAATAATAATA:1 - chr3L 13597177 3' + blood 7091 2 74.66 GAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCATGTTAATGTTAAATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTATCTCAACTGAGAACTTGCAGCTAAGTTGAGTTTATGGCCT:1 - chr2L 19094861 3' - 1360 3270 1 71.92 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTTGA:1 - chrX 13548294 3' - jockey 4806 1 54.79 GAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTTTACAATGCAATAAACAAAGTGTGCTAACTAAAAATTGGCTCATCACTGCCATAT:1 - chr2L 3734460 3' + mdg3 5437 2 58.22 TATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAACGTGTGAGCAACTCAAAGAG:1 - chr2L 7667380 3' + copia 256 1 59.29 ACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAGCATCAAAGCGTGGGTACCTTTGCGGCCACTCCGGGTGGTTCGGCACCAGGTGTTGGCGTTGCAATGCCGCCG:1 - chr3L 5513483 3' + Doc 495 1 61.16 AACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCGCCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTGGTTTAATCCCTCAGTGCTACGAGACATCTGGCCTGTTCCT:1 + chr2R 12499959 3' + gtwin 7307 2 73.29 AAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGACGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATTCACGTCATCGAGCAGGAAATGGGCACCCTCAGACAGGGAAGC:1 + chr3R 13954772 3' + accord 7310 2 67.81 CTTCCGACAGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATTGCGCATACGCGCCATCTAGCGGCGGTCACATTAATAGTTTATAAATCTTTTGAACATACACACATGCCT:1 + chrX 21605826 3' - P-element 14 1 73.29 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAAC:1 - chr3L 19397013 3' - F-element 61 1 52.05 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAATATACGATTCCGATTCCATCGGAGTGTTTTATGAGTTCATAAAATGGGTTTGTAGGTGTTTATTATCGTTGTGTTATTTTGGTTTGT:1 + chr2L 10089874 3' - 297 6604 2 68.97 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATAATGATTTCAATAAAG:1 - chr2L 19903364 3' + Transpac 5173 2 56.85 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGTTAAGTTTCGCAAGCC:1 - chr2L 7991235 3' - 297 22 2 71.23 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGCCAAGAGCGGTTGTTCGTAAGTCTAAATAATTAAATGTGAAATCTTGAAGAACATAAATA:1 + chr3L 24153273 3' - Tabor 61 2 62.33 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAGATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAATGATTAATTTTTGCTTCTAAGATAACCA:1 - chr2R 13849662 3' + roo 314 2 81.51 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCT:1 + chrX 983240 3' - 412 43 2 57.53 TAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCACCGACAATGCCCAAAATCAGCTTCCGAC:1 + chr3L 22221243 3' - 412 4 2 69.79 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGCTTTGGATACCCT:1 - chr2L 1073869 3' - Tirant 8123 2 75.00 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGACTCTACGAGTATTATAATTTGATTG:1 - chr3L 21630283 3' - Burdock 6164 2 66.44 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCCACCTGTATCCC:1 + chr2R 5900970 3' + Bari1 1689 1 74.66 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGAGATATATTCGTATATACACTCATATAT:1 - chr3L 21097078 3' - mdg3 24 2 69.18 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATTAAGTTGA:2 + chr2R 9033960 3' - F-element 4526 1 58.22 ACTAATAAAATTATGAAAAAAGTCCAAAAATTTTTCAAAAATTTGGCATTTGGGCATGGCAGTTATGGGCGGTTTTAGTGAGTCAGAGCGGGCGTGGCAAAAGTCGAAAAGACATAACTTATGTGCTTTGGTAACCTTCAATCATG:1 - chr3R 16261939 3' - INE-1 401 1 78.08 ACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTACAAAGTAGATTTTGGCTTTTCGGTTTTTGGCAAACAC:1 + chr2R 8047808 3' - roo 8909 2 74.66 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTCTTTTAATTTAATTTATTACTTAGAAATACCTAAAATCTCAAAATCACTTTCTGAAGTAGGTGTGTTTTGGTGATTGTTAAGCAACAAA:1 + chr3R 7649912 3' - Quasimodo 26 2 63.70 ACACACACACACACACATAGTCAGTCGGCTTGAAGTTGTATGGTTTTTTGCCATTATTTGTATGCAGTATCGTGCTCCAATCTTGCCTTCTTTTCGTTTCGTTTCGATTCGGTTTGCTTTACATTTATTTCAAAATTAATTGCTCA:1 - chr3R 29562164 3' + accord 185 2 67.81 GCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTGGCAAACATATATATAAACCCCCCCCGCCCCCGCCACCGCTACACTTGAGCAGGGTTAA:1 - chr3L 11666826 3' - Tabor 6929 2 59.59 CTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATTCCCATTTCTTCCTCCCAACTTGTGTGGCATATAGCATTTAGAGTGTCGTTTACCTGGCGCACT:1 - chr2L 7279568 3' + roo 8837 2 56.16 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCAT:1 + chr2R 22255443 3' - roo 41 2 56.16 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGC:1 - chr3R 6103577 3' + Tirant 336 2 60.27 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACATAAATCACGACTAACACTTTAGCAAACATAAGTTTTGCAGTAATAACACTTGTTATCTTAATTATGGGTTTTTTTTGGGCATTGTGATTGGATTTTA:1 - chr3R 23449199 3' + roo 393 1 73.97 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCCATATATCCCCGCTGCTGCTGTGGATAACCGCAGGCGGACATAAATTCCATTT:1 + chr2L 11668805 3' - mdg1 6 2 65.06 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACGTGCGATTG:1 - chr2L 2357309 3' + P-element 2796 1 21.92 CATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCCGCCCAACCCTTCTAGATTCGCAGCCTTTTTG:1 + chr3R 31916162 3' + hopper 1328 1 76.03 ACACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAATAAGAGGGCCAAGAGCAGTTGCATCTCCAGCTGCATCTGGAGCAGCAATCTGCCCTTTTGATGCTCCCGCCGACCCAAGTTCTACATACATATATTTA:1 + chr3L 9198723 3' - F-element 10 1 80.82 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGCGTTGAATCCATTTGACAGGCGAGCAT:1 + chrX 10538254 3' + pogo 2072 1 63.12 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAAGATGGTTCGAAGAACTCTGGGA:1 - chr2R 22798636 3' - hobo 78 1 72.60 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTAACCAGCTTTGGCCAAATGGTATCAAAGA:1 - chr2L 2357250 3' + P-element 2855 1 63.70 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCG:1 - chr3R 20292398 3' + pogo 2064 1 60.69 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCC:1 + chr2R 5992418 3' - pogo 39 1 58.90 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGAAAAGCTTAATGGCTAATTGAGCTGCCAAGGGAGTG:1 - chr2L 14969864 3' + Tirant 350 2 52.05 AAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTTGTTGC:1 - chr2R 10478648 3' + invader4 297 2 62.86 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATCAAT:1 + chr3R 15649894 3' - blood 34 2 62.33 AAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAATAACTAATTAATAATTAATTAATAATGTCCTTTTGGTTCTTATGTGAGATAAATATACTGCGACCTGGATATTCTTAATACTTATTGCGATTTACATCAGTTTCTTATCATTGAT:1 + chr2L 17841142 3' + Juan 4063 1 62.33 TAGTCAACTGACGGGACATTAATTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGCGAACCTAAATGGGTTACAGTGGGTGTATCAAAAGTGCAACATGCAGAGCCCGAGGTGGGTCAAACTTGATTAAAATATTTA:1 + chr2R 17986385 3' + 297 6943 2 56.16 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATTGAATATAAAGCGTTTACGGCCTGTTAGGTT:1 + chr3R 12559760 3' - mdg3 37 2 51.37 TGGACAAGTCCAGAATACTGGCACATATCGTAAATAGTGTAGGGAGTGACTATCAGTGAAATAATAGTGATGCTTTGTTATTTGTTTATGGCCATTTCGTTTTCCCATTTGTTTATAGAACTCAATTTGCGCGAGAGGAAAATTAA:1 - chrX 15047118 3' + X-element 84 1 52.74 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGGAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8270 2 50.00 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCC:1 - chr2R 6984305 3' - HMS-Beagle2 58 2 57.53 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTT:1 + chrX 983226 3' - 412 57 2 55.48 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAA:1 + chr2R 18722025 3' - 412 7117 2 61.64 AAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGCCATCAAAAGAGCATCAGCATAAAATGGACCCATCCAAGATTCAATTCGAAAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGA:1 - chr3L 18476520 3' + jockey 4800 1 69.86 CAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTGGTCGTTAAACTAACTATTAACTATTAACTATAACTATTAACTATACGGAAAAACTGATTCATTTAGCTTGTTAAGTTATTTGTGTACATCAAAACGAAAAACATTTAATAAATTAT:1 + chr3L 3482797 3' - X-element 18 1 72.60 AGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTTTAAATATGTACAATCGAAATTTACCT:1 - chr3R 11526721 3' + pogo 2086 1 71.03 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATA:1 - chr2R 13276459 3' - roo 8717 2 56.16 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCA:1 - chr2L 21237256 3' - P-element 102 1 15.75 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAA:1 + chr2R 18722031 3' - 412 7111 2 57.53 GGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATAACCTTTGGATAAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGAAGGTAGCAGGCCGATGGATTCTTGGTAAGCTCCGAACATGTTAACTTTTTTTGAAAAACATAAGCCTCCT:1 - chrX 7746723 3' - GATE 8116 1 64.38 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAGAAAACAATCTTTGGGGGAATTAGTATGCAACTCATCTCAGTCTTAAGCTGT:1 - chr3L 20076716 3' - roo 8679 2 75.34 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTT:1 + chr2L 15965308 3' - blood 61 2 57.53 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTGCTCATGGAGATCGCGTTCGGATCGCCGC:1 + chr3R 23507721 3' - 412 16 2 67.81 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCTAGCTGATTAACAGGCCTGAGGTCC:1 + chr3L 14581516 3' - pogo 26 1 65.07 GAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGC:1 + chr2L 11867381 3' + BS 4976 1 52.74 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATGCTGCCCGTTGTTTGTCATTCAGCTCCAT:1 + chr3R 15974815 3' + P-element 2844 1 54.29 TTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCC:1 + chr2R 5900959 3' + Bari1 1678 1 67.12 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAA:1 - chr2R 18807775 3' - jockey 78 1 61.64 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCT:1 + chr2R 15080089 3' + roo 8989 2 73.97 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAGATGAACACCCGATA:1 + chr3L 10856806 3' - P-element 69 1 37.06 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAGCATAAAGATTTTTAAATTGTTTAAAAATATTATTGTTTTTATACTTATACTTAACCTTGTAGCATATTCCA:1 - chr3R 11150968 3' + 1360 3339 1 54.79 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAA:1 + chrX 983219 3' - 412 7117 2 60.27 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCC:1 + chrX 22824814 3' - jockey 4742 1 68.28 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGGATGGCTGATATGCAGGTGGACTGTTGAAAACC:1 - chr3R 9563565 3' - P-element 31 1 63.01 GTGTTGGTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCAATTTGGCCGTATTCAACACATCAATCAACAACACAAAAAGCATATCACTCTGCCCTAAAATAAAACAAGAGAGACTGC:1 - chr3L 25263518 3' - I-element 4961 1 54.11 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTGTGATAAATGACGATGCG:1 + chr3R 26399875 3' - roo 8725 2 71.97 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGA:1 - chr3L 13722043 3' + blood 7314 2 78.52 TGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAATAAATTTATTGAGTTCTTAGGCTTTACATTTAAGTTGTAAATAAAT:1 + chr2L 5450524 3' + GATE 366 1 71.23 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATAATGAACATTGTTCTTGGTCACCCTGCTGTTAATACTTAATACCGTGCATAT:1 + chr2L 2464302 3' + pogo 2034 1 66.44 AGATTGCACGAATGATAAGTACTTCATATGCGCTATTTATGTAAATCGCCGACGAGTTTTATTTCACTTTTTGTCGCTGCTTCCCAATCAGCGTATTGAATGCTCCCGCTCAGCCGCCCACCACTCCCTAATCCTCCGCTGCACT:1 + chr3R 18104638 3' + Tc1 90 1 76.55 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAA:1 - chrX 7525072 3' + I-element 5272 1 73.97 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAA:1 + chr2L 7667507 3' - copia 4924 2 57.24 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCCGATCGCT:1 + chr3R 24479261 3' - 412 7126 2 67.12 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATT:1 - chr2L 17162783 3' - blood 81 2 73.29 TTTTGTTTTTTTTTTACTTTGCTTACTTCTGCTCCATTTGAAATATAGACAGACTGAATTATTCAACAAATTCTCAAATAGTTTGTCTTAACATTAAAGGCATTTAAAGATTCATAAAATCAGACTACTCAGATACGATTTCAGAA:1 + chr2L 9126762 3' - F-element 4679 2 34.25 AAGGGAACCATCGTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCCAGTCTTCCACCGGCACTTCCTTCCACCGCTGATC:1 + chr3R 2894736 3' + Q-element 494 2 53.57 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCGCAGGAGATTGATTAAGGCTCTGGCT:1 - chr2R 19900965 3' + mdg1 7408 2 52.05 AATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCA:1 - chrX 13548339 3' - jockey 4851 1 77.40 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAATATCGGCT:1 - chr3R 4884372 3' + pogo 2045 1 59.59 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGGCGACCTTGGCGGAAAACTTGCGTCGAGCGTAGCATAGTTTTC:1 + chr2L 6598417 3' - hobo 13 1 51.25 TTTCTCTTGGATTCAATTGCATTTGCTCTTGGATACAAGCGCTCTTAGATTCCTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTGAAATGGCAACAACTACATAGACACAATGGCATTGT:1 - chr2R 19214600 3' - Idefix 7165 2 75.34 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGG:1 + chr3R 15649852 3' - blood 7087 2 68.49 TTTTTTATTTTTTTAACTTTGTCATCTGAATTTCTAGCCCCCTCCATTTTAAGTTGGCACGCCTCTCGTTTACAAATATTTTGGTATCTCAGCTTACTTTGTGTATATTGTGACTTTAGATCGAACTTTAATCAAAGTAAACTTTT:1 + chr3L 10548954 3' - TAHRE 10439 1 78.08 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCGTGTCTTTTATCTTTTAACATTTT:1 + chrX 9816459 3' - jockey 86 1 69.18 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGC:1 - chrX 13548303 3' - jockey 4815 1 52.74 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTAAACGTACAGACTA:1 - chrX 8272400 3' + roo 9030 1 55.48 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTAACCTAACCTAACGGCTTAAATAGCCGGCTAGGGTTAAACCAATCGATTCATCG:1 + chr3L 22676401 3' + 412 7518 2 64.38 CTGGATGCAAGCAATTGCAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCACTAAATGCTTTAAGCAAACGCAAAACACGTGTGGCTCATGTGGCCGTGACTCACTTTAAGTGACGGCGG:1 + chr3R 31015047 3' + Q-element 94 2 52.74 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCA:1 - chr2R 15613765 3' - P-element 73 1 35.62 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGA:1 + chr2R 5992393 3' - pogo 64 1 65.07 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATAAAAATCACTAATTCATTTTGTGTTTGTA:1 + chr3R 30568937 3' + roo 9046 1 59.59 CGCGAGTTCTTTTCTCTTAACTTTGTTTTATTTTTGATTACTTCGATGCAAAAAATGCCTCCGCTTCGGTCATCCAACACCCATATGCAAAAGTGTAGAAACTTGCATCAATTGCTTAGAAGCAAAACACACAAACGACGGAGAAA:1 + chr3R 13375446 3' + frogger 2160 1 73.29 CCAGGATAGGGAGGTCATGAGGGTGGGGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAA:1 - chr3R 6782736 3' - jockey 4766 1 75.34 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGT:1 + chr3R 9482119 3' + roo 9019 2 54.79 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGAGCTTTAAAAAGCTTGTG:1 + chrX 21213410 3' - Doc 15 1 63.79 GGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTCGGGGAGTTGGTGGGGCACATTACTCGCAGATAAGATTGCAAGTTGCCGGAGATTCGTCGTGTGAATCACACCCACAGTTTCGCGGAACAGTCACTCTGTTCC:1 + chr3L 2273625 3' - I-element 4887 1 71.23 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGG:1 - chr2R 9164841 3' + 412 7480 2 62.33 AATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCATATGAGAATAGTTATGTTAAAGAAATAATTCA:1 - chrX 15174810 3' - 297 360 2 78.08 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATA:1 + chr2R 11656142 3' - HMS-Beagle 6827 2 64.38 ACATACACACACACATACACACACACATACACACACACACACACAAAGTCAAACACACTCTCGCGCAGTCGGAAACTTTCACAATAATGCTG:1 + chr3R 6419122 3' + accord 7100 2 69.57 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGTGGTCCATG:1 + chr2R 23313104 3' - Tabor 45 2 52.78 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATGAGTGCCCCACATGGGGCGCCATATGTTACTTCAGGGAAGTTCATACAGTGACAGCATAATAAATTTATTATTCTTCACACATCAGGTATCATTGGGTCGAGAG:1 - chr3L 21093097 3' + Ivk 5361 1 77.40 TTAGCTTTGGGATTCTAGTTTAGGGTCATATTAAATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGGAACAATAAATTGTTTGGCT:1 + chr2R 5022763 3' + Gypsy12A_LTR 66 1 57.53 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCTCGAGC:1 - chr2R 982288 3' - HMS-Beagle 6828 2 63.70 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGAC:1 - chr3L 22221111 3' + 412 7498 2 56.85 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTACTCCCTAGCTAGGGGAG:1 + chr3L 53112 3' + roo 9046 1 67.81 GCACGATAAAAACGTTTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGATTTAAAAAGGCTAGCTCAGTGAGTTTTGATTG:1 - chr2R 5214934 3' - F-element 29 1 58.87 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGGAAATTAAAAT:1 + chr2R 15080146 3' + roo 9046 1 68.49 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTGGTCACTGGAG:1 + chr2R 18051072 3' + mdg1 363 2 58.22 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCATCTACTT:1 - chr3L 14854636 3' - rover 22 2 71.23 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATTTCATCAATTTAACAGTAAATTGTTTAGTGCACGCCCTCTCCGCAACAACAACAACTGGACTATAAACAGCTTAACTCACACAAAAAACACGTATACGCACAATCGCACA:1 - chr3R 11002021 3' + flea 5004 2 78.08 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAAT:1 - chr2R 19353967 3' + 297 343 2 56.16 AGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTAGTTATGATTTAATCAAAACGCGCACAGCCATTTTAATTACCTTTATGTTGCACA:1 + chr2R 10478774 3' - invader4 63 2 56.85 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGGGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGATTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTT:1 - chr2L 20984308 3' - blood 44 2 56.67 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAA:1 - chr2R 18882588 3' - roo 8745 2 76.71 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATATTCGCGG:1 + chr3R 24175806 3' - Burdock 6168 2 63.70 ATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGAAATGAAATGAAATTACGAAATGATTCAACGTCGGCGTGCCCAG:1 + chr3L 24820646 3' + mdg1 95 2 69.86 GCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCGGCGTCATTATATGCATATGTGGGTTCTTCAGTTGATAAATATATGCGA:1 + chr2R 17014148 3' + HMS-Beagle 210 2 60.96 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGTGCTATATGGATAG:1 + chr2R 17100152 3' - P-element 64 1 40.41 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAA:1 - chrX 15089523 3' + P-element 2795 1 22.60 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAAATATCTAAAAAGACCTGACATCATTTGCCTCAGGTGTGACTGACTCATGAATGAAACGTGTCGTGACATAAGGAGACTTAGAAATATACTAAAATTATAGCATGAACGTGATCAA:1 + chr3R 27503179 3' + hobo 2935 1 76.03 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTT:2 - chr2R 18123399 3' - 412 40 2 52.74 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATG:1 + chr2R 22255394 3' - roo 8754 2 79.45 AGTCGGATCTATTGTACTACATATACCCTTGTAAATACCTTTGTATTAAATTATAAATAGAAACGTTAGGTGGAATCGAGAAGTCGTTTATACACAAAATTGATTGTTTATAATAGAAGCTCGCGAACCCAAGTTTTTAAACCAAT:1 - chr2R 5677324 3' - baggins 5395 1 73.29 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGGGAGAGCTTACGCTTGCGCGCGCC:1 - chr2L 16685290 3' - P-element 48 1 53.42 ACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCC:1 - chr2R 5900836 3' - Bari1 38 1 55.05 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAGAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGAGAAAGGTCGTTTAAATACAATAAATTAGTTTAAAC:1 - chr2R 16880919 3' - 1360 63 1 62.33 ATGTGTAAATATTGAGGTCTTTATGGAGTGTAGAGAGCATATAATATCTAAGCTGAAAGCCTTGCAAATGCAAGCCTTGGGCCAAAGGGAAGCCAAAAAGTTGAAGCTCAAGGCGAAACAGGTGTCCTCTTACCTTCG:1 + chr3R 7477597 3' - Helena 1198 1 73.91 GGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAATAATAAACAGTGGAAGCGTCGGTCGGCAAGAGGCCCGAAGGACACGAAAGGACGATCACCACAAGTGAAGAGTGATCCTGAGAGTGGATGAGAAGGATCTGGCGGGTCTGAAAGGG:1 - chr2R 603812 3' + gypsy8 444 1 87.67 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCA:1 - chr2R 18048803 3' + opus 7440 2 61.64 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAACACCCGAACTACCATTAATGGTGTCGGTACTGCTAAAGGAAACACAAATTAACAAGGTGTCCTTACCGAGAGCATTCATTAAAAATA:1 - chr2R 15062141 3' + blood 7355 2 61.64 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGA:1 - chr2L 13884584 3' - pogo 68 1 65.75 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCC:3 + chr3R 8402652 3' + mdg1 7409 2 50.68 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATAAGCTTGAGCACGTACAT:1 + chr3R 3527194 3' + Tabor 445 2 56.85 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATTTTTTTTTTCCTTGCAAAAGGAAGTGAAAAATGAAAACGAAATGACTCTTAATGGGAAAAACGTCCT:2 + chr3R 14527090 3' - 297 42 2 54.79 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACT:1 - chr3L 13597745 3' - blood 61 2 60.27 AATAAAATATTCTTAATTTTTTTAGTCCAATGGTGCTTCTATTATAGCCGAAGGAGGAGTAAGTTTGGACGAATCTCATGATTTCCAAATGCCTCCTCCGGTTGGGAACTTGGAATGGATGGCAGCATTTTTGGTCACGAATTGGG:1 + chr3R 30251457 3' - HB 326 1 52.74 GCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 211 2 76.92 CCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTGTAAATAAGACTGTAATTAGATGAATTGTCAATTAAAGTTTATGTAAGCGGCTCTATAACTTAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTA:1 - chr3L 23597292 3' - flea 362 1 68.79 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCTACCCACA:1 - chr2L 10912232 3' - Doc 76 1 67.12 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGA:1 - chr3R 25876843 3' - mdg3 16 2 70.59 TTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATACATTCGCCCATCGGAAGCACGCACTTAGCCATAGATATATGCTATGCTATATCCTATATGGTCATCTATCTGCTCGGTGTGATGTGATGGACAGACAACAA:1 + chrX 18913419 3' + Quasimodo 7352 2 76.03 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGTTAGCTTACGAAAGTGAAACTAATTTCCGCTTTTACGTGG:1 - chr3R 5940399 3' + hobo 2917 1 70.34 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGGTATGGTGTTGAGTTGGCCAAAA:1 + chr2R 10367613 3' + 412 472 2 69.18 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCT:1 + chr3R 5087076 3' + P-element 2835 1 31.13 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTA:1 + chr3R 25521890 3' - blood 64 2 60.69 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCT:1 + chr3L 14043633 3' - Ivk 48 1 52.74 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCA:1 - chr3R 10079257 3' - P-element 15 1 73.53 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAAT:1 - chr3R 8367125 3' - Doc 37 1 54.11 GCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATTT:1 - chr2L 23020627 3' + Transib5 2943 1 50.68 CCGACTATCATATAACCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTAATCCTCTGGGATATTAATAAATATTGTATAATGTGAAAAAATTTTAAAAAAATTCAAACGTATGGACGATTTGTCTCGTATCTGCATCCCATC:1 - chr2L 16677682 3' - INE-1 551 1 76.71 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAATTCCGC:1 - chr3R 9938569 3' - roo 8702 2 60.96 GATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCGCAAAAAGTTATTGTATTTGCTGACTGATATTCCCTAGTAACAA:1 - chr3L 10076273 3' + X-element 4691 1 66.21 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCTGAGTAAA:1 + chr3R 15514640 3' - 412 7091 2 58.90 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGT:1 + chr2R 9164935 3' - 412 7116 2 58.90 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGAT:1 - chr2R 22255312 3' + roo 9021 2 52.05 GGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTATGTGGAGTCCGGGGAGCAGAATATTATTATTTACGTTGAGAGGAACTTTCCCTTTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGTATAACAGCAACAGAATATAGTGTGGATACAATAATTAACACTCT:1 - chr4 167772 3' - Gypsy6A_LTR 333 1 69.18 ACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7233 2 77.78 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAA:1 - chrX 19162568 3' + pogo 2052 1 53.42 ATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAAACATTTTAAAGTTAAATTAAGAGAAGTTTCCATATACAACAATTATTTTAAGGAAATT:1 - chr2R 19987297 3' + copia 4884 2 59.59 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGATCGTCTAGGCTATTGATGCTGATCGGGAGTATATTGAGAATTTTTTATTTATTAACAAAATATTATAAAATATGTAGCTTATTTAAGAT:1 - chr3R 23037640 3' + 1360 3359 1 60.96 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAAT:1 + chrX 19162693 3' - pogo 52 1 55.48 AAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATT:1 + chr2R 6984393 3' + HMS-Beagle2 7117 2 73.29 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTAGCTAAACTGCACATACTTCACATCACGAAA:1 + chr3L 10814598 3' - 297 14 2 63.27 CTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAATCCCCGAACAGAAACTAGCGAAGTAACCACGTTATTCTATAG:1 + chr3R 5812361 3' + R1A1-element 20 1 71.23 CCCGAGATTGGACTTAGCTAAAACGTTTCGTTCAAAAAATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAAAACCAATTTGGTCATGTTATTCGATAAGTACATACCGCCTTCATTGGAAACGATTCGCGTGCGTTTCAAGAAGATCACG:1 - chr3R 21033354 3' + R2-element 3338 1 52.74 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCGTCCTAATGACCGCCCA:1 + chr3L 15035266 3' - pogo 14 1 74.66 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCTATGAACTAACACCATTGACCAGCCAGA:1 + chr2L 8397275 3' - roo 8699 2 59.31 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCAATACCTGAACCTGTGCTCTCTTTTTTCTCTGGCCATCAACGCACGCGCCCGCAT:1 - chrX 4589377 3' - Burdock 6157 2 71.23 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATGAAAAGCTTTTCGGTCAACGCTCGAGTCCGCAGCCGAAAATGCTCAGTCAGCGATCGGAAATCAATCGCAGTCTTC:1 - chr2L 18823476 3' + P-element 2852 1 60.00 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGT:1 + chr3R 19545417 3' + jockey 4936 1 55.48 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCC:1 + chrX 17258300 3' - 297 6633 2 63.57 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCATTTTCGTTTCGCTCTTGGTTTTTCTTATTGCATTTTTATG:1 + chr3R 26316030 3' - roo 23 2 69.86 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGGCAGTAAGGTTTTAATGGAAGTGAACGTGCCATTTCATAG:1 - chr3L 9241948 3' - roo 19 2 72.60 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATT:1 - chr3L 18835273 3' + pogo 2053 1 54.11 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGGTGGCAATATGGCATAGTGTGGGATTAACAGTTGCATAGTAAGGGGAAT:1 + chr3R 14097120 3' + transib2 2754 1 66.44 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATG:1 - chrX 15089526 3' + P-element 2792 1 20.55 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAG:1 - chr2R 21380586 3' - roo 43 2 56.16 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGTGAA:1 + chr3R 25384282 3' + mdg3 5437 2 57.53 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGGGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGC:1 - chr2R 6984310 3' - HMS-Beagle2 62 2 60.69 GGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATCTTTATCTGAAATTAGACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAATGCATGCAAAAAGGCAGCCAGCCTGATGACAAGTTTATTTGTTAT:1 + chr3L 5201206 3' - Cr1a 469 1 67.81 TTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCACAAAGGCGTTACAGCATAGGCAGCTTCAAGATAT:1 + chr3R 26833244 3' - hobo 469 1 76.71 ATAATAATAATAATAATAATTAGGCTCAATATTATGGTTTCCAAATGAATCTTAAAAACATATAAATATGTATCTAATATCTATTTCTATATCTATTAAGATGAACTAGTTTCTAAGCTAACCAAAGTTTTTGAGAACCAAGAAAT:1 - chrX 14157567 3' + mdg1 44 2 48.63 ATGCCAAGACGATGTCCAGCTGTCATTACCAGCATAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTTTTAGCTATAGTCGGATTTTAGACGAGATTTGCAGACAAAAAACTAAAGAAATTTGGAAGCAATTATTTAT:1 - chrX 19697395 3' + Tc1 1298 1 54.11 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCATTTGACAG:1 + chrX 10538246 3' + pogo 2059 1 56.85 AAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTA:1 + chr3R 5245640 3' + 1360 3317 1 76.74 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCTGTCACGTCGGCCCAAGAAA:1 - chr3L 4710732 3' - Doc 76 1 64.38 ACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTAAGAC:1 + chr3L 21093276 3' - Ivk 19 1 72.60 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAGCTGGGAATTGCGAATCAGCCGGCATCCCAAGTTGCCTATATTGTTGCACAAGTCTG:1 + chr2L 15920227 3' - jockey 18 1 76.71 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTC:1 + chr3L 19146682 3' + pogo 2046 1 60.74 CGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTTTTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTG:1 + chr2R 20913176 3' + 1360 3310 1 76.15 GGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAGACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTACACTCCTCAATTGAGAGTGTAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTCGAGTGTGTGGAGGTGTGTTTGTGTGGCTCGACTTAGATTAAGACACGTT:1 + chr2L 11158740 3' - Rt1b 5045 1 57.53 TAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATAACTATCGCCCAACGGCAAACAAACCTGCCCGG:1 - chr2R 24459937 3' + Ivk 5288 1 78.08 ACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTTCTGAATGTTGTCAGGCCAGATCTTATGATTGCCCAGCTCATATAGAATATGTCGTCCCAT:1 - chr2R 9189552 3' + Bari1 1649 1 56.85 TATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACACGCACTCAACAATCATTGCCTTCATTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTTGAAGATACTAGAGCTGGCACCAAG:1 + chr3R 9513049 3' - 1360 476 1 77.68 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTATAATTTTGATAAGCATACATGCATT:1 + chr2R 7098033 3' + copia 5052 2 69.86 GGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTACATACATACATAAATTGCATAGGTCCAGTCGAAAATGATTGATTTCGAATTGGAAAC:1 - chrX 5439930 3' - accord 6 2 80.14 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTGCATGGATTCCCATTTCCCATC:1 + chrX 8272509 3' - roo 8736 2 68.49 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGATGTTACTGCATTTAAATTTGCATACAAATTATTGTAGCATTCTTCATAGC:1 - chrX 14908383 3' + blood 7318 2 65.07 AATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGAAATGTTGCTGATTTCATGGCGATTGCATAACTCGATTCTCTGCCCCCT:1 + chr3R 11526863 3' - pogo 68 1 65.07 GAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCTCCTTAGATAACAAAATAATAAATATAATTTATTCTCATTTAGACGGATCATGTTTAATAATATTCA:1 - chr3R 2646829 3' - roo 8836 2 80.14 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATA:1 - chr3L 9426652 3' + P-element 2857 1 60.74 AAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAAGAAACTTGTGTACTCAAACACTCAAGTTGCCTGCGAGCAACGGTTAATTCCTTTTTGAGTGTTTTCGCTACTAAACGGCGATCAC:1 - chr2L 23395861 3' + HMS-Beagle2 279 2 63.01 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATGAGTGGTGTGAAGT:1 + chr2L 1449720 3' + opus 7474 2 65.75 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAA:1 - chr2L 18370310 3' - Doc 36 1 62.86 CGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTAT:1 - chr3L 21097143 3' - mdg3 5341 2 76.03 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCGGAAAACCCTTAAAATTTCAAACCTTTTTTTCCATTTAATTTTTTTTTTATTAAATCAATGC:1 - chr3R 13056695 3' - jockey 4785 1 63.70 AATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCGCAAAAAGTTATTGTAT:1 - chr3L 10076300 3' + X-element 4663 1 53.42 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAAAGTGAGCATTGAATAACAAGTTTAAAATATATTATTG:1 + chrX 6937939 3' - hopper 77 1 69.18 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTCTTTTACCGACAGTT:1 - chr2R 21078371 3' - jockey 23 1 69.86 ACCGTTTGGCATGGGGAGAGCTTGAAAGAGTCGCTCTCAGTGCGTTCGGTGTCTATTTTCGTCAATATTAAATGAATTACTCAGCAATCACGGCTGGGCTCTCCATTGCCTTTCGTAGAG:1 - chr3R 2859101 3' - Doc3-element 450 1 61.67 AGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGATGTACTCGTAAATCTCCTTAATGCCATCGGCCTCCGG:1 - chr3R 16787547 3' - mdg3 173 2 75.89 ATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTGTGAGCGTGGCACCGCCTGTTATATAT:1 + chrX 22913222 3' - gypsy7 39 2 58.90 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGC:1 + chr3R 10143038 3' + 412 7491 2 54.79 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTAC:1 - chr2L 20561428 3' + P-element 2787 1 18.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATT:2 + chrX 15167766 3' + roo 355 2 56.16 TGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGC:1 + chrX 19498129 3' - P-element 105 1 14.38 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTAGAGACATCATTAGTAA:1 + chr2L 13884704 3' + pogo 2063 1 56.16 AAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAAAGCCGAGATTAATATTGCCAACGGTTGTTTC:1 + chr3R 14331295 3' + Burdock 6390 2 56.85 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCTGTGAAACCACATT:1 + chr3R 5245662 3' + 1360 3322 1 64.38 AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAATAATTACAATCGGCTACGCGCGATTCACCAAATCACAGCAACAAC:1 - chr3R 29207545 3' - copia 4945 2 70.55 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACGAAAT:1 - chr3R 27503010 3' - hobo 47 1 53.42 ATAACAGCTGTTAATGTCAGCTGTTGCGAGCACATACCACGTGGCTGCATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAAATTAAAAAGAAGATCGCAAAAGAGTATAATTTGAATATTTATTTATTGATTTCATAAATATTGCATAAA:1 + chr3L 2760309 3' - hopper2 1459 1 76.55 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGTTACTATGCTGGACTAAAATATGGGGATATTACAGTTAGAACAACACACTACTTACATACATACATATATGGATAGTACTATTAAAAATAGCTAGATTTAAATGCCCCTA:1 + chr2L 2690722 3' + hobo 2928 1 76.71 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTTATATTATGTGTAAAACTTTTTTTTAACTTTACATATACTGAATTTTTTATAATTTATACGATAATCACGTTTCATTTGATTTCCAAAAGAGAAAAAAGAA:1 - chrX 11710366 3' - pogo 14 1 79.45 ACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATTATATGTATATTAATGACCACGGCATAAAAAGAACT:2 + chr3L 19339485 3' - Tc1 15 1 78.08 AAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAGTTCTTAAATAAACTCACCCA:1 - chr2L 19371303 3' - Bari1 87 1 76.03 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTG:1 - chr3R 3527069 3' - Tabor 52 2 53.24 TTCAAGCTTTTATACTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGACACTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCT:1 - chr3L 21484237 3' - INE-1 154 1 53.42 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATT:1 - chr2R 17014001 3' - HMS-Beagle 40 2 57.93 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTA:1 - chr2R 5214953 3' - F-element 70 1 58.22 GGAGTTTTCTGGCGTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCTCTCCGATCCCATAGCAGGATCGCCTTTTTCCAAGCGTTGATAGCGCGAAATTAGCGTTATATGAGTTGCCTATTCA:1 - chr2L 12087489 3' - I-element 403 1 48.63 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAA:2 - chr3L 2036982 3' - Doc 44 1 57.53 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGT:1 - chr3R 20292423 3' + pogo 2038 1 65.07 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTG:1 - chr2L 8103476 3' + pogo 2082 1 62.96 TCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGG:1 - chr3R 11121718 3' - copia 4949 2 71.72 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGGATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACC:1 - chrX 21668701 3' + mdg1 7414 2 49.66 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTTGA:1 + chr3R 10778772 3' + mdg3 5462 2 60.96 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGCCGC:1 - chrX 22858879 3' - mdg3 82 2 76.81 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAA:1 - chr3R 10140214 3' + P-element 2808 1 21.05 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCAT:1 + chr3L 5183807 3' + copia 205 2 54.79 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCGC:1 - chr3L 5446111 3' + roo 336 2 68.06 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGAAGAGTGCT:1 - chrX 3529723 3' - 412 7104 2 52.05 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTCGATAAAATAATTTAGATATAATTTAATGTTCAAAACTGAAAAAAGTTCAAAAAGATTTAATTATTATAAGCATTTAAAAC:1 + chr3R 11096799 3' + copia 216 2 58.90 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGAC:1 - chr3L 3979580 3' + opus 7433 2 66.44 TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATT:1 - chr3L 24153191 3' + Tabor 405 2 71.92 AAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGAAGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGATGTTAATGTTAATTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAATACATTTTTTAAAGGATAATGATATCTGAGAAATGCATATT:1 + chr2L 20485412 3' - Doc2-element 44 1 71.92 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCT:1 + chrX 15089579 3' - P-element 46 1 44.17 AAAAAATAAGAAAAAAAAACACAAAAAGGGTGGAAAGGCAGAAGGGCGAGGGAATTTCTCAGCGCGGCTGGCAACACCAATCTGAAGTGCTATCGCGAGAGCAGAATCAGCAGCAAGTGCAGGACAT:1 + chr3R 23038192 3' + gypsy7 5007 3 86.61 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAAA:1 - chr2L 17730402 3' + pogo 2063 1 57.64 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGAC:1 + chr2L 1229691 3' - opus 7067 4 69.18 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTA:2 + chr2L 5648516 3' - Burdock 6176 2 58.22 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCCACACGTCACAGGTTGCTTTCCTTATTTAAACAGAAATTTATGCTAAAAACACAAGTCTACAAACT:1 - chr2L 19816712 3' + pogo 2047 1 54.11 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTTGTCAGCATTCGTGT:2 + chrX 5222997 3' - 412 22 2 70.55 ATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAGTCCAGACTCTATATAAAATTTAAAAATACCGGTTCTCAGTCCATCCTTTGTTCATTACCTGCGTTCTGGTCATTGCTACTAGTTGTAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 14317416 3' - Chimpo 11 1 57.53 ATGCGCAGAGCTTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGAGTACACTTATTGGGTGGGG:1 + chrX 10728893 3' - springer 86 2 76.71 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGAGCCATGC:1 - chr3R 15590569 3' + roo 339 2 64.38 CACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGATCTCCCAGTGTGGGCCAGAGCTTGAAGGCAAAACTTAAGCAGCTTAGCAGGGTTGCATGCAAACGGAAGCACATTGTAGCTG:1 + chr3L 15775938 3' + 1360 279 1 54.11 GCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCGGGGCCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAATAAAGTTTCGCGGGACGCGGCCTTCTCCGACAAGAACATCCACGTC:1 - chr3R 5514505 3' - diver2 412 1 72.60 CAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAACTTTCCTACCGTAAGGCGAATATTATTTTCAGTGCACTAAGAGAAGAGCTACGGAGCAGAACTGGCGGAACAACAAACTGA:1 + chrX 2920037 3' + Rt1b 5066 1 61.64 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATTGTGG:1 + chr3R 20292559 3' - pogo 27 1 67.12 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCTAATTGGGATCTAAAAGATCTCGGTAGAAGGTATACCTACATACTTAGTCGTTCTTTTCAACTAATCTACAATAGTAAATTCCATGAGTTT:1 + chr2R 6579629 3' - mdg1 7068 2 62.33 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCCGACACTCGCACACCAATACCAATGCC:1 - chr2L 13546925 3' + P-element 2871 1 74.47 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGGTATGGTGTTGAGTTG:2 + chr2R 10367606 3' + 412 465 2 64.38 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGGATGGGG:1 - chr3L 13722001 3' + blood 333 2 53.42 CGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGAAAAAACCTTGCCGACCGCTAGGGGCCACACAAAG:1 + chrX 10728928 3' - springer 51 2 52.74 ACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATC:1 + chrX 21667934 3' - gypsy2 6560 2 69.86 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCG:1 - chr3L 4869133 3' + roo 9030 1 56.85 ATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGCCTGTAATGCAATGCGTGCTGCAAAGGGGGCGTGGC:1 - chr3R 9148040 3' - copia 86 2 75.34 GTGTATGTGTGTGTGTGTGTAGCGGTATATACAATACATACCGTCAAATACATTCGATGTATATGTAAATGCATCTGTATTTTTGGGGCAAACTTGTACAAATTGTGTACACAGAGAGCCAATTCTCTAAAGAGATCGTTGTTGTT:1 + chrX 3765681 3' - Quasimodo 37 2 68.49 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATA:1 - chr3R 19537477 3' + hopper2 1549 1 56.16 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGGACACGATATTTATC:1 + chr3R 27971152 3' - mdg1 7063 2 69.18 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATCGACCCGACAAGTAATCCGGATCATGAATATATAAAATAAATGGTATCGGAAACCATCCAGCATCTAGTATACTCTTTAATATATTCTTACCAATATA:1 + chr3R 3322597 3' + 1360 3369 1 72.60 AAGAGCATGTTTTGTCAAATTTACAATGCATGTCACTGGCATGCCTATAAAAGAGCTGTTCGTTGTAGAGCTCTCCGCTCTCTCACCACCTCTAGACTCGTTTTTGGTAATGATGGTAATGAATCGCCTTTGCCTCTTTTATATAT:1 - chr3L 6302182 3' - 1360 207 1 63.01 GAGCTGCTAAGTGTATGCTCAGCATTCTCACGCTCGGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAATCAAAAGTAATGGTTTTTGATCAGCAAGCATACTAAGTTACTTTTCAAGCAC:1 + chr3R 14409750 3' - Stalker2 191 2 62.33 AATATGAAGTAATTGTATTAGTTAAAGACCGCCCTAGGATTTTTTGCTGGGCTAGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGCAGACTCGCGTAAGCGACTTCTAAGCCAAGCTCTCGAAATCAAGTCCTTAAAAATTTAGT:1 + chr2R 13999382 3' - Doc2-element 4670 1 73.29 CGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGGCGTGATTACAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAAACTATTTGACTTAAGTATCCCCGGATGCCAGCACACAGAGCC:1 + chr3L 12986874 3' + 3S18 190 2 71.23 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAATATCGATTCCATTGCGAATCGATATTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGCGTCATAGTTCAGTTAATACCTAC:1 - chr3L 16157330 3' + Juan 4204 1 46.58 GGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTAC:1 - chrX 5439986 3' - accord 62 2 60.96 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCAAAACACACTCATGCAAACTGGCGCTGATTTACCTAACAAGCGCAACTCGAAGAACAAAAGGCCAAAAGGCAGGGGATCC:1 + chr3R 28144938 3' + hobo 2897 1 56.85 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGT:1 + chr3L 11196442 3' - pogo 62 1 63.01 CTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTATGTGTTAAATGCTTGCGTAAATAAAACAGGCAGCGAGT:1 + chr3L 14663774 3' - roo 195 2 73.97 GGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAGCTTTAGTTGCATGACTTGCTTTACATGTGTATATTTTTTTGGTAATTTTCAATGCCCAGAAACCAGTGAA:1 + chrX 2749925 3' - G6 1671 1 64.38 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATA:1 - chr2L 7459534 3' - BS 5039 1 53.42 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTATTTATTTTTTTGTTAATTTGATATAGCATTGAACGTTT:1 + chr3R 12363290 3' - jockey 32 1 66.67 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTC:1 - chr3R 7424561 3' + 412 434 2 70.59 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAG:1 + chr2R 1277166 3' - Tirant 49 2 53.42 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAGTGATACATAA:1 - chr2L 3006067 3' + pogo 2057 1 52.05 TATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGTTCTGGGATTCGGTGGTGTTGCTCCTCCGCC:1 - chr3R 11094130 3' + copia 4949 2 80.00 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTTCCTGTTTCAGTTAAGGGCTGGATAATGATACGATATCATATAGCTACCATGTGAATAAACTT:1 + chrX 22859001 3' + mdg3 235 2 74.66 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGG:1 - chr3R 25876879 3' - mdg3 5330 2 69.66 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGCTGCTAGTTTAACGCATCGCTGAATTCGAGTTTGTGGCCAAAGTCTTTCGTTTTCGTTCCCATTACTGACCTCGTGCTGCATTTTCAGCTTTTCA:1 - chrX 3452382 3' + Tirant 375 2 69.18 ACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTGCAGTAGAAACTTGCCTCGGGCCACTTTTACTTGGGGTAACAAAAGACCGTCGAGACCGGTTGATGATGCGCCCGAGGTGGGAAAA:1 + chr2R 19350207 3' + 297 6586 2 60.27 AACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTTATACATATTGATTTCAGAGCTATATTCAAGCAATTTTTAATTG:1 - chr3R 30731390 3' + gypsy6 328 2 70.16 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTATATTATATTTAATCTAGTTATGGTTTAAATACCAAGTCTTTCCAGACTGTCAAAAGTTTTTGGTAAGCTGAGCGGTAAGCCTTGCTAATTTTGA:1 + chr3L 15891121 3' + mdg3 5474 2 50.00 ACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATT:1 + chr2R 5900921 3' + Bari1 1646 1 63.57 GAAAATTTAGCTTTTCATTGGAGGACACACGGCGGTGAGCAGTCTCAAGCAGCGTTGACTCCCAAACAAAGTGGAGATGTAAAGCAGCAGTTCATAATTGAAGACAAGCCTGAGAGAAAATCTAATTGGAAGAGCTGGCGGAAACC:1 + chr3L 24880755 3' + aurora-element 4170 1 78.77 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAA:1 + chr3R 9345679 3' + pogo 2048 1 56.16 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATATAATATATATATATATATATATTTGTATATATATATATATTATATATA:1 - chrX 3391354 3' - blood 7062 2 60.80 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGCCGGGCACAAATTAAAAATGCCC:1 + chr2R 24338475 3' - 1360 7 2 76.11 TGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATATTGTATAATCAGGAGCCGAGCGTGCCACTTCCTGTTCCTGCATAATCGATGCCAGTCGGCAACTTTTTCTCGTTTTTGGCCAGC:1 - chr3L 4738339 3' + Idefix 7361 2 65.75 GTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGGTTTGACCACAATGTCGTGCGGATG:1 - chr3L 9375805 3' + mdg1 390 2 54.14 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGATTATGACTGCCTTACTTAAACTGTGTTATCAATAAGTGATTGACAATCACGAAAAACAAACAAAGCTCCAAGCTC:1 + chr3R 23664506 3' + pogo 2059 1 57.53 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGGATGGCTGATATGCAGGTGGA:1 - chr3R 9563577 3' - P-element 43 1 54.79 GCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGAAAAAACCTTGCCGACCGCTAGGGGCCACACAAAGGCTGGCTGG:1 + chrX 10728937 3' - springer 42 2 56.85 GTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTT:1 - chr2R 10478653 3' + invader4 307 2 66.40 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTT:1 + chr2R 18048904 3' - opus 7178 4 67.81 TGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAGTCAAGGT:1 + chrX 21907836 3' - accord 406 2 51.37 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCATGTCCGTCCTGCATCTTTCCCAAATATT:1 + chr4 1149948 3' - 297 51 2 60.96 GACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATG:1 + chr2L 19417081 3' - BS 4979 1 57.33 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAGTAGCACACCCACATATATATTTGTTTAAAGTTGCCCA:1 - chr2R 21897827 3' + 412 480 2 69.18 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGC:1 - chr3R 28008260 3' - hobo 84 1 76.03 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTT:2 - chr3R 7884552 3' - jockey 4835 1 70.55 TGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATT:1 + chr2R 5237876 3' - Doc 102 1 63.70 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATAAATGGAATTTCGAAGTTCCTCTTCAGCTCCCAGTAAACCCCATTTTCCGAGTAAAAGACAAATATGTTCGTTTGTTTGCGAGTTTATTTCAGTTTC:1 + chr3L 16264741 3' + Burdock 232 2 69.86 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGGAAAG:1 + chrX 3506208 3' - Tirant 11 2 73.97 AATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATACATGTGTACACGCCATGTCGACGGTCCTGCTCGGAGACATTTTAAATGCG:1 + chr2R 13323149 3' - Stalker2 335 2 70.55 AGTTACTCGACTATCAGATACCGACTAAGTTACGCTTGTGAGATCGCAAGCAAGCAAGTAAAAGGTTATTTTGGCATATTAACAGAAATTCTCACAAATAAACTTACATAATTGTGGAACTATTTCCATTCATTATTATTTCACTC:1 + chr2L 9086026 3' - INE-1 557 1 57.53 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACT:1 - chr3R 8542603 3' + roo 8987 2 73.29 GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATTATGAACGAACTTCAATAAATAGATTATAATTTCCATTAAACCCTATATGTTGGGAATTAAAAATGTAATTGATTTAATTAAACT:1 + chr3R 16529181 3' - Stalker2 7330 2 59.59 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATT:1 - chrX 22858811 3' - mdg3 22 2 71.92 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCT:1 + chr3R 9938719 3' + roo 9036 1 61.64 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCT:1 + chr3R 5087093 3' + P-element 2812 1 34.25 ATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAATGTAACAAATAGCGTGTCATGGTCAAAAAGCATAAATATTTACTTAAGCCCATTAT:1 - chrX 915537 3' + invader2 4678 1 71.23 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATATAGTTGGGTCTATGACAGGATCTGGGCTTGGATGCG:1 + chr3R 9983110 3' - HMS-Beagle 32 2 58.27 GACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATCAGCCGAGATGTTTTTGGCTTTTTTTGCTTCGATGCTGCG:1 + chrX 19231160 3' + mdg3 5242 1 72.41 ACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGCAAATGCAATTATTCATAATACGAGTTGGTATAAGCTTATTAGAGTTATAAGCTTAGTCCTCCGAGAGTTGAA:1 + chr2L 17748153 3' + Tirant 169 2 50.68 ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAATATACATGTTAC:1 + chr3R 21570573 3' + mdg3 187 2 55.48 AGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTTTCAAAATGATTATAGTATAAAATAGATTATAGAAACTATAAAAAGCAACAATTCGG:1 + chr2R 23713285 3' - Idefix 7182 2 58.99 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAGCTGGGAATTGCGAATCAGCCGGCATCCCAAGTTGCCTATATTGTTGCACAAGTCT:1 + chr2L 15920226 3' - jockey 19 1 76.03 TCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAA:1 - chr3R 10140216 3' + P-element 2793 1 17.81 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAGTGCGTGCG:1 - chrX 15167662 3' - roo 66 2 67.81 AGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTAGGGGAAATGGAACGTCTTCCATTTCTATTTGTTGTGCTGTGTTTTGATTTGATTTATTGGTTGATTTTGCAGTTCGCTTTTCACTTTTGCCGATTGCATTTGCC:1 + chr3L 16064486 3' - 297 6547 2 63.89 TCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAACGCAGGAGCTGGAGCCCTTTCTGAGCAAAAGAAACAACAGACAGTGCAGCTAATTATCAGCAGCCAGAAG:1 + chr3L 22522112 3' + pogo 1647 1 63.56 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGT:1 + chr3R 5087111 3' + P-element 2831 1 46.90 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAG:1 - chr3R 21421052 3' + roo 327 2 74.66 TGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTGCGTGCTCAAGGATGTTCGCAAAATTCACCACACTTGTC:1 - chr2L 12142577 3' - hobo 82 1 73.29 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCAACTCCG:1 + chr2R 18882716 3' + roo 396 1 76.03 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAACCATGAA:1 - chr3L 15058836 3' - blood 52 2 50.68 GCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCGATAGTGTGACATTCAAAAGAATCAAGTTAACATATTATTAAGGCTCTTTAACTAGTTAAAAGTGTCCCACCTGAAAGTGTTCCGGTTTATGCAACGGCTGC:1 + chr3R 8012140 3' + roo 8976 2 76.69 CATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCACGTGAAAAAAACCGCACAAGGTAAA:1 - chrX 21474368 3' - 1731 4345 2 80.14 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTGAAAATATATAAATCTGCTGCATCCACTTCCACACCCACCTCGAGTGAC:1 + chr3L 2615655 3' - I-element 69 1 68.49 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTT:1 + chr3R 19545422 3' + jockey 4941 1 52.05 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTG:1 - chr3L 20747087 3' - Burdock 6186 2 56.74 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGG:1 + chr2L 7667479 3' - copia 4953 2 75.34 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTGTATCCTTGGCAGCG:1 - chr2R 21227325 3' - mdg3 5273 2 65.62 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATTTGGCAAATGTTAACT:1 + chr2R 12703906 3' + blood 7372 2 71.92 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAA:1 - chr2R 21380588 3' - roo 29 2 61.54 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATAT:1 - chr3R 4722354 3' - roo 8699 2 60.27 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCAAATAACTCGTTCTTGAG:1 + chr2L 17162893 3' + blood 345 2 61.64 AATCAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAAATAAAATGGGTAAAATTTTACTCATAGTGCACTGTGGCCACGCCCCTCATTTTACCAACAAAACGACCAAAACGGGAACGGCAACACTTTTAAACAATTTTTAAAT:1 - chr3L 24073177 3' + transib4 2594 1 41.78 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATGAAAAGCTTTTCGGTCAACGCTCGAGTCCGCAGCCGAAAATG:1 - chr2L 18823510 3' + P-element 2818 1 35.71 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAAGCCAAGTGGCAGACAAAGATACAAATGTATCTTACGGCTGCCGCCATACAATTGGTGT:1 - chr2L 19906914 3' - Transpac 4934 2 59.41 TAGCTTTTATAGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCC:1 - chrX 693662 3' - INE-1 151 1 36.30 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTCTCTTCAT:1 + chrX 983249 3' - 412 7087 2 63.70 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGC:1 - chrX 8502165 3' + pogo 2041 1 61.64 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTC:1 - chr3R 10142944 3' - 412 74 2 67.12 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGCACGCCCTCAACACAAAGTGAAAGTGGAA:1 + chr3R 5765451 3' - opus 7157 4 57.24 AGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTTCCAGGGACATCTCCAGCTGTTTCCGCGCATCGCTGCTCAGCAGATCCACTTTGGTCAGCACATTGATGCGCGGCTGCTCC:1 - chr3R 7145396 3' + blood 7252 2 56.12 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTC:1 + chr2R 15613850 3' + P-element 2841 1 48.46 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTCGTGGAT:1 - chr3R 25271137 3' - 412 25 2 69.18 ACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCACAGCGTACATTGGCTTATTCGAAAATCTCAT:1 - chrX 16853295 3' - roo 31 2 64.38 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAA:1 + chr2R 8686650 3' - hobo 64 1 67.12 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGG:1 + chr3R 7424643 3' - 412 25 2 58.62 TGGTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGA:1 + chr2R 7098017 3' + copia 167 2 79.45 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAATTAGTTTGTTTTCACTTTGACATGTT:1 + chr3R 15465624 3' + mdg3 231 2 74.66 GTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGACCACTGGCTCTACCACTGCCACATGTAAGGAAGGTCGCAGGACTTTTATCTGCCCCGATCCTTCGGCTCCTTC:1 + chr3L 22592471 3' + blood 7253 2 50.00 TAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTC:1 - chr3L 20747091 3' - Burdock 6195 2 60.96 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATG:1 - chr2R 22671382 3' - jockey 4746 1 71.63 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCGTTCCGTTTCTGTTACTGCTATTTCTACTAATGTTTTTGTCCTTGCATCTAGTTTTATTGTGGATTCTGATCTCTTTTCTTTTTGAAGTATCTC:1 - chr2R 3009390 3' + pogo 2078 1 68.49 GTACATATATATTTAGAGAAAAGAATTACGCATTCTTTTTTATTGATCACGCTTACCGTTGCGCCAACAACTATTCCGAGTGCAATTAGGCTCCAAATCCAAACCATGTCGTATTGTAACCACTGTAACCACTTTACAATGGCTTC:2 + chr3L 3484638 3' + gypsy11 3987 2 73.97 ATGGAATAGCACTCTGGGGAAATGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATATCTTAGTTTCGTAGTGTAATGTATTCATTTCGAACTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATC:1 - chr2R 18035139 3' + Porto1 4276 1 51.03 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTGATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGATTTATAAAGCATTTAAGTTGCTTTTG:1 - chr3R 27835568 3' + 412 7501 2 52.74 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGTTGTAAGCGATGCAGC:1 - chrX 16456761 3' + P-element 2784 1 17.12 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGC:1 + chrX 19162707 3' - pogo 38 1 59.59 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAA:1 - chrX 13061693 3' - mdg3 49 2 51.37 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATA:1 - chr3R 25384202 3' - mdg3 82 2 73.29 GTCTGTCCGTATGAACATCGTGATCTCATTAACTATTAAAGCTAGTTCACGAGTGTGAAAAATCAAGCCAGAAAAGAATCCAAAAAATAAATACCGTGCTGATACGCACCGCGGTGGCAAAGCGTAAAGACAGTCGACGGGGAA:1 - chr2R 2873143 3' + INE-1 129 1 75.00 CCCCACCATCTGTGTTTAGCGTTCCAGTCACCTGCCATAAGGAACTTTGTGCCAAATTTTGTGAAGTCCAGTGCGTACATCACCATCGACGAGCCCCTGCCAAACTCGAACGATCGTATCATCACCATCTCGGGCACGCCGAAGCA:1 + chr2R 20605797 3' - G5A 428 1 56.16 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTTTTCGGCCACAAATAATTAATGGGTTAATGGGCTGGGAAAAAGGAAATTCAGACAGTC:1 + chrX 18034722 3' + Juan 4193 1 68.49 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTG:1 - chr3R 22659920 3' + 412 422 2 67.81 ATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTACCGTGGGACTACATACGTGCCCAGGAGTGTGTTCCTCCTGATGGAAAACGTCTAAGTAGGTCCTTTTCATAATTTTAATTTTAATTTTTTTGTGAGCTCTTATTTT:1 - chr3R 16818366 3' - baggins 5329 1 61.64 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTT:1 - chr3R 12608068 3' + roo 8991 2 73.29 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGGGTGCTTAACAAATAACTGCGGAATTACTTTAAACATTATTGT:1 - chr3R 15589931 3' - Transpac 4942 2 67.41 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATTCTCACATGCTCACGCATTCCCACACTCACACACACACACTGACACGGAAAAAGAGGAAAGGAAAAGTCAATGATGCGTGT:1 + chr2L 15621971 3' - hobo 34 1 58.90 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTTTCGTTAACAATGTAAACGCCCGACTCGA:1 - chr3L 6630339 3' - jockey 4748 1 69.86 AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATATCGGAATTTTAAAATAAAATTTGCTCTTTACAAAAGCATCTATTTTATT:2 + chr3R 8022249 3' + roo 368 1 57.53 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATCTCAGATCTACAAAGCGGTACCTCCAGAT:1 + chr3R 22289526 3' - 412 9 2 78.08 GGACAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCGGTTGCTTACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTGACGCTCGCGATTGTATCTAGAGGCTGTTCCCCACACTTGGTGCGCAGAGTTGTTTGTCTAATTAAACACCAACAGTC:1 - chr3L 17671333 3' - G5A 2554 1 74.66 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGA:1 + chr2R 19543783 3' - jockey 4791 1 61.64 AAATTCTTTAAATTAGAAACAGAATTTCTTTGTTATATTGTTCTATATCGCTGTTTGCAATAATTTGTTGTTCCGGGTTTATGTATTATTTTTAGGGTGAAGCTTTCTATGAAAGAATACCATCATTTTATTTCTACGTTCCGGTT:1 - chr3L 25208199 3' + TLD2_LTR 159 1 75.34 GGAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTT:1 - chr3L 1387151 3' - mdg3 86 2 71.92 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAGCCGCCAGCTTTATCTACTCAGGCCT:1 - chr3R 3527042 3' - Tabor 6871 2 66.44 TGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAACAGCCCAGGCAAAGCACAGAACTGCTGGAAAAACTGTTAATG:1 - chr2R 20362169 3' + diver 195 2 65.75 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAA:1 + chr3L 14969280 3' - P-element 59 1 31.15 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAA:1 - chrX 14692852 3' - Transpac 4991 2 66.44 CGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACTGTAATCATTTCGTGAAGTTCAAATCTCTCATGCTAAAAATGAACATGGTATAAAAGTAAACTGTAG:1 - chr2R 7687692 3' - Doc 304 1 54.11 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATA:1 - chrX 22858874 3' - mdg3 5337 2 74.66 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATC:1 - chr3L 18468339 3' - jockey 4720 1 51.37 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTACCCCCACCTG:1 + chrX 14136593 3' + roo 9033 1 42.47 AATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTCGGCATCACAGTAATGGGGTTCGCAAACACAAATCATATATGCACGATTTACGCGGGGCTTGCGCATCTTCTTGCCCTTGCCGTTGACGCGGAGGCCGGAGTCCTCGCACTTATCG:1 - chr2R 24819827 3' - diver 222 1 53.57 ATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGTACTGCAAGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATACGGCTTGTCCTGGGGATCAACACAGATCTTGGCACACTTGGCTG:1 + chr2L 13974573 3' + G2 2646 1 69.86 TTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGATTGTATTT:1 + chr2L 8393074 3' - I-element 5168 1 50.68 CGATCGTTACTCGTAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATTTAGTAAGCCATCTTGCAGATCTTAAATTACTTTTGA:1 - chrX 8122972 3' + invader1 3925 2 73.97 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACG:1 + chr2L 2519925 3' + roo 9033 1 58.22 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAG:1 - chrX 18193701 3' + hopper 1374 2 54.48 TACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGAT:1 + chrX 21667933 3' - gypsy2 6561 2 69.86 ATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTTTTCTAGCTAGCTAGCTTTTGCCCATATGTTTATAATGTTTGGTTAAAAA:1 + chr3R 15299560 3' + Tirant 184 2 64.38 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAA:1 - chr3L 4710707 3' - Doc 52 1 52.05 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGGAGGAAGTGGATGGCCGCAGGG:1 + chr2L 17747557 3' - Tirant 8114 2 79.17 TTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTGTTAAACCAAGGCAAAAGGGTAAATGCAACTTTTGGAAATGATCTTACAAATATTCATTAT:1 + chr3L 12030643 3' - I-element 5175 1 67.81 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAGTCTAGAGGGGTTTTTTGTCTTTACAAAGAGCCATATTAAAAGCATAAATAAATTTGAACTTGCAACACCTACTGCCT:1 - chr3R 13544010 3' + 1360 3348 1 49.32 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATTAAAATGGTAAAACTGCACTCATTAACCTTCTAACTACTACTAAATGGTT:1 - chr3L 176369 3' - Transpac 66 2 63.70 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTT:1 - chrX 13548296 3' - jockey 4808 1 53.42 AGTCGAGTTTCCCGACAATCAGATACCCGTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCTGTCAGTTAGTCAGGCAGTGGCG:1 - chrX 20348750 3' - INE-1 562 1 56.18 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTT:1 + chrX 12551809 3' - pogo 59 1 60.96 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTG:1 - chr3L 3540118 3' + mdg3 5437 2 56.85 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGAT:1 - chr3R 27835593 3' + 412 426 2 63.64 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTG:1 - chr3R 23507572 3' + 412 7488 2 56.16 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGGAGGTCGTCTAGAGGCC:1 - chr2R 15613735 3' - P-element 43 1 54.79 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAATGACTCCATTAAGGAG:1 - chr3R 20905336 3' - pogo 19 1 73.29 TCTGATCCAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAATTCGGATATCAGCCAGCTCTAGAACAACCACCTCCTGGCCTCTCTTGTCCTCGTCACATTTGGGCTCACC:1 - chr2L 11127952 3' - 1360 3163 1 50.68 ATGCATATTTTCTTTTGCTTTAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCATGTCGTAAATTTTCCCAAGTTCTTTGGCCTGTTTTCGAG:1 - chr2R 3133729 3' + Bari1 1529 1 73.29 GACTGATCGACTCACCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAATTTAAATTTTAAATAGCTGCAGAGAGCACACACACACGGCCTGGTACTCGTAACTCCCACTAGAGT:1 - chr2R 15652704 3' + mdg3 136 2 54.79 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGA:1 - chr2R 7223638 3' - blood 45 2 53.42 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAA:1 + chr2R 24338444 3' - 1360 71 1 67.12 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAAGTTCATAGTGCCAAGAAGGATATCAGCGATGTTG:1 + chr2L 7667541 3' - copia 22 2 70.55 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAAGGGATTTCTCTCTGCATCTTGTAAATCACGCACTAACATGGGGTTGTATG:1 - chr2L 9167370 3' + pogo 2097 1 78.77 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGGAGGTCGTCTAGAGGCCG:1 - chr2R 15613734 3' - P-element 16 1 67.50 ACACACACACACACACATACGCACACACAAACATTTATAGTTTGGAGAGAAGATCAAGGAACAAAAACAGCAAATATTTTGCTTTCAGTCAAGAAACCAAAAGTAAAGAATAAAATGGAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 13121861 3' + accord 185 2 76.15 GACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTCTTGTTGGTCCTTCTCACTAACTATAGTGTATAATGGCCTTGAATTTAAGCATGCTTCTATTTGACATAAAAGAGTTGACATTTCTT:1 - chr3R 19447649 3' - roo 415 1 63.70 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAA:1 - chr3R 4722390 3' - roo 71 2 68.49 GCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATTTATGAGTTTAGTACTATTCCGAAGGTGCTTCTACTGACCCACTTACAAATGTAGTAGGCGCTGTATTTGGGGTTCCGCAACTCGTTGGCC:1 - chr3R 9564337 3' - P-element 2767 1 63.70 CCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACACACACACAGACTCACGC:1 - chr3R 8367094 3' - Doc 6 1 75.34 CTCACCCCATCGTCAAGTTCCCGAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAATGCCTGTCAGCATTTGATAAGTGTGATATTGGCTCATTGCTGTTATTTTGGTACCGATAAAGAATTGTGAGCAATTCAGCAGCATTATCAG:1 + chrX 4108223 3' + Idefix 231 2 52.74 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGT:1 - chr2R 20461203 3' - jockey 92 1 74.66 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCT:1 - chr2R 5848964 3' + mdg1 356 2 62.33 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAAACCTCGGAGGTGG:1 - chr2L 8397109 3' + roo 399 1 75.56 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTAGCAAGTTGTCTAAACTAAACTTTGCTTAAT:1 + chrX 21205117 3' - 1360 25 1 65.75 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATCAAGTTTGATGGTAGGAATTCAAATGACCAACATTAAAAATCAGTTTAAGAGTGCAACTTTCGACGCGCGTAAATCGATTTATCAATTGCGTTTAAAAGAGA:1 - chr3L 4467741 3' - pogo 14 1 77.40 ATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACC:1 + chr2R 10552432 3' - S-element 87 2 79.17 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAAAAAATCCTTGCAACAAG:1 - chrX 22824718 3' + jockey 4958 1 53.42 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACAATATTTAAATAAAATATTTTTATCGCAGCT:1 - chr3R 25822941 3' + roo 9037 1 60.27 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAAC:1 - chr2L 7459526 3' - BS 5031 1 58.90 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGG:1 + chrX 19231865 3' - mdg3 36 2 60.96 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTAT:1 + chr3R 10143010 3' + 412 7463 2 72.60 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACTGCATTCTTGCCATGTGCAACCCGAAAACTTTTGCTAATTTCTCTATAATGTGTAGTGAATTA:1 + chr2L 12284082 3' + Quasimodo 7355 2 78.08 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTGGCAAGGG:1 - chr3R 11549799 3' - 297 34 2 63.20 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTT:1 - chrX 14962203 3' - jockey 72 1 59.59 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTGGTAGGACGTGGTCTGTGGTCATTCCCGCCGCTTA:1 + chr2L 6406600 3' + transib2 2791 1 61.64 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCG:1 + chr3L 14969311 3' - P-element 52 1 47.26 AGATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCA:2 - chr3R 30272993 3' + Tirant 8427 2 74.66 TTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCCTTTATCCCTGCTCTTTACTCCTCTATCGTCTTCTTTCGCTGGGCTTCGGGTTTGGTCGGTTTTTTGTCGGTGCGCCACATT:1 - chr3R 11091077 3' + copia 77 2 70.00 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAAACATTGGCGG:1 + chrX 10960296 3' + Transpac 5172 2 60.71 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGC:1 - chr3L 22529765 3' + roo 8984 2 80.00 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAG:1 + chr3L 19146688 3' + pogo 2041 1 58.22 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAAGAGGTCACAAAAATTGAAGAG:2 - chrX 21668658 3' + mdg1 7456 2 70.55 ACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACTGGACTGACACTAATTGCAAAGTGTGAGAATGATGGCCCTTTCCTTGGGACGCCCGAAA:1 - chr2R 13078803 3' - BS 4722 1 59.59 ACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTT:1 - chr2L 20638349 3' - Doc 65 1 58.22 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGGTTATCGGGGTCATAAACGTTATTCAAAAGAAAAGTGTCGCTAATGAGCGTTATTATAATCGTATATTTGGTTGGCCATTAACTTATAATTATAGGATT:1 + chrX 17161960 3' - FB 23 1 69.18 TTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATCAATAAAATATTAGGTAATTATTTCATGCAATTGATGTATT:1 + chr2L 17652522 3' - 1360 3198 1 77.24 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATTTTGGGATCGA:1 + chr2L 1074028 3' + Tirant 8460 2 53.42 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATT:1 - chr2R 17986254 3' - 297 11 2 67.71 TAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTAT:1 + chr3L 18296989 3' - Juan 4142 1 71.92 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATAA:1 + chr3L 21387527 3' - pogo 60 1 65.07 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTC:1 + chr3R 7424615 3' - 412 7136 2 74.66 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTCGAAAATTCGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCAAGTGTTAATGAGATTAGTTACATAAAT:1 - chr2L 18370279 3' - Doc 11 1 78.77 ACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTACAAAGGTAAAATGTA:1 + chr2R 5924451 3' + jockey 4725 1 48.63 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACAGCCACATCAGCAACCAAAATGCATAGCATACTTTGCTGGGCATTAAGTAGTTGAGTTTTTGAAGGGACGCA:1 - chr3R 25508446 3' + hobo 2888 1 53.42 ATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7187 2 63.77 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGGGGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTT:1 + chr2R 23225860 3' + Transpac 5194 2 63.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCAGATTTTCTGTGTA:2 + chr2L 2519947 3' + roo 9055 2 73.29 TTGCACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCTTACACTTCAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTTTATCGTTCTTTTTGTACACATATACTGACTAGACATATTCTCGGCCAGCGACTTTTGC:1 - chrX 10043640 3' + rover 7012 2 83.56 GTGTTTGGAAGTACCCGCGATGTGCGTGGGGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTTTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCAT:1 + chr3R 25508516 3' - hobo 81 1 81.25 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCG:1 + chr3R 29709038 3' + blood 7320 1 73.81 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATGGTGGAGGC:1 - chr2R 14553200 3' + mdg3 5469 2 62.33 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGTAAGTTCTTTAAGATGAAATTGAGAGTGATTGTGAAATATATACATAAATGTATAATAATATTAGTCATTTCGAAGG:1 - chr3R 10498747 3' - 297 6590 2 78.77 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATG:1 - chrX 15089462 3' + P-element 2857 1 64.83 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTAAACGCGTATTTCTAGTTTTTATCTACTTTTCAACCTTTTTGGTATTAAAATCAAGTAGTGTGTAGTGTATTTAATGCACATAAATTG:1 - chr3L 20711958 3' - 297 26 2 68.49 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATATTGACTACGGCGAGGACGAGCGGAGGAATGCGAATTTAAGTGAAATAAATGACTTTTACTTACTAATTAAT:1 + chr2L 18163878 3' - HMS-Beagle 6836 2 58.22 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGCACTCATTCCAGCTGAAGGAATAGTAAATCTGGGGCGGGGGCTCATCAAGTGGGAAATAGCTCAATTTTAGAGAAAAT:1 + chrX 9342561 3' + 1360 3346 1 57.53 GGTAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGC:1 - chr2R 14562132 3' - Burdock 6179 2 68.22 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGTGGTCCA:1 + chr2R 23313102 3' - Tabor 6888 2 50.68 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTCTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTGGTGTCTTTCTTGCCC:1 + chrX 21213422 3' - Doc 33 1 57.53 TTCCCCGACTATCAGATACCCGATACTTTAGGCAGTGGCAGCTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGACATGGCAAAATATGTATTTGCGCTTGTGTACGCACTTTACTGCCGCAGCGAAACTATCACGTTGTTATTAAT:1 + chr2L 17808894 3' - INE-1 555 1 55.24 CAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTATTTAACAAAGAATCCAGGCTATTTTTCA:1 - chr3R 12559678 3' + mdg3 158 2 78.08 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTCAGTGTTCATGTTCGTCAGTTAGTTTCGAATTTTCACTTTTCCTGATATGTGTTAGGGTGCTGTTCTTTGTGTTTAAGCATCGAGT:1 - chrX 22591240 3' - copia 37 2 60.96 GAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGGTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATA:1 - chr3R 31907360 3' - Tirant 87 2 77.40 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAATACTGGGGGATTGCCCTTTATTAAATAAACTGCAACAA:1 + chr3L 16764871 3' + I-element 5272 1 72.60 GATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGTATGTTGAACTGCGCTGCTGAT:1 + chr2R 982421 3' + HMS-Beagle 187 2 60.96 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTAATGAATATGCCTCC:1 - chr3R 21924245 3' - roo 53 2 56.16 AGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTATTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACACGCACCCTGGCTAGCTGAGCCCTCGATTCTGG:1 + chr2R 15032996 3' + invader2 154 2 78.62 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATTGAGCTCCAGCGAGCGGCGGCTAAAAAACTTTGGCTGCCTTCCGCGAGGCGCCTGGAAGTAGGCAACAATATTCTTTGTTATTCGTTGTGAGC:1 - chr3R 15030648 3' + jockey 4963 1 58.90 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAAGTA:1 - chr2R 14385557 3' - jockey 63 1 54.79 TTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGA:1 - chr3L 16157171 3' - Juan 38 1 58.22 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACTTTGTGGCGCTTTCATTATACTTCTTTGCTTGGCACTT:1 - chr2L 4416005 3' - jockey 29 1 71.23 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATTAAAGCGTCGATTCATTTTGTAAATAAATACTTCCACTTTTAAAAAACGGTAAAACTCTTCGAAAATA:1 - chr3L 21613780 3' - Burdock 54 2 53.42 TAAGTGAAACTGCTGCGGCTGATGAATCATTGGCTACTGCGGTTCTCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGTCCGCAAAAACGCATTCCAGCGGTAC:1 - chr3R 15365860 3' + X-element 332 1 77.97 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCC:1 + chr2R 6585522 3' + pogo 2043 1 60.27 ACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAACGCTGAGCATCGCCGTCAGACTGATCCATCGATTGAAAACGACACAGTGAAATAAATAAGCGCGTTGATTTTTAAG:1 - chr2L 8840912 3' + Stalker2 7369 2 52.78 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGTGATTTTCTATCTTTACAGGAT:1 - chr3R 18524230 3' + opus 454 2 56.16 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAAATATGAAATAACAGAAAGCGG:1 - chrX 13061672 3' - mdg3 28 2 65.75 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTC:1 - chr2R 17013999 3' - HMS-Beagle 6835 2 58.90 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTTCTCG:1 - chr3R 21421031 3' + roo 9012 2 60.27 CGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAACCGTGTATACAGCAAACAGATTCAGTAAAATTA:1 - chr2L 17550597 3' + Transib-N1_DM 457 1 79.45 TCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTGCTTTTCATTGGAAATTTAATCTATTTTCTTATATTAGGCTTTATAAAATTATTTG:1 + chr3L 10076435 3' - X-element 28 1 67.12 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTATTGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCC:1 - chr3L 18296919 3' + Juan 4144 1 66.44 ATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTTAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAGAAATTCCACATAAATAAAACTAGTATGCTAATCAATTCGAATGAGGCTGCGATTGATCCACGGA:1 + chrX 3838655 3' - Cr1a 4275 1 55.48 TTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTTAAGTAGCGACACTTCCACCATCAACCTGAAACAGTAAAATC:1 - chr3R 19330225 3' - F-element 4241 1 71.53 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGTAGCTAATAAAGTTGCAAGTGGTCGCCGTC:1 + chr3L 22529845 3' - roo 54 2 54.79 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTT:1 + chr3L 8253719 3' - jockey 4703 1 66.43 GTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAAATTTTTTTTTCTGCTGACCGTTTAATTATTTGGTAGTTGAATCGTTGAGTTAA:1 - chr3R 6368553 3' - Idefix 21 2 71.23 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTGCACTAAATGCAGTTAAAACAACGCACACTTAA:1 - chr3R 25521741 3' + blood 7380 2 77.40 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACT:1 - chr3R 23507577 3' + 412 7483 2 59.59 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAATAAAGTCCTCATAGCTA:1 - chr2L 20984266 3' - blood 28 2 63.70 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCTTAGTGAAAAAATACAACTGAAATATAAAATTTCAAAGTTATACTTAA:1 + chrX 23043213 3' + roo 9002 2 65.75 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTT:2 + chr2R 20500131 3' - 412 7123 2 66.44 AAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAACTGGCCCAGGATCAGCAGCACACCACGGAATCGCTGTCCACCAAGCACCACCAGCAGCAG:1 + chr3L 15337299 3' + R2-element 3357 1 60.96 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAA:1 + chr2R 7223727 3' + blood 7342 2 72.12 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCT:1 + chrX 983208 3' - 412 75 2 67.81 TCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGCTTAGCAGCCACGTTCCGAGTAA:1 - chr2L 9356778 3' + Stalker4 378 2 67.12 TTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGAACAAGGCTGTCCGGGATGCCACGATGCTCATGGACAATTAGGAAATCGGTTACATTATTGGCACGACAGGCGTGCATTAGTGTAGTCAGCTGGTAGTTTCCTCTGTT:1 - chr3R 25075767 3' - flea 4605 1 73.79 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATGGTGGAGGCTAAAC:1 - chr2R 14553195 3' + mdg3 222 2 65.75 ATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTACGTGCGGATGTCCTGGCGGCATCGGTGTAGTTGTAAATTGTT:2 - chr3R 23007268 3' - 1360 392 1 71.23 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTCGCTGATTTT:1 + chr2L 1449671 3' + opus 443 2 67.20 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGCGGAAGAGGTAAATTCCGCTGGCGATGCAA:1 + chr2L 7991403 3' + 297 6942 2 63.45 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTTGTATCTTAGCTGCCTATTGGC:1 + chr2R 6187967 3' - Tirant 8136 2 62.79 CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCAT:1 - chr3L 15321961 3' + Transpac 249 2 59.59 TGGTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGAACATTTCATAATTTTTCTGGGATATGCTCGGTTTGTGGCACAGTTGCCAAGAAAAAGGGCGCCGTAATGATGGCCAAAATGA:1 - chr3R 23906272 3' - INE-1 568 1 58.22 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTTAGATCT:1 - chrX 5222827 3' + 412 7515 2 63.70 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGTTAAGT:1 - chr2L 7991245 3' - 297 32 2 64.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACAATATTTAAATAAAATATTTTTATCGCAGCTCTCACTCTTCTTCAGTGGC:1 - chr3R 25822922 3' + roo 393 1 73.29 GCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTT:1 + chrX 10623913 3' + X-element 4659 1 56.85 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTGAAATGAAATCAGCACATCACCTAGCTGTCAGCCAGTCAGTCTTGGTTTAAGCCCCTGCTTTTCCTTAAGCCAACAGTTCAGCC:1 + chr2L 10937960 3' - mdg1 12 2 65.83 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGT:1 - chr2R 18123384 3' - 412 7078 2 63.01 AATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAAATTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACAGGGATGTATAGGGATACTGGGAACATTTCCTCAGACGAAGAAGTCCTTGAACTTCTACATGG:1 + chr3R 804981 3' + G5 4687 1 57.53 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAAGAACAGAAATCGAAGGTGCAACTCCAAAGAAACAAAAGAGGGCTC:1 - chr3R 10099804 3' - pogo 16 1 76.03 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGTAAAAAAAAAAATCTGGGTCTGCTGCATCAGCTGCTGCCTATGTGATTGAAGCTAAAAATTCG:1 + chr2R 16908587 3' - roo 8709 2 55.97 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAATATTTAAGTTTCTTCGAAATTAGT:1 - chr2R 16712928 3' - pogo 31 1 63.01 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATAACTTTTCAGACAGA:1 - chr2L 13884557 3' - pogo 41 1 56.16 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTAGTCCTCCTAGAAATCCCTACACATTGCTCTAAACAGAATCTCATTGATATTTACAGGTTCGAAAGTTCCTTAAATA:1 + chr3R 17756725 3' - 297 39 2 58.22 AAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAGTTTTTGTATCTTGAACGGTAACAAATCAAATCAAAATTCAATTCCCCAGCAGCTGCAACATTGCCATTATTGTTATTGTCAATGGTTATTAA:1 - chr2R 20015078 3' + X-element 4685 1 64.38 CGGCGCGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGAAAAGAAGGACAAAAAGGGTCTCCAAGATTTCGCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAGGCTGGAATATCTAGAGCGATGTTGGCTTGTAAAATGGATCACAGGTACGATGTGT:1 + chr3L 9031249 3' + X-element 4643 1 61.64 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGAGGAGATCGCTTGAGCCGTTTATTTGGGAG:1 - chr3R 14088564 3' - 1360 69 1 65.52 GTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGATTATGAGGCTTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAATAAAAATAAATGGTTCAAAAATAAAGTG:1 - chr3R 17305519 3' - HMS-Beagle 73 2 50.00 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATTCATCTAAAGTCATGGGTAGACATAAAAAAAAAAGAAAATAAATATGCTTGAATGC:1 - chrX 12843538 3' - roo 14 2 73.29 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTTTGTCGATTCGGTCACTTGGAAGTCGCAAGACTTTTTGCGCACAGC:1 + chrX 3444222 3' - pogo 22 1 70.55 AATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGTCAAACATTTTGATACTTGAAGGCAGTAAATAAAGCTACAATCTTAATTAACATGTACAAAAATCAAATTCAATGAAC:1 - chr3R 20554566 3' + mdg3 5161 1 53.42 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCTGCGGTTCAATTAAGTG:1 - chr3R 8402503 3' - mdg1 24 2 69.86 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATATAGTTAATTAAGAACACAACAATTACGCGGCCAGTGGATG:1 - chrX 685333 3' + BS 5053 1 61.76 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAA:1 - chr3R 20292426 3' + pogo 2035 1 65.75 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCAGCTTTGAGTTAAAGGCCCATTAAAGGACCCCCCAAAAACACAAGTTGCCACTGCCCCTGGCGTGTCCGTA:1 - chrX 20386634 3' + hopper 1370 1 54.79 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGA:1 - chr3L 21097105 3' - mdg3 5277 2 61.67 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGATACTCATTTTCGGAACGCCTCGC:1 + chrX 13762613 3' - P-element 97 1 19.18 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAAATGGAATTTTGGTACAAACACAGCGAGTTTCTCTGTGCAAATTGTGCGAGTTGTTGGACG:1 + chrX 10979162 3' + roo 408 1 80.14 TAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATA:1 + chr3L 21093215 3' - Ivk 92 1 70.55 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTT:1 + chr2R 9164922 3' - 412 7129 2 67.81 TAACAACTCTAAATGCTCTGTCATCCTTAAGCTGGTATGTGTGGTACTGCACACAATCATTATTAAGTGTTTTGACTATATTTAAATTATTTTAGATTTATTCTAACCTACAGGTGATTTGAAGACGCAGTAATGACCTCATTGTC:1 + chr3L 10110138 3' - G4 371 1 55.48 GTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATCTTGTAACAGGAAAGTAGTCCATTTTTTAGG:1 - chr3R 6827950 3' - flea 4845 1 79.45 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTC:1 - chr3R 31956747 3' + pogo 2065 1 60.69 CGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGT:1 + chr3R 27845561 3' + Stalker 7190 4 61.64 GTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACGGCTGAGTAGAATTGCGGAATAAATACTGGCAACGAGATAAGAATG:1 - chr2L 9707653 3' + HMS-Beagle2 6866 1 68.49 ACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTGTATACCCCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTT:1 - chr3L 21484243 3' + Cr1a 4101 1 69.18 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTT:1 - chr3R 6782727 3' - jockey 4757 1 71.92 TCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATT:1 + chrX 8200321 3' - flea 4790 2 63.01 GTTTGGGAACGAGACACCCTGTATGCGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTGTTTACATTATCATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGACCCCCGATCATTAGGGGTTTTTTTTTTGTCTACGATTTTCCAATAAACA:1 + chr3L 15126440 3' + 3S18 2 2 66.44 ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCATTACTACATCCC:2 - chr2L 7459505 3' - BS 5010 1 71.92 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATAT:1 - chr3L 9426651 3' + P-element 2859 1 61.94 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTCTTTTGAAGAATTTGTCTAAATTAGGTAATTAATAGCAAAATATTGCATTTGCTCCTTAAAATTTCATTACACATTCAACACCTTAACTTTT:1 + chr2R 20991337 3' + pogo 2077 1 66.21 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGC:1 - chr3R 20137248 3' - Burdock 6196 2 60.96 ATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGCGAATTCATAAAGTATCTTACGCTTTTAATGGTTTCT:1 + chr2L 21778943 3' - Tirant 170 2 73.38 CCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGG:1 - chr2L 17198038 3' - R1A1-element 5045 1 52.86 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGG:1 + chr3R 20292530 3' - pogo 55 1 58.62 CTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGGTCCTGATAAGCAAATTTTCTAATCATATTTTAAATACTTTCACTTTC:1 - chrX 3506055 3' + Tirant 337 2 64.38 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGGATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGA:1 - chr3R 25384221 3' - mdg3 57 2 80.39 TAAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAAAAAATAACTTATTACATGGTGCCAAATATCAAAAATAATATAGATTTAATTCACCACTCGACAGATCGCTTGATCTCCACAAGTGTTTGGACAAGGGTCAACACATTTCTGGTTCACG:1 + chr2L 4506677 3' - 1360 304 1 52.74 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTTTTAATTTATTTGCATTAAACTTGTATTACAATTTTATAACATCTATATATGATATAATAGTTACTCGCAATATGCCCATTATTAGGCGGATGA:1 + chr2R 9815163 3' - pogo 20 1 71.72 AATAATAGTAATAATAATAATAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTTGGTTAAAAATTGATAAAAGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCAGCTGTAGTATTTACTTTTGCATCTGCA:1 + chr2L 15763135 3' + mdg1 46 13 41.10 CTATCACTGTATGCGTAGAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTGGAGCCACGGCGTGTGGAGGAGCGGAAAATGGCACTTGGAAATGGCTAAAAAGTAGACAACTCGAGGGGCCAAAGCCAACAGTCGTTGGCCAC:1 + chrX 15312875 3' - 1360 145 1 56.55 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCAAACAATT:1 + chr3R 31956532 3' - pogo 29 1 65.07 ACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTACACTCCTCAATTGAGAGTGTAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTCGAGTGTGTGGAGGTGTGTTTGTGTGGCTCGACTTAGATTAAGACACGTTCACTAAATTATTAAAGCTGACACTTATT:1 + chr2L 11158768 3' - Rt1b 5017 1 76.71 TAAAAAAATTCCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTAAATAACATTATTTAAAATCAACGCTTTTGGCCATCCT:1 - chr2R 5701507 3' + S-element 1635 2 72.60 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATGCTTGGCAATTAAAATGCTGTTTTCACAAAAGCAAATTAGAAAATAAGC:1 + chr3L 18468469 3' + jockey 4967 1 57.53 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAACCACTGCGGCTCAGTTCTTGCGAAATGTCG:1 - chr2R 20704093 3' + hobo 2920 1 72.41 AAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGG:1 - chr2R 20382449 3' + Bari1 1681 1 67.81 GACGTGTGAAGACGTTCTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGTTAACGTTATTTTCACATTTCCTGCAGATT:1 + chr3R 21955752 3' + F-element 25 1 78.08 ACTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCAC:1 - chr3L 24039752 3' + R2-element 3203 1 58.22 CGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAA:1 - chr3L 18468365 3' - jockey 4746 1 68.49 GAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGTGGCACCCGCGTGTCTATTTTATTATTATTACTATTATCTTTCTTTGGCTGACTTTGGGAACTATCTGCCCAGT:1 - chr3R 29289244 3' - hobo 236 1 55.48 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCT:1 + chr3R 23507683 3' - 412 54 2 54.11 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACT:1 + chr2L 17069625 3' + 412 412 2 74.66 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAA:1 - chrX 21668723 3' + mdg1 7391 2 65.07 GCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGTCATCTGTATTATTTCTACGTTTGCTTGCCATTCAAAAAATACAAGGCAAATAATAAATTCGCCGAAAGTA:2 - chr3L 2316052 3' - Quasimodo 7207 2 51.37 TATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCG:1 - chr2L 14969900 3' + Tirant 314 2 75.34 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGT:1 - chr3R 7884550 3' - jockey 4833 1 69.18 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGCATGTCTGGG:1 - chrX 15089446 3' + P-element 2872 1 75.34 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGCGAAGTATGATTAGGTTATTGACTCGCCAA:1 + chr2R 19354056 3' - 297 6598 2 59.49 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTTCGGTTTAGAGTGTTTAGAGTGTGTATGAAATG:2 + chr3R 4722530 3' + roo 397 1 77.40 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTAT:1 - chr2R 7223672 3' - blood 79 2 72.60 CCAGAATCAAAATTAAAATTAAATTAAAATTCAACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAAAAGGATGCAGAGGGTGTTGTAATTTTATGGCTTTGTGAGCAAAAACTGACTACCTAT:1 - chr2L 16107267 3' - Rt1b 133 1 52.05 ATTTATTATAATATTAAGTTTATAGTACCATTTTCTCAGAGATTTTACACTTTAGAAGTAAATATAACAATGAACTTAGAAAGCATATCCCATTTGCAATTAGCTTCGTTCGGTGTGTTAATGCAACCATTAGCTTCACTGTACCG:1 - chr2R 13750459 3' + INE-1 428 1 84.93 GCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCATGCAGCTTGCCGGACATCATCTTGCTCATCATCTGGGATAGCATATTAGCGCCTGAGTCGCTGCTCTCGCCCAGCGATGTCTTGG:1 - chr3R 11375005 3' + baggins 5262 1 56.85 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTATGTTTGCAAAGTGGAGAAAATGGTATTT:1 + chr3L 11196482 3' - pogo 22 1 70.55 TTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTTTTATTTTTCCAACTGTTCTAAGATTATCCTTGATCACGTTCGTGAACAAGCACCTGGCCAAGCTGAACTTTGAGATCAGCGATCTGAA:1 + chrX 19747590 3' - F-element 4615 1 49.23 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCA:1 - chr3R 6103561 3' + Tirant 8459 2 53.42 AGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGTGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTTTCGTTAACAATGCAAACGC:1 - chr3L 6630348 3' - jockey 4751 1 72.14 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGGGAAAAAGAGACAGTCGCTCGACGTGGGAAAGAGAGGCAAGGAGACACCATTCTGGTGGAGGTGCCATAC:1 + chr3L 13204853 3' - jockey 15 1 80.14 ATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTTAATTCTGGCTGTATTTTCTTTAAGTTGGTTTATTAAGAACAATGTTTTCACTTTGAATGGTTGTGCAATATGGAAAT:1 + chr3R 13086238 3' + R1A1-element 5025 1 52.05 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACA:1 - chr3R 11526766 3' + pogo 2040 1 59.59 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAA:1 + chr3L 9242075 3' + roo 8996 2 68.49 TTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTTGCTTAGATGATAAGGTGTCCCACTTATTTG:1 - chr3R 21150535 3' - S-element 84 2 76.71 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGT:1 - chr2R 24630105 3' - copia 4910 2 54.79 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGAGGGCCAAAAAAAAAAAGGCGGCATGCAGGAGGGTTGGAAAATCGGAAAATTGG:1 + chr3L 16535256 3' - copia 67 2 65.07 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTCTATTCTCGGCTAATTGACGGCATCGGGCCATTGGCATTGTATTG:1 - chrX 17258151 3' + 297 388 2 78.77 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTACAATTGTTTAT:1 - chr2L 14222245 3' - Transpac 4979 2 61.64 AAAGTTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGG:1 - chr2R 5900844 3' - Bari1 83 1 70.55 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGTGCTATATGGAAAGAGAGAGAAACGGTGAGATCGGGAGAGGCGATAATTCTCGCACTTGC:1 + chr2R 17100198 3' - P-element 18 1 71.92 CTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTACGTTTGTGATCAATAAATAATAATTTCGATTTGCACATGACACGGCAATGTGAGTGTGTGTTTGTTTTGTGTATGTAT:1 - chr2L 19041204 3' - jockey 4891 1 53.42 ACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTCAGACAGTTGGCACATCAACTTCTCGGCGTGTTAACG:1 + chr3L 4738455 3' - Idefix 77 2 74.66 ACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACTGTCCTGGGAAA:1 - chr3L 1387086 3' - mdg3 21 2 69.86 CTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACGAACACTTTCGCACTGCATACTTTTCG:1 - chr2L 15920120 3' + jockey 4899 1 82.88 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGCGGAAGAGGTAAATTCCG:1 + chr2L 7991391 3' + 297 348 2 54.79 CCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATAC:1 - chr3L 10076321 3' + X-element 4642 1 67.81 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATAT:1 + chr2R 9327033 3' + mdg3 5411 2 76.71 GTCACTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTT:1 + chr2R 21227432 3' + mdg3 176 2 68.35 GTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCGTGGCGCTTTCCATCGGGACGAACAGACTCCTGGGCATTCACTAAACTATAGGTCGATGAAGATGACGAGTGGGAAG:1 + chr2R 19438410 3' + baggins 5195 1 71.94 ACGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCGTTCTTTATAAGAATGTAAAACATTGGG:1 + chr3L 11953827 3' - jockey 4764 1 81.51 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATGTGTTTGGATGCCTATCGGCTGGGCGGTGTTTTCTTTTCGCACCTTACCGCTTG:1 - chr2R 23312953 3' + Tabor 476 2 66.92 ATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGACGAGGCATTTGTTAAAATTCATACGCCATGTCGTACAGCCAAATCAGAAGGGCTCGGTGTGGAGCCACTACTACTC:1 - chr3R 22834542 3' - R1A1-element 9 1 54.23 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAG:1 - chrX 16853330 3' - roo 66 2 63.70 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACACATAAAAGTACTTATTAACTGTAGGTAGTACTAGTTAGTTAACTTAATAATAACACGGAAAACTTGTTGAGTTTTTTCGTTTATCAGGTAGATATGTTATACCAAAACC:1 + chrX 20656059 3' + Juan 4181 1 45.21 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGATCCGCCGGGTCAGCTGTTTATGAGTTAGCGAGGC:1 + chr3L 16887463 3' + roo 405 1 78.32 TGTCAGCACTTTGCTGTCACGAGCGATCGGCCTGCAGGCCACGCTAAGTTTCAGATATAAAATAAAAATATACACGTTGCGGCGATCTTGCATTGAATGCAAGCACGTCCAGTCGTGTATAACTTAAACAACTAATAATCATC:1 - chrX 19181270 3' + mdg1 7302 2 55.24 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGA:1 - chr2R 7534561 3' + roo 9037 1 62.33 ATATTATATGTGACTGCATGGCCCTTGCCATTAAGAGGAACAAACTCCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATA:1 + chr3L 23909050 3' + baggins 5240 1 68.49 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAACCGGTCAATCGATTGGTTAGGGATGGGAGTCTTAAAGAGTGCCAGTTCCAATATTTTC:1 + chr3L 9426811 3' - P-element 20 1 72.60 CCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGAAAA:1 - chr2L 8776802 3' - G4 3696 1 68.49 GTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGTGCTTTTGTTGCAGCGCCCAACTGGCCTCCTCGGCAGCAGTACGTCCCTTTTGCCGGATTTCATTGTTCGTATGCCTCTGACGGCCT:1 - chr2R 6822043 3' + Transpac 225 2 59.59 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCA:1 - chr2L 12261183 3' - jockey 93 1 75.52 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCAAATTGCGAAAATAATTGACAATGTTGACTATTGCTACCTACATACATATGTGAACGAGCTTAAG:1 + chr3R 7549752 3' - copia 4926 2 58.90 TTTCACGTTCGCCCAAAGGTTTTCGATTGGATTCAAGTCGGGTGACTGAGCAGGCCATTTCATTACTCTTATCGAAAGAGAAAGACATTTCCCGTTCAAACCTCACCCCCACATCCCTCGCCGCCAACCCATATCCTATATTCTCG:1 - chrX 4073345 3' - Tc1 1168 1 48.63 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGGATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTG:1 - chr2L 1136333 3' + 1360 3332 1 73.45 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAATTTCAAATATGAATATTTAAATGT:1 + chr2L 7215662 3' - 297 6602 2 69.18 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAA:1 - chr2L 8397162 3' + roo 8998 2 67.81 ACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7241 2 90.83 ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTTCCTGTTTCAGTTAA:1 + chrX 22858953 3' + mdg3 187 2 57.53 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTT:1 - chr3L 9430582 3' + P-element 2828 1 40.62 AGGAGATTTAAAAGGATGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATTACATTTAATTTGGTTACCAGCAGAAACAAGA:1 - chr3R 26342336 3' + BS 4918 1 78.08 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGAATGGTGAATCAAGTGAATGTGGAATG:1 + chr2L 10032778 3' - hobo 17 1 71.22 AGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACACTGAATTAAGATTTGCATACGCTGGTGATTTTATACTGGTTTATGCGTGCCTCAAAT:1 + chrX 11662945 3' - G2 451 1 60.96 AACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGACAGTGGAA:1 - chr2L 535425 3' + roo 397 1 58.75 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCCGGGGAGAGCTTATCAAACAATCATTAGCTGGCC:1 + chr3R 25443180 3' - 297 6596 2 74.66 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCG:1 - chr2L 4416059 3' - jockey 84 1 67.81 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTCACTGTCAGTCATGTAAATCTGTA:1 + chr2L 21596596 3' + blood 7334 1 50.68 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGCTAACTT:1 - chr2L 13884567 3' - pogo 47 1 52.82 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACATTTACGATTATTATTTTATGGTATGGTGTTGG:1 + chrX 14908510 3' - blood 7036 2 68.49 GCTCTATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGTGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGTTAATGGTGATGAATTGGAAACAGCTGCAGCATGAAATTCAC:1 - chr3R 9429765 3' + F-element 131 1 65.75 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACTTTGTGGCGCTTTCATTATACTTCTTTGCTT:1 - chr2L 4416012 3' - jockey 34 1 67.36 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCCAGCCCTCTGTCCCTATGCACAG:1 - chr2R 22867390 3' + hobo 2921 1 67.97 ATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTGCTCAAACGACTTGGGGAGTTAATTGAGTTCTCCGATT:1 - chr3L 7588764 3' - P-element 318 1 30.14 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGTGCATCATTGCCGCTAATCAATAAGAGACGCCA:1 - chr3L 3137801 3' - FB 89 1 76.71 ACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCG:1 + chr3R 15590041 3' + Transpac 5149 2 71.92 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGT:1 + chrX 18193821 3' - hopper 50 1 51.37 TACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTCTTGGTGACGCCCAAAATACACATGTTCATTAAATTCAAATGTGCATTGTCAACTGTGTCACACTGGTTTAATGGTCT:1 - chr2L 5738587 3' + Tc3 240 1 56.85 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCACGCGGCGTTCGACTACACACACACACA:1 + chr3L 131856 3' - P-element 24 1 69.18 AATTAAAAATATTTTTATTTTTAGGCCAAGCCTACTAAACATATATATTATATATTCGCGTTAAAAAAAAAACGAATTTACATGCTTTGTTAGTATGAAAATTCGAAAAATTCTACATGCTCTTTGCCCTTTCGCTTGGTGTTAGA:1 + chr3R 25569989 3' + Burdock 499 1 76.03 TTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTGTAAATATATATTTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGATTTAATAAATATACTAAAT:1 - chr3R 25504189 3' - 1360 2996 1 96.58 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATTTATAACTAAAATGTGAATTTTTAATCATTTAATCATGAAATATGTATAATAAATATATATGTTTATTAATTTTTATGACTTTTGATTATTT:1 + chr2R 8305344 3' + blood 7363 2 67.81 TATTACAATTTCATCAGAATGTGAAATCACAGAAGGAATTCCTAGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCAACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTTGTTTTTTTCGGTGCATTTAAGCTATACTATTTGCACAATCGTCTCGCTC:1 + chr3R 27453885 3' - invader4 2807 2 67.81 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGC:1 - chr2R 10367497 3' - 412 86 2 74.66 CGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCATGTTTTGGGCCCTCAAGCACGAAAACATAGCAGCCTTGCGAGGAGTATGTCTGAATACCAAACTC:1 - chrX 8175634 3' - Tirant 160 2 55.48 TCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAA:1 + chrX 3506126 3' - Tirant 82 2 77.78 AAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAATATATGCTCGAATATGTTTTCTTTCCTCGCTTACAAGCATCTGCCAGAAGGCAGTATACCATT:1 - chr3R 20180615 3' + mdg3 5084 1 55.48 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTG:1 - chr3R 8542568 3' + roo 358 2 49.32 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTT:1 + chr3L 13597862 3' + blood 340 2 55.80 GAAGTCAAGCCCTCCAACATAATCTTCCTAATTCAGTGTTCATAGGCCGACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAATTTCATTGGGGGATGCGAGTAGCCGCCTGGTCTGGCTGGGCTGGCAATCTTTTGGC:1 + chr3L 15908664 3' + gypsy 7347 2 65.75 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAA:1 - chrX 21668705 3' + mdg1 7410 2 52.41 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTG:1 - chr3R 25822984 3' + roo 8994 2 73.29 CTCGACGTTCATACGGACAGACGGACGTGGCCAGATCGACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATTTACGTTATATAGTCGAAAACTCTTTCTTCTGCCTGTTACATTCACCAGCGTAAGGATGCCCAGCGGCATGACCAGC:1 - chr3R 8591859 3' - INE-1 129 1 76.03 TGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATGGGATCTTTATAGGGGTATTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACAATTAGCCACTTTCAATAGAACCAAAAATCTCACTGCAAT:1 + chr2L 8463820 3' + baggins 5319 1 73.10 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATATCGGATGTTTTGACCGCCATTAAAACACT:1 - chr3R 23968569 3' + jockey 4944 1 54.79 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGGAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGAC:1 + chr2L 20561476 3' - P-element 72 1 35.62 TATGAATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGT:1 - chr2L 17550624 3' + Transib-N1_DM 430 1 79.45 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATATCCACACGTCACGGCTAC:1 - chr3L 9426634 3' + P-element 2864 1 68.49 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAATCATATGTACTAGTGGGTCACTAGTTTTTCGAGCTC:1 + chrX 2873482 3' + roo 9037 1 62.33 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGCTTAAATTTTATTTGAC:1 - chr2R 8305187 3' - blood 40 2 58.22 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAAATATCTAAAAAGACCTGACATCATTTGCCTCAGGTGTGACTGACTCATGAATGAAACGTGTCGTGACATA:1 + chr3R 27503134 3' + hobo 2890 1 52.74 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGAGGGAACGGTGTGCTGGCAGTT:1 - chr2R 14562081 3' - Burdock 6167 2 64.38 CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCAT:1 + chrX 14692943 3' + Transpac 5168 2 63.01 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAAATATGAAATAACAGAAAGCGGATAAGATAATAAAG:1 - chrX 13061658 3' - mdg3 5264 1 76.39 GACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGTCTAGTCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCATCAACTTAATCCATGTCCTTTAGCTTAATTCAGATCGAAACCGTAAGCGCCGACGTCCCCAGACCATCGAGA:1 + chr3L 9458438 3' - invader4 2742 1 56.16 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCATCTCCTTGACCTGCAGCCGAACTCCATTTAATTC:1 - chr2R 17986210 3' - 297 17 2 74.66 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGAATTACATTCACTAAACATTCATGCTTCTGCCTCTAGTACTACATAACATTATAAATA:1 - chr3R 20292427 3' + pogo 2065 1 52.17 ATTTGTTGGTAAATATTACAATAAAGTAAAGACAAAAACTAAACATTTGCTTAGAGCATTGTCCACTTTAATGATACATTTATAACCCATACAATGACATGACCATACAATATTTCTCTTTCCTTTTTTGGCACAAAATACTTTGC:1 - chr2L 15192842 3' + NOF 3912 1 50.68 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAA:1 + chr3L 15322055 3' - Transpac 69 2 65.75 GACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTATATGGTATGATAAATGCCTTGGCAGGTCTTATTAG:1 - chr3R 31967799 3' - roo 8847 2 76.03 AAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAATTTAATTGGCTTTTTAAACTAGGTCGAAAATCTGACTC:1 - chrX 18239343 3' - jockey 4550 1 50.68 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAAGAACAGAAATCGAAGGTGCAACTCCAAAGAAACA:1 - chr3R 10099815 3' - pogo 27 1 68.49 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATAATTAATTAGTTTTCTTTGTGCGTTTGGCCAATCAGTTGATTAATTTATATTTATATTTATATATATA:1 + chrX 13356343 3' + roo 9017 2 56.16 TAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTATAGCCGTCGAAATCGTAATCTCAATTCGCCATCCCATCGCCATATCCTGATTGCCCCATCTGCACATGTCACCCAGCAG:1 + chr2L 15142359 3' + Tc1-2 479 2 78.07 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTAGTTACATTCAACGTTCCTCAA:1 - chrX 14692808 3' - Transpac 4947 2 67.12 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATA:1 - chr2R 15080008 3' - roo 8723 2 59.59 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTT:3 + chrX 21213414 3' - Doc 41 1 54.79 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGAGATATATTCGTA:1 - chr3L 21097093 3' - mdg3 5291 2 58.90 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATTAGCATTCGGTTGCCTTTTTGGATAAATCAT:1 - chr3L 20747046 3' - Burdock 6150 2 76.03 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACACACACACAGACT:1 - chr3R 8367099 3' - Doc 11 1 71.92 TATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTTGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACAGAAAACAGC:1 - chr3R 10468014 3' + opus 423 2 67.81 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACC:1 + chr3L 21093266 3' - Ivk 22 1 69.06 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGTTTTCGAGACCCTGGG:2 + chr2R 21380750 3' + roo 393 1 73.97 GAGTTCCCCGACTATCAGATACTATCCTGAGATAGTGTGAATGTAAACGAGAAATTGCATAATTTTTCTGGGATATCGCCAGGAGTGGCTATCAGTCGCACCCTAAATTCCGACTGATGCTCATCTGCGATGCGTCTCCACTTATC:1 + chr2L 21782306 3' - INE-1 558 1 53.42 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCA:1 - chr3L 6096505 3' + roo 8999 2 65.07 ACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTAATAGAAACGTAACTGCGTACAATTGCTGGCTGCCGTCTAATGGGGCACGCACACATCGAAAGACA:1 + chr3L 9184828 3' - F-element 176 1 54.79 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGTTGTGTGT:1 - chr3R 18903350 3' + pogo 2081 1 71.92 TAAAAAAGGATAACAAGAAAAACTAGCCGGATTTTCTTTTTTCCCCTATCTACACATTCCATTTAACAAAATAAGTGGAATAAAATACTTTACGAAGGGGAAATACATACGAAATTGCTCAGGACATAAAAATTTGTTGTGTAAAA:1 + chr3L 9804560 3' - HB 152 1 58.22 GACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGTCTCCGTCTCCGCTCGAGTGTCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTTGGGTAGTTGTCCGCCGGTGTGTGTGTGTCTCTCGGCTGACCATGCCCCGCCCTG:1 - chrX 19112147 3' - Rt1a 9 1 70.54 AAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGG:1 - chr2L 535434 3' + roo 389 2 55.70 CTAAATGTTTATTGTTGCCGCGGCTTTATCTTTGCAGCCGGAAGACAAATTTTAAACTATTTATTTGTTCACTTGAAATTTGATTTTAATTAGTTTAGCGCCTGAGAGTCTTTGGCAAGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 167 1 80.82 CCCACACACACACATACACACACTCCGGTGGGGGCGAACCGATGCCCTGTCCTGGC:1 - chr3R 23113736 3' + accord 255 2 85.71 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATC:1 + chr3R 25384271 3' + mdg3 5426 2 65.07 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTTTTAATTTATTTGCATTAAACTTGTATTACAATTTTATAACATCTATATATGATATAATAGTTACTCGCAATATG:1 + chr2R 9815144 3' - pogo 40 1 58.22 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACG:1 - chr3L 9242005 3' - roo 8740 2 74.66 CAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATG:1 - chr2L 6406482 3' - transib2 72 1 64.38 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACGAACCAATTTCAACAAATCTAGACCCCCTACACACTGAGAAAAATAATCTAAGCGCTGATATTTTCTAAAGAGCTAAGTGCATTTGGAA:1 + chr3L 14863965 3' + Transpac 5197 2 63.45 CGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGGTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGAAAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTTCCATGCTATCCAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTGGTTGGAATTTATTAACGTTGAAGCAAAGCAA:1 - chr3R 19336792 3' - F-element 205 1 56.16 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATCTC:1 + chr3R 22289500 3' - 412 35 2 61.64 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATGTTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCGAGAAGC:1 + chrX 7329315 3' + Bari1 1657 1 55.48 ACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATGGTGGAGGCTAAACAA:1 - chr2R 14553193 3' + mdg3 246 2 79.03 GTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTAGGCAGTTTTGTTAGATGTTTAGCA:1 + chr3L 22635826 3' + hopper 1406 2 78.08 AGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATCCGGAACACCACATGGTACATAATGCCGGTCCTGAATCCGGACGGATATGCGTACAGCCACGAGTACGATCGT:1 - chrX 17081223 3' + hobo 2505 1 51.37 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAATTGGAAAAATG:1 + chrX 3452555 3' - Tirant 29 2 67.12 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAAATATAGTTAATTTATCGCAACAGTCTTCCAAGATCTTTGGGATTATCAGATGACCTGAT:1 + chr2R 22798718 3' + hobo 2879 1 57.53 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAG:1 + chrX 2873427 3' + roo 318 2 78.77 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCACTG:1 - chr3R 6068288 3' - jockey 4745 1 71.92 AATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGATAAAACGGGAAACGTGACACCACTGGCATCAAAGTGGCAAAGTGTCGCCATTTGCATTTTT:1 - chr3R 22209660 3' - roo 8960 2 58.22 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAATATACATGTTACGTTACGCTTTCTGCTTCTCTGC:1 + chr3R 21570595 3' + mdg3 210 2 60.27 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTATAGCTAA:1 + chrX 4566242 3' - Transpac 70 2 70.83 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAACGACGAGTTGATCTATTTCCGTATGA:1 - chr3R 16194079 3' + mdg1 7440 2 71.92 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCG:1 + chrX 18193845 3' - hopper 26 1 63.70 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGG:1 + chr3L 13597845 3' + blood 7327 1 61.64 AATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAGCAGATTCCCAAGCCTGACCTCGCAGTTTCGTCTGCTCTCTCTGAGGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAATGATCTTGCTCAGTAAGTCTGGCGATTCACTTTG:1 - chr2R 19596284 3' + McClintock 36 2 76.55 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGG:1 - chr3R 19700862 3' + roo 356 2 59.59 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCGAAGAGCTTAACTTTCACCCCAAAGACGCAAAACACACACGATGTTGCCTCGGGGGCACTTTAATTAAATAATTTGTTTGTGTGCATAAATATTTG:1 + chr3R 9616709 3' + roo 386 2 69.86 GATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCACGTTACATTTATGTATACTATATTTTATTTAGATGAGCAAAATTTAGATGGAAAATTC:1 + chr2R 4564650 3' - flea 4830 1 72.60 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATAG:2 - chr2L 13877646 3' + Transpac 5193 2 56.85 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATC:1 + chr3L 5446185 3' - roo 8739 2 69.86 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGTGTATGATTTAATTTACACATTTAAATGCCAAAATCATATGAATACTTAAGTTTTGAAGAATATGAGAGATCAGCATCCACTGCCTACCTATGGTAGTTTATGAACTCTCTGTCATA:1 - chr3R 97131 3' - Juan 6 1 76.71 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGT:1 + chrX 21639694 3' - Tirant 88 2 79.45 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTG:1 - chr2R 20500050 3' + 412 7474 2 69.18 GGCGTCTTACAATCGCTGCATTATATGATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAATGTTTATCGCGAGGTGGAGGTCTCAGACTGCATGCAGACACTTTTCCGTGGAAATTCTTTGGGCAGCAAAATCATGGCCTTTT:1 + chr3R 25987949 3' + rooA 237 2 55.48 GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCA:1 - chr2R 22867417 3' + hobo 2876 1 60.96 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCACTCGATATATCGCTCGAGCCTATCGGCGCTTTATCGATTGCCGGCCAGGGATGTTGCTACTCGAAGTTTAT:1 + chr3R 9563724 3' + P-element 2876 1 74.80 AAAAAAAAAAAGAAAAAACTCTATATATCGAGCAGAACTG:1 + chrX 11516671 3' + HMS-Beagle2 491 1 75.00 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATACCTCCAATAGTTTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCCAAATGCCCCATAGGGCAGTGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGTGGCGACGAAAAAGTTACGCCGGCG:1 + chrX 6938228 3' - hopper 75 1 62.33 GAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATATGGTTGTTTAAGGTTCCTGTGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATG:1 + chr3R 19449461 3' + accord 363 2 69.86 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTTCATCTTTTTTGCCGGCATTGCCTCTTCGTTGCCATGAGATT:1 + chr2R 20500171 3' - 412 7082 2 64.38 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCATTTGACAGGCGAGCATAAAACCTCAATTC:1 + chrX 10538267 3' + pogo 2080 1 69.86 CTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCAGTGTTTGCATACAGTTATAGTTGGCTAAGCTGCTGGCTGCGGAACCA:1 - chr2R 19903970 3' - Doc 4427 1 71.92 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTTATCCACATTAAGCACGACTAA:2 - chr3R 16041092 3' - jockey 56 1 53.42 AAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAA:2 - chr2R 20362211 3' + diver 153 2 65.07 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCAC:2 - chrX 15089493 3' + P-element 2825 1 43.15 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACTTAACAACACTTTGCTGACTAAATTGTGTCAGTCTTATATTACCCTCAGCCAAATCGCA:1 - chr3L 8067503 3' - copia 4930 2 60.96 ATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAGCAGCTCATCATAAATATGA:1 + chr2R 5022802 3' + Gypsy12A_LTR 114 1 73.72 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCA:1 + chr3L 17447545 3' - Tirant 8175 2 67.81 GCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCT:1 - chr3L 19146621 3' - pogo 109 1 72.14 TATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGGGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGT:1 - chrX 13061735 3' - mdg3 91 2 75.34 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGAC:1 + chr2R 19543790 3' - jockey 4779 1 68.79 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATGATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCG:1 - chr3L 4023605 3' - pogo 48 1 52.74 GAAACCGGATCAAAATAATTCGCGACAAAAGAAAATAACGGTGAAATCGTTTTATATAAACATATAAACCAAAACAACAACATTGCCATAATGATTCCGATCTTGGACATTCCCGATGTCGCTCTAGTTCGTCTTTTTGGCTCTTG:1 - chr3R 19448140 3' + gypsy9 364 1 51.37 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCAGTCCTCGCCAAGCTTGGCCACAACAATTTTCTAATTAA:1 - chr3R 28008198 3' - hobo 22 1 70.55 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATTCATCTAAAGTCATGGGTAGACATAAAAAAAAAAGAAAATAAATATGCTTGAATGCA:1 - chrX 12843537 3' - roo 8677 2 73.97 CGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAATTTTATCCTTATGAAGTTTTG:1 + chr3R 20368064 3' - Max-element 8294 2 65.60 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACACTTTTCGAGACTTTCAATTATGATTTCCACAAAGAGAGAGTGAGAAAGAGCGTGGCCAATGGGTACATTATGTAGTC:1 + chr3R 21154344 3' - jockey 4717 1 52.74 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACC:1 + chr3L 21093207 3' - Ivk 99 1 75.86 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATCGACCCGACAAGTAATCCGGATCATGAATATATAAAATAAATGGTATCGGAAA:1 + chr3R 3322552 3' + 1360 3341 1 57.36 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGTTATAATTTTTTTATGCGCTCGCTTTTTT:1 - chr2R 17100063 3' + P-element 2821 1 41.38 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGATGAATGACAGTAG:1 - chrX 18366035 3' - jockey 89 1 71.92 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATGAGTGGTGTGAAGTGCCATCGAGTGAT:1 + chr2L 1449733 3' + opus 484 2 74.66 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTG:1 - chrX 4789110 3' - 297 53 2 59.59 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACCTCCACTTTATATC:1 + chr3R 23426497 3' - pogo 40 1 58.22 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTGATTCAATTTGCTATCGCTGACAACTTCAGATCAGATAA:1 - chr3R 8130067 3' - Burdock 74 2 72.73 TGTCAAATCTGTGCAAACTCGGATTTAGTTGTTTTTCTCGTTCATTGTTAGTAGTTTTGTTATTATTTTTATACATATTGATAAAAAACATATGAATAAGATTGGGCATCCGCAACACGACCGATCCGCTTGAGATTTTTGAACGA:1 - chr2L 10544886 3' + S2 1523 2 68.49 GTGAGGCAGGAGCCTGCGACCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAACAACAAGTGTGAGAGGCAGACGGCTTAAATATTTGACTTAAGTTAGATACTCCCAAAATTCTTG:1 + chr2L 9342900 3' + blood 407 1 68.75 ATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGATATCTGCAAAGCTACTAACAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTTTCCCCGTTCCAGTCCCAATTCCGTGTTGGACGACTCCAGAAATGTC:1 + chr3R 24147276 3' + hopper 358 1 63.70 CACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCCAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAATTCAATTGCTCAGATTTCGCTGGCCTTCAGTTGGAG:1 - chr3L 5228849 3' + Quasimodo 7113 2 73.97 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTATAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCAATTTCTTTCGTTTTGGCTAAATCA:1 + chrX 9710099 3' - pogo 34 1 60.96 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTT:2 - chrX 18125130 3' - BS 5070 1 68.49 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTG:1 + chr2L 535507 3' - roo 8727 2 63.01 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGA:1 + chr3R 10778763 3' + mdg3 201 2 54.79 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAAGAAGAGAGTTAAGAAGATTCAACGTCGCGTC:2 - chr3R 5086964 3' - P-element 16 1 73.97 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAG:2 + chr3R 13358702 3' - mdg3 50 2 52.05 TGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATTATATGTATATTAATGACCACGGCAT:1 + chr3L 19339475 3' - Tc1 25 1 71.23 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCG:1 - chr3R 10079309 3' - P-element 76 1 33.10 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCAAGTGTTAATGAGATTAGTTAC:1 - chr2L 18370285 3' - Doc 17 1 77.40 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCCCGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCAATCTAGCCAAGCGGTAAATTCATCATATAATCGAGAATAAT:1 - chr3R 10288746 3' + copia 247 1 78.08 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATGAGGACA:1 + chr3L 6751751 3' + pogo 2035 1 64.83 AGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATACAGCCGAAACGAACCAAATCACACGCTCAACGTCAGAGC:1 - chr2R 21504123 3' - Doc 251 1 72.60 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAAACAATAAGATCCTTTGTTGGC:1 - chr3L 5438728 3' + hopper 1357 1 56.16 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATCTCAGATCTACAAAGCGTTAC:1 + chr3R 22289518 3' - 412 7070 2 73.97 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGTA:1 - chr3L 18835263 3' + pogo 2063 1 60.96 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGATTTATATATA:1 + chr3R 18903490 3' - pogo 65 1 67.81 ATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAACAAGATTGATTTTTTCTTAATTTATTTTCCATTTTAAATACATTTTT:2 + chr3L 21171553 3' - F-element 92 1 71.92 GTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAAATTTTT:1 - chr3R 6368600 3' - Idefix 68 2 67.81 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTATTACCCATGACAAAATCCAATTGAAAGTC:2 - chr3R 7569533 3' - Doc 4 1 58.90 AAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAATGAAAAGCGAAACCCCAAGCGGATTGACATCGAGCGGGGGATCAAATTGTTCGGGGGAATCGGGTC:1 + chr3L 13225737 3' + invader4 2613 1 54.79 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGATAGTCATCAGATAGAATCGATCGCGAATTGTT:1 + chr3L 13313217 3' - roo 87 2 77.40 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTG:1 + chr3L 16180963 3' - Transpac 51 2 63.11 ACTCCGCTATTGATCCTGATCAAGAATAAGCCTTATAAGGATCCTCTATATCTATCCATTTTTGAGATGAAATGAAATCTTAGTGCAACCTTCACGAGTGAAAAATGAGAGCGACTTGAAAATTTAATATCACTCAAGTAGCTG:1 - chr2L 12285866 3' - INE-1 91 1 80.56 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGCGTTATGCTAATGGCCAAGCTC:1 + chr3R 26399938 3' - roo 8676 2 77.40 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGA:1 - chr3L 4023601 3' - pogo 44 1 55.48 CGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATGTCTTATTACTAATTCTGATAATAATAAAAAATACAAAAACTATTAAATAAAATGGGATTTGCCTAGACAATGCCCGAGCTCAGGTGAACCGTATAAGCACGCTCGTCATTAAA:1 + chr2R 20015222 3' - X-element 12 1 56.85 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGACATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGTTGATGGCAAGTTATGGC:1 + chr2R 7223791 3' + blood 352 2 67.81 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTGAAGTGAAGAAAAATTGCAGTCAATATGTATTTG:1 - chr2L 17840977 3' - Juan 4041 1 70.34 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTC:1 + chr2R 9164940 3' - 412 58 2 55.48 AAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTCTAGCACAAATCAAGTCTCTGACAGCAACAAAACTCAACCCTTTCACAAACCACCTCCAATTGTGGTCAAAAATTGTGAATCTCTGAACGGACTTTTCAGACTCAT:1 - chr2R 5640919 3' + 1360 2 2 75.34 ATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGATTAAAAAATATAAAGATTTTAATTGGTCTCCATAACATTGCTGCCATTTTAAAATTAAA:1 + chr3L 19295579 3' - P-element 2786 1 38.36 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAG:1 - chr2R 16908487 3' + roo 342 2 62.33 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGA:1 - chr3L 16157175 3' - Juan 42 1 55.48 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAG:1 + chr3L 14581512 3' - pogo 27 1 66.43 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCTGTACCCGCGTC:1 - chr3L 18708550 3' - F-element 22 1 77.93 CCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAATCCCAGGATCTTCAGCAAAACAGGCGGCATGGGGATATTGTGGGGCATGGC:1 - chr3R 28656733 3' + roo 259 2 65.07 CACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCA:1 - chr2L 5771434 3' - Juan 84 1 73.10 GTGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTTGAGCTTTCA:1 + chr3R 13358679 3' - mdg3 73 2 63.70 AATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGATTGTATTTTGCGGCGTTT:3 + chr2L 8393084 3' - I-element 5158 1 57.53 GATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCTGTTGCCTTGGCCACAAATTCAATTACCAACCCGACCATCCATAAAAACAAGGCAACACAAAAAATTATCAAGAAT:1 - chr3L 16469438 3' - jockey 85 1 52.05 AATAATAAAAAAAAAATAAAAAATGTGGCGAAAACTGCACAAACTTCGCTTCAAGTTGGCCAGAAGAGCAGCCATTGGGTGGTGCGGGTGGTTTGTTTATAGTCAACGCATTCGAGGCGTGCTCGTTAAGAGGGCTCCCTCCATGA:1 + chr3L 15763907 3' + Rt1b 5149 3 61.64 CAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCTTCCATACTCCACACACATCACACCAGAAAATAGCCAATTGGGCAAC:1 + chr3R 18847424 3' + Stalker2 384 2 67.81 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATG:2 - chr2R 18123401 3' - 412 42 2 51.37 TGCACACACACACACACACACAGACACGTGTGGCCACTTACATAAGGACGAGAGGGTGTATGTGTGGATAACAACAGTGGAAAATCACTTCAGTTAACTAAATCCCCGCAGCAACCATGCGCCGACTGCGCCGCAGCAGCACGACT:1 - chr2R 22860392 3' + accord 7028 2 50.00 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCATTCGGTGTTTTGGACTCGGCGAGACTGGAAGTTGATGCTGCCGCGTGAATGCCATCGTCGGTCAGGTATTAAAACGTGA:1 - chr2L 10474268 3' + P-element 2868 1 72.22 CTTGATCAGGATCAATATCCCAGGAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCAAGCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCT:1 - chr3R 12170081 3' + INE-1 89 1 56.16 CCTACGTACTAAAACAAAGACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTACACTCCTCAATTGAGAGTGTAAGAGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 11083444 3' - Rt1b 5036 1 51.76 AAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACCATACGCCCGACACCATACGAATGTCGTCTCTCATTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGACTGGGAGAATGTGTGTCCGCCTGTCTGTGTTTGTATGTTTAAAA:1 + chr2L 4110072 3' - Rt1a 12 1 61.64 GTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCACACTGCCAAAATTCTGCGCTGACAGCGCTGGACAAGGATATATTCCAGAATGTGGTAAGCAGGGTGGGAATTATGGAAACTATGAGAATTCATTGCCTGGCTTACGAAATTAATCAAATT:1 - chr2R 9900710 3' + invader4 469 1 58.90 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCAC:1 - chrX 22858864 3' - mdg3 5327 2 67.81 CGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATT:1 - chr3L 23146502 3' - 1360 92 1 80.82 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGGTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGATGTTACTGCATTTAAATTTGCATACAAATTATTGTAGCATTCTTCATAGCATTAGTTTAAAATT:1 - chrX 14908369 3' + blood 7335 1 53.15 TATTGCAAACATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCAGAC:1 - chr2L 13546948 3' + P-element 2843 1 57.53 AAGACTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATTCACTTGCCAAAGACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATA:1 - chr3R 6103566 3' + Tirant 390 2 66.99 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATGTAATAAATTATTGGTTTCAGATGAAAGTTAGT:1 + chrX 11228660 3' - roo 56 2 56.85 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTT:1 - chr3R 19700869 3' + roo 349 2 64.38 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTCGCCATATCATTGCCTGTGCTGATTAGTTAC:1 + chr3R 11461904 3' + 17.6 7393 2 68.28 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACATAAAAATGCCAACATTTGAAGCATAACATTTGGGGCAGAGGAG:1 + chr2R 22867501 3' - hobo 67 1 67.14 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCC:1 - chr3R 23099071 3' + roo 9022 2 54.79 ACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAATTCTTACCAGCATGTATGTGTTTTTTCTGACGCGCCCGCGAGTTCTGGAACCATACTTGCGTCACACGCTTGC:1 - chr3L 3860346 3' - jockey 4959 1 53.42 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAGGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGACTGTACGGATCCCCGTAGAGCTCCTGGCACATCGTGT:1 - chr2L 16371533 3' - jockey 4795 1 71.23 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGTCATGGGTTTGTATCAACACTACATTTACATAATAATGTTTACCTATTTT:1 - chr2L 18581231 3' - roo 8686 2 69.18 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAATATCGATTCGCAATGGAATCAGACATTAAAACTGACACACAGTATATAATATGTTGTACAAATGTACATATGTATATATATATGGCCGGTAGGTATTAACTGAACTATGACGCC:1 + chr3L 16157334 3' + Juan 4204 1 75.34 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGTCATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAAGA:1 - chr3R 5086993 3' - P-element 15 1 66.38 CATAGCAACAAAGCGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAAC:1 + chr3R 7424641 3' - 412 57 2 55.48 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTCCAGGTTGT:1 + chrX 15167798 3' + roo 388 2 71.23 TTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGTTCTGAAAGTTTAATTCTTAAATAAACTCACCCAGTCGGACCATCAG:1 - chr2L 19371290 3' - Bari1 74 1 67.12 AAACAAAAATAAAACAAAGTTTATAAGCATATTTGAGCCAGTTCAGAAGCTAAGTAAGTTTCAAATTGGTAAACAAGGTTAACGTATTGTTCTACGACTGTCATGTTCTCTATATTGTTCAGTGTGCGAGGACGACTCCATTGACG:1 + chr3R 20299703 3' - frogger 2177 1 75.34 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGC:1 + chr3L 16973482 3' + S-element 1673 1 56.85 GCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGATCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTCCTCTGTGTTTCCTATTTTTCTACTTTTCCATGTGCTTGTTTCATCAACAGAT:1 - chr2R 8398158 3' - Doc 291 1 63.70 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGT:1 - chr3L 16764827 3' - I-element 86 1 71.92 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTGCAA:1 - chr3R 5765306 3' + opus 483 2 70.97 GTAGGGATTAATGGATAACTACTGCATCTGTTAATTTACGTTTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAAATAAGAAGAGAGAGAAAAAAAATATATATATGTA:1 - chrX 13958420 3' + G4 3760 1 80.00 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTTTATGC:1 + chr3L 13722147 3' - blood 7044 2 63.70 ACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACTATAGCCAAACAACGGATACTGTTTTTTTTATATTCCTTTATT:1 + chr2L 22260866 3' + G6 1752 1 79.45 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGTCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAACTTTCATCACAATT:1 + chr3R 25354568 3' - 297 6631 2 63.36 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTG:1 - chr2R 18123385 3' - 412 26 2 62.33 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGG:1 + chr3L 15371362 3' + Transpac 243 2 77.24 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGA:1 - chr3L 19279128 3' + opus 424 2 71.03 TAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGGATTGCGGTGGCA:1 - chrX 22858802 3' - mdg3 5263 1 77.78 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTG:1 - chrX 15089474 3' + P-element 2844 1 56.16 ATGCAACTAAGTGTTACTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATT:1 - chr2R 7404655 3' - blood 43 2 52.74 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGA:1 + chr3R 22429256 3' - roo 8704 2 58.22 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACT:1 + chr2L 19417104 3' - BS 5027 1 62.33 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTAATGAATATGCCTCCCTGAAAACCCATTTTCAAGACTTAATGCTCCTG:1 - chr3R 21924212 3' - roo 8684 2 70.55 TATTCTTTTCCCTTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCAACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAATAAATGCGTTACATTTCAATACGTTTGCCACAATCCCTTCGTT:1 - chrX 7480718 3' - Bica 342 2 72.60 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATTTGTCTGCAAGCGGTGTGAATATACAAGCGGTATTTCATACAAACAGTATAGGCATAC:1 - chr3R 3257454 3' - Burdock 58 2 59.59 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCG:1 - chrX 10978973 3' - roo 54 2 57.53 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTG:1 - chr3L 4869150 3' + roo 9033 1 52.38 GGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAGCAGCTCATCATAAATATGACTTATTT:1 + chr2R 5022809 3' + Gypsy12A_LTR 112 1 73.29 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGC:1 + chr3L 16887434 3' + roo 9043 1 64.03 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACT:1 - chr3L 3540088 3' + mdg3 5468 2 65.07 GTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGT:1 + chrX 21907812 3' - accord 7268 2 65.94 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATTACCATACACATTTTT:1 + chr3R 9938717 3' + roo 9034 1 58.90 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAATATCGGCTAGTTGTT:1 - chr3R 4884365 3' + pogo 2052 1 54.79 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAAAACAAACAATCGTATGTTTCCCAGTTGCAGGGTATTTAAGAAAAGACGAATACAATACAAAGACAACTAGAAAAGACATAGAGCTATGGTATTTGATCTCGCCACAA:1 + chr2L 16596340 3' - 412 12 2 74.66 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATT:1 - chr3L 9430606 3' + P-element 2786 1 19.18 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATGTAATAAATTAT:1 + chrX 11228639 3' - roo 77 2 71.23 ATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAGGGAATTGTTTAAATTAGGGGATAATTTAATAACAGGCAGAACCACTAGCTCGTGGATGAATG:1 + chr2R 10119335 3' - Idefix 7100 2 71.92 AATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAAT:1 + chr2R 1277147 3' - Tirant 8175 2 64.38 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGT:2 + chrX 11534518 3' - roo 8743 2 73.29 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCG:1 - chr3R 10142933 3' - 412 63 2 59.59 CCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGGAAAACT:1 - chr2L 17198032 3' - R1A1-element 5045 1 54.79 ACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCGCCCTCGATGCGAACCGGAGTCAGCTGGTCCTTGTTGTATTGGGCGAAGGCGTGGCTAGCCCCATCCTTTAGCAG:1 - chr2R 21058148 3' + Tirant 328 2 53.10 ATTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGA:1 + chr3R 29350794 3' - 297 6642 2 66.44 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATCAATTCCGATGGTCTATCCAGCTC:1 + chr3R 15649914 3' - blood 14 2 76.03 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAAATCTTTGTTTAAAGACACATGCACAATGTA:1 - chr3R 11553626 3' + hopper2 1564 1 56.16 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAAGAAAACAGGCAAGCACTTAACAATTAACCGATCGTTCCTGTAATTACCGAAAGCCCTAAATAAAGCCCCAATAAAA:1 - chrX 13651435 3' + 297 6939 2 60.27 CGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAA:1 - chr2R 19076493 3' - F-element 192 1 63.01 GCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCACATAGACGAC:1 - chr3R 18346610 3' + INE-1 538 1 47.26 CTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 8185457 3' - accord 187 2 73.58 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAG:1 - chrX 7467953 3' + hopper2 1526 1 72.41 TTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTG:1 - chr2L 20638353 3' - Doc 68 1 60.69 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTTTTATCATCTGAGTGACTTTTAAAACAAGCATTATTATTAATAATATGTATATATGTAGATCACAAGTATATGCAATATTT:1 - chr3L 26371385 3' + S-element 1677 1 58.90 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCGTTTGCT:1 + chr2L 2357358 3' - P-element 80 1 31.51 TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGA:1 - chr3L 11669799 3' + Tabor 7244 2 73.79 GCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACC:1 + chr3R 6103649 3' - Tirant 8198 2 76.03 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTAAACATTAAATGCTAAGTACTTTTTTATGTTTTTGAATGGAT:1 - chr3L 13313158 3' + roo 8995 2 73.97 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTTATTCTTA:1 + chr2R 18048911 3' - opus 55 4 63.01 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAG:1 + chr3R 8402642 3' + mdg1 7399 2 57.53 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTCAGTTCAGCTCTGCCAGCTTACAGATT:1 - chr2R 22255281 3' + roo 389 2 73.29 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTT:1 + chr2L 15965304 3' - blood 65 2 60.27 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGT:1 + chrX 10960281 3' + Transpac 232 2 72.60 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACAATACCCAAAAATTTTGAATAAACGTGGGCGGTAAAGAGCGCGTGCTCC:1 - chr2L 3006207 3' + pogo 2071 1 57.41 CGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGAAAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGTCTATGCCATAAATTCAATATATAT:1 + chr2L 12210746 3' - blood 331 2 80.14 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAGGAGTTCCGAAATATTCCTCTCGTTGTGGCAATTCAATTGCTGCCCAAACA:1 + chrX 9816527 3' - jockey 17 1 79.45 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCT:1 - chr3R 25876853 3' - mdg3 53 2 53.42 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTCGATGGATGGCAAGACCAGAACTGATTGGGATAATAGATCGCCTTCCTTTTTATATCAATACAACTGAAAGATAACTCACGTATATGAATATAATTGTTTGCTCGACGT:1 - chr3R 12375634 3' + copia 244 1 77.40 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAA:1 - chr3R 22846708 3' - 412 66 2 62.33 GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATG:1 - chrX 18913277 3' - Quasimodo 67 2 76.03 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCC:1 + chr2R 8686640 3' - hobo 74 1 73.97 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAACCACTGCGGCTCAGTTCTTGC:1 - chr2R 20704102 3' + hobo 2931 1 76.80 AAAGGGGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATG:1 + chr3L 13597852 3' + blood 7334 1 54.11 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAAT:1 - chr2L 13877666 3' + Transpac 266 2 52.99 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAG:1 - chr3L 13722008 3' + blood 7338 1 58.22 TTATTATAAGTATTATTATTATTAGCACAGCAATTCAATGGCTTTTATGCATGCTAAACCAAGAAAAACAACTGGGAAAATTGTTAAAATTAAATTGAAACGAACCCGGGCCCACGGACGGCGGCTCCGCTTGTTGGTGATGCGGC:1 + chr2L 9430716 3' - mdg1 7079 2 63.01 ATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGA:1 - chr2L 20638346 3' - Doc 62 1 56.16 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTTGTGGGGCAAAAACGTAACAAAGTAGCTGGAAAATTCAGAAGAGAAATTCCCCCCATCCAAGG:1 - chr3R 18846453 3' - roo 15 2 76.03 GTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 182 2 65.38 AAGAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGCAGCCAAAGCACGACTGAATATCAATTAGCGGGCCATTAAATGTGCTAATGGTTTATTACCACTAAATGTTTGATTAAAAAATCTAACATTTTGTATGAAAGATTTTATACCTTGAAATA:1 + chr3L 3544392 3' + Doc2-element 220 1 80.00 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGATTTAACACTTGACCAA:1 - chr2R 5992264 3' + pogo 2069 1 63.45 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCA:1 - chr2L 7459517 3' - BS 5022 1 65.07 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATAACCCGTTTCAACC:1 + chr3L 21387539 3' - pogo 48 1 56.85 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCT:2 + chrX 21213413 3' - Doc 42 1 54.11 AATCCATTATGCTTTCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGTCTGCTATCATCTCATTCGTAGAAGTGTACTCTAACACAACGTGATAACTCACGTTCGGTTTACTTTTACCGCCTGCTTTAT:1 + chr2L 2507617 3' - 1731 4235 1 70.16 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTGAAATAAGCAATAATTCTTAGCAGTATTCTAACTCATTCGAAGGTAGCAG:1 - chr2R 9815022 3' + pogo 2037 1 65.07 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATGTGTTTGGATGCCTATCGGCTGGGCGGAGTTTTCTTTTC:1 - chr2R 23312968 3' + Tabor 446 2 52.41 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAAAGGCCAAAAGGACGGGGCGTGGCTGCT:1 - chr2R 14553220 3' + mdg3 5451 2 51.39 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGT:1 + chr3L 20076831 3' + roo 315 2 84.25 AGAGTAAACAAAACAAAAAGAAGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAAACACAAAGAAAGTTCATTGAATCCCATAATATTTTGCCATGTGAACAATTTGGTTTTCGTAGAGAGCACAACATAGTG:1 - chrX 22928012 3' - Cr1a 202 1 53.42 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGTTGTGTGTG:1 - chr3R 18903349 3' + pogo 2082 1 72.60 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATATTAGAACTTAGTGTACTAATTTTATCAGGAAGAATAAATGGGTGCTTAG:1 - chr3R 7649781 3' + Quasimodo 7300 2 66.44 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCC:1 - chr3L 9430580 3' + P-element 2814 1 37.50 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAG:1 + chr3L 14969271 3' - P-element 92 1 19.86 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGC:1 + chr3R 9163947 3' - hobo 62 1 63.01 ACTGTATGTGTGCACACGTATGCTTATGCATTGTAAATTTGACTAAATATGGCCTTTATCTTAGAAATTCTTAGGCTTTAATCCAGCTGATGGCCTTCAAACAGGAACGTAAGACCTTTGGTCGCAACCCCGAGTGCCCTACG:1 - chr2R 24899725 3' + 1360 173 1 56.64 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAAC:1 - chr2R 18807728 3' - jockey 32 1 68.49 AAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGCATATAACTAAGTTAGAACGTTTTAAAATTGTTTCTTATTTTATTCCTCAATATTTGTCGATACATCAGAAAAATGATGAAATATAACACTAGCTGGGTAACGGGTATCTGATAGTCGGG:1 + chrX 15903346 3' + Tc3 1651 1 71.23 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCACAGTCCACGGCCTAGCGT:1 - chr3L 22518966 3' + pogo 2060 1 57.53 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTGGCAAGGGCATGAAAACAACTG:1 - chr3R 11549785 3' - 297 41 2 58.90 TAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTAATTTCGGGAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTATTTACTAAAAGCAAATGACGAAAGGTATAGAAGC:1 - chr2L 22986747 3' + Max-element 8447 2 76.71 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATTGAC:1 - chr3R 25876830 3' - mdg3 5282 2 66.44 TCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGATGTCCGAAGGACAGCATCGCAATGCGGCAGTCGCTCGG:1 + chr2L 20561518 3' - P-element 28 1 62.24 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCA:1 - chrX 15089488 3' + P-element 2830 1 46.58 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTACTTAACTGCCATCAAAGTTCTTTGCAGGACTTTGTCAC:1 + chr3L 20925834 3' + Transpac 5151 2 71.92 CATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTTTTACTGTTGCCGGCTAACGTTCGAAAATCGGAGGAT:1 - chr2R 16594450 3' + Quasimodo 6 2 74.48 TTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAATTAGTGTAGATGACATCTGTTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAACAGATAAACGGCTAACAGTTGTTTAATAGTTTTCTTTGACTTTTGAGCATT:1 - chr2R 18946968 3' - Q-element 337 2 65.07 AGGGCATCCTGATGACTCTTCGACACATACAAATAAATACAATAAAGCATGCAGACTTTAGTACTCTGTTCACTCTCTTTTTTATCTTGTTCCGACCAAATTGTTGAATGAACCAAGACAGCTAACAACAATTCGTCAGGATTAGC:1 + chr3R 14483000 3' + invader1 4008 2 57.53 GCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAATGACCAAATGTCGTTTACTGTAAGTATTATCCGAG:1 - chr2R 22506594 3' - F-element 131 1 76.03 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATT:2 - chr3L 23146480 3' - 1360 70 1 65.75 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTTCAAAGTTAACAAACAATTTTCTTAAGTAG:1 + chr2R 20362341 3' - diver 21 2 71.23 ATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTTCTTCTTTCGCTCTTCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGATTATCCTCGTAGCCCTGTCATCCTTGAGAAGAC:1 - chrX 3013034 3' + Cr1a 275 1 77.40 CCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTT:1 + chr2L 11867365 3' + BS 4960 1 63.70 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGC:1 + chr3R 21237817 3' - Doc 64 1 56.85 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGACGTCCCATATAGAAATTATCCCCGCAATAAACGTAGACCAAGGACCTCTTCCACACACCTACAAGAACCCGCAAACC:1 + chr3R 14874253 3' + flea 224 2 62.32 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATGCTTTCTTGATATCAAATAAGTGTCTAGAAATGTCT:1 - chr2R 7404620 3' - blood 7019 2 73.97 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATTTACAGCTTGCCACTTCTCCTCCAG:1 + chrX 17081546 3' - blood 7068 2 57.53 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGG:1 + chr3R 5245644 3' + 1360 3322 1 71.88 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCAAATAACTCGTTCTTGA:1 + chr2L 17162892 3' + blood 7356 2 60.96 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCA:3 - chr3L 2037007 3' - Doc 69 1 64.38 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAA:1 + chr3L 3540224 3' - mdg3 43 2 53.42 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGGACGTTGAGAAGTTTTTGATTTAAATAGTTTGGCCTGGCATTTTACTGCTT:1 - chr3L 14921335 3' - pogo 15 1 73.97 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATG:2 - chr3R 8367119 3' - Doc 31 1 58.22 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGCGTTATGCTAATG:1 + chr3R 26399929 3' - roo 8685 2 71.23 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACA:1 + chr3R 21237820 3' - Doc 61 1 54.79 CAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTT:1 + chr3L 17667604 3' - F-element 95 1 75.17 GCTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGCTTTGGATACCC:1 - chr2L 1073870 3' - Tirant 11 2 77.61 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCG:1 + chr2R 9164912 3' - 412 86 2 74.66 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAAAAG:2 - chr3R 7739655 3' - blood 40 2 58.22 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTGT:1 - chrX 21639577 3' + Tirant 8485 2 71.23 GTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATA:1 - chr2R 19076520 3' - F-element 219 1 52.74 TCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACTCATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACATAACCAAAAAACAAAAAACAATAAGGAAAAA:1 + chrX 7372794 3' + R1A1-element 5214 1 77.40 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAA:1 - chr3R 10468004 3' + opus 7436 2 60.96 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCATTATAATCC:1 - chrX 10978946 3' - roo 27 2 65.75 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCACTCAAGCACATAA:1 + chr3R 4659625 3' + P-element 2844 1 51.49 GTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAAT:1 + chr2L 6074056 3' - BS 78 1 76.71 CAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGC:1 + chr2L 20841967 3' + G6 1949 1 67.14 ATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTTTGTGTGCTGCGACAGGAAGGCGAGTAAGGGAATGACCTGCAGTATGCGTAATTAACCTTTGACACGAACGGGTTAGGCCGCCCAGCTC:1 - chr2L 12968463 3' - accord 7070 2 71.74 AAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGC:1 - chr3R 3527086 3' - Tabor 76 2 67.12 GAATTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAA:1 - chr2L 13877667 3' + Transpac 5172 2 56.16 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGG:1 + chr3L 16887426 3' + roo 9028 1 55.48 TTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTGCTGCTGTTGATATTTCCCCCATTTGTTGTTGGTTTTTGAAATCGACTTTCATGTCAATTGACTTGCGTACATCTGCCTG:1 - chr3R 13134353 3' - rover 7013 2 55.86 TCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGCTTAGCAGCCACGTTCCGAGTAATCCGCGTGCCAGCCGGGG:1 - chr2L 9356760 3' + Stalker4 399 1 81.12 AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGAC:1 - chr2R 8793897 3' - Transpac 4986 2 68.12 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGA:2 - chr3L 21097134 3' - mdg3 80 2 70.55 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACAATCAGAGCTGCTGA:2 + chr3L 16181019 3' - Transpac 4938 2 72.60 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAACGCAAAAGTCCAAGAAGTTCCTGATTTTCTATCGTGGTGCGTAGCAAGCAAAG:1 - chr3R 7793631 3' + mdg1 378 2 63.70 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCACAGTCTTTGCAT:1 - chr2R 19168065 3' - opus 7164 4 57.53 GCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAATTACTTTTTTTATTCATTGAAGTTATATTGATTTTCTTAAAACTTCTTTAAACTTGCACT:1 + chrX 19029354 3' + P-element 318 1 41.10 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAA:1 - chr3L 15035100 3' + pogo 2055 1 55.48 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCTTCTAATTTAAGAAGGGTAATGATGGAGTGTATTTTCTCAGT:1 - chr3R 12787072 3' - 297 6592 2 74.66 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTACTGTCAGCGAAGACAAATGGGATTTGTCAGCGAAGG:1 - chr3L 5514134 3' - Doc 15 1 75.54 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACTGCCATTGTATTTGTT:1 + chr2L 8103643 3' - pogo 31 1 63.01 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGAAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCCGTTCTCTGGGGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAG:1 - chr3R 5940477 3' + hobo 2867 1 75.21 CCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGCGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTT:1 + chr2R 20382585 3' - Bari1 60 1 59.57 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCACAGTCCACGGCCTAGCGTCCAAATCTAAC:1 - chr3L 22518955 3' + pogo 2071 1 63.70 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCACCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTG:1 + chr3R 31907428 3' + Tirant 8437 2 64.58 GGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAAC:3 + chrX 21667930 3' - gypsy2 76 2 69.86 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGTGCTATATGGAAAGAGAGAGAAACGGTG:1 + chr2R 17100166 3' - P-element 50 1 50.00 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCAT:1 + chr3R 9938707 3' + roo 360 2 53.42 TCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCAAACCGG:1 + chr3L 9426757 3' - P-element 65 1 36.50 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAA:1 + chr3R 15030752 3' - jockey 85 1 69.18 TGATAAATAAACATGGTCGTCCATATTCGCGCACGAAAGTCAGAGCATCCTGTAAATATTCTTGCATATGACGTGGACTGCCAAATTCAATTAAATCTGATGTTGGGAAAATACAAACACATAGTGGCT:1 + chr2R 11059852 3' - Helitron 160 1 63.57 TGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCTTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTATTTTCGGTGGTTTTTCAATCCAATTTAAACTTTATGTGTACACCGAACACAATAACATTGTTAAAAACTTTTCTCCGCAAGGCAAAA:1 - chr3R 8790091 3' + roo 8815 2 60.27 TAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATT:1 + chr2L 6074101 3' - BS 44 1 54.11 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGTTGATGGC:1 + chr2R 7223781 3' + blood 344 2 61.81 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGG:1 + chr3L 3540197 3' - mdg3 5322 2 71.92 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGCTGTGAAAAAGTCCACAAAAGAATCTGAAAACAAAATGTTGACAAAAAG:1 - chr3L 22635634 3' - hopper 20 1 70.14 GAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTG:2 - chr3L 25232691 3' + accord2 204 1 80.82 AACACATTTATCAAAAGTGAGGGCGCGACAGTTTTACGCGGAAGTCGGAGTGGGCTTAGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCCTTGTCTTTCTTTTACTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGAC:1 + chr3R 4487816 3' - INE-1 258 1 70.68 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTTTC:1 - chr2R 18123381 3' - 412 22 2 65.07 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATA:1 + chrX 14173289 3' + 412 7468 2 71.23 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACTTACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGAAATCCCTTGAGGTTTGTGAGCA:1 - chr3R 29708915 3' - blood 7022 2 71.72 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTTAAGGGTGGTTAAT:1 - chrX 19231703 3' + mdg3 221 2 68.49 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTAT:1 - chr3R 5245597 3' - 1360 89 1 80.14 GGTATCTGATAGTCGGGGAAATCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTATAGCCGTTACTCGTAGAGTAATATGGTATACTAGAAAAGTAAGGAATAAGTCCGACAATTTAGAGCTGGACTTACTAAGTGCTCCACAATTTTACGAAAA:1 - chr3L 26695854 3' + INE-1 557 1 60.96 CACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATATATTTAAAACTAAACAACATTATCATGATCAACATCAACTGTAGCGTTCCGA:1 - chr3R 9449078 3' + 412 167 2 64.38 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACCAGAGTAAATTTACAACGAAAAGTATCAGCCCGATCATTTAGAACGAGCTTGAACATGTTGGGAATCAT:1 - chr2L 13244786 3' + hobo 2888 1 54.17 CGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCGGCTAAAAGTAAGCTT:2 - chr3L 22980569 3' + INE-1 579 1 58.90 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGAGCAACAGGCGACAAACAGCGCTGAGGGGAATGCCATAAAAGTTAATTGCCTCAGTAGCCCCAAAAAGACAAAAGCTCTCCGGCAT:1 + chr2R 19985817 3' - copia 4905 2 61.64 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCG:1 + chr2R 22255432 3' - roo 52 2 53.42 AAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGAC:1 - chr2L 5771426 3' - Juan 77 1 67.81 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGATTTCTCATTCGTGCGAGAGCAGAGCTGTGTT:1 - chr3L 20785443 3' + P-element 2834 1 49.32 AATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATG:1 + chr2L 4104072 3' - roo 87 2 76.71 GCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTTATCAAAAAACCTATTTACAAGGGTAAATATTTGTCATGTTCCTATATTAACAATCAAGATA:1 - chr2L 65091 3' + X-element 4474 1 69.86 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCGGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTATAACCGACATAAAAGCCGCTTTTATTGAGGTAAAATGTTGGACTACAAATTGAGCAGCTATCGGCTA:1 + chr2L 9010559 3' + 1360 3369 1 72.22 TAAATTTATAATAAATAATGATATTGCATTACAATAAAACGATAATGTTGCCTTTAATTGCAGTGAAGTTCAAAAGCTTTAAAAACCTTAATAAAATTTATTTTCAATATCCTGTTGCGGTGGACTTACATCGATGTTGACTCCGG:1 - chr2L 17158734 3' - INE-1 422 1 58.22 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATATTATTTCCGCACTATTCGGATTTTACTATTCCACATGAACTGG:2 + chr3R 21237870 3' - Doc 11 1 77.40 GCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACGCAAGGGTATAGACATATTTGGAATAATGGTGCAATGTTACGAGGTGCTCA:1 + chr2L 15139207 3' + BS 4784 1 65.07 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACA:1 - chr2L 18370352 3' - Doc 84 1 71.92 CGGTAAGCTTCGGCTTTCAACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAAGAAGAGAGTTAAGAAGATT:1 - chr3R 5086976 3' - P-element 27 1 66.21 TAAATTTAATTTGATTTAATTTCTCGAAATTAAAATATTTCTATCCCATTTCATCTGCGGTCTTCTTCTGCCTTCTTTTGCCTTCTCACTTTTTATACTTGTCTGCTGTTTTTTTCATATACATTAAGCGTTATATCCATATGTTT:1 - chr3L 16979549 3' - TAHRE 38 1 65.75 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGCTGCTAGTTTAACGCATCGCTGAATTCGAGTTTGTGGCCAAAGTCTTTCGTTTTCGTTCCCATTACTGACCTCGTGCT:1 - chrX 3452399 3' + Tirant 358 2 57.53 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACTCGCCATC:1 + chr3L 22221217 3' - 412 80 2 71.92 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAA:1 - chr3L 9242010 3' - roo 81 2 78.08 AAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAATTTTTTATAGATTTTTTTTCCATCGCACGCGTTCATTTTCATGACCTTTGTTACTGTG:1 + chr3R 8189039 3' - 297 6970 2 60.27 AGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGC:1 - chr2R 5848970 3' + mdg1 350 2 65.75 GTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGAGGGCGGACTGCTACTTGGCCGACAAGCGAGTGCAATGAAGTGAAAAACCTTATAAATAAGGAAAATTTCACCCAAATTAAAAGTGGACAAGCCAAGGG:1 + chr2R 6540708 3' - Max-element 151 2 71.92 ACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAGCTAGTAAGCATTTTATAATGTTATTT:1 - chr2R 13574709 3' - diver 5907 2 70.55 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCA:1 + chr3L 13722117 3' - blood 7072 2 60.42 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGAGCTTTAAAAA:1 + chrX 21213403 3' - Doc 21 1 58.26 AAGTAACGGGTATCTGATACTCGGAGAACTCGACTATTGAATTCTCTCTTCTTTTATATTATTTTTGTATTAATTATTCCCAATACAGATTTTTGTCTTTCGTCTATCATAGTATAAATAAGCAAAATAAACCAACACGGCTACTG:1 + chr3L 27859913 3' + INE-1 549 1 56.16 CGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAATACTATAGATGAGCCGGCGACTCTCGGATCCCGG:1 - chr3L 22273520 3' - roo 8904 2 72.13 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGTGGCCATTTATTTGCCTTGCTGCGCTTTTAAT:1 - chr3R 7424496 3' + 412 7525 2 70.55 ACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATAAAGGATGGACTAATCGACGATATTGGGATTTCTGAG:1 + chr2R 9238888 3' - G2 2986 1 74.66 AGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAGTCTATACCGTTTTTCTTTTAAACCCGTAGTATTAAGAATCTTAATTGCTGGGGATAGTTGATATTGTGGAATCATTTGATTGAG:1 + chr2L 10966467 3' + invader2 206 2 65.07 GAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCACAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATG:1 + chrX 7329300 3' + Bari1 1656 1 62.12 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGAAAAGCTTAATGGCTAATTGAGCTGCCAAGGGAGTGGGAAA:1 - chr2L 14969859 3' + Tirant 355 2 55.48 AAAATCGCATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGTATACTCTGTCATGGCTGCACAAGCATAGGAAAGAAATAACATAAGAATATGCAGAGGGGTCAACGCGAGAGATTTTTAACAATTCGCCATATGAACCACG:1 + chrX 21125149 3' - 1360 22 1 69.86 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGGAACGATAAAAAAAAAAGACAGCTGAGATGAAAAAGTGCTGCAAAATAAGCGTGGGCGATTCATTTT:1 + chrX 10119698 3' - FB 7 1 73.97 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATGAACTTTATCTTGA:1 + chr3L 5183831 3' + copia 229 1 66.44 TAATAAAAACCAAATAAAGATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCAAGCTAAGAGAGCTGTTTTCAGTATTTTA:1 + chr3R 6842690 3' + mdg1 354 2 52.74 GTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGATTTCTTAATTATTGAGTAGAAAAGGAACTCTTGAATAACATAGCATACTTTGTGGCGTCTTTTACTGCCGCACGTAAAATAGGAG:1 + chrX 6039659 3' - G5 4791 1 60.27 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCACCTGCTGAAT:1 - chrX 4789095 3' - 297 6618 2 60.69 CCAGCTTCGTTCATAACTGGTAATGCTCTGCTTAAAAATAATCATTCGAGTTTCTTTGAGAACATCGGCTACAAGCTTATATGACCATGAGAAGCGAGATTGGTGCGCTATCAGTGACAAAACTTGCTTCGACTGCATTCGCTGCA:1 - chr3L 17609734 3' - G7 331 1 29.45 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAAT:1 - chr3L 19279126 3' + opus 425 2 69.86 CTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCATATGACTCCATCTCCGCATCGCTTTCCCGAAAAACTGACGGTGG:1 - chr2R 20385625 3' - Bari1 1586 1 69.86 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATATATATATATAAATTCTGCTCATATATCCGTTTTTAATAAATTAGTTCGCAATTTACCACGCCTGACTGACTGCAA:1 - chr3R 22810665 3' + flea 4966 2 61.64 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGGGGCCAGAT:1 + chr3R 24175798 3' - Burdock 40 2 56.85 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACTGCCATTGTATTTGTTATCGTA:1 + chr2L 8103649 3' - pogo 25 1 67.12 CAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGT:1 + chr3L 23678156 3' - Osvaldo 31 1 73.04 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAG:1 + chr3L 14581494 3' - pogo 48 1 52.74 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTTTACTTTGCTTGGTTGAAAAAGGATAATCACACATATATAAA:1 - chr3L 4175203 3' + roo 400 1 76.71 AGGAGAGGTGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTTAGAAGCAAACTGCCAAGCCGCTTAGCATTTAGCCGATCGTGGTCTTCATCGCTGCTGCTTTTTGTTTAGCT:1 - chr3R 23493857 3' - Doc 425 1 50.68 ATAATTTCGTTTAACAAATTTAATAAAAAAAGGAAACATAAATGTACACACTTTTCGAGAAAATATTTTAAACTTTGAGTGTCATAATTGTAGGCAACAGGAAAAGTTTTCATGTTGGTCGGTTAGTGCTTTTTTTTTTGCCAAT:1 + chr3R 4546776 3' + jockey2 3393 1 51.72 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAATTAGTTTGTTT:1 + chr3R 15465609 3' + mdg3 216 2 64.38 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGAT:1 + chrX 19231819 3' - mdg3 82 2 73.29 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGG:2 + chrX 983203 3' - 412 80 2 71.23 AGATAAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAAATAAAAAAAACTAATTAAGAGACGTTTCTTATGGACAAAATAAGTACGCAGAAATTTGTCTGTTCAATATTCATTTTCACTGGTTT:1 + chr2L 22696481 3' + X-element 4670 1 51.37 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAATATATGCATATATATGAAGGAGCTGACTTCATTTTAATGTGTGTAATAAGAG:1 - chr3R 21518002 3' - 297 63 2 73.29 TATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTTTGAAGAAGGCGAGCGCGGGAGACACTATCATTGATTTCCAGGAGCATGCCAACTACCTTACT:1 - chr2L 9749236 3' + 1360 220 1 57.53 CACGCCCACACTTTTGAAAAGCGTGTTAATATTTTTCATACTTGCATTAGTCTGGTAAATTTCCATCAATTTGCAAAAAAAAAACTCTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAAATTGAAGGGTCAAGCTTGCATAGTAGTACA:1 + chr3L 18454953 3' + INE-1 253 1 76.71 TATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAG:1 + chr3R 4884458 3' - pogo 84 1 73.97 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTTCTCTTCAATTGTCGAATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCCGTGGAGAGGAACACTCTAATGAGTCTAAAATAATCTTTTGTAGTGCCCGGC:1 + chr2L 13244934 3' - hobo 19 1 72.60 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGT:1 - chr2L 13884580 3' - pogo 64 1 63.01 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCTTTTACCCACCAGTTCACCAGCTAACCACCCAAAACTACCCACTGCATTCCGGCCTTGCCAACAACTTTACTATG:1 + chrX 3524332 3' - roo 45 2 49.32 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTC:1 + chr3L 12863762 3' + Transpac 5163 2 73.13 GATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATATTTTTTACTCGGTTAAAATATATAGTACTATGAAGCAATAATTCTAGTTTTGTCAGTTAATCGAACT:1 - chr2L 11775514 3' - mdg3 114 2 54.11 ACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAATAAGAGGGCCAA:1 + chr3L 9198637 3' - F-element 8 1 62.07 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAA:1 + chr2R 6052688 3' + mdg1 361 2 55.86 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAAATTTAA:1 - chr2L 12481396 3' - pogo 31 1 61.38 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGTTGAACGCTCGGCTGTGCAAAAGTGCAGAA:1 - chr3R 4464125 3' + 1360 3372 1 69.17 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGCTGCTAGTTTAACGCATCGCTGAATTCGAGTTTGTGGCCAAAGTCTTTCGTTTTCGTTCCCATTACTGACCTCGTGCTGCATTTTCAGCTTTTCATCGGAAAATTCAAT:1 - chrX 3452368 3' + Tirant 8496 2 78.77 TAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTAACTCTTGTTTCCCCCATTAATAATTCCCCCGGCCCATGGTGAAACCTGTAAAGGATCAGGCAGCCCTCGAAGGCCCAGCTC:1 + chr2R 14788911 3' + roo 480 1 54.79 ACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAAAACTTGGTAAAAGCTTTAAACTAGTCAAATAAGAGCGGAAAGAGGCAAAACCAACTCGAATTTGCTGTCAATTCTC:1 - chr2R 10364881 3' - Ivk 434 1 52.74 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGGCGTGGGGTTAAGTTTTGTTTAAGAGAC:1 + chr3L 5438869 3' - hopper 23 1 68.49 ACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTACAACTTTAGGCAAAAACATCGTATTCATGCGGACGTATTATGACTGGCACTGAACCAACAATTGAAATCCAAACGCAAAAGCAGCTGCGAAAGCGGAC:1 - chr2L 10485659 3' + P-element 371 1 70.55 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTTCGGATCGCCG:1 + chr3R 23507720 3' - 412 17 2 71.23 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAGATATATGTATATGCAGCTCTCACGCTTGACAGCACGCTAATCAGAATCAAGTGATGTTCGTTTTGCTGCACTCAGTTCTGGGACTTGGG:2 - chr3R 31071708 3' - opus 23 2 68.49 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAACGAG:1 - chrX 11228556 3' + roo 345 2 60.00 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTGGTCACTG:1 + chr2R 18051069 3' + mdg1 384 2 52.46 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGA:1 - chr3L 20747083 3' - Burdock 6187 2 55.48 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGAC:1 + chr3R 5087119 3' + P-element 2841 1 53.15 CGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAACATTTTGTTCTCTTTA:1 - chr2L 15153205 3' - G-element 13 1 69.86 TAGATTGTTCCAATATGCTACAGTATTCAAAACGTCTGATGAACGAGCTGCGACTTGATGGGTCTTCAGACATTTGCGGTACTTGGCGGATTTGCCGAAGTAATGAAAATAGTGGTGCTCTTGGACGTGGACGTGGACGTGG:1 - chrX 20741234 3' - Stalker 6850 4 73.24 GAGCGGCACAGAAATCGACTAGTTAAGGCACTGTCCAGAGCTCGCCCACCATACTTATGATATAAATTGCAGGAGGAAGTCTTTGAGTTTGTGAACAGAACGCTAAGCAATCCACCTGGACCGCGTATGCCCACATGTTTAATGCA:1 - chr2R 14150381 3' + BS3 1502 1 63.70 CCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGC:1 + chr3R 9163941 3' - hobo 68 1 67.12 GTCCGTCTGTCCGTATTAACGTCGAGATCTCAGGAACTAGAATGTTAAGATAAACCATACTGATTCTAGAGACATCACGCCCACACTTTTGAAAAATATTTTGATATTTTGTCATATTATATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 + chrX 4797163 3' + INE-1 125 1 59.59 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCTTCGATAAGA:1 + chr3L 19146689 3' + pogo 2042 1 57.53 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTATATTATATTTAATCTAGTTATGGTTTAAATACCAAGTCTTTCCAGACTGTCAAAAGTTTTTGGTAAGCTGAGCGGTAAGCCTTGCTA:1 + chr3L 15891114 3' + mdg3 5467 2 45.21 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTT:1 + chr3R 13358677 3' - mdg3 5327 2 65.75 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTTTGGGGGAAAACTT:1 - chr2R 16908439 3' + roo 391 2 72.60 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTGGCTTGTTA:1 + chr3L 17667646 3' - F-element 54 1 47.26 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGTAAAAAAAAAAATCTGGGTCTGCTGCATCAGCTGCTGCCTATGTGATTGAAGCTAAAAATTCGGCATTTTGGTTGT:1 + chr2R 16908600 3' - roo 44 2 54.79 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAA:1 + chr3L 23456280 3' + 1360 3339 1 55.86 GCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTACAAGCAGGGGCAACGTTGAAAAGGCGTCAAAGTCAGAGCGTTCGAATTTTTTACCTGTTACGTGGTCAGG:1 + chr2L 5410389 3' + roo 249 2 52.05 CCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGCCGTGTGCCAAAAAATCGTATGCATCTTGTTATTCAGTGTCTTTGTATGGACCAACACGTACAGTTGCGGTCAAAATAATAATTGTCAATTCTGGTCTCCTCCTCCCACTCCCCC:1 + chr3L 22851009 3' - G4 8 1 78.77 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTAATATTTTCTAATGTTCAA:1 + chrX 13651605 3' - 297 6603 2 69.18 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTC:1 - chr2L 21237230 3' - P-element 76 1 33.56 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGG:1 + chrX 11815088 3' + flea 4952 1 56.16 CGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACTATTAACCGTTTGCAGCCTGTTGGTCGGCTCATCTCATCGAGGTTCTGTAGGCGCCCCATCCCCCATCTTTCCCTCCGTACCATCGCATCATTATGTAATCAGTGGCTAT:1 - chr2R 7365499 3' + Chouto 5976 1 50.36 AAGTTATTTTCATGTGTTCTTGGTCTGTCTATATATTTTTAATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGACTAATTTGAACCAATTGTATCTCACGCGATTAAGATTGGATTGTTTCCCCAATTTGCCAAAGTGGAACCAT:1 + chr2L 6780453 3' - G4 3625 1 51.37 GTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATC:1 + chr2L 8393059 3' - I-element 5183 1 60.27 TAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCGTTTCGAAGCATATGGCAAGGACTTTGTCACTATTAAGGTGCCTTCTGGCCCTGGTTCGT:1 - chr3L 5878980 3' - roo 394 1 58.90 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCATTCTGCCGGTCGCCTACAGATGGCGCG:1 + chrX 22824875 3' - jockey 4681 1 74.48 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGGGAAAAAGAGACAGTCGCTCGACGTGGGAAAGAGAGGCAAGGAGACACCATTC:1 + chr3L 13204836 3' - jockey 32 1 68.49 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGT:2 - chr2R 9332116 3' + roo 9018 2 56.16 TGTCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAAT:1 - chr2L 14222270 3' - Transpac 5004 2 77.40 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAAAAATAAAAAACAAATTTGTGTGGC:1 - chrX 4858360 3' - BS 5075 1 68.49 CTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCCCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGTAATTCTTCTGTTTTCTGTTCGCGGGGCCAAGTCGAAAATGTTGCTTCATAGCCGGGACCATTAAATTTACAAGT:1 - chr2R 9381053 3' + Doc 362 1 51.37 GGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGT:1 - chr2L 15965219 3' + blood 7316 2 66.44 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAAAGAAGGCCCAGAAG:1 + chr3R 27835696 3' - 412 48 2 52.74 CAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAGTTTCAATTTTCTAGCTAGCTTAGGATCTTTGAAACTAAGTCATGAGAGCCTATTATTT:1 - chr3R 27519361 3' + X-element 4652 1 62.33 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTAGAGGGACTTTGAGATATATGAAAACAATGTATATTTATACAAACATTTTGGGAAGATTTTAAGCTAGTCAAGCAGTTAAGCTGGTCAACTATTAGAAC:1 - chr2R 6168207 3' - 1360 23 1 69.86 AGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCC:1 - chr2L 9356832 3' + Stalker4 7280 4 73.97 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTC:1 + chr3R 5087140 3' + P-element 2859 1 66.44 GAAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGATTGTTGGCTGCGCACGGGTTTCCCAATGCTTGTTCAACACTTTGATTTTATGTTTCATACACTGAGCCAACTTGTCTTGTTGCCAAAACGATCGTGCCTCGTTTG:1 + chr3L 23155357 3' - Gypsy6A_LTR 108 1 84.73 CATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAATTCGTGTTGATGG:1 - chr2R 2949007 3' + 17.6 7377 2 58.22 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAACTGGCAAATTTATTTTTAAATGAGTAATAAAAGCTTAAGGAGTTGGGGCTAAATAATGGAAGAAATTGTAAAAGATAATTACTAATTTGGTTATTATTTA:2 - chr2L 2464161 3' - pogo 18 1 77.40 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGCAATTAATTTCGCCTTGGGCCCG:1 - chr2R 11379697 3' - jockey 29 1 65.32 ATTTATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAAT:1 + chr3R 16799783 3' - X-element 4701 1 70.55 TCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTACCCCCACCTGAGTGAGTTTTCCGATAGGAAGGCATAACTGAGCCCACCTTC:1 + chrX 14136635 3' + roo 411 1 63.70 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAAAGAAG:1 + chr3R 27835687 3' - 412 57 2 54.11 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAAAGTTGCTA:1 - chrX 17614343 3' + roo 9044 1 66.44 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCA:1 - chr2R 14553213 3' + mdg3 204 2 54.79 TATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAG:1 - chr2R 21897864 3' + 412 7498 2 50.00 ATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTGCACTTTATTTTTTCCACTGTGCCTAGGCCGAGCCCTCTAAAAAAAAATTTTCCATTG:1 - chr2R 11655965 3' + HMS-Beagle 230 2 74.66 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTCGTGGATCGAGGTTG:1 - chr3R 25271129 3' - 412 17 2 74.66 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCCCAGCACACACGCACACGCATACACACCCACACACACACACACCACC:1 + chr3R 6525683 3' - hobo 13 1 70.49 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCATGAAAAACTGC:1 + chr2L 17069627 3' + 412 414 2 73.29 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTACACTTTAAAAATGGAACTGGTTCAACTT:3 - chr2R 15079970 3' - roo 8685 2 69.86 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCCG:1 + chr3R 25443148 3' - 297 6628 2 56.85 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGG:1 - chr3L 9241987 3' - roo 57 2 62.07 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTA:1 - chrX 14385155 3' - blood 65 2 60.27 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGTGAATCTGCCGCTGCTGAAAAGGAGG:1 + chr3R 25384304 3' + mdg3 5459 2 56.85 TGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTG:1 - chr2R 18048795 3' + opus 445 2 56.16 GTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGTGTCAAATATCACCTGGTGATATAT:1 - chr2R 21377799 3' + roo 265 2 72.22 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGCTTTCGCGACAACGCCAAATATCAACTACTTATATAGCG:1 - chr3R 21570492 3' - mdg3 5334 2 74.31 TACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGATTACAAATGGAACCAAACTATAT:1 - chr3L 16157148 3' - Juan 15 1 73.97 TTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTATCTATTTCCATTTCCATCATCATCACCATCGTCATATTCATCGTCTTTAGGGGCCCTGTCCGTTATTATGTGCCAACATGGTCGTCA:1 + chrX 20273865 3' - Tirant 369 2 58.22 GTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATCACTTCAAAATTAAATC:2 + chr2R 4122892 3' + rover 366 1 79.45 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCATCACCCTTCTACTACAT:1 + chr2R 22255459 3' - roo 14 2 71.85 AGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCTCAACTTTTACAACCCAATTTCTTACAACAGCCGGAAGTTTCTACGCCAATC:1 + chr3L 6767791 3' + R1A1-element 317 1 64.38 GCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCA:1 + chr2L 6074126 3' - BS 19 1 67.81 GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAA:1 - chr4 311201 3' + 1360 3320 1 66.44 GATCTCGACGTTCATCGGGACATGTCCGTCCGTCCGGCCAAATCGACTTGGCTAGTGATCCTGATGAATTCTCATAACGCTGGTCTTTGCCCGATATGCAAAGCCCACTTCAGAAACCGCTATCA:1 - chr2R 12354437 3' - INE-1 132 1 51.20 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTG:1 + chr3L 21093247 3' - Ivk 46 1 53.47 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTC:1 + chr3R 26315989 3' - roo 8727 2 62.07 TTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAAACAATAAGATCCTTTGTTGGCTGACTCCTGGATTAGGTTCCG:1 - chr3L 5438707 3' + hopper 1378 1 58.90 TATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7186 2 82.46 AAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAA:1 + chr2L 8393051 3' - I-element 5191 1 65.75 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGAGATATATTCGTATATACTCTCATATATGTA:1 - chr3L 21097075 3' - mdg3 5266 1 73.38 GAGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTAGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAATTTGTTCCATTTCTGGGCGAGATTCCTCTGTCGCATCTGCAAGAAA:1 - chr3R 31669807 3' - Cr1a 4120 1 73.29 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTT:1 - chr3R 29708952 3' - blood 49 2 52.74 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTAGAGACATCATTAGTAACTATAGAGGTTTTGGTGG:1 + chr2L 13884722 3' + pogo 2082 1 68.97 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTG:1 - chr3R 10973192 3' - jockey 61 1 52.05 GCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAAT:1 - chr3L 21630337 3' - Burdock 6218 2 75.34 CAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGTTCACGAAAGTATGTATTATTTTCAAAATCGCCAGACGTATTAATATTAACTACGAAAAATTTGAAATTGAATGAAATAGTTGGGGAGAAAGAATC:1 - chr2L 23010679 3' + Doc 211 1 64.38 ATAATTAGCATGCGCGACTGCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGTCACGCCCACCATGAAGCGGGGCAAGAAGCAATGGGGCACCAGGGAAAGATCAGGCATGAGCTTCCTTATCGTCATCACCTTCTTCGCCGTCTTT:1 - chr2L 13354123 3' + Tabor 178 2 65.07 AAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCCCTTTAAGCTGTTGACAGGTTTTGTGTGCAGATCCCGATACAAATGAATTTTTAAGCTAGCATTTTTCAAATATGTATATTCAGTAGATAACAAAGTACACATTTCAATGTGTTTGTTTTTTT:1 - chrX 3630571 3' - accord 7029 2 69.18 CCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGATGATTGAGTTGCGATTGGGCCTCGTGGGCAGCCGATGCGGCGGCATTGGCATTCGCTTGGGTGTTTTGTAGGGACG:1 + chr3R 14260678 3' + mdg3 5180 1 54.29 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCC:1 - chr3R 3527074 3' - Tabor 61 2 58.04 AAAAAAAAAAACATAAGTGAAATAAAAACGAAAGAAGTCAGTTCACCGCATTCCATGGCCCGAAAGAGTTGTTGGGGCATTGTCTCATTTTTCCACTATTTTATGCTAAATACAAACATTTATGTGGGTCGCCTATTTAGCTTCCG:1 - chr3L 16690534 3' + Porto1 169 1 60.96 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCC:1 - chrX 12623137 3' + jockey 4922 1 66.44 ATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAACAGGATCTATCGGAGCGAACATGGCGAATCTAATCTAGTTGTGCGATTGATAGTGACTAA:1 - chr3R 9814144 3' - hobo 459 1 58.90 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTG:1 - chr2L 8103479 3' + pogo 2070 1 56.94 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTT:1 + chrX 14908445 3' - blood 90 2 77.40 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAAGTTCATAGTGCCAAGAAGGATATCAGCGATGTTGCGGCT:1 + chr2L 7667546 3' - copia 9 2 78.26 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACA:1 + chr2R 2949131 3' - 17.6 6944 1 64.76 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAACCGGTCAATCGATTGGTTAGGGATGGGAGTCTTAAAGAG:1 + chr3L 9426792 3' - P-element 39 1 59.59 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGAT:1 - chr3R 7569576 3' - Doc 47 1 46.58 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGGACGTTGAGAAGTTTTTGATTTAAATAGTTTGGCCTGGCATTTTAC:1 - chr3L 14921340 3' - pogo 20 1 70.55 TCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACAGTTTCTGATAAGTCGCTGTTTGGGTATAGAGATTTAATTCAGAATACACTCCTTGCC:1 - chr2L 22641323 3' - HMS-Beagle2 60 2 59.59 GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGGCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCT:1 - chr2R 544768 3' - HMS-Beagle 6842 2 52.74 AGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATTAAGATATATCTTAAGAGCTCGAAGTTGGAATTGAAAATGATTATCGATTAAGTGTCTAACCCAGAGGAAAGTATGTTCTCTCAGTTATGTAACTTTTTTTCTAAAA:1 + chr3L 1383729 3' + mdg3 64 2 69.86 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACACACACA:1 - chr3R 8367105 3' - Doc 17 1 67.81 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATAGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAA:1 + chr2L 17162848 3' + blood 301 2 67.81 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGATTTGTCTGGTGATGCTGTT:1 - chr2R 7534542 3' + roo 393 1 75.34 AACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCACGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTCGACTTTAAATCTACATATTTATCTCTTTTTTATGAAATTTTAATAACTTCGACATGTGCGGAGACAAGCTCG:1 - chr3R 12548987 3' + 1360 172 1 60.27 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAA:1 + chr2R 10991422 3' - jockey 36 1 66.44 AGGTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTTGT:1 + chrX 5222985 3' - 412 7087 2 62.33 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTGTGTATCATTTTGCTGTAGACA:1 - chr2R 18048774 3' + opus 468 2 57.64 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATC:1 + chr2L 21237296 3' + P-element 2809 1 32.19 TTTTTTTTTTTGAATATGTTTATATATATTAAAGTAAATTAATTAGATGAATATTAAAGTATTTCTTTATGCATTCATCTCTCTTTTTTTTCATTTTATGTAAACTGCTCTGGCTTGTGTACTACAATTTCGTATTTGTTTGTTTT:1 - chr2L 281723 3' - TART-A 13401 1 67.81 GTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTGTCATGCTCTTCCTCTTGACACGACAGTTCACCAAGTCCTACAATCTGCTCATCCACGAAAGAACGCAC:1 - chr2L 3578929 3' - Bica 77 1 67.12 CTCTTATCTTAATTCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGCATCTATAGAGTATTACCTCTAATACCTCCTCTTACCTCTAATCCTGACTGTCTTCCGGTCTCTCTTTCCCAACTTGTATACCCTTTTCCTCTA:1 - chr3L 25481533 3' + Cr1a 4140 1 64.38 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCCAATACATATGCAATAGCCGAGAGTCATATGCATGTGTGTGTGTGTGTTTGTTATTGT:1 - chr2R 6587769 3' - hopper 56 1 61.27 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCT:1 + chrX 14692938 3' + Transpac 5166 2 65.73 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGGTCCTGATAAGCAAATTTTCTAATCATATTTTAAATACTTTCACTTTCAATCAGTGCTTTTTCAGCGGCTACCCATTTTTGCCA:1 - chrX 3506019 3' + Tirant 373 2 67.81 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGG:2 + chr3R 15649853 3' - blood 7086 2 67.81 AAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAAC:2 - chr2L 15153232 3' - G-element 40 1 51.37 CTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCCACTTTAATATCAGCGGATATGACCTCATCCATGCAGACCATCCTTCTGGCAGAGCACGCGGTGGAGCAGGAGAAGCTGGCGAAAAGGGCGTGGTCGGGGAAAGGCGAG:1 - chr2L 15149421 3' + G6 1704 1 73.10 GAGCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAGATGCGTCTTTCGCAAAAAAGTTATAGAAGGAAAAACCGAACCCAAAGGCAATCCCCCGCAA:1 + chr3L 19667029 3' + R2-element 3582 1 82.22 GTTAGTCTTAAGTAACCATGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTA:2 + chr3R 19545382 3' + jockey 4901 1 78.08 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACTGTACGAGTTCGATTCGATTGATAATTATTGAGCGGTTGC:1 - chr2R 21056696 3' - Tirant 77 2 72.03 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGATT:1 + chr2R 6945728 3' - pogo 57 1 56.85 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTTATGTACTATCTAGAATTGATTTCCAAACTCAATTTGTAATCTCTTGTTTATATTTTAAAATATACTTCTTAGATTTTCTTACTTGTGCAGAAATAGATCCTCTTTTTCTCTTATT:1 - chr2L 4103932 3' + roo 405 1 71.92 AGACGATTTTCGAGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTCGTTTTCATTGCCGGGCAAAAGCATTTTCAAAATTGATGCGGTGTCTGCGTTTAGGTGGAAAATTGAATTTTCA:1 + chr3R 14386761 3' - 1360 3188 1 51.37 CTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCGAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCC:1 - chr2L 18163786 3' + HMS-Beagle 6952 2 81.51 GATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAAAATCGGGGTCGCAAAACAAATAGATTAACTGAAGTCAGTCCGCATGAACGTCGGGATATTGGGACTTATAAAAGCTCGTATACGGTTGATTTCTTGAAAACCTT:1 + chr3L 25304701 3' - Cr1a 64 1 66.44 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACTAC:1 - chr3L 5183664 3' - copia 4898 2 65.75 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCT:2 - chr2R 20382477 3' + Bari1 1653 1 54.79 ACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGATAGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 33 1 60.27 TAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGTGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGGTATTTATACAGAAAACC:1 + chr3L 21093207 3' - Ivk 100 1 74.66 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAAATATCTAAAAAGACCTGACATCATTTGCCTCAGG:1 + chr3R 27503098 3' + hobo 2883 1 71.79 GAACATGTTATGCATAGAGTATGACTACTGCCTCTGTTCATTTAAGATTAATTATAAAATATACTTATTGTCATACTTTTTTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAAAATAAATTCTAGCGTTATCTAGGCTTTCCAT:1 + chr2L 8777091 3' + G4 3735 1 67.12 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCAATTAAAAAGTGAACGA:1 - chr3R 7884510 3' - jockey 4777 1 69.23 TTTCACTGTACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACG:1 - chr3L 22354436 3' - Doc 69 1 61.48 CGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGCTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTAT:1 + chr2R 11656086 3' - HMS-Beagle 87 2 77.40 AGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGAATATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGTATATGAT:1 + chrX 19231819 3' - mdg3 5332 2 70.83 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATA:1 - chr2R 20500022 3' + 412 449 2 53.42 AAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATGAATCTACTATACCCCTTTACGGTGACGGCGTTCAGAACACAATCAACACTGAACCATGTGGAACCGTCCATAAGATACAGGTCACTGGTATGGTTAAGGGTGTCCACAAT:1 + chr2R 4406570 3' - INE-1 33 1 66.44 TAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATAC:1 + chr2L 17162856 3' + blood 7321 1 63.45 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACTGATTCATTCATTTTTCCCGAGATGAAGCAGCTGACGTGCTTGAGGAAAATATGTGCCCGCCAGGCGCTTTTCAATTGAATTTTCCATCCTTTTACG:1 + chr2R 19901113 3' - mdg1 7062 2 69.86 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAACTCTATTACAGATAGAGTTATTTGATCATTAGTCTCATTACTCGTTTTGAAACTAACAAACTTATATATAAGTTTGATTTGTGA:1 + chr3R 20909038 3' + I-element 5310 1 58.22 AAAATCAAAAATTTCACTTCTTTCAATTTTTTTTTAGGGCTGTCCTTCATTTACTACCTTAGATGTTAATAGAGCTTTACTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTAACTATCAGACAGTATAGCAATGTGACTCCAAAGGCCGTTTTAGA:1 + chrX 21976902 3' + FB 157 1 68.49 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAACTAGTTTGTTTGAGTGAAGAT:1 + chr2R 10453480 3' - mdg3 30 2 50.00 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTTGCTTAGATGATAAGGTGTCCCACTTATTTGCGAAAAACATATGT:1 - chr3R 21150521 3' - S-element 70 1 71.23 ATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCATTCCAATATCACATGTCATGAGTCTCGAGTGC:1 - chr2R 19558129 3' - BS 4782 1 78.08 TATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTATAAAAGAATTCCTAATAATTTAAGTGTTCTACTAGCTCTTTAGGCGAATCTGACAAGTTAAGCCTAGCCTTAAATAGGAACTTTCG:1 + chr2R 10757683 3' + blood 6956 1 58.22 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATCATTTATGGCTCACAATTAAGGCA:1 - chr3L 18468316 3' - jockey 4697 1 62.33 AATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAACACTCTCAATTGACTGTGAACCGATTGAAATCTCTTTAATCTCAAACCGAT:1 - chr2L 11158640 3' + Rt1b 5067 1 65.07 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCACTTGGGCCTGTC:1 - chrX 8502151 3' + pogo 2055 1 54.11 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGC:1 - chr2R 17013995 3' - HMS-Beagle 35 2 61.64 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCGAGGCGAAACTG:1 - chr3R 25876885 3' - mdg3 5337 2 73.97 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGA:1 - chrX 11228557 3' + roo 9008 2 60.69 GAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTTTTCAGTTTGAGATTTTTAAAGCACATTTCGAAATCAGTAATCATTGAATCATTGAACAGATCTAAATGTTAA:3 + chr2R 9327124 3' + mdg3 5490 2 77.40 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGCAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGTATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATT:1 + chr3R 9938714 3' + roo 9031 1 55.48 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAA:1 + chr3L 5438824 3' - hopper 68 1 65.07 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTA:1 - chr2L 19424651 3' - Tirant 55 2 56.83 CTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACATATATGACCAGATATCAAATGCGATAAATGGTATGCAAATAGCGCCGTTTGTCTGCCGGCCAATTAATAGTATTTAAATCAGTCCAAGACAATG:1 - chrX 11850407 3' - Stalker2 7274 2 67.81 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTA:1 - chr3R 20452163 3' + blood 7347 2 56.16 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAGCTGGGAATTGCG:1 + chr2L 15920183 3' - jockey 63 1 54.79 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCACAATACCCAAAAATTTTGAAT:1 - chr2L 3006236 3' + pogo 2065 1 80.00 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTCAGCAGCGATTCGGCTCTCTGTCGTGACATGTCGCCCACATACCATCTAGAAAAGTAAGCAGGTGGACAATC:1 + chr2L 8261873 3' - 412 7101 2 50.68 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGCAGTGACGTGCCGATATATATTTGTGGAAAAATACTTTTCACAAAAAA:1 + chr3R 14165168 3' - Tabor 19 2 72.60 ATACCTAATGAAATTATAAAAAAAATTATCCCAAGCTCTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTACGTCTAGTGTTAAAATTGCAAAATATCATAATGAGACTTATTGCCATATTGCAGTCGCGGATCGTTCCATTGCTGGTTCAGCA:1 + chr3L 15867446 3' + HB 1539 1 58.90 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCA:1 - chrX 5222862 3' + 412 427 2 64.38 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGATATATTCATTTGTATCTGAGAGAGTTGGATAAAAATTG:1 - chr2L 11668734 3' + mdg1 339 2 72.60 GTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGACGTCCCATATAGAAATTATCCCCGCAATAAACGTAGACC:1 + chr3R 14874215 3' + flea 4937 1 72.60 AAGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGTGAATCTGCCGCTGCTGAAAAGGAGGAGTCTCATCCACCCA:1 + chr3R 25384319 3' + mdg3 222 2 65.75 AATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACCATACGCCCGACACCATACGAATGTCGTCTCTCATTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGACTGGGAGAATGTGGGTCCGCCTGT:1 + chr2L 4110052 3' - Rt1a 31 1 46.90 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGG:1 - chr2L 535437 3' + roo 8998 2 75.38 GCTTATCTTATCTTATCTTATTTTCCGTTTCCCGTTCAAATCGCCTCTCCCCGCAAATCGGCGGGTTTTATTACTCGCTCTCTCTCTCTCGAAAAGTCGGGCAAATATTGATAAGGCCGAGCTGAAGTACACAGTATAAA:1 + chr2R 6628436 3' - Stalker3T 200 1 72.14 TAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCAC:1 + chr3L 8253760 3' - jockey 4666 1 61.11 TTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGCGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCTCACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAATGGATCCGGTGGCCAAGATCCTGGGCTATCG:1 + chrX 6755049 3' + 1731 220 1 78.77 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATTTGTGTA:2 - chr3L 5446066 3' + roo 9043 1 65.75 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGTACTGGGGAATCAACTAAATGCTAAATAATCA:1 + chr3L 15371395 3' + Transpac 5172 2 58.22 TTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCC:1 - chr2L 15833012 3' + hobo 2859 1 73.10 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAA:1 + chr3R 9938678 3' + roo 9042 1 56.57 GTCTTTTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGCCCCAGGGTTCCGTTTAATAACAAAAACTGCTGTGACGAGAAAAAGTGTGGTTCATGTGTTACATGCTCATGTTTTTCATCTCTATTCTCGCTCTTTTGTGGCGTT:1 + chr3R 1443526 3' - INE-1 87 1 69.18 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTAGTAGACCTGCATTAACAACATTAACGAGTTAACCGGGACATCCGCCAGTCTTCTGCCGAGGCCTACA:1 + chr2R 6168352 3' + 1360 3336 1 54.79 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTATTCCATAGAAATGCTTACTTTAATGTTGGCTTTTCATGTTGAATAAGTTATGATTCTAGGAACGCTGAACCACACAACCGCAGAT:1 - chr2R 14717755 3' - Max-element 8258 2 65.83 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCAGTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTT:1 + chr3R 10468080 3' - opus 34 4 62.89 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGA:1 - chr3L 19397017 3' - F-element 61 1 53.52 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCT:1 + chr3R 19545436 3' + jockey 4955 1 58.22 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGC:1 + chrX 15089578 3' - P-element 73 1 35.62 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGC:1 + chr3R 18846644 3' + roo 9054 2 69.18 CCATTTAATAGGCTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCGGTGCGAACAATCCATCAGATGTCGCCATATCATTGCCTGTGCTGATTAGTTAC:1 + chr3R 11461904 3' + 17.6 7392 2 65.07 CTCAGCTAGTGTGAATGAGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGAGATATCGATAGATAAATATAAAAGATTTTTTCACTTTACTCTACAAGTATGCCTTCATCACTCACTTCAATCATGTGTCCTAAATCCATGTATTCATTCAT:1 - chr3R 19445143 3' - INE-1 530 1 64.38 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAACTAGG:1 + chr3R 20452288 3' - blood 56 2 56.16 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACATTTTTTACAAGGCTTA:2 - chr3R 24228842 3' - opus 7037 4 62.33 CGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTTAAGATATGAACAAAGCAAGAAGAAGCTAGAATTGCCAGCAATTAAGGACCCACCAAAGTCCTGAACACACTTGTACTCTGGGGT:1 - chr3R 17239283 3' + 1360 430 1 65.07 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATAT:1 + chr3L 14581485 3' - pogo 57 1 56.85 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCTAATTGGGATCTAAAAGATCTCGGTAGAAGGTATACCTACATACTTAGTCGTTCTTTTCAACTAATCTACAATAGTAAATTCCATGAGTTTTTTTTTCCTCATATCTCTAAT:1 + chr2R 6579649 3' - mdg1 6 2 76.92 ACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTTGTTGCCCC:1 - chr2R 10478645 3' + invader4 3053 2 62.33 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAGTTTATTTTGACGAATCTTATTCAATGTGTTTCCTGCATATGTATGTTCCGATTTGTCATATATAAAC:1 + chr2R 7534696 3' - roo 53 2 55.48 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCAC:1 - chr2L 15832981 3' + hobo 2889 1 50.00 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAA:1 - chr3R 10079267 3' - P-element 23 1 67.16 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTT:1 - chr3R 20292422 3' + pogo 2039 1 64.38 TATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAG:1 - chr2R 20362215 3' + diver 6037 2 67.81 CTGAATGTGAAATTGTATCTTAGTTAAGCAGTAAAAGTGATCTGAAACCGGATCAAAATAATTCGCGACAAAAGAAAATAACGGTGAAATCGTTTTATATAAACATATAAACCAAAACAACAACAAGGAAAAACAAAAAATAAAAA:1 + chrX 4435090 3' + gypsy9 218 2 36.30 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGGTTCTTGGTTT:1 - chr2R 22867437 3' + hobo 2856 1 74.66 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCCACCCTAGAAAAGCCACATCGCCTCGCTGAAATTATATTTCAATCAATGTTTATTTGTTTTCCTAGGCAATTTGTTTCAA:1 - chrX 9342424 3' - 1360 41 1 57.53 TATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCATACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAATGAGCTGCTTCTCGGCAAAATCGCAAATAGCCATAAACGTGTACATCAGACTTTGCTTTGGT:1 - chrX 6510878 3' + Stalker4 7241 4 57.53 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTCTTTCCCTACTTCGTAGTAAACTTCAAATACATACATTCTTTTCAGACTTAGCTTTTCAC:1 + chr2R 22145582 3' - FB 60 1 58.22 GCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAGCTAGTAAGCATTTTATAATGTTATTTTTT:1 - chr2R 13574706 3' - diver 16 2 72.60 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGGTTTTGATTATTCTTTCTAGGCCGCTCTCCACTGTGTAACCCCA:1 - chr3L 25272509 3' - 1360 69 1 58.90 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTC:1 - chr2L 20984294 3' - blood 7067 2 56.85 TAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 255 2 84.93 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAG:1 + chr2R 6585518 3' + pogo 2040 1 62.76 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGGGAAAATCAAGTA:2 + chrX 19231877 3' - mdg3 5276 2 69.18 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATGGGAATTCTAATTAACTACAGTATTAACTGCATGTACCAGCTAAGCAGACAAAGGTGTGTGTTGTGCACAGGAAAAAAAAAACTGCTA:1 - chr3R 27971010 3' + mdg1 7404 2 56.16 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAAGTAGAAAGCAATTAAGTTTTTAAACAATGAAATTGTCCCAT:1 + chr2L 8960042 3' + Ivk 5362 1 67.12 TGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTAT:1 - chr3R 10467992 3' + opus 7448 2 52.74 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATGCGCATAGCAAGTAGCTTGCTGGAGTTTAA:1 - chr2L 8392967 3' + I-element 5297 1 56.85 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGCACGCCCTCAACACAAAGTGAAAGTGGAAAG:1 + chr3R 5765453 3' - opus 7043 4 58.22 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACC:1 - chr2L 1136316 3' + 1360 3316 1 67.81 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAA:1 + chrX 10310336 3' - hobo 48 1 58.14 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAG:1 + chr3L 13597831 3' + blood 302 2 71.23 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTA:1 + chr3R 24479247 3' - 412 87 2 76.71 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCAATTAA:1 - chr3R 7884521 3' - jockey 4804 1 54.11 ATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTACTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATGCAGGAAAACCAATGGCCACAT:1 - chrX 19817457 3' - invader3 5086 1 74.66 ATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCG:1 - chr3R 17316050 3' - 3S18 70 2 63.01 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCAGTTGAAAAGTAAACAAAATAAATCGCTTAAAAGAGATTAAAAACATGTT:1 + chr3R 18357527 3' + jockey 4960 1 62.33 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGC:1 - chrX 8272415 3' + roo 9015 2 56.85 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTT:1 - chr2L 18048251 3' - blood 7066 2 53.47 AGTAGACTACTTTTAATAAATTTACCTTTCCTTACCGAATTGTTAATTGTAACTAGCGATTTTTGGGTACTTTCAATTTATTCTTGCTATATAAAATAGCCTGTGTTATAAGACATGAACGTATTGATGTTTTTTTTACTACAATT:1 + chr2L 21272373 3' + Cr1a 3980 1 72.60 CCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCC:2 + chrX 21667993 3' - gypsy2 9 2 76.71 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCCACCCTCTCGCTACTGCTAT:1 + chr3L 13722109 3' - blood 49 2 60.48 TCTTTTGTATAAATAAATTATGAGAAAGGCATAATTACGTTACTTCCCTTGCCTTAAAGAGAAGCCTATAGGCTGATGCTATGGGTATCGGATTTCGTTATTTACGCGAATTTTCGCAGACCATATTTTCGTTAAGCAAATTCATT:1 + chr3R 23446376 3' - Tom1 23 1 67.81 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTTTTGTATTTTCC:1 + chr2L 17228704 3' + mdg3 175 2 64.38 ATCCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGTTAATCAT:1 + chrX 8200335 3' - flea 4776 2 72.60 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTT:1 - chr2R 21078440 3' - jockey 71 1 68.55 TATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAACAGTATG:1 + chr3R 9163920 3' - hobo 89 1 81.51 TTTGGGTGGATCGCGTCCGGTGCCTGCAGCTTGCCGTAGGATGGCTATGTTGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCGAGTTACGGGGTTTTTTATATATTATTTATGGTCTATTTCCGCAAGTAGCTAACATTTT:1 - chr3L 14184969 3' + GATE 8157 1 68.97 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGGACGTTGAGAAGTTTTTGATTTAAATAGTTTGGCCTGGCATTTTA:1 - chr3L 14921341 3' - pogo 21 1 69.86 TATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTATTACTGAGCGATTTCTCACTGTGCTCCGACGAACTCCGCGATAAACT:1 - chrX 10705539 3' - mdg3 97 2 67.81 TGCACTTAAACTTCAATTTTAATCTAGTTTTCAATATTTTCATTCAAAAACACCTTTATTCTGTCTCTGTGTTCAATTTTCTGTGTGTTATGTGTGCTAGAACAGTTGCTATGGCTTCTGCCTGGTGCCTATCTGACATTTAAGTG:1 - chrX 13767600 3' - Porto1 47 1 65.75 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTTATAGTTTTGCGACCTAGACGTCCCTACATATGTATGTAGTTAAAAAAAAAA:1 + chr3R 24683329 3' + hobo 2909 1 50.93 TGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCCTGAAATTACAAATAATTTCGGATGGTGGATGGTGGATGGTGGTTCCTCCTG:1 - chrX 15090919 3' + P-element 263 1 23.97 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTAGGCTCTCACTG:1 + chr2L 5648527 3' - Burdock 6165 2 65.75 CTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGAGGGAATTTATTTAGTTGCAGTGGGATTGGACTTAAAAGGCAAACTTTCGTACA:1 - chr3L 4695523 3' + Doc 347 1 62.68 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAA:1 + chr2R 21897981 3' - 412 56 2 56.16 GAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAAGCCAGCCACGGCAAAAATATATGTTGTTGTGCTGCGGTATACATGAGTTGTGTAGCCAAAGATAA:1 - chr2L 10176441 3' - hopper 485 1 66.90 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTCACTGTCAGTCATGTAAATCTGTAACATATT:1 + chr2L 21596603 3' + blood 7341 2 52.05 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTT:1 + chrX 5222979 3' - 412 40 2 58.22 AAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACTGATTCATTCATTTTTCCCGAGATGAAGCAGCTGAC:1 + chr2R 19901052 3' - mdg1 7123 2 76.71 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATGTATGTATATGGCGAAAATGAAGAGTTGCCAGCGAATGGAATGGATA:1 - chr2R 17945132 3' - 297 60 2 71.23 ACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAAAATATAATACGGGGGAAGAACGGGAAGATAAAGCAGCTGAGAATTGCCAGGCATTGTGGAAATTTT:1 + chr3R 4400539 3' - S-element 1690 1 60.27 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAAACGGA:1 + chr3R 29350809 3' - 297 6616 2 56.30 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGAGCCTTCT:1 - chr3R 23254390 3' + pogo 2067 1 61.64 GAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGT:1 - chr2R 11656026 3' + HMS-Beagle 169 2 71.92 ACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGGGATGGCTATTTTGGCTACCCACTAAGGTAGGAGTTTATTAATTAACCGGCAACC:1 + chr3L 24312266 3' + pogo 1721 1 73.17 CAATAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCAAAGATTAGCTAAATAACTGGCGTTTAAAGCCACGCCGCATGCCACATACAAGCAGAATTGTCTTAGTTTTTGAAGTAGAAACAATCGAAC:1 - chrX 2513464 3' - 1360 277 1 57.64 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGACGCGTCGGCACGCACACACTCTTTAAAAATATTATGCTTTCCG:1 - chr2L 6598353 3' + hobo 2879 1 64.34 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTTGAAAGGTCA:1 + chr2R 15392809 3' - blood 57 2 56.16 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCT:1 - chr3L 22481246 3' + roo 330 2 74.48 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACCAACTCCTAACATAAGCGATTCATATGATATGAATGC:1 - chr2R 8793837 3' - Transpac 15 2 76.03 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAAAAATAAAAAACAAATTTGTGTGGCTAACAACTTCCGTCCAAAACGAAATAAACAAATAAATCAAAAGAAACACAAACACAAATAT:1 + chr2R 8653991 3' - BS 5014 1 71.92 AAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAA:1 + chr3L 18920486 3' - Juan 62 1 56.16 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATAGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGA:1 - chr3R 25271183 3' - 412 71 2 63.01 ACGCTCCCTTTTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGGCGAAACAAGCTGAGACACTTTAC:1 - chr2L 21936067 3' - INE-1 31 1 46.58 GCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTAGGCGCTACCACTCTTTTTCGCTCAC:1 - chr2L 21237347 3' - P-element 21 1 42.86 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTGCCTCTTAAAGGACTTATATACTTATATTTGTGTATGTAATGGGTATCGGATGGCTTATACTTTTATTAGCAAAGAACAACTAATAGTTGAAATC:1 + chrX 20386811 3' - hopper 23 1 44.52 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTG:1 - chr2L 17228615 3' - mdg3 64 2 60.27 ATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7189 2 84.00 TTAAAAAAAAAATAATAAAAAAAAAATACAACGTAGAGTGAAGTGAAAAGCGAGAAGCAGAAGGGCGGAAAAAGAAGAGAAAAATCAAAAGGCTCACAACGCACATCCTGTGAAATGGGTGACAAGGACACTC:1 + chrX 6145121 3' + Doc 4702 4 85.71 CTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTAGTTATGATTTAATCAAAACGCGCACAGCCATTTTAATTACCTTTATGTTGCACAAACTTATGTTTTTTTTTTATGGTTCAAAGCACTATTTCGCTTCTGTGTAAACTGAT:1 + chr2R 10478830 3' - invader4 2766 2 78.08 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGCAAACACCC:2 + chr3R 7424669 3' - 412 29 2 64.38 GGTGGCAAACATGGGCAAAAAATGAAGGCGCCACATCTCGATGGTTGTTGCCGCTAGCTTGAGTTGATG:1 - chrX 4218193 3' - FB 67 1 69.57 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAA:1 - chrX 8502174 3' + pogo 2032 1 66.44 TACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCGGCGTGGTGTATTAATGTGCGTTACAAGCTTTT:1 + chrX 17229127 3' + R1A1-element 335 1 70.41 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAG:1 + chr3R 4722475 3' + roo 341 2 63.70 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCAAGCTCGGCAATTGCTGGAGAAATAAATTAAATTTAACTTGCATTTTCCC:1 - chr2R 18884172 3' + roo 9007 2 60.96 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGCTAATTACTAAAGTGTGCCTCGTATCTTCATTTTAGAGAGTAATCTTA:1 + chr3R 23099209 3' - roo 29 2 67.14 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTTGATTTGAGTTATGCGACAACGTTTCAAATATGTAATACTTTA:1 + chrX 6398861 3' - blood 7085 2 66.44 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCAGTTGAAAAGTAAA:1 + chr3R 18357492 3' + jockey 4924 1 60.96 AAGTTTGGGCGTGCTAGTTTTGTGCTGATTGTGGGTATTACAGAAGGTGTAAAACCATTTGGAAATAAGCTCGCGCTGGGTTTAAGTCTGTGAAAATAAATTTATCAAAACGACAAAAAAAGATTCAGATGGGCTATACATTGTGT:1 + chr3R 19444999 3' - INE-1 244 1 61.64 CTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGT:1 - chr3R 3617316 3' + micropia 167 2 70.55 CTCGACTATCATATACCCGTTACTCAACTAGAGGGAGGTGCCAGGAAGATGTCTCTAAAAATTTGTTGGCATAGCAACGAATATTGTAAAATAGTAATAGTAAAATGACTGCTTTTTGCGGTTAAAGTAACAATGTTTTAAAACAA:2 - chr2R 16193773 3' - INE-1 552 1 48.63 CTGCTACCACTGACTAATTCGGCTTACAATATTAAAAAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACTCAACACGGGCATTAATTCTAGACAAGTGCTGCGGCGATGAGGAAATCAGACGAATTGGATTGCTT:1 - chr2R 4376187 3' - diver2 65 2 73.29 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTATAGTATCATATTTATGATGGTTTGCATTTTGTTTAGTATATGTAATTGTATGTAATATCTCCAAAATTTAT:1 - chrX 23043076 3' - roo 8680 2 74.66 AATACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATACTATACTATACACTATTTATTGTTAGGTACAAATCACGTCGAGGCCACTAAATTTTGAGCTTATAAGCTTTATTATTATCTATTTTAAAGCAATGAAAAGACGAGCTTT:1 - chr3R 2559937 3' - mdg1 7071 4 67.81 CAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATG:3 - chr3R 13358568 3' + mdg3 207 2 57.53 AATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGAC:1 + chr2R 2879478 3' + Stalker 6939 4 52.05 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAAT:4 + chrX 2873447 3' + roo 9002 2 65.07 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTC:3 + chr2L 15965300 3' - blood 69 2 63.01 CAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCATCATCTGTCGCTCCTTGTGTTGCATTGCACTTTTTTTTT:1 - chr3L 12249935 3' + flea 141 1 64.62 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTTATAGTTGAGCAAATATT:1 + chr3L 3762317 3' - roo 59 2 58.90 AGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGAATAACGCCATCTACCG:1 - chr2L 5771380 3' - Juan 31 1 64.38 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCTTGCGAATA:1 + chrX 14173320 3' + 412 446 2 52.74 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATAATATAATATAATGGTAAGAGTCTTCCCAAACTCAAAAATATTTATCAT:1 - chr3L 15261264 3' - pogo 67 1 67.12 TTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATAGCAGCTCGCATTGTGCAAGTGGCCAAGTCACGCCCCTCATTACAGCTTCAACTGGGACTGTCTATAATTTCCTGATCTAAAGTGTTGATACACGGTCGAATTGTT:1 - chr3R 4468869 3' - 1360 3021 1 71.23 AATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAACCGCTCTGGAGGTTGAATGCATGTATGAACCGCCTTCACCTGA:1 + chr3L 2400109 3' - roo 8771 2 70.55 TATATATTTACAAATAGTTAAAGAGTTAAAGAGTTACCAAAGAGTTATTAGTGATTTTGTACAGTAAGGTAAATGTACCGAGTATATCCTTTTTACCACACGAACAATGGGTATGAAAAAAGGACGCCAAAGTGAATTGCGTAATT:1 + chr3L 11400924 3' + G3 4484 1 80.82 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTA:1 - chr3L 4023624 3' - pogo 67 1 63.70 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAA:1 - chr3R 23099085 3' + roo 9008 2 64.38 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGT:1 + chr2R 9867163 3' + roo 323 2 73.97 GTTATTATGTTTCAATACGCTTCATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTATCGTAGATGGCTGCCAAAGTGCACTT:1 - chr3R 11040402 3' + accord2 7291 1 78.08 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAAGAAGAGAGTT:1 - chr3R 5086985 3' - P-element 37 1 59.59 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTTGTTGCCCCG:1 - chr2R 10478644 3' + invader4 3064 2 67.65 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTT:1 + chr3L 23871324 3' - Doc 76 1 64.38 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTTATTCTTATCAGCCAATA:1 + chr2R 18048921 3' - opus 158 4 58.90 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACT:1 + chr2L 2519922 3' + roo 9047 1 63.57 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCTTCTCATCGATGGTA:1 + chrX 16456798 3' - P-element 80 1 30.82 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGACTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGCGAAAATCAAGTAACCAAG:1 + chrX 19231883 3' - mdg3 18 2 70.55 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAATAAACCATATTGCTATAGTTAAGCTTACCCTTTTATTACAACAATCAAAATTATGTTTAGTATATGCAAGAAAACAAACGAAAATGTATTTTTATTTGGCCGGAAAATA:1 - chr2R 20462729 3' + copia 244 1 76.03 ATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGTACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACATTCTTGTGCTGCAGGTGCTGCTCGTGTCGCTGCAACAGCGGCA:1 + chr2L 14062376 3' + mdg1 52 2 69.18 AGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTGCAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCAGGATAAGCACTTATGGTATTCGAATAAGTGACACTGTGGGATTCAGGGGATCGACAG:1 + chrX 2190266 3' - Doc 498 1 58.90 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATATACTACGTATTTCGTTCATATGGTAGATTTATTGGCCCTTCACTTGACTTGTTTGCCCGC:1 - chr3R 25354469 3' + 297 334 2 63.01 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTAGGCTCTCACTGG:1 + chr2L 5648528 3' - Burdock 28 2 66.44 TTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACAT:2 - chr3L 9375791 3' + mdg1 7429 2 63.01 GCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCAGATGTTAATGGTTACATTAGGGCATGTTCCAGCAGCCGCAGGATGGCGGTGCTCCCTCCCAAGTACCGCTCTTCAATCCCTTCCCCAATCCCTTCGAGCTAAGCA:1 + chrX 7239159 3' - Quasimodo 6940 2 56.85 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCGAAGAGCTTAACTTTCACCCCAAAGACGCAAAACACACACGATGTTGCCTCGGGGGCACTTTAATTAAATAATTTGTTTGTGTGCATAAATATTTGTTA:1 + chr3R 9616712 3' + roo 389 2 71.92 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAAGTCAAACCCATAATCACGCCATATTTGCCTGTGTAAAGTGTGTGAAAGTGTTTAGCGAGGAGGGAAAGAGAGAAAGGGCTCCGATTCAACATCA:1 - chr2R 24427936 3' - jockey 4825 1 64.38 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGTCATCTGAAATGATGCCATTTAGGAAA:1 - chr2L 12355229 3' + hobo 2924 1 73.97 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGGCGACGTCGACGCCGTCAGAGGGTTGCCCCAGAGCAGTGTTGACATGG:1 + chrX 17258361 3' - 297 6588 2 77.93 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATTGTGGTT:1 + chr3R 20292561 3' - pogo 25 1 67.12 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCAT:1 + chr3R 15514614 3' - 412 64 2 60.27 ATTATCTGCAATCTTGACTCTCTGCATCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACAAATATTTAATATAGTTATTTTATCTCGTCCTTTCGTCCCGTTGCGTGAGCCTTAAGGTAAGTT:1 + chr2L 11302505 3' + Cr1a 4226 1 71.92 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGTCACAGTTTTTCACAAT:1 + chr3R 25508543 3' - hobo 72 1 69.18 TTTTGTAAATCATCTTGGGGGAAGTAAAGAGTAACACAAACCAAAATTGGTTAAGATAGGTCATCATTTCGAATTTCTGCCAAAAAAAAACACATAAAAAATAATGTTTAATAAATAGCTAGATATTAAAGTATGCTGTATGTGAA:1 - chrX 12262801 3' + transib1 2059 1 67.12 CGCTTCCTACTGCCTGTTCCATACCTTTTTTTCACCAATCCAGCATATGCTTAACTCTGACTGCTTCATCAACTTCAGACACCCAAAAGTATTTAGAGATCTGCAGAGACTCCAAAACATCCGCGCCATATATCTAACATATTTTG:1 - chrX 4914262 3' - INE-1 30 1 54.11 TTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATG:1 - chr3R 8402532 3' - mdg1 7040 2 76.84 GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTT:1 - chr2R 10478694 3' + invader4 264 2 69.29 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGA:1 + chr2R 20704213 3' - hobo 79 1 71.92 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATC:1 + chr3R 22289498 3' - 412 37 2 60.27 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCAT:1 - chr2R 21380596 3' - roo 8717 2 54.11 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTT:1 - chr2L 1136336 3' - 1360 85 1 65.75 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATATTTGGCCAAAAGGAAGAGGACTCGACGACATGCTGACGCTTTGCCAACAAGCAAACTGGCGAATCT:1 + chr3R 12578074 3' - jockey 4724 1 52.74 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGGTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAA:1 - chr3R 10468018 3' + opus 419 2 70.55 CGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTTGGCGCTGCGCAAGAAGTTCATT:1 - chr2L 6074368 3' - BS 10 1 58.22 GACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGTTAGCTATTAGATTCATAGGATGGAAACATGATCTATACAACATGTACATATGATCGCACGATTACTCCCGGATGCCAGGATCT:1 + chr2R 7150218 3' - R1A1-element 5171 1 57.53 GTGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAAATAATAATAATAATACAAATGTTTCTGGTTTGTGCCTCGGCTAGATCAGTTTTTCAC:1 - chrX 6035529 3' + Dm88 4471 2 71.23 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACG:1 - chr3R 9482029 3' - roo 80 2 73.97 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCG:1 + chr3R 20149819 3' + 1360 3355 1 62.33 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACC:1 + chr3L 13722093 3' - blood 7094 2 76.76 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTGCA:1 - chr2L 17228613 3' - mdg3 62 2 58.90 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCAT:1 + chr3R 6053080 3' - Quasimodo 38 2 58.62 ATAAATAATTTAATTTTTTTTTGTAAATTATAAATTTAATTACCATAGTATCGTCTTGAATCCATTAAAACTAAAAAATGCAATTACATATAACGCCTGCGGGGCCACAGCAACCGTAATAGCAATAGCGAAAGCATCAG:1 - chr3R 9169880 3' - NOF 3960 1 57.14 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAAACAATAACATCAATTTCGATATGTGTTACCAAGTTGTTAACACTTTAT:1 + chr3R 21826282 3' - GATE 8269 2 58.95 AATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTTTTTACCGATTCTAATTTCATATTTTAGTTATATACATATTTCAAAATAAATGATTTGGACCGCGAGCAGGATTAACTCCCAGTGGATCCAATTAATAAGCACGGTG:1 + chr3L 19529846 3' - Juan 3874 1 75.86 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTT:1 + chr2R 16891844 3' - jockey 84 1 67.81 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAACGGGGAAAGCTCTATGGGAATGGGTTGACTCCTGTTCCAGGATAACGAGTGTGTGTATGGGTGTGCGTGTGTGTGAGTGAGTG:1 - chr2R 7763359 3' - Tirant 28 2 64.23 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGAAGCGATAAGCAAACATAGCAGCAAATGGCAAATAAACAAGGCACTAAAATATTAGAATG:1 + chr3R 25409580 3' - jockey 68 1 56.85 AAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGACTTCTTTTTATGTTATCCTTTTCACTCCTCTGTTGTCGTGTTCTTCATTAGGAAG:1 + chr3L 20043654 3' + Ivk 420 1 67.12 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCC:1 + chr2R 18048894 3' - opus 185 4 74.66 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTCCAATGGCCTGGTGGAGCGGCACTTTGTGAGGAAGTACCTTCTGCCCCGCGGATACAATGCCAATG:1 + chr3L 9375928 3' - mdg1 7093 2 55.86 CTTTATGAAACGCAGATCAACAACCGCTTTTGAAGCTAACTTCCTTCGTACTGAAACTTCTTTCATTTGGCATTTTCCTGTGAGATGACAAAAAAACAAAAAGGGAAAGTAAGGGTTGAGGAGATGAGTAGTGGTGCACGTAGAGT:1 + chr2R 20732363 3' + Q-element 216 2 64.38 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGACCTTCAGCAG:1 + chr2R 12703859 3' + blood 7325 1 61.64 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACCTC:1 + chr2L 2338177 3' - blood 48 2 53.42 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTT:1 + chr3R 14049457 3' + transib2 2788 1 59.59 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGT:1 - chr3L 18708568 3' - F-element 41 1 65.07 TGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCATACACACAAGCCCAGAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCAGATCCTGGCAG:1 + chr3L 17447542 3' - Tirant 8173 2 65.96 GACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGC:1 - chr3L 23456269 3' + Gypsy6A_LTR 257 1 67.81 ATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTGAAGTGAAGAAAAATTGCAGTCAA:1 - chr2L 17840987 3' - Juan 4052 1 66.44 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTAGCAAGTTGTCTAAACTAAACTTTG:1 + chrX 21205111 3' - 1360 31 1 62.33 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGTGTGCAGCTAATGAAGCG:2 + chr2L 15965355 3' - blood 7025 2 76.03 CCAGGACGATTACCGGCTACGAATGGTACGTAAGAAACACAACCCTGCACAAATACCTCAAGTTAGCCACTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCAATCCAGCCGGTTATAAATAAATTAGCCATAGTATCACTTATTTTATATTTTA:1 + chr3L 12403721 3' + BS3 1383 1 71.92 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAGAGTTGGCATAAAAAGATAATCTTATTTAAATTTATTAAATTCAATAGGTATCGCAACACAAAACTCTCAG:1 + chr3R 21421146 3' - roo 8712 2 52.74 TACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGAGGCTTAATAAATAGAAGATTAAATGAACTTAGTTCTGAAAAGATGCCACGCAAAAGCACACCAGCAT:1 + chr2R 22666374 3' - Quasimodo 431 2 55.48 GACTACTTTTAATAAATTTACCTTTCCTTACCGAATTGTTAATTGTAACTAGCGATTTTTGGGTACTTTCAATTTATTCTTGCTATATAAAATAGCCTGTGTTATAAGACATGAACGTATTGATGTTTTTTTTACTACAATTACAA:1 + chr2L 21272377 3' + Cr1a 3984 1 75.34 CTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGCCTGTAATGCAATGCGTGCTGCAAAGGGGGCGTGGCGCATC:1 - chr3R 9148035 3' - copia 4950 2 71.92 GAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATTACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTATCATTTATGAAAAGCTGGTGTAAATTATAAAATAAGAAGGACTATACT:1 - chr2R 4695798 3' - 1360 208 1 63.70 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTATGGAAGCACG:1 + chr2R 7404817 3' + blood 7378 2 71.23 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGAGATATATTCGTATATACACTCATATATGTATGTACATATATGC:1 - chr3L 21097062 3' - mdg3 5260 1 80.14 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTG:2 - chr2L 8397177 3' + roo 319 2 78.08 TCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTG:1 + chrX 11815079 3' + flea 4943 1 62.33 ACCCGTTCAGGAAGAGCTCCCGATTTTCGAGATCCCCCACCAGAGGAGTCGGTAACCCGATCCATGGTGATGAAAATACGCAATTTTTCTCTGTCGCACTTTGGCCAATGACTTTTAGATGCGG:1 + chrX 13651785 3' + Rt1b 423 1 56.45 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAGCTCTTCAAATGTATCCAATAATCGAGATGATGAACAGCCATGTGA:1 - chr3R 6068226 3' - jockey 4683 1 78.08 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTG:1 - chr3R 20292414 3' + pogo 2047 1 58.90 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGA:1 - chr3R 29708937 3' - blood 34 2 56.16 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATT:1 + chr3L 11196453 3' - pogo 50 1 55.17 CTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTATTCCCAACACCCTTTGTGATTCGTAGGAAGGAAGCTGGTGTTGCCTACATTTCTGCGCTTTGCCCTTTTCCATTCAAAGCCAATAGCAG:1 + chr2L 21381048 3' - Quasimodo 81 2 67.12 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTAT:1 - chr3L 13597736 3' - blood 7063 2 54.11 AAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTGGTCGTTAAACTAACTATTAACTATTAACTATAACTATTAACTATACGGAAAAACTGATTCATTTAGCTTGTTA:2 + chr3L 3482754 3' - X-element 61 1 58.90 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATCCA:1 - chr3R 26765069 3' - mdg3 5282 2 59.09 GTGTGCGTATGTGTGTGTGTGTGCAACTTGTTATCGCATAGCGTAAAAAGGAGAAACAGCATGCCGCCAGTGCATGAACCAATGCGAAATTAATAACGAAACCGAAAGGCGGCTCCAAATTACACTTGCCACTGACTTGGGCTTCC:1 + chr2R 24305128 3' - accord 7035 2 56.85 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTT:1 - chrX 13548311 3' - jockey 4823 1 58.22 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGGGTAGGTCGTCTAGAGGCCGTTGC:1 - chr2R 15613730 3' - P-element 20 1 66.41 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTTTCTGAATTCTACTTCAAAACAAAAATTTTGGTGCTAATACAGCAATATTTTTACTCAAACTCGCAGCTCCAACT:1 - chr3L 7026774 3' + blood 7335 1 51.72 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACCAGAGTAAATTTACAACGAAAAGTATCAGCCCGATCATTTAGAACGAGCTTGAACATGTTGGGAATCATAATGATTGTAAAACGCAAACAACCCCTAAAGTA:1 - chr2L 13244753 3' + hobo 2919 1 71.92 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCACGACGCCCACAAATC:1 + chr2R 6052711 3' + mdg1 383 2 58.90 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCG:1 - chrX 19498072 3' + P-element 2837 1 49.28 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAG:1 - chr3L 21097108 3' - mdg3 54 2 52.74 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTG:1 + chr2R 21897995 3' - 412 7095 2 54.11 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTTAGATCTCTTGAAACTATCAA:1 - chrX 5222813 3' + 412 7529 2 73.29 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATAAATCATGTAATAAACTGGAGCAGCATAGTCCC:1 + chr3R 26782772 3' + hobo 2887 1 70.91 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAACGGGGATTAAAAAAGTTGATAGAAATATATAGTTAAGAGATTTTGAATATTCT:1 + chrX 12843676 3' + roo 338 2 65.75 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATT:1 + chr3R 12559730 3' - mdg3 67 2 70.55 GTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTACAATGTTGGCTATTATGGCTATTTAATATGCCACGAGCATCGGGATT:1 + chrX 8200842 3' + flea 443 1 53.00 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCTAGGGTAAT:1 + chr3L 23871334 3' - Doc 66 1 57.53 CTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTT:1 + chr2R 4551465 3' - roo 8906 2 52.05 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGTAGCTAATAAAGTTGCAAGTGGTCGCCGTCGTCTGAGTAGCAGTCTGCTAACCATGGCCGGATCTAGGAG:2 + chr3L 22529885 3' - roo 8678 2 75.34 ATGGTCAGCAATCCCACGCTAACCAAATTCCGCTATGTACATAATGTGCGCACATAGCATTTTCTCTCAACCCTCCTAACATAAATATGTGTGGAATTGCAGAAATTATATCTAATTTGTCTACCGTGCG:1 + chr2R 5038521 3' + gypsy11 4154 2 66.15 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCCCAGCACACACGCACACGCATACACACCCACACACACACACAC:1 + chr3R 27499992 3' - hobo 24 1 65.12 TGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCTCTAGTTGGCTGCGTGGGATCTCCTGAAAGCGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGC:1 - chr3R 10468000 3' + opus 493 2 62.22 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACT:1 - chr3L 18708580 3' - F-element 53 1 56.85 GATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAGTTTTTGTATCTTGAACGGTAACAAATCAAATCAAAATTCAATTCCCCAGCAGCTGCAACATTGCCATTATTGTTATTG:1 - chr2R 20015092 3' + X-element 4671 1 54.79 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCGCTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCC:1 - chr3L 14969235 3' + P-element 2795 1 21.23 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTCGGGGC:1 + chr3R 5940518 3' - hobo 78 1 67.81 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAAC:2 + chr3L 22221230 3' - 412 7120 2 63.01 AAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGAATA:1 - chr2L 5771393 3' - Juan 44 1 55.48 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCG:1 + chrX 18193790 3' - hopper 35 1 60.00 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTTTGTCGATTCGGTCACTTGGAAGTCGCAAGACTTTTT:1 + chrX 3444213 3' - pogo 31 1 64.38 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTC:1 + chr3R 6103664 3' - Tirant 65 2 66.67 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTTT:1 - chr2R 16908451 3' + roo 9042 1 64.38 GTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAAGATTCTCCAAAATTGTACAGCTAACCAAAG:1 + chr2R 6559005 3' - mdg3 5329 2 77.40 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGTTGT:1 - chr3R 18903354 3' + pogo 2077 1 69.18 GCTAGATTTAGTTTCGAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCCCTCCTCTGGCTGCCAATCTACCTACTG:1 - chr2L 18163759 3' + HMS-Beagle 183 2 63.01 TTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGGGTAGCGGTGGGTTA:1 - chr3R 19537432 3' - hopper 14 1 76.03 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGTGTGCAGCTAATGAAGCTAGAGTTG:1 + chr2L 15965362 3' - blood 7 2 79.45 ATATGTACATATATATTTAGAGAAAAGAATTACGCATTCTTTTTTATTGATCACGCTTACCGTTGCGCCAACAACTATTCCGAGTGCAATTAGGCTCCAAATCCAAACCATGTCGTATTGTAACCACTGTAACCACTTTACAATGG:1 + chr3L 3484634 3' + gypsy11 3983 2 71.23 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAG:1 - chr2L 16685329 3' - P-element 87 1 26.71 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGAAAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGAC:1 - chr2R 6984336 3' - HMS-Beagle2 28 2 61.18 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAA:1 - chr2L 2690562 3' - hobo 49 1 52.05 AAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATACTTACTGGCGTCATTCCATTT:1 - chr3R 10541194 3' + hopper 1407 2 80.82 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCCACCTTAAGCTGCAGAAATATTTCGGATATTTTTCCCTGCTGCACGGAGAAAAAAATCGTTGAAATCTGAGGGTTGTGCTTTCTATTCCAGCGA:1 - chr2R 23225742 3' - Transpac 4943 2 69.86 AAATTAAACAAAAAAAAAAAGAGGGACACACACACACACACACACAATTTTGTACACAGCCAAGAAATGGAAAATGTT:1 - chrX 2811581 3' + Doc 4699 1 52.56 GCGAAGTCCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGATTATGCGAGCACAACGCGGCGTATGAGTAATTTGCGTTTGCAATTAGAAAAAAAGGCGCCGACGTCGACGTGCTGAAATGT:1 + chr3L 7098451 3' + jockey 4538 1 56.16 ACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACA:1 + chr2L 6074130 3' - BS 15 1 70.55 ATTTGGCGTTCACTTTACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTAATCGGAAAATAGATGATAAAGAATTTTTAATACCCGGATGTCTGGGCCCACTCACCTTTGGT:1 - chr2L 6499813 3' - F-element 71 1 76.71 GAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGATTAGAATATATCAAACAGAAGCAAAAAAAAAAGTAAAATGCAACGATTAAATGAAGAG:1 + chr2L 10172733 3' + invader2 302 1 59.59 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCC:1 + chr2L 10032727 3' - hobo 75 1 69.18 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATTTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACGCCATGCACTTGCCATGGATACACCGCGAACTGACCTGACTGAGTGACTGACTACATGGGACAACTAGCTGGCTATCTGGCTATCTG:1 - chr3R 24175647 3' + Burdock 222 2 63.01 GCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCACCTATTGGTTATCAAAAGCTGAGAGCTCGGCGTTTCATGCTTATTATATAA:1 + chr3R 13357903 3' + mdg3 5264 1 63.83 TCTGTTAATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTAAAAGGAGGGAAAAGCGGTTGCCTTATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAAT:1 - chr3L 4605721 3' + gypsy4 273 1 57.53 GTCACCCATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGC:1 - chr2R 7534594 3' + roo 9004 2 62.33 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTTGAATCTTTAGATCTGTAAGATCTTTA:1 + chr3R 10778796 3' + mdg3 5486 2 77.40 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTACTACTCTTAAATACTGCTCTTAAACTAATATATATTTTCCAATAAGTTACATAAAGCTAGATGTTTTAAAATTTATACCAAAACACATCTAGCTTTATGTAACTTAT:1 - chr2R 14552798 3' - mdg3 5314 2 47.95 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGTATGTTGAACTGCGCTGCTGATGGCTTGTACTG:1 + chr2R 982432 3' + HMS-Beagle 6994 2 53.42 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGCGGAAGAGGTAAATTCCGCTGGCGATGCAACAGATC:1 + chr2L 7991409 3' + 297 366 2 67.12 AAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTAAACATAAAAAAGTACTTAGCATTTAATGTTT:1 + chr3L 13313178 3' - roo 487 1 58.90 AGGGATTTAATACGAACAACTTATCGAAGGGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGATTTAATTTACACGCCATGCTTAATTTAATTTAACAGTCAGTTACAACTCGCAAACCGAACACAAGTTGGCCAAA:1 - chr3R 27569156 3' + Dm88 283 1 52.74 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGT:1 - chrX 18125141 3' - BS 5081 1 76.03 ACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCTCTGCGCTGCCAACGAAGCCGGAAAAATGTAGCTGTGGAAGCCCCTCACC:1 - chr2R 5848915 3' + mdg1 407 2 75.00 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCTTCCATACTCCACACACATCACACCAGAAA:1 + chr3R 18847407 3' + Stalker2 367 2 57.53 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTATGAATATAAATGATATGGCCTAAGAATATTTTATTTTAAAAGATGGTCGCGAAAT:1 - chr3R 5245543 3' - 1360 35 1 62.33 TGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGACTCTACGAGTATTATA:1 - chr3L 21630292 3' - Burdock 37 2 60.27 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATCAGCAGTGTTATTCCATATGGTAACAC:1 - chr3R 14663181 3' + pogo 2070 1 63.01 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGACAT:1 - chr3R 9938617 3' - roo 85 2 76.71 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACG:1 - chr3L 18835265 3' + pogo 2069 1 63.04 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCAATTCTAATTTCTAAGCTGCTGGATCTAAGCTTAATGCTTTCGA:2 + chr2L 9287153 3' + jockey 4987 1 68.49 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATTCATAACAAATCTTACAAGTTTCTTCTTTAGCGCAGGGCGGTCTCGTAAGATTCGCTCATAATAATGGAGGGTGTTGTACAGATATGTTATAG:1 - chr2R 22892572 3' + pogo 2078 1 69.66 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCGACTTTCAGG:1 - chrX 16244851 3' - jockey 4783 1 64.38 TAACTTTTTTATTACATAATTGGATCCTACAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCATTTCTTTTATTTCGGTTGTGTCCATTCTGGCGAACTTACTTCCCTCATTCATTCTACGCCTTTGTTCCT:1 + chr2L 13630676 3' + Cr1a 4272 1 56.85 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATC:1 - chr3L 24153181 3' + Tabor 415 2 65.07 AAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAA:1 + chr2R 5849037 3' - mdg1 85 2 74.66 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAGAGTTAATTGGGTT:1 + chr2L 8772813 3' - Tabor 6913 2 66.44 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTA:1 - chr2L 12481428 3' - pogo 64 1 60.96 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATAT:1 + chr3R 25271285 3' + 412 443 2 53.42 TGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAA:1 - chr2L 17228619 3' - mdg3 5320 2 63.01 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGCCTATTGCGGCTATGCTGTTTTGTTTGATTTTTTGGTACT:1 + chrX 19498172 3' - P-element 62 1 43.84 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAAC:1 + chr2R 7404782 3' + blood 7352 2 50.36 GAAGAGCAGCGTATATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7203 2 82.19 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAAT:1 + chr2L 6406562 3' + transib2 2753 1 71.23 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTAT:1 - chr3R 20452162 3' + blood 7348 2 56.85 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCA:1 - chrX 21668682 3' + mdg1 394 2 58.22 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACTGCTCAAGCGGCTCTGTG:2 - chr3L 19274760 3' - transib2 32 1 63.70 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGCAGTAGCTGCATTAC:1 + chr3L 5490928 3' + 412 7496 2 60.83 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACA:2 - chr2R 21227372 3' - mdg3 5338 2 76.03 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACC:1 + chr3L 20785523 3' - P-element 87 1 26.03 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAA:1 - chr3R 16041129 3' - jockey 93 1 76.71 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCC:1 + chr3L 3540211 3' - mdg3 5307 2 62.07 CGGAAGAGACTAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGGTGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAACTAAATTGGCATCGTAAAACTGCAAAAAATATTACCAAGGGACTGGAAATTAGCA:1 + chr3R 9383695 3' + diver2 233 2 65.03 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACAT:1 - chr2R 18807781 3' - jockey 84 1 65.75 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGT:1 - chr3L 21630333 3' - Burdock 78 2 72.60 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATACTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGT:1 + chr2R 9164925 3' - 412 67 2 62.86 ATGCTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCG:1 - chrX 19498083 3' + P-element 2820 1 39.58 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGCTGTGAAAAAGTCCACAAAAGTATCTG:1 - chr3L 22635656 3' - hopper 44 1 55.48 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTC:1 + chr2L 17162873 3' + blood 7337 1 52.05 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCA:1 - chr2R 7223642 3' - blood 49 2 52.05 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTGAAAAAGTATTTGAGTTATCCATGTCACATAAGTTATACCATTTTATTTCATTC:2 - chr2R 14705706 3' + roo 401 1 76.03 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCAACTGAGTCTTGAAATGGATTCATTGCCTTTAACGA:1 + chr2R 9164976 3' - 412 7075 2 69.18 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTTTTATTCTTATCAGCCA:1 + chr2R 18048918 3' - opus 7164 4 58.22 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATT:1 - chr3L 13597758 3' - blood 7085 2 69.18 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTAGTGTGATATTTCTCTTCTATACAG:1 - chr2R 6558967 3' + mdg3 168 2 77.27 ACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGTCATGTCTTTACCTCGTTTAGAGTTAGAAGCCGCCAGAATTTACAAGACAAGATAGTTCGCTCCTCTAAATTTCAGGAATTGAATCCGTTTTTGATACAGT:1 - chr3L 26345102 3' - Porto1 386 1 77.93 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGAAGTGGTATGAGTG:1 - chr3R 20452143 3' + blood 355 2 69.86 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGA:1 + chr2R 15080126 3' + roo 9026 1 54.79 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGGATATAGTATAGTAATATAGGGTCCATTATGGAAC:1 + chr2L 12481665 3' - pogo 12 1 50.68 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCA:1 + chr2L 17162876 3' + blood 7340 1 50.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTGAAAAAGTATTTGAGTTATCCATGTCACATAAGTTATA:2 - chr2R 14705722 3' + roo 385 2 66.44 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAA:1 - chrX 18193675 3' + hopper 1388 1 66.44 CCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTCAGACAGTTGGCACATCAACTTCTCGGCGTGTTAACGAACA:1 + chr3L 4738459 3' - Idefix 73 2 71.92 AGCTGGAAACTCTAAAAAATTTCCACATCTCCGGGCCGGACTAAGGTGTCATTCGACCCGTGCCGAGAGTCTGCCACTCTGGTTAATATTTACATACCGCCGTTCATTTTCAAGGAATGCCCGAAGAGG:1 + chr3L 3982046 3' + baggins 179 1 63.57 AAATATTTGTATGTATATATATATTTATGCATTTTTCCCTGTGCCAAGAGGGAGTTAGCAACTGTGTGTGAAAGGGAAGGCAGCACCGAGGGAATCTCTGCCATCTGTAGGAATGTCTGTAAGATCCTTCGCTGCGTTCCCTTTTT:1 - chr3R 21640646 3' + 1731 4409 1 58.22 AATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCACTGGCATCCGTCTGCAACA:1 + chr3L 23678143 3' + Stalker 263 4 67.81 GAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATTGGCAGCTTTTGGATGCCTAATAATGATATTTTGCCAGAAATAATATTTTATAATA:1 + chr2R 10955979 3' + BS 5017 1 61.38 GCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCG:1 + chr2L 6074058 3' - BS 72 1 74.65 GACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAAC:1 + chr3L 3979662 3' - opus 187 4 70.55 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCGACTTT:1 - chrX 16244855 3' - jockey 4787 1 61.64 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGATGCTGTTTCTTCGCCTGCAAAACACGCAGTTCCATCTCGAAACACGGCTTCATATAAAACATT:1 - chr3L 6578719 3' - pogo 67 1 55.63 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAG:1 - chr2L 18581281 3' - roo 72 2 67.12 CCAAACTCACTTTTTAGAAAATATTGATCATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAAAACCACTGCTATTCTTAACAGACGTTGCGAATTTTTTGCATGCCACTTAAGCCTTCTCTTAGCGTAGAACAAAGCGAAAGGGACAGCCTCTGC:1 - chr3L 3494652 3' - HB 267 1 49.32 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTATTTATTTTTTTGTTAATTTGA:1 + chr3R 12363273 3' - jockey 61 1 50.68 AATAATAATAATAATAATAGTAGTAATACAAGATACACATGTGTGCGCCAGTTAATGTGACATTCATTCAGAAAAACGAGACATTGTGAATATTTTGGCAAACCGGTTTGGTGCTTTTTTATTTGAAATTCAACGAAT:1 - chr3L 15319647 3' + mdg1 40 13 77.54 GAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTACGTTGTATGCGCAGATTCCAAACAGAGCTAGAAATAAAGTGAGGAAAATGCGGAAA:1 + chr3R 2161045 3' - roo 9009 2 61.64 CTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTAGGGTTCAGGGCTGCAATTGACTTCTGTTGCACTTCTGGCCAGGAAGACTTCACTTTCATTGAAACTTCTCCTAACGTAAAGCGGTACCTTCAGAATTTTCTGAGTA:1 - chr3R 17409669 3' - baggins 5352 1 57.53 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTAAAAGCGAGAATGT:1 - chr3L 4710687 3' - Doc 31 1 67.12 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGC:1 - chrX 17614398 3' + roo 325 2 74.66 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGGTGT:1 + chr2L 14796924 3' - I-element 82 1 73.97 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACGAACCAATTTCAACAAATCTAGACCCCCTACACACTGAGAAAAATAATCTAAGCGCTGATATTTTCTAAAGAGCTAAGTGCATTTG:1 + chr3L 14863962 3' + Transpac 274 2 60.96 AAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTTAAATGTTGCAAATATATGTTTGGAACAATTTATTGATTTAATTT:1 - chr2L 8688567 3' - roo 411 1 68.49 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATACTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCCGGGGAGAGCTTAT:1 + chr3R 25443160 3' - 297 35 2 59.59 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCA:1 - chrX 11228552 3' + roo 9012 2 57.53 GACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTACACACAAAGACTGTTCCAAGAAAAGTTCTACGGTTAGCTAGTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCA:1 + chr3L 21093222 3' - Cr1a 4058 1 47.95 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCA:1 - chr3R 26315883 3' + roo 9019 2 52.74 CTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAA:2 - chrX 14914339 3' + mdg3 193 2 54.11 AATATCTATCGATATCCCAGAATTGTGATGAAATTTGGCCTTTGCATTTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAGTATTTGAGTTTGAGTATCTGGAGAGTATCCTTCGGTTCCAGCAAGTTGGGTTACTCGAGTTCACTTCTTC:1 - chr2R 11634166 3' + INE-1 497 1 54.11 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATG:1 - chr3L 5446121 3' + roo 324 2 75.34 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAACGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTC:1 + chr3L 13597863 3' + blood 349 2 60.00 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTTTTATCACTCAATAGTTTTGCTGCCAGATTATACTTCCGAATTGTAAGCGTAACTTTAGCCACTGCCAAGTGGATAAGAGGGGGTGCTTCAGAAGTCGCACAATAATATTTATTT:1 + chr2L 5341388 3' + S-element 1713 2 75.34 AATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATAAAATAAAACGACAACTTACTTCAGGTTCATTCAGCAAAGTGTTGTATACTTTCGGGCTGCTGTCTCTCCATT:1 - chrX 18707426 3' - BS 4737 1 67.59 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATA:1 - chr3R 10778660 3' - mdg3 75 2 67.81 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAA:1 - chrX 18193702 3' + hopper 1361 1 56.16 CATGACTTCTTTCGGCAAAGCGATTATTTTGTTTTGAGGCGATCTTTTGTTTAAGGCGCTTTTACGATTACTCAAAAGCATGCAAAGATAGATAGAACTTCTCACGTTATTTCATGTTCAAACTGATTAGTTTTACACCTGCTACA:1 + chr2L 19365771 3' - transib3 2463 1 62.33 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTT:1 + chr3R 13358664 3' - mdg3 88 2 74.66 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAGTGTGCTCCTCTTCAATTGATGA:1 - chr3L 13721972 3' + blood 7375 2 75.17 CGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAATTGGCATCAGGACCTCAGAAATACCACCAGCTGCAACTCCAGCTTCTGGTGCTTCTCCTCCAGCCCAAAAGGACGACG:1 + chr3R 13196166 3' + F-element 4487 1 54.48 TACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATACATGTTATTTCTTTAT:1 - chrX 19162529 3' + pogo 2093 1 76.39 AGGGTGCGGGAGCATAACTTCTTTTTTCTACAGCTTCCAGTTACAGCTAAGTTTTGTTACGGTTCAGTCGCCTTCATGCGTTGTAATAGTGAGGATCGTGCGGGAGATATAATGATAAATGAATTACGTCGACAGACTGTATGTTT:1 + chr2R 3287380 3' + mariner2 2 1 70.55 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATTAGCATTCGGTTGCCTTTTTGGATAA:1 - chr3L 20747051 3' - Burdock 6155 2 72.60 GTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACAATTTATTATAGAAATATAGATATTTTTTGCGTAGAATCAGCTAATAAAGTTTCGTAGCAAACGGCAGCAATAATTATAAGCAG:1 - chr3R 18469098 3' - Quasimodo 35 2 63.01 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACAC:1 + chr3R 5087134 3' + P-element 2853 1 62.33 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACTGTC:1 - chr3L 1387094 3' - mdg3 28 2 64.83 CTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACAGAGTCCCTTCTGAAGTTCAGCAATGTCAGTCTTAAGGCCATCGATCTCCTTGGCGGAGAGCGTAAACCAGTTGGCG:1 + chr2L 17463355 3' - invader4 2959 2 54.29 CTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACA:1 + chr3L 8253761 3' - jockey 4667 1 60.96 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAACTCTATTACAGATAGAGTTATTTGATCATTAGTCTCATTACTCGTTTTGAAACTAACAAA:1 + chr3R 20909014 3' + I-element 5286 1 58.90 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATAAGTCGCAAAAGTCTCGTGCGAGGCG:1 + chr3R 25753745 3' + hobo 2906 1 63.45 AATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTCCAAACAAAAGGTAGGCGAAATTGAAGCCGACTTGATGGGCTGTAAATGGCAAACTTTTCTTTTCGCTTTTCCGG:1 - chr3R 20876843 3' + jockey 4833 1 50.00 GGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATCTAACCGCAGCCTTTTAGACGTAGAAAACGTATGGCCAGTACGATAGAACCGTCTGTCTGCGCGCCGAGATCGTCGG:1 + chr2L 6196961 3' + 1731 4589 1 64.75 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGC:1 - chr3L 5490828 3' - 412 7100 2 54.79 CGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACACTTTCAAAATTTCAAATCTAATTCAATAATTGCGGACTGATAC:1 - chr2R 19633147 3' - jockey 4580 1 79.45 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACACTAGTTTAGAATG:1 - chr3R 9481985 3' - roo 8700 2 61.64 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCATGTCATTTTGGGTTTCTCTTCAGTTCTTTGGCATTTCTCTTGTGCTTTTTTG:1 + chr3R 27786649 3' - Tirant 68 2 63.01 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTA:1 + chr2L 2519919 3' + roo 9027 1 54.11 CGCAATATTACAATTTCAGCATACACGTGCTGCATGCGCTTACCGGCCATATGTTCTAAGATGTAATCATAATCTTGCTAGAGAGAGAGAGCAAGTGCACCCATCAACACCGAGGGTGTATTATCTTTTGGCCAGGAGTGAAACTT:1 + chr2R 8838203 3' - invader4 53 2 53.42 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGA:1 + chr2R 24427599 3' - jockey 4758 1 73.97 TGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTGACAGTTACGTTTGAAATTGCCGTTTGGAAAGAG:1 - chrX 5892097 3' + transib2 2740 1 75.34 ACACTGCCGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGCCTTGAATTCGAGCGGGTCGCAAAAGAGAGAAATAACCATGTGACCAGTAAGTTAGTACACGCGGTGGGCCATACGTGCACGAAGAG:1 - chr3L 25255119 3' - GATE 119 2 58.90 CATCCACACACACACACACACACACACACACACTAAGGCACACCCAGTGGGTCACATCCCGACACCGCCATCGAGGTGAACAGGAATTGGGCCGCAGCGG:1 + chr2R 16076264 3' + accord 7026 2 79.00 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCC:1 - chr2L 15833012 3' + hobo 2880 1 68.55 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGC:1 + chr3L 20076885 3' + roo 9033 1 60.27 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCCTCATTTCGATTGCAAACTTAATTTGAAAACTTGGCC:1 - chr2L 10650372 3' - Doc 88 1 78.08 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCAGCTTTGAGTTAAAGGCCCATTAAAGGACCCCCCAAAAACACAAGTTGCCACTGCCCCTGGCGTGTCCGT:1 - chrX 20386635 3' + hopper 1391 1 63.71 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATAAACAAATCTTCATCTAAACTTGAGCCTAAA:1 - chr2R 16409988 3' + opus 459 2 58.90 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGGCT:1 + chr2R 18882701 3' + roo 9044 1 64.38 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGG:1 - chr2L 13877662 3' + Transpac 259 2 53.79 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCC:1 - chr2R 17986279 3' - 297 59 2 74.79 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCAATCGCTTATTTGCCTATGCAAATTGTTGTGCATTAAGCACACACACACACACATGCACACTCTCTCTCACACACACACACACTTAAACG:1 + chr2L 12814890 3' + hopper 1388 1 60.96 AAGTAGATTCACTAGAAACTATAAGCCTCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAAATGCATGATCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATTTATTGATCTTTTTCGACCGAATGAAATGCAAAAAAA:1 + chr2L 15303065 3' + Cr1a 4114 1 71.23 GACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCGGCTAAAAGTAAGCTTA:2 - chr3L 22980568 3' + INE-1 580 1 58.22 ACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACGTAATTTTTCGTTTTTGTTCGCCATAAACATATAAATACAGAAATTTATTTTTATACATATTTTATGTGCATGAAATTTCTTTAAATTAAAT:1 - chr3L 9424676 3' - Bica 4658 1 60.96 ATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTCGCCAAGTTTATAACAAAGCAAAAAAAAATTCTAAACCGAAGTACTAAAATGCCTCATTGAACCAGAGAAAATTCTTT:2 - chr3R 27845451 3' - Stalker4 44 4 50.00 GATTCTAATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAACGCTCAACGAGACT:1 - chr3R 16771349 3' + roo 8995 2 66.44 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCT:1 + chr2L 17069628 3' + 412 432 2 68.99 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACT:1 + chrX 3452496 3' - Tirant 8195 2 78.08 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCCCAT:1 + chr3R 22846827 3' + 412 455 2 58.90 GATATGAACGGAGCCCGAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCATCAC:1 + chr2R 22255446 3' - roo 8702 2 58.22 ATCGACTCGGCTATTGATCCCTTATACAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCGTGTTACATTCCTTTAAATAAGAGTGCATGGAATCGCTTCGGGTCAGCAAGTGTGAAATATTCTTTTGATTTTGCACATCCTGTACCACCGCCTG:1 - chr3R 22168287 3' - INE-1 95 1 53.47 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAAA:1 + chrX 16853435 3' + roo 356 2 54.11 TCTTGAGGCGACAGTTTTCTGAATTGTGGGCAATTCAAAATTATGTGGTCTACAGCATTGCAGACAGGCCAGCAAGGGACCAGTCCGCTTAAGTGGTAGTCAGACATTGGTTTT:1 + chr2L 17107441 3' - G3 106 1 70.18 AATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGG:1 + chr3R 12559727 3' - mdg3 70 2 72.60 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATT:1 - chr3L 20747076 3' - Burdock 6180 2 55.48 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAATGATTTTAATTTTTTTA:1 - chr3L 4639058 3' + roo 9020 2 55.48 ATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGC:1 - chrX 21474409 3' - 1731 74 2 80.14 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAG:1 + chr2L 15920153 3' - jockey 93 1 75.34 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATTTTTTTTTTCCTTGCAAAAGGAAGTGAAAAATGAAAACGAAATGACTCTTAATGGGAAAAACGTCCTGCATGGCA:1 + chr3R 14527098 3' - 297 34 2 60.27 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTG:1 + chr3L 14581479 3' - pogo 63 1 60.96 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGTTAGCTTACGAAAGTGAAACTAATTTCCGCTTTTACGTGGATACCACTTG:1 - chr3R 5940389 3' + hobo 2926 1 75.34 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGGAAAGCCT:1 + chrX 3506211 3' - Tirant 8 2 76.03 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTTATATAGATAGTTAGTTATAAATTATTTGA:1 + chrX 12551849 3' - pogo 19 1 72.60 ATTCTGCAGCCTCTTCGCCAAAATAACCGACTGGAATAACTGTGTTTTCAAAAATCTGTGTCAGGGAAGCCAGGGAAGTTGTTCATACTTATCTAGGTCTATTAGCAATTGACGTGACATGCATATTACAAGTGTCCTCATGATTA:1 + chr3L 26869973 3' + hopper2 305 1 56.16 TAAATCAGGATCTTGGGTTCCTTCCTTTCACATACTCACCAAGTGAGTAGATTAAGATTTGTTAACTTATTGTTAGGCTCTACATACCAAGAGAAGATTCAATTAAATTTCACTACCCAATTAAAAAAAATAAAAAAAGATGCCAG:1 + chrX 4942280 3' + G3 433 1 68.49 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGGAAAGC:1 + chrX 3506209 3' - Tirant 10 2 74.66 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTATACAAAATCTACGGAAAACCAGCCCGC:1 + chr2L 14222397 3' + Transpac 298 2 78.08 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCGGGAACGCAACTATATGC:1 - chrX 20552780 3' + roo 9010 2 58.90 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGCTCACGCACTAATACAAATTCTGCCCACACACACACACACATTCAAGCAATCGCGTACAGAGAGAGATGC:2 + chr3L 7434963 3' + pogo 2053 1 56.16 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATAT:1 - chrX 22858873 3' - mdg3 84 2 73.97 GGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTATGTCTAGGGTTTCAGCTCGTTTCGCAATTGCCGACAATGGAAATGTCTTTTGCAATTTAACA:1 - chrX 9304270 3' - hobo 2621 1 57.53 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCCACACGTCACAGGTTGCTTTCCTTATTTAAACAGAAATTTATGCTAAAAACACAAG:1 - chr2L 19816722 3' + pogo 2037 1 60.96 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTCTTTATAGATTTATGAAAATCAACATGTT:1 - chr3R 10778628 3' - mdg3 5295 2 56.85 GCGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGA:1 + chrX 19231822 3' - mdg3 5331 2 69.86 GTCATCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACAAATTGTTAATAATCGTATAATGGATGACCATAAATTTCGAGTCAATTTCAAAAGGGACTATATATCCATATCCAACAAAAAAATGTTCACTATTG:1 - chr3L 14952396 3' - transib2 2449 1 59.31 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAAAGCCCCGCTACTTTTGGCCTTAGTTGCTGCTGCGGTTTGGAGCG:1 - chr2L 1136270 3' + 1360 3363 1 67.59 TCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGGCAAAACCATGAGCCCATTGATTTTCC:1 - chr3R 9289249 3' + HMS-Beagle 7027 2 75.34 TTGTCATTGTGGGCTGGCGTGCCCAGAAGGCCAGGAGATCCGCCAGACGATGGACGTGGCAATCGCTGAGTTAAAGTCGGCCGCGGGCGGGTTTGAAGTAATAAAAAAAAAGGGTGGCCATACCAAATACCAAATAATGCTAAAAC:1 + chr3L 27358523 3' + gypsy2 6379 1 60.27 CGTCCAAATATCTCTAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGG:1 + chr3L 5438842 3' - hopper 50 1 50.00 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATATCGGAATTTTAAAATAAAATTTGC:1 + chr3R 8022224 3' + roo 9007 2 62.33 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTC:1 - chr2R 18048804 3' + opus 437 2 62.07 AACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGATTTACTGATTAATTTGCAGGAATTATGAACTGCAGAGCGGCGCAAAAGTAAACAAAACATTT:1 + chr3L 9370999 3' - blood 271 2 57.53 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACA:1 - chr3R 27835606 3' + 412 7463 2 73.29 AAAAATATATTATAAAAAAGAATTTAAAGCTAATCTTAGGTTACCAAATCAACAGTCCCGAATTGTCCAAAGATTTGCTCCAGGTTGGGATTGTGCTACAATTGGTATGGTTTTATGAATGTCCTTAAACAAGGATATTCTTATAC:1 - chr2L 3635575 3' - hopper 163 1 44.52 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGG:1 - chr3L 15035129 3' + pogo 2034 1 73.91 TATTAAGAAAAGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACGCGCCATTTTCATTGCTGGCTTACGCCGTTGAGATGTTATTTTGCCCGGTGGCATATTAACTGCATCACGAGCCACTCCAAAACGCAGCAAAACCGTCCATTCAG:2 + chr3R 11121845 3' + copia 241 1 76.03 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGCCTATTGCGGC:1 + chrX 19498143 3' - P-element 91 1 23.97 AGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTATCAAGAGCTTTTCTCTCAGAGAGAAAGTCGCTCTTT:1 - chr2R 8686580 3' + hobo 2853 1 74.66 AAAAAATAAAATAAAATAAAATAGATAAAATTCATGCGAAAAACGGACCAGGTGTAAAGCCAAAAATCAACAAGAGATAAACATGGCTCTTAATTAATTTTGTAAACGGGTTGTGTGCACTGTGAAACACAGAGAATATTACGTGA:1 + chr3R 25933241 3' - transib1 1900 1 82.19 GGCGGTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTG:1 - chr3L 18708617 3' - F-element 67 1 68.29 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTAT:1 - chr3R 7569561 3' - Doc 21 1 42.96 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGATTTAACACTTG:1 - chr2R 5992269 3' + pogo 2069 1 62.14 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTTCTGGGTCATCTGGATCTACGGCACAC:1 - chr3R 24693564 3' + hobo 2889 1 56.39 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTATATACAAAACGACTTCTAAATGTTGGCAATAGCAATTAAAACATTTATTATTATAGTTACAGATACGAAAT:1 + chr2L 8452350 3' + copia 206 2 52.05 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCT:1 - chr2L 12355290 3' + hobo 2863 1 71.23 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGCGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGTGTAAGTGCCCAGTACGTGAG:1 - chr3L 14863807 3' - Transpac 4952 2 62.33 CACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGTGGCGCCAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAA:1 + chr2R 4253306 3' + Max-element 286 2 54.29 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAA:1 - chr2L 20923024 3' - pogo 55 1 58.90 TAGTTTAGGGTCATATTAAATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGAC:1 + chr2R 5022778 3' + Gypsy12A_LTR 81 1 52.05 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTAC:1 - chr3L 6096473 3' + roo 9031 1 57.53 TTTGTTTTTTATTTATAATTATGTTCTGTGGATGGGAGTAAGAAAATTGCAAATTGCAGAAAGAATTGCATTCAGGGCTACCCCTGAAGAAAAATGCTAGTAAATAATAATTGAATTCTAAAATATAACATAATGTGGTATTATGT:1 + chrX 17088839 3' - Burdock 312 1 58.22 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATG:1 + chrX 11534527 3' - roo 8734 2 67.12 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGCCTATTGCGGCTATGCTGT:1 + chrX 19498151 3' - P-element 83 1 29.45 CTATTGATCCTAATCAAGACTATATGAAAACGGATGGACTCGGAGCACTACATGGAGATCACCAAGCAGTTCTCGGGCAACAACTACGTGGACCAGGTGAGTTCTGGCCAACTGGTGCCAGCCGAAACACAAGCGAACGGTGGTGA:1 + chrX 17279696 3' - INE-1 85 1 78.08 AGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTGG:1 - chr2L 21580872 3' - INE-1 542 1 51.37 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTGTAGCTTTCCTAAG:1 - chr2L 6406467 3' - transib2 57 1 54.11 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTTGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTT:1 + chr2R 18882708 3' + roo 9051 2 69.18 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCTACCCACATCAACAATAAACCGAAA:2 - chr2L 10912215 3' - Doc 59 1 55.48 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAATGATTAATTTTTGCTTCTAAGATAACCATATAGTATCATTTAATTTAGCAAATCTTAGGGTAGTTCATCT:1 - chr2R 13849620 3' + roo 9020 2 54.11 ATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTCCACTGTAAACGTTCTCCTAAGAGATTTGATCTCTGTCGCCTCGCCTCCAATAGCGTTTCTTTCAAGAAACCGCAAGGGTGGCGGACGAGACGCACATCCGTGGCAAA:1 - chr3R 18669714 3' + 1360 3117 1 75.34 GCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTGTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTC:1 + chrX 4566255 3' - Transpac 4978 2 63.01 CCCTAAACCTCCACGCCTCTAACGTTGTCGGACACCGAACCGGGAAGGCGAACAACTAGAGCACCGCACGCTATTGCAGCCATATTGGCTAGGTATTGGTAACATTGTATATGTGTGCATGTGGGGGCAGCAAACTGCAAGA:1 - chr3L 5126290 3' + Tirant 8125 2 50.70 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTT:1 + chr3L 21387522 3' - pogo 64 1 68.28 GCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCGTTCCGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGTTTCCTTCGCGGATGTGTGGCGCATTCCTCGACCCCGTTTGCTTATAAATTCGTT:1 - chr3L 3508521 3' - F-element 221 1 62.33 ATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATTGCGAGGAGGAGGAGCAGGGATGTGGAGCAGTTGGCAGA:1 - chr2L 14974778 3' + Tirant 116 2 73.29 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGGTAAAGTGTGTCGTTGCAAATATGTCCATGCGT:1 + chr3R 10143077 3' + 412 7530 2 73.97 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGA:1 + chr2R 22692429 3' - Ivk 65 1 61.64 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTGTGAATAGACTATTTCAGGAAACTAAACTATCTTTTATAAGAACGGTTATATTAATCTAAAACATAATTAGGTATGCTAAAATAAAATAACTGGCAGAGTGTTCAAAAAT:1 + chr2R 9332273 3' - roo 8675 2 78.08 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGCCGGGCACAAATTAAAAATGCCCCACAATTGCCCGCGTGTTTGA:1 + chr2R 24338496 3' - 1360 19 1 71.92 ATTCATTTCTTCGATCAGAATTAATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTTCTTGCTGCTGCTAAAAATACACTACCATATATTTCACTATATTCTCAACTTCCC:1 + chr3L 8000891 3' + 1360 3166 1 62.07 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCAATGTCATTGTC:1 + chr3L 12863780 3' + Transpac 274 2 55.74 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCG:1 - chr2R 6984415 3' - Doc 60 1 54.55 GTTTATTGAACATTTAAGATTAAGATTAAGTAACATAAGTAACAGTAAGGAGGGCAAATCCAGGACCCCCCGCGGTATGGCCGTGAAGCATTGCTTCGCAAGGACGTCGTATATATTTTGTCACCAGTCTGGAAACAGTTCTTTA:1 + chr2R 20209979 3' - Rt1c 5408 1 48.97 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCAACTC:1 + chr2R 18882714 3' + roo 394 1 74.66 GTTAAGGGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGTAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAG:1 - chrX 15089496 3' + P-element 2857 1 52.25 TTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAATGAATTTTAAAAGCT:3 - chr3R 20001618 3' + FB 35 1 50.68 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGATTATGACTGCCTTACTTAAACTGTGTTATCAATAAGTGATTGACAATCACGAAAAACAAACAAAGCTCCAAGCTCGCTTATTATTATTTT:2 + chr3R 23664521 3' + pogo 2074 1 67.81 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGG:1 + chr2L 14222368 3' + Transpac 286 2 65.89 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTT:1 + chrX 18193834 3' - hopper 31 1 58.57 ATGACTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTATAAATCATGTAGAAAATGCATTATAATAAAAAAATATATGCTTTTGGCTTAAACACGGGTGACATAAGCTAGACATAAGAATTATTGCATTTAATTACACGATC:1 + chrX 8088090 3' - blood 7183 2 56.85 CAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAGAGAAGATTCAATA:1 - chr2R 5284497 3' + Doc4-element 2634 1 73.97 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTC:1 + chr3L 9430656 3' - P-element 69 1 38.36 GGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGAC:1 - chr2R 19076495 3' - F-element 194 1 61.64 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCC:1 - chr3R 6068303 3' - jockey 4760 1 82.19 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCTACTCAATTTTCCTATACAAGATAATTTTCTTTTTTCAAAATAAAACCAGGATTTGAAGAACTTTTACCATTTCTTCT:1 + chr3R 4913665 3' - 1360 43 1 56.16 TTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTGCACTTTATTTTTTCCACTGTG:2 - chr2R 11656001 3' + HMS-Beagle 194 2 54.79 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGG:1 - chr3L 18296894 3' + Juan 4174 1 53.19 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTC:1 - chr3L 13597761 3' - blood 7088 2 71.23 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCATATATTTGGGGGCGCGATTTTCGGGGGCTGAGCTCCTTTCGCTGTGTT:1 + chr3R 11553752 3' - hopper 41 1 53.33 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATGCGCATAGCAAGTAGCTTGCTGGAGTTT:1 - chr2L 8392969 3' + I-element 5295 1 58.22 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCGACAGAATATAACATTCAAAGTT:1 + chr2R 1277202 3' - Tirant 8120 2 78.08 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCAT:1 - chr3L 9430601 3' + P-element 2791 1 22.60 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACATTGTCAATAGAATACAGCTAGAACCCGAAACCGAATCGAAACAGGAATAAATCCGGCTTAAGGCC:1 - chr3R 30568794 3' - roo 8718 2 56.16 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTGGGATTTTTGCGGCG:1 - chr3R 25753590 3' - hobo 31 1 65.07 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGAC:1 - chrX 22858841 3' - mdg3 52 2 52.05 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGACATGCACTGACAAAATTAATTTAAAAAAATTAAAATTCCACTTACGAAACAAAATTTCCCTCTAGTTGTATTATGTATACAGTCA:1 + chr3R 15030813 3' - jockey 23 1 71.92 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGAC:1 - chr2R 15613784 3' - P-element 79 1 24.81 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCATTTTCGTTTCGCTCTTGGTTTTTCTTATTGCATTTTTATGCCCGCTC:1 + chr3R 26316037 3' - roo 8680 2 74.66 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACA:2 + chr3L 9242078 3' + roo 335 2 66.44 ATCATATACCCGTTACTCAACTAGAGGGAGGTGCCAGGAAGATGTCTCTAAAAATTTGTTGGCATAGCAACGAATATTGTAAAATAGTAATAGTAAAATGACTGCTTTTTGCGGTTAAAGTAACAATGTTTTAAAACAACTAAGCG:1 - chr2R 16193766 3' - INE-1 545 1 51.37 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCCGCACTTCGG:1 - chr3R 30272972 3' + Tirant 8479 2 58.26 CCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGT:1 - chr3L 25232772 3' + accord2 123 2 69.86 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATATTATAGATTATATTATTGCAAGGACTACCAAAATTCGTGGCTACCACTTAAGCAGCAGAATTCAGTTTTAAAT:1 + chr3R 13494438 3' + opus 7460 2 56.16 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCG:3 - chr3L 2036997 3' - Doc 59 1 57.53 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATAACTTTCCCCAGGCTAACCTTTTCAACCAATTGATTATCGGCTAAAAA:1 - chr3L 15890957 3' - mdg3 5264 1 65.75 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCT:1 - chr3L 24153196 3' + Tabor 7239 2 75.34 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGTACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTGGCTCCGCGT:1 - chr3R 22659911 3' + 412 432 2 60.00 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAGAG:1 - chr3R 15465452 3' - mdg3 5288 2 60.27 CGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGGTCGCTTTCGTTGCTGGGG:1 + chr2R 23225877 3' + Transpac 246 2 63.45 TCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGTCTCCAGCTCTTGCTGTCTTTATTTAATTGGTTGATTGGTTGACTTGGGTCGCTATACTCTTGGACCGCTGCGCTGTGAGGGCGATGATCTGTTCAGTAATGTGGTGACCTTCCGC:1 + chr3L 12154524 3' + gypsy6 7596 4 47.26 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGG:1 - chr3R 7884539 3' - jockey 4822 1 61.64 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATTTTTTTTTTCCTTGCAAAAGGAAGTGAAAAATGAAAACGAAATGACTCTTAATGGGAAAAACGTCCTGCATGGCATGAAAATTTCAG:1 + chr3R 14527110 3' - 297 6603 2 68.49 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCA:1 - chrX 11228565 3' + roo 8999 2 66.44 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCAATTGTTGGTTGTCAGCATTCGTG:1 + chrX 5222996 3' - 412 7076 2 69.86 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGGTAAAGTGTGTCGTT:1 + chr3R 10143059 3' + 412 7512 2 61.64 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTT:1 - chr3L 9571656 3' - jockey 74 1 63.70 GTCTGCATGGCGCATGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGTTCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATATAATGACTGCCTCTCATTTTCTGTCTTA:1 + chrX 22383091 3' - invader1 41 2 43.84 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTGCATGGATTCCCATTTCCCATCCTTCTGAAGGCGGGACTGC:1 + chrX 8272528 3' - roo 8717 2 55.48 CTATAAAACCTAGAAGGTTAAGATTTTGCATACAGATTCCAGAGACATAGACGCAGTACAAGTTGCCACACCCGCAAACCGCACAAAACAATTTTTAAATTTTTTCTTATTTTATTCCCTAATATCTATTGATATTCCAGAAAAAT:1 - chr4 972662 3' + INE-1 161 1 39.73 AGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + blood 7140 2 90.00 GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATAGTGTAGTGTGAGAAAACGGCAATGGCCTTGCTGGCTTCGCATGGGCCGGGAATTTCGAGTTCATTAAAAAT:1 - chr3R 14165017 3' + Tabor 7238 2 51.37 CATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATTAG:1 + chr2L 22063435 3' + INE-1 122 1 61.64 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTGTAAATATGTG:1 - chrX 10873754 3' - mdg3 5266 1 74.66 ATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATATTTAAACTGCAAATGAAATATATCTTAATTACAATTGTAATTAACCGAATTTCTGGCGTAATAATTCTTTAATGTTTTTAGATAAAC:1 + chr3R 16872007 3' + blood 108 2 58.90 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGTATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCC:1 + chr3R 9993433 3' - hobo 83 1 74.66 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATT:1 - chr3R 11526772 3' + pogo 2034 1 63.70 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTT:1 - chrX 19231716 3' + mdg3 208 2 59.59 TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTATATAAGTTAACCCACATGCCATGTGCTTTATTGCATTCAATTTTCTGTTG:2 - chrX 18913224 3' - Quasimodo 14 2 75.34 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTTCATCTTTTT:1 + chr2R 20500140 3' - 412 7114 2 60.27 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTGGC:1 - chr2L 15832961 3' + hobo 2909 1 63.01 AGTTTATTAAATAAGTTTATTTAAGTGAAAAACTGACAAATAGCGTCAAATATATAATTTTTCAAATATAAAACAAGCAAAAAAATGTATGATGCGAATTCTTTGATATTTGATTGATATGTATAAGATTTTTGATTTATTTTTGA:1 + chrX 12914651 3' - HeT-A 356 1 62.33 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATATTATTTCCGCACTATTCGGATTT:1 + chr3R 21237850 3' - Doc 31 1 63.70 GTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCAT:1 + chr2R 10991359 3' - jockey 100 1 78.77 GAGACGCTCTGTGCGATGCATCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAATGTCTGCCCACGGCAGCTTTGAAACGGGCACACGGCCCAGGGCCCAGGAAACCTATCAGTATTATCCAGTGTATGACAACCAGACC:1 + chr3L 5741568 3' + Doc2-element 118 1 56.85 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTACACTTATCACAATAAGTTTTGCTGTCTA:1 - chr3L 6096446 3' + roo 9058 1 76.03 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATGCGCA:1 - chr2L 8392992 3' + I-element 5272 1 73.97 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTAAATGTTTATTACAATGAATCA:1 - chr2L 10937834 3' + mdg1 363 2 56.85 GTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGGCACCGTCAACTTTATATACCAGTTTTTGCGCCAAAAGTTTTACACCTTT:1 + chrX 16316616 3' + mdg3 5293 2 65.75 TATAACCTTTGTAAATAAGTTAGATATTAAGAATCGTTAAAATTGATACCGATTAGATTCAGTTGCCTAAGAAGGGGAATAGTACGCTAGTCAATTAACTTAAATACATTTATTGCTTGGCACAGCAATCAATTGCTGTGGCCAAG:1 + chr2L 17034951 3' + jockey2 3290 1 73.29 TCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTGCCTGTAATGCAATGCGTGCTGCAAAGGGGGCGTGGCGCAT:1 - chr3R 9148036 3' - copia 82 2 72.60 AAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAAAAGTGGGCAATCGAAAAAAAAAGTGGAGCAATTCCATGCGATTTGCATAGCTGGTCGTATTTAATTAATTG:1 - chr3R 26656110 3' - FB 493 1 65.75 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTTATTTAAGTATCCAACATTAGTATCACATTAGTTTTTTTTCTGTGTACCTTGTGT:1 + chr2L 9669637 3' - roo 29 2 50.68 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGA:1 + chr2L 19417126 3' - BS 5005 1 53.42 TAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAATCGACTGATTTATGAAGTTTGCTTTGGCAATGGTATTTTTACGACGACTTTTC:1 - chr2R 19766480 3' + Rt1b 5069 1 63.45 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCAC:1 + chr3R 7424650 3' - 412 48 2 51.37 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCGGG:1 - chrX 20552795 3' + roo 8995 2 69.18 TCCTCGCAGCGAATGCTGGATCAAACTTATACCCCAGAAAGGCATGCACAGCCTCGTAAGTAATAAAATTGATTTTTCCTGCTAAACAAAAGTGGTTGAAAATGTCGGGAATCGCTGCCAAAAAGATTGCCGAAGCGGAGGACCTG:1 - chr2R 24048789 3' + copia 4750 1 54.79 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTAC:1 + chr2L 19417124 3' - BS 5007 1 52.05 GAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAG:1 - chrX 12893360 3' + Bari1 1625 1 73.97 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAAGGGATTTCTCTCTGCATCTTGTAAATCACGCACTAACAT:1 - chr2L 9167381 3' + pogo 2086 1 71.23 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGCAGACTGTGGAATGCCGAATCGCCTCATTTCGATTGCAAACTTAATTTGAAAACTTGG:1 - chr2L 10650374 3' - Doc 90 1 78.08 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTT:1 - chr3R 31956376 3' + pogo 2052 1 52.05 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCGGCCGATAAAAGTGATACGAAAAAATTGCCATCTCGATTCGGGTATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCT:1 - chr3L 3757149 3' + opus 7481 2 66.44 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAG:2 + chr2R 21897954 3' - 412 7136 2 74.66 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTCAGCAGAAATAATATACTTGTATAAGATATTCTTACTTAAAAATAGCTAACTTATAAGTGATTATTGTACAGTCTACTGAACTCCTTGCTCCTT:1 + chr2R 15062304 3' - blood 7039 2 63.01 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCAT:1 - chr2L 4416066 3' - jockey 91 1 72.60 GTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAAACGTACAAGAAGGAATAAATAAATTTAAATAAGTTCTTCAACCCGATGTAGTTCCAATGTAGTCTGGTCA:1 + chr3L 18872741 3' - copia 196 2 63.01 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGGATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGCACACCTGCT:1 + chr2L 17730551 3' - pogo 37 1 59.59 TGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAATTTAATTGGCTTTTTAA:1 - chrX 18239364 3' - jockey 4571 1 63.01 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAGGAGCATCAAAGGCCCAAAAAGCCAGTAACAAAAGTAGGCAAAGCATATTACACATCCGCCC:1 - chr3L 11665841 3' + pogo 2099 1 67.81 TACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGATGAAAGATAGAGCTGCCGAACGAGGAGGGTGAAGGAGAATCGTAGGGGG:1 + chr3R 9201438 3' - F-element 4350 1 66.67 AAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCTATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAA:1 - chr3L 24153131 3' + Tabor 7304 2 69.86 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCC:1 - chrX 19498084 3' + P-element 2832 1 42.75 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATTCTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCCTCTTTTTCCCCATCTTTGCATTTCACAAGTTT:1 - chr3L 5490791 3' - 412 9 2 72.60 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCC:1 + chr3R 22846824 3' + 412 7505 2 56.85 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGATTTG:1 - chr2R 7534557 3' + roo 9041 1 65.07 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGC:1 - chr2L 535433 3' + roo 322 2 75.34 ACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 331 1 63.64 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCCTTAATAGCTACCAGAATATCAACAAATTGCTTCGAGTCGATGGGAGCGTTGTGGGAGG:1 - chr2R 19985693 3' + copia 5062 2 61.64 AGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATATTTCTATAAAAAATATTCTTGTGTAGCACTGCATATGTATGATATATGTA:1 - chr2R 20594859 3' - roo 8835 2 65.07 TGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATACAAAATTTGCTAGAATATATAAATACGTTACAACTTCGTGAATTCTTCAGGCACAAGGTG:1 - chr3R 14331151 3' - Burdock 6136 1 51.49 CGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATCAGCGTTTTATTCGTTTCTGTTGTGG:1 - chrX 10728776 3' + springer 371 2 73.91 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACA:1 - chr3R 24809897 3' - 1360 68 1 67.12 CTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGATATGTGATTGAACTGGGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGCAGCGGATCAAGGATTAT:1 - chr2L 19492396 3' - Stalker2 7334 2 62.76 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATATTCTT:2 - chr3R 4722350 3' - roo 8695 2 63.01 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTAGTTA:1 - chrX 14692825 3' - Transpac 4964 2 55.48 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAACTTCCTCACCGGCATTTCCAACAT:1 + chr2R 8686674 3' - hobo 40 1 58.22 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATTGTG:1 + chr3R 20292558 3' - pogo 28 1 66.44 ATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGA:1 - chr2L 5771396 3' - Juan 12 1 70.27 ACGCACACATATACACGTTCTCGTCTCCTGTTTTTACCCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGAAAGAGAGCAAAGCAGGAAATGGGAAGCCAGGACACGATTGATGTCGATA:1 - chr3L 7004771 3' + 1360 3221 1 73.29 CTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTGGTCGTTAAACTAACTATTAACTATTAACTATAACTATTAACTATACGGAAAAACTGATTCATTTAGCTTGTTAAGTTATTTGTGTACATCAA:1 + chr3L 3482773 3' - X-element 42 1 56.16 AACTAAATGCAATTTTTTTATGTTCACATTTTGAACATCTGTTGCATCTGTATATTTAAATATCAACTTTGACAAGTCATGTATTAAATAGAATGACTTTGAATTAAAAGTGCTGTAGCTAATTATATGTTTATAAATTCAAAAGT:1 + chr2R 9248032 3' - S-element 1633 2 34.25 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGC:1 - chr2R 5848970 3' + mdg1 7388 2 66.44 ATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACAACTTTGAGTGGCATAAACCCAACGCACCACTCG:1 + chr2L 20842008 3' + G2 3027 2 58.74 ATAATAATAATTATTAATAATTTACACGTTTTTATCGCAGTTGAGCTAAACAACCCAGCATCATCCACGAACTGTTATAGGGACAGATTTTGCGGTCAAACGA:1 + chr3L 18163486 3' - Tc3 271 1 72.82 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCAT:1 - chrX 14692837 3' - Transpac 4976 2 56.16 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGTGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGTGTAAGTGCCCAGTACGTGAGAGCGTA:1 - chr3L 14863801 3' - Transpac 4946 2 67.81 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTATTTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGA:1 + chr3R 7424636 3' - 412 7115 2 58.90 GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCG:1 + chr2L 12142645 3' + hobo 2876 1 61.87 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACA:1 - chr2R 18123418 3' - 412 59 2 57.53 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGACTGTGCGAGGAC:1 + chr2L 12142637 3' + hobo 2869 1 65.94 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATT:1 - chr3R 7569566 3' - Doc 37 1 39.73 CACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCATCATTAGTATTCTTAATGAATACATTTCATGGATAAGGCAAGACAAGTTATTTTAAAGTACTCATGGTTTGACAAAACGA:1 - chr2L 6810944 3' + accord 7109 2 49.32 GTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGG:1 + chr2L 11867395 3' + BS 5020 1 70.69 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGCGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTA:1 + chr3R 9938700 3' + roo 9017 2 54.79 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGTACTTGCCATTCTTCATCAGATTG:1 - chr3L 18835241 3' + pogo 2085 1 76.03 AGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCTG:1 - chr3L 18708560 3' - F-element 30 1 72.03 AAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGA:1 - chr3L 24153132 3' + Tabor 7303 2 70.55 TTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACTTTTTAGAAAGGAACACTTGGCATAACTTGGATTCTCCTCGACAACTTGGGACTCTCTTGAGTAATATTTCGTTTTTGAATTTTCAATAACAGTTGAGTTAGAAG:1 + chr2R 7717347 3' + S-element 1703 1 72.60 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGAGCTAAAACACTGATAAAAAATAATGCAAAAAAGAAATAAACTTTTCTGTTTTTGTTGTTA:2 - chrX 10960196 3' - Transpac 4976 2 56.85 TATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATATTATGAAGTTATTTTAAAAGTAGGTAGATTATTAGAAAAGTTGTGTTATGATTGTTTTTTAAGTAC:1 - chr2R 3202646 3' - gtwin 19 2 71.23 ATCCCCGTTAGGAATAAGAATATTATTGTTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCAATAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCATACACACTTCAGAGAGCATTGGGGGGGCGTGGCTGGTCGAGGGGGTTAT:1 + chr2L 13579516 3' + invader3 5256 2 79.45 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGT:1 - chr3L 5263326 3' - pogo 30 1 61.64 CACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTTGTGAATTGCGGTTCTATTGCCTTGAATATGTTCGAGTGTGTGGGCTTTGAAGTC:1 + chr2R 20382639 3' - Bari1 11 1 77.40 AGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAAATGCAAAACGATAACTAAGCGGTTAAGAACCAAACAAGAAAGTGTACCGTAGCGAACGGTACTGGCTTGATGTTATCGTAATGGGATTGACCATCT:1 + chr3R 3254040 3' - Circe 122 1 67.12 CCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCG:1 - chr3R 3617317 3' + micropia 166 2 69.86 CACTTACACACACACACACACACACGCAAACCGTTTGCTATCTGGCGAAAATCGCATTATGTAACCGTATTTTTTCCCTTCCGACTTTTGAATTGGGAAGGATTTTGAACTAAGAAAACGTATATTTTAAACATGGCGTACTAACA:1 + chr3R 13762652 3' + Quasimodo 34 2 64.38 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTT:1 + chr3R 15590657 3' - roo 8730 2 64.38 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAATGTTATAC:1 + chr3R 25271297 3' + 412 7508 2 57.53 CGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACAC:1 - chr2R 19633189 3' - jockey 4622 1 52.05 AGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7201 2 79.73 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCC:1 + chr2R 24427604 3' - jockey 4753 1 70.55 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAAT:1 + chr2R 15392780 3' - blood 7097 2 76.03 CATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGATTTAAATCGGAATGGAAGTCCTTGGAAAAAACTCAATTAGAGCGCTAATTAATT:1 + chr2L 18228267 3' + roo 8789 2 62.76 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTGGCAAGGGCATGAAAA:1 - chr3R 11549791 3' - 297 6628 2 63.01 TCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCT:1 + chr3R 18847378 3' + Stalker2 7586 2 61.64 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTGTTTTTTTTATATCATCGATGTTCCCATTT:2 + chrX 14756790 3' - pogo 35 1 64.38 ATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCACTCAGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGTTCATACCAGACTGTTAATAAGCAAACAGTCCAGGATTCTGGATTCAGTTCAAAAACAACATACGCCTTGG:1 - chr2L 22643343 3' - invader4 23 2 60.27 AATATATGGAAAATAAATGCCAGTCACCCAGCCCCATTCGTCCTCATCTCATTTCATCTAGTTAAGAGCCTCTGCCGCAAAAACACACAGCTAAACAGCAGGGCACGAAACGAAACCAAACGAAACGAACTGCTGGAAATAAGGCA:1 - chr3R 19717671 3' + transib2 266 1 51.37 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACA:1 - chr3L 5514184 3' - Doc 72 1 53.42 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGGCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAACTTTCATCACAATTCGACAAAAAGGATAAAAATGAAAAA:1 + chr3R 25354593 3' - 297 38 2 63.89 TTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCT:1 + chr3L 17447553 3' - Tirant 45 2 58.02 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAA:1 + chrX 15089552 3' - P-element 99 1 17.81 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACTA:1 - chr3L 5183665 3' - copia 4896 2 66.43 CTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTG:1 - chr2L 8776806 3' - G4 3700 1 68.49 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCATGTCCGTCCTGCATCTTTCCCAAATATTTTCAGAA:1 + chr4 1149955 3' - 297 44 2 56.16 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACC:1 + chr3R 5087089 3' + P-element 2808 1 31.51 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGATTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGATTGTTATACTTGTAAAAGTATAACCTTTTGTTCTTCT:1 + chr2R 6945763 3' - pogo 22 1 69.18 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTGCTGCAGATGCACCTGATG:1 - chr2L 8103458 3' + pogo 2089 1 70.55 ATACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAAGGTTAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTATACTGGAAAAATGAGGTAATATACGGTTTGCCTCCCAATTTATGCAATAAATTAAACAAGCAACTTATTTCGAATACACCCGATTAAG:1 - chr3L 3715774 3' - Cr1a 4022 1 71.92 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTCGATGGATGGCAAGACCAGAACTGATTGGGATAATAGATCGCCTTCCTTTTTATATCAATA:1 - chr3R 12375682 3' + copia 196 2 57.53 TGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATC:1 - chr3L 5446090 3' + roo 9019 2 53.42 CGAAAAATAAAACAAAGCTAAGGTGCGCATAAGTTGTTTTTTTCACTGGGCTAATTATATTTCATGTTTCATATTTTTTTTTATTTTAGTATTCCATCTATAAATTTAATTGGTCTTCCACTTTAACTGCGGCGAGGAAGTGACAG:1 + chr3R 5494146 3' - frogger 2175 1 78.08 ATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCA:1 - chr3L 24153193 3' + Tabor 7242 2 73.29 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTG:1 - chr2L 17730433 3' + pogo 2098 1 66.67 TTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCCACTTTTGGTCAGCGGG:1 + chr2L 6074122 3' - BS 23 1 65.07 ACACACTAGCGCAAAGGGTCAGTCCAATGCAGGAACTGTCAAGAATATGTCCAAACAAGAGGATACTGCACATTGCGTCCAGTTTGTGTCATCTGTGGAGAGCTTCATGATTGATAAGCTAATACATTTATTTAGGCTTACATTGT:1 - chr3R 5076333 3' + Fw3 438 1 75.34 GTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATATTTTGTTTTTGTGAAATTGCATGCTCTTAAAAATATATAAAATATATTT:1 + chr3L 14546418 3' - copia 70 2 65.75 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGC:1 + chr3R 18846572 3' + roo 318 2 82.88 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTG:1 + chr3L 16887402 3' + roo 9008 2 61.97 CTGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATATCATCCTTACTAAAGTTTAACACATACCATACCCATCAAAAAAACGAATCAAACG:1 + chr3L 11596361 3' - gypsy6 53 2 60.43 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCA:1 - chrX 18193724 3' + hopper 1339 1 71.23 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAACTTCCTCACCGGCATTTCCAACATTTGTTTGTTTCCATTC:1 + chr2R 8686690 3' - hobo 24 1 69.18 GCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTTAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAAC:1 + chr2R 5022747 3' + Gypsy12A_LTR 102 1 52.13 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACC:1 + chr3L 53046 3' + roo 316 2 82.19 TAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCGAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCCCTCCTCTG:1 - chr2L 18163778 3' + HMS-Beagle 165 2 75.86 TAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAGCCCTTCTCCTTTGAGCTGGCCATCATTCAATTTGATTTGTATTTATTTAATGAGTTATTAATTGCATTAAGCTCTCGG:1 + chrX 12623032 3' + jockey 4698 1 57.53 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGCCCCAAGATCACTTGTCAGTCTGGGGCGAAGTCTAAG:1 - chr3R 4885274 3' - 1360 15 1 75.34 CTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAATTATTAAGGTCGTCAACGGGGCGCATGAGTAATGTTGAGCCTTACCTCTGCCTGCAAACGGAGGCATCGTAATCCGCGGGCTTATCAAAA:1 - chr3R 20885774 3' - I-element 4935 1 65.07 TTAGAGTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAAGTGGCACCATGTATAAAATTCTTGTTTCGCATTGCCTTAACGTTATTTTTATTTAAATATATTTCCTGCCTTCAAAAGGAAATTGAAATCGATGTGTGGATGGGATTTACCCTC:1 + chr3R 11725244 3' + 1360 243 1 63.70 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATTCCCTTGATTTGTTTCTAAAACCTCGACTTTATATCTGTTGT:1 + chr3R 23426503 3' - pogo 29 1 60.28 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGG:1 - chr3L 9430589 3' + P-element 2875 1 60.81 GATCTCGGGAACTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAATGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTAATCTACATTTCCCATTACAAACCCAATCAACTTTTCTTGATTGAATATGAAACTA:1 + chr2R 13259742 3' + INE-1 150 1 73.97 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGC:1 - chr2L 20561411 3' + P-element 2804 1 30.14 GCACCTACACACACACACACACACACACACACACGACACCGGGCGCATCTAATTAATAACAAAATTTTAATCGCCCAACGATAGCCGGGCATTAGCTGCCACTCCCACTTGGG:1 - chrX 3111865 3' + accord 7098 2 73.45 GTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACCAGGCAGGAGCTACATCCTAGGGCAAAAATAAAGTTGCACAAGTAACCATCACTGGGTTGCAGGAAATTATAAATGCCGCAAGCACGT:1 - chr2L 20568447 3' - P-element 412 1 65.07 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCTTCTAATTTAAGAA:1 - chr3R 12787100 3' - 297 6620 2 58.22 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGT:1 - chr2L 19424670 3' - Tirant 55 2 65.83 GGTGATCTTATATCACGCTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGGGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCAT:1 + chr3R 4571530 3' - blood 85 2 53.42 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACT:1 - chr3L 4023622 3' - pogo 65 1 62.33 CTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCAAGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAAGATAAGGTGTTGTTTGGGGTCGGAAGGA:1 - chr3R 26311327 3' - roo 8887 2 79.45 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTGGAAGCCTGTGCCGGG:1 + chr3R 31907443 3' + Tirant 8495 2 68.32 GGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCATTCACTGGGTCA:1 + chrX 21907822 3' - accord 7265 2 60.69 TAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGTATGTTGAACTGCGCTGCTG:1 + chr2R 982419 3' + HMS-Beagle 6981 2 62.33 GGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTAGGACTGCTTTTCAGCCCCACCATAACTCTTTTCGATCGCGCTGAGTTCGGCTTTTCCTCGCCCAGAATGTTAATACGAATTT:1 - chr3R 10659464 3' - roo 238 2 54.11 TTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAAATTTTTTTTTCTGCTGACCGTTTAATTATTTGGTA:1 - chr3R 6368571 3' - Idefix 39 2 58.90 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGTATGAATGATATTT:1 + chr3R 4884501 3' - pogo 40 1 55.17 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGATTT:1 - chr2R 5992277 3' + pogo 2055 1 54.11 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATGTGTTTGGATGCCTATCGGCTGGGCGGAGTTTTC:2 - chr2R 23312973 3' + Tabor 7279 2 48.63 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACTCGTGAAAAAAACTTATACGCCCCACTTTTCTCGCGGTGTGTCGTCTGAGCGCACAGTACGTGCTAAA:1 + chrX 4858429 3' + BS 5037 1 56.64 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATG:1 - chr2L 8392996 3' + I-element 5269 1 76.55 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATAC:1 - chrX 12893332 3' + Bari1 1653 1 54.79 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAA:1 - chrX 19231739 3' + mdg3 185 2 58.22 AAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGG:1 + chrX 21907826 3' - accord 7243 2 51.97 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGCTGCTAGTTTAACGCATCGCTGAATT:1 - chrX 3452451 3' + Tirant 372 2 68.75 GGGGTATCTTGACCCTTCACATACCCTTCTCCGTCCTCCTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCCACTCATTAATTTTCGGCAACACCGCCAAACTCCTCGCGGTCTTCCTCCAGCTTCCATCTGCTGCT:1 + chr2R 4948467 3' - gypsy8 4494 1 55.47 GCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGGCTAAAAAACCATAGACTCTGTGAAAGCTATGTGGTGCAATTTTCT:1 + chr2R 15613249 3' - P-element 474 1 38.36 GGTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTA:1 - chr2R 21227368 3' - mdg3 5334 2 71.92 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTACACTTATCACA:1 - chr3L 6096463 3' + roo 9041 1 64.38 TCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCG:1 + chr3L 23747151 3' + INE-1 88 1 60.96 AAATATTTTTTTTTTGGTAATGGGTATCTTATAGTCGAGGCAAACGACCTTATCATTGTCTCTTGTTTTAATATTCAAAATGTCCAAGGTGTATTGATTAAAGTCTGTTGTTTGTGAATGCTTCACTGAAATGCCGTGATTAGACG:1 - chr3R 4524202 3' + transib1 1964 1 63.70 TTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTT:1 + chr2R 10163616 3' - Juan 4161 1 78.77 GGAAACATTATCGTAAGGGGAGTACATCGAATGTACTTGGGTAGGGGACAAAATTTCTCGCACTTTTTTTCTAAAGCAAGCTAAAAGTAACAGCTGATAACTGGCATACAACGTAACGGTCACCGAAGGACCCAAGACCGGAAGTG:1 + chr3R 6764110 3' - G2 2996 1 60.96 GTGAACTAACGGTACCGCTCTGGACCTTGGACTCAAGTTGTTTAAGGGCACAGGGGTCGACGATACACCCTGCCCCATACATCCTAAGCCCGTTCCAGCCGGCAGGAGGACCTTGGTAAGGGAAGATAAGGATATGACGTGTTCGA:1 + chr3R 1432541 3' + gypsy8 4827 2 58.90 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAACAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTG:1 + chr3L 5183814 3' + copia 5087 2 55.71 TATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGATATATAGGTTAATAGCCCGCTCTAATCTTTGGTCCGTTCCGAGAGAGGACAGCGAAC:1 + chrX 20511883 3' + R2-element 234 1 60.42 CTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAACCATTC:1 + chr3R 10288876 3' - copia 83 2 72.41 TGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGTTAGGGGAGTCGAGAGCCGGGAAACAGAAGCTGCGAC:1 + chrX 702395 3' + pogo 341 1 74.66 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACAAAAACATTCCAAATTCAA:1 + chr3R 15590064 3' + Transpac 253 2 56.16 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTTATAGTTGAGCAAATATTTAACCTGATGATTAA:1 + chr3L 3762332 3' - roo 8708 2 52.05 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAA:1 + chrX 18193858 3' - hopper 13 1 72.60 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTA:2 + chr2L 19903497 3' - Transpac 4957 2 56.16 ACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAAAAATCAATATTTCCTTTTGGCGAAAGACACTTATACGTGCAAAATCTTTGGCAACTACA:1 - chr2L 22696343 3' - X-element 34 1 64.38 ATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACTGATTCATTCATTTTTCCCGAGATGAAGCAGCTGACGTGCTTGAGGAAAATATGTGCCCGCCAG:1 + chr2R 19901080 3' - mdg1 7095 2 57.53 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGGA:1 + chr3L 8253752 3' - jockey 4676 1 53.42 TTTTTCTCAAACAATTTTATTTTATAGCCGACCGTGAATTTTGTTTGTTAATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAAGGTACACTGGGAATACGAACATTAAACCACTTAAATGTATTGATGTATTAAACTCTTATTTTATTTTT:1 + chr2L 18168612 3' - HMS-Beagle 423 1 53.42 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATAATAATTTATATACAGATTAAGTGAATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAGAAAACCTCAATCCATATATCAAAAGCACATTAGCACGAATGTGAATTG:1 + chr3L 20747226 3' + Burdock 6368 2 64.03 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAA:1 - chr3L 2037000 3' - Doc 62 1 59.59 TACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAGCAGCTCATCATAAATATGAC:1 + chr2R 5022803 3' + Gypsy12A_LTR 106 1 69.18 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAGTGATATATG:1 - chrX 14385130 3' - blood 40 2 58.22 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGTTTTC:1 + chr2R 21380739 3' + roo 9045 1 66.44 GTTGGAGATGTTCGGCCAAGCAGTGCCCCTTACTATATATACAGTTTCCAAGGGCAAGA:1 + chr3R 12996834 3' - G4 3358 1 89.83 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTA:1 - chr2R 15080002 3' - roo 8717 2 55.48 GCAATCGTGCTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTAGACGGAGGATACAATACAGAACATCAGGAAACGCCGGAGGAGAATAACATACGAACCCGACTCATCCTCTTCCGATCCC:1 + chr3L 23453494 3' - rooA 97 2 53.42 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGGAAATTAAAATATATCGTA:1 + chr2R 15080154 3' + roo 9054 2 73.97 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCACAGCGTACA:1 - chrX 16853317 3' - roo 53 2 54.79 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATGAAAAACTTACGCCGCGCCGTGCCGAATATGATTTATGGTTTTTGTTTCAGTT:1 + chr3R 10099948 3' + pogo 2035 1 65.75 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATGAGTGGTGTGAAGTGCCATCGAGTGATGCGC:1 + chr2L 1449737 3' + opus 488 2 77.40 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTCACATCCAATTGCTCCTCC:1 + chr3L 9430674 3' - P-element 45 1 52.86 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAA:1 - chr3R 9482035 3' - roo 8750 2 78.08 CACTGCTAATTTGTAAGAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGTTTATGTTACCTAATTTACAATTTTTATCTGCTCTAAAAGGATATACCAGCCCTTCGCTCCGTTTTTTCACTCCCCCGCTGGATTACG:1 + chr3L 15747073 3' + Tc1-2 1452 1 52.05 TATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGG:1 + chr2R 6984396 3' + HMS-Beagle2 244 2 69.78 AGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGT:1 + chrX 12558313 3' + Transpac 5143 2 76.71 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATGTTACCACCTCCAGGTGGTTTCCCCTCCTCTGGCTGCCAATCTACCTACTGTTTTTTAAGTTATTAATTGATTATATTTAAGGACGAGGACTTAAAA:1 - chr2L 18163713 3' + HMS-Beagle 7025 2 73.97 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCC:1 + chr3R 25384263 3' + mdg3 166 2 70.55 ACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATAGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCTGGCAAGTTGATGATAGCTACAATAAC:1 + chr3L 15099693 3' - G4 3803 1 63.70 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTC:2 + chr3R 29709052 3' + blood 7314 2 67.81 CTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTGATTTGATTGATCTGCAAAGGTGGTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCATTTTTTATTCCAGAGATAAGGTATTGTTTAAAAATACAATTTTATTCGATAGTTAC:1 + chr3R 8319030 3' - Q-element 255 2 74.66 ATTCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAATTTCGCGGTTATACGGTCGCTATCTCCGCACAGACGCACGAGATTTTTATGGCGAAATTCCGCGAGCAAAAACTTTCAGATATGTTCGCATCT:1 - chr2L 20824870 3' - pogo 24 1 69.86 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTT:1 - chr2R 20461205 3' - jockey 94 1 76.03 CAGAGATAAATAAGGTTTTTAACACATATACATATGTGTTAGTGTCTTTTCGCTTTTAGTTGATGGTTGCACTTGGGCTTGACTTGCAGCACTAATGTAATATTTGTCACTTCTATGTGCTTTATCGCTGATATATTTTTGTTTTT:1 + chr2L 4547828 3' - Porto1 133 1 78.77 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGT:1 - chr3R 18903357 3' + pogo 2074 1 67.12 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCT:1 + chr3R 23507671 3' - 412 66 2 62.33 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCAT:1 - chr3L 12863656 3' - Transpac 40 2 56.16 TTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTAACTCTCTCGCTCTCCCACATCACTTACGCCCAGGCATATTTGGAAGCATTTCGTTTGCCTGTGAACAAAGGCGACA:1 + chr3R 15425188 3' + Cr1a 227 1 60.96 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACAT:2 + chr2R 10453456 3' - mdg3 54 2 52.05 TAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATACACCCATCCTTACTATATACATAATTATTGTCTTAGATTCGTGGCACTTTTTTTTAGCCATATTTCTGCATGTGTATTTCGTGTTTTTT:1 - chr2L 13190979 3' + mdg3 39 2 54.79 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAAGTTCATAGTGCCAAGAAGGATATCAGCG:1 + chr2L 7667535 3' - copia 4897 2 66.44 TGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACATCGA:1 - chr3L 9375788 3' + mdg1 7432 2 65.07 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCAC:1 - chrX 15167681 3' - roo 85 2 80.82 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCATTCTGCCGGTCGCCTACAG:1 + chrX 22824867 3' - jockey 4690 1 68.49 CATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGT:2 - chr3R 24228892 3' - opus 7087 2 76.71 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTAAAGGTGCGTGTGCCGGGGAAATTCGCAGGGAATGGGGATGGGGATGGGGATGTGGATGGGGGTGGTGTCGGCCTTAGGGGGTGTACTCTGCTGGGCTGCCACCGAGGG:1 + chr2R 22675949 3' - roo 8674 2 78.08 GGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATGCAAACAATATTTAATTACTAATGGGCCGTGCA:1 + chr2R 14884378 3' - mdg3 5267 2 71.31 TATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGTCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTATGGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGATCAAGAAGATAAGATTATACCACAAACACCTCAACCACCCGGCAATCTAAAGCCTTGA:1 - chr2R 15489700 3' - Ivk 201 1 73.29 CGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGATGGCGACGCAAAAACCACAACAACTAACTCTTCAACTTCTACAACAACTACAACAGCGCGTCAAAATACTTTTTGGAATCATT:1 + chrX 10196589 3' - Doc 431 1 43.15 ATGGCCAGATCGAATCGGCTATATATCCTGATCAAGAATATATATATATTCAACGAACTATACCTAACTAGTACACCCATTTTCACTACGAGTAACAGGTACACAAATATAGTTCATTTGAGGGAGAAACTAGAGAGGAAATGTGT:1 + chr2R 5191105 3' - INE-1 103 1 65.75 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTTCTCGCAACGAACGGCCATCGGCAGTGAACTTTCATTTTATGGCACTC:1 - chr3R 21420988 3' + roo 9055 2 73.97 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCAGTCCTCGCCAAGCTTGGCCACAACAATTTTCTAATTAAATTCGATT:2 - chr3R 28008190 3' - hobo 14 1 76.03 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTCTAAGCTCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCCACGTGGGGGAAGTTTAGACAGTCTACCTGCGGTTTTTTGTCGCTTC:1 + chr2R 5951316 3' + I-element 5264 1 63.85 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGA:1 - chrX 17614377 3' + roo 9010 2 58.90 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCATTATAATCATTTCGCTCGAC:1 - chrX 10978935 3' - roo 16 2 71.92 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATGTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCT:1 + chrX 2873436 3' + roo 8991 2 71.23 GAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGACGAGGCAGGTCCGCCGATAATTGTGCCAAATAAAAAGGAGCACCAAAATCAACACATCA:1 - chr3R 19307694 3' - R1A1-element 30 1 64.38 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACAAAATTGGCAAAGTTTTGCTTATCAGCGGGCTCTTG:1 + chr3R 19088934 3' - FB 75 1 74.07 TCGCAGTGCTGTTTGGTGTGGTTTTTTGCATGCGCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAATGCGGATGCATTTAATTTATTATTAGAATTATTTATGGCCAGCGCTTGGGG:1 + chr3R 29706795 3' + Cr1a 240 1 62.41 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGA:1 - chrX 15089500 3' + P-element 2827 1 40.88 ACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAGAGAAGATTCAATAAA:1 - chr2R 5284495 3' + Doc4-element 2636 1 75.34 AGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGG:1 + chr2R 23313071 3' - Tabor 6919 2 69.86 AGTTCCTATGATTTACAGTTTTAATAGGAAATTTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAACAGTTTCGAAAATTAATGACAAGAGCGCCAACTAAGTTGCACTG:1 - chr3R 22158664 3' - HB 1574 1 77.40 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCGCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAACAAATCAAAGTGTTTCG:1 + chr3L 18920504 3' - Juan 41 1 55.24 TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTAT:1 - chrX 18366015 3' - jockey 69 1 58.22 TCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACTCTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGCTATCGTTTTTTTTGAATCTACCGTAT:1 + chr2R 6433221 3' - F-element 184 1 65.75 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAAC:1 + chrX 15167755 3' + roo 9008 2 62.33 GGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGACTCTTTTTTTTATTATTATTTTGTTGATAGTTTTAAGCTGT:1 + chrX 17104215 3' - I-element 5081 1 71.92 ATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGC:1 + chr2R 6052658 3' + mdg1 330 2 76.71 AGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGTTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGTCTTTTATTTCGATCGCAGCTGTATAACGTACGATACACAGTGGGCATAGAGTTGGG:1 + chr2L 8690901 3' - 412 7336 2 59.59 ATTAAATACCTAATGATATTATAAAACAAATTTTACCAATAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAGACTCGCAGGTCCCAAGAACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTACTTAACCCTTCTGCAGGTGAGACTAACAC:1 - chrX 22882011 3' + HB 1534 1 69.18 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTG:1 - chr3L 19279104 3' + opus 7450 2 54.79 AGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATACTCGCAGCGAAAGCGTCAGTACGAGGATGAATTC:1 - chrX 6673405 3' + invader4 2965 2 76.71 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCCAACG:1 - chr2R 18882563 3' - roo 8680 2 58.49 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATTCTCACATGCTCACGCATTCCCACACTCACACACACACACTGACACGGAAAAAGAGGAAAGGAAAAGTCAATGATGCGTGTAAGCC:1 + chr2L 15621976 3' - hobo 18 1 67.41 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATATATATCTATCTGTGTCGAAAAGCCAGAGCTAAATCCTGGTCAACTCCC:1 + chr3R 9958709 3' + opus 7456 2 65.08 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACAT:1 - chrX 19162561 3' + pogo 2059 1 54.79 ATTTTTTTTTTTGTTTTTTAATAATTAAAAATCGAAACTTC:1 - chrX 3264954 3' - Doc 4701 3 90.24 CTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTAAATAAATAAATAGCACCCGAGTAACGAGAGCGCACGCTTTACTGGAATGATCTTTTTAGT:1 - chrX 15400984 3' - opus 7458 2 58.90 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCCGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGGGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCA:1 - chr3R 28008236 3' - hobo 38 1 50.81 GTGTATAGGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGT:1 + chr3L 3540198 3' - mdg3 69 2 69.86 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACC:1 + chr3R 22429234 3' - roo 8726 2 59.59 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTCTTTTACCGACAGTTAGATGT:1 - chr2R 21078365 3' - jockey 17 1 73.97 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCATCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATAT:1 + chr3R 9482134 3' + roo 9037 1 60.14 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTACCCAAAAACACGACGTCTCTCTCGCTCTTTCTCGCACTCTCTTTTGTTCTCTCTGCACGTAACAACATCCCTGCGTCA:1 - chr2R 14001001 3' - P-element 40 1 58.22 GGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGAGGCAGCCGCAGCTTTATCAATGGCCAGCAATCATCGCAAAGGCTCAG:1 + chr3R 10466307 3' + opus 199 2 62.79 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCA:1 + chr3L 3540261 3' - mdg3 5270 2 71.53 ATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAAC:1 - chr3R 17316063 3' - 3S18 5848 2 71.92 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACAGTTTCTGATAAGTCGCTGTTTGGGTATAGAGATTTAATTCAGAATACACTCCTTGCCTT:1 - chr2L 22641321 3' - HMS-Beagle2 6918 2 54.47 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTAAACGTACAGACTAACAACTAAATTTGCTTCCTTTTCGACA:1 - chrX 8272373 3' + roo 394 1 73.97 TTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACACTGATGAAACGCAGTTCAAGTGTTCCCAGTGCTCGAAGTCCTTTCAAGTCGAACATGAACTTTGGATGCACATG:1 - chr3L 21489252 3' + Cr1a 252 1 53.42 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTT:1 - chr2R 16908452 3' + roo 9042 1 64.14 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAGCATTTCTTTGGAGATATTTCTCCCACAACTACTTCTTACTGACCCAAGTGATTT:1 + chr2R 17144189 3' + pogo 2038 1 64.38 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAGCTAGTAAGCATTTTATAATGTTATTTTT:1 - chr2R 13574707 3' - diver 17 2 71.92 AAGGCACTATCCAGAGCTCGCCCACCAAGAAGGCTGCACAGGAGGCAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCTTGACGAGAGCCAGGCGGTGAAGATGATTTCAAATGGATCCCTGTTAGCTTTGCCTGTAAAGCTTGTTGTCAACT:1 - chr2R 8427506 3' + BS3 1526 1 55.48 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATGTTTATATGGAATTAACAGTTACGGCCTCATATAATTCAAGTTACTTATGACTGTTGATTACTTTTATTTTATAAGCAGT:1 - chr2L 8772704 3' + Tabor 445 2 58.22 GGTCAGGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAGAGCTAGAAGGTTTTCTAATTGAGACTTTGTCGTCTCTTTCACTTCAATTTGCCGCTCCTGTGCGGAAAATTCCTTGTTTATCTT:1 + chr3L 6567433 3' + INE-1 92 1 55.48 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGACAGAATCC:1 - chr3R 6782686 3' - jockey 4716 1 56.16 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCGCTTGGCTATTCCTATGCAGGAATTACG:1 - chrX 19498045 3' + P-element 2857 1 65.52 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATAATGATTTCAATAAAGCAAAATCAGAGAATCTTACTTTCATCTTTTATATATATCCTTACATATAGG:1 - chr2L 19903300 3' + Transpac 305 2 47.26 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCT:1 - chr3L 9571657 3' - jockey 75 1 64.38 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACATATGAAAATTAATATTTATTATGTGTATAAGTGAAAAATGTTGAAATATTCCC:1 + chr2L 7133585 3' + blood 7323 1 64.38 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGGAGAT:1 + chrX 11815092 3' + flea 4956 2 53.42 GTAGGTGGCATGCACGATTTATAAACTATAATGGGATTGTGGCTACGTACTAAAACAAAAATGATTCAATTTACATTTCCATCTTTCTCAGTTTTACTACAACAATCTCAGCCAAGTCAAGTGCTTTTTCCCCCACAGCTTTCGTT:1 + chr3L 10120215 3' - Rt1b 5077 1 56.85 GCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGC:1 - chr2R 544805 3' - HMS-Beagle 83 2 75.34 GGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTATTCCAATATAAATTGTTTCCGTTTCGAAAATGTTCTTCATTAGCTAATTGAATTGTATGTG:1 - chr2L 9679373 3' - X-element 4692 1 58.22 TGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTG:1 - chr2R 20382450 3' + Bari1 1697 1 75.97 GGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGTTCTTGAGACCAGCTTATCAATTAGAGCACATCGCATCAGCATCTGCACACACAGAAAACCAAACAC:1 - chr3R 26694504 3' - jockey 4657 1 54.11 TGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGTTGCGCTTCT:1 + chr3R 25876959 3' + mdg3 181 2 59.59 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGGCTGCT:1 - chr2R 21380576 3' - roo 33 2 61.64 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACC:1 + chr3L 13722093 3' - blood 7096 2 77.08 ATACATACACATATGTATGCAGCTCGAAGTGTTTGTGTGTGGGTGGGTGGGTGTGTGTCTTGATATCTTTCTCAAGCTTCTGGGTATTTCTGAAAGATCTTGCTTATCCCTCGATGACTTAAGGTGGGTGGATGTCACATGTCACA:1 - chr3L 17312389 3' - Stalker4 7196 6 56.85 GAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGGGCTAAAGATATATACACATAGTGTTT:1 + chr3L 22638908 3' - Juan 4107 1 70.55 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAAGCACATACTACACCTCTGTCGTAAAACAGCTAGCTTACACTACTATATCCATTCACTAAAATGGCTTTTCTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTCCATATACA:1 + chrX 16243794 3' - 412 17 2 71.92 TTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCACTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGA:1 - chr3L 16157171 3' - Juan 38 1 56.85 ACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTA:1 - chr2L 15142231 3' - BS 4757 1 50.68 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCACCAGGCATCCCACTCAGTCGTGCCCCGGCC:1 - chr2R 24338304 3' + 1360 3372 1 71.72 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCT:1 + chr2L 11573705 3' + jockey 4921 1 70.55 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCATTACTACATCCCATTCCA:2 - chr2L 7459499 3' - BS 5004 1 76.03 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTT:1 - chr3R 18846515 3' - roo 8741 2 69.86 ACAGCTGTGGTCAGGATAATAGTGGTGGGCAAAAAACGCATAAAGTGCCTAAAAAGACTTCTCATAATGCCAATAAAAGCGTTTTAAAATATTTTTCATAATTCTACATATTCTTTCCCTTGTGTTGCCGTTCTATTGAAATAG:1 - chr2L 13261943 3' - HB 1628 1 50.00 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAACTCTCGCTTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCCTTTTCATCCCCGCTCCTTCGCGGTTGCGG:1 + chr3R 30273078 3' - Tirant 56 2 58.57 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGTGCGAGATGCCCTGATTTGGTTGGAATAGTTTTATTT:1 + chr2R 18316883 3' - FB 85 1 73.97 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGAT:1 + chr2R 5992394 3' - pogo 63 1 64.38 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCAC:1 - chr3L 22221142 3' + 412 414 2 65.07 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGTAGCTAATAAAGTTGCAAGTGGTCGCCGTCGTCT:1 + chr3L 22529849 3' - roo 8707 2 53.24 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTC:1 + chr3R 15649869 3' - blood 7069 2 62.07 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAATTAAATTAATTATGTGAAAGTGTGTTAAGTGAAATGTCATGATCCTTATTATTTGATATCCAACTCTGGCAATCGCAAGATTTTCATCTCACCGAATTCAGCACTTGTTAGGA:1 - chr3L 21819917 3' + Juan 4198 1 71.23 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTT:2 + chr3R 9938720 3' + roo 9037 1 62.33 TATGTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATATTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCGCAAGATAAAAGAACAGATTACATTTTTGTTGACTAGCCAATTTATTTCT:1 - chr3L 12963072 3' + 1360 394 1 71.23 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTTTGTCGATTCGGTCACTTGGAA:1 + chrX 3444198 3' - pogo 46 1 54.11 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGC:1 - chr3L 20785486 3' + P-element 2791 1 19.86 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAACATAATA:1 - chr2R 5848977 3' + mdg1 7381 2 71.23 TAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAATAAGTGGTGTGCGTGCGTGCGTATGTGTGAGTGTGTATTTGTGTGTG:1 - chr2R 17943875 3' + 297 471 1 72.60 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAG:1 - chr3R 5087022 3' - P-element 74 1 35.62 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGGAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGGGGCTCACCCACCTTGACGGGCAA:1 - chr2L 8103488 3' + pogo 2072 1 50.38 CAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAG:1 + chrX 22517688 3' + 1360 3325 1 63.19 AAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCCATCCAATCGAGTTACCTGATGAATGGGGAAGCAAACAAAGAGGCTCGAAAAGACAAC:1 - chr2R 5900778 3' - Bari1 17 1 74.66 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTTTGGGGGAAAACTTGGC:1 - chr2R 16908436 3' + roo 9057 1 74.66 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTTCTGGGGCATCTGGATC:1 - chr3R 24693574 3' + hobo 2866 1 67.12 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAA:1 + chr2R 18722041 3' - 412 48 2 52.74 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTACACTGTAGCACAC:2 + chr2R 6585556 3' + pogo 2077 1 69.18 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAAC:1 - chr2R 20382470 3' + Bari1 1660 1 53.42 GGAACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCGGCTAAAAGT:1 - chr3L 22980575 3' + INE-1 573 1 63.01 AACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAA:1 + chr2R 5237882 3' - Doc 96 1 59.59 TTTACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAAACACCTCGTATGCGCAATAATTCAGCTACGTTACGTATACGCAGCGTATCGCATTGGG:1 + chr3L 16153815 3' + Juan 239 1 63.01 AAATAAAAGAGACACGGGAAATTGGATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTGGAAATATTGATATCACGTACTGCTGCTATAATT:1 + chr3R 26765211 3' + mdg3 5461 2 55.48 ATTTAATTAAATTTTTGATTGAAAAGTACGTATAATAAAATATTATTTTTCTGAATACGTTATAATTGCAGTGTCATAAAAATATGATTAAATAAAAAGGATTGAATGCTTGATTAGCAGATATCTCTAGTTAAGCTCTTGTTTTA:1 + chr2L 9315661 3' - transib1 1932 1 79.45 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAATAGGTAAAGAGAATTACCCACTTCGGTGCTTAGAAGCATAATTTTTTGCTCTATCAAAAGGATTATTAGCAAATTGTTTTCGTAGCTATTAACAATATGATGCTCAT:1 + chr2L 16942186 3' - mdg1 15 2 76.03 CTCCTCCCCCCCCCCTCCCCCCGCAAGAGCGGTATGGCAGGGG:1 + chrX 18245395 3' + accord2 223 1 81.40 TTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATATTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTACCATGATGGGTGTGACCTGCACAGGGCAATTGA:1 - chr2R 13094351 3' + BS 5010 1 76.03 TTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAAAATATACTCTTAAGCTGCCACACATATGTACTTTACTACCCAATAAGTCCGAAAGCAATCAGATTTT:1 + chr2R 20324744 3' - 17.6 7283 2 56.16 AGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 190 2 67.82 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTCAGTGTAAAGG:1 + chr3R 9938743 3' + roo 397 1 78.08 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTT:1 - chr2L 16942041 3' + mdg1 358 2 60.27 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCAT:2 + chr2L 15965325 3' - blood 7055 2 55.48 CGGTGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGA:1 + chr2R 22692429 3' - Ivk 65 1 60.27 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGACATATATATAAATTCGATAGTTATGGATGTGTGTGGGAAATGTTCGGGTTGTCGGTGGCGATAAGGTGCGTATGTGTATGTACGTTTATTGCTG:1 - chr3R 28724895 3' + pogo 2077 1 65.75 TTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTATCATCGGGTGGCGGCATTGTCTGACTGAAGATGAACACCTCGGCGCGCTCCTCGCGAGCA:1 + chrX 5306826 3' - P-element 257 1 39.73 ATCCTGATCAAGAATATACACACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTTCTTTTTCTTTCTTCTTTGCAGAGGAGAGCCATGCAGTGCTTTCTAGACTCAAGCTCTAAGCTTCATCAGGGTTCTAAA:1 + chr3L 23289604 3' - INE-1 79 1 44.96 CAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGATAGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 38 1 63.70 GAGTGCACTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACAAACTCCGTTAACCATTGTAGGCAGGCTGGCGGCCAGAGAAGAGAACTCTCTTCTACGCTGCAACGCCCATAATTAAAAGCAACAAGCTGTACAACGCCAAAA:1 + chr2R 18932856 3' + Doc4-element 178 1 52.74 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCACTTCTAGTTGA:1 + chr3R 25521933 3' - blood 22 2 70.55 ATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACCCTATAAGTATAAATATATTCT:1 - chr3L 25874515 3' + 1360 3151 1 66.44 TACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTGATCTCAGATGTTTA:1 + chr3L 3979657 3' - opus 79 2 72.60 CTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAACACTCTCCTACAGAGGATTGCTACCATAT:1 - chr3R 4913556 3' + 1360 129 1 53.42 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCC:1 + chr3L 4023724 3' + pogo 2043 1 59.31 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTTACATTTTGATGTGGTTGCCGCTGGCTTTTGGCAACTGACATCTGACCAAAGCCCCGCTACTTTT:1 - chr2L 1136299 3' + 1360 3357 1 56.56 ACTTTTTTATTTTTTTTTTGTTGGCACAACCAGTTAAAAAGGCTGCAACAACTTGACGGGAGTTTTGTTTGGGACTTGGTTTTTGACCAACTTTTTGTTT:1 + chr3L 4719481 3' - gypsy2 400 1 88.00 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCAAAAAAGATTCTTTACTAATTATGTTCATAAATTTATCAGTA:1 - chr2L 17747378 3' + Tirant 8468 2 59.59 AATATATGTCAGCCCGAGGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAA:1 - chr3L 22221116 3' + 412 443 2 54.55 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATT:1 + chr3L 15322053 3' - Transpac 4990 2 67.12 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCAGTAAACGGCGGCTAAATAAGTATATTAAACATTTTAAAAATTTAAATAGCAAATTCAGCTCATAGAGAGCCAGACTATTTTTAAACGATTGCGTTCTTCTCAATTGACTGCTAAAA:1 - chr2R 10453318 3' + mdg3 222 2 56.85 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAG:1 + chr3R 20292548 3' - pogo 38 1 59.59 GGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATATACTGCCACTCAAAAGTCGAGACAATTGCGTTCGGGCCGGGTCCGTCAAAGTCA:1 - chrX 16184108 3' - 1360 261 1 63.01 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCGCAAGGAA:1 + chr3R 20149826 3' + 1360 3367 1 68.09 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTG:1 - chr3R 11526770 3' + pogo 2036 1 62.33 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTTCTCGCAACGAAC:1 - chr3R 21421023 3' + roo 9020 2 54.79 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGGGATAACCCTTGGGCGCATTGTTCTCTAGGCATTATGGAACGTGTCTGGGCATCTCTTGAGTTTTG:1 + chr3R 31120285 3' - opus 50 4 54.11 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGA:1 - chrX 22824743 3' + jockey 4933 1 63.01 CGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACAATTTATTATAGAAATATAGATATTTTTTGCGTAGAATCAGCTAATAAAGTTTCGTAGCAAACGGCAGCAATAATTATAAGCAGGGCCA:1 - chr3R 18469093 3' - Quasimodo 30 2 66.44 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAAC:1 + chrX 4566244 3' - Transpac 4989 2 69.86 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTA:1 + chr3R 15030751 3' - jockey 86 1 69.86 GTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTATTAAGAAACAAGAAAATCTGTCAATTAAATGCGACATCTTTAA:1 + chr3L 21411658 3' + mdg3 5237 1 70.55 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTT:1 + chr3L 9430639 3' - P-element 86 1 26.71 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAATTAAAATTGCATTAAAGTCGAACAGTTGG:1 - chr3R 9345524 3' - pogo 18 1 71.92 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAG:1 - chr3R 29708942 3' - blood 7050 2 52.74 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGCATTGCAGGTGTG:1 - chr2R 21227339 3' - mdg3 5297 2 50.72 ATCCTGTCACGGTCGCCATGCTATATAAAAAATCCTTTGAATGTTTCTTTCTGAAGCATAGCTCCGTTTATTTTATAGTTGGACTTGTATCAGTTGTAAAACTCGAGTGATTCTTAACAGTTACTTTAAAATACAATACAACAAAC:1 - chr3R 19045994 3' - gypsy11 449 1 56.16 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCCCCTTGTACAATGCACAGGTCCTTAAAGTTTGGTGCTGTTTTGTATCCTTCTTTCGATGCGGTTAATCCGCTTATAGTATGACTAGTGGTTTCTC:1 + chr3L 4175391 3' - roo 26 2 69.18 AACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAAAAGGATGCAGAGGGTGTTGTAATTTTATGGCTTTGTGAGCAAAAACTGACTACCTATCTACCTCTACCTATGTCACTCCCTT:1 - chr2L 16107242 3' - Rt1b 101 1 72.66 CACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACA:1 - chr3R 23099077 3' + roo 352 2 58.22 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAGTGCGTGCGATGGGCAATG:1 - chrX 15167652 3' - roo 8720 2 60.96 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGAC:1 + chr2L 17730515 3' - pogo 73 1 67.81 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGTTGCGCTTCTTTTAATTTAATTAAAGGCAGTAAACTGAAACCAAGTACAAATTACAA:1 + chr3R 25877006 3' + mdg3 5481 2 72.60 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTG:1 - chr3R 18846518 3' - roo 80 2 71.92 CCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTCTGCTAAAACCAGCCAGATTTATGTGCCTGCCCTGTGGGATTGCATTCAGTTCGCCCTCAACTCTGGAGGCCCATCAAGCCTACTATTGCTCTCATAGAATT:1 + chr2L 536639 3' + roo 313 2 73.29 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCT:1 - chr3L 4869151 3' + roo 9029 1 51.94 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGGAAAGTCATAAGATCTGTATATCTTATGATAGTCCTTTGATTAATTCTTGATTCTAGGAATAATT:1 + chr2R 13849736 3' - roo 8720 2 57.53 CGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTAC:1 - chrX 19231746 3' + mdg3 178 2 63.01 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATG:1 - chr3R 31907338 3' - Tirant 8149 2 55.28 AATATAAATAAACAATATATATACATAGGGTTGAAGTAAGTTGCAATAATATCTAATAATGTAATTTGAAATTGCTGTGGAGCACACGTTCTAATTTATTCATTTTTTCCTTTTTTTTTTAATATCTTTCACATATCTCTTTAGCT:1 - chr3R 29701119 3' - S-element 1610 2 63.70 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTC:1 - chr3R 20137238 3' - Burdock 6186 2 54.11 AAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTGGAGAGGTTCCTGCCGGGAACTGAGCCTGGCTCACATCAAAGACTAAGGAT:1 + chr3L 1387251 3' + mdg3 5461 2 60.96 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAATGATTAATTTTTGCTTCTAAGATAACCATATAGTATCATTTAATTTAGCAA:1 - chr2R 13849639 3' + roo 9001 2 67.12 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTATATTGATATTAATATAAATAAATAAAATAAGAGTGACCTATATATTTCGCACAAAATGTACCCCGGACTAATTGATTTATTTACCATTTTT:1 - chr2L 16596160 3' + 412 7516 2 53.42 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTTCCATCCAACATCG:1 + chr3R 9345709 3' + pogo 2078 1 69.86 CAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGTCGAAAATCCCCCGAAGTATGTTGTATGTACGTACATATGTATGTGG:1 - chrX 1340994 3' + F-element 4280 1 67.59 TAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAACATTTATTTTTGAAAAATGGTTGAATATTTTTTCATAATTTTATTAGTCGTGTACATTTCTACCGATTTGCCAGACGGCAGCCGCCAGTGCGAATATTTTTGTGT:1 - chr3R 5417041 3' - Cr1a 4205 1 80.82 GGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGCTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCC:1 - chr2R 10478665 3' + invader4 3033 2 53.42 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGGTTTCTACAAGAAG:1 + chrX 13651553 3' - 297 6644 2 67.88 TAGTTACTGAGATCTCAACGTTCATACGGACAGACTGACATGGGTAGATCGACGAATAATCATTTCTAAAATAAGCTTACGTATTCCAAATTAAAATGGGAAGGGTGTGAGAATACTTTTGTATTACATTTAATTTCGAATAATTT:1 + chr2R 5434376 3' - INE-1 142 1 60.96 ACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGAGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTTTTTGTCGCTGCAAACACT:1 - chr3R 23346522 3' + Rt1a 5031 1 62.33 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAG:1 - chr3R 10973200 3' - jockey 62 1 55.40 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTTTTTGTTT:1 - chrX 8082357 3' - roo 8712 2 51.72 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGCCTATTGCGGCTATGCTGTTTTGTTTGATTTTTTGGTACTCGCTC:1 + chrX 19498177 3' - P-element 44 1 51.88 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGGAGGACCTG:1 - chr3L 18708560 3' - F-element 33 1 69.18 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGCAAACCCACTTTGAGTCAGGAATTGTTGACTAAAGCCAAATACGGGGATTTCTGCTGATGAAGTGCATTTTCAGGTCGGCGGATAACTGTTATCAA:1 - chr2L 9010387 3' - 1360 27 1 67.12 AGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCTGTAATATGTAATAATGCACGAGATCGAGATTGCAAAGAAGAGGCGCTTGACTCATAGCGACTAAAGCGCGGGTTAGAACCTAGATGAGAGTATTGCATTAATA:1 - chr2L 186169 3' - gypsy2 149 2 61.64 TAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTT:1 - chr3R 30486951 3' + Cr1a 113 1 75.34 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTTCCAGTTGATTGGCTGCCTCCATAAGCTCTGCTTAATT:1 + chr3L 20977488 3' - I-element 24 1 69.86 AATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCATCACCAGTCACTGGCAAATACTCGTGGTTAACCTGCTCATCGCTGGCAATGCTGATTTCCGGCTTGCGCACCACAGG:1 - chr2R 16140365 3' - roo 8977 2 51.37 AAACAATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAATTGAAAAAAATTGAAACTAATTGGTAGGCAAACAATTAAAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACCGAACCCAGCTTCTATGAGCTCATCTCATTGGCTTCTCCCAAATCTTT:1 - chrX 19502448 3' - FB 195 1 67.81 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGCTTTCGCGACAACGCCAAATATCAACTACTTATATAG:1 - chr3R 21570494 3' - mdg3 86 2 76.03 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAAT:2 - chr3R 25521805 3' + blood 305 2 68.49 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAA:1 + chr3R 26399889 3' - roo 8725 2 65.07 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATA:1 - chr3R 4659557 3' - P-element 97 1 19.18 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGTTATAATTTTTTTATGCGCTCGCTTTTTTATTATTTA:1 - chr2R 17100055 3' + P-element 2828 1 46.58 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAAAAATTAAATAATTTGAGAAAAAAATGGAAAAAATATGAATGAATTCGT:1 - chr3L 18920416 3' + Juan 4136 1 73.29 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCA:1 + chr3R 15465593 3' + mdg3 5452 2 53.42 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAACATCAGAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTAAATGTCCGGCTGCATCCGAATGGAGTACCATTCTGGCAGCTTCTGATCGCGTCAGTGTGCCGTGGAACCAGG:1 - chr3R 25891538 3' + invader3 263 2 53.42 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAATGATTTTAA:1 - chr3L 4639066 3' + roo 348 2 60.96 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCTTACTACCAGAGCTCCATAAAAAGTCTAAAATATGCTCGACAAA:1 - chr3L 22481189 3' + roo 387 2 71.92 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTCTGGTGAAATTAAA:1 - chr3R 31956734 3' + pogo 2077 1 69.18 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACA:1 - chr2L 19424648 3' - Tirant 8144 2 54.84 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAA:1 - chr3L 14581371 3' + pogo 2047 1 57.24 TATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCC:1 + chr3R 20147544 3' + 1360 317 1 73.97 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCAATTCTAATTTCTAAGCTGCTGGATCTAAGCTTA:1 + chr2L 9287143 3' + jockey 4977 1 61.64 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACA:1 - chr3R 9481998 3' - roo 8713 2 52.74 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGACGCGTCGGCACGCACCCACTCTTTAAAAATATTATGCTTTCCGGATGGCTG:1 - chr2L 6598345 3' + hobo 2871 1 62.76 TAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTATGCCTCCCAGATTGCCCAGCTTGTCGGTGATCATCCAGGCGGTC:1 + chr3L 16380081 3' + roo 8941 2 69.86 AGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATA:1 + chrX 4566249 3' - Transpac 4984 2 66.44 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGGTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCCATAATTCACAC:1 - chr2L 15832979 3' + hobo 2899 1 50.72 ATTAGAACATATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACATACCATATATACCATTACTCAGTGTCTAAAGTAATGGGTATCTGATAGTGAGGGACGCGTTGAACTAGCAACAATTTTGCCGCCGTTTTCCTGTTGCTCC:1 - chr2R 21699570 3' - rooA 7269 2 68.97 TCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTT:1 + chrX 8200301 3' - flea 53 2 57.53 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGCACGG:1 - chr3R 10142900 3' - 412 7082 2 64.14 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCT:1 - chr3R 10973204 3' - jockey 59 1 56.06 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCACAGTCTTT:1 - chr2R 19168069 3' - opus 7168 4 60.27 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGG:1 + chr3L 6774238 3' - pogo 68 1 63.70 GCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCA:1 - chr2R 5848985 3' + mdg1 335 2 76.03 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAA:1 + chr3L 21093230 3' - Ivk 65 1 62.33 CTTTCTTAAAGACTTGTGCGCTCCCAGTAACCAGAATCAAAATTAAAATTAAATTAAAATTCAACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAACAGGATGCAGAGGGTGTTGAAATTTTA:1 - chr2L 16107297 3' - Rt1b 163 1 62.33 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCAATTAAA:1 - chr3R 7884520 3' - jockey 4803 1 54.79 ATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAA:2 + chr2R 5237864 3' - Doc 114 1 71.92 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAAAAATAGAAGGTATACAAGGGTGGTATGCCACTAAAGAGGAATTGATCAC:1 + chr2L 21400185 3' - pogo 68 1 66.44 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGA:2 + chrX 11534541 3' - roo 8720 2 57.53 TAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCTTGCGAATGGATAGGGCCCAAATTAAACGGCTCATGACTTTAATGTATACGATTGTAAAATATA:1 - chr3L 11610592 3' + copia 5068 2 56.85 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATAAACAGACGCAACCATGACGTCAGGCGCTTTCGTTGTCTCGCGCGCATTTCGCCTTTTGTGTTCGTTGCAAATTTTGTGTATTCAATGTCAAAA:1 + chrX 8895342 3' - roo 8690 2 68.49 TTTTTTATTTTATTTTTAATTTATTATCATAAATTTTTCTATGAACTCTGCACTCAAAGAACTCTGTTTAACATTTTAAATTGGGATCTAATTATGTAGTAGAATCTTCTTATATTCGATTTTAAAATTACTTTATTTATCGTTAC:1 + chr2L 17292463 3' - Doc 4699 1 65.75 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAACAAACAACTGTTTAATGCATGGCCAGCCTGTGCGAGAACTT:1 - chr3L 21340740 3' + blood 7310 2 76.03 AAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTATCCTCCCGCTGGCACTCCAGCAGCTGCGACTGCGAACCGCTCCTGCCGC:1 - chr2L 13798505 3' + P-element 33 1 33.56 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTA:1 - chr3L 14581385 3' + pogo 2032 1 67.12 TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTAT:1 - chr3L 20747077 3' - Burdock 6181 2 54.79 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAACTTCATTAAAAAAGTTAATTAAAAATCGTAATTAGTTTTCAAAAATA:1 + chr2L 18776686 3' - mdg1 7 2 48.63 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAATGATTTTAATTTTTTTATTTCATGGGTGC:1 - chr3L 4639046 3' + roo 9032 1 58.22 AGCAACCGTGTCCACTGATCAGCTGCGTTAGATAGAACGTTATTTCGCCATACTTCCGTTCTATCCACGGCTTGAGATTGGGGATCAGCTGATGCGTCCATCCTAAAGCTCTCTAGCTATTATGATTCTTAATTATTTTACATTAG:1 + chr3L 20724450 3' - Rt1c 5005 1 68.49 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGAT:2 - chr3L 2037003 3' - Doc 65 1 61.64 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAA:1 - chr2L 20984284 3' - blood 46 2 51.37 CGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCA:1 + chrX 21667935 3' - gypsy2 71 2 69.86 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTATTACCCATGACAAAATCCAATT:1 - chr3R 7569540 3' - Doc 11 1 54.11 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGA:1 + chr2L 20561458 3' - P-element 90 1 23.97 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACA:1 - chr3R 5087037 3' - P-element 89 1 25.34 CCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAATCCAATTGAGAAATTGCATCAACTTAAATGGGAAACGTGTCTACCCCGACCTTCTGCTGCTTGGTCCTAGGGTTGGTAAAAGGTCCTTGAAAATCCAGAT:1 + chr3L 18418915 3' - Transpac 188 2 68.49 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGCTTTCAAGAGG:1 - chr3R 6782719 3' - jockey 4748 1 66.21 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATTTTGGGATCGATTCAGATTTCAGATA:1 + chr2L 1074043 3' + Tirant 368 2 63.70 GCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGACTTCATTATGTTCGCAATCTATATTTCGTATAATCTAGTAAACCTCAAACTCAATTCCAAATGAATTATCTCAAAAGGCGTTCTA:1 - chr3L 17539187 3' - G2 432 1 58.22 GTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAATAACTTAAGACTATTTTTCACTACCTGTACATAAACAATTTG:1 + chr2L 14420268 3' - 412 7239 2 71.23 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTGTAGCTTTCCTAAGTCTA:1 - chr2L 6406463 3' - transib2 53 1 51.37 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTTGCAAATGTAAACTCCTATGACTTGCATCGATATTAGTGTTAAGCT:1 - chr2L 5341238 3' - S-element 69 1 70.55 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGTCAGTGGAAGTGGACGTG:1 - chr2L 535416 3' + roo 9004 2 63.45 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCT:1 - chrX 22858871 3' - mdg3 82 2 72.60 ATAAACAAATATCAACCAAAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTAAACCAACAATGATAAATCAATTAGTGCGAAACTACTTTCTCTGGATCACTGTCACAAGTGACAG:1 + chr3R 13464439 3' + I-element 94 1 65.07 GAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTGCCTAAGTCCTGGCAGGTGTTCCCAAAAGCAACTAAGTTAGGCTATTTTATCCGCCAGCTACTTAAATCTTTAAGCTACCTTCGCTTGAAACTTTAACCACAATCCTTCTT:1 + chr3L 2997355 3' - baggins 5067 1 56.16 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTACCCACACAGAGACACAGTCGGGACAAGGACTT:1 - chr2R 20913060 3' + 1360 3379 2 78.77 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAG:1 - chr3R 6103564 3' + Tirant 8456 2 51.37 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAACGGGAACGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAAAAAAATGTAAATTGGTTTC:1 - chr2R 6803000 3' + 1360 3387 2 67.81 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGGTCAA:1 - chr3R 5940465 3' + hobo 2887 1 67.89 ACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGATAGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 12 1 54.03 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACATCCCGAAAGGTTCATTTGATTAGTCTGCTAAACATCTAA:1 - chr3L 22635834 3' + mdg1 7388 2 73.29 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATGATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTAC:1 - chr3R 9345569 3' - pogo 63 1 61.64 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAG:1 - chr3L 22221115 3' + 412 7495 2 54.48 TTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTGTAGGAGTATGGTGGCTTTACCAGGGGACCACCCGAAGATCCCGAGCCGTCTCCGTTGCCGCCGGC:1 - chr2R 22868706 3' + hobo 239 1 64.42 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTCAGTAGCCAAAGAGGTTCTTGCGTCGCGTCTGGTGAGCT:2 + chr3R 16194272 3' - mdg1 7049 2 78.77 TAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATGTAGTCTCCGAATTTAGTCAGTCGCTT:1 + chr2L 18823565 3' - P-element 2720 1 23.97 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAAT:1 + chr2L 15965280 3' - blood 7096 2 76.06 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:4 - chr3L 25232768 3' + accord2 7554 2 67.12 AAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCGCAGCCGTTCTCTCATTCTCCATCGGTCCGGTCCATAAGTTGTTCCA:1 + chr3R 21947412 3' + 297 6603 2 75.34 CTTTGAGCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATTGTCTGACACATGTGTGTGTGCTTGGGGTGTGATCCTGGCCGGTATATCCTGTAGTGTCCTGTCGCTGGTCTTTGG:1 + chrX 14666411 3' + Stalker 7179 4 52.74 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTCAGTAGCCAAAGAGGTTCTTGCGTCGCGTCTG:1 + chr3R 16194265 3' - mdg1 18 2 73.97 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTC:1 - chr2L 12355299 3' + hobo 2875 1 73.60 GACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGTTACAGGGCCGATGTTGCGAAACATAACCCGAGCGTAACCTCTACTTAGCCCCCAACTGGCGAGTCTGCTGCCGACAACTCTCGCCTTGTCT:1 - chr2L 15405147 3' - invader2 144 2 50.37 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCA:1 - chr2L 18370306 3' - Doc 38 1 63.01 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGACGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCG:1 - chr2R 5992293 3' + pogo 2047 1 60.14 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGACCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTG:1 - chr3L 18708585 3' - F-element 52 1 55.71 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCT:1 + chrX 15167789 3' + roo 9042 1 65.07 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTA:1 + chr3R 8402658 3' + mdg1 7415 2 54.79 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAATATACTTTTAGTATCCTAGCTTTATAGATATAAAATAAAATCATAAACATAATTCTAGAAAACTATAATCCGTAAACGTTTCCTCAGAAAATTTGCATCTCCG:1 + chr3R 6828070 3' + flea 5000 2 75.17 TCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGTAACT:1 + chrX 12558323 3' + Transpac 5153 2 69.86 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGAC:1 - chr3R 4722399 3' - roo 80 2 74.66 ATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGTGTTACAAAATGGAATACAGAAAAAAGACAATGCAAATGCAAATAATTCCCCCGAT:1 + chr2R 19045232 3' - Max-element 8410 1 61.64 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATTG:2 - chr2R 18721931 3' + 412 428 2 63.01 AGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGCGGTACCAAACTTTACATACTTTAATTGCATTCTTAAATTGTTCAAAAACTTACAA:1 + chrX 11265020 3' - hopper 114 1 63.70 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTGGCGATGGAAATTATGCCAAGCGCATGCATCTGGCG:1 - chr3L 22530232 3' + roo 8980 2 77.40 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTAGAGGGACTTTGAGATATATGAAAACAATGTATATTTATACAAACATTTTGGGAAGATTTTAAGCTAGTCAAGCAGTTAAGCTGGTC:1 - chr2R 6168219 3' - 1360 35 1 61.64 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAACTTCCTCACCGGCATTTCCAACATTTGTTTGTTTCCATTCGAAGATT:1 + chr2R 8686697 3' - hobo 17 1 73.97 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATATATATCTATCTGTGTCGAAAAGCCAGAGCTAAATCCTGGTCAACTCCCCATTTTTCTTATTCACGTTTTCCCGGAGAACAGCCTCCTTT:1 + chr3R 9958750 3' + opus 474 2 69.18 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACA:1 + chr3R 22846782 3' + 412 410 2 75.34 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCCTTGTCTGGCTGCAGGAGATCAACGAAAATCCAG:1 - chr2R 20704141 3' + hobo 2872 1 63.45 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGACAGTGG:1 - chr2L 535427 3' + roo 8992 2 71.23 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACATTTGTACTTTCTGGTCAAATTGGTGCACTATTTTTTCAGTGCATTTCTTCGTTCCAGCCGCTGACCTCGTTTCTCGTTTTCCCCATATCCCTGACCATGTTCGCTTTCCCGACT:1 + chrX 8357793 3' - FB 7 1 76.71 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAAT:1 - chr2R 18807774 3' - jockey 77 1 60.96 AATTATACCAAAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAACAAGGATAGCAGCAGGACCAACAACAGTGCGCACAACCACAGCGACTACAAGCGACTAATTTTGAATGCAGGGACTGGACACGAAACAGAAAAAGGAGCAT:1 + chr2R 5953520 3' + I-element 5176 1 71.92 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTG:2 - chr3L 24153149 3' + Tabor 447 2 58.90 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCAT:1 - chr2R 6945617 3' + pogo 2043 1 63.01 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTCGATAAAATAATTTAGATATAATTTAATGTTCAAAACTGAAAAAAGTTCAAAAAGATTTAATTATTATAAGCATTTAAA:1 + chr3R 11096797 3' + copia 5083 2 57.53 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGC:1 + chr2R 16891835 3' - jockey 93 1 73.97 CTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAA:1 - chr3R 6068300 3' - jockey 4725 1 74.56 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGATTTTTCAATCGTCGGCAGAAAAAAAAATACAC:1 + chr3L 10754274 3' - jockey 4737 1 77.40 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCG:1 - chr2L 18581286 3' - roo 8741 2 70.55 ATCCTGCTCACCGATGAAATACTTTGACTGGCAGTCCCGGTAAGTTTGACAAGGAGAGGAGAGAGATTGTCGCTAAAGCTGAAATTGGCGTATTAACCAGTTCATTAAAGGTGACATTGTTGCTAAGGATTAAGTACTAGGTAATG:1 + chr3R 17421592 3' + Rt1a 4895 1 54.79 TGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGTGTGTGTGTGGCCGCTGGCGATGGGTGCGTGACAGGGTGATAGCAGGAAGGTTCGGAAAACA:1 + chrX 685444 3' - BS 5012 1 72.60 AGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTATCAACGA:1 - chr3L 13227635 3' + hobo 2853 1 76.71 AAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGG:1 - chr2R 20382458 3' + Bari1 1672 1 61.64 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGC:1 - chr3L 21630315 3' - Burdock 6196 2 60.27 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACT:1 - chr2R 19353978 3' + 297 6913 2 63.70 ACCGCGCGTTCTCACTCCCGATCTCCTTCCTTTAACGCTTCGACTCCTATCTTCTTCCATCTGTGCTTGCGCCGACGCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTTTCCCCCTTTTTGC:1 + chr3R 14499106 3' - gypsy8 441 1 44.83 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAGTCTAGAGGGGTTTTTTGCCTTTACAAAGAGCCATATTAAAAGCATAAATAAATTGGAACTTGCAACACCTA:1 - chr3R 13544016 3' + 1360 3342 1 50.68 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGCGATTTGTT:1 - chr2R 16908452 3' + roo 392 2 70.45 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGCACACAACTGACTCCTGCGGACGTGAAAAGAGCGCCAAGAATTTT:1 - chr2R 18316825 3' - FB 67 1 67.88 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGCTCACGCACTAATACAAATTCTGCCCACACACACACACACATTCAAGCAATCGCGTACAGAGAGA:2 + chr3L 7434958 3' + pogo 2048 1 55.48 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGG:2 - chr3R 6068294 3' - jockey 4751 1 76.03 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTGCGCGTATTACCGTTTAAAATTTTTAGCAAATTAATCAATTTTTCAGCAGTGTTAAATT:1 - chr3R 24230601 3' + opus 441 2 59.59 TACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGAT:1 + chr2R 2949146 3' - 17.6 43 1 56.85 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTTGAAAGGGTTAGGAAATGGGAACATGGGATGGAGATGGAAGGTGATAATCTATGTGAT:1 - chr3R 24479170 3' + 412 434 2 59.59 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCAATGTCATTGTCCCT:1 + chr3L 12863783 3' + Transpac 253 2 60.96 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGTATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGAAGGATGTGCTGATATTAT:1 + chr3R 12540253 3' - flea 4796 2 52.05 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGATGTATTCGTATGATGACTAAATTATAAATA:1 + chr3R 8542731 3' - roo 8670 2 73.97 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATAAATATGTTTTTTGCGTACTGCGTACATATACTACATACATATGAATATGCGGCAGTTGCACAGATACAAGGTGAATGGAATGCGTTTGCT:1 - chr2L 17808151 3' + I-element 5324 1 59.59 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAAT:1 - chr2L 17730422 3' + pogo 2041 1 58.90 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAGCATTTCAAGCATATTCACTTTCATGATTGATTGCACTTAAACCGTTGCCATTGAACGAGGTCAAAAAATAGTATCTTAAAGGAAAGGTAAAATTTAAAG:1 - chr3L 11196295 3' + pogo 2084 1 73.97 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAAT:1 + chrX 3452509 3' - Tirant 69 2 67.86 GCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTATGTCAGGATCCCAGCAGGAAGCGTCCTGCTCTGTGGATTCAAGGAAAGCCTCG:1 - chr3R 4808558 3' - blood 466 1 63.70 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTA:3 - chr3R 20292408 3' + pogo 2053 1 54.79 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAAAAAGAGGGCCA:1 + chr3L 9198636 3' - F-element 59 1 66.06 GTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCATTATTGTGTGCCTGCGTTGGTTTGGATTGATATTTTGCTACATTAGGCTGGCCAGCTGAATTTCCTTCTTGGTTCATTACATTCT:1 + chrX 2329207 3' - F-element 4351 1 58.22 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAGAAAACAATCTTTGGGGGAATTAGTATGCAACTCATCTCAGTCTTA:1 - chr3L 20076722 3' - roo 8685 2 71.23 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGTGCCTTCTTCG:1 - chr3R 23254387 3' + pogo 2070 1 65.07 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCG:1 + chr2L 12142632 3' + hobo 2892 1 63.64 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTCTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATTAAGTTATTAGTA:1 + chrX 17469267 3' - blood 67 2 61.81 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGGGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTCTCTTTTCTCCCTTG:1 - chr3R 31956351 3' + pogo 2077 1 69.18 ATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCACCAGGCATCCCAATC:1 - chr2R 24338319 3' + 1360 3356 1 62.33 CCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTATACTACGATATATCATCCATCCTGACTGTATCATTGTACCCCCACAGTAAGTGGGACACCAACAAAAACAAACACCTGCATTCGGAAAATGCAGCATTGC:1 + chr2R 19899559 3' + mdg1 114 2 71.23 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACA:1 - chr3R 20905374 3' - pogo 57 1 60.96 TGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCA:1 - chr3R 25876868 3' - mdg3 68 2 63.70 TAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAAATATTCCGCTCTTTTAAG:1 + chr2R 10163656 3' - Juan 4121 1 54.79 CACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACCGAGTGTCTAATCTTACCTAATTTGTGGCCTCGAGAATCGACAACCCTCCGTTCGGCTTTGAAGACAGTAATCCATTGAGAAT:1 + chrX 2568124 3' - blood 7319 2 56.16 GGATTGGGGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGG:1 + chrX 21907818 3' - accord 7226 2 56.86 CTTAAGACTGACTGTGCAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTTTTTTTGGTGCTGTTGCAACTCATTATTTTGCGGTTGAAGAGGCAACTTTTGTTATGGCGTTCAAGTGCATAAAC:1 + chr2L 14226887 3' - rover 7170 2 52.05 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTCGCTG:1 - chr3L 9430572 3' + P-element 2820 1 42.47 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGTCAGACATGGACATCCTGGGTG:1 + chr3L 4023744 3' + pogo 2062 1 56.16 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGGAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTT:1 + chrX 3452503 3' - Tirant 8180 2 67.39 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGATTAATTGATA:1 + chr2L 14222358 3' + Transpac 259 2 56.85 GAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATATGTGGGCCGAGATGCGGTCCGGGTGGACCGTGCGCCGTGCCCAATTGCGGGCCCTG:1 + chr3R 28292186 3' + Stalker 189 4 61.64 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACTTTTATCTTTCACTCGTCCGCTTGG:1 + chr2R 21056810 3' + Tirant 8474 2 63.70 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATGAATGATATTTTATGCCTTACTTGCAAATCTGTGGGC:1 + chr3R 4884527 3' - pogo 15 1 73.97 CATTGTTAGTCTCTTAAAACAAAGGGAAGATTCAGCGCTCAGCTTGTGGAAGCTCTTTCACTTCCGAACAGGATGGATTCCCGGGCAAACTCGACAGCGGTACAGTTTCCATTGGCTTTTTTTTTCTTCTGTGCCAGTTTTACTGA:1 - chr3L 10317252 3' + Doc 4654 1 69.86 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTATTACCCATGACAAAATCCAAT:1 - chr3R 7569541 3' - Doc 6 1 55.71 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTGACGTACTTGCCATTCTTCA:1 - chr3L 18835249 3' + pogo 2077 1 70.55 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACATGTAGCAAGTTTTTATTATGTGTT:1 + chr2R 3824669 3' - 297 6623 2 76.00 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACA:1 - chr3R 4722398 3' - roo 8743 2 73.97 GTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACTATTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTGATTTATTTATTTACCACATCCCTATTTTGCTTTATTTAACTTTTATACAAAATGCATTACCTTGTGAAACTATAATGTTGGATACTTTAAGAG:1 + chr3L 18209400 3' - Tc3 317 1 70.55 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTCCTATTTCTGGTATTCGCTAGCCGAA:1 + chr2R 18882655 3' + roo 351 2 62.79 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCC:1 - chrX 19498093 3' + P-element 2839 1 40.87 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATCACCGCAAAATCGCCAGACTCATAAA:1 - chrX 13762585 3' + P-element 2809 1 23.26 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAG:1 + chr3R 24175778 3' - Burdock 60 2 60.27 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTCGAATAATTTACATACAT:1 - chr2L 20923003 3' - pogo 32 1 63.19 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAA:1 - chrX 8082395 3' - roo 87 2 78.08 TGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTAAGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATATGTACTCATTTCGTTGTAATAATGTAGTATGATATCTTAATCAGATT:1 + chr3R 22752159 3' - invader1 281 2 67.81 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATG:1 - chrX 11228538 3' + roo 9026 1 54.79 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTGGCTTGT:1 + chr3L 17667644 3' - F-element 56 1 48.63 GCTATGACCGCAAAATTACAAGTTCCCTTTAGAAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGGGTCCTATACCTTCAACAGTAGATGGACCATGGCGTACTATTATGGAAATGCAAAATACAAATTTAATTGAAC:1 - chr3R 2109438 3' - diver 5995 2 79.45 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATT:1 - chr3R 25384181 3' - mdg3 61 2 60.27 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATCGACCCGACAAGTAATCCGGATCATGAATATATAAAATAAATGGTATCGGAAACCATCCAGCATCTAGTATACTCTTTAATATATTCTT:1 + chr3R 3322588 3' + 1360 3360 1 66.44 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTT:1 - chr3R 18903368 3' + pogo 2064 1 60.00 GCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATTAAGTTTTGAAATAG:1 + chr3R 20368070 3' - Max-element 72 2 65.97 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACG:1 + chr2L 20561474 3' - P-element 73 1 35.17 ATATTTCGATACATTTGCCTAAACCCAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTGTTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCAGTACAAAATAAATCAATGCCATGCAAGCCGAAAAGTTAGTGACGTCGCCTGT:1 - chr2R 7604546 3' - Circe 7062 1 72.60 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCGCAG:1 - chr2R 7223627 3' - blood 7030 2 67.94 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTCGTGGATCGAGGTTGAGA:1 - chr3R 25271126 3' - 412 14 2 76.71 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCGGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTA:1 - chr3R 10541225 3' + hopper 1376 1 60.96 GAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACC:1 - chr3L 13722022 3' + blood 7324 1 67.81 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATCCAACTGACGGACTGACAAGGCAAAGTGCACAACTTCATTTCACATTAATGCAGTCGCTTTA:1 - chr3L 12250958 3' - flea 4806 2 54.79 ATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGCAAGGGGGTTTCGGTTGGGCGTGTAGGCGTGGT:1 + chrX 21667966 3' - gypsy2 6518 2 62.14 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTT:1 - chr3R 18903368 3' + pogo 2063 1 59.59 GCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAAATATGGAAACAGCAGTGAAGCAGTGCCAAAAATATGTGAAATATG:1 + chr2L 20228524 3' + F-element 4295 1 68.49 GTTACCTACATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTT:1 + chr3R 9345696 3' + pogo 2065 1 60.96 GAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTC:1 + chr2R 20362284 3' - diver 78 2 72.60 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCAT:1 - chr3L 13597759 3' - blood 75 2 69.86 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAAT:1 - chrX 3524247 3' + roo 324 2 80.58 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATCCACATACTACAGTTCAGCAGAAATAATATACTTGTATAAGATATTCTTACTTAAAAATAGCTAACTTAT:1 + chr2R 15062265 3' - blood 67 2 60.27 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACATTCTCATTTGCATATTTACATTGCC:1 + chr3R 10288898 3' - copia 62 2 58.22 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCTTAGTGAAAAAATACAACTGAAATATAAAATTTCAA:1 + chrX 23043201 3' + roo 8990 2 73.97 GATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGA:1 - chr3R 443033 3' - gypsy2 31 2 63.01 GCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTATATATATATATTCGAGTGGGTGAGAAACGCGAAAAGTGAGGCGACGCTTATTG:1 - chr3R 28539970 3' - accord 265 2 63.01 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCCTCTTTTTCCCCATCTTTGCATTTCACAAGTTT:1 - chr3L 5490791 3' - 412 9 2 72.60 TTAAAAACGCTTTCGTTTGTATCTGTATATTTTAATAAGATAGTTCTTATAAACTAAATTCGCTTTTTTGGTAACAACATAACTTAAGAGAAGTAGCACATACGAAAAAAAGTTACAAATTAACTGATCTAACTTAGTCGAAACTC:1 - chr2R 8030263 3' + transib4 2449 1 80.82 GACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGCGCATGAAGTTTGGGGGAAATTGCCAGACAAGTGGGGCTAACTACCA:1 + chrX 5440072 3' + accord 391 2 71.23 CATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCGTCGCTCGGCGC:1 + chr2R 13574856 3' + diver 204 1 59.09 GGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTC:1 - chr2R 544769 3' - HMS-Beagle 47 2 53.42 TTTCTTTTTTCGACGGCATAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTGTGGTCTTCTTTTGGTACAAATTAAAAAAAAATCTTTAATGAAACTAATTTTTTCTAAATTTGTCGAAAAAAAA:1 - chr3R 21619591 3' - Tc1 375 1 72.80 TGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATATGTTTAATTATTTATTGTGTTTATCATTGCAATT:1 + chr2L 10966648 3' + P-element 309 1 23.97 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAA:1 + chrX 15167764 3' + roo 353 2 56.16 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTACAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGT:1 + chr2L 15965338 3' - blood 7042 2 63.01 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCGTCTAGAG:1 - chr2R 15613738 3' - P-element 46 1 54.11 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTT:1 + chrX 17469274 3' - blood 62 2 58.90 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTTTAAATATGTACAATCGAAATTTACCTTATAAAT:1 - chr3R 11526714 3' + pogo 2092 1 75.34 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACA:1 - chr3R 23099098 3' + roo 331 2 73.29 GAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGTAAAATCAAATAATTAAAAAGTATATAAAATGATGTTACCATTAACTTAAGTTTATAGTAAATC:1 + chr2R 8249835 3' + 17.6 314 2 55.86 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCGAGAAGCTGCG:1 + chrX 7329319 3' + Bari1 1683 1 62.10 CATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGG:1 + chr2R 23313083 3' - Tabor 6907 2 62.33 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTG:1 - chr3R 9563610 3' - P-element 76 1 32.19 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCT:2 - chrX 5222850 3' + 412 439 2 56.16 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTTCGCTTTCGTTGCTGGG:1 + chr2R 23225876 3' + Transpac 5172 2 62.04 AGCACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTCTTTCTCTTCATGATCAGAACCCGTAAATATAGAACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAATTTCAAACTTTAATCTCAGCAGCATTCCCTTTGTCC:1 - chr2L 22191450 3' + Idefix 7144 2 52.05 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGT:1 - chrX 11228533 3' + roo 9032 1 58.62 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAGTTTGTGCACTTGAATGAATC:1 + chr2L 10832385 3' - Doc 22 1 73.29 TGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATGATATTGAATTGTTTTATCCCAAAACAATAAGCACAATGAAAAGTTCAAGACATTT:1 + chrX 10873896 3' + mdg3 181 2 60.96 GACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCGCAAAAAGTTATTGTATTTGCTGACTGATATTCCCTAGTAACAAATACCCTG:1 - chr3L 10076265 3' + X-element 4698 1 71.23 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCC:1 + chr3R 25443147 3' - 297 40 2 55.07 GGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGTGGCGACGAAAAAGTTACGCCGGCGGAAGTTCATTTTATGGCCATCTCTCTGG:1 + chrX 6938256 3' - hopper 26 1 60.80 GAGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGCGATGGCGTATGCATATTGTGAGGTGAACAGAACAGGATGTGTTCGAGTGGATGACACTTGGCTTGCACTTCTGCCATTTGGAAAATTCATAGG:1 + chr3R 8914536 3' + 1360 2997 1 70.55 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACGATTAGCGAGATCTACTCGAACCTGGACAAGAACTTTACATTCCTAAAGGTCGACTATCATCCCAATGCCGAGAAGGTTAAACG:1 + chrX 16364043 3' + roo 9038 1 54.86 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTA:1 - chr3L 13597737 3' - blood 53 2 54.79 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAG:1 + chr3R 25521879 3' - blood 74 2 68.06 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGCAAAAGCCGAAAAACTTTTCCCCACTCTCCCGG:1 - chrX 12623094 3' + jockey 4965 1 61.64 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAATGACTC:1 - chr3R 20905346 3' - pogo 29 1 66.44 ATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTCGAAGTA:1 - chr3L 19146602 3' - pogo 96 1 60.27 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTC:1 + chr2L 16685384 3' + P-element 2809 1 32.19 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTATGTTTGCAAAGTGGAGAAAATGGTATTTC:1 + chr3L 11196483 3' - pogo 21 1 71.23 GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTCGCCAAGTTTATAACAAAGCAAAAAAAAATTCTAAACCGAAGTACTAAAATGCCTCATTGAACCAGAGAAAATTCTTTTCATTC:2 - chr3R 27845445 3' - Stalker4 6994 4 53.42 TAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTG:1 - chr2L 15142228 3' - BS 4754 1 52.05 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATGTTTATATGGAATTAACAGTTACGGCCTCATATAATTCAAGTTACTTATGACTGTTGATTACTTTTATTTTATAAGCAGTGTGCAGAAACCTTTCCCACTCACTACAGAG:1 - chr2L 8772674 3' + Tabor 475 2 78.77 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAAT:1 + chr2L 14222353 3' + Transpac 5173 2 60.27 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCCCTCACAAGG:1 - chr3L 3540076 3' + mdg3 5480 2 73.29 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACT:1 - chr3R 5765339 3' + opus 7431 2 69.86 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTT:1 + chrX 983197 3' - 412 86 2 75.34 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTCAGTGTTCATGTTCGTCAGTTAGTTTCGAATTTTCACTTTTCCTGATATGTGTTAGGGTGCTGTTCTTT:2 - chrX 22591257 3' - copia 54 2 52.74 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCC:1 + chr3L 4023724 3' + pogo 2055 1 55.64 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAAC:1 + chr3R 13358694 3' - mdg3 5310 2 54.11 TAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCATGCAGTAAGAAGACTGCGGCTTTCATCTGTCTGTCTTGGTAGC:1 + chrX 10562828 3' - accord 7336 2 70.55 TCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAA:1 + chr4 829124 3' + INE-1 146 1 65.52 ATTTCTTTGTTATATTGTTTCTCAAAATGTAATTAAAACAGATCCAGATTCCACTTGGGGCTTCTATGGGGGCTACCATGGCGGCGGACAGTGGGATTCTTTTCGCACAATGGTATGTGTAAATTGTATTACATGGAGAGGACCC:1 - chr2L 3231814 3' + TLD2_LTR 182 1 59.31 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGG:1 + chr2R 1277167 3' - Tirant 48 2 54.11 TAAGTCTTTAAATATATTTGTGTTCATGTGTGAACACTTGATATCCAAGCTATGGGTATGGATTCCGCAAAGGAATCTCGAACGACAACGACCAACACGAAAGAAAAGGCTTTTCGTTTGCTTCTCTTACCTGCAAAGCATGAAAA:1 + chr3R 16771480 3' - roo 15 2 77.40 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAAAGCCGAGATTAATATTGCCAACGG:1 + chr3R 14331288 3' + Burdock 247 2 52.05 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGG:2 - chr3R 10142915 3' - 412 45 2 53.42 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTG:1 - chr2R 22671378 3' - jockey 4746 1 71.03 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCAAG:3 - chr2L 18370304 3' - Doc 36 1 64.38 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAAC:2 - chrX 983131 3' + 412 422 2 64.38 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACCTGATGGCTT:1 + chr3L 15322092 3' - Transpac 4951 2 59.59 GTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 205 2 87.06 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGT:1 + chr2R 6052667 3' + mdg1 7377 2 70.55 TGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTACATACATACA:1 - chrX 5439977 3' - accord 52 2 54.48 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCAT:1 + chr3R 26315991 3' - roo 62 2 60.96 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGCTGTTAACGAAACTCCCACGCTGCCGCCTCTGTTGCTGCGCTGCTACTGCGCTGCCGGCATCGCTGTTTTGTTGGACATTTTTGTGCGGCT:1 + chr2R 14001153 3' + P-element 2860 1 66.21 GACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTTTGTTTCTTCTTCATGCGCTCCACTTCCGTTTCCCTTCTTTCCTCATCTTCCTTTTTGTCGCTTCATCTATGTTTTGGTG:1 + chrX 21580089 3' - Burdock 6278 2 59.38 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCG:1 - chr2R 6585412 3' - pogo 35 1 54.47 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCAT:1 - chr3L 5490831 3' - 412 7103 2 56.85 TCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAAT:1 + chr4 829125 3' + INE-1 146 1 65.75 GAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTGTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCG:1 - chr3L 25232688 3' + accord2 208 1 82.07 ATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCG:1 + chr2R 19543723 3' - jockey 4850 1 80.00 GGGAGTGATCGGTTGCATCGGCAAGACCATTTGGAGCGCTTGGGACAGCTGGTCGTGAGTCGCGTCAACATCCTGGGGTAAAATGGCTTTTCTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTCCATATACATATA:1 + chrX 16243798 3' - BS3 190 1 53.42 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAA:1 + chr3R 21924372 3' + roo 9029 1 56.16 ATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTTAGTAAGCTAAAGAAAATGTATAAAGTACTGTATCACAATTTTCTAACTGGCTTTTTAAAACAAGAACTATCGTTTTATCGATACA:1 - chr2R 12686214 3' + blood 7209 2 67.12 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCG:1 + chr2R 15613860 3' + P-element 2859 1 59.84 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGAAATTTAAG:1 - chr3L 9571606 3' - jockey 25 1 71.23 GTACAGGGTCCACTGTGGCAATGCAGGTGCTCGGTAACGTTCACGCACTCGGCTTAGCCTTCAAGAGCGCGGTGACCAGAGTAATGGTCCGTCGGAACTACCCATTGAAGACGT:1 - chrY 2466932 3' + R1-2 3177 1 78.95 CGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGT:1 - chrX 18149804 3' + hobo 2868 1 64.38 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGT:1 + chrX 21213364 3' - Doc 91 1 75.34 TCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGGAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGGATTTTCAGAATATCGTATTCTGGGGAA:1 + chr2R 16312121 3' - G6 1987 2 54.79 CAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCA:1 - chr2R 6984309 3' - HMS-Beagle2 6942 2 59.44 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCG:1 - chrX 19498072 3' + P-element 2829 1 46.58 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGA:2 - chrX 13548319 3' - jockey 4831 1 63.70 TTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAGTATGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATCGCACGTGTGTAAGGTATTCGTATTAATTGATTGGTATCATGGACTGCTGTTTATTATAATCCATTCAAAATCAATTACACACGCCCCCGAGGTCAG:1 - chr2L 17079973 3' - I-element 4915 1 75.34 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAG:1 + chr2L 21342342 3' - roo 8740 2 78.77 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGTCTGGGCCGAGACAGCAGATAGGCCAACAGC:1 + chr3R 23623986 3' - roo 8695 2 66.44 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTGCTTACGTTTTATTTTTTGCCATTCAGGTGGACAAGTCAGCCAGGACTAAGTGC:1 - chr3L 4620669 3' - roo 8683 2 63.01 AGATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTA:1 - chrX 4789114 3' - 297 6634 2 59.86 CAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCCACCTGGATC:1 + chr2R 5900968 3' + Bari1 1688 1 72.41 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACAC:2 + chr3R 6053074 3' - Quasimodo 45 2 54.11 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACG:1 - chr2R 21380582 3' - roo 8703 2 58.22 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTCTTTATAGATTTATGAAAATCAACATGTTGCAGAAATGTTGTGCCACCTTTTTCATT:1 - chr3R 10778600 3' - mdg3 5267 2 76.03 ATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACAAGGAGCAGTGCTCCTTGCC:1 + chr3L 8253780 3' - jockey 4648 1 73.97 GATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCT:1 + chr3R 20147562 3' + 1360 335 1 61.64 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACA:1 - chr3R 25384204 3' - mdg3 79 2 73.76 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTGGTGAGTTCCGATTTCTGCGAGTGTAGTACGATGAATGGTGAATCAAGTG:1 + chr2L 10032767 3' - hobo 25 1 64.71 CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTG:2 + chr3R 22846775 3' + 412 7456 2 80.14 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAA:1 - chr3R 16194116 3' + mdg1 7403 2 54.79 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTAGAGGGACTTTGAGATATATGAAAACAATGTATATTTATACAAACATTTTGGGAAGATT:1 - chr2R 6168247 3' - 1360 63 1 60.27 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACA:1 + chr3R 25876937 3' + mdg3 5411 2 74.66 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGATAGTCATCAGATAGAATCGATCGCGAATTGTTAAGTCTCTCGATAAATTTCTCAGGGCCAAATGG:1 + chr3L 13313251 3' - roo 54 2 54.79 ATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATG:1 + chrY 2720335 3' + gypsy 7374 2 69.86 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATTCGTGTGTATTTTT:1 - chrX 17469175 3' + blood 7327 1 60.96 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACAC:1 + chr3R 10140274 3' - P-element 62 1 41.78 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAG:1 + chr3R 9345680 3' + pogo 2049 1 55.48 CCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAACG:1 + chr2L 11867399 3' + BS 5000 1 61.43 ACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGT:1 + chr2L 20841953 3' + G6 1929 1 78.08 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTT:1 + chrX 13651563 3' - 297 62 2 63.01 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTC:1 - chrX 18193694 3' + hopper 1369 1 54.79 CACCGAACATCCGCTTGAAAAAAAGGCCTCAACGGCAAAGGCACGCTACTTACTATTTTTTATTTAATTGCAATTTGTTTTTTGTTGGCGCGTGCCACTTTTGCAGCGGCGCATTTTAAGTTCTCTTTTTTTTGACACTTTTATGA:1 + chr3R 11276571 3' - mariner2 178 1 59.59 CTTAGGAAGCTTGAGCTTAGCTTTGGGATTCTAGTTTAGGGTCATATTAAATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAA:1 + chr2R 5022745 3' + Gypsy12A_LTR 50 1 70.14 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCT:1 + chr2R 5992387 3' - pogo 19 1 57.89 GACAAAGAGCTATATCGAATGCACTAGTTTAGTCTCTTCCGACAGACTATTTTCAATTTAATTGCCTTTATATAAGAAATAAGTATTTTCCTTCCGAAGATTAAAACCACTTCCCATGAACAACACAGAATTATTGATAACTCCAA:1 - chr2L 23179058 3' - diver2 4784 2 71.23 AGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATAACATGTCCAAATGTTTCTCTAATTCCAACCGACTAGTCATTTGCCTGATAACTTGATTAACAGCAGAAATTCCTAATTAATCGAGCATGCTAATG:1 + chr3R 7719850 3' - jockey 4857 1 67.12 CTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAATTTAATTGGCTTTTTAAACTAGGTCGAAAATCTGACTCGAAATGTTAACACCATTCGG:1 - chrX 18239323 3' - jockey 4530 1 64.38 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTCGGGGCACTAT:1 + chr3R 5940523 3' - hobo 65 1 63.77 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGATTTAACACTTGACCAAATATGAGTG:1 - chr2R 5992255 3' + pogo 2077 1 69.18 AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAATATAAAGAACGGGGTTTATTGTTCGTTAGGTGTTACCTACTTTT:1 - chr3L 11953787 3' + jockey 4918 1 71.92 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACTG:1 - chr3L 19274776 3' - transib2 48 1 52.74 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCCAGCGAGGAACTA:1 + chr3R 10079428 3' + P-element 2863 1 67.81 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTTGATTTCTCAGCGCCTTGCCATCTTTTCGTTTTT:1 - chrX 13548263 3' - jockey 4775 1 74.66 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGCTCCTGATAAGCAAATTTTCTAATCATATTTTAAATACTTTCACTTTCAATCAGTGCT:1 - chrX 3506045 3' + Tirant 347 2 57.53 CTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGAGGGTAGGATTCCAACGTAATCGATCGCGATTCCTGTGCCTGCA:1 - chr2L 12354858 3' - hobo 426 1 69.29 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTA:1 - chr2R 22671391 3' - jockey 4748 1 76.87 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAATCGATCCATGACACATGATCAAGAAAGCGAAAATCGG:1 - chr2R 22671315 3' - jockey 4684 1 72.60 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGC:1 - chr3L 12863688 3' - Transpac 72 2 70.55 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGC:1 - chrX 22858879 3' - mdg3 5342 2 78.08 TACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTAC:1 - chr2L 7459551 3' - BS 5056 1 57.53 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATGTATGCTTATTTAAGAGCGCTATTCACAGATTAGACTT:1 - chr2L 1229523 3' + opus 492 2 78.08 GAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCAAG:1 + chr3R 6842664 3' + mdg1 328 2 70.55 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATG:1 + chrX 14385240 3' + blood 7333 1 63.57 TAATTAAAACCTCTTTTTTCTTCCCCAATTCATGAATCGCATTAATCGAATCGATTTAAATACCTATTAACAAACTACAGCGAAGCCCACAACAAGTATCTTTTTGCTTTGAGGAGCGCCGCTTAATTTATTGAATGATTCCAAT:1 + chr2L 7122979 3' - Stalker2 7183 1 47.59 ATCGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAG:1 - chr2L 5771444 3' - Juan 95 1 78.08 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCTATTGGTCCTGATGAAGTAATATGTTCTTTATC:1 + chr3R 4464215 3' - 1360 86 1 77.62 TAAGAAATCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGTTTTCCGCCAACCAGAATTTGTTGATGAAAATTCGCATAGCCGGGACAGGGCAACCGAAATATTTTCTTTACCCGCTTTGTATATGTCTTTTA:1 + chr3R 2913024 3' + G5 4745 1 70.55 GACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCAAGCTAAGAGAGCTGTTTTCAGTATTTTATAGAAACTTAGCCCAAAAGCCTCTTTCCCACTCAGGCC:1 + chr3R 6842728 3' + mdg1 7435 2 69.18 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTTTTAATTATCCCAAACCCACGCTGAGCAATC:1 + chr2L 11573743 3' + jockey 4959 1 50.00 AAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAATAATTTTAAATAAAATAACCAAACCAACTCGACTCGTCCTTGTTGAGCCAAAATGGCTGTGTTTCGTCGTGCAGCTGATTGAGAG:1 - chrX 7070158 3' - 1360 3152 1 47.59 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACC:1 - chr2L 2690567 3' - hobo 54 1 54.79 CACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGGGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGTGGACTTCAGTGTCTGGGTCATACTTGGTATCTG:1 - chr3R 23588171 3' + hobo 2774 1 73.91 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCC:1 + chr3R 28033679 3' - diver 5893 2 67.50 AAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCTCATCCCATCACCACTCCCCTCCCCCCC:1 - chr3L 21364783 3' + G2 2712 1 69.33 ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGTCGGAAAGTCTCGAATAAAATAGGAGAAAGAGTATGCAAAAATCTGGACTAGTTGGGAAAACTTGCTACTGATAAATGATGCCCGGGGCTGTGTGGAAATTGTTCTCTAT:1 - chr2L 21935936 3' - INE-1 83 1 67.81 GTGTAAAGAAAGATCACCTTGGTGATGATGGGCACCATCACGCTGCTAAAGATAGTTATAAAACTGCGTGATGTCCAACTGAAAGCCACGAGTCAAGTTGGCCCAACGAAAACGGC:1 + chr3L 14282697 3' - I-element 5021 1 50.86 AACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCCGAGTAGAACAACAAGGATTTGTTGCATTTCGTCCACAAATTAGAAGTTTTACACAACAGAACTTAAATAAGACTGAGGAAAACGATTCAGTTCTTTTTGCATT:1 - chr2L 7227687 3' + INE-1 159 1 71.92 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGTGCATCATTGCCGCTAATCAATAAGAGACGCCATTCATTCGGCTCGCTGATGAAATCCCA:1 - chr3L 3137774 3' - FB 58 1 57.04 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATGTTGCGT:1 - chr3R 6782738 3' - jockey 4768 1 79.45 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTT:1 - chr2R 21227369 3' - mdg3 5335 2 73.97 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATT:1 - chr3L 13597773 3' - blood 89 2 79.45 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAG:1 - chr3R 10142925 3' - 412 55 2 54.11 GAGGGTCTCAAGTTTGCGGTGAAACCATAAACGGATTCGGACAGGTGTCCCCCAAGCCAATGCCCTTTTCCTTTTAATATACAACGCATTCACAGCATCCATAATGGCAGCCACATACGCTGACGACACGGCCTTCCTGACCGTGG:1 + chrY 996329 3' + G7 443 1 29.45 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAAGGTCGCTCCTCCACACGCACATTATCAAGCACAAACGCGGCACAAACGGATGCCTTTCACCTGGC:1 + chr2R 5849102 3' - mdg1 20 2 69.18 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATT:1 - chr3L 9241998 3' - roo 69 2 69.86 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGC:2 + chr3L 22481340 3' - roo 8714 2 52.05 GTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGGGTGGAAAAGCAAGCA:1 - chr2R 20382434 3' + Bari1 1696 1 78.08 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGT:1 - chr2R 8305216 3' - blood 69 2 65.75 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACATTTTTTACAAGG:1 - chr3R 24228846 3' - opus 151 4 59.59 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACG:1 - chrX 9709976 3' + pogo 2032 1 67.12 TTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAATCAGCAG:2 + chrX 14692954 3' + Transpac 5179 2 55.48 CCGGCAATTAAAAGGAATGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGATGAAAAATTTCACTTCGACTTTGTTTTCCTCACGTAGCATGCAATTATATTCG:1 - chr2L 3792394 3' - GATE 350 1 66.44 GAGGAGACTGATTGGCCGGTAGGACCCAGGGTTCTTTTCAGGCTTCCCAGGTCTATGAATCATGGTTCGGCTTGCTCTAAATCTCCGGGTCCCCAGATCGCCAGCTCCGCAGATCCCCCCATTCAATCCAATCCGATTCGATGA:1 + chr3L 14595735 3' - BS3 433 1 56.25 ATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGTATGTTGAACTGCGCTGCTGATGGCTTGTACTGTAGGTGTTGTGTATGCAAAACTTTGAGCACGT:1 + chr2R 982464 3' + HMS-Beagle 7026 2 74.66 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTATTTTTCCATGCGTTCTATGAGCAATTTAAGTCCCCATAACAGGA:1 + chr3L 11669862 3' - Tabor 78 2 68.49 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCC:1 + chr3L 22221240 3' - 412 7110 2 56.16 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAA:1 - chr3L 2036981 3' - Doc 37 1 60.71 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTC:1 - chr2L 20923020 3' - pogo 51 1 56.16 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATC:1 - chr3L 22529730 3' + roo 354 2 56.16 CAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTTTATTACGAGCCTATCGA:1 + chr3R 27845579 3' + Stalker4 7315 4 49.32 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCTTTAAGTATGAGTGCGATAATTGTCGCTTTAATT:1 - chr3L 20290698 3' - roo 8750 2 81.51 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGTTAGCTTACGAAAGTGAAA:1 - chr3R 5940420 3' + hobo 2901 1 57.86 AGTGATGGAAGAACGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGGCCCAACAATTACTCACATTGTGTGAGGTGCTCTTCTATACTGATTTTTTTTTAAGTGCATTTTGTGCAGACGACGATTGCGCTTATATTTATTGTCTCGTATGG:1 + chr2L 3914651 3' + Porto1 337 1 57.53 GTAGGCCATTTACTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAACTGGCGATAGTTGGCGATCGATCTATCGATAGTCGCTAATGTTTTCTTACATCACTAAAACTTTTGCAAGATGGAGCCTCTTTTGCTTGGTTTTAACACAT:1 + chr2L 5981768 3' + roo 8972 2 67.81 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTCCAGGTTGTATTCAATCAA:1 + chrX 15167808 3' + roo 398 1 78.08 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCCTTGTCCGTATTTTGCTCTTCTGTAGATCATCGCCACAATACGACATCAATGGAAGCCAAATACATCAAGTTATTTCATTTGGCCCATAACTCG:1 - chrX 11534400 3' + roo 9046 1 66.44 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGAT:1 - chr2L 19424632 3' - Tirant 43 2 57.53 GAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAA:1 + chr3L 18920458 3' - Juan 90 1 75.34 ACTTTGGCAGAGGCCGCTATAAAGCTCTTTCTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGAGTCAAGTCGGGCTCCAAAATTAACTCCTTCTTTCCAGGTATGCTACATAGTATGGAACAAAGCTGCA:1 - chr3R 25473623 3' + gypsy3 80 2 54.79 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACTACAAAAGTATTTTTCTTA:2 - chr3L 5183648 3' - copia 13 2 76.71 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACTAAAAAG:1 - chr3L 13597717 3' - blood 33 2 63.70 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCATTTTCGTTTCGCTCTTGGTTTTTCTTA:1 + chr3R 26316017 3' - roo 8700 2 60.96 TTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACCGGGTAGACCGAGAGATGAACTGGAACTAAATACTGGAAACCGAAAACCGAAAACTTTGCGCATTTGAAGAGGCGGCTGGGCTGGTGGGCGTG:1 + chr3R 27451766 3' + accord2 149 2 52.90 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCG:2 + chr3L 13597840 3' + blood 7322 1 65.07 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCA:1 + chrX 15089560 3' - P-element 91 1 23.29 CTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGGAGGAGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTGAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - accord2 7440 2 77.40 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTT:1 - chrX 10873765 3' - mdg3 5266 1 72.59 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCAGTGACAATATAAAGACAATATAAAAAATAAGAAATTACTAATAATATGAAAAAGGAATTGAATTGGAAATAAAAATTGTTTAATTATTTTATCTTAGACTAAC:1 - chr2L 22713315 3' - Ivk 29 1 65.07 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTAT:1 - chrX 23043146 3' - roo 86 2 80.82 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTACCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGCGGTG:1 - chrX 22858805 3' - mdg3 16 2 74.66 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGGTATGTTCGGACAAGGAAAAAGAAGGAAACAGTAAGCTAAGACTAGAACACTTAAACACAGAAGAAATAAATGTATTCAAGAGGTTATGCAAACAATTCCCAA:1 + chrX 17355116 3' + roo 391 2 73.29 CACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCATTTAGTAAAAATATCCTTAAAGTGCTGCAATTGGTTTATATAGAAAATT:1 + chr3L 6761314 3' - copia 133 2 66.44 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGCTTATGCAAAGCCAGTTTTAT:1 + chr2R 21898017 3' - 412 20 2 69.18 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGCACAAATGCCGCAA:1 + chr2R 18722067 3' - 412 7075 2 70.55 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAATAGTTTCTTGACAAACTGTATGCATCTAATTATGTATACATTTGTGTAAATTGTACTTGGCTCACTTGCTACATATATGCAGTGCACCGTGCTTGGCCAAAATCCAT:1 - chrX 15318764 3' + S-element 1680 2 60.96 ATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGC:1 - chr3R 10973215 3' - jockey 84 1 66.44 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTAC:1 + chrX 21213378 3' - Doc 59 1 60.94 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGC:1 + chr2R 7223766 3' + blood 7343 2 50.70 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGTGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGTGTAAGTGCCCAG:1 - chr3L 14863815 3' - Transpac 41 2 58.22 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGGGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACA:1 + chr2R 10552452 3' - S-element 69 1 65.07 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTGGTAGGACGTGGTCTGTGGTCATTCCCGCCGCTTATCCGCCTTGATTAGCAATTAGCAC:1 + chr2L 6406624 3' + transib2 2815 1 78.08 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGCTGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGG:1 - chrX 15814529 3' - P-element 81 1 28.28 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTGATTAAATCTGCACACACACACACACACACACACACACACACAGCCATAGAGAATTTTCTTTTAATTTTCTTTT:1 - chr3R 9163837 3' + hobo 2900 1 57.55 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGAAATTTCGCGACTCTATGTCCGGCCTTGTCTGTTG:1 - chr2L 1073917 3' - Tirant 8146 2 53.91 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCACAGTC:1 - chr3L 22518979 3' + pogo 2050 1 54.55 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATATTCTTCG:1 - chr3R 4722348 3' - roo 29 2 64.38 TATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCAGCAACGAAAAGAGGCTTGTCTCACCAGAGACGCCCTCGGAAACTGGGCGTCGGATCTTCAAATCG:1 + chrX 18886888 3' - Doc 4245 1 52.71 AAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTACAAATAAGGAAAACTAAGTTCTCTTCCCCAACCCAAAGAAACCTCTCTCCCCCAACCCCCGCTCCATCGAC:1 - chrX 4017762 3' - R1A1-element 114 1 63.70 GACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACTATTACATGTTTTCACATGAGTTATTGAACTAAAAGTGCTGTGAACATTTCTGAAGTA:1 + chr2R 10477241 3' - invader4 66 2 58.90 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGT:1 - chr2R 14385576 3' - jockey 82 1 67.81 CTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCC:1 - chr2R 6984313 3' - HMS-Beagle2 6949 2 63.01 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCG:1 - chrX 9709996 3' + pogo 2049 1 75.23 CTTGCGGGGTCACCAATATGGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGATTATAATAAAGTGACTTCTTACAGGAATCAGCCATGTTAAGAGAT:1 - chr2R 9818613 3' - Chimpo 202 1 68.49 ACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTTTGTTTAAAGAAACAAGAAATGGATATTCGCCATTTTTGTATTATTTCCGTAGGCGCTCTTTGTTAATTAATTAAACACAGCTCACACACCGCCTCTTTGGGCTTCCAATTTTTTTAATGAC:1 - chr3L 13335705 3' - 1360 3186 1 55.48 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCA:2 + chr3R 9345678 3' + pogo 2047 1 56.85 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTAAGGTCGTCACTGAATCCACGTTATGGATATACATTGGAGGAAATAACCTGACACTTGGACAGACTC:1 - chr2R 1277039 3' + Tirant 8456 2 53.42 TAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTA:1 - chr3R 17316023 3' - 3S18 5808 2 56.16 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCTAATTGGGATCTAAAAGATCTCGGTAGAAGGTATACCTACATACTTAGTCGTTCTTTTCAACTAATCTACAATAGTAAATTCCAT:1 + chr2R 6579623 3' - mdg1 7074 2 58.22 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCATTATCTTTTTGTGTTTCAGTGCACTTAGACGTGTGTGACTTGCAGCTATGCGAATGCCAGGCACCCACACT:1 + chr2R 16410129 3' - opus 7160 4 55.48 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTG:1 - chr2L 1073917 3' - Tirant 70 2 63.70 ATTTTATTTTATTTATTTAGGAATTAGTTTGAAAAATAATTCATTGGCAGATTCATTAATTCGCATCGGTTGCATTTGCCTGAGAGCTCCAAGTCCAGGTATAATTAATGCCCAAACACTTTTCTTCGCCCTTACCTGCGGCTCAT:1 + chr3L 14335013 3' - G7 1145 1 62.33 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTT:1 + chr2L 15833107 3' - hobo 44 1 54.11 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTT:1 - chr3R 19700869 3' + roo 9043 1 56.90 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTACTTATG:1 + chr2L 19903503 3' - Transpac 4944 2 59.71 CCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGCTTTCAATTTGGATTCTTCTGACAAACAGAC:1 - chrX 11815002 3' - flea 85 2 78.08 AAATAAAAAACCCTAGTGCAACTGCACTAAGCGAGTGAAAAACAAAAACCACGGCCGGTTTATGTGTAACATATAAAACGAAAACGCACAGAAATAGCAACAACAACAATACAAAACAAAAATA:1 - chr3L 16466994 3' + gypsy9 482 1 66.13 GGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTG:1 - chr2R 19076511 3' - F-element 194 1 56.92 CAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACATAGACGAGTATTAACAAATCAATAAAATATTTCGA:1 + chr3R 11520056 3' - Rt1a 23 1 73.97 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGAC:1 + chr3R 24175762 3' - Burdock 74 2 70.83 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTACTCCCTAGCTAGG:2 + chr3L 53108 3' + roo 9042 1 65.07 GCTAACGGCTGGAGTGCATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGGTGCGTTCCTTGCGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATG:1 + chrX 23108318 3' - BS3 1469 1 56.43 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCATCCAATGCCTTCTTGTTTGAGTTTTATTACGATGCTCTTGACCGGTTTTATTGCCCTCAATATTTCTTGCATATTCTGGCCACAACTCATTCAACAAATATGTG:1 - chr3L 16535119 3' + copia 238 1 71.92 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCACCAATCAGACACAAATTGTCGTTATTGATTAAAAGCAATTTTCATTTAATATTTC:1 + chr2L 21192630 3' - roo 8684 2 73.10 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAAAA:1 - chrX 23283145 3' + roo 8997 2 69.66 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGCTTTGG:1 - chr2L 1073876 3' - Tirant 8121 2 74.81 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTT:1 - chrX 5222833 3' + 412 456 2 59.59 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGAAAGATGCTGCATAAAAGGCAACTGGCAGATTCCCAAAATGGTCACAGCAGGCGCAGCCAGTGGAGCCTTCTTGTGTCCATACACGTAGGCCCACTCT:1 + chr2L 19905260 3' + Transpac 290 2 70.63 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTT:1 - chr3L 9426674 3' + P-element 2840 1 46.15 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATGAAAAGCTTTTCGGTCAACGCTCGAGTCCGCAGCCGAAAATGC:1 - chr2L 18823509 3' + P-element 2813 1 34.93 AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTT:1 + chr3R 10778770 3' + mdg3 208 2 59.59 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACG:1 + chr3R 5087120 3' + P-element 2841 1 53.47 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAATATCGATTCGCAATGGAATCAGACATTAAAACTGACACACAGTATATAATATGTTGTACAAATGTACATATGTATATATATATGGCCGGTAGGTATTAACTGAACTA:1 + chr3L 16157327 3' + Juan 4197 1 70.55 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGGTACATCGAGTGCATGTGTTGGTTAGAGTACAACGGTAATCAATTTCCAAGCATATGTCAATCGTACTACTTAGGGAAACCATTTGGTTG:1 + chr3R 19642949 3' + roo 9042 1 52.05 ACGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACACTTTTCGAGACTTTCAATTATGATTTCCACAAAGAGAGAGTGAG:1 + chr3R 21154311 3' - jockey 4750 1 65.75 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTATCGAATTAATCCAACCCCGGCAAATGGCAATCTGGAAACCGATGACCAAAGCC:1 + chr3R 24735428 3' - 412 12 2 41.10 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCCCGTGCGTTGGCAGG:1 + chr3L 20290782 3' + roo 9020 2 54.48 CAAACAGTAAACATATTGAAAATAGTTTTATAAACCTATAATATCATGTAGAATTTATATAATCAAAAAATCATATAGTCATCTAAATATGTGTTTACATCTAAGACATTTTCTTTTAGCATTCTTACTATACTAATTTCAAGATA:1 - chr3L 16519783 3' + 17.6 31 1 69.86 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAGCTCAACGAGACTTTGACTTGGGAAGTAACCACTTAATATTTGAGACCGTAAATCATCCCAGAACTGGTTAAC:1 - chr3R 16771289 3' + roo 392 2 74.66 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAATTTCTTATGATTCCCTGGCTTGCAGCTTCAACCGACAACTTGAGCAGCGACTTGAGTAGCTGG:1 + chr3L 12285495 3' - jockey 4849 1 56.85 CTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATCACCCGCGGTCCAGCCACTGGGCCGTGATGAACTGCCAGCAGGCATTTACCCAATCAATTAATCTC:1 - chr3R 9798251 3' + R2-element 3179 1 54.17 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGG:1 + chr3R 20149793 3' + 1360 3329 1 60.27 GGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGTTAACTCGGGCAACGGGGAAAGCTCTATGGGAATGGGTTGA:1 - chr2L 14139649 3' - Tirant 92 2 78.77 TTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCT:1 - chr2R 6984286 3' - HMS-Beagle2 39 2 58.90 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCGTTTGCTTTGGGCGGCTGTTGGTTCGATAGGTATTTAAGCCATATCAGCTGTTCATAAATTA:1 + chr2L 2357413 3' - P-element 25 1 69.18 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGG:1 - chr3L 18708600 3' - F-element 64 1 60.58 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCTGAGTAAATACTC:1 + chr3R 15514645 3' - 412 33 2 62.33 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATCA:1 - chr3L 18468338 3' - jockey 4719 1 51.37 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGCATGTTCGATTACATAGTTATATACATATGCGATGAATTACAAAAATAGATGAAGAGGGGAAAGGTAAA:1 + chr2L 8112170 3' + pogo 2077 1 54.48 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAAACATAACAAACTTGGGTTGCCGTTCGCCGTCGTGGTGAATTTTCCGCTG:1 + chr2L 10474397 3' + P-element 2817 1 39.04 ATATATACATATGTATATATATTTCCCCGGGTGTGTGCTGTATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCCACAGATGCTGCTCTT:1 + chr2R 10594209 3' + G3 4507 1 63.01 ATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAA:1 - chr3R 443022 3' - gypsy2 20 2 70.55 ATTCCATAAATATTTGTTAAAAATAAAAATTGTTAACTAAAATGCATACCCTTCAAAAAACTTACGACTCATACAAACATATTTCAGGATATGAGTTTCAGTTAAAAGCTATTATGTAGTGTTTAACTTCATCGACTTTATCTTAT:1 + chr3L 10429617 3' - transib4 462 1 56.16 TATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTTAGCACAAACAAAAAATAATATAATCGTCTGGCGATCGAACGCGCC:1 - chr3R 20990087 3' - Rt1a 5054 1 65.93 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGAACTGA:1 - chr3L 4023596 3' - pogo 39 1 58.90 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAA:1 + chr2R 16891858 3' - jockey 70 1 58.22 TAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGGGGGCGTGGCAATTGACAACTTT:1 + chr2L 20841980 3' + G6 1962 1 57.86 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTA:1 + chr3R 13358709 3' - mdg3 43 2 56.85 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGTGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGTGTAAGTGCACAG:1 - chr3L 14863815 3' - Transpac 4955 2 58.87 ACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATG:1 - chr3L 24153134 3' + Tabor 480 2 78.91 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCT:1 - chr3R 9938615 3' - roo 8747 2 75.34 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGAT:1 - chr3R 31956763 3' + pogo 2048 1 58.90 CCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGGGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGGCTCTGCGTAGGTTGCAGTTGCTGCTGCTGCAGTTGCTGGAGTTGCTGCTGCTGCTGCTG:1 - chrX 934057 3' + roo 231 2 60.00 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTAGA:1 + chr3R 14049464 3' + transib2 2795 1 64.38 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATGACCTGCAGGGCAGCTGGACGGGCGGGGAAAACTGCTGTCTATATATTCGAGGTC:1 - chr3R 9958601 3' - opus 7058 4 62.33 GTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACCTATGGATATGTCACTATATATATGTCAGACAGTTGGCACATCAACTTCTCGGCGTGTTAACGAACAAATCCATCTTGGCGTGGATGAAAAAATTGTCATAATTATAGC:1 + chr3L 4738501 3' - Idefix 31 2 60.96 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAGATATATGTATATGCAGCTCTCACGCTTGACAGCACGCTAATCAGAATCAAGTGATGTTCGTTTTGCTGCACTCAG:1 - chr3R 31071722 3' - opus 7040 4 58.90 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGCGGCAGTCGAACCTCTCTATCGTT:1 - chr2R 17013972 3' - HMS-Beagle 6804 2 78.17 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGATATTTGTTTGTATGTCATTAGCAGGCAAAAGGCCAAATAAACGAAATTATATGGGCTACCGAATAAGAGTCCTTATTAAAGGGTATAA:1 - chr2R 8862362 3' + pogo 2068 1 61.64 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTAAGCTAATATTGATTAA:1 + chr2L 15833124 3' - hobo 27 1 65.75 TGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCATAAAAAACAATCGACAAATTATTATGCCTGATAAAATAC:1 + chr2L 13877756 3' - Transpac 78 2 71.23 GCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTA:1 - chrX 18239385 3' - jockey 4592 1 77.40 TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAA:1 - chr2R 7404692 3' - blood 80 2 69.86 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAA:1 + chr2R 6052664 3' + mdg1 336 2 72.60 AAACATAAGTAATCTTAAAAGTTAACAAAAGGAGTATCAATACTTACTGACATCAGCTGTTCGAAGCTGAATGCCCGGATACTTATTCAGCAGCCAGTATTGCCTGCTACTGCACTCGGGAACCGCTATATTGTGCTATACCGCTA:1 - chr3L 24168340 3' + G4 466 1 63.70 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCGTCGCTCGGCGCTTGGCCATATAAAGTCATCGCGTC:1 + chr2R 13574880 3' + diver 6080 2 60.96 AAAACCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAAATTCAATCATTTAAGACAGCAGCAGCTTTAGCTTAAGCTTGTTTTTTGATTAGGTTACTCTTTTTAATTT:1 - chrX 20944674 3' - Bari1 89 1 50.68 ATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGGACCATCCAGCCACTTTGAGCGTGAACAGGTGAGTGA:1 - chrX 20329155 3' - X-element 4587 1 74.66 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGG:1 - chr3R 5087030 3' - P-element 82 1 30.14 GTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACACCGACGCTTCTCAAAGAGAAAAAATACCCACCT:1 - chr4 1301734 3' - 1731 72 2 63.70 AGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAATCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATTGTTAGATCTACAGTGATTTAATTAAAGGGGTATTCCAGTTCGGCAAAGCTCCTACTGAGCATACGGAA:1 - chr3R 29296294 3' - Cr1a 4225 1 76.03 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGG:1 - chr2R 14553251 3' + mdg3 5418 2 73.29 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCCTTGGGG:1 - chr2R 21380624 3' - roo 8745 2 73.29 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGG:1 + chr3R 13358671 3' - mdg3 5333 2 69.86 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTCTGGTGAAATTAAAAGC:1 - chr3R 31956731 3' + pogo 2080 1 71.23 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATA:1 - chr3R 27786568 3' + Tirant 322 2 72.60 GTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCACGTCACTTACGAAACCTGAAATCTCTCCCACGCACTAATGTG:1 - chr2R 9035648 3' - 1360 168 1 69.86 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGTCATAACTCATGCGACTCATGAGTGCGAATAACAACCACCGT:1 - chr3L 16180826 3' + Transpac 298 2 77.40 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACA:1 - chr3R 15465500 3' - mdg3 84 2 73.29 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCT:1 - chr3R 25271165 3' - 412 53 2 52.05 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAG:1 + chrX 9816477 3' - jockey 68 1 56.85 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCAT:1 + chrX 18193806 3' - hopper 65 1 61.64 ATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAAGTACGAAATGTAATCAAAGATCGAGAA:1 - chr3R 2171155 3' + G5 4740 1 50.68 TGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTG:1 - chrX 22858821 3' - mdg3 5284 2 65.07 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCAAGTGTTAATGAGATTA:1 - chr2L 18370290 3' - Doc 22 1 73.97 TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATG:1 + chr3L 17667625 3' - F-element 75 1 61.64 TCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGAT:1 - chr3L 15371316 3' - Transpac 88 2 77.40 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCA:1 - chr2R 18721934 3' + 412 425 2 65.07 GACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTATTTTGGCTCGAGAAGTTCAAGCCGTAAACGAA:1 - chr2R 19158981 3' - R1A1-element 5171 1 77.40 GCGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAA:1 + chr3R 934263 3' + Rt1b 4719 1 41.78 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAGCTAGTAAGCATT:1 - chr2R 13574723 3' - diver 33 2 60.96 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCGA:2 - chr3R 19700845 3' + roo 9037 1 61.64 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACT:2 - chrX 11228545 3' + roo 355 2 52.74 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATG:1 - chr3L 13722004 3' + blood 330 2 55.48 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGGCCCGAAATTTGGGACAAATATACTAGATAGCTCATAGCTGCACCAGGGAAG:1 - chrX 21086051 3' - jockey 4688 1 65.75 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCTGCGGTTCAATTAAGTGTTGTTCTTT:1 - chr3R 8402494 3' - mdg1 7053 2 76.03 AGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGGGC:1 + chr3L 22638884 3' - Juan 4131 1 54.11 CATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCATCCTTCTTGGATCCACTTGGTGGGAACAGCGAGGGGAAGAA:1 + chr3L 16925558 3' + Tirant 189 2 69.18 CGTGTTTTTAACAGAGCTACAGTTAATATCGAAGTTTAAGTGAAAAATTCAAGCCCAACCATCATATAAAAGTGAAAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTTGACCAGCCACGTGCCGGTTTACTTGCTCAATGGAGAAAGT:1 - chr3L 15131889 3' + Porto1 25 1 71.72 TAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCATGTGGTCATCATCTTCTTCAACGAACCCTACTCCGTGCTGCTGAG:1 + chr2R 15512582 3' - HMS-Beagle2 277 2 69.18 AACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGG:1 - chr2R 14553231 3' + mdg3 5438 2 59.59 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATT:2 - chr3L 5490824 3' - 412 43 2 52.05 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAACACCCGAACTACCATTAATGGTGTCGGTACTGCTAAAGGAAACACAAATTAACAAGGTGTCCTTACCGAGAGCATTCATTA:1 - chr2R 15062147 3' + blood 346 2 61.31 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGGCCCGCACTCACTCACACACACATACACACACACACACACAAAAGGGAGCAGGATTACAGCTCTGCTTTTGCCCATT:1 - chr2L 20561329 3' + P-element 2882 2 78.77 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGC:1 - chr3L 4869156 3' + roo 9055 2 61.22 TTTACTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTCGCCGTGCAAAAGTTGCCAAGAGCGGTTGTTCCTAAATCTACATAAAAAATTCCGTTTTAAGTCTAAATAATTAAATCTGA:1 + chr3L 25634658 3' + Tc3 238 1 52.74 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGTGATTTTCTATCTTTACAGGATATTCTAGCGAACTATTTCTAAAACT:1 - chr3R 18524205 3' + opus 479 2 72.60 CAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTA:2 - chr2R 13574759 3' - diver 69 2 65.75 AGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACCCTCTGTGATATTTCCTAAGTTCTCTTGTTCGCAACATATTTCCATTCAAAAACCTTATATTTTCTTTAAAATAAACAAAAATGTGAAGTAGTTACTT:1 - chr3L 10078808 3' - X-element 4608 1 63.70 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTTTCAGCCTGAATGCGAGC:1 - chrX 12623126 3' + jockey 4933 1 58.90 AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGCAG:1 + chr3R 14165123 3' - Tabor 64 2 59.59 GATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAAT:1 + chr3R 30731520 3' - gypsy6 17 2 71.53 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACTGCCATTGTATTTGTTATCGTATCA:2 + chr2L 8103652 3' - pogo 22 1 69.18 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAA:1 + chr3R 7424620 3' - 412 66 2 68.66 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACA:1 + chr3R 21924349 3' + roo 342 2 64.38 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCC:1 + chr3R 10079416 3' + P-element 2852 1 60.00 ACTATGCAGCAACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATGGCTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGATGGGATAATCTCGATTTGGCGAACATGCTG:1 + chr2L 19826242 3' - 1360 3339 1 75.17 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGTTATAATTTTTTTATGCGCTCGCTTTTTTATTATTTAGATTGCTCTC:1 - chr2R 17100045 3' + P-element 2838 1 53.42 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCC:1 + chrX 685376 3' - BS 5080 1 73.29 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTC:1 - chr3L 22518986 3' + pogo 2040 1 60.27 GAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAACCGAATAAAATAAAACGACAACTTACTTCAGGTTCATTCAGCA:1 - chrX 18707462 3' - BS 4774 1 56.85 GTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATG:1 + chr3R 20368078 3' - Max-element 66 2 60.96 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTAT:1 - chr2R 20500046 3' + 412 7485 2 64.75 AAAATAATTAAAAAAATTAAGACCAGTCCAAGTTCTAAAATTTTATGAGATTCATGCAGGTCTTATGTACATATATCTGGTATTACTTATGATCTTCTTTTCTCGGCGCGCAGAGCACGTGGAAAATCAGCTCGAAAGGTCAGATT:1 - chr2L 8228225 3' + S-element 1460 1 77.40 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCTTGCGAATATGATACATAGATAATCTTA:1 + chrX 14173339 3' + 412 7518 2 65.75 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAG:1 + chr2R 12703859 3' + blood 7344 2 55.91 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGC:1 + chrX 19498133 3' - P-element 92 1 18.25 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTCGAATAATTTACATACATTCTGGCACTCTCCGT:1 - chr2L 20922988 3' - pogo 19 1 72.60 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAATCATATGTACTAGTG:1 + chrX 2873461 3' + roo 9016 2 55.48 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCC:1 - chr2L 13546952 3' - P-element 60 1 54.79 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAGAAAACAATCTTTGGGGGAATTAGTATGCAACTCATCTCAGTCTTAAG:1 - chr3L 20076720 3' - roo 8683 2 72.60 ACAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAATGAAACAAAAAACAGGGTGCGAAAATTCACTGTGGGAAATGTGTGAAATTTCCCA:1 - chr3L 5475548 3' + G2 3076 5 57.65 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATC:2 - chr2R 18123442 3' - 412 83 2 73.97 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCAGCTGACCAAACATCCCATC:1 + chr3L 22221266 3' - 412 7084 2 64.38 CGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGGGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAACATTTTGT:1 - chr2L 15153213 3' - G-element 21 1 64.38 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAATTTCAAATATGAATATTTAAATGTTCGA:1 + chr2L 7215666 3' - 297 17 2 71.92 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGCCTA:1 + chr3L 20076888 3' + roo 9036 1 62.33 CATCGGCATTACTCCGATGGTGGCTCCTCCTTCCGTCGACTCCAGTAACCGTATGCTCACCGGCACGAGGTAGTTGCTTTGTGTACTGCTAGCTGTGTAGCTTCCCTAAACATGTTACATATTCGTAGTTTGTTCCCATATAAGCG:1 + chr2L 12051854 3' - R1A1-element 366 1 55.48 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTC:1 + chr3R 9938733 3' + roo 9052 2 72.22 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGGCCATCTTTTCGACTGGCTAAAT:1 + chr2L 13547064 3' - P-element 24 1 59.09 TCGCTTTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACTGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTAACAAACGCTTTCGGTTGCGAAATTTTCGACACTCAATTGG:1 + chr2R 10367688 3' + invader2 4945 2 70.55 TATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCA:1 + chrX 21907810 3' - accord 432 2 69.18 GTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAATTTCATTACTCTGACTTGCAATCTAATTGAACTGAATAC:1 + chr3R 28621516 3' + pogo 361 1 73.29 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGC:1 - chr3L 18708599 3' - F-element 72 1 62.33 CTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACATCGATGTCA:1 - chr3L 9375783 3' + mdg1 399 2 68.49 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTCATTACCA:1 + chr3L 14043652 3' - Ivk 29 1 65.75 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGTAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTCGAGGCAATAAACAATAAAAGAACACT:1 - chrX 18193695 3' + hopper 1407 2 68.22 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAATATACGATTCCGATTCCATCGGAGTGTCTTATGAGTTCATAAAATGGGTGTGTAGGTGGTTATTAT:1 + chr2L 10089853 3' - 297 6626 2 56.16 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAG:1 - chrX 10978986 3' - roo 67 2 66.44 TATTCAATATCTATTACACCGAGCTATTACTTATTACATATTACAGTATATTTATTTGGCAATGCCATATATGCGATGGACAAAAGATCTGCGAAATTCCAAGAGTCAGTCAATGAAGATCAACGAACAAAAGATGACAGCCCGTA:1 + chrX 11850581 3' + Stalker2 7628 2 66.44 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATTGAATATAAAGCGTTTACGGCCTGTTAGGTTTCCATTTAAATTTTGCATTTAAATTCAACCGTT:1 + chr3R 12559793 3' - mdg3 5270 2 73.97 GGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAACTAAGCACTTTCAAGGTTGTGAGAATGTTTTGGACATAATAGGTAATAATCGGCC:1 - chr2R 7366976 3' - P-element 112 1 37.67 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGA:1 - chrX 3529731 3' - 412 7112 2 57.53 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTG:2 - chrX 11228544 3' + roo 9020 2 52.05 GAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAATTTGACCGATTCCTTGGCAGTAACGGTCTCCGATCGCCTGGCGGATATCAACATATGT:1 - chr2R 22692343 3' + Ivk 5317 1 60.96 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACC:1 + chr3L 15322083 3' - Transpac 4960 2 56.85 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATAGATTCGGACAAATTAACTTTC:1 - chr2L 13877626 3' + Transpac 5214 2 71.03 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAAGCAAACCTGATATTGCA:1 - chrX 10101324 3' - mdg3 5319 2 60.27 ATTTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGACAAACCAAAACCCATCATCAGAAAAACGAAAGACTCAAGACACGAACTCGCTCGCTTTCTCCAAGCTAACTGCAATTGCAATA:1 + chr2R 12566702 3' + Doc 197 1 55.48 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGACATTTGTGGCCAGATATTCGCGGTC:1 + chr3R 24175808 3' - Burdock 6166 2 63.70 AATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATACACAAAAAAGTATGCGGTATGTGTGGCGGCGGTACACCAAAACCTGTCTGGTTGTTAACACCGT:1 + chr3L 12662852 3' - Stalker2 321 2 56.85 AGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTATGACCATAAGATCCCATTTATTAGATGCAACAAGCTTTGGAAAATATTTC:1 - chrX 7293218 3' + 1360 3323 1 67.12 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAAAGAAGGCCCAGAAGAAAGATGATTGATTTTATGTG:1 + chr3R 27835717 3' - 412 27 2 67.12 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGGTACATCGAGTGCAAATTGAATAAAAAATAAAAAAGAATAATTGTACAATAGAAAGGATTCCCGAGGAAGTGAAAAGTTTTATTA:2 - chr2L 21342230 3' + roo 9037 1 60.27 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTC:1 - chr2R 18807725 3' - jockey 29 1 70.55 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAATATGAGTGTGGCTACTTAAGTTAGTGTGTGCATGAGTGTGTGTTTGTGCAAGTGTGGTTTGTTTGCTTGGTCCTGTCCAAACACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978951 3' - jockey 25 1 72.60 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTC:1 - chr3L 5490823 3' - 412 42 2 51.37 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCG:1 - chr3R 10468006 3' + opus 449 2 57.03 ATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTATTAAAATATTTTTTGCCTGGCTGTGCTTCAGCATTGCCATTGC:1 - chr2L 10215411 3' - jockey 345 1 70.55 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATGCAAACAATATT:1 + chr2R 14884357 3' - mdg3 5298 2 55.48 GTGAAACTATTTCTCCTAAAAATTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTATGCAAAGGATATTGTCGATGGCGCAGACAACGAA:1 + chr3R 10498881 3' + 297 313 2 77.40 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGGTGTACCACCACTTTTTATGGCCACACGTGGCTGTCTGTTTTGTCGTC:1 + chr2L 14796968 3' - I-element 38 1 59.59 GTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATGATGTTGGGTAACATCTTCTTCAGACTGGGCGGCTGAGTAGGCTCCAGGCTCCAGATGATCAGTG:1 - chr3R 29989970 3' - INE-1 561 1 63.19 AAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGCGCATGAAGTTTGGGGGAAATTGCCAGACATGTGGGGCTAACT:1 + chrX 5440068 3' + accord 7336 2 66.67 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATACAAACATTTTAGCGTATTTTTATTACACATA:1 + chr2R 13628464 3' - jockey 98 1 77.40 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAGGAGCATCAA:1 - chr3L 11665893 3' + pogo 2047 1 57.53 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCGTGGCAAAGTTGTTGCCTGAGTGGAAAT:1 + chr3R 22429290 3' - roo 6 2 80.14 ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACT:1 - chrX 18193734 3' + hopper 1329 1 78.08 ATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATGGGGTTTATCATACGGAATGCCACGCCTCTTAAAATACGTTAGTTTGCGATGGAGTATATAGGTCAC:1 - chr3R 27478758 3' - hopper 352 1 54.11 GAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAACTGCTTTTTCTCCGCGACTTTACCTTCGGCTTTCGCTGCTCGCGAAGCTTC:1 + chr2R 24666577 3' + transib2 2487 1 62.22 ACAGGGGAAGAGGGTGATAAATCCACTTGGAGAGTTACGATGATTATGTTGGGAAGATGACTGTCTTCCTTAATGCATTTGGATGATACAAAGTAGAACCTGCACGGATCCTTGATCATTTAAAAATGATGTTGGG:1 - chr3R 14677266 3' - gypsy3 295 2 60.29 ATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATATCAATATCTTTGATTTTTCTCGCCGTTTTCTTAATAT:1 + chr2R 17633046 3' + hopper 1253 1 74.66 CATTTTCAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAAT:1 + chr3R 8049022 3' - Q-element 136 2 60.27 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCGAC:1 - chrX 16244858 3' - jockey 4790 1 59.59 GATAGCAGACAACTGTGTGTGTGCACACGTATCCATGCATTGTAAATTTGACAATATATGTACATATGTATGCCCTTCCACACACGGCTCCCAAAAAATATAAAGAAATATGCTCGCAACTTGAAAAAGTAAATAAATATTTGAAC:1 + chr2L 20964321 3' + 1360 162 1 53.42 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCGTTTGCTTTGGGCGGCTGTTGGTTCGATAGGTATTTAAGCCAT:1 + chr2L 2357394 3' - P-element 44 1 56.16 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGT:1 - chr3L 15891012 3' - mdg3 67 2 64.38 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTTCTCGCAAC:1 - chr3R 21421027 3' + roo 9016 2 57.53 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTGTATCCTTGGCAGCGTAGCTCATTCCTCTTCCAT:1 - chr2R 21227306 3' - mdg3 5272 2 70.55 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCT:1 - chr3R 23507567 3' + 412 440 2 52.74 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCCCCTTGTACAATGCACAGGTCCTTAAAGTTTGGTGCTGTTTTGTATCCTTCTTTCGATGCGGTTAATCCGCTTATAGTATGACTAGTGGTTTCTCGGGAACA:1 + chr3L 4175398 3' - roo 8683 2 73.97 TGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACAC:1 - chr3L 14546345 3' + copia 5045 2 73.29 GACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAGTTTTTGTATCTTGAACGGTAACAAATCAAATCAAAATTCAATTCCCCAGCAGCTGCAACATTGCCATTATTGTTATTGTCAATGGTTATTAAAATGTTTTACAAA:1 - chr2R 20015065 3' + X-element 4698 1 73.29 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGAAATTTAAGAATTAATTAGGA:1 - chr3L 9571594 3' - jockey 13 1 79.45 AGCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGCTGGATTTTCTTGTAAGGCCTCTTGCAGCGTCTTTCTCAACCTTCTAGTTTTTTAGTTTTTTTAGTTTTT:1 - chr3R 10220797 3' + hopper2 1564 1 46.81 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATTAGCAGTGTTATTCCATATGGTAACACTGCT:1 - chr3R 14663177 3' + pogo 2074 1 67.12 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTAATATTTTCTAATGTTCAAAAAAT:1 + chrX 13651610 3' - 297 6591 2 76.26 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACA:1 + chr3R 10140273 3' - P-element 62 1 44.14 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCACCAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTA:1 - chr3L 10370912 3' - copia 41 2 75.27 GTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAACATTT:1 - chr2L 15153216 3' - G-element 24 1 62.33 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGTACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATT:1 - chr3R 14049330 3' - transib2 39 1 52.00 AATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTCGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGAGCT:1 + chr2R 14793535 3' + Dm88 8 2 83.56 CGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGGGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGAATCTTGAGGGCCAGTTGGGGTTTTT:1 - chrX 20547837 3' + Quasimodo 6921 2 80.43 CGCACGGGGTTTTTCCTGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTCTATGCTTATATTCACGGAGGAGAATCTTACTGTAGCACACACATACATATATTTACCCCTAATATTTGTCCTTGGACCTTTAGGTTAATCGAACAACTTTTAC:1 + chr2R 18073289 3' - baggins 5102 1 49.32 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGTAGCTAATAAA:1 + chr3L 22529826 3' - roo 73 2 67.81 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTG:1 + chr2R 15613868 3' - P-element 22 1 65.32 AGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCC:1 - chr3L 10076327 3' + X-element 4636 1 71.92 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCCACCCTAGAAAAGCCACATCGCCTCGCTGAAATTATATTTCAATCAATGTTTATTTGTTTTCCTA:1 - chrX 9342439 3' - 1360 56 1 58.22 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATGCATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTA:1 - chr3L 15371267 3' - Transpac 39 2 59.59 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAAAGTACCAAAACTTGTGCACTTTATGGATCTGTAAC:1 - chr2L 2690527 3' - hobo 12 1 77.08 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATTCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGT:1 + chrX 17258292 3' - 297 55 2 68.55 CTATGTGTGTGTGTGTGTGTACGTGTTTATCTTTGCCATGTGGAATTAGTTTGCCGTGGCCAAAAACCACAACCGCTGGGCTTCGCATTAGCAACAACTTCATGGCAAAGTGTAATCAATTATTGGCAAATGTTGCTGCCGG:1 + chr3L 3916826 3' - accord 7029 2 72.54 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGCGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGGTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTG:1 - chr3R 5940439 3' + hobo 2897 1 51.20 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAGTTTGTGCACTTGAATGA:1 + chr2L 10832382 3' - Doc 25 1 71.23 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTCAGTG:2 + chr3R 9938737 3' + roo 9054 2 73.97 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCATTCGGTGCAAATAAAAAGTCATATAGTAAAACCAAAACACAAAAA:1 - chr3L 15321917 3' + Transpac 5212 2 74.66 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTTAA:1 - chrX 19231714 3' + mdg3 5468 2 63.57 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAGTTTGTGCACTTGAATG:1 + chr2L 10832381 3' - Doc 26 1 70.55 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCT:1 - chr3R 25876853 3' - mdg3 5291 2 56.06 CAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTTCAAAGTTAACAAACAATATTCTTAAGTAGTCA:1 + chr2R 20362344 3' - diver 5906 2 71.92 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATTGCCATTAAGTACTGATAAATGCCACTATTT:1 - chr2R 18721902 3' + 412 457 2 58.22 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTC:1 + chrX 21213412 3' - Doc 43 1 53.42 AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGAGGGAACGGTGTGCTGGCAGTTTACAAGTTA:1 - chr2R 14562072 3' - Burdock 6158 2 70.55 TTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACAAACGTAACCCAGAAAACTGAAATGAGCAGGAAAAGGATTTCATGTTT:1 - chrX 6937862 3' + hopper2 1539 1 63.01 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGAAAAATCGTTGTTTGACTTACAAACTTTATTGTTCATAGTCATAATCAGCT:1 - chr2L 14359042 3' + pogo 2033 1 67.12 ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACA:1 + chr2L 1229682 3' - opus 73 4 75.34 ATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCACACAGGCAAGGGAAAGCCAAGACCTTCACTAG:1 + chr2L 17198114 3' + R1A1-element 5250 1 77.24 AATTCTTTTTCATATGTATGAACATAAGCATAAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGTAAACAACCCACTAACATGGACCAAGCTGCGCCTGCCGCCCCTCTTCGCCGCGATCTTCGACATCCC:1 + chr3L 21264380 3' + Tom1 172 1 60.63 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCTAGGGTAATAGTA:1 + chr3L 23871338 3' - Doc 62 1 54.79 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCT:2 + chr3R 5087064 3' + P-element 2783 1 14.38 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGAACAAAAGGAATTCCCAAGCAAAATATATTGTCAAACAATTTCAGAGAACTTTTTAATCTTTGGTCCA:1 - chr3R 22289364 3' + 412 441 2 52.74 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTATTGGTCCTGATGAAGTAATATGTTCTTTATCGAGTCAGAAAAGAACATAAACTGCCTACC:1 + chr3R 4464244 3' - 1360 60 1 58.22 GGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGAATTTTCATGTTATTGCAACTAATTTTCATTTAATGCGTTTGTCGAGCACT:1 - chr3R 7330999 3' + micropia 5326 2 64.34 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATATTCG:2 + chr3R 24175803 3' - Burdock 6171 2 61.64 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATAT:1 + chr3R 8022201 3' + roo 8984 2 78.08 AGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCATTCACTGT:1 + chr3R 6053087 3' - Quasimodo 34 2 63.01 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGCATTGG:1 - chr3L 23146432 3' - 1360 22 1 70.55 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTGCGGAAGAGGTAAAT:1 + chr2L 7991387 3' + 297 344 2 54.11 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAGTGATACATAATTTATGGTAAATAAATCAGGTCA:1 - chr2L 3006044 3' + pogo 2080 1 66.44 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTATGAATATAAATGATATGGCCTAAGAATATTTTATTTTAAAAGATGGTCGCGAAATTGTCTTAGTACTCTCT:1 - chr3R 5245527 3' - 1360 19 1 73.29 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGGAAGTTCTTTAAGATGAAATTGAGAGTGATTGTGAAATATATACA:1 - chr3R 10498779 3' - 297 6622 2 56.16 TTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTATTAACAAT:1 - chrX 18239380 3' - jockey 4587 1 73.97 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTTCCATCCAA:1 + chr3R 9345704 3' + pogo 2073 1 66.44 TGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACACTTTCAAAATTTCAAATCTAATTCAATA:1 - chr2R 19633162 3' - jockey 4595 1 70.55 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTCAGCAGAAATAATATACTTGTATAAGATATTCTTACTTAAAAATAGCTAACT:1 + chr2R 15062262 3' - blood 70 2 63.70 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCG:1 + chrX 21213423 3' - Doc 32 1 60.96 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTTTTCAGGAGGG:1 - chr2R 6984274 3' - HMS-Beagle2 6910 2 67.12 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAAT:1 + chr3L 13722124 3' - blood 56 2 56.16 AAGCTAGGAGGTTGAGATTCAGCATAAAGATTTTAAAGACAAAGACGCATCGCAAGTTTGTTGACTCGTGGTGCCACACCCCCTTTTACGCCCAAGAACTGCCAATGAAATGGCAGCTTCGGCTAAGTTCAAATAGTATTCACCTC:1 + chr3L 5626013 3' + INE-1 167 1 69.18 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGA:1 - chr3R 10973199 3' - jockey 68 1 56.85 TTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCAAAAAGGCAACAGTTCGGTCAGGAACGTCGGTATGTCA:1 + chr3R 1140331 3' - X-element 141 1 74.48 CGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTC:1 - chr2L 15142234 3' - BS 4760 1 52.74 CAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACAAAAACAT:1 + chr3R 15590053 3' + Transpac 242 2 63.70 TCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACACCAAGTCGCGCC:1 - chrX 292366 3' + G3 4556 1 74.66 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCTACTTTTCCTTCGTTCACTTGC:1 - chr2R 544745 3' - HMS-Beagle 6819 2 69.86 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATTCCTGAATAATTACAAGTGTAAAAAAAAACAAGCGAAAATTCGCGGCGAATTGGCAAGTGACACAGAAAGAGCGGA:1 + chr2R 8862515 3' - pogo 29 1 62.96 CGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAATGCGGGAGAGGGAAAGTTGAAGCGGAAGTCCTTTCCAGATGACAGAAGCGCCGACTTCTTTACAAAGCTAGACTTTTTGGATGATTCAG:1 - chr3R 19024505 3' + roo 440 1 58.90 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTG:1 - chr2R 13574779 3' - diver 5976 2 77.93 TTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAACGAAATTTTACCAATTTCCGATTCCATTTTTATTAGGTCCGAACG:1 - chr3L 15322145 3' + P-element 280 1 32.19 CTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCACCGATGGGTATTTCGCCTTGTTTTGGATTTTGGTCCACCG:1 - chr3L 19041142 3' - Quasimodo 7216 2 74.66 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATATTCTTCGT:1 - chr3R 4722347 3' - roo 28 2 65.07 TTTTTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTATCAATAATGTATGTATTTACAGGAATATACAAGAGAGCCCAGCCCAGTCGCCGAGAATCCAGCCCACAGGCTTACACCCCGTACTTGATGCCGTAC:1 + chr3L 21474671 3' - F-element 4674 1 60.96 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAAGTGATTCCGAATGCACCACAGATCCGAGAAAACTTTCTAATGCAGGGGCCCAGGAACCAAAATCATTGTGGATGAAGTGCAAA:1 - chr3R 28033566 3' + diver 186 2 58.90 GCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCATGTTGTTGTTGTTTCGCCTAGCCATAAGCATAAAGCAAAAAGAAAATAAGCCTCA:1 - chr3L 8056696 3' - 1360 3246 1 62.33 ACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTT:1 - chr2R 10478653 3' + invader4 3049 2 58.45 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGCACGGAGGAGCTTCAGAG:1 - chr3R 10142887 3' - 412 7070 2 72.60 CTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTATTTGCATTTAGGATATGCTCGTTTTTGGTTCCCTTCTCGTGGTAAAC:1 - chr2R 7577750 3' - 17.6 7211 2 67.81 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAGCGTGAGAGTACTTGGGGAAACAGAGGAGCTCA:1 - chr3R 10140177 3' + P-element 2857 1 53.72 GGTGGGGGATCTCGAAAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCATATCCATCACGCTCAGTGAAGCAACCCCAGACCCCTCTGCCCCCTTTGTGCCTTCCCCGCCC:1 - chr2L 20942354 3' - Rt1b 442 1 71.77 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACAAAATTGGCAAAGTTTTGCTTATCAGCGGGCTCTTGCGGTGTGATAGCCGCTTAATATATGTACAGGTATTTGTTGCCGT:1 + chr3R 19088978 3' - FB 42 1 56.85 GGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTCCTTTGTATATCTCCTCGCTCCAGCAGATTCGGCTTGG:1 + chr3R 31521489 3' + R2-element 3199 1 73.97 TCACTCGCACATACACGGACACACACAACACAGTGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAGTTTTAAAGAGTAATAGGTATAGATGTAGTAGATGTAAGTTTGCCGCTCTCTCGACTTATCGACTGGGTCTCGCC:1 + chrX 17780940 3' - Stalker 450 1 73.29 CGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTAAAACACACACACACACACCTAACACACTGTACAGTTGAACCTCAATAGGG:1 + chr3L 3234827 3' + gypsy4 477 1 60.87 TGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTCGATGGATGGCAAGACCAGAACTGATTGGGAT:1 - chr3R 12375711 3' + copia 5036 2 77.40 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAA:1 - chr2R 18807794 3' - jockey 97 1 74.66 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGTTATAATTTTTTTATGCGCTCGCTTTTTTATT:1 - chr2R 17100060 3' - P-element 85 1 43.45 TTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTATAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTAAGAAATTTCTTTGCGGATGATTCTGGAGGGGACTCAGTTGGGGAGGTGATAGGAATTCGTCGTCAGGTGAATGAACT:1 + chr3L 23426270 3' - Porto1 4394 1 59.72 AAGGTGGTCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGGTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACA:1 + chr2R 12703843 3' + blood 7335 1 63.33 GAGCCGTATGGGTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTATACGCCCCGTATGTCCGTGAGGCTTTGCTACATTTTTATGCGATTTGTGCCCC:1 - chr2L 6599979 3' - hobo 2766 1 65.00 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTA:1 - chr3R 12608061 3' + roo 334 2 68.49 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGAC:1 - chr3L 16887333 3' - roo 86 2 77.40 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTACCATTATAAATACTTTATTTTTTCTTTTCCTCCGTCAACCTTGTTGTT:1 - chr3R 29340998 3' - blood 7029 2 80.82 CTAATCTATTTTCAAATATTAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAACTAACCCAAGTGCAAGCGGAAGCGGACTTGAC:1 + chr3R 7125946 3' - 1360 319 1 78.08 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACATAAATCACGACTAACACTTTAGCAAACATAAGTTTTGCAGTAATAACACTTGTTATCTTAATTATGGGTTT:1 - chr3R 23449226 3' + roo 9030 1 56.85 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTT:2 + chr3R 8402646 3' + mdg1 7403 2 54.79 TACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACATTTTGATTGGCTTAAAAATGAAAGGATGAAACTGGTGATAGACAAATCTCAGCGTGAAATTCATTCGGACGCACCGAGGAGG:1 + chr2L 10911743 3' + Doc 274 1 56.16 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTA:1 - chr3L 4710700 3' - Doc 44 1 58.22 TCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTA:1 + chr3L 53095 3' + roo 9029 1 56.16 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAATAGGTAAAGAGAATTACCCACTTCGGTGCTTAGAAGCATAATTTTTTGCTCTATCAAAAGGATTATTAGCAAATTGTTTTCGTAG:1 + chr2L 16942164 3' - mdg1 7075 2 60.96 ACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATT:1 - chr2L 15153227 3' - G-element 35 1 54.79 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGCAATTAATTTCGCCTTGGGCCCGGTCGAGTTCCAAGTGCTAA:1 - chr2R 11379678 3' - jockey 32 1 68.49 ACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTATATAAATTATATACTCGCTCGCAGATATACAAGAAATATTTAAATATAT:1 + chr3L 7904525 3' + gypsy11 3985 2 60.96 GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCAGTTTGCGCTGGC:1 - chr3L 14854659 3' - rover 6996 2 54.11 ATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTACTCCGCATATCCACAGCCCACTAAGCTGGTCTCACCCCAAACCAGTTGGGAATAGTGTCCAGTT:1 + chr3R 13210166 3' - F-element 4384 1 52.48 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATT:1 + chr3R 10079349 3' + P-element 2790 1 15.71 CGGCAATAGGCCGGTGCAAACGTACTTATCTGTAGTTGCCAATTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAAATATAACATCCCGCTGATGCCGACGCAGATCGTCGACCGCCTCTCGGCAAACGGTGACCATTAGCAC:1 - chr2L 13297872 3' - rooA 7347 2 60.27 GCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGC:1 + chr3L 21093232 3' - Ivk 63 1 61.64 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGT:1 + chr2R 1277158 3' - Tirant 57 2 57.53 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGCACACC:1 + chr2L 17730547 3' - pogo 35 1 61.43 TGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGC:1 + chr2R 9033933 3' - F-element 4553 1 60.96 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCCACCTTAAGCTGCAGAAATATTTCGGATATTTTTCCCTGCTGCACGGAGAAAAAAATCGTTGAAA:1 - chr2R 23225771 3' - Transpac 4972 2 54.79 GAGTAACAGGTATCTTATAGTCGCGACACTTAACTACAGCGTTCTCTCTTGTTGTTTTGCTATTGTGTTTGTCTTTTAACTTGCCCTTGATCCTTCCAGCATTTCACCTCCAATCCTCTCCGACTGTCTG:1 + chr3R 25570595 3' + INE-1 549 1 63.85 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATT:1 - chr2R 8305223 3' - blood 7087 2 70.55 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGT:1 + chr2L 15965338 3' - blood 7042 2 64.38 TTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGATTCTATTAGAATTCGGTTTGGACTCGAATTCGGATTTCTTCCCCCAAAATGC:1 - chr2L 12553741 3' - gypsy2 6642 2 63.64 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTTCTTCAATGTTTGGCACAGGAACGTTTTCTTTCTTGAT:1 + chr3R 3255440 3' - Doc 89 1 76.55 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATAATATAATATAATGGTAAGAGTCTTCCCAAACTCAAAAATATTTATCATATATAATTCTGGTATTAGTATTTCAA:1 - chr3L 15261238 3' - pogo 41 1 54.11 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTC:1 - chrX 18125108 3' - BS 5031 1 53.49 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCG:1 - chr3R 10142905 3' - 412 7088 2 60.27 CGGTGGAGAGAAGTATTGCAGCCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCATTCGACTTTCTTAACAGGTGCAGATTGCGGGTCACCCCAAGTTGGTGTCTTTCCCAACT:1 - chr2L 21593406 3' - BS3 349 1 69.86 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGATTTGTCTGGTGATGCTGTTACGC:1 - chr2R 7534538 3' + roo 397 1 78.08 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATT:1 - chr2R 19900992 3' + mdg1 343 2 70.55 GAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAATGCAAAATAAATTAACGGAGAGACGTGGAGAAAGTAAAAGCGTGACAAACATGTACGCTGTGCGGCGTTATTAAATTAACAAGGAAGGAGGGA:1 + chr2L 2363012 3' + P-element 2609 1 67.81 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGGAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCC:1 - chr2R 22867412 3' + hobo 2892 1 52.59 GCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTTTCGGAAAAGTGCACAAATTTCGTCTCAGATATATTTGTACGAGATTTATCAGCTAATCATGTCGCAACACAACAATCAAGTCATCGAGGCTGCGGTGGAA:1 - chr3R 2691101 3' + diver2 4718 2 63.01 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCATTACTACATCCCAT:1 - chr2L 7459503 3' - BS 5008 1 71.23 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAAT:1 + chr3L 5446184 3' - roo 76 2 70.55 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGCGT:1 + chr2R 23225845 3' + Transpac 279 2 73.75 AGTGGCTGGGTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATGTACATGGACATGGCGCAGATCAAGTGCC:1 + chr3R 25354539 3' - 297 12 2 57.81 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGAC:1 + chr3R 8402644 3' + mdg1 363 2 56.16 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTAATATTTTCTAAT:1 + chrX 13651599 3' - 297 27 2 65.52 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACA:1 - chrX 11228540 3' + roo 360 2 53.42 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAAC:1 - chrX 15089522 3' + P-element 2796 1 23.29 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTGCAATTGCCCAGGTCCTGG:1 - chr3R 5765291 3' + opus 7479 2 70.55 ATATTTTATACAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACACTTCATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAATCATAATATGAATAAATGTACTATAGTTTTTGA:1 + chrX 15077380 3' - S-element 89 2 96.58 TAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTGTTAAACCAAG:1 + chr3L 12030593 3' - I-element 5225 1 60.96 ACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCGACTCGTGTACTGTCCGGC:1 + chrX 21213448 3' - Doc 7 1 78.08 CAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCACTCAGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGTTCATACCAGACTGTTAATAAGCAAACAGTCCAGGATTCTGGATTCAGTTCAAAAACAACATACGCC:1 - chr2L 22643347 3' - invader4 2778 2 60.87 ATTTCAAAAATGGCTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCTGGAGTATGGACATATGTCCCGGTTTTACAAGAGAGACGACGAACAT:1 - chr3R 3877509 3' + 1360 378 1 67.81 TGTGCAAAGCACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTTCCATCCAACATCGATTTTC:1 + chr3R 9345715 3' + pogo 2084 1 73.97 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATATTTCAGCCTGAAGAAACTGCACAAGGTGCAATTGCTGGTGGATGCGTGCAATGTCTTCTATCAGCCCAATCTGGAG:1 + chr3R 28725048 3' - pogo 23 1 60.90 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCAT:2 + chr3R 6103667 3' - Tirant 8180 2 67.12 TTTGTTTGTTTTTTTTAATAATAGCAAGTGTTTTACTGGACGCCCACCCACTTGCCGACCGGAATGCACAAACAATGACGAGTGCCAGAACC:1 - chr2L 4519505 3' + hopper 155 1 60.87 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGG:1 - chr3L 20747095 3' - Burdock 6199 2 63.70 AATTGACTTTGTGCATAAACACACACACACCATTGCTATTGTGTTTTAGGGCGTTAGGTTGGGCGTTGCAAATCGACAGACAATTACAAGACTAATATAAATGTAAAAATAGTCTATGAGTAACGGGTATAATTAATATTTGTTTC:1 + chr3L 25413889 3' + G3 32 1 73.29 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTTTCCCTCTCGCTCTGGCAACAGGTAA:1 - chr3R 26315855 3' + roo 9047 1 68.49 CTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTGGA:1 + chr3R 31907430 3' + Tirant 8438 2 64.83 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGG:1 - chr2R 21380581 3' - roo 38 2 58.22 TCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGCTTTCAATTTGGATTCTTCTGACAAACAGACAGTGCCATTTTATTGGC:1 - chrX 11814985 3' - flea 4825 1 66.44 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCT:1 + chrX 14173312 3' + 412 439 2 55.17 CATATATGTACATATGTACATATATCTATACCTATATGTATGTATATATTTTGATATATGTTGAGATATGTGAGCGCATATATGGTCATATGCATGTATGTGTATTTTTGTGCAATTTATACACCTGACCCTGTCGCCGTTCCCTG:1 - chrX 13979913 3' - G3 4508 1 71.92 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGA:1 - chr3R 20292411 3' + pogo 2050 1 56.85 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAG:2 + chrX 21213363 3' - Doc 92 1 76.03 GCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCTAAAATGAACTCCAGACTTCTTTCGCTAAGCGAAACGTGCGAAATTC:1 + chr2L 19622755 3' + 412 7167 2 67.81 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAA:1 - chr2L 7459564 3' - BS 5069 1 66.44 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCGGAAAACCCTTAAAATTTCAAACCTTTTTTTCCATTTAATTTTTTTTTTATTAAATCA:1 - chr3R 13056699 3' - jockey 4787 1 61.81 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCA:1 + chr2L 14222362 3' + Transpac 5182 2 54.11 GCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAAATCAATCAAACATGTATTTATGGAAACTCATCAGGACCTAACTCTGTT:1 - chr3L 192332 3' - Quasimodo 7212 2 70.55 ACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATAAAATAAAACGA:1 - chrX 18707487 3' - BS 4799 1 73.97 AAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTACGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAATAGTACGGAAATATAAGCGCAAATAGTAAGTGCGATAATTCCCATTCCAATCGACTGGTATTATTCTTTA:1 - chr2L 3876683 3' + Transib5 2929 1 78.08 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTACACTTTAAAAATGGAACTGG:1 - chr2R 15079978 3' - roo 8687 2 67.14 GAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCGG:4 - chr3L 25232687 3' + accord2 208 1 83.56 ACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAAT:1 - chr2R 19076560 3' - F-element 249 1 79.85 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGA:1 - chr3R 25384206 3' - mdg3 86 2 76.03 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGGAGAGGCCGCG:1 - chr2L 16685321 3' - P-element 76 1 32.87 GACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTAACCACACGGCAGAGATGCTGAGCTAACTTTGTTGAAATGGACCCGGCCATACTGATAC:1 + chrX 11721709 3' - R1A1-element 4882 1 76.71 AAAAGGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATCCTTTGGATTAAATCGACGCAAAAGAGCTTACGTGGATGCAAAGTTAAGTCTTATGTCCATATCATCACTTTTA:1 - chrX 10445396 3' + 412 7418 2 52.05 GCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCAGTCCACGCACCGATACACTCGTTCCGGACACGTCGCGAACGTGTGC:1 + chr3L 19617965 3' - Tirant 8260 2 64.12 ACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATCTTCGGTTGTTTCAGCTTCAGCTTCTTCGTCGTCAACGTGTTCTTATTCCTGTTCTTTTTGGCGGGCTGCTGCTGCTGCTACGGCTGTGCTGTTGTTGTTCTTTTTTTTTTTCTT:1 - chr2L 12290425 3' - Porto1 4399 1 78.77 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGA:1 - chr3L 4710723 3' - Doc 67 1 58.22 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAACAGCCAAATATTCAT:1 - chr2L 12261146 3' - jockey 59 1 50.68 TAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCATCCCCTCACCCCATCGTTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAGTTGCTGTTTTTTTTTTATCTCAGTCCTTAAGTTTGT:1 + chr2L 17653671 3' + Idefix 170 2 69.86 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGA:1 + chr3L 20290750 3' + roo 323 2 76.71 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGCTAATTAAGTTA:1 + chr3L 4869266 3' - roo 48 2 52.74 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAG:1 - chr2R 21227360 3' - mdg3 5326 2 67.81 GAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAATTTACACGAGGAAATGAATTTACTCACAAATAAAACTATAATGACTTATGGAAAGGACAACGTTATAACCA:1 - chr3R 908312 3' - 1360 3256 1 67.12 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCGTCT:1 - chr2R 15613742 3' - P-element 34 1 57.69 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCAC:3 + chrX 15089561 3' - P-element 90 1 23.97 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTAAGACT:1 + chrX 17469293 3' - blood 43 2 56.85 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATATCTATATATATATGTATAGTTCCTATTGTTAAAGTACTTA:1 + chr3L 17444072 3' - Burdock 6211 2 76.71 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAATAATTTGCATTATGATTTCGACACTAGTTTTTTTTTTATACTTGCAAATTGGGTAATAAAAAAAAATAACAAA:1 - chr3R 21191981 3' + Juan 4167 1 52.74 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTTTAAATATGTACAATCGAAATTTACCT:1 - chr3R 11526721 3' + pogo 2085 1 70.55 TGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGCGATGGTACATGCAATT:1 + chr3L 24916725 3' - Porto1 148 1 38.36 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAATATCGGCTAG:1 - chr3R 4884370 3' + pogo 2048 1 57.93 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGATTTAA:1 - chr2R 5992275 3' + pogo 2057 1 55.48 CAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGCAAAAAAACGAGTTAACATTTAAGACCTAAAATGGCCAAAAAG:1 - chr3R 14651371 3' + 1360 167 1 70.55 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGA:1 - chr3L 21097138 3' - mdg3 84 2 73.29 ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTAGTATACCCTCTTCCTCTAGGAGTAACGGGAATAATCAACTGCAATCTTTAAAGATGCCCATGTCGTCGAATTCTATGTGGGGCTCGCTAGGTCCTTTC:1 + chr2R 25107357 3' - INE-1 83 1 69.18 GATCTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCATCATACAATTTCGCGTTCGCATTCGCACTTGCTGAACATTGGCGTGGATTACCGGGCCAAAAGCGGAGCAGAGCTCCAA:1 + chr3R 10465993 3' + INE-1 122 1 70.34 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAATTAAAATT:1 - chr3R 9345545 3' - pogo 39 1 57.53 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCGGCCGTTTTGTTGGCAAATCATAAAA:1 - chr3L 10370847 3' - copia 4898 2 65.07 GAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTA:1 - chr3L 25232696 3' + accord2 206 1 81.29 ACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGTTGCAATTGGCGAGACGCGGACAATAAATGGCCACATGACAAAACATACGTTTCATGTACAAATGTATGTGTGTCATAAATTTCGATTTGA:1 - chrX 22900439 3' + Tc1 1221 1 65.07 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAGGC:1 + chr2R 18123530 3' - pogo 47 1 52.05 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCT:1 - chr2L 20561434 3' + P-element 2782 1 14.48 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCTCCAGAAAGAAACAAAAGAGAACTGAAGGACACGTCTT:1 - chr2R 9332073 3' + roo 397 1 71.92 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAA:1 + chrX 21213401 3' - Doc 54 1 50.00 CAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAA:1 - chr3L 14854656 3' - rover 42 2 57.53 TGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGATATTAATTACTTAATTAAATGGTTGGAAAAGTTTCGGCGCTTGAAATTTACAAGCGTATTTTGCAACTTCCTTATCTGCAC:1 + chr3R 9218463 3' + 1360 456 1 57.25 CATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCT:1 - chr3R 20147898 3' - 1360 336 1 78.08 TAATCCTTTTATATGTTTTTTTATTTATAATAAAATAAAACAATTACTTATGACTAGGAAAGGTGTTAATGTGTTAATAAAACCAACAAGAATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATGTTAACCACGAGTGTGTAAT:1 - chr2R 10241451 3' + Circe 419 1 67.12 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGCTTACGCACTAATACAAATTCTGCCCA:1 + chr3L 7434920 3' + pogo 2051 1 74.29 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTAT:1 - chr3L 20785494 3' + P-element 2791 1 15.22 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATCGAAACTGCCATTGTATTTGTTAT:1 + chr2L 8103645 3' - pogo 29 1 64.38 TAGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAG:1 - chr2R 19904031 3' - Doc 4488 1 65.07 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGGTTTTGTATCTTAGCTGCCTATTGGCAGACGAA:1 + chr2R 6187974 3' - Tirant 25 2 65.15 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCTTCATTTGAAAAATAGTTTCCTATTCCTTTTTATATTAAAATACATTTTATAAGATTTTCAAATTATGAGATTTGTTTTTTTTTCGTGCACAAAAGGC:1 - chr2L 9669469 3' + roo 9049 2 64.38 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTGAAATAAGCAATAATTCTTAGCAGTATTCTAACTCATTCGAAGGTAGCAGAGCTTTCTTC:1 - chr2R 9815012 3' + pogo 2047 1 58.22 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCA:1 - chr2R 5214948 3' - F-element 22 1 63.11 CCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAAAATTAAAATATATTAGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACT:1 - chr2L 18581310 3' - roo 8765 2 80.14 AATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACATAGACGAGTATTAACAAATCAATAAAA:1 + chr3R 11520048 3' - Rt1a 31 1 68.49 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGTAGAATAAACCGAGAAATG:1 - chrX 18125153 3' - BS 5038 1 76.92 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAG:1 + chrX 22824798 3' - jockey 4759 1 78.77 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTGCATTATAAAAAAGCTCACCATTAGCAAAAGTGACAAAAC:1 - chr2L 17228576 3' - mdg3 25 2 69.18 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGGATTATATCTCTACAGATTATTACGATACGCTTGT:1 - chr3R 11121684 3' - copia 46 2 52.41 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCACTTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGGTTTATTGCCGGTTGCA:1 + chr2R 10991379 3' - jockey 80 1 65.07 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAAT:1 - chr2R 20461167 3' - jockey 56 1 52.05 ATGGCTTCTACGCCTGCCTCGTTTGTATTTCCTCTAGGCACTGCTTCGCTTTGTAGATACCTCGCCACAACCCTTTGGGCTTTCTTATCGGGCGCCTCCTGAGCTCACACCCTCGCCGCAGCCGCTGTCGCCATCGAGCAACTACA:1 - chr2L 17437928 3' - R1A1-element 444 1 71.23 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCCAAGTTTTAGGCCAGCATTTTGCTGCCTTTGTTCCACCCCATT:1 + chr2L 4104123 3' - roo 36 2 61.64 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAACGGCCATTCGGCATCAATTGC:1 - chr3L 5448847 3' - roo 8740 2 70.55 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGT:1 + chr3R 9345673 3' + pogo 2042 1 60.27 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACAAACGTAACCCAGAAAACTGAAATGAGCAGGAAAAGGATTTCATGTTTAACTATTAGT:1 - chrX 6937852 3' + hopper2 1549 1 56.16 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAAT:1 - chr3L 18468343 3' - jockey 4724 1 54.11 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGCTCGGCCGTCCGGCAAATTATCAGTTGTTTCTCATTAATTACATGCGCTCCTATC:1 - chrX 3444034 3' + pogo 2085 1 69.18 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTGTTT:1 - chrX 10571323 3' - Doc 61 1 58.22 TTCGCAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCAGCACGTGTAAGCACGGGTAAGCCTTTTTGAACAGCTGTGACAAAGCTTTTTGATGGCAGTGACTAGCTAAGGTCTGTGTCTTGGGACAGTTTAGTGCTGCCAGACCGGTGGACT:1 - chrY 2468610 3' + R1A1-element 144 1 32.19 CATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACAGATTTCTTTCCCTGCCCATTTGGACATGTAAATGCGTATTTATATATCCATAGAGAGATGGAT:1 + chr3L 20593639 3' + Stalker4 247 4 56.85 AGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATATTAAATCTTTAACATTATTACCGCATGTAGTTTTAAACTATACACTTTGAA:1 + chr2R 18308397 3' + FB 462 1 65.07 TGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTCATT:1 + chr3L 14043648 3' - Ivk 26 1 66.19 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACT:1 + chr3R 26399910 3' - roo 8704 2 58.22 CTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAA:1 + chr2L 21403564 3' - G5 4436 1 55.48 GATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGTCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAATGTCTACACACGACCGACGGCAAACACTTCAGTTACCT:1 - chr2L 18235388 3' + F-element 4628 1 50.68 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATCTCAG:1 + chr3R 22289502 3' - 412 7086 2 63.01 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTCAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTCGCTGTG:1 - chr3L 9430570 3' + P-element 2822 1 43.84 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTTATTTTCTTATTATATGAGGCATTCCCTGCAGGGTTCTGATCTAAAAAATAATCTT:1 - chr4 1152035 3' - Transpac 4980 2 60.96 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGGGGTAACCATTTTG:1 - chr3R 26782663 3' - hobo 12 1 77.04 GACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTGCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGTAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAATATA:1 - chr3R 23507549 3' + 412 458 2 59.59 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTTTTAGTTTCGCACTAATAACGTTTCTGCAATTTTATTTAAGCGTAACATAGTCAAATCTATATTAGTGTTTATTTTAATCGTACATTC:1 - chr2R 969104 3' - mdg1 34 2 62.33 AACTCGATTATGGCATTCTCTCTTGTTTGAATTGGGTATTTCTATTAGTAATTAGTTGGTAGATGAGATTTTCTACTGTGCCTTTCTGTAGGGGCCTGTTCTGTATCTTAAAAGACGAATCCGAAAAATGACAAACATATCTCTGG:1 + chr3L 18260877 3' + INE-1 575 1 74.66 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTAATAGA:1 - chr3L 15371262 3' - Transpac 34 2 63.01 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAATAGATTGTTTATGAACAGTCAAGCTGAGCAAACTAGTTATTGTTATATCGATTTATTATAAGGCATTTCTT:1 - chr2R 10163534 3' + Juan 4167 1 50.68 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATG:1 + chr3R 15590643 3' - roo 80 2 73.97 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTT:1 + chrX 13651584 3' - 297 6620 2 56.34 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTA:1 + chrX 17469264 3' - blood 7083 2 65.75 ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTG:1 + chr3R 10468090 3' - opus 7076 4 68.49 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACACACACACATCGTTTTCGTCCTTTAGGAATGGTAATTACTGTAGTGAGTGTGTTTCTCTGTGCGGGGGGGCAAAGGCAATTTTAATTTAATTGCAAGTGATGG:1 + chrX 3345466 3' + hobo 2921 1 62.33 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTGTACATTACACGAATCATACACTTGTCCTTTAAAAGCTATAAAGTGGTTTTAGTACTCATACGCTCAATGTCGTAG:1 + chr2R 8862154 3' + pogo 2053 1 52.05 GCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAACACTCTCCTACAGAGGATTGCTACCA:1 - chr3R 4913559 3' + 1360 126 1 55.48 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGTCATAACTCATGCGACTCATGAGTGCGAATAACAACCACC:1 - chr3L 16180828 3' + Transpac 296 2 76.03 AGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTTATACATATTGATTTCAGAGCTATATTCAAGCAATTTTTAAT:1 - chr3R 30731392 3' + springer 298 4 73.68 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGCAGTGACGTGCCGATATATATTTGTGGAAAAATACTTTTCACA:1 + chr3R 14165163 3' - Tabor 6863 2 69.18 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATATTCTTAATCCTCATTCAAGTCGATTTGGGCTTATCC:1 + chr3L 20712082 3' + 297 320 2 75.34 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACTTTTCGGTGCCATAAAAGTCTTGCGGTTAACAAAATTGA:1 + chr2R 6052687 3' + mdg1 364 2 55.32 GCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGTGTGTGTGTGGCCGCTGGCGATGGGTGCGTGACAGGGTGATAGC:1 + chrX 685426 3' - BS 5030 1 60.27 ATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCC:1 - chr3L 24153200 3' + Tabor 396 2 78.08 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCATTATCTTTTTGTGTTTCAGTGCACTTAGACGTGTGTGACTTGCAGCTATGCGAATGCCAGGCACCCACACTTTGTGTGGCT:1 + chr2R 16410139 3' - opus 147 4 62.33 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAAATAACCAGCAAAGCTGTTATGAAAGCA:2 + chr2L 19878280 3' - mdg3 5292 2 58.90 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTG:1 + chr2R 11656118 3' - HMS-Beagle 6846 2 55.32 TATAGTCGAGTTCACCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGTTAGTGCGAGTGCGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTGCTGCCTGTTATATACACTTTTCAACAAATCTAGTACACCCTTTTACCCAACGAGTA:1 - chr3L 16191143 3' - INE-1 565 1 52.05 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTATAATATGGCAG:1 - chr2R 14246945 3' + pogo 2052 1 53.42 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATT:1 + chr3L 22481334 3' - roo 8720 2 56.16 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCAAAGCGAGTGC:1 + chr3L 22519130 3' - pogo 21 1 71.23 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATACGCGTAGTCCGT:1 - chrX 13061731 3' - mdg3 87 2 73.97 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTA:1 + chrX 21205087 3' - 1360 55 1 58.22 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTC:1 - chr2R 21380598 3' - roo 55 2 55.48 ACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACTCACTAATGGCAGCAAAGCAAGATTGATGCAACTGAGTTGCTGG:1 + chr2L 19424741 3' + Tirant 371 2 56.00 GACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATTACTTATAGATTACCAATATATATATAACATACTTTGCAATGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGCGTATAAAAACTATTAACATGAGAAGAATTACTGCATAGGA:1 + chrX 14815843 3' - INE-1 101 1 75.34 CTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATACTCGTGAAAAAAACTTATACGCCCCACTTTTCTCGC:1 + chrX 4858396 3' + BS 5001 1 80.14 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAAGCAAAATGTGCATTATAAA:2 - chr2L 17228606 3' - mdg3 55 2 54.11 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATGGCAACGAGGACAATGCACACACACAGACACATATACACAATCAAGCCAAAAAGAGGGAAAGAAACACATTGACTGCAGTGGACGGCGAAAGTAATAGTTTAC:1 - chr3L 14898831 3' - jockey 21 1 74.13 CTGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCCCTGTTCGCCATCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGACTGTTTGGATTTGTGGAATGGGGTGACTTCTATAAATAAAGAAATCCACTGAATGGCAGTCTCCGGATT:1 + chr3L 15009990 3' - Rt1b 4741 1 50.71 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAA:1 - chr3R 23968606 3' + jockey 4907 1 80.14 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTT:1 - chr3L 1387150 3' - mdg3 5337 2 72.60 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTTTAACTTTCTTTTGTTTGGCCACATTTTGCTATCTCTTT:1 - chrX 9951332 3' - hobo 39 1 58.90 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGGATGGCTGATATGCAGGTGGACTGTT:1 - chr3R 9563572 3' - P-element 38 1 58.22 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATTAGCATTCGGTTGCCTTTT:1 - chr3L 20747058 3' - Burdock 6162 2 67.81 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAA:1 - chr3L 14581371 3' + pogo 2046 1 57.53 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGC:1 - chrX 15089485 3' + P-element 2833 1 48.63 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCCGAACCTGCAGTTTCAATTTGGGTCTTGTTTTTTTTTGGCCAACTCCAAGGGGAATGAGGATGGAGGGTTACCTGTGCATTGAGGCGG:1 + chr2R 20462905 3' - copia 30 2 60.84 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACGAGCGCTCGAGC:1 + chrX 15089584 3' - P-element 54 1 42.11 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCGTCGACCTTGGCGGAAAACTTGCGTCGAGCGTAGCATAGTTTTCCGCGCTTTTCCGAGACGCCCCGGCCCCGTCAAGCAGGCGCTTTAATTAACAC:1 + chr2L 6598469 3' - hobo 17 1 69.12 TTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCCATACTATAATTTAATTTAAGCAGATGGTGCTATAACATTCTGATTAAAGTTCTTTTATGCTAATT:1 + chr2R 18440798 3' - Doc2-element 4379 1 58.22 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGTATATACATATATATATATGCATGTGTCGGGGCAAGTTCATAAGCCGTTGCC:1 + chrX 14448146 3' + HMS-Beagle 6994 2 69.77 CGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATT:1 + chr2R 9327041 3' + mdg3 5419 2 71.23 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCGGAAAACCCTTAAAATTTCAAACCTTTTTTTCCATTTAATTTTTTTTTTATTAAATCAATGCGTGACTGGCGCAACTTTGA:1 - chr3R 13056676 3' - jockey 4766 1 76.71 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGCTTTCGCGACAACGCCAAATATCAACTACTTATATAGCGATATATATTCAGGAAAGTTTGGCTTTGGGTCGCCGCTG:1 - chr3R 21570454 3' - mdg3 5298 2 54.11 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTT:1 + chr4 311584 3' - 1360 79 1 71.23 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGG:1 - chr2R 21380624 3' - roo 8745 2 73.29 GCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAATGGAGTCAAATAATCAATAGACCTGCGCACGCGCAGCAGCAGCAGCATTCAGTTGCCGAATAATCGAAATCGGAATTCAAAT:1 + chr3R 24828503 3' + P-element 350 1 56.16 ATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTTGGAAAAAAGAGTACAAAAATAATGTGAATAGCTAAAACAATGATGGTTTAAATTGTTATTATGTGCATA:1 + chr2L 20955901 3' - Doc 197 1 52.05 CAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCA:1 - chr2L 7459547 3' - BS 5049 1 53.85 GATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTC:1 + chrX 21907813 3' - accord 7275 2 67.12 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGA:1 - chr3L 16887334 3' - roo 8751 2 78.08 AACAGATAAGGGCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGAAGGGCCCGAGCGCGGGACCTCGATGCAGTGCTACACTCGCCGGCAGTGATGTTTACTTATACATTTAAGTACGCGTCGCATTTAATGTACTGAAATTGCATGCCC:1 + chr3R 13515102 3' + roo 8883 2 56.43 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTG:1 + chr3L 22481353 3' - roo 37 2 58.90 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGTTAATTCGACTACTAAATATACATGTTACGTTACGCTTTCTGCTTCTCTGCTGCTTTGTTGTTTTATTTTAA:1 + chr3R 21570616 3' + mdg3 5483 2 74.66 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATTAAAATGGTAAAACTGCACTCATTAACCTTCTAACTACTACTAAATGGTTATAATAATAATAATAATCCCAAAAGTATGGTTGTTGAAATTGAAAT:1 - chr3L 176323 3' - Transpac 4939 2 72.60 CCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTGGGTGCGCACTTGCCAGGTCCTCGGCTGCAGCATTAATTTGAGGGGAAAGCAGGAAAAGC:1 - chr2R 7885554 3' - R2-element 499 1 63.01 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAGTAATAAACAATCTTACATATATATGACGTCCCATATAGAAATTATCCCCGCAATAAACGTAGACCAAGGACCTCTTCCAC:1 + chr3R 14874230 3' + flea 4952 1 60.96 CCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCG:1 - chrX 7467937 3' + hopper2 1541 1 61.64 GTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAGTTTTTAATTTACCGCTTTACTATTTCAAAAACAATTTTAATTTGAATTATGATAG:1 - chr3L 23287064 3' + Quasimodo 7303 2 67.12 CTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTTACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACATCGATGTCA:1 - chr3L 9375783 3' + mdg1 399 2 67.12 AAAACAAAAAAACAAAAATAATAAAAATAAAAATTGAAAACGAAAACTGTTTATATCTGCTTGCGCTTGTTTGCATCCCACGTTCTGTGCAACAAGATGTTGCATTTAGAGAGATACAAAAATGTTAATATTCCACTTGATGGTTA:1 + chr3L 2838961 3' - Tc3 86 5 74.66 TGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTA:1 - chr2R 9326989 3' - mdg3 5328 2 76.03 TTCCTCTCAACATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCCCGAAGCTGCCAACAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAAGATGCCTGACGATGACGAGCGCAAGACGAACGGGGCGCCGACAATAATGCGGCTGCCATTAGGAGTG:1 + chr3R 20360940 3' + Gypsy6A_LTR 288 1 70.55 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGGCATCTATTTTTAATGCGCTTAAAAGTATGCAGGAAAGAATTTTAACGCTCAGAGCTTAATAACTATGACAACTTATGCAAATAACTGGC:1 - chr2L 6583278 3' + hobo 2908 1 64.38 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATAATATAATATAATGGTAAGAGTCTTCCCAAACTCAAAAATATTTATCATATATAATTCTGGTATTAGTATTTCAAAAGCTGTGTGTAGATTTAAAGT:1 - chr3L 15261216 3' - pogo 19 1 67.81 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGAC:1 + chr2L 20561476 3' - P-element 72 1 35.62 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCAATCCAGATGTGAATGTTTATGGGTTCTTCAATGAATTGATGGGTT:1 - chr2L 8734034 3' - mdg3 5264 1 68.49 TAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATAGTGTAGTGTGAGAAAACGGCAATGGCCTTGCTGGCTTCGCATGTGCCTGGAATTTCGAGTTCATTAAAAATTTTGCAGGAATTCAAT:1 - chr3R 14165001 3' + Tabor 415 2 59.59 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGA:1 + chrX 11534546 3' - roo 8714 2 53.79 TTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAGTTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCA:1 + chrX 14385227 3' + blood 292 2 75.34 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCG:1 - chrX 19162583 3' + pogo 2037 1 63.70 CTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGATCCAATTTGATTATTACGATTTTTTTTTTATTTCGCCGGCGTACGAATAATGAATTT:1 + chr3R 13498248 3' + 1360 9 2 60.96 AAAAAATAAAAATAAAAAAAAACTGAAAATGAAAATGGAAAAAATCTAAGCCGAAAGAGATGATTGCGTCCTTTTTTGTTTTTGGGGTGCAAAGTTTGGCGCGAAAATTTTTGAACGTTTCTGCATAATAAATTTTGAAAAGTGG:1 + chr2L 9471636 3' - hopper 148 111 77.24 TAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAAATATTCCGCTCTTTTAAGCCAGCTTAGAGTATAAAAGTGGTCC:1 + chr2R 10163681 3' - Juan 4096 1 71.92 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATTCTCACATGCTCACGCATTCCCACACTCACACACACACACTGAC:1 - chrX 20902744 3' - hobo 71 1 68.49 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCA:1 + chr3L 22481341 3' - roo 8713 2 51.37 TTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAA:1 - chr3L 27356077 3' + Tc3 1640 1 64.38 GAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7200 2 78.38 AGAAAAAAAAAAAGGATAAGAAGCCGCAATCCGTCGAGCAACAGCCGCACGTGAAAAGCGAGCACTCTTCGCCAGTGCACAGCAAGGAGGA:1 + chr3L 19795175 3' + Doc2-element 249 1 74.73 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTGTACATTACACGAATCATACACTTGTCCTTTAAAAGCTATAAAGTGGTTTTAGTACTCATACG:1 + chr2R 8862141 3' + pogo 2040 1 60.96 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATGAACCATGTTTTTAGCGCATTCCTAGCCCCACTGTGC:1 - chr3R 13843716 3' - roo 83 2 75.34 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTA:1 + chr2R 19543745 3' - jockey 4798 1 55.65 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAACTTCCTCACCGGCATTTCCAACATTTGTTTGTGTCCATTCGAAGATTTCCATA:1 + chr2R 8686703 3' - hobo 11 1 76.71 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATT:2 - chrX 17469188 3' + blood 7314 2 69.86 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCATATTTAAATGTGAAACTAACCTATTTGAAAATGTGGCATATACAAATTATC:1 + chr3R 21518120 3' + 297 6912 2 67.81 ATTTGCAATAAATTATTGGAAATTTTGCACCGACGCCCGGGCGGCTACGTCAAACGATGCCATCGATGCTGACCCCCTACCCCCTGGGAATTAAATTCCATTTTGTTGTTTAATTAGCACTTGCGTTATGCGACAGAGTGTGCGG:1 - chrX 5744893 3' + R1A1-element 143 1 57.93 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACTGATTCATTCATTTTTCCCGAGATGAAGCAGCTGACGTGCTTGAGGAAAATATGTGCCCGCCAGGCGCTTTTCATTTGAATTTTCCTTCCTTTTACG:1 + chr2R 19901113 3' - mdg1 6 2 76.56 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAAAAACAGTTGGTTTCCATCT:1 + chr3R 28033715 3' - diver 5920 2 62.94 CAATAATAAAAATACAACAATTAACAATATATCAATTTGAGATCATCATCATCATAATTAATCCCGGCATTTCCCGTACTTGGCTTTCGACTTCAATTTCTTTCGTTTTAGGTAAGTTTAATTTTGCACTTATTCACTAGCTTAC:1 - chr3R 435114 3' - BS3 1649 1 73.10 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAAATATGAAATAACAGAAAGCGGATAAGATAATAAAGA:2 - chrX 13061657 3' - mdg3 5265 1 76.03 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCATTATCTTTTTGTGTTTCAGTGCACTTAGACGTGGGTGACTTGCAGCTATGCGAATGCCAGGCA:1 + chr2R 16410121 3' - opus 165 4 56.85 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAA:1 + chr2L 1074005 3' + Tirant 8437 2 64.38 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAACTAGGCATGAAATTGTATAGCTTTTTATCTGAATTTCTGCCCAA:1 + chr3R 20452327 3' - blood 17 2 74.66 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAAT:1 - chr3R 23507582 3' + 412 7478 2 63.01 TCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAGATGAACACCCGATACGAGA:1 + chr3L 10856811 3' - P-element 67 1 39.73 GTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAAG:1 - chr3L 24153129 3' + Tabor 468 2 73.10 AAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTCCAGAACCCCATCTAATC:1 + chr3R 21521437 3' + Bari1 1669 1 52.48 AGAGGAAGAGGGAAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGCTCCTTTTACTAATTAAATAACCAGCAAAGCTGTTATGAAAGCAAAAACCA:1 + chr2L 19878287 3' - mdg3 5264 1 72.80 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGCTGGCTTGCCAAACTGTTGC:1 - chr2R 14385573 3' - jockey 79 1 65.75 CTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGTCGCAGATTTATTTTTAATTTCAAGTATAACGACCCATTTCTGTTACTTTGTGCCCACTTCTTTCGTTTT:1 - chr2L 22448273 3' - gypsy 49 2 54.79 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTG:1 - chr3L 24153149 3' + Tabor 448 2 59.31 TTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGTCGTCGATGAATAAACCCCTGGCTGTTAACA:1 - chr3R 19449050 3' - invader4 452 1 78.62 ACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTG:1 + chr3R 8402626 3' + mdg1 345 2 67.12 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAACAATTTGTACAT:1 - chr3L 19397002 3' - F-element 50 1 54.79 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGAAGTGGGAGCGTCTAATTATAATCAAGTCGCGTCAAGTCCTTCAACGTTCATCTCTCATATCGCCTAGATCC:1 - chr3R 9993318 3' + hobo 2917 1 71.23 GAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTCGTGTGTCCTATACACTTGGTGGTGGCCAACCGAGCGTGTG:1 + chr2R 17643173 3' - I-element 5048 1 78.08 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACAT:1 + chr3L 3979664 3' - opus 7174 4 65.91 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAAAGTACCAAAACTTGTGCACTTTATGGCTCTGTA:1 - chr2L 2690529 3' - hobo 16 1 73.29 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATTAGCAGTGTTATTCCAT:1 - chr3R 14663191 3' + pogo 2060 1 57.53 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAATAAGAGGGCCAAGAGCAG:1 + chr3L 9198643 3' - F-element 89 1 68.49 ATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCATTGCTTTCTTAACGAACCACAAAACGTCCACAGGTCCGGCACAAATCACGGACAACATGTGCCATCCAGTC:1 + chr3R 7430946 3' + 412 7090 2 51.37 CGATGAATCAATACAATCCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGAAATTCCCAGTAAACTTGATATTGTGCAACTCGCATTTCGCAAGCGGAA:1 - chr3L 9907292 3' - BS 5067 1 63.70 GTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAACGCCCAATTACAAACTGGCGACATTAAATGGGGCTTG:1 + chr3R 21481774 3' - Doc 258 1 74.66 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAGTTTACAAGCACAGGTCGTTAAAAGTTACTTCAAGATCGACAAAACAATTGAAAG:1 - chr2L 8452244 3' - copia 67 2 64.38 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATA:1 - chr2R 16712954 3' + pogo 2044 1 59.59 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGGCAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTCTTTATAGATTTATGAAAATCAACATGTTGCAGAAATGTTGTGCCACCTTTTTCA:1 - chr3R 10778602 3' - mdg3 17 2 73.29 AGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAAGATCTAATACC:1 - chr3L 24153119 3' + Tabor 477 2 79.45 TTTATATATTTTTTTTTTCAATACACCATAGTAGATTTTCATTTTTTTGAGTGTTTTCCAGCCTTTTTGCTTTTCACAGTGATGCTTCGGAACATGGAGGATACCACTGCCAAACGCTCCAATCGACGCAGCTTCCAGTTTTCGGA:1 + chr2L 8394584 3' + Circe 426 1 53.42 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTG:1 - chr3L 5446127 3' + roo 8982 2 79.45 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGCCACAACCGCA:1 + chr3R 14088683 3' + 1360 3357 1 63.70 GCGAGTCTTGGTTAGCTATAAGAATAATTTTAAGCTTCAGTTTGAATTTGCATTTGTCTGATTAAATATTAGCTAATAATCATAAATTGATCGATTTAATGTTATAGTTTCTAAAAGCAGAATTTCCTGGTTGTCCCCTTAATTAA:1 - chr3L 15176060 3' + Gypsy6A_LTR 128 1 57.53 AAAAATGTTTTGAAATTTTTTTATTTTTGTATTAGTATTGTGCACTTCCATCGATTTGCAAAAGCCACAAATTGGGAAAACAATGCATGATGAGCGCCTGGAAGTGCTCCCTGCCTAAGAAGCTGATCCTCAGCTCATGCAGCTGC:1 + chr3R 4415159 3' - transib4 107 1 65.75 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCAATACCTGAACCTGTGCTC:1 - chrX 4589413 3' - Burdock 6193 2 61.64 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTT:1 + chr3L 15035237 3' - pogo 43 1 54.79 AAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGATAATAGCGTGACAGCGCATTTAAGTGGGCTTGTGGGCGTATCATTGGCTTAAAGAGATAAGATGAAAATAAACTACTTT:1 - chr2L 11764163 3' - S-element 236 1 54.79 ATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAAT:1 + chr2L 6074065 3' - BS 69 1 70.55 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTTATGATTGAGCTAGGCTTCATTTTTAA:1 - chr2L 19878128 3' + mdg3 5467 2 60.96 AAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTGCTTGCATATTCATA:1 - chrX 12893316 3' + Bari1 1670 1 60.00 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAAT:1 + chr3R 12608177 3' - roo 49 2 55.48 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATT:1 - chr2R 9164828 3' + 412 454 2 53.79 TTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTACTAGTCAAGTAAACCCTCTTAATTCAAGGAAACCGGGTGTATCTTGCAATGTTAAGATAGTAGAGCGTTAAAATTTGTAAATTTATGCAAAATTCT:1 + chr2L 19375053 3' - Bari1 1650 1 69.86 CTTAAGTAACCATGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACC:1 + chr3R 19545388 3' + jockey 4907 1 73.97 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCGCTTTGCATGGCTTTTCTTGCATGCAACT:1 - chrX 14962168 3' - jockey 36 1 64.38 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCG:2 + chr3L 20290759 3' + roo 8996 2 70.55 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACAGCCACATCAGCAACCAAAATGCATAGCATACTTTGCTGGGCATTAAGTAGTTGAGTTTTTGAAGGGACGCACTATAAGCTGAATTTTTCTGTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTATTT:1 - chr3L 3121914 3' + hobo 2932 1 61.64 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAATACCTCTTTATAGATTTATGAAAATCAACATGTTGCAGAAATGTTGTGCCACCTTTTTCA:1 - chr3R 10778602 3' - mdg3 17 2 74.66 TAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTACAAAGGTAAAATGTAACAAATTGGA:1 + chr2R 5924461 3' + jockey 4735 1 55.48 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACA:1 - chr3L 5438752 3' + hopper 1373 2 63.46 CTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAGG:1 + chr3R 3905858 3' - GATE 60 2 50.68 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTT:1 + chr3L 20977442 3' - I-element 69 1 61.38 GAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGC:1 + chrX 18193792 3' - hopper 79 1 71.23 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGGTTGGTGGAAAAAAACC:1 - chr3L 18296878 3' + Juan 4185 1 62.33 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAAAGCCGAGATTAATAT:1 + chr3R 14331279 3' + Burdock 238 2 45.89 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGCGGACTGTTCTTGGACTTTTTTAATCATCATTAACCTCCCTTATTATACACTCAA:1 + chrX 5892173 3' - transib2 63 1 61.64 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCCT:1 - chr3L 13597742 3' - blood 7069 2 58.22 GCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGG:1 + chrX 21667927 3' - gypsy2 79 2 69.86 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATTTTGAGCGCTGAATAGCAATTT:1 - chr3L 6774140 3' + pogo 2041 1 60.27 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTCATTACCAATAAATTTGTAA:1 + chr3L 14043664 3' - Ivk 17 1 73.97 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAGTTATTACCAGCTCATAGACAATTTCTTTTTCATTTGTGAGATAAATATGGGATTAGAGTTTGTTC:1 - chr3R 11096629 3' - copia 13 2 76.71 GCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCAT:1 - chrX 18913286 3' - Quasimodo 76 2 82.19 TCGCATTCACACTAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTAGGGGAACTCGACTATAGCATGCCTGTAATGCCTCGACTTAGGCGCATCATCCAAGTTATGCGTTCAACTGACTTGGAAATGCGCTCATGTGGCTCAATCAG:1 + chr2L 14920661 3' + INE-1 532 1 58.57 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGAATACTATACAGGCTGCGCCATCGTCTTGTTGTT:1 - chr3R 24455375 3' - 297 42 2 69.23 CTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTAAATGTTTATTACAATGAATCAGAGCTTAAAAACAAGAAGCTGTTACTCAATCTCCAT:1 - chr2L 10937798 3' + mdg1 399 2 67.81 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCA:1 + chr3L 13722136 3' - blood 44 2 56.16 CTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCAAGCTAAGAGAGCTGTTTTCAGTATTTTATAGAAACTTAGCCCAAAAGCCTCTTTCCCACTCAGGCCTC:1 + chr3R 6842730 3' + mdg1 7437 2 70.55 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGG:1 - chr3R 25384195 3' - mdg3 5327 2 67.81 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACATTTGTACTTTCTGGTCAAATTGGTGCACTATTTTTTCAGTGCATTTCTTCGTTCCAGCCGCTGACCTCGTTTCTCGTTTTCCCCATATCCCTGACCATGGTCGCTTTC:1 + chrX 8357787 3' - FB 13 1 73.97 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAG:1 - chr3R 25521798 3' + blood 7341 2 58.59 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTTATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGAC:1 + chr3R 25271252 3' + 412 7463 2 74.66 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAGTTATTACCAGCTCATAGACAATTTCTTTTTCATTTGTG:1 - chr3R 11096656 3' - copia 4909 2 58.22 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATA:1 - chr2R 19353980 3' + 297 330 2 65.07 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCC:1 - chr3L 4710738 3' - Doc 82 1 68.49 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATT:1 - chr2L 7991279 3' - 297 6644 2 67.13 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATAATTGAAAAAATTATCTAAATAAACTTTTGTTACCGAACTTAAGTATTATATTTTCACCCTCAATCGTTCGCAGCGACATCCTCACAGAATATGC:1 - chr3L 10614575 3' + I-element 5342 1 34.53 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAG:1 + chrX 3506183 3' - Tirant 8143 2 56.85 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACATATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCC:1 - chr3R 8402520 3' - mdg1 41 2 56.85 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCA:1 + chr3R 10541331 3' - hopper 78 1 69.86 CCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCCCTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGCCGGCAAAG:1 + chr3R 30731534 3' - gypsy6 5 2 78.77 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCAAAGCGAGTGCTGTAG:1 + chr3L 22519135 3' - pogo 16 1 74.66 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCA:1 + chr2R 24427595 3' - jockey 4762 1 76.71 GCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGATTTCAACTAGCCAACGGGGATGCAGCACCTGAAAAATGAAA:1 + chrX 4956685 3' - roo 286 2 71.92 GTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAACATTTTGTTCTCTTTAG:1 - chr2L 15153204 3' - G-element 12 1 70.55 AAACATAAACATAGCAACAAAGGGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAAC:1 + chr2R 21897971 3' - 412 66 2 61.64 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTTATCCACATTAAGC:1 - chr3R 16041100 3' - jockey 64 1 56.85 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCGAAAGGAATCAGTTATCACGATAG:2 + chr3R 20149842 3' + 1360 3378 1 78.08 TTTTGTTTTTTGTTTTTATTTTTCGTTTTTGTTGCTGTGTGTTTTGTTAGCTTCTGCTTTTCTGTTGTTCTTTGTGTGTGTGTCCGTGTTTTTTTGTTGGGTTTTCCCTTTACAGCCGCAACAATCGCAATACACCACGCTGTACT:1 - chr2L 7256216 3' - transib2 100 3 71.92 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAA:1 + chr2L 15920156 3' - jockey 90 1 73.29 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGCACAGTCCGCTTCCAGGCGACTCCGACCACTGCTCTGATTTCCAGGCAAAAGTCAAAGCCGGGCACAA:1 + chr2R 24338462 3' - 1360 53 1 54.79 TTAAATTAATGTATAAAAATTAAAAGTAAATAGTTTTAAATATCCCCATCCATATTATTCCTCAATTAAAACACATTAAAACTTTGATCGTTAGTTTAGCCATTTTATTTACTACTAATATCACTCAGTGTATATACATAGATTCG:1 - chrX 12489388 3' + Bari1 321 1 75.34 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTTATTTTCTTATTATATGAGGCATTCCCTGCAGGGTTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATG:1 - chr4 1152027 3' - Transpac 4972 2 55.48 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGCCTATCCTGTATTTTATAGTTTA:1 + chr3L 20076907 3' + roo 9055 2 75.34 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGACGTTTAAAGCAAGGCGA:1 - chr3R 25876890 3' - mdg3 5304 2 71.30 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTCTGGTGAAATTAAAAG:1 - chr3R 31956732 3' + pogo 2079 1 70.55 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATA:1 - chrX 18193680 3' + hopper 1383 1 63.01 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCACCTTCTTGGATAACTTGGGTGCTGACGCGAGCACAAATTACTCACTGTGGCGTATCACGAAACGGT:1 + chr2L 13842433 3' - jockey 65 1 54.11 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTG:1 - chr2R 8862040 3' - pogo 63 1 64.58 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTAT:1 - chr3L 18468378 3' - jockey 4759 1 77.40 TCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCC:1 + chr3R 24175750 3' - Burdock 6224 2 79.45 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGTACTGGGGAATCAACTAAATGCTAAATAATCAAATGTACGCAGGT:1 + chr3L 15371408 3' + Transpac 266 2 55.48 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGAAGTGGTATGAGTGTTTTTGTG:1 - chr3R 20452135 3' + blood 363 2 75.34 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCAC:1 - chrX 8502162 3' + pogo 2046 1 59.03 AATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACACCTAGATATATGCGTTAGGTACGCCAACCTATACACACCCCGACATTCTCGCATTCGTATCCTGTTTGCGGGCTGTACTTTATAGAGCAGCAAGTAGAAACACAAAAACAC:1 - chr3R 9982945 3' + HMS-Beagle 7034 2 77.40 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTGTATCCTTGGCAGCGTAGCTCATTCCTCTTCCATCGATG:1 - chr2R 21227301 3' - mdg3 5267 2 73.97 ACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAATTAAACTTTTACAATTATCTCTCTGTAACCACATAAAAACCATATTTTCAGCCAGCTCCGATACGGA:1 + chr3R 28488187 3' + Quasimodo 63 2 54.79 ATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAACGGCATGGCCTTCTGCGCTATTATTCATCATTTTGTGCCGGAGCTCATGTGAGTTGTCATGATTACGTTGAATTTCTTATTGAGCACTTTAT:1 - chr2R 17011908 3' - HMS-Beagle 154 2 71.33 TTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAGTTACCGTATTGAGTGTAATTACTTATTTCTTTATATTTGTGCAAGGAGTGCGTGCCTGTCGCCTACTTTCCAAAACCTTCAGAAGTAGACAAATTAAGTAGATCCTCGAGAGCGGAG:1 - chr3L 15323416 3' - Transpac 4752 1 57.24 TGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAAAACAAACAATCGTATGTTTCCCAGTTGCA:1 + chr2L 16596262 3' - 412 90 2 78.08 GTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAA:1 - chrX 21474407 3' - 1731 4384 2 80.14 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGA:1 - chr3L 14581398 3' + pogo 2032 1 73.68 CGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGAAAAAAAGTTGCAAAGGATCTTAACAAAGGGCAATCTATCGGATTCGGAAAATGCGGTCGCATATGGCCTGGATTGAATTC:1 + chr3L 24542548 3' + R1A1-element 35 1 60.96 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGA:1 - chr2R 21380609 3' - roo 66 2 63.01 GCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTTTGG:1 - chrX 20453707 3' - INE-1 552 1 79.84 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACTGCATTCTTGCCATGTGCAACCCGAAAACTTTTGCTAATTTCTCTATAA:2 + chr2L 12284068 3' + Quasimodo 7341 2 68.49 CGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTGACATGGTGCTTTTTCTGTTTAACAGCCATCGAAGTTGTTGCATCCTTTGATAACATCTCCGAGGCGTTATTTGTATGGGTTTTGGATCTGATGTAGCTG:1 + chr3R 5088701 3' - BS 4644 1 74.83 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGTTGCATACTTTGTGGCGCTTTCATTATACTACTTTGCTTGGC:1 - chr2L 4416009 3' - jockey 31 1 68.06 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTACCTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTATTTTTTTATGATTACAAATTACTAGACTGTATT:1 + chr3L 20893636 3' + mdg1 7373 2 73.97 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAA:1 + chr3R 5940498 3' - hobo 62 1 77.27 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGGGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGA:1 - chr3R 26765122 3' - mdg3 5301 2 73.47 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATCCATTAGCCAGCAGATTAATGTGTATCCTTCGACCTCCTG:1 - chr3R 26765032 3' - mdg3 5259 1 78.77 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTGCTATACGTTTTTTTTTAAATTATAAATTTCTGCAAATACATTTGCAGGCAGGGATTACATTTATCCCATAGCCATTCCTCTTTTTCCCCATCTTTGCATTTCACAA:1 - chr3L 5490795 3' - 412 13 2 69.86 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGGG:1 - chr3R 15589972 3' - Transpac 4937 2 56.18 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGC:1 - chr2L 19424665 3' - Tirant 68 2 66.67 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGTGGTCATGGATCCGCATGGTGGTGT:1 - chr3R 23099031 3' + roo 399 1 78.08 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCAC:1 + chr3L 13597860 3' + blood 330 2 52.74 AAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAAACCCCATTTGTTTTATTCATTAATTTTGCGCAGCACTGTTGATTAAAAAAAAATATTAAAATTTTAAGTTTTAGCGTGTCAA:1 - chrY 1447530 3' + G2 3025 1 44.52 GGGGTGTATATGTTGTAAGGGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATTTGCCATTGTTTTTAAATGACCAAAAGCGAGCATACGTAACACGCTTACGTATTTTTGAAAATTC:1 - chr3R 10791678 3' - Idefix 51 2 54.11 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATTTGGAAGGTGCCAGCACAGCTAGCGAGCAGCAG:1 - chr2R 9164852 3' + 412 458 2 57.69 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATACCATA:1 - chr3R 19545346 3' - jockey 89 1 70.55 TATTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAGGATCAACTCCGAAATAAATTAAACACTGAATAATGGAAATCATATGTCATCATTATTAACAGTGAGATGATTCTATTTTCCGGTACAACGGCCGCACATATGGCCCG:1 - chr2L 11474615 3' - rover 334 2 49.32 AATTATAACTCTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCATACTCAGGGAAAATGGGCGTTGTAATTTTCCTATTACTTGTCCCCGTCCCTATGCTAACAAACATATTTTGT:1 - chr3R 3344138 3' - Circe 229 1 64.38 TCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAA:1 - chrX 14914327 3' + mdg3 205 2 56.85 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCTTGCGAATATGATACATAGAT:2 + chrX 14173332 3' + 412 458 2 60.96 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGGGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTC:1 - chr2L 8103481 3' + pogo 2067 1 55.17 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGGAGGAAGTGGATGGCCGCAGGGGAG:1 + chr2L 17747560 3' - Tirant 6 2 80.14 CGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATCCAACTGACGGACTGACAAGGCAAAGTGCACAACTTCATTTCACATTAATGCA:1 - chr3L 12250967 3' - flea 4815 1 60.96 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACA:1 + chrX 15089554 3' - P-element 97 1 19.18 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAGTCGGTTTAGGCATTATATTAGT:1 + chr3L 9649182 3' - roo 8727 2 63.01 CGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATG:1 + chr3R 30731525 3' - gypsy6 14 2 73.97 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTACAATTGTTTATTTTTCGGTATACTTAGGACAGTAG:2 - chr2L 14222221 3' - Transpac 4955 2 61.64 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACG:1 + chr2R 11656137 3' - HMS-Beagle 6832 2 60.96 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCAAGCTAAGAG:1 + chr3R 6842671 3' + mdg1 335 2 65.75 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCTTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCTCTGCTCAAG:1 - chr3L 19274770 3' - transib2 42 1 54.11 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGACGCAACATGGGAGGCGGGCATGGTATTTCTGGGG:1 - chrX 3524195 3' + roo 395 1 71.07 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTTTTGTATTTTCCCTTTTCCATTAAATTGAGCATCAAATCGAAAAAA:1 + chr2L 17228738 3' + mdg3 5462 2 60.27 AAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGTCGGTTTCACTTAACAAGGTGAAACTGGGTCAATGTGGCCCAGTAATATCGATTAGATT:1 - chr3L 4214679 3' + G2 2624 1 59.59 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACC:1 + chr2L 2338175 3' - blood 49 2 53.10 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCTTTAAGTATGAGTGCGATAATTGTCGCTTTAATTATCAAACGAAAT:1 - chr3L 20290686 3' - roo 8738 2 73.29 CTCTGTAGCAACAAGCATAGTGGCAGATCGGAAACGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAACCATTTAAGCTGCATGTGTTTTATTGTGTGAGACTGTGTCAGAAAAGGCTCATATATTCCTC:1 + chr3L 13462801 3' + invader2 4973 2 54.74 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATATCCACACGTCACGGCTAC:1 - chr3L 9426634 3' + P-element 2866 1 69.44 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAAGTGCAAGGAAAC:1 + chr2R 9668094 3' - jockey 4716 1 53.42 TTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAACTCTCGCTTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCCTTTTCATCCACGCTCCTTCGCGGTTGCGGTTG:1 + chr3R 30273081 3' - Tirant 59 2 58.22 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTCAGGCACAAGGTGCTGCCTTTCCAAAAGAATGCATTCCAATACCCC:1 - chr3R 14331118 3' - Burdock 12 2 58.90 TCGATGGCCTTTTGGCTCAACGAGAATGTTCAATTAAAACAATTGGTATTTTACGGCCAAGTGCCGGAGTAGTCAAGGCGGCAGCCTTAATCACATTGTGAGTCATGTGTTTCATAAATATTCAACAGAAAATTATCATCGCAATG:1 - chr3L 13667808 3' - gtwin 334 2 50.68 CATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAAAATATAAGTGTACATTTAAAGAGACTTTGTTTATATTACCA:1 + chr3L 2217063 3' + Ivk 346 1 70.29 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTA:1 - chr3R 21924259 3' - roo 8731 2 65.75 CACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCCATCCAATCGAGTTACCTGATGAATGGGGAAGCAAACAAAGAGGCTCGAAAA:1 - chr2R 5900784 3' - Bari1 11 1 76.87 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATTGCCATTAAGTACTGATAAATGCCACTA:1 - chr2R 18721905 3' + 412 7507 2 56.16 CAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCCAGATCTGCATTCCGTACAGCCAGATCGGTGCTACTGGACTGACACTAATTGCACAGTGT:1 - chr2R 13078837 3' - BS 4745 1 78.52 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAG:1 - chrX 14385164 3' - blood 74 2 66.44 TATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTT:1 + chr3L 53091 3' + roo 9025 2 53.42 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTTTCAACTCGGAACAAGGCTACCCA:1 - chr3R 15514496 3' + 412 7505 2 54.11 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTTGTGGGGCAAAAACGTAACAAAGTAGCTGGAAAATTCAGAAGAGAAATT:1 - chr3R 18846467 3' - roo 8693 2 66.44 CACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGCACATATCTC:1 + chrX 15814574 3' + P-element 2794 1 21.92 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAGGATCAACCTTTATTTAGTTGATGC:1 - chrX 6398778 3' + blood 7338 1 51.37 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACA:1 + chr3R 14165115 3' - Tabor 6909 2 64.58 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCA:1 - chr2L 2690582 3' - hobo 67 1 64.58 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATTCATCTAAAGTCATG:1 - chrX 12843578 3' - roo 55 2 57.53 TATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTTACGGCAGTTTTTTTACAATTACGTCTCTTTATTTCGTTCAAAAATCTCAAAATCTTGAAAACCTAAAGCTCCCCGATTTTGAAT:1 - chrX 19669260 3' - Chouto 226 1 67.12 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACG:1 + chr3L 20785513 3' - P-element 86 1 20.74 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTTT:1 - chr2R 6984283 3' - HMS-Beagle2 35 2 61.38 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCCGACGTACTTGCCATT:1 - chr3L 18835254 3' + pogo 2072 1 65.75 ACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTGCTTTTCATTGGAAATTTAATCTATTTTCTTATATTAGGCT:2 + chr3L 10076420 3' - X-element 43 1 56.85 GCTGGGTTCGGAAAAATCTAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTA:1 - chr3R 20001641 3' + FB 12 1 59.59 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCC:1 - chr3R 25271157 3' - 412 42 2 56.64 AACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGGTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGT:1 + chr2R 9033939 3' - F-element 4547 1 56.85 AGAAGTACAAAAATTAAGCTGTCAGATTGCATGTATCTGAAAGATACTCGGTTTTTTTTGCGCTGTCATGCCGCCTGCAAAATCCCTCAGTTTATAGAGATGCCAAGTTGTTTG:1 + chr3L 10530290 3' + Gypsy12A_LTR 1846 1 64.04 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCATTCACTGTATTTTG:1 + chr3R 6053093 3' - Quasimodo 28 2 67.12 AACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAATTATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCATTGAGTTACATTCAACAGCTACAGTTGGAGTTCATAGCATGGAGTTGGTTGGA:1 - chr2R 14385233 3' + jockey 272 1 63.70 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGG:1 - chr2R 20704159 3' + hobo 2904 1 63.16 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 4464165 3' + 1360 3355 1 60.20 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAA:1 - chr3L 9375802 3' + mdg1 7418 2 55.48 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGATTATGCAAACTCGGCTTTGGGTTTCT:1 - chr2L 5063939 3' + roo 9046 1 50.68 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTACACTTTAAAAATGGAACTGGT:2 - chr2R 15079977 3' - roo 8692 2 65.07 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATTTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCA:1 - chrX 15089494 3' + P-element 2835 1 45.93 CTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGACGCGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTTCCTTCGTAGCAAGTGTGTCAGTGGG:1 + chr2L 465649 3' - Stalker3T 293 1 81.51 AAAAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGTTAAGGCAAAGTTCCATAATTTCTTCTGGGATATATATATATATTGGGGATAATAAAATAAGAGAAAATTTAAAAATTG:1 - chrX 21452475 3' - INE-1 580 1 73.97 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATAAATGGAATTTCGAAGTTCCTCTTCAGCTCCCAGTAAACCCCATTTTCCGAGTAAAAGACAAATATGTTCGTTTGTTTGCGAGTTTAT:1 + chr3L 16264732 3' + Burdock 6359 2 63.70 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCATTTAATTATGCCTATTTTTTATATGTGTACCCCTGCAATTGC:1 + chr3R 6103708 3' - Tirant 32 2 65.07 AATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATGCAAACAATATTTAATTACTAATGGGCCGTGCAAAAGGCGATA:1 + chr2R 14884388 3' - mdg3 5281 2 66.44 TCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATGATATTGAATTGTTTTATCCCAAAACAATAAGCACAATGAAAAGTTCAAGAC:1 + chrX 10873892 3' + mdg3 177 2 63.70 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAG:1 - chr3L 2036985 3' - Doc 47 1 55.48 TCTTTTTCTTTTTTTTTTTAGCTTTAAAACTAAAAAACTTTATAAATCAAAACATTATAACAATAGTGAACCTTTTTAAAACTAAAAAAATTGTTTGTATATTAGAAAGTTCTTTTTTTATAGCAATCCTTAGAATGTTTATTTTT:1 + chr3L 6837809 3' - G-element 4325 1 70.55 CCATGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGAC:1 + chr3R 19545397 3' + jockey 4916 1 67.81 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCATTATCCACACGT:1 - chr3L 9426643 3' - P-element 32 1 60.96 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTG:1 - chrX 10571350 3' - Doc 88 1 76.71 CTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTTTTGTATTTTCCCTTTTCCATTAAATTGAG:1 + chr2L 17228722 3' + mdg3 5445 2 52.05 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATTGAATATAAAGCGTTTAC:1 + chr3R 12559747 3' - mdg3 50 2 58.90 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATT:1 + chr3R 5087074 3' + P-element 2796 1 21.68 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGCGCAACACGCATGCG:1 + chrX 19162723 3' - pogo 22 1 70.55 AGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAA:1 + chr2L 23390220 3' + rooA 267 2 45.89 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGTGAGTTTGAGTGGT:1 - chr2R 24630092 3' - copia 28 2 63.70 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTGGCTCCGCG:1 - chr3R 22659912 3' + 412 430 2 62.33 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAAC:1 - chrX 14914338 3' + mdg3 5446 2 53.42 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTA:1 - chr3L 9242007 3' - roo 8742 2 76.03 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTATAGTA:1 - chrX 23043142 3' - roo 82 2 78.08 AACCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGTAGCCCCTCTTGAATGGGACCACTAGTGATCCGCTATGACATCAACTAAATAAATGGAATACGCAGAATTTGCTGCAAACATTGTTTTATGTATTTTCTTTTTCGACTCTTTGTGCGCTT:1 + chr3L 10561849 3' - mariner2 101 1 73.29 ATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGATTCGCAGTTTGGCACGTTCATTCAACTCGCAGCTTGGCAACAACAAGCGAAGCGGCCAAAACGGCTCAAACTCAATGCTTTCGCTGAGGT:1 + chr3R 19750625 3' - GATE 8146 1 62.07 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCAT:2 + chr3L 53051 3' + roo 8985 2 78.77 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACGAACACTTTCGCACTGCATACTTTTCGGTGTCCAGCGGGTGGTTTGCTCAGCAGTTTCCCACCCAGTTTTTTAACTATTTTGCGCCAAAAAAGTTGCCCGACTGCCGCG:1 - chr2L 15920038 3' + jockey 4981 1 76.03 GGTGGAAGGAGGAGCCTCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTACGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACTTTGATTGACAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGAATATTTATTGCTTAATACCGTTGAAATAT:1 + chr2L 15609506 3' + Rt1b 4907 1 79.45 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAA:1 - chr2R 6984444 3' - Doc 92 1 75.34 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATGTATGCCG:2 + chrX 14385247 3' + blood 7323 1 63.01 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAATAAAGTCCTCATAGCTAATT:1 - chr2L 20984263 3' - blood 25 2 65.75 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTACAATATTTAAAATCAACATATTTGCATTATAATGCTAAT:1 + chrX 8200332 3' - flea 4779 2 67.81 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAGACCAACATGGATAGAAGCTTTTCAGTGTGCATGTGTGCCTGTTTGTGGGGCAAAAACGTAACAAAGTAGCTGGAAAATTCAGAAGAGAAATTCCCCCCATCCA:1 - chr3R 18846456 3' - roo 8682 2 73.97 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACT:1 + chrX 15167749 3' + roo 338 2 66.44 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGG:1 - chr3R 19537459 3' + hopper 1376 1 58.33 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTGAGCTTACACCCTTAGCAAGTCAAGAGTCAGTCATTAATTAAGAAATATTTCCACACGGCAA:1 + chr3L 18834989 3' + 1360 3334 1 78.77 TGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACC:1 - chr2L 5771401 3' - Juan 52 1 50.68 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAAATTTAATCCAAGTAAATTAATTTC:1 - chr2L 12481378 3' - pogo 14 1 73.29 AATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGGACAGCTTTAGGCTCTCACTGGATTCTAGGCACAATCTCTGTTCGTACGCCTATCTCCTATTT:1 + chr2L 5648569 3' + Burdock 6146 2 75.69 AAGAAACAAATTAAAACATATTACCAATAGGTTAATTATCGATTTTTCATTAAATCTACTTAAAATTGAAGTGAGATTTGTGCGAGGGAAATCTTAATTTCTTCATAGTTGGCTGCGTTTCGTTGGCCACAAAAGCCGCGAGAACT:1 - chr2L 12275085 3' + HeT-A 5765 1 74.66 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGCAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATA:1 + chr2R 20704220 3' - hobo 71 1 66.90 TATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATTTCTTTTCATTATTTCCCGGCTTTAGTGTTGACTTATGTTG:1 + chr2L 9356939 3' - Stalker 31 4 62.07 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAGGCAAATATCTCCCC:1 + chr3R 12795158 3' - mdg1 7062 2 68.97 GAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCCAAAAAAAAGCTCCAGGACATGATACTATCTGCAACTCCATCTTAAAGGCACTTCCGAGATCCTTCTGCTTCAACATGCGCAACGACTCTACCGGTCTTCTCATCGCCTCATAATCCGGA:1 + chrX 1298254 3' + BS3 224 1 56.85 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCAC:1 - chr3L 9430578 3' + P-element 2840 1 46.67 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACACTAGTTTAGAATGTTTGTTAACGTAGAAATGCC:2 - chr3R 9481965 3' - roo 8680 2 75.34 CCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTATGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACA:1 + chr3R 433138 3' + 1731 240 1 66.44 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTTTAAATATGTACAATCGAAATTTA:1 - chr3R 11526724 3' + pogo 2082 1 68.49 ATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAGCACATAATCACTCGTCATTCCCTTCCTTTTGTCCCTGCCCC:1 + chr2R 9679877 3' + hopper 1028 1 76.03 CACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCA:1 + chr2L 19417137 3' - BS 4994 1 60.96 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCA:1 - chr3L 2037010 3' - Doc 72 1 66.44 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATGTCTAAAGTTGTATTCTGCCAACGGCTTTGGCA:1 - chr2R 19353934 3' + 297 6957 2 73.97 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACACATTTCCAATTTATACACACCCCTACCTCCCTTTATCAGCCACCAAAATCGTAGACCCCCTTGATCGAATCGAAAAGCGAAAAATAAAATATCTTCAATTTATTTT:1 + chr3R 28008378 3' + hobo 2930 1 73.10 CAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGATGTAAGAAATGGCAGGGATTTTTAAATAGAAATGTCCAC:1 + chr2R 7883158 3' - Bari1 288 1 73.97 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGG:1 + chrX 14385232 3' + blood 297 2 73.29 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTTGCGCGGTACTGCGTGG:1 - chr2L 18048235 3' - blood 41 2 56.16 CACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTTTCTGTTGTAGTTTCCGTGTTACTGCTGTGGGCAAAACTAATTTGTATAAAAGTGCAGGCGACTTTTATTTGATG:1 + chr3R 14929428 3' + R1A1-element 4923 1 51.37 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATATCGGAATTTTAAAATAAAATTTGCTCTTTACAAAAGCATCTATTTTATTTATTGTATGT:1 + chr3R 8022259 3' + roo 378 1 64.38 AAGCGATGTTCGCGCTGCCCGCTGCATTTGGCCGGCTACACAAAAATGATTTATGCTAAATACGAATAATTCTCCGGATACACATTCTTCAGCAGCTGGACCACCCGGTCATTTGCCTTGCGTTCGGCCAATTCCAAG:1 + chr3R 9044758 3' + Stalker 497 1 50.00 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAACGAAAAAGTGGG:1 - chr3L 13227626 3' + hobo 2894 1 60.53 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAAT:1 - chr3L 16157181 3' - Juan 48 1 52.05 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGTGCCCTGAGTAAATACTC:1 + chr3R 15514645 3' - 412 27 2 63.57 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAG:1 - chr2L 20984301 3' - blood 7074 2 61.64 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGT:2 + chr2R 5900948 3' + Bari1 1667 1 59.59 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCAC:1 - chr2R 20913103 3' - 1360 53 1 52.74 CCGACTATCAGATACCTGGTACTAAGCTTAAATAACTGGCACACGAGCTCCACCTTGTGGTCGCTACATGGGTTATGTGTAATGTGTGTTATTAATTTATTGTACTTCTATTTACCTTAATTTACAAGTAATGAATGAAATTAAAT:1 - chr2R 8777904 3' - INE-1 551 1 50.00 AGTGCAGTATTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTCGAAGTTTTAGGATCTACATGCAGATCTGACCACGGACTTGGTTTGATTATGCTTTTTTGGTTAT:1 + chr2R 3555083 3' + Cr1a 158 1 54.79 CGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCAC:2 + chr3R 10541343 3' - hopper 66 1 61.64 GGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7207 2 70.65 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAACCTGGC:1 + chr3R 13358730 3' - mdg3 5273 2 71.72 ATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTTGTGAATTGCGGTTCTATTGCCTTGAATATGTTCGAGTGTGTGGGCTTTGAA:1 + chr2R 20382636 3' - Bari1 14 1 75.34 ACAGCACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACCTAAAACGGACTTGTGTTCTTACTTGTAGTTCATCATGCCACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGC:1 - chr2R 20500078 3' + 412 7449 2 79.02 CTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTT:1 - chr3R 10973213 3' - jockey 82 1 65.07 GTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAGTAGATAGGGACAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 5062 1 58.22 AAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTTATATTGCAAACGGCG:1 + chrX 10623928 3' + X-element 4674 1 53.42 GTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGGATTTTCAGAATATCGTATTCTGGGTAAATGTTTTCTATGTGTAGCAATGCCAAGATATGTGGGAGTACCAATTTATGTTTACCTAT:1 + chr2R 16312180 3' - G6 1928 1 79.45 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATACCTCTTTTATAACATT:1 + chr3R 21924395 3' + roo 9052 2 71.92 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACACATTCTTATAAATCCAGCAATACTGTAGACACTATAAACTTGGTGAACCAGTACGCCATGGTTTTCTACATGCCACATG:1 + chr3L 21630441 3' + Burdock 217 2 59.59 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTTTCGTTAACAATGTAAACGCCCG:1 - chr3L 6630345 3' - jockey 4753 1 73.79 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTG:1 + chr2R 15613815 3' + P-element 2816 1 23.33 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGC:2 - chr2L 1073887 3' - Tirant 40 2 59.59 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCCACGATGTAGACTCTAA:1 + chr2R 5992434 3' - pogo 23 1 69.86 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTAGCTAAACTGCACATACTTCACATCACGAAACT:1 + chr3L 10814600 3' - 297 60 2 62.33 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGAGAAGATTTTCGGGACGAAATTTAATTTGCGAATA:1 - chr3R 22846659 3' - 412 17 2 74.66 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCATTGTATAG:1 - chr3L 5263314 3' - pogo 16 1 70.83 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGATTTGTCTGGTGAT:3 - chr2R 7534548 3' + roo 387 2 71.23 CATGCCCACACTTTTGAAACATATTTCAAAGTTTGCTTATAATTTTATTTGCCCTGTAAATTTCT:1 - chr3L 25611148 3' + INE-1 253 1 66.15 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGC:1 + chr3L 17447540 3' - Tirant 8180 2 71.23 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCCGCACTTCGGGTTTCAAGTGC:1 - chr3R 30272961 3' + Tirant 352 2 54.11 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAAGGTCGCTCCTCCACACGCACATTATCAAGCACAAACGAGGCACAAACGGATGCCTTTCACCTGGCTTCCC:1 + chr2R 5849107 3' - mdg1 9 2 77.14 CAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGA:1 - chr2R 5284537 3' + Doc4-element 2594 1 50.00 ATAGGTACAATAATTTGAGTTTTAGAGTTTAACATTGCATGTGGTGAGTTTGGGAGTTGGACATAGTTAATGTTAATGTTAATGTTAAAGTAGTTAGTATTTTTGAAGGCTGCTGTTGGTGGCTAGTGAGGCTGGGTGGCTGGGTA:1 - chr2L 8674274 3' - HeT-A 5969 2 71.92 CGCAGGCACCGTTATTCCTGTCGTCGAGTGCAAAATGTGCGGTTATGGTTTGTGCAGATCGAAGCGCAATTTCAATGCACAAGCCATAATTTTTCCTGGCCTTTTTCACACATGAAAATGATATTGTATGCAAAATAATATTGTTG:1 - chr2R 1954691 3' + Chimpo 305 1 54.11 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTC:1 + chr3R 9482090 3' + roo 8990 2 74.66 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCAGATTTTCTGTGTAATCC:2 + chr2L 2519951 3' + roo 396 1 76.03 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGGGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAAATCAAATTG:1 + chr2L 12142661 3' + hobo 2931 1 65.00 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACACATTCTTATAAATCCAGCAATACTGTAGACACTATAAACTTGGTGAACCA:1 + chr3L 21630412 3' + Burdock 6325 2 65.07 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAG:1 + chr3R 13358710 3' - mdg3 5294 2 57.53 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCGCTTGGGCCTG:1 - chrX 8502153 3' + pogo 2059 1 53.57 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCG:1 + chr3L 15035239 3' - pogo 39 1 56.94 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAG:2 - chr3L 4869174 3' + roo 8989 2 73.29 GTCTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAGGGCACGCTCCTCACTATTGCAATGCATAAGTATCGGGGTCAAAGCTCTTGTGCTTTATCACAGCCGTAACCGCACGTTGGATGGCCTGTGACTCCGAGG:1 - chr3R 25071955 3' - mariner2 186 1 52.05 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAGGAAAAGGGTCCGTTGGTAGTCAT:1 - chr3R 10143275 3' + 412 463 2 47.95 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGTAGAGTGACATTTTTTATTTGATAACTAGGTAGATTAAGCTTAGCATTAACAAATTAACAAATTATAAGTCGATAAGTAGAATATAATAAATTGGTT:1 - chr2L 1327456 3' + pogo 2080 1 67.12 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGATAATTTATAAGCAGCCTAAAAGCATGCTATTGTAATTAGATGGGCAGATTACATCCCTATTTACC:1 - chr2R 22798571 3' - hobo 13 1 75.34 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGC:1 - chr3R 4722382 3' - roo 63 2 63.01 GATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATACCAAGTATCTTAGGATGATTTGAGCTGGTGTCTTGCCGTATTTCGC:1 + chr3L 12500235 3' - FB 72 1 65.75 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTA:1 + chr3R 21924344 3' + roo 9001 2 67.81 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATA:1 - chr2L 15832987 3' + hobo 2883 1 56.16 AGAAATGGTTCTGCCAGTTCAACGTCTTGATCGTGTCTGTTCTGTGAGTGTTAAAATATCTTTCGTCTTAGGCTAATTACGTGATCATTAAGCGAATTGGAAAAATCATTACTTGATTTATTGCCATAATATTTTAACTACGCAAA:1 - chr3R 19692662 3' - 412 7441 2 52.05 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAGTTG:1 + chr2L 7991373 3' + 297 6911 2 63.70 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTC:2 + chr2L 535493 3' - roo 77 2 72.60 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGA:1 + chrX 3506149 3' - Tirant 70 2 65.07 GCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACGTCTAGCTAACCATAACACTA:1 + chr2R 1277136 3' - Tirant 79 2 72.60 GGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACAT:1 - chr3L 10076319 3' + X-element 4644 1 66.44 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAG:1 + chr3L 15035213 3' - pogo 67 1 67.81 AAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATG:1 - chr2R 14553208 3' + mdg3 209 2 58.22 AAATAACAATAATAATAATAATGGAAATTTTGCATGCGGGTGAAATTGAAAACACCATACAATACAAAATACACCGTAGAAAAGCCATAAAGACTTGGCTTTATGAGCTACCTGTATGTGGTAGCAATTACTTCAGGCAAAAACAA:1 + chr3L 11537693 3' + mdg1 30 2 80.14 TTTTTTTTTTTGTTTTTTAAAAAGTTTTGAAAAAAGCGTTGTGGATTTTGAATATTAATTAACCAAATAAATCTTTACCTATGATAAACTAATGGGCAAAATTGGAACGGCATGTTGAAA:1 - chrX 3243872 3' - HMS-Beagle2 481 7 75.00 GGGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTTATTAGTCGGCTTAACTTTTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATATCTTGTGGTTTGCTTTGCCGGCTGCAAGTTGAGTTTATTTACCGCTAATAATGGTCATTTGAGTTG:1 + chr2L 15378051 3' + Cr1a 4062 1 52.45 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTATCCGTATTTGAATGTCTAGCATTAGGGGCATCCCC:1 + chr3R 9993433 3' - hobo 83 1 74.66 GTGCACACATACAGTTGTCTGCTATTACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTATCATTTATGAAAAGCTGGTGTAAATTATAAAATAAGAAGGACTATACTATAAGAAGGAATAAGAAGAAGGGAATTGTAAAATCTGTAATG:2 - chr2R 4695756 3' - 1360 166 1 62.33 AGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTGGCTTGTTAAGCACAATTAAAGGTCTCAAAATA:1 + chr3L 17667670 3' - F-element 30 1 58.90 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTG:1 - chr2R 9332130 3' + roo 9004 2 65.75 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGCTGTTAACGAAACTCCCACGCTGCCGCCTCTGGTGCTGCGCTGCTACTGCGCTGCCGGCATCGCTGTTTTGTTGGACATTTT:1 + chr2R 14001144 3' + P-element 2860 1 62.50 AGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGA:1 - chr3R 5940462 3' + hobo 2853 1 75.34 ATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAATAATTACAATCGGCTACGCGCGATTCACCAAATCA:1 - chr3R 29207555 3' - copia 86 2 77.40 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAATAT:1 - chrX 11228523 3' + roo 9041 1 65.07 CGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTC:1 + chr2R 5900900 3' + Bari1 1619 1 79.45 AATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGA:1 + chr2R 2879477 3' + Stalker 96 4 50.36 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATG:1 - chr3L 13597741 3' - blood 7068 2 57.53 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCAC:1 + chr3L 131830 3' - P-element 50 1 52.05 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAA:1 + chrX 16853406 3' + roo 327 2 73.97 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTTAGCGAG:1 - chr2L 21237214 3' - P-element 60 1 44.52 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATAAAAATCA:2 + chr3R 30568916 3' + roo 361 2 50.00 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTA:1 - chr2R 21227350 3' - mdg3 5316 2 60.96 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGA:1 + chr2L 21237304 3' + P-element 2817 1 37.67 CAAGTGAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATATATAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGAAAGAAAGAATCACTCACTT:1 - chr3L 20895274 3' - invader3 5331 2 50.00 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATA:2 + chr3R 30568909 3' + roo 354 2 54.79 ATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTA:1 - chr2R 20362224 3' + diver 140 2 73.97 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCC:1 - chr3R 9345559 3' - pogo 53 1 57.53 AACACAAAAACAGTACAACTACACATATATTAACTACATACGTTAAAAACAATCGCCTGAGTGATAAATAGCATTTAATAATTTTCCGTGCGCACATTTCAGGTTCTCCACTACGAATAAAGCAATTAAATTCTCCTTTCTTGGCG:1 - chr3L 9202737 3' - transib2 325 1 64.38 ATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATTATACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCATGGGACCAGAAGGCAAGCGGAACTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGCGATA:1 - chr2L 11867258 3' + BS 5056 1 54.11 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAA:2 + chr3R 25443134 3' - 297 6642 2 66.44 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGGATGGCTGATATGCAGGTGGACTGTTGAAAACCGGCT:1 - chr3R 9563561 3' - P-element 27 1 65.75 TGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTATCCAACTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGTGAATTCAACATTTTTTAAT:1 + chr2L 21318074 3' + accord2 7262 1 45.89 GTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCTTTTCCTCGCTGGAGTTTACGGTCGCGCCAATTGCATTTGATTAGATTTTGTTTGGTTAGTTGGGCGATCAAAATTGATTTCGCCGTTGGAATG:1 - chr2L 9344909 3' + flea 50 2 60.27 CTTGTGTCCGAACTTCATGCCTCAAGATATGACTTTTGCAAAAGACAGTTTTCATGTTTTTATTTATTTTATAAATTTTTATTTTCCACTATTGCAGCAGATTTAGCATTTATTGATTGATACAGGTGTACTTCGGGGTAAAGGTC:1 - chr3L 26133883 3' + 1360 469 1 62.33 AAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTAGAACATATACACCCCAACACACATACACAAACAAGCAGAGAGCCACCCCGAAAAAAAAGTAAAAATGCCAAGCAAAATCAAATAAAAAACACAAAAAATAGGCAGAGAAG:1 + chrX 19828030 3' + Idefix 22 2 64.38 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTT:1 - chrX 15089475 3' + P-element 2843 1 55.48 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAG:1 + chrX 15167732 3' + roo 8985 2 78.08 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGAATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGA:1 - chrX 18193719 3' + hopper 1344 1 67.81 CTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTGGC:1 - chr2L 21580871 3' - INE-1 530 1 50.37 ACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAATAAATTAACGGCAAGATTCACTCAACAAATAGTTCACGC:1 - chrY 312470 3' + Ivk 379 1 73.29 ATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCACGTCTTTGCCTTTCTCGATTTACTTTTTGTATGTCTAAAAATGTTCGCGCGTAAAACGTTATCCGTTAGT:1 - chr3R 9994672 3' - hobo 2669 1 58.90 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAA:1 + chr3R 8542657 3' - roo 84 2 76.03 AGCCAAAAATAACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTAATGGCCGTACAAGTGATGACCTAGCAAAGGGTATATTTAATTTAATGCCACCCCCAACACAGCACAATACCCCACTTCTTGCCGCA:1 + chr3R 25378721 3' + Cr1a 496 1 63.70 CATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAACAAAGAGAACGAAAGAAAGAAAAAAACAACGGCAGGCAAGAAGA:1 + chrX 1948073 3' + Quasimodo 6995 2 62.50 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTT:1 - chrX 983142 3' + 412 411 2 71.92 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTGTTGGTGG:2 - chr3R 8542558 3' + roo 9032 1 53.42 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCG:2 + chr3L 4023721 3' + pogo 2039 1 61.64 GGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAACTAGTTTGTTTGAGTGAAGA:1 + chr2R 10453479 3' - mdg3 31 2 49.32 ATATCAGGAGCCCTAATAGAACAAAGTTTTAAGCCGAAAAAAGTTATCAACATATTTAACAAAGATAAAAAGCCATAAAATCCGTGATTATGGATGAGCAGTGCAACTCTATAGTACACCAAAGACCAATGCACAATGCACAGAAA:1 - chrX 1529324 3' + Fw2 479 1 53.42 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGCAAAAAACAAGCGAAGCAACAAATTTTGATGAAAGCCATCGCAAAAAATATTGATAA:1 + chr3R 27835682 3' - 412 7115 2 57.53 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTGGGATTTTTGCGG:1 - chr3R 25753592 3' - hobo 33 1 63.70 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTAT:1 + chrX 11228627 3' - roo 89 2 79.45 GAGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGACACCTTTGAGGCAATAAACTGTGCCTTACAAATACTTGCAACTCTTCTCGATTTGAAGTCAGCA:1 - chrX 2245704 3' - R1A1-element 497 1 64.58 TTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAGCACACAAAAAAT:2 + chr2R 10552458 3' - S-element 63 1 62.33 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTGTCTCTTTCTTTCTCATGCGATTTGACTTATTTTTGCTTGCTT:1 + chr3L 3762300 3' - roo 8740 2 70.55 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTT:1 - chr2L 18048271 3' - blood 74 2 67.13 TGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCCTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAAGAGGACGAAACTGCGCAACCAGTCGCTCACCTCGCTGTGCATCATCTCGCACCATCC:1 + chrX 15094342 3' + P-element 317 1 43.84 TATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTAT:1 - chr2L 5771414 3' - Juan 59 1 57.86 TTTTTTTTTTTGAATATTTTTTTGCTAATTTGCGGCACTTGCATTTCGGTCTTTCCAAATTTGGGCTTTTTTCATTTGTTTTTTTGGTTTTT:1 + chrX 16489967 3' - TART-A 13401 2 42.39 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAAT:1 + chr3L 13722119 3' - blood 7072 2 59.59 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAGTTTACAAGCACAGGTCGTTAAAAGTTACTTCAAGATCGACAAAACAATTGAAAGTGAATAAGTTCTAATTAGACCTCTGCTGGCGGCTGAATTTAATATTGAGATGAT:1 - chr2L 8452190 3' - copia 4882 2 76.71 AGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATTTGCTGTATGATCGAGACGAACGGGAGTATCCTGGCGGGCAGCGTCAGGTGTTGCGTACTGCCCAGGCTCCACTGTGGTCCATCGTCCAGTGGC:1 - chr2L 16869937 3' + X-element 4548 1 70.50 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTATCAAATTGTTTATGATGTATTCTTATTACCAGTTTGTAAGATTGCTTTTTTTCTATCAGAACAATGTAGTTTT:1 - chr2L 796144 3' - mdg3 70 2 50.00 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGGTCCTGATAAGCAAATTTTCTTAATCCGACTTGTGAATATGACTTTTCTTCAGCAAGTCCTACTTATTTTCGGTGATTATTCCCGCAGG:1 + chrX 3491521 3' + Tirant 378 2 48.63 ACAACACGAACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCCACAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACCGTAGATGCAAA:1 - chr2R 5530008 3' + 1360 3216 1 58.90 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAAGTTGCAAGGAGCGGAACATGTGTTTGCCATGT:1 - chr2R 14385528 3' - jockey 33 1 67.81 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTG:1 - chr2L 8397177 3' + roo 8989 2 77.14 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTT:1 - chr3R 15514519 3' + 412 7482 2 60.96 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACT:1 + chr3L 9242081 3' + roo 9002 2 64.38 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGACCAATTTCAGG:1 - chr2R 17013996 3' - HMS-Beagle 6832 2 59.59 AACATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAACCATTTTTTCTTTTTGCAAGTGTACATAGAGAAAACAGTGGGGTATAATGACCATTCA:1 + chrX 13795594 3' - 412 77 2 78.77 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTAACTGATTTCCCTTTGTGGCACATATGCGATTGATGTAAAGTAT:1 + chr3R 12608223 3' - roo 8667 2 53.42 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAACTTCTTCAGCGACAACTTAAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACCTCGATCTATTAGGCATTCACGGTGGGATTACCTTCCAACTTTATT:1 + chr3R 23254550 3' - pogo 32 1 63.70 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACCTGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACG:1 - chr3L 3979579 3' + opus 434 2 63.64 ATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCA:1 + chr2L 20841968 3' + G6 1944 1 67.81 AACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCAAATTGGGGACTTCTCCTACTAGAATTATTCATAATATCGAGCAA:1 + chr3R 21874076 3' + jockey 4781 1 69.86 GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGA:1 + chr3L 5183779 3' + copia 5046 2 73.97 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACCTCAAAATTGTAAAGTTCTTTAACAATTTGTAAGTTTAAT:1 - chrX 21204952 3' + 1360 3359 1 56.12 ATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATGCTCCTCTTGTCCGCGAACGATCGCTGGCC:1 - chr2R 17072169 3' - invader4 196 2 72.97 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCTTAGTGAAAAAATACAACTGAAATATAAAATTTCAAAGTTATACTTAAAGTATATTTTATACTATATG:1 + chrX 23043233 3' + roo 9022 2 52.05 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGGAGTACGATTTTCAAGAAACTATAAAGGATTATAACCGAACTTAAAGGAATTTATGTTCGAT:1 - chrX 7525000 3' + I-element 5344 1 77.40 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGACGCAA:1 - chrX 3524224 3' + roo 9004 2 65.75 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAG:1 + chr3R 26399904 3' - roo 46 2 54.79 TTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTGTGTTGCTTTTTATGAGTTTGTCTTGGTCTGTGTACTTTATTTATTTTTAATTTCGCTCGCGTCGATTATTGGTTAATTTTTGGTCATGAAATATGGAGCAATTGAGGGGCTGG:1 - chr3L 15268674 3' - G2 3076 2 65.00 AGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGT:1 + chr2R 5900957 3' + Bari1 1676 1 65.75 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGGAGTACGATTTTCAAGAAACTATAAAGGATTA:1 - chrX 7525030 3' + I-element 5314 1 56.85 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTG:1 - chr3R 8542568 3' + roo 9038 1 52.31 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATACCATAACAATATTTTCATAGCATACTTTC:1 - chr3R 19545322 3' - jockey 65 1 54.11 TTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAA:2 + chr3R 24175776 3' - Burdock 6198 2 61.64 GTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGCGGGCAATTTTGTAATTGTTGGACATTTGTCATGGCTGCAAAAAGGGTATTTAAGTAAGCAAAAGCATCTCGGATTTTAACCTAAATATTCCAAGTAAAAATTCTAATCAAATTGATGCAAAA:1 - chrX 13843889 3' - gypsy3 418 1 57.53 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGGATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTGCACTTTATTTTTTCCACTGTGCC:1 - chr2R 11655999 3' + HMS-Beagle 213 2 56.59 AATTAAAAATATTATTAGTTTTCTCTGTGTAAAATCACCCATAGCATGCAATTAACTATTATTTAAATTTTGTGAACCCAGGGGAATGGATTGGTGGAGTTTTTAGAATTAAACACCAGCACTTAAGTTTCGTTTTCTCGATAAGG:1 - chr3L 6588291 3' + Burdock 499 1 69.86 TATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTT:1 - chr3R 19537490 3' + hopper2 1536 1 63.70 GTGAAGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAGAGGAGCCACTTCTGATTGCACGTTTTCGCCCTCATCCGTTATTTATCCGTCTCTCCTTTCGTGGCAAATCGGCATACTGCATTGCACATGTTGGAGGGGCAGAGATCGCAGTC:1 - chrX 19626251 3' - accord 187 2 76.71 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAGTTTATTTTGACGAATCTTATTCAATGTGTATCCTGCATATGTATGTTCCG:1 + chr2R 7534679 3' - roo 8720 2 63.64 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTC:1 + chr3R 16194234 3' - mdg1 49 2 52.74 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTACTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCCACGAACTCAACTTCCTCACCG:1 + chr2R 8686661 3' - hobo 53 1 50.00 GTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGATCGCTGGCCTTTTGGCTCAGCGAGAATGTTCAAATAATTCCCATCAGGCAGTGTTCCTTGGTGCGTTGAAAGACCGCTTTCGGTTCAAGTTGCTTGGAG:1 - chr2L 8309415 3' - gtwin 372 2 55.47 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGA:2 - chr3L 1387148 3' - mdg3 83 2 71.23 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCTGGCAGCGCAAATAAGGGCA:1 + chr3L 6774268 3' - pogo 38 1 58.22 ATAACGTTATGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCGTGGTGGCAATTGATTAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATGGTGTTGGCATTTTGATCGGATCAGACATCGGAT:1 - chr3L 24535428 3' - 1360 298 1 75.34 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCGTGTCAATTTAAAGCGACATTTATAACCAATTTGTAATCAATTCTAACAATCAGCTAACGCATCACCCCACCATCCCCAGCCATACCCTTTTC:1 - chr3R 10562087 3' - I-element 28 1 65.07 GAGGACAGTCAACAATTCTGAGAACCATCGGAGCGCCGTGGTACGTTTGGAACGAAGACATACACAGAGACCTAAAAACCAAATTATTTCACTTTCACTCCGGATGACATTCGTATATGTATTTGCCGGAAACCGAATCGTAACCC:1 + chrX 13011317 3' + Doc 4350 1 58.90 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGC:1 + chr2R 19543743 3' - jockey 4831 1 66.44 TTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGTAAAAATATGGTTCGCAACGG:1 - chr3L 5183705 3' - copia 69 2 64.83 CTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATATTTTTATCGTGGCTGTGGGCGGCTGGCACGGAAGTCACAATGTCAGTGTCTGAACTT:1 + chr2R 19018281 3' - invader2 4973 2 62.07 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTAACCTAACCTAACGGCTTAAATAGC:1 + chr3L 22676372 3' + 412 7489 2 55.48 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCTGCGGTT:1 - chr3R 8402513 3' - mdg1 7066 2 65.71 ATTTCTTACGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCCGCATAGTGGCAAACCAATGTATAAATGGTATATAGTAGGGGCCTATTCCTCGGCGGAGGCCTGCTCGATTTTGGCTATT:1 - chr2L 7382303 3' + 1360 3287 1 59.59 ACAACCGATCTCTATGAATTTAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCGATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTTCTCAAC:1 + chr2L 6074108 3' - BS 6 1 66.96 TGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATG:1 - chr2R 5582160 3' - Cr1a 479 1 51.37 CGCTTGAATGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGCCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAATGTCCTGGCATGTCGAGCAGCACAAGTTGAAAACTTTT:1 + chr2R 9771148 3' + Cr1a 379 1 73.97 CGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGA:1 + chr2R 21227441 3' + mdg3 178 2 65.07 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTGATGTACACTTTC:1 + chr4 311617 3' - 1360 46 1 54.11 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGA:1 + chr3R 13358716 3' - mdg3 5288 2 61.64 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAATAATTACAATCGGCTACGCGCGATTCACCAAATCACAGCAACAACCACAGTGG:1 - chr3R 29207537 3' - copia 51 2 60.47 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGGGAAAATCAAGTAACCA:2 + chrX 19231881 3' - mdg3 20 2 71.92 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCGTAACAAACTCAATATTTTATTATTCTCTTCGTTATTATGT:1 - chr2R 15392724 3' + blood 297 2 75.34 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACATGTATATATAGATATGTATATATTTTTTAATATATCTGCTGTTCTTTAAGCCAAGAAATGGGCTAGCTACCCACCCAGGTCGTTAGACACCATAA:1 - chr3L 17443945 3' + Burdock 6369 2 70.55 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAGGCATCCTAAAACCTCCAGTTCAACTTC:1 + chr2R 22692466 3' - Ivk 28 1 65.07 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGACTTTTTCCGCCGAATGGCCATGTGG:1 - chr3L 16887309 3' - roo 8726 2 60.96 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTGGTCACTGGAGCCTCAGGAGTAGTGGACACTGGAGCCTCTGGAGTAGTGACCGTGACTGG:1 + chr2R 18051121 3' + mdg1 415 2 77.62 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTCTCATTTGGGTGCACTTTAGACAGCAAGTAGATCATGTAGCAACTCTTCTTAATCACCTTAATCTTC:1 - chr3R 25239865 3' - jockey 4765 1 54.11 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACT:1 - chrX 22858844 3' - mdg3 5307 2 54.11 CTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACCGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACCATTTAACTGAGGTGTATGTGGCATTGTTAAAGCGGAGCATTACGACGGGTAATGTGAGTGCT:1 + chr2L 8962935 3' - transib2 470 1 56.85 AGTACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTG:1 + chrX 22824252 3' + Gypsy12A_LTR 2233 1 48.97 CAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCC:1 - chr3R 6103579 3' + Tirant 8441 2 61.64 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATATATCTATGTGTACATACGAATCGTATATAATGTAATGCAATAAAACG:1 - chr3R 11262601 3' + Transpac 5162 2 71.92 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAG:1 - chr3L 12863659 3' - Transpac 4953 2 57.66 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGCGGC:1 - chr2R 17013992 3' - HMS-Beagle 6827 2 64.14 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTT:1 + chrX 9816460 3' - jockey 59 1 61.67 GTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATT:1 + chrX 22858938 3' + mdg3 5424 2 67.81 CTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGAACGTGACTTGTTATTTGACTTGTTTCGCGAGCTGGCTGCCTCTCTTAGTGCACGACTGTCCCTGTGTATTTGCGATGTGCATCTGAGCCCCAGTCATACGAGTA:1 + chr3R 5926563 3' + hobo 2801 1 76.03 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTATACAAAATCTAC:1 + chr2L 14222382 3' + Transpac 283 2 67.81 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTT:1 - chr3R 25822989 3' + roo 8989 2 76.71 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAAAAATAAAAAACAAATTTGTGTGGCTAAC:1 - chrX 4858356 3' - BS 5071 1 65.75 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTCAGTAGCCAAAGAGGTT:2 + chr3R 16194250 3' - mdg1 7071 2 63.70 CTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTTTACAATGCAATAAACAAAGTGTGCTAACTAAAAATTGGCTCATCACTGCCATATTAATGTGCAATCACAAAATACCAAAGAACATAATTGGATAAAACACTTGTTCATCTAATTTATTCTG:1 - chr2L 3734393 3' + mdg3 250 1 86.30 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTACCTAGTTGGTGTATGGCTTTACGGGCCATTCTTCTCATCGGGCAGAAAAAGTTCCGCTCAATGTTACAATATTTTGTGTAATATTAA:1 - chrX 11212710 3' + mdg1 7427 2 63.01 AGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAA:1 - chr3L 24153130 3' + Tabor 477 2 77.78 ACTTATAACCTAAGGCATTCTATGATTTGGTTTATGTCTGTTGCTTTGTGGTAATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTAGTCAAGTGTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATCTAAACACGACTAAAATTTCTT:1 - chr2L 23016848 3' - Quasimodo 90 2 73.97 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTCCAGAACCCCA:1 + chr3R 21521430 3' + Bari1 1657 1 52.05 GTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTGCCCATGCCACACACTTTCCCCACCCCCCATCCCTGGCGCTTTTCCCTCCCTTTTCCTCACGACACTCAGGCCACAGAAACTTTCTTTGC:1 + chr3R 17316170 3' + 3S18 6099 2 78.33 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCG:1 - chr2L 8397149 3' + roo 347 2 58.90 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGCGTTG:1 - chrX 22858805 3' - mdg3 5259 1 79.56 AAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAG:1 - chrX 19231734 3' + mdg3 190 2 54.79 GTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAATACTCAGCATTTTGTTTCCAATTTCTGGTGAATT:1 + chr3R 28425625 3' + I-element 325 1 76.71 GCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCG:1 + chr2R 21227454 3' + mdg3 5444 2 55.86 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTT:2 + chr2L 19417106 3' - BS 5025 1 60.96 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTG:1 + chr2R 10991395 3' - jockey 62 1 53.47 GCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGC:1 + chr2L 17228686 3' + mdg3 157 2 76.71 AAATGACTACATATATTACGTCCTTTCTTCAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTACCAATATATTAAATAAGTGGGTATAACTTAGAGTAAATACATACGTAAAGATTATACAGTGGGAGAAACAGAATCCGT:1 + chr2R 13859706 3' + Stalker2 7208 1 75.34 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAGCA:1 - chr2R 6585389 3' - pogo 35 1 61.64 GGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTGCGTGCTCAAGGATGTTCGCAAAATTCACCACACTTGTCGCTCGCTCGCAAAGA:1 - chr2L 12142562 3' - hobo 2661 1 42.96 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTCAC:1 + chr2L 21596575 3' + blood 7313 2 65.07 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATT:1 - chr3R 10468002 3' + opus 471 2 56.36 GTGGCATATATTGGTTTATTACACAAGAGTAGCCAAAGACCTCGTCATCAATTTAGTGACGCGTATGATATTGTCCCTATCATATAATTAATATATAAAGAATTTAAAGAATTTTATCAAGAGTAGCCAAACACCTCGTCATTAAC:1 + chrX 23431006 3' + blood 7388 2 76.03 GGGCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGTACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATCA:1 - chr2L 15153223 3' - G-element 25 1 58.57 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGGCTTAGCCT:1 - chr2R 544803 3' - HMS-Beagle 81 2 73.97 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGT:1 + chr2L 14222331 3' + Transpac 232 2 75.34 CTATTGATCCTGTCCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGTTTTCTTCACCTGGATATATATGGAATTGATTTTGTTTCACATATTTGTACGATGAATGTATATTACCAGAAAAAAAATGGATTTAAAAAAATATGTAT:1 + chr4 260223 3' - INE-1 85 1 32.19 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTG:1 - chr2L 8397140 3' + roo 9021 2 52.41 GTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATCCATCAGCAACCC:2 - chr2L 12283909 3' - Quasimodo 43 2 59.59 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGACAGAATCCTCAATTCGAAACGACAC:1 - chr3R 6782669 3' - jockey 4699 1 67.81 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCCAAGTTTTAGGCCAGC:1 + chr2L 4104096 3' - roo 8727 2 60.96 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTC:1 - chr3L 2037011 3' - Doc 73 1 67.12 TAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATGTATGC:1 + chrX 14385245 3' + blood 7321 1 64.38 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTACCCTTTCTATAAAATGAAATCGAAATGGTTTCGTATTTGTATTCCATTTCCTTGGGCTGTTTTATGGCGGTG:1 - chr2L 14005340 3' + hobo 2925 1 66.36 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGTGAGTTT:1 - chr2R 24630099 3' - copia 4904 2 58.90 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATTCGTATCAACACACTGATAGATACAACGCTTTGCATCTACGTACATATGTTTCAATCGTAACTAAGTTCCGTTATTCT:1 + chr3R 3257580 3' + Burdock 215 2 58.22 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTT:1 - chr3L 9426679 3' + P-element 2820 1 37.93 AGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCCTCTGCAACTC:1 - chrX 693652 3' - INE-1 141 1 40.41 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTT:1 - chr2R 22867445 3' + hobo 2899 1 69.47 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATAAGCTTGAGCACGTACATGGACCTCAGGAAACA:1 + chr3R 3527209 3' + Tabor 7299 2 67.12 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAG:1 - chr3R 3527076 3' - Tabor 66 2 60.27 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTT:1 + chrX 17469270 3' - blood 66 2 61.64 AAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCCCCTCATTCCACTCATTTTCCCCCCTCTTTTCACTC:1 + chr3R 31884456 3' + HB 1557 1 75.34 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACG:1 + chr3R 24175763 3' - Burdock 57 2 66.41 GCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAACACTCTCCTACAGAGGATTGCTACCATATTCTAA:1 - chr3R 4913551 3' + 1360 134 1 50.00 ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTG:1 - chrX 7467934 3' + hopper2 1544 1 59.59 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCCACGATGTAGACTCT:1 + chr2R 5992432 3' - pogo 25 1 68.49 AAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTC:2 - chrX 17614355 3' + roo 9032 1 58.22 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCACTGATTTCCTCGAAACTTGTTATGGTTGAA:1 - chr2R 6945582 3' + pogo 2078 1 69.86 AGGGACAACACGATTTTTTTTTGGTGGTTTGGCAGTCACAAACACATAATACAAGCCACACTGAATACAACTAATTTTGCAGTCTATTCGCATATGGATATGGAATGCTGTCTGCTGGGCTTTCGTTAACAATGCAATTTGTGCTG:1 + chr2R 25030536 3' + Transib-N1_DM 186 1 54.79 TAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAACAGTTTCGAAATGTGGGTGGCGATTGTGAGTGCACTCAAACTTAACAAATTAATTTCCATTTGCGTTTTTGGTTGCGTGTGAAACAGGCGTATT:1 + chr2R 22553616 3' - HB 1524 1 54.11 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCTTCTCATCGATGGTAGGTAAG:1 + chrX 16456804 3' - P-element 37 1 46.79 GAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGAATAACGCCATCTACC:1 - chr2L 5771381 3' - Juan 32 1 63.70 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCATTATAATCCTTTCGCTCGACCA:1 - chrX 10978933 3' - roo 14 2 74.66 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAGTAGCACACCCACATATATATTTGTTTAAAGTTGCCCAC:1 - chr2R 21897826 3' + 412 7534 2 69.86 AGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTATTCTTGAGGCTTGTGAAGAGCTGAGTCAGGCTGTGATTGCCACCAGCGGAAGCGAAGGCCAGGACAATGTGGCC:1 + chr2L 5138784 3' + jockey 200 1 49.32 ATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACGGGGAGAAACCTTTCACTTGATCACCCCTCCAGTCACCTGCGATCGTGAAAG:1 + chr2R 18788674 3' - McClintock 6054 2 63.64 CGTTAGGAATAAGAATATTATTGTTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCAATAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCATACGCTTTGTTGTTTTGCGCTTGAGTTTGATTCGCAGGCTCATTTCGATTCAGT:1 - chr2R 20878104 3' + invader3 75 2 65.07 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATAACTTTTCAGAC:1 - chr2L 13884560 3' - pogo 44 1 54.11 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACCTTATCTTATCACAGTCTTTGCATTTATCGCATTTAATAGCCATTAGTG:1 - chr2R 19168040 3' - opus 7026 2 68.49 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATCGTCAAGT:1 - chr3L 22529709 3' + roo 9039 1 63.01 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATTGGTTCCG:1 - chrX 9709963 3' + pogo 2045 1 58.90 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATT:1 + chrX 983221 3' - 412 62 2 58.90 AAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAAGTACCAAATGAAACTCAAACATATATTCAAACACAGGCGTCCACCCGAGTGACACCAATATTTAGAAGAAGTCAA:1 + chr2R 11737113 3' + Tirant 490 1 73.97 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAATAAAGTCCTCAT:1 - chr2L 20984271 3' - blood 7044 2 60.27 AGTCTGCTTGTGGGTATATCTGCTCTATAAAGGACGTATAGCGTAGGTCCAAGTTCGCTGCCTTGGAGAACTCCAGCGTTTATAGCGTGGTCATTGGACATATCATCACTTGGAATATATCAGAGCTCAGCTATTGCAGATCAGTC:1 - chr3L 12677143 3' - Fw3 2909 1 72.60 CTGCCTACTCTAAAATTAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCA:1 - chr2R 21897900 3' + 412 7461 2 72.60 TTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGAAACATGCATGTATGTATGTATGTAGTTCGTACTCCCTGGGCATTTTCAT:1 + chrX 18627168 3' - G2 3003 1 65.75 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAACTCTATTACAGATAGAGTTATTTGATCATTAGTCTCATTACTCGTTT:1 + chr3R 20909001 3' + I-element 5273 1 67.81 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCAC:1 + chr2R 20500115 3' - 412 86 2 77.40 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTCTGTGCGTAAATA:1 + chr3L 5446201 3' - roo 8723 2 58.90 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTG:1 - chr3R 5765309 3' + opus 458 2 58.22 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGGGTCAGCTGTTTATGAGTTATCGAG:2 + chr3L 16887461 3' + roo 400 1 79.45 AGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCGTATTAGGCATTCCCATGGGCGGAGGGGGGAAGGGGGAAGTTCGGAAAGGGCAGGGGTCGAGAGTTGAGCGAGGTTACGCCCCTCTGTTAAGGTGGAATAGTCTCTCCTATATGCAG:1 - chrX 3121909 3' + diver 221 1 77.40 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACCTGATGGCTTTTTTACACT:1 + chr3L 15322101 3' - Transpac 23 2 67.81 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAATCATAT:1 + chrX 2873452 3' + roo 343 2 61.64 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCATCACCCTTCTACTACAT:1 + chr2R 22255459 3' - roo 25 2 66.44 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGTTTCAGT:1 - chr2L 4416050 3' - jockey 75 1 61.64 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATG:1 - chr3R 26315895 3' + roo 9007 2 60.96 GTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTCACTAAGCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAA:1 + chr3R 11163089 3' - mdg3 5132 1 71.92 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGT:1 - chr3R 10778664 3' - mdg3 5331 2 70.55 ATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGATAATCCGTATAAGAGCTAGAAAAGATTAGATTAAGATGGTATTAAGCATTTAGATTCTCTATTTGAAAAGAGCCGTCCGCTTCTGCATGCAATTTCGTCAGGATATCTTCAA:1 - chrX 21312908 3' + INE-1 80 1 71.03 AATAAACTTACGCTAATAAATTTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACGCCATGCACTTGCCATGGATACACCGCGAACTGACCTGACTGAGTGACTGACTACATGGGACAACTAGCTGGCTATCTGGCTATCTGGCAAT:1 - chr3R 24175642 3' + Burdock 6363 2 66.44 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTC:1 - chr3R 10973206 3' - jockey 75 1 61.64 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTG:1 + chrX 17258305 3' - 297 6609 2 55.45 CTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCGCACTCGACAACAGAGTCGAACAACTCGGCGGCATTTGTTGCTGTTGTCTCCATC:1 + chr3L 19328115 3' - micropia 5175 1 62.33 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGA:1 - chrX 10978972 3' - roo 53 2 56.85 GTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGGGTGTTGTAAGTGAGTGTCTCTGCGTGTGTGTTTGCGGAGAAGATTGATGAACCCGTATCTTTTCTATGGATTCGTTTTCTCTTTAAGCTTCTTTTGGCGGG:1 + chr3R 19556900 3' - accord 7033 2 59.20 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGA:1 - chr3R 25384157 3' - mdg3 37 2 60.27 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGT:1 - chr2L 18581280 3' - roo 8735 2 66.44 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTT:1 - chr3R 31956403 3' + pogo 2046 1 65.60 CCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTATGAGCGAAAACAATATTTTTATTTAGAAGATTGGAAAGCTAAGATAAAAGGTTGGATTTTAAGTTTTTGTGA:1 - chr3R 6276555 3' - 1360 59 1 53.42 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGCTCGGCCGTCT:1 - chrX 3444078 3' + pogo 2041 1 59.59 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTG:1 + chrX 14756761 3' - pogo 64 1 67.12 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTG:1 + chr3L 15035215 3' - pogo 65 1 66.44 TATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACT:1 - chr3L 13922307 3' + Tirant 8421 2 80.14 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCAT:1 + chr3R 19545408 3' + jockey 4927 1 61.64 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGAGATTAAATTTTCAAAACACAAACGAGCACAG:1 - chr3L 10856747 3' + P-element 2798 1 24.66 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCG:1 + chr3R 22289472 3' - 412 7116 2 60.96 AAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTT:1 + chr2R 20362282 3' - diver 80 2 73.97 AGAAACAAATTAAAACATATTACCAATAGGTTAATTATCGATTTTTCATTAAATCTACTTAAAATTGAAGTGAGATTTGTGCGAGGGAAATCTTAATTTCTTCATAGTTGGCTGCGTTTCGTTGGCCACAAAAGCCGCGAGAACTT:1 - chr2L 12275084 3' + HeT-A 5766 1 75.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTCCTGAAATGCGTGAATGTCGGAGTGTGGGCGGGCCTTATAGGTATGTCGTGGACTGTATGTAATTCTGCGTGAGGACGCATAACTTTCGG:1 - chr3L 13315538 3' + roo 9034 1 62.33 ATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTTCCTTAGTTAAATTTTTTATTCGCGCTGCACAATTTTTTCGCGCTTGTCCTTCTCGTTAT:1 - chr2L 1524645 3' - Doc 140 1 58.90 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTG:2 + chr2L 16685379 3' + P-element 2804 1 28.77 CAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7211 2 97.18 CAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTTT:1 + chr2R 9327043 3' + mdg3 5422 2 69.66 GCGACAGAGTTCATTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAGTCAAAATGCACTCGGTGTTTTTCCCGTGTATGGTGAGGGGCACGACTCCGCTGCACAGATCGCTT:1 + chr3L 25344875 3' - baggins 5187 1 51.22 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTTGATTTCTCAGCGC:1 - chrX 13548283 3' - jockey 4795 1 62.33 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCTTTACTGAAAT:2 + chr2R 9072955 3' - Burdock 58 2 58.90 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCAACTATAGTATTTGTCGAACCAAAGGGGAAAATGAGCTTGGTCGTGGGAAAGAAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGAAAGGCGGAGGGGCGGGGCCACCTGCC:1 + chr2L 6583456 3' - hobo 19 1 64.38 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGCTTATGCAAAG:2 + chr2R 21898007 3' - 412 7083 2 62.33 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCT:1 + chr3L 131799 3' - P-element 79 1 31.25 CAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCA:1 + chr3R 30731475 3' - gypsy6 47 2 55.56 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAA:1 + chr3R 8402654 3' + mdg1 373 2 52.05 GCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAG:1 + chrX 21639703 3' - Tirant 8186 2 73.29 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTT:1 - chr3L 3979575 3' + opus 7438 2 63.01 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTAGAGAAATATGTGTGCAGGGGTCTGTCCAGTGGTGTCGTGTTTGGTTTTATGATTGTATATGTTAAGTACTGTTTCCATTTTGCTCAATTTTG:1 - chr3L 19346476 3' - hopper 26 1 66.44 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAATGATTAATTTTTGCTTCTAAGATAACCATATAGTATCATTTAATTTAGC:1 - chr2R 13849641 3' + roo 8999 2 68.49 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGACTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAGAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCAT:1 - chr3R 25384191 3' - mdg3 5323 2 63.70 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAATATCGATTCGCAATGGAATCAGACATTAAAACTGACACACAGTATATAATATGTTGTACAAATGTACATATGTATATATATATGGCCGGTAGGTATTAACTGAACTATGACGC:1 + chr3L 16157333 3' + Juan 4203 1 74.66 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTGGC:1 + chr3L 17667640 3' - F-element 60 1 51.37 CTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAAT:1 + chr3L 22635743 3' + hopper2 1515 1 78.08 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTT:1 + chr3R 24693695 3' - hobo 26 1 67.81 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATTGAATATAAAGCGTTTACGGCCTGTTAGGTTTCCATTTAAATTTTGCATTTAAATTCAACCGTTAC:1 + chr3R 12559795 3' - mdg3 16 2 75.34 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAATAATTAAAATCCATTTTTATATCGATTTCATTTATGATCACGTTGATGAATTA:1 - chrX 14173213 3' - 412 69 2 64.38 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGCCTTTCTCGGTACGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTGCCACAGCATA:1 + chr2L 16685420 3' + P-element 2876 1 66.96 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAG:1 + chr3R 12795144 3' - mdg1 39 2 58.90 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGTTGGCTAAGTTACAAAAATTTGGAGCGGGGCATATATGTCTATGTGACCCAGAGTATTTGCTTTAAGTTTGGAATGCAATCAAAGATTTAA:1 + chr2L 13576098 3' - 297 21 2 71.03 GGATGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTCATCGCAGGGTAGGCGCTGTACCTCTGTGACCTTCGTGGTTACATC:1 + chr2L 21746664 3' + R1A1-element 5008 1 57.52 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCTACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAG:1 - chr2R 22798646 3' - hobo 75 1 75.94 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAAGTTCAGGGAGTGCAAGAAGTGG:1 + chr3L 20290806 3' + roo 9052 2 69.34 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTACTGTCAGC:1 - chr3L 5514162 3' - Doc 40 1 57.35 GGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGCTATTACTTATTACTTATGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAACTGCGTAGGAATGGCAAACGTCTTCAAGGAGAGAGTCAGAGATT:1 - chr2L 10784781 3' - Stalker2 204 2 39.73 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCTTCATTTGAAAAATAGTTTCCTATTCCTTTTTATATTAAAATACATTTTATAAGATTTTCAAATTATGAGATTTGTTTTTTTTTCGTGCACAAAAGGCAGCTAG:1 - chr2L 9669463 3' + roo 9055 2 68.49 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAAC:1 + chrX 9816454 3' - jockey 91 1 72.60 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGGGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATCTATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTGTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATCTTT:1 + chr3R 15649859 3' - blood 68 2 60.69 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTAATATTTTC:1 + chrX 13651595 3' - 297 6613 2 62.33 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCTAACCGTATCCATCTGTCTGCCCATCTGTACGTC:1 - chr3R 3322484 3' - 1360 88 1 76.71 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGAAACTACTTTTAAAATTAATACAAAAAATTTTTTTAAGATGATAAAATTTCTTTATCGGATTTTATTTCTTTTTCACATTTTGTACCT:1 - chr2L 21192458 3' + roo 9042 1 65.07 ATCCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGAGTTGTCCTTTGACATGCATGTCTCGGTCTTTAGCTGTTCAGCCTGTCTGCTGCTAGCT:1 - chr2L 12933025 3' + Rt1a 4895 1 58.74 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGCCTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATA:1 - chr3R 6103566 3' + Tirant 8476 2 58.87 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCTC:1 - chr2R 982292 3' - HMS-Beagle 36 2 60.96 GTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACCTGACATTTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAA:1 - chrX 17469214 3' + Bica 173 1 65.65 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCT:1 + chr3R 10468111 3' - opus 7055 4 54.11 GCAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTACA:1 + chr2R 5924438 3' + jockey 4712 1 39.73 AGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGAATGACCAATAGAATAATTCTAGTGTCTTTCATACGACTTTTGCAATAAACAGTTTGGAAATGCAAGGCTGAAGCCGTTAAGTGTATTAAAATGTTGTTTTAAT:1 + chr3R 13580309 3' + 1360 465 1 66.44 GAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTA:1 + chr3R 5245640 3' + 1360 3320 1 76.19 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTATACAAAATCTACGGAAAACC:1 + chr2L 14222390 3' + Transpac 291 2 73.29 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTAC:1 + chr3R 26315977 3' - roo 76 2 70.55 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTGAAGTT:1 - chr3L 19279099 3' + opus 452 2 54.11 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTCTCAGAAAGC:1 + chr3L 9242115 3' + roo 395 1 59.59 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATCGTTATGGAGGCAATGCCCGCTTGATTTAAATGGTAAATTAATGGGTTACTTGTGATATATTATTTCCATAAA:1 - chrX 16982206 3' + roo 361 2 50.68 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTC:1 - chrX 5222843 3' + 412 446 2 52.74 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAGTCG:1 + chr3L 9649163 3' - roo 8730 2 73.08 TTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGACAGAATCCTCAATTCGAAACGACACG:1 - chr3R 6782668 3' - jockey 4698 1 68.49 AGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCAT:1 + chr2R 11656089 3' - HMS-Beagle 84 2 76.71 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCGTCTAGAGGCCG:1 - chr2R 15613734 3' - P-element 29 1 62.41 ATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTGAAATTTACAATGCATCACTGGCAAAGCAACTGGGCAAGAAGTACCTCGTGTTCGTGCCTATGGTCCAGCGCACTCTCAACAAACATCGCATTGTGGATC:1 + chr2L 13008917 3' - 1360 238 1 58.22 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGCACACAACTGACTCCTGCGGACGTGAAAAGAGCGCCAAGAATTTTCCATAAAAAGGCATTCTCAATTTGGTTTTGGAATTCTCATACTTCATAGTACGTGACTGGGA:1 - chr2R 18316763 3' - FB 14 1 76.71 AATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCACATTTATGCAGTAATCAGTCGAGTGCACAGTCCTCCATATTATGGAGCGACAT:1 - chr3R 20147816 3' - 1360 255 1 73.97 TAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAATAGTAAAATCAATCTCTTCTACCAATTAAAAGCTTGCAAATTATCAACTTAAAGTAAATCAAATGTTTCGAATATCAGGCTCCTTGCTACGCGTAATTATA:1 + chr2R 10839416 3' - G2 3024 1 71.92 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGA:1 + chr3R 24175758 3' - Burdock 6216 2 73.97 GGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCG:1 + chrX 10623910 3' + X-element 4658 1 58.33 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAGATACACAATTATTGCAATGCTCTTATCCATTCCAATGCATACTTTCATATCTTGTAAAACACACATTCACACAAACACTT:1 + chr3L 10506864 3' + S-element 1678 2 48.63 CCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCGACTCGTGTACTGTCCG:1 + chrX 21213446 3' - Doc 9 1 76.71 TGAGTAACGGGTATCTGCTAATCGGGAAACACGACATTTTCATTCTATCATGTTTTATTTTACTATTTTCTTTCCTTTTCTGTGTAATCATTTACTTTCACCTAAAATTGTTTGCCTTAGCCACTTCTCAATAGATTTTCAGTTTT:1 + chr2R 17254426 3' + INE-1 548 1 76.03 AGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAAAAACAGTTGGTTTCCATCTAATAATTGTTCTACTCATATTCCA:1 + chr3R 28033739 3' - diver 5899 2 78.08 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCAAACCGGAAACGGACAACTGATTGCGGGCTGCCCAAAATTCCACACACGTATTTATTACCAT:1 + chr3R 29722265 3' - 412 7090 2 52.42 GGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTTGAAGAGACTTCATTTCAGACTGCTCGCATGATTACGGCGAATTAAGTTG:1 + chr2L 16430080 3' - F-element 379 1 65.75 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGGTTGGTGGAAAAAAACCTACAGATAG:1 - chr3L 18296869 3' + Juan 4194 1 68.49 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAG:1 - chr3L 21097108 3' - mdg3 5280 2 59.17 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAAT:1 + chr3L 17667614 3' - F-element 86 1 69.18 GCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTATTGGGTGGGGAAAAAACCTTGCCGACCGCTAGGGGCCACACAAAGGCTGGCTGGAGAAGAAAA:1 + chrX 10728946 3' - springer 7170 2 63.01 GATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGTGATTTTCTATCTTTACAGGAT:1 - chr3R 18524230 3' + opus 7457 2 55.48 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATACCATAACAATATTTTCATAG:1 - chr3R 19545331 3' - jockey 74 1 60.27 ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGC:1 + chr2R 20382581 3' - Bari1 69 1 65.07 AACACTTAAGGGTTTTTTTAATGTCCTTATATGATTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTATTTTCTTTTGGAAGCAGTACTGTCCTCTACCCACTCAAACAGTAACAAAAACAACACCGGAGCAACTTGTAGAAATG:1 + chr3L 10825066 3' - HB 432 1 69.86 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTACTTATGTAGGCTAC:1 + chr2L 19903511 3' - Transpac 24 2 64.38 ATATTTGTTTTTTTGTTTTACTTTTCTCCTTTCGTTTTGCCTTCAAATCGTATGGTACTCCACGTTGGGCGCCATTTGTTTTTAGCCCCTCAACATATTTACGAGCATGGCGACCAGGAAAGGGCCCACTAGGAAGGAGACCACAA:1 - chr2L 16661714 3' - Doc3-element 173 1 48.63 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATAAGCTTGAGCACGTACATGGACC:1 + chr3R 3527199 3' + Tabor 7289 2 60.27 TTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTAATTGTAAATGGAATGTAAATGAAACTTTGGAGAAGACGACAGTAATTACAGTGGACGTCAGTACGCATCGGACAAAGCGCACCAGTTGAGTGCCAAGCCG:1 - chr3L 21484802 3' + Cr1a 205 1 71.92 GGCTGCAGGGTGATGCGGAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCTCCGCAGCGATAATGAGAACCTTCTTAAAGAAACGGAACACAATGGCTATCCGGTGGTGGTGTCGCGGGAGAATCAATATTTAGTGGGCTTTGTATTGCGCAGGG:1 + chr3L 16094731 3' + Rt1c 5207 1 63.01 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCTTTTACCCACCAGTTCACCAGCTAACCACCCAAAACTACCCACTGCATTCCGGCCTTGCCAACAACT:1 + chrX 3524324 3' - roo 8717 2 54.79 AAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTAATAATATGTACATAGATTGGGATGCATGTAGTGTGTAGAGTGGCACTACTTCCAGCCGGTTAACTATTTAACTACCGATAGATA:1 + chr3L 2080129 3' - 1360 407 1 55.48 TTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCATCTA:1 - chr3L 14854639 3' - rover 25 2 69.18 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTT:1 + chr2L 14262896 3' - blood 7098 2 76.71 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACATTACACAAGAAATGCATTTCTTTCAGTGCATGCCTAATGCCAAGTTTTAGGCCAGCATTTTGCTGCCTTTGTTCCACCCCATTCTCTCA:1 + chr2L 4104129 3' - roo 30 2 65.75 ATGGTGGCTCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 350 1 70.55 GAGTTTCTCGACTATCAGATGCCATTTACTCAGCAGTGGTAGTGCAAAGCAAAAATGTTTATATAACTTTGTAAAAGCAGAAACACACTTAATATAATTACAATATATACTACTAACTTTTTGATTTTTTAATGCATTTTAAGGGG:1 + chr3L 18702827 3' - INE-1 558 1 62.33 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTGAACTGATATATACATGCCATGGAAAACGCTTAGA:1 + chr3R 5765398 3' - opus 177 4 76.52 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGTTAAGTT:1 - chr2L 7991244 3' - 297 6612 2 65.07 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATAGATTCGGACAAATTAACTTTCCTTGGCGT:1 - chr2L 13877618 3' + Transpac 5221 2 76.03 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 2537522 3' - jockey 23 1 75.34 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCTGGCAGCG:1 + chr3L 6774256 3' - pogo 45 1 51.77 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATACAAGGATATTGACTTTGT:1 - chr2R 20500004 3' + 412 467 2 65.75 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCTGGCAGCGCAAATA:1 + chr3L 6774262 3' - pogo 44 1 54.11 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTT:1 - chr2L 16685345 3' - P-element 103 1 15.75 CATTAAGTGTACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATCTTATGCTGAAGAAGATGAACTCGGTGCGGTTCAGGCGGTCGTTGATCAGACAGTGGCACCCCACACGATGCACCACGAAGCACTGCAGCGGCACTTTG:1 - chr2L 5747200 3' + rooA 353 2 56.85 GTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGT:1 - chr3R 443024 3' - gypsy2 6510 2 69.18 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATTGCCATTAAGTACTGATAAATGCCACTATTTGTTGA:1 - chr2R 18721897 3' + 412 462 2 60.27 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACAGAGCTAATTAAGTT:1 + chr3L 4869265 3' - roo 8713 2 53.42 AGCGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGGTCCGGGGTCATGGGGGGTTAAAAGG:1 + chr3L 17447598 3' - Tirant 8118 2 78.87 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCT:1 + chr3R 5245649 3' + 1360 3341 1 65.79 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCAC:1 + chr3R 23507675 3' - 412 56 2 57.86 GAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACTCAGACACACACAC:1 + chr2L 768915 3' + accord 183 2 44.44 CTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCACAAAATAAATAAAATTATCAAATAAATTGTTCAAAAGAATACACCGCAAGAATTAATATGATGAAATAATATACTGCAGTAACATTACATGAGAGATTTTTTTTTTCAAATA:1 - chr3L 24912170 3' + diver2 4797 2 76.03 GTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTTGGGCCGAATATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATACTTCCCAAGTCAAAGTCTCGTTGAGCTTTAGCTTAAAGTTGAATTTTTAGCA:1 + chr3R 16771366 3' + 1360 3162 1 62.33 AAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAA:1 - chrX 17614351 3' + roo 9036 1 60.96 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCT:1 - chr3R 12787113 3' - 297 51 2 56.55 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGT:1 + chr2R 18882703 3' + roo 9046 1 67.12 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGTGCTCTATTTTATAA:1 - chr3L 16764813 3' - I-element 72 1 62.33 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTC:1 - chr2L 2690594 3' - hobo 65 1 70.00 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGA:1 - chr2L 8397139 3' + roo 358 2 51.72 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGCCACAACC:1 + chr3R 14088680 3' + 1360 3354 1 61.64 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCC:1 - chr3R 25876849 3' - mdg3 5277 2 63.93 TCGTGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCTCGTGTTAACTTGTACATAAATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCTCACCGTGTCGACCTAAGACAATTTGGTAACTGGGCAGTCGGCTCTTACTCCACATCCATTGG:1 + chr2R 3822001 3' - Gypsy6A_LTR 24 1 58.90 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCGAAGAGCTTAACTTTCACCCCAAAGACGCAAAACACACACGATGTTGCCTCGGGGGCACTTTAATTAAATAATTTGTACTCAATTAACTTAT:1 - chr3R 19450025 3' + roo 9045 1 56.85 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGCATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCAC:1 - chrX 21639612 3' + Tirant 389 2 67.00 GTTCGGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTTATGTGTGTATAAAGGTATATTAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTACAAAAGGGAAAATGTATAAGCAACTTACAAGTAAATGCGAAAGAATTGACGTGCGGTCAGCTTCTTG:1 - chr3R 5826196 3' - G5 4791 1 65.75 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGT:1 - chr3R 9345571 3' - pogo 65 1 65.75 AGAGTGTGGATCAGGACCAGGTAGTGGCCACGATCGGTGACTATAGGTATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCATATGCAAACGTCGTGCCACCAACAGACAGCA:1 - chr3L 10561689 3' - Chouto 414 1 76.71 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTGGCCAACTTCGAACTTTTGCAGCGATCCGCGGGGCCTAATCATCAGTGACCACC:1 + chr2L 535560 3' - roo 10 2 78.77 ATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCAATTAAATTAAAGTATTTATCGCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCAAGTGATATCCCAAGAAAACAAGGCACAACCGTTTGAAAAGAAAAAGTTTGTCATAAATT:1 + chr2L 17152087 3' - Stalker 7093 4 67.81 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCTCCCTTCG:1 - chr3R 20292384 3' + pogo 2077 1 71.23 ATCAGAAACTTTGCTATTAAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATTGGATTGCATACAACTAAGTTACAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATGTCCCAGTTGC:1 + chr3L 24088964 3' + Tc3 1604 1 86.30 AATTCTTTTTTCTCTGAACTTCGGGAGAGGCTTGGCTTGGTCTCTTTTTTTGCTTTGATTTAACTCTCTGCCATTTCAAAACTGTCTAATTAAAAACATTGCCACAGTGCGTAACAGAAATCA:1 + chr3L 15227212 3' - G4 2 1 63.41 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGCAGTGACGTGCCGATATATATTTGT:1 + chr3R 14165145 3' - Tabor 6881 2 56.85 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTTAAAAATGTACAAGTAACTTTTCATGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAA:1 + chr3L 5263461 3' + pogo 2036 1 64.38 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCTTTTT:1 - chr2R 22136643 3' + 412 7512 2 60.96 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATAAACAAATCTTCATCTAAACTTGAGCCTAAAATGCAGTTT:1 - chr2R 16409979 3' + opus 468 2 65.07 TGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATATTATGAAGTTATTTTAAAAGTAGTTAGATTATTAGAAAAGTTGTGTTATGATTGTTTTTTAAGTACAT:1 - chr2R 3202644 3' - gtwin 17 2 73.97 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATTATAAATATCTTCAAATTACTTGAATAGCAACAGCAATTTCTATATAACCTCCACAGATTTATAAGTGAAACGCACAGAATTTAAGCCCTTTAATTTTTTACGAACTTGCTTG:1 - chr3R 18847231 3' - Stalker2 11 2 64.38 GCTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAACTACACTGGTTTTTGTCTGTGTCGCTTCTTGGCCCCAAAAA:1 + chrX 10346042 3' + F-element 4355 1 72.60 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAGG:1 + chr3R 12795145 3' - mdg1 7046 2 75.00 ACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCAGTTCTGATTGGGATCTCATTGGGGGGCTGGTGGAGCAGTGGATCAGTTCGCGGGTGGGGTCGTTGGGATCCCTGTGTGTGTGCCCTTTGATTAACTTAGC:1 + chr2R 6590063 3' + mdg1 440 1 75.34 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCACCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTA:1 + chr3R 19545431 3' + jockey 4950 1 53.42 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAACGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTACAATTC:1 + chr3R 21237792 3' - Doc 89 1 73.97 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACTTTTATCTTTCACTCGTCCGCTTGGGCACTCTCTTTCTC:1 + chr2R 21056824 3' + Tirant 381 2 73.29 ATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAGTATTAAGACAAAATGTTAATGCTCCATTTTTTCAACAATCACTTTCTAAATATTCAGTTAACCAATATGCGATGACTGTGGTGGTTGGTCTTTAATTGGGTTGTTACATTTAG:1 - chr3R 21010402 3' + G4 3472 1 55.48 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAG:1 - chr3R 25271155 3' - 412 7081 2 63.36 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCG:1 + chr3L 5446177 3' - roo 8747 2 75.34 CTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCCGTCTGCTCATCAGTT:1 + chr3R 2270612 3' + invader4 2874 2 57.53 GAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAG:1 - chr3R 19537485 3' + hopper2 1542 1 60.69 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGCACAAATG:1 + chr2R 18722061 3' - 412 7081 2 66.44 TTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACACGTATATATCGAAAAATTTAAATAAATGATGTGTTCTTTTTCTTCTTTTAGCAACTAGTCCTCTTAGCATATATTGATTTGCCGCAGCGAGTCCAAAAATAAACTGTACG:1 - chrX 7314043 3' + invader2 232 2 77.24 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTAACCTAACCTAACGGC:1 + chr3L 22676363 3' + 412 427 2 64.38 CACGTCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAATTGTTGTTAATATTTTTTTTAGGAGAGAGATCGCCCGCTTGGGATATGGATTGTATAAAAACAAATCACGATTTTCGACTGATGGTTCCTATAGCAGCTACATGATATAG:2 - chrX 22894388 3' - 297 6875 2 62.33 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTA:1 + chrX 13651587 3' - 297 40 2 56.85 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTT:1 + chr3R 26315979 3' - roo 74 2 69.18 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGGCCGCATCGCTTGGCTATTCCTATGCAGGAATTACGAAAG:1 - chrX 19498041 3' + P-element 2860 1 66.44 AGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGATTCGACATCAGCAACGTTGCCGTTGTCGTTG:1 - chr3R 5060875 3' - Quasimodo 457 2 77.21 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAA:1 + chr3R 28033696 3' - diver 54 2 52.74 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATAT:1 - chrX 22858873 3' - mdg3 83 2 73.79 ATTTAAAGCCGTACTTCGCTTGGGAAGAGCCTGGCGTTCTGCCTGAGACTGTGTACATGGCTGTCATACAAAACATTTGCTTTTATGGCTTCAAGATTGAAACTGTTATGTTTGAAAAATTCGATTTTGG:1 + chr2R 19129503 3' - Max-element 376 1 50.77 GTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCATATGAAGGGGGCCAAAGGGGTTAGGGGTAG:1 - chr2L 11049978 3' + Tabor 7250 2 79.45 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTA:1 - chr2R 982301 3' - HMS-Beagle 6841 2 54.79 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACA:1 - chrX 14914328 3' + mdg3 204 2 56.16 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGTTGTGGGTGCCCCCCAAAG:1 - chr3R 18903339 3' + pogo 2092 1 78.08 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAA:2 - chr3L 18468365 3' - jockey 4746 1 69.18 ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAGTTA:1 - chr3R 11096691 3' - copia 4944 2 70.55 AGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTGTGCTACAGCCCCAACGTTATTCCTCATCAATTCTTCATTCGTGGGGCACAGCAACACC:1 + chr2R 19074351 3' - F-element 4220 1 59.31 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAGCTGTTAACGAAACTCCCACGCTGCCGCCTCTGTTGCTGCGCTGCTACTGCGCTGCCGGCATCGCTGTTTTGTTGGACATTTTTGTGCGGCTTCCTTCGATTTTTGT:1 + chr2R 14001168 3' + P-element 2874 1 76.03 CTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAATACCGTTTGCTTTTGCCTTCTAACTAAGCTTTTGTCGTTCGACTTCAACGTCCAT:1 + chr2L 13623836 3' + R1A1-element 343 1 62.33 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACACATTTCCAATTTATACACACCCCTACCTCCCTTTATCAGCCACCAAAATCGTAGACCCCCTTGATCGAATCGAAAAGCGAAAAATAAAA:1 + chr3R 28008361 3' + hobo 2913 1 61.38 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAA:1 + chrX 19231861 3' - mdg3 30 2 62.50 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCCAGCCCTCTGTCCCTATGCACAGAAAG:1 - chr2R 22867386 3' + hobo 2907 1 62.33 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAAT:1 - chr2L 20923045 3' - pogo 64 1 70.90 CCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGACCTAAAACACAACAACAGCTTATGACTGTAATAGTCGAAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAGTGAGTCGTGTGCAAAAGGCAAAATTAGTGTAAA:1 + chr3R 3179356 3' + S-element 1244 1 77.40 GAGTAACGGGTATGTGATAGTTGCGAAGAGTTGATAAGAAGAGAAGAGAAGAGAAAAGAATTATGAACGTTTTTTGCGGACTGCTGCTGCTGGCTGCAATTAATTGTGACTGATTCAAAGCGTTGGTAGCGCGTTGCATTTGATTT:1 - chr3R 23469391 3' + INE-1 549 1 58.90 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAATAGGTAAAGAGAATTACCCACTTCGGTGCTTAGAAGCATAATTTTTTGCTCTATCAAAAGGATTATTAGCAAATTGTTTTCGTAGCTATTAACAATATGA:1 + chr2L 16942179 3' - mdg1 22 2 71.23 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGG:1 + chrX 17469285 3' - blood 7062 2 51.37 GAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTT:1 - chr2R 6984284 3' - HMS-Beagle2 20 2 68.22 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTA:1 + chr3R 25271269 3' + 412 7481 2 64.14 GGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCATCATTATAATGTGACAAATGCGTGTGGCTTTGATGATGACCAAAACATGTGTTTAAAAGCGTGTTAAATATTTATATATCTTAGTCTGACATCTGACGTCA:1 + chr2L 17731113 3' + pogo 1741 1 74.66 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTC:1 + chr3R 10468106 3' - opus 170 4 57.53 AACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACTTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGCAAACCCACTTTGAGTCAGGAATTGTTGACTAAAGCCAA:1 - chr2L 9010444 3' - 1360 84 1 73.97 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTATGACCATAAGATCCCATTTATTAGATGCAACAAGCTTTGGAAAATATTTCTAGCC:1 - chrX 7293213 3' + 1360 3328 1 63.70 AAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAGAGTTAATTGGGTTAAACCCGTGCGGTTAATTGAATT:1 + chr2L 8772836 3' - Tabor 6890 2 50.68 AGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACTGTCCTGGGAAAAGTC:1 - chr3L 1387082 3' - mdg3 5269 2 72.60 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGGTGTACCACCACTTTTTATGGCCACACGTGGCTGTCTGTTTTGTCGTCAACCTGTCCAACAATG:1 + chr2L 14796984 3' - I-element 22 1 70.55 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGAAGTGGGAGCGTCTAATTATAATCAAGTCGCGTCAAGTCCTTCAACGTTCAT:1 - chr3R 9993338 3' + hobo 2897 1 57.53 ATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCC:1 - chr2L 22696406 3' - X-element 97 1 75.34 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTGCAAACATTTATGAAA:1 - chr3L 2036961 3' - Doc 23 1 71.92 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACC:1 + chr2R 1277127 3' - Tirant 88 2 77.40 AATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGACTTTTTTTTTGTAAGCTCGATTGCGCAATTGTATATCGTAATCGGGTTGTCTTCGCAACCCCAAACGCCCCATGGCG:1 + chrX 2005586 3' + G2 140 1 59.29 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACC:1 - chr3L 15035105 3' + pogo 2056 1 57.14 AGCAATTTAAATTATTATTAAATCTCATTCCTCACACTCTCACTTGCTGAGTAACGTGTATCTGATAGTCGAGGATTAAATTATTCGAGTTTGTTTTTATTTTAAGAAGCGCCCGTTATATATTATTTACGAGCTTCGGCGGCGAA:1 - chr3R 7467701 3' + invader2 433 1 52.05 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATATTTCAGCCTGAAGAAACTGCACAAGGTGCAATTGCTGGTGGATGCGTGCAATGTCTTCTATCAGCCCAATCTGGA:1 + chr3R 28725047 3' - pogo 37 1 54.79 GGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTGGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTCGCTAAATCAACAGTTGGCAAGCAAACCGCAACGCCGCCAAAAGCGAAAG:1 - chr3L 21327037 3' - I-element 4993 1 74.48 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACCAAATCGAGTAAATGAATGGGCAATGTTAGATGT:1 + chr2L 13556997 3' - FB 88 1 77.40 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCG:1 - chr2R 15613745 3' - P-element 16 1 66.06 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGGGGTTTT:1 - chr2L 23189411 3' - 1360 58 1 92.31 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACCGATTATATTGAGGGGGAGTTTCAGTCAACGAAAAGAAAATAGTGAGAGGAGAGGGCTTATTGAAGAGAGCCTCTCATTTTAAAATTTCTC:1 + chr2L 8542848 3' + P-element 2857 1 61.64 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGTTGATGGCAAGTTA:1 + chr2R 7223787 3' + blood 7360 2 65.07 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGA:1 + chr2R 19543789 3' - jockey 4785 1 65.75 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATAT:1 + chr3R 24228966 3' + opus 7435 2 68.49 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGAAATGTTGCTGATTTCATGGCGATTGCATAACTCGATTCTCTGCCCCCTTGTTCGTTC:1 + chr3R 11526872 3' - pogo 59 1 59.59 AATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAAAATGTCTTGCATATTATCTTGCTGACAGGACCGACACCAAAGTTTGATTACTATCTCTCTGTGTATAGGTGCATGTGTGTCCGCCGAGATCA:1 + chrX 22818311 3' + jockey 4815 1 66.44 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCACTCGATATATCGCTCGAGCATATCGGCGCTTTATCGATTGCCGGCCAGGGATGTTGC:1 + chr3R 9563710 3' + P-element 2843 1 56.85 TACCACTACCAACGCACTCGTACGTGCGTGTTATCGGTATCAACAACTACATTCGGCTCAAGGGCAGGCTAAAAGGACCATCATGTGGGTAAAGTGTTCAAACTTGTACGTGATTTTATTTAATAATTATTCCTTGTCATCATGGA:1 - chr2L 15152271 3' + G-element 160 1 58.90 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGACGCAACATGTGAGGCGGGCATGGTATTTCTGGGGG:1 - chrX 3524194 3' + roo 397 1 70.83 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGA:1 + chr3L 13597832 3' + blood 7314 2 70.55 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAAGAGAGCCAGATAACGCGTGTGGTTTTCCGAGAGAGAAAATTGGTG:1 + chr3L 13227746 3' - hobo 12 1 75.56 TTAAAATTCAACGGTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAAAAGGATGCAGAGGGTGTTGTAATTTTATGGCTTTGTGAGCAAAAACTGACTACCTATCTACCTCTACCTATGTCACTCCC:1 - chr2L 16107244 3' - Rt1b 110 1 67.81 GATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATGGAAAACTAAATATATATCTGGGTTATATAACGAATATGG:1 + chr3R 23390929 3' - invader4 220 2 71.23 AAGTACGACAATAAGGAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATAGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCTGGCAAGTTGATGAT:1 + chr3L 15099681 3' - G4 3810 1 57.45 GGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTAGATCAGGAGAAAACCTATAATAGTATATCAGTCCCTTTAGGTGATTAAACAATTTGCAGATGGATAG:1 - chr3L 16771061 3' - I-element 4888 1 54.11 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTATCGAGGGAGTGAATG:1 - chr3R 10467978 3' + opus 7462 2 57.53 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGATTTATATATACTCTTAGTTGGGCAGTTGCG:1 + chr3R 18903510 3' - pogo 26 1 62.70 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAACCCGCCATGCATGTGCATGTGCTTTGCATTGA:1 - chrX 15814464 3' - P-element 17 1 73.97 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGC:1 - chr2R 18807789 3' - jockey 92 1 71.23 ATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGGTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGACATAAAACACTTGGGGTATACTACTACTACTACGGTCCCCAGCGGAAAA:1 + chr3R 10028318 3' - 1360 383 1 65.75 CAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAA:1 - chr3L 3540097 3' + mdg3 207 2 58.90 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGA:1 - chrX 8082370 3' - roo 8726 2 60.96 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTGCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAACGTGTGAGCAACTCAAAGA:1 - chr2L 7667381 3' + copia 249 1 54.79 CTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAA:1 - chr3R 6103569 3' + Tirant 8451 2 54.79 ATATTAATATTAATATTCAAATATTAAAAAGTTCTGCATAATTTTAATTTTTTAATTTTAAACATCCAATTTATGAATTTTCGTATAAATTTCCACCACTGTGCAGTAGGTGTTCGTGTGCTTTTATAAATATTTTTTATGTCAGG:1 - chr2L 7770549 3' + Tc3 303 1 38.36 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAAC:2 - chrX 11228541 3' + roo 359 2 52.74 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGC:1 + chr3R 4884471 3' - pogo 71 1 65.07 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCGTAACAAACTCAATATTTTATTATTCTCTTCGTTATTATGTACCTATTGAAA:2 - chr2R 15392713 3' + blood 308 2 67.81 GCTTTGCAGTCCATAGAGCCATTAAGTATATCAGCAAAGACATCACATCCATCTCAAATTTTCGCGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTACGACCTTCTTTTCAGTTGCCGACGTCGGGCTAAAC:1 - chr3L 10795902 3' + Ivk 385 1 72.00 TATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAATCTGGGATGTTGC:1 + chr2R 9033909 3' - F-element 4575 1 77.08 TAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCAC:1 - chr2L 1449603 3' - opus 76 4 71.23 GGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCCTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAATAAAAGCTCTTTGAGCATGTCGTGGGCTAGCAGCCATT:1 - chr2L 11008529 3' - Cr1a 4427 1 63.46 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAATATGAGTGTGGCTACTTAAGTTAGTGTGTGCATGTGTGTGTGTTTGTGCAAG:1 - chr3R 26311354 3' - jockey 75 1 65.07 CACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGTTGGTTGGGTACATTCTTACCGGAGTAGCGCCTCGCAGGCGGGAGT:1 - chr3L 21206601 3' - accord2 7477 2 63.49 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATTCACGAAAACAGAAGGGCACAGACCGAATTGCCATCGGAGGTACAGCGATCTTCAAGTACAATAGAAAATTTCAGGAAACAACC:1 - chrX 8895173 3' + roo 9039 1 57.53 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAG:1 + chrX 19231826 3' - mdg3 5327 2 68.49 GTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGT:1 + chr3R 25876950 3' + mdg3 5424 2 65.75 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGC:1 - chr3L 9426692 3' + P-element 2811 1 29.79 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAG:2 - chr3L 14581370 3' + pogo 2047 1 56.85 TTAGCTGCAGTTTTAAGATACCTGCCCCGAGGCATTGTGCGAACTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATGTATAGAAGCTA:1 - chr2R 16712981 3' + pogo 2049 1 58.77 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAG:1 + chr2L 535495 3' - roo 73 2 70.83 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGA:1 + chr2L 17069630 3' + 412 7470 2 71.23 CTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCTTCCATACTCCACACACATCACACCAGAAAATAGCCAATTGG:1 + chr3R 18847419 3' + Stalker2 7627 2 65.75 CTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAATGTTTTATGAAATAATGTTTTCTATTGAACTATGATGTCCTGTTTGAAGTTTATATTCTCTTCTCCTATCTTATCTTAAGCTTATCTTAAAGATACAACTTTTCAACGGATACAG:1 - chr3R 17776857 3' + jockey 4784 1 78.77 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAG:2 + chr3R 25521879 3' - blood 76 2 68.49 ATGTTGGCACACATCATTTCTCACTCCACAATAGACGGTTAGATTTTATTTATATTTATATTATTCATACCTTGACCTTTATGTTCCATTTTATTTGTAATCCTGCTCCTGCTGCTCCTACGACCCGTCGCGTTGTGGTCAACGAT:1 - chr2R 15768845 3' - transib3 414 1 68.49 CAATTCTAGATAAGTCACCCAATGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCACGTTCCCATTCAAGAATGCAACATTTTCTTTGGCAGTCTGGTTTTTGCCATCTCCTGTTCCC:1 - chr2L 8565732 3' + Idefix 6976 2 64.83 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAATAAACCATATTGCTATAGTTAAGCTTACCCTTTTATTACAACAATCAAAATTATGTTTAGTATATGCAAGAAAACAAACGAAAATGTATTTTTAT:1 - chr2R 20462743 3' + copia 230 1 66.44 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATT:1 - chr3R 10079285 3' - P-element 53 1 49.32 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTG:1 + chrX 21213419 3' - Doc 36 1 58.22 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAAG:1 - chr2L 9167419 3' + pogo 2048 1 58.90 GGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACATA:1 + chr3R 11520023 3' - Rt1a 56 1 52.05 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGG:1 - chrX 21086102 3' - jockey 4739 1 61.64 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTGTACATTACACGAATCATACACTTGTCCTTTAAAAGCTATAAAGTGGTTTTAGTACTCATACGCTCAATGTCGTAGTAATGGAAAGC:1 + chr2R 8862165 3' + pogo 2064 1 57.53 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCT:2 - chrX 7467935 3' + hopper2 1543 1 60.27 CGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAGTCCACAGTCCACAGTCCATCCAATTCCTCTGGCTGGCCTCCTTTTTCCGAGTCCATTTTGCGAGTTTTTAGCCAAGATGAGTGCAGACAGTCGAACTGAAT:1 + chr3R 6049064 3' + Quasimodo 6980 2 72.60 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCAACAACTAAGACGTTTGGCAGAGTGTGAACAAAAGATTGTGGATGATCAAGTTCAGGAATGGTTGCAAGATTGTAAAGCCGAG:1 + chr3R 1327422 3' - Max-element 39 2 58.62 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGT:1 - chr3R 10973191 3' - jockey 59 1 51.03 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGTCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGC:1 - chr3L 4869160 3' + roo 356 2 58.91 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCATAAAACGAGATAGATAAAATGCG:1 - chrX 983080 3' + 412 473 2 71.23 TGTGCTATTAAGAGAAAATTTCCATCCTGCAGATGACCATTTAAAGATTTTCGTTTTTTCGGATACGCCACATTTAATTAAGTTAGTCCGTAACCACTATGTGGATTCCGGATTAACAATAAATGGGAAAAAATTAACAAAAAAAA:1 - chrX 3109144 3' + P-element 216 1 14.38 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGGGAGTATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGTGAATGTCTG:1 + chr3R 23623959 3' - roo 8722 2 60.27 TATGTTTGAAGCAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGGGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGCCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTTTTATGTTTAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 17467142 3' + Tc3 1399 1 75.34 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGG:1 - chr2L 8397171 3' + roo 325 2 73.97 ATGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCT:1 - chr2R 22867419 3' + hobo 2874 1 60.96 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAAGACAAGTAAGAGAAATCTTTGTAAATGTCT:1 + chr2L 1229723 3' - opus 7148 4 63.70 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTT:1 + chr2R 6187946 3' - Tirant 8151 2 56.10 TTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAAT:1 - chrX 17258197 3' + 297 6923 2 54.79 TATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGTTG:1 + chr2L 14796923 3' - I-element 83 1 74.66 GAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAATCTGGGGAACTGTTTAAAGTGACGCTCTTCAAGGGGAAAAATTAGAGA:1 - chr2L 9444801 3' - 297 6908 2 67.12 AAAAGGTCATAACTTTACGTTTGGAGCCATTTAAGTCTAATAAATTATCACGGCACCATATTTGAAATCTGTCTCGATCGGATTGTAAGTCCAAATGGTGAGCTAGTCAACATCGGTCGGAGTCACCACCCACCGTACAA:1 + chr3R 7582297 3' - Q-element 671 2 70.00 GCCGATGTTGCGGAACAGATAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTTAATGTTAATATACTATGTTGCTATACTGAATAGAATAAATAGTATAGCAGACTTTTAGACACCTTAATGAGTTATTATACT:2 - chr3L 1277208 3' - invader2 4952 2 65.07 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCCACGATG:1 + chr2R 5992424 3' - pogo 33 1 63.01 CGCATCCTTCTGCCTGTTGCATACATAACAAACCTAACTAACACCTTTAAGCAAATTGACGATTGGGGCGACCACTCTGGCTCAGTCTTATCAAAAGACAAGTGTCAAATCATCCAAATCTTCTACAAGTATAACTTCATGGGAAA:1 - chr2R 5529246 3' - INE-1 30 1 50.00 CATTATATAAATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTATATCGCTTCTATATCTTTTCGCGAATCGAGCCGTACGATACATGCCAGCTCGAAACTCACTCTCGAAATTACTTTCCTTGTCCCACTAAATTCTAAACGATAA:1 + chr2R 18036771 3' + Cr1a 4331 1 54.68 AGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGGGCATGTGTCCGTAACTCAAACGTCGTATAAATAACATGCAGCACTCGCCGAGCACAACGTATAGATAACGACTGATCATATCCATTTTGCAGCACGTT:1 + chr2R 21720932 3' - R1A1-element 5280 1 47.26 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTAACCTAACCTAACGGCTTAAATAGCCGGCTAGG:1 + chr3L 22676380 3' + 412 444 2 51.37 ATATATATATATATATATAGTTCTTTATGTCTGTTACATACTTTTGAATAAATCTTGTAAAATCTAGAAAATTTTACTCTTCGAGTATGAACCAAACAACGATTAAAAGCAACGAGATTACCTGATGCATATTGCATGAATGCATT:1 - chr2L 12757593 3' - 1731 4409 1 65.75 ACTCGGCTATAGCATTCTCTCTTTATAGCTTAGGAACTAGTTACATACACGATGGTGCCAAATGCATCTTAGAGGACGGTTAAAAATGATGTCAGCTGTGGAGTACCCTCGACTTAATCCAGCTTGGAATACACTCAGAACATTAT:1 + chr3L 27875015 3' + INE-1 576 1 76.03 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTTATCCACATTAAGCACG:1 - chr3R 16041097 3' - jockey 61 1 54.79 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAGTT:1 + chr3R 8402664 3' + mdg1 7421 2 58.90 TCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAGCTAGTAAGCATTTT:1 - chr2R 13574721 3' - diver 31 2 62.33 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGG:1 + chr3L 16887403 3' + roo 341 2 62.33 GCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGAATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAAT:1 - chr3L 19146615 3' - pogo 109 1 67.81 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGGGAAAAAGAGACAGTCGCTCGACGTCG:1 + chr3L 13204810 3' - jockey 33 1 59.50 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGAACTGAATCTCT:1 - chr3L 4023590 3' - pogo 33 1 63.01 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGA:1 + chr3R 23507686 3' - 412 7104 2 52.05 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGGGTGGAAAAG:1 - chr2R 20382440 3' + Bari1 1691 1 74.48 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATAAACAAATCTTCATCTAAACTTGAGCCTAAAATGCAGTTTTA:1 - chr2R 16409977 3' + opus 470 2 66.44 GAGAGAGCCTGAAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAACATTATGGTTGATAGCGCCCGATTTACACTAGAACTCTGCTGACAA:1 - chr2R 9251400 3' - 1360 73 1 71.23 AATATATATACTTACATAAAGTCTGTTCAAGTCTTTGGTGCCTTGGGTATGTGTGCAATTGTGTGCAATTGTGTGTGAGTGTAAGACGCGCCTCTCTTTGCGCTTCTCATTGAGGTGAGCTGGTGCCTGGGCCATGTCTTCGGACT:1 + chr2L 11041010 3' - 1731 98 2 70.55 ATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGA:1 - chrX 13548332 3' - jockey 4844 1 72.60 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATTTCATTTTTAAATCAGGCTTAAAACACCTTTTT:1 + chr3L 10370953 3' + copia 5037 2 77.40 AGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCATTGGTACGGAGTTACCGCACTGGTACGAGGTTACTACACTGTGTTCTGTTAATCCGCATGAATTCTTGTTTTCATAAACCTTGAGAAA:1 - chr3L 25492588 3' + Porto1 236 1 57.53 AGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGGCGGGATATCAGCA:1 + chr3R 30731475 3' - gypsy6 7477 2 58.90 CCTACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCCAAATTTTATTATTTTTTCTGGAATATCGATAGATATTGGGAAATAAAATGAAAACAAAATTTTCCAAACTCGTTGCATATTCATTCGAATTCGGAGTGCC:1 + chr2L 10182304 3' - INE-1 551 1 73.97 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTTAAGGGTGGTTAATGC:1 - chrX 19231701 3' + mdg3 5475 2 69.86 TCTGTCATCCGGATGGTTGGCAGTATGCAGGGTAAGGCCACAGAGCCTGAATTTGGACCGGGAGGAGAAGTGGCTTTCTTACAACAGGAGGATGTCTATGTCGTGAAGCTCAATCCGAAATTGAAACTTCAATGCCCGTCAAGATG:1 - chr3L 17678008 3' - G5A 180 1 78.08 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTG:1 + chr3R 8542662 3' - roo 8741 2 72.22 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGAACACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGGGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTACTATTT:1 + chrX 13651593 3' - 297 34 2 58.22 ATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGCACCTAAATAAATAA:1 - chr3R 3922958 3' - Cr1a 92 1 73.29 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTTTCCGTACTG:1 - chr2R 18123374 3' - 412 15 2 69.86 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCGGGAACGCAACTATATGCACTTCCTTCGCGGCCAATGCA:1 - chrX 20552759 3' + roo 9031 1 56.16 GAGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATTTTGTGCAGATGGCTTTGAAGTCGGCAATGCTCCGTTATAAGGCCAGTCGAAATGCGCACGGTGTTTTTACCGTGTGTCATTATTAATTAGACACTATATAGTAATAGTGAAATAG:1 + chr3L 18238633 3' - baggins 5187 1 77.40 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTAAACATTAAATGCTAAGTACTTTTTTATGTTTTTGAATGGATCTCAACTTTGTACATACTTTTGCTTT:1 - chr3L 13313132 3' + roo 357 2 56.16 TCTATTACACTGAGCTATTAGTTATTACTTATTACAATTGGGTTACACTGGGCCATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGTATCCGTATTTTAACCTCATTTGACTTCGACAGCCAAACAAATTTTACGGAAC:1 - chr3R 16535236 3' + Stalker2 7637 2 69.86 GCAATAAAGTATCTGCCACAGCGTCCGCATATATCTTCAGCTGTACCTATATTCCTGCAGCTTAGAGGTTTCGTGCATTTTGCATTCAACTTTTTGCTGAT:1 - chr3R 15519502 3' - ZAM 230 2 58.42 ACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGACTATATGAAAACGGATGGACTCGGAGCACTACATGGAGATCACCAAGCAGTTCTCGGGCAACAACTACGTGGACCAGGTGAGTTCTGGCCAACTGGTGCCAGCCGAAACACAAGCGAACGG:1 + chrX 17279690 3' - INE-1 91 1 75.34 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCA:1 + chr2L 20561501 3' - P-element 48 1 52.05 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGTCACAGCTTTTCACAATTT:1 + chr3R 25508545 3' - hobo 69 1 64.83 GGACATGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCCGCTCCATCATTGAGCTAAAAGTTTATTAAATAGCAAAGGCCAAATCGATTATTCACTGACAGGATTTTCGAAAAGAAGTTGAGGTTGGATCATAAAGTTTGTG:2 + chr3L 26834438 3' + invader4 2734 1 68.49 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCTACTTTTCCTTCGT:1 - chr2R 544753 3' - HMS-Beagle 31 2 64.38 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCGTGCATTCTGTGAAAGGTGCTCGAGCTGATTGTGCCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTTTACTCTTGCAGCTGAGTAAGTGCCCAGTAC:1 - chr3L 14863812 3' - Transpac 38 2 58.90 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACG:1 - chr3R 25271152 3' - 412 7093 2 58.90 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCC:1 - chr3R 19700866 3' + roo 9016 2 62.33 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACGAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGA:1 + chr3L 19146672 3' + pogo 2048 1 65.04 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCCCGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCAATCTAGCCAAGCGGTAAATTCATC:1 - chr3R 10288763 3' + copia 230 1 66.44 TTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACAGTTTCTGATAAGTCGCTGTTTGGGTATAGAGATTTAATTCAGAATACACTCCTTGCCTTTAAC:1 - chr2L 22641317 3' - HMS-Beagle2 52 2 54.86 TTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTATAGCCGTCGAAATCGTAATCTCAATTCGCCATCCCATCGCCATA:1 + chr2L 15142324 3' + BS 5026 1 69.86 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTG:1 - chr3L 14921417 3' - pogo 49 1 76.53 CGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGTGGTATA:1 + chr2L 14222372 3' + Transpac 273 2 59.59 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACCCAACAGCCATTGATTCTAATCTCAAGCAGCAGTTAATAATTTTAGGCAAACAGCAAACATAACAACTTATGTATATACCAAAAAGAAACCCAAAACATTTAAAACAT:1 + chr3R 18665399 3' + 1360 3379 2 79.45 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGG:1 - chr3R 26315887 3' + roo 9016 2 55.17 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGACGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTG:1 - chr2L 1073888 3' - Tirant 41 2 58.90 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGGTAGATATACATAGAT:1 + chr3L 22519115 3' - pogo 36 1 59.59 TGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGCTTTCAATTTGGATTCTTCTGACAAACAGACAGTGCCATTTTATTGGC:1 - chrX 11814985 3' - flea 4793 2 57.02 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGA:1 + chr3R 25521874 3' - blood 81 2 71.92 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGA:1 - chrX 15089510 3' + P-element 2810 1 31.94 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGTTGA:1 - chr3R 4464151 3' + 1360 3321 1 63.01 TCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGAGTTCATAATTTCACTGGTCTACTGTTGCTGGT:1 + chr3R 22810814 3' - flea 33 2 61.38 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGT:1 - chr2R 21380593 3' - roo 8714 2 52.05 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGT:1 + chrX 685383 3' - BS 5073 1 68.49 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCTTCTTCTAATACACTGTGTTGTTCCAGGTTGGCGCTATCACCAGCGCCTTTAG:1 + chr2R 22892709 3' - pogo 65 1 65.75 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAAACATAACAAACTTGGGTTGCCGTTCGCCGTCGTGGTGAATTTTCCGCTGCACAGTGGGGCAAACCGCATTTTTAATTTTAAAATGTTTGGTAGGATCAG:1 + chr2L 10474447 3' + P-element 2870 1 74.83 GTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGTAAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTTGCTTCGTAATTAACGACTATTTCCGCTAATTGTCTGTACT:1 + chr3R 7082440 3' + transib2 444 1 62.73 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCCCATACATATGCAATAGCCGAGATGCATATGCATGTGTGTGCG:1 + chrX 7468018 3' - hopper 74 1 68.97 GCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACAGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGA:1 - chr3L 16047627 3' + Cr1a 4372 1 52.59 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTG:1 - chr3L 16887336 3' - roo 88 2 79.31 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCGCAGGAGATTGATTAAGGCTCTGGCTGATACCTAATAATTTTAATTTCCGTAGCACACTTAATT:1 - chr2R 19900927 3' + mdg1 408 2 76.03 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGATATCAAATAAGTGTCTA:1 - chr2R 7404629 3' - blood 17 2 69.18 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAG:1 + chr3R 8402662 3' + mdg1 381 2 57.53 GCCTTAACGTTATTATTATTTAAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTTAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTT:1 + chr3R 20147534 3' + 1360 307 1 78.08 TTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGGCTGTTTAACTTGCCCTTTTTAATGATCGATAACTGGGAACTTTTGAACTATTTTTTTT:1 - chr3R 23108059 3' - G-element 67 1 59.59 AATGAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACCGTTCTCTTTGAAAGCTTTACGTATTTCTAACTTAAAATAACACTTGTTAATATATCTATATATTGTTTAGCTTTTTAATTATTTT:1 + chr2R 21532040 3' - Cr1a 61 1 73.10 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATTAGCCATGAGTGCTCTAAAGGATGGGGGGATGTCCATGGGTTCGGGGTGCGCGCTAAGCAACTGAACCGTGAA:1 - chr2R 12463668 3' - copia 4930 2 50.68 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTAT:1 - chr2L 18048256 3' - blood 7073 2 57.53 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTC:1 + chr3R 5087097 3' + P-element 2836 1 42.86 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTGAAATAAGCAATAATTCTTAGCAGTATTCTAACTCATTCGAAGGTAGCAGAGCTTTCTTCTTCTGGAGTATGATGATGATAGATG:1 - chr2R 9814987 3' + pogo 2072 1 69.18 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGGAACCGAGCCAATTTGCAA:1 + chr2R 21227467 3' + mdg3 204 2 56.85 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTAATAATATATAGAATTATACTAAAAATGTTCTTCGTTGCCTATTCGGTCACAGGAATTAACTTA:1 - chr2L 21724013 3' + pogo 2048 1 59.59 CAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAACATTTCATTTGCTAATCACTTGTAATAAAAGTCAAAATAATTAGAAATCAACCCATTCAGTAATGTACACTTCCC:1 + chr2L 1178658 3' + Idefix 214 2 50.00 AGTCCTCTTAAAAAATTCTTTATCTTGTTACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTGGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACTTCCCCTTAATAATAAAACATTTTAATTACCAATATTTTCCAGGTGTCGATACC:1 - chr3L 14330525 3' + Q-element 438 2 60.96 AAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAAGAAGATGCCACGCCTCTGTGATTGCATTTTTACACTTGTCATGGCGATTTGGACCTGTGTTGCCTTTGCCTTGTCAG:1 - chr2R 16357823 3' + Quasimodo 7104 2 51.37 CAAAGTGTCACAATGTATTGACGCAATGTTATACTCAATCATTTATTGTATTGGTAGGGTGGATTGCTACCATATGCTACACCTCCCTTTCTAATGAAATGACGTAATAAATGTTAGTTTCCACCCGTTCTCACAAAACAAGCCAA:1 + chr2L 8263847 3' - Stalker 60 4 81.51 TATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAACACTCTCTCGCATATTCGCACTTACACTGAGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTG:1 - chr3R 23346547 3' + Rt1a 5006 1 55.48 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAACAGCCAAATATTCATG:1 - chr2L 12261145 3' - jockey 58 1 50.68 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGGAAATAACTGAAATAAAACAGCAAATAGTAATTGCCCGTCGAGGGGGAAATGGGGGAGAACAGGTACAAGGCAA:1 - chr3L 16137280 3' - Juan 4070 1 52.41 CATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGA:1 - chr3R 27786576 3' + Tirant 8421 2 77.40 CCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTTCATCCCTTTACAACCGCTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATAAGATTAGTTCAAGGAGCGGACAATGCAAGCTGCGCTGGGACAATGGAACGGAGCGAAATGGAATCG:1 + chr3L 15414748 3' - Circe 7183 1 61.81 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTT:1 + chr2L 14222349 3' + Transpac 250 2 63.01 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAA:1 - chr2L 17730403 3' + pogo 2060 1 56.16 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTATAATATGG:1 - chr2R 14246948 3' + pogo 2065 1 56.15 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGACATATATATAAATTCGATAGTTATGGATGTGTGTGGGAAATGTTCGGGTTGTCGGTGGCGATAAGGTGC:1 - chr3R 28724920 3' + pogo 2052 1 56.85 TCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCATTCCTTTTGAATTCGCATATGAAAAAC:1 - chr2L 7467754 3' - BS 4995 1 66.44 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGGCCCGCACTCACTCACACACACATACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' + P-element 2848 1 57.53 CTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAATGTATCCAAAGGATGCACAGATCTACAGTTTTG:1 + chr3R 29709118 3' + blood 7380 2 77.40 TTGTCACTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATATGACTTGGCCAAAAAAGCAGGGCTGGATGTTGGATGGTAGATGGACTGC:1 + chr2R 20439510 3' - Doc 224 1 65.07 GCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGGGCTGGTGTGCGGGCGATCAGTCCGGGTAACTTAGTTAACTTGTATGTAAAAATGTAAAGTGTACACTTAATGGGTG:1 + chrX 10728890 3' - springer 7204 2 70.16 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTTATCATTCAGTCGCTGCCCAGAATTCTCCGTTATAACA:1 - chrX 18365968 3' - jockey 21 1 75.34 GGGACTATTTGCTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTTCAATGTACAGAGCACAGAATTCACAATACTCGGCCACCGACATGTGGCTCTGATTAGTGCG:1 - chr3R 20880295 3' + roo 284 2 49.60 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATAAACAAATCTTCATCTAAACTTGAGCCTAAAATGCAGTTTTAATCTACCCCAGAACT:1 - chr2R 16409962 3' + opus 7488 2 76.71 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGAAGAGTGCTTAT:1 - chrX 3529720 3' - 412 48 2 52.74 AATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTGTTGGTGCTCAACGGAATTATATAGACCGCATTCAGTCG:1 - chr2R 6187865 3' + Tirant 8428 2 70.55 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGAC:1 + chr3R 9938670 3' + roo 323 2 76.71 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGTGACCAAGGCAAATATCTCCCCGACCCACTGTGCAG:1 + chr3R 12795172 3' - mdg1 6 2 79.43 AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACATTTTTTACAAGGCTTAC:1 - chr3R 24228841 3' - opus 7149 4 63.01 ATATTATATGTGATTGCATGGCGCTTTCCATCAGTAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACTGGAAATAATTGCAGCCCGGAAACCCAATAATGTGATAAATCAATTTTATACGAAAATCACAGAGCATAAATTTATT:1 - chr3L 5406487 3' + baggins 5240 1 65.07 CATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTGAAAGGAAAGACAACAACTCTTCGAAAGAAATTTGACACGTCGAAATGCCAAAGTGTTTAGCACTATCTTTGAGTTTCGGTTGAGCGATATACTCCAATGCAAAG:1 - chr3R 25197735 3' + I-element 227 1 51.37 TTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTTGTATCTTAGCTGCCTATTGG:1 + chr2R 6187966 3' - Tirant 8129 2 66.12 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCA:1 + chr3R 20292546 3' - pogo 40 1 58.22 AAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATATAAAAAAATTCATATTAATTTAGTGGGTCACCGGGCGGTGGTGACCCCGATCGTGCGGATTTCCTGTTAGAAAGGCTCTGACTAACTGACTGCCCG:1 - chr2R 14122910 3' + X-element 4696 1 67.42 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAG:1 - chr3L 1387140 3' - mdg3 75 2 65.75 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCATTACTACATCCCATT:1 - chr2L 7459502 3' - BS 5007 1 71.23 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTATACATATAAGTAATTATATTTGTGCATTGTTGTTGGATGGGATGATTCATAAATTATGGAATTTTACATGCCC:1 - chrX 6858452 3' + roo 9031 1 50.00 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTCTCTTTTCTCC:1 - chr3R 31956355 3' + pogo 2073 1 66.44 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATT:1 + chr3R 20292555 3' - pogo 30 1 64.83 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTT:1 + chrX 21213407 3' - Doc 48 1 50.00 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGG:1 + chr3R 10143045 3' + 412 447 2 52.78 TAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGCTTAAATACATTTCAGTAGTGCAGATAAAACCAAACAAAACGGCAGCAACAAAAGGACCAAATTTAAAATGCAACATAAAATGTGGTAGAAATAATTTGAGACAAAAAAAACCCATTTGC:1 + chrX 12886991 3' + Bari1 284 1 77.40 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGATTAAAACTAGTTTCTTTGCAAAG:1 - chr3L 20076767 3' - roo 8730 2 65.75 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATT:1 - chr3R 20905358 3' - pogo 41 1 58.22 CTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTTAAGGAATCTAGTATACCCCTTTACTTTACGAGTTACAGTGGAGCCAAAAATTCGGGGGCCATTCTTCGAAATGAGGGTAAGTGTGGTGTTCTTATTATTTAATATGGTTCTTATTTATA:1 - chr2R 3526653 3' - INE-1 28 1 67.81 GGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGA:1 + chr3L 22638875 3' - Juan 4140 1 51.37 CTTCTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTC:1 + chrX 4566224 3' - Transpac 90 2 80.82 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCT:1 - chr3L 24153180 3' + Tabor 7255 2 64.38 GACGCGAAAAAAAAGGTTTCGGCCCACCGTTTGAAACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACGTTCGCACAACAACAAATGCCACAAAAAAACAATACGAAAAAAACG:1 + chrX 3364524 3' + Tc1 1181 1 81.29 TATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAAAACTGATTGCAAATTGCATTCTGGGTATGTGCAAAAAGTCTTAAAGAACGAATATGAAAACACACAGCATAAGAAACCTAACAACAGCAGATC:1 + chr3R 2216847 3' - invader2 4889 2 36.99 CTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATTT:1 + chr2L 1074019 3' + Tirant 8451 2 54.79 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAATCAACATATTTG:2 + chrX 8200317 3' - flea 4794 2 60.27 AATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAGCGATGAATAGTTCTTCTTGTCATGTTCTGTCTGACT:1 + chr2R 2527460 3' - roo 8736 2 54.79 CCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATAATATTTATATTTCAATGTATTTAGTTTATTTTCAATGTTGAAAGAAATAGTAATTGTTGAT:1 - chr3R 20455520 3' - blood 380 1 57.53 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGT:1 - chr3R 8402529 3' - mdg1 50 2 52.05 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTTTCGTTAACAATGTAAACGCCCGACTCGTAGT:1 - chr3L 6630336 3' - jockey 4745 1 67.81 ACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGGTGCCCCATTCCTGGCAG:1 - chr2L 9356820 3' + Stalker4 384 1 55.10 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGATTTCAAAACATATAGTGCTTCTGAATGAT:1 - chr3L 20076789 3' - roo 88 2 80.82 GTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAGTTAATAGTTATTACCTGTTTTTTACACAATTTGTTAATCATT:1 - chr3L 3482681 3' + X-element 4637 1 70.55 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACCGATTATATTGAGGGGGAGTTTCAGTCAACGAAAAGAAAATAGTGAGAGG:1 + chr2L 8542807 3' + P-element 2816 1 33.56 TATTTCATTTTTTATAAAGTCGTATACATCGCGCAATGGTTACATTTTTTACAGATAAAACTATAAACTTTGTAAAGAGCAAAGCATTCTCTCAGTGTACCCAAAGACCAGACTTTGGCTTACACATGTACGAGTGTGTGTAGTTT:1 + chr2R 16725259 3' - Tc1-2 379 1 76.03 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCTCATTGGCAGATGGGGATGGCTTCGGTACCGTTCGGATTTCTTCGTGCTGG:1 - chr3R 14096978 3' - transib2 11 1 73.29 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAG:2 - chr3L 24153141 3' + Tabor 7294 2 64.38 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTGCGTGCTCAAGGATGTTCGCAAAATTCACCACACTTGTCGCTCGCTCGCAAAGACACCTGTAGTGTGAAAGCTTTCGTTTTGTGCCAGTGTTGTCATGCCAAAGTAAA:1 - chr2L 12142508 3' - hobo 13 1 76.71 TCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTTAATACTAGCATGTGACGTATCGCCATATGGGCTGGGAGT:1 + chr2R 4551504 3' - roo 203 2 73.97 AGCCTGCTCACGGATTACACAACATTAGACAAAAACAGTAATGCAGATTCTGTAATAAGAAATCATAACTATATTTAACATATATGAACAAATATAATCCCAACTTTAAATGGAGATGATAACGTTCCGCGGTTCCTTTTCCCCTC:1 + chr2L 4142223 3' + 3S18 5681 1 87.67 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACTACAAA:1 - chr3L 5183661 3' - copia 4895 2 67.81 TGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATATGTATGTATTTCTAATAATACGCCTTGGCTGTTAATATTTCAT:1 - chrX 3796348 3' - invader1 7 2 64.00 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTG:1 + chr2L 20561465 3' - P-element 83 1 28.77 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGTAGCTAATAAAGTTGCAAGTGGTCGCCGTCGTCTGAGTAGCAGTCTGCTAACCATGGCCGGATCTAGGAGGCTCC:1 + chr3L 22529890 3' - roo 9 2 78.77 ATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTC:1 + chr3R 20147570 3' + 1360 343 1 56.16 ATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCA:1 + chr2L 9356886 3' - Stalker 85 4 78.08 TGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGC:1 + chr3R 11461855 3' + 17.6 416 2 76.03 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTGTGTATCATTTTGCTGCAG:1 - chr2R 18048777 3' + opus 463 2 60.27 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAA:1 + chr3L 9242070 3' + roo 327 2 71.92 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTG:1 + chr2L 11573708 3' + jockey 4924 1 68.49 CGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGGTCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGGGCGGCTGAGCATTTAGTATCGCATAATTAGGGTTCAACTATCAACACACCTTACAAAACTT:1 + chr2L 16644093 3' - Max-element 367 1 53.28 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGGAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTG:1 - chr2R 18807734 3' - jockey 17 1 73.60 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATGAATGATATTTTATGCCTTAC:1 + chr3R 4884511 3' - pogo 31 1 63.01 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCGACAGAATATAACATTCAAAG:1 + chr2R 1277200 3' - Tirant 15 2 76.71 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGC:1 - chrX 15089517 3' + P-element 2801 1 26.71 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGTCATCTGAAATG:1 - chr2L 12355244 3' + hobo 2911 1 64.58 GGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGTGCATCTGAAAGCAGCTCCTCGCATCTCCACAAATCACAACATTATCAT:1 + chrX 19506366 3' + R1A1-element 4994 1 66.44 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATCCATTAGCCAGCAGATT:1 - chr3R 26765055 3' - mdg3 28 2 63.89 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCA:1 + chrX 3452538 3' - Tirant 46 2 55.48 GTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGGAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGGATT:1 + chr2R 16312097 3' - G6 2011 1 70.55 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCTCAACTGTGCGATCGGATCGCTCGGGCAATGAGTTTTAACGCCCAGAAGTCTCC:1 - chr2L 10032650 3' + hobo 2936 1 67.90 GCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTTGTGAATTGCGGTTCTATTGCCTTGAATATGTTCGAGTGTGTGG:1 + chr2R 20382628 3' - Bari1 22 1 71.23 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTG:1 - chr3R 25521773 3' + blood 7348 2 56.85 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCACCTGCTGAATGCATCCATTTATGCGGC:1 - chrX 4789078 3' - 297 6599 2 73.43 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTGTATAACTGT:1 - chr2R 8862031 3' - pogo 56 1 58.90 CTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTG:1 - chr3R 3527091 3' - Tabor 81 2 70.55 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATT:1 - chr2R 21380595 3' - roo 52 2 53.42 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCGTGTCAAAACAAGTACACTAGGCGATAGACGTAATAATTACTATACATATCATTTCCATAAAAGGAAACTGCACAAATGCCA:1 + chr3L 9652645 3' + roo 320 2 67.12 ATTATGTTCGTATATACTACACTTGAAATGAAATCAGCACATCACCTAGCTGTCAGCCAGTCAGTCTTGGTTTAAGCCCCTGCTTTTCCTTAAGCCAACAGTTCAGCCCCAGGTGCCGCACAAATTGTCCTGGTTTAGTCAACAAT:1 + chr2L 10937998 3' - mdg1 7038 1 78.77 GCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAATAAGAGG:1 + chr3L 9198632 3' - F-element 100 1 76.03 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCTGTGAAACCACATTATTTCATAAGTGGAT:1 + chr3R 5245677 3' + 1360 3368 1 61.74 TGGCTCAAGGCCTTCGCCATCTCGCTTCCAGCCTGCTCAACCTCAGCTAGCTTCTGATGCTCATTCCAACGCATTGCAAGTAGTTGCGCAGGAATCATGCCTTGGACATGATATATCCTGCTGGTATGTCCTGGTCTATATGGCGT:1 - chr3L 5665408 3' + G3 253 1 73.97 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCCATCACCCTTCTACTACATAAGATGGATGGAAT:1 + chr2R 22255473 3' - roo 11 2 75.34 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGT:1 - chr2R 6984380 3' - Doc 27 1 67.59 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAAAAATCAATATTTCCTTTTGGCGAAAGACACTTATACGTGCA:1 - chr2L 22696361 3' - X-element 52 1 52.05 GCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGGTGGCTTTGTGAACGAGGTCTAGCATACTGGATTATTTACTAATTG:1 - chr3R 15351331 3' - R1A1-element 4909 1 68.49 CAATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTGTCTCAAGCTTTCTTTCGAATATAATAATTGGCTTCCTCCGATTATATCGATCTTATTCATTAATGTCTGTAGACCAACACACTCAATGCCAACGAGCTAGA:1 - chr2R 5580492 3' + Gypsy12A_LTR 1972 1 73.29 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTT:1 + chr3L 21093246 3' - Ivk 49 1 52.05 AGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGTATGTATATATTATATTATTAAATAAAATCTCT:1 - chr3L 14143114 3' - X-element 4693 1 52.74 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAATATT:2 - chrX 11228522 3' + roo 9042 1 65.75 GCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGT:1 + chr3R 1446144 3' + 1360 3377 1 27.40 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCACGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTAGCTTCC:1 + chr2R 22255441 3' - roo 42 2 55.17 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGGATGGCTGATATGCAGGTGGACTGTTGAAAACCGGCTAAAT:1 - chr3R 9563557 3' - P-element 23 1 68.49 TTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAATGGAATCTATTTTTAGAGTGAAACGCATGTTGACGCCAAAAGTGGA:1 + chr2L 7182715 3' - copia 201 2 67.14 ATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACAAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTA:1 - chr3L 27356079 3' + Tc3 1639 1 64.14 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTG:1 - chr3L 18708603 3' - F-element 76 1 65.07 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATT:1 - chr2R 17014001 3' - HMS-Beagle 6837 2 57.53 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAAAAAAATTAAAATTC:1 + chr3R 15030766 3' - jockey 71 1 59.59 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGCAAGAAATCCCTTGAGG:1 - chr3R 29708925 3' - blood 7029 2 64.79 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTACCCCGTACCGTGCTCGCCTATTGCGGCTATGCTGTTTTGTTTGATTTTTTGGTACT:1 + chrX 19498172 3' - P-element 61 1 44.14 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAAATCAAATTG:1 + chr2L 12142661 3' + hobo 2913 1 56.78 GAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTTTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTTGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAACTTTGCCTGTATGCCAAATTTCCTGGCAGGACCCCTTTGTCGCAACGTGTTCCTAC:1 + chr3L 22043175 3' - 1360 3238 1 61.11 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCCTTTTTGCTTAACTCC:1 + chr3L 17447560 3' - Tirant 8119 2 68.57 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACA:1 - chr3R 26765107 3' - mdg3 82 2 73.29 GGAGTTATGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTCGTCTAGACACGTGTCTAGTCGAGAGCTGCACGTCGTGCTTTTGGTCAGTTGCTTGCCGCAACTATCGCAGAT:1 + chr2L 19180502 3' + G5 4385 1 69.40 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTTGAAAGGTCAAAAATCGTATCTTTTATCT:1 + chr2R 15392828 3' - blood 7049 2 59.59 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCTTCTAATTTAAGAAGTGTAATGATGGA:1 - chr3R 12787087 3' - 297 20 2 68.57 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCC:1 - chr3R 23099090 3' + roo 339 2 67.81 ATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCAACGTGAAAAAAACCGCACA:1 - chrX 21474375 3' - 1731 40 2 78.77 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCAC:1 - chr3L 13597726 3' - blood 7053 2 57.53 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAA:1 - chr2L 21237253 3' - P-element 33 1 32.50 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACC:1 + chr3L 21093266 3' - Ivk 29 1 65.75 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTTTTAATTTATTTGCATTAAACTTGTATTACAATTTTATAACATCTATATATGATATAATAGTTACTCGCAATATGCCCATTATTAGGCGGATGAAT:1 + chr2R 9815165 3' - pogo 19 1 72.60 CTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAATTTGCGATTGC:1 - chr2R 19076476 3' - F-element 175 1 74.66 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAAC:1 - chr3L 5514194 3' - Doc 82 1 60.27 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAG:1 - chr3R 16771361 3' + roo 8983 2 76.03 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCCGCA:1 - chr3R 30272978 3' + Tirant 8442 2 65.75 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGTGTGTGTGTGGCCGCTGGCGATGGGTGCGTG:1 + chrX 685413 3' - BS 5043 1 51.37 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACA:1 - chrX 18366039 3' - jockey 93 1 74.66 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCT:1 - chr3L 4639093 3' + roo 8985 2 79.45 TGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAA:1 + chr2R 22692411 3' - Ivk 95 1 71.92 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAACACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTC:1 + chr3R 8542673 3' - roo 8732 2 65.07 AAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACC:1 + chr3R 28033673 3' - diver 77 2 68.49 CATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATT:1 - chr3R 3617311 3' + micropia 172 2 73.97 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCT:2 + chr3R 21237793 3' - Doc 88 1 73.29 TTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAACACTCTCAATTGACTGTGAACCGATTGAAATCTCTTTAATCTCAAACCGATACCTATTT:2 - chr2L 11158632 3' + Rt1b 5075 1 59.59 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGATCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAACCCGCCGTGCATGTGCATGTGCTTTGCCT:1 - chrX 15814467 3' - P-element 2 2 77.34 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATCGTCAAGTGGCTCAAGCGCTGCTAAA:1 - chr3L 22529691 3' + roo 401 1 79.14 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGC:2 - chr2L 2357314 3' + P-element 2791 1 19.86 TTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATCTCACTCACATTTGAAATTAGTCTTAAGTTGAAAGCATGCAGAGCGCGTAGGCAGAATGTGTAAACACACATCGATTTCCATTCCGAATGCGTCTCGTGTGCTATGCG:1 - chr2L 5245434 3' + McClintock 6170 2 50.00 GCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAA:1 - chr3L 14854657 3' - rover 6994 2 56.85 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATCTTATTAATGCAGCTATTCAATTTACAATTTACCTTTTCGCCTCTGTTCTACTTGCCGTCTCTACAAATAGATAACAATATAATGATATTGACCTACGCTGAA:1 - chr3R 18849698 3' - roo 8678 2 73.29 GCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATG:1 + chr2R 2949147 3' - 17.6 6963 2 60.00 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGGTTTAA:1 + chr3L 27391429 3' + 1360 3372 1 67.81 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGC:1 - chr3R 19700883 3' + roo 9013 2 71.21 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTTA:1 + chrX 4566262 3' - Transpac 52 2 57.53 GCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGTATGTTGAACTGCGCTGC:1 + chr2R 982417 3' + HMS-Beagle 183 2 63.70 AGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGT:1 + chr3L 14043643 3' - Ivk 38 1 59.59 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAAACGCGCAC:2 + chr2R 14562288 3' + Burdock 6375 2 44.52 CAGCATCCAATTTATGTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACCACGTCCACCACCACTCCGGCTCCATATCCGCCTCCAGCTCTACTGGACGTCGAGGACTCAGGCGCAGGCAAGCTAAATTACTTGCCCCC:1 + chr3L 4057849 3' - Bica 4708 1 60.56 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTT:1 + chr3R 6053064 3' - Quasimodo 55 2 60.96 GAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTC:1 - chr2R 21897875 3' + 412 7485 2 58.22 TAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAA:1 - chr3R 18346604 3' + INE-1 544 1 52.74 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGT:1 + chr3R 22429243 3' - roo 53 2 53.42 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGA:2 - chr2R 21380585 3' - roo 8706 2 56.85 CAGCAACATTGAAATAATACAACGAGGACAATCAAAAATCCTCCGAACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTAAAAACTGAAATTGGCCAGCAGAAGGCTAAATACCTTTGTTCAATTTGTCATGAATGATTAAAAAATCA:1 + chr3L 6976452 3' + Doc4-element 2637 1 59.59 AAAGATATTTAAGCAAACAAACAATTTTTAAACTATAACTATATAACAATTATACTATAACAATTTTAAACTATACATTTTCTTAAAATATGTAAAGTATGGTTAATCCCAGCTCATCCCCAATTTCGAGTCCAACAAAAAGTTGA:1 - chr2R 11999540 3' - Bari1 301 1 74.66 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACTTTGATTTA:1 - chr2R 5992276 3' + pogo 2056 1 54.79 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTA:1 + chr3R 9938700 3' + roo 9019 2 55.56 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTTTTCAGGAGGGGTGCTGCATCCCA:1 - chr2R 6984261 3' - HMS-Beagle2 12 2 77.08 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTGTATAACTGTGT:1 - chr2R 8862029 3' - pogo 54 1 57.53 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTTTAACTTTCTTTTGTTTGGCCACATTTTGCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAAAA:1 - chrX 9951310 3' - hobo 17 1 73.97 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATCAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGG:1 - chr3R 26782676 3' - hobo 19 1 68.99 GATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAA:2 - chrX 19231721 3' + mdg3 5455 2 56.16 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAA:1 - chr3R 25521799 3' + blood 7322 1 64.38 AAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAA:1 - chr3R 20137241 3' - Burdock 53 2 56.16 ATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAAT:2 + chr3L 21093214 3' - Ivk 93 1 71.23 AATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGACAGTGGAAGGGGACGTGGACATGGCACACACATGGCATGC:1 - chr2L 535393 3' + roo 406 1 74.76 ATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACAAATTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACATTGCTTTGTTGATGTTACAATTGTTGCACTTGTTGTGTGCGGCTTAGGACGTTGAACCACAGCC:1 + chr2L 19574451 3' + S-element 158 2 56.16 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCA:1 + chrX 22824848 3' - jockey 4709 1 55.48 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATGTCTATGAAAATCTGTCTATAAAAATATGTATAATTTGATTAAATTAATTTTTCATTTGTAAGA:1 + chr3L 23287167 3' - Quasimodo 55 2 56.16 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCGGGAACGCAACTATATGCACTTCCTTCGCGGCCAATGCAATATTAAGTAGCATGCGGCGA:1 - chrX 20552738 3' + roo 9052 2 70.55 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGGCCCGAAATTTGGGACAAATATACTAGATAGCTCATAGCTGCACCAGGGAAGATCTGAAAGC:1 - chrX 21086041 3' - jockey 4677 1 73.10 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCT:1 - chr2R 15613774 3' - P-element 34 1 43.88 ATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAATTATGTAAGGGAACAAATATACTTTATCTATTTTTGTACAATTCTC:1 + chr3R 2630713 3' - 1360 3183 1 69.86 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGA:1 - chrX 18193719 3' + hopper 1359 1 61.07 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATTGAGCTCCAGCGAGCGGCGGCTAAAAAACTTTGGCTGCCTTCCGCG:1 - chr3R 15030695 3' + jockey 4947 1 64.35 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATTTTCATTTGTTTGCCCCTGTTTTTTTAGTTCTGTTTTGGCTACGCCTTCGCCGTGTTTGGGTTGTTCCTGCTTCCTGTAACTGCGTGT:1 - chr2L 5648360 3' + Burdock 227 2 66.44 TTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTACAAAAGAACAGTTATTTACATATTTACATACATTTGCAATATTTCCATAGTGTTAATCATTCATGAATTGTAATTTTATAACAACAAATGTGCACCTTAAAATGTTATTT:1 - chrX 8357679 3' + FB 832 4 50.68 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGTTTGGGTTGT:1 + chr3L 13597818 3' + blood 7327 1 75.63 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGAC:1 + chrX 17258312 3' - 297 38 2 55.12 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTCGCTGTGGAA:1 - chr3L 9430567 3' + P-element 2825 1 45.89 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCG:1 + chr2L 17730509 3' - pogo 79 1 71.92 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATC:3 - chr3L 2037002 3' - Doc 64 1 60.96 CACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACATATGTATCTAAGTTCTAACTTGTATATACTGTATAACTTGTATGTACTGTATATACTGCTATATTCCGATTGGATTACACTCATGACTTGGCTGAAAGCTACGACTGGGCTGTACA:1 + chr3R 4186914 3' - HB 10 1 70.55 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAAGTGCACATGAA:1 + chr2R 10991433 3' - jockey 25 1 73.97 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGACAGAATCCTCAATTCG:1 - chr3R 6782678 3' - jockey 4708 1 61.64 GGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTG:1 - chr3L 14854680 3' - rover 65 2 67.59 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTGCAATTGC:1 - chr3R 5765302 3' + opus 465 2 63.01 TCCGTATGAACGTCGAGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGAGTCCCAAGTTGAGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCATAAAACAGCCCCGCTAAGATTATCGCCGTGAGGTAATGAAGAGGTCACTTGGTTCACCGGA:1 + chrX 15693510 3' + INE-1 134 1 77.40 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCT:1 - chr3L 21097122 3' - mdg3 25 2 55.34 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACATTTGTACTTTCTGGTCAAATTGGTGCACTATTTTTTCAGTGCATTTCTTCGTTCCAGCCGCTGACCTCGTTTCTCGTTTTCCCCATATCCCTGACCATGGTCGCTTTCCCGAC:1 + chrX 8357792 3' - FB 8 1 77.40 TTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTG:1 + chr2R 16312090 3' - G6 1997 2 72.00 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCA:1 - chr2R 981616 3' - 1360 36 1 61.54 GGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATTAATGTTACTGGCGGAGAACGAGGAATGGATCCCTTCCCACCGACAGCTTTAACGGCTATTAGAAAATTGCGAAA:1 + chr3L 2165466 3' - baggins 5285 1 54.01 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACA:1 - chr3L 18708590 3' - F-element 31 1 64.04 AGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCTGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTAT:1 + chr2L 9010493 3' + 1360 3308 1 76.98 AAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATCATGGCGACTTTTGCCCGGTCAATGCTTGATTTATGCTTGCATCAATGAAATTAAATTAAGGCGAAATAAAAACAAAGCCAAAAGC:1 + chr2L 8732487 3' + roo 9032 1 59.59 CCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATCCAACTGACGGACTGACAAGGCAAAGTGCACAACTTCATTTCACATTAATGCAGTCGCTTTAACTGAATTCGTCGGCTGGCTGTCTGCAAATTTATGCAAGAGAA:1 - chr3L 12250915 3' - flea 4763 1 80.82 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACG:1 - chr2R 21380582 3' - roo 26 2 63.91 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCACTTG:1 - chrX 8502159 3' + pogo 2047 1 57.53 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAGGCTAATACAAA:1 + chr2R 18123539 3' - pogo 38 1 58.22 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCG:1 + chr3L 9430635 3' - P-element 78 1 26.12 TATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGTCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAATGTCTACACACGACCGACGGCAAACACTTCAGTTACCTTGAAGA:1 - chr2L 18235382 3' + F-element 4640 1 55.00 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAGCAAACAAACACGAATGCCG:1 - chr2R 6585372 3' - pogo 18 1 73.29 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGAAGCGATAAGCAAACATAGCAGCAAATGGCAAATAAACAAGGC:1 + chr3R 25409563 3' - jockey 85 1 68.49 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATCCATCAGCAACCCACTAAAAAAGCATGGGAAAAAAT:1 - chr2L 12283886 3' - Quasimodo 16 2 75.34 TCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGT:1 + chr2L 14222333 3' + Transpac 234 2 73.97 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATGCTGGAGAAAATTACGCAGAGC:1 - chr2R 25138822 3' - hobo 65 1 65.07 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATAACACAGCTACCAAATGGCCGATATGGTCGTCTTGTATATCA:1 + chr3L 27390346 3' - 1360 74 1 73.97 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATT:1 - chr3L 15371270 3' - Transpac 42 2 57.53 AACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCA:1 - chr2L 1449613 3' - opus 7089 2 76.71 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGTCTTTCTCC:1 + chr2R 15613880 3' + P-element 2861 1 66.43 AATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATATCAGGCGG:1 - chr2R 17013993 3' - HMS-Beagle 6797 2 78.95 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGCACATATCTCATACATATCGTA:1 + chrX 15814586 3' + P-element 2806 1 30.14 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACCAACAGATTAATGAAACGGATCTTTACTTTGCTTGGTTGAAAAA:1 - chr3L 4175224 3' + roo 9042 1 62.33 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTCTTTGTATCTTAGCTGCCTATTGGCAGACGAATATCC:1 + chr2R 6187979 3' - Tirant 11 2 73.98 ACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACACATTCTTATAAATCCAGCAATACTGTAGACACTATAAACTTGG:1 + chr3L 21630405 3' + Burdock 6318 2 69.86 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCA:3 + chr2R 2949149 3' - 17.6 40 2 58.90 TTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAGAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTTGCTTAGATGATAAGGTGTCCCACTTATTT:1 - chr3R 21150536 3' - S-element 85 2 76.03 TTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTT:1 - chr2R 10478684 3' + invader4 255 2 66.44 AGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGTAAGCTCATTCATTACAAGCCAACATGGACATATTTT:1 + chr2L 3734593 3' - mdg3 31 2 44.29 TAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTT:1 - chrX 14692848 3' - Transpac 68 2 63.70 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAAACCTCGGAGGT:1 - chr2L 8397111 3' + roo 402 1 76.92 ACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTACGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGCCATTTGCCTGTTATTGATCGCATTCTAGGCTCAGGGCCAC:1 + chr3R 31994554 3' - Stalker4 7188 4 70.34 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAG:1 - chr3R 25753617 3' - hobo 58 1 57.53 TTTTTCTGGGATATCAATAGATATTGGGGAATAAAATGGGAAAAATTTTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGGGGTGACCTGTTTCGGTGCTTTAGGGCGTTAGAGTGGGATTCGTTTTTGGAATTTCTATTCGCCTTTGTTACTTCC:1 - chr3R 5188179 3' - INE-1 500 1 74.66 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCA:1 + chr3L 9242073 3' + roo 335 2 68.79 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTGGCAAGGG:1 - chr3R 11549799 3' - 297 6636 2 67.12 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCAGAC:1 - chr2L 13546948 3' + P-element 2843 1 57.53 AATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCAATGTACTAACACCATTGACCAGCCAGATGTGGGAAATATAAGGACGATTT:1 + chr2L 8397298 3' - roo 13 2 77.40 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTG:1 + chr3R 29709075 3' + blood 7337 1 52.05 GTTTCCCGACTACCAGATACCCGTTTCTTAGTATCAACGGGAGGCTATGATGAGTTGGAACTGCATTTTGCGTGTAAGTTTCAATTGGTTTCTGTAAAAAACAGTTTATTTACTATTAGGCAGAAATATACATTTTATTGACGTCA:1 + chr3R 4954464 3' - INE-1 556 1 76.03 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAACGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCT:1 - chr2L 12355290 3' + hobo 2909 1 58.00 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGGAAAG:1 + chrX 3506208 3' - Tirant 11 2 73.97 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGTTCGTTGGGCGTGGCCATT:1 - chr3R 7424520 3' + 412 448 2 52.74 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGCATGTCTGGGCATGTCC:1 - chrX 15089439 3' - P-element 8 2 80.14 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCAAAAAAGATTCTTTACTAATTATGTTCATAAATTTATCAGTAAACAAATTAAGTTCCTTTC:1 - chr2L 17747359 3' + Tirant 8487 2 72.60 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTCGTG:1 - chr3R 25271140 3' - 412 28 2 67.12 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAACATCAAGGAATCTCGTGTATATCGTAGGAAAGCC:1 + chrX 3506210 3' - Tirant 9 2 75.34 CTCCATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAAAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGATACAATAGCAGATAATGTGACTTTGATAGTCTAGAATATAATGATGTTTTTATGTAAGCAAAAATCTTGACATCTATTAAGACTT:1 - chr3L 13488135 3' + Doc3-element 4418 1 50.68 TAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGATAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCATGTAATTGATATGGCGCTCATAGAGCACATAGCACATACAGCAGTGCGTATGTATGGAGTTGGAGATTGGGGACC:1 + chr2R 24705823 3' - Cr1a 3977 1 52.05 CAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAAAAAACTGCTATAATTTGTTTTAAGCGAAAGAGACGTATTTCTTTGCTTTAATTATTACCATTATTTC:1 - chrX 9243597 3' + Quasimodo 7149 2 53.42 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCA:1 - chrX 17258212 3' + 297 327 2 65.07 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGC:1 + chrX 3452537 3' - Tirant 8132 2 64.52 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGGATACTCATTTTCGGAACGCCTCGCTCTCTCCGC:1 + chrX 13762622 3' - P-element 83 1 24.11 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCA:1 + chr2L 2519934 3' + roo 9042 1 64.38 CAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATG:1 - chrX 18193730 3' + hopper 1333 1 75.34 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAATGCAATTCGCTTT:1 + chr2R 20700772 3' - mdg1 14 2 76.03 CTGCCTCCAACCGAAGACTTGGCGGCCTGAATAAATTTGATTTGCATTTAGTTCGTAAGATACCAGAATTCAGGGCAGTTGGCTCTAATAAGAAGAATAATGACCGAACCTTGATTTGATCGAGCAAACTATATATTACATATCTG:1 + chr2R 7893235 3' + gypsy10 236 2 66.44 TCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTATAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGCAGAATTAAATGGCAAAATGCCTATATATATATCATATTTTTCAG:1 + chr2R 9327047 3' + mdg3 5425 2 65.75 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGG:1 - chr2L 535434 3' + roo 9023 2 67.59 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAG:1 + chr3R 24175768 3' - Burdock 6199 2 64.03 GTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGCTACGCCGGCAGCGCTGCTCCTCGACTTTGGCTAAGAAACCTTGGTATGTAGATCATAAGAGCATTGACAAATTGACTTCT:1 + chr2R 3194096 3' - McClintock 5951 1 68.49 AGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTG:1 + chrX 21667920 3' - gypsy2 86 2 73.97 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGTATACGAACAAATCCACTCTTCTGAGAAATTATCGAGATCTCGTAAACAATTAGTTCTAGAAATTTTCTTTTAAAATCTC:1 - chrX 14756637 3' + pogo 2063 1 59.59 CATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGAAAATAGATGTAACACTCGTAGCTCAAGTGTCCTCAATCTATGTATCTTTGTATCTCAATTTCGTTACTTTTTCA:1 + chr3R 22050805 3' + pogo 21 1 53.79 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCC:1 - chr3L 1387155 3' - mdg3 90 2 76.03 TCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAAAAATTAAATAATTTGAGAAAAAAATGGAAAAAATATGAA:1 - chr3L 18920425 3' + Juan 4127 1 79.45 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCT:2 - chr3R 31956378 3' + pogo 2050 1 53.42 TAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAACTAAGGTATGAAAGACTGTAGCTGAGAAATGCATTTTTAATTGAAAAGGTGATCGCATGGCTTG:1 + chr2L 9687895 3' + jockey 4548 1 56.16 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAATTGGAAAAATGCTGAAATTTGCTAGCC:1 + chrX 3452571 3' - Tirant 13 2 78.08 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCCCGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCAATCTAGCCAAGCGGTAAATTCATCATAT:1 - chr3R 10288759 3' + copia 234 1 69.18 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAACTAGGCATGAAATTGTATAG:1 + chr3R 20452303 3' - blood 41 2 58.22 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTAAAATTTAAATTTTAACATTTCGCTGCATACTTTCA:1 + chr2L 1136432 3' - 1360 32 1 62.33 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGT:1 + chr3R 23507709 3' - 412 7081 2 63.70 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGTGAGCCCCAAAAACGCAGACCAAAAATTCCAAATCCAAAACCGAAAACAAAACCGTAATCCGAAAAAACAAAACAAAATCAAAGCGGGAAACTCACGTAGCTCCGGCGACA:1 - chr3R 22429080 3' + roo 400 1 78.77 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATTCGTATCAACACACTGATAGATACAACGCTTTGCATCTACGTACATATGTTTCAATCGTAACTAAGTTCCGTTATTCTTTGCCAACGCGA:1 + chr3R 3257592 3' + Burdock 227 2 66.44 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTGGAAATATTGATATCACGTACTGTTGCTATAATTGAATTATTTATGC:1 + chr3R 26765224 3' + mdg3 5474 2 64.38 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGAGTGTGCAGCTAA:1 + chr2L 15965348 3' - blood 21 2 71.23 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCAT:1 + chr2R 7098024 3' + copia 5043 2 76.03 CAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCG:1 - chr2R 14553228 3' + mdg3 5441 2 57.53 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTATCCTCGCCATCC:1 + chr2L 12481546 3' + pogo 2057 1 55.48 TTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATAAGC:1 + chr3R 3527180 3' + Tabor 7270 2 51.37 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAATATCGGCTAGTTGTTCATGGGTT:1 - chr3R 4884357 3' + pogo 2060 1 57.53 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTA:1 - chr2R 7223658 3' - blood 7076 2 63.01 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACTGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACA:1 + chrX 15089554 3' - P-element 97 1 19.18 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCT:1 - chrX 15814506 3' - P-element 59 1 45.21 ATTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGGTATCCCGCTGAGATACTGCTGATCCACCCTCATAAAGCGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTCAATCGATTGTACGCCACAGTACAATTATAGCAAAAATCCCCACTAG:1 + chr3L 1320954 3' - gypsy7 5092 1 74.66 ATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTGATCCACTCGCCACTCTGTACAGAGCGCGGCAGTCAACACGTCGGTCCCTCTCCCTCTGGCGTTCACCTTCGTTGACCGCATG:1 - chrX 20895980 3' + mdg3 5329 2 67.81 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGGTACAGAATTTCCAGGCAATCCTCAGGCTTCAAGACC:1 - chr2R 9164784 3' + 412 484 2 78.77 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAAT:1 + chrX 12551801 3' - pogo 67 1 66.44 GTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGAATTCAGCGAATTATACTGTACTTTAAAAAACATGGGAGATAGATGTATTTTAGCTACTCGAAATTATTGACCGCACTATATAATCGTATTTCCACTGAAATAATT:1 + chr2L 20825034 3' + pogo 3 1 58.90 ATCCTACCGACTGCGCAACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTCTATGACGAAGACAAACATGTCCCTCTCATGTGGATTCCTTTGACTGCTTATAATTGGACGCGGTTGTGTTCTGATGACAGG:1 - chr2R 20624524 3' - rover 363 1 52.52 AATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAAATATGCTCTAAGTTCACACGAAGCGAAAACTTCCCTCTCTTAGTATTCACCTCGCTCTTTGC:1 - chr2L 2279646 3' + Stalker4 7231 4 57.53 CGACGGTCCTCCGCTCCGGTGTCTCTTCCTTCCAACTTCTCCGCAAAAATATCAAATTCGAATGGGAACAGCAGCAGGAAGACACATTCAACGAATGTAAACAGAAGCTCACCTGTAAGACGATTCTTGTAAGCTACCGTGTAGAC:1 + chr2R 4877924 3' - gypsy8 4588 1 76.03 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTTCTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTAT:1 - chr2R 8305221 3' - blood 7085 2 67.81 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCAT:1 - chr3L 13597742 3' - blood 58 2 58.22 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCGAGAAGCTGCGCCATAGTTTCGATGAAGAGGAGCGTAG:1 + chrX 7329346 3' + Bari1 1689 1 71.72 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTG:1 + chr3L 14043631 3' - Ivk 50 1 51.37 TTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTTAAGGGTGGTTAATGCTGATGG:1 - chrX 19231695 3' + mdg3 230 2 74.48 AAAGCAGTGAGGCATCACAACTATACATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAATATGTAAGCATGCATTATATAGGAATATATAACTATGTGTTTAGTTAAGTGAATTAATCACC:1 + chrX 19342707 3' + diver 219 1 56.16 CGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTTTAACTTTCTTTTGTTTGGCCACATTTTGCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTG:1 - chrX 9951318 3' - hobo 25 1 68.49 CTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTATATAGGGTGCCGTGGTTGTAAGTACTCGCCACAAATACACACAACATACATTAGAAATGTTAAA:1 - chrX 23439050 3' + R1A1-element 5194 1 69.18 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAGAGAGCGTCGG:2 - chr2L 16685331 3' - P-element 89 1 25.34 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGATCTGTCGTG:1 - chr2L 19424624 3' - Tirant 18 2 69.77 CCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAATAAGAAAAGCTCTGGG:1 - chr2L 15965237 3' + blood 288 2 79.31 CAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAATGTTCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATGATGTTAAATATACATTCAATATTCAGTCAATTTGTAATAACATCTTAGAGGGTAATTCAAATGTCCATCCTTGTGGTG:1 - chr3L 18005072 3' + Cr1a 4262 1 55.94 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTG:1 + chr2L 17069647 3' + 412 7487 2 59.59 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTAAGACTTAGTTTCGGGGA:2 + chrX 17469305 3' - blood 7042 2 65.07 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGT:1 - chr3L 9430588 3' + P-element 2804 1 31.51 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACCTCAAAACAATATCA:1 + chr2L 2338189 3' - blood 7047 2 61.64 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAG:1 + chr3L 16887412 3' + roo 9037 1 54.47 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGTGCCTTCTTCGATCGCGCTGGTCCAG:1 - chr3R 23254372 3' + pogo 2085 1 75.34 TATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCACACGCTTGATTGACGCAGTGCTGTCGCTCCTTCCTTGTTGAGTTGCTGCATCAAATAGGTCAGC:1 - chr3R 8753257 3' - 412 7276 2 56.16 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTCGAAGTATATAATATTCCCATTTTATATAAATTGCTTAGCGCTTTTAAAGTTTCT:1 - chr3L 19146554 3' - pogo 48 1 62.33 CTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTTGGAGACCAAACCCCGTAACTTGAACAAAAGAATTAATTAGAATGTTTTAAATAAAAATTCTAATT:1 - chr2R 1686237 3' + GATE 55 3 54.44 ACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCT:1 + chr2R 4551462 3' - roo 245 2 54.11 TTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTAAAAACCCAAAAAAAAAAGAAAATAAAAACCAGACAGAAAACAAAGAAGTCTGAAGGTGGTAAACCTTTTTCCCCAACTTTTAAT:1 - chr2R 25131571 3' + pogo 1749 1 58.04 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCT:1 - chr3L 5446088 3' + roo 9021 2 52.74 GCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGAAAAGCCTAACTAATTAGAATAAGCGGCAGTATGAAAGCAGTGGCAAATACTAAATAAATGGAATTCTAAAGACGA:1 + chrX 18249077 3' + GATE 8276 2 69.18 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAGCGTGAGAGTACTTGGGGAAACAGAGGAGCTCACTTGGCTTGTTTTTGAACAGTT:1 - chr3R 10140155 3' + P-element 2854 1 59.59 AAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTTTTTATTTTCTTGTATATTTCACATTTTTAATTTGTTTTTTTGATTTATTTGCGGTCCACCCCTGTGACCACACACACGAGTGGGCGAGTGGGCGCTGAAAATGGAGTGGGCCGCCATTG:1 - chr3R 8538169 3' + S-element 1529 1 51.37 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAAGAAAACAGGCAAGCACTTAACAATTAACCGATCGTTCCTGTAATTACCGAAAGCCCTAAATA:1 - chrX 13651449 3' + 297 6925 2 57.53 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTGTATAACTGTGTAGAACTATAGAGATTTACAGGACT:1 - chr2R 8862005 3' - pogo 30 1 63.70 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCT:1 - chr3L 4869164 3' + roo 393 1 58.43 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAG:1 - chr3R 6103564 3' + Tirant 8457 2 51.72 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTATGATGGTTGTTACACGATTTCTAGGGTTTTCATACTAGAAGGACATTA:1 + chr3L 18297036 3' - Juan 4095 1 53.42 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCGCAGGAGATTG:1 - chr2R 19900980 3' + mdg1 355 2 62.33 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGATACTCATTTTCGGAACGCCTCGCTCTCTCCGCTCATTC:1 + chrX 13762628 3' - P-element 82 1 28.77 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGT:1 + chrX 11534528 3' - roo 8733 2 66.44 CGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGTCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAATCCCCGTCGTGACGTGATGTCCAACGGTTGGACGGCTCATCGATTTGCA:1 - chr3R 16306211 3' - 1360 3364 1 65.07 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTATACAAAATCTACGGAAAACCAGCCC:1 + chr2L 14222395 3' + Transpac 296 2 76.71 ACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATCTAAATGAATGTGCACGCAGAGAAAATTAATGTATCACTTACTATCACGATCGAAAAGCACTCCATTAAGTCCAA:1 - chr3R 11461749 3' - 17.6 42 2 57.53 TATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACATAATTCGAGCGTTGATTGTGCTTTCCATATATTTGCGCTTTAGTTGCGGTACAGTGCGGCCTGGCTATGTGTGA:1 + chrX 5856806 3' + accord 202 2 51.03 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAA:1 - chr3R 5087024 3' - P-element 75 1 34.48 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTC:1 - chr3L 19397032 3' - F-element 80 1 65.07 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATGTATGTATATGGCGAAAATGAAGAGTTGCCAGCG:1 - chr2R 17945145 3' - 297 6637 2 77.52 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGG:1 - chr3R 19700863 3' + roo 9019 2 60.27 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAATCAAATATTTATAACCGCTATCAACAACTTTTGCTTTCGTTGTT:1 + chr3L 2148869 3' - 412 65 2 72.60 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCA:1 - chr2R 20913114 3' - 1360 64 1 60.27 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACATGTACAGTACCCCCCTCTGCGCTTCTCAATGTTATTAGGAACGTAACAATATCAAGAAATGTCAACATCCCTTTTAGTTGATGGTTGTTTGATGTTAAATAAGTTTTCAG:1 - chr3L 20925696 3' - Transpac 7 2 78.08 GGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAAGTGTAGAATCATGTAGCGTTCTTCGATATTATAAAGTTGAATTAAATACAGCTCCTTTGATGTGATGCAATACAATGCTGAGGCAATAACGAAGT:1 + chr2R 14717930 3' - Max-element 8262 2 65.75 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTTGCGCGGTACTGCGTGGAAATGCTGTGTGATTTACTTAGCAAA:1 - chr2L 18048209 3' - blood 15 2 73.97 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGATTGGCGGGCCGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTAC:1 + chr3R 25753702 3' + hobo 2905 1 52.43 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAATTTGGGGCTAGGTTTTTATTTCTGAGTGACTTTCTTTGGTTTATGTTATTTCAT:1 + chr2L 11471945 3' + roo 8978 2 64.38 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATGTATGCTTATTTAAGAGCGCTATTCACAGATT:2 - chr2L 1229529 3' + opus 486 2 73.97 AGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGAT:1 + chr3R 30731507 3' - gypsy6 7447 2 63.38 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTTAATACTAGCATGGGACGTATCG:1 + chr2R 4551487 3' - roo 8877 2 64.75 ACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATTTAAAGGGCAGATCCCTCGGTCACTCTGAACAGCCCAATATAAAAAAAA:1 + chr3L 21641015 3' + Quasimodo 7114 2 69.18 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAAGTGAGCCCCAAAAACGCAGACCAAAAATTCCAAATCCAAAACCGAAAACAAAACCGTAATCCGAAAAAACAAAACAAAATCAAAGCGGGAAACTCACGTAGCTCCGGCGACAG:1 - chr3R 22429079 3' + roo 401 1 79.45 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGTGGAGATCGCTTGAGCCGTTTATTTGGG:1 - chr3R 14088566 3' - 1360 72 1 67.12 AATAATTTTGTTGTTTTTTGTTGAGGAGTTTTGGTGAAGGAAAGGCACGCGGATCGGGAAAGTAGTGACAGCCATAGGGTGACCAGTTGATACCCTTGTCCACCACATCCCTTTCACGATCTCTGTCCTTGTCCGATCTGCTGCCG:1 + chr2R 10818164 3' - gypsy11 3935 1 82.19 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCAGACGCCC:1 - chrX 8502188 3' + pogo 2036 1 74.22 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAGTGATATATGAAGAGT:1 - chrX 14385124 3' - blood 7045 2 62.33 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAAT:1 + chr3R 22846819 3' + 412 447 2 53.42 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCC:1 + chr3R 23507667 3' - 412 7123 2 65.07 TTTTTATTTTTTTTTTATTGATATATAAAATTCATTCTTGGTACTTGAGAACACCTTAAGTTTTTATGCATTATTTTGAGCAAATGTCGTCGCAAATTGAGCCACTAACACACACAGGCAGCAAATCAAACCTTCATTAAACACAC:1 + chr3L 7835833 3' - R2-element 3583 3 78.08 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTTCAATGCCATGCC:1 - chr3R 10079241 3' + P-element 2878 2 78.08 AAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATCAATTCCTTCAAATTATGCTTAAGATGGTAAG:1 - chr3L 10506726 3' - S-element 61 1 63.01 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTGACAGTTACGTTTGAAATTGCCGTTTGGAAAGAGAATGGAAACG:1 - chrX 5892087 3' + transib2 2750 1 68.49 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGGGTGTTGGAGGCGCCTGGAAATATGCAATAAAATATTCATGATTTCTGTGCAGCAAAAACTTTCAGAAAGTTAATAAAACTTTGCCACTGCTGGTGGGTAATG:1 - chr2L 15621797 3' + hobo 2929 1 75.17 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTTACTTTAGCGAACTTA:1 + chr3R 24693710 3' - hobo 11 1 78.08 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCG:1 - chr3L 14969187 3' + P-element 2843 1 51.37 CATAAACAATTAGGACCACGGCGATGGTGATGCCACTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCAGCGACATAAAGGTGAGTTTGCGACTGCCCTTTTGGAGCACACAGACA:1 - chr2L 4837566 3' - gypsy4 6434 1 71.92 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATATTTGGCCAAAAGGAAGAGGACTCGACGACATGCTGACGCTTTGCCAACAAGCAAACTGGCGAATCTTAATTTAATTTCCAGACC:1 + chr3R 12578092 3' - jockey 4706 1 59.59 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCTC:1 - chr2R 9332109 3' + roo 9025 2 51.37 CAATGATGTCAAAGCAGGGAAGCATCACAACTATTCACACTATATATTTTCTCTCAGAGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTATCGACGGCGCGTCGCTCGGCGCTTG:1 + chr2R 13574859 3' + diver 209 1 55.56 GCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGTCTCCGTCTCCGCTCGAGTGTCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTTGGTTAGTTGTCCGCCGGTGTGTGTGTGTCTCTCGGCTGACCATGCCACGCCCTGCGGCT:1 - chrX 19112142 3' - Rt1a 21 1 68.49 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATA:1 - chr2R 8305226 3' - blood 79 2 72.60 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTGCGGCTGTTGCATTTATAATTGATCTCGACCCAAGCGATTTGCATGATCTGCGAGCTACCCACCTAA:1 + chr3L 6773431 3' + pogo 2068 1 46.92 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATACCAAGTATCTTAGGATGATTTGAGCTGGTGTCTTGCCGTATTTCGCTGCCAACGCCAGTAGCTTGGAATCAGTGTAGT:1 + chr3L 12500267 3' - FB 40 1 58.22 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAA:1 + chr3R 9345688 3' + pogo 2057 1 55.48 AGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAATCCTTGTTGACTTTTATCCTTTTTGGAATGTGCCCGTTCATCTTGGCTTAGAACCA:1 - chr2R 9326909 3' - mdg3 5262 1 78.77 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGCACACCTGCTGTTTGATTTGTGTTTTTCT:1 + chr2L 17730570 3' - pogo 15 1 76.22 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGGTTCCTTTTAC:1 + chr3R 25753702 3' + hobo 2903 1 57.14 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCATCCAATGCCTTCTTGTTTGAGTTTTATTACGATGCTCTTGACCGGTTTTATTGCCCTCAATATTTCTTGCATATTCTGGCCACAACTCATTCAAC:1 - chr3L 16535128 3' + copia 229 1 65.75 GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTAGTAGACCTGCATTAACAACATTAACGAGTTAACCGGGACATCCGCCAGTCT:1 + chr2R 6168336 3' + 1360 3320 1 64.38 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCATATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCC:1 - chr3L 16180873 3' + Transpac 291 2 62.26 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTGCACTAAATGCAGTTAAAACAACGCA:1 - chr3R 25521748 3' + blood 361 2 73.97 GAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAACGCCCACGGCGCCAAAGGCGTAATCAGTGCCCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGG:1 + chr2L 1382476 3' + micropia 5186 1 51.30 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTTAAATGGTTTTTACAAAGCTATTTATTATTATAGATCGTTATG:1 - chr3R 12608001 3' + roo 395 1 76.71 AAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGG:1 + chr2R 5900952 3' + Bari1 1671 1 62.33 CCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGA:1 - chr3R 4885319 3' - 1360 59 1 66.21 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAG:1 - chr3L 14969174 3' + P-element 2856 1 60.27 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAG:1 - chr2R 21078454 3' - jockey 27 1 62.69 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACG:1 + chr3L 20290770 3' + roo 344 2 62.76 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCAGATTAAAAATA:1 - chr3R 6103550 3' + Tirant 363 2 60.96 GAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCG:1 + chr2R 5900955 3' + Bari1 1674 1 64.38 TGCTAGATATCCCCGACAGGTTTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGTATATAGAAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATTATATGTGCCACGTTGAATGTCCTTACCGAGCTTATATCCGA:1 - chr3R 23040506 3' + G4 3703 1 73.79 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTC:2 + chr3R 22846796 3' + 412 424 2 65.75 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCACTAA:1 - chr2R 5214925 3' - F-element 42 1 60.27 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTA:1 - chr2R 20913092 3' - 1360 42 1 56.85 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATTAAAATGGTAAAACTGCACTCATTAACCTTCTAACTACTACTAAATG:1 - chr3L 176372 3' - Transpac 4988 2 65.75 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTTATTTAAGTATCCAACATTAGTATCACATTAGTTTTTTTTCTGTGTACCTTGTGTACTCGTCAGACGCTAGTTT:1 + chr2L 9669656 3' - roo 8674 2 62.33 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATTTTGGGATCGATTCAGATTTCA:1 + chr2L 1074039 3' + Tirant 8473 2 61.81 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAAT:1 - chr2R 18123415 3' - 412 56 2 55.48 TGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCATGTCTCTTACTTCGCTATCTCTCCTTGTGCCGTATCTTATTCTCCTTTGTTGCAGC:1 + chr3R 19570441 3' + Stalker 298 4 61.64 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAGCGATCCTTCCGCGTAAAACCAATGTAAGCAGTGCAGTGGAAAACCCAACCATTATTTT:2 + chr2R 24630225 3' + copia 194 2 61.64 TAAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTCACCAAACATTTCGTAAACCGATTTCTGGCCTTTGTCGTGACTCTTGTTAAAATAGCAGCGTATTGCGTTCCCCATCGGTTTCCCTCTTAACCT:1 - chr2R 15711306 3' - mariner2 770 1 72.66 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCATGATCCCCATGGCTGACAGCATCCTGAACTC:1 + chrX 20552855 3' - roo 87 2 78.08 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGG:2 + chr3R 25521873 3' - blood 82 2 72.60 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTTAAACGG:1 + chrX 4566267 3' - Transpac 4966 2 54.11 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCGTGTCAATTTAAAGCGACATTTATAACCAATTTGTAATCAATTCTAACAATCAGCTAACGCATCACCCCACCATCCCCAGCCA:1 - chr3R 10562097 3' - I-element 38 1 58.22 TGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATGATATTGAATTGTTTTATCCCAAAACAATAA:1 + chrX 10873871 3' + mdg3 5408 2 78.08 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAG:1 + chr3R 10541346 3' - hopper 63 1 59.59 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCCTTAATAGCTACCAGAATATCAACAAATTGCTTCGAGTCGATGGGAGCGTTGTGGGAGGAGCATTGGG:1 - chr2R 19985684 3' + copia 202 2 55.48 AGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTACTCGCACGAAACTGTCAATGACTGTCAAGGTCACCGATCGGTTAAGGAAACGATGTGGCGAT:1 - chrX 9058324 3' + P-element 2537 1 38.36 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAG:1 + chr3R 5245647 3' + 1360 3368 1 57.65 TGTTGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGG:1 - chr3R 443029 3' - gypsy2 6514 2 66.21 ATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTTATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCATATCCCTTTATATATCCTTAAGATGCTATAGAT:1 - chr3L 3829893 3' + Tirant 190 2 73.29 AGGCAACGATCTTTTGGTCCCAAGGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAGCTATATATGTTTGTGGGGGGGGTGGAGTGTATC:1 + chr2R 23225848 3' + Transpac 267 2 67.37 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCA:1 - chr3L 4869154 3' + roo 9020 2 56.30 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGC:1 - chr3L 18708625 3' - F-element 98 1 78.77 GTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACTGAGTATTATGTTCTGACTATAATTGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chr2R 16256876 3' + Cr1a 4158 1 84.25 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTT:1 + chr3R 20292534 3' - pogo 52 1 56.16 CTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTTCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGA:1 - chr3R 7739679 3' - blood 64 2 58.90 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCTACCCACATCAACAATAAA:1 - chr2L 10912221 3' - Doc 65 1 59.59 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAAT:1 + chrX 21668835 3' - mdg1 7094 2 56.16 GCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTATTGGCTCAGTGCACTTGAACATCTATTTGTTTACTGACGGATTTGCGGCGTGACTAAC:1 + chr2L 7155190 3' - roo 261 2 60.27 AGTTCGGTAATAATCGAACATTATTGTTAAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTGGTTCTTAGGAATTATAGTTCTGACTAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAGAGTGCCTAAGAACAACTAAAGCAAACTTAAAGCCAAATTG:1 + chrX 5396749 3' + Circe 449 1 54.11 ATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTCGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGGGCCACAAGGAGCAGTGCTCCTTGC:1 + chr3L 8253779 3' - jockey 4648 1 71.03 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTGGCCAACTTCGAACTTTTGCAGCGATCCGCGGGG:1 + chr2L 535540 3' - roo 8694 2 65.07 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGTCCATGTCCTTCAGTTATTACCAGCTCATAGACAATTTCTTTTTCATTTGTGAGATAAATATGGGATTAGAGTTTGT:1 - chr3R 11096631 3' - copia 4884 2 75.34 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGGTACCAACAAATTGCATTGAAGTC:1 - chr3R 13358539 3' + mdg3 236 2 76.03 TTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGCTAGTAGATAGGGACAGAAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 50 1 71.92 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTATATTATATTTAATCTAGTTATGGTTTAAATA:1 + chr3L 15891072 3' + mdg3 159 2 79.45 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCCGATCGCTCAG:1 + chr3R 24479264 3' - 412 70 2 65.07 CACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACCCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAAATTTCTTACGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTGCCAAACCAATGTATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 3220 1 50.00 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATTCATCTAAAGTCATGGGTAGACATAAAAAAAAAAGAAAATAAATATGCTTGAATGCAATTT:1 - chrX 12843533 3' - roo 9 2 76.71 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCG:1 + chr3R 8402640 3' + mdg1 7448 2 65.26 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCC:1 + chr2R 7223763 3' + blood 7336 1 55.48 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCATTCTGCCGGTCGC:1 + chrX 22824861 3' - jockey 4695 1 64.83 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGCTTTGGATACCCTACAG:1 - chr2L 1073865 3' - Tirant 18 2 74.66 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAG:1 - chrX 21668687 3' + mdg1 390 2 55.17 GGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTCGCCAT:1 + chr3R 11461879 3' + 17.6 7367 2 59.59 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCA:1 - chr2L 2690566 3' - hobo 53 1 54.11 ACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGAGC:1 - chr2L 20638344 3' - Doc 60 1 54.79 AGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGAAATGAAATGAAATTACGAAATGATTCAACGTCGGCGTGCCCAGGAT:2 + chr3L 24820649 3' + mdg1 7136 2 67.81 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGG:1 + chr3R 15649838 3' - blood 7100 2 77.93 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTA:1 + chrX 21213377 3' - Doc 78 1 66.44 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTTATTCGAAGCCATTTGGGTTTGTTAATTTACTAAAAGCTC:1 + chr3L 6096574 3' - roo 8745 2 76.71 ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGCGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTG:1 + chr3R 10468090 3' - opus 7189 4 67.12 AAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGA:1 + chr3L 19339440 3' - Tc1 62 1 54.11 CTGGCTAACTGGCGTTTTACAATCAATGAGCAGAAATGCAAACATGCCACAATTACGCTTAATAGGCGTAGCTGTCCCCCATTATTATTATTAGAACTTGAATAATTTCACAAAAAAAGATTTGTTTAAAAAGGA:1 - chr3R 18049740 3' + Doc4-element 2305 1 60.74 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTC:1 - chr3R 5087046 3' - P-element 98 1 19.18 ATGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAAATATGAAATAACAGAAAGCGGATAAGATAATAAAGAAG:1 - chrX 13061655 3' - mdg3 5263 1 77.40 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAGTATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTC:1 - chr3R 14331163 3' - Burdock 6193 2 65.75 GCGTGGCATGGCACATCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGCAGTTATTTAGGCCAAGACATCTGCAATAGCATTTGTAGGTACTGGTGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGCGAAGTCATAAGGAGTGAAGCGATCC:1 + chrX 22727594 3' - Helena 16 1 63.01 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCAAA:1 - chr2L 17747417 3' + Tirant 8429 2 71.92 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACATTGTCAATAGAATACAGCTAGAACCCGAAACCGAATCGAAAC:1 - chr3R 30568817 3' - roo 8741 2 71.92 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTC:1 + chr3L 24834440 3' - Doc 85 1 72.41 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCT:1 - chr2R 15613778 3' - P-element 86 1 26.71 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTGGCCAACTTCGAACT:1 + chr2L 535521 3' - roo 8713 2 53.42 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCAC:1 + chr3R 8542654 3' - roo 8751 2 78.08 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCATTTTATAATTTATTAACGTCAACATTGTTGCTGCTGGGCTGGCTCCCTTTTCCTTTCCAATTTCTTTCGTTTTG:1 + chrX 9710090 3' - pogo 43 1 54.79 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTATTGGTCCTGATGAAGTAATATGTTCTTTATCGAGTCAGAAAAGAACATAAACTGCCTACCTA:1 + chr3R 4464246 3' - 1360 58 1 56.85 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTGAACGGAGGCAGTAATAGCA:1 - chr2L 15965180 3' + blood 7361 2 65.00 TCCGCGACTTAGAATTTTGTCTTTCGTTCGCGTTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGAGCTCCGTATAAAATTACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAGTTAATAA:1 - chrX 17909681 3' - HMS-Beagle 305 1 67.81 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGAGCTAAAACACTGATAAAAAATAATGCAAAAAAGAAATAAACTTTTCTGTTTTTGTTGTTAATATCAA:1 - chrX 10960189 3' - Transpac 50 2 52.05 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTTACTTTAGCGAACTT:1 + chr3R 24693709 3' - hobo 12 1 77.40 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAG:1 - chr3L 18708578 3' - F-element 51 1 58.22 TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTACATTTATTTTTCATAACATTTGGGCTATTCCAGCCAGCTTGTGTAGGCAGTGCTGCGCAGCCCTGGTCGC:1 + chr3R 29489438 3' - TART-B 10199 1 54.11 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTAATGAATATGCCTCCCTGAAAACCCATTTTCAAGACCT:1 - chr3R 21924222 3' - roo 30 2 65.07 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGAC:1 - chr3R 25822972 3' + roo 342 2 65.07 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGA:1 + chr3R 21237808 3' - Doc 73 1 63.01 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAATCGATCCATGACACATGATCAAGAAAGCGAAAA:1 - chr2R 22671319 3' - jockey 4688 1 69.86 GAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATTATTAAGTCGTATTTTTCGTTTGGTATTACCAATTCCCAAACTGCCAGTAGCTCAC:1 - chr3R 30518924 3' - invader3 136 2 61.64 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTC:1 - chr3L 13597756 3' - blood 7083 2 67.81 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATAT:1 + chr3R 4722458 3' + roo 8988 2 75.34 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTCTATTCTCGGCTAATT:1 - chrX 17258180 3' + 297 6940 2 58.90 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTC:1 - chr3L 9375838 3' + mdg1 7403 2 64.00 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:2 - chr2R 20461151 3' - jockey 24 1 70.23 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCGGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTATAACCGACATAAAAGCCGCTTTTATTGAGGTAAAATGTTGGACTACAAATTGAGCAGCTATCG:1 + chr2L 9010555 3' + 1360 3363 1 68.49 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGATTTTATTAGCATTCGGTTGCCTT:1 - chr3L 20747060 3' - Burdock 28 2 66.44 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAAT:1 + chrX 16853401 3' + roo 8986 2 77.40 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCG:1 - chr2R 9164837 3' + 412 467 2 56.36 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAGAGTTAATTGGGTTAAACCCGTGCGG:1 + chr2L 8772825 3' - Tabor 62 2 58.22 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGG:1 + chr3R 4659579 3' + P-element 2786 1 17.12 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGTCTGGGCCGAGACAGCAGATAGGCCAACAGCCGAGA:1 + chr3R 23623991 3' - roo 25 2 70.34 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAACGTG:1 - chr2L 7667396 3' + copia 234 1 53.42 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGC:1 + chr3R 5087155 3' - P-element 6 2 80.58 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTT:1 - chr3R 8705708 3' - hopper 55 1 53.42 CAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCGCTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGTACAAAAATCGGCAC:1 - chr2R 2307899 3' + Stalker 102 4 49.32 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCAGGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCA:1 + chr3L 22481315 3' - roo 8713 2 60.83 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTATTTCTTTAAACCTCGTCTCAGTTAGCAAATTTACTCATCTATTTATTATTTGATTTATTTGTTGGCACACAAAAAAAAGGTTGGTCCATGCAAATTAATTT:1 + chr2R 16713124 3' - pogo 15 1 34.25 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAAGAGGTCACAAA:1 - chrX 21668668 3' + mdg1 408 2 65.07 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCA:1 - chr3L 4869154 3' + roo 9055 2 62.00 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAAGTGCACATGAAAGAGGGCCGCC:1 + chr2R 10991444 3' - jockey 14 1 81.51 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAA:1 + chr3R 20292517 3' - pogo 69 1 67.81 CGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACGGATTAAGTGTATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAGAAAACCTCAA:1 + chr3L 20747188 3' + Burdock 6324 2 71.23 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGATAATTTATAAGCAGCCTAAAAGCATGCTATTGTAATTAGATGGGCAGATTACATCCCTATTTACCTT:1 - chr2R 22798569 3' - hobo 11 1 76.71 CTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTTG:1 - chr2R 10478652 3' + invader4 3046 2 57.53 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGTTGCGCTTCTTTTA:2 + chr3R 25876963 3' + mdg3 185 2 56.85 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAG:1 + chrX 21639705 3' - Tirant 77 2 71.92 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAAGC:1 - chrX 14914325 3' + mdg3 207 2 58.22 TTTGAACTTGGCACAAATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTAAAGTTTTCGTTTACGATTGTCTTTTATTTTTGATCCTGCAAAGTCAGAGCTAATTCAACAAATCCAGTGCCTAAGAAAAG:1 - chr3L 22518336 3' - pogo 426 1 58.22 ATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAATTAAATTGTGTTGTAAAATTTATATAAAATGTGAAGTAATACAGCCATAGGATAACCAGCGATTGCCTAATGATACAT:1 + chr2L 13317579 3' + X-element 4672 1 46.58 CAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATTATTATTACTATTTTTGCATTTAG:1 + chr2R 9867207 3' + roo 367 1 56.85 CCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTCCAGAAATGCCCTGGTGGATTACCTCCTCGATGGAACGGCTATTAAGGAGGCATTGGAGCATGG:1 + chr3R 10780554 3' - mdg3 5157 1 56.16 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGTGGTCCATGTAGAATTCGATCACCAT:1 + chr2R 23313121 3' - Tabor 6869 2 63.70 GCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATTTCTTCAATTAAAAGCACGCGGCCAAGTTAAAAGAAATCG:1 + chr3L 16384303 3' + Burdock 6090 1 72.60 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTT:1 - chrX 15167672 3' - roo 8736 2 73.94 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATT:1 + chr3R 25521888 3' - blood 66 2 62.07 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTT:1 + chr3L 15035248 3' - pogo 32 1 62.33 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAA:1 + chr3R 14331264 3' + Burdock 223 2 42.47 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCATTTGACAGGCGAGCATAAAACCTCAATTCG:1 + chrX 10538268 3' + pogo 2081 1 70.55 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTTATGTACTATCTAGAATTGATTTCCAAACTCAATTTGTAATCTCTTGTTTAT:1 - chr2L 4103995 3' + roo 9005 2 62.33 GGTCCTCCGCTCTGGTGTCTCCTCGCATAGGCAGCTTCATTGTTCATTGTGCGCCCTTCTCCAGCTTCCAACTGCTGCTTCCGTCTGCTCCTCTCCATCAGCTCGGTATTTGAA:1 + chr2R 4948502 3' - gypsy8 4584 1 55.26 AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACAGATTAAGTGTATGTATGTATGCTTGCTGACGGATGTTAGAAAACCTCAATCCATATATCAAAAGCACATTAGCACGAATTTGAATTGGCAATTGGTATTTACTTGG:1 + chr3L 20747245 3' + Burdock 244 2 76.71 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTG:1 - chr2R 21078419 3' - jockey 72 1 58.90 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGGTCATCTTGCGGATAAGA:1 + chr3R 29709084 3' + blood 7349 2 53.85 AATAATAAAGAAAAAAAAAAAGGTAAAAATATATGGATAAAATGAAGGGAAA:1 - chrX 5922937 3' + BS 5099 3 88.46 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGC:1 - chr2R 18123388 3' - 412 7082 2 60.27 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAGGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGTAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGCGCCC:1 - chr3L 22354431 3' - Doc 31 1 45.10 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTTAAACGGAGATC:1 + chrX 4566272 3' - Transpac 4961 2 57.53 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTG:1 - chr3R 25521787 3' + blood 7334 1 56.16 TCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGATTTTAAAGGTTAAAAAAAATGTAAATATCACATTTTTATTTCAAAATCATGGGCCCATTCT:1 + chr3L 455866 3' + roo 408 1 58.22 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGG:1 - chr3L 6751657 3' - pogo 65 1 64.38 GGCCTCCATTCTTAACAGCAAGTCATGCAATTCCATCTAGTTGTCTAGAACGCAAACGGCCATCAGAACAGTAAGGCCATAGTCGAACACCATATAAAAGCCCACCATTCTAGTGCTGCACGGACCGCTCGACCACAAAAGCCGCG:1 + chr2L 18298899 3' + G6 1581 1 73.29 TAACTGGCAGTCTCGGTGAGCGAGCAAGGACTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAGTACGCGCCAGTGCACGTACCGCGACCGCCCGCTCTGCGACACGTTGCGTATACGCAGCTTCGAG:1 - chr2R 24421898 3' + Rt1b 4990 1 51.26 GAGAGTAAACAAAACATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACAATATGGTCATTTAATAGTAATGTGTTATATTAATAATTTCTTTTAGT:1 - chr3L 24791845 3' - Cr1a 203 1 42.07 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTTATATAGATAGTTAGTTATAAATTA:1 + chrX 12551844 3' - pogo 24 1 69.18 TAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACTTGTTGGGGTGGCCGCTAAGTCTGTCGGCATATGTCCACCTGCAGCAGCTTTATGTTGACACGTGCAACATGCTGTTAACACCAACAATCCGCATGTGTGAGTGCCAGCAACACTTT:1 - chr3L 1109023 3' - G5A 2650 1 58.22 AGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATATTCTTGAGCAAATCCAGACGGGATTTGCCTTGGTTTGTGTTCAATGGCGTGGAATTTATTACGT:1 + chr3L 5778003 3' - mdg1 7162 2 56.16 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGT:1 + chr3R 23623956 3' - roo 60 2 62.07 CAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCATAAAAATCAATATT:1 - chr2L 22696391 3' - X-element 82 1 65.75 ATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGAGTGATTCCACGATTACCTTAGCATGGATTAACAGTGGTCAGAGTAAGATCAAATTTATAAGAAGAAG:1 + chr3R 19446389 3' + Transpac 206 2 54.11 AAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGTGCATCATTGCCGCTAATCAATAAGAGACGCCATTCATTCTGCTC:1 - chr3L 3137789 3' - FB 77 1 68.49 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGG:1 - chr3R 15589973 3' - Transpac 3 2 67.12 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCTTACTACCAGAGCTCCATAAAAAGTCTAAAATATGCTCGACAAAC:1 - chr3L 22481188 3' + roo 9051 2 72.60 GGTAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGCGGTGGCACGCA:1 - chrX 22858798 3' - mdg3 5261 1 80.82 GATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATATGGAGGGTATTGTTTCGTCGGCACTGTGTTCCCGCTCTTTGTCAG:1 - chr3R 1062084 3' + Stalker 7031 4 69.18 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTAGAGCACATCACAACTTTTCG:1 + chr3R 14049482 3' + transib2 2813 1 76.71 AGTTTTGTTGACTGTGTCTATGTTTAAGTCATTATGTATAATGTACCATTCGGCTTTTGTAATTATTCTGATCATTTTTGATTGCGTTAGTATTTCACCTTTGAAGTGAACGCACGTCATTTTTG:1 + chr2L 17131069 3' - Porto1 4409 1 67.20 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTGAACGGAGGCAGTAATAGCAA:1 - chr2L 15965179 3' + blood 365 2 73.60 CGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTGTTGAATATTAAAATATTTATGTAAAAAATGCAA:1 + chr2R 5079265 3' - flea 81 2 73.97 AAATAATGCAGTTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGTT:1 - chr3R 10099857 3' - pogo 40 1 54.70 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTC:1 + chr2R 20500127 3' - 412 7127 2 69.18 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTAATCTTATAGCCGTCGAAATCGTAATCTCAATTCGCCATCCCATCGCCATATCCTGATTGCCCCATCTGC:1 + chr2L 15142343 3' + BS 5045 1 56.85 GTCTGTCCTTCTGTGAACACCTACAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAATTCCCAGCGTTATGTCAGAATCGCTATCGCCGGTGAGCACTTG:1 - chr3L 4273496 3' + baggins 5012 1 70.34 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGA:1 - chr3R 20452156 3' + blood 342 2 60.96 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATG:1 + chr3R 15649882 3' - blood 46 2 54.11 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGA:1 - chr3R 8367127 3' - Doc 38 1 53.10 AAATTAAATTAAAATAATTATTATAAATTATTTTAATTGTAATAATATAACGATTCGTATTGTATGTATCTAAACCTTAACTCTGGCAGAGCAACTTTTATTCTTCCACTAATATAATAGTTATTAATTTCCCTAAGATTATTTAA:1 - chr3R 17085329 3' + NOF 3961 1 72.60 CCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCATACGGCTCTTGAGTTTGAACTTGAAGTGAAAAGCTAAGAAACTTTCTAGACTTCTTTTTCCTATG:1 - chr3R 27561552 3' + hobo 2711 1 59.70 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAG:1 + chr2R 18051057 3' + mdg1 361 2 65.41 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACTTAACAACACTTTGCTGACTAAATTGTGTCAGTCTTATATTACCCTCAGCCAAATCGCATGCCCCCACCTACCT:1 - chr3L 8067488 3' - copia 46 2 54.11 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCGAAAGGAATCAGTT:1 + chr3R 20149832 3' + 1360 3368 1 71.23 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGTTATTTCTGTGTAAAACATTGGCGGTCA:1 + chrX 10960299 3' + Transpac 250 2 60.27 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGG:1 + chr2R 7404804 3' + blood 354 2 62.76 TAGAGCCTTCGCGTCAACCAACAGATCACTTTTCCCCCCGATATTCAGTAACCTGTGACTGCCCCAATCGAACCTTTGGGTCTGGGCGGGGGCGCTGTTTCAGATGTGCTCTGTCCTAAT:1 + chrX 22827428 3' - Gypsy12A_LTR 472 1 77.50 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTTATATAGATAGTTAGTTATAAAT:1 + chrX 12551842 3' - pogo 26 1 67.81 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGGCTGCTTACGATTTATAGTGCAA:1 - chr2R 21380559 3' - roo 15 2 73.79 AAAAATACAAGAAAATAAAAAAATAAAAAGTGGATAAAGTGGCGAGGGTCGCAATTTCCTGCCCCATTCCAGCATAGACAATTGCTGGTCATCTGCGGTAAGGAACTCATTGCAAAGTATGTCCCAGGCAATCAAAGTGTTAACAG:1 - chr3L 2014776 3' + S-element 163 2 74.66 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATACCATAACAATATTTTC:2 - chr3R 19545335 3' - jockey 78 1 63.01 TCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAG:1 - chr3L 15371311 3' - Transpac 83 2 74.66 GCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGAATGCAACGGAAAACGAG:1 + chrX 22824838 3' - jockey 4719 1 52.74 ATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAAAGTAGTTGATGGTTTAATGCCTAACGAGGTAGATGTCTGTTTAATCATGGCATCTCATGGAAGTGAAGAGTTCTTGATT:1 + chr3R 13275041 3' + copia 466 1 69.86 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCGC:1 - chr2R 7223629 3' - blood 36 2 59.59 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCTTTAGTTTTTAACTGAAATTTAAAC:1 + chr3R 19545460 3' + jockey 4979 1 74.66 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTGGAGGGGTTCCTGCCGGGAACT:1 + chr3L 1387222 3' + mdg3 179 2 61.64 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGTATAAGTATACATATGTACGTCGCATTTTTAGCTGAGTAACGAGTATCAACTAAGGAAGTGAACTCTTTTATAACCGACAAGTCTACAAGCTGTTTA:1 - chrX 22959131 3' + 297 377 2 55.48 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGAC:1 + chr2L 10832345 3' - Doc 62 1 58.90 GGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAATAATAAACAGTGGAAGCGTCGGGCGGCAAGAGGCCCGAAGGACAAGGAATTCAGTGCTCACTTTCCCATCTTTGAAATTCTAAAACGTGCTGTATTTCTGCAAAATGCCCAGGAAT:1 - chr3R 14579668 3' + gypsy8 444 1 52.74 ATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAAATATTCCGCTCTTTTAAGCCAGCTTAGAGTATAAAAGTGGTCCGAGAG:1 + chr2R 10163686 3' - Juan 4091 1 75.34 AATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAATTTTGTGGTCTTTCTAGTAGTTGCACTGCGGCTCTTTGGACCCGG:1 + chrX 10623911 3' + jockey2 3405 1 66.27 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAAAAACCACCTGCCACAGCCACACAAAACCAAAATCAAAACCAGAACAGACAAACAAATAAAAATTAGTACCACAACCGATAATGCGCCAAGTAGTTACTTTAGCGAACTTAC:1 + chr3R 24693711 3' - hobo 10 1 78.77 TGGTTGCCACTCCTGATGCGCATATTTTTGGTTAGACATTGGAAATTTGATATGCAAACCACACGTGACATGATGGTACACTCGCATGACATGGCCCATCATTCCGATATATGTATATGCCCTATAAGGCAACCGATATCTTCGGG:1 - chr2L 2413037 3' - G2 469 1 71.92 AAAGTCAGAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTAC:1 + chr3L 16973492 3' + S-element 1683 2 63.70 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGGCCCGAAATTTTGGACAAATATACTAGATA:1 - chrX 21086073 3' - jockey 4710 1 49.32 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGG:1 - chr3R 18903381 3' + pogo 2050 1 54.79 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATATTATAGATTATATTATTGCAAGGACTACCAAAATTCGTGGCTACCACTTAAGCAGCAGAATTCAGTTTTAAATGTAAAATGTGCGCGCTTAATT:1 + chr3R 13494459 3' + opus 478 2 59.59 TCTTTTTTTTTTCGTTTTCTTTTACTTTATTTGTATTTGTTAACAATTTCTCCGTGGCTCAAATGCACACACACACGGACAAAAAAAGGAGGAAGAAAGGTGAGCAGCACAAGAAGCGCAGTAGGAGAATACGGTAAAATTGAAAT:1 + chrX 18931026 3' - Doc2-element 219 1 54.79 TGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAATCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCGTATTAGGCATTCCCATGGGCGGAGGGGGGAAGGGGGAAGTTCGGAAAGGGCAGGGGTCGAGAGTTGAGCGA:1 - chrX 3121954 3' + diver 176 2 47.26 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACAC:1 - chr3R 9481997 3' - roo 48 2 53.42 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAGGCAAATATCTCCCCGACCCACTGT:1 + chr3R 12795168 3' - mdg1 7053 2 75.34 GCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAATTGTTAGCACTTTTTCAATAGCACTAGATACGGATTGGTATGTACATATATGCAATGGCTGTCGATCTGTTTGCACACTTT:1 + chr3L 7859309 3' + mdg3 5401 2 54.11 GTATAACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTATGATGGTTGTTACACGATTTCTAGGGTTTTCATACTAGAAGGACATTAAATCATGTATAAAGTCGCATTTTAATTACTTACG:1 + chr3L 18297070 3' - Juan 4062 1 76.71 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCAAAAAACAATATGAATTTTCCCACAAAG:1 + chr2R 16383392 3' + roo 9030 1 48.63 TGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGAGTTCATAATTTCACTGGTCGACT:1 + chr3R 22810805 3' - flea 42 2 56.55 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATTCACGAAAACGGAAGGGCACAGACCGAATTGCCATCGGAGGTACAGCGATCTTCAAGTACAATAGA:1 - chrX 8895191 3' + roo 357 2 52.74 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCT:1 - chrX 5222842 3' + 412 447 2 53.42 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTT:1 - chr3L 24153161 3' + Tabor 7274 2 51.37 CAATGAAGTTCTGGCATTTATACAGTGCTTTGGACGTCAGGGGGATCTTTGAGTCATAAAAGGGTAGTACTATAGTCAATATCAACAACCATTACAGCCTTTTCGCAACCCAAAGTTGAACGGCACGACGACGACAATTCGGACTC:1 + chr3L 25708929 3' + baggins 5334 1 71.23 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATA:1 + chr3R 13358701 3' - mdg3 5303 2 51.37 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGGG:1 - chr3R 15589972 3' - Transpac 3 2 67.57 GGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGCATCAGTCGATGATCTACATAAACACACACTGAACAAAATCAATATTTCAATTAATGGTAAAA:1 - chr3L 3978219 3' + opus 201 2 56.85 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCG:1 + chr3R 22846810 3' + 412 7491 2 56.16 GCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACCATACGCCCGACACCATACGAATGTCGTCTCTCATTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGACTGGGAGAATGTGTGACCGCCTGTCTGTG:1 + chr2L 4110057 3' - Rt1a 26 1 50.34 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCGATTAA:1 - chr3R 19700841 3' + roo 9041 1 64.38 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTAAGACTTAAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTA:1 - chr3R 23099086 3' + roo 343 2 63.01 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTAATAGACATT:1 - chr3L 15371258 3' - Transpac 30 2 65.75 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCG:2 - chr2L 20984314 3' - blood 7087 2 70.55 AATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAAGATTCTCCAAAATTGTACAGCTAAC:1 + chr2R 6559000 3' - mdg3 82 2 80.14 TCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATTTCATCAATTTAACAGTAAATTGTTTAGTGCACGCCCTCTCCGCA:1 - chr3R 11002086 3' + flea 4939 1 72.60 AACAAAGAGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTAT:1 + chr2R 21897986 3' - 412 51 2 51.37 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTAATTATGGAAAAATGTATGAAGAGAATACTATATAATAATAAATATTTTTATATATCAAGTGAGGGCTACGACTTTAGGCCAATTACATGAATTCATAT:1 + chr2R 8794028 3' + Transpac 295 2 68.53 AGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAGTTTTTGTATCTTGAACGGTAACAAATCAAATCAAAATTCAATT:1 - chr2R 20015127 3' + X-element 4636 1 68.49 CATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCC:1 + chr3L 18592072 3' - Cr1a 499 1 43.84 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATT:1 + chr3R 21237791 3' - Doc 90 1 74.66 TGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCC:1 - chr2L 1073931 3' - Tirant 8191 2 73.29 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAA:1 - chr3R 7739669 3' - blood 7065 2 53.42 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAA:1 - chr3R 16194105 3' + mdg1 376 2 54.11 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGGGCAACTTGCGTTAATTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCTAGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACT:1 - chr3R 10468009 3' + opus 7460 2 52.14 TTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGA:1 + chr2L 11867396 3' + BS 4992 1 57.24 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAAATGGAATTTTGGTACAAACACAGCGAGTTTCTCTGTGCAAAT:1 + chrX 10979144 3' + roo 393 1 69.23 AAGGATTTGCGTTGTCGACATCGAGGCTCCACTTTGCAGCTTGATAAATCATGATATTTAACATTACGTAGAATGCAAAGCGGATTGATGTTGGTGAAGGTGGCATCTGATTATTGATTGCTTCTAGCTTTCACTTGACAGATTTC:1 - chr2R 20748129 3' - Chouto 6263 1 76.71 GTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAG:1 - chr2R 14562123 3' - Burdock 73 2 71.92 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGAGCGCCAATTAGCAACGG:1 + chr2R 5900929 3' + Bari1 1648 1 59.59 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAA:1 - chr3R 7739670 3' - blood 55 2 54.11 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGA:1 + chr2R 9164915 3' - 412 7136 2 72.60 TTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAA:1 - chr3L 27356058 3' + Tc3 1659 1 60.96 AATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATGCAAACAATATTTAATTACTAA:1 + chr2R 14884367 3' - mdg3 5288 2 52.05 CTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 228 2 96.04 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCCACGATGTAGACTCTAATATT:2 + chr2R 5992438 3' - pogo 19 1 72.60 TTTCATTTATATACAAATACATTGTGTGTGTTGTGTGGGGTTGTTGGTGTATGTGTTTCCCTGACGATAAAGTGTTTTGGCTATCACCTGAACGGCACAGAGTCACCTGGCTACCCATTTTCCTGCCAATTCCGGAGTGACTCTTT:1 - chrX 10693752 3' + transib4 2459 1 74.66 CTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTA:1 - chr2L 15153226 3' - G-element 34 1 55.48 GCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCCGAAATGGTTAAAATCGGA:1 + chrX 22386818 3' - hobo 65 1 64.23 CAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGAGGAAGGAGAAATATTCATATCTTTGTGCGTGTATTTGCCAAAGGTCGCTGCCGCCTTTGTTCACTCGGTCATTAAGCATTTGATGCAACAAATTGAATGCA:1 + chr2L 5785958 3' + Juan 3805 1 74.26 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATGAACTTTATCTTGAC:1 + chr3L 5183832 3' + copia 231 1 67.59 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTG:1 - chr3L 19397026 3' - F-element 31 1 54.37 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAATACTGGGGGATTGCCCTTTATTAAATAAAC:1 + chr3L 16764863 3' + I-element 5264 1 78.08 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCA:1 - chr4 311205 3' + 1360 3316 1 69.18 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGCAATTAATTTCGCCTTGGGCCCGGTCGAGTTCCAAGTGCT:1 - chr2R 11379680 3' - jockey 23 1 72.59 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTA:3 + chr3L 17667606 3' - F-element 94 1 73.29 TTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAA:1 + chr2L 14222359 3' + Transpac 260 2 56.16 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAG:1 - chr2L 2357300 3' + P-element 2805 1 29.45 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACTCATATGCAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCGTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAA:1 + chr2L 14262938 3' - blood 38 2 50.36 CTGCTCTCTAGCTTTATAATTTGACTTTATGCCAAACAAAAAAGGAAATCTGGATTATAAATTTCTCTGAACTTCTCCTCCTGTTTACTCGAACTTTAATGTTTACTGAACTTACAAAACGTAACATCCAAATTCGGTAAAAAATA:1 - chr3R 13460850 3' + transib3 2824 1 63.01 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACCAACTCCTAACAT:1 - chr2R 8793861 3' - Transpac 4958 2 59.59 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTG:1 + chr3L 13722105 3' - blood 75 2 69.18 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAAT:1 - chr3R 19545352 3' - jockey 95 1 74.66 TAGGCCGCTACAATCGTACATATCTGTAGCTGCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAAATAGAACATATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACATATTTAGACCACCGAAAGGATTGACATTGAGGAGCGTTACTC:1 - chr3L 5357681 3' - rooA 7341 2 77.40 CACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 5366 2 68.49 AGATACCCGTTAGTCAGCTGGTGGAAAAAATTGTTTGTCTTTTAGATCATTGGCAAGATAATATATAATAATAGCTGAGTGGGAGGCGAAACAGCACGACATCCTGGGAATGTTGAAGCACTGCATAAAGCCAACTTGCAACGGAT:1 - chr2L 11571082 3' - INE-1 542 1 54.11 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAGATGAACACCCGATACGAGAGTTTCTCACGCTGTGCCACGACGGCGAAAGAGATGGGTATA:1 + chr3L 10856852 3' - P-element 26 1 67.81 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATC:1 - chrX 19498094 3' + P-element 2865 1 52.27 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAAAGGTAAACA:1 + chr3R 9163962 3' - hobo 46 1 53.79 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATGAGTGGTGTGAAGTGCC:1 + chr2L 1449723 3' + opus 7477 2 67.81 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGG:1 + chr2L 13884677 3' + pogo 2038 1 61.11 TGAAATTGTTTGCACAATGTAAACAGTTCGCAAAGCATTAAAGCGTTAAAAATAAGATCAGAGGAGCGGGCA:1 + chr3L 14636383 3' + S2 11 2 88.89 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTCAGATCTCTT:1 - chrX 5222824 3' + 412 469 2 66.20 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGC:1 + chr3R 26399917 3' - roo 33 2 63.01 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTATTTCTTTAAACCTCGTCTCAGTTAGCAAATTTACTCATCTATTTATTATTTGATTTATTTGTTGGCACACAAAAAAAAGGTTGGTCCATGCAAATT:1 + chr2R 16713119 3' - pogo 20 1 34.93 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCTGTCGCCGCCAGGCAGCATTCGAATGGAACCCACGTCATGGTGTTGCAGAGTCCTGCTCCGATCC:1 + chr2L 14139729 3' + Tirant 386 2 65.71 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGATTTATATATACTCTTAGTTGGGCAGTTGCGGCTGGATTTCATTCTGTGCT:1 + chr3R 18903530 3' - pogo 21 1 70.21 AAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAA:1 - chr2R 13574766 3' - diver 76 2 70.55 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAAT:1 - chr2L 18370313 3' - Doc 45 1 58.22 TCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGCATTGATAGACGGGGAACTTGACTATAGTATGCTCTCTTGTTTTATGTTACAAAGTATATTAATCTCTTATTGACCTGCCCATATTGCAGAAAAATAGTAATTGTTGTTAGCTTAATTA:1 - chr4 1128871 3' + INE-1 532 1 63.70 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTTGAAAGGTCAAAAATCGTATCTTTTATCTCTTTAAA:1 + chr2R 15392835 3' - blood 7042 2 64.38 GACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCATCCAATTTATCTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTTTGAATGCTCCCCGTTTAGATGCACGTCCAGTTTTTCCAGTAGAAGTTTACGAGCCTC:1 - chr2R 16292058 3' - Bica 4740 1 60.27 CATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTAT:1 - chr2L 15142230 3' - BS 4756 1 50.68 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGACTTGCCACATAGAGATGGCATGCATCTAACCGGTCAATCGATT:1 + chr3L 9426767 3' + P-element 2884 2 68.24 ATCAAATAAAATAAAATCATTTAAAAGCAACCTATTATAACTAATCATCTTAATCTATTGCTTTGTATAAGCCACAAATACGACTGAGAATTTCCTATCTTTAATAGGCGCAAAATTAGTTGATGGGAGAAATGAAAGGCAATAGC:1 + chr3R 13398352 3' - transib1 1895 1 78.08 CGAGTTTCTCGACTATCAGATGCCATTTACTCAGCAGTGGTAGTGCAAAGCAAAAATGTTTATATAACTTTGTAAAAGCAGAAACACACTTAATATAATTACAATATATACTACTAACTTTTTGATTTTTTAATGCATTTTAAGGG:1 + chr3L 18702826 3' - INE-1 559 1 62.33 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAAA:1 + chr3R 15030753 3' - jockey 84 1 68.49 GTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCT:2 - chr3L 24153173 3' + Tabor 423 2 59.59 TAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTTGTTGCCCCGATCATATGGTGGATTTG:1 - chr2R 10478627 3' + invader4 3071 2 74.66 GTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGGCAATGAAATCAT:1 - chr2L 19878162 3' + mdg3 5434 2 62.07 GACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7213 2 71.72 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGACAACAATTT:1 + chr2R 19543798 3' - jockey 4776 1 71.92 TTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCGAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGAAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCGGC:1 + chr2R 17014102 3' + HMS-Beagle 6960 2 71.92 GAACACCAGAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAAGAAAGAAGATGCTGATTGTGAAGATAGCGAGGTAAGAAACTGCAGTATTATATCACTTAGAACCCCTTAATTAACTCTAGATCAATTA:1 - chr2L 14601630 3' + HB 1442 1 58.22 ATAGTTTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGTGGCGACGAAAAAGTTACGCCGGCGGAAGTTCATTTTATGGCCATCTCTCTGGCGCTGTCACTTCC:1 + chrX 6938269 3' - hopper 34 1 60.96 TTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAATAAGAGGGCCAAGAGCAG:1 + chr3L 9198643 3' - F-element 88 1 68.28 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCTTTAAAAAATAGACTATATTGAAGGGCGTTCATATATTACAAATACATATAAGTAAAATTAAGAAGCAAATCCT:2 + chr3R 9258789 3' - 1360 43 1 56.16 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCA:1 + chrX 22824843 3' - jockey 4693 1 60.80 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGA:1 - chr2R 18807776 3' - jockey 79 1 62.33 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCATAAAAAACAATCGACAAATTATTATGCCTGATAAAATACGGTGAGCATATGCTGCATACGGTGAATCCCCGCCAGCAACTCATTCCATAGGAAGTGAATTGGCATCATAACAA:1 + chr2L 13877830 3' - Transpac 4923 2 80.14 GACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCTTATTGAG:1 + chr2R 4270297 3' - gypsy9 24 2 53.42 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAAGGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCTTTAAACCATTTCATATTCATATTTATTATATAAAATTAAATGTT:1 + chr2L 17638769 3' - blood 76 2 67.12 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAGTACAACCCCGCATGATTTTGTGAGTTTGAGTGGTGCAATTGCTTGT:1 - chr2R 24630080 3' - copia 4885 2 71.92 TTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTTCAAATATGCATAAGCTAATTTCATACATACTTTTCGGCCCACGGCATCGATGCTGCTGCT:1 - chr3L 20183776 3' - F-element 4455 1 58.90 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATA:1 - chr3R 23968598 3' + jockey 4916 1 74.48 ATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCACTGTTGTGATTGTGTGCGGCATAATTGCATGCGATTATGCTGCCCGCTC:1 + chr2R 19822789 3' + R1A1-element 5208 1 67.81 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAATCAGC:1 + chrX 14692952 3' + Transpac 258 2 56.85 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCATTCGGTGCAAATAAAAAGTCATATAGTAAAACCAAAACACAAAAAAGGCACAT:1 - chr3L 15321909 3' + Transpac 5220 2 80.14 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAG:1 + chr3L 27391410 3' + 1360 3353 1 56.16 CGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGATAGGGATGTAGATAGATGATAGATGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 15 1 50.35 AGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAATACCGTTCCTTTAAATACTGCTTACTCTGCTTACAATGGCGGTATAAAAAATATAGCGTCTGGCAG:1 - chr2R 2959621 3' - Max-element 57 2 56.85 CTTGAGGCACGAAGTGCGGGCACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTATTTTTTCACACGCCGCAAGCTGATTTTTCACACTTGACCAAATCCCTTCGTCCTCTCCTCCAGGACAACGCAGCTTAGTGGGAGGTGAGGAGCAAA:1 - chr3R 29333527 3' - 1360 473 1 48.63 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAA:1 - chr3R 31907321 3' - Tirant 8143 2 58.96 ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAAT:1 + chr3R 5765420 3' - opus 73 4 71.23 GCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAACGGGGAAAGCTCTATGGGAATGGGTTGACTCCTGTTC:1 - chr2L 14139640 3' - Tirant 79 2 73.24 TACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAAGGACGTCGC:1 + chr2R 2949171 3' - 17.6 6945 1 73.97 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCGCAGGAGATTGATTAAGGCTCTGGCTGATACCTAATAATTTTAATTTCCGTAGCACACTTAAT:2 - chr2R 19900928 3' + mdg1 407 2 75.34 ATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCA:1 - chr3L 15371312 3' - Transpac 84 2 74.66 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATT:1 + chr3R 15030749 3' - jockey 88 1 71.23 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCTCCAGAAAGAAACAAAAGAGAACTGAAGGACACG:1 - chr2R 9332077 3' + roo 393 1 69.18 GAATGGAGGCCACCAGCTGTGTCACTTGGGCGAACATTCTTTCCATCATCCTCTCCATCATGCCTTTTTATTGGTTTTTTTTTGTTGTATATTTTTTTTTTGTTGCTGCCTTTGATTTGCATTTAAAACGTTACGAACCCGCAAAA:1 - chr2L 5600010 3' - G6 1570 1 52.05 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATC:1 + chr3L 17447535 3' - Tirant 8185 2 74.66 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTACAGCTCTTTACTCTTTAGATCTC:1 - chrX 5222826 3' + 412 462 2 63.01 GGGCCCCTTTTTCCAACCTTCTTCTTTAAGAAGGCCCACAAATTTTCAATGGGGTTTAGATCAGGACTCTGAGGCGGCGTATCGATCACCTAAGGGTGACCCACCGGCGCAGGGGCGGAGCGCTATTAGTTGCAAAATAAATTGTT:1 - chrX 21486039 3' - S-element 1275 1 62.33 ATGTTTAATCCTAAATTTCTTATATTCTAAGCACTGTAGTAGAAGTAACTTATATTGCTTAGAGTAAAGTTTTCGCTCCTTAAAGCGCCATCGATCTTCGCTCTGGCCGAGGTAAATTCAATCAAGTTCTGCCATTTGCAAGCCAA:1 - chr2R 7135080 3' - S-element 1468 1 71.92 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGCACATGACAATATTTAAATAAAATATTTTTATCGCAGCTCTCACTCTTCTTCAGTG:1 - chr3R 25822924 3' + roo 391 2 71.92 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAGT:1 + chrY 311461 3' + 1360 3386 2 53.42 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTATTAATTCTCATAAAAAAATTGGTTAGTCTGGCCAAATCAGTCAAGGCAGAACTAAAATAAATAGCAACAAACGCAAAATGTGCCAAAGTCCAATGAAAGT:1 - chr3R 21588936 3' + flea 4997 2 74.66 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAATATCGATTCGCAATGGAATCAGACATTAAAACTGACACACAGTATATAATATGTTGTACAAATGTACATATGTATATATATATGGCCGGTAGGTATTAACTGAAC:1 + chr3L 16157325 3' + Juan 4195 1 69.18 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTGGCTCCGCGT:1 - chr3R 22659911 3' + 412 431 2 61.64 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCTGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCC:1 + chr3R 4659581 3' + P-element 2804 1 20.77 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAGAGCGTTAGGCGCTGACTACTCG:1 - chr3R 15465432 3' - mdg3 5265 1 75.52 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTC:1 - chr3L 4869163 3' + roo 338 2 65.28 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCTG:1 + chr3L 16181001 3' - Transpac 4935 2 68.80 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTA:2 + chr2R 21897985 3' - 412 7105 2 53.42 AAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGATTTTTGTTCCATCTTCGAGACAGATCCCTAACGTGATAATCTTTTAAATTGCTCAAATTTTA:1 + chr3L 14961413 3' + invader4 2909 2 59.59 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAA:1 - chr2R 5214968 3' - F-element 85 1 68.49 CAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGGACTGGGG:1 + chr3L 15371371 3' + Transpac 5161 2 72.18 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTAGTCACT:2 - chr2R 5992284 3' + pogo 2048 1 56.16 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATGTATGCCGCCTGC:1 + chrX 14385252 3' + blood 7328 1 59.59 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAA:1 - chr3R 20292396 3' + pogo 2065 1 63.01 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACG:1 - chr3R 27503014 3' - hobo 44 1 53.24 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAGTAACGATCATTTTAGATATAATTATACAAAGGTAACTTAAGCGAAAACCTAATCATATATCGCAATTATTTTCAAAATGTGTAGAATATTAATCAATGAAATTT:1 + chrX 13460671 3' - Quasimodo 9 2 73.97 GAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTTCGGGCCGAAATCATTAAACGATCTGTCCCAGCGAAGGTCAGCGGAGTGAAAAACACGCATGTGC:1 + chr3R 23486669 3' - 1360 3280 1 55.48 ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTACATTTAAGCAATTTAGTTGTCGGCGCTGCAAATGTCGCAAACATTTTTCGGTTCGGCATTTTCGCAAAGACGAAATCAAAAACCAATTAGAG:1 - chr2R 20483247 3' + copia 5058 2 58.22 CCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGGTCATATTTAAAAAGAAAAAGGAGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATATTTCAAGACGTGATTCCTTAGTTTTATGATTCCTTTTTT:1 + chrX 10258003 3' + Tc1-2 1172 1 77.40 CAAGATTGCGGCCGTCCTCGGTTGGTCCTAATTCAGCGATCATCCCGTTTAACTGGATTGCAGATCTCAGCTCTCCGATGTACCGTAGACAGGTGATGCCGATGCAAACCAAATAAAATCCAAACGCGCGCCATAAACGAACGACA:1 + chr3R 20609765 3' - gypsy3 6544 1 75.34 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATACCAAGTATCTTAGGATGATTTGAGCTGGTGTCTTGCCGTATTTCGCTGCCAACGCCAGTAGCTTGGAATCAGTGTAGTAATCGGGCAGCGGATTGCAGG:1 + chr3L 12500288 3' - FB 19 1 72.60 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGTAGCTAATAAAGTTGCAAGTGGTCGCCGTCGTCTGAGTAGCAGTCTGCTAACCATGGCCGGATCTAGGAGGCT:1 + chr3L 22529888 3' - roo 11 2 77.40 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTC:1 - chr3L 9426694 3' + P-element 2804 1 27.40 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTGTTAAAATATAT:1 - chrX 21639567 3' + Tirant 8495 2 76.71 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCTTAGTGAAAAAATACAACTGAAATATAAAATTTCAAAGTTATACTTAAAGTATATTTT:1 + chrX 23043223 3' + roo 9012 2 58.90 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTAATGAATATGCCTCCCTGAAAACC:1 - chr3R 21924236 3' - roo 44 2 55.48 GGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATTAAGTTGATACTAGCAATACTAGCTA:1 + chr2R 9033978 3' - F-element 4502 1 72.14 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTCTCTTTTCTCCCTTGGTTCATCTTCG:1 - chr3R 31956340 3' + pogo 2088 1 76.71 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCAT:2 + chr2R 24427618 3' - jockey 4739 1 60.96 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGA:1 + chr3R 20368084 3' - Max-element 8261 2 58.04 CTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATTTTCAAAGAGATGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTATGCCCATATACTTGTCGAACAGGAATTCGCCCACCTGGTTTTGTGCCTT:1 + chrX 13107524 3' + Q-element 247 2 66.44 CTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTGTTTGCAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTCGCCCACATTATAAACATTTTTACATTTATTTTTTAAATCTCATTTCCAATAACTATTCTTACCCCTTACCTATATAGTGGAAGTGT:1 - chr2R 6160956 3' - Tc1-2 1477 1 43.84 CTTTTAGAGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTATTTAACAAAGAA:1 - chrX 11547816 3' - mdg3 323 1 55.48 GCACTTGTGTTTACCCAGAAACAATGTTGAAACACAAGATGTAAGACAATCACTTGTAGGGCAATAACTTATATTACGCGGCCTCCGACTGTTTCGGACTCCGACTGTGACCCTCACAACGATTCCGATTCTGGTTCTGATTCC:1 - chr3L 22654820 3' - HMS-Beagle2 48 2 50.69 GCCTTAATAAATAAATTAAATAAAAAAAACTAATTAAGAGACGTTTCTTATGGACAAAATAAGTACGCAGAAATTTGTCTGTTCAATATTCATTTTCACTGGTTTCTCTTTAAAACTTTGTCTAAGACGTCAGTAGGAAAACTAAG:1 + chr2L 22696522 3' + X-element 4711 1 79.45 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGTGCAGCAGGAAAACCAGAATACTACCAACTCTCAACCGAGTGCA:1 + chr3L 14969355 3' - P-element 8 2 77.40 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCATTGGCCTTTGGA:1 + chr2L 15965336 3' - blood 33 2 63.01 ATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGT:1 - chrX 292425 3' + G3 4509 1 64.38 TGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAAGCAGCAACAGCATTTGCCATTTGCCATTTGCCGGAGGTGCGAGGGGCCAGGCTTCACTGTACCGTCCGT:1 - chrX 3525829 3' - R1A1-element 5004 1 52.41 TATAGTCGGAACATAATACTCTGTAAGTATCTAAAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAATAGAGAAGTTAAGTTAAGACTATGCCTTCATAAAGATGATTCACAGTGAGTTTCACATACTGGC:1 - chr2L 9124326 3' - Cr1a 4190 1 71.23 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAGCTCTTCAAATGTATCCAATAAT:1 - chr3R 6068249 3' - jockey 4706 1 62.33 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATTGGTTCCGGTTGGTTTCA:1 - chrX 9709953 3' + pogo 2055 1 57.53 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGACAAACAAATAGCAAAAAAAAAAATGAATAAGAGGGCCAAG:1 + chr3L 9198638 3' - F-element 94 1 71.92 TCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTA:1 + chrX 8200272 3' - flea 4839 2 77.40 AACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCCCCAGTCCCTCTCGCTCCGGTTCCCACATCCCTCCTTTATTTATCAGCTTGA:1 - chr2R 3292695 3' - hopper 2 2 64.38 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCTTTAAAAAATAGACTATATTGAAGGGCGTTCATATATTACAAATACATATAAGTAAAATTAAGAAGCAAATCCTTTTAAAAGTTTACTACTTCAC:1 + chr3R 9258810 3' - 1360 22 1 70.55 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCAGCTGACCAAACATCCCATCCACCTGCCCCCGTAGTCCA:1 + chr3L 22221285 3' - 412 12 2 77.40 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTTCATCTTTTTTGCCGGCATTGCCTCTTCGTTGCCATGAGATTGGATTTAAAT:1 + chr2R 20500181 3' - 412 19 2 71.23 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATACACTTAAATGGT:1 - chr3L 14581336 3' + pogo 2081 1 71.92 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTC:1 - chr3L 13721996 3' + blood 7351 2 58.62 TATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATATACGAGACTCCGCCGATTTACAACTACGTGCCGGATGCAGA:1 - chr3R 28993948 3' - McClintock 305 2 71.72 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATGAACTTTATCTTGAC:2 + chr3L 5183832 3' + copia 230 1 67.12 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTG:1 + chrX 11534517 3' - roo 80 2 73.97 TGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAATTTTTCATGCATCTTCAGTGGCGGCTGCTGACTGCGATGCCTTCGACCTTC:1 - chr2L 8279617 3' + invader1 244 2 63.31 AAATCAAAAGAAGAAATTGAGAATGGTTACTGTGTGCGTATAGATATTGATATCAATATTTTAGTTAAAGTGTCACAGTCAAACAAACATACACAAAACACACACATATATAGGTGTACAGGACATACACATACATACACATAAAG:1 - chrX 12577098 3' + 412 7473 2 65.75 GAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGCTTGCTGCTAAAAAGTGTATACCAC:1 + chr2L 19372157 3' + Bari1 1674 1 61.64 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATAAATGGAATTTCGAAGTTCCTCTTCAGCTCCCAGTAAACCCCATTTTCCGAGTAAAAGACAAATATGTTCGTTTGTTTG:1 + chr3L 16264723 3' + Burdock 6350 2 57.53 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGAAACAAATTTTATTCGCTGACTTGGTTGACTTTACCCGCATAGTAACAGATAAAAATATTTATTAAAAACTGACGTTAGTCT:1 - chr3R 23664358 3' - pogo 36 1 56.85 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGAGGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTGAAGTTGCAGGAA:1 - chr3L 19279092 3' + opus 459 2 58.90 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAA:1 - chr2L 15965210 3' + blood 7325 1 60.96 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAATCAAGAGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGCAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAAAGGT:1 + chr2L 17069671 3' + 412 458 2 57.53 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTTAAATGGTTTTTA:1 - chr3R 12608031 3' + roo 9039 1 60.74 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGA:1 - chrX 15089520 3' + P-element 2799 1 24.83 TCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGC:1 + chr2R 21056769 3' + Tirant 8433 2 69.86 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCTTCATTTGAAAAATAGTTTCCTATTCCTTTTTATATTAAAATACATTTTATAAGATTTTCAAATTATGAGATTTGTTT:1 - chr2L 9669491 3' + roo 9029 1 51.37 AGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTT:2 - chrX 12893350 3' + Bari1 1635 1 67.12 TTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATA:1 + chr3L 16973462 3' - S-element 63 1 64.38 AGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTCTCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAG:1 + chr3R 20368073 3' - Max-element 8305 2 64.14 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTTACCCT:1 - chr2R 9332110 3' + roo 9024 2 52.05 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAAC:1 + chr3R 30568891 3' + roo 9002 2 66.67 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTTCCAGTTGATTGGCTGCCTCCATAAG:1 + chr3L 20977476 3' - I-element 36 1 61.64 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAGGAAGGGAGATATATTCGTATATACACTCA:1 - chr3L 21097083 3' - mdg3 5281 2 65.75 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCGTGCAATGCCAGCGGAGTGAAGGGAGTGACTTTCTGTTAACTGTTTTCGTTATTATTTTAGGGATAGT:1 - chr3L 52935 3' - roo 8715 2 52.74 TATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAGTA:1 - chr2R 21897862 3' + 412 7498 2 49.32 ACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTGTATATATATATGTAATAAAGAATACATATCGTCGCTAGTCAGAACGTTGTATGCACAGCCGAGGGCCCAGGAGATTTCGTGGCC:1 + chr2L 2881281 3' + Stalker 212 4 61.64 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGCACACCTGCTGTTTG:1 + chr2L 17730556 3' - pogo 32 1 65.07 TATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTTAATACTAGCATGTGACGTATCGCCATATGGGCTGGGA:1 + chr2R 4551502 3' - roo 8869 2 73.29 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCGAAAGGAATCAGTTATCACGATAGG:2 + chr3R 20149843 3' + 1360 3379 2 78.77 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGCATATGTTTTGTAACAGCGATTTTAATAAATTGTAACTCGATCAATAAAAATTGTATAACTGTGTAGAACTAT:1 - chr2R 8862021 3' - pogo 46 1 52.74 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAACA:1 + chr3L 4869251 3' - roo 8727 2 63.01 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAG:1 + chr2R 2529356 3' + 1360 3330 1 56.85 AATGCTATAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATAACCGTTGCTCCGTTACTAAATTAATATATTATATACATTTATGACCTCGGTTTCTGTCTCGAAGGGTGCTTACAGAATGCGTGCGAATTTGGATGGCAGGCACCAAT:1 + chr2L 17034766 3' - INE-1 570 1 51.43 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTA:1 - chr2R 5067639 3' - F-element 89 1 76.03 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAG:1 + chr3R 12608127 3' - roo 83 2 78.77 ATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATGGTGTGCCACTATTGGTACCAACATCTGGACTACTTGTTTCCGAAGCGCACCTATAAGGTGGTTGTAGT:1 - chr3L 11870942 3' + mdg1 7275 2 52.74 GCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGCATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTTCCTTCTCGAGCTGGATGAAGCCTCATCATCGACAGCATTAAAGTCAA:1 + chr3R 18653013 3' - 1360 3276 1 65.75 ATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCCCACTGCACTCGTGGCTGGCAGATATAATGAAACTAATTAGCATTTGACAAACACCAATCTCATATTATATTCCTCATATACAGTGGGCGTTAGTTTGTACAAAAGCAAACG:1 + chr3R 10138348 3' + P-element 2759 1 77.40 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGTTGGCATTAAGCGAGGTTTTATGCAGCCAGC:1 - chr3R 10973161 3' - jockey 24 1 70.92 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCCAAAGGCCAGGGCAGACAGACACATACAACACACGAAAATTG:1 - chr2R 18882526 3' - roo 8683 2 69.18 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGTGGCC:1 - chr3R 7424523 3' + 412 446 2 52.41 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTTTTTTAAAATATAGTCTCCCCAACAGTAACACCTCGTTTAACCTTATT:1 - chr2L 17638662 3' + blood 343 2 65.75 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAGTTTAATCAAAATGTTTATCAACTG:1 + chr3R 8402686 3' + mdg1 7443 2 72.60 CGGACCGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGAT:2 + chr2R 4270284 3' - gypsy9 5050 2 50.00 CCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTACATACATA:1 - chrX 5439979 3' - accord 40 2 51.91 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTCCAATGGCCTGGTGGAGCGGCACTTTGTGAGGAAGTACCTTCTGCCCCGCGGATACAATGCCAATGAGGTAATCTCGGACATATCCAGCGATGGCATCCTCACCATCAAGGCTC:1 + chr3L 9375976 3' - mdg1 8 2 80.14 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTAAAAGCGAGAATGTGCTCTAGTA:2 - chr3L 4710678 3' - Doc 22 1 73.29 CAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTG:1 + chr3L 1387201 3' + mdg3 158 2 76.03 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAACAATTTGTACATTGAGGTCTATCCTGTGATATCCT:1 - chr3L 19396979 3' - F-element 27 1 70.55 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAAATTATAATTGAATTCAATAAAGTTGTCG:1 - chr2L 1449554 3' - opus 140 4 65.75 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTT:1 - chr2L 17638709 3' + blood 297 2 71.92 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACA:1 + chr3L 4869248 3' - roo 66 2 65.07 TTGATCAAATAATAAAAACATCAAAAATTGGCTTAAAGTCGGTCTTTGTTTTTATGACATGGCAATAAAAGCAGTTGAAAAGTAAACAAAATAAATCGCTTAAAAGAGATTAAAAACATGTTTGTATTAAAAAAAATACAATGTAC:1 + chr3R 18357551 3' + jockey 4984 1 77.40 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGGGTTCTTAATTGGAGGTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGAGATTGGTGTAAATGC:1 + chr3R 22846772 3' + 412 404 2 78.87 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTTT:1 - chrX 8082363 3' - roo 8719 2 56.16 GTCAACTAAAAAATTATAACAAATTAATAAAAAAAATATACCCTCTCAAAGACGTCGGATAAATGATGGCAAAAAAGGTTTGGCTTTCAGGAAGTCCAAAATTCGTAATAATCGGAGGACTAATGGTAAGCTTACGTCAAAAGATG:1 - chr2R 4711793 3' - Tc1-2 1380 1 69.18 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGGAAAAATTGTTTTTGTAGA:1 - chr2L 1229583 3' + opus 7435 2 66.44 GGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATATCATCCTTACTAAAGTTTAACACATACCATACCCATCAAAAAAACGAATCAAACGCAGTGATTTGAAGACCGCCCTTAAAGCTAAACAAAGAGTGCTTTTTG:1 + chr3L 11596408 3' - gypsy6 13 2 76.71 GGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATTAACGGAAGAACACCTCTCCTTTCGGGAGA:1 + chr3R 2999878 3' - McClintock 31 2 64.83 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTA:1 + chrX 14136583 3' + roo 359 2 49.32 TGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATG:1 - chr3R 443031 3' - gypsy2 6517 2 64.38 ATAAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATATTAATTTAGAATTTGTGTAAATAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATTCCT:1 - chr3L 19339313 3' + Tc1 1603 1 54.79 GACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTAGTTATGATTTAATCAAAACGCGCACAGCCATTTTAATTACCTTTATGTTGC:1 + chr2R 10478771 3' - invader4 66 2 58.90 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCGAGCCAATTTGCAAAATTTGACAGATTGCC:1 + chr2R 21227483 3' + mdg3 220 2 69.18 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAAGACAAGTAAGAGAAATCTTTGTAAATGTCTCGAA:1 + chr2L 1229727 3' - opus 140 4 66.90 TACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAGTAGATAGGGACAGTAGATAGGGACAGTAGGAA:1 + chr3R 9201037 3' - R1A1-element 5089 1 77.24 TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATT:1 + chr2L 1449669 3' + opus 7423 2 73.29 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGTTGTTGCTGGGCGTTCGATGGCGCTTGGTCT:1 - chr3L 13922265 3' + Tirant 367 2 59.26 CAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGG:1 - chr2R 5582152 3' - Cr1a 471 1 56.85 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATCCAACTGACGGACTGACAAGGCAAAGTGCACAACTTCATTTCACATTAATGCAGTCGCTTTAACTGAATTCGTCGGCTGGCTGTC:1 - chr3L 12250935 3' - flea 25 2 67.59 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAA:1 - chr3L 13597771 3' - blood 7098 2 78.08 AATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAA:1 + chr2L 6074099 3' - BS 46 1 55.48 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCTTTTACCCACCAGTTCACCAGCTAACCACCCAAAACTACCCACTGCATTCCGGCCTTGCCAACAACTTTACTATGCCAGACGACCGGCGGCAGACACTTTAAAGAGCTGCGG:1 + chrX 3524369 3' - roo 8668 2 74.65 TTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTTATTTAAGTATCCAACATTAGTATCACATTAGTTTTTTTTCTGTGTACCTTGTGTACTCGTCAGACGCTAGTTTTAATGCTTACA:1 + chr2L 9669667 3' - roo 8663 1 69.86 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGAC:1 + chr3R 7424630 3' - 412 68 2 64.38 ATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTAGCCATGGGCTATCGTATCCCGGCTATCGGTCATCCGAGCGCCTGAAGA:1 + chr2R 14705103 3' - roo 159 2 67.12 GGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCACTACAGCGAACCGATCTTTTCTACGCATACAGTGATTTTCGAGTGTCAACTTACCTCAGCTGGCTTTTCAGCCTCGCCATTTGTAGCCACC:1 - chr2L 8427517 3' + 1360 67 1 62.33 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAAGTTAAGTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCGGCCGTTTT:1 - chr3L 10370864 3' - copia 4915 2 52.74 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGC:1 - chrX 3529751 3' - 412 7131 2 71.03 AATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTCCCAGAAGTACAGACGTTTTTCTTCCCTTAGTGACTTTACATCCGCCGCCGGCGCAGCTCG:1 - chr3R 8399446 3' - baggins 5066 1 78.69 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTG:1 - chr3L 9375864 3' + mdg1 7398 2 81.73 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCCAAAGGCCAGGG:1 - chr2R 18882556 3' - roo 8713 2 54.79 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCATTTGACAGGCGAGCATAAAACCTCAATT:1 + chrX 10538266 3' + pogo 2079 1 69.86 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGG:1 + chr2R 11656138 3' - HMS-Beagle 35 2 61.64 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTTGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGAATAGTGCTTAT:1 - chrX 3529720 3' - 412 12 2 66.36 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTGCATGGATTCCCATTTCCCATCCTTCTGAAGGCGGTACTGCACCCGATCCGCGATTTGGTCGAGACCCACCTTCAGGAAGTCCCAAC:1 + chrX 8272574 3' - roo 7 2 77.40 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGG:1 + chr2L 2519877 3' + roo 8984 2 79.45 GTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCT:1 + chr2L 9356890 3' - Stalker4 81 4 75.34 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGTGAATCTGCCGCTGCTGAAAAGGAGGAGTCTCATCCACCCACTGCCTATATTCCCATTCCTGT:1 + chr3R 25384341 3' + mdg3 245 2 80.00 AATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACGTTTAAGGGTTCTTAAGTTGCATCACATTGATGCC:1 + chr3L 5294822 3' - R1A1-element 5095 1 76.03 GGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTTCCACCGCTGCCGC:1 - chr3L 19782216 3' + R1A1-element 131 1 61.74 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCTGCGGTTCAATTAAGTGTTGT:1 - chr3R 8402499 3' - mdg1 20 2 72.60 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATGAACTTTATCTT:1 + chr3L 5183829 3' + copia 227 1 65.07 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCGACTTTCAGGCCGTG:2 - chrX 16244846 3' - jockey 4778 1 67.81 CTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCT:1 + chrX 4566227 3' - Transpac 5006 2 78.77 TATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCTGCCCGAAAATATACATAAAGGTGAGGTGGTGGTGAAAGCACTGGAAAAGCAGGTTATCCCCGGCAGCAGAG:1 - chr2L 19064258 3' + 1360 3118 1 57.53 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGATTAATTGAG:3 - chr3R 25384146 3' - mdg3 26 2 67.81 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGT:1 + chr2R 15613872 3' + P-element 2848 1 58.62 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACATAAAAATGCCAACATTTGAAGCATAACATTTGGGGCAGAGGAG:1 + chr2R 22867501 3' - hobo 46 1 61.34 CAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGG:1 - chr3L 24153169 3' + Tabor 427 2 56.85 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCG:1 + chr2L 21237303 3' + P-element 2817 1 37.24 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGTGTGTATCATTTTGCTGCAGACACTGATCCAAAGATCGAAAG:1 - chr2R 18048755 3' + opus 7488 2 75.34 GTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATTATAAATATCTTCAAATTACTTGAATAGCAACAGCA:1 - chr3R 18847308 3' - Stalker2 88 2 77.40 AACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATAC:1 + chr3L 19339430 3' - Tc1 72 1 60.27 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTC:2 + chr2L 15965313 3' - blood 7067 2 54.79 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGACCCACATCGGAATGTTCAACAAAAACATTATATTTGATACACATATTGAATATTTATAATTATATGAACCAGATATCCGGCCGGAAAATTAT:1 - chr3L 22676237 3' - 412 7084 2 64.38 CTTTTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGCCCCAGGGTTCCGTTTAATAACAAAAACTGCTGTGACGAGAAAAAGTGTGGTTCATGTGTTACATGCTCATGTTTTTCATCTCTATTCTCGCTCTTTTGTGGCGTTAT:1 + chr3R 1443528 3' - INE-1 85 1 67.81 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCT:1 - chr3L 5514207 3' - Doc 75 1 64.29 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTACCCCCACCTGAGTGAG:1 + chrX 14136599 3' + roo 9048 2 46.72 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACCTAGTTTCCTTT:1 + chr3R 25753699 3' + hobo 2897 1 61.11 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCATATATTTGGGGGCGCGATTTTCGGGGGCTGAGCTCCTTTCGCTGTGTTGGTGAG:1 + chr3R 11553758 3' - hopper 46 1 53.42 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTC:1 + chr3R 9482107 3' + roo 343 2 63.01 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTTGAAAGGGTTAGGAAATGGGAACATGGGATGGAGATGGAAGGTGATAATC:1 - chr3R 24479178 3' + 412 7479 2 65.07 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGT:1 - chr2L 19424674 3' - Tirant 42 2 62.14 AATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACCCAGCTTTTTCCCTGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGTTATGCAGACCGCAGACAG:1 + chr2R 5022780 3' + Gypsy12A_LTR 99 1 52.31 CTGGAACTATAAAAGCTAGAAGGCTGAGATTCAGCATACGTATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAAATTGTTGACCCATGTTGCCACGCCTACTCTAGCTCCCTAAACAATCAGTTAAATTGTTTCTCATTTTATTCCCCACTA:1 - chr4 809179 3' + INE-1 155 1 82.19 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAGGCTAATACAAATCTGTAGTA:1 + chr2R 18123548 3' - pogo 29 1 64.38 ACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGAT:1 - chr3R 1047948 3' - invader4 2970 2 76.71 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTAACATCTACTATTGGTGCGATGTGCCCAAAAAGGC:1 + chr2R 17053115 3' + roo 323 2 75.34 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCAC:2 - chr3L 18708591 3' - F-element 64 1 56.85 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAA:1 - chr2L 9167420 3' + pogo 2047 1 59.59 AAATAATAGTAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGAACTTCTAAGGTGAATGGTATGGTCTATGATGTATCAAAGATGTATCTAGATGTATGTATCTAGT:1 - chr3L 23774126 3' - 1360 306 1 66.44 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGGTAAACAAATCGATCCATGACACATGATCAAGA:1 - chr2R 22671328 3' - jockey 4688 1 66.42 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAA:1 - chr2R 20500059 3' + 412 412 2 75.34 CAAAAGAAGAAATTGAATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCAC:2 + chr2R 10367565 3' + 412 424 2 61.64 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTTTTCAGGAGGGGTGCTGCATCCCAATCCC:1 - chr2R 6984256 3' - HMS-Beagle2 6890 2 80.56 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACAC:1 - chr2R 6984394 3' - Doc 27 1 64.12 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTA:1 + chr2L 15965294 3' - blood 7086 2 67.12 GTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 182 2 79.69 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCTCATTGGCAGATGGGGATGGCTTCGGTA:1 - chr3R 14097001 3' - transib2 34 1 57.53 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTTAAGGGTG:1 - chrX 19231709 3' + mdg3 215 2 64.38 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTAC:1 + chr3R 21924345 3' + roo 9002 2 67.12 CTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGATGTGCGAGTGTGGCATGCCGTTAGCTAACTTTCCGTTTACGTTTCTTTCTCTAT:1 - chr3R 21338543 3' - Idefix 270 2 63.01 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCG:1 - chr2R 20704136 3' + hobo 2907 1 53.91 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAA:1 + chr2R 14562280 3' + Burdock 232 2 44.83 ACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATATACCTTATATGTTCGGTAACGGTACACAGGTACTCTGAAATTCGCTTACGCTTACGTAGATTATTAACCCATGACACTTTCATTTGCAGTACTACAGACAGGCCAGGGTTAAGG:1 - chr3R 15142840 3' - INE-1 91 1 63.01 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTG:1 - chr2R 21380627 3' - roo 8748 2 75.34 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGAC:1 + chr3L 5183796 3' + copia 5063 2 62.33 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAAT:2 - chr3R 24228872 3' - opus 7180 4 63.70 CAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTGCAATAAACAGTTTTCTTCAGTTGTTGCGTGTCCACCTTAAGAGGCCGAA:1 + chrX 653512 3' + 1360 453 1 76.71 GGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAACAAGATCGAAACTAATTACCGACACTTCAATGGACTGTTAGT:1 + chr2L 10364937 3' + invader4 2715 1 71.23 ATAAGCGTAGTGGACATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTATCGTCTCACAGTGGCATCGAATTACATTCTTACCCCCGCGGGAATGGCCACCAGTACGGCCA:1 + chr3L 14794780 3' + accord2 7388 1 55.17 CAAAAATGCATTACAATTATTACAGATGATTTATAATTAAATTCAATTATGCAGCAAACGAAACACGATGTGTTTGGATGCCTATCGGCTGGGCGGAGTTTTCTTTTCGCACCTTACCGCTCGAATCGATCATGAAAATTTACGAG:1 - chr2R 23312930 3' + Tabor 483 2 77.40 GGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCC:1 + chr2R 5849031 3' - mdg1 91 2 78.77 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGC:1 - chr3L 23146437 3' - 1360 27 1 67.12 GTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGGCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTTTCACATTTCCCCGAAGCGTGTTGATCTCACCATTGTGGGCCAGGACTCGCAGAGGATGAGCCCTTTCCCA:1 + chr3L 16795847 3' - Chouto 484 1 50.00 TTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAACAGCCCAGGCAAAGCACAGAACTGCTGGAAAAACTGT:1 - chr2R 20362174 3' + diver 190 2 62.33 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTTTCAA:1 - chr3R 15514515 3' + 412 452 2 51.97 AAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACACCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTGGAACTGGGCGCACACAATAAACAATATATTAACCATTTGAGTTGAAAAGCCACATCCGAACCA:1 + chr3L 4093791 3' + hopper 1012 1 77.40 GAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGGGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGGGACAGACATTGAAGGTTTGTCTCTCCATTCAAAAATA:1 - chr2L 15833018 3' + hobo 2852 1 71.92 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATT:1 - chrX 4789116 3' - 297 6639 2 63.45 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAGAGTTGGCATAAAAAGATAATCTTATTTAA:1 + chr3R 21421105 3' - roo 89 2 78.77 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATATTCGCGGTCCATTACCATATTTATGA:1 + chr3R 24175825 3' - Burdock 13 2 76.71 TAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTAAAATACAAGAGAGTGTAAAAACTTTCGCCATTTTCTTTGCCAACTTTCCGTTGCATTTGCACAGAGCAAAATGTCTTTTTG:1 - chr2L 6221276 3' + roo 480 1 56.85 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATTAGCAGTGTTATTCCATATGGTAACACTGCTAAAGAAGA:2 - chr3R 14663169 3' + pogo 2082 1 72.60 CGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTT:1 - chr2L 15153235 3' - G-element 43 1 49.32 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCG:1 + chr3L 14043616 3' - Ivk 65 1 61.64 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGCAAACACCCAAGGAG:1 + chr3R 7424675 3' - 412 23 2 68.49 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTA:1 - chrX 5222854 3' + 412 435 2 58.90 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAA:1 + chr3L 5183786 3' + copia 184 2 69.18 ATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAGTAG:1 - chr2R 21897861 3' + 412 7499 2 48.63 CAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGCACACAACTGACTCCTGCGGACGTGAAAAGAGCGCCAA:1 - chr2R 18316832 3' - FB 83 1 74.66 TGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAATATAAAGTATTGGAAATCCAGTGAAGTCGTTAATCACAAGAGCTTAAAAGATGTACCTGTATTACA:1 + chr2L 22041984 3' + Stalker 6894 4 54.79 GCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCT:1 - chr2R 2949022 3' + 17.6 435 2 63.70 ACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAATGCGACATGAGCGCATTTTTGAAGGCTCCTGTTGAGTTTCTGTTCTGTGTTCTCGACGCATATGTAGATTCACTGGGAGAAAGTGCTTC:1 + chrX 22794013 3' - Stalker4 250 4 60.96 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGAAGAGATCAA:1 + chr3R 15649893 3' - blood 35 2 61.64 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCT:1 - chr3L 19274792 3' - transib2 64 1 61.64 AGTCTGCTAGCATATCTTACACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGTCAGCCAGATGCCACGACCCTGGGCACCAGAATCCGGTTTCAGGATGAACGTGCGTTTGTGGTTGAGCGCGTAG:1 + chr3R 27249957 3' - G2 2836 1 51.37 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCT:1 + chr3R 5087090 3' + P-element 2809 1 32.19 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTC:2 - chr3R 31956747 3' + pogo 2064 1 60.27 CCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTCATCTGCTAAAAGCCTGATCACTTTCATCCCCTTAGCCGGAGGTCACTCATCCGCCCCA:1 - chr3R 22320044 3' - 1360 101 1 59.59 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGCCCCAAGAG:1 - chr3R 4885302 3' - 1360 43 1 55.48 TTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGATTGTATTT:1 + chr2L 8393074 3' - I-element 5167 1 51.03 TCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAG:1 - chr3L 20747096 3' - Burdock 6200 2 64.38 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTG:1 - chr3R 10142938 3' - 412 7121 2 63.01 CTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTA:1 + chrX 4566235 3' - Transpac 4998 2 74.66 TAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAGCGGTGAGCTCGTCCCCGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTAAACAATGACAATAATTTCTTAAATCT:1 - chr2L 8959913 3' - Ivk 5159 1 59.03 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAGACGACTTAGAAACA:1 + chr3L 15261377 3' + pogo 2056 1 54.48 AAGCAGATTTGACGGCTCTCTTTAAATCTTTTCCTAATTGTGAAAACTCTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTTAATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAATTATATGCGAATATTTTGGCGAGCGACGAAGGA:1 + chr2L 9290514 3' + 297 156 2 77.40 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTA:1 + chrX 11534538 3' - roo 59 2 59.59 ACATAGCAACAAAGATCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGTCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGTCCCTTTTCTGCTGCTGCTGCTTCATGGTCATCA:1 + chr3R 15514613 3' - 412 7111 2 54.68 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTTGCTTAAGTCC:1 - chr3R 7424560 3' + 412 424 2 72.31 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAAAAATAGAAGGTATACAAGGGTGGTATGCCACTAAAGAGGAATTGATCACCGGTATAAAACGCTTGGTCTACAATTA:1 + chr2L 21400212 3' - pogo 41 1 57.53 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTATACAAAATCTA:1 + chr2L 14222381 3' + Transpac 282 2 67.12 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACGAAATGTA:2 - chr3R 27503007 3' - hobo 44 1 55.48 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTGCAAACATTTATGAAAC:1 - chr3L 2036960 3' - Doc 22 1 72.60 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTTAAGGTATGCAACGGAAAACGAGATGCAAGGCATTCTGCCGGTCGCCTACAGAT:1 + chrX 22824869 3' - jockey 4688 1 69.86 CCTTCACATACCCTTCTCCGTCCTCCTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCCACTCATTAATTTTCGGCAACACCGCCAAACTCCTCGCGGTCTTCCTCCAGCTTCCATCTGCTGCT:1 + chr2R 4948467 3' - gypsy8 4481 1 61.74 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAGGCTAATACAAATCTGTAGT:1 + chr2R 18123547 3' - pogo 30 1 63.70 TATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGC:1 + chr3L 13227679 3' - hobo 89 1 77.93 TTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAA:1 + chr2R 6984413 3' + HMS-Beagle2 254 2 59.59 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGGGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAG:1 - chr3R 31907354 3' - Tirant 55 2 69.17 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATCCTGAATGAATGATATTTTATGCCTTACTTGCAA:1 + chr3R 4884517 3' - pogo 19 1 68.57 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGGGGGTGGCACGTAATTAACGAAGAAGAG:1 - chr3R 5086989 3' - P-element 29 1 58.96 TGGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGAATACTCTAATGACCAATATTCTTACATAATGCAGCTTCGTTTCCCATTTTCCTCCTTTGCTGCTGCCTTGGATG:1 + chrX 5828988 3' - 1360 472 1 67.81 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGGC:1 - chr2R 21380580 3' - roo 8701 2 58.90 TCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTAATAGACATTCGGAGTCATAGTTGGGC:1 - chr3L 15371241 3' - Transpac 4932 2 77.40 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACT:1 + chr3L 5183797 3' + copia 5064 2 61.64 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAA:1 + chr2R 9668082 3' - jockey 4717 1 52.59 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTTTGTCGATTC:1 + chrX 3444186 3' - pogo 58 1 57.53 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGA:1 + chr2L 1449685 3' + opus 7439 2 62.33 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTAT:2 + chr3R 27971123 3' - mdg1 7092 2 55.48 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAACTTCTTCAGCGACAACTTAAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACCTCGATCTATTAGGCATTCACGGTGGGATTACCTTCCAACTTTATTGGCAAAGACTTT:2 + chr3R 23254562 3' - pogo 20 1 71.92 TTTGTTTTTTATTTTTTAATTTTTTTCCATGTGGAACAAGCAGTGACGGTGATTGGTGTTGAGTTACCATGACAGTCTTTTGTTGTTCGACGACTTTATGGTGTTTCGCCGTCGTAGTTGATATACTTGCCCTTTCGGAAATACGT:1 + chr2R 6725860 3' - Doc 4699 2 71.92 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGG:1 + chr2R 23313090 3' - Tabor 6900 2 57.53 TAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCACTCCACTGCTGCCGAGCGGCGACGGCGTCGTCAGGCGGAAATTAAGTTTACGGCG:1 + chr3L 12250268 3' - flea 4959 2 71.23 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTGCATGGATTCCCATTT:1 + chrX 8272503 3' - roo 8742 2 72.60 ACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTCTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAACTGTTTGCCGCCCAACCAGCCACCCAACTCCCCGCCAGCCAACTATTTCCC:1 + chr2R 14969420 3' + F-element 4533 1 65.07 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTA:1 + chr2L 14222351 3' + Transpac 5190 2 55.91 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGATGTATTCGTATGATGACCAAATTATAAATATTT:1 + chr3R 8542734 3' - roo 3 2 77.40 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAA:1 - chr3L 13227638 3' + hobo 2856 1 76.43 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTTGG:1 - chr2L 7991251 3' - 297 6619 2 58.90 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCGGAAAACCCTTAAAATTTCAAACCTTTTTTTC:1 - chr3R 13056725 3' - jockey 4814 1 57.93 GTTATGACCTTTTGTCGTGCCAACCCAATACGCACGACTTACACTCTAAGTGGGTGCTCTTTGGACATCCCCCATTCCAGCAATATATCTGTGTGTTGGTCGGAGTCATGTCGCGTCATATAATTTAAGTAAAAATTTATGTCAT:1 - chrX 668455 3' + Q-element 680 2 53.79 GGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGC:1 - chr3R 6103602 3' + Tirant 318 2 76.26 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTC:4 - chrX 22858867 3' - mdg3 78 2 69.86 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTT:1 - chrX 11228571 3' + roo 9014 2 65.60 ACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGAAAGCAAGAAGATTAAAACGCGGAACTCCAACAGAATTCCAAGTGCGAGTAAATGATAGCCTGAATATAGTGGCACCCATACAAACTGAGCCTGGGCCTAATCCAATTTATTTCAAA:1 + chr3L 6685872 3' + Porto1 4487 1 54.11 TTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAGGGTTTTGGCTGGTGGCCTTGAATTCTGATTAGGAAGCGATTTAAATT:1 + chr3R 9947660 3' + FB 696 2 67.12 GAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATACTGAACACTCTCCTACAGAG:1 - chr3R 4913570 3' + 1360 115 1 63.01 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATT:1 - chrX 16853343 3' - roo 79 2 72.60 ACTGAACTGTATTCTTTCTTTCGCTCTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAGGCCCTTTTATAGTAATTTGGATCCATATTGTCCCCTATCCACAAGCTCTGTATCTATCGTAGTTA:1 + chr2R 6039752 3' + diver 5970 2 54.79 CTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAAT:1 + chr2L 8393039 3' - I-element 5203 1 73.97 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACAAACGTAACCCAGAAAACTGAAATGAGCAGGAAAAGGATTTCATGTTTAACTATTAGTCATGATTTCAAAATTTATTATACTATTATTACAC:1 - chrX 6937818 3' + hopper 1390 1 68.49 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGA:1 - chr3L 1387104 3' - mdg3 5290 2 57.93 TAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAA:1 + chr3R 16194197 3' - mdg1 86 2 75.34 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCATTCGGTGTTTTGGACTCGGCGAGACTGGAAGTTGATGCTGCCGCGTGAATGCCATCG:1 - chr2L 10474290 3' + P-element 2880 2 74.55 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGC:1 - chr2R 7404675 3' - blood 63 2 58.22 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGG:1 + chr3L 14581506 3' - pogo 36 1 60.96 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATGCTGCCCGTTGTTTGTCATTCAGCTCC:1 + chr3R 15974813 3' + P-element 2836 1 50.68 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTGCCACA:1 + chr2L 16685415 3' + P-element 2840 1 53.42 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCAT:1 + chr3R 20149809 3' + 1360 3345 1 55.48 TTTATCAGGTTCAATAGCCGAGTCAAGTCAGCCGGCGCTGAACAACACGGCGCATGGAGCACGGACCCTGGAGCAGACCATCCAGAGCAA:1 - chr3L 22015420 3' + INE-1 90 1 68.89 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGT:1 - chrX 11228533 3' + roo 9031 1 58.22 GCGTAGTACATAAGAATTCTTTTTCCATATGTGTGCTGGGCATCCACGCTAACATAAGTGCGGTTGTTGAGCTTAGCTCCGACCACCTGGCTCTGGTAATTACGCTGGATGCGGGGGCAATATTCACATTCGTGAGAGG:1 - chrX 4301106 3' + Tom1 158 1 66.91 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGTGCAGCAGGAAAACCAGAATACTACCAACTCTCAAC:2 + chr3L 14969347 3' - P-element 16 1 71.92 TACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAA:1 - chr3L 15321970 3' + Transpac 240 2 65.75 GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGTATGTTGAACTGCGCTGCTGATGGCTTG:1 + chr2R 982427 3' + HMS-Beagle 6989 2 56.85 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAAT:1 - chr3L 9242009 3' - roo 8744 2 77.40 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGCTGGCCGCCCCG:1 - chr3L 22354415 3' - Doc 59 1 51.37 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATAGGGAACTAACTGATTCGTTATGTTACATACATACTTTCCAACTAATTTAGTATACCCTCCTACTCCAGGAATAACGGGTACAAAAATAAAGCATGAATCATCCAAATTGA:1 - chr2R 7665387 3' + blood 368 2 78.77 TGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATGTGTGTGTATGTGTGTGTGCGTCGGTGAGTTGTTAATGTGTTGCGCATTAGTAAGAATTTGCGTTTGTGTGTGTGC:1 + chrX 3112040 3' - accord 251 2 58.22 GCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACG:1 - chr2R 19076513 3' - F-element 210 1 50.00 ACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTATTTCTTTTAAATTAACGGTGTACGTATTACTTAACCGAGATATATAATGAATAAA:1 - chr3R 28844920 3' + roo 8884 2 62.33 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAATTCGGCAGT:1 + chr2L 20561511 3' - P-element 37 1 59.31 ATAAAACTCAGCTGCATTTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGATGCATTATATAATTAGAGATAAGAATCCAACCAGACAGAAAAAGGCATGTACGAATTGTGGCTG:1 + chrX 21520928 3' + rooA 203 2 70.18 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGT:1 - chr3R 5940438 3' + hobo 2877 1 58.90 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGA:1 - chr2R 9332129 3' + roo 341 2 65.07 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCATATATTTGGGGGCGCGATTTTCGGGGGCTGAGCTCCTTTCGCTGTGTTGGTGAGGTCA:1 + chr3R 11553762 3' - hopper 42 1 56.16 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGTAGGTAATTTCCCAGACCTAATTGAAAATGCAAATTAAGAAGCTAGTTTTCAGTTTTTTATTTTTTTTATTCAAAGTGT:1 + chrX 22563319 3' + S-element 1680 2 71.92 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTG:1 + chr3R 8542662 3' - roo 79 2 72.60 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCCAGCGAGGAA:1 + chr3R 10079425 3' + P-element 2860 1 65.75 GAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGT:1 + chr3R 10143025 3' + 412 7478 2 61.64 GTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATAATATTTATGTAATTGCAATTCCAAAATTTCTATTTAATGTTTGCAGGATGGCTTCATCGAGAAGCTGCGCCATAGTTTCGATGAA:1 + chrX 7329335 3' + Bari1 1677 1 63.70 CGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGCTGGCATTATCTGCAGTATATGACATATATATATAATATCTACGTATCT:1 + chr3R 25384895 3' - mdg3 145 2 62.96 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAA:2 - chr3L 19397016 3' - F-element 64 1 54.11 CACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATGTCTTATTACTAATTCTGATAATAATAAAAAATACAAAAACTATTAAATAAAATGGGATTTGCCTAGACAATGCCCGAGCTCAGGTGAACCGTATAAGC:1 + chr2R 20015207 3' - X-element 26 1 46.90 GTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGT:1 + chr3L 23678161 3' - Osvaldo 24 1 68.14 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTG:1 - chr3R 31907351 3' - Tirant 8118 2 62.03 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGAGGGCCAAAAAAAAAAGGCGGCATGCAGGAGTGTTGGAAAATCGGAAAATTGGAAAATGGGA:1 + chr3L 16535265 3' - copia 59 2 59.59 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTATATTATATTTAATCTAGTTATGGTTTAAATACCAAGTCTTTCCAGACTGTCAAAAGTTTTTGGTAAGCTGAGCGGTAAGCCTTGCTAATTTTGAAATTACCAATTAAGTTAT:1 + chr3L 15891139 3' + mdg3 5492 2 62.33 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAAGGTCGCTCCTCCACACGCACATTATCAAGCACAAACGAGGCACAAACGGAT:1 + chr2R 5849088 3' - mdg1 7068 2 62.68 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAA:1 + chr2R 17100126 3' - P-element 90 1 23.97 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCATTTCATTCATTTAATTCCCATTTAAC:1 - chr3L 22221081 3' + 412 475 2 77.40 ACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGGGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACATAGACGAGTATT:1 + chr3R 11520033 3' - Rt1a 46 1 56.85 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTT:1 + chr3R 25753699 3' + hobo 2883 1 65.57 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATGATGCTTTGGATATTCAAATGTTCTTTAAGAAACTGTGACAAATGTCGCTGATGTTGCGAACCGCGGGAAA:1 - chr3R 15974702 3' - P-element 58 1 45.89 ACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATACATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATAAA:1 + chr2L 21570282 3' - Dm88 45 2 57.53 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATT:1 - chr2R 22255331 3' + roo 338 2 65.07 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCATAAAACGAGATAGATAAAATGCGTAGCATTTG:1 - chrX 983071 3' + 412 7535 2 77.40 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCAC:2 + chr2L 19417109 3' - BS 5022 1 58.90 CGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTATCTTTGCGCACTAGGGTAAAATAAGAAATACTGAATTTGTTTTCCTATTTACCTTTACTAACACTTTTAATCCATTT:1 - chr3R 17023233 3' + roo 80 2 55.48 TGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTG:1 - chr2L 16371597 3' - jockey 4861 1 73.29 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTT:1 - chrX 3529734 3' - 412 7115 2 59.59 AAGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAAAAGGATCT:1 + chr3L 3979685 3' - opus 7167 4 53.42 GGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGATTATTCATGGTAAGTACTCGTACACTC:1 + chr3R 20368117 3' - Max-element 27 2 67.12 CAAACAGCAGATCAGACATATGAATTTGATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGACTTACTTAAATGTTTTTAATTAACAACAATTCTGGTGCTGTCCATTATATTCGCCACTACCTCCAAGCGATCCATGTTGGATAGCTTTGTAC:1 - chr2R 16765503 3' - transib3 165 1 53.42 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAA:1 - chrX 14692856 3' - Transpac 76 2 69.18 TACAGAGTTTCGTAAACTATACTTTCTATTTTGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGGAATTGTTGGAAATCCATTTCCTTAAGTTGAATCCAACTTTCTGCAATTCATGGGGAATTAATGTTATTAATTTATTAGC:1 - chr3R 19445653 3' - mdg3 5028 1 59.59 AAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTAAATAAAGTTTCACTTAATTTCACCTTTTAACTGGAAGAATG:1 + chrX 21123520 3' + S-element 1637 2 73.97 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAAAGGTGTGTGGGAGTTTGT:2 + chr2L 17069685 3' + 412 472 2 71.23 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGCTAATTACTAAAGTGTG:1 + chr3R 23099178 3' - roo 8730 2 65.07 ATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATATGTATACAATAAATATCTTAAGCGGGCGATCCCGCTCC:1 - chr4 1183462 3' + Transpac 4864 1 73.97 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGACGTCCCATATAGAAATTATCCCCGCAATAAACGGAGACCAAGGACCTCTTCCACACACCTACA:1 + chr3R 14874239 3' + flea 4968 2 53.96 GAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCGTTGTCTTTGTCAAAACAAAGCAAAATATGGCCAAAAGTATTACGCATAC:1 + chr2L 7672908 3' + BS 4976 1 67.81 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCATATATTTGGGGGCGCGATTTTCGGGGGCTGAGCTCCTTTCGCTGTGTT:1 + chr3R 11553752 3' - hopper 31 1 57.60 CCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAG:1 + chr2R 18048900 3' - opus 179 4 70.55 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTAGAGACATCATTAGTAACT:1 + chr2L 13884706 3' + pogo 2065 1 57.53 ATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAG:1 - chr3R 15465454 3' - mdg3 5290 2 58.90 CCGGAGACTGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATCAGCGTTTTATTCGTTTCTGTT:1 - chrX 10728780 3' + springer 7498 2 68.06 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGTGCTGATTCGTCTGATTTTTATTACCCATGACAAAATCCAATTGAAA:1 - chr3R 7569536 3' - Doc 7 1 55.48 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAATCAGTTTGTT:1 + chr3R 15465608 3' + mdg3 5476 2 66.42 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAATTGGTGTGTTGGTACTAATCATATCTGCG:1 + chr3R 24229014 3' + opus 7483 2 73.29 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTT:1 - chr2L 12261179 3' - jockey 92 1 73.29 TAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCATCATCGGTTTGTTGTAGTCCTCGGCATTGGCATTGGCATCGGTAATTCCTCGGGATTGATTTAATGTTGCGTGTGATATATCATGGTCCCCTCGACATCTTGGCT:1 + chr2L 21807462 3' + INE-1 544 1 73.97 CAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTT:1 - chr2L 19878154 3' + mdg3 5441 2 56.85 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGGGGTC:1 + chr3R 9345677 3' + pogo 2047 1 57.24 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAA:1 + chr3L 131777 3' - P-element 102 1 15.86 AGTTAATATAATAAATTTAATCATAGTTTTTTATATTCTAGTTGCTAAATTATGAAAAACTATGATTAAATTTATTATATTAACTAATAATAATCTTGTTTTCTTCTAAACAATGTGATGTAATTCGACATACACACTTAAAATC:1 + chrX 20582684 3' - transib3 2664 1 74.48 CTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTT:1 + chr2R 4206659 3' - 1360 319 1 73.29 TCCTAAATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAGCGATGAATAGTTCTTCTTGTCATGTTCTGTC:1 + chr2R 2527455 3' - roo 8741 2 51.37 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTAT:1 - chr3R 12608072 3' + roo 323 2 76.03 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCC:1 - chr3L 15371292 3' - Transpac 64 2 61.64 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTGAACGGAGGCAGTAAT:1 - chr2L 15965184 3' + blood 339 2 59.59 ACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTT:1 - chr3R 10973220 3' - jockey 89 1 69.86 AATAGGGTATGTAAGGGGATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGGAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTTCCGCTATCTATGTAAAGCAACG:1 - chr3L 12863632 3' - Transpac 7 2 75.91 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGCAGCAGCTGCA:1 + chr3L 5490924 3' + 412 7476 2 67.65 AGAACTTTAAGCTTCTAGCTGGTTCGAGTCGTCGCTAAGCATTTTTCTTTTTGAAAATGTATAACGGTCCACAGCAAAAATCTATCGACTACGAGATGTGGCAGCTAGCAATTTACACCGCACAATGCGTTGACACACGTCG:1 + chr2R 14521053 3' + G5 355 1 66.90 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAATTTTTATTTACTTTCCTTCTCTCATTTTC:1 + chr3R 26315995 3' - roo 8722 2 58.22 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAAAAGCTGGAGAAAGCTT:1 - chr3L 15035084 3' + pogo 2071 1 65.07 AAGTAAGATCCTTCGCGTCAACTAACAGATCACTTTTCCCTCGATATTCACTATCGATTGGCGATGCCTGCGCCAAGCGAAGATTAAATTTCCACTTTTAT:1 + chr2R 12205535 3' - Gypsy12A_LTR 476 1 52.48 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGGCAAAACCATGAGCCCATTGATTTTCCAAAG:1 - chr3R 9289245 3' + HMS-Beagle 7032 2 78.62 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAGAG:1 - chr3L 14969172 3' + P-element 2858 1 61.64 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACTGTCCTGGG:1 - chr3L 1387089 3' - mdg3 5260 1 76.15 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATAATGATTTCAATAA:1 - chr2L 19903366 3' + Transpac 5172 2 57.93 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAA:1 + chr3R 10143012 3' + 412 7465 2 71.23 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAG:1 + chr3L 20076860 3' + roo 9008 2 64.38 GCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACCATACGCCCGACACCATACGAATGTCGTCTCTCATTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGACTGGGAGAATGTGTGTCCGCCTGTCTGTGTTTGTATG:1 + chr2L 4110065 3' - Rt1a 19 1 56.85 TACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTTGAATGCTAATTAACTACAACATATATGGTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATAT:1 - chr2R 5848976 3' + mdg1 344 2 68.49 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGAC:1 + chr3R 7424637 3' - 412 58 2 58.74 ACACACACACACACACGCATTCAGTTGGCCCGTTTATTTAGTGAAAAATCGAGGACTGGAGGCATTTGGCAATTGGCAGCTGTTCGATCTGTATCTGTATCAATAAAATGCCCTCTCTCTTTCCCTCGATTTATTCTCTCCGATTT:1 - chrX 6190256 3' + accord 7031 2 66.44 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACC:1 - chrX 17469193 3' + blood 7309 2 73.29 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATAATGAACATTGTTCTTGGTCACCCTGCAGTTAATTCTTAATACTGTGCATATAGCAGAAGTCTTG:1 + chr2L 2464315 3' + pogo 2068 1 52.80 CTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTA:1 - chr2L 16942051 3' + mdg1 7386 2 65.75 CAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTTTATTACGAGCCTATCGAAATCATAATCCGCTTTGTTATAGGTAT:1 + chr3R 27845606 3' + Stalker4 386 1 66.44 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGAGCTAAAACACTGATAAAAAATAATGCAAAAAAGAAATAAACTTTTCTGTTTTTGTTGTTAATATCAAGGCATTTCCTAATTTTGATTACAAG:1 - chrX 10960164 3' - Transpac 4944 2 67.12 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAGATG:1 + chr2L 1449707 3' + opus 7461 2 56.85 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGACGCAAAAGGAGAAATACAAGCT:1 + chr2L 15920173 3' - jockey 65 1 59.42 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGAGGATCCACCAATTGA:1 + chr3R 14088650 3' + 1360 3346 1 57.26 ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACAGTTTCTGATAAGTCGCTGTTTGGGTATAGAGATTTAATTCAGAATACACTCCTTGCCTTTAA:2 - chr2L 22641318 3' - HMS-Beagle2 55 2 56.16 CTACCGTAAGTCAAATAATAAACAAAAAAAACACACACAGAACATGCAACAGCAGCCATACAGTTGCCACGCCAGAGCTCCTTGGTTTGTTTGGGGCTTCCTTCTACGTTACGATAAGGCCTCTA:1 - chrX 19047617 3' + Rt1b 5136 1 53.60 CAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTGCAGTGGAGTTCAAAAGAGTAACAGAGCGCAGTGTAGAACT:1 + chr2R 544935 3' + HMS-Beagle 7031 2 78.08 TAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATGTATTCTGATCGAAGAAACGATCGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATTGGGCGCTGTTTATAAATATCAAATTGGAATACCTTCCTTTCGACTCCCCTTTGAACTAATCT:1 - chr3L 17904076 3' - 1360 3192 1 78.77 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCACCAGGCATCCCAATCAGTCGTGCCCCGGCCACT:1 - chr2R 24338301 3' + 1360 3374 1 74.66 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCATTTAATTATGCCTATTTTTTATATGTGTACCCCTGCAATTGCCGCTTCATTATAATCGGAA:1 + chr3R 6103727 3' - Tirant 12 2 77.24 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGAGATTAATTTTTTAAAACACAAACGAGCACAGCACGAGAGAGCCAGAATGAGAGGGCGCTATGCGGCGCGAAAGAGACAGCATGAGCCG:1 - chr3L 10856690 3' - P-element 9 2 69.11 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTT:1 - chr3L 13597767 3' - blood 7094 2 75.34 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTGAAGTGAAGAAAAATTGCAGTCAATAT:1 - chr2L 17840984 3' - Juan 4048 1 59.31 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGC:1 - chr2R 20913136 3' - 1360 86 1 74.66 TGCACTCCATTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACTTTGAGGTGGCCAATCCAATGTGTTTACGCCAACATCTTTCAGAAACTTCGTAATCATAATGGGGAAGAGACGGCGAAAGGAGTCGT:1 + chr2R 14792660 3' - Tc1-2 1207 1 79.45 ATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTAAATGAAACCAAAGAATACCAGCAAAACTTTGGGCAGGAATCTTGAGCTATTTAAATGTTATTGAGCGTTTCTTA:1 - chr2R 20856182 3' - Juan 4152 1 54.11 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTTCTTAGCCAAAAGTAGCACACCCACATATATATTTGTTTAAAGTTG:1 - chr2R 21897831 3' + 412 476 2 67.81 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATTCT:1 + chr2R 6984452 3' + HMS-Beagle2 7176 2 72.60 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTG:1 - chr3L 18708575 3' - F-element 32 1 67.69 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACA:1 + chr3L 4023735 3' + pogo 2053 1 52.05 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAG:1 - chrX 22824769 3' + jockey 4907 1 80.82 GTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCATCTACTTGGACCCCTAC:1 - chr3L 14854626 3' - rover 12 2 76.71 TCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGGGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTGTTTCATTTCGCAGG:1 + chr3R 29709042 3' + blood 7304 2 73.29 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCA:1 - chr3L 22529718 3' + roo 9041 1 61.48 TATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAAT:1 + chr3R 20147550 3' + 1360 323 1 69.86 GGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATCAAGTATTTCCTAATCCAATTGCGAAACTATTCGGC:1 - chr3R 5351840 3' - Doc 374 1 75.34 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAA:1 - chr2R 10367475 3' - 412 58 2 58.57 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTTCAATACCAAATACAGAGCATTTTACCAA:1 - chr2L 16942013 3' + mdg1 7424 2 60.96 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACAT:1 - chr3R 10079286 3' - P-element 54 1 48.63 TTAACTTCAGTAAACGGCGGCTAAATAAGTATATTAAACATTTTAAAAATTTAAATAGCAAATTCAGCTCATAGAGAGCCAGACTATTTTTAAACGATTGCGTTCTTCTCAATTGACTGCTAAAATCGAAATTTGCATAATTCGCG:1 - chr2R 10453297 3' + mdg3 243 2 71.23 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATGATGCTTTGGATATTCAAATGTTCTTTAAGAAACTGTGACAAATGTCGCTGATGTT:1 - chr3R 15974717 3' - P-element 73 1 35.62 CAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGAGCCTAACAACAAAAACCGAGACAATGTAAAACACATAGGTAACGCTATTGTCAATATTGAGCCTCCCCTTCGGAAAGGCTTACGCAGCCGTTACTTTTCAGATTTTACTT:1 + chr3L 23511271 3' + G4 496 1 71.23 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAAAACACCGTTCATGCTGTGAGCGAAAAAGAGTGGTAGCGCCTAC:1 + chr2L 21237353 3' + P-element 2866 1 71.23 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAA:1 - chr3R 10099850 3' - pogo 61 1 60.00 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGATTTATATATACTCTTAGTT:1 + chr3R 18903499 3' - pogo 57 1 62.33 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAATAATTAAAATCCATTTTTATATCGATTTCATTTATGATCACGTTGATGAATTATCTTCAAGTGTAAAA:1 - chrX 14173198 3' - 412 54 2 54.11 AAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAAGTGATTCCGAATGCACCACAGATCCGAGAAAACTTTCTAATGCAGGGGCC:1 - chr3R 28033599 3' + diver 153 2 65.75 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTC:1 + chrX 21844338 3' - mdg1 7076 2 58.22 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAA:1 - chr3R 10140213 3' + P-element 2796 1 19.86 TTCCTCCGATTTTGTAAACTAGCTCCTCTATTCCGTTGTTGAAAGCACGCTCAATTCTTGATTTTAATTATTAATGCCTGTAGGGTTAAAAATAAATCGGTGTTAATTCCATTTTTGATGCAGTCCCTGAAATAGAAACCATATTT:1 + chr3R 11144751 3' + Gypsy12A_LTR 2071 1 56.85 CCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGC:1 + chr2R 2949109 3' - 17.6 6999 2 72.46 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAG:1 + chr3R 24175796 3' - Burdock 6178 2 56.85 CACTCGCACCTTAGCGCGTCTGACAACTCCATCAGCTCCGCTGTAGATCTCCTCCACGATGCCCTTGCGCCACTCTCGTCGGGCCAAGGCACTTGGTTGCGAAGCACAGCCGATCAAAGCAGAAACGCATCCAGGCGGCTTTCCTG:1 + chr2L 3640450 3' - aurora-element 3932 1 60.96 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAATTTCAAATATGAATATTTAAATGTTCGACTATAC:1 + chr2L 7215672 3' - 297 11 2 76.03 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCGCTTTGCATGGCTTTTCTTGCATGCAACTTCGCTT:1 - chrX 14962162 3' - jockey 30 1 68.49 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAATCAGCAGAAGA:1 + chrX 14692958 3' + Transpac 264 2 54.11 CTTAATACCTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTA:1 - chr2L 8776814 3' - G4 3708 1 67.12 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGGGTCAG:1 + chr3L 16887442 3' + roo 404 1 78.86 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAGGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGACTGTACGGATCCCCGTAGAGCTCCTGGCA:1 - chr2L 16371541 3' - jockey 4803 1 65.75 TGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTATTGTGCAATGCAAATGCCGCCAAATAGGCCATTTGTCCCGAGCGACTAAATAACTTACTAAA:1 - chr2R 18646578 3' + Transpac 5052 2 57.53 AATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGACAAAAAT:1 + chr2R 2879484 3' + Stalker 96 4 47.95 CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGTT:1 - chr3L 13922294 3' + Tirant 327 2 71.23 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATA:1 + chr3R 20292519 3' - pogo 67 1 66.44 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTACCCAAAAACACGAC:1 - chr2R 14001065 3' + P-element 2800 1 14.58 TTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATTATATGTATATTAATGACCACGGCATAAAAAG:1 + chr3L 19339481 3' - Tc1 19 1 75.34 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGA:1 - chr3R 15465462 3' - mdg3 5297 2 53.79 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCACTGATTTCCTCGAAA:1 - chr2R 6945597 3' + pogo 2063 1 59.59 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCATTTTTCAAGCAAAATTTTTTGAAAAAGGCCTAGATGGGTCAGCTATCATTCCGCCGCCCCCTTTTCCCCAGCTC:1 - chr2L 3967038 3' + hobo 2899 1 55.07 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCAAAAAACAATATGAATTTTC:1 + chr2R 16383384 3' + roo 9022 2 54.11 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCG:1 - chr3R 19700846 3' + roo 9036 1 60.96 ACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGTTACACTCGATTTCCCCACGGACACTTC:1 - chr3L 3782227 3' - roo 8809 2 78.77 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGATGCTCGAACATCCGCGG:1 + chr2L 5648507 3' - Burdock 46 2 56.64 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTAC:1 - chr3L 9242006 3' - roo 8713 2 69.49 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGCTGGATTTTCTTGTAAGGCCTCTTGCAGCGTCGGCAAGTCCCTCTGTTTGGTGGGCACAGTCCATATTATTATTATTATTATTAA:1 + chr3L 16260407 3' + hopper 1398 2 70.54 ATATCGATTTGCCGACAACATATTTTAATTTTTTTTCTCATTTTATCTTTTATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTCCTCGTCGCCAAACCCTCTCTCAGGGTCAACAATCAATAACGCGCCATAATCCGAGGCATTGA:1 + chr3L 21615053 3' + INE-1 449 1 51.37 TAAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCAAGGTGGCACCCTTATGGGACACCGGATGTGTCTCGGATACAAGATAGATTGTTGTAAGTTTAATATGCATCTTAGGAAGAAGATTTAATACCAGGTTACTTTCAAATGTTATAAAATATG:1 + chr3L 22969249 3' - Q-element 511 1 50.68 ACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAAC:1 + chr2R 18048888 3' - opus 7081 2 78.77 TGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGATCATATTTCATGAGAACTTTGCTCACTTCCTCCCG:1 - chr3R 28569099 3' + copia 4860 1 76.03 GAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCG:1 - chr3R 10468006 3' + opus 431 2 62.33 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGTCATGGGTTTGTA:1 - chr2L 18581268 3' - roo 8723 2 58.22 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGGAGCAAAATGTT:1 - chr2L 21237249 3' - P-element 95 1 19.18 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCACCTGCTGAATGCATCCATTTATGCGGCA:1 - chrX 4789077 3' - 297 6601 2 72.60 ATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGATTATTTAAATGCAAAATCGTTAACATCTGCTTCAGAGCATGTGATAATAAAACCAT:1 + chr2R 10356234 3' - R1A1-element 11 1 61.64 CTCCTCAATCCAATTTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATGTATGTATATGGGGAAAATGAAGAGTTGCCAGCGAAT:1 - chr2R 17945142 3' + 297 253 2 64.62 CGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGGCATCTATTTTTAATGCGCTTAAAAGTATGCAGGAAAGAATTTTAACGCTCAGAGCTTAATAACTA:1 - chr2L 6583302 3' + hobo 2896 1 52.24 GATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAATGAATTGCTGATCGGATCGATTTAAAGTTTACCCACTGACGCCCCTTAATTGCCGGAAGCTCTTAAAGAAAAATGGCAGGACAGAGCG:1 - chr3R 18523519 3' - opus 7396 2 72.99 CGGGGGGAGGATGTTGGGTCATGTAGCCGCCAAAACGAGTTAACTGCTGCGAGTTTATGGTGTGAAAAGGAGCAGCGTGTGGCCTCCGCATCCTCCATCACTGGCATCCCATCCGCGCCCACGCCCACACACATTTTTTGGCCAAC:1 + chr2R 12739508 3' + diver2 4522 1 79.45 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAG:1 - chrX 21668731 3' + mdg1 345 2 70.55 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCC:1 + chr2L 10832361 3' - Doc 46 1 56.85 TAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGTATTTTTTATTTAGTTTCCTTTATATGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCTATTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGCTATCGTTTTTTTTGAATCTACCGTAT:1 + chr2R 6433221 3' - F-element 134 1 63.01 AAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAACTTGTTCCTCATTTTCTTTTTGGTGTTTGTGTGCCTCTTGTTTTTTTTTTTACGTTGCCGCTAACAGCAGACGCGACGAAATTACGTATACGCCACGTTGC:1 + chr2R 14556530 3' + mdg3 5070 1 70.55 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCAAATTGCGAAAATAATTGACAATGTTGACTATTGCTACCTACATACATATGTGAACGAGCTTAAGGTAAAAAACGCAATTAA:1 + chr3R 7549769 3' - copia 40 2 58.90 ACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACTCATGCATGTTGCGTGTAGGCATGACCAATCCA:1 - chr2R 17426516 3' + F-element 4430 1 77.40 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGCTAATTACTAAAG:1 + chr3R 23099174 3' - roo 70 2 67.81 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTCTCTTCATTCCAACTG:1 + chrX 983257 3' - 412 7079 2 69.18 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACACTTTTCGAGACTTTCAATTATGATTTCCACAAAGAGAGAGTGAGAAAGAGCGTGGCCAATGGGTACATTATGTAGTC:1 + chr3R 21154344 3' - jockey 4716 1 53.10 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGCGTTA:1 + chr3R 26399921 3' - roo 8693 2 65.75 TTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGG:1 - chrX 7467949 3' + hopper2 1529 1 69.86 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCAGCTATAGTATTTGTCGAACCAAAGGGGAAAATGAGCTTGGTCGTGGG:1 + chr2L 6583395 3' - hobo 72 1 66.44 AAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTTCTTTATTAGTCATACATTGTATTCCCACATATAATTATCAGTGCCTTGTTCCATGCGAGTAACA:1 + chr3R 21614407 3' + S-element 1661 1 56.16 TTTTTTCTTCTGTGTTTCTTACCACTGGTGGGGGAAAACAACAGAATTTCTCGAAGGACGAAAATGTTCGCACTATAAACTTATGCGTAGATTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTCAAGTCACTTTTTGATAACGTATGCTTTCAGG:1 - chr2R 17511728 3' - rooA 430 1 76.71 AGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTTTCGTTAACAATGTAAACGCCCGACTCGAAGTCGGCCAAAAAAAAA:1 - chr3L 6630322 3' - jockey 4731 1 58.22 GAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCACAGCAAATGGATGTACACATTAATGGATGCTTGTCTGGAAACTTACTAAGTATATCATCCCAGT:1 - chr2L 8309181 3' + R2-element 448 1 69.18 GCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGATATTTATAGTTCCTGATGGCTGATGATAACAAAAAATTC:1 - chr2R 21091369 3' + Tirant 71 2 73.29 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATG:1 + chr2L 1229689 3' - opus 178 4 70.34 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATTCACAAACTGCATTTC:1 + chr3R 10079351 3' + P-element 2786 1 16.44 GCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCT:1 - chr3L 5514211 3' - Doc 99 1 71.92 ACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCGTCCAGCTCACCAGTTTGCCGATCACATTGTGTTGCAACAACATGGCCAGTGGGAAAGATATATTCGAAAATAATTGCGGCCCACCAAC:1 + chr3R 8542544 3' - roo 320 2 61.64 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCG:1 + chr3L 16887436 3' + roo 403 1 77.12 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTA:1 + chrX 11534519 3' - roo 8742 2 72.60 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCCGGACG:1 - chr3R 26399810 3' + roo 8989 2 75.34 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGTCTGGGCCGAGACAGCAG:1 + chr3R 23623973 3' - roo 44 2 57.53 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGCAGTGACGTGCCGATATATATTTGTGGAAAAATACTTTTCACAAAAAAGAA:1 + chr3R 14165171 3' - Tabor 6855 2 74.66 GTCCGTATGAACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGCTAGAAGGTTGACCCTAAGAACACAGTTTACAGGGCCATAAAACCGCCCAAAACTGCCACGCCCACATTTTTGAAAAATTTTTTGATCTATCTATCTATACACTTCGGC:1 - chr2L 21363121 3' + INE-1 133 1 54.11 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGC:1 + chr2L 14262950 3' - blood 33 2 58.22 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTTGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACCTCCACTTTAT:1 + chr3R 23426494 3' - pogo 37 1 57.14 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCATTTCATTCATTTA:1 - chr3L 22221094 3' + 412 462 2 68.49 ACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAANAANAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGC:1 + chr2L 17069614 3' + 412 7454 2 80.82 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTACGCAAATGGTCAAAGAGAACTAGTAATTCGGAAGAACCGCAATTAAGACTGTGAAAAAGATTGCAGCGCTATCGTCT:1 + chr2R 5701610 3' + S-element 1674 1 56.85 CCTCGACTCGGACACCAGAGCCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGTGAGAGGATGATATTTGGTAGATTTGACTGTGATTAGTCATGATCTGGGTTTTTCGAAATATTTTCTGTATT:1 + chr2R 19501922 3' - Rt1b 252 1 53.91 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCCTGAGGTCC:2 + chr3L 14581516 3' - pogo 26 1 67.81 GGACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAACTGAATCAAATTCGTTAACATTTTTTACAAGG:1 - chr3R 24228846 3' - opus 7154 4 59.59 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAA:1 + chr3R 21237789 3' - Doc 92 1 76.03 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTG:1 + chr2R 7404775 3' + blood 7336 1 55.48 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAGAGTTAATTGGGTTAAACCCGTGCGGTTAATTGAATTTTGTAAAGTTTTAAAAAATTTTCATATGA:1 + chr2L 8772865 3' - Tabor 6861 2 70.55 ATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATATGCCTGGACTTTGACGCGGAGCTCAGGACT:1 - chr2R 10296757 3' + hobo 120 1 79.45 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGC:1 + chrX 15089576 3' - P-element 75 1 34.25 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTAT:3 - chr3R 20292419 3' + pogo 2042 1 62.33 GAAAGACAAAATTCTAAGTCGCGGAGCAAAATCAAAATTTTGCTAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTTCTTTAATATTCTTCAATGTGACAGGGGTTTTAAAGTTCGAAAAAGGTTAAATCCCTTCAAACGCAATCGTTTGACT:1 + chrX 20508929 3' + HMS-Beagle 302 1 53.42 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTCGG:1 - chrX 18125106 3' - BS 5045 1 53.10 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAACGAAAAAGGGGGTGGTGTTTGTACGGTGAAAGGGGGGAGGGGGGTGTCGGCAAATGCGGTTGCATTCTTGG:1 - chr3L 13227567 3' + hobo 2921 1 71.92 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAAGGGATTTCTCTCTGCAT:1 - chr2L 9167403 3' + pogo 2064 1 56.16 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAAT:1 - chr2R 18048808 3' + opus 7435 2 65.07 CGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGCCGGC:1 + chr3R 30731530 3' - gypsy6 4 2 80.14 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTC:1 + chr3R 9938733 3' + roo 387 2 71.23 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGGTGCATTGT:1 - chr3L 6751649 3' - pogo 57 1 58.90 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTAAATGCATTTGGCAGATTATGAGACAGAGACGGTGGTACAAATGGTGGCGAGTTTTCGA:2 + chr2R 21380741 3' + roo 9047 1 67.81 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTAC:1 + chr3L 13722103 3' - blood 77 2 70.55 AAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAA:2 + chr2R 6984421 3' + HMS-Beagle2 262 2 54.11 GCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAACGGATGAAAGATCTGTAGACGAATGCCATTGCCATCCAA:1 - chrX 17848381 3' - Quasimodo 7354 2 73.29 GAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGAT:1 + chr2R 6984392 3' + HMS-Beagle2 7116 2 73.97 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCAC:1 - chrX 5222861 3' + 412 428 2 63.70 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACTTTTATCTTTCACTCGTCCGCTTGGGCACTCTCTTT:1 + chr2R 21056821 3' + Tirant 378 2 71.23 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGACGTGTGATCGCT:1 + chr2L 21237279 3' + P-element 2792 1 19.18 CGAGTACGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACATTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTATT:1 - chr3L 3685389 3' + Bica 50 1 78.77 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACA:1 - chr2R 18882591 3' - roo 80 2 78.17 AGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 24 2 26.71 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGATCGTATAGCCCCAAGATCACTTGTCAGCCTGGGGCGAAGTCTAAGCTCCTGTT:1 - chr3R 4885266 3' + 1360 3382 2 78.08 GCTTTTATGGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGAAGGGCATGGCTAGAAATTCTATTGATCCTGATGAAGAATATATATTCCTTATATTGTCGGAAATGCTTAACGGCATCGTCACTTTGATGTCGACTTTGT:1 - chr3L 2726397 3' - INE-1 149 1 77.14 GTTTTGCACTATACAGCCACTTATTTGGCGACGGCTAAAATAGCCTTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGACATTTTGGTTGGCAGTGAATAAATCGCATCCCAAGAAAAGAGTGTACCTTAGAGTAACGTAAGAATTAGAATAGGA:1 - chr2L 14436582 3' - 1360 3346 1 50.68 TTTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGACACCGAGACACAATTGCTGTTGTTTTTTTTTGTCGGCAAATTGCTTGCCTG:1 + chr2R 5627694 3' + TLD2_LTR 96 1 78.77 ACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGT:1 + chrX 12558319 3' + Transpac 230 2 72.60 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATGAATTTAAGTCTGATAATTTCTCACTTTTTCCTTACAGATTTTCAAGCT:1 + chr3R 12367530 3' - copia 4940 2 67.81 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTAAACATTAAATGCTAAGTACTTTTTTATGTTTTTGAATGGATCTCAACTTTGTACATACTTTTGCTTTTATAGTTAATTTGAAG:1 - chr3L 13313116 3' + roo 9037 1 61.64 CATATGTATATATATATATGTACGAATATGTGAATGGCTGGGGGGTGATCGGTGAAATTGTGGGGGCTTATCTCCATCAAATTACCTGTGATGGTTCGATGGATATAGTATGTGCCTGCTCTAGTTACACAACGCCCCTGATTTCC:1 - chr3L 5238218 3' + Stalker4 247 4 52.74 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTA:1 + chr2R 19543769 3' - jockey 4805 1 52.05 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGAAGCGATAAGCAAACATAGCAGCAAATGGCAAATAAACAAGGCACTAAAATATTAGAATGCGGACCGAAGAAACCCAATGCTAAATCCCGATTTCAAAGCCG:1 + chr3R 25409622 3' - jockey 23 1 75.00 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAGAGTTGGCATAAAAAGATAATCTTATTTAAATTT:1 + chr3R 21421109 3' - roo 84 2 75.86 GAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTT:1 - chr2R 19076553 3' - F-element 254 1 76.71 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAA:1 + chr2L 2338173 3' - blood 52 2 54.79 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAACCACTGCGGCTC:1 - chr2R 20704111 3' + hobo 2928 1 73.11 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGA:1 + chrX 19162691 3' - pogo 54 1 56.85 CCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTGTCGCCGTGTGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGAGTGGGGCCACTCAACACGCCAGTCAATTTATACTAATTGTAAG:1 + chr3R 11519240 3' + Rt1a 4992 1 55.17 GTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTC:1 + chr2R 5900958 3' + Bari1 1677 1 66.44 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGTATACGAACAAATCCACTCTTCTGAGAAATTATCGAGATCTCGTAAACAATTAGTTCTA:1 - chrX 14756658 3' + pogo 2042 1 60.27 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAACTCAGT:1 - chr2R 18048796 3' + opus 7449 2 56.25 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAGCGATCCTTCCGCGTAAAACCAATGTAAGCAGTGCAGTGGAAAACCCAAC:1 + chr2R 24630216 3' + copia 185 2 67.81 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGT:1 + chr3L 14581476 3' - pogo 66 1 63.01 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATTTGGCAAATGTTAA:1 + chr2R 12703904 3' + blood 358 2 70.55 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATT:1 + chr3R 23507699 3' - 412 7091 2 56.85 CCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGGCCGTCCTT:1 - chr2L 1073925 3' - Tirant 8178 2 67.63 TGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGC:1 + chr2R 9033909 3' - F-element 4577 1 77.40 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACC:2 - chr3R 8542577 3' + roo 9013 2 55.48 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCGCTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACC:1 - chr3L 14969240 3' + P-element 2790 1 17.81 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAGGAGTTCCGAAATCTTCCTCTCGTTGTGGCAATTCAA:1 + chrX 9816513 3' - jockey 31 1 68.49 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGT:1 - chr3R 20905355 3' - pogo 37 1 60.69 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTAATTATGCTACATACAGTGCAAAGTTTGACAAGTTAACGTTTTCTTTATCTAGGTGCATTGTTGTTGTAATGTAATTTAATTAA:1 - chr3L 6751627 3' - pogo 35 1 59.59 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGGAAAGTCATAAGATCTGTATATCTTATGATAGTCCTTTGATTAATTCTTGATTCTAGGAATAATTTTAATTTGTTAACCATATG:1 + chr2R 13849755 3' - roo 8701 2 57.53 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTATTAAATTAACTAATTAAATTAAATAATTAAATTAACGCCAGAAAGTTTTTCTTCCTTTGCCTCTTGCAGTGTTTTCCGAAGGGTGCCACAATGTGGCGTCGCATAATT:1 + chr2L 19851314 3' - F-element 24 1 55.48 AATATCAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACCCGTTGCTCAGCTAGTGTGAAAGCGAACGCGAAATATCAACAATTTTTGTATTTCTGATTGTTATTCACAAGCAAAAATGTAATACCAGTGACATT:1 - chrX 22906394 3' - INE-1 586 1 66.44 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGACTCTACGAGTATTATAATTTGATTGTTTCC:2 - chr3L 21630278 3' - Burdock 23 2 69.86 AAATGAAAAAAAAAAATGAAAAAATAAATGTAAAAACATTGGGTTTAATGCTGGGTCTTAGTGAAGGAAATGCTGGAGGTGCTGGCGAGATGAATCGTAGTTGACCAAGCGGATTGTGCTCCATTTCAGCGGGCTA:1 - chr3L 3390426 3' + Doc2-element 246 2 49.26 TTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTC:1 - chr2L 1449614 3' - opus 80 2 76.26 ACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAATTCGCAGTGAGGATCTTCGCGTAACATAAGACATTTGTCGCAGGTCGCATATGGCAATATGGCAATATTACCGAGAGCACAATCTCCTTATT:1 + chrX 16529815 3' + mdg1 7014 2 61.64 ATGAACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCA:1 + chr2L 15153323 3' + G6 1944 1 69.86 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGTGCGAGCACTTAACCTGGCTTAAAGTC:1 + chr3R 13358738 3' - mdg3 5266 1 76.71 CACTCTCGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATCCATTACAGTTGTGCTGATTTTGATTTGCTGCCCTTATGTAAGGCTGGCTGCCTGATGTTTC:1 - chr2L 12319884 3' - R1A1-element 388 1 53.62 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGGCCAGAAA:1 - chr3R 9563628 3' - P-element 94 1 21.23 CAAATAATAAAAACATCATCGACCATTGTTGGTTATTGTCACGGCCTGAAAGTCGGCAATTCAAAATATGAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATGAGCAG:1 + chrX 16244926 3' + jockey 4989 1 79.43 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTT:1 + chrX 16853423 3' + roo 9008 2 62.33 GCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAATTTCCCTCTGCGGTGAGCAGAGGTGTGTTTGCTGGGGGAAAAGGGACGATGGCGACGCGCCTTTTTCCACACGGCCTGTGTAATTGAGACTTTT:1 - chr3R 14457432 3' + Doc 4546 1 43.15 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCAGTATTATACTTTCAATTACTATATAGTATGTGCTCTATTTTATAAAAATGTTACGCTTATGATTTATGAGTAATCAAC:1 - chr3L 16764780 3' - I-element 38 1 57.93 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAA:1 + chr3L 3540223 3' - mdg3 5296 2 54.11 TCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATCACCGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGATGATTTGGTTTGCCCAAGCTCACGGGATGA:1 - chr3R 9124076 3' + diver 320 1 79.45 GGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCGTTATTTGCATTTGCATTAACGTAATTATTTGAAAATAGATTTGAAGTAGCCAAAACTATGTACATATTATCACAATGTTAGCCATCCCGGGATGGATTTTCATTTGAATTG:1 - chr3R 4849192 3' + 1360 277 1 75.34 CAATATGCTACACCTCCCTTTTAAAAAAATGACGAAATACATGTAGTCATTTAGTTTTAGTGTTAATATATTGTGTTACAAAATATAATATAATTGCAATCCAATAATAATTTGCATTTTTAATGCATCTTGACTTAAGGGTGAGC:1 - chr3R 27474281 3' - Stalker 6840 2 59.59 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACTTTCAACTGGGAAAATCAAGTAACCAAGTAATGTG:2 + chrX 19231890 3' - mdg3 5263 1 78.08 GACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGGGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACA:1 + chr2R 18048889 3' - opus 187 4 69.23 CTCTTTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAATCCTCGGAAAAATCCCATTCAATTTTTGTGTTCAGTTTCGCTTGTTTGCGGACAAACAAGAATGAGCG:1 + chr3R 26264652 3' + mdg3 5043 3 56.85 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCTGTGGTACCCCATTATTTCATAAGTGTATTTCTGCT:1 + chr3R 5245684 3' + 1360 3351 1 53.24 AGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCAAATAGAAATTATGCATTCCAGAATGTTTACAA:1 + chr2L 15153355 3' + G6 2005 1 62.39 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATATTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCAT:1 + chr3R 5087073 3' + P-element 2792 1 20.55 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAAGTGCACAT:1 + chr2R 10991430 3' - jockey 28 1 71.92 AGTGATAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCAAGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCGCAAAAGGGAGAGTAAACAAAACATTTAGTAAAACAGTTTTGGTTTTCGGTTAGTTTTTAGCATAGACTTAAAAGCGTG:1 + chr2R 13185486 3' - Cr1a 278 1 62.33 TGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCGGCGTCATTATATGCATATGTGGGTTCTTCAGTTGATAAATATATGCG:1 + chr2R 17014147 3' + HMS-Beagle 209 2 60.27 AAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCAATGTACTAACACCATTGACCAGCCAGATG:1 + chr2L 8397277 3' - roo 8686 2 68.66 AAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTGCTTTTCATTGGAAATTTAATCT:1 + chr3L 10076402 3' - X-element 61 1 50.68 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATACTATACAGGCAGCGCCATCGTCTTGTTGGTTCGGAAATTTTTGCCTTTTTTGAAGTTGATTTT:1 - chr3R 24455342 3' - 297 23 2 56.78 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTTTTCGGCCACAAATAATTAATGGGTTAATGGGCTGGGAAAAAGGA:1 + chrX 18034709 3' + Juan 4180 1 59.59 ATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAAC:1 + chr3L 21093206 3' - Ivk 101 1 76.71 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCA:1 + chr2L 16685385 3' + P-element 2810 1 32.88 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAGTTTG:1 + chr2L 10832369 3' - Doc 37 1 62.76 GATATGACCAAAACAAAGACACTAGACTAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTGCAATAATATCTCTTTGTTTCTCTATATATTTGCCAGACCAAGAGACGTCGTCGGGCGGGGGGAAAAGATCTGAGCGATGCCGCCGAAATC:1 - chrX 9967120 3' + 1360 494 1 54.79 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATACTGCCAAACCAATGGATGGCCGTTACGCATCTTGCTATTCTAATGTCTTTGGTTTAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGAC:1 + chr3R 5245637 3' + 1360 3326 1 72.65 TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGA:1 - chr3R 5087049 3' - P-element 101 1 17.12 GTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCGGTTGTGTCCGATGATTAGGACTAGCGAAT:1 + chr3R 30056545 3' + jockey 4901 1 78.77 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCACGC:2 + chr3R 4659615 3' + P-element 2822 1 41.78 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATGAACCATGTTTTTAGCGCATTCCTAGCCCCACTGTGCACTGGCGACTTCTCGGTCGTCATGGTCGTGCCTTTCAGTTCGAAACGTGATCGATAGACTG:1 - chr3R 13843655 3' - roo 8683 2 67.13 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGC:1 + chr2R 18722017 3' - 412 7125 2 67.12 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGGTGTACCACCACTTTTTATGGCCACACGTG:1 + chr2L 14796950 3' - I-element 17 1 64.49 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGTGGTCATGGATCCGCATGGTGGTG:2 - chr3R 23099032 3' + roo 398 1 77.40 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTTCCAGTTGATTGGC:1 + chr3L 20977464 3' - I-element 46 1 54.17 AGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTGTAAATATGTGACAT:1 - chrX 10873750 3' - mdg3 5262 1 77.40 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAATGGAGTCGACTTGAACTAATCAAATAAATGCATACCA:1 + chrX 5222973 3' - 412 7099 2 54.11 AGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTAC:1 - chr2L 15142246 3' - BS 4772 1 60.96 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGC:1 - chr2R 11379736 3' - jockey 91 1 71.23 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGCTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGG:1 - chrX 15089507 3' + P-element 2811 1 32.19 AAATCGCAATCGGTTAGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTACATATATACATAGATACATACTCCAAGAGGTGGTTAGCACCTTGAAAGTGAAAAACCCTAGCAACAACGATATGT:1 - chrX 11951865 3' + diver2 468 1 61.64 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGCACAAATGCCGCAATATAA:1 + chr2R 18722072 3' - 412 7070 2 73.97 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCACAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCA:1 - chr3L 22518951 3' + pogo 2075 1 67.81 GGGGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGGTCCGGG:1 + chr3L 17447579 3' - Tirant 8120 2 74.40 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGTGATTTTCTATCTTTACAGGATATTC:1 - chr3R 18524226 3' + opus 458 2 58.22 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGCACGCC:1 + chr3R 5765428 3' - opus 7181 4 65.75 ATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAAAAA:1 - chr2L 22696399 3' - X-element 90 1 71.23 ACAGCCAAAATGCAGCGCCCAAGTTTAACGTAGGTAGATAACAAAGAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATTTGGCCAACATCTTGGTGCTCTCTTCTTCATCCACTGTCCCCTTCTGCTGGGCATACATACAAT:1 - chr3R 12787263 3' - diver2 4712 2 51.77 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATATCTATATATATATGTATAGTTCCTATTGTTAAAGTACTTATGAGC:1 + chr3L 17444077 3' - Burdock 70 2 73.29 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCAA:1 + chr3R 31956526 3' - pogo 35 1 60.96 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAG:1 + chr2R 18051060 3' + mdg1 7389 2 66.44 GCTCAAAGAAGCTGGGTTCGGAAAAATCTAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAG:1 - chr3R 20001651 3' + FB 2 1 66.44 GAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAA:1 - chr3R 6103569 3' + Tirant 8453 2 54.17 CAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAACAAATGAATTATGAGTTGCTGGCGGCGG:1 - chr4 907882 3' + 1360 3301 1 79.17 GGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAA:2 + chr2L 6074055 3' - BS 79 1 77.40 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAAC:1 - chrX 16853333 3' - roo 69 2 65.75 GTATAAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAACCGCCAAAAACTGCCACGCCCCCATCAACATAAATGTTGAAACTAACTGAGCACGGATTTTCTCGCAGTGCAGGCACAGCAGGAA:1 + chr2R 19153520 3' - diver2 27 2 55.22 AAAAAATTTTCAAATTTAAATTGTACAATTGCGGATATATTAAATATCAGATCAATTAAGTTTTACAAGTTTTACAAGCAAGTGTGAGTGACTAATGAGTTGCACGAAAAATATTACGATTCATTTAATCTACAGTAGTAAATTCC:1 - chr2R 22369424 3' + 1360 3037 1 46.58 AAAAGTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATCTAAAAACGTCGCAGTGTGTGACACATACACACTGAAAACA:1 - chr3R 21521335 3' - Bari1 82 1 73.29 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATGTATAAGTATACATATGTACGTCGCATTTTTAGCTGAGTAACGAGTATCAACTAAGGAAGTGAACTCTTTTATAACCGACAAGTCTACAAGCTGTTTATCTCCTGTTTTT:1 - chrX 22959119 3' + 297 389 2 63.70 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCG:1 + chr2L 2357352 3' - P-element 86 1 27.40 ATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGTGTGTGTGT:3 + chrX 685391 3' - BS 5065 1 63.01 TCGGTCCGGTTAACTCAGTTAACTTATACATTACTCGTAGAAAAGTATGTATCAGGCGGAAGGAAGCGTTTCCGACTCTTTTTGTCATTAGATTAAATATTTCACATATTTTTGC:1 + chr3R 25472399 3' - gypsy3 6578 4 66.09 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGGAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCAT:1 + chrX 15089592 3' - P-element 49 1 48.53 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTGTGTTCGCTCCGCAAGAATTCGCTGCAATTAAGTTGGCAAGTTCTCTCATTAAAATATTTAAAAT:1 + chrX 8200306 3' - flea 4804 2 53.79 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCCTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCA:1 + chr3L 12863764 3' + Transpac 5186 2 66.37 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGGTGTACCACCACTTT:1 + chr2L 14796935 3' - I-element 71 1 66.44 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTA:2 + chr3L 22635787 3' + hopper2 1559 1 51.37 TTAGGGTAGATTAGTCCAATTAGTCCAACACCTCCCTCGTTTTATTCCTATTTGCAACCCTAAACGAGAGCTGAATGTGTTTTAGTGGATTTTTTTTTTATGAGGAGAGGTCAAATCGTATGATGTATTTTTGTAATAGCAGTTCG:1 + chr3L 23665507 3' - Stalker4 7 4 73.97 ACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGC:1 - chr2R 10367505 3' + 412 7184 2 76.03 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGGGTCAGCTGTTTAT:2 + chr3L 16887450 3' + roo 9052 2 71.92 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTG:1 + chr3R 27971126 3' - mdg1 51 2 53.42 TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATA:1 - chr3R 7884536 3' - jockey 4819 1 59.59 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGG:1 - chr2R 19168107 3' - opus 178 4 83.47 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAAGAGAGCCAGATAACGCGTGTGGTTTTCCGAGAG:1 + chr3L 13227734 3' - hobo 17 1 70.31 CGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACG:1 + chr2R 6187939 3' - Tirant 74 2 67.81 TTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAACTGGCGCGTTCGAGCACACCAAATACTCTACTCCCAAAGTGGGAACCAGCATCGCCAGCACAGTGAAGGCCAACCAGGG:1 - chr2L 2671256 3' + Transpac 70 2 54.11 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCTCCCTTCGACGCT:1 - chr3R 20292379 3' + pogo 2082 1 74.66 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAATATCGGCTATAGCAGGTGCAGGAACGTTGTTGGCTATGAAGAAATGGGTTCAG:1 - chrX 18042897 3' + pogo 2090 1 47.95 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGAGCCATGCCAACAAAATGTGAATGTATGTAAATATAGAATAATTAACAGTGGAGCTC:1 - chr3R 15590520 3' + roo 9052 2 67.81 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGA:1 + chrX 14908451 3' - blood 84 2 73.29 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTAC:1 - chrX 18913280 3' - Quasimodo 70 2 78.08 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGGGCTGCATGTATG:1 + chrX 14385244 3' + blood 7320 1 65.07 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTG:1 - chr3R 8542565 3' + roo 9025 2 48.63 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAAC:1 - chrX 18193709 3' + hopper 1354 1 60.96 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATCGTCAAGTGGCTCAAG:1 - chr3L 22529701 3' + roo 396 1 74.63 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGGCATCTGA:1 - chr2L 12355248 3' + hobo 2905 1 60.96 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATATCTGCTTTCGTTGAGCCTAACTGCGCGAACTTATAAATATCTATTT:1 + chr2R 20704266 3' - hobo 26 1 60.96 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAATGTTATACAATTTTTAATTTCT:1 + chr3R 25271311 3' + 412 7522 2 67.12 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGTATACGAACAAATCCACTCTTCTGAGAAATTATCGAGATCTCGTAAACAATTAGTTCTAGAAATTTTCTTTTAAAATCTCGT:1 - chrX 14756635 3' + pogo 2065 1 60.96 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTGACCACTTTGCCACTCATTTTCACACG:1 + chr3L 22481379 3' - roo 8675 2 76.71 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATA:1 + chr3R 24175799 3' - Burdock 39 2 58.90 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGG:1 + chr2R 17100137 3' - P-element 76 1 32.17 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACG:1 + chr3L 11196450 3' - pogo 53 1 57.24 GCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTATGATGGTTGTTACACGATTTCTAGGG:1 + chr3L 18297014 3' - Juan 4117 1 54.79 TTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACAAATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCT:1 - chr3L 18708561 3' - F-element 13 1 80.00 ACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTCTATTACATAATTAGATCCTACTAATACTAATAATTTAATAAAAGAAAATGTATCAATTATGTGAACGCAACGCCTTCTTAC:1 - chr2L 22173293 3' + Cr1a 4216 1 70.55 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGGGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAG:1 - chr2R 9164847 3' + 412 458 2 53.21 AACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTTTTGTATTTTCCCTTTTCCATTA:1 + chr2L 17228715 3' + mdg3 186 2 56.85 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTATGTAAACCTAATTCCATCTCCACCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAAGCAAAGGGGTATACAAAATCTACGGA:1 + chr2L 14222385 3' + Transpac 286 2 69.86 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCAT:1 + chr2L 1136376 3' - 1360 85 1 79.02 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACAT:2 - chr3L 9241992 3' - roo 8727 2 65.75 TAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCACATTTATGCA:2 - chr3R 20147859 3' - 1360 297 1 51.37 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGAAATTCGGAAACAGCAGAGTAAGTGCGGAAAAGTATATTTTTTTTCCTGCTCTGTGGGCGAAAATCTCAACGGAAATCATTAGGGGAAATGGA:1 - chr2R 22145453 3' - FB 22 1 67.14 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAG:1 - chr3R 10140209 3' + P-element 2800 1 22.60 TTTTTCTTTTTTTTTAAATTTTATCCAGCTATTTTGTTCGCATTTTGATTTTTATTTTACTTTCTCTCTAT:1 - chr2L 4103550 3' - TART-C 11096 1 35.21 TATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGTGTCCAACTGACAGCCGCTGGGGAAAAGGCTTTG:1 - chr3R 25570489 3' + blood 7206 2 72.80 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCATACATGCATTTGT:1 + chr2R 7098036 3' + copia 5062 2 66.19 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGTGCAGCGTGTATGAAATCAATGACATGTTGTC:1 - chr3R 25503848 3' - opus 7158 4 77.14 TGCATATGTGTGTGTGTGAGTGGGTATGTGTTTGTTGCAAGCGATGTATTTTTAATCCGAATCTGTCCGTCTGAATATGCCTTGATTTCGCGAAAAATATAAGGCTAGCAGATTCTAGTAACGCCGACGCAGCTTCGGAATAATAT:1 - chr2L 16945492 3' - accord 186 2 71.92 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGGGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAGTGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATAT:1 - chr3R 31956774 3' + pogo 2053 1 60.77 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAACCTAGTGAATGTATGTCAGTTAGCAGGGATGTGTATATATTGTGTAAGGTTGAATCAGC:1 + chr3R 19247165 3' - 412 7092 2 65.75 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGAT:1 + chrX 21844333 3' - mdg1 43 2 54.79 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGG:1 + chr2R 10367591 3' + 412 450 2 55.48 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAA:1 + chr2R 7404740 3' + blood 303 2 77.44 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGAT:1 + chr2R 6945727 3' - pogo 58 1 57.53 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGG:1 - chr3L 4869128 3' + roo 9053 2 68.75 GTCGTTTGACAGCCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCAGTTAGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGGTCTCTGGAGAGTTTAAAACTGAGCATTTAAATATAGCTAATTCTTGTCTTGTAACA:1 + chrX 17702902 3' + Circe 293 1 70.55 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTC:1 - chr3R 8402521 3' - mdg1 42 2 57.53 GTGAACGGTTATAAGCCAGTGTAGATCCCTTGCTTTTAGTCTGAGGTGCGTCGTCTTGGCATCTATGTGTTTCCGCCAGTTGATACAGAAATCTTTATATACACGTATATATATATATGCATTTTTGTTTCGGCTCGTTGCATTTT:1 - chr3L 4430905 3' - Doc3-element 4242 1 54.11 AAAACAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAGCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAATATTTTTCAAACATGTCCTTATGAAAATGATTCT:1 - chr2L 2186964 3' + I-element 5170 1 76.71 AGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAG:1 - chr2R 5582153 3' - Cr1a 470 1 56.94 GATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATCCCGTGTGAAAGTGGAGCATGAATGGTGCGGCGCTACG:1 - chrX 13131174 3' + Ivk 5181 1 73.97 CTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTTATATTGCAAACGGCGGCCAGCAGATTATG:1 + chrX 10623942 3' + X-element 4700 1 68.66 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAGTA:1 + chrY 311462 3' + 1360 3387 2 53.42 ATTCTAGTTTAGGGTCATATTAAATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGC:1 + chr2R 5022774 3' + Gypsy12A_LTR 77 1 50.00 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCTACTTTTCCTTCGTTCACTT:1 - chr2R 544747 3' - HMS-Beagle 25 2 68.49 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTACGACCACAAAAATTTCTTAGTGTTGAAATGAGTTTTGTTTTGTTTTGTTTCTTCC:1 + chr3R 24559762 3' + pogo 2042 1 63.01 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATC:1 + chr2L 10832326 3' - Doc 81 1 71.92 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATT:1 + chr3L 20290748 3' + roo 321 2 78.08 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTGCCTGCATCAAAAATCCCTGTTCAATGTTAATTGTTAATCATTAAATATTGTTGCTGGCAAAATCAATATGGCG:1 + chr2R 20913249 3' + 1360 3373 1 73.57 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAGCGATCCTTCCGCGTAAAACCAATGTAAGCAGTGCAGTGGAAAACCCAACCATTATTTTAATTGTA:1 + chr2R 24630232 3' + copia 201 2 56.85 TAGTCTTAAGTAACCATGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAAT:1 + chr3R 19545384 3' + jockey 4903 1 76.71 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGAT:1 - chr2R 15080011 3' - roo 62 2 61.64 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTTAATTT:1 + chr2L 6074102 3' - BS 43 1 53.42 TAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACATATTATTAAACATTTTGTTC:1 - chr2L 15153211 3' - G-element 19 1 65.75 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACTCCAC:1 - chr3R 20292402 3' + pogo 2059 1 57.53 TCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCAT:1 - chrX 983102 3' + 412 7504 2 56.16 AGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCAATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAAAGCACATTAATAGCAAATCCAGGTCGGCTTCGAGTATCAAAGGTTAGTACAACGGACAT:1 - chr2R 5516172 3' + F-element 95 1 56.85 TTTAGAAAATATTGATCATTTCGGGAGTTAACGTTGATCAAAACCAGACACTGCTATTCTGTTGATCAGCCTAAAAGTTGTGATTTTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAAAGGATAGCATGAACAGTTGCGATTGAGCAGGCTCAAT:1 + chrX 8459264 3' - HB 255 1 76.71 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCTGCTAATGTGATTGTTGTTGTTCTGATAAACGCTAA:1 + chr3R 10140320 3' - P-element 16 1 76.03 TGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAACCAAATCGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGCTCAAATATTTTTGCAACAATTTCGGCACGCCGATTTTCACCTCGGTAGCACTTGGTATCCTCGCCGATTGGGGCAGC:1 - chr3R 26041865 3' + Doc 191 1 53.42 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGC:1 - chrX 14692843 3' - Transpac 4982 2 60.27 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGT:1 - chr3R 6782699 3' - jockey 4728 1 52.41 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGGT:1 - chr2R 9164819 3' + 412 7502 2 54.79 GGGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGTGAGGGGACAGAGCCGAACGGTCAGGGAAAGTTTTTGGGCACTTAC:1 + chr3L 21489070 3' - Cr1a 299 1 63.77 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTC:1 - chr3R 19700868 3' + roo 9023 2 61.31 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGTTGTGTGTGCCCCC:1 - chr3R 18903344 3' + pogo 2087 1 76.03 GGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAAGAAATTAATCGAAACAAATTCTAAAACTTTTTGAAAATGTGGCGAGGTAAGTAAGCGGACCAGAACAGAGTCG:1 - chr3L 12846005 3' + HMS-Beagle 167 2 52.74 TCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAGTTTAAGATGTTTCGATTTGGCTACCAACTACCAGCTACCAACTACCAACTACCGACTACCGACTACAACGAAAATAAAGCGAGTAAATCA:1 - chr2L 10799544 3' - Doc 4227 1 53.42 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTTGTATTGTGGT:1 + chr3R 20292560 3' - pogo 26 1 67.81 GGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGACCATTTATCTACTATTTTCAATCATTTTTACATTTCTTCCGGACACTTAGTTATAGACTAAGATGGTTCCCAATCCAATTA:1 - chr3R 20734447 3' - roo 346 2 60.27 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTG:1 - chr3L 14581382 3' + pogo 2035 1 65.07 ATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTCGTTTCCGCCTCCAAATCCAAGGCTAGCACCACCGAAGCCCAGTCCGAATCCGGCGGATGC:1 + chr2L 10697952 3' + pogo 80 1 57.93 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAAGAAAACAGGCAAGCACTTAACAATTAACCGATCGTTCCTGTAATTACCGAAAGCCCTAAATAAAGCCCCAATAAAAATCACAACACTTCCAT:1 - chrX 13651419 3' + 297 6955 2 71.23 AATAAAAATTAAAAATATATTAACTTAAGTACGCTTTACTCAAAAAGTTATTTTTAATCATAAGCTAATATGTTTTGAAGTTTATCATACAATTTTTTAAAATATAATTTACTGTGTATCTTTCAACATTTTCATCGAAATTTCG:1 - chr2L 7773272 3' - hopper 173 1 46.21 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCATAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTCGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGGTGCTGCTTCCACT:1 - chr3L 25411049 3' - 1360 69 1 95.31 TTTATTATTATTGTTTTTTTTTAAATTTTAGTAAATCTGTTGCAACAAGCCAATCGAAGAATTGTCATGCAAATAAATTAAATACTTTAATTTTGCATGACTGCCTTAGGGGCACAATATTTTTTTCTCAGTGCACAGGCAGCTGG:1 - chrX 3206406 3' - flea 244 3 74.66 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAA:1 + chr3R 24175776 3' - Burdock 50 2 58.21 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAG:1 - chr2R 10367467 3' - 412 7108 2 54.48 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAACACTG:1 - chr3R 25753632 3' - hobo 73 1 67.81 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTCCAGGTTGTATTCAATC:1 + chrX 15167806 3' + roo 396 1 76.71 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTC:2 + chr3R 6053065 3' - Quasimodo 54 2 60.27 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGCGCAACTTTCAAAGATGCAGTAAGC:1 + chr2R 24427652 3' - jockey 4705 1 63.70 ATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAATTCGTGTTGATGGTGTCTTTCATCTGTCTG:1 - chr2R 2948990 3' + 17.6 467 2 69.86 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGAC:1 + chr3R 9938704 3' + roo 9021 2 53.42 GATCGTCTAAATCGGCTAAAATGGCAAATCGGTTATCATTGTTAATTATATGGTCGGCGCTGGAGAGAACCACCTCGACGACGGCGCTGGACAAGCGGGAGGCATTGTTTGCCTACTGGGATCCACTACCCTATTGCGCATACTAT:1 - chr3R 24114538 3' - Fw2 149 1 64.38 TTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTGTATTATTTTTGATTAGTAAGGGTATGAACACTTCGTTGTTCAGTCGTCTTGTTTTTCTTAGT:1 - chr2R 16095845 3' + 1360 175 1 71.92 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATTTTTCGGCCA:1 + chrX 18034673 3' + Juan 4144 1 67.12 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCA:1 + chr2L 21192575 3' - roo 8740 2 73.97 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGAATCGAG:1 + chrX 11534552 3' - roo 8709 2 53.42 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGGATTATATCTCTACAGATTATTACGATACGCTTGTTCTAGCTTGTTTGT:1 - chr3R 11121670 3' - copia 4902 2 60.27 GTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATTACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTATCATTTATGAAAAGCTGGTGTAAATTATAAAATAAGAAGGACTATACTATAAGAAGGAATAAGAAGAAGGGAATTGTAAAATCTGTAA:1 - chr2R 4695758 3' - 1360 168 1 60.96 GGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATA:1 + chr3R 30731469 3' - gypsy6 7481 2 62.50 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCCTGCAATTGCCCAGGGCCTGGCTCCCAGTT:1 - chr3R 5765282 3' + opus 7488 2 75.34 ACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGTTCACAAAATTCAATAGGGAATCATCACCCACATTCTTGAGT:1 + chr3L 21236497 3' - 1731 101 2 71.23 TCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACA:1 + chr2L 1073995 3' + Tirant 326 2 70.00 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATGACTCAAATCCGAAAACTTTGACGGGGAACACACACTTGAGTCACC:1 - chr2R 19168088 3' - opus 71 4 73.29 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACA:1 + chr2R 16891864 3' - jockey 64 1 54.11 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATATCTGCTTTCGTTGAGCCTAACTGCGCGAACTTATAAATATCTATTTAAAATAAA:1 + chr2R 20704274 3' - hobo 18 1 66.44 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATTAT:1 + chr2R 9867186 3' + roo 346 2 58.22 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGGCCATCTTTTCGACTGGCTAAATTAACT:1 + chr2L 13547069 3' - P-element 55 1 47.95 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTACCGTGCTCGCCTAT:1 + chrX 19498137 3' + P-element 2790 1 15.07 AAAAAAAAAATAACAAACTGAACTGAACTGAATCTTCTTTTTTGGCGTTCAAATTGAGGATGTAGTATGGAAACTCACAACAAGATAGCATTTGGTAGTTAAGAGTACGCACATGATATAGTAGATACACTCAGAACAGTATTTTA:1 - chr3R 24683559 3' + gypsy7 5018 1 72.60 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATGTAT:1 - chr2L 1229557 3' + opus 7461 2 54.79 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATA:1 - chr3R 31907323 3' - Tirant 15 2 69.37 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTT:1 - chr3R 4722380 3' - roo 8725 2 61.64 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTAATACCCAAATTCAAAGCTTCAGTGTATTTCCGAAAATTGATATGGTAATCCCACAGAATGTAGTATGAAA:1 + chr2L 21724140 3' - pogo 46 1 54.11 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATCTCAGATCTAC:2 + chr3R 22289508 3' - 412 27 2 67.12 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAA:1 - chr2R 18882574 3' - roo 8731 2 67.12 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAAT:1 - chr2L 1229561 3' + opus 7457 2 52.05 CAACCTACGCCGGAGACTGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATCAGCGTTTTATTCGT:1 - chrX 10728787 3' + gypsy6 7772 4 62.33 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGATATCAAA:1 - chr2R 7404639 3' - blood 27 2 63.70 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGGAGATGTGGTACGTTTTCTATAT:2 + chrX 11815110 3' + flea 215 2 65.75 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCA:1 - chr2R 5214948 3' - F-element 46 1 51.18 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAAGTGCAAGGAAACGCTGATGGAGAAGTGCTCGAAGGAAGAAAGCTTGGC:1 + chr2R 9668130 3' - jockey 4680 1 78.08 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATGTTTATTTATTTAACCCCATTTTTCTCTCAGTGCACGAACAGGTGAAGTTGGCAGGACCCGCAAGAGC:1 - chr3L 12616501 3' + Transpac 5226 2 53.42 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCGCAGCCTTCGACGGGGTCACCAAATGG:1 - chr2R 7223604 3' - blood 7022 2 76.71 AAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAA:1 - chr2L 5771419 3' - Juan 70 1 63.01 ACCTGTTGCGTCCTGCCATTCAGATAGATTATTTTTGAAGCCCTGCTGTCTTTACTATCCTTAATGCAAAAATGATTGTCTTCAGTTTTGTCTTAACAGTTTTGCGTATTTTTCCTAGGTTCTGTACCTACTATATGCGGTTTTAT:1 + chr3L 24533356 3' - Q-element 419 2 69.86 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAATCAAGTATCAATCGAATGGATGCAGTCGATACGTAAGCAGCTAAAATATGCTAATAGTCAGTAAAGTAGTATTTAA:1 - chr2R 16774083 3' + blood 7364 2 50.68 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCA:1 + chr3R 29709040 3' + blood 7323 1 72.00 TTTCACTATACTGTTGTGGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGAT:1 - chr3L 5514181 3' - Doc 69 1 50.00 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAAATGGCGGCGGCATTAGGCGTTGACATGCCATAAA:1 + chr2L 3967123 3' - hobo 86 1 76.55 GGTAGTAGAACACGTTTTATTCTGGAAGAATTCAATGTTTCACAATTGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAATAAAAGTTAATTGCCCGCGTGTGAGTGCAATTGTGCGA:1 - chr2R 7939561 3' - aurora-element 12 1 73.97 GTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGGGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGAGCGTGGCAAAAAGGTTTTTGGCATATTTATAGAAATTTACAAGACTA:1 + chr2L 23066893 3' - INE-1 534 1 39.73 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGGGGTAACCATT:1 - chr3R 26782666 3' - hobo 26 1 69.18 CGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAA:2 + chr3R 12559719 3' - mdg3 5330 2 77.40 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCA:1 + chr2R 16383365 3' + roo 9003 2 67.12 GATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAACATCTCGGCTTGGCCCCAAACCACTTTGCAGTTCCACGCCTCTCCATTGTCAATTAGCCGAGATAATGTTGACATTATCCGGGC:1 + chrX 18028733 3' - Juan 322 1 65.65 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGTGGCGACG:1 + chrX 6938211 3' - hopper 78 1 78.79 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGAAGTGGTATG:1 - chr3R 20452147 3' + blood 351 2 67.12 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATACCTCTTTTATAA:1 + chr3R 21924391 3' + roo 9048 2 69.18 GTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAACACTCTCCTACAGAGGATTGCTACCATATTCTAAAGGAATCTTTCAAATAAATGCCATGTAAATGTTTATAGCACTACAA:1 - chr3R 4913505 3' + 1360 180 1 73.29 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAA:1 - chr3L 5183682 3' - copia 4916 2 53.42 ATAGGTTTTCTATTAAAGATGTTCGAAAAGAGGTCCATTTGTTCACTTGGTCACTTCTACACTAGAAGTGTCCGTATAGGAAATCTATGCGTTCGGCCGACTTGATCATGTCCTCGAACTCTTCGTCCGTAAAACTTCTGGCATTC:1 + chr2R 11227197 3' + invader2 4627 1 56.85 CTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCACTACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGATGTTGTCTTGCTTTAGTTTTGTGGCAGGGAATGGTTTATGTGG:1 + chr2R 20097572 3' + Chouto 229 2 72.86 GCATGTACTTATATATTTTCACTTGTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAATCAACAAAGGAGAGCTTACAAACTAATAAGTGTGAAATCAAATACAGATTGGTTAACATCGTACGATGTTTAGAATTTAGTACAATATAAT:1 - chr3L 7972118 3' - Max-element 475 1 62.33 CATACACACACACACACACACTCATATATCGCTTAAGTGAAAGACTCTGGGCAGGGAGTTGTGGGGCGTGGGGCATTTGCCGACGGAGAAAACATTTTCCAAAAGGTCATTCACTTGTGGTCAAGTTCTTTCGCCTGGTCAAATCC:1 - chr2R 18922876 3' + accord 255 2 72.60 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTT:1 - chr3L 13597733 3' - blood 49 2 52.74 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATT:1 - chr3R 29708959 3' - blood 56 2 57.53 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGGAATACTATGCAAAATAATAACTTAATATTTAGTATAAGTGTATAATTTTGAGGTAATAAAAAAAGATACTTATCACTTATCACTATCCTTGATACT:1 + chrX 18149929 3' - hobo 23 1 67.12 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCTTTCGTTCTGTTTGTTGTACGATTTTATCAACTTAAAAATCTGTGTTATTTTCGATGTTAAATTC:1 - chr2L 17557397 3' - Burdock 6186 2 53.79 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCAACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATA:1 - chr3R 6103566 3' + Tirant 8454 2 51.37 CAAGAGCGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGCTGTCTTTGG:1 + chr3R 28033659 3' - diver 89 2 77.78 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTCACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACC:1 + chr2R 18882666 3' + roo 9009 2 58.22 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGCTTACAATTGTTTGCATAATCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAAATTTAATC:1 - chr2L 12481394 3' - pogo 30 1 59.59 ATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGTATTCTCTGGTTGGGGTCATAACGGTAATTGCCAACAAAACGAGTGATTAACTTGACAATACGCTCGCACGCACACATGGCGGTCC:1 + chrX 9819575 3' - Tabor 7131 2 60.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATAAA:1 + chr3R 30568911 3' + roo 356 2 53.42 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTT:1 - chr2R 22255345 3' + roo 8990 2 75.34 GGCACTCTTATGCAAACATTTGGTTATGGGCCCAGGCCCTACGCGTAAAGAAATGTATTGATTCGTTTATAAAGTATTCGTGAAGTGATCAAAGTGAAGTAATCAACTAAAGAATCGAGTCTTACTTTCGTTTTGGATCGCATAGC:1 - chr2R 7401906 3' - frogger 2277 1 72.60 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAAC:2 + chr3R 20452284 3' - blood 7071 2 58.90 TCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAATGCTTAAATTAATTGTGCCGCCCGAAAAATGTCGACAAACTGAGTTACATAACA:1 - chr3R 22598235 3' + Burdock 6302 2 62.76 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGT:1 + chr3R 10143023 3' + 412 7476 2 63.70 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGC:1 - chr3L 4869152 3' + roo 9014 2 57.34 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCT:1 + chr3L 6774249 3' - pogo 57 1 56.85 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCATTTACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAA:1 + chr3R 7424652 3' - 412 7075 2 63.11 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAATGTATCCAAAGGATGCACAGATC:1 + chr3R 29709108 3' + blood 7370 2 70.55 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAAGTAA:1 - chr3R 10778662 3' - mdg3 77 2 69.18 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTT:1 + chr3R 18846599 3' + roo 9009 2 64.38 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTAGCTAAACTGCACATACTTCACATCACGA:1 + chr3L 10814596 3' - 297 6643 2 64.58 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCGTCGCG:1 - chr3L 21097117 3' - mdg3 5283 2 52.63 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAACCAGAGTAAATTTACAACGAAAAGTATCAGCCC:1 - chr2L 13244823 3' + hobo 2903 1 68.48 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATTTTCTCAAATTATTTATTTCTCCAGTTTTTTCTCAAAAGTTTCCTTGTTGCAGATGTTTTAAAAA:2 + chr3L 18920487 3' - Juan 61 1 55.48 CTTCGCCGTGTTTCGTTCATTTCGACAAACAGCAGTGCTTTGCGGATCATTTGTTTGAGGACCCAATTATTTAAGCTACTTTTCGCGACCCACTTTTTGTATATAAGTACATATACAGCTTTTTCCAACCGCGCGTAACCTAATTA:1 + chr3L 24924810 3' - Tc1 498 1 68.49 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCATAAAAAACAATCGACAAATTATTATGCCTGATAAAATACGGTGAGCATATGCTGCATACGGTGAATCCCCGCCAGCA:1 + chr2L 13877794 3' - Transpac 40 2 55.48 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAGCTCAACG:1 - chr3R 16771354 3' + roo 328 2 70.83 GTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTTTTGCAGAGATTCTTCTTTGCTTTGCTTGTCGATACACCACACTATTCATCTTTTAATTCGTGTTTTTGCCGTTCGTATTTCTC:1 - chrX 990963 3' - 412 7447 2 57.53 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAAAGTTGCTAGTTGTTGGT:1 - chrX 17614334 3' + roo 9053 2 72.60 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTTTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGTTGCA:1 - chr2R 20704161 3' + hobo 2924 1 49.32 ATAAACTATAACCACCAGTTGAGAAAATCTATTCCAGAACAGTACGGGCAAGTCGTCCTTGTATGCGTTCTATAGGAGCGGACCGAGTACGCT:1 + chr2R 3130067 3' + S-element 443 1 61.29 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTCAGGCGAACTA:1 + chr3L 13227696 3' - hobo 51 1 60.48 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCC:1 - chr2R 18882567 3' - roo 8724 2 62.33 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTC:1 + chrX 15167790 3' + roo 9043 1 65.75 ACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATGGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAACCCCGGGCCTATTGGAGCTATCCAAACCATCGGAATTTCGTTTGAGAGCGCTT:1 + chr3R 28490229 3' + F-element 265 1 63.70 AAAAAACAAAAAAAAAAGGGGGAGGCAGATACACATACTCGTACAGCCGTGGAGGCTGGGCACTGTCAGCTTGACTGACATCATTTCCGATGTTTATCTTTTCATGTTAACATTCCCGCATCCAAACAAATCCGGGCTGAATGCTG:1 - chr3R 22823820 3' - hopper 139 1 73.97 AACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTA:1 - chr3R 18665272 3' - 1360 84 1 80.82 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGCTCGAGCAGCGAAACCGATGGGAGACG:1 - chr3L 131752 3' + P-element 2806 1 24.44 TAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGG:1 + chr2L 9287075 3' + jockey 4909 1 79.45 AAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTAGGTGGTCGGGAGCGGTCTAAATAATGTGCCAGAACG:1 - chr3R 10977192 3' - jockey 4923 1 73.10 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTATGCA:1 - chr3R 17316019 3' - 3S18 39 2 58.90 CTAAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGAA:1 - chr3R 5086995 3' - P-element 47 1 52.74 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCA:2 - chr3R 27503027 3' - hobo 64 1 63.01 GTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACA:1 - chr3L 9375792 3' + mdg1 7428 2 62.33 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAACTGGCAAATTTATTTTTAAATGAGTAATAAAAGCTTAAGGAGTTGGGGCTAAATAATGGAAGAAATTGTA:1 - chr2L 2464191 3' - pogo 48 1 56.85 CCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCACGTGCCAATGTGCTG:1 - chrX 17614357 3' + roo 9030 1 55.48 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCGACT:1 + chrX 21213433 3' - Doc 22 1 67.81 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATTATACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCATGGGACCAGAAGGCAAGCGGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGCGATACCTTGCTCTACAAC:1 - chr2L 11867244 3' + BS 5070 1 65.07 AAAGAGAGCAATTTCGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGGTTTCCAGCGGAGACGCCAACGACGTAGCGGATTCGAGGGG:1 - chr2L 23189374 3' + 1360 3317 1 73.57 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTT:1 - chr2L 19424667 3' - Tirant 8113 2 66.22 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTC:1 + chr3L 17447562 3' - Tirant 51 2 56.16 ATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATCCATCAGCAACCCACTAAA:1 - chr2L 12283903 3' - Quasimodo 33 2 63.70 TGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGTGCGACTTACGGCTAAGTCCGTAGATATTTTCTACTTATTGTG:1 + chr2L 17187003 3' - mdg3 5261 1 69.66 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATATTTGGCCAAAAGGAAGAGGACTCGACGACATGCTGACGCTTTGCCAACAAGCAAACTGGCGAATCTTAATTTAATTTCCA:1 + chr3R 12578088 3' - jockey 4710 1 56.85 GGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGAGATGCTTTCAACTCGGAACAAGGCTACCCATTCAAATGGCTCCTCTGAAAATCATGTCC:1 - chr3R 15514467 3' + 412 481 2 73.97 ATTAACACACACACACACACACACACCCTTATACCACTTCATCGCCAACTGCAAAATGCTGTTTTTCCAAATGACTTCATAGACAAGAGTAGTAGGAGCATGTGGATTCAAAGCAATCTCTCATTTCAAAGGGGAAGGCATAGTTA:1 + chr2L 18778049 3' + accord 181 2 60.27 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGT:1 + chr2R 15613847 3' + P-element 2822 1 41.10 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTAATCATACACATATACCGTCGGA:1 - chr3R 18665250 3' - 1360 62 1 65.75 GGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Cr1a 456 1 52.86 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATATTATTTCCGCACTATTCGGA:1 + chr3R 21237847 3' - Doc 34 1 61.64 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGCCACAACCGCAAAGTATTCAAATCCA:1 + chr3R 14088698 3' + 1360 3372 1 73.97 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTCATTACCAA:1 + chr3L 14043653 3' - Ivk 28 1 66.44 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGG:1 - chr3R 7884539 3' - jockey 4821 1 61.38 TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTA:1 + chr3L 21093250 3' - Ivk 45 1 54.79 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCACGCA:1 + chr3R 4659616 3' + P-element 2875 1 65.96 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAA:1 - chr2R 13276494 3' - roo 88 2 80.14 AACAACAAATTACACACGAAATTAGAGAGTGATATAAAAAGAGAATGCTTAGCACTTAGAAAATTAATTAGTTTCAAAGATTGCAGTTGTAATAAATTTTTAAATACAACATTTTAATATTGAACAAACATTTGAAATCAACCGGA:1 + chr2R 18885186 3' + Doc4-element 204 1 76.71 TTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGGAAATAACTGAAATAAAACAGCAAATAGTAATTGCCCGTCGAGGGGGAAATGGGGGAGAACAGGTACAAGGCAAGTACAAGCGATCTAGGCGAT:1 - chr3L 16137260 3' - Juan 4051 1 65.75 TAATATGACCCTAAATTAGAATCCCAAAGCTAAGCACAAGCTTCCTGTAGTTTGTCAATCCGGAGCTTTCAGAGTGATCTAACATAATAGTTTTAGTGTGCAACACTTTAAATTTATTTAAGCCTTACATTTTCAGTTTAAAAATT:1 - chr2L 2686613 3' - Gypsy12A_LTR 77 1 66.44 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCA:1 - chr2L 13546951 3' + P-element 2853 1 60.90 CCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAACTGAATGCATATAATTGAGTTTAAACTGAAACCTTAGCCTGGTTAATGTAATTAAGCCATTTCATCTCATTTTGCCTTTCCCAATT:1 - chr2R 19619367 3' + jockey 4645 1 64.38 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATT:1 + chr2R 9867184 3' + roo 344 2 59.59 GAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTGCACTCCTTTGATCCGCGTTGCCCCATGGACCGCCGTTTCCATCTCGTTGGCCAGATCGTAAGCGGCGATTGTTTGTAGCTGTTTCGGCGGACACAATCAGA:1 + chr3R 10466848 3' + opus 363 2 71.23 CCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTCATAGCCATTATATATTTTTCTTTGTGTAGTGCAATGTTTTTATGCATCTATAAAAGCGACCAC:3 + chrX 10101422 3' + mdg3 5440 2 55.48 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTC:1 - chr3L 22481235 3' + roo 9004 2 67.12 TGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTAT:2 - chr2L 12283922 3' - Quasimodo 56 2 57.53 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTGCATAAATAACTTCAAGCATCCCGCCCCATTTCTCAGTCAGTC:1 - chr3R 12795004 3' + mdg1 377 2 54.79 TACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGGCCTCGTTCTATATCGCTAAGCAGTTTCACATCGATTTTATAAGGTTCAGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGGTTGGT:1 + chrX 21587752 3' - INE-1 118 1 79.51 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCC:1 + chr3L 14969263 3' + P-element 2790 1 14.69 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATTAATTTTG:1 - chr2L 17162776 3' - blood 7085 2 68.49 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGTGCATCATTGCCGCTAATCAATAAGAGACGCCATTCATTCGGCTCGCTGATGAAA:1 - chr3L 3137779 3' - FB 67 1 61.64 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATG:1 + chr2R 18722028 3' - 412 59 2 59.03 GCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 211 2 76.19 ATTGTTCAAAAGTTTGGGCGTGACCATTTCAGGCATTTTGTAGGTATAGGTAAAAAGAGTATCCGAAGTGTGTTCGGTATACCGATAGAAATTGGAAATGGTTGGAACATACTTATTCAACAAATTGGATTCGATACGTGATCATG:1 - chrX 7543220 3' - INE-1 253 1 77.40 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTG:1 - chrX 8082385 3' - roo 8741 2 71.23 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTG:2 - chr3L 18835280 3' + pogo 2046 1 56.85 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCTGTACCCGCG:1 - chr3L 18708552 3' - F-element 25 1 76.03 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTTCCGCCAAGTCGCCTTCCGTCATATCCCATTTAAGATGCCCGATACACGGA:1 + chr2L 19930168 3' - jockey 75 1 64.38 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTT:1 + chr3R 9938722 3' + roo 9039 1 63.70 CCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCGGAACCCGTTGAAATTTACTCGGCCGGGGCCGTTTAGTTTTCGATTAGACTGCCTTTGATTTGCGACCTCACGACGA:1 + chr3R 30923760 3' + R1A1-element 462 1 53.42 AAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTCCAGAACCCCATCTAATCGAATTAC:1 + chr3R 21521444 3' + Bari1 1671 1 55.48 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTATGACCATAAGATCCCATTTATTAGATGCAACAAGCTTTGGAAAATATTTCTAGCCCCCTTTTTTTGT:1 - chrX 7293201 3' + 1360 3340 1 56.85 GGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTATTCCTAGCTAGATTTAGCTAGGTATAAGCAAGTGTAAGCTATCGGAACTCGATA:1 + chr3L 1307505 3' + micropia 188 2 63.01 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCTGGCAGCGC:1 + chr3L 6774257 3' - pogo 49 1 51.37 AGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTA:1 + chrX 21667917 3' - gypsy2 86 2 75.52 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAG:1 + chr2L 12142624 3' + hobo 2905 1 64.04 ATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAAAAAGAACAAAAAGAACAAAAAAGACATATGTGCAATTTAAATTTAACAT:1 - chr2L 15153230 3' - G-element 38 1 52.74 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGG:1 - chrX 21668720 3' + mdg1 356 2 63.01 TCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACC:1 - chr2R 10478699 3' + invader4 240 2 76.71 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATACAAGGATATTGACTTTGTCCGTACGAGCTTCA:1 - chr2R 20499990 3' + 412 7534 2 75.34 GCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCT:1 - chrX 16853357 3' - roo 8757 2 82.19 GAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAACACACATGCAAAAGTTTAATAATATGAATAAATGGAGAATGCTATAGAATATTTGAGGGATGATTTAGGTTGTTCACTATCAGCATTCTGGTAA:1 - chr2R 22796295 3' + hobo 2573 1 68.49 GAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGATT:1 - chr3L 16157169 3' - Juan 30 1 62.14 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTC:1 - chrX 19498110 3' + P-element 2809 1 23.44 CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATGAATTTAAGTCTGATAATTTCTCACTTTTTCCTTACAGA:1 + chr3R 12367520 3' - copia 81 2 73.29 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACT:1 - chrX 12893331 3' + Bari1 1657 1 53.15 TTGGCTTATTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTGTTTTTTTTATACATATGTGGACTACTACACTTAACCATGAAATCTTGTTCTGCTATCATAAAAATTAAATCAAAATTAATGATAATCAAATGCAATA:1 + chr3L 99308 3' - Doc3-element 208 1 60.69 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTGCAGTGGAGTT:1 + chr2R 544905 3' + HMS-Beagle 205 2 57.53 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGATTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:1 - chr2R 20461151 3' - jockey 31 1 65.22 AACTTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATATAAAAATTGTAAGATTGTATTGAGTTAAATGGCAAAGGACGATAAATTTAAGTTTAATAAGTTATAACCGCTTTCCTTATGGGGTCATGGGACATGCTTGAGCTGGATATGATTTCG:1 - chr2L 21948525 3' + Doc 4699 3 70.34 TATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATGTTACTTCATATTAAGTCGAATGATTTAATAAATATACTAAATAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATCTCAGTTTTACATATTTTGCTTTTATTTTTGTAGTTGCCTATACCGATAA:1 - chr3L 15789757 3' - 1360 3098 1 65.75 AAACTGCACTCTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAT:1 - chr3R 21575929 3' - Doc 97 1 59.59 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCA:1 + chr2L 535487 3' - roo 8747 2 76.71 AATCATCTGCAAAAAAAAAATAATAGAAATAAGGGATAAGGTTTTTTTCGAAAAAGGTTTAAGTACTAAGCAAGGAAGTTCGACAGACATTGGTGCTTCGAGCCGGATCAACAAAGGCAGATCAACGGCTTTAGTAAAAAGTATTG:1 + chrX 20491533 3' + gypsy5 499 1 56.16 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAA:1 + chr3L 9426753 3' - P-element 78 1 32.88 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAA:1 - chr3R 24228879 3' - opus 71 4 67.12 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTCAGTGTA:1 + chr3R 9938739 3' + roo 393 1 75.34 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAG:1 + chr2R 18123528 3' - pogo 49 1 51.37 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGGTAAAGTGTGTCGT:1 + chr3R 10143058 3' + 412 7511 2 60.96 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCT:1 - chr3R 7569570 3' - Doc 41 1 42.47 TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAA:1 - chr2L 16942057 3' + mdg1 7380 2 71.23 TAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATC:1 - chr3R 20137267 3' - Burdock 6215 2 73.97 AAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTGTAAATATGTGACATG:1 - chrX 10873749 3' - mdg3 5259 1 79.17 GCTAATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGCTGTCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGTGAAGTCGCCGCGCGATGAAGTCGAGCGTAACTATAAATGGCCCC:1 - chr3L 7752199 3' - Circe 232 1 67.39 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCCAAAAAAAAAATACATTATATGGTATGACTGCTCAATATAAATATCGGATG:1 - chr3R 23968591 3' + jockey 4922 1 69.86 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCA:1 + chr2R 14562274 3' + Burdock 6362 2 44.83 AGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATAAGCCAAACCGTTGATTATGGTTTGAATAACAGAATTTCATAAAAGTTTAATAATCTTCCATACTCCACACACATCACACCAGAAAATAGCCAATT:1 + chr3R 18847417 3' + Stalker2 7625 2 64.38 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACATTCTCATTTGCATATTTACATTGCCTATCTGGATG:1 + chr3R 10288908 3' - copia 4921 2 51.37 GCCTGCACACACACACACACACACAGACACGTGTGGCCACTTACATAAGGACGAGGGGGTGTATGTGTGGAAAACAACAGGGGAAAATCACTTCAGTTAACTAAATCCCCGCAACAACCATGCG:1 - chr2R 22860417 3' + accord 179 2 53.23 GTAACGGGTATCTGATAGTCGAAAGTCCCGAGGCAGTCTGAGATCTCTCTCGATTAATTTGTTCATTTTTATTTGGCGTTTTGGATAACAGCAGTTCGAGATGAAACCGTGAAGTAAGAGCCTGGGGATCATACACCTAAAAAAAA:1 - chr3L 14379419 3' + INE-1 551 1 56.16 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGG:1 + chr3L 15322042 3' - Transpac 82 2 74.66 GTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCT:1 - chr3L 24272059 3' - gypsy11 72 2 58.22 CATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAATT:1 - chr2R 19076485 3' - F-element 183 1 68.97 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTC:1 - chr3L 22518991 3' + pogo 2098 1 71.08 GCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTCGATTACGGTCCTGATTCGAGATACCACATCCTGGCATAGAGTTC:1 + chr2L 4250800 3' - F-element 294 1 68.49 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTACATGATTTTAATTTTTTTATTTCATGGGTGCT:1 - chr3L 4639045 3' + roo 9033 1 57.53 CACACACACACACATATACACTTACAGATATCCCAGCAGAGATATCCACTCTTACGCACACACACACAGAC:1 + chrX 7517513 3' + accord 7034 2 39.44 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTTCGGATCGCCGCAGC:2 + chr3R 23507724 3' - 412 13 2 73.97 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGCTCACGCACTAATACAAATTCTGCCCACACACACACACACATTCAAGCAATCGCGTACAGAGAGAGATGCGAATT:1 + chr3L 7434968 3' + pogo 2058 1 59.59 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGTTGGAATT:1 - chrX 18149797 3' + hobo 2891 1 54.62 TCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAATTTCGCGGTTATACGGTCGCTATCTCCGCACAGACGCACGAGATTTTTATGGCGAAATTCCGCGAGCAAAAACTTTCAGATATGTTCGCATCTA:1 - chr2L 20824869 3' - pogo 22 1 71.03 TAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTTC:1 + chr3R 23507711 3' - 412 4 2 76.61 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTGCATTTCTCTTCTTTGCCTTATTTGTTTGTAAACAAAGCAAGTCGCAGCTGACACAGTTGGATTGGATTCTGA:1 + chr3L 8067617 3' + copia 5077 2 53.42 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGTTGAA:1 - chr3R 4464150 3' - 1360 58 1 51.03 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACTCACTAATGGCAGCAAAGCA:1 + chr2L 19424717 3' + Tirant 8505 2 59.18 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGA:1 + chr3L 14969303 3' - P-element 54 1 43.57 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGCGGCCGTCGAACCTCTCTATC:4 - chr2R 17013975 3' - HMS-Beagle 15 2 75.34 GGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGTGGTGGAAAACATTGGAATGCCATTCGTGGATTGATTGATCGGGGGAAGGTTGGTGGTTAGGTGGTATGTTTTCAACCAAAATTTTGTCCAACCATTTGT:1 + chr2L 3589130 3' + Dm88 371 1 61.64 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAAT:1 + chr3R 24228986 3' + opus 7455 2 54.79 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGAT:1 + chr2R 22255430 3' - roo 54 2 54.79 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACATTAATAAATATAATACCCTTACTAGCTTATAAAAGTAATTATTTTAAGTTTGGTTTTTAAATAATTTTCTTTAAAAGATCT:1 - chr2R 7097924 3' - copia 4910 2 57.53 TGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTTCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATTAAGTTGATA:1 + chr2R 9033962 3' - F-element 4524 1 58.22 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGG:1 + chr3L 16180958 3' - Transpac 64 2 69.23 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGGTCGACGCGTCGGCACGCACACACTCTTTAAAAATATTATGCTTTCCGAATGGCTGTG:1 - chr2L 6598343 3' + hobo 2909 1 54.13 GTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGT:1 + chr3R 1446147 3' - 1360 9 2 29.45 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACAC:1 - chr3R 23099078 3' + roo 351 2 59.59 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAACTT:1 + chr3L 13597872 3' + blood 342 2 60.96 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATAATGAACAAGAAACTACGGAAGGCAATTACAAGCAATGGTGATAAATATATATGTAATTCACAAAATATTGGGCGTTGATCCCATTCGATGCGTCACCAATTTACAAATTG:1 - chrX 979439 3' + S-element 1712 2 52.05 CACACACACACACATAGGCACAGCCTCATTCCATGGCCCGCAATTTTGTAGAGGCATTTTCACTTTTCATTATCGCAGTCCATTCGCTTATTTTCTTTTTTGGTGTTTGGCACTTCTTTGTGTGGCAATAATCGTATTCGTAATCC:1 + chrX 7973231 3' + accord 7034 2 63.70 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGCAGTAAACAGTTTTTGCCGCAAATTACAGCTTAACATTTTTGGTCTACCAGCTCAGCACACTCACA:1 + chr3L 5444594 3' + roo 9048 2 50.00 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGATACTCATTTTCGGAAC:1 + chrX 13762606 3' - P-element 53 1 22.11 TCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGTCAATCACTGGGTTTTGTTTGCTTAGAAGAATAAATAT:1 - chr2R 11574959 3' + INE-1 146 1 66.21 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTA:1 + chr2R 15080120 3' + roo 9020 2 52.74 AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCGGAAAACCCTTAAAATTTCAAACCTTTTTTTCCATTTAATTTTTTTTTTATTAAATCAATGCGTGACTGGCGCAACTT:1 - chr3R 13056679 3' - jockey 4769 1 74.66 TGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGAGAAAAGCGAACGAGAGAGCGCAATTGAGAGAACGGGGATGCTACAGTTACATCCGTCGAGTAAGAACGTCCCCCG:1 - chr3L 13920083 3' - Tirant 342 2 53.96 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCT:1 + chr3R 15514633 3' - 412 41 2 55.63 CTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATAAAATAA:1 - chrX 18707492 3' - BS 4804 1 77.40 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGA:1 - chr3R 8367121 3' - Doc 33 1 56.85 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACT:1 - chrX 16853339 3' - roo 75 2 69.86 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGA:1 + chr3L 16887413 3' + roo 351 2 55.48 TCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGGTGGTACCCATATCGCGGGTAAGCTTGACTAATTATGTTACACCATACCC:1 - chr3R 8248145 3' + R1A1-element 4932 1 76.87 ATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGGCCAAGGGGTCCGGAACGCCGGCGTTGTCTGCCCTTCTTCATCTTTGTCTACTCTTGTCATGAATCTCATTCCGGGGCGTAGGTGGTCG:1 + chr3R 16531997 3' + Stalker2 237 2 59.85 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAGGATCAACCTTTATTTAGTTGATGCACAAAATCCTTTTTGCTTTCAATTGCGAATATTTTTCAGCATTT:1 - chrX 6398734 3' + blood 7382 2 68.49 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACATGTACAGTACCCCCCTCTGCGCTTCTCAATGTTATTAGGAACGTAACAATATCAAGA:1 - chr3L 20925749 3' - Transpac 60 2 55.48 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCTTTA:1 + chr3R 19545439 3' + jockey 4958 1 60.27 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTTAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTTTTATCACTCAATAGTTTTGCTGACAGATTATACTTCCGAATTGTAAGCGTAA:1 + chr2L 5341326 3' - S-element 65 1 63.70 AGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCT:1 - chrX 17258230 3' + 297 6890 2 77.40 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACAAATGGTGAAGTCTGGTTCTGCTCAGTCCGTACCCACTGAATTAAAAAGGATGTATT:1 + chr3R 8542707 3' - roo 8694 2 58.90 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCTCTGCGCTGCCAACGAAG:1 - chr2R 5848947 3' + mdg1 390 2 58.91 ACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCTTTTTAATAATTTAAAGCTTAAACATATATCATATGTTT:1 + chr2L 13669964 3' - roo 130 2 73.29 TAAAATAACCATATTAAATATTACTGTTAGTAGTATCGAATTATGTAATTAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGGGACGGTAAATTAATTACTTACCATTTGTCACGATAAAAGCTTTCAAACTATCCCTAAAAT:1 + chr2R 21397268 3' - Cr1a 4309 1 69.86 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTTCCATCCAACAT:1 + chr3R 9345707 3' + pogo 2076 1 68.49 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTCAAATGAATAGGCGCCTTCTACTCACTGTAGGGCTGAGGTCGTGTACCGTATAGAGGCTCCTGTAGTAATGGCG:1 + chr2R 19564467 3' + roo 8990 2 74.75 TATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACTGATTCATTCATTTTTCCCGAGATGAAGCAGCTGACGTGCTTGAGGAAAATATGTGCCCGCCA:1 + chr2R 19901079 3' - mdg1 7096 2 58.22 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGGTGGCAATATGGCATAGTGTGGGATTAACAGTTGCATAGTAAGGGGAATCCCAAA:1 + chr3R 14097126 3' + transib2 2760 1 62.33 AATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGAACAGCACAATTTGCTCGGCCCACGCTCTGGAC:1 - chr2L 8553002 3' + P-element 9 2 22.76 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTGAAGTTGCAGGAAGATAGTCACAAGCCACTTG:1 - chr3L 19279073 3' + opus 478 2 71.92 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATT:1 + chr2R 16891853 3' - jockey 75 1 61.64 AAATTATGCCTACGTACTAAACATAAATCTCCGATCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGCACTGCCAGTCATCGATTCCAGAATATTTGGAATGATGTCCGTTTCGCAATCGCGGAGGAAATCCTTCTGATCAAAGCTCGG:1 + chr3R 19155549 3' - Rt1b 5044 1 48.63 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGATTCGATTGCAAATGG:1 + chrX 10979106 3' + roo 9015 2 58.90 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGAGCAACAGGCGACAAACAGCGCTGAGGGGAATGCCATAAAAGTTAATTGCCTCAGTAGCCCCAAAAA:1 + chr2R 19985798 3' - copia 4924 2 56.85 AACATATTTAACAATTATTTCTTCAATGTCAACTTGATTGAAATTATTATTCTCTGTGTATTTGGGTTAAAAGCACCAACTCTTTAACTATTTTTTGCTTTCATTTTGCTCTACCTCACCCTATCTCCCTTTCACTCTATCTCTTT:1 - chr2L 3105887 3' + frogger 327 1 76.03 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCC:1 + chr2R 18123519 3' - pogo 58 1 57.53 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGC:1 + chrX 15814565 3' + P-element 2785 1 15.75 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTC:1 + chr3R 13358678 3' - mdg3 5326 2 65.07 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAACCATGAACCTGCAATATCAACAAATAATAATTTAAAGCCAACACA:1 - chr3L 15058798 3' - blood 14 2 47.95 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCTTCTAATTTAAGAAGTGTAATGATGGAGTGTATTTTCTCAGTG:1 - chr3R 12787071 3' - 297 6591 2 76.71 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATC:1 - chr3L 15058853 3' - blood 7080 2 62.33 AAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTACGTTTGGCCATCGCACATGTGATATGATGGAGCGGGGATGCGCAGGA:1 + chr2R 8820357 3' + flea 263 1 66.43 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCGTGTCAATTTAAAGCGACATTTATAACCAATTTGTAATCAATTCTAACAATCAGCTAA:1 - chr3R 10562122 3' - I-element 63 1 58.90 GGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAAAGTACCAAAACTTGTGCACTTTATGGATCTGTAACC:1 - chr2L 2690526 3' - hobo 13 1 76.71 CATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTTTATTATCGTGTAACTGGCTTGTTGTATTTTTTACATTCGTATGTGTTTGCCTTTGTGAATTGCGGTTCTATTGCCTTGAATATGTTCGAGTGTG:1 + chr2R 20382625 3' - Bari1 25 1 69.18 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACACCGCCAGTACACGAT:1 + chr3R 27971145 3' - mdg1 32 2 63.01 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAAATCTTTGTTTAAAGACACATGCACAATGTAAGTTAAATTGGCAATAACGTG:1 - chr3R 11553605 3' + hopper 1392 1 70.55 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGTAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACC:1 + chr3L 13722093 3' - blood 87 2 76.03 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAACCATGAACCTGCAATATCAACAAATAATAATTTAAAGCCAACAC:1 - chr3L 15058799 3' - blood 7026 2 47.26 AACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTATTACAAGTTAAATATTATTAATTATATTACATGGTTACGAACGT:1 - chr2R 13995195 3' + HMS-Beagle2 6772 1 69.86 GCCAGCAGAGGATACTTTAATGTTGACTCAGTGTACTGCCCTTCGACACTGTCCATGGGTGTGGCTCGGGATAATGTCTCC:1 + chrX 22718823 3' + G5A 304 1 58.02 AACCCGTCTTCGTCGTAATGATATGTCTACCCAACGATAATTATCAGGGCCACACAAACTCATATCAGTTGCAATAGTATAAGGACATTGATGTAGTGAACGGTGCTGGCAAAGTGGAGAAGATGCGACTGCAGAACATCCTTATG:1 + chr2R 12638309 3' + Fw2 3796 1 54.11 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTCTCTTCATT:1 + chrX 983250 3' - 412 33 2 64.38 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTC:1 + chrX 16456776 3' - P-element 102 1 15.75 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCCTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACTGCATCGTCAAGTGGCTCAA:1 - chr3L 22529702 3' + roo 9046 1 67.81 ATATAAATATACAAATACACAGTATACAAATACAAAAATACGAATAGAAATATAATGCTGTATAAAGTAATCACAACTTAAAATAAATTAAATCTTAAATAAACAACTTAATAGAAAAATCACGTGTCATAACTTCAAATCACGTT:1 - chr2L 21750065 3' + Stalker4 7047 4 57.53 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGTATACTATATTTTATTTAGATGAGCAAAATTTAGATGGAAAATTCATTCTTAAACTAGCCAA:1 + chr2R 4564667 3' - flea 4806 2 60.43 CACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTC:1 - chr3R 7739681 3' - blood 66 2 60.27 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGTCTGGGCCGAGA:1 + chr3R 23623967 3' - roo 8713 2 54.48 ATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTACCTACCCCATGTGTGACGATTAGTTGAAATCAAATGCATAAATTTTCCTCTTTCTTGGC:1 - chr2R 20703130 3' - 1360 3259 1 67.12 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCAT:2 - chr3L 5263321 3' - pogo 25 1 65.07 CACAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAACCTAGATATATAAGATACTGTATCTCCTCAGTTGGCAACTGTGTTTACTGTAGCTTTTCA:1 - chr2L 13903972 3' + 412 177 2 69.18 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGAT:1 - chr2R 18123428 3' - 412 7122 2 64.38 ATTGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGGCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAACTTTCATCACAATTCGACAAAAAGGATAAAAATGAAAAATTGCTCCACTGACAGCAGCCA:1 + chr3R 25354614 3' - 297 18 2 77.93 TCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTATTTCCTTATCTTATCAAAAAAGCACTTACCTAGCTGAATTTGGTTTCGCTATTTGGTAATCCTCTGCGATTCTA:1 + chrX 2049219 3' - 1360 396 1 52.41 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCT:1 - chr2R 21380630 3' - roo 8751 2 77.40 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAG:1 + chr2L 17747535 3' - Tirant 8117 2 73.60 CATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCATTTATGGATTTATACATTAAACGATTGAGGACTTTAGCATTAAATGAAATATTCTTTTGCGGCCCAGGGCTAAAATAACGGCCAAAAAATATATTACAAAAGG:1 - chr3L 14908283 3' - Juan 4163 1 71.92 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAAAGGTTCCGAGTTTATTTGAGTTCCAACAGCAGTTTCGGACCAAAGGTTTTTATGGTAAGTTTGCGTAGTATATAAAATGTTATACA:1 + chr3R 25271298 3' + 412 459 2 59.44 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCTTCTCATCGATGGTAGGTAAGCCCTTGTTTCAAATGATGTGAATGGTTCTATTTA:1 + chrX 16456838 3' - P-element 40 1 56.85 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTTCGGTTTAGAGT:1 + chr3R 4722509 3' + roo 9040 1 63.45 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAAT:1 + chr2R 15080116 3' + roo 352 2 55.48 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCAC:1 - chrX 19162557 3' + pogo 2063 1 57.53 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACCTCGGTCCTGATAAGCAAATTTTCTAATCATATTTTAAATACTTTCACTTTCAATCAGTGCTTTTTCAGCGGCT:1 - chrX 3506033 3' + Tirant 359 2 58.22 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGAACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAG:1 + chrX 17469280 3' - blood 56 2 53.42 AGGTGAGGCATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTGAAGTTGCAGGAA:1 - chr3L 19279092 3' + opus 7462 2 58.90 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTACCCCCACCTGAGTGAGTTTTCCGA:1 + chrX 14136607 3' + roo 9051 2 50.70 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCCGATCGCTCAGCTAATAAATCCGCACAAGAGGCTTTACAGCAAC:1 + chr3R 24479297 3' - 412 37 2 60.96 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTCGATAAAATAATTTAGATATAATTTAATGTTCAAAACTGAAAAAAGTTCAAAAAGATTTAATTATTA:1 + chr3R 11096785 3' + copia 202 2 54.79 AAGGCCTAAGGACTACAATCACTATCAAATCAAAATTTGTATTGGACTGGACTGGAAAGACGGATGGAAAACAAAATTCTGAGTGAGAAGAGTAAGGCATGCTAAACTTCGCACACACTCTCGAACCATAAAATAAAAAGGGCATG:1 + chr2L 1486332 3' + gypsy11 494 1 55.48 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTGACC:1 + chr3L 22481356 3' - roo 8698 2 60.96 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATAAATGGAATTTCGAAGTTCCTCTTCAGCTCCCAGTAAACCCCATTTTCCGAGTAAAAGACAAATATGTTCGTTTGTTTGCGAGTTTATTTCA:1 + chr3L 16264736 3' + Burdock 6363 2 66.44 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAATCAGCAGAAGACTG:1 + chrX 14692961 3' + Transpac 5186 2 56.16 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAA:1 - chr2R 19353983 3' + 297 327 2 67.12 AAAGCACTATATAAATGCCAGAACTTCATTGTGGTTCTGGGCTGCAATTGTTTCAGGAGTTTGTTCCTCTTAATGGCAAGGGCCATGCAGTCACATACGGTTATCACATCATTATTCAAGCATCAACTGCTGGTTTTTCTCCTTTG:1 + chr2L 21003968 3' - baggins 5343 1 65.07 GCAACAAAGTGCTGCTATATGTTGGTATGCTATTATACTTAAATGTTCTTTAATATTACATAGGCACATACTACACCCCTCTTCCGACCATTTCCCAATATTAATTACATTACAGGATGTAGGGGGTTGTAAAAAAATCCCTAATG:1 - chr2R 16617605 3' - 412 7106 2 53.42 TGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTTGCAAATGTAAACTCCTATGACTTGCATCGATATTAGTGTTAA:1 - chr2L 5341241 3' - S-element 72 1 72.60 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGAAGAATTCCATCAAGCAGTTTACAATTATCTATCCCTAATCCTTAACAAGATCGGATGTATAGGATTAAGAAATGTACAAGTAT:1 + chr2R 4996663 3' + transib2 2789 1 61.64 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGT:1 + chr2R 18882676 3' + roo 9019 2 52.74 AATATAAAAATATTTTTTCTTTTTGCTATTTTACTATCATATTAGTATATCATCACAATTTGGCCACGAATATTAAATAAGTGACTAATGTTGTTAATAGCCAACACGCGGAGTGTAAAAGAGGCAAAAGAGTTGGCTAACAAGAA:1 + chr3L 18653239 3' + transib1 1957 1 62.33 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATA:1 + chr3R 3527177 3' + Tabor 7268 2 53.10 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCTTAGTGAAAAAATACAACTGAAATATAAAATTTCAAAGTTATACTTAAAGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTAT:1 - chr3R 19449933 3' + roo 9032 1 45.21 AAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATGCTGAGAACAGCTCTCTGTCATGAAATCAGTAAC:1 - chr3R 10018172 3' + Doc 430 1 76.55 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATGAGAAAAAATTGTTTAACGTTACTTTACGTGTAAAGGGT:1 - chr3L 22737373 3' - mdg3 82 2 73.29 AGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7196 2 79.41 TAAGATAAAAATATTATCCGGAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAGGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATAAAACATTTGGCATAACAAGCGAAACCATCATTAAGGGATTTTCGGTCTGGGAGCAGTCAAGTCA:1 - chr2L 3675754 3' + Dm88 4311 1 56.16 AAAATATTATTATTAATTATTATCATTTATGGAATGCAATAAAATGCACAGAATTACATTATGAGGAGGAGGCAGAGCGGGCTAGGTGGCAATGACAGTCGCATTACGCATACGCCCCGTTCTCTATCAGCTATTACGTATACGCA:1 + chrX 9963078 3' + gypsy12 9769 3 58.90 CAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 194 2 70.79 GGGGAACTCGACTATACCATTCTCCCTTGTCTATAAGTGTATTAGGTTTGTAGTTGCAGATTTACACAAAAAGGTAACTGTACGTTTATTGTTTATTGTTGCCAAATGGCTGTCGAAGAGGCATGAACATTCTGAGCCGTGCTAAT:1 - chr3L 6435454 3' + INE-1 571 1 52.74 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTT:1 + chr2L 11573713 3' + jockey 4931 1 64.58 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCG:4 + chr3R 8402640 3' + mdg1 359 2 58.90 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGACGAGCGCAGAG:1 + chr3R 5087159 3' - P-element 9 2 79.45 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGATTAAATACGGTTTATTTTTAATCAATTCTTTTCCTTTAGTGCCCCACTTTGAGCACGCATCTTAATTTTATAG:1 + chr3R 11393414 3' - Doc 74 1 50.00 ATCTGTTTAAAGCTCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTCGGAAAAAAAGAGAAAGAACGCTAACCTTGAAAAGCAATCGCGATAT:1 + chr2L 9508405 3' - X-element 4449 1 66.44 CTGCAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTA:1 + chr2R 5924436 3' + jockey 4710 1 39.04 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGGGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTG:1 + chr3L 15035207 3' - pogo 61 1 69.40 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGT:2 - chr3R 4464154 3' + 1360 3318 1 65.07 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACAAACGTAACCCAGAAAACTGAAATGAGCAGGAAAAGGATTTCATGTTTAACT:1 - chrX 6937858 3' + hopper2 1543 1 60.27 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTG:1 - chr2R 5848966 3' + mdg1 7392 2 63.70 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTTCTCTTCATCTTTTTTGCCGGCATTGCCTCTTCGTTGCCATGAGATTGGATTTAA:1 + chr2R 20500179 3' - 412 21 2 69.86 TATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTCTAAAAAACAGTACACTTGTGTCATTAAAATAATGCATGTATCACTATGTGGTACGGGACTGTGACTGTTAACATATCTAGCTGTTAAGAATATAGCTTTTTGTGTTGATCGCTGAGAAT:1 - chr3R 7541409 3' + Tc3 308 1 73.29 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGACCATTGTTGGTTATTGTCACGGCCTGAAAGTCGGCAATTCAAAATATGAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACA:1 + chrX 16244890 3' + jockey 4948 1 53.42 TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAAGATTCTCCAAAATTGTACAGCTAACCAAAGAGATATAGATTTCCAAAAGTGTAGGTCCT:1 + chr2R 6559034 3' - mdg3 5300 2 57.53 CAAGGATGGGTGTATGAGTGTACAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGGAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAAT:1 - chrX 22858875 3' - mdg3 86 2 71.92 ATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGATTTTGTTGTTTTTTTATTTTTCCACCCCTCTTCGCAAAGCTTT:1 + chr3L 2613853 3' + roo 8726 2 70.55 AGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGC:1 - chr3L 25232690 3' + accord2 205 1 81.51 CGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTGTGAGTGTGTTTGTCCAAATTGCACAGGATTATGGGTCTTAATTTTATGATTGCTTCTTTAATCAGCCTCCGTAACTGCACGCCAATTACGTCCTGCTCCGTGCTA:1 + chrX 20387451 3' + hopper 348 1 74.31 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTC:1 - chr2R 22255307 3' + roo 9026 1 55.48 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTGCAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTGTGTATCCTTGTAGAAGGATAAACAAATCGATCCATGACACATG:1 - chr2R 22671335 3' - jockey 4704 1 57.53 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTTCCGCCAAGTCGCCTTCCGTCATATCCCATTTAAGATGCCCGATACACGGAAAAAAACTAATGAACGCTTATATGAATAAAATATATTCACATAAAAA:1 + chr2L 19930215 3' - jockey 27 1 69.86 AATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAATTCGTGTTGATGGTGTCTTTCATCTGTCTGCATA:1 - chr2R 2948986 3' + 17.6 471 2 72.60 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAAATTCGTATTGAAAGTGGGGTAA:1 - chr2L 17730381 3' + pogo 2082 1 71.23 TTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGAATAACGCCATCTACCGTAAAGGGTGTTTC:1 - chr2L 5771367 3' - Juan 18 1 73.29 AGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTT:1 - chr2R 10478687 3' + invader4 3011 2 68.49 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGCAAACACCCAAGG:1 + chr3R 7424673 3' - 412 25 2 67.12 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTT:1 - chr3R 19700875 3' + roo 9007 2 68.49 GGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAGTTAATAGTTATTACCTGTTTTTTACACAATTTGTTAATCATTTTTAATTGATTATTAAGGATTAAGTTGTAAACTGAAAAATAGGCTAGATTA:1 - chr3L 3482630 3' + X-element 4688 1 64.38 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGGGAGAAAGCGG:1 - chr3L 4869118 3' + roo 9053 2 71.01 ATTTATTTATTTATTTATGCTTATTTATAGAAAATAATTTAGTTAAAGAAGTTGTTGAAAACTTATATCTTAAAAATTCGTTGTCTAAGTATTATATGACTCTAAGCTCTCAATATAGTAATCATTTTTATAAACAGTCCAAATAT:1 - chr2L 14851968 3' - Juan 4211 1 34.25 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGTAGTGCAGTGGAGTTCAAAAG:1 + chr2R 544911 3' + HMS-Beagle 214 2 61.54 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACGAGA:1 - chr3R 27503011 3' - hobo 48 1 52.05 ACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAGGCAT:1 + chr2R 22692443 3' - Ivk 51 1 52.05 TAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACA:1 - chr3L 1387099 3' - mdg3 5265 1 71.20 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACTTCCCCTTTTTCAGGAGGGGTGCTGCATC:1 - chr2R 6984264 3' - HMS-Beagle2 6900 2 73.97 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCT:1 - chr2L 3006089 3' + pogo 2035 1 63.70 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTG:1 + chr3R 23507672 3' - 412 65 2 61.64 GCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAATTT:1 + chr3L 24916726 3' - Porto1 147 1 38.36 CATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCA:1 - chr2L 17550616 3' + Transib-N1_DM 438 1 79.45 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGGAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCG:1 + chr3L 16887436 3' + roo 397 1 71.77 GCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATATTGACTACGGCGAGGACGAGCGGAGGAATGCGAATTTAAGTGAAATAAATGACTTTTACTTACTAATTAATGCCGT:1 + chr2L 18163883 3' - HMS-Beagle 34 2 62.07 GCGTGCATAAACATAAGCATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCA:1 + chr3R 23507655 3' - 412 7133 2 71.53 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGA:1 + chr2L 12481528 3' + pogo 2039 1 62.33 ACAGAAGGTATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTGTCTCTGCCTATAATATATAACCCATTTTTGGCT:1 + chr2R 20439877 3' - invader4 20 2 75.34 AGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAACAAGCCAAAGCGAAACAAAAAACGAGCAAAAGGCGAAGAAAGCGAA:1 - chr2L 16645683 3' + Ivk 5306 1 67.81 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAACTTATTACCCCCACTTAAGGTTTTGAAATTAAAATAATTAAAGGCTTTATCACTGTAATTATACGC:1 + chr4 882905 3' + flea 250 2 54.79 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTGGAAATATTGATATCACGTACTGTTGCTATAATTGAATTATTT:1 + chr3R 26765220 3' + mdg3 5470 2 61.64 AAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATTGGAGGCGAATTTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTTATATTGCAAACG:1 + chrX 10623925 3' + X-element 4719 2 70.41 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTG:1 - chr3R 25753604 3' - hobo 42 1 56.64 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAAGT:1 + chr2L 7667509 3' - copia 4923 2 56.16 ACAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTA:1 - chr3L 21097140 3' - mdg3 86 2 73.29 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCCGGGGAGAGCTTATCAAACAATCATT:1 + chr3R 25443172 3' - 297 22 2 69.66 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAGTGATATATGAAGAGTCCGTCTACCAATTATTA:1 - chrX 14385107 3' - blood 7028 2 73.97 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATTTTGAGCGCTGAATAGCCATTTTATACAACACA:1 - chr3L 6774129 3' + pogo 2052 1 52.74 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAAC:1 - chr3R 6782712 3' - jockey 4742 1 61.64 GCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGG:1 - chr2R 20382449 3' + Bari1 1687 1 70.71 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTTCAAGGCCA:1 - chr3R 10079245 3' - P-element 13 1 76.71 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTG:1 - chr3R 25876851 3' - mdg3 51 2 52.05 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGGTATATGCACATACTACAGTTCAGCAGAAATAATATACTTGTATAAGATATTCTTACTTAAAAATAGCTAAC:1 + chr2R 15062261 3' - blood 71 2 63.01 TATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAGATACACAATTATTGCAATGCTCTTATCCATTCCAAT:1 + chr3L 10506809 3' - S-element 83 2 76.03 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAA:1 + chr3L 3979677 3' - opus 59 4 60.27 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGAATCGAGCTAAGCTCCCAT:1 + chrX 11534564 3' - roo 8697 2 61.64 AAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGAAGCATCTGTCGTTGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGGATATTTTGTTGGAGTTCTAAATACGTTCGGTTTGGTTTGGTTGATGTTTAAACGTGTCGTTGTGG:1 + chr3L 21824824 3' + Juan 135 1 52.41 TTGAGACCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGCTTCGTCGTATGGATTCACGGCGAGCGGGACTTCAATGTGAACGACTCCCAGG:1 - chr2R 16089570 3' + roo 174 2 60.99 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGTCCAGGTCCGATCTTCGT:1 + chr3R 10468108 3' - opus 168 4 56.16 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAGCAATTAA:1 - chr2R 10367460 3' - 412 31 2 57.81 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCC:1 - chr2R 18123410 3' - 412 51 2 52.05 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATGCGCATAGCAAGTAGCTTGCTGG:1 - chr2L 8392974 3' + I-element 5290 1 61.64 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCGACTCG:1 + chrX 21213435 3' - Doc 20 1 69.18 CAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTTTGTGCGGTTTTAGGGCGTTTTTTTTTAGCAAATCGATAGAAATTCACAAGACTAATTAAATCCTGCAGTTCCAGCTGAAAGTGCGCCCGATCTGTTACGCCATCGTAGTCCACATCCTCTGTC:1 - chr2L 5518177 3' - INE-1 247 1 56.85 AGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCA:1 - chr3R 13358611 3' + mdg3 5415 2 72.60 CTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGTCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAATGTCTACACACGACCGACGGCAAA:1 - chr2L 18235402 3' + F-element 4614 1 60.27 CTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGGGCTTTTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAATCGAAATCTTAACTAAGCATCGTATGCTGAATGCTGATGAACTTACTCTTATCGAAGAAGGG:1 - chrX 5707295 3' + 1360 426 1 56.16 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTTAAAAATGTACAAGTAACTTTTCATGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAATACGCACGGCTATTCCCAATTTCAGTATGCAATTTTCCTAATGAC:1 + chr3L 5263506 3' + pogo 2081 1 69.18 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTT:1 - chrX 14692830 3' - Transpac 50 2 52.05 GTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCCCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTCAATATAGTTAGGTTGGGCTGGTTGTCCGTAATAGTGGGATCTACCAAAGCTGCGATATTGGCAACGACC:1 + chr3L 24889212 3' + hopper 482 1 52.74 ATTCGTTCAATAAGCGTTATACTTACAATATAATAATAGTGATTAACAAACAATTTTAAGGTAGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTTTTGTTGGCTTTCCCCCGGCAACGTCGCCTATAGA:1 - chr3R 30534303 3' - Burdock 480 1 76.03 GCCGGAGACTGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATCAGCGTTTTATTCGTTTCTGT:1 - chrX 10728781 3' + springer 7497 2 67.36 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAACTTGTATGTCGAACTGGATTTGCGGATCTCTTTGACTCGTTCCGGGCCAATTGAGCTGACAACGAAAACACTTTGCCG:1 + chr2R 20856315 3' + Juan 4180 1 59.15 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCTTTACTGAAATGCTAAGCACTTTCTGAATTCATAAGGTAGATCAAAAGTCAGTTC:2 + chr2R 9072999 3' - Burdock 14 2 74.66 TATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATATAAGATTGGTAATGTCCTAGGTAAAGCTTAGTGTAGTCATGACCACCACAAGAACTGG:1 + chr2R 7768725 3' - Stalker2 7575 2 59.59 GGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGTAAGCTCATTCATTACAAGCCAACATGGACATATTTTCCGCTTGTCTTTCCGCCCAATTTTCTTA:1 + chr2L 3734621 3' - mdg3 5261 1 61.64 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAA:1 + chr3L 13597837 3' + blood 7319 2 67.12 AAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGACCCCATCACCTATTTACCCTTGCGTTCCGGAATAACCTGTAGCTTAGTTATGGTT:1 + chr3R 22277303 3' + R2-element 3238 1 62.33 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGGGTCAGCTGTTTATGAGTTATC:1 + chr3L 16887458 3' + roo 397 1 77.40 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAAT:1 - chr3R 8542600 3' + roo 326 2 71.23 AATAGAAAAAAAAACCATTTATAGAAGCTGCAGAAAAACTTTCTCCGCTGTT:1 + chr2R 9948069 3' + P-element 452 1 90.38 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATAACTTTTCAGACAGATCATAACTACCC:3 - chr2L 13884545 3' - pogo 29 1 64.38 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATGGCTA:1 - chr2R 19353962 3' + 297 348 2 53.42 GGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATAC:1 + chr2R 14884324 3' - mdg3 79 2 78.08 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGTACATACATACTGATTAAAGTGATCGTCGAATTGAAGTGTTTGTCATTTTATA:1 + chr3L 21387526 3' - pogo 61 1 65.75 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATA:1 + chr2R 6945716 3' - pogo 69 1 65.07 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGTAAAAAAAAAAATCTGGGTCTGCTGCATCAGCTGCTGCCTATGTGATTGAAGCTAAAAATTCGGCATTTTGGTTGTCTTTTTTTGCGTCCTTTTTTCACTT:1 + chr2R 16908625 3' - roo 19 2 70.55 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCG:1 - chr3R 5765321 3' + opus 446 2 57.53 GTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGCTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGTACATTTCAGATATACTTCTTATTTTCCGTGGTAATAATTTGGTTCGTATA:1 + chrX 20464764 3' + R1A1-element 438 1 63.70 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAGAAATTCGGAAACAGCAGAGTAAGTGCGGAAAAGTATATTTTTTTTCCTGCTCTGTGGGCGAAAATCTCAACGGAAATCATTAGGGGAAATG:1 - chr2R 22145455 3' - FB 30 1 63.01 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCACTACCCACATCAACAATAAACCGAAATATCAGCAGGTGGGCTCTTTG:1 - chr2L 10912194 3' - Doc 38 1 56.16 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCGTCT:1 - chr2R 15613742 3' + P-element 2878 2 71.43 GGTGGTATCATTAGAAGATTTTAATTATCCTACCGTCAGTCGAATAATTAAGAAACAAAACGAGGCCTTGTATATGTGTGCGTAAGTAATGTAAAAACGTACAGAAGCCAAGTTCTCGATCTGGACGCCTTGGTACCTGCATGTGC:1 - chr3R 7179274 3' + Rt1b 5107 1 76.03 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTG:2 - chr3R 31956765 3' + pogo 2046 1 60.27 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATA:1 - chr2R 21078408 3' - jockey 61 1 51.37 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAATTAAATTAATTATATGAAAGTGTGTTAAGTGAAATGTCATGATCCTTATTATTTGATATCCAACTCTGGCAATCGCAAGATTTTCATCTCACCGAATTCAGC:1 - chr3L 21819928 3' + Juan 4187 1 65.07 ATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCGCGAATTTGCTTAGCCTACTTTAAACCACCAGTGT:1 + chr2L 21235248 3' - P-element 452 1 28.08 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTCAAGCGACGTTTATTTCCCGTGCATGTGTGCGTGGTTCAGTTGCATA:1 - chr2L 4416044 3' - jockey 68 1 57.24 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACGCTTTCGCGACAACGCCAAATATCAACTACTTATATAGCGATATATATTCAGGAAAGTTTGGCTTTGGGTCGCCGCTGCTCCTTGCTGTTTT:1 - chr3R 21570440 3' - mdg3 5284 2 63.70 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATC:1 + chr2R 22255431 3' - roo 8717 2 54.11 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCCTCAAACCCGATTAC:1 - chr2R 982300 3' - HMS-Beagle 6840 2 54.11 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCAAATTGCGAAAATAATTGACAATGTTGACTATTGCTACCTACATACATATGTGAACGAGC:1 + chr3R 7549747 3' - copia 4931 2 62.33 GACAAAGGAGTTTTCAGCTACCACGTATAAAGTATAAATAAAAAAATAAAAAAAACTCCTGCAACATAATGACGGATGCAAGCAATATACAGAATTTAATGGCCTCCACTGCGTTCGCTTGTGTAAATTGCTTTGTGGTCTCCCCG:1 + chr3R 22823946 3' + BS3 1736 1 66.44 TAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAGGAAGTCTACTAATATAAGGAGGTAATTAACTGGTTTAACTTCAACGCTTTGGCCAACCTTATTGGTCAAGTAATGGG:1 + chr3R 19638677 3' - Cr1a 4037 1 65.07 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATG:1 - chr2L 535441 3' + roo 9006 2 76.27 ATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATTAACGGAAGAACACCTCTCCTTTCGGGAGAATAGACGTTG:1 + chr3R 2999888 3' - McClintock 22 2 71.23 GCACACACACACACACACATATGTACATAGGCTATATGGCTATATAGTATTTATAAATCCCAGCATTTCGTGGCAAATCTTGAGCTGTCTACCTTGTTCGGCTCCGCTGTTCTTATGCATATGGAAATGCCAATTTGAAGCGGGCA:1 - chr2R 20887322 3' + accord 7029 2 60.96 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGGTCCGGGGCGTCAGCTATTGCAGTTGGT:1 - chr2R 9164819 3' + 412 7515 2 57.14 AAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACGCGACACGCAGTGAAACCGCAGCAAATCCAACCGATTGACAGACAGAGCGGCACT:1 - chr2R 13623432 3' - S-element 61 1 61.81 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAA:1 - chr3R 4884381 3' + pogo 2036 1 65.75 CAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTTGACTCCCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTTCTTTTTGCTTCAGATTTTTATTCGGGTTGCACACGGCCAATTGTTTTGTTTATTCCGTTTGGCTTACTGTTCGTTTTCTTTAC:1 + chr3R 7648190 3' + Quasimodo 302 2 61.64 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTATTATGTTCAGAATATATCCACTTGAAGATTTTGAATCATATTTGAAAAATTGTTTTTTTTATATCATCGATGTTCCCATTTTTGAACAGCCACCTA:1 + chrX 14756805 3' - pogo 20 1 74.66 TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTC:2 + chrX 21213375 3' - Doc 80 1 67.81 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGT:1 - chr3R 3527080 3' - Tabor 6909 2 63.01 ATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATT:1 - chr3R 7739690 3' - blood 7085 2 66.21 TACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGG:1 + chr3L 21093217 3' - Ivk 52 1 63.33 GAAGCGATGAATCAATACAATCCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGAAATTCCCAGTAAACTTGATATTGTGCAACTCGCATTTCGCAAGC:1 - chr3L 9907296 3' - BS 5071 1 66.44 GAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAAT:1 - chr3R 18903398 3' + pogo 2033 1 65.75 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAAAGCACGCAATTAATTTCGCCTTGGGCCCGGTCGAGTTCCAAGTGCTAAGTGCT:1 - chr2R 11379673 3' - jockey 27 1 71.23 AGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAATCTT:1 - chr2R 21897876 3' + 412 431 2 58.90 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAACAAGAGTCCGAATACTCACTCATCCTTCTACCTGGTACATACTTTTCATCGAATCTAGTATAGTCTTTTACTATACGATTAAGGGGTATAA:1 - chr2L 10683005 3' - roo 8693 2 40.41 GGGCATTAATGAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAATCATTCACTCTTTGGTTCGTTTTAATCGCTGCCAGAGCTCAGTCTAGTTGCGAACTGTTTG:1 - chr2R 15787327 3' + Doc 4585 1 58.22 AGGAACTGTAAAAGCGAGAAGGTTAAGATTCAGGATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAAGTTTGTTGACCCATGTGGCCACACCCTCAATAACGCCTACAAACCGCAGAAAACTGCCCCGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTG:1 + chr2R 5212079 3' + INE-1 156 1 73.29 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACGTATATATATTGTCTGAGCCCCAAAAATATTATGCAACAAAAACGCGAACGAT:1 + chr2L 5648491 3' - Burdock 58 2 66.91 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAATAGGTAAAGAGAATTACCCACTTCGGTGCTTAGAAGCATAATTTTTTGCTCTATCAAAAGGATTATTAG:1 + chr2L 16942148 3' - mdg1 7091 2 51.37 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAA:1 + chr2R 6052663 3' + mdg1 335 2 73.29 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTAAACG:1 - chrX 8272409 3' + roo 357 2 52.74 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGGTATGGTGTTGAGTTGGCCAAAACCAA:1 + chr2R 10367617 3' + 412 476 2 71.92 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCA:1 - chr2R 20461179 3' - jockey 68 1 58.22 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTA:2 + chr3L 3540192 3' - mdg3 5327 2 75.34 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTCACATCCAATTGCTCCTCCTCTGGTTCCCTGGACTTCGACAGGCC:1 + chr3L 9430700 3' - P-element 7 2 78.12 GTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGGGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTGAACGGGGCCACAAACCTTCTTCTACTGTTGTTAGAAGTAATTCTACT:1 - chr3L 24149391 3' - hopper 1226 1 65.75 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCACCAGGCATCCCAATCAGTCGTGC:1 - chr2R 24338311 3' + 1360 3364 1 67.81 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACGGCTTCCGTGGTCAATTATTATCCTTCCTTGCAATGCCTTTGTAACCCGTT:1 - chr3L 3979529 3' + opus 7484 2 73.97 TCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTT:1 - chr3L 19397021 3' - F-element 12 1 68.54 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTTCCGGCCCCACCTTTACATGGCAATTTTTAACGCTCTTTTTATGACCAATGAAGAT:1 + chr3R 31956876 3' - pogo 59 1 61.38 AATAATAATTCTTAATATTTACAAAATAGCTTGCTTAACTGACCACAAAACAGATCAAATACGGATCAGTTTTGCTGATAAGCATAGATTTTATTGCCCCCTTCAGCTGTGCTTTATGCTTTCGCTTTCGGCATCTAATTTAGTTT:1 - chr2L 6075480 3' - BS 313 1 73.29 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATTTATTCTCAATTATAATTTTGTAATCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 + chrX 124082 3' - Doc 55 1 51.37 ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACAT:2 + chr3R 10288874 3' - copia 4955 2 73.97 CAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTATTAGAAGGAGGTTCCCTCCGCCGCCTTT:1 - chr3L 19046851 3' - S-element 344 1 80.82 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTGATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGG:1 - chrX 18366049 3' - jockey 86 1 77.52 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATGGCAAAATTAAACAACAGGCAAATGTATTTAATTGAGGTATGCTT:1 + chr3L 18468424 3' + jockey 4922 1 73.29 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGA:1 + chr3R 20905490 3' + pogo 2047 1 53.42 TATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGATTGTATTTTGCGGCGTTTGTGGACTTGGCAATGTAGCCATT:1 + chr2L 8393107 3' - I-element 5135 1 71.92 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTTAGCAGGTCAAAAAAGGTATAGTAGAGTTCCACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCAAAGCGAGTGCTGT:1 + chr3L 22519133 3' - pogo 18 1 73.29 TTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACA:1 - chr3L 19397040 3' - F-element 88 1 70.55 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAAGTGCAAGGAAACGCTGATG:1 + chr2R 9668101 3' - jockey 4709 1 58.22 ATAATTTAAACTTATTCAATAATTTGGGGCATATTAATATATATACCTTACTTGCGCCCCTTTTGGCAAGAGTATTTGCAACTTACTTCAGCATATGTATATAGTGAGAAATGTCGGCAAATATCAAACACCATGGCTCAATCCCA:1 + chr3L 2200627 3' + HeT-A 353 1 56.85 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATTGATATTGATATTAGCCCTTGAGTTATATATACACGATGACCGTTAAGAACGGCGATGT:1 + chr2R 14247071 3' - pogo 22 1 62.61 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAGCACGATGGTGGAGGCTAA:2 - chr2R 14553197 3' + mdg3 220 2 64.38 AAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACT:1 - chr2L 5771425 3' - Juan 76 1 67.12 TAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTCTTGTTTATTTTGTTGTATAATTAATATTTTTTTGACTTATAATACACCGCCGTGGTTGTGGCCAATCACGAGGCCCTCGCCCAGGTGC:1 + chr3R 19130135 3' + S-element 1495 1 68.49 CGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATA:1 + chr2R 14884323 3' - mdg3 80 2 78.08 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTC:1 + chrX 16853410 3' + roo 8995 2 71.23 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTCCAGAGGGCAAGCTAGAAGGTTTTTGGACCATATAAAGTAAATATATTCTTG:1 + chr2R 8443974 3' - Tirant 8138 2 65.75 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGGCTAGAAAGCACATATCATATGCGTGGCGCGTCCT:1 - chr3R 8402519 3' - mdg1 7067 2 62.22 TGGACGAAAATAATTTGTAAATTGCTTGGAGCCCCGTTCGTTCTGGCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATA:1 + chrX 20893577 3' - Juan 238 1 76.92 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTA:1 + chrX 17469267 3' - blood 69 2 63.70 AAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGTCACACTGGAACTTCATCATTTTGGCCGCTCCTCGCC:1 + chr3R 7107640 3' + Chimpo 58 1 71.95 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCATTATAATCCTTTC:1 - chrX 10978942 3' - roo 23 2 68.49 AGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCACAGCGTACATTGGCTTATTCGAAAATCTCATCTAA:1 - chrX 16853291 3' - roo 27 2 67.12 TAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGG:1 - chr2R 21897884 3' + 412 423 2 63.01 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTCCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTCTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCG:1 - chr2R 15613754 3' - P-element 19 1 59.22 ACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7212 2 71.43 ATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAATAAGGCCGTTTCGTTTAATTGCTGCGCCACATTATGTGACAA:1 - chrX 4579595 3' - Tabor 418 2 71.23 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAG:1 + chr3R 9163925 3' - hobo 79 1 77.30 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATTTTGGGATCGATTCAGATTTCA:1 + chr2L 1074039 3' + Tirant 8471 2 60.96 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTG:1 - chr3L 18708575 3' - F-element 31 1 68.22 ACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGA:1 + chr2L 1449667 3' + opus 7421 2 74.66 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCT:1 - chr3R 14097028 3' - transib2 53 1 57.97 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGAT:1 + chr2R 18123514 3' - pogo 63 1 60.96 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCA:1 - chr3R 6068302 3' - jockey 4759 1 81.51 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGAAATCCCTTGAGGTTTGTGAGCAAATTGCGA:1 - chr3R 29708907 3' - blood 7015 2 76.71 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTTGATTTCTCAGCGCCTTGC:1 - chrX 13548278 3' - jockey 4790 1 65.75 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAAATTATAA:1 - chr2L 1449575 3' - opus 48 4 52.05 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAAAGGTGTGTGGGAGTTTGTTTGTTTC:1 + chr2L 17069692 3' + 412 479 2 76.03 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAACCCGCCATGCATGTGCATGTGCTTTGCATTG:1 - chrX 15814465 3' - P-element 17 1 73.79 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATCGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACA:1 - chrX 14385166 3' - blood 76 2 67.81 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGAC:1 + chr2L 16685400 3' + P-element 2847 1 50.81 ACGAACGAGAAATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAA:1 - chr2R 5206895 3' - Doc4-element 65 1 64.38 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACTCTAC:1 - chrX 5222848 3' + 412 7494 2 54.79 ATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATT:1 + chr2R 10163615 3' - Juan 4162 1 79.45 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTG:1 + chr3R 20292529 3' - pogo 56 1 59.31 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATAC:1 + chr2L 15965284 3' - blood 7096 2 73.97 TATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATTTGCCATTGTTTTTAAATGGCCAAAAGCGAGCATACGTAACACGCTTACGTATTTTTGAAAATTCGTGCACATTTTGAGTACATTT:1 - chr3R 10791657 3' - Idefix 30 2 60.27 AAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTAGTTATTACTTATTACAATTGGGTTACACTGGGCCATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGTATCCGTATTTT:1 - chr3R 16535277 3' + Stalker2 348 2 52.74 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGGTTTTGTATCTTAGCT:1 + chr2R 6187957 3' - Tirant 8114 2 71.13 ATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATAGAAATCAAATAAAAAAATTAGTATACAGTGGAGGCTCAAAAGATTGGTTTATTTTTGGTTATGTAACAGAAAGTCTGTATGCGCATCCAAAA:1 - chr3L 21100706 3' + Ivk 281 1 55.48 ATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATTGACATTATTCAATTGGCTAATTCATATCACCCACTCCACATATCAGAGATGTGGTCTATCCCTAACCATATCAAGCTTCAAAAATATG:1 + chr3R 23628177 3' + Bari1 1250 1 49.32 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATACCTCTTTT:1 + chr3R 21924387 3' + roo 9044 1 66.44 TTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAATTTTGTGCGGTTTGAAGGATTTATAGTGGACGTGGCAACATTGGTAGAACAATCTTGCGGTGAGATCTCTACGTTCATACGGACAGACACAAAGTAGCATTGAATATACGCGAATGTAAAAA:1 + chr3R 30176097 3' - INE-1 250 1 77.24 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGCGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATATTCTTCATAAATATAGATATATATATATATATAAAAGTGTGTGTATATGGATTTTCGGGCCTTTGTG:1 - chrX 8626185 3' - Burdock 46 2 54.11 GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACAATTTATTATAGAAATATAGATATTTTTTGCGTAGAATCAGCTAATAAAGTTTCGTAGCAAACGGCAGCAATAATTATAAGCAGGGCCAAAAATCAACGAAAAG:1 - chr3R 18469078 3' - Quasimodo 15 2 76.71 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGG:1 + chr2R 5992397 3' - pogo 60 1 62.33 AAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTGTTATTCTCCTTCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATTTCCCATTCATGTTTGCGTAAAATTCAACGGGATTGAACAATCGGCAAATGTC:1 + chr3R 19342516 3' + baggins 5007 1 63.70 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGCCCACCAACTCCTAACATAAGCGATTCATAT:1 - chr2R 8793848 3' - Transpac 4945 2 68.49 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAAG:1 - chrX 14914326 3' + mdg3 5458 2 57.53 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCAT:1 - chr3L 14581349 3' + pogo 2068 1 63.01 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTA:1 + chr2L 8397219 3' - roo 8756 2 81.51 GGGTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGAT:1 - chr3L 21097137 3' - mdg3 83 2 71.23 ATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGATTACAAATGGAACCAAACT:1 - chr3L 16157152 3' - Juan 19 1 71.23 CAGAATTTAATTGGGGTTCACGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGAAAGAAAGCGCCATGCAGTCATGAAAAATTCGTTCAAATGCTTCAAGATCCCTCCGCTTGAAACCTTTTC:1 + chr2R 3927464 3' - baggins 5325 1 60.96 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCACCAATCAGACACAAATTGTC:1 + chr2L 21192595 3' - roo 8720 2 60.27 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTT:1 - chr3R 7424533 3' + 412 435 2 56.85 TAAATATAATTTATCGCCCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGATATCCAAGCTATGGGTATGGATTCCGCAAAGGAATCTCGAACGACA:1 + chr3R 16771421 3' - roo 74 2 67.12 TAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAAGAT:1 - chr3L 24153127 3' + Tabor 469 2 73.97 AATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATAC:1 - chr2L 17550620 3' + Transib-N1_DM 434 1 79.45 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGT:1 + chrX 17258314 3' - 297 46 2 55.47 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGG:2 + chr3L 21093248 3' - Ivk 47 1 53.42 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGACTTTTTCCGCCGAAT:1 - chr3L 16887319 3' - roo 8736 2 67.81 GTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCG:1 + chr2L 17551100 3' - Transib-N1_DM 225 1 51.75 CGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTTCAAAGTTAACAAACAATTTTC:1 + chr2R 20362333 3' - diver 29 2 65.75 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCT:1 + chr3R 10468118 3' - opus 7161 4 54.79 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTA:1 + chr3R 9482102 3' + roo 338 2 66.44 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGCTTTGGATACCCTAC:1 - chr2L 1073867 3' - Tirant 20 2 73.29 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATCAATTCCTTCAAATTATGC:1 - chr3L 10506739 3' - S-element 74 1 71.92 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTTCGCTTTCGTTGCTGGGGCTGAATTT:1 + chr2R 23225885 3' + Transpac 5172 2 58.22 GGATCATTTATTCGGCTCAGAACAATAACTATTGTACTTTATATGTTTAATATGTTTTCTGTATTTTTAAGATAGTATAAATTGTCAGATAGATTCAAATAGATTCGCTTCGTCTGTCTCCTCTTGGTCGTAGTGCTGCATTTGCC:1 - chr2L 23371774 3' + Tom1 373 1 71.92 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAATCGATCTCGTTAGCCTTGATCAATGGCCCGGAAAAACAGAATAAAGCTAAATAAAAGCCAGCGAAATTGAAATTGTTGACCGTTCGC:1 + chr2R 8597210 3' + blood 7313 2 60.27 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGGAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCACGATCCAATCAAA:1 + chrX 3506176 3' - Tirant 43 2 52.05 CTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGCACGACGCCCACAAATCGCTAGCGTACGAGCCC:1 + chr2R 6052727 3' + mdg1 399 2 69.86 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTGAAAAAGTATTTGAGTTATCCATGTCACATAAGTTATACC:1 - chr2R 14705720 3' + roo 9050 2 67.81 ATTTTTCTGGTATATCAATAGATCTTGGAGTGACAGAGCGTGTACTTGATTACCTTACTTACTACTACACAAACATTGAGAGTAGGGCCAAAAACAATTCAATTTGTCCCATTTCTGCAGCCTAAATTAAATTTCGAACTAAGAAC:1 - chr3L 22982970 3' - INE-1 501 1 78.08 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAA:1 - chr2L 17730426 3' + pogo 2043 1 60.00 TCGTCTTGACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTGTATAAGATGATATAATGCATGCATTCCCAATTTCCAAGTGACCTCCTTGTGCATATA:1 - chrX 4295520 3' - R1A1-element 426 1 58.99 TTGGGTTTAGGCAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTTGATTGAGCATTTAAAGAAGGCAGCGCGATTGGGTTTCGTGTTTGCGTCCGGATTCGATTTCGA:1 - chr2R 18981654 3' + Circe 7056 1 56.16 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAA:1 + chr3L 4869230 3' - roo 84 2 77.40 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACCTCCACTTTATATCTGTTGTACATTAATGACTGT:1 + chr3R 23426517 3' - pogo 20 1 71.92 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCT:1 + chr2R 14884337 3' - mdg3 66 2 68.49 AGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCG:1 + chr3R 28033682 3' - diver 5956 2 62.33 ATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAAAACTGATTGCAAATTGCATTCTGGGTATGTGCAAAAAGTCTTAAAGAACGAATATGAAAACACACAGCATAAGAAACCTAACAACAGCAGATCA:1 + chr3R 2216848 3' - invader2 30 2 37.67 AATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTTAAAATATGACCAAAGCAAAGAAACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACGCCATAACTGTTATTAAAGCCCCTGTAGAGTCCAATTTGTTC:1 - chr3L 4236321 3' + 1360 454 1 71.23 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGGTATGGTGTTGAGTTGGC:1 + chr2R 10367608 3' + 412 467 2 65.75 TTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTCTACACGTACGATACTAGATCAAACAAGCCATACAAAGCCATTTTATCCGGGCTGTATAAACTACCAATTGAAACTTTGCGTGCTTTTCGGTTAAGTTCGTTCCGTGCGCGCTGG:1 - chr3L 16164203 3' - Juan 3857 1 54.79 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGA:1 + chr3L 22481321 3' - roo 8733 2 65.07 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGAC:1 - chr3L 4023613 3' - pogo 33 1 56.10 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGG:2 - chr3L 18708569 3' - F-element 42 1 64.38 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATTCCAAAGGCCAGGGCAGACAGACACATACAA:1 - chr2R 18882539 3' - roo 8696 2 60.27 GCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAACCGAGGGATGCCAGGGCTGAGTGAAGGACAAAAGGAGGACATGGTGATTGGCTACTTAACTCCTTGGCAAACTCCTGACTCCGA:1 - chr2L 14753917 3' - Doc 339 1 56.85 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGA:1 + chrX 18193836 3' - hopper 35 1 57.53 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCATTTAATTATGCCTATTTTTTATATGTGTACCCCTGCAATTGCCGCTTCATTATAATCGGAAT:1 + chr3R 6103728 3' - Tirant 12 2 77.40 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTAAATTTTGGCATCAAAAGTTGGCAGTGCTGAAATTTAATTTCATTTTTA:1 - chr3L 11669736 3' + Tabor 467 2 69.18 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGGCAAAACCATGAGCCCATTGATTTTCCAAAGG:1 - chr3R 9289244 3' + HMS-Beagle 7032 2 78.77 AGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATTCTCCCTCTGCCCGTTTTCCTCACTTACGGGCAATGTAATGTGCATTTAAA:1 - chr3R 14653197 3' + Burdock 6294 2 65.07 ATATAAACCAAAACAACAAAAACGCAAAACAAAAAATAAAAAACCCCAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCACGGCCGGTTTATATGTAACATATATAACGAAAACGCACAGCAACAGCAACAACAACAATACA:2 + chr2R 13630172 3' + gypsy9 449 1 41.78 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCGCTTGGCTATTCCTACGCAGGAA:1 - chrX 19498050 3' + P-element 2851 1 60.27 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAGTG:1 - chrX 15167668 3' - roo 8708 2 65.25 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATCATTTTTTAATTACTAGTTCCGATTAAATGAAATACGAATTACAATATTTTTTTTTAAATCAGCAATAAATATGTAAGTATTAAAGCCGAG:2 + chr3R 14331271 3' + Burdock 6366 2 40.41 ACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCC:1 + chr2R 23313069 3' - Tabor 6921 2 71.92 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCGCAGTTGTTGTTGTTGCCCCGATCATATGGT:1 - chr2R 10478634 3' + invader4 305 2 69.86 GGCTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTTGGATTGAATATAAAGCG:1 + chr3R 12559742 3' - mdg3 55 2 60.96 AAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGTGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAAC:1 + chr2R 5532371 3' - G4 3775 1 52.74 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATT:2 + chr3L 17667620 3' - F-element 80 1 65.07 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTAACCAGCTTTGGCCAAATGGTATCAAAGAGACCTGGA:1 - chr2L 2357242 3' + P-element 2863 1 69.18 AATGAAGGTACATGTCTAAAGTTTCCTTATATATTAAATTTAGAAAGCAAGAAAAAATAATCAGGAATCCCTGAAAATTCGAACTTATCAATTGCCTGTAAATCCGCGCTATCATTTTGATTAGACCATCAACTTTGACCTTGGCT:1 - chr3R 29787385 3' - mariner2 809 1 54.11 TTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAATCTTTTGGCCAACATCTCTGGCCAATTGTCGGCCGAAGACGTGCCTGGGCTTGTCAAGGTGCCCCGACTTTGTGCGGC:1 - chr2L 20722220 3' - Burdock 224 2 54.11 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAAT:1 - chrX 21668725 3' + mdg1 351 2 66.44 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATGGTAGGACCT:1 - chr3L 18708561 3' - F-element 28 1 72.86 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGCTAAAATTTTCTTTCCA:1 + chr3R 9345699 3' + pogo 2068 1 63.01 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCATGTCCGTCCTGCATCTTTC:1 + chr4 1149939 3' - 297 60 2 67.12 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAAAAATAAAAAACAAATTTGTGTGGCTTACAACTTCCGTCCAAAACGAAATAAACAAATAAATCAAAAGAAACACAAACACAAA:1 - chr2L 20885492 3' - BS 5006 1 74.07 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTCATTTTTCGGCGTCCACACATTGAATATTGATAGAAAGATAACCGATTAAAGTTTTCTGTTAGTTAGTGGAAATAT:1 + chr3L 20895619 3' + S-element 1673 1 54.79 AAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATCAATTCCTTCAAATTATGCTTAAGATGGTAAGTTTTTAGAATTATTTACCAAATACTTGAATTATTG:1 - chr3L 10506691 3' + S-element 1690 1 67.81 TATCTATCGATATCCCAGATGACGAAATTTCGCATTCGCATTCACACTAGCTCACGCTAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTGGACCATAGCATTCTCTATTTTTTGTTTTTTTTTTGGGGGGAGGCCAGAGCAAGGGACCCACGA:1 + chrX 8313187 3' + INE-1 499 1 78.77 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCG:1 + chr2L 17069663 3' + 412 7503 2 56.16 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGGGGGATGGTA:1 - chr3L 18708567 3' - F-element 40 1 64.38 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGG:2 - chr2R 20382509 3' + Bari1 1621 1 76.71 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTCCTCCCCCCTCAAGATCTGCGTCCCGCAGATTAGTGATATGGATGTGTGCTTCGGCTAACGAAATTCGATATTCGATATTTCCTACGATTTATAAAGCAATCAAATAAACATGAGTTTT:1 + chrX 799166 3' - opus 6 2 56.16 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAAAAATAGAAGGTATACAAGGGTGGTATGCCACTAAAGAGGAATTGATCACCGGTATAAAAC:1 + chr2L 21400196 3' - pogo 57 1 58.90 AATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATAATTTTCGTATCATCCTTAAAGTATGCAATACCTAAA:1 + chr2L 6074099 3' - BS 46 1 55.48 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCTTCTCATCGATGGTAGGTAAGCCCTTGTTTCAAATGATGTGAATGGTTCTATTTAGGAGTTTGTCTGTCTGTGTC:1 + chrX 16456858 3' - P-element 20 1 70.55 GGACGGAAGCTTATGGTCAGGTACACGGATACCTACTCCGCTCCCTGCCAAATGTTAGCTGGAGTTCCGCAGTGCATTTGCACTTCGACTGGCGACATCTTAGTTACACAAA:1 + chr2R 16126675 3' + BS4 13 1 64.29 AGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCAAA:1 + chr3R 31956527 3' - pogo 34 1 61.64 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTTTGGATTCAAATTCGG:1 - chr3R 9563597 3' - P-element 63 1 41.10 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAAGGTCGCTCCTCCACACGCACATTATCAAGCACAAACGAGGCACAAACGGATGCCTTTCACC:1 + chr2R 5849098 3' - mdg1 24 2 67.81 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTTTG:1 + chr2L 10032718 3' - hobo 77 1 74.10 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGTTGCGCGGGCT:1 - chr3R 10468035 3' + opus 7458 2 72.04 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATC:1 + chr2L 17069662 3' + 412 7503 2 55.86 ATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGTATGTTGAGATTTATCTTTCGAACAATTAAAAAAAAAGTAATAATTTGTAAGTTAACAATTTATT:1 + chr3R 16731310 3' + INE-1 93 1 65.07 CGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGTAATAACAATTTATTTAACCAACTCAAATATCTTTCTCTGTTACATTTATTAACTTATAG:1 + chr3L 23597306 3' - invader4 2748 1 69.18 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACATATATAAAAAATGATATATGTAATTATTATGATTATATTTTGGCCTTCTTCGTTGGCTGTTTTGCGGCTTAAATCACATCTTTTT:1 - chrX 8200159 3' + flea 227 2 69.18 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCGTTTCCCTCGTTTCGACTTATTCGACTTTTGTGATTTATGCGCATAGTCATGGGTTTGTATCAACACTACATTTACATAAT:1 - chr2L 18581247 3' - roo 8699 2 59.44 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGTTCCAGTGCAAAATGCCGCTGGAATG:1 + chr2L 377089 3' + roo 407 1 76.99 AGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGTCGCAGACCCTCAGCATTCGCATATGAATCCATCCATCCAAAACAGCAGTTACC:1 - chr2L 11407655 3' + 1360 415 1 63.01 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAG:1 - chr3R 25271187 3' - 412 75 2 67.12 ACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAGAGTTAATTGGGTTAAACC:1 + chr2L 8772818 3' - Tabor 6908 2 63.01 CTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTATGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCTAAGTTTCTGAATGTGTTGTTATGCAAATCGCGTCCTTTTTGGC:1 + chr3R 10972772 3' + jockey 373 1 68.49 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGG:1 - chr3L 18708574 3' - F-element 45 1 61.81 GCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCCGTATTGCGCAATTACCCAAATATTCGTAAATCCGT:1 + chrX 17256307 3' - roo 8833 2 75.34 GTTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAGTTACCGTATTGAGTGTAATTACTTATTTCTTTATATTTTGGATTTGATTTTCCTACTTGATTATTTTTTACAAATATATTTTCTCTCAGTGCAAGGGTCGAGAGCCAGCTTCTTCCC:1 - chr2R 23240424 3' - Transpac 4753 1 75.34 AACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGATTGATTGATCAAATTATAAGCATGGATTTACTT:1 + chr2L 19417159 3' - BS 4972 1 76.03 AAAAAAAAAAGGAAAATAAACACATCAGAGGGTCACGGACAGTTTTGTTTTTACTTTACTTTTACGGTTACATGGGCTTTCGTCCCACAGCTGTGATCAACGCGAAAA:1 - chrX 13507155 3' + Doc2-element 252 1 87.96 ACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTGCACTTTATTTTTTCCACTGTGCCTAGGCCGAGCCCTCTAAAAAA:1 - chr2R 11655978 3' + HMS-Beagle 7013 2 65.75 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTCGATAAAATAATTTAGATATAATTTAATGTTCAAAACTGAAAAAAGTTCAAAAAGATTTAATTATTATAAGCATTTAAAACTTCCCCTTAAATTCCAC:1 + chr3R 11096816 3' + copia 233 1 70.55 CCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTATAGGGAAATTAGTGGAAGAGGTTTTCTTTGTTTGCGTAAGCTAACAGTTTACTTGTGCGTGCTAAGTCGCAATTCACCATGTG:1 + chr3L 11132446 3' - mdg3 5205 1 59.59 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGA:1 - chr2R 18882583 3' - roo 8740 2 73.29 GATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAACTTGTATGTCGAACTGGATTTGCGGATCTCTTTGACTCGTTCCGGGCCAATTGAGCTGACAACGAAAACACTTTGCCGGCTATTTAAGCCGACCGACGGACGAACAAAA:1 + chr2R 20856346 3' + Juan 4207 1 78.77 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTTTCATTGGCACTGATTTCCTCGAAACT:1 - chr2R 6945595 3' + pogo 2065 1 60.96 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACT:1 + chr3R 15974767 3' + P-element 2790 1 19.18 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGG:1 - chr3R 15589973 3' - Transpac 4995 2 70.55 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTC:1 + chr3L 15035238 3' - pogo 42 1 55.48 AGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAAATATGTTGAATATTGAATGAACCCAGCTGAGTGGCGGAATGGGTATGGGATTTTGGAGTCGCCTGGCTGAGTGGAGTGG:1 - chr2R 20230867 3' + Quasimodo 91 2 55.48 TTTTAAATATGAGGACAATATTAATGTGTCCGTCAAGTCAATTACCTATAAATCAAATTAAATATTTAAACTTTACTTTATTTACCATTATTTGGCCATTTCTTTGATTTACTCATTAATTGTTCACTTTTTCCCACTTAAATATA:1 - chr3L 18143742 3' - hopper2 494 1 54.79 ACCTTAGTTTCGTGGATGGTGCCCTTTTTTTGAGGTATTATGTGGAAGTTGTCTTTTCCAACAAGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAACATTCGAGCTTTTCTCTCGAATGTATATAGGTGTGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCC:1 - chr3L 25552489 3' - Fw3 84 1 84.25 TACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATATACAGATTGTAAACGGAAATTGCCTCAAATCAAAAATTATAGTCCAGAAATG:1 + chr2L 13869859 3' + F-element 4320 1 63.70 GGATCAGGTGGTGTCCACGATCGGTGACTATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATAAGCCGGTATGCTCTGCGACTAATTAGCCGCAAAATTGTTTTTCGTTGCCATTTCTTGTTTGGAGTGAGCACTTAGTGTTTTAATGTTTTCTC:1 - chr2L 14194292 3' - Chouto 254 1 57.53 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATA:1 + chr3R 8022200 3' + roo 319 2 78.77 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGATGGATGATGGAGCCTAGCGGTAAGCC:1 - chrX 2032092 3' + P-element 2818 1 24.37 GGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATCTAATTATGGCTTTGGACCCTATTTGTTTGTCCCGCGGCAACCTTGGCACCGATTTGTTTGCTTTACTTTGC:1 - chrX 16868678 3' - Doc 4482 1 53.42 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAAC:1 + chr3L 22481310 3' - roo 8744 2 72.60 GCGCGCGGCTTTTACTAACCAAGTGTCAGGCGGAGCCGTGACAATAAAAGATTAGGAGTTACTTTTAATGTTTTATTATACCGAGCTAAGCGGATTAAAATGGTTATGTATATGAACGCCAGATTTCTCAACTGAGTTATTTCT:1 + chr3R 31605414 3' - gypsy2 302 2 65.28 TGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGACCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGTCAAATTACCCCTGATTCTACTGTCACTAAGCTGACTCATCAAGTCGTCTAGTGAAGTTTATTTTATCTATTCA:1 - chr2L 18780811 3' + 1360 175 1 50.68 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATTGCATTTCAGATGCTTTTTGTTTACCAACGAAAAAGTGGGTGGTGTTTGTACGGTGAAAGGGGGGGGGGG:1 - chr3L 13227596 3' + hobo 2892 1 50.00 GTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGCCAACGAAATTCTTTTAATAATGGTTAAGCAACAATATTAACAGTTTAAGGAAACATCGGAATGCGTTTGTTTGCATGCATTTAC:1 + chr3R 17470641 3' + baggins 4956 1 58.90 ACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAATATTTATACTACGCTATACATGGCAGACGGCAACACGGAATATTGTTTTCTTAGCATCGAGAATA:1 + chr2R 4582219 3' + blood 7056 2 55.48 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCACTCGATATATCGCTCGAGCATATCGGCGCTTTATCGATTGCCG:1 + chr3R 9563696 3' + P-element 2829 1 47.26 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGGAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGC:1 + chr3R 14088673 3' + 1360 3347 1 55.48 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGATATGACAAA:1 - chr3R 10099849 3' - pogo 61 1 59.59 GAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCA:1 - chr3R 7739676 3' - blood 7072 2 56.85 AAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTT:1 - chr3L 5183693 3' - copia 4927 2 56.85 ACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTTCTTCGCTTATGTCGTCCAGATGCGACTTGCTGCGCGGCTCTACGCAGCCAAGGACTGGATT:1 - chrX 9257847 3' + P-element 2753 1 47.89 TTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAA:1 + chr2R 7404742 3' + blood 292 2 78.08 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTAATATTTTCTAATGT:1 + chrX 13651601 3' - 297 26 2 66.44 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:1 - chr2R 20461151 3' - jockey 23 1 70.77 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGANCACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTT:1 - chr3R 16041113 3' - jockey 72 1 63.83 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAGTTTTCGGGGGTTTTGCATTTTCCCCAGAC:1 + chr3R 10541375 3' - hopper 34 1 60.96 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTTTCCCTCTCGCTCTGGCA:1 - chr3R 26315863 3' + roo 9039 1 63.01 TATGTAGTTCCACGGGAAACAATTGCAGTCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTCTACAGTGCATTGGACTTCAGGGAGATCTTTGAGTCATGAAAGGGGAGTACAATAGAAAAAATGAACCACACAGCAAACAAACCTCGAC:1 - chr2L 421339 3' + baggins 5296 1 76.71 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTATTAAAAATATAGCCTCCCTTAGAGCCAACCGCAATTTTTTTTAAAATATAGCCTCCCCAACA:1 - chr2L 17638685 3' + blood 336 2 54.62 CAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGCTTAGCAGCCACGTTCCGAGTAATCCGCGTG:1 - chr2L 9356770 3' + Stalker4 386 1 69.18 AAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTT:1 - chrX 12893362 3' + Bari1 1623 1 75.34 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTTCTCATTGTTAAACCTCGGAGG:1 - chr2L 8397112 3' + roo 391 2 69.29 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGCCGCCAGATGGCGTCATTGACGCGTGGGCCCAGCG:1 - chr3R 25876816 3' - mdg3 5268 2 74.66 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAATATA:1 + chr3L 20785562 3' - P-element 48 1 52.74 CAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGATTAATAAGATTGCAGAGCTAGTCTCCGATCCCAACAACCTGGTGTGCGTGCTGATCGACGAGGTTGAGTCG:1 - chr3R 8560806 3' - F-element 4292 1 51.37 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGAGTAAAAAAAAAAATCTGGGTCTGCTGCATCAGCTGCTGCCTATGTGATTGAAGCTAAAAATTCGGCATTTTGGTTGTCTTTTTTTGCGTCCTTTTTTCACTTGGCTTTTA:1 + chr2R 16908633 3' - roo 8675 2 76.03 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATTTTTTTGGAT:1 - chr3R 9563607 3' - P-element 73 1 32.88 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTGAAAATATATAAATGAAATCAATGATTTAAATCATATTCCAATTGATAGTTTTGGATAGTAATAACCGCACAATTTTTGACCGTGCACTTCAACTCCTGTTCTCCAT:1 + chrX 8665900 3' - I-element 11 1 59.59 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAATAGGTAAAGAGAATTACCCACTTCGGTGCTTAGAAGCATAATTTTTTGCTCTATCAAAAGGATTATTAGCAAATTGTTTTCGTAGCTATT:1 + chr2L 16942169 3' - mdg1 7070 2 64.38 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTT:1 - chr2R 20913123 3' - 1360 73 1 65.75 AAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAAAAATCAATATTTCCTTTTGGCGAAAGACACTTATACGTGCAAAATCTT:1 - chr2L 22696354 3' - X-element 45 1 56.85 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGGGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAGCTCTTCAAATGTATCCAAT:1 - chr3R 6068252 3' - jockey 4709 1 58.90 GGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATATCATCCTTACTAAAGTTTAACACATACCATACCCATCAAAAAAACGAATCAAA:1 + chr3L 11596359 3' - gypsy6 62 2 63.70 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATATCCACACGTCACGGCTACGGCC:1 - chr3L 9426630 3' - P-element 18 1 71.72 TGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAAATTTTTTTTTCTGCTGACCGTTTAATT:1 - chr3R 6368579 3' - Idefix 47 2 53.42 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGCCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTTCCTGTTTCAGTTAAGGGCTGGATAATGATACGATATCATATAGCTACCAT:1 + chrX 22858989 3' + mdg3 5475 2 66.44 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTAGCTGGATCAATAGAAAAGAAGAAAATGGAAGGAAACCCAGCTGGCTGATTGCAATTATTAAAGGCCTAATTTGAAATTAGTCTTCGATGCGTTGCAATTAACAAGTAT:1 - chr3L 13722229 3' + blood 7363 2 74.66 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTGTTGG:1 - chr3R 8542561 3' + roo 9030 1 51.72 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTC:1 - chr3L 9571664 3' - jockey 82 1 69.18 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATAAACGAGATTAGGCTAAATATCCCAATATGTTTTATCATTAAATATATTTCAATTAAATATTTCCGACCTTCAAATAA:1 + chr3R 25823087 3' - roo 8706 2 56.85 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTGTAGCTTTCCTAAGTCTAAGTGGT:1 - chr2L 6406457 3' - transib2 47 1 54.79 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGTGGCCATTTA:1 - chr3R 7424518 3' + 412 7503 2 55.48 GGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAAGTAGAAAGCAATTAAGTTTTTAAACAATGAAAT:1 + chr2L 8960034 3' + Ivk 5354 1 61.64 TTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTATTTCTTGAAACAACGCATTTACAAAAAGTATTAAAAAATATAAAATCATCCTGAGATACTCGGAGTATGGTGACATTGTTACAGTCAAATTCATTGCCAAT:1 - chr3R 6069552 3' + jockey 4884 1 71.92 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTACACTTATC:1 - chr3L 6096466 3' + roo 9038 1 62.33 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCA:2 - chr3R 23099074 3' + roo 355 2 56.85 AGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTTCGAAGCTACCACGGCGCTCCAGTGATATTGATTTTGTGTGCACTTTTTACGCTTCTA:1 + chr3L 22145668 3' - Doc 4464 1 77.30 ACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATTAGAGTCACTCAAGTGTATCAATAATTCATCATAGAAAATACGATAAAAAGAAAGCATAAATTCGCATTAAAAGTTTTAATATTATTGCCTTTTCATCTT:1 + chr2L 18579242 3' - roo 9050 2 76.03 AAATATCTTACTCCGTTCTGGAGTTATTCATTTTAGCCAGAAAAAGTGGGTAAATTTCCCATAGTGCAAGGGTGAGAGTGAGAGTGAGAGGCGGATGACTAGCCTGATTAGTACATGTGACGCATGTTGCTTGCGACGGCCTGCAT:1 - chr2L 21329672 3' - Transib-N1_DM 45 1 71.92 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACC:1 - chr2R 9332127 3' + roo 343 2 63.70 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGATTTCTCATTCGTGCGAGAGCA:1 - chr3L 20785453 3' + P-element 2824 1 42.47 GGTGCTGTTATACAACACAGTTGTATAAAAAACCATAAAATCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTT:1 - chr2R 5284578 3' + Doc4-element 2565 1 78.08 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGA:1 + chrX 18193846 3' - hopper 25 1 64.38 TATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCC:1 - chr2R 20382467 3' + Bari1 1663 1 55.48 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAGCGGCGAAA:1 - chr2R 20704133 3' + hobo 2901 1 52.42 GTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAAGTCTCCTATTGCAGGTCATCTAAAAGTCGT:1 - chr3R 11096707 3' - copia 91 2 81.51 GGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATACTCATATGATTTCGATATTCCAATTATGATTATCCGATCTGTATCCAT:1 - chrX 11977619 3' - mdg3 130 2 66.44 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAATGATTAATTTTTGCTTCTAAGATAACCATATAGTATCATTTAATTTAGCAAATCTTA:1 - chr2R 13849633 3' + roo 343 2 63.01 CTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGT:1 - chr2R 5582157 3' - Cr1a 476 1 53.42 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGTGTCCTGTCTAGAAAGCTCATATCATATGCGTGGCGCGTCCTGCGGTTCAATTAAGTG:1 - chr3R 8402503 3' - mdg1 24 2 68.49 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATT:1 + chr3R 9482097 3' + roo 8997 2 69.86 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAGACTCCAGATAGTAATGCACCACTTTCGGAATTCATATAACCCTTTTCCAAGCCTACATCTCAATCCAAATCGGTTGGTGG:2 - chr3L 18296887 3' + Juan 4176 1 56.16 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTCCAGGTTGTATTCA:1 + chrX 15167803 3' + roo 393 1 74.66 AGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGCA:1 + chrX 15814566 3' + P-element 2786 1 16.44 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAAATTCCAGAAACCGTCGGAGAGGCCGCGAGAGCAGG:1 - chr2L 16685313 3' + P-element 2881 2 60.49 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACACGCCGCCGAATG:1 + chr2L 14262949 3' - blood 27 2 58.99 ACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAG:1 + chr2R 6984427 3' + HMS-Beagle2 268 2 55.48 CTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGGGGAATGATGATAAGGTCCGAGTGGCTAAAGTAAAGATG:1 + chr3R 19448037 3' - roo 9044 1 73.29 CACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGACTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATATAGTAGG:1 - chr3R 27786561 3' + Tirant 329 2 66.44 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCA:1 - chr3R 20292403 3' + pogo 2059 1 58.62 AGATCTACAATGCTTCAAGATAAGGGATATATAGTTTCTGGTGAATCTACTTGGAATATAAAGCATAAATAAAAATATAATGCAAACATAAAAAACATAAACACGAGAAATAAAACATTACAATTAAGTCACACAAATAAAAAAAC:1 + chr3R 3758615 3' - Cr1a 4144 1 63.70 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGGGGGCAAGGATAGGTGGTCC:1 + chr2R 23313101 3' - Tabor 50 2 50.00 AGACATCCACTCTGTTGACCATCTCGTATTGATCGGACACGCTTCATCATGGTGATTATGATGAAAATAAAATATATTACACTTATTGACGGGTTCATGTATTGGTTGCTATTGGTTCGTGG:1 - chr2L 16853582 3' - Rt1b 4803 1 54.92 GCTGTTCGCTGTAGCGCTTTCCGCTCTCTCTCGCATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGACTACAACTAGTAGCAATGACCAGAACGCAGGTAATGAACAAAAAGAATATGAACAATTAGCGTACAGCCAAACAGA:1 - chr3L 25190048 3' - 1360 121 1 78.08 TCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGCGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACA:1 - chr3R 20137243 3' - Burdock 6185 2 54.29 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTAGTTACATTCAACGTTCCTCAAACAGTTGA:1 - chrX 14692800 3' - Transpac 4939 2 72.60 CACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATACACTTTATTGATTTATTTGGCATCATTCTTACCGCATTATAAGCTCGTATTTTGACTTTGTAGAAATGAATTTTAAG:1 + chrX 993689 3' + jockey 4760 1 51.37 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACATCCCCTATTCAACGTATTGAATCATTATTTGCACCTCTCCCTACAACTTTTGAAATCACTTGTTTACT:1 - chrX 5222852 3' + 412 439 2 56.94 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGG:1 - chr3R 12787116 3' - 297 6621 2 52.67 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATATTCTTAATCCTCATTCAAGTCGATTTGGGCT:1 + chr3L 20712077 3' + 297 315 2 78.77 CTTTTAGCTTCTATAGTTCCTGAGATCTCAATATCCTGATATTCCTGATCAAGAATATATACACTTCATATTGTCGGAAACGTTTCCTTTTCAGCGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAGGGGAATAAATATTTATAT:1 - chr3R 5265752 3' - INE-1 155 1 45.21 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCGACAGAATATAACATTCAA:2 + chr2R 1277198 3' - Tirant 8124 2 75.34 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAGCAATTAAAGTAAGTGGCGC:1 - chr2R 10367448 3' - 412 7090 2 58.90 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAATTTCAGGCGGCCGTCGAACCTCTCTATCGTT:1 - chr2R 17013972 3' - HMS-Beagle 6808 2 77.40 AAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATATAATGATACAATGTTTGTTGAGTAAACCTGATATACAATTTATGATAAAATATTTGCTTAGCCAGTGCTATATAATTTATTATATAATATTTGCTTTTGCCATTCCCAACCATCACC:1 - chr3L 3762157 3' + roo 9068 1 76.03 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCGGTCGCTTTAAACTCTTATTCTCCCTCGCGATACTT:1 - chr2L 8542744 3' - P-element 86 1 25.34 GTGATTAAGATATGAAAAGATACAAATAATTTAATAGAATAATACATTCCATTTGGATTAACTAGGAGCATTTCCTTCCTGTAAAACAAATATATATCTTTAAGGAAATCCTAAACTTAAACTACAACTTAATAATTTCTAGATCT:1 + chr3L 13437603 3' + Stalker3T 197 1 44.52 ATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATACTTACTGGCGTCA:1 - chr3R 10541202 3' + hopper 1399 1 75.34 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATAATTCGCAAAAGTCTCGTGCG:1 + chr3R 25753740 3' + hobo 2900 1 58.22 CGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAAACAGCTACCAACTTAAATTAATTGCAACGTGATACTGGCTACAGATTACCTACTGATTTTAATG:1 + chr3L 14854818 3' + rover 329 2 70.83 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGCCCGTCCT:1 - chr2L 1073926 3' - Tirant 55 2 62.30 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCGAGTGCCGTTTATTTGATATAGAAAAATAAAAATCAAATTACACAGAGAATTAACCAACAAAATAT:1 - chr2R 5401662 3' + 1360 3319 1 60.96 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAGCTCTTCAAATGTATCCAATAATCGAGATGATGAACAGCCATGTGACT:1 - chr3R 6068224 3' - jockey 4681 1 79.45 CAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTAGGTTGGTCCTTTTGTTTTCGACTTGGACCAGTTAGCAGTCTCTGGCCATTTCTTTTCATTATTTCCCGGCTTTAGTGTTGACTTATGTTGCTGCCCA:1 + chr2L 9356946 3' - Stalker 6874 4 66.44 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTAAATGTT:1 - chr2L 10937849 3' + mdg1 7386 2 67.12 GAACCTTACGGTATCGCTACCACTACCAACGCACTCGTGCGTGCGTGTTATCGGTATCAACAGTTACACCAAAGCGTGTACCCATAGCCCAGCAGTTTGAATTTGAAATAACGGTAGCACCA:1 - chrX 15857668 3' + G-element 143 1 55.74 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAACT:1 - chr2R 6984292 3' - HMS-Beagle2 6928 2 54.79 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAAAAGC:1 - chr3L 15035096 3' + pogo 2059 1 56.85 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAGTTTACTATGCATATTATACTATACTTGAAGAGAAGTCATATCCAATAATGCATAATAAGCAATATGGT:1 - chr3L 16264590 3' - Burdock 6186 2 54.79 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAGTAGAGTACTGTTACCAAGAAAAAACAAGTTTATTTTT:1 + chr2L 21342379 3' - roo 39 2 58.90 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACAATCAGAGCT:1 + chr3L 16181014 3' - Transpac 4943 2 69.18 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGGCCCGCACTCACTCACACACACATAC:1 + chr2R 16221532 3' + P-element 2831 1 47.26 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGATGTGTGAGCCCAGCTTGATTTCT:1 - chrX 13548289 3' - jockey 4800 1 57.24 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAA:1 + chr2L 2338143 3' - blood 82 2 75.34 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATAC:1 + chrX 17469247 3' - blood 7100 2 77.40 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATG:1 + chr3R 20905480 3' + pogo 2037 1 60.27 TAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGG:1 - chrX 7525061 3' + I-element 5283 1 66.44 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGGTATGATAGTACTTTTCACTTACCGAAACCAGCAGA:1 + chr3R 25876523 3' - mdg3 81 2 54.79 GCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCT:1 - chr2L 1073926 3' - Tirant 8186 2 69.86 ACTTAAGTTGCAACACTGCATTTTTTATGCGATATCAAAATCATATGTTTGATCAGATGTTTGTTCAAGCAAAATTGGAAAGAGAGAGAACAGAGAACAGAGAACAGAAAACAGTCTTATCTGGCTAAGCAGTTTATATGCAAATT:1 - chrX 8933332 3' + transib3 124 1 52.05 GAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTATGAGATAGACGCACAGAACGTTGGACAAAGTTAGGCACATGCTGATGCCGCCGAGCACGGCCAATTCAGTGGCCTGGTTGTCCGAGTAGCG:1 + chr2L 10508773 3' + invader1 388 2 63.01 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAAATAACCAGCAAAGCTGTTATGAAAGCAAAAACCAACGCCAAA:1 + chr2L 19878295 3' - mdg3 25 2 69.18 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTG:1 + chr2L 14262926 3' - blood 7068 2 55.48 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCGTGTCAATTTAAAGCGACATTTATAACCAATTTGTAATCAATTCTAAC:1 - chr3R 10562132 3' - I-element 73 1 65.75 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTAACTGTTCGCCCGCCGAGTGTTAGCTATAATTTTTTT:1 - chr2R 17100079 3' + P-element 2808 1 29.58 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGAAATCCCTTGAGGTTTGTGAGCAA:1 - chr3R 29708914 3' - blood 11 2 71.92 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCACCAGGCATCCC:1 - chr2R 24338323 3' + 1360 3352 1 59.59 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTT:1 + chr3R 20292524 3' - pogo 62 1 63.01 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGG:1 + chr2R 15080136 3' + roo 9036 1 61.64 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTTACTAACCGACTTTCGCGCAATATCCACACGTCACGGCTACGGCCACAA:1 - chr3L 9426626 3' + P-element 2872 1 73.97 TTAAGATGAAATCGGATAGGTGACGTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACTCATGTTACAATTGATTTGCAGTCTGGGGCGAAGGCCAACGGGGCTAGCAGTGAAATACAAGAGAGCTTTATATTTTCATTGTTTGTCGCATTAAC:1 + chr2R 2951705 3' - mariner2 770 1 65.75 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATT:1 - chr2R 17986254 3' - 297 37 2 54.92 CAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTA:1 - chr2R 544807 3' - HMS-Beagle 85 2 76.71 AGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATGTATCTCTTCTTTTGTTGGAAAAATAAACGTGTATGATAATAACAAATTTT:1 - chr3R 6368601 3' - Idefix 69 2 68.49 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGTCATCTGAAAT:1 - chr2L 12355245 3' + hobo 2908 1 63.01 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAA:1 - chr2L 15965222 3' + blood 302 2 69.18 AGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGGGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCATATTGTGTATAATTGATTGAGGTCAATTGACGACATTAAGGCGCG:1 + chr2R 6060615 3' + P-element 228 1 36.80 CTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATTTTGGCCAGTCAAAATGCGCACGGGGTTTTTCCCCGCCTCCAGATCCCACACCTTCCCGACAAACTTTTCAAGTGTTGAGCAATAATCAGAAAGGCTG:1 - chr3R 20471333 3' - baggins 5205 1 54.79 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATC:1 - chr3L 2037008 3' - Doc 70 1 65.07 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGC:1 - chrX 21668696 3' + mdg1 7418 2 48.63 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCA:1 - chrX 15089494 3' + P-element 2824 1 42.47 AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGGAGA:1 + chrX 11815091 3' + flea 4955 2 54.11 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAA:1 + chr3L 5183787 3' + copia 185 2 68.49 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGCTTATGCAAAGC:1 + chr2R 21898008 3' - 412 7082 2 63.01 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGC:1 - chr3R 23099091 3' + roo 9002 2 68.49 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCGCCTGACAAAAAAGTATGACAAATGC:1 - chr2R 8793878 3' - Transpac 56 2 56.85 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGGGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTGTTGATTTAACG:1 + chr3R 25521893 3' - blood 7073 2 57.53 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAG:1 + chr3R 6053049 3' - Quasimodo 70 2 71.23 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTTTAAGGAGAATTCTTTAAGAAGCGAGAATAGGTAAACAATTAAGAAGATGAGCATCGTCTATGCAC:1 + chrX 3506164 3' - Tirant 55 2 54.79 AAGAGTTCGCTCTCTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGATTGAAGAGAGCCGACGCGCGTCTATTTCACATTTTGCCTCCCATGTAATTTGATGCGCATTTGCATAAAGT:1 - chr3R 28006069 3' - Doc4-element 112 1 73.97 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATATCAGTATCAATAAGTAATATA:1 - chr3R 24809872 3' - 1360 43 1 56.85 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCAG:1 + chr3L 22221248 3' - 412 49 2 52.05 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGC:1 - chrX 22858809 3' - mdg3 5272 2 73.29 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGCTGTGAA:1 - chr3L 22635676 3' - hopper 58 1 55.71 TGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTATATACAAAACGACTTCTAAATGTTGGCAA:1 + chr2L 8452308 3' + copia 5033 2 80.82 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGG:1 + chr2L 6406558 3' + transib2 2749 1 73.97 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAGTATCCC:1 - chr3R 5765311 3' + opus 456 2 56.85 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAATATTTAAGTTTCTTCGAAATTAGTTTCT:1 - chr2R 16712924 3' + pogo 2074 1 65.75 ACCCACATATCCTTCGCCACCCACGCTGCCACCGCCTCCCAAGGCCAATCCCAATCCCAATCCCATCCTGAACGCACCTTGACAGCTGTAACCGTTCTTGTTCAGCTCGTAGCCCTCGATGCAGTCGCACTCGTACATTCCATCG:1 - chr2R 16040192 3' + transib4 2415 1 73.10 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTCGTGGAT:1 - chr3R 25271137 3' - 412 13 2 75.37 ATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCT:2 + chr3L 22638868 3' - Juan 4147 1 56.16 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCCATAAAGCCAAAGACTTATGTTCAAATTTTCACAACCCA:1 + chrX 16982301 3' - roo 8745 2 73.29 CACCGGTGGAGAACGCGGAGAAATTGAAAGAAATCTTCGAGCTGGTGCGGGGAATATGGAGAAGGCAGCCCAGGATCAGGCACGCCACTATAATCTCCGAAGACGGCCGTGGAAATCATCCGACTGTTCGGCTATTGTT:1 - chr3R 18585753 3' + Osvaldo 1178 1 79.14 AAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTCGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATGGAAA:1 - chr3L 24153130 3' + Tabor 466 2 70.55 TGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACCTCCCGCACAGTACACACTCGAAATGTGCTGACAAAGACCTAATCTAGGGCGTCTATAAACATGCGCTCGGCTCTAGC:1 - chr3L 17219236 3' - roo 8761 2 54.11 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCAGCTGACCAAACATCCCATCCA:2 + chr3L 22221268 3' - 412 7082 2 65.75 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATCAGGTTTATTTTTGTGA:1 - chr3R 20292411 3' + pogo 2050 1 56.85 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGCGGTGGCACGCAC:1 - chrX 22858797 3' - mdg3 5260 1 81.51 GCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACAC:1 - chr2R 19076536 3' - F-element 237 1 65.07 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACG:1 - chr3R 15465492 3' - mdg3 64 2 66.42 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCT:1 - chr2L 8397131 3' + roo 9030 1 55.17 CGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACAATGAAATATAAAGCCCCTCACTATTAAATCTATAATAAGATATAAGAATAAAAGTCTGGATAA:1 - chr3R 20367981 3' + Max-element 8476 2 55.48 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGC:1 + chr3R 23099162 3' - roo 82 2 76.03 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTGAAATAAGCAATAATTCTTAGCAGTATTCTAACTCATTCGAAGGTAGCAGAGCTTTCTTCTTCTGGAGTATG:1 - chr2R 9815000 3' + pogo 2060 1 60.69 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATATACTACGTATTTCGTTCATATGGTAGATTTATTGGCCCTTCACTTGACTTGTTTGCCCGCCTGCAATC:1 - chr3R 25354461 3' + 297 344 2 56.94 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAGACCCTGAAACGCTTAAAATGCCAGACTTTGACACTAAATTGAATCATGTACACATATCAGTATCAATAAGTAATATATTCACCGAGCTAGATTAATACAGATTTCCCTA:1 - chr3R 24809840 3' - 1360 11 1 78.77 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTTTTCCACTTCCCTTTCATTCCTCCGCCGGCGAGTCCGCGACTCCCTCACTGCTCCGGCTCCGGGGCCAAATGAAAAATTGCACA:1 - chr2R 22675771 3' + roo 9037 1 56.85 GAATGCGAAGAGTCGCACTCAGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGTTCATACCAGACTGTTAATAAGCAAACAGTCCAGGATTCTGGATTCAGTTCAAAAACAACATACGCCTTGGATATGGCACCTGCTTTATT:1 - chr2L 22643324 3' - invader4 2763 2 52.74 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTC:1 + chr2R 21056779 3' + Tirant 8443 2 63.01 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCA:1 + chr3R 14088655 3' + 1360 3329 1 60.27 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACT:1 - chr3R 20292409 3' + pogo 2052 1 55.48 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCG:2 + chr2R 19543748 3' - jockey 4826 1 63.01 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATT:1 + chr3L 10856789 3' - P-element 30 1 41.38 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATCAAGTTTGATGGTAGGAATTCGAATGACCAACATTAAAAATCAGTTTAAGAGTGCAACTTTCGACGCGCGTAAATCGATT:1 - chr3L 4467763 3' - pogo 36 1 60.96 AGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAAACAGTTTTTCAGGTTAGATCATTCCTAGGTTACAGGTTCCTATTACCAGACAACAACTATATAGTGCAGGCGGGAGAAGTCCGGA:1 - chr3R 7403709 3' + invader2 206 2 73.10 TGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCGTGGGTGTGCAAATAACAAATAATACGACATGAACGACCAAGAGAAACAACACCAGCAACAACAACAACACTACTTCCACAGCGAGTGGAAGACTACCGCTAATAGT:1 + chr3L 9430578 3' + P-element 182 1 78.08 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAACC:1 - chrX 15814494 3' - P-element 47 1 53.42 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACTTAACAACACTTTGCTGACTAAATTGTGTCAGTCTTATATTACCCTCAGCCAAATCGCATGCCCCCACCTACCTTACAACAATGCTGTCATATCTGTTGGGTATATTTTTCCG:1 - chr3L 8067449 3' - copia 4876 2 79.45 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAA:1 - chr3R 19537479 3' + hopper2 1547 1 57.53 TCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATG:1 - chr2L 17747429 3' + Tirant 310 2 80.14 AACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACCATAGCATTCTCTATTGTTTTGAGCACGAAACATTTGTTATGCGTTGCGCCTTTTAGGAGTATACTTTGAACATAGAACGTTTAAAATA:1 - chr3L 13428176 3' + INE-1 553 1 40.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTGTTTATCGACTTTATTTTGATGTACGTTTAGGTTTTACTCAATCTATTGCTTTCGGTGAAAAAGTAT:1 - chr2R 14705750 3' + roo 9020 2 54.79 TTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCC:1 - chr2R 5900836 3' - Bari1 75 1 66.44 ATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAAGG:2 + chr2R 2949164 3' - 17.6 6952 1 69.18 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATT:1 - chr3R 12608044 3' + roo 9036 1 55.20 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGC:1 + chrX 19162687 3' - pogo 58 1 59.59 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTGAA:1 - chr2L 15965197 3' + blood 7338 1 52.05 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGTAAGTTCTTTAAGATGAAATTGAGAGTGATTGTGAAATATATACATAAATGTATAATAATATTA:2 - chr3R 10498760 3' - 297 6603 2 69.86 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAACTGCAGCTGTATCG:1 - chr3R 10467990 3' + opus 466 2 56.69 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGTCACAGTTTTTCACAATTTTGTGTATGTGTGTGTG:1 - chr2L 245873 3' - hobo 54 1 56.85 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGAATTAAGG:1 - chr3R 26315887 3' + roo 9015 2 55.48 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTTTGTAAA:1 - chrX 10873760 3' - mdg3 20 2 70.55 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCG:1 + chr3R 24175757 3' - Burdock 6216 2 74.48 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAAAAGCAAAAT:1 - chr3R 7739649 3' - blood 7045 2 62.33 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAATAACCTAATTTGAGAGTACCGAC:1 - chr3R 6782693 3' - jockey 4723 1 51.37 TGCGCGAAGAAATTTCGCGACACTTACGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTA:1 - chr2L 15153287 3' - G-element 101 1 77.40 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACAAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 58.90 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAGG:1 - chr3L 11665901 3' + pogo 2040 1 62.76 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTCAGTAGCCAAAGAGGTTCTTGCGT:1 + chr3R 16194257 3' - mdg1 25 2 68.97 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAACTACTTTCCTCCTTTGGAGGCGGAGGAAAATGAGTACTTCAATCCGCATTCAGGCCGACACCCGACCATAAACGTACCA:1 - chr2L 2690555 3' - hobo 42 1 55.48 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAA:2 + chr3R 21924363 3' + roo 356 2 54.79 CACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' - 1360 46 1 62.33 TAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGGCTGTTTAACTTGCCCTTTTTAATGATCGATAACTGGGAACTTTTGAACTATTTTTTTTTT:1 - chr3R 23108057 3' - G-element 65 1 58.22 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAG:1 - chr3L 18708595 3' - F-element 68 1 59.59 TACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAATTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACACATTCTTATAAATCCAGCAATACTGTAGACACTATAAA:1 + chr3L 21630400 3' + Burdock 6313 2 71.92 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCTATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCA:1 + chr3R 14088655 3' + 1360 3329 1 62.33 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGGTGTTGCTGGGCGTT:1 - chr3L 13922281 3' + Tirant 343 2 61.54 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAAGT:1 + chr2R 10991424 3' - jockey 34 1 67.81 GACTGCGTTGACAGGAACTATTTCTGTCTCCCTTTATGAATACAAAAGAAACAGAAAAAACGAAAAAAAACAAAAGGACAAAAAAATGGAATGCAAGTTTAGTGCATGCAAACAAACAGGCTTAAACTTAGCTCTAGCTATAAAGT:1 - chr2R 16625998 3' - invader5 112 2 66.44 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAAATGAACTACACTAA:1 - chr3L 4710713 3' - Doc 56 1 50.68 CGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAG:1 - chr3R 19537485 3' + hopper2 1541 1 60.27 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTAGGCA:1 + chr3L 22635806 3' + hopper 1385 1 64.38 GAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCAGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTCTAGTGTCTTTGGTAGCACGCTATACAAACGATATTGAACACTCTCCTACAGAG:1 - chr3R 4913570 3' + 1360 115 1 63.01 ATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATGGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGGTAAACAT:1 + chr3R 19446945 3' + roo 8746 2 56.55 ATAGAATAATATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGATAAATTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTCCTCCAGAGCTATTTGTGGTTTTCAGGCTTTCACGCCAATTTATTTTGCTAAACGGCTTTTGCA:1 - chr2R 9442864 3' + G5 4678 1 60.96 ATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATAAAAGCACAACGTAATTGAACTTTGGAGCTGCAAAAGTGTGCCCAATATTCGATAGCCGCACTGTGTGCGCTATCTAAT:1 - chr3L 16163535 3' - Juan 422 1 65.00 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACTGGGAATGAGAAAAGATGGAATTATAAACTTTTAATACAAATAATCTAATATACTTTTAAAGAGCTTTAAGACTTTAATAAGAATT:1 - chr2R 19263399 3' - Doc 31 1 53.73 CCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATAACATGCAAATTTCAACGATTTTCAATCACAACTCGGCACTCACTGCAGTT:1 + chr3L 19249502 3' + accord 82 2 63.04 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGA:1 + chr3R 7424639 3' - 412 7110 2 57.64 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAAAGCTAAACAAATACTACTCGAAGTTAA:1 + chrX 4566263 3' - Transpac 34 2 58.14 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTG:1 - chr3R 25271179 3' - 412 67 2 61.64 AGCCTGGCAAACGATTGAGTTTTGAAGTAGTTTAACTGATTTTTTATAATCACCATTTGGGAAAATTTGTTAAAGAATTGTCAGAAATGTTTTCTGCATCGCGGAGAACAAAAAAGAAAACATTTTTATATGCTTGCTCGAACACA:1 - chr3R 30328463 3' + S2 404 1 75.34 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCATTCACTGTATTTTGGTAGAGGATCA:1 + chr3R 6053104 3' - Quasimodo 17 2 74.66 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACACATTTCCAATTTATACACACCCCTACCTCCCTTTATCAGCCACCAAAATCGTAGACCCCCTTGATCGAATCGAAAAGCGAAAAAT:1 + chr3R 28008357 3' + hobo 2909 1 58.62 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCATTTACAGAACAAATAATTACACAGCCAA:1 + chr2R 3009547 3' + pogo 2053 1 54.79 GTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAA:1 - chr2R 6984308 3' - HMS-Beagle2 61 2 59.59 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTT:2 + chr2R 24427610 3' - jockey 4747 1 66.44 ACCACAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGC:1 + chr3L 25232861 3' - accord2 45 2 49.60 CTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTATGGACAATTAGTAAACCTTTTCAAGTTGCAGACCTAAA:1 - chr3R 10778666 3' - mdg3 5333 2 71.23 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCATGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTATTAATGAGTGGAATTATGCACTGGCTCACGTG:1 + chr3L 15285964 3' - roo 57 2 76.71 AAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCACACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTTCAAGCATAGTTACTCTTGCCATCCTTCTCCTTTATTCGCATCACGGCCAAGCCCGCCATTTTATCCACCTCCACGAAGACC:1 - chr2L 18709060 3' - Cr1a 4078 1 52.05 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTT:1 - chr3R 6782728 3' - jockey 4758 1 72.60 ACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAAT:1 - chr3L 10076332 3' + X-element 4631 1 75.34 AAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGG:1 - chr3R 19537446 3' + hopper 1410 2 78.86 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTTTTAATTATCCCAAACCCACG:1 + chr2L 11573733 3' + jockey 4950 1 51.03 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCCGGACGCTTTTGTGATTTTATTTTTGCGTTTTCCCGT:1 - chr3R 26399779 3' + roo 356 2 54.11 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTG:1 + chr3R 8402649 3' + mdg1 368 2 52.74 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAGCTCAACGAGACTTTGACTTGGGAAGTAACCACTTAATATTTGAG:1 - chr3R 16771317 3' + roo 9027 1 55.48 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAACTACAATCTGCCTTCGGCAAGCCAAACAAAATGAT:1 - chr3R 8544559 3' - roo 8727 2 61.64 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACATAAATCACGACTAACACTTTAGCAAACATAAGTTTTGCAGTAATAACACTTGTTATCTTAATTA:1 - chr3R 23449233 3' + roo 359 2 52.05 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGATG:1 - chr3L 18708570 3' - F-element 39 1 65.49 ATGTGAATCAAATATTTTTTCTGCCATTGAGCTACCTTATAACGTGATATTGTCGAAGGAGTATATATACATGCCCTAATTTTTTCGATCTTCAAATATTGAGGAAATCCCTACATACATAAATCTATCGCTCCATCAAAATGTTT:2 + chr3R 13913027 3' - transib2 2519 1 50.68 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCT:2 - chrX 17469192 3' + blood 299 2 72.60 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAATATACAAAATAATTTGCTGCACTCGCACG:1 + chr3L 20785587 3' - P-element 23 1 69.86 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTTTTAATTATCCCAAACCCACGCTGAGCAATCCACAA:1 + chr2L 11573748 3' + jockey 4964 1 53.42 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTAATAGACATTCGGAGTC:1 - chr3L 15371251 3' - Transpac 4942 2 70.55 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAGTCGGTTTAGGCATTAAATTAGTTGATGAGCCATTTCGATTTTGTCAGTAG:1 + chr3L 9649210 3' - roo 8699 2 60.27 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGATTAATTGAGGGCCAT:1 - chr3R 25384140 3' - mdg3 20 2 71.92 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAAAAGCAAAATCCGTTT:1 - chr3R 7739643 3' - blood 7039 2 66.44 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCTTGAGTTTCGGAGTTAAGAGGCTTC:1 + chr3R 17751762 3' + 412 431 2 62.59 TGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTCAAAGAAAAAAATTATAATTAAAGAAAATCATAAATTAATACAAAATTAAGAATTAAACTAGTTGATGAGACAGAACAGAGCGCAGAGAATTGGAAGGTGGTTACCAGGATA:1 - chr3R 12363132 3' + jockey 4978 1 69.18 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTAACTGATTTCCCTTT:1 + chr3R 12608194 3' - roo 8696 2 43.84 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTACTTAACTGCCATCAAAGTTCTTTGCAGGACTTTGTCACATTTGTGAAATAATCAATATTCAACACAAATTTT:1 + chr3L 20925868 3' + Transpac 5185 2 55.48 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATAACTTTTCAGACAGATCATAACTACCCACAAAGCAACC:1 - chr2L 13884534 3' - pogo 18 1 71.92 GAGAACATTGTGCTATGGTCACTCTGCTTCTTTAAAAGCTGGGAGCCATCAGAATTGATCTCATTCATTATCTTAATATTTACAAAATAACTTGCATAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAAT:1 + chrX 23280923 3' - BS 387 1 65.75 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAGGAGTT:1 + chrX 9816482 3' - jockey 63 1 53.42 CGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATGTCTTATTACTAATTCTGATAATAATAAAAAATACAAAAACTATTAAATAAAATGGGATTTGCCTAGACAATGCCC:1 + chr2R 20015184 3' - X-element 50 1 43.15 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAG:1 + chr3R 27971114 3' - mdg1 7101 2 61.64 ACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACAAGGAGCAGTGCTCCTTG:1 + chr3L 8253778 3' - jockey 4650 1 72.60 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAA:1 + chr2R 1277150 3' - Tirant 8172 2 63.01 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATACATGTTATTTCTTTATC:1 - chrX 19162528 3' + pogo 2092 1 76.03 CGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATATTAATTTAGAATTTGTGTAAATAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATTCCTTTTATATAT:1 - chr3L 19339304 3' + Tc1 1612 1 60.96 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTGATTTCGGTTATCTTAATGAAAATATGTCAACTCAGTGGCGCTGCAT:1 + chrX 14385239 3' + blood 304 2 68.49 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGC:1 - chr3R 4722408 3' - roo 8753 2 80.82 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCC:1 + chr2R 8686639 3' - hobo 75 1 74.66 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAATAAACCATATTGCTATAGTTAAGCTTACCCTTTTATTACAACAATCAAAATTATGTTTAGTATATGCAAGAAAACAAACGAAAATGTATTCTTATTTGGCCGGAAAATACACT:1 - chr2R 20462725 3' + copia 248 1 77.40 GCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCGTCGTGAAGTCGGG:1 + chr3L 23678165 3' - Osvaldo 32 1 68.00 AAGGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCT:1 - chrX 22858871 3' - mdg3 82 2 70.55 CTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAATGTTTCTCTAGAAATTCTGCCAGTCATTTATGTTTCTAGGGGAGTTACTGCTACAGATGAGGTCAAGCTAAGA:1 - chr3R 29318797 3' + mdg3 5043 1 50.00 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGTTTTTGTATCTTAGCTGCCTATTGGCAGACGAATATCCAAACAAAGTTCAATGATG:1 + chr2R 6187997 3' - Tirant 16 2 76.03 TAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCATCTAA:1 + chrX 4566236 3' - Transpac 78 2 73.97 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAATCAAATCAAATTGATTAC:1 + chr2L 12142666 3' + hobo 2925 1 63.06 CTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCACGT:1 - chrX 21474390 3' - 1731 4367 2 80.14 CATTGAAATATTGCAGAGATACCAGTCTATGATGCTTAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATCCACAAAGACATGGATTTCTTGATTGAGAATTTGTATTGACTGCGATTGAGACACTGTACACTTT:1 + chr3L 6914768 3' + G3 4240 1 65.75 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACG:1 - chr3R 20292406 3' + pogo 2057 1 56.94 TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAAT:1 + chr2R 14562269 3' + Burdock 220 2 45.21 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTC:1 - chr3R 3527084 3' - Tabor 74 2 65.75 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCATTGCGGTGGGTATG:1 + chrX 15089605 3' - P-element 46 1 54.11 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGTCTGGGCCGAGACAGCAGATAGGCCAACAGCCGAGAAGCTGT:1 + chr3R 23623997 3' - roo 8684 2 73.97 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGAGGCGGGCTGCTGTTCTCTGGGTTTTATAGTTTTTGGGGTATAGGTCCTACGCTTT:1 - chr3R 24693590 3' + hobo 2882 1 69.30 GACGGACATGTTCTTAACAGAGGTCCAGTTAATATCGAAGATTAAGTGCACGAAGCCAAAGAAAGAATAACCACATACATGCAATGCCATTCGTTGGCTTAAATTTAAAATCAAGCACTTTCGGGCGAAAGGCGTAAATGGTTCAC:1 + chr3R 17304709 3' + Porto1 19 1 65.75 ACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCG:1 - chr3L 16180875 3' + Transpac 251 2 59.72 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGG:1 - chr3R 7424545 3' + 412 425 2 64.58 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATGTATCTGCCATTCGACAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCA:1 - chr2L 1449591 3' - opus 7180 4 63.01 TTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATCAGCTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAGAGCATGAGCTCCCGCGTAACTGTG:1 + chrX 2607749 3' - roo 8778 2 66.44 GAGGGACTCCAGTTCTTCGTATTGTCGCTTTGGAGTAGCCCCTATTGAACAGGACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAAATAACTGAATGGCGCGCATTTGAAAAAGACAGTGTGTGCCAACAATGTAATTTTGACGCTTGATCT:1 - chrX 22818327 3' - mariner2 317 1 69.18 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGTGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTT:1 + chr3R 10140255 3' - P-element 68 1 34.59 AGAAATTGAATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCAC:1 + chr2R 10367565 3' + 412 7484 2 59.71 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACTGTGTGCATTGCTCTTTCATGTCTTTTATCTTTTAACATTTTTTTTTTGTAGTGCTGTAGGAGTTC:1 + chrX 9816483 3' - jockey 62 1 52.74 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTT:1 + chr3R 4722498 3' + roo 9029 1 55.86 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTTATTCAAGTT:1 + chr3R 20292550 3' - pogo 36 1 60.96 TGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGGGTTATTTTATTTTACCTTCAACGTAGATAGCAAGTTGAACAAGCTTAAGTTACTATT:1 - chr2R 14884258 3' + mdg3 184 2 58.90 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTT:1 - chr2R 6585407 3' - pogo 44 1 52.55 TTCTGCCTACTCTAAAATTAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCC:1 - chr2R 21897902 3' + 412 406 2 73.97 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGTTTCTAATATGTGGTTTTTAACAGAAGGCAGGTAGTCGAAATCTGGGATTTTTCGAGTGCTTCTGGCCACCAGATGGA:1 + chr3R 15649884 3' - blood 44 2 55.48 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGGAGGAAGTGGATGGCCGCA:1 + chr2L 17747554 3' - Tirant 12 2 76.03 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCT:1 - chr3L 19397022 3' - F-element 70 1 58.22 GAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTCTGCTCTGGGGCAACCCTCTGACGGCG:1 - chrX 17258345 3' + 297 6874 2 74.29 ATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCTCACAAATTTCC:1 - chr3R 17316067 3' - 3S18 83 2 73.94 TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGC:1 + chr2L 19878231 3' - mdg3 89 2 76.71 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGG:1 - chr3L 19397019 3' - F-element 65 1 55.56 TCCGACATCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCATTAGCTGCCCTGATGCGACCAGTGGGCATATCCTTTGTCTACCTTTTGATGTTCTTTGTATCGCCCTTTGTTCCGCTGGCCA:1 + chr2L 8173332 3' + G5A 2675 1 54.79 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTCACATCCAATTGCTCCTCCT:1 + chr3L 9430675 3' - P-element 50 1 51.37 ATTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGA:1 - chr3L 12863707 3' - Transpac 5009 2 80.69 AAATTAAACAAAAAAATAAAAATTTTTGGAATGTGTGGGGGTGACAGTGTGGTTAGTTACAACTAATTGCCTAATACTTGAATTTCAAACTGCATGTAAATAAATAATTTTTCAACATTGAATTAATGATTCACTTAATACCTGCG:1 - chr3R 20731050 3' + Doc 4699 2 59.59 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAAC:1 - chr3R 23507578 3' + 412 7482 2 60.27 TGCCAAAGTGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTTGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTACTGGACTGTATTTATTTGATATACGTTCATTTATTTTGTCTTTGGGTTTGATGGTCCATGTTACACTCGCAAAAATAAATACCAAA:1 - chr3R 13405124 3' - roo 8640 1 67.12 GAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGATTTCAATGTCTTAAAATCGAACCGAATCGTATAATTCAAAGGAA:1 - chrX 1117068 3' - accord 7059 2 69.86 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGCAATACACAAACTGCATTTCCCACTCTCTCGCACTTTTTCTCTCTCGCTATCTCTTGCTTGCTCTAAAGCAGGCCCTCCCTTTCCAGCGAGGAACTAAGAATCTCA:1 + chr3R 10079437 3' - P-element 14 1 73.10 AGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCAAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAAAGATATATCAAGCTTACTGCATAAAAATCTTGAAGACCAATT:1 - chr2L 17155829 3' + Idefix 113 2 71.23 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAGATTTCGCATCGCCAAAGTGACGAGCCATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAAT:1 + chr3R 12795127 3' - mdg1 56 2 53.42 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCT:1 - chr2L 1073937 3' - Tirant 88 2 74.31 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATCAACGAAAATCCAG:1 - chr2R 20704141 3' + hobo 2871 1 63.70 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTG:1 + chr2R 18051062 3' + mdg1 7416 2 57.85 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGCATCGCGAGTCGAGAATCTGTATCTCGTATATCTGAGATAAAAA:1 - chr3L 14546294 3' + copia 227 1 65.75 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAG:1 + chr2L 13547021 3' - P-element 103 1 15.07 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCATCTCAGAT:1 + chr3R 22289504 3' - 412 7084 2 64.38 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTC:1 - chr2L 12261184 3' - jockey 97 1 76.71 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCGTCGCTCGGCGCTTGGCCATATAAAGTCATCGCGTCTGGGGCG:1 + chr2R 13574887 3' + diver 199 2 65.75 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGGCTG:1 - chr2R 21380578 3' - roo 30 2 62.41 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGATTTAT:1 - chr3R 27835589 3' + 412 7484 2 60.56 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGCCGCAACATGGTAATTAAAATAGAAAATTAGGCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTATT:1 + chr2R 7223770 3' + blood 367 2 61.82 AGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTTCACAATGGCAGGACACTGGAGTACGGGACTCTGGGACATGGCATTGTTTTCGCATTCAATTCCCTGACAATAAGCATTATTGGGA:1 + chr3L 15314786 3' - X-element 4308 1 58.90 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTAATAGACATTCGGAGT:1 - chr3L 15371252 3' - Transpac 4941 2 70.83 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAAACATAACAAACTTGGGTTGCCGTTCGCCGTCGTGGTGAATTTTCCGCTGCACAGTGGGGCAAACCGCATTTTTAATTTTAAAATG:1 + chr2L 10474433 3' + P-element 2853 1 63.70 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCGTCCTAATGACAGCCCATAACTGC:1 + chr3L 15035273 3' - pogo 7 1 78.08 GCTCATACACTCATACACACATACAAGAGCACGTATATGTATTTGATATGTACATCATACACGTATGTACACGCATGCACACATATGTAGGTATATGAATGGCTGGCACACTCAAACTTTTGCGAATATTTTCCTGCGAGTTGGCC:1 - chr3R 28080613 3' + mdg3 5333 2 75.34 GCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACATGCTCGCTTGTTGTCAACATATTGATAATGCCCCGCCCCTTCATACCCGACCCGCCTCC:1 - chrX 18531180 3' - invader4 2749 1 55.97 ATCAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGA:1 + chr3R 4884459 3' - pogo 83 1 71.92 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGGCGTGGGGTTAAGTTTTGTTTAAGAGACC:2 + chr3L 5438870 3' - hopper 22 1 69.18 GAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGTTCGTTTGACTGTCAATAAATAACTATACACTTTCAAAATT:1 - chr2R 19633179 3' - jockey 4612 1 58.90 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGTATG:1 - chr3L 24153134 3' + Tabor 462 2 69.18 TAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAACACTCTCAATTGACTGTGAACCGATTGAAATCTCTTTAATCTCA:1 - chr2L 11158647 3' + Rt1b 5060 1 69.86 TCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAATCGCGGTGGAGCTCGCGGATTACATCCTCCAGATACTGATGCGGGTACTTAAGGGTGA:1 + chr3R 17772485 3' + F-element 488 1 53.60 GCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGT:1 - chr2R 17014024 3' - HMS-Beagle 64 2 63.70 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAATAAGTTATAAAAATGTTTTGATTTAATAATTAATTAAGCAAACCTGATATTGCACTGATCTC:1 - chrX 10101316 3' - mdg3 59 2 54.79 AAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATAGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCTGGCAAGTTGATGATAGC:1 + chr3L 15099684 3' - G4 3812 1 57.53 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATA:1 - chr2R 16908472 3' + roo 9021 2 52.05 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTTGAAAGGGTTAGGAAATGGGAACATGGGATGGAGATGGAAGG:1 - chr3R 24479186 3' + 412 418 2 70.55 TATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGTACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCAT:1 + chr2R 2949150 3' - 17.6 39 2 58.22 CAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTGTTTTTTAGTTTTAAGTAAATACAAAAAGAATGAAGAAGTTATACAATGATCATGTGTTTTACTTTGTTGCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTAT:1 - chr2R 6271511 3' - rover 6872 1 56.16 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAATATGAGTGTGGCTACTTAAGTTAGTGTGTGCATGAGTGTGTGTTTGTGCAAGTGTGGTTTGTTTGCTTGGTCCTGTCCAAACACACACACACACACACACACAGAG:1 + chrX 7978952 3' - jockey 19 1 74.48 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTCCCGCTATCTATGTAAAGCAACGGCTTCGAAG:1 - chr3L 12863623 3' - Transpac 4925 2 76.55 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACCGATTATATTGAGGGGGAGTTTCAGTCAAC:1 + chr2L 8542787 3' + P-element 2796 1 21.23 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCC:1 - chr3R 10973205 3' - jockey 72 1 60.42 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATG:1 - chr3L 18708622 3' - F-element 94 1 77.24 GTCAGCTTCAGCTAAGAAGGCAGGCTTGAGGAGATCGACTGATATGGCCTTCTCTTGTCCATGAATGCTGATGATGTAAACAAGACCAGGCAACAAGTTTCAATAACCCCGAACGCAGAAATAAACAAATAAATTATGCGTCGACA:1 + chr3L 16803637 3' - Chimpo 4105 1 53.42 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGT:1 + chr2R 21897949 3' - 412 88 2 78.08 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCT:1 + chr3L 14969260 3' - P-element 59 1 17.65 ATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGACCACTGTCAGAACCACCACTACCACCTTTACTACAAGTGCACCACCCGTGGAGACCAAGAAGT:1 - chr3R 24898252 3' - invader4 2 2 56.85 GAGCGAAGTGAGGACACAAGGTGCAAAAACCATTATTATGAGATAAAAGTCATTCTTCAACTTCATGCTCCAAGCGAGCCACAGTCACGTACATTTTATAAACTTCATTCGCTTCGCCCCGTCTCGTATTCGCTCGGCAGGGAGCC:1 + chrX 5818467 3' - transib4 2331 1 59.59 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGGTATGGTGTTGAGTTG:1 + chr2R 10367606 3' + 412 487 2 75.81 AACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGATTAGACTACAAAACAGCTACCAACTTAAATTA:1 + chr3L 14854774 3' + rover 7246 2 64.18 TCGACTCGGTTATTGATCCTTATCAAGAATATATAGAATATATATAAATATATTCAAGAATATATATATATATACGGTCGGGAACGTTTTCATATATGTATCTATTGTATTAGCATAACACTCTTGATTAAACTTTAATTATAATA:1 + chr3R 4183676 3' - INE-1 94 1 63.70 TATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGTTTCTGTCAGGCCAGCCCGCAGAAAACCTTCTTTGGAGTGGGACAAGTGTTGGCCCCTATAAGCCCTTTTTTTCGAAGTAGCACCCTAATATTTCTGCACTCCACCTTGGAA:1 - chrX 14447648 3' + HMS-Beagle 473 1 50.68 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATTTATTAGAAGCAATACTTGCAATCGGTTTCAACCTATCTTATCGATATTGATTGCCTTGGATTCTCAGACCTTTGGGTTAAGTTTCGCA:1 - chr2L 7991239 3' - 297 6601 2 71.43 AAATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACAGAGAAGTAAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATTAGATTCACGATCATGGCCATCCACATCGTTGTGTAAAATCCTTTCCAGTTCGTAGAATTCCCGAAGTAACTACTT:1 + chr2L 11186173 3' - Cr1a 4116 1 52.05 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGGGTTTGTATGCAACACACCTGTCTGCTTGACG:1 - chr3R 23623866 3' + roo 9001 2 63.01 GTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGA:1 + chr2R 9033930 3' - F-element 4552 1 61.97 GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAAC:1 - chr3R 24228877 3' - opus 69 4 67.12 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTGTTGGTGGGCCGCAATTATTT:1 - chr3R 8542545 3' + roo 9045 1 62.33 ATATCTATTACACTGAGCTATTAGTTATTACTTATTACAATTGGGTTACACTGGGCCATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGTATCCGTATTTTAACCTCATTTGACTTCGACAGCCAAACAAATTTTACGG:1 - chr3R 16535239 3' + Stalker2 386 2 67.81 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGC:1 + chr2L 16685405 3' + P-element 2861 1 59.13 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCAGAGATGACAAACGACGAGATGACAAACGGAAAGTAGAAAATTGCTAGCCGCTGAAAGCTAAAAAGTGCAAACTTAAAAGCAGCAAACAGA:1 - chr3L 513731 3' + mdg1 390 2 60.27 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGATTCGAAAACCTCCACTTTATATCTGTTGTACATTA:1 + chr3R 23426509 3' - pogo 27 1 65.52 CACTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAGAAAACTTTTATCTATGGAGATAAAAAAAAAACATGCATCCCGGGTTAAGATAATTTCGGGAGGATGTAAAATGAAATTAGAGGTTAAAGGGCGGCTTGGA:1 - chr2R 22396996 3' + 17.6 332 2 69.18 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATC:1 - chr3R 26765071 3' - mdg3 46 2 52.05 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGAT:1 + chr2R 2949140 3' - 17.6 49 1 52.74 TAAAAATGTTGTAAAATTATTGTTATTCTATCTTGTTACTTAAGAATCAAAAAATGAAAGAAGCATTAAAATATCACTCACAAAAAAATTACATTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCAAGTACTTGCCGGGCACATAGAGCG:1 + chr3R 22315549 3' - transib4 108 1 71.23 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAATCTATCGCACA:1 - chr2L 12355259 3' + hobo 2901 1 56.12 ACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGCGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGA:1 - chr3R 10468028 3' + opus 409 2 76.03 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCG:1 - chrX 17614382 3' + roo 9005 2 63.70 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAAATGGAATTTTGGTACAAACACAGCGAGTTTCTCTGTGCAAATTGTGCGAGTTGTTG:1 + chrX 10979158 3' + roo 404 1 77.40 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCCACTCAATAAATACAAGGATATTGACTTTGTCCGTACGAGCTTCATA:1 - chr2R 20499988 3' + 412 483 2 76.71 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCAATTCTAATTT:1 + chr2L 9287120 3' + jockey 4954 1 48.63 TGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACAACCACTGGGCCGC:1 - chr2R 10478663 3' + invader4 3039 2 50.70 ATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGTAAGCTCATTCATTACAAGCCAACA:1 + chr2L 3734581 3' - mdg3 5287 2 48.63 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTAAGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAATTTTCCTAGCTCAATGAAGTGTGCATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGTTTCGCG:1 - chr3L 21097117 3' - mdg3 62 2 57.24 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTCTTTTAC:1 - chr2R 21078379 3' - jockey 31 1 65.75 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATA:2 - chr3R 13358608 3' + mdg3 5418 2 70.55 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTGGTTGCATTACGCAGCACCAAAAATTAAGTTTTCAGCTGATTGAACAAGTTTAACAGATTTT:1 + chrX 3529837 3' + 412 435 2 55.48 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTT:1 + chr3L 8253725 3' - jockey 4703 1 63.70 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTTTTTGATTTACTATTAACTA:1 - chrX 16853331 3' - roo 67 2 64.38 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCA:1 - chr3R 19700889 3' + roo 8993 2 78.08 AGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAATTCGGCAGTCGCTCGGCTT:1 + chr2L 20561521 3' - P-element 22 1 68.57 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCACATGTTGGATTTAAGTG:1 + chr3R 21237816 3' - Doc 65 1 57.53 AAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGGAAGGGCGCTACTTTTCTTTTTCACATCTAGTTAACCAATTACTTATTGTTATTTTTTAAAAAAACACACTCGATCCGGCATTGCTGCGACCTGGTCGATTGGATCGTAAG:1 + chrX 11126398 3' + Porto1 4561 1 68.49 CTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATAATAATAATTACGAATTCATTTTTTTTAAATATGTAAATATGTATGTACATATGAGCA:1 + chr3R 21589081 3' - flea 4818 1 64.38 ATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCTGATGTTCAGGAAACATGGCCAGCAAAACGAGGGCATAATACACTGTGTGG:1 + chr3R 12235695 3' + BS 4808 1 65.07 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAAGAGGT:1 - chrX 21668674 3' + mdg1 7441 2 60.69 TTTTTTATTTTATTTTTAATTTATTATCATAAATCTCTCTATGAACTCTGCACTCAAAGTACTCTGTTTAACATTTTAAATTGGGATCTAATTATGTAGTAGAATCTTCTTATATTCGATTTTAAAATTACTTTATTTATCGTTAC:1 + chr2L 17292463 3' - Doc 4699 1 69.86 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGGGAGGAAGCGGGAAGGCGAG:1 - chr3L 4869109 3' + roo 391 2 71.92 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATC:1 + chr3R 22289461 3' - 412 74 2 68.49 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGCTAATTACTAA:1 + chr3R 23099172 3' - roo 72 2 69.18 GTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAA:1 - chr2R 10478691 3' + invader4 3007 2 71.23 ACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTAGTTATGATTTAATCAAAACGCGCACAGCCATTTTAATTACCTTTATGTTGCACAAACTTATG:1 + chr2R 10478782 3' - invader4 2814 2 51.37 AAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATAATCAGGCTTTTTGCCCTCCCTTCCCGTCGT:1 + chr2L 10592346 3' + rover 273 2 76.56 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTTGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTAT:1 - chr2L 23069853 3' + HMS-Beagle 213 2 63.01 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTAAATGTTTAT:2 - chr2L 10937846 3' + mdg1 351 2 65.07 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGGATGCAAAGCAAAATTATGA:1 + chr3R 9163936 3' - hobo 44 1 63.25 GCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCACAGAGGCAGATCGCAATGTAGGAGCATGCCAACTCAATGTATAATTCCGCTTTATTCCGCTTCAGAAATATTCCAACTTAC:1 + chr3L 8989427 3' + invader2 78 2 51.85 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCAATACCTGAACCTGTG:1 - chrX 4589416 3' - Burdock 6196 2 63.70 GCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGACGTTTTG:1 + chr3R 20368064 3' - Max-element 8307 2 68.84 GGAGCAAAAGGGCGAGGCCCACCGAGCCTATTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGAGTAGTTGTACCTGTGCTAAGCATGTTGCTGTTGCTCTGTGTGTGTAGGAAAACAAA:1 + chr2L 17656429 3' + R1A1-element 4904 1 58.22 CTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCAACACCTTTCAGCGTTGTTTTAGCTGCTTTTTTGGTTCCCGTCCAAAAGTTTAAACCTACCTGTTATTTTTGATTCTGCCTGGTTC:1 - chr3R 8874835 3' - F-element 4420 1 63.01 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTG:1 - chr3L 21097135 3' - mdg3 5333 2 71.23 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTT:1 + chr3R 19545422 3' + jockey 4944 1 51.05 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTCTC:1 + chrX 983244 3' - 412 39 2 60.27 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGGCAAACACC:1 + chr3R 7424668 3' - 412 30 2 63.70 GTGAATTAACGGCACAATATGTGGACCTTTTACCCGGGCGGGCCGTGCGCAAAAAGGGAAATAACGGGTAAGTAATTAGTATATCTTACAAAGTGCGGAGAAGATATGACTCGATCCAAAAGGCGAAACACTTCCCAGAAGCTCTG:1 + chr2R 21694245 3' + gypsy8 4915 2 53.42 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAGTGTGCTCCTCTTCA:2 - chr3L 13721980 3' + blood 354 2 69.18 ATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGATTCCCCTTTCCCACCGCACTCCATCCCCATCC:1 - chr3R 31698109 3' + F-element 112 1 72.41 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCTAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAAC:1 + chr3L 14969277 3' - P-element 36 1 34.38 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGC:1 + chr3R 5087092 3' + P-element 2811 1 33.56 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCTAAATACTAAAGGTTTTAGCCATTAGCATAACAACTTGTATGCCAAATAGGCATTTAGATTGTTATACTT:1 + chr2R 6945737 3' - pogo 48 1 52.74 CTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAA:1 + chr3R 934267 3' + Rt1b 4723 1 44.52 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACC:1 - chr2R 10367482 3' - 412 7124 2 65.07 AACCAAAGACACTAGAATACTTATTCTTTGGTCTAAGTGTAAGTCTTCATTTTTAAAAGTGCGGCCAACGAGTATAAAAATGATGCCCACCTCATGATGAAAAAAAACCGAAGCTAAATTTTTAATGCAGATTGCTTTAAAAGTGA:1 + chr3R 4352105 3' - Tc3 313 2 68.49 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGACAACCACGTATCTTAGCCAGTTAAAACGAAGGCGGAAGTGC:1 - chr3R 14773802 3' + flea 4933 1 71.23 GCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTGTTAAACCAAGGCAAAAGGGTAAATGCA:1 + chr3L 12030610 3' - I-element 5208 1 49.32 TATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCATTCACT:1 + chr3R 6053085 3' - Quasimodo 36 2 61.64 ATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGGTGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGTAATGTAGAATCAAAGGCACTAGTGTTTTTGGTAGAATGGTGGCTGGTATCTGTCCGGTTGTAT:1 - chr2R 552525 3' + Dm88 325 1 56.16 AGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACT:1 - chr3L 1387097 3' - mdg3 5284 2 62.33 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTATTTCTTTAAACCTCGTCTCAGTTAGCAAATTTACTCATCTATTTATTATTTGATTTATTTGTGGGCACACAAAAAAAAGGTTGGTCCATGCAAATTA:1 + chr2R 16713120 3' - pogo 19 1 34.25 TACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGAG:1 - chr2L 20638345 3' - Doc 61 1 55.48 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGC:1 + chr2L 16685370 3' + P-element 2795 1 22.60 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACTTTTCCGCCAAGTCGCCTTCCGTCATATCCCATTTAAGATGCCCGATACACGGAAAAAAACTAATGAACGCT:1 + chr2L 19930186 3' - jockey 57 1 52.05 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCACAAAGCGGGCA:1 - chr3R 6068291 3' - jockey 4748 1 73.97 GCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACCAATCGAGTCGTCCATCCTTTTTTCTGACCGAACAGCCATGAATTGATATTGGCCACATCGTTTATGCGGCATTTGCGTAATGAGGCAATT:1 - chr2R 19151566 3' - F-element 4448 1 66.44 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAG:1 - chr3L 9571615 3' - jockey 34 1 65.07 ATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGATGCTTGGTCGCTGACGTGTGAAGACGTTCATCGAGCTCCGTATCAAATCGGTTGTTTTTCGTGAAGTGAATATAACTATTGACAACTATTTTTTATCCACCCTATCCACATCTAAATCATT:1 - chr3R 21680785 3' - Doc3-element 397 1 65.75 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTA:1 - chr3L 6096497 3' + roo 9007 2 59.59 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTGCAGTGGAGTTCAAAAGAGTAACAGA:1 + chr2R 544920 3' + HMS-Beagle 7016 2 67.81 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGGAAAAGTTATAGACGG:1 + chr2R 17100137 3' - P-element 61 1 34.38 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATTTTACTGTCAGCGAAGACAAATGGGATTT:1 - chr3L 5514145 3' - Doc 33 1 65.07 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTTATC:1 - chrX 18366002 3' - jockey 56 1 53.42 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCTCTGCGCTGCCAACGAAGCCGGAAAAATG:1 - chr2R 5848936 3' + mdg1 7422 2 59.59 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCCCTC:1 - chr3L 3540082 3' + mdg3 222 2 69.18 AATTAAAATTAAATTAATATTAATGCAATTAAATTTAATTGCAATATTGAAACAAGATATTAAAGCAAGCAAACTAAACTAACAAAACAGTAGTTCCCAGTAGGAAATGAAACACCTGCTTTTATCCCTTGTAGGCAAATAGTTCT:1 - chr3L 9546658 3' - Rt1b 123 1 76.03 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAAT:1 + chrX 15167778 3' + roo 9031 1 57.53 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTTGAATATTGAAAGCAGAC:1 + chr3R 15590674 3' - roo 49 2 52.74 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTTTTCCACTTCCCTTTCATTCCTCCGCCGGCGAGTCCGGGACTCCTTCACTGCTCCGGCTCTGGGGCCAAATGAAAAATTGCACACG:1 - chr2R 22675769 3' + roo 9039 1 62.33 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATC:1 + chr2R 18722034 3' - 412 55 2 55.48 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAATACTGGGGGATTGCCCTTTATTAAATAAACTGCA:1 + chr3L 16764867 3' + I-element 5268 1 75.34 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAA:1 + chr3L 21093251 3' - Ivk 23 1 64.80 TATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAACTGATAATATATATACATAGATAGAAAGTACCTTCTGTTTATTTGGAACTTTCCCTGATTTGCCTACTTACCCCATCCAGTCGCACACTATAATATCCACCTTTTTG:1 + chr2L 4278810 3' - Bica 87 1 74.66 GAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGGAG:1 + chrX 11815090 3' + flea 4954 1 54.79 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCAC:1 - chrX 17258200 3' + 297 6920 2 56.85 TAATTAAAACCTCTTTTTTCTTCCCCAATTCATGAATCGCATTAATCGAATCGATTTAAATACCTATTAACAAACTACAGCGAAGCCCACAACAAGTATCTTTTTGCTTTGAGGAGCGCCGCTTAATT:1 + chr2L 7122962 3' - Stalker2 7183 1 53.91 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCAAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGGTAAAAGTATAGATGTGCAACTAAAACCCTTTTTTTT:1 + chr2L 17336724 3' + 1360 3326 1 74.17 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAACTCGCTGTTACTCGCTGTACCTCGCTTTTCCGCCACCCAACCGCGCTACCTTGCCACCCATTTTCCGCT:1 + chr3L 3536110 3' - 412 7141 2 52.74 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAG:1 - chr2R 10367467 3' - 412 29 2 56.30 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTGTTGGTGCTCAACGGAATTATATAGACCGCATTCAGTCGGTTACGACCAGTTAGCCACAAAGCTTAGTGCGCCGCTTCGATTGCACTTTGG:1 - chr2R 6187813 3' + Tirant 8480 2 67.81 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAAC:1 + chr2R 8686637 3' - hobo 77 1 76.03 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCTTATATTGGTTTATTACATGATGTTACTGCATTTAAATTTGCATACAAATTATTGTAGCATT:1 - chrX 14908392 3' + blood 298 2 69.86 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAG:1 + chr2L 2338136 3' - blood 7099 2 80.00 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTA:1 + chr2L 15965287 3' - blood 7093 2 71.92 GGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGGTCCGGGGTCATGGGGG:1 + chr3L 17447589 3' - Tirant 16 2 74.64 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGG:1 - chr3L 16157191 3' - Juan 58 1 58.90 TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCG:1 - chr3R 25876891 3' - mdg3 89 2 77.78 AAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGAGGCATTCGCATGATGCCCGCAGCACGGAGTTTAGCCGGCGCCTTAATTGGTAGAGCTGTTTGTTAGAAGTGAAAATGCAGTGCGTATCTTATGATGTATCTGTTATGTC:1 + chr2R 7016911 3' + Tc3 1701 1 59.31 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGAT:1 + chr3R 9938684 3' + roo 338 2 66.90 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGTGCAGCAGGAAAACCAGAATACTACCAA:1 + chr3L 14969339 3' - P-element 24 1 66.44 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAG:1 + chr3R 22429260 3' - roo 8679 2 71.20 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTTATTGTTCGAAATTCTCTATTCGAAATTAGTTACAAATCCGATCGCTCAGCTAATAAATCCGCACAAGAGGCTTTACAGCAACGTGATAGAGGTTGCAGCG:1 + chr3R 24479315 3' - 412 7072 2 73.29 TATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTTAAAAAAATACTGAAAAAAGGAAGCACAAGCTAATACTGGGAATTATTTATTTAAA:1 + chr3L 16092173 3' + TAHRE 10357 1 67.81 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCACATGCGACGACGGCCAGTTGCGAAAAGTATGGCATTTGTGGCCAGATAT:1 + chr3R 24175800 3' - Burdock 38 2 59.59 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCA:2 + chr3R 23507668 3' - 412 7122 2 64.38 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCC:1 - chr3R 14049311 3' - transib2 41 1 57.53 ATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCACTGTACGAGTTCGTTTCGATTGATAATTATTGAGCGGTTGCCATGAAAATGCAG:1 - chr2R 21056683 3' - Tirant 8174 2 62.33 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAATTGGAAAAATG:1 + chrX 3452555 3' - Tirant 8135 2 67.59 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGC:1 + chr2R 16383364 3' + roo 9002 2 67.81 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTT:1 + chr3L 6774244 3' - pogo 62 1 60.27 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACACTTTTCGAGACTTTCAATTATGATTTCCACAAAGAGAGAGTGAG:1 + chr3R 21154311 3' - jockey 4750 1 67.12 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAACAGCGGAAGGG:1 - chr3L 4869127 3' + roo 9036 1 60.96 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACACAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGAAATGGTGTT:1 - chr2R 9332115 3' + roo 355 2 54.79 GCGCGAAGAAATTTCGCGACACTTACGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTAC:1 - chr2L 15153286 3' - G-element 100 1 76.71 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTGAAATGAAATCAGCACATCACCTAGCTGTCAGCCAGTCAGTCTTGGTTTAAGCCCCTGCTTTTCCTTAAGCCAACAGTTCAGCCCCAGGTGCCGCACAAAT:1 + chr2L 10937977 3' - mdg1 7059 2 64.38 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATG:2 + chrX 19231817 3' - mdg3 5336 2 74.66 TCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCGGATAGTCGGGGAACTCGCATTCTCTCTTGTTATTTTTCTAACAATACTTAAAAAACTTAAGGTTACTGTATTTCTCTGGAATCTTAACGATTTTATGCTGTTGCTCGCCTCCAGTCCTTC:1 - chr2R 20763193 3' + INE-1 538 1 80.14 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTGCGATTT:1 - chr2R 7534558 3' + roo 9040 1 64.38 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAA:1 + chr3R 22846818 3' + 412 446 2 52.74 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAACACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTACGCATGTATCTGGAGCCAGTAACGCTGTGCTGGTGTGTAG:1 + chr3R 11771777 3' - S-element 77 1 71.92 CCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAAAAAAATGAAATGCAAAATATATCAACACATAAGTATCGGCAACATGAATGGGGTATTAATTATATTTTGGCCATTATTGCACGATTAAGCCTAGTTTACATCGAAAGATTCAACAACAAAAA:1 + chr3R 27521145 3' - Juan 4079 1 78.08 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAAAAAAATTAAAATTCCACTTACGAAACAAAATTTCCCTCTAGTTGTATT:1 + chr3R 15030800 3' - jockey 36 1 64.38 ATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGC:1 - chr2L 20360648 3' - micropia 5022 4 55.48 GTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTCTGTCAATGTCCTTTACACGGAGAAAAGTTAAGAACACGATTTACAACTTATTTCAAAT:1 - chr2L 18809173 3' - Doc 210 1 59.31 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAAATTCGTATTGAAAG:1 - chr2L 17730389 3' + pogo 2080 1 68.57 TTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTATCCCTTGACTCCGTACTTAGGTATGAATAAGCTAATATTTATCAAAAATATGACAACAAACGTGCTGGCAAATGCAAATAACGAATTTTAGCACG:1 + chr2L 14470766 3' + hopper 1227 1 65.52 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACT:1 - chr2R 6945625 3' + pogo 2035 1 68.49 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAACAAATCAAAATTCAAAATTTAAAACACTCTTCCAAGTGGAGCAGAATCCTTTTGAGAAG:2 - chr2R 24630126 3' - copia 62 2 63.01 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAAT:1 + chr3R 14088667 3' + 1360 3341 1 52.74 TCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCAC:1 + chr3L 20785543 3' - P-element 67 1 39.73 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGGCCGTGCTCTG:1 - chr2R 5848961 3' + mdg1 7397 2 60.27 CTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTGGCAATGACTCACAATAGGTCACAGTTATAAT:1 + chr3R 8109621 3' - jockey 4929 1 76.71 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATATATTTGTATCTACACTTTAAAAATGGAACTGGTTCAACTTGAATTCA:2 - chr2R 15079963 3' - roo 14 2 74.66 AGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACACATGCTGAATAAAAAACATTTTAATAGCTTGAAATTGCATAGAACCAGAAGTCTGAGACTTAAGCACCGCTAGCACTTG:1 + chr3L 3397041 3' + gypsy10 300 2 56.16 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAACGAAACAGTAATACAGGAGGGAATATATATTAATGAGGCCTTTTACAGAACAAATAATTACACAGCCAAAGTATAAAT:1 + chr2R 3009556 3' + pogo 2063 1 57.93 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGAT:1 + chr2R 9164916 3' - 412 7135 2 71.92 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTATTCGTAGTCTTGGGCTGATAT:1 - chr2R 15080009 3' - roo 60 2 60.27 CGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATATCTGCTTTCGTTGAGCCTAACTGCGCGAACTTATAAATATCTATTTAAAA:1 + chr2R 20704270 3' - hobo 22 1 63.70 CACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGACAAGAGATTAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTT:1 + chr2R 17350607 3' + Chimpo 4006 1 50.00 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGAC:1 - chr3R 26315893 3' + roo 345 2 59.59 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTAAAAGCGAGAATGTGCTCTAGTA:1 - chr3L 4710678 3' - Doc 20 1 74.31 AACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAAATTGGCATGTAGATATTATTTCCGCGAATTGACTTGATAAA:1 + chr3R 4131273 3' + baggins 5074 1 76.03 ATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGCTTTTGTCTCGTGGCGCGCCAAAACTTTTCTAATTAAGTGGCAACGCCGG:1 + chr2R 17182788 3' - jockey 4598 1 55.65 GCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAATGTTTTATGAAATAATGTTTTCTATTGAACTATGATG:1 - chr3R 17776935 3' + jockey 4706 1 74.66 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTATGAATAGTAGCAACAATATCCAATTGGAAACCGGAAAACCCTTAAAATTTC:1 - chr3R 13056738 3' - jockey 4828 1 67.12 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTTATA:2 - chr4 311192 3' + 1360 3329 1 60.27 AGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATGACAATAAATAACACAATATGTGTAGACTGTTCGAAGGACAAACAGGTTAAATGC:1 - chr2R 14554187 3' + mdg3 5256 1 62.33 GAGAGAGGGGGTATGTTAACTTGGGCTATAATGACACCATCTATACAAATTATCACATTAAACTCCCGCGTAAACTTAGAAAGATATGGCAATATAGGACAGAAAGACATTGCGATGTGGCAAGCCAATCGGCACCGATATGGC:1 - chr2R 14367050 3' + accord2 204 1 66.67 ACAATAATAACAATAAAAATAAAAATAATAATTTGCAACAAAAGTCAAACTGTTCGCCTCACGCCCCATTAGTTATCAATAAATAGGTTTTCTTATCTCTCATTGAATATATAGGTAAATTTGCACGTTTGTCCACGGTTAACACC:1 + chr2L 3894637 3' + mdg1 7064 2 65.75 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACAC:1 - chr3R 8367142 3' - Doc 54 1 50.00 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTAAACGCGTATTTCTAGTTTTTATCTACTTTTCAACCTTTTTGGTATTAAAATCAAGTAGTGTGTAGTGTATTTAA:1 - chr3L 20711971 3' - 297 6620 2 59.59 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTGATTATGACTGCCTTACTTAAACTGTGTTATCAATAAGTGATTGACAATCACGAAAAACAAACAAAGCTCCAAGCTCGCTTATTATTATTTTAGTTTTTATAA:2 + chr3R 23664532 3' + pogo 2085 1 75.34 AGTATAATAATATAATAATAATTATATAATATAATAATATAATTATAATATTATATAAATATAATAATATATATTATAATATAATTATAATATAATAATAAATATGGAACTGCTATAAGTTTTCGCATAACTCTGCGTTTCATCGT:1 - chr2L 9099199 3' + invader3 5049 5 54.11 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACCTTTTATATCTCGTATACATCATCCTACCTGTTTTTTTTTGTTGCCAAACAATTTACATTCAATTTTATCG:1 + chr2R 14705878 3' - roo 8713 2 52.74 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTG:1 + chr3L 6774246 3' - pogo 37 1 51.22 TTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTACACGTGTTTATGGCAATA:1 - chrX 4589428 3' - Burdock 6208 2 71.92 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGTTGGAATTTTTTTGTGGCTCTGCTATATGTTTATTTTTACCCTT:1 - chrX 18149761 3' + hobo 2911 1 63.70 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 2537522 3' - jockey 22 1 75.86 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGATTTATAAAGCA:1 - chr3R 27835583 3' + 412 433 2 57.53 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAAT:1 - chr3R 4722384 3' - roo 8729 2 64.38 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCG:1 + chr3R 22289489 3' - 412 46 2 54.11 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTATTACTTAACTGCCATCAAAGTTCTTTGCAGGACTTTGTCACATTTGTGAAATAATC:1 + chr3L 20925849 3' + Transpac 5166 2 61.64 GGAGGAAAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACTGACTTCTGGGCATGTACATATGTAGTCCCAATAATATATCAAAAAGAATAACAACCGACAAAGCATTTCCATTTACACTTAACCAAA:1 + chr2L 20866879 3' + baggins 5223 1 62.33 ATGCTCGTTGTATTATTTAAATGTTGCTGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGGTTTTAGAACTGTGTTGTATAACAACACCTTGTACACTGAGCCTCGAACTTATCATCTTAGCTGGTTTATAAAT:1 + chr2R 18677880 3' - Doc4-element 2644 1 72.60 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTTTACTTTGCTTGGTTGAAAAAGGATAATC:2 - chr3L 4175216 3' + roo 387 2 67.81 AGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGACCAACTCTAATATTGATTGCTCCATCCG:1 + chr3L 11610665 3' - copia 92 2 77.40 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTACTCCCCAATTTCTATCGGTATCGCAGAGAAACGGGTATCTGATAGTCGGGGACCTCGAAAATAGCATTCTCTCTTGTATAATACTCAAATCCTGAAACTC:1 + chr3L 22737496 3' + mdg3 229 2 73.10 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGGAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAA:1 - chr3R 13358553 3' + mdg3 5480 2 69.29 GTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACACTAGTAGTGCGTTATTAAAGTGGCCATTCGTCTATCGGTCATCTCACCTACTTCTTTATCCAGTTCGCCGATGAGCTGTTGCATTCTGGCGACTTCGATGATGTATG:1 - chr3R 3758994 3' + invader2 228 2 63.70 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGG:1 + chr3R 7424635 3' - 412 63 2 60.96 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAATGCTGTCGCTGCTCAACTTTTAACTTTCGCTTTCACATCTTTATTTTCGAATTACTTTGCTGCTACGCTTACGTATTTTTAAACAA:1 - chr3R 6609144 3' + roo 9002 2 58.90 CAAAAAAAGAAAAAAAAATGGGGAAAAAACACGAGCACATAAGCCTGTATCTGTGTGCAAACACACTCACAGAAACAGCTCACACACACACACACACACACGCA:1 - chr3R 9418239 3' - hopper 140 1 46.15 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTCTTTAAGTATGAGTGCGATAATTGTCGCTTTAATTATCAAACGAAATAACGAAATAAGCTGCTCAAAT:1 - chr3L 20290665 3' - roo 8717 2 58.90 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAAACTCTCCACCCATCTGCACAT:1 + chrX 15814569 3' + P-element 2789 1 18.49 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACTGTACGAGTTCGATTCGATTGATAATTATTGAGCGGTTGCCATGAAA:1 - chr2R 21056689 3' - Tirant 8180 2 67.81 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAAGGTAAATGTTTATTACAATGAATCAGAGCTTAAAAACAAGAAGCTGTTACTCAATCT:1 - chr2L 10937802 3' + mdg1 7433 2 65.07 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTAGGCAGTTTT:1 + chr3L 22635811 3' + hopper 1390 1 67.81 GCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCAAAATATCTAGATTAACGATTATTTGTAAAACAGCTCTTTAAATTAAAAACACATGATATGACGGAAAATGCACAAAGGTGG:1 + chr3L 22162162 3' + Tirant 111 2 43.84 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGATCTAAATATTATTAATAATAATTAAATTAAGAAGTGATGGGAATTGTTAGTTT:1 + chrX 14914442 3' - mdg3 67 2 62.33 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGCGTATTTGTTGTTAATTTTTCAACAATTGCCTTTGATTTTTTGAGAAAATCATTTTAGCAATAAGCCATATCGATTTTGCTTTTTTCTGCATGCATACATTTTG:1 - chr3R 8022083 3' - roo 8679 2 73.10 CGCCCACAAACCGCCCAAAACTGCACGCCTACTCTTTTATACACCTTAAATTTTTTACTATGTTCGACACTTTTCTTGTTTTTTATTCGAGTTTTCATCGTGTGTACCAAAAAATCAATCTGCCCTATCATAATTTAAACCAAAAA:1 + chr2R 25238385 3' + INE-1 346 1 76.71 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTAATGAATATGCCTCCCTGAAAACCCATTTTCAAGACCTAAT:1 - chr3R 21924219 3' - roo 8691 2 67.12 ACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGT:1 - chr2L 15142253 3' - BS 4779 1 65.75 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTAACT:1 + chr3R 12608183 3' - roo 8707 2 51.37 GAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTAAAAAAAAATAAATAAAATTGGGTTACACTGGTCAATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGAATCCGTATTTTAACCTCATTTGACTT:1 - chr3R 16535262 3' + Stalker2 7611 2 47.95 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTCGGAGTTGGCAACTTTACATATTATGAACTTTCCGTGCAAG:1 - chrX 18125068 3' - BS 5008 1 74.66 GTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCTTCGAGATAATCCAACTTTCTCTTTCTGATTGGCACTATAAAACATGCAAGCGATGGGCCACAAATGCTATAGCTCATTAGTTTG:1 - chrX 21605875 3' + P-element 215 1 65.07 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTTTGCAACGGC:1 - chr2L 1073881 3' - Tirant 34 2 63.70 GCCTCAAGATGAATACTCTAATGACCAATATTCTTACATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGAAACGTTTACTCATCACAATAGTAGTGACTAATGGCATGGATTGTAATTGTTCAATATTCTTTG:1 - chr2R 21297269 3' - 1360 412 1 56.85 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCA:1 + chr3R 13358679 3' - mdg3 73 2 64.38 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATAAAAATCACTAATTCATTTTGTGTTTGTATAAAATTCCATAATATAA:1 + chr3R 30568955 3' + roo 401 1 70.55 ATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCAGTCATCTGACCAATGTATGTATAAATGATTTTACCAGCTAACCATCTCCTACCCATCTGTTGCATATATGAAATTACGCCAACCGCTCACCGATAC:1 + chrX 13502179 3' + Rt1b 5088 1 73.97 GGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTTATTACACTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTCAT:1 + chr2R 5064834 3' + Stalker2 305 2 73.29 TGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGGGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTTTTAGAGAGAGATCTAAAAATTCAATCGCGATTTTGCAGTGTGTGTCCATCTAAGGATCCGACTGATATTCTTATTGGCAT:1 + chrX 674536 3' + 1360 23 1 52.74 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATT:1 + chr3L 15035218 3' - pogo 62 1 64.38 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAAGTTCATAGTGCCAAGAAGGATATCAGCGA:1 + chr2L 7667536 3' - copia 4896 2 67.12 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCATAAAAAACAATCGACAAATTATTATGCCTGATAAAATACGGTGAGCATATGCTGCATACGGTGAATCCCCGCCAGCAACTCATTCCATAGG:1 + chr2L 13877808 3' - Transpac 4945 2 65.07 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCAGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGCAGCAGCTGCA:1 + chr3L 5490924 3' + 412 7483 2 64.34 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGAAGCGATAAGCAAACATAGCAGCAAATGGCAAA:1 + chr3R 25409553 3' - jockey 68 1 69.75 TTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCATCCCAAATGAGACCGAAAAAAGATTCGCCAACGTCTAAGGTCGAACTGAGTTATTAACTCAATTTTTGGCTTCTGCTCCA:1 + chr2L 17429113 3' + opus 7238 2 53.42 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGATTAATTGAGG:1 - chr3R 25384145 3' - mdg3 25 2 68.49 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAGTGATACATAATTTATG:1 - chr2L 3006061 3' + pogo 2063 1 56.16 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTATACAACTCACAGCTCAATCTGGCGAAAAAGTGAAGGGTTAAACCTGAGAACTTCGTAGTTCATT:1 - chr2L 7215508 3' + 297 345 2 58.22 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGCACGGAGGAGCTTCAG:1 - chr3R 10142889 3' - 412 19 2 71.23 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATT:1 + chr3L 8253707 3' - jockey 4709 1 73.88 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAGAGTTGGCATAAAAAGATAATCTTATTTAAATTTATTAA:1 + chr3R 21421114 3' - roo 8744 2 72.60 CAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAATGCCTTATGGATTGACTCCTGTTTTTATTTCTTCGTACCAATCTATTTTTTGCCCGAGATTTTTCCGC:1 - chr2L 4174909 3' - hobo 2700 1 53.42 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCAATG:1 + chr2L 8397251 3' - roo 8724 2 59.59 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAGTAGAGTACTGTTACCAAGAAAAAACAAGTTTATTTTTGGTGAAT:1 + chr2L 21342386 3' - roo 8696 2 63.70 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCGGACCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCAAACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTT:1 - chr2R 5260084 3' + 1360 3379 2 54.79 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTGCACAAAAGGCTACACTTGCCTCATCGTTAGTTCGTCAG:1 - chr3R 5765317 3' + opus 453 2 53.85 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGTAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAA:1 + chr3L 14581482 3' - pogo 60 1 57.53 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGG:1 + chr2L 14262933 3' - blood 50 2 51.37 AGCGAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGAAGTGGT:1 - chr3R 20452150 3' + blood 349 2 65.52 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTTTTAAAATTATAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAACGACGAGT:1 - chr3R 16194097 3' + mdg1 7422 2 59.59 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTAT:1 + chrX 14908447 3' - blood 7098 2 75.86 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTTTAAATATGTACAATCGAAA:1 - chr3R 11526728 3' + pogo 2078 1 65.75 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGATAGTTCTGAAAGTGCAACTAATTTTAATCAAAACATATCGAACCCAACGAACTCAAC:1 + chr2R 8686651 3' - hobo 63 1 66.44 ATTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTTATGTACTATCTAGAATTGATTTCCAAACT:1 - chr2L 4104017 3' + roo 319 2 76.03 TATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAATGGCAAAAGGAAAAGAAATGGCTAAGAGCCGACCCACTTTCGGAGCAAGTTCCACTGGCAACTTGCATTGGAAAATGTGTCAAATAAAGCGTTAAATTA:1 - chr3L 22346456 3' + Doc 176 1 73.97 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCAGTCCTCGCCAAGCTTGGCCACAACAATTTTCTAATTAAATTCGATTT:1 - chr3R 28008189 3' - hobo 13 1 76.71 AACGGGCAAGTTGGTATTGAATGGAGTTAGGTGTATGGTGTATGGTGTATAGTGTTAGTTGTTTACTGTTTGCTGTTTAGGTTGTCGGTAGTAGGGGCAGAATCACATGCACCACCGTCGACACAGTTATTTGCTGCTCTATTGGT:1 + chr3R 25187840 3' - I-element 4996 1 80.82 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTG:1 - chr3R 22659929 3' + 412 415 2 73.61 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCAATTCTAATTTCTAAGCTGCTG:1 + chr2L 9287131 3' + jockey 4965 1 53.42 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTT:1 - chr3R 10079253 3' - P-element 21 1 71.23 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATG:1 + chrX 18193843 3' - hopper 28 1 62.33 CATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACA:1 - chr3R 26765107 3' - mdg3 82 2 72.60 GGGGGGAAGTAGATGTCTGCATACATCCGTCTCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTGTGTTACTGCTTATGAGTGTGTGGGTACTACCCATACACTGGCATGTGTGTTTACGTTCCATTTAAAACATGGCGCT:1 - chr2R 14443520 3' + invader1 143 2 60.00 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCGGACAGAGG:1 - chr2R 14562100 3' - Burdock 6183 2 55.24 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGTTGTTGCTGGGCGTTCGATGGCGCTTGGTCTCCGCGGTCTTGGCTTCTAAACCT:1 - chr3L 13922242 3' + Tirant 8486 2 69.18 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTAAATGTTAAATGGTCTAGGGTAGAACTGAAGTATCAGGCATAATATTCAAATGCTGAAAACATCACATAAA:2 + chr2R 10453459 3' - mdg3 5303 2 50.00 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTG:1 + chr2L 21237271 3' + P-element 2784 1 15.07 ATAAGATAAAATAAGATAAGATATGCAATATATTCGATGCTGATTTATAACACGCTTTTTCAATTTACTTATATTTCGTATTGCCCGTTTTTCTGTTTGCCCCGTAG:1 - chr2L 5241507 3' + Stalker3T 201 1 54.21 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTT:1 + chr3R 10143026 3' + 412 426 2 61.64 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAG:1 + chr2L 15965292 3' - blood 77 2 68.49 TCACGCACTGGTAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGTTAGCGATAACTATTTCTTACAATAATGAGTACATCAAAAAATGCCTATTTCAAGATTAATAACTTAATACCCACTAGAAC:1 + chr2R 15359513 3' - Max-element 189 2 55.48 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTAAGTGCACA:1 + chr2R 10991429 3' - jockey 29 1 71.23 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGCTCGTTGGACATGTTCGCGGTCAAAAGCCTACGGCTAAGATTTGGCCAGTAATTTCAATCTAAATTCAATGGGTTT:1 + chr3R 9289417 3' - HMS-Beagle 6837 2 56.16 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCACC:1 + chrX 3452528 3' - Tirant 8162 2 54.48 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAGGCCGTAATCTACGACATAATGCGTTGCCCAACTGCCCCAGGCA:1 - chr3R 12537729 3' - Doc 76 1 68.28 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAA:1 + chr2L 17162852 3' + blood 7318 2 65.97 ATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTCGTCGGC:1 - chr3L 24272052 3' - gypsy11 65 2 63.01 GCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 211 2 79.21 ATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 235 2 80.00 GTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCC:1 + chr3L 3540227 3' - mdg3 40 2 51.37 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGC:1 + chr3R 13358687 3' - mdg3 65 2 58.90 TTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTCTTTCCCTACTTCGTAGTAAACTTCAAATACATACATTCTTTTCAGACTT:1 + chr2R 22145572 3' - FB 70 1 65.07 CTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATATCCGTGCACTGTTTACTGTATTTCGAAGTCAACCAGTCAAGTTGCCCGTGGTATTAGAGTGCGTATCTCTGGCC:1 + chr2L 13698665 3' + Bica 159 1 50.68 AGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCA:2 - chr3R 19537499 3' + hopper2 1527 1 69.86 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTGGCCAACTTCGAACTTTTGCAGCGATCCGCGGGGCCTAATCATC:1 + chr2L 535550 3' - roo 20 2 71.92 GATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAATCACCTTATTTCGCCTGTCATTAAATATGGAA:1 - chrX 11628508 3' - R1A1-element 5321 1 78.08 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTTTTAATTTATTTGCATTAAACTTGTATTACAATTTTATAACATCTATATATGATATAATAGTTACTCGCAATATGC:1 + chr2R 9815145 3' - pogo 39 1 58.90 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAACCTTGGCAGAGTTAAGTCAGCTTTACTGGAGCTGACTGTCACTTCAACTCCGG:1 + chr2R 18882717 3' + roo 397 1 76.71 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAAAGCATTTAAATGGTTTTTACAAAGCTATT:2 - chr3R 12608021 3' + roo 9038 1 63.01 GCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTACTTTTTCAGGGTTTGCAGAACGGTGTTTTTTTCCCTGTTTTGTTTTGCAGCATTATGTGGTCG:1 + chr3R 11011379 3' - Rt1b 4951 1 52.99 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATT:1 - chr2L 8397127 3' + roo 397 1 70.59 AGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGCCCTGTACGAACTATAGCAGTTCAACAACCTCACGGACATACCCACGACCGATGAGTTCAATGTGAACTTCGACGACGACCCAGAGACG:1 + chrX 16443659 3' + INE-1 96 1 54.07 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACT:1 - chrX 12893331 3' + Bari1 1654 1 54.11 CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTG:1 + chr2R 23313062 3' - Tabor 6928 2 76.71 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTCGCGCATTTTGCATTTTAGTTGTTTCGCTTCGTTGCATAAATAACTTCAAGCATCCCGCCCCATTTCTCAGTCAGTCAGTTGCGCCCTTTTTATTGTTTCAATGCG:1 - chr3R 12794975 3' + mdg1 406 2 74.66 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTAATGAGTTATGCTCGTACATATGCATTTTGCATTTTGTATTTGGTATTTGTTGCCAGCCTCACTATTTGTACAACGCCAGGACACGATATT:1 + chr3R 27971148 3' - mdg1 7064 2 66.43 AGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAG:1 - chr3L 18708595 3' - F-element 68 1 58.90 AAAATAACAATAATAATAATAATGGAAATTTTGCATGCGGGTGAAATTGAAAACACCATACAATACAAAATACACCGTAGAAAAGC:1 + chr3L 11537632 3' + mdg1 29 2 67.44 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCTGTGAAACCACATTATTTTATAAGTGTATTT:1 + chr3R 5245679 3' + 1360 3366 1 61.34 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTCCAGATTAATTAATGATTACCTTTAATGCATTATATCTTAATTACGAATTATTGGACATTATGGC:1 - chr3L 9241986 3' - roo 8721 2 61.64 AGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATAT:1 + chr3R 9983075 3' - HMS-Beagle 79 2 75.54 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGGCTGTTAGCGAGCGT:1 - chr2L 21237211 3' - P-element 51 1 47.14 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGAGC:1 - chr3R 15590574 3' + roo 8998 2 67.81 ATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAAAAAAATGAAATGCAAAATATATCAACACATAAGTATCGGCAACATGAATGGGGTATTAATTATATTTTGGCCATTATTGCACGATTAAGCCTAGTTT:1 + chr3R 27521120 3' - Juan 4104 1 63.01 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTAAGACTTAGTTTCGGGGACGTATTAAAAATCTCTGCA:1 + chrX 17469324 3' - blood 12 2 78.08 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGTTGTAAGCGATGCA:1 - chrX 16456763 3' + P-element 2782 1 15.75 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGT:1 - chr3L 18708576 3' - F-element 49 1 59.59 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTT:1 - chrX 17614393 3' + roo 330 2 71.23 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACCACAACGTTTGGACTATTTCATGCTTGATTAAGCCAGCAAGCAAGCACAAATACTTATAGCTCAATGTCTAAAGTTG:1 - chr2R 19353956 3' + 297 6935 2 58.90 TAATATTTAAAAGATTTTATTTTGTTGTTAAACAGTAAAGAACTGAGAAGAAATTGAAATTTTAAATTGTTTTCCATTTATAACAAGTTTTACAATTAGCGAACATCGAAGATGTTTAATAGGTATCCAAGCATACATTACACAAA:1 - chr2R 22673833 3' - jockey2 3231 1 41.10 GTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCA:1 - chr2R 19076516 3' - F-element 215 1 50.00 CTCAGCTCTTCTGAGCTCGGTAGTTATCTCTGCGGCGAAGCTGTTGACCGCTTGCCATTCCGCCTCACTCTGCAGCATACTTGCAAATGCTCATATATAATCCTCTTTGATAACTTTTCAAGTAAATGCTTACCATTAATTTGTTA:1 + chr3R 23902959 3' - Rt1c 5262 1 53.42 AACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTACAAAAGAACAGTTATTTACATATTTACATACATTTGCAATATTTCCATAGTGTTAATCATTCATGAATTGTAATTTTATAACAACAAATGTGCACCTTAAAATGTTATTTTT:1 - chrX 8357677 3' + FB 681 4 50.68 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGC:1 - chr2R 6585394 3' - pogo 39 1 58.62 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAAAGGTAAACATAGCGAGCAAAGTGAAAGTGACACACGCC:1 + chr3R 9163991 3' - hobo 18 1 73.29 AAACGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGCAACTTATAGTTTACAAATTAATCGCTTGTCAAAATCGAATTCACGTCGAATCCACTTGGTCTTTGGAAAGCCGCAAAAAGGTAAAGTAAAACTGAAGTCGCA:1 + chr3R 13995967 3' - INE-1 33 1 69.18 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAAT:1 + chrX 14908453 3' - blood 7093 2 71.92 TCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGTTTTCCTCTAC:1 - chrX 12893343 3' + Bari1 1642 1 62.33 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGC:1 + chr2L 16685405 3' + P-element 2830 1 46.58 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTAAGACTTAGTTTCGGGGACGTATTAAAAATCT:1 + chrX 17469319 3' - blood 7028 2 74.66 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCG:1 - chr3L 5263329 3' - pogo 33 1 59.59 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGGAGATCTTTTACACATTTTTAGTATAGTTTTCGATTTCTTTAGCGGATATCAACATGGCCTCAGTAAAATTGGGGTGTTGGTACTATTCATATCTGCGTTCCA:1 + chr3R 24229019 3' + opus 485 2 73.97 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATA:2 + chr3R 21237827 3' - Doc 54 1 50.00 TACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATTTTCATTTGTTTGCCCCTGTTTTTTTAGTTCTGTTTTGGCT:1 - chr2L 5648407 3' + Burdock 6317 2 71.92 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATCCAACTGACGGACTGACAAGGCAAAGTGCACAACTTCATTTCACATTAATGCAGTCGCTTTAACTGAATTCGTCGGCTGGCTGTCTGCAAATTTATGC:1 - chr3L 12250922 3' - flea 13 2 76.03 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGAT:1 + chr3L 14581499 3' - pogo 43 1 56.16 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGT:1 + chr2L 17730530 3' - pogo 58 1 59.59 TGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGCAACTCTGCTCGAGCAACCCCCAGGTAAACTTGGCTAAAACGCAAAC:1 + chr3R 16029504 3' + R1A1-element 5177 1 67.81 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGC:1 + chr3L 17447544 3' - Tirant 48 2 61.60 GTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAGACACAGT:1 - chr2R 19633219 3' - jockey 4652 1 68.49 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGCACGCCCTCAACACAAAG:1 + chr3R 5765440 3' - opus 7168 4 57.24 TCGTAAAAAAAAATTATTTAATGTTTATTTTTTTTTTAA:1 - chr3R 24727414 3' + Tc1 49 1 84.62 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGAT:1 - chrX 15089514 3' + P-element 2804 1 28.77 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGCCTATCCTGTATTTTATA:1 + chr3L 20076902 3' + roo 387 2 71.92 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAA:1 - chr2R 7534583 3' + roo 351 2 56.16 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACT:1 + chr3L 13722138 3' - blood 7053 2 57.53 ACATTCAGCAACCATTTGGTCACTTTAGCTATAGGCACCGATCGTGGCCACTACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACTCCACAGGTACAGAGGCAACAACGACCACAGCACTATCATAACCATGTGCGTGATCCTGATCTG:1 - chr3R 9178493 3' + Chouto 362 1 66.21 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATA:1 + chr2L 15965283 3' - blood 86 2 74.66 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGAT:1 - chr2R 20461207 3' - jockey 96 1 77.40 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGC:1 + chr2L 20561470 3' - P-element 78 1 32.19 CTGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGCTTGTGTGGCGCTCAGTGGGTGGCAGTTGCGTTTAGTGTGTGGTGGTCTTAGCGGGTAG:1 - chr2R 22279274 3' - accord 187 2 80.19 GCAATAAAATATTTATTTAAATTTGTAGCCAGTCTTTGAATTACCAAATGATCAAAAATGGGTAATTCCACCGATAATGATCATTTCATTATTAAGTATTATTATAAAGCTTTGTGTCTGCATGAAAGACCTTTGAAGAGAGCTA:1 + chrX 20934495 3' + transib1 1932 1 49.66 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCTGGCAGCGCAAA:1 + chr3L 6774260 3' - pogo 46 1 52.74 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATC:1 - chr3R 23507581 3' + 412 426 2 62.33 AAAAATAAAATAAAAAATGGGGTATTCGCATTAGTAAGCCCACAAAGAGGAAGACAGACTGGTAGACAGAGGAATTTTTATGGCATTTCTCATGGGTCAAGCTCACACTTACACTTCCTCCCCCAAAGCACACACAACACACACAG:1 + chr3L 12054515 3' - hopper 139 1 72.60 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCT:1 + chr2R 16891836 3' - jockey 76 1 69.23 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCA:1 + chr3R 21237799 3' - Doc 82 1 69.18 AACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGTCCTCACAAATACTG:1 + chr3R 9482155 3' + roo 392 2 74.66 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGATTCGGGCGTGGGCAAGGATAGGTGG:1 + chr2R 23313098 3' - Tabor 53 2 52.05 AATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGT:1 - chr3L 16973334 3' - S-element 1552 2 60.27 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAAACCT:2 - chr2L 8397118 3' + roo 9042 1 63.70 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTGGAGATGAAAAGGGTTGCGGATCCACATTCACGCGGGGACACCGGAAGAATTAGACGGCAGGTAGGGGGTCGGAAAATTATAGTATAGACACCATCGGATATCCTCC:1 - chr2R 6052541 3' - mdg1 15 2 76.03 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCAAGGCAATATAAACAGAATGATTTTTACACGGCCTCATAATGGGTAATGCTGGTAGGACGTG:1 + chr2L 6406576 3' + transib2 2767 1 61.64 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTCAGT:1 - chr2R 22255304 3' + roo 9029 1 57.53 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTC:1 - chrX 19498086 3' + P-element 2821 1 38.57 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCGA:1 + chrX 21213431 3' - Doc 24 1 66.44 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTC:2 - chr3L 19397023 3' - F-element 71 1 58.90 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAA:1 + chr2R 20700759 3' - mdg1 7065 2 67.12 ACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAATTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGACTGTTACATACTTTTCAACGATTCTAGTATACCCTTTCCAAAAAGGTATTTGTAGTAGTAGTAGTAGTATTCCGTGTCCAAAATTATTTTTT:1 - chr2L 21689110 3' - INE-1 91 1 62.33 GGTATTTACAGTGTCTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTAAATGAAACCAAAGAATACCAGCAAAACTTTGGGCAGGAATCTTGAGCTATTTAAATGTTATTGAGCGTTTCTTATTGGTCTTCTGG:1 - chr2R 20856170 3' - Juan 4140 1 62.33 TGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTCCTTTGGATGCAACGGCTTCTGATGCAGATGCTGCTGCTGCTGCTGATTTTGCCTTTACTTTCGTCCCTGTCTGCTCCATTAATGGAAG:1 - chr3L 15479495 3' - Doc 4473 1 64.38 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGATACACACGCATACCAATGCCGCTGGCAGCCAGACACTCGCAC:1 - chr2L 13546940 3' + P-element 2852 1 63.45 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATGAGGACATCGTTAATTCCTTCACA:1 + chr3L 6751768 3' + pogo 2051 1 53.42 CATCATAACACCTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGGGACGTCACCTATCAGGAAATTTGTTTCCCATCAGCACTCATACTTGTTGAGTAATCGGGCGTCT:1 + chr3L 11783559 3' + mariner2 688 1 65.25 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCCAAT:1 - chr2R 17014002 3' - HMS-Beagle 42 2 56.85 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTATCCTCTCCATCCACAATTT:1 + chr2L 12481553 3' + pogo 2065 1 59.31 CTATATTTCGGGCGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATATTCTTCATAAATATAGATATATATATATATATAAAAGTGTGTGTATATGGATTTTCGGGCCTTTGTGTGCTTCGGCTTTGGCAGTGTTGTGGCTTGGGATG:1 - chrX 8626151 3' - Burdock 6148 2 76.03 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTCTTGGCTTTTCCCTCGCTGTGTGAAAATTCCACAGCTCTTTTTCCGATGCTGGACGTTGAGAAGTTTTTGATTTAAATAGTT:1 - chr3L 14921356 3' - pogo 35 1 60.00 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATG:1 + chr3R 4884491 3' - pogo 51 1 52.74 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGC:1 - chrX 14385146 3' - blood 56 2 54.11 CTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGGAGGAGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTGAATGCGGATAAGTG:1 + chr3L 25232916 3' - accord2 5 2 80.14 AATGATGCCAAGAAAAACTTTTAAACGTACCAGCTAAAAAGCAGCAAGGGGCTACAAATAGTTATTATTTATTTTAGGTAACAATTCAAATATCAAGAGCCCTTTGACTGAGTTTTAAATGGGCACTGGTCTCAAGAGGAGACGCT:1 + chr2L 12464560 3' + Fw2 380 1 56.85 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTAA:1 + chr3L 21093273 3' - Ivk 22 1 70.55 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGGTG:1 + chr3R 20905480 3' + pogo 2048 1 57.04 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCA:1 - chr3L 16180898 3' + Transpac 272 2 65.00 GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAATCGTCAAAAACATTGCCAGAGTGATTTGAACTTTTGTTTGCGGACATTTC:1 + chr3R 24809981 3' + 1360 3320 1 65.07 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGGTACATCGAGTGCAAATTGAATAAAAAATAAAAAAGAATAATTGTACAATAGAAAGGATTCCCGAGGAAGTGAAAAGTTTTA:1 - chr2L 21342233 3' + roo 9034 1 58.22 AATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCAAATAGAAATTATGCATTCCAGAAT:1 + chr2L 15153347 3' + G6 1968 1 54.79 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGGGTGTTGGAGGCGCCTGGAAATATGCAATAAAATATTCATGAT:1 - chr2L 15621858 3' + hobo 2904 1 60.91 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACATTGTCAATAGAATACAGCTAGAACCCGAAACCGAATCGAAACAGGAATAAATCCGGCTTAAGGCCACAACAAATCCTTCTGGCCATGTGTGACCCACAAAACTGAGACC:1 - chr3R 30568750 3' - roo 10 2 76.03 ATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAACACGACGAACTTGTTCGCAGAAGTACCCGGTTAAA:1 + chr2R 18173194 3' + P-element 2605 1 23.97 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTCATAGCCATTATATATTTTTCTTTGTGTAGTGCAATGTTTTTATGCATCTATAAAAGCGACCACACGCC:1 + chrX 10101427 3' + mdg3 194 2 51.72 TATGAACATGGAGATCTCAGGAACAATAAAAACTAGAAGGTTGTGATTCAGCATGCAGCTTCTAGCGACAAAGACGCAGCCGAGATGATATCATCCACCGACCAGGTGGACGTGGAACGGACAGCATAGACCCCAAACACCGAGGC:1 - chr2R 7046143 3' + INE-1 138 1 54.79 TATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTCCAGTGTTTGCATACAGTTATAGTTGGCTAAGCTGCTGGCTGCGG:1 - chr2R 19903975 3' - Doc 4432 1 68.49 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCCCCCCTGTATTACACTTTCAATTACTATATCGAATGTGCTCTATTTTATAAAAATGTTACGCTTAT:1 - chr3L 16764798 3' - I-element 18 1 54.21 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATGGGTGTGAAAACAGTGGGGATCCTGAATGGGTTGATAAGTTCAAGGCTAGCCACTCAACGTATACAACTTTCAGCTGAGTCAGTTTAGTT:1 - chrX 12551669 3' + pogo 2074 1 67.12 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATTCATAACAAATATTACAAGTTTCTTCTTTAGCGCAGGGCGTGAGGCGATGCTAGAAAA:1 + chr2R 22893267 3' + pogo 2043 1 65.52 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACTTTTATCTTTCACTCGTCC:1 + chr2R 21056804 3' + Tirant 361 2 59.59 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGTGTTCATGGATCCG:1 - chr3R 23099042 3' + roo 9055 2 71.13 ATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAACAAGGAAAGGGGGCACTTAAAGGATATATTTCAACCCTATCTATGTG:1 - chr2L 6406480 3' - transib2 70 1 63.01 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGCGCAACTTTCAAAGATGCAGTAAGCAATTGAGTGTTGCAT:1 + chr2R 24427667 3' - jockey 4690 1 73.97 TAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAA:1 + chr2R 10163631 3' - Juan 4146 1 68.49 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAATGAC:1 - chr3R 20905348 3' - pogo 31 1 65.07 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATATCGGGACACCCTGTGACCACATTTCACTTTCGCAATTCTCTAGTTC:1 + chr3R 10026304 3' - FB 69 1 66.90 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCT:3 + chr3R 4722466 3' + roo 8996 2 69.86 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGAAAATTAACTCAAGTGTTAATGAGATTAGTTACA:1 - chr2L 18370284 3' - Doc 16 1 78.08 GACCAAAAGAGTGAGAAACAGTGCATTGACTTTGTGGTGGCTCGTTCCTCGAGCTGTTGGGCATTTGATCAGCTAATCGGTAGCGTTGTTCCGTCAAATATTTTTCCCCAATTCCGCAGCTTTTCCGCC:1 + chr2R 498352 3' - Dm88 4420 2 73.64 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACTTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGCAAACCCACTTTGAGTCAGGAATTGTTGACTAAA:1 - chr2L 9010449 3' - 1360 89 1 77.40 CGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGATGAATAAATATGAGTGTACATGTATAAGTATGTTTATA:1 - chr2L 9439233 3' - Quasimodo 429 2 73.24 TAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTG:1 + chr2L 20841959 3' + G6 1952 1 70.54 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGTGTATAAAATTACACAA:1 + chr3L 4869249 3' - roo 65 2 64.38 AAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGCTTAGCAGCCACGTTCCGAGTAATCCG:1 - chr2L 9356774 3' + Stalker4 7338 2 69.86 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGTGCCTTCTTCGATCGCGCTGGTCC:1 - chr3R 23254374 3' + pogo 2083 1 73.97 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCATTTTATTCAACAATATCTTTCTACAAACAGCTAAACGTACAGACTAACAACTAAATTTGCTTCCTTTTCGAC:1 - chrX 8272374 3' + roo 393 1 73.29 CACAGCTGCAGTTCCGGGCTTCCTTGCTATGCTGTTGGGGTGTACTACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTT:1 + chrX 22824792 3' - jockey 4693 1 54.05 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTATTTTTCCATGCGTTCTACGAGCAATTTAAGTCCCCATAACAGGAT:1 + chr3L 11669863 3' - Tabor 6916 2 67.81 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCATCCCACCGATATTTATCCTCGC:1 + chr2L 12481541 3' + pogo 2052 1 53.42 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCTGCT:1 + chr3R 10140288 3' - P-element 33 1 60.31 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATAAACACTGATTTTAACTGGGCTGCCAACTCGTTTGCTTTGGGCGGCTGTTGGTTCGATAGGTATTTAAGCCATATCAGCTGTTCATAAATTAATAG:1 + chr2L 2357417 3' - P-element 21 1 71.92 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGATTTCTCAT:1 - chr3L 20785466 3' - P-element 23 1 52.69 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAAAATATACGATTCCGATTCCATCGGAGTGTTTTATGAGTTCATAAAATGGGGGTGTAGGTGTTTATTATCGTTG:1 + chr2L 10089858 3' - 297 6604 2 65.12 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGGTTTCGT:1 - chr3R 25271141 3' - 412 29 2 65.07 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGCGGACTGTTCTTGGACTTTTTTAATCATCATTAACCCCCCTTATTATACACTCAAAAAAAAACAAGTTTTGCTCAATTTTCCCAGATCATGCATTAAAATGGAA:1 + chrX 5892223 3' - transib2 14 1 72.60 AGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACA:1 + chr2L 11867371 3' + BS 4966 1 59.59 ATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAAT:1 - chr3R 3922964 3' - Cr1a 98 1 77.40 GGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACAGCCTTGGGCTTGGATTTGGATTTCCTTTATGTTCGAGCGGGGCTACCCATTTTCAAGAGGCTGG:1 + chr3R 15078266 3' - 17.6 7052 2 52.94 AGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGGAAAACTGTGGGCTGCAAAAGTCTGCCTCGG:1 - chr2L 17198008 3' - R1A1-element 5021 1 71.23 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCA:1 + chrX 10538238 3' + pogo 2051 1 51.37 TATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGGGGGCTTTACAAATAACTGCGGAATTACATTAAACATTATTGTACTGAATTAAATTATAATCCCTCGCTTGCATGCG:1 - chr3R 15589897 3' - Transpac 4919 1 80.14 ACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCATATCTCCATGTAGTCCAAGCGACATGGCTCTGTCTTGTGGATGGTCTCAAATATCGCCACCGC:1 + chr3L 7246728 3' - Chouto 144 1 56.85 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCTGCGCTTTAACCATACCAACAATATGCGCCAATCA:1 - chr2L 13877664 3' + Transpac 5178 2 54.55 GCATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATTGTGAAGGGAACGGTGATGGATGATGGCCAGGATAAATGCCCTAGAAGGTTCTGCGGATTTATGCGGCTGGAGACACGATT:1 + chr3L 19426964 3' - Stalker4 226 4 54.11 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACT:1 - chr3R 26765100 3' - mdg3 5327 2 68.49 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGCGCAACTTTCAAAGATGCAGTAAGCAATTGAGTGTTGCA:1 + chr2R 24427666 3' - jockey 4691 1 73.29 TTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTA:1 - chrX 21639630 3' + Tirant 8432 2 69.86 CGCTGGGTTAGTAAGTCCTTTCGTCGGAGACGTGAACGACTGCTGAGCTGAGTTAGATTTCTCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGAGGACCGCCTGTAGAGCCCAAGTGAGAGATATGATAGATTATTTAAGGGAATTACGCATGCTGG:1 - chr2R 17405585 3' - F-element 4527 1 57.53 GTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTG:1 - chr3L 16157184 3' - Juan 51 1 54.11 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCTTTTACCCACCAGTTCACCAGCTAACCACCCAAAACTACCCACTGCATTCCGGCCTTGCCAACAACTTTACTATGCCAGACGACCGGCGGCAGACAATT:1 + chrX 3524356 3' - roo 5 2 73.08 TGGAGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCAACTAAAAGTGCTGTGAACATTTCTGAAGTACTGCGACACTTAAAAACGTAACACACTATTGGTTGAGTGTGGTCGTTAAAAGCGGTCATA:1 + chr2R 10477301 3' - invader4 169 2 62.33 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGGTACTTCGAAAGAAGGTGTCAC:1 - chrX 19231762 3' + mdg3 5431 2 70.54 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATGCCATCGACGACTATCGTTTTCCAAGACCT:1 - chr2R 20403768 3' - Burdock 6206 2 67.12 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCAAAAAAAAAACAATATTATATATATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGGAGTA:1 - chrX 7525057 3' + I-element 5287 1 47.26 TAAGCACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTA:1 + chr3L 13204769 3' - jockey 94 1 80.00 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTT:2 - chr3R 25271145 3' - 412 33 2 63.70 ATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATGGCTATGAAAGAATCTTACAATTCCAAC:1 - chrX 4678099 3' - R2-element 3356 1 80.82 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAAAGGTAAACATAGCGAGCAAAGTGAAAGTGACACACG:1 + chr3R 9163989 3' - hobo 18 1 72.92 ATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCAAAGGCTGCCTTGTCGATGGTTCGGGTTAGGGTCTTCACATACTCGTTGATGGGTGGGTTACGCTTGTTCTGGCACTGACGCGGATCCGAAACGAATGCATCGTCGAAGAAGA:1 - chr3L 21967132 3' + roo 8686 2 79.45 ATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTGTTTTTGCTTTTGTTTCTCCTGCTGCCTGTTGGCTGGCAAAC:1 + chr3R 9962393 3' - opus 7086 2 71.23 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATAT:1 + chr3R 22289452 3' - 412 7136 2 74.66 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGAT:1 + chr2L 12142626 3' + hobo 2851 1 76.55 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTG:2 - chr3L 4869144 3' + roo 9019 2 52.74 TTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGG:1 + chr2R 4206657 3' - 1360 321 1 71.92 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGAAACCAAAGAGAGCACATCGTATATAAGGAGTCGGCCGTGCAGCAG:1 + chr3L 14969319 3' - P-element 42 1 50.69 ACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTAGTTATGATTTAATCAAAACGCGCACAGCCATTTTAATTACCTTTATGTTGCACAAACTTATGTTTTTTTTTTATGGTTCAAAGCACTATTT:1 + chr2R 10478811 3' - invader4 2779 2 67.86 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGATATCAAATAAG:1 - chr2R 7404635 3' - blood 23 2 65.07 GAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTTTATTACGAGCCTATCGAAATCATAATCCGCTTTGTTATA:1 + chr3R 27845601 3' + Stalker4 7337 2 64.38 TAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTA:1 - chr3R 16194150 3' + mdg1 7369 2 78.08 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTTGCCC:1 - chr3R 8705704 3' - hopper 51 1 50.68 GACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATGAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCAT:1 - chrX 292388 3' + G3 4534 1 59.59 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAA:1 - chr2R 20382463 3' + Bari1 1667 1 58.22 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCG:1 + chr3L 9430642 3' - P-element 82 1 28.97 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTGTTAA:1 - chrX 21639574 3' + Tirant 8488 2 73.29 TCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTCATTACCAATAAATTTGTAATCTGTAT:1 + chr3L 14043671 3' - Ivk 10 1 78.77 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTCGACAGTTACGTTTGAAATTGCCGTTTGGA:1 - chrX 5892102 3' + transib2 2736 1 78.62 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGGGCGCCAATTAGCAACGGCTCAGGGACCGCAACAAGTGTGGCCGGTCCAC:1 + chr2R 5900961 3' + Bari1 1693 1 73.68 GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACC:1 - chr2R 10478676 3' + invader4 3023 2 60.69 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGGACCAACTCTAATATTGATTGCTCCAT:1 + chr3L 11610662 3' - copia 4924 2 71.70 GCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATT:1 + chr2R 23313061 3' - Tabor 6929 2 77.40 TAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGT:1 - chr3R 13358562 3' + mdg3 213 2 61.64 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTT:1 - chr2R 7534565 3' + roo 9036 1 60.84 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATCGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGC:1 + chr3R 15514591 3' - 412 87 2 74.66 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAATCCATGTTAGTTGAGCTCAATGGAAAGTCGTGACCAAATATACGGAGGGAGTACGATTTTCAAGAAACTATAAAGGATTATAACCGAACTTAAAGGAATTT:1 - chrX 7525009 3' + I-element 5335 1 71.23 GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTTGCCCAAGGAGACCGTCTATTTTTATAACTCCATTTTGCAGAATGTGAGTATATACGTCTGCTCCAATG:1 - chr3R 19444749 3' + roo 8972 2 55.48 AGCCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTATACAAATAGTTGAGCCGCAAATGGCATTAAAATGAAACACGCATCAACGAAAGTTAATTGGCAGCC:1 - chr3R 18936658 3' - F-element 473 1 54.79 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTT:1 - chr3L 5446130 3' + roo 8986 2 79.71 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACAGCCTGGCAGGCATTTTTG:1 + chr3L 17447551 3' - Tirant 8143 2 55.83 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGAGGAGATCGCTTGAGCCGTTTATTTGGGAGTAAGC:1 - chr3R 14088559 3' - 1360 65 1 62.33 AAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAACATTTCACGAAATATATTGAAAGGAATCCGCTCTAGTTGATTACTTTGGGCTGAGAATTCTGACAAATGTTTCCGCTGATCCCGGAAAAGTTCACCAGGCA:1 - chr3R 21164382 3' + jockey 4836 1 67.12 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGGACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCTTTTGCTTGTTTACCT:1 - chr3R 29708967 3' - blood 44 2 55.56 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGCGAA:1 + chr2L 1074005 3' + Tirant 330 2 64.38 AAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTCAAAAGAGAGATGAAACATCGATTTTTGGGCAGACGCCACCATTCATATTAGAAAATTTTCTGTCCTATTCTATGGAAATGAAATATTGAA:1 + chr2R 18604707 3' - invader3 200 2 53.42 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACAC:1 - chr3L 15035114 3' + pogo 2041 1 65.07 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCG:1 + chr3L 4023721 3' + pogo 2065 1 53.33 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTCGAATAATTTACATACATTCTGGCAC:1 - chr2L 20922995 3' - pogo 26 1 67.81 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGC:1 - chr3L 4869143 3' + roo 357 2 51.72 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAA:1 + chr3R 7424652 3' - 412 7099 2 52.74 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGTAGTGACGTGCCGATATATATTTGTGGAAAAATACTTTTCACAAAAA:1 + chr3R 14165167 3' - Tabor 6859 2 70.55 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATAACTTTCCCCAGGCTAACCTT:1 - chr3L 15890984 3' - mdg3 39 2 47.95 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGCTTTC:1 - chr3L 20785470 3' + P-element 2827 1 34.13 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTATAGTATCATATTT:1 - chrX 23043134 3' - roo 74 2 72.60 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAAAGGTAAACATAGCGAGCAAAGTGAAAGTGACA:1 + chr3R 9163985 3' - hobo 24 1 69.18 TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTCA:1 - chr3R 14331162 3' - Burdock 55 2 62.76 GCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCGTCACTTGAACGTTTGATTGTACCACCCTCTGCACCTGATCCAGTTGCTGGGCTTGAACTTGCGATTTAGCCTGCT:1 + chr3R 6366473 3' - Juan 191 1 61.64 ATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACA:1 - chr2L 14969906 3' + Tirant 308 2 79.45 ATCTTCGGCTTAAATATGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGATGCCGTCTCTCCTTGTTTGTTTGCATTTGCGTATCATCGACGCATGTCGCGACGCCATTCTTGGTCCTGCGATGTCCGGGCCGCTCG:1 + chr3L 6882833 3' - roo 340 2 59.59 AAAATATGAAAATAAAAAAAGAAACGCAGATATGCCAAATGTAAACAGAAAAACATGTTCCAGACATACGCTAAAATAACCTCGGGCACGTTTCTCGGCTAACTGCTTACAAGTCCGGTTCTGTATTCCCTTAACCTCCCCAACAG:1 - chr3R 19517562 3' + Doc2-element 256 1 54.11 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTCCTTCCCGCCCCGGAGCATTATAAAGGTATAAGGCGCAGCTAATAAAGTTGCAAGCGGTCGCCGTCGTCTGAGTAGCAGTCTGCTAACCATGGCCGG:1 + chr3L 22529876 3' - roo 23 2 69.18 AAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGTATTTTTTTTCGTTCTTAACGATTTTTCCAGTGACCTTGTTGCGTACGCTAGAACGTACAAATTTACTCGGTATGTGTGTGTGTGTCGCTT:1 + chrX 15090163 3' + P-element 165 1 66.44 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCTGTGAAACCACATTATTTCATAAGTGTATTT:1 + chr3R 5245679 3' + 1360 3366 1 63.03 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAG:1 - chr2L 12481416 3' - pogo 52 1 52.74 GTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAATGCTTGGCTGGCTCCTTGCATTCGGTTCTGG:1 - chr2L 14922798 3' - 412 7247 2 78.77 ATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTACATTTATTTTTCATAACATTTGGTCTATT:1 + chr3R 29489397 3' - S-element 87 2 80.14 ATATAAAAAATAAAACAATAAATTTAAAAAATGTAGCTTTCAATGTTTTATACATGATCAATTTGTTTCTCTGTACTTTTACACACATGATTACGAATGTTGCGGTGTACCACGCGGCGTATGAGTAACGCTAAAAAGGGGAACGC:1 - chr3L 2410937 3' + gypsy11 3929 1 61.64 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGG:1 + chr2L 16685369 3' + P-element 2816 1 25.81 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCTCACAACTCGTATTTAGTTTTCGCAATCTACCCGTTTGCCTAACTCTATTCAGACTTCACTGGACTGAGCATACGTTTATAATTCCCATTTCTG:3 - chrX 21639578 3' + Tirant 8484 2 70.55 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAA:1 - chr2R 982298 3' - HMS-Beagle 6835 2 58.04 AAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAATTAAATTAATTATATGAAAGTGTGTTAAGTGAAATGTCATGATCCTTATTATTTGATATCCAACTCTGGC:1 - chr3L 21819960 3' + Juan 4155 1 59.59 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGGGATTTTCTATCTTTACAGGATATTCTAGCGAACTATTTCTAAAACTTTATA:1 - chr3R 18524200 3' + opus 484 2 74.66 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAA:1 - chr3L 5446075 3' + roo 9034 1 59.59 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCAGCTTTGAGTTAAAGGCCCATTAAAGGACCCCCCAAA:1 - chrX 20386668 3' + hopper 1336 1 71.92 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGAGTTCATAATTTCACTGGTCG:1 + chr3R 22810802 3' - flea 46 2 55.48 ACAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAAGTGGATGTTGATGAACTTTTTAAAGTCTTGGCAGG:1 - chr2R 8729063 3' - Transpac 5021 2 75.17 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTTATCATTCAGTCGCTGCCCAGAATTCTCCGTTAT:1 - chrX 18365972 3' - jockey 25 1 72.60 ATGAATCGTGCATGCTAGGAAACGCCGTTGTTGTAAGTACTCGCCACAAATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAA:1 + chrX 23280893 3' + R2-element 3502 1 54.11 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAA:1 + chr2L 1229693 3' - opus 175 4 67.81 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCAACTGAGTCTTGAAATGGATTCATTGCCTTTAACG:1 + chr2R 9164975 3' - 412 7076 2 68.49 CACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCATACTCAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAATCGGTCCCGTAATCGGTCCC:1 - chr3R 16535298 3' - Gypsy6A_LTR 19 1 69.86 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATTTATAAGCATGAAAAATCTACTAATTTAATTCGAAGTATATAATATTCCCATTTTATATAAATTGCTTAGCGCTTTTAAAGTTTCTTAATT:1 - chr3L 19146549 3' - pogo 43 1 65.75 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTC:1 - chr2L 8397154 3' + roo 9006 2 62.33 CAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACTTAGTTATGATTTAATCAAAACGCGCACAGCCATTTTAATTACCTTTATGTTGCACAAACTTATGTTTT:1 + chr2R 10478786 3' - invader4 2810 2 49.32 CTCAACTCGGCTATTGATCCTGCTTCAGAATATAACTACTTTATATGGTCGGAAACGCATCCTTCTGCCTGTTGCATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTTTTTTTCTCCACGGTATAATTAGGAAAAGCTTCCCTCTTACTTTA:1 + chr2R 5528660 3' - INE-1 95 1 54.79 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAAT:2 - chrX 11228525 3' + roo 9039 1 63.70 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAATTTCAGCCAAACAAGCGAGCAAA:2 - chr2R 6585387 3' - pogo 33 1 63.01 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTG:1 - chr2L 8103479 3' + pogo 2074 1 58.57 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGAAGTGGTATATTTTTCTCTCC:1 - chr2R 20500034 3' + 412 438 2 57.93 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGAAATCCCTTGAGGTTTGTG:1 - chr3R 29708919 3' - blood 7027 2 68.49 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGTTGTTGCTGGGCGTTCGATGGC:1 - chr3L 13922274 3' + Tirant 347 2 57.53 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACG:1 + chr3L 16887393 3' + roo 8995 2 69.18 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGATCTGTCGAG:1 - chr2L 19424624 3' - Tirant 34 2 63.45 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTT:1 - chr2R 5214963 3' - F-element 80 1 63.70 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTCACATCCAATTGCTCCTCCTCTGGTTCCCTGGACTTC:1 + chr3L 9430692 3' - P-element 8 2 76.03 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACGCAGTCACCCTTGCAAGCGCAAGCGAAGGCAGATTGTGCGAGGACTCGGCTCGAAA:1 + chr2L 12142648 3' + hobo 2917 1 53.47 CTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTT:2 - chr3R 7739683 3' - blood 7079 2 61.64 TGTGAAAAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAATCCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATAGGGAACATACTACATACCAAAACTTTTATTGTCTGCTGCCCATAAATTTAATATTTCCCG:1 + chr3R 31922113 3' + S-element 1337 1 77.93 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAATAATTAAAATCCATTTTTATATCGATTTCATTTATGATCACGTTGATGAATTAT:1 - chrX 14173212 3' - 412 7121 2 63.70 AAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGGAGATGTGGTACGTTTTCTATATCCTTTAAGCTAA:1 + chrX 11815122 3' + flea 4986 2 73.97 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCAGTTGTGGCAGGGCTGCGATTTCATAAATTGATTGATTGTCAAAATAAGACGTGCTAATTGATAACGATATCATATATAAAAACATCTCCTAAGAATATTTTTT:1 + chr2L 9167585 3' - pogo 15 1 73.97 AATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAACTTGTATGTCGAACTGGATTTGCGGATCTCTTTGACTCGTTCCGGGCCAATTGAGCTG:1 + chr2R 20856295 3' + Juan 4156 1 58.22 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATT:1 + chrX 14908469 3' - blood 7077 2 60.96 AATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACT:1 + chr3L 3540252 3' - mdg3 29 2 64.38 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGCAAAAACAGTTGGAAAAGGGGTGAGAGGGTACTGGGGAATCAACTAAATGCTAAATAATCAAATGTACGCAGGTAA:1 + chr3L 15371410 3' + Transpac 5187 2 56.85 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAAAA:1 - chr3L 15035098 3' + pogo 2057 1 55.48 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTGAATGAGACAGTCGACGTTGAGGAAGAAAAAGAGAGGGAATAAGAAAGCGCTGAATGTGTATTTGTCTACATGACAAGTAGG:1 - chrX 7467905 3' + hopper 1381 1 62.07 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGAGCTAAGACAGGATCC:1 - chr2L 20638331 3' - Doc 26 1 63.20 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAAGTCCT:1 + chr3R 9482144 3' + roo 9044 1 67.12 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATAACTTTTCAGACAGATCATAACTACCCACAAAGCAAC:2 - chr2L 13884535 3' - pogo 19 1 71.23 CTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACG:2 + chr2R 6984406 3' + HMS-Beagle2 7130 2 64.38 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGCCAGAACCAGCGAAAG:1 + chr2L 1449704 3' + opus 7458 2 54.79 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATAC:1 - chrX 19162544 3' + pogo 2076 1 66.44 CGATACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAAAGGGA:1 - chr3R 4885319 3' - 1360 10 2 67.71 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATT:1 - chr3R 20292418 3' + pogo 2043 1 61.64 CTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACAGACCGGAAAGCGTGATAGGGTCCTTGCTTCGGCTGTCC:1 - chr3L 18120798 3' + mdg1 135 2 73.79 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGGAGATTTTGTGTTTTGTGTTCTCTAAATAAAGCCATACAAGACAAAAAATCGAAAGTAGCTGGCCAGAGAAGTTCGAAAAGAATTTCAGCAGCCCAAAAA:1 + chr2L 3006346 3' - pogo 19 1 67.12 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAATT:1 + chr3R 15465600 3' + mdg3 207 2 58.22 TTGGGTGAGTAAAAACAAGAGACGTGCCAGAAGACGAGCCGAAGACGATTTAATGCCAAAGATTTCTCGCATGGTGCCAATTGATAAAATTGTAGTTTTTAGGGCGAATCAAATCTATTCGGGTTATTAAGTCGAACGGGCGACGT:1 - chr2R 12435692 3' - 1360 3244 1 58.90 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATAACTTTCCCCAGGCTAACCT:1 - chr3L 15890985 3' - mdg3 5292 2 47.26 TCAAAGGCAGAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATACATGCATTGCTTGTGTGCTCCGATCACACTGAATGTATAAGTGAGCATAGCATAACATATATGCTGCCAACCTCGGCGG:1 + chr3R 2476337 3' - S2 35 1 62.41 CAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTTCAAAGTTAACAAACAATTTTCTTAAGTAGTCA:1 + chr2R 20362344 3' - diver 5906 2 73.29 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACAGAGAGTATGGGGCCTTCAGTGTGCTCC:1 - chr3L 13721986 3' + blood 7360 2 65.07 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTT:2 + chrX 13651567 3' - 297 6639 2 60.27 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCG:1 + chr2R 12703867 3' + blood 7333 1 56.16 TTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCC:1 - chr2R 5900835 3' - Bari1 74 1 65.75 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAGTGCGTGCGATGGGCAATGGGCACGTAACTGCTGGCCATCAATAAAATTGTCAAA:1 - chrX 15167616 3' - roo 20 2 71.92 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAGCTTCACCAGCTTCCCTTACTACCAGAGCTCCATAAAAAGTCTAAAATATGCTCGACAAACGC:1 - chr3L 22481186 3' + roo 396 1 77.14 ACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTAAGACAGCATG:1 + chr3L 21093282 3' - Ivk 13 1 76.71 TAAACATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAACCATTTTTTCTTTTTGCAAGTGTACATAGAGAAAACAGTGGGGTATAATGACCATT:1 + chrX 13795592 3' - 412 7126 2 77.40 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCT:2 + chr3L 9242103 3' + roo 9046 1 51.37 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATC:1 + chr3R 15514603 3' - 412 7128 2 67.81 AATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTATACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCGTTGAAATGAAATATATATATAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTAA:1 - chr3L 25255413 3' - INE-1 301 1 67.12 AAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAGAGAGACAATCTCGATATTATAAATAAATGTTTCTTTG:1 - chr3L 16725517 3' + 297 6897 2 77.40 TTAGCCTATAATATTTCTTGAGGCGCTGGTTGGCTTGGTTTCTCTTTTTTAGGATATTTAATCCACGGACTGGCTCTTAAGCTGCTCCACAATATGTGGCGCCTTCTCGCTGCCCGGAGTAGTTGGTTTCTCCGGTTTGCTGGGCG:1 + chr3L 2091714 3' - G7 768 1 54.11 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATGGGAATTCTAATTAACTACAGTATTAACTGCATGTACCAGCTAAGCAGACAAAGGTGTGTGTTGTGCACAGGAAAAAA:1 - chr3R 27971020 3' + mdg1 7394 2 63.01 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGCTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCA:1 + chr3R 29709049 3' + blood 7311 2 68.49 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGTAGAGTGACATTTTTTATTTGATAACTAGGTAGATTAAGCTTAGCATTAACAAATTAACAAATTATAAGTCGATAAGTAG:1 - chr2L 1327473 3' + pogo 2063 1 55.48 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGTGTTCGGATCGCC:1 + chr3R 23507719 3' - 412 18 2 70.55 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCA:1 + chr3L 5438814 3' - hopper 78 1 71.92 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTG:1 - chr3R 31956750 3' + pogo 2061 1 58.22 CTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCATACAGCATCATATCACTTGCTTTCGAAGGTAAACAAAGGAATCTCATT:1 - chr3L 20389275 3' - 297 6528 1 75.34 GTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTTTACTACCCTTTTAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTCTTCTTTGGCTCGTGATTTGATGAAAGGGAAATGTGCTACCAGGAATTGTCATCTGATATGGCTGCTTTTACCAA:1 - chr3L 7996143 3' - invader2 355 1 60.27 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGCATCGCGAGTCGAGAATCTGTATCTCGTATATCTGAGAT:1 - chr3L 14546299 3' + copia 222 1 62.33 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAGTACGTTTTGAACTCGGCCAAAAGGAGGTGGCTAAGAGTTTAGCGCGGCACGCAAGCACATAATTC:1 + chr3R 4659628 3' + P-element 2880 2 73.27 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGGTCCGGGGTCATGGGGG:1 + chr3L 17447589 3' - Tirant 8 2 79.23 GAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCAACCAATTATATAATGCATATTTAATGCTGCCCCGAAATGTGGCAAAAATGCGATTAATAAAATAGGCCACAGAACATGTGT:1 + chr2L 2639864 3' - rooA 7548 2 56.16 TTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAGCCGCCAGCTTTATCTACTCAGTCCTGCTCCCCGT:1 - chr3R 3527033 3' - Tabor 17 2 74.29 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAG:1 - chr3L 18708607 3' - F-element 62 1 63.28 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGAC:1 - chr3R 5087038 3' - P-element 90 1 24.66 TACTTATTAGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCCATATATCCCCGCTGCTGCTGTGGATAACCGCAGTCGGACAT:1 + chr2L 11668794 3' - mdg1 80 2 72.60 GCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCTTAAGACCTCGAACACACCATCGCCTCGAGTGATTCCATGTTTGAATGGCATTCGTTGCTTGACCATCATCTGGATCATACTTGGT:1 + chr2L 1227946 3' + opus 188 4 61.64 AAAAAAAAAACAACAAAAAAAAAACAGAAAACTGTTAAGTGCACATAAATAATGAGACTTAATTATGAGTTATTGTTGGGTGTTTGATGGAGTTCGCTTCGCTCCGCAAAATAAGCTAAGGGATGTCATAACACCCGT:1 - chrX 13172177 3' + gypsy11 3934 112 50.00 AGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGATCTTGGTATAATCAATGCTCTCGTCAACTGTGAAGTGAAATCATATTG:1 - chr2L 6775944 3' - blood 157 2 67.12 AGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATATGTCATCCATTGCTCTTTGAAATATTC:1 - chr3L 22231510 3' - TLD2_LTR 182 1 59.59 AAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTTTCTTAAATAATTAATTAGAAAATATTGGCCATTAGCGGTGGGCCGCTGCAATTTATGCAGTTGCAATGCACAGCAACA:1 + chr2R 15634462 3' + F-element 107 1 54.11 TCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTA:1 + chr2L 14969959 3' - Tirant 82 2 70.55 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATAAACGAGATTAGGCTAAATATCCCAATATGTTTTATCATTAAATATATTTCAATTAA:1 + chr3R 25823066 3' - roo 8727 2 62.33 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGCAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAACCCGCCATGCATGTGCATGTGCTTTGCAT:1 - chrX 15814467 3' - P-element 20 1 70.55 AATTGAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGA:1 + chr2L 13884683 3' + pogo 2042 1 56.16 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAG:1 + chr3L 17447542 3' - Tirant 70 2 69.66 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACGGTCC:1 - chr3L 1387093 3' - mdg3 5280 2 63.70 AAAATGCAATTTACAAAAATTTTACTTAATTCTTGATAGTTCGGAATTGCCTTTCAAAAAGTAATTAGCCTAAATAGAGAAATTCTAGGAATTTTAGCTTTGATAAAAAATATTTGGTTAAAATTCCATTTACTTTTACCCACAGA:1 + chr3L 6280370 3' - transib3 41 1 59.59 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATG:1 + chr3L 4023731 3' + pogo 2049 1 54.79 ACAAATCGACAGGAAAGACACGTATTACAGGCAGCACTAACTTACTTACTATATAGACTATCATTCATGTTTCACGTGCTAATCGTGTAAGTGGCGAGGAGTATATGGAATTGGAAACGTGTTTGTGCAATCAAATCAATCTTAAG:1 + chr2L 12488042 3' - TART-C 63 2 67.12 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATTGCCATTAAGTACTGATAAATGCCACTATTTGTTGAGTAATTTTGGCCGTCTTTGTG:1 - chr2R 18721876 3' + 412 7536 2 73.29 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGCTCGGCCGTCTGTCAAATTATTAGTTGTTTCTCATTAAT:1 - chrX 3444050 3' + pogo 2069 1 59.59 CATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATCTAAAAACGTCGCAGTGTGTGACACATACACACTGAAAACAAATGAC:1 - chr3R 21521329 3' - Bari1 70 1 68.57 CCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCATTATGTCGTACAGTATCTTTTCGGTGTATCTAGTCGCA:1 - chr2R 13685266 3' + G2 2768 1 72.99 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCCATTTTGGGATTTTTGCGGCGCATAATGCAATGCCC:1 - chr3R 25753575 3' - hobo 16 1 75.34 CTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATT:1 - chr3R 13358619 3' + mdg3 5407 2 78.08 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGGCCATCTTTTCGACTGGCTAAATT:1 + chr2L 13547065 3' - P-element 58 1 45.52 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAAAAGCAAAATCCG:1 - chr3R 7739646 3' - blood 7042 2 64.38 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGATGTATATCAAATGTATGTATGCATTAAATTTATGTAAAAATAGGTGATTTTCTATCTTTACAGGA:1 - chr3R 18524231 3' + opus 453 2 56.85 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTG:1 + chrX 10979078 3' + roo 324 2 77.93 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTTTGTCGATTCGGTCACTTGGAAGTCGCAAGACTTTTTGCGCACAGCG:1 + chrX 3444223 3' - pogo 20 1 71.72 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGCAGCAGCTGCAT:1 + chr3L 5490925 3' + 412 7496 2 62.39 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATATACGTATGTAGTAGGGCTCTCTTCCTTTTTTCACCTCTTGGCA:1 + chr2L 15965324 3' - blood 45 2 54.79 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAATGACTCCAT:1 - chr3R 20905343 3' - pogo 26 1 68.49 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATATTAATAATATATAGAATTATACTAAAAATGTTCTTCGTTGCCTATTCGGTCACAGGAATTAAC:1 - chr2L 21724016 3' + pogo 2045 1 61.64 CAAAAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTACCTGTTCTCTGCATTGTTAGTTTCTGGCAT:1 + chr3R 25797585 3' - hopper 1384 1 72.60 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAG:1 + chr2R 12703848 3' + blood 303 2 69.18 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAAATTCAATTCAAGTGCCGCCGTGAGTCATAACTCATGCGACTCATGAGTGCGAATAACAACCAC:1 - chr3L 16180829 3' + Transpac 296 2 75.86 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTTAAAAATGTACAAGTAACTTTTCATGTTTTCTTTTTTCTTTTTGGTACTGTAATACGCACGGCTATTCCCAATTTCAGT:1 + chr3L 5263487 3' + pogo 2062 1 56.16 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTA:1 + chr2R 981767 3' + 1360 3354 1 58.22 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAG:1 - chr2R 9164824 3' + 412 444 2 51.37 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAGACGACTTAGAAACAAATC:1 + chr3L 15261381 3' + pogo 2059 1 56.85 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTTATCCACATT:1 - chr3R 16041104 3' - jockey 68 1 59.59 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGC:1 + chr3L 13597829 3' + blood 7311 2 72.60 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCCTTCT:1 + chr3R 25443124 3' - 297 50 2 68.80 AAAATTTAAAAAAGAAAAAAAATGGCTAATCGAAATAACCTTTTAAGACCCCCATTTTTGAACCCGAACGGGTTGGCTATTACGTGGTGAGTCACTAAAACGGTACCACCAACAGATCTTACATGAATAGGTTTTTAATTTTTTTT:1 - chr3R 3630999 3' + TART-C 11096 1 63.01 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTATTGAACGGCTTAGT:1 + chrX 18193867 3' + hopper 1411 2 78.77 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAATTAAAATTGCATTAAAGTCGAACAGTTGGTAAC:1 - chr3R 9345520 3' - pogo 14 1 74.66 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTACCCAAAAACACGACG:1 - chr2R 14001064 3' - P-element 62 1 20.95 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATCAAGGATAAATGAACTGTAAATATAGGCATTTACTTAAGAAATCGTTTAATCGACATGGGATTAAGT:1 - chrX 14136531 3' - roo 53 2 56.85 ACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATATTTTCATAGTTTCTTGATGATCCAGCTCGATAAAAAATCGTAGCCCCTAACCCACACACACACTCCGGC:1 + chr3R 8160557 3' - Doc 212 1 51.39 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTA:2 - chr3L 18708579 3' - F-element 52 1 57.53 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACT:1 - chr2R 14385578 3' - jockey 84 1 69.18 GCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGTTAGTTTTAATGGGCTCGAAGCATGTCCTGGTAGCAGCAGAATGTCACACTTACGGGCCGGGTGGAAAGCTCGCCAGGTACCCAGGGT:1 + chr3L 11877214 3' + pogo 33 1 58.90 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAGCATTTCTTTGGAGATATTTCTCCCACAACTACTTCTTACTGACCCAAGTGATTTCGCAGCTCTGCGGTCTTGACAAAACTA:1 + chr2R 17144216 3' + pogo 2065 1 59.59 TCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAA:1 + chr2L 21596566 3' + blood 7304 2 71.23 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGCCA:1 + chr3R 25508529 3' - hobo 86 1 78.77 AACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCCATCCAATCGAGTTACCTGATG:1 - chr2R 5900814 3' - Bari1 39 1 55.30 ATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGT:1 - chrX 21474418 3' - 1731 83 1 80.14 GGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCTCATTGGCAGATGGGG:1 - chr3R 14097013 3' - transib2 46 1 49.32 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAAAACACACAAATGTACACTTATCACAATAAGTTTTGCTGT:1 - chr3L 6096449 3' + roo 9055 2 73.97 GGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCAATTGAAGCATTGGAGTAATGCCAGTGCCGCCGGCAATCATGTTGACCCGCTTGGCGGTCACGTGCTTTG:1 + chr3L 11818369 3' + G2 2809 1 53.47 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCA:1 + chr2R 16891839 3' - jockey 89 1 71.23 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCCTTAATAGCTACCAGAATATCAACAAATTGCTTC:1 - chr2R 19985718 3' + copia 168 2 78.77 GCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACACCCATCATATGCGGCCTTCACGCTACCATCACTGGGCTCGATGGGAACCATTGCCGAGAAACCAGTGTCGGGAAACTGAGCACCAGAGAACATTTATCCGG:1 - chr3L 20749287 3' + Burdock 6115 1 59.03 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATA:1 - chr2L 13884571 3' - pogo 55 1 56.85 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTTTTTTTGTTTTGATGCAAAAGTTGTGTGTGCCCCCCAA:1 - chr3R 18903341 3' + pogo 2090 1 78.08 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTAGATCCAGCAAACGCTCTAAAATCTGGAAGTCTAATTTG:1 - chr2R 7534564 3' + roo 9034 1 60.27 TGTGTGTGTGAGTGTGTTCATATGCGGCATGCTTTCAATATAAAGCCAAAAAAGACTCATCACCCGTCCGCTCTCCACATCTCTTTCTATTTCTTCTGTCATCT:1 + chrX 14990206 3' - accord 7026 2 34.62 CACGGCCGCTGTCCAGCATCCGAGGTATAGCTTCGTTTTTCGTGTGTCGTTAGATGCAGTTTTTCCTTATGTTAGTTGGTAACTTGTACTCTATTGATTTTATCCTATATCATTGTGAATAAGTTCCAT:1 + chr3R 5027294 3' - Chouto 63 1 37.21 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTGCCTCTTAAAGGACTTATATACTTATATTTGTGTATGTAATGGGTATCGGATGGCTTATACTTTTATTAGCAAAGAACAACTAATAGTTGAAATCTCA:1 + chrX 20386814 3' - hopper 20 1 44.52 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTCACGTTCAAGGCCATGCC:1 - chr3R 10079241 3' + P-element 2878 2 79.45 AAAAAATAAATAAATAAATGGAAGCACTTGTACTCCAACCAGAACCACTCACACACGCGCACACACAAGTGCAGGCCACGCGCAGCAGAAAGGCAAACAGCGGAAAATCGAAAAATCAGGCGGCAAGACCGCAACAACTGCAGAGA:1 + chr2L 6078907 3' + Doc3-element 82 1 66.44 GTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGGGGACGAGACCATCCGGGGGCCACAGCTCTTCGTCGAGGGTCAGCTCATCGGGGTAACTAATAAGCAAATATTCTTCAATGAATATCTAAATATTTAACAAATTCATTATCTGCAGGA:1 - chrX 3466334 3' + hopper 955 1 77.40 AAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAAAGAAGAGCCACATGTTGAGAGCCAAGATGTAGGCCGAGAGTTGCCGCCCCAGG:1 - chr2R 10372465 3' + Doc2-element 4555 1 67.12 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATA:1 - chrX 14914334 3' + mdg3 198 2 52.05 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATTCACGAAAACAGAAGGGCACAGACCGAATTGCCATCGGAGGTACAGCGATCTTCAAGTACAATAGAAAATTTCAG:1 - chrX 8895182 3' + roo 9030 1 52.74 CAAAACAAAAAAAAAATAAAAATAAAAACAACGATTTGAGGGCGAAACAATTGAGGCAAGACTAATTCAAATTCAAGTGGCAGATTGCTTGATCTATTTCTGCTGACTCTCGATGTCTGCCAA:1 + chrX 5157311 3' + R2-element 3585 6 73.98 TGTGATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATTGTATTGTCTTCTCTCTTGTACGTTTACTAGCAGCAGAGCACCAAATCTTAAACATTTCCGCATTTGATCACCCGTTGAGAGCAAAGAACCTGTATTACCATTAAATGTCC:1 - chr2R 23938611 3' + BS 5052 1 68.49 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACATAAATCACGACTAACACTTTAGCAAACATAAGTTTTGCAGTAATAACACTTGTTATCTTAAT:2 - chr3R 23449235 3' + roo 357 2 52.74 GCCGTACGATACACGGCAGCGCCACTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCGAAATATGCGGTATTCTACTCTTTGTAGCTTTTTAGTATTGCTGT:1 + chr2R 1949175 3' + Cr1a 4397 1 71.92 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGAAATCCCTTGAGGTT:1 - chr3R 29708923 3' - blood 7019 2 71.64 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACTAAAAAGTTCTAACAA:1 - chr3L 13597708 3' - blood 10 2 77.27 GCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7198 2 81.16 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTCCGCAAATGTATTAAGGTTGCCTGGCCTCGA:1 - chr2L 14796882 3' + I-element 5264 1 77.40 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTAATCATACACAT:1 - chr3R 18665261 3' - 1360 73 1 73.29 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCTCTCTCTTAAATCTGGGCAAACGACATTCATAAT:1 + chr3R 26315967 3' - roo 86 2 77.40 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAAGAAAGAAAGATCCAATACCACTATTTATTTTAAGAAATGTT:1 + chrX 22960617 3' + 297 375 2 71.92 ATATGGATGATATAAAAATCTTTTCAAATACAATTGATCATCATTATCCGGAGTTCCCAGTTAACCATTTTCAAACAGTGCCTAACTCATTTATTCCCCTTTTTGATATAGTTGATATCAGCTGTGACAAAATTAATTCGATAAAT:1 + chr3R 2647452 3' + TLD2_LTR 44 1 75.34 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCG:1 + chrX 16853418 3' + roo 9003 2 65.75 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGCCGCTGGCTATGCTTGGTGGCCACGGATTGCTGTCGCCGGTGACCACGACAACGCCCACTAAAATGATTAGCTGCGCCCAGCTGGATGAGGCC:1 + chrX 11896920 3' + mdg3 211 2 64.58 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAACTTTGCTCATATAAATTGAAAT:1 + chr3L 13597891 3' + blood 7373 2 73.97 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCATTCGGTGTTTTGTACTCGGCGAGACTGGAAGTTGATGCTGCCGCGTGAATGC:1 - chr2L 10474295 3' - P-element 48 1 51.37 GGTCATCGCCACGTACTTTCTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTTGGCCAGAACTTAAGGCAACTTAAGTCATCAGCTGATAGCACTCTAAAAAGAGAATTACTATTTCCTA:1 - chr3L 4771181 3' + Burdock 6300 2 50.35 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTG:1 - chr3R 8367122 3' - Doc 34 1 56.16 TAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAA:1 + chr2R 10367582 3' + 412 7494 2 50.00 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGGGCAACAGGTCCGGCAATTGAA:1 - chr3L 16180892 3' + Transpac 232 2 71.92 ATCTATATTATTTTTTATCAATTCTATCAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTCAATTGCAATGCCTTAT:1 + chr3L 16047751 3' + 1360 254 1 32.19 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCAGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGCGCCAAGTTTTCTGATTTCAT:1 - chr2L 10474346 3' - P-element 86 1 19.55 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACATTTACGATTATTATTTTATGGTATGGTGTTGGTGTGGGTT:1 + chrX 14908518 3' - blood 17 2 73.97 GGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGC:1 + chr3R 30731526 3' - gypsy6 7432 2 74.66 CACACTAGCTGAGAAACGGGTTTTGGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTCTCCTATTTTATAATATTATTAGTCGTGTAAATTGTTATCGATTTGCCTAAAAAATTCAGTCCTTTTAGCAAGCAAACATCAAGCTTGGCT:1 + chr2R 21500571 3' + INE-1 539 1 75.34 GAAGATTGAGATTCAGCATACAGATTATAGAGACATAGACGCAGCGAAAGTTTGTTACAATAATCACATTGCTGCCAGGTGAAATTATCCGAGTAACGGATCAAACACCCAATTTAAACATTTTCGCCACGTCGAAGAAACAGAAT:1 - chr4 163637 3' + INE-1 173 1 38.36 TTGTTTTTTTTATTTTGTTTATGGGACAGGCGGGATCTGCGGACCAAGGAGTTAGGGCCTCGACTGGAACTAGAGCAGG:1 - chr3R 16070432 3' - Porto1 163 1 70.89 CTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGC:1 + chr3L 16180959 3' - Transpac 79 2 71.92 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGCGGACTGTTCTTGGACTTTTTTAATCATCATTAACCCCC:1 + chrX 5892157 3' - transib2 78 1 72.41 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGTTGCGCTTCTTTTAATTTAATTAAAGGCAGTAAACTGAAACCAAGTACA:1 + chr3R 25876998 3' + mdg3 5473 2 67.12 AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTATTTTTCCATGCGTTCTACGAGCAATTTAAGTCCCCATA:1 + chr3L 11669856 3' - Tabor 6922 2 72.41 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTTTATGCAG:1 + chr3L 13722149 3' - blood 29 2 65.97 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTAT:1 + chr3R 26399893 3' - roo 57 2 62.33 GTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGTTCGACATCTGCAAACTGAAGGTGCACACCAAACGCGGCATCCGTGAT:1 - chr2R 23326813 3' + 17.6 206 2 67.12 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGT:1 + chrX 21213409 3' - Doc 46 1 51.37 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGAAATATATCTTTGGCTTGTT:1 + chr3L 17667645 3' - F-element 55 1 47.95 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAAATACATTTCTAAGTGGAAAATTAATTCAAGACCTGCTGACCTTATTCGTGTGTATTTTTGTGCAGTGCACCTGAAGAATTTCGCGACTCAATTCAGCACTTTTGCG:1 - chrX 17469128 3' + blood 362 2 74.66 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAATATACAAAATAATTTGCTGCACTCGCACGCACACAC:1 + chr3L 20785594 3' - P-element 8 2 78.99 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGATTTCTCATTCGTGCGAGAGCAGAGCTGTGTTTGCTCTCTCTGGCTCTCTCGCCCATGCGCG:1 - chr3L 20785413 3' + P-element 2864 1 67.12 GACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTAGTTATTACTTATTACAATTGGGTTACACTGGGCCATATCTTCAATCGGTCCCGTCGTCGGTCCCGTAGTATGGTATCCGTATTTTAACCTCATTTGACTTCTAC:1 - chr3R 16535258 3' + Stalker2 7616 2 53.79 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAACACCCGAACTACCATTAATGGTGTCGGTACTGCTAAAGGAAACACAAATTAACAAGGTGTCCTTACCGAGAGCATTCATTAAAAATAATTTTCATA:1 - chr2R 15062132 3' + blood 352 2 67.81 GATGGGGGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGAT:1 + chrX 19231819 3' - mdg3 5334 2 71.92 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTG:1 + chrX 21668883 3' - mdg1 8 2 77.40 GTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCATACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGGTAACTTACACATGACCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCCAC:1 + chr3R 24175752 3' - Burdock 73 2 72.93 AAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATAGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCTGGCAAGTTGATGATA:1 + chr3L 15099682 3' - G4 3814 1 56.16 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTCGCTGGAGCGCACGCAAAAGTCATGCACTGACAAAATTAATTTAAAAAAATTAAAATTCC:1 + chr3R 15030767 3' - jockey 70 1 58.90 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAA:1 - chrX 16853334 3' - roo 8734 2 66.44 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACCTCTCCC:1 - chr3R 20292388 3' + pogo 2077 1 69.01 GCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTC:1 - chr3R 3527099 3' - Tabor 6928 2 75.34 TTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTGTTAAACCAAGGCAAAAGGGTAAATGCAACTTTTGGAAATGATCTTACAAATATTCATTATCCAGAAAA:1 + chr3L 12030651 3' - I-element 5167 1 71.92 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGAA:1 - chr3L 9571613 3' - jockey 31 1 66.90 AATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTAAACAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAA:1 - chr2L 8959900 3' - Ivk 5148 1 52.05 ATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACT:1 + chr2L 21400812 3' + Doc3-element 4671 1 45.21 AACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCG:1 - chr2L 20360643 3' - micropia 5099 4 54.14 AAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCAGACGTAGAGGCCATCTGGCCTTGTACATTTATCCTGTGTTGATAAATTCCTACCCGC:1 - chr3L 23025575 3' + R1A1-element 354 1 74.48 AGAAAAAAAAAAATTATACAAAGGGTTTTAGGATGTTTGATGATACATATGCAAGAAATTCATCAAAAATTTGATGAT:1 - chr3R 14590363 3' - Tc3 81 1 87.18 ACTTTGGTTAGATTTTTTCTAAACTAAGACGTAAACAAAGACAACAACAATTGCAACATGGAACACAAATTGTAATTTTAAATCAAGTATATATGTACTTATTTTAATTTCCAATATCTTTCAGAGCGGGCACCCGGGAGGTGCAC:1 + chrX 3699114 3' - transib3 374 1 58.22 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAAGTGATTCCGAATGCACCACAGATCCGAGAAAACTTTCTAATGCAGGGGCCCAGGAACCAAAATCATTGTGGATGAGGTGCA:1 - chr3R 28033568 3' + diver 184 2 56.16 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCG:1 - chr3L 9571650 3' - jockey 68 1 59.59 CCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTTGTTGCAGCCTTATGAGCTTGGTGCTTCCGGGAGTCCTTAGAAGGGAGGTTCTAAGCAGTACCTTAACCAT:1 + chr3L 26645605 3' - Rt1a 5009 1 52.05 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGAACCTTAGCATTCTCGTAGCCATTTTTCAGGGTCGCTGGGAAGATAGTGATGTCAAAAGTAAACTTT:1 - chr2R 4638797 3' + 1360 3335 1 97.26 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGGCCCGAAATTTGGGACAAA:1 - chrX 21086084 3' - jockey 4713 1 46.38 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACGGCATTTTGATATTATGCGAAATTTTA:1 + chrX 18193853 3' - hopper 18 1 69.18 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTATA:1 - chr2R 14246954 3' + pogo 2043 1 59.59 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTC:1 - chr2L 19424677 3' - Tirant 88 2 76.71 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGCCAGTTTGTTTTCCCG:1 - chr3R 19700865 3' + roo 353 2 61.64 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACAC:1 + chr3R 7424627 3' - 412 70 2 66.21 GGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTTAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGAGTCATATGAGGTTCTGCGACTCCATAAAATAAAACTT:1 - chr4 255909 3' + Doc 4586 1 71.11 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTG:1 - chrX 22858839 3' - mdg3 5302 2 52.74 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCCTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGATTAATATAGCTGAACTATTATTTTAACCGTTGCTGTTGAAAG:2 + chr2R 10552446 3' - S-element 75 1 70.55 TTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGGATTCATTCAAATAAAAAAGCCGCTCACATTAATATATTTCGTTATTGACATTTTTA:1 + chr3R 22826998 3' + Stalker2 7494 2 71.92 TGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTT:1 - chr2R 10478683 3' + invader4 3015 2 65.75 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAGGCCGTAATCTACGACATAATGCGTTGCCCAATTGCCCCAGGCAGCGGC:1 - chr3R 12537724 3' - Doc 72 1 65.07 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGATATGTTTTCTAAGATGTATCTTTTGCTACCATAAACTGTAGCATTATGTGAAGTATTTATGAAATGAATCGAGCTA:1 + chrX 11534555 3' - roo 8706 2 55.48 GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCATCAGGAACTACGTAAAATTCAACTTTGCATGTCTATAC:2 + chr2L 22513378 3' - Stalker2 7330 2 73.29 CTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACATGTACAGTACCCCCCTCTGCGCTTCTCAATGTTATTAG:1 - chr3L 20925768 3' - Transpac 79 2 68.49 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTT:1 - chr3R 31956368 3' + pogo 2060 1 57.53 GGACACGGAACTATGTAACAGGCGACAAAGCATGAGAGGCACACTGACCCAAAATCGGAAAATCATTTATACAATTGCAAAGCTATATCACGTTTTGGGAACTCATTTGCTAGCACATTCATATTGAGGATCGGTTTCGGCCCACT:1 + chrX 10570339 3' + Helena 307 1 50.68 ATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAA:1 - chr2R 5582165 3' - Cr1a 484 1 47.95 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATCGTTATGGAGGCAATGCCCGCTTGATTTAAATGGTAAATTAATGGGTTACTTGTGATATATTATTTCCATAAATAAATTGTACATTCTATGCGGGC:1 - chrX 16982183 3' + roo 385 2 63.70 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCATTGCGGTGGGTATGGGCTTGGCATGGCGTCCTTTGGTTAAGTTGCT:1 + chrX 15089637 3' - P-element 14 1 76.03 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGAAAAATCGTTGTTTGACTTACAAACTTTATTGTTCATAGTCATAATCAGCTGATTTCCAACCCAACGTTAGCATC:1 - chr2L 14359018 3' + pogo 2057 1 56.16 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCACAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCT:1 + chr3R 15514598 3' - 412 7133 2 69.86 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATA:1 - chr2R 18123407 3' - 412 48 2 50.00 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATGGTCATCACCAACTGGAGAGAGCAAAAAAAGAGCGTGAGAGTACT:1 - chr3R 10140197 3' + P-element 2812 1 30.82 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGA:1 + chr3R 9482109 3' + roo 345 2 61.64 GCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAATGAGGAAATAGAT:1 + chr2L 18689264 3' + Gypsy6A_LTR 266 1 78.77 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAA:1 + chr2L 7991357 3' + 297 6896 2 74.48 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGA:1 + chrX 15167776 3' + roo 9030 1 56.55 GTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAATGTATCCAAAG:1 + chr3R 29709096 3' + blood 7375 2 70.54 AAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGACTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 4464167 3' + 1360 3317 1 70.15 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTG:3 + chr3R 13358670 3' - mdg3 5334 2 70.55 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGCTTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCTTCTCTTCATTCCA:1 + chrX 983253 3' - 412 29 2 65.52 CTGGAATGCGAAGAGTCGCACTCAGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGTTCATACCAGACTGTTAATAAGCAAACAGTCCAGGATTCTGGATTCAGTTCAAAAACAACATACGCCTTGGATATGGAACCTGCTTT:3 - chr2L 22643327 3' - invader4 2766 2 52.05 AGTTCTTTGGCTTGTGTTAAATACTCCCCCTTCAAGATCATCCCGTTTAATTAGATTGCAGATCTCCGCGCTCCGATGAGCCGTAGACAGGTGATGCCGATACAAATCAATGCACAACAAATCGCTGTTGCGATAAATATTATGCG:1 + chr3L 23372155 3' - Gypsy6A_LTR 1 1 71.23 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGGCCACGTTAGCCCGCGTTGGGGTAACCATTTTG:1 - chr3R 26782663 3' - hobo 14 1 75.91 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATCATTTATGGCTCACA:1 - chr3L 18468325 3' - jockey 4706 1 56.16 CCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAAAAGGAGTAATACAAATGTTGATGTATTTATATTTTGCG:1 + chr3L 14459139 3' + roo 8653 1 73.29 AAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACACTTAAATCAATGCTTTCTTCAACTTCAAGTTGTGAAGCGAATTTAGTTTACTTAATTAT:1 + chr3L 9871223 3' + Doc 158 1 59.59 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACAT:2 + chr3L 9242062 3' + roo 8983 2 77.40 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATT:1 - chr3L 4710705 3' - Doc 49 1 54.79 CTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACCACGGCCTTTTTGGTATGTACAATGCGTGTTGGGGATGGCCAGTGCTATGTTATATTTGGGTG:1 - chrX 19222690 3' + I-element 336 1 56.85 CTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATACTCACTCGTTGCGGAAAAAAGGCAGGAAAGTCAGAAAAAGCCGACAAATGACACACGCAGACGGTCACAAAAGACA:1 + chr2L 7267576 3' + Stalker4 20 4 50.68 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACTGCTCAAGCGGC:1 - chr3L 19274766 3' - transib2 38 1 59.59 ATGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAAGTAAG:1 - chr2R 19633226 3' - jockey 4659 1 72.60 AACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGATCAATGTACTAACACCATTGACCAGCCAGATGTG:1 + chr2L 8397279 3' - roo 8696 2 64.38 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCCGGG:1 + chr3R 7424660 3' - 412 38 2 58.22 GCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAATACAAATGTGGTGGGAACGGGGGGAAGTGGGAGCGTCTAATTATAATCAAGTCGCGTCAAGTCCTTCAACGTGCATCTCTCATATCGCCTAGATCCTAGT:1 - chr3R 9993314 3' - hobo 2729 1 72.60 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTT:1 - chr3R 10079276 3' - P-element 41 1 56.64 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:2 - chr2R 20461151 3' - jockey 21 1 71.88 GGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGA:1 + chr2R 6984391 3' + HMS-Beagle2 232 2 74.66 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCTGGAAATTTTTTTAAAGGTCATTCAAGCTTTGCAACATTTTAAGTTAGCTTATAGCTGCATTTTTAGAGTCAATTTCAA:1 + chr2L 7215644 3' - 297 6620 2 56.85 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGTAAAGAGCT:1 - chr3L 4869164 3' + roo 8999 2 66.44 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATGGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACATCCTGGGTGAGACAGCC:1 + chr3L 4023752 3' + pogo 2072 1 62.50 AGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTTGCGACATATGTTGTCCAGACAGGACGTGACCAGCATATTGGCAACCGAACCCTTGGGCATGTACTTGCTCGTCTT:1 + chrX 6251611 3' + BS 4829 1 50.68 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGAACACTTCTTACAAATCGTATAAGCACTTTTTAATTAAAGTTTGTTAATAATTATTTACACATATTAGCAAGTTGTCTAAACTAAACTTTGCTT:1 + chrX 21205114 3' - 1360 28 1 63.70 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGTCAAGCAGGAGGAGCTGCACTGCCTGCTAATAAGTTGAT:1 + chr2R 7223778 3' + blood 7366 2 64.12 ATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGACTGACTGTGACTTTAACCGTTGGCGTTTGCGCCGCAGCCGTTAATTTAGACTCCG:1 - chrX 2363162 3' + G2 52 1 61.81 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGACTATTT:1 - chr2R 6945621 3' + pogo 2039 1 65.75 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAG:1 - chrX 19498088 3' + P-element 2816 1 36.36 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACCCAACAGCCATTGATTCTAATCTCAAGCAGCAGTTAATAATTTTAGGCAAACAGCAAACATAACAACTTATGTATATACCAAAAAGAAAC:1 + chr3R 18665381 3' + 1360 3361 1 67.12 GTGAAAAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAATCCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGGGGAATGTTATACCGCTTTGTGCTATCCAAAAGCCGAACAAAAAATTCATTAAAGTTTCCTC:1 - chr3L 15551466 3' + S-element 1338 1 60.96 CTTAGTTTCGTGGATGCTGTCCTTTTTTTGGGGTATTATGCGGAAGTTGTATTTTCGAACAAGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAGTATTCGAGCTTTTCTCTGTATATAGGTGGGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTTCATC:1 - chr3L 25552483 3' - Fw3 82 1 73.79 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTTTAACTTTCTTTTGTTTGGCCACATTTTGCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAAAAAAT:1 - chrX 9951307 3' - hobo 14 1 76.03 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAATTGAGGCCATCCTCAGGCCGAAAGGAATCAGTTATCA:1 + chr3R 20149836 3' + 1360 3372 1 73.97 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTCAGTCAC:1 - chr3R 14331157 3' - Burdock 28 2 52.03 CATGCACCGCGGCTGTTGCTAGGCCGCTCCCCTACACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCACAGTTTTAATGTTTGGCACTTAATACCTGGTTCCTTTATTATATTAAATACCTTATTTGGACCAATTTTGTGAACAATT:1 - chr2R 2015758 3' - gypsy8 46 2 72.60 CGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGATTTATGTTGTTGTAAAAGACCTATTTAAATATTACAAAAATTATAATATATCAGCATTAGCAATTATC:1 + chr2L 18495507 3' + Tirant 409 1 52.05 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCGTCTGATTTTTATTACCCATGACAAAATCCAATTGAA:1 - chr3R 7569537 3' - Doc 8 1 56.16 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAGCTGGGAATTGCGAATCAGC:1 + chr2L 15920190 3' - jockey 56 1 51.37 GGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTGTGAGCGTGGCACCGCCTGTTATATATTTTGTAGTTTGTAACT:1 - chr2L 7178811 3' - gypsy7 5258 2 50.68 AAATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAGCGATGAATAGTTCTTCTTGTCATGTTCTGTCTG:1 + chr2R 2527457 3' - roo 73 2 53.47 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCCTTGTCCGTATTTTGCTCTTCTGTAGATCATCGCCACA:1 - chrX 11534456 3' + roo 326 2 72.60 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAG:1 - chr3L 9426676 3' + P-element 2822 1 39.73 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAAGTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCG:1 - chr3L 10370872 3' - copia 4921 2 57.64 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCAACTGAGTCTTGAAATGGATTCATTGC:1 + chr2R 9164967 3' - 412 31 2 63.01 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGT:1 - chr2R 7404694 3' - blood 82 2 71.23 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAGGTGCTTTTGGAGTCG:1 - chr2R 14562108 3' - Burdock 58 2 61.64 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAA:1 - chr3L 14581354 3' + pogo 2063 1 59.59 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGA:1 - chr3R 6782721 3' - jockey 4751 1 67.81 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAG:2 + chr3R 23507669 3' - 412 68 2 63.70 GATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCGTCGCTCGGCGCCT:1 + chr2R 13574858 3' + diver 213 1 63.11 GAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCGGCGCTAGTTGCCTGTCAAATTAGTTCGGTTTCACGGTGACCGAGCCGCCGG:1 + chr3R 4885411 3' + 1360 3320 1 67.12 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAGTTCCGGTGCGTCAGCTATTGCAGTTGGTACAGAATT:1 - chr2R 9164811 3' + 412 458 2 60.69 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCCCGCGGAGAATAAACCGAGAAATGTGGCAGGCGAGGT:1 - chrX 18125140 3' - BS 5062 1 70.31 GAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATTCTTATGATATCAGCC:1 + chr2L 12481522 3' + pogo 2033 1 65.75 ATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAAAAACCTTCTTCTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCC:1 - chr3L 25411052 3' + F-element 309 1 62.90 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTTCCATTTCTGTACGAGTGAGCTAAACATGATTTCAGCTTTCAGTTCTCGCTTGCCAGTACTTACGCTCGAATAAATTTTAATAG:1 - chr3L 15371263 3' - Transpac 35 2 62.33 GGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCAAGGCAGTTCGAAACGGGACAGTGAAGGCAGAGAAGACCGATTTTT:1 - chrX 22564553 3' + G2 2684 1 69.18 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTTCAACTTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCAC:1 + chr2L 14262966 3' - blood 17 2 69.18 ATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGCTAGTCTTAAGTTATGTTGGCCAACTCACAGTTCGTCCTCCAGTTTTCACCTGTTAAAG:1 - chr2L 10155754 3' + jockey 4816 1 66.44 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGCATTATCTAAAAATATCACTGCAATCGAACGGAAATAGATGTGTGCTTCATTAAAGTACAGAGCTTAAGTTCAATCAGATTTCAATCAAATAACGTTAGGTAA:1 + chr3L 9689649 3' - mdg3 18 2 73.29 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAAT:1 + chr3R 20452263 3' - blood 7092 2 73.29 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACT:1 + chr2L 1229684 3' - opus 7074 4 73.97 GGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTCATTTAATCTTAATCAACTTATTTCTCTAGTACATTCGTAAGTGTCGTTATTTACATTTAAAACT:1 + chr3L 15447138 3' + Tirant 181 2 55.48 GAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCAGTAAACGGCGGCTAAATAAGTATATTAAACATTTTAAAAATTTAAATAGCAAATTCAGCTCATAGAGAGCCAGACTATTTTTAAACGATTGCGTTCTTCTCAATTGACTGC:1 - chr2R 10453323 3' + mdg3 5469 2 53.42 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAA:1 - chrX 23282941 3' + roo 9013 2 58.22 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGCAATTTGATTTGAGTTATGCGACAACGTTTCAAATATGTAATACT:1 + chrX 6398858 3' - blood 7088 2 68.49 GCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTAAGCTCTGCTTTCATTAAATGCCGTCCCCCACCGCCGGAGGCGTCTATTTGGCACAGGTGCTGT:1 - chr2R 20401914 3' + Stalker4 7246 4 69.18 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGGTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAGGCTCGAATAATTTACATACATTCTGGCACTCTCCGT:1 - chr2L 20922988 3' - pogo 19 1 69.86 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTG:1 - chr3R 4722392 3' - roo 8737 2 69.86 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCGTG:1 + chr3R 22429265 3' - roo 8694 2 64.83 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGCCAGCCTGCTGACCTTCTT:1 - chrX 9951370 3' - hobo 75 1 68.75 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAAACTTGGCGAGATTAAAATACTTGCACACGAAAATAGCAGCGACCATTACGCATACTTCCAAATGGAATAAATATATTTATTTCTGTA:1 + chr3L 293994 3' - FB 34 1 63.01 GAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTATTTAACAAAGAATCCAGGCTATTTTTTGACTGTGACTGCTTCTGTGACTCGGACTGTGACTGTGACTCTGATTGTGACTGAGATTCTGAAACAGGTGGGTTTTCCAACAG:1 + chr2L 18358276 3' + mdg3 5490 2 56.85 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTT:1 - chr3L 15891011 3' - mdg3 5318 2 63.70 ACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTT:1 + chr2L 8393049 3' - I-element 5193 1 67.12 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTC:1 + chr2R 15392798 3' - blood 68 2 63.70 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATG:1 + chr3L 22481305 3' - roo 8749 2 76.03 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTAACCTAACCTAACGGCTTAAATAGCCGGCTAGGGTTAAAACAATCGATTCATCGATTTTTGATATATTATT:1 + chr3L 22676418 3' + 412 482 2 77.40 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGTGCTTTGGTTTGGTTGATTACCAAT:1 + chr3L 14043654 3' - Ivk 23 1 67.61 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGGTGATCAGTCATGGCATTATTGACAGATAGTTTTCCG:1 - chr2R 8793903 3' - Transpac 5000 2 73.97 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTAAATTTTGGCATCAAAAGTTGGCAGTGCTGAAATTTAATTTCATTTTTAATGGATA:1 - chr3L 11669729 3' + Tabor 7313 2 73.97 ACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCA:1 - chr3L 14854643 3' - rover 6980 2 66.44 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCTCGAGC:1 - chr2R 982288 3' - HMS-Beagle 30 2 64.58 ATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACACCGACGCTTCTCAAAGAGAAAAAATACCCAC:1 - chr4 1301736 3' - 1731 74 2 65.07 TTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAGACGAATTTACTTTCTTTATGTGAGACTGGAACATAAACTTTTATTAGAAGACCGCTTATTAAGTAAATCTAAAGCCACTAGATACTTTGTGGGTGGAGTTTGAATGGAACTT:1 - chr3L 18399971 3' - I-element 8 1 79.45 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATTTGGC:1 + chr2R 12703895 3' + blood 349 2 64.38 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTTTACTTTGCTTGGTTGAAAAAGGATAATCACACATATATAA:1 - chr3L 4175204 3' + roo 399 1 76.03 AAATAGAATTTGCTTGCATGTTAATGTTAAATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGC:1 + chrX 23362226 3' - 1360 3261 1 77.40 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACTTAATTTTTCAGTATCAAGAATTAGGTTGACAAAGAGCTATATCCATGAACGGCAGAGAAGCCTGCATTTTGCCAAAAGTACTTAGTTGGTATTGGACCAT:1 + chr3L 23038959 3' + 1360 6 2 77.40 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTCAGTTCAGCTCTGCCAGCTTACAGATTCTG:1 - chr2R 22255278 3' + roo 9055 2 75.34 AACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGAGTTTGTTAGTTTTGGTAATTTAAAAGCCACAACCCGAAAATCAGTCTAGGTGCGCA:1 - chr3R 27053805 3' - HeT-A 6056 2 62.12 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGAAGAGTGCTTATAGGAGTTATCGGGAGCTTATCAGGTGTT:1 - chrX 3529692 3' - 412 7073 2 71.92 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTTACCTATTTCATCAGTATGAGTAAAGACGTAATAAATAAGCTGAAGG:2 - chrX 6398801 3' + blood 7315 2 67.12 GTTATTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTT:1 - chr2L 17841011 3' - Juan 4076 1 53.42 AAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAAGTTGTTACCTAATTCAACTACAATAACGCGCAACAGCAGCACCAGCAGGCCATACACTGAACAAAATCAATAGGCTGGTTTAATGATCATAAATAAAGTCG:1 - chr3L 8395819 3' + Tc1-2 1427 1 64.44 TTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGA:1 - chr3L 16973370 3' - S-element 1588 2 59.59 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATA:1 + chr2L 13884685 3' + pogo 2044 1 56.16 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAA:3 + chr3L 21093251 3' - Ivk 44 1 55.48 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAA:1 + chr3R 4722472 3' + roo 338 2 65.75 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGGGATAACCCTTGGGCGCATTGTTCTCTAGGCATTATGGAACGTGTCTGGGCATCTCTTGAGTTTTGG:1 + chr3R 31120286 3' - opus 7052 4 53.42 AAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAACAGCCCAGGCAA:1 - chr2R 20362199 3' + diver 165 2 58.22 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGC:1 + chr3L 20977440 3' - I-element 72 1 63.01 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAAAACACCGTTC:1 + chr2L 21237320 3' + P-element 2834 1 48.97 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTCATCTAAATTATAAAATTTTTGTGGACTATTTGATGTCTAAC:1 + chr3L 22676350 3' + 412 7467 2 70.55 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGGCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAACTTTCATCACAATTCGACAAAAAGGATAAAAATGAAAAATTGC:1 + chr3R 25354597 3' - 297 6607 2 70.59 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTCGGTCTGTCCATGTGTAGGTGGTACGCTCCGCTCAAGGTCGCTCCTCCACACGCACATTATCAAGCACAAACGA:1 + chr2R 5849075 3' - mdg1 7085 2 52.05 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTA:1 - chr2R 17014022 3' - HMS-Beagle 6858 2 62.33 TTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGA:1 - chr3R 9289316 3' + HMS-Beagle 6960 2 75.34 CTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCAGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACTGTCCTGG:1 - chr3L 1387090 3' - mdg3 5272 2 66.67 TATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATACCCTATGCCCATGTCCATTAAC:1 - chr3R 23020787 3' + INE-1 559 1 64.38 TTTTTAATAAGTGTGGGCGTGACAGTTTGGGACGGTTTCTAGACAGACAGACGGACATGCTCAGATCGACTCGGCTATGCATTTAAATTTCACTGAATTCAATTGCCGTAATTAAGTCAAATATGCATTCAAATGTTAATTACGTC:1 - chr3R 4552883 3' - INE-1 252 1 52.74 GACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTG:1 - chr2R 10478693 3' + invader4 257 2 70.37 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAAATACAAAAATCTTCAATCTTTTAATTAAACAA:1 - chr3L 6096488 3' + roo 352 2 53.42 CAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACGAACCAATTTCAACAAATCTAGACCCCCTACACACTGAGAAAAATAA:1 + chr3L 14863923 3' + Transpac 235 2 65.75 ATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGACACAGTGGTGCTCTGTATGGTGGTCACGAAACTAGGGGGCTGAATGCCACCCTTT:1 + chr3L 2092007 3' - R2-element 3429 1 62.33 GATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTGATTTTAGAGCGGAGCCGGAAAATTCGAAATGGAAATGGAAAATTCTTTGAATGGGCCATGATGTTTATGGCGAAATCTATATTTTTGTAAGCTACGCTCCGGTGTCCGG:1 + chr3L 21481448 3' + Cr1a 4267 1 74.66 CTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGA:1 - chrX 12893357 3' + Bari1 1628 1 71.92 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGACTTT:1 - chr3L 16887330 3' - roo 83 2 75.34 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATTTGGCAAATGTTAACTTTGCT:1 + chr2R 12703911 3' + blood 7377 2 75.34 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTT:1 + chr2L 10832338 3' - Doc 69 1 63.70 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATC:1 + chr3R 15514612 3' - 412 62 2 60.56 CACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAGTACGGGATTGATGCAAAGAAGCGGCTGCGTG:1 + chr4 1097712 3' - Tc1 1613 1 79.14 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTCTGTGCGTAAATAACATTTAGTTTGTTCATCCTAAGAATTATTTT:1 + chr3L 5446233 3' - roo 27 2 67.81 TTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAATGAATTTTAAAAGCTCTAAAAAGGGCATTCAGTA:1 - chr3R 20001599 3' + FB 60 1 66.43 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAAGCTCCTTCCACCGAAGTTTGGCATTTGCCAAACATTTGCATATGGGACCAACTGTTTTGAATATTGAAAGCAGACAACCAACCAAC:1 + chr3R 15590685 3' - roo 8701 2 60.00 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCTGCCGTTCTCCTTTT:1 + chr3R 10468132 3' - opus 7034 4 64.38 GGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAAAAATCAATATTTCCTTTTGGCGAAAGACACTTATACGTGCAAAATCTTTG:1 - chr2L 22696352 3' - X-element 16 1 71.43 TATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGACATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAAC:1 + chr3L 23112570 3' + R1A1-element 5276 1 56.30 TATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCC:1 - chr3L 24153194 3' + Tabor 7241 2 73.97 CAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGGGCGTATAAGTGTGTTAAAAGGGTGAGAAGCCCTACATTTGCGACACCTGTGGACAGGCC:1 - chrX 7012339 3' - BS 5054 1 56.43 AATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGT:1 - chr2R 5582131 3' - Cr1a 450 1 71.23 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCAT:1 - chr2L 20984303 3' - blood 7076 2 63.01 TCCCGACACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAACGTGCCTTTGCCGCAAATCAATTGTTACATGGGTCACTACATTCTGACACCAACCCTCGAGAATGCCGAATTCGCTGAGGCAAAACAGTGTTTAGAACCAC:1 - chr3R 12239154 3' + mariner2 110 1 74.66 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACT:1 - chr3R 15465503 3' - mdg3 5339 2 75.34 GTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGG:1 - chr3R 443030 3' - gypsy2 6516 2 65.07 GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTT:1 + chrX 22824816 3' - jockey 4741 1 67.12 AGTTTGTTGTTTATTATTTTCTAGCTTAATTATAGTCGAACCTGCAAAGACGTAACTCAAGGAAGTTTGATTGCGTTAACTTGTGTAACTGGTCCAGATTTGTGGCTATCGCTGCTTTCCTCTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACC:1 - chr2L 7170402 3' - gypsy7 5015 1 86.30 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAATATTTTGG:1 - chr2R 5848971 3' + mdg1 349 2 67.12 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTTCCTGTTTCAGTTAAGGGCTGGATAATGATACGATATCATATAGCTACCATGTGA:1 + chrX 22858993 3' + mdg3 227 2 69.18 AAATATCACTCACAAAAAAATTACATTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCATAGTGCAGGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTACAGTGGGCTTCACAACTTTTTTTTTGGCATATCATTAGAAATTTAAAAAACTAAT:1 + chr2R 13188590 3' - transib4 40 1 39.73 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAAT:1 + chrX 3452545 3' - Tirant 8146 2 60.27 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTT:1 - chr3R 20292416 3' + pogo 2045 1 60.27 GCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTACGCAACTGTGGTGGTAATATCTTTTCCATTAAAGGTGACATGGTGTAAGGGGCGTTGGTTAAACCAAATGGCATACCCACAAACTCATA:1 - chr2L 23297304 3' - micropia 5094 4 65.75 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATTGCCACACAAAACGCG:1 + chr2R 14562285 3' + Burdock 6374 2 45.14 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACCAGAGCTTCGGTCAAAAACGCACAC:2 + chr2L 14970028 3' - Tirant 13 2 78.08 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTCATAATCATAGTCGGGACGGT:1 + chrX 22517724 3' + 1360 3359 1 55.48 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAAGGGTATTTAGCGAAAAATTTGTGTTGTTGGCATATATAATTTATGCACTGGACGTTTTGGCTGGCAGCGCAAATAAGGG:2 + chr3L 6774266 3' - pogo 40 1 56.85 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAGAGCC:1 - chr3L 14969170 3' + P-element 2860 1 63.01 AATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATA:1 + chrX 21772473 3' - 1360 3166 1 77.50 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTT:1 + chrX 10538226 3' + pogo 2039 1 60.96 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGATTTGAT:1 + chr3R 25521887 3' - blood 68 2 63.01 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCGAAGGTCTACAA:1 + chr2R 18882664 3' + roo 343 2 60.96 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTGGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTATCCCTACTTACACACATACACCAT:1 - chr2L 20561415 3' + P-element 2800 1 26.03 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCGCTTAGGCGAACTATGAAATAGAGCCAGATA:1 + chr3L 13227713 3' - hobo 56 1 53.42 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTGGAAAAATCGAGATTAAGTCCCCAATTATGCCCATTAAATAAGGCATATTAA:1 + chr2L 1327598 3' - pogo 63 1 63.01 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAGGCTAAATTTTTCATTTTGTCGGCCAGCTTGCTGACCTTCTTTACTTTTCTTTTGTTTGGCCCCATTTT:1 - chrX 9951343 3' - hobo 1 1 64.95 ATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCACGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGGGTTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCGG:1 - chr3L 22980583 3' + INE-1 565 1 65.75 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCCCATGCTGTTCGACACTTG:1 + chr3R 22846842 3' + 412 7523 2 69.18 AAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAG:1 + chr3L 21093216 3' - Ivk 91 1 69.86 CCACCTCTAGAGCAACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTAGGGTCTTTGCTCTTGGATTCCACAATACGCAGTCCACTCGGACCGCATTGAATCGGTCCAAAAAAACTTCTTACTTTTTG:1 - chr2R 2007458 3' - 1360 59 1 50.68 TCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATGTAGAAGT:1 - chr3L 24153137 3' + Tabor 7298 2 67.12 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAA:1 - chr2L 1449582 3' - opus 168 4 56.85 AATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTAAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCATATGTGCCTCAAAAGGGGTCAGGTCTTGGTTCTGGTCCTGTTCCTGGTCCCCGGGAGATCGAG:1 - chr2L 11570596 3' + F-element 4332 1 56.85 CACCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTG:1 + chr3L 17447568 3' - Tirant 8152 2 56.16 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGTAACTTCACGCCAGCCCCAAACCAAGTGGCAAATATAAAATTTCGCTGCATAA:1 + chrX 12558371 3' + Transpac 5201 2 66.44 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCC:1 - chr3L 22354432 3' - Doc 76 1 63.01 AGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTATTTTCTAACTGGCTTTTTAAAACAAGAACTATCGTTTTATCGATACA:1 - chr2R 12686214 3' + roo 8775 2 67.81 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGT:1 - chr3R 19700861 3' + roo 357 2 58.90 AAAAATATATATATTTAATAATTGATATGGTATGGATAAGTTTCGCTTTGACGCATTAAATTACATTACCTCAATTTGTGAAATGCAATAGAATTTCCGTTTAAATATTTTCCTCTTATAATAATAACGTACCCTAAAAGTAATTA:1 - chr3L 15375550 3' - Tc1 61 1 48.63 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAATATCAAAATAAAATTTTTAGGGCTTCCCAAATGAAATTTGTTTCACTGATTCACTTCTTCGCCCTTTCTCCAGTTGTTAAACTCGTTTTAAGC:1 - chrX 16982468 3' - roo 38 2 75.57 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAAGCGTCACGAAGTGCGATAAGCTTGAGCACGTACATGGACCTCAGTAAACA:1 + chr3R 3527209 3' + Tabor 460 2 65.75 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTT:1 - chr2L 9167431 3' + pogo 2036 1 67.12 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAATGGATAAATCAAATCAA:1 - chr3R 7884525 3' - jockey 4808 1 52.05 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCACCTGCTGAATGCATCCATTTAT:1 - chrX 4789083 3' - 297 6607 2 68.49 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAGAGC:1 - chr3R 15465451 3' - mdg3 5284 2 62.24 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATAGTCGTTATTCACTTTGATTTAACACTTGACCAAATATGAGTGTTCCTGAG:1 - chr2R 5992247 3' + pogo 2085 1 73.29 AAGCTTTTTCTCTTCCCGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATAATAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATATTCTCCTTTCATAATAAATAAAGGAAACGCTTCGACATCCCCCTCACTTTCAG:1 - chr2R 1708481 3' + Idefix 374 2 63.70 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAAAAAATCCTTGCAACAAGGATATAGGATTATA:1 - chrX 22824704 3' + jockey 4972 1 63.70 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGTTGG:1 - chrX 18149801 3' + hobo 2871 1 62.33 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCATTTGTTGGATTCTCGCATGT:1 - chrX 15089461 3' - P-element 23 1 66.91 AATTTTGTGTAATATGTGTAATTTTAGGTAGTATATTATATATAAAGGCGAGTGCAGTCTAAATTGCGGTTAATCCTACCATCTCGAATTTCCGTTTATGGGCGTTATATGGGTCAACAAAGATAATGAAAGGCCCGAAATGTACG:1 - chr3R 9344746 3' - 1360 2931 1 76.71 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCTTCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTG:1 + chr2R 15613855 3' + P-element 2833 1 47.55 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATAC:2 - chr3R 19537472 3' + hopper2 1554 1 52.74 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACAC:2 + chr2R 16891865 3' - jockey 63 1 53.42 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAG:1 - chr3R 20137240 3' - Burdock 6188 2 55.48 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATACCTCTTTTATAACATTTCCG:2 + chr3R 21924399 3' + roo 393 1 74.66 TACGGTTAAAAAATATTTTTTTATTCAAATAAATTTAGTTTTGAAATAGTGAAGTATAATGGTGACTTCTCTGTGGCTTTAGTTTTTTGAACGAGCACGTCGTACAAAGAAGAAATATATTTACTTTTATTTGAAGCTTAAATCAT:1 - chr2R 22185703 3' + Transib5 2726 1 73.29 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCACTC:1 - chr3L 9430576 3' - P-element 59 1 43.28 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGAT:1 - chr2L 8397138 3' + roo 9022 2 51.37 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAA:1 - chr2L 12481402 3' - pogo 38 1 56.85 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTA:1 - chr2R 6984379 3' - Doc 27 1 67.81 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGTGAGCCCAGCTTGATTTCTCAGCGCCTTGCCATATTTTCGTT:1 - chrX 13548266 3' - jockey 4778 1 73.97 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCACGCGGCGT:1 + chr3L 131837 3' - P-element 43 1 56.85 ATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGTAAATAAAGATGTCCAAGTCCAAGCCATTACCCTTAAACAAAAACCAACTTTTCAAAAC:1 - chr3L 17774686 3' - roo 256 2 59.59 GCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGT:1 - chr3R 17316055 3' - 3S18 74 2 66.21 TTTCATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATGTTACGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAAACGCGGAGTGACGCGTACAGGTGCATTTATTATCCTTGAGCGGGGCAAGAAAACT:1 - chr2L 16924797 3' - diver2 345 2 61.64 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTT:1 + chr3R 20452275 3' - blood 69 2 65.07 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTGTGCATATTGCGCCCGAAGTTCAGCTCATTGCGCTGCAATATTGTCGGAGTTCATAATTTCACTGGTCGACTGTTGCTGGTTGT:1 + chr3R 22810817 3' - flea 4772 2 72.31 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGCTGGCCGCC:1 - chr3L 22354418 3' - Doc 25 1 60.55 ATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGAGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGGAAATAACTGAAATAAAACAGCAAATAGTAATTGCCCGTCG:1 - chr3L 16137313 3' - Juan 4104 1 67.81 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTGGTCGGCAACTGACGGTGCCACTGTAAACGTGACGCTAGATCAATGTAAATTCAATTTCATATT:1 + chr3R 11903819 3' - F-element 65 1 50.68 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAAACATAACAAACTTGGGTTGCCGTTCGCCGTCGTGGTGAATTTTCCGCTGCACAGTG:1 + chr2L 10474404 3' + P-element 2824 1 43.84 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGTACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGAATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAACTGTTGGATTTAAGTG:1 + chr3R 21237816 3' - Doc 65 1 56.16 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATATATCGGGACACCCTGTGACCATATTTCACTTTCGCAATTCTCTAGTTCGATTAAACGCTACGAACTTTGTGTGCTGCAAGAGACAAGTAATTTTGTC:1 + chr3R 10026353 3' - FB 24 1 69.18 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGTTTCACAAGCGTGATTGGTGTAAATGCTTGATTGACAAACGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCCCATGCTGTTCGACAC:1 + chr3R 22846839 3' + 412 467 2 67.12 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGCCTATCCTGT:2 + chr3L 20076894 3' + roo 9042 1 66.44 AGTTTAGGGTCATATTAAATGCAGTACTATGGATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGG:1 + chr2R 5022761 3' + Gypsy12A_LTR 82 1 53.91 AAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAGTGGGTAA:1 - chr2R 21897880 3' + 412 7480 2 61.64 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTT:1 - chr2L 21237220 3' - P-element 52 1 44.70 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATGTTTCAATGCCACAGTAAAATATAAAAAAATGTATATTTACAGGAAT:1 - chr2L 14262856 3' + blood 7315 2 66.44 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAATATTTAAGTTTCTTCGAAATTAGTTTCTTAT:1 - chr2R 16712921 3' + pogo 2077 1 67.81 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGCAATTCGCTTTCCGGCTCCCCGCCCGTCACATCC:1 + chr3L 9430662 3' - P-element 54 1 45.26 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGCATTGGC:1 - chr3L 23146431 3' - 1360 21 1 71.23 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAACGCGACTCGACGACAAATTACCGTTTCACAAATGCACTTGCCAAATACCCAAGAACCCGCTTAGCCAAATAAGCCAGATTAAAAATAATCCACCGATC:1 - chr3R 6103539 3' + Tirant 374 2 68.49 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGCCATCCACCAGCGGTCGCAACATGGAAATTAAAATCGAAAATGAGGCAAGCAGGAGGAGCAGCACTGCCTGCTAATAAGTT:1 + chr2R 7223775 3' + blood 7348 2 55.48 GATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAA:1 + chr2L 23373498 3' + Tc1-2 1533 1 77.40 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGAA:1 + chr3R 20905491 3' + pogo 2048 1 52.74 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTC:1 - chr3L 22221127 3' + 412 429 2 54.79 AGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATATTCAAATTGCCAAAATCCATTATGATCGCAAATATTATTTCAACAGCCAAC:1 - chr2R 20362210 3' + diver 6042 2 64.38 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAATTCAAAGTCT:1 + chr3L 131781 3' - P-element 99 1 17.12 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAAAAGCAAAATCCGTTTGTTACGCTTTAA:1 - chr3R 7739631 3' - blood 16 2 74.66 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAGAAGAGTGGTGGGCTGACGCGAAGCGAGGCTTTATACTGAGAGGCACGACTTAGCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTCCTCGAAACGGTCATTTATCTAATAC:1 + chr3L 20977409 3' - I-element 85 1 70.31 GGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAGAAATCGTATAAA:1 - chr2L 15153272 3' - G-element 55 1 61.40 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAATATTTTATTGGATAATTT:1 - chrX 11228508 3' + roo 9057 1 75.86 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAA:1 + chr2L 2519927 3' + roo 9035 1 59.59 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAATAGTCCTTCAGCAGGATGAGCTGGCCAAATGAAATTTTCGACAATT:1 + chr2R 12703891 3' + blood 345 2 61.64 CATGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACC:1 + chr3R 19545398 3' + jockey 4917 1 67.12 GCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGGACCTGACTATCGGCACTTGGCCAAGTTTAGGGCTAAAGTCTGCACCGCACGGCCA:1 - chr3R 7670824 3' + Stalker4 210 4 61.64 GTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCT:1 - chr3L 21630311 3' - Burdock 56 2 57.53 CGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACG:1 - chr2R 6984338 3' - HMS-Beagle2 82 2 78.83 GACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCA:1 + chr2R 5900925 3' + Bari1 1645 1 62.07 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACGTACGAGTCTGG:1 + chr2L 10032719 3' - hobo 83 1 74.66 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCACTGAACATGGTAGTCAATAAATATTTTATTGGATA:1 - chrX 11228512 3' + roo 9052 2 72.60 GGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGCATTTAGAGTTTCTAGAGTGTATCAACAGGTAACCAAGCTTATCGATTACCACAATAATACACTGGAGTCTA:1 + chr3R 16204029 3' + mdg1 424 1 60.98 TTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCA:1 - chr3R 14049332 3' - transib2 62 1 58.90 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGC:1 - chr3R 10079263 3' - P-element 31 1 64.38 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATCCCCCTGACCCCGCTCACCCCGATCCTTTGCTGCTGCTGCTGCATCATGGTCATCATTACTCAACTCCAGGGCCCTGAGTAAATACTCGTG:1 + chr3R 15514648 3' - 412 30 2 64.38 ACGAAAACAAGGGAGAAAAAAAAATGGGGAGCGCTGGGGGAAACAAGGAAAATAACAAGAGTTGCCAGATTTATGTTAGAGCCAGATTCTTTCATAAGCCATTGTACTTTAAAATTAAATATGTCATTTGTTTGCCTTTGTTCGAA:1 + chrX 18740769 3' - Juan 4037 1 67.12 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGCATCGCGAGTCGAGAATCTGTATCTCGTATATCTGAGATAAAAAATC:1 - chr3L 14546291 3' + copia 230 1 67.81 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAGCATTTCAAGCATATTCACTTTCATGATTGATTGCACTTAAACCGTTGCCATTGAACGAGGTCAA:1 - chr3L 11196330 3' + pogo 2049 1 56.16 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGCCAGAAACCGGATGAGAGGACAAAGGGGAGATGGTTCGGTTCGAGGGGGTGGAAAATGTCACCAAATGATGGAAAAGGGGAGGGGGGGGAAAAGGCGGGTTTGGCAACGGGGTTCAA:1 - chrX 9816763 3' - jockey 4801 1 78.77 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGAGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGGATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGAC:1 + chr2L 14970000 3' - Tirant 8120 2 71.19 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTG:1 - chr3L 23146495 3' - 1360 85 1 76.03 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTA:1 - chr2L 14222256 3' - Transpac 71 2 69.18 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACTTTTTAGAAAGGAACACTTGGCATAACTTGGATTCTCCTCGACAACTTGGGACTCTCTTGAGTAATATTTCGT:1 + chr2R 7717315 3' + S-element 1671 1 55.48 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAGATTAATTGAGGGCC:1 - chr3R 25384142 3' - mdg3 5274 2 70.55 CGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTAACAACATGTCGAAATTAATTGTTTCGCTAGACTAACACTCGCAGCCTT:1 + chrX 22824816 3' - jockey 4737 1 66.20 ATAGGGACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATGGCTCTTATACGTTTATTTTTTTCTTTTTTATTGGCGTCGGCTTTAAAATTATGGCTATCATTTGCGCGGTACTGCGTGGAAATGCTGTGTGATGTACTTAGC:1 - chr2L 18048212 3' - blood 7028 2 71.03 AAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTGGAGCCAGCGGAAGAGCATCAGGAAACGGAAACTACCAAACCAACAACGAC:1 + chr3R 9583656 3' + 1360 329 1 65.07 ATACGATCTAGATCGATTTCAATTATGGTGCTGTGATAACGTGTTAGACTTAAATGGCTCCAAGTGTAAAGTTATGACCTTTTGTCGTGCCAACCCAATACGTATTCCACATATGAAAATATGCCTCGGGTAATTATATCACTTTC:2 - chr2R 21097963 3' + Q-element 639 1 64.38 CAGACAACATTTACGGTTTCCATATTTATCTGAAATCAGATCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAAACATTGCGGGGAGCAGGGAATGTATTTTCGTAGCTAGTTGGTGTGCCTAGTTTTAATGCATCTATCGATACAAAACCC:1 + chr2R 17799714 3' - Cr1a 436 1 51.37 CTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATCAGAACAGTCACACTAGCTGAGTATCGGGTTCTTTCTTGTTTTTTTTTTACTAAAATGGGAATTTTTATTGTAATTAATGTATATACAAACTCGTAGG:1 - chr4 993995 3' - INE-1 530 1 61.64 GACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATATTCCACAAAATTATATTTTCCTTCATAAAACG:1 - chrX 983096 3' + 412 458 2 60.69 AAATACTGCGACTGCGCCGCCGCCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGCATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7237 2 74.79 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCATGTCCGTCCTGCATCTTTCCCAAA:1 + chr4 1149944 3' - 297 6636 2 63.70 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGTGGTCAT:2 - chr3R 23099049 3' + roo 9044 1 65.75 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCGAGAGACA:1 - chr3L 13722013 3' + blood 7333 1 61.64 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAAATGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGATATGCTTTTGTTTATATGTCTGCCTTGCAAAAGCAAACAAAT:1 + chr2R 12703846 3' + blood 7312 2 69.18 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAAAACACCGTTCATGCTGT:1 + chr2L 21237327 3' + P-element 2840 1 53.42 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATTTCTACAAAAAGATGCACCAAAAAATCCTTGCAACAAGGATATA:1 - chrX 22824712 3' + jockey 4964 1 58.22 CGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATATTATTTAACAAAGAATCCAGGCTATTTTTCATATCCGTTTCTATCCAGAACTTATCAATTTCTTGCTGCGACCTTGTTTTGCTAATGATGGGCGGAGTTTTTTGGGGCGTTA:1 - chr3R 12559597 3' + mdg3 237 2 77.40 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGA:1 - chr2R 18123429 3' - 412 70 2 65.07 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTGTTGGTGGGCCGCAATTATTTTCGAATATAT:1 - chr3R 8542535 3' + roo 9055 2 69.18 TCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTCGCCATATCATTGCCTGTGCTGATTAGTTA:1 + chr3R 11461903 3' + 17.6 464 2 67.12 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGCAGCAGCGCTGCCCGCACTTCGGTTTTCAAGTGCAAGGTGCTTGTGTGCCCC:1 - chr3R 30272943 3' + Tirant 8477 2 65.75 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGC:1 - chrX 15089457 3' + P-element 2862 1 68.28 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTATCGAGGAAGTGAATGTGAATGCGAATGGGGGGCG:1 - chr3R 10467959 3' + opus 478 2 71.92 ATAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACACTTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATGTTACTCCAGTCACAGCCCCACAAGTCCCACTTCGCATGCGAAATG:1 - chr2R 23592818 3' - P-element 275 1 23.97 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTTGTGCCTTTGTAGATACACGGCAAAAAGCAAACAAGTTTTTGCTTTCGAACATA:1 - chrX 983128 3' + 412 425 2 62.33 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGTTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGTAACTGATA:1 - chr2R 21078408 3' - jockey 59 1 50.69 GAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAATCCCATCGTGCTGGAGGTGCACCGCATTCTCG:1 + chr2L 9329215 3' + roo 261 2 78.08 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGA:2 - chr3R 8542588 3' + roo 338 2 63.01 AGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACCTCATTTCAAACTCTTCCGTTCGAGGTGACT:1 + chr3L 25323244 3' + Max-element 223 2 77.87 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTTGAAAGGTCAAAAATCGTATCTTTTATCTCTTTAAAGGTCAACAAGTTTTGAAGCAGC:1 + chr2R 15392857 3' - blood 9 2 78.08 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATGGCAACGAGGACAATGCACACACACAGACACATATACACAATCAAGCCAAAAAGAGGGAAAGAAACACA:1 - chr3L 14898865 3' - jockey 59 1 54.79 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACGTTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATATCTGGGCAAAGTCTTAGGACGAAAGGAAAACAAATTCGAGTCGATTTATAAA:1 - chr3R 27835586 3' + 412 7483 2 59.59 GCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCT:1 - chr2R 982293 3' - HMS-Beagle 37 2 60.27 CTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTGTTCTACGGTACCACAGCTGTGCAGCATATCTT:1 + chr4 909004 3' + 1360 3297 1 97.26 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGACAACAATTTGA:1 + chr2R 19543800 3' - jockey 4774 1 73.29 GCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAGGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGGATATGTGTGCGTGTTCGGATCATCGCTCGTGTGGAACCAATTTCTGAATGCCTGAAACAAGG:1 - chr3R 21255642 3' - 1360 3293 1 64.58 GACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCATTGTATTTGCTTTCGTCCTGTCTGCTCCCTGGCTTTTTTCAAAGGGTTTAATTGTC:1 + chr2L 10719345 3' + R1A1-element 443 1 61.38 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATCACCGCAAAATCGCCAGACTCATAAAAAGTATACTAGTATATACATAAATACATATGTATGTATGTACATATTT:1 + chrX 23016720 3' + P-element 2840 1 53.42 AACAAAATATTAAAAAAAAAAAGATATTTTTAGATACAACCGAAACATTAACTTCAAATCATTTGTGGAAGTTTTCCGAGCGCCCACTCTTGTACGGGGTATTTATCTGGAGATTTGTGTGCTGGGCATCCTGATCACCGCCTGGT:1 + chr3R 23406722 3' + BS4 730 2 61.64 AGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTTT:1 + chr2R 4103362 3' + invader1 3999 2 63.70 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGTGCCTTCTTCGATCGCGCTGG:1 - chr3R 23254377 3' + pogo 2080 1 71.92 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAA:2 + chr2R 1277146 3' - Tirant 69 2 65.75 TTTCCAGCACTTTTACTTAAGAGGAAATACTTTAAAGTGACTGGGGTACAGGGTACTTATTTTTACTATGTCTTAACTTGAGGTATATTGAAAAGACCTCTAGGCAGATTGGCTTGTAAAACTGTTAAAAACCAGCCAACCATGCA:1 + chr3R 24491810 3' + frogger 197 1 77.40 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAAAGAAACTTTCCGTCCGT:1 + chrX 16853451 3' + roo 9036 1 61.64 TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGG:1 - chr3R 4659562 3' - P-element 101 1 15.86 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCTG:1 - chr3L 18835268 3' + pogo 2058 1 57.53 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTG:1 - chrX 22858847 3' - mdg3 58 2 56.16 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCA:1 - chr3R 27503038 3' - hobo 75 1 70.55 AAATACCTAATTATACCATTAGCCTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAACTTGTATGTCGAACTGGATTTGCGGATCTCTTTGACTCGTTCCGGGCCAATTGAG:1 + chr2R 20856292 3' + Juan 4155 1 58.33 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTCTTGTATCTAGTTACAGCTAAGTTAGCCACTTAGGTCCAGACTTATTGGATATTTTGTGTTTAATAGTTAGACTCCACGAAATGCATCTGCTT:1 - chr2R 20991160 3' + pogo 2077 1 69.18 GATCGGGAATATACTAAACGAGATACATCTCTTTATCAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCTTGAGGAAATTTGCGGAAACAATAAATTGTTTGGCTATGCAGACCGCAGACAGCAG:1 + chr2R 5022783 3' + Gypsy12A_LTR 113 1 67.23 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAAT:1 - chr3R 31907334 3' - Tirant 49 2 57.46 GGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGAGGCACTCTCTTCCAGCCGACGACTCATTTAAACTCAAAACGTCAGATTA:1 + chr2R 21896786 3' + 412 7502 2 47.26 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCCGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATAAGTCG:1 + chr3R 25753725 3' + hobo 2928 1 69.90 GCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAAC:3 - chr3R 17660025 3' + micropia 380 2 69.18 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTGAAAGCATATCGAAGCTTAACAACCGATATCGGAATTTTAAAATAAAATTTGCTCTTTACAAAAGCATCTATTTTATTTATTGTATG:2 + chr3R 8022258 3' + roo 377 1 63.70 CGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACT:1 - chrX 18193722 3' + hopper 1341 1 69.86 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATT:1 + chr2R 5992409 3' - pogo 48 1 54.11 TAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGTTAAAACTTAAATAGTAGGTACACTATACTGTATGTACAACAACCGAGGCACATCACTGTTTCGGG:1 + chr2R 7219820 3' + blood 123 2 51.85 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATCACCGCAAAATCGCCAGACTCATAAAAAGTATACTAGTATATACATAAATACATATGTATGTATGTACATATTTGCAA:1 + chrX 23016724 3' + P-element 2844 1 56.16 GACCAGCTGTCCCAAGCGCTCCAAATGGACTTGCTTATGCAACCGATCACCCCCAGCGATATTGCTGACCAAATCCAAATAAGTACAGTTTTATGCCAGCGAAAATAACGGTACAGGGCACATACGAAACCAATCCGATAACGGGA:1 - chrX 5635370 3' + BS3 158 1 53.42 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGA:1 + chr3R 4722463 3' + roo 8993 2 71.92 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCTGTCGTAAAACAGCTAGCTTACACTACTATATCCATTCACTAAAATGGCTTTTCTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTCCATATACATA:1 + chrX 16243796 3' - 412 15 2 73.29 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGGCGACGTCGACGCCGTC:1 + chrX 17258330 3' - 297 39 2 57.53 GTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTATTTTCGGTTGTCGTACATTTATTGCCAGGCTATTTCCTTCTTGCTGCTGTTGGTTTTCCATCCTTTTTTCCTCGTTGATG:1 + chr2L 12260613 3' - jockey 104 1 57.86 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGT:1 - chr3L 14581386 3' + pogo 2031 1 67.81 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTGTTTTCACAAGAAGAAAGAAAT:1 - chr3R 29708934 3' - blood 7042 2 58.22 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAG:1 - chr3R 21924270 3' - roo 8742 2 73.29 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTG:1 + chr3R 22429245 3' - roo 43 2 51.45 CTGGTAAATTACAACTAACTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCCCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGTTTTAGTCCGCACTCATTAAATAGTATATTCAAGTGT:1 - chr3L 12611426 3' - Max-element 8417 1 71.23 TAGATAGAACGTTATTTCGCCATACTTCCGTTCTATCCACGGCTTGAGATTGGGGATCAGCTGATGCGTCCAGCGATCCTTAACTCGTTGTTCCATGCCTCCAAGGAGCTGCTCGAGAAGCGCTCGCAGC:1 + chr2R 17538517 3' - Rt1c 4977 1 73.08 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACTTCCATAGTTAAGTTCTATTATACATGGAAGTACAATAAATATTTATTAATGTTCAA:2 - chr2R 18048802 3' + opus 7441 2 60.96 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATAC:1 - chr3R 19545350 3' - jockey 93 1 73.29 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTTGCCCACTTAAACAAAAC:1 - chr3R 8705691 3' - hopper 38 1 58.22 GCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACA:1 - chr3R 14331184 3' - Burdock 6218 2 80.82 CCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAGTCACAATGTAAACACAACCCTTTTTTAATTCCAGCTCATCCGTTTGGCGTGGTTTGTATGGGAACAGGGCTAAGTATCCCCAGGGTAAATT:1 - chr2R 17570556 3' + INE-1 107 1 63.01 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATATTATTTCCGCACTATTCGGATTTTACTATTCCACATGAA:1 + chr3R 21237866 3' - Doc 15 1 74.66 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATATACGCTGGGATTCGGGTTAACGTCCTCTTCGTCCTCCTCT:1 + chr2R 8971504 3' + opus 7428 2 73.29 TGTAAGTACCCGCGATGTGTGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAA:1 + chr2R 20704216 3' - hobo 76 1 68.49 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAA:1 - chr3R 21924271 3' - roo 79 2 73.97 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGC:1 + chr3L 17447570 3' - Tirant 11 2 73.68 ACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGTAGATGGCAATCATTAATCACCAAAGGACTGAGATAACAGATTCGATATGTTTTTATGCTTTATAAACAATTAAA:1 - chr2L 5727234 3' - R1A1-element 220 1 51.37 TGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAAACA:1 + chr2L 23390223 3' + rooA 7505 2 45.89 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGT:1 - chr3R 23099055 3' + roo 9038 1 61.64 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTGGTTTTTTCCTAATTACTGCGGATATAGTATTTAAAGTTCGTTTATCTGGCAAA:1 - chr3R 9616576 3' - roo 67 2 67.81 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAAT:1 - chr3R 15465466 3' - mdg3 50 2 51.37 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAGTGCAAGACGAAAATTACATTCTAACATATGTTGCAATAAATAATAAGCGACTAAACAGTTTTGAGATACAAAATAAG:1 - chr2R 13574735 3' - diver 45 2 52.74 CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGAACCAATTATCATTTATGGCTCACAATTAAGGCAAAGAGCTAATAAAAATAAATTG:1 - chr3L 18468294 3' - jockey 4675 1 77.40 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCAGTCCTCGCCAAGCTTGGCCACAACACTTTTCTAATTA:1 - chr3R 28008199 3' - hobo 23 1 68.49 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAGTTTATTTTGACGAATCTTATTCAATGTGTTT:1 + chr2R 7534660 3' - roo 88 2 80.00 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTA:1 - chr3R 7739659 3' - blood 44 2 55.48 TGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCATCTACTTG:1 - chr3L 14854635 3' - rover 21 2 71.92 GTCAGTCGATTTTGGGAGATTAGAAGCTTCGGTCATCGCCACGTACTTACAATTCGCCTCATTAAGTGCACAGTGCTTTTCTGTGAATACTATTATATGGGATGAAAAGGTACTTGTATACCCTTTTAAAACGAACGTTGAGTGTT:1 + chrX 7459047 3' + Burdock 6270 2 75.34 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAGAGTAGCCAAAGACCTCGTCATCAATTTAGTGACGCGTATGATATTGTCCCTATCATATAATTAATATATAAAGAATTTAAAGAAT:1 + chr2R 10262094 3' + blood 342 2 55.48 AACAGTTAGAACCTTCGCGTCAACTAACATATCACTTTTCCGGATAGACAGAGATGATTCAGAGAAAGGCCCAGATCTCAAAATTGTTTAAGTACAGCTGAAGCATATCAGTGGCTGTATTGACGCAAGTATCTCTGGCCAGGACT:1 - chr3L 23698388 3' - Gypsy12A_LTR 478 1 73.97 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAATTAAAATTGCATTAAAGTCGAACAGTTGGTAA:1 - chr3R 9345521 3' - pogo 15 1 73.97 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGATTCTATTAGCGTATTTAATGATTCGGCACTGAAATGTATAATATTTTAATCTCTT:1 + chr2R 15392800 3' - blood 65 2 62.07 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGT:1 + chrX 19162704 3' - pogo 41 1 57.53 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCAATTTATGGCATAAATCATGCGCTG:1 - chr2R 13276422 3' - roo 8680 2 75.34 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGGTTTGGAGCTAAGACAGG:1 - chr2L 20638335 3' - Doc 43 1 54.35 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGGGGTTTTCCAGCGGAGACG:1 - chr2L 23189399 3' - 1360 47 1 92.38 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGGGTGCTTAACAAATAACTGCGGAATTACTTTAAACATTATTGTACTGAATTAAATTATAAT:1 - chr3R 15589913 3' - Transpac 16 2 74.66 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAATCTCAAAGCTGCAAATTGTACGAACTCTTTAGTTTCGTAGTTT:1 - chrX 12623143 3' + jockey 4916 1 70.55 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAAGGAAAGGAAAAGCGAAAAGTGAAAAGGAAAAACCATAGAAAAGCGAGTTGCAAATGACTTAAGGTCCATTTTCCCTCTCGCTCTGGCAACAGGTAACACTGCCTAGA:1 - chr3R 26315844 3' + roo 395 1 76.03 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACTAAAAAGTT:1 - chr3L 13597715 3' - blood 31 2 65.07 AACAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGAAGCTCAAAGTTGTTGACCCACGCCCAAATTTTTTAAAACTGTGTTGATATATTTGTCTTGATATTCATTCAATGCCACCCATTAAAAATACGTTCT:1 - chrX 21075131 3' + INE-1 165 1 71.23 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGC:1 - chr2R 15613779 3' - P-element 87 1 26.03 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGT:1 - chr3R 7884564 3' - jockey 4847 1 78.77 CGCAGTCTACGTTGGTAAATGCATCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGACCTATCTCTTGACACTTCGGCAATGGGCCGCTGCATAAAAACTAGTACTAAACAATACTACTACCGAGACTAAATGAAATAAAATGTGCAA:1 + chr2L 7630605 3' - rooA 216 2 61.64 GACAACACACACAAACACACACAGTAGCTACACTCCCAGCAAGGCGAATGCTAGTGGCCTTTCTGGCGGCGAAGACTACAAAGCA:1 + chr3R 31840461 3' + gypsy3 422 1 76.47 AAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCACAACACTGTAGTTAAATTGAGTGGTAGTCCCAGGTGCCGGAAATACAATACTTGAAGAAATGGCCC:1 - chr3R 10493274 3' + Doc3-element 415 1 58.22 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATATGATAATATTAATAACCTTTTTGTGTGGTCTTCAGCTTCAATAATTAAATGATTTTAATTTTTTTATTTCATGGGTGCTTGT:1 - chr3L 4639042 3' + roo 9036 1 60.96 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGGTATGAGTT:1 + chr3R 8402664 3' + mdg1 7421 2 57.53 AAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGTCGGTGGCTTAGTTGG:1 - chr2R 14562134 3' - Burdock 6220 2 79.45 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGG:1 - chr3R 10973196 3' - jockey 65 1 54.79 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGAC:1 + chrX 17258312 3' - 297 6633 2 58.16 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTACTCCCTAGCTAGGGGAGAGACAAGAAT:1 + chr3L 53122 3' + roo 393 1 74.66 AAGAAGCTGGGTTCGGAAAAATCTAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCTCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTG:1 - chr3R 20001646 3' + FB 7 1 61.64 TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTCATAGATGAGCATGGATTTGGACAATTATGTCACCAAAGATTACAATAAAACAATTTCAGAAGTGCTGGCGACTGCGAGACCAATGAGTTCCTTAATTTTTGT:1 + chr3L 27269638 3' + S-element 1704 1 74.66 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGTCACAGTTTTTCACAATTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCTCTTTGCGTGTGGCTGACTTTGTGAAAATTAATAAGTTT:1 + chr3R 25508609 3' - hobo 4 1 79.45 CGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGCCTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGCCACGTGCCCACCGCTGGCCGCCCCGCC:1 - chr3L 22354413 3' - Doc 4 1 72.04 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTGACCA:1 + chr3L 22481357 3' - roo 33 2 61.64 CAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATCTAGATAGACGGGTGTATATGCCGTGGGTACATGTGTCGTGCCGGAGCGTCGTTACTTTGTCGGCCGTATGTTGTTCTTGTGCCGGCACCCG:1 - chr3R 11771656 3' + S-element 1688 1 66.44 GTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCTGGACCTGATCTCCATGGCGGGTGAGTGGCTGACGG:1 - chr3L 4079423 3' - jockey 4660 1 69.23 CAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTAC:1 + chr3L 53096 3' + roo 9031 1 57.24 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAG:1 + chr2L 9287107 3' + jockey 4940 1 57.53 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCTGCCTAGTGATATGCCACAATTTATGAATTAAACATTTATGGCTC:1 - chr2R 20461151 3' - jockey 35 1 64.79 CAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATTCTATGTATATGAAATTCATTTATGCTGACTCAGCTGCATAAGCTTTCC:1 + chr3L 8527900 3' - jockey 375 1 65.97 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTG:1 + chr2L 19878233 3' - mdg3 5339 2 75.34 AAATAAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCAACACCGGCTGCGAGTGGTTTGTGCGAAACACCACCCTGCACAGATATCTCCATAAACCTTTGATTTTAATAACATAATAACTTCTAAGCTCTCAGCACGTT:1 + chr3L 7793248 3' + X-element 4276 1 59.59 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCA:1 - chr3R 19537468 3' + hopper 1381 1 57.69 AGAAACCACTTGAGCCGCCTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATGCCCAGCCTGTATGCCTTCCACTCGGACGCCCGTATTTGGTCGGATCCGGAGCAGTTCCGGCCGGAGAGATTCCTG:1 + chr3R 12965511 3' + Chimpo 3984 1 52.74 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAAAAATGG:1 - chr3R 4659550 3' - P-element 90 1 23.97 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAGCAATTAAAGTAAGTGGCGCCATTCGCCTT:1 - chr2R 10367438 3' - 412 7080 2 65.75 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGTAATACTCCACTAACTTCTAAAGTAAAACCTCAG:1 + chr2L 8772800 3' - Tabor 6926 2 75.34 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGATAT:2 - chr2R 7404643 3' - blood 31 2 60.96 CTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTACAGAACCCAGATATGGAAGCAATACCGATGAACTGGCCCAGCTAG:1 - chrX 10624122 3' + X-element 431 1 74.17 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATATATAGACATGTCATTCAATAGTTTACCCCTTCTTTGGCATATTTTTCCCCC:1 - chrX 5265697 3' - flea 4794 2 62.10 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTGAAT:1 - chr3R 20905351 3' - pogo 34 1 63.01 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGCACACAACTGACTCCTGCGGACGTGAAAAGAGCGCCAA:1 - chr2R 18316832 3' - FB 67 1 71.54 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATTTCCGTCCTT:1 - chr2L 1073925 3' - Tirant 73 2 68.09 CAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 186 2 64.56 AATTAAAAATATTTTTATTTTTAGGCCAAGCCTACTAAACATATATATTATATATTCGCGTTAAAAAAAAAAACGAATTTACATGCTTTGTTAGTATGAAAATTCGAAAAATTCTACATGCTCTTTGCCCTTTCGCTTGGTGTTAG:1 + chr3R 25569988 3' + Burdock 499 1 75.34 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTT:1 - chrX 3524236 3' + roo 353 2 68.60 CAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTATTCACATCATTTCCAACACGCTTTGCGAGAAAA:1 - chr3L 3818966 3' + F-element 4306 1 77.40 ATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAATATCAAAAATGACTAGGAGTCCGAAT:1 - chr2R 1571523 3' + 1731 4585 1 56.85 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTG:1 + chr3R 29709057 3' + blood 7319 2 64.38 GCATCGAGGCATTGTACAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTACACTGTAG:1 + chr2R 6585551 3' + pogo 2072 1 65.75 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCT:1 + chrX 21213376 3' - Doc 79 1 67.12 CTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCCATGAGGGGGGATAACCAAAGGGGGCATGGGAGTGGCTACCGTGAGCCATCAAATGCTGA:1 - chr2L 7124147 3' + Quasimodo 7120 2 58.90 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACTAAACATTAAATGCTAAGTACTTTTTTATGTTTTTGAATGGATCTCAACTTTGTACATACTTTTGCTTTTATAGTTAATTTGAAGGA:2 - chr3L 13313114 3' + roo 9039 1 63.01 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTTCCGTTATTTTCTGTCAAAATTGAAAAGTTTCTCGGGGAACAGCCGTCATAAAAAGCAAGAAATAAGTTCATAGTGCCAA:1 + chr2L 7667521 3' - copia 4911 2 56.85 GGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAA:1 + chr3R 12559718 3' - mdg3 5331 2 78.77 AACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATGCTCTGCTCACCGGTCTGCTCACTCTTTATCTTGTCTAATTAATTAAATTTATGTTTTTGCTGACAAGCTGGGCATACATACATATAATG:1 + chr3R 23005395 3' + Ivk 381 1 62.33 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATG:1 - chr3L 19397037 3' - F-element 78 1 66.91 TAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAAAAACAGTTGGTTTCCATCTA:1 + chr3R 28033716 3' - diver 5922 2 62.33 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGATACTCATTTTCGGAACGCCTCGCTCTCTCCGCTCATT:1 + chrX 13762627 3' - P-element 24 1 48.28 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGAATCGCTCAAACTCCTGGTTTTTGCCAATTAGAAGAATTTCCCAACGGCAAAACTAAAATGCAATG:1 + chrX 22591370 3' + copia 5069 2 54.11 GTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAAG:1 + chr2R 2949163 3' - 17.6 10 2 76.92 CTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTAATTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATGCTTTTGTGTTTCTGCTGAAATGATATATG:1 + chr2L 6007733 3' + 1360 248 1 78.08 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTGAAAGTCTCGCCC:1 + chr3L 131786 3' + P-element 2810 1 20.83 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCA:1 - chr2R 10367476 3' - 412 9 2 64.44 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAA:1 - chr3L 3979590 3' + opus 7427 2 71.83 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAATGGAACTTGGCCGACTTCACCGACTTCGCAAGGGAAGCGGCAAAAGCCTCGACCGACCGCAAACTAA:1 - chr3R 6060687 3' + roo 9038 1 47.86 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCT:1 + chrX 21213406 3' - Doc 49 1 49.32 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCGGGCTCCAT:1 + chr3R 22289497 3' - 412 38 2 59.59 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGTATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTCACGTAACTAATTTATGATCACTAAATCCCCATGCTGACGACTCCT:1 + chr3L 19146680 3' + pogo 2034 1 63.45 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAACTGAGCAATCGAAATGAGTGCATCC:2 - chr3R 25753610 3' - hobo 51 1 52.74 ATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTTCAATGGCCATTCGCGCCTTGCGCTACCATGGAAATATTCTTCATTAAGTTCCACAATTACTCGGCCATCAAATGGAAATTAAATGT:1 + chr3R 31183335 3' + hopper2 1183 2 58.90 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTGCGTGCTCAAGGATGTTCGCAAAATTCACCACACTTGTCGCTCGCTCGCAAAGACACCTGTAGTGTGAAAGCTTTCG:1 - chr2L 12142539 3' - hobo 44 1 55.48 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCT:1 - chr2L 19424679 3' - Tirant 8134 2 61.45 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCTATTCACGAAAACAGAAGGGCACAGACCGAATTGCCATCGGAGGTACAGCGATCTTCAAGTACAA:1 - chrX 8895195 3' + roo 353 2 55.48 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCGAAGAGCTTAACTTTCACCCCAAAGACGCAAAACACACACGATGTTG:1 + chr3R 9616660 3' + roo 9026 1 60.83 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCATTAT:1 - chrX 10978951 3' - roo 32 2 62.33 CACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTTGGAATACTGGTAAATCATCGGTTAACAGTATTTTCATCTTCACTGGTGTCGAACAATTTCGAATTGGCTTATAATCTGCAATTAGACTTAAAGCTATTTCTTTTTGA:1 - chr3R 1327254 3' + Max-element 286 2 75.34 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAA:1 - chrX 18193667 3' + hopper 1397 1 72.41 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTACACACGAGACCCTGCAGCACTGGAGCTTCATGGAGGTCATTTCCACGCGAAAGGTATGGAGTTGAAATTGCCTGCCAATGGC:1 + chrX 10963243 3' - Transpac 31 2 67.20 CTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACT:1 + chr3L 15322045 3' - Transpac 79 2 72.60 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAG:1 + chr3R 29709083 3' + blood 333 2 53.42 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGG:1 - chr3L 18708577 3' - F-element 50 1 58.90 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCGCT:1 - chr3L 18835269 3' + pogo 2057 1 56.85 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGA:1 - chr3R 25271177 3' - 412 65 2 60.27 CGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGATGCATATGTATATCATAGGAGGGCAGTGTAAGTT:1 - chrX 7908601 3' + opus 307 2 76.71 CGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACTGCATTCTTGCCATGTGCAACCCGAAAACTT:1 + chr2L 12284050 3' + Quasimodo 7323 2 56.16 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCG:2 - chr2R 7223630 3' - blood 37 2 58.90 TATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTTCGAAGGTATGATGCTGCTGATGTGTTTTGACTGCTGCGCTGATTTACGGCCAGCGCCTGCCGAGCGGCAATT:1 - chr3L 661539 3' - Doc 4454 1 56.16 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACAATCAGAGCTGCTGATTATACA:1 + chr3L 16181026 3' - Transpac 12 2 77.40 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCTTTACTGAAATGCTAAGCA:1 + chr2R 9072963 3' - Burdock 50 2 53.42 AGGTATAAATACCCTGGCTTTTAATTTGTGGCGTCTCCTCTCGTTTAGTTCGTCTCCTTTATTGGCCTTTCTCCTCTCCTTCCTTTAAATTTTCCTTGTTGCGGCCCGATTGAAATGGTTCCTTCCCGTCCGGATTGGATTGCAAG:1 - chrX 5018388 3' - TAHRE 398 1 71.23 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACCTCCACTTT:1 + chr3R 23426492 3' - pogo 40 1 56.12 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGAGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGGGGGATGGTAGGACCTGTACCCGCG:1 - chr3L 18708552 3' - F-element 25 1 73.29 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGCCATCTTTATCATTCAGTCGCTGCCCAGAA:1 - chrX 18365983 3' - jockey 34 1 67.36 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGTATACGAACAAATCCACTCTTCTGAGAAATTATCGAGATCTCGTAAACAATTAGTTCTAGAAATTTTCTTTT:1 - chrX 14756645 3' + pogo 2056 1 54.48 CACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGACTTTTTGTGCTTTGGCGCCAGATGTGCGAGTGCGAATCGCTGGGGACGAGCGCCAAAATGCAACTGTGCTATGCT:1 - chr3R 16594396 3' + roo 7 2 50.34 TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGCCGGTGGCTTAGTTGGGCGGGAATTAG:1 - chr2R 14562123 3' - Burdock 61 2 69.40 CTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCAT:1 - chr2R 20913140 3' - 1360 90 1 76.03 CTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATCTCGAGAAGTAATGGTGACGCCGAGAAGCTGGAGAAAAGAAAGATCTGAGAAGAACGAATTCGTCATATTG:1 - chr3R 2999730 3' + McClintock 435 2 56.16 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAACTTTGCTCATATAAATTGAAATT:1 + chr3L 13597892 3' + blood 362 2 74.66 CGCAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCAGCACGTGTAAGCACGGGTAAGCCTTTTTGAACAGCTGTGACAAAGCTTTTTGATGGCAGTGACTAGCTAAGGTCTGTGTCTTGGGACAGTTTAGTGCTGCCAGACCGGTGGACTGT:1 - chrY 2468608 3' + R1A1-element 146 1 33.56 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCAACGATGTTTCAGTAGGAGTCAGTATGCTTTAATATTCAGGACCTGTTGCCCACATTAAAACCTTTTAATGCAATTTGGGGCAATGATTATTTGAAAGAACTAGGTGCAGA:1 - chr2L 22746195 3' - 1360 10 2 78.77 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACA:1 + chr2R 15080100 3' + roo 336 2 66.44 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAATTC:1 + chr2L 20561505 3' - P-element 44 1 54.79 ACTAATTGGTGGACAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGTATAAACGACCTTAGAATTGTAAAGTGATAAAGATATTTATTGGCTAA:1 - chr3L 12500163 3' - FB 75 1 67.12 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGATCATAATGAATGGATTCATTCATTCATTGTGGGAAAGAACGGCTGCTTACGATTTATA:1 - chr2R 21380565 3' - roo 8685 2 69.66 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACT:1 - chrX 18193722 3' + hopper 1342 1 69.66 AATCTCAGAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGTTACCTAAAATACAAATCGAAGCGTACGCCCTGTGTACA:1 - chr3R 8715208 3' + mdg3 267 1 73.29 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAAACGGAGG:1 + chr3R 29350811 3' - 297 6615 2 57.35 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCGTGGCAA:1 + chr3R 22429269 3' - roo 20 2 70.50 ATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACTCTAATATGTACAATGTAAATTCAGCTGGAAAAATAAATGTTTCCAATAGGCTTTGGAGGACTTTAAATACAA:1 + chr2L 17319961 3' + 1360 3073 1 66.44 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGGGGCGGGCTTCAGTTTTCTGCCATTTTTCAAGCAAAATTTTTTGAAAAATGCCTAGTTGGGTCAGCTATCATTCC:1 - chr2L 3967060 3' + hobo 2872 1 60.84 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATG:1 + chr3L 20785532 3' - P-element 78 1 32.19 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCAATTTATGGCATAAATCATGCGCTGCATGAT:1 - chr2R 13276416 3' - roo 8674 2 79.45 TGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATC:1 - chr3R 907902 3' - gypsy11 365 2 30.14 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCACTTGTTTA:1 + chr3L 13722144 3' - blood 7047 2 61.64 ATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAATCCAGTGCTGAACACACTATAACTTGATGCCACCAATAAACCGCCGTTG:1 + chr2R 15092209 3' - copia 222 1 66.44 ATTGCTACGAAATTGACAAGAACTAGCGTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATCATTTCGTTTCGACACACGATAAGATAGTTCCAATG:1 + chr2L 22736746 3' + 1360 3119 1 75.34 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCT:1 - chrX 15167685 3' - roo 89 2 83.56 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGCCTTTCAAACGACACACAAAAGAAATTGATTTCACTTCTTCATTTT:2 + chr2R 20500126 3' - 412 7128 2 69.86 AACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTGGGCGTCGATCGTTGGGCGTGGCCATTTATTTGCCTTGCTGCGCTTTTAATTGCTTG:1 - chr3R 7424490 3' + 412 478 2 74.66 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCATATTTTGAATTGCCGACTTTCAGGCCGTGACAATAACCAACAATGG:1 - chrX 16244829 3' - jockey 4761 1 78.08 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAGCCGCCAGCTTT:1 - chr3R 3527056 3' - Tabor 6885 2 56.16 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCA:1 - chr3L 22221107 3' + 412 452 2 60.84 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGTGCGTTCGTCCCACCAAATTTATGATTTGTGGGATTGCCCGACCAAGAAAAAGCATACGGTTCTTATTA:1 + chr2R 603383 3' - 1360 51 1 78.77 GTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACAAGGAGCAGTGCTC:1 + chr3L 8253774 3' - jockey 4654 1 69.86 AGATCTCAGGAACAATAAGAGCTAGAAGATGAAGCATACAGATGGGAGGATCGGGGTGCGGTGGAATTGAGTGGGTGGGAGCGACAACGGCAACAATGACAACAACGGAGATGTGGACAGGTGAGAGACGGCAGCAGAATAGGGAA:1 - chr3L 22773834 3' + INE-1 149 1 71.92 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCCTGGACGATGACATAGTCGTCATTGGTTTTGACCACAATGTCGTGCGGATGAAATTGTCGCACATCGATGTCAATCCGAAATCCC:1 - chr3L 9375771 3' + mdg1 411 2 76.71 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTAC:1 - chr2R 20913091 3' - 1360 41 1 57.53 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTTATACTGCAATCAAAATACATATGTACATATATGCCCATCGTTTTCGAGTGGAATTTTTCAGCTCGACTGGAGTGACA:1 + chr3L 18835412 3' - pogo 39 1 58.90 ATCGAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGAT:1 + chr2R 4551451 3' - roo 256 2 61.64 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTG:1 - chr3L 19274785 3' - transib2 57 1 56.85 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATAC:2 - chr3L 14581347 3' + pogo 2070 1 64.38 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGTGATTACTCGACCAGCACAAAAAAGATGAGCCACACATGGTGAAG:1 + chr3R 8542665 3' - roo 8740 2 70.55 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATGGGTGTGAAAACAGTGGGGATCCTGAATGGGTTGATAAGTTCAAGGCTAGCCACTCAACGTATACAACT:1 - chrX 12551690 3' + pogo 2053 1 52.74 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCTTACTCTGCGCACTGAAGTTG:1 - chr3L 19279098 3' + opus 453 2 54.79 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGCTGGCCGCCACGCC:1 - chr3L 22354413 3' - Doc 27 1 59.48 CCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATAATGCTGTGCGATGGAAATCTCTTGAAGTCGTTGTCAAATAGAAATTATGCATTCCAGAATGTTTACAAA:1 + chr2L 15153356 3' + G6 1977 1 50.68 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAAC:1 - chr2L 5771418 3' - Juan 69 1 62.33 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTA:1 + chr2L 1136397 3' - 1360 67 1 66.44 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTGCCAAAATAA:2 - chr2R 5848979 3' + mdg1 7379 2 72.60 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGGATGTAAGGGTATACATGACTATATTATTTATTTTCTTATTATATGAGGCATTCCCTGCAGGGTTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATGTTATTTATTCTCATTCCCTTTTGGGGTGGT:1 - chr3R 1683216 3' - Transpac 4942 2 47.95 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGC:1 - chrX 19162584 3' + pogo 2036 1 64.38 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAG:1 - chrX 19231734 3' + mdg3 200 2 51.47 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGTAACTTCACGCCAGCCCCAAACCAAGTGGCAAATATAAAATTTCGCTGCATAAAAACGCGTGGAGCATCTCG:1 + chrX 12558390 3' + Transpac 301 2 79.45 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCA:1 + chr2R 5900925 3' + Bari1 1644 1 62.33 CATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGGTAGAAGAAAGCGTTTTCGACCATATCAAGTATATA:1 + chr2L 22136611 3' - 1731 88 1 75.34 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTGTTTCGTTTAAATTATACATAACGTAGCATACTTTTCAGCGTTATGCTAATGGC:2 + chr3R 26399931 3' - roo 8683 2 72.60 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATTGATATTGATATTAGCCCTTGAGTTATATATACACGATGACCGTTAAGAA:1 + chr2R 14247062 3' - pogo 62 1 65.07 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATGTATATTATATTTAATCTAGTTATGGTTTAAATACCAAGTCTTTCCAGACTGTCAAAAGTTTTTGGTAAGCTGAGCGGTAAGCCTTGCTAATTTTGAAATTACCAATTAAGTTATTAGGAGC:1 + chr3L 15891146 3' + mdg3 247 1 67.12 TCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCGGTTGTGTCCGATGATTAGGACTAGCG:1 + chr3R 30056542 3' + jockey 4898 1 80.82 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTA:2 - chr2R 21227368 3' - mdg3 82 2 73.29 GGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCATCAGGAACTACGTAAAATTCAACTTTGCATG:1 + chr2L 22513371 3' - Stalker2 7337 2 78.08 GTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTC:1 - chr2R 19904019 3' - Doc 4476 1 58.22 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCTCTAACCAATTTCGGATTTATATATACTCTTAGTTGGGCAGTTGCGGCTGGATTTCATT:1 + chr3R 18903523 3' - pogo 13 1 73.02 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGCTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCATCTCCTTGACCTGC:1 - chr2R 17986230 3' - 297 36 2 61.38 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAACTCCC:1 - chr3L 3540085 3' + mdg3 5471 2 67.12 CAAAAAAAAAATATAGAAAAAAGGAACTCACAAAGAAGACGTGCCCGCCGAGATCCCCCATGATTACCTGAACCGGGATAAAACAGTCTAAGACTGGAGAGCATAAAA:1 + chr2L 17929844 3' - Tc3 78 3 88.89 CGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGCTTCACAGCGATTA:1 + chr2R 9033954 3' - F-element 4503 1 67.52 GTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGTACAGGCAGGCATCCACATTTGGACCCCACTCTCCACTTGA:1 - chr3R 20765432 3' + R2-element 3458 1 71.92 GAGCATGCTATAGTCGAGTTGCCCGACTATTAGATACCCCTTACCCCTTAAAATGTTCAAAAACGTGGACGTGATCGTTTTCGGCGTATTGAAGATGTCAGGAAGGGCGAGGGCAAAGTGTTTATGGTATATCGATAGAAATT:1 - chr2L 22097515 3' - INE-1 573 1 60.14 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTCAAACTGTTATAGGTGCGTAGGT:2 + chr3R 13358712 3' - mdg3 40 2 58.90 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAA:1 - chr3R 20452158 3' + blood 340 2 59.59 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAAGGTTCATCTTGCGGATAAGAAT:1 + chr3R 29709086 3' + blood 336 2 55.48 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGCTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGCGGGGGGTTAGGGGGAGGGGTGGTAACTCGGGCAACTCTCGCTTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCCTTT:1 - chr2R 17345238 3' - Tirant 8195 2 73.29 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAG:1 + chr3L 9242071 3' + roo 328 2 71.23 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCAC:1 + chr2L 13547032 3' - P-element 49 1 32.04 GTAAAGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTGGACATTCAGTAGCATTCTCTCTTGTTTTCTTTGTATATTGGTGTACAAATTTATGCTCGCCAATGGAATTATACGGTTTTTGTTTATAAAGTAGAGGAATTCAACTATCGAAATATA:1 + chr4 511999 3' + INE-1 551 1 56.16 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAACTAGGTGGGAAGGTAGGACC:1 - chr3L 18708562 3' - F-element 35 1 67.81 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTTTGAATGAAAACTG:1 + chrX 3452517 3' - Tirant 8163 2 60.74 CTCCTCTGGTGGGGGATCTCGAAAATCGGGAGCTCTTCCTGAACGGGTCGTTGCGATCAGGGGGACTGCCCCCCACTGCGCTGTCCATGCATTTGGACGAGTGAAGTTGCCGCCGTTAGCTGACTTTTTGCTGGCAGTGTGTGTGT:1 - chr3R 16319714 3' - Rt1b 449 1 60.27 AGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGGTGTGTAAGAAGTTTATAGTGGGCGGGGCCGAGACTCCGGTTAATGGCCAAAAGGATGGGGCGTGGCTGCTATTAG:1 - chr2R 14553215 3' + mdg3 5454 2 53.42 AGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTTGGCCGCAGTTGGTGTTGTTGCCCCGATC:1 - chr2R 10478641 3' + invader4 3065 2 65.94 GTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTATTTTTTATCCTAGCGGAGAACGCAAAGCTCTCCGAGATCATATCCAAATTCGTGAATTTC:1 - chr2R 17575938 3' - Transpac 5136 2 58.90 AATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCAGCTGGAAAACTCGCCTTCCTTCTTAT:1 + chr3R 20147601 3' + 1360 373 1 68.49 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTATATGCTAATTTCGTAATCCCAACATAC:1 + chrX 17469247 3' - blood 7100 2 77.40 AAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAATAAAATAACAATTCATTTGGAGCAATTTTCTGTGCAT:1 + chr2L 6237547 3' + opus 7395 2 74.66 GTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCATCACGACATAAAATGCATAAATTGCAGAGAATTTATCAAATTTTTATACTCATTCACTTTCAGTGGCACATAATTACACCT:1 - chrX 17972115 3' + diver 361 1 50.00 GTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATTAGTTTTGTCATGACATTTCAAAAGAGCCGCCCCACCTGTCCTTTCATTCAATTGCATTGGGTGGAA:1 - chr3R 5904292 3' + invader2 4831 1 54.11 CCCGACTATCAGATACCCCTTACTCAGCTAGTTGAAATGCGAACGCGTAATTTTATCATATTTTTGGGACATCGATAGATATTGTGAAAAGGGGGCTATTGATCCTGATCAAGAATCTATCTAGGAAACGGAAACAAGTCAGGCG:1 + chr3L 24491808 3' - INE-1 552 1 64.83 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTG:1 - chr2R 20461202 3' - jockey 85 1 72.86 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTT:1 - chr3R 18903385 3' + pogo 2046 1 57.53 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTA:1 - chr2L 2357278 3' + P-element 2827 1 44.52 GAAAAAATTTTCAACTTTAAATAGAGCTACAACAATTTGTTTAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTATGAATCGGACTCAATTGCACTCAATCGCAAGTCTGCATTTTAATATACCGACCAAATATATATATACTT:1 - chrX 11945560 3' - hopper 1028 1 52.74 AAGTACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTG:2 + chrX 22824252 3' + Gypsy12A_LTR 2232 1 48.63 AAATTCATATTTTCAAAATCAATCAATGCTTAATAATTAATAACAATGTTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTAAATATAAATCTAACTGGTCTGTTACCAGCCCAGGAATGAGACATCGGGGCGTGGATAT:1 + chr2R 24074842 3' - gypsy12 9799 2 65.75 TTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAGTTTACTATGCATATTATACTATACTTGAAGAGAAGTCATATCCAATAATGCATAAT:1 - chr3L 16264602 3' - Burdock 6198 2 63.01 CACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTTGGGAAGTGCATCAGGTAATCTGCGCCTGACCCGCTGCCAGGACATGATTTTCAGAGGAGCCATTTGAATGGGTAGCCTTGTTCCGA:1 + chr3R 15514492 3' + 412 7260 2 63.01 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGTAAATAATACTCGGTTCATGTTTTGAATTAATTTTAATTGAGATTCATTTGTAAGCAATCAGTTAGATTGTTCAGTTCAGCTCTGCCAGCTTACAGA:1 - chr2R 22255283 3' + roo 9050 2 71.92 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCACAAAGGCGTATAAAATTACACAACAGAGCTAATTAAGTTAGAAATGTTTGTTACTGCATACCCTTTACAGAAACC:1 + chr3L 4869301 3' - roo 8677 2 74.66 GGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAATCCAGACGGCGGCGCATTTTAAGCATCTTAAAAAAGTTTTCACTCCGGTTTGGGGCCACAC:1 - chr2L 12259312 3' - Idefix 7212 2 58.22 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTT:1 - chrX 15814533 3' - P-element 86 1 26.71 ATACAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATGACTGTTACGATTGTGATCTTGCGAGAAAACCCGCAGCAAACTGTAGGATAGTGTAGAGATAACTTTTCAGACAGATCATAA:1 - chr2L 13884551 3' - pogo 35 1 60.27 ACAAGTGCCCAAAATGCTGACTCAGAGGGCTGCACAGTTTCCGCAGCCATCAACTTCAACGAACTCTTAAAGTGCGATCATCAGCACTTCTCCGCTGCGACGCTGCTGACGAACACACATTATGGCATTTTTGCCAATTCCTTGCT:1 + chr2L 22497746 3' + HMS-Beagle2 6945 2 76.03 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCC:1 - chr2L 8397143 3' + roo 9017 2 54.79 AATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAGTGGCATTAGAGGCGCTTAGCAGCCACGTTCCGAGTAATCCGCGTGCC:1 - chr2L 9356768 3' + Stalker4 388 1 73.97 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATCATTATGCAAACAATATTTAATTACTAATGGGCCGTGCAAAAGGCGATAGAT:1 + chr2R 14884391 3' - mdg3 26 2 68.49 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAACTAGGCATGAAATTGTATAGCTTTTTATCTGAAT:1 + chr3R 20452317 3' - blood 7038 2 67.81 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGATGATTGTGCTATCTGTTATCGC:1 - chrX 18366012 3' - jockey 66 1 56.16 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAGACCGAGACGTAGACGCGTGCGCACG:1 + chr2L 10032708 3' - hobo 72 1 79.03 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAA:1 + chr2L 19878253 3' - mdg3 5319 2 63.01 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAACGTTAAGACAGAATTTGCGAGCTATGAATATAAATGATATGGCCTAAGAATATTTTATTTTAAAAG:1 - chr3R 5245556 3' - 1360 48 1 53.42 TCCATACCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAGGTTCGAACATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTCAGATTTATTGTCAGATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTATTTTTCATGTCTTACAATTGGCCCGACCGAAGTT:1 - chr2L 4619481 3' + GATE 351 1 76.71 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCGGCAGGATATCAACCAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAAC:1 - chr2R 20704122 3' + hobo 2926 1 65.45 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTA:1 - chrX 19231744 3' + mdg3 180 2 61.64 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAAATGG:1 + chrX 10979106 3' + roo 351 2 58.90 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGGTGGCATTAAGCGAGTTTTTATGCAGC:1 - chr3R 10973165 3' - jockey 26 1 69.06 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACG:1 - chr3L 16157227 3' - Juan 47 1 73.74 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCAAAAAAGATTCTTTACTAATTATGTTCATAAATTTATCAGTAAACAAATTAAGTT:1 - chr2L 17747365 3' + Tirant 8481 2 68.49 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGC:1 - chr2R 16908463 3' + roo 9031 1 56.55 AATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTCATGAAGTAAACAGAAATAAAAACATACATACACACACCTCGCCAAACCGCTATACAAAGGGGACCACCGATTTTTCGCAGGTTGCCATTTAAAGG:1 - chr2R 547674 3' - Stalker 7223 4 66.44 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAATAGGTAAAGAGAATTACCCACTTCGGTGCTTAGAAGCATAATTTTTTGCTCTATCAAAAGGATTATTAGCAAATTGTTTTCGTAGCTATTAACAATATGATGCTCATAATT:1 + chr2L 16942190 3' - mdg1 11 2 78.77 GCACGGGTTTCCGGCCCAATGCTGGGTCAGCACTATGTTATTATGTTTTATACACTGAGCCGAGGTCAGAGAAGATGTCACATATTTATCAAATTTCGCCAACAACGAATCGTACATTTCGCTT:1 + chr2R 8068397 3' - Gypsy6A_LTR 71 1 58.87 AAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAAAAAATAGCAGAGAAATGTGCTACAATTGCTTCCTTATCAAAAAAGG:1 - chr3L 3786478 3' + hobo 217 1 68.49 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGGTACATCGAGTGCAAATTGAATAAAAAATAAAAAAGAATAATTGTACAATAGAAAGGATTCCCGAGGAAGTGAAAAGTTTTATTAG:1 - chr2L 21342229 3' + roo 9038 1 60.96 TTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATAAGCCACTATATATATATACATTTAGCAAGTTTCTATTATGTGTTACTTTATTGTT:1 + chr2R 3824680 3' - 297 6611 2 56.57 CGCAAGTACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATA:1 + chrX 22824249 3' + Gypsy12A_LTR 2229 1 46.58 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCA:1 - chr2R 10367496 3' - 412 84 2 73.79 CAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAG:1 - chr2R 5582164 3' - Cr1a 432 1 74.74 ATTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATG:1 - chr3L 23456281 3' + Gypsy6A_LTR 245 1 76.03 CATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGGCGTAATCGCGCCCAGAGGAGACAGACACACTTAAAAACCGACAAAACTTAATTAAATGCAGGCGCACAGAAAAATATCCACAAATAAA:1 - chr3R 25380560 3' + mdg3 92 2 74.63 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGCGCAACTTTCAAAGATGCAG:1 + chr2R 24427647 3' - jockey 4708 1 61.11 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCTTTGCAATCCCCTGTT:1 + chr3R 25443143 3' - 297 52 2 60.27 GCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCTGCTAATGTGATTGTTGTTGTTCTGATAAAC:1 + chr3R 10140315 3' - P-element 21 1 72.60 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAATTAAAATTGCATTAAAG:1 - chr3R 9345536 3' - pogo 30 1 63.70 CTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGACAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACATGACAAATGTGTGGCACTCACCATCAGATGTGGCATTCAGCTGCAACTAAATGTTGTTTTACTAACCGATAT:1 + chr2R 19893896 3' + mdg1 233 2 52.05 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTTTGATTGATATTCAGTGCATCATTCG:1 - chr3L 18835271 3' + pogo 2055 1 55.48 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTA:2 + chrX 17469288 3' - blood 7059 2 53.42 GACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGAC:1 - chr2R 20382485 3' + Bari1 1645 1 60.27 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCTAGTGGAGTACCAACCTGGCCGCGCATGCGTGTAAACATATCGATCCAG:1 + chr2L 7991370 3' + 297 6909 2 65.52 CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCT:1 - chr3L 14854662 3' - rover 6999 2 55.48 TTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAAAGACCCAAGCGATATGCTATGATTTTTATTTTGTCATTAATTTGCTAGGTAGATGTGGAAGTTTATT:1 - chr2L 1552966 3' + gypsy4 417 2 54.11 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCGTGGCAAAGTTGTT:1 + chr3R 22429276 3' - roo 8683 2 71.03 GAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTTTTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAA:1 - chrY 2346867 3' + micropia 5395 2 53.49 ACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATA:1 + chr3R 27845547 3' + Stalker 327 4 71.23 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGCGGCTGTGAGGAAATAAGGTATTTCATTTCTCCGCCTGGTGTTGCACTTTATTTTTTCCACTGTGCCTAGGCCGAGCCCTCTAAAAAAAAATTT:1 - chr2R 11655972 3' + HMS-Beagle 223 2 69.86 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGAACATTGAAACCCACTTGGACGCGGGGCACCACGACATAGGAAAGGCCATTTCCTTGATTTGAGCTAATGGCATTCTTGTTGGAG:1 - chr3R 25384156 3' - mdg3 5288 2 60.96 ACTGTATGTATGTATGTATACTCCCTTACAAAATATAAACCTATTGGCTCCATCTTTTGTGTTGCTACATCTGGGTTGCCATCTTATGAGGTGGGATTCGCGCAGATGAGTGATGCCAGGATCAGGAAATTTTGTGTAGCTGAAAT:1 - chr3L 24051779 3' + 1731 98 1 28.77 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCACGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCAATCTAGCCAAGCGG:1 - chr3R 10288773 3' + copia 220 1 58.22 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGACAGTAGA:1 - chrX 18366034 3' - jockey 88 1 71.23 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTTATATAGCGCTCGGCTTGCTGGCAGCGATATAGTTGGGTCTATGACAGGATCTGGGCTTGGATGCGTAACTTAGGAT:1 + chr3R 9983121 3' - HMS-Beagle 40 2 58.22 ACAGATGCCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCACACGCGAAATTTCATTATTTATCTGGGGTATCGATAGATATTGAGAATAAAATGAGTAAATATTAAACAAAGAACCGTTTACACATTTATGCGTGAAATACTTAAGCTACAAA:1 - chr3L 22940487 3' - INE-1 544 1 66.44 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTG:1 - chr2R 18123430 3' - 412 7123 2 65.52 TAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGCAAAAACACTGTGGCCACGACCTTTCTTTCTTATTTAAAATTTTTTAATTTCTTTAACGGGTATCTGATAGTAGAGGATCACGACTATATTAAAATTGATGGGCCTGCCGAAGTGGGAGGA:1 + chr3R 15458718 3' + Tc3 307 1 78.08 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCACAAATTGCCCATATCAATGTTAATTTGAAGGCTTGTTTCCGTACTGATT:1 - chr2R 18123371 3' - 412 12 2 71.92 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAGAACACCGTTCATGCTGTG:1 + chr2L 21237328 3' + P-element 2841 1 52.74 ATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCAAACAGATT:1 - chr2L 17550608 3' + Transib-N1_DM 446 1 79.45 GATAAGCACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAG:1 + chr3L 13204773 3' - jockey 96 1 78.08 CAACGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTGTGCAGAAAAACGCAGTCGAGCAGTTAAAACAACAAG:1 - chr3R 10541252 3' + hopper 1349 1 60.27 AGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTATTTTTTGAAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCTTATATTTG:1 + chr3R 11553712 3' - hopper 66 1 70.83 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCCGGACGCAGGACGCGGAGGCCCACGGCAACGTGGCAGCCATTAA:1 - chr2R 10367460 3' - 412 49 2 51.37 AAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATCCCCAAACTGCGCTTCCCAGATAATCAGGTTGTTGGGATTGTCAATGGCCATGCCGTACTCGAATCCCAGCACCGCCTCCTCCGAGAGAATA:1 - chr3R 31202153 3' - Tirant 8447 2 60.27 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACGAAACATTGGCAATTATTGATACAATGGAAATGCGCATAGCAAGTAGATTGCTGGAGTTTAAGGCACAGATG:1 - chr2L 8392957 3' + I-element 5308 1 50.34 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAGGATTTAAAGGCCTATCCTGTATTTTATAGTTTAC:1 + chr3L 20076908 3' + roo 393 1 76.03 AATTAATAATAATAATTATAATTAATAATAATTACCCCCACCATCTGCAGTAATTGTCCGGGACATGGTGCAAATGCCGCCGCCGCCCTCGAACGCCCCCACATCGGCGGACGCC:1 + chr3R 31612022 3' - Gypsy12A_LTR 1811 1 75.65 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTC:1 - chr3L 15058848 3' - blood 64 2 58.90 TACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATAACCCATTGAGGAGGCATTTCAATTATGTTTGGATACACACAAGCAATGCGAACACTCGTTGAC:1 - chr3R 19300904 3' + mdg1 439 1 56.16 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGCGCGACCACGCCCACGAGCAGAAAACAATATGAATTTTCCCACAAAGAGAAAAAGAAGGAAATGAAACCCAGACGG:1 + chr2R 16383421 3' + roo 398 1 65.28 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCTACTTTTCCTTCG:1 - chr2R 544754 3' - HMS-Beagle 6828 2 63.70 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTGAATACTTATTACATGGCGACCGTGACAGGACTCGATTTTGGTATATGAAATGCTTTCGGGACTTATGTTGGCTTAGCAGCAAACTTGTCTA:1 + chr3L 13611059 3' + Stalker2 7605 2 50.68 CAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATGTTGTGTTACGGATTTTTGTGGCCTATAAATCGTAATTACTT:1 + chr2L 15143391 3' - BS 4785 1 69.86 ATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTCGCCAAGTTTATAACAAAGCAAAAAAAAATTCTAAACCGAAGTAC:1 - chr3R 27845484 3' - Stalker 77 4 69.18 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACTCGCACCCACATACACGTGATAAAAAAACCGTATTCATTCACAGAACAGTGAAATTGGGTGTCATTTTGGGATCGAT:1 + chr2L 1074029 3' + Tirant 354 2 54.11 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACATTCTCATTTGCATATTTACATTGCCTATCTGGATGGAATTTATTGTTGCTA:1 + chr3R 10288924 3' - copia 4905 2 58.22 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACCCGTCAATTACGTTGCCTAGGCTGAAAATACATATATCAATGCTATC:1 + chr2R 14884340 3' - mdg3 5315 2 67.12 CATTAATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAATATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGATCGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAA:1 - chr3L 27282408 3' - INE-1 535 1 39.73 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGTTGGCATTAAGCGAGTTTTTATGCAGC:1 - chr3R 10973165 3' - jockey 33 1 67.12 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAATTGTTAACTACAACACGAGTAACTTTTTCCATATG:1 - chr2R 10164625 3' - jockey 90 1 71.92 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGAGCGTCTGGTGCTGCAGAGGCACCTGATGC:1 - chr2L 8103457 3' + pogo 2090 1 69.86 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCTGCCGTTCTCCTTTTGGAGCA:1 + chr3R 10468138 3' - opus 7141 4 68.49 CGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCGTCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCT:1 - chr2R 982347 3' + rooA 7474 2 41.10 CAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATGTCCAGCTGGAGTTCGAAAACCAACTGCCTACATGCGACGAC:1 + chr3R 24175762 3' - Burdock 76 2 71.23 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTCCAGGTTGTATTCAA:1 + chrX 15167804 3' + roo 394 1 75.34 GCTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGC:1 - chr3R 25521812 3' + blood 7310 2 72.41 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACCTTTTATATCTCGTATACATCATCCTACCTGTTTTTTTTTGTTGCCAAACAATTTACATTCAATTTTATCGCAGGCTTTCTAATTTCACATCGTCATGCTTGCCACA:1 + chr2R 14705914 3' - roo 13 2 74.66 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACTCTGCGGTACCCCAGCCGTGCAGCAAATTCTTCGTTATCTACGCTCCCCTTTTTTGCTCTCTCTATCTTTTGTCAATAAATATCATTTTATTTTCTTTACGCTCTGCGACTATAA:1 - chr3L 5979259 3' - 1360 2 2 66.21 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATCAATTCCTTCAAATTATGCTTAAGATGGTAAGTTTTTAGAATTATTTAC:1 - chr3L 10506709 3' + S-element 1673 1 55.86 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGATATACAATCTCTAGGGCTTTAAATTGAACCA:1 + chr3L 4869226 3' - roo 8752 2 80.14 GCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAATTGCTACTACTGACTAATTCGGCTTACCATATTATAATGGGCAGGTGCTCCAAGCAATTGTTGTACAAGTCCAAGTGGCG:1 + chr3L 9508369 3' - diver2 4652 2 64.44 GGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAAGTTCCCCTTTTTCAGGAG:1 - chr2R 6984276 3' - HMS-Beagle2 6889 2 76.42 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATTTTAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACTCACAGA:1 - chr3L 10330690 3' + P-element 2816 1 35.97 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCT:1 + chr3R 10140285 3' - P-element 51 1 52.05 TGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTCCGTGGTCCTTTGGCCTGCCTCATTGTAGCTGGTTTTATTCGGACGCATTATCGCTGTCGTCATCACCATTTGTTGTGGGTTA:1 - chrX 11040223 3' - F-element 4585 1 65.22 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGA:1 - chr3R 25753638 3' - hobo 79 1 71.92 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATGCACCGGGAGAAAATACA:1 - chrX 19162543 3' + pogo 2077 1 66.44 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCCGGACGCTTTTGTGATTTTATTTTTGCGTTTTCCCGTGATT:1 - chr3R 26399775 3' + roo 360 2 52.74 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGGACAGTGGAAGTGGACGTGGACATGGCAC:2 - chr2L 535406 3' + roo 355 2 55.00 ACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACAACTTTGAGTGGCATAAACCCAACGCACCACTCG:1 + chr2L 20842008 3' + G6 1984 1 57.53 CAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 7552 2 68.49 ACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGGGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCAGGCGTAAAGGCCATCTGTTTTTAAGATAACATTTTAGTTAAATCGGAAAATAGCAACTTAT:1 - chrX 2890261 3' + R1A1-element 367 1 67.12 TATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCCCACAATAGATGGA:1 - chr2L 18370317 3' - Doc 49 1 55.48 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATACAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAA:1 - chr3R 7739696 3' - blood 7092 2 69.18 GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCGCAGGAAAT:1 + chr3L 3540267 3' - mdg3 5266 1 74.66 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGAGCCATGCCAACAA:1 - chr3R 15590563 3' + roo 9009 2 60.27 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATTGATATTGATATTAGCCCTTGAGTTATATATACACGATGACCGTTAAGAACGGCGATGTCGTCAAGGACGATGTGAATTCGCGATCG:1 + chr2R 14247099 3' - pogo 25 1 68.49 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTGAAATGAAATCAGCACATCACCTAGCTGTCAGCCAGTCAGTCTTGGTTTAAGCCCCTGCTTTTCCTTAAGCCAACAGTTCAGCCCCAGG:1 + chr2L 10937965 3' - mdg1 33 2 57.53 GCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACTTTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTG:1 + chr2R 16312088 3' - G6 2013 1 74.82 TTTTGTTTTTATTTTTATTATTTTGTTTATTTATTTTTTAGCACACCAAGCGTACCTTCCACGACGCCCAAAACAAAGTGCGCCGTCAGGAATCTGGTTACTTCATTATGCCCCAGGACAGACGCACTTACACCGTGAAAAGTA:1 + chr2R 19361478 3' - Doc 4691 4 75.69 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATATTTTGTTTTTGTGAAATTGCATGCTCTTAAAAATATATAAAATATATTTTCAAGTATATTTCATGATCTTTTTGCATTTGTTTAGCCT:1 + chr3L 14546457 3' - copia 4900 2 65.07 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATG:2 - chr3L 21097142 3' - mdg3 88 2 76.03 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATGTTTCTCTACGTGTTGTTCGTAAATTATAACAACTCCTACAGCTTGGGGCTCAGATCTGGTGTGGTGCATTTTTGGTCTGGAGCCAGTTAA:1 - chr3L 20893529 3' - mdg1 7068 2 65.07 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACCTCAAAACAATATCAAT:1 + chr2L 2338191 3' - blood 34 2 63.01 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCT:1 - chr3L 5446116 3' + roo 8993 2 71.92 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAA:1 + chr3L 9426753 3' - P-element 35 1 46.60 TCACAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCATTAATTAATGCACTTATCCCGTTTATAAATAATGAACATTAACATAGTGTCTATGATATTATGAAGTAGTGAC:1 + chr2L 17552336 3' + diver2 350 2 73.97 ATATAATAGAATATTTGTCATTAGAGTATCCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAACAGCGGGTCCGTGGCCGTGGGCATGGCCA:1 + chrX 12456664 3' + 1360 393 1 78.77 ACAATGAAGTTATCCATATGTTTATGTTACCTAATTTAACTACTAAAATTATTAAACAATTTCCCATTAAGCTTCTTACGGAGGAAACAAGTTAGATGATTATAAAATCAAATTTATATACCCGTTATATTATTTCTGTCTGCATC:1 + chrX 22923612 3' + Tc1-2 1490 1 53.42 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATTTCATTTTTAAATCAGGCTTAAAACACCTTTTTAATTGATACTTCAGAATATTTTATAGCCATGC:1 + chr3L 10370985 3' + copia 5069 2 55.48 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAGCTGTGAAACCACATTATTTCATAAGTGTATTTCTGCTATTGCTGCTGAAACATTGCAGTTGACAGCGACAG:1 + chr3R 5245718 3' + 1360 3378 1 78.08 TAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAAGACCATGAATAACAATTTCTGAACACCGGATGCGTCGGCATTATATGCATATGTGGGTTCTTCAGTT:1 + chr2R 17014133 3' + HMS-Beagle 7000 2 51.09 TCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGATGATTCGCAGGATAAGCGAGTTGTAGTCCTTGGCTCGCTG:1 - chrX 14367904 3' - roo 421 1 72.60 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTGACACAGGCGAATCACAGGCGAATCATATGTGAACGGGCTATAAATCGTCAATAGGTTACCCACCTTGCGAATATGATAC:1 + chrX 14173326 3' + 412 7505 2 56.85 ATTTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGGATTTTC:1 + chr2R 16312100 3' - G2 3039 2 67.15 TACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTT:1 + chr3L 25508750 3' - 1360 338 1 61.64 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAG:1 - chr2R 6945629 3' + pogo 2031 1 69.86 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCAT:1 + chr2R 19543764 3' - jockey 4789 1 56.80 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAA:2 - chrX 11228577 3' + roo 323 2 74.66 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTAACTGATTTCCCTTTGTGGCACATATGCGATTGAT:1 + chr3R 12608214 3' - roo 12 2 47.26 TTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAAC:1 - chr3R 22659936 3' + 412 406 2 78.77 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGC:1 + chr2R 16891838 3' - jockey 89 1 71.72 CGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTT:1 + chr2R 9033927 3' - F-element 4527 1 55.26 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATGAGGACATCGTTAATTC:1 + chr3L 6751761 3' + pogo 2044 1 58.22 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTA:1 - chr3R 26782716 3' - hobo 75 1 72.41 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATTGACGTGTTT:1 + chr2L 1449683 3' + opus 7437 2 63.70 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTGTTGCTGCTAATGTGATTGTTGTTGTTCTGTTAAACGCTAATTTGCCT:1 + chr3R 10140327 3' + P-element 2878 2 79.45 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCC:2 + chr2R 5992417 3' - pogo 40 1 58.22 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAAATAACCAGCAAAGCTG:1 + chr2L 19878269 3' - mdg3 5303 2 52.05 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCAACTGATCCTAATCA:1 - chr2R 18123420 3' - 412 7114 2 58.90 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCA:1 - chr2L 20984304 3' - blood 7077 2 63.70 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCAATGAATTTAAGTCTGATAATTTCTCACTTTTTCCTTACAGATTTTCAAGCTTCTTTTTTGAGGCCTTCACCACATAAAACTAACG:1 + chr3R 12367564 3' - copia 4906 2 61.64 CTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAA:1 + chr2L 21596567 3' + blood 7305 2 70.55 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCG:1 + chr3L 15035250 3' - pogo 30 1 63.70 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAA:1 - chrX 13061723 3' - mdg3 5331 2 68.49 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGGGAGACAATAA:1 + chr3R 29350802 3' - 297 32 2 55.20 CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTG:1 - chr2L 19424653 3' - Tirant 8171 2 60.27 TGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAACGTTCTCTCTTGTTATGTGTATGTGCATATATAGTCTTTGAGTTAAACTAAATATAAATAAATATTCGCAAAGTGCAGTCGTGTATACGAAACTGCGGTCGAGTCTTACCCTTG:1 + chr4 380289 3' + INE-1 556 1 55.48 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAAAGTTGCGAGTTGTTGGTTATGTGT:1 - chrX 17614327 3' + roo 397 1 76.03 ACAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTTGTAGTTTGCAGTATATGTAGTTAATCCCTAGTGGATCGGAATCGGCATCGAAATTTAGATTTTACACTTAAAGTAACATCTTCAAATTGAATGG:1 + chrX 19707885 3' - Tc1 1466 1 60.27 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTC:1 - chr3L 22481250 3' + roo 8989 2 77.40 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTA:1 + chr3L 22635782 3' + hopper2 1554 1 51.37 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACA:1 - chr3R 11526758 3' + pogo 2048 1 54.11 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTCACTGTCAGTCATGTAAATCTGTAACATAT:1 + chr2L 21596602 3' + blood 7347 2 53.96 GCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTTCCAAGTGGATGGAGCATGAGGCTTGCGTATCCGTGATCTTTGTG:1 - chr2R 16999690 3' + F-element 4546 1 69.18 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGGCTAATTACGCCTGCACTAAATGCAGTTAAAACAACGC:2 - chr3R 25521749 3' + blood 360 2 73.29 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACAC:2 - chr3R 8367110 3' - Doc 22 1 64.38 GAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTGCTTGCATATTCATAAGACT:1 - chrX 12893311 3' + Bari1 1674 1 63.01 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAA:1 + chr2R 9867170 3' + roo 330 2 69.18 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCAAAACACACTCATGCAAACTGGCGCTGATTTACCTAACAAGCGCAACTCGAAGAACAAAAGGCCAAAAGGCAGGGGATCCC:1 + chr3R 28144939 3' + hobo 2909 1 62.22 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAAC:1 - chr2L 12261160 3' - jockey 67 1 58.57 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCG:1 + chrX 21213430 3' - Doc 25 1 65.75 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAATGCAAT:1 + chr2R 20700765 3' - mdg1 21 2 71.23 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACCGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACGATTATGTTTGCAAAGTGGAGAAAAT:1 + chr3L 11196475 3' - pogo 29 1 65.75 AGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAATGCACTTCTGCAGAAGCAACGGAAAGGAATGCCATTACAAGAATCAG:1 + chrX 14664471 3' - P-element 2794 1 32.19 AGGCGAAACCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAGAGTGAACACTCAGCAAGTGGGAATGCGAATGTTCAAATAACCGGCCATCACCTGGGGACCACGAAC:1 + chrX 14935061 3' + rooA 299 2 74.66 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTTCGATAAAATAATTTAGATATAATTTAATGTTCAAAACTGAAAAAAGTTCAAAAAGATTTAATTATTATAAGCATTTAAAACTTCCCCTTAAATTCC:1 + chr3R 11096814 3' + copia 231 1 69.18 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGACCGTTCGGAGAACCGAAGAAAGCCGACGGCGCTGTCTTCGCGGCCATTGCTCAGGCGTGTAGGTCGTCTAGAGGCCGTTG:1 - chr2R 15613731 3' - P-element 39 1 57.53 GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACAATTTATTATAGAAATATAGATATTTTTTGCGTAGAATCAGCTAATAAAGTT:1 - chr3R 18469130 3' - Quasimodo 67 2 67.81 GGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGTGACATTTTAAAGGAAGATGAATCAATTACTACAATTACAATAGAGATTGCAACA:1 - chrX 2042191 3' + hobo 474 1 77.24 GCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGTTTTTAGTTTCATTTTTTCCCCCTTTTTTGTTCTGTTGACTGATGGCGTACGTGTTATATATTG:1 + chr2R 11433602 3' + Stalker2 7404 6 55.00 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGCGCAACACGC:1 + chrX 19162718 3' - pogo 27 1 67.12 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGT:1 - chrX 14692850 3' - Transpac 70 2 65.07 CTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTCCGCACTGCACCCCACGGATATATACTATATGTAT:1 + chr3R 4780439 3' + Quasimodo 7131 2 76.03 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGCGTAGTTTACGCACAATATTGATGAGATAAAAAAGTTTACTTAAATGCTCTTTACTGAAATGCTAAGCACTTTCTGAATTCATAAGGTAGATC:1 + chr2R 9072987 3' - Burdock 6162 2 66.44 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGCGAAGTATGATTAGGTTATTGACTCGCCAACTTGAAATATATATGAGAACAAGGG:1 + chr2R 19354081 3' - 297 59 2 60.96 AATACTTTGTATGCATACCCTTAGCATTAATAAAATATTGCAGAAGTTTTTTCATTGAAAAAATAACTTTTCAAGATCATTTTGTTTTGGGATCTTATATTCAGTGAGTCAAGGCAAACGACAGAGCTTTCGGTGTGCAAATCAGC:1 + chr3R 18915003 3' - S2 1417 1 68.49 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGAACAGGAACATTTTTCTGAACAGATTGTGTATTAAGTTTTAAAGTCGGTTTAGGCATTAAATTAGTTGATGAGCCATTTCGATTTTGTCAGTAGGTGATTAACATA:1 + chr3L 9649222 3' - roo 23 2 68.49 CCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAATGTGTTGTCGGCTTTCTGCATGAGGACAGCAGTACAG:1 - chr3R 1135498 3' - Doc 462 1 73.19 TATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTATCGTATTCTGTTCGCCCTATTTGCTGATGATCCTGCTGCGCATTCTGAAGGGCAGCCTAGC:1 - chrX 17653684 3' + 3S18 5788 2 58.22 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGCTAACCG:1 + chr3L 9426756 3' - P-element 75 1 34.93 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATTCTTGCATAGCGGGCAAATACTTGATTCCTATATAGTATGCAATAAATGCAATAGAAA:2 + chr3R 10357854 3' + pogo 2042 1 60.27 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGTACTAAATAGCAGCCAAACGTATTCGGAATCATCGTATTTTTGTGCTGCCATCTCGCTTGCGCATTAAATGGGTATTTTTCAAAACATTTTTCATACT:1 + chrX 8626344 3' + Burdock 6372 2 72.60 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGCGAAGTATGATTAGGTTATTGACTCGCCAACTTGAAATATATATGAGAACAAGGGCACTGCTCTTACAACAAGCACTTAATTTGGGGATTA:1 + chr2R 19354117 3' - 297 23 2 70.55 CCTATTATCTGTAATCTTGATTCTGCCGCTCTTAAGCAATCGATTTTAACTTTTTATTGCATAATTAGATCTTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATCCGGTTCGGTAACCACACTGGCCGGTGGGGCACTCTCCGC:1 + chrX 13191565 3' + Cr1a 4223 1 71.43 TGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGG:1 - chr3L 14854660 3' - rover 46 2 54.79 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAA:1 - chr3R 19537467 3' + hopper2 1559 1 52.05 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTT:1 + chr2R 21897951 3' - 412 86 2 76.71 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAAC:1 + chrX 15089553 3' - P-element 98 1 18.49 AAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAAT:1 - chrX 18707499 3' - BS 4791 1 79.37 TATTATGTTCGTATATACTACAATACACACACACACACATACACACACACACAGGCTCAACGACGGGTCCTGGCTAGAAAGCTCATATCATATGCGGGGCGCGTCCTG:1 - chr3R 8402518 3' - mdg1 7039 2 76.85 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCATTATAATCCTTCCGCTCGAC:1 - chrX 10978935 3' - roo 10 2 75.00 AATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGAGC:1 + chr2R 14793534 3' + Dm88 8 2 84.83 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAA:1 - chr3R 16194123 3' + mdg1 360 2 59.03 CATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGGGCCTTGAGCGGTTTGTTTTGACCAGGGCTACGTTAGAAACTTGC:1 + chr3L 9679128 3' + R1A1-element 307 1 76.03 TTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAG:1 - chr3R 3527067 3' - Tabor 57 2 54.11 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTCGCGATTTGAAGCTATAATTAGATGAGGTATTTACTTTGGCAGAAGTGAAAG:1 + chr3R 20137386 3' + Burdock 229 2 66.44 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTCCACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATCTGCGAAAATTATTCATCAATTC:1 - chrX 18034633 3' - Juan 81 1 66.44 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAAGAGGTC:1 - chrX 21668673 3' + mdg1 403 2 60.27 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGCCACAACCGCAAAGTATTCAA:1 + chr3R 14088693 3' + 1360 3367 1 70.55 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCAGCTTTGAGTTAAAGGCCCATTAAAGGACCCCCCAAAAACACA:1 - chrX 20386662 3' + hopper 1342 1 67.81 GTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGTCAATCACTGGGTTTTGTTTGCTTAGAAGAATAAATAT:1 - chr2R 11574959 3' + INE-1 145 1 65.75 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCACTTCATAATATTGTCCCCGGCATAAGCGTGTGACTTCATCTATCTTTTATCTTGTCATAAACCATGAACCTGCAATATCAAC:1 - chr3L 15058822 3' - blood 7049 2 41.10 GTAGGGCAATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTGTCTCAAGCTTTCTTTCGAATATAATAATTGGCTTCCTCCGATTATATCGATCTTATTCATTAATGTCTGTAGACCAACACACTCAATGCCAACGA:1 - chr2R 5580498 3' + Gypsy12A_LTR 1966 1 77.40 ACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAAAACCTCAAAACGCAACAAATATGACTTAGCGATGCTCCACTTTAT:1 - chr3L 8959416 3' - hobo 146 1 68.49 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGC:1 + chr2L 17730542 3' - pogo 46 1 55.48 TGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATAGCTAGATCGACACGGCTATTGATCCTAATAAAAATAAAAAAATAATGGGGGGAAAAAAAAGAAAGAACCGAGGAGTTGTCGTACGAAACTTACTACACCGGAAATATAAAA:1 + chr3R 23319180 3' - INE-1 135 1 48.63 TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCT:1 - chr3L 19279131 3' + opus 420 2 73.29 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGGTGCTGGTTGTGCCTTTCGTTAACAATGTAAACGCCCGACTCGAAGTCGG:1 - chr3L 6630333 3' - jockey 4742 1 65.75 ACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGAAAATGGCTGTGAGACGGCAATGCCCCGTAAGAAGGTCTTAGACTCGGTAGTGGAGTGGGTAGAGCTCCCCAGTTAGTAGAGCTCTACCGCCAGCC:1 + chr2L 22298950 3' - baggins 5184 1 54.26 CCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTACACTTTCACAACGTGACTGTTTACGATTGATT:1 + chr2L 19417132 3' - BS 4999 1 57.53 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAAATTTAATCCAAGTAAATT:1 - chr2L 12481384 3' - pogo 20 1 69.18 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTATAACCACAGTGCAATCAATTGTAGTGGTCCAGAAAACACACTCGGTCG:1 + chr2L 2076691 3' - roo 40 2 67.12 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGAGCGTAGGAATTTGTGGATATAAAAATGGGGCGGAGTGTGGCCAGCTGAATCAGTTGAGGTGGGGCGAATCGGACTACGAGCGGTATTTTTATCTGTCCGCAGG:1 - chr3R 4659475 3' + P-element 2872 1 73.97 GAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACA:1 + chr3R 20368086 3' - Max-element 58 2 55.48 GCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTT:1 - chr2R 5070920 3' - gypsy5 6964 2 25.69 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGACCGGA:1 - chr2R 9332124 3' + roo 346 2 61.64 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAGTAACGATCATTTTAGATATAATTATACAAAGGTAACTTAAGCGAAAACCTAATCATATATCGCAATTATTTTCAAAATGTGTAGAATATTAATCAA:1 + chrX 13460663 3' - Quasimodo 17 2 68.49 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTACC:1 + chrX 14136585 3' + roo 9025 2 47.95 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGC:1 + chr3L 22221225 3' - 412 72 2 66.44 GCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAACTACTAACGGGCAGGCCCTTGAAGTGGTTTATTGCCAACAACAATTTCTGGAAGACATGGGTCGAGTTCATACAAAGCTTCCAGGAATTTTTCCTGCCTAGA:1 - chr3L 26026966 3' - F-element 4542 1 70.55 AACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATCTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATTCATTGCTCTGTAAAAGACATCAGATTTCTTTACATTCAATTCCCTTTTCAATTTTAT:1 - chr3L 22636608 3' + hopper 286 2 73.97 TAAGCATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTGAGGTGCTCTGTATGTGTGTGTGCGCCAGGTAAGATGCAAGGGTGTTAACCTTTTGTTCTCTAACCATATCGCGGTAGTCTGGCAGCCCTGTCACAACCGGTACCGATAACCACGACCA:1 - chrX 4318110 3' - Quasimodo 38 2 50.68 GAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGTTAGCTTGCAAAGTTGAGTGAGGTGAATGGTGTGTTTGCCAAGCATCTTTCGGAGTT:1 - chr2L 6721079 3' - 412 7537 2 60.96 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCC:1 - chr3L 4869177 3' + roo 8986 2 75.34 CAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTAGAATGATTTAAGATCATCATTAACGTTTCCATTGATTTCAGTGATGTGCGTTTGG:1 + chrX 11661596 3' - Cr1a 4228 1 71.92 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTTCCGGCCCCACCTTTACATGGCAATTTTTAACGCCCTTTTTATGACCAATGAAGATGCCCC:1 + chr3R 31956881 3' - pogo 55 1 58.22 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGGTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAGTG:1 - chr3R 7424546 3' + 412 422 2 64.38 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCCAGAGAATGTCTGGGCCGAGACAGCAGATA:1 + chr3R 23623976 3' - roo 8705 2 59.59 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCTGATAAAT:1 - chr2R 16712951 3' + pogo 2047 1 57.53 GATTATTTTTTTTTAAGTTTTTCCC:1 + chr3L 18338668 3' - gypsy2 427 1 84.00 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCCCTTTCTGAGGAGGAGGAATTTCACAATCATTTGTGGATGATATGACATTTTGTCGATTCGGTCACTTGGAAG:1 + chrX 3444199 3' - pogo 39 1 57.14 GCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCTATTTTTTGTTATTTAGCCCGCTAATGACGTTTGCTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTCCATCGCACAACCTAATGATGATGATGATGAC:1 - chr3R 27245621 3' - I-element 225 1 60.27 AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAACTAAAGGGTTCAAAAGTAATTACAATTTGAATGTAATATAACAAATTTATAGGGGAACTGAATGGCTTAACACGAGAATAACTTTAAA:1 - chr3L 3540090 3' + mdg3 214 2 63.70 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTATCCCCCAG:1 + chr2L 10832365 3' - Doc 40 1 60.42 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTATCCTCGCCATCCACAATTTAGCA:1 + chr2L 12481557 3' + pogo 2068 1 63.01 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAA:1 - chr3R 10468012 3' + opus 7428 2 66.44 AAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCA:1 - chr3L 20747117 3' - Burdock 6221 2 78.77 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACATTTACGATTATTATTTTA:1 + chrX 14908496 3' - blood 39 2 58.90 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGCGCATTTCATACCTCGCTTACCGAACAGCAGACAGACGATGAAATCGCATTATGTCGTATTCTGAATGAATGATATTTTATGCCTTACTTGCAAATCTG:1 + chr3R 4884522 3' - pogo 20 1 70.55 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACT:2 + chr3R 21924374 3' + roo 9031 1 57.53 ATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGCTCACGCCTAGTTCTTAAGATTAAGCTGCGAAGAAGCCATAAATAAACTGTTATATAAATAGA:1 + chr3R 17214507 3' - blood 7179 2 56.85 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGAT:1 - chr3L 21097137 3' - mdg3 5335 2 72.60 CGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAATGATCTGTGATGG:1 + chr2R 16312094 3' - G6 2012 1 72.92 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGTTGCCATTTGCTGATAGCCATCTTAGTCCGACGACAAAACATGGCCAGCAAGACCCG:1 - chr3L 13722020 3' + blood 7337 1 63.70 AAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGATCGAGCACCGCCCAAGTACAGTGGTAATCCGAGCTGGAG:1 - chr3R 24072915 3' + Stalker 7111 4 73.10 GTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGACAAAGTGCAGGAAAGAGTGTTTTAAATCTATGAGCCATAAAAGTAGCAAGGGAAAAACTATAAACAAAAAATCGAAACTTTACAATCACCAAG:1 + chr3L 26008512 3' - G5 4791 1 59.59 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCT:1 - chr3L 22221128 3' + 412 428 2 55.48 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAGTGGATCATCCATGACTTGCCGC:1 - chrX 10978995 3' - roo 76 2 72.60 ACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGGAAAACTGTGGG:1 - chr2L 17198027 3' - R1A1-element 5040 1 58.22 GTTTTGAGACTTTATTGACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAACCCTCGTCGCGACGATTGTGATTTCCC:1 - chr3L 9375855 3' + mdg1 7428 2 66.27 TATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATA:1 - chr3R 3922959 3' - Cr1a 93 1 73.97 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGTCGCTTCAAAGAGCTCGATTCGTGCGGACATAGGAGGAGATAAAGCGTGGTGTGTGGCACGTAATTAACGA:1 - chr3R 5086996 3' - P-element 47 1 52.41 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTCAAC:1 - chr2R 18807722 3' - jockey 26 1 72.60 TATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTC:1 - chrX 21474400 3' - 1731 65 2 80.14 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATATATATCTATCTGTGTCGAAAAGCCAGAGCTAAATCCTGGTCAACTCCCCATTTTTCTTATTCACGTTTTCCCGGAGAACAGCCTCCTTTT:1 + chr3R 9958751 3' + opus 7478 2 69.86 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAACACCCGAACTACCATTAATGGTGTCGGTACTGCTAAAGGAAACACAAATTAACAA:1 - chr2R 15062173 3' + blood 7323 1 63.70 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCAACTTGTATTTGCCCACTTTGTTGTTGTTGTTGTTCGTTTTTGGCTTTTAACTCGCTCGCGCCGATC:1 + chr2L 8103622 3' - pogo 52 1 58.22 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAA:1 + chrX 17258307 3' - 297 15 2 63.64 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCCAAGTTATTTCTGGGACTGTCTCAAAATATTTGATGTTTCCCGGTCCACTGGAATTCCTTGCGAGCGATCCAATCTAGCCAAGCGG:2 - chr3R 10288773 3' + copia 220 1 59.59 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGTTTATTCCATCATTATAATTACA:1 + chrX 14908478 3' - blood 7068 2 54.79 TTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGTCTGACGCTCCAGACGAAGGTTTTCGTGG:1 - chr3R 25271139 3' - 412 5 2 79.84 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAATATACAAAATAATTTGCTGCACTCGCACGC:1 + chr3L 20785588 3' - P-element 22 1 70.55 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTCTAAACTGAATTCTATGATTACAAGAAAATTTAAAAGCTACTTCTAATAGTCGTGAATACCAAGTGTATACTACCAATTTCCGCGTAGCATTGTATAGTGGCTACCACACCTT:1 - chr3L 5263299 3' - pogo 3 1 78.77 TTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAAT:1 - chr2R 2949019 3' + 17.6 7365 2 61.64 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTACCTCC:1 + chr3L 17447560 3' - Tirant 8155 2 56.03 AAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAACTATCTCACTCTCTAGAATCGGGTCTTTATATCCGTGTTGGCGTAAACAACAACAACGGGGGCACATAGGAATGAC:1 + chr2L 18650877 3' + 17.6 6966 2 52.05 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACCAGAGCTTCGGTCAAAAACGCACA:1 + chr2L 14970027 3' - Tirant 8121 2 77.40 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGA:1 - chr3R 8542606 3' + roo 8985 2 75.17 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGAGTGAGTGTATTGGAATGGGAATGATTCTATTAATATGGCGG:1 - chr3R 15589973 3' - Transpac 4991 2 69.72 ATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAATGAAAATGAGCTGAAATCTGAACGCGAG:1 - chr3L 7064255 3' + jockey 4577 1 78.79 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACTTTCAGTATTCGTATAGCTAAGAAGGCGCGTTTATATATTAAATTTATGATTGATATTCAGTGCAT:1 - chr3L 18835277 3' + pogo 2050 1 54.48 TATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTACAACGCTTCTATTTTTTAACTTCTGACTGTATGTGGTCTATAATATAGCATGAAACTTTCCTATATGTTGGAATATGTTTGTTATGGGGTAGTCGATCAAACG:1 + chr2R 5421527 3' + Cr1a 4324 1 73.97 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTC:1 - chr2R 544767 3' - HMS-Beagle 45 2 54.79 AAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTTTGATAAAAAACTGTGTTTCAAAGGA:1 - chrX 10119515 3' + FB 6 1 65.07 AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGAAAGCATTAAAATTCATTAAAGCGCAAATATGAAATAACAGAAAGCGGATAAGATAATAAA:1 - chrX 13061659 3' - mdg3 5267 2 74.66 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGAGCACTGAATTTAAGAGTATACTACGGTAACCGTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTAATTCATCATGCCCCGAAAGAAACTCGAAACTT:1 - chr2L 16685345 3' - P-element 82 1 15.20 ACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCAATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCAAAAATAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATGTCTTCTGTGGTGCTGTAGTTGGTGGCTTCAGCTGCTGCACCGCCCTGTTTTTCACA:1 - chrX 12285045 3' + micropia 42 4 43.15 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCGCAGGAGATTGATTAAGGCTC:1 - chr2R 19900970 3' + mdg1 7403 2 55.48 ATTTTTAATAATTTGTACTTTCTTTAATGTAATTATAATATATACACGTATCTCTTACAAATTACCTTATTTTTAACAGTGTAGTCCCTGAAACGGGGACCGGGAAAGGGGGAAGAGTCAACAGCAAACA:1 - chr3R 9379018 3' - P-element 2678 1 73.08 TTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGAAGCACCTTCAACGTTTTCTCAAGCGATCTCTCCTTCTCTGACATCACGGAAATTGG:1 - chr2L 20638352 3' - Doc 68 1 60.27 ACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATATATATCCTTTAGTTGATGTTCCGCTACAAAGAAAAGTTCTAAC:1 - chrX 16325318 3' + mdg1 345 2 69.86 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTT:1 + chrX 983210 3' - 412 7126 2 66.44 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTC:1 + chr3R 22429247 3' - roo 49 2 52.05 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATGCTCTTAATGTTTATGGACACTCTTTTTTGAAAACAAGTCTGAGCAATGTGATAATCCATATATCAGGCTAATACAAATCTGTAGTAATATCTGAAGT:1 + chr2R 18123559 3' - pogo 18 1 71.92 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACC:1 + chrX 15089559 3' - P-element 92 1 22.60 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATGGCAACGAGGACAATGCACACACACAGACACATATACACAATCAAGCCAAAAAGAGGGAAAGAAACACATTG:1 - chr3L 14898862 3' - jockey 56 1 52.74 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGG:1 - chr3L 18708601 3' - F-element 60 1 59.85 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCATTTCGAGTTGAAATTGTCTGGAAGAAATTCTAAAAAAAGAAACGAAGTTTCTAGCATCCATTGAAGTTAGTTACATTCAACGTTCCTCAAAC:1 - chrX 14692806 3' - Transpac 4945 2 68.49 AAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTCAGGTACTGACGGTCGGGAGCTGGCATTATTATGTCGTTAATTCATTTTGCCTCATA:1 - chr3R 9077756 3' - hopper 1025 1 61.64 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACATCAGCTTCCGACTGCAGCTGACCAAACATCCCATCCACCTGCCCCCGTAGTCC:1 + chr3L 22221284 3' - 412 13 2 76.71 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAATGTGTGTAGTGGAAAATAAAGCTGAGAAATTTCAGTTGGTCAAAAATTAGTACATTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 18126079 3' - Doc 12 1 61.47 AATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTGTGATTGGCCTAAAAAATATGTTTCAACGGAAAAAAGCAATAA:2 - chr2L 15142187 3' - BS 4712 1 78.08 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTTCCGCTA:1 - chr3L 12863648 3' - Transpac 4951 2 61.64 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTAACTGATTTCCCTTTGTGGCACATATGCGAT:1 + chr3R 12608210 3' - roo 16 2 44.52 GCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAATTTTTGGGCTGTGTCCTGGGTCTGACGTGTGCTGTATGAGCATAGAGCG:1 - chr3R 11366363 3' + 1360 3223 1 66.44 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGATGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACATCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTG:1 + chr2R 5900895 3' + Bari1 1621 1 79.14 CTCTCATTGTAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAGACAGCGAGTGGTCAATCACCATATCCTCATCAGGAACTACGTGAAATTCAACTTGCATGTCTATACCATCTACCTCCACCGAAATTACAAA:1 - chr2R 3603324 3' + Doc2-element 336 1 53.42 GAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAAACGCGCACTGTGGTCTTCGCTT:1 + chr2R 14562302 3' + Burdock 6389 2 44.52 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTATACAACTCACAGCTCAATCTGGCGAAAAAGTGAAGGGTTAAACCTGAGAACTTCGTAGTTCATTGAACCTATTTCA:1 - chr2L 7215496 3' + 297 358 2 63.45 CCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAAAGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACT:1 - chr2L 1449593 3' - opus 7182 4 64.38 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTC:1 + chr2L 20561462 3' - P-element 86 1 26.71 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGC:1 + chr2R 19543767 3' - jockey 4807 1 50.68 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTTATGCTTGATTTTGCTTGACTTCTAGCTAACCATAACACTAACAAAATTAATCAAAGAGTAGTTTGTATAGGTGCAGCGTATCCGACAGAATATAACATTCA:1 + chr2R 1277197 3' - Tirant 8125 2 74.66 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATG:1 + chr3L 9242101 3' + roo 9044 1 50.00 ATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTACACCGACAAAAGGCAATTAAATAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGTTTTGGGAAAGGTTCTTCGGTTCTTTGGTTTCGGACTTCCCCGAAA:1 + chr3R 14776348 3' + GATE 398 1 64.03 GGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTTTTGG:1 + chr2R 4103365 3' + invader1 393 2 65.75 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGATAATTTAATGAAGAGAAGTCTGAACATAAAGATTGTGTGGTAAGTACTGCAAACAAGTTTTAATTGAATACTTGAATTGAAAAAATCTCCAGGTTGTA:1 + chrX 15167799 3' + roo 389 2 71.92 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTC:1 + chr3L 5183770 3' + copia 168 2 80.14 TTTTTAATTTAGTTGTAAGTCTAAATTTCTC:1 + chr3R 17221348 3' + Juan 4007 1 58.06 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGGATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGATTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCTAGCAGATTAACAGGCCTG:1 + chr3L 14581510 3' - pogo 13 1 73.23 TAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATACTTGTCTGTAGAGTATTCAGCTTGCGAATAACTAACGTTTGTTGCCAGCAAGTAAATCTGTTCATTACATCTCCAGATGACCTG:1 - chr3R 17375773 3' + 1360 375 1 60.87 ACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAATACAAAGATTGTGGATTCAACTGCTTAATCATGCGTTA:1 - chr3R 19582801 3' + mdg3 108 2 73.97 GGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAATAACCCCAATACATGCGCAAAAAGTTAT:1 - chr3L 10076305 3' + X-element 4658 1 56.85 CGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGCCGGCAAAGG:1 + chr3R 30731535 3' - gypsy6 7423 2 80.82 ACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTATTTTTCCATGCGTTCTACGAGCAATTTAAGTCCCCATAAC:1 + chr3L 11669858 3' - Tabor 82 2 71.23 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGGCGAGTGGGAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTTTATCTCCCAACTTTAACCATCCAACTAGTGCCAGCCACCGAAAA:1 - chr3R 25753635 3' - hobo 65 1 64.44 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTCATAATCATAGTCGGGACGGGT:1 + chrX 22517725 3' - 1360 6 2 65.04 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTAAACGCGTATTTCTAGTTTTTATCTACTTTTCAACCTTTTTGGTATTAAAATCAAGTAGTGTGTAGTGTATTTAATGCACATAAAT:1 - chr3L 20711960 3' - 297 6603 2 70.00 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTAGCGCTCGAGCAGGGGCATTGCGGTGGGCATGGGCTTGGCATGGCGTCCTTT:1 + chrX 15089625 3' - P-element 26 1 66.44 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGGCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAA:1 + chrX 21213403 3' - Doc 52 1 47.26 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAAT:1 - chr3L 5446093 3' + roo 352 2 56.16 CGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTT:1 + chr2L 19878244 3' - mdg3 76 2 67.12 CAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAATCGTCAAAAACATTGCCAGAGTGATTTGAAC:1 + chr3R 24809962 3' + 1360 3301 1 76.71 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGC:1 - chr2R 5214933 3' - F-element 50 1 54.79 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGATAGGGAAATCACTCGCTTTGCTGCTTGCAACTT:1 - chr2R 6579522 3' + mdg1 7373 2 76.71 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAATAGTTTGTTCAGGGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAACAGCCAAATATTCATGAAA:1 - chr2L 12261142 3' - jockey 36 1 57.48 CGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGGGCTTAT:1 - chr3R 10973218 3' - jockey 86 1 68.28 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTAAAAGCGAGAATGTGCTCTAGTAAG:1 - chr3L 4710676 3' - Doc 20 1 74.66 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGG:1 - chr3R 9289275 3' + HMS-Beagle 7001 2 57.53 CCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATCACAGAAAAAGTGAAACGGAAGAGTAAATTCCTAAGACTCGTG:1 + chr3L 10076380 3' - X-element 83 1 65.75 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGC:1 + chr3L 13227682 3' - hobo 71 1 73.08 AACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCCG:1 - chr2R 10478664 3' + invader4 276 2 52.41 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCATGGCCTTGCATAGAAATTACTTTTACTGGGGAA:1 + chrX 9443338 3' - jockey 4814 1 77.40 CTGGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGGGCGCCGATGTTGACAACAATT:1 + chr2R 19543797 3' - jockey 4777 1 69.86 ACAAAAATTCAAGAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCGC:1 - chr3L 26852643 3' - 1360 83 1 67.83 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACAGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCGAGC:1 + chr2R 21227457 3' + mdg3 194 2 52.74 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAGTGCCAATGTGCTGTCAAAAAGTTGCTAGTTGTTGG:1 - chrX 17614335 3' + roo 9053 2 71.23 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAAACAGGAGCAGAGCAAAGCGACAGGCAGCATGACATGCACTTCATAAAAC:1 + chr3L 13597870 3' + blood 7352 2 59.59 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAACTAAAGCCCATAGTTGTTGGTATTATCGCCGCTGTTGCTGGGCATTCTGCAATTCGAGTTCACAATTCTATT:1 - chrX 17258191 3' + 297 348 2 51.37 TGCACGTTCAGCAATTCCGTTTTGCTGAGGGGTATACGAGACACTTAACTGTCTCTTTATCCCGCATTGGCTTAAACAAAGATTATTGTGATATGTTTCAGAAGACAAACTCGACGAGGGATGACACTCCCCTCGTCG:1 - chr2R 25026905 3' + frogger 2074 1 58.70 AATAACTATATTAAATATTAGTGTTACTAACATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATTAAGATTATTCTCGCAATTTATTTTAAAAAATTTAATTTCACACTTATAATTGTTTTATTTAACTCTTTTTTGTGCTCATGATTTC:1 + chr3R 1953649 3' - Cr1a 4306 1 58.90 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGACGCAACATGGGAGGCGG:1 - chrX 3524212 3' + roo 9046 1 59.48 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTG:2 + chr3R 23507685 3' - 412 7105 2 52.74 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAATGGGTGTGAAAACAGTGGGGATCCTGAATGGGTTGATAAGTTCAAGGCTAGCCACTCAACGTATACAACTTTCAGCTGAG:1 - chrX 12551680 3' + pogo 2063 1 59.59 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCG:1 - chr3R 31907313 3' - Tirant 27 2 65.41 ACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGGCAAAGAAAGCATTAATATTGAGTAATGCTGTTAATTTCGCTTTCTTTTCTA:1 - chr3R 26121590 3' + G6 366 1 72.60 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCTTTTCTACGCTTTTCGGCAATCATGTCCATTGTCATGCTCCAAATGTATGAATGCTTGAAAAAATAT:1 - chr2L 2519796 3' - roo 8718 2 54.79 AAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATGATTAGGGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTAGAGACATTTCTAGAGAGGTTTGCCTGTCTTTTCGGGTCCCTTTTTTTCGTATTT:1 - chr3L 12609920 3' + F-element 4529 1 63.01 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGCTGAAACACTTGTGCACTGCAAGAAAATTGTAAGTTCTTTAAGATGAAATTGAGAGGGATTGTGAAATATAT:1 - chr3R 10498782 3' - 297 6625 2 54.79 GAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGACATTTTATTGTACGGGTGTACGAGTATGCGATGCAAA:1 - chrX 22847874 3' - roo 9054 2 74.66 TTGGACTACAAGGTGCTGTTAGATAACACAGTTCTAAAACCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGACAATGCATGCAACAGCAACATCAAACAAAAGGTCGACAAGGTACAGTTGTGCTCGATAGGCAGATGCAATCCGTT:1 + chrX 11051219 3' + Doc4-element 2554 1 65.07 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAG:1 - chr3R 25521798 3' + blood 7325 1 63.19 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGTTCAAG:1 - chrX 17614370 3' + roo 353 2 55.48 CATAAGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTTATTAAGAATATATAAGCTTTATATGTTCGGACAAATTTCCTCAACACAATTTCAACCGATCTCAGAACCGGGCGCTCGACTTTTTCGCATTTGTTTAGC:1 - chr3R 7480831 3' - INE-1 120 1 65.75 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACACTTTTCGAGACTTTCAATTATGATTTCCA:1 + chr3R 21154296 3' - jockey 4758 1 76.26 ATTTAAATTTAAAAAATATATATATTTAAAAGCTTTCTGATAGCGCAAACATACTTGTAACTTGATATCGAAGATATCTCAAAGATTGTATTTGTATTCAAAGTATGCCCTGAACTTTTTAAGAATGTTTCCAATTAAATTCTTAG:1 + chr3R 14386335 3' - copia 4670 1 45.89 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAAGAAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACT:1 - chr2L 12283925 3' - Quasimodo 59 2 59.59 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCGTGTCAATTTAAAGCGACATTTATAACCAATTTGTAATCAATTCTAA:1 - chr3R 10562133 3' - I-element 74 1 66.44 CCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGCTTTTGTCTCGTGGCGCGCCAAAACTTTTCTAATTAAGTGGC:1 + chr2R 17182780 3' - jockey 4637 1 70.55 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCT:1 + chr2R 19543717 3' - jockey 4835 1 81.45 TTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGT:1 + chr3R 16194206 3' - mdg1 77 2 69.18 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTA:1 - chr3L 21097144 3' - mdg3 5342 2 77.40 ATCAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCTTTAGTT:1 + chr3R 19545442 3' + jockey 4987 1 75.83 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTATTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGCTTAAAGAAAATGTTCTGGCCAAAAGGACTGCAGGCGACAAAATCTGTATGTGCGTAAATAACATTTAGTTT:1 + chr3L 5446212 3' - roo 8710 2 52.78 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTG:1 - chr2L 18370356 3' - Doc 70 1 71.09 ACTATAAAAGCTAGAAAGTTAAGATTGTGCCATGCCCTTTTTAAGTTTTCGTTTATTTTTTTTCAATGGCCAAGCAAAGCTGGCGCATTCGCCCTCTAGAGCTGTGGATCCGGCATAGCGATATCAATCCGGAAATAGTTCAAAGT:1 - chr2L 11792736 3' + INE-1 160 1 54.79 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCAC:1 + chr3L 16181004 3' - Transpac 4953 2 62.33 TAAAAGTGAAAAAAATATTTGAAAAAATTAAAAGTTTGTATATGATTTGAATGGGTTGTCATTTGGTATTGTCACTTGATTTGTACGATTTCTATTGGCCGACGATTTCCGCTGTCTATATACCGATCCTATAGCTTCCGATTGGT:1 + chr2R 20593796 3' + NOF 3896 1 56.16 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTTATCCGCTACGCTTAGCACAATCAAAACATAAACAAATCCAGAAACACGTACTGATCGTTTTCCCGCGCATTTATTTTCCTAAG:1 - chr3R 10357718 3' - pogo 31 1 67.12 CCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTCTTCCGAATGCACACATACACGTCCTTTGAGAAAGCAAGACATCGGAGTGGCGGAAAAATTTAATTGTTCAGTCGGGTGACTAATTGAAAACTTTCAGCTTGAATGACGAAAATGGG:1 - chr3L 18496470 3' - opus 250 2 47.26 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGCCTCATTTCGATTGCAAACTTAATTTGAAAACTTGGCCTCGCGGCGTGTAAATATGCGTTC:1 - chr2L 10650349 3' - Doc 65 1 62.33 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAAAATCCTTAAGGTTCTTTCCCAAATAAAACAAAGCAA:1 - chr3L 6096520 3' + roo 8984 2 75.34 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATG:1 + chr3L 5183818 3' + copia 5085 2 57.53 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTG:1 + chr2L 14969991 3' - Tirant 8150 2 55.40 GAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGATTACAAATGGAACCA:1 - chr3L 16157156 3' - Juan 23 1 68.49 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAATAGACCGTATAAACGTCAAGATCTCTCTTGTTTTTTTTTTTACGATGATCGTTGAACGCTCGGCTGTGCAAAAGTGCAGAAACG:1 - chr3R 4464122 3' + 1360 3353 1 60.14 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTCTAATGCATTGTTTCCCAAGTAGTTATTTATTTATTTATTTAAGTATCCAACATTAGTATCACATTAGTTTTTTTTCTGTGTACCTTGTGTACTCGTCAGACGCTAGTTTTAATG:1 + chr2L 9669661 3' - roo 8669 2 65.75 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTGCG:1 + chr3L 3540259 3' - mdg3 5274 2 69.18 ATAATAAAAATTAATAAAAAAAACAATACATAATTAGAAAATTTATAGAGCTTAAAAGTTATATTTTGGTCTACCTATTTAGTTGATTTTTGAAGAATTGAAATCGATGTTCATGATGAGGATTTGAAGTCAGGACGTGACTGTCA:1 + chr3R 26670096 3' + Doc 4692 1 75.34 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCATATTCGGCCCATTCAGATC:1 + chr2R 6585521 3' + pogo 2042 1 60.96 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGAATGAAAAGCTTTTCGGTCAACGCTCGAGTCCGCAGCCGA:1 - chr2L 18823515 3' + P-element 2807 1 30.82 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTGGTAATTGTTTGTCCCGGTTGATTTGCACCCAGTTCGCTTGGAGCTTTCAATTTGTGCCTC:1 + chr3R 13358690 3' - mdg3 5314 2 56.85 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTT:1 + chr3L 13722121 3' - blood 7029 2 63.81 ATCATGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGCTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCCAATAATAAAAAAAAATACGCTGAAAAGCGCGCTACACTTTTTATTAAATCTCTGG:1 - chrX 20396897 3' + Rt1b 5081 1 93.50 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCCACTGCGAACGTCTCCC:1 - chr3R 20292388 3' + pogo 2073 1 68.49 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTCTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTTCATAGGCACATACTACCCAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATATAATTGCATTTCTTTGGCTTCTTTCTGTCATAA:1 + chrX 983219 3' - 412 7114 2 58.04 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAG:1 - chr2L 16371594 3' - jockey 4831 1 64.71 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTAT:1 + chr3R 8402659 3' + mdg1 7416 2 55.48 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAGAGCAATTGACAAAGTGCAGTTTTCCCCAGCCCCACTAAGTAGGCTACAAATATT:1 - chr2L 11573648 3' - jockey 4739 1 64.38 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTGAAAGCTTAAGGGTGGTT:1 - chrX 19231706 3' + mdg3 218 2 66.44 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACT:1 - chr3R 9482001 3' - roo 8716 2 54.79 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAAAAAAAAATACAAATTCAGCTAGGAGAGAAGTTTTCCCGAGTTTGTTGACTCGTAAATTTTGGCATCAAAAGTTGGCAGTGCTGAAATTTAATTTC:1 - chr3L 11669743 3' + Tabor 460 2 64.38 CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATGCAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTC:1 - chr3R 3527099 3' - Tabor 89 2 74.66 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGGGAGTTTGATCGTAAAGTTAATGAAATAATCAGGCGTGACAAATCCGCAGGTTTGGACTTGGGAGTGGGAACGGGCGTGGATTGCAGTGGAGTGGAGTGG:1 - chr3R 24615221 3' - Doc 31 1 68.49 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTACAATTGTTTATTTTTCGGTATACTT:1 - chr2L 14222231 3' - Transpac 4964 2 55.17 AAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATAT:1 + chr3L 19339443 3' - Tc1 59 1 52.05 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTCATGGAAGAAATTACGTTGATT:1 - chrX 22824755 3' + jockey 4921 1 71.23 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACTGACTTAATATATCTAAGATGGATCTGGCAATTAACAAATCCTAAAAGTT:1 + chr2R 18048902 3' - opus 64 4 69.18 ACTAATAAATGTATACTTTATTAAATAGTTTTAGTGGTCAAACCTATTCAATTGAGCCAACAAAATGAAGATTTTTAACTTTTGCTGCTGCTTCTATTTTAGGTTTTTGTTGTCTTCGAATCGAGTTAAAGTTTCTTCAATTAGTC:1 - chr3R 26495874 3' + Tc3 1507 1 52.05 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGACTTTTTCCGCCGAATGGCCATGTGGCGTTCGCGGGTGGGAAACTTAGGCTGCTTCTTCACCACTTTCGGCTG:1 - chr3L 16887262 3' - roo 8679 2 74.66 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGATAGTCATCAGATAGAATCGATCGCGAATTGTTAAGTCTCTCGATAAATTTCTCAGGGCCAAATGGCTTTCTCCCGTCATGG:1 + chr3L 13313267 3' - roo 38 2 56.85 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTTTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGTTCCTTTTACTAATTAAATAACCAGCAAAGCTGTTATGAAAGCAAAAACCAACGCCAAAAGGCTAA:1 + chr2L 19878302 3' - mdg3 18 2 73.97 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCT:1 + chr3L 16973483 3' + S-element 1674 1 57.53 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAA:1 + chr3R 25753678 3' + hobo 2921 1 66.67 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAAATTATTACATTAAGCCTATTGATAAATCAATCCGGAAAATCCGTACTGCGCATGAGAAAACCCCCTAGGAACGCTGAAG:1 - chr3R 15649746 3' + blood 336 2 59.59 CGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCTGCCTCTTCCTGGCACTCAAACTGGGATGTTGCCACTAATTGCCGCCTCTTCGATGCACATGTGC:1 + chr2R 9033941 3' - F-element 4545 1 55.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGAGATGTATATATTTTTAAAAAAGCTAGAAGTAGGTACTGTTGGCCAACAATTAAACATAGAGCATAA:1 + chr3R 30568910 3' + roo 9019 2 54.11 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAATATATGAAATTACCTTGTTCTATAACAT:1 - chr3R 23507525 3' + 412 482 2 77.40 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGATAATTTATAAGCAGCCTAAAAGCAT:1 - chr2R 22798611 3' - hobo 53 1 55.48 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCAC:1 + chr3L 3540255 3' - mdg3 25 2 66.90 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTGCGGCTTTCGACGGGACCACCTAATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCG:1 + chr3L 9430626 3' - P-element 99 1 17.81 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCACAATAATAACAACAATAACATCACCAGTAGTAACAACAATACCAGTGGTCACCCCAATCCCAGTATGAGTTCCATGAGTCAAATGTTCTAGCTG:1 + chr3L 17450729 3' + Tirant 8479 2 78.23 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCCCCTTGTACAATGCACAGGTCCTTAAAGTTTGGTGCTGTTTTGTATCCTTCTTTCGATGCG:1 + chr3L 4175357 3' - roo 8723 2 62.76 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGAAAAATAGAAGGTATACAAGGGTGGTATGCCACTAAAGAGGAATTGATCACCGGTATAAAACGCTTGGTCT:1 + chr2L 21400205 3' - pogo 48 1 52.74 GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTAATTATCTGGAGTCTATTGTGATTGCTGTTGCATTATTAAGTTATGATGGTTGTTACACGATTTCTAGGGTTTTCATACTAGAAGGACATTAAATCAT:1 + chr3L 18297042 3' - Juan 4089 1 57.53 AAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTGATAATATGATGGTTAGATAGAATAAAGCTGAATAAAATT:1 + chr3R 5506911 3' - transib2 203 1 72.60 ATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACA:1 - chr2L 17550619 3' + Transib-N1_DM 435 1 79.45 ATAAATATAAATATACAAATATACAAAACATTTTTACATACATACATTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACCAAAT:1 + chr3L 10714403 3' + Stalker4 87 4 65.07 TTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAATTAAATTAATTATATGAAAGTGTGTTAAGTGAAATGTCATGATCCTTATTATTTGATATCCAACTCTGGCAATCGCAAGATTTTCATCTCACCG:1 - chr3L 21819936 3' + Juan 4179 1 59.59 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCGGCGATGCGGATCCGGAAGTTGCCAGCACAGCTAGCGAGAAGCAGCGCAG:1 - chr2R 9164847 3' + 412 7493 2 61.42 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAATTCCGCGCCAATGTCGATTCTGTTTCAGCCATTT:1 - chr3R 9938541 3' - roo 8673 2 80.14 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAACATGCCATCTTGCAATTGAGTTTGAAAGGTATTTCTGTGTAA:1 + chrX 10960285 3' + Transpac 247 2 67.41 ATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAATATCCACACAGCTCTATTAACTTTCAAATTGTTCAATTTATTTGCGTAT:1 - chr2L 16615220 3' - opus 7451 2 66.44 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTGATCATGGTCGGGCCCCCTTCCCGTGCTCGCCTATTGCGGCT:1 + chrX 19498144 3' - P-element 78 1 15.67 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGTGTGGGTGTGCGAGTGCTGCTTGTGTTTCGACTGGGATTTTTATAAAGCCTAAGGTAGTTTGATGTTATTTTATTTGATTTTTTCCGCCTGCCTTACC:1 - chr3L 17447408 3' + Tirant 378 2 71.23 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTTACCCGAATATTTCACCCTTTCTAGAGCCACCACTAGTTTATAGAAGTAGAACTGGACCAGCTCGGT:1 - chr3R 25271167 3' - 412 7108 2 53.42 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTGGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGG:1 - chr3L 18708594 3' - F-element 67 1 58.90 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACATGTACAGTACCCCCCTCTGCGCTTCTCAATGTTATTAGGAACGTAAC:1 - chr3L 20925759 3' - Transpac 70 2 62.33 GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTTTGCCATATGCAGAGTTAACCGAATTATTAATGTAATTTAATTAGCATCGTCAATGA:1 - chr3L 18468349 3' - jockey 4730 1 58.22 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACACTAGTTTAGAATGTTTGTTAACGTAGAAATGCCG:3 - chr3R 9481964 3' - roo 15 2 76.03 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATGATTGAATTGAATTTTTCTGTTGAGAATTTTTTAAATCCAGCCGCTACCCACATCAACAATAAACCGAAATATCAGCAGGTGGGCTCTTTGGCTTCAAC:1 - chr2L 10912186 3' - Doc 30 1 63.01 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAGTGATACATAATTTATGGTAAATAAATC:1 - chr2L 3006050 3' + pogo 2074 1 63.70 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATT:1 + chrX 22517669 3' + 1360 3345 1 68.57 ATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAATCC:1 - chr2L 18370330 3' - Doc 62 1 56.85 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCAGATTTTCTGTGTAATCCCATC:1 + chr2L 2519955 3' + roo 400 1 78.77 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAGAGAGACAATCTCGATATTATAAATAAATGTTTCTTTGTCCATTTAT:1 - chr3L 16725508 3' + 297 325 2 71.23 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTG:1 - chr2R 6984321 3' - HMS-Beagle2 6957 2 68.49 AAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACGCGGGGAGGAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGAAAACGTTGAAATGTCAACAATGGCTAACGGTTTCAACTGCC:1 + chr3L 12317784 3' + gypsy4 6535 1 64.35 TGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATG:1 + chr3R 14088657 3' + 1360 3331 1 58.90 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGACGAAGCCAGCGAA:1 - chr2R 6585410 3' - pogo 56 1 56.85 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTGTGAGTAAGCTACATTTTTTC:1 - chr2R 19904019 3' - Doc 4474 1 57.64 AGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGATATGTTCATAACAAATGTTTTATGTTAGTCCAACTTAAATCTTCAGTTAAAACAAACACAAAT:1 - chr3L 12466839 3' + mdg3 5332 2 56.55 TTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGTGCAATGATAACATATAAATAAATCAAATTCATTCTACATTCCTTTCTGATTTTCGTGCCCTA:1 + chr2L 6700662 3' - Transpac 338 1 56.85 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAATCTTATTAATGCAGCTATTCAATTTACAATTTACCTTTTCGCCTCTGTTCTACTTGCCGTCTCTACAAATAGATAACAATATAATGATATTGACCTACGCTGAACAAA:1 - chr3R 18849694 3' - roo 10 2 76.03 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGAAATATGTTGAAAAGTAAGTAACTCGTGGCATACACATTTTTTTCCATACTTTAAGACTGCTTGATTAAG:1 + chr3L 20076874 3' + roo 9022 2 54.79 ATAAACATAGCAACAAAGGGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACAAAACAAACAATCGTATGTTTCCCAGTTGCAGG:1 + chr2L 16596264 3' - 412 7115 2 70.00 CTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATATATTGTCCACAGGGGCCGGTGGCTTAGTTGGGCG:1 - chr2R 14562131 3' - Burdock 6217 2 77.40 CTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTGGTTAGTAAGTCAAAGAATGTATTCTAAATGCGAAAGTTGTAGTT:1 - chr2L 14227248 3' + Transpac 4913 1 73.29 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACAACCGAACATAAACAGCAACAAAAACTTTAACATTAATAACCAAAAAAGTATGCCACAGAAAAAGTGCAAGGAAACGCTGATGGAGAAGTGCTCGAAGGAAGAAAGCTTGG:1 + chr2R 9668129 3' - jockey 4681 1 77.40 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCC:2 - chrX 22858824 3' - mdg3 35 2 63.01 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCCGGGGAGAGCTTATCAAACAATCATTAGCTGGCC:1 + chr3R 25443180 3' - 297 14 2 75.17 AAAATATATATATTTAATAATTGATATGGTATGGATAAGTTTCGCTTTGACGCATTAAATTACATTACCTCAATTTGTGAAATGCAATAGAATTTCCGTTTAAATATTTTCCTCTTATAATAATAACGTACCCTAAAAGTAATTAG:1 - chr3L 15375549 3' - Tc1 60 1 49.32 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATT:1 + chr2L 10832342 3' - Doc 65 1 60.96 CTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACATGACTTTTTAAGCTAATTGAATGAGCATTTGATTGACTGCTGGCGTTCAC:1 + chr3R 26360374 3' - roo 338 2 65.07 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTCTCAGAAAGCTC:1 + chr3L 9242117 3' + roo 397 1 60.96 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGA:1 - chrX 8502193 3' + pogo 2044 1 75.65 CCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGAGAACCTGTGGCGTTGCCAGACTTGTTGATCATTGCGTTATGCAATTTCACAAGTAATTTCGAATCGCTCAACAACCTTACTTGAACTCCTGGTGAAAGCTTATC:1 - chr3R 14874082 3' - flea 4763 1 80.58 ATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGTGTGGCCGGTCTGGGTTTGGGGGCTTGCTGTGCCTTTGCCTTTTTATAAGCAGGGCACCCTCTAATCCTTTATCCTTGCCAGCGTCTCCTTTAGCGACATC:1 + chr3L 23768090 3' - G2 39 1 73.97 ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTAACTTGTATGTCGAACTGGATTTGCGGATCTCTTTGACTCGTTCCGGGCCAATTGAGCTGA:1 + chr2R 20856296 3' + Juan 4157 1 57.53 GTTCATACGGATAGACGGACATGGCCAGATCCTATTCAAGAATATATATACTTTATGTGGTTGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTCCATATTTTTACACGTATATTTACATATAATAAACAACATTTTGTTTAGCTATCCTTATAC:1 - chr2R 5780167 3' - INE-1 123 1 67.81 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCTTCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGC:1 + chr3R 19545427 3' + jockey 4946 1 52.05 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGACTTACGAGCTAAGAGTATTTTGAGCGAATCCCCGTTTGAAGTGGGAGCCAGGATATCCAATAGACGATAGATATGTTATTTGAGCACACTGTCCTGGGAAAAGTCTTATAATC:1 - chr3L 1387074 3' - mdg3 5261 1 78.08 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTTATAGTTTTTGGGGGATAGGTCCTACGCTTTCT:1 - chr3R 24693588 3' + hobo 2933 1 58.46 GGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGGGAAAAAG:1 + chr3L 13204791 3' - jockey 78 1 65.75 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAAC:1 + chrX 19162683 3' - pogo 48 1 58.33 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAGTTTAATCAAAATGT:1 + chr3R 8402676 3' + mdg1 7433 2 67.12 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGCATCGCGAGTCG:1 - chr3L 14546326 3' + copia 196 2 60.00 CAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGAGGTCAAATAAATGTTTTG:1 + chr2R 5674786 3' + S-element 1696 1 75.34 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGAGCCACGCAAATGCATCTGGTCATATTAGCTGATTTTATGGACGTGTTTGATGGC:1 + chr2L 1449689 3' + opus 440 2 59.59 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATTCTCACATGCTCACGCATTCCCACACTCACACACACACACTGACACGGAAAAAGAGGAAAGGAAAAGTCAATGATGCGTGTAAGCCAGCTCCTTTTATCAA:1 + chr2L 15621991 3' - hobo 14 1 72.60 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCTTCCTCGGCAATTCTGGTTCTTTTTCTGGTATTCGCTAGCCG:1 + chr2R 18882653 3' + roo 339 2 66.91 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTCATATTTAAATGTGAAACTAACCTATTTGAAAATGTGGCATATACAAATTATCATAGTTCAAA:1 + chr3R 21518130 3' + 297 6922 2 60.96 CAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTTCGAATTGAAATGATAATGAATTGTGTGGAATGATTATTAAAATTCTCTGACATTTCACGTTTTATTTGTCTCTCGATTTG:1 + chrX 10023932 3' + Idefix 339 2 55.17 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTGTAACCCACTGAAGCTTTATAGGCTAAATAAATACCGCAAGGGGGCGGTGCTGGGCGGTGG:1 - chr3R 19537446 3' + hopper 1390 1 67.83 CTGTGGTTGGTACCCATTTCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGAAAATATCGTCGCAACATTTGCAAAAGTAAGCAAAACTAACAGGTAAAAACGAGAATAG:1 + chr2R 17054825 3' + R1A1-element 5010 1 58.22 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTA:1 - chr3R 25521795 3' + blood 7326 1 61.64 AGAAAATTTTGCAAAAACAAATAGACTGAGTAAAAAGCAACAGATGTATTTTATTCGTAAGGCAATTACTAAGGCCCCCATTGATACAATTGGGATCCAAAGTGCCTGCTAGGCAGTGCAATTCATGTTGGAATTTATTGACAATC:1 + chrX 20081540 3' + HMS-Beagle2 397 1 52.05 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTGAG:1 - chr3L 21097112 3' - mdg3 5297 2 51.13 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCG:1 + chr3R 22429263 3' - roo 8697 2 63.01 TTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGTGCCGTATTTGATCAACGAGGTAACTCATCTGTACAACTGCACCTGCGAGAACGG:1 + chr3R 24310119 3' + micropia 5176 1 54.55 GAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTT:1 + chr3R 27845562 3' + Stalker4 7298 4 60.96 CCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAGGGGTGTCGAGTGCGCATGGTAGCCGAATGGGAAATGGCC:1 + chrX 1054442 3' - pogo 2080 1 72.41 GTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTTATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGGAAGGACGAGCAGTGGATCCTTGCAGTGGAGGAACAAGAAACTGGCGTGTTCGAAGGGGACAGTTGAATCAGTGGTCGGCAAAGGCGG:1 - chr3L 27130636 3' + 1360 297 1 64.03 AAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTTGGAATACTGGTAAATCATCGGTTAACAGTATTTTCATCTTCACTGGTGTCGAACAATTTCGAATTGGCTTATAATCTGCAA:1 - chr3R 1327280 3' + Max-element 8495 2 57.53 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTATTT:1 - chr3R 2527709 3' + INE-1 549 1 48.95 ACGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCCACCC:1 + chrX 21667993 3' - gypsy2 6497 2 76.71 CCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGAAGAGTATTTTAATACGGCAGCAAGCTGACAGTTAG:1 - chr2L 21338980 3' + BS 4971 1 76.03 CGGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATATATATACAT:1 + chr3R 11520022 3' - Rt1a 57 1 52.74 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACATGTTTGCCGGGTGAGAATGCAAAACTTTTTCAATTAACAGTTGCC:1 + chr3R 23623947 3' - roo 69 2 68.97 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATATCCATTAGCCAGCAGATTAATGTGTATCCTTCGACCTCCTGT:1 - chr3R 26765031 3' - mdg3 5257 1 80.00 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAACGTGT:1 - chr2L 7667395 3' + copia 242 1 50.36 ACGCATCTTGTTAATCTAGTGTCTTTGGAGATACCCATAAATACGCCGATCGGAAATTGCTTTACACGGACGGTTTAAAGTCTGACGCATCAACTACCGTTGCAGTACGCCTACGCCCCTCTTGCCATCGGATTTATGGGCCTGGC:1 + chrX 11190484 3' + 1360 3383 2 73.29 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAATACATGATCAGAGTTGAAAGAACTTTGAGAAACCAATTTGGCATGAAATGGTTAACAATCATGTGATGGCC:1 - chr2R 17014005 3' - HMS-Beagle 6841 2 54.79 GTATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATATTTATTGAACGGTGTTTTACAGCTATAAGCGCTGATGT:1 + chr2L 19878237 3' - mdg3 83 2 71.23 ATATTCTTGATCAGGATCAATATCCCAGGAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCAAGCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGAT:1 - chr3R 18346660 3' + INE-1 84 1 58.90 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCCGAACCTGCAGTTTCAATTTGGGTCTTGTTTTTTTTTTTGGCCAACTCCAAGGGGAATGAGGATGGAGGGTTACCTGT:1 + chr2R 20462893 3' - copia 43 2 51.37 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTCGGGGCACTATCTGC:1 + chr3R 5940527 3' - hobo 49 1 57.14 CCTTTCTTATTCTCTTTCATACACCACTACACATACACACTGTGGTGAGTTTAACGGGAGTGTATCCGTCCCATTCATGCCCGTTGACAATCTTAATATACTGTTTTCAAATAGTGTGATGAGCAAATCATCTTATGACTCAGAGC:1 - chr3R 7933188 3' - invader5 200 2 60.96 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTGTTTTTGGAGCAGATGGAGGAGTAGGAAGAACAAAAAACGAAATGATAAAGTATT:1 - chr2R 18882569 3' - roo 8726 2 63.70 CTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTATGTCTTTGGTCATTGTATTGTCTGGGGAAATTTAGTGAAAGAGTCTGTGGCAAATGTGCGATAAATATGTGTGCTGAATACTTGAGGTTTTAGAATGCGGAGCCA:1 + chrX 10572442 3' - Doc 4615 1 78.08 GCATGTGTGAGTAAAAACAATAAACGTGCACGTCTATATGCAAAACGTTGCAAAACTTCAAGTAATCTAGAATACCCTTTTATTCTAAGGTTGTATCATCCACTGTAGTGTGTTCTCCAAGCCCCCT:1 - chr3R 19906249 3' - 1360 3246 1 74.80 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTAC:1 - chrX 16853340 3' - roo 8740 2 70.55 TTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCG:2 - chr3R 20147872 3' - 1360 310 1 60.27 GAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGC:1 + chr2R 4551454 3' - roo 8917 2 59.59 AATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTTTTTATAAACACTGCCCATGCCACACACTTTCCCCACCCCC:1 + chr3R 17316108 3' + 3S18 285 2 70.09 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGGCTGTGA:1 - chr3L 20747086 3' - Burdock 6190 2 57.53 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATATACTACGTATTTCGTTCATATGGTAGATTTATTGGCCCTTCACTTGACTTGTTTGCCCGCCTG:1 - chr3R 25354466 3' + 297 344 2 58.99 TTTTTGGACTTCGTTTGGAAAAAATTCAATTAAAATCTTTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAACCCAAAGCATCCATTCCTATCAATTTTATTCAGCAAATACGAACAAGGATTAACAAACAAAGTCCCGGT:1 - chr3R 902946 3' - Tc1 327 1 76.03 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATG:1 - chr3R 9345572 3' - pogo 66 1 66.44 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTAAAATTTA:1 + chr2L 1136404 3' - 1360 60 1 61.64 AGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATCATGTGCTTGCTGCTAAAAAGTGTATACCACGAAAAATG:1 + chr2L 19372165 3' + Bari1 1682 1 67.12 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTTTGTAAACAAAACCGCGACACGCATTG:1 + chr3R 10140280 3' - P-element 56 1 48.63 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAGAACAAAAGGAATTCCCAAGCAAAATATATTGTCAAACAATTTCAGAGAACTTTTTAATCTTTGGTCCAGCAAAAGGTTGCCTG:1 - chr3R 22289349 3' + 412 7509 2 59.59 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATATTTTGTTTTTGTGAAATTGCATGCTCTTAAAAATATATAAAATATATTTTCAAGTATATTTCATGATCTTTTTGCATTTGTTTAGCCTG:1 + chr3L 14546458 3' - copia 30 2 65.75 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCCAGCTATAGTATTTGTCGAACCAAAGGGGAAAATGA:1 + chr2L 6583382 3' - hobo 85 1 75.34 TATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAAATATTCCGCTCTTTTAAGCCAGCTTAGAGTATAAAAGTGG:1 + chr2R 10163678 3' - Juan 4099 1 69.86 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCACCCAGACCAATCCAAGCGAACCGAACCCCTGGCACCACCCAACCATCCACCCATCCCATCA:1 + chr3L 3137873 3' - FB 58 1 56.16 AAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTGAGAGGGTATTGCGGTGGCACG:1 - chrX 22858800 3' - mdg3 5263 1 79.45 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCAGGAGAC:1 + chr3R 5087149 3' + P-element 2868 1 72.60 AAAAAAAAAAACAACTGAACACTTTTCCAAAGGAATCGCACAACGCATCGCAACGCCAAGCATTGAATTGCTTTTTTTTTCA:1 - chrX 18692454 3' + Porto1 171 1 85.37 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAA:1 - chr3R 6068290 3' - jockey 4735 1 70.90 TACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACTGGACTGACACTAATTGCAAAGTGTGAGAATGATGGCCCTTTCCTTGGGACGCCCGAAAGTAGGCAATAAAAAGTAATGAAAGCCCAAGTGGACAGCCAAAAATAT:1 - chr2R 13078756 3' - BS 4675 1 72.60 TATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAAGGTTTGTCGCCTAACGTAAGACGAAGGACTTGTGGCGACAGAAAGTTTGTTCACGAAGGGAAGAGAGGCATTGCATTAGTG:1 + chr3R 14050905 3' - transib2 475 1 56.85 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCAGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGTAAACCGAGCCAATTTGCAAAATTTG:1 + chr2R 21227473 3' + mdg3 241 2 75.65 AAAGGCTACAAAAAAAAAAAGACAAAAACCCACGGCCAAA:1 + chrX 12094601 3' + G2 3069 1 85.00 AGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATAGATAATCGTCGTCGGAGTCAATACAGTTGTCGCAATACCACGACCCAGCTGGGATCTCGTACAGCGG:1 + chr3R 5586899 3' + G3 4420 1 54.79 ATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACATGTTTGTCAAGGCTGCGATAGTTAGCCCACATTCTGGCCCAAACGTTTTTGGCCCTGACCAAAACTAAACTTTGGCCA:1 - chr3R 10237533 3' + flea 4722 1 53.42 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTATATAAGTTAA:1 - chrX 18913264 3' - Quasimodo 54 2 67.12 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGCGCTCATATTTCCACTTTATGTTACAACAATTTAGT:1 + chr3R 21570545 3' + mdg3 159 2 74.66 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGCTCCAAAGAAAACTTCACCCCCAAAAATCTGTGCTCGCCGCAAACGATGTTCAGTT:1 - chr3L 9426674 3' + P-element 2824 1 41.10 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAAAATTTTTTCCAGCTAGTGTTTCCTGTTTCAAGTCAAATGATTTTTGGTAATTGCGTTCGATACG:1 + chr3L 11196450 3' - pogo 54 1 57.53 CAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAGTTTCAATTTTCTAGCTAGCTTAGGATCTTTGAAACTAAGTCATGAGAGCCTATTATTTTTACTTTGCCTTTTTTTATCTAATATTGCCTT:1 - chr3R 27519329 3' + X-element 4684 1 58.90 CAATAGCCGACTCGATCTGGCCCTGCCCGTCCGTCTGTCTGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAATGAAGCGGGGCTGACAGGGGCTGGTGGTAGGGGGTGGCTGGGTGGGTAGGGCGCTTTTGGGGG:1 - chrX 8781282 3' + INE-1 101 1 55.63 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGGGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGAAGTGGTATGAGTGT:1 - chr3R 20452142 3' + blood 356 2 70.55 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCC:1 - chr2L 12261172 3' - jockey 85 1 68.49 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGCAGCTGCACAAAC:1 - chr3L 4869137 3' + roo 9026 1 54.11 TTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATAATTTAGAGCCTGCTGGCCGCCAAATCGAAGTGCATTCAAATGCACAGC:1 - chr3R 15467688 3' - mdg3 5094 1 65.97 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAACT:1 - chr3L 5183666 3' - copia 31 2 64.38 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAGAGAAAACAGGGAAAAAGGACGTGGCATTTTGTCCGTGTCACGATCTC:2 + chrX 11228717 3' - roo 8735 2 79.45 ATTATGTTCGTATATACTACACTTGAAATGAAATCAGCACATCACCTAGCTGTCAGCCAGTCAGTCTTGGTTTAAGCCCCTGCTTTTCCTTAAGCCAACAGTTCAGCCCCAGGTGCCGCACAAATTGTCCTGGTTTAG:1 + chr2L 10937990 3' - mdg1 7038 1 77.54 CTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTTGTTTGAAAATTTGAAAATTTGATTAAAGGCTTCGGCTGAACAGTAGGCCTCATTAGAATAAT:1 - chr2L 18370332 3' - Doc 64 1 58.22 GGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGGATTTTCTTCCGCTTAGCTAGAACTATCAGCTCTGCCCAGCAAATGGAGTTAAACTGAAGGTAAACTAATT:1 + chr3R 24355892 3' + Doc 410 1 51.37 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATC:2 + chr3L 22221217 3' - 412 7133 2 71.92 TACGCTAATAAATTTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACGCCATGCACTTGCCATGGATACACCGCGAACTGACCTGACTGAGTGACTGACTACATGGGACAACTAGCTGGCTATCTGGCTATCTGGCAATACGATTGC:1 - chr3R 24175634 3' + Burdock 235 2 71.92 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAAGTGCAGGGAG:1 + chr3L 20290794 3' + roo 9034 1 59.44 AATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACGATTTAACTATATATATGTCGCATTACGGATGTATTCTGACGGCGTTGAGGCTTCCGGCTACATAGAAAACGAC:1 - chr2R 13177983 3' + McClintock 419 2 59.59 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATCGCGAATCAAAAACAACTTGCGATTGAAATCGAAGTTCGAAAAGTTAGTTGTAGCTAACCAGCTTTGG:1 - chr2L 2357267 3' + P-element 2838 1 52.05 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCCCAAGAAAAAAAAATGAACTACACTAACATAAATTGTCTAAAAG:1 - chr3L 4710696 3' - Doc 40 1 60.96 AGACAAAGCAGGCTGCACGAAGCTGGAGTGAGGGCATTAAGTTGAAATGCGAATGATTCATTTGCGAACTCACATGTATTTACCGATTTTTGGACACGCTTCACATTTTACCTGCCGAAATTTCGCATTGTTTGTCACACTCGATT:1 + chr3R 20917854 3' + micropia 297 1 76.03 AGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAATTCGTGTTGATGGTGTCTTTCATCTGTCTGCATACGT:1 - chr2R 2948983 3' + 17.6 474 2 74.66 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATAT:1 - chr2R 8305219 3' - blood 72 2 67.81 CTGCATTTTTAAGTTACCGGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCACTTGGGCCTG:1 - chrX 8502153 3' + pogo 2053 1 52.74 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTTTAC:1 - chr3L 4175241 3' + roo 361 2 52.05 AGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTCTACTTTTAAAATTAGTTACTTCGAAAGAAGGTGTCACAGACCTCACTTCCTACTAAAAAATTAAGTGTACATTTTG:1 - chrX 19231723 3' + mdg3 202 2 55.17 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGGCATTATGCCAGATTTCGCATCACGACCTCCTGCCAACTCTTTCTGAAATTAATCAACTTTTTGGCTCTTTTCCATTCTTAAA:1 - chr3R 23507553 3' + 412 454 2 58.22 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGGCATTCAGACAATAATTGTGACCATAACGGAGAACTAATGCCAAAGCCGGATAATTCCAACCCATCACCTGTTGTTGGTGGGCCGCA:1 - chr3R 8542552 3' + roo 9038 1 57.53 TGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACACTACAAACAAGGGCCAACGACAAAACCCCTTGAAGACGGAGGAGCCCCATCCAATCGAGTTACCTGATGAATGG:1 - chr2R 5900809 3' - Bari1 48 1 53.42 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACG:1 - chrX 14962225 3' - jockey 94 1 74.66 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGGGTGAATGCGAAGGCAAAATGTCATAATTTTTGTGGGATATCGATAGATATCGGGGAATTTATTTTCAATTGTTGAGTGTCAGCTATTAATATTATTATTACGCGTATATACTTTCGATGTG:1 - chr3L 15342460 3' - INE-1 545 1 56.85 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTG:1 - chr2L 15965199 3' + blood 7336 1 53.42 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGACCGTGGGGCCTGGCGCTCTCTTTTGAAGAAGATTTT:1 + chr3R 10140254 3' - P-element 76 1 32.14 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTC:1 + chr3R 25521915 3' - blood 7051 2 58.22 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATA:2 - chr2R 7404686 3' - blood 74 2 65.75 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGACATATATATAAATTCGATAGTTATGGATGTGTGTGGGAAATGTTCGGGTTGTCGGTGGCGATAAGGTGCGTATGTGTATGTACGTTTATT:1 - chr3R 28724899 3' + pogo 2073 1 63.01 CAAGCCCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACAGCTGAATCTAACTCATTAAGTGTACACACAAGTTGATACAAACTTTGTTTAATACAAAGGATTAGCTAACTGATGCCTATTCAAATTATGAATTGGTATGGCCTGAAAT:1 - chr3R 5801138 3' + rooA 303 2 51.37 ATTACTTTGTTATACAACGCTAACTTAACAAAAATACATCTGAATCTCTATAGTGCACTATTCTAACCATGCTCCTAATACAATTAATAATACAATTCTAATACAATTACCAAACCACAAAAATTATAAGAACCCTTAACTATGAT:1 - chr2L 12026776 3' + BS3 320 1 43.84 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAACCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACACCATTTGCGTCCCGCACTC:1 - chr2L 20561400 3' + P-element 2815 1 36.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGT:1 - chrX 15089476 3' - P-element 9 2 72.73 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTGTGGGGCAGTCTATCGATCTCCTGGATGGCTATTACTTGGTGATTGGTTATGAC:1 - chr3R 10099852 3' - pogo 28 1 55.45 TGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACTTAGTGAACTGAGAACTGAACCTTTTGGCCTCTATTCCAGATACGGCCTGCCCGATAAGCCG:1 - chr3L 19372381 3' + 1360 3154 1 54.20 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATAATTCACAGCCATTTGCGTAGCAAACTGTGCGTAAAAAGCCGAAAATAATTAAGTTAACAATTTGG:1 - chr3R 25521786 3' + blood 7334 1 54.79 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGAGAAGATTTTCGGGACGAAATTTA:1 - chr3R 22846670 3' - 412 7081 2 67.12 AAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGACCAACGGCGATGCTGGCCGAGATTATGGCGGCGG:1 - chr2L 535434 3' + roo 390 2 55.13 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATCATCGCTAGTTGGCTGCGCGGGCTCTCCTGAAAACGGAAAACAGCAAACTGCGAATTGCAGCTGTATCGAGGAAGTGAATGTGAATGCGAATGGGGGGC:1 - chr3R 10467960 3' + opus 478 2 71.72 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCT:1 - chr2R 7404649 3' - blood 37 2 56.85 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCATACATGCATTTGTGAATCAAATATTTCGTTTTACC:1 + chr2R 7098058 3' + copia 208 2 52.74 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTAAAACCATTATCTTGATTTTGGACGATTTCAT:1 - chrX 8272445 3' + roo 8985 2 77.40 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATGAGAAAAAATTGTTTAACGTTACTTTACGTGTAAAGGGTATAAAAACGGAACTGGTGGTTTCGGAAGGGTTGCATTTCTCAGAT:1 - chr3L 22737328 3' - mdg3 37 2 60.96 CGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGACCGCTATGAGAGCGTGGGTGAAACCTAAAAAAGGGCCAACTTTTT:1 + chr3R 6632765 3' - hobo 157 1 68.49 GTTTTATCCATAATTTAAAATATGTATTTATGCCCAGTTAAGTCACTGCAGCACATTATAGGAAATATACCTTGCTAAAAAGTTGAAGCATATTGGATATTCTATACACCTTGTTAAAAATGGTTAAGGATGCTTTTTCTCCGTGT:1 + chr3R 30979291 3' - transib4 259 1 80.82 TAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGATGTCACTATTGGGACTACGATAAGAAGAAGAAAAATTCCACTTAATACGTTTCGTGGAATTGTCGATCACTTTCCTTGACACTTACCAAAC:1 + chr3R 6908508 3' + Tc1 1565 1 53.42 ATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAGTTTCAATTTTCTAGCTAGCTTAGGATCTTTGAAACTAAGTCATGAGAGCCTATTATTTTTACTTTGCCTTTTTTTAT:1 - chr3R 27519342 3' + X-element 4672 1 48.97 GTATGCGGACTAGAACAACTGTCTTAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAATCAGGAGACCAACAAAGAAATGCATTCGATATGCAGATCTACACAGCCGCAAGATACACAC:1 + chr2R 11391622 3' + invader1 3820 2 58.22 AAATTAGTCAAGCGCAAAATCAAGGCGCTGACTCTTAATGTTGATATATTAACTTGTTACCATCACTTTAGCCGGTGAGAAAGTTTCTAATCCTTTCAAGTAGAAATAGAAATGTGCCGCATTTATTTAATTGTTCAACCATTTTT:1 - chr3R 18452646 3' - invader2 394 1 56.85 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATAT:1 - chr2R 13276454 3' - roo 8712 2 53.42 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTC:1 + chrX 21213429 3' - Doc 26 1 65.07 CCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACC:2 + chrX 21667969 3' - gypsy2 6521 2 63.01 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGATATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAG:1 + chr3L 21093231 3' - Ivk 64 1 59.59 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAA:1 - chr2L 20984283 3' - blood 7055 2 52.41 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACGAGATGATCTGTCGAGATCGGGTAGGTCTGTCTGGG:1 - chr2L 19424604 3' - Tirant 8 2 79.14 GCGAAGAAATTTCGCGACACTTACGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCACAGCATGACTTAATTTTTTGTTATTGTACAG:1 - chr2L 15153284 3' - G-element 98 1 75.34 ACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATCTACCTATATATATTACCTTATGTATCAATTCGGCGGAGCAAAGACGGGCCAA:1 - chrX 7329202 3' - Bari1 64 1 67.12 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCAGTCATAATTTATTGTATTAACTTAAGATGCAAGAATGTTTTCGAAGCGATGGGGTTTCCCAAATCCCTATTGCAGTGTATGCAAGAAGTGGTATG:1 - chr3R 20452147 3' + blood 351 2 65.75 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCC:1 + chrX 21213422 3' - Doc 33 1 60.27 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGC:1 - chr3L 14581375 3' + pogo 2042 1 60.27 ATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTGCAACTTTTTATATGCCGCCCCACTGAATTTTTCCCTCTTTCATTCGACTGCAG:1 - chr2L 2660099 3' - G2 335 1 61.54 TCGTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTCAGTCTGCCACCATCTCCCTTACCCACTTCCCAGCTGGCCAATAAAAGTTGCGGG:1 + chr3L 8149269 3' - gypsy7 5009 2 80.77 AATAAAACAACAATTTTACTATATATGAAGATGGTGATCAAACATATATCAATTACACAAATCCTTAGTTTGGTT:1 + chr3R 12787215 3' + 297 395 1 66.67 ACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAACTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGTTACTCGCGAACGCATGCGAAACATAAAAGCGTTTCTTGATA:1 + chr3R 7505153 3' - roo 8854 2 69.86 TCCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGTAGCCTTCGCATAGCCGGCAAAAGCTCTACTCCATTTTCCGAAACCGGAATAAAGCTATATATACTTGTCCATAGTACCTTACGTGACTAATAAAGA:1 - chr3L 23547994 3' + springer 7178 2 54.62 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGAATAAACCATATTGCTATAGTTAAGCTTACCCTTTTATTACAACAATCAAAATTATGTTTAGTATATGCAAGAAAACAAACGA:1 - chr2R 20462757 3' + copia 216 2 58.22 TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGGAATAAC:1 + chr2R 11656151 3' - HMS-Beagle 22 2 70.55 AAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGG:1 + chr2R 4939196 3' + 1360 3364 1 33.56 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAAAAGGATCTTA:1 + chr3L 3979687 3' - opus 7052 4 53.42 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCATACTGCTTGCATGTGCAAGTCAACCAGGAAGGGGTTTTTATAATTCCTATTTTGAATTTCATTTTGCAGACCCCTAACTACGAAACTCCCAGATTTTCTGTG:2 + chr2L 2519945 3' + roo 9053 2 71.92 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCCATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGACTTGCCGCTTGTTCTAGGAGCTATCCTGCGATCCTGTTGAATAGCCCAT:1 - chrX 10978954 3' - roo 8699 2 60.27 GATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGTGAGAACGAGAGAATAGGTGCAGAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACGCCAAACAGCACTGCGAACAACGCACATTCATTTTATTATTTGCCTTGCTATGTTTTATTGATTTAAA:1 + chr2R 5309059 3' - Cr1a 309 1 71.92 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCCTCGCCCGAGGGAGCCAAGTTTTCAGGCCGATTTGTGTGTTTCT:1 - chr2R 20461195 3' - jockey 84 1 69.18 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGATTTCTG:2 - chr3R 29708955 3' - blood 7063 2 54.79 GGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' + R1A1-element 99 1 48.97 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATTCATAACAAATCTTACAAGTTTCTTCTTTAGCGCAGGGCGGTCTCGTAAGATTCGCTCATAATAATGGAGGGTGTTGTACAGATATGT:1 - chr2R 22892577 3' + pogo 2072 1 65.75 GCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAATATTCGCTGATTTTTTATAATCAAACGAAACACTTTGATG:1 + chr2L 12504426 3' + blood 7226 2 71.01 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATGTAATAAATTATTGGTTTCAGATG:1 + chrX 11228651 3' - roo 57 2 60.87 ATTCTCATGTCACCCATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATCATGTTGAATAAATAACGAATAAACACGTAAAAAATAATCTTTA:1 - chr2R 7534602 3' + roo 8996 2 67.81 GAAGAAATCTCGGGACACTACGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTTTTACTAGCGCTGGTAATTTCATCGAATTTTAATTTACTTTCCTCTGTTGCATATT:1 - chr3L 2201337 3' - G-element 96 1 59.72 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTTATATAGATAGTTAGTTATAAATT:1 + chrX 12551843 3' - pogo 25 1 68.49 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAACAAATATTAAGGAAGCTCGAAGAATTTGCAAAATTAAGACACAGTTCGTTTGACT:1 - chr2R 19633209 3' - jockey 4621 1 55.20 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATAATACTTTGGACTTACATGTGTTCTGAAATTTTCTTTTAATTTTTTAAGTAAGCTCATTCATTACAAGCCAA:1 + chr2L 3734579 3' - mdg3 37 2 50.00 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTATAATATTTCGCCGTGGCCAAAACAGAAACAAATCAGATGTCAGTTCGGGATTCTGGCCAACTTCGAACTTTTG:1 + chr2L 535525 3' - roo 45 2 54.79 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGAAGATAAGTACTTATCATTGGAATTATTTGTCACAATAATTAAAAGAAAACTTACAATTCAAGTAAGTTATC:1 + chr3R 23449358 3' - roo 49 2 52.05 GAAAGAGTGAGAGAGTAAGAGCGAGAGAATAGATGCACAGTGCAGTTTATGTGCATACAAAAACAACACCAAACAACAAAGAGAACAATTCTATAATAATGCTGAAGTTTATGAGGTGGTGGAAAGGGTTGCCGAGCTGCGGAAAC:1 + chr3L 14796085 3' - Cr1a 291 1 60.27 GGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAA:1 + chr3R 10288871 3' - copia 4958 2 76.03 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATCTTGTTCGTGGAATTATTTTTGTGTCAATTAAATACCATAACAATATTTTCATAGCATACTT:1 - chr3R 19545324 3' - jockey 67 1 55.48 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCGCTGTCAGTTTGTTTTCCCGGGGTAACCCTGTCGAACCGATTAAGATC:1 - chr3R 19700837 3' + roo 9045 1 67.12 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTCTGCAAGTAGTAGCAGCTTCTTTCCGAAAATAT:1 + chr2L 15965282 3' - blood 7098 2 75.34 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGAGCACGGCAACGTGGCAGCAA:1 - chr2R 10367464 3' - 412 53 2 52.74 CAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 194 2 71.59 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATACTGTAATTACCTTTCCCTTACGCAGGACATTTTTATCGCATATCA:1 - chr2R 18123434 3' - 412 7128 2 68.49 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGCGCTTAAATAAATTAAACACTTGGTCATTACTACAT:1 - chr2L 7459508 3' - BS 5013 1 71.23 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTT:1 + chr3L 15035245 3' - pogo 35 1 60.27 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGCATAAAAGCATAACGGCGTTCATTAATCATGCCGGTCACGTCGGCC:1 - chr3L 4710739 3' - Doc 76 1 67.63 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAGGGCAGGTGCCCAGAAAAGGGGAAGGAAGCATGTGATTGGGGTGGACAAGTTAAAATTTAAATTTTAACATTTCGCTGCATACTTTCAAATCTTTCAATGTTC:1 + chr2L 1136447 3' - 1360 17 1 72.60 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAGATAGATAGACTACCGAAGTGATGGTGAAGTATGTTTGGTGTAT:1 + chr3L 59606 3' + I-element 5278 1 69.86 ATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCACGGGGGCTTTGGGAGCGGTTCCGGGCAAGGTGAGCGAGTTGTTATCATTACACG:1 - chr3R 9932590 3' - Rt1b 4946 1 54.74 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTAC:1 - chr3R 9345566 3' - pogo 60 1 62.33 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAG:1 + chr3R 15465594 3' + mdg3 201 2 54.11 CTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACGGGTTATTTTATTTTACCTTCAACGTAGATAGCAAGTTGAACAAGCT:1 - chr2R 14884270 3' + mdg3 5432 2 65.22 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTACGTACTTCAACACAATGTGTAAAAATCACTTGGGGATCTTCGAAATCAATTTTAAAGTTCAGTTAAAGTATTTCAATCGACGGTAG:1 + chr3L 22635803 3' + hopper 1382 1 62.33 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGAAATTTAAGAATTAATT:1 - chr3L 9571598 3' - jockey 17 1 76.71 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTTGCTTAGATGATAAGGTGTCCCACTTATTTGCGAAAAACATATGTCCATAGTAATATTAGTAATATGTCCATATATTATTATTAGAGCAACTAAACAATGACAACAG:1 - chr3R 21150484 3' + S-element 1708 2 34.25 TGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCATTATGGTCATGTGAGTAATTAAATTACCTAACTTTGGGCAGAAATTAGATCCCGGAATCTAATGA:1 - chr3R 14138417 3' - F-element 4371 1 56.85 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGTCCTTGAAGGTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCTCGCGCTTGAAAGGATGCTATAATT:1 - chr2L 15832984 3' + hobo 2906 1 46.83 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGT:1 + chr3R 25443142 3' - 297 6634 2 60.96 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAGATGAACACCCGATACGAGAGTTTCTCACGCTGTGCCACGACGGCGAAAGAGATGGGGATATG:1 + chr3L 10856854 3' - P-element 24 1 65.07 AAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATTCCTATTACAAAAACCTAAACAACTCGCAATAGATATTCCTTCTTATAAGTATATTTTATATTATTAATTCTTATTA:1 + chrY 385895 3' + hobo 261 1 54.79 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGC:1 + chr3L 17447552 3' - Tirant 43 2 57.81 AACACACACACACACACATGCTTAAAATGTACCTGCTGGCACATATCCAACTATTTCCTTGATTTTTGGCGGATTTCTGCCACATAGCGTTGTAAGCACAGCTCGCTGATTCCGTAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATAC:1 - chr3L 12159695 3' + accord 184 2 67.81 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTTGTTTAGACTTCAGCCAGATTGCGAATAATCTTCTTGTACACATTAATGCCATTAAGATACACATCAGCCTGCAGAAACTCGTCGTGGT:1 - chr3R 23099052 3' + roo 9041 1 63.70 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCACATATTGTAGCCCTACTTACACACATACAC:1 - chr2L 20561418 3' + P-element 2802 1 26.24 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGGATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAA:1 + chr3L 20785558 3' - P-element 52 1 48.63 TCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGAATGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGATCAACTGTGATCGCCAAACATCAGAAAGCAACAAAAAATACACGTCAAGAATTGCCAAGTTAGTTATTCTCAA:1 + chr3R 13647194 3' - GATE 369 1 50.68 GTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGATAACCATTTTATAAGGAAATAAAGCGATGGGGCAGCTACAAATTGCGCT:1 + chr3L 7092839 3' + 412 7440 2 66.44 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGCTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGC:1 - chr2R 11379733 3' - jockey 88 1 67.81 AAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1 - chr2R 981617 3' - 1360 40 1 62.33 TATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGTGTACGCCACGACGGAAGTCCGAAGGACAGCATCGCAATTCGGCAGTCGCTCGGCTTC:1 + chr2L 20561522 3' - P-element 13 1 73.48 AAATACAGAATAAATACCCAAACAAAACAATATACCCAGCTTCTAGCAAATATAAAATGTACTTTACAAATTGAATGCATCCTAAACTTAACCCAATCACGAACTGCGGTCTCTGCAGCTGAACCCAATGTGGCGAACCCCGAAGG:1 - chrX 534798 3' - invader5 75 2 51.37 GTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTAAATAAAGTTTCACTTAATTTCACCTTTTAACTGGAAGAATGGAATGAAGAAAGGAACATTTTGTTCCTCAGATCACGTCCCTTGTGTGCG:1 + chrX 21123569 3' + S-element 1686 1 65.07 AAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATCCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGATTACTAGCTCGAAGACAATTCATTCCGCAAATGG:1 + chr2L 15977749 3' + micropia 101 1 76.71 TTAATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTACAATGCTTGCCGCGACCCATAACTAGGGAATTTTTGGTCTTCGTTTGGGAAAAATTCAATTAAAACCTTTAATACCTTAATACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCC:1 + chr3R 4571527 3' - Tc1 384 1 78.08 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGG:1 - chr3L 22354445 3' - Doc 89 1 71.92 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGAGTTTTGAGCTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAA:1 - chr2R 14385560 3' - jockey 66 1 56.85 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTGGCCAGG:1 - chr2L 15832957 3' + hobo 2913 1 65.75 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGACTCTACG:1 - chr3L 21630301 3' - Burdock 46 2 54.11 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACA:1 + chr3L 8253714 3' - jockey 4693 1 66.40 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATTTGTGTAGACAATTTCCGT:1 - chr3L 5446054 3' + roo 392 2 73.97 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCTCTTGTGTAGCCGTCTGAGCCGCCAGCTTTATC:1 - chr3R 3527053 3' - Tabor 6882 2 58.90 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATAAACGAGATTAGGCTAAATATCCCAATATGTTTTATCATTAAATATATTTCAATTAAATATTTCCGACCTTCAAATAAAATTGTGCTCATC:1 + chr3R 25823100 3' - roo 8693 2 65.75 AATAAGAATAATAATAATAACAATAGCAGCACAAACAGACATAACAATCAGGAGCATCGAAATGCACAGCACACTGACTCGAGCAACTCGCGAGTTGCTCAATTGCAAAGTGACAATTTGATTAAATTATAGCGCTATTGCAAAAC:1 - chr3L 14863123 3' + mdg1 31 3 57.53 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTATGAACAATTATCGTGCAATGCCAGCGGAGTGAAGGGAGTGACTTTCTGTTAACTGTTTTCGTTATTATTTTAGGGATAGTTTTAAAGATCGCTTTGATGGATTACT:1 - chr3L 52909 3' - roo 25 2 34.93 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGCGGAATATAATCGACCATCTAACGTACAATCGGTGTACCACCACTTTTTATGGCCACACGTGGCTGTCTGTTTTGTCGTCAACCTGTCC:1 + chr2L 14796977 3' - I-element 29 1 65.75 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGGAGTAAAGGTTAAAGTCTAGTCTGCTTTTGAACCAATTGTAAATGACCAATTAAATGTGCATATGAACGATATGAACAAGCATTTTTTA:1 - chrX 14914317 3' + mdg3 5467 2 63.70 GCTATGACATCAAATAACTGAATGGCGCGCATTTGAAAAAATGGAAGCGATGCTGCCGCACCCATTCGTAAAATTTACAAATGACGAAAAGAAACAAAAAAAATCCCAGGATCATCAATAGAAATCCACTTA:1 + chr2R 21321503 3' - mariner2 43 1 75.00 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGGCAGAAGAATGGGGGAACTGGGGTTCTGCCGGGTCAGCT:1 + chr3L 16887444 3' + roo 9046 1 67.81 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCATACATGCATTTGTGAATCAAATATTTCGTTTTACCAATAAGTGCTTTAGTTTATAAAACGAACGT:2 + chr2R 7098088 3' + copia 238 1 73.29 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTCTGGTGAAATTAAAA:1 - chr3R 31956733 3' + pogo 2078 1 69.86 AATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAATACAAAAAACAGAAACTAAATAACTCTCCGTTTTGATGTTATTAAT:2 - chr2R 4561104 3' - Stalker2 7324 2 69.18 GTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCACTTCTTAATTAGTGTCGACGAAATCAATATTCCTTAAAAATCAATAT:1 - chr2L 22696392 3' - X-element 80 1 65.73 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACG:1 + chr2R 16383361 3' + roo 336 2 69.66 ATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGCAAACGGATGGCTGATGCC:1 + chr3L 13722088 3' - blood 92 2 80.82 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGTGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTAGCGCGTTCAGGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGC:1 + chr2R 6187923 3' - Tirant 43 2 64.65 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGTGTGGGTGTGCGAGTGCTGCTTGTGTTTCGACTGGGATTTTTATAAAGCCTAAGGTAGTTTGATGTTATTTTATTTGATTTTTTCCGCCTGCCTT:1 - chr3L 17447411 3' + Tirant 8482 2 69.18 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAGCAAGGACACTCCGTCGCCATCCTTGATCCGTGCTCATTGTTAAA:1 - chr2L 8397121 3' + roo 9039 1 61.64 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAA:1 - chr2L 20984324 3' - blood 86 2 77.40 ACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGTGTATATGTTGTAAGTGGATTAGGATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGGGAAGAGATCTGTATAGGGACATAATAGATCTGCACAAT:1 + chr3R 3855228 3' - Idefix 77 2 93.84 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCAGACGAATAATTCCCAAATGGAAAGGGAAATTAGCTGACTCTTTTTTCATTTCGCTGAATGAACTTTATCTTGACGTTTGGCATTTGTC:1 + chr3L 5183846 3' + copia 244 1 76.71 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTCTTTAAATTGCGTATACGCCCCGTCTGGCAATTGAAGGCAGTCGAGTGGGCCACGTGCGTTGGCAGGAAGTTCAGGGAGTG:2 + chr3L 20290796 3' + roo 9033 1 58.22 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTTACAGAATGTCTTACAGAGAGAAAACACT:1 + chrX 19231856 3' - mdg3 45 2 54.79 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTGAAAAGTT:1 + chrX 19231828 3' - mdg3 5325 2 67.12 TCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAAATAAAAAAAACTAATTAAGAGACGTTTCTTATGGACAAAATAAGTACGCAGAAATTTGTCTGTTCAATATTCATTTTCACTGGTTTCTCTTTAAAACTTTGTCTAAGACG:1 + chr2L 22696505 3' + X-element 4694 1 67.81 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCA:1 + chrX 10538238 3' + pogo 2051 1 52.74 CGAGTGTCGAGAACCCTGATGCAAGTAGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGCGCAGCTACTTTTGAATCGGGGGAGGACGTTGGGTTGCTGGACGAGGCGGGGCGGCCGGGGTCGTGACGCCGACG:1 + chr3R 31071885 3' + opus 477 2 63.36 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAACCAAATTTATGAACATATTAATTTATGAACATAAAACTTTAAAAATAATGGTATTTAATGA:1 + chr3L 17667626 3' - F-element 74 1 60.96 TAAGCACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCA:1 + chr3L 13204775 3' - jockey 94 1 76.71 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGCACACACATAAATATCCCAGGCACACACCCTCGCACTCACACACGCACACACTAACACACTCGCAAACGATGCCGGAACTGTTGTCAAAGGAGGAAGTGGATGGCCGCAGG:1 + chr2L 17747556 3' - Tirant 8117 2 77.40 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATACACTTAAATGGTTTAGTTGT:1 - chr3L 14581328 3' + pogo 2089 1 77.40 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTT:1 + chr3L 15035236 3' - pogo 44 1 54.11 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAATAAACAATCTTACATATATACGCATAAAGGAACGGTGCTCCTTGTTAGTGATTGCTGTTACTGCCGCAATTGTTTGCGCAAATCGTTAAAACGTTAATCAAAA:1 - chr3R 12540011 3' + flea 4968 2 60.96 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTAAGTTCGTTAGTAAGTTCATGTAAGTAGTTTAAATTTTACCAATTTAACAGTTAAAGATGACTAATTAAGTAGCAACAAATTAT:1 - chr3R 13494308 3' - opus 7035 4 42.47 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGG:1 - chr3L 14969225 3' + P-element 2805 1 26.71 GTTTTGAGTGTTGTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTATAAAGACTAGTATATGATACCTGAACTTTTTCCAAGTGCAGCCAATTGCAGAGGCGTCTCAATGGTCCTTTTGGACACAGCACATATCATTTGGTTAAAG:1 - chr3R 8472499 3' - Porto1 4197 1 73.29 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTTAATAAATATAAGATTAACAGGAATGATTGTTTTGATCGTTTAATAAGGAC:1 - chr2R 6945626 3' + pogo 2034 1 69.18 GAATTAATAGCAACCAAAGTGACAACGGGGTTTTCAGCTACCCCGTACGCCTTAATAAAGTCTAACACAAAAAAAGAAAATACTTTAATCGCACGAAACAGTTTCGTTTCTTTATGTTGTGTGCTGCACGCAACGCAACTAGGATT:1 - chr2L 1237875 3' + BS3 1716 1 59.59 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAAAAGCAGGCA:1 + chr2L 9287110 3' + jockey 4986 1 54.81 ATATGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGCCAATCTTTATGGATATCATTACGAATACCAGATGGACTCAGAAATTAAATATAGATTTTAACGCTTCTAGAAAACCTGATGGCTTTTTTACACTTGGCTGCAAAGTTG:1 + chr3L 15322115 3' - Transpac 9 2 77.40 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTT:1 - chr2R 18721942 3' + 412 417 2 70.55 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAGGAGC:1 - chr3L 11665898 3' + pogo 2042 1 60.96 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTGATAACTACTGGGCACTCGATATATCGCTCGAGCATATCGGCGCTTTATCGATTGCCGGCCAGGGATGTTGCTACTCG:1 + chr3R 9563716 3' + P-element 2857 1 64.49 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATGG:1 - chrX 9709969 3' + pogo 2052 1 59.40 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTGCGTGCGCCGATGTTGAC:1 + chr2R 19543790 3' - jockey 4766 1 75.78 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGC:1 - chr3R 20292405 3' + pogo 2069 1 62.41 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGGTTATGTGTATATGTTTTGACGAGCGTGTACCAAGCGTATGCGCACCGCCACAAGCGGAATAAAAAATATACAAAATAATTTGCTG:1 + chr3L 20785577 3' - P-element 33 1 63.01 CGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAA:1 + chr2R 22692432 3' - Ivk 62 1 57.53 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGAAACTAACAGTTGATTTC:2 + chr3R 20905507 3' + pogo 2064 1 60.27 AGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTTCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' + R1A1-element 139 1 62.96 CTATTTAAATTATTTTATTTTAACTTATTTTCGTTACTCCGAGAGTAACCATACTCATTGTCCTTTAAAACCCAAGTTACCACCTCCTTCGCAACCATAAAATGGATCTCCTAATTTTATGCACAGAAGCACATTTGTAACCTAAT:1 - chr2L 7546462 3' - jockey 4929 1 61.64 TACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGT:1 + chr2L 8393048 3' - I-element 5194 1 67.81 CACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAATGGCTAATTTCAGTGTGGTTATCGTATCTGAGAAAGACCCACTTTCTAATGGTCTT:1 + chr2L 1447319 3' - Stalker4 7008 4 61.64 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTTGCAAATGTAAACTCCTATGACTTGCATCGATATTAGTGTTAAGCTTTTTCATCTGAAAAAGCTTCGACATTAACTAA:1 - chr2L 5341206 3' - S-element 37 2 57.53 TCGTGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCTCGTGTTAACTTGTACATAAATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCTCACCGTGTCGACCTAAGACAATTTGGTAACTGGGCAGTCGGCTCGTACTCCACATCCATTGG:1 + chr2R 3822001 3' - Gypsy6A_LTR 24 1 60.27 CGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATCTAACTAGGTCACTAATGCCGCCGCCGTTGCCGTGTGCAACGTACATTGTCACAGGGATGTGAG:1 - chrX 20089704 3' + blood 229 2 56.16 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGT:1 + chr3L 22481325 3' - roo 8729 2 62.33 TAATTGAATTCATTAATATTAACACCGAGCTGCTGGTTCTGTTCTTCAGCTGCTTTTTGTAGTCGCTCGTTTTGAATTTTCCGCATTTTACTTCATTTCGACAGCACAGCAGGAGGGCCAAGATTATGCAGCTTCTGGCTCCTG:1 + chr3L 8250619 3' - HeT-A 380 1 68.06 AGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACTTGACATTAATTCGACTCAAAAATATAAAAACTATTTAAATGGCGCAGGCGGTAGAATACGAAAATGCACCAGGAGTCAAATGACCTGCTCAGCGGGTCGTCATCGTCGTCGGTAACCACGC:1 - chr3L 14507845 3' + 297 350 2 59.59 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTACACTTAATTTTGAAACGAAACGAAATGCACTCGAATGTAAAGAGTATTTACAACATTAAAAGATTAGAACTCACCCAACTGAATAC:1 + chr3R 21924380 3' + roo 9037 1 61.64 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATGCTGCCCGTTGTTT:1 + chr3R 15974800 3' + P-element 2823 1 41.78 GGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGAAAAATCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCATTCTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAATTGAAAATATATA:1 + chr2L 6547383 3' - Max-element 435 1 80.14 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATATATATCTATCTGTGTCGAAAAGCCAGAGCTAAATCCTGGTCAACTCCCCATTTTTCTTATTCACGTTTTCCCGGAGAACAGCCTCCTTTTAGGG:1 + chr3R 9958755 3' + opus 7482 2 72.60 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGAATGCACAAGGCGTAAATCAAGCAATTGCGGCGCTTTAACCATACCAATAATATGCGCCAATCAGGTGTAAATTGCATATAGATTCGGACAAAT:1 - chr2L 13877634 3' + Transpac 286 2 65.07 GGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTACATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTATATAATTGTCTCGGACCTCGGATCACCAGCTGCCTCTATACCATTTGGAGGATGATGATGGGTGCTGAAATACA:1 + chr2L 21859145 3' + Ivk 4947 1 52.41 CTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACTGGACTGACACTAATTGCAAAGTGTGAGAATGATGGCCCTTTCCTTGGGACGCCCGATAGTAGGCAATAAAAAGTAATGAAA:1 - chr2R 13078780 3' - BS 4665 1 71.43 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCCACGAGATGGTATGTTGTTCAT:1 - chrX 16244874 3' - jockey 4806 1 50.00 AGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATATGCAACAGCAGCAACAACCACAACTACTTTTACGACCACAGCGGGCACGGGCA:1 - chr3R 7096441 3' + hobo 440 1 63.70 TCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTTATTTTTTCGCTGCATGAGCAAATCTTTAGTATTTGTACAAGCGACAGCCGCAGACTGAAAAAAGCCGCCGCATTTGAATATGCAATTTGCAATTTGACTTGGCTC:1 - chr3R 20454929 3' - blood 454 1 75.34 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAATGCAATTC:2 - chr3R 10079258 3' - P-element 26 1 67.81 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAACTGATTTACGATATTCGCTAGGGAGATACAGTGGAACGCGTTTCGAGTGCTTCGAAAAAATCGAATTTTCCGTATTGTA:1 + chr3L 13922407 3' - Tirant 41 2 49.32 GGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGC:1 + chr3R 5765423 3' - opus 70 4 69.18 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCGAACGCAAAAAAAAAAGGGGCTTTTTATGGGTTTTGGGTTGAGGTGAGCTCTGGGCTTTTGGAA:1 + chr2L 9287101 3' + jockey 4935 1 61.64 CCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAGGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGC:1 - chr2L 23373389 3' - Tc1-2 26 1 60.96 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTAT:1 + chr3R 12363253 3' - jockey 81 1 64.38 GACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAA:1 - chr2R 6984334 3' - HMS-Beagle2 87 2 77.40 GCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTC:1 - chr2R 5070918 3' - gypsy5 6964 2 26.03 CCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGG:1 - chr3R 443029 3' - gypsy2 9 2 75.00 GACCAGCATGTATCAAGCGAGATAGAGCGATGTTGAAATGTACACGGGGCACTTATGTTTGAAAATGTGGAAATTAATGTTCCTCATGATCGAATGTAGCACATGTTGCAATCTTATTATATAGCATATAGTACGATCCGAATCGG:1 - chr2L 18969368 3' + invader6 227 2 55.48 AGTATTACACTAATAAATTGTTCGCTTTTCGCGTGTCACTAAATGTTTATTGTTGCCGCGGCTTTGTCTTTGCAGCCGGAAGACATTTTAGGGGGTAAACAAAAGGCAAAAACCGTAAATGAAGCAGATAGAAACCAAAATTGATT:1 + chr3L 12889745 3' - HeT-A 205 1 56.85 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGG:1 - chr3R 23254398 3' + pogo 2060 1 57.93 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCT:2 - chrX 22858868 3' - mdg3 5331 2 70.55 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAATAATGCATTACAATTATTACACAACTTTTGCACTCGACTCTCCTTCACTCTACCCCCGCTCCATTT:1 - chr3L 24153190 3' + Tabor 406 2 71.23 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCCGCAATTACAGGTAATAATTTTGCGCATTGGATTTATTGCCGGTTGCATACTTTCGGGCGCCTGACTTTGCCTAATGGAGGCGACAATTA:1 + chr2R 10991421 3' - jockey 35 1 66.67 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTCCTTGTCTGTTGCTAATAAATCAAGACCCATGTTCATTT:1 - chr2L 1073890 3' - Tirant 43 2 57.53 CTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTACCCCCACCTGAGTGAGTTTTCCGATAGGAAGGCATAACTGAGCCCACCT:1 + chrX 14136633 3' + roo 409 1 62.33 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTCGCCTGTGCCGGTTGTCTGCTGTCTTTCTCCTGCCTCTCTCTCTT:1 + chr2R 15613894 3' + P-element 2870 1 73.79 GCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAA:1 + chr3R 934282 3' + Rt1b 4738 1 54.79 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTACGGACAAGATGACTCAGAAAGGAGCTGACCAATCGTGGCGCGTCACGTGCCCACCGCTGGCCGC:1 - chr3L 22354419 3' - Doc 45 1 50.78 AGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACATATGTGCCTATCAACATTAATGTGATCCTTCTTTCAGAATTCAGTCATGAAATCATGGTGGGACAAAGGAGATGTGGTACGTTTTCTATATCCTTT:1 + chrX 11815115 3' + flea 221 2 69.66 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTC:1 + chr3L 3979669 3' - opus 7183 4 65.75 CTCCACTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATATTTCGAGTCCGCGATACATCCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAAATCATGATGGTGACATAAACGACCAGACCTTGGCATTGTGTTGAAGGACTGTGAATCGAATTATTCGA:1 - chr3L 17481840 3' + Max-element 312 1 56.16 AACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTCCAGA:1 + chr3R 21521424 3' + Bari1 1651 1 56.16 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAAAAATGTTGTTAGCACTGTGTTTTGGACATGCTATGTACAAGTGACATTCGATTAAAACATTAAAAGACAATAAATATT:1 + chrX 22826837 3' + jockey 4955 1 52.74 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGGTGTTTAAATTGTAAGTAGTATTTAAATAATATGTTTCGTGAACATTTCATGA:1 + chr2R 15373392 3' - 1360 68 1 66.44 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTACAAGGCTACGTGATTGGATGACCAAACTTTCATAATTTGAATGTCAAGAGCGTTAGGCGCTGACTACT:1 - chr3R 15465434 3' - mdg3 5257 1 79.70 TTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAATAGTACCAGTTCATGTACAATATTTTAGCATTGTCCATAAATGCCTGATACGTTTATTACGAGCCTATCGAAATCATAATCCGCTTTGTTATAGGTATGAAATC:2 + chr3R 27845612 3' + Stalker4 392 1 70.55 CTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCATGGCAAGCCTCATCTGCATCAACATTGGCATATTCATTCCAATGGGGGCATTCTGATTCACATTCTGAGTGAGGCTGGCCAGTCCGACACCACTCTCCGCC:1 - chr3R 4485891 3' - pogo 1640 1 58.27 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTGTTCAAGTCAGCAGCAATTTGGTAAAGTGTGTCG:1 + chr3R 10143057 3' + 412 457 2 60.27 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAAATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACAAGTCGCTTCGTGCACGC:1 + chr3L 131832 3' - P-element 48 1 52.05 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTAACGCACACACACACACACATGCAGAAACTCGCCCACTCAATGCTTTTTGCGCTCTTCTTTTTTGCCCAC:1 - chr3R 8705702 3' - hopper 49 1 50.68 CACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTAAATACGATGCAATCAAATCGAATAAAATAAAACGACAACTTACTTCAGGTTCATTCAGAA:1 - chrX 18707462 3' - BS 4762 1 52.99 AAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGTAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:1 + chr2L 14147250 3' - transib2 2591 1 68.28 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTTACGTTATAACGTTATAATTGAATCAAAACAATTTCAAACTAGCTTAGCTTTCGCCTTCTCCGCTTTTTTTGGGCTGATTCG:1 - chr3R 7569573 3' - Doc 44 1 44.52 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGC:1 - chrX 18193687 3' + hopper 1376 1 59.59 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATGAAACTATAGAAGTTTAAAGCAAGGCGAAACTGGGCGGGGCAGTCTCCCACTTTAATTGCCGCCTTGC:1 - chr3R 25876850 3' - mdg3 50 2 52.74 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAACTAACCCAGGGACTGTGGCGCTACGAGACATGGGGCTATCCCATTGTGGAGGCCACCAGCGGTGCCGAGATGTGGGCGTGGT:1 - chrX 8406428 3' + mdg1 359 2 56.16 ATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTATGCTATTGGTTTCGAATCAGTGTTTTTTAAAAATCTACACGCATCCAATGTTATGTTGAACATGAAGGGTCTGTAG:1 + chr3R 9582840 3' - pogo 2093 1 52.05 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAACTCGACTCGTGTACT:1 + chrX 21213441 3' - Doc 14 1 73.29 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATGTGTGTGTGTGTGGGTGAAATGAGTAGTGTGGGTGGCTATTGTTCTGAACTACGCTCAATTGCAACAATTACAGCAACAATGCTGCCCGTGAGC:1 - chrX 5121030 3' - Quasimodo 25 2 68.49 CCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGCTCGAGCAGCGAAACCGATGGGAGACGAGCGCCACCCGAGAGAACTCTCTTTGGCGTTGCCGCCCCCGCCAAGCT:1 - chr3L 131704 3' + P-element 2885 2 77.88 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAG:1 + chrX 13651550 3' - 297 49 2 65.83 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATTTATAGGAGCTAAGTCCCATTGCATTATTAGCTTAATTTTTGTATTTTCCCTTTTCCATTAAATTGAGCATCAAATCGAAAAAATTACGAAG:1 + chr2L 17228746 3' + mdg3 218 2 65.75 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGC:1 + chr3R 5245645 3' + 1360 3322 1 72.87 TTTTATAGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGTATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTGCCTC:1 - chrX 693660 3' - INE-1 147 1 36.81 CAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTCAAGGGCGCAAGCCTTAAAAGATTCATGGGTCGTGAATAATCCCGGAAAGCGGGTTTTTC:1 + chr3R 21521420 3' + Bari1 1647 1 58.90 TATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTC:2 + chr2L 11867385 3' + BS 4980 1 50.00 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACGGCCAATACCGCAACACATCCTGTGATACGTGCATATCCTGCTCGCCTTCAACTGCACTAATTTATGTTATCCTTGCCACTCCACTGAGGCCACACAAAGGGAAATTCTAT:1 - chrX 4773074 3' - hobo 6 1 44.52 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACATCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCT:4 + chr3L 9242105 3' + roo 385 2 52.74 TAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATGAGAAAGCTGGGACTGAGTGACAATGAAATTGGCCGCCTGCCGCCGGATATACAAAACTTTGAAAATCTCGTT:1 + chr3R 26545117 3' + I-element 242 1 52.05 GGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTGAAAATTGCTTACAAATTTAGTGTTGCATACTTTGCGGCTGCTGCTGTTGAAAGTGCCACAAGGAGCAGTGC:1 + chr3L 8253772 3' - jockey 4655 1 68.97 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGATTATGATGATGATCCACCAATTGAGCCCATGGATATTGAATATGAGCCACAACCG:1 + chr3R 14088681 3' + 1360 3355 1 62.33 TAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAATTCCGTTAGATCTGACAATAAATCTGACACAAAAAAATGTTTCATACGAATCACATACAATTACCATCAAAAAGAGTAATCAGGAAATAAACCTCAAACGATAACTAGTAAAAAA:1 + chr2L 15876700 3' - GATE 452 1 59.59 GGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTGGGGGCTTGCTGTGCCTTTGCCTTTTTATAAGCAGGGCACTCTCCCGCTCGCTCCTTTGCTGCATCAAGTTGTCAATTGCAAAATT:1 - chr2L 19414054 3' - G2 36 1 68.49 GTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTATAAGATTAGTACCGCAGGCGAGTGAAATGAGAAAAAGAATATAATATGTTGCCTACATATGAGCGCTCTTATTGTG:1 - chr2L 15142226 3' - BS 4752 1 53.42 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATAT:1 - chr2R 16908503 3' + roo 8990 2 73.29 GATCTAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTAAAAAAATCAATAGCCACAAATTTCGACATTTGTCCAACGACTTTGCGAAACTTTTTTTGCG:1 - chr2L 16111492 3' - 1360 3160 1 61.64 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATATGGAATATATAGGCGGATTACCACTTGTGGGCTTTGCATGTTTTCACAGCCAGCTGAAGGATGTGCTGATATTATTCCTTGC:1 + chr3R 12540260 3' - flea 32 2 63.70 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATGAT:1 - chr3L 20747082 3' - Burdock 50 2 54.79 GATACCCATTAATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAATATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGATCGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAAATCGATAGAAATTTAAA:1 + chr2R 5667272 3' - INE-1 541 1 45.52 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTGTGCGCACTGTAACAGCAAAGACG:1 - chr2L 19424639 3' - Tirant 49 2 53.10 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGAGCCATGCCAACAAAATGTGAATGTATGTAAATATAGAATAATTAACAGTGGAGCTCCTCAT:1 - chr3R 15590515 3' + roo 394 1 71.23 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAAACATAACAAACTTGGGTTGCCGTTCGCCGTCGTGGTGAATTTTCCGCTGCACAGTGGGGCAAACCGCATTTTTAATTT:1 + chr2L 10474426 3' + P-element 2846 1 58.90 AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTGGCT:1 - chr3R 3527085 3' - Tabor 75 2 66.44 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGCCCTTAGGCGAACTATGAAAGAGAGCCA:1 + chr3L 13227709 3' - hobo 48 1 53.73 ATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGAC:1 - chr3L 25232765 3' + accord2 7557 2 65.07 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGA:1 - chrX 19162578 3' + pogo 2042 1 60.27 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACTCAATGGGCTTATTAGTTTCGTCCGTATTGCCTCGAAAGCTCGTGCTTAAAAATGCAGTCAGCATCTCTTCGACT:1 - chr3L 22529721 3' + roo 9043 1 60.00 AGCAATATGATAAAATAAAATAATTATTAAAAATTCACGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCAGTCCAAACAGCAGATGCAATCCAGTTTGTCCTTGAGCGCTGGT:1 - chr3L 20269769 3' - 1360 3103 1 69.86 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGGCAAAAC:1 - chr3R 9289269 3' + HMS-Beagle2 275 4 61.64 TACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACTTCGGCAGCACATTGGCGCCATCTAGCCGC:1 + chr3L 13227682 3' - hobo 87 1 76.03 CAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATG:2 + chr3R 11461872 3' + 17.6 433 2 64.38 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTTTGTGCCTTAATAAAAGCAATTAAAATTCATTAGCTGCAAACACACTTACACTCGCACACACTCGCACAAACCCACTTACCCACACAGAGACACAGTCGGGACA:1 - chr2R 20913067 3' - 1360 17 1 73.97 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGTG:1 - chr3R 20905354 3' - pogo 36 1 61.38 AAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAAATAAAAAAAACTAATTAAGAGACGTTTCTTATGGACAAAATAAGTACGCAGAAATTTGTCTGTTCAATATTCATTTTCACTGGTTTCTCTTTAAAACTTTGTCTAAGACGTC:1 + chr2L 22696507 3' + X-element 4696 1 69.18 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTC:1 + chr3R 5087113 3' + P-element 2870 1 64.81 GGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAGTTTCAATTTTCTAGCTAGCTTAGGATCTTTGAAACTAAGTCATGAGAGCCTATTATTTTTACT:1 - chr3R 27519356 3' + X-element 4657 1 58.90 AGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAACCAATTGGTCGAATATTCAGTAAATTGAAGAATGGCCCAAACAATTGGTGA:1 + chr3R 26525780 3' + 1360 114 1 65.07 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTCAACGTT:1 - chr2R 18807719 3' - jockey 23 1 73.97 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGATATTAACGAAAATCCAGCGGCGAAAGGATAAGCAACCACTGCGGC:1 - chr2R 20704113 3' + hobo 2922 1 67.48 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTC:1 - chr2L 5771406 3' - Juan 57 1 54.11 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGGCAGAAAATCTCTATTCTTTTGCAATTTGTTTTGATTTCTCATTC:1 - chr3L 20785464 3' + P-element 2813 1 34.93 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAATAAAAAACCGAAGCGACGACTCCGTTTAGCTTAAGTCCATTACGGAAAAG:1 - chr3R 7424548 3' + 412 421 2 66.90 GCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTT:1 + chr3R 20368063 3' - Max-element 72 2 69.34 ATGTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATG:1 + chr2R 22692406 3' - Ivk 29 1 58.62 AATTAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATAGGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACAACCTACATTCATTTCATTACAATTGACGGCCCAGCAACTTGTACAG:1 - chr2R 21897887 3' + 412 420 2 62.33 TATAATTATATGAATATTATATTAATATGGCATAAAAAATATTGATAACTTAAAAGTTAACCCTTCGACTTTTGGTTTGCAATTTCGCACCCACTTACTTAACCCTTTAAACGGAAATGAATCCTGCGACGTGAGCGGATGTGTCC:1 + chrX 11461974 3' + transib3 2622 1 71.92 TGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCTCAATTAGTTGCAAGACCGCCATTTTCGTCGCTATTTAAAGAGCAGTTGAACTGAACTA:1 - chrX 5439987 3' - accord 63 2 61.64 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAAC:1 - chrX 19162572 3' + pogo 2048 1 56.16 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTT:1 + chrX 12551820 3' - pogo 48 1 53.42 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTGATTAAATCTGCACACACACACACACACACACACACACACACCGCCATAGAGAATTTTCTTTTTATTTTTTTTTTT:1 - chrX 12239359 3' + hobo 2931 1 69.09 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTTGACAGTTACGTTTGAAATTGCCGTTTGGAAAGAGAATGGAAACGCGAG:1 - chrX 5892083 3' + transib2 2754 1 65.75 TTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCGTCGCTCGGCGC:1 + chr2R 13574856 3' + diver 6056 2 54.79 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTGGGTGCCCAGGATTTTTGTGTGGCAGTCACGTTGTTGCCACTTGGCACTTGGCATTACCCCGCGTTGTTGTCCAAATTTGAACAGTCGTGGCAAAGTTGTTGCCTGAG:1 + chr3R 22429283 3' - roo 8676 2 75.86 ATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTGTTGAATATTAAAATATTTATGTAAAAAATGCAATTTTT:1 + chr2R 5079270 3' - flea 4829 1 69.72 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATCCTGCAGGCAGATGGAACACTTGTAGGGCCGTTCATCCGAGTGGCGTCGTCGGTGCTTCGCCAGGTTATTGTTGTCCGAAAAAGTCTTGG:1 - chr3R 9628441 3' + roo 9041 1 62.33 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCTCACTTCTTTTAGCCCCCGAAAACGTTGCCTACATTTCGGGG:1 + chr3R 5940517 3' - hobo 17 1 54.76 AGACCAAATATCATCCTCTGTCGTCGTCTAGGGACCAGCTATTACTATTGGGATTTGGATACAACAATTGTATAAGCTTACCTTTCGTAGAACTGCACAGCAAATTTTGGTATTGCCGCAATTACTGGAGCGGTAATCAAATGTTG:1 + chr2L 17455769 3' + Rt1b 210 1 58.22 TCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAAGAAGGCGAATCGAAGGCAGTTGACATTACTTCAGTTCT:1 - chr2R 8332097 3' + F-element 4492 1 71.23 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCACGTTCAAACCGCATTCATATTATTCCAGTGACTTTACGGGTTAGTTGTTGCTGGGCGTTCGATGGCGCTTGGTCTC:1 - chr3L 13922264 3' + Tirant 373 2 62.31 ACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGGGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGAAATTTAGCATTGTGTATTTCTTTGTTTATCTGCTG:1 + chr2R 24461930 3' + Idefix 7252 2 78.08 AGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGATGTAAGATGGATGTGCTATAAAGTGTAGGCCCACATCAC:1 + chr2L 1229859 3' - 1360 228 1 73.29 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCGATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGTGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCGTCCTAATGAC:1 + chr3L 15035260 3' - pogo 20 1 70.55 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCAATGTGAAAACAAAATGGCCACTGAACACGGCCAATCCGCAGGACATTTCCCCAATCTGTCCCCTTTTTGGCACACCT:1 + chr2L 17730548 3' - pogo 40 1 59.59 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTT:1 + chr2R 9867177 3' + roo 9001 2 64.38 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCTGTTGCCGCCGCAAAATTTGTGGCTGAAGCGGAAGACGTAGCTGGAAGCCTGTGCCGGGGGATAGCGGTAATGGACAAAATCC:1 + chr3R 31907467 3' + Tirant 8474 2 63.70 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTG:1 - chr3L 5446115 3' + roo 8994 2 71.23 GTATGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGAAGAATTCCATCAAGCAGTTTACAATTATCTATCCCTAATCCTTAACAAGATCGGATGTATAGGATTAAGAAATGTACAAGTATATGGCTT:1 + chr2R 4996670 3' - transib3 21 2 69.78 AAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTACATGTACATGGCGCAGATCAAGTGCCGAAAGCTAATCGCAACTTTCATCACAATTCGACAAAAAGGATAAAAATGA:1 + chr3R 25354589 3' - 297 6625 2 60.27 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACATTC:1 + chr3R 10288876 3' - copia 84 2 72.60 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAAACACCAGAAATTCGTATTGAAAGTGGGGTAACAG:1 - chr2L 17730378 3' + pogo 2085 1 73.29 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCGCAGCAGCTGTTCGAGCGCATTAAGCTCGTTATACGGCAGCTGTCTTACATTTATGAAATAACATAAGATAAAACGAGGCGTAGTACATGCAACATACGAAATAAAGATG:2 - chr3R 31907284 3' - Tirant 11 2 79.45 AAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACATTCCACGGTCTTAAACGTGGGCGATGAGATGATTCGCGTGGTCGATGAAAAGATCTCCAGTTCTTCGCAGA:1 + chr2R 14878289 3' + Doc 2 1 50.00 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATA:1 - chr3L 13597747 3' - blood 63 2 61.64 TAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTTATTAATGGAACAGTTTCATTACAAATCTGGGGCAAAGGTTTGATTGAC:1 + chr3R 16799865 3' - X-element 4619 1 73.29 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTC:1 - chr2R 21380634 3' - roo 8755 2 80.14 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATCCAGAAATGGAATCGTAGTAATAGTCAATTGAATCGAGTAAGTTATAGATTGTTACGCATTGATTCATACTTATTATTCTTTCTTGATATCAAATA:1 - chr2R 7404637 3' - blood 25 2 64.38 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCAGCAATTAAAGTAAGTGGCGCCATGCGCCTTTCACGCTGCCTTGGTCAT:1 - chr2R 10367420 3' - 412 9 2 76.71 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTGCGTTAACTGCTAGCGGTATTCCCTGGTCGTAATTGTAACTTCACGCCAGCCCCAAACCA:1 + chrX 12558342 3' + Transpac 5173 2 56.55 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAGA:1 - chr3R 15590576 3' + roo 8996 2 69.18 CCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTGCTTACATCAAATTCAACAACTTTATCCTTATGAAGTTTTGAAATAGGAGATATGAGCAGACAAGGATTATTCATGGTAAGTACTCGTACACTCAG:3 + chr3R 20368119 3' - Max-element 8260 2 68.49 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGGTATGGTGTTGAGTTGGCCAA:1 + chr2R 10367611 3' + 412 470 2 67.81 AGTCTCAACCTTCTAGCTTTTAAAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCACATGGACAGTAGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACCCGGCTATTGATTCTGATCAAGAAAATTAAGGGTTGTATAGCAGCTGCAAATCCACTGGATGC:1 + chr2R 5088051 3' - INE-1 164 1 75.34 TGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTA:1 + chr2L 21403570 3' - G5 4430 1 51.37 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCATTGCGTTGTCTCTCATTCAA:1 + chrX 14692947 3' + Transpac 5172 2 60.27 GGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCTGTTAATACTAGCATGTGACGTATCGCCAT:1 + chr2R 4551491 3' - roo 8880 2 65.75 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAATAGGCTAACTATGTCATTTATATAGCTTGTGGAGCTATAAAAGACGAACGTG:1 + chr3R 10143024 3' + 412 424 2 63.01 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGC:1 - chrX 11228555 3' + roo 345 2 59.59 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAA:1 + chr3R 20452254 3' - blood 7101 2 79.45 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCAAATTAAGTTGATTTTCGTTTTGCTTTTACGAGTTGTTATTTTTACACCGTCGACTTGTGTTGAATCCATTT:1 + chrX 10538241 3' + pogo 2054 1 53.42 ATAATAATCTTTTCTAATACAACAACCATTACAGCCTTTTCCTAATCCATACCAGTTTTCACCCATTTAATCAACAACCATTACAGCCTTTTTTAACCCAAAGAGACGCACACGCTTAATAGCGGACGCTAGTTCTGTAGCTCTTG:1 - chr3L 25727215 3' + TLD2_LTR 55 1 41.10 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGGCAGA:1 - chrX 3524229 3' + roo 8999 2 69.18 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTTTTTTCCCTTTACATTTTCGCTTTTCGAGCGCAAA:1 - chr3R 10079266 3' - P-element 34 1 62.33 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATAT:1 + chr2R 7404787 3' + blood 7348 2 50.68 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGACTCTTAGAGGTTCCTCCGGGTTCAATGACTTGGCATGGCCACAG:1 - chr2L 8397165 3' + roo 8995 2 69.86 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGTATTTGTCTCGAATGCGATAATAGCACTTAAAGCTCTTA:1 + chr2R 21380683 3' + roo 325 2 75.34 TCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAAAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAATGAATATGAGCATTATTTTTTTCTTTAGCACAAACTTTCGTCACTTTTTT:1 - chr3L 5198236 3' + invader2 5068 2 72.60 CTTGTATGGAGCAGCGGCCGTAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTAGGCATCTAATATTGATTTTTGATAGGATTAGCTAAGGAGAATGATATAGTCAATGACCTCGACTAGCAGACACTGAATATACACA:1 + chr4 1110037 3' - Transib5 2967 1 56.85 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAATATAGATCGGCTTGGAAACCATTCAAATGATCTATCAGAGAGTATAATAATGGCTAAGATAAAAATAATACCTAAGCTAATACTAGATCCAAAA:1 - chrX 21668679 3' + mdg1 7435 2 60.27 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCGACCCTGACGATGTTGAATCTT:1 + chr3R 10778777 3' + mdg3 5467 2 64.38 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTT:1 + chr2L 15833087 3' - hobo 64 1 61.64 GGCTGACATATATTTATTTAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGATTTTACAGTTCGAAGGGTCGGGAGAGCATTTCTACCTAAGGTCGAGAACCATAATCC:1 - chr3R 16251492 3' - 412 435 2 66.44 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGTAAAGGCAATTTATTGTTGGTCAAGTTAATCGCGTGCCTCAAGTGGC:1 - chrX 3444088 3' + pogo 2063 1 57.02 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCTGATTGTTAACTGACTTATTCCGATTTCGGTGCAGCTGCTCTGGCTGATATTTTCGTTCACTTTTATCTTTCACTCGTCCGCTTGGGCACTCTCTTTCTCCGTTTCT:2 + chr2R 21056831 3' + Tirant 8495 2 78.08 TCAGATACCCGTTACTCAGCTGGAAGCTAGTGGAGGCGAACGAAAAATTCCAACATTAATTGTTGGGGATTGAATTACTTTAAATGAATTAATTGTACAGTCTATTTTTTGTGAATAAAATCAATAATTGACGCAAATAAAAATA:1 - chr3R 12018407 3' - INE-1 544 1 62.07 TTTAACGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATCTGGACAATAATTACATGTTTGGGCGTTAGATATATACATGTATATATGGGAACTCCTGAAATGCATTTAATATCTTATTCCATGCTGGGGAGCATATAGCCACTACGTT:1 - chr3L 25515800 3' - G-element 4309 1 61.64 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGGTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCCATACGTCGCAAAAG:1 + chr3R 25753731 3' + hobo 2920 1 63.25 TTTTCTTAGCTTTGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGTATTAAGATAAACAAAATAGTTCCCCGGGCGCATGTCCACTGTCAATCAATGCTGCACTCCACTCCACTACACGGCGA:1 + chr3R 16092083 3' - Ivk 243 1 53.79 GAACCCTCTTCTTGCGCTCTACGACAGTACCCTCCCTGATTAACTTTTTCTGATGAAATAATTTTTTTATCCCAATACGCTTGAGTGG:1 - chr3L 13023140 3' + opus 7 2 30.68 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAGTTTTCAAGAGGAAA:1 - chr3R 6782716 3' - jockey 4746 1 64.38 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATCTGCTCATGGCCAACCATAGTTGTGGTTCGCTTATCTGTCCATAGGTGGCGCC:1 - chrX 16244895 3' - jockey 4827 1 62.33 GGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTTATGTTGCTTGCCTTGTGGCTTAGCAATGCAATGTAAATAAGAACAAAGTGATCATTATGTCTTTGTTTATACCTCAGCACCGTTGAAGTGCTGGCCACTCTTACTAGCGATGCAGGACG:1 + chr3L 21537461 3' - gypsy 7340 2 54.11 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGAAAT:1 - chr3L 9571611 3' - jockey 30 1 67.81 AGTTTGTCAAGAAACTGATTACACACTGTGACTTAAAAGCTAAAACTTAAGGGTTCTTTGCTTAATTATGTGAGGGGAGTATTTTTTGATTAGAATTAGGAGTTGGCTGTAGTTGTTTACCGAGGGTGAGTTTAAGCAACCAGTTA:1 - chrX 5709107 3' - S-element 1714 2 52.05 GAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACCTCAAAAT:1 - chrX 21204984 3' + 1360 3320 1 63.70 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATTGAAAACAGTGAAGAAAATACAGCATTGAACAGCATTGAACTTAGTGTGAACAGTGACAAAT:1 + chr3L 9586893 3' - jockey 4699 1 56.64 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACAGTTTCTGATAAGTCGCTGTTTGGGTATAGAGATTTAATTCAGAATACACTCCTTGCCTT:2 - chr2L 22641321 3' - HMS-Beagle2 58 2 58.22 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCA:1 + chr3L 17447563 3' - Tirant 50 2 55.48 ATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGC:1 + chr2L 14969974 3' - Tirant 8174 2 60.27 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTT:1 + chr3L 14043622 3' - Ivk 55 1 56.34 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCAAAGTTGAAACAATTAGTCCTCGGTGAAATAGGTTAAAAGCTCATTGCGGCTGGCAAAAAATAATTAAACCTCAAAAC:1 + chr2L 2338182 3' - blood 40 2 58.04 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAG:1 - chr3L 5183673 3' - copia 38 2 59.59 AATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGATTATCCGCACAATCAGCACATCTATCTGCTGCCCGAGGGTGCCATTCAGCAAGTTTGTAACGCCGTCTACGTGAGA:1 - chr3L 16426805 3' + invader4 310 2 50.69 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATCAACTTCAGTTGTCAGTAATATATAGAAGCTAGTCGTTTATCATCTATTACCGCT:1 - chr2R 16712958 3' + pogo 2040 1 62.33 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGCAAGCGAAGTATGATTAGGTTATTGACTCGCCAACTTGAAATATATATGAGAACAAGGGCACTGCTCTTACAACAAGCACTTAATTTG:1 + chr2R 19354110 3' - 297 30 2 65.75 GACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTGTTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTAAGAGCGCTTGATTACAAAAGTTGGGTTGATTAAACATTTTTCGTGGAGGATAAAGCGGTTAGATGGT:1 + chr3L 23224544 3' - X-element 4520 1 59.59 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAAAAGACATG:1 - chrX 19162560 3' + pogo 2060 1 55.48 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAACTTAGATTATTAACTGGCCATATGCGGAATAAAACACAAAACTACTATCAAAATTGCCGTAGCTGTGGGTAAACGATATGGTTATCGTTACTATGGCTATG:1 + chr2R 7404809 3' + blood 7384 2 72.73 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCCCGAATCTCTTTCGCCACTAATTCGACATGTGTAAGA:1 - chr3L 9571614 3' - jockey 33 1 65.75 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCG:1 - chr2L 23372625 3' + 1360 3338 1 68.49 ACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAATGACTTTCAAACTTATGAATTCTCAAACCTTTGAATAACGCCATCTACCGTAAAGGGTGTTTCTTTT:1 - chr2L 5771363 3' - Juan 14 1 76.03 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGCGCAACTTTCAAAGATGCAGTAAGCAATTGAGTGTTGC:2 + chr2R 24427665 3' - jockey 4692 1 72.60 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGGAGCGGACAACTTGAAAAACTTTTAATAATTGCATTTTGCGCAAGCAGCAGCATCGACTTCAACTGGCTCACATAATAAACTCCCTCAAC:1 - chr2R 13657632 3' - flea 4782 2 68.28 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACACTAGTTTAGAATGTTTGTTAA:1 - chr3R 9481977 3' - roo 28 2 67.12 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTGAGGTGGCTCCACAAAGTGCTCGCCTCACAAATGATCACATCACATGACATTCGTTGTGGGAG:1 - chrX 13548304 3' - jockey 4801 1 51.91 ACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAAACAATTGCAGCAATTGGAGAATTTCAACAACTTTTTAGGGAACCGCCTGGCGAATCTAGAGGGTCGCTCACTGGTGGCGATTGTGAGCTTATCTG:1 - chr2L 1066123 3' + Tirant 217 2 78.12 ATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTTAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGATGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACCCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2 - chr3L 20988181 3' - 1360 263 1 71.92 TGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACACTATTTATTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGAC:1 + chr2R 13574839 3' + diver 151 2 66.44 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGGATTATGATACCAACTCGTCGCGC:1 + chr3L 9430629 3' - P-element 96 1 19.86 ACTCCAGCATCCAGATGACGATACCTTTCCGAAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACGCGGGGAGGAGTTAACACAGTGAAGAAAATTTGCATAGTCAGGGGGTAAGCGGAGCACTATGTACATAGGTTCGCATGTTAATGATTT:1 - chr2L 7592517 3' + gypsy4 6504 1 52.05 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGAGACACTTCCTAATTGGCTTCCTGTTTGGGAAGCAATCTATTGTGCTACATTAATTAACTCCAAATCGTAGTCAGATATTGAGGGGAAATTA:1 + chr2R 15080142 3' + roo 9042 1 65.75 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTTCTCTGCTTTTATCTTATTGGTAAATCATCGTAATTATATATTAATAACATATGAGGCGGTCTTCTAATTTAA:1 - chr3R 12787103 3' - 297 6623 2 56.16 GACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:2 - chrX 12649915 3' - blood 7228 2 86.00 CAGGGGGACTGCCCACCAATGCACTGTCCATCAATTACGGCCTACGGTTACCAGGCGATTTTCCACTTTTCAGTTGCTCTTTAATGACTTTCGTTATCTCGATTGGCCGAAATTCTTTCCTTGTTTTGTTCTTTTGGATTTGAGTG:1 + chr2R 4987343 3' - Rt1b 392 1 79.45 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACATCCTGGGTGAGACAGCCCACCTGGCTTAATCCTCG:1 + chr3L 4023770 3' + pogo 2089 1 75.86 ACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCCAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCTCTAAGTGCGCCAATTAGCAACGGC:1 + chr2R 5900930 3' + Bari1 1649 1 57.53 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAAACGG:1 + chr3R 29350808 3' - 297 15 2 65.79 AACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAA:1 + chr3R 11461861 3' + 17.6 7349 2 71.92 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGG:1 + chr2R 5992397 3' - pogo 54 1 60.71 GATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATAGTTATTTTCCGGGACCGATTCTTCCCAGCGACTGGACGCGACCGCTCTTCAAACTCGAC:1 + chr3L 20792753 3' + roo 81 2 52.00 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCTCTGTGCGAGAATTCTCCCCCGCCGAGAGCAACCAAAGAGCGCAAATCGTATATAAGGAGTCGGTCGGGCAGC:1 + chr3L 14969317 3' + P-element 2882 2 65.71 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTGAACT:1 + chr3R 12608183 3' - roo 43 2 51.37 GGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTCGCCAAGTTTATAACAAAGCAAAAAAAAATTCTAAACCGAAGTACTAAAATGCCTCATTGAACCAGAGAAAATTC:1 - chr3R 27845454 3' - Stalker 47 4 47.95 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACTATATTTGAACACTCTGATGGACGGACAGGTG:1 - chr3R 5765355 3' + opus 432 2 76.19 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGTATATTCACTCGGTGTTTTGGTTTGCAGAAGTGCGACCACGCCCACGAGCAAAAAACAATATGAATTTTCCCACAAAGA:1 + chr2R 16383393 3' + roo 9031 1 47.95 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGACCTTATCGCGCCCACTGTGCGCAAATGCACAAATGCACACACAAAATGTCAATTCTGCGCACGTCGCTTCAC:1 - chr2R 24338333 3' + 1360 3380 2 71.30 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGACTATGCTGCTAGTCCAATTTTGCGTAAAGTGAG:1 - chr3R 6782730 3' - jockey 4760 1 73.97 ATAGAGACCAAGGTGACAAATGTGTTTTCAGCTACCCCGTATGCCTTCGAAAAGTATAAATAAACAAAGAAAAAAAATTATTGAACTGTACAATTCAGTTGTATTGTCTGCAGAAAGTTTACTAATGATGGACAGGAGAACTCGCT:1 + chr3L 23287712 3' + BS3 1722 1 62.33 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATGCCATGGAAAACGCTTATAAATAATGAAATTGCCAATAAATGGCACGCCCTCAACACAAAG:1 + chr3R 5765440 3' - opus 7157 4 53.73 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTAT:2 + chr2L 10832325 3' - Doc 82 1 72.60 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTGCTGCGGATTTAGAGCGGAGAA:2 + chrX 16853434 3' + roo 9019 2 54.79 TGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATATAAAGTAATAAATTCCAAAACTAAAACAAAATTTTT:1 + chr3R 12559725 3' - mdg3 5324 2 73.97 AATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACCTTGATCCCATTCCTTTTGCAGCGCAATCTAGACGCCTCCGGCTACCGCTCGCACGG:1 - chr3R 10142900 3' - 412 3 2 78.15 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTTTTTATAGTTTTTGGGGGATAGGTCCTACGCTTT:1 - chr3R 24693590 3' + hobo 2866 1 73.85 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGAGAAGATTTTCGGGACGAAATTTAATTTGCGAATATTTTT:1 - chr3R 22846654 3' - 412 12 2 78.08 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACACACACAAGCCCACAAAGATACTGAAGAGAAATGCGCACATCCTGGCAGGCATTTTTGCTTAACTCCTCAAAGTGGCTGG:1 + chr3L 17447573 3' - Tirant 40 2 59.59 ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATCCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCATTTCCGGGAT:1 + chr2R 23313074 3' - Tabor 6902 2 65.15 AACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTTCACACGGCACAAACACAGTAACGCAAATAATAAACTAATTAAATCGACAGAGGCCTCTATACGTAATGTGCTTAATAATTTGCTAAATTAATTGCT:1 + chr3L 13616086 3' + roo 136 2 63.70 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGAGCAAGTTGCGCTTTGTTCGTGGCCAGGAACTCGT:1 + chr2L 20561464 3' - P-element 84 1 28.08 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCGACTCAATTTTTTTGACTTATTCCGTCTATTTCCCTTTATGTATAAAATGTTTTC:1 + chr3L 26371508 3' - S-element 64 1 62.33 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTAAATATAGAAAATATTCGAAGCAAATCATATTATTGCAAATTATCTGAGGCATATGCAGACGACTTAGAAACAAATCTTCTCCAGAGG:1 + chr3L 15261392 3' + pogo 2070 1 64.38 CGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCTCTTTTGCTATGACAAGCATGGTTAGAGGAATAACCACTTCCAATTTGACAGATATGGTTTTACTCCATAGATATCTTCACCCAATCCGGATTCACTGCAGCCGTG:1 + chr2R 8090537 3' - R1A1-element 4926 1 52.52 CTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGATTTTTGGTTGTTGTTGTTTATTTTTGTGGGAATTTAATATTC:1 + chrX 15374596 3' + R2-element 356 1 71.23 ATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATACCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTT:1 - chr3R 23020782 3' + INE-1 565 1 62.76 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAGCTTTGTGGGCGTGGATGTGTGTGTGTAACGTGTGTGTGATTCGTGTATGCGTGTGGCTCACCCATCTTGACGGGCAAGA:1 - chr2L 8103486 3' + pogo 2067 1 53.57 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAACAGCCAAATATTCATGAAAATATCACATACATTTGTT:1 - chr2L 12261124 3' - jockey 36 1 65.07 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAATATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAGGCATCCTA:1 + chr2R 22692447 3' - Ivk 29 1 57.81 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAGTAGAGTACTGTTACCAAG:1 + chr2L 21342360 3' - roo 8722 2 66.44 GACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATTTTCAATTCTATTAACCGGGGAAACCCACATCGCTGTGGAAATATGCGCTGGAAATATTGATATCACGTACTGT:1 + chr3R 26765201 3' + mdg3 199 2 51.37 GTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCATGCTTTGCTACCCTGTTAAACCAAGGCAAAAGGGTAAATGCAACTTTTGG:1 + chr3L 12030618 3' - I-element 5200 1 50.68 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTCAGTGTTCATGTTCGTCAGTTAGTTTCGAATTTTCACTTTTCCTGATATGTGTTAGGGTGCTGTTCTTTGTGTTTAAGCATCGAGTG:1 - chrX 22591239 3' - copia 4903 2 62.50 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAATCGTCAAAAACATTGCCAGAGTGATTTGAACTTTTGTTTGCGGACATTTCAATTTTTCAATTTCCGGTATGTATGCTT:1 + chr3R 24810009 3' + 1360 3348 1 58.22 ACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAACGCTTTAATTAGACTTCAATCAATGCCAGAGGCAATTGTCAGCGCCCTA:1 + chrX 2356538 3' + Stalker2 7330 2 63.70 AATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACAGAAAAGTCGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAGCGAAGCTGAAGATAGCAGCGAAGACGATTTTTCCAGTAGTATTACCATCAATGCCATTCCAAATCGAGCGATGCG:1 - chrX 14146512 3' + invader2 486 1 66.44 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCTGTTGCTATTTGCTCACTCATGTGCATAACGTC:1 + chr3R 25508528 3' - hobo 62 1 75.21 ATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCG:1 + chr2L 11867386 3' + BS 4981 1 50.00 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCGGCCATAGCTTTGCTCGCTCGCTGGCTGCGAAACTCCATTCATTCGTGCTGCGCGTCTC:1 + chr2R 15613850 3' + P-element 2825 1 43.15 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATG:2 + chr3R 9938702 3' + roo 355 2 54.79 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTCGTTCATCTCTGTAACTCAACTGA:1 + chr2R 9164946 3' - 412 52 2 51.37 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACG:1 - chr3L 4023607 3' - pogo 50 1 52.05 CAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGA:1 - chr3R 14049342 3' - transib2 72 1 65.75 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCGAAATTCTGTTATCACGGCTCAATTTTCTAGCATAAGGCCAGCAA:1 - chr2L 5771430 3' - Juan 81 1 70.55 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTACAAATGCTCGAGCTAGTACA:1 - chr2R 982281 3' - HMS-Beagle 25 2 68.49 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGAATAACTATAATTTATGAACATGTTATTTGGTAATCTTGAATAGTTTTCT:1 - chr3L 19279118 3' + opus 464 2 54.78 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCGGAAGGAAGCATTTCCGATTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAATGTAGCCATGTCCATATGTCCGTATTTCCGATTTAAGCTTGACAAATTCCTTGGCC:1 + chr4 871532 3' + INE-1 16 1 78.77 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATACAATTAAAATCTCTATGACCATACACATTTTTCTTTTCCTATTTTCTCAGTGTAA:1 + chr3R 9938740 3' + roo 394 1 76.03 TATTGTTTTTTATTAATTTATTATTTCGGATAATGTTCATCTTTTAAAATAAAAATTATTATTGGGAGAATAAGTCGAAAAGGGGGCGAAATTACTTTAGGAAAATACCAGACTTACATATATGCATATGTCTTGCTGATAATTCT:1 - chr2L 14898061 3' - flea 4995 2 38.36 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGGCCAAGTTATGAGTTTAATCAA:1 + chr3R 8402671 3' + mdg1 7428 2 63.70 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTATTGCCTCCGAAAGTCAAAGCGTTCGCCTCCCGGACGCTTTTGTGATTTTATTTTTGCGTTTTCCCGTG:1 - chr3R 26399778 3' + roo 9022 2 53.10 CAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTAAACAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACACCTAGAA:1 - chr2L 8959891 3' - Ivk 5139 1 45.89 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAGAGTTGGCATAAAAAGATAATCTTATTTAAA:1 + chr3R 21421106 3' - roo 88 2 78.08 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTCTCCCGACGACTTTCAGTTGACTTGGTCCTCTCCATGGCTT:1 - chr2R 17986267 3' - 297 6641 2 68.18 ACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCATACTCAGTCCCGTACTCGGTCCCGCAATCGGTCCC:1 - chr3R 16535298 3' - Gypsy6A_LTR 18 1 67.67 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCTCATTGGCAGATGGGGATGGCTTCGGTACCGTTCGGATTT:1 - chr3R 14096989 3' - transib2 13 1 70.07 CAGCATTAGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTC:1 - chr2L 1073928 3' - Tirant 8188 2 69.86 ACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTACTATCGCCACTAACAAAGGAATGAATGACTAAAAATTAAATTCGATTTAGCCAAGCGTAAAGTTATCATAAATGCG:1 - chr3R 15589674 3' + Transpac 251 2 55.48 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCAAAATGAAAGTTTTGCGCTCGGTTTTTTCTTCACTCGTTTGTTAGTGCGTGCGATGGGCAATGGGCACGT:1 - chrX 15167645 3' - roo 49 2 56.16 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACACAGTTTATCACTACAATTAACTACATTTGCACTACGTGATCTTGCATAGGTAATTTAAATTATTGCTGATTT:3 + chr3R 21150665 3' - Burdock 47 2 54.79 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTT:1 - chrX 14962203 3' - jockey 60 1 55.97 GATCAGGATCGATAGCCTAGTCGATCTGGCCTTGTCCGTCTGTCCCTCCGTACGAACGTCGTGTTCTCAGGAACTATGCCATATACTACGCAAGAAATCGTATCATGATACCGAG:1 - chr3L 20517711 3' + INE-1 92 1 66.96 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATATCACTTTGTTTTCTTCTGCACTTAGCACTGCAACTCCCCTTTCTTCTGCTCTGCGCTTTCCCTGCTGCTT:1 + chrX 1616103 3' - HMS-Beagle2 45 2 47.95 GTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATGTCCCGAAATAAACCAATTGCCATTCTCGACGAATAGTCAATAGTCGGGATATCAGCAATCCGATTGCACTTTCGACAGCCGATCCCAAGAAACAATTAATGCCGGC:1 + chr3R 30731530 3' - gypsy6 9 2 77.40 ATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCC:1 - chr2R 20382467 3' + Bari1 1664 1 55.86 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATAATCTGCCGCATTCTGTTCCTTGGAGCAGCACTCCATTCTTTCATTGCAATCCCCTGTTGCCC:1 + chr3R 25443147 3' - 297 43 2 54.61 AAAAAAAAATGAGACATTGCAATTTGTTGACACCCACAAACGGTTCTTGATGTACGTATGTATGTACCAATTATGATGTTCGTCTGAGTTTTTGTGTTAAAAATTCAGGTAAATCCTATTTGAAACATTACCTTGTTTCACAGATC:1 - chr3L 12735235 3' + P-element 145 1 80.14 GCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAA:1 - chr2R 19076493 3' - F-element 191 1 63.45 CATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGCGCATGAAGTTTGGGGGAAATGGCCAGACAAGTG:1 + chrX 5440059 3' + accord 7224 2 80.14 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGTATGTTGAATGAATTCATTAGCATTTTGCATTTGCATGGACTGCCAGATAGAGGCTGGGGCAAAGGCACACATTGAAA:1 - chr3L 18708582 3' - F-element 43 1 58.96 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGTGTTTCAAAATCAGTCTGCATTAGAATTTTGATAAGCATACATGCATTTGTGAATCAAATATTTCGTTTTACCAATAAGTGCTTTAGTTTATA:2 + chr2R 7098078 3' + copia 228 1 66.44 AGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAGACTATTGTAAAATTCCTTTTTTAAACATCCAGGAATATGATTG:1 + chrX 19231821 3' - mdg3 80 2 71.23 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATC:1 + chr3R 31956518 3' - pogo 43 1 55.48 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAAGCAAAATGCGACACATACGAAGGGATTCTACGGAAAGTGCATGTATGGAAATTTGTTTTCGGTTTGCGGCTT:1 - chr3R 18903378 3' + pogo 2053 1 52.74 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCGGGCCTAGTGATAACATAATCTAATCTTTATAACCGACATA:1 + chr2L 9010503 3' + 1360 3311 1 72.60 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAGCTCAACGAGACTTTGACTTGGGAAGTAACCACTTAATATTTGAGACCGTAAATCATCCCAGAACTGGTTAACG:1 - chr3R 16771288 3' + roo 393 1 75.34 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATACACAA:1 - chr2R 16410013 3' + opus 7437 2 65.75 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGCTATGGCCCCAAAAACGAAGAGAGGTGCACTAAAAGAAATTGGAG:1 - chr3R 15590577 3' + roo 8995 2 69.86 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAAAAGAAATAAAATAAAATAAAAAACGGACAACTTCCGGAGCGACTTGCAGTGTCATCAGGATCAACCGATTTCCGTTGAGTAAAGTGTGCAAACATTTA:1 - chr3L 2036966 3' - Doc 28 1 68.49 CCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGAAAATGTCTTATTACTAATTCTGATAATAATAAAAAATACAAAAACTATTAAATAAAATGGGATTT:1 + chr2R 20015169 3' - X-element 65 1 53.42 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAATACGCGATAAGGGCAATCGAAGGAGGGGCTCGGTTTTCTGATTGATAAGCCAGCGTGGGGAACTGATAACACACTATAACAGTGGGTATTC:1 - chr2R 21078385 3' - jockey 37 1 58.90 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAGAGATATATGA:1 - chrX 14385129 3' - blood 39 2 57.53 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGCTATTATCTGGAATCCATCGCAACTCAACTGTTCTCCCGCTGCTG:1 - chr3R 3527088 3' - Tabor 6916 2 68.28 AAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAACAGTGTGGGGACTATGCCCATTTCGATTTGAAGCGCACCATCTGGAG:1 - chr2R 22070884 3' - Transpac 4823 1 67.12 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTCTCTTT:1 - chr3R 31956360 3' + pogo 2068 1 63.01 TTTGCATACTTGTGAAAAACACTTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGAACCAACACACATGCGACTGCACGCACACACACACAAACAATAAGATCCTTTGTTGGCTGACTCCTGGATTAGGTTCC:1 - chr3L 5438708 3' + hopper 1377 1 58.22 GGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGGGGGTTATAGGTGGCGTAAAAATATCTATATTAACAGCACTGGCATCGAAAAGTATCTTAACTCA:1 - chr4 56555 3' - G-element 4272 1 63.70 AGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGTAAATGTTAAAGGATTATTAGCTGACGGCACACGTGGCGTATGCGTAATTTGC:1 + chr2L 14920036 3' - R2-element 3365 1 63.70 TATAGTCTCATCGCTGGACACCACGCCAACGCCTGTCTAATGCAAATCAACTTACATATTACTCTAAAATCTACTTATAACTGTCCCCTCTAATGATAATTCCCTCGTTGTGCTTGTAAACCCGGTAACCAAGTTAGCTGCTACAC:1 + chr3L 20052389 3' + TART-C 301 2 67.81 TAAATATAAATATAAAAATAAAATATAAATATAAAATCATTTGGAACTCACTATTCCTTTTAGTTTTCCCTCTTAAAAACTCTTCTTAAGATATAGAAATGCGATTTCAAACGGCTCACGATCACGTTTTCTAATGATTGAAGAAT:1 - chr3L 9852702 3' + Stalker 6937 4 63.70 ACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACAGAGTTACTAAAAGGGAAACCTGCCAACTGCACCAGAACAAATAACCAACACGTCCCACTGGCACAATAAATATTGACGGGAGGACCACCAACCTCAATGGTATGTTC:1 - chr3L 27715992 3' + G5A 2508 1 71.72 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAAATTGCA:2 - chr3R 13358547 3' + mdg3 228 2 71.92 GCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGCTCGTTGGACATGTTCGCGGTCAAAAGCCTACGGCTAAGATGTGGCCAGTAATTTCAATCTAAATTCAATGGGTTTCCAC:1 + chr3R 9289421 3' - HMS-Beagle 6833 2 60.27 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATTTATTCTCAATTATAATTTTGTAATCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chr2L 22211546 3' - Doc 61 1 55.48 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGGACCCTCTAAAAATGAATGGTTGTTTGGGCCAGGATGGACAGCAGGACAATGCGAA:1 - chr3R 4885324 3' - 1360 65 1 69.86 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAATATATGCATATATATGAAGGAGCTGACTTCATTTTAATGTGTGTAATAAGAGCT:1 - chr3R 21518000 3' - 297 6640 2 71.53 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCA:1 - chrX 16853326 3' - roo 8726 2 60.96 AAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACCAATTTCGATATGCACAGTCAGACAAGGACATTTCCGTGCAATAAAAGCGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGC:1 - chr3R 13358566 3' + mdg3 5461 2 58.90 ATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 463 1 55.14 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGTGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGATTTATTTCTTGGTTGTTAGTTAATAGATTCCAAAA:1 - chr2L 10937859 3' + mdg1 7376 2 72.60 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAGAAGTGCCCCGCCGAAGGAGACTGGGGTTCAATGAGCCCGTCATCATTGCGCAGCTTGTTAGCTTACGAAAGGGAAACT:1 - chr3R 5940418 3' + hobo 2897 1 55.48 ATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATTAAGATATATCTTAAGAGCTCGAAGTTGGAATTGAAAATGATTATCGATTAAGTGTCTAACCCAGAGGAAAGTATGTTCTCTCAGTTATGTAACTTTT:1 + chr3L 1383720 3' + mdg3 5307 2 63.70 GGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATCACTTCAAAATTAAATCAT:1 + chr2R 4122894 3' + rover 368 1 78.77 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCACGGCAACGTGGCA:1 - chr2R 10367468 3' - 412 46 2 53.33 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCCATTATATATCTGGGCAAAGTGAGTGACAAACTTCTCCCCTGCTTTGGTACATTATTAACTTAAGCTATCGCACAGAGTCATCTGAAATGA:1 - chr2L 12355243 3' + hobo 2910 1 64.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAGGCCGACTGCCTGCAGGTGGTTGCACAAACAGTGAGAGCGGGAGACAAAAGAGAGCCTAGAGAAAGCGGTCTCG:1 - chr3L 14969153 3' - P-element 9 2 73.79 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTAT:1 + chr3R 18846609 3' + roo 355 2 57.53 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTTTTTGTTTTTTTTTTGCCGTAGGCCAAA:1 - chrX 8082337 3' - roo 8692 2 64.83 GTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATATATTTAGGCCTCGTCGTGCCAGCTTTTGGTTCCACCTCCAACGCAATGTCATTGT:1 + chr3L 12863779 3' + Transpac 5175 2 61.87 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACAATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAA:1 - chr2R 5214968 3' - F-element 85 1 67.12 AAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCCAAAATAAAATAGATTTGAAGCCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTGAAATTTACAATCCATTTTTTGTACTCCTACCTGAACGCTTGTCCGCCTCATTGATGGGAAC:1 + chr3R 5873426 3' - 1360 276 1 65.75 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTGCCAC:1 + chr2L 16685414 3' + P-element 2841 1 53.47 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAATATACCCCCTG:1 - chrX 22858821 3' - mdg3 32 2 65.07 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCATTTTGCGCTGGCAAAATTCATCGCTCCATCTACTTGGACCC:1 - chr3L 14854630 3' - rover 16 2 75.34 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAAACTACATACTGCTGTAAGATTTTCCTTACACCATCTTAAGCAAAACAACTCGAACATGTATATGTTGTTTACTAGTTGATCTATTGTAACATGCTCTCTCAGAAAG:1 + chr3L 9242114 3' + roo 394 1 57.53 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCTCGGATTCGACAAGAATTCAGCCTGAGTATTGTGAAGTTACATGACTAATCTAATCTGTGACAG:1 - chr2L 3006077 3' + pogo 2047 1 55.48 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTGTGACCCCCCCTCCAACTCCAACTCCGCTTGCATTTTCATTTGCTTGTTTACCTTGCTGAT:1 - chr3R 29708960 3' - blood 7068 2 58.22 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATATTTAATAGCTTCGTGCAATCAAAGAGCTCAGCCCA:1 - chrX 11228547 3' + roo 353 2 54.11 GACTATAGCATTCTGTCTTGTTTTTCAATTGAAACGAAATGCCTGTCCAGCTGCTCCTTGTCGGTTATGTGGTGTGATGGTCTTGTCCTAGAATCTCAGCCTAATTTTTCATTCTACTGTTTATCAATTTGGTTGCATGCTACGAC:1 + chr2L 23315581 3' + INE-1 580 1 56.85 GACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTCTTACACTATAGATTCTTGAAAATTTCTTATTGCCATATTTATTTCTAGGAGACCCTAGCTGTAAATAAGAGTTGCCGAAACGCCGAAGTTGCTTGTTGTTGACACTAATTACGTCATCTTT:1 + chr3R 4403556 3' + INE-1 580 1 61.64 CACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTTCTTTCAAAAGTAACTTTTACGATATGACATTTAG:1 - chr3L 20461564 3' + Ivk 5171 1 76.03 GTTCTTGTGTCTTTGGTCGAGTGTCTCGGCTGGTAATTGCGCCTTTTTTGTTTTTTGCTATGCACTTACTAGCATGTTAGGATTCAGTATGATTTCGATTTAATCTTGAGCTTTATTGTTATTTTTGGTTAGCTATAGCGCCTAAC:1 + chr3R 22056867 3' + hobo 342 1 64.38 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTCTATTATGATATTTTCCTGCAAAGTTTTTCAGCCATCGTTAATGTCTAAGCAATATTTCAATACCAAATACAGAGCATTTTACCAATA:1 - chr2L 16942011 3' + mdg1 7426 2 62.33 GATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTTACCTGTTGTTGTTGTTCACATTGTGTATTAGCCACGTATTGGATTCATTTAAACGGTTAAAT:1 - chr2L 20665794 3' + Stalker2 7396 6 58.22 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGCTTAACAAAACACAAATTAAACCACAATTTAACAAGTGTGATTCGATTGGCTCCGCGTATTGTTCGCGGTTCATAC:2 - chr3R 22659893 3' + 412 7502 2 54.79 AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACAACATATATGTTTGCTGAGCCGCCTGCCATTCACTG:1 - chr2R 5848988 3' + mdg1 7370 2 78.77 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCTCATATAAATTAATTTATAATAAGCAGTCTTAATAGAAATGAACCATTTTATATC:1 + chr2L 19372127 3' + Bari1 1644 1 60.96 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAA:1 + chr3R 25521869 3' - blood 7097 2 75.34 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACC:1 + chr2L 16685365 3' + P-element 2790 1 19.18 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACAGGCGAGAAGAGCTGGGCGAAAATGGAGGGATTGGGATATAGGAGGGTGATCCTTTGCTACGAAAAGTCAGCCAGAACATTGCTATCATTA:1 - chr3R 27786516 3' + Tirant 8481 2 67.12 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCTCCTGCTATCTCTTTCGCACACCGAGTGCGACTCGACTTTATGAATGAAAACTGATGATGGCGCCAAAGAGAGCAAACAAATTGGAAAAATGCTGAAATTTGCTAGCCAGC:2 + chrX 3452574 3' - Tirant 10 2 80.14 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGATTTAAATGAATACCGCTGGCAACATGTCGCACACTTAATATTCGCAGGAG:2 - chr2R 19900984 3' + mdg1 351 2 65.07 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATTGTAGCTATAATGAGTAAGCGCATCTATCGTTTGAGACGTCCGCGCATAAACTGCAAGGTCTTCGCCATTAGAGGTGCCTTCTTCGATCGCGC:1 - chr3R 23254380 3' + pogo 2077 1 69.86 GGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAA:1 - chr2R 6984334 3' - HMS-Beagle2 6964 2 76.43 TTTATTAAGAAAAGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACGCGCCATTTTCATTGCTGGCTTACGCCGTTGAGATGTTATTTTGCCCGGTGGCATATTAACTGCATCACGAGCCACTCCAAAACGCAGCAAAACCGTCCATTC:1 + chr3R 11121843 3' + copia 239 1 74.66 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACACTTTAGTTTTGTATAAATGCAAATGGTATTTGGTATTATTATAACAAGGCAATAAGCAATCCTTGTTGACTTTTATCCTTTTTGGAATGTGCCCGTTCAT:1 - chr2R 9326924 3' - mdg3 25 2 68.49 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAAAAAATAAATGACCGTTTCGTCTTTTGATGTCGCTTTGCATAGATTTTCGAGAACTCAA:1 - chr3L 20977369 3' + I-element 5290 1 60.96 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCTTCTTCTAATACACTGTGTTGTTCCAGGTTGGCGCTATCACCAGCGCCT:1 + chr2R 22892705 3' - pogo 67 1 68.06 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGG:1 - chrX 17614381 3' + roo 342 2 63.01 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGGCCCGAAATTTGGGACAAATATACTAGATAGCTCATAGCTGCACCAGGGAAGAT:1 - chrX 21086049 3' - jockey 4686 1 67.12 GCTGCATTTCTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGTTGAATCGAACCGCAAAGAGAAGAGATAAAAGCCACCAACAACAACTGGCTCACCTTGTGGTCAAGAGC:1 + chr3R 9345683 3' + pogo 2052 1 52.05 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACGTTGACACTACTAATATTAGAGG:1 + chr3R 9482140 3' + roo 9041 1 63.45 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAAAAAGCGGGCAATGGTTTACTCCAAGCAAAGCT:1 - chr3R 6068269 3' - jockey 4719 1 56.83 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCCATTGCTCTTCTTTCTTAGGTTAGATTGGATTT:1 - chr3R 8894892 3' - 1360 89 1 76.71 CAAATAATAAAAACATCATCATGAATAATAAACGAACAAGATCCGCCGGGCATGGCTAATGACCTGACCTGACCTGACCTCCATGTGAGCGGTGCTTTTATGCATTAATTCTTTAGTTTTTAACTGAAATTT:1 + chr3R 19545456 3' + jockey 4989 1 79.55 AAGCCGATCGCGGAGCGTAGGAATGATGAGCATCCACTTTGCTGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATATGTATATGTATAAATGTAAAAAGGGCGAGTCCTGGCGAAAATAATAAATGGGAAATGCAGAGAGCGGCTA:1 + chrX 6309689 3' + Stalker4 177 4 63.70 CGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATT:1 + chr3R 2999830 3' - McClintock 6032 2 74.66 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGAGTCAAATGTCTTTTTCTGCCTCTCAGCTGGTAGCCAAGTGGCATTTTTCCAACTT:1 - chr3R 21421035 3' + roo 344 2 63.01 GTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTCGACTTATTATTATGTAGACACCCACTCAACGTTCTCAATCCCAGTGGTAGTCAGAACGGATGTCATCGTT:1 + chr3R 4531017 3' - mdg1 142 2 61.11 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGTTGCGCTTCTTTTAATTTAATTAAAGGCAGTAAACTGAAACCAAGTAC:1 + chr3R 25876997 3' + mdg3 5472 2 66.44 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATGTATGTATATGGCGAAAATGAAGAGTTGCCAGCGAATGGAATGGATACCTTTGCAAATATTAG:1 - chr2R 17945116 3' - 297 6594 2 66.96 CTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATC:1 + chr3L 21093259 3' - Ivk 36 1 60.96 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACATTCGACGGGTAAACGGATGGCTGATGCCCAACCCTCTCGCTACTGCTATTATTGTCAATTTAATCGGAGTCTTGCAC:1 + chr3L 13722137 3' - blood 43 2 56.85 GAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACG:1 - chr3L 3979579 3' + opus 7434 2 65.75 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGGGGTTAGGAGGAAATGGAGTTGTTGCTGCTGCTGTGCTTATTGCTTATTGCTCCTGTAGAGGGCGTGTTGGCATTAAGCGAGTTTTTATGCAGCC:1 - chr3R 10973164 3' - jockey 32 1 67.81 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGG:2 + chr3L 16180968 3' - Transpac 4989 2 65.75 AAGCCGACTAATCCAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTAAATAAAGACTGTTCCAAGCAGAGTTCTATTTTCCCACAATTCTCTGATTAATTTGTTCCTTTGTTCGTAACGTAATTTCCTTTATTCCCACAGTTCT:1 - chr3L 6519202 3' - Cr1a 4078 1 52.74 ATGCCAATCTTGTGAAAATGGCTGTGAGACGGCAATGCCCCGTAAGAAGGTCTTAGACTCGGTAGTGGAGTGGGTAGAGCTCCCCAGTTAGTAGAGCTCTACCGCCAGCCAAGGTTCAAGCCCAGGTATTCTGAAGCCAAAAATTA:1 + chr2L 22298986 3' - baggins 5165 1 63.70 ATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7189 2 83.33 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGCAGAGGAAAATTTAATCCAAGT:2 - chr2L 12481389 3' - pogo 25 1 65.75 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAAATGGAATTTTGGTACAAACACAGCGAGTTTCTCTGTGCA:1 + chrX 10979141 3' + roo 387 2 65.75 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGCAAGCAAAGGACATCGTAGCAATGAAATAGTTTAGATTTGAAAAAATATCTGCTTTTGTTGAGCCTAACTGCGCGAACTTATAAATATCTATTTAAAATAAGGTAAATTTATCT:1 + chr2R 20704286 3' - hobo 6 1 71.92 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTGTACTGTACATAAATACATATGTATGTACATATGTATTTTCCGATGGATATCACTAACCTCAGGTTAACTTATCGAAGGGATTTCTCTCTGCATCTTGTAAATCACGCACTAACATGGG:1 - chr2L 9167378 3' + pogo 2089 1 73.29 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTACCTTTCAGTTCCAATATCACCTTACCAGAATCCAAGCCATTCCAAGGCCATTCCTTTCCA:1 - chr3L 22518984 3' + pogo 2045 1 58.04 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCACTCGCAGCAGTCGTCCAGAAATTCTGGCATATATTTT:1 - chr3R 9563612 3' - P-element 78 1 30.82 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGCGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACG:1 + chr2R 19543728 3' - jockey 4846 1 72.60 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACAATACAAAAAACAGAAACTAAATAACTCTCCGTTTTGATGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATATATTGCCTATAGTGCAATGTTGCGCAAGTGAAAGAGCA:1 + chr3R 16535430 3' - Stalker2 7263 2 69.86 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAATTATCTAAATGACTGTAGAAATAAGCCAAAATAAAAACACGCCACTGCATCGCGAGTCGAGAATCTGTATCTCGTATATCTGAGATAAAAAATCTCACATTTTAAG:1 - chr3L 14546279 3' + copia 242 1 76.03 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGACCATTGTTGGTTATTGTCACGGCCTGAAAGTCGGCAATTCAAAATATGAACAACATACCATCTCGTGGCGCCACCTATGGACAGATAAGCGAACCACAACTATGGTTGGCCATG:1 + chrX 16244921 3' + jockey 4979 1 71.23 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTAAGCAAATAATTGTATATTTACCACGAATCAAGAGTTCATACTTCCCGTTTTGCAACCATTTGTTGAAGATGTGCTTTCGGCGGCAGAAGTAGCAGC:1 + chr2R 18974024 3' - 1360 24 1 72.60 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTC:1 - chr2R 6585428 3' - pogo 48 1 62.50 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAGAGAGACAATCTCGATATTATAAATAAATGTTTCTTTGTCCATTTATTGAACATGC:1 - chr3L 16725499 3' + 297 334 2 65.07 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTG:1 - chr2L 19903386 3' + Transpac 5151 2 71.92 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATTACACGAGTGAGACAATAAA:1 + chr3R 29350803 3' - 297 52 2 60.96 AAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAACCGTACACGGGTCTTTATTTAATTTAATGCCATTTTGT:1 + chrX 3122034 3' - diver 5983 2 78.77 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAATGGGATA:1 + chr3R 9938685 3' + roo 9002 2 66.44 GGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCT:1 + chr2R 4270290 3' - gypsy9 5044 2 53.42 ACACGATCTGCGGAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGG:1 + chr3L 13204780 3' - jockey 89 1 73.29 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAATTTAGCTACAAAAGCGGAAATTCTAGGCAAGTAATGAACGCAAACAAAACTGCAATCCATCAAATACTACACTAGTTT:1 - chr3R 9481991 3' - roo 8706 2 57.53 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACAGCAATAATAACATTTCCTATGGCAAAAACGTCATAT:1 - chrX 11228581 3' + roo 319 2 77.40 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTCT:1 - chr2R 544766 3' - HMS-Beagle 44 2 55.48 AAATCATGGAAATAATACCGAGCTTCCACTGTGGAGGGAAGTATTGCAGCCTTACCATAGCGTTGAATGACAACGACACTTTTCTATTAATTTACTATTGAGGTTCTTTGGTATCGTACTAATTAAGATTTCTTTTTCCCTTTAGA:1 + chr2R 21325371 3' - BS3 377 1 52.05 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGATATGGCAACAAATATGCTACAATTTCATTGAGATGAACACCCGATACGAGAG:1 + chr3L 10856812 3' - P-element 66 1 40.41 CAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGTGTTAGCAAGTTCCATACATGTTGACGCTGCTTTT:1 + chr3L 22979114 3' + jockey 4584 1 75.00 TAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCTATGGACCCGGTTATATTGCAAACGGC:1 + chrX 10623927 3' + X-element 4673 1 52.74 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGAATGTGGGGGGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTTCGCTTTCGTTGCTGG:1 + chr2R 23225875 3' + Transpac 5166 2 64.08 AGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTA:1 - chr2R 4260435 3' - micropia 5204 1 47.15 GTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTAACCGCTGCTCAGCGATTTTTTTTGTGTTGTGATTAGCAGAGAAAATTTTAACGAGGAACTAACCGGCAACACCAGCTATATTCCGTAG:1 - chr3R 564568 3' - blood 7353 2 70.99 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCCACTCTCAGACAGGACGAAG:1 + chr2L 16685404 3' + P-element 2829 1 44.52 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGT:2 + chr3L 21093245 3' - Ivk 50 1 52.74 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGTGCGCCATCGTCTTACGTTGTAATTTCGCGACTCTATGTCCGTC:1 - chr2L 1073928 3' - Tirant 8177 2 68.89 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGAGATCAACGAAAATCCAGC:1 - chr2R 20704140 3' + hobo 2898 1 56.67 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAAT:2 - chrX 15089498 3' + P-element 2820 1 39.73 CATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACTCTGCGCCACGTGA:1 - chrX 21474388 3' - 1731 53 2 80.14 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAATGCCCAACA:1 + chr3L 22221231 3' - 412 7119 2 62.33 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTGGAGATGAAAAGGGTTGCGGATCCACATTCACGCGGGGACACCGGAAGAATTAGACGGCAGGTAGGGGGTCGGAAAATTATAGTATAGACACCATCGG:1 - chr2R 6052550 3' - mdg1 7062 2 69.86 ATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGCGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCC:1 + chrX 22386800 3' - hobo 92 1 47.95 TTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACTCGTATATGTTGATGTGGGCGGTTGGGTTGTGAA:1 + chr3L 13597821 3' + blood 7303 2 78.08 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACCCAACATCATCGTAAACGTCAATTGCTCTCACCTAATCAATTATGTATTGCTCTGCTCTTTTAATTATCCCAAACCCACGCTGAGCA:1 + chr2L 11573740 3' + jockey 4956 1 47.95 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAAT:1 - chr3L 12863685 3' - Transpac 69 2 69.18 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTGAAATGAAATCAGCACATCACCTAGCTGTCAGCCAGTCAGTCTTGGTTTAAGCCCCTGCTTTTCCTTAAGCCAACAGTTCAGCCCCAGGTGCC:1 + chr2L 10937969 3' - mdg1 7048 2 69.29 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACGCATTGTGGCAAATGGGTAAATACCTAATTACAACTAAACAAGTACGATTGCTAATGAATATGCCTCCCTGAAAACCCATTTTCAAGACCTAATGCTCCTG:1 - chr3R 21924212 3' - roo 20 2 71.92 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAGGGCGAAGAAAGGTAAACATA:2 + chr3R 9163964 3' - hobo 45 1 54.79 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGTATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACCAGAGCTTCGGT:1 + chr2L 14970015 3' - Tirant 12 2 76.52 CACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAACAACAACAGAACCCTGAACTCAAGTGAAGTGCAGTGCTGTGAGTGTGGCCAGCGTTTCGGTGGGTCGCTTGTTGTGCGCGCAATTTCCGGTTTCCGGTTCCGCCGGCGCT:1 + chr2R 13623584 3' + S-element 1706 1 78.62 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATAGTGGAGAGTACAGCAATAATTTAGTTTAACCAGTCTTTTTGCTTTAATATTTTTTTGTTTTTATCTTATATAGATAGTTAGTTATAA:1 + chrX 12551840 3' - pogo 28 1 66.44 AGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAACAGATTCCTGGGCATGTATGTAGGTGGCCAAAACAGTTGTTAGCAAATAATGCTATTTAATTTAATTACTTAAATGGTCGCTTCGCACCTAAAA:1 + chr3L 24159064 3' + baggins 5225 1 51.37 GGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTTGAAAGGGTTAGGAAATGGGAACATGGGATGGAGATGGAAGGTGATAATCTATGTGATCTTTTGAAATAGTTCTTACAAAAAAAA:1 - chr3R 24479143 3' + 412 461 2 60.96 GAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGACTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCCACTTCAGGGCCACTAGTTTTCATCCTTAA:1 - chr3R 2689331 3' - diver2 4466 1 44.52 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTACAATATTACAAAAATATGTAGGTACAGAAATCGTTTTTTTGTGTGC:1 - chr3R 25822979 3' + roo 335 2 69.86 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTTTTTGTTTTTTTTTTGCCGTAGGCCAAA:1 - chrX 8082337 3' - roo 29 2 64.38 CAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTATTTGCATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACAT:1 + chr2L 11867362 3' + BS 4957 1 65.75 CAACACATTTTTCAAAAGTGTGGTCGTGTCAGTTTTGTGTGGTTTGTGGGCGTGACCCATCAACAAACTTGCGCTGCGTCTATTACATGCACTTTTAGGGTCCTAAACATTTTCTAATACATTTAATTTAGTTAGTGGTTGCTTGG:1 - chr3R 7269582 3' - INE-1 259 1 55.48 ACTCCGTGGCCTACGTGGGAACCCCTTCCTAAGGCTGGTGCTTCGCCTAGGGAACCTTAGGCCATCCTTCAGTTGAACACTAACCACTTTGAGGAAGGGG:1 + chr2L 18264370 3' + Rt1b 308 1 74.00 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAACAAAGTCACC:1 - chr3R 20137235 3' - Burdock 46 2 52.41 AACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACTATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAAAAATCACTAATTCTGTACATTGTATTGTATAAATAGAAAATATTGCAAAGCTAAGGAAATAGTTCAAACTACGCAATATA:1 + chr2L 17593199 3' - 1360 3218 1 52.74 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGACCCCGTCGATTCCACCGATGTCGCTGACTCTCGGAATCCGGGAGTCCCGAGTCCGCATCGCTTGGCTATTCCTATGCAGGAATTACGAAAGGTTGCGGTAAATAGC:1 - chrX 19498026 3' + P-element 2875 1 78.08 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCTACTCAATTTTCCTATACAAGATAATTTTCTTTTTTCAAAATAAAACCAGGATTTGAAGAACTTTTACCATTTCTTCTCCATGCATATG:1 + chr3R 4913676 3' - 1360 32 1 63.70 CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGGGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGGACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCC:1 - chr2R 544804 3' - HMS-Beagle 82 2 70.55 TAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTTCAGTGCAATATTTTAGGAATACATTAAATATACAGTACCTTTTCCTAGAAATTAGCTAAGAGTTACCTCCAATCATGGTTGGGGCAGGAGGACTTTTTACA:1 + chr2R 8527109 3' - Doc 4634 1 78.08 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGG:1 - chr2L 12481430 3' - pogo 65 1 62.07 TTGTTAATCCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAATATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTTTGCTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTAAATCTACATCCTGTGGCCATGTACACACTCTGCTATCTACCCATTGAGACAACACA:1 + chr3L 10380229 3' + G4 3517 1 61.64 GTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGCGGTGCGGGCAGCATGACCACCACCTGCATTCCGCA:1 - chr3L 11862588 3' - G2 2747 1 64.71 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGCACATTGCACTA:1 + chrX 15089574 3' - P-element 77 1 32.88 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATTACATTAAAAAAAAATTCAGATCTGGTCAGTGAGCTGGCTTTTGGCCTGATCCGTTTGAAGAGTGCTTATAGGAGTTATCGGGAGCTTATCAGGTGTTTAT:1 - chrX 3529689 3' - 412 17 2 73.97 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAAATAAATAAGCAAAATATTTGCTTTAATTTACAAGCATAGGGAAGGGAAAAAGAGACAGTCGCTCGACGTG:1 + chr3L 13204809 3' - jockey 60 1 54.79 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATGCTAATCAAAAATATTAAATTCGTG:1 + chrX 16853413 3' + roo 334 2 69.18 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACCTTTTCGTTCAAAGGGATTCCAATTCCAACTTCTGTGTAGGACGAAGTAATATTTTTGAAAAAATATTTTAC:1 + chrX 14136584 3' + roo 9024 2 48.63 TCTACAATGATTAAGGATAAGGGTATATAGTTTCTAATGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTCAATACCAGCCTCCACATAAACTTGCACTTTATCCAGTGCATTGGCTATGAAATCATCGTTTGATAGCTCATTCCGCTCCTGCTG:1 + chr3R 13186363 3' - Cr1a 4141 1 56.16 TATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTCTCAAGCCAATTAAAAAATGATATCAATCGTAATA:1 + chr2L 6074063 3' - BS 70 1 71.72 GCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATATATTTGTTCTGCCTCTTCTTTGTTTGCATGCACAAAAAGTAATGTCAATGAAATCATATTTATTTATG:1 - chr2L 19878151 3' + mdg3 192 2 54.79 AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAAACGCGCACTGTGG:1 + chr2R 14562293 3' + Burdock 6380 2 44.52 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGTTTAACTGAAGTGGTTAAATGTTACCGGTAGATAATTGAGACAGTAGAGTACTGTTACCAAGAA:2 + chr2L 21342362 3' - roo 8720 2 65.07 GAAGACTGTGGAATGTCGAATGTATCATGAATAGTAATCATGAATCTGAAAAGTACCAGCAACAAGTGTGGAATTCGGGAGCATTTTTGGGACACCCACTAAATACCTGAATTTGATGAACGCACACACACACAGACTCACGCATT:1 - chr3R 8367091 3' - Doc 3 1 77.40 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACTTGAGGCAATAAACAATAA:1 - chrX 18193704 3' + hopper 1359 1 57.53 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCACTCGACACGCAATGTCTTCTGTTCGTGTTGCGTG:1 - chr2L 19424662 3' - Tirant 8115 2 66.67 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTATGACCATAAGATCCCATTTATTAGATGCAACAAGCTTTGGAAAATATTTCTAGCCCCCTTTTTTTGTGCCACGCCCCTGTTC:2 - chrX 7293186 3' + 1360 3355 1 62.33 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGA:2 + chr3L 22221219 3' - 412 7131 2 70.55 AACATACACACACACACACACACTCATATATCGCTTAAGTGAAAGACTCTGGGCAGGGAGTTGTGGGGCGTGGGGCATTTGCCGACGGAGAAAACATTTTCCAAAAGGTCATTCACTTGTGGTCAAGTTCTTTCGCCTGGTCAAAT:1 - chr2R 18922878 3' + accord 253 2 71.23 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCGACAAT:1 + chr3L 22221223 3' - 412 74 2 67.81 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTTACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTCCGGTTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCT:1 - chr2R 16908466 3' + roo 9056 1 65.81 GATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAATCAACATCACATCCAACATGCTGGCCTGCATGCTTGTGGACACTAGTATCCGCAGTGGGGAGCAAGCAGTGATTT:1 + chr2R 13236255 3' - 3S18 5857 2 50.00 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCGTGCAATGCCAGCGGAGTGAAGGGAGTGACTTTCTGTTAACTGTTTTCGTTATTATTTTAGGGATAGTTTTAAAGATCGCTTTGATGGATTACTAAGCCA:1 - chr3L 52903 3' - roo 19 2 39.04 TGTACTTATGGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTAGTTCGCTTTGATAGTTAATTTTCCTATAGGGCTTAAAGTTATTTAAAGTTTCGAGCATTTCAAATCTATCTTTAAAAGCAAAATCCGTTTGTTA:1 - chr3R 7739639 3' - blood 7035 2 69.18 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATGTGTGAAATATAAATGACGATGCTGACGCCCGAATCTGGCCCGAATCAATAAGCCACTT:2 - chrX 8502160 3' + pogo 2046 1 58.22 GAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCCCTATGTAGCTTAGAGCTTAATGGACTTAGTGGCAG:1 + chr3R 5245647 3' + 1360 3320 1 72.18 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGAAGGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGACTGTACGGATCCCCGTAGAGCTCCTGGCACATCGTGTGACCCGTAA:1 - chr2L 16371524 3' - jockey 4786 1 77.40 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGAGAAATAAAATATAATTGCGCTAGTTCGTTATAGTATCATATTTATGATGGTTTGCATTTTGTTT:1 - chrX 23043113 3' - roo 8717 2 58.22 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCAGCTGGAAAACT:1 + chr3R 20147586 3' + 1360 374 1 65.38 CGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7229 2 88.78 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGAGAAGATTTTCGGGACGAAAT:1 - chr3R 22846673 3' - 412 31 2 65.07 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTCATTACACAATTTAAAAGAAATAGTTTGAAGAAATCATTCTTAAAAACTTTTCACTGTCAGTCA:1 + chr2L 21596584 3' + blood 7322 1 58.90 AAAAATAAATAAATATTTTGTGGTGGCGTTGAACGCACTGAGAATGCATTTAGATAGAAACGACTAGATGAATAACGGAAATAATTATTTAC:1 + chr3L 6398469 3' + mariner2 833 1 78.26 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAAACATAGCAAGCTATTACGAGAAAATACAAACAAATATATATATAAACTTCTGATTTCGAATAGAATGTGCAGATT:1 - chr2L 14008698 3' + pogo 2059 1 56.85 CGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATAGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCTGGCAAGTTGATGATAGCTACAATA:1 + chr3L 15099691 3' - G4 3805 1 62.33 CACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAATGAGGAA:1 + chr2L 18689258 3' + Gypsy6A_LTR 260 1 74.66 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAA:1 + chr2L 17069657 3' + 412 7497 2 52.74 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAGACTTTTGG:1 + chr3R 8402650 3' + mdg1 369 2 52.05 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTTTATACTGCAATCAAAATACATATGTACATATATGCCCATCGTTTTCGAGTGGAATTTTT:1 + chr3L 18835393 3' - pogo 58 1 60.96 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTACTATCTACAGATATATTCCAATATTGTTAATACCGATGTGTG:1 - chr2R 22671378 3' - jockey 4747 1 71.23 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAGTGCCGAATGAGATGAGAATTGTTAAACGTAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAA:1 - chr2R 6984398 3' - Doc 46 1 54.79 TAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAGTATTCGTGTCTGACATAATTCATTCATTATTTTAATATGAGGTGATATATGGAGGTCATTGTCTGGCG:1 + chr3R 10778756 3' + mdg3 194 2 53.42 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACTCTATAGCGATGGAGAGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGGTCTCCGTTTTCGGGTGACTTTCTCAAATGAAAA:1 - chrX 15814496 3' - P-element 49 1 52.05 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTACTATACTGCTTGCATATTCATAAGACTGCAAAATGA:1 - chrX 12893302 3' + Bari1 1683 1 69.18 CCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGAAAACTTGGGAACTGTTTATACGATTCGAATTACAAAGTTAGTCAACGCGACGTGCATTTTTATTTCGTGTCTTAAATAAG:1 + chr2L 3347578 3' - opus 251 2 55.48 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAAGCTTGATTTTTTTCTTAACCGATTTAATTGCATTTCTTTGGTTTCTTTCTGTCATAATTTCCTTTCGAGCCGCTTTCT:1 + chrX 983240 3' - 412 42 2 57.93 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCACTGTCACT:1 + chr3R 25521924 3' - blood 31 2 64.38 CACATTTTTCAAAACTGTGGGTGGCTCAACAAGCTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTCTTGTTTTATAGTTCCTGAATTATCGCTCGCGTTGCTTTCAGCAATTTTAATAAACAAATGCC:1 + chr3R 23871285 3' - INE-1 256 1 64.00 GGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGTTTGCTCTATACCTAGCTTGTATCTCGACAACACATTTACCTAGAAGAATATGTGTATTGCAGGTGTGTATCCTTGG:1 - chr2R 21227330 3' - mdg3 32 2 58.96 CATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAAACAGCAAACAATCGAAGACAAGCAACAAAATGTTGGGCAAGGAAAAC:1 + chr3L 11761462 3' - opus 449 2 67.12 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTG:1 + chr2R 6984434 3' + HMS-Beagle 212 4 60.69 ATATTTAAGTAATTTTTATTTTATAATGGTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAATTTTTCTATATTTTGCAGATGTAATGAGAAAAAGTTCCACGCAAGTCAAACAAAATATGCA:1 - chr3R 18331193 3' + blood 6924 1 55.80 CCACGAGAAGAAAACGTGCTCTGCTGTTTCGCTCCGTCCACTTCTGCACCATGGGCAATCATCCGCCTCCTCATGTCCAAAGCGCTTCACCAATCTAAGAGGAACTGGTTTCGATCTCAACTGACTCGTGATGCAGAATTCACGTG:1 + chr2R 20248085 3' - Rt1c 5106 1 60.27 ATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCTCTTCCGTCGCCTCTCGAAACTCCCATTCCATCTCTGATTAGCTTTTACAAATTGCAACAGTGTCATTTGTTACACGCACACACACACACACACACC:1 - chrX 12173676 3' + copia 4955 2 67.13 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGATTTTGATAAGTGGACAACGGCATTATTTATTTTTTTGTTAATCTGATATAGCATTGAACGTTTAAATTGATT:1 + chr3R 12363299 3' - jockey 34 1 66.44 AGTAATTAATAACTAGAAAAATTCTTTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACAAAAATCACAGTTTATAATAGATTTTATATTTTACGAATTTTGAAGTATTCTTAACAGAT:1 + chr4 112299 3' + G5 4701 1 59.59 CGGGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTT:1 + chr2R 9164919 3' - 412 79 2 68.49 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTATGCATGCCAGTGTTGTTGTTTCTGTTGTTGCTGACGCGTGCTCAGCCGAGTGAAGCGACGTCGAC:1 + chrX 17258318 3' - 297 6596 2 67.27 CTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACATGCTTCGATTCCCAATTTTCCTGTCAACAAAGCGCCGAAAACC:1 + chr2L 20429215 3' - Tabor 6983 2 74.66 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGCAGTGACAGCTTAATTTAATTTGCGCACAAATTTCCAAACTTGTGAGTTATCGAAATTTCCACATAGTTGTAATGAATTATGCAGCACCACT:1 - chr3R 17316011 3' - 3S18 31 2 63.01 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATAAGCGTCAATATGCGTTCAACCGTGGCAGAATCCCGCCGAGCTCTTCGAC:1 - chr2R 6585422 3' - pogo 54 1 61.36 TAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTATTCTTATCTACTATCTCGGATTTTATTTTTATGGCTTGAACTTGAACTGAAA:1 + chr3L 1549086 3' - Transpac 5076 2 65.83 GGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAACATTAATGTATG:2 + chr3R 16799800 3' - X-element 4684 1 59.59 GCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGACGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTTGCGGAACCAATAGAAATAGAAAACGCGGAAATATGAAGCGAAAAAA:1 + chr3L 26159773 3' - F-element 481 1 91.78 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACTTTCCACATAACTATATGGCCACCGTATTTATCTAGCGTGCAAC:1 - chr3L 16180908 3' + Transpac 274 2 69.32 CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTG:1 - chr3L 5514206 3' - Doc 94 1 68.49 TGATACGGTAGATTCAAAAAAAACGATAGCCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAATTAAATTTGCATAAGCACTAAATCAACACGAAAGGGGAACCCGAAAACGAAGAAGGCAACTCAAAATCCTGGCGAGCAGAACAGGATGTCA:1 - chr2L 2336329 3' - Circe 7294 1 63.01 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGGTGAGGGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTT:1 + chr3R 6103663 3' - Tirant 8170 2 63.64 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACTGATGCCTTTGAACGCTCTGCAAACTAATTTAATGGAAACTGCCATGTAGATGGTGGAGCCATTCATTGCACAACCCTCTTTGACCACTTT:1 + chr3L 22481361 3' - roo 29 2 64.38 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGGTTTATCTCTTTTCCTATATGATGATACAAAGGGGGTTTCTCCACCAATCAGACACAAATTGTCGTTATTGATTAAAAGCAATTTTCCTTTAATATTTCCTTTT:1 + chr2L 21192635 3' - roo 16 2 74.66 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGGATTCAGC:1 + chr3R 5087128 3' + P-element 2853 1 59.29 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCTCGAAAGAAACTCGAAACTTCCAG:1 - chr2L 16685341 3' - P-element 99 1 18.49 GGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAGTTGAAAGGGCACATTCAACATTATCAGAATTAGCTCGTTGCATAAAAGAAGCACTTAATCTCATTGACTGT:1 - chr3L 25323175 3' - Max-element 51 2 50.00 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGCCGGCGCTTCGCGTTG:1 - chr3L 21097114 3' - mdg3 60 2 56.85 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTTAGCGAGCGTTGCCACC:1 - chr2L 21237204 3' - P-element 50 1 51.37 TACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATCGAACAATGCCTAAAAATAGATGAAACCGCACAATTTGGCTAAAAACGCAAAAAAACTGTTTGC:1 + chr2R 17714410 3' + 1360 130 1 55.86 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTC:1 + chr3R 25521908 3' - blood 7058 2 53.42 TGAACATACATACATACACACGTTTTAGCTGCCACCTGCTCCCCCTTCTATCCTTGCAATGGACAACAATGGTTCTGCAGCCGGATTCGGAATGGTGTCTGATGGCAGCTAAAACGTGGGTAATCAGAGCATAATTGTC:1 + chr2R 20675499 3' + 1731 75 2 76.26 GTGGCATGGCACATCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGCAGTTATTTAGGCCAAGACATCTGCAATAGCATTTGTAGGTACTGGTGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGCGAAGTCATAAGGAGTGAAGCGATCCTC:1 + chrX 22727596 3' - Helena 14 1 64.38 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTGTAATCGAGTCTCGAACCGATCGATCCGATACGATACGATCGCAATAGCGCACAGCCATTGCCATCGCGATCGCCG:1 + chr2L 2703889 3' + copia 210 2 54.11 ACCAACACACACACACACACACACACACACCGCGCCCGAGCAACGGCAGTTTTAATGTATCCTTAGAATTCCAAACAGGTGAGCATACAACCCAAATTGTGAACACAGATAAGGCAGGATATACGTATAATAAATCATTGTGTTTA:1 - chr3L 13901593 3' + accord 7100 3 73.29 ATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGTTTATAAAGAAATAAACCATGATTCAATTTCAGAATGATGACACCCACAAAAA:1 - chr3L 707603 3' + opus 412 2 63.70 AAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGAC:1 - chr3L 16973327 3' + S-element 171 2 65.07 ATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTGAAAATTTGAATTGCAGTTAGGGAAAATGTTTCTTTGTGTTTGAAAACAAATAACATCTTCTCTACAAAGAAAATAGGGCTAAAGATATATACACATAGTGTTTAGCTTGCAA:1 + chr3L 22638917 3' - Juan 4098 1 75.34 CAGCGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACCGAGTATCTGAAGGGGAAGCTGCTCGAATCGCACAACCAAAAGGGTCCGAATACACTCTGAACTGAAATGATGAAT:1 - chr2R 18901067 3' + opus 7278 2 53.10 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTTGCTGTTGGTGCTCAACGGAATTATATAGACCGCATTCAGTCGGTTACGA:1 - chr2R 6187858 3' + Tirant 375 2 54.55 TCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTCTTTTTTTGCACCGATATCCAAGTACTCTCTTCCA:1 + chrX 4566231 3' - Transpac 83 2 77.40 GGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCGGAAAATAAAAGGAAACAAGAAACTAGGCAGATCGACTACAGAAGACAATCGGACTCTCGGGGTGGATAC:1 + chr2R 960944 3' + transib2 2449 1 54.11 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCATCGTATCCTTTTTATTGCACAAAGCATGAGCGCACTCAAAAAAGATTC:1 - chr2L 17747409 3' + Tirant 8437 2 66.44 GAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAGGAGGAGATCGCTTGAGCCG:1 - chr3R 14088576 3' + 1360 3307 1 75.34 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACAGCCGTTTATTTAATTATATTCAGGGTCATTGAGAATATTCAGCTCGAGAGCAGCCGTCAAAAACGAAATGTATACGCATCTTGTTAGACATTT:1 - chr3R 27502986 3' - hobo 23 1 69.86 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTTGAAAGGGTTAGGAAATGGGAACATGGGATGGAGATGGAAGGTGATAATCTATGTGATCTTTTGAA:1 - chr3R 24479162 3' + 412 442 2 54.11 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACCCAGGACCTGAACTGGAGCTCCTCGAGTAATTAAAGCACCAAAGCGCACCGCATCCATTGCAACAATGCGACCGG:1 + chr2R 10367591 3' + 412 473 2 65.85 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACGAATACCTGGGGATATTTTGCGAAAAGTCGGAGGGCAAAATCTATAAACATA:1 - chr2R 5992297 3' + pogo 2037 1 64.58 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCTATTAAATGTAAAAAAAAGAACTTAATTCTATGTAATAAATTATTGGTTTCAGATGA:1 + chrX 11228652 3' - roo 8728 2 62.33 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGTTTAATTAAAGGTTTAATATGTGGGATATGGCTATAAAAAGTTGGTTCAGGGGTACCGATATTAGAGACATCATTAGTAACTATAGAGGTTTTGGTGGTGTTTTAA:1 + chr2L 13884730 3' + pogo 2092 1 75.52 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGTTAGAGAAACTCGAGTGGTTTTTCATTTCGCAGGCGATTCAGTCGAGTGGAAAAAA:1 + chr3R 29709064 3' + blood 7326 1 59.59 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATAAGAAATGATTAAAACTCCTTAAATTTAATTGTAAGCCTGGAAGCTTGCCAGATTCTCTCTGCTGTCGACCGTTTTGATGGCAAATCAGATAAATATTTATGTTAATTAATCATTTA:1 - chr3L 10370823 3' - copia 4872 2 74.31 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGTATACGAACAAATCCACTCTTCTGAGAAATTATCGAGATCTCGTAAACAATTAGTTCTAGAAATTTT:1 - chrX 14756650 3' + pogo 2050 1 54.79 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCA:1 + chr2R 19543763 3' - jockey 4811 1 52.74 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGC:1 + chr3R 25521910 3' - blood 7056 2 54.79 TCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAA:1 + chr3R 15465598 3' + mdg3 5457 2 56.85 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCAATTTATGGCATAAATCATGCGCTGCAT:1 - chr2R 13276419 3' - roo 13 2 77.40 TTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTAAGGGCAAAGGTAGAAAGATATTGTCCTGATTATCCCTCCATAGCGTCCA:1 - chr2L 23371611 3' + Quasimodo 7240 2 67.12 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTCCACGCCTGACTGAATAAACTCGTAAACTTTTTCCCCTGCTGGCTGTGCGTGAAAAACTTTGTCAACAGATATTCTATT:1 - chr3L 5514173 3' - Doc 61 1 45.89 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATCTGCCATTCGAACGCCAGTTGCTCAACTCAGTATTTGCACATCTCACACTCAGGTGTGAAAATTATAATTGAATTCAATAAAGTTGTCGTGT:1 - chr2L 1449551 3' - opus 7140 4 66.44 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTGTTGATTAAGAGCCCGCTACACTGTAGCACACCAATGTATGTAC:1 + chr2R 6585568 3' + pogo 2089 1 77.40 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGA:1 + chr3L 9426737 3' - P-element 78 1 24.62 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAGCCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTAAGCTAATATTGATTAATTTTTA:1 + chr2L 15833130 3' - hobo 21 1 69.86 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACTTGAATCCTGGGAATCGTCTGGTTGTCTTTGGACGCCCACTTGACCCCGCCCCCGGCATTGTGTTGGAAAAATAGTTGGTTTCCA:1 + chr3R 28033712 3' - diver 5926 2 58.22 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGTCTGTTACTTTAAATAAGTTGGACG:1 - chr3L 3979579 3' + opus 7441 2 64.03 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGTATTTATACATAAAAAATTTGCTAGAATATATACATACGTTACAACTTCGCGAATTCTTCAGGCACAAGGTGCTGCCTTTCCAAA:1 - chr3R 14331138 3' - Burdock 6168 2 46.58 AGTGTAAATAAAACAAAGGAAACAAACAAAATCAAGTACAAACTGCTTCACAGGTGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGAGGATGGTTCGGGCCAAATCGAATTTGAAGAATTTACCACCTTGGCAGCCCGCTTCCTTGTGG:1 - chr2R 5066723 3' - accord2 7264 1 54.48 ACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTACAATCGCATTTAATATTATTCTTAACAAATGTAATTTATCCTTAAATTCTAGAAATTTTGCACGTCGTATTGAATGAGAA:1 + chr2R 23103951 3' - Stalker4 7088 4 45.89 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAATCGTCAAAAACATTGCCAGAGTGATTTGAACTTTTGTTTGCGGACATTTCAATTTTTCAATTTCCGGTATGTATGCTTAAAATAATAT:1 + chr3R 24810019 3' + 1360 3358 1 65.07 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGACTCGAAACGTCGTCTTCGCTCCATTCTGCCGACGCCTACCTGCTGTTCGGCACAGCTGATGTTCCGTGACGTATTCAGCACACACACAGTCGCA:1 + chr3R 5087143 3' + P-element 2862 1 68.49 AGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATTATTGTCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATAGGTCGGTGTTCTTCTGAAATATTTTCCTTTGAAACGTAAAAATAATACAAAATCGTTAAATGCAATCATTTT:1 - chr3L 8683531 3' + Idefix 7239 2 65.07 GACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAACAAGGCGCACTCCAAGGACTTGTGCATCCACGTACATACATACATATATGTTATGATTTCATGAGTTCTGACCAGGATGGTGATGGGT:1 - chr3R 30310470 3' + invader4 257 2 56.16 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTAGAGTAGCCACTCAACCGATAAATATTTATGTATGCTTATGATATCAGCCCACCGATATTTAT:1 + chr2L 12481535 3' + pogo 2058 1 53.73 TACGCATCTTGTTATTCTAGTTCTTTTGACGAAACTACCTATTACATAATTCTGAACAAGACGAGCAACCGAAAATGAAGAGGAATAATAAAATTAAACTAAGCTTTGTTATGCTCTACAAAAATGTAGCACATTCGTTGCCATGC:1 + chrX 22885311 3' - 1360 7 2 63.01 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATATTATTTCCGCACTATTCGGATTTT:1 + chr3R 21237851 3' - Doc 30 1 64.38 TTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 322 1 71.23 GAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATGATAAAACACCCGGCTAGGGTATTGCAAAGTGAAAA:1 - chr3R 17300353 3' + hobo 448 1 75.34 CAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGGTGGGTGTAGTGTATCTCTGCGCTTGTTCGCTTTCGTTGCTGGGG:1 + chr2R 23225877 3' - Transpac 5020 2 69.18 CGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCTATAACCCATAGCCCAAAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGATATGACATGAAAACAAGTCATTTTTCATTTCACATTACATATTGAC:1 - chr3L 21414424 3' + F-element 266 1 65.52 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGATTACTCCGCCCACACTTGTGGCAACCTGTAATCTCCAAAAATCACACCATA:1 + chr2L 3006184 3' - pogo 65 1 67.81 ACAACATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGAAGATAAGTACTTATCATTGGAATTATTTGTCACAATA:1 + chr3R 23449324 3' - roo 83 2 73.29 CTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGAGCTAAAACACTGATAAAAAATAATGCAAAAAAGAAATAAACT:1 - chrX 10960214 3' - Transpac 4994 2 69.18 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTCTATGTGTCTCGGTGTGCTAGTGTTCGAGCAAAGTTCGGCTGTTTGCGCCTGGGCGAG:1 + chr3R 8402642 3' + mdg1 7400 2 57.24 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGCGCCTGTGTGCGTTCAAACTTTTTGCTTTGGCACATTTCGCTCGGTGTTTGTT:1 - chr3R 10079300 3' - P-element 68 1 39.04 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACCTCCACTTTAT:1 + chr3R 23426494 3' - pogo 43 1 56.16 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTCTCTTGCATCGAAATGCGAAACAAAAACATTCCAAATTCAATTGCAAATTATGCATTTATTATTAACAATTGTTGTCTG:1 + chr3R 15590102 3' + Transpac 5210 2 73.29 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTAAGTGCACAGCCTATATTATTTCCGCACTATTCGGATTTTAC:2 + chr3R 21237853 3' - Doc 28 1 65.75 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCGTGCAATGCCAGCGGAGTGAAGGGAGTGACTTTCTGTTAACT:1 - chr3L 52992 3' - roo 77 2 70.55 AAGTAGAAGGTATTTACTTTGTATACAAAAACTTATAATTAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGAATAATTCGGGACTTAAGCCTAAAAAGTATAACATTTAAATAGTTATTTCCTTCATTCAGCCATATTAAGATAAATCACTCT:1 - chr3R 10450695 3' + Transib5 283 1 56.16 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTATGTACAAGTAAAGTGTATGCAATATGAATGTAAAAATTGTTTTTGTAGATATATCACACATTATAAAAAATGTATG:1 - chr2L 1229556 3' + opus 459 2 55.48 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATAAAATATTCAGAATAGAGTATAGTTCCATATAAAAAGCGCAAGTGGAAA:1 - chr2L 17228625 3' - mdg3 5326 2 67.12 CGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGTTGGACGCAGACTATATACATAGCAACTGCTGTTGCGCT:1 + chr3R 25876956 3' + mdg3 178 2 61.64 GAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATGAACAGACGAGACGAAACGTCCATCTGTTTTTTCAAAAGCCTATTTCCTGTTTCAGTTAAGGGCTGGATAATGATACGATATCATATAGCTACCATGTGAATAAACTTAAA:1 + chrX 22859004 3' + mdg3 5490 2 76.71 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCCTTTTACCCACCAGTTCACCAGCTAACCACCCAAAACTACCCACTGCATTCCGGCCTTGCCAACAACTTTACTATGCCAGACGACCGGCGGCAGACAATTTAAAGAGCTGCGGCGG:1 + chrX 3524372 3' - roo 1 2 78.17 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCT:1 + chr3R 23507653 3' - 412 7137 2 74.66 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCA:1 - chr3L 13597765 3' - blood 81 2 73.97 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTTCTCTTCAATTGTCGAATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCCGTGGAGAGGAACACTCTAATGAGTCTAAAATAATCTTTTGTAGTGCCCGGCGACT:1 + chr2L 13244938 3' - hobo 15 1 75.34 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATTGAGGAACTCCTCCATATACTTATGCGGGCAGGCAATCATTTACAAGAATCAACTACATTTGGGCGCGCCAGTGATATATGAAG:1 - chrX 14385127 3' - blood 7048 2 60.27 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCCCAGAATACCATATGAATATATGGTCGCTTGTAACTGGTCAT:1 + chrX 14692928 3' + Transpac 236 2 72.92 GCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGGAAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACTCGTTATTTTCACTACCCATATAATAACGAATTCAATACC:1 + chr2R 6247964 3' - Cr1a 341 1 72.60 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATATTCT:1 - chr3R 4722351 3' - roo 8696 2 62.33 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGGGCAGTTTTCTGCCTAAAACTGCGACCTTAAATTTTCCACTGAGATATATATAAGTATAAGTATACGCATGCCCTATGCCAAA:1 + chrX 9951459 3' + hobo 2900 1 54.96 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGACTTTTAGTTAAATCTTGGCACATAATGAAAAAACATAAATTAATCCATTTTTTATTTTAACTAGGCATGAAATTGTATAGCTTTTTATCTGAATT:1 + chr3R 20452318 3' - blood 7037 2 68.49 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACAATGTAATATGCTCGGGGCTGACGCTTATGCAAATATGAACAACACATGCCGGA:1 - chr3R 15514526 3' + 412 425 2 65.03 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGACGATGCGGTG:1 + chr3R 26399878 3' - roo 8736 2 72.60 CAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGC:2 + chr3R 6842661 3' + mdg1 325 2 72.60 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACTATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGACTACGCC:1 - chr3R 20292404 3' + pogo 2057 1 56.16 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGAT:1 - chrX 16853344 3' - roo 8744 2 73.29 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTATATTGGTCAGTTATAGTTTTTAATGGTTTGTAAATTCGCAGAGTACTAATAAGTTTGATTGGTGTTTCGATTT:1 + chr3R 20292541 3' - pogo 44 1 55.17 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAACGACGAGTTGATCTATTTCCG:1 - chr3R 16194084 3' + mdg1 7435 2 68.49 CAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAATATACAAGTCAATTTTTAGAATAGATATTGGGACTAAGAATATTCGGTTATATTACA:1 - chr3L 13345946 3' + F-element 4605 1 60.96 ACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGA:1 - chr2L 17198050 3' - R1A1-element 5046 1 52.71 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCCACCTTAAGCTGCAGAAATATTTCGGATATTTTTCCC:1 - chr2R 23225799 3' - Transpac 81 2 73.29 GGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATAATAATTGACTACAGAGCAACAGAATAGGAATACCTGTTGAACAGGCAA:1 + chr3R 6842663 3' + mdg1 7365 2 71.23 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTTCGTGACTGGAATCTTTTGAATCGCTCACAACCCGTTAGAACGGCTTCCATTTAATTATGCCTATTTTTTATATG:1 + chr3R 6103691 3' - Tirant 8156 2 53.42 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCAC:1 + chr3R 23507659 3' - 412 7131 2 70.55 AAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATGACTTTTAAGCTTTGTTAAGAACATCAGTAAATAATGTGTAAATTAGTAGTGCTTGGCATCTTGA:1 - chr3L 21630308 3' - Burdock 6189 2 55.48 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGAGTTGTAAGTGTACTGGTATTGTCTGATGGCAGTTGCAGACAGTTTCGGTTCTAACCTTCAAACCCGATTAC:1 - chr2R 982300 3' - HMS-Beagle 6840 2 55.48 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATACTATACAGGCAGCGCCATCGTCTTGTTGTTTCGCAAATATTTGCCTTTTTTGAAGTTGATTTTTGGTCTCCGGCTGAGCGCCTTTTGTTGCCATCTCAAGTTCTCAAGT:1 - chr3R 24455296 3' - 297 6586 2 78.77 TATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAGCTTTGGTTTAGGCTTTTATTCAATTCAACTAC:1 + chr3L 16329440 3' - copia 236 1 77.40 CTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAAGCTGCGTAAGTCCAGTGTGCAATGGTGAAACTAATGTCTACACA:1 - chr2L 18235416 3' + F-element 4600 1 69.86 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGTCTTATATAGTACATTTTATTGCTATCACAAGTTAATCATACACATATACCGTCGGAAAAAACAAACTAAA:1 - chr3R 18665236 3' - 1360 48 1 56.16 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTAAGTTCGTTAGTAAGTTCATGTAAGTAGTTTAAATTTTACCAATTTAACAGTTAAAGATGACTAATTAAGTAGCAACAAATTATGGTAATTTAAATTTTTAAGCTAGAGTTATCCC:1 - chr3R 13494276 3' - opus 113 3 62.33 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATCGGTCAAATAAAAACTGAAGTGGTACCAGGAAATGCGAAAATAAGTGTGCACTTAGGATAAAGCAAAGGCATCCTAAAACCTCCAGTTCAACTTCAGATATATGTACC:1 + chr2R 22692479 3' - Ivk 15 1 73.97 AGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAATTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCACTTTCCTCTCGGATCAAACCATTCGGATAGATCTCCTTCAATTCATTA:1 + chr3R 8511044 3' - 297 6930 2 66.90 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTTTTCCCCAGTGTCTAGATTTTGGCCGGGATGCCAAGGGAAAGAGCTCGGCTGGCCAGCTGC:1 - chr3L 4869149 3' + roo 9033 1 52.76 AAAAAAACAAAAAAAAAAAGGAAACGAAACCTATGACACGACACTGTTTTTTTATAAACAGTTTTCCCTGTCAACAACATCA:1 + chr2L 20471825 3' + Doc2-element 224 5 78.05 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCCCACTGGTGTACAAGATGGTAAACGGAGACAGAATTGCCTTGGACTAGGTTTCGATTGCAAATGGAATTTTGGTACAAACACAGCGAGT:1 + chrX 10979130 3' + roo 9039 1 58.22 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGAAACTAACAGTTGATTTCACGAGGAGTGTCA:2 + chr3R 20905520 3' + pogo 2077 1 69.18 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAAGTGTCTGCTAAAAATTCAACTTTAAGCTAAAGCTCAACGAGACTTTGACTTGGGAAGTAACCACTTAATATTTGAGACCGTA:1 - chr3R 16771311 3' + roo 9033 1 59.59 GAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGTCATCAGGCAGGCCTTGTCCACGGGCTCCACCTTCTTGACCGCCTGCCGCACCTGGTCGTAGTC:1 - chr2L 1164738 3' - FB 450 1 55.56 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAATTTCGCGGTTATACGGTCGCTATCTCCGCACAGACGCACGAGATTTTTATGGCGAAATTCCGCGAGCAAAAACTTTCAGATATGTTCGCATCTAATCATTTTTC:1 - chr2L 20824859 3' - pogo 13 1 77.40 CATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATAT:1 + chr2R 10163614 3' - Juan 4163 1 80.14 GAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATATTTAACCCGCCTCGAGAGAGTGTGCACTCGAAGCT:1 + chr2R 5900906 3' + Bari1 1625 1 75.34 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTAGTTTTCATTGTGACGTACTTAATAACTGCGAAAAAATATGGTTCGCAACGGAACTTGTGCTTTTCACTTTGTAAACTTTGAAGTCAAA:1 - chr3L 5183668 3' - copia 33 2 63.01 GTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAA:1 - chrX 10873829 3' - mdg3 75 2 76.03 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATCTTTGAACCAAATAATACCTCTCATTGGCGTAAATTGTACATTGGTTCTGGTTTCCTGAGCTTTTTTTGTTTT:1 - chrX 8082356 3' - roo 48 2 51.37 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGGCAAGGAGTGCGAACTTCAGCCAATCGATAAAAGTAGCTGCATATGCAATCGAGAGGGACCGAAAACAGGGCCAAGCATTTCCGCTATCTATGTA:1 - chr3L 12863640 3' - Transpac 24 2 67.12 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCAAATGATTTTCAATTGTTGCTGCATTGACAATTCACCAAATCGA:1 - chr2R 20500054 3' + 412 417 2 71.92 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCG:1 - chr3L 9571673 3' - jockey 91 1 75.34 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTGTACATTACACGAATCATACACTTGTCCTTTAAAAGCTATAAAGTGGTTTTAGTACTCATACGCTCAAT:1 + chr2R 8862147 3' + pogo 2046 1 56.85 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACG:1 - chr2R 10367498 3' - 412 7137 2 74.83 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATACTTTCAAGAAAGTATTTGGTATTTTGATTTAAGCATAACAGAAGGAAATGCTTATACTTGTTTATACTATAAATCCAGTGCA:2 + chr3R 31956525 3' - pogo 36 1 60.27 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCAGTATAATTAACTTCTCGTAGTCATGCAGTTACCTTTCGTA:1 - chr2R 15080030 3' - roo 81 2 74.66 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGAAGAATTCCATCAAGCAGTTTACAATTATCTATCCCTAATCCTTAACAAGATCGGATGTATAGGATTAAGAAATGTACAAGTATAT:1 + chr2R 4996665 3' + transib2 2791 1 63.01 CAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCATGGATGTGGGTAATGACGATTTATGAT:1 + chr3R 14088627 3' + 1360 3301 1 78.77 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGCAGCAGCCGCATTACACGCCGTCA:1 + chr3L 5490937 3' + 412 452 2 53.33 ACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGTTTAGTATCAATGAACCGAAAGTTTTGTATGT:1 + chr3L 14043630 3' - Ivk 51 1 52.05 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAATGATTAATTTTTGCTTCTAAGATAACCATATAGTATCATTTAATTTAGCAAATCTTAGGGTAGTTCATCTCCCGATCTCTTTGCCTTTTCTGTAATTCAAGATAATAT:1 - chr2R 13849582 3' + roo 9058 1 71.92 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCATTTAAATATCGATATCAGTATGGCAATTTGATTGAGTTGGGGCACAACGGAATATGGAATAACCACGGT:1 + chr2R 11656157 3' - HMS-Beagle 16 2 74.66 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAATTGCTCTAGTGCGGCGTTGCTGGGGCTG:1 + chr3L 8253701 3' - jockey 4711 1 77.69 GTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTCGGATTGTCGGTGCTCTCCGGATGAGGATGAAGAGGCCACTGCCGCCGCCGCTGCCCACGATCCGTTGCTCCCGGC:1 - chr2R 20311158 3' - F-element 320 1 52.94 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTTTTGTTCTTGGGAAAACAATTTGTACATTGAGGTCTATCCTGTGATATCCTTATAA:1 - chr3L 19396974 3' - F-element 20 1 75.00 CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGGCGAAACAAGCTGAGACACTTTACGCTTGGATGGAGCG:1 - chr2L 21936053 3' - INE-1 17 1 43.15 TGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGCTATTACTTATTACTTATGAGCTATTACTTATTACTTATTACACAACTGCGTAGGAATGGCAAACGTCTTCAAGGAGAGAGTCAGAGATTTTCATTTGTCGTTGGTGTTTTTTT:1 - chr2L 10784757 3' - Stalker2 180 2 48.63 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATGTTAATTTTTATTTAAATTTATATTTTCCTAAAGGTAATTAATTTTGGTATAAAAATATTAATT:1 - chr2L 17162759 3' - blood 57 2 56.85 CGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTCATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTCGGCCAACTTGTCAAGCAGACGGTCGCG:1 - chr3R 14789284 3' - 1360 41 1 68.69 CTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCAT:1 + chrX 21772472 3' - 1360 3193 1 63.01 GTGGTCTGATTTCAGATAAACATGAAAACCTGCTTTTATATAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTTGCAGTTTGGACAGTGACGGACAGGCGGTGGGTAAACTA:1 - chrX 9487224 3' + Cr1a 414 1 73.29 GGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATACATATAGACAAGTGCAGAAGTTTGATGGCTTAACCCTTTTGAAACTTGTTTAGCCACCACCACTGGGCC:2 - chr2R 10478665 3' + invader4 3033 2 53.42 CCCAGTCGAAACTTGGGGTCTGGCGACAAGGCTGCGGCGCGATGGCTGTGCCAAGCGACGATCTTTCCGGCTTAAAAAAATTTTTTAACGGAAAAGAGTTGGTAAAATGAATATTTTTAAGAAATATGTCATAGATTGCAGGCC:1 + chr3R 14810821 3' - Gypsy12A_LTR 416 1 60.42 GGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAAT:2 + chr3L 21093237 3' - Ivk 58 1 58.22 AGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGTGAGCAGCAAGAAAA:1 - chr2R 20382495 3' + Bari1 1635 1 67.12 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGACACCAACAAAAAATAGTTTGTTCAGTGGTCAACTTTTTTTCCTCCATATTCAACAGCCAAATATTCATGAAAATATCACATACATTTGTTT:2 - chr2L 12261123 3' - jockey 35 1 65.75 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGT:1 + chrX 21668885 3' - mdg1 6 2 78.77 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGCTCTGGCTCCTTTGTGTATTTGGCCGCCAGGACGCAGGACGCGGAGGACCAC:1 - chr2R 10367480 3' - 412 69 2 63.70 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGGATCTCTGAGCTTTGGCAACCAAATTTTCGTGGGCGTGATGTTCTTC:1 + chr2R 9164923 3' - 412 7128 2 67.12 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGGAAAAATACAG:1 + chr2L 17069640 3' + 412 427 2 64.38 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGTAGGAGATGCGATTCCGACACTTGGTTTTCAGTGGAAACACTCTTGTTATATAAGTGGATA:1 - chr3R 7884536 3' - jockey 4818 1 59.31 GGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAATGATTGATTGACGGTTAATGCGTTCGAAAGTTTAAACAAAAACATAAATCGAAAAAGGCAATG:1 + chr2R 11449757 3' - gypsy4 6512 1 56.85 CACGCTGAATACTCTAATGACAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTTGAATTTTTTTTTGTGATATATTATTGTTGTTGGTTGAGCGATTTATGTCGGAGATTACGTGCATTTGCCTTGTGGTCTCGCCCATCGTCGCCTTTCAAT:1 + chrX 13503341 3' - 1360 408 1 54.79 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATTTTTATTTGTGCGCCGTTTTGCGTTTATTTTGCTGCCAAATTCGGCCCATTCAGATCCCTG:1 + chr2R 6585525 3' + pogo 2046 1 58.22 ACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTAGGGACCAGTAGCACCACAACAACGAGCACCACATCGGCCACCCTGCCAGAGAGCACTGTATCTACAGTGGCTCCTAC:1 - chr2R 19647128 3' + Juan 26 1 53.42 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATTGTTCGCGGAAAATCGTAGTCCTCTAAACTCCCCAGCTGGGCAGCTGTTAAAAAAAATTCTTGGAAAA:1 - chr2L 17730412 3' + pogo 2051 1 52.05 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTCGCGC:1 + chrX 19162709 3' - pogo 36 1 60.96 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGAAAATAATGGGAAAAGCAAAAATAAGCGTAGTCCGTTAAAACAAATGA:1 - chrX 13061719 3' - mdg3 75 2 65.75 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCGTTCTTTATAAGAATGTAAAACATTGGGTGCCTATTTGCAATATCTG:1 + chr3L 11953846 3' - jockey 4745 1 69.86 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTACATTTTGATGTATTCAGGAATGACCACTTCCTAAACTAAAGGCTTTCGTTTTCTTTCAACAAACACTAGCATTCACTGTATT:1 + chr3R 6053090 3' - Quasimodo 31 2 65.07 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAAACCAGCAAAGAAGTCACTTTAGCTTTGTTTCTTAAACCTGAAACATAATGATTTCAATAAA:1 - chr2L 19903365 3' + Transpac 253 2 57.53 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCTAGTAGACCTGCATTAACAACATTAACGAGTTAACCGGGACATCCGCCAGTCTTCTGCCGAGGCCTACAAACAC:1 + chr2R 6168357 3' + 1360 3341 1 52.74 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCTCAACGCAGGTCAGCAGAGCAACAACAGTAAGCGCCGTAGCTAACAATAAAAACAAAGGCCAAAAAAGAACCCAACGAC:1 - chr3R 16194101 3' + mdg1 7418 2 56.85 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAATGGCAACGAGGACAATGCACACACACAGACACATATACACAATCAAGCCAAAAAGAGGGAAAGAAACACAT:1 - chr3L 14898864 3' - jockey 58 1 54.11 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATATTTCATATTGAGGTATCTGGGGATTCCTTTAGCTCAGCTCTTAAATATAAATCATATGTACTAGTGGGTCACTAGTTTT:2 + chrX 2873474 3' + roo 9029 1 56.85 AGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGGACAATCGGGTTTCAATTGGCCTGGTCTAAATCTGCTGCCATCGAATCTGGCCGGTGAATCTGC:1 + chr3R 25384287 3' + mdg3 5443 2 53.79 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCATATACCCACCACTAACCCATTGTCTGGCTGCAGGGTATCAACGGAAATCCAGCGGCGAAAGG:1 - chr2R 20704131 3' + hobo 2935 1 68.48 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATACTATATGTGGAGCAGATCGAATAAGATTTAAATACAGATATAGATACAGATTCGCGCAGCTGTCGGATGTGCTCAGGCAATTAGTTTGTTTTCACTTTGACA:1 + chr3R 15465620 3' + mdg3 227 2 71.92 TATATTTATTATGACCAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGTGTAGATTAGTCTATGATTTGCATGCAATGCAAGTGCAATTATTATGCCAAAGGTGACCAGTTTTCGTCGATGGT:1 + chr3R 19267726 3' - Stalker 74 4 56.85 CAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTT:1 - chrX 292440 3' + G3 4494 1 74.66 ACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCATACTCAAGAATTTATTACCAGGTATCTTATAGTTGAGAAGCCCCAGCATAGTGGTTCAACTTGTTACCGTTGAGGATGGGATGCTG:1 - chr3L 15189823 3' + R2-element 3528 1 52.41 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATAGGCCACCAAATTAAATGCTAAATG:1 + chrX 16853389 3' + roo 9001 2 82.35 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACATGCCGGGAACACAAACAAACCGAATTGGCAAGCCCCGTTTCAAAGTCAGTTTGCAATATTTCAGCGAGCAGATTAACAGGCC:1 + chr3L 14581508 3' - pogo 27 1 65.47 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGTTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTC:1 + chrX 13651585 3' - 297 42 2 55.48 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGCATGTCTG:1 - chrX 15089448 3' + P-element 2870 1 73.97 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTACTCGAGTATCTGCGTATCTCTTCAGTACCTGTAGTGGATTATATCTCTACAGATTATTACGATACGCTTGTTCTAGCTTGTTTGTCGAGACTCTACAGATTT:1 - chr3R 11121653 3' - copia 16 2 70.55 GTATTAGAATATTAACTTCAGTAAACGGCGGCTAAATAAGTATATTAAACATTTTAAAAATTTAAATAGCAAATTCAGCTCATAGAGAGCCAGACTATTTTTAAACGATTGCGTTCTTCTCAATTGACTGCTAAAATCGAAATTTG:1 - chr2R 10453308 3' + mdg3 232 2 63.70 AATAAAGACTGTTTCAAGCATAATTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAATGGAGGAGGTGGCTTATACAATTTAACGAATCTGTCAACCTG:1 + chr3L 778753 3' - Cr1a 4027 1 67.80 TCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGAGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCGGTCGTACATCGTTCGTTCGCATTTAATTCTCCCATTCCATTCCATTTCCCC:1 - chr3R 24231250 3' + opus 7178 4 62.86 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGACATCTAAGGGTCTTACAGTGGGCTCAGTGAAAAAACGGATAAAGGTTTTGATTTAACGTATACTTAATATTTCGCAACTCA:1 + chr3R 25521916 3' - blood 39 2 58.90 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCCGGCTGTCTGATAACGAATTTCCATGACTATTAGCGGTAGTCTTCCA:1 - chr3L 9430579 3' + P-element 2813 1 37.67 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGCTCTACTGAAATCACAGGCAATTGCATCGGCCAACTCAG:1 - chr3L 22481248 3' + roo 327 2 76.03 ATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATGTATATGCCAACACCCCCAATTGAAATCTTCGGCTGTGCGAACAATTCATCAGATGTCGCCATATCATTGCCTGTG:1 + chr3R 11461892 3' + 17.6 472 2 68.50 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGGGTATACCACAATTAGGTGGACACGTGCATGGATTCCCATTTCCCATCCTTCTGAAGGCGGTACTGCACCCGATCCGCGATTTGGTCGAGACCCACCTTCAGG:1 + chrX 8272564 3' - roo 17 2 70.55 GTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAATGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGGAACCAGTAGAATGACTCACGGCAAAA:1 + chr2R 16312081 3' - G6 2011 1 79.23 TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAATAGCCCTTTAAAGTCAAAATAATAGACAAAGACCGAGTACAAGGGACTTTTCTCCGAGTGCGTTCGAAGCCAATA:1 - chr3R 26765073 3' - mdg3 48 2 50.68 TGCAGTTTACGGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGGTGTGTGTGTGAATGTAAGTGGGTTTGTGACAGAACAGAAGGCCAAATGAAATCTGAATATATA:1 + chr3R 11520013 3' - Rt1a 66 1 58.90 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTAAGGTATATAAGGAACTATTTCAAACTTGTGCATAAATACCAAAATAAACAAA:1 - chr2R 16410012 3' + opus 435 2 65.07 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAGATGGCATGCAGC:2 + chr3L 9426750 3' - P-element 81 1 30.82 AAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAATATTAACAATATATTCTTTAAGAAATTGAACAATTTTAAATAAATTATGAGTGACCCTGTGTTGTGTAAAAT:1 + chrX 4939021 3' + 412 7408 2 60.27 ACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAAACTCGTTTAGCAGCTAATTTGTCTCTTGCCCGACGGACAGTTCAATGCCCCGCTTTTCCCAGGCTGCCAGTCAGCCAGCCAGGCAGTCTGCCAGGGTC:1 - chrX 15147581 3' + R2-element 117 1 52.74 TTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTGCGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACTTCAT:1 + chrX 23108345 3' - BS3 1448 1 48.63 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGATGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAAAAGG:1 + chr3L 3979681 3' - opus 168 4 57.53 GTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTACCAATTTCATAAGCTTTCGCTTTAAAACCAGCTCTCTAAGCAAGATGAGTTCC:1 + chr2L 5986154 3' + 1360 233 1 63.70 CGAGCCGGATATCCTGGATTTTTCAAGTTTGTCCTTCAGCGACCAACTTATAAGATAAGTACGAAATCTCCATACCCTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAGGTTCGAACATCTCCCTGCCGTTTAAAAGTTTTCGCAAATCTGTAA:1 + chr2R 6942664 3' + GATE 284 1 76.71 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGAAAGTCAACAAAAAATAAAATAGCCATAAAAGAAAAGTGAAAGTACTAACAAAGCATAAGCTTTGGGAATTCAGTAGCCAAAGAGGTTCTTGCGTCGCGTC:1 + chr3R 16194263 3' - mdg1 7057 2 73.10 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGTTCCTTCGCCCACTGGCGCACTGCATTTATTAAATTTCATTTCATTTCAGCTCTATACTCATGTTTATTTTACAGCACACT:1 - chr3L 13597723 3' - blood 39 2 59.59 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCAGCATAGCCAATCAAAAATTCAGCCTACGCACTTGTATCTCTACATTTGTATCTCGGCATTTGCATCTGCCTGTGGCAGAGGACAACC:1 + chr2L 14970004 3' - Tirant 36 2 60.69 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTAAATTGTGTGTGCGTTGAATAGAGGAGATTACAATTGTTTGCATAAGCAGGGTACTAGGTGACAAGTATGGC:1 - chr2L 12481410 3' - pogo 46 1 51.37 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTTCTCCTAAAAGTACTCGTTTAGTTTGTTAATGAGATCCCAAAAGTATGCTAC:1 + chr2L 19417101 3' - BS 5030 1 64.38 ACAATGCATGAGCATACGTGTGTACACACAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGATATGAGACTATGAAGGTCCTATAAAAACAATTACAGTTGCAGAGTATATGAAATCATGGCCTGATCCATTCGAGGCGAATGT:1 + chr3R 1061575 3' - 1360 185 1 60.96 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGGGAGTCGAGTGGGAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCACATAAAAATGCCAACATTTGAAGCATA:1 + chr2R 22867483 3' - hobo 46 1 64.36 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCC:1 - chr3R 14049348 3' - transib2 78 1 69.86 TAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGATAGGGAAATCACTCGCTTTGCTGCTTGCA:1 - chr2R 6579526 3' + mdg1 331 2 79.45 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGGTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTG:1 - chr3L 20747089 3' - Burdock 6190 2 57.34 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCAATTGATTTTGGTAACTCTATTACCTCCTTTTATGAGAATTGT:1 + chrX 14908456 3' - blood 7090 2 69.86 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAATATTATTACACACGCACACATAGGGGATTACATACAGGGACTTTCGCAAGGGCAGGCAGTCAAATTTTTCGTGCAAAGTTAAC:1 + chr2R 20362322 3' - diver 33 2 59.71 GTCTCCTTTGTGCACGCCCCGTTACCGTTCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTT:1 + chr2R 2994312 3' - gypsy8 4800 2 54.35 TATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAAACGTTGTGTGGGAGGAAGTTCATTTGTATGCGCAGAGAGCACACAAGAGCGAACTAAAAAACAATTTGCATACGAAATGAAAAAAAGACGCGTGTAA:1 + chr3R 7668775 3' - copia 5036 2 63.89 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATCAAGTTTGATGGTAGGAATTCAAATGACCAACATTAAAAATCAGTTTAAGAGTGCAACTTTCGACGCGCGTAAATCGATTTATCAATTGCGTTTAAA:1 - chr3L 4467746 3' - pogo 19 1 73.97 TGAATAAATTCGGTTTTGTTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTTTTTTTCGCAGGGGTACCTATTATGGCAGTGGTAGTGGTTGGGGTCTCGGGGGGAATGGGGCGGTATCGGGAGAA:1 + chrX 1082829 3' - McClintock 335 2 53.47 AAAGCGAACGGTCGTATTTTTTTTTTGCGCCCCGATTTTTTATTTTGTGTTTGTCACTCTTCCCTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCTC:1 - chr3L 8285368 3' + Cr1a 10 1 65.07 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGA:1 + chr2L 16685399 3' + P-element 2830 1 44.29 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATTTCTGGCCAGGTCCGATCTTCGTCCTCCTATCTGCCGTTCTCCTTTTGGAGC:1 + chr3R 10468137 3' - opus 139 4 67.81 ATAGTACAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCAAGAGGTATGAAGTTCTTTGACCACTATCACGAAGGCGCATTGCGTTCGGCATTAGAAATCCTGACCAACAATCATCT:1 + chrX 13825360 3' + Tc1-2 60 1 51.72 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATTAATTTGAGCTTAAAGAATAAACTGTTATCTCAGAGGTTTAATAACATGTTTCTTTTCTAAAAGGCTCTTA:1 + chr3L 3979687 3' - opus 7052 4 49.32 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTCACTTTTTCCCTTTGACAGCGACGATGATCAGGATTCATATTCAATTTCGGGTTCAGTTGAAAGTTTTTATAGTTGCTGGCAGTGATTTGT:1 - chr2R 16908453 3' + roo 9052 2 64.18 CTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTCACGATTACTTAATATTAATGACGCCAGGCTGTGTGGTCACTCGGTGGCCATTGG:1 - chr2R 21232174 3' + mdg3 16 2 62.33 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATACAGTCCTCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTT:1 - chr2R 11379739 3' - jockey 89 1 72.34 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCTTCTTAGCTAGAAGCAAGTGCATAAATGCCAGGAAAAACTGCTGAAAAAATACAGAACTTTGCCAACAGCAACAATCGCGAA:1 + chr2L 17069667 3' + 412 455 2 59.31 ACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGCAAGTAAATGCGGATAAG:1 + chr3L 25232914 3' - GATE 74 2 60.69 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTGGTTACGGGGCACATTTAAAAGCGATAAATCACGGACTTTTTGG:1 - chrX 3524233 3' + roo 8995 2 71.92 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTCTTAATTAACTGAAATCGCATTCATAATTTCCCTGCCATCTTGTGTG:1 + chrX 685386 3' - BS 5070 1 66.44 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGCCATAGGAGTTTCTAATGAGAAAATAAAGTCCTCATAG:1 - chr2L 20984269 3' - blood 7042 2 61.64 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGACAAAATGTCGCACTTGACTTGACCCAGAAAAACATTCTCATTTGCATATTTACATTGCCTATCTGGATGGAATTTATTGTTGCTATTCCTGTCGAAAA:1 + chr3R 10288937 3' - copia 23 2 67.12 AACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTGCTGCTCTGGATACTCAGGACTGGTATTAGTTAGTGATTGGTTTCCTCTACTCGTAC:1 - chrX 12893337 3' + Bari1 1648 1 58.22 CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACACCAGCCACGGGCCAGCAACAAGAACAAAAGCAGC:1 + chr3L 5490914 3' + 412 403 2 76.71 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGGGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACACGCCACCTAGCGACAGCTAGCGGCAACATCCAACTCATCGCTAGCTG:1 + chr2R 19543773 3' - jockey 4801 1 54.79 AGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAATGTACACTTAATTTTTTAGTAGGAAGTGAGGTCTGTGACACCTTCTTTCGAAGTAACTAATTTTAAAAGTAGACTT:1 + chrX 19231782 3' + mdg3 5074 1 56.16 ATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCAAAACCTAATACGAAAGCCGATACACCCGCATTAGTCCCCATTTGAAGTTGATGAGGCAATCAAAAAAATTTCCTACTCCCTAGCT:1 + chr3L 53105 3' + roo 9039 1 63.01 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCATCCAATGCCTTCTTGTTTGAGTTTTATTACGATG:1 - chr3L 16535189 3' + copia 5037 2 78.77 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAAGAC:1 + chr2L 1229696 3' - opus 7062 4 65.75 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGG:1 + chr3R 18846629 3' + roo 9039 1 58.90 CGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGCGTTGTCTGACCAAATTTTTTCTTTTTTTGGCGAAACGTGTTTGAACGCTATAAATCAATTTGGCGCAGGGTCGTCGAAGGATGCATGCATAAATTCCAGTGAA:1 + chr3L 5954679 3' - diver2 188 2 63.01 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGTCTTTATCAGAACTTTAACAAAATTCCTTTTCTATGTATAAGCCATAAAAACAGCATTCGG:1 - chr3L 15321957 3' + Transpac 253 2 56.85 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGGGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCGCTTTGCATGGCTTTTCTTGCATGCAACTTCGCTTTGC:1 - chrX 14962159 3' - jockey 27 1 67.81 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTGCCCACTAAACATCACCCACTCGGCAGCCTGTTGCGTGGGCTCCTCCGTCTAACAGCTC:1 - chr3R 14097027 3' - transib2 43 1 54.26 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCTTAAAACTATGAGTTCTAAAGACCGATTCCGATATACCGATCTAAAAAAAAGGAGCGAAGAGTAGCATGCGATTTCGGTTTAGAGT:1 + chr3R 4722509 3' + roo 9039 1 63.01 TTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGTAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAAAGAATCGTCACGAAGT:1 + chr3R 3527171 3' + Tabor 430 2 55.07 GAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGCGGTAACTCGCGCCCACTTCATCGCCCATTCGACACGCAATGTCTTC:1 - chr2L 19424677 3' - Tirant 87 2 73.79 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGAATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGAGGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTTTCCATACTTGAACATGATTGAAGACTGTTACTTTAAATA:1 - chr3L 3979588 3' + opus 428 2 67.86 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATATACACAAGAGCATTT:1 - chr3R 11526747 3' + pogo 2059 1 52.74 CCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGTCATTCGACTTGCTTCGCTACTTCTATTGTTCTTTGATTTACTATTAACTAGAGCACAGCGTACATTGGCTTATTCGAAAATCTCATCTAAC:1 - chrX 16853290 3' - roo 8688 2 68.06 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCCAAGTGTCCGGAACAACGGTGAGCATGTGAAAAACGGGAAACGGGTAAAGTGGGGTCAGAAG:1 + chr3L 16887412 3' + roo 9022 2 53.62 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGAT:1 + chr3R 15974783 3' + P-element 2806 1 30.14 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCATGAAAAACATGAGTTAATAGGAAGTTTTCCTGCACATAGTCTGCAGTAGTCTACGAGCACCATTTCGGTGCTTTAAAAAGCTTGTGTCTTTCTTGCCCGCAAC:1 + chrX 21213427 3' - Doc 28 1 63.70 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGCCTAAGAACACGCATATTAGCAAGCTGCCAATAGAAAGCCCCATAGCTTGCTTGATGGGATGATGGAAACTAACAGTTGATTTCACGAGGAG:1 + chr3R 20905515 3' + pogo 2073 1 66.21 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAA:1 - chr3L 14581356 3' + pogo 2068 1 61.15 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCTTCTTCTAATACACTGTGTTGTTCCAGGTTGGCGCTATCACCAGCGCCTTTAGCGAGATTCGGCCGCCCAACTGGAGTGTTAGTGAGCCGTACAAGGTG:1 + chr2R 22892755 3' - pogo 19 1 72.60 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATCTAAATGAATGTGCACGCAGAGAAAATTAATGTATCACTTACTATCACGATCGAAAAGCACTCCATTA:1 - chr3R 11461756 3' - 17.6 49 1 54.11 GAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATATATAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGAAAGAAAGAATCACTCACTTACCAA:1 - chr3L 20895269 3' - invader3 140 2 50.00 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGCATCTGTATTAG:1 + chr3R 18846655 3' + roo 402 1 76.71 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATTGTCTAAAGTTTGATTTCACCTGTTTTTGGAGGAAAAACTATTCCGAATTTTGC:1 - chr2L 20984306 3' - blood 68 2 65.07 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACATGGACATCCTGGGTGAG:1 + chr3L 4023746 3' + pogo 2064 1 58.90 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAAGTTTACTTGCCGAACTTGACTGCGGCATTGCGATGATGATGCTGCCCG:1 + chr3R 15974794 3' + P-element 2817 1 37.67 GAGAGAGGGAGCCATCATTGAAATACGGAGATTTGGTCCAAATTGACATTAGAATTTGGGCTTTGTTTTGCTAGGTACTTTAGTAGATATAGAGATACATAAATATCTGGCGATCAGTGGATTACGGGACGGGAATC:1 - chr2L 19365325 3' + Bari1 1263 1 58.39 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCACGTAGCGCAGAAAGAGTTTGTCAAATTAGAGAAGGCAACTCCTGGACATCGGGA:1 + chr2L 8397245 3' - roo 8730 2 63.70 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGCGGTTCTCTCGATCGATGGACCCAGCCAATAGGAAG:1 - chr3L 14969226 3' + P-element 2805 1 26.21 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGTAAAGGAAAAAATATTCT:1 - chr3R 4722351 3' - roo 8695 2 62.76 AGTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAGCTTCGTG:1 + chr3R 2689465 3' + diver2 4465 1 69.18 AGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTACATATGTACGCATACAGAAAAAAGAGTATGATGGGGT:1 + chr2R 982400 3' + HMS-Beagle 166 2 75.34 TATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTTATAATCCCACATTTAACCATGTAATTTAATATCTAAACTATACAATGTGTTCCTT:1 - chr3L 19397029 3' - F-element 77 1 63.01 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCCTTAATACCGACAGGAGCGAGTTTCGCGTTAAAATTATTCGCTGCATTACTTAGTACGAAATTTCTTTTAACAACTTC:1 - chr2R 17109604 3' - copia 4913 2 55.48 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTGCGGGTGGTGGCTAATAAATGAGTTTAGATGAGATTTTCGAATA:1 + chrX 16853289 3' + roo 324 2 69.86 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCTAATGGCCAGCTAATTAGGGGAGAGATATCGCCGTCGGCCGTGGATGGGGGCAAACTTTCCGCCTGTCTCCGATTTTGCAGCACAATCAGAGCTGCTGAT:1 + chr3L 16181020 3' - Transpac 4937 2 73.29 TATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAATAGATCTGGATCTCGTAAGCCAAATGAGGCGTTTCGAG:1 - chr3R 15964828 3' + P-element 221 1 29.45 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGGGAAGTCGCATACA:1 - chr3L 15035115 3' + pogo 2040 1 65.75 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAATCGCTGCCAAGTC:1 + chrX 19162705 3' - pogo 34 1 60.71 AATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACTCCAGTGTGTATAGACATTAGAGAATATGATGAAGTATTGGTGAAGGCGAGTCAAGGCGACCTCAAGCCAAGTCCTTCGTTTCCACCTTTTTGCAATAGCGTTCGGTTT:1 + chr3R 11269830 3' + invader4 2910 2 47.59 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCGCT:1 - chrX 14962194 3' - jockey 63 1 53.42 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACATAATAATTAACATTTTGCGAGCCGTTTTGATAAATGAC:2 + chr3R 26399869 3' - roo 8745 2 78.77 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTGTATTTGTTATGGGTAGAGTTAGAAAAGAAAAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTT:1 + chr3R 19449485 3' + roo 397 1 67.12 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAAATAGATCTTCTTTTTATTATTGAAATGGGAAATGATTGCTTTCAGATTACTGGACTGGACATGACGCGAGGAACTGAATCTCTGGCC:1 - chr3L 4023586 3' - pogo 29 1 65.75 GTGGCGTGGACTGCTGATGGGGTGCGAGGAGCGGGGGCGATATTAATGTACAAATACTACCCACAAGATACATTTGCATCTCGTTCTGAATCTGCCAATGAAAGGCAGGTATGGTTAGGTACGAGTATATTTGTATGTATGTAAAT:1 + chr3R 22673351 3' - gypsy5 78 2 56.85 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCGAATGTTTTTCTAACCGTATGTCGACGTTTCTTGGTTTCTCTCGGGCTTGCAATCTCATTCCCAGCCCTCTGTCCCTATGCACAGAAAGA:1 - chr2R 22867385 3' + hobo 2908 1 63.01 GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACATATATATCGGAACGCTGGCATGTACAACGCATACGTACATGCTATATAAGTTAACCCACATGCCATGTGCTTTATTGCATTCAATTTTCTGTT:1 - chrX 18913225 3' - Quasimodo 15 2 74.66 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGAGCTTTAATGTGCGTGTATAAAAAAAATTTGAGAGCTGCACTTTATGCATTGTGGCCCG:1 - chrX 21086098 3' - jockey 4735 1 58.90 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGAAGATAAGTACTTATCATTGGAATTATTTGTCACAATAATTAAAAGAAAACTTACAATT:1 + chr3R 23449345 3' - roo 8726 2 60.27 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTC:3 + chr2R 16891833 3' - jockey 95 1 75.34 ATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAATTTGCAAAAAATAATGGAGAAAATGGTTGCA:2 + chr3L 12030568 3' - I-element 5250 1 78.08 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTACATACTTACATAAGTAGAAAATCGATAGATTCAAAGATAGCGCATACGCG:1 + chrX 21605768 3' - P-element 69 1 35.66 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTGTTTTCCGACGTGGTCGTGACCATGGCCGTGGACTTTTTCCGCCGAATGGCCATGTGGCGTTCGCGGGTGGG:1 - chr3L 16887295 3' - roo 39 2 55.47 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTCGAGGCTTTCTCGGTTCGGCGAACCTAGGCGGCAGTTTGATTTCAACTCTCAGACAGGACGAAGCGCCTGCCACAGGATATGGCTGG:1 + chr2L 16685427 3' + P-element 2852 1 61.64 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCCGCACTTCACTCGGAACGAATGAAACAAGGGGCATCTTCATTGTTCGCCACTATTCCGTGATCCTCTGGCTCTCCAAGTGACCGCAT:1 - chr3L 22221106 3' + 412 7511 2 63.77 GTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTATTATTGCAGTCAACGCCTTCGAATATAAAAAGATAACTACACTTGGATAGGCTGCCTATTTTTTTGTACAGTGTACAG:1 + chr3R 28831010 3' - G5 4791 1 54.11 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAACTGAATTTAAATTCTACTCAGCGCATTTATACAACGTTTACAACAACTAACAGATTAATGAAACGGATCTTTACTTTGCTTGGTTGAAAAAG:2 - chr3L 4175223 3' + roo 9043 1 63.70 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCGCAGCCTTCGACGGG:1 - chr2R 7223616 3' - blood 17 2 71.43 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCTTCTCATCGATGGTAG:1 + chrX 16456799 3' - P-element 78 1 31.72 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCTGCGACGAAGTAGCAAAATGTTTGTTTTGTTAGTGGAGCTCTCGGTCTGTTAGCGAGCGT:1 - chr2L 21237211 3' - P-element 56 1 46.90 TATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTAAAAATCGTAATTTTAACTCGGTCCAAAAAAGTCCCCTAATATCGTGAATGCTCCACCTCATTTCGCTCAAAAAACCCTACTTATGTAGGCTACAACCTTGGGTGTGACTGTGGCACA:1 + chr2L 19903535 3' - Transpac 4919 1 78.08 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCAAAACACACTCATGCAAACTGGCGCTGATTTACCTAACAAGCGCAACTCGAAGAACAAAAGGCCAAAAGGCAGGGGATCCCAGTTGTTGTTTTCATTTAAAGGGATTT:1 + chr3R 28144966 3' + hobo 2928 1 77.62 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATTTATTCGAAGCCATTTGGGTTTGTTAATTTACTAAAAGCTCTACAAGCTTT:1 + chr3L 6096584 3' - roo 71 2 69.86 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACCACCCCAAACCAGCCATTCACCCACTCACAGCTTCAAAAAAGTGAAACAATCGGCAGTGACGTGCCGATATATATTTGTGGAAAAATACTTTTCACAAAAA:1 + chr3R 14165167 3' - Tabor 6859 2 71.92 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAAAAAAAATAATTTTCGCAGATAAGTAAACTAATATACCGCCGGACGATT:1 + chrX 18034664 3' + Juan 4135 1 73.29 CTTATTTGGGATTTTACAGTAGTTATGTACTATCTAGAATTGATTTCCAAACTCATTTTGTAATCTCTTGTTTATATTTTAAAATATACTTCTTAGATTTTCTTACTTGTGCAGAAATAGATCCTCTTTTTCTCTTATTTTGGGC:1 - chr2L 4103926 3' + roo 412 1 75.17 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGTAAATTTCCAAGCTCAATGAAGTGTGAATTATGTAGATTGAGGTGC:1 - chr3L 21097129 3' - mdg3 75 2 67.12 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAGGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTATATATGTAATAAGTTCGGCGGGGCGGATCCGGACTAC:1 - chr3R 15465501 3' - mdg3 5337 2 72.60 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTATTTTTTTTTTCCTTGCAAAAGGAAGTGAAAAATGAAAACGAAATGACTCTTAATGGGAAAAACGTCCTGCATGGCATGAAAA:1 + chr3R 14527104 3' - 297 28 2 64.38 ATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTTTGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACATGTGGAGGACACCATCACAAAATGTTCGATTTGCGGCGGGAAGTGTATTGTGTT:1 + chr3R 5764258 3' - Stalker 71 4 95.89 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATGTTCGAACAAGCTCGGGCGAATATAAGCTGCGATAGGGACAGTCTTGAAAAGAATGCTTCTTTGAACCAGT:1 - chr3R 4722368 3' - roo 49 2 53.42 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGGTGAAAACTAATTTAGCAGGGGTTCGCCCCCCCCGGAATCCCCTTGATTTGTTTCGAAAACCTCCACTTTATATCTGTTGTACATT:2 + chr3R 23426508 3' - pogo 29 1 65.75 TTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTCAGACAGTTGGCACATCAACTTCTCGGCGTGTTAACGAACAAATCCATCTTGGCGTGGATGAAAAAATTGTCATAATTATAGCATCATGCCACCAGTCAGCAGTCACCATTT:1 + chr3R 10486502 3' - Idefix 2 2 69.18 GTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGATTGCGTCCTTCATGTGAGGAATGTGGTATACACCACGAACATGATCTCTGAATATATGTTTTTTTGATAAGTTAT:1 + chrX 20747594 3' + 1360 239 1 52.05 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACACAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTAGTGATGCTTACTCAGATGCGACTGTAACACC:1 - chr3R 10142956 3' - 412 7139 2 73.97 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCTTACCTACCAAGAACCTCCGACCTTTTGTGTGTATGCATCTGGCTCATGTATATTTCATGCAATATCCTGTTGAATATTTAAATTTGTGTAGACAATTTCCGTAGCCG:1 - chr3L 5446049 3' + roo 398 1 77.93 GAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAACACAATCATGGCCTTATCCCATCGATTGTTGAGTATAAAGAGATTTGGACGCGAGAGTTTGGATG:1 + chr3R 23203237 3' + F-element 4255 1 57.55 GATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAAGAAATAAAAGCAAAGTAAAAACAAAAAAAAATAAAAAAAAATGTATGGTCTAAAACATTAGGGGGCTGGGCTCCGTCTGCCGACCCCT:1 + chr2R 24808219 3' + F-element 4628 1 75.38 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTAATTAACAGAGCGCTTGTTAAACACATGTGTGAGATGATAATGAATTTCAAAATA:1 - chr3R 31196715 3' - jockey 4827 1 64.38 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTGACACTCACTAGAAGTGGACGCGTATATGAGCCGCACTCACTCAGATTGACACACATCTCTCGATCGGTA:1 + chr2R 22255435 3' - roo 8713 2 51.37 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTTACCACTCCTCGCAGCGTGGGATCTGCGACGGGCGACCGATTGCCATGCAAATCCGGCCAGACAT:1 + chr3L 4023730 3' + pogo 2048 1 55.48 AGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAGAAGTGCTAGTAATTCTGCAAAGACTTTGTGTTGACACACAGGGTTTAGCTTGTACCCGATTGTGCACGATTGTTAGCACTCTGTAATACTTATTTT:1 - chr3L 26729316 3' + gypsy4 303 1 63.70 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGAGGAATGCCGAATAACTTTAATAACACACTATTAATACTACTTAAGAATAATCCTTTATCCTTTAGTTATTTGATTGACTGTGTAATGGTAT:1 + chr2L 10832358 3' - Doc 20 1 68.38 TAGTTTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGCGTAGCTGAAAGGGGGCGTGGCGACGAAAAAGTTACGCCGGCGGAAGTTCATTTTATGGCCATCTCTCTGGCGCTGTCACTTCCG:1 + chrX 6938270 3' - hopper 33 1 61.64 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAAAATATTAAAACACAGCATATTTTGTGTGTCTGCAAACATTTTGATGGATGAAGGAGCA:1 - chr3L 11665897 3' + pogo 2043 1 60.27 ACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAATGGTGTATTGGGTTATCAACTAATTTCGGTTGGACATAGTTTTTGCCATGAAGAGAGGAATTCCTTACTCTAAA:1 + chr2L 22746361 3' - 1360 45 1 50.00 GGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCC:1 + chr3R 19450078 3' - roo 8880 2 61.64 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCG:2 - chr3R 26782706 3' - hobo 66 1 65.75 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCATAAAACTGGGAACAACTCAATTGAGAATTCAACGATCAATCAAATGGTTTGTGAGTGAATCCATTAATAGTTGACTTCATCTTGTAGACAAGTTT:1 - chrX 10873766 3' - mdg3 5278 2 66.44 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTAACTCCGGCCTAAATATTGACAAAATCCCGTGCAAATGAGAGTTGCGTGCCATT:1 - chr2R 18721932 3' + 412 7480 2 63.70 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAGTAGACACCAA:1 + chr2R 2949162 3' - 17.6 6954 1 67.81 CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAG:1 - chr2R 544784 3' - HMS-Beagle 61 2 60.69 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTTAGAGCGGGCAACAAGGAAAATTGCAAGCGGAGGGAGCAGCAAGAAAATGCTTACGACAGTTGCCTTGCCAACCCCAAAAGGGGGCGTGGTTGGGTGGAAAA:1 - chr2R 20382441 3' + Bari1 1689 1 73.29 ATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGATGTTTCGTTTTGTTTAAGCGCGTTGTATGTAAACCAATAATTCTGGTTAATACCAATCTGATCGATTGTATTTTGCGGCGTTTGTGGACTTGGCAATGTAGCCATTC:1 + chr2L 8393108 3' - I-element 5134 1 72.60 CTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTCCCGGCTTTTCTCAGGTCCCTCTCTGCCC:1 - chr3L 6547675 3' + mdg3 130 2 78.68 GAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAAATCGGAGTCGAAATTTGTGGTCTTTCTAGTAGATGCACTGCGGCTCT:1 + chrX 10623901 3' + X-element 4647 1 65.07 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTATTACAAATAAAGAACCAAAGGGGTCTTCTGTATTTTTCCCATTAAGCACATTGAA:1 - chr3R 12608050 3' + roo 345 2 60.96 AGTTCTTGACTTTAGATACAATTTGTACATGTCCTAAGTTGCGCATGTGATAACATTTAATGATCCAAACATTTTTAGCTATGTTAAAATGTGCCAAAGATGGATTTCGATAATTAATTGTGCGTGCTTATTTTCTACAGTGCTTT:1 - chrX 7350733 3' - invader1 3857 2 89.73 ACAAAAAAAAAGAACACAAAAAAAAAACATAATGCCAAATGAGGATGGGGAACTACATGC:1 - chrX 2781714 3' + gypsy7 5005 2 75.00 ATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTGGCGTACTGTCCCCCTTAAAACATTTTTGACAATTTCGA:1 - chr2L 14969899 3' + Tirant 8422 2 74.66 GACCGGTAACGGTGCGTGCACAAAGAGGGCGCACCGTATACTAACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGAGCGGGTACAAAAGGGGAAATAAAAGGGTATGGTATAAGCTTATTTGCTAAGTGAGAGCTTTGAAATCTGGAGTC:1 + chr3L 12525735 3' + gypsy8 141 2 64.38 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATACACACACCTACACACGCACACACCTGATTCAATGTTTGGCGTATACGTATTATGGCTGGAATTTGGAATTAAAGATTGAAATGGCCACACAAAAA:1 + chr2R 14562282 3' + Burdock 6370 2 44.83 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATACCAAGTATCTTAGGATGATTTGAGCTGGTGTCTTGCC:1 + chr3L 12500226 3' - FB 81 1 72.60 GATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGGGGTGCATGGGGGCAGGGGGGAGCATTTGAGCCAAGTTAAGTTATTGGCCAAGTTTGTGCTGTTGCTGCTGCTGCGGTGGCTTTGCTCGCCTGTTTGCATATTAGTCACAGAAC:1 - chr2L 7094179 3' - accord 184 5 71.92 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGGAAAGTCATAAGATCTGTATATCTTATGATAGTCCTTTGATTAATTCTT:1 + chr2R 13849720 3' - roo 72 2 68.49 ACCTGCAACCTACGCCGGAGACTGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTACATGTGTACATCGCCCCGCCACCCACTGCCCACCGACCACCGTCCACCGTCCATTGGTCGATTTATGTTTTCGGATC:1 - chrX 10728801 3' + springer 347 4 56.20 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGTGCATGTGTATCTACACAGGTCGCTTGTGGCCTCCACACTCTCGACGGGGTTTTGTATC:1 + chr2R 6187951 3' - Tirant 8169 2 59.59 GACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAATTTGCGATT:1 - chr2R 19076478 3' - F-element 177 1 73.29 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATACCCATAAATATACGCATGCAGTGAGCATGATTTATGAAATTAATTATATCCGGATTTTACTGG:1 - chr3R 26782695 3' - hobo 43 1 54.48 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATCGTATCCTTTTACTATCATTGGGCCGCCATA:1 + chr3R 25753720 3' + hobo 2892 1 52.99 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATTTTTATTATATTTGTTTGCCTTTTTTGGGGGCTTCTCCAATGGCAGCCAA:1 - chr2L 16480866 3' - P-element 68 1 40.80 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTAAAGGTGCGTGTGCCGGGGAAATTCGCAGGGAATGGGGATGGGGATGGGGATGTG:1 - chr2L 16055728 3' - roo 49 2 58.02 GTGGCTTGTTCGCGGCTATGTTGGCGAAAAGCGGGGCTTGGGGGCGGGGGCACAGCCTTAGCATTAAAATGATGAAGG:1 - chr2L 18379588 3' + Rt1b 4708 1 80.77 AGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAGAGGTTGACGTGGCATGACTGCAGTGCCTGCATC:1 + chr2R 20913184 3' + 1360 3302 1 74.66 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAAACATTTTGTGTACTCTTTAAGGTTATATTTTTGCGTCTCAGTATG:1 + chr3L 6751745 3' + pogo 2035 1 67.63 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGATTGTTAGATTATTCATTTGCTGATAATTACCATATTTTCAGATCTCATGATCGCGAAAGCGGCGACTACGCG:1 + chr3R 22289489 3' - 412 7097 2 54.86 GCCAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTACGCCGCTTAGTCGAAGTTGACACGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTATAGTTAACAATATATTTCCATAATAGTTTGTACATC:1 + chr3L 2808082 3' - Gypsy6A_LTR 234 1 79.45 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATTAAGGTAAAGTTTATTAAGGTATGTAAATATTTAAAATTCTGAAGCAAATGTTGGATTTA:1 + chr3R 21237812 3' - Doc 69 1 60.27 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCCAACAAAATAACTCACTTTAGAATACCTCGACACGGAACCTAAGATCAGTTGGAATTTTTTTGTGGCTCTGCTATATGTTTATTTTTACCCTT:1 - chrX 18149761 3' + hobo 2919 1 67.39 GTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTGGCTTTTCTAGGCCCCGCGTCTCACATTCCCATTCTGGTATACCTTATGTAGATGA:1 - chr2R 23122982 3' + rover 339 2 61.64 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTATAATGCTATTGCTCAATCTAATGGATCATCCATGAC:1 - chrX 10979002 3' - roo 83 2 77.40 TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAGGCGACGACAGCGACATTGTCCTTGTTCGACA:1 + chr2R 19543726 3' - jockey 4848 1 78.08 GGTGCGGGAGCATAACTTCTTTTTTCTACAGCTTCCAGTTACAGCTAAGTTTTGTTACGGTTCAGTCGCCTTCATGCGTTGTAATAGTGAGGATCGTGCGGGAGATATAATGATAAATGAATTACGTCGACAGACTGTATGTTTT:1 + chr2R 3287381 3' + mariner2 4 1 71.72 ATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACTATCGGATAGAACCCAAACGTTTTTGTTCTCATCAATTTTC:1 - chrX 360455 3' + mdg3 121 2 71.53 ACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAAT:1 + chr3R 10468085 3' - opus 78 2 71.92 GAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATGTATAGTATGGATAACAACCATTTTAGATCTATAAAAATTTTCGCACCTAAATGTTTTACATAACTTTCCCCAGGCTAACCTTTTCAACCAATTGATTATCGGCTAAAAA:1 - chr3L 15890957 3' - mdg3 5264 1 65.75 TGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAATCAATCAATTTACCGGATCGGAGGCAGTTATCA:1 + chr2R 11656088 3' - HMS-Beagle 74 2 75.56 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGAAATCAAACATGAGCTTTATATGAATGTAATGCAGTGAAT:1 + chrX 5222937 3' - 412 76 2 75.00 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATAAACAGACGCAACCATGACGTCAGGCGCTTTCGTTGTCTCGCGCGCATTT:1 + chrX 8895298 3' - roo 8700 2 56.25 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCCCCTTGTACAATGCACAGGTCCTTAAAGTTTGGTGCTGTTTTGTATCCTTCTTTCGATGCGGTTAATCCGCTTATAGTATGACTAGTGGGTT:1 + chr3L 4175388 3' - roo 29 2 65.75 CTAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTCTGTTTCATGTTGCTGACTT:1 + chr3R 10990182 3' + P-element 2476 1 21.92 GTTTAATTTTAAGTTTAATTTTGAAAGCGGTTTTCCACTGGATCGACAACTAAAAGGATGCAGAGGGTGTTGTAATTTTATGGCTTTGTGAGCAAAAACTGACTACCTATCTACCTCTACCTATGTCACTCCCTTACGCACAGTTT:1 - chr2L 16107231 3' - Rt1b 97 1 76.71 GTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCATAAATTGAAAACTTGCTTAGTAGATTTGTAACCATAA:1 - chrX 19556574 3' - Stalker 7177 4 76.71 CATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAAAATAAGAATCCAAATAATAGCTAGGAGTATGGAAGAGAGA:1 + chr3L 11030633 3' + 1360 3169 1 72.60 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTT:1 + chrX 17469275 3' - blood 61 2 58.22 CACACACACACACACACACATTAGGATTCCATAAGGATACTCTGCCTCGCTCACATGCGCATCGAGTGGTATACGTAATATATCAAGTATACTTCGATTCAGCTCAACGTACCCATCGCCTCGGAACGAGGCATTGAAGCC:1 + chrX 2473559 3' + accord 7030 2 65.25 AAAAAAAAAAACAAAAATAAATATATTTCGGGGTTGGGGGTTTGGGTTTTTGGG:1 + chr2L 14702779 3' - hopper 143 14 50.00 TTTTTTTTTTTAAATAAAACAGCAAGTTCTGCAGGGAATCAAAACTGCTTTTCGCAAAGCCTACTTTTGCATGTGCCAAAGCAATTGAACAG:1 + chr3R 27477357 3' - transib2 2630 1 85.87 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACC:1 + chr3R 25753683 3' + hobo 2888 1 74.26 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACAATTTATTATAGAAATATAGATATTTTTTGCGTAGAATCAGCTAATAAAGTTTCGTAGCAAACGGCAGCAATAATTATAAGC:2 - chr3R 18469100 3' - Quasimodo 37 2 61.64 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAATCAGGGTTAGGGGAACTCTATAGAATATCGCATACTTCTTTACTTGCGTAAAT:1 - chr3R 4884379 3' + pogo 2038 1 64.38 CCAATGTATGGCCGTTACGAATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTTAAACGTTTTGAGTGTAGGGAGTAGGAAAAACTTAACTATAGTATTTGGGTCGATTCGGATCTTGCTCCTTGTTAACTTTCACTCAGATTCCTTGCTGCTT:1 + chr3L 23317456 3' + 1360 3367 1 67.12 GCAATGCTTGTTGATTGCTTGTGTCCGAACTTCATGCCTCAAGATATGACTTTTGCAAAAGACAGTTTTCATGTTTTTATTTATTTTATAAATTTTTATTTTCCACTATTGCAGCAGATTTAGCATTTATTGATTGATACAGGTGT:1 - chr3L 26133900 3' + 1360 452 1 73.97 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGGAATACTATGCAAAATAATAACTTAATATTTAGTATAAGTGTATAATTTTGAGGTAATAAAAAAAGATACTTATCACT:1 + chrX 18149910 3' - hobo 42 1 54.11 CGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTACACTCCAACCAGGCGGAAGTGAGCTCCTTGTTGCCCCATTCCTGGCAGCCAAG:1 - chr2L 9356815 3' + Stalker 7190 4 62.33 CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGCTCGTTGGACATGTTCGCGGTCAAAAGCCTACTGC:1 + chr3R 9289376 3' - HMS-Beagle 82 2 74.66 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTCACTAAACATTCATGTTTCTGCCTCTAGTACTACATAACAATATAAATAAGGTTTATTTTTGTGAC:1 - chr3R 20292410 3' + pogo 2051 1 56.16 GTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAA:2 - chr3R 20137261 3' - Burdock 73 2 69.86 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATTCATTTTAAAGTACAATTTCATAAGCCCTTGAGATGCCTCTCTATGATTTCCTATTTTCGATCTTCAACG:1 + chr3R 9482118 3' + roo 354 2 55.48 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCAGAGATGACAAACGACGAGATGCCAAACGGAAAGTAGAAAATTGCTAGCCGCTGAAAGCTAAAAAGTGCAAACTTAAAAGCAGCAAACAGACGG:1 - chr3L 513728 3' + mdg1 393 2 59.59 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACATTTCATCATAAAAGGACTAAAGCAACTTTTGAAATCTTTTTTCCCCGTGCAGTTGCCATGAATAAAAATCGTATTAATTCCGCGCCAATGTCGATTCTGTTTCAGCCA:1 - chr3R 9938544 3' - roo 8676 2 78.08 ATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCG:1 + chr3L 16047622 3' - Cr1a 463 1 61.72 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATATAATGATACAATGTTTGTTGAGTAAACCTGATATACAATTTATGATAAAATATTTGCTTAGCCAGTGCT:1 - chr3L 3762205 3' + roo 9020 2 54.79 ATTTTCATATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGCGCCAATTGATTGGTTGGTGATGAAATCCTCTCATCTCTCTGGTAGCTAGGAGATGTGAGGCTGTTTGCTTTGATCACATTACCGGAATCGG:1 + chr4 952041 3' - 1360 312 1 63.70 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGGCGAAGCTTTGGCTTGCCACATAGAG:1 + chr3L 9426738 3' - P-element 93 1 22.60 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTGGTCGGGCGGTATTGAAGTCAAAACATTTCATTAAAGGCAGCAGCGAATGCTGTGAAAAAGTCCACAAAAGTATCTGAAAACA:1 - chr3L 22635650 3' - hopper 38 1 59.59 GAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCCATAGGCAAATCAAGTGGCGAGTGGGATATGGTCTGCGTTTTCCATTTCGCCGGAGGAGGTCAAGTGC:1 - chrX 17614367 3' + roo 356 2 53.42 CGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCCATATATCCCCGCTGCTGCTGTGGATAACCGCAGTCGGACATAAATTCCATTT:1 + chr2L 11668805 3' - mdg1 69 2 65.07 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTCATTTAAATGCTAATTTCGTAATCCCAACATACTCTAAATGAAGTTATTAGTAGTTTTTTTGCGAGAGTGGTTAAG:1 + chrX 17469290 3' - blood 46 2 54.79 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTATTGAATTTGTTATGAGATTTTATTTATGTAACTAAATAAAATATGAAATTCATCTAAAGTCATGGGTAGACATAAAAAAAAAAGAAAATAAATATGCTTGAATG:1 - chrX 12843539 3' - roo 8679 2 72.60 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACCTTTCCACCGCACGCAAGGTCAGTGCGGCGCACGTAAGTATGCAACACATAATTTTTGGCCCG:1 - chrX 14962196 3' - jockey 65 1 54.79 GTGAATGTGTGTGTGTGTGTGCACTCGCCT:1 - chrX 4789542 3' - accord 7033 2 83.33 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTATATGTGGACGCCGCCATAAATATGGTTCGAAGAACTCTGGGAT:1 - chr2R 22798635 3' - hobo 75 1 71.53 GTTTACTTAAAGTTTTAGTTACACTTAAGTAACTCAAATGCCAGCAAACAGGAAGCCCGAATCGCTGCGCATTTGCGCTACTGAATGGAAAGGATGGAAACTGCAAGGACAACGTCAGTGCATTAAAGTTGATTAATTTTATTAGT:1 - chr3L 4931537 3' + Transib5 402 1 52.74 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCATTGCGCTTTAAGTCGTCTTACG:1 + chrX 18193827 3' - hopper 44 1 51.37 CAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATACCGAAACTGCCATACAATGTGTAGAACAATCAAACGAAATATATTTAAAACAAAACCTGCGACGAACCCCTAGCGCCCCGCCTAAAAGCGGCACCTATGCG:1 + chr2R 4756427 3' - HB 1437 1 76.71 CAAGAGAGCATGCTATAGTCGAGTTGCCCGACTATTAGATACCCCTTACCCCTTAAAATGTTCAAAAACGTGGACGTGATCGTTTTCGGCGTATTGAAGATGTCAGGAAGGGCGTGGGCAAAGTGTTTATGGTATATCGATAGAAA:1 - chr2L 22097517 3' - INE-1 578 1 58.90 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAGGAGTAGTGGGCACTGGAGCTTCAGTAGTGGATGGAGCTACAGGAGTAGTGGTCACTGGAGC:1 + chr2R 18051073 3' + mdg1 7402 2 57.53 ATTTTATTTATTTATTTCGAGTTGCGCTTTGCTTTCGCGGTGGGCGCCAAAATCACCGGCAGACGATGGACTATTGTTCTT:1 - chr2R 5917963 3' - Copia1_DM 287 1 87.65 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACTCATTATGAATATAAATACTTCAAATGGTCGCAAATATCTCCTCCACTTCGTTGCCAACTACTGACTGACTGAAATCAAT:1 - chrX 22858831 3' - mdg3 42 2 58.22 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCTGTCGCCGCCAGGCAGCATTCGAATGGAACCCACGTCATGTTGTTGCAGAGTCCTGCTCCGATCCCCCCAAAAAGACCCCTCCTTATACCTTCGCCAGCTTACCC:1 + chr2L 14139769 3' + Tirant 385 2 76.03 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTGAACGGAGGCAGTAATAGCAACAAAAACCACAACAAG:1 - chr2L 15965163 3' + blood 360 2 73.97 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTTGATTAATTGCTTTATTGTTTTCGGCCACTAAGAGAATGCTAAACCGTATTGGCATTGCATAAGATTAGAGATCTTAAAAATCATACACTTAAATGGTTTAGTT:1 - chr3L 14581330 3' + pogo 2087 1 76.03 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATATTGACTACGGCGAGGACGAGCGGAGGAATGCGAATTTAAGTGAAATAAATGACTTTTACTTACTAATTAATGCCGTCGTAGCCGGCGCCCAGTCCAACGT:1 + chr2L 18163907 3' - HMS-Beagle 11 2 78.08 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGTTACGGCTGGCTGCATTGTTTGTTTCCAAGATCGATT:1 - chr3L 6774161 3' + pogo 2047 1 68.91 GAGATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCATTAGAACAACAACAAATGCATCGACGGCGTCGACGGC:1 - chr3R 30272994 3' + Tirant 319 2 75.34 GTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTGCCCACCCCTCCCCAACACGCATACACACATAGAGGGTTGCCCCAAATGGACCTCAAAAGCA:1 - chrX 10441167 3' - HMS-Beagle2 488 7 73.33 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATTATTTATTGAATTAGCAGTGTTATTCCATATG:2 - chr3R 14663188 3' + pogo 2063 1 59.59 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTAGATGATGACGATGGAAGCGATGCTGCACATCCTGGCGGCCATCTTTTCGACTGGCTAAATTAACTTTTTGAGCCGCCTCTCACATGTTGTT:1 + chr2L 13547095 3' - P-element 22 1 69.06 AGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAATCAAGATGACTAGTTGGCCATTGTATCGGTTGATTGTTT:1 - chr3L 17822801 3' + roo 8911 2 73.29 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTGTGTTGCGTCGTGTGATCGCTAGAGCGGTTGTGGAATCGGATTCGAGCGCAA:1 + chr2L 21237310 3' + P-element 2823 1 41.78 ATACACGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCTAGTGTGTAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATGAAGACGTTTTCTGTGTAGTTAATTCGAACGATAAGATTTTATTGA:1 + chr2R 946704 3' + 1360 3231 1 68.49 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCAAAAGGAGAAATACAAGCTGGGAATTGCGAATCAGCCGGCATCCCAAGTTGCCTAT:1 + chr2L 15920210 3' - jockey 35 1 65.07 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCCTTTAATTGGTTTATACATTTCCCACACACATTTAAATCCGATTTAAACTCACTCCGCTGAAACTCACTG:1 + chr3L 3540257 3' - mdg3 5276 2 67.81 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTCAACGTTTTT:1 - chr2R 18807716 3' - jockey 20 1 75.34 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGATGTCAGCTTAGGTTGTTATTGAAGTGTAATTAGAGGTTATAAGAAAGTAAATAAACTTTATGCGATTATAGGAAATGGTCTTAAAATTTATGTTCTTTAAAGCTT:1 - chr3R 25866305 3' + mdg3 234 2 67.81 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTAATTTCAGGGGTGAATCGGTTTTTGCGGGGAATCGGGAATCGGGAACGCAACTATATGCACGTCCTTCGC:1 - chrX 20552769 3' + roo 357 2 51.37 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGTAGAGTGACATTTTTTATTTGATAACTAGGTAGATTAAGCTTAGCATTAACAAATTAACAAATTATAAGTCGATAAGTAGAATAT:1 - chr2L 1327468 3' + pogo 2068 1 58.90 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATCATCGACATTGACATACAACTAGCAGAGGGTTTCTACAAGAAGCGCATTTCTTTTTTTTGTTTGTATATTTTCTAATATTTTCTAATGTT:1 + chrX 13651602 3' - 297 25 2 65.75 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATTCTGTACAATAGCAAATAGTTCAGTTTAAATAACGCGATTTTTTGTGAAACTTATCGATGATTTATTGAAT:1 - chr3R 14663208 3' + pogo 2049 1 55.71 CTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGTTCACTTAATCAGCATTTAGCGTAATTTCAGCTTTTACAATT:1 + chr3R 10468086 3' - opus 7193 4 71.23 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAATACAAAGTAATACTTTGCTCTTACAATGGGATACTTTTTATGAGAATCATCTGAC:1 - chr2R 9332128 3' + roo 9006 2 64.38 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAAACCAGCGGGAAAAAGAAAAGCTCTGGGAGCCGAGCAGGTCAAAGTTACACAAAAGGAAAAACTTGAACGGAGG:1 - chr2L 15965191 3' + blood 334 2 55.56 AGCGATGAATCAATACAATCCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGAGAGGACTTACTGAAATTCCCAGTAAACTTGATATTGTGCAACTCGCATTTCG:1 - chr3L 9907301 3' - BS 5069 1 66.91 ACCGACTCCTCTGGTGGGGGATCTCGAAAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCATATCCATCACGCTCAGTGAAGCAACCCCAGACCCC:1 - chr2L 20942381 3' - Rt1b 454 1 59.81 TTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATCCAGCCAGTTGAGCCTACGTCATTAAATCGGGGCGAGAACTTTCGAACGGACGCTTTGGCCACAGTTTTCTATTCGGCAA:1 - chr3R 9289272 3' + HMS-Beagle 208 2 59.59 GGATTGCGCATGGATACAGATCAGCAAAGTTTGAAATACGTGGAAAGTTTTGATCCGTGAAGCTGTGTAAGCAGCTTTCACCTTTCTAGTGGGAATAACGAATAAGATCTCCAAACATATGCATAGATAAATTATACGCGGTAAG:1 - chr3L 22079977 3' - Quasimodo 405 2 72.41 TCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACCCTCCTCAACATGACTGAAAAATCAATTGCTTTTGATGGGCGCACACACACACACACACATCGCTCATACGCAACGTGATCCAGCTATGCCGACAAACGCAATTTGC:1 - chr2R 19076482 3' - F-element 174 1 74.10 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCC:1 + chr3R 23507666 3' - 412 7124 2 65.75 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGACGATATACATTTTTTTGTATCGCAGCCAAGATTTCCACGCAATTTAACTTGAAAACCATGTCAGGCGTGGGGTTAAGT:1 + chr3L 5438855 3' - hopper 37 1 58.90 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAGTTAAAGTATTTAGTTACCAATTTAGTGAGGATCAGGGTCGAAATGGGGGGAAAGCGGGACAGGGGGCTAACTGGCCACTGTCCGAGCGTTGAT:1 - chrX 17371464 3' + roo 339 2 63.70 AGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTAACAACGACATAGAATTAATTCAACACATCGATATGGATATGATAAAGCTAACCAAGCTGCGA:1 + chr3R 25984194 3' + 1360 3302 1 56.94 TAGGCTATTGATCCTGATTAAGAATATGTCTACTTTATATAGTCGCAAACGCTTCCTCATGCCTGTTACATACTCCTCAACCAATTTAATTTACGAGTAATAATTGGTGATTAAAACTCTAATCCTGTTTTTAATTGCTAATTAAG:1 + chrX 18543246 3' - INE-1 89 1 68.49 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGCATTCAAATAGATCCCTGGCCAGACTCAATTGTGACTATCAACGGCAAGGCGTCTGTGATG:1 - chr3L 20747084 3' - Burdock 6188 2 56.16 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAGGACAAAACTTAAACATGCAAAAGTTGATAAAAAGTTTGTAAATGAGTTTCTTTATTATTATTACTATTTTTGCATTTAGGAATTAAGAGCCATATTCAGTTCTAT:1 + chr2R 9867233 3' + roo 393 1 73.29 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTAGCTGGCTAGGTTTTTAAGTACAACAAGTTGGTTTTAGGTATTGCCCATTGCAACCACTGTAAAAACTATCTTATTTTGGC:1 + chr2R 21897997 3' - 412 40 2 55.48 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAACTCTCGCTTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCCTTTTCATCCACGCTCCTTCGCGGTTGCGGTTGTTGCAACTCCAACTCGAACTGCGGCAGCGACGGCGACTGCGAC:1 - chrX 9201861 3' - Tirant 8118 2 75.89 ACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTCGCTCCGGTTCCCACATCCCTCCTTTATTTATCAGCTTGAG:1 - chr2R 3292694 3' + hopper 1414 2 66.44 ACACACACATACACACACATACACACACATACACACACATACACACACACATACACACACACATACACACACACACACACAAAGTCAAACACACTCTCGCGCAGTCGGAAACTTTCACAATAATGCTGCCTTGGGGGTTGCTGTCG:1 + chr3R 6419140 3' + accord 193 2 56.16 AAACTAAAATGTTTTTAAATATATTTATAACGAATTTTACAATCCATTTAGAAAGCATGTGCGTTTGGGCGAATTCAACGTGAAAACTGAACCCGACTGCATCGAGGAGCCAAACTAT:1 - chr3R 30242377 3' - transib3 112 1 77.12 AACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGTTTTTACATAATTTTACGTTATGCCGCTGCCGAGGCG:1 + chr3R 6234638 3' - F-element 4263 1 74.66 GTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAAAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTAGTGTTGCCTAAATTAAGAAAATGTTTCGTTGGCTGGAAATCAAAATCCAATCCGTATAGCCCAAATGCTGC:1 + chr2L 17088700 3' - Tirant 8452 2 50.68 ATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAAAGACAGCTGAGATGAAAAAGTGCTGCAAA:1 + chrX 10119676 3' - FB 29 1 61.64 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAATTTCGGAATCATTTAAAAAACTTTAAGCTATGCACTTCATTTTGTCAGTGAACCACGGAAACCGAGCCAATTTGCAAAATTTGACAGATTGCCAAAC:1 + chr2R 21227487 3' + mdg3 224 2 71.92 GTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAAAAATTAGTTAAAATTTCTTTACCTCATAAATGAAAATGTG:1 - chr2R 19904039 3' - Doc 4496 1 71.92 AGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACCATTTTCTACCCATCCAAGCTGGCCAAGTCGAGCGTGAAATGTTGATGAAGTAACCGCACATGTTTG:1 - chr3R 5941941 3' - hobo 394 1 54.11 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGAATGA:3 - chrX 18366041 3' - jockey 95 1 76.03 AAAACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCT:1 - chr2R 2949037 3' + 17.6 420 2 72.60 GATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGTTAGAAGAAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTAGAGCCCGTTTACACATGCTGTTGCAAAATAAATAATTCATAGAATAAAGAGCAATCAAACCGTGAGATAGACGAATATA:1 - chr2R 4517323 3' + INE-1 15 1 54.79 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTGTGAGTCCCATTTCAGTAACTGATGACATTTGACACACGAAAT:1 + chr3R 9938679 3' + roo 8998 2 70.14 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTTTGTTCCGTGAAATAATAAGAAC:1 - chr2L 7667399 3' + copia 231 1 55.48 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATGCGAATCGATATGGAATCGCAATGGAAACGCACACGTGCAGTGGAAACTCGGCATTGTGAGTTCGGAATTCTGAATCAATGAGCGATTACAAATGGAACCAAACTATATGTCTGCT:1 - chr3L 16157141 3' - Juan 8 1 78.77 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACTGAAACAGTACCGTTGCGAATGAAACGAAGCGATACGAAGGCTGCCGAATAGCACTTCCATGCCGCACTTGTTGGATTCTCGCATGTCTGCGC:1 - chrX 15089455 3' + P-element 2863 1 69.18 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGTCAGCAATTGGAGTTGAATATAATTTGCGACTTGACCCGTGATTACCGCGGCTATAAATGCAAATCAACGGAACTGGGCAAACTGCAC:1 + chr2R 18722056 3' - 412 33 2 63.01 TCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACACCACCACGC:1 + chrX 15089563 3' - P-element 88 1 25.34 AACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTGCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAACTTTTTCTGTGCTGATTTCCAAGTAACTCTTCAAAAA:1 - chr3L 10076333 3' + X-element 4630 1 76.03 AAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGTATAAACATCATAAGGGGTTTTTTTGGAAAATTTAAAATTTAGCTTGCTTTCT:1 - chr2L 12322095 3' - hopper 58 1 61.59 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGGCGAAGGATAAATCTTTCTGAGCTGGAAGGGATTTCTGTT:1 - chr2L 7667421 3' + copia 209 2 70.55 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTATGTTGGGTACATTTGGTGATTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATTTTTATCCACATTAAGCACGACT:1 - chr3R 16041094 3' - jockey 58 1 52.74 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTAAAAAATTAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAAAA:1 + chr2L 7418312 3' - pogo 79 1 75.34 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATGCTAATTAACTACACAATTCCTCTTTCCTAACATCACCTTTCGGTGCCATAAAAGTTTTGCGGTTAACAAAATTGAAACGGCGC:1 + chr2R 6052695 3' + mdg1 367 2 51.37 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATCGCAGCACATGTTGTCTAATCATTTTATTGTGGTGGTTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTGCTTTTGTAAGTTCTCTCTTTTCTCCCTTG:1 - chr3R 31956351 3' + pogo 2077 1 69.18 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGGGCTATATGGAAAGAGAGAGAAACGGTGAGATCGGGAGAGGCG:1 + chr2R 17100181 3' - P-element 35 1 58.90 CGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAGCGATGAATAGTTCT:1 + chr2R 2527438 3' - roo 94 2 60.27 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCAGCACCACAAGCTACCCAACCGCAAAAAGTATGCAAAGCAAAATTATGAAAAGCCAG:1 + chr3R 9163944 3' - hobo 65 1 65.07 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAATAAATAATATACTTTATATGGTCGAAAACGTTTTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAG:1 + chr3L 25245594 3' - pogo 31 1 67.12 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTTCTCGCGCACGCTGCAATTTGCACCATTAACCCGCCATCG:1 + chr3L 22221218 3' - 412 7132 2 71.23 CCGAGACCTCGACGTTCATACGAACGGACGGATATTACAACATCGACTCTGCTATTGATCCTGTTAATATAATTTTTTGTTTAGCCTTTTTATGTGATAAGATACGATATTAGATCAATTTTTTTTATTCTACTTCATTCATTAGG:1 - chrX 12473340 3' - INE-1 136 1 51.37 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTAAATAAAATAAAAAAGTTTGTAGAAGCTCGAATAATTTACATACATTCTGGCACTCTCCGTAACAG:1 - chr2L 20922983 3' - pogo 14 1 76.03 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGCTTGGCATTAAAGCAAACGTTTAAAAACAAAGCGCACGCTCTAGAAAATCGTCATAAATGTGGATAAATATTTGAACCAATTTATGGCATAAATCATGCGCTGCATGA:1 - chr2R 13276417 3' - roo 8675 2 78.77 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAAAAAAATTAAATAATTTGAGAAAAAAATGGAAAAAATATGAATGAATTCGTTTTAAGATTGCATACGATAAATCCATTACAACCATTTTCCATTTTGAGTAGATTGGCGAAATCAA:1 - chr3L 18920344 3' + Juan 4201 1 73.97 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCT:1 + chr3L 21093208 3' - Ivk 99 1 75.34 TTATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTT:1 + chr3R 16799785 3' - X-element 4699 1 68.49 GCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCATTCTGTATAAAATTGAATCTTATTTATAGTCCTTGTCCATGGGCCTA:1 - chr2L 1199576 3' + hobo 2673 1 67.81 ATCGACTCGGTTATTAATCCTGATCAAGAATATACACACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTTCTTTTTCTTTCTTCTTTGCAGTGGAGGGCCATGCAGTGCTTTCTAGACTCAAGCTCTAAGCTTCAT:1 + chr3L 23289592 3' - INE-1 95 1 54.14 GCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTGTTTACGTTTAACAATT:1 + chr2R 6984450 3' + HMS-Beagle2 7174 2 71.23 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATAAACAACCGCAAGCAGAGCAAACGACCTCACATAGTTTCCTTTTACGATCATTGGGCCGCC:1 + chr3R 25753717 3' + hobo 2903 1 53.33 ATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAGGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAGGA:1 - chr2L 17104608 3' + transib4 2577 1 28.08 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATGACAAAACACATAAGCAAAGACAGAGGCGGCGGATGGATGTGGATGGGAACGCGAATTGGTTCCGGT:1 - chrX 9709961 3' + pogo 2047 1 57.53 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACGTAGTTCCTTTTGCAACTGCTAACACAAACAGTTCAAGTTATGAGGAACACAGGAATTATTTGCTTAACATCTTTCACAATCCATTTGT:1 - chr3R 20905355 3' - pogo 38 1 60.27 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAAAACCAGACGGCGGGAGCGGCAGCGGTAAAAGTTATAGACGGGGGCTATATGG:1 + chr2R 17100148 3' - P-element 45 1 44.72 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCACCTGCTGAATGCATCCATTTATGCGGCAA:1 - chrX 4789076 3' - 297 19 2 73.29 AGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGTGAAATTTCACAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTAGGTATCCGGAACTGGTCCAGATCGAACTTGTTGGGTTCGAAAACAAATGGTTCTGTCTTTCCATTTTGAGA:1 + chr3R 6054915 3' - INE-1 542 1 53.79 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAAACGGTCATTTATCTAATACCTTAGATATGCAAATCAACCAAATTCTTGGCTTTGCTGGCTTC:1 + chr3L 20977452 3' - I-element 60 1 54.79 CAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAGTTGAAAGGGCACATTCAACATTATCAGAATTAGCTCGTTGCATAAAAGAAGCACTTAATCTCATTGACTGTTCAGAAATAATTATCA:1 - chr3L 25323159 3' - Max-element 8270 2 60.96 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATACCAAGTATCTTAAGATGATTTGAGCTGGTGTCTTGCCGTATTTCGCTGCCAACGCCAGTAGCTTGGAATCAGTGTAG:1 + chr3L 12500266 3' - FB 4 1 75.23 GCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCAAAAGGATTAGGATCAGGGGATAATAAGGATCATACTTATACACCTAGCATACGA:1 + chr2R 7562212 3' + G6 1649 1 62.33 CTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCTAGAAGTAACTGAGTGACAAGAACAGTGAGTAAAA:1 - chr3R 26817642 3' + baggins 5211 1 76.03 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATACACATAAATCACGACTAACACTTTAGCA:1 - chr3R 23449273 3' + roo 353 2 70.54 GCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTATTCACGTTTATATTAGTCTTGTGCGAGTAGTCGTGTGTGCGTGTGATGGCCTTAAAAGAAAACAGCAAAGGCAGACAAATAATCAAAAGCGAGAGAAAACTAGTTTAATAACA:1 + chrX 22487251 3' + INE-1 256 1 62.76 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATATTGTTAGAAAATATCTGCATATTGTATTTTCAGTTCTCAAATAATGTTATCGAAACTCGAACGGAAGGA:1 - chr3R 22846693 3' - 412 51 2 52.05 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGCCAGCATGCAAATGCTCAACATGAGCGTAATTTGTATTCATTATCTGATGCATAATTATAACGCAGATACGCCAACGAAGCTATCGCAGCCTTCGACGGGGTCACCAAATGGA:1 - chr2R 7223603 3' - blood 10 2 77.40 CCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCCACCGATTATCCCTGTCATTTCCGCTTCCGGCCGTAGCCTACTCCCGCCT:1 - chrX 4353631 3' + jockey 4684 1 65.75 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTCCAAAGAAATTCAAATTTAGCAACTGGCAAACCCGCATGATAATGCGCATATTTTTATGCATTATAGCCTACTTTTTGGGGCTGGCTTAGAGCCGTTTGCA:1 + chr3R 18846645 3' + roo 393 1 70.34 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAGGATATATTCATTTGTATCTGAGAGAGTTGGATAAAAATTGCATTGATTAAAGTTTGTTATTTGAATATTCATTGGCAGTGGCGG:1 - chr2L 11668690 3' + mdg1 7436 2 64.89 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAGTGTTCGTGAATTAAGCAATTAGCCAAGTCGAAGCA:1 + chr2L 15920155 3' - jockey 91 1 73.97 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATCACATATATCGATAACATTGTTAGCAAAGGCAACACCTCACCACTTCATCCCAGCTGCACCCAGTTCTTGATGAAGTTCTCATTGAGATCGT:1 + chr3R 23507707 3' - 412 7083 2 62.33 ATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAAAC:1 + chr2L 23390222 3' + rooA 269 2 45.89 ATAAAGACAACAACAAATACAAATACGAAAGGCAAACAAGGATTTGAAAGCAACAACAACAACAAGCACAACAAGAACAACAACACATACGGAATATACGATGGCGGAGTGCGGGGCGTTGCTTCGAGGGCTCAAAGCTGTTCAAA:1 - chrX 10001520 3' - transib3 340 1 63.70 AAATGCTGCATACTTTTACGGGGAGGGGGAGCATATTTTGTTTGGAGATGGTGCTCTTGGTATGCTTATTAATCGTAAAGCAGATATATGCATTGGAGCTATGTACTCGTGGTACGAAGATTACACATACTTAGACCTTTCTATGT:1 + chr2R 5020440 3' + Transib5 2812 1 71.23 AGTTCCTGCGATCTCGTCGTTCATACCGACAGACTCTACGAGTAACGGGAATAACAAGAAAGAACTCCATAGACGAGTACTTTGACTTTTGGTATGTCGTTCGGAACGTACTATCTTTTACTTTCGGCTACCTG:1 - chrX 693664 3' - INE-1 141 1 38.06 GTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTCATTTAGCCAACTCGCATTTCTATTCGCCTGGCATTTGTCTATCAT:1 - chr2L 2581562 3' + copia 5011 2 71.23 GATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTCTAGTGTTTTAATTTTTGGGATTGTTTGTGAAAGAAATTGT:1 + chr3L 14043599 3' - Ivk 94 1 73.29 CAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATGCCTGTGTGGACAATAATATCCTCTCACATTTTATTACACTTGTAATGTGCAACGATTGGAGAAAAGGCAAGGAAAACTGTGGGCTG:1 - chr2L 17198024 3' - R1A1-element 5037 1 60.27 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGTGTGCCAATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCAAATATCTTAAGATATTTTAAGATTGGCGTTTTATTTCATAAGGTGTCTTCTTTTCTTTTAACACTTGACTTGGGG:1 - chr3R 3282432 3' - 1360 63 1 77.93 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATGGGAATTCTAATTAACTACAGTATTAACTGCATGTACCAGCTAAGCAGACAAAGGTGTGTGTTGCGCACAGGAA:1 - chr3R 27971024 3' + mdg1 352 2 64.38 CGCCACAAATACATGTACAATAGCATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGC:1 + chr2L 20841956 3' + G6 1932 1 74.66 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAATGCATTACAATTATTACAAGCCATTGTAAAGAGTAGGAAGACTGGCGAAGAAAGTAGTGAACAA:1 + chr3R 3527155 3' + Tabor 7245 2 68.49 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTAGAGATCGTTGTGGAGAAATCTTGTACAGTGTAAGCTGCATATACATGTAGAATACATGTAGAATTAGAATGTAAACAGAAGTTACCAGGTGATCAACCTCAACGTTTTTATCAT:1 - chr2R 18807711 3' - jockey 15 1 78.77 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAACGCTGGTCTGGTGAAATTAAAAGCTAGCCA:1 - chr3R 31956725 3' + pogo 2086 1 75.34 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTAGTATTTTAATTTCTTTAAAATAGTTCTACTTTTTTAAGTCAAATTAATTATTCATCACCTCCCAGTATCAATTTA:1 + chr3R 12608180 3' - roo 46 2 53.42 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAAATATCTAAAAAGACCTGACATCATTTGCCTCAGGTGTGACTGACTCATGAATGAAACGTGTCGTGACATAAGTAGACTTAGAAATATACTAAAATTATAGCATGAACGTGATCAAAC:1 + chr3R 27503181 3' + hobo 2937 1 76.03 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTTAATATTAAATGGTATGTCCAGGCGCGAGTCCCCACTGCGAGTCCCTTCTGGATTGGATACTAGCCATTAGTATTCCCACG:1 + chr2R 5992421 3' - pogo 36 1 60.96 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTATGTAGTTACCAACTTGACGTACTATCTGACTAATTAGTCATAAAATTACACGACCCAGGACGAACGGGCCGCACAAAAGCC:1 + chr3R 7424657 3' - 412 41 2 56.16 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATTTCTTGTTTTTATTCGTTTTTGTGGTTTCCTCATAAGTACACATACACATGTACTACATAAGCCAGGAAA:1 - chr3R 9345553 3' - pogo 47 1 53.42 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAATTATGACACCAAGCAAACAGCAAGTGAGCGGCCCCAA:1 - chr3R 6068301 3' - jockey 4758 1 80.82 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTGAAAGTATTGCATCGAAATAATTCTATTGTAAATCTAATAAAAGCAAATACCATACTGGCTTAGTTTCTCAAATAACTCGTTCTTGAGGTTGCATTAATCATCT:1 + chr2L 17162909 3' + blood 361 2 72.60 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGGATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 127 2 65.75 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACAAAACTTAAATGAAAACCCCCGAAAGTATGCAAGATGAACACTAAATGACAAGACAAGTAAGAGAAATCTTTGTAAATGTCTCGAACAGTTTTTGTTAG:2 + chr2L 1229740 3' - opus 15 2 75.34